Бесплатный автореферат и диссертация по биологии на тему

Редокс-зависимая регуляция экспрессии генов, индуцируемых окисью азота

ВАК РФ 03.00.03, Молекулярная биология

Содержание диссертации, кандидата биологических наук, Литвинов, Дмитрий Юрьевич

ВВЕДЕНИЕ

Глава 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ: БИОХИМИЯ NO

И NO-ЗАВИСИМАЯ ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ

1.1. Биохимия NO

1. 1.1. Образование NО

1.1.2. Образование АФА

1.2. Модификации белков под действием N0 и АФА

1.2.1 Нитрозилирование гемового железа

1.2.2. S-нитрозация и окисление тиольных остатков

1.2.3. Нитрование тирозина

1.3. N0- и АФА- чувствительные сигнальные пути и транскрипционные факторы

1.3.1. МАР-протеинкиназы

1.3.2. H-Ras

1.3.3. cGMP-зависимая протеинкиназа (PKG)

1.3.4. Тирозиновые протеинкиназы

1.3.5. Транскрипционный фактор HIF

Глава 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ

2.1. Реактивы

2.2. Синтез GSNO

2.3. Ферменты

2.4. Растворы

2.5. Бактериальные среды

2.6. Очистка фрагментов ДНК в легкоплавкой агарозе

2.7. Трансформация Е. coli плазмидной ДНК

2.8. Выделение плазмидной ДНК из Е. coli

2.9. "Вычтенная" клонотека

2.10. Секвенирование кДНК и анализ нуклеотидных последовательностей

2.11. Полимеразная цепная реакция (ПЦР)

2.12. Культивирование клеток и выделение РНК

2.13. Электроперенос РНК

2.14. Получение меченых зондов

2.15. Гибридизация на мембранах с перенесенной РНК

2.16. Определение сОМР

Глава 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ

3.1. Выявление генов, индуцируемых N0: анализ вычтенной клонотеки, обогащенной КО-индуцируемыми генами

3.2. Участие АФК в стимуляции экспрессии генов под действием N

3.3. Стимуляция экспрессии генов 1Ь-8, ММР-3 и СОХпри действии каталазы в хондроцитах человека

3.4. сОМР и стимуляция экспрессии генов каталазой и N0 в хондроцитах

3.5. Роль внутриклеточных сигнальных систем в >Ю-зависимой экспрессии генов

Введение Диссертация по биологии, на тему "Редокс-зависимая регуляция экспрессии генов, индуцируемых окисью азота"

Любая клетка должна уметь правильно отвечать на внешние воздействия. Поскольку лишь часть генов экспрессируется конститутивно, клетка должна решать вопрос, в какой степени экспрессировать тот или иной ген. У млекопитающих подобные решения принимаются при участии внутриклеточных сигнальных систем, передающих сигнал с рецепторов на транскрипционные факторы и другие белки, регулирующие экспрессию генов. Именно так клетки отвечают на действие ростовых факторов, цитокинов, химокинов и других сигнальных молекул.

Одним из факторов межклеточной сигнализации является окись азота (N0). N0 участвует в разнообразных биологических процессах - регуляции тонуса кровеносных сосудов, иммунном ответе, агрегации тромбоцитов, возбуждении пресинаптических нейронов. Влияние N0 на экспрессию генов лишь частично связано с непосредственным действием N0 на транскрипционные факторы. В большинстве известных случаев непосредственными мишенями N0 становятся регуляторные белки, контролирующие активность транскрипционных факторов опосредовано.

В реакциях с кислородом и активными формами кислорода (АФК) N0 превращается в активные формы азота (АФА). N0 и АФА отличаются по способности реагировать с разными аминокислотными остатками и простетическими группами белков, поэтому мишени N0 и АФА различны.

Поскольку соотношение N0 и АФА в клетке зависит от концентрации кислорода и АФК, действие N0 модулируется редокс-условиями.

В обзоре литературы мы рассмотрим реакции N0 с кислородом и АФК, модификации, производимые N0 и АФА, а также рецепторы N0 и АФА, влияющие на экспрессию генов.

Заключение Диссертация по теме "Молекулярная биология", Литвинов, Дмитрий Юрьевич

выводы

1. Окись азота (N0) в хондроцитах человека стимулирует экспрессию генов mcl-1, СОХ-2 и VEGF.

