Бесплатный автореферат и диссертация по биологии на тему

Создание модельных систем для выяснения функции инсуляторов и репрессоров транскрипции в организации взаимодействия между энхансерами и промоторами в сложных регуляторных локусах

ВАК РФ 03.00.26, Молекулярная генетика

Содержание диссертации, кандидата биологических наук, Куллыев, Андрей Поллыевич

1 .ВВЕДЕНИЕ. 4.

2. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.

2.1 ИНСУЛЯТОРЫ - РЕГУЛЯТОРНЫЕ ЭЛЕМЕНТЫ ГЕНОМА ЭУКАРИОТ. 6.

2.2 ИНСУЛЯТОРЫ В ЛОКУСЕ ГЕНА ТЕПЛОВОГО ШОКА 8.

2.3 ИНСУЛЯТОР В СОСТАВЕ МОБИЛЬНОГО ЭЛЕМЕНТА. 12.

2.4 ИНСУЛЯТОРНЫЕ СВОЙСТВА ПРОМОТОРА EVE. 22.

2.5 ИНСУЛЯТОР В ЛОКУСЕ ГЕНА NOTCH. 22.

2.6 ИНСУЛЯТОР В ЛОКУСЕ ГЕНОВ SCR-FTZ 23.

2.7 ИНСУЛЯТОРЫ В ЛОКУСЕ ГЕНА ABD-B. 23.

2.8 ВОЗМОЖНЫЕ МЕХАНИЗМЫ ДЕЙСТВИЯ РЕГУЛЯТОРНЫХ ЭЛЕМЕНТОВ В ЛОКУСЕ ГЕНА ABD-B. 29.

2.9 УНИВЕРСАЛЬНОСТЬ СВОЙСТВ ИНСУЛЯТОРОВ. 32.

3. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

3.1. ГЕНЕТИЧЕСКИЕ МЕТОДЫ. 34.

3.1.1. ЛИНИИ DROSOPHILA MELANOGASTER, ИСПОЛЬЗОВАННЫЕ В ДАННОЙ РАБОТЕ. 34.

3.1.2. ТРАНСФОРМАЦИЯ ЭМБРИОНОВ DROSOPHILA MELANOGASTER И ПОЛУЧЕНИЕ ТРАНСГЕННЫХ ЛИНИЙ. 34.

3.1.3. ФЕНОТИПИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ ЭКСПРЕССИИ ГЕНОВ YELLOW И MINIWHITE В ТРАНСГЕННЫХ ЛИНИЯХ. 35.

3.1.4. ГЕНЕТИЧЕСКИЕ СКРЕЩИВАНИЯ. 35.

3.2. БИОХИМИЧЕСКИЕ МЕТОДЫ. 36.

3.2.1. ВЫДЕЛЕНИЕ ДНК ИЗ ДРОЗОФИЛЫ. 36.

3.2.2. САУЗЕРН-БЛОТ-АНАЛИЗ. 36.

3.2.3. МЕТОД ПОЛИМЕРАЗНОЙ ЦЕПНОЙ РЕАКЦИИ (ПЦР). 37.

3.2.4. СЕКВЕНИРОВАНИЕ ПЛАЗМИД И ПЦР ПРОДУКТОВ. 39.

3.2.5. МОЛЕКУЛЯРНОЕ КЛОНИРОВАНИЕ. 39.

3.2.6. ТРАНСФОРМАЦИЯ БАКТЕРИАЛЬНЫХ КЛЕТОК ПЛАЗМИДАМИ. 39.

3.2.7. ВЫДЕЛЕНИЕ ДНК ПЛАЗМИД МЕТОДОМ ЩЕЛОЧНОГО ЛИЗИСА. 41.

3.2.8. СОЗДАНИЕ КОНСТРУКЦИЙ. 41. 4.РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЯ

4.1. РЕГУЛЯТОРНЫЕ ЭЛЕМЕНТЫ SCS И ZW5 СПОСОБНЫ БЛОКИРОВАТЬ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ МЕЖДУ ЭНХАНСЕРАМИ И ПРОМОТОРАМИ, НАХОДЯСЬ МЕЖДУ НИМИ. 45.

