Бесплатный автореферат и диссертация по биологии на тему

Биоразнообразие покоящихся форм микроорганизмов

ВАК РФ 03.00.07, Микробиология

Содержание диссертации, кандидата биологических наук, Дорошенко, Елена Владимировна

ВВЕДЕНИЕ.

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Состояние покоя у микроорганизмов (метаболическая активность)

1.1.1. Типы покоя: пролиферативный и метаболический.

1.1.2. Механизмы развития состояния покоя.

1.1.3. Механизмы превращения метаболически покоящихся форм (образование, прорастание).

1.2. Типы покоящихся форм микроорганизмов

1.2.1. Специализированные покоящиеся формы.

1.2.2. Покоящиеся формы неспорообразующих бактерий (ЖНК, УМБ, НБ).

1.2.3. Цистоподобные рефрактерные клетки микроорганизмов.

1.3. А^тсюег^'лягтая образования покоящихся форм микроорганизмов.

1.4. Метастабильность фенотипа и основные механизмы ее реализации у микроорганизмов

1.4.1. Понятие.

1.4.2. Особенности Я^-М-типа диссоциации.

1.4.3. Молекулярные и генетические основы диссоциации бактерий.

ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ

ГЛАВА 2. ОБЪЕКТЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ

2.1. Объекты исследования.

2.2. Получение покоящихся форм бактерий.

2.3. Микробиологические методы.

2.4. Биохимические методы анализа.

2.5. Генетические методы.

2.6. Статистическая обработка.

ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ

3.1. Внутривидовой полиморфизм покоящихся клеток бактерий Bacillus cereus.

3.2. Внутрипопуляционное разнообразие фенотипов у бактерий Bacillus cereus.

3.2.1. Колониально-морфологические характеристики диссоциантов Bacillus cereus.

3.2.2. Физиолого-биохимические характеристики диссоциантов Bacillus cereus.

3.2.3. Сопряженность естественной изменчивости с типом покоящихся форм Bacillus cereus.

3.3. Образование покоящихся форм диссоциантами Bacillus cereus в условиях репрессии спорообразования и их фенотипическая вариабельность

3.3.1. Влияние среды на развитие и стабильность диссоциантов Bacillus cereus в условиях депрессии спорообразования.

Введение Диссертация по биологии, на тему "Биоразнообразие покоящихся форм микроорганизмов"

Актуальность проблемы. Проблема адаптации организмов к изменяющимся условиям является одной из центральных в биологии. Наибольшей приспособляемостью к флуктуациям окружающей среды обладают микроорганизмы. К эволюционно выработанным и наследственно закрепленным механизмам сохранения вида в неблагоприятных для роста условиях окружающей среды относят способность микроорганизмов образовывать покоящиеся формы (ПФ), различающиеся способами образования, морфологией клеток, параметрами покоя. К настоящему времени наиболее изучено разнообразие морфотипов покоящихся форм, коррелирующее с таксономической принадлежностью бактерий: эндоспоры у бацилл, конидии у актиномицетов, цисты у азотобактера и др. Другой уровень разнообразия покоящихся форм, значительно менее изученный - их внутривидовой полиморфизм, когда различающиеся морфотипы ПФ образуются адаптивно к конкретным условиям развития культуры. Например, у бацилл - эндоспоры [Sussman & Halvorson, 1966] и цистоподобные рефрактерные клетки [Мулюкин с соавт., 1996]; у миксобактерий - миксоспоры [Dworkin & Gibson, 1964] и периферийные клетки [Kim et.al, 1992]; у стрептомицетов - эк-зоспоры и эндоспоры [Калакуцкий, Агре, 1977; Stastna et.al., 1992]. Разные морфотипы покоящихся форм, как правило, отличаются по глубине метаболического покоя, что связано с различиями в структурной и биохимической организации клетки [.Калакуцкий, Агре, 1977; Беккер с соавт., 1987]. Наконец, биоразнообразие, ассоциированное с покоем, проявляется на стадии прорастания покоящихся форм, как развитие варианта (клона, серотипа - в зависимости от определяемых признаков), адаптивно к новым условиям. Интерес к проблеме внутрипопуляционной изменчивости микроорганизмов и возможностям ее контроля постоянен. Особенно он возрос в последние годы, поскольку обозначились новые подходы к изучению фенотипической изменчивости как генетического феномена, лежащего в основе таких явлений и процессов как изменение скорости микробных синтезов и трансформаций, вирулентность и персистенция патогенных и условно-патогенных бактерий, результативность симбиозов и замещение продуктивных вариантов промышленных штаммов. В появившихся в последние десятилетия экспериментальных работах анализируется причинность повышения фенотипической гетерогенности популяции в стационарной фазе роста, в стареющих и длительно хранящихся микробных культурах [Милъ-ко, Егоров, 1992; Стасишена с соавт., 1999; Rajeshwari & Sonti, 2000; Kelly et.al., 2001]. Согласно ряду гипотез, это связано с состоянием пролиферативно-го покоя клеток, с включением общего регулона стационарной фазы [Yildiz & Schoolnik, 1998; Suh et.al,, 1999; Andersson et.al, 1999] и действием сигнальных молекул, контролирующих переход клеток к состоянию покоя и экспрессию генов этой фазы [Beck von Bodman & Farrand., 1995; Parsek, Greenberg, 2000]. Среди внеклеточных ауторегуляторов микроорганизмов такими функциями могут обладать аутоиндукторы анабиоза (факторы di) - алкилоксибензолы [Элъ-Регистан, 1988; Батраков с соавт., 1993; Мулюкин с соавт., 1996], плотност-ные сенсоры ("quorum sensing") - ацилированные лактоны гомосерина (ГСЛ) [Fukua et.al., 1994; Person et.al., 1995;], а также внеклеточные метаболиты, описанные по биологическому действию культуральных жидкостей, но пока с не установленной структурой [.Rowbury, 1998, 1999].

Исходя из изложенного, исследование разнообразия форм покоя и ассоциированной с ними фенотипической изменчивости представляется актуальным. Решение таких вопросов как описание и характеристика новых морфоти-пов покоящихся форм, методов их хранения и реанимации; оценка потенциального спектра колониально-морфологических вариантов, реализуемых при прорастании ПФ; регуляция диссоциативных переходов и разработка подходов к стабилизации диссоциантов бактерий имеет важное значение для микробиологии, медицины и биотехнологии.

Цель работы - изучение альтернативных морфотипов покоящихся форм бактерий Bacillus cereus, вариабельности фенотипов, которые реализуются при их прорастании, и выяснение роли в регуляции этих процессов факторов d] и d2.

Задачи исследований: 1) анализ разнообразия морфотипов покоящихся форм В. cereus, образующихся в различных условиях развития культур, в том числе, в богатых средах, репрессирующих эндоспорообразование; 2) исследование фенотипической диссоциации В.cereus, реализующейся при прорастании покоящихся форм различных морфотипов; характеристика полученных колониально-морфологических вариантов; выявление зависимости между морфоти-пом покоящихся клеток и диссоциативной способностью бактерий; 3) оценка роли факторов d! и d2 - алкилоксибензолов (АОБ) и свободных ненасыщенных жирных кислот (СНЖК), соответственно, в регуляции вариабельности бактериальной популяции и стабильности фенотипов; 4) изучение возможных механизмов действия АОБ в процессах фенотипической изменчивости бактериальных культур.

