Бесплатный автореферат и диссертация по биологии на тему

Влияние донорских генетических структур на специфичность интеграции транспозонов Tr9 и Tr903

ВАК РФ 03.00.07, Микробиология

Содержание диссертации, кандидата биологических наук, Шаталин, Константин Юрьевич

Список сокращений и условных обозначений

ВВЕДЕНИЕ

I. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.

ГЛАВА I. МЕХАНИЗМ ТРАНСПОЗИЦИИ МИГРИРУЮЩИХ ГЕНЕТИЧЕСКИХ ЭЛЕМЕНТОВ.

1.1. Необходимость репликации мигрирующих элементов для их транспозиции

1.2. Особенности интеграции мигрирующих элементов в ДНК реципиента.

1.3. Мигрирующие элементы индуцируют геномные перестройки.

• ГЛАВА 2. МОЛЕКУЛЯРНЫЕ МОДЕЛИ ТРАНСПОЗИЦИИ

2.1. Молекулярные модели транспозиции, в которых репликация мигрирующего элемента происходит до его интеграции.

2.2. Молекулярные модели транспозиции, в которых рекомбинационные процессы предшествуют репликации мигрирующего элемента

ГЛАВА 3. СПЕЦИФИЧНОСТЬ ИНТЕГРАЦИИ МИГРИРУЮЩИХ

ГЕНЕТИЧЕСКИХ ЭЛЕМЕНТОВ.

II. ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ.

ГЛАВА 4. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ.

ГЛАВА 5. ПОЛУЧЕНИЕ ЛИЗОГЕННЫХ ШТАММОВ £

СОДЕРЖАЩИХ В СОСТАВЕ ГЕНОМА ПРОФАГА НЕЗАВИСИМЫЕ ВНЕСЕНИЯ ЭЛЕМЕНТОВ Tt~9 И 7Ъ0оЗ ИЗ РАЗЛИЧНЫХ ДОНОРСКИХ ГЕНЕТИЧЕСКИХ СТРУКТУР

5.1. Введение элемента из разных донорских генетических структур в штамм ^^ дефектный по гену fx.*-/?

5.2. Картирование сайтов локализации элемента JZS в штамме

5. 3. Получение независимых внедрений элемента TL6 из различных донорских генетических структур в геном бактериофага

5.4. Получение лизогенных штаммов /с/ъ^^яо) t содержащих в составе генома профага независимые внедрения элемента 7*^ 903 из различных донорских генетических структур.

ГЛАВА 6. ФИЗИЧЕСКОЕ КАРТИРОВАНИЕ В ГЕНОМЕ БАКТЕРИОФАГА

САЙТОВ ЛОКАЛИЗАЦИИ НЕЗАВИСИМЫХ ВНЕДРЕНИЙ ЭЛЕМЕНТОВ 7^9 И ^ ТРАНСП03ИР0ВАННЫХ ИЗ РАЗЛИЧНЫХ ДОНОРСКИХ ГЕНЕТИЧЕСКИХ СТРУКТУР. 77 6.1. Доказательства наличия сайтов узнавания для эндонуклеаз и /■сс^Ш в ДНК элементов 71S и а/. Определение сайтов узнавания для эндонуклеаз &Т и OL в нуклеотидной последовательности элементов и 7*^9^3 , . 77 б/. Клонирование элемента 7^3 в составе fat^/H фрагмента ДНК бактериофага на плазмиде в/. Компьютерный анализ нуклеотидной последовательности элемента 7Х

6.2. Картирование в геноме 'бактериофага А сайтов независимых внедрений элемента , транспозированного из плазмидного и хромосомного донорских сайтов а/. Картирование в геноме бактериофага Дд^^о сайтов независимых внедрений элемента 7*^9, транспозированного из плазмидного донорского сайта. б/. Картирование в геноме бактериофага сайтов независимых внедрений элемента 7й-9, транспозированного из хромосомного донорского сайта. ЮЗ

6.3. Картирование в геноме бактериофага \а££?с> сайтов независимых внедрений элемента7LW3, транспозированного из хромосомного и плазмидного донорских сайтов а/. Картирование в геноме бактериофага ^а&яя сайтов независимых внедрений элемента транспозироваяного из хромосомного донорского сайта. б/. Картирование вгеноме бактериофага сайтов независимых внедрений элемента^^З, транспозированного из плазмидного донорского сайта. П

ОБСУВДНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ. П

ВЫВОДЫ.

Введение Диссертация по биологии, на тему "Влияние донорских генетических структур на специфичность интеграции транспозонов Tr9 и Tr903"

Открытие класса мигрирующих генетических элементов, способных перемещаться из одного сайта в другой независимо от наличия протяженных областей гомологии, явилось одним из наиболее значительных достижений генетики микроорганизмов за последнее время.

Интенсивное изучение свойств мигрирующих элементов, а также развитие таких методов исследования как рестрикцион-ный и гетеродуплексный анализы, привело к накоплению фактов об участии этих элементов в целом ряде рекомбинационных событий известных под названием "незаконной рекомбинации". Так, было продемонстрировано, что именно мигрирующие генетические элементы обусловливают возникновение мутаций, обладающих полярным эффектом, вызывают геномные перестройки типа делеций, инверсий, дупликаций, а также осуществляют ъе&Л -независимым путем рекомбинационное взаимодействие негомологичных последовательностей ДНК.

