Бесплатный автореферат и диссертация по биологии на тему

Молекулярно-генетическая характеристика вариантов вируса гепатита B, циркулирующих в Санкт-Петербурге и Якутии

ВАК РФ 03.00.06, Вирусология

Содержание диссертации, кандидата биологических наук, Морозов, Вячеслав Михайлович

1. Введение.

2. Обзор литературы.

2.1. Молекулярная биология ВГВ.

2.1.1. Структура и организация генома.

2.1.2. Вирусные белки.

2.1.3. Структура капсида.

2.1.4. Жизненный цикл ВГВ.

2.1.5. Репликация ВГВ.

2.2. Молекулярные варианты ВГВ.

2.2.1. Генотипы ВГВ.

2.2.2. Сочетанное инфицирование различными генотипами

2.2.3. Рекомбинация.

2.2.4. Методы генотипирования ВГВ.

3. Материалы и методы.

4. Результаты собственных исследований.

4.1. Филогенетический анализ полноразмерных нуклеотидных последовательностей ВГВ.

4.2. Генотипирование ВГВ в популяциях больных гепатитом В Санкт-Петербур ге и Якутии.

4.2.1 Разработка стратегии генотипирования ВГВ методом РСЯ

ЯП^Р по трем участкам генома.

4.2.2. Генотипирование вариантов ВГВ, циркулирующих в Санкт-Петербурге, методом РСЯ-К^ЬР по трем участкам генома.

4.2.3. Генотипирование вариантов ВГВ, циркулирующих в Санкт-Петербурге, методом амплификации с типоспецифичными праймерами.'.

4.2.4. Определение генотипа ВГВ у больных острым гепатитом В.

4.2.5. Генотипирование вариантов ВГВ, циркулирующих в Якутии.

4.3. Определение нуклеотидных последовательностей фрагментов генома ВГВ. Компьютерный анализ, полученных последовательностей.

4.3.1. Секвенирование и филогенетический анализ нуклеотидных последовательностей ВГВ.

4.3.2. Анализ аминокислотных замен.

4.4. Секвенирование и анализ рекомбинантного генома ВГВ из Санкт

Петербурга.

4.4.1. Доказательства рекомбинантной природы изолята ВГВ. Картирование участков рекомбинации.

4.2.2. Анализ аминокислотных замен.

5. Обсуждение результатов.

5.1. Генотипирование вариантов ВГВ у больных ХГВ в Санкт-Петербурге и Якутии.

5.2. Гомологичная рекомбинация у ВГВ.

Выводы.

Введение Диссертация по биологии, на тему "Молекулярно-генетическая характеристика вариантов вируса гепатита B, циркулирующих в Санкт-Петербурге и Якутии"

Актуальность проблемы

Вирусный гепатит В является важнейшей медико-социальной проблемой для здравоохранения как Российской Федерации, так и всего мира. Это связано с широким распространением инфекции, а также ее частыми неблагоприятными исходами, выражающимися в развитии хронического гепатита, цирроза печени и гепатокарциномы. По данным ВОЗ, ежегодно около 50 млн. человек в мире заболевают гепатитом В, а умирают до 2 млн. человек. В нашей стране в последние годы отмечен резкий рост заболеваемости: число больных ВГВ за последние 5 лет увеличилось более чем в 2 раза. Если в 1992 г. показатель заболеваемости составлял 18,1 на 100 тыс. населения и был близок к показателям в других развитых странах, то в последующем происходил систематический рост заболеваемости и в 1999-2000 гг. она достигла пика (43,8-42,5). В Санкт-Петербурге, Пермской, Омской, Саратовской областях, Приморском крае, республиках Алтай, Калмыкия, Тува, Саха (Якутия), Ханты-Мансийском автономном округе показатели заболеваемости в 1,9-3 раза превышали средний показатель по стране. Почти в половине регионов 60-85% общего числа больных приходится на долю лиц в возрасте 15-19 и 20-29 лет, а показатели заболеваемости в этих группах населения достигают 300-500 на 100 тыс. В связи с возможностью передачи вируса от матери новорожденному и интенсивным вовлечением в эпидемический процесс лиц основного репродуктивного возраста (20-29 лет) участились случаи заболевания детей до 1-го года жизни [Онищенко Г., 2001, 2002]. Все это свидетельствует о том, что заболеваемость ВГВ представляет собой реальную угрозу здоровью нации.

В последнее десятилетие возрос интерес к влиянию генетической вариабельности ВГВ на течение и исход болезни. Генетическая вариабельность проявляется как в возникновении мутаций в вирусном геноме "de novo" у каждого инфицированного субъекта, так и в существовании различных генотипов ВГВ, свойственных определенным популяциям носителей. Современная классификация включает восемь генетических групп ВГВ, обозначенных как генотипы А-Н. В последнее время появляется все больше данных, указывающих на то, что генотипы ВГВ могут влиять на скорость НВе-сероконверсии, тяжесть течения болезни, частоту хронизации и вероятность развития гепатокарциномы [Mayerat С. et al.,

1999; Ding X. et al., 2001; Lindh M. et al., 2000; Orito E. et al., 2001a; Tsubota A. et al., 2001; Thakur V. et al., 2002]. Генотипы ВГВ характеризуются различным географическим распределением, которое коррелирует со значительной вариабельностью в частоте ВГВ-носительства в различных областях мира. Вероятно, гетерогенность в проявлениях болезни и в ответе на антивирусную терапию среди пациентов с хроническим гепатитом в различных регионах может быть связана, по крайней мере частично, с различными генотипами [Norder H. et al., 1993a; Chu C.-J. and Lok A., 2002].

Генотипирование ВГВ только начинает приобретать популярность среди исследователей гепатита В. В настоящий момент наиболее употребляемым методом для определения генотипов является анализ полиморфизма длин фрагментов рестрикции участков генома, амплифицированных с помощью полимеразной цепной реакции (PCR-RFLP) [Lindh M. et al., 1997; Lindh M. et al., 1998]. Также доступны метод, использующий технику обратной гибридизации на нитроцеллюлозной мембране - INNO-LiPA (Innogenetics) [Stuyver L. et al., 1996], и система с иммобилизованными моноклональными антителами к генотип-специфичным эпитопам [Usuda S. et al., 1999]. В случае необходимости эти методы могли бы быть легко внедрены в лаборатории клинической диагностики. Однако, прежде необходимо ответить на ключевой вопрос: каким образом знание генотипа ВГВ может помочь в лечении пациента?

Для этого необходимы дальнейшие исследования связи между генотипами ВГВ и вирусной нагрузкой, активностью инфекционного процесса, ответом на антивирусную терапию; необходимо определить превалирующие генотипы в каждом регионе и выявить их филогенетические связи с изолятами из других регионов.

Однако, в России исследования в этом направлении не проводились. Более того, даже сведения о генотипах циркулирующих на территории Российской Федерации до сих пор являются весьма отрывочными: лишь одна публикация посвящена анализу нуклеотидных последовательностей российских изолятов ВГВ [Flodgren E. et al., 2000].

