Бесплатный автореферат и диссертация по биологии на тему
ß-D-рибофуранозилнуклеозиды: синтез и свойства
ВАК РФ 03.00.03, Молекулярная биология
Содержание диссертации, кандидата химических наук, Родионов, Андрей Александрович
Список сокращений.
Введение.
Глава 1. Дисахаридные нуклеозиды: структура и методы синтеза. (Обзор литературы).
1.1. Дисахаридные нуклеозиды в составе антибиотиков.
1.1.1. Гликозильные нуклеозиды.
1.1.2. Нуклеозиды на основе высших моносахаридов.
1.1.3. Производные жирных кислот.
1.1.4. Фосфорилированные производные нуклеозидов.
1.2. Дисахаридные нуклеозиды как минорные компоненты т-РНК.
1.3. Реакция ADP-рибозилирования. Поли(АЕ)Р-рибоза).
1.4. Методы синтеза дисахаридных нуклеозидов.
1.4.1. Конденсация дисахарида и нуклеинового основания (iV-гликозилирование).
1.4.2. Конденсация моносахарида и нуклеозида (О-гликозилирование).
Глава 2. Дисахаридные нуклеозиды. Синтез и свойства. (Обсуждение результатов).
2.1. Синтез пиримидиновых 5'-0-Р-В-рибофуранозилнуклеозидов.
2.2. Синтез пиримидиновых 5'-0-Р-0-рибофуранозил-2'-дезоксинуклеозидов.
2.3. Изучение устойчивости защитных групп в условиях реакции О-рибозилирования.
2.4. Кислотный гидролиз дисахаридных нуклеозидов.
2.5. Синтез 5'-0-рЛ>рибофуранозиладенозина. Образование трисахаридных нуклеозидов.
2.6. Использование 2',3'-Оизопропилиденовых нуклеозидов в условиях реакции О-гликозилирования.
2.7. Синтез и свойства 0-Р-Б-рибофуранозил-(1"-2')-аденозин-5"-(9-фосфата и его
УСЛОВНЫЕ СОКРАЩЕНИЯ.
В работе использованы символы и сокращения структурных компонентов нуклеиновых кислот и их производных в соответствии с рекомендациями Комиссии по номенклатуре Международного Союза чистой и прикладной химии (IUPAC) и Международного Союза биохимиков (IUB), а также следующие обозначения:
Ас.ацетил;
Ви.изо-6утироил;
Ви.трет-бутп;
Вп.бензил;
Bz.бензоил;
DBU.1,8-диазабицикло[5.4.0]ундец-7-ен;
DCC.дициклогексилкарбодиимид;
ММТг.4-монометокситритил;
NPE.ляра-нитрофенилэтил;
Рг.изо-пропил;
Ру.пиридин;
Rib.рибоза;
TPSC1.триизопропилфенилсульфохлорид;
ВЭЖХ.высокоэффективная жидкостная хроматография;
КССВ.константа спин-спинового взаимодействия
ТСХ.тонкослойная хроматография
ЯМР.ядерный магнитный резонанс
ЯЭО.ядерный эффект Оверхаузера
Нумерация веществ в экспериментальной части соответствует нумерации в обсуждении результатов.
Введение Диссертация по биологии, на тему "ß-D-рибофуранозилнуклеозиды: синтез и свойства"
Важным структурным элементом многих нуклеозидных антибиотиков, таких как амидетин, антелмицин, туникамицин, эзомицин, аденофостин и др., являются дисахаридные нуклеозиды. Из дрожжевых тРНК выделены 9-(2'-0-Р-В-рибофуранозил-(3-0-рибофуранозил)аденин и 9-(2'-0-(3-0-рибофуранозил-Р-0-рибофуранозил)гуанин. Анализ литературных данных показывает, что дисахаридные производные нуклеозидов изучены недостаточно хорошо, что объясняется отсутствием простых и эффективных методов синтеза. В литературе описаны два пути получения дисахаридных нуклеозидов. Синтез дисахаридных нуклеозидов может быть осуществлен конденсацией соответственно защищенного дисахарида с нуклеиновым основанием или реакцией нуклеозида с моносахаридом. Большинство нуклеозидных антибиотиков были синтезированы по первому пути. Эта схема синтеза достаточно длинна. Если в составе природного соединения имеется остаток нуклеозида, то схема получения может быть существенно сокращена. В литературе известны несколько примеров образования О-гликозидной связи из частично защищенного нуклеозида и моносахарида. Однако выходы подобных реакций не превышали 20-30% из-за образования ряда побочных продуктов.
Недавно в Лаборатории стереохимии ферментативных реакций ИМБ РАН был разработан общий метод получения 2'-0-Р-0-рибофуранозилнуклеозидов. Этот подход был также использован для синтеза производных пиримидиновых 3'-0-Р-Б-рибофуранозил-2'-дезоксинуклеозидов. Метод заключается в конденсации активированной четыреххлористым оловом 1-0-ацетил-2,3,5-три-0-бензоил-Р-0-рибофуранозы с частично защищенными рибонуклеозидами в 1,2-дихлорэтане при 0°С в атмосфере азота. В отличие от предыдущих синтезов выход дисахаридных нуклеозидов на стадии конденсации составлял 70-80% и реакция протекала стереоспецифично с образованием |3-аномеров.
Целью настоящей работы являлось изучение возможностей и ограничений данного 5 метода реакции О-рибозилирования. Первый этап работы состоял в получении 5'-0-P-D-рибофуранозилнуклеозидов и 5'-0-Р-В-рибофуранозил-2'-дезоксирибонуклеозидов. На следующем этапе планировался синтез 0-Р-В-рибофуранозил-(1"-2')-аденозин-5"-0-фосфата - минорного нуклеозида тРНК и получение на его основе защищенного производного, пригодного для автоматического олигонуклеотидного синтеза.
