Бесплатный автореферат и диссертация по биологии на тему
Клинико-генеалогическая и молекулярно-генетическая характеристика этноспецифических форм наследственной патологии у якутов
ВАК РФ 03.00.15, Генетика
Автореферат диссертации по теме "Клинико-генеалогическая и молекулярно-генетическая характеристика этноспецифических форм наследственной патологии у якутов"
На правах рукописи
МАКСИМОВА Надежда Романовна
КЛИНИКО-ГЕНЕАЛОГИЧЕСКАЯ И МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА ЭТНОСПЕЦИФИЧЕСКИХ ФОРМ НАСЛЕДСТВЕННОЙ ПАТОЛОГИИ У ЯКУТОВ
03.00.15 - генетика 14.00.09 - педиатрия
АВТОРЕФЕРАТ
диссертации на соискание ученой степени доктора медицинских наук
□ □34 "/БоЬи
Томск - 2009
003476360
Работа выполнена в Учреждении Российской академии медицинских наук Якутском научном центре комплексных медицинских проблем Сибирского отделения РАМН и Учреждении Российской академии медицинских наук НИИ медицинской генетики Сибирского отделения РАМН
Научные консультанты: академик РАМН, доктор медицинских наук,
профессор Пузырев Валерий Павлович, доктор биологических наук Степанов Вадим Анатольевич
Официальные оппоненты: доктор медицинских наук, профессор
Назаренко Людмила Павловна доктор медицинских наук, профессор Филиппов Геннадий Пантелеевич доктор медицинских наук, профессор Асанов Алий Юрьевич
Ведущая организация: Медико-генетический научный центр РАМН
Защита состоится «¿3 » 2009 года в {(? часов на заседании диссер-
тационного совета ДМ001.045.01 при НИИ медицинской генетики СО РАМН по адресу: 634050, г. Томск, Набережная р. Ушайки, д. 10.
С диссертацией можно ознакомиться в библиотеке НИИ медицинской генетики СО РАМН, г. Томск
Автореферат разослан «_»_._2009 г.
Ученый секретарь диссертационного совета доктор биол. наук ; Кучер А.Н.
ОБЩАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА РАБОТЫ
Актуальность проблемы. Среди факторов, определяющих уровень здоровья популяций человека, наследственным заболеваниям отводится существенная роль, достигающая по некоторым оценкам 20% (Вельтшцев и др., 2007). Поэтому исследование количественных и качественных характеристик груза наследственной патологии и механизмов его формирования в различных регионах страны представляется важной проблемой.
В этиологии детской инвалидности и ограничений жизнедеятельности значительная доля принадлежит наследственным факторам. Так, в Республике Саха (Якутия) среди причин детской инвалидности на первом месте (28,5%) стоят врожденные пороки развития, на втором - заболевания нервной системы (23,9%), на третьем - психические расстройства (11,9%). По данным Росстата среди причин младенческой смертности врожденные пороки развития занимают второе-третье место в Республике Саха (Якутия) и в целом по Российской Федерации. Остается значительной доля врожденных и наследственных заболеваний среди причин детской смертности (в возрасте до 5 лет), в структуре которой на долю хромосомных болезней приходится 2-3% (Новиков, 2008).
Необходимо учитывать, что подходы к диагностике и профилактике наследственных и врожденных заболеваний постоянно совершенствуются, расширяются возможности их применения в разных областях медицинской практики. В настоящее время в отношении лечения наследственной патологии обозначены подходы (патогенетический и генная терапия), сформированы предпосылки к осуществлению генотерапии. И одной из основных задач современной педиатрии и медицинской генетики в настоящее время является установление молекулярно-генетических причин возникновения и развития моногенных заболеваний.
При проведении генетико-эпидемиологических, а также молекулярно-генетических исследований по поиску генов наследственных заболеваний важно учитывать особенности формирования популяций и факторы популяцион-ной динамики. Считается, что при проведении работ по картированию моногенных заболеваний человека предпочтение следует отдавать изолированным популяциям, с так называемым «эффектом основателя» (SefBeld et al., 1998; Пу-зырев, 2003; Peltonen et al., 2006; Наследственные болезни..., 2002; Гинтер, 1978; Зинченко и др., 2007; Кириллов, 2008). Якутское население относится именно к таким популяциям и является удобным объектом для картирования и идентификации новых генов наследственных заболеваний.
Длительное время для якутских популяций были характерны расселен-ность на обширной территории небольшими по численности группами, низкая плотность населения и высокий уровень рождаемости, что благоприятствовало проявлению эффектов дрейфа генов. В настоящее время территориальные группы якутов отличаются по антропологическому составу, по языковым диалектам, выражена генетическая гетерогенность территориальных групп, по-разному проявляющаяся для разных классов маркеров. Высокий уровень генетической дифференциации якутских популяций, подтвержден данными о фамильной структуре сельских популяций Якутии, о полиморфизме аутосомных
локусов и (СТС)п-участка гена БМРК, о неравномерности распространенности наследственной патологии (Ноговицына, 2001; Максимова, 2002; Хшринская и др., 2003; Данилова и др., 2005; Тарская и др., 2004; Федорова и др., 2005; Кучер и др., 2007). В то же время низкий уровень генетического разнообразия в популяциях якутов, по сравнению с другими популяциями Евразии, был выявлен при анализе линий митохондриальной ДНК, У-хромосомы и на основании данных о полиморфизме (СГС)п-повторов гена ВМРК в популяциях Якутии (Попова и др., 2002; Пузырев и др., 2003; Ракепс1огГ е1 а!., 2003, 2006; Федорова и др., 2005; Харьков и др., 2008; Федорова, 2008). Проведенные ранее в Якутии генетико-эпидемиологические исследования выявили высокую частоту и широкий спектр наследственной патологии, а также накопление отдельных форм моногенной патологии: спиноцеребеллярной атаксии 1-го типа, миотонической дистрофии, наследственной энзимопенической метгемоглобинемии I типа и т.д. (Ноговицына, 2001; Назаренко и др., 2001; Тарская, 2004; Брахфогель, 2000; Платонов и др., 2004; Захарова, 1982; Банщикова, 2002; Сухомясова, 2005; Га-леева и др., 20Об; Барашков, 2007; Яковлева, 2008). Следующим этапом более глубокого изучения частоты и спектра наследственной патологии в регионе, особенно редких форм наследственных заболеваний, является длительное и динамическое наблюдение за больными и их семьями при помощи территориального генетического регистра наследственной и врожденной патологии (Гинтер, 2003; Наследственные болезни ..., 2002; Пузырев и др., 2000).
Исследования, посвященные комплексному медико-генетическому изучению моногенной патологии на основе территориального регистра наследственной и врожденной патологии с применением молекулярно-генетических методов, в республике ранее не проводились. Таким образом, является актуальным проведение комплексного генетико-эпидемиологического исследования наследственной патологии с привлечением молекулярно-генетических методов исследования в РС(Я) с целью дальнейшего планирования и организации медико-генетической помощи населению Якутии.
Цель исследования: клинико-генеалогический анализ этноспецифиче-ской наследственной патологии в Республике Саха (Якутия), изучение молеку-лярно-генетической основы якутских наследственных болезней и раскрытие механизмов их накопления.
Задачи исследования:
1. Оценить частоту и спектр наследственных заболеваний на основе созданного Республиканского генетического регистра наследственной и врожденной патологии Республики Саха (Якутия), провести анализ распространенности пяти наследственных заболеваний в улусах республики.
2. Провести клинико-генеалогический анализ заболеваний, вызванных динамическими мутациями: спинально-бульбарной амиотрофии Кеннеди, атаксии Фридрейха, окулофарингеальной миодистрофии.
3. Провести поиск мутаций в генах наследственных заболеваний, вызванных динамическими мутациями: спинально-бульбарной амиотрофии Кеннеди, атаксии Фридрейха, окулофарингеальной миодистрофии.
4. Представить клинико-генеалогическую характеристику двух частых наследственных форм низкорослости у якутов.
5. Провести поиск кандидатных генов и идентификацию мутаций для заболеваний с низкорослостью у якутов.
6. Установить популяционные частоты найденных мутаций, оценить время возникновения мутаций в генах этноспецифических наследственных заболеваний у якутов.
7. Выявить популяционно-генетические механизмы накопления наследственных заболеваний на основании построения гаплотипов в локусах исследуемых болезней с привлечением микросателлитных маркеров.
8. Разработать алгоритм медико-генетического консультирования, пренаталь-ной диагностики с использованием молекулярно-генетических методов диагностики для заболеваний с динамическими мутациями и для редких синдромов с низкорослостью.
Научпая новизна. В ходе выполнения получены новые знания о распространенности и клинико-генеалогических особенностях заболеваний, вызванных динамическими мутациями: окулофарингеальной миодистрофии, атаксии Фридрейха, спинально-бульбарной амиотрофии Кеннеди в Республике Саха (Якутия). В результате выполнения работы впервые проведен молекулярно-генетический анализ вариабельности генов PÂBPN1 при окулофарингеальной миодистрофии, AR при болезни Кеннеди, FRDA при атаксии Фридрейха и найдены мутации, вызывающие эти заболевания в якутской популяции. Впервые изучена частота редкого якутского синдрома низкорослости (ЯСН, 3-М синдром) в якутской популяции и описан фенотип якутских больных. Впервые проведено картирование гена, поиск кандидатного гена и идентификация мутации, вызывающей якутский синдром низкорослости у якутов. Название «якутский синдром низкорослости» зарегистрировано в электронной международной базе МакКьюсика (OMIM) как альтернативное названию болезни З-М-синдром. Впервые дано клинико-генеалогическое описание нового синдрома низкорослости с колбочковой дисфункцией, атрофией зрительных нервов и пельгеров-ской аномалией у якутов и изучена его распространенность в якутской популяции. Впервые проведено картирование кандидатного гена для нового синдрома, открыт ген и идентифицирована мутация, вызывающая синдром низкорослости с колбочковой дисфункцией, атрофией зрительных нервов и пельгеровской аномалией лейкоцитов. Новому синдрому дано название SCOP синдром (Short stature syndrome with Cone dysfunction, Optic atrophy and Pelger-Huet anomaly). Рассмотрены механизмы накопления этноспецифических форм наследственной патологии (ОФМД, ЯСН, SCOP синдрома) в популяциях Якутии на основании построения гаплотипов в локусах генов исследованных болезней с помощью микросателлитных маркеров. Впервые оценен возраст идентифицированных мутаций в генах CUL7 и NAG в якутской популяции.
Практическая значимость. Создан Республиканский регистр наследственной и врожденной патологии на базе медико-генетической консультации РБ№1-НЦМ. На основании клинико-генеалогических и молекулярно-генетических методов диагностики выделены две новые формы низкорослости
у якутов: якутский синдром низкорослости и синдром низкорослости с колбоч-ковой дисфункцией сетчатки, атрофией зрительных нервов и пельгеровской аномалией лейкоцитов. В практику медико-генетического консультирования внедрена ДНК-диагностика ОФМД, болезни Кеннеди, атаксии Фридрейха, ЯСН. На основе полученных результатов предложен и внедрен в практику алгоритм диагностики пяти наследственных заболеваний: ОФМД, болезни Кеннеди, атаксии Фридрейха, ЯСН и SCOP синдрома. Результаты работы используются в преподавании курса медицинской генетики для студентов МИ ЯГУ и врачей на курсах повышения квалификации МИ ЯГУ.
Положения, выносимые на защиту:
1. В якутской популяции имеется накопление некоторых форм редкой аутосом-но-рецессивной, Х-сцепленной рецессивной и аутосомно-доминантной наследственной патологии. В ходе исследования выявлено пять этноспецифи-ческих наследственных заболеваний у якутов, которым присвоено название «якутские наследственные болезни»: спинально-бульбарная амиотрофия Кеннеди, атаксия Фридрейха, окулофарингеальная миодистрофия, якутский синдром низкорослости, синдром низкорослости с колбочковой дисфункцией, атрофией зрительных нервов и пельгеровской аномалией лейкоцитов.
2. Распространенность ОФМД (И на 100 тыс. нас.) и болезни Кеннеди в отдельных улусах республики (408,7 и 106,6 на 100 тыс. мужчин) превышает мировые значения в десятки раз. Показатели распространенности синдрома ЯСН и SCOP синдрома получены в мире впервые (12,72 и 9,95 на 100 тыс. нас., соответственно) и позволяют отнести оба редких в мире заболевания к частым наследственным заболеваниям у якутов. АФ зарегистрирована в популяции якутов, относящихся к азиатской расе, где ранее не было описано случаев болезни.
3. Клинико-генеалогическая характеристика больных с ОФМД, болезнью Кеннеди и АФ в PC (Я) сопоставима с клиникой больных, описанных ранее. Мо-лекулярно-генетическими причинами болезней, вызванных динамическими мутациями у якутов являются экспансии (GCG)i0 в гене PABPN1 при ОФМД, (CAG)n в гене AR при болезни Кеннеди и (GAA)n в гене FRDA при АФ.
4. Основными причинами (40%) низкорослости в якутской популяции якутов являются 3-М синдром и новый синдром низкорослости с колбочковой дисфункцией, атрофией зрительных нервов и пельгеровской аномалией лейкоцитов. Распространенность обоих форм низкорослости в якутской популяции - 22,7 на 100 тыс. населения, среди детей - 67,5 на 100 тыс. населения. Клиника ЯСН у якутских больных сходна с клиникой ранее описанных больных с 3-М синдромом, за исключением дистресс-синдрома у новорожденных. Мутации 4582insT в гене CUL7 и G5741—>А в гене NAG являются единственными молекулярно-генетическими причинами двух форм низкорослости, особенно часто встречающихся в якутской популяции.
5. Основными популяционными механизмами накопления наследственных заболеваний в якутской популяции являются дрейф генов и эффект основателя.
6. Республиканский генетический регистр наследственной и врожденной патологии, созданный в ходе исследования, позволяет решать задачи накопления
эпидемиологической информации о нозологической структуре, диспансеризации семей с наследственными заболеваниями, пре- и постнатальной диагностики и профилактики наследственной патологии у детей, а также проводить генетический мониторинг населения.
Апробация работы. Основные материалы диссертационной работы доложены и обсуждены на всероссийской научно-практической конференции «Современные достижения клинической генетики» (Москва, 2003); научно-практической конференции «Генетические аспекты патологии человека. Проблемы сохранения генофонда коренных народов Севера» (Якутск, 2005); на V съезде Российского общества медицинских генетиков (Уфа, 2005); на II межрегиональной научно-практической конференции «Экология и здоровье человека на Севере» (Якутск, 2007); на VIII научной конференции «Генетика человека и патология» (Томск, 2007); на межрегиональной научно-практической конференции «Здоровье детей Севера» (Якутск, 2008); на ХШ международной конференции «Геном человека» (Индия, 2008); на российской научно-практической конференции «Современные проблемы клинической генетики» (Москва, 2008); Первом молодежном инновационном конвенте (Москва, 2008); на научно-практической конференции «Актуальные проблемы медицинской генетики на Крайнем Севере» (Якутск, 2009); межлабораторных семинарах НИИ мозга Университета г. Ниигаты (Япония, 2005, 2006, 2008); межлабораторных семинарах ЯНЦ КМП СО РАМН (Якутск, 2007, 2008, 2009); межлабораторном семинаре НИИ медицинской генетики СО РАМН (Томск, 2009).
Внедрение в практику здравоохранения. Материалы диссертации внедрены в работу медико-генетической консультации РБ№1-НЦМ Республики Саха (Якутия), а также включены в учебный процесс для студентов, в программу обучения ординаторов, интернов, врачей на кафедрах детских болезней, педиатрии, неврологии, курса медицинской генетики МИ ЯГУ. Научно обоснованные рекомендации по клинической и молекулярно-генетической диагностике и профилактике пяти якутских наследственных заболеваний внедрены в практику МГК РБ№1-НЦМ. Получен патент Российской Федерации № 2315310 «Способ диагностики 3-М синдрома в якутской популяции». По результатам исследования название заболевания «якутский синдром низкорослости» внесено в международный электронный каталог ОМ1М как альтернативное названию синдром 3-М.
Публикации. По теме диссертации опубликовано 73 работы, из которых 13 статей в журналах, рекомендованных для опубликования работ при защите диссертации на соискание ученой степени доктора медицинских наук, одна статья в международном журнале, 43 публикации - в виде тезисов и статей в материалах международных и российских научно-практических конференций. Получен патент РФ на изобретение.
Структура и объем работы. Диссертация изложена на 424 страницах машинописного текста. Данные проиллюстрированы таблицами (68), рисунками (67) и приложениями (8). Библиографический указатель включает 375 источников литературы, из них 126 работ отечественных авторов.
МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ
Проведено генетико-эпидемиологическое и молекулярно-генетическое исследование на основании созданного в МГК РБ№1-НЦМ Республиканского генетического регистра наследственной и врожденной патологии (табл.1).
Таблица 1
Характеристика и численность выборки исследованных больных, включенных в клинико-генеалогический и молекулярно-генетический анализ
Нозология Группы Количество, Количество
человек образцов ДНК
Окулофарингеальная - больные 40 40
миодистрофия - родственники 59 59
- семей 35
Атаксия Фридрейха - больные 9 12
- родственники 20 20
- семей 9
Спинально- - больные 6 6
бульбарная амио- - родственники 10 10
трофия Кеннеди - семей 4
Якутский синдром - больные 43 43
низкорослости - родственники 39 39
- семей 37
- популяционная выборка,
всего, из них 651
центральные якуты 110
вилюйские якуты 116
северные якуты 100
эвены 50
эвенки 50
юкагиры 25
русские из Томска 100
буряты из Бурятии 100
Синдром низкорос- - больные 34 43
лости с колбочковой - родственники 35 64
дисфункцией, атро- - семей 31 300
фией зрительных - популяционная выборка,
нервов и пельгеров- всего, из них 300
ской аномалией лей- якуты 200
коцитов японцы 100
Всего - больные 132 144
- родственники 163 192
- семей 116
-популяция 951
всего 295 1287
Клинико-генеалогическая характеристика больных и семей с наследственной патологией. На первом этапе основным источником информации о семьях с больными с наследственными заболеваниями служил Республиканский генетический регистр наследственной и врожденной патологии и сведения, полученные в ходе экспедиционных обследований населения улусов, из центральных улусных больниц, медико-социальной экспертной комиссии. В исследование распространенности наследственных заболеваний включены данные о 50 больных с диагнозом ОФМД из 45 семей, из которых 48 больных из 43 якутских семей, 6 больных со спинально-бульбарной амиотрофией Кеннеди из 4 якутских семей и 12 больных из 12 семей с атаксией Фридрейха, из которых 11 были якутами. Структура низкорослости была рассмотрена на примере 250 больных, зарегистрированных в медико-генетической консультации РБ№1-НЦМ с наследственными заболеваниями с задержкой роста. Было выделено 2 отдельные группы больных с нанизмом. Первая группа нанизма включала 55 больных из 46 якутских семей и характеризовалась лицевыми дизморфиями, пре и постнатальной гипоплазией, нормальным интеллектом, без эндокринологических нарушений и аутосомно-рецессивным типом наследования. Вторая группа включала 43 больных из 40 якутских семей с лицевыми дизморфиями, низким ростом, микромелией стоп и кистей, частичной атрофией зрительных нервов, колбочковой дисфункцией и пельгеровской аномалией лейкоцитов с аутосомно-рецессивным типом наследования. Распространенность всех пяти наследственных заболеваний рассчитана по республике в целом и по отдельным улусам, по этническим группам, исходя го численности населения по данным Всероссийской переписи 2002 г.
На втором этапе исследования проведено комплексное клинико-генеалогическое обследование пробандов и их родственников на базе МГК РБ№1-НЦМ с заполнением специально составленного протокола для каждого отдельного заболевания (табл.1).
На третьем этапе для верификации диагноза проводились лабораторные, функциональные методы исследования, осмотр специалистов. Диагноз ОФМД, АФ, спинально-бульбарной амиотрофии Кеннеди был выставлен согласно современной классификации нервно-мышечных заболеваний (Гринио, Агафонов, 1997; Лобзин, 1998) и основывался на семейном анамнезе, общепринятых клинических критериях ОФМД, а также данных дополнительных исследований и консультаций специалистов.
Молекулярно-генетические методы анализа. Молекулярно-генетическая часть работы (исследования по анализу мутаций, гашхотипа с использованием микросателлитных БТИ-локусов в генах ОФМД, АФ, болезни Кеннеди, по картированию гена, идентификации мутации и анализу по генетическому неравновесию в генах двух форм нанизмов) выполнялась совместно с японскими коллегами в НИИ мозга Университета г.Ниигата (Япония) в период с 2004 по 2008 гг., в отделе молекулярной генетики ЯНЦ КМП СО РАМН (сбор и выделение ДНК, популяционно-генетические исследования) и в НИИ медицинской генетики СО РАМН (популяционно-генетические исследования бурятов и русских Томской области). В совокупности исследовано 1287 образцов
ДНК, в том числе 144 образца ДНК больных с различными наследственными заболеваниями и 192 образца ДНК клинически здоровых родственников, а также 951 образец ДНК здоровых людей различных национальностей (табл.1). ДНК выделяли из 10 мл периферической крови стандартным методом с использованием протеиназы К и последующей фенольно-хлороформной экстракцией (Медицинские лабораторные технологии, 1999).
Анализ заболеваний, вызванных динамическими мутациями. Амплификация областей генов, содержащих тандемные тринуклеотидные повторы, осуществлялась в процессе ПЦР с помощью ранее описанных методик при ОФМД (Bouchard et al., 1997), АФ (Campuzano et al, 1996), болезни Кеннеди (La Spada et al., 1991). Результаты амплификации для ОФМД и болезни Кеннеди оценивали в автоматическом ДНК-анализаторе ABI PRISM 310 (Applied Biosystems), для АФ - в 1% агарозном геле.
Прямая идентификация типа мутации в гене PABPN1. С целью идентификации типа мутации в гене PABPN1 после амплификации необходимых фрагментов ДНК методом ПЦР в 20 мкл объема и состава реакционной смеси описанной ранее проводилось разделение аллелей методом электрофореза в 1,5% агарозном геле (Takara) в течение 1,5 часов при 100 Вт и вырезание аллель-специфических бендов из геля. Затем ДНК выделяли из агарозного геля набором Wizard SV Gel and PCR Clean-Up System (Promega) и субклонировали в плазмидный вектор (pGEM-T Easy Vector, Promega). По шесть клонов для каждого аллеля были очищены с помощью набора QIAptrep Miniprep (QIAGEN). Продукты амплификации были очищены с помощью флюоресцентного дидеок-си-терминационного метода (DyeEx 2.0 Spin Kit (QIAGEN)) и просеквенирова-ны на автоматическом ДНК-анализаторе 3100 (Applied Biosystems). Анализ результатов секвенирования проводился с помощью нормального сшсвенса человека по базе данных NCBI.
Анализ гаплотипов в локусе окулофарингеальной миодистрофии. Для анализа гаплотипов были использованы высокополиморфные СА-маркеры находящиеся на равном расстоянии в локусе гена PABPN1, подобранные с помощью базы UCSC Genome Browser. Физическая и генетическая локализация на хромосомах и генетическая дистанция между соседними маркерами была определена на основании данных из базы генетической карты сцепления Marshfield. Результаты амплификации оценивали в автоматическом ДНК-анализаторе ABIPRISM 310 и 3100(Applied Biosystems).
Быстрая идентификация мутаций в генах PABPN1. AR или ДНК-диагностика ОФМД и болезни Кеннеди. Осуществляли методом ПЦР с вышеописанными праймерами и условиями ПЦР с последующим электрофорезом в 8% полиакриламидном геле (ОФМД) и в 1% агарозном геле (болезнь Кеннеди).
Анализ генов двух синдромом с низкорослостъю. Поиск кандидатного гена для обеих форм наследственных нанизмов был проведен в несколько этапов. Первый этап - анализ по генетическому сцеплению с локусами генами других заболеваний, сходных по клинике. У 19 больных и их родственников из 5 семей в случае якутского синдрома низкорослости, у 17 больных из 7 семей в случае второго нанизма проведен молекулярно-генетический анализ для исключения
аллельных вариантов заболеваний низкорослости с пропорциональным скелетом и сходной клиникой (метафизарная хондродисплазия Маккьюсика, болезнь Ларона, нанизм Мюлибрея, ген IGF1). Для анализа были выбраны динуклсо-тидные маркеры, использованные ранее (Avela et al., 2000; Karlberg et al., 2000; Ridanpaa et al., 2001; Buckway et al., 2001; Kant et al„ 2003).
Второй этап - полный геномный скрининг и картирование гена. Для полногеномного скрининга якутского синдрома низкорослости использована панель из 763 микросателлитных маркеров (ABI PRISM Linkage Mapping Set HD-5, Applied Biosystems), для нанизма с колбочковой дисфункцией, атрофией зрительных нервов и пельгеровской аномалией лейкоцитов - панель из 811 микросателлитных маркеров (ABI PRISM Linkage Mapping Set HD-5, Applied Biosystems), покрывающая все аутосомы со средним интервалом 4,6 сМ. Проведена ПЦР с использованием панели MapPair из микросателлитных маркеров и проанализирована на генетическом анализаторе 3100 (Applied Biosystems). Все размеры аллелей определены с помощью компьютерной программы Genscan (v.3.1.2. ABI) и GENEMAPPER (Applied Biosystems). Расчет мультилокус-ного лод-балла был проведен с использованием статистической программы ALLEGRO для всех локусов с частотой аллеля для аутосомно-рецессивного заболевания равной 0,001. Для анализа были использованы одинаковые частоты аллелей для полиморфных маркеров.
Частота 763 и 811 микросателлитных маркеров, использованных для обоих форм нанизма была определена при анализе 180 здоровых японцев (лаборатория отдела геномных исследований Центра биоресурсов, НИИ мозга, университет г.Ниигаты). Частота маркеров, находящихся на хромосоме 6: D6S1549, D6S1672, D6S1017, D6S1552, D6S1582, D6S282, D6S271, D6S1604, D6S451, D6S1650 и хромосоме 2: D2S168, D2S328, D2S2199, D2S2267, D2S149, D2S219, D2S312, D2S2295, D2S1360, D2S2375, D2S305, D2S2150 была определена дополнительно у 50 здоровых якутских индивидов, не связанных кровным родством. Физическая и генетическая локализация на хромосоме и генетическая дистанция между соседними маркерами была определена на основании данных из генетической карты базы Marshfield.Также, для сужения интервала между маркерами были созданы дополнительные два полиморфных маркера между маркерами D6S1552 и D6S1582 на 6 хромосоме и три полиморфных маркера между D2S219 и D2S2295 на 2 хромосоме, найденные с помощью базы данных на сайте UCSC Genome Browser on Human May 2004. Частота новых микросателлитных маркеров в якутской популяции определена при анализе 50 здоровых якутов, не связанных кровным родством.
Третий этап - идентификация мутаций в генах CUL7, DDX1, NAG. Для идентификации мутации в гене Куллин 7 (CUL7) было создано 25 пар олигоп-раймеров для амплификации 25 кодирующих экзонов гена CUL7, для идентификации мутации в гене полипептида 1 DEAD бокса (DDX1) - 24 пары олигоп-раймеров для амплификации 26 кодирующих экзонов гена DDX1, для идентификации мутации в гене белка амплифицированного при нейробластоме (NAG) - 52 пары олигопраймеров для амплификации 52 кодирующих экзонов гена NAG. Амплификацию необходимых фрагментов ДНК проводили методом ПЦР.
