Бесплатный автореферат и диссертация по биологии на тему

Теоретическое исследование рептации ДНК в процессах упаковки и эхекции генома бактериальных вирусов

ВАК РФ 03.00.02, Биофизика

Автореферат диссертации по теме "Теоретическое исследование рептации ДНК в процессах упаковки и эхекции генома бактериальных вирусов"

и.

ИНСТИТУТ ЗЯЗЙКЯ АКЛДЕШШ НАУК РЕСПУБЛИКИ ГРУЗИЯ

На правах рукописи УДК 57Г.3+578.2334539.19 -

Габашвилл Ирина Сергаэвна

ТЕОРЕТИЧЕСКОЕ исследование РЕПШИИ НКК В ПРОЦЕССАХ УПАКОВКИ Л ЭНЕК1Г.Ш ГЕНОМА БАКТЕРИАЛЬНЫХ ВИРУСОВ

03.00.02 - Биофизика

АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание ученой степени кандидата фязкко-ыагеыатстеских наук

Тбилиси - 1991

Работа выполнена в Тбилисском государственном' университете им.йо.Джавахжизилв.

Научные руководителя:

доктор амзпко-ыатеттических наух, профессор А.Ю.Гросбсрг; доктор фазшсо-ыатоштичеслих паук, профессор Г. М. Крезлаавалк.

Офидкалькис- оппоненты:

доктор фкзико-;/.ах'йь',ат1:ческих наук, ад:ся-корр. АН Республик Грузкя, профессор Л.Л.Букавклн; доктор фазщда-катеиатаческпх наук Д. Р. Мокае елидз е.

Ведущая организации - Иаетиту? молекулярной биологии АК СССР.

феЛpaAXi^z:

Заздгса диссертаций состоится "ii "• (jfre*? ;;/3 часов .tía заседа.ч^к спсцналиаироьащюго совета Д 007.01.01 Института ¿мзкка АН Республика Грузна, г.Тбилиси, 380077, ул. Такзраавлл!:, 6.

С диссертацией 1ло;г,ло оз^нгссмлться Б библиотеке IbiCTiwyía AJI Рескублжкк Грузил.

Да тор ефср а т paco с л a¡.:

Ученсекретарь созста, дохзор Сззгэт-кйтек&тг-гес:«?:

¿3' ¿j&jC¿r¿>pSL-l<¿s

ест

ОБЩАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА РАБОТЫ

Актуальность исследования процесса транслок&ции даусшфальной ЩК в белковую оболочку бактериофага, ей упаковки внутри головки ) высококоеденсированнои форые, пространственной структуры )браэутегося конденсата, а такяе возможностей быстрой декоипактизации и высвобождения аз фага, с одной стороны, »буславлйвается фундаментальной общебиолопгческой значимостью. )б этом говорит, в частности, взшшосоязь названных вопросов : прсблекаш сауосборкк биологических структур н ыолекулярнк шхаяязмов биологической регуляции, природа нуклеинснЗелкового iзаимодччстбля и роли ДНК-связыващих белков, общих принципов фганизации генетического материала и механизмов его обратной юндеисащш. С другой стороны, важность исследования упа.'янутл: [роблсм очевидна и с практической точки зрения, - например, для »азвития диагностика а терапии вирусных инфекций, разработки способов борьбы с вирусными болезнями растений и животных (ибо ice перечисленные выше явления в той или иной степени ¡гмепт ¡вето 2 ашэненком цикле вирусной частицы, поражающей любой живой ргакямо и для генетической инженерии.

На ^згодняшний день накоплен достаточно большом фактически!! атеря/л о структуре вяутрифаговой ДНК, механизмах и двиаудах ил ах процессов её упаковки и зжекции, тем не менее, они всё ещё стаются недостаточно понятыми. Авторы множества работ, в том исле сашх недавних, причины названных процессов ищут в особых войг.таах высокоспецяфнческого биологического аппарата. Однако алый ряд экспериментальных наблвденяй: об индуцируемом ¿л выходе нуклеиновой кислоты, из фага (напр., работа Г.М. рввлиш1|Или и др., 1990). и его фаэнко-хйшческом регулировании, эзмолшостй упаковки . ДНК в "чужие" для неё вирусные календы т.д. - позволяет предполагать важной, а в некоторых случаях и оределяадёй, роль чисто физических механизмов, и следовательно, первую о«зредь, физических свойств генетической макромолекулы.

