Бесплатный автореферат и диссертация по биологии на тему
Характеристика штаммов кори, циркулирующих на территории Российской Федерации в период массовой вакцинопрофилактики
ВАК РФ 03.00.06, Вирусология
Содержание диссертации, , Журавлева, Юлия Николаевна
ВВЕДЕНИЕ.3.
ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
ГЛАВА 1. Структура вируса кори и функциональная активность вирусных белков.10.
ГЛАВА 2. Геном вируса кори и генотипирование диких штаммов коревого вируса.22.
ГЛАВА 3. Географическое распространение штаммов вируса кори разных генотипов.37.
СОБСТВЕННЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ
ГЛАВА 4. Материалы и методы исследования.46.
ГЛАВА 5. Подбор прайм еров и условий для проведения реакции обратной транскрипции и полимеразной цепной реакции.60.
ГЛАВА 6. Анализ нуклеотидной последовательности СООН-концевого участка Ы-гена штаммов вируса кори, изолированных на территории России.66.
ГЛАВА 7. Анализ нуклеотидной последовательности полноразмерного
Н-гена штаммов вируса кори, изолированных на территории России.89.
ОБСУЖДЕНИЕ.97.
ВЫВОДЫ.110.
Введение Диссертация по биологии, на тему "Характеристика штаммов кори, циркулирующих на территории Российской Федерации в период массовой вакцинопрофилактики"
До настоящего времени среди инфекционных болезней человека значительное место занимает корь. Это заболевание имеет огромное социально-экономическое значение на протяжении всей истории цивилизации. Повсеместное распространение этой инфекции с периодическими эпидемическими подъемами, высокая восприимчивость к ней человека ставят корь в ряд тех болезней, которые наносят значительный урон здоровью населения.
Реальная возможность борьбы с корью появилась в 1954 году, когда I. Епс1ег5 и Т. РееЫэ (75) получили первый штамм вируса кори, ставший родоначальником многих вакцинных и диагностических препаратов. Со времени создания эффективных вакцин против кори, это заболевание стало контролируемым в некоторых странах мира (43,125), но, тем не менее, несмотря на явные успехи в борьбе с корью, достигнутые с помощью вакцинации, корь остается серьезной проблемой для многих стран.
Впервые вопрос о ликвидации кори встал в 1975 году, когда специалистами ВОЗ была разработана Расширенная Программа Иммунизации (РПИ), результатом которой, в частности, стало сокращение числа случаев кори на территориях, включившихся в выполнение РПИ. Позднее в 1991 году Панамериканская конференция выдвинула задачу элиминации кори на американском континенте к 2000 году. Результатом усилий, предпринимаемых для достижения поставленной задачи, явилось искоренение кори в Америке, где с 2000 года не было зарегистрировано ни одного случая этого заболевания, вызванного эндемичными штаммами вируса кори (19, 43).
Та же стратегия намечена в программе Всемирной Организации Здравоохранения «Здоровье для всех», провозгласившей в 1998 году в качестве одной из основных задач XXI века - глобальную ликвидацию кори к 2010 - 2020 гг. При этом Восточно-Средиземноморский и Европейский регионы должны сертифицировать элиминацию кори в 2007-2010 гг. (8).
Наличие в России высокоэффективной живой коревой вакцины позволило разработать Национальную программу ликвидации кори, утвержденную Приказом Минздрава России от 19.08.2002 года № 270. Одним из важных пунктов программы является подробная молекулярно-генетическая характеристика штаммов вируса кори с целью слежения за их циркуляцией среди населения на более современном уровне, так как молекулярно-генетические методы позволяют проводить оценку эпидемиологических связей между выделяемыми штаммами вируса кори и изучать пути их трансмиссии.
В мировом плане, изучение вируса кори на молекулярно - генетическом уровне позволило выявить существование различных генетических групп коревого вируса и соотнести эти группы с ареалами распространения, что дало возможность классифицировать все получаемые изоляты вируса кори. Это явилось предпосылкой для создания стандартной номенклатуры описания генетической характеристики диких штаммов вируса кори и его генотипирования. В 1998 г. все известные штаммы вируса кори были подразделены на 15 генотипов, которые объединены в 8 групп:А, В, С, Э, Е, V, в, Н (151). Генотипы различаются по количеству нуклеотидных замен на участке генома коревого вируса, состоящего из 450 нуклеотидов, кодирующих СООН - конец Ы-белка.
К 2001 году, с момента первой публикации стандартной номенклатуры, применяемой для классификации диких штаммов вируса кори (1998), количество охарактеризованных и изученных генотипов возросло с 15 до 22, что свидетельствует не только о расширении регионов изучения, но и о постоянном накоплении мутаций в геноме коревого вируса (152, 153).
Анализ данных литературы демонстрирует усилившееся в последние годы внимание исследователей к характеристике диких штаммов вируса кори, циркулирующих в настоящее время в разных географических регионах. При этом авторы преследуют несколько целей: во-первых, осуществление наблюдения за изменчивостью вируса кори и определение ее эпидемиологической значимости; во-вторых, генотипирование вируса кори, определение местных и завозных случаев кори и прерывание трансмиссии эндемичных штаммов коревого вируса для контроля выполнения программы элиминации кори на данных территориях.
Необходимо заметить, что если за рубежом такие исследования уже вошли в повседневную практику, то в России имеются только разрозненные данные о генотипах диких штаммах вируса кори, циркулирующих на территории Российской Федерации, тогда как только постоянное наблюдение за всеми изменениями вирусного генома на определенной территории в течение длительного времени позволяет документировать прерывание трансмиссии эндемичного генотипа вируса кори на данной территории и является одним из основных методов оценки эффективности выполнения программы элиминации кори.
В связи с изложенным ЦЕЛЬЮ настоящей работы явилась молекулярно-генетическая характеристика штаммов вируса кори, циркулирующих среди населения на территории Российской Федерации.
В соответствии с поставленной целью в ЗАДАЧИ исследования входило:
1. Подбор праймеров и отработка условий проведения реакции обратной транскрипции и полимеразной цепной реакции.