Продукты амплификации были очищены и секвенированы используя флюоресцентный дидеокси-терминационный метод (Big Dye Terminator v.3.0, PE Applied Biosystems) на автоматическом ДНК-анализаторе 3100 (Applied Biosystems). Анализ результатов секвенирования проводился с помощью программы BLAST.
Четвертый этап. Идентификация мутации 4582insTe гене CUL7 с использованием ПДРФ-анализа. Молекулярно-генетическая диагностика мутации 4582insT в гене CUL7 проводилась методом ПЦР в 25 мкл общего объема смеси С праймерами: F: 5 ' - AGC AAAAGG АТАТ АСС AGG AG-31 ; R: 5'-TCCGTCTCTTCTCCAAGTTC-3 ' при следующих условиях: первоначальная денатурация при 95° - 15 мин, 35 циклов амплификации: 94° -1 мин, 55o- 1 мин, 72o- 1 мин, заключительная элонгация при 72°-10 мин. Затем проводился ПДРФ-анализ с использованием эндонуклеазы Hinfl (Сибэнзим) и последующим электрофорезом в 3% агарозном геле.
Идентификация мутации G5741—*A в гене NAG с использованием ПДРФ-анализа. Молекулярно-генетическая диагностика мутации в 45 экзоне гена NAG проводилась методом ПЦР в 25 мкл объема смеси с праймерами: F: 5'-TTTTTAAGCTGTCTGTGGAAGACC-3'; R: 5'- CTCCAGATGATTCAAAG-TATCTGC-3* при условиях ПЦР описанных выше. Затем проводился ПДРФ-анализ с использованием эндонуклеазы HpyCH4III (Toyobo) и электрофорезом в 3%-ном агарозном геле.
Оценка возраста мутации. Вначале проанализирована степень неравновесия по сцеплению по формуле (Bengtsson, Thomson, 1981): <5= (PD- PN) /(1-PN), где PD и PN-частоты аллеля на хромосомах, несущих мутацию и на нормальных хромосомах, соответственно с доверительным интервалом (Diaz et al., 2000). Для определения возраста мутации использовался подход «генетических часов» (Labuda et al, 1997), оценивающий количество поколений g с момента появления мутации в популяции до настоящего времени, исходя из изменения неравновесия по сцеплению полиморфных маркеров с локу-сом заболевания за этот период времени (Risch et al., 1995).
РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЯ И ОБСУЖДЕНИЕ
Изучение структуры и частоты наследственной патологии в Республике Саха (Якутия) проведено на основании Республиканского генетического регистра наследственной и врожденной патологии, созданного на базе медико-генетической консультации Республики Саха (Якутия), где собрана и накоплена информация по наследственной и врожденной патологии с 2000 года. По данным регистра зарегистрировано более 2800 семей с наследственной и врожденной патологией, весь массив диагнозов включает около 130 нозологий. В настоящее исследование были включены только наследуемые формы, учтенные в регистре по состоянию на 1 ноября 2008 года. Весь спектр наследственной патологии включает 104 нозологии. Диагноз наследственного заболевания был выставлен 1247 больному из 854 семей, из них якутской национальности - 973 больных из 643 семей. Всего в регистре с наследственным заболеванием с АД типом наследования состоит на диспансерном учете 782 больных из 451 семьи, из которых 618 больных из 328 якутских семей. Среди болезней с АД типом на-
следования установлено 46 менделирующих заболеваний. Наиболее часто встречались спиноцеребеллярная атаксия 1-го типа, миотоническая дистрофия, невральная амиотрофия Шарко-Мари-Тус, нейрофиброматоз Реклингаузена, окулофарингеальная миодистрофия, синдром Марфана, синдром множественных экзостозов. Из всех перечисленных все, кроме нейрофиброматоза Реклингаузена и синдрома Марфана, встречаются в основном в якутских семьях. В МГК обратилось 319 больных из 274 семей, которым в ходе обследования в МГК РБ№1-НЦМ выставлен диагноз наследственного заболевания с АР типом наследования. 260 больных были из 227 якутских семьи. АР заболевания представлены 34 нозологическими формами патологии. Чаще других встречаются наследственный нанизм, метгемоглобинемия, нанизм с колбочковой дисфункцией, атрофией зрительных нервов и пельгеровской аномалией лейкоцитов и невральная амиотрофия Шарко-Мари-Тус. Учтено всего 12 нозологий с X-сцепленным рецессивным типом наследования. На диспансерном учете 112 больных из 91 семьи, 81 из них из 74 якутских семей. Частыми в этой группе являются гемофилия А, ихтиоз и прогрессирующая мышечная дистрофия Дю-шенна. Больных с Х-сцепленным доминантным типом наследования всего 5. 29 больных из 29 семей были консультированы по 10 нозологиям с неизвестным типом наследования.
Болезни, вызванные динамическими мутациями
Окулофарингеальная миодистрофия (ОФМД, OMIM 164300). Распространенность ОФМД в Республике Саха (Якутия) составляет 5,2 на 100 тыс. населения, в якутской популяции -11,1 на 100 тыс. якутского населения, что превышает в 10 с лишним раз распространенность ОФМД в Европе (Braise et al., 1998). Имеет место локальное накопление заболевания в центральной и вилюй-ской группах улусов республики, преимущественно в Усть-Алданском районе, где частота ОФМД (1:2200) сопоставима с частотой в изолированной франко-канадской популяции (1:1000) (Braise et al., 2003).
В клинико-генеалогическое исследование включено 40 больных с клинически выставленным диагнозом ОФМД (19 женщин и 21 мужчина) из 35 семей. Средний возраст больных с ОФМД в момент обследования составил 63,9±7,89 лет. 38 (95%) больных были из 33 якутских семей, 2 (5%) - из русских. Средний возраст больных к периоду начала заболевания был 49,95±8,30 года (от 31 года до 65 лет), что сопоставимо с литературными данными - 50,1 лет (Codere et al., 2001). Ввиду пожилого возраста и длительного течения заболевания у больных, точный возраст начала первых клинических симптомов в большинстве случаев выяснить удается не всегда, из-за чего многие случаи болезни остаются недиаг-ностированными (Ruegg et al., 2005).
При анализе родословных в 25 случаях выявляется аутосомно-доминантный тип наследования (рис. 1), в 15 - семейной отягощенности выяснить не удалось.
Как первый симптом заболевания наибольшее число больных отмечало двусторонний птоз - 25 человек (52,5%), дисфонию - 5 (12,5%), дисфаппо - 4 (10%), одновременный птоз и дисфаппо - 4 (10%), в единичных случаях
II. о О .
6/6 6/6
IV
6/6
6/10
6/10 6/10 6/6
6/6 6/10
ьЩЖ-;
дованные пациенты; Д - больной с ОФМД: нически здоровый носитель мутации в гене PABPN1.
отмечалось начало заболевания с общей слабости (2,5%), птоза и дисфогош (2,5%). В клинической картине заболевания у большинства (97,5%) больных преобладал двусторонний птоз (полуптоз), наружная офтальмоплегия (67,5%), дисфагия (92,5%), днсфония (65%) и слабость мимической мускулатуры (35%). Результаты анализа клинической картины сопоставимы с данными из других стран мира (Sluijs et al., 2004; Meóla et al., 1997; Medici et al., 1997; Fardeau, Tome, 1997; Bouchard et al., 1997; Blumen et al., 1993; Muller et al., 2001; Becher et al., 2001). Продолжительность заболевания была в среднем 14,62±9,26 года (варьировала от 2 до 34 лет). У большинства больных при длительном течении заболевания отмечаются гипотрофии нескольких групп мышц (лица, плечевого пояса, межлопатоточных, проксимальных отделов конечностей), слабость верхних и нижних конечностей с легочными осложнениями (пневмония, хронический обструктивный бронхит). Пятерым больным проведена хирургическая коррекция птоза.
Для молекулярно-генетического исследования использована ДНК 40 больных с клиническим диагнозом ОФМД и их 59 клинически здоровых родственников из 35 неродственных семей. У всех тестируемых была проведена амплификация фрагмента ДНК, содержащего исследуемые области тринуклео-тидных GCG-повторов в 1 экзоне rem PABPN1. В результате у всех 40 больных длина амплифицированного фрагмента одного из аллелей гена PABPN1 соответствовала 245 п.н., длина второго - 257 п.н. (рис. 2, А). Из 59 клинически здоровых родственников 46 были гомозиготами по нормальному аллелю и имели аллель длиной 245 п.н. (рис. 2, Б), 13 - гетерозиготами и имели 2 аллели с длиной 245 п.н. и 257 п.н. Далее, для выяснения типа мутации в гене PABPN1 у 17 больных и 1 здорового родственника из 17 неродственных семей (16 - якутских семей, 1 - русская) с мутацией проведено прямое секвенирование участка ДНК 1 экзона гена РAB PNI.
Рис. 1. Пример родословной семьи с ОФМД с результатами ДНК-диагностики. 6/6; 6/10 - результаты ДНК-анализа на мутацию в гене РАВРМ1;*-пичяо обсле-
-клинически здоровыйЙ^Я- кли-
Рис. 2. Результаты электрофореза ДНК у больного с ОФМД (А) и у здорового (Б) на ДНК-анализаторе ABIPRISM 310 (Applied Biosystems). А - электрофоре-грамма больного с ОФМД, визуализируются 2 аллели: нормальный с длиной 245 п.н. (6 GCG-повторов) и патологическая аллель с 257 п.н. (10 GCG-повторов). Б - элекгрофореграмма здорового человека, визуализируется 1 нормальный аллель длиной 245 п.н. (6 GCG-повторов).
При исследовании нуклеотидной последовательности фрагментов ДНК была обнаружена мутация - экспансия тринуклеотидных GCG-повторов до 10
А Б
Рис. 3. Сиквенс участка 1 экзона гена РА ИРМ 1 у здорового (А) и больного (Б) окулофарингеальной миодистрофией человека. У здорового 6 ОСО-повторов. У больного происходит удлинение до 10 за счет добавления 4 ОСО-повторов (подчеркнуто черной линией).
В «здоровом» аллеле длиной 245 п.н. вьивлено 6 ОСО-повторов, в му-тантном аллеле длиной 257 п.н. - 10 ОСО-повторов. У всех 17 обследованных больных и одной здоровой с мутацией в гене РАВРЫ1 выявлена одинаковая мутация в патологическом аллеле - экспансия ОСО-повторов за счет добавления 4 ОСО-повторов и 6 ССО-повторов в «здоровом» аллеле.
В 29 семьях (28 якутских и в одной русской) проведен анализ гаплотшюв с использованием 9 8ТК.-локусов, расположенных в локусе гена РАВРИ1 приблизительно на одинаковом расстоянии друг от друга.
В каждой семье были выбраны больные с (ОСО)ш мутацией и здоровые члены семьи без мутации. Для выявления аллелей, ассоциированных с окулофарингеальной миодистрофией, проведен семейный анализ полиморфных маркеров и определен галлотип, характерный для хромосом, несущих мутацию (ССО)ю. Наиболее вероятным нам представляется следуюпщй гаплотип осно-
вателя: D14S1003 - D14S50 - D14S283 - D14S990 - D14S581 - D14S972 - D14S64 -D14S264 - D14S1041-. 2-3-3-1-2-2-5-3-2. Интересным является тот факт, что выявленный в русской семье гаплотип одинаков с гаплотипом, выявленным для всех 27 якутских семей. Данный гаплотип отличен от гаплотииов, обнаруженных в популяции латиноамериканцев США и евреев Бухары (Blumen et al., 2000; Becher et al., 2001), что говорит о различном происхождении найденной мутации.
Факт, что у всех исследованных больных было одинаковое удлинение до 10 GCG-повторов, позволяет с успехом применять метод ПЦР с последующим электрофорезом в 8% полиакриламидном геле в рутинной практике медико-генетического консультирования. Подтверждением клинического диагноза ОФМД служит обнаружение у больного на электрофореграмме двух различных фрагментов ДНК, один из которых имеет нормальный размер длиной 245 п.н. (6 GCG-копий), другой - патологически удлинен и соответствует длине более 251 п.н. (экспансии GCG-повторов более 8 копий). Обнаружение у клинически здорового человека удлиненного аллеля с более 8 GCG-повторами предполагает пресимптоматическое носительство мутантного гена окулофарингеальной миодистрофии. Метод опробован на всех пациентах и их родственниках. Все 40 больных были гетерозиготами и имели 2 аллеля длиной 245 п.н. (6 GCG-повторов) и 257 п.н. (10 GCG-повторов). Из 59 здоровых родственников, у 13 выявлено пресимптоматическое носительство мутации в гене PABPN1, остальные здоровы. Разработан алгоритм диагностики ОФМД с использованием прямой ДНК-диагностики ОФМД.
Атаксия Фридрейха (АФ, OMIM 229300). Общая частота АФ среди всего населения Республики Саха (Якутия) — 1,26 на 100 тыс. населения сопоставима с мировыми частотами (2-5 на 100 тыс. населения) (Palau, Espinos, 2006), также как и частота среди якутов 2,78 на 100 тыс. нас. Распространенность среди детского населения якутской национальной принадлежности - 7,5 на 100 тыс. детского населения.
Дебют болезни АФ наблюдался в среднем в возрасте 4,7 ±2,07 лет, варьируя с 2 до 9 лет. Все больные были с классическим фенотипом болезни, характеризовавшимся ранним началом, быстрым прогрессированием и сочетанием типичных неврологических и экстраневральных проявлений.
Всем девяти больным и 20 родственникам из девяти семей проведен мо-лекулярно-генетический анализ на мутацию в гене FRDA с применением удлиненной ПЦР. У больных была выявлено отсутствие аллеля в месте нормальных аллелей, то есть имеется экспансия тринуклеотидных GAA-повторов в 1-м ин-троне гена FRDA в гомозиготном состоянии, что является молекулярным подтверждением диагноза АФ, у их 20 родственников - в гетерозиготном состоянии. Разработан алгоритм диагностики атаксии Фридрейха в PC (Я) с применением молекулярно-генетических методов диагностики.
Спинально-бульбарная амиотрофия Кеннеди или болезнь Кеннеди (OMIM 313200). В республике болезнь Кеннеди встречается только среди якутского населения. Распространенность болезни среди якутов мужчин составила 2,8 на 100 тыс.якутов, что сопоставимо со средней частотой в мире - 2,5 на 100
тыс. (Andrew et al., 1997). Но в республике заболевание распространено неодинаково и зарегистрировано только в 3 улусах (Абыйском, Верхнеколымском, Нюрбинском). Частота в Верхнеколымском улусе (408,7 на 100 тыс. мужчин) намного превышает частоту, зарегистрированную в финской популяции с эффектом основателя (15,3 на 100 тыс. населения) (Udd et al., 1998).
Под нашим наблюдением находилось шесть больных из четырех неродственных якутских семей. Возраст больных от 33 до 60 лет, все имеют инвалидность Н-Ш группы. В клинической картине болезни Кеннеди у якутов средний возраст начала заболевания (45,1±4,4 лет) сопоставим со средним возрастом в других популяциях мира (44,8±10,1 лет) (Guidetti et al., 2001). Клиническая картина сходна с клиникой больных описанных ранее.
Для молекулярно-генетического исследования использована ДНК 6 больных с клиническим диагнозом болезнь Кеннеди и 10 сибсов из 4 неродственных якутских семей, проведена амплификация фрагмента ДНК, содержащего исследуемые области тринуклеотидных CAG-повторов в 1 экзоне гена AR (рис. 4).
□□ 143:14«1ч-АА$733/ -
Рис. 4. Результаты ПЦР фрагаентного анализа размеров аллелей на ДНК-анализаторе ABIPRISM 310. А - больной с болезнью Кеннеди с одним удлиненным аллелем до 283 п.н. (45 CAG-повторов). Б - гетерозиготная носительница болезни Кеннеди с двумя аллелями. Один аллель нормальной длины - 219 п.н. (24 CAG-повтора), второй удлиненный - 300 п.н. (51 CAG-повтор).
В результате у всех 6 больных длина амплифицированного фрагмента одного аллеля гена AR была более 38 CAG- повторов (рис. 4, А). Кроме того, у одной из сестер больных болезнью Кеннеди выявлено гетерозиготное носи-тельство мутации в гене AR (рис. 4, Б).
Внедрен метод прямой ДНК-диагностики болезни Кеннеди, основанный на ПЦР с визуализацией в 1% агарозном геле, позволяет уточнить клинический диагноз, проводить дифференциальную и пресимптоматическую диагностику, гетерозиготное носительства среди женщин с целью ранней профилактики и дородовой диагностики заболевания в отягощенных семьях и на популяцион-ном уровне. Разработан алгоритм диагностики болезни Кеннеди в PC (Я) с применением прямой ДНК-диагностики.
Наследственные заболевания с низким ростом
Патологически низкий рост является одной из частых причин обращения взрослых и детей в МГК РБ№1-НЦМ РС (Я) (Ноговицына и др., 1999). В Республиканском генетическом регистре наследственной и врожденной патологии зарегистрировано более 250 больных с различными наследственными и хромосомными формами низкорослости. 40% от всех случаев обращения с низкорос-лостью занимают 2 формы наследственных синдромов с низкорослостыо. Всего 98 больных, из них 81 - дети до 15 лет (82,7%).
Якутский синдром низкорослости (ЯСН). Распространенность ЯСН среди якутов составляет 12,72 на 100 тыс. населения (1:7800), среди детей якутской национальности составила - 36,7 на 100 тыс. населения. Наибольшая частота ЯСН встречается в Ленском, Оленекском, Усть-Майском, Амгинском, Намеком, Сунтарском улусах.
Проанализировано 43 генетические карты больных с якутским синдромом низкорослости из 37 неродственных семей. Все больные были коренной национальности (90% - якуты, 10% - эвены и эвенки от смешанных браков с якутами). 25 (58%) больных были женского, 18 (42%) мужского пола. Возраст больных варьировал от 0 до 45 лет. 88,4% больных (38) - дети в возрасте до 15 лет. Рост родителей у всех больных средний, в кровном родстве не состоят. Беременность при данной патологии протекала в основном гладко. Срок гестации при беременности варьировал от 35 до 42 недель (в среднем 37 недель); в 87% роды произошли в срок. У 18 детей (41,9%) была асфиксия в родах, и 11 (25,6%) новорожденным понадобились реанимационные мероприятия в родильном зале. В 5 семьях (11,6%) дети со схожими клиническими проявлениями, без видимых пороков развития умерли сразу же после рождения.
При рождении рост и масса тела 42 (97%) пациентов были низкими для гестационного возраста (средний рост - 42±0,64 см, средняя масса тела -2,33±0,07 кг). Среднее стандартное отклонение (БОБ) рост при рождении было -6,0±0,37, варьируя от -1,8 до -12,2 (рис. 5, А). В течение всей жизни среднее значение среднего стандартного отклонения длины тела варьирует от -4,23 до -6,57. К 18 годам и старше рост больных достигал 133-138 см.
У всех больных (100%) был низкий рост с относительно большой головой гидроцефальной формы (81,4%), особенно выраженной в раннем детском периоде (рис. 5, Б). Такие признаки, как короткая и широкая грудная клетка, бра-хидактилия, микромелия кистей и стоп, выступающие пятки встречались у всех больных (100%). 95% больных имели характерный фенотип, включающий в себя лицо треугольной формы, широкий лоб, гипоплазию скуловых костей, запавшее переносье, мясистый нос, длинный фильтр, полные губы, выступающий подбородок, и широкую шею. Гидроцефальная форма головы, широкие густые брови, деформация грудины (килевидная или воронкообразная), поясничный лордоз, мышечная гипотония, гипермобильность мелких и крупных суставов встречались с частотой от 65% до 86%. Другие клинические признаки являлись наименее патогномоничными для данного синдрома, и частота их варьировала в зависимости от возраста. Например, большой живот встречается у всех детей в возрасте только до 5 лет, особенно заметен в неонатальном периоде.
19
Возраст (годы)
О 10 20 30 40 50
5 ,
о Женщины
■ Мужчины
- Среднее ЭОЭ 5«в„о_. .
О ЙР.% о -
? 00
3
0 Тс
I 2>-
А Б
Рис. 5. А - БВБ (стандартное отклонение) роста 43 больных с ЯСН при рождении и в различные возрастные периоды жизни. Б - больные сибсы из одной семьи с ЯСН 9 и 11 лет.
Моторное развитие детей в основном протекало по возрасту, иногда с небольшим отставанием, в физическом развитии дети отставали с первых месяцев жизни. Интеллектуальное развитие соответствовало возрасту. В половом развитии пациенты не отстают от сверстников. Менструации у девочек начинаются в среднем в 12-13 лет, при ультразвуковом исследовании размеры матки и яичников соответствуют возрасту и размерам тела. Лабораторные показатели минерального обмена, гормонов щитовидной железы, гормонов роста - в пределах возрастных норм.
При рентгенологическом исследовании костный возраст слегка отстает в раннем детском возрасте (от 0 до 5 лет) и затем после 10 лет - соответствует паспортному возрасту, после 16 лет - опережает. По данным рентгенологической картины были описаны расширенные метафизы у 11 больных (25,6%), тонкие трубчатые кости у - 1 (2,3%), высокие позвонки и сниженный передне-задний диаметр в грудопоясничном отделах - у 4 (9,3%), закрытая спинномозговая грыжа у 9 больных (20, 9%).
При анализе 37 родословных в 11 случаях четко прослеживался аутосом-но-рецессивный тип наследования: в семье было 2 и более пораженных сибсов или имелся родственник с похожим заболеванием.
Молекулярно-генетический анализ. У 19 больных и их родственников из 5 семей проведен анализ генетического сцепления с известными генами заболеваний, сходных по клинике. Применен метод гомозиготного картирования. В результате анализа все больные с данной формой нанизма не являются гомозиготами и не имеют одинаковых гашютипов в локусах генов, вызывающих эти заболевания.
Полногеномный скрининг проведен с помощью панели из 763 микроса-теллитных маркеров на ДНК 39 больных и 39 их родственников из 33 неродственных якутских семей с ЯСН. В результате был определен кандидатный регион гена протяженностью ~ 2,7 млн. п.н. в хромосомном регионе 6р21.1 с максимальным мультилокусным лод-баллом, равным 24,6 (при частоте рекомбинаций 0=0) в локусе маркера 065282 (рис. 6, А). Анализ рекомбинационных событий определил в качестве центромерной и теломерной границ области локализации гена маркеры 0681650 и 0681549, соответственно.
а 0651575 1)651549 0652Я2 1)651650 О65452
Рис. 6. Результаты расчета мультилокусного лод-балла на 6р21.1 и физическая карта вовлеченных локусов при якутском синдроме низкорослости. А - максимальный лод-балл в локусе 068282, равный 24,6. Б - кандидатный регион гена протяженностью ~ 623 тыс.п.н., ограниченный маркерами М4298 и 068271.
Затем у 43 больных и 39 их родственников из 37 семей, основываясь на данных о возможном существовании эффекта основателя, вследствие которого редкий в мире аутосомно-рецессивный синдром получил высокое накопление в якутской популяции, был применен метод тонкого генетического картирования, основанный на реконструкции протяженных гаплотипов у ключевых членов из 37 семей. Для анализа были использованы 6 дополнительных полиморфных маркеров, выбранных между маркерами 0681549, 068282, 0681650 и представляющих собой высокоинформативные динуклеотидные СА-повторы: 0681672, 0681017, 0681552, 068271, 0681604, 068451. Все пациенты были гомозиготами только в области маркера 068282. Следовательно кандидатный регион для гена расположен между маркерами 06Б1552 и 068271 и составил
~1,5 млн. п.н. (рис. 6, Б). Из 37 семей 24 семьи имели одинаковый гаплотип 7-55 в районе маркеров 0681552, Б6Я282 и 068271 в гомозиготном состоянии.
Среди пораженных сибсов отсутствие гомозиготности было обнаружено в 12 из 37 семей. А в семьях 15 и 23 это наблюдалось в области маркера 068271. Эти результаты свидетельствуют о наличии сильного эффекта основателя, лежащего в основе данного синдрома, а гаплотип 0681549-06816720681017-0681552-06828-068271-0681604-068451-0681650: 2-4-6-7-5-5-2-44 вероятно и является гаплотипом основателя. Затем, с помощью 0681582 и 2 дополнительных динуклеотидных маркеров М4298 и М4265 сузили границы кандидатного региона (рис. 6, Б). Все больные были гомозиготами в области маркера £>65252, гетсрозиготами в области маркера М4265 в семьях 16, 33, в области маркера М4298 - в семье 16 и в области маркера 068271 в семьях 15 и 23. Все пациенты также были гомозиготами по аллелю 2 в области маркера М4298, кроме пациента 595 из 16 семьи. Тогда как ни один из 32 исследованных якутов из популяционной выборки не имел аллель 2. Со стороны теломер-ной части хромосомы границы кандидатного региона ограничены маркером М4298, со стороны центромерной части - маркером 068271. Таким образом, кандидатный регион определился между маркерами М4298 и 068271 и размер его составил 623 тыс.п.н. (рис. 6, Б).
В момент проведения данного исследования С. Хубер и соавт. идентифицировали ген С1Л7, ответственный за развитие 3-М синдрома (НиЬег et а1., 2005). Данный ген находился в критическом регионе. Так как клинические проявления у наших пациентов были схожи с клиникой редкого в мире 3-М синдрома, мы решили, что данный ген является хорошим кандидатом для ЯСН. Проведено полное прямое секвенирование 25 кодирующих экзонов гена СШ7 и прилегающих к ним экзон-интронных участков. Была обнаружена новая мутация - инсерция Т в 4582 положении в 25 экзоне (рис. 7, Б), не описанная ранее (НиЬег ег а!., 2005,2009).
CTCÁAGATTCGAG ATGGCAGC
I
CTCAAG ATTTCGAG ATGGC AGC
Рис.7. Фрагмент результатов автоматического секвенирования области 25 экзо-на гена CUL7. А - норма. Б - патология, с мутацией 4582insT в гомозиготном состоянии, стрелкой помечена вставка Т в позиции 4582.
Эта мутация приводит к сдвигу рамки считывания кодона и последующему преждевременному стоп-кодону в положении 1553(Q1553X). Было установлено, что у всех 43 обследованных больных мутация 4582ms Т находится в гомозиготном состоянии, а у их 34 родителей и сибсов - в гетерозиготном состоянии, у 5 сибсов мутации не выявлено.
Найдена единственная мутация 4582 insT в гене CUL7, приводящая к потере сайта рестрикции эндонуклеазы Hinfl, что позволило нам разработать способ быстрой идентификации патологической мутации методом ПЦР и ПДРФ (рис. 8).
Маг О Б M Cl С2 П1 П2 ПЗ
240 п.н.
125 пл. 115 п.н.
в^-о
□
Рис. 8. Результаты электрофореза в 3% агарозном геле после ПДРФ с рестрик-тазой Hinfl. Mar - маркер; Б - больной пробанд, гомозигота (240 п.н.); О (отец), M (мать), С2 (сибс) - здоровые гетерозиготные носители (240, 125 и 115 п.н.); Cl (сибс) и П1, П2, ПЗ (здоровые якуты) - здоровые (115 и 125 п.н.).
