Бесплатный автореферат и диссертация по биологии на тему

Белок Р70, связывающий сателлитную ДНК in vitro: характеристика и локализация

ВАК РФ 03.00.25, Гистология, цитология, клеточная биология

Содержание диссертации, кандидата биологических наук, Енукашвили, Нателла Иосифовна

1. ВВЕДЕНИЕ.

1.1. Цели и задачи исследования.

1.2. Основные положения, выносимые на защиту.

2. ЛИТЕРАТУРНЫЙ ОБЗОР.

2.1. Тандемно организованные высокоповторяющиеся последовательности (сателлитные ДНК) человека и мыши.

2.1.1. История открытия.

2.1.2. Сателлитные ДНК человека.

2.1.2.1. СатДНКс простой последовательностью- сателлиты 1,2иЗ.

2.1.2.2. Альфоидная ДНК.

2.1.3. Сателлитные ДНК домовой мыши Mus musculus.

2.2. Организация и функции центромера и кинетохора млекопитающих.

2.3. Центромерные белки высших эукариот.

2.3.1. Конститутивные центромерные белки.

2.3.2. Транзитные центромерные белки.

2.4. Концепция ядерного матрикса.

2.5. Современные представления о функциях избыточной ДНК.

3. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ.

3.1.Биохимические методы.

3.1.1 .Плазмиды.

3.1.2.Выделение ядер и ядерного матрикса; экстракция белков ЯМ.

ЗЛ.З.Ионообменная хроматография.

3.1.4. Метод замедления в геле (ретардации).

3.1.5. Аффинная очистка ДНК-связывающих белков ядерного матрикса.

3.1.6. Диск-электрофорез и окрашивание гелей.

3.2. Иммунологические методы.

3.2.1. Иммуноблоттинг.

3.2.2. Получение антител: иммунизация и аффинная очистка.

3.2.3. Иммунопреципитация.

3.3. Цитологические методы.

3.3.1. Использованные объекты.

3.3.2. Непрямое иммунофлюоресцентное окрашивание.

3.3.3. Флуоресцентная гибридизация in situ (FISH) и HMMyHoFISH.

4. ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ.

4.1. Выявление ДНК-связывающей активности в препаратах ЯМ человека.

4.2. Специфичность связывания альфоидной ДНК с белками ЯМ человека.

4.3. Выявление ДНК-связывающей активности в препаратах ЯМ мыши.

4.4. Аффинная хроматография белков, входящих в состав LMP и НМР.

4.5. Получение антител к белкам LMP и НМР комплексов.

4.6. р70 в составе ядерного матрикса мыши.

4.7. Определение молекулярной массы белков, взаимодействующих с альфоидной ДНК, методом Саузвестерн-блоттинга.

4. 8. Получение аффинно очищенных антител к белку р70.

4.9. Сравнение р70 с известными белками матрикса и группы CENP.

4.9.1. Сравнение белка р70 с белками группы CENP.

4.9.2. Выявление в р70 общей антигенной детерминанты с белками ПФ.

4.9.4. Сравнение р70 с белком, связывающим сателлит 3 человека.

4.10. Локализация р70 в ядрах клеток человека и мыши.

4.10.1 Определение положения р70 по отношению к гетерохроматину.

4.10.2. Определение взаимного расположения р70 и ламинов.

4.10.3. Определение положения а-сателлитной ДНК и сателлита 3 (HS3) в клетках линий человека.

4.10.4. Определение положения р70 по отношению к альфоидной ДНК и ДНК сателлита 3 в клетках линий А431 человека.

4.10.5. Определение положения р70 по отношению к центромеру в клетках линии ЗТЗ мыши.

4.11. Локализация р70 на метафазных хромосомах мыши и человека.

5. ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ.

6. ВЫВОДЫ.

Введение Диссертация по биологии, на тему "Белок Р70, связывающий сателлитную ДНК in vitro: характеристика и локализация"

Размер генома возрастает на основных этапах эволюции. Однако, количество генов возрастает, по-видимому, только до уровня позвоночных. Количество кодирующей ДНК геноме человека не превышает 10% (Holmquist, 1989). Функции же избыточной, или некодирующей, ДНК практически не исследованы. Значительную часть некодирующей ДНК составляют повторяющиеся последовательности. Среди них выделяют рассеянные по геному (interspersed) повторы и тандемно организованные высокоповторяющиеся последовательности - сателлитные ДНК (сатДНК). История изучения сатДНК насчитывает более 30 лет, однако ее роль в функционировании генома до сих пор не ясна. Районы формирования конститутивного гетерохроматина - центромерные и прицентромерные участки хромосом являются основным местом локализации сателлитных ДНК. У высщих эукариот в центромерной области другие нуклеотидные последовательности, кроме сатДНК^ не обнаружены (Lee et al., 1997). Таким образом, сателлитные последовательности принимают участие в функционировании центромера как во время митоза, так и в интерфазный период.

Известно, что центромерные (CEN) и прицентромерные участки хромосом выполняют важные функции на протяжении всего клеточного цикла. Они обеспечивают корректное спаривание и сегрегацию хромосом в ходе как митотического, так и мейотического деления клетки. На основе центромеров происходит формирование кинетохора. Центромерные участки хромосом обеспечивают удержание сестринских хроматид вместе до начала анафазы митоза. В процессе ассоциации сестринских хроматид важную роль играют прицентромерные блоки сат ДНК. Показано что, центромеры принимают участие в регуляции клеточного цикла, регулируя наступление анафазы.

В интерфазный период центромерные (CEN) и прицентромерные районы хромосом участвуют в формировании 3-х мерной (3-D) организации хроматина (Manuelidis and Borden, 1988). Доказано, что формирование ядерных доменов является основным принципом 3-D организации ядра. Центромеры и прицентромерные участки хромосом принимают участие в формировании ряда ядерных доменов, таких как хромосомные территории и ядрышки. Показано участие центромеров в формировании хромоцентров у мыши и дрозофилы. По мнению ряда авторов, сформированный на основе центромерных и прицентромерных участков хромосом конститутивный гетерохроматин также может рассматриваться как один из ядерных доменов, обладающий сложной и динамичной организацией (Craig et al., 1999; Martou, de Boni, 2000).

Известно, что структура и состав ядерных доменов подвержены значительным изменениям в зависимости от степени дифференцировки и функционального состояния клетки. Характер распределения центромеров в ядре меняется в течение клеточного цикла (Ferguson, Ward, 1992). Увеличение экспресионной активности генома приводит к перемещению центромеров (Chon, De Boni, 1996). В активированных B-лимфоцитах мыши показано перемещение транскрипционно неактивных генов в область конститутивного центромерного гетерохроматина (Brown et al., 1999). Предполагают, что подобное перемещение является одним из механизмов индуцированного дифференцировкой ингибирования экспрессии. Центромерный хроматин является местом локализации многих белков, регулирующих уровень транскрипции путем изменения структуры хроматина. Таким образом, факт участия центромерных участков интерфазных хромосом в формировании архитектуры ядра, а также в регуляции транскрипционной активности генов^не вызывает сомнения. Однако, механизмы этих процессов еще только начинают исследоваться. Белки, ответственные за формирование ядерных доменов и, соответственно, за пространственную организации ядра, изучены пока очень слабо. Необходимо исследование структуры и белкового состава конститутивного гетерохроматина, сформированного на основе последовательностей сатДНК центромерных и прицентромерных участков хромосом.