Научная новизна. (1) Впервые проведен анализ разнообразия покоящихся форм бактерий В. cereus, образующихся в циклах развития культур в различающихся условиях их роста. При развитии культур В. cereus в богатых средах обнаружено образование кокковидных цистоподобных покоящихся клеток (ЦПК). (2) Установлена зависимость степени фенотипической диссоциации бактериальных популяций от морфотипа покоящихся форм, из которых развивается культура. (3) Обнаружено, что диссоциативная способность бактериальных культур контролируется концентрационным уровнем ауторегуляторных факторов dj и d2. Определены диапазоны концентраций факторов dj и d2,

T-V т-т-V т 1-ГТ Лттттт Q ттг» »^Т Tt Г Д> АТТ ЛтгтТТ П ТТТТ /-» Л /Л ГТТТЛ ТТТ t~\ "Г"» U /1 ЛТЛ/14 / fl ТТ TT-V^ Л ТТ л ТТ iTT/-v ТТТТТ О Т Т О ТТ^Л О 7") ujin^ix^/jJ^jdv^ п.<х wviwiij tjjwjawj.jriij.a iwis и. иагаи^ kl НапрсШления диссоциативных переходов. (4) Впервые в опытах in vitro с ферментами показана способность АОБ к образованию комплексов с белками, что приводит к изменению конформации и функциональной активности макромолекул, в том числе, возможно, вовлеченных в регуляторные механизмы диссоциации на уровне образования транскриптов. (5) Впервые показано, что некоторые гомологи АОБ обладают слабой мутагенной активностью, что позволяет рассматривать их как эндогенные мутагены, которые могут инициировать обратимые пе7 рестройки генетического материала, обуславливающие диссоциативные переходы фенотипов.

Практическая ценность работы. Полученные в работе результаты могут быть использованы: (1) для совершенствования методов хранения коллекционных культур и промышленных штаммов микроорганизмов; (2) для быстрого получения широкого спектра диссоциантов микроорганизмов с целью селекции вариантов с требуемыми характеристиками; (3) для повышения эффективности экологического и санитарно-эпидемиологического мониторинга окружающей среды за счет учета внутривидового фенотипического разнообразия микроорганизмов и различий в физиологической активности фенотипов.

Заключение Диссертация по теме "Микробиология", Дорошенко, Елена Владимировна

выводы

1. Проведен сравнительный анализ биоразнообразия морфотипов покоящихся форм В.сегеш, образующихся в циклах развития культур бактерий при различающихся условиях роста. При развитии культур В. сегеш на богатых средах обнаружено образование кокковидных цистоподобных клеток (ЦПК), которые по совокупности необходимых и достаточных признаков могут быть отнесены к покоящимся формам микроорганизмов.

2. Установлена корреляция между морфотипом покоящихся форм и степенью диссоциации бактериальных популяций, которая реализуется при прорастании ПФ и возрастает в ряду: эндоспоры - кокковидные цистоподобные клетки - цистоподобные рефрактерные клетки. Показано, что диссоцианты В. сегеш различаются колониально-морфологическими признаками, физиологическими и биохимическими характеристиками.

3. Обнаружено, что диссоциативная способность бактериальных культур контролируется ауторегуляторными факторами с1] и с12. Установлены диапазоны концентраций ауторегуляторов, влияющие на смену фенотипа диссоциантов В. сегеш и определяющие направления диссоциативных переходов.

4. Изучены возможные механизмы действия алкилоксибензолов (факторов Ф) в процессах фенотипической диссоциации бактерий. Обнаружено, что алки-локсибензолы в результате их комплексообразования с белками способны изменять конформацию и функциональную активность макромолекул, возможно, вовлеченных в регуляцию диссоциативных переходов на уровне образования транскриптов. Показано, что алкилоксибензолы обладают слабой мутагенной активностью, что позволяет рассматривать их как эндогенные мутагены, которые могут инициировать обратимые перестройки генетического материала, обуславливающие диссоциативные переходы фенотипов.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

В выполненной работе предложено рассматривать существование трех уровней разнообразия покоящихся форм (ПФ) бактерий: (1) разнообразие мор-фотипов ПФ, жестко коррелирующее с таксономической принадлежностью бактерий; (2) внутривидовой полиморфизм ПФ, когда различающиеся морфо-типы образуются адаптивно конкретным условиям развития культуры; (3) внутрипопуляционное разнообразие фенотипов, сохраняемое в покоящихся формах и реализуемое при их прорастании, как развитие варианта (клона, серо-типа - в зависимости от определяемых признаков), адаптивного к новым условиям. Эти положения, принятые при планировании исследований были доказаны в настоящей работе.

Мы установили, что один и тот же штамм бактерий обладает определенным биоразнообразием морфотипов покоящихся форм. У Bacillus cerens это эндоспоры, цистоподобные рефрактерные клетки и впервые описанные нами цис-топодобные покоящиеся клетки. Данные формы - ЦПК, альтернативны эндоспорам и цистоподобным рефрактерным клеткам и отличаются от них формой, размерами, ультраструктурной организацией, а также менее выраженной устойчивостью к температурным воздействиям. Преимущественное образование того или иного типа покоящихся форм зависит от условий роста микробной культуры. Подчеркнем, что в условиях самых разнообразных дисбалансов по источникам питательных веществ и энергии, циклы развития культур всегда заканчивались образованием покоящихся форм в количестве, достаточном для репродукции популяции.

При рассеве цистоподобных покоящихся форм была обнаружена высокая степень гетерогенности популяции, реализуемой через расщепление популяции на клоны, различающимися по ряду колониально-морфологических и физиоло-го-биохимических характеристик. Нами было показано, что степень диссоциации не только существенно различается в популяциях вегетативных и покоящихся клеток, но в высокой степени зависит от того, в виде покоящихся форм какого типа переживает культура. Процентное содержание минорных вариантов возрастало в ряду: эндоспоры - цистоподобные покоящиеся клетки (ЦПК) -анабиотические цистоподобные рефрактерные клетки (ЦРК), образующиеся в цикле развития В. cereus - ЦРК, полученные при действии нативного ауторегу-ляторного фактора dj (выделенного из В.cereus). Доля минорных вариантов была всегда выше при рассеве покоящихся форм, чем пролиферирующих клеток. Различия в диссоциативной способности у разных типов анабиотических покоящихся форм являются, по-видимому, следствием различий в механизмах их образования. Так, формирование эндоспор, характеризовавшихся наибольшей стабильностью фенотипа, в отличие от образования ЦРК, сопровождается существенными изменениями морфологии клетки, особенно поверхностных культур, в процессах цитодифференцировки, а так же реорганизацией в упаковке генетического материала. Это, возможно, уменьшает вероятность рекомбина-ционных перестроек генома, обуславливающих смену фенотипа. Общей закономерностью вариабельности микробных культур в проводимых нами исследованиях, была нестабильность (вариабельность) фенотипа в процессе образования покоящихся форм (до 14 суток). При хранении культур тенденция к диссоциации снижалась. Стабильность фенотипа ПФ зависела от состава сред, в которых они образовывались. Жесткая стандартизация условий определения спектра диссоциации изучаемых бактериальных популяций позволяет говорить об эффекте индукции диссоциативной способности бактерий, а не о селекции всегда имеющихся в небольшом проценте в микробной культуре клеток с альтернативным фенотипом.

Результаты, полученные при изучении популяционной вариабельности основного объекта исследований Bacillus cereus, и показавшие сопряженность интенсивности диссоциации культуры на фенотипы с типом покоящихся форм, были подтверждены при работе с другими бактериями: Bacillus subtilis, штамм 720 (ВКМ), Staphylococcus aureus. Наличие метастабильности фенотипа у вышеописанных микроорганизмах позволяет рассматривать это свойство как один из общих способов адаптации микроорганизмов к условиям окружения. Следует отметить, что реализация диссоциативной способности как доминантного фенотипа, так и отдельных вариантов происходит через стадию покоя клеток, которая регулируется уровнем аутоиндукторов анабиоза. Этот факт подчеркивает безусловную важность фундаментальных исследований, связанных с выяснением зависимости между формами покоя и физиологическими механизмами устойчивости микроорганизмов и метастабильностью фенотипа у микроорганизмов. В практическом аспекте выводы из этих работ предполагают возможность направленной регуляции популяционной вариабельности.

