Бесплатный автореферат и диссертация по биологии на тему

Внутривидовая генетическая дифференциация и филогеография сигов (P. Coregonus) Сибири

ВАК РФ 03.02.07, Генетика

Автореферат диссертации по теме "Внутривидовая генетическая дифференциация и филогеография сигов (P. Coregonus) Сибири"

На правах рукописи

БАЛДИНА Светлана Николаевна

ВНУТРИВИДОВАЯ ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ДИФФЕРЕНЦИАЦИЯ И ФИЛОГЕОГРАФИЯ СИГОВ (Р. СОИЕвОтЯ) СИБИРИ

Специальность 03.02.07 - генетика

АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук

2 5 ноя 2010

Москва - 2010

004613969

Работа выполнена в лаборатории популяционной генетики Учреждения Российской академии наук Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН

Научный руководитель:

доктор биологических наук Политов Дмитрий Владиславович,

Учреждение Российской академии наук Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН, г. Москва

Официальные оппоненты:

доктор биологических наук Милишников Александр Николаевич,

Учреждение Российской академии наук Институт проблем экологии и эволюции РАН, г. Москва

кандидат биологических наук Шубина Елена Александровна,

Научно-исследовательский институт физико-химической биологии им. А.Н. Белозерского МГУ, г. Москва

Ведущее учреждение:

Учреждение Российской академии наук Лимнологический институт Сибирского отделения РАН, г. Иркутск

Защита состоится 25 ноября 2010 г. в 12 часов на заседании диссертационного совета Д 002.214.01 при Учреждении Российской академии наук Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН, по адресу: 119991, ГСП-1, Москва, ул. Губкина,д. 3. Факс: 8(499) 135 1439 электронный адрес а5р!гап1ига@.уше.ги. адрес в интернете www.vigg.ru

С диссертацией можно ознакомиться в библиотеке Учреждения Российской академии наук Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН.

д^73> октября 2010 г.

Ученый секретарь диссертационного совета, кандидат биологических наук

Т.А Синельщикова

ОБЩАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА РАБОТЫ

Актуальность темы. Сиговые рыбы (сем. Coregonidae, или подсем. Coregoninae, отр. Salmoniformes, Teleostei) широко распространены в субарктической и бореальной зоне Европы, Азии и Северной Америки и являются важнейшими компонентами экологических систем и ценными объектами местного и промыслового рыболовства. Современные морфо-экологические, генетические, палеонтологические данные позволяют рассматривать сиговых рыб как отдельное семейство, внутри которого большинство исследователей выделяют три рода Coregonus, Prosopium и Stenodus (Берг, 1948; Решетников, 1980; Решетников и др., 2002; Черешнев и др., 2002; Богуцкая, Насека, 2004). Наибольшее число видов рода собственно сигов Coregonus сосредоточено именно в водоёмах Сибири, а также в прибрежной акватории омывающих ее полярных морей.

Сиговые рыбы обладают высокой морфо-экологической пластичностью и имеют сложную внутривидовую структуру (Решетников, 1980; Bernatchez et al., 1991; Bodaly et al., 1991; Бодали и др., 1994; Reist et al., 1998; Черешнев и др., 2002). Таксономический статус многих аллопатрических и симпатрических форм остается неясным. Кроме того, для представителей рода Coregonus свойственно явление межвидовой естественной гибридизации.

В рамках морфо-экологического подхода не представляется возможности решить спорные вопросы внутривидовой дифференциации, реконструировать филогению и филогеографию сиговых. Развитие исследований в этом направлении стало возможным благодаря использованию генетических маркеров. Изменчивость молекулярно-генетических маркеров не зависит от условий среды обитания и отражает различия в генотипах особей. МтДНК является удобным инструментом для решения филогеографических вопросов, поскольку она обладает высокой скоростью мутирования и имеет клональный характер наследования по материнской линии (Ferris, Berg, 1987; Avise, 1994). Анализ полиморфизма мтДНК позволяет не только дифференцировать таксоны, но и реконструировать возможные эволюционные сценарии. Изоферментные локусы, являющиеся кодоминантными ядерными генными маркерами, зарекомендовали себя как эффективный инструмент для изучения внутри- и межвидовой дифференциации. Совместное применение ядерных и митохондриальных генетических маркеров позволяет получить наиболее полную информацию о состоянии генофондов сиговых рыб и о процессах, протекающих в популяциях.

Сиговые рыбы, обитающие на территории Сибири, в отличие от европейских (Sendek, 2002; 0stbye et al., 2005), генетически изучены слабо. Ранее полученные данные в основном касаются межвидовых отличий представителей рода Coregonus (Ермоленко, 1992; Бодали и др., 1994; Politov et al., 2000, 2002, 2004). В то же время внутривидовая дифференциация сиговых на сибирской части ареала с помощью молекулярно-генетических маркёров изучалась крайне фрагментарно. Имеются сведения о генетических особенностях некоторых видов в локальных водоемах (Ермоленко, 1989, 1991, 1992; Мамонтов, Яхненко, 1987, 1994; Sendek, 2002; Суханова, 1996; Яхненко, Мамонтов, 2006; Sukhanova et al., 2002, 2004; Суханова и др., 2007), однако, широкомасштабный сравнительный анализ между популяциями бассейнов сибирских рек ранее не проводился.

Высокая изменчивость, широкая адаптивная радиация, способность к межвидовой гибридизации (Reist et al., 1992; Медников и др., 2000) позволяет использовать данную группу рыб в качестве модельного объекта для изучения процессов видообразования и расселения (Правдин, 1949; Пирожников и др., 1975; Сычевская, Яковлев, 1976; Шапошникова, 1976, 1977; Сычевская, 1988; Politov et al., 1999, 2002, 2004; Фролов, 2000). Понимание генетических процессов в популяциях позволит наиболее оптимально использовать ресурсы этих ценнейших рыб.

В свете изложенного целью исследования было: изучение внутривидовой генетической дифференциации сиговых рыб Сибири и уточнение их филогенетических связей.

В соответствии с заявленной целью работы были поставлены следующие задачи:

• Разработать систему молекулярных маркеров для филогеографических и популяционно-генетических исследований сигов Сибири.

• Исследовать внутривидовую генетическую дифференциацию сигов рода Coregonus рек Сибири по ядерным и митохондриальным локусам.

• С использованием молекулярно-генетических маркеров уточнить филогенетические взаимоотношения представителей сиговых рыб Сибири

• Оценить роль межвидовой гибридизации в видообразовании и адаптации у сиговых рыб

Научная новизна и теоретическая значимость работы. Впервые был проведён сравнительный анализ популяций сиговых рыб, обитающих в бассейнах ряда сибирских рек с использованием полиморфизма мтДНК и изоферментных локусов. Уточнено филогенетическое положение ряда представителей рода Coregonus, как пыжьян С. pidschian, чир С. nasus, муксун С. muksun. Выявлено генетическое сходство симпатричных видов С. pidschian, С. muksun. Использованные маркеры не подтверждают монофилию муксуна. Получены данные, свидетельствующие о гибридном происхождении С. muksun. Обнаружено существование отдельной, дифференцированной от ледовитоморской, южно-сибирской линии в эволюции «настоящих» сигов (С. lavarelus/C. pidschian complex) Сибири, в наиболее чистом виде сохранившейся в верхней Оби. Выдвинута гипотеза о том, что Енисей выступает в качестве главного пути обмена генами между южным и северным генными пулами сигов. В пределах бассейна Енисея концентрация специфических аллелей, маркирующих южно-сибирский генный пул, уменьшается от верхнего к нижнему течению Енисея. Впервые с помощью анализа мтДНК и аллозимного анализа было показано генетическое своеобразие популяций чира С. nasus Западной Сибири и Северо-Востока России. Работа послужит основой для дальнейших исследований в области внутривидовой дифференциации, филогеографии и филогении сиговых рыб.

Практическая значимость работы. Пополнена коллекция образцов тканей представителей рода Coregonus: «настоящих» сигов (С. pidschian complex), чира, муксуна. Создана база генетических данных исследованных видов, включающая гаплотипы мтДНК и аллельные частоты по 31 изоферментному локусу в 43 популяциях. Результаты представленной работы могут применяться для идентификации видов и локальных популяций сигов p. Coregonus. Полученные данные о внутривидовой структуре и межвидовых отличиях могут быть использованы для разработки научно обоснованных мер сохранения генофондов сиговых и для мониторинга рыбных ресурсов Сибири. Положения, выносимые на защиту.

1. Комплексный подход с использованием ядерных (изоферментных) и нерекомбинирующих клонально наследуемых мтДНК маркеров представляется наиболее перспективным в изучении популяционно-генетической структуры сигов p. Coregonus.

2. Генетическая близость муксуна С. muksun с снмпатричными пыжьяновидными сигами С. pidschian complex указывает на существование общей пыжьяновидной предковой формы. Монофилетичность муксуна не подтверждается молекулярными данными.

3. Существует отдельная, дифференцированная от ледовитоморской, южно-сибирская линия в эволюции пыжьяновидных сигов, в наиболее чистом виде сохранившаяся в верхней Оби.

4. Енисей является главной магистралью для обмена генами между южным и северным генными пулами сигов.

5. Восточносибирские популяции муксуна и чира являются предковыми для данных видов. Апробация работы. Материалы диссертации были представлены в виде личных устных докладов автора на российских и международных конференциях: 9-ая Международная Пущинская школа-конференция молодых ученых «Биология - наука XXI века» (Пущино, 2005), Научная школа молодых ученых «Актуальные проблемы современной генетики» при Международной конференции «Генетика в России и мире», посвященной 40-летию Института общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН (Москва, 2006), Конференция молодых

учёных «Экология: от Арктики до Антарктики» (Екатеринбург, 2007), X Международный симпозиум «Биология и управление ресурсами сиговых рыб» (Виннипег, Канада, 2008), Всероссийская конференция «Водные и наземные экосистемы: проблемы и перспективы исследований» (Вологда, 2008), Международная конференция «Эволюционная экология рыб - разнообразие, адаптация и видообразование» (Эркнер, Германия, 2009), Седьмое международное научно-производственное совещание «Биология, биотехника разведения и состояние запасов сиговых рыб» (Тюмень, 2010), V Верещагинская Байкальская конференция (Иркутск, 2010). Кроме того, материалы диссертации были представлены на следующих конференциях: IX международный симпозиум «Биология и управление ресурсами сиговых рыб» (Ольштын, Польша, 2005), Научно-практическая конференция «Водпозерские чтения: естественнонаучные и гуманитарные основы природоохранной, научной и просветительской деятельности на охраняемых природных территориях Русского Севера» (Петрозаводск, 2006), XII Европейский ихтиологический конгресс (Дубровник, Хорватия, 2007), Рабочее совещание «Штрих-кодирование видов рыб в России на основе ДНК: интеграция в глобальную программу FISH-BOL» (Владивосток, 2007), Международная конференция «Современное состояние водных биоресурсов» (Новосибирск, 2008), Международная конференция, посвященная 100-летию со дня рождения B.C. Кирпичникова «Генетика, селекция, гибридизация, племенное дело и воспроизводство рыб» (Санкт-Петербург, 2008), Вторая Московская международная конференция «Молекулярная филогенетика MolPhy-2» (Москва, 2010).

Декларация личного участия автора. В диссертационной работе использованы экспериментальные материалы, полученные лично автором, а также совместно с коллегами из лаб. популяционной генетики ИОГен РАН (Д.В. Политов, Н.Ю. Гордон) и Института систематики и экологии животных СО РАН (H.A. Бочкарёв, Е.И. Зуйкова). Автор принимал участие в полевых работах по сбору биологического материала, проводил выделение ДНК, полимеразную цепную реакцию (ПЦР), рестрикционный анализ, принимал участие в проведении изоферментного анализа и секвенирования, самостоятельно проводил подготовку баз данных и статистическую обработку результатов экспериментов, принимал участие в обсуждении и оформлял результаты своих исследований в виде статей и докладов на конференциях. Суммарное личное участие автора составило 75%.

Публикации. По результатам исследований опубликовано 12 статей, из которых 1 статья в журнале, включенном в перечень научных журналов и изданий, рекомендованных ВАК Минобрнауки России (Генетика, 2008) и 12 тезисов, в которых полностью изложен материал диссертации.

Структура п объем работы. Диссертация состоит из введения, четырёх глав, заключения, выводов, списка литературы и приложения. Работа изложена на 157 страницах, иллюстрирована 26 рисунками и содержит 23 таблицы. Список литературы содержит 290 наименований, из них 117 на иностранных языках.

Благодарности. Автор считает приятным долгом выразить признательность своему руководителю Д.В. Политову и ближайшему соратнику - Н.Ю. Гордон за всестороннюю помощь в работе и обсуждении диссертации. Автор благодарит за помощь в сборе материала участников международной экспедиции «Экология тундры-1994» и Д.Р. Балданову, C.B. Носкова, Н.Д. Карташева, а также за предоставленный материал: А.Г. Бубличенко, O.A. Исаеву, А. М. Мамонтова, А.Н. Матвеева, Д.С. Сендека, H. М. Соломонова, J1.B. Суханову. И.А. Черешнева, A.B. Шестакова. Отдельное спасибо за помощь в сборе материала и ценную методическую помощь в проведении экспериментов по секвенированию H.A. Бочкареву и Е.И. Зуйковой. Автор выражает благодарность Ю.С. Белоконю за помощь в обработке результатов, Е.А. Салменковой и М.М. Белоконь за искренние наставления и ценные советы, а также всем сотрудникам лаборатории популяционной генетики ИОГен РАН за поддержку и творческую благожелательную атмосферу в коллективе. Особую признательность автор выражает своему первому руководителю H. JI. Болотовой за помощь в выборе научного пути.

ГЛАВА I. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

В главе рассматриваются особенности распространения и биологии сиговых рыб, проблемы систематики, идентификации и видообразования сиговых. Обсуждаются основные методы изучения внутривидовой и популяционной структуры сиговых рыб. Подробно рассмотрены современные методы молекулярно-генетического анализа, их достоинства и недостатки, на основании чего предложены методы, используемые в данной работе.

ГЛАВА И. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

Сбор материала по сигам р. Coregonus Сибири (табл. I) производился в период с 2005 по 2009 гг., использованы также образцы сиговых рыб, предоставленные научным руководителем и соавторами (1994-2005 гг.). Для исследования мтДНК использовались ткани, фиксированные в 70-96% этаноле или насыщенном р-ре №С1 с добавлением 20% диметилсульфоксида. Для изоферментного анализа были взяты скелетные мышцы и печень, поскольку ряд ферментов у рыб имеет выраженную тканевую специфичность. Пробы брались у свежевыловленной рыбы, затем хранились в замороженном состоянии при температуре -70°С (табл. 1).

Для уточнения филогенетического положения исследованных форм сигов использованы ранее опубликованные и полученные с участием автора данные по другим видам сиговых рыб - пеляди, сибирской и европейской ряпушкам, арктическому омулю, байкальскому омулю (Политов, Гордон, 1998; РоМоу е1 а!., 2000; Политов и др., 2008; Гордон и др., 2010).

Таблица 1. Географическая локализация и объем выборок, исследованных по двум классам

генетических маркеров

№ Аббре- Локальность Координаты ПЦР- Алло-

виатура ПДРФ зимы

мтДНК

пыжьяновидныесига СрийсА/ял, С. апаШогит, С. хпиШ, С.ргаусИмсИи.^

1 1Р оз. Кузнецкое-То (вблизи устья р. 68°49'с.ш.; 53°42 в. д. 5 27

Печоры)

2 2Р р. Мордыяха (Зап. Ямал) 70°20' с.ш.; 67°50' в.д. 5 20

3 ЗР р. Обь, Тазовская губа 67°08' с.ш.; 72°13' в.д. 4 11

4 4Р р. Обь, вблизи п. Салехард бб°08' с.ш.; 65°13' в.д. - 20

5 5Р оз. Телецкое (С. .чтИИ) 5Г59' с.ш.; 87 65'в.д. 58 58

басс. верх. Оби

6 6Р оз. Телецкое (С. ргагсИпеИш) 5Г59' с.ш.; 87°65' в.д. 53 105

7 7Р Енисейский залив (вблизи п. 71"80' с.ш.; 82°97'в.д. - 29

Воронцово)

8 8Р р. Курейка (басс. нижн. Енисея) 69°5Г с.ш.; 84°11' в.д. - 32

9 9Р оз. Кадыш (басс. верх. Енисея) 52°40' с.ш.; 97°25' в.д. 12 35

10 ЮР р. Хамсара (басс. верх. Енисея) 52°47' с.ш.; 97°60' в.д. 12 37

11 ПР оз. Азас, «прибрежный» (басс. 52°42' с.ш.; 97°30' в.д. - 41

верх. Енисея)

12 12Р оз. Азас, «глубинный» (басс. верх. 52°42' с.ш.; 97°30' в.д. - 30

Енисея)

13 13Р оз. Ессей, бассейн р. Хатанга 68°47' с.ш.; 102°42' в.д. - б

14 14Р оз. Орон, басс. верх. Лены («С. 57°15' с.ш.; 116°44' в.д. 23

ШагеШ огопетгя»)

15 15Р оз. Орон, басс. верх. Лены (С. 57°15' с.ш.; 116°44' в.д. 7 -

р1с1хсЫап)

16 16Р оз. Баунт, басс. верх. Лены (С. 55°27' с.ш.; 113°14'в.д. 8 44

р1с!зсМап)

17 17Р оз. Баунт, басс. верх. Лены 55°27'с.ш.; П3°14' в.д. 4 4

(среднетычинковый озёрный сиг)

18 18Р оз.Баунт, басс. верх. Лены (С. 55°27' с.ш.; 113°14' в.д. 3 40

№ Аббре- Локальность Координаты ПЦР- Апло-виатура ПДРФ зимы _мтДНК

19 19Р ишши) р. Яна, нижнее течение 70°63' с.ш.; ; 135°17' в.д. 5 6

20 20Р р. Индигирка, дельта 71°26' с.ш.; 1 149°45' в.д. 5 31

21 21Р р. Колыма, дельта 69°32' с.ш.; ; 160°42' в.д. 7 25

22 22Р р. Анадырь, нижнее течение (С. 64°90' с.ш.; ; 176°02' в.д. 14 -

апаиЬгит - сиг-востряк)

23 23Р р. Анадырь, нижнее течение (С. 64°90' с.ш.; ; 176°02' в.д. 11 -

р1сксЫап - сиг-горбун)

24 24Р р. Пенжина (С. апаиЬгит - сиг- 62°45' с.ш.; 165° 52' в.д. 4 4

востряк)

25 25 Р р. Онон, басс. р. Амур (С. сИа(1а1у) 51°47' с.ш.; 115° 99' в.д. 6 9

26 26Р р. Амур (С. Ш5ипепз1з) 53°20' с.ш.; 140°20' в.д. 8 -

Всего 264 614

муксун С. muksun

1 1М р. Мордыяха (западный Ямал) 70° 20' с.ш. ; 67° 50' в.д. 9 36

2 2М р. Обь, среднее течение 61° 57' с.ш. ; 68° 02' в.д. 18 17

(искусственная популяция,

Ленинградская обл.)