2. NO-опосредованная индукция экспрессии гена VEGF в хондроцитах подавляется тиольными антиоксидантами N-ацетилцистеином и глутатионом, а также каталазой. NO-зависимая индукция экспрессии гена НО-1 в моноцитах подавляется N-ацетилцистеином, тогда как индукция IL-8 подавляется диметилтиомочевиной. Это свидетельствует об участии в NO-опосредованной экспрессии генов различных АФК.

3. NO-зависимая индукция гена IL-8 в моноцитах U937 человека подавляется ингибитором тирозиновых протеинкиназ генистеином и ингибитором МАР-протеинкиназы р38 SB 203580, что свидетельствует о возможной активации этих протеинкиназ под действием N0 и об их участии в регуляции экспрессии гена IL-8.

4. Экспрессия генов IL-8, ММР-3 и СОХ-2 в хондроцитах стимулируется dBcGMP - негидролизуемым и проникающим в клетки аналогом cGMP.

5. Экспрессия генов IL-8, ММР-3 и СОХ-2 в хондроцитах стимулируется каталазой или пероксидазой. Каталаза на уровень cGMP не влияет и действует через регуляторные механизмы, отличающиеся от активации PKG.

6. N0 в хондроцитах человека увеличивает внутриклеточную концентрацию cGMP, однако, индуцирует гены СОХ-2, НО-1 и VEGF без его участия.

7. Полученные результаты открывают возможность избирательно ингибировать ЫО-индуцированную экспресиию генов с помощью антиоксидантов и ингибиторов редокс-чувствительных сигнальных путей.

3.6. Заключение

Одна из центральных задач молекулярной биологии и геномики -выявление ответа генов на те или иные воздействия и изучение лежащих в основе этого ответа механизмов регуляции экспрессии генов. В данной работе мы выявили в хондроцитах человека характерный спектр генов, экспрессия которых чувствительна к окиси азота. Поскольку действие N0 зависит от присутствия АФК, мы изучили чувствительность эффекта NO к антиоксидантам различной природы и выявили антиоксиданты, проявляющие высокую эффективность и избирательность в отношении тех или иных генов. При этом мы обнаружили самостоятельный эффект каталазы, пероксидазы и dBcGMP на экспрессию нескольких генов. Определение уровня cGMP и ингибиторный анализ позволяют утверждать, что эффекты N0 и каталазы не связаны с активацией sGC. В тоже время, полученные данные приводят к предположению, что некоторые эффекты N0 опосредованы МАР-протеинкиназой р38 и тирозиновыми протеинкиназами. Таким образом, в результате проделанной работы мы выявили ряд факторов редокс-зависимой регуляции индукции экспрессии генов под действием N0: чувствительность к антиоксидантам и подконтрольность редокс-чувствительным сигнальным путям.

Библиография Диссертация по биологии, кандидата биологических наук, Литвинов, Дмитрий Юрьевич, Москва

1. Ванин, А. Ф. (2001). "Оксид азота: регуляция клеточного метаболизма без участия систем клеточных рецепторов" Биофизика 46(4): 631-41.

2. Северина, И. С. (1998). "Растворимая гуанилатциклаза в молекулярном механизме физиологических эффектов оксида азота" Биохимия 63(7): 794-801.

3. Турпаев, К. Т. (1998). "Роль окиси азота в передаче сигнала между клетками." Молекулярная Биология 32(4): 581-91.

4. Турпаев, К. Т. (2002). "Активные формы кислорода и регуляция экспрессии генов." Биохимия 67(3): 339-52.

5. Ahern, G. P., V. A. Klyachko and М. В. Jackson (2002). "cGMP and S-nitrosylation: two routes for modulation of neuronal excitability by NO." Trends Neurosci 25(10): 510-7.

6. Akiyama, Т., J. Ishida, S. Nakagawa, H. Ogawara, S. Watanabe, N. Itoh, M. Shibuya and Y. Fukami (1987). "Genistein, a specific inhibitor of tyrosine-specific protein kinases." J Biol Chem 262(12): 5592-5.

7. Alessi, D. R., A. Cuenda, P. Cohen, D. T. Dudley and A. R. Saltiel (1995). "PD 098059 is a specific inhibitor of the activation of mitogen-activated protein kinase kinase in vitro and in vivo." J Biol Chem 270(46): 27489-94.