4.2. ИНСУЛЯТОРЫ SCS И ZW5 СПОСОБНЫ ВЗАИМОДЕЙСТВОВАТЬ ДРУГ С ДРУГОМ, ЧТО ОБЛЕГЧАЕТ КОММУНИКАЦИЮ МЕЖДУ ЭНХАНСЕРАМИ И ПРОМОТОРОМ. 4 47.

4.3 ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ МЕЖДУ ЭЛЕМЕНТАМИ SCS И ZW5, ОБЛЕГЧАЮЩЕЕ КОММУНИКАЦИЮ МЕЖДУ ЭНХАНСЕРОМ И ПРОМОТОРОМ, ВОЗМОЖНО ЛИШЬ ПРИ НАЛИЧИИ ДОСТАТОЧНОГО РАССТОЯНИЯ МЕЖДУ НИМИ. 51.

4.4 РЕГУЛЯТОРНЫЕ ЭЛЕМЕНТЫ SCS И ZW5 НЕ СПОСОБНЫ

ВЗАИМОДЕЙСТВОВАТЬ С ИНСУЛЯТОРОМ SU(HW). 54.

4.5. РЕГУЛЯТОРНЫЙ ЭЛЕМЕНТ FAB-8 НЕ ЯВЛЯЕТСЯ СИЛЬНЫМ ИНСУЛЯТОРОМ В СИСТЕМЕ ГЕНОВ YELLOWW M1NIWHITE. 55.

4.6 РЕГУЛЯТОРНЫЙ ЭЛЕМЕНТ FAB-8 ЧАСТИЧНО НЕЙТРАЛИЗУЕТ ДЕЙСТВИЕ ИНСУЛЯТОРА SU(HW). 57.

4.7 РЕГУЛЯТОРНЫЙ ЭЛЕМЕНТ FAB-7 ПРОЯВЛЯЕТ СВОЙСТВА ИНСУЛЯТОРА И НЕ СПОСОБЕН НЕЙТРАЛИЗОВАТЬ ДЕЙСТВИЕ ИНСУЛЯТОРА SU(HW). 58.

4.8 ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ МЕЖДУ САЙЛЕНСЕРАМИ НЕ ОБЕСПЕЧИВАЕТ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ МЕЖДУ ИНСУЛЯТОРАМИ ZW5 И SU(HW). 60.

5.0БСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ

5.1 ПРЕДПОЛАГАЕМЫЕ МЕХАНИЗМЫ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ ИНСУЛЯТОРОВ. 65.

5.2 ВОЗМОЖНЫЕ МЕХАНИЗМЫ ДЕЙСТВИЯ РЕГУЛЯТОРНЫХ ЭЛЕМЕНТОВ 67. В ЛОКУСЕ ГЕНА АВИ-В

6. ВЫВОДЫ 71.

Введение Диссертация по биологии, на тему "Создание модельных систем для выяснения функции инсуляторов и репрессоров транскрипции в организации взаимодействия между энхансерами и промоторами в сложных регуляторных локусах"

Геном высших эукариот содержит огромное количество генов и их регуляторных элементов, таких как энхансеры, сайленсеры и инсуляторы. Энхансеры могут активировать транскрипцию гена независимо от ориентации и, находясь от промотора на расстоянии, которое может достигать нескольких сотен тысяч пар нуклеотидов (Dorsett 1999). Многие энхансеры не имеют специфичности к определенному промотору и. способны активировать транскрипцию с целого ряда генов. Так как в геноме гены располагаются часто достаточно близко друг к другу, то должны существовать механизмы, обеспечивающие взаимодействие энхансера с промотором своего гена и предотвращающие активацию чужих промоторов. В определении взаимодействий между энхансерами и промоторами важную роль играют инсуляторы и сайленсеры. Инсуляторы блокируют взаимодействие между энхансером и промотором, находясь между ними, но, при этом не влияют на их активность, т.е. промотор может быть активирован любым неизолированным энхансером, а энхансер может активировать любой другой неизолированный промотор. В то же время репрессирующее действие сайленсеров не зависит от пространственного расположения по отношению к энхансеру или промотору.