Цели исследования

Охарактеризовать варианты ВГВ, циркулирующие в Санкт-Петербурге и Якутии; определить особенности генотипического состава ВГВ в этих двух популяциях; оценить филогенетические взаимоотношения российских вариантов ВГВ с изолятами из других регионов мира.

Задачи исследования

1. Провести филогенетический анализ полноразмерных нуклеотидных последовательностей ВГВ, депонированных в СепВапк/ЕМВЬ.

2. Разработать метод генотипирования вариантов ВГВ на основе анализа полиморфизма длин фрагментов рестрикции участков генома, амплифицированных с помощью полимеразной цепной реакции (РС11-КРЬР).

3. Определить генотипический состав популяций ВГВ, циркулирующих в Санкт-Петербурге и Якутии.

4. Определить нуклеотидные последовательности фрагментов генов 8 и С у изолятов ВГВ, относящихся к различным генотипам.

5. Охарактеризовать филогенетические взаимоотношения между изолятами ВГВ из Санкт-Петербурга и Якутии и изолятами из различных географических регионов, представленными в Международном генетическом банке СепВапк/ЕМВЬ.

6. Установить возможность генетической рекомбинации между вариантами ВГВ, принадлежащими к разным генотипам.

Научная новизна

Впервые на основе сочетания методов амплификации с типоспецифичными праймерами и РСЯ-М^Р изучена генетическая структура популяций ВГВ, циркулирующих на территории Санкт-Петербурга и Якутии. Определена первичная нуклеотидная последовательность фрагментов генов 8 и С для изолятов, принадлежащих к разным генотипам. С помощью филогенетического анализа нуклеотидных последовательностей определены генетические взаимоотношения между изолятами, распространенными в Санкт-Петербурге и Якутии и в других регионах мира.

Показано, что в Санкт-Петербурге и Якутии циркулируют три генотипа ВГВ - А, С и О. При этом популяция в Санкт-Петербурге представлена преимущественно О генотипом, тогда как в Якутии генотипы А, С и Э циркулируют почти в равной пропорции, с небольшим доминированием генотипа В.

Выявлена возможность смешанной инфекции, обусловленной разными генотипами ВГВ.

В результате филогенетического анализа полноразмерных последовательностей генома ВГВ, представленных в СепВапк/ЕМВЬ, получены данные, указывающие на высокую частоту рекомбинационных событий в эволюционной истории ВГВ. Для обнаруженных мозаичных геномов картированы предполагаемые точки рекомбинации.

В Санкт-Петербурге выявлен и секвенирован вариант ВГВ, образовавшийся в результате рекомбинации между двумя разными генотипами.

Практическое значение

Разработан метод определения генотипов ВГВ, основанный на сочетании амплификации с типоспецифичными праймерами и РСЯ-КРЬР. В ходе исследования было изучено распространение генотипов ВГВ в Санкт-Петербурге и Якутии. Эти данные могут быть использованы при решении эпидемиологических задач.

Показано, что генотипирование с помощью КИ^Р-РСЯ по трем областям генома ВГВ может быть использовано для идентификации рекомбинантных штаммов.

Обнаружен дополнительный источник вариабельности ВГВ - межгеномная рекомбинация, который необходимо учитывать при филогенетических реконструкциях эволюционной истории ВГВ, проведении эпидемиологических исследований, а также при разработке новых вакцин.

Положения, выносимые на защиту 1. В настоящее время в Санкт-Петербурге циркулируют ВГВ трех генотипов: А, С и О. Среди больных ХГВ в Санкт-Петербурге ВГВ представлен преимущественно генотипом Б; генотип А встречается значительно реже; генотип С был обнаружен только у выходцев из Юго-Восточной Азии.

2. В Якутии в популяции больных хроническим гепатитом В генотипы ВГВ О, А и С встречаются приблизительно с равной частотой, лишь с небольшим доминированием генотипа Б; при этом с высокой частотой выявляется смешанная инфекция, обусловленная двумя генотипами ВГВ.

3. Рекомбинация между геномами ВГВ, принадлежащими к разным генотипам, является дополнительным источником вариабельности вируса.

Апробация работы

Материалы диссертации были представлены на международной научной конференции "Грипп - XXI век" (С.-Петербург, 1997), 2-ой Международной конференции, посвященной 75-летию С.-Петербургского института им. Пастера, "Идеи Пастера в борьбе с инфекциями" (С.-Петербург, 1998), Всероссийской научной конференции "Современные аспекты вакцинопрофилактики, химиотерапии, эпидемиологии, диагностики гриппа и других вирусных инфекций" (Санкт-Петербург, 2001), Всероссийской научно-практической конференции "Новые препараты в профилактике, терапии и диагностике вирусных инфекций" (Санкт-Петербург, 2002).

Публикации

По теме диссертации опубликовано 7 печатных работ.

Структура и объем диссертации

Диссертация изложена на 127 страницах, содержит 17 таблиц и 31 рисунков, включает введение, обзор литературы, материалы и методы, результаты собственных исследований и обсуждение в 5 главах и выводы. Список литературы включает 232 работы отечественных и зарубежных авторов.

Заключение Диссертация по теме "Вирусология", Морозов, Вячеслав Михайлович

Выводы

1. Использование разработанных методов РСЯ-КРЬР и быстрого скрининга генотипов А и Б амплификацией с применением типоспецифичных праймеров позволяет обеспечить точное генотипирование ВГВ, что подтверждено данными секвенирования соответствующих участков вирусного генома.

2. В Санкт-Петербурге выявлена циркуляция трех генотипов ВГВ: А, С и О. Среди больных ХГВ в Санкт-Петербурге ВГВ был представлен преимущественно генотипом Б (90,7%), генотип А встречался в 7,6% случаев, генотип С - в 1,7% случаев, при этом генотип С был обнаружен только у выходцев из Юго-Восточной Азии.

3. В Якутии в популяции больных ХГВ вирус генотипа Б был обнаружен в 37,9% случаев, генотипа А - в 24,1%, генотипа С - в 24,1%. У 4 пациентов (13,8%) было обнаружено одновременное присутствие ВГВ двух генотипов. Высокий процент смешанной инфекции у больных ХГВ в Якутии может быть обусловлен высокой эндемичностью этого региона по гепатиту В и, соответственно, высокой вероятностью повторного заражения.

4. Определена первичная нуклеотидная последовательность фрагментов генов Б и С для изолятов, принадлежащих к трем различным генотипам. С помощью филогенетического анализа нуклеотидных последовательностей определены генетические взаимоотношения между изолятами, распространенными в Санкт-Петербурге, в Якутии и в различных регионах мира; подтверждены результаты, полученные с помощью РС11-КГЪР.

5. Филогенетический анализ полноразмерных последовательностей генома ВГВ, полученных из вепВапк/ЕМВЬ, позволил выявить высокую частоту рекомбинационных событий в эволюционной истории ВГВ. Для 9 мозаичных геномов картированы предполагаемые точки рекомбинации.

6. Среди ВГВ, циркулирующих в Санкт-Петербурге, выявлен вариант, образовавшийся в результате рекомбинации между геномами ВГВ, принадлежащими к разным генотипам.