В норме должны образовываться фрагменты 125+115 п.н., в случае носи-тельства в гомозиготном состоянии (больной) - вместо фрагментов 125 +115 п.н. образуется фрагмент длиной 240 п.н. В случае гетерозиготного носительст-ва мутации (здоровый носитель) длины фрагментов будут 240+125+115 п.н. Было установлено, что у всех 43 обследованных больных мутация 4582insT находится в гомозиготном состоянии, у их 34 обследованных родителей и сибсов - в гетерозиготном, а у 5 сибсов - мутация не обнаружена.
Получен патент Российской Федерации № 2315310 «Способ диагностики 3-М синдрома в якутской популяции». Способ применен при популяционных исследованиях и при проведении 2 случаев пренатальной ДНК-диагностики в медико-генетической консультации PC (Я).
Популяционные исследования частоты мутации 4582insT в гене CUL7 в популяциях Республики Саха (Якутия) и Сибири. Всего было прогенотипирова-но 326 ДНК я;кутов, примерно одинаковое количество ДНК якутов было взято из 3 групп якутов: вилюйской, центральной и северной групп республики. Частота мутации 4582insT у якутов из центральных улусов Якутии составила 3,2%, у якутов из северных улусов — 1,0%, у якутов из вилюйской группы улусов -0,4%. Таким образом, общая популяционная частота мутации 4582insT в гене
CUL7 в якутской популяции составила 1,5%, а частота гетерозиготного носи-тельства - 3%. Среди 100 прогенотипированных хромосом эвенов и эвенков и 50 хромосом юкагиров, проживающих в PC (Я), не было выявлено ни одного гетерозиготного носителя мутации 4582insT в гене CUL7. Согласно историческим данным, одним из мест возможного проживания якутов до переселения в Якутию было Прибайкалье (Гоголев, 2000). Поэтому мы прогенотипировали 100 образцов ДНК бурятов из Бурятии. Среди 200 прогенотипированных хромосом бурятов мутация 4582insT не была выявлена. Также прогенотипировано 100 ДНК русских из Томской области, среди которых мутации 4582insT тоже не была найдена.
Оценка возраста мутации 4582insT в якутской популяции. Среднее значение числа поколений, прошедших после начала распространения мутации 4582insT в якутской популяции составило 13,72 поколений со стандартным отклонением 9,93. Учитывая продолжительность одного поколения (25 лет), время, за которое это произошло, составляет 343 ± 248,25 лет. Исходя из того что средний год рождения больных ЯСН - 1988, период начала распространения мутации соответствует XVII-XVIII в.в. (1645 ±248,25 год).
Синдром низкорослости с колбочковой дисфункцией, атрофией зрительных нервов и пельгеровской аномалией лейкоцитов (SCOP). Распространенность синдрома у якутов составляет 9,95 на 100 тыс. (1:10053).
Мы проанализировали генетические карты 34 больных с задержкой роста из 31 неродственной семьи. Все больные (100%) были коренной якутской национальности. Из них 22 (64,7%) - женского, 12 (35,3%) - мужского пола. Возраст больных варьировал в период первого осмотра: 28 (82,4%) пациента были возрасте от 5 до 15 лет и 6 (17,6%) были в возрасте старше 15 лет. Рост всех родителей средний, в кровном родстве не состоят. Составлено 31 родословная, тип наследования заболевания - аутосомно-рецессивный. В 6 семьях поражено по 2 сибса.
Беременность при данной патологии протекала в основном гладко. Срок гестации варьировал от 38 до 40 недель (в среднем 39 недель). В 100% случаев роды были физиологическими. Средний рост и масса тела при рождении были нормальными (50,23=0,44 см и 2,96±0,08 кг, соответственно). Рост больных в возрасте старше 18 лет не превышает 140 см, окружность головы - 55 см.
Родители больных обращаются к врачам после 3 летнего возраста с жалобами на частые падения ребенка и отставание в росте. Моторное развитие детей в основном протекало по возрасту, с небольшим отставанием. В физическом развитии дети отставали с первых месяцев жизни; после 3-х лет отставание в росте становилось значительным. Интеллектуальное развитие соответствовало возрасту.
Большинство пациентов имеют череп брахицефальной формы с гипоплазией лобных и теменных бугров и плоский затылок (90%). Старческое выражение лица в сочетании с мелкими чертами, прямой нос с выступающей переносицей, маленькими орбитами глаз, легким экзофтальмом, гипоплазией скуловых костей, узким лбом, длинным фильтром и тонкими губами. Эти симптомы встречаются у 88-97% пациентов (рис. 9). Короткая шея у 88%. Кожа пациентов
дряблая, тургор ткани снижен. Волосы тонкие, тусклые. Голова пропорциональна туловищу, кисти маленькие, брахидактилия (100%), клинодактилия V пальца, стопы маленькие широкие с высоким сводом, сандалевидной щелью (около 90%), брахидактилией.
А Б В
Рис. 9. Больная 34 лет с синдромом SCOP. А - низкий пропорциональный рост 132 см (SDS -5,0), короткая шея, короткая и широкая грудная клетка, слегка укороченные верхние и нижние конечности, дряблая кожа. Б - микромелия кистей рук. В - микромелия стоп.
У всех больных выявлено нарушение зрения, к 5-7 годам больные начинали проходить обследование у офтальмологов с диагнозом частичная атрофия зрительных нервов. Пациенты обследованы детским и взрослым офтальмологами. У всех пациентов (100%) выявлена двухсторонняя частичная атрофия зрительных нервов. Клинические исследования до лечения выявили снижение остроты зрения в среднем до 0,23±0,21. 12 пациентов имели миопическую рефракцию: один - с 3 степенью четверо - со 2 степенью, семеро- с 1 степенью; три пациента имели гиперметропию; девять - страбизм. Одному больному по результатам углубленного исследования в условиях офтальмологического отделения НИИ мозга Университета г.Ниигата (Япония) выставлен диагноз коротковолновой чувствительной (З)-колбочковой дисфункции сетчатки (рис. 10). Шестеро больных из обследованных одиннадцати в условиях МГТС РБ№1-НЦМ имели по результатам дихотомической панели Фарнсворта на дальтонизм различные нарушения цвета: тритановые, деутановые, протановые и все (100%) не могли прочитать псевдоизохроматический тест Ишихары. Таким образом, обследованные больные имели колбочковую дисфункцию сетчатки.
А Б В
Рис. 10. Результаты офтальмологического исследования больного С., 15 лет. А -глазное дно правого глаза. Б - толщина слоя нервных волокон и ганглиозных клеток, измеренная с помощью оптической когерентной томографии (Optovue, RTVue-100, Fremont, С А) в правом глазу. Выявлено истончение нервных волокон сетчатки во всех направлениях вокруг диска зрительного нерва. В - результаты ЭРГ правого глаза больного (справа) в сравнении со здоровым человеком (слева).
При рентгенологическом исследовании костного возраста дети отстают на 2-3 года. Со стороны эндокринных органов: 15 больных (44,1%) прошли исследование соматотропного гормона, у всех наблюдался нормальный выброс СТГ после нагрузки инсулином, у 3 - преходящие нарушения со стороны щитовидной железы. Исследование кортизола в крови не выявило нарушения. У всех больных выявлен нормальный кариотип.
В общем анализе крови у больных обнаружена пельгеровская аномалия нейтрофилов (OMIM 169400) (аномалия лейкоцитов, содержащих гиполобули-рованные ядра: несегментрованные, бисегментироваяные или круглые вместо четырех - пяти - ядерных) (рис. 11, А).
А Б
Рис. 11. Мазки крови больного с синдромом SCOP (А) и здоровой матери (Б). А - пельгеровская аномалия лейкоцитов: несегментированный (стрелка с прерывистой линией) и бисегментоядерный нейтрофилы (сплошная стрелочка). Б -норма: многоядерный нейтрофил (стрелочка).
Гетерозиготы (родители больных и сибсы) имели нормальные нейтрофи-лы (рис. 11, Б). Средний лобулярный индекс (СЛИ) (общее количество долей ядрышек в 100 нейтрофилах делится на 100) (Oneson et al., 1987) у больных с синдромом низкорослости в среднем был 1,54±0,15 и варьировал от 1,32 до 1,86, у здоровых родственников - 3,03±0,35 (от 2,62 до 3,22) и у здоровых-3,74±0,01. В норме СЛИ - от 2,5 до 3,1.
Новому синдрому дано название SCOP синдром (Short stature syndrome with Cone dysfunction, Optic atrophy and Pelger-Huet anomaly).
Молекулярно-генетический анализ. У 17 больных и их родственников из 7 семей мы провели анализ генетического сцепления с известными генами заболеваний, сходных по клинике. Применен метод гомозиготного картирования. В результате анализа все больные с данной формой нанизма не являются гомозиготами и не имеют одинаковых гаплотипов в локусах генов, вызывающих эти заболевания. Следовательно, генетического сцепления в данных семьях с локу-сами на хромосомах 5,9,17 не выявлено и эта форма нанизма не относится ни к одному из этих заболеваний.
Для полногеномного скрининга использована ДНК 31 больных и 27 их родственников из 28 неродственных якутских семей с синдромом SCOP. Полногеномный скрининг проведен с использованием панели из 811 микросател-литных маркеров, покрывающих все аутосомы со средним интервалом 4,6 сМ. Был применен метод гомозиготного генетического картирования. 25 больных из 33 были гомозиготами в области маркера D2S149 на 2 хромосоме, тогда как частота этого маркера в нормальной якутской популяции составляет 0,06. Затем, с помощью 9 дополнительных микросателлитных маркеров, выбранных между маркерами D2S168, D2S149 и D2S215, мы провели тонкое генетическое картирование гена для нового синдрома. В результате был определен кандидат-ный регион гена на 2 хромосоме в локусе маркера D2S312, протяженностью 2,7 млн.п.н. и ограниченный маркерами D2S2295 и D2S2267, соответственно. Максимальный мультилокусный лод-балл был равен 17,73 (при частоте рекомбинаций 6=0) в локусе маркера D2S312 (рис. 12, А).
Анализ рекомбинационных событий определил в качестве центромерной и теломерной границ области локализации гена маркеры D2S2295 и D2S2267, соответственно. Таким образом, в соответствии с цитогенетической картой 2 хромосомы, мутантный ген может быть локализован в хромосомной области 2р24.3, лежащей между маркерами D2S2295 и D262267. Затем, с помощью 3 дополнительных динуклеотидных маркеров: MI491, Ml542, М1599 со следующей локализацией на физической карте хромосом: 114913070 п.н., 15429187 п.н., и 15991354 п.н. мы сузили кандидатный регион. Отсутствие гомозиготно-сти наблюдалось в теломерной части в 4 семьях (817, 2913, 1839 и АА900), в области маркера М1491, в центромерной части в 3 семьях (817, АА3362,2913) в области маркера Ml599. Так как пациент 817 не был гомозиготой в этом регионе, то мы не можем исключить возможности, что этот пациент является компа-унд-гетерозиготой. Поэтому мы исключили этого пациента их дальнейшего исследования по гомозиготному картированию.
лод-балл
Генетическое расстояние (сМ)
Теломера
Известные гены
NSE1
Центромера
NAG ! MYCN
DDX1; ■
Регион гомозиготпости 1,1 млн.п.н.
Рис. 12. Результаты мультилокусного лод-балла на 2р24.3 и физическая карта вовлеченных локусов при синдроме SCOP. А - максимальный лод-балл в локусе D2S312, равный 17,73; кандидатный регион гена протяженностью ~ 2,7 млн. п.н., ограниченный маркерами D2S2267 и D2S2295. Б - регион гомозиготности протяженностью -1,1 млн. п.н., ограниченный маркерами Ml491 и Ml599. В этом регионе находится всего 2 гена: NAG и DDX1.
Хотя и в области маркера М1599 в одной семье (АА3362) наблюдалось отсутствие гомозиготности, пациенты 565, АА2357, АА71, АА787,2555, АА805 имели сходный гаплотип 4-2-1-3-1-1-2 в области маркеров D2S149, D2S219, Ml491, D2S312, М1599, D2S2295 и D2S1360 в гомозиготном состоянии. Поэтому мы предположили, что произошло репликационное слипание с маркером Ml542 и кандидатный ген для нового синдрома низкорослости находится в регионе, ограниченном микросателлитными маркерами М1491 и М1599, и имеет протяженность 1,1 млн. п.н. (рис. 12, Б). В данном регионе находилось 2 канди-датных гена: NAG и DDX1. А выявленный гаплотип: 8-2-1-3-4-2-1-3-3-1-1-2-7 для 13 микросателлитных маркеров: D2S168-D2S328-D2S2199-D2S2267-D2S149- D2S219-M1491-D2S312-M1542-M1599-D2S2295-D2S1360-D2S2375, вероятно и является гаплотипом основателя.
В критическом регионе, между маркерами М1491 и М1599, находилось 2 кандидатных гена для синдрома низкорослости с колбочковой дисфункцией, атрофией зрительных нервов и пельгсровской аномалией лейкоцитов: ген белка амплифицированного при нейробластоме (NAG) и ген полипептида 1 DEAD бокса (DDX1) (рис. 12, Б).
Проведено полное прямое секвенирование 26 кодирующих экзонов гена DDX1 и прилегающих к ним экзон-интронных участков. В гене DDX1 мутаций не было найдено. Значит, этот ген не является геном, вызывающим синдром низкорослости у якутов.
Затем проведено полное прямое секвенирование 52 кодирующих экзонов гена NAG и прилегающих к ним экзон-интронных участков. При исследовании нуклеотидной последовательности фрагментов ДНК, содержащих кодирующие регионы и области сайтов сплайсинга гена NAG, было обнаружено девять нук-леотидных замен в семи экзонах (2,15, 16,21,25,26 и 45) и одна сплайсинговая вставка ТААТ перед 45 экзоном. Нуклеотидные замены в трех экзонах: в 15 (A—>G), 21(G-*A) и 26 (G->A), представлены на сайте NCBI являются нормальными полиморфизмами. Сплайсинговая вставка insTAAT перед 45 экзоном была обнаружена у 8 пациентов и у 12 исследованных якутов из популяцион-ной выборки и, по-видимому, является нормальным полиморфизмом для якутской популяции. Шесть из девяти обнаруженных нуклеотидных замен в гене NAG не были представлены в международной базе данных NCBI: С130—>G (приводящее к аминокислотной замене Q44E) во 2 экзоне, А1611—»G (без аминокислотной замены) в 16 экзоне, Т2775—*С (без аминокислотной замены), G2845—>С (приводящее к аминокислотной замене V949L) в 25 экзоне, G3026—»С (приводящее к аминокислотной замене C1009S) в 26 экзоне, и G5741—>А (приводящее к аминокислотной замене R1914H) в 45 экзоне (рис. 13).
Экзоны 52
A AG С СCAT A A A G AG
н
AAGCCCGTААAG AG
R
Контроль
Рис. 13. А - схематическая структура гена NAG и расположение обнаруженных ОНП во 2,16,25,26 и 45 экзонах. Б - электрофореграмма фрагмента 45 экзона с нуклеотидной заменой G5741-+A у больного (выше) и в норме (ниже).
Было установлено, что у 42 из 43 обследованных больных с синдромом SCOP все обнаруженные нуклеотидные замены в гене NAG находятся в гомозиготном состоянии, а у их 34 родителей и сибсов - в гетерозиготном состоянии, у 4 сибсов замены не выявлены. У пациента 817 все шесть нуклеотидных замен обнаружены в гетерозиготном состоянии и также не было найдено других нуклеотидных замен в других экзонах гена. NAG.
Было обследовано 104 индивида якутской национальности на 5 нуклеотидных замен: C130-+G во 2 экзоне, А1611—>G в 16 экзоне, Т2775—>С, G2845—»С в 25 экзоне, G3026-+C в 26 экзоне и 203 якута и 100 японцев на нук-леотидную замену в 45 экзоне: G5741—>А. Не было обнаружено ни одной нук-леотидной замены в гомозиготном состоянии в популяционной выборке якутов и японцев. Нуклеотидные замены во 2, 16, 25 и 26 экзонах (C130-+G, А1611—Ю, Т2775—>С, G2845—>С, G3026->C) встречаются в популяционной выборке якутов с частотой выше 1% (1,9 - 3,4%), что дает основание предположить, что все 5 нуклеотидных замен являются нормальными полиморфизмами; также они тесно сцеплены с мутацией в гене NAG и с синдромом низкорос-лости с колбочковой дисфункцией, атрофией зрительных нервов и пельгеров-ской аномалией лейкоцитов в якутской популяции.
В якутской семье 13, у здорового отца больного 484 была обнаружена нуклеотидная замена G5741—>А (R1914H) в 45 экзоне гена NAG в гетерозиготном состоянии, а остальные 5 нуклеотидных замен в 2, 16, 25, 26 экзонах гена NAG были выявлены в гомозиготном состоянии. Также в 45 экзоне гена NAG среди 406 хромосом в якутской выборке и 200 хромосом в японской выборке не было выявлено ни одного гомозиготного носителя нуклеотидной замены G5741—>А. Частота аллеля с нуклеотидной заменой G5741—>А в гетерозиготном состоянии в популяционной выборке якутов составила 0,005.
По данным сравнения аминокислотных последовательностей бежа NAG у разных видов было выявлено, что позиция 1914 является высококонсервативной позицией, в которой у всех биологических видов представлен аргинин, тогда как, глутамин в позиции 44, валин в позиции 949 и цистеин в позиции 1009 у человека не являлись консервативными в ходе эволюции и у ряда других видов в этих позициях представлены другие аминокислоты.
Таким образом, нуклеотидная замена в 45 экзоне, G5741—>А (приводящая к аминокислотной замене R1914H) в гене NAG в гомозиготном состоянии является миссенс-мутацией и наиболее вероятной молекулярно-генетической причиной возникновения синдрома низкорослости с колбочковой дисфункцией, атрофией зрительных нервов и пельгеровской аномалией лейкоцитов в якутской популяции. NAG ген высоко экспрессируется в соединительной ткани, глазах, головном мозге, спинном мозге, то есть в тканях и органах, которые поражаются при синдроме низкорослости с колбочковой дисфункцией, атрофией зрительных нервов и пельгеровской аномалией лейкоцитов.
Оценка возраста мутации. Среднее значение числа поколений, прошедших после начала распространения мутации G5741—>А в якутской популяции составило 37,76 поколений со стандартным отклонением 25,61. Учитывая про-
должительность одного поколения (25 лет), время, за которое это произошло, составляет 944± 640,25 года. Исходя из того что средний год рождения больных с синдром низкорослости - 1996, то период начала распространения мутации 05741—>А в якутской популяции соответствует первой половине XI века (1052 год ±640,25 лет).
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
Проведено комплексное генетико-эпидемиологическое, клинико-генеалогическое и молекулярно-генетическое изучение отдельных форм этнос-пецифической наследственной патологии в Республике Саха (Якутия). Результаты проведенного исследования позволяют добавить к списку этнически приуроченных или этноспецифических «якутских наследственных болезней» (спи-ноцеребеллярная атаксия 1-го типа, миотоническая дистрофия, наследственная энзимопеническая метгемоглобинемия I типа) еще пять наследственных заболеваний: АД окулофарингеальную миодистрофию, АР атаксию Фридрейха, X-сцепленную рецессивную спинально-бульбарную амиотрофию Кеннеди, АР якутский синдром низкорослости (3-М синдром) и новый, не описанный ранее АР синдром низкорослости с колбочковой дисфункцией, атрофией зрительных нервов и пельгеровской аномалией лейкоцитов (табл. 2).
Анализ регистра показал, что в Республике Саха (Якутия) имеется накопление редкой наследственной патологии, в основном, у якутов, и позволил определить распространенность пяти наследственных заболеваний в РС (Я). Два заболевания (ОФМД, АФ) зарегистрированы, в основном (92-96%), у якутского населения, а болезнь Кеннеди и обе наследственные формы низкорослости встретились только у якутов (табл. 2). Распространенность ОФМД у якутов в 10 раз выше распространенности описанной в мире. Показатели распространенности двух форм низкорослости в якутской получены впервые и позволяют отнести оба заболевания к числу частых наследственных заболеваний у якутов. При анализе территориального распространения заболевания определены очаги накопления для каждого заболевания отдельно. В улусах вилюйской и центральной Якутии зарегистрированы единичные случаи аутосомно-рецессивной атаксии Фридрейха без накопления в отдельных улусах. Интересен тот факт, что заболевание зарегистрировано у якутского этноса, являющегося представителем азиатской расы, среди которых ранее не было зарегистрировано случаев атаксии Фридрейха (РапсЫй а а1., 2001). Это может быть объяснено привнесением в генофонд якутов европейской компоненты, поэтому выяснение причин возникновения и распространения атаксии Фридрейха среди якутов требует дальнейшего изучения. Х-сцепленная спинально-бульбарная амиотрофия Кеннеди распространена в северных улусах (Абыйском и Верхнеколымском), где частота заболевания превышает мировые значения в сотни раз. Причиной накопления может быть положительная брачная ассортативность по национальности и низкая миграционная активность женщин якуток (Кучер и др., 2005; 2007). ОФМД получила накопление на территории улусов центральной Якутии и вилюйских улусов, особенно в Усть-Алданском улусе и городе Якутске. Оба синдрома с низкорослостью получили высокое накопление в центральной и вилюйской группе улусов, где, в основном, и проживает якутское население с
Таблица 2
Сравнительные данные по частоте наследственных болезней и специфическим мутациям у якутов и в мире
Название болезни (OMIM **) Тип наследования*** Ген Мутация у якутов Распространенность болезни на 100 тыс. чел.
у якутов в мире
Спиноцеребеллярная атаксия 1-го типа (164400) АД ATXN1 экспансия CAG-повторов 36,8 [1] 1,0-2,0 [2]
Миотоническая дистрофия (160900) АД DMPK экспансия CTG-гювторов 21,3 [3] 4,0-5,0 [4]
Наследственная энзимопеническая метгемогло-. бинемия (250800) АР DIA1 РгогбЭЬеи*' 14,9 [5] 1,0 [6]
Окулофарингеальная мышечная дистрофия (164300) АД PABPN1 экспансия 10 GCG-повторов* 11,1 [собств. рез.] 1,0 [7]
Спинально-бульбарная амиотрофия Кеннеди (313200) Х-сцепл. рецессив. AR экспансия CAG-повторов 2,8 [собств. рез.] 2,5 [8]
Атаксия Фридрейха (229300) АР FRDA экспансия GAA-повторов 2,78 [собств. рез.] 2-5 [9]
3-М синдром (273750) АР сип 4582insT* 12,72 [собств. рез.] неизвестно
SCOP синдром АР NAG R1914H* 9,95 (собств. рез.) неизвестно
Примечание. Литературные ссылки: 1 — Платонов и др., 2004; 2 — Иллариошкин и др., 2006; 3 - Сухомясова, 2005; 4 -Harper et al., 2004; 5 - Тарская и др., 2004; 6 - Галеева и др., 2006; 7 - Bouchard et al., 1997; 8 - Andrew et al., 1997; 9 - Palau, Espinos, 2006.
* - отмечены специфические только для якутов мутации; **ОМ1М — номер в электронной версии каталога В. Маккыоси-ка «Mendelian Inheritance in Man» (MIM): www.ncbi.nlm.nih.gov/omim/i_***АД и АР - аутосомно-доминантный и ауто-сомно-рецессивный типы наследования.
давних времен. Но наибольшая частота распространенности для ЯСН была получена в Ленском улусе со смешанным населением, куда могли мигрировать якуты из соседнего Сунтарского улуса, где также показаны высокие значения распространенности якутского синдрома низкорослости.
Показано, что клинические проявления у якутов при ОФМД, АФ и болезни Кеннеди сходны с описанными ранее фенотипами. Проведенное впервые у якутов клинико-генеалогическое изучение ЯСН (3-М синдрома) показало, что для якутских больных характерны те же признаки, что и для описанных ранее в литературе клинических случаев 3-М синдрома в других популяциях мира (Miller et al., 1975; Spranger et al., 1976; Garcia-Cruz, Cantu, 1979; Cantu et al., 1981; Winter et al., 1984; Hennekam et al., 1987; von Goethem, Malvaux, 1987), за исключением дистресс-синдрома в периоде новорожденности почти у половины (41,9%) больных. Патогномоничные рентгенологические признаки для данного синдрома не характерны для якутских больных.
Впервые клинически описан новый наследственный синдром низкорослости у якутов. Основными клиническими симптомами нового синдрома являются: постанатальная гипоплазия, пропорционально низкий рост (SDS-4), лицевые дизморфии, микромелия стоп и кистей, вялая и дряблая кожа, колбочковая дисфункция с атрофией зрительных нервов и пельгеровская аномалия нейтро-филов. Новому синдрому дано название «синдром низкорослости с колбочко-вой дисфункцией, атрофией зрительных нервов и пельгеровской аномалией лейкоцитов» (SCOP).
Выявлена молекулярно-генетическая причина всех пяти наследственных заболеваний. Для трех заболеваний выявлены мажорные мутации, характерные для якутской популяции: экспансия (GCG)10 в гене PÁBPN1 для окулофаринге-альной миодистрофии, нонсенс мутация 4582insT в гене CUL7 для ЯСН (3-М синдрома) и миссенс мутация мутации G5741—>А в гене NAG для синдрома низкорослости с колбочковой дисфункцией, атрофией зрительных нервов и пельгеровской аномалией лейкоцитов.
Таким образом, основными факторами накопления наследственных заболеваний в якутской популяции являются: небольшая численность популяции предков, географическая изолированность, высокая рождаемость якутов (Федорова, 1999), положительная брачная ассортативность по национальности (Данилова и др., 2005; Кучер и др., 2007), и как следствие этого, дрейф генов и «га-шготип основателя». Доказательствами этому являются найденные единственные мутации в генах, приводящих к окулофарингеальной миодистрофии, 3-М синдрому и новому синдрому SCOP и выявленный «гаплотип основателя» в ло-кусах генов PABPN1, CUL7, NAG по данным STR-локусов.
Подсчитан возраст двух новых мутаций: 4582insT в гене CUL7 и мутации G5741—>А в гене NAG, равный 13,7 и 37,7 поколениям или 1645± 248,25 и 1052 год ±640,25 год, соответственно. То есть возраста мутаций примерно совпадают с двумя волнами увеличения численности якутского населения. Первая волна произошла с массовым заселением предками якутов территории современной Якутии в XI-XII веках (Гоголев, 2000), со временем которой совпадает возраст мутации G5741-+A в гене NAG. В это же примерно время (37 поколений) рас-
пространилась мутация в гене SCA1, вызывающая другое частое у якутов наследственное заболевание - спиноцеребеллярную атаксию 1-го типа (Осаков-ский и др., 2004). Возраст второй мутации 4582insT в гене CUL7 совпадает со временем второй волны увеличения численности, со временем прихода русского населения на территорию Якутии в XVII веке и массовым расселением якутов по всей территории Якутии (Парникова, 1971).