Заключение Диссертация по теме "Молекулярная биология", Родионов, Андрей Александрович
ВЫВОДЫ
1. Разработаны удобные методы синтеза пиримидиновых 5'-0-(3-0-рибофуранозил-рибонуклеозидов и 5'-0-Р-В-рибофуранозил-2'-дезоксирибонуклеозидов из 2',3'-ди-0-ацилрибонуклеозидов и 3'-0-т/>е/и-бутилдифенилсилил-2'-дезоксирибонуклеозидов. Изучена устойчивость защитных групп в условиях реакции О-рибозилирования. Показана возможность использования монометокситритильной и /яретя-бутилдифенилсилильной защитных групп для временной защиты 5'-гидроксильной группы в исходных нуклеозидах.
2. Обнаружено, что в условиях реакции О-рибозилирования Л^-бензоил-2',3'-ди-О-ациладенозинов происходит побочное образование трисахаридных нуклеозидов. Установлен механизм их образования, связанный с неустойчивостью vV-гликозидной связи в пуриновых нуклеозидах в условиях реакции Орибозилирования. Использование 2',3 '-0-изопропилиденовых нуклеозидов позволило избежать образования трисахаридных нуклеозидов и получить целевые пуриновые 5'-0-рибофуранозилнуклеозиды с хорошими выходами.
3. В ходе работы синтезировано 35 новых дисахаридных нуклеозидов, структура которых подтверждена данными масс-, УФ- и ЯМР-спектроскопии. Изучена устойчивость полученных соединений в кислой среде. Показано, что в пуриновых дисахаридных нуклеозидах гидролиз О-гликозидной связи протекает одновременно с апуринизацией, в то время как распад пиримидиновых дисахаридов происходит только по О-гликозидной связи и приводит к нуклеозиду и рибозе.
4. Впервые осуществлен одиннадцатистадийный синтез 0-р-О-рибофуранозил-(1"-2')-аденозин-5"-0-фосфата - компонента дрожжевых тРНК и его защищенного производного, пригодного для автоматического олигонуклеотидного синтеза.
Библиография Диссертация по биологии, кандидата химических наук, Родионов, Андрей Александрович, Москва
1. Suhadolnik R. J. Nucleoside Antibiotics. New York, Wiley Interscience, 1970.
2. Suhadolnik R. J. Nucleoside as Biological Probes. New York, Wiley Interscience, 1979.
3. Suhadolnik R. J. Naturally accuring nucleoside and nucleotide antibiotics. Prog. Nucleic Asid Res. Mol. Biol., 1979, v. 22, p. 193-272.
4. Goodchild J. The biochemistry of nucleoside antibiotics. Part B. In: Topics in Antibiotic Chemistry, (Ed. Sammes P. G.), Chichester, Elies Horwood Limited, 1982, v. 6, p. 99-227.
5. Buchanan J. G., Wightman R. H. The chemistry of nucleoside antibiotics. Part C. In: Topics in Antibiotic Chemistry, (Ed. Sammes P. G.), Chichester, Elies Horwood Limited, 1982, v. 6, p. 229339.
6. Isono K. Nucleoside antibiotics: structure, biological activity, and biosynthesis. J. Antibiot., 1988, v. 41, p. 1711-1739.
7. Isono K. Current progress on nucleoside antibiotics. Pharmacol. Ther., 1991, v. 52, p. 269-286.
8. Garner P. Syntetic approaches to complex nucleoside antibiotics. Studies in natural product chemistry, Atta-ur-Rahman. Ed.; Elsevier: Amsterdam, 1988, Part A, v. 1, p. 397-434.
9. Lerner L. M. Synthesis and Properties of Various Disaccharide Nucleosides. In: Chemistry of Nucleosides and Nucleotides, (Ed. Townsend L.B.), Plenum Press, New York, 1991, -v. 2, p. 27-79.
10. Knapp S. Synthesis of complex nucleoside antibiotics. Chem. Rev., 1995, v.95, p. 1859-1876.
11. McKormick M. H., Hochn M. M. Isolation of a new antibiotic from Streptomuces fasiculatus. -Antibiot. Chemother, 1953, v. 3, p. 718-720.
12. DeBoer C., Caron E. L., Hinman J. W. Amicetin a new streptomyces antibiotic. J.Am. Chem. Soc., 1953, v. 75, p. 499-550.
13. Hinman J. W., Caron E. L., DeBoer C. The isolation and purification of amicetin. J. Am. Chem. Soc., 1953, v. 75, p. 5864-5866.
14. Stivens С. L., Nigarajan К., Haskell Т. H., The structure of amicetin. J. Org. Chem., 1962, v. 27, 2991-3005.
15. Stivens C. L., Cross В., Toda T. The syntesis of DL-threo and erythreo- amicetose 2,4-dinitrophenylhydrazones. J. Org. Chem., 1963, v. 28,1283-1286.
16. Hanessian S., Haskell Т. H. Configuration of the anomeric linkages in amicetin. Tetrahedron Lett, 1964, p. 2451-2460.
17. Flynn E. H., Hinman J. W., Caron E. L., Woolf D. O. The chemistry of amicetin, a new antibiotic. J.Am. Chem. Soc., 1953, v. 75, p. 5867-5871.
18. Sensi P., Greco A. M., Gallo G. G., Rolland G. Isolation and structure determination of a new amicetine-like antibiotic: amicetin B. Antibiot. Chemother, 1957, v. 7, p. 645-652.
19. Haskell Т. H., Ryder A., Fohardt R. P., Fusari S. A., Jakubowski Z. L., Bartz Q. R. The isolation and characterization of three crystalline antibiotics from Streptomyces plisatus. J. Am. Chem. Soc., 1958, v. 80, p. 743-747.
