Бесплатный автореферат и диссертация по биологии на тему
Генетический контроль координированной регуляции метаболизма основных биогенных элементов у дрожжей Saccharomyces cerevisiae
ВАК РФ 03.00.15, Генетика
Автореферат диссертации по теме "Генетический контроль координированной регуляции метаболизма основных биогенных элементов у дрожжей Saccharomyces cerevisiae"
На правах рукописи
ОЧИР-ГАРЯЕВА ИРИНА КАЛИНОВНА
ВВЕДЕНИЕ КАЛМЫКИИ В СИСТЕМУ ГОСУДАРСТВЕННОГО УПРАВЛЕНИЯ РОССИИ: ИСТОРИКО-ПРАВОВЫЕ АСПЕКТЫ (70-е гг. XVIII в. — первая половина XIX в.)
12.00.01 — теория и история права и государства; история учений о праве и государстве
Автореферат
диссертации на соискание ученой степени кандидата юридических наук
Москва - 2006
Работа выполнена на кафедре теории и истории государства и права Российского государственного социального университета
Научный руководитель - доктор юридических наук,
профессор
Пахомов Виталий Гаврилович
Официальные оппоненты — доктор юридических наук,
профессор
Сафонов Владимир Евгеньевич;
кандидат юридических наук Аксенов Илья Чудеевич
Ведущая организация — Московский университет МВД России
Защита состоится «14» декабря 2006 г. в 12 часов на заседании диссертационного совета Д 212.341.04 по юридическим наукам при Российском государственном социальном университете по адресу: 129256, г. Москва, ул. В. Пика, д. 4, к. 2, зал диссертационных советов.
С диссертацией можно ознакомиться в библиотеке Российского государственного социального университета по адресу:
129256, г. Москва, ул. В. Пика, д. 4, к. 2.
Автореферат разослан «13» ноября 2006 г.
Ученый секретарь диссертационного совета
доктор юридических наук, профессор >рисова Н. Е.
Актуальность темы исследования. Значительный интерес представляет процесс становления и развития калмыцкой государственности, которая, с одной стороны, развивалась на основе государственных структур калмыцкого ханства, а, с другой стороны, ощущала существенное влияние со стороны российского государственного аппарата. Именно в этом проявилось своеобразие развития государственности у калмыцкого народа.
Исследования правового наследия Калмыкии позволяют показать уровень развития калмыцкого права, его характерные черты и трансформации под влиянием российского законодательства.
Институты общественной организации калмыков в условиях политической зависимости от российского государства постепенно видоизменялись. Российское правительство пыталось ограничить полномочия и самостоятельность хана. С этой целью вводится институт наместничества. Исследуемый период внутриполитической деятельности России и его политико-правовые явления не могут не иметь уроков для государственного строительства России и следовательно требуют специального исследования.
В научных исследованиях проблемы управленческой сферы калмыцкого общества рассматривались как правило с точки зрения исторической науки. Теоретическое осмысление этих проблем не менее актуально и для юриспруденции.
Степень научной разработанности темы. Учеными проделана большая работа по изучению различных политико-правовых проблем развития Калмыкии. Эти исследования не равноценны как по содержанию рассматриваемых вопросов, так и по своей значимости.
Прежде всего, исследователи пытались решить вопрос о том, какими целями руководствовалось царское правительство, принимая калмыков в подданство России, и почему оно на первом этапе допускало известную политическую, правовую и экономическую независимость Калмыцкого ханства в составе России.
Ряд исследователей обращает также внимание и на экономическую заинтересованность правительства в калмыках. В частности, Н.И. Страхов с полным основанием писал о миллионах десятин «бесплодной и иссушенной солнечным зноем земли», превращенных калмыками в «миллионные табуны и стада, ... в надежный и богатый конный и скотный двор для целой России».
Вторая проблема — начало политики правового ограничения калмыков, H.A. Нефедьев и М.Н. Новолетов истоки правительственного надзора в Калмыцкой степи относили к началу XVIII века, но их точка зрения не нашла поддержки. И таким образом, в исследованиях дореволюционных ученых этот вопрос фактически решен не был.
Вопросы же правового регулирования общественных отношений калмыков, установление общегосударственного порядка управления нашли свое отражение как в дореволюционной, так и в современной литературе. Однако следует отметить, что большинство работ рассматривает преимущественно этнографические и исторические аспекты этих явлений.
Калмыки, войдя в состав России, сохранили свод законов, принятый в 1640 году на съезде монгольских, ойратских и калмыцких ханов. Этот свод в литературе получил названия: «Монголо-ойратские законы», «Степное Уложение», «Великое Уложение» и стал предметом пристального изучения со стороны русских правоведов и востоковедов: К.Ф. Голстунского, Ф.И. Леонтовича, И.Я. Гурлянда, М.Н. Новолетова, Ю.И. Лыткина, А.М. Позднеева, Н.Я. Бичурина. Однако следует иметь в виду, что исследования этих документов в дореволюционный период в своем большинстве преследовало цель использовать их как источник для изучения социально-экономического строя.
Что касается исследований советского времени, то их немного и большинство из них также посвящены экономическому и социальному положению калмыцкого общества более позднего периода (второй половины XIX и началу XX вв.). И лишь с 30-х гг. XX века начались первые исследования советских ученых по истории калмыков. К ним следует
отнести труды H.H. Пальмова, Г.З. Минкина и других. В частности, последний, характеризуя Калмыкию как колониальную окраину России, правовых аспектов практически не затрагивал.
После выселения калмыцкого народа исследования по социальной, политической и правовой истории Калмыкии были прерваны. Возобновлены они были только в 60-х годах. Среди авторов, активно разрабатывающих эти вопросы, следует отметить П.С. Преображенскую, М.Л. Кичикова, Т.П. Беликова и других. К сожалению, и в настоящее время исследования, посвященные истории управления Калмыкией в составе России, практически не выходят за рамки чисто исторических. К таким работам можно отнести исследования А.Г. Метирова, И.В. На-хаевой, К.Н. Максимова и некоторые другие.
Из представителей современной юридической науки представляет интерес диссертационная работа И.Ч. Аксенова, в которой проанализированы процессы становления и развития калмыцкой государственности и права в XVII—XIX вв. и не затрагиваются интересующие нас вопросы.
Таким образом, комплексного монографического исследования, посвященного развитию управленческой сферы калмыцкого общества в XVIII-XIX вв., до настоящего времени предпринято не было. Представленная работа является первой попыткой в некоторой степени устранить этот пробел.
Объектом исследования являются государственно-правовые институты и правовые акты, в том числе материалы Архива внешней политики Российской империи Министерства иностранных дел РФ (АВПРИ), Национального архива Республики Калмыкия (НАРК), регулирующие деятельность и взаимоотношения государственных органов власти и управления, политико-правовые идеи и взгляды государственных деятелей, ученых, повлиявшие на характер организации государственного управления в Калмыкии и оценивающие ее состояние в позитивном и критическом планах.
Предметом исследования выступают историко-правовые аспекты генезиса государственного управления Калмыкии в период становления общеимперского управления данным регионом, отношений центральных и местных органов государства, структура, компетенция и деятельность национального аппарата управления.
Цели и задачи исследования. Целью работы является изучение политико-правовых процессов в Калмыкии в указанный период и связанного с ними политического курса России.
Для достижения поставленной цели необходимо было решить следующие задачи: определить содержание и направленность правовой политики российского правительства в национальных окраинах на примере Калмыцкой степи; рассмотреть структуру государственных учреждений как центральных, так и местных органов управления калмыцким народом и правовое обеспечение их деятельности; изучить влияние политических сил в калмыцком обществе в пореформенный период на процесс вхождения Калмыкии в систему государственного управления России.
Источниковая база диссертации. Источниковую основу диссертации составляют опубликованные и преимущественно неопубликованные архивные документальные материалы.
Значительную по объему группу опубликованных источников представляют собой законодательные акты Российской империи. Особый интерес в этой связи представляет «Полное собрание законов Российской империи».
Ценным источником для изучения общественного и административного устройства Калмыцкой степи являются Монголо-ойратские законы «Их цааз» (Великое уложение).1 Принятые в 1640 году на съезде монгольских, ойратских и калмыцких правителей законы дают картину сложных взаимоотношений в кочевом обществе.
1 См.: Их Цааз (Великое уложение). Памятник монгольского феодального права 17 в. — М.. «Наука».-1981.
Богатый и фактически не введенный в науку материал хранится в архивах. На сегодняшний день в этом отношении самыми крупными хранилищами остаются Национальный архив Республики Калмыкия (НАРК) и Архив внешней политики российской империи министерства иностранных дел Российской Федерации (АВПРИ).
Указанные архивы являются на сегодняшний день вполне достаточным и надежным источником для изучения узловых проблем политико-правовой истории Калмыцкой степи и развития русско-калмыцких отношений в 1771—1847 гг. По интересующему периоду нами выявлены и изучены более 300 дел.
Хронологические рамки исследования охватывают период в истории калмыцкой государственности и права с 1771 года до середины XIX века. Это период кризиса национальной государственности, поиска новых форм управления данной окраиной. Период начинается откочевкой большей части калмыков из пределов России. После чего рескриптом Екатерины II Калмыцкое ханство было ликвидировано.
Начался новый этап в истории калмыцкого народа, который заканчивается в первой половине следующего столетия. На протяжении последней трети XVIII — первой половины XIX вв. происходил интенсивный процесс реорганизации системы управления калмыцкими кочевьями. Завершающий этап характеризуется административными реформами второй четверти XIX века, что свидетельствовало об активном процессе введения данного региона в общероссийскую систему управления, о включении калмыцкого народа в правовую систему Российского государства.
Территориальные рамки исследования охватывают Калмыцкое ханство, т. е. современные территории Республики Калмыкия, некоторых частей Ставропольского края и Астраханской области.
Методологическая база исследования. В процессе исследования автор руководствовался диалектическим методом научного познания, предполагающим исследование всех процессов и явлений в их развитии, взаимосвязи и взаимообусловленности. Использовались также систем-
ный,, сравнительно-правовой, исторический, структурно-функциональный и Другие, методы познания, а также принципы единства исторического и логического, абстрактного и конкретного. Это дало возможность рассматривать проблему включения калмыцких кочевий в состав империи в связи с особенностями социальной организации калмыцкого народа, а также с развитием российской государственности и права.
Научная новизна диссертации определяется:
Во-первых, тем, что при рассмотрении вопроса управления калмыками как составной части российских инородцев впервые сделан акцент на политико-правовые аспекты, на основании чего проанализированы правовые процессы формирования правительственной политики по отношению к калмыцкому народу;
Во-вторых, впервые вопросы о характере социальной организации, государственности и права калмыков рассматриваются через их отражение в древних законодательных памятниках — кодексе «Цааджи— Бичик», законах Дондук-Даши;
В-третьих, работа построена на основе архивных источников, впервые вводимых в научный оборот.
Научно-практическая значимость работы. Выводы, представленные автором в диссертационной работе, могут быть использованы в дальнейших научных исследованиях проблем истории и теории государства и права, в учебном процессе, а также в решении практических задач современного государственно-правового устройства Республики Калмыкия и других субъектов РФ.
На защиту выносятся следующие положения:
1. Становление системы государственного управления в Калмыкии проходило на основе гибкого применения общегосударственных подходов и политико-правовых институтов в сочетании с национальными особенностями и с учетом сложившейся системы традиционного управления и обычаев калмыцкого народа.
2. Концептуально генезис государственного управления в Калмыкии выражался в создании вертикали власти: «центр-регион» (правительство - губернатор — подразделения по калмыцким делам: Экспедиция, канцелярия, правление, действующие под руководством губернатора).
3. Система органов государственного управления в Калмыкии строилась на сочетании опыта деятельности учреждений, доказавших жизнеспособность в других регионах страны и особенностей данной окраины, что обеспечивалось законодательным закреплением без нарушения общих принципов, ориентированных на формирование централизованной системы управления от уровня имперского центра до уровня региона с включением в нее всех звеньев управления Калмыкии.
4. Четко выраженной правовой политики управления Калмыкией выработано не было, хотя верховная власть учитывала региональные особенности Калмыкии, придавая им статус системообразующих факторов при разработке законодательства в области государственного управления регионом.
В качестве фактора, определяющего особенности становления системы и организации государственного управления в регионе, выступал социальный состав местного населения, который имел существенные отличия в этническом и податном отношениях, а также в правовом сознании от населения внутренних губерний России.
5. Современный институт представителей президента в субъектах Российской Федерации берет свое начало с практики наместников, широко используемой царским правительством в национальных окраинах, в том числе и в Калмыкии. Однако этот институт в условиях Калмыкии не оправдал себя и был заменен губернским правлением.
6. Царское правительство в ходе введения Калмыкии в систему государственного управления России гибко использовало национальный фактор, создавая благоприятные условия для проживания и хозяйственной деятельности, что нашло отражение в нормативно-правовых актах, использовавших обычное право и отдельные положения древних
калмыцких законов, в признании традиционных систем управления, включении калмыков в систему местного управления.
Апробация работы. Основные положения работы были отражены в выступлениях автора на республиканских научно-практических конференциях («Актуальные проблемы экономики, истории, права Калмыкии» - Элиста, 2001; «Образование и развитие многонационального государства в России: сущность, формы и значение» — Элиста, 2002), а также изложены в ряде статей.
Структура работы подчинена ее главной исследовательской задаче. Диссертация состоит из трех глав, введения и заключения.
СОДЕРЖАНИЕ РАБОТЫ
Во введении обоснована актуальность темы, охарактеризован уровень научной разработанности, раскрыта научная новизна, представлены основные положения, выносимые на защиту.
Глава первая «Нормативно-правовой статус калмыков до официального вхождения в состав России» состоит из двух параграфов.
Первый параграф «Договорные отношения калмыков на российской территории до откочевки 1771 г.» отражает процесс вхождения калмыцкого народа с начала XVII в. до 70-х годов XVIII в. в состав России, характеризует особенности правового положения кочевников.
Процесс развития взаимоотношений России с калмыками и принятия ими российского подданства был многоэтапным и длительным.
Начальный этап характеризуется обоюдным поиском взаимоприемлемых условий в установлении официальных отношений, оформленных нормативно-правовыми актами. Этот этап охватывает значительное время — с 1607—1609 гг. (первые официальные связи на уровне городов и улусов, аудиенция калмыцких послов у российского царя Василия Шуйского, первые официальные грамоты) и до середины 1650-х годов, когда еще не были установлены четкие договорные отношения. Этот период можно охарактеризовать как начало процесса добровольного вхождения калмыков в состав Российского государства,
но не как одномоментный акт оформления принятия добровольного подданства калмыками.
Проводя политику по приведению инородцев в свое подданство, царская администрация, прежде всего, преследовала следующие цели: обеспечение безопасности государственных границ, развитие торговли и экономики (включая выгоду от дани).
В рамках периода возникновения и развития российско-калмыцких отношений прослеживаются два этапа. С 1607 г. и до начала 1620-х годов проявляются обоюдная заинтересованность, стремление оформить устанавливавшиеся отношения официальными государственными актами, подкрепить дипломатическими связями (обмен посланниками). В Жалованных грамотах Михаила Федоровича (1618 и 1620 гг.), данных калмыцким тайшам, выражено уважительное отношение со стороны российских властей к ним, гарантировано покровительство, а калмыки в свою очередь - верную службу.
Следовательно, с самого начала установления официальных отношений России с калмыками они строились на договорных принципах — самостоятельности отдельных калмыцких кочевий внутри Российского государства. Но, начиная с 1620-х годов, царские власти стремятся изменить правовой статус калмыков, принимавших русское подданство, до уровня сюзеренитета — царь, воевода, тайша.
Во второй половине XVII в., как известно, продолжался процесс укрепления Российского государства как единого и централизованного. В этих условиях постепенно вносились изменения в правовое положение национальных районов России. Если ранее заключаемые договорные акты оформляли, уточняли и закрепляли принятие калмыками российского подданства, то шертная запись 1677 г. вносила принципиальные изменения не только в отношении обеих сторон, но и в правовой статус Калмыцкого ханства. Впервые в документе указывалось, что Калмыкия вступает в «совершенное повиновение Российской Державе», и ее
правитель будет «грамоты принимать, встав и сняв шапку, с великою честию».1
Хотя с военной точки зрения царская администрация была заинтересована в едином и сильном ханстве, тем не менее не очень-то желала иметь вассала, пытавшегося вести независимую политику и даже пользовавшегося определенным влиянием на международной арене.
Поэтому правительство, во-первых, не препятствовало откочевке некоторых калмыцких улусов на новые места, а иногда этому способствовало (уход, например, части калмыков в 1690 г. на Дон)1, во-вторых, стремилось создать благоприятные правовые условия для перехода калмыков в православие.
Следующим шагом правительства, направленным на включение Калмыкии в систему единоуправляемости Российского государства, в овладении ситуации в ней, стало установление контроля за действиями правителей ханства. По инструкции Коллегии иностранных дел 1715 г. в Калмыцком ханстве формируется полномочный представительный орган центральной администрации — Калмыцкие дела, входящие в систему исполнительной власти (сначала это Коллегия иностранных дел, позднее — астраханский губернатор) с функциями административного и ' надзирательного характера.
В 30-е годы XVIII в. произошли принципиальные изменения в русско-калмыцких взаимоотношениях: отныне правителю Калмыкии ханский титул присваивался российским императором, а это свидетельствовало о том, что Калмыкия с этого периода стала в полном юридическом смысле неотъемлемой и составной частью России.
В условиях абсолютной монархии в России власть калмыцкого правителя становилась все более формальной. Если до начала XVIII в. воеводы не вмешивались во внутренние дела калмыков, выступая лишь посредниками в установлении их отношений с центральной властью, то астраханские губернаторы (1708-1771 гг.), представители российского
1 Там же. Т.2. № 672. С. 80, 84.
правительства при ханах (1715-1771 гг.) жестко контролировали и активно вмешивались во внутренние дела ханства, определяя кадровую политику высшего звена.
Второй параграф — «Социальная структура калмыцкого народа» рассматривает правовое положение основных сословных категорий калмыцкого общества и их эволюцию в XVIII—XIX вв.
Социальные отношения в калмыцком обществе в XVIII в. носили отчетливо выраженный феодальный характер, хотя и с пережитками дофеодального, патриархально-родового строя. Феодальная собственность на землю составляла основу общественных отношений у калмыков.
Источники свидетельствуют, что калмыцкое общество и в XVIII в. делилось на два основных класса: класс светских и церковных феодалов и класс феодально-зависимых кочевников.
Калмыцкое ханство не имело развитого государственного аппарата. Формально власть калмыцкого хана в делах внутреннего управления была неограниченной. Фактически же его прерогативы зачастую подрывались сепаратизмом тайшей.
Что касается гражданского управления и суда, то здесь защищались неприкосновенность феодальной собственности на землю, равно как и другие права и привилегии феодалов.
По новому положению о Зарго (старое положение действовало с 1640 г.), вступившему в силу 12 августа 1762 г., суд состоял из нойонов, представлявших все калмыцкие улусы, а не только один ханский. Состав Зарго отныне (1762 г.) подлежал утверждению российского правитель-тва. Все дела в Зарго должны были решаться по большинству голосов, причем хан, в случае своего несогласия, уже не мог единолично своей властью отменить вынесенное постановление, а должен был просить у российских властей разрешения на его отмену или изменение.
1 См.: Батмаев М.М. Калмыки в XVII-VIII вв. События, люди, быт. В 2 т. Элиста, 1993. С. 171-173.
Законы Дондук-Даши в известной мере раскрывают картину внутренней жизни калмыков второй половины XVII в. В них сказалось и влияние российского законодательства. В новых законах, например, независимо от штрафа скотом и наряду с ним введены телесное наказание и денежный штраф. Эти узаконения свидетельствуют не только о влиянии российского права, но и о тех внутренних изменениях, которые претерпело калмыцкое общество, находясь в составе России. В новых законах, в частности, отразилось развитие товарно-денежных отношений, усиление роли и значение денег в жизни калмыков.