Библиография Диссертация по биологии, кандидата биологических наук, Морозов, Вячеслав Михайлович, Санкт-Петербург

1. Нетесова И.Г. Субтип HBs как одна из характеристик инфекции гепатита В у различных групп населения Западной Сибири. // Автореф. канд. биол. наук. -Кольцове, 2002-19 с.

2. Онищенко Г.Г. О состоянии заболеваемости вирусными гепатитами в Российской Федерации и неотложных медицинских мерах по ее стабилизации. // Вопр. вирусол. 2001 - Т.45, №4. - С.4-7.

3. Онищенко Г.Г. О государственных мерах по предупреждению распространения в Российской Федерации заболеваемости инфекционными гепатитами. // Эпидемиол. и инфекц. бол. 2002, №3. - С.4-8.

4. Онищенко Г.Г. Эпидемиологическая обстановка в Российской Федерации и основные напрвления деятельности по ее стабилизации. // Материалы к докладу на VIII Всероссийском съезде эпидемиологов, микробиологов и паразитологов. Москва, 2002.

5. Яшина Т.Д., Фаворов М.О., Шахгильдян И.В. и др.//Вопр. вирусол. 1992. -№4.-С. 194-196.

6. Akarca US, Lok AS. Naturally occurring hepatitis В virus core gene mutations. // Hepatology. 1995. - Vol.22, № 1. - P.50-60.

7. Alexopoulou A, Karayiannis P, Hadziyannis SJ, Aiba N, Thomas HC. Emergence and selection of HBV variants in an anti-HBe positive patient persistently infected with quasi-species. // J. Hepatol. 1997. - Vol.26, №4. - P.748-753.

8. Arauz-Ruiz P, Norder H, Visona KA, Magnius LO. Molecular epidemiology of hepatitis В virus in Central America reflected in the genetic variability of the small S gene. // J. Infect. Dis. 1997. - Vol.176, №4. - P.851-858.

9. Arauz-Ruiz P, Norder H, Robertson BH, Magnius LO. Genotype H: a new Amerindian genotype of hepatitis В virus revealed in Central America. // J. Gen. Virol. 2002. - Vol.83, Pt.8. - P.2059-2073.

10. Asahina Y, Enomoto N, Ogura Y, Kurosaki M, Sakuma I, Izumi N, Marumo F, Sato C. Sequential changes in full-length genomes of hepatitis B virus accompanyingacute exacerbation of chronic hepatitis B. // J. Hepatol. 1996. - Vol.25, №6. - P.787-794.

11. Banerjee K, Guptan RC, Bisht R, Sarin SK, Khandekar P. Identification of a novel surface mutant of hepatitis B virus in a seronegative chronic liver disease patient. // Virus. Res. 1999. - Vol.65, №2. - P. 103-109.

12. Barnabas S, Hai T, Andrisani OM. The hepatitis B virus X protein enhances the DNA binding potential and transcription efficacy of bZip transcription factors. // J. Biol. Chem. 1997. - Vol.272, №33. - P.20684-20690.

13. Blumberg B.S., Alter H.J., Visnich S. A "new" antigen in leukemia sera. // JAMA. -1965.-Vol.191.-P.541-546.

14. Bottcher B, Wynne SA, Crowther RA. Determination of the fold of the core protein of hepatitis B virus by electron cryomicroscopy. // Nature. 1997. - Vol.386, №6620. -P.88-91.

15. Bowyer SM, van Staden L, Kew MC, Sim JG. A unique segment of the hepatitis B virus group A genotype identified in isolates from South Africa. // J. Gen. Virol. -1997. Vol.78, Pt.7. - P.1719-1729.

16. Bowyer SM, Sim JG. Relationships within and between genotypes of hepatitis B virus at points across the genome: footprints of recombination in certain isolates. // J. Gen. Virol. 2000. - Vol.81, Pt.2. - P.379-392.

17. Bozkaya H, Ayola B, Lok AS. High rate of mutations in the hepatitis B core gene during the immune clearance phase of chronic hepatitis B virus infection. // Hepatology. 1996. - Vol.24, №1. -P.32-37.

18. Breiner KM, Urban S, Schaller H.Carboxypeptidase D (gpl80), a Golgi-resident protein, functions in the attachment and entry of avian hepatitis B viruses. // J. Virol. 1998. - Vol.72, №10. - P.8098-8104.

19. Bruss V, Ganem D. The role of envelope proteins in hepatitis B virus assembly. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1991. - Vol.88, №3. - P. 1059-1063.

20. Bruss V, Thomssen R. Mapping a region of the large envelope protein required for hepatitis B virion maturation. // J. Virol. 1994. - Vol.68, №3. - P. 1643-1650.

21. Bruss V, Lu X, Thomssen R, Gerlich WH. Post-translational alterations in transmembrane topology of the hepatitis B virus large envelope protein. // EMBO J. -1994 Vol.13, №10. - P.2273-2279.

22. Bruss V, Vieluf K. Functions of the internal pre-S domain of the large surface protein in hepatitis B virus particle morphogenesis. // J. Virol. 1995. - Vol.69, №11 -P.6652-6657.

23. Bruss V, Hagelstein J, Gerhardt E, Galle PR. Myristylation of the large surface protein is required for hepatitis B virus in vitro infectivity. // Virology. 1996. -Vol.218, №2. -P.396-399.

24. Bullock P, Champoux JJ, Botchan M. Association of crossover points with topoisomerase I cleavage sites: a model for nonhomologous recombination. // Science. 1985. - Vol.230, №4728. - P.954-958.

25. Chao L. Fitness of RNA virus decreased by Muller's ratchet. // Nature. 1990. -Vol.348, №6300. - P.454-455.

26. Chao L, Tran TT, Tran TT. The advantage of sex in the RNA virus phi6. // Genetics. 1997,-Vol.147, №3.-P.953-959.

27. Chisari FV. Rous-Whipple Award Lecture. Viruses, immunity, and cancer: lessons fromhepatitis B. // Am. J. Pathol. 2000. - Vol.156, №4. - P.l 117-1132.

28. Chu CJ, Hussain M, Lok AS. Hepatitis B virus genotype B is associated with earlier HBeAg seroconversion compared with hepatitis B virus genotype C. // Gastroenterology. 2002 - Vol. 122, №7. - P. 1756-1762.

29. Clayton RF, Owsianka A, Patel AH. Evidence for structural differences in the S domain of L in comparison with S protein of hepatitis B virus. // J. Gen. Virol. -2001. Vol.82, Pt.7. - P.1533-1541.

30. Conway JF, Cheng N, Zlotnick A, Wingfield PT, Stahl SJ, Steven AC. Visualization of a 4-helix bundle in the hepatitis B virus capsid by cryo-electron microscopy. // Nature. 1997. - Vol.386, №6620. - P.91-94.

31. Courouce A.M., Holland P.V., Muller J.Y., Soulier J.P. HBs antigen subtypes. // Bibliotheca haematologica. 1976. - Vol.42. -P.l.

32. Courouce-Pauty A.M., Lamaire J.M., Roux J.F. New hepatitis B surface antigen subtypes inside the ad category. // Vox sanguinis. 1978. - Vol.35. - P.304-308.

