Бесплатный автореферат и диссертация по биологии на тему

Влияние факторов среды на рост и экспрессию клонированных генов Escherichia coli Z905/pPHL7 и Bacillus subtilis 2335/pBMB105

ВАК РФ 03.00.23, Биотехнология

Содержание диссертации, кандидата биологических наук, Бояндин, Анатолий Николаевич

Список обозначений.

Введение.

Глава 1. Обзор литературы.

1.1. Проблемы использования генетически модифицированных микроорганизмов.

1.2. Влияние факторов окружающей среды на рост и развитие микроорганизмов.

1.3. Биолюминесценция и ее практическое применение.

1.4. Исследование рекомбинантных микроорганизмов Escherichia coli

Z905/pPHL7 и Bacillus subtilis 2335/pBMB105: современный этап.

Глава 2. Объекты и методы исследования.

Глава 3. Влияние источников питания и концентрации антибиотиков на рекомбинантные микроорганизмы.

Глава 4. Влияние минеральных солей на характеристики рекомбинантных микроорганизмов.

Глава 5. Перспективы разработки и использования информационной системы для прогноза состояния трансгенных люминесцентных микроорганизмов.

Введение Диссертация по биологии, на тему "Влияние факторов среды на рост и экспрессию клонированных генов Escherichia coli Z905/pPHL7 и Bacillus subtilis 2335/pBMB105"

Применение генетически модифицированных микроорганизмов (ГММО) в биотехнологии имеет огромные перспективы и с течением времени будет только расширяться. Это делает необходимым разработку соответствующих мер безопасности и проведение исследований для оценки возможной судьбы таких микроорганизмов в природных экосистемах, включая как выживание, размножение и распространение самих ГММО, так и сохранение, стабильность и распространение в природных сообществах генетического материала. Даже микроорганизмы r-типа стратегии, обычно требующие для своего размножения более высокой концентрации питательных веществ, чем К- и L-''стратеги", способны длительное время сохраняться в олиготрофных условиях, одним из ярких примеров чего служит уже вызвавшее большую тревогу загрязнение Средиземного моря Escherichia coli, достигающее в некоторых участках 103-104 кл/мл [1].

Измененные методами генетической инженерии штаммы часто проявляют пониженную устойчивость к экстремальным условиям по сравнению с исходными микроорганизмами [2-7], за исключением случаев устойчивости к селективным факторам, кодируемой рекомбинантным геномом. В то же время известны случаи, когда плаз-мидсодержащие штаммы могут обладать одинаковой конкурентоспособностью с бес-плазмидными штаммами или даже иметь преимущества перед последними [8-11]. Существуют различные методы анализа выживания и адаптации ГММО, а также стабильности генетического материала и уровня экспрессии клонированных генов. Наряду с широко распространенным для этой цели использованием модельных микроэкосистем (микрокосмов), существует необходимость проведения экспериментов, моделирующих воздействие отдельных факторов на микроорганизмы для уточнения роли того или иного фактора в каждом конкретном случае.

Очевидно, что важное значение при изучении выживания микроорганизмов имеет оценка их способности к адаптации при изменении условий среды. Знание таких характеристик актуально и для биотехнологических процессов, проводимых с использованием трансгенных микроорганизмов. Во всех случаях большую роль играют как функционирование клонированных генов, в том числе в экстремальных условиях, так и характеристики самих штаммов - в частности, их отношение к изменению источников питания либо физико-химических условий среды. Значимость таких исследований обусловлена и появлением у микроорганизмов в неблагоприятных условиях различных, часто наследственно закрепленных, изменений, направленных на их адаптацию [12-15]; при этом в настоящее время окончательно не установлено, влияют ли эти изменения только на адаптацию микроорганизмов к конкретному стрессовому фактору, или же они могут затрагивать и общие механизмы, определяющие их устойчивость к неблагоприятным воздействиям.

В качестве показателя влияния различных факторов на микроорганизмы можно использовать ростовые характеристики, в частности, скорость роста и максимальный прирост биомассы штамма. Последний показатель может отражать как способность клеток микроорганизмов использовать питательные вещества с наибольшей эффективностью, так и их непродуктивные затраты, возникающие в силу тех или иных нарушений нормальной жизнедеятельности клетки. Не исключено, что затраты на поддержание плазмид могут оказать влияние как на выживание ГММО в различных условиях, так и на реакцию клеток на воздействие неблагоприятных для них факторов (изменение температуры, повышение концентрации солей, свет и т.д.).

В то же время по ростовым характеристикам достаточно трудно оценить влияние факторов на метаболизм микроорганизма, непосредственно связанный с экспрессией плазмидных генов. Для этого могут использоваться различные репортерные генетические системы, в частности, биолюминесценция; /ш>гены в настоящее время широко используются для клонирования в самых разных штаммах. Люминесцентная реакция, связанная с метаболизмом переносчиков водорода (NAD(P)+, FMN), жирных кислот (через биосинтез альдегидов) и углеводов (через контроль экспрессии посредством САР-зависимой регуляции), может отражать метаболическую активность бактериальной клетки. Используемая, с одной стороны, как легко регистрируемый показатель для изучения действия различных факторов на бактериальную клетку, биолюминесценция в то же время применяется и для изучения таких характеристик, как стабильность сохранения, регуляция и стабильность экспрессии рекомбинантного генома, что делает ее уникальным инструментом и при исследовании последствий интродукции ГММО в окружающую среду.

В данной работе в качестве исследуемых факторов были выбраны источники питания (глюкоза, глицерин, пептон), антибиотики (ампициллин и канамицин), устойчивость к которым определяется рекомбинантными плазмидами данных микроорганизмов - как один из наиболее специфичных факторов, отличающий рекомбинантные штаммы от бесплазмидных, а также концентрация минеральных солей (хлорида натрия, сульфата натрия, хлорида магния и сульфата магния) - как фактор, действие которого неспецифично по отношению ни к энергетическим затратам на поддержание рекомбинантных плазмид, ни к функциям клонированных генов; использовались индивидуальные соли и их смесь, в качестве примера которой был использован минеральный состав одного из природных водоемов - соленого озера Шира. Объектами экспериментов служили рекомбинантные штаммы Escherichia coli Z905/pPHL7 (грамотрицательный микроорганизм, несущий маркерные гены биолюминесценции и устойчивости к ампициллину) и Bacillus subtilis 2335/рВМВ105 (грамположительный микроорганизм, несущий гены устойчивости к канамицину и используемый для получения лекарственного препарата "Субалин" [16]). Исследовались также клоны исследуемых ГММО, выделенные в течение 5 лет после интродукции в пресноводные микрокосмы.

Цель работы заключалась в изучении влияния условий среды на рост и экспрессию клонированных генов генетически модифицированных микроорганизмов Escherichia coli Z905/pPHL7 и Bacillus subtilis 2335/pBMB105, а также их клонов, выделенных после интродукции в модельные микрокосмы.

Основные задачи исследования:

1. Изучить динамику роста и изменение концентрации плазмидной ДНК генетически модифицированных штаммов Escherichia coli Z905/pPHL7 и Bacillus subtilis 2335/pBMB105 при периодическом культивировании на средах с различными концентрациями антибиотиков (ампициллина и канамицина соответственно);

2. Исследовать влияние источников углеродного питания (глюкоза, глицерин, пептон) на рост рекомбинантного и бесплазмидного штаммов Bacillus subtilis, рост и люминесценцию рекомбинантного штамма Escherichia coli;

3. Исследовать влияние минеральных солей на рост рекомбинантных и бес-плазмидных штаммов Escherichia coli и Bacillus subtilis, а также на экспрессию клонированных генов биолюминесценции рекомбинантного штамма Escherichia coli Z905/pPHL7 (AprLux+).

На защиту выносятся следующие положения:

1. Концентрация плазмидной ДНК рекомбинантных штаммов Escherichia coli Z905/pPHL7 и Bacillus subtilis 2335/pBMB105 при периодическом культивировании не увеличивается даже при токсических концентрациях антибиотиков. Штамм Е. coli Z905/pPHL7, сохраняя исходную концентрацию плазмидной ДНК, проявляет устойчивость к широкому диапазону концентраций ампициллина в среде. Для штамма В. subtilis 2335/рВМВ105 наблюдается аналогичная зависимость по отношению к ка-намицину.

2. Для рекомбинантного штамма Bacillus subtilis 2335/рВМВ105 характерны меньшие значения прироста биомассы при изменении источников углеродного питания (глюкоза, глицерин, пептон), чем для бесплазмидного штамма Bacillus subtilis 2335.