3 ЗМ оз. Широкое, п-ов Таймыр 73°60' с.ш. ; 97°90' в.д. 13 -

4 4M Енисейский залив (вблизи п. 7Г80' с.ш.; ; 82°97' в.д. - 31

Воронцово)

5 5М р. Лена, нижнее течение 71°68' с.ш.; 127°27' в.д. - 14

6 6М р. Лена, нижнее течение, п. Тит- 60°83' с.ш.; 125°61' в.д. 10 13

Ары

7 7М р. Яна, нижнее течение 70°63' с.ш.; 135°17' в.д. 9 10

8 8М р. Индигирка, дельта 71°26' с. ш.; ; 149°45' в.д. 6 30

9 9М р. Колыма, дельта 69°32' с. ш; 160°42' в.д. 6 32

Всего 71 183

чир С. nasus

1 1N р. Мордыяха (западный Ямал) 70°20' с.ш.: ; 67°50' в.д. 8 15

2 2N басс. Оби, Тазовская губа 67°08' с.ш.; ; 72°13' в.д. - 10

3 3N Енисейский залив (вблизи п. 71°80' с.ш.: ; 82°97' в.д. 7

Воронцово)

4 4N р. Курейка (басс. р. Енисей) 67°27'с.ш.; 94°34' в.д. - 10

5 5N р. Яна, нижнее течение 70°63' с.ш.; 135°17' в.д. 16 17

6 6N р. Индигирка, дельта 71°26' с. ш.; ; 149°45' в.д. 24 27

7 7N р. Колыма, дельта 69°32' с. ш.; ; 160°42' в.д. 14 73

8 8N р. Пенжина 62°45' с.ш.; 165°52' в.д. 44 16

Всего 106 175

ПЦР-ПДРФ анализ и секвеннрование мтДНК. Препараты тотальной ДНК выделяли из тканей по стандартной методике фенолом и хлороформом (Маниатис и др., 1984), а также с помощью набора для выделения DNAPrep («ООО Лаборатория Изоген»), С помощью ПЦР амплифицирован фрагмент мтДНК, кодирующий субъединицу 1 NADH-дегндрогеназного комплекса (ND-1) с фланкирующими последовательностями (Cronin et al., 1993).

Аликвоты ПЦР-фрагментов обрабатывали 18 рестрикционными эндонуклеазами: Ase I, A va II, Bsa) I, Bsp 1286 I, BstN I, BslV I, We I, Dpn II, Hue III, Hha I, Hinc II, Яш/I, Hph I, Msp I, Nci I, Rsa I, S.sp I, Taq I. После электрофореза в агарозном геле фрагменты ДНК окрашивали бромистым этидием и фотографировали в проходящем ультрафиолетовом свете с помощью системы гель-документации Kodak ID. Размер фрагментов определяли визуально и с помощью программы ID-Scan. В качестве стандартов молекулярной массы ДНК использовали маркеры 1 тыс. п.н. и 100 п.н. («Сибэнзим»; «Fermentas»),

Сведения о длинах рестрикционных фрагментов конвертировали в бинарную матрицу присутствия/отсутствия отдельных сайтов рестрикции, на основе которой проводили

построение минимально протяженной сети гаплотипов с помощью компьютерной программы Network 4.2.0.1. (Fluxus Technology Ltd). При этом использовались ранее полученные данные о гаплотипах сиговых рыб (Politov et al., 2000, 2004). Гаплотипическое (h) и нуклеотидное (л) разнообразие оценивали с помощью пакета программ REAP (McEIroy et al., 1991). Степень генетической подразделенности популяций оценивалась методом анализа молекулярной дисперсии AMOVA (Schneider et al., 2000). Генетические дистанции по рестриктным данным рассчитывались согласно Нею и Таджиме (Nei, Tajima, 1981; Nei, 1987; Nei, Miller, 1990).

ND-1 фрагмент секвенировали в прямом и обратном направлениях с использованием внешних праймеров LGL381 и LGL563 (Cronin et al., 1993) и трёх пар внутренних праймеров (Бочкарёв и др., 2010). Выравнивание нуклеотидных последовательностей производилось вручную и с помощью Chromas LITE v. 2.01, Ultra Edit-32 v. 10.10a. Анализ и построение филогенетического древа проводили с использованием программы MEGA 3.0 (Kumar et al., 2004).

Изоферментный анализ. Электрофоретический анализ генетической изменчивости изоферментных (аллозимных) локусов в тканях белых скелетных мышц и печени проводили в блоках горизонтального 13% крахмального геля с использованием трёх буферных систем (табл. 2).

Таблица 2. Изученные ферментные системы

Энзим Аббревиатура Буферная система Ткань Локусы

Аконитаза АН А M AH-l*, AH-2*

Алкогольдегидрогеназа ADH С, В L ADH*

Креатинкиназа CK С M CK-A1.2* CK-3*

Эстераза EST С L EST-2*

Глицерол-3- G3PDH А, В L, M G3PDH-1*

фосфатдегидрогеназа

Изоцитратдегидрогеназа IDHP А M L mIDHP-1,2* mIDHP-3,4*

Идитолдегидрогеназа IDDH (SDH) С L SDH-1,2*

(сорбитолдегидрогеназа)

Лактатдегидрогеназа LDH С M LDH-A 1,2* LDH-B1.2*

Малатдегидро геназа MDH В L M sMDH-Al,2* sMDH-Bl,2

Малик-энзим (НАДФ-зависимая ME В M МЕР-1,2*

малатдегидрогеназа)

6-фосфоглкжонатдегидрогеназа PGDH В M, L PGDH*

Глкжозо-6-фосфатизомераза GPI С M GPI-B1.2*

Фосфоглюкомутаза PGM С M PGM-1* PGM-2*

Супероксиддисмутаза SOD с L, M SOD-1 * SOD-2*

Примечания. Буферные системы: А. Морфолин-цитратная рН 8.0, В. Морфолин-цитратная рН 6.5 (обе - Clayton, Tretiak, 1972), С. Трис-цитратная/ИЮН-боратная (Ridgeway et al„ 1970). Ткани: М - скелетная мускулатура, L - печень.

Оценки аллельного и генного разнообразия, генетических дистанций (Nei, 1972, 1987) и коэффициента генетической подразделенности Fst (Nei, 1977) были получены с помощью макроса (программной надстройки) для Microsoft Office Excel 2003 - программы GenAlEx 6 (Peakall, Smouse, 2006). Для недуплицированных локусов оценивалось также отклонение

наблюдаемого распределения генотипов от ожидаемого при панмиксии соотношения Харди-Вайнберга. Для построения UPGMA-дендрограммы и оценки бутстрэп-поддержки использовалась программа PHYLIP 3.68 (Felsenstein, 2008). Многомерный анализ матрицы частот аллелей был произведён методом главных компонент с использованием компьютерной программы STATISTICA 5.0 (StatSoft, 1998).

ГЛАВА 111. РЕЗУЛЬТАТЫ

3.1 Взаимоотношения внутри группы сигов с нижним ртом

3.1.1 Данные ПЦР-ПДРФ анализа мтДНК. По результатам ПЦР-ПДРФ-анализа мтДНК построена медианная сеть, включающая в себя гаплотипы изученных видов сиговых рыб. Популяции чира отличаются специфичными, свойственными только данному виду, комплексными гаплотипами. С. nasus на общей сети комплексных гаплотипов представлен отдельной самостоятельной ветвью, что иллюстрирует значительное число нуклеотидных замен, произошедших в мтДНК чира (см. раздел 3.3). С. pidschian и С. muksun слабо дифференцированы и не представляют собой отдельных ветвей на медианной сети, поскольку имеют ряд общих комплексных гаплотипов (рис. 1). Наиболее распространён комплексный гаплотип РЗ, который имеет относительно высокую частоту встречаемости и присутствует от р. Печоры до р. Колымы (рис. 2). В популяциях муксуна и пыжьяна из р. Колымы встретились комплексные гаплотипы, резко отличающиеся от гаплотипов пыжьяна и муксуна, но характерные для сибирской ряпушки (Politov et al., 2000).

Для количественной оценки величины генетических различий проводилось разложение общей молекулярной дисперсии частот гаплотипов на два иерархических уровня. Оценивался уровень разнообразия между группами популяций муксуна и пыжьяна и внутри этих групп. Проведённый анализ показал, что большая часть молекулярного разнообразия в популяциях муксуна и пыжьяна приходится на различия внутри популяций (75.8% дисперсии). Уровень различий между группами популяций муксуна и пыжьяна практически такой же, как и разнообразие внутри групп, что свидетельствует о генетической близости С. pidschian и С. muksun. Гаплотипы мтДНК, характерные для пыжьяна, занимают на минимально-протяжённой сети базальное положение и дают начало многочисленным вариантам комплексных гаплотипов других пыжьяновидных сигов и муксуна (рис. 1).

Сиги из оз. Телецкое (бассейн верхней Оби), Баунт, Орон (бассейн верхней Лены) имеют редкие уникальные комплексные гаплотипы, однако они кластеризуются вместе с гаплотипами других пыжьяновидных сигов. На минимально протяжённой сети комплексные гаплотипы муксуна и пыжьяновидных сигов расположены между гаплотипами чира С. nasus и гаплотипами сиговых из оз. Байкал (рис. 11).

Средние значения нуклеотидного и гаплотипического разнообразия в выборках муксуна, пыжьяна, чира оказались сходными у трех видов (табл. 3).

Таблица 3. Средние значения нуклеотидного и гаплотипического разнообразия в выборках

муксуна, пыжьяна, чира

Средние значения нуклеотидного/ гаплотипического разнообразия С. muksun С.pidschian С. nasus

к 0,0323 0,0340 0,0500

h 0,5530 0,5750 0,5528

Рисунок 1. Медианная сеть комплексных гаплотипов мтДНК муксуна и пыжьяна (белым обозначены гаплотипы муксуна, чёрным пыжьяна, серым - общие гаплотипы)

Рисунок 2. Частота встречаемости комплексных гаплотипов в выборках муксуна (белым цветом) и пыжьяна (чёрным цветом)

3.1.2 Результаты изоферментпого анализа показали, что внутри группы сигов с нижним ртом чир дифференцируется от близких ему видов (рис. 3), при этом диагностическими являются локусы СК-3*, АН-2*, МЕР-1,2*, СР1-А1,2*, 500-1*. Выборки С. р:с1зс1иап и С. тиЬип по аллозимным данным практически не отличаются, что согласуется с результатами, полученными ранее (Ермоленко, 1991; Ро1йоу е( а1., 2000, 2002, 2004). Обнаружены только некоторые отличия в частотах встречаемости общих аллелей. Так, по локусу СЗРйН-!* у пыжьяна и муксуна преобладает аллель 03Г0Н-1*3, в то время как в выборках муксуна встречаются аллели ОЗРОН-1 *5, ОЗРО!!-!*7.

Уровни генетической изменчивости в популяциях пыжьяна, муксуна и чира оказались сходными (табл. 4), с некоторой долей инбридинга, о чем свидетельствуют положительные значения индекса фиксации Райта.

1.5

-1.5

«

а С. I. рШвсШап сотр!ех о С.тикзип • С.пазиэ

-2.0

-2.5

-3.0 -2.0 -1.0 0.0 1.0 2.0 -2.5 -1.5 -0.5 0.5 1.5

РАСТОШ

Рисунок 3. Ординация выборок сиговых рыб на плоскости двух главных компонент по результатам изоферментного анализа

Таблица 4. Основные популяционно-генетические показатели для изученных видов сигов

рода Coregonus

Na Ne Но НЕ F Р%

С. pidschian среднее 1,388 1,141 0,055 0,077 0,221 27,98%

станд.ошибка 0,028 0,013 0,005 0,006 0,015 2,39%

С. muksun среднее 1,395 1,131 0,062 0,078 0,166 32,81%

станд.ошибка 0,039 0,019 0,008 0,009 0,025 3,44%

С. nasus среднее 1,324 1,111 0,039 0,069 0,274 28,13%

станд.ошибка 0,035 0,016 0,006 0,009 0,027 4,94%

Примечание. Na - среднее число аллелей на локус, Ne - число эффективных аллелей, Но -наблюдаемая гетерозиготность, Не - ожидаемая гетерозиготность, F- индекс фиксации, Р% - число полиморфных локусов

3.2 Внутривидовая генетическая дифференциация сигов Сибири 3.2.1 Внутривидовая генетическая дифференциация муксуна

Всего в популяциях муксуна было идентифицировано 17 комплексных гаплотипов мтДНК. Общим для всех популяций является гаплотип РЗ, который имеет высокую частоту (33-83%) и широко представлен также и у пыжьяна. На минимально протяжённой сети РЗ является базальным для целого ряда гаплотипов, характерных как для муксуна, так и для пыжьяна. Наиболее близкое положение к основанию древа на минимально протяжённой сети занимают гаплотипы, характерные для муксуна из р. Лены и оз. Широкое (п-ов Таймыр). Своё происхождение данные гаплотипы берут из наиболее древнего комплексного гаплотипа Р1 (рис. 1), характерного для пыжьяновидных сигов. Выборка из р. Колыма содержит гаплотип, свойственный видам комплекса ряпушек (С. sardinella complex).

Проведённый анализ молекулярной дисперсии (AMOVA) показал, что большая часть изменчивости мтДНК приходится на различия внутри популяций (96,17% дисперсии), а межпопуляционная компонента составила 3,83% (fVr=0.0383).

Таблица 5. Уровень нуклеотидного и гаплотипического разнообразия в выборках муксуна Уровень о.

нуклеотидного/ Западный Р- Широкое, Р- Р- Р- Р-

гаплотипического Ямал Обь п-ов Лена Яна Индигирка Колыма

разнообразия Таймыр

я 0,022 0,039 0,012 0,033 0,017 0,059 0,044

h 0,528 0,524 0,298 0,560 0,383 0,789 0,789

Наиболее высокий уровень гаплотипического (А) и нуклеотидного разнообразия (гг) наблюдается в популяциях муксуна из pp. Индигирки и Колымы (табл. 5), что может указывать на отсутствие эффекта «бутылочного горлышка» в недавнем прошлом.

По результатам изоферментного анализа полиморфными оказались следующие локусы: АН-2*, СК-А1.2*. СК-3*. EST-2*, G3PDH-1*, ЮНР-1,2*. IDHP-3.4*. LDH-A1.2*, LDH-B1.2* MDH-A1.2*, MDH-B1.2*. МЕР-1.2*. PGDH*, GP1-B1.2*. PGM-1* PGM-2*, SDH-1,2*. SOD-2*. В локусах АН-2*, СК-А1.2*. СК-3*. ЮНР-1,2*. PGDH*, SOD-2* встретились редкие аллели, которые не влияют на картину дифференциации популяций муксуна. Показатели аллельного разнообразия и число полиморфных локусов максимальны в выборках из pp. Индигирка и Колыма (Р=46,88%, 43,75% соответственно), что совпадает с оценками по мтДНК, а минимальные значения характерны для искусственно разводимой популяции, происходящей из р. Обь (Р=15,8%). По генетическим расстояниям (Ne!, 1972)

было построено консенсусное дерево, отражающее взаимоотношения муксуна из различных бассейнов сибирских рек с использованием внешней группы - байкальского омуля (рис. 4).

Выборки из Западной и Средней Сибири и р. Лены (Тит-Ары) образуют отдельный кластер. При этом вторая выборка из нижнего течения р. Лена кластеризуется вместе с остальными восточносибирскими выборками, что подчеркивает гетерогенность ленского муксуна. Внутри группы выборок из Восточной Сибири муксун из р. Индигирка несколько дифференцирован от С. тиЬип из р. Яна и р. Колыма.

р. Мордыяха(Зап.Ямал)

р.Обь

Енисейский залив

р. Лена(Тит-Ары)

р. Лена(нижнее течен) р. Яна р. Колыма р. Индигирка С. migratorius

0.20 0.00 Linkage Distance

Рнсунок 4. UPGMA дендрограмма С. muksun по данным аллозимного анализа. В узлах приведены соответствующие значения бутстрэп-поддержки (из 1000 репликаций)

3.2.2 Внутривидовая генетическая дифференциация пыжьяновидных сигов Сибири

ПЦР-ПДРФ анализ образцов С. pidschian complex показал, что наибольшее число полиморфных сайтов характерно для следующих рестриктаз: Ava II, BsaJ I, Bsp!2861, ßs/N I, Hae 111, Msp I, Rsa 1. Всего no 18 рестриктазам среди выборок пыжьяновидных сигов было идентифицировано 48 комплексных гаплотипов. Связующим звеном являются гаплотипы РЗ и PI (рис. 5), которые встретились в восьми и четырёх выборках, соответственно.

Выборки из оз. Кадыш, р. Хамсара, р. Онон (бассейн р. Енисей) отличаются низкой изменчивостью и представлены одним-двумя гаплотипами. По данным ПЦР-ПДРФ анализа наиболее полиморфными оказались телецкие сиги, оронский сиг, а на территории Восточной Сибири - выборка из Колымы. У пары симпатричных сигов из оз. Телецкое обнаружен распространённый галлотип РЗ, а также ряд уникальных гаплотипов.

Распределение гаплотипов сигов в оз. Баунт и Орон указывает на сходство верхнеленских мало- и среднетычинковых сигов по мтДНК с пыжьянами других бассейнов, в то время как так называемая «баунтовская ряпушка» (С. baunti) имеет уникальные гаплотипы, свойственные только данной форме (рис. 5).