В 1985 году были открыты первые два инсулятора дрозофилы, ses (specialised chromatin structure) и ses', которые окружают ген теплового шока hsp70 дрозофилы и изолируют его от окружающего хроматина (Udvardy et al, 1985). Инсуляторы обнаружены также в регуляторной части гена Abd-B и в мобильном элементе gypsy (инсулятор Su(Hw)). Недавно было показано, что инсуляторы Su(Hw) способны взаимодействовать друг с другом, приводя к выпетливанию участка ДНК, находящегося между ними, и способствуя коммуникации между энхансерами и промотором (Muravyova et al, 2001). В то же время остается неизвестным, все ли инсуляторы способны проявлять данные свойства, а также, способны ли взаимодействовать инсуляторы из разных локусов.

Другой неразрешенной проблемой является выяснение механизма регуляции экспрессии гена Abd-B. Регуляторная область этого гена содержит все три класса регуляторных элементов. Предполагается, что инсуляторы окружают каждый энхансер и организуют ДНК регуляторной области теш Abd-B в серию изолированных хроматиновых доменов.

При этом в непосредственной близости от инсулятора или даже в его составе находятся так называемые PRE-сайты {Polycomb Responsible Elements), участвующие в процессе сайленсинга, необходимого для нормального развития. В результате, регуляторные элементы, находящиеся между хроматиновыми доменами, с одной стороны функционируют как границы, а с другой стороны осуществляют функцию сайленсинга, что позволяет поддерживать индивидуальный и независимый паттерн экспрессии гена Abd-B. Парадоксально то, что энхансер может взаимодействовать с промотором на больших дистанциях, несмотря на присутствие инсуляторов и сайленсеров, и при этом правильно узнавать свой промотор. Таким образом, выяснение механизмов действия инсуляторов и сайленсеров представляет большой интерес, так как позволяет приблизиться к пониманию проблемы взаимодействия между энхансером и промотором в геноме. Кроме того, изучение действия инсуляторов является важной прикладной задачей для создания векторов, которые способны поддерживать стабильную экспрессию генов вне зависимости от места интеграции в геноме.

В данной работе были изучены свойства инсуляторов и сайленсеров из разных локусов, а также их способность регулировать взаимодействия между энхансерами и промотором.

2.0Б30Р ЛИТЕРАТУРЫ

Заключение Диссертация по теме "Молекулярная генетика", Куллыев, Андрей Поллыевич

6.ВЫВОДЫ

1. Подтверждены инеуляторные свойства регуляторных элементов ses и zw5 в трансгенной системе генов yellow и miniwhite. Впервые продемонстрирована возможность взаимодействия инсуляторов ses и zw5 друг с другом, приводящая к взаимной нейтрализации их инсуляторной активности.

2. Показано, что ses и zw5 не способны взаимодействовать с инсулятором Su(Hw) и нейтрализовать его активность.

3. Подтверждены инеуляторные свойства регуляторных элементов Fab-7 и Fab-8 в трансгенной системе генов yellow и miniwhite. Показано, что Fab-8, в отличие от Fab-7, способен взаимодействовать с инсулятором Su(Hw) и частично нейтрализовать его активность.

4. Показано, что взаимодействие сайленсеров из регуляторной области гена Abd-B не способно усиливать взаимодействие между инсуляторами.

Библиография Диссертация по биологии, кандидата биологических наук, Куллыев, Андрей Поллыевич, Москва

1. Георгиев П.Г., Муравьева Е.Е., Головнин А.К., Грачева Е.М., Беленькая Т.Ю. Инсуляторы и взаимодействие между регуляторными элементами на больших дистанциях у высших эукариот // Генетика. 2000. Т.36. № 12. С. 1588-1597.

2. Глазков М.В. Границы структурно-функциональных единиц (доменов) эукариотических хромосом//Генетика. 1998. Т.34(5). С.593-604.