Согласно современным представлениям популяционная вариабельность бактерий обусловлена процессами внутригеномной рекомбинации генетического материала клетки [Прозоров, 2001]. Однако, неясно, что индуцирует эти генетические перестройки, которые можно отнести к мутационным изменениям особого типа, возникающим с высокой частотой (10"2—10"4 на клеточную генерацию), спонтанным и высоко ревертабельным. Полученные нами данные акцентируют внимание на той роли, которую играют микробные ауторегуляторы анабиоза (алкилоксибензолы) в метастабильности вида, а также на сопряженности обоих контролируемых АОБ процессов: развития и поддержания покоя и фенотипической диссоциации микробной популяции. В ходе наших исследований показано, что диссоциация вариантов В. сегеш зависела от концентрации и баланса ауторегуляторных факторов ё! и ё2 в среде роста. Было установлено существование определенных закономерностей в диссоциативных переходах между клонами при изменении баланса факторов с\\1&2 в споровых суспензиях (инокуляте), за счет искусственного внесения факторов ё] или ё2. Различающаяся концентрационно эффективность действия фактора <¿1 или ё2 на эндоспоры бактерий разных вариантов, приводящая к изменению стабильности фенотипа, может быть обусловлена различиями в строении споровых рецепторов, существенных для инициации ростовых процессов.

При выяснении возможных механизмов действия АОБ как регулятора процессов фенотипической диссоциации мы остановились на двух вариантах. Первый - это непосредственное взаимодействие АОБ с ДНК, выявляемое как мутагенный эффект этих ауторегуляторов и продемонстрированное нами в тесте Эймса. Показанные мутагенные свойства АОБ, по-видимому, должны учитываться при объяснении как механизмов диссоциации в популяциях прорастающих покоящихся форм, а также такого явления как возрастная изменчивость микроорганизмов. Увеличение удельной доли минорных вариантов (фенотипов) в развивающихся культурах микроорганизмов с максимумом их в стационарной фазе (пролиферативно покоящиеся клетки) было впервые описано Красильниковым Н.А. при наблюдении за стрептомицетами [Красилъников, 1954] и затем подтверждалось другими авторами для микроорганизмов разных таксонов. Мы полагаем, что отмеченные в данной работе возрастные изменения в проявлении популяционной вариабельности микроорганизмов, у B.cereus, могут быть обусловлены закономерным возрастанием в развивающихся культурах микроорганизмов концентрации факторов d] (АОБ) [Светличный с соавт., 1986; Мулюкин с соавт., 1996], обладающих функциями аутоингибиторов роста и мутагенной активностью. Дальнейшее повышение концентрации АОБ в развивающихся микробных популяциях с максимальным их накоплением в покоящихся формах бактерий, как показано нами, сопряжено со сменой фенотипов бактерий: у Bacillus cereus - Д<->М<->П<->Б; у Bacillus subtilis - Д<->С<->П, у Staphylococcus aureus - D«-»G, Salmonella typhymurium - S<->R. Возможно, пороговые количества АОБ (гомолога с мутагенной активностью), накапливающихся в естественных условиях в стареющей культуре микроорганизмов, индуцируют адаптивные перестройки генетического материала (мутации), необходимые для развития группы клеток с измененной экспрессией генов (другой фенотип) и более адекватными реакциями на изменившиеся условия. Наследственная закрепленность таких мутаций предполагается высоким процентом реверсий к исходному фенотипу и является одним из механизмов стабилизации и

135 сохранения вида в пределах нормы его реакций на изменения окружающих условий.

Другой возможный механизм действия АОБ в регуляции фенотипической диссоциации бактерий основан на их действием как химических шаперонов. Нами было показано, в модельных экспериментах in vitro с ферментами, что алкилоксибензолы (факторы dj), обладают свойствами низкомолекулярных модификаторов конформации белка, что обеспечивает регуляцию функциональной активности. Можно предположить аналогичную функцию факторов d] в отношении таких белков как РНК-полимераза, а-факторы, что контролируюет смену доминантного фенотипа альтернативными вариантами на уровне транс-криптов, за счет изменения специфичности регуляторных белков к определенным промоторам.

Таким образом, в условиях неблагоприятных для роста стратегия выживания микроорганизмов обеспечивается образованием покоящихся форм, морфо-тип которых определяется трофическими факторами среды. При прорастании покоящихся форм в новом цикле развития микробных культур реализуется диссоциативная способность популяций. И тот, и другой процессы контролируются, в том числе, уровнем ауторегуляторных факторов dj и d2.

Библиография Диссертация по биологии, кандидата биологических наук, Дорошенко, Елена Владимировна, Москва

1. Андрюшечкина A.B., Николаева Л.П. Особенности обмена фосфорсодержащих соединений у S- и R-форм некоторых видов микроорганизмов // Микробиология. 1962. Т. 31. № 4. С. 643-645.

2. Ануфриев Л.Ф. К вопросу о диссоциации в культуре В. thuringiensis var.dendrolimus в жидких и твердых среды среды. В кн. Биология микроорганизмов и их использование в народном хозяйстве. Иркутск. 1979. С. 118-121.

3. Айсина Р.Б., Казанская Н.Ф. Лукашева Е.В., Березин И.В. Получение и свойства микрокапсулированного а-химотрипсина // Биохимия. 1976. Т. 41. №9. С.1656-1661.

4. Бабынин Э.В., Гизатуллин Ф.Ш. Анализ зависимости частоты возникновения His+- реверсий у Salmonella typhimurium от плотности клеточной популяции // Генетика. 1997. Т. 33. № 9. С. 1215-1220.

5. Бабусенко Е.С., Элъ-Регистан Г.И., Градова Н.Б., Козлова А.Н., Осипов Г.А. Исследование мембранотропных ауторегуляторных факторов метанокисляющих бактерий // Успехи химии. 1991. Т. 60. Вып. 11. С. 23622373.

6. Батраков С.Г., Элъ-Регистан Г.И., Придачина H.H., Ненашева В.А., Козлова А.Н., Грязнова М.Н., Золотарева КН. Тиразол ауторегуляторный фактор di дрожжей Saccharomyces cerevisiae II Микробиология. 1993. T. 62. Вып. 4. С. 633-638.

7. Бахматова И.В., Жарикова Г.Г. Физиолого-биохимические особенности вариантов Bacillus subtilis, образующих амилазу // Микробиология. 1978. Т. XLVII. Вып. 5. С. 893-899.

8. Беккер М.Е., А.И. Раппопорт, Калакуцкий и др. Торможение жизнедеятельности клеток // Рига: 1987. С. 240.

9. Ю.Беляков В.Д., Каминский Г.Д., Каминская С.Г. Гипотеза направленной самоперестройки популяции микроорганизмов и ее общебиологическое значение // Журн. микробиол., эпидемиол. и иммунобиол. 1985. № 1. С. 93100.

10. Вайнштейн М.Б., Кудряъиова Е.Б. О наннобактериях // Микробиология. 2000. Т. 69. №2. С. 163-174.

11. Гальченко В.Ф. Метанотрофные бактерии. М.: ГЕОС. 2001. С.56.

12. Головлев Е.Л. Метастабильность фенотипа у бактерий // Микробиология. 1998. Т. 67. №2. С. 149-155.

13. Головлев Е.Л. О старых проблемах новой систематики бактерий // Микробиология. 1998. Т. 67. № 2. С. 281-286.

14. Головлев Е.Л. Другое состояние неспорообразующих бактерий // Микробиология. 1998. Т. 67. № 6. С. 525-535.

15. П. Головлев Е.Л. Введение в биологию стационарной фазы бактерий // Микробиология. 1999. Т. 68. № 5. С. 623-631.

16. ХЪ.Горленко В.М., Kennen О.И., Пучков А.Н. Морфологическая дифференциация несерных пурпурных бактерий II Микробиология. 1976. Т. 47. Вып. 5. С. 817-823.

17. Епифанова О.И. Лекции о клеточном цикле. М.: КМК Scientific Press. 1997. С. 144.

18. Жарикова Т.В. Биология Bacillus brevis var G.-B.M.: Изд-во МГУ. 1968. С.191.

19. Жилина Т.Н., Турова Т.П., Кузнецов Б.Б., Кострикина H.A., Лысенко A.M. Osenia sivashensis sp. noy. новая умеренно галофильная анаэробная бактерия из лагун Сиваша//Микробиология. 1999. Т. 68. № 4. С. 519-527.

20. Ильинская О.Н., Колпаков А.И., Мулюкин А.Л., Дрейр Ф., Элъ-Регистан Г.И. Влияние мембраноактивных микробных ауторегуляторов на рост культуры ras-трансформированных фибробластов // Прикл. биохимия и микробиология. 2000. Т. 62. № 5. С. 475-480.

