Бесплатный автореферат и диссертация по биологии на тему

Закономерности динамики экспрессии люминесцентных генов, клонированных в рекомбинантном штамме Escherichia Coli Z905, в различных условиях существования

ВАК РФ 03.00.02, Биофизика

Содержание диссертации, кандидата биологических наук, Максимова, Елена Евгеньевна

ВВЕДЕНИЕ.

ГЛАВА 1. МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЕ АСПЕКТЫ ИНТРОДУКЦИИ ГЕНЕТИЧЕСКИ МОДИФИЦИРОВАННЫХ МИКРООРГАНИЗМОВ В ОКРУЖАЮЩУЮ СРЕДУ.

1.1. Нестабильность рекомбинантных плазмид и экспрессии клонированных генов у микроорганизмов.

1.2. Основные аспекты регуляции транскрипционной активности. бактериальных оперонов.

1.3. Бактериальная люминесценция и интродукция ГММО.

1.4. Механизмы адаптации микроорганизмов к условиям окружающей среды.

ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ.

ГЛАВА 3. РЕГУЛЯЦИЯ ЭКСПРЕССИИ /их-ОПЕРОНА В ШТАММЕ Escherichia coli Z905.

3.1. Закономерности экспрессии плазмидных /их-генов в штамме Escherichia coliZ905.

ГЛАВА 4. ОЦЕНКА СТАБИЛЬНОСТИ ЭКСПРЕССИИ lux-ГЕНОВ, КЛОНИРОВАННЫХ В ШТАММЕ Escherichia coliZ905, В СОСТАВЕ РЕКОМБИНАНТНОЙ ПЛАЗМИДЫ pPHL7.

4.1. Изменение структуры популяции штамма Escherichia coli Z905 в ряду последовательных пассажей на различных средах.

4.2. анализ экспрессии плазмидных /их-генов у клонов Escherichia coli Z905, полученных после пассажей на различных средах.

ГЛАВА 5. ЗАКОНОМЕРНОСТИ ДИНАМИКИ ЭКСПРЕССИИ lux-ГЕНОВ, КЛОНИРОВАННЫХ В ШТАММЕ Escherichia coli Z905, В УСЛОВИЯХ МОДЕЛЬНЫХ ВОДНЫХ МИКРОЭКОСИСТЕМ ПОСЛЕ ИНТРОДУКЦИИ.

5.1. влияние условий модельных водных микроэкосистем на экспрессию генов рекомбинантной плазмиды PPHL7 в клетках Escherichia coli Z905.

5.2. Изучение механизмов снижения эффективности экспрессии lux генов у клонов Escherichia coli Z905, выделенных из модельных водных микроэкосистем.

5.3. Оценка возможности экспрессии плазмидных /ш>генов, клонированных в плазмиде PPHL7, в клетках Flavobacterium spp.

Введение Диссертация по биологии, на тему "Закономерности динамики экспрессии люминесцентных генов, клонированных в рекомбинантном штамме Escherichia Coli Z905, в различных условиях существования"

Проблема интродукции микроорганизмов в окружающую среду в последнее время интенсивно разрабатывается в связи с созданием биотехнологических методов повышения урожайности растений и улучшения качества сельскохозяйственной продукции, проблемами геологической микробиологии и гидрометаллургии, производстве вакцин, иммуномодуля-торов создании препаратов, направленных на лечение онкологических заболеваний, био-ремедиации [1-4].

Потенциальная возможность негативного воздействия генетически модифицированных микроорганизмов (ГММО) на экологические характеристики окружающей среды является самой малоизученной проблемой. Можно ожидать, что ГММО, интродуцированные в среду в больших количествах (особенно вместе с питательными веществами) смогут нарушить равновесие в микробном сообществе [5].

Так, например, известно, что ГММО могут ингибировать рост и взаимодействие микоризных грибов с растением-хозяином [6]; способствовать изменению генетического материала аборигенных микроорганизмов [7]. Известен печальный опыт повышения устойчивости патогенных микроорганизмов к антибиотикам [8].

Однако основная задача интродукции ГММО связана с достижением благоприятного эффекта [9]. В настоящий момент на основе рекомбинантных штаммов разрабатываются препараты, которые могут найти широкое применение в различных отраслях промышленности [10]: сельском хозяйстве, в пищевой промышленности [11,12], в сфере здравоохранения (создание "живых" вакцин [13], фармацевтических препаратов [14], ферментов [15]), в биотехнологических процессах выщелачивания металлов и обогащения руд [16].

Интродукция ГММО может решить и некоторые экологические проблемы (биоремедиация экосистем, утилизации промышленных отходов и т.д.). Как показали многочисленные исследования [17,18,19], такая интродукция наиболее безопасна, т.к. при уменьшении поллютаната в среде количество клеток штамма-деструктора уменьшается. При биоремедиации ГММО целесообразнее использовать, когда:

- их биохимические характеристики, обеспечивающие биоремедиацию, улучшены, а спектр разлагаемых загрязнителей расширен;

- ГММО улучшают прогнозирование хода биоремедиации, что позволяет оперативно управлять ее процессом (использование "репортерных" ГММО, несущих легко тестируемые специфические признаки);

- генетическая модификация обеспечивает устойчивость микроорганизмов к враждебным для них факторам среды (устойчивость к тяжелым металлам);

- генетическая модификация позволяет управлять жизненно важными функциями микроорганизмов и тем самым контролировать процесс пролиферации клеток (например для предотвращения нежелательного распространения ГММО в окружающей среде можно активировать в нем условно-летальную функцию и др.);

- ГММО вносят в среду в качестве реципиента для коньюгативных или мобилизуемых плазмид, содержащихся в естественных резидентных штаммах (считается, что плазмиды, выделенные таким образом, смогут быть полезными для создания ГММО-деструкторов) [20].

Вопрос об интродукции ГММО в экосистемы является очень сложным и неоднозначным. Исследователи пытаются оценить возможные последствия этого процесса [21]. Безопасность использования ГММО должна обеспечиваться не только наличием концептуальных подходов к их конструированию, но и проведением их мониторинга в окружающей среде. В мире разработаны законодательства, регулирующие использование рекомбинантных организмов и содержат целый ряд требований, которые необходимо выполнять в экспериментах по интродукции [9,22,23].

В западноевропейских странах, США, Канаде и Австралии активно финансируются проекты, направленные на создание ГММО и оценку риска их выпуска в среду. В нашей стране контроль за выпуском ГММО практически не ведется. Тем не менее научная сторона этой проблемы не остается без внимания и у нас, о чем свидетельствуют публикации в научных изданиях, проведение международных встреч и осуществление научных проектов по оценке генетической безопасности рекомбинантных микроорганизмов. Требования, предъявляемые к ГММО, заключаются в обеспечении их генетической и экологической безопасности [22].

Как бы ни был тщательно охарактеризован ГММО и предназначенная для него среда обитания, его дальнейшая судьба не может быть предсказана с полной определенностью. Предложенная американскими исследователями схема [24] концептуального риска применения ГММО включает в себя все необходимые для этого требования.

Важно еще учитывать и то, что, как показывает опыт, и сам ГММО и принимающая его экосистема обладают способностью к саморегуляции и поддержанию новой функциональной целостности. Возрастание масштабов эксперимента с рекомбинантными микроорганизмами сопряжено с возрастанием экологического риска, оценить и прогнозировать который можно с помощью молекулярной экологии [25].

Цель работы состояла в изучении возможных путей адаптации генома рекомбинантной плазмиды pPHL7 в клетках Escherichia coli Z905 (AprLwc+) в различных условиях существования.

Основные задачи работы:

1. Оценить механизмы экспрессии /га-генов, клонированных в составе плазмиды pPHL7 в клетках рекомбинантного штамма Escherichia coli Z905;

2. Исследовать влияние концентрации питательных веществ и антибиотика на стабильность сохранения плазмиды и экспрессию lux-генов в клетках штамма Escherichia coli Z905;

3. Изучить динамику изменения экспрессии lux-генов и оценить возможные механизмы адаптации генома рекомбинантной плазмиды после интродукции штамма Escherichia coli Z905 в модельные водные микроэкосистемы.

На защиту выносятся следующие основные положения:

1. Синтез ферментов люминесцентной системы светящихся бактерий, клонированной в рекомбинантной плазмиде pPHL7, подвержен в штамме Е. coli Z905 регуляции, опосредованной через действие индуктора, репрессора и катаболитактивирующего белка.

2. В популяции штамма Е. coli Z905 наблюдается гетерогенность клеток по свечению, обусловленная изменением регуляции /их-оперона и изменением копийности плазмиды. Уровень экспрессии люминесцентных генов зависит от условий существования рекомбинантного штамма.

Полученные результаты по методологии изучения влияния факторов среды на изменение экспрессии плазмидного /wx-оперона могут иметь практическое значение при исследовании стабильности экспрессии других рекомбинантных ДНК. Впервые показано, что регуляция экспрессии /шг-оперона, клонированного в составе плазмиды pPHL7 в Е. coli, осуществляется на уровне регуляторных компонентов клетки-хозяина. Впервые установлено, что при интродукции в модельные водные экосистемы и при пассажах на средах с различными концентрациями питательных веществ и селективного фактора происходит постепенное снижение уровня люминесценции клеток, обусловленное изменением регуляции экспрессии /их-генов, снижением копийности плазмиды. Впервые разработан методологический подход, позволяющий проводить прогнозное исследование поведения рекомбинантного штамма Escherichia coli Z905 (AprLux4) до и после интродукции в окружающую среду (на молекулярно-клсточном и популяционном уровнях).

