Бесплатный автореферат и диссертация по биологии на тему 
			Множественные формы транскетолазы
			ВАК РФ 03.00.04, Биохимия
			Автореферат диссертации по теме "Множественные формы транскетолазы"
РГб од
- 5 ДЕК 133'}
МОСКОВСКИЙ ОРДЕНА ЛЕНИНА И ОРДЕНА ТРУДОВОГО КРАСНОГО ЗНАМЕНИ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ им.М.В.Ломоносова
Кафедра биохимии Биологического факультета и
Отдел биохимии животной клетки НИИ физико-химической биологии им. А.Н.Белозерского МГУ
На правах рукописи
ФИЛИППОВ МАКСИМ ЮРЬЕВИЧ
УДК 577.152.121
МНОЖЕСТВЕННЫЕ ФОРМЫ ТРАНСКЕТОЛАЗЫ (03.00.04 - Биохимия)
АВТОРЕФЕРАТ
диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук
МОСКОВСКИЙ ОРДЕНА ЛЕНИНА И ОРДЕНА ТРУДОВОГО КРАСНОГО ЗНАМЕНИ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ им.М.В.Ломоносова
Кафедра биохимии Биологического факультета и
Отдел биохимии животной клетки НИИ физико-химической биологии им. А.Н.Белозерского МГУ
На правах рукописи
ФИЛИППОВ МАКСИМ ЮРЬЕВИЧ
УДК 577.152.121
МНОЖЕСТВЕННЫЕ ФОРШ ТРАНСКЕТОЛАЗЫ (03.00.04 - Биохимия)
АВТОРЕФЕРАТ
диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук
Работа ишюлноиа в отдоло биохимии жинотноИ клетки института физико-химической биологии им. А.и.иилсхяфгкоп) Московского государственного университета
Научный руководитель: доктор биологических наук,
профессор Г.А.Кочетов
Официальные оппоненты: доктор химических наук,
профессор л.М.Гинодман доктор биологических наук, профессор Н.Н.Чернов
Ведущее учреждение: Институт биохимии им.А.Н.Баха РАН.
Защита состоится " ^//¿¿^А 1994г. в "_" часов на
заседании Специализированного Совета Д. 053.05.32 при Московском государственном университете имени М.В.Ломоносова по адресу: г.Москва 119899, Ленинские горы, Биологический факультет.
С диссертацией можно ознакомиться в библиотеке Биологического факультета МГУ.
Автореферат разослан 2 % Н-С'А-й^Л_ 1994г.
Ученый секретарь
Специализированного Совета ^__
кандидат биологических наук Ю.Н.Лейкин
с
ОБЩАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА РАБОТЫ
Актуальность проблемы. Транскетолаза относится к груше тиаминовых ферментов, катализирует взаимопревращение фосфэсаха-ров путем переноса двууглеродного фрагмента (остатка гликолевого альдегида) с кетосахаров на альдосахара. В результате ее функционирования в пентозном пути превращения углеводов образуются, в частности, рибозо-5-фосфат и восстановленный НАДФ. Этим определяется роль трзнскетолазы. в процессах синтеза нуклеиновых кислот, восстановительного синтеза жирных кислот1 и стероидов.
Фосфоглицериновый альдегид является одним из субстратов транскетолазы (а также и продуктом реакции) и в то же время -субстратом глицеральдегидфосфатдегидрогеназы, ключевого фермента гликолитического пути превращения углеводов. Более того, показано непосредственное взаимодействие (с образованием достаточно стабильного комплекса) транскетолазы с глицеральдегидфосфатде-гидрогеназой (Чернов, 1971).
Таким образом осуществляется тесная взаимосвязь пентозного пути превращения углеводов и гликолиза, и возможность переключения процесса обмена углеводов с одного пути на другой.
Транскетолаза широко распространена в природе. Она обнаружена во всех исследованных органах и тканях животных и растений, а также у микроорганизмов. В настоящее время из многих источников фермент выделен в гомогенном виде.
Наиболее изученной является транскетолаза пекарских дрожжей. Известна ее олигомерная структура, в достаточной степени «
хорошо изучены функциональные группы апобелка и кофермента, структура активного центра, химизм катализируемой ею реакции. До сих пор , однако, ничего не известно относительно механизма ре-
4 I
гуляции данного фермента. Одним из возможных путей решения этой проблемы могло бы стать изучение множественных форм транскетола-зы. В литературе этому вопросу посвящено достаточно много работ. Все они проводились, в основном, на гемолизатах эритроцитов и касались идентификации (электрофоретически) белковых полос, обладающих транскетолазной активностью. Однако, для решения проблемы множественных форм, в связи с их возможным участием в процессах регуляции, необходимо не только идентифицировать множественные формы, но й выделить их в высокоочищенном состоянии и подробно изучить свойства".
