Бесплатный автореферат и диссертация по биологии на тему
Молекулярно-биологический анализ генов Sinorhizobium meliloti, вовлеченных в контроль симбиотической эффективности и нодуляционной конкурентоспособности
ВАК РФ 03.00.07, Микробиология
Содержание диссертации, кандидата биологических наук, Чижевская, Елена Петровна
ВВЕДЕНИЕ. 6.
ГЛАВА 1. НОДУЛЯЦИОННАЯ КОНКУРЕНТОСПОСОБНОСТЬ КЛУБЕНЬКОВЫХ БАКТЕРИЙ. 9.
1.1. Методы определения нодуляционной конкурентоспособности. 10.
1.2. Связь нодуляционной конкурентоспособности с культурально-биохи-мическими и симбиотическими признаками клубеньковых бактерий. 11.
1.3. Локализация генов, ответственных за конкурентоспособность, в геноме клубеньковых бактерий. 13.
1.4. Генетические детерминанты, вовлеченные в контроль нодуляционной конкурентоспособности клубеньковых бактерий. 14.
1.4.1. Хемотаксис ризобиальных штаммов к корням растения-хозяина. . 14.
1.4.2. Способность штаммов клубеньковых бактерий к продукции бактериоцинов.16.
1.4.3. Детерминанты клеточной поверхности клубеньковых бактерий. . 17.
1.4.3.1. Экзополисахариды клубеньковых бактерий.18.
1.4.3.2. Капсулярные полисахариды клубеньковых бактерий.20.
1.4.3.3. Липополисахариды клубеньковых бактерий.22.
1.4.4. Гены вирулентности клубеньковых бактерий.23.
1.4.5. Гены клубеньковых бактерий, вовлеченные в метаболизм специфических соединений.29.
1.4.6. Способность к синтезу и катаболизму ризопинов.31.
1.4.7. Гены с неизвестной функцией. .35.
1.5. Участие растения-хозяина в контроле конкурентоспособности штаммов клубеньковых бактерий.37.
1.6. Разработка методов повышения конкурентоспособности штаммов клубеньковых бактерий.37.
Введение Диссертация по биологии, на тему "Молекулярно-биологический анализ генов Sinorhizobium meliloti, вовлеченных в контроль симбиотической эффективности и нодуляционной конкурентоспособности"
Актуальность темы. Биологическая азотфиксация - глобальный процесс, который обеспечивает существование жизни на Земле. Способность восстанавливать N2 до ЫН/ выявлена для многих групп микроорганизмов (эубактерии, цианобактерии, актиномицеты, архебактерии). Однако наиболее биологически активными фиксаторами азота являются клубеньковые бактерии, связывающие его в симбиозе с бобовыми растениями. Высокая эффективность симбиотической азотфиксации обусловлена тем, что этот процесс происходит в специфических структурах, образуемых на корнях бобовых растений (клубеньках), которые служат для бактерий надежной защитой от неблагоприятных условий окружающей среды. Кроме этого, в клубеньки поступают продукты фотосинтеза растений, которые обеспечивают бактерий необходимыми источниками питания и энергии. Клубеньковые бактерии, в свою очередь, снабжают растение-хозяина легкоусваиваемыми соединениями азота. Благодаря этому некоторые бобовые растения (люцерна, клевер) не только полностью обеспечивают себя азотом, но и накапливают его в почве (до 600 кг/ га в год) (Симаров и др., 1990).
Бобово-ризобиальный симбиоз уже давно привлекает внимание специалистов, работающих в самых различных областях биологии. Интерес к этой биологической системе особенно резко возрос в последние годы, когда появилась возможность проводить генетический и молекулярно-биологический анализ наследственных факторов, детерминирующих признаки клубеньковых бактерий, необходимые для вступления в симбиоз. Так, за последние 15 лет у клубеньковых бактерий были выявлены и подробно изучены гены, контролирующие все качественные симбиотические признаки - вирулентность, азотфиксирующую активность и хозяйскую специфичность.
Долгое время единственным способом повышения интенсивности симбиотической азотфиксации был подбор природных активных штаммов клубеньковых бактерий, на основе которых готовили препарат нитрагин, используемый для предпосевной обработки (инокуляции) семян бобовых. На сегодняшний день, благодаря бурному развитию методов молекулярной генетики и генной инженерии, появилась реальная возможность направленно конструировать высоко эффективные производственные штаммы клубеньковых бактерий.
Кроме того, весь опыт использования нитрагина показал, что его эффективность часто бывает недостаточной высокой из-за того, что производственные штаммы, обладающие высокой нитрогеназной активностью и симбиотической эффективностью, в полевых условиях часто не способны конкурировать за образование клубеньков с находящимися в почве штаммами "дикого типа". Поэтому в настоящее время наибольший научный интерес и практическую значимость представляет выявление и изучение генетических детерминант, контролирующих количественные симбиотические признаки клубеньковых бактерий - эффективность симбиоза и нодуляционную конкурентоспособность.
Цели и задачи исследования. Цель настоящей работы заключалась в изучении генетических детерминант, вовлеченных в контроль симбиотической эффективности и нодуляционной конкурентоспособности клубеньковых бактерий люцерны (Sinorhizobium melilotí).
Конкретными задачами данной работы являлись:
1. Картирование на мегаплазмидах S. meliloli семи генов, мутации в которых приводят к повышению симбиотической эффективности и одного гена, мутация в котором приводит к снижению нодуляционной конкурентоспособности.
2. Клонирование в мультикопийных векторах мутантной и "дикой" копии гена стр-107, вовлеченного в контроль нодуляционной конкурентоспособности штамма СХМ1-105 S. meliloti. Определение и анализ нуклеотидных последовательностей клонированных фрагментов ДНК.
3. Проведение сайт-направленного мутагенеза гена стр-107 у родительского штамма СХМ1-105 и анализа конкурентоспособности у полученного мутанта. Комплементационный анализ гена стр-107 у мутанта Т107, обладающего сниженной конкурентоспособностью.
4. Анализ экспрессии гена стр-107, как в чистой культуре, так и в симбиотических условиях.
Научная новизна работы:
На мегаплазмидах S. meliloti картировано пять генов, мутации в которых приводят к повышению симбиотической эффективности штаммов и один ген, мутация в котором приводит к снижению нодуляционной конкурентоспособности. Показано, что еще два гена, мутации в которых приводят к повышению симбиотической эффективности, локализованы намегаплазмиде-1 за пределами nod-nif региона.
Впервые проведен детальный молекулярно-биологический анализ гена, мутация в котором приводит к снижению нодуляционной конкурентоспособности штамма СХМ1-105 S. meliloti при симбиозе с Medicago sativa. Доказано, что функционирование гена стр-107 действительно влияет на способность штамма СХМ1-105 конкурировать за образование клубеньков. Обнаружено, что ген стр-107 представляет собой самостоятельную транскрипционную единицу и кодирует заякоренный в клеточной мембране 45 кДа протеин, функция которого неизвестна. Показано, что ген стр-107 экспрессируется у свободноживущих клеток 5. meliloti, а также на самых ранних этапах становления симбиотических взаимоотношений, и не функционирует в азотфиксируюших бактероидах.
Практическая ценность:
На генетические карты мегаплазмид клубеньковых бактерий люцерны нанесено шесть новых генов, принимающих участие в контроле таких важнейших симбиотических признаков как эффективность и нодуляционная конкурентоспособность. Построенные карты сцепления несут дополнительную информацию о структуре генома клубеньковых бактерий люцерны, а картированные мутации могут быть использованы в качестве "опорных точек" для дальнейшего построения генетических карт мегаплазмид S. meliloti.
Выявлен и проанализирован ген стр-107, вовлеченный в контроль нодуляционной конкурентоспособности штамма СХМ1-105 S. meliloti. Проведение таких исследований способствует наиболее полному выявлению молекулярно-генетических основ ранних этапов симбиотического взаимодействия и создает предпосылки для направленного конструирования хозяйственно ценных штаммов клубеньковых бактерий.
Никто не подавал команды - все побежали, когда захотели. Трудно было понять, как и когда должно кончиться это состязание. (.) До до вдруг закричал:
- Бег окончен!
Все столпились вокруг него и, тяжело дыша, стали спрашивать:
- Кто же победил?
На этот вопрос Додо не мог ответить, не подумав как следует.
Л. Кэрролл "Приключения Алисы в Стране Чудес"
Заключение Диссертация по теме "Микробиология", Чижевская, Елена Петровна
ВЫВОДЫ.
1. С использованием Саузерн блот-гибридизационного и трансдукционного анализа на мегаплазмиде-2 Sinorhizobium meliloti картировано пять генов, мутации в которых приводят к повышению симбиотической эффективности.
2. С использованием метода конъюгации и Саузерн блот-гибридизационного анализа на мегаплазмиде-1 картирован ген стр-107, мутация в котором приводит к снижению конкурентоспособности штамма СХМ1-105 S. meliloti. Показано, что еще два гена, мутации в которых приводят к повышению симбиотической эффективности, локализованы на мегаплазмиде-1 за пределами nod-nif региона.
3. Проведено клонирование в мультикопийных векторах pTZ19R и pK18/woô мутантной и "дикой" копии гена стр-107, построены рестрикционные карты полученных рекомбинантных плазмид и определены нуклеотидные последовательности клонированных фрагментов.
4. Показано, что ген стр-107 представляет собой отдельную самостоятельную транскрипционную единицу и кодирует 45-кДа протеин, заякоренный в клеточной мембране. Обнаружено, что Стр107 имеет значительную гомологию с белками Sma0907 штамма Rml021 S. meliloti, Yp034 Rhizobium etli и Mlr9246 Mesorhizobium loti, функция которых неизвестна.
5. Проведен сайт-направленный мутагенез гена стр-107 у родительского штамма СХМ1-105 и комплементационный анализ мутанта Т107, с помощью которых показано, что функционирование гена стр-107 действительно влияет на способность штамма СХМ 1-105 конкурировать за образование клубеньков.
6. Сконструировано транскрипционное слияние cmp-107::gusA и установлено, что ген стр-107 экспрессируется у свободноживущих ризобиальных клеток и в клетках инфекционных нитей в корневых волосках Medicago sativa и не функционирует в азотфиксирующих бактероидах.
ЗАКЛЮЧЕНИЕ.
Представленная работа посвящена молекулярно-генетическому анализу Тп5 мутантов штаммов СХМ1-105 и СХМ1-188 БтогЫгоЫит теШоН, обладающих повышенной симбиотической эффективность (ЕГГ+) и сниженной нодуляционная конкурентоспособность (Сшр"). В данной работе, с использованием как классических генетических, так и молекулярно-биологических методов, мы картировали пять е//-мутаций на мегаплазмиде-2 и одну с/и/?-мутацию на мегаплазмиде-1.
Построение детальных генетических карт традиционно рассматривалось как конечная цель генетического изучения того или иного организма. Для чего же нужны генетические карты? Конечно, прежде всего они необходимы для планирования генетических экспериментов, т.к. наиболее рациональное проведение скрещиваний, которые при наименьших затратах труда и времени дадут необходимый результат, возможно только с учетом взаимного расположения генов. Информация, которую дают генетические карты, может быть полезной и при планировании молекулярно-биологических экспериментов, в частности, при клонировании генов, направленном мутагенезе и многих других генно-инженерных манипуляций. И, наконец, сравнение и анализ генетических карт микроорганизмов может дать ценную информацию для понимания путей эволюции геномов (Захаров, Мацелюх, 1986).
Кроме этого, в представленной работе мы провели детальный молекулярно-биологический анализ гена, мутация в котором приводит к снижению нодуляционной конкурентоспособности штамма СХМ1-105 5. теШой. Для этого были клонированы мутантная и "дикая" копии данного гена, определены и проанализированы их нуклеотидные последовательности, проведен комплементационный анализ и изучен характер экспрессии.
Проведение таких исследований позволит со временем полностью расшифровать молекулярно-генетические основы становления растительно-микробных симбиозов. Кроме фундаментального значения, проведение подобных исследований создает предпосылки для направленного конструирования хозяйственно ценных штаммов клубеньковых бактерий и сортов бобовых растений, способных максимально эффективно использовать потенциал симбиотического взаимодействия (Симаров и др., 1990; Проворов, Аронштам, 1991; Тихонович, Проворов, 1998).
Библиография Диссертация по биологии, кандидата биологических наук, Чижевская, Елена Петровна, Санкт-Петербург
1. Адаме М. Бактериофаги. -М.: ИЛ, 1961. -527 с.
2. Андронов Е.Е., Румянцева МЛ., Симаров Б.В. Генетическое разнообразие природной популяции Sinorhizobium meliloti, выявленное при анализе криптических плазмид и IS/?m2011-2-фингерпринтов // Генетика. 2001. Т. 37. № 5. С. 610-616.
3. Гааль Э., Мадьеши Г., Верецкеи JI. Электрофорез в разделении биологических макромолекул: Пер. с англ. -М.: Мир, 1982. -448 с.
4. Гловер Д. Клонирование ДНК. Методы: Пер. с англ. -М.: Мир, 1988. -538 с.
5. Доросинский JI.M. Конкурентная способность клубеньковых бактерий // Биологический азот в сельском хозяйстве СССР. -М.: Наука, 1989. С. 27-34.
6. Зарецкая А.Н. Метод трансформации как способ повышения активности клубеньковых бактерий люцерны // Микробиология. 1976. Т. 45. № 5. С. 873-878.
7. Затовская Т.В., Ушаков К.В., Юргель С.Н. и др. Получение Тп5-мутантов Rhizobium meliloti с измененным составом липополисахаридов и анализ их симбиотических свойств // Генетика. 1998. Т. 34. № 6. С. 742-748.
8. Захаров И.А., Мацелюх Б.П. Генетические карты микроорганизмов: Справочное пособие. -Киев: Наук. Думка, 1986. -252 с.
9. Злотников K.M. Изучение плазмид у штамма ДМ7 Rhizobium meliloti II Генетика. 1984. Т. 20. №4. С. 1607-1611.
10. Краснльников И.А., Кореняко А.И. О методах количественного учета клубеньковых бактерий в почве // Микробиология. 1940. Т. 9, С. 27-31.
