Бесплатный автореферат и диссертация по биологии на тему

Изменение состава и ферментативных активностей протеасом при апоптозе в клетках К562

ВАК РФ 03.00.03, Молекулярная биология

Содержание диссертации, кандидата биологических наук, Цимоха, Анна Сергеевна

ГЛАВА 1. ВВЕДЕНИЕ.

1.1. Актуальность проблемы.

1.2. Цели и задачи исследования.

1.3. Основные положения, выносимые на защиту.

1.4. Научная новизна.'.

1.5. Теоретическое и практическое значение работы.

1.6. Финансовая поддержка.

1.7. Публикации.

1.8. Апробация работы.

1.9. Объем и структура диссертации.

ГЛАВА 2. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.

2.1. Убиквитин-протеасомный путь деградации белков.

2.1.1. Протеасомы.

2.1.2. Ферментативные активности протеасом.

2.1.3. Убиквитин-зависимый протеолиз.

2.1.4. Участие протеасом в важнейших клеточных процессах.

2.1.5. Ингибиторы протеасом.

2.2. Молекулярные механизмы регуляции апоптоза.

2.3. Вовлечение убиквитин-протеасомного пути в апоптоз.

2.3.1. Протеасомные ингибиторы как индукторы апоптоза.

2.3.2. Ингибиторы протеасом могут также ингибировать апоптоз.

2.3.3. Ингибиторы протеасом в терапии рака.

ГЛАВА 3. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ.

3.1. Культивирование клеток.

3.2. Анализ фрагментации клеточной ДНК.

3.3. Флуоресцентная окраска хроматина.

3.4. Выделение препаратов цитоплазматических РНК.

3.5. Выделение препаратов ядерных и цитоплазматических протеасом.

3.6. Флуориметрическое измерение протеолитической активности протеасом

3.7. Электрофорез РНК в нативных условиях.

3.8. Электрофорез РНК в денатурирующих условиях.

3.9. Обработка протеасом щелочной фосфатазой кишечника теленка (CIAP).

3.10. Обработка РНК с помощью протеасом.

3.11. Транскрипция in vitro.-.

3.12. Анализ содержания субъединиц протеасом и их статуса фосфорилирования методом вестерн-блотинг.

3.13. Диск-электрофорез белков по Лэммли.

3.14. Двумерный электрофорез белков.

3.15. Материалы.

ГЛАВА 4. РЕЗУЛЬТАТЫ.

4.1. Диэтилмалеат и доксорубицин вызывают апоптоз в клетках К562.

4.2. Воздействие на клетки К562 индукторов апоптоза вызывает изменения в субъединичном составе цитоплазматических протеасом.

43. Популяция протеасом в клетке гетерогенна.

4.4. После индукции апоптоза в клетках К562 субъединицы протеасом модифицируются.

4.4.1. Цитоплазматические протеасомы.

4.4.2. Ядерные протеасомы.

4.5. При индукции апоптоза в клетках К562 измененяются ферментативные активности протеасом.

4.5.1. Воздействие на клетки К562 индукторов апоптоза изменяет специфичность протеолитической активности протеасом.

4.5.2. При индукции апоптоза в клетках К562 изменяется специфичность эндорибонуклеазной активности протеасом.

4.6. После индукции апоптоза в клетках К562 наблюдается модифицирование субъединиц протеасом, ответственных за ферментативные активности протеасом: а5, аб и 02.

4.7. При индукции апоптоза в клетках К562 изменяется статус фосфорилирования протеасом.

4.8. Дефосфорилирование субъединиц протеасом специфическим образом изменяет ферментативные активности протеасом, выделенных из клеток К562.

4.8.1. Протеолитическая активность протеасом.

4.8.2. Механизм регуляции протеолитической активности протеасом при индукции апоптоза связан с фосфорилированием (дефосфорилированием) протеасом.

4.8.2. Эндорибонуклеазная активность протеасом.

ГЛАВА 5. ОБСУЖДЕНИЕ.

5.1. Изменения субъединичного состава протеасом при апоптозе в клетках К

5.2. Изменения ферментативных активностей протеасом при апоптозе в клетках К562.

5.3. Изменение статуса фосфорилирование протеасом при апоптозе в клетках К

5.4. Неспецифическое дефосфорилирование белковых субъединиц протеасом изменяет специфичность их ферментативных активностей..

ВЫВОДЫ.

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ.

Введение Диссертация по биологии, на тему "Изменение состава и ферментативных активностей протеасом при апоптозе в клетках К562"

1.1. Актуальность проблемы

Апоптоз, или программированная клеточная гибель, является важнейшим механизмом контроля над качеством и численностью клеточной популяции в многоклеточном организме. Он обеспечивает равновесие в пролиферации клеток, элиминации поврежденных (например, радиацией), пораженных вирусом и неопластических клеток, а также селекцию лимфоцитов, при которой удаляются аутоиммунные клоны. Неспособность клеток претерпевать апоптоз - это один из ключевых моментов в опухолеобразовании. Молекулярные механизмы, задействованные в этом процессе, до сих пор окончательно не исследованы.

Апоптоз представляет собой сложно регулируемый клеточный процесс, который принято подразделять на две стадии: запуск и выполнение программы (Earnshaw, 1995). Известно, что запуск программы, приводящей к смерти клетки, может осуществляться как специфическими сигналами (например, цитокинами или гормонами), так и неспецифическими, такими как радиация, повышение температуры или действие окислителей (например, проокислитель - глутатион-истощающий агент диэтилмалеат (ДЭМ)).

Стадия выполнения инициируется активацией каспаз (семейство цитоплазматических цистеиновых протеаз), которые деградируют специфические клеточные белки, такие как поли-(АДФ-рибоза)-полимераза (PARP) (Martin, Green, 1995). Это приводит к серии определенных метаболических изменений, характерных для апоптоза (в том числе, ядерной фрагментации, образование апоптотических телец).

В настоящее время широко изучается участие в апоптозе протеасом. При использовании ингибиторов протеасом обнаружили как про-апоптозное, так и анти-апоптозное функционирование протеасом в клетке (Grimm et al., 1996; Lopes et al., 1997; Dou et al., 1999; Wojcik, DeMartino, 2003; Yang et al., 2006). Такие противоположные роли протеасом в регуляции апоптоза, по-видимому, обусловлены пролиферативным статусом клетки (Naujokat,

Hoffmann, 2002; Wojcik, DeMartino, 2003; Chen, Lin, 2004; Sohn et al., 2006; Vink et al., 2006).

Для осуществления разнообразных функций в клетке протеасомы должны быть подвержены строгому регуляторному контролю. Фосфорилирование регуляторных белков (например, киназ) является ключевым моментом в передаче сигнала, продвижении клетки по клеточному циклу и в апоптозе (Bandyopadhyay et al., 2004; Sabatini et al., 2004; Contri et al., 2005; Jin et al., 2005; Wang et al., 2005; Ptacek, Snyder, 2006). Фосфорилирование субстратов и ферментов также играет важную роль в убиквитин-протеасомном пути (Glickman, Ciechanover, 2002; Wojcik, DeMartino, 2003). Известно также, что 26S протеасомы посттрансляционно модифицируются в различных случаях как фосфорилированием (Bose et al., 1999, 2004; Fernandez Murray et al., 2002; Iwafime et al., 2002), так и N-ацетилированием (Arendt, Hochstrasser. 1999; Kimura et al., 2000; Tokunaga et al., 1990; Claverol et al., 2002), гликозилированием (Schmid et al., 1993, Zachara, Hart, 2004; Sumegi et al., 2003) и 4-гидрокси-2-ноненил-алкилированием (Farout et al., 2006). Обнаружены сайты потенциального фосфорилирования на субъединицах 20S протеасомы и 19S регуляторных комплексов, и исходя из этого, выдвинуто предположение о возможном контроле протеолитической активности протеасом посредством фосфорилирования (Bose et al., 1999; Fernandez Murray et al., 2002). Так, например, дефосфорилирование аЗ и а7 субъединиц протеасом приводило к снижению двух пептидазных активностей протеасом (Mason et al., 1996). Кроме того, фосфорилирование субъединиц протеасом ответственно за ассоциацию 20S протеасомы и 19S регуляторных комплексов (Rivett et al., 2001). Известно, что в зависимости от стадии клеточного цикла, изменялся статус фосфорилирования протеасом (Iwafune et al., 2002) и что некоторые клеточные сигналы вызывают изменения в фосфорилированности субъединиц протеасом (Bose et al., 2001; Rivett et al., 2001; Bardag-Gorce et al., 2004). Однако воздействие индукторов апоптоза на изменение статуса фосфорилирования протеасом не исследовалось.