Перемещение центромеров, реорганизация центромерного гетерохроматина, по данным некоторых авторов, происходит при участии скелетных белков ядра -белков ядерного матрикса (ЯМ). Малорастворимые в физиологических условиях белки матрикса участвуют своими разными доменами 6 сложных комплексах с РНК, ДНК и другими белками. Ассоциация центромеров с ЯМ в интерфазном ядре доказана (Не, Brinkley, 1996). Также показано обогащение остаточной ДНК ЯМ центромерными и прицентромерными последовательностями сателлитной ДНК. Мы предположили, что среди белков ЯМ присутствуют белки, способные распознавать сатДНК центромерных участков и прицентромерных участков хромосом. Взаимодействие центромерной и прицентромерной сателлитной ДНК с белками ЯМ должно быть необходимо для функционирования центромера в интерфазный период. Поиски таких белков до сих пор приводили к неоднозначным результатам. Причина неудач заключалась в том, что господствовавшая последнее время модель организации центромера предполагала наличие сиквенс-специфических белков, связывающих сатДНК. Однако не было выявлено ни определенной последовательности, ни сиквенс-специфического белка, которые необходимы и достаточны для выполнения функций центромера. Наиболее часто используемый подход - выявление центромер-локализованных белков с помощью сыворотки аутоиммунных больных и последующее изучение этих белков, имеет свои ограничения.

В настоящей работе использован другой подход для поиска белков, взаимодействующих с сатДНК. Изучение способности белков ЯМ взаимодействовать с сатДНК центромерных районов хромосом проводили с помощью метода ретардации в геле и, таким образом, подтвердили предположение о специфическом взаимодействии белков ЯМ с центромерными сатДНК in vitro.

Заключение Диссертация по теме "Гистология, цитология, клеточная биология", Енукашвили, Нателла Иосифовна

6. ВЫВОДЫ

1. Ядерный матрикс человека содержит белковый комплекс, специфически связывающий сатДНК in vitro. Белок р70 (70 кДа) является основным ДНК-связывающим белком данного комплекса.

2. Р70 не является уже известным белком из группы CENP и не относится к ламинам. Р70 обладает общей антигенной детерминантой с белками промежуточных филаментов. Р70 является белком описанным ранее, как связывающий сателлит 3 человека (HS3) и, вероятно, W-сатДНК птиц.

3. В интерфазных клетках культуры человека и мыши р70 локализован в непосредственной близости от прекинетохоров. При динамическом характере распределения р70 в ядре только в некоторых случаях наблюдается совпадение р70 с теми сатДНК, по специфическому связыванию с которыми он тестирован in vitro.

4. На препаратах ядерного матрикса in situ локализация р70 полностью совпадает с соответствующими сатДНК. Локализация р70 совпадает с областями околоядрышкового гетерохроматина в выделенных ядрах печени.

5. На метафазных пластинах р70 расположен в области центромера, а также является компонентом межхромосомной нити, соединяющей между собой хромосомы.

БЛАГОДАРНОСТИ

Автор искренне благодарен Ольге Игоревне Подгорной за предложенную тему и научное руководство. Автор также глубоко благодарен Ольге Владимировне Яровой, Андрею Петровичу Перевозчикову и оппоненту ведущего научного учреждения Елене Романовне Гагинской за любезное согласие оппонировать представленную их вниманию диссертацию. Хотелось бы поблагодарить администрацию Института цитологии РАН за предоставленные для работы условия.

Постоянное внимание и интерес, проявленные коллегами, также способствовали успешному завершению диссертационной работы. Особенно хотелось бы поблагодарить А.П. Воронина, А.Г. Урусова, М.Е. Урусову, Е.В. Асееву, Д.В. Творогова за ценные научные комментарии и И.Б. Лобова за терпеливую работу по обучению автора современным биохимическим и молекулярно-биологическим методам работы.

Библиография Диссертация по биологии, кандидата биологических наук, Енукашвили, Нателла Иосифовна, Санкт-Петербург

1. Барсукова А. С., Артеменко Е.Г., Калайдзидис А. Л., Зацепина О. В. 2001. Стабильность пространственной ассоциации прекинетохоров и хромоцентров в интерфазных клетках мыши. Цитология. 43(1): 46-51

2. Беридзе Т.Г. 1982. Сателлитная ДНК. М., Наука. 121 с.

3. Виноградов А.Е. 1999. Парадокс размера генома и проблема избыточной ДНК. Цитология. 41(1): 4-13.

4. Дин П., Джонсон У., Мидл Ф. 1988. Аффинная хроматография. Методы. М., Мир, с. 132

5. Енукашвили Н.И., Лобов И.Б., Подгорная О.И. 1999. Ядерный матрикс человека содержит белковый комплекс, специфически связывающий альфа-сателлитную ДНК in vitro. Биохимия. 64(4): 432-40.

6. Енукашвили Н.И1., Подгорная О.И. 2001. Белок ядерного матрикса мыши, специфически взаимодействующий с центромерной сателлитной ДНК. Цитология. 43(1): 52-60

7. Збарский И.Б., Дебов С.С. 1948. Белки клеточного ядра. Докл. АН СССР. 63:795-798.

8. Лобов И. Б., Митчелл А. Р., Подгорная О.И. 1998. Белок ядерного матрикса, специфически связывающий основной сателлит мыши. Молекуляр. Биол. 32(6): 893-898.

9. Лобов И. Б., Подгорная О. И. 1999. Роль белков ядерного матрикса в формировании гетерохроматина. Цитология. 41(7): 562-573.

10. Маниатис Т., Фрич Э., Сэмбрук Дж. 1984. Молекулярное клонирование., М., Мир.,479 с.

11. Марке В, Ворсанова С.Г, Ройзе Г., Юров Ю. 1999. Анализ вариаций альфоидной ДНК и размера кинетохора в хромосоме 21 человека. Цитология и генетика. 33(1): 25-31.

12. Марченко Б.Н., Подгорная О.И. 1998. Мутационный процесс в мини-сателлитах. Цитология. 40(5): 455-466

13. Полторацкий В.П., Деи Р., Белгрейдер Ф., Березней Р., Подгорная О. 1991. Белок, связанный с сателлитной ДНК, присутствует в препаратах ядерного матрикса клеток человека. Мол. Биол. 25(1): 83-90.

14. Прокофьева-Бельговская A.A. 1986. Гетерохроматические районы хромосом. Наука, Москва, с. 41

15. Разин C.B., Брандт Д., Разина М. В., Чернохвостое В.В. 1987. Прочно связанные с ДНК белки опосредуют прикрепление к ядерному скелету транскрипционно активной фракции ДНК. Мол. Биол. 21: 1276-1285.

16. Стикланд Ю. 1999. Получение зондов и их мечение. В кн. «Молекулярное клонирование. Методы», с. 329-372.

17. Ченцов Ю.С., Бураков В.В., Косых ММ. 2000. Белки ядерного матрикса переносятся в составе периферического материала митотических хромосом. Биол. Клет. Мембран. 13(6): 799-810

18. Яровая О.В., Разин C.B. 1983. Два типа участков прикрепления ДНК к ядерному скелету в клетках асцитной карциномы Эрлиха. Молекуляр. биология. 17:303-312.

19. Aaronson R.P., and Blobel G. 1975. Isolation of nuclear pore complexes in association with a lamina. Proc.Natl.Acad.Sci. USA. 72:1007-1011.