Материалы диссертации опубликованы в одиннадцати статьях в центральных и зарубежных журналах, а также доложены на Всероссийской конференции «Интродукция микро6 организмов в окружающую среду» (Москва, 1994 г.); на VII и VIII Международных конференциях «Новые направления биотехнологии» (Москва, 1996, 1998 гг.); на 31-ой Международной Ассамблее COSPAR (Бирмингем, Англия, 1996 г.); на Международной конференции «Современные концепции эволюционной генетики» (Новосибирск, 1997 г.); на VII Международном Экологическом Конгрессе «INTECOL» (Флоренция, Италия, 1998 г.); на Международной конференции «Environmental Pollution ICEP'98» (Москва, 1998 г.).

Заключение Диссертация по теме "Биофизика", Максимова, Елена Евгеньевна

ОСНОВНЫЕ РЕЗУЛЬТАТЫ И ВЫВОДЫ

1. Установлено, что синтез ферментов люминесцентной системы светящихся бактерий, клонированной в рекомбинанпной плазмиде pPHL7, подвержен в клетках Е. coli Z905 рефляции, опосредованной через действие индуктора, репрессора и катаболитактивирующего белка. Впервые показано, что контроль экспрессии /их-генов, клонированных в рекомбиыантной плазмиде регулируется индуктором, синтезируемым собственно клетками Е. coli.

2. Показано, что в популяции рекомбинантного штамма Е. coli Z905 проявляется гетерогенность клеток по свечению, обусловленная изменением транскрипционного контроля плазмидных /их-генов.

3. Впервые определены условия среды, способствующие доминированию в популяции штамма Е. coli Z905 клеток с различным уровнем свечения. Клетки с исходным фенотипом наиболее стабильно сохраняются только на среде с пептоном в присутствии ампициллина. Клетки с низким уровнем свечения накапливаются в популяции в отсутствии антибиотика в среде, независимо от концентрации питательных веществ. Клетки с высоким уровнем свечения преобладают в популяции только в условиях жидкой среды, независимо от концентрации ампициллина.

4. После интродукции рекомбинантного штамма E.coli Z905 в модельные водные микроэкосистемы наблюдали снижение уровня свечения клеток, обусловленное значительным (в 5-10 раз) снижением копийности плазмиды; усилением регуляторного контроля экспрессии /их-генов; нарушением синтеза основного субстрата люциферазной реакции - альдегида.

5. Показана спонтанная передача рекомбинантной плазмиды от клеток штамма Е. coli Z905 клеткам Flavobacterium spp, выделенным из модельных водных микроэкосистем. Установлено, что в клетках, флавобактерий возможно сохранение рекомбинантной плазмиды и экспрессия плазмидных /их-генов.

6. Разработан методологический подход к изучению последствий интродукции ГММО в природные экосистемы, позволяющий проводить исследования закономерностей сохранения и изменения экспрессии клонированных генов под воздействием ряда ключевых факторов окружающей среды.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

В заключении суммируем изложенные выше результаты и проанализируем механизмы адаптации генома рекомбинантной плазмиды при существовании клеток ГММО в различных условиях окружающей среды.

В настоящее время широкое распространение приобретают биотехнологии, основанные на использовании рекомбинантных микроорганизмов. Зачастую при этом сложно прогнозировать насколько эффективно будут экспрессироваться гетерологичные гены в условиях, отличающихся от лабораторных. С другой стороны, существует вероятность того, что широкое использование этих новых технологий в различных отраслях промышленности приведет к нарушению функционирования природных экосистем, куда они могут попасть при целенаправленной или случайной интродукции. В проводимых в мире исследованиях основное внимание уделяется сохранению плазмиды в клетках рекомбинантных штаммов, а также выживанию самих ГММО в тех или иных условиях окружающей среды. Однако, практически не уделяется внимания тому, будет ли сохраняться экспрессия рекомбинантного генома в клетках ГММО, а также будет ли возможной его экспрессия в клетках природных микроорганизмов.

Предложенный нами метод комплексного исследования процессов адаптации рекомбинантного генома, клонированного в плазмиде pPHL7, в штамме Е. coli Z905 (AprLwc+) в зависимости от ведущих факторов среды включает в себя несколько последовательных этапов изучения ГММО (рис. 54).

Наиболее важным в предложенной методологии является этап детального изучения механизмов экспрессии рекомбинантного генома в клетках штамма-хозяина. Существенным моментом является выявление зависимости между общеклеточной и специфичной регуляцией экспрессии клонированных lux-генов. В данном исследовании было показано, что люминесцентные гены, клонированные в составе плазмиды в клетках Е. coli Z905, подвержены сложному транскрипционному контролю. Основную роль в данном процессе выполняет индуктор плазмидных /ш:-генов, синтезируемый собственно клетками Е. coli, синтез которого, в свою очередь, также подвержен сложной регуляции. Это было подтверждено при анализе динамики люминесценции клеток рекомбинантного штамма на средах с добавлением различных веществ (табл. 17).

ГММО Е. coli 7.905

Оценка стабильности поодержания рскомби-; нантиойплазмиды pPHL7 Оценка стабильности экспрессии плазмидных lux-генов

Относительно субстратов, необходимых для люминесцентной реакции

Анализ возможных рсгуляторных компонентов клеток Е. coli, участвующих в регуляции //¡.T-uueiioim

Изучение механизмов регуляции экспрессии .в клетках Е. coli

Этап I

Выявление ключевых факторов среды, ока чываюших влияние на экспрессию плазмид ных /«х-генов

Изучение динамики экспрессии lux-генов в популяции Е. coli Z905 в различных условиях среды при последовательных пассажах

Этап II

Анализ возможных механизмов изменения экспрессии плазмидных генов в клетках Е,соН2905

Рис. 54. Схема поэтапного исследования стабильности рекомбинантного генома, клонированного в штамме Escherichia coli Z905, на молекулярном уровне.

Библиография Диссертация по биологии, кандидата биологических наук, Максимова, Елена Евгеньевна, Красноярск

1. Кондратьева Т.Ф., Каравайко Г.И. Изменчивость генома Thiobacillus ferroxidans и ее значение в биогидрометаллургии// Микробиология. 1997. Т.66. №6. С. 735-743.

2. Заборина О.Е., Барышникова Л.М., Баскунов Б.П., Головлев Е.Л., Головлева Л.А. Разложение пентахлорфенола в почве интродуцированным штаммом Streptomyces rochei 303 и активированной почвенной микрофлорой// Микробиология. 1997. Т.66, №5. С. 661-666.

3. Хабарова Е.И., Пшеничникова А.Б. Швец В.И. Основные аспекты экологической безопасности и биотехнологических производств//Биотехнология. 1997. №4. С. 31-395.

4. Bej A.K., Perlin M., Atlas R.M. Effect of introducing of genetically engineered microorganisms on soil microbial community diversity // FEMS Microbiol. Ecol. 1991. № 86. P. 169-176.

5. Backman M., Jacobson K., Ringertz S. The virgin population of Neisseria gonorrhoeae in Stockholm has decreased and antimicrobial resistance is increasing// Genitourin.Med. 1995. Vol.71, №4. P. 234-238.

6. The release of genetically modified microorganisms REGEM-2/ Eds Stewart-Tull D.E.S., SussmanM. N.Y.;L.: Plenum Press, 1992.

7. Henschke R.B., Henschke E.J., Schmidt F.RJ. Monitoring survival and gene transfer in soil microcosms of recombinant Escherichia coli designed to represent an industrial production strain//Appl. Environ. Microbiol. 1991. V. 35. P. 247-252.

8. Klijn N., Weerkamp A.M., DeVos W.M. Biosafety assessment of the application of genetically modified Lactococcus lactis spp. in the production of fermented milk products// Syst. Appl. Microbiol. 1996. V.18, №. 4. P. 486-492.

9. Новый закон о генной инженерии// Обозрение по ген. инж. и биотехнол. 1995. Т.1, №.4. С.42-43.

10. Dertzbaugh М.Т. Genetically Engineered Vaccines: An Overview//Plasmid. 1998. V. 39, №2. P. 100-113.

11. Ho M.-N., Traavik Т., Olsvik O., Tappeser В., Howard C.V., von Weizsäcker С., McGavin G.C. Gene technology and gene ecology of infectious diseases// Microb. Ecol.in Health and Deseases. 1998. V.10, № 1. P. 33-58.

12. Di Salvo M., Yang, Zhao E.G., Winkler M.E., Schirch V. Expression, Purification, and Characterization of Recombinant Escherichia coli Pyridoxine 5-Phosphate Oxidase// Prot. Expres. Purif. 1998. V. 13, № 3. P. 349-356.

13. Анисимова JI.А., Воронин A.M. Детерминируемая плазмидами грамотрицательных бактерий устойчивость к металлам// Биотехнология. 1994. № 3. С. 3-9.