8. АН, В. H. (2001). "Dimethyl sulfoxide: recent pharmacological and toxicological research." Yet Hum Toxicol 43(4): 228-31.

9. Andoh, T„ C. C. Chiueh and P. B. Chock (2003). "Cyclic GMP-dependent protein kinase regulates the expression of thioredoxin and thioredoxin peroxidase-1 during hormesis in response to oxidative stress-induced apoptosis." J Biol Chem 278(2): 885-90.

10. Aulak, K. S., M. Miyagi, L. Yan, K. A. West, D. Massillon, J. W. Crabb and D. J. Stuehr (2001). "Proteomic method identifies proteins nitrated in vivo during inflammatory challenge." Proc Natl Acad Sci U S A 98(21): 12056-61.

11. Bogdan, C. (2001). "Nitric oxide and the regulation of gene expression." Trends Cell Biol 11(2): 66-75.

12. Bruick, R. K. and S. L. McKnight (2001). "A conserved family of prolyl-4-hydroxylases that modify HIF." Science 294(5545): 1337-40.

13. Brunner, F., H. Stessel and W. R. Kukovetz (1995). "Novel guanylyl cyclase inhibitor, ODQ reveals role of nitric oxide, but not of cyclic GMP in endothelin-1 secretion." FEBS Lett 376(3): 262-6.

14. Caccia, S., I. Denisov and M. Perrella (1999). "The kinetics of the reaction between NO and 02 as studied by a novel approach." Biophys Chem 76(1): 63-72.

15. Carrero, P., K. Okamoto, P. Coumailleau, S. O'Brien, H. Tanaka and L. Poellinger (2000). "Redox-regulated recruitment of the transcriptional coactivators CREB-binding protein and SRC-1 to hypoxia-inducible factor 1 alpha." Mol Cell Biol 20(1): 402-15.

16. Casteel, D. E., S. Zhuang, T. Gudi, J. Tang, M. Vuica, S. Desiderio and R. B. Pilz (2002). "cGMP-dependent protein kinase I beta physically and functionally interacts with the transcriptional regulator TFII-I." J Biol Chem 277(35): 32003-14.

17. Chazotte-Aubert, L., P. Hainaut and H. Ohshima (2000). "Nitric oxide nitrates tyrosine residues of tumor-suppressor p53 protein in MCF-7 cells." Biochem Biophvs Res Commun 267(2): 609-13.

18. Chun, Y. S., M. S. Kim and J. W. Park (2002). "Oxygen-dependent and -independent regulation of HIF-1 alpha." J Korean Med Sci 17(5): 581-8.

19. Cobbs, C. S., M. Samanta, L. E. Harkins, G. Y. Gillespie, B. A. Merrick and L. A. MacMillan-Crow (2001). "Evidence for peroxynitrite-mediated modifications to p53 in human gliomas: possible functional consequences." Arch Biochem Biophvs 394(2): 167-72.

20. Cuenda, A., J. Rouse, Y. N. Doza, R. Meier, P. Cohen, T. F. Gallagher, P. R. Young and J. C. Lee (1995). "SB 203580 is a specific inhibitor of a MAP kinase homologue which is stimulated by cellular stresses and interleukin-1." FEBS Lett 364(2): 229-33.

21. Datta, S. R., A. Brunei and M. E. Greenberg (1999). "Cellular survival: a play in three Akts." Genes Dev 13(22): 2905-27.

22. Deahl, S. T., 2nd, L. W. Oberley, T. D. Oberley and J. H. Elwell (1992). "Immunohistochemical identification of superoxide dismutases, catalase, and glutathione-S-transferases in rat femora." J Bone Miner Res 7(2): 18798.

23. Dimmeler, S., I. Fleming, B. Fisslthaler, C. Hermann, R. Busse and A. M. Zeiher (1999). "Activation of nitric oxide synthase in endothelial cells by Akt-dependentphosphorylation." Nature 399(6736): 601-5.

24. Ding, Y., H. C. Gonick, N. D. Vaziri, K. Liang and L. Wei (2001). "Lead-induced hypertension. III. Increased hydroxyl radical production." Am J Hypertens 14(2): 169-73.