20. Allshire R. 1997. Centromeres, checkpoints and chromatids cohesion. Curr. Opin. Genet. Dev. 7: 264-273.

21. AndradeL.E.C., TanE. M. and ChanE.K.L. 1993. Immunocytochemical analysis of the coiled body in the cell cycle and during cell proliferation. Proc. Natl. Acad. Sci. 90: 1947-1951.

22. BaderBL, Magin TM, Freudenmann M, Stumpp S, and Franke WW, 1991. Intermediate filaments formed de novo from tail-less cytokeratins in the cytoplasm and in the nucleus. J Cell Biol. 115: 1293-1307

23. Bartholdi M. F. 1991. Nuclear distribution of centromeres during the cell cycle of human diploid fibroblasts. J. Cell Sci. 99: 255-263.

24. BelgraderP., SiegelA.J, Berezney R. 1991. A comprehensive study on the isolation and characterization of the Hela S3 nuclear matrix. J. Cell Sci. 98:281-291.

25. Berezney R., Mortillaro M.J., Ma H., and Samarabandu, J. 1995. The nuclear matrix: a structural milieu for genomic function. Int Rev of Cytol. 162A: 2-67.

26. Berezney R., and Coffey D.S. 1974. Identification of a nuclear protein matrix. Biochem. Biophys. Acta. 60: 1410-1417.

27. Berezney R., and Coffey D.S. 1975. Nuclear matrix: association with newly synthesized DNA. Science. 189: 291-293.

28. Bovery Th. 1909. Die Blastomerenkeme von Ascaris megalocephalaund die Theorie der Chromosomenindividualitat. Arch. Zellforsch. 3: 181-268

29. Bridge E, Xia D, Carmo-Fonseca M, Cardinali B, Lamond A, Pettersson U. 1995. Dynamic organization of splicing factors inadenovirus-infected cells. J. Virol. 69:281 -290.

30. Bridger J.M., KillLR., LichterP. 1998. Association of pKi-67 with satellite DNA of the human genome in early G1 cells. Chromosome Res. 6(1): 13-24

31. Britten R.G., and Kohne D.E. 1968. Repeated sequences in DNA. Science, 161:529-540.

32. BroersJ.L. V., machielsB., Eys G.J.J.M., KuijpersH.J.H., Manders E., van Driel R., and Ramaekers F.C. 1999. Dynamics of the nuclear lamina as monitored by GFP-tagged A-type lamins. J. Cell. Sci. 112: 3463-3475.

33. Brown K. E., Baxter J., GrafD., Merkenshlager M., and Fisher A. 1999. Dynamic repositioning of genes in the nucleus of lymphocytes preparing for cell division. Molecular Cell. 3: 207-217.

34. Brown K.E., GuestS., SmaleS., HahmK., Merkenschlager M., and Fisher A. 1997. Association of transcriptionally silent genes with Ikaros complexes at centromeric heterochromatin. Cell. 91: 845-854.

35. Bukvic N., Susca F., Gentile M., Tangari E., Ianniruberto A. 1996. An unusual dicentric Y chromosome with a functional centrmere with no detectable a-satellite. Hum. Genet. 97: 453-456.

36. Catasti P., Chen X., Mariappan S. V., Bradbury E.M., Gupta G. 1999. DNA repeats in the human genome. Genetica. 106(1-2): 15-36.

37. Cavalli G., andParo R. 1998. Chromo-domain proteins: linking chromatin structure to epigenetic regulation. Curr. Opin. Cell Biol. 10: 354-360.

38. Cerda M. C., Berrios S., Fernandez-Donozo R., Garagna S., Redi C. 1999. Organization of complex nuclear domains in somatic mouse cells. Biology of the Cell. 91: 55-65.

39. Chon V., De Boni U. 1996. Spatial repositioning of centromeric domains during regrowth of axons in nuclei of murine dorsal root ganglion neurons in vitro. J. Neurobiol. 31(3): 325-332.

40. Choo K. H. A. 1997. The Centromere, Oxford-NY-Tokio, Oxford University Press,403 p.

41. Choo K.H.A. Centromerization. 2000. Trends in Cell Biol. 10: 182-188.

42. Choo KH, Earle E, McQuillan C. 1990. A homologous subfamily of satellite III DNA on human chromosomes 14 and 22. Nucleic Acids Res 18:5641-5648.

43. Choo KHA, Earle E, Vissel B, Kalitsis P. 1992. A chromosome 14-specific human satellite III DNA subfamily that shows variable presence on different chromosomes 14. Am J Hum. Genet. 50:706-716.

44. Cooke C.A., HeckM.M.S., andEarnshaw W.C. 1987.The INCENP antigens: Movement from the inner centromere to the mid body during mitosis. J.Cell Biol. 105: 2053-2067.

45. Cooke H.J., HindleyJ. 1979. Cloning of human satellite III DNA: different components are on different chromosomes. Nucleic Acids Res. 6:3177-3197.

46. Cooper K.F., Fisher R.B., and Tyler-Smith C. 1993. Structure and sequences adjacent to the centromeric alphoid satellite DNA array on the human Y chromosome. J. Mol. Biol. 230: 787-799.

47. Corneo G, GinelliE, PolliE. 1967. A satellite DNA isolated from human tissues. J Mol Biol 23:619-622.

48. Corneo G, Ginelli E, Polli E. 1970. Repeated sequences in human DNA. J Mol Biol 48:319-327

49. Craig J.M., Earnshaw W.C., VagnarelliP. 1999. Mammalian centromeres: DNA sequence, protein composition, and role in cell cycle progression. Exp. Cell. Res. 246: 249-262.

50. De Boni U. 1994. The interphase nucleus as a dynamic structure. IntRev Cytol 150: 149-171.

51. Deininger PL, Jolly DJ, Rubin CM, Friedmann T, Schmid CW. 1981. Base sequence studies of 300 nucleotide renatured repeated human DNA clones. J Mol Biol 151:17-33

52. Dietzel S., Schiebel K., Little G., Edelman P., Rappold G., Eils R., Cremer C., and Cremer T. 1999. The 3-D positioning of ANT2 and ANT3 Genes within female X chromosome territories correlates with gene activity. Exp. Cell. Res. 252: 363-375.

53. Doolittle W.F., Sapienza C. 1980. Selfish genes, the phenotype paradigm and genome evolution. Nature. 284: 601-603.

54. DozortsevD., ColemanM.S., NagyP., DiamondM., ErmilovA., Weier U., Liyanage M., Reid T. 2000. Nucleoli in a pronuclei stage mouse embryo are represented by major satellite DNA of interconnecting chromosomes. Fertil. Steril. 73: 366-371.

55. Earnshaw W.C., and Rothfield N. 1985. Identification of a family of human centromere proteins using autoimmune sera from patients with scleroderma. Chromosoma 91:313-321.

56. Earnshaw WC, Sullivan KF, Machlin PS, Cooke CA, Kaizer DA, Pollard TD, RothfieldNF. and ClevelandDW, 1987. Molecular cloning of cDNA for CENP-B, the major human centromere autoantigen. J Cell 'Biol 104: 817-829.

57. Earnshow JVC, Ratrie H, and Stetten G, 1989. Visualization of centromere proteins CENP-B and CENP-C on a stable dicentric chromosome in cytological spreads. Chromosoma 98: 1-12.