Основываясь на том, что при индукции апоптоза в дифференцированных клетках изменялся субъединичный состав и протеолитическая активность протеасом, было сделано предположение, что такие изменения в протеасомах могут приводить к усилению деградации по протеасом-убиквитиновому пути определенных клеточных белков, приводящих к апоптозу (Naujokat, Hoffmann, 2002). Однако до сих пор нет данных об изменении субъединичного состава и регуляции активностей протеасом в быстро пролиферирующих клетках при индукции апоптотической гибели. Кроме того, при индукции апоптоза в клетках не было исследовано изменение эндорибонуклеазной активности протеасом. Не исследовано влияние изменения статуса фосфорилирования протеасом на их протеолитическую и эндорибонуклеазную активности при индукции апоптоза как в дифференцированных, так и в быстро пролиферирующих клетках. Одним из актуальных и наименее исследованных, кроме всего прочего, является вопрос о гетерогенности популяции протеасом в клетке (в том числе, в отдельных клеточных компартментах), о назначении множественных форм протеасом. Так, например, нет данных об исследованиях субъединичного состава, статуса фосфорилирования и ферментативных активностей ядерных протеасом при индукции апоптоза в клетках.

В свете вышесказанного, представляется весьма актуальным исследование специфических изменений субъединичного состава и статуса фосфорилирования протеасом, очищенных из цитоплазмы и ядер клеток проэритролейкемии человека линии К562 при индукции программированной клеточной гибели при помощи диэтилмалеата (ДЭМ) или доксорубицина (ДР). Кроме того, важно проанализировать воздействие данных индукторов апоптоза на протеолитическую и эндорибонуклеазную активности протеасом, а также влияние дефосфорилирования протеасомных субъединиц на ферментативных активностей протеасом при индукции апоптоза в клетках К562. «

Заключение Диссертация по теме "Молекулярная биология", Цимоха, Анна Сергеевна

выводы

1. Индуктор программированной клеточной гибели (ДЭМ или ДР) вызывает изменения в субъединичном составе как цитоплазматических, так и ядерных 26S протеасом клеток К562. После воздействия на клетки индуктора апоптотической программы наблюдается модифицирование субъединиц 20S протеасом, как а-, так и р-типа, в том числе и субъединиц, ответственных за ферментативные активности протеасом (а5, аб и (32).

2. Действие индуктора апоптоза на клетки К562 приводит к изменению специфичности ферментативных (протеолитической и эндорибонуклеазной) активностей протеасом из ядер и цитоплазмы клеток К562.

3. Спектр фосфорилирования субъединиц протеасом различен в ядрах и цитоплазме клеток К562. Индукция апоптоза в клетках К562 приводит к специфическим изменениям статуса фосфорилирования ядерных и цитоплазматических протеасом по серину, тирозину и треонину.

4. Неспецифическое дефосфорилирование белковых субъединиц 26S протеасом из ядер и цитоплазмы клеток К562, приводит к изменению специфичности их протеолитической активности и изменению эндорибонуклеазной.

5. Полученные данные свидетельствуют о существовании новой, не исследованной, системы регуляции субъединичного состава и статуса фосфорилирования протеасом в составе клеточной программы в ответ на апоптотические стимулы.

Библиография Диссертация по биологии, кандидата биологических наук, Цимоха, Анна Сергеевна,

1. Абрамова Е.Б., Шарова Н.П., Карпов B.JL 2002. Протеасома: разрушать, чтобы жить. Мол. Биол. 36: 761-776.

2. Галкин В.Э., Туроверова Л.В., Константинова И.М., Пинаев Г.П. 1998а. Взаимодействие просом с фибриллярным актином. Цитология. 40: 161-166.

3. Галкин В.Э., Туроверова Л.В., Константинова И.М., Пинаев Г.П. 19986. 268-рибонуклеопротеиновый комплекс (268-протеасома) непосредственно взаимодействует с фибриллярным актином. Цитология. 40: 618-626.

4. Георгиев Г.П., Мантьева В.Л. 1962. Информационная и рибосомная РНК хромосомно-ядрышкого аппарата, методы разделения и нуклеотидный состав. Биохимия. 27(7): 949-957.

5. Копнин Б.П. 2000. Механизмы действия онкогенов и опухолевых супрессоров // Молекулярная биология.(5): 7-40.

6. Туроверов К.К., Бикташев А.Г., Дорофенюк А.В., Кузнецова И.М. 1998. Комплекс аппаратных и программных средств для измерения спектральных и поляризационных кинетических характеристик флуоресценции в растворе. Цитология. 40(8/9): 806-814.

7. Чистохина А.В. 1993. Роль ретиноевой кислоты в процессах пролиферации и дифференцировки клеток линии К562. Автореф. канд. дис. Санкт-Петербург. Стр. 24.

8. Adams J. 2001. Proteasome inhibition in cancer: development of PS-341. Semin. Oncol. 28: 613-619.

9. Adams J. 2003. Potential for proteasome inhibition in the treatment of cancer. Drug Discov Today. 8(7):307-15.

10. Adams J. 2004. The development of proteasome inhibitors as anticancer drugs. Cancer Cell. 5(5):417-21.

11. Adams J., Palombella V. J., Sausville E. A., Johnson J., Destree A., Lazarus D. D., Maas J., Pien C. S., Prakash S., Elliott P. J. 1999. Proteasome inhibitors: a novel class of potent and effective antitumor agents. Cancer Res. 59: 2615-2622.

12. Arendt C.S., Hochstrasser M. 1999. Eukaryotic 20S proteasome catalytic subunit propeptides prevent active site inactivation by N-terminal acetylation and promote particle assembly. EMBO J. 18: 3575-3585.

13. Arrigo A. P., Tanaka K., Goldberg A. L., Welch W. J. 1988. Identity of the 19S 'prosome' particle with the large multifunctional protease complex of mammalian cells (the proteasome). Nature. 331: 192-194.

14. Bach I., Ostendorf H.P. 2003. Orchestrating nuclear functions: ubiquitin sets the rhythm. TiBS. 28(4): 189-195.

15. Ballut L., Petit F., Mouzeeyar S. Le Gall O., Candresse Т., Schmid P., Nicolas P., Badaoui S. 2003. Biochemical identification of proteasome-associated endonuclease activity in sunflower // Biochim. Biophys. Acta. 1645: 30-39.

16. Bardag-Gorce F., Venkatesh R., Li J., French B.A., French S.W. 2004. Hyperphosphorylation of rat liver proteasome subunits: the effects of ethanol and okadaic acid are compared. Life Sci. 75: 585-597.

17. Barret A.J. 1980. Fluorimetric assays for cathepsin В and cathepsin H with methylcoumarylamide substrates. Biochem. J. 187: 909-912.

18. Baumeister W., Walz J., Zuhl F., Seemuller E. 1998. The proteasome: paradigm of a selfcompartmentalizing protease. Cell 92: 367-380.

19. Bold R.J. 2001. Virudachalam S., McConkey D. J., Chemosensitization of pancreatic cancer by inhibition of the 26S proteasome. J. Surg. Res. 100: 11-17.