В настоящее время показана широкая распространенность мигрирующих генетических элементов. Они обнаружены в составе ГеНОМОВ ^йЬ^йЛ^О' f С/ц^б^А-, / S&yis&A&c}., а также у некоторых эукариотических организмов. Кроме того, мигрирующие генетические элементы идентифицированы в составе ДНК плазмид и бактериофагов. Поскольку плазмиды обнаружены у представителей более 40 бактериальных родов и некоторые из них обладают широким спектром хозяев, то очень вероятно, что мигрирующие элементы распространены практически среди всех видов бактерий. Исследование новых бактериальных видов подтверждает это предположение. Широкое распространение мигрирующих генетических элементов указывает на их важную роль в жизни микроорганизмов.

Данные о постоянном присутствии мигрирующих элементов в бактериальных клетках, демонстрация их участия в регуляции выражения генов, способность индуцировать геномные перестройки и обусловливать нестабильность геномов бактерий также говорят о большом значении этих элементов для микроорганизмов как в функциональном, так и в эволюционном аспектах. Выяснение механизма рекомбинационных событий, вовлекающих мигрирующие генетические элементы, является одной из "горячих точек" современной биологической науки. Интенсивность исследований, направленных на изучение механизма транспозиции определяется также практической значимостью мигрирующих элементов для медицины и микробиологической промышленности. Открытие транспозонов - одной из групп мигрирующих генетических элементов - позволило понять причины чрезвычайно быстрого распространения факторов множественной лекарственной устойчивости среди бактерий. Кроме лекарственной устойчивости транспозоны могут содержать самые разнообразные гены, такие, как гены детерминирующие синтез энтеротоксина, утилизации различных веществ и другие. В последнее время появились работы, в которых продемонстрирована возможность конструирования транспозонов. Таким образом, практически любой ген? будучи фланкирован мигрирующими элементами, может стать транспозоном и, благодаря способности мигрирующих элементов внедряться посредством ье&Л -независимой рекомбинации в негомологичную ДНК, распространяться между различными видами и родами бактерий. Это свойство мигрирующих элементов делает их очень ценным инструментом в генетической инженерии т^-ъо на различных бактериальных объектах. Микробиологические методы, которые при этом применяют, отличаются простотой, доступностью и универсальностью и существенно дополняют рестриктазно-лигазную технику, лежащую в основе генетической инженерии iu. . Использование транспозонов для конструирования штаммов, выделения мутантов, маркировки плазмид и определенных областей хромосомы, создание участков гомологии в неродственных геномах, отбора штаммов с различными геномными перестройками в интересующей исследователя области особенно перспективно при изучении генетической организации микроорганизмов, имеющих важное практическое значение в медицине и микробиологической промышленности.

Все вышеперечисленное свидетельствует о чрезвычайной актуальности и перспективности исследований, направленных на изучение механизма необычных рекомбинационных событий, лежащих в основе процесса транспозиции. Одним из центральных вопросов этой проблемы является вопрос о специфичности интеграции мигрирующих генетических элементов. Однако, в этой области известно пока далеко не все. Хотя имеются работы, указывающие на различную специфичность внедрения разных мигрирующих элементов в реципиентную ДНК, в последнее время появились данные, свидетельствующие о принципиальном сходстве способов интеграции разных мигрирующих элементов.

Показано, что специфичность внедрения мигрирующих генетических элементов определяется не только их собственной функцией, а также обусловлена и стуктурой ДНК-мишени. Роль донорной ДНК в выборе сайтов внедрения до настоящего времени не изучена.

Цель настоящей работы состояла в выявлении и изучении специфичности интеграции мигрирующих генетических элементов, транспозируемых из различных по локализации донорских сайтов В соответствии с поставленной целью предполагалось решить следующие задачи:

1. Разработать методические подходы для изучения специфичности интеграции элементов Т**.в и ;

2. Определить распределение сайтов внедрения элементов и Та. $0% в геноме бактериофага ^а-й?^ и выяснить степень специфичности интеграции элементов 72^,9 и 7^ 9о? •

3. Изучить зависимость специфичности интеграции элементов и от сайтов их предшествующей интеграции, а также выяснить роль типа донорского репликона в выборе сайтов внедрений транспозонов;

4. Определить возможность изменения структуры элементов 7^-9 и в процессе транспозиции;

Научная новизна работы. Впервые проведено изучение влияния донорских генетических структур на специфичность транспозиции элементов и в геном бактериофага Ца-И^о Установлено, что донорские генетические структуры могут оказывать влияние на выбор сайтов внедрения вышеназванных мигрирующих элементов при их транспозиции в геном бактерио-" фага 2а.б6?о . При этом элементы и 9<>3 транспозируют-ся из хромосомных сайтов локализации в один, характерный ' для каждого транспозона участок ДНК бактериофага .