3. Barges S., Mihaly J., Galloni M. et al. The Fab-8 boundary defines the distal limit of the bithorax complex iab-1 domain and insulated iab-1 from initiation elements and a PRE in the adjacent iab-8 domain // Development. 2000. Vol.127 P.779-790.

4. Belozerov V., Majumder P., Shen P., Cai H. A novel boundary element may facilitate independent gene regulation in the Antennapedia complex of Drosophila.// EMBO 2003 Vol. 22(12). P. 3113-3121.

5. Bhat К. M., Farkas G., Karch F., Gyurkovics H., Gausz J., Schedl P. The GAGA factor is required in the early Drosophila embryo not only for transcriptional regulation but also for nuclear division. // Development. 1996. Vol. 122. P. 1113-1124.

6. Bi X., Broach J. UAS rpg can function as a heterochromatin boundary element in yeast // Genes Dev. 1999. V. 13. P.1089-1101.

7. Bi X., Broach J. Chromosomal boundaries in S. cerevisiae II Curr. Opin. Gen. Dev. 2001. V. 11. P. 199-204.

8. Blanton J, Gaszner M, Schedl P. Protein:protein interactions and the pairing of boundary elements in vivo. И Genes Dev. 2003 Vol.17 (5). P.664-675.

9. Bondarenko V.A., Liu Y.V., Jiang Y.I., Studitsky V.M. Communication over a large distance: enhancers and insulators. // Biochem. Cell Biol. 2003 Vol.81. P.241-251

10. Breiling A., Bonte S., Ferrari P., Becker P.B., Paro R. The Drosophila polycomb protein interacts with nucleosomal core particles in vitro via its repression domain // Mol. Cell. Biol. 1999. Vol.19. P.8451-8460.

11. Brown J. L., Mucci D., Whiteley M., Dirkesen M.L., Kassis J.A. The Drosophila Polycomb group gene Pleohomeotic encodes a DNA binding protein with homology to the transcription factor YY1//Mol. Cell.1998. Vol. 1. P. 1057-1064.

12. Buchner K., Roth P., Schotta G., Krauss V., Saumweber H., Reuter G., Dorn R. Genetic and molecular complexity of the position effect variegation modifier mod(mdg4) in Drosophila H Genetics. 2000. Vol.155. P. 141-157.

13. Busturia A., Bienz M. Silencers in Abdominal-B, a homeotic Drosophila gene // EMBO J. 1993. Vol. 12. P. 1415-1425.

14. Busturia A., Lloyd A., Bejarano F., Zavortink M.,Xin H., Sakonjo S. The MCP silencer of the Drosophila Abd-B gene requires both Pleoihomeotic and GAGA factor for the maintenance of repression// Development. 2001. Vol. 128. P. 2163-2173.

15. Busturia A., Wrightman C., Sakonju S. A silencer is required for maintenance of transcriptional repression throughout Drosophila development // Development. 1997. Vol. 124. P. 4343-4350.

16. Cai H., Levine M Modulation of enhancer-promoter interactions by insulators in the Drosophila embryo //Nature. 1995. Vol. 376. P. 533-536.

17. Cai H., Levine M. The gypsy insulator can function as a promoter-specific silencer in the Drosophila embrio // EMBO J. 1997. Vol.16. P. 1732-1741.

18. Cai H., Shen P. Effects of cis Arrangement of Chromatin Insulators on Enhancer-Blocking Activity Science 2001.Vol. 291. P. 493-495.

19. Celniker S. E., Sharma S., Keelan D. J.,Lewis E. B. The molecular genetics of the bithorax complex of Drosophila: cis-regulation in the Abdominal-B domain // Embo J. 1990. Vol. 9. P. 4227-4286.

20. Chiang A., O'Connor M. B., Paro R., Simon J.,Bender W. Discrete Polycomb-binding sites in each parasegmental domain of the bithorax complex // Development. 1995. Vol. 121. P. 1681-1689.

21. Chung J., Whitely M., Felsenfeld G. A 5' element of the chicken P-globin domain serves as an insulator in human erythroid cells and protects against position effect in Drosophila II Cell. 1993. V. 74. P. 505-514.