14. Sayler, G.S., Layton, A., Lajoie, С., Bowman, J., Tschantz, M., Fleming, J.T. Molecular site assessment and process monitoring in bioremediation and natural attenuation// Appl.Biochem.Biotechnol. 1995. Vol. 54, №1-3. P. 277-290.

15. Ronchel M.G., Ramos C., Jensen L.B., Molin S., Ramos J.L. Construction and behavior of biologically contained bacteria for envirinment applications in bioremediation// Appl. Env. Microbiol. 1995. V.61, №8. P.2990-2994.

16. Hooker, B.S., Skeen, R.S. Intrinsic bioremediation: an environmental restoration technology// Curr.Opin.Biotechnol. 1996. Vol. 7, №3. P.317-20.

17. Вельков B.B. Биоремедиация: принципы, проблемы, подходы//Биотехнология. 1995. № 3-4. С.20-27.

18. Воробьев A.A., Чугасова В.А., Коровин В.И. Проблемы безопасности биотехнологии. М.:ВНИИСЭНТИ, 1986. 69 с.

19. Шарыпова JI.A., Симаров Б.В. Перспективы конструирования и выпуска в окружающую среду генетически модифицированных штаммов клубеньковых бактерий// Генетика. 1994. Т.30, № 11. С.1435-1457.

20. Голиков А.Г., Степанова Н.Г., Красовский О.А., Скрябин К.Г. Конвенция о биологическом разнообразии развитие взгляда на биобезопасность и биотехнологию// Биотехнология. 1997. №1. С.53-58.

21. Smit Е., van Elsas J.D., van Veen J.A. Risks associated with the application of genetically modified microorganisms in terrestrial ecosystems//FEMS Microb.Rev. 1992. V.88. P.263-278.

22. Williamson M. Environmental Risk from the Release of Genetically Modified organisms (GMOs) the Need for Molecular Ecology// Mol.Ecol. 1992. V.l, №.1. P.3-8.

23. Lederberg J. Plasmid (1952-1997)// Plasmid. 1998. V.39, №1. P. 1-9.

24. Geider K., Baldes R., Bellemann P., Metzger M., Schwartz T. Mutual adaptation of bacteriophage fd, pfd plasmids and their host strains// Microbiol.Res. 1995. Vol.150, N4. P.337-346

25. Diels L., Sadouk A., Mergeay L.M. Large plasmids governing multiple resistances to heavy metals: a genetic approach//Environ. Chem. 1989. V.23. P.79-89.

26. Bouchez M., Blanchet D., Vandecasteele J.P. The microbiological fate of polycyclic aromatic hydrocarbons: carbon and oxygen balances for bacterial degradation of model compounds//Appl.Microbiol.Biotechnol. 1996. Vol.45, №4. P. 556-561.

27. Zillig W., Prangishvilli D., Schleper C., Elferink M., Holz I., Albers S., Janekovic D., Gotz D. Viruses, plasmids and other genetic elements of thermophilic and hyperthermophilic Archaea// FEMS.Microbiol.Rev. 1996. Vol.18, №2-3. P. 225-236.

28. Микеров И.Н., Кутырев В.В. Белки внешней мембраны иерсиний, кодируемые плазми-дой вирулентности// Молекул, ген., микробиол. и вирусол. 1997. №3. С. 3-10.

29. Williams D.R., Thomas С. М. Active partitioning of bacterial plasmids// J. of Gener. Microb. 1992. V. 138. P.l-16.

30. Conlry E.C. Saunders J.R. Recombination-dependent recicularization of linearised pBR322 plasmid DNA following transformation in Escherichia colill Mol.Gen.Genet. 1984. V. 194. P.211-218.

31. Summers D.K., Betón C.W.H., Withers H.L. Multicopy plasmid instability: the dimer catastrophe hypotesis// Mol. Microbiol. 1993. V.8, №6. P.1031-1038.

32. Stueber D., Bujard H. Transcription from efficient promotores can interfere with plasmid replication and diminish expression of plasmid specified genes// EMBO Journal. 1982. V.l. P.1399-1404.

33. Вячеславов Л.Г., Мосевицкий Н.И. Высокая мультимеризация плазмиды pBR322 в бактериях E.coli В //Молекул, генетика, микробиол. и вирусол. 1993. №.6. С.23-27.

34. Strauch E., Wohlleben W., Puhler A. Development of a plasmid-cloning System for Streptomyces viridochromogenes Tu 494 // J.Basic Microbiol. 1887. V.21. P.449.

35. Battacharya S., Dubey A.K. Metabolic burden as reflected by maintenance coefficient of recombinant Escherichia coli overexpressing target gene// Biotechnol. Lett. 1995. V.17, №.11. P.1155-1160.

36. Тренина М.А., Лысенко A.M., Суходолец В.В. Изменчивость плазмидного набора штамма Lactococcus lactis 195// Микробиология. 1997. Т66, №2. С. 233-236.

37. Sohaskey C.D., I.H. Schauer А.Т. Construction and application of plasmid and transposon based promoter-probe vector for Streptomyces spp. that employ a Vibrio harveyi luciferase report cassette// J.Bacteriology. 1992. V. 174. P. 367-376.

38. Maniatis Т., Fritsch E.F., Sambrook J. Molecular cloning, a laboratory manual. New york: Gold Spring Harbor Laboratory, 1982.

39. Massie В., Langelier Y., Lamarche N. High level recombination protein production using conditional helper-free adenovirus vector: Пат. 5518913 США, MKU56 0 C12N 1/01, C12N 15/85// National Research Council of Canada. №. 232998.

40. Костров C.B., Носовская E.A., Чистосердов А.Ю., Протасова Н.В., Цыганков Ю.Д., Арсатянц Р.А., Стеркин В.Э., Стронгин А.Я. Регулируемая экспрессия гена интерлейкина-2 человека в клетках E.coli и Pseudomonas putidall Биотехнология. 1990. № 2. С.26-28.

41. Almashanu S., Musafia В., Hadar R., Suissa M.& Kunh I. Fusion of luxA and luxB and its expression in E.coli, S.cerevisia and D.melanogasterll J. of Biolum.and Chemilum. 1990. V.5. P.89-97.

42. Brownlie L., Stephenson J.R., Cole J.A. Effect of growth rate plasmid maintenance by Escherichia coli HB101(pAaT153)// J. Gen. Microbiol. 1990. V. 136. P. 2471-2480.

43. Вейко В.П., Сипрашвили 3.3., Ратманова К.И., Гулько Л.Б., Андрюхина Р.В., Деба-бов В.Г. Клонирование и экспрессия в Escherichia coli тимидинфосфорилазы под контролем промотора уридинфосфорилазы//Биотехнология. 1994. №4. С.2-4.

44. Yanofsky С., Horn V. Role of regulatory features of the trp operon of Escherichia coli in mediating a response to a nutritional shift// J. Bacteriol. 1994. V.176, №.20. P. 6245 6254.

45. Sa J.-H., Namgung M.A., Lim C.-J., Fuchs J.A. Expression of the Escherichia coli Thioredoxin Gene Is Negatively Regulated by Cyclic AMP// Biochem. Biophys. Res. Com. 1997. V.234, №3. P. 564-567.

46. Ulitzur S., Matin A., Fraley C., Meighen E. H-NS Protein Represses Transcription of the lux Systems of Vibrio fischeri and Other Luminous Bacteria Cloned into Escherichia colill Curr. Microbiol. 1997. V. 35. P. 336-342.

47. Hayashi N., Matsubara M., Takasaki A., Titan K., Taniguchi H. An Expression System of Rat Calmodulin Using T7 Phage Promoter in Escherichia coli// Prot. Expr.Purif.1998. V.12, №1. P. 25-28.

48. Gu Man Bock, Dhurjati P.S., Van Dyk Tina K., LaRossa R.A. A miniature bioreactor for sensing toxity using recombinant bioluminescent Escherichia coli cells// Biotechnol. Progr. 1996. V.12, №. 3. P.393-397.

49. Gonzaales-Flecha В., Demple B. Intracellular generation of superoxide as a by-product of Vibrio harvey luciferase expresseed in Escherichia coliII J. Bacteriol. 1994. V.176, №.8. P.2293-2299.

50. Gambello M.J., Ilewski B.H. Cloning and characterization of the Pseudomonas aerugenosa lasR gene, a transcriotional activator of elastase expression// Ann.Rev. Microbiol. 1991. V.50. P. 727-751.

51. Ochsner U.A., Koch A.K., Fiechter A., Reiser J. Isolation and characterization of a regulatory gene affecting rhamnolipid biosurfactant synthesis in Pseudomonas aeruginosa!I J. Bacteriol. 1994. V. 176. P. 2044-2054.

52. Baum J.A., Coyle D.M., Gilbert M.P., JAny C.S., Gawron-Burke C. Novel cloning vectors for Bacillus thurengiensis// Appl.Env. Microbiol. 1990. V.56. №11. P.3420-3428.

53. Jacobs M., Hill P.J., Stewart G.S.A.B. Highly bioluminescent Bacillus subtilis obtained throutg higt-level expression of a lux AB fusion gene// Mol. and Gen. Genetics. 1991. V. 230. P. 251-256.