2. Определение нуклеотидной и аминокислотной последовательности СООН-концевого участка N-гена и полноразмерного Н-гена разных штаммов вируса кори.
3. Определение генотипов штаммов вируса кори, циркулирующих на территории России в разные годы вакцинопрофиоактики.
Многоплановость исследований потребовала при выполнении работы комплекса с различными специалистами. В этой связи в диссертации нашли отражения результаты работ, проведенных совместно с вирусологами и эпидемиологами ГУ «МНИИЭМ им Г.Н. Габричевского» МЗ РФ; с сотрудниками лаборатории молекулярной диагностики и генно-инженерных конструкций Всероссийского Научно-исследовательского института сельскохозяйственной биотехнологии РАСХН; с сотрудниками Measles Virus Section, Centers for Disease Control and Prevention (CDC), Atlanta.
НАУЧНАЯ НОВИЗНА РАБОТЫ:
Впервые проведен анализ нуклеотидной и аминокислотной последовательности СООН - концевого участка N-гена 21 штамма вируса кори и полноразмерного Н-гена 5 штаммов вируса кори, выделенных на территории Российской Федерации в период с 1988 по 2003 годы. Установлено, что в настоящее время наблюдается изменение генотипической картины штаммов вируса кори, циркулирующих на территории России. Если в 80-е годы на данной территории циркулировали штаммы генотипа А, который являлся эндемичным для России в довакцинальный период, то в последнее время циркуляция данного генотипа не зафиксирована. В настоящее время на территории Российской Федерации наиболее постоянной циркуляцией отличается вирус кори, принадлежащий к генотипу 04, который и является эндемичным для России в данный момент.
Выявлено, что для вируса кори, циркулирующего на территории России характерно ежегодное увеличение количества мутаций, как на нуклеотидном, так и на аминокислотном уровне, что свидетельствует о необходимости постоянного слежения за изменчивостью вируса кори.
ПРАКТИЧЕСКАЯ ЗНАЧИМОСТЬ РАБОТЫ заключается в создании на основе разработанных специфических праймеров для СООН-концевого участка И-гена вируса кори и определении оптимальных условий проведения реакции обратной транскрипции и полимеразной цепной реакции "Набора реагентов для выделения РНК и диагностики вируса кори методом обратной транскрипции и полимеразной цепной реакции в одной пробирке" (ДВК-ПЦР) в соответствии с п.3.6. ГОСТ Р15.013-94. Проект технических условий данного набора был представлен и рассмотрен на заседании комиссии по РИА - и ИФА-наборам Комитета по новой медицинской технике МЗ РФ 20.10.2002 года.
МАТЕРИАЛЫ ДИССЕРТАЦИИ НАШЛИ ОТРАЖЕНИЕ:
1. В депонировании одного из изученных штаммов вируса кори MVi/Moscow.Rus/05.99[D4] в Государственную коллекцию вирусов (ГУ «НИИ вирусологии им. Д.И. Ивановского РАМН», Москва, Россия). Данному штамму присвоен номер ГКВ № 2360.
2. В депонировании 11-ти изученных штаммов вируса кори, циркулирующих на территории Российской Федерации, в Международную коллекцию штаммов (CDC, Atlanta, США) и передачи нуклеотидных последовательностей данных штаммов в Genebank (NCBI, Bethesda, США).
НА ЗАЩИТУ ДИССЕРТАЦИИ ВЫНОСЯТСЯ СЛЕДУЮЩИЕ
ПОЛОЖЕНИЯ:
1. С помощью реакции обратной транскрипции, полимеразной цепной реакции и секвенирования установлено, что на территории России в период с 1988 по 2003 годы циркулировали штаммы вируса кори четырех генотипов: A, D4, D6 и HI.
2. В течение последних 15 лет на территории России произошли изменения в генотипическом пейзаже штаммов вируса кори. Циркуляция штаммов генотипа А, эндемичного для России в довакцинальный период, в последние годы не зафиксирована. Наиболее постоянной циркуляцией отличается вирус кори, принадлежащий к генотипу D4, который и является эндемичным для России в настоящее время.
Для штаммов вируса кори генотипа Э4, выделенных на территории Российской Федерации характерно интенсивное ежегодное накопление мутаций на нуклеотидном и аминокислотном уровне, что свидетельствует о важности постоянного слежения за дикими штаммами вируса кори с помощью методов молекулярной эпидемиологии.
ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
Заключение Диссертация по теме "Вирусология", Журавлева, Юлия Николаевна
110 выводы.
1. Разработаны оригинальные праймеры: МУ-Ш/МУ-Р2 и МУ-К-ИЛ/МУ-Ы-Р1, фланкирующие 685 и 545 нуклеотидов (соответственно) С-концевого участка гена нуклеопротеина вируса кори, используемого при генотипировании, а также отработаны условия для проведения реакции обратной транскрипции и полимеразной цепной реакции при использовании данных праймеров. Предложена схема проведения реакций, продемонстрирована ее высокая чувствительность и специфичность. Показано, что получаемые продукты реакции могут быть использованы для изучения нуклеотидной и аминокислотной последовательностей вирусных изолятов.
2. Впервые проведен анализ нуклеотидной и аминокислотной последовательности СООН-концевой части Ы-гена с целью генотипирования 21 штамма вируса кори, циркулировавших на территории России в период с 1988 по 2003 годы. Установлено, что в 1988 году на территории России циркулировали штаммы вируса кори, относящиеся к генотипу А и близкие по молекулярно-генетическим характеристикам к штамму Эдмонстон. В период с 1999 года по 2003 год на территории России выделен вирус кори трех генотипов 04, Об и Н1.
3. Анализ нуклеотидной и аминокислотной последовательности полноразмерного Н-гена штаммов вируса кори, изолированных на территории России в период с 1999 по 2003, подтвердил принадлежность вируса кори к генотипам 04, Об и Н1, установленным при секвенировании СООН-конца Ы-гена.