25. Dudley, D. T, L. Pang, S. J. Decker, A. J. Bridges and A. R. Saltiel (1995). "A synthetic inhibitor of the mitogen-activated protein kinase cascade." Proc Natl Acad Sci U S A 92(17): 7686-9.

26. Eiserich, J. P., M. Hristova, C. E. Cross, A. D. Jones, B. A. Freeman, B. Halliwell and A. van der Vliet (1998). "Formation of nitric oxide-derived inflammatory oxidants by myeloperoxidase in neutrophils." Nature 391(6665): 393-7.

27. Elfering, S. L., T. M. Sarkela and C. Giulivi (2002). "Biochemistry of mitochondrial nitric-oxide synthase." J Biol Chem 277(41): 38079-86.

28. Fulton, D., J. P. Gratton, T. J. McCabe, J. Fontana, Y. Fujio, K. Walsh, T. F. Franke, A. Papapetropoulos and W. C. Sessa (1999). "Regulation of endothelium-derived nitric oxide production by the protein kinase Akt." Nature 399(6736): 597-601.

29. Garcia-Villafranca, J., A. Guillen and J. Castro (2003). "Involvement of nitric oxide/cyclic GMP signaling pathway in the regulation of fatty acid metabolism in rat hepatocytes." Biochem Pharmacol 65(5): 807-12.

30. Giulivi, C. (2003). "Characterization and function of mitochondrial nitric-oxide synthase." Free Radic Biol Med 34(4): 397-408.

31. Gow, A. J., Q. Chen, D. T. Hess, B. J. Day, H. Ischiropoulos and J. S. Stamler (2002). "Basal and stimulated protein S-nitrosylation in multiple cell types and tissues." J Biol Chem 277(12): 9637-40.

32. Gow, A. J. and J. S. Stamler (1998). "Reactions between nitric oxide and haemoglobin under physiological conditions." Nature 391(6663): 169-73.

33. Gu, M., J. Lynch and P. Brecher (2000). "Nitric oxide increases p21(Wafl/Cipl) expression by a cGMP-dependent pathway that includes activation of extracellular signal-regulated kinase and p70(S6k)." J Biol Chem 275(15): 11389-96.

34. Haby, C., F. Lisovoski, D. Aunis and J. Zwiller (1994). "Stimulation of the cyclic GMP pathway by NO induces expression of the immediate early genes c-fos andjunB in PC12 cells." J Neurochem 62(2): 496-501.

35. Hart, T. W. (1985). "Some observations cocerning the S-nitroso and S-phenylsulphonyl derivatives of L-cysteine and glutathione." Tetrahedron Lett 26: 2013-6.

36. Hermes-Lima, M., P. Ponka and H. M. Schulman (2000). "The iron chelator pyridoxal isonicotinoyl hydrazone (PIH) and its analogues prevent damage to 2-deoxyribose mediated by ferric iron plus ascorbate." Biochim Biophys Acta 1523(2-3): 154-60.

37. Hess, D. T., A. Matsumoto, R. Nudelman and J. S. Stamler (2001). "S-nitrosylation: spectrum and specificity." Nat Cell Biol 3(2): E46-9.

38. Hooper, D. C., S. T. Ohnishi, R. Kean, Y. Numagami, B. Dietzschold and H. Koprowski (1995). "Local nitric oxide production in viral and autoimmune diseases of the central nervous system." Proc Natl Acad Sci U SA 92(12): 5312-6.

39. Huang, L. E., W. G. Willmore, J. Gu, M. A. Goldberg and H. F. Bunn (1999). "Inhibition of hypoxia-inducible factor 1 activation by carbon monoxide and nitric oxide. Implications for oxygen sensing and signaling." J Biol Chem 274(13): 9038-44.

40. Jaffrey, S. R., H. Erdjument-Bromage, C. D. Ferris, P. Tempst and S. H. Snyder (2001). "Protein S-nitrosylation: a physiological signal for neuronal nitric oxide." Nat Cell Biol 3(2): 193-7.

41. Ji, Y. and B. M. Bennett (2003). "Activation of microsomal glutathione s-transferase by peroxynitrite." Mol Pharmacol 63(1): 136-46.

42. Kirkman, H. N., M. Rolfo, A. M. Ferraris and G. F. Gaetani (1999). "Mechanisms of protection of catalase by NADPH. Kinetics and stoichiometry." J Biol Chem 274(20): 13908-14.