22. Cook PR. Nongenic transcription, gene regulation and action at a distance. J Cell Sci. 2003 Vol. 116(22). P.4483-4491.

23. Cuvier O., Hart C.M., Laemmli U.K. Identification of a class of chromatin boundary elements//Mol. Cell. Biol. 1998. Vol. 18. P. 7478-7486.

24. Decoville M., Giacomello E., Leng M., Lockergenetics D. DSP1, an HMG-like protein, is involved in the regulation of homeotic genes // Genetics. 2001. Vol. 157. P. 237-244.

25. Donze D., Adams C.R., Rine J. et al. The boundaries of the silenced HMR domain in Saccharomyces cerevisiae II Genes Dev. 1999. V.13. P.698-708.

26. Dorsett D. Distant liaisons: long range enhancer-promoter interactions in Drosophila II Curr. Opin.Genet. Dev. 1999. Vol. 9. P. 505-514.

27. Dunaway M, Hwang JY, Xiong M, Yuen HL. The activity of the scs and scs1 insulator elements is not dependent on chromosomal context // Mol Cell Biol. 1997. Vol.l7(l) P.182-189.

28. Duncan I.The bithorax complex // Annu. Rev. Genet. 1987. Vol. 21. P. 285-319.

29. Farkas G., Gausz J., Galloni M., Reuter G., Gyurkovics H., Karch F. The Trithorax-like gene encodes the Drosophila GAGA factor // Nature. 1994. Vol. 371. P. 806-808.

30. Farkas G., Udvardy A. Sequence of scs and scs' Drosophila DNA fragments with boundary function in the control of gene expression // NAR. 1992. Vol. 20. P. 2604.

31. Fourel G, Magdinier F, Gilson E. Insulator dynamics and the setting of chromatin domains. // Bioessays. 2004 Vol.26(5). P.523-532.

32. Fritsch C., Brown J., Kassis J., Muller J. The DNA-binding Polycomb group protein Pleiohomeotic mediates silencing of a Drosophila homeotic gene // Development. 1999. Vol. 126. P. 3905-3913.

33. Galloni M, Gyurkovics H, Schedl P, Karch F. The bluetail transposon: evidence for independent cis-regulatory domains and domain boundaries in the bithorax complex // Embo J. 1993. Vol. 12. P. 1087-1097.

34. Garcia E., Marcos-Gutierrez C., del Mar Lorente M., Moreno J., Vidal M. RYBP, a new repressor protein that interacts with components of the mammalian Polycomb complex and with the transcription factor YY1 // EMBO J. 1999. Vol. 18. P. 3404-3418.

35. Gaszner M., Vazquez J., Schedl P. The Zw5 protein, a component of the scs chromatin domain boundary, is able to block enhancer-promoter interaction // Genes Dev. 1999. Vol. 13. P. 2098-2107.

36. Gelbart W. Synapsis-dependent allelic complementation at the decapentaplegic gene complex in Drosophila melanogaster!7 Proc. Natl. Acad. Sci. Usa. 1982. Vol. 79. P. 26362640.

37. Georgiev P., Kozycina M. Interaction between mutations in the suppressor of Hairy wing and modifier of mdg4 genes of Drosophila melanogaster affecting the phenotype of gypsy-induced mutations // Genetics. 1996. Vol. 142. P. 425-436.

38. Georgiev P., Corces V. The Su(Hw) protein bound to gypsy sequences in one chromosome can repress enhancer-promoter interactions in the paired gene located in the other homolog // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1995. Vol.92. P.5184-5188.

39. Gerasimova T.I, Byrd K., Corces V.G. A chromatin insulator determines the nuclear localization of DNA. Mol Cell. 2000 Vol.6(5). P.1025-1035.

40. Gerasimova T.I., Corces V.G. Polycomb and Trithorax group proteins mediate the function of a chromatin insulator // Cell. 1998. Vol. 92. P.511-521.

41. Gerasimova T., Gdula D., Gerasimov D., Simonova O. , Corces V. A Drosophila protein that impacts directionality on a chromatin insulator is an enhancer of position-effect variegation // Cell. 1995. Vol. 82. P.587-597.