58. Enukashvily N. I., KukalevA. S., Podgornaya O. I. The protein of 70 kD related to intermediate filaments is involved in centromere attachment to the nuclear matrix.// Mol. Biol. Cell (Suppl). 1999. V 10. P. 287a

59. Everett R.D., Earnshaw W.C, PlutaA.F., SternsdorfT., Ainsztein A.M, Carmena M., Ruchaud S., Hsu W-L., and OrrA. 1999a. A dynamic connection between centromeres and ND10 proteins. J. Cell. Sci. 112(20): 3443-3454.

60. Everett RD, Earnshaw WC, Findlay J, LomonteP. 1999b. Specific destruction of kinetochore protein CENP-C and disruption of cell division by herpes simplex virus immediate-early protein Vmwl 10. EMBO J. 18(6): 1526-1538.

61. Fakan S. Perichromatin fibrils are in situ forms of nascent ranscripts. Trends Cell Biol. 1994. 4: 86-90.

62. Fakan S., and Puvion E. 1980. The ultrastructural visualization of nucleolar and extranucleolar RNA synthesis and distribution. Int. Rev. Cytol. 65: 255-299.

63. Ferguson M, and Ward DC. 1992. Cell cycle dependent chromosomal movement in pre-mitotic human T-lymphocyte nuclei. Chromosoma 101: 557-565.

64. Fey E.G., Krochmalnic G., andPennman S. 1986. The nonchromativ substructures of the nucleus: the ribonucleoprotein matrices analyzed by sequential fractionation and resinless section electron microscopy. J. Cell. Biol. 102: 1654-1665.

65. Figueroa J., Saffrich R., Ansorge W., and Valdivia M. 1998. Microinjection of antibodies to centromere protein CENP-A arrests cells in interphase but does not prevent mitosis. Chromosoma. 107: 397-405.

66. Fisher D.Z., ChaudharyN., andBlobel G. 1986. cDNA sequencing of nuclear lamins A and C reveals primary and secondary structural homology to intermediate filament proteins. Proc. Natl. Acad. Sci.USA. 83: 6450-6454.

67. FowlerK.J., Hudson D., Salamonsen L.A., Edmonson S., Earle E., Sibson M.C., and Choo K.H.A. 2000. Uterine disfunction and genetic modifiers in centromere protein B-defi-cientmice. Genome Res. 10(1): 30-41.

68. Frommer M., Paul C., Vincent P.C. 1988. Localisation of satellite DNA sequences on human metaphase chromosomes using bromodeoxyuridine-labelled probes. Chromosoma 97:11-18

69. Frommer M, ProsserJ, TkachukD, ReisnerAH, Vincent PC. (1982) Simple repeated sequences in human satellite DNA. Nucleic Acids Res 10:547-563.

70. FuX.-D., andManiatis T. 1990. Factor required for mammalian spliceosome assembly is localized to discrete regions in the nucleus. Nature. 343: 437-441.

71. Fukagawa T, Pendon C, Morris J, Brown W. 1999. CENP-C is necessary but not sufficient to induce formation of a functional centromere. EMBO J. 18(15): 4196-4209.

72. Gaff C, du Sart D, Kalitsis P, Ianello R, Nagy A, and Choo KH, 1994. A novel nuclear protein binds centromeric alpha satellite DNA. Hum Mol Genet 3: 711-716.

73. GallegoJ., GoldenE.B., Stanley D., andReidB.R. 1999. The folding of centromeric DNA strands into intercalated structures: A physicochemical and computational study. J. Mol. Biol. 285:1039-1052.

74. Geisler N., Kaufmann E., Fisher S., Plessmann U., and Weber K. 1983. Neurofilament architecture combines structural principles of intermediate filaments with carboxy-terminal extensions increasing in size between triplet proteins. EMBO J. 2: 1295-1302.

75. Georgiev G.P., Chentsov J.S. 1962. On the structural organization ofnucleolo-chro-mosomal ribonucleoproteins. Exp.Cell. Res. 27: 570-572.

76. Gimelli G., Zuffardi 0., Giglio S., Zeng C., and He D. 2000. CENP-G in neocentromeres and inactive centromeres. Chromosoma. Online publication (25 May 2000), DOI 10.1007/s004120000082.

77. GisselssonD., HifglundM., MertensF., MandahlN. 1999. Variable stability of chromosomes containing amplified a-satellite sequences in human mesenchymal tumours. Chromosoma. 108: 271-277.

78. Goldberg I. G., SawhneyH., PlutaA.F., Warburton P.E., Earnshaw W.C. 1996. Surprising deficiency of CENP-B binding sites in African green monkey alpha-satellite DNA: implications for CENP-B function at centromeres. Mol Cell Biol Sep. 16(9):5156-68

79. Gondos B., Westergaard L., Byskov A.G. 1986. Initiation of oogenesis in the human fetal ovary: ultrastructural and squash preparation study. Am. J. Obstet. Ginecol. 155(1): 189-195.

80. Gosden J.R, Mitchell A.R, BucklandR.A., Clayton R.P., Evans H.J. 1975. The location of four human satellite DNAs on human chromosomes. Exp Cell Res 92:148-158.

81. Grady,D.L., Ratliff,R.L., Robinson,D.L., McCanlies,E.C., MeyneJ., andMoyzis,R.K. (1992). Highly conserved repetitive DNA sequences are present at human centromeres. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89:1695-1699.

82. Gruenbaum Y., Wilson C., Harel A., GolbergM., and Cohen M. 2000. Review: Nuclear lamins structural proteins with fundamentals functions. J. Struct. Biol. 129:313-323.

83. Gruss P., and Sauter G. 1975. Repetitive primate DNA containing the recognition sequences for two restriction endonucleases which generate cohesive ends. FEBS Lett 60:85-88.

84. HaafT., and Ward D. C. 1994. Structural analysis of a-satellite DNA and centromere proteins using extended chromatin and chromosomes. Hum. Mol. Genet. 3(5): 697-709.

85. HaafT., and WardD.C. 1996. Inhibition of RNA polimerase II transcription causes chromatin decondensation, loss of nucleolar structure, and dispersion of chromosomal domains. Exp. Cell res. 224: 163-173.

86. HaafT., Schmid M. 1991. Chromosome topology in mammalian interphase nuclei. Exp Cell Res 192: 325-332.

87. Halverson D, Baum M, Stryker J, Carbon J, Clarke L. A centromere DNA-binding protein from fission yeast affects chromosome segregation and has homology to human CENP-B. J. Cell. Biol., 1997,136:487-500.

88. HancockR. 2000. A new look at the nuclear matrix. Chromosoma. 109: 219-225.

89. HarataM., Ouchi, K., Ohata S., KikuchiA., MizunoH. 1988. Purification and characterization of W-protein, a DNA-binding protein showing high affinity for the W-chromo-some specific repetitive DNA sequences of chicken. J. Biol. Chem. 263: 13952-13961.

90. He D., Brinkley B. R. 1996. Structure and dynamic organization of centromeres/prekinetochores in the nucleus of mammalian cells. J. Cell. Sci. 109: 2693-2704.

91. HeD., ZengC., Woods K., ZhongL., Turner D., BuschR. K., Brinkley B. R. BuschH. 1998. CENP-G: a new centromeric protein that is associated with the alpha-1 satellite DNA subfamily. Chromosoma. 107: 189-197

92. Hendzel M., Boisvert F-M., Bazett-Jones D.P. 1999. Direct visualization of a protein nuclear architecture. Mol. Cell. Biol. 10: 2051-2062.