43. Kirsch, M. and H. de Groot (2002). "Formation of peroxynitrite from reaction of nitroxyl anion with molecular oxygen." J Biol Chem 277(16): 13379-88.

44. Kirsch, M., H. G. Korth, R. Sustmann and H. de Groot (2002). "The pathobiochemistry of nitrogen dioxide." Biol Chem 383(3-4): 389-99.

45. Koesling, D. and A. Friebe (1999). "Soluble guanylyl cyclase: structure and regulation." Rev Physiol Biochem Pharmacol 135: 41-65.

46. Kuncewicz, T., E. A. Sheta, I. L. Goldknopf and B. C. Kone (2003). "Proteomic analysis of S-nitrosylated proteins in mesangial cells." Mol Cell Proteomics 1: 1.

47. Lander, H. M., D. P. Hajjar, B. L. Hempstead, U. A. Mirza, B. T. Chait, S. Campbell and L. A. Quilliam (1997). "A molecular redox switch on p21(ras). Structural basis for the nitric oxide-p21 (ras) interaction." J Biol Chem 272(7): 4323-6.

48. Landmesser, U. and H. Drexler (2002). "Toward understanding of extracellular superoxide dismutase regulation in atherosclerosis: a novel role of uric acid?" Arterioscler Thromb Vase Biol 22(9): 1367-8.

49. Lando, D., D. J. Peet, D. A. Whelan, J. J. Gorman and M. L. Whitelaw (2002). "Asparagine hydroxylation of the HIF transactivation domain a hypoxic switch." Science 295(5556): 858-61.

50. Lee, E., S. Yim, S. K. Lee and H. Park (2002). "Two transactivation domains of hypoxia-inducible factor-lalpha regulated by the MEK-l/p42/p44 MAPK pathway." Mol Cells 14(1): 9-15.

51. Li, S. and A. R. Whorton (2003). "Regulation of protein tyrosine phosphatase IB in intact cells by S-nitrosothiols." Arch Biochem Biophys 410(2): 269-79.

52. Liu, S. X., M. Athar, I. Lippai, C. Waldren and T. K. Hei (2001). "Induction of oxyradicals by arsenic: implication for mechanism of genotoxicity." Proc Natl Acad Sci U S A 98(4): 1643-8.

53. Liu, X., M. J. Miller, M. S. Joshi, D. D. Thomas and J. R. Lancaster, Jr. (1998). "Accelerated reaction of nitric oxide with 02 within the hydrophobic interior of biological membranes." Proc Natl Acad Sci U S A 95(5): 2175-9.

54. Luchsinger, B. P., E. N. Rich, A. J. Gow, E. M. Williams, J. S. Stamler and D. J. Singel (2003). "Routes to S-nitroso-hemoglobin formation with heme redox and preferential reactivity in the beta subunits." Proc Natl Acad Sci U SA 100(2): 461-6.

55. MacMillan-Crow, L. A., J. S. Greendorfer, S. M. Vickers and J. A. Thompson (2000). "Tyrosine nitration of c-SRC tyrosine kinase in human pancreatic ductal adenocarcinoma." Arch Biochem Biophys 377(2): 350-6.

56. Mahon, P. C., K. Hirota and G. L. Semenza (2001). "FIH-1: a novel protein that interacts with HIF-1 alpha and VHL to mediate repression of HIF-1 transcriptional activity." Genes Dev 15(20): 2675-86.

57. Mallozzi, C., A. M. Di Stasi and M. Minetti (1999). "Activation of src tyrosine kinases by peroxynitrite." FEBS Lett 456(1): 201-6.

58. Mallozzi, C., M. A. Di Stasi and M. Minetti (2001). "Peroxynitrite-dependent activation of src tyrosine kinases lyn and hck in erythrocytes is under mechanistically different pathways of redox control." Free Radic Biol Med 30(10): 1108-17.

59. Marshall, H. E. and J. S. Stamler (2001). "Inhibition of NF-kappa B by S-nitrosylation." Biochemistry 40(6): 1688-93.

60. Matsumoto, K., H. Aizawa, H. Inoue, H. Koto, S. Fukuyama and N. Hara (2000). "Effect of dimethylthiourea, a hydroxyl radical scavenger, on cigarette smoke-induced bronchoconstriction in guinea pigs." Eur J Pharmacol 403(1-2): 157-61.

