Молекулярно-генетическое исследование псориаза

Галимова, Эльвира Сафуановна

Бесплатный автореферат и диссертация по биологии на тему
Молекулярно-генетическое исследование псориаза
ВАК РФ 03.00.15, Генетика

Автореферат диссертации по теме "Молекулярно-генетическое исследование псориаза"

Han,

прща^рукописи

□□3455991

ГАЛИМОВА ЭЛЬВИРА САФУАНОВНА

МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ

ПСОРИАЗА

03.00.15-генетика

АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук

а* №

УФА-2008

003455991

Работа выполнена в Институте биохимии и генетики Уфимского научного центра РАН

Научный руководитель: доктор биологических наук, профессор

Хуснутдинова Эльза Камилевна

Официальные оппоненты: доктор медицинских наук, профессор

Бахтиярова Клара Закиевна ГОУ ВПО Башкирский государственный медицинский университет

доктор биологических наук, профессор Носиков Валерий Вячеславович ФГУП «ГосНИИ генетика»

Ведущая организация: Институт общей генетики РАН

им. Н.И.Вавилова

Защита диссертация состоится « 24 » декабря 2008 г. в

часов на заседании

Объединенного диссертационного совета ДМ 002.133.01 при Институте биохимии и генетики Уфимского научного центра РАН по адресу: 450054, Уфа, просп. Октября, 71.

С диссертацией и авторефератом можно ознакомиться в Научной библиотеке Уфимского научного центра РАН, по адресу: 450054, Уфа, просп. Октября, 71 и на сайте Института биохимии и генетики: http://www.anrb.ru/moleen/dissov.html

Автореферат разослан « 24 » ноября 2008 г.

Ученый секретарь Диссертационного совета

Бикбулатова С.М.

ОБЩАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА РАБОТЫ

Актуальность проблемы. Псориаз - один из наиболее распространенных хронических воспалительных дерматозов, характеризующийся гиперпролиферацией эпидермиса и нарушением кератинизации [Скрипкин Ю.К., 2005]. Известно, что псориазом страдают 0,3-7 % населения во всем мире [Campalani et al., 2005]. Согласно последним данным Международной Организации Псориаза, 125 миллионов людей в мире имеют псориаз. Псориаз представляет собой системный процесс с выраженными функциональными и морфологическими изменениями ряда органов и систем организма. Приблизительно у 15-40% больных псориазом развивается псориатический артрит, приводящий нередко к инвалидизации. В связи со значительной распространенностью заболевания, хроническим и тяжелым течением, несовершенством имеющихся методов лечения, неясностью этиологии и патогенеза, проблема псориаза является одной из актуальных в медицине.

В настоящее время признана точка зрения, согласно которой псориаз является Т-клеточно-опосредованным заболеванием с преобладанием Thl цитокинового профиля. Аутоиммунные изменения характеризуются первичным вовлечением в процесс Т-лимфоцитов и вторичной активацией и пролиферацией кератиноцитов [Bowcock et al., 2005]. Псориаз - многофакторное заболевание, на развитие которого влияют как генетические факторы, так и факторы внешней среды. Генетические факторы доминируют над средовыми, о чем свидетельствуют высокие значения коэффициента наследуемости псориаза [Bowcock et al., 2005].

Проведенные исследования выявили ассоциацию и сцепление 19 геномных локусов с псориазом, при этом максимальный LOD-балл был получен для локуса PSORS1 в хромосомном регионе 6р21.3 главного комплекса гистосовместимости (MHCI), где идентифицировано 10 генов - HLA-C, HCG27, OTF-8, TCF19, HCR, SPR1, CDSN, SEEK1, STG, HCG22 [Nair et al., 2006]. Кроме того, возможно участие в формировании предрасположенности к псориазу генов, расположенных за пределами MHCI: гены цитокинов (факторы некроза опухоли - TNFA и TNFB и ряд интерлейкинов, в частности, IL1,семейство генов IL10, IL23), ген CTLA4, семейство генов S¡00 [Bowcock et al., 2005].

При молекулярно-генетических исследованиях любого многофакторного признака принципиально важным является учет этнической принадлежности обследованных лиц

[Bishop, Sham, 2000]. Генетическая структура этноса включает сумму частот самых разных генов, а частота того или иного генотипа является результатом отбора по какому-либо признаку, зависящему от социально-демографических, климатических и прочих факторов.

Идентификация специфичных генов, вовлеченных в патогенез псориаза, будет способствовать формированию фундаментальных представлений о генетических, иммунных и патогенетических аспектах псориаза. И как следствие, понимание генетических механизмов развития заболевания имеет существенное значение для определения подходов к профилактике псориаза в отягощенных семьях и для разработки оптимальных и эффективных методов терапии.

В соответствии с вышеизложенным были поставлены цель и задачи исследования. Цель исследования — изучение роли генов главного комплекса гисгосовместимости и генов семейства Толл-нодобных рецепторов в формировании предрасположенности к псориазу. Задачи исследования

Провести у больных псориазом и здоровых индивидов:

1. Анализ распределения частот аллелей и генотипов полиморфных локусов Cw6 гена HLA-C, G305A, С307Т, С325Т, Т477С, G1723T, A1911G, C2327G гена HCR, С1243Т гена CDSN и G308A гена TNFA главного комплекса гисгосовместимости (МНС).

2. Анализ ассоциаций исследованных полиморфных вариантов генов H LA-С, HCR, CDSN и TNFA с риском развития псориаза у индивидов с учетом этнической принадлежности, клинических форм и возраста начала развития болезни.

3. Анализ неравновесия по сцеплению между полиморфными локусами генов HLA-C, HCR, CDSN и TNFA.

4. Анализ ассоциаций гаплотипов полиморфных локусов генов HLA-C, HCR, CDSN и TNFA с псориазом.

5. Оценку роли межгенных взаимодействий в формировании предрасположенности к псориазу.

6. Анализ ассоциаций полиморфных локусов генов HLA-C, HCR, CDSN и TNFA с риском развития псориаза в семьях с повторными и множественными случаями псориаза с помощью теста на неравновесную передачу.

7. Исследование полиморфных вариантов генов семейства То11-подобных рецепторов TLR с использованием SNPlex платформы (Applied Biosystems).

Научная новизна исследования. Впервые создан банк ДНК больных псориазом и здоровых индивидов четырех этнических групп, проживающих на территории России -русских, татар, башкир и хакасов, общей численностью 1222 индивида. Впервые проведен молекулярно-генетический анализ полиморфных локусов генов HLA-C, HCR, CDSN и TNFA у больных псориазом и здоровых индивидов. Определены генетические маркеры риска развития заболевания у индивидов с учетом этнической принадлежности, клинических форм и возраста начала развития псориаза и оценена роль взаимодействия изученных генов в формировании предрасположенности к псориазу. Выявлен гаплотип по полиморфным локусам генов PSORS1, ассоциированный с риском развития псориаза у лиц русской, татарской и хакасской этнической принадлежности. Получены данные об ассоциации полиморфных вариантов генов PSORS1 с риском развития псориаза в семьях с повторными и множественными случаями псориаза. Впервые проведено исследование 48 полиморфных вариантов генов семейства То11-подобных рецепторов - TLR (1-10) с использованием SNPlex платформы (Applied Biosystems) и установлено, что полиморфные варианты генов TLR3 и TLR7 маркируют повышенный риск развития псориаза у лиц русской и татарской этнической принадлежности.

Научно - практическая значимость работы. Результаты работы вносят вклад в общее представление о генетических основах предрасположенности к псориазу. Получены новые данные о влиянии исследуемых ДНК-локусов на риск развития псориаза у индивидов с учетом этнической принадлежности, клинических форм и возраста началк развития болезни. В клинической практике тестирование полиморфных вариантов генов-кандидатов псориаза может быть применено для определения подходов к профилактике псориаза в отягощенных семьях и для разработки оптимальных и эффективных методов терапии. Данные диссертационной работы могут послужить основой для последующих исследований по определению генетических факторов риска развития псориаза. Результаты исследования могут бьгть использованы при чтении спецкурсов на факультетах биологии, в медицинских высших образовательных учреждениях, на курсах повышения квалификации медицинских работников.

Апробация диссертации. Результаты исследования были представлены на ежегодных международных конференциях Европейского общества генетиков человека

(Прага, 2005; Амстердам, 2006; Ницца, 2007; Барселона, 2008), международной конференции «Генетика в России и мире» (Москва, 2006), 5 Всемирном конгрессе по иммунопатологии и аллергии (Москва, 2007), ежегодных международных конгрессах Европейской Академии дерматологии и венерологии (Родос, 2006; Венна, 2007; Париж, 2008), школе-семинаре «Биомика-наука XXI века» (Уфа, 2007).

Конкурсная поддержка работы. Исследования выполнены в рамках Программы фундаментальных исследований Президиума РАН «Фундаментальные науки -медицине», РФФИ № 07-04-12045офи и РГНФ № 08-06-84605 А/У.

Публикации. По материалам диссертации опубликовано 12 работ, из них 2 - в изданиях, рекомендованных ВАК.

Структура и объем диссертации. Работа изложена на 157 страницах машинописного текста. Состоит из введения, обзора литературы, описания материалов и методов исследования, результатов и их обсуждения, заключения, выводов и библиографического списка (включает 170 работ отечественных и зарубежных авторов). Диссертация иллюстрирована 26 рисунками и 37 таблицами.

МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ Материалы исследования. В работе использованы образцы ДНК 1222 индивидов, из них - 552 больных псориазом, состоящих на учете и находящихся на стационарном лечении в Республиканских кожно-венерологических диспансерах г.Уфа, г.Сибай, г.Кумертау Республики Башкортостан, г.Краснодар и г.Абакан, г.Черногорск Республики Хакасия в 2004-2008 гг. Выборку больных составили неродственные между собой пациенты в возрасте от 3 до 80 лет русской, татарской, башкирской и хакасской этнической принадлежности. Клиническое обследование проведено врачами отделений, которое включало в себя сбор жалоб и анамнеза, физикальные, лабораторные и инструментальные методы диагностики. В диагностике псоришического артрита использовалось рентгенографическое исследование суставов и позвоночника, а также анализ крови для определения ревматоидного фактора в крови пациента и исключения ревматоидного артрита. Контрольная группа была сформирована из 670 здоровых неродственных индивидов, соответствующих выборке больных по возрасту, полу и этнической принадлежности.

Методы исследования. ДНК была выделена из лимфоцитов периферической крови методом фенольно-хлороформной экстракции (Mathew С. et al., 1984). Анализ полиморфных ДНК-локусов МНС проводили методом полимеразной цепной реакции синтеза ДНК и полиморфизма длин ресгрикционных фрагментов с последующим электрофорезом в 7% полиакриламидном геле и визуализацией в проходящем УФ-свете после окрашивания гелей бромистым этидием. Генотилирование 48 SNPs генов семейства То11-подобных рецепторов было осуществлено с использованием SNPlex платформы согласно протоколу (SNPlex Genotyping System 48-plex Protocol) компании Applied Biosystems. SNPlex технология основана на методе лигирования синтетических олигонуклеотидных зондов (OLA). Электрофоретический анализ меченных одношггевых фрагментов ДНК провели на автоматическом секвенаторе ABI 3730x1 DNA Analyzer (Applied Biosystems).

Статистическая обработка полученных данных проводилась с использованием пакета прикладных программ Genepop 3.3 [Raymond and Rousset, 1995], «Statistic for Windows 6.0» (StatSoft), MS Excel 2003 (Microsoft) и RxC (Rows x Columns) [Roff D., Bentzen P., 1989]. При сравнении частот аллелей и генотипов в группах больных и здоровых лиц применялся критерий точный критерий Фишера и критерий '¿ с поправкой Йетса для таблиц сопряженности 2x2. Силу ассоциаций генотипических характеристик с риском развития псориаза оценивали по значениям показателя отношения шансов (odds ratio, OR) [Schlesselman J., 1982]. При оценке неравновесия по сцеплению каждой пары локусов использовался коэффициент D' [Lewontin, 1984], рассчитанный в программе EMLD и 2LD. Величины коэффициента D' неравновесия по сцеплению были визуализированы графически с помощью программы GOLD [Abccasis G. ànd Cookson W., 2000]. Для реконструкции гаплотипов и оценки их частот применяли программы Chaplin 1.2.2 [Epstein M. and Satten G., 2003] и Zaykin [Zaykin, 2002]. При анализе межгенных взаимодействий использовали метод GMDR [Lou, 2007]. Анализ ассоциаций полиморфных локусов генов HLA-C, HCR, CDSN и TN F А с риском развития псориаза в семьях с повторными и множественными случаями псориаза провели с помощью теста на неравновесную передачу [Spielman R., 1993]. Данные SNPlex генотипирования анализировали с помощью программы Genemapper 3.7. (Applied Biosystems).

РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ 1. Анализ ассоциаций полиморфных локусов генов HLA-C, HCR и CDSN хромосомного региона PSORS1 (6р21 J) и TNFA с развитием псориаза Анализ ассоциации полиморфного локуса Cw6 гена HLA-C с псориазом. Бьшо показано, что некоторые аминокислотные замены в полиморфных участках молекул HLA-C могут влиять на структурные изменения, значимые для образования «карманов», в которых связываются определенные презентируемые пептиды [Nair et al., 2006]. Эти изменения могут полностью нарушать правильное связывание конкретного пептида, препятствуя его успешной презентации, а также влиять на корректное физиологическое распознавание комплекса «пептид-молекула HLA» Т-клетками.

При сравнении распределения частот аллелей и генотипов полиморфного локуса Cw6 гена HLA-C между группой больных псориазом и контрольной выборкой в целом, с учетом этнической принадлежности, клинических форм и возраста начала развития болезни выявлены достоверно значимые различия (рис.1).