54. Goldberg I.D., Gwinn D.D., Thome C.B. Interspecies transformation between Bacillus subtilis and Bacillus licheniformisll Biochem. Biophys. Res. Commun.,1966. V.23. P. 543-548.

55. Дебабов В.Г., Лившиц В.И. Современные методы создания промышленных штаммов микроорганизмов. М.: Высш.школа, 1988. 208с.

56. Белогурова Н.Г., Дельвер Е.П., Калюжный С.В., Белогуров А.А., Варфоломеев С.Д. Плазмиды для Clostridium thermosaccharoluticum как потенциальные векторы для генно-инженерных манипуляций с термофильными клостридифми// Биотехнология. 1992. №5. С. 27-34.

57. Марченко Н.Д., Марченко Г.Н., Азизбекян P.P. Конструирование векторов широкого круга хозяев различного функциональ Bacillus thurengiensis в грамотрицательных бактериях//Биотехнология. 1994. № 3. С7 2-5.

58. Stotzky G. Gene transfer among bacteria in soil// Gene transfer in the enviroment/ Eds. Levy В.,Miller R.V. New-York: Mc. Grow-Yill Book Co., 1989. P. 165-222.

59. Griffith F. The significance of pneumococcal types// J. Hyg. 1928. V. 27. P. 113-159.

60. Zeph L.R., Oraga M.A., Stotzky G. Transduction of Escherichia coli by bacteriphage PI in soil// Appl.Environ.Microbiol. 1988. № 54. P. 1731-1737.

61. Ippen-Ihler K. Bacterial conjugation/ Gene transfer in the environment. New-York: McGraw Hill Publishing Co, 1989. P.33-72.

62. Clewell D.B., Gawron-Burke C. Conugative transposons and the dessimination of antibiotic resistance in streptococci// Annu. Rev. Microbiol. 1986. V.40. P. 635-659.

63. Stewart G.J., Carlson C.A. The biology of natural transformation// Annu.Rev.Microbiol. 1986. V.40. P.211-235.

64. Вельков В.В. Интродукция генетически модифицированных микроорганизмов в окружающую среду. Перспективы и риск.// Генетика. 1994. Т.30. №5. С.581-592.

65. Kahn М., Concio М., Gromkova R., Goodgal S. DNA binding vesicles produced by competence deficient mutants of Haemofilusll Biochem. Biophys.Res. Commun. 1979. V.87. P.764-772.

66. Dreiseikelmann B. Translocation of DNA across bacterial membranes// Microbiological Rewiews 1994. V.58, №. 3. P. 293-316.

67. Hill K.E., Fry J.C., Weightman A.J., Day M.J., Bradley D.J., Comsland B. Retrotransfer of Inc PI-like plasmids from aquatic bacteria// Lett.Appl.Microbiol. 1995. V.20. P. 317-322.

68. Natarajan M.R., Oriel P. Transfer of transposon Tn9 from Bacillus subtilis into a natural soil population//Appl.Env.Microbiol. 1992. V.58. P.2701-2703.

69. Lorenz M.G., Wackernagel W. Bacterial gene transfer by natural genetic transfer by natural genetic transformation in the environment// Microbial. Rev. 1994, V.5. № 3. P.563-602.

70. Четина E.B. Влияние некоторых физиологических и генетических факторов на процесс перехода энтеротоксигенных штаммов Escherichia coli в некультивируемое состояние// Мол. генетика, микробиол. и вирусол. 1997. №1. С. 8-14.

71. Bacterial genetics in natural environments/ Eds Fry J.D., Day M.J. L.:Chapman and Hall, 1990.

72. Borenstein S., Ephrati-Elizur E. Spontaneous release of DNA in sequential genetic order by Bacillus subtilisll J.Mol.Biol. 1996. V.45. P. 137-152.

73. Magnuson N.S., Linzmaier P. M., Reeves R., An G., HayGlass K., Lee J.M. Secretion of biologically bctive human interleukin-2 and interleukin-4 from genetically modified tobacco cells in suspension culture//Prot. Expr.Purif. 1998. V. 13, № 1. P. 45-52.

74. Fernandez-Astorga A., A.Muela, R.Cisterna, J.Iriberri, Barcina I. Biotic and abiotic factors affecting plasmid transfer in Escherichia coli strains// Appl.Environmen.Microbiol. 1992. V.58, №.1. P.392-398.

75. Daane L.L., Molina J.A., Berry E.C., Sadowsky M.J. Influence of earthworm activity on gene transfer from Pseudomonas fluorescens to indigenous soil bacteria// AppLEnviron.Microbiol. 1996. Vol.62, №2. P. 515-521

76. Rattray E.A.S., Prosser J.I., Killham K., Clover L.A. Luminescence based nonextractive technique for situ detection of Escherichia coli in soil// App.Env.Microbiol. 1990. V.56, № 12. P.3368-3374.

77. Teng F., Murray B.E., Weinstock G.M. Conjugal transfer of plasmid DNA from Escherichia coli to Enterococci: a method to make insertion mutations// Plasmid. 1998. V. 39, №3. P. 182-186.

78. Bej A.K., Perlin M., Atlas R.M. Effect of introducing of genetically engineered microorganisms on soil microbial community diversity // FEMS Microbiol. Ecol. 1991. № 86. P. 169-176.

79. Khanna M., Stotzky G. Transformation of Bacillus subtilis by DNA bound on montmorillonite and effect of DNase on the transforming ability of bound DNA// Appl. Environ. Microbiol., 1992. V.58. P. 1930-1939.

80. O'Morchoe S.B., Ogunseitqn O., Sayler G.S., Miller R.V. Conjugal transfer of R68.45 and FP5 between Pseudomonas aeruginosa strains in a freshwater environment// Appl. Env. Microbiol. 1988. V.54. P. 1923-1929.

81. McClure N.C., Fry J.C., Weightman AJ. Survival and catabolic activity of natural and genetically engineered bacteria in laboratory-scale activated-sludge unit// Appl.Env.Microdiol. 1991. V.57, №.2. P.366-373.

82. Simonsen L., Gordon D.M., Stewart F.M., Levin B.R. Estimating the rate of plasmid transfer: an end-point method// J. Gen. Microbiol. 1990, V. 136. P. 2319-2325.

83. Van Elsas J.D., Trevors J.T. Environmental risks and fate of genetically engineered microorganisms in soil// J.Environmen. Sci.Health. 1991. V.26. P. 981-1001.

84. Hermasson M., Linberg C. Gene transfer in the marine environment// FEMS Microbiol. Ecol. 1994. V.15.P. 47-54.

85. Trevors J.T., BarkarT., BourquinA.W. Gene transfer among bacteria in soil and aquatic environments: a review// Can.J.Microbiol. 1988. № 42. P. 717-743.

86. Van Elsas J.D., Govaeret J.M., Van Veen J.A. Transfer of plasmid pFT30 between Bacilli ib soil as influenced by bacterial population dynamics and soil condintions// Soil Biol. Biochem. 1987. V.19, № 5. P.639-647.

87. Paul J.H., David A.W. Production of extracellular nucleic acids by genetically altered bacteria in aquatic-environment microcosms// Appl. Environ. Microbiol. 1989. V.55. P. 1963-1966

88. Lebaron P., Roux V., Lett M.C., Baleux B. Effects of pili regidity and energy availability on conjugative placmid transfer in aquatic environments// Microbiol. Releases. 1993. V.2. P. 127-133.

89. Arana I., Justo J.I., Pocino M., Iriberri J., Barcina I. Influence of survival process in a freshwater system upon plasmid transfer between Escherichia coli strains// Microbial Ecology. 1997. V.33. P. 41-49.

90. Gerjets D., Wackernagel W. Release of transforming plasmid and chromosomal DNA from two cultured soil bacteria//Arch.Microbiol. 1991. V.156. P. 319-326.

91. Cohan F.M. Roberts M.S. King E.C. The potential for genetic exchange by transformation within a natural population of Bacillus subtilisII Evolution. 1991. V.45. P.1383-1421.

92. Воробьев А.А., Хорошко Н.В., Селезнева О.Ю. Рекомбинантные штаммы: Биологические свойства и меры безопасности при работе./Вестн.Рос.АМН. 1993. № 2. С.31-37.

93. Уотсон Дж., Туз Дж., Курц Д. Рекомбинантные ДНК. Краткий курс: Пер. с англ. М.: Мир, 1986. С. 54-83.

94. Friedrich W.F., Greenberg Е.Р. Glucose repression of luminescence and luciferase in Vibrio fischeri// Arch.Microbiol. 1983. V. 134. P. 87-91.

95. Anderson W.B. Pastan I. Catabolitical activation protein in the bacteria //Biochem.Biophys.Acta. 1973. V.10, №3. P.577-587.

96. Jacob F., Monod J. Genetic regulatory mechanisms in the synthesis of proteins// J. Mol. Biol. 1961. V.3. P.318-356.

97. Friedrich W.F., Greenberg E.P. Glucose repression of luminescence and luciferase in Vibrio fischeri!I Arch.Microbiol. 1983. V. 134. P. 87-91.

98. Collins J.F. The regulation of penicillinase synthesis in gram-positive bacteria/ Metabolic Pathways. Lodon: Academic Press 1971. P.489-521.