61. Mazure, N. M., M. C. Brahimi-Horn and J. Pouyssegur (2003). "Protein kinases and the hypoxia-inducible factor-1, two switches in angiogenesis." Curr Pharm Pes 9(7): 531-41.

62. Murphy, M. E. and H. Sies (1991). "Reversible conversion of nitroxyl anion to nitric oxide by superoxide dismutase." Proc Natl Acad Sci U S A 88(23): 10860-4.

63. Palmer, L. A., B. Gaston and R. A. Johns (2000). "Normoxic stabilization of hypoxia-inducible factor-1 expression and activity: redox-dependent effect of nitrogen oxides." Mol Pharmacol 58(6): 1197-203.

64. Park, H. S., S. H. Huh, M. S. Kim, S. H. Lee and E. J. Choi (2000). "Nitric oxide negatively regulates c-Jun N-terminal kinase/stress-activated protein kinase by means of S-nitrosylation." Proc Natl Acad Sci U S A 97(26): 14382-7.

65. Patterson, C. E. and R. A. Rhoades (1988). "Protective role of sulfhydryl reagents in oxidant lung injury." Exp Lung Res 14(Suppl): 1005-19.

66. Radi, R., G. Peluffo, M. N. Alvarez, M. Naviliat and A. Cayota (2001). "Unraveling peroxynitrite formation in biological systems." Free Radic Biol Med 30(5): 463-88.

67. Sampson, J. B., Y. Ye, H. Rosen and J. S. Beckman (1998). "Myeloperoxidase and horseradish peroxidase catalyze tyrosine nitration in proteins from nitrite and hydrogen peroxide." Arch Biochem Biophys 356(2): 207-13.

68. Sauzeau, V., M. Rolli-Derkinderen, C. Marionneau, G. Loirand and P. Pacaud (2003). "RhoA Expression Is Controlled by Nitric Oxide through cGMP-dependent Protein Kinase Activation." J Biol Chem 278(11): 9472- 80.

69. Scheid, M. P. and J. R. Woodgett (2001). "PKB/AKT: functional insights from genetic models." NatRevMol Cell Biol 2(10): 760-8.

70. Schieke, S. M., K. Briviba, L. O. Klotz and H. Sies (1999). "Activation pattern of mitogen-activated protein kinases elicited by peroxynitrite: attenuation by selenite supplementation." FEBS Lett 448(2-3): 301-3.

71. Schonhoff, C. M„ M. C. Daou, S. N. Jones, C. A. Schiffer and A. H. Ross2002). "Nitric oxide-mediated inhibition of Hdm2-p53 binding." Biochemistry 41(46): 13570-4.

72. Schonhoff, C. M., B. Gaston and J. B. Mannick (2003). "Nitrosylation of cytochrome c during apoptosis." J Biol Chem 19: 19.

73. Semenza, G. (2002). "Signal transduction to hypoxia-inducible factor 1." Biochem Pharmacol 64(5-6): 993-8.

74. Sen, C. K. (2001). "Update on thiol status and supplements in physical exercise." Can J Appl Physiol 26(Suppl): S4-12.

75. Serio, R., M. G. Zizzo and F. Mule (2003). "Nitric oxide induces muscular relaxation via cyclic GMP-dependent and -independent mechanisms in the longitudinal muscle of the mouse duodenum." Nitric Oxide 8(1): 48-52.

76. Sharpe, M. A. and C. E. Cooper (1998). "Reactions of nitric oxide with mitochondrial cytochrome c: a novel mechanism for the formation of nitroxyl anion and peroxynitrite." Biochem J 332(Pt 1): 9-19.

77. Soh, J. W., Y. Mao, L. Liu, W. J. Thompson, R. Pamukcu and I. B. Weinstein (2001). "Protein kinase G activates the JNK1 pathway via phosphorylation of MEKK1." J Biol Chem 276(19): 16406-10.

78. Stamler, J. S., S. Lamas and F. C. Fang (2001). "Nitrosylation. the prototypic redox-based signaling mechanism." Cell 106(6): 675-83.

79. Sumbayev, V. V., A. Budde, J. Zhou and B. Brune (2003). "HIF-1 alpha protein as a target for S-nitrosation." FEBS Lett 535(1-3): 106-12.