20. Haskell Т.Н. Amicetin, bamicetin, and plicacetin. Chemical studies. J. Am. Chem. Soc., 1958, v. 80, p. 747-751.
21. Evans R., Weare G. Norplicacetin, a new antibiotic from Streptomyces plisatus. J. Antibiot., 1977, v. 30, p. 604-606.
22. Konishi M., Kimeda M., Tsukiura H., Yamamoto H., Hoshiya Т., Miyaki Т., Fujisawa K., Koshiyama H., Kawaguchi H. Oxamicetin, a new antibiotic of bacterial origin. I. Production, isolation and properties. J. Antibiot., 1973, v. 26, p. 752-756.
23. Konishi M., Naruishi M., Tsuno Т., Tsukiura H., Kawaguchi H. Oxamicetin, a new antibiotic of bacterial origin. II. Structure of oxamicetin. J. Antibiot., 1973, v. 26, p. 757-764.
24. Tomita K., Uenoyama Y., Fujisawa K., Kawaguchi H. Oxamicetin, a new antibiotic of bacterial origin. III. Taxonomy of the oxamicetin-producing organism. J. Antibiot., 1973, v. 26, p. 765-770.
25. Itoh J. Miyadoh Sh. SF 2457, a new antibiotic related to amicetin. J. Antibiot., 1992, v. 45, p. 846-853.
26. Ogita Т., Otake, Y.Miyazaki N. Yonehara H., Macfarlane R. D., McNeal C. J. The structure of adenomycin (C19.97 substance). Tetrahedron Lett., 1980, v 27, p. 3203-3206.
27. Yamaguchi H., Sato S., Yoshida S., Takada K., Itoh M., Seto H., Otake N. Capuramycin, a new nucleoside antibiotic. Taxonomy, fermentation, isolation and characterisation. J. Antibiot., 1986, v. 39, p. 1047-1053.
28. Seto H., Otake N„ Sato S., Yamaguchi H., Takada K., Ito M., Lu H. S. M., Clardy J. The structure of a new nucleoside antibiotic, capuramycin. Tetrahedron Lett., 1988, v. 29, p. 23432346.
29. Nishizawa N., Kondo Y., Koyama M., Omoto S., Iwata M., Tsuruoka Т., Unouye S. Studies on a new nucleoside antibiotic, dapiramicin. П. Isolation, physico-chemical and biological charakterisation. J. Antibiot., 1984, v. 37, p. 1-5.
30. Sakata K., Sakurai Т., Tamuraz S. Isolation of novel antifungal antibiotics, ezomycins Аь A2, Bi, and B2. Agric. Biol. Chem., 1974, v. 39, p. 1883-1890.
31. Sakata K., Sakurai Т., Tamuraz S. L-Cysthionine as a component of ezomycins Ai and Bi from a Streptomyces. Agric. Biol. Chem., 1973, v. 37, p. 697-699.
32. Sakata K., Sakurai Т., Tamuraz S. Ezoaminuroic acid, 3-amino-3,4-dideoxy-D-xy/o-hexopyranuronic acid, as a constituent of ezomycins Ai and A2. Tetrahedron Lett., 1974, p. 15331536.
33. Sakata К., Uzawa J. Application of C-13 NMR spectrometry to the structural investigation of the novel bicyclic anhydrooctose uronic asid nucleosides, constituents of ezomycins. Agric. Biol. Chem., 1977, v. 41, p. 413-415.
34. Sakata K., Uzawa J., Sakurai A. Application of Carbon-13 NMR spectrometry to the structural investigation of ezomycins. Org. Magn. Resonance, 1977, v. 10, p. 230-234.
35. Sakata K., Sakurai Т., Tamuraz S. Structures of ezomycins Ai and A2. Agric. Biol. Chem., 1976, v. 40, p. 1993-1999.
36. Sakata K., Sakurai Т., Tamuraz S. Structures of ezomycins Bi , B2 , Ci , C2 , Di , and D2 . -Agric. Biol. Chem., 1977, v. 41, p. 2033-2039.
37. Chambers R. W. The chemistry of pseudouridine. Prog. Nucleic Asid Res. Mol. Biol., 1966, v. 5, p. 358-360.
38. Hamill R. L., Hoehn M. M. Anthelmycin, a new antibiotic with anthelmintic properties. J. Antibiot., 1964, Ser. A, v. 17, p. 100-103.
39. Uchida K., Ichikawa Т., Shimauchi Y., Ishikura Т., Ozaki A. Hikizimycin, a new antibiotic. J. Antibiot., 1971, v. 24, p. 259-262.
40. Das В. C., Defaye J., Uchida K. The structure of hikizimycin. Part I. Identification of 3-amino-3-deoxy-D-glucose and cytosine as structural components. Carbohydr. Res., 1972, v. 22, p. 293299.
41. Uchida K., Das В. C. Hikizimycin, a novel Сц aminosugar component of the antibiotic hikizimycin. Biochimie, 1973, v. 55, p. 635-636.
42. Uchida K. Structure de l'hikizimycin, un antibiotique nucleosidique. Agric. Biol. Chem., 1976, v. 40, p. 395-404.
43. Uchida K., Breitmaier E., Koenig W. A. 13C-NMR investigations of the nucleoside antibiotic hikizimycin and its constituents. Tetrahedron, 1975, v. 31, p. 2315-2317.
44. Ennifar S., Das В. C., Nash S. M., Nagarajan R. Structural identity of anthelmycin with hikizimycin. J. Chem. Soc. Chem. Commun., 1977, p. 41-42.
45. Kobayasi J., Doi Y., Ishibashi M. Shimofuridin A, a nucleoside derivative embracing an acylfucopyranoside unit isolated from the Okinavan marine tunicate Aplidium multiplication. J. Org. Chem., 1994, v. 59, p. 255-257.