99. Calvo J.M., Matthews R.G. The leucin-responsive regulatory protein, a global regulator of methabolism in Escherichia colill Microbiol Rev. 1994. V. 58, №. 3. P. 466-490.

100. Michalizin G.A., Meighen E.A. Unduced polipeptide synthesus during the development of bacterial bioluminescence// J. Biol.Chem. 1976. V. 251, №.9. P.2541-2549.

101. Nealson K.H. Piatt Т., Hastings J.W. Cellular control of the synthesis and activity of the bacterial luminescent system// J. Bacteriol. 1970. V. 104. P. 313-322.

102. Gentry D.R., HernandezV.J., Mguyen L.H., Jensen D.B., Cashel M. Synthesis of the stationary phase sigma factor positively regulated by ppGpp// J. Bacteriol. 1993. V. 175. P.7982-7989.

103. Астаурова О.Б., Погорелова Т.Е., Фомина О.Р., Полякова И.Н., Яненко А.С. Регуляция биосинтеза ферментов биодеградации нитрилов у Rhodococcus rhodochrous МО// Биотехнология. 1991. №5. С. 10-14.

104. Williams М.К., Stec В., Kantrowitz Е. R. A rk К Single mutation in the regulatory chain of Escherichia coli aspartate transcarbamoylase results in an extreme T-state structure// J. Mol. Biol. 1998. V 281, №17. P. 121-134.

105. Bhargava P. Sigma 570 0 of Escherichia coli: many more wonders// Curr. Sci. (India). 1994. V.67, №.7. P.490-491.

106. Kenney L.J., Bauer M.D., Silhavy T.J. Phosphorylation-dependent conformational changes in OmpR, an osmoregulatory DNA binding protein of Escherichia coli// Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1995. Vol. 92. P. 8866-8870.

107. Setlow В., Setlow P. Small, aacid-soluble proteins bound to DNA protect Bacillus subtilis spores from killing by dry heat// Appl.Env.Microb. 1995. V.61, № 7. P.2787-2790.

108. Cohen G. Regulation of enzyme activity in microorganisms// An. Rev. Microbiol. Palo Alto: Annual Rev. 1965. Vol. 19. P. 105-126.

109. Roberts J.W., Roberts C.W., Craig N.L. Escherichia coli recA product inactivates phage X repressor//Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1978. V. 75, № 10. P. 47114-4718.

110. Gilson L., Kuo A., Dunlup P.V. AinS and a new family of autoinducer synthesis proteins// J. Bacteriol. 1995. V.177, №23. P.6946-6951.

111. Pierson in L.S., Wood D. W., Pierson E. A., Chancey S.T. N-acyl-homoserine lactone-mediated gene regulation in biological control by fluorescent pseudomonads: current knowledge and future work// Europ. J. Plant Pathol. 1998. V.104. P. 1-9.

112. Piper K.R., Beck von Bodman S., Farrand S.K. Conjugation factor of Agrobacterium tumefaciens regulates Ti plasmid transfer by autoinduction//Nature. 1993. V. 362. P. 448-450

113. Fuqua W.C., Winans S.C., Greenberg E.P. Quorum sensing in bacteria: the LuxR-LuxI family of cell density-responsive transkriptional regulators// J. Bacteriol. 1994. V. 176. P.269-275.

114. Meighen A.E., Dunlap P.V. Physiological, biochemical and genetic control of bacterial bioluminescence// Adv.in Microbial Physiology. 1993. V. 34. P. 1-67.

115. Камашев Д.Э., Эбралидзе K.K., Есипов Н.Г., Мирзабеков А.Д. Влияние ииндуктора на ориентацию ДНК-сввязывающих доменов /яс-репрессора// Мол. биология. 1995. Т.29, №.4. С. 950-960.

116. Gilbert W., Muller-Hill В. Isolation of the lac repressor// Proc.Natl. Acad. Sci. USA. 1966. V.56. P.1891-1898.

117. Ptashne M. Isolation of the X phage repressor// Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1967. V. 60. P.1282-1287.

118. Meighen E.A. Bacterial bioluminescence: organization, regulation, and application of the lux genes// FASEB J. 1993. Vol.7, №11. P. 1016-1022.

119. Pearson J.P., Gray K.M., Passador L., Tucker K.D., Eberhard A., Iglewaski B.H., Greenberg E.P. Structure of the autoinducer required for expression of Pseudomonas aeruginosa virulence genes// Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1994. V. 91. P. 197-201.

120. Brenchley J.A., Baker C.A., Patil L. G. Regulation of the ammonia assimilation enzymes in Salmonella typhimurium// J. Bacteriol. 1975. V. 124. P. 182-189.

121. Johnson A.D. The price of repression// Cell. 1995. V.81. P. 655-659.

122. Werner K.M. The arginine repressor of Escherichia colill Microbiol. Rev. 1994. V.58, № 4. P.631-640.

123. Швинка Ю.Э. Энергетическая эффективность метаболизма бактерий//Успехи мик-робиол. М.: Наука, 1992. Т. 25. С. 211-237.

124. Гузев B.C., Халимов Э.М., Волде М.И., Куличевская И.С. Регуляторное действие глюкозы на активность углеводородокисляющих микроорганизмов в почве// Микробиология. 1997. Т.66, №2. С. 154-159.

125. Голышин П.Н., Гузев B.C. Роль минеральных солей и цАМР в утилизации почвенными микроорганизмами полимерных субстратов// Вестн. Моск. ун-та. 1992. Сер. 17. №2. С. 56-62.

126. Головченко Н.П., Чувильская Н.А., Акименко В.К. Регуляция биосинтеза целлюлоли-тических ферментов и начальных ферментов катаболизма глюкозы и целобиозы у Clostridium thermocellum/'/ Микробиология. 1986. Т.55, Вып.1. С. 31-33.

127. Shiba Т., Hill R.T., Straube W. L., Colwell R.R. Decrease in culturability of Vibrio cholerae caused by glucose// Appl. env. Microbiol. 1995. V. 61. P. 2583-2588;

128. O'Connor K., Buckley C.M., Hartmans S., Dobson A.D.W. Possible revulatory role for nonaromatic carbon sourdes in styrene degradation by Pseudomonas putida CA-3// Appl. Env. Microbiol. 1995. V.61. P. 544-548.

129. Mikulskis A., Aristarkhov A., Lin E.C.C. Regulation of expression of the ethanol dehydrogenase gene (adhE) in Escherichia coli by catabolite repressor activator protein Crall Journal of Bacteriology. 1997. Vol. 179, №. 22. P. 7129-7134.

130. Noel R.J., Reznikoff W.S. CAP, the -45 Region, and RNA polymerase: three partners in transcription initiation at lac? I in Escherichia colill J. Mol. Biol. 1998. V.282, №3. P. 495-504

131. Wing HJ., Williams S.M., Busby S.J.W. Spacing requirements for transcription activation by Escherichia coli FNR protein// J. Bacteriol. V.177, №.23. P.6704-6710.

132. Jishage M., Ishihama A. Regulation of RNA polymerase sigma subunit synthesis in Escherichia coli: intracellular levels of a70 and o38// J. Bacteriol. 1995. V.177, № 23. P. 68326835.

133. Ueguchi C., Suzuki Т., Yoshida Т., Tanaka K.-I., Mizuno T. Systematic mutational analysis revealing the functional domain organization of Escherichia coli nucleoid protein H-NS// J. Mol. Biol. 1996. V.263, № 2. P. 149-162.

134. Murphy L.D., Zimmerman S.B. Stabilization of compact spermidine nucleoids from Escherichia coli under crowded conditions: implications for in vivo nucleoid structure// J. Struct. Biol. 1997. V.l 19, №3. P. 336-346.

135. Boosl W., Shuman H. Maltose/Maltodextrin System of Escherichia coli: transport, metabolism, and regulation//Microbiol. Molec. Biol. Rev. 1998. Vol. 62, №. 1. P. 204-229.

136. Gallegos M.-T., Schleif R., Bairoch A., Hofmann K., Ramos J.L. AraC/XylS family of transcriptional regulators// Microbiol. Molec. Biol. Rev. 1997. Vol. 61, №. 4. P. 393-410.

137. Deutscher J, Kester E, Bergstedt U, Charrier V, Hillen W. Protein kinase-dependent HPr/CcpA interaction links glycolytic activity to carbon catabolite repression in Gram-positive bacteriaII Mol. Microbiol. 1995. V.15, №6. P. 1049-1053.

138. Завигельский Г.Б., Манухов И.В. Роль Хя-протеазы в негативном контроле экспрессии luxICDABE Vibrio fischeri в клетках Escherichia colill Мол. биол. 1997. Т.32. С. 945-949.

139. Matin A., Little C.D., Fraley C.D., Keyhan М. Use of starvation promoters to limit growth and select for trichloriethylene and phenol tranformation activuty in recombinant Escherichia colill Appl. Env. Microbiol. 1995 V. 61, №9. P.3323-3328.

140. Королева O.H., Друца B.JI., басби С.Дж.В. Модельный прокариотический промотор. VI. Свойства конструкций, содержащих перекрывающиеся консенсунсные промоторы// Молеккул. биол. 1997. Т.31, №6. С. 935-944.