В то же время, элементы и при транспозиции из плазмидных сайтов локализации внедряются в разные области генома бактериофага /} . Кроме того, нами получены новые данные, свидетельствующие о возможности возникновения структурных перестроек в нуклеотидной последовательности элемента в процессе его транспозиции.

Практическое значение работы вытекает из возможности использования полученных данных для конструирования генетических структур с заданными свойствами, что в свою очередь необходимо при генноинженерных работах, значение которых для медицины и микробиологической промышленности трудно переоценить. Кроме того, решение вопроса о специфичности интеграции транспозонов существенно облегчит изучение генетики новых микробиологических объектов важных для медицины, а также откроет пути к разработке рациональных методов борьбы с распространением среди бактерий факторов тожественной лекарственной устойчивости, имеющих транспозонную природу.

ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

При изучении регуляции работы генов у бактерий, были открыты необычные хромосомные мутации. Мутации нового типа затрагивали регуляторную область генов и обладали выраженным полярным эффектом / , 1966; алУ SyU^U^sL , 1967; , 1969; , 1972/. Появление и развитие физико-химических методов исследования позволило определить характер мутаций. Так, методами рестрик-ционного и гетеродуплексного анализов было определено, что необычные мутации вызваны внедрением коротких нуклеотидных последовательностей / Ргл+^б- и f 1972; .

1975; ^ 1975; 1975; Сa^J sr^/^^. , 1972; 1976; f 1976 /. Мигрирующие генетические элементы оказались присущими микроорганизмам различных видов. Они были выявлены у &?/ /Чя^а-А*-^ г 1967, 1970; SeucJge^ ^ /йг^уе^. , 1967; SW^gs*, 1972; /Ау^^ , 1969 /, , jleJf** ^ ., 1977 /, / ^ 1977 /, / 1977 /, j^A^A- / бс^ы^&ъ е£ . 1978 /, pfiXfa»" 1977 /, / M&^tg

Jo,**/ , 1974 /, SttL/o^^*^*^'* / ч 1979 /, / ? 1977 / а также у представителей других родов микроорганизмов. Так как известно, что у бактерий существуют плазмиды широкого спектра хозяев, можно предположить наличие мигрирующих гене

- т^

L о тических элементов у всех видов бактерий. Кроме того, мигрирующие генетические элементы обнаружены у эукариоти-ческих организмов таких как дрожжи /t 1977; ■сб. , 1979 /, дрозофилы / Л . , 1974; c^- ^aV, 1974; .сиС., 1980 /, кукуруза / , 1952, 1965 /.

У бактерий идентифицировано три группы дискретных генетических элементов, способных перемещаться из сайта в сайт одного или разных геномов, независимо от известных рекомби-национных систем клетки, в отсутствии протяженной гомологии у рекомбинирующих структур. Это: £$ -элементы, транспозоны и эписомы. Систематика и номенклатура мигрирующих генетических элементов изложена Кэмпбеллом с соавторами /

1979 /. Мы рассмотрим данные, касающиеся механизма транспозиции и специфичности интеграции IS -элементов и транспозонов бактерий.

Заключение Диссертация по теме "Микробиология", Шаталин, Константин Юрьевич

выводы

1. Выбор сайта интеграции в ДНК-мишени при транспозиции элементов Tn 9 и тп 903 зависит от предшествующей локализации транспозона.

2. Плазмидные донорские сайты элементов тп 9 и Тп 90 з определяют большую вариабильность участков последующих внедрений по сравнению с хромосомными донорскими сайтами.

3. В процессе транспозиции может происходить полное удвоение элемента Тп 9 .

4. В ходе транспозиции с определенной вероятностью происходит появление сайта рестрикции для эндонуклеазы Hind hi в составе элемента тп 9 , что указывает на структурные перестройки этого транспозона.

5. Нуклеотидные последовательности элемента тп 9 содержат один сайт узнавания для эндонуклеазы Eco hi , который расположен в районе 1200 нуклеотидной пары.

Библиография Диссертация по биологии, кандидата биологических наук, Шаталин, Константин Юрьевич, Москва

1.Бреелер G.E.,Ланцов В.А.,Тамм С.Э. "Запоминание" транспозоном меета предшествующей интеграции. Доклады АН СССР, 1982,т.267, #6, с.1468-1471.

2. Гинцбург А.Л.,Покровская М.С.,Янишевский Н.В.,Титце Э.,Мотин В.Л. «Смирнов Г.Б. Образование плазмид при инфекции бактерий E.coli фагом Я att80 01857 S7 (Tn 9) .Молекулярная генетика,микробиология и вирусология,1983,№4,с.15-20.

3. Ильина Т.С.,Нечаева Е.В. ,Пасынкова Л.Н.,Смирнова Н.И.,Смирнов Г.Б. Сайты интеграции Тп 9 и их влияние на свойства транспозона. Генетика ,1980,т.16,№1,с.46-54.

4. Миллер Дж. Эксперименты в молекулярной генетике.М.Мир,1976.

5. Миркин G.M.,Покровская М.С* «Каратаев Г.И. ,Гинцбург А.Л. Природа плазмид,определяющих нестабильное наследование транспозона Тп 9 в Escherichia coii К12 .Генетика, 1983,т.19,№5, с.720-726.