21. Калакуцкий Л.В., Агре Н.С. Развитие актиномицетов. М.: Наука. 1977. С. 285.

22. Карманенко Н.М., Казанцева О.Ф. Колориметрический метод определения Сахаров в растительном материале // Агрохимия. 1986. Вып. 1. С. 107-110.

23. Коновалова Е.Ю., Элъ-Регистан Г.И, Бабьева И.П. Динамика и накопление ауторегуляторных факторов dj и d2 дрожжами Rhodosporidium toruloides II Биотехнология. 1985. № 3. С. 71-74.

24. КотыкА., ЯнычекК. Мембранный транспорт. М.: Мир. 1980. С.82-114.

25. Красшъников H.A. Микроорганизмы и плодородие почв // Изв. АН СССР, сер. биол. 1954. №2. С. 14-39.

26. Кузнецов БД. Спонтанная изменчивость актиномицетов продуцентов антибиотиков и стабилизация их биосинтетической активности и таксономических свойств / Док. дис. ИНМИ РАН. 1974.

27. Максимов В.Н., Милъко Е.С., Ильиных И.А. Влияние углеродного, азотного и фосфорного питания на рост R-, S- и М-диссоциантов Pseudomonas aeruginosa II Микробиология. 1999. Т. 68. № .4. С. 206-210.

28. Марголин А.Л., Шрстюк С.Ф., Изумрудов В.А., Швядас В.Ю., Зезин А.Б., Кабанов В.А. Фазовые превращения в растворах полиэлектролитовых комплексов как модель спорообразования // Докл. АН СССР. 1983. Т. 272. №1. С. 230-233.

29. Медицинская микробиология. М.: ГЕОТАР Медицина. 1998. С. 344-416.

30. Милъко Е.С., Ботвинко ИВ., Степанова Р.А., Егоров Н.С. Сравнительное изучение химического состава и некоторых свойств полисахаридов капсул М-, S-, R-вариантов Mycobacterium lacticolum II Микробиология. 1983. Т. 52. № 3. С. 388-391.

31. Милъко Е.С. Егоров Н.С. Гетерогенность популяции бактерий и процесс диссоциации. М.: Изд-во МГУ. 1991. с. 143.

32. Мулюкин А.Л., Козлова А.Н., Капрелъянц А.С., Элъ-Регистан Г.И. Обнаружение и изучение динамики накопления ауторегуляторного фактора dj в культуральной жидкости и клетках Micrococcus luteus II Микробиология. 1996. Т. 65. Вып. 1.С. 20-25.

33. Мулюкин А.Л., Луста К.А., Грязнова М.Н., Козлова А.Н., Дужа М.В., Дуда В.И, Элъ-Регистан Г.И. Образование покоящихся форм Bacillus cereus и Micrococcus luteus //Микробиология. 1996. Т. 65. № 6. С. 782-789.

34. Мулюкин А.Л., Луста К.А., Грязнова М.Н., Бабусенко Е.С., Козлова А.Н., Дужа М.В., Митюшина Л.А., Дуда В.И., Элъ-Регистан Г.И. Образование покоящихся форм в автолизирующихся суспензиях // Микробиология. 1996. Т. 66. № 1. С. 42-49.

35. Ненашев Е.А., Придачина Н.Н., Элъ-Регистан Г.И., Золотарева И.Н., Батраков С.Г. Действие ауторегуляторов анабиоза некоторых микроорганизмов на дыхание митохондрий печени крысы // Биохимия. 1994. Т. 59. Вып. 1. С. 1511-1515.

36. Николаев Ю.А. Участие экзометаболитов в адаптации Escherichia coli к стрессам // Микробиология. 1997. Т. 66. № 1. С. 38-41.

37. Осипов Г.А., Элъ-Регистан Г.И., Светличный В.А., Козлова А.Н., Дуда В.И., Капрелъянц A.C., Помазанов В.В. О химической природе ауторегуляторного фактора d Pseudomonas carboxydoflava 11 Микробиология. 1985. Т. 54. Вып. 2. С. 186-190.

38. Прозоров A.A. Поглощение ДНК бактериальной клеткой: естественный процесс и лаборатоные приемы // Генетика. 1998. Т. 34. №5. С. 581-592.

39. Прозоров A.A. Рекомбинантные перестройки генома бактерий, и адаптация к среде обитания // Микробиология. 2001. Т. 70. № 5. С.581-594.

40. Романова А.К, Емнова Е.Е. Метаболизм водородных бактерий и его регуляция факторами окружающей среды // Успехи микробиологии. 1980. Вып. 15. С. 23.

41. Светличный В.А., Романова А.К, Элъ-Регистан Г.И. Изучение содержания мембраноактивных ауторегуляторов при литоавтотрофном росте Pseudomonas carboxydoflava // Микробиология. 1986. Т. 55. Вып. 1. С. 55-59.

42. Стасишина Т.Н., Могильная O.A., Волова ТТ., Гусейнов O.A., Калачева Г.С., Медведева С.Е., Плотников В. Ф., Франк Л.А. Исследование гетерогенности в культуре водородных бактерий Alcaligenes eutrophus // Микробиология. 1999. Т. 68. №2 . С. 198-205.

43. Страховская М.Г., Иванова Е.В., Фрайкин Г.Я. Стимулирующее влияние серотонина на рост дрожжей Candida guillermondii и бактерии Streptococcus faecalis //Микробиология. 1993. Т. 62. Вых. 1. С. 46-49.

44. Ткаченко А.Г., Чудиное A.A. Обмен полиаминами между клеткой и средой как один из факторов, определяющих развитие культур Escherichia coli II Микробиология. 1989. Т. 58. Вып. 4. С. 584-590.

45. Торгуноеа А.И. Туберкулез. Руководство по микробиологической диагностике инфекционных болезней. М.: 1973. С. 239-249.

46. Феофилова Е.П., Терешина В.М., Меморская A.C., Хохлова Н.С. О различных механизмах биохимической адаптации мицелиальных грибов к температурному стрессу: изменения в составе липидов // Микробиология. 2000. Т.69. №5.С.612.

47. Филиппова С.Н., Кузнецов В.В., Бадяутдинов Д.Н., Рысков А.П. Изучение внутрипопуляционных спонтанных морфологических вариантов Streptomyces oligocarbophilus ISPS 5589 // Микробиология. 1999. Т. 68. № 3. С. 375-382.

48. Хохлов A.C. Низкомолекулярные микробные ауторегуляторы. М.: Наука. 1988. С. 271.

49. Шеховцев В.П., Жарикова Г.Г. Электронно-микроскопическое изучение расположения клеток в колониях бактерий // Биол. Науки. 1984. № 3. С. 9397.

50. Шолъц К.Ф., Островский Д.Н. Ячейка для амперометрического определения кислорода// Методы современной биохимии. М.: Наука. 1975. С.52-58.

51. Элъ-Регистан Г.И. Роль мембранотропных ауторегуляторных факторов в процессах роста и развития микроорганизмов // Док. дис. ИНМИ РАН. 1988.

52. Элъ-Регистан Г.И., Дуда В.И., Светличный В.А., Козлова А.Н., Типисева И.А. Динамика ауторегуляторных факторов d в периодических культурах Pseudomonas carboxydoflava и Bacillus cereus II Микробиология. 1983. Т. 52. Вып. 2. С. 238-243.

53. Alexander E., Pham D., Steck T.R. The viable-but-nonculturable condition is induced by copper in Agrobacterium tumefaciens and Rhizobium leguminosarum II Appl. Environ. Microbiol. 1999. V. 65. № 8. P. 3754-3756.

54. Alper S., DuncanndL., LosickR. An adenosine nucleotide switch controlling the activity of a cell type-specific transcription factor in B. subtilis I I Cell. 1994. V. 77. P. 195-206.