93. Hennig W. 1999. Heterochromatin. Chromosoma. 108: 1-9.

94. Hibino Y., Nakamura K., Tsukada S., Sugano N. 1993. Purification and characterization of nuclear scaffold proteins, which bind to a highly repetitive bent DNA from rat liver. Biochim. biophys. acta. 1174: 162-170.

95. Higgins M.J., WangH., Shtromas I., Haliotis T., Roder J.C., Holden J.J.A., White B.N. 1985. Organization of a repetitive human 1.8 kb Kpnl sequence localized in the heterochromatin of chromosome 15. Chromosoma 93:77-86

96. Holmquist G.P. 1989. Evolution of chromosome bands: molecular ecology of non-coding DNA. J. Mol. Evol. 28: 469-486.

97. Howman, E. V., FowlerK.J., NewsonA.J., RedwardS., MacDonaldA.C., KalitsisP., Choo K.H. 2000. Early disruption of centromeric chromatin organization in centromere protein A (Cenpa) null mice. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 97: 1148-1153

98. HozakP., Sasseville A.M.J., Raymond Y., and CookP.R. 1995. Lamin proteins form an internal nucleoskeleton as well as a peripheral lamina in human cells. J. Cell Sci.108: 635-644.

99. Hsu T.S. 1975. A possible function of constitutive heterochromatin: the bodyguard hypothesis. Genetics. 79, suppl 2: 137-150.

100. Jabs E. W., WolfS.F., and Migeon B.R. 1984. Characterization of a cloned DNA sequence that is present at centromeres of all human autosomes and the X chromosome and shows polimorphic variation. Proc. Natl Acad. Sci. USA. 81: 4884-4888.

101. Jackson D.A., and Cook P.R. 1986. Replication occurs at a nucleoskeleton. EMBO J. 7: 3667-3677.

102. Jagatheesan G., S. Thanumalayan, Bh. Muralikrishna, Nandini Rangaraj, Anjali A. Karande, and Veena K. Parnaik. 1999. Colocalization of intranuclear lamin foci with RNA splicing factors. J. Cell Sci. 112: 4651-4661.

103. James T.C, Elgin S.C.R. 1986. Identification of a nonhistone chromosomal protein associated with heterochromatin in Drosophila melanogaster and its gene. Mol. Cell Biol. 6: 3862-3872.

104. Janevski J., Park P. C., and deBoni U. 1997. Changes in Morphology and spatial position of coiled bodies during NGF-induced neuronal differentiation of PC 12 cells. J. Histochem. Cytochem. 45(11): 1523-1531.

105. Janevsky J., Park P. C., De Boni U. 1995. Organisation of centromeric domains in hepatocyte nuclei: rearrangements associated with de novo activation of the vitellogenin gene family in Xenopus laevis. Exp. Cell. Res. 217: 227-239.

106. Joseph A., Mitchell A., Miller O. 1989. The organization of the mouse satellite DNA at centromeres. Exp. Cell. Res. 183: 494-500.

107. KalitsisP, EarleE, VisselB, Shaffer LG, Choo KHA. 1993. A chromosome 13-spe-cific human satellite I DNA subfamily with minor presence on chromosome 21: further studies on Robert- sonian translocations. Genomics 16:104-112

108. Kalitsis P, Fowler KJ, Earle E, Hill J, Choo KH. 1998. Targeted disruption of mouse centromere protein C gene leads to mitotic disarray and early embryo death. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 95: 1136-1141.

109. Kaplan F.S., Murray J., Sylvester J.E., Gonzales I.L., O'Connor P., Doering J.L., Muenke M., Emanuel B.S., ZaslojfM.A. 1993. The topographic organization of repetitive DNA in the human nucleolus. Genomics. 15: 123-132.

110. Kapoor M., de Oca Luna R.M., Liu G., Lozano G., Cummings C., Mancini M., Ouspenski /., Brinkley B., May G. 1998. The cenpB gene is not essential in mice. Chromosoma. 107: 570-576.

111. Karpen G.H, Allshire R.C. 1997. The case for epigenetic effectson centromere identity and function. Trends Genet 13:489^196.

112. Kellum R., Raff J. W., Alberts B.M. 1995. Heterochromatin protein 1 distribution during development and during the cell cycle in Drosophila embryos. J. Cell Sci. 108: 1407-1418.

113. KiledjianM.,'Dreyfuss G. 1992. Primary structure and binding activity of the hnRNP U protein: binding RNA through RGG box. EMBO J. 11: 2655-2664.

114. Kipling D., and Warburton P. 1997. Centromeres, CENP-B and Tigger too. Trends Genet. 13(4): 141-145.

115. KiplingD., Mitchell A.R., MasumotoH., WilsonH.E., NicolL., and Cooke H.J. 1995. CENP-B binds a novel centromeric sequence in the Asian mouse Mus caroli. Mol. Cell. Biol. 15: 4009-4020.

116. Kipling D., Wilson H., Mitchell A., Taylor B., Cooke H. 1994. Mouse centromere mapping using oligonucleotide probes that detect variants of the minor satellite. Chromosoma. 103: 46-55.

117. Kit S. 1961. Equilibrum sedimentation in density gradients of DNA preparations from animal tissues. J. Mol. Biol. 3:711-716.

118. Magin T.M., HatzfeldM., andFranke W. W. 1987. Analysis of cytokeratin domains by cloning and expression of intact and deleted polipeptides in Esherichia coli. EMBO J. 6: 2607-2615.

119. Mahtani M.M., WillardH. 1998. Physical and genetic mapping of the human X chromosome centromere: repression of recombination. Genome Res. 8:100-110.

120. Mahtani M.M., Willard H. 1990. Pulsed-field gel analysis of alpha satellite DNA at the human X chromosome centromee: high frequency polymorphisms and array size estimate. Genomics. 7: 607-613.

121. Maio, J. J. 1971. DNA strand reassociation and polyribonucleotide binding in the African green monkey, Cercopithecus aethiops. J. Mol. Biol. 56: 579-595

122. Maniotis A. G., Bojanowski K., IngberD.E. 1997. Mechanical continuity and reversible chromosome ^disassembly with intact genomes removed from living cells. J. Cell Biochem.

123. Manuelidis L., Borden J. 1988. Reproducible compartmentalization of individual chromosome domains in human CNS cells revealed by in situ hybridization and three-dimensional reconstruction. Chromosoma. 96: 397-410

124. Manuelidis, L. 1976. Repeating restriction fragments of human DNA. NucleicAcids Res. 3: 3063-3076.

125. Manuelidis, L. 1978a. Complex and simple sequences in human repeated DNAs Chromosoma 66: 1-21.

126. Manuelidis, L. 1978b. Chromosomal localization of complex and simple repeated human DNAs. Chromosoma 66: 23-32.

127. Martelli A.M., Bortul R., Fackelmayer F.O., Tazzari P.L., Bareggi R., Narducci P., Zweyer M. 1999. Biochemical and morphological characterization of the nuclear matrix from apoptotic HL-60 cells. J. Cellular Biochem. 72: 35-46

128. Martou G., de Boni U. 2000. Nuclear topology of mirine, cerebellar Purkinje neurons: Changes as a function of development. Exp. Cell. Res. 256: 131-139.