4. Результаты генотипирования штаммов вируса кори, изолированных на территории Российской Федерации в разные годы вакцинопрофилактики, выявили изменения генотипической картины вируса кори, циркулирующего на данной территории. Циркулировавший ранее на территории России вирус, принадлежащий к генотипу А, в последнее время не регистрируется, а его место занял вирус генотипа D4. Анализ частоты обнаружения штаммов вируса кори разных генотипов позволяет предположить, что в настоящий момент генотип D4 является эндемичным для России. Вирусы других генотипов, вызывающие на территории России локальные случаи кори, по-видимому, являются импортированными из других стран.
5. Определение нуклеотидной и аминокислотной последовательности двух наиболее вариабельных участков генома вируса кори (СООН-конца N-гена и полноразмерного Н-гена) свидетельствует об усилившейся в последнее десятилетие изменчивости вируса кори. Полученные данные говорят о важности изучения молекулярно - генетической и биологической характеристики штаммов вируса кори в период реализации программ элиминации кори в мире.
За помощь в выполнении работы автор выражает глубокую благодарность сотруднику Института им. Баха РАН, кандидату биологических наук Ворониной Ольге Львовне.
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
Анализ данных литературы показал, что геном вируса кори кодирует информацию о 8 структурных белках, три из которых (Н, F и М) связаны с оболочкой вириона коревого вируса, а три (Ь, Р и ^ связаны с нуклеокапсидом. Детальное изучение строения и функций вирусных белков показало существование у вируса кори выраженных антигенно-генетических мутаций, особенно в N и Н -белках. Это диктует необходимость дальнейшего наблюдения за изменчивостью вируса кори.
Анализ данных литературы свидетельствует об усилившемся в последние годы внимании исследователей к характеристике диких штаммов вируса кори, циркулирующих в настоящее время в разных географических регионах. При этом авторы преследуют несколько целей: во-первых, осуществление наблюдения за изменчивостью вируса кори и определения ее эпидемиологической значимости; во-вторых, генотипирование вируса кори, определение местных и завозных случаев кори и прерывание трансмиссии местных штаммов коревого вируса для контроля за выполнением программы элиминации кори на данных территориях.
Нетрудно заметить, что если за рубежом такие исследования уже вошли в повседневную практику, то в России имеются только разрозненные данные о диких штаммах вируса кори, циркулирующих на территории Российской Федерации. Принятая Всемирной организацией здравоохранения программа глобальной элиминации кори и Национальная программа ликвидации кори к 2010 году на территории Российской Федерации (Приказ Минздрава России от 19.08.2002 года № 270), требуют подробной молекулярно-генетической характеристики штаммов вируса кори, циркулирующих на территории России, с целью слежения за их циркуляцией среди населения.
Таким образом, анализ данных литературы дал возможность сформулировать основную задачу данной работы: изучить и генотипировать штаммы вируса кори, изолированные на территории России в разные годы массовой вакцинопрофилактики.
СОБСТВЕННЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ ГЛАВА 4. Материалы и методы исследования.
4.1. Выделение изолятов от больных корью
Выделение изолятов вируса кори из инфекционного материала проводили на базе лаборатории прикладной иммунохимии Московского научно-исследовательского института эпидемиологии и микробиологии имени Г.Н. Габричевского.
Материалом для выделения вируса служили: взвесь мононуклеарных клеток, полученная из гепаринизированной венозной крови больных корью, плазма и сыворотка крови.
Венозную кровь собирали в стерильных условиях в пробирки с гепарином (5 мл + 0,2 мл гепарина). Взятые образцы доставлялись в лабораторию для выделения вируса. При выделении фракции моноцитов из гепаринизированной крови в пробирку с кровью добавляли желатин из расчета 1 мл 10% желатина на 5 мл крови. Полученную смесь тщательно перемешивали. Затем пробирку помещали в термостат фирмы Jouan (Франция) на 40 минут при температуре 37°С. По истечении данного времени жидкость, образовавшуюся над осадком, отсасывали в центрифужную пробирку, добавляли 5 мл среды RPMI-1640 и центрифугировали в центрифуге с качающимся ротором фирмы Jouan (Франция) при 1000 об/мин. в течение 10 минут. Затем аккуратно отсасывали среду и клеточную взвесь суспендировали в небольшом объеме питательной среды.
Изоляты вируса кори культивировали на перевиваемых культурах клеток В-95а и Vero. Культуры клеток выращивали в среде RPMI-1640 с 5% эмбриональной телячьей сыворотки (BioClot (Pty)Ltd, Германия) при температуре 37°С.
Инфицирование клеточных культур вирусом кори осуществляли путем внесения вируса непосредственно в питательную среду. Все манипуляции по получению вируссодержащей жидкости проводили в строго стерильных условиях, в ламинаре II степени защиты SterilCARD III фирмы The Baker Company (США).
Всего исследованы 21 штамм вируса кори, полученные от больных в период с 1988 по 2003 годы (табл.4). Определение генотипов данных штаммов проводили на базе двух лабораторий - на базе лаборатории молекулярной диагностики и генно-инженерных конструкций Всероссийского Научно-исследовательского института сельскохозяйственной биотехнологии, РАСХН и на базе Measles Virus Section, Centers for Disease Control and Prevention (CDC), Атланта, США.
Библиография Диссертация по биологии, , Журавлева, Юлия Николаевна, Москва
1. Анджапаридзе О.Г. Вакцинопрофилактика кори.// В кн. «Медицинская вирусология».-М., 1977.-С.З-6.
2. Букринская А.Г., Зайдес В.М. Молекулярная биология парамиксовирусов// М., «Медицина», 1978, 184с., ил.
3. Вирусология// В 3-х томах.: Пер.с англ./ Под ред. Б.Филдса, Д.Найпа, при участии Р.Ченока, Б.Ройзмана, Дж.Мелника, Р.Шоупа.-М.: Мир, 1989.
4. Гендон Ю.З. // Вопр. вирусологии. 1996. - Т.41. - №2. - С.88-92.
5. Гипермутация генома вируса кори и персистентная инфекция: К вопросам о целесообразности вакцинации детей в раннем возрасте: Ред.ст.// Вопр. вирусол.-1990.-Т.35, №5.- С.438-439.