Фактически же реорганизованное Зарго мало напоминало ханский суд, оно превращалось в государственное учреждение с определенным штатом чиновников, составом, утверждавшимся российскими властями и получавшим государственное жалованье. В своей деятельности калмыцкий суд был подотчетен Коллегии иностранных дел.
К середине XVIII в. Калмыцкое ханство переживает глубокий кризис. Царское правительство, с целью ослабить местные институты власти в ханстве, в 1741 г. вводит институт наместника ханства. Следствием этого явилось дальнейшее обострение отношений между калмыцкой знатью и царской администрацией.
Последовавшее в 1758 г. утверждение калмыцкого правителя в статусе хана не способствовало политической стабилизации в данном регионе. Политический кризис Калмыцкого ханства вылился в откочевку наместника Убаши из России.
Таким образом, в течение почти столетия правовая политика царского правительства по отношению к калмыцкому народу была для него в общем благоприятной. Им была пожалована обширная территория для кочевания в избранных ими районах Нижнего Поволжья, они получили неограниченные возможности для обмена излишков своего производства на продукты земледелия и русской промышленности, им гарантировалась защита от внешних недругов и полное невмешательство во взаимоотношения степной знати с калмыками-простолюдинами.
Вхождение Калмыкии в состав России отвечало интересам рядовых калмыков, обеспечивало им более или менее устойчивые условия для жизни и хозяйствования. Благоприятная в общем политика российских властей была главной причиной провала неоднократно предпринимавшихся ханами Джунгарии попыток убедить калмыцких тайшей вернуться на прародину, оставленную ими в начале XVII в.1
Реорганизация Зарго, поощрение перехода калмыков в православие, вмешательство российских властей в выборы ханов и наместников — все это свидетельствовало о стремлении царского правительства ослабить значение калмыцких ханов, превратить нойонов и зайсангов в правительственных чиновников. Принять такую политику калмыцкая знать не хотела. В этих условиях в ее среде зародилась идея об откочевке из пределов России и возвращения в Джунгарию. Немалое влияние оказывали и высшие иерархи ламаистской церкви Тибета.
Общественный и государственный строй Калмыцкого ханства в России в XVIII в., как свидетельствуют источники, в основном продолжал соответствовать общественному и государственному строю Джунгарского ханства. Однако, сравнивая их в этом отношении, следует отметить и существенное различие: Калмыцкое ханство находилось в составе другого государства и являлось зависимым. И, если можно назвать несколько одинаковыми принципы и механизмы их государственного управления, то суть управления, круг и характер рассматриваемых и решаемых вопросов отличались. Калмыцкое ханство, как и Джунгарское, возглавлял хан и руководство в государстве осуществлял с помощью коллегиального органа Зарго, которое было наделено полномочиями как высшего судебного, так и исполнительного учреждения. Но в своей деятельности Зарго был подотчетен Коллегии иностранных дел Российской империи, ведавшей международными делами.
Вторая глава носит название «Правовое регулирование вводимых форм управления калмыцких кочевий в 1771-1801 гг.» и состоит из двух параграфов.
1 См.: Очерки и истории калмыцкой АССР. Дооктябрьский период. - С. 212
В первом параграфе «Введение губернского управления» рассматривается процесс становления института губернского правления.
Уход наместника Убаши с частью подвластного ему народа застиг российское правительство врасплох. Губернские власти также не были готовы к состоявшейся откочевке калмыков. Сознавая необходимость решительных действий, царское правительство ввело на территории кочевий прямое губернское правление. Это можно считать историко-правовыми корнями сформированного ныне института прямого президентского правления в субъектах РФ.
Назначение «главным над калмыцкими владельцами» Дондукова, человека, не пользовавшегося признанием калмыков, было со стороны правительства ошибочным. Оно не только не способствовало установлению удовлетворительных отношений губернской администрации с калмыцким народом, но и вызвало волну негодования знатных нойонов.
Промедление царского правительства в вопросе определения статуса оставшихся калмыков в составе России объяснимо его надеждой на возвращение наместника с его подвластными. Поэтому не случайно границы государства долгое время (до октября 1771 г.) оставались открытыми для возвращающихся калмыков.
Откочевка Убаши представила российскому правительству возможность установления прямого механизма управления оставшимися его подвластными. В этой связи особое внимание российских властей было обращено на астраханскую губернию — крупную по тем временам административно-территориальную единицу с. достаточно сильным чиновничьим аппаратом, где ключевую роль играл губернатор.
Именно губернатор был в состоянии взять на себя функции надзора, управления и судопроизводства над кочевниками губернии, чтобы вывести их из состояния «дикости».
Учрежденная при канцелярии губернатора Экспедиция калмыцких дел снимала, по мнению Екатерины II, вопрос о создании некоего исполнительно-распорядительного органа для управления калмыками.
Более целесообразным, на взгляд императрицы, было иметь ему при себе трех зайсангов (имеется в виду суд Зарго).
Рескрипт Екатерины II от 19 октября 1771 г. свидетельствовал об изменении правовой политики российского государства по отношению к калмыкам. Цель такой политики состояла в приведении данных кочевников «... в несумненное для России и полезное ей состояние».1 Изменилось правовое положение астраханского губернатора. Он становится доверенным лицом императрицы и надежным защитником государственных интересов в степях Нижней Волги. Именно к нему, минуя многие центральные органы управления, Екатерина II будет обращаться с рескриптами. При открывшихся вследствие откочевки калмыцкого наместника обстоятельствах императрица рекомендовала Бекетову как прямо, так и завуалировано предпринять все для окончательного уничтожения даже мысли у калмыков о возможности восстановления былой государственности.
Второй параграф главы носит название «Правовые основы деятельности Экспедиции калмыцких дел (1771—1786 гг.), калмыцкой канцелярии и калмыцкого правления (1788-1801 гг.)».
Стремясь использовать в государственных интересах взаимоотношения кочевых народов, населявших территорию Астраханского края, и держать их под своим контролем, российские власти пытались достичь этого через губернатора. Губернатор, как правило, выступал посредником в отношениях между калмыками и казахами, черкесами, туркменами и другими народами.
Учреждение Кавказского наместничества и включение в его состав Астраханской губернии привело к изменениям в управлении кочующими здесь калмыками. Прежде всего в 1786 г. вместо Экспедиции была учреждена войсковая канцелярия, которая была призвана осуществлять управление, а вернее, командование калмыками как иррегулярным войском. Такая практика не прижилась и в 1788 г. канцелярию переименовали в калмыцкую, изменив тем самым цели и функции ведомства.
1 АВПРИ. Ф. 119. оп. 2. Д.37. л. 60.
Калмыцкая канцелярия являлась более самостоятельным учреждением, нежели Экспедиция. Осуществляя административный контроль над калмыками, канцелярия не просто выполняла приказы губернатора, а рассматривала «предложения» вышестоящих инстанций с целью принятия более приемлемых для подведомственного ей народа решений.
В целом, перед калмыцкой канцелярией стояли те же задачи, что и перед Экспедицией. Во-первых, предпринимались попытки проведения переписи кочевого населения. Ввиду сложностей при выполнении этой задачи из-за постоянных перемещений калмыков, новому ведомству не удалось завершить перепись даже поулусно. Хотя это было одним из самых серьезных сдвигов в решении общей задачи не только по овладению ситуацией в кочевьях, но и по установлению всеобъемлющего контроля над ними.
Третья глава — «Наместничество и установление попечительской системы управления Калмыкией (1801—1847 гг.)» состоит из двух параграфов.
В первом параграфе «Положение о наместничестве и правовое оформление приставства» отражены изменения в системе управления Калмыкией в первой четверти XIX в.
Восстановление наместничества не дало ожидаемых царским правительством результатов. Причины неудачного восстановления наместничества следует, по нашему мнению, искать не только во взаимоотношениях российских властей с кочевым народом, но и в обстановке, сложившейся внутри самого калмыцкого общества. Первая группа причин представлена прежде всего отсутствием у российского правительства четкой национальной политики по отношению к калмыкам, стремлением имперских властей во что бы-то ни стало ввести кочевой народ в систему государственного управления. Этим объясняются как ограничения, так и тактические уступки национальной власти в лице наместника и Зарго, что зачастую вводило в заблуждение политические группировки калмыцкой знати, по прежнему стремившихся к установлению национальны« институтов власти.
Вторая причина - противоречивое состояние калмыцкого общества, которое привело к обострению из-за политических разногласий во взаимоотношениях дербетов и торгоутов, отсутствия единства среди самих дербетов. К тому же наместник не мог являться проводником российской политики в кочевьях, так как не пользовался достаточным авторитетом среди калмыцких владельцев.
Преобразования, происходившие в России в первой четверти XIX в., побудили царское правительство в интересах более полного экономического и политического контроля народов окраин выработать систему управления, целью которой должно было стать унифицирование их социально-экономического и политического строя.
Попытки введения единой системы управления осуществлялись постепенно. Российское правительство преследовало цель разработать такую систему управления инородцами, суть которой сводилась бы к дальнейшему ограничению политической самостоятельности калмыцких феодалов и подчинению их деятельности непрестанному надзору царских чиновников. Впоследствии это нашло отражение в законодательных актах. Одним из таких документов был Указ Александра I от 10 марта 1825 г., утвердивший «Правила для управления калмыцкого народа».
Итак, после временного восстановления наместничества калмыцкие кочевья подверглись переустройству в соответствии с основными принципами проведенной реформы управления народами Сибири и инородцами, в результате чего Калмыкия влилась в единую централизованную систему административно-территориального устройства страны на правах особой области. Правила 1825 года установили правовое положение Калмыкии, определили основы взаимоотношений Калмыкии с органами государственного управления России, Астраханской губернии и Кавказского края и наряду с обычным правом, действовавшим среди калмыков, заложили основы новой правовой системы Калмыкии -гражданское право, уголовное право и процесс, а также установили систему судебных органов.
Второй параграф главы носит название «Попечительская система управления Калмыкии в середине XIX в.».
Учитывая исторические традиции самостоятельности калмыцкого народа, фактическое его хозяйственное положение, состояние судоустройства и судопроизводства, российские власти в тридцатые годы решили ввести новую систему управления и принять новый документ, определяющий правовой статус Калмыкии. Таким нормативным актом явилось «Положение об управлении калмыцким народом»1, принятое Государственным советом и утвержденное 24 ноября 1834 г. императором Николаем I.
«Положение» 1834 г. закрепило основные черты политического и общественного строя Калмыкии, оказавшиеся достаточно стабильными вплоть до 1860-х годов. Принятые в последующем нормативные документы в основном его дополняли и развивали, внося изменения в организацию управления.
Первое такое изменение произошло в 1838 г. в связи с образованием 26 декабря 1837 г. Министерства государственных имуществ.
Основной задачей министерства было управление казенными землями и передача ему управления национальными окраинами из МВД.
С течением времени был постепенно выработан социально-правовой статус всех категорий калмыцкого крестьянства, означавший для них уравнение в правах с разными сословиями податного населения России.
Особый след в истории Калмыкии XIX в. оставило «Положение об управлении калмыцким народом», одобренное Государственным советом и утвержденное 23 апреля 1847 г. высочайшим указом Николая I.
«Положение» 1847 г. впервые в условиях России ввело в Калмыкии систему местных органов самоуправления — улусные и аймачные сходы, которые по составу и принципам действия более всего напоминали институты сословно-представительных органов, формируемых исключительно на основе цензового представительства.
1 ПСЗ Российской империи. 1 отд. Т. 22. № 21144. - С. 349 - 372.
Сама система «попечительства» в отношении калмыков превратилась в строгую государственную опеку через центральные и местные (губернские) государственные органы путем бюрократизации и монополизации управления и контроля, регламентации всей сферы жизни калмыков.
В заключении подведены основные итоги исследования, сделаны выводы^ связанные с особенностями процесса введения Калмыкии в общегосударственную систему управления России, намечены дальнейшие пути исследования темы.
По теме диссертации опубликованы следующие работы:
1. Очир-Гаряева И.К. О некоторых историографических аспектах вопроса управления Калмыкией во И-ой четверти XIX в. II Вестник Калмыцкого университета. 2000. № 1. С. 35—41—0,44.
2. Очир-Гаряева И.К. Система управления Калмыкией в первой половине XIX века: историографические аспекты // Актуальные проблемы экономики, истории, права Калмыкии. — Элиста, 2001. С. 25—33. — 0,56.
3. Очир-Гаряева И.К. Система управления Калмыкии во второй четверти XIX в. // Образование и развитие многонационального государства в России: сущность, формы и значения. Материалы российской научной конференции (25-26 октября 2002 г.). - Элиста: КалмГУ, 2002. С. 170-176.-0,43.
4. Очир-Гаряева И. К. Деятельность Калмыцкого Зарго в первой половине XIX века // Конституционный строй и конституционализм в России: история и современное состояние. Материалы межвузовской научно-практической конференции. — М., 2005. С. 66-78. — 0,75
5. Очир — Горяева И. К. Законодательное восстановление наместничества в Калмыкии (1801 - 1803) // Закон и право. 2006. № 10. -С. 87-88. - 0,4.
Изд. лиц. № 05322 от 09.07.2001 Сдано в набор 01.11.06. Формат 60x90/16 Бумага офсетная № 1. Гарнитура «Times». Объем 1,3 печ. л. Тираж 100 экз. Заказ № 37
Отпечатано в издательстве «Готика» Тел.: (495) 268-53-73 e-mail: Eotika@rambler.ru
Содержание диссертации, доктора биологических наук, Самбук, Елена Викторовна
Список использованных сокращений.
ВВЕДЕНИЕ.
Глава I. Генетический контроль метаболизма углерода, азота и фосфора у дрожжей Saccharomyces cerevisiae (Обзор литературы).
1.1. Генетические механизмы регуляции метаболических путей и принципы построения регуляторных моделей у эукариот.
1.2. Метаболизм углерода и генетические механизмы, обеспечивающие адаптацию клеток дрожжей S. cerevisiae к наличию и отсутствию глюкозы в среде.
1.2.1. Транспорт глюкозы и пути переноса сигнала о наличии глюкозы в среде.
1.2.1.1. Семейство генов НХТ и регуляция их транскрипции.
1.2.1.2. Система мембранных рецепторов глюкозы, взаимодействующих с ГТФ - связывающими белками.
1.2.2. Генетический контроль глюкозной индукции генов, кодирующих ферменты гликолиза.
1.2.3. Генетический контроль регуляции глюкозной репрессии.
1.2.3.1.Репрессор Miglp.
1.2.3.2. Структура и функции регуляторного комплекса SNF1.
1.2.3.3. Регуляция экспрессии гена ADH2, кодирующего структуру алкогольдегидрогеназы.
1.2.3.4. Регуляция транскрипции генов, кодирующих ферменты цикла Кребса.
1.3. Генетический контроль метаболизма азота у дрожжей Saccharomyces cerevisiae.
1.3.1. Роль источников азота в регуляции продолжительности стадий клеточного цикла у дрожжей S. cerevisiae.
1.3.2. Центральный путь азотного метаболизма у дрожжей.
1.3.3. Генетический контроль регуляции основных ферментов азотного метаболизма.
1.3.3.1. Регуляция транскрипции GLN1.
1.3.3.2. Регуляция транскрипции GDH1.
1.3.3.3. Регуляция транскрипции GDH2.
1.3.3.4. Регуляция транскрипции GLT1.
1.3.4. Генетический контроль азотной катаболитной репрессии.
1.3.4.1. Белки- регуляторы азотного метаболизма.
1.3.5. Пути передачи информации о количестве и качестве источника азота в среде у дрожжей.
1.3.5.1. Филаментозный рост у дрожжей-сахаромицетов - как пример генетического контроля формирования адаптивных модификаций.
1.3.5.2. Система, воспринимающая пищевые сигналы (SPS).
1.3.5.3. Дискриминационный путь.
1.3.6. Генетический контроль утилизации пролина.
1.4. Генетический контроль метаболизма фосфора у дрожжей
S. cerevisiae.
1.4.1. Метаболизм фосфора у дрожжей.
1.4.2. Биохимическая характеристика КФ.
1.4.3. Генетический контроль регуляции кислых фосфатаз дрожжей ПГЛ.
1.4.3.1. Генетический контроль синтеза КФ1.
1.4.3.2. Генетический контроль синтеза КФ2 и КФЗ.
1.4.4. Механизмы мембранного транспорта Ф„ у дрожжей.
1.4.5. Пути передачи сигнала о концентрации фосфата.
1.4.6. Регуляторные белки регулона РНО.
1.4.6.1. Позитивные регуляторы.
1.4.6.2. Негативные регуляторы.
1.4.6.3. Модель регуляции экспрессии генов регулона
Глава II. Материалы и методы
2.1. Основные обозначения.
2. 2. Основные штаммы и условия их культивирования.
2. 2.1. Штаммы и плазмиды.
2. 2. 2. Условия культивирования штаммов.
2.3. Методы
2.3.1.Генетические методики.
2.3.2. Биохимические методики.
2.3.2.1.Определение активности кислых фосфатаз.
2.3.2.2. Качественное определение уровня гликогена.
2.3.2.3.Определение активности р - галактозидазы у дрожжей.
2.3.2.4. Приготовление экстракта белков дрожжей S. cerevisiae.
2.3.2.5. Гибридизация белков с фрагментом промотора гена CIT1.
2.3.2.6. Выделение и очистка тропомиозина в составе фракции термостабильных белков.
2.3.3. Цитологические методики
2.3.3.1. Визуализация митДНК с помощью DAPI.
2.3.3.2. Окраска дрожжей родамин - фаллоидином.
2.3.3.3. Получение и обработка цифровых изображений.
2.3.4. Молекулярно-биологические методики
2.3.4.1. ПЦР с праймерами к гену РН085.
2.3.4.2. Секвенирование фрагментов ДНК.
2.3.5. Статистическая обработка результатов.
Глава III. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ
3.1. Структурно-функциональная характеристика киназы Pho85p и генетический анализ плейотропных эффектов мутацийpho85.
3.1.1. Установление аллельности генов АСР82 иРН085.
3.1.2. Фенотипическая характеристика мутантовpho85.
3.1.3. Структурно - функциональный анализ мутацийpho85.
3.1.4. Поиск генов, кодирующих шапероны комплекса Pho85p-Pho80p.
3.1.4.1. Генетический анализ спонтанных супрессорных мутаций, подавляющих проявлениеpho85-3 иpho85-7.
3.1.4.2. Рекомбинационный тест мутаций DSP.
3.1.5. Генетический анализ плейотропных эффектов мутаций pho85.
3.1.5.1. Генетическая нестабильность ядерного и митохондриального геномов - новый плейотропный эффект мутаций pho85.
3.1.5.1.1. Определение количества генов, в которых возникают мутации ts на фоне дизрупции гена РН085.
3.1.5.1.2. Влияние дизрупции гена РН085 на распределение митохондриальных нуклеоидов между материнской клеткой и почкой.
3.1.5.1.3. Влияние дизрупции РН085 на структуру цитоскелета.
3.1.5.1.4. Влияние дизрупции РН085 на спектр термостабильных белков.
3.2. Поиск регуляторных путей, связывающих метаболизм азота и фосфора у дрожжей.
3.2.1. Изучение роста мутантов pho на средах с различными источниками азота.
3.2.2. Генетический анализ признака Pro' - "неспособность к утилизации пролина".
3.2.3. Влияние мутаций pho85 на транспорт пролина.
3.2.4. Влияние мутаций pho4 на рост pho85 мутантов на среде с пролином.
3.2.5. Анализ нуклеотидных последовательностей промоторов генов катаболизма пролина.
3.3. Поиск регуляторных путей, связывающих метаболизм углерода и фосфора у дрожжей S. cerevisiae.
3.3.1.Определение зависимости экспрессии гена CIT1 от концентрации фосфата и дизрупции гена РН085.