42. Geyer P. The role of insulator elements in defining domains of gene expression // Curr. Opia Genet Dev. 1997. Vol. 7. P. 242-248.

43. Geyer P., Corces V. DNA position-specific repression of transcription by a Drosophila zinc finger protein //Genes Dev. 1992. Vol.6. P.1865-1873.

44. Geyer P., Corces V. Separate regulatory elements are responsible for the complex pattern of tissue-specific and developmental transcription of the yellow locus in Drosophila melanogaster II Genes Dev. 1987. Vol.1. P.996-1004.

45. Gdula D., Corces V. Characterization of functional domains of the Su(Hw) protein that mediate the silencing effect of mod(mdg4) mutations // Genetics. 1997. Vol.145. P.153-161.

46. Ghosh D., Gerasimova T., Corces V. Interactions between the Su(Hw) and Mod(mdg4) proteins required for gypsy insulator function // EMBO J. 2001. Vol.20. P.2518-2527.

47. Gorczyca M., Popova X., Budnik V. The gene mod(mdg4) affects synapse specificity and structure in Drosophila II J.Neurobiol. 1999. Vol.39. P.447-460.

48. Gyurkovics H., Gausz J., Kummer J., Karch F. A new homeotic mutation in the Drosophila bithorax complex removes a boundary separating two domains of regulation // Embo J. 1990. Vol. 9. P. 2579-2585.

49. Hagstrom K., Muller M., Schedl P. Fab-7 functions as a chromatin domain boundary to ensure proper segment specification by the Drosophila bithorax complex // Genes Dev. 1996. Vol. 10. P. 3202-3215.

50. Hagstrom K., Muller M., Schedl P. A Polycomb and GAGA dependent silencer adjoins the Fab-7 boundary in the Drosophila bithorax complex // Genetics. 1997. Vol. 146. P. 13651380.

51. Harrison D. A., Gdula D. A., Coyne R. S., Corces V. G. A leucine zipper domain of the suppressor of Hairy-wing protein mediates its repressive effect on enhancer function // Genes Dev. 1993. Vol. 7. P.1966-1978.

52. Hogga I., Mihaly J., Barges S., Karch F. Replacement of Fab-7 by the gypsy or scs insulator disrupts long-distance regulatory interactions in the Abd-B gene of the bithorax complex // Mol. Cel. 2001. Vol. 8. P. 1145-1151.

53. Karch F., Galloni M., Sipos L., Gausz J.,Gyurkovics H., Schedl P. Mcp and Fab-7: molecular analysis of putative boundaries of as-regulatory domains in the bithorax complex of Drosophila melanogaster II Nucleic Acids Res. 1994. Vol. 22. P. 3138-3146.

54. Kellum R., Schedl P. A position-effect assay for boundaries of higher order chromosomal domains II Cell. 1991. Vol. 64. P. 941-950.

55. Kellum R., Schedl P. A group of scs elements function as domain boundaries in an enhancer-blocking assay // Mol. Cel. Biol. 1992. Vol. 12. P. 2424-2431.

56. Keppy DO, Welshons WJ. The cytogenetics of a recessive visible mutant associated with a deficiency adjacent to the notch locus in Drosophila melanogaster. Genetics. 1977 Vol.85(3). P. 497-506.

57. Kim J., Shen B., Rosen C., Dorsett D. The DNA-binding and enhancer-blocking domains of the Drosophila suppressor of Hairy-wing protein // Mol. Cel. Biol. 1996. Vol. 16. P.3381-3392.

58. Krebs J. E., Dunaway M. The scs and scs' insulator elements impart a cis requirement on enhancer-promoter interactions. // Mol. Cell. 1998. Vol. 1. P. 301-308.

59. Kuhn E.J., Geyer P.K. Genomic insulators: connecting properties to mechanism. Current Opinion in Cell Biology 2003. Vol. 15. P.259-265

60. Lewis E. B. A gene complex controlling segmentation in Drosophila //Nature. 1978. Vol. 276. P. 565-570.

61. Lu L., Tower J. A transcriptional insulator element, the su(Hw) binding site, protects a chromosomal DNA replication origin from position effects // Mol. Cell. Biol. 1997. Vol.17. P.2202-2206.

