Бесплатный автореферат и диссертация по биологии на тему
Эпидемиология и молекулярно-генетические основы наследственных болезней нервной системы в Республике Башкортостан
ВАК РФ 03.00.15, Генетика
Автореферат диссертации по теме "Эпидемиология и молекулярно-генетические основы наследственных болезней нервной системы в Республике Башкортостан"
РОССИЙСКАЯ АКАДЕМИЯ НАУК УФИМСКИЙ НАУЧНЫЙ ЦЕНТР
ИНСТИТУТ БИОХИМИИ И ГЕНЕТИКИ
На правах рукописи
ХИДИЯТОВА ИРИНА МИХАЙЛОВНА
ЭПИДЕМИОЛОГИЯ И МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ОСНОВЫ НАСЛЕДСТВЕННЫХ ЗАБОЛЕВАНИЙ НЕРВНОЙ СИСТЕМЫ В РЕСПУБЛИКЕ БАШКОРТОСТАН
03.00.15. - генетика
Автореферат диссертации на соискание учгвоИ доктора биологически!; г§г
003457909
Уфа- 2008
003457909
Работа выполнена в Институте биохимии и генетики Уфимского научного центра РАН
Научный консультант:
доктор биологических наук, профессор Хуснутдинова Эльза Камилевна
Официальные оппоненты:
доктор биологических наук, профессор Мусгафина Ольга Евгеньевна Институт биохимии и генетики УНЦ РАН
доктор биологических наук
Голденкова Ирина Васильевна
Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН
доктор медицинских наук, профессор Петрин Александр Николаевич
Медико-стоматологический московский государственный университет МЗ РФ
Ведущее учреждение:
ГУ Медико-генетический научный центр РАМН
Защита состоится 25 декабря 2008г. в_14.00_час.
на заседании Диссертационного совета ДМ 092.133.01 по адресу: г.Уфа, 450054, Проспект Октября, 71 http://vyww.anrb.ru/niolgeii/dissov.html
С диссертацией можно ознакомиться в библиотеке Уфимског о научного центра РАН
Автореферат разослан «___»_2008г.
Ученый секретарь Диссертационного совета кандидат биологических наук
С.М.Бикбулатова
ОБЩАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА РАБОТЫ
Актуальность проблемы Изучение молекулярно-генетической природы наследственных и наследственно предрасположенных заболеваний является основой для познания их патогенеза, разработки высокоточных методов ДНК-диагностики, методов профилактики и лечения. В структуре моногенных заболеваний (МЗ) значительную часть составляют наследственные болезни нервной системы (НБНС), более для 300 из которых полностью
расшифрованы молекулярные дефекты или установлена хромосомная локализация мутантных генов. Большинство НБНС носит тяжелый прогрессирующий характер, часто приводит к ранней инвалидизации, а иногда и смерти больного, но эффективное лечение в настоящее время возможно лишь для некоторых из этих заболеваний. Поэтому разработка наиболее эффективных методов медико-генетического консультирования (МГК), включающих ДНК-диагностику, в том числе пренатальную и пресимптоматическую, направленная на профилактику МЗ, имеет большое социально-экономическое значение.
Многие НБНС являются клинически и генетически гетерогенными, что значительно затрудняет их дифференциальную диагностику и, соответственно, медико-генетическое консультирование. Для большинства МЗ существуют популяционные различия, как по распространенности, так и по спектру и частоте мутаций в генах, детерминирующих их развитие. Поэтому для обеспечения наиболее эффективного МГК необходимо изучение распространенности и молекулярно-генетических основ наследственных заболеваний (НЗ) в отдельных регионах и этнических группах. Причины распространения в регионе тех или иных НЗ могут быть связаны как со структурными особенностями ответственных генов, так и с генетической структурой популяций, формирование которых происходит под воздействием различных факторов микроэволюции, среди которых в настоящее время наиболее значимыми могут являться дрейф генов и миграции. Изучение процессов изоляции и миграции возможно на основе анализа брачно-миграционной структуры популяций [Гинтер Е.К., Зинченко P.A., 2006].
Актуальность популяционно-генетического исследования моногенной патологии, в частности, НБНС, в Республике Башкортостан (РБ) определялась значительным своеобразием генофонда ее населения, формирование которого имеет длительную и сложную историю. Территория Южного Урала, где располагается РБ, как и всего Волго-Уральского региона, находясь на границе двух частей света - Европы и Азии, - с древнейших времен была ареной постоянных генетических контактов между сибирскими, индоевропейскими, среднеазиатскими и другими этническими образованиями. Сегодня РБ имеет многонациональный состав населения с общей с численностью 4104336 человек. Коренное население республики - башкиры, численность которых, по данным переписи 2002г., составляет 1.2 млн. человек (29.8%); наиболее многочисленными представителями других национальностей являются русские (36.3%) и татары (24.1 %). На основании
полученных нами ранее данных по изучению полиморфизма ядерной и митохондриальной ДНК в популяциях Волго-Уральского региона, в том числе в четырех этногеографических группах башкир, было установлено своеобразие генетической структуры народов этого региона, определен вклад европеоидного и монголоидного компонентов в их генофонд и показана их генетическая подразделенность [Хуснутдинова Э.К., Хидиятова И.М., Викторова Т.В. и др., 1991, 1993, 1994, 1998, 1999]. Эти и многие другие исследования по изучению разнообразия генома человека в популяциях, проведенные в рамках международных и национальных программ «Геном человека» в 90-х годах XX столетия, послужили основой для разработки нового направления в молекулярной генетике человека - этногеномики, - и определили основные перспективы его развития, среди которых важнейшее место занимает исследование молекулярной структуры наследственной патологии в различных популяциях.
Частыми наследственными заболеваниями условно принято считать такие, распространенность которых составляет > 1: 50000 населения [Гинтер Е.К., Зинченко P.A., 2006]. К ним относятся такие НБНС, как миотоническая дистрофия, хорея Гентингтона, миодистрофия Дюшенна/Беккера, моторно-сенсорные нейропатии, неравномерная распространенность которых в РБ была показана еще в 80-х годах проф. Магжановым Р.В. и сотрудниками кафедры неврологии БГМУ. С развитием методов молекулярной генетики появилась возможность изучения молекулярных основ этих заболеваний, выявления популяционного разнообразия их генетических форм и генетических механизмов распространения в популяциях.
Особый интерес для современной медицинской генетики представляют популяционные и молекулярно-генетические исследования болезни Паркинсона (БП) - одного из наиболее частых заболеваний нервной системы, чаще всего имеющего многофакторную природу со значительным вкладом генетического компонента. Актуальность этих исследований определяется нерешенностью проблемы генетической основы патогенеза БП, существованием многочисленных моногенных форм заболевания, отсутствием информации о распространенности семейных и спорадических форм заболеваний в различных регионах и этнических группах.
В целом, выявление этно-территориальных особенностей
распространенности и генетической природы наследственных и наследственно предрасположенных заболеваний является основой для создания эффективной системы их мониторинга и разработки методов диагностики и профилактики, оптимальных для конкретного региона.
Цель я задачи исследования
Целью работы является изучение молекулярно-генетических основ, популяционно-демографических и генетических механизмов распространения ряда частых наследственных заболеваний нервной системы в Республике Башкортостан и разработка оптимальных для региона подходов их ДНК-диагностики.
Для достижения поставленной цели были сформулированы следующие задачи:
1. Провести анализ брачно-миграционной структуры в шести районах РБ и охарактеризовать основные демографические факторы формирования генетической структуры населения республики.
2. Изучить распространенность и популяционно-генетические факторы распространения в РБ частых НБНС - миотонической дистрофии, хореи Гентингтона, моторно-сенсорных нейропатий, семейных и спорадических форм болезни Паркинсона.
3. В генах DMPK и HD (IT-J5), ответственных за развитие болезней «экспансии» - миотонической дистрофии Россолимо-Куршмана-Штейнерта-Баттена и хореи Гентингтона, соответственно, - исследовать полиморфизм числа тринуклеотидных повторов (ТНП) и ряда вариабельных внутригенных локусов у больных из РБ и в популяциях Волго-Уральского региона; определить закономерности экспансии ТНП, ее происхождение и механизмы распространения,
4. Определить характерные для РБ спектры и частоты мутаций в генах НБНС: при мышечной дистрофии Дюшенна/Беккера - в гене дистрофина (DMD), при моторно-сенсорных нейропатиях - в генах периферического белка миелина (РМР22'), структурного белка миелина (MPZ), коннексина 32 (GJB1), EGR2 (early growth response gene-2); провести анализ полиморфизма ряда вариабельных локусов исследованных генов.
5. Провести поиск мутаций в генах а-синуклеина (PARK1), паркина (PARK2) и дардарина (LRRK2') у больных с наследственными и спорадическими формами болезни Паркинсона.
6. Провести поиск маркеров генетической предрасположенности к спорадической форме болезни Паркинсона на основе анализа ассоциации заболевания с полиморфными вариантами генов ядерного генома и исследования структурных особенностей митохондриальной.ДНК.
7. Разработать оптимальные для РБ подходы ДНК- диагностики исследованных неврологических заболеваний.
Научная новизна и практическая значимость исследования
Впервые проведено комплексное популяционно-молекулярно-генетическое исследование ряда частых наследственных заболеваний нервной системы (миотонической дистрофии, хореи Гентингтона, мышечной дистрофии Дюшенна/Беккера, наследственных моторно-сенсорных нейропатий) и многофакторного, наследственно предрасположенного заболевания - болезни Паркинсона в РБ, население которой характеризуется этнической подразделенностью. Использование такого подхода позволило получить наиболее адекватные оценки распространенности заболеваний, выявить популяционно-демографические факторы формирования генетической структуры популяций, влияющие на распространение наследственной
патологии, и провести углубленный анализ молекулярно-генетических основ исследуемых заболеваний.
Впервые проведенный анализ брачно-миграционной структуры населения шести районов РБ выявил преобладание в них моноэтнических браков, положительную этническую брачную ассортативность башкир и татар, и высокий уровень эндогамности, что способствует территориальной и этнической неравномерности распространения наследственной патологии.
Молекулярно-генетическое исследование болезней динамических мутаций - миотонической дистрофии и хореи Гентингтона, - позволило идентифицировать экспансию тринуклеотидных повторов в соответствующих генах практически у всех обследованных пациентов и во многих случаях выявить ее у родственников больных, не имеющих на момент обследования клинических признаков заболеваний. Впервые у больных из РБ определены гаплотипы, сцепленные с мутациями - экспансией тринуклеотидных повторов, - в генах DMPK и HD, что позволило установить единое происхождение миотонической дистрофии на территории РБ, ее распространение в результате эффекта основателя и дрейфа генов, и, как минимум, три источника происхождения хореи Гентингтона. Выявлены генетические факторы нестабильности тринуклеотидных повторов: в гене DMPK нестабильными являются аллели с числом CTG повторов >19; в гене HD установлена роль числа (CCG)n повторов как цис-активного фактора, модифицирующего стабильность (CAG)„ повторов. Впервые определены генетические и эпигенетические факторы, модифицирующие возраст манифестации хореи Гентингтона.
У больных миодистрофией Дюшенна/Беккера из РБ впервые определены спектр и частота делеций в гене дистрофина, выявлены две новые мутации -p.Thrl34ThrfsX7 и p.Lys2210ArgfsXl 1.
Впервые для РБ установлены региональные и этнические особенности распространенности наследственных моторно-сенсорных нейропатий, спектра и частоты мутаций в генах периферического белка миелина (РМР22), структурного белка миелина (MPZ), коннексина 32 (GJB1) и EGR2 (early growth response gene-2). Определен вклад типов НМСН 1А и НМСН IX в структуру НМСН в исследуемом регионе. Установлена высокая частота НМСН IX типа среди башкир, обусловленная мутацией р.Рго87А1а, распространившейся в популяции в результате эффекта основателя. В гене GJB1 выявлена ранее не описанная мутация p.Thr86Ile.
Впервые получены данные по распространенности болезни Паркинсона в РБ, показана этническая и территориальная неравномерность распространения заболевания. Проведено изучение генетических факторов риска развития БП с учетом этнической принадлежности. Впервые в качестве гена-кандидата исследован Alu-инсерционный полиморфизм гена калиевого канала KCNJ6 и обнаружена ассоциация Alu-инсерции с БП во всех исследованных этнических группах. Выявлена ассоциация с БП полиморфного варианта гена катехол-орто-метилтрансферазы, детерминирующего активную форму фермента. Впервые
проведено углубленное исследование роли мтДНК в развитии БП, в результате которого обнаружена ассоциация гаплогруппы Н мтДНК с БП у татар, выявлен гаплотип, протективный для развития заболевания. Впервые проведено полное секвенирование мтДНК у 4-х пациентов с БП, у двух из них обнаружены две точковые мутации, которые, предположительно, могут являться факторами развития заболевания у этих больных.
На основе полученных результатов разработаны оптимальные для населения РБ подходы ДНК-диагностики исследованных заболеваний. Выявление этиологической основы заболевания у больных, а также носителей мутантного гена способствует проведению ранних лечебно-профилактических мероприятий, позволяющих отсрочить клиническую манифестацию заболевания или замедлить темпы его прогрессирования. Кроме того, оно является необходимым условием для проведения пренатальной диагностики с целью профилактики повторных случаев заболевания в семьях. Полученные данные легли в основу созданных в РБ национальных автоматизированных регистров по всем исследованным заболеваниям, обеспечивающих их эпидемиологический мониторинг и оптимизацию лечебно-диагностической и диспансерной работы врачей (неврологов, генетиков).
Положения, выносимые на защиту
1. Этническая подразделенность населения, преобладание моноэтнических браков и высокий уровень эндогамности в районах РБ способствуют сохранению имеющегося генетического разнообразия, территориальной и этнической неравномерности распространения наследственной патологии.
2. Распространение миотонической дистрофии Россолимо-Куршмана-Штейнерта-Баттена в РБ связано с эффектом основателя и дрейфом генов. Локальное накопление заболевания среди башкир в отдельных районах Зауралья обусловлено доминантным типом его наследования, моноэтнической структурой населения и высоким уровнем эндогамности этих районов. В локусе (CTG)„ гена DMPK нестабильными являются аллели с числом тринуклеотидных повторов >19.
3. Распространенность хореи Гентингтона в Башкортостане сопоставима с таковой в европейских популяциях. Распространение ХГ на территории республики связано, как минимум, с тремя источниками происхождения заболевания, о чем свидетельствуют три различных гаплотипа в гене HD на мутантных хромосомах у больных из РБ. (CCG)n -тракт, сцепленный с (CAG)„ повторами в гене ЯД является цис - активным фактором, модифицирующим стабильность (CAG)n -повторов. Генетические и эпигенетические факторы, влияющие на возраст манифестации ХГ.
4. Высокий уровень гетерозиготности локусов (CTG)n гена DMPK и (CAG)n гена ЯД неоднородный характер распределения частот их аллелей в популяциях Волго-Уральского региона, в том числе на уровне этногеографических групп одного этноса, свидетельствуют о возможности использования данных высокополиморфных ДНК - локусов в качестве генетических маркеров популяций.
5. Спектр и частота делеций и делеционных точек разрыва в гене дистрофина (DMD), две новые точковые мутации у больных мышечной дистрофией Дюшенна/Беккера из РБ.
6. Неравномерное территориально-этническое распространение наследственных моторно-сенсорных нейропатий (НМСН) в РБ. Региональные и этнические особенности спектра и частоты мутаций в генах периферического белка миелина (РМР22'), структурного белка миелина (MPZ), коннексина 32 (GJB1) и EGR2 (early growth response gene-2). Вклад типов НМСН 1А и НМСН IX в структуру НМСН в РБ. Среди башкир наиболее частой формой НМСН 1 типа является НМСН IX, обусловленная мутацией р.Рго87А1а, распространившейся в популяции в результате эффекта основателя. Новая мутация p.Thr86Ile в гене GJB1.
7. Неравномерное территориально-этническое распределение болезни Паркинсона в РБ с эпидемиологическими характеристиками, сопоставимыми с современными показателями в мире. Ассоциация спорадической формы БП с мутациями в генах паркина (PARK2) и дардарина (LRRK2, PARK8), а также с полиморфными вариантами ряда генов-кандидатов ядерного и митоховдриального геномов. Генетические факторы риска развития и характера течения спорадической БП в этнически подразделенных группах населения РБ.
8. Разработка оптимальных для региона подходов ДНК-диагностики исследованных заболеваний.
Апробация работы
Материалы исследования докладывались и обсуждались на Российских и международных совещаниях, конференциях и симпозиумах, таких как II (IV) и V съезд Российского общества медицинских генетиков (Курск, 2000; Уфа, 2005); II и III съезд Российского общества генетиков и селекционенров им. Вавилова (Санкт-Петербург, 2000; Москва, 2004); 19-е Международное совещание по болезни Гентингтона (Копенгаген, 2001); 5-й и 7-й Балканский конгресс по генетике человека (София, 2002; Скопье, 2006); конференции Европейского общества генетиков человека (Лиссабон, 1998; Женева, 1999; Амстердам, 2000; Страсбург, 2002; Мюнхен, 2004; Прага, 2005; Амстердам, 2006; Ницца, 2007; Барселона, 2008); Международный конгресс по геному человека (Эдинбург, 2001; Берлин, 2004; Монреаль, 2007); IX Всероссийском съезде неврологов (Ярославль,
2006); Международной научно-практической конференции «Актуальные проблемы диагностики и лечения наследственных нервно-мышечных заболеваний. Нейроортопеднческие аспекты» (Москва, 2008).
Публикации
По теме диссертации опубликовано 39 статей в рецензируемых научных журналах, получен 1 патент на изобретение.
Объем п структура диссертации
Работа изложена на 340 стр. машинописного текста, состоит из введения, обзора литературы, материалов и методов, результатов и обсуждения, выводов, заключения, списка литературы, приложения. Диссертация иллюстрирована 63 таблицами и 35 рисунками, список литературы состоит из 508 источников (92 отечественных и 416 зарубежных).
Благодарности Автор выражает глубокую благодарность заведующему кафедрой неврологии с курсами нейрохирургии и медицинской генетики Башкирского государственного медицинского университета д.м.н., профессору Магжанову Р.В. за консультативную помощь и организацию забора материала.
МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
В работе использованы как материалы комплексного сплошного медико-и популяционно-генетического исследования населениия семи районов РБ, проведенного в период с 2005 по 2008 гг. совместно с Медико-генетическим научным центром РАМН (г. Москва), так и сведения о всех известных больных с исследу емыми патологиями, проживающими на территории РБ, полученные из базы данных Медико-генетической консультации РБ и из материалов ежегодных отчетов неврологов всех городов и районов республики, собираемых на кафедре неврологии с курсами нейрохирургии и медицинской генетики Башкирского государственного медицинского университета (БГМУ). Полученные таким образом сведения дополнительно уточнялись на момент исследования как путем целенаправленного запроса в центральные городские и районные больницы, так и в процессе экспедиционных выездов 1994-2004гг, проводимых нами совместно с сотрудниками кафедры неврологии БГМУ с целью дополнительного клинического осмотра больных и членов их семей, и забора крови для ДНК-анализа. Для клинико-эпидемиологического исследования были собраны данные о каждом пациенте, проживавшем на территории РБ за исследуемый период времени с 1 января 1994 по 1 января 2006 года.
Для сплошного популяционно-генетического исследования были выбраны 7 районов РБ: Абзелиловский, Баймакский, Бурзянский, -расположенные в юго-восточном Зауралье, - где почти 90% населения составляют башкиры; Архангельский, Салаватский, Аскинский и Балтаческий - это центральный, северо- восточный и северные районы, население которых полиэтнично. Исследование охватывало все население районов (201619 человек) независимо от национальности.
Исследование брачно-миграциоппой структуры населения, основанное на анализе брачных записей, проведено в шести районах Республики
Башкортостан (Абзелиловском, Бурзянском, Баймакском, Салаватском, Архангельском и Балтачевском) с общей численностью населения 177691 человек. Брачные записи изучены за 4 временных периода: 1) начало 60-х годов XX века, 2) начало 80-х годов XX века, 3) конец 90-х годов XX века, 4) начало XXI века. Всего проанализировано 16135 брачных записей.
Сведения о численности больных, обследованных молекулярно-генетическими методами, приведены в таблице 1.
Выборка здоровых доноров представлена коренными жителями Волго-Уральского- региона: башкирами Архангельского (50 чел), Абзелиловского (166 чел.), Баймакского (100 чел.), Бурзянского (100 чел.), Салаватского (100 чел.), Аскинского (100 чел.), Илишевского (59 чел.) и Стерлибашевского (48 чел.) районов РБ, относящихся к разным исторически сложившимся этногеографическим группам: северо-восточной, юго-восточной, северозападной и юго-западной; коми-зырянами Сысольского района Коми (70 чел.); татарами Елабужского района Татарстана (46 чел.); удмуртами Мало-Пургинского района Удмуртии (64 чел.); мордвой-мокшей Старошайгинского района Мордовии (45 чел); чувашами Моргаушского района Чувашии (56 чел.); луговыми мари Звениговского района Марий Эл (47 чел.) и русскими из различных районов РБ (31 чел.).
Забор крови производили после медицинского осмотра и получения информированного согласия у взрослых жителей, принадлежащих к разным семьям, что позволяет рассматривать выборки случайными для популяций.
Таблица 1. Численность больных (абс.) с наследственными и наследственно предрасположенными заболеваниями из Башкортостана, обследованных молекулярно-генетическими методами___
Заболевание Число больных/чнело неродств. семей Число клинически здоровых родственников Контроль
Миотоническая дистрофия 92/50 (72/36)* 84 (54)*
Хорея Гентингтона 59/46 127 91
Миодистофия Дюшен на/Беккера 64/61 87 -
Наследственные моторно-сенсорные нейропатии 173/131 120 150
Болезнь Паркинсона: Спорадическая форма Семейная форма 341 8 10 360
Примечание:*- идентификация экспансии (СТС)п- повторов в гене ОМРК проведена методом блот-гибридизацни по Саузерну.
Для анализа частоты мутирования локуса CTG повторов в гене DMPK исследована передача аллелей данного локуса от родителей к детям в 300 семьях здоровых доноров (900 чел.) из Башкортостана различной этнической принадлежности.
Для оценки параметров, отражающих отдельные факторы популяционной динамики - этнической брачной ассортативности, индекса эндогамии, локального инбридинга, - использованы стандартные методы популяционно-генетического анализа [Crow J.F., 1958; 1965; Cavalli-Sforza L.L., Bodmer W.F., 1971; Morton N.E., 1977].
Молекулярно-генетические исследования проведены с использованием стандартных методов: выделения ДНК; полимеразной цепной реакции синтеза ДНК (ПЦР); полиморфизма длины амплифицированных фрагментов (ПДАФ), полиморфизма длины рестрикционных фрагментов (ПДРФ), блот-гибридизации по Саузерну; конформационного полиморфизма однонитевой ДНК (SSCP) и секвенирования .
Определение размера экспансии (CTG)„ повторов в гене DMPK у больных миотонической дистрофией методом геномной блот-гибридизации с олигонуклеотидным зондом (CTG).) а также идентификация делеций экзонов в гене PARK2 методом анализа дозы гена у пациентов с болезнью Паркинсона было проведено на базе Института молекулярной генетики РАН (г.Москва) (зав. Отделом - д.б.н., проф. С.А. Лимборская).
Статистический анализ полученных данных проведен с использованием стандартных для популяционно-генетических и медицинских исследований методов и соответствующего программного обеспечения (Statistica 5.5, SPSS 9.0, GenePop 3.3, Fstat 2.9.3.1, Cervus 2.0, Genetic Data Analysis 1.0).
РЕЗУЛЬТАТЫ II ОБСУЖДЕНИЕ
ИССЛЕДОВАНИЕ ФАКТОРОВ ПОПУЛЯЦИОННОЙ ДИНАМИКИ, ВЛИЯЮЩИХ
IIA РАСПРОСТРАНЕННОСТЬ НАСЛЕДСТВЕННЫХ ЗАБОЛЕВАНИЙ В РЕСПУБЛИКЕ БАШКОРТОСТАН Анализ этнической брачной ассортативности и ее временной динамики
Под этнической брачной ассортативностью понимают предпочтение заключения брака внутри своей национальности. Этническая ассортативность обусловливает изолированность популяций по национальному признаку, влияя таким образом на формирование их генетической структуры. Установлено, что этническая ассортативность в исследованных районах РБ меняется в зависимости от представительства определенного этноса в районе (табл.2). Так, в Бурзянском районе, 95.3% населения которого составляют башкиры, их этническая ассортативность составляет 1.02, что характерно для моноэтнической популяции, а в Балтачевском районе, где численность башкир значительно ниже,
Таблица 2. Этническая ассортативность (Н) в 6 районах Башкортостана (начало XXI века)
Район РБ башкиры русские татары
Абзелиловский 1.11 5.81 -
Бурзянский 1.02 - -
Баймакский 1.09 7.50 4.4
Балтачевский 2.71 - 1.30
Архангельский 1.93 2.14 5.99
Салаватский 1.15 5.09 2.47
ассортативность возрастает до 2.71. В том же Балтачевском районе этническая ассортативность татар составляет 1.30, а в других районах, где татар меньше, их этническая ассортативность выше. Для русских характерна та же тенденция -наиболее низкая этническая ассортативность русских в Архангельском районе (2.14), где их более 38%, наиболее высокая - в Баймакском (7.50), где они составляют 8.4% населения района.
Временная динамика этнической ассортативности (рис.1) рассчитывалась не для районов, а в совокупности для всей выборки, а процентное соотношение русских и татар - в целом для РБ. На протяжении последнего полувека этническая ассортативность башкир возрастает (от 8.97 в 60-е годы до 13.6 в 90-е годы XX в.), резко падая в начале XXI века (7.23). Этническая ассортативность русских является отрицательной на рубеже веков (0.50), практически не меняясь за четверть века. При этом, для
Рисунок 1. Временная динамика этнической ассортативности
межэтнических русско-татарских и русско-башкирских браков выявлено резкое превышение ожидаемого их числа над наблюдаемым, так что отрицательная ассортативность русских обеспечивается за счет браков с украинцами, белорусами, латышами, марийцами, чувашами, удмуртами и др., а не с башкирами и татарами, традиционно населяющими Башкортостан. Брачная этническая ассортативность татар невысока, но положительна (1.67 на начало XXI века). Число башкиро-татарских браков превышает в общем числе зарегистрированных браков 10%-уровень; в течение второй половины XX века наблюдается устойчивый рост метисации башкир и русских - от 0.85% до
4.15%. Основная доля браков (-80%) в исследованных районах РБ является моноэтнической. Исследования брачной этнической ассортативности были проведены ранее и в некоторых других республиках Вол го-Уральского региона (Чувашия, Удмуртия), в которых так же прослеживается тенденция роста метисации коренного населения с русскими [Ельчинова Г.И. с соавт., 2003, 2006].
Анализ эндогамии и изоляции расстоянием
Индекс эндогамии, рассчитанный для трех этнических групп, оказался достаточно высоким во всех исследованных районах: на начало XXI века для башкир - 0.58- в Салаватском, 0.60 - в Архангельском, 0.71 - в Баймакском, 0.86 - в Бурзянском, 0.79 - в Абзелиловском, 0.97 - в Балтачевском районах. Для татар индекс эндогамии оказалось возможным рассчитать только по Балтачевскому району, где он составил 0,9, а для русских - по Архангельскому району - 0.68 на начало XXI века. Устойчивое снижение индекса эндогамии зафиксировано только в Баймакском (0,80, 0.76, 0.71) и в Салаватском (0.77, 0.72, 0.63, 0.58) районах. Согласно нашим исследованиям, брачные миграции башкир практически не выходят за пределы Республики. Исключение составляют части Челябинской и Оренбургской областей, примыкающие к Башкортостану, где традиционно проживают башкиры. Таким образом, Республика Башкортостан является популяцией высшего иерархического уровня для своего автохтонного населения. Аналогичная картина эндогамности характерна и для других республик Вол го-Уральского региона, где проводились подобные исследования - Марий Эл [Гинтер Е.К., 2002], Чувашии [Гинтер Е.К., Зинченко P.A.; 2006] и Удмуртии [Ельчинова Г.И. с соавт., 2006]. Подобная структура эндогамности, обусловленная реальной миграционной ситуацией, может приводить к территориальной неоднородности распространения наследственной патологии (НП).
Инбридинг
Параметры изоляции расстоянием, рассчитанные для шести исследуемых районов РБ, отражены в таблице 3. В качестве обследуемой единицы выступает район. Из таблицы видно, что в трех районах Зауралья основные параметры изоляции с течением времени меняются незначительно. Наименьшие изменения локального инбридинга а в Баймакском районе (от 0.00015 до 0.00012), чуть сильнее а падает в Абзелиловском (от 0.00025 до 0.00017) и Бурзянском (от 0.00049 до 0.00041) районах. Локальный инбридинг а невысок во всех этих трех районах (0.0001-0.0004), что, видимо, в значительной степени обусловлено брачными традициями населения. В Бурзянском районе а (0.0004) несколько выше, чем в двух других, что обусловлено наименьшим эффективным размером популяции (5.5 тыс. чел), при этом в Бурзянском районе оказывается наиболее низкой степень изоляции расстоянием (0.009). В Балтачевском районе существенные изменения зафиксированы у показателя Ne. По-видимому, деление на татар и башкир в этом районе достаточно условно, уровень метисации составляет 21-26% за
указанные периоды, поэтому мы рассчитали параметры изоляции для совокупной выборки башкир и татар, и даже в этом случае изменение параметров изоляции расстоянием во времени оказывается более существенным, чем в зауральских районах. В Салаватском районе обнаружено незначительное снижение локального инбридинга во времени для башкир (с 0.0004 до 0.0003), а его увеличение вдвое для татар мы относим к разряду артефактов, обусловленных малым числом браков (п=62), зарегистрированных между татарами в начале XXI века и вошедшими в анализ. В Архангельском районе, так же, как и в Салаватском, установлено
Таблица 3. Параметры изоляции расстоянием Малеко (N0 -эффективный
объем популяции; о - средняя квадратичная миграция; а- локальный инбридинг. Ь - степень изоляции расстоянием) ___
Район Временной интервал Ке а а ь
Баймакский (башкиры) 80-е годы XX века 14189 67.7 0.000151 0.011444
90-е годы XX века 15528 63.7 0.000152 0.010819
начало XXI века 16937 75.2 0.000118 0.010804
Абзелиловский (башкиры) 80-е годы XX века 10979 55.4 0.000253 0.012789
1995-2004 гг 12687 62.8 0.000170 0.012048
Бурзя некий (башкиры) 80-е годы XX века 4508 73.3 0.000489 0.008947
1995-2004 гг 5509 65.8 0.000405 0.009207
Балтачевский (башкиры) 80-е годы XX века 7931 31.4 0.001051 0.014886
90-е годы XX века 1833 16.4 0.002274 0.031522
начало XXI века 5766 6.7 0.000737 0.046674
Балтачевский (татары) 80-е годы XX века 647 54.6 0.004056 0.021492
90-е годы XX века 4909 28.1 0.000824 0.025236
начало XXI века 1212 40.3 0.002909 0.020785
Балтачевский (башкиры и татары) 80-е годы XX века 8458 59.5 0.000335 0.017989
90-е годы XX века 6743 27.0 0.000570 0.025274
начало XXI века 6978 35.2 0.000446 0.026095
Архангельский (русские) 80-е годы XX века 3595 82.0 0.000701 0.006416
90-е годы XX века 2751 77.2 0.001258 0.006003
начало XXI века 2570 69.9 0.000956 0.012862
Архангельский (башкиры) 80-е годы XX века 3174 65.7 0.000838 0.007843
90-е годы XX века 2836 42.9 0.000831 0.014307
начало XXI века 3092 77.2 0.000694 0.008729
Салаватский (башкиры) 80-е годы XX века 5181 73.9 0.000439 0.011388
90-е годы XX века 5178 91.9 0.000369 0.009490
начало XXI века 6364 83.0 0.000293 0.011011
Салаватский (татары) 80-е годы XX века 2820 85.9 0.000925 0.009257
90-е годы XX века 2545 144.1 0.000872 0.004916
начало XXI века 2102 106.1 0.001700 0.003849
Примечание: учтены брачные миграции до 500 км
незначительное снижение локального инбридинга для башкир (с 0.0004 до 0.0003) и незначительное увеличение этого показателя для русских (с 0.0007 до 0.0009). Значения локального инбридинга сходны с таковыми для чувашей в Республике Чувашия (0.0002-0.0005) [Гинтер Е.К., Зинченко P.A.; 2006], Для марийцев в Республике Марий Эл (0.0002-0.0006) [Гинтер Е.К., 2002], для удмуртов Республики Удмуртия (0.0003-0.0006) [Ельчинова Г.И. с соавт., 2006] и для русских Костромской области (0.0001-0.0002 при учете миграций до 500 км) [Ельчинова Г.И., 2004]. Видимо, такой порядок локального инбридинга характерен для российского сельского населения, а небольшие различия обусловлены различиями эффективного размера популяции.
Средняя квадратичная миграция о в исследованных районах варьирует достаточно сильно - от 6.7км для башкир Балтачевекого района до 106 км для татар Салаватского района. Малые миграционные расстояния для башкир в Балтачевском районе согласуются с наибольшим индексом эндогамии для башкир в этом районе (0.97), но, учитывая высокую степень метисации здесь башкир и татар, более адекватным для данного района следует считать показатель дальности миграций, рассчитанный для совокупной выборки башкир и татар, равный 35.2 км. Во всех других исследованных районах средняя квадратичная миграция для башкир различается незначительно - от 62.8 км в Абзелиловском районе до 83.0 в Салаватском.
Степень изоляции расстоянием b для башкир во всех исследуемых районах, кроме Балтачевекого, различается очень незначительно (0.009-0.012). В Балтачевском районе как для башкир, так и для совокупной выборки башкир и татар, этот показатель имеет более высокие значения - 0,047 и 0,026, соответственно. Степень изоляции расстоянием b в других популяциях Волго-Уральского региона имеет схожие значения [Гинтер Е.К., 2002; Гинтер Е.К., Зинченко P.A.; 2006; Ельчинова Г.И. с соавт., 2006].
Таким образом, для исследованных популяций башкир характерны высокий уровень эндогамности при невысоком локальном инбридинге, существенного изменения основных параметров брачно-миграционной структуры за четверть века не зафиксировано. Наибольшее сходство по эндогамности и локальному инбридингу наблюдается для зауральских башкир. Моноэтнический характер браков и высокий уровень эндогамности населения отдельных районов РБ являются популяционно-демографическими факторами генетической изоляции и могут приводить к территориальной неоднородности распространения наследственной патологии.
МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ИССЛЕДОВАНИЯ Миотоническая дистрофия
Миотоническая дистрофия (МД) - аутосомно-доминантное мультисистемное заболевание, характеризующееся исключительной вариабельностью клинических проявлений, среди которых - миотония, прогрессирующая мышечная слабость, поражения сердца, катаракта,
эндокринные нарушения. Частота МД варьирует в разных популяциях и составляет 2.2 - 5.5 : 100000 населения в Западной Европе [Harper Р., 1989], 5.5:100000 - в Японии [Davies J. et al., 1992], реже заболевание встречается в странах Южной Азии и практически отсутствует в Южной и Центральной Африке [Ascizavva Т., Epstein Н., 1991]. В Башкортостане частота МД крайне неоднородна среди отдельных этнических групп: для русских она составляет 1.94: 100000, для татар - 3.21: 100000, для башкир - 5.21: 100000, в среднем -3.01: 100000 населения [Ахмадеева Л.Р., 2001]. Более трети семей с МД происходят из предгорной и горной зон Южного Урала [Магжанов Р.В., 1989]. По нашим данным, в Баймакском и Абзелиловском районах РБ распространенность ее составляет, соответственно, 40 и 30 на 1000000 населения.