129. Masumoto H., Ikeno M., Nakano M., Okazaki T., Grimes B., Cooke H., Suzuki N. 1998. Assay of centromere function using a human artificial chromosome. Chromosoma. 107: 406-416

130. Matsumoto H, Masukata H, Muro Y, Nozaki N. and Okazaki T. 1989. A human centromere antigen (CENP-B) interacts with a short specific sequence in alphoid DNA, a human centromeric satellite. J. Cell Biol. 109: 1963-1973.

131. Matsumoto L.H. 1981. Enrichment of satellite DNA on the nuclear matrix of bovine cells. Nature. 294: 481-482.

132. Mattern K.A., Humbel B.M., Muijsers A.O., de Jong L., and van Driel R. 1996. hnRNP proteins and B23 are the major proteins of the internal nuclear matrix of HeLa S3 cells. J. Cell Biochem. 62: 275-289.

133. Maul G., Negorev D., Bell P., and Ishov A. Review: Properties and Assembly Mechanisms of ND10, PML Bodies, or PODs. 2000, J. Struct. Biol. 129: 278-287.

134. McEwen B.F., Hsieh C.E., Mattheyses A.L., and Rieder C.L. 1998. A new look at kinetochore structure invertebrate somatic cells using high pressure freezing and freeze substitution. Chromosoma. 107: 366-375

135. Muhes G.,- T6rnok A., Pajor L., Muhes K. 1996. Objective analysis of centromere separation Hum. Genet. 97:365-366

136. Melcak I., Cermanova S., Jirsova K., Koberna K., Malinsky J., and Raska I. 2000. Nuclear pre-mRNA compartmentalization: Trafficking of released transcripts to splicing factor reservoirs. Mol. Biol. Cell. 11: 497-510.

137. Meyne J, Goodwin EH, Moyzis RK. 1994. Chromosome localization and orientation of the simple sequence repeat of human satellite I DNA. Chromosoma 103:99-103

138. Mine E., Allory Y., WormanHJ., CourvalinJ-C., Buendia B. 1999. Localization and phosphorylation of HP1 proteins during the cell cycle in mammalian cells. Chromosoma. 108: 220-234.

139. MintzP.J., andSpectorD.L. 2000. Compartmentalization ofRNA processing factors within nuclear speckles. J. Struct. Biol. 129: 241-251.

140. MintzP.J., Patterson S.D., NeuwaldA.F., Spahr C.S., and Spector D.L. 1999. Purification and biochemical characterization of interchromatin granule clusters. EMBO J. 18(15): 4308-4320.

141. Mirkovitch J., Mirault M.E., andLaemmli U. K. 1984. Organization of the higher-order chromatin loop: specific ENAattachment sites on nuclear scaffold. Cell. 1: 223-232.

142. Mirsky A.E., Ris H. 1947. The chemical composition of isolated chromosomes. J. Gen. Physiol. 31:7-18.

143. Misteli T., and Spector D.L. 1998. The cellular organization of gene expression. Curr. Opin. Cell Biol. 10:323-331

144. Misteli T., Caxceres J.F., and Spector D.L. 1997. The dynamics of a pre-mRNA splicing factor in living cells. Nature. 387: 523-527.

145. Mitchell A.R, Gosden J.R., and Miller D. A. 1985 A cloned sequence, p82H, of the alphoid repeated DNA family found at the centromeres of all human chromosomes. Chromosoma. 92: 369-377.

146. Mitchell A.R., 1996. The mammalian centromere: its molecular architecture. Mutat Res. 372: 153-162.

147. MoirR.D., Montaglowy M., and Goldman R.D. 1994. Dynamic properties of nuclear lamins: Lamin B is associated with sites of DNA replication. J. Cell Biol.125: 1201-1212.

148. Moir R.D., Spann T., Lopez-Soler R., Yoon M., Goldman A.E., Khuon S., and Goldman R.D. Review: The dynamics of the nuclear lamins during the cell relationship between structure and function. J. Struct. Biol. 129: 324-334

149. Monneron,A., and Bernhard, W. 1969. Fine structural organization of the interphase nucleus in some mammalian cells, J. Ultrastruct.Res. 27: 266-288.

150. Moroi Y., Peebles C., Fritzler M.J., Steigerwald J., and Tan EM. 1980. Autoantibody to centromere (kinetochore) in scleroderma sera. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 77: 1627-1631.

151. MoyzisRK, AlbrightKL, BartholdiMF, Cram LS, Deaven LL, Hildebrand CE, Joste NE, LongmireJL, Schwarzacher-Robinson T. 1987. Human chromosome specific repetitive DNA sequences: novel markers for genetic analysis. Chromosoma 95: 375-386.

152. Muro Y., Masumoto H., Yoda K., Nozaki N., Ohashi O., and Okazaki T. 1992 Centromere protein B assembles human centromeric alpha-satellite DNA at the 17-bp sequence, CENP-B box. J. Cell. Biol. 116: 585-596.

153. Nagele R.C., Freeman T., Fazekas J., Lee K.-M., Thompson Z., Lee H.-Y. 1998. Chromosome spatial order in human cells: evidence for early oigin and faithful propagation. Chromosoma. 107: 330-338.

154. Nickerson J. A. 1995. The architectural organization of nuclear metabolism. Int Rev Cytol. 162A: 67-123

155. OrgelL.H., and CrickF.H.C. 1980. Selfish DNA: the ultimate parasite. Nature. 284: 604-607.

156. Osborn M, Weber K, 1987. Cytoplasmic intermediate filament proteins and the nuclear lamins A, B and C share the IFA epitope. Exp Cell Res. 170: 195-203

157. Pardue M.L., Gall J. G. 1970. Chromosomal localization of mouse satellite DNA. Science 168:1356-1358.

158. Parry D.A.D., and Fraser R.D.B. 1985. Intermediate filament structure. 1. Analysis of IF protein sequence data. Int. J. Biol. Macromol. 7:203-213.

159. Parry DAD, 1994. NuMA/centrophilin: sequence analysis of the coiled-coil rod domain. Biophys J. 67: 1203-1206

160. Pederson T. 1998. Thinking about a nuclear matrix. J. Mol. Biol. 277: 147-159.

161. Pederson T. 2000. Half a century of "the nuclear matrix". Mol. Cell. Biol. 11: 799-805.

162. Perez-Castro A. V, Shamansky F.L., Meneses J.J., Lovato T., Vogel K. G., Moyzis R., Pedersen R. 1998. Centromeric Protein B Null Mice Are Viable with No Apparent Abnormalities. Dev. Biol. 201(2): 135-143.

163. PidouxA., AllshireR. 2000. Centromeres: getting grip of chromosomes. Curr. Opin. Cell. Biol. 12: 308-319.

164. Pietras D., Bennet K., Siracusa L., Woodworth-Gutai M., Chapman V., Gross K. 1983. Construction of a small Mus musculus repetitive DNA library: identification of a new satellite sequence in Mus musculus. Nucleic Acids Res. 11: 6965-6983.

165. Podgornaya O.I., Dey R., Lobov I. B., Enukashvily N.I. 2000. Human satellite 3 binding protein from the nuclear matrix: isolation and binding properties. Biochim. Biophys. Acta. 1497: 204-214.

166. Politz J.C., Tuft R., Pederson T., and Singer R.H. 1999. Movemen to of nuclear poly(A)RNA throughout the inter chromatin space. Curr.Biol. 9:285-291.