В больны© □ контроль

Cw6-/Cw6- Cw6+/Cw6- Cw6+/cw6+ cw6 Cw6+

Рис. 1. Распределение частот аллелей и генотипов полиморфного локуса С\ч6 гена Н1Л-С у больных псориазом и здоровых доноров в целом

В группе больных псориазом отмечено статистически достоверное увеличение частоты гомозиготного генотипа НЬА-См>6+1См/6+, на долю которого приходилось 17.2% по сравнению с контрольной группой, где частота данного генотипа достигала лишь 5.07% (х2=45.92, р«0.000). Установлено, что аллель Н1А-С™6+ маркирует повышенный риск развития псориаза в изученных группах (рис. 1).

Анализ ассоциаций полиморфны!; локусов G305A, С307Т, C32ST, Т477С, G1723T, AI911G, C2327G гена HCR с псориазом. Ген HCR кодирует белок, участвующий в иммунной регуляции кожи. Установлено, что SNPs в кодирующих последовательностях гена HCR изменяют вторичную структуру белка HCR что может сказаться на его биохимических свойствах, и, следовательно, привести к модуляции функционирования белкового продукта и развитию псориатического фенотипа [Asumalahti et al., 2002].

При сравнении распределения частот аллелей и генотипов вышеуказанных полиморфных локусов гена HCR между группой больных псориазом и контрольной выборкой в целом, с учетом этнической принадлежности, клинических форм и возраста начала развития болезни выявлены достоверно значимые различия (р<0.001). Исключение составил полиморфный локус HCR-G305A гена HCR, который не показал существенную ассоциацию с псориазом (р>0.05).

Выявлен более высокий риск развития псориаза у русских с гомозиготным HCR-1723*Т/1723*Т генотипом (OR=4.96, 95%С1 2.14-11.9), у татар с гомозиготным HCR-325*Т/325*Т генотипом (OR=5.83, 95%С1 1.50-6.41), у башкир с гомозиготным HCR-1723*Т/1723*Т генотипом (OR=4.94, 95%С1 1.66-15.69) и у хакасов с гетерозиготным HCR-325* С/325 * Т генотипом (OR=5.42, 95%С1 2.47-12.01) (рис. 2).

OR=S.A2

русские 1723*Т/1723*Т

татары 325*Т/325Т

башкиры 1723*Т/1723*Т

хакасы 325"»325*Т

Рис. 2. Распределение частот генотипов полиморфных локусов гена HCR у лиц разной этнической принадлежности

Аллель HCR-325*T является маркером более высокого риска развития заболевания у больных вульгарным псориазом и I типом заболевания (OR=3.9 и OR=4.3, р=0.0005, соответственно), аллель HCR-1723*T - у больных псориатическим артритом и II типом заболевания (OR=3.21 и C>R=3.07, р=0.0005).

Анализ ассоциаций полиморфного локуса С1243Т гена CDSN с псориазом. Ген S (CDSN), кодирующий белок корнеодесмозин, экспрессируется в эпидермальных кератиноцитах гранулярного слоя эпидермиса. Предполагается, что полиморфный вариант С1243Т может быть важным в развитии псориатического фенотипа за счет модуляции уровня экспрессии и изменения стабильности мРНК CDSN гена и, видимо, отвечает за развитие процесса повреждающего шелушения, характерного для псориаза [Ahnim et al, 1999]. Установлена ассоциация аллеля 1243*С и гомозиготного генотипа 1243*С/С гена CDSN с вульгарным псориазом и началом развития заболевания до 40 лет (OR=1.62, 95%С1 1.3-1.9, р=0.0005 и OR=1.68, 95%С1 1.3-2.04, р=0.0005, соответственно) (рис.3).

Рис. 3. Распределение частот аллеля 1243*С и генотипа 1243*С/С полиморфного локуса С1243Т гена CDSN в изученных группах

Аллель 1243*С гена С£)5Л' маркирует риск развития псориаза у индивидов русской и татарской этнической принадлежности (СЖ=1.79, 95%С1 1.4-2.3 и (Ж=1.56, 95%С1 1.04-2.3, соответственно).

Анализ ассоциаций полиморфного локуса ОЗОЯА гена ПУРА с псориазом.

а больные □ контроль

русские 1243*С татары 1243*С вульгарный <40лет

псориаз 1243*С 1243*С/1243*С

Гиперплазия кератиноцитов может быть обусловлена дисбалансом ци гокинов, ростовых

факторов и их рецепторов, отвечающих за эпвдермальную пролиферацию. На линиях В-клеток человека показано, что полиморфизм в положении -308 промоторного участка гена TNFA, характеризующийся заменой гуанина на аденин, ассоциирован с повышенной экспрессией гена in vitro: присутствие аллеля А связано с повышенной продукцией цитокина по сравнению с аллелем G [Wilson A., 1997).

Сопоставление распределения частот аллелей и генотипов полиморфного локуса G308A гена TNFA между группой больных псориазом и контрольной выборкой в целом, с учетом этнической принадлежности, клинических форм и возраста начала развития болезни не выявило достоверно значимых различий (р>0.05).

2. Анализ неравновесия по сцеплению между парами маркеров генов HLA-C,

HCR и CDSN хромосомного региона PSORS1 и TNFA главного комплекса гистосовместимости (МНС)

Одной из причин ассоциации может быть неравновесие по сцеплению между маркерным локусом и локусом болезни. Неравновесное сцепление предполагает, что ассоциированный аллель находится на предковой хромосоме в непосредственной близости от причинного гена болезни, и эта связь не была нарушена рекомбинациями за время существования популяции. Мы провели анализ неравновесия по сцеплению между парами маркеров генов HLA-C, HCR, CDSN и TNFA в выборках больных псориазом и здоровых индивидов в целом и с учетом этнической принадлежности. При оценке неравновесия по сцеплению каждой пары локусов использовался коэффициент D' [Lewontin, 1984], рассчитанный в программе EMLD и 2LD. Величины коэффициента D1 неравновесия по сцеплению были визуализированы графически с помощью программы GOLD. Цвета соответствуют степеням неравновесия по сцеплению между маркерами: красный цвет указывает на максимальные значения D', тогда как синий - на минимальные значения D' (рис. 4). Анализ неравновесия по сцеплению в выборках больных и здоровых доноров в целом выявил, что все аллели 305*А, 307*Т, 325*Т, 477*С, 1723*Т, 191 l*G, 2327*G гена HCR находятся в сильном неравновесии по сцеплению как между собой (D'>0.51), так и аллелем Cw6+ гена HLA-C (D'>0.53). При этом показано единственное сниженное значение D' между HLA-Cw6+ и HCR-477*C (D-0.24,1^=0.002) (рис. 4).

CDSN*12<3C ЕСКП327С

HCK*1911Ç

HCR* 1723T

HCR-477C HCR" 3Î5T HCR*307T

HCR*305A

HLA-Cw*6+ TNTA*308G

I>TA*308G ! HCR'ÎOSA | HCR*325T I HCR*I 723T | HCR*232TC |

HLA-Cw*6+ HCR*307T HCR-477C HCR*1911G CDSN4143C

Рис. 4. График неравновесного сцепления между полиморфными локусами генов TNFA, HLA-C, HCR и CDSN в группах больных псориазом и здоровых индивидов в целом

В то же время величина неравновесия по сцеплению для других пар аллелей Cw6+/CDSN-I243*С, HCR-307*T/CDSN-1243*C, HCR-325*TICDSN-1243*C и HCR-1723*Т/С DSN-1243* С была высокой (D'>0.37), а между аллелями HCR-477*C!CDSN-1243*С, HCR-1911*G/CDSN-1243*C и HCR-2327*G!CDSN-1243*C - низкой (D'<0.20). Тем самым можно предположить прошедшие hot-spot рекомбинации между генами HLA-С и HCR с одной стороны, HCR и CDSN- с другой стороны. Видимо, также прошедшие рекомбинации снизили выраженность ассоциации аллелей 477*С, 191 I*G и 2327*G гена HCR с псориазом (OR=1.50, OR=1.9 и OR=2.8). Наши результаты согласуются с данными, которые были получены международным консорциумом при исследовании 419 семей с псориазом из шести популяций [Asumalahti et al., 2002] и учеными из Великобритании [Capon et al., 2003].

3. Реконструкция и анализ гаолотипов полиморфных локусов генов HLA-C, HCR и CDSN хромосомного региона PSORS1 (6р21.3)

Анализ гаплотипов обладает огромным потенциалом для точного и эффективного выявления генов наследственной предрасположенности к многофакторным заболеваниям. В ассоциативных исследованиях рекомбинации между маркерными SNPs и аллелями, причинно связанными с заболеваниями, будут «размывать» неравновесие по сцеплению между ними, и снижать выраженность ассоциации [Воевода М.И., 2006]. С другой стороны, гаплотипы, которые, например, определяются двумя SNPs маркерами, фланкирующими аллель ассоциированный с заболеванием, с большей вероятностью останутся сцепленными с этим аллелем, чем каждый из SNP по отдельности. Важно также и то, что многие расположенные рядом SNPs могут встречаться в составе одного гаплотипа благодаря неравновесию по сцеплепию. В связи с этим для идентификации таких гаплотипов можно генотипировать только часть SNPs, так называемые SNPs, маркирующие гаплотип. Данный подход позволяет существенно сократить временные и материальные затраты на генотипирование и соответственно уменьшить число независимых переменных в анализе.

На основе генотипических данных больных псориазом и здоровых индивидов по полиморфным локусам Cw6 гена HLA-C, С307Г, С325Т, Т477С, G1723T, A1911G, C2327G гена HCR, С1243Т гена CDSN были реконструированы гаплотипы и оценены их частоты с помощью двух программ Chaplin 1.2.2 и Zaykin. Показано, что рисковый гаплотип 255 ассоциирован с риском развития псориаза у больных русской, татарской и хакасской этнической принадлежности (OR=7.6 95%С1 4.0-14.9, OR=5.05 95%С1 1.8-14, OR=3.3 95%С1 1.3-8.2, соответственно, р<0.05). Гаплотипы 16,- 17, 20, 21 маркируют пониженный риск развития псориаза у лиц русской, татарской и хакасской этнической принадлежности. Гаплотип повышенного риска характеризуется одновременным присутствием всех рисковых аллелей полиморфных локусов генов HLA-C, HCR и CDSN (табл. 1), что может быть обусловлено, прежде всего, высокими значениями неравновесия по сцеплению аллеля HLA-Cw6+ с аллелями 307*Т, 325*Т, 477*С, 1723*Т, 191i*G, 2327*0 гена HCR и с аллелем 1243*С гена CDSN (D'>0.51). При этом аллели, между которыми наблюдается низкие значения неравновесия по сцеплению (D'<0.20) тоже входят в состав этого рискового гаплотипа Протективные гаплотипы 20 и 21 отличаются друг от друга аллелями полиморфного локуса С1243Тгена CDSN: первый

содержит протективный аллель Сй8И-1243*Т (СЖ=0.5, 95%С1 0.43-0.71), а второй -аллель повышенного риска развития псориаза С08Ы-1243*С (011= 1.79, 95%С1 1.392.29). Интересно отметить, что альтернативный аллель Су/6- гена Н1А-С состоит во всех протективньгх гаплотипах и во всех из них инвариантными являются аллели Омб- гена Н£Л-Си307*С, 325*С, 1723Ю, 2327*С гена НСК.

Таблица 1

Распределение частот рисковых и протективных гаплотипов полиморфных локусов генов HLA-C, HCR и CDSN у больных псориазом и здоровых индивидов русской, татарской и хакасской этнической принадлежности

Гаплотипы VO а i f-СЧ С Ой £ HCR-C325T MCR-T477C 1 HCR-G1723T 0 --ч Os 1 g <4 Г) G 1 h, 0 1 Контроль N=297 Больные N=273 OR(95%CI) хЧр)

о Pi Pi

русские

20 Cw 6- С С С G G С т 0.078 0.034 0.4 (0.17-0.9) 4.5(0.034)

21 Cw6- С С С G G С с 0.146 0.069 0.4 (0.23-07) 9.14(0.005)

255 Cw6+ т т С Т G G с 0.045 0.263 7.6 (4.0-14.9) 51.2(0.005)

татары

16 Cw6- с с С G А С т 0.182 0.063 0.27(0.09-0.7) 6.9(0.0094)

255 Cw6+ т т с Т G G с 0.056 0.217 5.05 (1.8-14) 11.8(0.0013)

хакасы

17 Cw6- с с с G А С с 0.1240 0.0389 0.1(0.06-0.8) 4.7(0.030)

21 Cw6- с с с G G С с 0.2382 0.0783 0.2 (0.04-0.7) 6.1(0.014)

255 C\v6+ т т с Т G G с 0.1164 0.3001 3.3 (1.3-8.2) 7.15(0.0083)

Примечание здесь и далее: N - объем выборки; п - численности групп; р^ - частота гаплотапа у здоровых доноров; р, - частота гаплотипа у больных. Значения СЖ с вероятностью р<0.05 были приняты как статистически значимые.

Полученные данные свидетельствуют о спорной роли гена СЙХУ в патогенезе псориаза, а достоверно значимая ассоциация с псориазом аллеля СВ5А'-1243*С, возможно, обусловлена неравновесием по сцеплению с аллелем НЬ4-Си>6+ и прошедшими рекомбинациями с рисковыми аллелями предполагаемого причинного гена.

