Темы диссертаций и авторефератов по биологии

Биоинформатика

ВАК РФ 03.00.28

• Автоматический анализ научных текстов для создания семантических сетей белков

  Результаты транскриптомных и протеомных экспериментов в общем случае представляют собой соответственно либо выборки генов с измененным уровнем экспрессии или списки идентифицированных белков. Обработка экспериментально полученных выборок должна проводиться с учетом современного уровня знаний в области молекулярной биологии. Автоматизация процесса...

  • Пономаренко, Елена Александровна
  • Москва, 2009
  • 03.00.00
• Алгоритмы сравнительного анализа первичных структур биополимеров

  По мере накопления экспериментальных данных сравнительные методы играют все более важную роль. Таким образом, задача разработки алгоритмов сравнительного анализа биологических последовательностей изначально являлась одной из важнейших задач биоинформатики. С другой стороны, по мере разработки таких алгоритмов все большее значение приобретало...

  • Ройтберг, Михаил Абрамович
  • Пущино, 2009
  • 03.00.00
• Выявление взаимосвязанных белков методами анализа геномов

  Для предсказания групп взаимосвязанных белков в работе использовали метод филогенетических профилей (ФП), согласно которому функционально взаимосвязанные белки также связаны и эволюционно [Pellegrini М. et al., 1999]. Данный метод использует интуитивно понятную идею, а также относительно прост в реализации. В методе ФП предполагается, что гены...

  • Пятницкий, Михаил Алексеевич
  • Москва, 2009
  • 03.00.00
• Изучение клеточной функции транскрипционного фактора E. coli GreA

  ДНК-зависимая РНК-полимераза - главный фермент транскрипции в клетке, который ответственен за синтез цепи РНК, комплементарной транскрибируемой цепи ДНК-матрицы, в присутствии субстратов -рибонуклеозид-5'-трифосфатов. Мультисубъединичные РНКП эукариот, архебактерий и эубактерий гомологичны друг другу [8]. Каталитически активный кор-фермент РНКП...

  • Степанова, Екатерина Викторовна
  • Москва, 2009
  • 03.00.00
• Изучение эволюции регуляторных систем прокариот методами сравнительно-геномного анализа

  Долгое время изучение регуляции транскрипции осуществлялось только лишь экспериментально. При этом исследования сосредотачивались, как правило, на транскрипции индивидуальных генов, что позволяло собрать массу необходимых сведений, но не давало полной картины регуляторных взаимодействий. Современные методы массового анализа, такие как метод...

  • Равчеев, Дмитрий Андреевич
  • Москва, 2009
  • 03.00.00
• Кинетическое моделирование центрального метаболизма Escherichia coli

  Апробация работы. Результаты работы докладывались на 12-ой и 15-ой международных конференциях «Математика. Компьютер. Образование» (Пущино, 2005 год; Дубна, 2008); на конференции «Российская биоэнергетика: от молекул к клетке» (Москва, 2005); на 12-ой международной конференции по биотермокинетике (Тракай, 2006); на седьмой международной...

  • Песков, Кирилл Витальевич
  • Пущино, 2009
  • 03.00.00
• Компьютерный прогноз взаимодействия ксенобиотиков с цитохромами Р450 человека

  Рнс. 1. Ферменты биотрансформации лекарств англ. Р450 carbon oxidation). Данные типы биотрансформации в совокупности составляют около 70% реакций, катализируемых указанными выше цитохромами Р450; поэтому предсказание реакций биотрансформации, проходящих через этап P450CARBONOX, является важной задачей для прогнозирования метаболитов. Многие...

  • Дмитриев, Александр Викторович
  • Москва, 2009
  • 03.00.00
• Построение оптимальных моделей ДНК-сайтов связывания факторов транскрипции высших эукариот на основе данных различных экспериментальных методов

  ...

  • Кулаковский, Иван Владимирович
  • Москва, 2009
  • 03.00.00
• Разработка классификации НЕСТ-доменных убиквитин-протеин лигаз на основании филогенетического и структурно-функционального анализа

  Полифункциональность убиквитин-протеин лигаз опосредуется их структурными особенностями. В настоящее время известны 2 основные разновидности ЕЗ лигаз: ферменты ЕЗ, содержащие каталитический1 RING домен (Really Interesting New Gene), и НЕСТ-доменные ЕЗ лигазы (Homologous to E6-associated protein C-Terminus, гомологичный С-концевой...