20. Bose S,. Brooks P., Mason G.G., Rivett A J. 2001. gamma-Interferon decreases the level of 26 S proteasomes and changes the pattern of phosphorylation. Biochem. J. 353: 291-297.

21. Bose S., Mason G.G., Rivett A.J. 1999. Phosphorylation of proteasomes in mammalian cells. Mol Biol Rep. 26:11-14.

22. Bradford M.M. 1976. A rapid and sensitive method for the quantitation of microgram quantities of protein utilizing the principle of protein-dye binding. Anal. Biochem. 72: 248-254.

23. Brannigan J.A., Dodson G., Duggleby H.J., Moody P.C., Smith J.L., Tomchick D.R., Murzin A.G. 1995. A protein catalytic framework with an N-terminal nucleophil is capable of self-activation. Nature. 378: 416- 419.

24. Breitschopf K., Zeiher A.M., Dimmeler S. 2000. Ubiquitin-mediated degradation of the proapoptotic active form of bid. A functional consequence on apoptosis induction. J. Biol. Chem. 275(28): 21648-21652.

25. Briggs S.D., Xiao Т., Sun Z.W., Caldwell J.A., Shabanowitz J., Hunt D.F., Allis C.D., Strahl B.D. 2002. Gene silencing: trans-histone regulatory pathway in chromatin. Nature. 418: 498.

26. Burger S.R., Zutter M.M., Sturgill-Koszycki S., Santoro S.A. 1992. Induced cell surface expression of functional alpha 2 beta 1 integrin during megakaryocyte differentiation of K562 leukemic cells. Exp Cell Res. 202(1): 28-35.

27. Burns T.F., El Deiry W.S. 1999. The p53 pathway and apoptosis. J. Cell Physiol.l 81: 231-239.

28. Burri L., Hockendorff J., Boehm U., Klamp Т., Dohmen R.J., Levy F. 2000. Identification and characterization of a mammalian protein interacting with 20S proteasome precursors. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 97: 10348-10353.

29. Bush K.T., Goldberg A.L., Nigan S.K. 1997. Proteasome inhibition leads to a heat-shock response, induction of endoplasmatic reticulum chaperones, and thermotolerance. J. Biol. Chem. 272: 9086-9092.

30. Castelli J.C., Hassel B.A., Maran A., Paranjape J., Hewitt J.A., Li X.L., Hsu Y.T., Silverman R.H., Youle R.J. 1998. The role of 2'-5' oligoadenylate-activated ribonuclease L in apoptosis. Cell Death Differ. 5: 313-320.

31. Castillo E.A., Ayte J., Chiva C., Moldon A., Carrascal M., Abian J., Jones N., Hidalgo E. 2002. Diethylmaleate activates the transcription factor Papl by covalent modification of critical cysteine residues.Mol Microbiol. 45(1): 243-254.

32. Chen F., Chang D., Goh M., Klibanov S.A., Ljungmann M. 2000. Role p53 in cell cycle regulation and apoptosis following exposure to proteasome inhibitors. Cell Growth Differ. 11: 239-246.

33. Chen W.J., Lin J.K. 2004. Chen, Lin Induction of G1 arrest and apoptosis in human jurkat T cells by pentagalloylglucose through inhibiting proteasome activity and elevating p27Kipl, p21Cipl/WAFl, and Bax proteins. J Biol Chem. 279: 13496-51305.

34. Cho J.W., Park J.C., Lee J.C., Kwon Т.К., Park J.W, Baek W.K., Suh S.I., Suh M.H. 2001. The levels of MDM2 protein are decreased by a proteasomemediated proteolysis prior to caspase-3-dependent pRb and PARP cleavages. J. Korean Med. Sci. 16: 135-139.

35. Chuang C.Y., Chuang L.F. 1979. Inhibition of chicken myeloblastosis RNA Polymerase activity by adriamydcin. Biochemistry. 18: 2069-2073.

36. Claverol S., Burlet-Schiltz O., Girbal-Neuhauser E., Gairin J.E., Monsarrat B. 2002. Mapping and structural dissection of human 20S proteasome using proteomic approaches. Mol Cell Proteomics. 1: 567-578.

37. Coffey R.N., Watson R.W., Hegarty N.J., O'Neill A., Gibbons N., Brady H.R., Fitzpatrick J.M. 2000. Thiol-mediated apoptosis in prostate carcinoma cells. Cancer. 88(9): 2092-2104.

38. Cohen D.R., Curran T. 1989. The structure and function of the fos proto-oncogene. Crit. Rev. Oncog. 1: 65-88.

39. Coux O., Goldberg A.L. 1998. Enzymes catalyzing ubiquitinilation and proteolytic processing of the pi05 precusor of nuclear factor kappa Bl. J. Biol. Chem. 273: 8820-8828.

40. Dahlmann B. 2005. Proteasomes. Essays Biochem. 41: 31-48.

41. Dahlmann В., Ruppert Т., Kloetzel P. M., Kuehn L. 2001. Subtypes of 20S proteasomes from skeletal muscle. Biochimie 83: 295-299.

42. Dallaporta В., Pablo M., Maisse C., Daugas E., Loeffler M., Zamzami N., Kroemer G. 2000. Proteasome activation as a critical event of thymocyte apoptosis. Cell Death. Differ. 7: 368-373.

43. Demartino G.N., Slaughter C.A. 1999. The proteasome, a novel protease regulated by multiple mechanisms. J. Biol. Chem. 274: 22123-22126.

44. Distelhorst C.W. 2002. Recent insights into the mechanism of glucocorticosteroid-induced apoptosis. Cell Death. Differ. 9: 6-19.

45. Dou Q.P., McGuire T.F., Peng Y., An B. 1999. Proteasome inhibition leads to significant reduction of Bcr-Abl expression and subsequent induction of apoptosis in K562 human chronic myelogenous leukemia cells. J. Pharmacol. Exp. Ther. 289(2): 781-790.

46. Drexler H.C.A. 1998. Programmed cell death and the proteasome // Apoptosis. 3: 1-7.

47. Drexler H.G., Matsuo Y., MacLeod R.A. 2004. Malignant hematopoietic cell lines: in vitro models for the study of erythroleukemia. Leuk. Res. 28(12): 12431251.

48. Dubiel W., Ferrell K., Rechsteiner M. 1995. Subunits of the regulatory complex of the 26S proteasome. Mol. Biol. Rep. 21: 27-34.

49. Earnshaw WC. 1995. Nuclear changes in apoptosis. Curr Opin Cell Biol. 7: 337-343.

50. Elliott P.J., Pien C.S., McCormack T.A., Chapman I.D., Adams J. 1999. Proteasome inhibition: A novel mechanism to combat asthma. J. Allergy Clin. Immunol. 104: 294-300.

51. Etlinger J. D., Goldberg A. L. 1977. A soluble ATPdependent proteolytic system responsible for the degradation of abnormal proteins in reticulocytes. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 74: 54-58.

52. Ezhkova E, Tansey W.P. 2004. Proteasomal ATPases link ubiquitylation of histone H2B to methylation of histone H3. Mol Cell. 13(3): 435-442.

53. Fang S., Jensen J. P., Ludwig R. L., Vousden К. H., Weissman A. M. 2000. Mdm2 is a RING finger-dependent ubiquitin protein ligase for itself and p53. J. Biol. Chem. 275: 8945-8951.

54. Farout L., Mary J., Vinh J., Szweda L.I., Friguet B. 2006. Inactivation of the proteasome by 4-hydroxy-2-nonenal is site specific and dependant on 20S proteasome subtypes. Arch Biochem Biophys.;453(l): 135-142.

55. Fenteany G., Standaert R.F., Lane W.S., Choi S., Corey E.J., Schreiber S.L. 1995. Inhibition of proteasome activities and subunit-specific amino-terminal threonine modification by lactacystin. Science. 268(5211): 726-731.