6. Романова Ю.М. ,Ганелин В.Л.,Денисов А.А. Транспозиция детерминанта канамицинрезистентности /тп 601 / из плазмиды R6 в веном бактериофага Д и выражение этого гена после индукции профага.Генетика,1980,т.16,№2,с.199-204.

7. Смирнов Г.Б.,Ильина Т.С. is -элементы и их роль в генетической рекомбинации.Генетика,1977,т.13,№4,с.696-709. Э.Смирнов Г.Б.,Ильина Т.С. Изменение специфичности интеграции Тп9 в процессе его миграции.Генетика,1979,т.15,№7,с.1333-1336.

8. Ю.Хесин Р.Б. Непостоянство генома .Мол. Био ло гия, 1980, т Л 4, выл.6,c.I205-1217.

9. Ahmed A.,Scraba D. Nature of deletions formed in response to IS2 in a revertant of the gal3 insertion of E.coli.Mol.Gen. Genet.1978,v.163,N2,p.189-196.

10. Allet B.Mu insertion duplicates a 5 base pair sequence at the host inserted site.Cell,1979,v.16,p.123-131•

11. Alton N.K.,Vapnek D. Nucleotide sequence analysis of the chloramphenicol resistance transposon Tn9.Nature, 1979,v.282,p.864-869.

12. Arthur A.,Sherratt D. Dissection of the transposition process: a transposon encoded site-specific recombination system.Mol. Gen.Genet.,1979,v.175,N3,p.267-274.

13. Barth P.T.,Datta N.,Hedges R.W.,Grinter N.J. Transposition of a deoxyribonuclic acid sequence encoding trimethoprim and streptomycin resistances from R483 to other replicons.

14. J.Bact eriol.,1976,v.125,N3,p.800-810.

15. Barth P.Т.,Grinter N.J. Tn7 insertion map of RP4.In:DNA insertion elements,plasmids and episomes (eds.Bukhari A.J.,Shapiro J.A.,Adhya S.L.)Cold Spring Harbor Lab.,Cold Spring Harbor, N.Y.,1977,p.675-682.

16. Bennett P.M.,Richmond M.H. Translocation of a discrete piece- 133 of deoxyribonucleic acid earring an amp gene between repli-cons in Escherichia coli.J.Bacterid., 1976,v.126,N1 ,p.1-8.

17. Bennett P.M.,Grinsted J.,Richmond M. Transposition of TnA does not generate deletions.Mol.Gen.Genet.,1977,v.154,N2, p.205-211.

18. Berg D.,Davies J.,Allett B.,Rochaix J.D. Transposition of R factor genes to bacteriophage lambda.Proc.Nat.Acad.Sci.USA, 1975,v.72,N9,p.3628-3632.

19. Bossi L.,Ciampi M.S. ША sequences at the sites of three insertions of the transposable element Tn5 in the histidine operon of Salmonella.Mol.Gen.Genet.,1981,v.183,N2,p.406-408.

20. Bresler S.E.,Tamm S.E.,Goryshin I.Yu.,Lanzov V.A. Postexcisi-on transposition of the transposon Tn10 in Escherichia coli K12.Mol.Gen.Genet.,1983,v.190,N1,p.139-142.

21. Bukhari A.I.,Zipser D.Random insertion of Mu-1 DNA within a single gene.Nature New Biol.,1972,v.236,p.240-243.

22. Bukhari A.I. Bacteriophage Mu as a transposition element. Ann.Rev.Genet.,1976,v.10,p.389-412.

23. Bukhara A.I.,Proshauer S.Insertion of a transposon for chloramphenicol resistance in bacteriophage Mu.Gene,1978,v.3,N2, p.303-314.

24. Bukhari A.I. Models of DNA transposition.Trends Biol.Sci., 1981,v.6,N2,p.56-60.

25. Calos M.P.,Miller J.H. Transposable elements.Cell,1980,v.20, N3,p.579-595

26. Calos M.P.,Johnsrud J.,Miller J.H. ША sequence at integration sites of IS1.Cell,1978,v.13,N2,p.411-418.

27. Calos M.P.Johnsrud J.,Miller J.H. A genetic and sequencing study of IS1 and Tn9 insertions in the Escherichia coli lac operon.Cold Spring Harbor Simp.Quant.Biol.,1979,v.43>P«1263-1271.

28. Cameron J.R.,Loh E.Y.,Davis R.W. Evidence for transposition of dispersed repetitive ША families in yeast.Cell,1979,v.16, N3,p.739-745.

29. Campbell A. Episomes.Adv.Genet.,1962,v.11,p.101-145.

30. Chandler M.,Roulet E.,Silver L.,Boy de la Tour E.,Caro L. Tn10 mediated integration of the plasmid R100.1 into the bacterial chromosome:inverse transposition.Mol.Gen.Genet., 1979a,v.173,N1,p.23-31•

31. Chandler M.,Boy de la Tour E.,Willems D.,Caro L. Some properties of the chloramphenicol resistance transposon Tn9. Mol.Gen.Genet.,1979b,v.176,N2,p.221-231.