Ранее, в высокоочшценных препаратах пекарских дрожжей было показано наличие двух форм фермента, разделяемых хроматографи-чески на ионообменных колонках (Чернов, 1971). Подробно, однако, они не исследовались, т.к. тогда такая задача не ставилась.
Целью настоящей работы являлась идентификация множественных форм транскетолазы в дрожжевом экстракте, их выделение и очистка до гомогенного состояния, и исследование их свойств.
Научная новизна. В результате работы в экстрактах пекарских дрожжей и ряда животных тканей были обнаружены и идентифицированы три формы транскетолазы, отличающиеся по термостабильности и обозначенные нами как А, В и С. Все три формы фермента из пекарских дрожжей были выделены в гомогенном виде и закристаллизованы; морфология их кристаллов различна. Проведено сравнительное изучение физико-химических и кинетических свойств транскетолазы А и С. В частности показано, что в транскетолазе формы С, в отличие от транскетолазы А, субъеденицы связаны между собой ди-сульфидными связями.
Практическое значение. Полученные результаты расширяют наши представления о транскетолазе с точки зрения наличия множествен-
пых ({к)[)м ({к'.рмспта. Разработан простой, быстрый и эффективный метод идентификации множественных форм транскетолазы в тканевых экстрактах, который может быть взят за основу при разработке клинического метода определения количественного соотношения форм фермента в норме и при патологии с целью диагноза различных заболеваний, Разработан метод выделения и очистки до гомогенного состояния множественных форм транскетолазы пекарских дрожжей, что являлось необходимым условием для дальнейшего изучения свойств этих форм и их отношения к проблемме регуляции данного фермента.
Апробация. Результаты работы доложены на совместном заседании кафедры биохимии Биологического факультета МГУ и отдела биохимии животной клетки Института физико-химической биологии им.А.Н.Белозерского МГУ.
Публикации. Результаты исследования изложены в 3 печатных работах.
Структура и объем работы. Диссертационная работа состоит из введения, обзора литературы, описания методов исследования, полученных результатов и их обсуждения, выводов и списка цитируемой литературы. Работа содержит страниц машинописного текста, таблиц и рисунков. Список литературы включает источников.
Изложение полученных результатов и их обсуждение составляют содержание экспериментальной части диссертации. Обзор литературы посвящен рассмотрению вопросов, непосредственно связанных с предметом настоящего исследования.
ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДУ
Материалы. Использованные в работе nadh, /s-аланин, глицин, бариевая соль рибозо-5-фосфата - фирмы Reanal. Тиашшщрофосфат, 1,4-дитиотреитол и tris-hcl получены от фирмы мегск. Препараты mes, mops, hepes, натриевая соль фруктозо-6-фэсфата, сульфат аммония - от фирмы serva. Препараты оксипирувата, даоксиацетона, d-седогептулозо- 7-фосфата - от фирмы sigma. Фосфоцеллмоза pu -фирмы Whatman (Англия). Остальные реактивы - отечественного производства квалификации "осч".
Выделение транскетолазы. Для получения высокоочшценных препаратов дрожжевой транскетолазы использовали описанную ранее методику (Tikhomirova and Kochetov, 1990).
Определение белка. В препаратах транскетолазы содержание белка определяли спектрофотометрически, по величине " оптической плотности при 280 нм в кюветах с длиной оптического пути 10 мм, используя величину удельной оптической плотности = 1.45.
(Heirich et al.,1972).
Хроматография на фосфоцеллюлозе. Для хроматографии на фосфоцеллюлозе рН препарата частично или высокоочищенной транскетолазы доводили до 6,0 и раствор наносили на колонку (1x1см) с фосфоцеллюлозой Pu ("Whatman", Англия), уравновешенной с 20 мМ калий=фосфатным буфером, рН 5,9. Элюцию проводили градиентом юо мМ калий= фосфатного буфера, рН 6,0-8,0, со скоростью 2-3 ил/иm при 4°.
Кристаллизация различных форм транскетолазы. Для кристаллизации использовали препараты, содержавшие не менее 85 % одной из форм; примесь двух других не превышала 15 % (по активности). В препарате, полученном хроматографией на фосфоцеллюлозе, рН дово-
7 f
дили до V., в, вносили - сульфат .аммония до: 35 %■ насыщения- и -инкубц-. ровали в течение.ночи,цЗатем концентрацию сульфата :аммония.;уве-.( личивали до 70 % насыщения, полученный осадок растворяли в малом объеме o,i М MES-KOH-буфера, рН 6,5, или HEPES-КОН-буфера, рН 7,0-7,8, с добавлением i мМ Mgso4. Удаляли нерастворившуюся часть осадка центрифугированием в течение 3 мин при 3000 g, а ферментный раствор использовали для кристаллизации. Кристаллы транскетолазы выращивали методом диффузии паров растворителя в висячей капле (Davis and segal, 1971) при 4°. Раствор для кристаллизации содержал 0,1 М mes-KOH-буфер, рН 6,5, или hepes-КОН-буфер, рН 7,0-7,8, 1-2 &-ную транскетолазу, сульфат аммония 30-40 % насыщения, i мМ Mgso4, 0,02 %-ный азид натрия.