По результатам популяционно-генетических исследований получены данные о частоте гетерозиготного носительства новых мутаций: 4582insT в гене CUL7 и мутации G5741—»А в гене NAG в популяциях якутов и народов Сибири и Якутии. Частота гетерозиготного носительства мутации 4582insT в гене CUL7 в якутской популяции составляет 3%, что говорит о том, что около 13 тыс. якутов (каждый 33-ий якут) являются гетерозиготными носителями мутации 4582insT в гене CUL7. Частота гетерозиготного носительства мутации G5741—>А в гене NAG составляет 1%, что говорит о том что, около 4,5 тыс. якутов (каждый 100 якут) являются гетерозиготными носителем мутации G5741—»А в гене NAG. В популяциях эвенов, эвенков, юкагиров, русских Томской области и бурятов из Бурятии мутации 4582insT в гене CUL7 не обнаружено, в популяции японцев мутации G5741—»А в гене NAG не выявлено.
На основании полученных результатов разработаны и внедрены в практику медико-генетического консультирования PC (Я) новые методы молекулярной диагностики пяти наследственных заболеваний. Разработан, обоснован и внедрен в работу консультации алгоритм диагностики пяти наследственных заболеваний: ОФМД, АФ, болезни Кеннеди, ЯСН и нового синдрома SCOP.
ВЫВОДЫ
1. В якутской популяции имеется накопление редкой аутосомно-рецессивной, Х-сцепленной рецессивной и аутосомно-доминантной наследственной патологии. В ходе исследования выявлено пять этноспецифических заболеваний в якутской популяции.
2. Распространенность аутосомно-доминантной окулофарингеальной миоди-строфии в PC (Я) среди якутов составляет 11,1 на 100 тыс. населения с преимущественным накоплением в центральной и вилюйской группах улусов Якутии. Единственная молекулярно-генетическая причина всех случаев ОФМД в якутской популяции - мутация (GCG)m в 1 экзоне гена PABPN1. Выявленный единственный гаплотип является гаплотипом основателя.
3. Распространенность Х-сцепленной спинально-бульбарной амиотрофии Кеннеди среди якутского населения PC (Я) составляет 2,8 на 100 тыс. мужчин с преимущественным накоплением в северной группе улусов, где распространенность выше мировых значений в сотни раз (106,6 и 408,7 на 100 тыс. нас.). Молекулярно - генетической причиной болезни Кеннеди у якутов является экспансия (CAG)n в гене AR.
4. Распространенность аутосомно-рецессивной атаксии Фридрейха среди якутского населения PC (Я) составляет 2,8 на 100 тыс. населения. Молеку-лярно-генетической причиной АФ у якутов является экспансия (GAA)n- повторов в 1 интроне гена FRDA. Атаксия Фридрейха зарегистрирована в популяции якутов, относящихся к азиатской расе, где ранее не было описано
случаев болезни.
5. Одной из причин наследственной аутосомно-рецессивной низкорослости в якутской популяции является 3-М синдром. Распространенность среди всего якутского населения - 12,72 на 100 тыс. населения, среди детского населения - 36,7 на 100 тыс. детского населения. Клинические признаки якутских больных с 3-М синдром сходны с клиникой других больных в мире, за исключением дистресс-синдрома новорожденных и низкой частоты рентгенологической патологии. Мутация 4582insT в гене CUL7 является единственной причиной 3-М синдрома в якутской популяции. Частота гетерозиготного носительства мутации 4582insT в якутской популяции составляет 3%. Выявленный одинаковый гаплотип является гаплотипом основателя. Возраст мутации 4582insT составляет 13,7 поколений или 342,5 лет. В популяциях эвенов, юкагиров, эвенков, бурятов Бурятии, русских Томской области гетерозиготных носителей мутации 4582insT в гене CUL7 не встречается.
6. Описан новый синдром наследственной аутосомно-рецессивной низкорослости в якутской популяции с распространенностью 9,95 на 100 тыс. якутов, среди детского населения - 30,8. Основными клиническими проявлениями болезни являются: пренатальная гипоплазия, низкий пропорциональный рост, лицевые дизморфии, микромелия стоп и кистей, вялая и дряблая кожа, колбочковая дисфункция сетчатки с атрофией зрительных нервов и пельге-ровская аномалия нейтрофилов. Новому синдрому дано название «синдром низкорослости с колбочковой дисфункцией, атрофией зрительных нервов и пельгеровской аномалией лейкоцитов» (SCOP). Мутация G5741—»-А (R1914H) в гене NAG является единственной причиной синдрома низкорослости с колбочковой дисфункцией, атрофией зрительных нервов и пельгеровской аномалией, с аутосомно-рецессивным типом наследования в якутской популяции. Популяционная частота гетерозиготного носительства мутации G5741—>А в якутской популяции составляет 1%. Выявлен «гаплотип основателя». Возраст мутации R1914H в гене NAG составляет 37,8 поколений или 945 лет.
7. Популяционным механизмом накопления наследственных заболеваний: 3-М синдрома, окулофарингеальной миодистрофии и аутосомно-рецессивного синдрома низкорослости с колбочковой дисфункцией, атрофией зрительных нервов и пельгеровской аномалией лейкоцитов в якутской популяции является эффект основателя. Возраст мутаций 4582insT и G5741—»А совпадает с двумя волнами экспансии численности якутского населения в XI и XVII вв.
8. Создан Республиканский генетический регистр наследственной и врожденной патологии, позволяющий решать задачи накопления эпидемиологической информации о нозологической структуре, диспансеризации семей с наследственными заболеваниями, пре- и постанатальной диагностики и профилактики НП, а также проводить генетический мониторинг населения.
9. Разработан, обоснован и внедрен в работу медико-генетической консультации алгоритм диашостики пяти наследственных заболеваний: окулофарингеальной миодистрофии, атаксии Фридрейха, болезни Кеннеди, 3-М син-
дрома и нового синдрома низкорослости с колбочковой дисфункцией, атрофией зрительных нервов и пельгеровской аномалией лейкоцитов с применением молекулярно-генетических методов диагностики мажорных мутаций в исследованных генах.
ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ
1. Полученные в ходе исследования данные о спектре, распространенности наследственной патологии в Республике Саха (Якутия), о частых якутских наследственных болезнях довести до сведения сотрудников медико-генетической консультации РБ№1-НЦМ PC (Я), использовать при обучении студентов старших курсов медицинского института Якутского государственного университета им. М.К. Аммосова, последипломной подготовки врачей на кафедрах педиатрии, терапии, семейной медицины, неврологии.
2. Врачам-педиатрам, терапевтам, эндокринологам, невропатологам, офтальмологам, ортопедам рекомендуется направлять пациентов с клиническими проявлениями окулофарингеальной миодистрофии, спинально-бульбарной амиотрофии Кеннеди, атаксии Фридрейха, ЯСН и SCOP синдрома в медико-генетическую консультацию РБ№1-НЦМ с учетом предложенных алгоритмов.
3. Учитывая высокую распространенность в Республике Саха (Якутия) двух форм низкорослости ЯСН и SCOP синдрома, связанных с мутациями 4582insT гена CUL7 и G5741—>А гена NAG, и высокую частоту гетерозиготного носительства данных мутаций среди якутов, всем пациентам с низким ростом и атрофией зрительных нервов в Республике Саха (Якутия) рекомендуется ДНК-диагностика для уточнения диагноза и прогноза потомства.
4. На основе разработанной в период выполнения настоящей работы методики ДНК-диагностики «якутских наследственных болезней»: окулофарингеальной миодистрофии, спинально-бульбарной амиотрофии Кеннеди, атаксии Фридрейха, ЯСН и SCOP синдрома среди брачующихся пар рекомендуется проведение скрининга на гетерозиготное носительство мутаций 4582insT гена CUL7 и G5741-+A гена NAG с целью последующей пренатальной и преимплантационной ДНК-диагностики.
5. В целях совершенствования медико-генетической помощи больным с наследственной патологией в Республике Саха (Якутия) разработать и внести на утверждение Министерством здравоохранения PC (Я) «Республиканскую целевую программу профилактики врожденной и наследственной патологии» на 2009-2013 гг.
6. Основные дифференциально-диагностические критерии окулофарингеальной миодистрофии, спинально-бульбарной амиотрофии Кеннеди, атаксии Фридрейха, ЯСН и SCOP синдрома в виде методических рекомендаций и информационных писем направить во все лечебно-профилактические учреждения Республики Саха (Якутия).
7. Вести широкую просветительскую работу среди педиатров, терапевтов, невропатологов, ортопедов, офтальмологов, психиатров, эндокринологов с целью активного выявления и формирования ориентированного потока для оказания медико-генетической помощи.
Список работ, опубликованных по теме диссертации:
1. Максимова Н.Р., Ноговицына А.Н., Сухомясова A.JL, Аргунов В.А. Респираторный дистресс-синдром у новорожденных - новый клинический признак у якутских больных с 3 М-синдромом?// Педиатрия им. Г. Н. Сперанского. 2009. Т. 87. №3. С. 52-56.
2. Максимова Н.Р., Сухомясова A.JL, Ноговицына А.Н., Пузырев В.П. Этнос-пецифическая наследственная патология в Республике Саха (Якутия)// Якутский медицинский журнал. 2009. №2. С. 15-19.
3. Николаева И.А., Коротов М.Н., Гуринова Е.Е., Степанова С.К., Максимова Н.Р. и др. Наследственные болезни нервной системы в Республике Саха (Якутия) // Якутский медицинский журнал. 2009. №2. С. 52-54.
4. Куртанов Х.А., Максимова Н.Р., Марусин A.B., Степанов В.А. Полиморфизм локуса ОФМД в популяциях Якутии // Якутский медицинский журнал. 2009. №2. С. 54-58.
5. Максимова Н.Р., Сухомясова A.JL, Томский М.И. ДНК-диагностика моногенных заболеваний в Республике Саха (Якутия)// Илин. 2009. №3. С. 54-56.
6. Максимова Н.Р., Скрябин H.A., Павлова Н.Л. и др. 3-М синдром у плода: ультразвуковые, молекулярно-генетические и гистологические особенности / Тез. научно-практ. конференции «Итоги и перспективы развития службы охраны материнства и детства в Республике Саха (Якутия). Якутск: Изд-во «ИНИТ», 2009. С.80-86.
7. Пузырев В.П., Максимова Н.Р. Наследственные заболевания у якутов // Генетика. 2008. Т.44. №10. С. 1317-1325.
8. Максимова Н.Р., Николаева И.А., Коротов М.Н. и др. Клинико-генеалогическая и молекулярно-генетическая характеристика окулофарин-геальной миодистрофии в Республике Саха (Якутия) // Журнал неврологии и психиатрии им. С.С. Корсакова. 2008. Т. 108. №6. С. 52-60.
9. Максимова Н.Р., Сухомясова A.JI., Гуринова Е.Е. и др. Генетико-эпидемиологические и социально-экономические аспекты наследственной этноспецифической патологии в Якутии // Медицинская генетика. 2008. Т. 7. №10. С. 35-43.
10. Барашков H.A., Джемилева Л.У., Федорова С.А., Максимова Н.Р. и др. Мутации гена коннекснна 26 (GJB2) у больных наследственной несиндромаль-ной сенсоневральной тугоухостью в Республике Саха (Якутия) // Вестник оториноларингологии. 2008. № 5. С. 23-28.
11. Ноговицына А.Н., Максимова Н.Р., Сухомясова А.Л. и др. Мониторинг новорожденных и детей до 1 года жизни с врожденными пороками сердца в 2003-2007 г. в Республике Саха (Якутия) // Якутский медицинский журнал. 2008. №3. С. 21-25.
12. Куртанов Х.А., Максимова Н.Р., Стапанова С.К. и др. Внедрение ДНК-диагностики окулофарингеальной миодистрофии в практику медико-генетического консультирования Республики Саха (Якутия) // Якутский медицинский журнал. 2008. №4. С. 43-46.
13. Максимова Н.Р., Скрябин Н.А., Павлова H.JI. и др. 3-М синдром у плода: ультразвуковые, молекулярно-генетические и гистологические особенности // Медицинская генетика. 2008. №2. С. 42-47.
14. Maksimova N., Нага К., Miyashita A. et al. Novel CUL7 mutation in 49 Yakut patients with short stature syndrome / Тез. XIII международной конференции «Human Genome Meeting». Хайдерабад, Индия, 2008. P.109.
15. Koneva L.A., Babushkina N.P., Kuharskiy M.S., Maksimova N.R. Prevalence of CAT-interruption in (CAG)n-repeat region in the gene for SCA1 in Siberian populations // Тез. международной конференции «European Human Genetics conference». Barcelona, Spain, 2008. P. 391.
16. Ноговицына A.H., Максимова H.P., Сухомясова A.JI. Современные подходы к организации профилактики инвалидности от врожденной патологии / Тез. межрегиональной научно-практической конференции «Современные аспекты эпидемиологии, диагностики и лечения неврологических заболеваний на Севере». Якутск: ИП «Петрова Н.Н.», 2008. С. 71-74.
17. Коротов М.Н., Максимова Н.Р., Николаева И.А. и др. Болезнь Кеннеди в Якутии/ Тез. межрегиональной научно-практической конференции «Современные аспекты эпидемиологии, диагностики и лечения неврологических заболеваний на Севере». Якутск: ИП «Петрова Н.Н.», 2008. С. 64-65.
18. Максимова Н.Р., Пузырев В.П. Этноспецифические наследственные болезни у якутов / Тез. межрегиональной научно-практической конференции «Здоровье детей на Севере». Якутск: ЯНЦ СО РАМН, 2008. С. 91-94.
19. Николаева И.А., Гуринова Е.Е., Степанова С.К., Коротов М.Н., Максимова Н.Р. и др. Наследственные заболевания нервной системы у детей в Якутии / Тез. межрегиональной научно-практической конференции «Здоровье детей на Севере». Якутск: ЯНЦ СО РАМН, 2008. С. 102-104.
20. Maksimova N., Нага К., Miyashita A. et al. Clinical, molecular and histopatho-logical feature of short stature syndrome with novel CUL7 mutation in Yakuts: new population isolate in Asia // J. Med. Genetics. 2007. V.44. №12. P 772-778.
21. Dzhemileva L.U., Posukh O.L., Barashkov N.A., Tazetdinov A.M., Fedorova S.A., Maximova N.R. et al. Mutational analysis of the mitochondrial 12SrRNA and tRNASer (UCN) genes in patients with aminoglycoside-induced and nonsyn-dromic hearing loss from Volga-Ural region and Siberia (Russia) // Тез. международной конференции «European Human Genetics conference». Nice, France, 2007. P. 213
22. Sukhomyasova A.L., Maximova N.R., Nogovitsina A.N. et al. Myotonic Dystrophy in Yakutsk (Russian Federation)// Тез. международной конференции «European Human Genetics conference». Nice, France, 2007. P. 336.
23. Maximova N.R., Нага K., Nikolaeva I. A. et al. Novel mutation in CUL7 in Yakut patients with 3-M syndrome / Тез. международной европейской конференции European Human Genetics conference. Nice, France, 2007. P. 232.
24. Максимова H.P., Ноговицына A.H., Николаева И.А. и др. Идентификация новой мутации в гене CUL7 при 3-М синдроме в якутской популяции // Медицинская генетика. 2007. №11. С.34-38.
25. Максимова Н.Р., Ноговицына А.Н., Николаева И.А. и др. Клиническая характеристика 3-М синдрома у 43 якутских пациентов и подходы к ДНК-диагностике в Республике Саха (Якутии)// Медицинская генетика. 2007. №12. С.35-38.
26. Барашков H.A., Джемилева Л.У., Федорова С.А., Максимова Н.Р. и др. Вклад мутаций 35delG, 167delT и 235delC гена коннексина 26 (GJB2) в возникновении наследственной несиндромальной сенсоневральной тугоухости в Республике Саха (Якутия) // Медицинская генетика. 2007. №9. С. 26-30.
27. Максимова Н.Р., Ноговицына А.Н., Сухомясова А.Л. и др. Клинические и молекулярно-генетические аспекты наследственного нанизма у якутов с мутацией в гене CUL7II Якутский медицинский журнал. 2007. №2. С.6-9.
28. Ноговицына А.Н., Бурцева Е.И., Максимова Н.Р. и др. Социально-экономический ущерб от наследственных болезней в PC (Я) //Якутский медицинский журнал. 2007. №3. С.64-67.
29. Исаков Л.О., Ушницкий И.Д., Максимова Н.Р. и др. Медико-генетические и эпидемиологические аспекты врожденных расщелин верхней губы и/или неба у детей Якутии // Прил. к журналу «Сибирский медицинский журнал». Иркутск, 2007. №2. С. 90-93
30. Максимова Н.Р., Ноговицына А.Н., Пузырев В.П. Редкий 3-М синдром у якутов: клиническая и молекулярно-генетическая характеристика / Сб. VIII научно-практической конференции «Генетика человека и патология». Томск: Изд-во «Печатная мануфактура», 2007. С. 162-167.
31. Максимова Н.Р., Николаева И.А., Коротов М.Н. и др. Клинико-генеалогическое и молекулярно-генетическое исследование окулофаринге-альной миодистрофии в Республике Саха (Якутия) / C6.VIII научно-практической конференции «Генетика человека и патология». Томск: Изд-во «Печатная мануфактура», 2007. С. 160-161.
32. Ноговицына А.Н., Максимова Н.Р., Сухомясова А.Л. Оценка социально-экономического ущерба от наследственных болезней в Республике Саха (Якутия) / Сб. VIII научно-практической конференции «Генетика человека и патология». Томск: Изд-во «Печатная мануфактура», 2007. С. 169-173.
33.Максимова Н.Р., К.Хара, Николаева И.А. и др. Молекулярно-генетическая причина З'-М синдрома в якутской популяции / Тез. межрегиональной научно-практической конференции «Молекулярно-клеточные аспекты патологии человека на Севере». Якутск: ЯНЦ СО РАМН, 2007. С. 42-43.
34. Максимова Н.Р., Николаева И.А., Коротов М.Н. и др. Окулофарингеальная миодистрофия в Республике Саха (Якутия): клинические и молекулярно-генетические аспекты / Тез. П межрегиональной научно-практической конференции «Экология и здоровье человека на Севере». Якутск: ЯНЦ СО РАМН, 2007. С. 34.
35. Максимова Н.Р., Ноговицына А.Н., Сухомясова А.Л. и др. Редкий синдром с низкорослостью с мутацией в гене CUL7 у якутов: клиническая и молекулярно-генетическая характеристика / Тез. II межрегиональной научно-практической конференции «Экология и здоровье человека на Севере». Якутск: ЯНЦ СО РАМН, 2007. С.37.
36. Максимова Н.Р., Ноговицына А.Н., Сухомясова А.Л. и др. Молекулярно-генетические и гистологические особенности в плаценте и легких плода с мутацией в гене CUL7 с 3-М синдромом / Тез. II межрегиональной научно-практической конференции «Экология и здоровье человека на Севере». Якутск: ЯНЦ СО РАМН, 2007. С. 38.
37. Максимова Н.Р., К.Хара, Николаева И.А. и др. Молекулярно-генетическая причина 3-М синдрома в якутской популяции / Тез. межрегиональной научно-практической конференции «Молекулярно-клеточные аспекты патологии человека на Севере». Якутск: ЯНЦ СО РАМН, 2007. С. 42-43.
38. Степанова С.К., Кононова С.К., Федорова С.А., Максимова Н.Р. и др. Моле-кулярно-генетические методы диагностики наследственных моногенных болезней в РБ№1-НЦМ PC (Я)/ Тез. межрегиональной научно-практической конференции «Молекулярно-клеточные аспекты патологии человека на Севере». Якутск: ЯНЦ СО РАМН, 2007. С. 49-51.
39. Ноговицына А.Н., Сухомясова A.JL, Максимова Н.Р. и др. Компьютерная система регистрации семей с врожденной и наследственной патологией / Тез. межрегиональной научно-практической конференции «Национальный проект-повышение доступности высокотехнологичной медицинской помощи населению PC (Я)». Якутск, 2007. С. 165-166.
40. Степанова С.К., Захарова В.А., Сидорова О.Г., Максимова Н.Р. и др. ДНК-тестирование в пренатальной диагностике моногенных болезней в медико-генетической консультации / Тез. межрегиональной научно-практической конференции «Национальный проект - повышение доступности высокотехнологичной медицинской помощи населению PC (Я)». Якутск, 2007. С. 218.
41. Степанова С.К., Кононова С.К., Федорова С.А., Ноговицына А.Н., Максимова Н.Р. и др. Внедрение методов молекулярно-генетической диагностики наследственных моногенных болезней в медико-генетической консультации / Тез. межрегиональной научно-практической конференции «Национальный проект - повышение доступности высокотехнологичной медицинской помощи населению PC (Я)». Якутск, 2007. С. 219.
42. Сухомясова А.Л., Ноговицына А.Н., Максимова Н.Р. О состоянии и перспективах развития медико-генетической службы в PC (Я) / Тез. межрегиональной научно-практической конференции «Национальный проект - повышение доступности высокотехнологичной медицинской помощи населению PC (Я)». Якутск, 2007. С. 222-223.
43. Барашков Н.А., Кононова С.К., Максимова Н.Р. и др. Идентификация мутации 35delG в гене GJB2 у больных нейросенсорной тугоухостью в PC (Я) // Наука и образование. 2006. №2(42). С.129-133.
44. Максимова Н.Р., Коротов М.Н., Николаева И.А. и др. Окулофарингеальная миодистрофия в Республике Саха (Я) / Тез. III международной научно-практической конференции «Проблемы вилюйского энцефаломиелита и других нейродегенеративных заболеваний в Якутии». Якутск: «Копиртех-сервис», 2006. С. 22-23.
45. Максимова Н.Р., Коротов М.Н., Степанова С.К. и др. Внедрение молекулярной диагностики Х-сцепленной бульбо-спинальной амиотрофии Кеннеди в
практику медико-генетического консультирования в Республике Саха (Я) / Тез. Ш международной научно-практической конференции «Проблемы ви-люйского энцефаломиелита и других нейродегенеративных заболеваний в Якутии». Якутск: «Копиртехсервис», 2006. С. 24.
46. Максимова Н.Р., Степанова С.К., Коротов М.Н. и др. Внедрение ДНК диагностики атаксии Фридрейха в практику медико-генетического консультирования в Республике Саха (Якутия) / Тез. III международной научно-практической конференции «Проблемы вилюйского энцефаломиелита и других нейродегенеративных заболеваний в Якутии». Якутск: «Копиртехсервис», 2006. С. 25.
47. Кычкина О.И., Кононова С.К., Федорова С.А., Максимова Н.Р. и др. О деятельности "Банка ДНК наследственных патологий и популяций народов Республики Саха (Якутия)" / Тез. Ш международной научно-практической конференции «Проблемы вилюйского энцефаломиелита и других нейродегенеративных заболеваний в Якутии». Якутск: «Копиртехсервис», 2006. С. 25-26.
48. Барашков Н.А., Терютин Ф.М., Сухомясова А.Л., Максимова Н.Р. и др. Анализ локуса CX26AU у больных нейросенсорной тугоухостью и глухотой из республики Саха (Якутия) // Якутский медицинский журнал. Якутск, 2006. №2. С. 4.
49. Максимова Н.Р., Хара К., Ноговицына А.Н. и др. Идентификация новой мутации в гене CUL7 при Три-М синдроме в якутской популяции /Тез.13 международного конгресса по приполярной медицине // Бюллетень СО РАМН. Прил. Новосибирск, 2006. С.124.
50. Кучер А.Н., Данилова А.Л., Конева Л.А., Максимова Н.Р. и др. Генетико-демографическое изучение народонаселения PC (Я) // Якутский медицинский журнал. 2005. № 2(10). С. 4-12.
51. Данилова А.Л., Кучер А.Н., Максимова Н.Р. и др. Генетико-демографический анализ сельских популяций PC (Я) // Наука и образование. №2 (38). 2005. С. 98-103.
52. Барашков Н.А., Федорова С.А., Кононова С.К., Сухомясова A.JL, Максимова Н.Р. и др. Внедрение идентификации мутации 35del G гене GJB2 при наследственных формах тугоухости/глухоты в практику медико-генетического консультирования PC (Я) //Якутский медицинский журнал. 2005. №3 (11). С. 70-76.
53. Sukhomyasova A.L., Maximova N.R., Korotov M.N. et al. Myotonic dystrophy in the Republic of Sakha (Yakutia) (Russia) // Тез. международной конференции «European Human Genetics conference». Prague, Czech Republic, 2005. P. 119.
54. Ноговицына A.H., Максимова H.P., Сухомясова А.Л. и др. Регистр наследственной и врожденной патологии в Республике Саха (Якутия) / Тез. V съезда мед. генетиков. ЧЛ. //Медицинская генетика. 2005. №5. С. 241.
55. Коротов М.Н., Николаева И.А., Максимова Н.Р. и др. Наследственно-дегенеративные заболевания нервной системы в Якутии / Тез. научно-практической конференции с международным участием «Генетические ас-
пекты патологии человека. Проблемы сохранения генофонда коренных народов Севера//Якутский медицинский журнал. Прил. №1.2005. С. 30-31.
56. Maximova N.R., Sukhomyasova A.L., Nogovicina A.N. et al. Friedreich ataxia in Yakut families / Тез. научно-практической конференции с международным участием «Генетические аспекты патологии человека. Проблемы сохранения генофонда коренных народов Севера» // Якутский медицинский журнал. Прил. №1.2005. С. 94-95.
57. Maximova N.R., Sukhomyasova A.L., Nogovicina A.N. et al. Hereditary nanisms with autosomal recessive inheritance in Yakuts / Тез. научно-практической конференции с международным участием «Генетические аспекты патологии человека. Проблемы сохранения генофонда коренных народов Севера» // Якутский медицинский журнал. Прил. №1. 2005. С. 92-93.
58. Коротов М.Н., Сухомясова A.JI, Максимова Н.Р. и др. Миотония Томсена в Якутии и дифференциальная диагностика с миотонической дистрофией // Якутский медицинский журнал. 2004. №2. С. 16-19.
59. Ноговицына А.Н., Максимова Н.Р., Сухомясова АЛ. и др. Республиканский генетический регистр наследственной и врожденной патологии в Республике Саха(Якутия)// Якутский медицинский журнал. 2004. №4. С.4-7.
60. Maximova N.R., Sukhomyasova A.L., Nogovitsina A.N. Two forms of hereditary nanisms with autosomal recessive inheritance as one of the reasons of height retardation among children in Yakut population (Russia) / Тез. международной конференции «Eleventh International Symposium». Niigata, Japan, 2004. P. 139.
61. Maximova N.R., Sukhomyasova A.L., Nogovitsina A.N. Hereditary nanisms with autosomal recessive inheritance in Yakut population (Russia) / Тез. международной конференции «European Human Genetics conference». Munich, Germany. 2004. P. 9
62. Maximova N.R., Nogovocina A.N. One of the often nanism in Yakut population // Тез. международной конференции «Genetics of Complex Diseases and isolated populations». Tortoli, Sardinia, Italy. 2003. P. 14.
63. Сухомясова A.JI., Федорова С.А., Коротов M.H., Максимова H.P., и др. Миотоническая дистрофия в Республике Саха (Якутия): Популяционные особенности и подходы к ДНК-тестированию // Якутский медицинский журнал. 2003. №2. С. 12-17.
64. Ноговицина А.Н., Максимова Н.Р., Федорова С.А. Состояние и перспективы развития медицинской генетики в Республике Саха (Якутия) // Якутский медицинский журнал. 2003. №1. С. 33-37.