другой стороны, изучение специфики поведения полимеров этодамк современной теоретической фигэнки, которое позволило задать • овчра теорию глобулкзации макромолекул (И.М.Лкфкщ, .Ю.ГросОерг, А.Р.Хохлов), во етогом способствует и успешному писанию особенностей пространственной организации биологических микероп, такяе как и пониманию многих явлений, связанных с их уикционир• т&еы.

Всё сказанное выше приводит к целесообразности формулировки модели упаковки 1! эжекцш: двунитевои ДНК бактериального вируса в терцинах статистической физики макромолекул л позволяет надеяться на плодотворность к результативность применения статистического подхода ' к исследовании равновесных свойств и релаксачионпо-киаетйчсского поведения это» системы, Решен*е на званных задач а яидяетск пелые настоите,1, работы.

Научная новизна диссертации заклачается в том, чтс в нек впервые на основе последовательной теории глобулярного жидкскрксТаддкческого состояния ' соламернои попя бил проведён анализ шкроь.олекулярноа динамики генетического материала ковкретнок биологической систем - безоболочечного бактериофага, содержащего двусииральйу» ДИК. Исследование теоретической модели лоз ыш: ло: '

— определить условии тертодйкамическол выгодности упаковки и ажекции (¿аговои нуклекиогои каслота;

— исследовать возможности сопряжения транслокодда геномной макромолекулы 'с' теш или иными события:.®, имеющими место в морфогенезе ведомо« чаоткцц;

— предположить еукиетьонанье структурных перестроек, лредассшдоцих и сопроваеддецих выход генетического материала; —: "описать отаик конденсации ' ■ виугрифаговоа "катуши" ДНК;

— предложить модель раз&иткг ей 'пространственной структуры при наиболее быстро», релаксации кз'шутрйкйаеидйого глобулярного б клубкокое состояние - вне фаговол головки.

Практическая'- значимость. Результаты и выводы ' работа " сцос-обствуют интерпретации результатов целого рада иыешшхе* ' 'экспериментальных исследовании, касающихся упакопки и эжекцяк ¿агавой "как так «; и\ оо*» * особенностей уклейки

нуклеипокои ккслстГв' вируснод'оболочке, а также систематизкет шеюдйхсл .моделвь'1 и. гиг.отаз о' механизмах'' к движущих силах •• названных процессов. 'Кроае того, ' возможно их использование для постановка йоеых киленаправленнлх исследовании, которые могли бы способстаой'а'гь' расти»- некоторых практических задач медицина, ьетеринираи','' сельского хозяйства Св часткос-ги, каеаедихся ькяьлония уяййдмкх для ьезде^етвил ви'руе-спепи&ических фуншш.) к гвнао» 'ин^енерий С шарим ер, " ь от» с ' п^г:пекп:вваа иозользовакия *' сьстек, способных ¡л ши> угаковывать рекоюоу-шшпш ДйК 'и вьоди'Л их к определенную клетку-хозяина). '

Лпроесси'л ¡уг--.г.'ц. Оипънис резулипт: диссертации доклеивалась ■щ Бсесоыицом соводшии "Цроодемм геор.:а пояи.'.чрэв" /Черноголовка, 19о9/; ^едуьароднои «оперений« "ДНК: взаимодействие с белками и ¿щшми лчгпндами" /Тбилиси,, К20/; V'! Всесоюзном симпозиуме по сои^рмшионным изменениям биополимеров в- растворах /Тбилиси, /390/; Республиканской конференции «о биологическом физике 'Тбилиси, 1930/; Кшгдународкой 'школе-семинаре "Современные фойлекы фазико-хаким мзкромолефл" /Дуигипо, 1991/; на научных динарах в Институтах хаывч'ёскои физики АН СССР /19В9/; гслекулярноя биологии АН СШ> /1990/; на Зазичесхег« факультете ТУ /191)О,Г391/.