4. Анализ роли меш енных взаимодействий в формировании предрасположенности

к псориазу

В большинстве случаев наследственная предрасположенность формируется специфической комбинацией аллелей нескольких генов, вносящих вклад в развитие или модификацию клинических проявлений болезни. Участие нескольких генов в генетическом контроле может иметь форму их аддитивного действия, либо один из генов окажется главным, остальные будут иметь модифицирующее влияние. Мы провели оценку роли межгенных взаимодействий в формировании генетической предрасположенности к псориазу с помощью метода ОМБЯ, который позволяет выстроить оптимальную модель межгенных и ген-средовых взаимодействий на основе анализа неодинаковых по числу выборок неродственных индивидов, одновременного анализа множества полиморфных вариантов генов, выбора комбинации локусов, предрасполагающих к развитию заболевания, и расчета уровня значимости их взаимодействия. В результате исследования межгенных взаимодействий полиморфных локусов См/6 гена Н1А-С, С305А, С307Т, С325Т, Т477С, в1723Т, Л191Ю, С2327в гена ЯСЯ, С1243Т гена СДЯУ и 0308А гена ТЫРА в общей выборке больных псориазом и здоровых индивидов показано, что практически все изученные локусы достоверно взаимодействуют друг с другом. В общей выборке определена основная модель из комбинации трех ДНК-локусов: НЬА-См/б, НС!1-01723Ти НСИ-С2327(т, взаимодействие которых возможно предрасполагает к развитию псориаза (р<0.0001) (рис. 5).

нся-сгзггг

HLA-Сиб

CaS-CwS-

к й

<?GT

-т.1

HLA-CW6

CwfrtCw6+ Cw6+CwS- С*6-С*6-

ще ш ш>

" i.

' ■ '

ppj isirn« 1

Ш .

ШШЗ

HLA-CW6

CX6tC*S+ CnfrCHè- C#ie«v

□ □

Повышенный риск

Пониженный риск

Пустая ячейка

Рис. 5. Сочетания генотипов полиморфных локусов генов HLA-C и HCR повышенного и пониженного риска развития псориаза в изученных выборках в целом. Левый столбик - больные псориазом, правый - здоровые индивиды.

Обнаружено 15 комбинаций генотипов повышенного риска развития заболевания, из которых ассоциированными с развитием псориаза оказались следующие сочетания: HLA *Cw6+/Cw6+-HCR*I723T/T-HCR*2327G/G (OR= 7.49, 95%CI 3.13-17.95, p<0.0000); HLA *Cw6-/Cw6+-HCR*1723G/T-HCR*2327C/G (OR=6.22, 95%CI 3.21-12.04, p<0.0005); HLA *Cw6+7Cw6+-HCR*I723G/T-HCR*2327C/G (OR=4.52, 95%CI 2.13-9.55, p<0.0000); HLA *Cw6+/Cw6+-HCR */ 723G/T-HCR *2327G/G, HLA *Cw6+/Cw6+-HCR*l 723G/T-HCR*2327C/G и HLA*Cw6-/Cw6+-HCR*1723T/T- HCR*2327G/G (OR=inf. p<0.0000).

...............- 7NFA-G308A

-------S-C1243T

—HCR-A1911G

--— HCR-C2327G

HCR^3C7T I HCR-ai723T T| —HLA-Cwe '-HCR-C325T

Рис. 6. Сочетания полиморфных локусов генов HLA-C, HCR, CDSN и TNFA, приводящих к формированию наследственной предрасположенности к псориазу в изученных выборках в целом.

Проведенный анализ показал значительные ген-генные взаимодействия между локусами HLA-Cw6, HCR-C307T, HCR-C325T, HCR-G1723T, HCR-C2327G и подтвердил полученные нами результаты анализа ассоциаций данных локусов с развитием псориаза (рис. 6) Таким образом, можно предположить, что в формировании наследственной предрасположенности к псориазу основную роль играет взаимодействие полиморфных вариантов генов HIA-C и HCR.

5. Анализ ассоциаций полиморфных локусов генов HLA-C, HCR, CDSN и TNFA с

псориазом в семьях

К группе «семейных» (family-based) тестов на сцепление и ассоциацию относится тест на неравновесие при передаче (TDT - transmission disequilibrium test). TDT был впервые предложен Spielman и коллегами в 1993 г. при анализе сцепления маркерных аллелей с сахарным диабетом типа 1. Тест сводится к сравнению частот альтернативных аллелей у больных потомков гетерозиготных родителей: если один из аллелей существенно чаще встречается у больных потомков, это свидетельствует о его

ассоциации с заболеванием [Spielman et al., 1993]. Для выполнения этого теста используются пары родитель - больной ребенок. Среди других подобных тестов TDT обладает самой высокой способностью определения сцепления или ассоциации. Другим преимуществом теста является то, что его разрешающая сила практически не зависит от тестируемой модели наследования при анализе сцепления. Наиболее эффективен TDT при анализе аддитивной модели наследования.

Нами проведен анализ ассоциаций полиморфных локусов генов HLA-C, HCR, CDSN и TNFA с риском развития псориаза в 18 семьях с повторными и множественными случаями псориаза с помощью теста на неравновесную передачу. Выявлено значительное нарушение равновесия в передаче аллеля Cw6+ гена 1ILA-C, что приводит к выводу о существовании ассоциации с псориазом (табл. 2).

Таблица 2

Результаты анализа TDT теста полиморфных локусов генов HLA-C, IICR, С DSN к TNFA

Аллели TDT Р

Cw6+ 1.5 0.001

305*А 0.13 0.62

307*Т 0.8 0.54

325*Т 0.9 0.36

477*С 0.35 0.72

1723*Т 0.6 0.23

191I*G 0.41 0.11

2327*G 0.53 0.69

1243*С 0.33 0.47

308*А 0.001 0.38

При анализе остальных полимофных локусов генов HCR, CDSN и TNFA мы не получили достоверных значений, а значит не обнаружили нарушения равновесия связи аллелей 305*А, 307*Т, 325*Т, 477*С, 1723*Т, 1911*G, 2327Ю гена HCR, аллеля 1243*С гена CDSN, аллеля 308*А гена TNFA с псориазом (табл. 2).

Полученные нами результаты согласуются с данными зарубежных семейных исследований, где также показана ассоциация с псориазом для аллеля Cw6+ гена HLA-C [Asumalahti et al., 2002; Nair et al., 2006].

Таким образом, анализ ассоциаций с риском развития псориаза полиморфных локусов генов HLA-C, HCR, CDSN и TNFA в 18 семьях с повторными и множественными случаями псориаза с помощью теста на неравновесную передачу подтвердил, что возможно, ген HLA-C влияет на формирование предрасположенности к заболеванию в семьях.

б. Анализ ассоциаций 48 полимофных вариантов генов семейства Toll-подобных рецепторов — TLR (1-10)

Толл-подобные рецепторы - класс клеточных рецепторов с одним трансмембранным фрагментом, которые распознают консервативные структуры микроорганизмов, активируют клеточный иммунный ответ и играют ключевую роль во врожденном иммунитете. В настоящее время известно 10 клеточных TJIP, распознающих бактерии, вирусы, грибы и др. патогены человека. Толл-подобные рецепторы активируются различными лигандами, которые, главным образом, являются структурными компонентами бактерий, вирусов и грибов. SNPs в генах регуляторных молекул начальных этапов развития воспалительной реакции в ряде случаев обусловливает нарушения, которые приводят к изменениям количественных показателей функционирования, что сказывается на развитии и исходе инфекционных, воспалительных и иммунопатологических процессов.

Учитывая' возможное участие в 'механизмах иммунопатогенеза псориаза полиморфных вариантов генов семейства TLR (1-10), мы провели генотипирование 48 SNPs генов семейства TLR (1-10) с использованием SNPlex платформы Applied Biosystems).

При сравнении выборок больных псориазом и контрольной группы в целом обнаружены статистически значимые различия по распределению частот аллелей и генотипов полиморфного локуса rs4862632 гена TLR3 (р<0.001) (рис.7).

ге12013728 с

п.4862632аа

гэ4862632 а

г34862632 а

г5179020 а

(5179008 т

10 20 30 40 50

60 70 80 90

Рис. 7. Маркеры повышенного риска развития псориаза полиморфных локусов генов Т/.ИЗ и ТЬЮ в исследованных выборках

В группе больных псориазом отмечено статистически достоверное увеличение частоты гомозиготного генотипа АЛ (ге4862632) гена ТЮЗ, на долю которого приходилось 76% по сравнению с контрольной группой, где частота данного генотипа составила 65% (х2=45.92, р<0.004). Было выявлено, что аллель А (ге4862632) гена Т1КЗ маркирует повышенный риск развития псориаза в изученной выборке (011== 1.65, 95%С1

Сравнительный анализ распределения частот аллелей и генотипов полиморфного локуса ге4862632 гена- ТЬЯЗ у больных псориазом и контрольной группе русской этнической принадлежности обнаружил достоверные различия (р<0.001) (рис.7). Установлена ассоциация аллеля А и генотипа АА (ге4862632) гена Т1,ЯЗ с развитием псориаза у индивидов русской этнической принадлежности (<Ж=2.7, 95%С1 1.3-5.5 и ОЯ=3.1, 95%С11.8-8.0).

При сравнении выборок больных псориазом и контрольной группы татарской этнической принадлежности обнаружены статистически значимые различия по распределению частот аллелей полиморфных локусов ^179008, гз179020, гя 12013728 гена ТИП (р<0.001). Аллель Г (Ы79008) гена ТЬЯ7 (22.9%) у больных псориазом татарской этнической принадлежности определялся достоверно чаще, чем в контрольной

1.18-2.32).

группе (13.6%). Относительный риск развития псориаза у лиц, имеющих аллель

179008), составил 1.9 (95%С1 1.08-3.3). Аллель A (rs 179020) гена TLR7 достоверно чаще встречался у больных псориазом (31.5%) по сравнению со здоровыми индивидами (20.5%) (ОR-1.79, 95%С1 1.12-2.8). Также, было показано, что аллель G (ïsI2013728) гена TLR7 является маркером повышенного риска развития псориаза у индивидов татарской этнической принадлежности (OR=1.90, 95%С1 1.26-2.8) (рис.7).

Таким образом, была установлена ассоциация полиморфных вариантов генов семейства То11-подобных рецепторов с развитием псориаза: аллеля А и генотипа АА (rs4862632) гена TLR3 у индивидов русской этнической принадлежности, аллелей Т (rs 179008), A (rsl79020) и G frsl2013728) гена TLR7 у индивидов татарской этнической принадлежности.

Резюмируя вышеизложенные результаты, можно заключить, что полиморфные варианты генов PSORS1 могут занимать определенное место не только в структуре механизмов определения фетоштических вариантов псориаза (вульгарного псориаза и псориатического артрита) у больных, но и играть важную роль в формировании предрасположенности к развитию псориаза. Изученные полиморфные маркеры генов семейства То11-подобных рецепторов (генов TLR3 и TLR7) могут рассматриваться в качестве возможных маркеров генетической предрасположенности к псориазу.

ВЫВОДЫ

1. Позитивный аллель Cw6, генотипы Cw6+/Cw6+ и Cw6+/Cw6- гена HLA-C являются маркерами повышенного риска развития псориаза во всех изученных этнических группах.

2. Обнаружена ассоциация с псориазом аллелей 307*Т, 325*Т, 1723*Т, 1911*G, 2327*G и генотипов 307*Т/Т, 325*С/Т, 325*Т/Т, 1723*С/Т, 1723*Т/Т, 2327*C/G, 2327*G/G гена HCR во всех изученных этнических группах.

3. Установлена ассоциация аллеля 1243*С гена CDSN с псориазом у индивидов русской и татарской этнической принадлежности, аллеля 1243*С и гомозиготного генотипа 1243*С/С гена CDSN с вульгарным псориазом и началом развития заболевания до 40 лет.

4. Показано, что все аллели гена HCR находятся в сильном неравновесии по сцеплению как между собой (D'>0,51), так и с аллелем Cw6+ гена HLA-C

(D'>0,53), за исключением локуса Т477С гена HCR. Выявлены области пониженного неравновесия по сцеплению между генами HLA-C и HCR, /ICR и CDSN.

5. Определен гаплотип HLA-Cw6+/HCR-307*mfCR-325*r/HCR-477',G'!!CR-1723*T/HCR-I9U*G/HCR-2327*G/CDSN1243*C, ассоциированный с развитием псориаза у индивидов русской, татарской и хакасской этнической принадлежности.

6. Показано, что в формировании генетической предрасположенности к развитию псориаза лежит взаимодействие полиморфных вариантов генов HLA-C и HCR: HLA-Cwó, HCR-C307T, HCR-C325T, HCR-G1723T, HCR-C2327G.

7. Выявлено значительное нарушение равновесия в передаче позитивного аллеля Cwó гена HLA-C (TDT=1.5, р=0.001) в семьях с повторными и множественными случаями псориаза.

8. Установлена ассоциация полиморфных вариантов генов семейства ТоН-подобных рецепторов с развитием псориаза: аллеля А и генотипа АА (rs4862632) гена TLR3 у индивидов русской этнической принадлежности, аллелей 7"frs 179008), A (rsl79020) и G (rsl2013728) гена TLR7 у лиц татарской этнической принадлежности.

Список публикаций по теме диссертации

1. Э. С. Галимова, В. Л. Ахметова, Э. К. Хуснутдинова. Молекулярно-генетические основы предрасположенности к псориазу. Генетика. Т. 44. №5. 2008. С. 594-605.

2. Э. С. Галимова, В. Л. Ахметова, Б. Б. Юнусбаев, Б. Г. Латыпов, 3. 3. Султанова, Л. Р. Газизова, Р.'З. Галина, В. М. Котюшев, M. X. Кызласова, Е. Е. ШушеНачева, Э. К. Хуснутдинова. Гаплотипический анализ локуса PSORS1 у больных псориазом в России. Медицинская генетика. № 2. С. 26-31.