6. Глик Б., Пастернак Дж. Молекулярная биотехнология. Принципы и применение// Пер. с англ. М.: Мир, 2002. - 589 е., ил.
7. Zhdanov V.M. The measles virus. // Molec. and cell biochem.- I980.-Vol.29.-№1.-P.59-66.
8. Здоровье-21: основы политики достижения здоровья для всех в Европейском регионе ВОЗ. Предупреждение болезней и травм и борьба сними. // Европейская серия по достижению здоровья для всех, №6.
9. Коптяева И.Б. Персистенция вируса кори // Вопросы вирусологии.- 1996.-t.41.-№2.-С.74-76.
10. Ляшенко В.А. Коревая иммунодепрессия в условиях инфекции и вакцинации // Иммунология.- 1996.-№ 1 .-С. 10-12.
11. Мамаева Т.А. Противокоревые антигемолизины и методы их выявления: Автореф. дис. канд. биол. наук: 14.00.36 // Моск. НИИ эпидемиолог, и микробиол. им. Г.Н. Габричевского,- М., 1987.- 21с.
12. Маркушин С.Г., Рота П., Тихонова Н.Т., Мамаева Т.А., Беллини В. Сравнительное изучение нуклеотидной последовательности Р/С гена дикого штамма ИЛ и вакцинного штамма Л-16 вируса кори// Вопр. вирусол.-1995.-№4.-С.151-155.
13. Маркушин С.Г. Генетика вируса кориII Вопросы вирусологии.- 1996.- т.41.-№2.-С.70-72.
14. Marcushin S, Bellini W, Rota P. 1994. Genetic analysis of the M-F intercistronic region of measles vaccine and wild-type strains. In: Abstracts of 9th //International Conference on Negative Strand Viruses.- Estoril.- 1994. p 126
15. Москалева Т.Н. Клинико-иммунологическая характеристика и дифференциальная диагностика современной кори// Автореф. дис. канд. мед. наук: 14.00.10/ЦНИИЭ.- 1996.-20с.
16. Наумова М.А. Характеристика штаммов вируса кори, циркулирующих среди населения в период массовой вакцинопрофилактики// Автореф. дис. канд. биолог, наук: 14.00.36 / Моск. НИИ эпидемиолог, и микробиол. им. Г.Н. Габричевского.- М., 1998.-21с.
17. Носивец Г.В. Критерий оценки эпидемической ситуации по кори на современном этапе// Эпидемиология инфекционных болезней.- 1999.-№5.-С.14-17.
18. Патогенетические аспекты коревой инфекции: меморандум совещания ВОЗ// Бюллетень ВОЗ,-1994.-т.72.-№2.-С. 16-21.
19. Руководство по лабораторной диагностике кори// ВОЗ, отдел вакцин и биологических препаратов.- Декабрь.- 1999.
20. Свежина Ю.А. Состав и некоторые свойства антигена вируса кори// В кн.: "Актуальные проблемы вирусных инфекций".-М. -1965.-С.344-345.
21. Сингер М, Берг П. Гены и геномы: В 2-х т. Пер. с англ. М: Мир - 1998 - 373 е., ил.
22. Тарос Л.Ю. Опыт непосредственного выделения вируса кори на однослойных культурах почечной ткани морских свинок и фибробластов куриных эмбрионов//Вопросы вирусологии,- 1963.-№3.-С.316-322.
23. Тихонова Н.Т., Герасимова А.Г., Чава О.О. и др. Совершенствование системы эпиднадзора за корью на этапе ее элиминации.// Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. М. - 2003,- №2.- стр.5
24. Хозинский В.И. Материалы по этиологии и профилактике некоторых вирусных инфекций и по биологии вируса кори// Доклад, обобщающий опубликованные работы, представленные к защите на соискание ученой степени доктора биол. наук.- М.- 1969.-С.67-92.
25. Чернеску К., Шородок Й., Кажал Н. Корь. Патогенез и профилактика// Перев. с румыне,- 1981.- 242с.
26. Alkhatib G, Briedis DJ. The predicted primary structure of the measles virus hemagglutinin//Virology.- 1986.-Vol.150.-P. 479-490.
27. Baczko K., Carter M.J., Billeter M. and ter Meulen V. Measles virus gene expression in subacute sclerosing panencephalitis// Virus Research.- 1984.-Vol.l.-P. 585-595.
28. Baczko K., Liebert V.G., Billeter M., Cattaneo R., Budka H. and ter Meulen V. Expression of defective measles virus gene in brain tissues of patients with subacute sclerosing panencephalitis // Journal of Virology.- 1986.-Vol.59.-P. 472-478.
29. Baczko K., Brinckmann U., Pardowitz I., Rima K. Bert and ter Meulen V. Nucleotide sequence of genes encoding the matrix protein of two measles virus wild-type strains.//J. Gen. Virol.-1991.-Vol.72.- P. 2279-2282.
30. Baczko K., Carstens C., Kreth H.W. et al. // Abstracts of IX International Conference on Negative Strand Viruses.- Estoril, Portugal, October 2-7.- 1994.- P.152.
31. Barrero OR, de Wolff CD, Passegi CA, and Mistchenko AS. Sequence analysis of measles virus hemagglutinin isolated in Argentina during the 1997-1998 outbrea//. J Med Virol.- 2000.-Vol.60.-P. 91-96
32. Barrero OR, Zandomeni RO, and Mistchenko AS. Measles virus circulation in Argentina: 1991-1999//Arch Virol.-2001.-Vol.146.-P. 815-823
33. Barrett T, Underwood B. Comparison of meassenger RNAs induced in cells infected with each member of the morbillivirus group// Virology.- 1985.-Vol.l45.-P.195-199
34. Bartz R., Brinckmann U., Dunster L.M., Rima B., ter Meulen V. and Schneider-Schaulies J. Mapping Amio Acid of the measles Virus Hemagglutinin Responsible for Receptor (CD46) Downregulation.//Virology.- 1996.-Vol.224.-P. 334-337.