3.В популяциях рекомбинантных микроорганизмов Escherichia coliZ905/pPHL7 и Bacillus subtilis 2335/pBMB105 появляются клоны, различающиеся по реакции на повышение концентрации минеральных солей по сравнению с исходными штаммами. Для ряда клонов рекомбинантного штамма В. subtilis отмечен более высокий максимальный прирост биомассы при повышенных концентрациях хлорида натрия, чем у исходного рекомбинантного штамма. Для некоторых клонов рекомбинантного штамма Е. coli отмечена стимуляция люминесценции высокими концентрациями минеральных солей.

Полученные результаты могут быть использованы для прогнозирования выживания и распространения рекомбинантных микроорганизмов в случае их интродукции в окружающую среду, а также при использовании таких микроорганизмов в биотехнологических процессах. Результаты могут иметь практическое значение при использовании трансгенных люминесцентных штаммов для анализа влияния различных факторов среды на уровень и стабильность экспрессии клонированных генов.

Установлено, что устойчивость к высоким концентрациям антибиотиков обусловлена усилением экспрессии генов устойчивости к антибиотикам, а не увеличением копийности плазмиды. Наличие рекомбинантной плазмиды влияет на адаптацию микроорганизмов при изменении источника углеродного питания в среде и добавлении хлорида натрия. В гетерогенных популяциях трансгенных микроорганизмов Е. coli Z905/pPHL7 и В. subtilis 2335/рВМВ105 в условиях дефицита биогенных элементов появляются клоны с измененной устойчивостью к действию хлорида натрия. В популяции штамма Е. coli Z905/pPHL7 возникают клоны, различающиеся по реакции lux-генов на воздействие повышенных концентраций минеральных солей в среде. Рекомбинантный штамм Е. coli способен длительное время сохраняться в природной солевой среде, значительно снижая при этом уровень экспрессии клонированных генов. Предложена структура информационной системы по трансгенным светящимся штаммам, ориентированной на прогноз биологической опасности использования рекомбинантных микроорганизмов.

Материалы диссертации были опубликованы в шести центральных и зарубежных журналах, трех рецензируемых сборниках, а также представлены: на VIII Международной конференции «Новые направления биотехнологии» (Москва, 1998 г.); на Международной конференции «Проблемы загрязнения окружающей среды - 98» (Москва, 1998 г.); на VII Международном Экологическом Конгрессе «INTECOL» (Флоренция, Италия, 1998 г.); на 33-й Международной Ассамблее «COSPAR» (Варшава, Польша, 2000 г.); на I Международной конференции "Биоразнообразие и динамика экосистем Северной Евразии" (Новосибирск, 2000 г.); на I Международном рабочем совещании "Биоразнообразие и динамика экосистем Северной Евразии: информационные технологии и моделирование" (Новосибирск, 2001 г.); на V Международной конференции "Проблемы загрязнения окружающей среды - 2001" (Волгоград -Пермь, 2001).

Заключение Диссертация по теме "Биотехнология", Бояндин, Анатолий Николаевич

ОСНОВНЫЕ РЕЗУЛЬТАТЫ И ВЫВОДЫ

1. Установлено, что при периодическом культивировании рекомбинантных микроорганизмов Е. coli Z905/pPHL7 и В. subtilis 2335/рВМВ105 на средах с антибиотиками (ампициллином и канамицином соответственно) даже при токсических концентрациях антибиотиков не происходит увеличение концентрации плазмидной ДНК.

2. Обнаружено, что рекомбинантный штамм В. subtilis 2335/рВМВ105 по сравнению с бесплазмидным более чувствителен к изменению источников углеродного питания. При пересевах со среды с глюкозой или глицерином на среду с пептоном рекомбинантный штамм Bacillus subtilis проявляет значительно меньший максимальный прирост биомассы, чем бесплазмидный штамм.

3. Отмечено, что, при равной ионной силе, соли магния по сравнению с солями натрия обладают меньшим ингибирующим действием на рост исследуемых микроорганизмов. Повышенные концентрации минеральных солей в большей степени подавляют рост рекомбинантного штамма Е. coli, чем бесплазмидного; для В. subtilis не наблюдается существенных различий между рекомбинантным и бесплазмидным штаммами по галотолерантности.

4. Экспериментально обнаружено, что в популяциях рекомбинантных штаммов Е. coli Z905/pPHL7 и В. subtilis 2335/рВМВ105 возникают клоны с измененной реакцией на повышенные концентрации минеральных солей в среде. Часть клонов В. subtilis 2335/рВМВ105 характеризуется повышенной устойчивостью к хлориду натрия по сравнению с исходным рекомбинантным штаммом. Для некоторых клонов Е. coli Z905/pPHL7 со сниженным уровнем свечения в присутствии минеральных солей (2% и выше) отмечена стимуляция свечения; однако при этом и не достигается уровень свечения исходного штамма.

5. При интродукции рекомбинантного штамма Е. coli Z905/pPHL7 в стерильную соленую озерную воду отмечалось сохранение микроорганизма в культивируемом состоянии в течение 160 дней. При высеве проб в жидкую питательную среду в присутствии ампициллина люминесценция регистрировалась в течение всего периода наблюдений, что позволяет обнаруживать сохранение штамма в данных условиях.

6. Предложена структура информационной системы по трансгенным светящимся микроорганизмам, включающей сведения, необходимые для прогноза биологической опасности рекомбинантных штаммов.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

Поставленные в данном исследовании задачи заключались в изучении влияния рекомбинантных плазмид на характеристики генетически модифицированных микроорганизмов, а также изменения этих характеристик в различных условиях существования. Такие исследования актуальны и для использования рекомбинантных штаммов в биотехнологических процессах, и для прогноза выживаемости и распространения таких микроорганизмов в окружающей среде. При этом имеют значение как свойства штамма, детерминируемые рекомбинантной плазмидой, так и другие его характеристики, в частности, способность и механизмы адаптации к неблагоприятным условиям среды.

Изучение устойчивости микроорганизмов к антибиотикам показало, что в периодической культуре штаммы способны адаптироваться к очень высоким концентрациям антибиотиков практически при сохранении исходной копийности рекомбинантных плазмид. Подобная степень лабильности биохимических процессов микробной клетки, способных обеспечить ей в ряде случаев устойчивость к многократному усилению воздействия фактора, требует пристального внимания и дальнейших тщательного исследований.

Проведенные эксперименты позволили выявить влияние в ряде случаев наличия рекомбинантной плазмиды на способность к росту и ростовые характеристики микроорганизмов при изменении источников углеродного питания. То есть, даже при сравнительно небольших отличиях штаммов в большинстве стандартных условий культивирования, в определенных случаях такие отличия могут оказать существенное влияние на микроорганизмы и даже оказаться решающими. В перспективе такие различия могут быть использованы как при биотехнологических процессах, так и при интродукции рекомбинантных штаммов в окружающую среду - при решении задач, связанных с достижением наибольшего эффекта, или, напротив, со сведением к минимуму возможного риска такой интродукции.

Исследования, касающиеся оценки влияния концентрации минеральных солей на микроорганизмы, в определенной степени затронули и гораздо более общий, один из фундаментальных, вопрос современной микробиологии - вопрос о механизмах выживаемости бактерий в окружающей среде. К настоящему времени уже изучены многие перестройки метаболизма микроорганизмов в неблагоприятных условиях, известно об усилении мутационного процесса и увеличении гетерогенности микробных популяций в экстремальных условиях - то есть по сути об уже наследственно закрепленных перестройках метаболизма, сохраняющихся изменениях. В связи с этим возникает принципиальный вопрос - касается ли эта гетерогенность только признаков, обеспечивающих устойчивость микроорганизмов к данным условиям, или же она обладает плейотроп-ным эффектом и может затрагивать и другие признаки, для данной среды нехарактерные. Было установлено, что среди интродуцированных в пресноводные микроэкосистемы микроорганизмов появляются клоны, проявляющие измененную реакцию (значения максимального прироста биомассы, уровень экспрессии клонированных генов биолюминесценции) и на такой неспецифичный для условий интродукции фактор, как концентрация минеральных солей в среде. Это ставит вопрос как о причинах, обусловливающих такие изменения, так и о механизмах адаптации микроорганизмов к стрессовым условиям и влиянии генетической модификации на такие механизмы. Возможно, что внедрение рекомбинантной плазмиды затрагивает функционирование всего генома и, при определенных обстоятельствах, может влиять на уровень экспрессии генов ответа на стрессовые воздействия и ее регуляцию. При этом микроорганизмы, проявляя худшие показатели роста в нормальных условиях, могут легче и быстрее адаптироваться к неблагоприятным условиям, в частности, высокой концентрации минеральных солей. Применительно к прогнозированию возможности выживания и распространения рекомбинантных микроорганизмов в окружающей среде такие данные делают необходимой тщательную оценку возможной гетерогенности популяций микроорганизмов и их изменяющихся свойств. Без этого простое сравнение рекомбинантных штаммов с их бесплазмидными аналогами следует считать совершенно недостаточным. В частности, для данного случая нельзя исключить, что полученные варианты рекомбинантного штамма В. subtilis с повышенной устойчивостью к минеральным солям в условиях засоленных почвенных и морских экосистем будут более конкурентоспособными, чем исходный ГММО, и, возможно, природные популяции В. subtilis. Следует отметить, что, даже если гетерогенность рекомбинантного штамма будет не больше, чем у бесплазмидного, явление возникновения увеличенной устойчивости в популяции ГММО само по себе требует более осторожного подхода при решении вопросов об интродукции таких микроорганизмов в окружающую среду. Биолюминесценция, как показано в данном исследовании, в ряде случаев может служить хорошим маркером для оценки подобной гетерогенности.