80. Sun, J., C. Xin, J. P. Eu, J. S. Stamler and G. Meissner (2001). "Cysteine-3635 is responsible for skeletal muscle ryanodine receptor modulation by NO." Proc Natl Acad Sei U S A 98(20): 11158-62.

81. Tao, L. and A. M. English (2003). "Mechanism of S-Nitrosation of Recombinant Human Brain Calbindin D(28K)." Biochemistry 42(11): 3326-34.

82. Tatosyan, A. G. and O. A. Mizenina (2000). "Kinases of the Src family: structure and functions." Biochemistry (Mosc) 65(1): 49-58.

83. Taylor, M. S. (2001). "Characterization and comparative analysis of the EGLN gene family." Gene 275(1): 125-32.

84. Thomas, D. D, M. G. Espey, M. P. Vitek, K. M. Miranda and D. A. Wink (2002). "Protein nitration is mediated by heme and free metals through Fenton-type chemistry: an alternative to the N0/02- reaction." Proc Natl Acad Sci U S A 99(20): 12691-6.

85. Wang, Q. and C. M. Doerschuk (2000). "Neutrophil-induced changes in the biomechanical properties of endothelial cells: roles of ICAM-1 and reactive oxygen species." J Immunol 164(12): 6487-94.

86. Wiener, C. M., G. Booth and G. L. Semenza (1996). "In vivo expression of mRNAs encoding hypoxia-inducible factor 1." Biochem Biophys Res Commun 225(2): 485-8.

87. Wolin, M. S, (2000). "Interactions of oxidants with vascular signaling systems." Arterioscler Thromb Vase Biol 20(6): 1430-42.

88. Yu, A. Y., M. G. Frid, L. A. Shimoda, C. M. Wiener, K. Stenmark and G. L. Semenza (1998). "Temporal, spatial, and oxygen-regulated expression of hypoxia-inducible factor-1 in the lung." Am J Physiol 275(4 Pt 1): L818-26.

89. Yu, F., S. B. White, Q. Zhao and F. S. Lee (2001). "Dynamic, site-specific interaction of hypoxia-inducible factor-1 alpha with the von Hippel-Lindau tumor suppressor protein." Cancer Res 61(10): 4136-42.

90. Zhu, B. Z., H. T. Zhao, B. Kalyanaraman and B. Frei (2002). "Metal-independent production of hydroxyl radicals by halogenated quinones and hydrogen peroxide: an ESR spin trapping study." Free Radic Biol Med 32(5): 465-73.

91. Zundel, W., C. Schindler, D. Haas-Kogan, A. Koong, F. Kaper, E. Chen, A. R. Gottschalk, H. E. Ryan, R. S. Johnson, A. B. Jefferson, D. Stokoe and A. J. Giaccia (2000). "Loss of PTEN facilitates HIF-1-mediated gene expression." Genes Dev 14(4): 391-6.

92. СПИСОК РАБОТ, ОПУБЛИКОВАННЫХ ПО ТЕМЕ ДИССЕРТАЦИИ

93. Turpaev К., Litvinov D., Dubovaya V., Panasyuk A., Ivanov D., Prassolov V. (2001) Induction of vascular endothelial growth factor by nitric oxide in cultured human articular chondrocytes. Biochimie, 83(6), 515-522.

94. Литвинов Д.Ю., Дубовая В.И., Васильев М.Г., Лекишвили М.В., Прасолов B.C., Турпаев К.Т. (2003) Влияние каталазы на экспрессию no-зависимых генов в первичных хондроцитах. Молекулярная биология, 37(3)

95. Turpaev К., Litvinov D., Justesen J. (2003) Redox modulation of N0-dependent induction of interleukin 8 gene in monocytic U937 cells. Cytokine, 21,1. БЛАГОДАРНОСТИ

96. Я выражаю глубокую благодарность и искреннюю признательность Кириллу Тиграновичу Турпаеву за руководство и поддержку в работе, и Льву Львовичу Киселеву за внимательное и ценное обсуждение результатов.

97. Спасибо Виктору Васильевичу Петухову за высококвалифицированную инженерную помощь.

98. Работа поддержана грантами федеральной подпрограммы "Геном человека" и РФФИ 00-04-49059, 03-04-49367, РФФИ MAC 02-04-06569.