35. Baumeister E, Siqueira MM, Savy V, Friedrich F. Genetic characterization of wildtype measles viruses isolated during the 1998 measles epidemic in Argentina// Acta Virol.- 2000.- Jun-Aug.-Vol.44(3).-P. 169-74
36. Bellini WJ, Englund G, Richardson CD, Rozenblatt S. Positive identification of a measles virus cDNA clone encoding a region of the phosphoprotein// J. Virol.- 1984.-Vol.50.- P.939-942.
37. Bellini W.J, Englund G.,Rozenblatt S et al. // J.Virol. 1985. - Vol. 53. - P. 908-919.
38. Bellini W.J, Englund G., Richardson CD ,Rozenblatt S, Lazzarini RA. Matrix genes of measles virus and canine distemper virus: cloning, nucleotide sequence, and deduced amino acid sequences//L Virol.- 1986.-Vol.58.-P.408-416.
39. Bellini WJ, Rota PA. Genetic diversity of wild-type measles viruses: implications for global measles elimination programs// Emerg Infect Dis.- 1998.- Jan-Mar.-Vol.4(1).-P.29-35
40. Bilkis MD, Barrero PR, and Mistchenko AS. Measles resurgence in Argentina: 19978 outbreak// Epidemiol Infect.- 2000.-Vol.124.-P. 289-293.
41. Birrer MJ, BloomBR, Udem S. Characterization of measles polypeptide by monoclonal antibodies// Virology.-1981.-Vol.2.-p.381-390
42. Blmberg BM, Crowley JC, Silverman JI, Menonna J, Cook SD, Dowling PC. Measles virus L protein evidences elements of ancestral RNA polymerase// Virology.- 1988.-Vol.l64.-P.487-497
43. Bolt Gert and Pedersent lb Rode. The Role of Subtilisin-like Proprotein Convertases for Cleavage of the Measles Virus Fusion Glikoprotein in Different Cell Types.//Virology.-1998.-Vol.252.-P.387-398.
44. Brown D, Cohen B, Hujan R, Jin L, Ramsay M, and White. Molecular epidemiology of measles in the UK 1992 to 2001// In 5th Annual Meeting of the European Society for Clinical Virology.-2001.- Vol.22.
45. Buckland R., Gerald C., Barker R. and Wild T.F. Fusion Glicoprotein of Measles Virus Nucleotide Sequence of the Gene and Comparison with Other Paramyxoviruses.//J. Gen. Virol.-1987.-Vol.68.-P. 1695-1703.
46. Buckland R. and Wild T.F. Is CD46 the cellular receptor for measles virus? // Virus Res.-1997.-Vol.48.-P. 1-9.
47. Buchholz CJ, Koller D, Devaux P, Mumenthaler C, Schneider-Schaulies J, Braun W, Gerlier D, Cattaneo R. Mapping of the primary binding site of measles virus to its receptor CD46//J Biol Chem.- 1997.-Vol.272.-P. 22072-22079.
48. Byass P, Adedeji MD, Mongdem JG, Zwandor AC, Brew-Graves SH, and Clements CJ. Assessment and genetic approaches// Acta Virol.- 1995.-Vol.-44.-P. 35-39
49. Canepa E, Siqueira M, Hortal M, and Friedrich. Recent measles viral activity in Uruguai: serological and genetic approaches// Acta Virol.- 2000.-Vol.44.-P.35-39
50. Casasnovas JM, Larvie M, Stehle T. Crystal structure of two CD46 domains reveals an extended measles virus-binding surface// EMBO J.- 1999.-Vol.18.-P. 29911-2922.
51. Cattaneo R., Rebmann G., Baczko K., ter Meulen V. and Billeter M.A. Altered ratios of measles virus transcripts in diseased human brains.// Virology.- 1987.-Vol.160.-P. 523-526.
52. Cattaneo R.,Rose JK Cell fusion by the envelope glycoproteins of persistent measles viruses which caused lethal human brain disease.// J Virol.- 1993.-Vol.-67.-P.1493-1502.
53. Cattaneo R., Kaelin., Baczko K., Billeter M.A. // Cell. 1989. - Vol. 58 - P. 759764.
54. CDC Center for Disease Control and Prevention. Progress toward interrupting indigenous measles transmission - Region of the Americas, January 1999 -September 2000.// MMWR Morb Mortal Wkly Rep.- 2000.-N49.-P. 986-990.
55. Chadwick N, Bruce I, Davies M, van Gemen B, Schukkink R, Khan K, Pounder R, Wakefield A. A sensitive and robust method for measles RNA detection.//J of Virol Method.-l 998.-Vol.70.- P.59-70.
56. Chibo D., Birch CJ., Rota PA., Catton MG. Molecular characterization of measles viruses isolated in Victoria, Australia, between 1973 and 1998.// J Gen Virol.- 2000.-Vol.81.- P.2511-2518.
57. Chibo D, Riddell M, Catton M, Birch C. Novel measles virus genotype, East Timor and Australia.// Emerg Infect Dis.- 2002.- Jul.-Vol.8(7).-P. 735-737.
58. Chomczynski P, Sacchi N. Single-step method of RNA isolation by acid guanidinium thiocyanate-phenol-chloroform extraction.// Anal Biochem.- 1987.- Apr.- Vol. 162.-N1.-P.156-9.
59. Cocks BG, Chang C-CJ, Carballido JM, Yssel H, de Vries JE, Aversa G. A novel receptor involved in T-cell activation.// Nature.- 1995.-Vol.376.-P.260-263.
60. Crowley J, Dowling PC, Menonna J, Schazer B, Young E, Cook SD, Blumberg BM. Molecular cloning of 99% of measles virus genome, positive identification of 5'end clones, and mapping of the L gene region.// Intervirology.- 1987.-Vol.28.-P.65-77
61. Crowley J, Dowling PC, Menonna J, Silverman JI, Schuback D, Cook SD, Blumberg BM. Sequence variability and function of measles virus 3'and 5'ends and intercistronic regions.//Virology.- 1988.-Vol.164.-P. 498-506.