Молекулярной причиной подавляющего большинства случаев МД является увеличение числа (CTG)„-noBTopa в З'-нетранслируемой области гена DM (DMPK), локализованного на хромосоме 19 (ql3.2-13.3) [Mahadevan М. et al., 1992, Shelbourne P. et al., 1992]. У здоровых людей число CTG-триплетов (п) в гене DM варьирует от 5 до 30 - 35, тогда как у больных оно составляет от 50 -100 до 1000 при классическом течении, с дебютом во взрослом возрасте, и может достигать нескольких тысяч при врожденных формах заболевания [Harris S. et al., 1996]. Ген DM кодирует белок миотонин-протеинкиназу (Mt-РК), имеющий серин-треонин-киназную ферментативную активность [Brook J. et al., 1992; Dunne P. et al., 1994].
Нами была исследована экспансия (CTG)n- повторов у 72 больных МД и 54 членов их семей, проживающих в РБ, методом блот-гибридизации по Саузерну. Экспансия обнаружена у 67 (93% ) больных. Минимальный размер аллеля с экспансией составил 400 п.н. (около 130 единиц повтора), максимальный - 5000 п.н. (около 1500-1600 триплетных единиц). Большинство (60) больных имели классическую взрослую форму МД, 8 - классическую юношескую, 3 - раннюю детскую, 1 - врожденную. Максимальное число (CTG)„-noBTopoB - свыше 1000 копий,- обнаружено у 22 больных МД, в том числе у всех пациентов с ранней детской и врожденной формами заболевания. В этой группе наблюдалось резкое уменьшение возраста дебюта заболевания (в среднем 14.8 года), некоторое утяжеление церебральных (р=0.081) и достоверное усиление экстраневральных (р=0.0139) проявлений, парезов (р=0.0168), по сравнению с группами больных, содержащих в мутантных хромосомах менее 1000 копий CTG-триплетов. В целом, полученные данные подтвердили известные факты о прямой зависимости от размера экспансии тяжести заболевания и об обратной зависимости - возраста его манифестации, но корреляция генотипа и фенотипа при МД не являлась абсолютной, поскольку на развитие и течение заболевания, по-видимому, оказывают влияние и другие генетические и эпигенетические факторы.
Сравнительный анализ экспансии (CTG)n -повторов при передаче из поколения в поколение в 17 семьях выявил как случаи увеличения экспансии, (70.6%), так и ее сохранения на исходном уровне (11.8%) или снижения
(17.6%). В 10 случаях больной являлась мать, а в 7 случаях - отец. Оказалось неожиданным, что все случаи уменьшения размера экспансии обнаружены при передаче мутации по материнской линии (в этом случае они составляют 30%), тогда как при передаче по линии отца только в одном случае зафиксировано сохранение числа повторов на исходном уровне. Проведенный простой и множественный регрессионный анализ влияния на величину экспансии пола родителя и размера передающегося аллеля, как в отдельности, так и в сумме этих факторов, отчетливых закономерностей не выявил (табл.4).
Таблица 4. Зависимость между величиной мутации и размером исходного (СТС)п аллеля у мужчин и женщин __
Передача по линии R R2 Р
материнской 0.439 0.193 0.205
отцовской 0.011 0.001 0.981
В целом 0.181 0.033 0.487
В результате сравнения числа (CTG)n повторов, возраста начала и формы заболевания в 15 парах сибсов, страдающих МД, не установлено зависимости уровня экспансии (CTG)n -повторов гена DMPK от порядкового номера потомка в семье.
Таким образом, полученные нами результаты анализа наследования экспансии (CTG)„ -повторов гена DMPK в семьях больных не соответствуют аналогичным данным, полученным другими авторами. Возможно, это связано с недостаточно большим количеством наблюдений, поэтому, пока не делая обобщающих выводов, мы предлагаем рассматривать данный факт только как отдельное наблюдение.
При изучении- причин и механизмов экспансии (CTG)„-noBTopa- в гене DMPK, закономерными становились вопросы о разнообразии и частоте нормальных аллелей данного генного локуса, о характере их нестабильности, а также о происхождении и распространении миотонической дистрофии. В связи с этим полиморфизм (CTG)„- локуса в гене DMPK был исследован во многих популяциях мира, а также проведен анализ неравновесного сцепления МД с другими полиморфными внутригенными и фланкирующими ген DMPK локусами [Иващенко Т.Э. и др., 1997; Сломинский П.А., 2000; Davies J. et al., 1992; Goldman A.et al., 1995; Deka R. et al., 1996; Yamagata H. et al., 1998; Tishkoff S.et al., 1998; Pan H. et al., 2001; Segel R. et al., 2003]. По распределению частот аллелей локуса (СГС)п-повторов в гене DMPK выявлена значительная популяционная неоднородность. Кроме того, было сделано предположение, что аллели с числом CTG-повтора 5 и >19 являются более нестабильными, предрасполагающими к DM-мутации, по сравнению с группой более стабильных аллелей с числом повторов 11-17.
В популяциях Волго-Уральского региона нами обнаружено 28 аллелей, соответствующих повторам с А—34 тринуклеотидами; отмечается два пика частот (рис. 2). По распределению частот всех аллелей области (CTG)n-повторов в гене DMPK между некоторыми исследованными популяциями, в том числе между отдельными этногеографическими группами башкир выявлена достоверная неоднородность. Установлено, что в целом по распределению частот аллелей CTG- повтора в гене DMPK, Волго-Уральский регион занимает промежуточное положение между популяциями Европы и Азии, тяготея в большей степени в сторону последних.
С целью изучения закономерностей нестабильности локуса (CTG)n-повторов мы провели ряд исследований. Так, наши данные позволили проверить гипотезу о нестабильности аллелей с числом CTG повторов >19 и взаимосвязи между частотой таких аллелей и распространенностью МД в популяциях на примере трех субпопуляций зауральских башкир -Абзелиловского, Баймакского и Бурзянского районов, для каждой из которых методами популяционной демографии нами была показана значительная обособленность. В Абзелиловском и Баймакском районах РБ установлена наибольшая распространенность МД - (30 - 40 на 100000), тогда как в Бурзянском районе не выявлено ни одного случая заболевания. Однако по распределению частот аллелей (CTG)n- локуса эти три группы башкир являются однородными, а аллели с высоким числом (>30) повторов обнаружены как в Абзелиловском, так и в Бурзянском районах. В популяциях Волго-Уральского региона частота аллелей (CTG)>i9 варьировала от 6% среди удмуртов, чувашей и мордвы, до 15% среди татар. В популяциях башкир в целом она составила 9%, являясь наиболее низкой среди абзелиловских, баймакских и бурзянских башкир (-6%). Таким образом, данное исследование не выявило корреляции частоты нормальных аллелей с высоким числом CTG- повторов в гене DMPK с частотой МД в популяции.
С целью дальнейшего изучения вопроса о причинах распространения МД в Башкортостане был проведен анализ сцепления мутации с определенными гаплотипами, установленными по двум полиморфным внутригенным локусам, сцепленным с геном DMPK (intron 5, nt pos 6043 -Hhal и intron 9, nt posl0693 -Hinfl рестрикционные полиморфизмы). В 24 из 37 семей с МД (64.8%) у больных на мутантной хромосоме выявлен одинаковый гаплотип: Hhal(-) -Hinfl (+), характерный для больных МД из большинства исследованных популяций мира. В этих 24 семьях гаплотип был установлен на основе семейного анализа или гомозиготного состояния исследуемых локусов у отдельных больных. В оставшихся 13 семьях данный гаплотип не исключен, т.к. больные имели гетерозиготное состояние по обоим локусам, а данные для семейного анализа отсутствовали. Таким образом, мы предполагаем, что все больные МД из Башкортостана имеют одинаковый гаплотип на мутантной хромосоме, что указывает на распространение заболевания в регионе в результате эффекта основателя.
, морде а марийцы Удмурты
И бацкиры и татары очуваи*! ш удмурты ■ марийцы пмордва ■ коми
Рисунок 2. Распределение частот аллелей локуса (CTG)n гена DMPK в популяциях Волго-Уральского региона.
Далее. также с целью исследования нестабильности (CTG)n - повторов гена DM мы провели анализ их наследования в 300 здоровых семьях, из трех человек каждая. Из них в трех семьях (1 % или 0.5% от числа переданных хромосом) было выявлено изменение числа CTG-повторов при передаче как от матери к ребенку (два случая), так и от отца к ребенку (один случай). В одном случае нестабильным оказался аллель CTG22, он перешел в CTG26; в другом случае аллель CTG,? изменился до CTG22, в третьем случае - аллель CTG32 изменился до CTG2o- Во всех трех случаях кровное родство родителей и детей было подтверждено анализом ряда высокополиморфных ДНК-маркеров. Эти данные подтверждают гипотезу о нестабильности аллелей гена DM с числом CTG повторов > 19, а частота их мутаций составляет 5x10", что в значительной степени соответствует известным данным о скорости мутаций в микросателлитных районах, равной 2x10° [Горбунова В.Н.. Баранов B.C., 1997].
Таким образом, наше исследование показало, что в гене DMPK «нормальные» аллели с числом CTG повторов >19, действительно, являются наиболее нестабильными, подверженными к изменению числа триплетных повторов, причем, как в сторону увеличения, так и в сторону уменьшения. Вероятно, что именно такие аллели и являются определенным резервом в популяциях, на основе которого, скорее всего, могут возникнуть новые случаи экспансии (CTG)„ повторов, а следовательно, и миотонической дистрофии. Но при этом, в реальности, корреляции между частотой «нормальных» аллелей с большим числом триплетов и распространенностью заболевания в популяциях
не наблюдается. В РБ миотоническая дистрофия распространилась в результате эффекта основателя и дрейфа генов. Очевидно, что такой же путь распространения является причиной накопления заболевания и в других популяциях. В связи с этим, с точки зрения практической медицины, остается актуальным мониторинг заболевания в конкретных регионах и своевременное генетическое консультирование семей, включающее проведение ДНК-диагностики, в том числе пренатальной, направленной на предотвращение рождения больных детей. В ходе данного исследования, проводившегося более 10 лет, была получена информация практически о всех семьях с МД, проживающих в Республике Башкортостан, большинству больных и членов их семей проведена ДНК-диагностика; на основе этих данных создан автоматизированный генетический регистр [Ахмадеева Л.Р., 1998], оптимизирующий диспансерную работу врачей.
Хорея Гентингтона
Хорея Гентингтона (ХГ) - тяжелое прогрессирующее
нейродегенеративное заболевание, наследуемое по аутосомно-доминантному типу. Заболевание характеризуется распространенными гиперкинезами, прогрессирующим снижением интеллекта, вплоть до развития глубокой деменции, и нарушениями в эмоционально-волевой сфере [Hayden М., 1981]. ХГ имеет крайне неравномерное распространение в различных регионах мира. Наибольшая частота ее отмечается в североевропейских популяциях (4-10 : 100000), наиболее низкая - в странах Азии и Африки (0,4 -1 : 100000) [Simpson S. et al., 1989; Pavoni M. et al., 1990; James C. et al., 1994; Adachi Y., Nakashima K. et al., 1999]. По нашим данным, в РБ этот показатель на сегодняшний день составляет 2.57 :100000 населения.
Молекулярной основой развития ХГ является экспансия (CAG)n-повторов в первом экзоне гена HD (¡T15), локализованного на коротком плече 4-й хромосомы в области 4р16.3 [Gusella J. et al., 1983; HDCRG, 1993]. Соответственно, кодируемый геном белок гентингтин содержит длинный полиглютаминовый тракт. Нормальные аллели гена HD содержат от 9 до 35 CAG-повторов, а мутантные- от 36 до 180 [Kremer B.et al., 1994].
При консультировании семей с ХГ решающее значение имеет прямая ДНК-диагностика, основанная на определении числа (CAG)n- повторов в гене /775. При этом до сих пор актуальной остается проблема поиска и других генетических факторов, действующих в комплексе с основной мутацией и влияющих на развитие и течение заболевания.
В состав гена HD входит ряд полиморфных участков, сцепленных с (CAG)n-noBTopaMH. К таким участкам относятся (ССС)„-повторы, почти непосредственно прилежащие к (САС)п-тракту в первом экзоне гена. В экзоне 58 на расстоянии « 150 т.п.н. от полиморфного (САС)„-участка в ряде случаев обнаруживается нейтральная делеция одного из четырех GAG-кодонов, кодирующих пролин, - del2642. Исследование распределения частот аллелей
локуса. содержащего (САО)„-повторы. и сцепленных с ним других полиморфных маркеров, в различных популяциях может способствовать выяснению условий возникновения, распространения и сохранения мутантных аллелей и. в целом, способствовать оценке риска развития патологии на популяционном уровне.
С целью определения закономерностей экспансии (САО)„-повторов в гене НО и происхождения ее у больных хореей Гентингтона в РБ. мы проанализировали полиморфизм (САО)п-. (ССО)„-повторов и делеции ёе!2642 гена НО в 11 популяциях Волго-Уральского региона, а также в 46 семьях с ХГ из Башкортостана, включающих 59 больных и 127 их близких родственников.
В популяциях Волго-Уральского региона было выявлено 26 аллельных вариантов САО - локуса с числом триплетов от 9 до 36 (рис.3). Распределение частот аллелей соответствует нормальному одномодальному, с пиком в (САО)]7. что согласуется с данными других исследователей [Н-иЫпзйет О. й а!.. 1994: Кгетег В. й а!.. 1994: \Vatkins V. е1 а!.. 1995].
о Коми
Рисунок 3. Распределение частот аллелей локуса (САО)„ повторов гена НО в популяциях Волго-Уральского региона. По оси абсцисс - число (САО)„ повторов, по оси ординат - частоты аллелей.
"Переходные" аллели, содержащие более 29 триплетов САО, составляющие резерв для развития из них мутации. с частотой <1% обнаружены в популяциях русских, чувашей, мордвы и удмуртов. Среди башкир, татар, марийцев и коми не найдены аллели (САО)г9-з5. Проведенный нами анализ распространенности хореи Гентингтона в Башкортостане показал, что наименьший ее показатель имеют башкиры - 0.89 на 100000 жителей, в то время как среди русских и татар степень распространенности достигает 4.02 и 5.14 на 100000 жителей, соответственно. Однако в популяции башкир Илишевского района у человека 65 лет без клинических проявлений хореи Гентингтона. и в семье которого не было случаев ХГ. обнаружен аллель с 36 САО-повторами, т.е. экспансия триплетного повтора, что встречается
исключительно редко. Возраст проявления заболевания у таких пациентов приходится, как правило, на 6-7 декаду жизни. Следует отметить, что по данным Медико-генетического центра г. Уфы, за 26 лет не было ни одного случая хореи в Илишевском районе Башкортостана. Таким образом, обнаруженная нами экспансия повтора-это, фактически, новый случай хореи.
По характеру распределения частот аллелей локуса (САС)п-повторов в гене НО наблюдается значительная популяционная неоднородность. По этим показателям популяции Волго-Уральского региона в большей степени сопоставимы с популяциями Европы.
В локусе (ССС;)п-повторов обнаружено 6 вариантов аллелей, содержащих от 6 до 12 триплетов, за исключением аллеля (ССО)ц. Во всех популяциях самыми частыми являются аллель (ССО)7. встречающийся в среднем с частотой 0.603, и (ССС)к)- его частота составляет в среднем 0.333.
В результате регрессионного анализа сцепления полиморфных участков (САО)„ и (ССО)п, для популяций Волго-Уральского региона в целом установлена обратная нелинейная зависимость между числом повторов в этих участках на одной хромосоме. Аллели с семью ССв-повторами сцеплены с аллелями, содержащими в среднем 19.2 + 3.8 САС-повторов, а (ССО)ю - с аллелями, содержащими 17.3 ± 1.5 САС-повторов (табл. 5).
Таблица 5. Среднее число (САО)„ повторов на хромосомах с различными вариантами аллелей (ССО)п и с!е12642 в популяциях Волго-Уральского региона
Аллели (CCGh (CCG)io del- del+
Число (CAG)„ повторов 19.20+3.8 17.30±1.5 17.92+3.00 19.75+5.26
Число хромосом 1204 182
Достоверность различий Сравнение средних1 U=109678.50, Z=7.05, p«0.00001 U=661.00, Z= -2.04, p=0.0418
ANOVA F=18.606, p«0.001 2 H=4.42, p=0.0355 3
Примечания: 'непараметрический ранговый критерий Манна-Уитни, однофакторный дисперсионный анализ (ANOVA) для аллелей (CCG),„ (CCG)7, (CCG)«, (CCGk (CCG)m и (CCG)i2,3ранговыи непараметрический ANOVA Крускала-Уоллеса, так как в выборке не соблюдалась нормальность распределения согласно тесту Шапиро-Унлка.
При исследовании нейтральной полиморфной делеции del2642 гена HD в популяциях Волго-Уральского региона установлена ее достоверная ассоциация с аллелями (CAG)„ локуса, содержащими в среднем 19.75±5.26 CAG -повторов, а отсутствие делеции (del-) - с аллелями, содержащими 17.92+3.0 CAG -повторов (см. табл. 5). Эти данные подтверждают предположение о возникновении данной делеции преимущественно на хромосомах с числом CAG повторов >20 [Almqvist Е. et al., 1995; Иллариошкин С.Н., 2002].
В результате прямой молекулярно-генетической диагностики у 57 из 59 больных хореей Гентингтона выявлена экспансия (CAG)„- повторов в 1 экзоне гена I1D. Число (CAG)n-noBTopoB на мутантных хромосомах у больных ХГ варьировало от 39 до 75, составляя в среднем 46.47±5.70.
С целью изучения характера генетической нестабильности (CAG)„ повторов проведен анализ передачи их аллелей с экспансией в поколениях в 17 семьях больных ХГ, показавший, что величина мутации зависит от величины исходного аллеля в большей степени при передаче по материнской линии и в меньшей степени - по отцовской.
Установлено сцепление экспансии (CAG)n - повторов с полиморфным вариантом (CCG)7 и нейтральной делецией del2642. В результате определения гаплотипов (анализ по трем исследуемым локусам оказался возможным в 39 семьях больных ХГ) у больных ХГ из Башкортостана выявлено три основных гаплотипа, сцепленных с мутацией: (CCG)7/del- (48.72% семей), (CCG)7/del+ (46.15%) и (CCG)i0/del- (5.13%), что позволяет предполагать, как минимум, три различных источника происхождения хореи Гентингтона в республике. Выявленное неравновесие по сцеплению экспансии (CAG)„ повторов с (CCG)7, и ассоциация в популяциях Волго-Уральского региона аллелей (CAG)n>2o с аллелем (CCG)7 свидетельствуют не только о различных источниках заболевания, но и о том, что (CCG)n тракт может играть роль цис-активного фактора, модифицирующего стабильность (CAG)„ повторов. Исходя из полученных данных, можно предположить, что новые случаи экспансии, возникающие из переходных аллелей, будут появляться на хромосомах, имеющих определенный гаплотип: (CCG)7/del- или (CCG)7/del+. Подтверждению этому может служить случайно обнаруженная мутация de novo - (CAG)3(i - в ходе популяционного анализа у индивида в возрасте 65 лет, не имевшего клинических признаков ХГ и с отрицательным семейным анамнезом по этому заболеванию. В данном случае экспансия была ассоциирована именно с гаплотипом (CCG)7/del-,
Проведен также анализ роли ряда генетических факторов на возраст появления первых признаков ХГ (табл.6). Установлено, что кроме величины экспансии CAG повторов (которая чем больше, тем раньше проявляется хорея), на возраст манифестации влияют также пол родителя - при передаче аллеля с экспансией от отца заболевание дебютирует, в среднем, на 4. 72 года раньше, чем при передаче от матери; наличие del2642 на хромосоме с экспансией (CAG)n, определяет более позднюю манифестацию ХГ. С возрастом появления первых клинических признаков заболевания ассоциированы и определенные генотипы локуса АроЕ: наличие генотипа е2еЗ приводит к достоверному увеличению этого показателя. Вышеупомянутые факторы объясняют 88.71% возраста манифестации ХГ.
Таблица 6. Регрессионный анализ зависимости между возрастом манифестации ХГ и размером нормального аллеля, путем вертикальной передачи, наличием делеции с!е12642 и генотипом АроЕ с учетом размера экспансии (САО)п
Зависимые переменные (X) Сводка регрессии
N R R2 Р(Х) ВО вх B(CAG)e 1 Ml
(CAG)„ О 2 31 0.8695 0.7560 0.8255 97.772 .1145 -1.339
М3 17 0.8458 0.7154 0.7968 141.39 -.0785 -2.110
В целом 54 0.8228 0.6770 0.5140 110.888 0.1776 -1.599
Передача (CAG)„„ 48 0.8700 0.7570 0.0086 125.402 -4.719 -1.479
del2642 46 0.8738 0.7635 0.0067 114.725 4.842 -1.661
АроЕ 54 0.8335 0.6947 0.0542 110.009 1.521 -1.565
Примечание: р для (САС)„ во всех случаях <0.00001, передача аллеля с экспансией от отца, 'передача аллеля с экспансией от матери.
Комплексное определение этих факторов у носителей мутантного ХГ-аллеля, не имеющих клинических проявлений заболевания, может способствовать повышению эффективности медико-генетического консультирования и ведения таких пациентов.
Прогрессирующая мышечная дистрофия Дюшенна-Беккера
Прогрессирующие мышечные дистрофии Дюшенна и Беккера- наиболее распространенные наследственные заболевания нервно-мышечной системы. Их частота составляет, соответственно, 1:3500 и 1:20000 рожденных мальчиков [Emery А. 1991]. Миодистрофия Дюшенна (МДД) - более тяжелая форма болезни, она начинается в возрасте 2-5 лет со слабости мышц тазового пояса и проксимальных отделов ног, быстро прогрессирует, приводя к обездвиженности. Большинство больных (около 90%) умирают до 20 лет от сопутствующих респираторных осложнений, связанных с нарушением дыхания [Гринио Л.П., 1976; Темин П.А. и др., 1997; Emeiy А. 1993; Specht L., Kunkel L., 1993]. Мышечная дистрофия Беккера (МДБ) - более «мягкая» форма МДД, характеризующаяся более поздним дебютом (в 10-20 лет) и доброкачественным течением.
Миодистрофии Дюшенна и Беккера обусловлены мутациями в гене дистрофина (DMD) и являются аллельными формами заболевания [Kingston Н. et al., 1983; Goodfellow Р. et al., 1985; Monaco A. et al., 1986; Hoffman E„ Kunkel L., 1989]. Ген DMD локализован на коротком плече хромосомы X (р21), он состоит из 2.5 млн.п.н. и содержит 79 коротких экзонов и 78 длинных интронов [Koenig М. et al., 1987; Roberts R. et al., 1992]. Основной функцией дистрофина является участие в поддержании целостности мембраны при сокращении мышечного волокна. Известно, что от 25% до 70% всех мутаций гена
дистрофина составляют крупные делении, захватывающие от одного до нескольких экзонов и расположенные обычно в двух «горячих» точках - в области 5'-конца гена (6-19 экзоны) и в З'-конце (40-53 экзоны). Около 6% мутаций составляют крупные дупликации, а остапьные мутации являются точковыми. Примерно в 30% случаев крупные делеции гена дистрофина возникают de novo, поэтому в 2/3 семей заболевание носит изолированный характер.
С использованием мультиплексной полимеразной цепной реакции синтеза ДНК нами изучен спектр делеций и распределение делеционных точек разрыва (ДТР) в гене дистрофина у 70 больных из 63 семей, проживающих в РБ (из 63 неродственного больного: русских -20 (31.7%); татар - 23 (36.6%); башкир - 12 (19.0%); чувашей - 3 (4.7%); марийцев - 2 (3.17%); украинцев - 2 (3.17%) и 1 кабардинец (1.59%). В 60 семьях больные имели диагноз МДД, в 3 - МДБ. «Семейная» форма МДД была точно зафиксирована в 10 из 63 обследованных семей (15.87%), в остальных 53 случаях заболевание носило изолированный характер.
Из 63 неродственных больных делеции длиной от одного до девяти экзонов обнаружены у 20 (русских - 4, татар - 11, башкир - 2, марийцев - 1; украинцев - 1; 1 - кабардинец), что составило 31.75% . 13 делеций (65.0%) локализовались в З'-конце гена, 7 (35.0%) - в 5"-"'горячсм" районе гена: соотношение делеций в дистальном и проксимальном районах «горячих» точек составило 1.86:1. Участки локализации ДТР также распределились в районах двух «горячих» точек гена: в 5'-районе (до 19 экзона) зафиксировано 30% ДТР, в 3' - районе - 70% (рис.4).
Рисунок 4. Распределение делеционных точек разрыва в гене DMD у больных МДД из Башкортостана
Выявленные нами относительно высокие частоты ДТР в регионах гена между экзонами 44-45, 45-47 и 50-52 говорят об обоснованности применения известных высокополиморфных маркеров STR-44, STR-45, STR-49, STR-50 [Clemens Р. et al., 1991] не только для косвенной, но и для прямой диагностики носительства делеций у родственниц больных с делениями.
Мы провели диагностику носительства делеций в 13 семьях с
0,25
0,2
0,15
до 6 6 - 8 8- 19 - 42 - 44- 45 - 47- 48- 50- >52 19 42 44 45 47 48 50 52
использованием внутригенных маркеров DYS II [Feener С. et al.,], STR-44, 45, 49, 50 [Clemens Р. et al.,1991], а также диаллельных маркеров pERT-878/TaqI, pERT-8715/ BamHI и 17 exon/Taql [Евфафов O.B., Макаров В.Б., 1987, Евграфов O.B. и др., 1991], в результате которой носительство мутации подтверждено у 11 и отвергнуто у 14 родственниц больных.
У 43 больных МДД/МДБ без крупных делеций в гене DMD проведен поиск точковых мутаций методом SSCP-анализа и последующего секвенирования в тех же 20 участках гена, которые исследовались на их наличие/отсутствие. В результате этого исследования были идентифицированы две новые, ранее не описанные мутации и один известный полиморфизм. В 6-м экзоне у трех больных из двух неродственных семей русской этнической принадлежности выявлена делеция 4-х нуклеотидов - c.401_404delCCAA, приводящая к сдвигу рамки считывания и образованию стоп-кодона через 7 кодонов после мутации, терминирующего дальнейший синтез белка -(p.Thrl34ThrfsX7) (рис. 5) Частота этой мутации в выборке неродственных больных из РБ составила 3.17%.
Д Ji
; ciii|:icG!it iiie i : : с
U V-^X j—i /~ч\ Л- ¿-lLK ■ Л,'
CAAACCAACAGTGAAAAGATTCTCCTGAGC
Рисунок 5. 58СР-анализ и секвенирование 6-го экзона гена ОМО: выделенные фрагменты - образец с измененной подвижностью однонитевой ДНК; мутация с.401_404с1е1ССАА (курсором отмечен нуклеотид, следующий за делецией); внизу - нормальная последовательность фрагмента ДНК
В 46-м экзоне у одного больного татарской этнической принадлежности выявлена делеция аденина в 6626 положении нуклеотидной последовательности гена - с.6626с!е1А (рис. 6), приводящая к сдвигу рамки
Рисунок 6. 88СР-анализ и секвенирование 46-го экзона гена ОМО: выделенный фрагмент - образец с измененной подвижностью однонитевой ДНК; мутация 6626с1е1А ; внизу- нормальная последовательность фрагмента
считывания и образованию стоп-кодона через 11 кодонов в аминокислотной последовательности белка - p.Lys2210ArgfsXl 1. Частота данной мутации в выборке больных из РБ составила 1.6%.
В 53 экзоне гена DMD у одного больного выявлена ранее описанная нуклеотидная замена - с.7728Т>С, обусловливающая синономичную замену в аминокислотной последовательности белка - Asn2575Asn. Функциональное значение данной нуклеотидной замены не установлено, скорее всего, она представляет собой нормальный полиморфизм.
Таким образом, в целом, с помощью доступных нам методов, для больных с миодистрофией Дюшенна/Беккера из РБ установлен несколько более низкий процент делеций в гене дистрофина, но сравнению с европейскими странами, но выявлены две новые мутации в неродственных семьях, в различных этнических группах. Выявление точковых мутаций в гене дистрофина в настоящее время имеет особое значение, т.к. именно для таких случаев уже сейчас разрабатываются методы генной терапии.
Наследственные моторно-сенсорные нейропатии
Наследственные моторно-сенсорные нейропатии, НМСН (болезнь Шарко-Мари-Тута, ШМТ) - генетически гетерогенная группа заболеваний периферической нервной системы. Основными клиническими проявлениями большинства форм НМСН являются прогрессирующая слабость и атрофия мышц дистальных отделов ног и, на поздней стадии - рук, угнетение сухожильных рефлексов, деформация стоп по типу pes cavus (полая стопа, «стопа Фридрейха»), расстройства чувствительности по полиневритическому типу [Harding А., 1980]. В основе болезни лежат дегенеративные изменения миелиновой оболочки или аксонов двигательных и чувствительных волокон периферических нервов и спинномозговых корешков. Соответственно этому, выделяют два основных типа заболевания: НМСН I — димиелинизирующий и НМСН II - аксональный, клиническая дифференциация которых возможна только на основе электронейромиографического исследования, выявляющего скорость проведения импульса (СПИ) по срединному нерву. Среди обоих типов НМСН встречаются аутосомно-доминатные, аутосомно-рецессивные и X-наследуемые формы [Dyck Р. et al., 1993]. В настоящее время картировано более 25 локусов НМСН, идентифицировано 22 гена. Распространенность всех форм НМСН в разных популяциях мира различна, составляет от 10 до 40:100000 населения [Skre Н„ 1974; Emery А., 1991, Ionasescu V., 1995].
В Республике Башкортостан распространенность всех форм НМСН составляет 10,3 на 100000 населения, установлена ее территориальная и этническая неравномерность.
Молекулярно-генетическое исследование проведено на выборке, представленной 173 больными НМСН из 131 семьи. По этнической принадлежности исследуемые семьи распределялись следующим образом: 42 русских, 37 татарских, 27 башкирских, 3 украинских, по одной семье
чувашской, марийской и азербайджанской принадлежности. В 19-ти семьях пробанды происходили из межнациональных браков.
Дупликация гена РМР22, являющаяся наиболее частой причиной заболевания в большинстве европейских стран, обнаружена у 46 больных из 35 неродственных семей. В пересчете на неродственных больных, частота данной мутации составила 26.72% из НМСН всех типов. Несколько чаще она встречалась среди татар - 37.14% и русских - 31.43%, реже —среди башкир — 14.78%. У двух пациентов (1.53%) выявлена делеция гена РМР22, ведущая к развитию наследственной нейропатии со склонностью к параличам от сдавления.
В семьях больных без дупликации гена РМР22 проведен поиск точковых мутаций во всех кодирующих областях генов РМР22, МРХ, С.1В1 и БОН, также часто ответственных за развитие НМСН, причем, как 1-го, так и 2-го типа.
В гене РМР22 обнаружена одна новая нуклеотидная замена в области 3-го интрона- с.309-29 0>А. В гене МРХ у двух пациентов татарской этнической принадлежности обнаружена ранее описанная, но редкая миссенс - мутация -р.Бег88Ьеу (с.263С>0), у двух пациентов - синонимичная замена р.5ег2388ег. В гене ЕОЯ2 у наших больных изменений не обнаружено.
В гене коннексина 32 (СЛЗ!), связанном с Х-сцепленной доминантной формой НМСН IX, в настоящее время известно > 300 различных мутаций. У больных из РБ были выявлены 4 различных мутации. С высокой частотой (10%) - обнаружена трансверсия с.25900, приводящая к замене аминокислоты пролина на аланин в 87 положении белка Сх32 (р. Рго87А1а). Наиболее часто данная миссенс-мутация встречается среди башкир - 33%, реже - среди русских (10%), и практически не обнаруживается среди татар. Анализ неравновесия по сцеплению мутации р.Рго87А1а с аллелями 5-и полиморфных микросателлитных ДНК-локусов, сцепленных с геном ОЛ31, показал, что у неродственных больных на 10 из 13 хромосом, несущих данную мутацию, обнаружен общий гаплотип по маркерам БХ58111-ОХ8983гОХ88Ю7-0X88052, что свидетельствует о ее распространении на территории РБ в результате эффекта основателя.
Вторая мутация - новая, ранее не описанная - нуклеотидная замена с.257С>Т, приводящая к замене треонина на изолейцин в 86 положении аминокислотной последовательности белка (р.ТЬг8611е) (рис.7). Данная мутация обнаружена в одной татарской семье у больного с клиническим диагнозом НМСН и у его тети, внешне не имеющей выраженных признаков заболевания. В контрольной выборке (п=150) данная нуклеотидная замена не обнаружена. Относительно функциональной роли этой нуклеотидной замены мы предполагаем, что, скорее всего, она может оказывать определенное влияние на структуру и функцию белка Сх32, т.к. полярная аминокислота треонин, способная формировать сложные водородные связи в структуре молекулы белка, заменяется на неполярную аминокислоту изолейцин, обладающую, благодаря наличию углеводородного радикала,
12 3 4 5 6 Рисунок 7. 88СР - анализ и секвенирование образца ДНК с мутацией с.257С>Т (р.ТИг8611е) в гене С./8/. Дорожка 4 -одноцепочечный фрагмент ДНК больного НМСН с измененной электрофоретической подвижностью: 1.2. 3, 5, 6 -образцы ДНК без мутации.
гидрофобными свойствами. Данное предположение основывается также на том. что известны и другие миссенс-мутации 86-го кодона. приводящие к заболеванию (р.ТЬг86А1а, р.ТКг868ег. р.ТЬг86Азп)
[мтотулю^еп. ua.ac.be/CMTMutations].
Третья мутация - с.650>А (р. Аг§22С1п). - обнаружена у трех больных из двух татарских семей. Ранее эта мутация была описана в семьях из разных стран, а также из России. Четвертая мутация - с.44С>А (А^1501п) -. идентифицирована у двух неродственных больных. В целом, мутации в гене йЛ31 были выявлены у 18 из 131 неродственного больного НМСН. что составило 13.7%. В европейских популяциях НМСН IX также составляет 1020% среди всех НМСН ПопаБеБси У.й аЦ 1993].
Таким образом, анализ 4-х генов у больных из РБ позволил выявить своеобразный спектр и частоту мутаций для отдельных этнических групп данного региона (рис.8), что необходимо учитывать при проведении ДНК-диагностики. Всего мутации были выявлены в 61 неродственной семье (47%). В этих семьях возможно проведение пресимптоматической и пренатальной ДНК-диагностики.
иРМРШф оРМРШ
|СЛ51:р.Рго87А1а русские шМ1:р.ТМ61!е ВМ1:рЛгд22аг та1аРы □ 0Л31:р.АгдШ1 |МРг:р.5ег881еу башкиры
одр,гае мутации 0% 20% 40% {0% 80% ш
Рисунок 8. Спектр и частота мутаций в генах РМР22, СЛ!1 и МР1 в выборке неродственных больных НМСН из РБ (п=131)
Болезнь Паркинсона
Болезнь Паркинсона (БП) - это хроническое прогрессирующее нейродегенеративное заболевание головного мозга, избирательно поражающее дофаминергические нейроны компактной части черной субстанции в среднем мозге, приводящее к дефициту дофамина в стриатуме и нарушению функционирования подкорково-корковых систем, регулирующих двигательные функции и проявляющееся в виде сочетания гипокинезии с ригидностью и/или тремором покоя и, в более поздней стадии, постуральной неустойчивостью. В популяциях мира БП встречается с частотой 60-187 на 100 ООО населения, а среди лиц старше 50 лет частота заболевания составляет 2-4% [Голубев В.Л., 1999].