11. Курчак О.Н., Проворов H.A., Симаров Б.В. Плазмида pSym 1 -32 Rhizobium leguminosarum bv. viciae, контролирующая азотфиксирующую актвность, эффективность симбиоза, конкурентоспособность и кислотоустойчивость // Генетика. 2001. Т. 37. № 9. С. 1225-1232.
12. Лакин Г.Ф. Биометрия. -М.: Высшая школа, 1980. -293 с.
13. Лаптев Г.Ю., Симаров Б.В. Картирование генетического фактора, контролирующего эффективность азотфиксации у клубеньковых бактерий люцерны // ДАН СССР. 1981. Т. 201. С. 207-210.
14. Маниатис Т., Фрич Э., Сэмбрук Дж. Методы генной инженерии. Молекулярное клонирование: Пер. с англ. -М.: Мир, 1984. -480 с.
15. Новикова Н.И., Симаров Б.В. Трансдукция у Rhizobium meliloti II Генетика. 1984. Т. 20. № 4. С. 542.
16. Новикова Н.И., Чеснокова О.Н., Сафронова В.И. и др. Трансдукция генов Rhizobium meliloti, маркированных Тп5, с помощью фага ф М12 // Генетика. 1989. Т. 25. № 12. С. 2121-2125.
17. Новикова Н.И., Симаров Б.В. Конкурентоспособность клубеньковых бактерий люцерны вприсутствии бактериофага//Докл. ВАСХНИЛ. 1990. № 6. С. 29-31.
18. Онищук О.П., Чеснокова О.Н., Шарыпова JI.A., Симаров Б.В. Генетический анализ мутанта Т37 Rhizobium meliloti, обладающего сниженной скоростью клубенькообразования и конкурентоспособностью// Генетика. 1990. Т. 26. № 3. С. 560-562.
19. Оннщук О.П., Симаров Б.В. Генетическая изменчивость нодуляционной конкурентоспособности у клубеньковых бактерий и ее использование в селекции // Генетика. 1995. Т. 31. № 3. С. 293303.
20. Онищук О.П., Симаров Б.В. Гены, контролирующие нодуляционную конкурентоспособность клубеньковых бактерий // Генетика. 1996. Т. 32. № 7. С. 1157-1166.
21. Онищук О.П., Курчак О.Н., Шарыпова JI.A. и др. Анализ различных типов конкурентоспособности у Тп5-мутантов клубеньковых бактерий люцерны (Sinorhizobium meliloti) II Генетика. 2001. Т. 37. № 11. С. 1507-1512.
22. Проворов H.A., Симаров Б.В., Федоров С.Н. Симбиотические свойства разных типов мутантов клубеньковых бактерий // Известия АН СССР, сер. биол. 1985. № 6. С. 870-884.
23. Проворов H.A., Симаров Б.В., Зарецкая А.Н. и др. Изменчивость культурных видов люцерны по способности к симбиотической азотфиксации // С.-х. биол. 1987. № 6. С. 29-32.
24. Проворов H.A., Аронштам A.A.; Под ред. Б.В. Симарова. Генетика симбиотической азотфиксации у клубеньковых бактерий // Итоги науки и техники, сер. микробиол. 1991. Т. 23. С. 3-97.
25. Сагуленко Е.А., Шарыпова JI.A., Кроль Е.А., Симаров Б.В. Клонирование генов "эффективности" Rhizobium meliloti с использованием вектора рК18mob II Генетика. 1998. Т. 34. № 7. С. 903-907.
26. Симаров Б.В., Аронштам A.A., Новикова H.H. и др. Генетические основы селекции клубеньковых бактерий / Под ред. Б.В. Симарова. -JI.: Агропромиздат, 1990. -192 с.
27. Симаров Б.В., Шарыпова JI.A., Чеснокова О.Н. и др. Анализ TnJ-мутантов клубеньковых бактерий люцерны с повышенной симбиотической эффективностью // Генетика. 1990а. Т. 26. № 4. С. 630-635.
28. Тихонович И.А., Проворов H.A. Генетика симбиотической азотфиксации с основами селекции. -СПб.: Наука, 1998. -194 с.
29. Федоров С.Н., Бутвина О.Ю., Симаров Б.В. Мутагенное действие УФ-излучения на клубеньковые бактерии люцерны и анализ симбиотических свойств полученных ауксотрофных мутантов // Генетика. 1983. Т. 19. № 5. С. 727-736.
30. Федоров С.Н., Симаров Б.В. Получение мутантов с измененными симбиотическими свойствами у Rhizobium meliloti под действием УФ-лучей // С.-х. биол. 1987. Т. 9. С. 44-49.
31. Четкова С.А., Тихонович И.А. Выделение и исследование штаммов Rhizobium leguminosarum, эффективных на горохах афганского происхождения // Микробиол. 1986. Т. 55. № 1. С. 143-147.
32. Чижевская Е.П., Кроль Е.А., Онищук О.П., и др. Физическое и генетическое картирование мутаций симбиотической эффективности на мегаплазмиде-2 штамма СХМ1 Rhizobium meliloti И Генетика. 1998. Т. 34. № 9. С. 1220-1227.
33. Шарыпова JI.A., Симаров Б.В. Транспозоновый мутагенез, векторы и молекулярное клонирование в изучении симбиотических свойств клубеньковых бактерий. Генет. пром.• микроорганизмов и биотехнол. 1990. С. 100-122.
34. Шарыпова JI.A., Симаров Б.В. Способ сравнения конкурентоспособности эффективных штаммов Rhizobium meliloti // Тр. ВНИИСХМ. 1985. Т. 55. С. 85-90.
35. Шарыпова Л.А., Симаров Б.В. Перспективы конструирования и выпуска в окружающую среду генетически модифицированных штаммов клубеньковых бактерий // Генетика. 1994. Т . 30. № И. С. 1445-1457.
36. Юргель С.Н., Шарыпова JI.A., Сырцова JI.A. и др. Дыхательная активность и симбиотическая эффективность у клубеньковых бактерий Rhizobium meliloti II Микробиология. 1996. Т. 65. №4. С. 517-521.
37. Юргель С.Н., Шарыпова JI.A., Симаров Б.В. Тп5 мутации Rhizobium meliloti, вызывающие повышение редокс-потенциала свободноживущих клеток и эффективность их симбиоза с люцерной // Генетика. 1998. Т. 34. № 6. С. 1-5.
38. Aguilar М.М., Ashby А.М., Richards A.J.M. et al. Chemotaxis of Rhizobium leguminosarum biovar phaseoli towards flavonoid inducers of the symbiotic nodulation genes // J. Gen. Microbiol. 1988. V. 134. P. 2741-2746.
39. Allen O.N. Experiments in soil bacteriology. -Minneapolis: Burges Publishing Co, 1959. -54 p.
40. Altschul S. F., Gish W., Myers E.W. Lipman D.J. Basic local alignment search tool // J. Mol. Biol. 1990. V. 215. P. 403-410.
41. Aman P., McNeil M., Franzen L. et al. Structural elucidation, using HPLC-MS and GLC-MS, of the acidic polysaccharide secreted by R. meliloti strain 1021 // Carbonydr. Res. 1981. V. 95. P. 263-282.
42. Amarger N. Competition for nodule formation between effective and ineffective strains of Rhizobium meliloti II Soil Biol. Biochem. 1981. V. 13. № 6. P. 475 480.
43. Amarger N., Lobreau J.P. Quantitative stady of nodulation competitiveness in Rhizobium strains // Appl. Environ. Microbiol. 1982. V. 44. P. 583-588.
44. Ames-Gottfred N.P., Christie B.R. Competition among strains of Rhizobium leguminosarum biovartrifolii and use of a diallel analysis in assessing competition // Appl. Environ. Microbiol. 1989. V. 55. № 6. P. 1599-1604.
45. Anthamatten D., Henneke H. The regulatory status of the fixL- and fixJ-Wkz genes in Bradyrhizobium japonicum may be different from that in Rhizobium meliloti // Mol. Gen. Genet. 1991. V. 225. № l.P. 38-48.
46. Anthamatten D., Scherb B., Henneke H. Characterization of a y?xL/-regulated Bradyrhizobium japonicum gene sharing similarity with the Escherichia coli fnr and Rhizobium meliloti JixK genes // J. Bacteriol. 1992. V. 174. № 7. P. 2111-2120.
47. Appleby C.A. The origin and functions of hemoglobin in plants // Sci. Progr. 1992. V. 76. P. 365-395.
48. Araujo R.S., Robleto E.A., Handelsman J.O. A hydrophobic mutant of Rhizobium etli altered on nodulation competitiveness and growth in the rhizospere //Appl. Environ. Microbiol. 1994. V. 60. № 5. P. 1430-1436.
49. Armitage J.P., Gallagher A., Johnston A.W.B. Comparison of the chemotactic behaviour of Rhizobium leguminosarum with and without the nodulation plasmid // Mol. Microbiol. 1988. V. 2. P. 743-748.
50. Atkinson E.M., Palcic M.M., Hindsgaul O., Long S.R. Biosynthesis of Rhizobium meliloti lipooligosaccharide Nod factors: NodA is required for an N-acyltransferase activity // PNAS. 1994. V. 91. P. 8418-8422.
51. Ayanaba A., Haugland R.A., Sadowsky M.J. et al. Rapid colored nodule assay for assessing root-exudate-enhanced competitiveness of Bradyrhizobium japonicum II Appl. Environ. Microbiol. 1986. V. 52. №4. P. 847-851.
52. Baev N., Kondorosi A. Nucleotide sequence of the Rhizobum meliloti nodL gene located in locus n5 of the nod- region // Plant. Mol. Biol. 1992. V. 18. P. 843-846.
53. Bahar M., Majnik J., Wexler M. et al. A model for the catabolism of rhizopine in Rhizobium leguminosarum involved a ferredoxin oxigenase complex and the inositol degradative pathway // MPMI. 1998. V. ll.№ 11. P. 1057-1068.
54. Banfalvi Z., Sakanyan V., Koncz C. et al. Location of nodulation and nitrogen fixation genes on a high molecular weight plasmid of R. meliloti II Mol. Gen. Genet. 1981. V. 184. P. 318 325.
55. Banfalvi Z., Randhawa G.S., Kondorosi E. et al. Construction and characterization of R-prime plasmids carrying symbiotic genes of R. meliloti I I Mol. Gen. Genet. 1983. V. 189. № 1. P. 129-135.
56. Banfalvi Z., Kondorosi E., Kondorosi A. Rhizobium meliloti carries two megaplasmids // Plasmid. 1985. V. 13. P. 129-138.
57. Barbour W.M., Elkan G.H. Physiological characteristics and competitive ability of plasmid-cured derivatives of Rhizobium fredii USDA206 // Arch. Microbiol. 1990. V. 154. № 1. P. 1-4.
58. Barnet M.J., Long Sh. R. Identification and characterization of a gene on Rhizobium meliloti pSyma, syrB, that negatively affects syrM expression // MPMI. 1997. V. 10. № 5. P. 550-559.
59. Barnet M.J., Fisher R.F., Jones T. et al. Nucleotide sequence and predicted functions of the entire Sinorhizobium meliloti pSymA megaplasmid // PNAS. 2001. V. 98. № 17. P. 9883-9888.
60. Batut J., Daveran-Mingot M-L., David M. et al. fixK, a gene gomologous with fnr and crp of E. coli, regulates nitrogen fixation genes both positively and negatively in Rhizobium meliloti // EMBO J. 1989. V. 8. P. 1279-1286.
61. Beattie G.A., Handelsman J.O. Evaluation of a strategy for identifying nodulation competitiveness genes in Rhizobium leguminosarum biovar phaseoli // J. Gen. Microbiol. 1993. V.139. № 3. P. 529-538.
62. Bec-Ferte M.P., Krishnan H.B., Prome D. Structures of nodulation factors from the nitrogen-fixing soybean symbiont Rhizobium fredii USDA257 // Biochemistry. 1994. V. 33. P. 11782-11788.
63. Becker A., Kleickmann A., Arnold W. et al. Analysis of the Rhizobium meliloti exoHlexoKlexoL fragment: ExoK shows homology to excreted endo-beta-l,3-l,4-glucanases and ExoH resembles membrane proteins // Mol Gen Genet. 1993. V. 238. № 1-2. P. 145-154.
64. Becker, A. Ruberg S., Kuster, H et al. The 32-kilobase exp gene cluster of Rhizobium meliloti directing the biosynthesis of galactoglucan: genetic organization and properties of the encoded gene products// J. Bacteriol. 1997. V. 179. P. 1375-1384.
65. Becquart-de Kozak L., Reuhs B.L., Buffard D. et al. Role of K-antigen subgroup of capsular polysaccharides in the early recognition process between Rhizobium meliloti and alfalfa leaves // MPMI. 1997. V. 10. P. 114-123.
66. Berg D.E., Davies J., Allet B., Rochaix J. D. Transposition of R-factor genes to bacteriophage // PNAS. 1975. V. 72. № 9. P. 3628-3632.
67. Beringer J.E. R1 transfer in Rhizobium leguminosarum II J. Gen. Microbiol. 1974. V. 84. P. 188-198.
68. Bertram-Drogatz P.A., Ruberg S., Becker A., Puhler A. The regulatory protein MucR binds to a short DNA region located upstream of the mucR coding region in Rhizobium meliloti // Mol. Gen. Genet. 1997. V. 254. P. 529-538.
69. Bhagwat A.A., Keister D.L. Identification and cloning of Bradyrhizobium japonicum genes expressed strain selectively in soil and rhizospere // Appl. Environ. Microbiol. 1992. V. 58. № 5. P. 1490-1495.
70. Birnboim H., Doly J. A rapid alcaline extraction procedure for screening recombinant plasmid DNA // Nucl. Acids Res. 1979. V. 7. P. 1513-1523.
71. Bissonnette L., Roy P.H. Characterization of InO of Pseudomonas aeruginosa plasmid pVSl, an ancestor of integrons of multiresistance plasmids and transposons of gram-negative bacteria // J. Bacteriol. 1992. V. 174. № 4. P. 1248-1257.
72. Bittinger M.A., Milner J.L., Saville B.J., Handelsman J. RosR, a determinant of nodulation competitiveness in Rhizobium etli II MPMI. 1997. V. 10. № 2. P. 180-186.
73. Bladergroen M.R., Spaink H.P. Genes and signal molecules involved in the rhizobia-Leguminoseae symbiosis //Current Opinion in Plant Biology. 1998. V. 1. P. 353-359.