141. Моно Ж., Жакоб Ф. В сб. Регуляторные механизмы клетки. М.: Мир. 1964. С. 477497.

142. Meighen А.Е. Molecular biology of bacterial bioluminescence// Microbiol.Rev. 1991. V.55. P.123-142

143. Клонирование ДНК. Методы. M.: Мир, 1988. С.219-227.

144. Guzman L.-M., Belin D., Carson M.I., Beckwin J. Tight regulation, modulation, and high level expression by vectors containing the arabinose Рвad promoter// J. Bacteriol. 1995. V.177, №.4. P. 4121-4130.

145. Klemm P., Jensen L.B., Molin S. A stochastic killing system, for biological containment of Escherichia colill Appl. Env. Microbiol. 1995. V.61, №2. P.481-486.

146. Molin S., Klemm P., Poulsen L.K., Gerdes K. Andersson P. Conditional suicide system for containtment of bacteria and plasmids// Biotechnology. 1987. №.5. P. 1315-1318.

147. Trevors J.T., Elsas J.D. A review of selected methods in environmental microbial genetics// Can.J.Microbiol. 1989. V.35. № 10. P. 895-902.

148. Schmidt, S.K., Colores, G.M., Hess, T.F., Radehaus, P.M. A simple method for quantifying activity and survival of microorganisms involved in bioremediation processes// Appl.Biochem.Biotechnol. 1995. Vol. 54, №1-3. P.259-270.

149. Porter J., Deere D., Pickup R., Edwards C. Fluorescent probes and flow cytometry: new insights into environment bactteriology// Cytometry. 1996. V.23. P.91-96.

150. Porter J., Diaper J., Edwards C., Pickup R. Direct measurements of natural planctonic bacterial community viability by flow cytometry// Appl. Env. Microbiol. 1995. V.61, №7. P.2783-2786.

151. Чернов И.Ю. Микобное разнообразие: новые возможности старого метода// Микробиология. 1997. Т.66. № 1. С. 107-113 Чернов И.Ю. Микобное разнообразие: новые возможности старого метода// Микробиология. 1997. Т.66. № 1. С. 107-113.

152. Arnann R. I., Ludwig W., Schleifer K.-H. Phylogenetic identification and in situ detection of individual microbial cells without cultivation//Microbiol. Rev. 1995. V.59, №.1. P.143-169.

153. Pitulle C., Hedenstierna K.O.F., Fox G.E. A novel approach for monitoring genetically engineered microorganisms by using artificial, stable RNAs// Appl. Env. Microbiol. 1995. V.61, №.10. P. 3661-3666.

154. Amy P.S., Hiatt H.D. Survival and detection of bacteria in an aquatic environment// Appl. and Environ. Microbiol. 1989. V.55. № 4. P. 788-793.

155. Bejerenck M.W. Die leuthbacterien der Nord sea in august und septomber// Folia Microbiol. 1916. V.4. P. 15-40.

156. Harvey E. N. A history of luminescence// Am. Phil.Soc. Philadelphia, 1957a.

157. Engebrecht J., Nealson K.H., Silverman M. Bacterial bioluminescence: isolation and genetic analysis of functions from Vibrio fischerill Cell. 1983. V. 32. P. 773-781.

158. Flemming C.A.,Leung K.T.,Lee H.,Trevors J.T.,Greer C.W. Survival of lux-lac-marked biosurfactant-producing Pseudomonas aerugenosa UG2L in soil monitorrd by nonselective plating and PCR//Appl.Env.Micr. 1994, v.60,№5,p. 1606-1613.

159. Shaw J.J.,Dane F.,Geiger D.,Klopper J.W. Use of bioluminescence for detection of genetically engineered microorganisms released into the environment// Appl.Env.Microb. 1992. V.58. P.267-273.

160. Van-Dyke M.I., Lee H., Trevors J.T. Survival of /ux^B-marked Alcaligenes eutrophus H850 in PCB-contaminated soil and sediment// J.Chem.Technol.Biotechnol. 1996. Vol.65, №2. P.l 15-122.

161. White D., Leifert C., Ryder M., Killham K. Lux gene technology a strategy to optimize biological control of soil-borne diseases// New Phytol. 1996. V. 133. P.173-181.

162. Ferguson Y., Glover L.A., McGillivray D.M., Prosser J.I. Survival and activity of lux-marked Aeromonas salmonicida in seawater// Appl. Env. Microbiol. 1995. V.61, №9. P.3494-3498.

163. Hall L.R., Harding S.E., Waites W.M. Use of bioluminescence to study heat resistance of spores of Bacillus megaterium KM// J. Appl.Bacteriology. 1990. V.69. P. 26-30.

164. Duffy G., Ellison A., Anderson W., Cole M.B., Stewart S.A.B. Use of bioluminescence to model the thermal inactivation of Salmonella typhimorium in the presence of a competitive microflora//AppLEnv. Microbiol. 1995. V.61, №9. P.3463-3465.

165. Lampinen J., Virta M., Karp M. Use of controlled luciferase expression to monitor chemicals affecting protein synthesis// Appl. Env. Microbiol. 1995. V.61, №8. P. 2981-2989.

166. Burlage R.S., Sayler G.S. & Larimer F. Monitoring of naphthalene catabolism by bioluminescence with nah-lux transcriptional fusions// J.Bacteriology. 1990. V.172. P.4749-4758

167. Shaw J.J., Kado C.J. Development of Vibrio bioluminescence gene-set to monitor phitopathogenic bacteria during the ongoing disease process in non-disruptive mannual// BioTechnology. 1986. V.4. P. 560-564.

168. Stewart G.S. A. B., Williams P. Lux genes and the application of bacterial bioluminescence//J. ofGener. Microbiol. 1992. V. 138. P. 1289-1300.

169. Hastings J.W., Potrikas C.J., Gupta S.C., Kurfurst M., Makemson J.C. Biochemistry and physiology of bioluminescent bacteria// Adv. Microbiol.Physiol.1985. V.26. P.235-291.

170. Miyamoto C., Boylan M., Cragg L., Meighen E. Comparison of the Lux systems in Vibrio harveyi and Vibrio fischerill J. Bioluminescence and Chemiluminesccence. 1988. V.2, №.4. P.237.

171. Byers D.M. Luminescence-specific synthesis of myristic acid in the bioluminescent bacterium Vibrio harveyi// Biochem. and Cell Biol. 1988. V.66, №.7. P.741-749.

172. Mansini J.A., Boylan M., Soly R.R., Graham A.F. Meighen E.A. Cloning and expression of the Photobacterium phosphoreum luminescence system demonstrates a unique lux gene organization// J. Biol. Chem. 1988. V.263. P.14308-14314.

173. Lee C.Y., Szittner R., Meighen E.A. The lux genes of the luminous bacterial symbiont, Photobacterium leiognathi, oftheponyfish//Eur.J.Biochem. 1991. V.201. P. 161-167.

174. Xi L., Cho K.W., To S.C. Cloning and nucled sequences of lux genes and characterization of luciferase Xenorhabdus luminescence from a human wound// J.of Bacteriology. 1991. V. 173. P. 289-301.

175. Fravel D.R., Lumsden R.D., Roberts D.P. In situ visualization of the biocontrol rhisobacterium Enterobacter cloacae with bioluminescence// Plant Soil. 1990. V.125. P.233-238

176. Hastings J.W., Nealson K.H. Bacterial bioluminescence// An.Rev.Microbiol. 1977. V.31. P.549-595.

177. Lee J. The mechanism of bacterial bioluminescence/ Chemiluminescence and bioluminescence. N.-Y.: Marcel Dekker Inc. 1985. P. 401-437.

178. Meighen E.A. Genetics of bacterial biolumenscence// Ann. Rev. Genet. 1994. V. 28. P.117-139.

179. Lin J.-W., Lin B.-L., Chen H.-Y., Shu-Fen Weng S.-F. Characteristic analysis of the luzA gene encoding chaperone from Photobacterium leiognathi related to bioluminescence// Biochem. Biophys. Res. Com. 1998. V. 244, №3. P.838-842.

180. Lin J.-W., Yu K.-Y., Chen H.-Y., Weng S.-F. Regulatory region with putA gene of proline dehydrogenase that links to the lum and the lux operons in Photobacterium leiognathill Biochem.Biophys.Res. Com. 1996. V.219, №3. P. 868-875.

181. Lin J.-W., Chao Y.-F., Weng S.-F. Nucleotide sequence and functional analysis of the luxE gene encoding acyl-protein synthetase of the lux operon from Photobacterium leiognathill Biochem. Biophys. Res. Com. 1996. V.228, №3. P. 764-773.

182. Eberhard A., Burlingame A.L., Eberhard C., Kenyon G.L., Nealson K.H. Oppenheimer N.J. Structural identification of the autoinduceer of Photobacterium Jischeri luciferasse// Biochemistry. 1981. V. 20. P.2444-2449.

183. Engebrecht J., Silverman M. Identification of genes and gene products necessary for bacterial bioluminescence// Proc. NAt. Acad. Sci. USA. 1984. V. 81. P. 4154-4158.