В Республике Башкортостан распространенность БП составила 68.6 на 100 000 взрослого населения. Частота семейных форм - 5.95%,- в значительной степени соответствует среднемировым показателям.
Главным патогенетическим механизмом гибели дофаминергических нейронов считается повышенный уровень апоптоза, обусловленный развитием в клетках окислительного стресса, Среди причин развития здесь окислительного стресса рассматриваются нарушения внутриклеточной убиквитин-зависимой деградации поврежденных белков и блокада митохондриального комплекса 1, приводящие к накоплению в клетках свободных радикалов, источниками которых могут являться различные эндогенные и экзогенные нейротоксины [Крыжановский Г.Н. с соавт., 2002]. В большинстве случаев болезнь Паркинсона носит спорадический характер и имеет многофакторную природу с определенной генетической предрасположенностью. Существуют и моногенные формы заболевания. В настоящее время картировано 11 генных локусов, связанных с отдельными наследственными формами БП, в шести из них идентифицированы гены.
Молекулярно-генетическое исследование болезни Паркинсона в РБ включало: 1) поиск у всех обследуемых больных мутаций в генах, связанных с моногенными формами БП - а-синуклеина (PARK1), паркина (PARK2) и дардарина (LRRK2'); 2) анализ ассоциации спорадической БП с полиморфными вариантами ряда генов-кандидатов (Yb8NBC36 Alu-инсерционного локуса гена клиевого канала KCNJ6; делеционного полиморфизма генов глутатионтрансфераз GSTMl(0/0) и GSTT1 (0/0)\ рестрикционных полиморфизмов Ile462Val гена цитохрома семейства р-450 CYP1A1, Gin 191 Arg гена параоксоназы 1 (PONI), Vall08Met гена катехол-О-метилтрансферазы (СОМТ); З'УЫТК-полиморфичма гена дофаминового транспортера (DAT]), (ТСАТ)п-повторов в 1 экзоне гена тирозингидроксилазы (ТН))\ 3) анализ мтДНК у пациентов с БП и в контрольных группах, включающий определение гаплогрупп мтДНК, поиск мутаций в гене цитохрома Ь; а также полное секвенирование мтДНК у 4-х больных с определенными гаплогруппами мтДНК.
При анализе частот генотипов и аллелей каждого локуса учитывались этническая принадлежность больных и здоровых доноров, а также возраст
манифестации, форма заболевания и его тяжесть, определенная на основании унифицированной шкалы, предложенной Хеном и Яром (Hoehn and Yahr Rating Scale) и унифицированной оценочной шкалы болезни Паркинсона (Unified Parkinson's Disease Rating Scale).
В гене альфа-синуклеина (PARK1) проведен скрининг двух известных мутаций - p.Ala53Thr и р.А1аЗОРго, - у 200 больных со спорадической и 8-и неродственных больных с наследственными формами БП: данные мутации у обследованных больных не обнаружены.
В гене белка паркина (PARK2), ответственного за развитие ювенилыюй рецессивной формы БП, проведен поиск мутаций во всех его кодирующих областях (12 экзонов). Методом полуколичественного анализа дозы отдельных экзонов у двух неродственных больных со спорадической БП, этнических русских, была выявлена не описанная ранее делеция 12-го (последнего) экзона в гетерозиготном состоянии. 12-й экзон гена кодирует С-концевой участок паркина, отвечающий за связывание паркина с убиквитин-конъюгирующим ферментом Е2, т.е. за один из наиболее важных моментов в процессе убиквитин-зависимого протеолиза. Исходя из этого, было сделано предположение о возможной роли гетерозиготного носительства найденной делеции в развитии спорадической БП.
С помощью SSCP-анализа и последующего секвенирования у 31 из 200 пациентов с БП выявлено 5 типов изменений нуклеотидной последовательности - в трех экзонах и двух нитронах, однако все они были признаны нейтральными полиморфизмами как на основании сопоставления с литературными данными, так и на основании того, что они встречаются и в контрольной выборке (табл. 7).
Таблица 7. Изменения нуклеотидной последовательности в гене PARK2 у
пациентов со спо радической формой идиопатической болезни Паркинсона
Локализация мутации Изменения нуклеотидной последовательности Изменения в структуре белка Частота (%)
Больные N=200 Контроль N=200
4-й экзон C.601G>A p.Serl67Asn 2 1
7-й экзон С.866ОТ - 0.5 -
11-й экзон C.1281G>A p.Asp394Asn 4 2.5
2-й интрон IVS2+25T>C - 9 6
4-й интрон IVS4 -25 delA - 4.5 3.5
В гене LRRK2 (leucine-rich repeat kinase 2), связанном с аутосомно-доминантной формой БП, проведен скрининг трех известных, наиболее частых, мутаций у 341 пациента со спорадической БП (русских -129, татар - 156, башкир - 56) и у 360 человек из группы контроля (русских - 103, татар- 131, башкир -126). В результате данного исследования мутация Gly2019Ser в гетерозиготном состоянии (рис. 9) была выявлена у одной больной башкирской
этнической принадлежности, имеющей акинетико-ригидно-дрожательную форму БП с манифестацией заболевания в 63 года. Частота данной мутации составила для башкир 1.79% (1/56). Примерно с такой же частотой данная мутация выявлена в популяциях Европы [Di Fonzo A. et al., 2006]. В контрольной выборке данная мутация не обнаружена.
Замена Gly2385Arg обнаружена у двух больных татарской этнической принадлежности с частотой 1.28% среди татар. В исследуемой группе контроля данный полиморфный вариант не выявлен. Одна из этих больных имела ригидно-дрожательную форму заболевания с манифестацией в 62 года, другой больной - акинетико-ригидно-дрожательную форму БП с манифестацией в 36 лет. В исследуемой группе контроля данный полиморфный вариант не обнаружен. Полиморфизм Gly2385Arg ранее был описан, он выявлен как среди больных, так и среди контроля в Тайване [Di Fonzo A. et al., 2006] и Сингапуре [Tan Е. et al., 2007].
íze na i »>
Рисунок 9. Секвенирование гена LRRK2: а) мутация 6055G>A (Gly2019Ser); б) Gly2385Arg
Мутация 11е2020ТЬг в наших выборках пациентов с БП и контроля не обнаружена.
В результате исследования в группах больных и контроля полиморфизма 8-и указанных выше ядерных генов-кандидатов БП выявлена ассоциация заболевания с полиморфными вариантами трех генов.
Во всех исследованных этнических группах обнаружена ассоциация БП с инсерцией УЬ8ЫВС36 гена калиевого канала КСЮ6: у пациентов с БП русской, татарской и башкирской этнической принадлежности по сравнению с соответствующими контрольными группами чаще встречался генотип *1/*1 (62.96% и 38.38%, 76% и 37.08%, 72.22% и 32.40% соответственно) (рис.10). Различия оказались статистически значимыми для всех трех сравниваемых групп (р=0.007, 011=2.73, 95%С1=1.30-5.74; р=0.0005, 011=5.37, 95%С1=2.74-10.62; р=0.0059, 011=5.42, 95%С1=1.54-20.10, соответственно). Эта же закономерность верна и для аллеля *1: при р<0.05 для русских 011=1.95, 95%С1=1.07-3.62; для татар ОЯ=3.36, 95%С1=1.92-5.93; для башкир ОЯ=3.17, 95%С1=1.08-9.93.
Кроме того, генотип *1/*1 и аллель *1 достоверно (р<0.01) преобладают при всех клинических формах заболевания по сравнению с контролем, а также для всех степеней тяжести заболевания. При разделении пациентов по возрасту
начала БП статистически значимые отличия обнаружены в группах старше 40 лет. Мы пришли к заключению, что генотип *!/*! и аллель *1 являются генетическими маркерами повышенного риска развития БП для людей разной этнической принадлежности (русских, татар и башкир) из республики Башкортостан.
Рисунок 10. Распределение частот генотипов Alu- инсернионного локуса Yb8NBC36 гена KCNJ6 у пациентов БП и в контроле в разных этнических группах
Теоретически, инсерция Alu-повторов может изменять транскрипцию гена путем изменения статуса метилирования его промотора, нарушения структуры промотора или внедрения добавочных регуляторных последовательностей, таких как связывающие сайты рецепторов стероидных гормонов, которые содержатся у некоторых членов Alu-семейств. Мы предполагаем, что Alu-инсерция Yb8NBC36 может изменять экспрессию гена KCNJ6, нарушая в какой-то степени функцию калиевого канала.
При исследовании роли генов дофаминовой системы выявлена ассоциация БП с полиморфными вариантами гена катехол-орто-метилтрансферазы (СОМТ) у татар. Частота генотипа *Н/*Н, детерминирующего активную форму фермента, была достоверно выше среди больных (45.54%) по сравнению с контролем (19.18%) (OR=3.52, 95%С1=1.95-6.38), так же, как и частота аллеля *Н - 65.63% и 51..03%, соответственно (OR=1.83; 95%С1=1.26-2,67). Частота генотипа *L/*H, детерминирующего синтез фермента с промежуточным уровнем активности, среди больных составила 40.18%, среди контроля - 63.7% (OR=0,38. 95%С1=0.22-0.65). Следует отметить, что и в других исследуемых этнических группах (русских и башкир) наблюдается аналогичное изменение распределения частот и генотипов (увеличение частоты генотипа *Н/*Н и уменьшение частоты генотипа*Ь/*Н), и аллелей (увеличение частоты аллеля *Н и уменьшение частоты аллеля *L) среди больных, по сравнению с контролем, хотя и не достигающее статистической значимости. Таким образом, можно предполагать, что генотип *Н/*Н и аллель *Н гена СОМТ являются факторами генетического риска, а
генотип *L/*H и аллель*L - протективными факторами для развития болезни Паркинсона не только для татар, но и для других жителей Республики Башкортостан.
При анализе числа тетрануклеотидных повторов (ТСАТ)п в интроне 1 гена тирозингидроксилазы (77/) показана ассоциация генотипа *6/*8 с акинетико-ригидной формой БП (/2=7.39, Р=0.007, OR=4.75, 95%С1=1.43-15.33), третьей (/2=4.53, Р=0.03, OR=3.12, 95%С1= 1.08-8.96) и четвертой степенями тяжести заболевания (х2=5. 94, Р=0.015, OR=3,04, 95%С1=1.21-7.70).
В результате исследования полиморфизма мтДНК, основанного на секвенировании гипервариабельного сегмента I и рестрикционном анализе 11 однонуклеотидных полиморфизмов кодирующего региона, в выборках татар (157 больных и 183 контроля) были выявлены достоверные различия, характеризующиеся значительным преобладанием среди больных гаплогруппы Н (39.5% больных и у 20.0% контроля (OR=2.58, С1= 1.55-4.30, Р=0.0008) и уменьшением частоты гаплогруппы U (16.6% и 34.4%, соответственно), (OR=0.38, С1= 0.22-0.66 Р=0.0002). Протективные свойства гаплогрупп U, К, J, Т для развития БП были показаны ранее и другими авторами [van der Walt J. et al., 2003; Wallace D., 2005]. Ассоциация гаплогруппы H с БП, выявленная нами только в популяции татар, ранее не описана.
В результате секвенирования гена митохондриального цитохрома В в выборках больных (п=58) и контроля (80) татарской этнической принадлежности было выявлено 16 миссенс-мутаций и 9 синонимичных нуклеотидных замен. Достоверно значимое различие было показано для мутации Т15693С, обнаруженной только в контроле и не выявленной у больных, а также установлен гаплотип 15693С-15218А-14793А, ассоциированный с гаплогруппой U, который можно считать протективным для БП в популяции татар (OR=0.04, С1=0.006-0.65)
С целью более углубленного исследования природы выявленных ассоциаций гаплогрупп мтДНК с БП мы провели полное секвенирование мтДНК (16569 пн) у 4-х пациентов татарской этнической принадлежности, двое из которых имели гаплогруппу Н, двое - кластер гаплогрупп UK; полученные результаты секвенирования сравнивались с Кембриджской последовательностью мтДНК (rCRS). Наиболее интересным результатом, на наш взгляд, оказалась выявленная у носителя субгаплогруппы Н2 в гомоплазмическом состоянии миссенс-мутация 4659G>A (Ala64Thr) в высококонсервативном сайте гена ND2. А у пациента с гаплогруппой Ukl была выявлена миссенс-мутация 7637G>A/G (Glul8Lys) в гене СОИ в гетероплазмическом состоянии (рис. 11). Обе эти мутации, предположительно, имеют функциональную значимость и могут обусловливать предрасположенность к БП у данных пациентов.
ic i in ein i^NyiiiGiiGc 11 in cTcncccni^nnccccnicc
Рисунок 11. Секиенирование мтДНК: а) мутация 7637G>A/G (Glul 8Lys) в гене COII у пациента БП с гаплогруппой Ukl; б) мутация 4659G>A (Ala64Thr) в гене ND2 у пациента БП с субгаплогруппой Н2
Таким образом, выявленные этноспецифические структурные особенности генов наиболее частых наследственных заболеваний нервной системы, определение демографических и генетических механизмов их распространения на территории РБ позволили разработать наиболее оптимальные для региона подходы их ДНК-диагностики. На основе этих результатов в РБ уже созданы и действуют национальные генетические регистры (компьютерные базы данных) по всем представленным заболеваниям, что реально способствует повышению эффективности медико-генетического консультирования в семьях больных.
ВЫВОДЫ
1. Республика Башкортостан является популяцией высшего иерархического уровня для своего автохтонного населения. В исследованных районах установлены высокие показатели индекса эндогамии - от 0.58 до 0.97. Основная доля браков в РБ является моноэтнической. Суммарно по шести районам, положительная этническая брачная ассортативность установлена для башкир (Н=13.6 на конец XX в.) и татар (Н=1.09), отрицательная - для русских (0.45). Этническая подразделенность населения и высокий уровень эндогамности в районах РБ являются основными факторами, способствующими сохранению имеющегося генетического разнообразия и территориальной неравномерности распространения наследственной патологии.
2. Высокая распространенность миотонической дистрофии Россолимо-Куршмана-Штейнерта-Баттена среди зауральских башкир (35 - 40 на 100000 населения) обусловлена эффектом основателя и дрейфом генов, о чем свидетельствует общий гаплотип, сцепленный с экспансией (CTG)n повторов в гене миотонинпротеинкиназы (DMPK) ((Hhal(-)/ffinfl(+)/CTGexp)). Корреляции между частотой нормальных аллелей с высоким числом тринуклеотидных повторов ((CTG)iw5) и распространенностью заболевания в популяциях не выявлено. На основании анализа наследования данного локуса в семьях здоровых доноров подтверждена нестабильность аллелей с числом CTG повторов >19, частота мутирования составила 5x103.
3. Распространенность хореи Гентингтона в Башкортостане составляет 2.6 на 100000 населения, что соответствует таковой в среднем в европейских популяциях. Экспансия (CAG)n повторов в гене хореи Гентингтона (HD) обнаруживает практически полное неравновесие по сцеплению с аллелем (CCG)7 и делецией del2642. На мутантных хромосомах выявлено три гаплотипа: (CCG)7/del-, (CCG)7/del+ и (CCG)w/del-, что позволяет предположить, как минимум, три различных источника происхождения ХГ в Республике Башкортостан. Показана роль (CCG)„ тракта как цис-активного фактора, модифицирующего стабильность (CAG)„ повторов. Величина и вектор мутации зависят от исходного числа (CAG)„ повторов и от пола больного родителя: более выраженная экспансия наблюдается при наследовании ХГ от отца. Наличие делеции del2642 на хромосоме с экспансией и аллеля е2 гена АроЕ ассоциировано с более поздним началом болезни.
4. Анапиз распределения частот генотипов и аллелей высокополиморфных локусов (CTG)n в гене DMPK и (CAG)„ в гене HD у народов Вол го-Уральского региона выявил высокий уровень их гетерозиготности и значительную неоднородность исследованных популяций как на уровне этносов, так и на уровне этногеографических групп одного этноса (башкир). По характеру полиморфизма локуса (CTG)n популяции Волго-Уральского региона занимают промежуточное положение между популяциями Европы и Азии, а по локусу (CAG)„ выявляют значительное сходство с популяциями Европы.
5. У больных мышечной дистрофией Дюшенна из Башкортостана частота делеций в гене дистрофина составляет 31.75%. Определен спектр и частота делеционных точек разрыва гена, высокая частота которых в регионах между экзонами 44-45(10%), 45-47(13%) и 50-52(23%) обосновывает применение высокополиморфных маркеров STR-44, STR-45, STR-49 и STR-50 для прямой диагностики носительства делеций у родственниц больных. Выявлены две новые мутации: c.401_404delCCAA (p.Thrl34ThrfsX7), с частотой 3.17% во всей выборке больных (10% среди русских) и c.6626delA (p.Lys22 lOArgfsXl 1) (1.59% во всей выборке и 4.35% - среди татар).
6. Распространенность наследственных моторно-сенсорных нейропатий различных типов в Республике Башкортостан составляет 10.3 на 100000 населения. На основании молекулярно-генетического исследования установлено, что среди всех типов НМСН частота НМСН 1А типа составляет 26%, НМСН IX типа - 13.7%. Установлены региональные и этнические особенности спектра и частот мутаций в генах периферического белка миелина (РМР22), структурного белка миелина (MPZ) и коннексина 32 (GJB1). В гене MPZ выявлена миссенс-мутация р. Ser88Ley (с. 263C>G) (0.8%) и синонимичная замена p.Ser238Ser (с.714С>Т) (1.6%). В гене GJB1 обнаружены 4 миссенс-мутации: p.Pro87Ala (c.259C>G) (10%), p.Arg22Gln (c.65G>A) (2.98%); p.Arg 15Gln (c.44G>A) (1.5%) и p.Thr86Ile (c.257C>T) (0.8%), последняя из которых ранее не описана. Частая мутация Рго87А1а, наиболее распространенная среди башкир (33% среди всех случаев НМСН), сцеплена с
общим гаплотипом, что свидетельствует о ее распространении в РБ в результате эффекта основателя.
7. Распространенность болезни Паркинсона в Республике Башкортостан (68.6 на 100 000 взрослого населения) и частота семейных форм (5.95%),-сопоставимы с современными показателями в мире. Установлено неравномерное территориально-этническое распределение заболевания, преобладание среди пациентов лиц татарской этнической принадлежности.
8. Показано, что мутации в генах, ответственных за моногенные формы БП, вносят определенный вклад в развитие спорадической БП: в гене PARK2 выявлена новая мутация - деления 12-го экзона в гетерозиготном состоянии с частотой 5.26%; в гене LRRK2 обнаружены миссенс-мутация p.Gly2019Ser (1.79% среди башкир), и p.Gly2385Arg (1,28% среди татар).
Генетическим фактором риска развития БП для всех исследованных этнических групп населения Башкортостана является Alu-инсерция Yb8NBC36 гена калиевого канала KCNJ6 (генотип *1/*1 и аллель *1). У татар маркерами повышенного риска развития БП являются генотип *Н/*Н и аллель *Н гена катехол-орто-метилтрансферазы, детерминирующие активную форму фермента. Генотип *6/*8 полиморфного локуса (ТСАТ)п гена
тирозингидроксилазы ассоциирован с акинетико-ригидной формой заболевания.
9. Установлено, что в популяции татар гаплогруппа Н мтДНК является генетическим маркером повышенного риска, а гаплогруппа U - маркером пониженного риска развития спорадической формы болезни Паркинсона. В гене митохондриального цитохрома В выявлен гаплотип 15693С-15218А-14793А, ассоциированный с гаплогруппой U, не обнаруженный у пациентов с БП. В результате полного секвенирования мтДНК у 4-х пациентов БП татарской этнической принадлежности у носителя субгаплогруппы Н2 выявлена мутация Ala64Thr в гене ND2 в гомоплазмическом состоянии, а у носителя гаплогруппы Ukl- мутация Glul8Lys в гене СОИ в гетероплазмическом состоянии.
10. На основе полученных результатов разработаны оптимальные для этнически подразделенного населения Республики Башкортостан алгоритмы ДНК-диагностики моногенных заболеваний нервной системы (миотонической дистрофии, хореи Гентингтона, мышечной дистрофии Дюшенна/Беккера, наследственных моторно-сенсорных нейропатий); и спорадической формы болезни Паркинсона.
СПИСОК ПУБЛИКАЦИЙ ПО ТЕМЕ РАБОТЫ В РЕЦЕНЗИРУЕМЫХ НАУЧНЫХ ЖУРНАЛАХ
1. Хидиятова И.М., . Хуснутдинова Э.К., Иващенко Т.Э., Рафиков Х.С ПДРФ-анализ локусов МЕТ и D7S23, сцепленных с геном муковисцидоза, в популяции башкир и коми // Генетика. 1993. N 12. С. 329-334.
2. Khusnutdinova E.K,, Khidivatova I.M.. Ivachenko Т.Е. et al..Polymorphism of MET and D7S23 loci linked to the cystic fibrosis gene in Bashkir and Komi
populations.// Human Heredity. 1994. V.44. P.191-195.
3. Хуснутдинова Э.К., Хидиятова И.М., Просняк М.И., Лимборская С.А. Анализ полиморфизма ДНК, выявляемого методом геномной дактилоскопии на основе ДНК фага М13, в популяциях башкир и коми // Генетика. 1994. N 12. С. 1621-1625.
4. Хуснутдинова Э.К., Хидиятова И.М., Погода Т.В., Просняк М.И., Лимборская С.А Анализ аллельных вариантов гипервариабельного локуса аполипопротеина В в популяциях башкир и коми.//Генетика.1994.№7.С.995-1000.
5. Kalnin V.V., Kainina O.V., Khidiyatova I.M., Prosnjak M.I., Limborska S.A., Khusnutdinova E.K..Use of DNA fingerprints for human population genetic studies.// Molecular and General Genetics. 1995. V. 247. P.488-493.
6. Хуснутдинова Э.К., Хидиятова И.М.. Галеева A.P., Гринчук О.В., Лимборская С.А Анализ полиморфизма гипервариабельного локуса гена аполипопротеина- В в популяциях народов Волго-Уральского региона.// Генетика. 1996. Т. 32. № 12. С.1678-1682.
7. Хуснутдинова Э.К., Викторова Т.В., Хидиятова И.М., Фатхлисламова Р.И., Иващенко Т.Э..Аллельный полиморфизм ДНК-локусов МЕТ и D7S23, сцепленных с геном муковисцидоза, в популяциях Волго-Уральского региона.// Генетика. 1997. Т.ЗЗ. № 9. С. 1290-1296.
8. Хуснутдинова Э.К., Хидиятова И.М.. Фатхлисламова Р.И., Викторова Т.В., Гринчук О.В Рестрикционно-делеционный полиморфизм V-области митохондриальной ДНК в популяциях Волго-Уральского региона.// Генетика. 1997. Т.ЗЗ. № 7. С. 996-1001.
9. Гринчук О.В., Киселев A.B., Хидиятова И.М., Магжанов Р.В., Хуснутдинова Э.К Анализ делеций в гене дистрофина у больных мышечной дистрофией Дюшенна в Башкортостане // Генетика. 1999. Т. 35. №4. С. 551555.
Ю.Хуснутдинова Э.К., Хидиятова И.М.. Викторова Т.В., Фатхлисламова Р.И., Лимборская С.А. Анализ полиморфизма ДНК, выявляемого методом геномной дактилоскопии на основе фага М13, в популяциях Волго-Уральского региона// Генетика. 1999. Т. 35. №4 С. 509-515.
11.Хуснутдинова Э.К., Хидиятова И.М.. Викторова Т.В., Фатхлисламова Р.И Рестрикционный полиморфизм главной некодирующей области митохондриальной ДНК в популяциях народов Волго-Уральского региона// Генетика. 1999. Т. 35. №5. С. 695-702.
12.Хуснутдинова Э.К., Хидиятова И.М.. Викторова Т.В., Фатхлисламова Р.И., Галеева А.Р., Лимборская С.А. Оценка генетических расстояний и таксономический анализ популяций народов Волго-Уральского региона на основе данных о полиморфизме ДНК // Генетика. 1999. Т. 35. № 7. С. 982987.
13.Фатхлисламова Р.И., Хидиятова И.М.. Попова С.Н., Сломинский П.А., Хуснутдинова Э.К., Лимборская С.А.. Анализ полиморфизма CTG-повторов
в гене миотонической дистрофии в популяциях Волго-Уральского региона // Генетика. 1999. Т. 35. №7. С. 988-993.
14.Хидиятова И.М.. Р.И.Фатхлисламова, Р.В.Магжанов, С.Н.Попова, П.А.Сломинский, С.А.Лимборская, Э.К.Хуснутдинова. Изучение экспансии и частоты мутирования CTG повторов гена миотонической дистрофии. //Генетика.-2000.- V.36.-№ 10.-С. 1181 -1183.
15.Хилиятова И.М., Фатхлисламова Р.И., Магжанов Р.В., Попова С.Н., Сломинский П.А., Лимборская С.А., Хуснутдинова Э.К. Анализ CTG повторов гена миотонинпрогеинкиназы у больных миотонической дистрофией из Башкортостана. // Журнал неврологии и психиатрии,-
2001.№З.С.54-59.
16.Хндиятова И.М. Джемелева Л.У., Хабибуллин P.M., Хуснутдинова Э.К. Анализ частоты мутации 35deIG в гене коннексина 26(GJB2) у больных с несиндромальной аутосомно-рецессивной глухотой из Башкортостана и в популяциях народов Волго-Уральского региона. // Молекулярная биология.
2002, том 36, №3, с.438-441.
17.Dzhemileva L.U., Khidiyatova 1.М.. Khabibullin R.M., Khusnutdinova E.K. Novel mutations and haplotype analysis of genomic polymorphisms of GJB2 and GJB3 genes associated with profound and moderately severe hearing loss in patients from Bashkortostan// Balkan Journal of Medical Genetics. 2003. V.6. P.43-46.
18.П.А.Сломинский, Милосердова O.B., Попова С.И., Гилязова И.Р., Хидиятова И.М., Магжанов Р.В., Хуснутдинова Э.К., Лимборская С.А. Анализ делеционных мутаций в гене паркина у больных идиопатической формой болезни Паркинсона //Генетика.2003 №2. С.223-228.
19.Кутуев И.А., Фатхлисламова Р.И., Хидиятова И.М., Хуснутдинова Э.К. Анализ полиморфных локусов гена IT15 у народов Волго-Уральского региона //Молекулярная биология 2003. Т.37. №6. С.961-970.
20.Хидиятова И.М.. Хуснутдинова Э.К. Геномная структура и ДНК-диагностика наследственных моногенных заболеваний в Волго-Уральском регионе//Молекулярная биология. 2004. Т.38. №1. С.139-149.
21 .Хидиятова И.М.. Ишмухаметова А.Т., Хуснутдинова Э.К. Анализ полиморфизма гена HLA-DRB1 в популяциях Волго-Уральского региона //Генетика. 2004. Т.40. №2. С.203-208.
22.Кутуев И.А., Хусаинова Р.И., Хидиятова И.М.. Магжанов Р.В., Хуснутдинова Э.К. Анализ гена IT15 в семьях больных хореей Гентингтона //Генетика. 2004. Т.40. № 8. С.919-926.
23 .Хидиятова И.М., Гилязова И.Р., Байтимеров А.Р., Магжанов Р.В., Хуснутдинова Э.К. Поиск мутаций в генах PARK1 и PARK2 у пациентов со спорадической и наследственными формами болезни Паркинсона из Башкортостана //Медицинская генетика. 2004. № 6. С.280-284.
24.Кутуев И.А., Хусаинова Р.И., Хидиятова И.М.. Хуснутдинова Э.К. Анализ взаимодействия повторяющихся последовательностей в гене хореи Гентингтона//Медицинская генетика. 2004. №9. С.451-455.
25.Ишмухаметова А.Т., Хидиятова И.М.. Магжанов Р.В., Хуснутдинова Э.К. Анализ ассоциации миастении с полиморфиными локусами (AT)n +49A/G, -318С/Т гена белка 4 цитотоксических Т-лимфоцитов (CTLA4) //Медицинская генетика. 2005. Т.4. №3. С. 128-133.
26.Хуснутдинова Э. К., Хидиятова И. М., Хусаинова Р.И., Карунас A.C., Исламгулов Д.В., Валиев P.P., Мурзабаева С.Ш. Молекулярно-генетическое изучение наследственной патологии в Волго-Уральском регионе // Вестник ВОГиС. 2005. №6. С. 102-123.
27.Ишмухаметова А.Т., Мусин Р.Г., Хидиятова И.М., Магжанов Р.В, Хуснутдинова Э.К. Эпидемиологическое исследование миастении Гравис в Республике Башкортостан // Неврологический журнал. 2006. № 6. С. 16-21.
28.Крупина Н.Б., Хидиятова И.М., Латыпова Э.Г., Сайфуллина Е.В., Магжанов Р.В., Хуснутдинова Э.К. Клинико-эпидемиологическое исследование наследственных моторно-сенсорных нейропатий и скрининг дупликации гена РМР22 у больных в Республике Башкортостан // Медицинская генетика. 2006. №11. С. 126-128.
29.GiIyazova I., Khidiyatova I. Akhmetova V., Baitimerov A., Magzhanov R., Khusnutdinova E. Alu-insertion Yb8NBC36 of KCNJ6 gene is a risk factor for Parkinson's disease development // Balkan Journal of medical genetics. 2006. V.9. (1&2). P.33-37.
ЗО.Зинченко С.П., Кириллов А.Г., Абрукова A.B., Сорокина T.B., Шаронова Е.И., Хидиятова И.М.. Джемилева Л.У., Шокарев P.A., Близнец Е.А., Зинченко P.A., Гинтер Е.К. Генетико-эпидемиологическое исследование наследственных (изолированных и сивдромальных) нарушений слуха в Республике Чувашии // Медицинская генетика. 2007. Т.6. №5. С. 19-29.
31.Ельчинова Г.И., Хидиятова И.М., Тереховская И.Г., Хуснутдинова Э.К., Зинченко P.A. Индекс эндогамии и его изменение во времени в некоторых популяциях Волго-Уральского региона // Генетика, 2007, Т.43., №8. -С.1146-1148.
32. Зинченко P.A., Морозова A.A., Галкина В.А., Хидиятова КМ., Хлебникова О.В., Кононов А.Б., Федотов В.П., Хуснутдинова Э.К., Гинтер Е.К. Медико-генетическое изучение населения Республики Башкортостан. Сообщение I. Отягощенность наследственной патологией в трех районах Республики // Медицинская генетика, 2007. - Т.6, № 6. - С. 17-22.
33. Зинченко P.A., Морозова A.A., Галкина В.А., Хидиятова И.М.. Хлебникова О.В., Кононов А.Б., Федотов В.П., Хусаинова Р.И., Ахметова В.Л., Джемилева Л.У., Щагина O.A., Хуснутдинова Э.К., Гинтер Е.К. Медико-генетическое изучение населения Республики Башкортостан. Сообщение И. Разнообразие наследственной патологии в трех районах Республики // Медицинская генетика, 2007. - Т.6, №7. - С. 18-25.
34.Ельчинова Г.И., Хидиятова И.М., Морозова A.A., Тереховская И.Г., Хуснутдинова Э.К., Зинченко P.A. Медико-генетическое изучение населения Республики Башкортостан. Сообщение III. Временная динамика этнической
ассортативности зауральских башкир // Медицинская генетика, 2007. - Т.б, №7.-С. 43-47.
35. Тереховская И.Г., Ельчинова Г.И., Хидиятова И.М., Морозова А.А., Хуснутдинова Э.К., Зинченко Р.А. Медико-генетическое изучение населения Республики Башкортостан. Сообщение IV. Репродуктивные характеристики популяций семи сельских районов // Медицинская генетика, 2007. - Т.б, № 8.-С. 14-21.
36. Ельчинова Г.И., Хидиятова И.М., Морозова А.А., Тереховская И.Г'., Хуснутдинова Э.К., Зинченко Р.А. Медико-генетическое изучение населения республики Башкортостан. Сообщение V. Эндогамия и изоляция расстоянием зауральских башкир // Медицинская генетика, 2007. - Т.б, № 9. - С. 42-45.
37.Хидиятова И.М., Багаутдинова Э.Г., Галиева Д.В., Крупина Н.Б., Щагина О.А., Тибрукова Т.Б., Магжанов Р.В., Поляков А.В., Хуснутдинова Э.К. Спектр и частота мутаций в гене коннексина 32 (GJB1) у больных с наследственной моторно-сенсорной нейропатией IX типа из Башкортостана // Генетика, 2008. - Т.44, №10. - С.1385-1391.
38.Гилязова И.Р., Хидиятова И.М., Ахметова B.JL, Байтимеров А.Р., Магжанов Р.В., Хуснутдинова Э.К. Исследование ассоциации полиморфных вариантов ряда генов метаболизма дофамина с идиопатической болезнью Паркинсона в Республике Башкортостан// Медицинская генетика, 2008. - №1. - С. 39-49.
39.Khusnutdinova Е., Gilyazova I., Ruiz-Pesini Е., Derbeneva О., Khusainova R., Khidiyatova I., Magzhanov R. and Wallace D. A Mitochondrial Etiology of Neurodegenerative Diseases: Evidence from Parkinson's Disease //Annals of the New York Academy of Sciences, 2008 - V3, N11.- P. 447-467.
40.Джемилева Л.У., Хуснутдинова Э.К., Хидиятова И.М., Хабибуллин P.M., Тазетдинов A.M. Способ выявления мутаций в гене GJB2, сопровождающихся развитием несиндромальной аутосомно-рецессивной глухоты. Патент на изобретение №2317547. - Зарегистрировано в Гос.реестре изобретений РФ 20 февраля 2008г.
ХИДИЯТОВА ИРИНА МИХАЙЛОВНА
ЭПИДЕМИОЛОГИЯ И МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ОСНОВЫ НАСЛЕДСТВЕННЫХ ЗАБОЛЕВАНИЙ НЕРВНОЙ СИСТЕМЫ В РЕСПУБЛИКЕ БАШКОРТОСТАН
03.00Л в. - генетика
Автореферат диссертации на соискание ученой степени доктора биологических наук
Подписано в печать 20.1108 г. Формат 60x84 1/16. Бумага офсетная. Печать ргао[рафическая. Тираж 100 экз. Заказ 204. Гарнитура «ТтюзЫеигИотап». Отпечатано п типографии «ПЕЧАТНЫЙ ДОМЪ» ИИ ВЕРКО. Объем 0,4 п.л. Уфа, Карла Маркса 12 корп. 4, т/ф: 27-27-600, 27-29-123
Содержание диссертации, доктора биологических наук, Хидиятова, Ирина Михайловна
ВВЕДЕНИЕ.
ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1.1.Население Республики Башкортостан. Краткое описание этногенеза башкир.
1.2. Демографические, генетико-биохимические и молекулярно-генетические исследования популяций башкир в ряду народов Волго-Уральского региона.
1.3. Болезни динамических мутаций.
1.3.1. Миотоническая дистрофия.
1.3.2. Хорея Гентингтона.
1.4. Прогрессирующая мышечная дистрофия Дюшенна-Беккера.
1.5. Наследственные моторно-сенсорные нейропатии (НМСН).
1.5.1. Клиническая характериститка и классификация НМСН.
1.5.2. Молекулярно-генетические основы НМСН.
1.6. Болезнь Паркинсона.