3.3.2. .Поиск белков, взаимодействующих с областью промотора гена CIT1, ответственной за глюкозную репрессию.
3.4. Зависимость экспрессии гена HSP82, кодирующего структуру белка-шаперона от концентрации фосфата в среде и мутаций в генах РНО.
3.4.1. Получение изогенных CSG55 штаммов с мутациями в генах РНО и их генетический анализ.
3.4.2. Влияние концентрации фосфата и мутаций в генах РНО на транскрипцию HSP82.
3.5. Идентификация ортолога гена РН085 дрожжей Pichia pas tor is.
3.5.1. Получение штаммов с дизрупцией гена РН085 у дрожжей
P. pas tor is.
3.5.2. Изучение фенотипического проявления дизрупции в гене РН085Рр.
3.5.3. Изучение функций ортологов Pho85p у представителей разных эволюционных групп.
Глава IV. Роль фосфопротеинкиназ Pho85p, Snflp, Tori,2 в реализации закона лимитирующего фактора у дрожжей (Заключение).
4.1. Координация метаболизма в ответ на лимитирующий фактор.
4.1.1. Координация метаболизма при азотном голодании.
4.1.1.2. Изменения метаболизма углерода в ответ на недостаток азота.
4.1.1.3. Недостаток азота и метаболизм фосфора.
4.1.2. Координация метаболизма при недостатке источника углерода.
4.1.2.1. Глюкозное голодание и метаболизм азота.
4.1.2.2. Глюкозное голодание и метаболизм фосфора.
5.1.3. Координация метаболизма при недостатке фосфора.
5.1.3.1. Недостаток фосфата и метаболизм азота.
5.1.3.2. Недостаток фосфата и метаболизм углерода.
5.2. Влияние лимитирующего фактора на клеточный цикл.
5.3. Лимитирующий фактор и его роль в формировании « адаптивных» мутаций.
ВЫВОДЫ.
Введение Диссертация по биологии, на тему "Генетический контроль координированной регуляции метаболизма основных биогенных элементов у дрожжей Saccharomyces cerevisiae"
Актуальность исследования. Изучение генетических механизмов, лежащих в основе координированной регуляции метаболизма основных биогенных элементов, является фундаментальной проблемой биологии. Ее решение позволит подойти к пониманию принципов, лежащих в основе самоорганизации живых систем и регуляции адаптивной нормы клетки.
Совокупность биохимических реакций в отдельной клетке и в многоклеточном организме обеспечивает постоянство внутренней среды -гомеостаз. Именно гомеостаз является одной из причин стабильности фенотипа. Его поддержание гарантируется генетическими и биохимическими механизмами, возникшими в ходе эволюции.
Важную роль в поддержании гомеостаза играют системы регуляторных сетей, координирующих сигналы, поступающие из внешней среды, с ответом клетки, который выражается в дифференциальной активности генов, корректировке скорости биохимических реакций, высокой или замедленной скорости клеточных делений, повышении или понижении частоты спонтанных мутаций, развитии или программированной гибели организма. Координированный ответ на внешние воздействия ведет к формированию адаптивных модификаций, «реакции клеток и организма на изменения условий среды, которые неоднократно действовали на организм в ходе эволюции. Все они в пределах нормы реакции, заданной генотипом» (Инге-Вечтомов, 1989).
Проблема координированного ответа живых организмов на изменение характера питания издавна привлекает внимание исследователей. В 1840 году Юстус Либих открыл закон лимитирующего фактора: "Веществом, находящимся в минимуме, управляется урожай и определяется величина и устойчивость последнего во времени" (цит. по Одум, 1975). Этот закон широко используется в экологических и агрохимических исследованиях, а в настоящее время особенно актуален в промышленной микробиологии - в связи с развитием производства гетерологичиых белков генетически модифицированными микроорганизмами.
Согласно закону, если в среде не хватает нескольких компонентов, лимитирующим является только одно вещество. Таким образом, именно один лимитирующий фактор контролирует в данный момент практически все стороны жизнедеятельности организма и направляет работу многих генных сетей. Сигнал о лимитирующем факторе должен быть воспринят всеми возможными мишенями, и метаболизм клетки соответствующим образом скорректирован.
Важнейшую роль в передаче информации об изменении состава среды играют фосфопротеинкиназы и фосфатазы, так как именно они обеспечивают быстрый ответ клетки, не требующий синтеза белка de novo. Дополнительной возможностью для координированной экспрессии ключевых генов разных метаболических путей является вовлечение в их регуляцию различных транскрипционных факторов, что обеспечивает тонкую корректировку уровня транскрипции в зависимости от потребностей клетки. Механизмы, координирующие ответ на лимитирующий фактор, в настоящее время изучены недостаточно.
Дрожжи Saccharomyces cerevisiae являются наиболее подходящим объектом для изучения координированной регуляции метаболизма. Прекрасная генетическая изученность и доступность полной последовательности генома дрожжей предоставили уникальную возможность развития системного подхода, позволяющего понять, как действие и взаимодействие генов в геноме обеспечивают интегральный ответ клетки дрожжей на внешний фактор. В последние годы были развиты методы направленного генерирования мутаций (Delneri et al., 2001) и созданы новые технологии, позволяющие анализировать уровень всех иРНК организма (транскриптом), всех белков (протеом) и низкомолекулярных промежуточных соединений (метаболом). Использование сложных компьютерных программ для обработки различных баз данных позволяет понять структуру метаболических путей, рассчитать скорость потока метаболитов (Stafford a. Stephanopoulos, 2001), а также получать графические изображения генных и белковых взаимодействий.
Углерод, азот, кислород и фосфор - важнейшие элементы, используемые клеткой для производства биологических молекул. Недостаток любого из компонентов среды ведет к накоплению клетками гликогена и трегалозы, нарушению морфологии клеток, переходу их в стадию Go, резкому снижению количества рибосом, споруляции (Ferea et al, 1999; Konopka, 2000). Эти изменения можно рассматривать как адаптивную модификацию, реакцию на голод вообще, в основе которой лежит дифференциальная активность генов. Регуляция общего ответа осуществляется при участии протеинкиназы A (Roosen et al, 2005).
Наряду с общим ответом дрожжи формируют и специфический ответ, который определяется природой соответствующего компонента среды. Ведущую роль в этом случае играют специфические для каждого метаболического пути фосфопротеинкиназы - Snflp, Torl,2p, Pho85p (Schuller et al, 2003; Ter Schure et al, 2000; Oshima, 1997).
В настоящей работе был предпринят поиск генетических механизмов, координирующих ответ различных метаболических путей на лимитирующий фактор и управляющих формированием адаптивных модификаций.
Моделью, позволившей выявить связи между различными метаболическими путями, послужила кислая фосфатаза (КФ) дрожжей. Неспецифические КФ относятся к гидролитическим ферментам (фосфомоноэстеразам) и расположены в периплазматическом пространстве клетки. При взаимодействии с фосфоорганическими соединениями КФ расщепляют эфирную связь и высвобождают Фн (Boer a. Steyn-Parve, 1966; 1970).
Идея использовать КФ в качестве модели для изучения механизмов регуляции у дрожжей S. cerevisiae была выдвинута на кафедре генетики и селекции Ленинградского университета М.Н.Смирновым в 70-е годы прошлого века. С тех пор эта модель чрезвычайно популярна во многих лабораториях мира и в настоящее время является одной из самых изученных в генетическом отношении. В лаборатории биохимической генетики Биологического НИИ СПбГУ были изучены физико-химические свойства КФ (Падкина и др., 1974; Краснопевцева и др., 1979) и создана большая коллекция мутантов в регуляторных и структурных генах РНО, что и послужило основой для выполнения данной работы (Смирнов и др., 1974; Тер-Аванесян и др., 1974; Кожин, Самсонова, 1975; Самсонова и др., 1975).
Одним из подходов, который использовали в данной работе, стал анализ плейотропных эффектов мутаций в регуляторных генах, а также поиск новых мишеней регуляторных молекул системы РНО.
Цель и задачи работы. Целью наших исследований являлось изучение генетического контроля координированной регуляции метаболизма основных биогенных элементов у дрожжей Saccharomyces cerevisiae.
Основной задачей было выявление ключевых регуляторных факторов, способных функционировать в различных системах клетки и обеспечивать тонкую корректировку метаболизма и других процессов.
Поскольку в работе в качестве основного инструмента использовали систему регуляции репрессибельных КФ, то претендентами на роль белков, координирующих различные метаболические и клеточные процессы, явились регуляторные белки Pho4p и Pho85p. Идентификация новых мишеней этих регуляторных молекул позволила оценить их вклад в координированную регуляцию метаболизма углерода и азота, а также в поддержание стабильности генома.
Необходимым этапом работы явилась подробная характеристика циклинзависимой фосфопротеинкиназы (CDK- Cyclin Dependent Kinase) Pho85p, так как к началу нашей работы об ее функциях было известно очень мало. Это потребовало изучения плейотропных эффектов мутаций pho85, что привело к выявлению нового плейотропного эффекта - генетической нестабильности - ядерной и митохондриальной, вызванной такими мутациями.
Кроме того, задачей наших исследований являлся поиск и ортолога гена РН085 у дрожжей Pichia pastoris, широко используемых в биотехнологии и фенотипическая характеристика мутаций в этом гене.
Научная новизна состоит в том, что экспериментально установлено, что сигнальная трансдукция является связующим звеном в координации различных метаболических процессов и формировании модификационных и наследственных изменений в клетке.
Использование модели регуляции КФ дрожжей - сахаромицетов позволило впервые продемонстрировать важную роль циклин-зависимой фосфопротеинкиназы Pho85p и активатора Pho4p в координации экспрессии генов различных метаболических путей и осуществлении связи метаболизма фосфора, азота и углерода.
• Впервые показано, что белки Pho85p и Pho4p участвуют в глюкозной катаболитной репрессии гена CIT1, кодирующего цитратсинтазу -первый и лимитирующий фермент цикла Кребса (Падкина и др., 2003).
• Установлено влияние мутаций в генах РН085 и РН04 на катаболизм пролина, и, тем самым, впервые продемонстрирована генетическая связь между метаболизмами фосфора и азота (Попова и др., 2000).
• Выявлен важный плейотропный эффект мутаций в гене РН085 -повышенная генетическая нестабильность митохондриального и ядерного генома, что указывает на роль Pho85p в поддержании стабильности генетического материала клетки (Самбук и др., 2003; Самбук и др., 2005).
• Продемонстрировано влияние недостатка фосфата и мутаций в генах РНО на уровень экспрессии гена HSP82, кодирующего белок семейства Hsp90 (Самбук и др., 2002). Известно, что эти белки играют важную роль в формировании буферной системы, канализирующей процессы развития у эукариот и нарушение их функций выявляет скрытые ресурсы изменчивости.
• Проведен анализ последовательности ДНК pho85 у мутантов коллекции, что позволило идентифицировать мутации, приводящие к нарушению фолдинга киназы. Изучение спонтанных супрессоров мутаций pho85-7 и pho85-3 выявило доминантные супрессоры, тесно сцепленные с геном РН085, предположительно возникающие в гене EGD1, кодирующем структуру белка - шаперона (Самбук и др., 2003).
• Впервые идентифицирован ортолог гена РН085 у дрожжей Pichia pastoris и изучены плейотропные эффекты мутаций в этом гене (Падкина и др., 1998).
• Предложена модель регуляции координированного ответа клетки на лимитирующий фактор и формирования адаптаций в ответ на голодание по одному из лимитирующих факторов (Самбук, 2005).
Теоретическое и практическое значение работы Работа вносит существенный вклад в понимание механизмов координированной регуляции метаболизма и выявляет важную роль фосфорилирования белков в этом процессе. Полученные данные убедительно демонстрируют наличие генетической инфраструктуры в регуляции адаптивной нормы клетки и позволяют предложить возможный механизм ее реализации. Работа открывает новые перспективы для дальнейших исследований в этой области.
Результаты работы использованы при составлении магистерской программы «Молекулярная и медицинская биотехнология» на биолого-почвенном факультете, в практикумах и лекционных курсах, а также при выполнении исследовательских работ бакалаврами, магистрами, аспирантами биолого-почвенного факультета. Штаммы Pichia pastoris, созданные в данной работе, использовали для получения продуцентов биологически важных фармацевтических препаратов.
Положения, выносимые на защиту
1. Выбор клеткой стратегии ответа на лимитирующий фактор определяется конкуренцией между фосфопротеинкиназами, контролирующими метаболические пути. При этом общий ответ на голодание инициируется специфическим ответом.
2. Тонкая корректировка экспрессии генов, кодирующих ферменты различных метаболических путей, осуществляется регуляторными белками системы, соответствующей лимитирующему фактору.
Заключение Диссертация по теме "Генетика", Самбук, Елена Викторовна
выводы Картирование мутаций аср82 ПГЛ и анализ их фенотипического проявления показало, что ген АСР82 ПГЛ соответствует гену РН085.
2. Доказано, что признаки Ts и дыхательная некомпетентность не являются плейотропными эффектами мутаций pho85.
3. Обнаружено что, отсутствие киназы Pho85p приводит к нестабильности ядерного генома, в результате чего происходит накопление ядерных мутаций ts и pho4.
4. Показано, что дизрупция гена РН085 приводит к нестабильному распределению митохондриальных нуклеоидов между материнской клеткой и почкой, что является причиной высокой частоты появления клеток [rhoO].
5. Установлено, что дизрупция гена РН085 приводит к достоверному увеличению числа актиновых «заплат», что может свидетельствовать о нарушении структуры цитоскелета у мутантов pho85.
6. Идентифицированы гены, в которых возникают доминантные мутации, супрессирующие проявление миссенс-мутаций pho85-3, pho85-7. Один из них, ген DSP1, тесно сцеплен с РН085 (2,1 сМ) и, возможно, аналогичен гену EGD1, кодирующему белок-шаперон.
7. Впервые продемонстрировано участие белков-регуляторов Pho85p и Pho4p в регуляции транспорта и катаболизма пролина.
8. Впервые обнаружено влияние недостатка фосфата на уровень глюкозной катаболитной репрессии гена CIT1 и обнаружено, что белок - регулятор фосфатного метаболизма Pho85p способен корректировать экспрессию одного из генов метаболизма углерода.
9. Идентифицирован белок с мол. массой 34 кДа, который способен взаимодействовать с областью промотора гена CIT1 и участвовать в ослаблении глюкозной катаболитной репрессии гена С/77 в ответ на голодание по фосфату.
10. Удалось продемонстрировать зависимость экспрессии гена HSP82 от концентрации фосфата и показать, что мутации в генах РНОЗ, РН085 и РН04 влияют на уровень транскрипции гена HSP82.
11. Впервые получены штаммы дрожжей Pichia pastoris с дизрупцией гена РН085 и продемонстрирована зависимость фенотипических проявлений мутации pho85Pp от источника углерода.
12. Предложен принцип координированного ответа клетки на действие лимитирующего фактора.
Библиография Диссертация по биологии, доктора биологических наук, Самбук, Елена Викторовна, Санкт-Петербург
1. Айала Ф., Кайгер Дж. Современная генетика // М., Мир.- 1988.
2. Белова И.В., Самбук Е.В., Падкина М.В., Смирнов М.Н. Активаторы транскрипции Pho2 и Gcn4 в регуляции синтеза кислых фосфатаз у дрожжей Saccharomyces cerevisiae//Генетика.- 1992,- Т.28.- С.11-18.
3. Бельков В. В. Новые представления о молекулярных механизмах эволюции: стресс повышает генетическое разнообразие// Мол. Биол.-2002.- Т.36.- С. 277-285.
4. Гловер Д. Клонирование ДНК. Методы.// М.: "Мир".- 1988.- 538 с.
5. Гусев Н.Б., Богачева Н.В., Марстон С.Б. Структура и свойства малых белков теплового шока (sHsp) и их взаимодействие с белками цитоскелета//Биохимия.-2002.-Т. 67.-С.613-623.
6. Захаров И.А, Кожин С.А., Кожина Т.Н., Федорова И.В. Сборник методик по генетике дрожжей-сахаромицетов // Л.: Наука.-1984,- 112 с.
7. Захаров И.А., Мацелюх Б.П. Генетические карты микрорганизмов // Киев: Наукова Думка.- 1986.-252 с.
8. Инге-Вечтомов С.Г. Генетика с основами селекции // М.- Высш. Шк.-1989.- 591 с.
9. Калинин В.Л. Транскрипция и регуляция экспрессии генов // СПб. Изд-во СПбГТУ.- 2001.-246 с.
10. Кожин С.А., Самсонова М.Г. Генетико-биохимическое изучение кислых фосфатаз дрожжей Saccharomyces cerevisiae. Сообщение IV. Генетический контроль активности кислой фосфатазы 2 // Генетика.-1975.- T.XI.- С. 104-111.
11. Кожин С.А., Самсонова М.Г., Самбук Е.В. Изучение генетического контроля экспрессии генов, контролирующих синтез кислых фосфатаз у дрожжей // Исследования по генетике.- 1986.- Т. 10.- С. 41-52.
12. Кожин С.А., Тер-Аванесян М.Д. Сравнительная генетика неспецифических фосфомоноэстераз у микроорганизмов // Исследования по генетике.- 1979,- Вып. 8.- С.89-109.
13. Кулаев И.С. Биохимия молекулярных полифосфатов // М.: МГУ.-1975,-231 с.
14. Ленинджер А. Биохимия // 1974.- М.:«Мир».- 957 с.
15. Лучникова И.Л., Самбук Е.В., К.В.Останин, Падкина М.В. Изучение механизмов влияния тиамина на активность кф дрожжей // Тез. X Всесоюзного симпозиума "Структура и функции клеточного ядра".-Гродно.- 1990.- С. 66.
16. Маниатис Т., Фрич Э., Сэмбрук Д. Молекулярное клонирование // М.: Мир.- 1984.- 480с.
17. Миллер Д. Эксперименты в молекулярной генетике // М.: Мир.- 1976. 436 с.
18. Одум Ю. Основы экологии // М.: «Мир» .-1975.- С.139.
19. Падкина М. В., Тарасов С. А., Карстен С. Л., Парфенова Л. В., Попова Ю. Г., Самбук Е. В. Влияние мутаций pho85 на катаболитную репрессию гена С/77 у дрожжей Saccharomyces cerevisiae II Генетика.- 2003.-Т. 39.-С.732-738.
20. Падкина М.В., Краснопевцева Н.Г., Петрашень М.Г., Кожин С.А., Смирнов М.Н. Генетико-биохимическое изучение КФ дрожжей Saccharomyces cerevisiae. I. Характеристика кислых фосфатах разных штаммов//Генетика.- 1974.-Т. 10.- С. 100-110.
21. Падкина М.В., Павлова Н.А., Самбук Е.В., Смирнов М.Н. Анализ функции гена ACPI дрожжей Saccharomyces cerevisiae// В кн.: «Молекулярные механизмы генетических процессов».- М.- 1991.- С. 186190.
22. Падкина М.В., Павлова Н.А., Самбук Е.В., Смирнов М.Н. Анализ функции гена ACPI дрожжей Saccharomyces cerevisiae// Тез. VII Всесоюзного симпозиума « Молекулярные механизмы генетических процессов».- Москва.- 1990.- С.250.
23. Падкина М.В., Парфенова JI.B., Самбук Е.В., Смирнов М.Н. Штамм дрожжей Pichia pastoris продуцент бета-интерферона человека. Рекомбинантная плазмидная ДНК pHIF и способ ее конструирования // Патент РФ RU 2180687 С1.-МКИ С 12 N1/19,15/22. -2000.
24. Попова Ю.Г., М.В. Падкина, Е.В. Самбук Влияние мутаций в генах РН085 и РН04 на утилизацию пролина у дрожжей Saccharomyces cerevisiae II Генетика.- 2000.- Т.36.- С.1622-1628.
25. Рейвн П., Эверт Р., Айкхорн С. Современная ботаника // М.- «Мир». 1990.- 348 с.