56. Fernandez Murray P., Biscoglio M.J., Passeron S. 2002. In vivo and in vitro phosphorylation of Candida albicans 20S proteasome. Arch. Biochem. Biophys. 404:116-125.

57. Ferry A.E., Baliga S.B., Monteiro C., Pace B.S. 1997. Globin gene silencing in primary erythroid cultures. An inhibitory role for interleukin-6. J. Biol. Chem. 272: 20030-20037.

58. Figueiredo-Pereira M.E., Chen W.E., Yuan H.M., Wilk S. 1995. A novel chymotrypsin-like component of the multicatalytic proteinase complex optimally active at acidic pH. Arch. Biochem. Biophys. 317(1): 69-78.

59. Forrest V.J., Kang Y.H., McClain D.E. Robinson D.H., Ramakrishnan N. 1994. Oxidativee stress-induce apoptosis prevented by Trolox. Free. Radic. Biol. Med. (16):675-684.

60. Franco A.V., Zhang X.D., Van Berkel E., Sanders J.E., Zhang X.Y., Thomas W.D., Nguyen Т., Hersey P. 2001. The role of NF-kappa В in TNF-related apoptosis-inducing ligand (TRAIL)- induced apoptosis of melanoma cells. J. Immunol. 166: 5337- 5345.

61. Frisan Т., Levitsky V., Polack A., Masucci M.G. 1998. Phenotypedependent differences in proteasome subunit composition and cleavage specificity in В cell lines. J. Immunol. 160: 3281-3289.

62. Fu H.Y., Doelling J.H., Arendt C.S., Hochstrasser M., Vierstra R.D. 1998. Molecular organization of the 20S proteasome gene family from Arabidopsis thaliana. Genetics. 149: 677-692.

63. Fu H.Y., Reis N., Lee Y., Glickman M.H., Vierstra R. 2001. Subunit interaction maps for the regulatory particle of the 26S proteasome and the COP9 signalosome reveal a conserved core structure. J. EMBO. 20: 7096-7107.

64. Fujihara S., Ward C., Dransfield I., Hay R., Uings I., Hayes В., Farrow S., Haslett C., Rossi A. 2002. Inhibition of nuclear factor-кВ activation un-masks the ability of TNF-a to induce human eosinophil apoptosis. Eur. J. Immunol. 32: 457466.

65. Fujita E., Mukasa Т., Tsukahara Т., Arahata K., Omura S., Momoi T. 1996. Enhancement of CPP32-like activity in the TNF-treated U937 cells by the proteasome inhibitors. Biochem. Biophys. Res. Comm. 224: 74-79.

66. Gao G., Luo H. 2006. The ubiquitin-proteasome pathway in viral infections. Can. J. Physiol. Pharmacol. 84(1): 5-14.

67. Gao X., Li J., Pratt G., Wilk S., Rechsteiner M. 2004. Purification procedures determine the proteasome activation properties of REGy (PA28y). Arch. Biochem. Biophys.425: 158-164.

68. Gautier-Bert K., Murol В., Jarrousse A.S., Ballut L, Badaoui S., Petit F., Schmid H.P. 2003. Substrate affinity and substrate specificity of proteasomes with RNase activity. Mol. Biol. Rep. 30: 1-7.

69. Glickman M.H., Ciechanover A. 2002. The ubiquitin-proteasome proteolytic pathway: destruction for the sake of construction. Physiol Rev. 82: 373-428.

70. Glickman M.H., Raveh D. 2005. Proteasome plasticity. FEBS Letters 579: 3214-3223.

71. Green D. 1998. Apoptotic pathways: the roads to ruin. Cell. 94: 695-698.

72. Gregory M.A., Hann S.R. 2000. c-Myc proteolysis by the ubiquitin-proteasome pathway: stabilization of c-Myc in Burkitt's lymphoma cells. Mol. Cell Biol. 20: 2423-2435.

73. Grethe S., Ares M.P., Andersson Т., Porn-Ares M.I. 2004. p38 МАРК mediates TNF-induced apoptosis in endothelial cells via phosphorylation and downregulation of Bcl-x(L). Exp. Cell Res. 298(2): 632-642.

74. Grimm L.M., Goldberg A.L., Poirier G.G., Schwartz L.M., Osborne B.A. 1996. Proteasomes play an essential role in thymocyte apoptosis. EMBO J. 15: 3835-3844.

75. Grisham M.B., Palombella V.J., Elliot P.J., Conner E.M., Brand S., Wong H.L., Pien C., Mazzola L.M., Destree A., Parent L., Adams J. 1999. Inhibition of NF-kB activation in vitro and in vivo: role of 26S proteosome. Methods Enzymol. 300: 345-363.

76. Groll M., Bajorek M., Kohler A., Moroder L., Rubin D.M., Huber R., Glickman M.H., Finley D. 2000. A gated channel into the proteasome core particle. Nat. Struct. Biol. 7(11): 1062-1067.

77. Groll M., Bochtler M., Brandstetter H., Clausen Т., Huber R.2005. Molecular machines for protein degradation. Chembiochem. 6(2): 222-256.

78. Groll M., Ditzel L., Lowe J., Stock D., Bochtler M., Bartunik H.D., Huber R. 1997. Structure of 20S proteasome from yeast at 2.4 A resolution. Nature, 386: 463-471

79. Groll M., Huber R. 2004. Inhibitors of the eukaryotic 20S proteasome core particle: a structural approach. Biochim. Biophys. Acta. 1695(1-3): 33-44.

80. Grzanka A., Zuryn A., Styczynski J., Grzanka A.A., Wisniewska H. 2005. The effect of doxorubicin on the expression of cyclin A in K-562 leukemia cell line. Neoplasma. 52(6): 489-493.

81. Haass С., Kloetzel P.M. 1989. The Drosophila proteasome undergoes changes in its subunit pattern during development. Exp. Cell Res. 180: 243-252.

82. Haass C., Pesold-Hurt В., Multhaup G., Beyreuther K., Kloetzel P.M. 1989. The PROS-35 gene encodes the 35 kd protein subunit of Drosophila melanogaster proteasome. EMBO J. 8(8): 2373-2379.

83. Heinemeyer W., Fischer M., Krimmer Т., Stachon U., Wolf D.H. 1997. The active sites of the eukaryotic 20 S proteasome and their involvement in subunit precursor processing. J. Biol. Chem. 272: 25200-25209.

84. Heinemeyer W., Ramos P.C., Dohmen RJ. 2004. The ultimate nanoscale mincer: assembly, structure and active sites of the 20 S proteasome core. Cell. Mol. Life Sci. 61: 1562-1578.

85. Hendil K.B., Khan S., Tanaka K. 1998. Simultaneous binding of PA28 and PA700 activators to 20S proteasomes. Biochem. J. 332: 749-754.

86. Hendil K.B., Kristensen P., Uerkvitz W. 1995. Human proteasomes analysed with monoclonal antibodies. Biochem. J. 305: 245-252.

87. Herrmann J., Ciechanover A., Lerman O., Lerman A. 2004. The ubiquitin-proteasome system in cardiovascular diseases a hypothesis extended. Cardiovascular Res. 61: 11-12.

88. Herrmann J.L., Briones F.J., Brisbay S., Logothetis C.J., McDonnell T.J. 1998. Prostate carcinoma cell death resulting from inhibition of proteasome activity is independent of functional Bcl-2 and p53., Oncogene. 17: 2889-2899.

89. Hershko A. 1997. Roles of ubiquitin-mediated proteolysis in cell cycle control. Curr. Opin. Cell Biol. 9: 788-799.

90. Hershko A., Ciechanover A., Varshavsky A. 2000. Basic Medical Research Award. The ubiquitin system. Nat. Med. 6: 1073-1081.