1.6.1. Исследования эпидемиологии, этиологии и патогенеза болезни Паркинсона.
1.6.2. Молекулярно-генетические исследования болезни Паркинсона.
ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
2.1. Объект исследования.
2.2. Методы исследования.
2.2.1. Методы анализа брачно-миграционной структуры населения.
2.2.2. Молекулярно-генетические методы исследования.
2.2.3. Статистическая обработка результатов исследований.
ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ
3.1. ИССЛЕДОВАНИЕ ФАКТОРОВ ПОПУЛЯЦИОНИОЙ ДИНАМИКИ, ВЛИЯЮЩИХ НА РАСПРОСТРАНЕННОСТЬ НАСЛЕДСТВЕННЫХ
ЗАБОЛЕВАНИЙ В РЕСПУБЛИКЕ БАШКОРТОСТАН.
3.1.1.Анализ брачно-миграционной структуры.
3.1.1.1. Анализ этнической брачной ассортативности и ее временной динамики.
3.1.1.2. Анализ эндогамии и изоляции расстоянием.
3.1.1.3. Инбридинг.
3.2. РАСПРОСТРАНЕННОСТЬ И МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ОСНОВЫ МОНОГЕННЫХ НЕВРОЛОГИЧЕСКИХ ЗАБОЛЕВАНИЙ В РЕСПУБЛИКЕ БАШКОРТОСТАН.
3.2.1. Миотоническая дистрофия.
3.2.1.1. Анализ распространенности миотонической дистрофии в семи районах Республики Башкортостан.
3.2.1.2. Исследование экспансии (CTG)n повторов в гене DMPK и анализ гаплотипов на мутантных хромосомах у больных миотонической дистрофией из Республики Башкортостан.
3.2.1.3. Анализ полиморфизма (CTG)„ повторов в гене DMPK в популяциях Волго-Уральского региона.
3.2.2. Хорея Гентингтона.
3.2.2.^Распространенность хореи Гентингтона в
Республике Башкортостан.
3.2.2.2. Анализ полиморфизма локусов (CAG)n-, (CCG)n- повторов и нейтральной делеции del2642 гена HD (IT15) в популяциях Волго-Уральского региона и у больных хореей Гентингтона из Башкортостана.
3.2.3. Прогрессирующая мышечная дистрофия Дюшенна-Беккера
МДЦ/МДБ).
3.2.3.1 Распространенность мышечной дистрофии Дюшенна в Республике Башкортостан.
3.2.3.2. Анализ частоты и спектра крупных делеций гена DMD у больных МДЦ/МДБ из Республики Башкортостан.
3.2.3.3. Поиск точковых мутаций в гене DMD.
3.2.3.4. ДНК-диагностика гетерозиготного носительства делеций гена DMD.
3.2.4. Наследственные моторно-сенсорные нейропатии (НМСН).
3.2.4.1. Распространенность НМСН в Республике Башкортостан.
3.2.4.2. Молекулярно-генетическое исследование НМСН в Республике Башкортостан.
3.2.5. Болезнь Паркинсона.
3.2.5.1.Распространенность болезни Паркинсона в Республике Башкортостан.
3.2.5.2.Молекулярно-генетическое исследование болезни Паркинсона
3.2.5.2.1.Анализ генов а-синуклеина (PARK1), паркина (PARK2) и LRRK2 (PARK8) у пациентов с болезнью Паркинсона.
3.2.5.2.2.Анализ ассоциации болезни Паркинсона с полиморфными вариантами генов - кандидатов ядерного генома.
3.2.5.2.3.Исследование роли митохондриальной ДНК в развитии болезни
Паркинсона.
Введение Диссертация по биологии, на тему "Эпидемиология и молекулярно-генетические основы наследственных болезней нервной системы в Республике Башкортостан"
Изучение молекулярно-генетической природы наследственных и наследственно предрасположенных заболеваний является основой для познания их патогенеза, разработки высокоточных методов ДНК-диагностики, методов профилактики и лечения. К настоящему времени идентифицировано >17000 генов наследственных заболеваний из существующих примерно 25000 генов человека http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/omim]. В структуре моногенных заболеваний (МЗ) значительную часть составляют наследственные болезни нервной системы (НБНС), более для 300 из которых полностью расшифрованы молекулярные дефекты или установлена хромосомная локализация мутантных генов. Большинство НБНС носит тяжелый прогрессирующий характер, часто приводит к ранней инвалидизации, а иногда и смерти больного, но эффективное лечение пока разработано лишь для некоторых из этих заболеваний. Поэтому разработка наиболее эффективных методов медико-генетического консультирования (МГК), включающих ДНК-диагностику, в том числе пренатальную и пресимптоматическую, направленная на профилактику МЗ, имеет большое социально-экономическое значение.
Многие НБНС являются клинически и генетически гетерогенными, что значительно затрудняет их дифференциальную диагностику и, соответственно, медико-генетическое консультирование. Для большинства наследственных заболеваний существуют популяционные различия по частоте встречаемости и спектру мутаций генов, детерминирующих их развитие, а также по распределению частот аллелей сцепленных с генами полиморфных ДНК-локусов. Поэтому для обеспечения наиболее эффективного МГК необходимо изучение распространенности НЗ и их молекулярно-генетических основ в отдельных регионах и этнических б группах. При этом, для оценки и прогнозирования величины и структуры наследственной патологии важное значение имеет и выявление причин (механизмов) распространения в регионе тех или иных наследственных заболеваний, которые могут быть связаны как со структурными особенностями ответственных генов, так и с генетической структурой популяций.
Исследования генетической структуры популяций России и их отягощенности наследственной патологией уже более трех десятилетий проводятся сотрудниками лаборатории генетической эпидемиологии ГУ Медико-генетического научного центра РАМН. На примере популяций русских их различных регионов России, а также и других этнических групп4 было показано, что даже незначительная генетическая дифференциация популяций влияет на груз рецессивных заболеваний и что, зная особенности генетической структуры популяций, можно достаточно надежно предсказать величину груза рецессивных заболеваний [цит. по Гинтеру Е.К., 2002].
Генетическая структура (частота генов и генотипов) и адаптация популяций к определенным условиям среды и к их изменениям, распространение тех или иных моногенных заболеваний в значительной степени зависят и от социальных, демографических процессов. Одной из наиболее важных демографических характеристик, определяющих частоту генов в популяции, является структура браков, характеризующая возрастной и национальный состав, уровень и направление миграций, и определяющая такие важные для популяции параметры, как эндогамность и инбридинг. Наиболее информативным является изучение генетико-демографических процессов в динамике. В настоящее время наиболее доступна информация по бракам, начиная со второй половины XX века по сегодняшний день, но и она является очень важной, т.к. этот период в России характеризуется и значительным усилением ассимиляционных процессов, связанных с миграциями и урбанизацией, и различными изменениями в уровне экономики и производства.
Актуальность популяционно-генетического исследования моногенной патологии, в частности, НБНС, в Республике Башкортостан (РБ) определялась значительным своеобразием генофонда ее населения, формирование которого имеет длительную и сложную историю. Территория Южного Урала, где располагается РБ, как и всего Волго-Уральского региона, находясь на границе двух частей света - Европы и Азии, - с древнейших времен была ареной постоянных генетических контактов между сибирскими, индо-европейскими, средне-азиатскими и другими этническими образованиями. Сегодня РБ имеет многонациональный состав населения с общей с численностью 4104336 человек. Коренное население республики - башкиры, численность которых, по данным переписи 2002г., составляет 1,2 млн. человек (29,8%); наиболее многочисленными представителями других национальностей являются русские (1221302; 36,3%) и татары (990702; 24,1 %), а также здесь проживают чуваши (117317; 2,9%), марийцы (105829; 2,6%), украинцы (105829; 1,3%), мордва (26020; 0,6%), удмурты (22625; 0,6%), белорусы (17117; 0,4%) и другие национальности (53094; 1,3%). Составляющие население РБ народы относятся, по лингвистической классификации, к тюркской ветви алтайской языковой семьи (башкиры, татары, чуваши), славянской группе индо-европейской семьи (русские, белорусы, украинцы) и финно-угорской ветви уральской языковой семьи (марийцы, мордва, удмурты). По антропологическому составу эти народы относятся к европеоидной расе с различной долей монголоидного компонента [Рогинский, Левин, 1978]. На основании полученных нами ранее данных по изучению полиморфизма ядерной и митохондриальной ДНК в популяциях Волго-Уральского региона, в том числе в четырех этногеографических группах башкир, было установлено своеобразие генетической структуры народов этого региона, определен вклад европеоидного и монголоидного компонентов в их генофонд, и показана их генетическая подразделенность [Хуснутдинова Э.К., Хидиятова И.М., Викторова Т.В. и др., 1991, 1993, 1994, 1998, 1999]. Эти и другие исследования по изучению разнообразия генома человека в популяциях, проведенные в рамках международных и национальных программ «Геном человека» в 90-х годах XX столетия, послужили основой для разработки нового направления в молекулярной генетике человека - этногеномики, - и определили основные перспективы его развития, среди которых важнейшее место занимает исследование молекулярной структуры наследственной патологии в различных популяциях.
Молекулярно-генетическое исследование некоторых моногенных заболеваний в РБ, в частности, муковисцидоза [Корытина с соавт., 2003], фенилкетонурии [Ахметова с соавт., 2003], болезни Вильсона [Карунас с соавт., 2000], нейросенсорной несиндромальной тугоухости/глухоты [Хидиятова с соавт. 2002, 2005; ОгЬетНеуа е! а1., 2002] обнаружило значительное своеобразие спектра и частот мутаций в соответствующих генах, как в целом для больных из РБ, так и в отдельных этнических группах, был выявлен ряд новых, ранее не описанных мутаций. Одновременно проводилось исследование распространенности и молекулярных основ ряда наиболее частых наследственных неврологических заболеваний - миотонической дистрофии, хореи Гентингтона, миодистрофии Дюшенна/Беккера, моторно-сенсорных нейропатий, - результаты которого обобщены в настоящей работе. Наряду с этим, был проведен анализ генетической гетерогенности (поиск генетических факторов развития) и распространенности в РБ одного из наиболее частых заболеваний нервной системы - болезни Паркинсона. Актуальность генетико-эпидемиологического исследования этого чаще всего многофакторного заболевания в регионе определялась значительной сложностью и нерешенностью проблемы генетической основы его патогенеза, в частности, существующими сведениями о его многочисленных моногенных формах и отсутствием информации о распространенности семейных и спорадических форм заболеваний в различных регионах, в том числе в РБ. Все эти исследования послужили основой для определения стратегии анализа моногенных и многофакторных заболеваний в этнически подразделенных популяциях и разработки наиболее оптимальных подходов их ДНК-диагностики в Республике Башкортостан.
Цель и задачи исследования
Целью работы является изучение молекулярно-генетических основ, популяционно-демографических и генетических механизмов распространения ряда частых наследственных заболеваний нервной системы в Республике Башкортостан и разработка оптимальных для региона подходов их ДНК-диагностики.
Для достижения поставленной цели были сформулированы следующие задачи:
1. Провести анализ брачно-миграционной структуры в шести районах РБ и охарактеризовать основные демографические факторы формирования генетической структуры населения республики.
2. Изучить распространенность и популяционно-генетические факторы распространения в РБ частых НБНС - миотонической дистрофии, хореи Гентингтона, моторно-сенсорных нейропатий, семейных и спорадических форм болезни Паркинсона.
3. В генах ИМРК и НИ (1Т-15'), ответственных за развитие болезней «экспансии» - миотонической дистрофии Россолимо-Куршмана-Штейнерта-Баттена и хореи Гентингтона, соответственно, - исследовать полиморфизм числа тринуклеотидных повторов (ТНП) и ряда вариабельных внутригенных локусов у больных из РБ и в популяциях Волго-Уральского региона; определить закономерности экспансии ТНП, ее происхождение и механизмы распространения.
4. Определить характерные для РБ спектры и частоты мутаций в генах НБНС: при мышечной дистрофии Дюшенна/Беккера - в гене дистрофина (.DMD), при моторно-сенсорных нейропатиях - в генах периферического белка миелина (РМР22'), структурного белка миелина (MPZ), коннексина 32 (GJB1), EGR2 (early growth response gene-2); провести анализ полиморфизма ряда вариабельных л оку сов исследованных генов.
5. Провести поиск мутаций в генах а-синуклеина (PARK1), паркина (PARK2) и дардарина (LRRK2) у больных с наследственными и спорадическими формами болезни Паркинсона.
6. Провести поиск маркеров генетической предрасположенности к спорадической форме болезни Паркинсона на основе анализа ассоциации заболевания с полиморфными вариантами генов ядерного генома и исследования структурных особенностей митохондриальной ДНК.
7. Разработать оптимальные для РБ подходы ДНК- диагностики исследованных неврологических заболеваний.
Научная новизна и практическая значимость исследования
Впервые проведено комплексное популяционно-молекулярно-генетическое исследование ряда частых наследственных заболеваний нервной системы (миотонической дистрофии, хореи Гентингтона, мышечной дистрофии Дюшенна/Беккера, наследственных моторно-сенсорных нейропатий) и многофакторного, наследственно предрасположенного заболевания - болезни Паркинсона в РБ, население которой характеризуется этнической подразделенностью. Использование такого подхода позволило получить наиболее адекватные оценки распространенности заболеваний, выявить популяционно-демографические факторы формирования генетической структуры популяций, влияющие на и распространение наследственной патологии, и провести углубленный анализ молекулярно-генетических основ исследуемых заболеваний.
Впервые проведенный анализ брачно-миграционной структуры населения шести районов РБ выявил преобладание в них моноэтнических браков, положительную этническую брачную ассортативность башкир и татар, и высокий уровень эндогамности, что способствует территориальной и этнической неравномерности распространения наследственной патологии.
Молекулярно-генетическое исследование болезней динамических мутаций - миотонической дистрофии и хореи Гентингтона, - позволило идентифицировать экспансию тринуклеотидных повторов в соответствующих генах практически у всех обследованных пациентов и во многих случаях выявить ее у родственников больных, не имеющих на момент обследования клинических признаков заболеваний. Впервые у больных из РБ определены гаплотипы, сцепленные с мутациями -экспансией тринуклеотидных повторов, - в генах DMPK и HD, что позволило установить единое происхождение миотонической дистрофии на территории РБ, ее распространение в результате эффекта основателя и дрейфа генов, и, как минимум, три источника происхождения хореи Гентингтона. Выявлены генетические факторы нестабильности тринуклеотидных повторов: в гене DMPK нестабильными являются аллели с числом CTG повторов >19; в гене HD установлена роль числа (CCG)n повторов как цис-активного фактора, модифицирующего стабильность (CAG)n повторов. Впервые определены генетические и эпигенетические факторы, модифицирующие возраст манифестации хореи Гентингтона.
У больных миодистрофией Дюшенна/Беккера из РБ впервые определены спектр и частота делеций в гене дистрофина, выявлены две новые мутации - p.Thrl34ThrfsX7 и p.Lys2210ArgfsXl 1.
Впервые для РБ установлены региональные и этнические особенности распространенности наследственных моторно-сенсорных нейропатий, спектра и частоты мутаций в генах периферического белка миелина (РМР22), структурного белка миелина (MPZ), коннексина 32 (GJB1) и EGR2 (early growth response gene-2). Определен вклад типов НМСН 1А и НМСН IX в структуру НМСН в исследуемом регионе. Установлена высокая частота НМСН IX типа среди башкир, обусловленная мутацией р.Рго87А1а, распространившейся в популяции в результате эффекта основателя. В гене GJB1 выявлена ранее не описанная мутация p.Thr86Ile.
Впервые получены данные по распространенности болезни Паркинсона в РБ, показана этническая и территориальная неравномерность распространения заболевания. Проведено изучение генетических факторов риска развития БП с учетом этнической принадлежности. Впервые в качестве гена-кандидата исследован Alu-инсерционный полиморфизм гена калиевого канала KCNJ6 и обнаружена ассоциация Alu-инсерции с БП во всех исследованных этнических группах. Выявлена ассоциация с БП полиморфного варианта гена катехол-орто-метилтрансферазы, детерминирующего активную форму фермента. Впервые проведено углубленное исследование роли мтДНК в развитии БП, в результате которого обнаружена ассоциация гаплогруппы Н мтДНК с БП у татар, выявлен гаплотип, протективный для развития заболевания. Впервые проведено полное секвенирование мтДНК у 4-х пациентов с БП, у двух из них обнаружены две точковые мутации, которые, предположительно, могут являться факторами развития заболевания у этих больных.
На основе полученных результатов разработаны оптимальные для населения РБ подходы ДНК-диагностики исследованных заболеваний. Выявление этиологической основЧы заболевания у больных, а также носителей мутантного гена способствует проведению ранних лечебно-профилактических мероприятий, позволяющих отсрочить клиническую манифестацию заболевания или замедлить темпы его прогрессирования. Кроме того, оно является необходимым условием для проведения пренатальной диагностики с целью профилактики повторных случаев заболевания в семьях. Полученные данные легли в основу созданных в РБ национальных автоматизированных регистров по всем исследованным заболеваниям, обеспечивающих их эпидемиологический мониторинг и оптимизацию лечебно-диагностической и диспансерной работы врачей (неврологов, генетиков).
Положения, выносимые на защиту
1. Этническая подразделенность населения, преобладание моноэтнических браков и высокий уровень эндогамности в районах РБ способствуют сохранению имеющегося генетического разнообразия, территориальной и этнической неравномерности распространения наследственной патологии.
2. Распространение миотонической дистрофии Россолимо-Куршмана-Штейнерта-Баттена в РБ связано с эффектом основателя и дрейфом генов. Локальное накопление заболевания среди башкир в отдельных районах Зауралья обусловлено доминантным типом его наследования, моноэтнической структурой населения и высоким уровнем эндогамности этих районов. В локусе (СТО)п гена ИМРК нестабильными являются аллели с числом тринуклеотидных повторов >19.
3. Распространенность хореи Гентингтона в Башкортостане сопоставима с таковой в европейских популяциях. Распространение ХГ на территории республики связано, как минимум, с тремя источниками происхождения заболевания, о чем свидетельствуют три различных гаплотипа в гене НИ на мутантных хромосомах у больных из РБ. (ССО)п -тракт, сцепленный с (САО)п повторами в гене НИ, является цис - активным фактором, модифицирующим стабильность (САО)п -повторов. Генетические и эпигенетические факторы, влияющие на возраст манифестации ХГ.
4. Высокий уровень гетерозиготности локусов (CTG)n гена DMPK и (CAG)n гена HD, неоднородный характер распределения частот их аллелей в популяциях Волго-Уральского региона, в том числе на уровне этногеографических групп одного этноса, свидетельствуют о возможности использования данных высокополиморфных ДНК -локусов в качестве генетических маркеров популяций.
5. Спектр и частота делеций и делеционных точек разрыва в гене дистрофина (DMD), две новые точковые мутации у больных мышечной дистрофией Дюшенна/Беккера из РБ.
6. Неравномерное территориально-этническое распространение наследственных моторно-сенсорных нейропатий (НМСН) в РБ. Региональные и этнические особенности спектра и частоты мутаций в генах периферического белка миелина (РМР22), структурного белка миелина (MPZ), коннексина 32 (GJB1) и EGR2 (early growth response gene-2). Вклад типов НМСН 1А и НМСН IX в структуру НМСН в РБ. Среди башкир наиболее частой формой НМСН 1 типа является НМСН IX, обусловленная мутацией р.Рго87А1а, распространившейся в популяции в результате эффекта основателя. Новая мутация p.Thr86Ile в гене GJB1.
7. Неравномерное территориально-этническое распределение болезни Паркинсона в РБ с эпидемиологическими характеристиками, сопоставимыми с современными показателями в мире. Ассоциация спорадической формы БП с мутациями в генах паркина (PARK2) и дардарина (LRRK2, PARK8), а также с полиморфными вариантами ряда генов-кандидатов ядерного и митохондриального геномов. Генетические факторы риска развития и характера течения спорадической БП в этнически подразделенных группах населения РБ.
8. Разработка оптимальных для региона подходов ДНК-диагностики исследованных заболеваний.
Автор выражает глубокую благодарность за неоценимую помощь в проведении совместных исследований и обсуждении результатов работы научному руководителю, профессору Э.К. Хуснутдиновой (ИБГ УНЦ РАН, Уфа), а также профессору Р. В. Магжанову (БГМУ, Уфа), профессору С.А. Лимборской и д.б.н. П.А. Сломинскому (ИМГ РАН, Москва), д.б.н. P.A. Зынченко и д.б.н. Г.И. Ельчиновой (МГНЦ РАМН, Москва), профессору Д. Уоллесу (Центр молекулярной и митохондриалъной медицины и генетики Калифорнийского университета, США), профессору В. Бонифати (Отделение клинической генетики Erasmus медицинского центра, Роттердам, Голландия), директору Института биохимии и генетики УНЦ РАН профессору В.А. Вахитову, сотрудникам ИБГ УНЦ РАН к.б.н. Р.И.Хусаиновой, к.м.н. И.А.Кутуеву, к.б.н. И.Р. Гшязовой и всем коллегам лаборатории молекулярной генетики ИБГ УНЦ РАН.
Заключение Диссертация по теме "Генетика", Хидиятова, Ирина Михайловна
выводы
1. Республика Башкортостан является популяцией высшего иерархического уровня для своего автохтонного населения. В исследованных районах установлены высокие показатели индекса эндогамии - от 0.58 до 0.97. Основная доля браков в РБ является моноэтнической. Суммарно по шести районам, положительная этническая брачная ассортативность установлена для башкир (Н=13.6 на конец XX в.) и татар (Н=1.09), отрицательная - для русских (0.45). Этническая подразделенность населения и высокий уровень эндогамности в районах РБ являются основными факторами, способствующими сохранению имеющегося генетического разнообразия и территориальной неравномерности распространения наследственной патологии.
2. Высокая распространенность миотонической дистрофии Россолимо-Куршмана-Штейнерта-Баттена среди зауральских башкир (35 - 40 на 100000 населения) обусловлена эффектом основателя и дрейфом генов, о чем свидетельствует общий гаплотип, сцепленный с экспансией (CTG)n повторов в гене миотонинпротеинкиназы (.DMPK) ((Hhal(-)/Hmfl(+)/CTGeXp))-Корреляции между частотой нормальных аллелей с высоким числом тринуклеотидных повторов ((CTG) 19.35) и распространенностью заболевания в популяциях не выявлено. На основании анализа наследования данного локуса в семьях здоровых доноров подтверждена нестабильность аллелей с числом CTG повторов >19, частота мутирования составила 5x10" .
3. Распространенность хореи Гентингтона в Башкортостане составляет 2.6 на 100000 населения, что соответствует таковой в среднем в европейских популяциях. Экспансия (CAG)n повторов в гене хореи Гентингтона (HD) обнаруживает практически полное неравновесие по сцеплению с аллелем (CCG)7 и делецией del2642. На мутантных хромосомах выявлено три гаплотипа: (CCG)7/del-, (CCG)7/del+ и (CCG)i0/del-, что позволяет предположить, как минимум, три различных источника происхождения ХГ в Республике Башкортостан. Показана роль (CCG)n тракта как цис-активного фактора, модифицирующего стабильность (САО)п повторов. Величина и вектор мутации зависят от исходного числа (САО)п повторов и от пола больного родителя: более выраженная экспансия наблюдается при наследовании ХГ от отца. Наличие делеции (1е12642 на хромосоме с экспансией и аллеля б2 гена АроЕ ассоциировано с более поздним началом болезни.
4. Анализ распределения частот генотипов и аллелей высокополиморфных локусов (СТО)п в гене ПМРК и (САО)п в гене НИ у народов Волго-Уральского региона выявил высокий уровень их гетерозиготности и значительную неоднородность исследованных популяций как на уровне этносов, так и на уровне этногеографических групп одного этноса (башкир). По характеру полиморфизма локуса (СТО)п популяции Волго-Уральского региона занимают промежуточное положение между популяциями Европы и Азии, а по локусу (САО)п выявляют значительное сходство с популяциями Европы.
5. У больных мышечной дистрофией Дюшенна из Башкортостана частота делеций в гене дистрофина составляет 31.75%. Определен спектр и частота делеционных точек разрыва гена, высокая частота которых в регионах между экзонами 44-45(10%), 45-47(13%) и 50-52(23%) обосновывает применение высокополиморфных маркеров 8ТЯ-44, 8ТЯ-45, 8ТЯ-49 и 8ТЯ-50 для прямой диагностики носительства делеций у родственниц больных. Выявлены две новые мутации: с.401404с1е1ССАА (р.Т11г134Т1пТ8Х7), с частотой 3.17% во всей выборке больных (10% среди русских) и с.6626ёе1А (р.Ьу82210Аг§£зХ11) (1.59% во всей выборке и 4.35% - среди татар).
6. Распространенность наследственных моторно-сенсорных нейропатий различных типов в Республике Башкортостан составляет 10.3 на 100000 населения. На основании молекулярно-генетического исследования установлено, что среди всех типов НМСН частота НМСН 1А типа составляет 26%о, НМСН IX типа - 13.7%. Установлены региональные и этнические особенности спектра и частот мутаций в генах периферического белка миелина (РМР22), структурного белка миелина (МР2) и коннексина 32 (ОЗВ1). В гене МР2 выявлена миссенс-мутация р. 8ег88Ьеу (с. 26300) (0.8%) и синонимичная замена р.8ег2388ег (с.714С>Т) (1.6%). В гене вЗВ1 обнаружены 4 миссенс-мутации: р.Рго87А1а (с.259С>в) (10%>), р.А^22С1п (с.65С>А) (2.98%); р.Агё1501п (с.440>А) (1.5%) и р.ТЬг86Ие (с.257С>Т) (0.8%), последняя из которых ранее не описана. Частая мутация Рго87А1а, наиболее распространенная среди башкир (33% среди всех случаев НМСН), сцеплена с общим гаплотипом, что свидетельствует о ее распространении в РБ в результате эффекта основателя.
7. Распространенность болезни Паркинсона в Республике Башкортостан (68.6 на 100 000 взрослого населения) и частота семейных форм (5.95%>),- сопоставимы с современными показателями в мире. Установлено неравномерное территориально-этническое распределение заболевания, преобладание среди пациентов лиц татарской этнической принадлежности.
8. Показано, что мутации в генах, ответственных за моногенные формы БП, вносят определенный вклад в развитие спорадической БП: в гене РАШС2 выявлена новая мутация - делеция 12-го экзона в гетерозиготном состоянии с частотой 5.26%>; в гене ЬШК2 обнаружены миссенс-мутация р.С1у20198ег (1.79%о среди башкир), и р.С1у2385Аг§ (1,28%) среди татар).
Генетическим фактором риска развития БП для всех исследованных этнических групп населения Башкортостана является А1и-инсерция УЪ8ЫВС36 гена калиевого канала КСШ6 (генотип *1/*1 и аллель *1). У татар маркерами повышенного риска развития БП являются генотип *Н/*Н и аллель *Н гена катехол-орто-метилтрансферазы, детерминирующие активную форму фермента. Генотип *6/*8 полиморфного локуса (ТСАТ)п гена тирозингидроксилазы ассоциирован с акинетико-ригидной формой заболевания.
9. Установлено, что в популяции татар гаплогруппа Н мтДНК является генетическим маркером повышенного риска, а гаплогруппа и - маркером пониженного риска развития спорадической формы болезни Паркинсона. В гене митохондриального цитохрома В выявлен гаплотип 15693С-15218А-14793А, ассоциированный с гаплогруппой и, не обнаруженный у пациентов с БП. В результате полного секвенирования мтДНК у 4-х пациентов БП татарской этнической принадлежности у носителя субгаплогруппы Н2 выявлена мутация А1а64Т11г в гене N02 в гомоплазмическом состоянии, а у носителя гаплогруппы 11к1- мутация 01и18Ьуз в гене СОИ в гетероплазмическом состоянии.
10. На основе полученных результатов разработаны оптимальные для этнически подразделенного населения Республики Башкортостан алгоритмы ДНК-диагностики моногенных заболеваний нервной системы (миотонической дистрофии, хореи Гентингтона, мышечной дистрофии Дюшенна/Беккера, наследственных моторно-сенсорных нейропатий); и спорадической формы болезни Паркинсона.
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
В структуре моногенных заболеваний значительную часть составляют наследственные болезни нервной системы (НБНС), большинство из которых носит тяжелый прогрессирующий характер, часто приводит к ранней инвалидизации, а иногда и смерти больного, но эффективное лечение в настоящее время разработано лишь для некоторых из них. Поэтому разработка наиболее эффективных методов медико-генетического консультирования (МГК) и ДНК-диагностики, направленных на профилактику моногенных заболеваний, имеет большое и медицинское, и социально-экономическое значение.
Многие НБНС являются клинически и генетически гетерогенными. Для большинства из них существуют популяционные различия по частоте встречаемости и спектру мутаций генов, детерминирующих их развитие. Поэтому для обеспечения наиболее эффективного МГК необходимо изучение распространенности НЗ, их молекулярно-генетических основ и механизмов распространения в отдельных регионах и этнических группах. Причины распространения в регионе тех или иных наследственных заболеваний могут быть связаны как со структурными особенностями ответственных генов, так и с генетической структурой популяций, формирование которых происходит под воздействием различных факторов микроэволюции, среди которых в настоящее время наиболее значимыми могут являться дрейф генов и миграции. Изучение процессов изоляции и миграции возможно на основе анализа брачно-миграционной структуры популяций.
В течение последних двух десятилетий отягощенность населения отдельных регионов России грузом наследственной патологии и ее связь с генетической структурой популяций активно исследуется сотрудниками Медико-генетического научного центра РАМН (Москва). Такой анализ проведен как в ряде национальных республик - Адыгее, Удмуртии, Мари-Эл, Чувашии, где население имеет выраженную этническую и, соответственно, генетическую подразделенность, так и в популяциях русских из ряда регионов России. В результате этих исследований было показано, что даже незначительная генетическая дифференциация популяций влияет на груз наследственных заболеваний [Гинтер, 2006].
Популяционно-генетические исследования моногенной патологии в Республике Башкортостан, одной из многонациональных республик Волго-Уральского региона России, наиболее актуально в связи со значительным своеобразием генофонда ее населения и генетической подразделенностью проживающих здесь популяций башкир, татар, русских, а также ряда других этнических групп, что было ранее показано на основе анализа большого числа высокоинформативных ДНК-маркеров ядерного и митохондриального геномов [Хуснутдинова, Хидиятова, Викторова и др., 1991,1993, 1994, 1998, 1999].
К наиболее частым НБНС (распространенность которых составляет > 1:50000 населения) относятся миотоническая дистрофия (МД), хорея Гентингтона (ХГ), миодистрофия Дюшенна/Беккера (МДД/МДБ), моторно-сенсорные нейропатии, неравномерная распространенность которых в РБ была показана еще в 80-х годах проф. Р.В. Магжановым и сотрудниками кафедры неврологии БГМУ. С развитием методов молекулярной генетики появилась возможность изучения молекулярных основ этих заболеваний, выявления популяционного разнообразия их генетических форм и генетических механизмов распространения в популяциях.
Особый интерес для современной медицинской генетики представляют популяционные и молекулярно-генетические исследования болезни Паркинсона (БП) - одного из наиболее частых заболеваний нервной системы, чаще всего имеющего многофакторную природу со значительным вкладом генетического компонента. Остаются нерешенными проблемы генетической основы патогенеза БП, гетерогенности и распространенности моногенных форм заболевания в различных регионах и этнических группах.
В целом, выявление этно-территориальных особенностей распространенности и генетической природы наследственных и наследственно предрасположенных заболеваний является основой для создания эффективной системы их мониторинга и разработки методов диагностики и профилактики, оптимальных для конкретного региона.
Исходя из этих предпосылок, мы провели исследование распространенности и молекулярно-генетических основ ряда частых моногенных заболеваний - миотонической дистрофии, хореи Гентингтона, мышечной дистрофии Дюшенна/Беккера, наследственных моторно-сенсорных нейропатий, а также наследственно предрасположенного заболевания - болезни Паркинсона в Республике Башкортостан. При этом одной из важных задач являлось выяснение причин имеющегося неравномерного этно-территориального распространения некоторых из этих заболеваний в РБ. Для этого были проанализированы и демографические процессы, влияющие на формирование генетической структуры популяций -изоляция и миграции, - и исследованы структурные особенности генов, позволяющие определять происхождение мутаций.
В работе использованы как материалы комплексного сплошного медико- и популяционно-генетического исследования населения семи районов РБ, проведенного в период с 2005 по 2008 гг. совместно с Медико-генетическим научным центром РАМН (г. Москва), так и сведения о всех известных больных с исследуемыми патологиями, проживающими на территории РБ, полученные из базы данных Медико-генетической консультации РБ, из материалов ежегодных отчетов неврологов всех городов и районов республики, собираемых на кафедре неврологии Башкирского государственного медицинского университета. Полученные таким образом сведения дополнительно уточнялись на момент исследования как путем целенаправленного запроса в центральные городские и районные больницы, так и в процессе экспедиционных выездов 1994-2004гг, проводимых нами совместно с сотрудниками кафедры неврологии БГМУ с целью дополнительного клинического осмотра больных и членов их семей, и забора крови для ДНК-анализа. Таким образом, для клинико-эпидемиологического исследования были собраны данные о каждом пациенте, проживавшем или проживающем на территории РБ за исследуемый период времени с 1 января 1994 по 1 января 2006 года. Соответственно, материал для молекулярно-генетического анализа выбранных для исследования заболеваний также был максимально собран на территории всей РБ.
Выбор районов для сплошного популяционного исследования основывался на их территориальном расположении и этническом составе. С одной стороны, необходимо было исследовать население различных географических зон республики, с другой стороны, важно было обследовать достаточно большое число башкир - коренных жителей РБ, для которых анализ отягощенности и структуры генетического груза ранее не проводился. Таким образом, были выбраны следующие районы РБ: Абзелиловский, Баймакский, Бурзянский, - расположенные в юго-восточном Зауралье, - где почти 90% населения составляют башкиры (юго-восточные башкиры, по этногеографическому подразделению башкир); Архангельский и Салаватский - центральный и северо-восточный регионы республики, население которых полиэтнично, но здесь проживают северо-восточные башкиры; Аскинский и Балтаческий - северные районы РБ с многонациональным составом населения. Медико-генетическое исследование охватывало все население районов (201619 человек), независимо от национальности.
С целью исследования факторов популяционной динамики, влияющих на распространенность наследственных заболеваний в Республике Башкортостан, проведен анализ брачно-миграционной структуры населения 6-и районов РБ, для описания которой использованы брачные записи, полученные в районных отделах ЗАГСов. На основе анализа 16135 брачных записей определены показатели, отражающие отдельные факторы популяционной динамики - этническая брачная ассортативность, индекс эндогамии, инбридинг.
Этническая брачная ассортативность обусловливает изолированность популяций по национальному признаку, влияя таким образом на формирование их генетической структуры. Установлено, что этническая брачная ассортативность в исследованных районах РБ меняется в зависимости от представительства определенного этноса в районе. В целом, наиболее высокие значения этого показателя установлены для башкир: на протяжении последнего полувека этническая ассортативность башкир возрастает (от 8.97 в 60-е годы до 13.6 в 90-е годы XX в.), резко падая в начале XXI века (7.23). Этническая ассортативность русских является отрицательной на рубеже веков (0.50), практически не меняясь за четверть века, что, однако, обеспечивается за счет браков с украинцами, белорусами, латышами, марийцами и др., а не с башкирами и татарами, традиционно населяющими Башкортостан. Брачная этническая ассортативность татар невысока, но положительна (1.67 на начало XXI века), число башкиро-татарских браков превышает в общем числе зарегистрированных браков 10%-уровень; в течение второй половины XX века наблюдается устойчивый рост метисации башкир и русских - от 0.85% до 4.15%. Основная доля браков в РБ является моноэтнической.