62. Curran J, Boeck R, Kolakofsky D. The Sendai virus P gene expresses both an essential protein and an inhibitor of RNA synthesis by shuffling modules via nRNA editing.// EMBO J.-1991.-Vol. 10.-P. 3079-3085
63. Doring R., Marcel A., Chopra A. and Richardson C.D. The human CD46 molecule is a receptor for measles virus (Edmonston strain). // Cell.-1993.-Vol.75.-P. 295-305.
64. Dowling PC, Blumberg BM, Menonna J, Adamus JE, Cook PJ, Crowley JC, Kolakofsky D, Cook SD. Transcriptional map of the measles virus genome.// J Gen Virol.- 1986.-Vol.67.-P. 1987-1992.
65. Emerson SU, Yu YH. Both NS and L proteins are required for in vitro RNA synthesis by vesicular stomatitis virus.// J. Virol.- 1975.-Vol.l5.-P.1348-1356.
66. Enders J.F., Peebles T.C. Propagation in tissue cultures of cytopathogenic agents from patients with measles. // Proc.Soc.Exp.Biol.Med.-1954.-Vol.86.-P.277-286.
67. FirschingR, Buchholz C, Schneider U, Cattaneo R, ter Meulen V, Schneider-Schaulies J. Measles virus spread by cell-cell contacts: Uncoupling of contactmediated receptor (CD46) downregulation from virus uptake.// J.Virol.- 1999.-Vol.73.-P.5265-5273
68. Fujinami R.S. and Oldstone M.B.A. Failure to cleave measles virus fusion protein in lymphoid cell.//J.Exp.Med.- 1981.-Vol.154.-P. 1489-1499.
69. Fujinami R.S. and Oldstone M.B.A. Alterations in Expression of Measles Virus Polipeptides by Antibody: Molecular Events in Antibody Induced Antigenic Modylation. // J.Immunol.- I980.-Vol. 125.-N1.-P. 78-85.
70. Gerald C, Buckland R, Barker R, Freeman G, Wild TF. Measles virus haemoagglutinin gene: cloning, complete sequence analysis and expression in Cos cell.// J Gen Virol.- 1986.-Vol.67.-P. 2695-2703
71. Giraudon P, Jacquier MF, Wild TF. Antigenic analysis of African measles virus field isolates: identification and localization of one conserved and two variable epitope sites on the NP protein.// Virus Res.- 1988.-Vol.18.-P. 137-152
72. Gombart AF, Hirano A, Wong TC. Expression and properties of the V protein in acute measles vius and subacute sclerosing panencephalitis virus strains.// Virus Res.-1992.-Vol.25.-P.63-78.
73. Graves M.C., Silver S.M., Choppin P.W. Measles virus polipeptide synthesis in infected cell. //Virology.- 1978.-Vol.88.-P. 254-263.
74. Greer PA, Hasel KW, Millward S. Cloning and in vitro expression of the measles virus matrix gene.// Biochem Cell Biol.- 1986.-Vol.65.-P.1038-1043.
75. Hamaguchi M, Yoshida T, Nishikawa K, Naruse H, Nagai Y. Transcriptive complex of Newcastle disease virus I. Both L and P proteins are required to reconstitute an active complex.//Virology.- 1983.-Vol.l28.-P.105-117.
76. Hamaguchi M, Nishikawa K, Toyoda T, Yoshida T, Hanaichi T, Nagai Y. Transcriptive complex of Newcastle disease virus II. Structural and functional assembly associated with the cytoskeletal framework.// Virology.- 1985.-Vol. 147,-P.295-308
77. Hanses F, Binnendijk R, Ammerlaan W, Truong AT, de Rond L, Schneider F, and Muller CP. Genetic variability of measles viruses circulating in the Benelux.// Arch Virol.- 2000.-Vol.145.-P. 541-551.
78. Hasel KW, Day S, Millward S, Richardson CD, Bellini WJ, Greer PA. Characterization of cloned measles virus mRNAs by in vitro transcription, translation and immuno-precipitation.// Intervirology.- 1987.-Vol.28.-P.26-39.
79. Heggeness MH, Scheid A, Choppin PW. The relationship of conformational chages in the Sendai virus nucleocapsid to proteolytic cleavage in the NP polypeptide.// Virology.- 1981.-Vol.114.-P.555-562
80. Hirano A, Wang AH, Gombart AF, Wong TC. The matrix proteins of neurovirulent subacute sclerosing panencephalitis virus and its acute measles virus progenitor are functionally different.// Proc Natl Acad Sci USA.- 1992.-Vol.89.-P.8745-8749
81. Horikami SM, Moyer SA. Structure, transcription, and replication of measles virus.// Curr Top Microbiol Immunol.- 1995.-Vol. 191.-P.35-50
82. Hsu EC, Iorio C, Sarangi F, Khine AA, Richardson CD. CDwl50 (SLAM) is a receptor for a lymphotropic strain of measles virus and may account for the immunosuppressive properties of this virus.// Virology.- 2001.-Vol.279.-P.9-21.
83. Jin L, Brown DW, Ramsay ME, Rota PA, and Bellini WJ. The diversity of measles virus in the United Kindom, 1992-1995.//J Gen Virol.- 1997.-Vol.78.-P.1287-1294
84. Jin L, Knowles WA, Rota PA, Bellini WJ, and Brown DW. Genetic and antigenetic characterization of the haemagglutinin protein of measles virus strain recently circulating in the UK.// Virus Res.- 1998.-Vol.55.-P.107-113.
85. Jin L, Sun YJ, Ge L, and Brown DW. Characterization of new genotype of measles virus detected in China and England.// Epidemiol Infect.- 1998.-Vol.l21.-P.691-697
86. Katayama Y, Shibahara K, Kohama T, Homma M, and Hotta. Molecular epidemiology and changing distribution of genotypes of measles virus field strains in Japan.//J Clin Microbiol.- 1997.-Vol.35.-P. 2651-2653
87. Kouomou DW, Nerrienet E, Mfoupouendoun J, Tene G, Whittle H, Wild TF. Measles virus strains circulating in Central and West Africa: Geographical distribution of two B3 genotypes.// J Med Virol.- 2002.- Nov.-Vol.68.-N3.-P.433-40.