62. Mallin D., Myung J., Patton J. et al. Polycomb group gene repression is blocked by the Drosophila suppressor of Hairy-wing Su(Hw). insulator// Genetics. 1998. Vol.148. P.331-339.

63. Martin C. H., Mayeda C. A., Davis C. A., Ericsson C. L., Knafels J. D., Mathog D. R., Celniker S. E., Lewis E. B., Palazzolo M. J. Complete sequence of the bithorax complex of Drosophila// Proc. Natl. Acad. Sci. Usa. 1995. Vol. 92. P. 8398-8402.

64. Mazo A., Mizrokhi L., Karavanov A. et al. Suppression in Drosophila: su(Hw) and su(f) gene products interact with a region of mdg4 (gypsy) regulating its transcriptional activity // EMBO J. 1989. Vol. 8. P.903-911.

65. Melnikova L., Gause M., Georgiev P. The gypsy Insulators Flanking yellow Enhancers Do Not Form a Separate Transcriptional Domain in Drosophila melanogaster : The Enhancers Can Activate an Isolated yellow Promoter. Genetics 20021 Vol. 60. P. 1549-1560.

66. Mihaly J., Hogga I., Gausz J., Gyurkovics H., Karch F. In situ dissection of the Fab-7 region of the bithorax complex into a chromatin domain boundary and a Polycomb-response element//Development. 1997. Vol. 124. P. 1809-1820.

67. Muller M., Hagstrom K., Gyurkovics H., Pirrotta V., Schedl P. The Mcp element from the Drosophila melanogaster bithorax complex mediates long-distance regulatory interactions // Genetics. 1999. Vol. 153. P. 1333-1356.

68. Muravyova E., Golovnin A., Gracheva E., Parshikov A., Belenkaya T., Pirrotta V., Georgiev P. Loss of insulator activity by paired Su(Hw) chromatin insulators // Science. 2001. Vol. 291. P. 495-498.

69. Nabirochkin S., Ossokina M., Heidmann T. A nuclear matrix/scaffold attachment region co-localizes with the gypsy retrotransposon insulator sequence // J.Biol.Chem. 1998. Vol.273. P.2473-2479.

70. Ohtsuki S., Levine M. GAGA mediates the enhancer blocking activity of the eve promoter in the Drosophila embryo. // Genes Dev. 1998. Vol.12. P.3325-3330.

71. Paro R., Harte P. J. The role of PcG and trxG chromatin complexes in the maintenance of determined cell states, in Epigenetics. // Cold Spring Harbor Laboratory Press. 1996. P. 507528.

72. Pattatucci A. M., Kaufman T. C. The homeotic gene Sex combs reduced of Drosophila melanogaster is differentially regulated in the embryonic and imaginai stages of development. II Genetics. 1991. Vol. 129. P. 443-461.

73. Pirrotta V. PcG complexes and chromatin silencing // Curr.Opin.Gen.Dev. 1997. Vol.7. P.249-258.

74. Pirrotta V. Polycomb silencing and the maintenance of stable chromatin states // Results Probl. Cell Differ. 1999. Vol.25. P.205-228.

75. Ramos RG, Grimwade BG, Wharton KA, Scottgale TN, Artavanis-Tsakonas S. Physical and functional definition of the Drosophila Notch locus by P element transformation. Genetics. 1989 Vol. 123(2) P. 337-348.

76. Roseman R. R., Johnson E. A., Rodesch C. K., Bjerke M., Nagoshi R. N., Geyer P. K.

77. A P element containing suppressor of Hairy-wing binding regions has novel properties for mutagenesis in Drosophila melanogaster. II Genetics. 1995. Vol. 141. P. 1061-1074.

78. Roseman R, Pirrotta V., Geyer P. The Su(Hw) protein insulates expression of the Drosophila melanogaster white gene from chromosomal position-effects // EMBO J. 1993. Vol.12. P.43 5-442.