Для всех исследуемых районов установлены высокие показатели индекса эндогамии (0.58 - 0.97). Примечательно, что даже для трех граничащих между собой районов башкирского Зауралья индексы эндогамии высоки (0.71 - в Баймакском, 0.79 - в Абзелиловском, 0.86 - в Бурзянском), из чего следует, что каждый из этих районов представляет собой локальную субпопуляцию башкир. Согласно нашим исследованиям, брачные миграции башкир практически не выходят за пределы Республики. Исключение составляют части Челябинской и Оренбургской областей, примыкающие к Башкортостану, где традиционно проживают башкиры. Таким образом,
Республика Башкортостан является популяцией высшего иерархического уровня для своего автохтонного населения. Аналогичная картина эндогамности характерна и для других республик Волго-Уральского региона, где проводились подобные исследования - Марий Эл [Гинтер Е.К., 2002], Чувашии [Гинтер Е.К., Зинченко P.A.; 2006] и Удмуртии [Ельчинова Г.И. с соавт., 2006].
Коэффициент локального инбридинга и коэффициент линейного систематического давления миграций, рассчитанные на представлении изоляции расстоянием Малеко, имеют невысокие значения во всех исследованных популяциях (табл. 9) и сходны с таковыми для ряда исследованных народов Волго-Уральского региона.
Таким образом, моноэтнический характер браков и высокий уровень эндогамности населения отдельных районов РБ являются популяционно-демографическими факторами генетической изоляции, способствующими сохранению имеющегося генетического разнообразия и территориальной неравномерности распространения наследственной патологии.
Для выявления молекулярно-генетических основ частых наследственных заболеваний нервной системы, их генетических механизмов распространения в РБ проведено исследование структурно-функциональных особенностей соответствующих генов у больных из РБ и в популяциях Волго-Уральского региона.
Среди исследованных моногенных заболеваний два - миотоническая дистрофия и хорея Гентингтона, - связаны с экспансией (многоступенчатым увеличением) внутригенных тринукледотидных повторов (ТНП). Данный тип мутаций (динамические мутации) был открыт в начале 1990-х годов и обнаружен при целом ряде заболеваний. Изучение закономерностей экспансии ТНП, приводящей к наследственным заболеваниям, - причин и механизмов ее возникновения, особенностей наследования, роли в патогенезе заболеваний, - было основано на комплексе разнообразных исследований, среди которых большое значение имело и накопление данных о распространенности подобных заболеваний в различных популяциях, о числе ТНП у больных и здоровых, о характере наследования мутаций, их связи с клинической картиной и т.д. В ряду этих исследований заняло свое место и изучение молекулярно-генетических основ миотонической дистрофии и хореи Гентингтона в Республике Башкортостан, результаты которого представлены в настоящей работе.
Первостепенный интерес в этом плане представляла собой миотоническая дистрофия, для которой еще ранее была показана и этническая, и территориальная неравномерность распространения в Республике Башкортостан, накопление заболевания среди зауральских башкир [Магжанов, 1989; Ахмадеева, 1997]. Проведенное нами эпидемиологическое исследование МД в семи районах РБ показало значительное возрастание числа больных в Баймакском и Абзелиловском районах за последнее десятилетие. В настоящее время распространенность МД в этих районах составляет 40 и 30 на 100000 населения, соответственно.
При исследовании гена DMPK у 72 больных МД и 54 членов их семей экспансия (CTG)n- повторов обнаружена у 67 (93%) больных. Минимальный размер аллеля с экспансией составил 300 - 400 п.н. (около 130 единиц повтора), максимальный - 5000 п.н. (около 1500-1600 триплетных единиц).
Анализ гено-фенотипической корреляции подтвердил известные факты о прямой зависимости от размера экспансии тяжести заболевания и об обратной зависимости - возраста его манифестации, но корреляция генотипа и фенотипа при МД не является абсолютной, поскольку на развитие и течение заболевания, по-видимому, оказывают и другие генетические и эпигенетические факторы. Также подтвержден феномен антиципации, обусловленный увеличением размера экспансии (CTG)n повторов в гене DMPK при передаче из поколения в поколение.
Уменьшение размера экспансии зафиксировано в 17.6%) случаев ее передачи из поколения в поколение.
Выявленный у всех обследованных больных МД из РБ общий гаплотип, сцепленный с мутацией (Hhal(-) - Hinfl(+)), распространенный в большинстве исследованных популяциях мира, свидетельствует о распространении заболевания на территории республики в результате эффекта основателя и дрейфа генов. Сцепление определенных гаплотипов по двум полиморфным локусам Hha\ и Hinfl с различными группами (CTG)n аллелей гена DMPK позволяет использовать их для проведения косвенной ДНК-диагностики носительства экспансии (CTG)n повторов в семьях с МД.
Мы исследовали полиморфизм (CTG)n- повторов в гене DMPK в 13 популяциях Волго-Уральского региона (7 субпопуляций башкир, татары, чуваши, марийцы, удмурты, мордва, коми) (всего 1333 чел.), среди которых было обнаружено 28 различных аллелей с числом CTG - повторов от 4 до 34; отмечается два пика частот. Показана значительная гетерогенность исследованных популяций по распределению частот аллелей (CTG)n локуса, в том числе на уровне этногеографических групп одного этноса (башкир), а также высокий уровень его гетерозиготности (приблизительно, 80%), что позволяет считать данный микросателлитный локус высокоинформативным генетическим маркером популяций. Установлено, что по характеру распределения частот аллелей (CTG)n локуса гена DMPK популяции Волго-Уральского региона занимают промежуточное положение между популяциями Европы и Азии.
С целью изучения характера нестабильности числа CTG повторов гена DMPK впервые был проведен анализ наследования аллелей данного локуса в 300 здоровых семьях. Установлено, что нестабильными являются аллели с числом CTG > 19, а частота мутирования данного локуса составила 5x10" .
Анализ распределения частот аллелей (CTG)n повторов в субпопуляциях башкир с крайними значениями распространенности МД не подтвердил гипотезы о прямом влиянии частоты аллелей с большим числом повторов (>19, > 30) на распространенность заболевания в популяции.
Таким образом, было установлено, что миотоническая дистрофия распространилась на территории РБ в результате эффекта основателя, а ее накопление среди башкир, имеющее локальный территориальный характер, связан с дрейфом генов, обусловленным положительной брачной ассортативностью башкир и высоким уровнем эндогамии в районах республики.
Хорея Гентингтона - также одна из частых наследственных патологий нервной системы. Проведенное нами эпидемиологическое исследование ХГ показало, что на конец 2007 года распространенность заболевания в среднем в РБ составляет 2.65 на 100000 населения. По данному показателю РБ занимает промежуточное положение между популяциями Западной Европы и Азии. Установлена неравномерная распространенность ХГ на территории РБ (р<0.01).
Распространенность заболевания в трех этнических группах составляет 2.35 на 100000 среди русских, 3.73 на 100000 - среди татар и 0.9 на 100000 -среди башкир. Более низкая распространенность заболевания среди башкир, на наш взгляд, опять же может быть обусловлена популяционно-демографическими процессами, в частности, определенной этнической изолированностью башкир.
При консультировании семей с ХГ решающее значение имеет прямая ДНК-диагностика, основанная на определении числа (CAG)n- повторов в гене HD (IT 15). При этом до сих пор актуальной остается проблема поиска и других генетических факторов, действующих в комплексе с основной мутацией и влияющих на развитие и течение заболевания.
В состав гена HD входит ряд полиморфных участков, сцепленных с (САС)п-повторами. К таким участкам относятся (ССО)п-повторы, почти непосредственно прилежащие к (CAG)n-TpaKTy в первом экзоне гена. В экзоне 58 на расстоянии «150 т.п.н. от полиморфного (САО)п-участка в ряде случаев обнаруживается нейтральная делеция одного из четырех GAG-кодонов, кодирующих пролин, - del2642. Исследование в различных популяциях распределения частот аллелей локуса, содержащего (CAG)n-noBTopbi и сцепленных с ним других полиморфных маркеров, может способствовать выяснению условий возникновения, распространения и сохранения мутантных аллелей и, в целом, способствовать оценке риска развития патологии на популяционном уровне.
С целью определения закономерностей экспансии (САО)п-повторов в гене HD и происхождения ее у больных хореей Гентингтона в РБ, мы проанализировали полиморфизм (CAG)n-, (CCG)n-noBTopoB и делеции del2642 гена HD в 11 популяциях Волго-Уральского региона, а также в 46 семьях с ХГ из Башкортостана, включающих 59 больных и 127 их близких родственников.
Анализ распределения частот генотипов и аллелей микросателлитных локусов (CAG)n, (CCG)n повторов и полиморфной делеции del2642 гена HD в популяциях Урало-Поволжья, с одной стороны, внес определенный вклад в изучение генофонда народов этого региона, показав при этом высокую информативность локуса (CAG)n как генетического маркера популяций, а с другой стороны - позволил выявить сцепление определенных аллелей локусов (CAG)n, (CCG)n повторов и их ассоциацию с делецией del2642. Было установлено, что характеру полиморфизма данных трех локусов популяции Волго-Уральского региона в большей степени сопоставимы с популяциями Европы. Между числом CAG и CCG повторов выявлена обратная нелинейная зависимость на одной хромосоме. Аллели с семью CCG повторами сцеплены с аллелями, содержащими в среднем 19.2 ± 3.8 CAG повторов, a (CCG)io - с аллелями, содержащими 17.3 ± 1.5 CAG-повторов. Делеция del2642 гена HD в популяциях Волго-Уральского региона достоверно ассоциирована с аллелями (CAG)n локуса, содержащими в среднем 19.75±5.26 CAG повторов, а отсутствие делеции (del-) - с аллелями, содержащими 17.92±3.0 CAG повторов. Эти данные подтверждают предположение о возникновении данной делеции преимущественно на хромосомах с числом САв повторов >20 [АЬж^б! Е. е1 а1., 1995; Иллариошкин С.Н., 2002]. Эти сведения были необходимы для дальнейшего выяснения генетических условий возникновения экспансии (САО)п повторов и влияния полиморфных вариантов локусов, расположенных вблизи с (САО)п повторами, на развитие заболевания.
У 57 из 59 обследованных больных ХГ была выявлена экспансия (САО)п повторов в гене ЯД число которых на мутантных хромосомах варьировало от 39 до 75, составляя в среднем 46.47. Анализ передачи аллелей с экспансией САв повторов в поколениях, проведенный в 17 семьях, выявил достоверные различия в величине и векторе переданной мутации по мужской и женской линиям. Было показано, что величина мутации зависит от величины исходного аллеля в большей степени при передаче по материнской линии и в меньшей степени - по отцовской. Т.е. отцовские аллели являются более нестабильными, здесь большую роль играет сам пол родителя, чем размер исходной мутации.
Установлено сцепление экспансии (САО)п повторов с полиморфным вариантом (ССО)7 и нейтральной делецией с1е12642. У больных ХГ из Башкортостана выявлено три основных гаплотипа, сцепленных с мутацией, что позволяет предполагать, как минимум, три различных источника происхождения хореи Гентингтона в республике. Выявленное неравновесие по сцеплению свидетельствует не только о различных источниках заболевания, но и о том, что (ССО)п тракт играет роль цис-активного фактора, модифицирующего стабильность (САО)п повторов. Исходя из полученных данных, можно предположить, что новые случаи экспансии, возникающие из переходных аллелей, будут появляться на хромосомах, имеющих определенный гаплотип: (ССО)7/с1е1- или (ССО)7Ме1+.
Проведен также анализ роли ряда генетических факторов на возраст появления первых признаков заболевания. Установлено, что кроме величины экспансии САС повторов (которая чем больше, тем раньше проявляется хорея), на возраст манифестации влияют также пол родителя - при передаче аллеля с экспансией от отца заболевание дебютирует, в среднем, на 4. 72 года раньше, чем при передаче от матери; наличие del2642 на хромосоме с экспансией (CAG)n, определяет более позднюю манифестацию ХГ. А также с возрастом появления первых клинических признаков заболевания ассоциированы определенные генотипы гена АроЕ: наличие генотипа е2еЗ приводит к достоверному увеличению этого показателя. Вышеупомянутые факторы объясняют 88.71% возраста манифестации ХГ. Таким образом, получена возможность с определенной точностью указать возраст манифестации у индивидов без клинических признаков заболевания на основе генетических данных, что особенно важно для пресимптоматической ДНК-диагностики.
Прогрессирующие мышечные дистрофии Дюшенна и Беккера-наиболее распространенные наследственные заболевания нервно-мышечной системы, обусловленные мутациями в гене дистрофина (DMD), являющиеся аллельными формами заболевания. Известно, что от 25%> до 70%> всех мутаций гена дистрофина составляют крупные делеции, захватывающие от одного до нескольких экзонов, около 6%> - крупные дупликации, а остальные мутации являются точковыми. Примерно в 30% случаев крупные делеции гена дистрофина возникают de novo, поэтому в 2/3 семей заболевание носит изолированный характер. В различных популяциях мира по частоте и спектру распределения делеций и, соответственно, делеционных точек разрыва (ДТР) в гене DMD выявляются как некоторые общие закономерности, так и определенная неоднородность. По спектру делеций и ДТР в гене DMD наблюдаются выраженные популяционные различия и на уровне крупных мировых регионов, и на уровне отдельных этнических групп. Предполагается, что это может быть связано с популяционными особенностями интронных последовательностей гена DMD [Onengut et al., 2000; Lai et al., 2002].
В результате проведенного нами эпидемиологического исследования в Республике Башкортостан выявлена более низкая частота МДД по сравнению с европейскими популяциями (1: 10246 и 1: 3500 рожденных мальчиков, соответственно). Отмечается более низкая встречаемость заболевания среди башкир, хотя данное наблюдение не подтверждено статистической обработкой. В результате молекулярно-генетического исследования, проведенного у 70 больных из 63 семей установлена и более низкая частота крупных делеций в гене дистрофина у больных из РБ (31.75%), по сравнению с европейскими популяциями (>60%). Установлены спектр и частота делеционных точек разрыва в гене 1)МД характерные для жителей РБ в целом. Выявленные нами относительно высокие частоты ДТР в регионах гена между экзонами 44-45, 45-47 и 50-52 говорят об обоснованности применения известных высокополиморфных маркеров 8ТЯ-44, 8Т11-45, 8ТК-49, 8ТЯ-50 не только для косвенной, но и для прямой диагностики носительства делеций у родственниц больных с делециями. Выявлены две новые точковые нонсенс-мутации в неродственных семьях (р.ТЪг 134ТМзХ7 и р.Ьу82210А^зХ11). Выявление точковых мутаций в гене дистрофина в настоящее время имеет особое значение, т.к. именно для таких случаев уже сейчас разрабатываются методы генной терапии МДД.
Наследственные моторно-сенсорные нейропатии (НМСН) или болезнь Шарко-Мари-Тута (ШМТ) - генетически гетерогенная группа заболеваний периферической нервной системы, одна из самых частых среди всех НБНС. В настоящее время картировано более 25 ДНК- локусов, ответственных за различные формы НМСН. Известна значительная популяционная неоднородность по распространенности как НМСН в целом, так и их отдельных генетических форм. В связи с этим, исследование генетической гетерогенности НМСН в отдельных регионах и этнических группах является необходимым условием для разработки эффективных, оптимальных для конкретных регионов подходов ДНК-диагностики.
В результате эпидемиологического исследования определена распространенность всех форм НМСН в РБ, составившая 10.3 на 100000 населения, установлена территориальная и этническая неравномерность распространения заболевания.
Молекулярно-генетическое исследование, включающее анализ 4-х генов (РМР22, СЛ$1, МР2, ЕОЯ2), мутации в которых являются наиболее частыми причинами НМСН I типа, а также, в ряде случаев, и НМСН II типа, проведено на выборке, представленной 173 больными НМСН из 131 семьи. Установлено, что среди всех типов НМСН частота НМСН 1А типа, обусловленная дупликацией гена РМР22, составляет 26%, НМСН IX типа, детерминируемая мутациями в гене коннексина 32 ((7.72?./) - 13.7%. В гене РМР22 обнаружена одна новая нуклеотидная замена в области 3-го интрона-с.309-29 С>А. В гене МР2 обнаружена миссенс-мутация р.8ег88Ьеу (с.263С>0) (0.8%) и синонимичная замена р.8ег2388ег (с.714С>Т) (1.6%). В гене (ЯЛ? 7 вывлены 4 миссенс-мутации: р.Рга87А1а (с.259С>0) (10%), р.Агё22С1п (с.650А) (2.98%); р.Агё15С1п (с.44С>А) (1.5%) и р.ТЬг8611е (с.257С>Т) (0.8%), последняя из которых ранее не описана. Частая мутация Рго87А1а, наиболее распространенная среди башкир (33% среди всех случаев НМСН), сцеплена с общим гаплотипом, что свидетельствует о ее распространении в РБ в результате эффекта основателя. Анализ исследованных генов у больных из РБ позволил выявить своеобразный спектр и частоту мутаций для отдельных этнических групп данного региона, что необходимо учитывать при проведении ДНК-диагностики. Всего мутации были выявлены в 61 неродственной семье (47%). В этих семьях возможно проведение пресимптоматической и пренатальной ДНК-диагностики.
Болезнь Паркинсона - одно из самых частых нейродегенеративных заболеваний, имеющее, как правило, многофакторную природу со значительным вкладом генетического компонента, но также встречающееся и в моногенных формах. Изучение молекулярно-генетических основ БП в настоящее время активно ведется во всем мире. Поиск генетических причин развития БП направлен на познание ее этиологии и патогенеза, что, в свою очередь, необходимо для разработки эффективных методов лечения и профилактики. Важными здесь являются и эпидемиологические исследования, позволяющие определять как частоту и разнообразие моногенных форм заболевания, так и выявлять различные факторы, предрасполагающие к спорадической БП. Кроме того, знания о распространенности БП в регионах должны способствовать улучшению организации медицинской помощи больным, а определение этнических особенностей генетической предрасположенности к заболеванию разработке оптимальных методов раннего ДНК-тестирования с целью его профилактики.
В результате эпидемиологического исследования нами было установлено, что распространенность болезни Паркинсона в РБ (68.6 на 100 ООО взрослого населения) и частота семейных форм (5.95%) сопоставимы с современными показателями в мире. Выявлено неравномерное территориально-этническое распределение заболевания, преобладание среди пациентов лиц татарской этнической принадлежности.
Молекулярно-генетическое исследование БП, в целом, представляло собой определение роли ряда генов-кандидатов, выбранных в соответствие с известными основными механизмами патогенеза заболевания. В первую очередь, в качестве генов - кандидатов как для нескольких семейных случаев, выявленных в РБ, так и для спорадической БП, были исследованы гены, ответственные за некоторые моногенные формы заболевания (PARK1, PARK2, PARK8). Кодируемые этими генами белки выполняют различные функции в клетках, но взаимосвязаны между собой через сложную систему убиквитин-зависимого протеолиза, нарушение которого, как предполагают, является одним из важных звеньев патогенеза БП. В результате данного исследования мы не выявили мутаций в этих генах у 8 больных с наследственными формами БП, но обнаружили ряд нуклеотидных изменений у больных со спорадической формой заболевания. В гене белка паркина (.PARK2), ответственного за развитие ювенильной рецессивной формы БП, у двух неродственных больных, этнических русских, была выявлена не описанная ранее делеция 12-го (последнего) экзона в гетерозиготном состоянии. 12-й экзон гена кодирует С-концевой участок паркина, отвечающий за связывание паркина с убиквитин-конъюгирующим ферментом Е2, т.е. за один из наиболее важных моментов в процессе убиквитин-зависимого протеолиза. Исходя из этого, было сделано предположение о возможной роли гетерозиготного носительства найденной делеции в развитии спорадической БП. Также в этом гене у 31 из 200 пациентов с БП выявлено 5 типов изменений нуклеотидной последовательности - в трех экзонах и двух интронах, однако все они были признаны нейтральными полиморфными вариантами как на основании сопоставления с литературными данными, так и на основании того, что они встречаются и в контрольной выборке.
В гене LRRK2 (leucine-rich repeat kinase 2) (PARK8'), связанном с аутосомно-доминантной формой БП, у пациентки башкирской этнической принадлежности со спорадической БП выявлена известная мутация Gly2019Ser в гетерозиготном состоянии. Частота данной мутации среди башкир составила 1.79%, что примерно соответствует ее частоте среди больных спорадической БП в популяциях Европы. В контрольной выборке данная мутация не обнаружена. Известная как полиморфный вариант замена Gly2385Arg обнаружена у двух больных татарской этнической принадлежности с частотой 1.28% среди татар, но не найдена в группе контроля. Таким образом, данное исследование показало, что редкие мутации в генах паркина и LRRK2 в отдельных случаях, вероятно, могут служить генетическими факторами, предрасполагающими к развитию БП. В связи с этим, представляет интерес дальнейшее исследование роли генов, кодирующих ферменты убиквитин-зависимой протеолитической системы деградации поврежденных белков в развитии болезни Паркинсона.
Также были проведены ассоциативные исследования спорадической БП с полиморфными вариантами ряда генов-кандидатов ядерного и митохондриального геномов. В частности, у пациентов с БП и в контрольных группах, с учетом этнической принадлежности, а также с учетом формы заболевания, степени тяжести и возраста манифестации были определены частоты генотипов и аллелей полиморфных локусов генов ферментов детоксикации ксенобиотиков (GSTM1, GSTT1, CYP1A1, PONI), генов системы метаболизма дофамина (COMI\ DAT1, ТН) и гена калиевого канала KCNJ6. Анализ мтДНК у пациентов с БП и в контрольных группах включал определение гаплогрупп мтДНК, поиск мутаций в гене цитохрома Ь; а также полное секвенирование мтДНК у 4-х больных с определенными гаплогруппами мтДНК.
В результате данного исследования выявлена ассоциация с БП полиморфных вариантов трех генов ядерного генома и гаплогрупп мтДНК. Во всех исследованных этнических группах обнаружена ассоциация БП с Alu-инсерцией Yb8NBC36 гена калиевого канала KCNJ6. Предположительно, Alu-инсерция может изменять экспрессию гена KCNJ6, нарушая в какой-то степени функцию GIRK канала. Самой главной функцией калиевых каналов является катализ быстрого проникновения ионов К+ и отторжение биологически многочисленных потенциальных конкурентов, таких как Na+, Са2+, Mg2+, изменение экспрессии гена может вести к потере избирательности ионов К+ и изменению тока ионов, т.е. вхождению ионов Na+ и Са2+ в клетку, что может повышать уровень апоптоза в клетках, внося вклад в процесс дегенерации дофаминергических нейронов. Однако, для понимания роли К+ каналов в патогенезе БП требуются дальнейшие исследования.
При изучении роли генов дофаминовой системы выявлена ассоциация БП с полиморфными вариантами гена катехол-орто-метилтрансферазы ('СОМТ) у татар. Частота генотипа *Н/*Н, детерминирующего активную форму фермента, а также частота аллеля *Н были достоверно выше среди больных по сравнению с контролем (Р<0.05). Следует отметить, что и в других исследуемых этнических группах (русских и башкир) наблюдается аналогичное различие в распределении частот генотипов и аллелей данного гена, хотя и не достигающее статистической значимости. Таким образом, мы предполагаем, что генотип *Н/*Н и аллель *Н гена СОМТ являются факторами генетического риска, а генотип *L/*H и аллель*Ь -протективными факторами для развития болезни Паркинсона не только для татар, но и для других жителей Республики Башкортостан.
При анализе числа тетрануклеотидных повторов (ТСАТ)п в интроне 1 гена тирозингидроксилазы (ТН) показана ассоциация генотипа *6/*8 с акинетико-ригидной формой БП, третьей и четвертой степенями тяжести заболевания (Р<0.05).
Следует отметить, что изучение роли Alu-инсерционного полиморфизма гена калиевого канала KCNJ6 в развитии предрасположенности к БП ранее не проводилось, а при исследовании ассоциации БП с генами системы детоксикации ксенобиотиков и системы дофаминового метаболизма разными авторами были получены противоречивые результаты, что может быть связано с популяционными различиями в распределении частот аллелей исследованных генов.
В результате исследования полиморфизма мтДНК, основанного на секвенировании гипервариабельного сегмента I и рестрикционном анализе 11 однонуклеотидных полиморфизмов кодирующего региона, в выборках татар (157 больных и 183 контроля) были выявлены достоверные различия (Р<0.001), характеризующиеся значительным преобладанием среди больных гаплогруппы Н (39.5% больных и у 20.0% контроля) и уменьшением частоты гаплогруппы U (16.6%) и 34.4%), соответственно). Протективные свойства гаплогрупп U, К, J, Т для развития БП были показаны ранее и другими авторами [van der Walt et al., 2003; Wallace, 2005]. Ассоциация гаплогруппы Н с БП, выявленная нами только в популяции татар, ранее не описана.
В результате секвенирования гена митохондриального цитохрома В в выборках больных (п=58) и контроля (п=80) татарской этнической принадлежности было выявлено 16 миссенс-мутаций и 9 синонимичных нуклеотидных замен. Достоверно значимое различие было показано для мутации Т15693С, обнаруженной только в контроле и не выявленной у больных, а также установлен гаплотип 15693С-15218А-14793А, ассоциированный с гаплогруппой и, который можно считать протективным для БП в популяции татар.
С целью более углубленного исследования природы выявленных ассоциаций гаплогрупп мтДНК с БП мы провели полное секвенирование мтДНК (16569 пн) у 4-х пациентов татарской этнической принадлежности, двое из которых имели гаплогруппу Н, двое - кластер гаплогрупп ЦК; полученные результаты секвенирования сравнивались с Кембриджской последовательностью мтДНК (гСЫ8). Наиболее интересным результатом, на наш взгляд, оказалась выявленная у носителя субгаплогруппы Н2 в гомоплазмическом состоянии миссенс-мутация 4659в>А (А1а64ТЪг) в высококонсервативном сайте гена N02. А у пациента с гаплогруппой 1Лс1 была выявлена миссенс-мутация 16ЪЮ>АЮ (01и18Ьуз) в гене СОИ в гетероплазмическом состоянии. Обе эти мутации, предположительно, имеют функциональную значимость и могут обусловливать предрасположенность к БП у данных пациентов.
Обобщая результаты исследования роли генетических причин в развитии болезни Паркинсона, можно заключить, что наследственную предрасположенность к этому заболеванию обусловливает целый комплекс генетических факторов, которыми могут являться как более функционально значимые изменения структуры генов, участвующих в процессах функционирования нейронов мозга - мутации, - приводящие к возникновению моногенных форм БП, так и менее опасные нарушения -полиморфные варианты генов, встречающиеся как среди больных БП, так и среди здоровых индивидуумов с определенной частотой. Исследования ассоциации полиморфных вариантов генов-кандидатов, вовлеченных в известные звенья патогенеза БП, достаточно информативны и позволяют определять как роль исследуемых функциональных систем для БП в целом, так и выявлять конкретные маркеры риска и анти-риска развития заболевания. Однако при этом необходимо учитывать, что исследуемые нами полиморфные варианты генов могут являться как непосредственными участниками патогенеза БП, так и быть просто сцепленными с какими-либо другими, неизвестными нам мутациями в этих же генах, или даже в других, расположенных рядом генов. Именно поэтому часто возникают противоречивые результаты при анализе ассоциаций полиморфных вариантов генов с многофакторными заболеваниями. Это объясняется различной частотой встречаемости аллелей многих генов в разных популяциях. Поэтому этническая однородность сравниваемых выборок больных и контроля при анализе ассоциаций является крайне важной. Безусловно, что наиболее значимыми результатами можно считать ассоциации, выявленные в ряде различных, генетически подразделенных популяциях. В этих случаях наиболее вероятно, что выявленный полиморфный вариант, ассоциированный с заболеванием, является генетическим фактором, участвующим в его патогенезе. Хотя для полного доказательства последнего нужны и более глубокие исследования, подтверждающие роль этих факторов в патогенезе заболевания. Во всех же остальных случаях, скорее всего, мы имеем дело только с маркерами риска развития многофакторной патологии, демонстрирующими определенную причастность соответствующего гена к развитию заболевания. Однако, в плане определения предрасположенности к болезни с целью разработки мер ее профилактики, выявление таких генетических маркеров риска для каждой отдельной этнической группы также является достаточно важным. Кроме того, вероятно, что имеет значение и число различных генетических факторов предрасположенности к мультифакториальным заболеваниям, распространенных в популяциях. С этим может быть связана и различная частота таких заболеваний в различных этнических группах, проживающих в одинаковых климатических и др. условиях.
Таким образом, исходя из сказанного и обращаясь к нашим результатам, можно сделать вывод, подтверждающий роль в развитии БП и генов системы убиквитин зависимого протеолиза, и генов метаболизма дофамина, и генов митохондриальной ДНК. Для каждой из этих систем выявлены полиморфные варианты, ассоциированные с БП в определенных этнических группах, или во всех исследованных этнических группах. Эти результаты являются основой для продолжения более углубленного исследования роли этих генов в патогенезе БП, их взаимодействия между собой, а также в совокупности с различными факторами окружающей среды, что, в целом, направлено на разработку новых методов лечения и профилактики этого тяжелого нейродегенеративного заболевания. В плане практической медицины сегодняшнего дня, выявленные генетические маркеры БП могут быть использованы для раннего определения риска развития заболевания у жителей РБ с целью его профилактики.
В целом, выявленные этно-специфические структурные особенности генов наиболее частых наследственных заболеваний нервной системы, определение демографических и генетических механизмов их распространения на территории РБ позволили разработать наиболее оптимальные для региона подходы их мониторинга и эффективные методы ДНК-диагностики. На основе этих результатов в РБ уже созданы и действуют национальные генетические регистры (компьютерные базы данных) по всем представленным заболеваниям, что реально способствует повышению эффективности медико-генетического консультирования в семьях больных. Выявление этиологической основы заболевания у больных, а также носителей мутантного гена способствует проведению ранних лечебно-профилактических мероприятий, позволяющих отсрочить клиническую манифестацию заболевания или замедлить темпы его прогрессирования. Кроме того, оно является необходимым условием для проведения пренатальной диагностики с целью профилактики повторных случаев заболевания в семьях.
Библиография Диссертация по биологии, доктора биологических наук, Хидиятова, Ирина Михайловна, Уфа
1. Аверьянов Ю. Н., Подчуфарова Е. В., Дубанова Е. А. Наследственная невропатия со склонностью к параличам от сдавления // Неврол. журнал.1999. №4. - С.32-37.
2. Авижанская С.А., Бикбулатов Н.В., Кузеев Р.Г. Декоративно-прикладное искусство башкир. Уфа.- 1964. - 259с.
3. Акимова М.С. Антропологические исследования в Башкирии // В кн.: Антропология и геногеография. М.: Наука. - 1974. - С.77-95.
4. Алтухов Ю.П. Генетические процессы в популяциях. 1989. - М.: Наука. - 328с.
5. Атаджанов М.А. Паркинсонизм и 1-метил-4-фенил-1,2,3,6-тетрагидропиридин//Невропатология и психиатрия. 1991.- Т.91.- №.4. -С .117-121.
6. Ахмадеева JT.P. Миотоническая дистрофия в Республике Башкортостан// Дис.канд. мед. наук.- 1997,-Пермь.
7. Ахмеров Р.Б. Некоторые вопросы этногенеза башкир по археологическим данным //СЭ. -1952. №3. - С.25.
8. Ахметова B.JL, Викторова Т.В., Мурзабаева Ш.С. и др. Анализ мутаций гена фенилаланингидроксилазы у больных фенилкетонурией из Башкортостана//Мед. генетика.- 2003. Т. 6, №4.- С. 182-187.
9. Баранов А.Н., Киселев A.B., Баранов B.C. Генная терапия миодистрофии Дюшенна // Медицинская генетика. 2007. - Т.6.,№4. - С.9-16.
10. Баранов B.C., Баранова Е.В., Иващенко Т.Э., Асеев М.В. Геном человека и гены «предрасположенности» // Санкт-Петербург: Интермедика,2000. 195 с.
11. Башкортостан: краткая энциклопедия / Редкол.: Р. 3. Шакуров (гл. ред.) и др. Уфа : Башк. энциклопедия, 1996. - 670 с.
12. Бермишева М., Тамбетс К., Виллемс Р. и др. Разнообразие гаплогрупп митохондриальной ДНК у народов Волго-Уральского региона России // Молекулярная биология. 2002. - Т. 36. - №6. - С. 990 - 1001.
13. Бикбулатов Н.В. Терминология и система родства башкир //АЭБ. Уфа. - 1964. - Т.2. - С.164-176.
14. Бикбулатов Н.В., Юсупов P.M., Шитова С.Н., Фатыхова Ф.Ф. Башкиры. Этническая история и традиционная культура. Уфа.: науч. изд-во «Башкирская энциклопедия» - 2002.- 345с.
15. Бочков Н.П., Николаева И.В., Тихопой М.В. и др. Брачная ассортативность в населении современного города // Генетика. 1984.- Т.20, №7.- С.1224-1229.
16. Вейр Б. Анализ генетических данных: Пер. с англ. М.: Мир, 1995. -400с.
17. Вельтищев Ю. Е., Темин П. А. Наследственные болезни нервной системы. М.: Медицина, 1998. - 322 с.
18. Викторова Т.В. Генофонд народов Волго-Уральского региона: полиморфизм ядерной, митохондриальной ДНК и анализ мутаций в генах наследственных заболеваний // Дис.док.мед.наук.- 2002. Москва.
19. Габдрафиков И., Баймухаметова Г. Республика Башкортостан//На пути к переписи / под ред. В.Тишкова М.: ОАО «Авиаиздат», 2003. - 528 с. / http://www.eawarn.ru/bin/view/EthnoCensus/WebHomePutiMira
20. Генетическая структура и наследственные болезни чувашской популяции /под редакцией Е.К.Гинтера, Р.А.Зинченко. Чебоксары: Издательский дом «Пегас». - 2006, 232 с.
21. Гинтер Е.К., Зинченко P.A. Наследственные болезни в российских популяциях //Вестник ВОГиС.-2006.- Т.10,№1. С. 106-125.
22. Голубев В.Л., Левин Я.И., Вейн A.M. Болезнь Паркинсона и синдром паркинсонизма // М.: Медпресс, 2000. — 416 с.
23. Горбунова В.Н., Баранов B.C. Введение в молекулярную диагностику и генотерапию наследственных заболеваний. СПб: Специальная литература. -1997.-287 с.
24. Горбунова В.Н., Савельева-Васильева Е.А., Красильников В.В. Молекулярная неврология. ч.1, 2. 2002. - С.-Петербург. «Интермедика».
25. Горохов А. Очерки по истории Башкирии. http://www.arriere-garde.ru/content/print.php?idrazdel=4&id=35
26. Евграфов О.В., Макаров В.Б. Диагностика миодистрофии Дюшенна с помощью зондов ДНК //Журн. неврол. и психиатрии. 1987. - Т. 87. - №11. -С.1732-1736.
27. Евграфов О.В., Макаров В.Б. ДНК-диагностика наследственных заболеваний //Итоги науки и техники: Генетика человека. 1991. - Т.9. -С.53-126.
28. Ельчинова Г.И. Методы обработки популяционно-генетических данных: структура брачных миграций // Медицинская генетика. 2004. - Т.З, №4. -С. 185-192.