26. Самбук Е. В., Павлова Н.А., Шарыпова JI.A., Падкина М.В., Мясников А.Н., Смирнов М.Н. Генетико-биохимическое изучение кислых фосфатаз дрожжей. Сообщение XI. Идентификация и клонирование гена АСР5 И Вестник ЛГУ.- 1988.- Сер.З.- Вып.24.-С. 300-307.
27. Самбук Е. В., Павлова Н.А., Шарыпова JI.A., Падкина М.В., Мясников А.Н., Смирнов М.Н. Генетико-биохимическое изучение кислых фосфатаз дрожжей. Идентификация и клонирование гена АСР5 // Вестник ЛГУ.-1988.- Сер.З.- Вып.4.- С.106-117.
28. Самбук Е. В., Падкина М.В., Павлова Н.А., Шарыпова Л.А., Мясников А.Н., Смирнов М.Н. Идентификация и клонирование гена АСР80 // Вестник ЛГУ.- 1988.- Сер.З.- Вып.4.- №24.- С.300-307.
29. Самбук Е.В. Генетические механизмы реализации закона лимитирующего фактора у дрожжей Saccharomyces cerevisiae // Журнал Общей Биологии.- 2005.-Т. 66.- №4.- С. 310-325.
30. Самбук Е.В. Изучение регуляции синтеза фосфатаз у дрожжей Saccharomyces cerevisiae И Дис. на соискание уч. степени канд. биол. наук.- ЛГУ.- Ленинград. 1985.
31. Самбук Е.В., Аленин В.В., Кожин С.А. Ген АСР80 контролирует транспорт неорганического фосфата//Генетика.- 1985.- т. XXI.- С. 14491454.
32. Самбук Е.В., Кучкартаев А.И., Падкина М.В., Смирнов М.Н. Картирование генов, регулирующих синтез кислых фосфатаз дрожжей Петергофских генетических линий // Генетика.-1991.- Т. 27.- С. 644-648.
33. Самбук Е.В., Лучникова И.Л., Падкина М.В. Картирование гена ACPI, кодирующего структуру кфЗ дрожжей-сахаромицетов // Тез. X Всесоюзного симпозиума «Структура и функции клеточного ядра».-Гродно.-1990.- с.55.
34. Самбук Е.В., Маарич М.А., Шарыпова Л.А., Кожин С.А. Новые маркеры Петергофских генетических линий дрожжей // Вестн. Ленингр. Ун-та.-1984.- Т. 3.-С. 90-95.
35. Самбук Е.В., Попова Ю.Г., Падкина М.В. Генетический анализ спонтанных супрессоров мутаций pho85 у дрожжей Saccharomyces cerevisiae II Генетика.- 2003.- Т.39.-№1.- С. 18-24.
36. Самбук Е.В., Попова Ю.Г., Падкина М.В. Изучение влияния фосфата и мутаций в генах РН085, РН080, РН04 на транскрипцию гена HSP82 у дрожжей Saccharomyces cerevisiaell Вестник СПбГУ.- 2002.- Т.2.- С. 3441.
37. Самбук Е.В., Попова Ю.Г., Физикова А.Ю., Падкина М.В. Генетический анализ плейотропных эффектов мутаций pho85 у дрожжей Saccharomyces cerevisiae II Генетика. -2003. -Т.39.- №8. -С. 871-877.
38. Самсонова М.Г., Падкина М.В., Краснопевцева Н.Г. Генетико-биохимическое изучение кислых фосфатаз дрожжей Saccharomycescerevisiae. V. Генетический контроль регуляции синтеза кислой фосфатазы II //Генетика,- 1975.- Т.П.- С. 104-115.
39. Сибирный А.А., Титоренко В.И. Молекулярные механизмы катаболитной регуляции у дрожжей //М.:ВИНИТИ.-1990. -214 с.
40. Смирнов М.Н., Н.Г. Краснопевцева, С.Г. Инге-Вечтомов, А.А. Янулайтис. Изучение мутантов по экзогенной фосфатазе дрожжей// Исследования по генетике. 1974. Вып. 5. С.59-62
41. Тер-Аванесян М.Д., Инге-Вечтомов С.Г., Петрашень М.Г. Генетико-биохимическое изучение кислых фосфатаз дрожжей Saccharomyces cerevisiae.II. Изучение мутаций, влияющих на активность кислой фосфатазы 1//Генетика.- 1974.- Т.10.-№ 12.- С.101-109.
42. Тиходеев О.Н., Журина Е.В. Автономная изменчивость: феномен и возможные механизмы // Экологическая генетика.-2004.-Т.2.- С.3-10.
43. Урбах В.Ю. Биометрические методы // М.- Наука.-1964.- с.218.
44. Шмальгаузен И.И. Факторы эволюции//М.-Изд-во Академии Наук СССР.-1946.-396 с.
45. Aboitiz F., Montiel J., Lopez J. Critical steps in the early evolution of the isocortex. Insight from developmental biology // Baraz. J. Med.Biol.Res. -2002.- V. 35.-P.1455-1472.
46. Aimer A., Horz W. Nuclease hypersensitive regions with adjacent positioned nucleosomes mark the gene boundaries of the PH05/PH03 locus in yeast // EMBO J.- 1986.- V. 5.- P.2681-2687.
47. Aimer A., Rudolph H., Hinnen A., Horz W. Removal of positioned nucleosomes from the yeast PH05 promoter upon PH05 induction releases additional upstream activating DNA elements // EMBO J.- 1986.- V. 5.- V. 2689-2696.
48. Andrulis E.D., Zappulla D.C., Alexieva-Botcheva K., Evangelista C., Sternglanz R. One-hybrid screens at the Saccharomyces cerevisiae HMR locus identify novel transcriptional silencing factors // Genetics.- 2004.- V. 166.- P. 631-635.
49. Arst H. N., MacDonald D.W. Reduced expression of a distal gene of the prn gene cluster in deletion mutants of Aspergillus nidulans: genetic evidence for a dicistronic messenger in an eukaryote // Mol. Gen. Genet.- 1978,- V. 163. P. 17-22.
50. Babudri N., Pavlov Y.I., Matmati N., Ludovisi C., Achilli A. Stationary-phase mutations in proofreading exonuclease-deficient starins of the yeast Saccharomyces cerevisiae И Mol. Genet. Genomics.- 2001.- V.265.- P. 362366.
51. Bajwa W., Meyhack В., Rudolph H., Schweingruber A.M., Hinnen A. Structural analysis of the two tandemly repeated acid phosphatase genes in yeast // Nucleic Acids Res.- 1984.- V. 12.- P. 7721-7739.
52. Baker H.V. Glycolytic gene expression in Saccharomyces cerevisiae: nucleotide sequence of GCR1, null mutants, and evidence for expression // Mol Cell Biol.- 1986.- V. 6.- P. 3774-3784.
53. Bakker B.M., Bro C., Kotter P., Luttik M.A., van Dijken J.P., Pronk J.T. The mitochondrial alcohol dehydrogenase Adh3p is involved in a redox shuttle in Saccharomyces cerevisiae II J. Bacteriol. 2000.- V. 182.- P. 4730-4737.
54. Barbaric S., Munsterkotter M., Svaren J., Horz W. The homeodomain protein Pho2 and the basic-helix-loop-helix protein Pho4 bind DNA cooperatively at the yeast PH05 promoter // Nucleic Acids Res.- 1996.- V. 24.- P. 4479-4486.
55. Barbaric S., Reinke H., Horz W. Multiple mechanistically distinct functions of SAGA at the PHOS promoter // Mol. Cell. Biol.- 2003.-V. 23.-P. 3468-3476.
56. Barral Y., Jentsch S., Mann C. G1 cyclin turnover and nutrient uptake are controlled by a common pathway in yeast // Genes Dev.- 1995,- V. 9.- P. 399409.
57. Barton A.B., Bussey H., Storms R.K., Kaback D.B. Molecular cloning of chromosome I DNA from Saccharomyces cerevisiae: characterization of the 54 kb right terminal CDC 15-FLO 1-PHO 11 region // Yeast.- 1997.- V. 13.- P. 1251-1263.
58. Beck Т., Hall M.N. The TOR signalling pathway controls nuclear localization of nutrient-regulated transcription factors // Nature.- 1999.- V. 402.- P. 689692.
59. Begley T. J., Rosenbach A.S., Ideker Т., Samson L.D. Damage recovery pathways in Saccharomyces cerevisiae revealed by genomic phenotyping and interactome mapping // Mol. Cancer Res. 2002. V.l. P. 103-112.
60. Beier D.R., A. Sledziewski, E.T. Young Deletion analysis identifies a region, upstream of the ADH2 gene of Saccharomyces cerevisiae, which is required for JDZ?7-mediated derepression // Mol Cell Biol.- 1985.- V.5.-. P. 17431749.
61. Bemis L.T., Denis C.L. Identification of functional regions in the yeast transcriptional activator ADR1 //Mol. Cell. Biol.- 1988.- V.8.- P.2125-2131.
62. Benjamin P.M., Wu J.I., Mitchell A.P., Magasanik B. Three regulatory systems control expression of glutamine synthetase in Saccharomyces cerevisiae at the level of transcription // Mol. Gen. Genet.-1989.- V. 217. P. 370-377.
63. Berben G., Legrain M., Hilger F. Studies on the structure, expression and function of the yeast regulatory gene PH02 II Gene.- 1988.- V. 66.- P.-307-312.
64. Bergman L.W., Eisenberg S., Туе B.-K. An agarose gel electroforesis assay for detection of DNA-binding activities in yeast cell extract // Methods Enzymol.- 1987.-V. 195.-P.528-538.
65. Bergman L.W., Stranathan M.C., Preis L.H. Structure of the transcriptionally repressed phosphate-repressible acid phosphatase gene (PHOS) of Saccharomyces cerevisiae И Mol. Cell. Biol.- 1986.- V. 6.- P. 38-46.
66. Bertram P.G., Choi J.H., Carvalho W. Ai, Zeng C., Chan T.-F., Zheng X.F.S. Tripartite regulation of Gln3p by TOR, Ure2p, and phosphatases // J. Biol. Chem.- 2000.- V. 275.- P. 35727-35733.
67. Bertram P.G., Choi J.H., Carvalho W. Ai, Zeng C., Chan T.-F., Zheng X.F.S. Convergence of TOR-nitrogen and Snfl-glucose signaling pathways onto Gln3 // Mol. Cell. Biol.- 2002.- V. 22.- P. 1246-1252.
68. Bisson L.F., Thorner J. Mutations in the pho80 gene confer permeability to 5-mononucleotides in Saccharomyces cerevisiae II Genetics.- 1982.- V. 102,- P. 341-359.
69. Blinnikova E.I., Mirjuschenko F.L., Shabalin Y.A., Egorov S.N. Vesicular transport of extracellular acid phosphatases in yeast Saccharomyces cerevisiae // Biochemistry (Mosc).- 2002.- V. 67.- P.485-490.
70. Boer P., Steyn-Parve E.P. Further studies on mechanism of action of an acid phosphatase from baker's yeast // Biochem. Biophys. Acta.- 1966,- V. 206.-P.400 -402.
71. Boer P., Steyn-Parve E.P. Further studies on mechanism of actionof an acid phosphatase from baker's yeast. Information from experiments on transphosphorylation // Biochim.Biophys. Acta.- 1970.- V.206.- P. 281-288.
72. Bohen S.P., Yamamoto K.R. Isolation of Hsp90 mutants by screening for decreased steroid receptor function // Proc. Natl. Acad. Sci .USA.- 1993.- V. 90.- P. 11424-11428.
73. Boldogh I.R., Yang H.C., Nowakowski W.D., Karmon S.L., Hays L.G., Yates J.R., Pon L. Arp2/3 complex and actin dynamics are required for actin-based mitochondrial motility in yeast // Proc. Natl. Acad. Sci. USA.- 2001.- V. 98.-P. 3162-3167.
74. Boles E., Heinisch J., Zimmermann F.K. Different signals control the activation of glycolysis in the yeast Saccharomyces cerevisiae И Yeast.-1993.- V. 9. P. 761-770.
75. Boles E., Hollenberg C.P. Function and regulation of yeast hexose transporters // Microbiol. Mol. Biol. Rev.- 1999.- V. 63. P. 554-569.
76. Boles E., Hollenberg H.P. The molecular genetics of hexose transport in yeast // FEMS Microbiol Rev.- 1997.- V. 21.- P. 85-111.
77. Bond J., Woods C.G. Cytoskeletal genes regulating brain size // Curr. Opin.Cell. Biol.- 2006.- V.-18.- P. 95-101.
78. Booher R.H., Deshaies R.J., Kirschner M.W. Properties of Saccharomyces cerevisiae weel and its differential regulation of p3 AC DC2 8 in response to G1 and G2 cyclins // EMBO J.- 1993.- V. 12.- P. 3417-3426.
79. Bourne J., Watson M.H., Hickey M.J., Holmes W., Rocque W., Reed S.I., Tainer J.A. Crystal structure and mutational analysis of the human CDK2 kinase complex with cell cycle-regulated protein Cks Hsl // Cell.- 1996.-V.84.- P.863-874.
80. Bradford M.M. A rapid sensitive method for quantitation of microgram quantities of proteins utilizing the principle of protein-dye binding // Anal. Biochem. 1981.- V. 72.- P. 247-251.
81. Brauer M. J., Saldanha A.J., Dolinski K., Botstein D. Homeostatic adjustment and metabolic remodeling in glucose-limited yeast cultures // Mol. Biol. Cell.-2005.- V. 16.- P. 2503-2517.
82. Brazas R.M., Bhoite L.T., Murphy M.D., Yu Y., Chen Y., Neklason D.W., Stillman D.J. Determining the requirements for cooperative DNA binding by Swi5p and Pho2p (Grfl0p/Bas2p) at the HO promoter // J. Biol. Chem.-1995.-V. 270,-P. 29151-29161.
83. Breton A.M., Aigle M. Genetic and functional relationship between Rvsp, myosin and actin in Saccharomyces cerevisiae И Curr. Genet.- 1998,- V. 34.-P.280-286.
84. Brown C.J., Todd K.M., Rosenzweig R.F. Multiple duplications of yeast hexose transport genes in response to selection in a glucose-limited environment // Mol. Biol. Evol.- 1998.- V. 15.- P. 931-942.
85. Brown T.A., Evangelista С., Trumpower B.L. Regulation of nuclear genes encoding mitochondrial proteins in Saccharomyces cerevisiae II J. Bacterid.- 1995.- V. 177. P. 6836-6843.
86. Bryan B. A., McGrew E., Lu Y., Polymenis M. Evidence for control of nitrogen metabolism by a START-dependent mechanism in Saccharomyces cerevisiae II Mol. Genet Genomics.- 2004. V. 271.- P. 72-81.
87. Budd M.E., Campbell J. L. Interrelationships between DNA repair and DNA replication // Mutation Res.- 2000.- V. 451.- P. 241-255
88. Bun-Ya M., Harashima S., Oshima Y. Putative GTP-binding protein, Gtrl, associated with the function of the Pho84 inorganic phosphate transporter in Saccharomyces cerevisiae II Mol. Cell.Biol.- 1992.- V. 12.- P. 2958-2966.
89. Bussink H.J., Osmani S.A. A cyclin-dependent kinase family member (PHOA) is required to link developmental fate to environmental conditions in Aspergillus nidulans I IEMBO J.- 1998.- V. 17.- P. 3990-4003.
90. Cameroni E., Hulo N., Roosen J., Winderickx J., De Virgillio C. The novel yeast PAS kinase Rim 15 orchestrates GO-associated antioxidant defense mechanisms // Cell Cycle.- 2004.- V. 3.- P. 462-468.
91. Cannon J.F., Tatchell K. Characterization of Saccharomyces cerevisiae genes encoding subunits of cyclic AMP-dependent protein kinase // Mol. Cell. Biol.-1987.- V. 7. P. 2653-2663.
92. Cardenas M.E., Cutler N.S., Lorenz M.C., DiComo C.J., Heitman J. The TOR signaling cascade regulates gene expression in response to nutrients // Genes Dev.- 1999.- V. 13.- P. 3271-3279.
93. Carlson M., Osmond B.C., Neigeborn L., Botsteain D. A suppressor of SNF1 mutations causes constitutive high-level invertase synthesis in yeast // Genetics.- 1984.-V. 107. P. 19-32.
94. Carroll A.S., Bishop A.C., DeRisi J.L., Shokat K.M., O'Shea E.K. Chemical inhibition of the Pho85 cyclin-dependent kinase reveals a role in the enviromental stress response // Proc. Natl. Acad. Sci. USA.- 2001.- V.98.-P.12583-12583.
95. Carvalho J., Zheng X.F.S. Domains of Gln3p interacting with karyopherins, Ure2p, and the target of rapamycin protein //J. Biol. Chem.- 2003.- V. 278.- P. 16878-16886.
96. Celenza J.L., Carlson M. A yeast gene that is essential for release from glucose repression encodes a protein kinase // Science.- 1986.- V. 233.- P. 1175-1180.
97. Celenza J.L., Carlson M. Mutational analysis of the Saccharomyces cerevisiae SNF1 protein kinase and evidence for functional interaction with the SNF4 protein // Mol. Cell. Biol.- 1989.- V. 9. P. 5034-5044.
98. Charbon G., Breunig K.D., Wattiez R., Vandenhaute J., Noel-Georis I. Key role of the Ser 562/661 in Snfl-dependent regulation of Cat8 in Saccharomyces cerevisiae and Kleyveromyces lactis // Mol.Cell. Biol.-2004.-V. 24.- P.4083-4091.
99. Chisholm G., Cooper T.G. Isolation and characterization of mutants that produce the allantoin-degrading enzymes constitutively in Saccharomyces cerevisiae И Mol. Cell. Biol.- 1982.- V. 2.- P. 1088-1095.
100. Ciriacy M. Cis-dominant regulatory mutations affecting the formation of glucose-repressible alcohol dehydrogenase (ADHII) in Saccharomyces cerevisiae И Mol.Gen. Genet.-1976.- V. 138,- P. 157-164.
101. Ciriacy M. Genetics of alcohol dehydrogenase in Saccharomyces cerevisiae.II. Two loci controlling synthesis of the glucosr-repressible ADHII //Mol.Gen. Genet.-1975.-V.145.-P. 327-333.
102. Ciriacy M. Isolation and characterization of further cis- and transacting regulatory elements involved in the synthesis of glucose-repressible alcohol dehydrogenase (ADHII) in Saccharomyces cerevisiae 11 Mol. Gen. Genet.- 1979.- V.176.- P.427-431.
103. Clark G. Staining procedures // London: Williams & Wilkins Baltimore. 1980.- P. 91-92.
104. Coffman J.A., Rai R., Loprete D.M., Cunningham T.C., Svetlov V., Cooper T.G. Cross regulation of four GATA factors that control nitrogen catabolic gene expression in Saccharomyces cerevisiae II J. Bacterid.- 1997.- V.179.-P.3416-3429.
105. Colwill K., Field D., Moore L., Friesen J., Andrews B. In vivo analysis of the domains of yeast Rvsl67p suggests Rvsl67p function is mediated through multiple protein interactions // Genetics.- 1999.- V.152.- P.881-893.
106. Cooper T.G., Gorski M., Turoscy V. A cluster of three genes responsible for allantoin degradation in Saccharomyces cerevisiae II Genetics.- 1979.- V. 92,-P. 383-396.
107. Cooper T.J., Lawther R.P. Induction of the allantoin degradative enzymes in Saccharomyces cerevisiae by the last intermediate of the pathway // Proc. Natl. Acad. Sci. USA.- 1973.- V. 70.- P. 2340-2344.
108. Coschigano P. W., Magasanik B. The Ure2 gene product of Saccharomyces cerevisiae plays an important role in the cellular response to the nitrogensource and has homology to glutatione S-transferases // Mol. Cell. Biol.-1991.-V.11.-P.822-832.