32. Chandler M.,Glerget M.,Galas D.J. The transposition frequency of IS1-flanked transposons is a function of their size.

33. J.Mol.Biol.,1982,v.154,N2,p.229-243.

34. Coelho A.,Leach D.,Maynard-Smith S.,Symonds N. Transposition studies using a Col E1 derivative carrying bacteriophage Mu. Cold Spring Harbor Symp.Quant.Biol.,1981,v.45,p.323-328.

35. Cohen S.N. Transposable genetic elements and plasmid evolution. Nature,1976,v.263,N5580,p.731-738.

36. Cohen S.N.,Kopecko D.J. Structural evolution of bacterial plasmidssrole of translocating genetic elements and DNA sequence insertions.Fed.Proc., 1976,v.35,N9,p.2031-2036.

37. Cohen S.N.,Casadaban M.J.,Chou J.,Tu C.P.D. Studies of the specificity and control of transposition of the Tn3 element. Cold Spring Harbor Symp.Quant.Biol.,1979,v.43,p.1247-1256.

38. Cornelis G.,Saedler H. Deletion and an inversion induced bya resident IS1 of the lactose transposon Tn951.Mol.Gen.Genet., 1980,v.178,N2,p.367-374.

39. Cornelis G.,Ghosal D.,Saedler H. Tn951:a new transposon carrying a lactose operon.Mol.Gen.Genet.,1978,v.l60,N2,p.215-224.

40. Daniell E.,Roberts R.,Abelson J. Mutations in the lactose operon caused by bacteriophage Mu.J.Mol.Biol.,1972,v.69,N1, p.1-12.

41. Davis R.W.,Simon M.,Davidson N. Electron microscope hetero-duplex methods for mapping regions of base sequence homology in nucleic acids.In:"Methods in Enzymology"(eds.Grossman L.,

42. Moldave K.)N.Y.,Academic Press,1971,v.21,p.413-428.

43. Eckhardt Т. A rapid method for the identification of plas-mid deoxyribonucleic acid in bacteria.Plasmid,1978,v.1,p.584

44. Egel R. "Flip-flop" control and transposition of mating type genes in fission yeast.In:DUA insertion elements,plasmids and episomes(eds.Bukhari A.I.,Shapiro J.,Adhya S.)Cold Spring Harbor Lab.,Cold Spring Harbor,U.Y.,1977,p.447-456.

45. Engler J.A.,van Bree M.P. The nucleotide sequence and protein-coding capability of the transposable element IS5. Gene,1981,v.14,U3,p.155-163.

46. Faelen M.,Toussaint A. Stimulation of deletions in Escherichia coli:chromosome by partially induced Mu cts62 prophages. J. Bacterid. 1978, v.136,Fl,p.477-483.

47. Faelen M.,Toussaint JU,de Lafonteyne J. A model for the enhancement of Д -gal integration into partially induced Mu-1 lysogens. J.Bacteriol.1975,v.121,112, p. 87 3-880.

48. Fedoroff U.V. Deletion mutants of Xanopus laevis 5S riboso-mal DUA.Cell,1979,v.16,112,p.551-561 .

49. Fiandt M.,Szibalski W.,Malamy M.H. Polar mutations in lac, gal and phage Я consist of a few DUA sequences inserted with either orientation.Mol.Gen.Genet.,1972,v.119,N1,p.223-231.

50. Poster T.J. R factor-mediated tetracycline resistance in- 13?

51. Escherichia coli K12.Dominance of some tetracycline sensitive mutants and relief of dominance by deletion.Mol.Gen.Genet., 1976,v.143,N1,p.339-348.

52. Poster T.J. Insertion of the tetracyclin resistance translocation unit Tn10 in the lac operon of Escherichia coli K12. Mol.Gen.Genet.,1977,v.154,N1,p.305-317.

53. Poster T.J.,Lundblad V.,Hanley-Way S.,Hailing S.M.,Kleckner N. A symmetrical six-basepair target site sequence determines Tn10 insertion specificity.Cell,1981,v.23,N1,p.215-227.

54. Galas D.J.,Calos Ш.P.,Miller J.H. Sequence analysis of Tn9 insertions in the lacZ gene.J.Mol.Biol.,1980,v.144,N1,p.19-41.

55. Galas D.J.,Chandler M. On the molecular mechanism of trans-posit ion. Proc .Nat .Acad. Sci. USA, 1 981 , v. 78, N8, p .4858-4862.

56. Galas D.J.,Chandler M. Structure and stability of Tn9-medi-ated cointegrates,evidence for two pahtways of transposition. J.Mol,Biol.,1982,v.154,N2,p.245-272.

57. Ghosal D.,Gross J.,Saedler H. The DNA sequence of IS2-7 and generation of mini-insertions by replication of IS2 sequences. Cold Spring Harbor Symp.Quant.Biol.,1979a,v.43,p.1193-1201.

58. Ghosal D.,Sommer H.,Saedler H. Nucleotide sequence of the transposable DNA element IS2.Nucleic Acid Res.,1979b,v.6,1. N2,p.1111-1120.