3. Э.С. Галимова, В.Л.Ахметова, З.К.Хуснугдинова. Анализ ассоциаций полиморфных локусов генов HLA-C, HCR, MTHFR с развитием псориаза в России. // Сборник тезисов "Генетика в России и мире, посвященной 40-летию Института общей генетики им. Н. И. Вавилова РАН". Москва. 2006. С.42.

4. Galimova E.S, Akhmetova V.L., Khusnutdinova E. HLA-C gene association with psoriasis vulgaris in Russian population // 8th International Meeting On Human Genome Variation and Complex Genome Analysis. Hong Kong. 2006. V.12. P. 102.

5. Galimova E.S., Akhmetova V.L., Khusnutdinova E.K. Investigation of HLA-C, HCR and MTHFR genes polymorphisms in Russian patients with psoriasis // 15th Congress of the European Academy of Dermatology and Venereology. Greece. 2006. P. 118

6. Galimova E.S., Akhmetova V.L., Khusnutdinova E.K. The analysis of association of polymorphisms in HLA-C, HCR and MTHFR genes with development of psoriasis in Bashkortostan // Abstracts of the European Human Genetics Conference. Amsterdam. 2006. V.324. P. 1024.

7. E.Galimova, V.Akhmetova, E.Khusnutdinova.. HLA-C and HCR genes association with psoriasis in Russian populations II 16th Congress European Academy of Dermatology and Venereology. Vienna, Austria.. 2007. P. 120

8. E. Galimova, V. Akhmetova, E. Khusnutdinova Association of PSORS1 with psoriasis in Russian populations // Abstracts of the European Human Genetics Conference. Nice, France. 2007. P. 85

9. Э. С. Галимова, В. JI. Ахметова, 3. 3. Султанова, Л. Р. Газизова, Э. К. Хуснутдинова. Генетический анализ HLA-C, HCR и CDSN генов главного комплекса гистосовместимости у больных псориазом в России II 5 Всемирный конгресс по иммунопатологии и аллергии. Москва. 2007. С. 105

10. Э. С. Галимова, В. Л. Ахметова, Б. Б. Юнусбаев, Э. К. Хуснутдинова. Гаплотипический анализ полиморфных локусов главного комплекса гистосовместимости МНС I у больных псориазом II Биомика-наука 21 века. Школа-семинар молодых ученых УФНЦ РАН и Волго-Уральского региона по физико-химической биологии и биотехнологии. Уфа. 2007. С. 37

11. E.Galimova, V.Akhmetova, L.Gazizova, Z.Sultanova, E.Shushenacheva, M.Kizlasova, E.Khusnutdinova. Haplotype associations of the MHC with psoriasis vulgaris in Russian patients // Abstracts of the European Human Genetics Conference. Barcelona, Spain.. 2008. V. 16. P. 343

12. E.Galimova, V.Akhmetova, E.Khusnutdinova.. HLA-C and HCR genes association with psoriasis in Russian populations // 17th Congress European Academy of Dermatology and Venereology. Paris. France. 2008. P. 127

Список сокращений и обозначений

МНС - Главный комплекс гистосовмесгимости;

TLR - Толл-подобный рецептор;

SNP - Однонуклеотидный полиморфизм;

GMDR- Generalized Multifactor-Dimensionality Reduction;

PSORS1 - Локус предрасположенности к псориазу 1;

TDT - Transmission disequilibrium test;

ПЦР - Полимеразная цепная реакция;

ПДРФ - Полиморфизм длины рестрикционных фрагментов;

OR (odds ratio) - Показатель соотношение шансов;

CI, confidence interval - 95% доверительный интервал;

р - Вероятность;

Галимова Эльвира Сафуановна

Молекулярно-генетическое исследование псориаза

03.00.15 - генетика Автореферат диссертации на соискание учёной степени кандидата биологических наук

Подписано в печать 20.11.08 г. Формат 60x84 1/16. Бумага офсетная. Печать ризографическая. Тираж 120 экз. Заказ 205. Гарнитура «Тше8Ке\уЯотап». Отпечатано в типографии «ПЕЧАТНЫЙ ДОМЪ» ИП ВЕРКО. Объем 0,9 п.л. Уфа, Карла Маркса 12 корп. 4, т/ф: 27-27-600, 27-29-123

Содержание диссертации, кандидата биологических наук, Галимова, Эльвира Сафуановна

ВВЕДЕНИЕ.

Глава 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.

1.1 .Этиология и патогенез псориаза.

1.2.Клиника псориаза.

1.3.Генетические аспекты псориаза.

1.3.1. Гены главного комплекса гистосовместимости 1.

Гены HLA-C.

Ген HCR.

Ген S(CDSN).

Ген SEEK (PSORS1C1) и SPR (PSORS1C2).

1.3.2. Гены цитокинов.

Гены TNF

Гены IL-1 н IL-IRA.

Ген ILIO.

1.3.3. Ген CTLA4.

1.3.4. Семейство генов 5700.

Глава 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ.

2.1 .Материалы исследования.

2.2.Методы исследования.

2.2.1. Выделение геномной ДНК.

2.2.2. Полимеразная цепная реакция синтеза ДНК.

2.2.3. Рестрикционный анализ.

2.2.4. Метод электрофореза.

2.3.Генотипирование с использованием SNPlex платформы (Applied Biosystems).

2.4. Статистическая обработка результатов.

2.5. Web ресурсы, используемые в данном исследовании.

Глава 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ.

3.1.Исследование полиморфных вариантов генов HLA-C, HCR и CDSN хромосомного региона PSORS1 (6р21.3) и TNFA главного комплекса гистосовместимости (МНС).

3.1.1. Анализ ассоциаций полиморфных локусов генов HLA-C, HCR и

С DSN хромосомного региона PSORS1 (6р21.3) и

TNFA.

Анализ ассоциаций полиморфного локуса Cw6 гена HLA-C с псориазом.

Анализ ассоциаций полиморфных локусов G305A, С307Т, С325Т,

Т477С, G1723T, A1911G, C2327G гена HCR с псориазом.

Анализ ассоциаций полиморфного локуса С1243Т гена CDSN с псориазом.

Анализ ассоциаций полиморфного локуса G308A гена TNFA с псориазом.:.

3.2.Анализ неравновесия по сцеплению между парами маркеров генов HLA-С, HCR и CDSN хромосомного региона PSORS1 (6р21.3) и TNFA главного комплекса гистосовместимости (МНС).

3.3.Реконструкция и анализ ассоциаций гаплотипов полиморфных локусов генов HLA-C, HCR и CDSN хромосомного региона PSORS1 (6р21.3).

3.4. Анализ роли межгенных взаимодействий в формировании предрасположенности к псориазу.

3.5.Поиск ассоциаций с псориазом полиморфных локусов генов HLA-C,

HCR, CDSN и TNFA в семьях.

3.6. Анализ ассоциаций 48 полимофных вариантов генов семейства Toll- 123 подобных рецепторов - TLR (1-10) с псориазом.

Введение Диссертация по биологии, на тему "Молекулярно-генетическое исследование псориаза"

Актуальность проблемы

Распространенные хронические заболевания, в этиологии которых существенную роль играет генетическая компонента, но характер наследования не может быть объяснен простыми менделевскими правилами, образуют группу многофакторных заболеваний [Гинтер Е.А., 2003]. Такие патологии в настоящее время приобретает все большее значение для медико-генетического консультирования и практического здравоохранения, так как в среднем около 10% населения страдает болезнями с наследственной предрасположенностью, а их доля среди общего числа случаев наследственной патологии человека достигает 90% [Иванов В.И., 2006].

Примером многофакторного заболевания, когда изменчивость того или иного признака определяется не одним главным геном, а влиянием большого числа генетических и внешнесредовых факторов, является псориаз [Сатра1аш е1 а1., 2005]. Псориаз - один из наиболее распространенных хронических воспалительных дерматозов, характеризующийся гиперпролиферацией эпидермиса и нарушением кератинизации [Скрипкин Ю.К., 2005]. Известно, что псориазом страдают 0,3-7 % населения во всем мире [Сатра1аш й а1., 2005]. Согласно последним данным Международной Организации Псориаза 125 миллионов людей в мире имеют псориаз. Псориаз представляет собой системный процесс с выраженными функциональными и морфологическими изменениями ряда органов и систем организма. У больных псориазом наблюдаются проявления нарушений функций центральной, периферической и вегетативной нервной системы, эндокринных желез, метаболические изменения, особенно выраженные при остром и распространенном псориазе [Скрипкин Ю.К., 2005]. Приблизительно у 15-40% больных псориазом развивается псориатический артрит, часто с множественным поражением суставов, приводящих нередко к инвалидизации, что в значительной степени усугубляет качество жизни больных. По меньшей мере, у 30% больных, имеющих псориаз наряду с другими серьезными заболеваниями, такими как депрессия, заболевания сердечно-сосудистой системы и диабет, отмечена склонность к суицидам [Krueger, 2001; Mallbris et al., 2004]. В связи со значительной распространенностью заболевания, хроническим и зачастую, тяжелым течением, несовершенством имеющихся методов лечения, неясностью этиологии и патогенеза, проблема псориаза является одной из актуальных в медицине.

Несмотря на длительную историю изучения псориаза, этиология и патогенез заболевания окончательно не выяснены, что значительно затрудняет разработку оптимальных и эффективных методов терапии и возможность добиться длительной клинической ремиссии. В настоящее время признана точка зрения, согласно которой псориаз является многофакторным заболеванием, на развитие которого влияют как генетические факторы, так и факторы внешней среды (травматические, нервно-психические, применение некоторых медикаментов, злоупотребление алкоголем, курение, инфекционные заболевания и т.д.) [Bowcock et al., 2005]. Генетические факторы доминируют над средовыми, о чем свидетельствуют высокие значения коэффициента наследуемости псориаза. Вместе с тем средовая компонента, играя определенную роль в возникновении дерматоза, оказывает значительное влияние на характер течения и прогноз уже развившейся болезни.

Многочисленные популяционные, семейные исследования и изучения конкордантных и дискордантных по заболеванию близнецов, проводимые во всем мире, указывают на значительную роль генетических факторов в развитии псориаза [Bowcock et al., 2005; Campalani et al., 2005; Rahman et al., 2005]. Молекулярно—генетические исследования псориаза проводятся с помощью анализа сцепления и ассоциаций, исследования экспрессии генов, модельных животных и др. [Bowcock et al., 2005]. В настоящее время опубликованы данные об ассоциации и сцеплении, по меньшей мере, 19 геномных локусов с различными формами псориаза [Nair et al., 2006]. Международный консорциум по изучению генетики псориаза провел анализ сцепления 14-ти локусов кандидатов в выборке 942 пораженных пар сибсов, при этом максимальный LOD-балл был получен для локуса PSORS1 в хромосомном регионе 6р21.3, где идентифицировано 11 генов -HLA-C [Schmitt-Egenolf et al., 1996], HCG27 [Nair et al., 2006], PSORS1C3 [Nair et al., 2006], OTF-3 [Takeda et al., 1992], TCF19 [Ku et al., 1991], HCR [Oka et al, 1999], SPR1 [Oka et al, 1999], SEEK1 [Oka et al, 1999], CDSN [Zhou and Chaplin, 1993], STG [Oka et al, 1999], HCG22 [Nair et al, 2006]. Часть из этих генов открыта сравнительно недавно и мало изучена их роль в патогенезе псориаза. Кроме того, возможно участие в формировании предрасположенности к псориазу генов, расположенных за пределами главного комплекса гистосовместимости (МНС, Major histocompatibility complex): гены цитокинов (факторы некроза опухоли - TNFA и TNFB и ряд интерлейкинов, в частности, IL1 (участок 2ql2-2ql3) и семейство генов IL10 (участок lq31-32), ген CTLA4 (участок 2q33), семейство генов S100 ( 1 q21 ) [Bowcock et al, 2005].

Идентификация специфичных генов, вовлеченных в патогенез псориаза, и анализ взаимодействия генома и факторов окружающей среды будут способствовать формированию фундаментальных представлений о генетических, иммунных и патогенетических аспектах псориаза. И как следствие, понимание генетических механизмов развития заболевания имеет существенное значение для определения подходов к профилактике псориаза в отягощенных семьях и для разработки оптимальных и эффективных методов терапии.

В соответствии с вышеизложенным были поставлены цель и задачи исследования.

Цель исследования изучение роли генов главного комплекса гистосовместимости и генов семейства Толл-подобных рецепторов в формировании предрасположенности к псориазу.

Задачи исследования

Провести у больных псориазом и здоровых индивидов:

2. Анализ ассоциаций исследованных полиморфных вариантов генов HLA-С, HCR, CDSN и TNFA с риском развития псориаза у индивидов с учетом этнической принадлежности, клинических форм и возраста начала развития болезни.

3. Анализ неравновесия по сцеплению между полиморфными локусами генов HLA-C, HCR, CDSN и TNFA.

4. Анализ ассоциаций гаплотипов полиморфных локусов генов HLA-C, HCR, CDSN и TNFA с псориазом.

5. Оценку роли межгенных взаимодействий в формировании предрасположенности к псориазу.

7. Исследование полиморфных вариантов генов семейства Толл-подобных рецепторов TLR с использованием SNPlex платформы (Applied Biosystems).