109. Courchesne W. E., Magasanik B. Ammonia regulation of amino acid permeases in Saccharomyces cerevisiae II Mol. Cell. Biol.- 1983.- V. 3.- P. 672-683.
110. Courchesne W. E., Magasanik B. Regulation of nitrogen assimilation in Saccharomyces cerevisiae: roles of URE2 and GLN3 genes // J. Bacteriol.-1988.- Vol. 170.-P. 708-713.
111. Сох К. H., Tate J. J., Cooper T.G. Actin cytoskeleton is required for nuclear accumulation of Gln3 in response to nitrogen limitation but not rapamycin treatment in Saccharomyces cerevisiae И J. Biol. Chem.- 2004.-V. 279. P. 19294-19301.
112. Creasy C.L., Madden S.L., Bergman L.W. Molecular analysis of the PH081 gene of Saccharomyces cerevisiae II Nucleic Acids Res.- 1993.- V. 21.- P. 1975-1982.
113. Creasy C.L., Shao D., Bergman L.W. Negative transcriptional regulation of PH081 expression in Saccharomyces cerevisiae II Gene.- 1996,- V. 168.- P. 23-29.
114. Cregg J.M., Cereghino J.L., Shi J., Higgins D.R. Recombinantprotein expression in Pichia pastoris // Mol. Biotechnol.- 2000.- V. 16.- P. 2352.
115. Crouzet M., Urdaci M., Dulau L., Aigle M. Yeast mutant affected for viability upon nutrient starvation: characterization and cloning of the RVS161 gene // Yeast.-1991.- V. 7.- P. 727-743.
116. Cunningham T.C., Cooper T.G. The Saccharomyces cerevisiae DAL80 repressor protein binds to multiple copies of GATAA-containing sequences// J. Bacterid.-1993.- V.175.- P.5851-5861.
117. Cunningham T.C., Ray R., Cooper T.G. The level of DAL80 expression down-regulates GATA factor-mediated transcription in Saccharomyces cerevisiae // J. Bacterid.- 2000.- V. 182,- P. 6584-6591.
118. Datta A., Jinks-Robertson S. Association of increased spontaneous mutation rates with high levels of transcription in yeast // Science.- 1995.- V. 268.- P. 1616-1618.
119. De Vit M.J., Johnston M. The nuclear exportin Msn5 is required for nuclear export of the Migl glucose repressor of Saccharomyces cerevisiae // Curr. Biol.- 1999.- V. 9.- P. 1231-1241.
120. Delneri D., Brancia F.L., Oliver S.G. Towards a truly integrative biology through the functional genomics of yeast // Curr Opin Biotechnol.-2001.- V.12.- P.87-91.
121. Deminoff S.J., Santangelo G.M. Raplp requires Gcrlp and Gcr2p homodimers to activate ribosomal protein and glycolytic genes, respectively // Genetics.- 2001.-V. 158.- P. 133-143.
122. Denis C.L., Audino D.C. The CCR1 (SNF1) and SCH9 protein kinases act independently of cAMP-dependent protein kinase and the transcriptional activator ADR1 in controlling yeast ADH2 expression // Mol. Gen. Genet.-1991.- V. 229.- P.395-399.
123. Denis D., Daignan Former B. Synthesis of glutamine, glycine and 10-formyl tetrahydrofolate is coregulated with purine biosynthesis in Saccharomyces cerevisiae II Mol. Gen. Genet.- 1998.- V. 259,- P. 246-255.
124. DeRisi J. L., Iyer V.R., Brown P.O. Exploring the metabolic and genetic control of gene expression on a genomic scale // Science.- 1997.- V. 278. P. 680-686.
125. Des Etages S.A., Falvey D.A., Reece R.J., Brandriss M.C. Functional analysis of the PUT3 transcriptional activator of the proline utilization pathway in Saccharomyces cerevisiae II Genetics.- 1996.- V. 142.- P. 1069-1082.
126. Hl.Desfarges L., Durrens P., Jaguelin H., Cassagne C., Bonneu M., Aigle M. Yeast mutants affected in viability upon starvation have a modified phospholipid composition // Yeast.- 1993.- V. 9.- P. 267-277.
127. Diderich J.A., Raamsdonk L.M., Kruckeberg A.L., Berden J.A., Van Dam K. Physiological properties of Saccharomyces cerevisiae from which hexokinase II has been deleted// Appl. Environ. Microbiol.- 2001.- V. 67. P. 1587-1583.
128. Dilova I., Chen C.Y., Powers T. Mksl in concert with TOR signaling negatively regulates RTG target gene expression in S. cerevisiae II Curr. Biol.- 2002.- V. 12.- P. 389-395.
129. Dohlman H.G., Thorner J., Caron M.G., Lefkowitz R.J. Model systems for the study of seven-transmembrane-segment receptors // Annu. Rev. Biochem.-1991.- V. 60.- P. 653-688.
130. Dombek K.M., S .Camier, E.T. Young. ADH2 expression is repressed by REG1 independently of mutations that alter the phosphorylation of the yeast transcription factor ADR1 И Mol. Cell. Biol.- 1993.- V.13.- P.4391-4399.
131. Donoviel M.S., Kacherovsky N ., Young E.T. Synergistic activation of ADH2 expression is sensitive to upstream activation sequence 2 (UAS2) orientation, copy number and UAS1-UAS2 helical phasing // Mol. Cell. Biol. 1995. V.15. №6. P. 3442-3449.
132. Dou X., Wu D., An W., Davies J., Hashmi S.B., Ukil L., Osmani S.A. The PHOA and PHOB cyclin-dependent kinases perform an essential function in Aspergillus nidulans II Genetics.- 2003.- V. 165.- P. 1105-1115.
133. Douglas H.C., Hawthorne D.C. Regulation of genes controlling synthesis of the galactose pathway enzymes in yeast // Genetics.- 1966.- V. 54.- P. 911916.
134. Drees В., Brown C., Barrel B.G., Bretscher A. Tropomyosin is essential in yeast, yet the TPM1 and TPM2 products perform distinct functions // J. Cell. Biol.- 1995.- V. 128.- P. 383-392.
135. Edskes H. K., Hanover J. A., Wickner R. B. Mkslp is a regulator of nitrogen catabolism upstream of Ure2p in Saccharomyces cerevisiae И Genetics.-1999.- V. 153.- P. 585-594.
136. Entian K.D., Zimmermann F.K. New genes involved in carbon catabolite repression and derepression in the yeast Saccharomyces cerevisiae // J. Bacterid.- 1982.-V. 151.-P. 1123-1128.
137. Erickson J.R., Johnston M. Genetic and molecular characterization of GAL83: its interaction and similarities with other genes involved in glucose repression in Saccharomyces cerevisiae II Genetics.- 1993.- V. 135. P. 655-664.
138. Erickson J.R., Johnston M. Suppressors reveal two classes of glucose repression genes in yeast Saccharomyces cerevisiae И Genetics.- 1994,- V. 136.- P. 1271-1278.
139. Erkine A.M., Magrogan S.F., Sekinger E.A., Gross D.S. Cooperative binding of heat shock factor to the yeast HSP82 promoter in vivo and in vitro II Mol. Cell. Biol.- 1999.-V. 19. P. 1627-1639.
140. Erkine A.M., Szent-Gyorgyi C., Simmons S.F., Gross D.S. The upstream sequences of the HSP82 and HSC82 genes of Saccharomyces cerevisiae: regulatory elements and nucleosome positioning motifs // Yeast.-1995.- V. 11.- P. 573-580.
141. Evans I.H. Yeast protocols, methods in cell and molecular biology // Humana Press, Totowa. NY.- 1996,- 538 p.
142. Fantes P. A. Dependency relations between events in mitosis in Schizosaccharomycespombe II J. Cell. Sci.- 1982.- V. 55.- P. 383-402.
143. Fascher K.D., Schmitz J., Horz W. Role of trans-activating proteins in the generation of active chromatin at the PH05 promoter in S. cerevisiae И EMBO J.- 1990.- V. 9.- P. 2523-2528.
144. Ferea T.L., Botstein D., Brown P.O., Rosenzweig R.F. Systematic changes in gene expression patterns following adaptive evolution in yeast // Proc. Natl. Acad. Sci. USA.- 1999.-V. 96.- P. 9721-9726.
145. Finkel Т., Due J., Fearon E.R., Dang C.V., Tomaselli G.F. Detection and modulation in vivo of helix-loop-helix protein-protein interactions // J. Biol. Chem.- 1993.- V. 268.- P. 5-8.
146. Fisher F., Goding C.R. Single amino acid substitutions alter helix-loop-helix protein specificity for bases flanking the core CANNTG motif // EMBO J.-1992.- V. 11.- P. 4103-4109.
147. Flick J.S., Thorner J. An essential function of a phosphoinositide-specific phospholipase С is relieved by inhibition of a cyclin-dependent protein kinase in the yeast Saccharomyces cerevisiae II Genetics.- 1998.-V. 148.- P. 33-47.
148. Floyd S.R, Porr E.B, Slepnev V.I, Ochoa G.C, Tsai L.H, De Camilli P. Amphiphysin 1 binds the cyclin-dependent kinase (cdk5) regulatory subunit p35 and is phosphorylated by cdk5 and cdc2// J. Biol. Chem.- 2001.- V. 276. P. 8104-8110.
149. Forsberg H., Gilstring С. F., Zargari A., Martinez P., Ljungdahl
150. P.O. The role of the yeast plasma membrane SPS nutrient sensor in metabolic response to extracellular amino acids // Mol. Microbiol.- 2001.- V.42.- P.215-228.
151. Forsberg H., Ljungdahl P.O. Genetic and biochemical analysis of the yeast plasma membrane Ssylp-Ptr3p-Ssy5p sensor of extracellular amino acids // Mol. Cell. Biol.- 2001.- V.21.- P. 814-826.
152. Foster P.L. Adaptive mutation: implication for evolution // Bioessays.- 2000.-V.22.- P. 1067-1074.
153. Fradkin L.G., Garriga G., Salinas P.C., Thomas J.B., Yu X., Zou Y. Wnt signaling in neuronal circuit development // J. Neurosci.- 2005.-V. 25.- P. 10376-10378
154. Franke J., Reimann В., Hartmann E., Kohlerl M., Wiedmann B. Evidence for a nuclear passage of nascent polypeptide-associated complex subunits in yeast //J. Cell. Sci.- 2001.- V.l 14. P. 2641-2648.
155. Friddle R.W., Klare J.E., Martin S.S., Corzett M., Balhorn R., Baldwin E.P., Baskin R.J., Noy A. Mechanism of DNA compaction by yeast mitochondrial protein Abf2p // Biophys. J.- 2004.-V. 86.- P. 1632-1639.
156. Fujimura H., Sakuma Y. Simplified isolation of chromosomal and plasmid DNA from yeasts // Biotechniques.- 1993.- V. 14.- P.538-540.
157. Gagiano M., Bauer F.F., Pretorius I.S. The sensing of nutritional status and the relationship to filamentous growth in Saccharomyces cerevisiae // FEMS Yeast Res.- 2002,- V. 2.- P. 433-470.
158. Gancedo C., Gancedo J.M. Phosphorylation of 3-O-methyl-D-glucose and catabolite repression in yeast // Eur. J. Biochem.- 1985.- V. 148.- P. 593-597.
159. Gancedo J.M. Yeast carbon catabolite repression // Microbiol. Mol. Biol. Rev.- 1998.- V. 62. P. 334-361.
160. Garriga G., Harbaugh Т.Е. Role of the Caenorabditis elegans homologs of the cdk5 and p35 in migration and axon outgrowth // Intern. C. elegans Meeting.- 1999.- P.375.
161. Gasch A.P., Spellman P.T., Kao C.M., Carmel-Harel 0., Eisen M.B., Storz G., Botstein D., Brown P.O. Genomic expression programs in the response of yeast cells to environmental changes // Mol. Biol. Cell.- 2000.- V. 11. P. 4241-4257.
162. Gaudreau L., Schmid A., Blaschke D., Ptaschne M., Horz W. RNA polymerase II holoenzyme recruitment is sufficient to remodel chromatin at the yeast PH05 promoter // Cell.- 1997.- V. 89.- P. 55-62.
163. Gerber M.R., Farrell A., Deschaies R.J., Herskowitz I., Morgan D.O. Cdc37 is required for association of the protein kinase Cdc28 with G1 and mitotic cyclins // Proc. Natl. Acad. Sci. USA.- 1995.- V.92.- P. 4651-4655.
164. Gildor Т., Shemer R., Atir-Lande A., Kornitzer D. Coevolution of cyclin Pcl5 and its substrate Gcn4 // Eukaryot. Cell.- 2005.- V. 4.- P. 310-318.
165. Gilliquet V., Berben G. Positive and negative regulators of the Saccharomyces cerevisiae 'PHO system' participate in several cell functions // FEMS Microbiol Lett.- 1993.-V. 108.-P. :333-339.
166. Gilliquet V., Legrain M., Berben G., Hilger F. Negative regulatory elements of the Saccharomyces cerevisiae PHO system: interaction between PH080 and PH085 proteins // Gene.- 1990.- V. 96.- P. 181-188.
167. Gilliquet V., Legrain M., Hilger F. Sequence of the region 5' to the negative regulatory gene PH080 of Saccharomyces cerevisiae II Nucleic Acids Res.-1987,- V. 15.-P. 5893.
168. Gonzalez В., deGraaf A., Renaud M., Sahm H. Dynamic in vivo (31)P nuclear magnetic resonance study of Saccharomyces cerevisiae in glucose-limited chemostat culture during the aerobic-anaerobic shift // Yeast.- 2000.- V. 16.-P. 483-497.
169. Gourlay C.W., Ayscough K.R. The actin cytoskeleton in ageing and apoptosis // FEMS Yeast Res.- 2005.- V. 5.- P. 1193-1198.
170. Gray J.V., Petsko G.A., Johnston G.C., Ringe D., Singer R.A., Werner-Washburne M. Sleeping beauty": quiescence in Saccharomyces cerevisiae II Microbiol. Mol. Biol. Rev.- 2004.-V. 68.- P. 187-206.
171. Gregory P. D., Schmid A., Zavari M., Lui L., Berger S. L., Horz, W. Absence of Gcn5 HAT activity defines a novel state in the opening of chromatin at the PH05 promoter in yeast // Mol. Cell. 1998.- V. 1. P. 495-505.
172. Grenson M., Dubois E., Piotrowska M., Drillen R., Aigle M. Ammonia assimilation in Saccharomyces cerevisiae as mediated by the two glutamate dehydrogenases // Mol. Gene. Genet.- 1974.- V. 128.- P. 73-85.
173. Gross D.S., Adams C.C., Lee S., Stentz B. A critical role for heat shock transcription factor in establishing a nucleosome-free region over the TATA-initiation site of the yeast HSP82 heat shock gene // EMBO J.-1993.- V. 12.-P. 3931-3945.
174. Gross D.S., English K.E., Collins K.W., Lee S.W. Genomic footprinting of the yeast HSP82 promoter reveals marked distortion of the DNA helix and constitutive occupancy of heat shock and TATA elements // J. Mol. Biol.-1990. V. 216.- P. 611-631.
175. Guo Z., Stiller J.W. Comparative genomics of cyclin-dependent kinases suggest co-evolution of the RNAP II C-terminal domain and CTD-directed CDKs // BMC Genomics.- 2004.-V.5.- P. 69-72.
176. Gupta R.S. Phylogenetic analysis of the 90 kD heat shock family of protein sequences and an examination of the relationship among animals, plants, and fungi species // Mol. Biol. Evol.- 1995.- V. 12.- P. 1063-1073.
177. Hall B.G. Adaptive mutagenesis: a process that generates almost exclusively beneficial mutations// Genetica.- 1998.- V. 102-103.- P. 109-125.
178. Hall B.G. Selection-induced mutations occur in yeast // Proc. Natl. Acad. Sci. USA.- 1992.- V. 89.- P. 4300-4303.
179. Han M., Kim U-J., Kayne P. Grunstein M. Depletion of histone H4 and nucleosomes activates the PH05 gene in Saccharomyces cerevisiae // EMBO J. 1988. V.7. P.2221-2228.
180. Hanks S.K., Hunter T. The eukaryotic protein kinase superfamily: kinase (catalytic) domain structure and classification // FASEB J.- 1995.- V. 9.- P. 576-596.
181. Hansche P. E. Gene duplication as a mechanism of genetic adaptation in Saccharomyces cerevisiae // Genetics.- 1975,- V. 79.- P. 661-674.
182. Hanway D., Chin J.K., Xia G., Oshiro G., Winzeler E.A., Romesberg F.E. Previously uncharacterized genes in the UV- and MMS-induced DNA damaga response in yeast // Proc.Nath. Acad. Sci. USA.- 2002.- V. 99.- P. 1060510610.
183. Hazbun T.R., Fields S. A genome-wide screen for site-specific DNA-binding proteins // Mol. Cell. Proteomics.- 2002.- V. 1. P. 538-543.
184. Hedges D., Proft M., Entian K.D. CAT8, a new zinc cluster-encoding gene necessary for derepression of gluconeogenic enzymes in the yeast Saccharomyces cerevisiae II Mol. Cell. Biol.- 1995.- V. 15.- P. 1915-1922.
185. Hellmann H., Funck D., Rentsch D., Frommer W.B. Hypersensitivity of an Arabidopsis sugar signaling mutant toward exogenous proline application // Plant Physiol.- 2000.- V. 123.- P. 779-789.
186. Hellmich M.R., Kennison J.A., Hampton L.L., Battey J.F. Cloning and characterization of the Drosophila melanogaster CDK5 homolog // FEBS Lett.- 1994.- V. 356. P. 317-321.
187. Hemmings B.A. Phosphorylation and proteolysis regulate the NAD-dependent glutamate dehydrogenase from Saccharomyces cerevisiae II FEBS Lett.-1980.-V. 122.-P.297-302.
188. Hemmings B.A. Phosphorylation of NAD-dependent glutamate dehydrogenase from yeast // J. Biol. Chem.- 1978.- V. 253.- P. 5255-5258.
189. Hemmings B.A., Zubenko G.S., Jones E.W. Proteolytic inactivation of the NADP-dependent glutamate dehydrogenase in proteinase-deficient mutants of Saccharomyces cerevisiae II Arch. Biochem Biophys.- 1980.- V. 202. P. 657660.
190. Henchoz S., Chi Y., Catarin В., Herskowitz I., Deshaies R.J., Peter M. Phosphorylation- and ubiquitin-dependent degradation of the cyclin-dependent kinase inhibitor Farlp in budding yeast // Genes Dev.- 1997.-V. 11.- P. 3046-3060.
191. Henzi V., Reichling D.B., Helm S.W., MacDermott A.B. L-proline activates glutamate and glycine receptors in cultured rat dorsal horn neurons // Mol. Pharmacol.- 1992,- V. 41.- P. 793-801.
192. Hermann G.J., E.J.King, J.M. Show The yeast gene, MDM20, is necessary for mitochondrial inheritance and organization of the actin cytoskeleton // J. Cell. Biol.- 1997.- V.137.- P.141-153.
193. Herrgard M.J., Palsson B.O. Untangling the web of functional and physical interactions in yeast // J. Biol.- 2005.- V. 4,- P. 5.
194. Hinnebusch A.G. Translational regulation of GCN4 and the generalamino acid control of yeast // Annu. Rev. Microbiol.- 2005.- V. 59.-P.407-450.
195. Hirst K., Fisher F., McAndrew P.C., Goding C.K. The transcription factor, the Cdk, its cyclin and their regulator: directing the transcriptional response to a nutritional signal // EMBO J.- 1994,- V. 13.- P.5410-5420.
196. Ho Y., Gruhler A., Heilbut A. et al. Systematic identification of protein complexes in Saccharomyces cerevisiae by mass spectrometry // Nature.-2002.- V. 415.- P. 180-183.