Дальнейшее изучение выживаемости рекомбинантных микроорганизмов и изменения экспрессии клонированных генов в олиготрофных условиях делает необходимым тщательный анализ полученных как автором, так и другими сотрудниками лаборатории управления биосинтезом гетеротрофов ИБФ СО РАН вариантов, прежде всего светящегося штамма Е. coli, в том числе с использованием современных методов молекулярной биологии и биоинформатики, что требует систематизации как уже полученной, так и получаемой информации. Решение этой задачи видится в создании информационной системы по трансгенным светящимся микроорганизмам, разрабатываемой в настоящее время как часть единой электронной коллекции светящихся организмов - BiolumBase -в рамках проекта РФФИ № 00-07-90111. Ее создание даст возможность хранить и обрабатывать информацию как о молекулярно-биологических особенностях светящихся ГММО, так и об особенностях их выживания, адаптации и ответа /их-системы в разных условиях. К настоящему времени автором разработана структура информационной системы по люминесцентным ГММО; ее дальнейший перенос на уровень физических таблиц в системе PowerBuilder и разработка программ пользовательского интерфейса и обработки запросов сделает возможным наполнение системы информацией с последующим предоставлением доступа к ней через сеть Интернет. Сочетание экспериментов с их систематизацией и теоретической обработкой может значительно облегчить адекватную интерпретацию результатов по изучению как светящихся микроорганизмов, так и их адаптационных приспособлений к различным условиям.

В заключении хочу выразить огромную благодарность за постоянный интерес и помощь в работе моим научным руководителям - доктору биологических наук, профессору Н.С. Печуркину и кандидату биологических наук Л.Ю. Поповой. Искренне признателен моим коллегам - сотрудникам лаборатории управления биосинтезом гетеротрофов, а в особенности Т.Ю. Крыловой, Т.В. Каргатовой, Е.Е. Максимовой, Т.И. Лобовой и А.В. Брилькову, за большую поддержку и помощь в проведении экспериментов и обсуждении результатов исследований.

Библиография Диссертация по биологии, кандидата биологических наук, Бояндин, Анатолий Николаевич, Красноярск

1. Новиков Ю., Сайфутдинов М. Вода и жизнь на Земле. - М.: Наука, 1981.

2. Бельков В.В. Интродукция генетически модифицированных микроорганизмов в окружающую среду. Перспективы и риск // Генетика. 1994. - Т. 30, № 5. - С. 581-592.

3. Вельков В.В. Оценка риска при интродукции генетически модифицированных микроорганизмов в окружающую среду // Агрохимия. 2000. - № 8. - С. 76-86.

4. Хабарова Е.И., Пшеничникова А.Б. Швец В.И. Основные аспекты экологической безопасности биотехнологических производств //Биотехнология. 1997. - № 4. -С. 31-39.

5. Gene Technology in Microbiology: Benefits and Risks / Report of Working Party of the European Microbiological Societies. 1996. - 57 p.

6. Van Elsas J.D., Gardener B.B.M., Wolters A.C., Smit E. Isolation, characterization, and transfer of cryptic gene-mobilizing plasmid in the wheat rhizospere // Appl. Env. Microbiol. 1998. - V. 64, № 3. - P. 880-889.

7. Wagner-Dobler J., Pipke R., Timmis K.N., Dwyer D.F. Evaluation of aquatic sediment microorganisms and their use in assessing possible effects of introduced microorganisms on ecosystem parameters // Appl. Env. Microbiol. 1992. - V. 58. - P. 1249-1258.

8. Гузев B.C., Голышин П.Н. Пролонгированная катаболитная репрессия и проблема интродукции микроорганизмов в почву //Микробиология. 1994. - Т. 63, №4. -С.565-572.

9. Bej А.К., Perlin М., Atlas R.M. Effect of introducing of genetically engineered microorganisms on soil microbial community diversity // FEMS Microbiol. Ecol. 1991. - № 86. -P. 169-176.

10. Chao W.L., Feng R.L. Survival of genetically engineered Escherichia coli in natural soil and river water // J. Appl. Bacteriol. 1990. - V. 68. - P. 319-325.

11. П.Шарыпова JI.А., Симаров Б.В. Перспективы конструирования и выпуска в окружающую среду генетически модифицированных штаммов клубеньковых бактерий //Генетика. 1994.-Т. 30, № 11.-С. 1435-1457.

12. Суходолец В.В. Природа адаптивных и генетических изменений: приспособле-ность и экологический потенциал. // Генетика. 1998. - Т. 34, № 12. - С. 1589-1596.

13. Velkov V.V. How environmental factors regulate mutagenesis and gene transfer in microorganisms 11 J. Biosciences. 1999. - V. 24, № 4. - P. 529-559.

14. Rosenberg S.M., Thulin C., Harris R.S. Transient and heritable mutators in adaptive evolution in the lab and in nature // Genetics. 1998. - V. 148. - P. 1559-1566.

15. Foster P.L. Mechanisms of stationary phase mutation: a decade of adaptive mutation // Annu. Rev. Genet. 1999. - V. 33. - P. 57-88.

16. Белявская B.A., Ромашева Н.Г., Сорокулова И.Б., Ильичев А.А., Нестеров А.Н., Колосов А.В., Подкуйко В.В., Михайлов В.В. Разработка технологии получения таблеточной формы препарата субалин // Биотехнология. 2001. - № 2. - С. 64-69.

17. The release of genetically modified microorganisms REGEM-2 /Eds Stewart-Tull D.E.S., Sussman M. -N.Y.;L.: Plenum Press, 1992.

18. Brokamp A., Schmidt F.R.J. Survival of Alcaligenes xylosoxidans degrading 2,2-dichloropropinate and horizontal transfer of its halidohydrolase gene in soil microcosm H От. Microbiol. 1991. -V. 22. - P. 229-306.

19. Ka J.O., Holben W.E., Tiedje J.M. Analysis of competition in soil among 2,4-dichlorophenoxyacetic acid-degrading bacteria //Appl. Env. Microbiol. 1994. - V. 60, № 4. - P. 1121-1128.

20. McClure N.C., Fry J.C., Weightman A.J. Survival and catabolic activity of natural and genetically engineered bacteria in laboratory-scale activated-sludge unit // Appl. Env. Microbiol. 1991. - V. 57, № 2. - P. 366-373.

21. Астаурова О.Б, Погорелова Т.Е., Фомина О.Р, Полякова И.Н, Яненко А.С. Регуляция биосинтеза ферментов биодеградации нитрилов у Rhodococcus rhodochrous МО // Биотехнология. 1991. - № 5. - С. 10-14.

22. Sayler G.S., Ripp S. Field applications of genetically engineered microorganisms for bioremediation processes // Curr. Opin. Biotechnol. 2000. - V. 11, № 3. - P. 286-289.

23. Международные руководящие принципы техники безопасности ЮНЕП в области биотехнологии, программа организации объединенных наций по окружающей среде. 1996. 39 с. // Микробиология. 1997. - Т. 66, № 6. - С. 863-864.

24. Сохранение биологического разнообразия в России (первый национальный доклад Российской федерации) /Проект Глобального Экологического Фонда "Сохранение биоразнообразия" Москва: Изд-во Гос. Комитета РФ по охране окружающей среды, 1997- 170 с.

25. Калакуцкий JI.B. 2-ая Международная конференция по интродукции (выпуску) ГММО в окружающую среду // Успехи современ. биол. 1992. - Т. 112, № 3. - С. 475479.

26. Williamson М. Environmental Risk from the Release of Genetically Modified organisms (GMOs) the Need for Molecular Ecology // Mol. Ecol. - 1992. - V. 1, № 1. - P. 3-8.

27. Atlas R.M., Sayer G., Burlage R.S., Bej A.K. Molecular approaches for environmental monitoring of microorganisms // Biotechniques. 1992. - V 12, № 5. - P.706-717.

28. Arana I., Justo J.I., Pocino M., Iriberri J., Barcina I. Influence of survival process in a freshwater system upon plasmid transfer between Escherichia coli strains // Microbial Ecology. 1997. - V. 33.-P. 41-49.

29. Arturo-Schaan M., Tamahai-Shacoori Z., Thomas D., Cormier M. Variations in R-plasmid DNA concentrations of Escherichia coli during starvation in sewage and brackish waters // J. Appl. Bacteriol. 1996. - V. 80. - P. 117-123.