46. Doi Y., Ishibashi M., Kobayasi J. Isolation and structure shimofuridins A-G from the Okinavan marine tunicate Aplidium multiplicatum. Tetrahedron, 1994, v. 50, p. 8651-8656.
47. Takatsuki A., Arima K., Tamura G. Tunicamycin, a new antibiotic. I. Isolation and characterization of tunicamycin. J. Antibiot., 1971, v. 24, p. 215-223.
48. Ito Т., Takatsuki A., Kawamura K., Sato K., Tamura G. Isolation and structures of components of tunicamycin. Agric. Biol. Chem., 1980, v. 44, p. 695-698.
49. Takatsuki A., Kawamura K., Okina M., Kodama Y., Ito Т., Tamura G. The structure of tunicamycin. Agric. Biol. Chem., 1977, v. 41, p. 2307-2309.
50. Takatsuki A., Kawamura K., Kodama Y., Ito Т., Tamura G. Structure determination of fatty acids from tunicamycin complex. Agric. Biol. Chem., 1979, v. 43, p. 761-764.
51. Ito Т., Kodama Y., Kawamura K., Suzuki K., Takatsuki A., Tamura G. Structure determination of tunicaminyl uracil, a degradation product of tunicamycin. Agric. Biol. Chem., 1979, v. 43, p. 1187-1195.
52. Ekcard K., Inh W., Tresselt D., Krebs D. The chemical structures of streptovirudins. J. Antibiot., 1981, v. 34, p. 1631-1632.
53. Isono K., Uramoto M., Kusakabe H., Kimura K., Izaki K., Nelson С. C., McCloskey J. A. Liposidomycins: novel nucleoside antibiotics which inhibit bacterial peptidoglycan sinthesys. J. Antibiot., 1985 v. 38, p. 1617-1621.
54. Ubukata M., Isono K., Kimura K., Nelson С. C., McCloskey J. A. The structure of liposidomycin B, an inhibitor of bacterial peptidoglycan synthesis. J. Am. Chem. Soc., 1988, v. 110, p. 4416-4417.
55. Ubukata M., Kimura K., Isono K., Nelson С. C., Gregson J. M., McCloskey J. A. Structure elucidation of liposidomycins, a class of complex lipid nucleoside antibiotics. J. Org. Chem., 1992, v. 57, p. 6392-6403.
56. Kimura K., Ikeda Y., Kagami S., Yoshihama M., Suzuki K., Osada H., Isono K. Selective inhibition of the bacterial peptidoglycan biosynthesis by the new types of liposidomycins. J. Antibiot., 1998, v. 51, p 1099-1104.
57. Sebesta K., Horska K., Vancova J. Isolation and properties of the insecticidal exotoxin of Bacillus thuringiensis var. gelechiae Auct. Coll. Czech Chem. Commun., 1969, v. 34, p. 891-900.
58. Bond R. P. M., Boyce С. В. C., French S. J. A purification and some properties of an insecticidal exotoxin from Bacillus thuringiensis berliner. Biochem. J., 1969, v. 114, p. 477-488.
59. Sebesta K., Sternbah H. The specificiti of inhibition of DNA-dependent RNA polymerase by Bacillus thuringiensis exotoxin. FEBS Letters., 1970, v. 8, p. 233-235.
60. Farkas J., Sebesta K., Horska K., Samek Z., Dolejs L., Sorm F. The structure of exotoxin of Bacillus thuringiensis var. gelechiae. Coll. Czech Chem. Commun., 1969, v. 34, p. 1118-1120.
61. Kalvoda L., Prystas M., Sorm F. The structure of the allaric portion of exotoxin from Bacillus thuringiensis. Tetrahedron Lett., 1973, p. 1873-1876.
62. Farkas J., Sebesta K., Horska K., Samek Z., Dolejs L., Sorm F. Structure of thuringiensin, the thermostable exotoxin from Bacillus thuringiensis. Coll. Czech Chem. Commun., 1976, v. 42, p. 909-929.
63. Takahashi S., Kinoshita., Takahashi M. Adenophostins A and B: potent agonists of inositol-1,4,5-trisphosphate receptor produced by Penicillum brevicompactum. Structure elucidation. J. Antibiot., 1994, v. 47, p. 95-100.
64. Takahashi M., Tanzawa К., Takahashi S. Adenophostins, newly discovered metabolite of Penicillum brevicompactum, act as potent agonists of the inositol-1,4,5-trisphosphate receptor. J. Biol. Chem., v. 269, p. 369-372.
65. Katoh H., Yamada H., Lida K., Aoki M., Itezono Y., Nakayama N., Suzuki Y., Watanabe M., Shimada H. Isolation and structure elucidation of novel chitin synthase inhibitors guanofosfocins produced by microorganisms. Chem. Abstr., 1996, v. 125, 322575y.
66. Limbach P. A., Crain P. F., McCloskey J. A. Summary: the modified nucleosides of RNA. -Nucl. Acids Res., 1994, v. 22, 2183-2196.
67. Hall R. H. A general procedure of the isolation of "minor" nucleosides from ribonucleic acid hydrolysates. Biochem., 1965, v. 4, p. 661-670.
68. Simsek M., RajBhandary U. L. The primary structure of yeast initiator transfer ribonucleic acid. Biochem. Biophys. Res. Commun., 1972, v. 49, p. 508-514.
69. Yamashiro-Matsumura S., Takemura S. The primary structure of cytoplasmic initiator transfer ribonucleic acid from Torulopsis utilis. J. Biochem., 1979, v. 86, p. 335-346.
70. Canaday J., Guillemaut P., Weil J.-H. The nucleotide sequences of the initiator RNAs from bean cytoplasmic and chloroplasts. Nucl. Acids Res., 1980, v. 8, p. 999-1008.