33. Cui C, Shi J, Hui L, Xi H, Zhuoma, Quni, Tsedan, Hu G. The dominant hepatitis B virus genotype identified in Tibet is a C/D hybrid. // J. Gen. Virol. 2002. - Vol.83, Pt.l 1. -P.2773-2777.

34. Cullen BR. Nuclear RNA export pathways. // Mol. Cell. Biol. 2000. - Vol.20, №12.- P.4181-4187.

35. Dane D.S., Cameron C.H., Briggs M. Virus-like particles in serum of patients with Australia antigen associated hepatitis. // Lancet. 1970. - №2. - 695-698.

36. Devarbhavi HC, Cohen AJ, Patel R, Wiesner RH, Dickson RC, Ishitani MB. Preliminary results: outcome of liver transplantation for hepatitis B virus varies by hepatitis B virus genotype. // Liver Transpl. 2002. - Vol.8, №6. - P.550-555.

37. Ding X, Mizokami M, Yao G, Xu B, Orito E, Ueda R, Nakanishi M. Hepatitis B virus genotype distribution among chronic hepatitis B virus carriers in Shanghai, China. // Intervirology. 2001. - Vol.44, №1. - P.43-47.

38. Eckhardt SG, Milich DR, McLachlan A. Hepatitis B virus core antigen has two nuclear localization sequences in the arginine-rich carboxyl terminus. // J. Virol. -1991.-Vol.6, №2.-P.575-582.

39. Eble BE, MacRae DR, Lingappa VR, Ganem D. Multiple topogenic sequences determine the transmembrane orientation of the hepatitis B surface antigen. // Mol. Cell. Biol. 1987.-Vol.7,№10.-P.3591-3601.

40. Feitelson MA, Zhu M, Duan LX, London WT. Hepatitis B x antigen and p53 are associated in vitro and in liver tissues from patients with primary hepatocellularcarcinoma. // Oncogene. 1993. - Vol.8, №5. - P. 1109-1117.

41. Felsenstein J. Confidence limits on phylogenies: An approach using the bootstrap. // Evolution. 1985. - Vol.39. - P.783-791.

42. Felsenstein J. PHYLIP (Phylogeny Inference Package) Version 3.5c, 1993.

43. Franco A, Paroli M, Testa U, Benvenuto R, Peschle C, Balsano F, Barnaba V. Transferrin receptor mediates uptake and presentation of hepatitis B envelope antigen by T lymphocytes. //J. Exp. Med. 1992. - Vol.175, №5. - P. 1195-1205.

44. Fujie H, Moriya K, Shintani Y, Yotsuyanagi H, lino S, Koike K. Hepatitis B virus genotypes and hepatocellular carcinoma in Japan. // Gastroenterology. 2001. -Vol.120, №6.-P. 1564-1565.

45. Ganem D, Varmus HE. The molecular biology of the hepatitis B viruses. // Annu. Rev. Biochem. 1987. - Vol.56. -P.651-693.

46. Ganem D. Assembly of hepadnaviral virions and subviral particles. // Curr. Top. Microbiol. Immunol. 1991. - Vol. 168. - P.61 -83.

47. Gazina EV, Fielding JE, Lin B, Anderson DA. Core protein phosphoiylation modulates pregenomic RNA encapsidation to different extents in human and duck hepatitis B viruses. //J. Virol. 2000 - Vol.74, №10. - P.4721-4728.

48. Garcia AD, Ostapchuk P, Hearing P. Functional interaction of nuclear factors EF-C, HNF-4, and RXR alpha with hepatitis B virus enhancer I. // J. Virol. 1993. - Vol.67, №7. - P.3940-3950.

49. Gerelsaikhan T, Tavis JE, Bruss V. Hepatitis B virus nucleocapsid envelopment does not occur without genomic DNA synthesis. // J. Virol. 1996. - Vol.70, №7. -P.4269-4274.

50. Gong SS, Jensen AD, Chang CJ, Rogler CE. Double-stranded linear duck hepatitis B virus (DHBV) stably integrates at a higher frequency than wild-type DHBV in LMH chicken hepatoma cells. //J. Virol. 1999. - Vol.73, №2. - P. 1492-1502.

51. Goodrich DW, Duesberg PH. Retroviral recombination during reverse transcription. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1990. - Vol.87, №6. - P.2052-2056.

52. Gripon P, Le Seyec J, Rumin S, Guguen-Guillouzo C. Myristylation of the hepatitis B virus large surface protein is essential for viral infectivity. // Virology. 1995. -Vol.213, №2. -?292-299.

53. Guidotti LG, Matzke B, Schaller H, Chisari FV. High-level hepatitis B virus replication in transgenic mice. //J. Virol. 1995. - Vol.69, №10. -P.6158-6169.

54. Gunther S, Paulij W, Meisel H, Will H. Analysis of hepatitis B virus populations in an interferon-alpha-treated patient reveals predominant mutations in the C-gene and changing e-antigenicity. // Virology. 1998. - Vol.244, №1. - P. 146-160.

55. Gunther S, Fischer L, Pult I, Sterneck M, Will H. Naturally occurring variants of hepatitis B virus. // Adv. Virus. Res. 1999. - Vol.52. - P.25-137.

56. Guo JT, Pugh JC. Topology of the large envelope protein of duck hepatitis B virus suggests a mechanism for membrane translocation during particle morphogenesis. // J. Virol. 1997. - Vol.71, №2. - P.l 107-1114.

57. Guo WT, Wang J, Tam G, Yen TS, Ou JS. Leaky transcription termination produces larger and smaller than genome size hepatitis B virus X gene transcripts. // Virology. -1991.-Vol.181, №2.-P.630-636.

58. Guo W, Chen M, Yen TS, Ou JH. Hepatocyte-specific expression of the hepatitis B virus core promoter depends on both positive and negative regulation. // Mol. Cell. Biol.- 1993.-Vol.13, №l.-P.443-448.

59. Hannoun C, Norder H, Lindh M. An aberrant genotype revealed in recombinant hepatitis B virus strains from Vietnam. // J. Gen. Virol. 2000. - Vol.81, Pt.9. -P.2267-2272.

60. Hannoun C, Krogsgaard K, Horal P, Lindh M. Genotype mixtures of hepatitis B virus in patients treated with interferon. // J. Infect. Dis. 2002. - Vol.186, №6. - P.752-759.

61. Heermann KH, Goldmann U, Schwartz W, Seyffarth T, Baumgarten H, Gerlich WH. Large surface proteins of hepatitis B virus containing the pre-s sequence. // J. Virol. -1984. Vol.52, №2. - P.396-402.

62. Heijtink RA, van Hattum J, Schalm SW, Masurel N. Co-occurrence of HBsAg and anti-HBs: two consecutive infections or a sign of advanced chronic liver disease? // J. Med. Virol. 1982. - Vol. 10, №2. - P.83-90.

63. Henning L. WinGene/WinPep: User-friendly software for the analysis of aminoacid sequences. BioTechniques. 1999. - Vol.26. - P. 1170-1172

64. Hino O, Tabata S, Hotta Y. Evidence for increased in vitro recombination with insertion of human hepatitisB virus DNA. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. — 1991. -Vol.88, №20. P.9248-9252.