30. Fernandez-Astorga A., Muela A., Cisterna R., Iriberri J., Barcina I. Biotic and abiotic factors affecting plasmid transfer in Escherichia coli strains // Appl. Env. Microbiol. 1992. - V. 58, № l.-P. 392-398.

31. Goodman A.E., Hild E., Marshall K.C., Hermansson M. Conjugative plasmid transfer between bacteria under simulated marine oligotrophic conditions // Appl. Env. Microbiol. -1993.-V. 59.-P. 1035-1040.

32. Smit E., van Elsas J.D., van Veen J.A. Risks associated with the application of genetically modified microorganisms in terrestrial ecosystems //FEMS Microbiol. Rev. 1992. -V. 88.-P. 263-278.

33. Bacterial genetics in natural environments / Eds Fry J.D., Day M.J. L.: Chapman and Hall, 1990.-283 p.

34. Nielsen K.M., Bones A.M., Smalla K., van Elsas J.D. Horizontal gene transfer from transgenic plants to terrestrial bacteria a rare event? // FEMS Microbiology Reviews. -1998.-V. 22.-P. 79-103.

35. Paul J.H. Microbial gene transfer an ecological perspective // J. Molec. Microbiol. Bio-technol.- 1999.-V. 1,№ 1.-P. 45-50.

36. Прозоров A.A. Горизонтальный перенос генов у бактерий: лабораторное моделирование, природные популяции, данные геномики //Микробиология. 1999. - Т. 68, №5.-С. 632-647.

37. Ippen-Ihler К. Bacterial conjugation / Gene transfer in the environment. New York: McGraw Hill Publishing Co, 1989. P. 33-72.

38. Clewell D.B., Gawron-Burke C. Conjugative transposons and the dissemination of antibiotic resistance in streptococci // Annu. Rev. Microbiol. 1986. - V. 40. - P. 635-659.

39. Rumney C.J., J.T. Counts, J.S. Smith, Rowland I.R. Microbiological end-point determination of antibiotics //Microbial Ecology in Health and Disease. 1998. - V.10, № 1. -P.3-11.

40. Krimsky S., Wrubel R.P., Naess I.G., Levy S.B., Wetzler R. E., Marshall B. Standartized microcosms in microbial risk assessment // BioSci. 1995. - V. 45, № 9. - P. 590-599.

41. Steffan R.J., Goksoyr J., Bej A.K., Atlas R.M. Recovery of DNA from soils and sediments // Appl. Env. Microbiol. 1988. - V. 54. - P. 2908-2915.

42. Barcina I., Lebaron P., Vives-Rego J. Survival of allochthonous bacteria in aquatic systems: biological approach // FEMS Microbiol. Ecol. 1997. - V. 23. - P. 1-9.

43. Meikle A., Amin-Hanjani S., Glover A.L., Killham K., Prosser J.I. Metric potential and the survival activity of a Pseudomonas fluorescens inoculum in soil // Soil Biol, and Bio-chem. 1995. -V. 27, № 7. - P. 881-892.

44. Byrd J .J., Colwell R.R. Long-term survival and plasmid maintenance of Escherichia coli in marine microcosms // FEMS Microbiol. Ecol. 1993. - V. 2. - P. 9-14.

45. Leff L.G., McArthur J.V., Shimkets L.J. Persistence and dissemination of introduced bacteria in freshwater microcosms // Microb. Ecology. 1998. - V. 36. - P. 202-211.

46. Каргатова T.B., Максимова E.E., Попова Л.Ю., Брильков А.В., Печуркин Н.С. Фе-нотипическая изменчивость популяции рекомбинантного люминесцентного штамма Escherichia coli в водных микрокосмах //Микробиология. 1997. - Т.66, № 1. -С.101-106.

47. Dukstra A.F., J.M. Govaert, G.H.N. Scholten, Van Elsas J.D. A soil chamber for studying the bacterial distribution in the vicinity of roots // Soil Biol.Biochem. 1987. - V. 19, №3.-P. 351-352.

48. Гладышев М.И. Основы экологической биофизики водных систем. Новосибирск: Наука. Сиб. предприятие РАН, 1999. - 113 с.

49. Angle J.S., Levin М.А., Gagliardi J.V., Mcintosh M.S. Validation of microcosms for examining the survival of Pseudomonas aureofaciens (lacZY) in soil I I Appl. Env. Microbiol. 1995. - V. 61, №> 8. - P. 2835-2839.

50. Ronchel M.C., Ramos C., Jensen L.B., Molin S., Ramos J.L. Construction and behaviour of biologically contained bacteria for environmental applications in bioremediation // Appl. Env. Microbiol. 1995. -V. 61, № 8. - P. 2990-2994.

51. Ahl Т., Christoffersen K., Riamaan В., Nybroe O. A combined microcosm and meso-cosm approach to examine factors affecting survival and mortality of Pseudomonas fluorescens Agl in seawater // FEMS Microbiol. Ecol. 1995. - V. 17. - P. 197-116.

52. Sorenson SJ. Survival of E. coli К 12 in seawater //FEMS Microbiol. Ecol. 1991. -V. 85.-P. 161-168.

53. Miller R.V. Bacterial gene swapping in nature // Sci Am. 1998. -№ 1. - P. 67-71.

54. Meikle A., Killham K., Prosser J.I., Glover L.A. Luminometric measurement of population activity of genetically modified Pseudomonas fluorescens in soil // FEMS Microbiol. Lett. 1992. -V. 99. - P. 217-220.

55. Van Elsas J.D., Duarte G.F., Rosado A.S., Smalla K. Microbiological and molecular biological methods for monitoring microbial inoculants and their effects in the soil environment//J. Microbiol. Methods. 1998.-V. 32. - P. 133-154.

56. Ammons D., Rampersad J., Fox G.E. A genetically modified marker strain of Escherichia coli II Curr. Microbiol. 1998. - V. 37. - P. 341-346.

57. Moller A., Norrby A.-M., Gustafson K., Jansson J. Luminometry and PCR-based monitoring of gene-tagged cyanobacteria in Baltic Sea microcosms // FEMS Microbiol. Lett. -1995. V. 129, № 1. -P.43-50.

58. Recorbet G., Steinberg C., Faurie G. Survival in soil of genetically engineered Escherichia coli as related to inoculum density, predation and competition II FEMS Microbiol. Lett.- 1992,-№ 101.-P. 401-408.

59. Munro P.M., Clement R.L., Flatau G.N., Gauthier M.J. Effect of termal, oxidative, osmotic or nutritional stresses on susequent culturability of Escherichia coli in seawater //Microb. Ecol. 1994. -V. 27. - P. 57-63.

60. Сиренко JI.А., Козицкая B.H. Биологически активные вещества водорослей и качество воды. Киев: Наук, думка, 1988. - 256 с.

61. Bernard L., Schafer Н., Joux F., Courties С., Muyzer G., Lebaron Ph. Genetic diversity of total, active and culturable marine bacteria in coastal seawater // Aquatic Microbial Ecology. 2000.-V. 23.-P. 1-11.

62. Morita R.Y. Bioavailability of energy and its relationship to growth and starvation survival in nature // Can. J. Microbiol. 1988. - V. 34, № 4. - P. 436-441.

63. Паников H.C., Шеховцова H.B., Дорофеев А.Г., Звягинцев Д.Г. Количественные исследования динамики отмирания голодающих микроорганизмов // Микробиология. 1988.-Т. 57, №6.-С. 983-991.

64. Matin A. The molecular basis of carbon-stavration-induced general resistance in Escherichia coli И Mol. Microbiol. 1991. - V. 5, № 1. - P. 3-10.

65. Grossman Т.Н., Kawasaki E.S., Punreddy S.R., Osburne M.S. Spontaneous cAMP-dependent derepression of gene expression in stationary phase plays a role in recombinantexpression instability // Gene. 1998. - V. 209. - P. 95-103.

66. Regulation of gene expression in Escherichia coli II Eds. Lin E.C.C., Lynch S.R.G. Lan-des: Georgetown, 1996. 596 p.

67. Nystrom Т., Neidhardt F.C. Cloning, mapping and nucleotide sequencing of a gene encoding a universal stress protein in Escherichia coli //Mol. Microbiol. 1992. - V. 6. -P. 3187-3198.

68. Головлев Е.Л. Введение в биологию стационарной фазы бактерий: механизм общего ответа на стрессы // Микробиология. 1999. - Т. 68, № 5. - С. 623-631.

69. Tweeddale Н., Notley-McRobb L., Ferenci Т. Effect of slow growth on metabolism of Escherichia coli, as revealed by global metabolite pool ("metabolome") analysis //J. Bacteriol. 1998,-V. 180, №9.-P. 5109-5116.