/{■/бликами. Но материалам диссертации опубликовано 5 печатных абот з виде статен ¡! тезисоз.

Структура и объём работы. Диссертация состоит из владения, 5 лав, применяя, выводе» л списка цатироэанной литературы.

Ойгцни объём работа составляет 176 отр.чнш мгцзиноиисного текста, ХАйчая. I тайдицу и 33 рисункои. 'список дитпраиуры содержит 36 наименовании.

КРАТКОЕ СОДЕШйИЕ РАБОТЫ '

Во введении отражала актуальность тахи работы н сформулирована \ цель.

В первой главе диссертации, икещеи обзорный характер, даётся щая характеристика бактериальных вирусов и классификация тех упп, особенности . жизненного цикла которых позволили ккретизнровать исследуемую проблем; по имеющимся в литературе спераизктальнык данным и гипотезам коротко описывается структура их вирусов и организация 'их генетического материала; сборка говон головни и ряд интересных событии, ей сопровождающих; чальяке стадии инфекционного процесса я связанная с инъекииеи в ктерив фагового генома модификация вирусной чаетзди. Эжекняя клеиновоа кислоты» индуцируемая ^ ь проиллюстрирована эгочкеленнами экспериментальными зависимостями, которое испо-зувтея при с равно ¡игл с теоретическим результатами <гл.5). зечнеляжгея основные модели, предложенные для объяснения ■цесса транЬлокации ДАН в прообразованную белковую оболочку, а <же общие предпо/.охеяия о биологических и физических механизмах зкции и попытки объяснения причин я движущих сил выхода {деияоней кислоты из бактериофага в икфяиируемуя клетку /§1/.

Кратко охарактеризована проводившиеся к кастомцему време теоретические исследования кинетики высвобозденик ДНК из белков оболочки и анализ футоров, определявших ' тсршдинамическ состояние упакованной в фаге нуклеиновой кислоты; отмена основные недостатки этих работ /§2/.

В ааклзочительнои параграфа обзорной главы излагаются некотор. фундаментальные понятия, модельные представления, методы результаты статно треском фиалки макрошлеяуд, необходимые д ^язичегкол постановки задачи и решения исследуемой нробле: Рассматривается некоторые аспекты основанной -на приближены самосогласованного коля общей теории глобулязаиик макромолекул также теории полимерного жидкого кристалла, обобщающей мето, нахождения ¡сон^оркашонном энтропии дли описания ориентащюни упорядочения в макрокодекулярных системах и вичисдешш сгеричес оттьлкиващш сегыентов цеаи на область высоких концентраи; вахтера в растворе. Ооаскьакися результта работ по тщ глобулы, образованной как предельно длинной, так и относителы коротко,: персистантноП деньа н плохом няэкоиолекулярнок ш полимерном растворителе, либо помещённой в полость колок объема.

Во второе главе на основе имеющихся в литератд экспериментальных и теоретических результатов в Теркине статгстическои '¿изаки шкрошлекул формулируется модель уяаков а зкекцик ¿НК бактериофага, 'анализируется термоданамкческс состояние модельной систеш, рассматриваются асе возможные вклад в её свободную энергии, приводятся их оценки.

Основные положения теоретическое модели кратко излагается следукзцлх пунктах:

1. дазоэое состояние нуклеиновой кислоты, располагащеас внутрй бедкошл оболочки вируса, соответствует глобулярному.

2. Глобула конденсата ДНК х&зкюся жидкокристаллической.

3. В крсиессах упаковки и эжекции ДИК ведёт себя как едина упругая гоыояодимерная ыакроиолекула.

4. В раыках выиелёречксленнкх утверждении наиболее вероятн организации конденонрошишок нуклеиновой кислоты в виде г.н "катуижк шток" - концентрических конец свитков). способны перемещаться по все^у объг&еу, гжчто^у тороидальной глобулой Сри IX '

Ь. ий". мсхет нзаимодаНатвогагь- со внутренней: поверхность

фаге¿Он головки и бедковыУ «адом, локализованным внутри волеет

Ряс Л Глобула внутржЬаговои ДНК.