167. Prades C., Laurent A-M., Puechberty J., Yurov Y., Roizes G. 1996. SINE and LINE within human centromeres. J. Mol. Evol. 42: 37-43.

168. ProsserJ., Frommer M., PaulC., Vincent P. C. 1986. Sequence relationships ofthree human satellite DNAs. J Mol Biol 187:145-155.

169. Pruss R.M., Mirsky R., and RaffM.C. 1981. All classes of intermediate filaments share a common antigenic determinant defined by a monoclonal antibody. Cell. 27:419-428

170. Rabl C. Uber Zellteilung. Morph. Jb., 1885., 10: 214-330

171. RattnerJ. 1991. The structure of the mammalian centromere. Bioessays. 13:51-56.

172. Razin S.V., Gromova I.I. 1995. The channels model of nuclear matrix structure. Bioessays. 17: 443-450.

173. Razin S. V., KekelidzeM.G., Lukanidin E.M., SherrerK., Georgiev G.P. 1986. Replication origins are attached to the nuclear skeleton. Nucl. Acid Res. 14: 8189-8207.

174. Razin S. V., Yarovaya O. V., and Georgiev G.P. 1985. Low ionic strength extraction of nuclease-treated nuclei destroys the attachment of transcriptionally active DNA to the nuclear nucleoskeleton. Nucl. Acid Res. 13: 7427-7444.

175. Reichenzeller M., BurzlajfA., LichterP., Herrmann H. 2000. In vivo observation of a nuclear channel-like system: Evidence for a distinct interchromosomal compartment in interphase cells. J. Struc. Biol. 129(2/3): 175-185.

176. RiemerD., DodemontH., and Weber K. 1991. Cloning of the non-neuronal intermediate filament protein of the gastropod Aplysia californica; identification of an amino acid residue essential for the IFA epitope. Eur. J. Cell Biol. 56: 351-357.

177. Rivera H., Vassquez A.I., Ayala-Madrigal M.L., Ramirez-DuenasM.L., Davalos LP. 1996. Alphoidless centromere of a familial unstable inverted Y chromosome. Ann. Genet. 39: 236-239.

178. RoberR.A., Weber K., andOsbornM. 1989. Differential timing of nuclear laminA/C expression in the various organs of the mouse embryo and the young animal: A developmental study. Development 105: 365-378.

179. Romig, H., Fackelmayer, F.O., Renz, A., Ramsperger, U., Richter, A. 1992. Characterization of SAF-A, a novel nuclear DNA binding protein from HeLa cells with high affinity for nuclear matrix/scaffold attachment DNA elements. EMBO J. 11, 3431-3440.

180. Schnedl, W., Breitenbach, M., Stranzinger, G. 1977. Mithramycin and DIPI: a pair of fluorochromes specific for GC-and AT-rich DNA respectively. Hum. Genet. 36, 299-305.

181. Schulman I., Bloom K.S. 1991. Centromeres: an integrated protein /DNA complex required for chromosome movement. Annu. Rev. Cell Biol. 7:311-336

182. Shelby D.R, Hahn K. M., Sullivan K. F. 1996. Dynamic elastic behavior of alpha-satellite DNA domains visualized in situ in living human cells. J. Cell Biol. 135: 545-557.

183. Shelby R.D, Vafa O., Sullivan K.F. 1997. Assembly of CENP-A into centromeric chromatin requires a cooperative array of nucleosomal DNA contact sites. J.Cell Biol. 136: 501-513

184. Shiels C., Coutelle Ch., and Huxley C. 1997. Contiguous Arrays of Satellites 1, 3, and b Form a 1.5-Mb Domain on Chromosome22p. Genomics. 44: 35-44.

185. Smith K.P., MoenP.T., Wydner K.L., Coleman J.R., and Lawrence J.B. 1999. Processing of endogenous pre-mRNAs in association withSC-35 domains is gene specific. J. Cell Biol. 144: 617-629.

186. So J., Zhao C., Stevens C., Holmes C., Cummings MandDoering J. 1999. Detailed physical mapping of alphoid sequences in the centromere region of human chromosome 21. Mol. Biol Cell. Suppl, V.9: 451a

187. Spann T.P., MoirR.D., Goldman A.E., StickR., and Goldman R.D. 1997. Disruption of nuclear lamina organization alters the distribution of replication factors and inhibits DNA synthesis. J. Cell Biol. 136: 1201-1212.

188. Spector D. L. 1993. Macromolecular domains within the cell nucleus. Annu. Rev. Cell Biol. 9: 265-315.

189. Spector D.L., Schrier W.H. and Bush H. 1983. Immunoelectron microscopy localization of snRNP. Biol. Cell. 49: 1-10

190. Steinert P.M., and Roop D.R. 1988. Molecular and cellular biology of intermediate filaments. Annu.Rev.Biochem. 57: 593-625.

191. Stewart C., and Burke B. 1987. Teratocarcinoma stem cells and early mouse embryos contain only a single major lamin polypeptide closely resembling lamin B. Cell. 51: 383-392.

192. Stitou S., De La Guardia A.D., Jimenez H., and Burgos M. 1999. Isolation of a Species-Specific Satellite DNA with a Novel CENP-B-like Box from the North African Rodent Lemniscomys barbarus. Exp. Cell. Res. 250: 381-386.

193. Strauss F., and VarshavskyA. 1984. A protein binds to a satellite DNA repeat at three specific sites that would be brought into mutual proximity by DNA folding in the nucleosome. Cell. 37: 889-901

194. Strissel P.L., Espinosa (III) R„ Rowley J. D., Swift H. 1996. Scaffold attachment regions in centromere-associated DNA. Chromosoma. 105: 122-133.

195. Stuurman N, Heins S, and Aebi U. 1998. Nuclear lamins: their structure, assembly, and interactions. J Struct Biol. 122: 42-66

196. Sugata N., Munekata E., Todokoro K. 1999. Characterization of a novel kinetochore protein, CENP-H. J. Biol. Chem. 274(39): 27343-27346.

197. SugimotoK, TsutsuiM, AuCoin D, VigBK. 1999. Visualization of prekinetochore locus on the centromeric region of highly extended chromatin fibers: does kinetochore autoantigen CENP-C constitute a kinetochore organizing center? Chromosome Res. 7(1): 9-19.

198. Sugimoto K., Shibata A., Himeno M. 1998. Nucleotide specificity at the boundary and size requirement of the target sites recognized by human centromere protein B (CENP-B) in vitro. Chromosome Res. 6: 133-140

199. Sullivan K. F„ Shelby R. D. 1999 Using time-lapse-confocal microscopy for analysis of centromere dynamics in human cells. Methods Cell Biol. 58: 183-202.

200. Sumner A. T. 1991. Scanning electron microscopy of mammalian chromosomes from prophase to telophase. Chromosoma. 100: 410-418.

201. Sumner A. T. 1998. The structure of the centromeric region of CHO chromosomes. Cell. Biol. Int. 22(2): 127-130.

202. Swift H. 1959. Studies on nuclear fine structure. Brookhaven Symp. Biol. 12: 134-152.

203. Tagarro I, Wiegant J, Raap AK, Gonz6lez-Aguilera JJ, Fernfmdez Peralta AM. 1994. Assignment of human satellite 1 DNA as revealed by fluorescent in situ hybridization with oligonu cleotides. Hum Genet. 93:125-128

204. Taimen P., Viljamaa M., KallajokiM. 2000. Preferential expression of NuMa in the nuclei of proliferating cells. Exp. Cell. Res. 256: 140-149.