  • Жаберева, Анастасия Сергеевна
  • Москва, 2009
  • 03.00.00
• Роль летучих стероидов (на примере андростенона) в регуляции агрессивного поведения у домовой мыши

  Научная новизна. Впервые на основе генетического анализа гибридов второго поколения от скрещивания инбредных линии мышей CBA/J и NZB/B1NJ определены хромосомные локусы, оказывающие влияние на такие признаки,* как обонятельная чувствительность к летучему стероиду андростенону и межсамцовая агресссия. Впервые на модели специфической аносмии к...

  • Ключникова, Мария Александровна
  • Москва, 2009
  • 03.00.00
• Роль стресса в регуляции восприятия химических сигналов рецептивной самки у домовой мыши

  В рамках настоящей работы впервые исследовано влияние стресса на восприятие химических сигналов эстральной самки самцами домовой мыши на уровне периферического звена ДОС. Впервые показана иммунореактивность к рецептору глюкокортикоидов в рецепторной ткани...

  • Вознесенская, Анна Евгеньевна
  • Москва, 2009
  • 03.00.00
• Сравнительно-геномный анализ систем бактериального иммунитета

  Типичная CRISPR-система представляет собой кассету, предположительно содержащую информацию о геномах тех фагов, которые уже атаковали клетку, и набор генов, продукты которых позволяют использовать эту информацию для противодействия вновь атакующим клетку фагам. Кассета представляет собой последовательность ДНК, состоящую из коротких (25-45 п.о...

  • Сорокин, Валерий Андреевич
  • Москва, 2009
  • 03.00.00
• Фронтальная устойчивость вертикальной позы человека

  Предложенные методы оценки устойчивости тела могут использоваться при разработке компьютерных стабилоанализаторных комплексов как диагностические постуральные тесты. Полученные результаты могут оказаться полезными: для анализа изменения возрастной устойчивости, диагностики ряда заболеваний, при которых устойчивость человека нарушается, и при...

  • Денискина, Наталья Владимировна
  • Москва, 2009
  • 03.00.00
• Электростатические свойства геномной ДНК

  ...

  • Осипов, Александр Александрович
  • Москва, 2009
  • 03.00.00
• Эффективность очищающего отбора в геномах митохондрий и протеобактерий

  Вероятность мутирования одного нуклеотида в ядерном геноме человека на поколение равна 2.5* 10'8 (Kondrashov 2001). Поскольку в геноме человека содержится около 3x109 нуклеотидов, то на диплоидный геном, на поколение, получается 2.5х Ю-8х2хЗхЮ9 = 150 новых мутаций. Около 2% новообразовавшихся мутаций попадает в ненейтральные области генома, а это...

  • Мамирова, Лейла Абдумажетовна
  • Москва, 2009
  • 03.00.00
• Анализ регуляции генов метаболизма и транспорта метионина и лейцина методами сравнительной геномики

  Методы, основанные только на сходстве аминокислотных последовательностей, не способны определить функции многих гипотетических генов. Более того, выяснилось, что они могут даже приводить к неточным или неправильным аннотациям генов. Функциональное описание большинства из этих гипотетических белков потребовало бы огромного количества экспериментов...

  • Ковалева, Галина Юрьевна
  • Москва, 2008
  • 03.00.00
• Динамика экспрессии генов сегментации у дрозофилы

  Фундаментальным понятием биологин развития является морфогенетическое поле - совокупность клеток, в результате взаимодействия которых формируется орган. Эти взаимодействия приводят к тому, что каждая клетка поля становится детерминированной, выбирая один из многих возможных путей развития, а также занимает определенное положение относительно одной...

  • Самсонова, Мария Георгиевна
  • Санкт-Петербург, 2008
  • 03.00.00
• Классификация триплетной периодичности нуклеотидных последовательностей генов из базы данных KEGG-29

  ...

  • Френкель, Феликс Ефимович
  • Москва, 2008
  • 03.00.00
• Компьютерное конструирование ферментативных систем, обеспечивающих синтез макролидов с заданными свойствами

  Теоретически методами комбинаторного биосинтеза можно получить огромное количество новых макролидов [12], однако провести генно-инженерные эксперименты по получению такого большого числа микроорганизмов-продуцентов невозможно. Также заранее неизвестно, будут ли синтезируемые ими вещества проявлять требуемую биологическую активность. Таким образом...

  • Сергейко, Анастасия Павловна
  • Москва, 2008
  • 03.00.00
• Компьютерные методы массового анализа регуляции транскрипции в бактериях

  ...

  • Ставровская, Елена Дмитриевна
  • Москва, 2008
  • 03.00.00

• 1