¡салсйда. Допускается, что характер этих взадаэдействий может меняться. • - •

6. Для описания ■ внутреннего объёма полости фаговой головки приемлемо сферическое приближение.

?. Размер» белковой оболочки на разных стадиях упаковки я секция могут .меняться.

В. Состав растворителя внутри и вне фага и, следовательно ■арактер объемных взаимодействий участков ДНК может бить ■азличным. ■ ' .

9. Молекула ДНК транслонируется в голоэку я- переметается заражаемую клетку, черёз узкое отверстие в белковой оболочке с ошщью диффузионного прояоязания вдоль своего контура. 10. процессы упаковки и зжекции, по-видимому, могут как суаестоляться статястически-равновосным образом, так и протекать релэксационао-кикетическом режиме.

"йким образом, в качестве модельной рассматривается система из восоЗнои к расширению и сжатию полол сферической оболочка и

лереиегоитной цопи, одним свода кондом - через отверстие с диаметрам, близким к диметру цегщ, - аащшавдзй гк>лзсть. я другим - располагающейся в окружяшмг орд«. При этой соотношение длю! частей цеш, находятся внутри оосышчки - в состоянии жидкокристаллической глобула » вн* а о - в клуоковсм состоянии, регулируется р»пгшшошгш дште-нимм макромолекулы в соответствии с характером и изы«н*»ийт свободной энергии.

Тдр.юдиШ1М1!че>окое ссстсчпш рассматриваемой сйстоШ определййтся бадане?»« следуших осшыш. вкладов е сьооодедю аноргпы:

к - у , + к , + у ' 1 Г ь г . (1 )

о; » ц» г« I г т.<лг

ПарЕЦЙ иг которых . - 1г., , - 01ШСЫ1ШВДЙЙ уменьшение коифзримиюниэй энтрпнт из-за лсодлозадки .части ц<*ш длиной 1{г ь помост» гзлэькиь шчпсляится как »нгргия упругого икгцбаяия колокулы, раоемьтрившкой как лгакропкошиеский ¿•ластичный ст^ркоиь; . ''

- потери в ьнтротт из-?ь ориентации ь фикздфоеанноа Ю1дк0!сристаял1!4':'ск0й г,ч~..-оу;й1 - с помощью извоста.-.:*. оценок для переистан-гиоЯ цоли, {юдодоиюй в грелку малого даайвтра;

У - вклад оогдшшх йзт!мод*йстви8 участков мпкршодекулы, находящихся н каноид*, - • щашкаето)» на осиоь-;- эшишеа выражений для коротксд-г оскву йщвго сч-зрйчйского отталкавамя шкд? сегментами глооулюоыаэыго с высокой объемной плотность» внутрш.к1лекулярн.:>гс/ жидкого кристалла, олектроетатическнх и т.н. гвдрагациоиких вааимодясткий к эффективного ваи-дер ••каальсог» щмтяынпи, огюср^л-'Нанно; "о присутствием атершчесхого растюрит-.'ля;

г - вклады в&«шод»йствкй внешнего слоя "катуыкя" с внутр^шк-й. поверхность» ООЖОВОЙ оболочки И шут|!«тшг поверхности тороидал1>н'.а гдооуж с оедкоьым ядром, -которые феномен элогичьеки ошюезаютоя с помоаь» "ьид«л«ния" слоев "кату&ки", состоящих ми участков ДНК, контактирумцих со виутркниими станкими белковой оболочки к находящихся в

нйтасредегвенноя олвзостл с центральким ойлковим ядром (Н );

р - свободна* анергия внефашний нуклеиноьой кислоты, локально простая оаипсо . которой вызвана не только -несуз^еть^нко.-ггь» оОъамш г-чышпдъдстгазй сегмзитов цЬли 'и - учатом лтк о кмкнезй'-'тшй " . но а значительно»

у прочащимися 3 аРКСЙЛ !ОСГЯ!.СИ ОТ ДЛИНЫ К.'|КЭЫЗ£А„>Н Ь

состоянии «шфоиоЛекули некоторых друткк вклепок ц ееободяуь :iiwpri«ü.

В третьей глава рассматриваются равииыеаые ссстозт:«

шд^лъноЛ система.