55. Alper, S., Dufour A., Garsin D.A., Duncan L., Losick R. Role of adenosine nucleotides in the regulation of a stress-response transcription factor in Bacillus subtilis//. Mol. Biol. 1996. V. 165-177

56. Azam. T.A., Iwata A., Nishimura A., Ueda S., Ishihama A. Growth phase-dependent variation in protein composition of the Escherichia coli nucleoid // J. Bacteriol. 1999. V. 181. № 20. P. 6361-6370.

57. Barer M.R., Gribbon L.T., Harwood., Nwoguh C.E. Viable but non-culturable hypothesis and medical bacteriology // Rev. Med. Microbiol. 1998. V. 4. P. 183191.

58. Barrete W.C., Hannum D.M., Wheeler W.D., Hurst J.K. Viability and metabolic capability are maintained by Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa and Streptococcus lactis at very low adenylate energy charge // J. Bacteriol. 1988. V. 170. P. 3655-3659.

59. Beck von Bodman S., Farrand S.K. Capsular polysaccharide biosynthesis and pathogenicity in Erwinia stewartii require induction by an N-acylhomoserine lactone autoinducer // J. Bacteriol. 1995. V. 177. №17. P. 5000-5008.

60. Biebl H., Schwab-Hanisch //., Sproer C., Lunsdorf H. Propionispora vibrioides, nov. gen., nov. sp., a new gram-negative, spore-forming anaerobe that ferments sugar alcohols // Arch. Microbiol.2000. V. 174. P. 239-247

61. Bjorklund M., Ciftcioglu N., Kajander E.O. Extraordinary survival of nanobacteria under extreme conditions // SRIE Proceedings. 1998. V. 3441. P. 123-129.

62. Bogosian G., Sammons L.E., Morris P.J.L., O'Neil J.P., Heitkamp M.A., Weber D.B. Death of the Escherihia coli K-12 stain W3110 in soil and water // Appl. and Environ. Microbiol. 1996. V. 62. № 11. P. 4114-4120.

63. Bohringer J., Fischer D., Mosler G., Hengge-Aronis R. UDP-glucose is a1. S Spotential intracellular signal molecule in the control of expression of a and a dependent genes in Escherichia coli // J. Bacterid. 1995. V. 177. P. 413-422.

64. Brauns LA., Hudson M.C., Oliver J.D. User of polymerase chain reaction in detection of culturable and non culturable Vibrio vulnificus cells // Appl. Environ. Microbiol. 1991. V. 57. № 9. P. 2651-2655.

65. Caro A., Got P., Lesne J., Binard S., Baleux B. Viability and virulence of experimentally stressed nonculturable Salmonella typhimurium II Appl. Environ. Microbiol. 1999. V. 65. №7. P. 3229-3232.

66. Cashel M., RuddK.E. The stringent response //Escherichia coli and Salmonella typhimurium / Eds. Neidhardt F.C. et.al. Washington D.C.: Amer. Soc. Microbiol. 1996. P. 1410-1438.

67. Chancey S.T., Wood D.W., Pierson L.S. Two-component transcriptional regulation of N-Acyl-homoserin lacton production in Pseudomonas aureofaciens II Appl. and Environ. Microbiol. 1999. V.65. № 6. P.2294-2299.

68. Ciftcioglu N., Bjorklund M., Kajander E.O. Stone formation and calcification by nanobacteria in the human body // SPIE Proceedings. 1998. V. 3441. P. 105-111.

69. Claverys J.P., Prudhomme M., Mortier-Barriere L, Martin B. Adaptation to the environment: Streptococcus pneumoniae, a paradigm for recombination-mediated genetic plasticity? //Mol. Microbiol. 2000. V. 35(2). P. 251-259.

70. Colwell R.R. Viable but noculturable bacteria: survival strategy // J. Infect. Chemother. 2000. V.6. P. 121-225.

71. Cronan J. E. Evidence that incorporation of exogenous fatty acids into the phospholipids of Escherichia coli does not require acyl carrier protein // J. Bacteriol. 1984. V. 159. P. 773-775.

72. Donelli G., Matarrese P., Fiorentini C., Dainelli B., Taraborelli T., Di Campli E., Di Bartolomeo S., Cellini L. The effect of oxygen on the growth and cell morphology of Helicobacter pylori II FEMS Microbiol. Lett. 1998. V. 168. P. 915.

73. Driks A. Bacillus subtilis spore coat // Microbiol, and Mol. Biol. Rev. 1999. V. 63. №1. P.1-20.

74. Dukan.S., Levi. Y., Tonati D. Recovery of culturability of an HOCl-stressed population of Escherichia coli after incubation in phosphate buffer: resuscitation or regrowth ? // Appl. Environ. Microbiol. 1997. V. 63. №11. P. 4204-4209.

75. Dunny G.M., Leonard B.A.B. Cell-cell communication in grampositive bacteria // Annu. Rev. Microbiol. 1997. V. 51. P. 527-564.

76. Dworkin M.,Gibson S.M. A system for studying microbial morphogenesis: rapid formation of microcysts in Myxococcus xanthus II Science. 1964. V.146. P.243-245.

77. Elion E.A. Routing MAP kinase cascades // Scince. 1998. V.281. №5383. P.1625-1626.

78. Eze M.O., McElhaney R.N. The effect of alterations in the fluidity and phase state of the membrane lipids on the passive permeation and facilitated diffusion of glycerol in Escherichia coli 111. Gen. Microbiol. 1981. V. 124. P. 229-307.

79. Folk R.L., Lynch F.L. The possible role of nannobacteria (dwarf bacteria) in clay mineral diagenesis and the importance of careful sample preparation //J. Sed. Res. 1997. V.67. P. 597-603.

80. Foster P.L. Mechanisms of stationary phase mutation: a decade of adaptive mutation // Annu. Rev. Genet. 1999. V. 33. P. 57-88.

81. Fuqua W.C., Winans S.C., and Greenberg E.P. Quorum sensing in bacteria: the LuxR-LuxI family of cell density-responsive transcriptional regulators // J. Bacteriol. 1994. V. 176. №2. P. 269-275.

82. Gazotti P., Peterson S. W. Lipid requirement of membrane-bound enzymes // J. Bioenerg. Biomembr. 1977. V. 9. № 6. P. 373-386.

83. Gentry D. R., Hernandez V.J., Nguyen L. H., Jensen D. B., Cashel M.c t

84. Synthesis of the stationary-phase sigma factor a is positively regulated by ppGpp //J. Bacteriol. 1993. V. 175. P. 7982-7989.

85. Gerritsen L.J., de Raay G., Smits P.H. Characterization of form variants of Xenorhabdus luminescens II Appl. Environ. Microbiol. 1992. V. 58. №6. P. 19751979.

86. Gould G.W., Dring G.I. Role of an expanded cortex in resistance of bacterial endospores // Spores VI / Eds. Gerhardt P. Et. Al. Washington D.C.: Amer. Soc. Microbiol. 1975. P 541-546.

87. Grange J.M., Redmond W.B. Host-phage relationships in the genus Mycobacterium and their clinical sighificance // Tubercle. 1978. V. 59. № 3. P. 203-225.

88. Gray KM. Intercellular communication and group behavior in bacteria // Trends Microbiol. 1995. V. 5. №5. P.184-188.

89. Grey B.E., Steck T.R. The viable but nonculturable state of Ralstonia solanacearum may be involved in long-term survival and plant infection // Appl. and Environ. Microbiol. 2001. V.67. № 9. p.3866 3872.

90. Groman N.B. Evidance for the inducede nature of the change from nontoxigenicity to toxigenicity in Corynebacterium diphtheriae as a result of exposure to specific bacteriophage // J. Bacteriol. 1953. V. 66. № 2. P 184-191.112. Gronan, 1984

91. Hass R., Meyer T. The repertoire of silent pilus genes in Neisserial gonorrhoeae: evidence for gene conversion// Cell. 1986. V. 44. № 1. P. 107-115.

92. Hengge-Aronis R., Loewen P.C. The role of the sigma factor {sigma} S (KatF) in bacterial global regulation // Annu.Rev.Microbiol. 1994. V. 48. P.53-80.

93. Ho J., McCurdy H.D. Demonstration of positive chemotaxis to cyclic GMP and 5'-AMP in Myxococcus xanthus by means of a simple apparatus for generating practically stable concentration gradients // Can. J. Microbiol. 1979. V. 25. P. 1214-1220.