Сиги Северо-Востока России - сиг-горбун С. pidschian и сиг-востряк С. anat/Ioruin pp. Андырь и Пенжина имеют также уникальный спектр комплексных гаплотипов мтДНК. Две основные гаплогруппы этих сигов достаточно сильно дивергировали. Одна из них широко распространена также среди пыжьяна на всей территории Сибири, а другая эндемична для этих сигов беринговоморского и охотоморского бассейнов, и при этом обнаруживает черты родства с сигами бассейнов Амура и Байкала.

Сиг-хадары (С. сИаЖиу) из р. Оион имеет сходные гаплотипы с амурским сигом, и на минимально протяжённой сети комплексных гаплотипов данная группа дифференцирована от других форм и образует отдельную ветвь (рис. 11). Анализ минимально протяжённой сети комплексных гаплотипов показал, что от гаплотипа РЗ берут начало большинство гаплотипов муксуна, а также группа гаплотипов, которые встретились в геноме сигов из оз. Телецкое. Гаплотип Р1 занимает одно из базальных положений на сети гаплотипов, что указывает на его более древнее происхождение. Данный гаплотип встречался в выборках из удалённых частей ареала (р. Мордыяха, р. Обь, р. Онон, р. Анадырь) (рис. 5).

На основании результатов секвенирования N01 фрагмента мтДНК было построено консенсусное дерево (рис. 6). Отдельный кластер образуют сиги верховьев р. Енисей (Тоджинская котловина), в то время как гаплотипы пыжьяна из р. Курейка (нижнее течение р. Енисей) кластеризуется в разных частях консенсусного древа. Сиги оз. Телецкого не образуют единой группы, значительная дифференциация их гаплотипов может указывать на древнее происхождение этой группы. Отдельный кластер образуют также сиги из бассейна р. Амур, что свидетельствует о сходстве симпатрических видов, различающихся положением рта - амурского сига С. шзиггепза и сига-хадары С. сИаёагу. Кроме того, амурские сиги образуют единую кладу с байкальским омулем С. ¡т&'Шопш.

Результаты анализа изоферментных локусов показали, что С. р1<1.\сЫап образует несколько кластеров (рис. 7). Первую группу составляют субарктические пыжьяновидные сиги. Вторая группа включает в себя эндемичных симпатричных сигов из оз. Телецкое -телецкий сиг и сиг Правдина (верхнеобской озёрно-речной район), которые характеризуются наличием уникальных и нетипичных для сиговых аллелей по ряду аллозимных локусов -ЮВН-1,2*, ШН-Ли* РСМ-1*, РСМ-2*.

Промежуточную между субарктическими и верхнеобскими сигами группу образуют сиги из бассейна верхнего Енисея из водоемов Тоджинской котловины. Сиговые рыбы из нижнего Енисея (р. Курейка) более близки к типичным субарктическим пыжьянам, но также содержат аллели, характерные для сиговых из верхней Оби. Внутри бассейна Енисея концентрация специфических аллелей, маркирующих южно-сибирский генный пул уменьшается от верхнего (водоемы Тоджинской котловины) к нижнему течению Енисея (Енисейский залив, р. Курейка).

Рисунок 5. Расположение комплексных гаплотипов мтДНК пыжьяновидных сигов (выделены чёрным цветом) на минимально протяжённой сети. Цифрами показаны уникальные

гаплотипы и их соответствие определённому региону. Белым цветом выделены гаплотипы муксуна, серым -общие для пыжьяна и муксуна.

оз.Телецкое (бассейн нижней Оби)

I—УЕЫЮЕмгг С. рМвсМап р. Енисей мзюв С. тик$ип р. Обь СРЮТЕ 1-Едээ С. ьтии оз. Телецкое

_СКШЕ1КА02 С. р/с/всЛ/ал р.КуреЙка, бассейн р. Енисей

СРРА\/0ТЕ1.Е215 С. ртсНпеПиЗ

СРЮТЕ1Е2оа С. втПИ срродуоте!.Ё214 С. pravcfine/lus

I—СРЮТЕ1.Е214 С. этИМ

сРРАУСгшиЕгов0- ргампеииз срютеседю С. вт/М

_стлг1в О. р/с/зсЬ/ап Тазовская губа, р. Обь

СМЕ1_М14 ' пе1т1и$СЬка оз. Кубенское. п 19|у12 С. тиквип р. Морды яха, Западный Ямал ]г СОУ1МАОЗ С. рШзсЫап р. Северная Двина

,4_ск£ЦИ15 С. / пе/ти$сЬка оз. Кубенское

71-СОУ1ЫА04 С. р1бйсЫап р. Северная Двина

\

57|-АгА80и9С. рАйсй/вл""^ 1д

Водоемы Тоджинской КОТЛОВИНЫ, бассейн р. Енисей

' АХАБСиЗО С. рШзсЫап

- МЕН12 С. тиквип тоогнАЮ? С. р/с/всЛ/ал каоу8Н05 С. рШэсМап тсшгнАКи С. р/'с/зсЛ/ал УЕЫ15ЕУ121 С. р/С/5С/1/аЛ

- каоусн2Э С. рМэсЫап А2АБ0128 С. р1(3$СЫап .

I—С Р ЮТЕ 1.Е201 с.

иЧ,сррауоте1Е201 С. pravdinellus I. вЛ- СРРАУОТЫ.Е212 С. ргач&пеПизJ оаз998в4СШ2КН1Р01 С. /ауагеГов Польша • АВ034824СЬМ1УА С. ^агеШЭ скиЛЕ1КА01 С. рШэсЫап р.Ко рейка, бассейн р. Бниссй С№ЮЮ50 с. рШясЫап р. Индигирка

оз.Телецкое (бассейн нижней Оби)

- омою 5 5 » С НЕ 02

-САМАй12

-Аи МТ52~1

- ЯВАиГТГ53 X

>С. лавив р. Енисей С. рШвсЫап р. Анадырь С.Ьаипи оз. Баунт

73|ОВМЮКАТ5

«Уовмюнатю I.С. гл!дга^пи5 оз. Байкал

овмкзРАПв Г

I- ОВМЮЯАТ17^

- согчЕюг

- САМШ02 - СНАйАРОб

I-СНАОАВОЗ!

I- СНА0АЯ04 _ nj.SN1.EN15 "1-8МЬЕЫ28

щ_

С. 1/5зиггеп5/з, С. сЬабагу бассейн р. Амур

У

в

Б^елос/ив /еиОсЫЬу$ ле/та^

р.Енисей

-опркзв! С. аиЮтпаНз

-пюиытлизн С. (идип р.Таловка

-Р1.ЕН03

100|ДР01НР1РР381 I СЭивАиТРЕМОг |- СХЭ399869СА1_А1Р01.

_3_ , ООЗ99 870СА1А 2 С Е К

68 р-СУ41Ы01РЛ381

Зв||-00399871СРЕР1Р01.

53 I-Р1.0В01

С. в а гс//л е //а/а/Ь и/а/ре/е б ^ сотр!ех

Рисунок 6. Схема филогенетических взаимоотношений, построенная на основе нуклеотидных последовательностей N01 фрагмента мтДНК. В узлах приведены соответствующие значения бутстрэл-подцержки (из 100 репликаций)

Сиг-хадары (р. Онон) занимает промежуточное положение между группой арктических сигов и сигами из оз. Телецкое и бассейна Енисея.

Сиги из оз. Баунт близки к группе арктических сигов, однако «баунтовская ряпушка» С. ЬаипН несколько дифференцирован от данной группы, в то время как среднетычинковый озёрный сиг и пыжьян имеют большее количество общих аллелей с арктическими сигами.

Рисунок 7. Ординация выборок пыжьяновидных сигов на плоскости главных компонент по результатам аллозимного анализа

Енисейский залив оз. Ессей о. Печсюа

р. Мордыяха (Западный

Ямал)

р.Обь

Тазовская губа (бассейн р.Обь) р. Индигирка р. Колыма р. Пенжина р. Яна

оэ. Баунт (малотычинковый) оз. Баунт ЬаипН <зз. Баунт (среднетычинковый) о. Хамсаоа

оз. Азас (прибрежный) оэ. Азас (глубинник) о. Куоейка оз.Телецкое оз.Телеикое оз. Кадыш р. Онон (С. сЬабагу) С. тфгаЮлив

Рисунок 8» иРСМА-дендрограмма пыжьяновидных сигов по данным аллозимного анализа

По генетическим расстояниям Ые1 была построена Ш'СМА дендрограмма пыжьяновидных сигов (рис. 8). Отдельный кластер образуют сиги из рр. Печора, Мордыяха (Западный Ямал), нижняя Обь, Енисей. Следующую группу образуют выборки из Восточной Сибири рр. Яна, Индигирка, Колыма и Охотоморья - р. Пенжина. Наиболее дифференцированными от других пыжьяновидных оказались выборки из верхней Оби и Енисея. Отдельный кластер образуют все сиговые оз. Баунт. Сиг-хадары из басс. верхнего Амура (р. Онон) наиболее сильно дифференцирован от других пыжьяновидных сигов, что согласуется с данными анализа мтДНК.

3.3.3 Внутривидовая генетическая дифференциация чира Сибири

С помощью ПЦР-ПДРФ анализа среди популяций чира было идентифицировано 15 комплексных гаплотипов. Наибольшее число полиморфных сайтов у С. паяш отмечено для следующих рестриктаз: Вш] I, I, В.\-р 128 6 I, Мчр I, ЛЫ I, йга I. Для чира характерен уникальный набор комплексных гаплотипов, свойственный только данному виду. Диагностические для чира спектры рестрикции дают следующие рестриктазы: Нае Ш, Д^И I, Я$р1286, Мзр I, N011, Яга 1.

л». Рис. 9. Медианная сеть комплексных гаплотипов мтДНК

|Р№503 С.таш

С помощью анализа мтДНК обнаружены существенные отличия чира в крайних точках исследованной нами части ареала. Выборка чира из Западной Сибири (п-ов Ямал, р. Мордыяха) мономорфна и представлена уникальным комплексным гаплотипом N1. В популяции С. па.чиа из р. Пенжина, которая является самой восточной точкой изученной нами территории, обнаружено два комплексных гаплотипа N4501 и N4504, которые близки между собой, но имеют существенные отличия от других гаплотипов.

Наиболее высокий уровень гаплотипического (И) и нуклеотидного разнообразия (я) наблюдается в популяциях чира из рр. Яны и Индигирки (табл. 6). Оценка уровня разнообразия между популяциями чира и внутри этих популяций показала, что большая часть молекулярного разнообразия приходится на различия внутри популяций (60,9% дисперсии). Межпопуляционная компонента генетического разнообразия (/^т) составила 39,1%. Выборки из Восточной Сибири (Яна, Индигирка, Колыма) отличаются высоким сходством, во всех представлены четыре комплексных гаплотипа: N13, N70, N17, N16, которые являются базальными для чира Сибири (рис. 9).

Таблица 6. Уровень гаплотипического и нуклеотидного разнообразия в выборках чира

Уровень гаплотипического/ нуклеотидного разнообразия р. Мордыяха п-ов Ямал р. Яна р. Индигирка р. Колыма р. Пенжина

1С 0,000 0,081 0,090 0,061 0,018

А 0,000 0,784 0,877 0,653 0,450

На основании результатов изоферментного анализа в изученных выборках чира выявлен полиморфизм локусов АН-!*, АН-2*, ОЗРОН-/*, Е5Т-2*, тЮНР-3,4*, ШШ1-А1.2*, хМйН-В1,2*, МЕР-1,2*. РаОН*, ОР1-А1.2*, РОМ-1", РвМ-2*, .4011-1,2*, 80й-1*, .ЮР-2*.

Наиболее полиморфными по данным аллозимного анализа являются выборки из рр. Индигирки и Колымы (Р=53,13% и 43,75%, соответственно). Уровень средней гетерозиготности не показал существенных различий между выборками чира, максимален данный показатель в выборках из рек Яны, Индигирки, Колымы. Среднее число аллелей на локус и число полиморфных локусов максимально в выборках из Колымы и Индигирки. Отмечено изменение аллельного состава и частот в выборках чира с запада на восток, особенно заметен данный факт в случае с локусами малик-энзима МЕР-1,2*.

На основании частот аллелей аллозимных локусов были рассчитаны генетические расстояния и построена иРОМА-дендрограмма (рис. 10). На дендрограмме отдельную группу образуют выборки Восточной Сибири - Яна, Индигирка Колыма к которой примыкают сиговые из бассейнов Енисея, Оби, Пенжины.

р. Мордыяха (Зап. Ямал) Енисейский залив р. Курейка р. Яна

р. Индигирка р. Колыма р. Пенжина р.Обь

С. migratorias

0.30 0.00

Linkage Distance

Рисунок 10. UPGMA дендрограмма выборок чира по данным аллозимного анализа (аутгруппа представлена байкальским омулем С. migralorius). В узлах приведены соответствующие значения бутстрэп-поддержки (из 1000 репликаций).

3.3 Уточнение филогенетического положения изученных видов сигов рода Coregonus

На основании ПЦР-ПДРФ анализа ND1 фрагмента мтДНК была построена минимально протяжённая сеть комплексных гаплотипов, включающая представителей всех трёх родов семейства: сиги Coregonus, нельма, или белорыбица — Stenodus и вальки — Prosopium (рис. 11). Помимо собственных данных, использованы результаты анализа мтДНК, полученные ранее (Политов, Гордон, 1998; Гордон и др., 2010; Politov et al., 2000, 2002).

Согласно данным анализа мтДНК, роды Prosopium и Stenodus генетически хорошо дифференцированы от Coregonus и представляют собой отдельные ветви на минимально протяжённой сети комплексных гаплотипов мтДНК. Полученные результаты не подтвердили разделение рода Coregonus на два подрода Coregonus и Leucichthys, существует более чем два дивергировавших между собой комплекса видов. Представители исследованных видов образуют одну из центральных групп гаплотипов на медианной сети (рис. 11). Она располагается между комплексом ряпушек и пеляди и группой байкальских сигов (включая байкальского омуля). К группе байкальских сигов близки также сиги бассейна Амура -амурский сиг С. ussuriensis, сиг-хадары С. chadary и одна из двух сильно дивергировавших

гаплогрупп востряка С. апач1огит (вторая гаплогруппа этого вида относится к типично «пыжьяновым»). Гаплотипы пеляди С. ре1е(1 и так называемого «пенжинского омуля» С. ¡иЬаШитпа/й кластеризуются внутри группы гаплотипов ряпушки.

Чир С. nasus по мтДНК хорошо дифференцируется от других сигов с нижним ртом, его комплексные гаплотипы располагаются на минимально протяжённой сети между гаплотипами ряпушки и комплексом муксуна и пыжьяна. Хорошо морфологически различимые виды - муксун С. тиЪип и пыжьян С. р1(ксЫап практически не дифференцируются по мтДНК. В эту группу входят также все сиги Южной Сибири, включая сижка Правдина, оронских и баунтовских сигов, независимо от положения рта и числа жаберных тычинок.

Рисунок 11. Медианная сеть комплексных гаплотипов сиговых рыб, построенная на основе нуклеотидных последовательностей ND1 фрагмента мтДНК. Длина ветвей, соединяющих гаплотипы, пропорциональна количеству мутационных шагов.

На основании полного секвенирования ND1 фрагмента мтДНК показано, что сиговые группируются в два отдельных кластера. Кластер «А» образуют нельма Stenodus nelma, тугун С. tugim, С. sardinella/peled/albula complex, арктический омуль С. autumnalis. Кластер «В» объединяет собственно сигов (подрод Coregonus), байкальского омуля и баунтовскую ряпушку. Внутри данного кластера пыжьяновидные сиги группируются вместе с муксуном, кроме сига из р. Анадырь, для которого свойственны уникальные нуклеотидные последовательности. Чир близок к группе пыжьян-муксун, однако образует отдельную ветвь (рис. 6).

Результаты изоферментного анализа показали, что представители рода Stenodus также образуют отдельную группу, однако, генетические различия с родом Coregonus выражены не так сильно, как по мтДНК (рис. 12). Внутри p. Coregonus можно выделить ряд групп. Отдельную группу образуют сибирская, европейская ряпушки, пелядь и С. subautumnalis.

Арктический омуль С. аиШтпаИя занимает полярное положение по первой главной компоненте, а байкальский омуль вместе байкальским озёрным сигом ближе к настоящим сигам, но занимает обособленное положение, что подтверждает результаты анализа мтДНК.

По сравнению с выраженными различиями по аллозимам между комплексами видов, настоящие сиги слабо дифференцированы друг от друга и на схеме представляют собой единую группу, включая пенжинского сига-востряка. Различия внутри этой группы обсуждались выше (Раздел 3.2.2).

♦ С. autumnalis Д С. migratorius

• С. sp. байкальский

озёрный сиг

Ж С. pidschian complex

О С. muksun

0 С. nasus □ С. peled

1 С. albula

О С. sardinella

* С. rtelma

-2.5 -2.0 -1.5 -1.0 -0.5 0.0 0.5 1.0 1.5 2.0 FACTO R1

Рнсунок 12. Ординация выборок сиговых рыб на плоскости двух главных компонент по результатам изоферментного анализа

ГЛАВА IV. ОБСУЖДЕНИЕ

4.1 Взаимоотношения внутри группы сигов с нижним ртом (подрод Согецопия)

Группа сигов с нижним ртом традиционно объединяется в подрод Соге^о/гил; однако наши результаты не подтвердили существования однородности внутри данного комплекса видов. По данным мтДНК в группе изученных видов С. гииш наиболее дифференцирован от других видов, поскольку содержит специфичные, свойственных только данному виду комплексные гаплотипы. МтДНК С. сильно дивергировала по сравнению с другими

видами номинального подрода Соге^опих. Отличия чира от близких видов по изоферментным локусам не столь существенны. Данный факт иллюстрирует неравномерность эволюционных процессов. Тем не менее, как по мтДНК, так и по комплексу аллозимных локусов диагностировать видовую принадлежность чира не представляется затруднительным.