65. Ноговицына А.Н., Максимова Н.Р. Состояние и проблемы медико-генетического консультирования в Республике Саха (Якутия) / Тез. Всероссийской научно-практической конференции "Современные достижения клинической генетики"// Медицинская генетика. 2003. №10. С. 432.
66. Кононова С.К., Сухомясова A.JI., Ноговицына А.Н., Максимова Н.Р. и др. Биоэтические проблемы при использовании современных генетических методов диагностики наследственных болезней в практике медико-
генетического консультирования с анализом анкетирования коренного населения Якутии // Медицинская генетика. 2003. №5. С. 218-222.
67. Максимова Н.Р., Ноговицына А.Н., Федорова С.А. и др. Нейрофиброматоз в РС (Я) / Тез. научно-практической конференции «Вопросы формирования здоровья и патологии человека на Севере: факты, проблемы и перспективы». Якутск: ЯФ изд-ва СО РАМН, 2002. С. 260-262.
68. Ноговицына А.Н., Максимова Н.Р. Республиканский регистр наследственной патологии / Тез. научно-практической конференции «Актуальные вопросы педиатрии». Якутск: Изд-во ЯГУ, 2002. С. 109-111.
69. Ноговицына А.Н., Максимова Н.Р. Республиканский регистр наследственной и врожденной патологии / Тез. IV медицинской ассамблеи союза городов Заполярья и Крайнего Севера. Якутск: Изд-во «РТС-Импульс», 2002. С. 46-49.
70.Максимова Н.Р., Ноговицына А.Н, Сухомясова А.Л. и др. Медико-генетическое консультирование больных с наследственными заболеваниями нервной системы / Тез. Республиканской научно-практической конференции «Актуальные проблемы клинической неврологии». Якутск: Изд-во ЯГУ, 2001. С. 20-21.
71. Ноговицына А.Н., Максимова Н.Р., Ханды М.В. Наследственная патология семей, обратившихся в МГТС Национального центра медицины Республики Саха (Якутия) / Тез. второго (четвертого) Российского съезда медицинских генетиков. Курск, 17-19 мая 2000. С.161-162.
72. Ноговицына А.Н., Максимова Н.Р., Ханды М.В. Моногенные наследственные заболевания семей, обратившихся в медико-генетическую консультацию Национального Центра Медицины Республики Саха (Якутия) с 1990 по 1998 год//Дальневосточный медицинский журнал. 1999. №1. С. 26-30.
73. Ноговицына А.Н., Максимова Н.Р. Одна из наиболее часто встречающихся форм нанизма в популяции саха / Тез. всероссийской конференции «Актуальные проблемы диагностики, лечения и профилактики наследственных заболеваний у детей». Москва, 1998. С. 95-96.
74. Максимова Н.Р., Ноговицына А.Н., Сухомясова А.Л. (Россия). Пат. 2315310 Российская Федерация, МПК вОШ 33/50 С12С> 1/68. Способ диагностики 3-М синдрома в якутской популяции / №2006118727/15 // Бюллетень ФИПС. Москва, заявл. 30.05.2006; опубл. 20.01.2008. №2.
Список использованных сокращений
АФ атаксия Фридрейха
ДНК дезоксирибонуклеиновая -кислота
МГК медико-генетическая консультация
МД миотоническая дистрофия
МИ ЯГУ медицинский институт Якутского Государственно!
университета
ЮМ наследственная энзимопеническая метгемоглобенемия
ОНП однонуклеотидный полиморфизм
ОФМД окулофарингеальная миодистрофия
ПЦР
РБ№1 - HUM
PC (Я)
ЯСН
3-М
ЯНЦКМПСОРАМН
AR
CUL7
FRDA
NAG
OMIM
PAPBN1, РАВР2
STR
SCOP
полимеразная цепная реакция
Республиканская больница №1 - Национальный центр медицины
Республика Саха (Якутия) якутский синдром низкорослости аббревиатура фамилий 3 авторов (Марвелл, Малвакс и МакКьюсик), впервые описавших синдром, получивший их имя
Якутский научный центр комплексных медицинских
проблем Сибирского отделения Российской академии
медицинских наук
ген андрогенного рецептора
ген Куллин 7
ген бежа фратаксина
ген белка, амплифицированного при нейробластоме Online Mendelian Inheritance in Man - номер наследственной болезни или признака в международном каталоге МакКыосика
ген поли-(А)-связывающего белка 2 короткие тандемные повторы
синдром низкорослости с колбочкой дисфункцией, атрофией зрительных нервов и пельгеровской аномалией лейкоцитов (Short stature syndrome with Cone dysfunction, Optic atrophy and Pelger-Huet anomaly)
Отпечатано в ООО «НИП» . Томск, ул. Советская, 47, тел.:53-14-тираж 150 экз
Содержание диссертации, доктора медицинских наук, Максимова, Надежда Романовна
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
ВВЕДЕНИЕ
ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1.1. Генетическое картирование генов болезней человека
1.1.1. Современные подходы к генетическому картированию генов наследственных болезней человека
1.1.2. Генетическое картирование генов наследственных болезней в изолированных популяциях
1.2. Современные представления о болезнях, вызванных динамическими мутациями
1.2.1. Аутосомно-доминантная окулофарингеальная миодистрофия
1.2.2. Аутосомно-рецессивная атаксия Фридрейха
1.2.3. Х-сцепленная спинально-бульбарная амиотрофия Кеннеди
1.3. Молекулярные основы заболеваний с низкорослостью
1.3.1. Классификация заболеваний с низкорослостью
1.3.2. Синдромы с задержкой роста при пропорциональном телосложении
1.3.3. Клинические особенности синдрома 3-М
1.3.4. Диагностика заболеваний с низким ростом
1.4. Этногенез и генетическое разнообразие якутского этноса
1.4.1. Этноисторические сведения о якутах
1.4.2. Наследственные болезни в якутской популяции
ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ
2.1. Клинико-генеалогическая характеристика больных и их родственников из обследованных семей
2.2. Молекулярно-генетические и другие методы анализа материала
2.2.1. Молекулярно-генетический анализ
2.2.2. Гистологическое исследование
2.3. Анализ генетического сцепления и методы статистического анализа результатов исследования
ГЛАВА 3. СТРУКТУРА И ЧАСТОТА НАСЛЕДСТВЕННОЙ ПАТОЛОГИИ В РЕСПУБЛИКЕ САХА (ЯКУТИЯ)
ГЛАВА 4. КЛИНИКО-ГЕНЕАЛОГИЧЕСКИЙ И МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ БОЛЕЗНЕЙ, ВЫЗВАННЫХ ДИНАМИЧЕСКИМИ МУТАЦИЯМИ
4.1. Аутосомно-доминантная окулофарингеальная миодистрофия в
Республике Саха (Якутия)
4.1.1. Распространенность окулофарингеальной миодистрофии
4.1.2. Клинико-генеалогическая характеристика больных с окулофарингеальной миодистрофией
4.1.3. Молекулярно-генетический анализ окулофарингеальной миодистрофии 158 4.1.3.1 .Поиск мутации в гене PABPN
4.1.3.2.Анализ гаплотипов по данным STR-локусов
4.1.3.3.Прямая ДНК-диагностика окулофарингеальной миодистрофии
4.1.3.4.Алгоритм диагностики окулофарингеальной миодистрофии в Республике Саха (Якутия)
4.1.4. Резюме
4.2. Аутосомно-рецессивная атаксия Фридрейха в Республике
Саха (Якутия)
4.2.1. Распространенность атаксии Фридрейха
4.2.2. Клинико-генеалогическая характеристика больных с атаксией Фридрейха
4.2.3. Молекулярно-генетический анализ атаксии Фридрейха
4.2.4. Алгоритм диагностики атаксии Фридрейха в Республике
Саха (Якутия)
4.2.5. Резюме
4.3. Х-сцепленная спинально-бульбарная амиотрофия Кеннеди в
Республике Саха (Якутия)
4.3.1. Распространенность спинально-бульбарной амиотрофии Кеннеди
4.3.2. Клинико-генеалогическая характеристика больных со спинально-бульбарной амиотрофией Кеннеди
4.3.3. Молекулярно-генетический анализ спинальнобульбарной амиотрофии Кеннеди
4.3.3.1 .Поиск мутации в гене AR
4.3.3.2.Быстрая ДНК-диагностика спинальнобульбарной амиотрофии Кеннеди
4.3.4. Алгоритм диагностики спинально-бульбарной амиотрофии Кеннеди в Республике Саха (Якутия)
4.3.5. Резюме
ГЛАВА 5. КЛИНИКО-ГЕНЕАЛОГИЧЕСКИЙ И МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ НАСЛЕДСТВЕННЫХ ЗАБОЛЕВАНИЙ, ХАРАКТЕРИЗУЮЩИХСЯ НИЗКИМ РОСТОМ 203 5.1. Якутский синдром низкорослости в Республике Саха (Якутия)
5.1.1. Распространенность якутского синдрома низкорослости
5.1.2. Клинико-генеалогическая характеристика больных с якутским синдромом низкорослости
5.1.3. Молекулярно-генетический анализ якутского синдрома низкорослости
5.1.3.1.Молекулярно-генетический анализ сцепления с генетическими локусами, ответственными за развитие низкорослости
5.1.3.2.Полногеномный скрининг и картирование гена
5.1.3.3.Идентификация мутации в гене CUL
5.1.3.4.Быстрая идентификация мутации 4582insT в гене
CUL7 у якутов
5.1.3.5.Популяционные исследования частоты мутации 4582insT в гене CUL7 в популяциях Республики
Саха (Якутия) и Сибири
5.1.3.6.Анализ возраста мутации 4582insT в гене CUL7 в якутской популяции
5.1.4. Гистологическое исследование тканей плаценты и легких плодов с якутским синдромом низкорослости или
3-М синдромом
5.1.5. Алгоритм диагностики якутского синдрома низкорослости в Республике Саха (Якутия)
5.1.6. Пренатальная диагностика якутского синдрома низкорослости или 3-М синдрома в якутской популяции
5.1.7. Резюме 260 5.2. Синдром низкорослости с колбочковой дисфункцией, атрофией зрительных нервов и пельгеровской аномалией лейкоцитов в Республике Саха(Якутия)
5.2.1. Распространенность синдрома низкорослости с колбочковой дисфункцией, атрофией зрительных нервов и пельгеровской аномалией лейкоцитов
5.2.2. Клинико-генеалогический анализ больных с синдромом низкорослости с колбочковой дисфункцией, атрофией зрительных нервов и пельгеровской аномалией лейкоцитов
5.2.3. Молекулярно-генетический анализ синдрома низкорослости с колбочковой дисфункцией, атрофией зрительных нервов и пельгеровской аномалией лейкоцитов 297 5.2.3.1.Молекулярно-генетический анализ сцепления с генетическими локусами, ответственными за развитие низкорослости
5.2.3.2.Полногеномный скрининг и картирование гена
5.2.3.3.Поиск гена и идентификация мутации в генах
DDX1 и NAG
5.2.3.4.Быстрая идентификация мутации G5741—>А в гене NA G у якутов
5.2.3.5.Анализ возраста миссенс-мутации G5741—>А в гене NA G в якутской популяции
5.2.4. Иммуногистохимическое исследование на NAG
5.2.5. Алгоритм диагностики синдрома низкорослости с колбочковой дисфункцией, атрофией зрительных нервов и пельгеровской аномалией лейкоцитов в Республике
Саха (Якутия)
5.2.6. Резюме
ГЛАВА 6. ОБЩЕЕ ЗАКЛЮЧЕНИЕ 326 ВЫВОДЫ 336 ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ 339 СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННОЙ ЛИТЕРАТУРЫ 341 Приложения 1
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
АФ атаксия Фридрейха
АР аутосомно-рецессивный
АД аутосомно-доминантный
АД артериальное давление
ДНК дезоксирибонуклеиновая кислота
МГК медико-генетическая консультация
МИ ЯГУ медицинский институт Якутского государственного университета
МД миотоническая дистрофия
МРТ магнитно-резонансная томография
НПО наружные половые органы
НЭМ наследственная энзимопеническая метгемоглобенемия
ОСТ оптикокохлеарная томография
ОРД однородительская дисомия
ОФМД окулофарингеальная миодистрофия
ПААГ полиакриламидный гель
ПЦР полимеразная цепная реакция
РБ№1-НЦМ Республиканская больница №1 - Национальный центр медицины
РНК рибонуклеиновая кислота
РС (Я) Республика Саха (Якутия)
СЦА спиноцеребеллярная атаксия
ТНП тринуклеотидные повторы
УЗИ ультразвуковое исследование
УО умственная отсталость
ЧПС четырехпальцевая складка
ЭКГ электрокардиография
ЭНМГ электронейромиография
ЯСН якутский синдром низкорослости
3-М аббревиатура фамилий 3 авторов (Марвелл, Малвакс и
МакКьюсик), впервые описавших синдром, получивший их имя
ЧСС частота сердечных сокращений
ЭОС электрическая ось сердца
ЭРГ электроретинограмма
AR ген андрогенного рецептора
CUL7 ген Куллин
ERG элетроретинограмма
FRDA, Х25 ген белка фратаксина
NAG ген белка, амплифицированного при нейробластоме
OMIM номер наследственной болезни или признака в международном каталоге МакКьюсика (Online Mendelian Inheritance in Man) PAPBN1, PABP2 ген поли-(А)-связывающего белка 2 SCOP синдром низкорослости с колбочкой дисфункцией, атрофией зрительных нервов и пельгеровской аномалией лейкоцитов (Short stature syndrome with Cone dysfunction, Optic atrophy and Pelger-Huet anomaly) SNP однонуклеотидные полиморфизы
STR короткие тандемные повторы
Введение Диссертация по биологии, на тему "Клинико-генеалогическая и молекулярно-генетическая характеристика этноспецифических форм наследственной патологии у якутов"
Актуальность проблемы. Среди факторов, определяющих уровень здоровья популяций человека, наследственным заболеваниям отводится существенная роль, достигающая по некоторым оценкам до 20%. Поэтому исследование количественных и качественных характеристик груза наследственной патологии и механизмов его формирования в различных регионах страны представляется важной проблемой.
В этиологии детской инвалидности и ограничений жизнедеятельности значительная доля принадлежит наследственным факторам (Вельтищев, Новиков, 2007). Так, в Республике Саха (Якутия) среди причин детской инвалидности на первом месте (28,5%) стоят врожденные пороки развития, на втором -заболевания нервной системы (23,9%), на третьем — психические расстройства (11,9%). По данным Росстата среди причин младенческой смертности врожденные пороки развития занимают второе-третье место в Республике Саха (Якутия) и в целом по Российской Федерации. Остается значительной доля врожденных и наследственных заболеваний среди причин детской смертности (в возрасте до 5 лет), в структуре которой на долю хромосомных болезней приходится 2-3% (Новиков, 2008).
Необходимо учитывать, что подходы к диагностике и профилактике наследственных и врожденных заболеваний постоянно совершенствуются, расширяются возможности их применения в разных областях медицинской практики. В настоящее время в отношении лечения наследственной патологии обозначены подходы (патогенетический и генная терапия), сформированы предпосылки к осуществлению генотерапии. В перспективе ожидается внедрение фармакогенетических исследований, открывающих путь к индивидуальной терапии. Для совершенствования медико-генетической помощи населению в связи с обозначившимися новыми направлениями в отношении оказания специализированной помощи больным с наследственными и врожденными заболеваниями одной из основных задач современной педиатрии и медицинской генетики в настоящее время является установление молекулярно-генетических причин возникновения и развития моногенных заболеваний.
При проведении генетико-эпидемиологических, а также молекулярно-генетических исследований по поиску генов наследственных заболеваний важно учитывать особенности формирования популяций и факторы популяцион-ной динамики. Считается, что при проведении работ по картированию моногенных заболеваний человека предпочтение следует отдавать изолированным популяциям, с так называемым «эффектом основателя» (Гинтер, 1978; 8е£йеШ е! а1., 1998; Наследственные болезни., 2002; Пузырев, 2003; Рекопеп е1 а1., 2006; Зинченко и др., 2007; Кириллов, 2008). Якутское население относится именно к таким популяциям* и является удобным объектом для картирования и идентификации новых генов наследственных заболеваний.
Длительное время- для якутских популяций были характерны расселен-ность на обширной территории небольшими по численности группами, низкая плотность населения и высокий уровень рождаемости, что благоприятствовало проявлению эффектов дрейфа генов. В настоящее время территориальные группы якутов отличаются по антропологическому составу, по языковым диалектам, выражена генетическая гетерогенность территориальных групп, по-разному проявляющаяся для разных классов маркеров. Высокий уровень генетической дифференциации якутских популяций, подтвержден данными о фамильной структуре сельских популяций Якутии, о полиморфизме аутосомных локусов и (СТО)п-участка гена ЭМРК, о неравномерности распространенности наследственной патологии (Ноговицына, 2001; Максимова, 2002; Хитринская и др., 2003; Данилова и др., 2005; Тарская и др., 2004; Федорова и др., 2005; Кучер и др., 2007а, 20076). В то же время низкий уровень генетического разнообразия в популяциях якутов, по сравнению с другими популяциями Евразии, был выявлен при анализе линий митохондриальной ДНК, У-хромосомы и на основании данных о полиморфизме (СТО)п-повторов гена ЭМРК в популяциях Якутии (Попова и др., 2002; Пузырев и др., 2003; РакелсМ et а1., 2003, 2006; Федорова и др., 2005; Харьков и др., 2008; Федорова, 2008). Проведенные ранее в Якутии генетико-эпидемиологические исследования выявили высокую частоту и широкий спектр наследственной патологии, а также накопление отдельных форм моногенной патологии: спиноцеребеллярной атаксии 1-го типа, миотони-ческой дистрофии, наследственной энзимопенической метгемоглобинемии I типа и т.д. (Ноговицына, 2001; Назаренко и др., 2001; Тарская, 2004; Брахфо-гель, 2000; Платонов и др., 2004; Захарова, 1982; Банщикова, 2002; Сухомясова, 2005; Галеева и др., 2006; Барашков, 2007; Яковлева, 2008). Следующим.этапом более глубокого изучения частоты и спектра наследственной патологии в регионе, особенно редких форм наследственных заболеваний, является длительное и динамическое наблюдение за больными и их семьями при помощи территориального генетического регистра наследственной и врожденной патологии (Пузырев и др., 2000; Наследственные болезни ., 2002; Гинтер, 2003).
Исследования, посвященные комплексному медико-генетическому изучению моногенной патологии на основе территориального регистра наследственной и врожденной патологии с применением молекулярно-генетических методов, в республике ранее не проводились. Таким образом, является актуальным проведение комплексного генетико-эпидемиологического исследования наследственной патологии с привлечением молекулярно-генетических методов исследования в РС (Я) с целью дальнейшего планирования и организации медико-генетической помощи населению Якутии.
Цель исследования: клинико-генеалогический анализ этноспецифиче-ской наследственной патологии в Республике Саха (Якутия), изучение молеку-лярно-генетической основы якутских наследственных болезней и раскрытие механизмов их накопления.
Задачи исследован ия: 1. Оценить частоту и спектр наследственных заболеваний на основе созданного Республиканского генетического регистра наследственной и врожденной патологии Республики Саха (Якутия), провести анализ распространенности пяти наследственных заболеваний в улусах республики.
2. Провести клинико-генеалогический анализ заболеваний, вызванных динамическими мутациями: спинально-бульбарной амиотрофии Кеннеди, атаксии Фридрейха, окулофарингеальной миодистрофии.
3. Провести поиск мутаций в генах наследственных заболеваний, вызванных динамическими мутациями: спинально-бульбарной амиотрофии Кеннеди, атаксии Фридрейха, окулофарингеальной миодистрофии.
4. Представить клинико-генеалогическую характеристику двух частых наследственных форм низкорослости у якутов.
5. Провести поиск кандидатных генов и идентификацию мутаций для заболеваний с низкорослостью у якутов.
6. Установить популяционные частоты найденных мутаций, оценить время возникновения мутаций в генах этноспецифических наследственных заболеваний у якутов.
7. Выявить популяционно-генетические механизмы накопления наследственных заболеваний на основании построения гаплотипов в локусах исследуемых болезней с привлечением микросателлитных маркеров.
8. Разработать алгоритм медико-генетического консультирования, пренаталь-ной диагностики с использованием молекулярно-генетических методов диагностики для заболеваний с динамическими мутациями и для редких синдромов с низкорослостью.
Научная новизна. В ходе выполнения получены новые знания о распространенности и клинико-генеалогических особенностях заболеваний, вызванных динамическими мутациями: окулофарингеальной миодистрофии, атаксии Фридрейха, спинально-бульбарной амиотрофии Кеннеди в Республике Саха (Якутия). В результате выполнения работы впервые проведен молекулярно-генетический анализ вариабельности генов РАВРИ1 при окулофарингеальной миодистрофии, АЯ при болезни Кеннеди, РЯВА при атаксии Фридрейха и найдены мутации, вызывающие эти заболевания в якутской популяции.
Впервые изучена частота редкого якутского синдрома низкорослости (ЯСН, 3-М синдром) в якутской популяции и описан фенотип якутских больных. Впервые проведено картирование гена, поиск кандидатного гена и идентификация мутации, вызывающей якутский синдром низкорослости у якутов. Название «якутский синдром низкорослости» зарегистрировано в электронной международной базе МакКьюсика (OMIM) как альтернативное названию болезни З-М-синдром. Фотографии и описание якутских больных включены в международные базы ПОССУМ и Лондонскую базу данных.
Впервые дано клинико-генеалогическое описание нового синдрома низкорослости с колбочковой дисфункцией, атрофией зрительных нервов и пель-геровской аномалией у якутов и изучена его распространенность в якутской популяции. Впервые проведено картирование кандидатного гена для нового синдрома, открыт ген и идентифицирована мутация, вызывающая синдром низкорослости с колбочковой дисфункцией, атрофией зрительных нервов и пель-геровской аномалией лейкоцитов. Новому синдрому дано название SCOP синдром (Short stature syndrome with Cone dysfunction, Optic atrophy and Pelger-Huet anomaly).
Рассмотрены механизмы накопления этноспецифических форм наследственной патологии (ОФМД, ЯСН, SCOP синдрома) в популяциях Якутии на основании построения гаплотипов в локусах генов исследованных болезней с помощью микросателлитных маркеров. Впервые оценен возраст идентифицированных мутаций в генах CUL7 и NAG в якутской популяции.
Практическая значимость. Создан Республиканский регистр наследственной и врожденной патологии на базе медико-генетической консультации Республиканской Больницы №1-Национального Центра Медицины (РБ№1-НЦМ). На основании клинико-генеалогических и молекулярно-генетических методов диагностики выделены две новые формы низкорослости у якутов: якутский синдром низкорослости и синдром низкорослости с колбочковой дисфункцией сетчатки, атрофией зрительных нервов и пельгеровской аномалией лейкоцитов. В практику медико-генетического консультирования внедрена ДНК-диагностика ОФМД, болезни Кеннеди, атаксии Фридрейха, ЯСН. На основе полученных результатов предложен и внедрен в практику алгоритм диагностики пяти наследственных заболеваний: ОФМД, болезни Кеннеди, атаксии Фридрейха, ЯСН и SCOP синдрома. Результаты работы используются в преподавании курса медицинской генетики для студентов Медицинского института ЯГУ (МИ ЯГУ) и врачей на курсах повышения квалификации МИ ЯГУ.
Положения, выносимые на защиту:
1. В якутской популяции имеется накопление некоторых форм редкой ауто-сомно-рецессивной, Х-сцепленной рецессивной и аутосомно-доминантной наследственной патологии. В ходе исследования выявлено пять этноспеци-фических наследственных заболеваний у якутов, которым присвоено название «якутские наследственные болезни»: спинально-бульбарная амиотро-фия Кеннеди, атаксия Фридрейха, окулофарингеальная миодистрофия, якутский синдром низкорослости, синдром низкорослости с колбочковой дисфункцией, атрофией зрительных нервов и пельгеровской аномалией лейкоцитов.
2. Распространенность ОФМД (11 на 100 тыс. нас.) и болезни Кеннеди в отдельных улусах республики (408,7 и 106,6 на 100 тыс. мужчин) превышает мировые значения в десятки раз. Показатели распространенности синдрома ЯСН и SCOP синдрома получены в мире впервые (12,72 и 9,95 на 100 тыс. нас., соответственно) и позволяют отнести оба редких в мире заболевания к частым наследственным заболеваниям у якутов. АФ зарегистрирована в популяции якутов, относящихся к азиатской расе, где ранее не было описано случаев болезни.
3. Клинико-генеалогическая характеристика больных с ОФМД, болезнью Кеннеди и АФ в PC (Я) сопоставима с клиникой больных, описанных ранее. Молекулярно-генетическими причинами болезней, вызванных динамическими мутациями у якутов являются экспансии (GCG)io в гене PABPN1 при ОФМД, (CAG)n в гене AR при болезни Кеннеди и (GAA)n в гене FRDA при АФ.
4. Основными причинами (40%) низкорослости в якутской популяции якутов являются 3-М синдром и новый синдром низкорослости с колбочковой дисфункцией, атрофией'зрительных нервов и пельгеровской аномалией лейкоцитов. Распространенность обоих форм низкорослости в, якутской популяции - 22,7 на 100 тыс. населения, среди детей — 67, 5 на 100-тыс. населения. Клиника ЯСН у якутских больных сходна с клиникой ранее описанных больныхс 3-М- синдромом, за исключением дистресс-синдрома у новорожденных. Мутации 4582insT в гене CUL7 и G5741—>А вггене NAG являются единственными молекулярно-генетическими причинами двух форм низкорослости, особенно часто встречающихся»в якутской популяции.
5. Основнымишопуляционными механизмами накопления наследственных заболеваний в якутской популяции являются дрейф генов и эффект основателя.
6. Республиканский генетический регистр наследственной и врожденной патологии, созданный в ходе исследования, позволяет решать задачи накопления эпидемиологической информации о нозологической структуре, диспансеризации семей с наследственными заболеваниями, пре- и постнатальной диагностики и профилактики наследственной патологии у детей, а также проводить генетический мониторинг населения.
Апробация работы. Основные материалы диссертационной работы доложены и обсуждены на всероссийской научно-практической конференции «Современные достижения клинической генетики» (Москва, 2003); научно-практической, конференции с международным участием «Генетические аспекты патологии человека. Проблемы сохранения генофонда коренных народов Севера» (Якутск, 2005); на V съезде Российского общества медицинских генетиков (Уфа, 2005); на II межрегиональной научно-практической конференции «Экология и здоровье человека на Севере» (Якутск, 2007); на VIH научной конференции «Генетика человека и патология» (Томск, 2007); на межрегиональной научно-практической конференции «Здоровье детей Севера» (Якутск, 2008); на XIII международной конференции «Геном человека» (Хайдерабад, Индия, 2008); на российской научно-практической конференции «Современные проблемы клинической генетики» (Москва, 2008); Первом молодежном инновационном конвенте (Москва, 2008); на научно-практической конференции «Актуальные проблемы медицинской генетики на Крайнем Севере» (Якутск, 2009); межлабораторных семинарах НИИ мозга Университета г. Ниигаты (Ниигата, Япония, 2005, 2006, 2008); межлабораторных семинарах отдела молекулярной генетики ЯНЦ КМП СО РАМН (Якутск, 2007, 2008, 2009); межлабораторном семинаре НИИ медицинской генетики СО РАМН (Томск, 2009).