205. TanJ-H., Wooley J.C., and LeStourgeon W.M. 2000. Nuclear matrix-like filaments and fibrogranular complexes form through the rearrangement of the specific nuclear ribonucleoproteins. Mol. Biol. Cell. 11: 1547-1554.

206. Taylor S.S., LarinZ., Tyler-Smith C. 1996. Analysis ofextrachromosomal structures containing human centromeric alphoid satellite DNA sequences in mouse cells. Chromosoma. 105: 70-81.

207. Telenius H, Szeles A, Kereso J, Csonka E, Praznovszky T, Imreh S, Maxwell A, Perez CF, DrayerJI, Hadlaczky G. 1999. Stability of a functional murine satellite DNA-based artificial chromosome across mammalian species. Chromosome Res. 7(1): 3-7.

208. Therkelsen A. J.,- A. Nielsen • S. Kuilvraa. 1997. Localisation of the classical DNA satellites on human chromosomes as determined by primed in situ labelling (PRINS). Hum Genet. 100:322-326

209. Tomkiel J.E., Cooke C.A., Saitoh H„ BernatR.L., Earnshaw W.C. 1994. CENP-C is required for maintaining proper kinetochore size and for a timely transition to anaphase. J. Cell Biol. 125: 531-545.

210. Traub P. 1995. Intermediate filaments and gene regulation. Physiol Chem Phys & Med. 27: 377-400

211. Trowell HE, Nagy A, Vissel B, Choo KHA. 1993. Long-rangeanalyses of the centromeric regions of human chromosomes 13, 14, and 21: identification of a narrow domain containingtwo key centromeric DNA elements. Hum Mol Genet 2:1639-1649.

212. Tsutsui, K, Tsutsui, K., Okada, S., Watarai, S., Seki, S., Yasuda, T., Shohmori, T. 1993. Identification and characterization of a nuclear scaffold protein that binds the matrix attachment region DNA. J. Biol. Chem. 268: 12886-12894.

213. Turner B.M., and Franchi L. 1987. Identification of protein antigens associated with the nuclear matrix and with clusters of interchromatin granules in both interphase and mitotic cells. J Cell. Sci. 87: 269-282.

214. Vafa O., Shelby R.F., Sullivan K.F. 1999. CENP-A associated complex satellite DNA in the kinetochore of the Indian muntjac. Chromosoma. 108:367-374.

215. Verheijen R., Kuipers H.J.H., Sclingemann R.O. 1989. Ki-67 detects a nuclear matrix associated proliferation related antigen. II. Intracellular localization during interphase. J. Cell. Sci. 92: 531-540.

216. VerschurePJ, vanDerKraanl, MandersEM, vanDrielR. 1999. Spatial relationship between transcription sites and chromosome territories. J.Cell.Biol. 147(1): 13-24.

217. VigB.K, and Willcourt M. 1998. Decondensation of pericentric heterochromatin alters the sequence of centromere separation in mouse cells. Chromosoma. 107: 417-423

218. VisselB., Choo K.H.A. 1989. Mouse major (gamma) satellite is highly conserved and organized into extremely long tandem arrays: implications for recombination between nonhomologous chromosomes. Genomics 5: 407-414.

219. Voullaire L.E., Slater H.R., Petrovic V., and Choo K.H.A. 1993. A functional marker centromere with no detectable alpha-satellite, satellite III, or CENP-B protein: activation of a latent centromere? Am. J. Hum. Genet. 52: 1153-1163.

220. Wandall A., Tranebjaerg L„ Tommerup N. 1998. A neocentromere on human chromosome 3 without detectable a-satellite DNA forms morphologically normal kinetochores. Chromosoma. 107: 359-365.

221. Wang HS, Riddell DC, Donald LJ, Cameron EC, Tonogai J, Holden JJA, Higgins MJ, Shtromas I, White BN, Hamerton JL. 1984. Mapping of a 1.8 kb Kpnl sequence to the short arm of chromosome 15. Cytogenet Cell Genet 37:601-602.

222. Warburton P.E. 1999. making CENs of mammalian artificial chromosomes. Mol. Genet. Metab. 68: 152-160.

223. Warburton P.E., and Cooke H.J. 1997. Hamster chromosomes containing amplified human a-satellite DNA show delayed sister chromatid separation in the absence of de novo kinetochore formation. Chromosoma. 106: 149-159.

224. Waye J.S., and WillardH.F. (1989). Human b satellite DNA: Genomic organization and sequence definition of a class of highly repetitive tandem DNA. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 86: 6250-6254.

225. Weimer R., Haaf T., Kruger J., Poot M., Shmid M. 1992. Characterization of centromere arrangements and test for random distribution in GO, G1, S, G2, G1 and early S' phase in human lymphocytes. Hum. Genet. 88: 673-682.

226. WevrickR., Willard H. F. 1991. Physical map of the centromeric region of human chromosome 7: relationship between two distinct alpha satellite arrays. Nucleic Acids Res. 19: 2295-2301.

227. Willard H.F. 1998. Centromeres: missing link in the development of human artificial chromosomes. Curr. Opin. Genet. Dev. 8: 219-225.

228. Willard H.F., WayeJ.S. 1987. Chromosome-specific subsets of human alpha satellite DNA: analysis of sequence divergence within and between chromosomal subsets and evidence for an ancestral pentameric repeat. J Mol Evol. 25:207-217

229. Wong A., RattnerJ. 1988. Sequence organization and cytological localization of the mouse minor satellite of mouse. Nucleic Acids res. 16: 11645-11661.

230. Wu JC, and Manuelidis L, 1980. Sequence definition and organization of a human repeated DNA. J Mol Biol. 142: 363-386.

231. Yen T. J., Compton D.A., EarnshawW.C., and Cleveland D.W. 1991. CENP-E, ahuman centromere associated protein released from chromosomes at the onset of anaphase. EMBO J.10: 1245-1254.

232. Yoda K, Ando S, Okuda A, Kikuchi A, Okazaki T. 1998. In vitro assembly of the CENP-B/alpha-satellite DNA/core histone complex: CENP-B causes nucleosome positioning. Genes Cells. 3: 533-548.

233. Yoda K., Nakamura T., Matsumoto H., Suzuki N., Kitagawa K., Nakano M., Shinjo A., and Okazaki T. 1996. Centromere protein B of African green monkey cells: Gene structure, cellular expression and centromeric localization. Mol. Cell. Biol. 16: 5169-5177.

234. Yu W., and de la Espina S.M.D. 1999. The plant nucleoskeleton: Ultastructural organization and identification of NuMa homologues in the nuclear matrix and mitotic spindle of plant cells. Exp. Cell Res. 246: 516-526.

235. Zbarsky I.B., Dmitrieva N.P., Yermolaeva L.P. 1962. On the structure of tumor cell nuclei. Exp.Cell. Res. 27: 573-576.

236. ZinkD., Cremer C. 1998. Cell nucleus: Chromosome dynamics in nuclei of living cells. Curr. Biol. 8:R321-R324.

237. Zink D., Cremer T., Saffrich R., Fischer R., Trendelenburg M.F., Ansorge W., and Stelzer E.H. 1998. Structure and dynamics of human interphase chromosome territories in vivo. Hum.Genet.102: 241-251.