70. Matin A. Molecular analysis of the starvation stress in Escherichia coli I I FEMS Microbiol. Ecol. 1990.-V. 74.-P. 185-196

71. Saby S., Leroy P., Block J.-C. Escherichia coli resistance to chlorine and glutathione synthesis in response to oxygenation and starvation // Appl. Env. Microbiol. 1999. - V. 65, №12.-P. 5600-5603.

72. Nystrom Т., Olsson R.M., Kjelleberg S. Survival, stress resistance, and alterations in protein expression in the marine Vibrio sp. strain S14 during starvation for different individual nutrients // Appl. Env. Microbiol. 1992. V. 58. - P. 55-65.

73. Giard J.-C., Hartke A., Flahaut S., Benachour A., Boutibonnes P., Auffray Y. Starvation-induced multiresistance in Enterococcus faecalis JH2-2 // Curr. Microbiol. 1996. - V. 32. -P. 264-271.

74. Huisman G., Kolter R. Sensing starvation: a homoserine lactone dependent signaling pathway in E. coli // Science. 1994. - V. 265. - P. 537-539.

75. You Zh., Fukushima J., Tanaka K., Kawamoto S., Okuda K. Induction of entry into the stationary growth phase in Pseudomonas aeruginosa by N-acylhomoserine lactone // FEMS Microbiol. Lett. 1998. -V. 164. - P. 99-106.

76. McLean R.J.C, Whiteley M, Stickler D.J, Fuqua W.C. Evidence of autoinducer activity in naturally occurring biofilms // FEMS Microbiol. Lett. 1997. - V. 154. - P. 259-263.

77. Hardman A.M., Stewart G.S.A.B, Williams P. Quorum sensing and the cell-cell communication dependent regulation of gene expression in pathogenic and non-pathogenic bacteria // Antonie van Leeuwenhoek. 1998. - V. 74. - P. 199-210.

78. McCarter L.L. OpaR, a homolog of Vibrio harveyi LuxR, controls opacity of Vibrio parahaemolyticus // J. Bacteriol. 1998. - V. 180, № 12.-P. 3166-3173.

79. Salmond G.P.C, Bycroft B.W, Stewart G.S.A.B, Williams P. The bacterial Enigma : cracking the code of cell-cell communication //Mol. Microbiol. 1995. - V. 16, №4. -P.615-624.

80. Головлев E.JI, Головлева JI.A. Физиология микробной клетки и метаболическая инженерия // Микробиология. 2000. - Т. 69, № 2. - С. 149-163.

81. Callahan S.M, Dunlap P.V. LuxR- and acyl-homoserine-lactone-controlled non-lux genes define a quorum-sensing regulon in Vibrio fischeri II J. Bacteriol. 2000. - V. 182, № 10.-P. 2811-2822.

82. Dunphy G, Miyamoto C, Meighen E. A homoserine lactone autoinducer regulates virulence of an insect-pathogenic bacterium, Xenorhabdus nematophilus (.Enterobacteriaceae) II J. Bacteriol. 1997. - V. 179, № 17. - P. 5288-5291.

83. Романова Ю.М, Гинцбург A.Jl. Есть ли сходство в механизмах образования "некультивируемых" форм у грамотрицательных бактерий и спор бацилл? // Мол. генетика, микробиол. и вирусол. 1993. - № 6. - С. 34-36.

84. Вайнштейн М.Б, Кудряшова Е.Б. О наннобактериях //Микробиология. 2000. -Т. 69, №2.-С. 163-174.

85. Palmer L.M, Boya A.M., Grinces D.J, Colwell R.R. Molecular genetic and phenotypicalteration in Escherochia coli in natural water microcosms, containing toxic chemicals //FEMS Microbiol. Lett. 1984. -№ 21. - P. 169-173.

86. Russel J.B., Cook G.M. Energetics of bacterial growth: balance of anabolic and cata-bolic reactions // Microbiol.Rev. 1995. - V. 59, № 1. - P. 48-62.

87. Postgate J. A microbial way of death // New Sci. 1989. - № 1665. - P. 43-47.

88. Lloyd D., Hayes A.J. Vigour, vitality and vibility of microorganisms //FEMS Microb. Lett. 1995,-V. 133.-P. 1-7.

89. Головлев E.JI. Другое состояние неспорулирующих бактерий // Микробиология. -1998.-Т. 67, №6.-С. 725-735.

90. Мулюкин А.Л., Луста К.А., Грязнова М.Н. Бабусенко Е.С., Козлова А.Н., Дужа М.В., Митюшина Л.А., Дулу В.И., Эль-Регистан Г.И. Образование покоящихся форм в автолизирующихся суспензиях микроорганизмов //Микробиология. 1997. - Т. 66, № 1, -С. 42-49.

91. Романова Ю.М., Алексеева Н.В., Гинцбург А.Л. Изучение особенностей перехода в некультивируемое состояние штаммов Salmonella typhimurium с мутациями, нарушающими синтез пуриновых оснований // Молекул, генетика, микробиол. и вирусол. 1996.-С. 26-28.

92. Colwell R.R., Bryton P., Hug A. Viable but nonculturable Vibrio cholerae 01 revert to a culturable state in the human intestine // World J. Microb. Biotechn. 1996. - V. 12. -P. 28-31.

93. Joux F., Lebaron P., Trousseller M. Succession of cellular states in a Salmonella typhimurium population during starvation in artifical seawater microcosms //FEMS Microbiol. Ecol. 1997. - V. 22. - P. 65-76.

94. Nwoguh C.E., Harwood C.R., Barer M.R. Detection of induced (3-galactosidase activity in individual non-culturable cells of pathogenic bacteria by quantitative cytological assays // Mol. Microbiol. 1995. -V. 17. - P. 545-554.

95. Steinert M., Embody L., Amam R., Hacker J. Resuscitation of viable but nonculturable Legionella pneumophila Philadelphia JR32 by Acanthamoeba castellani II Appl. Env. Microbiol. 1997. - V. 63. - P. 2047-1053.

96. Dukan S., Levi Y., Tonati D. Recovery of culturability of an HOCl-stressed population of Escherichia coli after incubation in phosphate buffer: resuscitation or regrowth? // Appl.

97. Env. Microbiol. 1997. - V. 63. - P. 4204-4209.

98. Kaprelyants A.S., Gottschal J.C., Kell D.B. Dormancy in non-sporulating bacteria //FEMS Microb. Rev.- 1993.-V. 140.-P. 271-286.

99. Kragelund L., Nibroe O. Cullturability and expression of outer membrans proteins during carbon, nitrogen, or phosphorous starvation of Pseudomonas putida DF14 // Appl. Env. Microbiol. 1994. - V. 60. - P. 2944-2948.

100. Muela A., Arana I., Justo J.I., Seco C., Barcina I. Changes in DNA content and cellular death during a starvation-survival process of Escherichia coli in river water // Microbial Ecol. 1999. - V. 37. - P. 62-69.

101. Whitesides M.D., Oliver J.D. Resuscitation of Vibrio vulinificus from the viable but nonculturable state // Appl. Env. Microbiol. 1997. - V. 63. - P. 1002-1005.

102. Manachan S.H., Steck T.R. The viable but nonculturable state in Agrobacterium tume-faciens and Rhizobium meliloti II FEMS Microbiol. Ecol. 1997. - V. 22. - P. 29-38.

103. Troxel J., Zala M., Moenne-Locooz Y. Predominance of nonculturable cells of biocontrol stran Pseudomonas fluorescens CHAO in the surface horizon of large outdoor lysimeters //Appl. Env. Microbiol. 1997. -V. 63. - P. 3776-3782.

104. Четина E.B. Влияние некоторых физиологических и генетических факторов на процесс перехода энтеротоксигенных штаммов Escherichia coli в некультивируемое состояние // Мол. генетика, микробиол. и вирусол. 1997. - № 1. - С. 8-14.

105. И1. Klappenbach J.A., Dunbar J.N., Schmidt Т.М. rRNA operon copy number reflects ecological strategies of bacteria //Appl. Env. Microbiol. 2000. - V. 66, № 4. - P. 13281333.

106. Oliver J.D. The viable but non-culturable state in the human pathogen Vibrio vulnificus И FEMS Microb. Lett. 1995. - V. 141. - P. 203-208.

107. Дебабов В.Г. Жизнь бактерий за стенами лабораторий // Молекулярная биология. 1999. - Т. 33, № 6. - С. 1074-1084.

108. Романова Ю.Т., Кириллов Т.Ю., Терехов А.А., Гинцбург АЛ. Идентификация генов, контролирующих переход бактерий Salmonella typhimurium в некультивируемое состояние // Генетика. 1996. - Т. 32. - С. 1184-1190.

109. Dong Н., Nilsson L., Kurland C.G. Gratuitous overexpression of genes in Escherichia coli leads to growth inhibition and ribosome destruction //J. Bacteriol. 1996. - V. 177,6.-P. 1497-1504.