71. Olins P. O., Jones D. S. Nucleotide sequence of Scenedesmus obliquus cytoplasmic initiator tRNA. Nucl. Acids Res., 1980, v. 8, p. 715-729.
72. Gillum A. M., Ecker L. I., Silerklang L., Scharwzbach S. O., Rajbhandry U. L„ Barnett W. E. Nucleotide sequence of Neurospora crassa cytoplasmic initiator tRNA. Nucl. Acids Res., 1977, v. 4, p. 4109-4131.
73. Ghosh H. P., Ghosh K., Simsek M., Rajbhandry U. L. Nucleotide sequence of Wheat germ cytoplasmic initiator methionine transfer ribonucleic acids. Nucl. Acids Res., 1982, v. 10, p. 32413247.
74. Desgres J., Keith G., Kuo К. C., Gehrke C. W. Presence of phosphorylated O-ribosyl-adenosme in T-vj/-stem of yeast methionine initiator tRNA. Nucl. Acids Res., 1989, v. 17, p. 865-882.
75. Keith G., Glasser A.-L., Desgres J., Kuo К. C., Gehrke C.W. Identification and structural characterization of 0-P-ribosyl-(l"-2')-adenosine-5"-phosphate in yeast methionine initiator tRNA. -Nucl. Acids Res., 1990, v. 18, p. 5989-5993.
76. Glasser A.-L., Desgres J., Heitzler J., Gehrke C.W., Keith G. O-Ribosyl-phosphate purine as a constant modified nucleotide located at position 64 in cytoplasmic initiator tRNAsMet of yeasts. -Nucl. Acids Res., 1991, v. 19, p. 5199-5203.
77. Kiesewetter S., Ott G., Sprinzl M. The role of modified purine 64 in initiator/elongator discrimination of tRNAjMet from yeast and wheat germ. Nucl. Acids Res., 1990, v. 18, p. 46774682.
78. Keith G., Heitzler J., Adlouni С. E., Glasser A.-L., Desgres J., Dirheimer G. The primary structure of cytoplasmic initiator tRNAMet from Schizosaccharomyces pombe. Nucl. Acids Res., 1993, v. 21, p. 2949.
79. Basavappa R., Sigler P. B. The 3 A crystal structure of yeast initiator tRNA: functional implications in initiator/elongator discrimination. J. EMBO, 1991, v. 10, p. 3105-3111.
80. Chambon P., Weil J. D., Doly J., Strosser M. Т., Mandel P. On the formation of a novel adenylic compound by enzymatic extracts of liver niclei. Biochem. Biophys. Res. Commun., 1966, v. 25, p. 638-643.
81. Fujimura S., Hasegawa S., Sugimura T. Nicotinamide mononucleotide-dependent incorporation of ATP into acid-insoluble material in rat liver nuclei preparation. Biochim. Biophys. Acta, 1967, v. 134, p. 496-499.
82. Nishizuka Y., Ueda K., Nakazawa K., Hayaishi O. Studies on the polymer of adenosine diphosphate ribose. 1. Enzymatic formation from nicotinamide in mammalian nuclei. J. Biol. Chem., 1967, v. 242, p. 3164-3171.
83. Sugimura Т. Poly(adenosine diphosphate ribose). Prog. Nucleic. Acid. Res. Mol. Biol., 1973, v. 13, p. 127-151.
84. Sugimura Т., Miwa M. Poly(ADP-ribose): historical perspective. Mol. Cell. Biochem., 1994, v. 138, p. 5-12.
85. Miwa M., Sugimura T. Splitting of the ribose-ribose linkage of poly(adenosine diphosphate-ribose) by a calf thymus extract. J. Biol. Chem., 1971, v. 246, p. 6362-6364.
86. Ueda K., Oka J., Narumiya S., Miyakawa N., Hayaishi O. Poly ADP-ribose glycohydrolase from rat liver nuclei, a novel enzyme degrading the polymer. Biochem. Biophys. Res. Commun., 1972, v. 46, p. 516-523.
87. Ferro A. M., Oppenheimer N. J. Structure of a of poly(adenosine diphoribose) monomer: 2'-(5"-phosphoribosyl)-5'-adenosine monophosphate. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1978, v. 75, p. 809813.
88. Oppenheimer N. J., Sing M., Sweeley С. C., Sung S. J., Srere P. A. The configuration and location of the ribosidic linkage in the prosthetic group of citrate lyase (.Klebsiella aerogenes). J. Biol. Chem., 1979, 254, p. 1000-1002.
89. Tanaka M., Hayashi K., Sakura H., Miwa M., Matsushima Т., Sugimura T. Demonstration of high molecular weight poly-(adenosine diphosphate ribose). Nucleic. Acids Res., 1978, v. 5, p. 3183-3194.
90. Watanabe K. A., Hollenberg D. H., Fox J. J. Nucleosides LXXXV. On mechanisms of nucleoside synthesis by condensation reactions. J. Carbohydrates Nucleosides Nucleotides. 1974, v. l,p. 1-37.
91. Vorbruggen H. Nucleoside Analogs, Chemistry, Biology and Medical Applications. New York: Plenum Press, 1979. p. 35-69.
92. Vorbruggen H. Adventures in silicon organic chemistry. - Acc. Chem. Res., 1995, v. 28, p. 509-520.
93. Vorbruggen H. Some recent trends and progress in nucleoside synthesis. Acta Biochimica Polonica, 1996, v 43, p. 25-36.
94. Лукевиц Э. Я., Заблоцкая A. E. Силильный метод синтеза нуклеозидов. Рига: Зинатне. 1985. с 440.