Внедрение в практику здравоохранения. Материалы диссертации внедрены в работу медико-генетической консультации РБ№1-НЦМ Республики Саха (Якутия), а также включены в учебный процесс для студентов, в программу обучения ординаторов, интернов, врачей на кафедрах детских болезней, педиатрии, неврологии, курса медицинской генетики МИ ЯГУ. Научно обоснованные рекомендации по клинической и молекулярно-генетической диагностике и профилактике пяти якутских наследственных заболеваний внедрены в практику МГК РБ№1-НЦМ. Получен патент Российской Федерации № 2315310 «Способ диагностики 3-М синдрома в якутской популяции». По результатам исследования название заболевания «якутский синдром низкорослости» внесено в международный электронный каталог ОМ1М как альтернативное названию синдром 3-М. Фотографии и описание якутских больных включены в международные базы Поссум и Лондонскую базу данных.
Публикации. По теме диссертации опубликовано 73 работы, из которых 13 статей в журналах, рекомендованных для опубликования работ при защите диссертации на соискание ученой степени доктора медицинских наук, одна статья в международном журнале, 43 публикации - в виде тезисов и статей в материалах международных и российских научно-практических конференций. Получен патент РФ на изобретение.
Структура и объем работы. Диссертация изложена на 424 страницах машинописного текста. Данные проиллюстрированы таблицами (68), рисунками (67) и приложениями (8). Библиографический указатель включает 375 источников литературы, из них 126 работ отечественных авторов.
Заключение Диссертация по теме "Генетика", Максимова, Надежда Романовна
выводы
1. В якутской популяции имеется накопление редкой аутосомно-рецессивной, Х-сцепленной рецессивной и аутосомно-доминантной наследственной патологии. В ходе исследования выявлено пять этноспеци-фических заболеваний в якутской популяции.
2. Распространенность аутосомно-доминантной окулофарингеальной мио-дистрофии в РС (Я) среди якутов составляет 11,1 на 100 тыс. населения с преимущественным накоплением в центральной и вилюйской группах улусов Якутии. Единственная молекулярно-генетическая причина всех случаев ОФМД в якутской популяции — мутация (ОСО)ю в 1 экзоне гена РАВРЫ1. Выявленный единственный гаплотип является гаплотипом основателя.
3. Распространенность Х-сцепленной спинально-бульбарной амиотрофии Кеннеди среди якутского населения РС (Я) составляет 2,8 на 100 тыс. мужчин с преимущественным накоплением в северной группе улусов, где распространенность выше мировых значений в сотни раз (106,6 и 408,7 на 100 тыс. нас.). Молекулярно - генетической причиной болезни Кеннеди у якутов является экспансия (САО)п в гене АЯ.
4. Распространенность аутосомно-рецессивной атаксии Фридрейха среди якутского населения РС (Я) составляет 2,8 на 100 тыс. населения. Моле-кулярно-генетической причиной АФ у якутов является экспансия (ОАА)п— повторов в 1 интроне гена РЯОА. Атаксия Фридрейха зарегистрирована в популяции якутов, относящихся к азиатской расе, где ранее не было описано случаев болезни.
5. Одной из причин наследственной аутосомно-рецессивной низкорослости в якутской популяции является 3-М синдром. Распространенность среди всего якутского населения — 12,72 на 100 тыс. населения, среди детского населения — 36,7 на 100 тыс. детского населения. Клинические признаки якутских больных с 3-М синдром сходны с клиникой других больных в мире, за исключением дистресс-синдрома новорожденных и низкой частоты рентгенологической патологии. Мутация) 4582insT в гене CUL7 является единственной причиной 3-М синдрома в якутской популяции. Частота гетерозиготного носительства мутации 4582insT в якутской популяции составляет 3%. Выявленный одинаковый гаплотип является гаплоти-пом основателя: Возраст мутации 4582insT составляет 13,7 поколений или 342,5 лет. В популяциях эвенов, юкагиров, эвенков, бурятов Бурятии, русских Томской области гетерозиготных носителей мутации 4582insT в гене CUL7 не встречается.
6. Описан новый синдром наследственной аутосомно-рецессивной низко-рослости в якутской популяции с распространенностью 9,95 на 100 тыс. якутов, среди детского населения - 30;8. Основными клиническими проявлениями болезни являются: пренатальная гипоплазия, низкий пропорциональный рост, лицевые дизморфии, микромелия стоп и кистей, вялая и дряблая кожа, колбочковая дисфункция сетчатки с атрофией зрительных нервов и пельгеровская аномалия нейтрофилов. Новому синдрому дано название «синдром низкорослости с колбочковой дисфункцией, атрофией зрительных нервов и пельгеровской аномалией лейкоцитов» (SCOP). Мутация G5741—>А (R1914H) в гене NAG является единственной причиной синдрома низкорослости с колбочковой дисфункцией, атрофией зрительных нервов и пельгеровской аномалией; с аутосомно-рецессивным типом наследования в якутской популяции. Популяционная частота гетерозиготного носительства мутации G5741—>А в якутской популяции составляет 1%. Выявлен «гаплотип основателя». Возраст мутации R1914H в гене NAG составляет 37,8 поколений или 945 лет.
7. Популяционным механизмом накопления наследственных заболеваний: 3-М синдрома, окулофарингеальной мио дистрофии и аутосомно-рецессивного синдрома низкорослости с колбочковой дисфункцией, атрофией зрительных нервов и пельгеровской аномалией лейкоцитов в якутской популяции является эффект основателя. Возраст мутаций
4582insT и G5741—>A совпадает с двумя волнами экспансии численности якутского населения в XI и XVII вв.
8. Создан Республиканский генетический регистр наследственной и врожденной патологии, позволяющий решать задачи накопления эпидемиологической информации о нозологической структуре, диспансеризации семей с наследственными заболеваниями, пре- и постанатальной диагностики и профилактики НП, а также проводить генетический мониторинг населения.
9. Разработан, обоснован и внедрен в работу медико-генетической консультации алгоритм диагностики пяти наследственных заболеваний: окулофа-рингеальной миодистрофии, атаксии Фридрейха, болезни Кеннеди, 3-М синдрома и нового синдрома низкоросл ости с колбочковой дисфункцией, атрофией зрительных нервов и пельгеровской аномалией лейкоцитов с применением молекулярно-генетических методов диагностики мажорных мутаций в исследованных генах.
ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ
1. Полученные в ходе исследования данные о спектре, распространенности наследственной патологии в Республике Саха (Якутия), о частых якутских наследственных болезнях довести до сведения сотрудников медико-генетической консультации РБ№1-НЦМ PC (Я), использовать при обучении студентов старших курсов медицинского института Якутского государственного университета им. М.К. Аммосова, последипломной подготовки врачей на кафедрах педиатрии, терапии, семейной медицины, неврологии.
2. Врачам-педиатрам, терапевтам, эндокринологам, невропатологам, офтальмологам, ортопедам рекомендуется направлять пациентов с клиническими проявлениями окулофарингеальной миодистрофии, спинально-бульбарной амиотрофии Кеннеди, атаксии* Фридрейха, ЯСН и SCOP синдрома в медико-генетическую консультацию РБ№1-НЦМ с учетом предложенных алгоритмов.
3. Учитывая высокую распространенность в Республике Саха (Якутия) двух форм низкорослости ЯСН и SCOP синдрома, связанных с мутациями 4582insT гена CUL7 и G5741—»А гена NAG, и высокую частоту гетерозиготного носительства данных мутаций среди якутов, всем пациентам с низким ростом и атрофией зрительных нервов в Республике Саха (Якутия) рекомендуется ДНК-диагностика для уточнения диагноза и прогноза потомства.
4. На основе разработанной в период выполнения настоящей работы методики ДНК-диагностики «якутских» наследственных болезней: окулофарингеальной миодистрофии, спинально-бульбарной амиотрофии Кеннеди, атаксии Фридрейха, ЯСН и SCOP синдрома среди брачующихся пар рекомендуется проведение скрининга на гетерозиготное носительство мутаций 4582insT гена CUL7 и G5741—»А гена NAG с целью последующей пренатальной и преимплантационной ДНК-диагностики.
5. В целях совершенствования медико-генетической помощи больным с наследственной патологией в Республике Саха (Якутия) разработать и внести на утверждение Министерством здравоохранения PC (Я) «Республиканскую целевую программу профилактики врожденной и наследственной патологии» на 2009-2013 гг.
6. Основные дифференциально-диагностические критерии окулофаринге-альной миодистрофии, спинально-бульбарной амиотрофии Кеннеди, атаксии Фридрейха, ЯСН и SCOP синдрома в виде методических рекомендаций и информационных писем направить во все лечебно-профилактические учреждения Республики Саха(Якутия).
7. Вести широкую просветительскую работу среди педиатров, терапевтов, невропатологов, ортопедов, офтальмологов, психиатров, эндокринологов с целью активного выявления и формирования ориентированного потока для оказания медико-генетической помощи.
Библиография Диссертация по биологии, доктора медицинских наук, Максимова, Надежда Романовна, Томск
1. Абрукова A.B. Эпидемиологическое и клииико-генетическое исследование наследственного гипотрихоза в Республике Чувашия: Автореф. дисс. . канд. мед. наук. — М., 2007. — 25 с.
2. Бадалян JI.O. Темин П.А., Задавенко H.H. и др. Поздно прогрессирующая рецессивная Х-сцепленнная проксимальная спинально-бульбарная амио-трофия // Журн. невр. и псих. им. С.С.Корсакова.- 1987. №11. - С. 16061609.
3. Балановская Е.В. Новые технологии изучения пространственной структуры генофонда: Автореф. дисс. . докт. биол. наук. — М., 1998. — 39 с.
4. Балановская Е.В., Рычков Ю.Г. Этническая генетика: адаптивная структура генофонда народов мира по данным о полиморфных генетических маркерах человека // Генетика. — 1990. — Т. 26. № 4. — С. 739 - 747.
5. Банщикова Е.С. Особенности клинического течения и морфофункцио-нальное состояние эритроцитов у детей с наследственной энзимопениче-ской метгемоглобинемией: Автореф. дисс. . канд. мед. наук. -Томск, 2002.- 25 с.
6. Барашнев Ю.И., Бахарев В.А., Новиков П.Н. Диагностика и лечение врожденных и наследственных заболеваний у детей (путеводитель по клинической генетике). М., «Триада-Х», 2004.- 506 с.
7. Барашков H.A. Молекулярно-генетическое изучение наследственной не-синдромальной сенсоневральной глухоты в Республике Саха (Якутия): Автореф. дисс. . канд.биол.наук. Уфа, 2007. — 23 с.
8. Близнец Е.А., Зинченко P.A., Тверская С.М. и др. Популяционная частота и возраст мутации c.807+5G>A в гене TCIRG1, являющееся причиной ауто-сомно-рецессивного остеопетроза в Чувашии // Мед. генетика. — 2006. — Т.5, №9.- С. 9-14.
9. Боева С.Б. Антропогенетическое обследование коренного населения Якутской АССР в связи с вопросами этногенеза якутов: Автореф. дис. . канд. биол. наук. М.: МГУ, 1988. - 24 с.
10. Бравина В.И. Погребальный обряд якутов (XVTI-XVIX в.в.): Учебное пособие. Якутск: Изд. ЯГУ, 1996. -С. 140-141.
11. Брагина Д.Г. Этнические и этнокультурные процессы в Республике Саха (Якутия): 70-90 гг. XX века. — Новосибирск: Наука, 2005.- 208 с.
12. Брахфогель И.Ф. Молекулярно-генетическая характеристика спиномоз-жечковой атаксии I типа в Якутии: Автореф.дисс. . канд.биол.наук. — Томск, 2000. 24 с.
13. Бочков Н.П., Тимофеев-Ресовский Н.В. Географическая среда и наследственная патология человека. // Медицинская география: Научные труды Обнинского отдела ГО СССР.- Обнинск, 1968. С. 13-18.
14. Вассерман H.H., Зинченко P.A., Поляков A.B. «Возраст»' мутации Arg200Trp в гене VHL, приводящей к развитию аутосомно-рецессивного эритроцитоза в Чувашии// Мед. генетика. — 2007.- Т.6, №9.- С. 31-36.
15. Витебская A.B. Антропометрические, гормональнеы, рентгенологические и молекулярно-генетические проявления'идиопатической низкорослости у детей: Автореф. дисс. канд. мед. наук. — М., 2003. — 152 с.
16. Вельтищев Б.Е., Новиков П.В. Роль наследственных факторов в патологии детского возраста// Руководство по педиатрии. Врожденные и наследственные заболевания. М.: Династия, 2007. - С. 25-34.
17. Владимирцев А.И. Хронический якутский (вилюйский) энцефалит за 12 лет по материалам неврологического отделения Якутской республиканской больницы.-Якутск, 1964.- С.97-106.
18. Волков В.В., Шамшинова A.M. Функциональные методы исследования в офтальмологии. -М.: Медицина, 1998.-415 с.
19. Воронкин М.С. Диалектная система языка саха: Образование, взаимодействие с литературным языком и характеристика. Новосибирск: Наука,1999. С.21-23, 169.
20. Всесоюзная перепись населения 1926 года. Том XLI. Дальневосточный край. Якутская АССР. -М.: Изд. ПЛАНХОЗИЗА, 1930. С. 158-163.
21. Всесоюзная перепись населения 1939 года. Основные итоги. — М.: Наука, 1992.-С. 25,68.
22. Галеева Н.М., Назаренко Л.П., Назаренко С.А.и др. Молекулярно-генетическая причина наследственной метгемоглобинемии первого типа в Якутии // Мед. генетика. 2006. - Т. 5. - С. 15-20.
23. Геномика- медицине. Научное издание / Под ред. акад. РАМН В.И. Иванова и акад. РАН Л.Л. Киселева, М.: ИКЦ «Академкнига», 2005. - 392 с.
24. Генофонд и геногеография народонаселения. Т. 1. Генофонд населения России и сопредельных стран / Под ред. Ю.Г. Рычкова.- СПб.: Наука,2000.-611 с.
25. Гинтер Е.К. Этнические особенности распространения наследственных болезней // Генетика человека.- М.:ВИНИТИ, 1978.- Т. 3,- С. 122-159.
26. Гинтер Е.К. Популяционная генетика и медицина. // Вестник РАМН. 2001.- № 10.- С. 25-31.
27. Гинтер Е.К. Медицинская генетика: Учебник. М.: Медицина, 2003. - 448 с.
28. Гинтер Е.К. Перспективы развития медицинской генетики//Мед. генетика.- 2007.- Т.6, №1(55).- С. 3-9.
29. Гоголев А.И. Историческая этнография якутов: Учебн. пособие. — Якутск, 1980.-С. 67, 106.
30. Гоголев А.И. Якуты (проблемы этногенеза и формирования культуры). Якутск, 1993. С. 123-126.
31. Гоголев А.И. История Якутии (Обзор исторических событий до начала XX в.). Якутск: Изд-во Якутского ун-та, 2000. — 201 с.
32. Горбунова В.Н., Баранов B.C. Введение в молекулярную диагностику и ге-нотерапию наследственных заболеваний. Спб.: «Специальная литература», 1997.-287с.
33. Горбунова В.Н., Савельева-Васильева, Красильников В.В. Молекулярная неврология. 4.1. Заболевания нервно-мышечной системы. СПб.: Интермедика, 2000. - 320 с.
34. Горбунова В.Н., Савельева-Васильева, Красильников В.В. Молекулярная неврология. Ч 2. Заболевания координаторной, пирамидной и экстрапирамидной систем. Болезни экспансии. СПб.: Интермедика, 2002. — 364 с.
35. Григорьева Л.В. Молекулярно генетическое исследование инфаркта миокарда в популяции Якутов: Автореф. дисс. . канд. мед. наук. -Уфа, 2006.23 с.
36. Гринио Л.П., Агафонов Б.В. Миопатии. М.: Медицина. - 1997.- С.6.
37. Данилова А.Л., Кучер А.Н., Максимова Н.Р. и др. Генетико-демографический анализ сельских популяций РС(Я)// Наука и образование, 2005.-№2 (38).-С. 98-103.
38. Динамика популяционных генофондов при антропогенных воздействиях / Под ред. Ю.П. Алтухова. -М.: Наука, 2004.- 619 с.
39. Жуковский М.А. Детская эндокринология: (Руководство для врачей).-3-е изд., перераб. и доп. М.: Медицина, 1995. - 656 с.
40. Зак М. «Бетюген» своеобразная наследственная форма бульбарного паралича среди якутов// Сов. невропатол. и психогиг.- 1932. Т.1, №12.- С.814-817.
41. Захарова Ф.А. Клинико-биохимические особенности эритропоэза и наследственной энзимопенической метгемоглобинемии в Якутии: Автореф. дисс. . канд. мед. наук. — М., 1982. — 19 с.
42. Зинченко Р.А., Ельчинова Г.И., Галкина В.А.и др. Дифференциация этнических групп России по генам наследственных болезней // Мед. генетика. — 2007. Т.6, №2 (56).- С.29-37.
43. Зубри Г.Л., Гольдфарб Л.Г. Наследственная мозжечковая атаксия в Яку-тии//Первая Всесоюзная конференция по медицинской генетике: Тез. докл.- М.: АМН СССР, 1975. С. 60-62.
44. Иванов В.Ф. Историко-этнографическое изучение Якутии ХУП-ХУШ в.в.- М.: Наука, 1974. С. 37-38.
45. Игнатьева В.Б. Республика Саха (Якутия): Ретроспектива этнополитиче-ской истории. Новосибирск: Наука, 1999.- 143 с.
46. Иллариошкин С.Н., Друзина Е.Б., Багиева Г.Х.и др. Болезнь Фридрейха: истинный спектр клинических проявлений в свете возможностей прямой ДНК-диагностики. //Журн. неврол. и психиатрии им. С.С. Корсакова. -1999.-№8.-С. 31-34.
47. Иллариошкин С.Н., Иванова-Смоленская И.А., Маркова Е.Д. ДНК-диагностика и медико-генетическое консультирование в неврологии. М.: МИА, 2002.-591 с.
48. Иллариошкин С.Н. ДНК-диагностика и медико-генетическое консультирование." М.: Медицинское информационное агентство, 2004.- 207 с.
49. Иллариошкин С.Н., Ершова М.В., Багыева и др. Атипичные фенотипы болезни Фридрейха: ДНК-анализ и клинико-генетические сопоставления. // Мед. генетика. 2004.- Т.З, №1.- С.- 36-42
50. Иллариошкин С.Н., Руденская Г.Е., Иванова-Смоленская И.А.и др. Наследственные атаксии и параплегии. М.:МЕДпресс-информ, 2006.- 416 с.
51. Кадурина Т.И. Наследственные коллагенопатии (клиника, диагностика, лечение и диспансеризация). — СПб.: «Невский Диалект», 2000. —271 с.
52. Кадурина Т.И., Горбунова В.Н. Дисплазия соединительной ткани. Руководство для врачей.- СПб.: Элби-СПб, 2009. 704 с.
53. Кириллов А.Г. Наследственные болезни в Чувашской Республике: автореф. дисс. . д-ра мед. наук.- М., 2008. 39 с.
54. Кириллов А.Г., Зинченко С.П., Абрукова А.В.и др. Наследственные заболевания среди чувашей Республики Чувашия// Мед. генетика. — 2007.- Т.6, №1(55).-С.19-27.
55. Клюшников С.А., Иллариошкин С.Н., Иванова-Смоленская И.А. Семейный случай спинально-бульбарной амотрофии Кеннеди // Нервные болезни. 2008.- №1. - С. 1-4.
56. Козьмин H.H. К вопросу о происхождении якутов сахалар // Очерки по изучению Якутского края. - Иркутск, 1928. Вып. II. - С. 4-5.
57. Коротов М.Н., Кузьмина З.М. К вопросу о распространенности наследственных дегенеративных заболеваний нервной системы на территории Республики Саха // Актуальные вопросы здоровья населения Республики Саха. Якутск, 1994,- С. 132-134.
58. Константинов И.В. Захоронения с конем в Якутии (новые данные по этногенезу якутов)// По следам древних культур Якутии. Якутск: Якутское книжное издательство, 1970. - С. 183-197.
59. Константинов И.В. Происхождение якутского народа и его культуры // Якутия и ее соседи в древности (труды Приленской археологической экспедиции). -Якутск: Изд. ЯФСОАН СССР, 1975. -С 138-140.
60. Константинов И.В. Ранний железный век Якутии.- Новосибирск: Наука, 1978. 127 с.
61. Ксенофонтов Г.В. Ураанхай — сахалар. Очерки по древней истории якутов. В 2 кн.- Якутск: Национ.книжное изд. РС(Я), 1992. С.203-213.
62. Кучер А.Н. Популяционная структура коренного и пришлого населения Сибирского региона // Мед. генетика,- 2002.- Т.1, №.6.- С. 262-270.
63. Кучер А.Н., Данилова A.JL, Конева, JI.А. и др. Генетико-демографическое изучение народонаселения Республики Саха (Якутия)//Якутский медицинский журнал.- 2005,- №2.- 4-12 с.
64. Лобзин B.C., Сайкова Л.А. Шиман А.Г. Нервно-мышечные болезни. -СПб.: Гиппократ, 1998. 224 с.70: Маак Р.К. Вилюйский округ. 2-е изд., - М.: «Яна», 1994. - С. 250.
65. Майнов И.И. Население Якутии// Якутия: Сб.статей/Под ред. Виттенбурга П. В. Л.: Изд. АН СССР, 1927. - С. 265.
66. Максимова Н.Р. Генетическая характеристика населения Усть-Алданского улуса Якутии:, демографические параметры, гены-кандидаты и факторы риска сердечно-сосудистых заболеваний: Автореф. дисс. . канд. мед. наук. Томск, 2002. - 23 с.
67. Медицинские лабораторные технологии: Справочник/ Под ред. А.И. Кар-пищенко. Т.2. СПб.: Интермедика, 1999. 604 с.
68. Назаренко Л.П., Назаренко С.А., Кириллина-В.И., Прокопьева Ю.Н. Гене-тико-экологическая оценка состояния здоровья'жителей Якутии.- Якутск: Изд-во «С.К. Имидж», 2001. 132 с.
69. Наследственные болезни в популяциях человека /Под ред. Гинтера Е.К.-М.: Медицина, 2002.- 304 с.
70. Наследственные и врожденные заболевания сетчатки и зрительного нерва: руководство для врачей/Под ред. Шамшиновой А.М. М.: Медицина, 2001,- 528 с.
71. Неретин В.Я., Агафонов Б.В., Сидорова О.П. Медико-генетическое консультирование при наследственных и врожденных болезнях нервной системы. М.: Медицина, 2004. - 224 с.
72. Новиков П.В. Наследственная патология в структуре болезней детского возраста и организация медико-генетической помощи детям в Российской Федерации. //Мед. генетика. 2008.- №12.- С. 3-7.
73. Ноговицына А.Н. Отягощенность населения Республики Саха (Якутия) наследственной патологией и анализ работы региональной медико-генетической консультации: Автореф. дисс. . канд. мед. наук—Томск, 2001.-24 с.
74. Ноговицына А.Н., Максимова Н.Р. Ханды М.В., Алексеева С.П. Наследственная патология семей, обратившихся в МГК Национального Центра Медицины Республики Саха (Якутия) с 1990 по 1998 год// Дальневост. мед. журн. 1999.- № 1.- С.26-30.
75. Ноговицына А.Н., Максимова Н.Р., Сухомясова А.Л. и др. Республиканский регистр наследственной и врожденной патологии в РС(Я).- Якутский медицинский журнал.- 2004.- №4. ~ С.4-7.
76. Об итогах Всероссийской переписи населения 2002 года по Республике Саха (Якутия). Госкомстат РС (Я). — Якутск, 2005. 42 с.
77. О национальном составе населения Якутской-Саха ССР по итогам переписи населения 1989 года: Аналитическая записка. -Якутск: Якутское республиканское управление статистики, 1990 г.
78. Осаковский В.Л, Шатунов А.Ю, Гольдфарб Л.Г, Платонов Ф.А. Оценка возраста мутантной хромосомы по БСА1 в якутской популяции // Якутский медицинский журнал.- 2004.- №2. С. 63.
79. Основные демографические характеристики Республики Саха(Якутия): Демографический ежегодник (Госкомстат РС(Я)) № 1/5060. Якутск, 2000. -57 с.
80. Парникова А.С. Расселение якутов в ХУП-начале ХХ.вв. Якутск: Якутское книжное изд-во, 1971. - С.140-144.
81. Петров П.А. Вилюйский энцефалит. Новосибирск, 1987. - С. 108-109.
82. Петрова И.Р. Клинические и генетические особенности гипертонической болезни в якутской популяции: Автореф. дисс. . канд. мед. наук. — М, 2004.- 24с.
83. Петрухин А.А. Молекулярная диагностика и медико-генетический прогноз спинальной и бульбарной амиотрофии Кеннеди у детей и подростков. Автореф. дисс. . канд.мед.наук. — М, 1996.- 23 с.
84. Платонов Ф.А, Иллариошкин С.Н, Кононова С.К. и др. Спиноцеребел-лярная атаксия первого типа в Якутии: распространенность и клинико-генетические сопоставления// Мед. генетика, 2004. Т.5. - С. 242-248.
85. Попова С.Н, Сломинский П.А, Галушкин С.Н. и др. Анализ аллельного полимофризма триплетных повторов (СТО)п и (САО)п в генах ОМ, ОКРЬА и 8СА1 в различных популяциях России //Генетика. 2002. - Т.38, №11.- С.1549-1553.
86. Популяционно-генетическое изучение народа саха: Коллектив, монография. -Якутск, 2001. 103 с.
87. Пугачев В.В, Иллариошкин С.Н, Прокунина Л.В. и др. ДНК-диагностика атаксии Фридрейха с клинико-генетическим анализом// Молекулярная генетика наследственных болезней и медико-генетическое консультирование.- М.: МЛНИКИ, 1996.- С. 22-34.
88. Пузырев В.П. Изучение особенностей распространения наследственных болезней в Западной Сибири. // Вестн. РАМН.- 1984. № 7. - С. 76-78.
89. Пузырев В.П. Генетика мультифакториальных заболеваний: между прошлым и будущим // Мед. генетика.- 2003.- Т.2, № 12,- С. 498-508.
90. Пузырев В.П., Степанов В.А. Патологическая анатомия человека. — Новосибирск: Наука, 1997. — 224 с.
91. Пузырев В.П., Эрдыниева Л.С., Кучер А.Н., Назаренко Л.П. Генетико-эпидемиологическое исследование населения Тувы. Томск: STT, 1999. —255 с.
92. Пузырев В.П., Назаренко Л.П. Генетико-эпидемиологическое исследование наследственной патологии в Западной Сибири. Томск: STT, 2000. -187 с.
93. Пузырев В.П., Степанов В.А., Голубенко М.В. и др. Линии мтДНК и Y-хромосомы в популяции якутов // Генетика.- 2003. Т. 39, № 7. - С. 975-981.
94. Пузырев В.П., Фрейдин М.Б., Кучер А.Н. Генетическое разнообразие народонаселения и болезни человека. Томск: Изд-во «Печатная мануфактура», 2007. - 320 с.