Традиционно, опираясь на морфо-экологические данные, муксуна и пыжьяна относят к разным видам. Результаты анализа мтДНК, как и данные изоферментного анализа, не выявили чётких диагностических различий между С. р'^сЫап и С- тикзип. В целом, невысокий уровень генетической дифференциации указывает на недавнюю дивергенцию этих форм сигов. В свете генетических данных логично предположить, что пыжьян либо был близок к предковой форме муксуна, либо эти два вида имеют ближайшего общего предка. Гаплотипы мтДНК, характерные для пыжьяна, занимают на минимально-протяжённой сети базальное положение и дают начало многочисленным вариантам комплексных гаплотипов других пыжьяновидных сигов и муксуна. У муксуна и пыжьяна встречаются как редкие

варианты комплексные гаплотипы другого комплекса р. Coregonus - группы ряпушек. Возможно, происхождение муксуна связано с гибридизацией его предка (общего с современным пыжьяном) с каким-то представителем комплекса ряпушек/пеляди. Это, на наш взгляд, может свидетельствовать о роли видов этого комплекса в происхождении муксуна, тем более что такие гибриды описаны в литературе (Берг, 1948; Шишмарев, 1976). Вероятнее всего, в эволюционном масштабе обмен генами мог происходить не как единовременный акт, а как постоянная интрогрессия, имеющая место в разных частях ареала как в относительно далеком, так и в недавнем прошлом, и, скорее всего, продолжающаяся в настоящем. Такая интрогрессия предусматривает возвратные скрещивания, по крайней мере, на одного из родителей - пыжьяна, что и объясняет генетическую близость его с муксуном. Эта гипотеза согласуется с предложенным ранее механизмом видообразования у сиговых рыб (Медников и др., 2000). Гены ряпушек или пеляди - видов, имеющих большое число жаберных тычинок - могут проявляться у муксуна и после череды возвратных скрещиваний, определяя своеобразный «химерный» фенотип этого уникального в экологическим смысле нектобентофага.

Таким образом, изученные нами виды представляют отдельные эволюционные линии: 1) чир С. nasus, 2) пыжьяновидные сиги комплекса С. pidschian и муксун С. muksun.

4.2 Внутривидовая генетическая дифференциация сигов Сибири

4.2.1 Внутривидовая генетическая дифференциация муксуна Сибири

Муксун - эндемичный вид, обитающий на территории Сибири. Особенности различных морфологических форм муксуна были описаны в 40-70 гг. (Меньшиков, 1949; Новиков, 1966; Александрова, Кузнецов, 1968, 1970, 1972). Первые генетические данные о С. тиЬип касаются в основном межвидовых отличий (Ирискин, 1972; Ермоленко, 1992; Politov et al., 1999,2000).

Высокие показатели бутстреп-поддержки узлов ветвления дендрограммы по данным изоферментного анализа указывают на существование как минимум двух групп муксуна -западной и восточной, что свидетельствует о полифилетическом происхождении С. muksun. Промежуточное положение занимает муксун из бассейна р. Лена, поскольку выборки из нижнего течения р. Лена попали в разные кластеры.

Наиболее близкое положение к основанию минимально протяжённой сети комплексных гаплотипов мтДНК занимают гаплотипы, характерные для муксуна из р. Лены и оз. Широкое (п-ов Таймыр). Своё происхождение данные гаплотипы берут от комплексного гаплотипа, характерного для пыжьяновидных сигов. Предполагаемый сценарий происхождения вида С. тиЬип обсуждается в разделе 4.1.

По результатам аллозимного анализа выборка из р. Обь отличается низким уровнем полиморфизма. Морфо-экологические отличия обского муксуна от С. muksun из других сибирских рек были отмечены ещё в 1946 году, а, более поздние исследования указывают на неоднородность муксуна на территории Обь-Тазовского района (Москаленко, 1958, Никонов, 1977). В нашем исследовании участвовала выборка, взятая из среднего течения Оби, однако материал получен из искусственной популяции муксуна (Ленинградская область «Ропша»), что может объяснять невысокий уровень изменчивости.

4.2.2 Внутривидовая генетическая дифференциация пыжьяновидных сигов Сибири

Малотычинковый сибирский сиг Coregonus pidschian s. I. является самым полиморфным

видом сиговых, который в Сибири представлен комплексом аллопатрических и симпатрических популяций и существует в виде различных морфо-экологических форм (Исаченко, 1925; Дрягин, 1933; Михин, 1959; Шапошникова, 1974; Решетников, 1980; Шубин идр., 1997; Черешнев идр.,2002).

По результатам ПЦР-ПДРФ анализа мтДНК ND1 пыжьян в разных сибирских реках имеет уникальные спектры гаплотипов. Для пыжьяновидных сигов характерен высокий уровень полиморфизма, однако, комплексные гаплотипы мтДНК всех изученных форм образуют единую группу, которая также включает в себя и гаплотипы муксуна. Исключение

составили сиги бассейнов оз. Байкал, а также р. Амур и р. Анадырь (одна из двух гаплогрупп).

Результаты изоферментного анализа показали наличие сложной внутривидовой структуры С. pidschian complex на территории Сибири. Первую группу составляют эндемичные симпатричные сиги из оз. Телецкое в бассейне верхней Оби - малотычинковый телецкий сиг и среднетычинковый сиг Правдина. Две формы телецких сигов генетически близки между собой, но по аллозимам чётко дифференцируются от пыжьяна из нижней Оби и низовьев других сибирских рек. Хотя существует вероятность генного обмена сигов Телецкого оз. с верхнеобскими речными популяциями, изоляция от ледовитоморских пыжьянов достаточно выраженная. Она связана с неподходящими для жизни рыб анаэробными условиями в среднем течении Оби и низкой миграционной активностью данных видов. Кроме того, плотина Новосибирской ГЭС, возведённая на р. Обь в 1961 году, также является дополнительным барьером для миграции сиговых рыб. Однако, несмотря на наличие ряда уникальных редких гаплотипов, данные анализа мтДНК в целом не показали глубокой дифференциации телецких сигов от других сибирских «настоящих» сигов, в выборках преобладает гаплотип РЗ, характерный для муксуна и пыжьяна. Таким образом, происхождение этих форм связано, скорее всего, с событиями плейстоценового времени, но обособленность южного генного пула сигов наиболее ярко проявляется именно в верхней Оби.

Группа выборок пыжьяновидных сигов из бассейна реки Енисей показала их генетическую неоднородность внутри бассейна. Так, в верхнем течении Енисея (водоёмы Тоджинской котловины оз. Азас, оз. Кадыш, р. Хамсара) преобладают аллели, характерные для верхнеобских популяций, но присутствуют и аллели ледовитоморского пыжьяна. Сиги нижнего Енисея более близки к типичным субарктическим пыжьянам, но также содержат аллели, характерные для сиговых из верхней Оби. Таким образом, внутри бассейна Енисея концентрация специфических аллелей, маркирующих южно-сибирский генный пул, уменьшается от верхнего (водоемы Тоджинской котловины) к нижнему течению Енисея (Енисейский залив, р. Курейка). Отмечено, что дифференциация внутри южных популяций и между ними достаточно сильно выражена, в то время как северные (субарктические) группы генетически относительно однородны на территории от Европы до Восточной Сибири.

Сиговые из оз. Баунт в бассейне верхней Лены образуют две группы. Наши результаты, полученные с помощью изоферментного анализа и мтДНК, показали, что т.н. «ряпушка» оз. Баунт, несмотря на некоторое внешнее сходство с С. sardinella, не имеет характерных для настоящих ряпушек аллелей и гаплотипов, и относится к комплексу сигов с нижним ртом. Однако эта форма достаточно хорошо дифференцируется от пыжьяновидных форм как оз. Баунт, так и других водоемов Сибири. Очевидно, что баунтовскую ряпушку следует рассматривать как отдельный вид, но в составе комплекса пыжьяновидных сигов. В то же время малотычинковые и среднетычинковые сиги оз. Баунт обнаруживают сходство между собой и с ледовитоморским кластером сигов.

Сиг-хадары С. chadary из бассейна Амура (в частности наш материал происходил из верховьев р. Онон), по морфологии относится к пыжьяновидным сигам. По аллозимам он занимает промежуточное положение между телецкими, верхнеенисейскими и ледовитоморскими сигами. Очевидно его близкое родство с амурским сигом С. tissuriensis -симпатричным видом, имеющим конечный рот. Дифференциация сигов из р. Амур от других пыжьяновидных и относительную близость с сигами и омулем оз. Байкал показана нами также и с помощью мтДНК (Baldina et al., 2007; Bochkarev et al., 2010).

Таким образом, полученные результаты указывают на существование отдельной, хорошо дифференцированной от ледовитоморской, южно-сибирской линии в эволюции сигов, в наиболее чистом виде сохранившейся в верхней Оби. При этом енисейские сиги являются промежуточными между телецкими и ледовитоморскими, и Енисей служит главной магистралью обмена между северным и южным генным пулом.

4.2.3 Внутривидовая генетическая дифференциация чира Сибири

Чир С. па$ш имеет обширный ареал как в Сибири, так и в Неарктике, но большинство исследователей отмечают морфо-экологическое однообразие этого вида. Сравнительные данные, основанные на морфологических признаках (Решетников, 1980; Черешнев и др., 2002), аллозимах (Ермоленко, 1991) и микросателлитах (Район е1 а1., 1997), не показали высокого уровня внутривидовой дифференциации,

С помощью совместного анализа мтДНК и изоферментных локусов обнаружены существенные отличия чира в крайних точках исследованной нами части ареала. Однородность и уникальность С. паяю с п-ова Ямала (выборка с западной части ареала), возможно, связаны с такими стохастическими процессами как эффект основателя или прохождение популяции через «бутылочное горлышко». Известно, что основной нагул чира происходит в эстуарии р. Мордыяхи. Зимний период молодь чира проводит в озёрах (Богданов, 1995; Богданов, Мельниченко, 1995). Озёра в нижнем течении и дельте Мордыяхи зимой часто перемерзают, что резко сокращает численность сиговых (Богданов и др., 2000) и может влиять на генетическое разнообразие.

Выборка С. латг р. Пенжина (бассейн Охотского моря), которая является крайней восточной точкой изученной нами территории, представлена двумя митохондриальными комплексными гаплотипами, которые близки между собой, но имеют существенные отличия от всех остальных сибирских гаплотипов. Значительна и дифференциация по частотам аллозимных локусов (в частности, МЕР-1,2*). Единая Анадырско-Пенжинская речная система со стоком в Охотское море известна с плейстоцена (Черешнев, 1986, 1998), таким образом, чир из данного региона длительное время был географически изолирован от ледовитоморских популяций.

Наиболее разнообразен генетически чир из рр. Яны и Индигирки. Комплексные гаплотипы, которые располагаются в основании ветви С. пихт на минимально протяжённой сети, характерны для Яны, Индигирки и Колымы. Можно предположить, что именно из бассейнов данных рек шло расселение чира как на запад, так и на восток.

4.3 Уточнение филогенетического положения изученных видов сигов рода Со^опия

Сопоставление наших данных с ранее полученными указывает на то, что род Ргоьортт наиболее существенно дивергировал от р. Согеёопш. Для 51епо11ш и Соге^огаи обнаружено большее количество сходных аллелей, и не столь выраженная дивергенция мтДНК. В рамках рода Coregonus существует несколько комплексов видов, не вполне соответствующих традиционным подродам. Исследованные «настоящие» сиги с нижним ртом (включая также и муксуна), а также некоторые озерные формы с конечным ртом из верховьев сибирских бассейнов, относятся к единой эволюционной ветви. Они обнаруживают определенное сходство с байкальскими сиговыми, с которыми может быть связано их происхождение.

Сиги из бассейна р. Амур - амурский сиг и сиг-хадары - по мтДНК и аллозимам значительно дивергировали от других сибирских видов. Очевидна связь этого комплекса сигов с байкальскими сигами и омулем.

Эндемичная форма пыжьяновидного сига - сиг-востряк (С. апаиЬгит), обитающая в рр. Анадырь и Пенжина, является, вероятно, производной формой пыжьяна, поскольку содержит в геноме как признаки, свойственные С. р1(ксЫап, так и уникальные, характерные только С. апаиЬгит. Формирование С. апаиЬгит могло произойти в период существования единой Анадырско-Пенжинской речной системы.

Таким образом, границы внутри- и межвидовой генетической дифференциации у сигов р. Соге$опш являются достаточно условными. Сохранение и рациональная эксплуатация генофондов сиговых рыб невозможны не только без детального изучения популяционно-генетической структуры и частной филогеографии отдельных видов, но и без тщательной ревизии таксономической системы группы в целом, основанной на реконструкции филогенетических взаимоотношений.

ВЫВОДЫ

1. Разработана система молекулярных маркёров для идентификации, дифференциации и анализа родственных взаимоотношений сигов рода Coregonus Сибири на внутри- и межвидовом уровнях.

2. Группа пыжьяновидных сигов, включая ряд среднетычинковых верхнеобских и верхнеленских форм с конечным ртом по данным мтДНК и изоферментным локусам хорошо дифференцируется от других представителей рода Coregonus (кроме муксуна).

3. По данным анализа мтДНК и изоферментных локусов показана генетическая близость муксуна С. muksun с пыжьяновидными сигами, с которыми муксун в водоёмах Сибири обитает симпатрично, что указывает на существование общей пыжьяновидной предковой формы.

4. Обнаружены молекулярные признаки, свидетельствующие о возможности гибридогенного происхождения муксуна от пыжьяноподобного предка с участием видов комплекса ряпушек и пеляди (С. sardinella - С. peled). Молекулярные данные не подтверждают монофилетическое происхождение муксуна бассейнов сибирских рек.

5. Обнаружено существование отдельной, дифференцированной от ледовитоморской, южно-сибирской линии в эволюции малотычинковых сигов, в наиболее чистом виде сохранившейся в верхней Оби.

6. В пределах бассейна Енисея концентрация специфических аллелей, маркирующих южно-сибирский генный пул, уменьшается от верхнего к нижнему течению Енисея. Енисей выступает в качестве главного пути обмена генами между южным и северным генными пулами сигов.

7. При исследовании внутривидовой дифференциации чира показано, что наибольшей генетической изменчивостью характеризуются популяции Восточной Сибири, которые можно рассматривать как предковые. Западноямальская и пенжинская популяции значительно дифференцированы от восточносибирских.

8. Полученные данные свидетельствуют об эффективности использованного метода для выявления популяционно-генетической структуры сигов p. Coregonus, а результаты, демонстрирующие соответствие генетической кластеризации географическому происхождению выборок, могут стать основой программ сохранения генофондов и рационального использования запасов ценных сиговых рыб Сибири.

Список работ опубликованных по теме диссертации

Статьи в рецензируемых журналах

Балдина С. Н., Гордон Н. Ю., Политов Д. В. Генетическая дифференциация муксуна Coregonus muksun (Pallas) и родственных видов сиговых рыб (Coregonidae, Salmoniformes) Сибири по мтДНК //Генетика. 2008. Т. 44. № 7. С. 896-905.

Baldina S. N., Gordon N. Y., Politov D. V. Genetic relationships of the Ussuri cisco, Coregonus ussuriensis Berg 1906, in view of mtDNA data //Advances in Limnology. 2007. V. 60. P. 83-89.

Политов Д. В., Балдина С. Н., Гордон Н. Ю. Молекулярное маркирование генетических ресурсов сиговых рыб Сибири // Рыбоводство и рыбное хозяйство. 2008а. № 8. С. 32-35.

Статьи в сборниках

Балдина С. Н., Гордон Н. Ю., Политов Д. В. Генетическая дифференциация некоторых видов сиговых рыб Сибири // (под ред. Литвиненко А.И, Решетников Ю. С.) Мат. 7-го Всеросс. науч.-произв. совещания по биологии, биотехнике сиговых рыб. Тюмень: ФГУП Госрыбцентр, 2010. С. 5-9.

Балдина С. Н., Политов Д. В., Гордон Н. Ю. Генетическая дифференциация муксуна Coregonus muksun (Pallas) // Экология: от Арктики до Антарктики: Материалы конференции молодых ученых. Екатеринбург: Академкнига, 2007. С. 14-23.

Балдина С. Н., Гордон Н. Ю., Политов Д. В. Генетическая изменчивость и межпопуляционные различия некоторых видов сиговых рыб Сибири // Мат. конф. «Водные и наземные экосистемы: Проблемы и перспективы исследований». Вологда: 2008. С. 45-51.

Боровикова Е. А., Балдина С. Н., Гордон Н. Ю., Махров А. А., Политов Д. В. Генетическое разнообразие, особенности морфологии и происхождение ряпушки (Coregonus) Водлозера // Водлозерские чтения: Естественно-научные и гуманитарные основы природоохранной и просветительской деятельности на охраняемых территориях Русского Севера. Петрозаводск: 2006. С. 69-74.

Боровикова Е. А., Гордон Н. Ю., Балдина С. Н., Болотова Н. Л., Политов Д. В. Аплозимный полиморфизм в популяции карликового сига нельмушки озера Кубенское и родственных форм сигов ледовитоморского бассейна // Биологические ресурсы Белого моря и пресных вод Европейского Севера. Вологда: 2005. С. 84-86.

Гордон Н. Ю., Балдина С. Н., Политов Д. В. Филогенетические отношения сиговых рыб оз. Телецкое по молекулярно-генетическим данным // (под ред. Литвиненко А.И, Решетников Ю. С) Мат. 7-го Всеросс. науч.-произв. совещания по биологии, биотехнике сиговых рыб. Тюмень: ФГУП Госрыбцентр, 2010. С. 19-24.

Политов Д. В., Балдина С. Н„ Гордон Н. Ю. Характеристика генетических ресурсов сиговых рыб Сибири с помощью молекулярных маркеров // Мат. межд. конф. "Современное состояние водных биоресурсов" (Новосибирск, 26-28 марта 2008 г.). Новосибирск: Агрос, 2008. С. 185-190.

Политов Д. В., Балдина С. Н., Гордон Н. Ю. Некоторые вопросы филогении и филогеографии сиговых рыб Н Мат. конф. «Водные и наземные экосистемы: Проблемы и перспективы исследований. Вологда: 2008. С. 56-63.