74. Bloemberg G.V., Thomas-Oates J.E., Lugtenberg B.J.J. et al. Nodulation protein NodL of Rhizobium leguminosarum O-acetylates lipooligosaccharides // Mol. Microbiol. 1994. V. 11. P. 793-804.
75. Boivin C., Camut S., Malpuka C.A. et al. Rhizobium meliloi genes encoding catabolism of trigonellina are induced under symbiotic conditions // Plant Cell. 1990. V. 2. P. 1157-1170.
76. Boivin CM Barran L.R., Malpuka C.A., Rosenberg C. Genetic analysis of a region of the Rhizobium meliloti pSym plasmid specifying catabolism of trigonelline, a secondary metabolite present in legumes // J. Bacteriol. 1991. V. 173. P. 2809-2817.
77. Boogerd F.C., Van Rossum D. Nodulation of groundnut by Bradyrhizobium: a simple infection process by crack enttry//FEMS Microbiol. Rev. 1997. V. 21. P. 5-27.
78. Borthakur D., Gao X.F. A 150-megadalton plasmid in Rhizobium etli strain TALI82 contains genesfor nodulation competitiveness on Phaseolus vulgaris L. // Can. J. Microbiol. 1996. V. 42. № 9. P. 903-910.
79. Bosworth A.H., Williams M.K., Albrecht K.A. et al. Alfalfa yield response to inoculation with recombinant strains of Rhizobium meliloti with an extra copy of dctABD and/or modified ni/A expression // Appl. Envir. Microbiol. 1994. V. 60. P. 3815-3832.
80. Breedveld M.W., Cremers H.C., Batley M. et al. Polysaccharide synthesis in relation to nodulation behavior of Rhizobium leguminosarum // J Bacteriol. 1993. V. 175. № 3. P. 750-757.
81. Breedveld M.W., Miller K.J. Cyclic y?-glucans of members of the family Rhizobiaceae // Microbiol. Rev. 1994. V. 58. P. 145-165.
82. Breil B.T., Ludden P.W., Triplett E.W. DNA sequence and mutational analysis of genes involved in the production and resistance of the antibiotic peptide trifolitoxin // J. Bacteriol. 1993. V. 175. № 12. P. 3693-3702.
83. Breil B.T., Borneman J., Triplett E.W. A newly discovered gene, tfuA, involved in the production of the ribosomally synthesized peptide antibiotic trifolitoxin // J. Bacteriol. 1996. V. 178. № 14. P. 4150-4156.
84. Brewin N.J., Wood E.A., Young J.P.W. Contribution of the symbiotic plasmid to the competitiveness of Rhizobium leguminosarum II Gen. Microbiol. 1983. V. 129. P. 2973-2977.
85. Brewin N.J. Hydrogenase and energy efficiensy in nitrogen-fixing symbiosis. In: Plant Gene Research: Genes Involved in Microbe-Plant Interaction. Edited by D.P.S. Verma and T. Hohn. SpringerVerlag, N.Y. 1984. P. 179-203.
86. Brink B.A., Miller J., Carlson R.W., Noel K.D. Expression of Rhizobium leguminosarum CFN42 genes for lipopolysaccharide in strains derived from different R. leguminosarum soil isolates // J. Bacteriol. 1990. V. 172. P. 548-555.
87. Bromfield E.S.P., Rao J.V., Kumar D.K. Studies on fast and slow growing Rhizobium spp. nodulating Cajanus cajan and Cicer arietinum II Ann. Appl. Biol. 1983. V. 102. № 3. P. 485-493.
88. Bromfield E.S.P. Variation in preference for Rhizobium meliloti within and between Medicago sativa cultivars grown in soil // Appl. Environ. Microbiol. 1984. V. 48. № 6. P. 1231-1236.
89. Bromfield E.S.P., Lewis D.M., Barran L.R. Cryptic plasmid and rifampin resistance in Rhizobium meliloti influencing nodulation competitiveness// J. Bacteriol. 1985. V. 164.№ 1. P.410-413.
90. Broughton W.J., Perret X. Genealogy of legume-Rhizobium symbioses // Curent Opinion in Plant Biology. 1999. V. 2. P. 305-311.
91. Broughton W.J., Jabbouri S., Perret X. Keys to symbiotic harmony Hi. Bacteriol. 2000. V. 182. №20. P. 5641-5652.
92. Brown P.D., Ahmad M.H. Competitive interaction among strains of Rhizobium leguminosarum bv. phaseoli in the nodulation of kidney beans (Phaseolus vulgaris L.) // Biol. Fértil. Soils. 1996. V. 21. № 1-2. P. 7-9.
93. Buikema W.J., Klingensmith J. A., Gibbons S.L., Ausubel F.M. Conservation of structure and location of Rhizobium meliloti and Klebsiella pneumoniae rtifB gene // J. Bacteriol. 1987. V. 169. P. 1120-1126.
94. Burkardt B., Burkardt H.J. Visualization and exact molecular weight determination of a Rhizobium meliloti symbiotic megaplasmids // J. Mol. Biol. 1984. V. 175. P. 213-218.
95. Caetano-Anolles G., Wall L.G., De Micheli A.T. et al. Role of motility and chemotaxis in efficiency of nodulation by Rhizobium meliloti II Plant Physiol. 1988. V. 86. P. 1228-1235.
96. Caetano-Anolles G., Crist-Estes D.K., Bauer W.D. Chemotaxis of Rhizobium meliloti to the plant flavone luteolin requires functional nodulation genes// J. Bacteriol. 1988a. V. 170. P. 3164-3169.
97. Canter-Cremers H., Wijffelman C.A., Pees E. et al. Host specific nodulation of plants of the pea cross-inoculation group is influenced by genes in fast growing Rhizobium downstream nodC II J. Plant. Physiol. 1988. V. 132. № 4. P. 398-404.
98. Capela D., Barloy-Hubler FM Gatius M.-T. et al. A high-density physical map of Sinorhizobium meliloti 1021 chromosome derived from bacterial artificial chromosome library//PNAS. 1999. V. 96. P. 9357-9362.
99. Carlson R.W., Reuhs B., Chen T.-B. et al. Lipopolysaccharide core structures in Rhizobium etli and mutants deficient in O-antigen //J. Biol. Chem. 1995. V. 270. P. 11783-11788.
100. Castillo M., Flores M., Mavingui P. et al. Increase in alfalfa nodulation, nitrogen fixation, and plant growth by specific DNA amplification in Sinorhizobium meliloti II Appl. Environ. Microbiol. 1999. V. 65. №6. P. 2716-2722.
101. Cevallos M.A., Encarnación S., Leija, A. et al. Genetic and physiological characterization of a Rhizobium etli mutant strain unable to synthesize poly-P-hydroxybutyrate//J. Bacteriol. 1996. V. 178. P. 1646-1654.
102. Charles T.C., Finan T.M. Genetic map of Rhizobium meliloti megaplasmid pRmeSU47b // J. Bacteriol. 1990. V. 172. P. 2469-2476.
103. Charles T.C., Finan T.M. Analysis of a 1600-kilobase Rhizobium meliloti megaplasmid using defined deletions generated in vivo II Genetics. 1991. V. 127. P. 5-20.
104. Cheetham B.F., Tattersall D.B., Bloomfield G.A. et al. Identification of a gene encoding a bacteriophage-related integrase in a vap region of the Dichelobacter nodosus genome // Gene. 1995. V. 162. P. 53-58.
105. Cheng Ge, Fan Hui, Xu Lingmee. A competition between fast- and slow-growing soybean rhizobia for nodulation an occurence frequence of fast-growing soybean rhizobia in the field of China // Trans. 13
106. Congr. Int. Soc. Soil Sei. Hamburg. 1986. V. 2. P. 572-573.
107. Clarke H.R.G., Leigh J.A., Douglas C.J. Molecular signals in the interactions between plants and microbes//Cell. 1992. V. 71. № 2. P. 191-199.
108. Cleyetmarel J.C., Crozat Y., Pinochet X. Ability of two Bradyrhizobium japonicum strains to persist in soil and nodulate soybeans after dual inoculation // Biol. Fertil. Soils. 1995. V. 20. № 4. P. 289-293.
109. Clover R., Kieber J., Signer E.R. Lipopolysaccharide mutants of Rhizobium meliloti are not defective in symbiosis // J. Bacteriol. 1989. V. 171. P. 3961-3967.
110. Cohn J., Stokkermans T., Kolli V. K. et al. Aberrant nodulation response of Vigna umbellata to a Bradyrhizobium japonicum NodZ mutant and nodulation signals // MPMI. 1999. V. 12. P. 766-773.
111. Colonna-Romano S., Arnold W., Schulter A. et al. An FNR-like protein encoded in Rhizobium leguminosarum bv. viciae shows homology to Rhizobium meliloti FixK //Mol.Gen.Genet. 1990. V. 223. P. 138-147.
112. Cordovilla M.D.P., Ligero F., Lluch C. Effect of salinity on growth, nodulation and nitrogen assimilation in nodules of faba bean (Vicia faba L.) // Appl. Soil Ecol, 1999. V. 11. P. 1-7,
113. Corvera A., Prome D., Prome J.-C. et al. The nolL gene from Rhizobium etli determines nodulation efficiency by mediating the acetylation of the fucosyl residue in the nodulation factor // MPMI. 1999. V. 12. P. 236-246.
114. Cregan P.B., Keyser H.H. Influence of Glycine spp. on competitiveness of Bradyrhizobium japonicum and Rhizobium fredii II Appl. Environ. Microbiol. 1988. V. 54. № 3. P. 803-808.
115. David M., Daveran M.-L., Batut J. et al. Cascade regulation of nif gene expression in Rhizobium meliloti II Cell. 1988. V. 54. P. 671-683.
116. Davis E.O., Evans I.J., Johnston A.W.B. Identification of nodX, a gene that allows Rhizobium leguminosarum biovar viciae strain TOM to nodulate Afganistan peas // Mol. Gen. Genet. 1988. V. 212. P. 531-535,
117. Davis E.O., Johnston A.W.B. Regulatory of the 3 nodD genes of Rhizobium leguminosarum bv. phaseolill Mol. Microbiol. 1990. V. 4. P. 933-941.
118. Dazzo F.B., Truchet G.L., Hollingsworth R.I. et al. Rhizobium lipopolysaccharide modulates infection thread development in white clover root hairs // J. Bacteriol. 1991. V. 173. № 17. P. 5371-5384.
119. De Jong T.M., Brewin N.J., Johnston A.W.B., Phillips D.A. Improvement of symbiotic properties in Rhizobium leguminosarum by plasmid transfer // J. Gen. Microbiol. 1982. V. 128. № 8. P. 1829-1838.
120. De Ley, J., Rassel A. DNA base composition, flagellation and taxonomy of the genus Rhizobium II J.
121. Gen. Microbiol. 1965. V. 41. P. 85-91.
122. Demont N., Debelle F., Aurelle H. et al. Role of the Rhizobium meliloti nodF and nodE genes in the biosynthesis of lipooligosaccharidic nodulation factors III. Biol. Chem. 1993. V. 268. P. 20134-20142.
123. Denarie J., Debelle FM Rossenberg C. Signaling and host range variation in nodulation // Annu. Rev. Microbiol. 1992. V. 46. P. 497-531.
124. Denefle P., Kush A., Norel F. et al. Biochemical and genetic analysis of the nifHDKE region of Rhizobium ORS571 // Mol. Gen. Genet. 1987. V. 207. P. 280-287.
125. De Oliveira L.A., Graham P.H. Speed of nodulation and competitive ability among strains of R. leguminosarum bv. phaseoli II Arch. Microbiol. 1990. V.153. P. 311-315.
126. De Oliveira L.A., Graham P.H. Evaluation of strain competitiveness in Rhizobium leguminosarum bv. phaseoli using a noctfix natural mutant // Arch. Microbiol. 1990a. V. 153. P. 305-310.
127. De Vos G.F., Walker G.C., Signer E.R. Genetic manipulations in Rhizobium meliloti utilizing two new transposon Tn5 derivatives // Mol. Gen. Genet. 1986. V. 204. № 3. P. 485-491.
128. D'Haeze W., Gao M., De Rycke R. et al. Roles for azorhizobial Nod factors and surface polysaccharides in intercellular invasion and nodule penetration, respectively // MPMI. 1998. V. 11. P. 9991008.
129. Dharmatilake A.J., Bauer W.D. Chemotaxis of Rhizobium meliloti towards nodulation gene inducing compounds from alfalfa roots // Appl. Environ. Microbiol. 1992. V. 58. № 4. P. 1153-1158.
130. D'hooghe I., Michiels J., Vlassak K. et al. Structural and functional analysis of the fixLJ genes of Rhizobium leguminosarum biovar phaseoli CNPAF512 // Mol. Gen. Genet. 1995. V. 249. № 1. P. 117-126.
131. Djordjevic S.P., Rolfe B.G., Batley M., Redmond J.W. The structure of the exopolysaccharide from Rhizobium sp. strain ANU280 (NGR234) // Carbohydr. Res. 1986. V. 148. P. 87-99.
132. Doherty D., Leigh J.A., Glazebrook J., Walker G.C. Rhizobium meliloti mutants that overproduce the R. meliloti acidic calcofluor-binding exopolysaccharide // J Bacteriol. 1988. V. 170. № 9. P. 4249-4256.
133. Donald R.G.K., Nees D.W., Raymond C.K. et al. Characterization of three genomic loci encoding Rhizobium sp. Strain ORS571 N2 fixation genes // J. Bacteriol. 1986. V. 165. P. 71-81.
134. Dowling D.N., Stanley J., Broughton W.J. Competitive nodulation blocking of Afghanistan pea is determined by nodDABC and nodEF alleles in Rhizobium leguminosarum II Mol. Gen. Genet. 1989. V. 216. P. 170-174.
135. Drevon J.J., Kalia V.C., Heckmann M.O. et al. Influence of Bradyrhizobium japonicum hydrogen-nase on the growth of Glycine and Vigna species // Appl. Environ. Microbiol. 1987. V. 53. P. 610-612.
136. Dusha I., Olah B., Szegletes Z. et al. syrM is involved in the determination of the amount and ratio of the two forms of the acidic exopolysaccharide EPSI in Rhizobium meliloti IIMPMI. 1999. V. 12. P. 755-765.