184. Шендеров A.H., Виделец И.Ю., Попова Л.Ю. Влияние глюкозы на развитие биолюминесценции, индуцированной аминокислотами у Photobacterium beloserskii/l Известия СО АН СССР. 1980. Вып.1. С.89-96.

185. Dunlap P.V., Mueller U., Lisa T.A., Lundberg K.S. Growth of the marine luminous bacterium Vibrio fischei on 3':5'-cyclic AMP: correlation with a periplasmic 3':5'-cyclic AMP phosphodiesterase// J. ofGener. Microb. 1992. V. 138. P. 115-123,

186. Nealson K.H., Hastings J.W. Bacterial bioluminescens: its control and Ecological significans// MicrobioLRev. 1979. V.43, № 4. P.496-518.

187. Rupani S.P., Gu Man Bosk, Konstantinov K.B., Dhurjati P.S., Van Dyk Tina K., LaRossa R.A. Characterizaion of the stress response of the bioluminescent biologica sensor in batch and continous culture// Bitechnol.Progr. 1996. V.12, № 3. P.387-392.

188. Ulitsur S. Factors affecting the cellular expression of bacterial luciferase// Arch.Microbiol. 1981. V.129. P.67-71.

189. Strehler B.L., Jonson F.H. The temperature-pressure inhibitor relationof bacterial luminescence in vitro// Proc. Nat. Acad. Sci. USA. 1954. V. 40. P. 10-12.

190. Giese Q.H. Effects of ultraviolet radiations on luminescence and respiration of Achromobacter Jlscherill J. Cell. Сотр. Physiol. 1946. V. 96. P.80.

191. Светящиеся бактерии. Новосибирск: Наука, 1984. 278 с.

192. Wada М., Kogure К., Ohwada К., Simidu U. Coupling between the respiratory chain and the luminescent system of Vibrio harveyill J. of Gener. Microb. 1992. V.138. P.1607-1611.

193. Гемжа А., Рузгенс А., Вашкайте В., Рузгите P., Дилявичуте Я. Исследование условий биосинтеза люциферазы культурой Photobacterium phosphoreum 430// Прикл. биохимия и микроб. 1994. Т.30, вып.4-5. С.582-588.

194. Langridge W., Escher A., Wang G., Ауге В., Fodor I., Szalay A. Low-Light image analysis of transgenicc organisms using bacterial luciferase as a marker// J.Biolumin.Chemilumin. 1994. V.9. P.185-200.

195. Park S.F., Nissen U., Stewart G.S.A. The cloning and expression of lux А В in Listeria monocytogenes! In Bioluminescence & Chemilum. Current Status, pp.35-38. Edited by P.E.Stenley & L.J. Kricka. Chichester: John Wiley. 1991.

196. Inouye S., Nakazawa T. Nucleotide sequence of the promoter region of the xylDEGF operon on TOL plazmids of Pseudomonasputidall Gene. 1984. V.29. P.323-330.

197. Sheehan B.J., Foster T.J., Dorman C.J., Park S.F. & Stewann G.S.A.B. Osmotic and growth-phase dependent regulate of the eta gene of Staphylococcus aureus: a role for DNA supercoiling// Mol. and Gen. Genetics. 1992. V. 55. P.1516-1520.

198. Dammann-Kalinovskii Т., Niemann S., Keller M., Selbischka W., Tebbe C.C., Puller A. Characterization of two bioluminescent Rhizobium meliloti strains constructed for field releases// Appl. Microbiol. Biotechnol. 1996. V.45. P. 509-512.

199. Wolk C.P., Cai Y., PanoffJ.-M. Use of transposon with luciferase as a reporter to identify environmentally responsive genes in cyanobacterium// Microbiology. 1991. V.88, №6. P.5355-5359.

200. Дужий Д.Е., Завигельский Г.Б. Бактериофаг лямбда: LUX: конструирование и экспрессия биолюминесценции в клетках Е. coli// Молекул, генетика, микробиол. и вирусол.,1994. №2. С. 36-38.

201. Kodikara С.Р., Crew H.H., Stewart G.S.A.B. Near on-line detection of enteric bacteria using lux recombinant bacteriophage// FEMS Microbiology Letters. 1991. V. 83. P. 261-266

202. Barton G.A., Gunnison D., Lanza G.R. Survival of pathogenic bacteria in various freshwater sedimants// Appl. Env. Microbiol. 1987. V. 53. P. 633-638.

203. Sorensen S.J. Survival of Escherichia coli K12 in seawater// FEMS Microbiol. Ecol. 1991. V. 85. P.161-168.

204. Liang L.N., Sinclair J.L., Mallory L.M., Alexandeer M. Fate in a model ecosystems of microbial species of petential use in genetic engineering//Appl. Env. Microbiol. 1982. V. 44. P.708-714.

205. Byrd J. J., Colwell R.R. Long-term survival and plasmid maintenance of Escherichia coli in marine microcosms// FEMS Microbiol. Ecol. 1993. V. 2. P.9-14.

206. Armstrong J.L., Knudsen G.R., Seidler R.J. Microcosm method to assess survival of recombinant bacteria associated with plants and herbivorous insects// Curr.Microb. 1987. 15. P.229-232.

207. Meikl A., Amin-Hanjani S., Glover A.L., Killham K., Prosser J.I. Matric potential and the survival aactivity of a Pseudomonas fluorescence inoculum in soil// Soil Biol, and Biochem.1995. V.27,№.7. C. 881-892.

208. Gile J.D., Collins J.C., Gillett J.W. Fate and impact of selected wood preservatives in a terrestrial model ecosystem// J. Agric. Food. Chem. 1982. V. 30. P.295-301.

209. Natioanal Research Consil. Field tessting genetically modified organisms: framework for desisions. Washington: National Acaademy Press, 1989.

210. Krimsky S., Wrubel R.P., Naess I.G., Levy S.B., Wetzler R. E., Marshall B. Standardized micrjcosms in microbial risk assessement// BioSci. 1995. V.45, №.9. P. 590-599.

211. Barton J., Ford R.M. Determination of effective transport coefficients for bacterial migration in sand columns// Appl. Env. Microbiol. 1995. V.61, № 9. P. 3329-3335.

212. Trevors J.T., Elsas J.D., Van Overbeek L.S., Starodub M.E. Transport of genetically engineered Pseudomonas fluorescense strain throug two a Soil Microcosm //Appl.Environ.Microbiol. 1990. V.56. № 2. P. 401-408.

213. Dukstra A.F., J.M. Govaert, G.H.N. Scholten, J.D. Van Elsas A soil chamber for studying the bacterial distribution in the vicinty of roots//Soil Biol.Biochem. 1987. V.19. № 3. P. 351352.

214. Van Veen J. A. , van Overbeek L. S., van Elsas J. D. Fate and activity of microorganisms introduced into soil// Microbiol. Molec. Biol. Rev. 1997. Vol. 61, № 2. P. 121-135.

215. Angle J.S., Levin M.A., Gagliardi J.V., Mcintosh M.S. Validation of microcosms for examining the survival of Pseudomonas aureofaciens (lacZY) in soil// Appl.Env.Microbiol. 1995. V.61,№8. P.2835-2839.

216. Hassani M.D., Pincus D.H., Bennett G.N., Hirshfield I.N. Temperature-dependent induction of an acid-inducible stimulation of Escherichia coli in broth// Appl. Environ. Microbiol. 1992. V.58. P.2704-2707.

217. Oliver J.D., McDougaldD., Barrett T., Glover L. A., Posser J.J. Effect of temperature and plasmid carriage on nonculturability in organisms targeted for relase// FEMS Microbiol. Ecol. 1995. V. 17. P. 229-238.

218. Graumann P., Marahiel M.A. Some like it cold: response of microorganisms to cold shock//Arch. Microbiol. 1996. V. 166. P. 293-300.

219. Zhang Y., Olsen D.R., Nguyen K.B., Olson P.S., Rhodes E.T., Mascarenhas D. Expression of eukaryotic proteins in soluble form in Escherichia colill Pro. Expr.Purif. 1998. V. 12, № 2. P. 159-165.

220. Lucht J.M., Bremer E. Adaptation of Escherichia coli to hugh osmolarity environment: osmoregulation to the high-affinity glycine betaine trnsporter system ProUII FEMS Microbiol.Rev. 1994. V.14. P. 3-20.

221. Barcina I., Lebaron P., Vives-Rego J. Survival of allochthonous bacteria in aquatic systems: biological approach// FEMS Microb.Ecology. 1997. P. 1-9.

222. Ogahara T., Ohno m., Tokayama M., Igarashi K., Kobayashi H., Accumulation of glutamate by osmolitically stressed Escherichia coli is depended on pH// J. Bacteriol. 1995. V.177, №20. P. 5987-5990.

223. Islam M.S., Rezwan F.B., Khan S.I. Survival of Shigella flexneri in artificial aquatic environment: effects of different physicochemical stress factors// J.Diarrhoeal.Dis.Res. 1996. Vol.14, №1. P. 37-40.

224. Munro P.M.,Clement R.L.,Flatau G.N., Gauthier M.J. Effect of termal, oxidative, osmotic, or nutritional stresses on susequent culturability of Escherichia coli in seawater// Microb.Ecol. 1994. V.27. P.57-63.