95. Пузырев В.П., Эрдынеева Л.С., Назаренко Л.П. Генетико-эпидемиологическое исследование населения Тувы. Томск: STT, 1999.256 с.
96. Романова Т.А. Факторы риска и тяжесть ишемической болезни сердца у жителей Якутии: связь с полиморфизмом генов-кандидатов: автореф. дисс. . канд. мед. наук. — М., 2003.—21 с.
97. Серошевский В. Л. Якуты. Опыт этнографического исследования. — 2-е изд. -М, 1993.-С. 197-199.
98. Соколов М.П. Якутия по переписи 1917 года. Выпуски I-II с картой /Изд. Якутского статистического управления. Иркутск, 1925. - С. 3-5.
99. Спиридонова М.Г., Степанов В.А., Максимова Н.Р., Пузырев В.П. Популя-ционное исследование частоты полиморфизма С677Т гена метилентетра-гидрофолат редуктазы в Якутии//Генетика,- М., 2004.- Т. 40, №5.- С. 704708.
100. Степанов В.А. Этногеномика населения Северной Евразии. Томск: Изд-во «Печатная мануфактура», 2002. - 244 с.
101. Сукнева С.А., Мостахова Т.С. Демографическое развитие региона: Оценка, прогноз, политика. — Новосибирск: Наука, 2002. — 192 с.
102. Сухомясова A.JI. Аутосомно — доминантная миотоническая дистрофия в Республике Саха (Якутия): автореф. дис. . канд. мед. наук. — Томск, 2005. -22 с.
103. Статистический сборник № 4. Итоги всесоюзной переписи населения на 12 января 1989 г. Август 1990. Якутск, 1990. - С. 6-7.
104. Статистический сборник Госкомстата PC (Я). Демографический ежегодник. -Якутск, 2003.-С. 24-27.
105. Тарская Л.А., Зинченко P.A., Ельчинова Г.И., и др. Структура и разнообразие наследственной патологии в Республике Саха(Якутия).// Генетика. -2004. -Т.40, №11.-С.51-62.
106. Токарев С.А. Очерк истории якутского народа. — М.: Соц.-экон. лит., 1940. 247 с.
107. Токарев Ю.Н., Халлаи С.Р., Корраля-Альмонте Х.Ф., Наследственные анемии и гемоглобинопатии. М.: Медицина, 1983.- 333 с.
108. Федорова E.H. Население Якутии: прошлое и настоящее (геодемографическое исследование). 2-е изд., испр. и доп. — Новосибирск: Наука, 1999. — 207 с.
109. Федорова С.А. Генетические портреты Республики Саха (Якутия): анализ линий митохондриальной ДНК и Y-хромосомы / Отв.ред. М.И. Томский. — Якутск: Изд-во ЯНЦ СО РАН. 2008.- 235 с .
110. Федорова С.А., Хусаинова Р.И., Кутуев И.А. и др. Полиморфизм (CTG) -повторов гена миотонинпротеинкиназы в популяциях Республики Саха
111. Якутия) и Средней Азии // Молекулярная биология. -2005.- Т.39, №3. -С.385-393.
112. Фогель Ф., Мотульски А. (Vogel F., Motulsky А.) Генетика человека. (Пер. с англ.). В 3 т. М.: Мир.- 1990.
113. Харьков В.Н., Степанов В.А., Медведева О.В. и др. Происхождение якутов: анализ гаплотипов Y-хромосомы// Молекулярная биология. 2008. - Т. 42. - №2.- С. 226-237.
114. Хитринская И.Ю., Степанов В.А., Пузырев В.П. и др. Генетическое своеобразие населения Якутии по данным аутосомных локусов// Молекулярная биология.- 2003.- Т. 37, №2.- С. 234-239.
115. Шамшинова A.M., Зольникова И.В. Молекулярно-генетические основы патогенеза наследственных дистрофией сетчатки // Мед. генетика. — 2004а.-Т.З, №4.- С. 150- 165.
116. Шамшинова A.M., Зольникова И.В. Молекулярная генетика наследственных дисфункций палочковой и колбочковой систем. // Мед. генетика. — 20046.- Т.З, №5.- С. 202 209.
117. Эфроимсон В.П., Калмыкова Л.Г. Успехи неврологической и психиатрической генетики // Генетика-психических болезней.- М., 1970. -С. 186-291.
118. Abu-Amero S., Monk D., Frost J. et al. The genetic etiology of Silver-Russell syndrome. //J. Med.Genet. 2008.- 45(4)- P. 193-199.
119. Alper G., Narayanan V. FridreichAs ataxia. Pediatr Neurol. 2003.- V.28.- P. 335-341.
120. Amselem S., Duquesnoy P., Attree O. et al. Laron drawfism and mutations of the growth hormone-receptor gene// New Engl. J. Med.- 1989.- V. 321. P. 989-995.
121. Andrew S.E., Goldberg Y.P., Hayden L. et al. Rethinking genotype and phenotype correlations in polyglutamin expansion disorders.// Hum. Mol.Genet.- 1997.-N6.- P.2005-2010.
122. Arai T., Kasper J.S., Skaar J.R. et al. Targeted disruption of pl85/Cul7 gene results in abnormal vascular morphogenesis// Proc. Natl. Acad. Sci. USA.-2003.- №100. P.9855-9860.
123. Avela K., Lipsanen-Nyman M., Idanheimo N. et ah Gene encoding a new RING-B-box-coiled-coil protein is mutated in mulibrey nanism// Nat. Genet. -2000.- V. 25.- P. 298-301.
124. Bae J.S., Ki Ch-S., Kim J.-W., Kim B.J. Identification of a novel mutation in a Korean patient with oculopharyngeal muscular dystrophy //J. Clin. Neurosc. -2007.- V. 14.- P. 89-92.
125. Baird P.A., Anderson N.W., Newcombe N.B., Lowry R.B. Genetic disorders in children and young adults: a population study // Am. J. Hum. Genet. 1988.- V. 42.- P. 677-694.
126. Barton D.E., Foellmer B.E., Wood W.I., Francke U. Chromosome mapping of the growth hormone receptor gene in man and mouse// Cytogenet. Cell. Genet. -1989.-V.50.- P.137-141.
127. Becher M. W., Morrison L., Davis L.E. et al. Oculopharyngeal Muscular Dystrophy in Hispanic New Mexicans // JAMA. 2001.- V. 286. -P. 2437-2440.
128. Bellus G.A., Spector E.B., Speaiser P.W. et al. Distinct missense mutations of the FGFR3 lys650 codon modulate receptor kinase activation and the severity of the skeletal dysplasia phenotype// Am. J. Hum. Genet.- 2000. -V.67 P. 14111421.
129. Biesecker L.G. Lumping and splitting: molecular biology in genetics clinic // Clin. Genet. 1998.- V. 53. - P. 3-7.
130. Bengtsson B.O., Thomson G. Measuring the strength of associations between HLA antigens and diseases// Tissue Antigens. — 1981. — V. 18.- P.356-363.
131. Bilgen C., Bilgen I.G., Sener R.N. Oculopharyngeal muscular dystrophy: clinical and CT findings // Computer Medical Imaging and Graphics.- 2001.- V. 25.-P.527-529.
132. Blumen S.C., Brais B., Korczyn A.D., et al. Homozygotes for oculopharyngeal muscular dystrophy have a severe form of the disease // Ann. Neurol.- 1999.-V. 46.-P. 115-118.
133. Blumen S.C., Korczyn A.D., Lavoie H. et al. Oculopharyngeal MD among Bukhara Jews is due to a founder (GCG)9 mutation in the PABP2 gene //Neurology.-2000.-N2.- P. 1268-1270.
134. Blumen S.C., Nisipeau P., Saden M. et al. Clinical features of oculopharyngeal muscular dystrophy among Bukhara Jews //Neuromuscul. Disord.— 1993.-V.3.- P.575-577.
135. Bouchard J.-P., Brais B., Brunei D. et al. Recent studies on oculopharyngeal muscular dystrophy in Quebec//Neuromusc. Disord. -1997. -V. 7 (Suppl 1). -P. S22-29.
136. Boukriche Y., Maisonobe Th., Masson C. Neurogenic involvement in a case of oculopharyngeal muscular dystrophy// Muscle &Nerve.- 2002.- V. 25. P.98-101
137. Bourgeron T., Chretien D., Poggle-Bach J. et al. Mutation of the fumorase gene in two siblings with progressive encephalopathy and fumorase deficiency// J.Clin.Invest. -1994.- N93.- P.2514-2518
138. Bowen P. Invited editorial comment: Workshop on Genetic disorders in the Hutteriters Edmonton, Canada, Oct.2-13, 1983 //AmJ.Genet. -1985. -V.22, №3. P.449-451.
139. Braise B: Oculopharyngeal muscular dystrophy: a late-onset polyalanine disease// Cytogenet. Genome. Res. -2003. V. 100. - P. 252-260.
140. Braise B., Bouchard J.-P., Xie Ya-G. et al. Short GCG expansions in the PABP2 gene cause oculopharyngeal muscular dystrophy// Nat. Gen.- 1998.- V.18.- P. 164-167.
141. Braise B., Xie Y.G., Sanson M. et al. The oculopharyngeal muscular dystrophy locus maps to the region of the cardiac a and (3 myosin heavy chain genes on chromosome 14ql 1.2ql3. // Hum.Molec.Genet. 1995.- V.4.- P.429-434.
142. Broman K.W., Murray J.C., Sheffield V.C. et al. Comprehensive human genetic maps: individual and sex-specific variation in recombination// Am. J. Hum. Genet. 1998.- N63.- P.861-869.
143. Brook CGD: A Guide to the Practice of Pediatric Endocrinology. Cambridge, Cambridge University Press, 1993.-P. 181-213.
144. Buckway C.K., Guevara-Aguirre J., Pratt K.L. et al. The IGF-I generation test revisited: a marker of GH sensitivity// J. Clin. Endocrinol. Metab.- 2001. V. 86. -P. 5176-5183.
145. Cagnoli C., Michielotto Ch., Matsuura T. et al. Detection of large pathogenic expansions in FRDA1, SCA10 and SCA12 genes using a simple fluorescent repeat-primed PCR assay // J. Mol. Diagn. -2004,- V.6.- P. 96-100.
146. Campuzano V., Montermini L., Molto M.D. et al. Friedreich 's ataxia: autosomal recessive disease caused by an intronic GAA triplet repeat expansion //Science.- 1996.- V. 271.- P.1423-1427.
147. Cantu J.M., Garcia-Cruz D., Sanchez-Corona J., et al. 3-M slender-boned nanism. An intrauterine growth retardation syndrome// Am. J. Dis. Child. -1981.-Vol.135.- P.905-908.
148. Cavalli Sforza L.L., Bodmer W.F. The genetic of human populations.- San Francisco: W. F. Freeman C, 1971. - 962 p.
149. Carr R.E., Siegel I.M. Cone dysfunctions in man // Trans. Am. Acad. Ophthalmol. Otolaryngol. 1976.- V. 81.- P. 653-658
150. Chamberlain S, Shaw J, Rowland A, et al. Mapping of mutation causing Friedreich' ataxia to human chromosome 9 //Nature. 1988. - V.334 (6179). -P. 248-250.
151. Chudoba I., Franke Y., Senger G. et al. Maternal UPD 20 in a hyperactive child with severe growth retardation // Eur. J. Hum. Genet. 1999.- V. 7. - P. 533-540.
152. Clotti P., Maria E., Bellone E. et al. Triplet repeat primed PCR (TP PCR) in molecular diagnosis testing for Friedreich ataxia// J. Molec. Diagnosis. 2004. -V. 6.- No.4.- P. 285-289.
153. Codere F., Brais B., Rouleau G., Lafontaine E. Oculopharyngeal muscualr dystrophy: Whaf s new? //Orbit.- 2001.-V. 20.-P. 259-266.
154. Cogan J.D., Phillips J.A. Growth disorders caused by genetic defects in the growth hormone pathway //Adv. Pediatr. 1998.- V. 45. -P. 337-361.
155. Conneally P.M., Rivas M.L. Linkage analysis in man //Advances in Human Genetics. V.10./ Eds.Haris H. Hirschhorn K. - Plenum Press.- 1980.- P. 209266.
156. Consantino B.T. Pelger-Huet Anomaly Morphology, Mechanism, and Significance in the Peripheral Blood Film// LABMEDICINE.- 2005. V. 36. -P. 103-107.
157. Cossee M., Schmitt M., Campuzano V. et al. Evolution of the Friedreich's ataxia trinucleotide repeat expansion: founder effect and permutations// Proc. Natl. Acad. Sei.- 1997.- V.94.- P. 7452-7457.
158. Dedrick D., Brown L. Obstructive sleep apnea syndrome complicating oculopharyngeal muscular dystrophy//Chest.- 2004.-V.125.- P. 334-336.
159. Dejager S., Bry-Gaullard H., Bruckert E. et al. A comprehensive endocrine description of Kennedy's Disease revealing Androgen Intensively linked to a CAG repeat length // J. Clin. Endocrinol. Metab.- 2002,- V.87.- P. 3893-3901.
160. Detalycki MiB., Williamson R., Forrest S.M. Friedreich ataxia: an overview // J.Med.Genet. -2000.- V. 37.- P. 1-8.
161. De La Chappele A., Wright F.A. Linkage disaquelibrium mapping in isolated populations: The example of Finland revisited //Proc. Natl. Acad. Sei. 1998. -V. 95. - P.12416-12423.
162. Diaz G.A., Gelb B.D., Risch.N. et al. Gaucher disease: the origins of the Ashkenazi Jewish N370S and 84GG acid ß-glucosidase mutations // Am. J. Hum. Genet.- 2000.- V. 66.- P: 1821-1832.
163. Dias D. C.; Dolios, G.; Wang, R.; Pan, Z.-Q. : CUL7: A DOC domain-containing cullin selectively binds Skpl-Fbx29 to form an SCF-like complex // Proc. Nat. Acad. Sei.- 2002,- N 99. -P. 16601-16606.
164. Dib C., Faure S., Fizames C et al. A comprehensive geneticmap of the human genome based on 5,264 microsatellites//Nature.- 1996.- V.380.- P. 152-154.
165. Dreyer SD, Zhou G, Lee B: The long and the short of it: developmental genetics of the skeletal dysplasias// Clin. Genet. -1998. -V.54. P.464-473.
166. Durr A. Fridreich ataxia: treatment within reach// Lancet. Neurology. 2002.- V. l\- P.370-374.
167. Echaniz-Laguna A., Rousso E., Auheim M. et al. A family with early-onset and rapidly progressive X-linked spinal and bulbar muscular atrophy// Neurology. -2005 .-V.- 64.- P. 1458-1460.
168. Edwards A., Hammond H.A., Jin L. et al. Genetic variation at the five trimeric and tetrameric tandem repeat loci in four human population groups// Genomics.-1992.- V.12.- P.241-253.
169. Elliot A.M., Graham J.M., Curry J.R. et al. Spectrum of dolichospondylic dysplasia: two new patients with distinctive findings// Am. J. Med. Genet. -2002.- V. 113.-P: 351-361.
170. Fardeau M., Tome F.M.S. Oculopharyngeal muscular dystrophy in France // Neuromusc. Disord.- 1997,- N 7(Suppl 1).- P. S30-33.
171. Feldmann M., Gilgenkrantz S., Parisot S. et al.3-M dwarfism a study of two further sibs // J. Med. Genet.- 1989.- V.26.- P. 583-585.
172. Figlewicz D.A., Orrell R.W. The genetics of motor neuron diseases// ALS and other motor neuron disorders. — 2003.-V. 4,- P. 225-231.
173. Francomano C.A., Biesecker L.G. Medical genetic studies in the Amish. // Am. J. Med. Genet. 2003.- V. 121. - P. 1-83.
174. Fujita R, Agid Y, Trouillas P. et al. Confirmation of linkage of Friedreich ataxia to chromosome 9 and identification of a new closely linked marker // Genomics. 1989. - V. 4. - P. 110-111.
175. Gambelli S., Malandrini A., Ginanneschi F. et al Mitochondrial Abnormalities in Genetically Assessed Oculopharyngeal Muscular Dystrophy// Eur. Neurol.2004.-V. l.-P. 44-147.
176. Gardner E.J., Simmons M.J., Snustad D.P. Principles of genetics. New York: John Wiley&Son, Inc. - 1991.
177. Garcia-Cruz D., Cantu J.M. Heterozygous expression in 3-M slender-boned nanism.// Hum.Genet.- 1979.- V. 52.- P. 221-226.
178. Gatchel J.R., Zoghbi H.Y. Disease of Unstable repeat expansion: mechanisms and common principles // Nat. Rev. Genet. 2005. - V. 6(10). - P. 743-755.
179. Georgiou I., Sermon K., Lissens W. et al. Preimplantation genetic diagnosis for spinal and bulbar muscular atrophy (SBMA) // Hum. Genet. -. 2001. V.108. - P. 494-498.
180. Gitscher J., Wood W.I., Goralka T.M. et al. Characterization of the human factor VIII gene//Nature. 1984.-V. 312. - P.326-330.
181. Goh K.J., Wong K.T., Nishino I. et al. Oculopharyngeal muscular dystrophy with PABPN1 mutation in Chinese Malaysian woman // Neuromusc. Disord.2005.-V. 15.-P. 262-264.
182. Goldar. D.E, Green P, Parry D.M. et al. Multipoint linkage analysis in neurofibromatosis type I: an international collaboration // Am. J. Hum. Genet. -1989.-V. 44. P. 6-12.
183. Goldfarb L.G, Vasconselos O, Platonov F.A, et al. Unstable triplet and phenotypic variability of spinocerebellar ataxia type 1// Ann. Neurol'. 1996. V.39: - P.500-506.
184. Grewal R.P, Karkera J.D, Grewal R.K, Detera-Wadleigh S.D. Mutation analysis of oculopharyngeal, muscular dystrophy in Hispanic American families// Arch. Neurol. 1999.- V. 56. -P. 1378-1381.
185. Hall C.M, Shaw D.G. Computer diagnosis of skeletal* dysplasias and malformation syndromes //Acta. Paediatr. Suppl. 1994. -V. 406: -P. 73-76.
186. Hall C.M. International nosology and classification of constitutional disorders of bone (2001) // Am. J. Med: Genet.- 2002. V. 113. - P.65-77.
187. Hamel Ch. P. Cone rod dystrophies // Orphanet Journal of Rare Diseases. 2007. - V. 2. - P: 7 doi: 10.1186/1750-1172-2-7
188. Hannula K, Lipsanen-NymamM, Kristo P. et al'. Genetic screening for maternal uniparental disomy of chromosome 7 in prenatal and- postnatal growth retardation of unknown cause// Pediatrics. 2002.- V. 109.- P.441-448.
189. Harper P.S, Van Engelen B, Eymard B, Wilcox D.E. Myotonic dystrophy: present management, future therapy.- New York: Oxford University Press, 2004.- 251 p.
190. Harrison K, Eisenger K, Anyane-Yeboa K, Brown S: Maternal uniparental disomy of chromosome 2 in a baby with,trisomy 2 mosaicism in amniotic fluid culture //Am. J. Med. Genet. 1995. - V. 58.- P. 147-151.
191. Heinrich UE. Intrauterine growth retardation and familial short stature.// . Baillieres. Clin. Endocrinol. Metab.-1992. V.6. P. 589-601.
192. Hennekam R.C., Bijilsma J.B., Sparnger J. Further delineation of the 3M syndrome with review of the literature // Am. J. Med. Genet.- 1987.- №28.- P. 195-209.
193. Hill M.E., Creed G.A., McMullan T.F.W, et al. Oculopharyngeal muscular dystrophy. Phenotypic and genotypic studies in a UK population// Brain, 2001.-V. 124. — P.522-526.
194. Hoffmann K., Dreger C.K., Olins A.L., et al. Mutations in the gene encoding the lamin B receptor produce an altered nuclear morphology in granulocytes (Pelg-er-Huet anomaly) // Nat.Gen.- 2002. V. 31. - P.410-414.
195. Hoffmann K., Sperling K., Olins A.L., Olins D.E. The granulocyte nucleus and lamin B receptor: avoiding the ovoid //Chromosoma.- 2007.- V. 116.- P. 227235
196. Holm V.A., Cassidy S.B., Butler M.G. et al. Prader Willi syndrome: Consensus diagnostic criteria// Pediatrics.- 1993.- V. 91. - P. 398-402.
197. Horton WA: Molecular genetic basis of the human chondrodysplasias //Endocrinol. Metab. Clin. N. Am. 1996.- V.25.- P. 683-697.
198. Huber C., Dias-Santagata D., Glaser A. et al. // Identification of mutations in CUL7 in 3-M syndrome// Nature Genet.-2005.- Vol. 37.-P.1119-1124.
199. Huber C., Delezoide A.-L., Guimiot F. et al. A large-scale mutation search reveals genetic heterogeneity in 3M syndrome // Eur. J. Hum.Gen.-2009.- V. 17.-P. 395^00.
200. Jourdan C., Lieberman A.P. Spinal and bulbar muscular atrophy: a motoneuron or muscle disease? // Current opinion in Pharmacology. -2008.- V.8.- P. 752-758.
201. Justice C., Den Zh., Nguyen S.V. et al. Phylogenetic Analysis of the Friedreich Ataxia GAA trinucleotide repeat // J.Mol.Evol.- 2001.- V.52.- P. 232-238.
202. Juvonen V., Kulmala S.-M., Ignatius J. et al. Dissecting the epidemiology of a trinucleotide repeat disease example of the FRDA in Finland// Hum.Genet.-2002.-V. 10.-P. 36-40.
203. Kalousek D.K., Langlois S., Barrett I. et al. Uniparental disomy for chromosome 16 in humans. // Am. J. Hum. Genet.- 1993.- V. 52.- P. 8-16.
204. Kant S.G., Wit G.M., Breuning M.H. Genetic analysis of short stature.// Hormone Research.- 2003. -V. 60. -P. 157-165.
205. Katsuno M.; Adachi H.; Doyu M. et al. Leuprorelin rescues polyglutamine-dependent phenotypes in a transgenic mouse model of spinal and bulbar muscular atrophy // Nature Med. 2003. - V.9:- P. 768-773.
206. Karlberg N., Jalanko H., Perheentupa J., Lipsanen-Nyman M. Mulibrey nanism: clinical features and diagnostic criteria // J. Med. Genet. 2004. - V. 41. - P. 92-98.
207. Kellner U., Kellner S. Clinical findings and diagnostics of cone dystrophy // Ophthalmologe. -2009.- Feb. 5.-online.
208. Kennedy W. R.; Alter M., Sung, J. H. Progressive proximal spinal and bulbar muscular atrophy of late onset: a sex-linked recessive trait. //Neurology.- 1968. -N18.-P. 671-680.
209. Kere J. Human population Genetics: Lessons from Finland // Ann. Rev. Genomics Hum. Genet. 2001. - V.2. - P. 103-128.
210. Kohl S. Genetic causes of hereditary cone and cone-rod dystrophies // Ophtalmologe.- 2009.- N 2.- Epub ahead of print.
211. Kondo M., Miyake Y., Kondo N. et al. Peripheral Cone Dystrophy. A variant of Cone Dystrophy with predominant dysfunctions in the peripheral cone systems// Ophthalmology. 2004. - V. 111. - N4. - P. 732-739.
212. Kotzot D., Schmitt S., Bemasconi F. et al. Uniparental disomy 7 in Silver-Russell syndrome and primordial growth retardation// Hum.Mol. Genet.- 1995.-V. 4.- P. 583-587.
213. Kousseff B.G., Gallardo L.A., Mueller O.T. Unusual clinical presentation associated with uniparental disomy of chromosome 10 in a child presymptomatic for multiple endocrine neoplasia type 2 A //Am. J. Hum. Genet. 1992.-V.51.-A219.
214. Kuhlmann B.V., Mullis P.E. Genetics of the growth hormone axis. // J. Pediatr. Endocrinol. Metab. 1997.- V. 10. -P.161-174.
215. Kuzmiak H.A., Maquat L.E. Applying nonsense-mediated mRNA decay resaech to the clinic: progress and challenges// Trends Mol. Med. 2006.- V.12.- P. 306-316.
216. Laberge A-M., Michaud J., Richter A. et al. Population history and its impact on medical genetics in Quebec // Clin. Genet. 2005. V. 68. - P. 287-301.
217. La Spada A.R., Wilson E.M:, Lubahn D.B. et al. Androgen receptor gene mutations in X-linked spinal and bulbar muscular atrophy // Nature 1991. N352,- P.77-79.
218. Laan M., Paabo S. Demographic history and linkage disequilibrium in the human population // Nat: Genet. 1997. - V. 17. - P. 435-438.
219. Labuda D., Zierkiewicz E., Labuda M. The genetic clock and the age of the founder effect in growing populations: a lesson from French Canadians and Ashkenazim// Am. J. Genet.- 1997.- V. 61.- P. 768-771.
220. Labuda M., Labuda D., Miranda C. et al. Unique origin and specific ethnic distribution of the Friedreich ataxia GAA expansion// Neurology. — 2000.- V. 54.- P. 2322-2324.
221. Lunkes A., Golfarb L.G., Platonov F.A. et al. Autosomal dominant spinocerebellar ataxia (SCA) in Siberian ataxia type III Exp.Neurol.-1994. -V.126.- P.310-312.
222. Lander E.S., Botsein D. Homozygosity mapping: a way to map human recessive traits with the DNA of inbred children// Science.- 1988.- V.236.- P. 1567-1570.
223. Lathrop G.M., Lalouel J.M. Easy calculations of lod scores and genetic risks on small computers // Am. J. Hum. Genet.- 1984a.- V.36.- P.460-465.
224. Lathrop G.M., Lalouel J.M., Julier C., Ott J. Strategies for multilocus linkage analysis in humans//Proc. Natl. Acad. Sci.USA.- 1984b.- V.81.- P. 3443-3446.
225. Lavoie H., Debeane F., Trinh Q.-D. et al. Polymorphism, shared functions and convergent evolution of genes with sequences coding for polyalanine domains// Hum.Mol.Genet.-2003.- V.12, No.22.- P.2967-2979.
226. Laron Z.V.I. Laron syndrome (primary growth hormone resistance or insensitivity): the personal experience 1958-2003 // J. Clin. Endocrinol. Metab. -2004.-V. 89. P. 1031-1044.
227. Le Merrer M., Brauner R., Maroteaux P. Dwarfism with gloomy face: a new syndrome with features of the 3- M syndrome// J. Med. Genet.- 1991.-Vol. 28.-P. 186-191.
228. Leppert M.F. Gene mapping and other tools for discovery// Epilepsia. 1990.-V.31 (Suppl.3).- P. 11-18.
229. Lund A., Udd B., Juvonen V. et al. Multiple founder effects in spinal and bulbar muscular atrophy (SBMA, Kennedy disease) around the world. // Europ. J. Hum. Genet.- 2001.-V. 9.-P. 431-436.
230. Lund A., Udd B., Juvonen V. et al. Founder effect in spinal and bulbar muscular atrophy (SBMA) in Scandinavia// Europ. J. Hum. Genet. 2000.- V. 8.-P. 631-636.
231. Lunkes A., Goldfarb L.G., Platonov F.A. et al. Autosomal dominant spinocerebellar ataxia (SCA) in Siberian ataxia type 1// Exp .Neurol.-1994. -V.126. -P.310-312.