Политов Д. В., Балдина С. Н., Гордон Н. Ю. Филогенетика и филогеография сиговых -сравнение морфологического и генетического подходов // (под. ред. Литвиненко А.И, Решетников Ю. С) Мат. 7-го Всеросс. науч.-произв. совещания по биологии, биотехнике сиговых рыб Тюмень: ФГУП Госрыбцентр, 2010. С. 37-41.

Тезисы

Baldina S. N., Gordon N. Y., Politov D. V. Genetic differentiation among Siberian populations of broad whitefish Coregonus nasusll 10th Int. Symp. on the Biology and Management of Coregonid Fishes (Winnipeg, Manitoba, Canada, August 25-29, 2008). Winnipeg: 2008. P. 2.

Baldina S. N., Gordon N. Y., Politov D. V. Intra-specific genetic differentiation in several Siberian species of Coregonus by mtDNA and allozyme loci // Int. Conf. Evolutionary Ecology of Fishes: Diversification, Adaptation and Speciation (22-25 November 2009, Berlin, Germany). 2009. P. 89.

Gordon N. Y„ Baldina S. N., Mamontov A. M., Vlasov S. O., Kirillov V. V., Politov D. V. Genetic variability within and among morphologically different forms of whitefishes in a South Siberian Lake Teletskoe at nuclear and mtDNA genetic markers // 10th Int. Symp. on the Biology and Management of Coregonid Fishes (Winnipeg, Manitoba, Canada, August 25-29, 2008). Winnipeg: 2008. P. 20.

Gordon N. Y., Baldina S. N., Politov D. V. Phylogenese relationships of whitefish and cisco species of lake Baikal and adjacent watersheds // Int. Conf. Evolutionary Ecology of Fishes: Diversification, Adaptation and Speciation (22-25 November 2009, Berlin, Germany). 2009. P. 35.

Politov D. V., Batdina S. N., Gordon N. Y. Patterns of genetic differentiation and speciation in Palearctic coregonids // Int. Conf. Evolutionary Ecology of Fishes: Diversification, Adaptation and Speciation (22-25 November 2009, Berlin, Germany). 2009. P. 125.

Politov D. V., Gordon N. Y., Baldina S. N., Borovikova E. A. Molecular phylogeny and phylogeography of Palearctic coregonids // XII European Congress of Ichthyology (Abstracts). Cavtat: 2007.

Балдина С. H., Гордон Н. Ю., Политов Д. В. Генетическая дифференциация популяций сигов ледовитоморского бассейна // Генетика в России и в мире. Москва: Институт общей генетики им. Н.И.Вавилова РАН, 2007. С. 14.

Балдина С. Н., Политов Д. В., Гордон Н. Ю. Использование гена NADH-дегидрогеназы (субъединица 1) митохондриальной ДНК для решения вопросов эволюции и филогении сиговых рыб // 9 Межд. Пущинская конф. молодых ученых «Биология - Наука XX века». Пущино: 2005. С. 69.

Гордон Н. Ю., Политов Д. В., Балдина С. Н., Боровикова Е. А., Яхненко В. М., Мамонтов А. М. Родственные связи сиговых рыб озера Байкал в свете молекулярно-генетических данных // Четвертая Верещагинская Байкальская конференция. Тезисы докладов и стендовых сообщений. Иркутск: ЛИН РАН, 2005. С. 48-49.

Балдина С. Н., Гордон Н. Ю., Исаева О. А., Политов Д. В. Генетические связи сигов Coregonus (Teleostei, Salmoniformes, Coregonidae) бассейнов Оби и Енисея // Пятая Верещагинская Байкальская конференция. Тезисы докладов и стендовых сообщений. Иркутск: ЛИН СО РАН, 2010. С. 62-63.

Гордон Н. Ю., Матвеев А. Н., Балдина С. Н., Политов Д. В. Симпатрические формы сигов оз. Орон из Забайкалья // Пятая Верещагинская Байкальская конференция. Тезисы докладов и стендовых сообщений. Иркутск: ЛИН СО РАН, 2010. С. 72.

Политов Д. В., Балдина С. Н., Гордон Н. Ю. Механизмы видообразования у сиговых рыб Палеарктики // Пятая Верещагинская Байкальская конференция. Тезисы докладов и стендовых сообщений. Иркутск: ЛИН СО РАН, 2010. С. 41-42.

Подписано в печать: 22.10.10

Объем: 1,5 усл.п.л. Тираж: 100 экз. Заказ № 769157 Отпечатано в типографии «Реглет» 119526, г. Москва, пр-т Вернадского,39 (495) 363-78-90; www.reglet.rn

Содержание диссертации, кандидата биологических наук, Балдина, Светлана Николаевна

4-

ГЛАВА I. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1 Сиговые рыбы как объект исследования. Систематика, проблемы идентификации; дифференциации и видообразования

1.1.1 Статус сиговых и традиционные взгляды на филогению

1.1.2 Распространение сиговых рыб

1.1.3 Биология сиговых

1.1.4 Происхождение сиговых рыб

1.1.5 Видообразование, микросистематика и микроэволюция сиговых 19 1.1.6. Экологическое и хозяйственное значение сиговых рыб

1.2 Методы изучения внутривидовой дифференциации и популяционной структуры сиговых рыб

1.2.1 Морфо-экологические признаки

1.2.2 Цитогенетические методы. Кариология

1.2.3 Биохимические маркеры •

1.2.4 ДНК маркеры 30 • 1.2:4.1 Метод ДНКхДНК гибридизации

1.2.4.2 Ядерная ДНК

1.2.4.3 Митохондриальная ДНК

1.3 Дифференциация сигов Сибири на основе морфо-экологических и генетических данных

1.3.1 Кариология сиговых рыб Сибири

1.3.2 Внутривидовая дифференциация и филогеография сигов Сибири по данным морфологического, биохимического и ДНК анализа.

ГЛАВА II МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

2.1 Основные сведения о собранном и обработанном материале

2.1.1. Пыжьян и близкие ему виды и формы

2.1.2. Муксун

2.1.3. Чир

2.2 ПЦР-ПДРФ анализ мтДНК

2.2.1 Выделение ДНК

2.2.2 Амплификация мтДНК 55.

2.2.3 Электрофоретический анализ полиморфизма длин рестрикционных ПЦР-фрагментов мтДНК

2.2.4 Статистический анализ полиморфизма длины рестрикционных фрагментов мтДНК

2.3 Секвенирование N01 фрагмента мтДНК

2.4 Изоферментный анализ

2.4.1 Экстракция ферментов из тканей

2.4.2. Буферные системы

2.4.3 Изученные ферментные системы

2.4.4 Электрофорез в крахмальном геле

2.4.5 Статистический анализ изоферментных данных

ГЛАВА III РЕЗУЛЬТАТЫ

3.1 Взаимоотношения внутри группы сигов с нижним ртом 66 3.1.1 Данные ПЦР-ПДРФ анализа мтДНК 66 3.1.3 Результаты изоферментного анализа (подрод Coregomis)

3.2 Внутривидовая генетическая дифференциация сигов Сибири

3.2.1 Внутривидовая генетическая дифференциация муксуна Сибири

3.2.2 Внутривидовая генетическая дифференциация пыжьяновидных сигов Сибири

3.3.3 Внутривидовая генетическая дифференциация чира Сибири

3.3 Уточнение филогенетического положения изученных видов сигов рода Coregonus 1053.3.1 Уточнение филогенетического положения сиговых рыб Сибири на основе ПЦР-ПДРФ анализа мтДНК

3.3.2 Уточнение филогенетического положения сиговых рыб Сибири по результатам секвенирования ND1 фрагмента мтДНК

3.3.3 Уточнение филогенетического положения изученных сиговых рыб Сибири на основе изоферментного анализа

ГЛАВА IV ОБСУЖДЕНИЕ

4.1 Взаимоотношения внутри группы сигов с нижним ртом (подрод Coregonus)

4.2 Внутривидовая генетическая дифференциация сигов Сибири

4.2.1 Внутривидовая генетическая дифференциация муксуна Сибири

4.2.2 Внутривидовая генетическая дифференциация пыжьяновидных сигов Сибири

4.2.3 Внутривидовая генетическая дифференциация чира на территории Сибири

4.3 Уточнение филогенетического положения изученных видов сигов рода Coregonus

ВЫВОДЫ

Введение Диссертация по биологии, на тему "Внутривидовая генетическая дифференциация и филогеография сигов (P. Coregonus) Сибири"

Актуальность. Сиговые рыбы (сем. Coregonidae, или подсем. Coregoninae, отр. Salmoni formes, Teleostei) широко распространены в субарктической и бореальной зоне Европы, Азии и Северной Америки и являются важнейшими компонентами экологических систем и ценными объектами местного и промыслового рыболовства. Современные морфо-экологические, генетические, палеонтологические данные позволяют рассматривать сиговых рыб как отдельное семейство, внутри которого большинство исследователей выделяют три рода Coregonus, Prosopium и Stenodus (Берг, 1948; Решетников, 1980; Решетников и др., 2002; Черешнев и др., 2002; Богуцкая, Насека, 2004). Наибольшее число видов рода собственно сигов Coregonus сосредоточено именно в водоёмах Сибири, а также в прибрежной акватории омывающих ее полярных морей:

Сиговые рыбы обладают высокой морфо-экологической пластичностью и имеют сложную внутривидовую структуру (Решетников, 1980; Bernatchez et al., 1991; Bodaly et al, 1991; Бодали и др., 1994; Reist et al., 1998; Черешнев и др., 2002). Таксономический статус многих аллопатрических и симпатрических форм остается неясным. Кроме того, для представителей рода Coregonus свойственно явление межвидовой естественной гибридизации.

В рамках морфо-экологического подхода не представляется возможности решить спорные вопросы внутривидовой дифференциации, реконструировать филогению и филогеографию сиговых. Развитие исследований в этом направлении стало возможным благодаря использованию генетических маркеров. Изменчивость молекулярно-генетических маркеров не зависит от условий среды обитания и отражает различия в генотипах особей. МтДНК является удобным инструментом для решения филогеографических вопросов, поскольку она обладает высокой скоростью мутирования и имеет клональный характер наследования по материнской линии (Ferris, Berg, 1987; Avise, 1994). Анализ полиморфизма мтДНК позволяет не только дифференцировать таксоны, но и реконструировать возможные эволюционные сценарии. Изоферментные локусы, являющиеся кодоминантными ядерными генными маркерами, зарекомендовали себя как эффективный инструмент для изучения внутри- и межвидовой дифференциации. Совместное применение ядерных и митохондриальных генетических маркеров позволяет получить наиболее полную информацию о состоянии генофондов сиговых рыб и о процессах, протекающих в популяциях.

Сиговые рыбы, обитающие на территории Сибири, в отличие от европейских (Sendek, 2002; 0stbye et al., 2005), генетически изучены слабо. Ранее полученные данные в основном- касаются межвидовых отличий представителей рода Coregonus (Ермоленко, 1992; Бодали и др., 1994; Politov et al., 2000, 2002, 2004). В то же время внутривидовая дифференциация сиговых на сибирской, части ареала с помощью молекулярно-генетических маркёров изучалась крайне фрагментарно. Имеются сведения о генетических особенностях некоторых видов в локальных водоёмах (Ермоленко, 1989, 1991, 1992; Мамонтов, Яхненко, 1987, 1994; Sendek, 2002; Суханова, 1996; Яхненко, Мамонтов, 2006; Sukhanova et al., 2002, 2004; Суханова и др., 2007), однако, широкомасштабный сравнительный анализ между популяциями бассейнов сибирских рек ранее не проводился.

Высокая изменчивость, широкая адаптивная радиация, способность к межвидовой гибридизации (Reist et al., 1992; Медников и др., 2000) позволяет использовать данную группу рыб в качестве модельного объекта для изучения процессов видообразования и расселения (Правдин, 1949; Пирожников и др., 1975; Сычевская, Яковлев, 1976; Шапошникова, 1976, 1977; Сычевская, 1988; Politov et al., 1999, 2002, 2004; Фролов, 2000). Понимание генетических процессов в популяциях позволит наиболее оптимально использовать ресурсы этих ценнейших рыб.

Цель исследования: изучение внутривидовой генетической дифференциации сиговых рыб Сибири и уточнение их филогенетических связей.

В соответствии с заявленной целью работы были поставлены следующие задачи:

• Разработать систему молекулярных маркеров для филогеографических и популяционно-генетических исследований сигов Сибири.

• Исследовать внутривидовую генетическую дифференциацию сигов рода Coregonus рек Сибири по ядерным и митохондриальным локусам.

• С использованием молекулярно-генетических маркеров уточнить филогенетические взаимоотношения представителей сиговых рыб Сибири

• Оценить роль межвидовой гибридизации в видообразовании и адаптации у сиговых рыб

Научная новизна и теоретическая значимость работы. Впервые был проведён сравнительный анализ популяций сиговых рыб, обитающих в бассейнах ряда сибирских рек, с использованием полиморфизма мтДНК и изоферментных локусов. Уточнено филогенетическое положение ряда представителей рода Coregonus, таких как пыжьян С. pidschian, чир С. nasus, муксун С. muksun. Выявлено генетическое сходство симпатричных видов С. pidschian, С. muksun. Использованные маркеры не подтверждают монофилию муксуна. Получены данные, свидетельствующие о гибридном происхождении С. muksun. Обнаружено существование отдельной, дифференцированной от ледовитоморской, южно-сибирской линии в эволюции «настоящих» сигов (С. lavaretus/C. pidschian complex) Сибири, в наиболее чистом виде сохранившейся в верхней Оби. Выдвинута гипотеза о том, что Енисей выступает в качестве главного пути обмена генами между южным и северным генными пулами сигов. В пределах бассейна Енисея концентрация специфических аллелей, маркирующих южно-сибирский генный пул, уменьшается от верхнего к нижнему течению Енисея. Впервые с помощью анализа мтДНК и аллозимного анализа было показано генетическое своеобразие популяций чира С. nasus Западной Сибири и Северо-Востока России. Работа послужит основой для дальнейших исследований в области внутривидовой дифференциации, филогеографии и филогении сиговых рыб.

Практическая значимость работы. Пополнена коллекция образцов тканей представителей рода Coregonus: «настоящих» сигов (С. pidschian complex), чира, муксуна Создана база генетических данных исследованных видов, включающая гаплотипы мтДНК и аллельные частоты по 31 изоферментному локусу в 43 популяциях. Результаты представленной работы могут применяться для идентификации'видов и локальных популяций сигов р. Coregonus. Полученные данные о внутривидовой структуре и межвидовых отличиях могут быть использованы для разработки научно обоснованных мер сохранения генофондов сиговых и для мониторинга рыбных ресурсов Сибири.

Положения, выносимые на защиту.

1. Комплексный подход с использованием ядерных (изоферментных) и нерекомбинирующих клонально наследуемых мтДНК маркеров представляется наиболее перспективным в изучении популяционно-генетической структуры сигов p. Coregonus.

2. Генетическая близость муксуна С. muksun с симпатричными пыжьяновидными сигами С. pidschian complex указывает на существование общей пыжьяновидной предковой формы. Монофилетичность муксуна не подтверждается молекулярными данными.

3. Существует отдельная, дифференцированная от ледовитоморской, южно-сибирская линия в эволюции пыжьяновидных сигов, в наиболее чистом виде сохранившаяся в верхней Оби.

4. Енисей является главной магистралью для обмена генами между южным и северным генными пулами сигов.

5. Восточносибирские популяции муксуна и чира являются предковыми для данных видов.

Апробация работы. Материалы диссертации были представлены в виде личных устных докладов автора на российских и международных конференциях: 9-ая Международная Пущинская школа-конференция молодых ученых «Биология — наука XXI века» (Пущино, 2005), Научная школа молодых ученых «Актуальные проблемы современной генетики» при Международной конференции «Генетика в России и мире», посвященной 40-летию Института общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН (Москва, 2006), Конференция молодых учёных «Экология: от Арктики до Антарктики» (Екатеринбург, 2007), X Международный симпозиум «Биология и управление ресурсами сиговых рыб» (Виннипег, Канада, 2008), Всероссийская конференция «Водные и наземные экосистемы: проблемы и перспективы исследований» (Вологда, 2008), Международная конференция «Эволюционная экология рыб - разнообразие, адаптация и видообразование» (Эркнер, Германия, 2009), Седьмое международное научно-производственное совещание «Биология, биотехника разведения и состояние запасов сиговых рыб» (Тюмень, 2010), V Верещагинская Байкальская конференция (Иркутск, 2010). Кроме того, материалы диссертации были представлены на следующих конференциях: IX международный симпозиум «Биология и управление ресурсами сиговых рыб» (Ольштын, Польша, 2005), Научно-практическая конференция «Водлозерские чтения: естественнонаучные и гуманитарные основы природоохранной, научной и просветительской деятельности на охраняемых природных территориях Русского Севера» (Петрозаводск, 2006), XII Европейский ихтиологический конгресс (Дубровник, Хорватия, 2007), Рабочее совещание «Штрих-кодирование видов рыб в России на основе ДНК: интеграция в глобальную программу П8Н-ВОЬ» (Владивосток, 2007), Международная конференция

Современное состояние водных биоресурсов» (Новосибирск, 2008), Международная конференция, посвященная 100-летию со дня рождения B.C. Кирпичникова «Генетика, селекция, гибридизация, племенное дело и воспроизводство рыб» (Санкт-Петербург, 2008), Вторая Московская международная конференция «Молекулярная филогенетика MolPhy-2» (Москва, 2010).

Декларация личного участия автора. В диссертационной работе использованы экспериментальные материалы, полученные лично автором, а также совместно с коллегами из лаборатории популяционной генетики ИОГен РАН (Д.В. Политов, Н.Ю. Гордон) и Института систематики и экологии животных СО РАН (H.A. Бочкарёв, Е.И. Зуйкова). Автор принимал участие в полевых работах по сбору биологического материала, проводил выделение ДНК, полимеразную цепную реакцию (ПЦР) и рестрикционный анализ, принимал участие в проведении изоферментного анализа и секвенирования, самостоятельно проводил подготовку баз данных и статистическую обработку результатов экспериментов, принимал участие в обсуждении и оформлял результаты своих исследований в виде статей и докладов на конференциях. Суммарное личное участие автора составило 75%.