79. Rykowski, M. C., S. J. Parmelee, D. A. Agard and J. W. Sedat. Precise determination of the molecular limits of a polytene chromosome band: regulatory sequences for the Notch gene are in the interband. Cell. 1988 Vol.54. P. 461^72.

80. Sánchez-Herrero E. Control of the expression of the bithorax complex genes abdominal-A and abdominal-B by cis-regulatory regions in Drosophila embryos. // Development. 1991. Vol. 111.P.437-449.

81. Sanchez-Herrero E., Vernys I., Marco R., Morata G. Genetic organization of Drosophila bithorax complex. //Nature. 1985. Vol. 313. P.108-113.

82. Scott K. S., Geyer P. K. Effects of the su(Hw) insulator protein on the expression of the divergently transcribed Drosophila yolk protein genes. // EMBO J. 1995. Vol. 14. P. 62586279.

83. Scott K., Taubman A., Geyer P. Enhancer blocking by the Drosophila gypsy insulator depends upon insulator anatomy and enhancer strength // Genetics. 1999. Vol.153. P.787-798.

84. Shao Z., Raible R., Mollaaghababa R. et al. Stabilization of chromatin structure by PRC1, a polycomb complex// Cell. 1999. Vol.98. P.37-46.

85. Sigrist G, Pirrotta V. Chromatin insulator elements block the silencing of a target gene by the Drosophila Polycomb Response Element (PRE) but allow trans interactions between PREs on different chromosomes // Genetics. 1997. Vol.147. P.209-221.

86. Simon J., Chiang A., Bender W., Shimell M. J., O'Connor M. Elements of the Drosophila bithorax complex that mediate repression by Polycomb group products. // Dev. Biol. 1993. Vol. 158. P. 131-144.

87. Simon J., Peifer M., Bender W., O'Connor M. Regulatory elements of the bithorax complex that control expression along the anterior-posterior axis. // Embo J. 1990. Vol. 9. P. 39453956.

88. Smith P., Corces V. The suppressor of Hairy-wing binding region is required for gypsy mutagenesis // Mol.Gen.Genet. 1992. Vol.233. P.65-70.

89. Spana C., Harrison D., Corces V. The Drosophila melanogaster supressor of Hairy wing protein binds to specific sequences of the gypsy retrotransposon // Genes Dev. 1988. Vol.2. P.1414-1423.

90. Spana C., Corces V. DNA bending is a determinant of binding specificity for a Drosophila zink finger protein // Genes Dev. 1990. Vol.4. P. 1505-1515.

91. Sun F.-L., Elgin S. Putting boundaries on silence // Cell. 1999. V.99. P.459-462.

92. Sutter N.B., Scalzo D., Fiering S., Groudine M., Martin D.I.K. Chromatin insulation by a transcriptional activator.// PNAS. 2003. Vol. 100(3). P.l 105-1110.

93. Vazquez J., Schedl P. Deletion of an insulator element by the mutation facet-strawberry in Drosophila melanogaster II Genetics. 2000. Vol.155. P.1297-1311.

94. Welshons WJ, Keppy DO. Intragenic deletions and salivary band relationships in Drosophila. Genetics. 1975 Vol. 80(1). P.143-155.

95. West A.G., Gaszner M., Felsenfeld G. Insulators: many functions, many mechanisms. // Genes Dev. 2002 Vol. 16(3). P.271-288.

96. Xu Q, Li M, Adams J., Cai H.N. Nuclear location of a chromatin insulator in

97. Drosophila melanogaster. J Cell Sci. 2004. Vol. 117(Pt 7). P. 1025-1032.

98. Zhou J, Levine M. A novel cis-regulatory element, the PTS, mediates an anti-insulator activity in the Drosophila embryo. // Cell. 1999. Vol. 99(6). P. 567-575.

99. Zhou J., Barolo S., Szymanski P., Levine M. The Fab-7 element of the bithorax complex attenuates enhancer-promoter interactions in the Drosophila embryo.// Genes Dev. 1996. Vol. 10. P.3195-3201.