Научная новизна исследования

Впервые создан банк ДНК больных псориазом и здоровых индивидов четырех этнических групп, проживающих на территории России — русских, татар, башкир и хакасов, общей численностью 1222 индивида. Впервые проведен молекулярно-генетический анализ полиморфных локусов генов HLA-С, HCR, CDSN и TNFA у больных псориазом и здоровых индивидов. Определены генетические маркеры риска развития заболевания у индивидов с учетом этнической принадлежности, клинических форм и возраста начала развития псориаза и оценена роль взаимодействия изученных генов в формировании предрасположенности к псориазу. Выявлен гаплотип по полиморфным локусам генов PSORS1, ассоциированный с риском развития псориаза у лиц русской, татарской и хакасской этнической принадлежности. Получены данные об ассоциации полиморфных вариантов генов PSORS1 с риском развития псориаза в семьях с повторными и множественными случаями псориаза. Впервые проведено исследование 48 полиморфных вариантов генов семейства То11-подобных рецепторов - TLR (1-10) с использованием SNPlex платформы (Applied Biosystems) и установлено, что полиморфные варианты генов TLR3 и TLR7 маркируют повышенный риск развития псориаза у лиц русской и татарской этнической принадлежности.

Научно — практическая значимость работы

Результаты работы вносят вклад в общее представление о генетических основах предрасположенности к псориазу. Впервые получены статистические оценки частот аллелей и генотипов исследуемых ДНК-локусов у больных псориазом. Получены новые данные о влиянии исследуемых ДНК-локусов на риск развития псориаза у больных с учетом этнической принадлежности, клинических форм и возраста начала развития болезни. В клинической практике тестирование полиморфизмов генов-кандидатов псориаза может быть применено для определения подходов к профилактике псориаза в отягощенных семьях и для разработки оптимальных и эффективных методов терапии.

Данные диссертационной работы могут послужить основой для последующих исследований по определению генетических факторов риска развития псориаза.

Результаты исследования могут быть использованы при чтении спецкурсов на факультетах биологии, в медицинских высших образовательных учреждениях, на курсах повышения квалификации медицинских работников.

Основные положения, выносимые на защиту

1. Аллель Cw6+, генотипы Cw6+/Cw6+ и Cw6+/Cw6- гена H LA-С — маркеры повышенного риска развития псориаза у лиц русской, татарской, башкирской и хакасской этнической принадлежности.

2. Ассоциация с псориазом аллелей 307*Т, 325*Т, 1723*Т, 1911*G, 2327*G и генотипов 307*Т/Т, 325*С/Т, 325*Т/Т, 1723*С/Т, 1723*Т/Т, 2327*C/G, 2327*G/G гена HCR во всех изученных этнических группах.

3. Ассоциация аллеля 1243*С гена CDSN с псориазом у индивидов русской и татарской этнической принадлежности, аллеля 1243*С и гомозиготного генотипа 1243*С/С гена CDSN с вульгарным псориазом и с началом развития заболевания до 40 лет.

4. Ассоциация гаплотипа HLA-Cw6+/HCR-307*T/HCR-325*T/HCR-477*C/HCR-1723*T/HCR-1911*/-HCR-2327*G/CDSN1243*C с псориазом у лиц русской, татарской и хакасской этнической принадлежности

5. Детерминация риска развития псориаза взаимодействием полиморфных вариантов генов H LA-С и HCR: HLA-Cw6, HCR-C307T, HCR-C325T, HCR-G1723T, HCR-C2327G.

Заключение Диссертация по теме "Генетика", Галимова, Эльвира Сафуановна

выводы

2. Обнаружена ассоциация с псориазом аллелей 307*Т, 325*Т, 1723*Т, 1911Ю, 2327Ю и генотипов 307*Т/Т, 325*С/Т, 325*Т/Т, 1723*С/Т, 1723*Т/Т, 2327*C/G, 2327*G/G гена HCR во всех изученных этнических группах.

4. Показано, что все аллели гена HCR находятся в сильном неравновесии по сцеплению как между собой (D'>0,51), так и с аллелем Cw6+ гена HLA-C (D'>0,53), за исключением локуса Т477С гена HCR. Выявлены области пониженного неравновесия по сцеплению между генами HLA-C и HCR, HCR и CDSN.

5. Определен гаплотип HLA-Cw6+/HCR-307*T/HCR-325*T/HCR-477*C/HCR-1723 *T/HCR-1911 *G/HCR-2327*G/CDSN1243 *С, ассоциированный с развитием псориаза у индивидов русской, татарской и хакасской этнической принадлежности.

6. Показано, что в формировании генетической предрасположенности к развитию псориаза лежит взаимодействие полиморфных вариантов генов HLA-C и HCR: HLA-Cw6, HCR-C307T, HCR-C325T, HCR-G1723T, HCR-C2327G.

7. Выявлено значительное нарушение равновесия в передаче позитивного аллеля См>6 гена НЬА-С (ТОТ=1.5, р=0.001) в семьях с повторными и множественными случаями псориаза.

8. Установлена ассоциация полиморфных вариантов генов семейства То11-подобных рецепторов с развитием псориаза: аллеля А и генотипа АА (гб4862632) гена ТЬЯЗ у индивидов русской этнической принадлежности, аллелей 7уЫ79008), А (гб179020) и (7 (ге12013728) гена ТЬЮ у лиц татарской этнической принадлежности.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

Наличие наследственной предрасположенности к псориазу не вызывает сомнения. Основная цель всех молекулярно-генетических исследований, проводимых повсеместно, заключается в поиске гена, а, скорее всего, целой сети взаимосвязанных генов, предрасполагающих к заболеванию. При отсутствии главного причинного гена, исследование наследственных основ сводится к установлению комплекса генов, обуславливающих подверженность к сложнонаследуемому заболеванию. Составной частью подобного рода молекулярно-генетических исследований является анализ ассоциаций заболевания с полиморфными вариантами генов-кандидатов, белковые продукты которых, предположительно, могут быть вовлечены в патогенез заболевания.

Проведенный нами анализ ассоциаций полиморфных локусов ряда генов-кандидатов у больных псориазом с целью оценки их роли в развитии псориаза позволил получить следующие результаты.

Исследование ассоциаций с псориазом полиморфного локуса HLA-Cw6 гена HLA-C у больных псориазом и здоровых доноров выявило, что аллель HLA-Cw6+ является маркером повышенного риска развития псориаза (OR=4,04; 95%С1 3,36-4,87). У больных татарской этнической принадлежности (OR=6,81 и OR=4,6; р<0,05, соответственно) и хакасской этнической принадлежности (OR=5,64 и OR=3,9; р<0,05, соответственно) риск развития псориаза у носителей гомозиготного HLA-Cw6+/Cw6+ генотипа оказался выше , чем у носителей гетерозиготного HLA-Cw6-/Cw6+. Выявлена высокая ассоциация аллеля HLA-Cw6+ с вульгарным псориазом и с началом развития заболевания до 40 лет (OR=4,26; 95%С1 3,48-5,22 и OR=4,71; 95%С1 3,79-5,86; соответственно).

Анализ полиморфных вариантов гена HCR обнаружил, что риск развития псориаза в общих выборках существенно увеличен у носителей гомозиготного

132 генотипа 1723*Т/1723*Т (011=6,32; 95%С1 3,54-11,45; р=0,0005) полиморфного локуса НСЯ-в1723Т в сравнении с другими локусами, тогда как у носителей гетерозиготных генотипов - для 325*С/325*Т полиморфного локуса НСЯ-С325Т (СЖ=4,35; 95%С1 3,39-5,67; р=0,0005). Установлен повышенный риск развития псориаза у индивидов русской этнической принадлежности с гомозиготным 1723 *Т/1723 *Г генотипом (ОЯ=4,96; 95%С1 2,14-11,9), татар с гомозиготным 325*Т/325*Т генотипом (СЖ=5,83; 95%С1 1,50-6,41), башкир с гомозиготным 1723*Т/1723*Т генотипом (СЖ=4,94; 95%С1 1,66-15,69) и хакасов с гетерозиготным 325*С/325*Т генотипом (СЖ=5,42; 95%С1 2,47-12,01). Достоверная ассоциация с вульгарным псориазом и I типом заболевания была определена для аллеля НСЯ-325*Т (ОЯ=3,9 и (Ж=4,3; р=0,0005, соответственно), тогда как с псориатическим артритом и II типом заболевания -для аллеля НСВ.-1723*Г((Ж=3.21 и (Ж=3,07; р=0,0005).

Анализ ассоциаций с псориазом полиморфного локуса С£>5УУ-С7243Г гена СШУУ, показал, что аллель СИЗЫ-1243 *С маркирует повышенный риск развития псориаза (СЖ=1,58; 95%С1 1,3-1,8; р=0,0005). Установлена достоверно значимая ассоциация с псориазом у индивидов русской этнической принадлежности аллеля СВЗИ-1243*С (СЖ=1,79; 95%С1 1,4-2,3) и гомозиготного 1243*С/1243*С генотипа (СЖ=1,97; 95%С1 1,3-2,8), а также у татар - аллеля СБ8И-1243*С (СЖ=1,56; 95%С1 1,04-2,3). Риск развития данного заболевания существенно увеличен у больных вульгарным псориазом и с началом развития заболевания до 40 лет (СЖ=1,62; 95%С1 1,3-1,9; р=0.0005 и 011=1,68; 95%С1 1,3-2,04; р=0,0005; соответственно).

Сопоставление распределения частот аллелей и генотипов полиморфного локуса ТЫРА-С308А гена ТИРА между группой больных псориазом и контрольной выборкой в целом, с учетом этнической принадлежности и возраста начала развития болезни не выявило достоверно значимых различий (р>0,05).

Анализ неравновесия по сцеплению между парами маркеров генов HLA-C, HCR, CDSN и TNFA в выборках больных псориазом и здоровых доноров в целом, а также с учетом этнической принадлежности выявил, что области пониженного неравновесия по сцеплению формируют два блока: один — от гена HLA-C до гена HCR и второй - от гена HCR до гена CDSN. Тем самым можно предположить прошедшие hot-spot рекомбинации между генами HLA-C и HCR с одной стороны, HCR и CDSN- с другой стороны.

Гаплотипический анализ установил, что рисковый гаплотип 255 (HLA-Cw6+/HCR-307*T/HCR-325*T/HCR-477*C/HCR-1723 *T/HCR-1911 *G/HCR-2327*G! CDSN1243С) ассоциирует с развитием псориаза у индивидов русской, татарской и хакасской этнической принадлежности (OR=7,6; 5,05 и 3,3, р<0,05, соответственно).

Нами проведен анализ ассоциаций с риском развития псориаза полиморфных локусов генов HLA-C, HCR, CDSN и TNFA в 18 семьях с повторными и множественными случаями псориаза с помощью теста на j неравновесную передачу. Выявлено значительное нарушение равновесия в передаче аллеля Cw6+ гена HLA-C, что приводит к выводу о существовании ассоциации с псоразом (TDT=1,5, р=0,001). Таким образом, можно предположить, что ген HLA-C влияет на формирование предрасположенности к заболеванию в семьях.

Проведенный анализ с использованием GMDR показал значительные ген-генные взаимодействия между локусами HLA-Cw6, HCR-C307T, HCR-C325T, HCR-G1723T, HCR-A1911G, HCR-C2327G, которые приводят к формированию наследственной предрасположенности к псориазу. Необходимо отметить, что во всех изученных группах локусы HLA-Cw6, HCR-G1723T и HCR-C2327G были основными маркерами, ассоциированными с развитием псориаза. Эти данные согласуются с результатами, полученными ранее при анализе ассоциаций полиморфных вариантов генов HLA-C, HCR, CDSN, TNFA. Можно предположить, что в формировании наследственной предрасположенности к псориазу основную роль играет взаимодействие полиморфных вариантов генов НЬА-С и НСЯ.

ЗМРэ в генах регуляторных молекул начальных этапов развития воспалительной реакции в ряде случаев обусловливает нарушения, которые приводят к изменениям количественных показателей функционирования, что сказывается на развитии и исходе инфекционных, воспалительных и иммунопатологических процессов. Учитывая возможное участие в механизмах иммунопатогенеза псориаза полиморфных вариантов семейства генов ТЬЯ (110) мы провели генотипирование 48 ЭМРэ семейства генов ТЬЯ (1-10) с использованием ЭМИех платформы. Была установлена ассоциация полиморфных вариантов генов семейства То11-подобных рецепторов с развитием псориаза: аллеля А и генотипа АА (гэ4862632) гена ТЬЯЗ у индивидов русской этнической принадлежности, аллелей Т (гэ 179008), А (гэ 179020) и О (гэ 12013728) гена ТЬЯ7 у индивидов татарской этнической принадлежности.

Резюмируя вышеизложенные результаты, можно заключить, что полиморфные варианты генов Р80Я81 могут занимать определенное место не только в структуре механизмов определения фенотипических вариантов псориаза (вульгарного псориаза и псориатического артрита) у больных, но и играть важную роль в формировании предрасположенности к развитию псориаза. Изученные полиморфные маркеры генов семейства То11-подобных рецепторов (генов ТЬЯЗ и ТЬЯТ) могут рассматриваться в качестве возможных маркеров генетической предрасположенности к псориазу.

Библиография Диссертация по биологии, кандидата биологических наук, Галимова, Эльвира Сафуановна, Уфа

1. Баранов B.C., Баранова Е.В., Иващенко Т.Э., Асеев М.В. Геном человека и гены "предрасположенности ". (Введение в предиктивную медицину).- СПб, Интермедика, 2000. — 272 с

2. Баранов B.C. и соавт. Геномика — медицине. Научное издание // Под ред. Академика РАМН В.И. Иванова и академика РАН Л.Л. Киселева. М.: ИКЦ «Академкнига», 2005. - 63 с.

3. Белозеров Е.С., Буланьков Ю.И., Митин Ю.А. Болезни иммунной системы. Элиста: АПП «Джангар», 2005. - 272 с.

4. Гинтер Е.А. Эволюция представлений о генетической природе мультифакториальных заболеваний // Медицинская генетика. — 2003. Т. 2.-№4.-С. 146-156.

5. Горбунова В.Н., Баранов B.C. Введение в молекулярную диагностику и генотерапию наследственных заболеваний // СПб.: Специальная литература, 1997. 287 с.