137. Earl C.D., Ronson C.W., Asubel F.M. Genetic and structural analisys of the Rhizobium meliloti fixA,fixB,fixC and fixXgenes // J. Bacteriol. 1987. V. 169. P. 1127-1136.
138. Eckhardt T. A rapid method for the identification of plasmid desoxyribonucleic acid in bacteria // Plasmid. 1978. V. 1. P. 584-588.
139. Eisbrenner G., Evans H.J. Aspects of hydrogen metabolism in nitrogen-fixing legumes and other plant-microbe associations//Annu. Rev. Plant Physiol. 1983. V. 34. P. 105-136.
140. Eisenschenk L., Diebold R., Perz-Lesher J. et al. Inhibition of Rhizobium etli polysaccharide mutants by Phaseolus vulgaris root compounds // Appl. Environ. Microbiol. 1994. V. 60. P. 3315-3322.
141. Engelke T.H., Jagadish M.N., Puhler A. Biochemical and genetical analysis of Rhizobium meliloti mutants defective in C4-dicarboxylate transport//J. Gen. Microbiol. 1987. V. 133. C. 3019-3029.
142. Engelke T.H., Jording D., Kapp D., Puhler A. Identification and sequence analysis of the Rhizobium meliloti dctA gene encoding the C4-dicarboxylate carrier // J. Bacteriol, 1989. V. 171. P. 55515560.
143. Evans H.J., Barnet Y.M., Vincent J.M. Effect of a bacteriophage on colonization and nodulation of clover roots by paired strains of Rhizobium trifolii II Can. J. Microbiol. 1979. V. 25. № 9. P. 974-978.
144. Evans H.J., Harker A.R., Papen H. et al. Physiology, biochemistry, and genetics of the uptake hydrogenasa in Rhizobiall Annu. Rev. Microbiol. 1987. V. 41. P. 335-361.
145. Faucher C., Maillet F., Vasse J. et al. Rhizobium meliloti host-range nodH gene determines production of an alfalfa-specific extracellular signal //J. Bacteriol. 1988. V. 170. № 12. P. 5489-5499.
146. Finan T.M., Hartwieg E., Lemieux K. et al. General transduction in Rhizobium meliloti II J. Bacteriol. 1984. V. 159. P. 120-124.
147. Finan T.M., Hirsch A.M., Leigh J.A. et al. Second symbiotic megaplasmid in Rhizobium meliloti carrying exopolysaccharide and thiamine synthesis genes // J. Bacteriol. 1986. V. 167. P. 66-72.
148. Finan T.M., Weidner S., Wong K. et al. The complete sequence of the 1,638-kb pSymB megaplasmid from the N2-fixing endosymbiont Sinorhizobium meliloti II PNAS. 2001. V. 98. № 17. P. 9889-9894.
149. Fischer H. M. Genetic regulation of nitrogen fixation in Rhizobium II Microbiol. Reviews. 1994. V. 58. № 3. P. 352-386.
150. Fleischmann R.D., Adams M.D., White O. et al. Whole-genome random sequencing and assembly of Haemophilus influenzae Rd // Science. 1995. V. 269. P. 496-512.
151. Foussard M., Garnerone A-M., Ni F. et al. Negative autoregulation of the Rhizobium meliloti fixK gene is indirect and requires a newly identified regulator, flxT/l Mol. Microbiol. 1997. V. 25. P. 27-37.
152. Freiberg C., Fellay R., Bairoch A. et al. Molecular basis of symbiosis between Rhizobium and legumes//Nature. 1997. V. 387. P. 394-401.
153. Fry J., Wood M., Poole P.S. Investigation of myoinositol catabolism in Rhizobium leguminosarum bv. viciae and its effect on nodulation competitiveness//MPMI. 2001. V. 14. № 8. P. 1016-1025.
154. Galbraith M.P., Feng S.F., Borneman J. et al. A functional myo-inositol catabolism pathway Is essential for rhizopine utilization by Sinorhizobium meliloti II Microbiol. 1998. V. 144. № 10. P. 2915-2924.
155. Gallagher P.G., Turetsky TM Mentzer W.C. Genomic organization and 5*-flanking DNA sequence of the murine stomatin gene (Epb72) // Genomics. 1996. V. 34. P. 410-412.
156. Gao W.M., Yang S.S. A Rhizobium meliloti strain that nodulates and fixes nitrogen in association with alfalfa and soybean plants //Microbiol. 1995. V. 141. P. 1957-1962.
157. Gao X., Borthakur D. Discrete differences between strains of different Rhizobium spp. for competitive nodule occupancy on beans // World J. Microbiol. Biotechnol. 1995. V. 11. № 6. P. 681-682.
158. Galibert F., Finan T.M., Long S.R. et al. The composite genome of the legume symbiont Sinorhizobium meliloti II Science. 2001. V. 293. P. 668-672.
159. Galinier A., Garnerone A.M., Reyrat J.M. Phosphorylation of the Rhizobium meliloti FixJ protein induces its binding to a compound regulatory region at the/o^T promoter// J. Biol Chem. 1994. V. 269. № 38. P. 23784-23789.
160. GarcHa-Rodriguez F.M., Toro N. Sinorhizobium meliloti nfe (nodulation formation efficiency) genes exhibit temporal and spatial expression patterns similar to those of genes involved in symbiotic nitrogen fixation // MPMI. 2000. V. 13. № 6. P. 583-591.
161. Garg F.C., Beri N., Tauro P. Intrinsic antibiotic resistance in chickpea (Cicer arietinum) rhizobia // J. Agr. Sci. 1985. V. 105. № 1. P. 85-89.
162. Garnerone A.M., Cabanes D., Foussard M. et al. Inhibition of the FixL sensor kinase by the FixT protein in Sinorhizobium meliloti II J. Biol. Chem. 1999. V. 274. P. 32500-32506.
163. Garrido M.C., Herrero M. Kolter R., Moreno F. The export of the replication inhibitor microcin
164. B17 provides immunity for the host cell U EMBO J. 1988. V. 7. P. 1853-1862.
165. Genilloud O., Moreno F., Kolter R. DNA sequence, products, and transcriptional pattern of the genes involved in production of the DNA replication inhibitor microcin B17// J. Bacteriol. 1989. V. 171. P. 1126-1135.
166. George D.G., Hunt L.T., Yeh L.-S.L., Barker W.C. New perspectives on bacterial ferredoxin evolution//J. Mol. Evol. 1985. V. 22. P. 20-31.
167. George T., Bohlool B.B., Singleton P.W. Bradyrhizobium japonicum environment interactions: nodulation and interstrain competition in soils along an elevational transect // Appl. Environ. Microbiol. 1987. V. 53. №5. P. 1113-1117.
168. Geremia R.A., Mergaert P., Geelen D. et al. The NodC protein of Azorhizobium caulinodans is an Af-acetylglucosaminyltransferase // PNAS. 1994. V. 91. P. 2669-2673.
169. Gigova L., Petrova N., Vassileva VM Ignatov G. Symbiotic properties of antibiotic-resistant mutants of Rhizobium galegae II Biologia Plantarum. 1998. V. 40. N 3. P. 433-440.
170. Girard M L., Flores M., Brom S. et al. Structural complexity of the symbiotic plasmid of Rhizobium leguminosarum bv. phaseoli II J. Bacteriol. 1991. V. 173. № 8. P. 2411-2419.
171. Glazebrook J., Walker G.C. Genetic techniques in Rhizobium meliloti II Methods in Enzymology. 1991. V. 204. P. 399-418.
172. Glenn A.R., Brewin N.J. Succinate-resistant mutants of Rhizobium leguminosarum II J. Gen. Microbiol. 1981. V. 126. № 1. P. 237-241.
173. Gloux K., Le Rudulier D. Transport and catabolism of proline betaine in salt-stressed Rhizobium meliloti II Arch. Microbiol. 1989. V. 151. P. 143-148.
174. Glucksmann M.A., Reuber T.L., Walker G.C. Family of glycosyl transferases needed for the synthesis of succinoglycan by Rhizobium meliloti IIJ Bacteriol. 1993. V. 175. № 21. P. 7033-7044.
175. Glucksmann M.A., Reuber T.L., Walker G.C. Genes needed for the modification, polymerization, export, and processing of succinoglycan by Rhizobium meliloti: a model for succinoglycan biosynthesis // J Bacteriol. 1993a. V. 175. № 21. P. 7045-7055.
176. Goethals K. Leyman B., Eede G.V.D. et al. An Azorhizobium caulinodans ORS571 locus involved in lipopolysaccharide production and nodule formation on Sesbania rostrata stems and roots // J. Bacteriol. 1994. V. 176. № 1. P. 92-99.
177. Goldmann A., Lecoeur L., Message B. et al. Simbiotic plasmid genes essential to the catabolism of proline bataine, or stachydrine, are also required for efficient nodulation by Rhizobium meliloti II FEMS Microbiol. Lett. 1994. V. 115. P. 305-312.
178. Goodman S.L., Axtell K.M., Bindoff L.A. et al. Molecular cloning and expression of a cDNA encoding human electron transfer flavoprotein uibiquinone oxidoreductase // Eur. J. Biochem. 1994. V. 219. P. 277-286.
179. Gordon D.M., Ryder M.H., Heinrich K., Murphy P.J. An experimental test of the rhizopine concept in Rhizobium meliloti II Appl. Environ. Microbiol. 1996. V. 62. P. 3991-3996.
180. Gottfert M., Lamb J.W., Gasser R. et al. Mutational analysis of the Bradyrhizobium japonicum common nod genes and further «ofifoox-linked genomic DNA regions // Mol. Gen. Genet. 1989. V. 215. № 3. P. 407-415.
181. Grant S.G.N., Jessee J., Bloom F.R. et al. Differential plasmid rescue from transgenic mouse DNAs into Escherichia coli methylation-restriction mutant // PNAS. 1990. V. 87. P. 4645-4649.
182. Green J., Sharrocks A.D., Green B. et al. Properties of FNR proteins substituted at each of the five cisteine residues // Mol. Microbiol. 1993. V. 8. P. 61-68.
183. Groarke J. M., Mahoney W.C., Hope J.N. et al. The amino acid sequence of D-ribose-binding protein from Escherichia coli K12 // J. Biol. Chem. 1983. V. 258. P. 12952-12956.
184. Gross D.C., Vidaver A.K. Bacteriocin like substances produced by Rhizobium japonicum and other slow-growing rhizobia//Appl. Environ. Microbiol. 1978. V. 36. P. 936-943.
185. Gubler M., Hennecke H.jixA, B and C genes are essential for symbiotic and free-living microaerobic nitrogen fixation // FEBS Lett. 1986. V. 200. P. 186-192.
186. Guerinot M.L., Chelm B.K. Molecular aspects of the physiology of symbiotic nitrogen fixation in legumes//MPMI. 1987. V. 2. P. 103-146.
187. Gurta R.P., Kaiza M.S., Bhandari S.C. et al. Intrinsic multiple antibiotic resistance markers for competitive end effectiveness studies with various strains of mung bean rhizobia // J. Biosci. 1983. V. 5. № 3. P. 253-260.
188. Hahn M., Studer D. Competitiveness of a Nif Bradyrhizobium japonicum mutant against the wildtype strain//FEMS Microbiol. Lett. 1986. V. 33. № 1. P. 143-148.
189. Hahn M., Hennecke H. Cloning and mapping of a novel nodulation region from Bradyrhizobium japonicum by genetic complementation of a deletion mutant // Appl. Environ. Microbiol. 1988. V. 54. № 1. P. 55-61.
190. Handelsman J., Ugalde R.A., Brill W.J. Rhizobium meliloti competitiveness and the alfalfa agglutinin//J. Bacterid. 1984. V. 157. № 3. P. 703-707.
191. Hanukoglu I., Gutfinger T. cDNA sequence of adrendoxin reductase. Identification of NADP-binding sites in oxidoreductases // Eur. J. Biochem. 1989. V. 180. P. 479-484.
192. Hardarson G., Heichel G.H., Vance C.P., Barnes D.K. Evaluation of alfalfa and Rhizobium meliloti for compatibility in nodulation and nodule effectiveness // Crop Sci. 1981. V. 21. № 4. P. 562-567.
193. Hartwig U.A., Joseph C.M., Phillips D.A. Flavonoids released naturally from alfalfa seeds enhance growth rate of Rhizobium meliloti II Plant Physiol. 1991. V. 95. P. 797-803.
194. Hashem F.M., Angle J.S. Phage effects on nodulation and soybean growth: field studies // Abstr. Annu. Meet. Amer. Soc. Microbiol., 86-th Annu. Meet., Washington: D.C. 1986. P. 145.
195. Hawkins F.K.L., Kennedy C., Johnston A.W.B. A Rhizobium leguminosarum gene required for symbiotic nitrogen fixation, melanin synthesis and normal growth on certain growth media // J. Gen. Microbiol. 1991. V. 137. P. 1721-1728.
196. Her G.R., Glazebrook J., Walker G., Reinhold V.N. Structural studies of a novel exopolysaccharide produced by a mutant of Rhizobium meliloti strain Rml021 // Carbohydr. Res. 1990. V. 198. P. 305-312.
197. Hernandez B.S., Poth M., Focht D.D. Increased effectiveness of competitive Rhizobium strains upon inoculation of Cajanus cajan II Appl. Environ. Microbiol. 1987. V. 53. № 9. P. 2066-2068.
198. Herreracervera J.A., Rodriguezalonso F.I., Olivares J., Sanjuan J. Evaluation of the recA-based containment system in Rhizobium meliloti GR4 // FEMS Microb. Ecol. 1997. V. 22. № 1. P. 49-56.
199. Hiroaki I., Nogima H., Okayama H. High efficiency transformation of Escherichia coli with plasmids // Gene. 1990. V. 96. P. 23-28.
200. Hirsch A.M. Role of the lectins (and rhizobial exopolysaccharides) in legume nodulation // Curent Opinion in Plant Biology. 1999. V. 2. P. 320-326.
201. Hirsch P.R. PJasmid determined bacteriocin production by Rhizobium leguminosarum II J. Gen. Microbiol. 1979. V. 113. P. 219-228.