91. Hilt W. 2004. Target of programmed destruction: a primer to regulatory proteolysis in yeast. CMLS. 61: 1-18.

92. Hirsch Т., Dallaporta В., Zamzami N., Susin S. A., Ravagnan L., Marzo I., Brenner C., Kroemer G. 1998. Proteasome activation occurs at an early, premitochondrial step of thymocyte apoptosis. J. Immunol. 161: 35-40.

93. Hochshtrasser M. 1996. Ubiquitin-dependent protein degradation. Annu. Rev. Immunol. 17: 405-439.

94. Hough R., Pratt G., Rechsteiner M. 1987. Purification of two high molecular weight proteases from rabbit reticulocyte lysates. J. Biol. Chem. 262: 8303-8313.

95. Hoyt M.A., Coffino P. 2004. Ubiquitin-free routes into the proteasome. CMLS. 61: 1-5.

96. Humbard M.A., Stevens S.M.J., Maupin-Furlow J. A. 2006. Posttranslational modification of the 20S proteasomal proteins of the archaeon Haloferax volcanii. J. Bacteriol. 188(21): 7521-7530.

97. Imajoh-Ohmi S., Kawaguchi Т., Sugiyama S., Tanaka K., Omura S., Kikuchi H. 1995. Lactacystin, a specific inhibitor of the proteasome, induces apoptosis in human monoblast U937 cells. Biochem. Biophys. Res. Comm. 217: 1070-1077.

98. Iqbal M., Chatterjee S., Kauer J. C., Das M., Messina P., Freed В., Biazzo W., Siman R. 1995. Potent inhibitors of proteasome. J. Med. Chem. 38: 2276-2277.

99. Isoe Т., Naito M., Hirai R., Tsuruo T. 1991. Inhibition of ubiquitin-ATP-dependent proteolysis and ubiquitination by cisplatin. Anticancer Res. 11: 1905-1909.

100. Isoe Т., Naito M., Shirai A., Hirai R., Tsuruo T. 1992. Inhibition of different steps of the ubiquitin system by cisplatin and aclarubicin. Biochim. Biophys. Acta. 1117: 131-135.

101. Iwafune Y., Kawasaki H., Hirano H. 2002. Electrophoretic analysis of phosphorylation of the yeast 20S proteasome. Electrophoresis. 23: 329-338.

102. Jarrousse A.S., Petit F., Kreutzer-Schmid K., Gaedigk R., Schmid H.P. 1999. Possible involvement of proteasomes (prosomes) in AUUUA-mediated mRNA decay. J. Biol. Chem. 274: 22023-22028.

103. Jin Z.H., Kurosu Т., Yamaguchi M., Arai A., Miura O. 2005. Hematopoietic cytokines enhance Chkl-dependent G2/M checkpoint activation by etoposide through the Akt/GSK3 pathway to inhibit apoptosis. Oncogene. 24: 19731981.

104. Karin M., Ben-Neriah Y. 2000. Phosphorylation meets ubiquitination: the control of NF-kappa.B activity. Annu Rev Immunol. 18: 621-663.

105. Kessel M., Wu W., Gottesman S., Kocsis E., Steven A.C., Maurizi M.R. 1996. Six-fold rotational symmetry of ClpQ, the E. coli homolog of the 20S proteasome, and its ATP-dependent activator, ClpY. FEBS Lett. 398: 274-278.

106. Kim S.J., Kim H.G., Kim B.C., Park E.H., Lim C.J. 2004. Transcriptional regulation of glutathione synthetase in the fission yeast Schizosaccharomyces pombe. Mol. Cells. 18(2): 242-248.

107. Kimura Y., Takaoka M., Tanaka S., Sassa H., Tanaka K., Polevoda В., Sherman F., Hirano H. 2000. N-Acetylation and proteolytic activity of the yeast 20 S proteasome. J. Biol. Chem. 275: 4635^1639.

108. Kishino Т., Lalande M., Wagstaff J. 1997. UBE3A/E6-AP mutations cause Angelman syndrome. Nat Genet. 15(1): 70-73.

109. Kisselev A.F., Callard A., Goldberg A.L. 2006. Importance of the different proteolytic sites of the proteasome and the efficacy of inhibitors varies with the protein substrate. J. Biol. Chem. 281: 8582-8590.

110. Kisselev A.F., Goldberg A.L. 2001. Proteasome inhibitors: from research tools to drug candidates. Chem. Biol. 8: 739-758.

111. Kiyomiya K., Kurebe M., Nakagawa H., Matsuo S. 2002. The role of the proteasome in apoptosis induced by anthracycline anticancer agents. Int. J. Oncol. 20(6): 1205-1259.

112. Kiyomiya K., Matsuo S., Kurebe M. 1998. Proteasome is a carrier to translocate doxorubicin from cytoplasm into nucleus. Life Sci. 62: 1853-1860.

113. Kiyomiya K., Matsuo S., Kurebe M. 2001. Mechanism of specific nuclear transport of adriamycin: the mode of nuclear translocation of adriamycin-proteasome complex. Cancer Res. 61(6): 2467-2471.

114. Kloetzel P.M. 2001. Antigen processing by the proteasome. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2: 179-187.

115. Kloetzel P.M. 2004. The proteasome and MHC class I antigen processing. Biochim. Biophys. Acta.;1695(l-3): 225-233.

116. Kloetzel P.M., Soza A., Stohwasser R. 1999. The role of the proteasome system and the proteasome activator PA28 complex in the cellular immune response. Biol. Chem. 380: 293-297.

117. Kostova Z., Wolf D.H. 2003. For whom the bell tolls: protein quality control of the endoplasmic reticulum and the ubiquitin-proteasome connection. EMBOJ. 22: 2309-2917.

118. Kristensen P., Johnsen A.H., Uerkvitz W., Tanaka K., Hendil K.B. 1994. Human proteasome subunits from 2-dimensional gels identified by partial sequencing. Biochem. Biophys. Res. Commun. 205: 1785-1789.

119. Kroll M., Arenzana-Seisdedos F., Bachelerie F., Thomas D., Friguet В., Conconi M. 1999. The secondary fungal metabolite gliotoxin targets proteolytic activities of the proteasome. Chem. Biol. 6: 689-698.

120. Kumeda S.I., Deguchi A., Toi M., Omura S. Umezawa K. 1999. Induction of G1 arrest and selective growth inhibition by lactacystin in human umbilical vein endothelial cells. Anticancer Res. 19: 3961-3968.

121. Kuttler C., Nussbaum A.K., Dick T.P., Rammensee H.G., Schild H., Hadeler K.P. 2000. An algorithm for the prediction of proteasomal cleavages. J. Mol. Biol. 298: 417-429.

122. Kwok J.C., Richardson D.R. 2004. Examination of the mechanism(s) involved in doxorubicin-mediated iron accumulation in ferritin: studies using metabolic inhibitors, protein synthesis inhibitors, and lysosomotropic agents. Mol. Pharmacol. 65: 181-195.

123. Laemmli U.K. 1970. Cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage T4. Nature. 227: 680-685.

124. Lee D.H., Goldberg A.L. 1998. Proteasome inhibitors: valuable new tools for cell biologists. Trends Cell Biol. 8: 397-403.

125. Lee L.W., Moomaw C.R., Orth K., McGuire M.J., DeMartino G.N., Slaughter C.A. 1990. Relationships among the subunits of the high molecular weight proteinase, macropain (proteasome). Biochim. Biophys. Acta 1037: 178— 185.

126. Lee M.H., Hyun D.H., Jenner P., Halliwell B. 2001. Effect of proteasome inhibition on cellular oxidative damage, antioxidant defences and nitric oxide production. J. Neurochem. 78: 32-41.

127. Lehmann A., Janek K., Braun В., Kloetzel P.M., Enenkel C. 2002. 20S proteasomes are imported as precursor complexes into the nucleus of yeast. J. Mol. Biol. 317(3): 401-413.

128. Liu C.-W., Corboy M.J., DeMartino G.N., Thomas P.J. 2003. Endoproteolytic activity of the proteasome. Science. 299: 408-411.