Публикации. По результатам исследований опубликовано 12 статей, из которых 1 статья в журнале, включенном в перечень научных журналов и изданий, рекомендованных ВАК Минобрнауки России (Генетика, 2008) и 12 тезисов, в которых полностью изложен материал диссертации.

Структура и объем работы. Диссертация состоит из введения, четырёх глав, заключения, выводов, списка литературы и приложения. Работа изложена на 157 страницах, иллюстрирована 26 рисунками и содержит 23 таблицы. Список литературы содержит 290 наименований, из них 117 на иностранных языках.

Заключение Диссертация по теме "Генетика", Балдина, Светлана Николаевна

ВЫВОДЫ

1. Разработана система молекулярных маркеров для идентификации, дифференциации и анализа родственных взаимоотношений сигов рода Coregonus Сибири на внутри- и межвидовом уровнях.

2. Группа пыжьяновидных сигов, включая ряд среднетычинковых верхнеобских и верхнеленских форм с конечным ртом, по данным мтДНК и изоферментных локусов хорошо дифференцируется от других представителей рода Coregonus (кроме муксуна).

3. По данным анализа мтДНК и изоферментных локусов показана генетическая близость муксуна С. тикзип с пыжьяновидными сигами, с которыми муксун в водоёмах Сибири обитает симпатрично, что указывает на существование общей пыжьяновидной предковой формы.

4. Обнаружены молекулярные признаки, свидетельствующие о возможности гибридогенного происхождения муксуна от пыжьяноподобного предка с участием видов комплекса ряпушек и пеляди (С. яагсИпеПа - С. ре1есГ). Молекулярные данные не подтверждают монофилетическое происхождение муксуна бассейнов сибирских рек.

5. Обнаружено существование отдельной, дифференцированной от ледовитоморской, южно-сибирской линии в эволюции малотычинковых сигов, в наиболее чистом виде сохранившейся в верхней Оби.

6. В пределах бассейна Енисея концентрация специфических аллелей, маркирующих южно-сибирский генный пул, уменьшается от верхнего к нижнему течению Енисея. Енисей выступает в качестве главного пути обмена генами между южным и северным генными пулами сигов.

7. При исследовании внутривидовой дифференциации чира показано, что наибольшей генетической изменчивостью характеризуются популяции Восточной Сибири, которые можно рассматривать как предковые. Западноямальская и пенжинская популяции значительно дифференцированы от восточносибирских.

8.- Полученные данные свидетельствуют об эффективности использованного метода для выявления популяционно-генетической структуры сигов р. Coregonus, а результаты, демонстрирующие соответствие генетической кластеризации географическому происхождению выборок, могут стать основой программ сохранения генофондов и рационального использования запасов ценных сиговых рыб Сибири.

Библиография Диссертация по биологии, кандидата биологических наук, Балдина, Светлана Николаевна, Москва

1. Александрова Е. Н., Кузнецов В. В. О внутривидовых формах ленского муксуна Coregonus muksun (Pallas) // Вестник ГУ. 1968. № 1. С. 28-37.

2. Александрова Е. Н., Кузнецов В. В. Дифференциация муксуна р. Лены. 1. Морфометрическая характеристика четырёх форм муксуна // Вестник МГУ. Биология, почвоведение. 1970. № 4. С. 16-23.

3. Александрова Е. Н., Кузнецов В. В. Дифференциация муксуна р. Лены. 2. Корреляционные системы, выбор информативных признаков и морфологическое сравнение форм // Вестник МГУ. Биология, почвоведение. 1972. №4. С. 15-23.

4. Алтухов Ю. П. Генетические процессы в популяциях. М.: Наука, 1989. 328 с.

5. Алтухов Ю. П., Салменкова Е. А., Омельченко В. Т. Популяционная генетика лососевых рыб. М.: Наука, 1997. 320 с.

6. Амстиславский А. 3., Иванов Ю. Н. (под ред.). О гибриде между ледовитоморским сигом Coregonus lavaretus pidschian (Gmelin) и пелядью Coregonus peled (Gmelin) в низовьях р. Оби. Свердловск: Академия наук СССР Уральский филиал, 1970. 52-55 с.

7. Андреев В. Л., Решетников Ю. С. Применение ЭВМ для морфологического анализа сиговых рыб // Лососевидные рыбы. Ленинград: ЗИН АН СССР, 1976. С. 4-5.

8. Андреев В. Л., Решетников Ю. С. Исследование внутривидовой и морфологической изменчивости сига Coregonus lavaretus (L.) методами многомерного статистического анализа. // Вопросы ихтиологии. 1977. Т. 17 №5. С. 862-878.

9. Андреев В. Л., Решетников Ю. С. Использование ЭВМ для распознания симпатрических форм сига р. Анадырь. Владивосток: ДВНЦ АН СССР, 1978. 123-135 с.

10. Балдина С. Н., Гордон Н. Ю., Политов Д. В. Генетическая дифференциация муксуна Coregonus muksun (Pallas) и родственных видов сиговых рыб (Coregonidae, Salmoniformes) Сибири по мтДНК // Генетика. 2008. Т. 44. № 7. С. 896-905.

11. Беляев В. И., Венглинский Д. JI. Морфологические особенности пеляди бассейна реки Северной Сосьвы // Труды Ин-та экологии растений и животных Уральского филиала АН СССР. 1976. Т. 99. С. 12-22.

12. Берг Л. С. Рыбы пресных вод СССР и сопредельных стран. Ч. 1. Издательство Всесоюзного ин-та озерного и речного рыбного хоз-ва, 1932. 543 с.

13. Берг Л. С. Рыбы пресных вод СССР и сопредельных стран. М.-Л.: Издательство Академии наук СССР, 1948. 466 с.

14. Биология, биотехника разведения и состояние запасов сиговых рыб. Тюмень: ФГУП Госрыбцентр, 2010. 318 с.

15. Богданов В. Д. Пространственная структура популяций и промысел рыб в бассейне р. Морды-Яхи// Современное состояние растительного и животного мира полуострова Ямал. 1995. С. 49-54.

16. Богданов В. Д. Экология и воспроизводство сиговых рыб Нижней Оби // Автореферат дисс. на соискание уч. степени д.б.н. М: 1997. С. 38.

17. Богданов В. Д. Выживание икры сиговых рыб на нерестилищах в уральских притоках Нижней Оби. Современное состояние и динамика природных сообществ Севера // Научный вестник Ямало-Ненецкого автоном. округа. Салехард: 2007. С. 42-49.

18. Богданов В. Д., Мельниченко И. П. Промысловые рыбы низовьев р. Морды-Яхи // Современное состояние растительного и животного мира полуострова Ямал. Екатеринбург: 1995. С. 55-67.

19. Богданов В. Д., Решетников Ю. С. Особенности воспроизводства сиговых рыб // (Р. Ю. С. Литвиненко А.И под. ред.) Биология, биотехника разведения и состояние запасов сиговых рыб. Тюмень: Госрыбцентр, 2010. С. 78-82.

20. Богданов В. Д., Богданова Е. Н., Госькова О. А., Мельниченко И. П. Ретроспектива ихтиологических и гидробиологических исследований на Ямале. Екатеринбург: Екатеринбург, 2000. 88 с.

21. Богуцкая Н. Г., Насека А. М. Каталог бесчелюстных и рыб пресных и солоноватых вод России с номенклатурными и таксономическими комментариями. Москва: Товарищество научных изданий КМК, 2004. 389 с.

22. Бодали Р. А., Вуоринен Д. А., Решетников Ю. С., Рист Д. Д. Генетические связи пяти видов сиговых рыб Сибири // Вопросы ихтиологии. 1994. Т. 34. № 2. С. 195-203.

23. Бочкарёв Н. А. Популяционная структура сигов Телецкого озера // Сибирский биологический журнал. 2000. Т. 7. № 3. С. 305-313.

24. Бочкарёв Н. А., Гафина Т. Э. Сравнительная характеристика телецкого сига и сига Правдина Телецкого озера (Алтайский край) // Сибирский биологический журнал. 1993. № 2. С. 64-69.

25. Бочкарёв Н. А., Гафина Т. Э. Морфобиологическая характеристика телецкого сига р. Чулышман // Сибирский экологический журнал. 1996. № 2. С. 175178.

26. Бочкарёв Н. А., Зуйкова Е. И. Морфобиологическая и экологическая дифференциация симпатрических сигов рода Coregonus из Телецкого озера // Зоологический журнал. 2006. Т. 85. № 8. С. 950-958.

27. Бочкарёв Н. А., Зуйкова Е. И. Характеристика сига-пыжьяна из озёр верхнего течения рек Обь и Енисей по пластическим признакам // Рыбоводство и рыбное хозяйство. 2008. № 8. С. 15-17.

28. Бурмакин Е. В. Биология и рыбохозяйственное значение пеляди // Труды Барабинского отделения ВНИОРХ Новосибирск: 1953. С. 45-46.

29. Васильев В. П. Эволюционная кариология рыб. Москва: Наука, 1985. 300 с.

30. Венгильский Д. Л. Эколого-морфологические особенности пеляди субарктических водоемов // Труды Института биологии УФ АН СССР. 1966. № 49. С. 17-36.

31. Викторовский Р. М., Ермоленко Л. И. Хромосомные наборы чира и пыжьяна и вопросы дивергенции кариотипов сигов // Цитология. 1982. Т. 24. № 7. С. 797-801.

32. Викторовский Р. М., Максимова Т. Г. Хромосомный набор амурского сига и некоторые вопросы эволюции кариотипа сигов // Цитология. 1978. Т. 20. № 8. С. 967-970.

33. Викторовский Р. М., Ермоленко Л. И., Макоедов А. Н. Дивергенция кариотипов сигов // Цитология. 1983. Т. 25. № 11. С. 1309-1315.

34. Владыченская Н. С., Кедрова О. С. Сравнительный анализ геномов некоторых видов рыб рода Coregonus II Морфоэкологические особенности рыб бассейна реки Северной Сосьвы. Свердловск: Сб. статей. УНЦ АН СССР, 1979. С. 94-102.

35. Гросвальд М. Г. Евразийские гидросферные катастрофы и оледенение Арктики. Опыт геоморфологического анализа палеогидрологических систем материка. М: Научный мир, 1999. 120 с.

36. Гундризер А. Н. К систематике тугунов Сибири // Рыбное хозяйство водоемов южной зоны Западной Сибири. Новосибирск: 1969. С. 16-29.

37. Гундризер А. Н., Иоганзен Б. Г., Кафанова В. В., Кривощеков Г. М. Рыбы Телецкого озера. Новосибирск: Наука, 1981. 159 с.

38. Дорофеева Е. А. Использование данных кариологии для решения вопросов систематики и филогении лососёвых рыб // Основы классификации и филогении лососевидных рыб. JL, 1977. С. 86-96.

39. Дрягин П. А. Рыбные ресурсы Якутии // Труды Совета по изучению производительных сил Якутской АССР. JL: Издательство АН СССР, 1933. С. 3-94.

40. Дрягин П. А. Помеси сиговых рыб реки Колымы // Труды Зоологического института АН СССР. Л.: 1936. С. 443-454.

41. Дулькейт Г. Д. О сиговых верхней и средней Оби // Труды Биологического ин-та Томского ун-та. 1939. С. 40-46.

42. Ермоленко Л. И. Электрофоретическое исследование трёх видов сигов Восточно-Сибирского моря // Биология моря. 1985. № 5. С. 32-36.

43. Ермоленко Л. И. Генетическая изменчивость и межпопуляционные различия сигов группы Coregonus lavaretus П Генетика. 1989а. Т. 25. С. 886-893.

44. Ермоленко Л. И. Генетическая изменчивость и межпопуляционные различия у сибирской ряпушки // Генетика. 1989b. Т. 25. С. 1081-1088.

45. Ермоленко Л. И. Генетическая дивергенция сигов рода Coregonus II Генетика. 1991а. Т. 27. № 3. С. 515-522.

46. Ермоленко Л. И. Генетическая изменчивость и межпопуляционные генетически различия у чира Coregonus паяш II Генетика. 1991Ь. Т. 27. № 2. С. 299-303.

47. Ермоленко Л. И. Генетическая дивергенция трех родов сиговых рыб (Со^ошёае) // Генетика. 1992. Т. 28. № 6. С. 122-127.

48. Ермоленко Л. И., Викторовский Р. М. Дивергенция изоферментов рыб подсемейства Соге§ошпае // Биология пресноводных животных Дальнего Востока. Владивосток: ДВНЦ РАН, 1982. С. 54-63.

49. Ермоленко Л. И., Викторовский Р. М. Электрофоретический анализ гемоглобина сиговых рыб (подсемейство Согедогнпае) // Экология и систематика пресноводных организмов Дальнего Востока. Владивосток: ДВНЦ АН СССР, 1983. С. 121-125.

50. Есипов В. К. О пеляди {Coregonus ре1ес1 ОтеНп) из озер Болынеземельской тундры // Зоологический журнал. 1938. Т. 17. № 2. С. 303-314.

51. Журавлёв В. Б. Рыбы бассейна верхней Оби. Барнаул: Издательство Алтайского университета, 2003. 292 с.

52. Ирискин Н. Т. Электрофоретический анализ белков сыворотки крови пеляди, чира и муксуна, акклиматизированных в Ленинградской области // Рыбохозяйственное изучение внутренних водоемов. 1972. Т. 10. С. 8-12.

53. Ирискин Н. Т. Электрофоретический анализ белков сыворотки крови ряпушки и рипуса Ладожского озера // Известия ГосНИОРХ. 1974. Т. 92. С. 136-140.

54. Ирискин Н. Т. К вопросу о видовой специфичности белков сыворотки крови некоторых представителей рода Coregonus И Современные вопросы экологической физиологии рыб. 1979. С. 160-164.

55. Исаченко В. Л. Новый вид сига из бассейна р. Енисей // Труды Сибирской ихтиологической лаборатории. 1925. Т. 2. № 2. С. 3-18.

56. Кайданова Т. И. Исследование кариотипов двух видов сиговых рыб // Известия ГОСНИОРХ. 1978. Т. 130. С. 50-55.

57. Кайданова Т. И. Сравнительный кариологический анализ некоторых видов лососёвых и сиговых рыб // Кариологическая изменчивость, мутагенез и гиногенез у рыб. Л.: 1980. С. 16-23.

58. Кайданова Т. И. Сравнительно-кариологический анализ пяти видов сиговых рыб // Генетика промысловых рыб и объектов аквакультуры. 1983. С. 73-78.

59. Кайданова Т. И. О состоянии кариологических иследований сиговых рыб. М.: Наука, 1988. 48-57 с.

60. Канеп С. В. Анализ изменчивости пластических, меристических и интерьерных признаков сиговых рыб (сем. Coregonidae) // Вопросы ихтиологии. 1976. Т. 16. № 4. С. 610-623.

61. Карасев Г. JI. Рыбы Забайкалья. Новосибирск: Наука, 1987. 296 с.

62. Картавцев А. Ф., Мамонтов А. М. Электрофоретическая оценка белковой изменчивости и сходства омуля, двух форм сигов и хариуса оз. Байкал // Генетика. 1983. Т. 19. № U.C. 1895-1902.

63. Каукоранте М., Медников Б. М. Генетическая дивергенция сигов Фенноскандии // Биология сиговых рыб. М.: Наука, 1988. С. 31-48.

64. Кириллов А. Ф. Промысловые рыбы Якутии. Москва: Научный мир, 2002. 194 с.

65. Кириллов С. Д. Метод многомерного статистического анализа в исследованиях по микроэволюции рыб и популяционной структуре вида Барнаул: Изд-ва Алтайского государственного университета, 1999. 87 с.

66. Кириллов Ф. Н. Рыбы Якутии. М.: Наука, 1972. 359 с.

67. Китаев С. П. Морфологическая структура вида Coregonus lavaretus (L.) // Лососевые (Salmonidae) Карелии. Петрозаводск: Карельский филиал АН СССР, 1976. С. 42-46.

68. Крохалевский В. Р. Морфологические особенности пространственная структура пеляди реки Оби // Известия НИИ озёрн. и речн. рыбн. хоз-ва. Л, 1978а. С. 56-65.

69. Крохалевский В. Р. Некоторые данные о сезонной изменчивости морфологических признаков пеляди реки Оби // Известия НИИ озёрн. и речн. рыбн. хоз-ва. Л: 1978b. С. 126-129.

70. Крохалевский В. Р. Половые циклы, созревание и периодичность нереста обской пеляди // Биология и экология гидробионтов экосистемы Нижней Оби. Свердловск: Средне-Урал. кн. изд-во, 1983. С. 93-110.

71. Кузмин А. Н. Некоторые закономерности развития воспроизводительной системы и периодизация гаметогенеза у сиговых рыб // Биологическое обоснование воспроизводства сиговых рыб и их значение в повышении рыбопродуктивности водоёмов. Л., 1975. С. 17-26.

72. Кузнецов В. В. Изменчивость в группе молодых видов животных (на примере сигов род Соге§огшз) // Некоторые проблемы теории эволюции. Сборник трудов. М.: 1973.

73. Ламакин В. В. Пресноводная четвертичная ихтиофауна Европейской части СССР. М: 1960. 402 с.

74. Лебедев В. Д. Пресноводная четвертичная ихтиофауна Европейской части СССР. Москва: Издательство МГУ, 1960. 402 с.

75. Линдберг Г. У. Закономерности распространения рыб и геологическая история дальневосточных морей. Очерки по общим вопросам ихтиологии. Издательство АН СССР, 1953. 47-57 с.

76. Линдберг Г. У. Четвертичный период в свете биогеографических данных. Москва, Ленинград: Издательство АН СССР, 1955. 334 с.

77. Линдберг Г. У. Крупные планетарные колебания уровня океана и палеонтография четвертичного периода. Основные проблемы изуч. четвертю. периода. М: 1965. 135-141 с.

78. Локшина А. Б. Сравнительный электрофоретический анализ некоторых белков сиговых рыб // Генетика промысловых рыб и объектов аквакультуры. М.: Легкая и пищевая промышленность, 1983. С. 19-24.

79. Лугаськов А. В., Следь Т. В., Мельниченко И. П. Опыт анализа внутрипопуляционной структуры чира в бассейне нижней Оби

80. Экологическая обусловленность фенотипа рыб и структура их популяций. Екатеринбург: Академия наук СССР. Уральское отделение, 1989. С. 9-18.