29. Ельчинова Г.И., Зинченко P.A., Гинтер Е.К. Временная динамика этнической ассортативности в Цивильском районе Чувашии // Генетика. -2003. Т.39, №4. - С.562-564.
30. Ельчинова Г.И., Осипова Е.В., Зинченко P.A., Гаврилина С.Г., Малышев П.Ю. Брачно миграционная характеристика городского и сельского населения Удмуртии //Генетика. - 2006. - Т.42, №4. - С. 566-570.
31. Ельчинова Г.И., Хидиятова И.М., Морозова A.A. и др. Медико-генетическое изучение населения Республики Башкортостан. Сообщение III. Временная динамика этнической ассортативности зауральских башкир // Медицинская генетика. 2007. - Т.6, №7. - С. 43-47.
32. Ельчинова Г.И., Хидиятова И.М., Тереховская И.Г. и др. Индекс эндогамии и его изменение во времени в некоторых популяциях Волго-Уральского региона // Генетика. 2007. - Т.43, №8. - С. 1146-1148.
33. Ефимова С.Г. К краниологии средневековых кочевников Южного Урала // Сб. Сравнительная антропология башкирского народа. Уфа. -1990.- С.98-106.
34. Животовский JI.A. Популяционная биометрия / М: Наука. 1991. - 271с.
35. Загоровская Т.Б., Иванова-Смоленская И.А., Маркова Е.Д., Иллариошкин С.Н., Брис А. Семейные случаи ювенильного паркинсонизма // Неврологический журнал. 2001. - №4. - С. 13-18.
36. Зенков JI. Р., Ронкин М. А. Функциональная диагностика нервных болезней // Элктронейромиография. М.: МЕДпресс-информ, 2004. - 310 с.
37. Зинченко P.A., Ельчинова Г.И., Гаврилина С.Г., Гинтер Е.К. Анализ разнообразия аутосомно-рецессивных заболеваний в российских популяциях // Генетика. 2001. - Т.З7, № 11. - С. 1536-1546.
38. Зинченко P.A., Ельчинова Г.И., Нурбаев С.Д., Гинтер Е.К. Разнообразие аутосомно-доминантных заболеваний в российских популяциях // Генетика. -2001. Т.37, №3. - С.373-385.
39. Иванова-Смоленская И.А., Маркова Е.Д., Загоровская Т.Б., Иллариошкин С.Н. Семейные случаи болезни Паркинсона (клинико-генетический анализ) // Медицинская генетика. 2002. - Т.1 - №5. - С. 234237.
40. Иванова-Смоленская И.А., Маркова Е.Д., Иллариошкин С.Н., Никольская H.H. Моногенные наследственные болезни центральной нервной системы //Наследственные болезни нервной системы. Под ред. Ю.Е. Вельтищева, П.А. Темина. -М. Медицина.: 1998. - С.30-45.
41. Иващенко Т.Э., Глазков П.Б., Хромов-Борисов H.H. и др. Популяционный анализ тринуклеотидных CTG-повторов в гене миотонической протеинкиназы I //Генетика. 1997. - Т.ЗЗ. - №9. - С. 1287-1290.
42. Иллариошкин С. H., Иванова-Смоленская И. А., Маркова Е. Д. ДНК-диагностика наследственных болезней нервной системы. М.: Мед. информ. агентство, 2002. - С. 173-191.
43. Иллариошкин С.Н., Иванова-Смоленская И.А., Маркова Е.Д. с соавт. Анализ экспансии тринуклеотидных повторов как нового механизма мутации при хорее Гентингтона: теоретические и прикладные аспекты //Генетика. -1996. Т.32. - С.103-109.
44. Каменецкий, В.К. Паркинсонизм. СПб., 2001. - 413 с.
45. Карунас A.C., Мерсиянова И.В., Поляков A.B. и др. Анализ мутаций и гаплотипов полиморфных маркеров у пациентов с болезнью Вильсона-Коновалова из Башкирии //Генетика. 2000. - Т.36. - С.972-979.
46. Корытина Г.Ф., Викторова Т.В., Иващенко Т.Э., Баранов B.C., Хуснутдинова Э.К. Спектр мутаций гена CFTR у больных муковисцидозом из Башкортостана // Молекулярная биология. 2003. - Т. 37. - С. 1-7.
47. Крыжановский Г.Н., Карабань И.Н., Магаева C.B. и др. Болезнь Паркинсона (этиология, патогенез, клиника, диагностика, лечение, профилактика) / М.: Медицина, 2002. - 336с.
48. Кузеев Р.Г. Волго-Уральский регион этнокультурного взаимодействия финно-угорских и тюркских этносов //Сб. Антропология и популяционная генетика башкир. Уфа. - 1987.- С.6-17.
49. Курбатова O.JL, Победоносцева Е.Ю. Городские популяции: возможности генетической демографии (миграция, подразделенность, аутбридинг) // Вестник ВОГиС. 2006.-Т.10, №1. -С. 155-188.
50. Левин О.С. Наследственные моторно-сенсрные невропатии Полинейропатии. М.: Мед. информ. агентство, 2005. - 496 с.
51. Левин, О.С. Эпидемиология паркинсонизма и болезни Паркинсона / О.С. Левин, Л.В. Докадина // Неврологический журнал. 2005. - № 5. - С. 41-49
52. Лимбормкая С.А., Хуснутдинова Э.К., Балановская Е.В. Этногеномика и геногеография народов Восточной Европы. М: Наука, 2002. - 261с.
53. Магжанов P.B. Клинико-генетический анализ наследственных заболеваний нервной системы в популяции Башкирской АССР: Дис.доктора мед. наук. Уфа, 1987. 470 с.
54. Магжанов Р.В. Наследственные заболевания нервной системы //В сб.: Эпидемиология заболеваний нервной системы в Башкирской АССР. Уфа, 1989.- 121 с.
55. Мажитов И.А. Происхождение башкир. Историко-археологический анализ //АЭБ. Уфа. - 1964. - Т.4. С.11.
56. Мамедова P.A., Гинтер Е.К., Петрин А.Н. и др. Структура и разнообразие наследственной патологии в Кировской области // Генетика. 1993. - Т.29, №7.-С.1186-1195.
57. Наследственные болезни в популяциях человека / Ред. Е.К.Гинтер //М.: Медицина. 2002. - 304 с.
58. Попова С.Н., Сломинский П.А., Галушкин С.Н и др. Анализ аллельного полиморфизма триплетных повторов (CTG)n и (CAG)n в генах DM, DRPLA, SCA1 в различных популяциях России // Генетика. 2003. - Т. 38. - С.1549-1553.
59. Пузырев В.П., Эрдыниева Л.С., Кучер А.Н., Назаренко Л.П. Генетико-эпидемиологическое исследование населения Тувы. Томск. 1999. - 255с.
60. Пузырев В.П., Назаренко Л.П. Генетико-эпидемиологическое исследование наследственной патологии в Западной Сибири / Томск. 2000. -187с.
61. Пчелина С.Н., Иванова О.Н., Емельянов А.К. и др. Мутации в гене LRRK2 у больных с болезнью Паркинсона в России // Медицинская генетика. 2006. - Т.5,№2. - С.48-51.
62. Пчелина С.Н., Якимовский А.Ф., Шварц Е.И. Наследственные основы болезни Паркинсона // Медицинская генетика. 2003. - Т.2. - №9. -С.411-425.
63. Пшеничнюк А.Х. Племена раннего железного века в Башкирии // АЭБ. -Уфа, 1971.-Т.4.-С.358.
64. Рафиков Х.С., Белова И.Ю., Юмагужина Н.Х., Кузеев Р.Г. Структура популяции башкир в регионе Среднего Поволжья и Урала / в кн. Популяционно-генетические исследования народов Южного Урала. 1981. -С.3-36.
65. Рафиков Х.С., Кузеев Р.Г., Юмагужина Н.Х. К популяционной генетике башкир // В кн.: Культура и быт башкир. Уфа: БФ АН СССР. -1978. - С.23.
66. Рафиков Х.С., Хуснутдинова Э.К., Долматова И.Ю. и др. Структура и генетическая близость башкир к народам Волго-Уральского региона и Сибири // В сб.:Антропология и популяционная генетика башкир. Уфа. -1987. - С.60-76.
67. Рафиков Х.С., Хуснутдинова Э.К., Долматова И.Ю., Хидиятова И.М., Кузеев Р.Г. Генетические связи башкир с народами Волго-Уральского региона и Сибири //В сб.: Сравнительная антропол. Башкирского народа. -Уфа: БНЦ УрО АН СССР. 1990. - С.68-75.
68. Рогинский Я.Я., Левин М. Г., Антропология. М.: Высш. Школа. - 1978. - 527с.
69. Роменская Л.Х. Вопросы эпидемиологии, клиники и фармакотерапии паркинсонизма // Автореф. дис.канд. мед. наук. -М., 1976
70. Руденко С.И. Башкиры М. : АН СССР. - 1955. - 351с.
71. Руденская Г. Е. Наследственные болезни нервной системы в российских и среднеазиатских популяциях: клинико-генетико-эпидемиологическое исследование: дис. . д.м.н.-М, 1998.-312 с.
72. Сальников К.В., Очерки древней истории Южного Урала. М.: Наука. -1967.-С.408.
73. Скупченко В. В., Романова Т. В. Клинико-генеалогический и электрофизиологический анализ наследственных моторно-сенсорных невропатий в Самарской области // Журн. неврологии и психиатрии им. С.С. Корсакова.-2001. -№ 8.-С.8-11.
74. Сломинский П.А., Попова С.Н., Шадрина М.И. с соавт. Нормальный полиморфизм повтора (CTG)n в гене миотонинпротеинкиназы (DM) на хромосоме 19ql3.3 в популяциях Восточной Европы //Генетика. 2000. -Т.36. - №7. - С.980-985.
75. Сломинский П.А., Попова С.Н., Шадрина М.И. с соавт. Нормальный полиморфизм повтора (CTG)n в гене миотонинпротеинкиназы (DM) на хромосоме 19ql3.3 в популяциях Восточной Европы //Генетика. 2000. -Т.36. -№7.-С.980-985.
76. Смирнов А.П. Из этнической истории западного Приуралья 1 тыс. н.э. // АЭБ. Уфа. - 1971. - Т.4. - С.79-84.
77. Спицын В.А., Спицына Н.Х. Генетическая дифференциация башкир Зауралья на разных уровнях иерархической структуры // В сб. Сравнительная антропология башкирского народа. Уфа. - 1990. - С.76-84.
78. Спицына Н.Х. Оценка вклада угорского компонента в формирование башкир (по данным популяционной генетики) // Мат. 7 Междунар. Конгресса финно-угроведения. Дебрецен. - 1990. - С. 199- 203.
79. Стоколос B.C. Культура населения бронзового века Южного Зауралья. -М.: Наука. 1972.-С. 168.
80. Темин П.А., Белозеров Ю.М., Страхова О.С., Никанорова М.Ю. Клинический и генетический полиморфизм и вопросы современной терапии Х-сцепленных прогрессирующих мышечных дистрофий Дюшенна и Бекера // Вестник практич. неврол. 1997. - Т.З. - С.85-101.
81. Тереховская И.Г., Ельчинова Г.И., Хидиятова И.М. и др. Медико-генетическое изучение населения Республики Башкортостан. Сообщение IV. Репродуктивные характеристики популяций семи сельских районов // Мед. генетика. 2007. - Т.6, №8. - С.14- 20.
82. Федорова С.А., Хусаинова Р.И., Кутуев И.А. и.др. Полиморфизм (CTG)n-иовторов гена миотонинпротеинкиназы в популяциях республики Саха (Якутия) и Средней Азии //Молекулярная биология. 2005. - Т.39, №3. - С. 385-393.
83. Федотов В. П. Клинико-генетический анализ наследственных моторно-сенсорных нейропатий в Воронежской области: автореф. дис. . канд. мед. наук. -М., 2002. 22с
84. Халиков А.Х. Истоки формирования тюркоязычных народов Поволжья и Приуралья // ЭАТ. Казань. - 1971а. - вып. 1. - С.25-28.
85. Хедрик Ф. Генетика популяций // М.: Техносфера. 2003. - 592с.
86. Хидиятова И.М., Джемилева Л.У, Хуснутдтнова Э.К. Наследственная нейросенсорная тугоухость/глухота //ДНК-диагностика и профилактика наследственной патологии в Республике Башкортостан /Под ред. Хуснутдиновой Э.К. Уфа. Китап. 2005- С.99-116.
87. Хоменко Е. И. Распространение и клинический полиморфизм невральной амиотрофии Шарко-Мари в Амурской области // Журн. невропатологии и психиатрии им. С.С. Корсакова. 1982. - №11. - С.22-25.
88. Хуснутдинова Э.К. Молекулярная этногенетика народов Волго-Уральского региона. -Уфа: «Гилем». 1999.- 237с.
89. Хуснутдинова Э.К., Хидиятова И.М., Викторова Т.В и др. Анализ полиморфизма ДНК, выявляемого методом геномной дактилоскопии на основе фага М13, в популяциях Волго-Уральского региона// Генетика. 1999. Т. 35. №4 С. 509-515.
90. Хуснутдинова Э.К., Хидиятова И.М., Викторова Т.В. и др. Оценка генетических расстояний и таксономический анализ популяций народов Волго-Уральского региона на основе данных о полиморфизме ДНК //
91. Генетика. 1999. Т. 35. № 7. С. 982-987.
92. Чухрова A.JI. Анализ мутаций в гене дистрофина //Автореф. дис. . канд. мед. наук. М.: Ин-т клинической генетики Медико-генетич. Научного центра РАМН. - 1997. -25с.
93. Шаркова И.В. Клинико-генетический анализ наследственной моторно-сенсорной нейропатии IX типа: Дис. .канд. биол. наук. М.: Медико-генетический научный центр РАМН, 2004. 189с.
94. Шитова С.Н. Народная одежда башкир // АЭБ. Уфа. - 1968. - Т.З. -С.125-128.
95. Шток, В.Н. Болезнь Паркинсона / В.Н. Шток, Н.В. Федорова // Экстрапирамидные расстройства. Руководство по диагностике и лечению / под ред. В.Н. Штока, И.А. Ивановой-Смоленской, О.С. Левина. М.: Медпресс-информ, 2002. - С. 87-124.
96. Щагина О. А., Мерсиянова И. В., Дадали Е. Л., Федотов В. П., Поляков А. В. Картирование и идентификация генов болезни Шарко-Мари-Тута второго типа // Мед.генетика. 2005. - Т.4. - №8. - С.378-382.
97. Юсупов P.M. Краниологическое изучение башкир //В сб. Антропология и популяционная генетика башкир. Уфа: БФ АН СССР. - 1987. - С.77-94.
98. Abbas N., Lucking СВ., Ricard S. et al. A wide variety of mutations in the parkin gene are responsible for autosomal recessive parkinsonism in Europe // Hum. Mol. Genet. 1999. - V. 8. - P. 567-574.
99. Abbs S., Yau S.C., Clark S. et al. A convinient multiplex PCR system for the detection of dystrophine gene deletions: A comparative analysis of cDNA hybridisation shows mistypings by both methods //J. Med. Genet. 1991. - V.28. -P.304-311.
100. Abe К. Т., Lino A. M., Hirata M. T. A novel stop codon mutation in the PMP22 gene associated with a variable phenotype // Neuromuscular disorders. -2004. V. 14. - № 5. - P.313-20.
101. Abeliovich A., Schmitz Y., Farinas I., et al. Mice lacking a- synuclein display functional defects in the nigrostriatal dopamine system // Neuron. 2000 -V.25. - P.239 - 252.
102. Abeliovich D., Lerer I., Pashut- Lavon I. et al. Negative expansion of the myotonic dystrophy unstable sequense //Am. J. Hum. Genet. 1993. - V. - 52. -1175-1181.
103. Abrams K. C., Oh S., Ri Y. et al. Mutations in connexin 32: the molecular and biophysical bases for the X-linked form of charcot-marie-Tooth disease // Brain. -2000.-V.32.-P.203-214.
104. Adachi Y., Nakashima K. Population genetic study of Huntington's disease-prevalence and founder's effect in the San-in area, western Japan //Nippon Rinsho. 1999. - V.57. - P.900-904.
105. Adam D. Pesticide used linked to Parkinson's disease // Nature. 2000. -V.408. - P.88 - 90.
106. Ahmadi A., Fredrikson M., Jerregard H. et al. GSTM1 and mEPHX polymorphisms in Parkinson's disease age of oneset // Biochem. Biophys. Res. Commun. 2000. - V.269. - P. 676 -680.
107. Ahn A.H., Kunkel L.M. The structural and functional diversity of dystrophin //Nature Genet. 1993. - V.3 - P.283-291.
108. Ajioka R.S., Jorde L.B., Gruen J.R. et al. Haplotype analysis of hemochromatosis: evolution of different linkage disequilibrium approaches and evolution of disease chromosomes // Am. J. Hum. Genet. 1997. - V. 60. - P. 1439-1447.
109. Alter J., Lou F., Rabinowitz A. et al. Systemic delivery of morpholino oligonucleotide restores dystrophin expression bodywide and improves dystrophic pathology //Nat.Med. -2006. V. 12. - P. 175-177.
110. Ambrose C.M., Duyao M.P., Barnes G. et al. Structure and expression of the Huntington's disease gene: evidence against simple inactivation due to an expanded CAG repeat // Somat. Cell Mol. Genet. 1994. - V. 20. - P. 27-38.
111. Anderson S., Bankier A., Barrell B.G., et al. Sequence and organization of the human mitochondrial genome // Nature. 1981. - V. 290. - P. 457-465.
112. Andrade M., Bork P. HEAT repeats in Huntington's disease protein //Nat. Genet. 1995,-V.ll -P.l 15-116.
113. Andrew S.E., Goldberg Y.P., Kremer B. et al. The relationship between trinucleotide (CAG) repeat length and clinical features of Huntington's disease //Nat. Genet. 1993. - V.4. - P.398-403.
114. Andrews R.M. et al. Reanalysis and revision of the Cambridge reference sequence for human mitochondrial DNA //Nat. Genet. 1999. - V. 23. - P. 147.
115. Anvret M., Ahlberg G., Crandell U. et al. Larger expansions of the CTG repeat in muscle compared to lymphocytes from patients with myotonic dystrophy //Hum. Mol. Genet. 1993. - V.2. - 1397-1400.
116. Aquadro C.F., Greenberg B.D. Human mitochondrial DNA variation and evolution: analysis of nucleotide sequences from seven individuals // Genetics. -1983.-V. 103.-P. 287-312.
117. Armstrong M., Daly A.K., Cholerton S. Et al. Mutant debrisoquine hydroxilation genes in Parkinson's disease // Lancet- 1992. V.339.-p.1017-1018
118. Ashizawa T., Anvret M., Baiget M. et al. Characteristics of intergenerational contractions of the CTG repeat in myotonic dystrophy //Am. j. Hum. Genet. -1994a. V.54.-P.414-423.
119. Ashizawa T., Epstein H.F. Ethnic distribution of myotonic dystrophy gene (Letter) //Lancet. 1991. - V.338. - P.642-643.
120. Ashizawa T., Wong L-J.C., Richards C.S. et al. CAG repeat size and clinical presentation in Huntington's disease //Neurology. 1994. - V.44. - P. 1137-1143.
121. Atac F.B., Elibol B., Schaefer F. The genetic analysis of Turkish patients with Huntington's disease //Acta Neurol. Scand. 1999. - V.100. - P.195-198.
122. Athanassiadou A., Voutsinas G., Psiouri L. et al. Genetic analysis of families with Parkinson's disease that carry the Ala53Thr mutation in the gene encoding alpha-synuclein // Am J Hum Genet. 1999. - V.65. - P.555-558.
123. Autere J. et al. Mitochondrial DNA polymorphisms as risk factors for Parkinson's disease and Parkinson's disease dementia // Hum. Genet. 2004. -V.l 15 -P.29-35.
124. Aylward E.H., Li Q., Stine O.C. et al. Longitudinal change in basal ganglia volume in patients with Huntington's disease //Neurology. 1997. - V.48. - P.394-399.
125. Bach D. et al. Mitofusin 2 determines mitochondrial network architecture and itochondrial metabolism. A novel regulatory mechanism altered in obesity // J. Biol. Chem. - 2003. - V.278, №19. - P.17190-7.
126. Bai, Y., Attardi,G. The mtDNA-encoded ND6 subunit of mitochondrial NADH dehydrogenase is essential for the aseembly of the membrane arm and the respiratory function of the enzyme//EMBO Journal 1998. - V.l7. - P. 48484858.
127. Bakker R.W., Veenema H., den Dunnen J.T. et al. Germinal mosaicism increases the reccurrence risk for "new" Duchenne muscular dystrophy mutations //J. Med. Genet. 1989. - V.26. - P.553-559.
128. Balice-Gordon R. J., Bone L. J., Scherer S. S. Functional gap junctions in the Schwann cell myelin shearth // J. Cell Biol. 1998. - V.142. - P. 1095-1104.
129. Ballo R., Viljoen D., Beighton P. Duchenne and Becker muscular dystrophy prevalence in South Africa and molecular findings in 128 persons affected //S. Afr. Med. J. 1994. - V.84. - P.494-497.
130. Bandman O., Vaughan J.R., Holmans P., Marsden C.D. et al. Association of a slow acetylator genotype for N-acetyltransferase 2 with familial Parkinson's disease // Lancet. 1998. - V.350. - P. 1136-1139.
131. Bar S., Barnea E., Levy Z. et al. A novel product of the Duchenne muscular dystrophy gene which greatly differs from the known isoforms in its structure and tissue distribution //Biochem. J. 1990. - V.272. -P.557-560.
132. Baranov V., Gorbunova V., Malysheva O. et al. Dystrophin gene analysis and prenatal diagnosis of Duchenne muscular dystrophy in Russia// Prenat. Diagn. -1993. V.13, N5. - P.323-333.
133. Barbeau A., Roy M., Cloutier T. et al. Environmental and genetic factors in the etiology of Parkinson's disease // Adv. Neurol. 1987. - V. 45. - P. 299-306.
134. Barton-Davis E.R., Cordier L., Shoturma D.I. et al. Aminoglycoside antibiotics restore dystrophin function to skeletal muscles of mdx mice // J. Clin. Invest. 1999. -V. 104, N4. -P.375-381.
135. Beggs A.H., Koenig M., Boyce F.M., Kunkel L.M. Detection of 98% of DMD/BMD gene deletions by polimerase chain reaction //Hum. Genet. 1990. -V.86. - P.45-48.
136. Bell M.V., Hirst M., Nakahori Y. et al. Physical mapping across the fragile X: hypermethylation and clinical expression of the fragile X syndrome //Cell. 1991. - V.64.-P.861-866.
137. Ben Othmane K. et al. Localization of gene (CMT2A) for autosomal dominant Charcot-Marie-Tooth disease type 2 to chromosome 1 p and evidence of genetic heterogeneity // Genomics. 1993. - V.17. - P.370-375.
138. Benmoyal-Segal L, Soreq H. Gene-environment interactions in sporadic Parkinson's disease// J. Neurochem. -2006- V.97, N6. P.1740-1755.
139. Benner R.R., Dunnen J., O'Brein K.F. et al. Detection of mutations in the dystrophin gene via automated DHPLS screening and direct sequencing //BMC Genet.- 2001. -V.2.-P.17.
140. Bennett D.A., Beckett L.A., Murray A.M., et al. Prevalence of Parkinsonian Signs and Associated Mortality in a Community Population of Older People // N Engl J Med. 1996. -V. 334. - P. 71-76.
141. Berger P., Niemann A., Suter U. Schwann cells and the pathogenesis of inherited motor and sensory neuropathies (Charcot-Marie-Tooth disease) // Glia. -2006.-V.54.-P.243-257.
142. Bergoffen J., Scherer S. S., Wang S. et al. Connexin mutations in X-linked Charcot-Marie-Tooth disease // Science. 1993. - V.24. - P.2039-42.
143. Bezard E., Gross C.E., Foumier M.C. et al., Absence of MPTP- induced neuronal death in mice lacking the dopamine transporter // Exp. Neurol.- 1999.-V.l 15.- P.268-273.
144. Bharucha N.E., Bharucha E.P., Bharucha A.E. et al. Prevalence of Parkinson's disease in the Parsi community of Bombay, India // Arch. Neurol. 1988. - V. 45. -P. 1321-1323.
145. Bialecka M., Drozdzik M., Honczarenko K. et al. catechol-O-methyltransferase and monoamino oxidase B genes and susceptibility to sporadic Parkinson's disease in a Polish population// Eur. Neurol.-2005.- V.53. P.68-73.
146. Boerkoel C. F., Takashima H., Garcia C. A. et al. Charcot-Marie-Tooth disease and related neuropathies: mutation distribution and genotype-fenotype correlation// Ann. Neurol. 2002. - V.51. - P. 190-201.
147. Bonifati V., Rizzu P., van Baren M.J. et al. Mutations in the DJ-1 gene associated with autosomal reseccive early-onset parkinsonism // Science.-2003.-V. 299,- P.256-259.
148. Bort S., Nelis E., Timmerman V. et al. Mutational analysis of the MPZ, PMP22 and Cx32 genes in patients of Spanish ancestry with Charcot-Marie-Tooth disease and hereditary with liability to pressure palsies // Hum. Genet. 1997. -V.99. - P.746-754.
149. Bostantjopoulou S., Katsarou Z., Papadimitriou A. et al. Clinical features of Parkinsonian patients with alpha-synuclein (G209A) mutation // Mov. Disord. -2001-V.6. P. 1007- 1013.
150. Botstein D., White R.L., Skolnick M., Davis R.W. Construction of a genetic linkage map in man using restriction fragment length polymorphisms // American Journal of Human Genetics. 1980. -V. 32. - P. 314-331.
151. Bouhouche A., Nazha B., Azzedine H. et al. Autosomal recessive axonal Charcot-Marie-Tooth disease (ARCMT2): phenotype-genotype correlations in 13 Moroccan families // Brain. 2007. - V. 130. - P. 1062-1075.
152. Boyce F.M., Beggs A.H., Feener C., Kunkel L.M. Dystrophin is transcribed in brain from a distant upstream promoter //Proc. Natl. Acad. Sei. 1991. - V.88. -P1276-1280.
153. Boyd Y., Buckle V., Holt S. et al. Muscular dystrophy in girls with X: autosome translocations //J. Med. Genet. 1986. - V.23. - P.484-490.
154. Brandon M., Baldi P. And Walles D. Mitochondrial mutations in cancer // Oncogene. 2006. - V.25. - P.4647-4662.
155. Brandt J., Bylsma F.W., Gross R. et al. Trinucleotide repeat length and clinical progression in Huntington's disease //Neurology. 1996. - Vol.46. -P.527-531.
156. Brewis M., Posnanker D., Rolland C., Miller H. Neurological diseases in an English city. // Acta. Neurol. Scand. 1966. - V.42. - P. 1-89.
157. Briggs M., Mortier G.,Cole W., et al. Diverse mutations in the gene for cartilage oligomeric matrix protein in the pseudoachondroplasia-multiple epiphyseal dysplasia disease spectrum // Am. J. Hum. Genet. 1998. - V. 62. - P. 311-319.
158. Brock G., Anderson N.H., Monckton D.G. Cis-acting modifiers of expanded CAG/CTG triplet repeat expandability: associations with flanking GC content and proximity to CpG islands //Hum. Mol. Genet. 1999. - Vol.8. - P.1061-1067.
159. Brook J., McCurrach M.E., Harley H.G. et al. Molecular basis of myotonic dystrophy: expansion of a trinucleotide (CTG) repeat at the 3' end of a transcript encoding a protein kinase family member //Cell. 1992. - V. - 68. - P.799-808.
160. Brooks A., Chadwick C.A., Gelbard H.A.et al. Paraquat elicited neurobehavioral syndrome caused by dopaminergic neuron loss // Brain Research. 1999.-V.823.-P.1-10.
161. Brown M.D., Shoffner J. M., Kim Y.L., Jun A.S., Graham B.H., Cabell M.F., Gurley D.S. and Wallace D.C. Mitochondrial DNA sequence analysis of
162. Alzheimer's and Parkinson's disease patients // American Journal of Human Genetics 1996. - V. 61. - P.283-289.
163. Brunner H.G., Briiggenwirth H.T., Nillesen W. et al. Influence of sex of the transmitting parent as well as of parental allele size on the CTG expansion in myotonic dystrophy (DM) //Am. j. Hum. Genet. 1993. - V.53. - P. 1016-1023.
164. Bruzzone R., White T. W., Paul D. L. Connections with connexins: the molecular basis of direct intercellular signaling// Eur. J. Biochem. 1996. - V.238, №1. - P.1-27.
165. Buxton J., Shelbourne P., Davies J. et al. Detection of an unstable fragment of DNA specific to individuals with myotonic dystrophy //Nature. 1992. - V.355. - P.547-548.
166. Canet-Aviles R.M., Wilson M.A., Miller D.W. et al. The Parkinson's disease protein DJ-1 is neuroprotective due to cysteine-sulfmic acid-driven mitochondrial localization//Proc. Natl. Acad. Sei. USA 2004. - V. 101, N24. -P. 9103- 9108.
167. Cavalli-Sforza L.L., Bodmer W.F. The Genetics of Human populations. -San Francisco: Ed. W.H. Freeman and Company, 1971. 965p.
168. Chamberlain J.S., Gibbs R.A., Ranier J.E. et al. Deletion screening of the Duchenne muscular dystrophy locus via multiplex PCR amplification //Nuc. As. Res. 1988. - V.16. - P. 11141-11155.
169. Chan D.K.Y., Mellick G.D., Buchanan D.D. et al. Lack of assosiation between CYP1A1 polymorphism and Parkinson's disease in a Chinese population // J. Neur. Transmis. V.109. - P. 35-39.
170. Chance P.F., Fischbeck K. H. Molecular genetics of Charcot-Marie-Tooth disease and related neuropathies // Hum. Mol. Genet. 1994. - V.3. - P. 15031507.
171. Chapon F., Latour P., Diraison P. Axonal phenotype of Charcot-Marie-Tooth disease associated with a mutation in the myelin protein zero gene // J. Neurol. Neurosurg. Psychiatry. 1999. - V.66. - P.779-782.
172. Chen Y.C., Olckers A., Schurr T.G. et al. mtDNA variation in the South African Kung and Khwe and their genetic relationships to other African populations // Am. J. Hum. Genet. - 2000. - V. 66. - P. 1362-1383.
173. Cho H-J., Sung D. H., Kim B. J. and Ki C.-S. Mitochondrial GTPase mitofusin 2 in Korean patients with Charcot-Marie-Tooth neuropathy type 2 // Clin. Genet. 2007. - V.71. - P.267-272.
174. Choi B.-O., Lee M. S., Shin S. H. et al. Mutational analysis ofPMP22, MPZ, GJB1, EGR2 and NEFL in Korean Charcot-Marie-Tooth neuropathy patients // Mutation in Brief. 2004. - V.732.- P. 115-122.
175. Claes S., Van Zand K., Legius E. et al. Correlations between triplet repeat expansion and clinical features in Huntington's disease //Arch. Neurol. 1995. -V.l 13. - P.749-753.
176. Clemens P., Fenwick R., Chamberlain J.S. Carrier detection and prenatal diagnosis in Duchenne and Becker muscular dustrophy families, using dinucleotide repeat polymorphisms //Am.J.Hum.Genet. 1991. - V.49. - P.951-960.
177. Crow J. F. Some possibilities for measuring selection intersites in man // Hum. Biol.- 1958.- V.30, N1.-P.l-13.
178. Dada T.O. Dystrophia myotonica in Nigerian family //East Afr. Med. J. -1973.-V.50. -P.213-228.
179. Danielli G., Mioni F., Muller S. et al. Patterns of deletions of the dystrophine gene in different European populations //Hum. Genet. 1993. - V.91. - P.342-346.
180. Darras B., Koenig M., Kunkel L.M., Francke U. Direct method for prenatal diagnosis and carrier detection in Duchenne/Becker muscular dystrophy using the entire dystrophin cDNA //Am. J. Med. Genet. 1988. - V.29. - P.713-726.
181. Davies J., Yamagata H., Shelbourne P. et al. Comparison of the myotonic dystrophy associated CTG repeat in European and Japanese populations //Med. Genet. 1992. - V.29. - P.766-769.
182. De Benedictis G., Rose G., Carrieri G., et al. Mitochondrial DNA inherited variants are associated with successful aging and longevity in humans // FASEB J.- 1999.~V.13.-P. 1532-1536.
183. De Coo I., Renier W., Ruitenbeek W. et al. A 4-base pair deletion in the mitochondrial cytochrome b gene associated with parkinsonism/ MELAS overlap syndrome// Ann Neurol. 1999. - V.45.-P. 130-133.
184. De Rijk M., Tzourio C., Breteler M. et al. Prevalence of parkinsonism and Parkinson's disease in Europe: the EUROPARKINSON Collaborative Study // J. Neurol. Neurosurg. Psychiatry. 1997. - V. 62, № 1. - P. 10-5.
185. Deininger P., Batzer M. Alu-repeats and human genomic diversity// Nat. Rev.- 2002. V. 3, N5. - P. 370-379.
186. Deka R., Majumder P.P., Shriver M.D. et al. Distribution and evolution of CTG repeats in the myotonin protein kinase gene in human populations //Genome Res. 1996. - V.6. - P.142-154.
187. Den Dünnen J.T., Grootscholten P.M., Bakker E. et al. Topography of the Duchenne muscular dystrophy (DMD) gene: FIGE and cDNA analysis of 194 cases reveals 115 deletions and 13 duplications //A. J. Hum. Genet. 1989. - V.45. -P.835-847.
188. Derenko M., Malyarchuk B., Dambueva I. et al. Mitochondrial DNA variation in tow south Siberian aboriginal populations: implications for the Genetic History of North Asia // Human Biology. 2000. - V. 72. - P. 945-973.
189. Di Monte D., Sandy M., Jewell S. et al. Oxidative phosphorylation by intact muscle mitochondria in Parkinson's disease // Neurodegeneration. 1993. - V.2. -P.275-281.
190. Difiglia M., Sapp E., Chase K. et al. Huntingtin is a cytoplasmatic protein associated with vesicles in human and rat brain neurons //Neuron. 1995. - V.14.- P.1529-1539.
191. Dincer P., Topaloglu H., Auter S. et al. Molecular deletion patterns in Turkish Duchenne and Becker muscular dystrophy patients //Brain Dev. 1996. - V.18. -P.91-94.
192. Djian P. Evolution of simple repeats in DNA and their relation to human disease //Cell. 1998. - V.94. - P.155-160.
193. Dunne P. W., Walch E. T. and Epstein H. F. Phosphorylation reactions of recombinant human myotonic dystrophy protein kinase and their inhibition //Biochemistry. 1994. - V.33. - P. 10809-10814.
194. Duvoisin R.C., Eldridge R., Williams A. et al. Twin study of Parkinson's disease//Neurology. 1981.- V.31.-P. 77-80.
195. Dyck P. Inherited neuronal degeneration and atrophy affecting peripheral motor, sensory, and autonomic neurons // Peripheral neuropathy. 1984. - V.2. -P.1600-1655.
196. Dyck P., Chance P., Lebo R., Carney J. A. Hereditary motor and sensory neuropathies // Peripheral neuropathy. 1993. - V.2. — P. 1094 - 1136.
197. Dyck P., Litchy W., Minnerath S. et al. Hereditary motor and sensoiy neuropathy with diaphragm and vocal cord paresis// Ann. Neurol. 1994. - V.35, № 5. - P.608-615.
198. Edwards J.H. The populations genetics of Duchenne: natural and artificial selection//J. Med. Genet. 1986. - Y.23. -P.521-530.