95. Бейгельман Л. Н., Михайлов С. Н. Возможности использования моносахаридов в синтезе нуклеозидов (часть 1). Химико-Фармацевтический журнал, 1988, т. 7, с. 843-856.
96. Wilson L. J., Hager М. W., El-Kattan Y. A., Liotta D. C. Nitrogen glycosylation reactions involving pyrimidine and purine nucleosidebases with furanoside sugars. Synthesis, 1995, p. 14651479.
97. Wolfrom M. L., McWain P., Shafizadeh F., Thompson A. 9-P-Lactosyladenine and 2,6-diamino-9-p-lactosylpurine. J. Am. Chem. Soc., 1959, v. 81, p. 6080-6082.
98. Wolfrom M. L., McWain P., Thompson A. Nucleosides of disaccharides; cellobiose and maltose. J. Am. Chem. Soc., 1960,v. 82, p. 4353-4354.
99. Lerner L. M. 9-|3-Melibiosyladenine. Protection of the 1-6 glycosidic linkage of melibiose with benzoate ester blocking groups. J. Org. Chem., 1967, v. 32, p. 3663-3665.
100. Lerner L. M. 9-(2-Deoxycellobiosyl)adenine. J. Med. Chem., 1968, v. 11, p. 912.
101. Baker B. R. Stereochemistry of nucleoside synthesis, in: The Chemistry and Biology of Purines (Eds. Wolstenholme G. E. W., O'Connor С. M.) Ciba Foundation Symposium, Little, Brown, & Co., Boston, 1957, p. 120-133.
102. Yamaoka N., Aso K., Matsuda K. New synthesis of nucleosides. The synthesys of glycopyranosides of purines, pyrimidines, and benzimidazole. J. Org. Chem., 1965, v. 37, p. 149152.
103. Rao D. R., Lerner L. M. Disaccharide nucleosides of benzimidazole. J. Org. Chem., 1972, v. 37, p. 3741-3743.
104. Stevens C. L., Blumbergs P. Pyrimidine disaccharide nucleosides. Synthesis of an aminosugar disaccharide nucleoside. J. Org. Chem., 1965, v. 30, p. 2723-2728.
105. Hilbert G. E., Johnson Т. B. Researches on pyrimidines. СХУП. A method for the synthesis of nucleosides. J. Am. Chem. Soc., 1930, v. 52, p. 4489-4494.
106. Fox J. J., Yung N., Wempen I., Doerr I. I. Pyrimidine disaccharide nucleosides. Ш. On the synthesis of cytidine and related pyrimidine nucleosides. J. Am. Chem. Soc., 1957, v. 79, p. 50605064.
107. Niedballa U., Vorbruggen H. A general synthesis of N-glycosides. Ш. A simple synthesis of pyrimidine disaccharide nucleosides. J. Org. Chem., 1974, v. 39, p. 3664-3667.
108. Watanabe K. A., Matsuda A., Halat M. J., Hollenberg D. H., Nisselbaum D. H., Fox J. J. Nucleosides. 114. 5'-O-Glucuronides of 5-fluorouridine and 5-fluorocytidine. Masked precursors of anticancer nucleosides. J. Med. Chem., 1981, v. 24, p. 893-897.
109. Ogura H., Furuhatu F., Iwaki K., Takahashi H. Synthetic O-glycosyl nucleoside analogs. -Nucleic Acids Res. Symp., 1991, Ser. №. 10, p. 23-26.
110. Halmos Т., Filippi J., Bach J., Antonakis K. Unsaturated ketonucleosides: Keto derivatives of benzoylated disaccharide nucleosides. Carbohydr. Res., 1982, v. 99, p. 180-188.
111. Kraska В., Lichtenthaler F. W. (l-5)-Verknupfte Glucopyranosyl- und Galactopyranosylribosen. Chem. Ber., 1981, v. 114, p. 1636-1648.
112. Кочетков H. К., Бочков А. Ф., Дмитриев Б. А., Усов А. И.,Чижов О. С., Шибаев В. Н. Синтез олигосахаридов. В книге: Химия углеводов. Москва: Химия 1967, с. 458-474.
113. Бочков А. Ф., Афанасьев В. А., Заиков Г. Е. Гликозилирование защищенных производных с одним свободным гидроксилом. В книге: Образование и расщепление гликозидных связей. Москва: Наука 1978, с. 69-92.
114. Schmidt R. R. Synthesis of glycosides; in: Comprehensive Organic Synthesis, (Ed. Trost B. M.) Pergamon Press, Oxford, 1991, v. 6, p. 33-64.
115. Lis A. W., Passarge W. E. A direct synthesis of 9-2'(3')-0-ribofuranosyl-p-D-ribofuranosyljadenine. Physiol. Chem. Phys. 1, 1969, v. 14, p. 68-71.
116. Lichtenthaler F. W., Sanemitsu Y., Nohara T. Synthesis of 5'-<3-glycosyl-rz£o-nucleosides. -Angew. Chem. Int. Ed. Engl., 1978, v. 17, p. 772-774.
117. Eberhard W., Lichtenthaler F. W., Kahn K. A. Galactopyranosyl P-(l-3')-ribonucleosides. Structural evidence and synthesis. Nucleic Acids Res. Symp. Ser., 1981, №. 9, p. 15-19.
118. Kitahara K., Kraska В., Sanemitsu Y., Lichtenthaler F.W. Synthetic approaches to O-glycosyl-ribonucleosides, Nucleic Acids Res. Symp. Ser., 1975, N 1, p. 21-24.
119. Lichtenthaler F. W., Kitahara K., Riess W. iV-versus O-glycosylation of purine nucleosides. -Nucl. Acids Res., Special Publ.,. 1978, v. 4, p. 115-118.
120. Lichtenthaler F. W., Kitahara K. Ribose-glucose exchange in purine nucleosides. Angew. Chem. Int. Ed. Engl., 1975, v. 14, p. 815-816.