59. Gill R.,Heffron :F.,Dougan G.,Fallow S. Analysis of sequences transposed by complementation of two classes of transposition-deficient mutants of Tn3.J.Bacterid.,1978,v. 136,N2,p. 742-756.- 138

60. Gottesman M.,Rosner J.L. Acquisition of a determinant of chloramphenicol resistance by coliphage lambda.Proc.Nat. Acad.Sci.USA,1975,v.72,p.5041-5050.

61. Grindley N.D.F. IS1 insertion generates duplication of a 9 base pair sequence at its target site.Cell,1978,v.13,N3,p. 419-426.

62. Grindley N.D.F.,Sherratt D.J. Sequence analysis at IS1 insertion site:models for transposition.Cold Spring Harbor Symp.Quant.Biol.,N.Y.,1979,v.43,p.1257-1262.

63. Grinsted J.,Bennett P.M.,Higginson S.,RichmondM.H. Regional preference of insertion of Tn501 and Tn802 into RP1 and its derivatives.Mol.Gen.Genet.,1978,v.166,N2,p.313-322.

64. Grinsted J.,Bennett P.M.,Higginson S.,Richmond M.H. Sites of insertion of TnA. and TnM in RP1 and its derivatives .J. Сontrib.Microbiol.Immunol.,1979,v.6,N1,p.16-25.

65. Haberman P.,Klaer R.,Kuhn,Starlinger P. IS4 is found between eleven or twelve base pair duplications.Mol.Gen.Genet., 1979,v.175,N3,p.369-373.

66. Hedges R.W.,Jacob A.E. Transposition of ampicillin resistance from RP4 to other replicons.Mol.Gen.Genet.,1974,N1,p.31-40.

67. Hedges R.W.,Matthew M.,Smith D.J.,Cresswell J.M.,Jacob A.E. Properties of a transposon conferring resistance to penicillin and streptomycin.Gene,1977,v.1,N2,p.241-249.

68. Heffron P.,Rubens C.,Palkow S. Translocation of a plasmid DNA sequence which mediates ampicillin resistancesmolecular nature and specificity of insertion.Proc.Nat.Acad.Sci.USA, 1975,v.72,N9,p.3623-3627.

69. Kallmann R.,Kamp D. Nucleotide sequence of the attachment sites of bacteriophage Mu DNA.Nature,1979,v.280,p.247-252.

70. Kamp D.,Kahmann R. Two pathways in bacteriophage Mu transposition? Cold Spring Harbor Symp.Quant.Biol.,1981,v.45,p« 329-336.

71. Klaer R.,Pfeifer D.,Starlinger P. IS4 is still found in its chromosomal site after transposition of gal T.Mol.Gen.Genet., 1980,v.178,N1,p.281-292.

72. Klaer R.,Kuhn S.,Fritz H.J.,Tillman E.,Saint-Girons I.,Ha-bermann P.,Pfeifer D.,Starlinger P. Studies on transposition mechanisms and specificity of IS4.Cold Spring Harbor Symp. Quant .Biol., 1981 a.v. 45, p. 215-224.

73. Klaer R.,Kuhn S.,Tillman В.,Fritz H.J.,Starlinger P. The sequence of IS4.Mol.Gen.Genet., 1981 .?v. 181 ,N1,p. 169175.

74. Kleckner N.,Chan R.K.,Tye B.K.,Botstein D. Mutagenesis by insertion of a drug resistance element carrying an invertedrepetition.J.Mol.Biol.,1975,v.97,N3,p.567-573.

75. Kleckner N. Traslocatable elements in prokariotes.Cell, 1977,v.11,N1,p.11-23.

76. Kleckner N.,Barker D.F.,Ross D.G.,Botstein D. Properties of the translocatable tetracycline-resistance element Tn10- 140 in Escherichia coli and bacteriophage lambda.Genetics,1978, v.90,12,p.427-461.

77. Kleckner N. DM sequences analysis of Tn10 insertions:origin and role of 9bp flanking repetitions during Tn10 translocation. Cell,1979,v.16,N4,p.711-720.

78. Kleckner N.,Ross D.G. Translocation and other recombination events involving the tetracycline-resistance element Tn10. Cold Spring Harbor Symp.Quant.Biol.,N.Y.,1979,v.43,P.1233-1245.

79. Kleckner N.,Reichardt K.,Botstein D. Inversions and deletions of the Salmonella chromosome generated by TnlO.J.Mol. Biol.,1979a,v.127,N1,p.89-96.

80. Kleckner IT., Steele D.A. ,Reichardt K.,Botstein D. Specificity of insertion by the translocatable tetracycline-resistanceelement Tn10.Genetics,1979b,v.92,N4,P.1023-1040.

81. Kleckner IT. Transposable elements in procaryotes.Ann.Rev. Genet.,1981,v.15,p.341-404.

82. Kleckner N. Transposon Tn10:genetic organization,regulation and insertion specificity.Fed.Proc.1982,v.41,N10,p.2649-2652.

83. Kopecko D.J. Specialized genetic recombination systems in bacteria:their involvement in gene expression and evolution. Prog.Mol.Subcell.Biol.,1980,v.7,p.135-234.