88. Kreis S., Vardas E and Whistler T. Sequence analysis of the nucleocapsid gene of measles virus isolates from South Africa identifies a new genotype. // J. of General Virology .-1997.-Vol.78.-P. 1581-1587.
89. Kreis S, and Schoub BD. Partial amplification of the measles virus nucleocapsid gene from stored sera and cerebrospinal fluids for molecular epidemiological studies.// J Med Virol.- 1998.-Vol.56.-P. 174-177.
90. Lecouturier V., Fayolle J., Caballero M., Carabana J., Celma M.L., Fernandez-Munoz R., Wild T.F. and Bucland R. // J. of Virology.- 1996.- July.-P. 4200-4202.
91. Mori T., Sasaki K., Hashimoto H. and Makino S. Molecurlar cloning and complete nucleotide sequence of genomic RNA of the AIC-C strain of attenuated measles virus.//Genes.- 1993.-Vol.7.-P. 67-81.
92. Morrison T.G., Portner A Structure, function and intracellular processing of paramyxovirus membrane proteins. // Virus Research.- 1988.-Vol.10.-P. 113-136.
93. Ono N, Tatsuno H, Hidaka Y, Aoki T, Minagawa H, Yanagi Y. Measles virus on throat swabs from measles patients use signaling lymphocytic activation molecule (CDwl50) but not CD46 as a cellular receptor.//J.Vrol.- 2001.-Vol.75.-P.4399-4401.
94. Osterhaus AD, Groen J, De Vries P, UytdeHaag FG, Klingeborn B, and Zarnke R. Canine distemper virus in seals.// Nature.- 1988.-Vol.335.-P.403-404
95. Peebles ME. Paramyxovirus M proteins: Pulling it all together and taking it on the road. In: Kingsbury DW (ed)// The paramyxoviruses.- Plenum.- New York.- 1991.-P.427-456
96. PHLS CDSC Communicable Disease Surveillance Centre. Outbreaks of measles in communities with low vaccine coverage.// Commun Dis Rep Wkly.- 2000.-N10.-P.29-32.
97. Polacino PS, Pinchuk LM, Sidorenko SP, . Clark EA. Immunodeficiency virus cDNA synthesis in resting T lymphocytes is regulated by T cell activation signals and dendritic cells.// J Med Primatol.- 1996.-Vol.25.-P.201-209
98. Pringle CR. Phabdovirus genetics. In:Wagner RR (ed).// The rhabdoviruses.-Plenum.- New York.- 1987.-P. 167-243.
99. Radecke F., Spielhofer P., Schneider H., Kaelin K., Huber M., Dotch C., Christiansen G. and Billeter M.A. Rescue of measles viruses from cloned DNA.// EMBO J.- 1995.-Vol. 14.-P.5773-5784.
100. Rayn KW, Morgan EM, Portner A. Two noncontiguous regions of Sendai virus P protein combine to form a single nucleocapsid binding domain.// Virology .-1991.-Vol.180.-P. 126-134.
101. Richardson C., Berkovich A, Rozenblatt S, Bellini W. Use of antibodies directed against synthetic peptides for identifying cDNA clones, establishing reading frames and deduction the gene order of measles virus.//J.Virol.- 1985.-Vol.54.-P.186-193.
102. Riddell MA, Chibo D, Kelly H, Catton MG, and Birch CJ. Investigation of optimal specimen type and sampling time for detection of measles virus RNA during a measles epidemic.//J of Clin Microb.- 2001.- Vol.39.- N.I.- P.375-376.
103. Rima BK, Baczko K, Clarke DK, Curran MD, Marten SJ, Billeter MA, ter Meulen V. Characterization of clones for the sixth (L) gene and a transcriptional map for morbilliviruses.// J Gen Virol.- 1986.-Vol.67.-P.1971-1978
104. Rima B.K., Earle J.A.P., Yeo R.P., Herlihy L., Baczko K., ter Meulen V., Carabana J., Caballero M., Cema M.L. and Fernandez-Munoz R. Temporal and geographical of measles virus genotypes. // J. of General Virology.-1995.- Vol.76.-P.l 173-1180.
105. Rota J.S., Hummel K.B., Rota P.A., and Bellini W.J. Genetic Variability of the Glicoprotein Genes of Current Wild-type Measles Isolates. // Virology.- 1992.-Vol.188.- P.135-142.
106. Rota P.A., Bloom A.E., Vanchieri J.A. and Bellini W.J. Evolution of the nucleoprotein and matrix genes wild-type strains of measles virus isolated from recent epidemics.//Virology.- 1994.-Vol.l98.-P.724-730.
107. Rota J.S., Wang Z., Rota P.A. and Bellini W.J. Cmparison of sequences of the H, F and N coding genes of measles virus vaccine strains. // Virus Res.-1994.-Vol.31.-P.317-330.
108. Rota P.A., Rota J.S., Newton B.R. et al. // Abstracts of IX International Conference on Negative Strand Viruses.- Estoril, Portugal.- October 2-7.- 1994.-P.153.
109. Rota PA, Liffick S, Rosenthal S, Heriyanto B, Chua KB. Measles genotype G2 in Indonesia and Malaysia.// Lancet.- 2000.- Apr 29.-Vol.355.-N9214,- P.1557-1558.
110. Rota JS, Heath JL, Rota PA, King GE, Ceima ML, Carabana J, et al. Molecular epidemiology of measles virus: identification of pathways of transmission and implications of measles elimination.// J Infect Dis.- 1996.-Vol.173.-P.32-7
111. Rota PA, Liffick SL, Rota JS, Katz RS, Redd S, Papania M, Bellini WJ. Molecular epidemiology of measles viruses in the United States, 1997-2001.// Emerg Infect Dis.-2002.- Sep.-Vol.8(9).-P.902-8.
112. Rozenblatt S, Eizenberg O, Ben-Levy R, Lavie V, Bellini WJ. Sequence homology with the morbilliviruses.//J Virol.- 1985.-Vol.53.-P. 684-690.