Термоинактивация изоформ транскетолазы. Для опытов по термоинактивации рН ферментного раствора, содержавшего 10 - 10 М транскетолазу, юо мМ калий-фосфатный буфер, 2 мМ СаС12 и 0,4 мМ тиаминпирофосфат, доводили до 6,5, отбирали пробы для определения исходной активности и помещали образец в водяную баню, нагретую до 60°. Через определенные промежутки времени отбирали аликвоты для определения активности транскетолазы. Аликвоты охлаждали во льду и центрифугировали для осаждения денатурированного белка в микроцентрифуге.
Определение активности транскетолазы. Определение активности транскетолазы проводили спектрофотометрически по скорости окисления nadh в результате восстановления диоксиацетонфосфата (Cooper et ai.,1958), образующегося в ходе триозофосфатизомераз-ной реакции из одного из продуктов транскетолазной реакции -3-фосфоглицеринового альдегида. Реакционная смесь, в конечном объеме 2 мл, содержала юо мМ глицил-глициновый буфер рН 7,6,
0,2 мМ nadh, 2 мг вспомогательных ферментов, 2,5 мМ caci2, 0,4 мМ тиаминшрофосфат, ю мМ смесь фосфопентоз, 0.5-5 мкг ТК. Смесь фосфопентоз, которую использовали в качестве субстрата транскетолазы, получали по методу Гублера и др. (Gubier et ai.,-
1970).
Активность транскетолазы с субстратами-донорами в присутствии феррицианида измеряли спектрофотометрически по уменьшению оптической плотности при 420 нм (Усманов и Кочетов, 1983).
Титрование сульфгидрильных групп. Титрование сульфгидриль-ных групп проводили в 4М мочевине по методу Эллмана (Eiiman, 1959). Предварительно фермент, в концентрации 2мг/мл, диализова-ли 20ч при 4°С против IOOmM калий-фосфатного буфера, рН 8,0, содержащего 4мМ р- меркаптоэтанол, затем пропускали через сефадекс G-50, уравновешенный тем же буфером, но не содержащий и- меркаптоэтанол. Обработку фермента боргидридом натрия проводили в 8М мочевине ПО методу Cavallini et al. (Cavallini et al.,1966). Прямое титрование дисульфидов дитиотреитолом проводили в 8М мочевине в присутствии 50 мМ калий-фосфатного буфера рН 8,0 по методу Iyer and Klee (Iyer and Klee, 1973), При ЭТОМ концентрация фермента составляла ЗхЮ~5М.
Определение Km и v для субстратов-доноров. При определении к и v для субстратов-доноров транскетолазы ферментативную ак-
m
тивность измеряли спектрофотометрически по реакции с феррициани-дом, используя в качестве субстрата только субстрат-донор. Состав реакционной смеси: 0,05 М трис-нсь- буфер рН 7,6; 2,5 мМ Mgci2; 0,1 М ТПФ; 1,3 мМ K3(Fe(CN)6]; 2хЮ~7М транскетолаза и субстрат-донор в интервале концентраций: фруктозо-6-фэсфат -0,75-7,5хЮ_5М; фруктоза - 0,15-1,5 М; оксипируват - 0,5-67хЮ-4 М; диоксиацетон - 0,75-25x10-2 М. Результаты обрабатывали в ко-
|>ди||.-1Т;1Х Л;1Й11,уии( Филиппов, Максим Юрьевич Филиппов, Максим Юрьевич
- 
									 кандидата биологических наук кандидата биологических наук
- 
									 Москва, 1994 Москва, 1994
- 
									 ВАК 03.00.04 ВАК 03.00.04
- Природа оптических изменений при взаимодействии транскетолазы с лигандами
- Взаимодействие апотранскетолазы пекарских дрожжей с тиаминпирофосфатом
- Связывание субстратов с транскетолазой Saccharomyces Cerevisiae и их каталитические превращения
- Изменение свойств транскетолазы в результате ее взаимодействия с кофакторами и субстратами
- Особенности метаболизма тиамина в организме при росте злокачественных опухолей

 
                                         
                                         
                                         
                                         
                                        