65. Hu J, Seeger C. Hsp90 is required for the activity of a hepatitis B virus reverse transcriptase. //Proc.Natl. Acad. Sci. USA. 1996.- Vol.93.-№3.-P.1060-1064.

66. Huang ZM, Yen TS. Role of the hepatitis B virus posttranscriptional regulatory element in export of intronless transcripts. // Mol. Cell. Biol. 1995, Vol.15. - №7. -P.3864-3869.

67. Junker-Niepmann M, Bartenschlager R, Schaller H. A short cis-acting sequence is required for hepatitis B virus pregenome encapsidation and sufficient for packaging of foreign RNA. // EMBO J. 1990. - Vol.9, №10. - P.3389-3396.

68. Kann M, Sodeik B, Vlachou A, Gerlich WH, Helenius A. Phosphorylation-dependent binding of hepatitis B virus core particles to the nuclear pore complex. // J. Cell. Biol.- 1999.- Vol.145, №l.-P.45-55.

69. Kao JH, Chen PJ, Lai MY, Chen DS. Hepatitis B genotypes correlate with clinical outcomes in patients with chronic hepatitis B. // Gastroenterology. 2000a. -Vol.118, №3.-P.554-559.

70. Kao JH, Wu NH, Chen PJ, Lai MY, Chen DS. Hepatitis B genotypes and the response to interferon therapy. // J. Hepatol. 2000b. - Vol.33, №6. - P.998-1002.

71. Kao JH, Chen PJ, Lai MY, Chen DS. Acute exacerbations of chronic hepatitis B are rarely associated with superinfection of hepatitis B virus. // Hepatology. 2001. -Vol.34. -№4, Pt.l. -P.817-823.

72. Kao J.H., Chen D.S. Reply on "Hepatitis B virus genotypes and hepatocellular carcinoma in Japan". // Gastroenterology. 2001. - Vol.120, №6. - P.1564.

73. Kato H, Orito E, Gish RG, Bzowej N, Newsom M, Sugauchi F, Suzuki S, Ueda R, Miyakawa Y, Mizokami M. Hepatitis B e antigen in sera from individuals infected with hepatitis B virus of genotype G. // Hepatology. 2002b. - Vol.35, №4. - P.922-929.

74. Kenney JM, von Bonsdorff CH, Nassal M, Fuller SD. Evolutionary conservation in the hepatitis B virus core structure: comparison of human and duck cores. // Structure.- 1995.-Vol.3, №10.-P.1009-1019.

75. Kidd-Ljunggren K, Miyakawa Y, Kidd AH. Genetic variability in hepatitis B viruses. // J. Gen. Virol. 2002. - Vol.83, Pt.6. - P. 1267-1280.

76. Kimura M (1980) A simple method for estimating evolutionary rates of base substitutions through comparative studies of nucleotide sequences. // J. Mol. Evol. -Vol.16.-P.l 11-120.

77. Kock J, Borst EM, Schlicht HJ. Uptake of duck hepatitis B virus into hepatocytes occurs by endocytosis but does not require passage of the virus through an acidic intracellular compartment. // J. Virol. 1996. - Vol.70, №9. P.5827-5831.

78. Konig S, Beterams G, Nassal M. Mapping of homologous interaction sites in the hepatitis B virus core protein. // J. Virol. 1998. - Vol.72, №6. - P.4997-5005.

79. Sudhir Kumar, Koichiro Tamura, Ingrid B. Jakobsen, and Masatoshi Nei. MEGA2: Molecular Evolutionary Genetics Analysis software, Arizona State University, Tempe, Arizona, USA, 2001.

80. Lai M.E., Melis A., Massoleni A.P., Balestrieri A. Sequence analysis of hepatitis B virus genome of new mutant ayw subtype isolated in Sardinia. // Nucleic. Acids Res. 1991.- 19.-P.5078.

81. Lai M.E., Massoleni A.P., Melis A., Balestrieri A. 1992. Unpublished. Direct submission to the EMBL/GenBank/DDBJ databases.

82. Lambert C. and Prange R. Dual topology of the hepatitis B virus large envelope protein: determinants influencing post-translational pre-S translocation. // J. Biol. Chem. 2001. - Vol.276, №25. - P.22265-22272.

83. Lanford RE, Notvall L, Lee H, Beames B. Transcomplementation of nucleotide priming and reverse transcription between independently expressed TP and RT domains of the hepatitis B virus reverse transcriptase. // J. Virol. 1997. - Vol.71, №4.-2996-3004.

84. Le Pogam S, Yuan TT, Sahu GK, Chatterjee S, Shih C. Low-level secretion of human hepatitis B virus virions caused by twoindependent, naturally occurring mutations (P5T and L60V) in the capsid protein. // J. Virol. 2000. - Vol.74, №19. -P.9099-9105.

85. Le Seyec J, Chouteau P, Cannie I, Guguen-Guillouzo C, Gripon P. Role of the pre-S2 domain of the large envelope protein in hepatitis B virus assembly and infectivity. // J. Virol. 1998. - Vol.72, №7. - P.5573-5578.

86. Liao W and Ou J.-H. Phosphorylation and nuclear localization of the hepatitis B virus core protein: significance of serine in the three repeated SPRRR motifs. // J. Virol. 1995. - Vol.69, №2. - P. 1025-1029.

87. Liaw YF, Chien RN, Yeh CT, Tsai SL, Chu CM. Acute exacerbation and hepatitis B virus clearance after emergence of YMDD motif mutation during lamivudine therapy. // Hepatology 1999. - Vol.30, №2. - P.567-572.

88. Lien JM, Aldrich CE, Mason WS. Evidence that a capped oligoribonucleotide is the primer for duck hepatitis B virus plus-strand DNA synthesis. // J. Virol. 1986. -Vol.57, №1. — P.229-236.

89. Lindh M, Andersson AS, Gusdal A. Genotypes, nt 1858 variants, and geographic origin of hepatitis B virus-large-scale analysis using a new genotyping method. // J. Infect. Dis. 1997. - Vol.175, №6. - P. 1285-1293.

90. Lindh M, Gonzalez JE, Norkrans G, Horal P. Genotyping of hepatitis B virus by restriction pattern analysis of a pre-S amplicon. // J. Virol. Methods 1998. - Vol.72, №2,-P. 163-174.

91. Lindh M, Hannoun C, Dhillon AP, Norkrans G, Horal P. Core promoter mutations and genotypes in relation to viral replication and liver damage in East Asian hepatitis B virus carriers. //J. Infect. Dis. 1999. - Vol.179, №4 -P.775-782.

92. Lindh M, Horal P, Dhillon AP, Norkrans G. Hepatitis B virus DNA levels, precore mutations, genotypes and histological activity in chronic hepatitis B. // J. Viral. Hepat.- 2000. Vol.7, №4. - P.258-267.

93. Loeb DD, Hirsch RC, Ganem D. Sequence-independent RNA cleavages generate the primers for plus strand DNA synthesis in hepatitis B viruses: implications for other reverse transcribing elements. // EMBO J. 1991. - Vol.10, №11. - P.3533-3540.

94. Loffler-Mary H, Dumortier J, Klentsch-Zimmer C, Prange R. Hepatitis B virus assembly is sensitive to changes in the cytosolic S loop of the envelope proteins. // Virology 2000. - Vol.270, №2. - P.3 58-367.