6. Животовский Л.А. Популяционная биометрия. Москва. Наука — 1991. -272 с.

7. Игнатов П.Е. Иммунитет и инфекция.- М.: Время, 2002. 263 с.

8. Короткий Н.Г., Песляк М.Ю. Псориаз как следствие включения р~ стрептококков в микробиоценоз кишечника с повышенной проницаемостью (концепция патогенеза) // Вестник дерматологии и венерологии. -2005. -№1. С. 9-18.

9. Курдина М.И. Антицитокиновая терапия новое направление в лечении псориаза // Вестник дерматологии и венерологии. — 2005. - №1. — С. 3-8.

10. Петров Р.В. Иммунология. М.: Медицина, 1983. - 386с.

11. И. Пузырев В.П., Степанов В.А. Патологическая анатомия генома человека.- Новосибирск.: Наука, 1997. С. 224.

12. Скрипкин Ю.К., Мордовцев В.Н. Кожные и венерические болезни: Руководство для врачей. М: Медицина, 1999. - С. 116-118.

13. Хаитов P.M. Иммунология: Учебник. М.: Медицина, 2000. - 432 с.

14. Abecasis G., Cookson W.: GOLD-graphical overview of linkage disequilibrium //Bioinfomatics. 2000. -V. 16.-P. 182-183.

15. Akira S. Toll-like receptor signaling // J. Biol. Chem. 2003. - V. 278. - P. 38105-8.

16. Akira S., Hemmi H. Recognition of pathogen-associated molecular patterns by TLR family // Immunol. Lett. 2003. - V. 85. - P. 85-95.

17. Al-Heresh A, Proctor J., Jones S. et al. Tumour necrosis factor-a polymorphism and the HLA-Cw*0602 allele in psoriatic arthritis // Rheumatology. -2002. V.41. - P. 525-530.

18. Allen M., Ishida-Yamamoto A., McGrath J. et al. Corneodesmosin expression in psoriasis vulgaris differs from normal skin and other inflammatory skin disorders // Lab. Invest. 2001. - V. 81. - 969-976.

19. Ameen M., Allen M., Fisher S. et al. Corneodesmosin (CDSN) gene association with psoriasis vulgaris in Caucasian but not in Japanese populations // Clin. Exp. Dermatol. 2005. - V. 30. - P. 414-418.

20. Asadullah K., Eskdale J., Wiese A. et al. Interleukin-10 promoter polymorphism in psoriasis // J. Investig. Dermatol. — 2001. — V. 116. P. 975-978.

21. Asadullah K., Sterry W. and Volk H. Interleukin-10 therapy Reiew of a new approach. // Pharmacol. Rev. - 2003. - V. 55. - P. 241-269.

22. Asahina A., Akazaki S., Nakagawa H. et al. Specific nucleotide sequence of HLA-C is strongly associated with psoriasis vulgaris // J. Invest. Dermatol. -1991.-V.97.-P. 254-258.

23. Asumalahti K., Laitinen Т., Itronen-Vatjus R. et. al. A candidate gene for psoriasis near HLA-C, HCR (Pg8) is highly polymorphic with a diseaseassociated susceptibility allele // Hum. Mol. Genet. 2000. - V. 10. - P. 1533-1542.

24. Asumalahti K., Veal C., Laitinen T. et al. Psoriasis Consortium. Coding haplotype analysis supports HCR as the putative susceptibility gene for psoriasis at the MHC PSORS1 locus // Hum. Mol. Genet. 2002. - V.l 1. - P. 589-597.

25. Baker B., Swain A., Fry L. et al. Epidermal T lymphocytes and HLA-DR expression in psoriasis // Br. J. Dermatol. 1984. - V. 110. - 555-564.

26. Baker B., Ovigne J., POwles A. et al. Normal keratinocytes express Toll-like receptors (TLRs) 1, 2 and 5 : modulation of TLR expression in chronic plaque psoriasis // Br. J. Dermatol. 2003. - V. 148. - P. 670-679.

27. Balding J., Kane D., Livingstone W. et al. Cytokine gene polymorphisms: association with psoriatic arthritis susceptibility and severity // Arthritis Reum. 2003. - V. 48. - P. 1408-1413.

28. Balendran N., Clough R.L. et al. Characterization of the major susceptibility region for psoriasis at chromosome 6p21.3 // J. Invest.Dermatol. 1999. - V. 113.-P. 322-8.

29. Barton A. Genetic epidemiology: Psoriatic arthritis // Arthritis Res. — 2002. — V. 4. -P. 247-251.

30. Barrat F., Coffman R. Development of TLR inhibitors for the treatment of autoimmune diseases // Immunol. Rev. 2008. - V. 223. - P. 271-283.

31. Batliwalla F., Li W., Ritchlin C. et al. Microarray Analyses of Peripheral Blood Cells Identifies Unique Gene Expression Signature in Psoriatic Arthritis // Mol Med. 2005. - V. 11. - P. 21-29.

32. Begon E., Michel L., Flageul B. Expression, subcellular localization and cytokinic modulation of Toll-like receptors (TLRs) in normal human keratinocytes: TLR2 up-regulation in psoriatic skin // Eur. J. Dermatol. -2007. V. 17, №6. - P. 497-506.

33. Bos J., Hulsebosch H., Krieg S. Immunocompetent cell in psoriasis. In site immunophenotyping by monoclonal antibodies // Arch. Dermatol. Res. -1983.-V. 275.-P. 181-189.

34. Bowcock A.M., Cookson W.O. The genetics of psoriasis, psoriatic arthritis and atopic dermatitis // Hum. Mol. Genet. V. 13. - P. 43-55.

35. Bowcock A.M. The genetics of psoriasis and autoimmunity // Annu. Rev. Genomics Hum. Genet. 2005. - V. 6. - P. 93-122.

36. Brandrup F., Hange M., Henningsen J. and Eriksen B. Psoriasis in an unselected series of twins // Arch. Dermatol. 1978. - V. 114. - P. 874-878.

37. Cassia F., Carneiro S., Marques M. et al. Psoriasis vulgaris and human leukocyte antigens // E. J. A. Dermatol Venereol. 2007. - V. 21. - P. 303310.

38. Campalani E., Barker J. The clinical genetics of psoriasis // Current Genomics. 2005. - V. 6. - P. 51-60.

39. Cario E., Brown D., McKee M. et al. Commensal-associated molecular pattern induce selective Toll-like receptor-trafficking from apical membrane to cytoplasmic compartments in polarized intestinal epithelium // Am. J. Patrol. 2002. - V. 160.-P. 165-173.

40. Carlen L., Sakuraba K., Stahle M., Sanchez F. HLA-C expression pattern is spatially different between psoriasis and eczema skin lesions // J. Invest. Dermatol. 2007. - V. 127. - P. 342-348.

41. Cavallo M.G., Rozzilli P., Thorpe R. Cytokines and autoimmunity // Clin. Exp. Immunol. 1994. - V. 96(10). - P. 1-7.

42. Craven N., Jackson C.W., Kirby B. et al. Cytokines gene polymorphisms in psoriasis//Br. J. Dermatol.-2001.-V. 144.-P. 849-53.

43. Capon F., Novelli G., Semprini S. et al. Searching for psoriasis susceptibility genes in Italy: genome scan and evidence for a new locus on chromosome 1 // J. Invest. Dermatol. 1999. - V. 112. - P. 32-35.

44. Capon F., Novelli G., Semprini S. et al. Searching for psoriasis susceptibility genes in Italy: genome scan and evidence for a new locus on chromosome 1 // J. Invest. Dermatol. 1999. - V. 112. - P. 32-35.

45. Capon F., Toal I.K., Evans J.C. Haplotype analysis of distantly related populations implicates corneodesmosin in psoriasis susceptibility // J. Med. Genet. 2003. - V. 40. - P. 447-452.

46. Capon F., Allen M.5 Ameen M. et al. A synonymous SNP of the corneodesmosin gene leads to increased mRNA stability and demonstrates association with psoriasis across diverse ethnic groups // Human Molecular Genetics.-2004.-V. 13(20).-P. 2361-2368.

47. Caubet C., Jonca N., Lopez F. et al. Homo-oligomerization of human corneodesmosin is mediated by its N-terminal glycine loop domain // J. Invest. Dermatol. 2004. - V. 122. - P. 747-754.

48. Chia N.V.C., Stuart P., Nair R.P. et al. Variation in the HCR (Pg8) gene are unlikely to be causal for familial psoriasis // J. Invest. Dermatol. 2001. - V. 116.-P. 823-824.

49. Chang Y.T., Chou C.T., Yu C.W. et al. Cytokine gene polymorphisms in Chinese patients with psoriasis // Br. J. Dermatol. 2007. - V. 156. - P. 899905.

50. Curry J., Qin J., Bonish B. et al. Innate immune-related receptors in normal and psoriatic skin // Arch. Pathol. Lab. Med. 2003. - V. 127. - P. 178-186.

51. Denny M. et al. Interferon-alpha promotes abnormal vasculogenesis in lupus: a potential pathway for premature atherosclerosis // Blood. 2007. — V.l 10. — P.2907-2915.

52. Duncan R.D., Epstein M.P., Satten G.A. Case-control haplotype inference (CHAPLIN). Version 1.2. 2006.

53. Ena, P., Madeddu, P., Glorioso N. et al. High prevalence of cardiovascular diseases and enhanced activity of the rennin-angiotensin system in the psoriatic patients // Acta Cardiol. 1985. - V. 40. - P. 199-205.

54. Enland F., Samuelsson L., Enerback C. et al. Psoriasis susceptibility locus in chromosome region 3q21 indentified in patients from southwest Sweden // Eur. J. Hum. Genet. 1999. -V.l.- P. 783-790.

55. Enerback C., Martinsson T., Inerot A. et al. Evidence that HLA-Cw6 determines early onset of psoriasis, obtained using sequence t— specific primers (PCR-SSP) // Acta. Derm. Venerol. 1997. - V. 77. - P. 273-276

56. Elder J., Nair R., Guo S. et al. The genetics of psoriasis // Arch. Dermatol. — 2001.-V. 130.-P. 216-224.

57. Ellis C., Gorsulowsky D., Hamilton T. et al. Cyclosporine improves psoriasis in a double-blind study // J. Am. Med. Assoc. 1986. - V. 256. - P. 3110-6.

58. Elomaa O., Majuri I., Suomela S. et al. Transgenic mouse models support HCR as an effector gene in the PSORS1 locus // Hum. Mol. Gen. 2004. - V. 13.-P. 1551-1561.

59. Epstein M., Veal C., Trembath R. et al. Genetic Association Analysis Using Data from Triads and Unrelated Subjects // Am. J. Hum. Genet. 2005. - V. 76(4). - P. 592-608.

60. Epstein M.P. and Satten G.A. Inference on haplotype effects in case-control studies using unphased genotype data // Am. J. Hum. Genet. 2003. - Vol. 73. -P. 1316-1329.

61. Excoffier L., Slatkin M.: Maximum-likehood estimation of molecular haplotype frequencies in a diploid population // Mol. Biol. Evol. 1995. - V. 12.-P. 921-927.

62. Fabre E.M., Nail L. and Watson W. Natural history of psoriasis in 61 twin pairs // Arch. Dermatol. 1974. V. 109. P. 207-211.

63. Fan X., Yang S., Huang W. et al. Fine mapping of the psoriasis susceptibility locus PSORS1 supports HLA-C as the susceptibility gene in the Han Chinese population // PLoS Genet. 2008. - V. 4. - P. 1-10.

64. Freidlin B., Zheng G., Li Z.H., and Gastwirth J.L. Trend tests for case-control studies of genetic markers: Power, sample size and robustness // Human Heredity. -2002. V. 53.-P. 146-152.

65. Glazier A.M., Nadeau J.H., Aitman T.J. Finding genes that underlie complex traits // Science. 2002 - V. 20. - P. 2345-2349.

66. Ghoreschi K., Mrowietz U., Rocken M. A molecule solves psoriasis? Systemic therapies for psoriasis inducing interleukin-4 and Th2 responses // J. Mol. Med.-2003.-V. 81.-P. 471-80.

67. Ghoreschi K., Thomas B., Breit S. et al. Interleukin-4 therapy of psoriasis induces Th2 responses improves human autoimmune disease // Nat. Med. -2003. V. 9. - P. 40-46.

68. Gottlieb S., Gilleaudeau P., Johnson et al. Response of psoriasis to a lymphocyte-selective toxin (DAB389IL-2) suggests a primary immune, but not keratinocyte, pathogenic basis // Nat. Med. 1995. - V. 1. - P. 442-447.

69. Gottlieb A. Immunologic agents for the treatment of psoriasis // Arch Dermatol. 2003. V. 139. - P. 791-93.

70. Gonzaga H., Torres E., Alchorne M., Gerbase-Delima M. Both psoriasis and benign migratory glossitis are associated with HLA-Cw6 // Br. J. Dermatol. -1996.-V. 135.-P. 368-370.

71. Gonzales S., Martines Borra J., Del Rio J.S. et al. The OTF3 gene polymorphism confers susceptibility to psoriasis independent of the association of HLA-Cw*0602 // J. Invest. Dermatol. 2000. - V. 115. - P. 824-828.

72. Griffiths C., Powles A., Leonard J. et al. Clearance of psoriasis with low dose cyclosporin // Br. Med. J. 1986. - V. 293. - P. 731-732.

73. Griffiths C., Voorhees J. Psoriasis, T cell and autoimmunity // J. R. Soc. Med. 1996.-V. 89.-P. 315-319.

74. Griffiths C. The immulogical basis of psoriasis // J. Eur. Dermatol. Venerol. -2003.-V. 17.-P. 1-5.

75. Gudmundsdottir A.S., Sigmundsdottir H., Sigurgeirsson B. et al. Is an epitope on keratin 17 a major target for autoreactive T lymphocytes in psoriasis? // Clin. Exp. Immunol. 1999. - Vol. 117. - P. 580-586.