202. Hogg B., Davies A.E., Wilson K. et al. Competitive nodulation blocking of cv. Afganistan pea is related to high levels of nodulation factors made by some strains of Rhizobium leguminosarum bv. viciae II MPMI. 2001. V. 15. № 1. P. 60-68.
203. Hogg R.W., Voelker C., Carlowitz I.V. Nucleotide sequence and analysis of the mgl operon of Escherichia coli K12 // Mol. Gen. Genet. 1991. V. 229. P. 453-459.
204. Hollingsworth R.I., Dazzo F.B., Hallenga K., Mussel man B. The complete structure of the trifoliin A lectin-binding capsular polysaccharide of Rhizobium trifolii 843 // Carbohydr. Res. 1988. V. 172. P. 97112.
205. HoIIoway B.W. Plasmids that mobilize bacterial chromosome // Plasmid. 1979. V. 2. № 1. P. 1-19.
206. Hubac CM Ferran J., Guerrier D. et al. Luteolin absorption in Rhizobium meliloti wild-type and mutant strains//J. Gen. Microbiol. 1993. V. 139. №7. P. 1570-1578.
207. Hubac C., Ferran J., Tremolieres A., Kondorosi A. Luteolin uptake by Rhizobium meliloti: evidence for several steps including an active extrusion process // Microbiol. 1994. V. 140. P. 2769-2774.
208. Hungría M., Stacey G. Molecular signals exchanged between host plants and rhizobia: basic aspects and potential application in agriculture // Soil Biol. Bichem. 1997. V. 29. № 5-6. P. 819-830.
209. Hungría M., Boddey L.H., Santos M.A., Vargas M.A.T. Nitrogen fixation capacity and nodule occupancy by Bradyrhizobium japonicum and B. elkanii strains // Biol. Fértil. Soil. 1998. V. 27. № 4. P. 393399.
210. Hunter W.J., Fahring C.J. Movement by Rhizobium and nodulation of legumes // Soil Sci. Biochem. 1980. V. 12. P. 537.
211. Hynes M.F., Simon R., MuIIer P. et al. The two megaplasmids of Rhizobium meliloti are involved in the effective nodulation of alfalfa // Mol. Gen. Genet. 1986. V. 202. № 2. P. 356-362.
212. Hynes M.F., McCregor N.F. Two plasmids other than the nodulation plasmid are necessary for formation of nitrogen-fixing nodules by Rhizobium leguminosarum II Mol. Microbiol. 1990. V. 4. P. 567574.
213. Ish-Horovics D., Burke J.F. Rapid and efficient cosmid cloning // Nucl. Acids Res. 1981. V. 9. P. 2989-2998.
214. Israel D.W., Mathis J.N., Barbour W.M. et al. Symbiotic effectiveness and host-strain interactions of Rhizobium fredii USDA191 on different soybean cultivars // Appl. Environ. Microbiol. 1986. V. 51. P. 898-903.
215. Issa S., Simmonds L.P., Wood M. Passive movement of chickpea and bean rhizobia through soil // Soil Biol. Biochem. 1993. V. 25. P. 959-965.
216. Jimenez-Zurdo J.I., Vandillewijn P., Soto M.J. et al. Characterization of a Rhizobium meliloti proline dehydrogenase mutant altered in nodulation efficiency and competitiveness on alfalfa roots // MPMI. 1995. V. 8. № 4. P. 492-498.
217. John M., Rohrig H., Schmidt J. et al. Rhizobium NodB protein involved in nodulation signal synthesis is a chitooligosaccharide deacetylase // PNAS. 1993. V. 90. P. 625-629.
218. Jorgensen R.A., Rothstein S.J., Reznikoff W.S. A restriction enzyme cleavage map of Tn5 and location of region encoding neomycin resistance // Mol. Gen. Genet. 1979. V. 177. P. 65-72.
219. Julliot J.S., Boistard P. Use of RP4-prime plasmids constructed in vitro to promote a polarized transfer of the chromosome in Escherichia coli and Rhizobium meliloti II Mol. Gen. Genet. 1979. V. 173. № 3. P. 289-298.
220. Kahn D., Batut J., Daveran M.L., Fourment J. Structure and regulation of the fixNOQP operon of Rhizobium meliloti II In: New Horizons in Nitrogen Fixation, Palacois R., Mora J., Newton W.E. (eds), Kluver Academic Publishers. 1993. P. 474.
221. Kaminski P.A., Glmerich C. Involvement of fixLJ in the regulation of nitrogen fixation in Azorhizobium caulinodans II Mol. Microbiol. 1991. V. 5. № 3. P. 665-673
222. Kamst E., van der Drift K.M.G.M., Thomas-Oates J.M. et al. Mass spectrometric analysis of chitin oligosaccharides produced by Rhizobium NodC protein in Escherichia coli /I J. Bacteriol. 1995. V. 177. P. 6282-6285.
223. Kaneko T., Nakamura Y., Sato S. et al. Complete genome structure of the nitrogen-fixing symbiotic bacterium Mesorhizobium loti II DNA Res. 2000. V. 7. № 6. P. 331-338.
224. Katz M.E., Strugnell R.A., Rood J.I. Molecular characterization of a genomic region associated with virulence in Dichelobacter nodosus II Infect. Immun. 1992. V. 60. P. 4586-4592.
225. Keller M., Roxlau A., Weng W.M. et al. Molecular analisis of the Rhizobium meliloti mucR gene regulating the biosynthesis of the exopolysaccharides succinoglycan and galactoglucan // MPMI. 1995. V. 8. № 2. P. 267-277.
226. Kiss G.B., Dobo K., Dusha I. et al. Isolation and characterization of an R-prime plasmid in Rhizobium meliloti II J. Bacteriol. 1980. V. 141. № 1. P. 121-128.
227. Kiss E., Reuhs B., Kim J.S. et al. The rkpGHI and -J genes are involved in capsular polysacchride production by Rhizobium meliloti II J. Bacteriol. 1997. V. 179. № 7. P. 2132-2140.
228. Klein S., Lohman K., Clover R. et al. A directional, high-frequency chromosomal mobilization system for genetic mapping of Rhizobium meliloti H J. Bacteriol. 1992. V. 174. P. 324-326.
229. Klipp W., Reilander H., Schlüter A. et al. The Rhizobium melilotifdxN gene encoding a ferredoxin -like protein is necessary for nitrogen fixation and is cotranscribed with nifA and nifB // Mol. Gen. Genet.1989. V. 216. P. 293-302.
230. Kolter R., Moreno F. Genetics of ribosomally synthesized peptide antibiotics // Annu. Rev. Microbiol. 1992. V. 46. P. 141-163.
231. Kondorosi A., Kiss G.B., Forrai T. et al. Circular linkage map of Rhizobium meliloti chromosome // Nature. 1977. V. 268. № 5620. P. 525-527.
232. Kondorosi A., Vincze E., Johnston A.W.B., Beringer J.E. A comparison of three Rhizobium linkage maps // Mol. Gen. Genet. 1980. V. 178. P. 403-408.
233. Kondorosi E., Banfalvi Z., Kondorosi A. Physical and genetic analysis of a symbiotic region of Rhizobium meliloti: identification of nodulation genes // Mol. Gen. Genet. 1984. V. 193. P. 445-452.
234. Kosier B., Puhler A., Simon R. Monitoring the diversity of Rhizobium meliloti field and microcosm isolates with a novel rapid genotyping method using insertion elements // Molec. Ecol. 1993. V. 12. P. 35-46.
235. Kowalski M. Prophage substitution in Rhizobium meliloti strains // Microb. Genet. Bull. 1965. V. 22. № l.P. 19.
236. Kriete G., Broer I. Influence of the herbicide phosphinothricin on growth and nodulation capacity of Rhizobium meliloti II Appl. Microbiol. Biotechnol. 1996. V. 46. P. 580-566.
237. Krol J., Wielbo J., Mazur A. et al. Molecular characterization of pssCDE genes of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii strain TA1: pssD mutant is affected in exopolysaccharide synthesis and endocytosis of bacteria//MPMI. 1998. V. 11. P. 1142-1148.
238. Kurchak O.N., Krol L.A., Ushakov K.V. et al. Sinorhizobium meliloti IpsL mutant causes a disruption of symbiosis with alfalfa // Abstr. 9-th Internat. Congr. Molec. Plant-Microbe Interact. Amsterdam: Holland (July 25-30). 1999. P.58.
239. Lagares A., Caetano-Anolles G., Niehaus K. et al. A Rhizobium meliloti lipopolysaccharide mutant altered in competitiveness for nodulation of alfalfa// J. Bacteriol. 1992. V. 174.№ 18. P. 5941-5952.
240. Lamrabet Y., Bellogin R.A., Cubo T. et al. Mutation in GDP-fucose synthesis genes of Sinorhizobium fredii alters Nod factors and significantly decreases competitiveness to nodulate soybeans // MPMI. 1999. V. 12. P. 207-217.
241. Leigh J.A., Reed J.W., Hanks J.F. et al. Rhizobium meliloti mutants that fail to succinylate their Calcofluor-binding exopolysaccharide are detective in nodule invasion // Cell. 1987. V. 51. P. 579-587.
242. Leigh J.A., Coplin D.L. Exopolysaccharides in plant-bacterial interaction // Annu. Res. Microbiol. 1992. V. 46. P. 307-346.
243. Lepek V.C., D'Antuono A.L., Tomatis P.E. et al. Analysis of Mesorhizobium loti glycogen operon: effect of phosphoglucomutase (pgm) and glycogen synthase (glgA) null mutants on nodulation of Lotus tenuis II MPMI. 2002. V. 15. P. 368-375.
244. Lerouge P., Roche P., Faucher C. et al. Symbiotic host-specificity of Rhizobium meliloti isdetermined by a sulphated and acylated glucosamine oligosaccharide signal //Nature. 1990. V. 344. P. 781784.
245. Lloret J., Bolanos L., Lucas M.M. et al. Ionic stress and osmotic pressure induce different alterations in the Iipopolysaccharide of a Rhizobium meliloti strain // Appl. Environ. Microbiol. 1995. V. 61. № 10. P. 3701-3704.
246. Lloret J., Martin M., Oruezabal R.I. et al. MucR and MucS activate exp genes transcription and galactoglucan production in Sinorhizobium meliloti EFB1 // MPMI. 2001. V. 15. P. 54-59.
247. Lohrke S.M., Orf J.H., Sadowsky M.J. Inheritance of host-controlled restriction of nodulation by Bradyrhizobium japonicum strain USDA 110// Crop Science. 1996. V. 36. № 5. P. 1271-1276.
248. Lois A.F., Ditta G.S., Helinski D.R. The oxygen sensor FixL of Rhizobium meliloti is a membraneprotein containing four possible transmembrane segments//J. Bacteriol. 1993. V. 175. №4. P. 1103-1109.
249. Lois A.F., Weinstein M., Ditta G.S., Helinski D.R. Autophosphorylation and phosphatase activities of the oxygen-sensing protein FixL of Rhizobium meliloti are coordinately regulated by oxygen // J. Biol Chem. 1993a. V. 268. № 6. P. 4370-4375.
250. Lopez-Lara I.M., Orgambide G., Dazzo F.B. et al. Characterization and symbiotic importance of acidic extracellular polysaccharides of Rhizobium sp. strain GRH2 isolated from acacia nodules // J. Bacteriol. 1993. V. 175. № 10. P. 2826-2832.
251. Lopez-Lara I.M., van den Berg J.D.J., Thomas-Oates J.E. et al. Structural identification of the lipo-chitin oligosaccharide nodulation signals of Rhizobium loti II Mol. Microbiol. 1995a. V. 15. P. 627-638.
252. Lupwayi N.Z., Stephens P.M., Noonan M.J. Relationship between timing of infection and nodulation competitiveness of Rhizobium meliloti II Symbiosis. 1996. V. 21. № 3. P. 233-248.
253. Lupwayi N.Z., Hague I., Holl F.B. Effectiveness, competitiveness and persistence of inoculant
254. Rhizobium for perennial African clovers in a highland vertisol // J. Agr. Sci. 1997. V. 129. № 4. P. 429-437.
255. Luyten E., Vanderleyden J. Survey of genes identifield in Sinorhizobium meliloti spp., necessary for the development of an efficient symbiosis // Eur. J. Soil. Biol. 2000. V. 36. P. 1-26.
256. Madinabeitia N., Bellogin R.A., Buendia-Claveria A.M. et al. Sinorhizobium fredii HH103 has a truncated nolO gene due to a-1 frameshift mutation that is conserved among other geographically distant S. fredii strains // MPMI. 2001. V. 15. P. 150-159.
257. Malek W. The role of motility in the efficiency of nodulation by Rhizobium meliloti II Arch. Microbiol. 1992. V. 158. P. 26-28.
258. Mandon K., Kaminski A.P., Elmerich C. Functional analysis of the fixNOQP region of
259. Azorhizobium caulinodans II J. Bacterid. 1994. V. 176. P. 2560-2568.
260. Martin M., Lloret J., Sanchez-Contreras M. et al. MucR is necessary for galactoglucan production in Sinorhizobium meliloti EFB1 IIMPMI. 1999. V. 13. P. 129-135.
261. Martinez E., Romero D., Palacios R. The Rhizobium genome // Crit. Rev. Plant Sciences. 1990. V. 9. P. 59-93.
262. Martinez-Romero E., Rosenblueth M. Increased bean (Phaseolus vulgaris L.) nodulation competitiveness of genetically modified Rhizobium strains // Appl. Environ. Microbiol. 1990. V. 56. № 8. P. 23842388.
263. Mavingui P., Flores M., Romero D. et al. Generation of Rhizobium strains with improved symbiotic properties by random DNA amplification (RDA) // Nature Biotech. 1997. V. 15. № 6. P. 564-569.
264. Mazur A., E. Kryl J.E., Wielbo J. et al. Rhizobium leguminosarum bv. trifolii PssP protein is required for exopolysaccharide biosynthesis and polymerization // MPMI. 2002. V. 15. P. 388-397.
265. McLoughlin T.J., Owens P.A., Alt S.G. Competition studies with fast-growing Rhizobium japonicum strains // Can. J. Microbiol. 1985. V. 31. № 3. P. 220-223.
266. McLoughlin T.J., Merlo A.O., Satola S.W., Johansen E. Isolation of competition-defective mutants of Rhizobium fredii //J. Bacteriol. 1987. V. 169. № 1. P. 410-413.