121. Lichtenthaler F. W., Eberhard W., Braun S. Assignment of glycosylation sites in O-hexopyranosyl-ribonucleosides by 13CNMR. Tetrahedron Lett., 1981, v. 22, p.4401-4404.
122. Arndt D., Hullsman W., Tschiersch B. Darstellung und Eigenschaften von Glycosiden mit zytotoxischen Aglykonen und Disacchariden im Zuckeranteil. Pharmazie, 1978, v. 33, p. 248-250.
123. Sato S-, Furuhata K., Itoh M., Shitori Y., Ogura H. Studies on sialic acids. XI. Synthesis of 2-O-glycosyl derivatives of vV-acetylneuraminic acid. Chem. Pharm. Bull., 1988, v. 36, p. 914-919.
124. Nakamura M., Fujita S., Ogura H. Synthesis of disaccharide nucleoside derivatives of 3-deoxy-D-gfycero-D-ga/acfo-2-nonulosonicacid (KDN). Chem. Pharm. Bull., 1993, v. 41, p. 21-25.
125. Bredereck H., Wagner A., Kuhn H., Ott H. Synthesen von Di- und Trisacchariden des Gentiobiosetyps. Chem. Ber., 1960, v. 93, p. 1201-1206.
126. Чкаников H. Д., Толкачев В. H., Преображенская М. Н. 5'-(9-Глюкопиранозиды тимидина и -2'-дезоксицитидина. Биоорг. хим., 1978, т. 4, с. 1620-16269.
127. Чкаников Н. Д., Преображенская М. Н. 5'-0-(Р-В-Глюкопиранозилуронат)-6-азауридин. Биоорг. хим., 1980, т. 6, с. 67-69.
128. Наппа N. В., Robins R. К., Revankar G. R. Synthesis of 5'-0-p-D-glucopyranosyl and 5'-0-P-D-galactopyranosyl derivatives of ribavirin. Carbohydr. Res., 1987, v. 165, p. 267-274.
129. Niewczyk A., Krzyzaniak A., Barciszewski J., Markiewicz W. T. Studies on the synthesis of O-ribozyl-adenozine a new minor nucleoside of tRNA. - Nucleosides & Nucleotides, 1991, v. 10, p. 635-638.
130. Mikhailov S. N., De Bruyn A., Herdewijn P. Synthesis and properties of 0-ribosyl-nucleosides. Nucleosides & Nucleotides, 1995, v. 14, p. 481-484.
131. Markiewicz W. Т., Niewczyk A., Gdaniec Z., Adamiak D. A., Dauter Z., Rypniewski W., Chmielewski M. Studies on synthesis and structure of 0-P-D-ribofuranosyl(r-2')ribonucleosides and oligonucleotides. Nucleosides & Nucleotides, 1998, v. 17, p. 411-424.
132. Markiewicz W. Т., Wiewiorowski M. Simultaneous protection of 3'- and 5'-hydroxyl groups of nucleoside. Nucl. Acid Chem., Improved and New Synthetic Procedures, and Techniques (Eds. Townsend L.B., Tipson R.S.), Wiley J., New York, 1986, part 3, p. 229.
133. Hanessian S., Banoub J. Preparation of 1,2-trans-glycosides in the presence of stannic chloride. Methods in Carbohydrate Chemistry, Academic Press, New York, 1980, p. 243.
134. Mikhailov S. N„ De Clercq E., Herdewijn P. Ribosylation of 2'-deoxynucleoside. -Nucleosides & Nucleotides, 1996, v. 15, p. 1323-1334.
135. Родионов А. А., Ефимцева E. В., Фомичева M. В., Падюкова Н. Ш, Михайлов С. Н. Дисахаридные нуклеозиды. Синтез пиримидиновых 5'-<9-Р-Б-рибофуранозилрибо- и 2'-дезоксирибонуклеозидов. Биоорган, химия, 1999, т. 25, № 3, с. 204-211.
136. Schmidt R. R. New method for the synthesis of glycosides and oligosaccharides. Are there alternatives to the Konigs-Knorr method? Angew. Chem. Int. Ed. Engl., 1986, v. 25, p. 212-235.
137. Knapp S., Gore V. K. Synthesis of the shimofuridin nucleoside disaccharide. J. Org. Chem., 1996, v. 61, p. 6744-6747.
138. Duynstee H. I., Wijsman E. R., van der Marel G. A., van Boom J. H. Synthesis of 2'-0-(4"-0-sorboil)-a-L-fucopyranosyl.inosine: a shimofuridin analogue. Synlett, 1996, p. 313-314.
139. Ning J., Kong F. Synthesis of 2'-<9-(4"-<9-stearoil)-a-L-facopyranosyl.thymydine: a shimofuridin analogue. Bioorg. Medic. Chem. Lett, 1997, v. 7. p. 2941-2944.
140. Hotoda H., Takahashi M., Tanzawa K., Takahashi S., Kaneko M. DP3 Receptor-ligand. 1: synthesis of adenophostin A. Tetrahedron Lett., 1995, v. 36, p. 5037-5040.
141. Van Straten N. C. R., van der Marel G. A., van Boom J. H. An expeditious route to the synthesis of adenophostin A. Tetrahedron Lett., 1996, v. 37, p. 3599-3602.
142. Van Straten N. C. R., van der Marel G, A., van Boom J. H. An expeditious route to the synthesis of adenophostin A. Tetrahedron, 1997, v. 53, p. 6509-6522.
143. Van Straten N. C. R., Kreik N. M. A. J., Cziria Z. A. C., van der Marel G. A., van Boom J. H. Synthesis of 3",4"-bisphosphate-containing analogs of adenophostin A. Tetrahedron, 1997, v. 53, p. 6539-6554.