129. Loening U.E. 1969. The determination of molecular weight of ribonucleic acid by polyacrylamide-gel electrophoresis. Biochem. J. 113: 131-138.

130. Lopes U.G., Erhardt P., Yao R., Cooper G.M. 1997. p53-dependent induction of apoptosis by proteasome inhibitors. J. Biol. Chem. 272: 12893-12896.

131. Lowe J., Stock D., Jap В., Zwickl P., Baumeister W., Huber R. 1995. Crystal structure of the 20S proteasome from the archaeon T. acidophilum at 3.4 A resolution. Science, 268:533-539.

132. Lozzio C.B., Lozzio B.B. 1975. Human chronic myelogenous leukemia cell-line with positive Philadelphia chromosome. Blood. 45(3): 321-334.

133. Ludemann R., Lerea K.M., Etlinger J.D. 1993. Copurification of casein kinase II with 20 S proteasomes and phosphorylation of a 30-kDa proteasome subunit. J. Biol. Chem. 268: 17413-17417.

134. Ludemann R., Lerea K.M., Etlinger J.D. 1993. Copurification of casein kinase II with 20 S proteasomes and phosphorylation of a 30-kDa proteasome subunit. J. Biol. Chem. 268(23): 17413-17417.

135. Lum R.T., Kerwar S.S., Meyer S.M., Nelson M.G., Schow S.R., Schiffman D., Wick M.M., Joly A. 1998. A new class of proteasome inhibitors that prevent NFkB activation. Biochem. Pharmacol. 55: 1391-1397.

136. Luo H., Wu Y., Qi S., Wan X., Chen H., Wu J. 2001. A proteasome inhibitor effectively prevents mouse heart allograft rejection. Transplantation. 72: 196-202.

137. Machiels B.M., Henfling M.E., Gerards W.L., Broers J.L., Bloemendal H., Ramaekers F.C. Schutte B. 1997. Detailed analysis of cell cycle kinetics upon proteasome inhibition. Cytometry 28: 243-252.

138. MacLaren A.P., Chapman R.S., Wyllie A.H., Watson C.J. 2001. p53-dependent apoptosis induced by proteasome inhibition in mammary epithelial cells. Cell Death. Differ. 8:210-218.

139. Maniatis Т., Fritsch E.F., Sambrook J. 1982. Molecular cloning: a laboratory manual. In: Gel electrophoresis. New York: Cold Spring Harbor Laboratory: 150-162.

140. Martin M.C., Dransfield I., Haslett C., Rossi A.G. 2001. Cyclic AMP regulation of neutrophil apoptosis occurs via a novel PKA- independent signaling pathway. J. Biol. Chem. 276(48): 45041-45050.

141. Martin S.J., Green D.R. 1995. Protease activation during apoptosis: Death by a thousand cuts? Cell. 82: 349-352.

142. Mason G., Murray R., Pappin D., Rivett A.J. 1998. Phosphorylation of ATPase subunits of the 26S proteasome. FEBS. 430: 269-274.

143. Mason G.G., Hendil K.B., Rivett A.J. 1996. Phosphorylation of proteasomes in mammalian cells. Identification of two phosphorylated subunits and the effect of phosphorylation on activity. Eur. J. Biochem. 238: 453-462.

144. Masson P., Andersson O., Petersen U.M., Young P. 2001. Identification and characterization of a Drosophila nuclear proteasome regulator. A homolog of human 11 S REGgamma (PA28gamma ). J. Biol. Chem. 276(2): 13831390.

145. Maupin-Furlow J.A., Humbard M.A., Kirkland P.A., Li W., Reuter C.J., Wright A.J., Zhou G. 2006. Proteasomes from structure to function: perspectives from Archaea. Curr. Top Dev. Biol. 75: 125-169.

146. Mayr J., Seemuller E., Miiller S.A., Engel A., Baumeister W. 1998. Late events in the assembly of 20S proteasomes. J. Struct. Biol. 124: 179-188.

147. McDonough H., Patterson C. 2003. CHIP: a link between the chaperone and proteasome systems. Cell Stress Chaperones. 8(4): 303-308.

148. Meiners S., Laule M., Rother W., Guenther C., Prauka I., Muschick P., Baumann G., Kloetzel P. M., Stangl K. 2002. Ubiquitin-proteasome pathway as a new target for the prevention of restenosis. Circulation. 105: 483-489.

149. Meng L., Kwok B.H., Sin N., Crews C.M. 1999. Eponemycin exerts its antitumor effect through the inhibition of proteasome function. Cancer Res. 59: 2798-801.

150. Meng L., Mohan R., Kwok B.H., Elofsson M., Sin N., Crews C.M. 1999. Epoxomicin, a potent and selective proteasome inhibitor, exhibits in vivo antiinflammatory activity. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 96: 10403-10408.

151. Miller J., Gordon C. 2005. The regulation of proteasome degradation by multi-ubiquitin chain binding proteins. FEBS Letters 579: 3224-3230.

152. Mizutani H., Tada-Oikawa S., Hiraku Y., Kojima M., Kawanishi S. 2005. Mechanism of apoptosis induced by doxorubicin through the generation of hydrogen peroxide. Life Sci. 76(13): 1439-1453.

153. Murata S. 2006. Multiple Chaperone-Assisted Formation of Mammalian 20S Proteasomes. IUBMB Life, 58: 344-348.

154. Murray A.W. 2004. Recycling the cell cycle: cyclins revisited. Cell. 116(2): 221-234.

155. Nalepa G, Rolfe M, Harper J.W. 2006. Drug discovery in the ubiquitin-proteasome system. Nat. Rev. Drug Discov. 5(7): 596-5613.

156. Nam S., Smith D. M., Dou Q. P. 2001. Tannic Acid Potently Inhibits Tumor Cell Proteasome Activity, Increases p27 and Bax Expression, and Induces G(l) Arrest and Apoptosis. Cancer Epidemiol. Biomarkers Prev. 10: 1083-1088.

157. Nandi D., Tahiliani P., Kumar A., Chandu D. 2006. The ubiquitin-proteasome system. J. Biosci. 31(1): 137-155.

158. Nandi D., Woodward E., Ginsburg D.B. and Monaco J.J. 1997. Intermediates in the formation of mouse 20S proteasomes: implications for the assembly of precursor beta subunits.EMBO J. 16: 5363-5375.

159. Naujokat C., Hoffmann S. 2002. Role and Function of the 26S Proteasome in Proliferation and Apoptosis. Laboratory Investigation. 82: 965-980.

160. Olink-Coux M., Arcangeletti C., Pinardi F., Minisini R., Huesca M., Chezzi C., Scherrer K. 1994. Cytolocation of prosome antigens on intermediate filament subnetworks of cytokeratin, vimentin and desmin type. J. Cell Sci. 107: 353-366.

161. Orlowski M. 1990. The multicatalytic proteinase complex, a major extralysosomal proteolytic system. Biochemistry. 29: 10289-10297.

162. Orlowski M., Wilk S. 2000. Catalytic activities of the 20S proteasome, a multicatalytic proteinase complex. Arch Biochem Biophys. 383: 1-16.

163. Orlowski M., Wilk S. 2003. Ubiquitin-independent proteolytic functions of the proteasome. Arch Biochem Biophys. 415: 1-5.

164. Orlowski R. Z., Eswara J. R., Lafond-Walker A., Grever M. R., Orlowski M., Dang C.V. 1998. Tumor growth inhibition induced in a murine model of human Burkitt's lymphoma by a proteasome inhibitor. Cancer Res. 58: 43424348.

165. Orlowski R.Z., Dees E.C. 2003. The role of the ubiquitination-proteasome pathway in breast cancer: applying drugs that affect the ubiquitin-proteasome pathway to the therapy of breast cancer. Breast Cancer Res. 5(1): 1-7.