113. Sato T.A., Kohama T. and Sugiura A. Intracellular processing of measles virus fusion protein. // Arch. Virol.- 1988.- Vol.98.-P.39-50.
114. Santibanez S, Heider A, Gerike E, Agafonov A, and Schreier E. Genotyping of measles virus isolates from central Europe and Russia.// J Med Virol.- 1999.- Vol.58.-P.313-320
115. Schmid A., Cattaneo R. and Billeter M.A. A procedure for selective full length cDNA cloning of specific RNA species. // Nucleic Acids Research.- 1987.-Vol.15.-P.3987-3996.
116. Schneider-Schaulies S, Liebert UG, Baczko K, Cattaneo R, Billeter M, ter Meulen V. Restriction of measles virus gene expression in acute and subacute encephalitis of Lewis rats.//Virology.- 1989.- Vol.171.- P.525-534.
117. Schneider-Schaulies J., ter Meulen V., Schneider-Schaulies S. Measles virus interactions with cellular receptors: consequences for viral pathogenesis//Journal of NeuroVirology.- 2001.-Vol.7.-P. 391-399.
118. Sheshberadaran H, Chen SN, Norrby E. Monoclonal antibodies against five structural components of measles virus. // Virology ,-1983.-Vol.l28.-N2.-p.341-353.
119. Stallcup KC, Raine CS, Fields BN. Cytochalasin B inhibits the maturation of measles virus.//Virology.- 1983.-Vol. 124.-P.59-74
120. Takahashi M, Nakayama T, Kashiwagi Y, Takami T, Sonoda S, Yamanaka T, Ochiai H, Ihara T, and Tajima T. Single genotype of measles virus is domainantwhereas several genotypes of mumps vrus are co-circulating.// J.Med Virol.- 2000.-Vol.62.-P.278-285.
121. Takeda M., Sakaguchi T., Li Yan, Kobune F., Kato A., and Nagai Y. The Genome Nucleotide Sequence of a Contemporary Wild Strain of Measles Viruses and its Comparison with the Classical Edmonston Strain Genom. // Virology.- 1999.-Vol.256.-P. 340-350.
122. Tatsuo H, Ono N, Yanagi Y. SLAM (CDwl50) is a cellular receptor for measles virus.// Nature.- 2000.-Vol.406.-P.893-897.
123. Taylor M.J., Godfrey E., Baczko K., ter Meulen V., Wild T.F. and Rima B.K. Identification of several different lineages of measles virus. // J. of General Virology.-1991.-Vol.72.-P.83-88.
124. Truong AI, Mulders MN, Gautam DC, Ammerlaam W, de Swart RL, King CC, Osterhaus AD, and Muller CP. Genetic analysis of Asian measles virus strains new endemic genotype in Nepal.//Virus Res.- 2001.-Vol. 76.-P.71-78.
125. Tyrrell D.L.J, and Norhby E. Structural polypeptides of measles virus. // Journal of General Virology.- 1978.- Vol.39.-P.219-229.
126. Van den Hof S, Meffre CM, Conyn-van Spaendonck MA, Woonink F, de Melker HE, and van Binnendijk RS. Measles outbreak in a community with very low vaccine coverage, the Netherlands Emerg Infect Dis.- 2001.-Vol.7.-P.S593-597
127. Varsani T.M., Utter G., Norrby E. Purification, morphology and antigenic characterization of measles virus envelope components.//J Gen Virol.-1984.-Vol.65.-N2.-P.355-366.
128. Visser LK, Kumarev VP, Orvell C, de Vries P, Broeders HW, van de Bildt MW, Groen J, et al. Comparison of two morbilliviruses isolated from seals during outbreaks of distemper in north west Europe and Siberia.// Arch Virol.- 1990.-Vol.l 11.-P.149-164/
129. Wardrop EA, BriedisDJ. Characterization of V protein in measles virus-infected cells.//J. Virol.- 1991.- Vol.65.-P.3421-3428.
130. Weissbrich B, Shneider-Schaulies J, and ter Meulen V. Measles and its neurological complications. // Clinical Neurovirology.- 2002.- Apr.-P.2-46
131. WHO World Health Organization. Expanded Programme on Immunization (EPI). // Weekly Epidemiological Record.- 1998.-N73.-P.265-272.
132. WHO World Health Organization. Nomenclature for describing the genetic characteristics of wild-type measles viruses (update). Part 1 // Weekly Epidemiological Record.- 2001.-Vol. 76.-N 32-33.-P.241-256.
133. WHO World Health Organization. Nomenclature for describing the genetic characteristics of wild-type measles viruses (update). Part 2 // Weekly Epidemiological Record.- 2001.- Vol.76.-N 32-33.-P.241-256.
134. Wild TF, Malvoisin E, Buckland R. Measles virus: both the haemagglutinin and the fusion glycoprotein are required for fusion.// J Gen Virol. 1991- Vol.72. P.439-442
135. Xu W, Tamin A, Rota JS, Zhang L, Bellini WJ, Rota PA. New genetic group of measles virus isolated in the People's Republic of China.// Virus Res.- 1998.- Apr.-Vol.54.-N2.-P. 147-56
136. Yoshikawa Y, Mizumoto K, Yamanouchi K. Characterization of meassenger RNAs of measles virus.// J Gen Virol.- 1986.-Vol.67.-P.2807-2812.
- Журавлева, Юлия Николаевна
- Москва, 2005
- ВАК 03.00.06
- Молекулярно-генетическая характеристика штаммов B. pertussis и совершенствование микробиологического мониторинга коклюшной инфекции
- Характеристика штаммов вируса кори, циркулирующих на территории Российской Федерации в период массовой вакцинопрофилактики
- ШТАММ "ОРЛОВ – Д" ДЛЯ ПОЛУЧЕНИЯ ЖИВОЙ АТТЕНУИРОВАННОЙ ВАКЦИНЫ ПРОТИВ КРАСНУХИ
- Генетическая характеристика штаммов вируса болезни Ньюкасла, выделенных на территории России и сопредельных государств
- Особенности генетической структуры современных штаммов Bordetella pertussis.