144. Marwood R., Shuto S., Jenkins D., Potter B. Convergent synthesis of adenophostin A analogues via a base replacement strategy. Chem.Commun., 2000, p. 219-220.
145. Binder W. H., Kaehlig H., Schmid W. Galactosylation by use of (3-galactosidase: enzymatic syntheses of disaccharide nucleosides. Tetrahedron: Asymmetry, 1995, v. 6, p. 1703-1710.
146. Suzuki Y., Uchida K. Formation of beta-galactosyl compounds of arabinosylcytosine in growing culture of Sporobolomyces singularis. Biosci. Biotechnol. Biochem., 1994, v. 58, p. 639643.
147. Bhat V., Ugarkar B. G., Sayeed V. A., Grimm K., Kosora N., Domenico P. A., Stokcer E. A simple and convenient method for the selective vV-acylation of cytosine nucleoside, Nucleosides and Nucleotides, v. 8, p. 179-183, 1989.
148. Beigelman L. N., Mikhailov S. N. Transient protection in nucleoside synthesis using trityl groups: is it necessary to block hydroxyl groups? Carbohydr. Res. 1990 v. 203. p. 324-329.
149. Charubala R., Uhlmann E., Beiter A. H., Pfleiderer W. Nucleotides; ХХШ Synthesis of protected 2'-deoxyribonucleoside-3'-phosphotriesters containing the />-nitro-phenylethyl phosphate blocking group. Synthesis. 1984. p. 965-968.
150. Jones R. A. Preparation of protected deoxyribonucleosides In: Oligonucleotide synthesis. A practical approach. (Ed. Gait M. J.) IRL Press, Oxford, 1984, p. 23-34.
151. Kohli V., Blocker H., Koster H. The triphenylmethyl (trityl) group and its uses in nucleotide chemistry. Tetrahedron Lett. 1980, v. 21, p. 2683-2686.
152. Munson H. R. 5'-0-Tritylthymidine. Selective tritylation of a pyrimidine nucleoside. (Eds. Zorbah W. W., Tipson R. S.) Synthetic procedures in nucleic acid chemistry. Wiley-Interscience. New York. v. l.p. 321-322.
153. Ogilvie К. K. Nucleosides, nucleotides, and their biological applications. (Eds Rideout J. L., Henry D. W., Beacham L. M.). Academic Press. 1983. p. 209-256.
154. Oivanen M., Hovinen J., Lehikoinen P., Lonnberg H. Hydrolysis of the vV-glycosidic bond of nucleosides and nucleotides. Trends Org. Chem. 1993. v. 4. p. 397-412.
155. Михайлов С. H. Использование производных 2,3-изопропилиден-£>-рибофуранозы в синтезе нуклеозидов. Стереоселективное образование Р- и а-нуклеозидов. Биоорганическая химия, 1989, т. 15, с. 1522-1526.
156. Mikhailov S. N., Pfleiderer W. Nucleosides; XLI. A simple synthesis of pyrimidine nucleosides via direct glycosylation. Synthesis, 1985, p. 397-399.
157. Jeno T. 2',3'-Isopropylideneacetals of D-ribonucleosides. Intermediates in the preparation of 5'-substituted ribonucleosides. (Eds. Tipson R. S., Townsend L. В.). Nucleic Acid Chemistry, Part two. p. 765-769.
158. Rodionov A. A., Efimtseva E. V., Mikhailov S. N. Synthesis of 0-p-D-ribofuranosyl-(l"-2')-adenosine-5'-(9-phosphate. Nucleosides and Nucleotides. 1999. v. 18, p. 623-624.
159. Tener G. M. 2-Cyanoethyl phosphate and its use in the synthesis of phosphate esters. J. Am. Chem. Soc., 1961. v. 83. p. 159-168.
160. Danyluk S. S., Hruska, F. E. The effect of pH upon the nuclear magnetic resonance spectra of nucleosides and nucleotides. Biochemistry. 1968. v. 7. p. 1038-1043.
161. Davies D. В., Danyluk S. S. Nuclear magnetic resonance studies of 5'-ribo- and deoxyribonucleotide structures in solution. Biochemistry. 1974. v. 13. p. 4417-4434.
162. Himmelsbach F., Charubala R., Pfleiderer W. The (2-/?-nitrophenylethyl)phosphorochloridate, a new versatile phosphorylating agent in nucleotide chemistry. Helvetica Chim. Acta. 1987. v. 70. p. 1286-1295.
163. Hirao I., Koizumi M., Ishido Y., Andrus A. l,l,3,3-Tetraisopropyl-3-(2-(triphenylmethoxy)ethoxy)disiloxane-l-yl group, a potential 5'-0-protecting group for solid-phase RNA synthesis. Tetrahedron Lett. 1998. v. 39. p. 2989-2992.
164. Damha M. J., Ogilvie К. K. Oligoribonucleotide Synthesis. In Protocols for Oligonucleotides and Analogs; Methods in Molecular Biology, v. 20 (Ed. Agrawal S.); Humana Press Inc., Totowa, NJ. 1993, p. 81-114.
- Родионов, Андрей Александрович
- кандидата химических наук
- Москва, 2001
- ВАК 03.00.03
- Оценка влияния противотурбулентных присадок на гидравлическую эффективность нефтепродуктопроводов
- Особенности регуляции биосинтеза полигидроксибутирата у Methylobacterium extorquens
- Экологически безопасные методы получения сульфидов металлов в среде жидких алканов
- Участие синтеза ДНК в формировании и поддержании долговременной памяти у цыплят
- Образование 8-оксигуаниловых нуклеотидов под действием φ-радиации и влияние 80окси-GTP на синтез олигонуклеотидов в РНК-полимеразной реакции