199. Egensperger R., Bancher C., Kosel S. et al. Association of the mitochondrial tRNA(A4336G) mutation with Alzheimer's and Parkinson's diseases // Neuropatol. Appl. Neurobiol. 1997. -V. 23. - P.315-321.
200. Elbaz A., Grigoletto F., Baidereschi M. et al. Familial aggregation of Parkinson's disease: a population-based case-control study in Europe //Neurol. -1999.-V.52.-P. 1876-1882.
201. Elizer D., Kutluay E., Bussell R.Jr. Conformational properties of alpha-synuclein in its free and lipid-associated states // J. Mol.Biol. 2001. - V.307. -P.1061-1073.
202. Emery A. Population frequency of inherited neuromuscular diseases a world survey //Neuromusc. Disorder. - 1991. - V.l. - P. 19-29.
203. Engelender S., Kaminsky Z., Guo X. Et al. Synphilin-I associates with a-synuclein and promotes of cytosolic inclusions // Nature Genet.-1999.- V.22.-p.l 10-114.
204. Ervasti J.M., Campbell K.P. Membrane organisation of the dystrophin-glycoprotein complex//Cell. 1991. - V.66. - P. 1121-1131.
205. Erwin W. G. A pedigree of sex-linked recessive peroneal atrophy // J. Hered. 1944.-V.35-P.24-26.
206. Esposito L.A., Melov S., Panov A. et al. Mitochondrial disease in mouse results in incresed oxidative stress // Proceedings of the Nat. Acad, of Sciences of the USA. 1999. - V.96. - 4820-4825.
207. Essen A.J., Abbs S., Baidet M. et al. Paternal origin and germ-line mosaicism of deletions and duplications of the dystrophine gene: European study //Hum. Genet. 1992. - V.88. - P.249-257.
208. Evgrafov O.V., Artemyeva O.V., Chuhrova A.L. et al. Comparison of dystrophin gene deletion breakpoints in Russian and other European Duchenne/Becker muscular dystrophy patients //Balkan J. Med. Genet. 1998. -V. 1. - №2. - P.54-59.
209. Fabrizi G., Taioli F., Cavallaro T. et al. Focally folded myelin in Charcot-Marie-Tooth neuropathy type IB with Ser49 Ley in the myelin protein zero // Acta Neuropathol (Berl). 2000,- V.100. - P.299-304.
210. Fairweather N., Bell C., Cochrane S. et al. Neva Mutationa in the connexin 32 gene in X-linked dominant Charcot-Marie-Tooth disease (CMTX1) // Human Molecular Genetics. 1994. - V.3. - P.29-34.
211. Fajakusova I., Kuhrova V., Hajck J., Fajkus J. Distribution of dystrophin gene deletions mapped by multiplex PCR in the Moravian population // Mol. Cell. Probes. 1997. - V. 11 ,N1. - P.85-87.
212. Falk M., Buehler L., Kumar N., Gilula N. Cell-free synthesis and assembly of connexins info functional gap junction membrane channels // EMBO J. 1997. -V. 16 - P.2703-2716.
213. Fallon L., Moreau F., Croft B., et al. Parkin and CASK/LIN-2 associate via a PDZ-mediated interactions and are co-localized in lipid rafts and postsynaptic densities in brain // J. Biol. Chem. 2002. - V.277. - 486-491.
214. Feener C., Boyce F., Kunkel L. Rapid detection of CA polymorphisms in cloned DNA: application to the 5' region of dystrophin gene //Am. J. Hum. Genet. 1991. - V.48. - P.621-627.
215. Flanigan K., von Niederhausern A., Dunn D. et al. Rapid direct sequence analysis of the dystrophin gene //Am. J. Hum. Genet. 2003. - V.72. - P.931-939.
216. Florentin L., Mavrou A., Kekou K., Metaxotou C. Deletion patterns of Duchenne and Becker muscular dystrophies in Greece//J. Med. Genet.- 1995. -V.32. P.48-51.
217. Foltynie, T. The heterogeneity of idiopathic Parkinson's disease / T. Foltynie, C. Brayne, R.A. Barker // J. Neurology. 2002. - Vol. 249. - P. 138-145.
218. Fomo L., DeLanney L., Irwin I.Similarities and differences between MPTP-indused parkinsonism and Parkinson's disease // Adv. Neurol.-1993.-V.60. -P.600-608.
219. Foroud T., Uniacke S., Liu L. et al. Yeterozygosity for a mutation in the parkin gene leads to later onset Parkinson disease // Neurology. 2003. - V.60, N.5. -P.796-801.
220. Forrest E., Cross G., Speer A. et al. Preferential deletion of exons in Duchenne and Becker muscular dystrophies //Nature. 1987. - V.329. - P.638-640.
221. Fu Y., Friedman D., Richards S. et al. Decreased expression of myotonin-protein kinase messenger RNA and protein in adult form of myotonic dystrophy //Science. 1993. - V.260. -P.235-238.
222. Funayaama M., Hasegawa K., Kowa H. et al. A new locus for Parkinson's disease (PARK8) maps to chromosome 12pl 1.2-p. 13.1 // Ann. Neurol. 2002. -V. 51.-P. 296-301.
223. Furtado S., Suchowersky O., Rewcastle B. et al. Relationship between trinucleotide repeats and neuropathological changes in Huntington's disease //Ann. Neurol. 1996,- V.39.-P.132-136.
224. Garcia-Lozano J.R. et al. A new mitochondrial DNA mutation in the tRNA leucine 1 gene (C3275A) in a patient with Leber's hereditary optic neuropathy // Hum. Mutat. 2000. - V. 15. -P.120-121.
225. Gasser T. Genetics of Parkinson's disease // Ann Neurol.-1998.-Vol.44.-p.S53-S57.
226. Ghezzi D. et al., Mitochondrial DNA haplogroup K is associated with a lower risk of Parkinson's disease in Italians // Eur. J. Hum. Genet. 2005. - V.13. -P.748-752.
227. Golbe L.I. Young-onset Parkinson's disease: a clinical review // Neurology. -1991.-V. 41.-P. 168-173.
228. Goldberg Y., Andrew S., Clarke L., Hayden M. A PCR method for accurate assessment of trinucleotide repeat expansion in Huntington disease // Hum. Mol. Genet. 1993a. -V. 2. - No. 6. - P. 635-636.
229. Goldberg Y., Kremer B., Andrew S. Molecular analysis of new mutations for Huntington's disease: intermediate alleles and sex of origin effects //Nat. Genet. -1993b. -Vol.5 -P.174-179.
230. Goldman A., Krause A., Ramsay M. and Jenkins T. Founder effect and the prevalence of myotonic dystrophy in South Africans: molecular studies //Am. J. Hum. Genet. 1996. - Y.59. - P.445-452.
231. Goldman A., Ramsay M. and Jenkins T. Absence of myotonic dystrophy in southern African Negroids is associated with a significantly lower number of CTG trinucleotide repeats //Med. Genet. 1994. - V.31. - P.37-40.
232. Goldman A., Ramsay M. and Jenkins T. New founder haplotypes at the myotonic dystrophy locus in southern Africa //Am. J. Hum. Genet. 1995. - V.56.- P.1373-1378.
233. Goldwurm S., Di Fonzo A., Simons E. Et al., The G6055A (G2019S) mutation in LRRK2 is frequent in both early and late onset Parkinson's disease and originates from a common ancestor // J.Med. Genet. 2005. - V. 42. - P. 11-18.
234. Goodfellow P., Davies K., Ropers H. Report of the committee on the genetic constitution of the X and Y chromosomes //Cytogenet. Cell Genet. 1985. - V.40.- P.296-352.
235. Gordenin D., Kunkel T., Resnick M. Repeat expansion all in a flap? // Nat. Genet. - 1997.-Vol.16.-P.l 16-118.
236. Goudet J., Raymond M., De Meeiis T., Rousset F. Testing differentiation in diploid populations // Genetics. 1996. - V. 144. - P. 1933-1940.
237. Goudier R., LeGuern E., Gudenheim M. Clinical, electrophysiologic, and molecular correlations in 13 families with hereditary neuropathy with liability to pressure palsies and a chromosome 17pl 1.2 deletion // Neurology. 1995. - V.45. -P.2018-2023.
238. Goudreau J., Maraganore D., Farrer M. et al. Case-control study of dopamine transporter-1, monoamine oxidase-B, and catechol-O-methyl transferasepolymorphisms in Parkinson's disease// Mov Disord. -2002. -V.17, N6. P. 13051311.
239. Graham D. Oxidative pathways for catecholamines in the genesis of neuromelanin and cytotoxic quinones // Mol. Pharmacol. 1978. - V.14. - P. 633643.
240. Granieri E., Carreras M., Casetta I. et al. Parkinson's disease in Ferrara, Italy, 1967 through 1987 // Arch. Neurol. 1991. - V. 48, № 8. - P. 854-857.
241. Green D., Reed J. Mitochondria and apoptosis // Science. 1998. - V.281. -P.1309-1316.
242. Guo S. Linkage disequilibrium measures for fine-scale mapping: a comparison // Hum. Hered. 1997. - V. 47. - P. 301-314.
243. Guo S., Thompson E. Performing the exact test of Hardy-Weinberg proportions for multiple alleles // Biometrics. 1992. - V. 48. - P. 361-372.
244. Gusella J., Wexler N., Conneally P. et al. A polymorphic DNA marker genetically linked to Huntington's disease //Nature. 1983. - V.306. - P.234-238.
245. Hahn A., Bolton C., White C. et al. Genotype/phenotype correlations in X-linked dominant Charcot-Marie-Tooth disease // Ann. NY Acad. Sci. 1999. V.14. - P. 366-382.
246. Haldane G. The rate of spontaneous mutation of human gene //J. Genet. -1935. -V.31. -P.317-326.
247. Hampshine D., Roberts E., Crow Y. et al. Kufor-Rakeb syndrome, pallido-pyramidal degeneration with supranuclear upgaze paresis and dementia, maps to lp36 // J. Med Genet. 2001. -V.38. -P.680-682.
248. Harada, H. Epidemiology of Parkinson's disease in a Japanese city / H. Harada, S. Nishikawa, K. Takahashi // Arch. Neurol. 983. - V. 40,№ 3. - P. 151-4.
249. Harding A. E. The clinical features of hereditary motor and sensory neuropathy types I and II// Brain. 1980. - V. 103. - P.259-280.
250. Harding A. E., Thomas P. K. Autosomal recessive forms of hereditary motor and sensory neuropathy // J. Neurol. Neurosurg. Psychiat. 1980. - V.43. - P.669-678.
251. Harley H., Brook D., Rundle S. et al. Expansion of an unstable DNA region and phenotypic variation in myotonic dystrophy //Nature. 1992a. - V.355. -P.545-546.
252. Harley H., Rundle S., MacMillan J. et al. Size of the unstable CTG repeat sequence in relation to phenotype and parental transmission in myotonic dystrophy //Am. J. Hum. Genet. 1993. - V.52. - P. 1164-1174.
253. Harley H., Rundle S., Reardon W. et al. Unstable DNA sequence in myotonic dystrophy //Lancet. 1992b. - V.339. - P. 1125-1128.
254. Harper P.S. and Dyken P.R. Early onset dystrophia myotonica evidence supporting a maternal environmental factor //Lancet. - 1972. - V.2. - P.53-55.
255. Harper P.S. Myotonic Dystrophy //W.B. Saunders Comp., London. 1989. -P.384.
256. Harris S., Moncrieff C. and Johnson K. Myotonic dystrophy: will the real gene please step forward //Hum. Mol. Genet. 1996. - V.5. - P. 1417-1423.
257. Hattori N., Kitada T., Matsumine H. et al. Molecular-genetic analysis of a novel parkin gene in Japanese families with autosomal recessive juvenile parkinsonism // Ann. Neurol. 1998.- V.44. - P. 935-941.
258. Hattori N., Matsumine H., Asakawa S. et al. Point mutations (Thr240Arg and Ala311Stop) in the parkin gene // Biochem. Biophys. Res. Commun.-1998.-V.249.-P.754-758.
259. Hayasaki K., Ohnishi A., Takada G. et al. Mutation of the myeline (sic) PO gene in the Charcot-Marie-Tooth neuropathy type 1 // Biochem. Biophys. Res. Commun. 1993. - V. 194. - P. 1317-1322.
260. Hay den M.R. Huntington's Chorea. Berlin-Heidelberg-New-York, SpringerVerlag, 1981.
261. Hayes J., Strange R. Potential contribution of the glutathione S-transferase supergene family to resistance to oxidative stress // Free Radic. Res. 1994. -V.22- P.43-48.
262. Hicks A.A., Petursson H., Jonsson T. Et al. A susceptibility gene for late-onset idiopatic Parkinson's disease // Ann Neurol.-2002.- V.52(5).-P. 549-550.
263. Higuchi S., Muramatsu T., Arai H. Et al. Polymorphisms of dopamine receptor and transporter genes and Parkinson's disease// J. Neural. Transm. Park. Dis. Dement. Sect. -1995.-V.10, N. 2-3.-P. 107-113.
264. Hoda F., Nicholl D., Bennett P. et al. No association between Parkinson's disease and low-activity alleles of catechol-O-methyltransferase// Biochem. Biophys. Res. Commun. -1996. -V.228.-P.780-784.
265. Hoffman E., Hudecki M., Rosenberg P. et al. Cell and fiber-type distribution of dystrophin //Neuron. 1988. - V.l. - P.411-420.
266. Hoffman E.P., Kunkel L.M. Dystrophin abnormalities in Duchenne/Becker muscular dystrophy //Neuron. 1989. - V.2. - P. 1019-1029.
267. Holmberg B., Kallio M., Johnels B., Elam M. Cardiovascular reflex testing contributes to clinical evaluation and differential diagnosis of parkinsonian syndromes // Mov Disord.-2001.-V.16,- p.217-225.
268. Housman D. Gain of glutamines, gain of function? //Nat. Genet. 1995. -V.10. -P.3-4.277. http://www.dmd.nl278. http://www.neuro.wustl.edu/neuromuscular/time/hmsn.html
269. Hu X., Burghes A., Ray P. et al. Partial gene duplication in Duchenne and Becker muscular dystrophy //J. Med. Genet. 1988. - V.25. - P.369-376.
270. Hu X., Burghes A., Ray P., Worton R. Evidence for mutation by unequal sister chromatid exchange in the Duchenne muscular dystrophy gene //Am. J. Hum. Genet. 1989. - V.44. - P.855-863.
271. Huerta C. et al. Mitochondrial DNA polymorphisms and risk of Parkinson's disease in Spanish population // J. Neurol. Sci. 2005. - V.236. - P.49-54.
272. Hugnot J.P., Recan D., Jeanpierre M. Et al. A highly informative CACA repiet polymorphism ustream of the human dystrophin gene // Nucl. Acids. Res. -1991.-V.19.-N.il.-P.3159.
273. Huntington's disease collaborative research group (HDCRG) A novel gene containing a trinucleotide repeat that is expanded and unstable on Huntington's disease chromosomes //Cell. 1993. - V.72. - P.971-983.
274. Ioannou P., Christopoulos G., Panayides K. et al. Detection of Duchenne and Becker muscular dystrophy carriers by quantitative multiplex polymerase chain reaction analysis // Neurology. 1992. - V.42. - P. 1783-1790.
275. Ionasescu V., Lonasescu R., Searby C. Screening for dominantly inherited Charcot-Marie-Tooth neuropathies//Muscle Nerve. 1993. V.16. P.1232-1238.
276. Ionasescu V. V. Charcot-Marie-Tooth neuropathies: from clinical description to molecular genetics // Muscle Nerve. 1995. - V.18(3). - P. 267-75.
277. Ishikawa A., Tsuji S. Clinical analysis of 17 patients in 12 Japanese families with autosomal-recessive type juvenile parkinsonism // Neurol. 1996. - V.47. -P. 160-166.
278. James C.M., Houlihan G.D., Snell R.G. et al. Late onset Huntington's disease: a clinical and molecular study //Age and ageing. 1994. - V.23. - P.445-448.
279. Jansen G., Bachner D., Coerwinkel M. et al. Structural organization and developmental expression pattern of the mouse WD-repeat gene DMR-N9 immediately upstream of the myolonic dystrophy locus //Hum. Mol. Genet. 1995.- V.4.-P.843-852.
280. Jansen G., Mahadevan M., Amemiya C. et al. Characterization of the myotonic dystrophy region predicts multiple protein isoform-encoding mRNA's //Nat. Genet. 1992. - V.l. -P.261 -266.
281. Jansen G., Willems P., Coerwinkel M. et al. Gonosomal mosaicism in myotonic dystrophy patients: involvement of mitotic events in (CTG)n repeat variation and selection against extreme expansion in sperm //Am. J. Hum. Genet. -1994. V.54.-P.575-585.
282. Jellinger K., Kienzl E., Rumpelmair G. Et al. Iron-melanin complex in substantia nigra of parkinsonian brains: an x-ray microanalysis // J. Neurochem.-1992.-V.59.-P.1168-1171.
283. Jordanova A., Thomas F., Guergueltcheva V. Dominant intermediate Charcot-Marie-Tooth type C maps to chromosome Ip34-p35 // Am. J. Hum. Genet. 2003.- V.73. P.1423-1430.
284. Joseph L., Le Beau M., Jamieson G. , et al. Molecular cloning, sequencing, and mapping of EGR2, a human early growth response gene encoding a protein with «zinc-binding finger» structure // Proc. Nat. Acad. Sei. 1988. - V.85. -P.7164-7168.
285. Kang A., Palmatier M. and Kidd K. Global variation of a 40-bp VNTR in the 3'-untranslated region of the dopamine transporter gene (SLC6A3)// Biol. Psychiatry 1999.- V.46. -P. 151-160.
286. Karlin S., Bürge C. Trinucleotide repeats and long homopeptides in genes and proteins associated with nervous system disease and development //Proc. Natl. Acad. Sei. USA. 1996,- V.93. - P.1560-1565.
287. Karlin S., Bürge C. Trinucleotide repeats and long homopeptides in genes and proteins associated with nervous system disease and development //Proc. Natl. Acad. Sei. USA. 1996. - V.93. - P. 1560-1565.
288. Kehoe P., Krawczak M., Harper P.S. et al. Age of onset in Huntington disease: sex specific influence of apolipoprotein E genotype and normal CAG repeat length //J. Med. Genet. 1999. - V.36. - P. 108-111.
289. Kieburtz K., MacDonald M., Shih C. et al. Trinucleotide repeat length and progression of illness in Huntington's disease //J. Med. Genet. 1994. - Vol.31. -P.872-874.
290. Kim H.-J., Hong S. H., Ki C.-S., et al. A novel locus for X-linked recessive CMT with deafness and optic neuropathy maps to Xq21.32-q24 // Neurology. -2005. V.64. - P.1964-1967.
291. Kim R. H., Smith P.D., Aleyasin H. et al. Hypersensitivity of DJ-1-deficient mice to l-methyl-4-phenyl-l,2,3,6- tetrahydropyrindine (MPTP) and oxidative stress //Proc. Natl. Acad, Sei. USA . -2005. V.102, N14. -P.5215-5220.
292. Kimura M., Ohta T. Theoretical Aspects of population Genetics. Princeton (N.J.): Princeton Univ. Press. 1971. - 219p.
293. Kingston H.M., Thomas N.S.T., Pearson P.L. et al. Genetic linkage between Becker muscular dystrophy and a polymorphic DNA sequence on the short arm of the X chromosome //J. Med. Genet. 1983. - V.20. - P.255-258.
294. Kitada T., Asakawa S., Hattori N. et al. Mutation in the parkin gene cause autosomal recessive juvenile parkinsonism // Nature. -1998. V.392. - P.605-608.
295. Kitoh Y., Matsuo M., Nashio H., Nakamura H. Amplification of selected exons by polymerase chain reaction enables determination of the translation reading frame of dystrophin mRNA //Kobe J. Med. Sei. 1994. - V.40. - P.39-48.
296. Klein C., Pramstaller P., Kis B. et al. Parkin deletions in a family with adult-onset,tremor-dominant parkinsonism: expanding the phenotype // Ann. Neurol. -2000,- V.48. P. 65-71.
297. Klesert T.R., Otten A.D., Bird T.D. and Tapscott S.J. CTG-repeat expansion in myotonic dystrophy suppresses transcription of the DMAHP gene //Nat. Genet. 1997.-V.16.-P.402- 406.
298. Kobayashi K., Kaneda N., Ichinose H. et al. Structure of the human tyrosine hydroxylase gene: alternative splicing from a single accounts for generation of four mRNA types//J. Biochem 1988.- V.130.-P. 907-912.
299. Kochanski A., Drac H., Kabzinska D., Hausmanowa-Petrusewicz I. A novel mutation, Thr65Ala, in the MPZ gene in a patient with Charcot-Marie-Tooth type IB disease with focally folded myelin // Neuromusc. Disorder. 2004. - V. 14, №3. - P.229-232.
300. Kodaira M., Hiyama K., Karakava et al. Duplication detection in Japanese Duchenne muscular dystrophy patients and identification of carriers of partial gene deletions using pulsed-field gel electrophoresis // Hum. Genet.- V.82. -P.237-243.
301. Koenig M., Beggs A.H., Moyer M. et al. The molecular basis for Duchenne versus Becker muscular dystrophy: correlation of severety with type of deletion //Am. J. Hum. Genet. V.45. - P.498-506.
302. Koenig M., Hoffman E.F., Bertelson C.J. et al. Complete cloning of the Duchenne muscular dystrophy (DMD) cDNA and preliminary organization of the DMD gene in normal and affected individuals //Cell. 1987. - V.50. - P.509-517.
303. Koenig M., Monaco A.P., Kunkel L.M. The complete sequence of dystrophin predicts a rod-shaped cytosceletal protein //Cell. 1988. - V.53. - P.219-228.
304. Kogelnik A., Lott M., Brown M. et al. MITOMAP: a human mitochondrial genome database -1998 update // Nucl. Acids Res. 1998. - V.26. - P. 112-115.
305. Kondo I., Kanazawa I. Debrisoquine hydroxylase and Parkinson's disease // Adv. Neurol. 1993. - Vol.60. - P. 338-342.
306. Kovach M. J., Lin J.-P., Boyadjiev S. et al. Unique point mutation in the PMP22 gene is associated with Charcot-Marie-Tooth disease and deafness // Am. J. Hum. Genet. 1999,- V.64. - P. 1580-1593.
307. Krahe R., Ashizawa T., Abbruzzese C. et al. Effect of myotonic dystrophy trinucleotide repeat expansion on DMPK transcription and processing //Genomics. 1995. - V.28.-P.1-14.
308. Krawczak M., Konecki D.S., Schmidtke I. et al. Allelic association of the cystic fibrosis locus and two DNA markers, Xv-2c and KM-19 in 55 German families // Hum. Genet. 1988. - V. 80. - P. 78-80.
309. Kremer B., Almqvist E., Theilmann J. et al. Sex-dependent mechanisms for expansions and contractions of the CAG repeat on affected Huntington disease chromosomes //Am. J. Hum. Genet. 1995. - V.57. - P.343-350.
310. Kremer B., Goldberg P., Andrew S.E. et al. A worldwide study of the Huntington's disease mutation: The sensitivity and specificity of measuring CAG repeats //N. Engl. J. Med. 1994. - V.330. - P. 1410-1416.
311. Kremer B., Squitieri F., Telenius H. et al. Molecular analysis of late onset Huntington's disease //J. Med. Genet. 1993. - V.30. - P.991-995.
312. Kruger R., Kuhn W., Muller T. et al. Ala30 Pro mutation in the gene encoding a-synuclein in Parkinson's disease //Nature Genet. 1998. - V.18. - P. 106-108.
313. Kunugi H., Nanko S., Ueki A., et al. High and low activity alleles of catechol-O-methyltransferase gene: ethnic difference and possible association with Parkinson's disease//Neurosci Lett.-1997.-V.221.-P.202-204.
314. Kwon J. M., Elliott J. L., Yee W.-C., et al. Charcot-Marie-Tooth type II locus to chromosome 3q. // Am. J. Hum. Genet. 1995. - V.57. - P.853-858.
315. Lai P.-S., Takeshima Y., van Tran K.A.K. et al. Comparative study on deletions of the dystrophin gene in three Asian populations //J. Hum. Genet. -2002. V.47. - P.552-555.
316. Langston J.W. MPTP-induced parkinsonism how good a model is it. Recent development in Parkinson's disease // N.Y.: Raven Press, 1986. P.l 19-126.
317. Lavedan C., Hofmann-Radvanyi H., Boileau C. et al. French myotonic dystrophy families show expansion of a CTG repeat in complete linkage disequilibrium with an intragenic 1 kb insertion //J.Med. Genet. 1994. - V.31. -P.33-36.
318. Lavedan C., Hofmann-Radvanyi H., Rabes J. et al. Different sex dependent constraints in CTG length variation as explanation for congenital myotonic dystrophy//Lancet. 1993a. - V.341. -P.237.
319. Lavedan C., Hofmann-Radvanyi H., Shelbourne P. et al. Myotonic dystrophy: size- and sex-dependent dynamics of CTG meiotic instability and somatic mosaicism //Am. J. Hum. Genet. 1993b. - V.52. - P.875-883.
320. Le Couteur D., Leighton P., McCann S., Pond S. Association of a polymorphism in the dopamine-transporter gene with Parkinson's disease// Mov. Disord. -1997. -V.12, N5. -P.760-763.
321. Lebo R.V., Lynch E.D., Bird T.D. Multicolor in situ hibridization and linkage analysis order Charcot-Marie-Tooth type I (CMT 1A) gene-region markers // Am. J. Hum. Genet. 1992. - V.50. - P.42-55.
322. Lederfein D., Levy Z., Augier N. et al. A 71-kilodalton protein is a Duchenne muscular dystrophy gene major product of the in brain and other nonmuscle tissue //Proc. Natl. Acad. Sci. 1993a. - V.89. - P.5346-5350.
323. Lederfein D., Yaffe D., Nudel U. A housekeeping type promotor, located in the 3-prime region of the Duchenne muscular dystrophy gene, controls the expression of Dp71, a major product of the gene //Hum. Mol. Genet. 1993b. -V.2. -P.1883-1888.
324. Leeflang E.P., Zhang L., Tavare S. et al. Single sperm analysis of the trinucleotide repeats in the Huntington's disease gene: Quantification of the mutation frequency spectrum //Hum. Mol. Genet. 1995. - V.4. - P. 1519-1526.
325. Leighton., Le Couteur D., et al. The dopamine transporter gene and Parkinson's disease in a Chinese population// Neurology 1997. - V. 49, N6. -P.1577-9.
326. Leroy E., Boyer R., Auburger G. Et al. The ubiquitin pathway in Parkinson's disease // Nature.-1998.-V.395.- P.451-452.
327. Leung C.M., Chan Y.W., Chang C.M. et al. Huntington's disease in Chinese: a hypothesis of its origin //J. Neurol. Neurosurg. Psychiat. 1992. - V.55. - P.681-684.
328. Lev N., Roncevich D., Ickowicz D., Melamed E., Offen D. Role of DJ-1 in Parkinson's disease // J. Mol. Neurosci. 2006. - V.29, N3. - P.215-225.
329. Lewontin R.C. The interaction of selection and linkage. I. General considerations; heterotic models // Genetics. 1964. - V. 49. - P. 49-67.
330. Li X., Li S., Sharp A. et al. A huntingtin-associated protein enriched in brain with implications for pathology //Nature. 1995. - V.378. - P.398-402.
331. Lightowlers R., Chinnery P., Turnbull D., Howell N. Mammalian mitochondrial genetics: heredity, heteroplasmy and disease // Trends. Genet. -1997.-V.13.-P. 450-455.
332. Lin B., Nasir J., Kalchman M. et al Structural analysis of the 5' region of mouse and human Huntington disease genes reveals conservation of putative promoter region and di- and trinucleotide polymorphisms //Genomics. 1995. -V.25. - P.707-715.
333. Lin B., Rommens J., Graham R. et al Differential 3' polyadenylation of the Huntington disease gene results in two mRNA species with variable tissue expression //Hum. Mol. Genet. 1993. - V.2. - P.1541-1545.
334. Lindenbaum R., Clarke G., Patel C. et al. Muscular dystrophy in an X:1 translocation female suggest that Duchenne locus is on X chromosome short arm //J.Med. Genet. 1979. - V.16. - P.389-392.
335. Louis E., Dempster E.R. An exact test for Hardy-Weinberg and multiple alleles // Biometrics. 1987. - V. 43. - P. 805-811.
336. Lucking C., Abbas N., Durr A. et al. Homozygous deletions in parkin gene in European and North-African families with autosomal recessive juvenile parkinsonism // Lancet.-1998.-V.352.- P.1355-1356.
337. Lucking C., Durr A., Bonifati V. et al. Association between early-onset Parkinson's disease and mutations in the parkin gene. French Parkinson's disease Genetics Study Group // N. Engl J. Med.-2000.-V.342.-p. 1560-1567.
338. Lucotte G., Gerard N., Roubertoux P. et al. Relationships of the 2642 deletion polymorphism (delta 2642) in the huntingtin gene with the CAG repeat expansionlength and age at onset of the disease //Genet. Couns. 1996. - Vol.7. - P.297-302.
339. Lupski J. R., Monies de Oca-Luna R., Slaugenhaupt S. et al. DNA duplication associated with Charcot-Marie-Tooth disease type 1A // Cell. 1991. - V.66. -P.219-232.
340. Macaulay V., Richards M., Hickey E. et.al. The emerging tree of West Eurasian mtDNA: A synthesis of control-region sequences and RFLPs // Am. J. Hum. Genet. 1999. - V. 58. - P. 1309-1322.
341. MacDonald M.E., Barnes G., Srinidhi J. et al. Gametic but not somatic instability of CAG repeat length in Huntington's disease //J. Med. Genet. 1993. -Vol.30.-P.982-986.
342. MacDonald M.E., Vonsattel J.P., Shrinidhi J. et al. Evidence for the GluR6 gene associated with younger onset age of Huntington's disease //Neurology. -1999. Vol.53. -P.1330-1332.
343. Mackey D., Howell N. A variant of Leber hereditary optic neuropathy characterized by recovery of vision and by an unusual mitochondrial genetic etiology//Am. Hum. Genet. 1992.-V.51.-P. 1218-1228.
344. Macleod D., Dowman J., Hammond R. et al. The familial parkinsonism gene LRRK2 regulates neurite process morphology // Neuron. 2006. - V.52, N4. - P. 587-593.
345. MacMillan J.C., Snell R.G., Tyler A. et al. Molecular analysis and clinical correlations of the Huntington's disease mutation //Lancet. 1993. - V.342. -P.954-58.
346. Mahadevan M., Amemiya C., Jansen G. et al. Structure and genomic sequence of the myotonic dystrophy (DM kinase) gene //Hum. Mol. Genet. 1993. - V.2. -P.299-304.
347. Mahadevan M., Tsilfidis C., Sabourin L. et al. Myotonic dystrophy mutation: an unstable CTG repeat in the 3' untranslated region of the gene //Science. 1992. -V.255. - P. 1253-1255.
348. Mahadevan M., Amemiya C., Jansen G. et al. Structure and genomic sequence of the myotonic dystrophy (DM kinase) gene //Hum. Mol. Genet. 1993. - V.2. -P.299-304.
349. Malecot G. Isolation by distance // Genetic Structure of Population / N.E. Morton ed. Univ. of Hawaii Press. - 1973. - P.72-75.
350. Malecot G. Les Matematiques de l'heredite // Hermann et Cie. Paris.- 1948.
351. Malecot G. Les modeles stochastiques en genetique de population // Publ. Inst. Statist. Univ. Paris. - 1959. -V.8. - P. 173-210.
352. Malecot G. Quelques schnmas probabilistiques sur la variabilité de populations naturelles // Ann. Univ. Lion. A. -1950. V.13.- P.37-60.
353. Mandel J.L. Question of expansion //Nat. Genet. 1994. - Vol.4. - P.8-9.
354. Manfioletti G., Ruaro M. E., Del Sal G. A growth arrest-specific (gas) gene codes for a membrane protein // Mol. Cell. Biol. 1990. - V.10. - P.2924-2930.
355. Mann V.M., Cooper J.M., Krige D. et al., Brain, skeletal muscle and platelet homogenate mitochondrial function in Parkinson's disease // Brain. 1992a. -Vol.115.-P. 333-342.
356. Mânnistô P, Kaakkola S. Catechol-O-methyltransferase (COMT): biochemistry, molecular biology, pharmacology, and clinical efficacy of the new selective COMT inhibitors// Pharmacol Rev. -1999. V.51, N4. - P.593-628.
357. Maraganore D., Farrer M., Hardy J. et al. Case-control study of the ubiquitin carboxy-terminal hydrolase LI gene in Parkinson's disease // Neurology. -1999. -V.53, N8. P. 1858-1860.
358. Marshall T.C., Slate J., Kruuk L.E.B., Pemberton J.M. Statistical confidence for likelihood-based paternity inference in natural populations // Molecular Ecology. 1998. - V. 7. - P. 639-655.
359. Martin J.B., Gusella J.F. Huntington's disease. Pathogenesis and management //N. Engl. J. Med. 1986. - V.315. - P.1267-1276.
360. Martorell L., Martinez J.M., Carey N. et al. Comparison of CTG repeat length expansion and clinical progression of myotonic dystrophy over a five year period //Med. Genet. 1995. - V.32. - P.593-596.
361. Maruyama M., Ikeuchi T., Saito M. et al. Novel mutations, pseudo-dominant inheritance, and possible familial effects in patients with autosomal recessive juvenile parkinsonism // Ann. Neurol. 2000. - V.48. - P.245-250.
362. Mathew C.C. The isolation of high molecular weight eucoriotic DNA // Methods in Molecular Biology. Human Press, 1984. - V. 2. - P. 31 -34.
363. Matsumine H., Saito M., Shimoda-Matsubayashi S. et al. Localization of a gene for autosomal recessive form of juvenile parkinsonism to chromosome 6q25.2-27 // Am.J.Hum.Genet. 1997. -V.60. - P. 588-596.
364. Matsuyama W., Nakagawa M., Moritoyo T. et al. Phenotypes of X-linked Charcot-Marie-Tooth disease and altered trafficking of mutant connexin 32 (GJB1).// J Hum Genet. 2001. - V.46(6). - P.307-13.
365. McEntagart M., Norton N., Williams H. et al. Localization of the gene for distal hereditary motor neuronopathy VII (dHMN-VII) to chromosome 2ql4 // Am. J. Hum. Genet. 2001. - V.68. - P. 1270-1276.
366. McNeil S.M., Novelletto A., Srinidhi J. et al. Reduced penetrance of the Huntington's disease mutation //Hum. Mol. Genet. 1997. - Vol.6. - P.775-779.
367. Meloni R., Albanese V., Ravassard P., et al., Tetranucleotide polymorphic microsatellite, located in the first intron of the tyrosine hydroxilase gene, acts a transcription regulatory element in vitro //Hum. Mol. Genet. -1998,- V. 7.- P. 423428.
368. Menegon A., Board P.G., Blackburn A.C. et al. Parkinson's disease, pesticides, and glutathione transferase polymorphisms // Lancet.-1998.-Vol.352.-p.1344-1346.
369. Meray R.K., Lansbury P.T., Reversible monoubiquitination regulates the Parkinson's disease-associated ubiquitin hydrolase UCH-L1 // J.Biol. Chem. 2007.- V.282, N14. P. 10567-10575.
370. Mersiyanova I. V., Ismailov S. M., Polyakov A. V. et al. Screening for mutations in the peripheral myelin genes PMP22, MPZ and Cx32(GJBl) in Russian Charcot-Marie-Tooth neuropathy patients // Hum. Mutat. 2000. - V.15.- P.340-347.