267. McNeil M., Darvill J., Darvill A.G. et al. The discernible, structural features of the acidic polysaccharides secreted by different Rhizobium species are the same//Carbohydr. Res. 1986. V. 146. P. 307-326.
268. Mead D.A., Szczesna Scorupa E., Kemper B. Single-stranded DNA "blue" T7 promoter plasmids: a versatile tandem promoter system for cloning and protein engineering // Protein Eng. 1986. V. 1. P. 67-74.
269. Meade H.M., Long S.R., Ruvkun G.B. et al. Physical and genetic characterization of symbiotic and auxotrophic mutants of Rhizobium meliloti induced by transposon mutagenesis // J. Bacteriol. 1982. V. 149. №1. P. 114-122.
270. Melor H.Y., Glenn A.R., Arwas R., Dilworth M.J. Symbiotic and competitive properties of motility mutants of Rhizobium trifolii TA1 // Arch. Microbiol. 1987. V. 148. P. 34-39.
271. Mergaert P., van Montagu M., Prome J.-C. et al. Three unusual modifications, a D-arabinosyl, a N-methil, and a carbamoil group, are present on the Nod factors of Azorhizobium caulinodans strain ORS571 // PNAS. 1993. V. 90. P. 1551-1555.
272. Merrick M. Organisation and regulation of nitrogen fixation genes in Klebsiella and Azotobacter II In: Bothe H., de Bruijn F.J., Newton W.E.(eds): Nitrogen Fixation: Hundred Years After. Gustav Fisher.
273. Stuttgard. 1988. P. 293-302.
274. Miller K.J., Gore R.S., Johnson R. et al. Cell-associated oligosaccharides of Bradyrhizobium spp. II J. Bacteriol. 1990. V. 172. P. 136-142.
275. Milner J., Araujo R., Handelsman J. Molecular and symbiotic characterization of exopolysaccharide deficient mutants of Rhizobium tropici CIAT899 // Mol. Microbiol. 1992. V. 6. P. 31373147.
276. Minamisawa K. Comparison of extracellular polysaccharide composition, rhizobitoxine production, and hydrogenase phenotype among various strains of Bradyrhizobium japonicum II Plant Cell Physiol. 1989. V. 30. № 6. P. 877-884.
277. Miranda J., Membrillo-Hernández J., Tabche M., Soberon M. Rhizobium etli cytochrome mutants with derepressed expression of cytochrome terminal oxydases and enhanced nitrogen accumulation // Appl. Microbial Biotechnol. 1996. V. 45. P. 182-188.
278. Moenne-Loccoz Y., Weaver R.W. Plasmids influence growth of rhizobia in the rhizosphere of clover // Soil Biol. Biochem. 1995. V. 27. P. 1001-1004.
279. Muller P., Hynes M., Kapp D. et al. Two classes of Rhizobium meliloti infection mutants differ in exopolysaccharide production and in coinoculation properties with nodulation mutants // Mol. Gen. Genet. 1988. V. 211. P. 17-26.
280. Muller P., Keller M., Weng W.M. et al. Genetic analysis of the Rhizobium meliloti exoYFQ operon: ExoY is homologous to sugar transferases and ExoQ represents a transmembrane protein 11 MPMI. 1993. V. 6. № 1. P. 55-65.
281. Murphy P. J., Heycke N., Banfalvi Z. et al. Genes for the catabolism and synthesis of an opine like compound in Rhizobium meliloti are closely linked and on the Sym plasmid // PNAS. 1987. V. 84. № 2. P. 493-497.
282. Murphy P.J., Trenz S.P., Grzemski W. et al. The Rhizobium meliloti rhizopine mos locus is a mosaic structure facilitating its symbiotic regulation // J. Bacteriol. 1993. V. 175. № 16. P. 5193-5204.
283. Murphy P.J., Wexler W., Grzemski W. et al. Rhizopines their role in symbiosis and competition // Soil Biol. Biochem. 1995. V. 27. № 4-5. P. 525-529.
284. Naumkina T.S. Improvement of nitrogen fixation in peas (Pisum sativum L.) // Nitrogen Fixation: Fundamentals and Applications, Proc. of 10th Intern. Congr. on Nitrogen Fixation. St.-Petersburg: Russia, 28 May-3 June, 1995. P. 714.
285. Niehaus K., Kapp D., Puhler A. Plant defence and delayed infection of alfalfa pseudonodulesinduced by an exopolysaccharide (EPSl)-deficient Rhizobium meliloti mutant // Planta. 1993. V. 190. P. 415425.
286. Niehaus K., Lagares A., Puhler A. A Sinorhizobium meliloti lipopolysaccharide mutant induces effective nodules on the host plant Medicago sativa (alfalfa) but fails to establish a symbiosis with Medicago truncatula IIMPMI. 1998. V. 11. P. 906-914.
287. Noel K.D., Vandenbolsh K.A., Kuplaca B. Mutations in Rhizobium phaseoli that lead to arrested development of infection threads // J. Bacteriol. 1986. V. 168. № 3. P. 1392-1401.
288. Nogales J., Campos R., Abdelkhalek H.B. et al. Rhizobium tropici genes involved in free-living salt tolerance are required for the establishment of efficient nitrogen-fixing symbiosis with Phaseolus vulgaris II MPMI. 2002. V. 15. P. 225-232.
289. Norrander J., Kempe T., Messing J. Construction of improved M13 vectors using oligonucleotide-directed mutagenesis // Gene. 1983. V. 26. P. 101-106.
290. Novikova N.N., Pavlova E.A. Enhanced competitiveness for nodulation of Medicago sativa by Rhizobium meliloti transconjugants harbouring the root-inducing plasmids of Agrobacterium rhizogenes strain 15834// FEMS Microbiol. Ecol. 1993. V. 12. P. 61-68.
291. O'Brian M.R., Maier R.J. Molecular aspects of energetitics of nitrogen fixation in Rhizobium-legume symbiosis // BBA. 1989. V. 974. P. 229-246.
292. Olah B., Kiss E., Gyorgypal Z. et al. Mutation in ntrR gene, a member of the vap gene family, increases the symbiotic efficiency of Sinorhizobium meliloti II MPMI. 2001. V. 14. № 7. P. 887-894.
293. Olivares J., Casadesus J., Bedmar E.J. Method for testing degree of infectivity of Rhizobium meliloti strains // Appl. Environ. Microbiol. 1980. V. 39. № 5. P. 967-970.
294. Oliveira. A, Ferreira. E.M., Pampulha M.E. Nitrogen fixation, nodulation and yield of clover plants co-inoculated with root-colonizing bacteria // Symbiosis. 1997. V. 23. № 1. P. 35-42
295. Olson E.R., Sadowsky M.J., Verma D.P.S. Identification of genes involved in the Rhizobium-legume symbiosis by mu-dl (kan,/ac)-generated transcription fusions I I Biotechnology. 1985. V. 3. P. 143149.
296. O'Neill E.A., Kiely G.M., Bender R.A. Transposon Tn5 encodes streptomycin resistance in nonenteric bacteria//J. Bacteriol. 1984. V. 159. № 1. P. 388-389.
297. Onishchuk O.P., Sharypova L.A., Simarov B.V. Isolation and characterization of the Rhizobium meliloti Tn5-mutants with impaired nodulation competitiveness // Plant and Soil. 1994. V. 167. № 2. P. 267274.m
298. Oresnik I.J., Pacarynuk L.A., O'Brien S.A.P. et al. Plasmid-encoded catabolic genes in Rhizobium leguminosarum bv. trifolii: evidence for a plant-inducible rhamnose locus involved in competition for nodulation // MPMI. 1998. V. 11. № 12. P. 1175-1185.
299. Ovtsyna A.O., Rademaker G.-J., Esser E. et al. Comparison of characteristics of the nodX genes from various Rhizobium leguminosarum strains // MPMI. 1998. V. 12. P. 252-258.
300. Ovtsyna A.O., Geurts R., Bisseling T. et al. Restriction of host range by the sym2 allele of Afghanistan pea is nonspecific for the type of modification at the reducing terminus of nodulation signals // MPMI. 1998a. V. 11. P. 418-422.
301. Ozga D.A., Lara J.C., Leigh J.A. The regulation of exopolysaccharide production is important at two levels of nodule development in Rhizobium meliloti II MPMI. 1994. V. 7. P. 758-765.
302. Pain A.N. Symbiotic properties of antibiotic-resistant and auxotrophyc mutants of Rhizobium leguminosarum II J. Appl. Bacterid. 1979. V. 47. № 1. P. 53-64.
303. Pankhurst C.E., Schwinghamer E.A. Adenine requirement for nodulation of pea by an auxotrophyc mutant of Rhizobium leguminosarum II Arch. Microbiol. 1974. V. 100. № 2. P. 219.
304. Pankhurst C.E., MacDonald P.E., Reeves J.M. Enhanced nitrogen fixation and competitiveness for nodulation of Lotus pedunculatus by a plasmid-cured derivative of Rhizobium loti II J. Gen. Microbiol. 1986. V. 132. №8. P. 2321-2328.
305. Parke D., Rivelli M., Ornston L.W. Chemotaxis to aromatic and hydroaromatic acids: comparison of Bradyrhizobium japonicum and Rhizobium trifolii II I. Bacteriol. 1985. V. 163. P. 417-422.
306. Parniske M., Kosh K., Werner D., Muller P. ExoB mutants of Bradyrhizobium japonicum with reduced competitiveness for nodulation of Glycine max II MPMI. 1993. V. 6. № 1. P. 99-106.
307. Parveen N., Webb D.T., Borthakur D. Leucaena leucocephala nodules formed by a surface polysaccharide defective mutant of Rhizobium sp. strain TALI 145 are delayed in bacteroid development and nitrogen fixation // MPMI. 1996. V. 9. № 5. P. 364-372.
308. Patschkowski T., Schluter A., Priefer U.B. Rhizobium leguminosarum bv. viciae contains a second fnrlfixK-like gene and an unusual fixL homologue // Mol. Microbiol. 1996. V. 21. № 2. P. 267-280.
309. Phillips N., Joseph C., Maxwell C. Trigonelline and stachydrine released from alfalfa seeds activatenodD2 protein in Rhizobium meliloti II Plant Physiol. 1992. V. 99. P. 1526-1531.
310. Pleier E., Schmitt R. Identification and sequence analysis of two related flagellin genes in Rhizobium meliloti //J. Bacteriol. 1989. V. 171. P. 1467-1475.
311. Poole P.S., BIyth A., Reid C.J. et al. myoinositol catabolism and catabolite regulation in Rhizobium leguminosarum bv. viciae II Microbiol. 1994. V. 140. P. 2787-2795.
312. Poole P.S., Schofield N.A., Reid C.J. et al. Identification of chromosomal genes located downstream of dctD that affect the requirement for calcium and the lipopolysaccharide layer of Rhizobium leguminosarum II Microbiol. 1994a. V 140. P. 2797-2809.
313. Poupot R., Martinez-Romero E., Gautier N. et al. Wild-type Rhizobium etli, a bean symbiont,produces acetyl-fucosylated, N-methylated, and carbamoylated nodulation factors II J. Biol. Chem. 1995. V. 270. P. 6050-6055.
314. Preisig O., Athamatten D., Hennacke H. Genes for a microaerobically induced oxidase complex in Bradyrhizobium japonicum are essential for a nitrogen-fixing endosymbiosis // PNAS. 1993. V. 90. P. 33093313.
315. Preisig O., Zufferey R., Hennecke H. The B. japonicum fixGHJS genes are required for the formation of the high-affinity cbb3-type cytochrome oxidase // Arch. Microbiol. 1996. V. 165. P. 297-305.
316. Priefer U.B. Genes involved in lipopolysaccharide production and symbiosis are clustered on the chromosome of Rhizobium leguminosarum biovar viciae VF39 // J. Bacteriol. 1989. V. 171. P. 6161-6168.
317. Putnoky P., Petrovich G., Kereszt A. et al. Rhizobuim meliloti exopolysacchride can have the same function in the plant-microbe interaction //J. Bacteriol. 1990. V. 172. № 9. P. 5450-5458.
318. Puvanesarajah V., Schell F.M., Gerhold D., Stacey G. Cell surface polysaccharides from
319. Bradyrhizobium japonicum and non-nodulating mutant // J. Bacteriol. 1987. V. 169. P. 137-141.
320. Radnedge L., Davies M.A., Youngren B., Austin S.J. Plasmid maintenance functions of the large virulence plasmid of Shigella flexneri II J. Bacteriol. 1997. V. 179. P. 3670-3675.
321. Ramirez M.E., Israel D.W., Wollum A.G. Using spontaneous antibiotic-resistant mutants to assess competitiveness of bradyrhizobial inoculants for nodulation of soybean // Can. J. Microbiol. 1998. V. 44. № 8. P. 753-758.
322. Ramirez-Romero M.A., Bustos P., Girard L. et al. Sequence, localization and characteristics of the replicator region of the symbiotic plasmid of Rhizobium etli II Microbiol. 1997. V. 143. № 8. P. 28252831.
323. Rao J.R., Cooper J.E. Rhizobia catabolize nod gene-inducing flavonoid via C-ring fission mechanisms//J. Bacteriol. 1994. V. 176. P. 5409-5413.
324. Rao J.P., Grzemski W., Murphy P.J. Rhizobium meliloti lacking mosA synthesis the rhizopine sc/7/o-inosamine in place of 3-<9-methyI-icy//o-inosamine // Microbiol. 1995. V, 141. № 7. P. 1683-1690.
325. Rastogi V., Labes M., Finan TM Watson R. Overexpression of the dctA gene in Rhizobium meliloti: effect on transport of C4 dicarboxylates and symbiotic nitrogen fixation//Can. J. Microbiol. 1992. V. 38. P. 555-562.
326. Reed J.W., Walker G.C. Acidic conditions permit effective nodulation of alfalfa by invasion-deficient Rhizobium meliloti exoD mutants // Genes Dev. 1991. V. 5. P. 2274-2287.
327. Reed J.W., Walker G.C. The exoD gene of Rhizobium meliloti encodes a novel function needed for alfalfa nodule invasion//J Bacteriol. 1991a. V. 173. № 2. P. 664-677.