166. Pajonk F., McBride W. H. 2001. The Proteasome in Cancer Biology and Treatment. Radiat. Res. 156: 447-459.

167. Palmer A., Rivett A.J., Thomson S., Hendil K.B., Butcher G.W., Fuertes G., Knecht E. 1996. Subpopulations of proteasomes in rat liver nuclei, microsomes and cytosol. Biochem. J. 316: 401-407.

168. Pereira M.E., Yu В., Wilk S. 1992. Enzymatic changes of the bovine pituitary multicatalytic proteinase complex, induced by magnesium ions. Arch. Biochem. Biophys. 294: 1-8.

169. Petit F., Jarrousse A.-S., Boissonnet G., Dadet M.-H., Buri J. 1997a. Proteasome (prosome) associated endonuclease activity. Mol. Biol. Rep. 24: 113117.

170. Petit F., Jarrousse A-S., Dahlmann В., Sobek A., Hendil K.B., Bury J., Briand Y., Schmid H.-P. 1997b. Involvement of proteasomal subunits zeta and iota in RNA degradation. Biochem. J. 326:93-98.

171. Piccinini M., Tazartes O., Mezzatesta C., Ricotti E., Bedino S., Grosso F., Dianzani U., Tovo P.A., Mostert M., Musso A., Rinaudo M.T. 2001. Proteasomes are a target of the anti-tumour drug vinblastine. Biochem. J. 356: 835841.

172. Pickart C.M. 2001. Mechanisms underlying ubiquitination. Annu Rev Biochem. 70: 503-533.

173. Pleban E., Bury M., Mlynarczuk I., Wojcik C. 2001. Effects of proteasome inhibitor PSI on neoplastic and non-transformed cell lines. Folia Histochem. Cytobiol. 39: 133-134.

174. Pouch M.N., Petit F., Buri J., Briand Y., Schmid H.-P. 1995. Identification and initial characterization of a specific proteasome (prosome) associated RNase activity. J. Biol. Chem. 270: 22023-22028.

175. Ptacek J., Snyder M. 2006. Charging it up: global analysis of protein phosphorylation. Trends Genet. 22(10): 545-554.

176. Rajkumar S.V., Richardson P.G., Hideshima Т., Anderson K.C. 2005. Proteasome inhibition as a novel therapeutic target in human cancer. J. Clin. Oncol. 23(3): 630-639.

177. Ramos P.C., Hockendorff J., Johnson E.S., Varshavsky A., Dohmen RJ. 1998. Umplp is required for proper maturation of the 20S proteasome and becomes its substrate upon completion of the assembly. Cell 92: 489-499.

178. Rao S., Porter D.C., Chen X., Herliczek Т., Lowe M. Keyomarsi K. 1999. Lovastatin-mediated G1 arrest is through inhibition of the proteasome, independent of hydroxymethyl glutaryl-CoA reductase. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 96: 7797-7802.

179. Reed S. 2005. The ubiquitin-proteasome pathway in cell cycle control. Results Probl. Cell Differ. 42: 147-181.

180. Rivett A., Bose S., Brooks P., Broadfoot K.I. 2001. Regulation of proteasome complexes by y-interferon and phosphorylation. Biochimie. 83: 363366.

181. Rivett A.J. 1998. Intracellular distribution of proteasomes. Curr. Opin. Immunol. 10: 110-114.

182. Rivett A.J., Palmer A., Knecht E. 1992. Electron microscopic localization of the multicatalytic proteinase complex in rat liver and in cultured cells. J. Histoch. Cytochem. 40: 1165-1172.

183. Rivett A.J., Sweeney S.T. 1991. Properties of subunits of the multicatalytic proteinase complex revealed by the use of subunit-specific antibodies. Biochem. J. 278: 171-177.

184. Rohrwild M., Coux O., Huang H.C., Moerschell R.P., Yoo S.J., Seol J.H. 1996. HslV-HslU: A novel ATP-dependent protease complex in Escherichia coli related to the eukaryotic proteasome. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 93: 58085813.

185. Ryabova L.V., Virtanen I., Olink-Coux M., Scherrer K., Vassetzky S.G. 1994. Distribution of prosome proteins and their relationship with the cytoskeleton in oogenesis of Xenopus laevis. Mol. Reprod. Dev. 37: 195-203.

186. Sabatini N., Di Pietro R., Rapino M., Sancilio S., Comani S., Cataldi A. 2004. PI-3-kinase/NF-kappaB mediated response of Jurkat T leukemic cells to two different chemotherapeutic drugs, etoposide and TRAIL. J Cell Biochem. 93: 301-311.

187. Salghetti S.E., Kim S.Y., Tansey W.P. 1999. Destruction of Мус by ubiquitin-mediated proteolysis: cancer-associated and transforming mutations stabilize Мус. EMBO J. 18: 717-726.

188. Sarin A., Adams D.H., Henkart P.A. 1993. Protease inhibitors selectively block T cell receptor-triggered programmed cell death in a murine T cell hybridoma and activated peripheral T cells. J. Exp. Med. 178: 1693-1700.

189. Satoh M., Lindahl T. 1993. Role of poly(ADP-ribose) formation in repair. Nature. 356: 356-358.

190. Schmid H.P., Pouch M.N., Petit F., Dadet M.H., Badaoui S., Boissonnet G., Buri J., Norris V., Briand Y. 1995. Relationships between proteasomes and RNA. Mol. Biol. Rep. 21 (1): 43-47.

191. Schwartz L.M., Myer A., Kosz L., Engelstein M., Maier C. 1990. Activation of polyubiquitin geneexpression during developmentally programmed cell death. Neuron. 5:411-419.

192. Seemuller E., Lupas A., Stock D., Lowe J., Huber R., BaumeisterW. 1995. Proteasome from Thermoplasma acidophilum: a threonine protease. Science. 268: 579-582.

193. Shah S.A., Potter M.W., Callery M.P. 2001a. Ubiquitin proteasome pathway: implications and advances in cancer therapy. Surg. Oncol. 10: 43-52.

194. Shah S.A., Potter M.W., McDade T.P., Ricciardi R., Perugini R.A., Elliott P.J., Adams J., Callery M. P. 2001b. 26S proteasome inhibition induces apoptosis and limits growth of human pancreatic cancer, J. Cell Biochem. 82: 110122.

195. Shen Y., White E. 2001. p53-dependent apoptosis pathways. Adv. Cancer Res. 82: 55-84.

196. Smalle J., Vierstra D. 2004. The ubiquitin 26S proteasome proteolytic pathway. Annu. Rev. Plant Biol. 55: 555-590.

197. Sohn D., Totzke G., Essmann F., Schulze-Osthoff K., Levkau В., Janicke R.U. 2006a. The Proteasome Is Required for Rapid Initiation of Death Receptor-Induced Apoptosis. Mol. Cel. Biol. 26: 1967-1978.

198. Sohn D., TotzkeG., Schulze-Osthoff K., Janicke R.U. 2006b. Friend or Foe? The Proteasome In Combined Cancer Therapy. Cell Cycle 5: 841-845.

199. Soza A., Knuehl C., Groettrup M., Henklein P., Tanaka K., Kloetzel P-M. 1997. Expression and subcellular localization of mouse 20S proteasome activator complex PA28. FEBS Lett. 413: 27-34.

200. Staub O., Yeger H., Plant P.J., Kim H., Ernst S.A., Rotin D. 1997. Immunolocalization of the ubiquitin-protein ligase Nedd4 in tissues expressing the epithelial Na+ channel (ENaC). Am. J Physiol. 272:1871-1880.

201. Sumegi M., Hunyadi-Gulyas E., Medzihradszky K.F., Udvardy A. 2003. 26S proteasome subunits are O-linked N-acetylglucosamine-modified in Drosophila melanogaster. Biochem Biophys Res Commun. 312(4): 1284-1289.