76. Gudjonsson J., Thorarinsson. A., Sigurgeirsson B. et al. Streptococcal throat infections and exacerbation of chronic plaque psoriasis: a prospective study // Br. J. Dermatol. 2003. - V.149, N3. - P. 530-534.

77. Gudjonsson J., Karason A., Antonsdottir A. et al. HLA-Cw6-positive and HLA-Cw6-negative patients with psoriasis vulgaris have distinct clinical features // J. Invest. Derm. 2002. - V. 118. - P. 362-365.

78. Gudjonsson J.E., Johnston A., Sigmundottir H., Valdimarsson H. Immunopathogenic mechanisms in psoriasis // Clin. Exp. Immunol. 2004. -V. 135.-P. 1-8.

79. Gudjonsson J., Karason A., Runarsdottir E. et al. Distinct clinical differences between HLA-Cw*0602 positive and negative psoriasis patients an analysis of 1019 HLA-C- and HLA-B-typed patients // J. Invest. Dermatol. - 2006. -V. 126.-P. 740-745.

80. Guo S., Thompson E. Performing the exact test of Hardy-Weinberg proportions for multiple alleles // Biometrics. 1992. - V. 48. - P. 361-372.

81. Hamamoto Y., Tateno H., Ishida T., Muto M. Lack of association between promoter polymorphism of the tumor necrosis factor-alfa gene and psoriatic arthritis in Japanese patients // J. Invest Dermatol. 2000. - V. 115. - P. 1162-1164.

82. Hasan et al. Human TLR10 is a functional receptor, expressed by B cell and plasmacytoid dendritic cell, which activates gene transcription through MyD88 // J. Immunol.-2005.-V. 174.-P. 2942-2950.

83. Henseler T., Koch F., Westphal. E. et al. Presence of HLA-DR7 in typel in psoriasis // Clin. Res. 1992. - V. 40. - P. A 457.

84. Helms C., Saccone N., Cao L. et al. Localization of PSORS1 to a haplotype block harboring HLA-C and distinct from corneodesmosin and HCR // Hum. Genet. 2005. - Vol. 118(3-4). - P. 466-76.

85. Hensen P., Asadullash K., Windemuth C. et al. Interleukin-10 promoter polymorphisms IL10.G and familial early onset psoriasis // Br. J. Dermatol. — 2003.-V. 149.-P. 381-385.

86. Holm S., Carlen L., Mallbris L. et al. Polymorphisms in the SEEK1 and SPR1 genes on 6p21.3 associate with psoriasis in the Swedish population // Exp. Dermatol. 2003. - V. 12. - P. 435-444.

87. Hothorn T., Hornik K., van de Wiel M.A., and Zeileis A. A Lego system for conditional inference // The American Statistician. 2006. - V. 60. - P. 257263.

88. Hothorn T., Hornik K., van de Wiel M.A., and Zeileis A. Coin: Conditional inference procedures in a permutation test framework. 2007. URL http://CRAN.R-project.org. R package version 0.5-2.

89. Hui J., Oka A., Tamiya G. et al. Corneodesmosin DNA polymorphisms in MHC haplotypes and Japanese patients with psoriasis // Tissue Antigens. -2002.-V. 6.-P. 77-83.

90. Hohler T., Kruger A., Schneider P. et al. A TNF alpha promoter polymorphism is associated with juvenile onset psoriasis and psoriatic arthritis // J. Invest. Dermatol. 1997. - V. 109. - P. 562-565.

91. Ishihara M., Yamagata N., Ohno S. et al. Genetic polymorphisms in the keratin-like S gene the human major histocompatibility complex and association analysis on the susceptitibility to psoriasis vulgaris // Tissue Antigenes. 1996.-V. 48.-P. 182-186.

92. Janeway C., Medzhitov R. Innate immune recognition // Annu. Rev. Immunol. 2002. - V. 20. - P. 197-216.

93. Janssens S., Beyaert R. Role of Toll-like receptors in pathogen recognition // Clin. Microbiol. Rev. 2003. - V. 14. - P. 637-646.

94. Jenisch S. Linkage disequilibrium analysis of multiple disease-associated MHC haplotypes // Tissue Antigens. 1999. - V. 53. - P. 135-146.

95. Jenisch S., Koch S., Henseler T. et al. Corneodesmosin gene polymorphism demonstrates strong linkage disequilibrium with HLA and association with psoriasis vulgaris // Tissue Antigens. 1999. - V. 54. - P. 439-449.

96. Jonca N., Guerrin M., Hadjiolova K. Et al. Corneodesmosin, a component of epidermal corneocyte desmosomes, displays homophilic adhesive properties // J. Biol. Chem. 2002. - V. 277. P. 5024-5029.

97. Kanzler H., Barrat F., Hessel E., Coffman R. Therapeutic targeting of innate immunity with Toll-like receptor agonist and antagonist // Nat. Med. — 2007. -V. 13.-P. 552-559.

98. Kawai K., Shimura H., Minagawa M. Et al. Expression ofr functional Tolllike receptor 2 on human epidermal keratinocytes // J. Dermatol. Sci. V. 30. -P. 185-194.

99. Kere J. Mapping and identifying genes for asthma and psoriasis // Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci. 2005. - V. 360(1460). - P. 1551-1561.

100. Kim T., Pyo C., Hur S. et al. Polymorphisms of tumor necrosis factor (TNF) a and p genes in Korean patients with psoriasis // Arch. Dermatol. Res. — 2003. ,-V. 295.-P. 8-13.

101. Kingo K., Koks S., Silm H., Vasar E. IL-10 promoter polymorphisms influence disease severity and course in psoriasis // Genes. Immun. — 2003. — V. 4.-P. 455-477.

102. Kingo K., Ratset R., Koks S. et al. Influence of genetic polymorphisms on interleukin-10 mRNA expression and psoriasis susceptibility // J. Dermatol. Science. 2005. - V. 37. - P. 111-113.

103. Krishnon B., Jamry I. and Chaplin D.D. Feature mapping of HLA class 1 region: localization of the P05F1 and TCF 19 genes // Genomies. 1995. -V. 30.-P. 53-58.

104. Krueger G., Bowcock A. Psoriasis pathophysiology: current concepts of pathogenesis // Annals of the Rheum. Diseases. 2005. - V. 64. P. 30-36.

105. Kollisch G., Kalali B., Voelcker V. Various members of the Toll-like receptor family contribute to the innate immune response of human epidermal keratinocytes//Immunology.-2005.-V. 114.-P. 531-541.

106. Korendowych E., Ravindran J. et al. Disease-specific alleles of the MHC class I related gene, MICA, are associated with type I psoriasis and psoriatic arthritis // Br.J. Dermatol. 2006. - P. 154-154.

107. Krueger G. The impact of psoriasis on quality of life: result of a 1998 National Psoriasis Foundation patient-membership survey // Arch. Dermatol. -2001.-V. 137.-P. 280-284.

108. Ku D-H., Chang C-D., Koniecki J. A new growth-regulated complementary DNA with the sequence of a putative trans-activating factor // Cell Growth Differ. 1991.-V. 2.-P. 179-186.

109. Kumagai Y., Takeuchi O., Akira S. Patogen recognition by innate receptors // J. Infect. Chemother. 2008. - V. 14. - P. 86-92.

110. Lande R. et al. Plasmacytoid dendritic cell sense self-DNA coupled with antimicrobial peptide // Nature. 2007. - V. 449. - P. 564-569.

111. Landegren U.N. Legation-based DNA diagnosis // BioAssays. 1993. - V.15, № 11.-P. 761-765.

112. Lascorz J., Burkhardt H., Huffmeier U et al. Lack of genetic association of the three more common polymorphisms of CARD 15 with psoriatic arthritis and psoriasis in German cohort // Ann Rheum Dis. 2005. - V. 64. - P. 951-954.

113. Lewontin R.: The interaction of selection and linkage. 1. General considerations; heterotic models // Genetics. 1984. - V. 49. - P. 49-67.

114. Liu Y., Kruger J., Bowcock A. Psoriasis: genetic associations and immune system changes // Genes and Immunity. 2007. - V. 8. - P. 1-12.

115. Liu Y., Helms C., Liao W. et al. A genome-wide association study of psoriasis and psoriatic arthritis identifies new disease loci // PLoS Genetics. -2008.-V. 4.-P. 831-842.

116. Lou X., Chen G., Yan L. et al. A generalized combinatorial approach for detecting gene-by-gene and gene-by-environment interactions with application to nicotine dependence // Am. J. Hum. Genet. 2007 - V. 80, № 6. -P.1125-1137.

117. Lv K., Chen R., Cai Q. et al. Effects of a single nucleotide polymorphism on the expression of human tumor necrosis factor-a // Scand. J. Immunol. -2006.-V. 64.-P. 164-169.

118. Mackay I., Rosen F. Autoimmune diseases // N. Engl. J. Med. 2001. - V. 345, №5.-P. 340-350.

119. Mallbris, L., Akre O., Granath, F. et al. Increased risk for cardiovascular mortality in psoriasis inpatients but not in outpatients // Eur. J. Epidemiol. -2004.-V. 19.-P. 225-230.

120. Marrack P., Kappler J., Kotzin B. Autoimmune disease: why and where it occurs // Nature Med. 2001. - V. 7, № 8. - P. - 899-905.

121. Martinez-Borra J., Gonzalez S., Santos-Juanes J. et al. Psoriasis vulgaris and psoriatic arthritis share a 100 kb susceptibility region telomeric to HLA-C // Rheumatology. 2003. - V. 42. - P. 1089-1092.

122. Martines Borra J., Brautbar C., Gonzales S. et al. The region of 150 kb telomeric to HLA-C is associated with psoriasis in the Jewish population // J. Invest. Dermatol. - 2005. - V. 125. - P. 928-932.

123. Matthews D., Fry L., Poules A. et al. Evidence that a locus for familial psoriasis maps to chromosome 4q // Nature Genet. 1996. - V. 14. — P. 231233.

124. Mallon E., Bunce M., Wojnarowska F. et al. PILA-Cw*0602 is a susceptibility factor in type 1 psoriasis and evidence Ala-73 is increased in male type 1 psoriatics //J. Invest. Dermatol. 1997. -V. 109. - P. 183-186.

125. Mansfield J., Holden H., Tarlow J. et al. Novel genetic association between ulcerative colitis and the anti-inflammatory cytokine interleukin-1 receptor antagonist // Gastroenterology. 1994. - V. 106. - P. 637-42.

126. Marshall B., Leelayuwat C., Degli-Esposti M. et al. New major histocompatibility complex genes // Hum. Immunol. 1993. - V.38. - P. 2429.

127. Matsuzaki H., Loi H., Dong S. et al. Parallel genotyping of over 10.000 SNPs using a one-primer assay on a high-density oligonucleotide array // Genome Res. 2004. - V. 14. - P. 414-425.

128. Máurer M., Loserth S., Kolb- Máurer A. et al. A polymorphism in the human cytotoxic T-lymphocyte antigen 4 (CTLA4) gene (exon 1 +49) alters T-cell activation // Immunogenetics. 2002. - V. 54(1). - P. 1-8.

129. Mathew C.C. The isolation of high molecular weight eukaryotic DNA. Methods in Molecular Biology // Human Press. 1984. №2. - P.31-34.

130. Mechanic L., Luke B., Goodman J., Chanock S., Harris C. Polymorphism Interaction Analysis (PIA): a method for investigating complex gene-gene interactions // BMC Bioinformatics. 2008. - V.9. - P. 146.

131. Mitsuru M., Yiqing Z., Shinji M. et al. Targeted deletion of the murine corneodesmosin gene delineates its essential role in skin and hair physiology // Proc Natl Acad Sci USA.- 2008. V. 105(18). - P. 6720-6724.

132. Misery L. Skin, immunity and nervous system // Brit. J. Dermatol. 1997. — V. 137, №6.-P. 843-850.

133. Moore J., Williams S. New strategies for identifying gene-gene interactions in hypertension // Ann. Med. 2002. - V.34. - P.88-95.

134. Morel P., Revillard J., Nicolas J. et al. Anti-CD4 monoclonal antibody therapy in severe psoriasis // J. Autoimmun. — 1992. V.1992. - P. 465-77.

135. Mossner R., Kingo K., Kleensang A. et al. Association of TNF -238 and -308 promoter polymorphism with psoriasis vulgaris and psoriatic arthritis but not with pustulosis palmoplataris // J. Invest. Dermatol. 2005. - V. 124. - P. 282.

136. Motsinger-Reif A., Fanelli T., Davis A., Ritchie M. Power of grammatical evolution neural networks to detect gene-gene interactions in the presence of error // BMC Res. Notes 2008. - V. 1. - P.65.

137. Mrowietz U., Elder J., and Barker J. The importance of disease associations and concomitant therapy for the long-term management of psoriasis patients // Arch Dermatol Res. 2007. - V. 298(7). - P. 309-319.

138. Mclntuff J., Modlin R., Kim J. The role of Toll-like receptors in the pathogenesis and treatment of dermatological disease // J. Invest. Dermatol. —2005.-V. 125.-P. 1-8.

139. Nair R., Henseler T., Jenisch S. et al. Evidence for two psoriasis susceptibility loci (HLA and 17q) and two novel candidate regions (16q and 20q) by genome scan // Hum. Mol. Genet. 1997. - V. 6. - P. 1349-1356.

140. Nair R., Stuart P., Henseler T. Localization of psoriasis susceptibility locus PSORS1 to a 60-kb interval telomeric to HLA-C // Amer. J. Hum. Genet. -2000.-V. 66.-P. 1833-1844.