95. Lopez-Cabrera M, Letovsky J, Hu KQ, Siddiqui A. Transcriptional factor C/EBP binds to and transactivates the enhancer element II of the hepatitis B virus. // Virology- 1991.-Vol.183, №2.-P.825-829.

96. Magnius L.O. and Norder H. Subtypes, genotypes and molecular epidemiology of the hepatitis B virus as reflected by sequence variability of the S-gene. // Intervirology 1995. - Vol.38, №1-2. - P.24-34.

97. Mahoney FJ. Update on diagnosis, management, and prevention of hepatitis B virus infection. // Clin. Microbiol. Rev. 1999. -№12, №2. -P.351-366.

98. Mangold CM, Unckell F, Werr M, Streeck RE. Secretion and antigenicity of hepatitis B virus small envelope proteins lacking cysteines in the major antigenic region. // Virology 1995. - Vol.211, №2, - P.535-543.

99. Mayerat C, Mantegani A, Frei PC. Does hepatitis B virus (HBV) genotype influence the clinical outcome of HBV infection? // J. Viral. Hepat. 1999. - Vol.6, №4. -P.299-304.

100. Melegari M, Scaglioni PP, Wands JR. Hepatitis B virus mutants associated with 3TC and famciclovir administration are replication defective. // Hepatology 1998. -Vol.27, №2. -P.628-633.

101. Milich DR, Jones JE, Hughes JL, Price J, Raney AK, McLachlan A. Is a function of the secreted hepatitis B e antigen to induce immunologic tolerance in utero? // Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1990. - Vol.87, №17. - P.6599-6603.

102. Milich DR, Chen MK, Hughes JL, Jones JE. The secreted hepatitis B precore antigen can modulate the immune response to the nucleocapsid: a mechanism for persistence. // J. Immunol. 1998. - Vol.160, №4, - P.2013-2021.

103. Miyake Y, Oda T, Li R, Sugiyama K. A compárison of amino acid sequences of hepatitis B virus S gene in 46 children presenting various clinical features for immunoprophylaxis. // Tohoku J. Exp. Med. 1996. - Vol.180, №3. - P.233-247.

104. Mizokami M, Nakano T, Orito E, Tanaka Y, Sakugawa H, Mukaide M, Robertson BH. Hepatitis B virus genotype assignment using restriction fragment length polymorphism patterns. // FEBS Lett. 1999. - Vol.450, №1-2. - P.66-71.

105. Molnar-Kimber KL, Summers JW, Mason WS. Mapping of the cohesive overlap of duck hepatitis B virus DNA and of the site of initiation of reverse transcription. // J. Virol. 1984.-Vol.51, №1.-P.181-191.

106. Morozov V, Pisareva M, Groudinin M. Homologous recombination between different genotypes of hepatitis B virus. // Gene 2000. - Vol.260, №1-2. - P.55-65.

107. Muller H.J. The relation of recombination to mutational advance. // Mutation Research 1964. - 1. - P.2-9.

108. Musacchio A, Rodriguez EG, Herrera AM, Quintana D, Muzio V. Multivalent DNA-based immunization against hepatitis B virus with plasmids encoding surface and core antigens. // Biochem. Biophys. Res. Commun. 2001. - Vol.282, №2. -P.442-446

109. Naito H, Hayashi S, Abe K. Rapid and specific genotyping system for hepatitis B virus corresponding to six major genotypes by PCR using type-specific primers. // J. Clin. Microbiol. 2001. - Vol.39, №1. - P.362-364.

110. Nassal M, Rieger A. A bulged region of the hepatitis B virus RNA encapsidation signal contains the replication origin for discontinuous first-strand DNA synthesis. // J. Virol. 1996. - Vol.70, №5. - P.2764-2773.

111. Nassal M. Hepatitis B virus replication: novel roles for virus-host interections. // Intervirology 1999. - Vol.42. - P. 100-116.

112. Neurath AR, Strick N, Sproul P. Search for hepatitis B virus cell receptors reveals binding sites for interleukin 6 on the virus envelope protein. // J. Exp. Med. 1992. -Vol.175, №2. -P.461-469.

113. Ngui SL, Hallet R, Teo CG. Natural and iatrogenic variation in hepatitis B virus. // Rev. Med. Virol. 1999. - Vol.9, №3. - P. 183-209.

114. Noguchi A, Hayashi J, Nakashima K, Ikematsu H, Hirata M, Kashiwagi S. Decrease of hepatitis A and B virus infections in the population of Okinawa, Japan. // J. Infect. 1991. - Vol.23, №3. - P.255-262.

115. Norder H, Hammas B, Magnius LO. Typing of hepatitis B virus genomes by a simplified polymerase chain reaction. // J. Med. Virol. 1990. - Vol.31, №3. - P.215-221

116. Norder H, Courouce AM, Magnius LO. Molecular basis of hepatitis B virus serotype variations within the four major subtypes. // J. Gen. Virol. 1992a. - Vol.73, Pt 12. - P.3141-3145.

117. Norder H, Courouce AM, Magnius LO. Complete nucleotide sequences of six hepatitis B viral genomes encoding the surface antigen subtypes ayw4, adw4q-, and adrq- and their phylogenetic classification. // Arch. Virol., Suppl. 1993b. - 8. -P.189-199.

118. Norder H, Courouce AM, Magnius LO. Complete genomes, phylogenetic relatedness, and structural proteins of six strains of the hepatitis B virus, four of which represent two new genotypes. // Virology 1994. - Vol.198, №2. - P.489-503.

119. Okamoto H, Tsuda F, Sakugawa H, Sastrosoewignjo RI, Imai M, Miyakawa Y, Mayumi M. Typing hepatitis B virus by homology in nucleotide sequence: comparison of surface antigen subtypes. // J. Gen. Virol. 1988. - Vol.69, Pt 10. -P.2575-2583.

120. Ori A, Shaul Y. Hepatitis B virus enhancer binds and is activated by the Hepatocyte nuclear factor 3. // Virology 1995. - Vol.207, №1. - P.98-106.

121. Park GT, Yi YW, Choi CY, Rho HM. A negative regulatory element and its binding protein in the upstream of enhancer II of hepatitis B virus DNA. // Cell Biol.- 1997. Vol.16, №12. -P.1459-1465.

122. Pineau P, Marchio A, Mattei MG, Kim WH, Youn JK, Tiollais P, Dejean A. Extensive analysis of duplicated-inverted hepatitis B virus integrations inhuman hepatocellular carcinoma. // J. Gen. Virol. 1998. - Vol.79, Pt 3 - P.591-600.

123. Poisson F, Severac A, Hourioux C, Goudeau A, Roingeard P. Both pre-Sl and S domains of hepatitis B virus envelope proteins interact with the core particle. // Virology 1997. - Vol.228, №1. - P.l 15-120.

124. Pollack JR, Ganem D. An RNA stem-loop structure directs hepatitis B virus genomic RNA encapsidation. // J. Virol. 1993. - Vol.67, №6. - P.3254-3263.