328. Reuber T.L., Walker G.C. The acetyl substituent of succinoglycan is not necessary for alfalfa nodule invasion by Rhizobium meliloti RmI02I // J. Bacteriol. 1993. V. 175. P. 3653-3655.
329. Reuhs B.L., Kim J.S., Badgett A., Carlson R.W. Production of cell-associated polysaccharides of Rhizobium fredii USDA205 is modulated by apigenin and host root extract // MPM1.1994. V. 7. P. 240-247.
330. Reuhs B.L., Williams M.N.V., Carlson R.W. et al. Suppression of the Fix" phenotype of Rhizobium meliloti exoB mutants by IpsZ is correlated to a modified expression of the K-polysacchride // J. Bacteriol. 1995. V. 177. № 15. P. 4289-4296.
331. Richaud F., Richaud C., Ratet P., Patte J.C. Chromosomal location and nucleotide sequence of the Escherichia coli dapA gene // J. Bacteriol. 1986. V. 166. № 1. P. 297-300.
332. Riedel K.U., Jouanneau YM Masepohl B. et al. A Rhizobium meliloti ferredoxin (FdxN) purified from Escherichia coli donates electrons to Rhodobacter capsulatus nitrogenase // Eur J Biochem. 1995. V. 231. №3. P. 742-746.
333. Riess GM Masepoh B., Puhler A. Analysis of IS21-mediated mobilization of plasmid pACYC184 by R68.45 in E. coli II Plasmid. 1983. V. 10. № 2. P. 111-118.
334. Robleto E.A., Scupham A.J., Triplett E.W. Trifolitoxin production in Rhizobium etli strain CE3 increases competitiveness for rhizosphere colonization and root nodulation of Phaseolus vulgaris in soil // MPMI. 1997. V. 10. № 2. P. 228-233.
335. Robleto E.A., Kmiecik K., Oplinger E.S. et al. Trifolitoxin production increases nodulation competitiveness of Rhizobium etli CE3 under agricultural conditions//Appl. Environ. Microbiol. 1998. V. 64. № 7. P. 2630-2633.
336. Robleto E.A., Borneman JM Triplett E.W. Effect of bacterial antibiotic production on rhizosphere microbial communities from a culture-independent perspective // Appl. Environ. Microbiol. 1998a. V. 64. № 12. P. 5020-5022.
337. Roche P., Debelle F., Maillet F. et al. Molecular basis of symbiotic host specificity in Rhizobium meliloti: nodH and nodPQ genes encode the sulfatation of lipooligosaccharide signals // Cell. 1991. V. 67. P. 1131-1143.
338. Roche P., Lerouge P., Ponthus C. et al. Structural determination of bacterial nodulation factors involved in the Rhizobium meliloti-alfalfa symbiosis // J. Biol. Chem. 1991a. V. 266. P. 10933-10940.
339. Rodelas B., Gonzales-Lopes J., Salmeron V. et al. Symbiotic effectiveness and bacteriocin production by Rhizobium leguminosarum bv. viciae isolated from agricultural soils in Spains // Appl. Soil Ecol. 1998. V. 8. № 1-3. P. 51-60.
340. Roelvink P.W., Van Den Bos R.C. Regulation of nitrogen fixation in diazotrophs: the regulatory nifA gene and its characteristics // Acta Bot. Neerl. 1989. V. 38. № 3. P. 233-252.
341. Rohrig H., Schmidt J., Wieneke U. et al. Biosynthesis of lipooligosaccharide nodulation factors: Rhizobium NodA protein is involved in jV-acylation of the chitooligasaccharide backbone // PNAS. 1994. V. 91. P. 3122-3126.
342. Ronson C.W., Lyttleton P., Robertson J.G. C4-dicarboxyIate transport mutants of Rhizobium trifolii form ineffective nodules on Trifolium repens II PNAS. 1981. V. 78. P. 4284-4288.
343. Rosenberg C., Boistard P., Denarie J., Casse-Delbart F. Genes controlling early and late functions in symbiosis are located on a megaplasmid in Rhizobium meliloti II Mol. Gen. Genet. 1981. V. 184. P. 326333.
344. Rossbach SM Kulpa D.A., Rossbach U., de Bruijn F.J. Molecular and genetic characterization of the rhizopine cataboHsm (mocABCR) genes of Rhizobium meliloti L5-30 // Mol. Gen. Genet. 1994. V. 245. № 1. P. 11-24.
345. Rumjanek N.G., Gama S.A., Triplett E.W. Bacteriocin production by Bradyrhizobium strains // Proc. of 10th Intern. Congr. on Nitrogen Fixation. St.-Petersburg: Russia. 1995. P. 433.
346. Ruvkun G.B., Sundaresan V., Asubel F. Directed transposon TnJ mutagenesis and complementation analysis of Rhizobium meliloti nitrogen fixation genes // Cell. 1982. V. 29. P. 551-559.
347. Rynne F.G., Glenn A.R., Dilworth M.J. Effect of mutations in aromatic catabolism on the persistence and competitiveness of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii II Soil. Biol. Biochem. 1994. V. 26.1. P. 703-710.
348. Sadowsky M.J., Olson E.R., Foster V.E. et al. Two host-inducible genes of Rhizobium fredii and characterization of the inducing compound // J. Bacteriol. 1988. V. 170. P. 171-178.
349. Saint C.P., Wexler M., Murphy P.J. et al. Characterization of genes for synthesis and catabolism of a new rhizopine induced in nodules by Rhizobium meliloti Rm220-3: Extension of the rhizopine concept // J. Bacteriol. 1993. V. 175. № 16. P. 5205-5215.
350. Sanjuan J., Olivares J. Implication of nifA in regulation of genes located on a cryptic plasmid that affect nodulation efficiency//J. Bacteriol. 1989. V. 171. № 8. P. 4154-4161.
351. Sanjuan J., Olivares J. NifA-NtrA regulatery system activates transcription of nfe, a gene locus involved in nodulation competitiveness of Rhizobium meliloti II Arch. Microbiol. 1991. V. 155. P. 543-548.
352. Sanjuan J., Olivares J. Multicopy plasmids carrying the Klebsiella pneumoniae nifA gene enhance Rhizobium meliloti nodulation competitiveness on alfalfa//MPMI. 1991a. V. 4. P. 365-369.
353. Sanjuan J., Carlson R.W., Spaink H.P. et al. A 2-O-methylfucose moiety is present in the lipo-oligosaccharide nodulation signal of Bradyrhizobium japonicum II PNAS. 1992. V. 89. № 18. P. 8789-8793.
354. Sasakava C., Berg D.E. IS50 mediated inverse transposition: discrimination between the two ends of an IS element // J. Mol. Biol. 1982. V. 159. P. 257-272.
355. Saxena A.K., Mittal S., Dwivedi A. et al. Competitiveness and symbiotic efficiency of potential inoculant of Bradyrhizobium sp. (Vigna) // Microbiol. Res. 1996. V. 151. № 2. P. 219-224.
356. Saxena A.K., Rathi S.K., Tilak K.V.B.R . Differential effect of various endomycorrhizal fungi on nodulating ability of green gram by Bradyrhizobium sp. (Vigna) strain S24 // Biol. Fertil. Soils. 1997. V. 24. №2. P. 175-178.
357. Scott D.B., Young C.A., Collins-Emerson J.M. et al. Novel and complex chromosomal arrangement of Rhizobium loti nodulation genes // MPMI. 1996. V. 9. № 3. P. 187-197.
358. Selbitschka W., Puhler A., Simon R. The construction of recA-deficient Rhizobium meliloti and R. leguminosarum strains marked with gasA or luc cassettes for use in risk-assessment studies // Mol. Ecol.1992. V. 1. P. 9-19.
359. Selbitschka W., Dresing U., Hagen M. et al. A biological containment system for Rhizobium meliloti based on the use of recombination-deficient (recA') strains // FEMS Microbiol. Ecol. 1995. V. 16. P. 223232.
360. Sessitsch A., Jjemba P.K., Hardarson G. et al. Measurement of the competitiveness index of Rhizobium tropici strain C1AT899 derivatives marked the gusA gene// Soil Biol. Biochem. 1997. V. 29. №7. P. 1099-1110.
361. Sessitsch A., Hardarson G., de Vos W.M., Wilson K.J. Use of marker genes in competition studies of Rhizobium II Plant and Soil. 1998. V. 204. P. 35-45.
362. Shafer A., Tauch A., Jager W. et al. Small mobilizable multi-purpose cloning vectors derived from the Escherichia coli plasmids pK18 and pK19 selection of defined deletions in the chromosome Corynebacterium glutamicum II Gene. 1994. V. 145. P. 69-73.
363. Sharma S.B., Sakadevan K., Sharma S. Mutations conferring azide resistance enhance symbiotic nitrogen fixation in Rhizobium loti II Plant and Soil. 1997. V. 189. N 2. P. 221 -229
364. Sharypova L.A., Onishchuk O.P., Chesnokova O.N. et al. Isolation and characterization of Rhizobium meliloti Tn5 mutants showing enhanced symbiotic effectiveness // Microbiol. 1994. V. 140. P. 463-470.
365. Sheoran A., Khurana A.L., Dudeja S.S. Nodulation competitiveness in the Rhizobium-cYiickpea nodulation variants symbiosis // Microbiol. Res. 1997. V. 152. № 4. P. 407-412.
366. Simon R., Priefer U., Puhler A. A broad host range mobilization system for in vivo genetic engenering: Transposon mutagenesis in gram negative bacteria // Biotechnology. 1983. V. 1. № 11. P. 784791.
367. Simon R., Priefer U., Puhler A. Vector plasmids for in vitro manipulations of gram-negative bacteria. In: Molecular Genetics of the Bacteria-Plant Interaction. Edited by A. Puhler. Springer-Verlag, Berlin, Heidelberg. 1983a. P. 98-106.
368. Simon R. High frequency mobilization of gram-negative bacterial replicons by the in vitro constructed Tn5-mob transposon // Mol. Gen. Genet. 1984. V. 196. № 3. P. 413-420.
369. Soberon M., Williams H.D., Poole R.K., Escamilla E. Isolation of Rhisobium phaseoli cytochrome mutant with enhanced respiration and symbiotic nitrogen fixation // J. Bacteriol. 1989. V. 171. P. 465-472.
370. Soberon M., Lopez O., Morera C. et al. Enhanced nitrogen fixation in Rhizobium etli ntrC mutant that overproduce the Bradyrhizobium japonicum symbiotic oxydase cbb3 II MPM1. 1999. V. 65. P. 1-5.
371. Sofia H.J., Burland V., Daniels D.L. et al. Analysis of the Escherichia coli genome V. DNA sequence of the region from 76,0 to 81,5 minutes //Nucleic Acids Res. 1994. V. 22. P. 2576-2586.
372. Sorensen G.M., Windaele R. Effect of transfer of symbiotic plasmids and of hydrogenase genes (hup) on symbiotic efficiency of Rhizobium leguminosarum strains // J.Microbiol. 1986. V. 132. №2. P. 317-324.
373. Soto M.J., Zorzano A., Mercado-Blanco J. et al. Nucleotide sequence and characterization of Rhizobium meliloti nodulation competitiveness genes nfe II J. Mol. Biol. 1993. V. 229. P. 570-576.
374. Soto M.J., Zorzano A., Garciarodriguez F.M. et al. Identification of a novel Rhizobium meliloti nodulation efficiency nfe gene homolog of Agrobacterium ornithine cyclodeaminase II MPMI. 1994. V. 7. № 6. P. 703-707.
375. Sourjik V., Sterr W., Platzer J. et al. Mapping of 41 Chemotaxis, flagellar and motility genes to a single region of the Sinorhizobium meliloti chromosome // Gene. 1998. V. 223. P. 283-290.
376. Sourjik V., Muschler P., Scharf B., Schmitt R. VisN and VisR are global regulators of Chemotaxis, flagellar and motility genes in Sinorhizobium (Rhizobium) meliloti II J. Bacteriol. 2000. V. 182. № 3. P. 782-788.
377. Spaink H.P., Sheeley D.M., Van Brüssel A.A.N. et al. A novel highly unsaturated fatty acid moiety of Iipooligosaccharide signals determines host specificity of Rhizobium II Nature. 1991. V. 354. P. 125130.
378. Spaink H.P., Wijfjes A.H.M., van Vliet T. B. et al. Rhizobial lipo-oligosaccharide signals and their role in plant morphogenesis; are analogous lipophilic chitin derivatives produced by the plant? // Aust. J. Plant Physiol. 1993. V. 20. P. 381-392.
379. Spiro S., Guest J.R. FNR and its role in oxigen regulated gene expression in E.coli II FEMS Microbiol. Rev. 1990. V. 75. P. 339-428.
380. Srinivasan M., Petersen D.J., Holl F.B. Influence of indoleacetic-acid-producing Bacillus isolates on the nodulation of Phaseolus vulgaris by Rhizobium etli under gnotobiotic conditions // Can. J. Microbiol. 1998. V. 42. № 10. P. 1006-1014.
381. Srivastava J.S., Singh B.D., Dhar B. et al. Use of streptomycin resistance and phage sensitivity as markers in competition studies with R. leguminosarum // Ind. J. Exp. Biol. 1980. V. 18. № 10. P. 11711173.
382. Stacey G., So J.S., Roth L.E. et al. A lipopolysaccharide mutant of Bradyrhizobium japonicum thatuncouples plant from bacterial differentiation //MPMI. 1991. V. 4. P. 332-340.
383. Stacey G., Luka S., Sanjuan J. et al. nodZ, a unigue host-specific nodulation gene, is involved in the fucosylation of the lipooligosaccharide nodulation signal of Bradirhizobium japonicum II J. Bacteriol. 1994. V. 176. P.620-633.
384. Stephens P.M., Cooper J.E. Variation in speed of infection of "no root hair zone" of white clover and nodulating competitiveness among strains of Rhizobium trifolii II Soil Biol. Biochem. 1988. V. 20. P. 465470.
385. Stewart G.W., Hepworth-Jones B.E., Keen J.N. et al. Isolation of cDNA coding for an ubiquitous membrane protein deficient in high Na+, low K+ stomatocytic erythrocytes // Blood. 1992. V. 79. P. 15931601.