84. Kopecko D.J.,Cohen S.H. Site-specific rec-A-independent recombination between bacterial plasmids:involvement of palindromes at the recombinational loci.Proc.Nat.Acad.Sci. USA,1975,v.72,N4,p.1373-1377. .

85. Kopecko D.J.,Brevet J.,Cohen S.N. Involvement of multiple translocating DNA segments and recombinational ho.tspots in the structural evolution of bacterial plasmids.J.Mol.Biol., 1976,v.108,N2,p.333-360.

86. Kopecko D.J.,Holcombe J.,Formal S.B. Molecular characterization of plasmids from virulent and spontaneously occuring avirulent colonial variants of Shigella flexneri.Infect. Immun.,1979,v.24,N2,p.580-594»

87. Kretschmer P.J.,Cohen S.N. Effect of temperature on translocation frequency of the Tn3 element.J.Bacteriol.,1979, v.139,N2,p.515-519.

88. Kuhn S.,Fritz H.J.,Starlinger P. Close vicinity of IS1 integration sites in the leader sequence of the gal operon of E.coli.Mol.Gen.Genet.,1979,v.167,N2,p.235-241.

89. Malamy M.H. Frameshift mutations in the lactose operon of E.coli. Cold Spring Harbor Symp.Quant.Biol.,1966,v.31,p. 189-201.

90. Malamy M.H. Some properties of insertion mutations in the lactose operon of E.coli.In:"The lactose operon"(eds.Beck-with J.R.,Zipser D.)Cold Spring Harbor Lab.,Cold Spring Harbor,N.Y.,1970,p.359-373.

91. Mandel M.,Higa A. Calcium-dependent bacteriophage DNA infection. J.Mol.Biol.,1970,v.53,N1,p.159-162.

92. Matsubara K. Preparation of plasmid ^ dV from bacteriophage Я :role of promoter-operator in the plasmid repli-con.J.Virol.,1974,v.13,p.596-602.

93. Matsubara K. Replication control sistem in lambda dV. Plasmid,1981,v.5,N1,p.32-53»

94. Maxam A.,Gilbert W.A. A new method for sequencing DNA. Proc.Nat.Acad.Sci.USA,1977,v.74,N2,p.560-569.

95. McClintock B. Chromosome organization and gene expression. Cold Spring Harbor Symp.Quant.Biol.,1952,v.l6,p.13-22.

96. McClintock B. The control of gene action in maize.Brookha-ven Symp.Biol.,1965,v.18,p.162-171.

97. Meyer J.,Iida S. Amplification of chloramphenicol resistance transposons carried by phage P1 Cm in Escherichia coli. Mol.Gen.Genet.,1979,v.176,N2,p.209-219.

98. Meyer J.,Iida S.,Arber W. Does the insertion element IS1 transpose preferentially into A+T-rich DNA segments?

99. Mol.Gen.Genet.,1980,v.178,N2,p.471-473.- 143

100. Noel K.D.,Ames G.F.-L. Evidence for a common mechanism for the insertion of the Tn10 transposon and for the generation of Tn10-stimulated deletions.Mol.Gen.Genet.,1978, v.l66,N2,p.217-226.

101. Cold Spring Harbor Symp.Biol.,1979,v.43,p.1269-1277.

102. Oka A.,Nomura N.,Sugimoto K.,Sugasaki H.,Takanami M. Nucleotide sequence at the insertion sites of a kanamycin transposon.Nature,1978,v.276,p.845-851.

103. Oka A.,Sugisaki H.,Takanami M. Nucleotide sequence of thekanamycin transposon Tn903. J.Mol.Biol. ,1981, v.147,N2,p. 217-226.

104. Pattee P.A. Distribution of Tn551 integration sites responsible for auxothrophy on the Staphylococcus aureus chromosome. J. Bacterid.,1981 ,v. 145, N1, p. 479-488.

105. Potter S.,Truett M.,Phillips M.,Maher A. Eucariotic trans-posable genetic elements with inverted terminal repeats. Cell,1980,v.20,N4,p.639-651.

106. Rasmuson В.,Green M.M. Genetic instability in Drosophila melanogaster.A mutable tandem duplication.Mol.Gen.Genet., 1974,v.133,N1,p.249-256.

107. Rasmuson В.,Green M.M.,Karlson B.M. Genetic instability in Drosophila melanogaster.Evidence for insertion mutations .Mol.Gen.Genet.,1974,v.133,N1,p.237-248.

108. Reif H.J. Genetic evidence for absence of transposition functions from the internal part of Tn981 a relative of Tn9.Mol.Gen.Genet.,1980,v.177,N3,p.667-674.

109. Reif H.J.,Saedler H. IS is involved in deletion formationin the gal region of E.coli K12.Mol.Gen.Genet.,1975,v.137, N1,p.17-28.

110. Roberts R.J. Restriction and modification enzymes and their recognition sequences.Gene,1980,v.8,N2,p.329-342.

111. Rosner J.L.,Guyer M.S. Transposition of ISl-bio-IS1 from a bacteriophage derivative carrying the ISl-cat-IS1 transposon (Tn9 ).Mol. Gen. Genet., 1980, v.l 78, N1 ,p.111-120.