81. Макоедов А. Н. Кариология, биохимическая генетика и популяционная фенетика лососёвых рыб Сибири и Дальнего Востока. М.: УМК "Психология", 1999.291 с.

82. Мамонтов А. М. Ледниковые периоды и формообразования у реликтовых сиговых рыб в водоёмах Юга Сибири // Вопросы ресурсоведения, ресурсоиспользования, экологии и охраны. Ч. 5. Якутск: Якутский гос. университет, 2000. С. 127-146.

83. Мамонтов А. М. Генетико-биохимический анализ гибридов омуля migratorшs и озёрно-речного сига С.1ауагеШя р1(1$сЫап озера Байкал // Вопросы ихтиологии. 2006. Т. 46. № 4. С. 495-502.

84. Мамонтов А. М., Яхненко В. М. Биохимический полиморфизм омуля // (Г. И. Галазий, под. ред.) Морфология и экология рыб. Новосибирск: Наука, Сибирское отделение, 1987а. С. 9-19.

85. Мамонтов А. М., Яхненко В. М. Морфологическая и генетико-биохимическая оценка популяционной дифференциации байкальского озёрно-речного сига Coregonus lavaretus pidschian (Coregonidae) // Вопросы ихтиологии. 1987b. Т. 35. № 2. С. 175-181.

86. Мамонтов А. М., Яхненко В. М. Биологический и изоферментный анализ ряпушки реки Лены // Биология и биотехнология разведения сиговых рыб. СПб: 1994. С. 97-98.

87. Матковский А. К. Явление хоминга у сиговых рыб Обь-Иртышского и Пур-Тазовского бассейнов // Поведение рыб. Материалы докладов международной конф. Борок, Россия, 2005. М: "АКВАРОС", 2005. С. 322326.

88. Медников Б. М., Решетников Ю. С., Шубина Е. А. Изучение родственных связей сиговых рыб методом молекулярной гибридизации ДНК // Зоологический журнал. 1977. Т. 56. № 3. С. 33-341.

89. Медников Б. М., Решетников Ю. С., Шубина Е. А. Изучение родственных связей сиговых рыб методом молекулярной гибридизации ДНК // Зоологический журнал. 1977. Т. 56. № 3. С. 33-341.

90. Медников Б. М., Шубина Е. А., Мельникова М. Н. Сиговые рыбы: новый механизм репродуктивной изоляции // Журнал общей биологии. 2000. Т. 61. № 4. С. 393-399.

91. Меньшиков М. И. О географической изменчивости муксуна Coregonus muksun // Доклады АН СССР. 1946. Т. 52. № 8. С. 739-742.

92. Меньшиков М. И. О возрастной и географической изменчивости сигов Coregonus nasus (Pallas) и Coregonus lavaretus pidschian (Gmelin) // Ученые записки Пермского университета. 1949. Т. V. № 1. С. 77-82.

93. Михин В. С. Сиг-пыжьян реки Оленек // Вопросы ихтиологии. 1959. № 13. С. 71-74.

94. Москаленко Б. К. Биологические основы эксплуатации и воспроизводства сиговых рыб Обского бассейна // Труды Обь-Тазовского отделения Всесоюзного научно-исследовательского института озёрного и речного рыбного хозяйства. 1958. С. 251-257.

95. Москаленко Б. К. Сиговые рыбы Сибири. М.: Пищевая промышленность, 1971. 182 с.

96. Мухомедияров Ф. Б. Расы байкальского омуля (Соге%оп№ т'щгаЬопт вео^) их морфологические и биологические особенности и роль в промысле // Известия Биолого-географического ин-та Восточно-Сибирского ун-та. 1942. Т. 9. № 3/4. С. 35-96.

97. Нестеренко Н. В. Опыт гибридизации уральского рипуса с чудским сигом в прудовых условиях // Известия ВНИОРХ. 1957. Т. 39. С. 41-59.

98. Нестеренко Н. В. Морфологические особенности гибридов рипуса с чудским сигом // Труды Уральского отделения СибНИИРХ. 1966а. Т. 7. С. 186-196.

99. Нестеренко Н. В. Особенности гибрида рипуса как производителя // Рыбное хозяйство. 1966Ь. № 12. С. 28-31.

100. Новиков А. С. Рыбы реки Колымы. М.: Наука, 1966. 134 с.

101. Новиков Г. Г. Изменчивость белкового состава сыворотки крови некоторых видов лососевых рыб в связи с их биологическим состоянием видовой принадлежностью: Автореф. канд. дисс. Москва: 1970. 23 с.

102. Новиков Г. Г., Решетников Ю. С. Исследование белкового состава сыворотки крови лососевых рыб // Вопросы ихтиологии. 1969. Т. 9. № 1. С. 163-171.

103. Носаль А. Д. О гибридизации чудского сига с пелядью // Акклиматизация рыб и беспозвоночных в водоёмах СССР. М: Наука, 1968. С. 250-255.

104. Обедиентова Г. В. (под ред.). Границы и характер оледенений на востоке центральной части русской равнины. 1965. 111-128 с.

105. Остроумов Н. А. Рыбы и рыбный промысел реки Пясины // Труды Полярной комиссии. 1937. № 30. С. 7-114.

106. Павлов Д. С., Мочек А. Д. (под ред.). Экология рыб Обь-Иртышского бассейна. М: Творчество научных изданий КМК, 2006. 596 с.

107. Павлов С. Д., Савваитова К. А., Груздева М. А., и д. р. Разнообразие рыб Таймыра. Москва: Наука, 1999. 207 р.

108. Перелыгин А. А. Генетическая дифференциация популяций европейской ряпушки Coregonus а1Ьи1а Ь. трех больших озер Северо-Запада СССР // Генетика в аквакультуре. Л.: Наука, 1989. С. 113-124.

109. Пирожников П. Л. Некоторые данные по биологии муксуна. // Труды Всесоюзного гидробиологического общества. 1953. Т. 5. С. 339-348.

110. Пирожников П. JI. Материалы по биологии промысловых рыб р. Лены // Известия ВНИОРХ. 1955. Т. 35. С. 61-128.

111. Пирожников П. Л. О распределении и численности сиговых в реках и эстуарных районах Сибири // Известия ГосНИОРХ. 1967. Т. 62. С. 6-15.

112. Пирожников П. Л. О формообразовании у сиговых (Coregonidae, Pisces) // Проблемы эволюции. Новосибирск: Наука, 1973. С. 132.

113. Пирожников П. Л., Дрягин П. А., Покровский В. В. О таксономическом ранге и филогении сиговых (Coregonidae, Pisces) // Известия ГОСНИОРХ. 1975. Т. 104. С. 5-17.

114. Подлесный А. В., Сесягин С. М. Енисейская пелядь Coregonus peled (Gmel.): поромыслово-биологическая характеристика // Вопросы ихтиологии. 1968. Т. 8. №6. С. 1094-1096.

115. Политов Д. В., Гордон Н. Ю. Систематический статус байкальского омуля в свете данных изоферментного анализа // Современные проблемы систематики рыб. СПб: Изд-во Зоол.ин-та РАН, 1998. С. 51.

116. Политов Д. В., Балдина С. Н., Гордон Н. КХ Молекулярное маркирование генетических ресурсов сиговых рыб Сибири // Рыбоводство и рыбное хозяйство. 2008а. № 8. С. 32-35.

117. Политов Д. В., Балдина С. Н., Гордон Н. Ю. Некоторые вопросы филогении и филогеографии сиговых рыб // Мат. конф. «Водные и наземные экосистемы: Проблемы и перспективы исследований. Вологда: 2008b. С. 56-63.

118. Политов Д. В., Балдина С. Н., Гордон Н. Ю. Характеристика генетических ресурсов сиговых рыб Сибири с помощью молекулярных маркеров, // Мат. межд. конф. "Современное состояние водных биоресурсов". Новосибирск: Агрос 2008с. С. 185-190.

119. Попов И. Ю., Сендек Д. С. Квинтессенция эволюции // Эволюционная биология: история и теория. СПб: СПбФИЕЕТ, 2003. С. 172-189.

120. Постников В. М. Морфобиологическая характеристика пеляди р. Большой Анюй // Биологические проблемы Севера. Тезисы X Всесоюзного симпозиума. 1983.

121. Правдин И. Ф. Сиги озерной области СССР // Известия ВНИОРХ. 1931. Т. 12. № 1. С. 166-235.

122. Правдин И. Ф. Морфобиологическая классификация и генезис сигов {Coregonus б. 51г.) Онежского озера и его бассейна // Известия Карельской научно-исследовательской базы АН СССР. 1949. С. 40-46.

123. Правдин И. Ф. Сиги водоемов Карело-Финской ССР. М.-Л.: Изд-во АН СССР, 1954. 324 с.

124. Прокофьева А. А. Морфология хромосом некоторых видов рыб и амфибий // Труды Института генетики. 1935. № 10. С. 153-176.

125. Пронин Н. М., Матвеев А. Н., Самусёнок В. П. Рыбы озера Байкал и его бассейна. Улан-Удэ: Издательство Бурятского научного центра СО РАН, 2007. 284 с.

126. Решетников Ю. С. О систематическом положении сиговых рыб // Зоологический журнал. 1975. Т. 54. № 11. С. 1656-1671.

127. Решетников Ю. С. Сложные проблемы таксономии сиговых рыб и проблемы зоогеографии // (Е. А. Дорофеева, Клюканов, В.А, Коровина, В.М, Шапошникова, Г.Х, под. ред.) Основы классификации и филогении лососёвых рыб. Л: ЗИН АН СССР, 1977. С. 71-78.

128. Решетников Ю. С. О связи сиговых рыб Сибири и Северной Америки // Изменчивость рыб пресноводных экосистем. М: Наука, 1979а. С. 48-72.

129. Решетников Ю. С. Сиговые рыбы в северных экосистемах // Вопросы ихтиологии. 1979Ь. Т. 19. № 3. С. 419-433.

130. Решетников Ю. С. Экология и систематика сиговых рыб. Москва: Наука, 1980.300 с.

131. Решетников Ю. С. Современные проблемы изучения сиговых рыб // Вопросы ихтиологии. 1995. Т. 35. № 2. С. 156-174.

132. Решетников Ю. С. Семейство сиговые Со^ошёае // Аннотированный каталог круглоротых и рыб континентальных вод России. М.: Наука, 1998. С. 41-48.

133. Решетников Ю. С. Атлас пресноводных рыб России. Наука, 2002. 379 с.

134. Романов В. И. Экология естественных гибридов сиговых рыб в условиях формирующейся ихтиофауны Хантайского водохранилища // Биологические основы рыбного хозяйства Западной Сибири. Новосибирск: Наука, 1983. С. 108-112.

135. Романов В. И. К вопросу о популяционной структуре муксуна (Coregonus muksan (Pallas)) водоемов Таймыра // Вестник Томского гос. пед. ун-та. Серия естественные и точные науки. 1999. № 7(16). С. 38-43.i.

136. Световидов А. Н. О географической изменчивости пыжьяна {Coregonus lavaretus pidschian) II Доклады АН СССР. 1934. Т. 4. № 5/6. С. 343-345.

137. Селюков А. Г. Репродуктивная система сиговых рыб {Coregonidae,Samoniformes) как индикатор состояния экосистемы Оби. 2. Половые циклы муксуна Coregonus muksun II Вопросы ихтилогии. 2002а. Т. 42. № 2. С. 225-235.

138. Селюков А. Г. Репродуктивная система сиговых рыб (Coregonidae, Samoniformes) как индикатор состояния экосистемы Оби. 2. Половые циклы пеляди Coregonus peledll Вопросы ихтиологии.2002b. Т. 42. № 1. С. 85-92.

139. Сендек Д. С. О видовой принадлежности ряпушки, обитающей в реке Печоре // Сборник научных трудов ГОСНИОРХ. 1998. № 323. С. 191-198.

140. Сендек Д. С. Филогенетический анализ сиговых рыб сем .Coregonidae методом белкового.электрофореза. СПб: ГосНИОРХ, 2000. 22 с.

141. Сендек Д. С., Новосёлов А. П., Студёнов И. И., Гуричев П. А. Филогенетические связи популяций обыкновенного сига ( Coregonus lavaretus, L.) из водоёмов бассейна Белого моря // Лососевидные рыбы Восточной Феноскандии. Петрозаводск: 2005. С. 135-147.

142. Скрябин А. Г. Рыбы Баунтовских озёр Забайкалья. Новосибирск: Наука, 1977. 232 с.

143. Скрябин А. Г. Сиговые рыбы юга Сибири. Новосибирск: Наука, 1979. 230 с.

144. Смирнов В. В., Смирнова-Залуми Н. С., Суханова Л. В. Микроэволюция байкальского омуля: Coregonus autumnalis migratorius (Georgi). Новосибирск: СО РАН, 2009. 246 с.

145. Стерлягова М. А. Биология и промысел баунтовских сигов Coregonus lavaretus pidschian (Gmelin) // Вопросы ихтиологии. 1964. Т. 4. № 2. С. 249254.

146. Сулимова Г. Е. ДНК-маркеры в генетических исследованиях: типы маркёров, их свойства и области применения // Успехи современной биологии. 2004. Т. 124. №3. С. 260-271.

147. Суханова Л. В., Смирнов В. В., Кирильчик С. В. Происхождение сиговых рыб озера Байкал:молекулярно-филогенетическая реконструкция // Труды ФГНУ ТосНИОРХ". 2007.

148. Сычевская Е. К. Происхождение сиговых рыб в свете исторического развития лососевидных (8а1топо1с1еа) // Биология сиговых рыб. М.: Наука, 1988. С. 31-48.

149. Сычевская Е. К., Яковлев В. Н. Современные представления о филогенетических взаимоотношениях лососеобразных // Лососевидные рыбы. Ленинград: ЗИН АН СССР, 1976. С. 111-112.

150. Талиев Д. Н. Серологический анализ рас байкальского омуля // Труды ЗИН АН СССР. 1941. Т. 6. №4. С. 68-91.

151. Фролов С. В. Добавочные хромосомы в кариотипе чира // Цитология. 1986а. Т. 28. №7. С. 215.

152. Фролов С. В. Полиморфизм и мозаицизм по добавочным хромосомам у сибирской ряпушки // Цитология. 1986Ь. Т. 28. № 7. С. 740.

153. Фролов С. В. Некоторые моменты эволюции кариотипов сиговых рыб // Современные проблемы сиговых рыб. Владивосток: ДВО РАН, 1991. С. 91101.

154. Фролов С. В. Изменчивость и эволюция кариотипов лососёвых рыб. Владивосток: Дальнаука, 2000. 229 с.

155. Цой Р. М., Сергиенко И. В., Пак И. В. Хромосомная мутабильность у сиговых рыб из речных и озёрных экосистем обь-иртышского бассейна // Генетика. 1996. Т. 32. № 1. С. 137-139.

156. Черешнев И. А. О находке сига-пыжьяна Coregonus 1ауаге(ж р1с18сМап (ОшеНп) на Чукотском полуострове // Вопросы ихтиологии. 1976. Т. 16. № 5. С. 939-940.

157. Черешнев И. А. Фауна, систематика и родственные связи пресноводных рыб Восточной Чукотки // Экология и систематика пресноводных организмов Дальнего Востока. Владивосток: ДВНЦ АН СССР, 1983. С. 89-108.

158. Черешнев И. А. (под ред.). Происхождение пресноводной ихтиофауны районов Берингии. 1986. 122-145 с.

159. Черешнев И. А. Популяционая структура чира и обыкновенного валька Северо-Востока Азии // Современные проблемы сиговых рыб. Владивосток: ДВО АН СССР, 1991. Р. 3 8-49.

160. Черешнев И. А. Сравнительная краниология омулей Голарктики // Биология и биотехника разведения сиговых рыб. СПб: ГосНИОРХ, 1994. С. 157-160.

161. Черешнев И. А. Аннотированный список рыбообразных и рыб пресных вод Арктики и сопредельных территорий // Вопросы ихтилогии. 1996. Т. 36. № 5. С. 597-608.

162. Черешнев И. А. Биогеография пресноводных рыб Дальнего Востока России. Владивосток: Дальнаука, 1998. 130 с.

163. Черешнев И. А., Волобуев В. В., Шестаков А. В:, Фролов С. В. Лососевидные рыбы Северо-Востока России. Владивосток: Дальнаука, 2002. 496 с.

164. Черешнев И. А., Шестаков А. В., Скопец М. Б., Коротаев Ю. А., Макоедов А. Н. Пресноводные рыбы Анадырского бассейна. Владивосток: Дальнаука, 1 2001.335 с.

165. Чистобаева Р. Е. Естественное воспроизводство пеляди в бассейне реки Печоры // Сборник научных трудов ГОСНИОРХ. 1983. № 207. С. 127-137.

166. Шапошникова Г. X. Сравнительно-морфологический анализ сигов Советского Союза// Морфология низших позвоночных животных. Л.: Наука, 1968. С. 206-256.

167. Шапошникова Г. X. Сиг-пыжьян Coregonus lavaretus pidschian (Gmelin) водоемов Советского Союза // Вопросы ихтиологии. 1974. Т. 14. № 5. С. 749768.

168. Шапошникова Г. X. История расселения сигов рода Coregonus // Зоогеография и систематика рыб. Л.: Наука, 1976. С. 54-67.

169. Шапошникова Г. X. История расселения сигов полиморфного вида Coregonus lavaretus (L.) и некоторые соображения о его внутривидовой дифференциации // Основы классификации и филогении лососевидных рыб. Ленинград: Зоол. ин-т АН СССР, 1977. С. 78-86.i

170. Штылько Б. А. Неогеновая фауна пресноводных рыб Западной Сибири // Труды Всесоюзного геолого-разведывательного управления. 1934. № 359. С. 1-96.

171. Шубин Ю. П., Челпанова Т. И., Ефимцева Э. А., Шубин П. Н. Генетическая дифференциация жилой и полупроходной форм сига-пыжьяна Coregonus lavaretus pidschian И Вопросы ихтилогии. 1997. Т. 37. № 5. С. 634-638.

172. Юрьев А. Л., Белан Е. С. Биология тугуна Coregonus tugun (Pallas 1814) среднего течения реки Нижняя Тунгуска // Бюллетень ВСНЦ СО РАМН. 2007. V. 54. №2. Р. 156-160.