Анализируются зависимости среднего расстояний соседним:

сегментами сконденсированной в белковой оОодочкв нуклеиновой кислоты, размеров центрального тцюидпльиого отъ-рпкы нку}?« ДНК, длины ее внешнего к внутреннего "иов^рхнссгнык" слоев ;*. рудяусоа мдоимзльшк витков «пмоткя от часлэ звеньев упвковгинс& м*«кромслекули при различных зяьччнияк параметров, «арзктермаукимх об*<зиныа взэтодейстьия участков, э также вэаимодвйстгия со стенками полости фагового капсвдя и ьнутренним б^лконнм ядром. Исследуются цзденэккл соотносила длин кие- и ънутрифагсигч частей молекулы ДНК ирп изменениях условий среди кт п ьнутри Фаговой головки ("качестьэ растворителя* - % 5, "сродсте.')* Д:К н ствикэм внутренней пслоети фэгоиого кдосида (о> и к бшэвс#>у ядру (o>N ), размеров фагоьей голоьки ÍR) и внутреннего бежавого комплекса ¡ так«» для разных значений парачтзтроь систему, в том или ином конкретном рассматриваемом случав играющих вспомогательную роль.

Рисунки 2-4 илдистрируют условия термодинамической выгодности упаковки ДНК, сбееп^чинаж-й любу» финальну» плотность конденсации макромолекулы но ьнутреннем объеме фаговой частицу, и аолн.'.то опуотсцмиия каисэдй. Видно, что возможность осущусга.ад»вы или блокирования раншввсной трздслокании нуклеиновой кмслоти люоой длины зависит от относительного состояния вне- и внутрифаговой сред {конкретной влияние которых условно н&дошо "качеством растворителя" - % , рас,2); размеров целости фагового кансида (рис.З) и внутреннего бежевого комплексе (рис.4). Изменение "сродства" /Ш к стенкам округшиаего ее компартмеитз практически позволяет упаковку (эжекцим* только "поверхностного" слоя "катушки" <ркс.5).

В четвертой глар» исследуется динамика процесса реятации ДИК, Анализируется различные модели изменения пространственной оргакжшзги молекул«, наряду с чнелзшшми решзнаяш кине плоского уряакпкиа приводятся ц-котеркч аншштически« оценки.

Нсио, что плр>г».д v-í т-рм'ляинамичвскаго оичдяза к изучении ^даксацяожо--кгонткч1гскйх onoB«"m с.жрлаш с н-юбкодЕглость^

I 'V;'

2 \

Ш

-so

T T <•*> i-0

+/Í

i'i'C.2. Завясшость числе звеньев ДНК, уяакованной в каискдз, (!íir), от "качества растворителя"- (\{í)-

1j О ■-- V; г; а = -25; 3) 0= -10; 4) ö = 15. R/* - о,¿4; d/í = 0,04; н боо

îiKl.3. Зйьиегиосгь плотности ушжолки, т.о.. объемной д^д /{¡к ь подсети от размеров последней.

о =. о,

(а) о - о, (ь) о - -1, (с! а ••• --'). •■!) о а +5,

IУ % ■'*) г -к ! ¿Га =

■ч

/ / {

1,

2.

Р / Р

Рис.4. Упаковка Д11К при изменении размеров внутренней белковой структура.

500

М-

30

Г

+ зо

в

РйС.-з. Зависимость даны упакованной ДКК от ее "сродства" внутренней поверхности кайсида.

ко

1 ) т » +«; .?) т

(■с ® т" ); з) ^ -о ' * '

некоторого уточнения описанной шие модельной екстеуы.

йз уравнения, к решению которого сводится ностацлекзиш задача

*Г ->Ъ1п ----- (2)

(где Цп(1>) - длине дак, оставшейся внутри фага к иоиету t (—-P/i Li( ) - "двнлуйая сила" реатацг-си, s данной зшшо практически означающая просто понижение свободной энергии ДИК У 'I.ir/i1 - скорость процесса), видно, что упоыянутое уточнение j пернув очередь, касается иехаыизыов ковдеисацнн и декоаденсацш виутрикшсидноЯ глобулы, с которыми и связан вопрос о , природ* трекам, т.е. о коэффициенте трения Здесь возиозшм сдедуси^и часткме случаи: А) ыаксшаяькое трение имеется в канале отросткг - const; В) в треншг участвует вся. вкутрафаговая ДНК, I % Lit.; С) при деконденсацил нуклеиновой кислота происходит rpeisti практически только одного "слоя" ДНК о внутреинш поверхности кзпсида, i L»tjr.