112. Ross D.G.,Grisafi P.,Kleckner N.,Botstein D. The ends of TnlO are not IS3.J.Bacteriol.,1979a,v.139,N3,p.1097-1101.

113. Ross D.G.,Swan J.,Kb3ckner N. Physical structures of Tn10-promoted deletions and inversions:role of 1400 bp inverted repetitions.Cell,1979b,v.16,N4,p.721-731.

114. Saedler H.,Starlinger P.0° mutations in the galactose ope-ron of E.coli.Mol.Gen.Genet.,1967,v.100,N2,p.178-189.

115. Saedler H.,Besemer J.,Kemper B.,Rosenwirth B.,Starlinger P. Insertion mutations in the control region of the gal operon of E.coli.I.Biological characterization of the mutations. Mol.Gen.Genet.,1972,v.115,N3,p.258-265.

116. Saedler H.,Heiss B. Multiple copies of insertion sequence ША sequences IS1 and IS2 on the E.coli chromosome.Mol. Gen.Genet., 1973, v.122,113,p.267-277.

117. Saedler H.,Ghosal D. Properties of DUA insertion elements in E.coli.In:"R factors:their properties and possible control" (eds.Drews J.,Hogenauer),N.Y.,Springer-Verlag,1977, p.131-141.

118. Saedler H.,Ghosal D.,Uevers P. The role of gene rearrangements in evolution.In"Modern trends in Human Leukemia III. (eds.Neth R.,et.al)Springer-Verlag,1979,p.507-516.

119. Saedler H.,Cornelis G.,Cullum J.,Schumacher B.,Sommer H. IS1-mediated DMA rearrangements.Cold Spring Harbor.Symp. Quant.Biol.,1980,v.45,p.93-99.

120. Saint-Girons I.,Fritz H.J.,Shaw C.,Tillman E.,Starlinger P. Integration specificity of an artificial kanamycin transposon constructed by the in vitro insertion of an internal Tn5 fragment into IS2.Mol.Gen.Genet.,1981,v.183, N1,p.45-50.

121. Shapiro J.A. Mutations caused by the insertion of genetic material into the galactose operon of Escherichia coli. J.Mol.Biol.,1969,v.40,Fl,p.93-101.

122. Shapiro J.A. Molecular model for the transposition andreplication of bacteriophage Mu and other transposable elements.Proc.Hat.Acad.Sci.USA,1979,v.76,N4,p. 1933-1937.

123. Sharp P.A.,Cohen S.N.,Davidson N. Electron microscope he-teroduplex studies of sequence relations among plasmids of E.coli.II.Structures of drug resistance (R) factors and (F) factors.J.Mol.Biol.,1973,v.75,N3,p.235-255.

124. Shimada K.,Weisberg R.A.,Gottesman M.E. Prophage lambda at unusual chromosomal locations.II.Mutations induced by bacteriophage Д in Escherichia coli K12.J.Mol.Biol., 1973,v.80,Ж2,p.297-306.

125. So M.,Heffron P.,McCarthy B. The E.coli gene encoding heat stable toxin is a bacterial transposon flanked by inverted repeats of IS1.Nature,1979,v.277,p.453-456.

126. Sommer H.,Cullum J.,Saedler H. Integration of IS3 into12 generates a short sequence duplication.Mol.Gen.Genet., 1979,v.177,N1,p.85-90.

127. Starlinger P. IS elements and transposons.Plasmid,1980, v.3,N3,p.241-259.

128. Starlinger P.,Saedler H. Insertion mutations in microorganisms .Biochemie., 1972,v.54,N1,p.177-191.

129. Staudenbauer W.L. Replication of small plasmids in extracts of Escherichia coli:requirement for both DNA polime-rases I and III.Mol.Gen.Genet.,1976,v.149,N1,p.151-173.

130. Toussaint A.L.,Faelen M.,Bukhari A.I. Mu mediated illegitimate recombination as an integral part of the Mu life cycle.In:"DNA insertion sequences,plasmids and episomes" (eds.Bukhari A.I.,Shapiro J.A.,Adhya S.L.)Cold Spring

131. Harbor Lab.,Cold Spring Harbor,N.Y.,1977,p.275-285.

132. Tu Ch.-P.D.,Cohen S.N. Effect of DM sequences adjacent to the termini of Tn3 on sequential translocation.Mol. Gen.Genet., 1980a,v.177,N3,p.597-601 .

133. Tu Ch.-P.D.,Cohen S.N. Translocation specificity of the Tn3 element:characterization of sites of multiple insertions .Cell,1980b,v.19,N1,p.151-160.

134. Weinstock G.M.,Botstein D. Regional specificity of illegitimate recombination associated with the translocatable ampicillin-resistance element Tn1.Cold Spring Harbor Symp. Quant.Biol.,1979,v.43,p. 1209-1215.

135. Weinstock G.M.,Susskind M.M.,Botstein D. Regional specificity of illegitimate recombination by the translocatable ampicillin-resistance element Tn1 in genome of phage P22. Genetics, 1979, v.92, N2, p. 685-7Ю.