110. Eisenstark A., Miller C., Jones J., Leven S. Escherichia coli genes involved in cell survival during dormancy: role of oxidative stress // Biochem. Biophys. Res. Commun. 1992. -V. 188.-P. 1054-1059.

111. Pinhassi J., Hangstrom A. Seasonal succession in marine bacterioplankton // Aquatic Microbial Ecology. 2000. - V. 21. - P. 245-256.

112. Гусев M.B., Минеева Jl.A. Микробиология. М.: Изд-во МГУ, 1985. - 376 с.

113. Ившина И.Б. Бактерии рода Rhodococcus (иммунодиагностика, детекция, разнообразие) / Диссертация в виде научного доклада на соискание ученой степени доктора биологических наук. Пермь, 1997. - 98 с.

114. Wood J.M. Osmosensing by Bacteria: signals and membrane-based sensors // Microbiol, and Mol. Biol. Rev. 1999. - V. 63, № 3. - P. 230-262.

115. Громов Б.В., Павленко Г.В. Экология бактерий. Л.: Изд-во ЛГУ, 1989. - С. 3035.

116. Mager W.H., de Kruijff A.J.J. Stress-induced transcriptional activation //Microbiol. Rev. 1995.-V. 59, №3. P. 506-531.

117. Nekolny D., Chaloupka J. Protein catabolism in growing Bacillus megaterium during adaptation to salt stress // FEMS Microbiol. Lett. 2000. - V. 184. - P. 173-177.

118. Матвеева Н.И., Воронина H.A., Борзенков И.А., Плакунов В.К., Беляев С.С. Состав и количественное содержание осмопротекторов в клетках нефтеокисляющих бактерий при разных условиях культивирования //Микробиология. 1997. Т. 66, № 1. -С. 32-37.

119. Xu J., Johnson R.C. Activation of i^oS-dependent proP P2 transcription by the Fis protein in vitro // J. Mol. Biol. 1997. - V. 270, № 3. - P. 346-359.

120. Conter A., Menchon C., Gutierrez C. Role of DNA supercoiling and RpoS sigma factor in the osmotic and growth phase-dependent induction of the gene osmE of Escherichia coli K12 // J. Mol. Biol. 1997. - V. 273, № 1. - P. 75-83.

121. Bernstein С., Bernstein H., Payne C.M., Beard S.E., Schneider J. Bile salt activation of stress response promoters in Escherichia coli И Current Microbiol. 1999. - V. 39. - P. 6872.

122. Calvo J.M., Matthews R.G. The leucine-responsive regulatory protein, a global regulator of metabolism in Escherichia coli II Microbiol. Rev. 1994. - V. 58, № 3. - P. 466490.

123. Эйхлер В. Яды в нашей пище. 2-е доп. изд. - М: Мир, 1993. - 189 с.

124. Кузовникова Т.А., Федоров Ю.И. Механизм резистентности к ионам серебра у мутантов Escherichia coli В, устойчивых к СиС12 //Биотехнология. 1991. - № 5. -С. 39-41.

125. Анисимова JI.A., Воронин A.M. Детерминируемая плазмидами грамотрицатель-ных бактерий устойчивость к металлам //Мол. генетика, микробиол. и вирусол. -1994.-№ 1.-С. 3-9.

126. Davies J. Another look at antibiotic resistance // J. Gener. Microdiol. 1992. - V. 138. — P.l 553-1559137. Cairns J., Foster P.L. Adaptive reversion of a frameshift mutation in Escherichia coli

127. Genetics. 1991.-V. 128.-P. 695-701.

128. Cairns J., Overbaugh J., Miller S. The origin of mutants //Nature. 1988. - V. 335. -P. 142-145.

129. Torkelson J., Harris R.S., Lombardo M.J., Nagendran J., Thulin C. et al. Genome-wide hypermutation in a subpopulation of stationary-phase cells underlies recombination-dependent adaptive mutation // The EMBO Journal 1997. -V. 16. -P. 3303-3311.

130. Foster P.L. Nonadaptive mutations occur in the F' episome during adaptive mutation conditions in Escherichia coli II J. Bacteriol. 1997. - V. 179. - P. 1550-1554.

131. Bull H.J., McKenzie G.J., Hastings P.J., Rosenberg S.M. Evidence that stationary-phase hypermutation in the Escherichia coli chromosome is promoted by recombination //Genetics.-2000.-V. 154.-P. 1427-1437.

132. Дебабов В.Г. Интродукция генетически измененных микроорганизмов в окружающую среду // Биотехнология. 1992. - № 6. - С. 8-11.

133. Но M.-W., Travik Т., Olsvik О., Tapeser В., Howard C.V., von Weizsacker С., McGa-vin G.C. Gene Technology and Gene Ecology of Infectious Diseases // Micr. Ecol. in Health and Disease. 1998. - V. 10, № 1. - P.3-11.

134. Sarangova A.B., Somova L.A. A new enzymatic technique to estimate the efficiency of microbial degradation of pollutants //Adv. Space Res. 1997. - V. 20, № 10. - P. 20492052.

135. Anderson I.C., Rhodes M., Kator H. Sublethal stress in Escherichia coli: a function of salinity //Appl. Env. Microbiol. 1979. -V. 38, № 6. - P. 1147-1152.

136. Ben-Israel О., Ben-Israel Н., Ulitzur S. Identification of toxic chemicals by use of Escherichia coli carrying lux genes fused to stress promoters //Appl. Env. Microbiol. 1998. - V. 64, № 11.-P. 4346-4352.

137. Reid B.J., Semple K.T., Macleod C.J., Weitz H.J., Paton G.I. Feasibility of using pro-karyote biosensors to assess acute toxicity of polycyclic aromatic hydrocarbons // FEMS Microbiol. Lett. 1998. - V. 169. - P. 227-233.

138. Rettberg, 45. Rettberg P., Baumstark-Khart C., Bandel K., Ptitsyn L.R., Horneck G. Microscale application of the SOS-LUX-TEST as biosensor for genotoxic agents // Analytica chimica acta. 1999. - V. 387, № 3. - P. 289-296.

139. Ripp S., Nivens D.E., Werner C., Sayler G.S. Bioluminescent most-probable-number monitoring of a genetically engineered bacterium during a long-term contained field release //Appl. Microbiol. Biotechnol. -2000. V. 53. - P. 736-741.

140. Биолюминесценция моря / Под ред. И.И. Гительзона. М. Наука, 1969. - 131 с.

141. Meighen Е.А., Dunlap P.V. Physiological, biochemical and genetic control of bacterial bioluminescence // Advanced in Microbial Physiology. 1993. - V. 34. - P. 1-67.

142. Kondo Т., Ishiura M. Circadian rhythms of Cyanobacteria: monitoring the biological clocks of individual colonies by bioluminescence //J. Bacterio1. 1994. - V. 176, № 6. -P. 1981-1885.

143. Гительзон И.И., Родичева Э.К., Медведев С. и др. Светящиеся бактерии. -Новосибирск: Наука, 1984.

144. Meighen Е.А. Genetics of bacterial bioluminescence //Annu. Rev. Genet. 1994. -V. 28.-P. 117-139.

145. Ulitzur S. LuxR controls the expression of Vibrio fischeri IvxCDABE clone in Escherichia coli in the absence of luxl gene // J. Biolumin. Chemilumin. 1998. - V. 13. -P. 365-369.

146. Mansini J.A., Boylan M., Soly R.R., Graham A.F. Meighen E.A. Cloning and expression of the Photobacterium phosphoreum luminescence system demonstrates a unique lux gene organization // J. Biol. Chem. 1988. - V.263. - P. 14308-14314.

147. Meighen E.A., Riendeau D., Bognar A. Bacterial bioluminescence. Accessory enzymes II In: Bioluminescence and Chemiluminescence. -N.Y.: Acad. Press, 1981. P. 409-416.

148. Попова Л.Ю. Составные компоненты люминесцентной системы у Photobacterium leiognathi / Диссертация на соиск. уч. ст. канд. биол. наук. Красноярск. 1982. 190 с.

149. Freeman J.A., Bassler B.L. Sequence and function of LuxU: a two-component phos-phorelay protein that regulates quorum sensing in Vibrio harveyi II J. Bacteriology. 1999.1. V. 181,№3.-Р. 899-906.

150. Meighen Е.А. Molecular biology of bacterial bioluminescence //Microbiol. Rev. -1991. V.55. -P.123-142.

151. Данилов B.C., Егоров H.C. Бактериальная биолюминесценция M.: Изд-во МГУ, 1990,- 152 с.

152. Wada М, Kogure К, Ohwada К, Simidu U. Coupling between the respiratory chain and the luminescent system of Vibrio harveyi II J. Gener. Microbiol. 1992. - V. 138. -P.1607-1611.