Разумеется, в реальности все эти ыехашзыы трения тгуч действовать одновременно , т.е.

£л + Р + У khur • i3>

а конкретная схема "разиотки-сиативзния" "катушки" будет зависеть от численных значения коэффедиинтов fi и j (находящихся в пределах от 0 до I).

Понижение свободной энергии молекулы ДНК, обеспечнвавдее ее релаксаций из анутркфаговой глобула в клубок вне фагово.1 част 1щи (для определенности рассматривается процесс эжекции), как следует из результатов яредцдущ»ай глаш, ыокет обуславливаться: а) отличием "качества растворителя", имеющегося ко ереыеии "открывания" какала хвостоеого отростка от создащегосл при упаковке; Ь) сокращенней белковой оболочки. Однако оба случая качественно иохш проанализировать в терминах \;(Т, точнее с поиощьы параметра Ат « %tt - 1ен(** «оказали аолучешще для достаточно больной выгодности "выползания" аналитические зависимости L(V£t) маяно обозначить "качество"

растворителя в начале равновесной упаковки, (или к концу sseKigut), когда вся ЩЕК еда (или ухе) располагается Bite фаговое

ГОЛОВКИ).

Рисунки 6-8, по№:<ы£ащие качестаешо разный характер даш®

- Ii -

LJLX' 2 3

1. Л Т. = 10Й VJ (.I

J'. A'î « ?>j ч> a - 0; I-.- о - MO; /.•) a -c>

h: о ■ • ■■ ; 0 -- Ц; о -f-

¿wjt.Z

!й€.7 Временная зяяионуость выхода молекулы да «о модели В.

¿■Л; 7.

£ г^-10

1'ЙП.в Премйшя :зависчшость выхода молекулы дак. Модель с. и Й- со ' :'■) о <Л Ъ~) О '.)

:. ЛЧ - а; 0 ~ О Ъ) о «-$>; о) О

рептащш ДФС для 3-х упошшутых частных случаев, указывают, в ••»етности, иа возможность резкого понижения вронсии полного •щустойекия Силковой оболочки при наличии "отрицательного •^х/дства" ее ьну транша стенок к нуклеиновой кислого, вращающейся при дсконд«нсац»й как ««лая "катушка" (механизм 2, > = I, р =0). Как ноказувагл' для полного высвобождения из бактериофага

"/го „-ешлип&ского иатериала (в отсутствие взаимодействий •. л-.-днего с шутг*»нчЯ поверхность«» капсвда) в среднем'трибуетеп г-'.' деносятельш* условий внутри- и вкефаговой экешиокной '-и от аьчлогиччкх кри упаковке; дч ^ •}, V 100, и х Ю в

случаях А, В и С соответственно. При наличии отрицательного

также не будет превышать наиболее приаалемых зазче :<-(*£ порядка 1, а результате чего при реализации махашймэ 2 «оглп т иметь usr.ro конкуренция относительных вкладов ? л к вудусмя к качественно разним временным зависимостям зжею.щи для фагок с короткими и длишами хвосташ.

В ..пятой, главе сумммруются я анализируются результаты диссертационной работы, в сьете которых излагается обцэ* представление о процессах упаковки ДШС, их возможных двклеутдих силах и механизмах реализации, отношение к некоторым события« моногенеза и относительной роли и влиянии последних, с/цаствущих путях укладки "катушки" и схем* ее "размотки".