125. Pollack JR, Ganem D. Site-specific RNA binding by a hepatitis B virus reverse transcriptase initiates two distinct reactions: RNA packaging and DNA synthesis. // J. Virol. 1994. - Vol.68, №9. - P.5579-5587.

126. Pontisso P, Ruvoletto MG, Tiribelli C, Gerlich WH, Ruol A, Alberti A. The preSl domain of hepatitis B virus and IgA cross-react in their binding to the hepatocyte surface. // J. Gen. Virol. 1992. - Vol.73, Pt 8. - P.2041-2045.

127. Pourquier P, Jensen AD, Gong SS, Pommier Y, Rogler CE. Human DNA topoisomerase I-mediated cleavage and recombination of duck hepatitis B virus DNA in vitro. // Nucleic Acids Res. 1999. - Vol.27, №8. - P. 1919-1925.

128. Prange R. and Streck R. Novel transmembrane topology of the hepatitis B virus envelope proteins. // EMBO J. 1995. - Vol.14, №2 - P.247-256.

129. Proutski O, Sokur, O. Kiselev. Multifunctional software for optimized selection of PCR primers // Final Programme Abstracts of Joint Meeting: Progress in Clinical Virology 1994, Stockholm, Sweeden - P.7-20.

130. Radziwill G, Tucker W, Schaller H. Mutational analysis of the hepatitis B virus P gene product: domain structure and RNase H activity. // J. Virol. 1990. - Vol.64, №2-P.613-620.

131. Rail LB, Standring DN, Laub O, Rutter WJ. Transcription of hepatitis B virus by RNA polymerase II. // Mol. Cell. Biol. 1983. - Vol.3, №10. - P. 1766-1773.

132. Raney AK, McLachlan A. Characterization of the hepatitis B virus large surface antigen promoter Spl binding site. // Virology 1995. - Vol.208, №1. - P.399-404.

133. Raney AK, Johnson JL, Palmer CN, McLachlan A. Members of the nuclear receptor superfamily regulate transcription from the hepatitis B virus nucleocapsid promoter. // J. Virol. 1997. - Vol.71, №2. - P. 1058-1071.

134. Ray S., SimPlot for Windows, Vers. 2.5. 1999.

135. Rehermann B, Pasquinelli C, Mosier SM, Chisari FV. Hepatitis B virus (HBV) sequence variation of cytotoxic T lymphocyte epitopes is not common in patients with chronic HBV infection. //J. Clin. Invest. 1995. - Vol.96, №3. - P. 1527-1534.

136. Rehermann B, Lau D, Hoofnagle J, Chisari F. Cytotoxic T lymphocyte responsiveness after resolution of chronic hepatitis B virus infection. // J. Clin. Invest.- 1996. Vol.97, №7. - P. 1655-1665.

137. Repp R, Rhiel S, Heermann KH, Schaefer S, Keller C, Ndumbe P, Lampert F, Gerlich WH. Genotyping by multiplex polymerase chain reaction for detection of endemic hepatitis B virus transmission. // J. Clin. Microbiol. 1993. - Vol.31, №5. -P.1095-1102.

138. Rieger A., Nassal M. Specific hepatitis B virus minus-strand DNA synthesis requires only the 5' encapsidation signal and the 3'-proximal direct repeat DR1. // J. Virol. 1996. - Vol.70, №1. - P.585-589.

139. Rigg R, Schaller H. Duck hepatitis B virus infection of hepatocytes is not dependent on low pH. // J. Virol. 1992. - Vol.66, №5. - P.2829-2836.

140. Robertson D., Hahn B., Sharp P. Recombination in AIDS viruses. // J. Mol. Evol.- 1995. Vol.40. - P.249-259.

141. Salminen MO, Carr JK, Burke DS, McCutchan FE. Identification of breakpoints in intergenotypic recombinants of HIV type 1 by bootscanning. // AIDS Res. Hum. Retroviruses 1995. - Vol.11, №11. - P.1423-1425.

142. Sambrook J., Fritsch E., Maniatis T. Molecular cloning. // Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989.

143. Satrosoewignjo R, Omi S, Okamoto H., Mayumi,M., Rustam,M. and Sujudi,X. The complete nucleotide sequence of HBV DNA clone of subtype adw (pMND122) from Menado in Sulawesi Island, Indonesia. // ICMR Ann. 1987. - 7 - P.51-60.

144. Schierup M. and Hein J. Consequences of recombination on traditional phylogenetic analysis. // Genetics 2000. - Vol.156. - P.879-891.

145. Seifer M. and Standring D.N. A protease-sensitive hinge linking the two domains of the hepatitis B virus core protein is exposed on the viral capsid surface. // J. Virol. 1994 - Vol.68, №9. - P.5548-5555.

146. Shih CH, Li LS, Roychoudhury S, Ho MH. In vitro propagation of human hepatitis B virus in a rat hepatoma cell line. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1989. -Vol.86, №16. - P.6323-6327.

147. Shih JW, Cheung LC, Alter HJ, Lee LM, Gu JR. Strain analysis of hepatitis B virus on the basis of restriction endonuclease analysis of polymerase chain reaction products. // J. Clin. Microbiol. 1991. - Vol.29, №8. - P.1640-1644.

148. Shiraki K. Perinatal transmission of hepatitis B virus and its prevention. // J. Gastroenterol. Hepatol. 2000. - 15 SupphEl 1-5.

149. Smith GJ, Donello JE, Luck R, Steger G, Hope TJ. The hepatitis B virus post-transcriptional regulatory element contains two conserved RNA stem-loops which are required for function. // Nucleic Acids Res. 1998. - Vol.26, №21.- P.4818-4827.

150. Smith J.M. Analizing the mosaic structure of gene. // J. Mol. Evol. 1992. -Vol.34.-P.126-129.

151. Staprans S, Loeb DD, Ganem D. Mutations affecting hepadnavirus plus-strand DNA synthesis dissociate primer cleavage from translocation and reveal the origin of linear viral DNA. //J. Virol. 1991. - Vol.65, №3. - P. 1255-1262.

152. Stuyver, L., Rossau, R., and Maertens, G. Line Probe Assays for the detection of HCV and HBV genotypes. // Antiviral Therapy 1996. - 1, Suppl.3. - P.53-57.

153. Stuyver L, De Gendt S, Van Geyt C, Zoulim F, Fried M, Schinazi RF, Rossau R. A new genotype of hepatitis B virus: complete genome and phylogenetic relatedness. // J. Gen. Virol. 2000. - Vol.81, Pt. 1. - P.67-74.

154. Su H, Yee JK. Regulation of hepatitis B virus gene expression by its two enhancers. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1992. - Vol.89, №7. - P.2708-2712.

155. Summers J, Smith PM, Horwich AL. Hepadnavirus envelope proteins regulate covalently closed circular DNA amplification. // J. Virol. 1990. - Vol.64, №6. -P.2819-2824.

156. Tavis JE, Perri S, Ganem D. Hepadnavirus reverse transcription initiates within the stem-loop of the RNA packaging signal and employs a novel strand transfer. // J. Virol. 1994. - Vol.68, №6. - P.3536-3543.