225. Eisenstark A., Miller C., Jones J., Leven S. Escherichia coli genes involved in cell survival during dormancy: role of oxidative stress// Biochem. Biophys. Res. Commun., 1992. V.188. P.1054-1059.

226. Marthi В., Fieland V.P., Walter M., Seidler R.J. Survival of bacteria during aerosolization// Appl. Env. Microbiol. 1990. V.56. №. 11. P.3463-3467.

227. Fujikwa H., Ushioda H., Kudo S. Kinetics of Escherichia coli destruction by microwave irradiation// Appl.Env.Microbiol. 1992. V.58. № 3. P.920-924.

228. Muela A., Arana I., Garcia-Bringas J.M., Iriberri J., Barcina I. Effect of visible light upon Escherichia coli activity in freshwater system: role of humic acids// J.Appl.Bacteriol. 1996 (submitted).

229. Боиле Д., Монтелоне Б., Корнео А., Такимото JI. Влияние невесомости на рост, морфологию и экспрессию рекомбинантного белка в клетках Escherichia colill Косм, исследов. 1996. Т.34, №.6. С.658-662.

230. Sobecky P.A., Schall М.А., Moran М.А., Hodson R.E. Adaptation of model genetically engineered microorganisms to lake water: growth rate enhanceements and plasmid loss// Appl. Environ. Microbiol. 1992. V. 58. P. 3630-3637.

231. Moller S., Kristensen С.S., Poulsen L.K., Carstensen J.M., Molin S. Bacterial growth on surfaces: automated image anlysis for quantification of growth rate-related paramètre// Apll. Env. Microbiol. 1995. V. 61. P.741-748.

232. Matin A. The molecular basis of carbon-stavration-induced general resistance in Escherichia colill Mol.Microbiol. 1991. V.5. № 1. P.3-10.

233. Galdiereo E., Donnarumma G., de Martino L., Marcatili A., Cipollaro de L'Ero G., Merone A. Effect of low nutrient seawater on morphology, chemical composition and virulance of Salmonella typhimuriumll Arch. Microbiol. 1994. V.162. P. 41-47.

234. Ostling J., Flardh K., Kjelleberg S. Isolation of a carbon starvation regulatory mutant in a marine Vibrio strains//J. Bacteriol. 1995. V.177, №23. P.6978-6982.

235. Романова Ю.М., Гннцбург А.Л. Есть ли сходство в механизмах образования "некультивируемых" форм у грамотрицательных бактерий и спор бацилл? //Молекул, генетика,микробиол. и вирусол. 1993. №6. С.34-36.

236. Иванов А.Ю., Фомченков В.М., Хасанова JI.A., Гаврюшкин А.В. Токсическое действие гидроксилированных ионов тяжелых металлов на цитоплазматическую мембрану бактериальных клеток// Мискробиология. 1997. Т.66. №5. С. 588-594.

237. Klein Т.М. et al. Bacterial inhibitors in lake water// Appl. Env. Microbiol. 1986. V. 52. P. 144-148.

238. Kreutzweiser D.P., Cringorten J.L., Thomas D.R., Butcher J.T. Functional Effects of the Bacterial Insecticide Bacillus thuringiensis var. kurstaki on Aquatic Microbial Communities// Ecotoxicol. Env. Saf. 1996. V.33, № 3. P. 271-280.

239. Balciunas D., Lawler S.P. Effects of basal resources, predation, and alternative prey in microcosm food chains//Ecology. 1995. V.76. P. 1327-1336.

240. Recorbet G., Steinberg C., Faurie G. Survival in soil of genetically engineered Escherichia coli as related to inoculum density, predation and competition // FEMS Microbiol. Lett. 1992. № 101. P. 401-408.

241. Hennes K.P., Somon M. Significance of bacteriophages for controlling bacterioplankton growth in a mesotrophic lake// Appl. Env. Microbiol. 1995. V.61. P. 333-340.

242. Ronchel M.C., Ramos C., Jensen L.B., Molin S., Ramos J.L. Constraction and behaviour of biologically contained bacteria for environmental applications in bioremediation// Appl. Env. Microbiol. 1995 V.61, №8. P.2990-2994.

243. Bogozin G., Sammons L.E., Morris. P.I.L., CNeil J.P., Heikamp M.A., Weber D.B. Death of the Escherichia coli K-12 strain W3110 in soil and water//Appl. Env. Microbiol. 1996. V.62, № 11. P.4114-4120.

244. McKay A.M. Viable but non-culturable forms of potentially pathogenic bacteria in water// Lett.Appl.Microbiol. 1992. V.14.P. 129-135.

245. Russel J.B., Cook G.M. Energetics of bacterial growth: balance of anabolic and catabolic reactions// Microbiol.Rev. 1995. V.59, №.1. P.48-62.

246. Четина E.B. Влияние некоторых физиологических и генетических факторов на процесс перехода энтеротоксигенных штаммов Escherichia coli в некультивируемое состояние// Мол. генетика, микробиол. и вирусол. 1997. №1. С. 8-14.

247. Huisman G., Kolter R. Sensing starvation: a homoserine lactone dependent signaling pathway in E. colill Science. 1994. Vol. 265. P. 537-539.

248. Мулюкин А.Л., Луста К.А., Грязнова M.H. Бабусенко Е.С., Козлова А.Н., Дужа М.В., Митюшина Л.А., Дуду В.И., Эль-Регистан Г.И. Образование покоящихся форм в автолизи-рующихся суспензиях микроорганизмов//Микробиология. 1997. Т.66, №1. С.42-49.

249. Николаев Ю.А. Участие экзометаболитов в адаптации Escherichia coli к стрессам// Микробиология. 1997. Т.66, №1. С.38-41.

250. Byrd J.J., Leahy J.C., Colwell R.R. Determination of plasmid DNA concentration maintained by nonculturable Escherichia coli in marine microcosms// Appl. Env. Microbiol. 1992. V.58, №7. P.2266-2270.

251. Cruz-Cruz N.E., Toranson G.A., Ahearn D.G., Hazen T.C. In suti survival of plasmid-bearing and plasmid-less Pseudomonas aerogenosa in pristine tropical waters// Appl.Environ.Microbiol. 1988. V. 54. P. 2574-2577.

252. Morita R.Y. Bioavailability of energy and its relationship to grouth and and stavration survival in nature//Can.J.Microbiol. 1988. V.34, No4. P.436-441.

253. Chao W.L., Feng R.L. Survival of genetically engineered Escherichia coli in natural soil and river water// J.Appl.Bacteriol. 1990. V. 68. P. 319-325.

254. Милько E.C., Егоров H.C. Гетерогенность популяции бактерий и процесс диссоциации (корине- и нокардиоподобные бактерии). М.: Изд-во МГУ, 1991. 144 с.

255. Пшеничное Р.А. Внутривидовое разнообразие E.coli основа построения пространственно- временного мониторинга// In: trends of International conference "Microbial diversity: current situation, conservation strategy, and ecological aspects», Perm, p.90-91.

256. Илларионов Б.А., Протопопова М.В. Клонирование и экспрессия генов люминесцентной системы Photobacterium leiognathi в плазмидном векторе pUC18 //Генетика. 1985. №6. С.10-13.

257. Миллер Дж. Эксперименты в молекулярной генетике. М.:Мир,1976. С.393.

258. Dammann-Kalinovskii Т., Niemann S., Keller М., Selbischka W., Tebbe C.C., Puller A. Characterization of two bioluminescent Rhizobium meliloti strains constructed for field releases// Appl. Microbiol. Biotechnol. 1996. V.45. P. 509-512.

259. Uhlin B.E., Nordstrom K. R plasmid gene dosage effect in E.coli K-12: copy mutants of the R plasmid Rldrdl9// Plasmid. 1993. V.l. P.l-7.

260. Nicolopoulou A., Zoumbou K., Papageorgacopoulou M., Papapetropoulou M. Metabolic and compositional changes in Escherichia coli cells starved in seawater// Microbiol. Res. 1994. V.149, №4. P.343-350.

261. Шендеров A.H., Попова Л.Ю. Путь синтеза альдегидного фактора люциферазы у Ph. mandapamensis и влияние предшественника альдегида на развитие люминесценции. Генетика. 1980. Т. 16, №6. С. 1109-1112.

262. Попова Л.Ю., Репета Т.В., Максимова Е.Е., Брильков А.В., Печуркин Н.С. Динамика роста клеток Escherichia coli в экспериментах с водными микроэкосистемами до и после "цветения" зеленых водорослей //Биотехнология. 1993. №10. С.35-38.

263. Попова Л.Ю., Максимова Е.Е., Репета Т.В., Брильков А.В., Печуркин Н.С. Экспрессия клонированных генов бактериальной люминесценции у микроорганизмов, выделенных из лабораторных микрокосмов//Биотехнология. 1994. №5. С.6-10.

264. Ратнер В. А. Молекулярно-гентические системы управления. Новосибирск: Наука. 287 с.

265. Каргатова Т.В., Максимова Е.Е., Попова Л.Ю., Брильков А.В., Печуркин Н.С. Фено-типическая изменчивость популяции рекомбинантного люминесцентного штамма Escherichia coli в водных микрокосмах // Микробиология. 1997. Т.66, №1. С.101-106.