197. Holsbeeks I., Lagatie O., Van Nuland A., Van de Velde S., Thevelein J.M. The eukaryotic plasma membrane as a nutrient-sensing device // Trends Biochem. Sci.- 2004.- V. 29.- P. 556-564.
198. Hu G. Z., Ronne H. Yeast BTF3 protein is encoded by duplicated genes and inhibits the expression of some genes in vivo // Nucl. Acid Res.- 1994.- V.22.-P. 2740-2743.
199. Hu Y., Cooper T.G., Kohlhow G.B. The Saccharomyces cerevisiae Leu3 protein activates expression of GDH1, a key gene in nitrogen assimilation // Mol. Cell. Biol.- 1995.- V. 15.- P. 52-57.
200. Hu Z., Nehlin J.O., Ronne H., Michels C.A. MIG1-dependent and MIG1-independent glucose regulation of MAL gene expression in Saccharomyces cerevisiae II Curr. Genet.- 1995.- V. 28. P. 258-266.
201. Huang D., Chun K.T., Goebl M.G., Roach P.J. Genetic interactions between REG1/HEX2 and GLC7, the gene encoding the protein phosphatase type 1catalytic subunit in Saccharomyces cerevisiae II Genetics.- 1996.-V. 143.-P. 119-127.
202. Huang D., Moffat J., Andrews B. Dissection of a complex phenotype by functional genomics reveals roles for the yeast cyclin-dependent protein kinase Pho85 in stress adaptation and cell integrity //Mol. Cell. Biol.- 2002.-V. 22.- P.5076-5088.
203. Huang D., Patrick G., Moffat J., Tsai L.H., Andrews B. Mammalian Cdk5 is a functional homologue of the budding yeast Pho85 cycl in-dependent protein kinase // Proc. Natl. Acad. Sci. USA.- 1999.- V. 96. P. 14445-14450.
204. Huang H.L., Brandriss M.C. The regulator of the yeast proline utilization pathway is differentially phosphorylated in response to the quality of the nitrogen source // Mol. Cell. Biol.- 2000.- Vol. 20.- P.892-899.
205. Hubscher U. Double replica Southwestern // Nucleic Acids Res.-1987.- V.15.-P. 5486.
206. Irani M., W.E. Taylor, E. T. Young Transcription of the ADH2gene in Saccharomyces cerevisiae is limited by positive factors that bind competitively to its intact promoter region on multicopy plasmids // Mol. Cell. Biol.- 1987.- V.7.-P. 1233-1241.
207. Ito Т., Chiba Т., Ozawa R., Yoshida M., Hattori M., Sakaki Y. A comprehensive two-hybrid analysis to explore the yeast protein interactome // Proc. Natl. Acad. Sci. USA.- 2001.- V. 98.- P. 4569-4574.
208. Jacob F., Monod J. Genetic regulatory mechanisms in the synthesis of proteins // J. Mol. Biol.-1961.- V.3. P.318-356.
209. Jayaraman P.S., Hirst K., Goding C.R. The activation domain of a basic helix-loop-helix protein is masked by repressor interaction with domains distinct from that required for transcription regulation // EMBO J.- 1994.- V. 13.- P. 2192-2199.
210. Jeffery D.A., Springer M., King D.S., O'Shea E.K. Multi-site phosphorylation of Pho4 by the cyclin-CDK Pho80-Pho85 is semi-processive with site preference // J. Mol. Biol.- 2001.- V.9.- P. 997-1010.
211. Jesus -Berrioz M., Rodriguez-del Valle N. Expression of a Pho85 cyclin-dependent kinase is repressed during the dimorphic transition in Sporothrix schenckii // Fungal Genet. Biol.- 2002.- V. 37,- P. 39-48.
212. Jiang R., Carlson M. Glucose regulates protein interactions within the yeast SNF1 protein kinase complex // Genes Dev.- 1996.- V. 10. P. 3105-3115.
213. Jiang Y.W., Kang C.M. Induction of S. cerevisiae filamentous differentiation by slowed DNA synthesis involves Mecl, Rad53 and Swel checkpoint proteins// Mol. Biol. Cell.- 2003.- V. 14.- P. 5116-5124.
214. Johnson G.D., Noguera A.G.M. A simple method of reducing the fading of immunofluorescence during microscopy // J. Immunol. Meth. -1981.- V. 43.-P. 349-350.
215. Johnston M, Carlson M. Regulation of carbon and phosphate utilization // Mol. And Cell. Biol, of the yeast Saccharomyces cerevisiae: Gene expression.- NY: Cold Spring Harbor, 1992.-P. 283-317.
216. Justice M.C., Hogan B.P., Vershon A.K. Homeodomain-DNA interactions of the Pho2 protein are promoter-dependent // Nucl. Acids. Res.- 1997.- V. 25.-P. 4730-4739.
217. Kaffman A., Herskowitz I, Tjian R., O'Shea E. K. Phosphorylation of the transcription factor PH04 by a cyclin-CDK complex, PH080-PH085 // Science.- 1994.- V.263.- P. 1153-1156.
218. Kaffman A., Rank N. M., ONeill E. M., Huang L. S., O'Shea E. K. The receptor Msn5 exports the phosphorylated transcription factor Pho4 out of the nucleus // Nature.- 1998.- V. 396. P. 482-486 (b).
219. Kaffman A., Rank N.M., O'Shea E. K. Phosphorylation regulates association of the transcription factor pho4 with its import receptor Psel/Kapl21 // Genes Dev.- 1998.- V. 12,- P. 2673-2683.(a).
220. Kang D., Hamasaki N. Maintenance of mitochondrial DNA integrity: repair and degradation // Curr.Genet.- 2002.- V.41.- P.311-322.
221. Kaniak A., Xue Z., Macool D., Kim J.-H., Johnston M. Regulatory network connecting two glucose signal transduction pathways in Saccharomyces cerevisiae II Eucaryot. Cell.- 2004.- V.3.- P. 221-231.
222. Kassir Y., Granot D., Simchen G. IME1, a positive regulator gene meiosis in Saccharomyces cerevisiae II Cell.- 1988.- V.52.- P. 853-862.
223. Kawauchi Т., Chihama K., Nabeshima Y., Hoshino M. Cdk5 phosphorylates and stabilizes p27kipl contributing to actin organization and cortical neuronal migration // Nat. Cell. Biol.- 2006.- V.8.- P. 17-26.
224. Kesti Т., McDonald W.H., Yates J.R., Wittenberg C. Cell cycle-dependent phosphorylation of the DNA polymerase epsilon subunit, Dpb2, by the Cdc28cyclin-dependent protein kinase // J. Biol. Chem.- 2004.- V. 279.-P. 14245-14255.
225. Kim J.H., Polish J., Johnston M. Specificity and regulation of DNA binding by the yeast glucose transporter gene repressor Rgtl // Mol. Cell. Biol.- 2003.-V. 23.- P. 5208-5216.
226. Kimura M., Recent development of the neutral theory viewed from the Wrightian tradition of theoretical population genetics // Proc. Natl. Acad. Sci. USA.- 1991.-V. 88. P. 5969-5973.
227. Klasson H., Fink G.R., Ljungdahl P.O. Ssylp and Ptr3p are plasma membrane components of a yeast system that senses extracellular amino acids // Mol Cell Biol.- 1999.- V. 19. P. 5405-5416.
228. Klein C.J., Olsson L., Nielsen J. Glucose control in Saccharomyces cerevisiae: the role of Migl in metabolic functions // Microbiology.- 1998.- V. 144. P. 13-24.
229. Kolodner R.D., Putnam C.D., Myung K. Maintenance of genome stability in Saccharomyces cerevisiae II Science.- 2002.- V. 297.- 552-557.
230. Komarnitsky P.B., E.RKlebanow, P.A. Weil, C.L.Denis ADR1-mediated transcriptional activation requires the presence of an intact TFIID complex//Mol. Cell. Biol.- 1998.- V.18.- P.5861-5867
231. Komeili A., Wedaman K.P., O'Shea E.K., Powers T. Mechanism of metabolic control. Target of rapamycin signaling links nitrogen quality to the activity of the Rtgl and Rtg3 transcription factors // J. Cell. Biol.- 2000.- V. 151.- P. 863-878.
232. Komeili, A., and O'Shea, E. K. Roles of phosphorylation sites in regulating activity of the transcription factor Pho4 // Science.- 1999.- V. 284.-P. 977-980.
233. Konopka A. Microbial physiological state at low growth rate in natural and engineered ecosystems // Curr. Opin. Microbiol.- 2000.- V. 3.- P.244-247.
234. Koolman J., Rohm K.-H. Taschenatlas der Biochemie // 1998.- Georg Thieme Verlag Stuttgart.- NY. 469 p.
235. Kron S.J., Styles C.A., Fink G.R. Symmetric cell division in pseudohyphae of the yeast Saccharomyces cerevisiae II Mol. Biol. Cell.- 1994.- V. 5.- P.1003-1022.
236. Kuchin S., Treich I., Carlson M. A regulatory shortcut between the Snfl protein kinase and RNA polymerase II holoenzyme // Proc. Natl. Acad Sci. USA.- 2000.- V. 97.- P. 7916-7920.
237. Kuchin S., Yeghiayan P., Carlson M. Cyclin-dependent protein kinase and cyclin homologs SSN3 and SSN8 contribute to transcriptional control in yeast // Proc. Natl. Acad. Sci .USA.-1995.- V. 92.- P. 4006-4010.
238. Kulkarni A.A., Abul-Hamd A.T., Rai R., Berry H.E., Cooper T.G. Gln3p nuclear localization and interaction with Ure2p in Saccharomyces cerevisiae!I J. Biol. Chem.- 2001.- V. 276.- P. 32136-32144 .
239. Kunz J., Henriquez R., Schneider U., Deuter-Reinhard M., Mowa N.R., Hall M.N. Target of rapamycin in yeast, TOR2, is an essential phosphatidylinositolkinase homolog required for G1 progression // Cell.- 1993.- V. 73.- P. 585596.
240. Kuruvilla F.G., Shamji A. F., Schreiber S.L. Carbon- and nitrogenquality signaling to translation are mediated by distinct GATA-type transcription factors // Proc. Natl. Acad. Sci. USA.- 2001.- V. 98.- P. 72837288.
241. Kwan J.J., Warner N., Pawson Т., Donaldson L.W. The solution structure of the S.cerevisiae Stel 1 MAPKKK SAM domain and its partnership with Ste50 // J Mol Biol.- 2004.- V. 342.- P. 681-693.
242. Laemmli U.K. Cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage T4 // Nature.- 1970.- V. 15.- P. 680-685.
243. Lafaye A., Pereira Y., Lagniel G., Tabet J.C., Ezan E., Labarre J. Combined proteome and metabolite-profiling analyses reveal surprising insights into yeast sulfur metabolism // J. Biol. Chem.- 2005.- V. 280.- P. 24723-24730.
244. Lahaye A., Stahl H., Thines-Sempoux D., Foury F. PIF1: a DNA helicase in yeast mitochondria// EMBO J.-1991.- V.10.- P.997-1007.
245. Lange P., Hansche P.E. Mapping of a centromere-linked gene responsible for constitutive acid phosphatase synthesis in yeast // Mol. Gen. Genet.- 1980.- V. 180. P.605-607.
246. Larsson C., Pahlman I.L., Gustafsson L. The importance of ATP as a regulator of glycolytic flux in Saccharomyces cerevisiae II Yeast.- 2000.- V. 16.- P. 797-809.
247. Lasko P.F., Brandriss M.C. Proline transport in Saccharomyces cerevisiae II J. Bacterid.-1981.- V. 148.- V. 241-247.
248. Lau W., Schneider K.R., O'Shea EK. A genetic study of signaling processes for repression of PH05 transcription in Saccharomyces cerevisiae II Genetics.- 1998.-V. 150.-P.1349-1359.
249. Lee H.C., Hon Т., Zhang L. The molecular chaperone Hsp90 mediates heme activation of the yeast transcriptional activator Hap 1 // J. Biol. Chem.- 2002.-V. 277.- P. 7430-7437.
250. Lee J., Colwill K., Aneliunas V., Tennyson C., Moore L., Ho Y., Andrews B. Interaction of yeast Rvsl67 and Pho85 cyclin-dependent kinase complexes may link the cell cycle to the actin cytoskeleton // Curr. Biol.- 1998.- V. 8. P. 1310-1321.
251. Lee M., O'Regan S., Moreau J.L., Johnson A.L. Johnston L.H., Goding C.R. Regulation of the Pcl7-Pho85 cyclin-cdk complex by Pho81 // Mol. Microbiol.- 2000.- V. 38.- P. 411-422.
252. Lemire J.M., Willcocks Т., Halvorson H.O., Bostian K.A. Regulation of repressible acid phosphatase gene transcription in Saccharomyces cerevisiae II Mol. Cell. Biol.- 1985.- V. 5.- P. 2131-2141.
253. Lenburg M.E., O'Shea E.K. Genetic evidence for morphogenetic function of the Saccharomyces cerevisiae Pho85 cyclin-dependent kinase // Genetics.-2001.- V. 157- P. 39-51
254. Lenburg M.E., O'Shea E.K. Signalling phosphate starvation // Trends Biochem.Sci.- 1996.- V.21.- P. 383-387.
255. Li Q., Johnston S.A. Are all DNA binding and transcription regulation by activator physiologically relevant? // Mol. Cell. Biol.- 2001.- V. 21.- P. 24672474.
256. Liang H., Gaber R.F. A novel signal transduction pathway in Saccharomyces cerevisiae defined by SnO-regulated expression of HXT6 // Mol. Biol. Cell.- 1996.- V. 7. P. 1953-1966.
257. Liao X., Butow R.A. RTG1 and RTG2: two yeast genes required for a novel path of communication from mitochondria to the nucleus // Cell. 1993. V. 72.-P. 61-71.
258. Lieb J.D., Liu X., Botstein D., Brown P.O. Promoter-specific binding of Rap 1 revealed by genome-wide maps of protein-DNA association // Nat. Genet.-2001.- V. 28.- P. 327-334.
259. Liu C., Yang Z., Yang J., Xia Z., Ao S. Regulation of the yeast transcriptional factor PH02 activity by phosphorylation // J. Biol. Chem.- 2000.- V. 275.- P. 31972-31978.
260. Liu H., Styles C.A., Fink G.R. Elements of the yeast pheromone response pathway required for filamentous growth of diploids // Science.- 1993.- V. 262.-P. 1741-1744.
261. Liu H.P., Bretscher A. Disruption of the single tropomyosin gene in yeast results in the disappearance of actin cables from the cytoskeleton // Cell.-1989.- V.57.- P.233-242.
262. Liu Z., Butow R.A. A transcriptional switch in the expression of yeast tricarboxylic acid cycle genes in response to a reduction or loss of respiratory function // Mol. Cell. Biol.- 1999.- V. 19- P. 6720 6728.
263. Liu Z., Spirek M., Thornton J., Butow R.A. A novel degron-mediated degradation of the RTG pathway regulator, Mksl, by SCFGrrl // Mol.Bio.Cell.- 2005.- V. 16.-P. 4893-4904.
264. Lo W.S., Duggan L., Emre N.C., Belotserkovskya R., Lane W.S., Shiekhattar R., Berger S.L. Snfl- a histone kinase that works in concert with the histone acetyltransferase Gcn5 to regulate transcription // Science.- 2001.- V. 293.- P. 1142-1146.
265. Lo W.S., Raitses E.I., Draginis A.M. Development of pseudohyphae by embedded haploid and diploid yeast // Curr Genet.- 1997.-V. 32. P. 197-202.
266. Ma E., Haddad G. A. Drosophila CDK5 alpha-like molecule and its possible role in response to O2 deprivation // Biochem. Biophys. Res. Commun.-1999.- V. 261.- P.459-463.
267. MacAlpine D.M., Perlman P.S., Butow R.A. The numbers of individual mitochondrial DNA molecules and mitochondrial DNA nucleoids in yeast are co-regulated by the general amino acid control pathway // EMBO J.- 2000.-V. 19.-P. 767-775.
268. Maccioni R.B., Otth C., Concha I., Munoz J.P. The protein kinase Cdk5. Structural aspects, roles in neurogenesis and involvement in Alzheimer's pathology // Eur. J. Biochem.- 2001.- V. 268.- P. 1518-1527.
269. Madden S.L., Johnson D.L., Bergman L.W. Molecular and expression analysis of the negative regulators involved in the transcriptional regulation of acid phosphatase production in Saccharomyces cerevisiae II Mol. Cell. Biol.-1990,- V. 10.- P. 5950-5957.
270. Magasanik B. Regulation of nitrogen utilization // Mol. And Cell. Biol, of the yeast Saccharomyces cerevisiae: Gene expression.-NY: Cold Spring Harbor, 1992.-P. 283-317.
271. Magasanik В., Kaiser C.A. Nitrogen regulation in Saccharomyces cerevisiae //Gene.- 2002.- V. 290. P. 1-18.
272. Manganas J.L., Alexander M.K., Sandell L.L., Zakian V.A. Repair of chromosome ends after telomere loss in Saccharomyces II Mol. Biol. Cell.-2001.-V. 12.-P. 4078-4089.
273. Мао X.C., Xia Y.L., Hu Y.F.,Liu C.D. Involvement of PH080 and PH085 genes in Saccharomyces cerevisiae ion tolerance //Sheng Wu Hua Xue Yu Sheng Wu Wu Li Xue Bao (Shanghai).- 2003.- V. 35.- P.86-91.
274. Martinez P., Persson B.L. Identification, cloning and characterization of a derepressible Na+-coupled phosphate transporter in Saccharomyces cerevisiae II Mol. Gen. Genet.- 1998.- V. 258.- P. 628-638.
275. Martinez P., Zvyagilskaya R., Allard P., Persson B.L. Physiological regulation of the derepressible phosphate transporter in Saccharomyces cerevisiae // J. Bacteriol.- 1998.-V.180,- P. 2253-2256.
276. Marzluf G.A. Genetic regulation of nitrogen metabolisn in the fungi // Microbiol. Mol. Biol. Rev.- 1997.- V.61.- P. 17-32.
277. Mashida M., Uemura H., Jigami Y., Tanaka H. The protein factor which binds to the upstream activating sequence of Saccharomyces cerevisiae ENOl gene //Nucleic Acids Res.- 1988.- V. 16.-P. 1407-1422.
278. Matsumoto, K., Uno, I., and Ishikawa, T. Regulation of repressible acid phosphatase by cyclic AMP in Saccharomyces cerevisiae II Genetics.- 1984.-V. 108.- P. 53-66.
279. Matsuoka S., Huang M., Elledge S. J. Linkage of ATM to cell cycle regulation by the Chk2 protein kinase // Science.- 1998.- V. 282.- P. 18931897.
280. McCartney R.R., Schmidt M.C. Regulation of Snfl kinase. Activation requires phosphorylation of threonine 210 by an upstream kinase as well as a distinct step mediated by the Snf4 subunit // J. Biol. Chem.- 2001.- V. 276.- P. 36460-36466.
281. McDaniel D., Caplan A.J., Lee M.S., Adams C.C., Fishel B.R., Gross D.S., Garrart W.T. Basal-level expression of the yeast HSP82 gene requires a heat shock regulatory element // Mol. Cell. Biol.- 1989.- V. 9.- P. 4789-4798.
282. Measday V., Moore L., Retnakaran R., Lee J., Donoviel M., Neuman A.M., Andrews B. A family of cyclin-like proteins that interact with the PH085 cyclin-dependent kinase // Mol. Cell. Biol.- 1997.- V.17.- P.1212-1223.
283. Mendenhall M.D., Hodge A.E. Regulation of Cdc28 cyclin-dependent protein kinase activity during the cell cycle of the yeast Saccharomyces cerevisiae II Microbiol. Mol. Biol. Rev.- 1998.-V. 62.- P. 1191-1243.
284. Mercado J.J., Gancedo J.M. Regulatory regions in the yeast FBP1 and PCK1 genes 11 FEBS Lett.- 1992.- V. 311. P. 110-114.