202. Sun Z.W., Allis C.D. 2002. Ubiquitination of histone H2B regulates H3 methylation and gene silencing in yeast. Nature. 418: 104-108.

203. Szulawska A, Czyz M. 2006. Molecular mechanisms of anthracyclines action, Postepy Hig. Med. Dosw. 60: 78-100.

204. Tamura Т., Nagy I., Lupas A., Lottspeich F., Cejka Z., Schoofs G., Tanaka K., De Mot R., Baumeister W. 1995. The first characterization of a eubacterial proteasome: the 20S complex of Rhodococcus. Curr. Biol. 5(7): 766774.

205. Tanahashi N., Murakami Y., Minami Y., Shimbara N., Hendil K.B., Tanaka K. 2000. Induction by interferon- and contribution to ATP-dependent proteolysis. J. Biol. Chem. 275: 14336-14345.

206. Tani E., Kitagawa H., Ikemoto H., Matsumoto T. 2001. Proteasome inhibitors induce Fas-mediated apoptosis by c-Myc accumulation and subsequent induction of FasL message in human glioma cells. FEBS Lett. 504: 53-58.

207. Tanimoto Y., Kizaki H. 2002. Proteasome inhibitors block ras/ERK signaling pathway resulting in the downregulation of Fas ligand expression during activation-induced cell death in T cells. J. Biochem. 131:319-326.

208. Tenev Т., Marani M., McNeish I., Lemoine N. R. 2001. Pro-caspase-3 overexpression sensitises ovarian cancer cells to proteasome inhibitors. Cell Death. Differ. 8: 256-264.

209. To W.Y., Wang C.C. 1997. Identification and characterization of an activated 20S proteasome in Trypanosoma brucei. FEBS Lett. 404(2-3): 253-262.

210. Tokumoto M., Horiguchi R., Nagahama Y., Tokumoto T. 1999. Identification of the Xenopus 20S proteasome alpha4 subunit which is modified in the meiotic cell cycle. Gene. 239(2): 301-308.

211. Tokunaga F., Aruga R., Iwanaga S., Tanaka K., Ichihara A., Такао Т., Shimonishi Y. 1990. The NH2-terminal residues of rat liver proteasome (multicatalytic proteinase complex) subunits, C2, C3 and C8, are Na-acetylated. FEBS Lett. 263: 373-375.

212. Touitou R., Richardson J., Bose S., Nakanishi M., Rivett J., Allday M.J. 2001. A degradation signal located in the C-terminus of p21WAFl/CIPl is a binding site for the C8 alpha-subunit of the 20S proteasome. EMBO J. 20: 23672375.

213. Traenckner E.B., Wilk S. Baeuerle P.A. 1994. A proteasome inhibitor prevents activation of NFkB and stabilizes a newly phosphorylated form of I kappa B-alpha that is still bound to NFkB. EMBO J. 13: 5433-5441.

214. Umeda M., Manabe Y., Uchimiya H. 1997. Phosphorylation of the C2 subunit of the proteasome in rice (Oryza sativa L.). FEBS Lett. 403(3): 313-307.

215. Ustrell V., Hoffman L., Pratt G., Rechsteiner M. 2002. PA200, a nuclear proteasome activator involved in DNA repair. EMBO J. 21(13): 3516-3525.

216. Ustrell V., Pratt G., Gorbea C., Rechsteiner M. 2005. Purification and assay of proteasome activator PA200. Methods Enzymol. 398: 321-329.

217. Vink J., Cloos J., Kaspers G.J. 2006. Proteasome inhibition as novel treatment strategy in leukaemia. Br. J. Haematol. 134(3): 253-262.

218. Vivancos A.P., Castillo E.A., Biteau В., Nicot C., Ayte J., Toledano M.B., Hidalgo E. 2005. A cysteine-sulfinic acid in peroxiredoxin regulates H202sensing by the antioxidant Papl pathway. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 102(25): 8875-8880.

219. Volker C., Lupas A.N. 2002. Molecular evolution of proteasomes. Curr. Top. Microbiol. Immunol. 268: 1-22.259. von Mikecz A. 2006. The nuclear ubiquitin-proteasome system. J. Cell Sci. 119(10): 1977-1984.

220. Wagenknecht В., Hermisson M., Eitel K. Weller M. 1999. Proteasome inhibitors induce p53/p21-independent apoptosis in human glioma cells. Cell Physiol. Biochem. 9: 117-125.

221. Wallace A.D., Cidlowski J. A. 2001. Proteasomemediated glucocorticoid receptor degradation restricts transcriptional signaling by glucocorticoids. J. Biol. Chem. 276: 42714-42721.

222. Walz J., Erdmann A., Kania M., Турке D., Koster A.J., Baumeister W. 1998. 26S proteasome structure revealed by three-dimensional electron microscopy. J. Struct. Biol. 121: 19-29.

223. Wang C.Y., Mayo M.W., Baldwin A.S.Jr. 1996. TNFand cancer therapy-induced apoptosis: potentiation by inhibition of NFkB. Science. 274: 787789.

224. Wang H.R., Kania M., Baumeister W., Nederlof P.M. 1997. Import of human and Thermoplasma 20S proteasomes into nuclei of HeLa cells requires functional NLS sequences. Eur. J. Cell Biol. 73: 105-113.

225. Wang J., Maldonado M.A. 2006. The Ubiquitin-Proteasome System and Its Role in Inflammatory and Autoimmune Diseases. Cell Mol. Immunol. 3(4): 255-261.

226. Wang L, Chen L, Benincosa J, Fortney J, Gibson LF. 2005. VEGF-induced phosphorylation of Bcl-2 influences В lineage leukemic cell response to apoptotic stimuli. Leukemia. 19: 344-353.

227. Wang X.W. 1999. Role of p53 and apoptosis in carcinogenesis. Anticancer Res. 19: 4759-4771.

228. Wilk S., Orlowski M. 1983. Evidence that pituitary cation- sensitive neutral endopeptidase is a multicatalytic protease complex. J. Neurochem. 40: 842849.

229. Witt E., Zantopf D., Schmidt M., Kraft R., Kloetzel P.M., Kruger E. 2000. Characterisation of the newly identified human Umpl homologue POMP andanalysis of LMP7 (beta 5i) incorporation into 20 S proteasomes. J. Mol. Biol. 301(1): 1-9.

230. Wojcik C. 1999. Inhibition of the proteasome as a therapeutic approach. Drug Discov. Today. 4: 188-192.

231. Wojcik C. 2002. Regulation of apoptosis by the ubiquitin and proteasome pathway. J. Cell. Mol. Med. 6: 25-48.

232. Wojcik C., Bury M., Stoklosa Т., Giermasz A., Feleszko W., Mlynarczuk I., Pleban E., Basak G., Omura S., Jakobisiak M. 2000. Lovastatin and simvastatin are modulators of the proteasome, Int. J. Biochem. Cell Biol. 32: 957965.

233. Wojcik C., DeMartino G.N. 2003. Intracellular localization of proteasomes. Int. J. Biochem. Cell Biol. 35: 579-589.

234. Wolf D.H. 2004. From lysosome to proteasome: the power of yeast in the dissection of proteinase function in cellular regulation and waste disposal. CMLS.61: 1-14.

235. Yang W., Monroe J., Zhang Y., George D., Bremer E., Li H. 2006. Proteasome inhibition induces both pro- and anti-cell death pathways in prostate cancer cells. Cancer Lett. 243(2): 217-227.

236. Yao Y., Huang L., Krutchinsky A., Wong M.L., Standing K.G., Burlingame A.L., Wang C.C. 1999. Structural and functional characterizations of the proteasome-activating protein PA26 from Trypanosoma brucei. J. Biol. Chem. 274: 33921-33930.

237. Zachara N.E., Hart G.W. 2004. O-GlcNAc modification: a nutritional sensor that modulates proteasome function. Trends Cell Biol. 14(5): 218-221.