141. Nair R.P., Stuart P.E., Nistor I. et al. Sequence and haplotype analysis supports HLA-C as the psoriasis susceptibility 1 gene // Am. J. Hum. Genet.2006. V. 78(5). - P. 827-51.

142. Nedoszytko B., Szczerkowska-Dobosz A. et al. Associations of promoter region polymorphisms in the tumour necrosis factor-a gene and early-onset psoriasis vulgaris in a Polish population // Br. J. Dermatol. 2007. — V. 157. -P. 165-167.

143. Nicklin M., Weith A., Duff G. A physical map of the region encompassing the human interleukin-1 alpha, interleukin-1 beta, interleukin-1 receptor antagonist genes // Genomics. 1994. - V. 19. - P. 382-4.

144. Nickoloff B., Wrone-Smite T. Injection of pre-psoriatic skin with CD4+T cell induces psoriasis // Am. J. Pathol. 1999. - V.155. - P. 145-58.

145. Nickoloff B., Nestle F. Recent insights into the immunopathogenesis of psoriasis provide new therapeutic opportunities // J. Clin. Invest. 2004. - V. 113.-P. 1664-1675.

146. Nishibu A., Oyama N., Nakamura K., Kaneko F. Lack of association of TNF-23 8A and -308A in Japanese patients with psoriasis vulgaris, psoriatic arthritis and generalized pustular psoriasis // J. Dermatol. Sci. 2002. — V. 29. -P. 181-184.

147. Oka A., Tamiya G., Tomizawa M. et al. Association analysis using refined microsatellite markers localizes a susceptibility locus for psoriasis vulgaris within a 111 kb segment telomeric to HLA-C gene // Hum. Mol. Genet. -1999.-V. 8.-P. 2165-2170.

148. Orru S., Giuressi E., Casula M. et al. Psoriasis is associated with a SNP haplotype of the corneodesmosin gene (CDSN) // Tissue Antigens. 2002. -V. 60. - P. 292-298.

149. Orru S., Giuressi E., Carcassi C. et al. Mapping of the Major psoriasis-susceptibility locus (PSORS1) in a 70-kb interval around the corneodesmosin gene (CDSN) // Am. J. Hum. Genet. 2005. - V. 76. - P. 164-171.

150. O'Brien K., Holm S., Nilsson S. et al. The HCR gene on 6p21 is unlikely to be a psoriasis susceptibility gene // J. Invest. Dermatol. 2001. - V. 116. - P. 750-754.

151. Polymeropoulos M., Xiao H., Rath D., Merril C. Dinucleotide repeat polymorphism at the human CTLA4 gene // Nucleic. Acids. Res. — 1991. — V. 19. -P. 4018.

152. Queiro R., Gonzalez S., Lopez-Larrea C. et al. HLA-C locus alleles may modulate the clinical expression of psoriatic arthritis // Arthritis Res Ther. -2006.-V. 8(6).-P. 185.

153. R Development Core Team. R: A Language and Environment for Statistical Computing. R Foundation for Statistical Computing, Vienna, Austria. 2007. URL http:// www.R-project.org. ISBN 3-900051-00-3.

154. Ravindran J., Owen P., Lagan A. et al. Interleukin la, interleukin 1(3 and interleukin 1 receptor gene polymorphisms in psoriatic arthritis // Rheumatology. 2004. - V. 43. - P. 22-26.

155. Rahman P., Elder J. Genetic epidemiology of psoriasis and psoriatic arthritis // Ann. Rheum. Dis. 2005. - V. 64. - P. 37-39.

156. Rahman P., Butt'C., Siannis F. et al. Association of SEEK1 and psoriatic arthritis in two distinct Canadian populations // Ann Rheum Dis. — 2005. — V. 64.-P. 1370-1372.

157. Rahman P., Siannis F., Butt C. et al. TNFa polymorphisms and risk of psoriatic arthritis // Ann. Rheum. Dis. 2006. - V. 65. - P. 919-923.

158. Raymond M., Rousset F. GENEPOP (version 1.2): population genetics software for exact tests and ecumenicism // J. Heredity. 1995. - V. 86. - P. 248- 249.

159. Reich D., Cargill M., Bolk S. et al. Linkage disequilibrium in the human genome//Nature.-2001.-V. 411.-P. 199-204.

160. Reich D. and Langer E. On the allelic spectrum of human disease // Trends Genet.-2001.-V. 17.-P. 502-511.

161. Rech K., Huffineier U., Konig I. et al. Association of psoriatic arthritis with the promoter polymorphisms TNF*-857 independent of the PSORS1 risk allele // Arthritis and rheumatism. 2007. - V. 56. - P. 2056-2064.

162. Rifkin I., Leadbetter E., Busconi L. et al. Toll-like receptors endogenous ligands, and systemic autoimmune disease // Immunol. Rev. 2005. - V. 204. - P. 27-42.

163. Rüssel T.J., Schultes L.M., Kuban DJ. Histocompatibility (HL-A) antigens associated with psoriasis // Engl. J. Med. 1972. - V. 287. - P. 738-743.

164. Roitberg-Tamburg A., Friedmann A., Tzfoni E. et al. Do specific pockets of HLA-C molecules predispose Jewish patients to psoriasis vulgaris? // J. Acad. Dermatol. 1994. - V. 31. - P. 964-968.

165. Romphruk A.V., Oka A., Romphruk A. et al. Corneodesmosin gene: no evidence for PSORS1 gene in North-eastern Thai psoriasis patients // Tissue Antigenes. 2003. - V. 62. - P. 217-224.

166. Romphruk A.V., Romphruk A. et al. Major histocompatibility complex class I chain-related gene A in Thai psoriasis patients: MICA association as a part of human leukocyte antigene-B-Cw haplotypes // Tissue Antigens. 2005. - V. 63.-P. 547-554.

167. Sabat R., Philipp S., Hoflich C. et al. Immunipatogenesis of psoriasis // Exp. Dermatol. 2007. - V. 16. - 79-798.

168. Sagoo S., Cork M.J. et al. Genom-wide studies of psoriasis susceptibility loci:a review//J. Dermatol. Scince. 2004.-Vol.35.-P. 171-179.

169. Sachidanandam R., Weissman D., Schmidt S.C. et al. A map of human genome sequence variation containing 1.42 million single nucleotide polymorphisms // Nature. 2001. - V. 409. - P. 928-933.

170. Schön M., W.-Henning B. Psoriasis // The New England J. Med. 2005. - V. 352.-P. 1899-1912.

171. Seung N., Park E., Kim C. Comparison of expression of heat-shock protein 60, Toll-like receptors 2 and 4, and T-cell receptor y8 in plaque and guttate psoriasis // J. Cutan. Pahology. 2007. - V. 34. - P. 903-911.

172. Simon M., Tazi-Ahnini R., Cork M. et al. Abnormal proteolysis of corneodesmosin in psoriatic skin // Br. J. Dermatol. 2002. - V. 147. - P. 1053.

173. Siren J., Pirhonen J., Julkunen I. et al. IFN-a regulates TLR-dependent gene expression of IFN- a, IFN-B, IL-28, and IL-29 II The J. Immunology. 2005. -V.174.-P. 1932-1937.

174. Smith C. and Barker J N W N. Psoriasis and its management II BMJ. 2006. - V. 333(7564). - P. 380-384.

175. Song P., Park Y., Abraham T. et al. Human keratinocytes express functional CD14 and toll-like receptor 4 // J. Invest. Dermatol. 2002. - V. 119. - 424432.

176. Spielman R., Mc Ginnis R., Ewens W. Transmission test for linkage disequilibrium: the insulin gene region and insulin-dependent diabetes mellitus (IDDM) // Am. J. Hum. Genet. 1993. - V. 52. - P. 506-516.

177. Suomela S., Kainu K., Onkamo P. et al. Clinical associations of the risk allele of HLA-C and CCHCR1*WWCC in psoriasis // Acta Derm Venereol. 2007. -V. 87.-P. 127-134.

178. Shaw G., Kamen R. A conserved AU sequence from the 3'-untraslated region of GM-CSF mRNA mediates selective mRNA degradation II Cell. 1986. -V. 46. - P. 659-667.

179. Svejgaard A., Nielsen L., Svejgaard E. et al. HL-A in psoriasis vulgaris and pustular psoriasis-population and families // Br. J. Dermatol. 1974. - V. 91. -P. 145-153.

180. Takeda J., Seino S. and Bell G.I. Human Oct3 gene family: cDNA sequences, alternative splicing, gene organization, chromosomal location, and expression at low levels in adult tissues // Nucleic. Acids Res. 1992. - V. 20. - P. 46134620.

181. Tarlow J., Cork M., Clay F. et al. Association between interleukin-1 antagonist (IL-lra) gene polymorphisms and early and late- onset psoriasis // Br. J.Dermatol.- 1997.-V. 136.-P. 147-8.

182. The International Psoriasis Genetics Study: Assessing Linkage to 14 Candidate Susceptibility Loci in a Cohort of 942 Affected Sib Pairs // Am. J. Hum. Genet. 2003. - V. 73(2). - P. 430-437.

183. Trembath R., Clough R., Rosbotham J. et al. Identification of a major susceptibility locus on chromosome 6p and evidence for further disease loci revealed by a two stage genome-wide search in psoriasis // Hum. Mol. Genet.- 1997.-V. 6.-P. 813-820.

184. Tomfohrde J., Silverman A., Barnes R. et al. Gene for familial psoriasis susceptibility mapped to the distal end of human chromosome 17q // Science.- 1994. V. 264. - P. 1141 -1144.

185. Tiilikainen A., Lassus A., Karvonen J. Psoriasis and HLA-Cw6 // Br. J. Dermatol.-1980.-V. 102.-P. 179-184.

186. Tazi Ahnini R., Camp N.J., Cork M.J. et al. Novel genetic association between the corneodesmosin (MHC S) gene and susceptibility to psoriasis // Hum. Mol. Genet. 1999. - V. 8. - P. 1135-1140.

187. Valdimarsson H., Baker B.S., Johnsdottir I. and Fry L. Psoriasis: a disease of abnormal keratinocyte proliferation induced by T lymphocytes // Immunol Today. 1985. - V. 7. - P. 256-259.

188. Valdimarsson H., Sigmundsdottir H., Jonsdotir I. Is psoriasis induced by streptococcal superantigens and maintained by M-protein-specific T cell that cross-react with keratin? // Clin. Exp. Immunol. 1997. - V. 107. - P. 21-24.

189. Vamvakopoulos J., Green C., Metcalfe S. Genetic control of IL-lbeta bioactivity through differential regulation of the IL-1 receptor antagonist // Eur. J. Immunol. 2002. - V. 32. - P. 2988-96.

190. Van der PM, Crusius JB, Garcia-Gonzales MA et al. Interleukin-1 beta and interleukin-1 receptor antagonist gene polymorphisms in ankylosing spondylitis // Rheumatology. 2002. - V. 41. P. 141119-23.

191. Vasku V., Vasku A., Holla L. et al. Polymorphisms in inflammation genes (angiotensinogen, TAP1 and TNF-beta) in psoriasis // Arch. Dermatol. Res. -2000. V. 292. - P. 531-534.

192. Veal C., Capon F., Allen M. et al. Family-based analysis using a dence single-nucleotide polymorphism-based map defines genetic variation at PSORS1, the major psoriasis-susceptibility locus // Am. J. Hum Genet. — 2002,-V. 71.-P. 554-564.

193. Vega F., Isaac H., Collins A. et al. The linkage disequilibrium maps of three human chromosomes across four populations reflect their demographic history and a common underlying recombination pattern // Genome Res. -2005. V. 15(4). - P. 454-462.

194. Walsh E., Mather K., Schaffner S. et al. An integrated haplotype map of the Human Major Histocompatibility Complex // Am. J. Hum. Genet. 2003. -V. 73.-P. 580-590.

195. White S., Newcomer V., Mickey M., Terasaki P. Disturbance of HL-A antigen frequency in psoriasis // N. Engl. J. Med. 1972 - V. 287. - P. 740743.

196. Wilson A. , Symon J., McDowel T.L. et al. Effects of polymorphisms in the human tumor necrosis factor alpha promoter on transcriptional activation // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. 1997. -V. 94. - P. 3195-3199.

197. Wongpiyabovorn J., Hirankarn N., Ruchusatsawat K. et al. Association of the interleukin-10 distal promoter (-2763 A/C) polymorphism with late-onset psoriasis // Clin, and Experimen. Dermatol. 2007. - V. 33. - P. 186-189.

198. Zalevska A., Wyezofkowsha J., Dziankowska-Bartkowiak B., Sysa-Jedrzejowska A. Interleukin 4 plasma levels in psoriasis vulgaris patients // Med. Sei. Monit. 2004. - V. 10(4). - P. 156-162.

199. Zenz R., Eferl R., Scheinecker C. et al. Activator protein 1 (Fos/Jun) functions in inflammatory bone and skin disease // Arthritis Res Ther. 2008. -V. 10(1). -P. 201.

200. Zhang X., He P., Wang Z. et al. Evidence for a major psoriasis susceptibility locus at 6p (PSORS1) and a novel candidate region at 4q31 by genome-wide scan in Chinese Hans // J. Invest, dermatol. 2002. - V. 119. - P. 1361-1366.

201. Zhou Y., Chaplin D. Identification in the HLA Class I region of a gene expressed late in keratinocyte differentiation // Proc. Natl. Asad. Sei. USA. -1993. V. 90. - P. 9470-9474.

Информация о работе

Галимова, Эльвира Сафуановна
кандидата биологических наук
Уфа, 2008
ВАК 03.00.15

Диссертация

Молекулярно-генетическое исследование псориаза - тема диссертации по биологии, скачайте бесплатно

Автореферат

Похожие работы