386. Streeter J.G. Carbohydrate, organic asid, and amino acid composition of bacteroids and cytosol from soybean nodules // Plant Physiol. 1987. V. 85. P. 768-773.
387. Streit W., Kosch K., Werner D. Nodulation competitiveness of Rhizobium leguminosarum bv. phaseoli and Rhizobium tropici strains measured by glucoronidase (gus) gene fusion // Biol. Fertil. Soils. 1992. V. 14. P. 140-144.
388. Streit W.R., Joseph C.M., Phillips D.A. Biotin and other water-soluble vitamins are key growth factors for alfalfa root colonization by Rhizobium meliloti 1021 // MPMI. 1996. V. 9. № 5. P. 330-338.
389. Streit W.R., Phillips D.A. Recombinant Rhizobium meliloti strains with extra biotin synthesis capability //Appl. Environ. Microbiol. 1996. V. 62. № 9. P. 3333-3338.
390. Sutcliffe J.G. Complete nucleotide sequence of the Escherichia coli plasmid pBR322 // Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol. 1979. V. 43. P. 77-90.
391. Suzuki M., Hayakawa T., Shaw J.P. et al. Primary structure of xylene monooxygenase: Similarities to and differences from the alkane hydroxylation system // J. Bacteriol. 1991. V. 173. P. 1690-1695.
392. Swelim D.M., Kuykendall L.D., Hashem F.M. et al. Competitiveness of Rhizobium sp. Leucaena leucocephala (LAM) dewit. strains and their genetically marked derivatives // Lett, in Appl. Microbiol. 1996. V. 22. № 6. P. 443-447.
393. Takashi O., Hiroshi O., Ryouichi D., Yutaka K. Isolation of transposon Tn5-induced hydrophobic mutants of a Bradyrhizobium japonicum strain with improved competitive nodulation abilities // Soil Sci. and Plant Nutr. 1992. V. 38. № 3. P. 545-552.
394. Toro N. Nodulation competitiveness in the rhizobium-legume symbiosis //World J. Microbiol. Biotechnol. 1996. V. 12. № 2. P. 157-162.
395. Torok I., Kondorosi A. Nucleotide sequence of Rhizobium meliloti nitrogenase reductase gene nifH II Nucleic Acid Res. 1981. V. 9. P. 5711-5723.
396. Trinick M.J., Rhodes R.L., Galbraith J.H. Competition between fast- and slow-growing tropical legume rhizobia for nodulation of Vigna unguiculata II Plant Soil. 1983. V. 73. № 1. P. 105-115.
397. Triplett E.W., Barta T.M. Trifolitoxin production and nodulation are necessary for the expression of superior nodulation competitiveness by Rhizobium leguminosarum bv. trifolii strain T24 on clover // Plant. Physiol. 1987. V. 85. № 2. P. 335-342.
398. Triplett E.W. Isolation of genes involved in nodulation competitiveness from Rhizobium leguminosarum bv. trifolii T24 // PNAS. 1988. V. 85. № 1. P. 1-5.
399. Triplett E.W. Schink M.J. Noeldner K.L. Mapping and subcloning of the trifolitoxin production and resistance genes from Rhizobium leguminosarum bv. trifolii T24 // MPMI. 1989. V. 2. P. 202-208.
400. Triplett E.W., Vogelzang R.D. A rapid bioassay for the activity of the antirhizobial peptide, trifolitoxin//J. Microbiol. Methods. 1989. V. 10. P. 177-182.
401. Triplett E.W. Construction of a symbiotically effective strain of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii with increased nodulation competitiveness // Appl. Environ. Microbiol. 1990. V. 56. № 1. P. 98-103.
402. Triplett E.W. The molecular genetics of nodulation competitiveness in Rhizobium and Bradyrhizobium II MPMI. 1990a. V. 3. № 4. P. 199-206.
403. Triplett E.W., Sadowsky M.J. Genetics of competition for nodulation of legumes // Annu. Rev. Microbiol. 1992. V. 46. P. 399-428.
404. Truchet G., Roche P., Lerouge P. et al. Sulfated lipooligosaccharide signals of Rhizobium meliloti elicit root nodule organogenesis in alfalfa // Nature. 1991. V. 351. P. 670-673.
405. Ugalde R.A., Handelsman J., Brill W.J. Role of galactosyltransferase activity in phage sensitivity and nodulation competitiveness of Rhizobium meliloti II J. Bacteriol. 1986. V. 166. № 1. P. 148-154.
406. Van Dillewijn P., Martinez-Abarca F., Toro N. Multicopy vectors carrying the Klebsiella pneumoniae nifA gene do not enhance the nodulation competitiveness of Sinorhizobium meliloti on alfalfa // MPMI. 1998. V. 11. № 8. P. 839-842.
407. Van Egeraat A.W.S.M. The possible role of homoserine in the development of Rhizobium leguminosarum in the rhizosphere of pea seedlings // Plant Soil. 1975. V. 42. P. 381-386.
408. Van Rensburg H.J., Strijdom B.W. Rott surface association in relation to nodulation of Medicago sativa II Appl. Environ. Microbiol. 1982. V. 44. № 1. P. 93-97.
409. Vasudev S., Lodha M.L., Sreekumar K.R. Imparting hydrogen-recycling capability to Cicerrhizobial strains by plasmid pIJ1008 transfer//Curr. Sci. 1991. V. 60. P. 9-10.
410. Velazquez E., Mateos P.F., Pedrero P. et al. Attenuation of symbiotic effectiveness by Rhizobium meliloti SAF22 related to the presence of a cryptic plasmid//Appl. Environ. Microbiol. 1995. V. 61. № 5. P. 2033-2036.
411. Velazquez E., Mateos P.F., Velasco N. et al. Symbiotic characteristics and selection of autochthonous strains of Sinorhizobium meliloti population in different soils // Soil. Biol. Biochem. 1999. V. 31. P. 1039-1047.
412. Vieira R.F., Cardoso E.J.B.N., Vieira C., Cassini S.T.A. Foliar application of molybdenum in common beans. I. Nitrogenase and reductase activities in a soil of high fertility // J. of Plant Nutrition. 1998.1. V. 21. № 1. P. 169-180.
413. Rhizobium meliloti strains carrying pRmeGR4b-type plasmid within indigenous soil population by PCR using primers derived from specific DNA sequences//FEMS Microbiol. Ecol. 1995. V. 17. № 3. P. 161-168.
414. Viprey V., Rosenthal A., Broughton W.J., Perret X. Genetic snapshots of the Rhizobium species NGR234 genome // Genome Biology. 2000. V. 1. № 6. Research0014.1-0014.17.
415. Vizan J.L., Hernandez-Chico C., del Castillo I., Moreno F. The peptide antibiotic microcin B17 induces double-strand cleavage of DNA mediated by E. coli DNA gyrase // EMBO J. 1991. V. 10. P. 467476.
416. Vlassak K.M., Mercante F., Straliotto R. et al. Evaluation of the intrinsic competitiveness and saprophytic competence of Rhizobium tropici IIB strains // Biol. Fertil. Soils. 1997. V. 24. № 3. P. 274-282.
417. Vlassak K.M., Vanderleyden J. Factors influencing nodule occupancy by inoculant Rhizobia II Crit. Rev. Plant Sci. 1997. V. 16. № 2. P. 163-229.
418. Watson R.J., Chan Y.-K., Wheatcroft R. et al. Rhizobium meliloti gene required for C4-dicarboxylate transport and symbiotic nitrogen fixation are located on a megaplasmid // J. Bacteriol. 1988. V. 170. P. 927-934.
419. Watson R.J. Analysis of the C4-dicarboxylate transport genes of Rhizobium meliloti: nucleotide sequence and deduced products of a dctA, dctB, dctD II MPMI. 1990. V. 3. P. 174-181.
420. Weber G., Reilander H., Puhler A. Mapping and expression of a regulatory nitrogen fixation gene (fixD) of Rhizobium meliloti II EMBO J. 1985. V. 4. P. 2751-2756.
421. Wexler M., Gordon D., Murphy P.J. The destribution of inositol rhizopine genes in Rhizobium population // Soil. Biol. Biochem. 1995. V. 27. P. 531-537.
422. Wilkinson-Sproat J., Wohldman P. 2,2 Mb of contiguous nucleotide sequence from chromosome III of C. elegans II Nature. 1994. V. 368. P. 32-38.
423. Willets N.S., Growther C., Holloway B.W. The insertion of sequence IS21 of R68.45 and the molecular basis for mobilization of the bacterial chromosome // Plasmid. 1981. V. 6. № 1. P. 30-52.
424. Williams P.M. The isolation of effective and ineffective mutants of cowpea Rhizobium II Plant Soil. 1981. V. 60. № 3. P. 349-356.
425. Williams M.N.V., Hollinsworth R.I., Brzoska P.M., Signer E.R. Rhizobium meliloti chromosomal loci required for suppression of exopolysaccharide mutations by lipopolysacchride//J. Bacteriol. 1990. V. 172. № 11. P. 6596-6598.
426. Williams M.N.V., Hollinsworth R.I., Klein S., Signer E.R. The symbiotic defect of Rhizobium meliloti exopolysacchride mutants is suppressed by lpsZ+, a gene involved in polysaccharide biosynthesis // J. Bacteriol. 1990a. V. 172. P. 2622-2632.
427. Wilson K.J. Molecular techniques for the study of rhizobial ecology in the field // Soil. Biol. Biochem. 1995. V. 27. P. 501-514.
428. Winarno R., Lie T.A. Competition between Rhizobium strains in nodule formation: interaction between nodulating and non-nodulating strains// Plant Soil. 1979. V. 51. № 1. P. 135-142.
429. Wood M., Stanway A.P. myoinositol catabolism by Rhizobium in soil: HPLC and enzymatic studies // Soil. Biol. Biochem. 2001. V. 33. P. 375-399.
430. Wu T. A model for three-point analysis of random general transduction//Genetics. 1966. V. 54. P. 405-410.
431. Yarosh O.K., Charles T.C., Finan T.M. Analysis of C4-dicarboxylate transport genes in Rhizobium meliloti II Mol. Microbiol. 1989. V. 3. P. 813-823.
432. Yoshida K.-I., Sano H., Miwa Y. et al. Cloning and nucleotide sequencing of a 15 kb region of the Bacillus subtilis genome containing the iol operon // Microbiol. 1994. V. 140. P. 2289-2298.
433. Yoshida K.-I., Aoyama D., Ishio I et al. Organization and transcription of the myoinositol operon, iol, of Bacillus subtilis II J. Bacteriol. 1997. V. 179. P. 4591-4598.
434. You Z., Gao X., Ho M.M., Borthakur D. A stomatin-like protein encoded by the sip gene of Rhizobium etli is required for nodulation competitiveness on the common bean//Microbiol. 1998. V.144. P. 2619-2627.
435. Yurgel S.N., Soberon M., Sharypova L.A. et al. Isolation of Sinorhizobium meliloti Tn5 mutants with altered cytochrome terminal oxidase expression and improved symbiotic performance // FEMS
436. Microbiol. Lett. 1998. V. 165. P. 167-173.
437. Zdor R.C., Pueppke S.G. Nodulation competitiveness of TnJ-induced mutants of Rhizobium fredii 208 that are altered in motility and extracellular polysaccharide production // Can. J. Microbiol. 1991. V. 37. P. 52-58.
438. Zevenhuizen L.P.T.M., van Neerven A.R.W. (l-2)-/?-D-gIucan and acidic oligosaccharides produced by Rhizobium meliloti II Carbohydr. Res. 1983. V. 118. P. 127-134.
439. Zhan H.J., Lovery S.B., Lee C.C., Leigh J.A. A second exopolysaccharide of Rhizobium meliloti strain SU47 that can function in root nodule invasion // PNAS. 1989. V. 86. № 9. P. 3055-3059.
440. Zhan H.J., Lee C.C., Leigh J.A. Induction of the second exopolysaccharide (EPSb) in Rhizobium meliloti SU47 by low phosphate concentrations //J Bacteriol. 1991. V. 173. № 22. P. 7391-7394.
441. Zhang X., Zhou J., Li F., Chen H. Interaction between exogenous and indigenous symbiotic genes in Rhizobia II Proc. of the 9th Intern. Congr. on Nitrog. Fixât. Mexico: Cancun, 1992. P. 753.
442. Ziegler R.J., Peirce C., Bergman K. Mapping and cloning of a fla-che region of the R. meliloti chromosome // J. Bacteriol. 1986. V. 168. № 2. P. 785-790.
443. Zimmermann J., Voss H., Schwager C. et al. A simplified method protocol for fast plasmid DNA sequencing//Nucleic. Acids Res. 1990. V. 18. P. 1067
444. Zuanazzi J.A.S., Clergeot P.H., Quirion J.-C. et al. Production of Sinorhizobium meliloti nod gene activator and repressor flavonoids from Medicago sativa roots // MPMI. 1998. V. 11. P. 784-794.
445. Zumpf W.G., Mortensen L.E. Nitrogen fixing complex of bacteria // Biochem. Biophys. Acta. 1975. V.4I6. P. 1-52.1. БЛАГОДАРНОСТИ.
446. В завершении я хочу выразить глубокую признательность и благодарность всем тем людям, благодаря которым моя работа появилась на свет такой, какая она есть.
447. Я благодарна всем моим друзьям, в особенности однокурсникам Виталии Владимировне Сагуленко и Елизавете Александровне Кроль за помощь, советы и, самое главное, постоянную моральную поддержку.
448. Спасибо деревне Горбунки за покой, а также серой полосатой кошке Ксюше -лучшему учителю независимости.1. Спасибо!!!
-
Чижевская, Елена Петровна
-
кандидата биологических наук
-
Санкт-Петербург, 2003
-
ВАК 03.00.07
- Получение и анализ Tn5-мутантов Sinorhizobium meliloti с измененными поверхностными полисахаридами
- Симбиотические гены как инструмент поиска и модификации клубеньковых бактерий дикорастущих бобовых растений Южного Урала
- Молекулярно-биологический анализ генов Sinorhizobium meliloti, вовлеченных в контроль симбиотической эффективности и модуляционной конкурентоспособности
- Клонирование симбиотических генов гороха посевного (Pisum sativum L.) с использованием синтении геномов бобовых растений
- Генетический анализ процесса развития симбиотических клубеньков у гороха посевного (Pisum sativum L. )