94. Hood M.A., Guckert J.B., White D. C., Deck F. Effect of nutrient deprivation on lipid, carbohydrate, DNA, RNA, and protein levels in Vibrio cholerae // Appl. Environ. Microbiol. 1986. V.52. №4. P. 788-793.

95. Huisman G. W., Kolter R. Sensing starvation: a homoserine lactone dependent signaling pathway in Escherichia coliU Scince. 1994. V. 265. P. 537-539.

96. Ihihama A. Adaptation of gene expression in stationary phase bacteria // Curr.Opin.Genet.Develop. 1997.V. 7. P. 582-588.

97. Iriarte M., Stainier I., Cornelis G.R. The rpoS gene from Yersinia enterocolitica and its influence on expression of virulence factors // Infect. Immun. 1995. V.63. P. 1840-1847.

98. Jeksbak L., Sogaard-Andersen L. The cell surface-associated intercellular C-signal induces behavioral changes in individual Myxococcus xanthus cells during fruiting body morphogenesis // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1999. V. 96. P. 50315036.

99. Jiang X., Chai T. Survival of Vibrio parahaemolyticus at low temperatures under starvation conditions and subsequent resuscitation of viable, nonculturable cells // Appl. Environ. Microbiol. 1996. V. 62. №.4. P. 1300-1305.

100. Jones B., Renaut R.W. Formation of silica oncoids around geysers and hot springs at El Tatio, northern Chile // Sedimentology. 1997.V.44. P. 287-304.

101. Joux F., Lebaron P., Trousseller M. Succession of cellular states in a Salmonella typhimurium population during starvation in artificial seawater microcosms //FEMS Microbiol. Ecol. 1997. V. 22. P. 65-76.

102. Julien B., Kaiser A.D., Garza A. Spatial control of cell differentiation in Myxococcus xanthus II Proc. Natl. Acad. Sci. 2000. V. 97. № 16. P. 9098-9103.

103. Kaiser D., Manoil C., Dworkin M. Myxobacteria: cell interaction, genetic and development // Annu. Rev. Microbiol. 1979. V. 33. P. 595 -628.

104. Kajander E.O., Kuronen I., Akerman K., Pelttari A., Ciftcioglu N. Nanobacteria from blood, the smallest culturable autonomously replicating agent on Earth // SPIE Proceedings. 1997. V. 3111. P. 420-428.

105. Kajander E.O., Bjorklund M, Ciftcioglu N. Mineralization by nanobacteria // SPIE Proceedings. 1998. V. 3441. P. 86-94.

106. Kaprelyants A.S., Gottschal J.C., Kell D.B. Dormancy in nonsporulating bacteria//FEMS Microbiol. Rev. 1993.V. 104. №3. P.2 71-286.

107. Kelly A. F., ParkS.F., Bovill R., Mackey B.M. Survival of Campylobacter jejuni during stationary phase: evidence for the absence of a phenotypic stationary-phase response // Appl. Environ. Microbiol. 2001. V. 67. № 5. P. 2248-2254.

108. Kim S.K., Kaiser D., Kuspa. Control of cell density and pattern by intercellular signaling in Myxococcus development // Annu. Rev. Microbiol. 1992. V. 46. P. 117-139.

109. Kjelleberg S., Hermansson M. Starvation-induced effects on bacterial surface characteristics //Appl. Environ. Microbiol. 1984. V.48. P. 497-503.

110. Rolling G.L., Matthews K.R. Examination of recovery in vitro and vivo of nonculturable Escherichia coli II Appl. and Environ. Microbiol. 2001. V.67. № 9. P.3928 3933.

111. Kozubek A. Resorcinol lipids, the natural non-isoprenoid phenolic amphiphiles and their biological activity // Chem. Rev. 1999. V.99. №1. P. 1-31.

112. Kuspa A., Plamann L., Kaiser L. Identification of he at-stable A-factor from Myxococcus xanthus II J. Bacteriol. 1992. V. 174. № 10. P. 3319-3326.

113. Lachica R. V., Zink D., Ferris W.R. Association of fibril structure formation with cell surface properties of Yersinia enterocolitica II Infec. and Immunol. 1984.V. 46. № l.P. 272-275.

114. Lange R., Hengge-Aronis R. Growth phase-regulated expression of bolA and• smorphology of Escherichia coli cells is controlled by the novel sigma factor, orpoS) // J. Bacteriol. 1991. V. 173. P.4474-4481.

115. Lange R., Hengge-Aronis R. Identification of a central regulator of stationary-phase gene expression in Escherichia coli// Mol. Microbiol. 1991. V. 5. P. 49-59.c

116. Lange R., Hengge-Aronis R. The cellular concentration of the o subunit of RNA polymerase in Escherichia coli is controlled at the levels of transcription, translation, and protein stability // Genes Dev. 1994. V.8. P.1600-1612.

117. Laue B.E., Gill R.E. Using a phase-locked mutant of Myxococcus xanthus to study the role of phase variation in development //J. Bacteriol. 1995. V. 177. № 14. P. 4089-4096.

118. Lazazzera B.A., Kurtser I.G., McQuade R.S., Grossman A.D. An autoregulatory circuit affecting peptide signaling in Bacillus subtilis II J. Bacteriol. 1999. V.181. №17. P. 5193-5200.

119. Leblond P., Denuyter Ph., Moutier L., Laakel N., Decaris B., Simonet J.N. Hipervariability, a new phenomenon of genetic instability, related to DNA amplification in Streptomyces ambofaciens // J. Bacteriol. 1989. V.171. №1. P.419-423.

120. Lenard J. Mammalian hormones in imicrobial cells // Trends Biochem. Sci. 1992. V.137. P.147-150.

121. Lleo M.M., Tafi M.C. Signoretto C., Cero C.D., Canepari P. Competitive polymerase chain reaction for quantification of nonculturable Enterococcus faecalis in lake water // FEMS Microbiology Ecology. 1999. V. 30. P. 345-353.

122. LloydD„ Biaginit G.A. Too much 02? // Microbiology. 1998. V.144. P.l 131.

123. Lewis J.C. Dormancy // The bacterial spores / Eds. Gould G.W., Hurst A. London: Academic Press. 1969. P. 301-352.

124. Losick R., Stragier P. Crisscross regulation of cell-type-specific gene expression during development in Bacillus subtilis // Nature. 1992. V. 355. P. 601-604.

125. Losick R., Kaiser D. Why and how bacteria communicate // Sci. Amer. 1997. Fel 73.

126. Lyte M. The role of microbial endocrinology in infection desease // J. Endocrinol. 1992. V.137. P.343-345.

127. MacDonnel M.T., Hood M.A. Isolation and characterization of ultramicrobacteria from a Gulf Coast estuary // Appl. Environ.Microbiol. 1982. V. 43. P. 566-571.

128. Maron .M., Ames B.N. Revised methods for the Salmonella mutagenicity test // Mut. Res. 1983. V.113. P.173-215.

129. Matin A. Molecular analysis of the starvation stress in Escherichia coli II FEMS Microbiol. Ecol. 1990. V. 74. P. 185-196.

130. Mamson M.D., Armitage J.D., Hoch J. A., Macnab R.M. Bacterial locomotion and signal transduction // J. Bacteriol. 1998. V. 180. № 5. P. 1009-1022.

131. Mizuguchi Y. Mycobacteriophages II The Mycobacteria. N.Y. 1984. P. 641662.

132. Mobile DNA / Eds. Berg D.E. et.al.Washington D.C.: Amer.Soc.Microbiol. 1989. P.972.

133. Moxon E., Rainey P., Nowak M., Lenski R. Adaptive evolution of highly mutable loci in pathogenic bacteria II Current Biol. 1994. V.4. №1. P.24 -33.

134. Moyer C.L., Morita R.Y. Effect of growth rate and starvation-survival on the viability and stability of a psychrophilic marine bacterium // Appl. Environ. Microbiol. 1989. V. 55. P. 1122-1127.