371. Mersiyanova I. V., Perepelov A. V., Polyakov A. V. et al. A new variant of Charcot- Marie-Tooth disease type 2 is probably the result of a mutation in the neurofilament-light gene// Am. J. Hum. Genet. 2000. - V.67. - P.37-46.
372. Mizuno Y., Ikebe S., Hattori N. et al. Role of mitochondria in the etiology and pathogenesis of Parkinson's disease // Biochem.et Biophis. Acta.-1995.-V. 1271.-p.265-274.
373. Mizuno Y., Suzuki K., Sone N., Saitoh T. Inhibition of mitochondrial respiration by MPTP in mouse brain in vivo // Neurosci. 1988. - V.91. - P.349-353.
374. Mokri B., Engel A.G. Duchenne dystrophy: electron microscopic findings pointing to a basic or early abnormality in the plasma membrane of the muscule fibre //Neurology. 1975. - V.25. - P.l 111-1120.
375. Momose Y., Murata M., Kobayashi K. et al. Association studies of multiple candidate genes for Parkinson's disease using single nucleotide polymorphisms // Ann Neurol. -2002. -V.51. P. 133-136.
376. Monaco A., Bertelson C., Liechti-Gallati et al. An explanation for the phenotypic differences between patients bearing partial deletions of the DMD locus //Genomics. 1988. - V.2. - P.90-95.
377. Monaco A., Bertelson C., Middeleswort W. et al. Detection of deletions spanning the Duchenne muscular dystrophy locus using a tightly linked DNA segment //Nature. 1986. - V.316. - P.97-101.
378. Monckton D., Wong L-J., Ashizawa T. and Caskey C. Somatic mosaicism, germline expansions, germline reversions and intergenerational reductions in myotonic dystrophy males: small pool PCR analyses //Hum. Mol. Genet. 1995. -V.4.-P.1-8.
379. Montiel-Sosa F. et al. Differencess of sperm motility in mitochondrial DNA haplogroup U sublineages //Gene. 2006. - V. 368C. -P.21-27.
380. Morikawa N., Nakagawa-Hattori Y., Mizuno Y. Effect of dopamine, dimethoxyphenylethylamine, papaverine, nd related compounds on mitochondrial respiration and complex I activity// J. Neurochem 1996. - V. 66. - P. 1174-1181.
381. Morris G., Simmons C., Man N.T. Apo-dystrophins (Dpl40 and Dp71) and dystrophin splicing isoforms in developing brain //Biochem. Biophys. Res. Commun. 1995. - V.215(l). - P.361-367.
382. Morton N.E. Isolation by distance in human populations // Ann. Hum. Genet. 1977,-V. 40.-P. 361-365.
383. Mostacciuolo M., Schiavon F., Angelini C. Frequency of duplication at 17pl 1.2 in families of northest Italy with Charcot-Marie-Tooth disease type I // Neuroepidemiology. 1995. - V.14. - P.49-53.
384. Muller H., Suter U., Van Broeckhoven C. Advances in Charcot-Marie-Tooth disease research: cellular function of CMT-related proteins, transgenic animal models, and pathomechanisms //Neurobiol. Disease. 1997. - V.4. - P.215-220.
385. Myers R., MacDonald M. , Koroshetz W. De novo expansion of a (CAG)n repeat in sporadic Huntington's disease //Nat. Genet. 1993. - V.5. - P. 168-173.
386. Myers R., Sax D., Koroshetz W. et al. Factors associated with slow progression in Huntington's disease //Arch. Neurol. 1991. - V1.48. - P.800-804.
387. Nagarajan R., Svaren J., Le N. EGR2 mutations in inherited neuropathies dominant-negatively inhibit myelin gene expression // Neuron. 2001. - V.30. -P.355-368.
388. Nasir J. Goldberg Y.P. Hay den M.R. Huntington disease: new insights into the relationship between CAG expansion and disease //Hum. Mol. Genet. 1996. -V.5 Spec. No. - 1431-1435.
389. Nei M. Analysis of gene diversity in subdivided populations // Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1973. -V. 3. - P. 3321-3323.
390. Nei M. Molecular population genetic and evolution. Amsterdam: North-Holland, 1975.-278 p.
391. Nelson D.L., Warren S.T. Trinucleotide repeat instability: when and where? //Nat. Genet. 1994,- V.4. - P. 107-108.
392. Nestor P., Dennet X., Day B. Proximal myotonic myopathy: a report of a kindred. J. Clin. Neuroscience. 1996. - V.5. - P.218-220.
393. Neville C.E., Mahadevan M.S., Barcelo J.M. et al. High resolution genetic analysis suggests one ancestral predisposing haplotype for the origin of the myotonic dystrophy mutation //Hum. Molec. Genet. 1994. - V.3. - P.45-51.
394. Nicholl D., Bennett P., Hiller L. et al. A study of five candidate genes in Parkinson's disease and related neurodegenerative disorders. European Study Group on Atypical Parkinsonism // Neurology. -1999 -V. 53, N7. P.1415-1421.
395. Nicklas W.J., Vyas I., Heikkila R.E. Inhibition of NADH-linked oxidation in brain mitochondria by MPP+, a metabolite of the neurotoxin MPTP // Life Sci. -1985. V.36. -P.2503-2508.
396. Niemann-Seyde S., Slomski R., Rininsland F. et al. Molecular genetic analysis of 67 patients with Duchenne/Becker muscular dystrophy //Hum. Genet. -1992. V.90.-P.65-70.
397. Niemi A. K. et al. Mitochondrial DNA polymorphisms associated with longevity in a Finnish population // Hum. Genet. -2003. V.l 12. - P.29-33.
398. Norris J., Fan Dio, Aleman C. et al. Identification of a new subclass of Alu DNA repeats which can function as estrogen receptor-dependent transcriptional enhancers //J. Biol. Chem. 1995,- V.270, N39. -P. 22777-22782.
399. Noveletto A., Persichetti F., Sabbadini G. et al. Polymorphism analysis of huntingtin gene in Italian families affected with Huntington disease //Hum. Mol. Gen. 1994. - V.3. - P.l 129-1132.
400. Nowakowski A., Kochanski A. Screening of the myelin protein zero gene in patients with Charcot-Matie-Tooth disease // Acta Biochimica Polonica. 2004. -V.51. -P.273-280.
401. Nudel U., Zuk D., Einat P et al. Duchenne muscular dystrophy gene product is not identical in muscle and brain //Nature. 1989. - V.337. - P.76-78.
402. Palma G., Mozzoni P., Mutti A. et al. Case-control study of interactions between genetic and environmental factors in Parkinson's disease // Lancet.-1998.-V.352.- p.1986-1987.
403. Palmucci L., Mongini T., Chiado-Piat L. et al. Dystrophinopathy expressing as either cardiomyopathy or Becker dystrophy in the same family //Neurology.2000.-V.54.-P.529-530.
404. Pan H., Lin H., Ku W. et al. Haplotype analysis of the myotonic dystrophy type 1 (DM 1) locus in Taiwan: implications for low prevalence and founder mutations of Taiwanese myotonic dystrophy type // Europ. J. Human Genet.2001. V.9. - P. 638-641.
405. Pankratz N., Nichols W., Uniacke S., Significant linkage of Parkinson's disease to chromosome 2q36-37 // Am J Hum Genet. 2003. - V.72. -P. 10531057.
406. Park J., Lee S., Lee S. et al. Mitochondrial dysfunction in Drosophila PINK1 mutants is complemented by parkin // Nature. 2006. - V.441, N7097. - P. 11571161.
407. Patel P., Franco B., Garcia C. Genetic mapping of autosomal dominant Charcot-Marie-Tooth disease in a large French-Acadian kindred: identification of new linked markers on chromosome 17 // Am. J. Hum. Genet. 1990. - V.46. -P.801-809.
408. Pavoni M., Granieri E., Govoni V. et al. Epidemiologic approach to Huntington's disease in northern Italy (Ferrara area) //Neuroepidemiology. 1990.- V.9. P.306-314.
409. Pemble S., Schroeder K., Spencer S. et al. Human glutathion S-transferase thêta (GSTT1): cDNA cloning and the characterization of a genetic polymorphism//Biochem. J.-1994.-V.300.-P.271-276.
410. Penney J.B.Jr., Vonsattel J-P., MacDonald M.E. et al. CAG repeat number governs the development rate of pathology in Huntington's disease //Ann. Neurol.- 1997. V.41. - P.689-692.
411. Pentao L., Wise S. A., Chinault A. C. Charcot-Marie-Tooth type 1A duplication appears to arise from recombination at repear sequences flanking the 1.5 Mb monomer unit // Nature Genet. 1992. - V.2. - P.292-300.
412. Perutz M. Polar zippers: Their role in human disease //Protein Sci. 1994. -V.3. - P.1629-1637.
413. Pizzuti A., Pieretti M., Fenwick R. et al. A transposon-like element in the deletion prone region of the dystrophin gene //Genomics. 1992. - V.13. - P.594-600.
414. Polymeropoulos M., Higgins J., Golbe L., Mapping of a gene for Parkinson's disease to chromosone 4q21-23 // Sei.-1996.- V.274.-p.l 197-1199.
415. Polymeropoulos M., Lavedan C., Leroy E. et al. Mutation in the a-synuclein gene identified in families with Parkinson's disease // Sei. 1997. -V.276. -P.2045-2047.
416. Pridmore S. The prevalence of Huntington's disease in Tasmania //Med. J. Aust. 1990. - V.6. - P.133-134.
417. Priest J., Fischbeck K., Nouri N. A locus for axonal motor-sensory neuropathy with deafness and mental retardation maps to Xq24-q26 // Genomics. 1995. -Y.29. -P.409-412.
418. Pule A. et al. Mitochondrial DNA haplogroup cluster UKJT reduces the risk of PD // Ann. Neurol. 2005. - V.57. - P.564-567.
419. Quintana-Murci L., Semino O., Bandelt H- J. et al. Genetic evidence of an early exit of Homo sapiens sapiens from Africa through eastern Africa // Nat. Genet. 1999,-V. 23.-P. 437-441.
420. Raeymaekers P., Timmerman V., De Jonghe P. et al. Localization of the mutation in an extended family with Charcot-Marie-Tooth neuropathy (HMSN I) // Am. J. Hum. Genet. 1989. - V.45. - P.953-958.
421. Rahbar A., Kempkes M., Muller Th., Reich S., Welter F.L. et al. Glutathione-S-transferase polymorphism in Parkinson's disease // J. Neural Transm. 2000. -V.107.-P. 331-334.
422. Ramsay R.R., Singer T.P. Energy-dependent uptake of N-methyl-4-phenylpyridinium, the neurotoxic metabolite of l-methyl-4-phenyl-l,2,3,6tetrahydropyridin, by mitochondria // J. Biol. Chem. 1986. - V.261. - P.7585-7587.
423. Ranum L.P.W., Rasmusen P.F., Benzow K.A. et. al. Genetic mapping of a second myotonic dystrophy locus //Nat. Genet. 1998. - V.19. - P. 196-198.
424. Raymond M., Rousset F. An exact test for population differentiation // Evolution. 1995. - V. 49. - P. 1280-1283.
425. Reichmann H., Janetzky B. Mitochondrial dysfunction a pathogenetic factor in Parkinson's disease // J. Neurol. 2000. - V. 247. - Suppl. 2. - P. 11/63- 11/68.
426. Reid P., Mahler V., Vogt P. et al. Direct carrier detection by in situ hybridization with cosmid clones of Duchenne (Becker) muscular dystrophy locus // Hum. Genet. 1990. - V. 85. - P. 581-586.
427. Ridley R., Frith C., Farrer L., Conneally P. Patterns of inheritance of the symptoms of Huntington's disease suggestive of an effect of genomic imprinting //J. Med. Genet. 1991. - V.28. - P.224-231.
428. Rieder M. Automating the identification of DNA variations using quality-based fluorescence re-sequencing: Analysis of the human mitochondrial genome // Nucleic Acids Res. 1998. - V.26. - P-967-973.
429. Roa B., Garcia C., Suter U. Charcot-Marie-Tooth disease type IA: association with a spontaneous point mutation in the PMP 22 gene // New Engl. J. Med. -1993. V.329. -P.96-101.
430. Roberts R. Dystrophin, its gene and dystrophinopaties. In: "Advancec in genetics: incorporating molecular genetic medicine" (J.C.Hall, J.C.Dunlap, T.Friedman, F.Gianelli, eds.). 1995. - P. 177-231. Academic Press: San Diego, CA.
431. Roberts R., Barby T.F.M., Manners et al. Direct detection of dystrophin gene rearrangement by analysis of dystrophin mRNA in peripheral blood lymphocytes // Am. J. Hum. Genet.- 1991.-V.49.-P. 298-310.
432. Roberts R., Coffey A., Bobrow M., Bentley D. Determination of the exon structure of the distal portion of the dystrophin gene by vectorette PCA //Genomics. 1992. - V.13. - P.942-950.
433. Robinson B. Human Complex I deficiency: clinical spectrum end involvement of oxygen free radicals in the pathogenecity of the defect // Biochem. Biophys. Acta. 1998. - V.1364. - P. 271-286.
434. Rocca W., Bower J., McDonnel S. Time trends in the incidence of parkinsonism in Olmsted County, Minnesota // Neurology.-2001.-Vol.57.-P.462-467.
435. Roest P., Roberts R., Sugino S. et al. Protein trancation test (PTT) for rapid detection of translation-terminating mutations // Hum. Mol. Genet. 1993. - V.2.- P.1719-1721.
436. Rosenberg R.N. DNA-triplet repeats and neurologic disease//New Engl.Med.- 1996. V.335. - P.1222-1224.
437. Ross C. When more is less: Pathogenesis of glutamine repeat neurodegenerative diseases //Neuron. 1995. - Vol.15. - P.493-496.
438. Ross O. et al. Mitochondrial DNA polymorphism : Its role in longevity of the Irish population //Exp.Gerontol. 2001. - V.36. -P.l 161-1178.
439. Rousset F. Inferences from spatial population genetics // Balding D., Bishop M., Cannings C. eds. Handbook of Statistical Genetics. John Wiley & Sons, 2001.-P. 239-269.
440. Rousset F., Raymond M. Testing heterozygote excess and deficiency // Genetics. 1995. - V. 140. - P. 1413-1419.
441. Rubinsztein D., Leggo J., Chiano M. et al. Genotypes at the GluR6 kainate receptor locus are associated with variation in the age of onset of Huntington disease //Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1997. - V.94. - P.3872-3876.
442. Ruiz Pesini E., Wallace D. An enhanced MITOMAP with a global mtDNA mutational phylogeny // Nucleic. Acids Res. - 2007. - V.35. - P. D823-D828.
443. Ruiz Pesini E., Wallace D. Evidance for adaptive selection acting on the tRNA and rRNA genes of the human mitochondrial DNA // Hum. Mutat. - V.27. -P.1072-1081.
444. Schapira A., Gu M., Taanman J. Mitochondria in etiology and pathogenesis of Parkinson's disease / Eds.: C.W.Olanow, P.Jenner. Beyond the decade of the brain. Neuroprotection in Parkinson's disease. Kent: Wells Medical Limited, 1998.-P. 177-188.
445. Scherer S., Deschenes S., Xu Y., et al. Connexin 32 is a myelin-related protein in the PNS and CNS //J. Neurosci. 1995.-V. 15,- P.8281-8294.
446. Schlotterer C., Tautz D. Slippage synthesis of simple sequence DNA //Nucleic Acids Res. 1992. - V.20. - P.211-215.
447. Scott A., Detmer and David C. Chan. Complementation between mouse Mfn1 and Mfn 2 protects mitochondrial fusion defects caised by CMT2A disease mutations// The Journal of Cell Biology. 2007. - V.176. - P.405-414.
448. Scott W., Stajich J., Yamaoka L. et al. Genetic complexity and Parkinson's disease / / Science. 1997. - V. 277. - P. 387-388.
449. Segel R., Silverstein S., Lerer I. et al. Prevalence of myotonic dystrophy in Israeli Jewish communities: inter-community variation and founder permutations //Am. J. Med. Genet. 2003. - V.l 19A. - P.273-278.
450. Senderek J., Bergmann C., Quasthoff S. et al. X-linked dominant Charcot-Marie-Tooth disease: nervr biopsies allow morphological evaluation and detection of connexin 32 mutations (Argl5Trp, Arg22Gln) // Acta Neuropathol. 1998. -V.95. - P.443-449.
451. Senderek J., Hermans B., Lehmann U. Charcot-Marie-Tooth neuropathy type2 and Po point mutations: two novel amino acid substitutions (Asp61Gly;
452. Tyrl 19Cys) and a possible «hotspot» on Thrl24Met // Brain Path. 2000. - V.10. - P.235-248.
453. Sharma M., Mueller J.C., Zimprich A. et al. The sepiapterin reductase gene region reveals association in the PARK3 locus: analysis of familial and sporadic Parkinson's disease in European populations // J. Med. Genet. 2006. - V.43, N7. -P.557-562.
454. Sharp A., Loev S. Schilling G. et al. Widespread expression of Huntington's disease gene (IT-15) protein product //Neuron. 1995. - V. 14. - P. 1065-1074.
455. Shelbourne P., Winqvist R., Kunert E. et al. Unstable DNA may be responsible for the incomplete penetrance of the myotonic dystrophy phenotype //Hum. Mol. Genet. 1992. - V.l. -P.467-473.
456. Shimura H., Hattori N., Kubo S. Et al. Familial Parkinson's disease gene product, parkin, is a ubiquitin-protein ligase // Nature Genet.-2000.-V.25.- P.302-305.
457. Shimura H., Schlossmacher M.G., Hattori N. Et al. Ubiquitination of a new form of a-synuclein by parkin from human brain: implications for Parkinson's disease // Sci.-2001.-V.293,- P.263-269.
458. Shoffner J., Brown M., Huoponen K., et al. A mtDNA mutation associated with maternally inherited Parkinson's disease (PD) and deafness // Am. J. Hum. Gen. 1994.-V.55.-P. 1417.
459. Shoffner J., Brown M., Torroni A. et al. Mitochondrial DNA variants observed in Alzheimer disease and Parkinson's disease patients // Genomics. -1993. V.U.- P. 171-174.
460. Shomrat R., Gluck E., Legum C., Shilov Y. Relatively low proportion of dystrophin gene deletions in Israeli Duchenne and Becker muscular dystrophy patients // Am. J. Med. Genet. 1994. - V. 49. - P.369-373.
461. Shy M. E. et al. CMT1X phenotypes represent loss of GJB1 Gene function // Neurology. 2006. - V.68. - P.849-855.
462. Silander K., Juvonen V., Ignatius J. et al. Spectrum of mutations in Finnish patients with Charcot-Marie-Tooth disease and related neuropathies // Hum. Mutat. 1998. - V.12. -P.59-68.
463. Silander K., Meretoja P., Pihko H., et al. Screening for connexin 32 mutations in Charcot-Marie-Tooth disease families with possible X-linked inheritance // Hum. Genet. 1997. - V.100. - P.391-397.
464. Simpson S., Johnston A. The prevalence and patterns of care of Huntington's chorea in Grampian //Br. J. Psychiatry. 1989. - V.155. - P.799-804.
465. Singh V., Sinha S., Mishra et al., Proportion and pattern of dystrophin gene deletions in north Indian Duchenne and Becker muscular dystrophy patients // Hum. Genet. 1997. - V.99, N2.- P.206-208.
466. Skre H. Genetic and clinical aspects of Charcot-Marie-Tooth disease // Clin. Genet. 1974. - V.6. - P.98-118.
467. Smith C., Gough A., Leigh P. et al. Debrisoquine hidroxilase gene polymorphism and susceptibility to Parkinson's disease // Lancet. 1993. - V. 339.-P. 1375-1377.
468. Smith W., Pei Z., Jiang H. et al. Leucine-rich repeat kinase 2 (LRRK2) interacts with parkin, and mutant LRRK2 induces neuronal degeneration //PNAS. -2005,N51. -P.18676-18681.
469. Snell R., MacMillan J., Cheadle J. et al. Relationship between trinucleotide repeat expansion and phenotypic variation in Huntington's disease //Nat. Genet. -1993. V.4. - P.393-397.
470. Sofic E., Pauls W., Jellinger K. Selective increase of iron in substantia nigra zona compacta of parkinsonin brain // J. Neurochem. 1991. - V. 56. - P. 978-982.
471. Southern E. Detection of specific sequences among DNA fragments separated by gel electrophoresis //J. Mol. Biol. 1975. - V.98. - P.503.
472. Squitieri F., Andrew S., Goldberg Y. et al. DNA haplotype analysis of Huntington disease reveals clues to the origins and mechanisms of CAG expansion and reasons for geographic variation of prevalence //Hum. Mol. Genet. 1994. -V.3. -P.2103-2114.
473. Starikovskaya Y. Sukernik R., Schurr T. et al. MtDNA diversity in Chukchi and Siberian Eskimos: implications for the genetic history of Ancient Beringia and the peopling of the New World // Am. J. Hum. Genet. 1998. - V. 63. - P. 14731491.
474. StatSoft, Inc. STATISTICA for Windows (Computer program manual). Tulsa, OK: StatSoft, Inc., 1999. WEB: http://www.statsoft.com.
475. Stern M., Koller W. Parkinson's disease / In: Parkinsonian Syndromes / Ed.: M.Stern, W.Koller. New York, Basel, Hong Kong: Marcel Dekker, 1992. - P. 322.
476. Stern, M. The epidemiology of Parkinson's disease. A case-control study of young-onset and old-onset patients / M. Stern, E. Dulaney, S.B. Gruber // Arch. Neurol. 1991. - V. 48, № 9. - P. 903-907.
477. Suter U., Snipes G. J., Schoener-Scott R. Regulation of alternative peripheral myelin protein-22 (PMP22) gene transcripts by two promoters // J. Biol. Chem. -1994. V.269. - P.25795-25808.
478. Takahashi H., Ohama E., Suzuki S. et al. Familial juvenile parkinsonism: clinical and pathologic study in a family // Neurology. 1994. - V.44. - P.437-441.
479. Takashima H., Nakagawa M., Umehara F. et al. Gap junction protein beta 1 (GJB1) mutation and central nervous system symptoms in X-linked Charcot-Marie-Tooth disease. // Acta Neurologica Scandinavica. 2003. - V.107. - P.31-37.
480. Tan E., Khajavi M., Thoronby J.I. et al. Variability and validity of polymorphism association studies in Parkinson's disease // Neurology. 2000. -V.55. - P.533-538.
481. Tanaka M. et al. Mitochondrial genome variation in eastern Asia and the peopling of Japan I I Genome Res. 2004. -V.14. - P. 1832-1850.
482. Tanaka M. Mitochondrial genotypes and cytochrome b variants associated with longlivety or Parkinson's disease // J. Neurol. 2002. - V.249. - P. 11-18.
483. Tanaka Y., Engelender S., Igarashi S. et al. Inducible expression of mutant alpha-synuclein decreases proteasome activity and increases sensitivity to mitochondria-dependent apoptosis // Hum. Mol.Gen. 2001. - V. 10. - P. 919-926.
484. Taneja K., McCurrach M., Schalling M. et al. Foci of trinucleotide repeat, transcripts in nuclei of myotonic dystrophy cells and tissues //J. Cell. Biol. 1995. - V.128.-P.995-1002.
485. Telenius H., Kremer H.P.H., Theilmann J. et al. Molecular analysis of juvenile Huntington disease: The major influence on (CAG)n repeat length is the sex of the affected parent //Hum. Mol. Genet. 1993. - V.2. - P.1535-1540.
486. Tenhunen J., Salminen M., Lundstrom K. et al. Genomic organization of the human catechol O-methyltransferase gene and its expression from two distinct promoters //Eur. J. Biochem. -1994 -V.223, N3. P. 1049-1059.
487. The inherited peripheral neuropathies mutation database: http://www.molgen.ua.ac.be/CMTMutations.
488. Timmerman V. et al. Linkage and mutation analysis of Charcot-Marie-Tooth neuropathy type 2 families with chromosomes Ip35-p36 and Xql3 // Neurology. -1996. V.46. - P. 1311-1318.
489. Timmerman V., Raeymaekers P., De Jonghe P. Assignment of the Charcot-Marie-Tooth neuropathy type I (CMT 1A) gene to 17pll.2-pl2 // Am. J. Hum. Genet. 1990. - V.47. - P.680-685.
490. Tinsley J., Blake D., Zuellig R., Davies K.E. Inceasing complexity of the dystrophin-associated protein complex //Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1994. -V.91. -P.8307-8313.
491. Tishkoff S., Goldman A., Calafell F et al. A global haplotype analysis of the myotonic Dystrophy locus: implications for the evolution of modern humans and for the origin of myotonic dystrophy mutations //Am. J.Hum. Genet. 1998. -V.62. - P.1389-1402.
492. Torroni A., Huoponen K. et al. Classification of European mtDNAs from an analysis of three European populations // Genetics. 1996. - V. 144. - P. 1835— 1850.
493. Trottier Y., Devys D., Imbert G. et al. Cellular localization of the Huntington's disease protein and discrimination of the normal and mutation form //Nat. Genet. 1995. - V.10. - P.403-406.
494. Trounce I. et al., Cloning of neuronal mtDNA variants in cultured cells by synaptosome fusion with mtDNA-less cells // Nucleic Acids Res. 2000. -V.28. -P.2164-2170.
495. Uhl G. Dopamine transporter: basic science and human variation of a key molecule for dopaminergic function, locomotion, and parkinsonism// Mov. Disord. -2003 V.18.-P.71-80.
496. Uversky V., Li J., Fink A., Pesticides directly accelerate the rate of alpha-synuclein fibril formation: a possible factor in Parkinson's disease // FEBS Letters. 2001. -V.500. - P.105-108.
497. Valente E., Bentivoglio A., Dixon P. et al. Localization of a novel locus for autosomal recessive early-onset parkinsonism, PARK6, on human chromosome Ip35-p36 // Am. J. Hum. Gen. 2001. - V. 68. - P. 895-900.
498. Valente E., Salvi S., Ialongo T. et al. PINK1 mutations are associated with sporadic early-onset parkinsonism // Ann. Neurol. 2004. - V.56, N3. - P. 336-341.
499. Valentijn L. J., Baas F., Wolterman R. A. et al. Identical point mutations of PMP-22 in Trembler-J mouse and Charcot-Marie-Tooth disease type 1A // Nature Genet. 1992. - V.2. - P.288-291.
500. Vallat J-M., Sindou P., Preux P. Ultrastructural PMP 22 expression in inherited demyelinating neuropathies// Ann. Neurol. 1996. - V.39. - P.813-817.
501. Van der Walt J., Noureddine M., Kittappa R. et al. Fibroblast growth factor 20 polymorphisms and haplotypes strongly influence risk of Parkinson's disease // Am. J. Hum.Genet. 2004. - V.74. - P.l 121 - 1127.
502. Van Dijk J.F., van der Velde E.A., Roos R.A.C., Bruyn G.W. Juvenile Huntington disease //Hum Genet. 1986. - V.73. - P.235-239.
503. Van Duijn C., Dekker J., Bonifati V. et al. PARK7, a novel locus for autosomal recessive early-onset parkinsonism, on chromosome lp36 / // Am. J. Hum. Genet. 2001. - V. 69. - P. 629-634.
504. Vandenbergh D., Persico A., Hawkins A., et al. Human dopamine transporter gene (DAT1) maps to chromosome 5pl5.3 and displays a VNTR// Genomics. -1992,-V.14. -P.1104-1106.
505. Van Ness S., Owens ML, Kilts C. The variable number of tandem repeats element in DAT1 regulates in vitro dopamine transporter density// BMC Genet. -2005- V. 27,N6.-P. 55.
506. Vaughan J., Farrer M., Wszolek Z. et al. Sequencing of the alpha-synuclein gene in a large series of cases of familial Parkinson's disease fails to reveal any further mutations // Hum. Mol.Genet. 1998. - V.7. - P.751-753.
507. Verkerk A., Pieretti M., Sutcliffe J. S. et al. Identification of a gene (FMR- 1) containing a CGG repeat coincident with a breakpoint cluster region axibiting length variation in fragil X syndrome //Cell. 1991. - V.65. - P.905- 914.
508. Vigilant L., Pennington R., Harpending et al. Mitochondrial DNA sequences in single hairs from a Southern African population // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. -1990. -V. 86.-P. 9350-9354.
509. Vuillaume I., Vermersch P., Destee A. et al. Genetic polymorphisms adjacent to the CAG repeat influence clinical features at onset in Huntington's disease //J. Neurol. Neurosurg. Psychiatry. 1998. - V.64. - P.758-762.
510. Walker D., Harper P. Wells C. et al. Huntington's chorea in South Wales. A genetic and epidemiological study //Clin. Genet. 1981. - V.19. - P.213-221.
511. Wallace D. Mitochondrial diseases in man and mouse // Science. 1999. -V.283. - P.1482-1488.
512. Wallace D., Brown M.D., Lott M.T. Mitochondrial DNA variation in human evolution and disease // Gene. 1999. - V.238. - P. 211-230.
513. Wallace D., Lott M.T. Mitochondrial genes in degenerative diseases, cancer and aging // Pr. Med.Genet. 2002. - P. 299-409.
514. Wang J., Liu Z., Chen B. Association beetween cytochrome P-450 enzyme polymorphisms and Parkinson's disease // Nat. Lib. Med. 2000. - V.80. - P. 585587.
515. Wang J., Pegoraro E., Menegazzo E. et al. Myotonic dystrophy: evidence for a possible dominant-negative RNA mutation //Hum. Mol. Genet. 1995. - V.4. -P.599- 606.
516. Warner J., Barron L., Brock D. A new PCR assay for the trinucleotide repeat that is unstable and expanded on Huntington's disease chromosomes // Molecular and cellular probes. 1993. - V. 7. - P. 235-239.
517. Warner L., Shohat M., Shorer Z., Lupski J. Multiple de novo MPZ (PO) point mutations in a sporadic Dejerine-Sottas case // Hum. Mutat. 1997. - V.10. -P.21-24.
518. Warner L., Svaren J., Milbrandt J., Lupski J. R. Functional consequences of mutations in the early growth response 2 gene (EGR2) correlate with severity of human myelinopathies // Hum. Mol. Genet. 1999. - V.8. - P. 1245-1251.
519. Watkins W., Bamshad M., Jorde L. Population genetics of trinucleotide repeat polymorphisms //Hum. Mol. Genet. 1995. - V.4. - P.1485-1491.
520. Weir B., Cockerham C. Estimating F-statistics for the analysis of population structure//Evolution. 1984.-V. 38.-P. 1358-1370.
521. Welcher A., Suter U., De Leon M. A myelin protein is encoded by the homolog of a growth arrest specific gene // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 1991. — V.88. - №16. - P.7195-7199.
522. Wells R. Molecular basis of genetic instability of triplet repeats // J. Biol. Chem. 1996. - V.271. - P.2875-2878.
523. Wenham P., Price W., Blundell G. Apolipoprotein E genotyping using one stage PCR// Lancet. 1991. - V. 337.-P. 1158-1159.
524. Werneck L., Scola R., Maegawa G., Werneck M. Comparative analysis of PCR-deletion detection and immunohistochemistry in Brazilian Duchenne and Becker muscular dystrophy patients //Am. J. Med. Genet. 2001. - V.103. -P.l 15-120.
525. Willems P. Dynamic mutations hit double figures //Nature Genet. 1994. -V.8. - P.213-215.
526. Wite M., Karbalho M., Derse D et al. Detecting of single base substitutions as heteroduplex polymorphisms //Genomics. 1992. - V.12. - P.301-306.
527. Wong G., Gray S. Hassanein R. et al. Environmental risk factors in siblings with Parkinson's disease // Arch. Neurol. 1991. - V. 48, № 3. - P. 887-889.
528. Wright S. The genetic structure of populations //Ann. Eugen. 1951.- V.15. -P.323-354.
529. Wright S. The interpretation of population structure by F-statistics with special regard to systems of mating //Evolution. 1965. - V.19.- P. 395-420.
530. Wu R., Cheng C., Chen K., et al. The COMT L allele modifies the association between MAOB polymorphism and PD in Taiwanese// Neurology.-2001.-V.56.-P.375-382.
531. Xie T., Ho S., Li L., Ma O. G/A 1947 polymorphism in catechol-O-methyltransferase (COMT) gene in Parkinson's disease// Mov. Disord. -1997.-V.12.-P.426-427.
532. Yamagata H., Miki T., Ogihara T. et al. Expansion of unstable DNA region in Japanese myitonic dystrophy patients (Letter) //Lancet. 1992. - V.339. - P.692.
533. Yamagata H., Nakagawa M., Johnson K., Miki T. Further evidence for a major ancient mutation underlying myotonic dystrophy from linkage disequilibrium studies in the Japanese population //J.Hum. Genet. 1998. - V.43. -P.246-249.
534. Yang R., Yang S., Jin S. et al. Detection of dystrophin gene deletion in Chinese Duchenne/Becker muscular dystrophy patients utilizing multiplex polymerase chain reaction// Kao Hsiung I Hsuch Tsa Chih. 1994. - V.10, N1. -P.11-18.
535. Yoritaka A., Hattori N., Yoshino H., Mizuno Y. Catechol-O-methyltransferase genotype and susceptibility to Parkinson's disease in Japan// J. Neural Transm. -1997.-V.104,- P. 1313-1317.
536. Yu S., Pritchard M., Kremer E. et al., Fragile X genotype characterized by an unstable region of DNA//Science. 1991. - V.252. - P. 1179-1181.
537. Yuge L., Hui L., Bingdi X. Detection of gene deletions in Chinese patients with Duchenne /Becker muscular dystrophy using cDNA probes and the polymerase chain reaction method //Life Sei. 1999. - V.65. - P.863-86
538. Zamzani N, Susin S., Marcchetti P. Mitichondrial control of nuclear apoptosis //J. Exp. Med. 1996. - V. 83. - P. 1533-1544.
539. Zarranz J., Alegre J., Gomez-Esteban J.C. et al. The new mutation, E46K, of a-synuclein causes Parkinson and Lewy body dementia // Ann. Neurol. -2004. -V.55, N2. P.164-173.
540. Zerylnick C., Torroni A., Sherman S. L. And Warren S. T. Normal variation at the myotonic dystrophy locus in global human populations //Am. J. Hum. Genet.- 1995.-V.56.-P.123- 130.
541. Zhang C., Baumer A., Maxwell R.J. et al. Multiple mitochondrial DNA deletions in an elderly human individual // FEBS. Lett. 1992. - V.297. - P.4-8.
542. Zimowski J., Bisko M., Fidzianska E. et al. Deletions within the gene of dystrophin in Duchenne and Becker muscular dystrophy // Neurol. Neurochir. Pol.- 1993. V.27,N4.- P.469-478.
543. Zuchner S. et al. Mutations in the mitochondrial GTPase 2 cause Charcot-Marie-Tooth neuropathy type 2A // Nat. Gene. 2004. - V.36. - P.449-451.
- Хидиятова, Ирина Михайловна
- доктора биологических наук
- Уфа, 2008
- ВАК 03.00.15
- Комплексное медико - и популяционно-генетическое изучение населения республики Башкортостан
- Генетическая эпидемиология моногенных болезней нервной системы у населения Ростовской области
- Анализ генов MFN2, GDAP1 и NEFL у больных наследственными моторно-сенсорными нейропатиями из Республики Башкортостан
- Динамика распределенности наследственной патологии в Томской обл.
- Оптимизация медико-генетической службы Республики Башкортостан