173. Avise J. C. Molecular markers, natural history and evolution. NY.: Chapman and Hall, 1994. 511 p.

174. Avise J. C. Phylogeography. The history and formation of species. Cambridge, Massachusetts, London, England: Harvard University Press, 2000. 447 p.

175. Baldina S. N., Gordon N. Y., Politov D. V. Coregonus ussuriensis is closely related to Lake Baikal coregonines: mtDNA PCR-RFLP data // Archiv fur Hydrobiologie. 2007. V. 60. Spec. Issues Advances in Limnology. P. 83-89.

176. Binz T., Largiader C., Muller R., Wedekind C. Sequence diversity of MHC genes in lake whitefish // Journal Of Fish Biology. 2001. № 58. P. 359-373.

177. Bochkarev N. A., Katokhin A. V., Zuykova E. I. Morphological, ecological and genetic differentiation of the sympatric coregonid fish species of Teletskoe Lake // The 1 st Baikal Workshop on Evolutionary Biology. Irkutsk. 2004. P. 4.

178. Bodaly R. A., Vuorinen D. A., Reshetnikov Y. S., Reist J. D. Genetic relationships between five species of coregonid fishes from Siberia // Journal of Ichthyology. 1994. V. 34. №2. P. 117-130.

179. Bodaly R. A., Vuorinen J., Ward R. D., Luczynski M., Reist J. D. Genetic comparisons of New and Old World coregonid fishes // Journal of Fish Biology. 1991. V. 38. № l.P. 37-51.

180. Brzuzan P. DNA length variation and RFLP of the mitochondrial control region in two samples of whitefish, Coregonus lavaretus, from Lake Baikal (Russia) and Lake Maroz (Poland). // Ergebnisse der Limnologie. 1998. № 50. P. 349-356.

181. Brzuzan P. Tandemly repeated sequences in mtDNA control region of whitefish, Coregonus lavaretus II Genome. 2000. V. 43. № 3. P. 584-587.

182. Brzuzan P., Ciesielski S. Mitochondrial DNA sequence from an extinct population of European vendace, Coregonus albula L. // Folia Biologica (Krakow). 2000. V. 48. №3-4. P. 151-154.

183. Brzuzan P., Luczynski M. Molecular confirmation of introgressive hybridization between whitefish (Coregonus lavaretus) and peled (C. peled) a case study // Pol. Arch. Hydrobiol. 1999. V. 46. № 3-4. P. 289-296.

184. Cain A. I. Animal Species and their Evolution. L: 1954. 190 p.

185. Cann R. L., Brown W. M., Wilson A. C. Polimorphic sites and the mechanism of evolution in human mitochondrial DNA // Genetics. 1984. V. 106. № 3. P. 479499.

186. Carleton K. L., Parry J. W. L., Bowmaker J. K., Hunt D. M., Seehausen O. Colour vision and speciation in Lake Victoria cichlids of the genus Pundamilia II Molecular Ecology. 2005. № 14. P. 4341-4353.

187. Clayton J. W., Tretiak D. N. Amine citrate buffers for pH control in starch gel electrophoresesis // Journal of Fish Biology of Canada. 1972. № 29. P. 1169-1172.

188. David L. R. Some typical Upper Eogene fish scales from California (four plates and ten text figures). // Carnegie Inst. Washington, Pub. 1946. № 551. P. 45-79.

189. Davidson W. S., Birt T. P., Green J. M. Organization of the mitichondrial genjme from Atlantic salmon (Salmo salar) II Genome. 1989a. V. 32. P. 340-342.

190. Douglas M. R., Brunner P. C., Bernatchez L. Do assemblages of Coregonus (Teleostei: Salmoniformes) in the Central Alpine region of Europe represent species flocks? II Molecular Ecology. 1999: V. 8. № 4. P. 589-603.

191. Dymond J. R. The coregonine fishes of northwestern Canada // Transactions of the Royal Canadian Institute. 1943. V. 24. № pt. II. P. 171-232.

192. Elo K. Intra- and interspecific gene flow and phylogenetic relationships in the Salmonidae as revealed by protein and DNA analyses // Joensuun Yliopiston Luonnontieteellisia Julkaisuja. 1996. №37. P. 1-51.

193. Ermolenko L. N. Genetic divergence in the family Coregonidae // (ed. by T. N. Todd and M. Luczynski) Polskie Archiwum Hydrobiologii. 1990. P. 533-539.

194. Ermolenko L. N. Genetic divergence in the family Coregonidae // Genetica. 1992. P. 533-539.

195. Felsenstein J. Phylip 3.68. Phylogeny inference package. WA: DeDepartment of Genome Sciences and Department of Biology University of Washington, 2008.

196. Ferguson A. The genetic relationships of coregonid fishes of Britain and Ireland indicated by elestrophoretic analysis of tissue proteins // J. Fish. Biol. . 1974. V. 6. №3. P. 311-315.

197. Ferguson A., Himberg K. J. M., Svardson G. Systematics of the Irish pollan {Coregonus pollan Thompson): an electrophoretic comparison with other Holarctic Coregoninae // J. Fish. Biol. 1978. V. 12. № 3. P. 221-234.

198. Ferris S. D., Berg W. J. The utility of mitochondrial DNA in fish genetics and fishery management // (ed. by N. Ryman and F. Utter) WA: Univ. of Washington Press, 1987. P. 277-299.

199. Gaikalov I. V., Ilyna O. V., Kirilchik S. V., Sukhanova L. V. Description of tree microsatellite loci of the baikal omul Coregonus migratorius (Georgi) // Russian Journal of Genetics. 2008. V. 44. № 3. P. 365-368.

200. Garside E. T., Christie W. J. Experimental hybridization among three coregonide fishes // Transactions of the American Fisheries Society. 1962. V. 9. № 2. P. 196200.

201. Gasowska M. The morphology of hybrids and the ways of inheriting parental features by reciprocal hybrids: whitefish X small whitefish(Coregonus lavaretus maraenjides Poljakov X C.albula L. // Pol. Arch. Hydrobiol. 1958. V. 4. P. 277287.

202. Gasowska M. Genus Coregonus L. discussed in connection with a new systematic feature that of shape and proportion of os maxillare and os supramaxillare // Annales Zoologici, Warszawa. 1960. № XVIII (26). P. 471-513.

203. Haldane J. The cost of natural selection // Journal of Genetics. 1957. V. 55. P. 551524.

204. Hansen M. M., Mensberg K. D., Berg L. S. Postglacial recolonization and genetic relationships among whitefish (Coregonus sp.) populations in Denmark, inferred from mitochondrial dNA and microsatellite markers // Molecular Ecology. 1999. № 8. P. 239-252.

205. Himberg K. J. M. A systematic and zoogeographic study of North Eurupean Coregonids. Winnipeg: Univers. Manitiba press., 1970. 219-250 p.

206. Hubby J. L., Lewontin R. C. A molecular approach to the study of genie heterozygosity in natural populations. I. The number of alleles at different loci in Drosophila pseudoobscura II Genetics. 1966. V. 54. P. 577-594.

207. Jankun M., Ocalewicz K., Pardo B. G., Martinez P., Woznicki P., Sanchez L. Localization of 5S rRNA loci in three coregonid species (Salmonidae) II Genetica. 2003. V. 119. P. 183-186.

208. Jankun M., Rab P. Multyple polymorphism of chromosome Nol. in the karyotype of whitefish, Coregonus lavaretus from lake system Saimaa, Finland // Caryologia. 1997. V. 50. P. 185-195.

209. Jankun M., Rab P., Vuorinen J. A karyotype study of Coregonus albida (Pisces, Coregoninae) // Hereditas. 1991. № 115. P. 291-294.

210. Jankun M., Woznicki P., Ocalewicz K., Furgala-Selezniow. Chromosomal evolution on the three species of Holarktic fish of the genus Coregonus (Salmoniformes) // Advanc.Limnol.Biology and Management of Coregonid Fishes-2005. 2005. № 60. P. 25-37.

211. Kaupinis A., Bukelskis E. Genetic variablity of vendace (Coregonus albula (L.)) in Lithuanian lakes // Advanc.Limnol.Biology and Management of Coregonid Fishes. 2005. № 60. P. 35-45.

212. Kimura M. Evolutionary rate at the molecular level // Nature. 1968. V. 217. P. 624-626.

213. Kirtiklis L., Jankun M. Chromosome study of peled (Coregonus peled, Salmoniformes) // Folia. biol.(Krakow). 2004. № 52. P. 47-51.

214. Koelz W. N. Coregonid fishes of the Great Lakes // Bulletin of the US Bureau of Fisheries. 1929. V. 43. № 2. P. 297-643.

215. Koelz W. N. The coregonid fishes of northeastern America // Pap. Mich. Acad. Sei., Arts and Letters. 1931. V. 13. P. 303-432.

216. Kohlmann K., Kempter J., Kersten P., Sadowski J. Haplotype variability at the mitochondrial ND1 gene region of Coregonus lavaretus from Polish lakes // Advanc.Limnol.Biology and Management of Coregonid Fishes. 2005. № 60. P. 4757.

217. Kottelat M., Frey hof J. Handbook of European freshwater fishes. Berlin, Germany Kottelat,Cornol and Freyhof Switzerland, 2007. 646 p.

218. Kumar S., Tamura K., Nei M. MEGA 3 rlntergrated Software for Molecular Evolutionary Genetic Analysis and Sequence Alignment // Briefing in Bioinformatics. 2004. V. 5. P. 150-163.

219. Kupka E. Revue Suisse de Zoologii. 1948. 285 p.

220. Makoedov A. N. Relationship of coregonid fishes: karyological aspect. // Biology and Management of Coregonid Fishes. Pol. Arch. Hydrobiol. 1992. V. 39. № 3-4. P. 517-522.

221. Mayr E. Sistematitics and the Origin of Species. NY: 1942.

222. McElroy D., Moran P., Bermingham E., Kornfield I. REAP: The Restriction Enzyme Analysis Package. Version 4.0. 1991. 50 p.

223. McPhail J. D., Lindsey C. C. Freshwater Fishes of Northwestern Canada and Alaska // Bulletin of Fisheries Research Board of Canada. 1970. № 173. P. 103105.

224. Miller R. R., Smith G. R. New fossil fishes from Plio-Pleistocene Lake Idaho. Occas. // Papers Museum Zool.Univ.Mich. 1967. № 654. P. 1-24.

225. Miya N., Nishida M. Use of mitogenomic information in Teleostean molecular phylogenetics: a treebased exploration under the maximum-parsimony optimality criterion // Mol Phyl Evol. 2000. № 17. P. 437-455.

226. Morrow J. E. Freshwater Fishes of Alaska. Anchorage, AK: Alaska Northwest Publishing Company, 1980. 248 p.

227. Myers G. S. The Endemic Fish Fauna of Lake Lanao, and the Evolution of Higher Taxonomic Categories // Evolution. 1960a. V. 14. № 3. P. 323-333.

228. Myers G. S. Fish Evolution in Lake Nyasa // Evolution. 1960b. V. 14. № 3. P. 394-396.

229. Nei M. Genetic distance between populations // Am.Nat. 1972. № 106. P. 283-292.

230. Nei M. Molecular evolutionary genetics. New York: Columbia University Press, 1987. .

231. Nei M., Miller J. C. A simple method for estimating average number of nucleotide substitutions within and between populations from restriction data // Genetics. 1990. V. 125. P. 873-879.

232. Nei M., Tajima F. DNA polymorphism detectable by restriction endonucleases // Genetics. 1981. V. 97. P. 145-163.

233. Nelson J. S. Fishes of the World. Toronto: John Wiley & Sons, Inc., 1994. 600 p.

234. Nikolsky G. W., Reshetnikov Y. S. Systematics of coregonid fishes in the USSR: intraspecies variability and difficulties in taxonomy // Biology of Coregonid Fish. 1970. P. 251-266.

235. Norden C. R. Comparative osteology of representative salmonid fishes, with particular reference to the grayling (Thymallus arcticus) and its phylogeny // Fish. Res.Board Canada. 1961. V. 18. № 5. P. 679-791.

236. Numann W. Artbildungsvorgange bei Forellen (Salmo lacustris und S. caprio) // Biol. Zentralbl. 1947. V. 3. № 4. P. 241-259.

237. Park L. K., Moran P. Developmens in molecular genetic techniques in fisheris // Rev. Fish Biol. 1994. V. 4. № 272-299.

238. Peakall R., Smouse P. E. GENALEX 6: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research // Molecular Ecology Notes 2006. V. 6. P. 288-295

239. Pethon P. Naturally occuring hybrids between whitefishes (Coregonus lavaretus) and cisco (Coregonus albula L.) in Orreyann // Norw.J.Zool. 1974. V. 22. № 4. P. 287-293.

240. Politov D. V., Bickham J. W., Patton J. C. Molecular phylogeography of Palearctic and Nearctic ciscoes // Annales Zoologici Fennici. 2004. V. 41. № 1. P. 13-23.

241. Politov D. v., Gordon N. Y., Afanasiev K. I., Altukhov Y. P., Bickham J. W. Identification of Palearctic coregonid fish species using mtDNA and allozyme genetic markers // Journal of Fish Biology. 2000. V. 57. P. 51-71.

242. Politov D. V., Gordon N. Y., Baldina S. N., Borovikova E. A. Molecular phylogeny and phylogeography of Palearctic coregonids // XII European Congress of Ichthyology. Cavtat: 2007a.

243. Politov D. V., Gordon N. Y., Makhrov A. A. Genetic identification and taxonomic relationships of six Siberian Coregonus species // Archiw fur Hidrobiologie Special Issues Advances in Limnology. 2002. V. 57. P. 21-34.

244. Prokes M., Penaz M. Biometric comparison of reciprocal hybrids of Coregonus lavaretus C. peledll Ibid. 1976. V. 26. № 2. P. 157-159.

245. Ridgeway G. J., Sherburne S. V., Lewis R. D. Polymorphism in the esterase of Atlantic herring // Transactions of the American Fisheries Society. 1970. № 99. P. 147-151.

246. Sajdak S. L., Reed K. M., Phillips B. Intraindividual and Interspecies Variation in the 5S rDNA of Coregonid Fish // J. Mol. Evol. I998. P. 680-687.

247. Schneider S., Roessli D., Excoffier L. Arlequin ver 2.000: A software for population genetic data analysis. Genetics and Biometry Laboratory. University of Geneva. Switzerland: 2000.

248. Scott W. B., Crossman E. J. Freshwater Fishes of Canada. 1973. 966 p.

249. Sendek D. S. Electrophoretic studies of Coregonine fishes from across Russia // Arch. Hydrobiol. Spec. Issues Advanc. Limnol. 2002. V. 57. P. 35-55.

250. Shaklee J. B., Allendorf F. W., Morizot D. C., Whitt G. S. Gene nomenclature for protein-coding loci in fish // Transactions of the American Fisheries Society. 1990. V. 119. № l.P. 2-15.

251. Smith G. R., Todd T. D. Morphological cladistic study of coregonine fishes // (ed. by T. N. Todd and M. Luczynski) Polskie Archiwum Hydrobiologii. 1992. P. 479490.

252. Smith S. H. Evolution and distribtion of the coregonids // Journal of the Fisheries Research Board of Canada. 1957. V. 14. № 4. P. 599-604.

253. StatSoft. StatSoft I. STATISTICA for Windows. Tulsa: OK:StatSoft Inc, 1998.

254. Steinmann P. Monographie der schweizerisches Koregonen. Beitrag zum Problem der Entstehlung von neuen Arten // Sweiz. Z. Hydrobiol. 1951. V. 13. P. 54-155.

255. Sukhanova L. V., Smirnov V. V., Smirnova-Zalumi N. S., Slobodyanyuk S. Y., Skulin V. A., Baduev B. K. Study of the populations of the Baikal omul

256. Coregonus autumnalis migratorius by restriction analysis of mitochondrial DNA // Voprosy Ikhtiologii. 1996. V. 36. № 5. P. 667-673.

257. Svardson G. The coregonid problem. I. Some general aspects of the problem // Report of the Institute of Freshwater Research Drottningholm. 1949. P. 89-101.

258. Svardson G. The coregonid problem. VI. The Palearctic species and their intergrades // Report of the Institute of Freshwater Research Drottningholm. 1957. P. 267-356.

259. Svardson G. The coregonid problem. VII. The isolating mechanisms in sympatric species // Report of the Institute of Freshwater Research Drottningholm. 1965. P. 95-123.

260. Tautz D. Hypervariability of simple sequences as a general sourse for polymorphic DNA markers // Nucl. Acids Res. 1989. V. 17. P. 6463-6471.

261. Tautz D., Schlotterer C. Simple sequences // Curr. Opin. Genet.Dev. 1994. V. 4. № 832-837.

262. Thomas D., Beckenbach A. T. Variation in salmonid mitochondrial DNA: Evolutionary constrains and mechanisms of substitution // J. Mol. Evol. 1989. V. 29. P. 233-245.

263. Turgeon J., Bernatchez L. Clinal variation at microsatellite loci reveals historical secondary intergradations between glacial races of Coregonus artedi (Teleostei : Coregoninae) // Evolution. 2001. V. 55. № 11. P. 2274-2286.

264. Vuorinen J. Electrophoretic variation in central European coregonid populations // Archiw fur Hidrobiologie Special Issues Advances in Limnology. 1986. V. 22. P. 291-298.

265. Vuorinen J., Luczynski M. Electrophoretic variation in four Polish populations of vendace (Coregonus albula (L.)) // Acta Hydrobiologica. 1991. V. 33. № 1-2. P. 77-86.

266. Vuorinen J., Naesje T. F., Sandlund O. T. Genetic changes in a vendace Coregonus albula (L.) population, 92 years after introduction // Journal of Fish Biology. 1991. V. 39. P. 193-201.

267. Vuorinen J. A., Bodaly R. A., Reist J. D., Luczynski M. Phylogeny of five Prosopium species with comparisons with other Coregonine fishes based on isozyme electrophoresis // Journal of Fish Biology. 1998. V. 53. № 5. P. 917-927.

268. Walters V. Fishes of western Arctic and eastern Arctic Siberia // Bull. Am. Mus. Nat. Hist. 1955. V. 106. № 5. P. 255-368.