135. Muffler A., Fischer D., Hengge-Aronis R. The RNA-binding protein HF-I, known as a host factor for phage Qß RNA replication , is essential for rpoS translation in Escherichia coli // Genes Dev. 1996. V. 10. P.l 143-1151.

136. Mukamolova G.V., Kaprelyants A.S. Young D.I., Young M., Kell D.B. A bacterial cytokine // Proc. Natl. Acad. Sei. USA. 1998. V. 95. P. 8916-8921.

137. Murphy G., Connel T., Barrits D., Koomey M., Cannon J. Phase variation of gonococcal protein 2: regulation of gene expression by slipped-strand mispairing of a repetitive DNA sequence // Cell. 1989. V.56. №4. P. 539-547.

138. Nakano M.M., Ozawa K., Ogawara H. Mutation of secondary metabolism in Streptomycetes II J. Pharm. Dyn. 1981. V. 4. № 4. P. 51.

139. Nicholos J.M. & CarrN.G. Akinetes of cyanobacteria // Spores VII/ Eds. Chambliss G. & Vary J.C. Washington D.C.: Amer. Soc. Microbiol. 1978. P. 335343.

140. Nicholson W.L., Munakata N., Horneck G., Melosh H.J., Setlow P. Resistance of Bacillus endospores to extreme terrestrial and extraterrestrial environments I I Microbiol, and Mol. Biol. Rev. 2000. V. 64. № 3. P. 548-572.

141. Nicholson W. L., Fajardo-Cavazos P. DNA repair and the ultraviolet radiation resistance of bacterial spores: from the laboratory to the environment // Recent Res. Dev. Microbiol. 1997. V. 1. P. 125-140.

142. Nystrom T. The glucose-starvation stimulon of Escherichia coli induced and repressed synthesis of enzymes of central metabolic pathways and role of acetyl phosphate in gene-expression and starvation-survival // Mol. Microbiol. 1994. V.12. P. 833-843.

143. Nystrom T., Larsson C., Gustaffson L. Bacterial defense against aging: role of the Escherichia coli ArcA regulator in gene expression, readjusted energy flux and survival during stasis //EMBO J. 1996. V.15. P. 3219-3228.

144. Nystrom T. To be or not to be: the ultimate decision of the growth-arrested bacterial cell //FEMS Microbiol. Rev. 1998. V. 21. P. 283-290.

145. Oliver J.D., Bockian R. In vivo resuscitation, and virulence towards mice, of viable but nonculturable cells of Vibrio vulnificus II Appl. Environ. Microbiol. 1995. V.61. №7. P.2620-2623.

146. Pace J.L., Chai T., Rossi H.A., Jiang X. Effect of bile on Vibrio parahaemolyticus II Appl. and Environ. Microbiol. 1997. V.63. №6. P. 23722377.

147. Paidhungat M., Setlow P. Isolation and characterization of mutations in Bacillus subtilis ihat allow spore germination in the novel germinant D-alanine // J. Bacterid. 1999. V.181. №11. P.3341-3350.

148. Parsek M.R., Greenberg E.P. Acylhomoserine lactone quorum sensing in Gramnegative bacteria: A signaling mechanism involved in associations with higher organisms // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2000. V.97. №16. P. 8789-8793.

149. Pashin Iu.V., Bakhitova L.M., Bantkhen T.I. Experimental study of the antimutagenic proprties of 5-methylresorcinol // Biull. Eksp. Biol. Med. 1985. V.100. ISS7.P. 63-65.

150. Pedone V.A., Folk R.L. Formation of aragonite cement by nannobacteria in the Great Salt Lake // Utah. Geology. 1996. V. 24. P. 763-765.

151. Pierson L. S., Wood D. W., Pierson E. A. Homoserine lactone-mediated regulation in plant-associated bacteria // Annu. Rev. Phytopathol. 1998. V. 36. P.207-225

152. Perego M. A peptide Export-import control circuit modulating bacterial development regulates protein phosphatases of the phosphorelay // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1997. V. 94. № 16. P. 8612-8617.

153. Perry A., Nicolson I., Saunders J. Structural analysis of the pil E region of Neisseriae gonorrhoeae II Gene. 1987. V. 60. № l.P. 85-92.

154. Plasterk R., Simon M, Barbour A. Transposition of structural genes to an expression sequence on a plasmid cause antigenic in the bacterium Borrelia /zmrazz//Nature. 1985. V.318. №1315. P.257-263.

155. Pommepuy M., Butin M., Derrien M., Gourmelon M., Colwell R.R., Cormier M. Retention of enteropathogenicity by viable but nonculturable Escherichia coli exposed to seawater and sunlight // Appl. Environ. Microbiol. 1996. V.62. № 12. P.4621-4626.

156. Primm T.P., Andersen S.J., Mizrahi V., Avarbock D., Rubin H. Barry C.E. The stringent response of Mycobacterium tuberculosis is required for long-term survival //J . Bacteriol. 2000. V. 182. 17. P.4889-4898.

157. Rahman I., Shahamat M., Kirchman P.A., Rissek-Cohen E., Colwell R.R. Methionine uptake and cythopathogenicity of viable but nonculturable Shigella dysenteriae type 1 // Appl. Environ. Microbiol. 1994. V.60. №9. P.3573-3578.

158. Rajeshwari R., Sonti R.V. Stationary-phase variation due to transposition of novel insertion elements in Xanthomonas oryzae pv. oryzae // J. Bacteriol. 2000. V. 182. № 17. P. 2248-2254.

159. Ravel J., Knight I.T., Monahan C.E., Hill R.T., Colwell R. Temperature-induced recovery of Vibrio cholerae from the viable but nonculturable state: growth or resuscitation? // Microbiology. 1995. V. 141. P. 377-383.

160. Reusch R.N., Sadoff H.L. 5n-Alkylresorcinols from encysting Azotobacter vinelandii: isolation and characterization // J. Bacteriol. 1979. V.139. №2. P.448-453.

161. Revenchon S., Bouillant M.L., Salmond G., Nasser W. Integration of the quorum-sensing system in the regulatory networks controlling virulence factor synthesis in Erwinia chrysanthemii II Mol. Microbiol. 1998. V.29. P. 1407-1418.

162. Riesenman P. J., Nicholson W. L. Role of the spore coat layers in Bacillus subtilis resistance to hydrogen peroxide, artificial UV-C, UV-B and solar radiation. Appl. Environ. Microbiol. 2000. V. 66. P. 620-626.

163. Robertson B.D., Meyer T. Genetic variation in pathogenic bacteria // Trends in Genet. 1992. V. 8. № 12. P. 422-427.

164. Rosenbluh A., Rosenberg E. Autocide AMI rescues development in dsg mutants of Myxococcus xanthus //1989. J. Bacteriol. V. 171. P. 1513-1518

165. Roszak D.B., Colwell R.R. Survival strategies of bacteria in the natural environment // FEMS Microbiol. Rev. 1987. V.51. № 2. P.365-379.

166. Rowbury R. J. Acid tolerance induced by metabolites and secreted proteins, and how tolerance can be counteracted 11 Novartis Found. Symp. 1999. V. 221. P.93-106.

167. Rowbury R. J. Killed cultures of Escherichia coli can protect living organisms from acid stress //Microbiology. 2000. V. 146. P. 1759-1760

168. Samner J.B., Somers G.F. Laboratory experiments in biological chemistry. New York: Academic Press. 1944.

169. Sandermann H. Regulation of membrane enzymes by lipids // Biochim. Biophys. Acta. 1977. V.515. №3. P.209-237.

170. Sankawa U., Shimada H., Yamasaki K. Biosynthesis of 2-Hexyl-5propyl13 13resorcinal: biosynthetic incorporation of deuterium from 2- , 2-H 3 acetate // J.Chem. and Pharum Bull. 1981. V.29. №12. P.3601-3606.

171. Schut F., Gottschal J.C., Prins R.A. Isolation and characterisation of the marine ultramicrobacterium Sphingomonas sp. stain RB2256 // FEMS Microbiol. Rev. 1997. V. 20. P. 363-369.