285. Metzgar D., Wills C. Evolutionary changes in mutation rates and spectra and their influence on the adaptation of pathogens// Microbes and infection.-2000.- V.2.-P. 1513-1522.
286. Meyhack В., Baiwa W., Rudolph H., Hinnen A. Two yeast acid phosphatase structural genes are the result of a tandem duplication and show different degrees of homology in their promoter and coding sequences // EMBO J.-1982.- V. 1.- P. 675- 680.
287. Mick S.J., Thach R.E., Hagedorn C.H. Selective inhibition of proteins synthesized from different mRNA species in reticulocyte lysates containing L-pyrroline-5-carboxylic acid // Biochem. Biophys. Res. Commun.- 1988.- V. 150.- P. 296-303.
288. Miller S.M., Magasanik B. Role of NAD-linked glutamate dehydrogenase in nitrogen metabolism in Saccharomyces cerevisiae И J. Bacterid.- 1990. V.172.- P.4927-4935.
289. Miller S.M., Magasanik B. Role of the complex upstream region of the GDH2 gene in nitrogen regulation of the NAD-linked glutamate dehydrogenase in Saccharomyces cerevisiae II Mol. Cell. Biol.- 1991.- V. 11.-P. 6229-6247.
290. Minami Y., Kimura Y., Kawasaki H., Suzuki K., Yahara I. The carboxy-terminal region of mammalian HSP90 is required for its dimerization and function in vivo //Mol. Cell. Biol.- 1994.- V. 14.- P. 1459-1464.
291. Mitchell A.P. The GLN1 locus of Saccharomyces cerevisiae encodes glutamine synthetase // Genetics.- 1985.- V. 111. P. 243-258.
292. Mitchell A.P., Magasanik B. Biochemical and physiological aspects of glutamine synthetase inactivation in Saccharomyces cerevisiae II J. Biol. Chem.- 1984.-V. 259.-P. 12054-12062.
293. Mitchell I., Bevan E.A. Definition of the blue mutant phenotype and its genetic basis in Saccharomyces cerevisiae II Genet Res.- 1973.-V. 22.- P. 169179.
294. Mitsui K., Yaguchi S., Tsurugi K. The GTS1 gene, which contains a Gly-Thr repeat, affects the timing of budding and cell size of the yeast Saccharomyces cerevisiae И Mol. Cell. Biol.- 1994,- V.14.- P. 5569-5578.
295. Miyakawa Y. Identification of a Candida albicans homologue of the PH085 gene, a negative regulator of the PHO system in Saccharomyces cerevisiae // Yeast.- 2000.- V. 16.- P. 1045-1051.
296. Monaco E.A. Recent evidence regarding a role for Cdk5 dysregulation in Alzheimer's disease// Curr. Alzheimer. Res.- 2004.- V. l.-P. 33-38.
297. Monod M, Haguenauer-Tsapis R, Rauseo-Koenig I., and Hinnen A. Functional analysis of the signal-sequence processing site of yeast acid phosphatase // Eur. J. Biochem.- 1989.- V. 182. P. 213-221.
298. Moore S.K., Kozak C., Robinson E.A., Ullrich S.J., Appella E. Murine 86-and 84-kDa heat shock proteins, cDNA sequences, chromosome assignments, and evolutionary origins // J. Biol. Chem.- 1989.- V.264.- P. 5343-5351.
299. Morano K.A., Liu P.C., Thiele D.J. Protein chaperones and the heatshock response in Saccharomyces cerevisiae II Curr. Opin. Microbiol.- 1998.-V. l.-P. 197-203.
300. Morgan D. 0. The dynamics of cyclin-dependent kinase structure // Curr. Opin. Cell. Biol.- 1996.- V.8.- P.767-772.
301. Morrison A., Sugino A. The 3'->5' Exonucleases of both DNA polymerases delta and epsilon participate in correcting errors of DNA replication in Saccharomyces cerevisiae II Mol.Gen.Genet.- 1994.- V. 242.- P. 289-296.
302. Mosch H.U., Fink G.R. Dissection of filamentous growth by transposon mutagenesis in Saccharomyces cerevisiae II Genetics.- 1997.- V.145.- P. 671684.
303. Moskvina E., Imre E.M., Ruis H. Stress factors acting at the level of the plasma membrane induce transcription via the stress response element (STRE) of the yeast Saccharomyces cerevisiae И Mol. Microbiol.- 1999.- V. 32.-P. 1263-1272.
304. Mosley A.L., Lakshmanan J., Aryal B.K., Ozcan S. Glucose-mediated phosphorylation converts the transcription factor Rgtl from a repressor to an activator//J. Biol. Chem.- 2003.-V. 278.- P. 10322-10327.
305. Munn A.L., Stevenson B. J., Geli M.I., Riezman H. end5, end6, and end7: mutations that cause actin derealization and block the internalization step of endocytosis in Saccharomyces cerevisiae II Mol. Biol. Cell.- 1995.- V. 6.-P.1721-1742.
306. Myung K., Chen C., Kolodner R.D. Multiple pathways cooperate in the suppression of genome instability in Saccharomyces cerevisiae II Nature.-2001.- V. 41 l.-P. 1073-1076.
307. Nakao J., Miyanohara A., Toh-e A., Matsubara K. Saccharomyces cerevisiae PH05 promoter region: location and function of the upstream activation site // Mol. Cell.Biol.- 1986.- V. 6.- P.2613-2623.
308. Navarro P., Durrens P., Aigle M. Protein-protein interaction between the RVS161 and RVS167 gene products of Saccharomyces cerevisiae И Biochim. Biophys. Acta.- 1997.-V. 1343.-P. 187-192.
309. Nehlin J.O., Carlberg M., Ronne H. Yeast SKOl gene encodes a bZIP protein that binds to the CRE motif and acts as a repressor of transcription // Nucleic Acids Res.- 1992.- V. 20. P. 5271-5278.
310. Nehlin J.O., Ronne H. Yeast MIG1 repressor is related to the mammalian early growth response and Wilms' tumour finger proteins // EMBO J.- 1990.-V.9.- P. 2891-2898.
311. Nicolson T.A., Conradt В., Wickner W.T. A truncated form of the Pho80 cyclin of Saccharomyces cerevisiae induces expression of a small cytosolic factor which inhibits vacuole inheritance // J. Bacterid.- 1996.-V. 178.- P. 4047-4051.
312. Nicolson T.A., Weisman L.S., Payne G.S., Wickner W.T. A truncated form of the Pho80 cyclin redirects the Pho85 kinase to disrupt vacuole inheritance in S. cerevisiae // J. Cell. Biol.- 1995.- V. 13,- P. 835-845.
313. Nigg E.A. Cyclin-dependent protein kinases: key regulators of the eukaryotic cell cycle // Bioessays.- 1995.- V. 17.- P. 471-480.
314. Nishimura K., Yasumura K., Igarashi K., Harashima S., Kakinuma Y. Transcription of some PHO genes in Saccharomyces cerevisiae is regulated by spt7p // Yeast.- 1999.-V. 15.-P. 1711-1717.
315. Nishizawa M., Kanaya Y., Toh-E A. Mouse Cyclin-dependent Kinase (Cdk) 5 Is a Functional Homologue of a Yeast Cdk, Pho85 Kinase.// J Biol Chem.-1999.- V. 274.- P. 33859-33862.
316. Nishizawa M., Kawasumi М., Fujino М., Toh-e A. Phosphorylation of sic 1, a cyclin-dependent kinase (Cdk) inhibitor, by Cdk including Pho85 kinase is required for its prompt degradation // Mol. Biol. Cell.- 1998.- V.9.- P.2393-2405.
317. Nishizawa M., Tanabe M, Yabuki N., Kitada K., Toh-e A. Pho85 kinase, a yeast cyclin-dependent kinase, regulates the expression of UGP1 encoding UDP-glucose pyrophosphorylase // Yeast.- 2001.- V. 18.-P. 239-249.
318. Nosaka K., Kaneko Y., Nishimura H., Iwashima A. A possible role for acid phosphatase with thiamin-binding activity encoded by РНОЗ in yeast // FEMS Microbiol. Lett.- 1989.- V. 51.- P. 55-59 (a).
319. Ogawa N., De Risi J., Brown P.O. New components of a system for phosphate accumulation and polyphosphate metabolism in Saccharomyces cerevisiae revealed by genomic expression analysis // Mol. Cell. Biol- 2000.- V.ll.- P. 4309-4321.
320. O'Neill, E. M., Kaffman, A., Jolly, E. R., and O'Shea, E. K. Regulation of PH04 nuclear localization by the PH080-PH085 cyclin-CDK complex // Science.- 1996.- V. 271.- P. 209-212.
321. Ozcan S., Dover J., Johnston M. Glucose sensing and signaling by two glucose receptors in the yeast Saccharomyces cerevisiae //EMBO J.- 1998.-V. 17. P. 2566-2573.
322. Ozcan S., Johnston M. Function and regulation of yeast hexose transporters // Microbiol. Mol. Biol. Rev.- 1999,- V.63.- P.554-569.
323. Ozcan S., Johnston M. Three different regulatory mechanisms enable yeast hexose transporter (HXT) genes to be induced by different levels of glucose // Mol. Cell. Biol.- 1995.- V. 15. P. 1564-1572.
324. Ozcan S., Leong Т., Johnston M. Rgtlp of Saccharomyces cerevisiae? A key regulator of glucose-induced genes? Is both an activator and repressor of transcription // Mol. Cell. Biol.- 1996.- V. 16.- P. 6419-6426.
325. Ozcan S., Schulte F., Freidel K., Weber A., Ciriacy M. Glucose uptake and metabolism in grrl/cat80 mutants of Saccharomyces cerevisiae II Eur. J. Biochem.- 1994.- V. 224. P. 605-611.
326. Palecek S.P., A.S.Parick, J.H.Huh, S.J. Kron Depression of Saccharamyces cerevisiae invasive growth on non-glucose carbon sources requires the Snfl kinase // Mol. Microbiol.- 2002.- V.48.- P. 453-469.
327. Pan X., Heitman J. Cyclic AMP-dependent protein kinase regulates pseudohyphal differentiation of Saccharomyces cerevisiae // Mol. Cell. Biol.- 1999.- V.19.- P. 4874-4887.
328. Papamichos -Chronakis M., Gligoris Т., Tzamarias D. The Snfl kinase controls glucose repression in yeast by modulating interactions between the Migl repressor and the Cyc8-Tupl co-repressor // EMBO Rep.- 2004.- V. 5.-P. 368-372.
329. Parthun M.R., Mangus D.A., Jaehning J.A. The EGD1 product, a yeast homolog of human BTF3, may be involved in GAL4 DNA binding // Mol. Cell. Biol.- 1992.- V. 12.- P. 5683-5689.
330. Paulovich A.G., Hartwell L.H. A checkpoint regulates the rate of progression through S phase in S. cerevisiae in response to DNA damage // Cell.- 1995.-V. 82.- P. 841-847.
331. Pavlov Y. I., Shcherbakova P.V., Kunkel T.A. In vivo consequences of putative active site mutations in yeast DNA polymerases a, c, 5, С, II Genetics.-2001.-V. 159.- P. 47-64.
332. Payne W.E., Gannon P.M., Kaiser C.A. An inducible acid phosphatase from the yeast Pichia pastoris: characterization of the gene and its product // Gene.-1995.-V.163.- P. 19-26.
333. Pearl L.H., Prodromou C. Structure, function, and mechanism of the Hsp90 molecular chaperone // Adv. Protein Chem.- 2001.- V. 59.- P. 157-186.
334. Persson B.L., Petersson J., Fristedt U., Weinander R., Berhe A., Pattison J. Phosphate permeases of Saccharomyces cerevisiae: structure, function and regulation // Biochim. Biophys. Acta.- 1999.- V. 1422.- P. 255272.
335. Pryne D.W., Schott D.H., Bretscher A. Tropomyosin-containing actin cables direct the Myo2p-dependent polarized delivery of secretory vesicles in budding yeast//J. Cell. Biol.- 1998.-V. 143.-P.-1931-1945.
336. Queitsch C., Sangster T.A., Lindquist S. Hsp90 as a capacitor of phenotypic variation // Nature.- 2002.- V. 417. P.618-624.
337. Rahner A., Hiesinger M., Schuller H.J. Deregulation of gluconeogenetic structural genes by variants of the transcriptional activator Cat8 of the yeast Saccharomyces cerevisiae II Mol. Microbiol.- 1999.- V. 34,- P. 146-156.
338. Randez-Gil F., Sanz P., Entian K.D., Prieto J.A. Carbon source-dependent phosphorylation of hexokinase PII and its role in the glucose-signaling response in yeast//Mol. Cell. Biol.- 1998.- V. 18. P. 2940-2948.
339. Rappsilber J., Siniossoglou S., Hurt E.C., Mann M. A generic strategy to analyze the spatial organization of multi-protein complexes by cross-linking and mass spectrometry // Anal. Chem.- 2000.- V.72. P. 267-275.
340. Rasmussen S.W. A 37.5 kb region of yeast chromosome X includes the SME1, MEF2, GSH1 and CSD3 genes, a TCP-1-related gene, an open reading frame similar to the DAL80 gene, and a tRNA(Arg) // Yeast.- 1995.- V. 11.-P. 873-883.
341. Riego L., Avendano A., DeLuna A., Rodriguez E., Gonzalez A. GDH1 expression is regulated by GLN3, GCN4, and HAP4 under respiratory growth // Biochem. Biophys. Res. Commun.- 2002.- V. 293. P. 79-85.
342. Rivin C.J., Fangman W.L. J. Cell cycle phase expansion in nitrogen-limited cultures of Saccharomyces cerevisiae И Cell. Biol.- 1980,- V. 85.- P. 96-107.
343. Roe S.M., Prodromou С., O'Brien R., Ladbury J.E., Piper P.W.,
344. Pearl L.H. Structural basis for inhibition of the Hsp90 molecular chaperone by the antitumor antibiotics radicicol and geldanamycin // J. Med. Chem.- 1999.-V. 42.-P. 260-266.
345. Rogers D.T., Lemire J.M., Bostian K.A. Acid phosphatase polypeptides in Saccharomyces cerevisiae are encoded by a differentially regulated multigene family // Proc. Natl. Acad. Sci. USA.- 1982.- V. 79.-P. 2157-2161.
346. Rolland F., Winderickx J., Thevelein J.M. Glucose-sensing and -signalling mechanisms in yeast // FEMS Yeast Res.- 2002.- V. 2.- P. 183-201.
347. Ronne H. Glucose repression in fungi // Trends Genet.- 1995.- V. 11. P. 1217.
348. Rosenkrantz M., Alam Т., Kim K.S., Klark B.J., Srere P.A., Guarente L. Mitochondrial and nonmitochondrial citrate synthases in Saccharomyces cerevisiae are encoded by distinct homologous genes // Mol Cell Biol.-1986.V.- 6. P. 4509-4515.
349. Rosenkrantz M., Kell C.S., Pennell E.A., Devenish L.J. The HAP2,3,4 transcriptional activator is required for derepression of the yeast citrate synthase gene, CIT1 // Mol. Microbiol.- 1994.- V. 13.- P. 119-131.
350. Rosenkrantz M., Kell C.S., Pennell E.A., Webster M., Devenish L.J. Distinct upstream activation regions for glucose-repressed and derepressed expression of the yeast citrate synthase gene CIT1 // Curr. Genet.- 1994,- V. 25.- P.185-195.
351. Rouxel Т., Danchin A., Henaut A. METALGEN.DB: metabolismlinked to the genome of Escherichia coli, a graphics-oriented database // Comput. Appl. Biosci.- 1993.- V. 9.- P. 315-324.
352. Rudolph H., Hinnen A. The yeast PH05 promoter: phosphate-control elements and sequences mediating mRNA start-site selection // Proc. Natl. Acad. Sci. USA.- 1987.- V. 84.- P. 1340-1344.
353. Rutherford S.L., Lindquist S. Hsp90 as a capacitor for morphological evolution // Nature.- 1998.- V. 396. P. 336-342.
354. Sambuk E.V., Popova J.G., O.Demberelijn, Smirnov M.N. Genetic analysis of suppressors of pho85 mutations in Saccharomyces cerevisiae // 1995.- 17th Int.Conf.on yeast genetics and molecular biology. S.89, Lisboa, Portugal.
355. Sanger F., Nicklen S., Coulson A.R. DNA sequencing with chain-terminating inhibitors // Proc. Nath.Acad.Sci. USA.- 1977.- V. 74.- P.5463-5467.
356. Santos R. C., Waters N. C., Creasy C. L., Bergman L. W. Structure-function relationships of the yeast cyclin-dependent kinase Pho85 // Mol. Cell. Biol.-1995.-V.15.-P. 5482-5891.
357. Sanz P. Snfl protein kinase: a key player in the response to cellular stress in yeast // Biochem. Soc. Trans.- 2003.- V. 31. P. 178-181.
358. Sanz P., Alms G.R., Haystead T.A., Carlson M. Regulatory interactions between the Regl-Glc7 protein phosphatase and the Snfl protein kinase // Mol. Cell. Biol.- 2000.- V. 20,- P. 1321-1328.
359. Schmitt H.D., M.Ciriacy, F.K.Zimmermann The synthesis of yeast pyruvate decarboxylase is regulated by large variations in the messenger RNA level // Mol. Gen. Genet.- 1983.- V.192- P.247-252.
360. Schneider K.R., Smith R.L., O'Shea E.K. Phosphate-regulated inactivation of the kinase PH080-PH085 by the CDK inhibitor PH081 // Science.- 1994.- V. 266.- P.122-126.
361. Schott D.H., Collins R.N., Bretcher A. Secretory vesicle transport velocity in living cells depends on the myosin-V lever arm length // J. Cell. Biol.- 2002.-V. 156.-P. 35-39.
362. Schuller H.J. Transcriptional control of nonfermentative metabolism in the yeast Saccharomyces cerevisiae II Curr. Genet.- 2003. V.43.- P. 139-160.
363. Schwock J., Kichberger J., Edelmann A., Kriegel T.M., Kopperschlager G. Interaction of 6-phosphofructokinase with cytosolic proteins of Saccharomyces cerevisiae // Yeast.- 2004.- V. 21,- P. 483-494.
364. Scott M.S., Perkins Т., Bunnell S., Pepin F., Thomas D.Y., Hallett M. Identifying regulatory subnetworks for a set of genes // Mol. Cell. Proteomics.- 2005.- V. 4. P.683-692.
365. Scowyra D., Craig K.L., Tyers M., Elledge S.J., Harper J. W. Fbox proteins are receptors, that recruit phosphorylated substrates to the SCF ubiquitin-ligase complex // Cell.- 1997.- V. 91.-P. 209-219.
366. Sekito Т., Liu Z., Thornton J., Butow R.A. RTG-dependent mitochondria-to-nucleus signaling is regulated by MKS1 and is linked to formation of yeast prion URE3. // Mol. Biol. Cell.- 2002.- V. 13.- P. 795-804.
367. Sekito Т., Thornton J., Butow R.A. Mitochondria-to-nuclear signaling is regulated by the subcellular localization of the transcription factors Rtglp and Rtg3p // Mol. Biol. Cell.- 2000.- V. 11.- P.2103-2115.
368. Serrano R., Ruiz A., Bernal D., Chambers J.R., Arino The transcriptional response to alkaline pH in Saccharomyces cerevisiae: evidence for calcium-mediated signaling//Mol. Microbiol.- 2002,- V. 46. P. 1319-1333.
369. Shao D., Creasy C.L., Bergman L. W. A cysteine residue in helixll of the bHLH domain is essential for homodimerization of the yeast transcription factor Pho4p // Nucl. Acids Res.- 1998.- V.26.- P. 710-714.
370. Shao D., Creasy C.L., Bergman L. W. Interaction of Saccharomyces cerevisiae Pho2 with Pho4 increases the accessibility of the activation domain of Pho4// Mol. Gen. Genet.- 1996.- V. 25.- P. 358-364.