157. Teles SA, Martins RM, Vanderborght B, Stuyver L, Gaspar AM, Yoshida CF. Hepatitis B virus: genotypes and subtypes in Brazilian hemodialysis patients. // Artif. Organs 1999. - Vol.23, №12. - P.1074-1078.

158. Thakur V, Guptan RC, Kazim SN, Malhotra V, Sarin SK. Profile, spectrum and significance of HBV genotypes in chronic liver disease patients in the Indian subcontinent. // J. Gastroenterol. Hepatol. 2002. - Vol.17, №2. - P. 165-170.

159. Toh H, Hayashida H, Miyata T. Sequence homology between retroviral reverse transcriptase and putative polymerases of hepatitis B virus and cauliflower mosaic virus. // Nature 1983. - Vol.305, №5937. - P.827-829.

160. Treichel U, Meyer zum Buschenfelde KH, Dienes HP, Gerken G. Receptor-mediated entry of hepatitis B virus particles into liver cells. // Arch. Virol. 1997. -Vol.142, №3.-P.493-498.

161. Tsubota A, Arase Y, Ren F, Tanaka H, Ikeda K, Kumada H. Genotype may correlate with liver carcinogenesis and tumor characteristics in cirrhotic patients infected with hepatitis B virus subtype adw. // J. Med. Virol. 2001 - Vol.65, №2. -P.257-265.

162. Urban S, Breiner KM, Fehler F, Klingmuller U, Schaller H. Avian hepatitis B virus infection is initiated by the interaction of a distinct pre-S subdomain with the cellular receptor gpl80. // J. Virol. 1998. - Vol.72, №10. - P.8089-8097.

163. Uy A, Wunderlich G, Olsen DB, Heermann KH, Gerlich WH, Thomssen R. Genomic variability in the preSl region and determination of routes of transmission of hepatitis B virus. // J. Gen. Virol. 1992. - Vol.73, Pt. 11. - P.3005-3009.

164. Van Geyt C.S., Ma M.M., Fisher V.G., et al. A line probe assay for hepatitis B virus genotype. // In "Therapies of viral hepatitis" (R.F. Schinazi, J.P. Sommadossi, H. Thomas, eds) International Medical Press, London, UK, 1998. P. 139-145.

165. Wang GH, Seeger C. The reverse transcriptase of hepatitis B virus acts as a protein primer for viral DNA synthesis. // Cell 1992. - Vol.71, №4. - P.663-670.

166. Wang GH, Seeger C. Novel mechanism for reverse transcription in hepatitis B viruses. //J. Virol. 1993. - Vol.67, №11. - P.6507-6512.

167. Wei Y, Tavis JE, Ganem D. Relationship between viral DNA synthesis and virion envelopment in hepatitis B viruses. // J. Virol. 1996. - Vol.70, №9. - P.6455-6458.

168. Weiller GF. Phylogenetic profiles: a graphical method for detecting genetic recombinationsin homologous sequences. // Mol. Biol. Evol. 1998. - Vol.15, №3. -P.326-335.

169. Wooley DP, Smith RA, Czajak S, Desrosiers RC. Direct demonstration of retroviral recombination in a rhesus monkey. // J. Virol. 1997 - Vol.71, №12. -P.9650-9653.

170. Wu JY, Zhou ZY, Judd A, Cartwright CA, Robinson WS. The hepatitis B virus-encoded transcriptional trans-activator hbx appears to be a novel protein serine/threonine kinase. // Cell 1990. - Vol.63, №4. - P.687-695.

171. Wu TT, Coates L, Aldrich CE, Summers J, Mason WS. In hepatocytes infected with duck hepatitis B virus, the template for viral RNA synthesis is amplified by an intracellular pathway. // Virology 1990. - Vol.175, №1. -P.255-261.

172. Wu X, Zhu L, Li ZP, Koshy R, Wang Y. Functional organization of enhancer (ENII) of hepatitis B virus. // Virology 1992. - Vol.191, №1. - P.490-494.

173. Wynne S.A., Leslie A.G., Butler P.J., Crowther R.A. Crystalisation of hepatitis B virus core protein shells, determination of cryoprotectant conditions and preliminary X-ray characterisation. // Acta Crystallogr. 1999a. - D 55. - P.557-560.

174. Wynne SA, Crowther RA, Leslie AG. The crystal structure of the human hepatitis B virus capsid. // Mol. Cell 1999b. - Vol.3, №6. - P.771-780.

175. Yang W, Summers J. Illegitimate replication of linear hepadnavirus DNA through nonhomologous recombination. // J. Virol. 1995. - Vol.69, №7. - P.4029-4036.

176. Yang W, Summers J. Infection of ducklings with virus particles containing linear double-stranded duck hepatitis B virus DNA: illegitimate replication and reversion. // J. Virol. 1998 - Vol.72, №11. -P.8710-8717.

177. Yeh CT, Liaw YF, Ou JH. The arginine-rich domain of hepatitis B virus precore and core proteins contains a signal for nuclear transport. // J. Virol. 1990. - Vol.64, №12. - P.6141-6147.

178. Yuan TT, Shih C. A frequent, naturally occurring mutation (P130T) of human hepatitis B virus core antigen is compensatory for immature secretion phenotype of another frequent variant (I97L). // J. Virol. 2000. - Vol.74, №10. - P.4929-4932.

179. Yuh CH, Ting LP. The genome of hepatitis B virus contains a second enhancer: cooperation of two elements within this enhancer is required for its function. // J. Virol. 1990. - Vol.64, №9. - P.4281-4287.

180. Yuh CH, Chang YL, Ting LP. Transcriptional regulation of precore and pregenomic RNAs of hepatitis B virus. // J. Virol. 1992. - Vol.66, №7. - P.4073-4084.

181. Zhang P, Raney AK, McLachlan A. Characterization of the hepatitis B virus X-and nucleocapsid gene transcriptional regulatory elements. // Virology 1992. -Vol.191, №1.-P.31-41.

182. Zang WQ, Fieno AM, Grant RA, Yen TS. Identification of glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase as a cellular protein that binds to the hepatitis B virus posttranscriptional regulatory element. // Virology 1998. - Vol.248, №1. - P.46-52.

183. Zhang X, Zoulim F, Habersetzer F, Xiong S, Trepo C. Analysis of hepatitis B virus genotypes and pre-core region variability during interferon treatment of HBe antigen negative chronic hepatitis B. // J. Med. Virol. 1996. - Vol.48, №1. - P.8-16.

184. Zhou DX, Yen TS. The hepatitis B virus S promoter comprises A CCA AT motif and two initiation regions. // J. Biol. Chem. 1991. - Vol.266, №34. - P.23416-23421.

185. Zlotnick A, Cheng N, Conway JF, Booy FP, Steven AC, Stahl SJ, Wingfield PT. Dimorphism of hepatitis B virus capsids is strongly influenced by the C-terminus of the capsid protein. // Biochemistry 1996. - Vol.35, №23. - P.7412-7421.

186. Zollner B, Petersen J, Schafer P, Schroter M, Laufs R, Sterneck M, Feucht HH. Subtype-dependent response of hepatitis B virus during the early phase of lamivudine treatment. // Clin. Infect. Dis. 2002. - Vol.34, №9. - P. 1273-1277.