153. Попова Л.Ю, Шендеров A.H. Генетические исследования Photobacterium manda-pamensis. Сообщение 1. Получение и описание коллекции ауксотрофных и темновых мутантных штаммов // Генетика. 1979. - Т. 15, № 1. - С. 56-61.

154. Cline T.W, Hastings J.W. Bacterial bioluminescence in vivo: control and synthesis of aldehyde factor in temperature conditional luminescence mutants // J. Bacteriol. - 1974. -V. 118.-P. 1059-1066.

155. Hastings J.W, Nealson K.H. Bacterial bioluminescence //Annu. Rev. Microbiol. -1977.-V.31.-P. 549-595.

156. Ulitzur S, Matin A, Fraley C, Meighen E. H-NS Protein represses transcription of the lux systems of Vibrio fischeri and other luminous bacteria cloned into Escherichia coli II Curr. Microbiol. 1997. - V. 35. - P. 336-342.

157. Медведева C.E. Морфология и ультраструктура светящихся бактерий /Светящиеся бактерии / Под ред. Е.Н. Кондратьева. Новосибирск: Наука, 1984. -С. 74-90.

158. Могильная О.А. Морфологическая гетерогенность колоний Alcaligenes eutrophus ж Photobacterium leiognathi (по данным электронной микроскопии): Автореферат дис. канд. биол. наук. Красноярск, 1998. -20 с.

159. Шендеров А.Н, Виделец И.Ю, Луцкая Н.И, Могильная О.А, Гуревич В.Б. Фи-зиолого-биохимические свойства наследственных вариантов, возникающих в популяции Photobacterium leiognathi И Микробиология. 1989. - Т. 41. - С. 1000-1006.

160. Bassler B.L, Greenberg Е.Р, Stevens A.M. Cross-species induction of luminescence in the quorum-sensing bacterium Vibrio harveyi // J. Bacteriol. 1997. - V. 179, № 12. -P. 4043-4045.

161. Backhaus Т., Grimme L.H. The toxicity of antibiotic agents to the luminescent bacterium Vibrio fischerill Chemosphere. 1999. -V. 38, № 14. - P. 3291-3301.

162. Froechner K., Backhaus Т., Grimme L.H. Bioassays with Vibrio fischeri for the assessment of delayed toxicity // Chemosphere. 2000. - V. 40, № 8. - P. 821-828.

163. Girotti S., Muratori M., Fini F., Ferri E.N., Carrea G., Koran M., Rauch P. Luminescent enzymatic flow sensor for D- and L-lactate assay in beer // Eur. Food. Res. Technol. 2000. -V. 210.-P. 216-219.

164. Murakami S., Ito K., Goto Т., Kamada S., Maeda M. Bioluminescent enzyme immunoassay using thermostable mutant luciferase and acetate kinase as a labeled enzyme // Analytica chimica acta. 1998. - V. 361, № 1-2. - P. 19-26.

165. Кратасюк В.А., Гительзон И.И. Использование светящихся бактерий в биолюминесцентном анализе // Успехи микробиологии. 1987. - Т. 21. - С. 3-30.

166. Кудряшева Н.С., Зюзикова Е.В., Гутник Г.В. Механизм действия солей металлов на бактериальную биолюминесцентную систему in vitro // Биофизика. 1999. - Т. 44, № 2. - С. 244-250.

167. Karatani Н., Konaka Т. In vitro bacterial bioluminescence coupled with a mediated electrochemical process of flavin on a viologen polymer electrode // Biomaterials. 1998. -V. 19, № 19.-P. 227-235.

168. Palmer G., McFadzean R., Killham K., Sinclair A., Paton G.I. Use of /га-based biosensors for rapid diagnosis of pollution in arable soils // Chemosphere. 1998. - V. 36, № 12. -P. 2683-2697.

169. Попова Л.Ю., Луцкая Н.И., Жуков А.Г., Брильков А.В., Печуркин Н.С. Микробные тест-системы для оценки степени токсичности химических соединений / Препринт № 163 Б. Красноярск, Институт биофизики СО АН СССР, 1991. - 31 с.

170. Шендеров А.Н., Виделец И.Ю., Луцкая Н.И., Попова Л.Ю., Гуревич В.Б. Авт.св. № 1321056 СССР. Штамм бактерий Photobacterium leiognathi 54-В7, используемый в качестве тест-культуры для определения активности антибиотиков / Открытия, изобретения. 1987.

171. Popova L.Yu., Brilkov A.V., Pechurkin N.S. Microbial bioassay systems for pollution control // Modeling, Measurement, Control, C, France, AMSE Press, 1993. V. 37, № 4. -P. 1-26.

172. Кратасюк B.A., Егорова О.И., Попова Л.Ю., Орлова Н.Ю., Львова Л.С. Использование биолюминесцентного метода для выявления зерна, пораженного фузариозом / Препринт № 167 Б. Красноярск, Институт биофизики СО АН СССР, 1991. - 16 с.

173. Попова Л.Ю., Калачева Г.С., Могильная О., Медведева С.Е., Печуркин Н.С. Штамм светящихся бактерий с повышенной чувствительностью к гексохлоранцикло-гексану // Прикладная биохимия и микробиология. 1994. - Т. 30, № 4-5. - С. 650-656.

174. Langridge W., Escher A., Wang G., Ауге В., Fodor I., Szalay A. Low-light image analysis of transgenic organisms using bacterial luciferase as a marker // J. Biolumin. Chemilumin. 1994. - V. 9. - P. 185-200.

175. Hill Ph.J., Stewart G.S.A.B. Use of lux genes in applied biochemistry // J. Biolumin. Chemilumin. 1994. - V. 9. - P. 211-215.

176. Min J., Lee Ch.W., Moon S.-H., LaRossa R.A., Gu M.B. Detection of radiation effects using recombinant bioluminescent Escherichia coli strains //Radiat. Environ. Biophys. -2000.-V. 39.-P. 41-45.

177. Lampinen J., Virta M., Karp M. Use of controlled luciferase expression to monitor chemicals affecting protein synthesis //Appl. Env. Microbiol. 1995. - V. 61, №8. -P.2981-2989.

178. Tibazarwa C., Wuertz S., Mergeay M., Wyns L., van der Lelie D. Regulation of the cnr cobalt and nickel resistance determinant of Ralstonia eutropha (Alcaligenes eutrophus) CH34//J. Bacteriol. -2000. V. 182, №5. -P. 1399-1409.

179. Ludwig C., Ecker S., Schwindel K., Rast H.-G., Stetter K.O., Eberz G. Construction of a highly bioluminescent Nitrosomonas as a probe for nitrification conditions // Arch. Microbiol. 1999. - V. 172. - P. 45-50.

180. Carmi O.A., Stewart G.S.A.B., Ulitzur S., Kuhn J. Use of bacterial luciferase to establish a promoter probe vehicle capable of nondestructive real-time analysis of gene expression in Bacillus spp. // J. Bacteriol. 1987. - V. 169, № 5. - P. 2165-2170.

181. Flemming C.A., Leung K.T., Lee H., Trevors J.T., Greer C.W. Survival of lux-lacmarked biosurfactant -producing Pseudomonas aeruginosa UG2L in soil monitored by nonselective plating and PCR// Appl. Env. Microbiol. 1994. - V. 60, № 5. - P. 1606-1613.

182. Fukui R., Fukui H., Alvarez A.M. Suppression of bacterial blight by a bacterial community isolated from the guttation fluids of anthuriumst // Appl. Env. Microbiol. 1999. -V. 65, №3,-P. 1020-1028.

183. Stewart G.S. А. В., Williams P. lux genes and the applications of bacterial biolumines-cence//J. Gener. Microbiol. 1992.-V. 138.-P. 1289-1300.

184. Sinclair G.M., Paton G.I., Meharg A.A., Killham K. Lux biosensor assessment of pH effect on microbial sorption and toxicity of chlorphenols // FEMS Microbiol. Lett. 1999. -V. 174, №2.-P. 273-278.

185. Chaudri A.M., Lawlor K., Preston S., Paton G.I., Killham K., McGrath S.P. Response of a Rhisobium-based luminescence biosensor to Zn and Cu in soil solutions from sewage sludge treated soils // Soil Biol. Biochem. 2000. - V. 32. - P. 383-388.

186. Schwedt G., Reiter C., Uthemann R., Grabert E. Development of an automated bacterial luminescence test for biomonitoring of environmental contaminants // Fresenius J. Anal. Chem.- 1997.-V. 359.-P. 155-160.

187. Bar R., Ulitzur S. Bacterial toxicity of cyclodextrins: luminous Escherichia coli as a model // Appl. Microbiol. Biotechnol. 1994. - V. 41. - P. 574-577.

188. Jacobs M.F., Tynkkynen S., Sibakov M. Highly bioluminescent Streptococcus thermo-philus strain for the detection of dairy-relevant antibiotics in milk // Appl. Microbiol. Biotechnol. 1995. -V. 44. - P. 405-412.