Укрывается на хорошее согласий с теорией результатом целого ркдл самих рапных экспериментальных наблюдений, касысдася кик оборки Фчговой голоьки, тэк и начальных СТАДИЙ инфекционного процесса, изнжий параметров третичной структуры нуклеиновой кислот«, шзьлнгшх определимыми мутациями и изменением условий ср&ди или происходящих в течение <зе выхода из фаговой х'оловки, а такхй физико-химических факторах, инициирующих, либо блокирузздх выход ДНК

ОСНОВНЫЕ ВЫВОДИ

1. Траяслок-щия ДНК в пр-здголо&ку бактериофага {осуществляемая после, еогмоягио, специфического "уэнаиакия") и ее рептзция из фаговой частицы (с "открытой" "входной" вераиной) могут обуславливаться простыми физическими причинами и не требовать спациальмого высокослецифического биологического аппарата.

2. Упаковка {с л»бой финальной плотностью) стаковитс« термодинамически выгодной при:

a) благоириятствущем ей неравновесно« соотношении усяовкй внутрнфаговой микросреда и растворителя, окрух&щего бактериофаг;

b) достаточно большх • (в зависимости от имеющегося :4ф'.*ктквиого "качества растворителя") рвзмерзх вирусного Аапсида и достаточно малом обгм&г обляст», яагатей белками, локдлкзов&эдпш н иочосги фага.

3. Ьаекция нуклекновок кгслоти аз вирусном частицы ггохот происходить:

а) при определённой отличии условия растворителя от тех, которые имелись при упаковке;

б) при достаточном уменьшении размеров фаговой головки, относительно аиенаихся в "зрелой.'- чьсткце ила увеличении натнаенйя' белковой оболочки.

4. Как конденсация, так а деконденсаакя ДИК будут осуществляться в гда-ишальиое враг.«, не предъявляя при этом слишком строгих к вред ли выполнимых требовании к состоянии внутркфаговои к окружающей сред и пределам "гипёррасаирешт" а сжатая головки, если:

а) на первых стадиях упаковки и к началу охекиии стенки внутренней полости каксмда будут обладать "отрицательным сродством" к нуклеиновом кислоте, препятствуя лсжажзшиш её витков в. непосредственной •• близости, ит белковой поверхности;

б) формируясь (пая "разматываясь" глобуль виутри$аговой ¿Ц1К будет вращаться итаосительно белковой.ободочки как "целая катушка", так, чтобы при этом взаимного трения соседних участков макромолекулу практически не происходило.

Список публикаций по теие диссертации

1. Hr-miehvili G.M., K-tiiftarashviU f.D.. Oabash'/iii I.S., ïsir.adZé- LЛ'., Grosbferg A.Y'd, Kusn?teo7 D.V. On the Problem ci Packaging and Injection of Bacteriophage- Genera«. - Ab»tr. Int.bioph.Congress, Vancouver, Cana-.la,

¿. Mrevlishvili O.fi., Crosierg A.Y;;, üabriöhvili I,S., Kuznetsov D.Y., Mdzinarashvili T.P., Tsinadae L.ï1. Thermodymuieal and Statistical Aspeuts ci Bacteriophage •ïenerne Pa-jtoging an-l Injeeticn. - Abstr. iltil I'TJPaO conference on chemical thermodynamics (late- arrivais.), Coiao. Italy, 1990. PP-¿0-01.

3. Cabaehvili I.S., Orsberg A. Yu, Kuanetsov D.V., Mrevlishvili о .M. Phage DNA pLv;kx<?irig and Rotation frcsi Protein Shell. - Тезисы докладов «»кадньродной вкода-cistcmapa "Современные проблемы фиаако-химя« макромолекул", Пущияо, 1991. - с.Ю5.

4. Габаавили И.С., Гросберг A.D., KysHciio» Д.В., Мренлишии Г.М.

Теоретическая модель упаковки Ш в гоховк* фага. - Биофизика, 1991, Ï-36. внп.5, С.7дО-787.

5. Гвбаввият (i.e., Грасберг Рсотзеш ДНК И» бактериофага. -

Биофизика, 1991, НЯ1.5, с.73-793.

"bäföcfhoxzfin gnfqbQbnb ¿g^öob ^nSi^öSbcnjftftUo ipc» OCQ^U00^* ipft^l) ЛоЗ^СТ-оЬ оолЛоэкщ bOÔnjg^OQvi"

гогоззгто плово ьолагъ

ТЕрся 100 окз.