371. Sharma P., Sharma M., Amin N.D. Albers R.W., Pant H.C. Regulation of cyclin-dependent kinase 5 catalytic activity by phosphorylation // Proc. Natl. Acad. Sci. U S A.- 1999.- V. 96. P.l 1156-11160.
372. Sheaff R. J., Roberts J.M. End of the line: proteolytic degradation of cyclin-dependent kinase inhibitors // Chem. Biol.- 1996.- V. 3.- P.869-873.
373. Shi X., Parthun M.R., Jaehning J.A. The yeast EGD2 gene encodesa homologue of the alpha NAC subunit of the human nascent-polypeptide-associated complex // Gene.- 1995.- V. 165.- P. 199-202.
374. Shi X.Z., Ao S.Z. Analysis of phosphorylation of YJL084c, a yeast protein // Sheng Wu Hua Yu Sheng Wu Wu Li Xue Bao.- 2002.-V. 34.- P. 433-438.
375. Shnyreva M. G., Petrova E. V., Egorov S. N., Hinnen A. Biochemical properties and excretion behavior of repressible acid phosphatases with altered subunit composition // Microbiol. Res.- 1996.- V. 151. P. 291-300.
376. Siddique A.H., Brandriss M.C. The Saccharomyces cerevisiae PUT3 activator protein associates with proline-specific upstream activation sequences // Mol Cell Biol.- 1989.- V. 9.- P. 4706-4712.
377. Sloan J.S., Dombek K.M., Young E.T. Post-translational regulation of Adrl activity is mediated by its DNA binding domain // J.Biol. Chem.- 1999.- V. 274.- P. 37575-37582.
378. Smart W.C., Coffman J.A., Cooper T.G. Combinatorial regulation of the Saccharomyces cerevisiae CAR1 (arginase) promoter in response to multiple environmental signals // Mol Cell Biol.- 1996.- V. 16.- P. 5876-5887.
379. Sorger P.K., Pelham H.R. Purification and characterization of a heat-shock element binding protein from yeast // EMBO J.- 1987.- V. 6. P. 3035-3041.
380. Springael J.-Y., Penninckx M.J. Nitrogen -source regulation of yeast r-glutamil transpeptidase synthesis involves the regulatory network including the GATA zinc-finger factors Gln3, Nil 1/Gat 1 and Gzf3 // Biochem. J.-2003.- V. 371.- P. 589-595.
381. Springer M., D.D. Wykoff, N. Miller, E.K. O'Shea Partially phosphorylated Pho4 activates transcription of a subset of phosphate-responsive genes // PLoS Biology.- 2003.- V.I.- P. 261-270.
382. Srethapakdi M., Liu F., Tavorath R., Rosen N. Inhibition of Hsp90 function by ansamycins causes retinoblastoma gene product-dependent G1 arrest // Cancer Res.- 2000.- V.60.- P. 3940-3946.
383. Stafford D.E., Stephanopoulos G. Metabolic engineering as an integrating platform for strain development // Curr. Opin. Microbiol.- 2001.- V.4.- P. 336340.
384. Stanbrough M., Magasanik B. Two transcription factors, Gln3p and Nillp, use the same GATAAG sites to activate the expression of GAP1 of Saccharomyces cerevisiae II J. Bacteriol.- 1996.- V. 178. P.2465-2468.
385. Surana U., Robitsch H., Price C., Schuster Т., Fitch I., Futcher A.B., Nasmyth K. The role of CDC28 and cyclins during mitosis in the budding yeast S. cerevisiae // Cell.-1991.- V. 65.- P. 145-161.
386. Svaren J., Horz W. Transcription factors vs nucleosomes: regulation of the PH05 promoter in yeast // Trends Biochem. Sci.- 1997.- V. 22.- P. 93-97.
387. Svaren J., Schmitz J., Horz W. The transactivation domain of Pho4is required for nucleosome disruption at the PH05 promoter //EMBO J.-1994.- V. 13,-P. 4856-4862.
388. Svetlov V.V., Cooper T.G. The Saccharomyces cerevisiae GATA factors Dal80p and Dehlp can form homo- and heterodimeric complexes // J. Bacterid.- 1998.- V. 180.- P. 5682-5688.
389. Swinnen E., Rossellls J., Winderickx J. The minimum domain of Pho81 is not sufficient to control the Pho85-Riml5 effector branch involved in phosphate starvation-induced stress responses // Curr Genet.- 2005.- V. 48.- P. 18-33.
390. Szent-Gyorgyi C. A bipartite operator interacts with a heat shock element to mediate early meiotic induction of Saccharomyces cerevisiae HSP82 // Mol. Cell. Biol.- 1995.- V. 15.- P. 6754-6769.
391. Tachibana C., Yoo J.Y., Tagne J.B. et al. Combined global localization analysis and transcriptome data identify genes that are directly coregulated by Adrl and Cat8 // Mol.Cell. Biol.-2005.- V. 25.- P. 2138-2146.
392. Tamai Y., Toh-e A., Oshima Y. Regulation of inorganic phosphate transport systems in Saccharomyces cerevisiae II J. Bacteriol.- 1985.-V. 164.- P. 964968.
393. Tanaka K., Okayama H. A pel-like cyclin activates the Res2p-Cdcl0p cell cycle "start" transcriptional factor complex in fission yeast // Mol. Biol. Cell.-2000.-V. 11.-P. 2845-2862.
394. Tennison C.N., Lee J., Andrews B.J. A role for the Pcl9-Pho85 cyclin-cdk complex at the M/Gl boundary in Saccharomyces cerevisiae II Mol. Microbiol.- 1998.- V.28.- P.69-79.
395. Ter Schure E. G., van Riel N. A., Verrips C.T. The role of ammonia metabolism in nitrogen catabolite repression in Saccharomyces cerevisiae // FEMS Microbiol. Rev.- 2000.- V. 24.- P.67-83.
396. Tercero J.A., Diffley J.F. Regulation of DNA replication fork progression through damaged DNA by the Mecl/Rad53 checkpoint // Nature.- 2001.- V. 412.- P.553-557.
397. Then Bergh F., Flinn E.M., Svaren J., Wright A.P., Horz W. Comparison of nucleosome remodeling by the yeast transcription factor Pho4 and the glucocorticoid receptor // J. Biol. Chem.- 2000.- V. 275.-P. 9035-9042.
398. Thevelein J.M. Signal transduction in yeast // Yeast.- 1994.- V. 10. P. 17531790.
399. Thill G.P., Kramer R.A., Turner K.J., Bostian K. A. Comparative analysis of the 5'-end regions of two repressible acid phosphatase genes in Saccharomyces cerevisiae II Mol. Cell. Biol.-1983.- V. 3.- P. 570-579.
400. Thukral S.K., Eisen A., Young E.T. Two monomers of yeast transcription factor ADR1 bind a palindromic sequence symmetrically to activate ADH2 expression//Mol .Cell. Biol.-1991.- V.l 1-P.l566-1577.
401. Timblin В. К., Tatchell К., Bergman L. W. Deletion of the gene encoding the cyclin-dependent protein kinase Pho85 alters glycogen metabolism in Saccharomyces cerevisiae II Genetics.- 1996.- V.143.- P. 5766.
402. Tisi R., Baldassa S., Belotti F., Martegani E. Phospholipase С is required for glucose-induced calcium influx in budding yeast // FEBS Lett.- 2002.- V. 520.-P. 133-138.
403. Toda T;, Cameron S., Sass P., Zoller M., Wigler M. Three different genes in S. cerevisiae encode the catalytic subunits of the cAMP-dependent protein kinase // Cell.- 1987.- V.50.-P. 277-287. (b)
404. Toh-E A., Inouye S., Oshima Y. Structure and function of the PH082-pho4 locus controlling the synthesis of repressible acid phosphatase of Saccharomyces cerevisiae II J. Bacteriol.- 1981.-V. 145.- P. 221-232.
405. Toh-E A., Kakimoto S. Genes coding for the structure of the acid phosphatases in Saccharomyces cerevisiae II Mol. Gen. Genet.- 1975.- V. 143.- P. 65-70.
406. Toh-E A., Schimauchi T. Cloning and sequencing of the PH080 gene and CEN15 of Saccharomyces cerevisiae И Yeast.- 1986,- V. 2. P. 129-139.
407. Toh-E A., Tanaka K., Uesono Y., Wickner R.B. PH085, a negative regulator of the PHO system, is a homolog of the protein kinase gene, CDC28, of Saccharomyces cerevisiae II Mol Gen Genet.- 1988.- V. 214.-P. 162-164.
408. Treitel M.A., Carlson M. Repression by SSN6-TUP1 is directed by MIG1, a repressor/activator protein // Proc. Natl. Acad. Sci. USA.- 1995.- V. 92.- P. 3132-3136.
409. Treitel M.A., Kuchin S., Carlson M. Snfl protein kinase regulates phosphorylation of the Migl repressor in Saccharomyces cerevisiae II Mol. Cell. Biol.- 1998.-V. 18-P. 6273-6280.
410. Tsai L.H., Delalle I., Caviness V.S.Js, Chae Т., Harlow E. p35 is a neural-specific regulatory subunit of cyclin-dependent kinase 5 // Nature.- 1994.- V. 371.- P. 419-423.
411. Turoscy V., Chisholm G., Cooper T.G. Location of the genes that control induction of the allantoin-degrading enzymes in Saccharomyces cerevisiae H Genetics.- 1984.- V. 108.- P. 827-831.
412. Turoscy V., Cooper T.G. Pleiotropic control of five eucaryotic genes by multiple regulatory elements // J. Bacteriol.- 1982,- V.151.- P. 1237-1246.
413. Tyler В., Magasanik B. Physiological basis of transient repression of catabolic enzymes in Escherichia coli H J. Bacteriol.- 1970.- V. 102.- P. 411-422.
414. Tzamarias D., Struhl K. Distinct TPR motifs of Cyc8 are involved in recruiting the Cyc8-Tupl corepressor complex to differentially regulated promoters // Genes Dev.- 1995.- V. 9.- P. 821-831.
415. Uemura H., Koshio M., Inoue J., Lopez M.C., Baker H.V. The role of Gcrlp in the transcriptional activation of glycolytic genes in yeast Saccharomyces cerevisiae I I Genetics.- 1997.- V. 147.- P. 521-532.
416. Uesono Y., Tanaka K., Toh-e A. Negative regulators of the PHO system in Saccharomyces cerevisiae: isolation and structural characterization of PH085 //Nucleic Acids Res.- 1987.-V. 15.- P. 10299-10309.
417. Uesono Y., Tokai M., Tanaka K., Toh-e A. Negative regulators of the PHO system of Saccharomyces cerevisiae: characterization of PH080 and PH085 // Mol Gen Genet.-1992.- V. 231.- P. 426-432.
418. Uetz P., Hughes R.E. Systematic and large-scale two-hybrid screens // Curr. Opin. Microbiol.- 2000.- V. 3. P. 303-308.
419. Valenzuela L., Regulation of expression of GLT1, the gene encoding glutamate synthase in Saccharomyces cerevisiae II J. Bacteriol.-1998.-V. 180.-P. 3533-3540.
420. Vandenbol M., Jauniaux J.C., Grenson M. The Saccharomyces cerevisiae NPR1 gene required for the activity of ammonia-sensitive amino acid permeases encodes a protein kinase homologue // Mol. Gen. Genet.- 1990.- V. 222.- P. 393-399.
421. Venter U., Svaren J., Schmitz J., Schmid A., Horz W. A nucleosome precludes binding of the transcription factor Pho4 in vivo to a critical target site in the PH05 promoter // EMBO J.- 1994.- V. 13. P. 4848-4855.
422. Verdone L., Cesari F., Denis C.L., Di Mauro E., Caserta M. Factors affecting Saccharomyces cerevisiae ADH2 chromatin remodeling and transcription // J. Biol. Chem.- 1997.- V.272.- P.30828-30834.
423. Versele M., de Winde J.H., Thevelein J.M. A novel regulator of G protein signalling in yeast, Rgs2, downregulates glucose-activation of the cAMP pathway through direct inhibition of Gpa2 // EMBO J.- 1999.- V. 18.- P. 5577-5591.
424. Vincent O., Carlson M. Gal83 mediates the interaction of the Snfl kinase complex with the transcription activator Sip4 // EMBO J.- 1999.- V. 18. P. 6672-6681.
425. Vincent О., Carlson M. Sip4, a Snfl kinase-dependent transcriptional activator, binds to the carbon source-responsive element of gluconeogenic genes // EMBO J.- 1998.- V. 17.- P. 7002-7008.
426. Vincent O., Townley R., Kuchin S., Carlson M. Subcellular localization of the Snfl kinase is regulated by specific beta subunits and a novel glucose signaling mechanism//Genes Dev.- 2001.-V. 15.-P. 1104-1114.
427. Vogel K., Horz W., Hinnen A. The two positively acting regulatory proteins PH02 and PH04 physically interact with PH05 upstream activation regions // Mol. Cell. Biol.- 1989.- V. 9.- P. 2050-2057.
428. Vyas V.K., Kuchin S., Berkey C.D., Carlson M. Snfl kinases with different beta-subunit isoforms play distinct roles in regulating haploid invasive growth // Mol. Cell. Biol.- 2003.- V. 23,- P. 1341-1348.
429. Vyas V.K., Kuchin S., Carlson M. Interaction of the repressors Nrgl and Nrg2 with the Snfl protein kinase in Saccharomyces cerevisiae II Genetics.- 2001.-V. 158. P. 563-572.
430. Wang S.S., Brandriss M.C. Proline utilization in Saccharomyces cerevisiae: sequence, regulation, and mitochondrial localization of the PUT1 gene product // Mol. Cell. Biol.- 1987.- V. 7.- P. 4431-4440.
431. Whistler J.L., Rine J. Ras2 and Rasl protein phosphorylation in Saccharomyces cerevisiae 111. Biol. Chem.- 1997.- V. 272. V. 18790-18800.
432. Wickert S., Fink M., Herz В., Ernst J. F. A small protein (Agslp) and the Pho80p-Pho85p kinase complex contribute to aminoglycoside antibiotic resistance of the yeast Saccharomyces cerevisiae II J. Bacteriol.- 1998.-V.180.- P.1887-1894.
433. Williamson D. H., Fennell D. J. Visualization of yeast mitochondrial DNA with fluorescent stain "DAPI"// Methods Enzymol.- 1979.- V.56.- P.728-733.
434. Willis K. A., Barbara K.E., Menon B.B., Moffat J., Andrews В., Santangelo G.M. The global transcriptional activator of Saccharomyces cerevisiae,
435. Gcrlp, mediates the response to glucose by stimulating protein synthesis and CLN-dependent cell cycle progression // Genetics.- 2003. V.165.- 1017-1029.
436. Wills C. Regulation of sugar and ethanol metabolism in Saccharomyces cerevisiae II Crit. Rev. Biochem. Mol. Biol.- 1990.- V. 25.- P. 245-280. Review.
437. Wu D., Dou X., Hashmi S.B., Osmani S.A. The Pho80-like cyclin of Aspergillus nidulans regulates development independently of its role in phosphate acquisition // J. Biol. Chem.- 2004,- V. 279. P. 37693-37703.
438. Wu J., Zhang N., Hayes A., Panousopoulou K., Oliver S.G. Global analysis of nutrient control of gene expression in Saccharomyces cerevisiae during growth and starvation // Proc. Natl. Acad. Sci. U S A.- 2004,- V. 101.- P. 3148-3153.
439. Wu W.H., Hampsey M. An activation -specific role for transcription factor TFIIB in vivo// Proc. Natl. Acad. Sci. USA.-1999.- V.96.- P.2764-2769.
440. Xing Y., Fikes J.D., Guarente L. Mutations in yeast НАР2/ HAP3 define a hybrid CCAAT box binding domain // EMBO J.- 1993.- V. 12.- P. 4647-4655.
441. Xu S., Falvey D.A., Brandriss M.C. Roles of URE2 and GLN3 in the proline utilization pathway in Saccharomyces cerevisiae // Mol Cell Biol.- 1995.- V. 15.- P. 2321-2330.
442. Yaffe M.P., Stuurman N., Vale R.D. Mitochondrial positioning in fission yeast is driven by association with dynamic microtubules and mitotic spindle poles // Proc. Natl. Acad. Sci. U S A.- 2003.- V. 100.- P. 11424-11428.
443. Yang X., Jiang R., Carlson M. A family of proteins containing a conserved domain that mediates interaction with the yeast SNF1 protein kinase complex //EMBO J.- 1994.- V. 1. P. 5878-5886.
444. Young E.T., Kacherovsky N., Van Ripen K. Snfl protein kinase regulates Adrl binding to chromatin but not transcriptional activation // J. Biol. Chem.-2002.- V. 277.-P. 38095-38103.
445. Yun D.F., Sherman F. Degradation of CYC1 mRNA in the yeast Saccharomyces cerevisiae does not require translation // Proc. Natl. Acad. Sci. U S A.- 1996.- V. 93. P. 8895-8900.
446. Zacharski C.A., Cooper T. G. Metabolic compartmentation in Saccharomyces cerevisiae II J. Bacterid.- 1978.- V. 135- P. 490-497.
447. Zelder O., Hauer B. Environmentally directed mutations and their impact on industrial biotransformation and fermentation processes // Curr. Opin. Microbiol.- 2000.- V. 3.- P. 248-251.
448. Zeng X., Deminoff S.J., Santangelo G.M. Specialized Raplp/Gcrlp transcriptional activation through Gcrlp DNA contacts requires Gcr2p, as does hyperphosphorylation of Gcrlp // Genetics.- 1997.- V. 147.- P. 493-505.
449. Zhao R., Davey M., Hsu Y.C. et al. Navigating the chaperone network: an integrative map of physical and genetic interactions mediated by the hsp90 chaperone // Cell.- 2005.- V. 120.- P. 715-727.
450. Zurita- Martinez S.A., Cardenas M.E. Tor and cyclic AMP-protein kinase A: two parallel pathways regulating expression of genes required for cell growth // Eukaryot. Cell.- 2005.- V. 4.- P. 63-71.
451. В заключение считаю своим приятным долгом выразить искреннюю признательность Сергею Георгиевичу Инге-Вечтомову, воодушевлявшему и консультировавшему меня в течение всей работы над диссертацией.
452. Я благодарна Михаилу Николаевичу Смирнову, заведующему лабораторией биохимической генетики, который всячески поддерживал наши исследования.
453. Я глубоко признательна Марине Владимировне Падкиной за ценные советы и замечания, а также за интересную многолетнюю совместную работу на поприще биохимической генетики.
454. Я благодарна Анне Владимировне Дукельской и Галине Алексеевне Артемьевой за внимание к работе и дружескую поддержку.
455. Хочется отдельно поблагодарить сотрудников центра «Хромас» БиНИИ СПбГУ за техническую поддержку при проведении исследований и Романа Петровича Костюченко за ценные методические советы.
456. В заключение хочется поблагодарить всех генетиков и биохимиков, стоявших у истоков генетико-биохимического изучения кислых фосфатаз дрожжей в Санкт-Петербургском университете, результаты исследований которых послужили фундаментом настоящей работы.
-
Самбук, Елена Викторовна
-
доктора биологических наук
-
Санкт-Петербург, 2006
-
ВАК 03.00.15
- Исследование генетических механизмов корегуляции метаболизма азота и фосфора у дрожжей Saccharomyces cerevisiae
- Координация экспрессии генов, контролирующих метаболизм пуринов и аминокислот у дрожжей Saccharomyces cerevisiae
- Изучение регуляции синтеза фосфатаз у дрожжей Saccharomyces cerevisiae
- Морфофизиологические и биотехнологические особенности дрожжей рода Saccharomyces в зависимости от состава питательной среды
- Генетический контроль чувствительности про- и эукариотических микроорганизмов к мутагенным аналогам пуринов