189. Бурмакина C.B., Авдиенко И.Д., Исмаилов З.Ф., Мирошникова Л.К., Чернин JI.C., Степанов А.И. Использование биолюминесцентной метки для изучения почвенных бактерий антагонистов фитопатогенной микрофлоры //Биотехнология. - 1993. -№9.-С. 35-38.

190. Stephenson J.R., Warnes A. Release of genetically-modified microorganisms into environment // J. Chem. Tech. Biotech. 1996. - V. 65. - P. 5-16.

191. Matrubutham U., Thonnard J.E., Sayler G.S. Bioluminescence induction response andsurvival of the bioreporter bacterium Pseudomonas fluorescens HK44 in nutrient-deprived conditions // Appl. Microbiol. Biotechnol. 1997. - V. 47. - P. 604-609.

192. Ford C.Z., Sayler G.S., Burlage R.S. Containment of a genetically engineered microorganism during a field bioremediation application // Appl. Microbiol. Biotechnol. 1999. -V. 51.-P. 397-400.

193. Unge A., Tombolini R., Molbak L., Jansson J.K. Simultaneous monitoring of cell number and metabolic activity of specific bacterial populations with a dual gfp-luxAB marker system // Appl. Env. Microbiol. 1999. - V. 65, № 2. - P. 813-821.

194. Fidopiastis P.M., Sorum H., Ruby E.G. Cryptic luminescence in the cold-water fish pathogen Vibrio salmonicida II Arch. Microbiol. 1999. - V. 171. - P. 205-209.

195. Максимова Е.Е., Попова Л.Ю., Каргатова Т.В., Шпагина В.В. Регулируемая экспрессия генов бактериальной люминесценции, клонированных в многокопийной рекомбинантной плазмиде // Микробиология. 1997. - Т. 66, № 2. - С. 223-227.

196. Печуркин Н.С., Брильков А.В., Марченкова Т.В. Популяционные аспекты биотехнологии Новосибирск: Наука, 1990. - 172 с.

197. Попова Л.Ю., Максимова Е.Е., Репета Т.В., Брильков А.В., Печуркин Н.С. Экспрессия клонированных генов бактериальной люминесценции у микроорганизмов, выделенных из лабораторных микрокосмов // Биотехнология. 1994. - № 5. - С. 6-10.

198. Попова Л.Ю., Луцкая Н.И., Богучаров А.А., Брильков А.В., Печуркин Н.С. Динамика структуры популяции рекомбинантного штамма Escherichia coli при непрерывном культивировании // Микробиология. 1992. Т. 61, № 4. - С. 598-603.

199. Pechurkin N.S, Brilkov A.V, Ganusov V.V, Kargatova T.V, Maksimova E.E, Popova L.Yu. Modelling of genetically engineered microorganisms introduction in closed artificial microcosms // Adv. Space Res. 1999. - V. 24, № 3. - P. 335-341.

200. Каргатова T.B, Максимова E.E, Попова Л.Ю. Сосуществование трансгенного штамма Escherichia coli с природными микроорганизмами при совместной интродукции в водные микрокосмы // Микробиология. 2001. - Т. 70, № 2. - С. 253-258.

201. Бакулина Л.Ф, Тимофеев И.В, Перминова Н.Г, Полушкина А.Ф, Печоркина Н.И. Пробиотики на основе спорообразующих микроорганизмов рода Bacillus и их использование в ветеринарии // Биотехнология. 2001. - № 2. - С. 48-56.

202. Попова Л.Ю, Каргатова Т.Ю., Максимова Е.Е, Белявская В.А. Адаптация штамма Bacillus subtilis, содержащего рекомбинантную плазмиду с геном интерферона-а2 человека, к разным условиям существования // Микробиология. 1997. - Т. 66, № 6. -С. 761-766.

203. Крылова Т.Ю, Попова Л.Ю, Печуркин Н.С, Кашперова Т.А, Белявская В.А. Изучение гетерогенности в популяциях плазмидсодержащего и бесплазмидного штаммов Bacillus subtilis в разных условиях существования // Микробиология. 2000. -Т. 69, №2.-С. 270-275.

204. Илларионов Б.А, Протопопова М.В. Клонирование и экспрессия генов люминесцентной системы Photobacterium leiognathi в плазмидном векторе pUC18 //Генетика. 1985.-№6.-С. 10-13.

205. Белявская В.А. Перспективы создания рекомбинантных штаммов бацилл для конструирования новых биопрепаратов / Автореферат дис. к.б.н. Киев, 1992. - 24 с.

206. Hastings J.W, Weber G. Total quantum flux of isotopic sources // J. Opt. Soc. Am. -1963.-V. 53.-P. 1410-1415.

207. Жемчужина Хакасии (Природный комплекс Ширинского района) / Под. ред. В.П. Парначева и И.В. Букатина. Абакан: Изд-во Хакасского государственного университета им. Н.Ф. Катанова, 1997. - 180 с.

208. Лакин Г.Ф. Биометрия. Учебное пособие для университетов и педагогическихинститутов. М.: "Высшая школа", 1973. - 343 с.

209. Маклаков С.В. BPwin и ERwin. CASE-средства разработки информационных систем. М.: ДИАЛОГ-МИФИ, 2000. - 256 с.

210. Кузьмин С.М., Ожиганова Е.В., Дульдиер М.П. Исследование развития катабо-литной репрессии при росте Escherichia coli на смеси углеводов // Известия РАН. Биологические науки. 1986. - № 8. - С. 92-97.

211. Garcia-Lara J., Martinez J., Vilamu M., Vives-Rego J. Effect of previous growth conditions on the starvation-survival of Escherichia coli in seawater // J. Gen. Microb. 1993. -V. 139.-P. 1422-1431.

212. Бояндин A.H., Попова Л.Ю., Печуркин H.C. Плазмидсодержащий и бесплазмидный штаммы Bacillus subtilis при изменении источников углеродного питания // Биотехнология. 2000. - № 4. - С. 40-44.

213. Николаев Ю.А. Обнаружение двух новых внеклеточных адаптогенных факторов у Escherichia coli К-12 // Микробиология. 1997. - Т. 66, № 6. - С. 785-789.

214. Максимова E.E. Закономерности динамики экспрессии люминесцентных генов, клонированных в рекомбинантном штамме Escherichia coli Z905, в различных условиях существования: Автореф. дис. канд. биол. наук. Красноярск, 1999. - 20 с.

215. Шендеров А.Н., Попова Л.Ю. Путь синтеза альдегидного фактора люциферазы у Photobacterium mandapamensis и влияние предшественника альдегида на развитие люминесценции // Генетика. 1980. - Т. 16, № 6. - С. 1109-1112.

216. Гущин А.Е., Ладыгина В.Г., Говорун В.М. Роль мутаций в рагС и gyrA в формировании устойчивости Mycoplasma hominis к фторхинолонам // Мол. генетика, микробиол. и вирусол. 1999. - № 4. - С. 19-24.

217. Бояндин А.Н., Лобова Т.И., Крылова Т.Ю., Каргатова Т.В., Попова Л.Ю., Печур-кин Н.С. Фактор солености и адаптационные возможности рекомбинантных микроорганизмов Escherichia coli и Bacillus subtilis //Микробиология. 2000. - Т. 69, №2. -С. 243-247.

218. Жизнь микробов в экстремальных условиях / Под ред. Д. Кашнера. М.: Мир, 1981.-520 с.

219. Ждан-Пушкина С.М. Основы роста культур микроорганизмов. Л.: Изд-во Ле-нингр. ун-та. - 1983. - 188 с.

220. Кнорре Д. Г., Мызина С. Д. Биологическая химия. 2-е изд., перераб. и доп. М.: Высш. шк, 1998.-С. 65.

221. Бояндин А.Н., Попова Л.Ю. Зависимое от минеральных солей ингибирование свечения люминесцентного микроорганизма Escherichia coli Z9051 //Биофизика. -2001.-Т. 46, №2.-С. 251-255.

222. Чумакова Р.И., Гительзон И.И. Светящиеся бактерии. М.: Наука, 1975. - 108 с.

223. Finkel S.E., Kolter R. Evolution of microbial diversity during prolonged starvation // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1999. - V. 96. - P. 4023-4027.

224. Пехов А.П. Плазмиды бактерий. M.: Медицина, 1986. - 224 с.

225. Pierson III L.S., Wood D.W., Pierson E.A., Chancey S.T. N-acyl-homoserine lactone-mediated gene regulation in biological control by fluorescent pseudomonads: current knowledge and future work // Europ. J. Plant Pathol. 1998. - V. 104. - P. 1-9.

226. Ульман Дж.Д., Уидом Дж. Введение в системы баз данных. М.: Лори, 2000.121374 с.