172. Schweder T., Lee K.-K, Lomovskaya O., Matin A. Regulation of Escherichiaccoli starvation sigma factor a by ClpXP protease // J. Bacteriol. 1996. V.178. P.470-476.

173. Seifert H.S. Question about gonococcal pilus phase and antigenic variation // Mol. Microbiol. 1996. V.21. №3. P.433-440.

174. Setlow P., Primus G. Protein metabolism during germination of Bacillus megaterium spores. I. Protein synthesis and amino acid metabolism // J. Biol. Chem. 1975. V. 250. P. 623-630.

175. Setlow P. Mechanisms for the prevention of damage to DNA in spores of Bacillus species II Annu. Rev. Microbiol. 1995. V.49. P. 29-54.

176. Setlow B., Mcginnis K.A., Ragkousi K., Setlow P. Effects of major spore-specific DNA binding proteins on Bacillus subtilis sporulation and spore properties // J. Bacteriol. 2000. V. 182. № 24. P. 6906-6912.

177. Siegele D.A., KolterR. Life after log // J. Bacteriol. 1992. V.174. №2. P.345-348.

178. Signoretto C., Lleo M.M., Tafi M.C. Canepari P. Cell wall chemical composition of Enterococcus faecalis in the viable but nonculturable state // Appl. Environ. Microbiol. 2000. V.66. №5. P.1953-1959.

179. Signoretto C., Lleo M.M., Canepari P. Modification of the peptidoglycan of Escherichia coli in the viable but nonculturable state // Cur. Microbiol. 2002. V.44. P. 125-131.

180. Shimkets L.J., Dworkin M. Excreted adenosine is a cell density signal for the initiation of fruiting body formation in Myxococcus xanthus II Develop. Biol. 1981. V.84. P.51-60.

181. Shimkets L. J. Social and developmental biology of the Myxobacteria II Microbiol. Rev. 1990. V. 54. P. 473-501.

182. Slieman T.A., Nicholson W.L. Role of dipicolinic acid in survival of Bacillus subtilis spores exposed to artificial and solar UV radiation // Appl.and Environ. Microbiol. 2001. V. 67. № 3. P. 1274-1279.

183. Smith A.M., Guzman C.A., Walker M.J. The virulence factors of Bordetella pertussis: a matter of control // FEMS Microbiol. Rev. 2001. V.25. №3. P.309-333.

184. Stastna J., Goodfellow M., Kristufek V., Novotna J., Jirba J., Caslavska J., Kofronova O., Blumauerova M. Characteristics of Streptomyces globisporus Stain0234 forming endospores in submerged cultures // Folia Microbial. 1992. V.37. №2. P. 11-116.

185. Stern A., Meyer T. Commn mechanism controlling phase and antigen variation in pathogenic Neisseriae II Mol. Microbiol. 1987. V.l. P.5-12.

186. Stewart G.G., Eaton M.W., Johnstone K., Barrett M.D., Ellar D.F. An investigation of membrane fluidity changes during sporulation and germination of

187. Bacillus megaterium K.M. measured by electron spin and nuclear magnetic resonance spectroscopy // Biochim. Biophys. Acta. 1980. V. 600. P. 270-290.

188. Stragier P., Losick R. Molecular genetics of sporulation in Bacillus cereus II Annu. Rev. Genet. 1996. V. 30. P. 297-341.

189. Swanson J., Bergstrom S., Robbins K., Barrera O., Corwin D., Koomey J. Gene conversion involving the pilin structural gene correlates with pilus lilus changes in Neisseria gonorrhoeae I I Cell. 1986. V.47. №2. P. 267-276.

190. Su C.J., Sadoff H.L. Unique lipids in Azotobacter vinelandii cysts synthesis, distribution and fate during germination // J. Bacteriol. 1981. V.147. P. 80-90.

191. Suh S-J., Silo-Suh L., Woods D.E., Hassett D.J., West S. E.H., Ohman D.E. Effect of rpoS mutation on the stress response and expression of virulence factors inPseudomonas aeruginosa 111. Bacteriol. 1999. V.181. №13. P.3890-3897.

192. Summer J.B., Somers G.F. Laboratory experiments in biological chemistry. New York: Academic Press. 1944.

193. Sun Z., Zhang Y. Spent culture supernatant of Mycobacterium tuberculosis H37Ra improves viability of aged cultures of this strain and allows small inocula to initiate growth// J. Bacteriol. 1999. V. 181. 24. P. 7626-7628.

194. Sussman A.S., Southit H.A. Dormancy in microbial spores // Annu. Rev. Plant. Physiol. 1973. V.24. P.311-315.

195. Sussman A.S., Halvorson H.O. Spores. Their dormancy and germination. New York: Harper a. Row. 1966.-P.203.

196. Taylor B.L., Zhulinl.B. PAS domain: internal sensors of oxygen, redox potential and light // Microbiol, and Mol. Biol. Rev. 1999. V.63. №>2. P.479-506.

197. Tolozan J.L., Cappelier J.M., Tissier J.P., Delattre G., Federighi M. Physiological characterization of viable-but-nonculturable Campylobacter jejuni cells // Appl. and Environ. Microbiol. 1999. V.65. №3. P. 1110-1116.

198. Torkelson J., Harris R.S., Lombardo M.J., Nagendran J., Thulin C., Rosenberg S.M. Genome-wide hypermetation in a subpopulation of stationary-phase cells underlies recombination-dependent adaptive mutation // EMBO J. 1997. V. 16. P. 3303-3311.

199. Uchida L, Sekizaki T., Hashimoto K., Tarakado N. Association of the encapsulation Bacillus anthracis with a 60 megadalton plasmid // J. Gen. Microbiol. 1985. V. 131. № 2. P. 363-367.

200. Varon M., Cohen S., Rosenberg E Autocids produced by Myxococcus xanthus II J. Bacteriol. 1984. V.160. P. 1146-1150.

201. Vinter V, Stastna. Spores microorganisms XXI conversion of outgrrowing spores of Bacillus cereus to refractile forms by basic peptides and proteines // Folia Microbiol. 1967. V.12. №3. P.301-307.

202. Vinter V., Stastna., Caslavska J. Interference of some cations and basic compounds with the germinating and outgrowth of bacterial spores // Edt. Gould G.W. & Hurst A. Spores IV/Acad. Press. London-New York. 1969. P. 73-123.

203. Vinter V., Chaloupka J., Stastna J. Some characteristic of non-growing forms of Bacillus subtilis II J. Gen. Microbiol. 1984. V.130. № 7. P.19-28.

204. Vulic M., Kolter R. Evolutionary cheating in Escherichia coli stationary phase cultures // Genetics. 2001. V. 158. P. 519-526.

205. Watson S.P., Clements M.O., Foster S.J. Characterization of starvation-survival response of Staphylococcus aureus II J. Bacteriol. 1998. V. 180. № 7. P. 17501758.

206. Whiteley M., Lee K.M., Greenberg E.P. Identification of genes controlled by quorum sensing in Pseudomonas aeruginosa I I Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1999. V. 96. №24. P. 13904-13909.

207. Whitesides M.D., Oliver J.D. Resuscitation of Vibrio vilnificus from the viable but nonculturable state // Appl. Environ. Microbiol. 1997. V.63. №3. P. 10021005.

208. Wireman J. W., Dworkin M. Morphogenesis and developmental interactions in Myxobacteria II Science. 1975. V. 189. P. 516-523.

209. Wolf P. W., Oliver J.D. Temperature effects on the viable but non-culturable state of Vibrio vulnificus II FEMS Microbiol. Ecol. 1992. V.101. №1. P.33-39.

210. Yamashino T., Ueguchi C., Mizuno T. Quantitative control of the stationary phase-specific as, in Escherichia coli\ involvement of the nucleoid protein H-NS 11 EMBO J. 1995. V.14. P.594-602.

211. Zinser E.R., Kolter R. Mutations enhancing amino acid catabolism confer a growth advantage in stationary phase // J. Bacteriol. 1999. V. 181. № 18. P. 58005807.

212. Zhou Y., Gottesman S. Regulation of proteolysis of the stationary-phase sigma factor RpoS//J. Bacteriol. 1998. V. 180. №5. P. 1154-1158.