232. Marik I., Maricova O., Kuklik M. et al. 3-M syndrome in two sisters // J.Paediatr. Child Health.- 2002.- №38.- P. 419 422.
233. Marmor MF, Arden GB, Nilsson SEG, Zrenner E. Standard for clinical electroretinography//Archives of Ophthalmology.- 1989.- V. 107.-P. 816-819.
234. Martila P., Stene M. Screening for short-stature homebox (SHOX) gene defects using SHOXDNA-Dx Esoterix // Endocrinology. 2001.- P. 201-203.
235. McDaniel D.O., Keats B., Vedanarayanan V.V., Subramony S.H. Sequence variation in GAA repeat expansions may cause differential penotype display in Friedrech ataxia // Movement disorders. 2001.- V. 16, No. 6.- P. 1153-1158.
236. McKusick V.A. On lumpers and splitters, or the nosology of genetic disease. // Perspect. Biol. Med.- 1969.- V. 12,- P. 298-312.
237. McKusick V.A. et al. Medical Genetic studies of the Amish: Selected Papers. Baltimore, MD: Johns Hopkins Univ. Press. 1978. -523p:
238. McKusick V.A. Genomics: structural and functional, studies of genomes // Genomics.- 1997. -V. 45,- P. 244-249.
239. McKusick V.A. A 60-year tale of spots, maps and genes // Annu. Res. Genomics Hum. Genet. 2006. - N. 7. - P. 1-27.
240. Mendez H. Introduction to the study of pre-and postnatal growth in humans: A review//Am. J. Med. Genet. 1985.-V. 20.- P. 63-85.
241. Meo F.P Pinto V., D'Addario V. 3-M syndrome: a prenatal ultrasonographic diagnosis //Prenat. Diagnos. -2000.- №20.- P. 921-923.
242. Meola G., Sansone V., Rotondo G. et al. Oculopharyngeal muscular dystrophy in Italy//Neuromusc. Disord.- 1997.- 7 (Suppl 1).- S53-56.
243. Merette C., Ott J. Finding and excluding gene locations by linkage analysis// The molecular and genetic basis of neurological disease /Eds. Rosenberg R.N. Prusiner S.B., Dimauro and al. Boston: Butterworth-Heinemann.- 1993.- P. 25-28.
244. Miller J.D., McKusick V., Malvaux P. et al. The 3-M syndrome: a heritable low birthweight dwarfism // Birth Defects Orig. Artie. Ser. -1975. -№11. -P.39-47.
245. Mirabella M., Silvester G., Rosa G. et al. GCG genetic expansions in Italian patients with oculopharyngeal muscular dystrophy //Neurology.- 2000.-February (1 of 2).- P.608-614.
246. Monaco A.P., Neve R.L., Colletti-Feener C. et al. Isolation of candidate cDNAs for portions of the Dushenn muscular, dystrophy gene// Nature.- 1986. 323.- P. 646-650.
247. Monros E., Molto M.D., Martinez F. andothers. Phenotype Correlation and Integrationaln Dynamics of the Friedreich Ataxia GAA Trinucleotide Repeat. //Am J. Hum. Genet. 1997.-N 61.- P.101-110.
248. Montermini L., Andermann E., Labuda M. et al. The Friedrech ataxia GAA triplet repeat: permutation and normal alleles //Hum. Mol. Genet. 1997.- V. 6. -N0.8.-P. 1261-1266.
249. Mourant A.E., Kopec A.C. The distribution of the Human Blood Groups and Other Polymorphisms. London: Oxford University Press, 1976. - 1056 p.
250. Mueller R.F., Buckler J., Arthur R., Bonsor G., Dear P. et al. The 3-M syndrome: risk of intracerebral aneurism? // J.Med.-1992.- №29.- P. 425-427.
251. Muller T., Schoroder R., Zierz S. GCG repeats and phenotype in oculopharyngeal muscular dystrophy// Musce & Nerve.- 2001.- V. 24.- P. 120122.
252. Munitiz V., Ortiz A., Martinez de Haro L.F. et al. Diagnosis and treatment of oculopharyngeal dystrophy: A report of three cases from the same family //Diseases of the esophagus.- 2003.- V. 16-P. 160-164.
253. Myhailova V., Muller T., Petrova I. et al. Unique PABPN1 gene mutation in a large Bulgarian family with OPMD// J. Neurol. 2008,- 255.- P.- 609-611.
254. Nachtsheim H. The Pelger-anomaly in man and rabbit; a mendelian character of the nuclei of the leucocytes// J. Hered. 1950.- V. 41. - P. 131-137
255. Nagashima T., Kato H., Maguchi Y. et al. Oculopharyngeal muscular dystrophy (GCG) 11 in PABP2// Neuromusc. Disord. 2000,- V. 10. - P. 173-177.
256. Nakamoto M., Nakano S., Kawashima Sh. et al. Unequal crossing-over in unique PABP2 mutations in Japanese patients// Arch. Neurol. 2002. - V. 59. -p. 474-477.
257. Nakamura M., Ito S., Piao Ch-H. et al. Retinal and optic disc atrophy associated with a CACNA1F mutation in a Japanese family// Arch. Ophthalmol. 2003. -V.121.-P. 1028-1033.
258. Netchine 1., Sobrier M.L., Krude H. et al. Mutations in LHX3 result in a new syndrome revealed by combined pituitary hormone deficiency. //Nat. Genet. -2000.-V. 25. -P.182-186.
259. Norio R. Finnish Disease Heritage// Hum. Genet. 2003a. - V.l 12. - P.441-526.
260. Norio R. The Finnish disease heritage III: the individual diseases. // Hum. Genet. -2003b.-V. 112.- P.470-526.
261. Oneson R., Sabio H., Innes D.J. Acute lymphoblastic leukemia in a child with familial Pelger-Huet anomaly// Br. J. Haematol.- 1987.- V. 66.- P. 193-197.
262. Oosterwijk J.C., Mansour S., van Noort G. et al. Congenital abnormalities in Pelger Huet homozygosity as compared to Greenberg/HEM dysplasia: highly variable expression of allelic phenotypes // J. Med. Genet. - 2003.- V.40.- P. 937-941.
263. Ott J. Analysis of human genetic linkage. 2nd ed.- Baltimore: Johns Hopkins University Press.- 1991.
264. Otto S.P. Detection the form of selection from DNA sequence data // TIG. — 2000. V. 16. - № 12. - P. 526-529.
265. Pakendorf B., Wiebe V., Tarskaia L. et al. Mitochondrial DNA Evidence for Admixed Origins of Central Siberian Populations// Am. J. Phys. Anthropol.-2003.-V. 120.-P. 211-224.
266. Pakendorf B., Novgorodov I.N., Osakovskij V.L. andothers. Investigating the effects of prehistoric migrations in Siberia: genetic variation and the origins of Yakuts// Hum. Genet. 2006. - V.120. - P.334-53.
267. Palau F., Espinos C. Autosomal recessive cerebellar ataxias // Orphanet J. Rare Diseases.- 2006.- V. 1. -P. 47.
268. Pandolfo M. Molecualar basis of Friedreich ataxia/ZMovement Disorders. -2001. V. 16. - No. 5.- P. 815-821.
269. Pandolfo M. Friedreich ataxia /Arch. Neurol. 2008,- V. 65,- No. 10.- P. 12961303.
270. Pandolfo M., Montermini L. Prenatal diagnosis of Friedreich ataxia// Prenat. Diagn.- 1998.-V. 18.-P. 831-833.
271. Parks J.S., Brown M.R., Hurley D.L. et al. Heritable disorders of pituitary development// J. Clin. Endocrinol. Metab.- 1999.- V. 84.- P.4362-4370.
272. Parks JS, Brown MR: Transcription factors regulating pituitary development// Growth Horm. IGF Res.- 1999.- V. 9 (suppl B).- P.2-8.
273. Peltonen L. Identification of Disease genes in Genetic Isolates. //Methods: A companion to methods in Enzymology.-1996.- N9.- P. 129-135.
274. Peltonen L., Jalanko A., Varilo T. Molecular genetics of the Finnish disease heritage//Hum.Mol.Genet. 1999.- V.8, No.l0.-P.1913-1923.
275. Peltonen L., Varilo T. Isolates and their potential use in complex gene mapping efforts// Current Opinion in Genetics & Development.- 2004.- V. 14.- P.316-323.
276. Peltonen L., Perola M., Naukkarien J., Palotie A. Lessons from studying monogenic disease for common disease // Hum. Mol. Genet.- 2006.- V.15. -Review Issue 1. 67-74.
277. Perie S., Eymard B., Laccourreye L. andothers. Dysphagia in oculopharyngeal muscular dystrophy: a series of 22 French cases// Neuromusc. Disord.- 1997.- 7 (Suppl 1).- S96-S99.
278. Pianese L., Turano M., Gasale M.S. et al. // Real time PCR quantification of frataxin mRNA in the peripheral blood leucocytes of Friedreich ataxia patients and carriers // J. Neurol.Neurosurg Psychiatry. 2004.- V. 75.- P.1 1061-1063.
279. Pook M.A., Mahdawi^ S.A, Thomas N.H. et al. Identification of three novel fraimshift mutations in patients with Friedreich "s ataxia // J:Med.Genet.- 2000.-V.37.-P.1-5.
280. Preece M.A., Abu-Amero S.N., Ali Z. et al. An analysis of the distribution of hetero- and isodisomic regions of chromosome 7 in five mUPD7 Silver-Russell syndrome probands // J. Med .Genet.- 1999. -V. 36: -P. 457-460.
281. Price S.M., Stanhope R., Garrett C. et al. The spectrum of Silver-Russell syndrome: a clinical and molecular genetic study and new diagnostic criteria// J. Med. Genet. -1999.- V. 36. P.937-842.
282. Procter AM, Phillips JA III, Cooper DN: The molecular genetics of growth hormone deficiency// Hum. Genet.- 1998.- V. 103. -255-272.
283. Pueschel S.M. Growth, thyroid* function, and sexual maturation in Down syndrome//Growth,Genet. Horm.- 1990.- V. 6.- P.1-5-.
284. Rampersaud E., Scott W.K., Hauser E.R., Speer M.C. Potential for expanded power in linkage studies using the ALLEGRO and MERLIN software programs // J. Med; Genet. 2005.42.- doi: 10.1136/img.2005.-32029.
285. Ranke M.B. The KIGS etiology classification,system. //RankeMB, Gunnarsson R (eds): Progress in Growth Hormone Therapy 5 Years, of KIGS. Mannheim, J&J Verlag.- 1994.- P. 51-61.
286. Rappold G., Blum W.F., Shavrikova E.P. et al. Genotype and phenotypes in children, with short stature: clinical indicators of SHOX haploinsufficiency //J.Med:Genet. -2007.- N44.-P.306-313.
287. Ribai P., Pousset F., Tangay M.-L. et al. Neurological., cardiological, and oculomotor progression in 104 patients with Friedreich ataxia during long-term follow-up // Arch. Neurol. 2007.- V. 64.- P. 558-564.
288. Ridanpaa M, van Eenennaam H, Pelin K. et al. Mutations in the RNA Component of RNase MRP Couse a Pleiotropic Human Disease, Cartilage-Hair Hypoplasia// Cell.- 2001. -V.104. P. 195-203.
289. Riordan J.R, Rommens J.M, Kerem B.S. et al. Identification of the cystic fibrosis gene: cloning and characterization of complementary DNA// Science.-1989.- V. 245.- P.1066-1073.
290. Risch N, de Leon D, Ozelius L. et al. Genetic analyses of idiopathic torsion dystonia in Ashkenazi Jews and their recent descent from a small founder population // Nat. Genet.- 1995.- V. 9.- P. 152-159.
291. Rivera D, Mejia-Lopez H, Pompa-Mera E.N. et al. Two different PABPN1 expanded alleles in a Mexican population with oculopharyngeal muscular dystrophy arising from independent founder effects // Brit. J. Ophtalm. -2008. -V.98.-P. 998-1002.
292. Robinson D.O, Wills A.J, Hammans S.R. et al. Oculopharyngeal muscular dystrophy: a point mutation with mimics the effect of the PABPN1 gene triplet repeat expansion// J.Med. Genet.- 2006.- V. 43.- P.23-24.
293. Rodriguez M, Camejo C, Bertoni B. et al. (GCG)11 founder mutation in the PABPN1 gene of OPMD Uruguayan families// Neuromusc. Disord. -2005. -V. 15.- P.185-190.
294. Russell A. A syndrome of intra-uterine-dwarfism recognizable at birth with cranio-facial dysostosis, disproportionate short arms, and other anomalies (5 examples)// Proc. Roy. Soc. Med.- 1954.- V. 47.- P. 1040-1044.
295. Ruegg S, Hagen M.l, Hobl U. et al. Oculopharyngeal muscular dystrophy an under-diagnosed disorder? //Swiss Med. Wily.- 2005.- V. 135.- P.574-586.
296. Scacheri P.S., Garcia C., Hebert R., Hoffman E.P. Unique PABP2 mutations in «Cajuns» suggest multiple founders of Oculopharyngeal muscular Dystrophy in populations with French ancestry// Am. J. Med. Gen.- 1999.-V. 86.- P. 477-481.
297. Schiller S., Spranger S., Schcchinger B. et al. Phenotypic variation and genetic heterogeneity in Leri-Weill syndrome// Eur. J. Hum. Genet.- 2000.- V.8.- P.54-62.
298. Schinzcl A.A., Robinson W.P., Binkert F. et al. Exclusively paternal X chromosomes in a girl with short stature// Hum.Genet.- 1993.-V. 92. -P. 175178.
299. Schmidt B.J., Greenberg C.R., Allingham-Hawkins D.J., Spriggs EL. Expression of X-linked bulbospinal muscular atrophy (Kennedy disease) in two homozygous women // Neurology. -2002.-V.59 (5). P. 770-772.
300. Schober R., Kreb W., Grahmann F. et al. Unusual triplet expansion associated with neurogenic changes in a family with oculopharyngeal muscular dystrophy //Neurophathology.- 2001.- V. 21.- P. 45-52.
301. Schooneveld M.J., Went L.N. Oosterhuis J.A. Dominant cone dystrophy starting with blue cone involvement// Brit. J. Ophtalmol. 1991.- V. 15.- P. 332-336.
302. Scott E.M. The relation of diaphorase of human erythrocytes to inheritance of methemoglobinemia // J.Clin.Invest. 1960. -V.3039.- P. 1176-1179.
303. Scott D.K., Board J.R., Lu X. et al. The neuroblastoma amplified gene, NAG: genomic structure and characterisation of the 7.3 kb transcript predominantly expressed in neuroblastoma// Gene.- 2003.- V. 307. P. 1-11.
304. Scriver Ch.R. Human Genetics: Lessons from Quebec populations // Ann.Rev.Genomics Hum.Genet.- 2001,- V.2. -P.69-101.
305. Seffield V.C., Stone E.M., Carmi R. Use of isolated inbred human population for identification of disease genes // TIG. 1998. - V. 14, № 10. - P. 391-396.
306. Seielstad M. Asymmetries in the maternal and paternal genetic histories of Colombian populations // Am. J. Hum. Genet. 2000. - V. 67. - P. 1062-1066.
307. Silver H. K., Kiyasu W., George J., Deamer W.C. Syndrome of congenital he-mihypertrophy, shortness of stature, and' elevated- urinary gonadotropins // Pediatrics. 1953.- V. 12. P. 368-376.
308. Shultz L.D., Lyons B.L., Burzenski L.M. et al. Mutations at the mouse ichthyosis locus are within the lamin B receptor gene: a single*gene model3 for human Pelger-Huet anomaly// Hum. Mol. Genet.- 2003. V. 12.- P. 61-69.
309. Sluijs B M:, Engelen B.G.M., Hoefsloot L.H. Oculopharyngeal Muscular Dystrophy (OPMD) Due to a Small Duplication in the PABPN1 gene// Human Mutation.- 2003.- 609.- online.
310. Slatkin M. and Rannala B. Estimating allele age //Annu. Rev. Genomics Hum. Genet. 2000! -V. 1.-P. 225-49:
311. Sluijs B: M., Hoefsloot L.H., Padberg G.W. et al. Oculopharyngeal muscular dystrophy with limb girdle weakness as major complaint// J. Neurol.- 2003. — V.250:- P. 1307-1312.
312. Smith A., Jauch A., Slater H. et al. Syndromal obesity due to paternal duplication 6(q24.3-q27) //Am. J. Med. Genet.- 1999.- V. 84.- P. 125-131.
313. Spranger J., Opitz J.M., Nourmand A. A new familial intrauterine growth retardation syndrome the "3 M syndrome" //Eur. J1. Pediatr. -1976.-№123.- P. 115-124:
314. Strachan T., Read A.P. Human Molecular genetics / Tom Strachan, Andew P.Read:- 3rd edl 2004.- 674 p.
315. Sulek A., Hoffman-Zacharska D., Krysa W. et al. CAG.repeat polymorphism in the androgen receptor (AR) gene of SBMA patients and control group// J. Appl. Genet. 2005. - V.46.- P. 237-239.
316. Sousa S;B., Russell EggittL, Hall Ch. et al. Further delineation of spondylome-taphyseal dysplasia with cone-rod dystrophy//Am. J. Med. Genet. — 2008.- 146 A(24).-P. 3186-3194.
317. Sulisalo T., Sistonen P., Hastbacka J. and othser. Cartilage-hair hypoplasia gene assigned to chromosome 9 by linkage analysis// Nat Genet.-1993.-V. 3.- P. 338341.
318. Superti-Furga A., Bonafe L., Rimoin D.L. Molecular-pathogenetic classification of genetic disorders of the skeleton // Am. J. Medl Genet.- 2001. V. 106 (4). -P.282-93.
319. Superti Furga A., Unger Sh. Nosology Group of the International Skeletal Dysplasia Society. Nosology and classification of genetic skeletal disorders: 2006 revision// Am. J. Med. Genet. - 2007. - Part A, 143A.- P. 1-18.
320. Swart B., Sluijs B., Vos A. et al. Ptosis aggravates dysphagia in oculopharyngeal muscular dystrophy // J.Neurol Neurosurg. Psychiatry.- 2006.- V.77.- P. 266268.
321. Tanner J.M., Whitehouse R. Clinical longitudinal standarts for height, weight, height velocity, and the stages of puberty.// Archives of Disease in Childhood.-1976. -V.51.- P.170-179.
322. Taybi H., Lachman R.S. Radiology of syndromes, metabolic disorders, and skeletal dysplasias. St. Louis: Mosby-Year Book, 1996. - 250 p.
323. Temple I.K., Cockwell A., Hassold T. et al. Maternal uniparental disomy for chromosome 14// J. Med. Genet.- 1991.- V.28.- P.511-514.
324. Temtamy S.A., Aglan M.S., Ashour A.M. et al. 3-M syndrome: a report of three Egyptian cases with review of the literature// Clin. Dysmorphol. -2006. -V.15. -P.55-64.
325. Tills D., Kopec A.C., Tills R.E. The distributions of the human blood groups and other polymorphism. Supplement 1.- Oxford, New-York, Toronto: Oxford University Press, 1983. 343 p.
326. Tome F.M.S., Fardeu M. Nuclear inclusions in oculopharyngeal dystrophy// Acta Neuropathol (Berlin) .- 1980.- V.49.- P.85-87.
327. Udd B.; Juvonen V.; Hakamies L.; and others. High prevalence of Kennedy's ' disease in western Finland: is the syndrome underdiagnosed? // Acta Neurol.
328. Scand.- 1998.-V. 98,-P. 128-133.
329. Usui T., Tanimoto N., Takagi M. et al. Rod and cone a-waves in three cases of Bietti crystalline chorioretinal dystrophy// Am. J. of Ophthalm.- 2001.- V.132.-P.395-402.
330. Uyama E., Nohira O., Tome F.M.S. et al. Oculopharyngeal muscular destrophy in Japan//Neuromusc.Disord.- 1997.-7 (Suppl 1).- S41-49.
331. Uyama E., Tsukahara T., Goto K.M. et al. Nuclear accumulation of expanded PABP2 gene product in oculopharyngeal muscular dystrophy// Muscle & Nerve.- 2000.-V. 23.-P. 1549-1554.
332. Uyama E., .Uchino M., Chateau D., Tome F.M.S. Autosomal recessive oculopharyngeal myopathy in light of distal myopathy with rimmed vacuoles and oculopharyngeal muscular dystrophy// Neuromusc. Disord.- 1998.- V. 8. -P.l 19-125.
333. Vallance H., Ford J. Carrier Testing for autosomal recessive disorders // Crit. Rev. Clin. Lab. Sci.- 2003. - V.40(4). - P.473-497.
334. Van der Wal G., Otten B.J., Brunner H.G., Van der Burgt I. 3 M syndrome: description of six new patients with review of the literature// Clin. Dysmorphol. -2001.-№10.-P. 241-252.
335. Van Goethem H., Malvaux P. The 3-M syndrome. A heritable birthweight dwarfism // Helv.Paediatr Acta. 1987.- V. 42.- P. 159-165.
336. Verkerk A.J. Identification of a gene (FMR-1) contacting a GCG repeat coincident with a breakpoint cluster region exhibiting length variation in fragile X syndrome// Cell. -1991.- V.65.- P.905-914.
337. Victor M., Hayes R., Adams R.D. Oculopharyngeal muscular dystrophy. A Familial Disease of Late Life characterized y Dysphagia and Progressive Ptosis of the Eyelids// The New Engl. J. Med. 1962. -V. 267. - P. 1267-1272.
338. Visapaa Г. Molecular genetics of the GRACILE syndrome (Growth Retardation, Aminoaciduria, Cholestasis, Iron overload; Lactacidosis and Early death)// Academic Dissertation-Helsinki, 2002.-No. 19.- 86 p.
339. Woods K.A., Oamacho-Hubner C., Savage M.O:, Dark A.J. Intrauterine growth retardation,and postnatal growth failure associated'with deletion of the insulinlike growth factor I gene// N. Engh J. Med.- 1996. -V.335.- P.1363-1367.
340. Wright A.F., Carother A.D., Pirastu Mi Population choice in mapping genes for complex diseases // Nat. Genet. 1999.' - V. 23. - P: 397-404.
341. Wu Hi, Cowing J.A., Michaelides M. et ah Mutations in the gene KCNV2 encoding a voltage-gated potassume channel subunit cause 'cone dystrophy with supernormal rodelectroretinogram" in humans// Am. J. Hum. Genet. 2006.- V. 79.- P. 574-579.
342. Yamada M., Sato T., Tsuji Sh:, Takahashi H. CAG repeat disorder models and human neuropathology: similarities and differences //Acta Neuropathol. 2008.-115.-P. 71-86.
343. Yang Z., Chang, Y.-J., Yu I.-C. et ah ASC-J9 ameliorates spinal" and bulbar muscular* atrophy phenotype via degradation of androgen receptor. // Nature Med. -2007.- V. 13:.- P. 348-353.
344. Online Mendelian Inheritance in Man, OMIM (TM) (ноябрь 2008) URL: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/oniim/
345. UCSC Genome Browser on Human May 2004, URL:http://genome.ucsc.edu/index.html
346. Marshfield linkage map, URL: http://research.marshfieldclinic.org/genetics/
347. GeneBank, URL: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Genbank/
348. ClustalW, URL: http://www.ebi.ac.uk/Tools/clustalw/
349. GeneDoc, URL: http://www.nrbsc.orGfx/genedoc/index.html
350. NCBI, URL: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/UniGene/
351. S.O.U.R.C.E, URL: http://source.stanford.edu/cgi-bin/source/sourceSearch
352. ПРОТОКОЛ РЕГИСТРАЦИИ ОКУЛОФАРИНГЕАЛЬНОЙ МИОДИСТРОФИИ
353. НомерНачало наблюдения «»200г.1. ФамилияИмяОтчество
354. Год рожденияВозрастПол:М Ж №ДНК
355. Место рождения: (район, город)Село
356. Место жительство: (район, город)Село1. Этническое происхождение1. ОбразованиеПрофессия1. Место работы1. Перенесенные заболевания
357. Семейное положение: женат/замужем холост/не замужем
358. Возраст вступления в бракКакой по счету бракРодственный брак: да, нет
359. Для женщин: возраст начала менструального циклавозраст окончания
360. Возраст рождения первого ребенкаВозраст рождения последнего ребенка
361. Число беременностей -родов -мед/аборт -с/аборт (выкидыш)1. Внем/берем.- ж/рм/р1. Анамнез заболевания1. Жалобы:
362. Начало болезни слет. Первые проявления1. Кем направлен1. Направительный диагноз:
363. Диагноз ОФМД выставлен вгоду в возрастелет1. Инвалидностьгруппы сгода1. Тип наследования:
364. Показатель Возраст начала Прогрессирование1. Птоз 1. Дисфагия 1. Дизартрия
365. Слабость проксимальных отделов рук
366. Слабость проксимальных отделов ног1. Передвигается с трудом
367. Передвигается с тросточкой1. Самостоятельно не ходит
368. Операция по пластике верхнего века ( год операции):1.I Фенотип1. Вес
369. РостКонституцияТелосложение1. Кожные покровы1. Продолжение приложения 11. ГоловаЛицо1. ГлазаЗрение
370. Уши: размер, форма, локализация
371. СлухРот: наруж. аномалиивнутренние
372. Зубы: аномалииШея: формааномалии1. Грудь: формадеформации
373. Сердце: аускультативные изменения1. Живот:
374. Верхние конечности: ограничение подвижности1. Деформации^
375. Нижние конечности: ограничение подвижности1. Деформации1. Признаки болезни1. Гипо-, атрофии мышц:
376. Группы мышц Характеристика1. Мимическая мускулатура
377. Мышцы шеи, грудино-ключично-сосцевидные1. Мышцы верхнего пояса1. Проксимальная группа в\к1. Дистальная группа в\к1. Мышцы туловища1. Мышцы тазового пояса1. Проксимальная группа н\к1. Дистальная группа н\к2. Мышечная сила:
378. Сила кистей сжимать три пальца исследователя кистью
379. Сила всей руки высвобождение сжатых 2 пальцев исследователя
380. Сила мышц бедра встать после глубокого приседания
381. Сила мышц голени и стопы — пройтись на пятках, на носках1. Показатель Баллы1. Dextra Sinistra
382. Сила кисти (по динамометру)
383. Сила проксимальных отделов верхних конечностей
384. Сила мышц проксимальных отделов нижних конечностей
385. Сила мышц дистальных отделов нижних конечностей1. Другие группы мышц
386. С рук: -карпорадиальные -бицепсы -трицепсы1. Коленные1. Ахилловы
387. Другие невральные и экстраневральные проявления:
388. Есть(+), Нет(-) Примечание
389. Офтальмологические — птоз -наружная офтальмоплегия другие
390. Дисфония гнусавость - малоразборчивость
391. Дисфагня подвижность дужек мягкого неба при фонации - поперхивание - глоточный рефлекс
392. Сердечно-сосудистые кардиалгии сердцебиение отеки одышка АД
393. Костно- суставные высокое небо другие- общая слабость утомляемость 5. Чувствительные нарушения6. Походка
394. У Лабораторные и инструментальные исследования:
395. Биохимические исследования:1. Дата проведения
396. Норма Значение Значение Значение примечания1. КФК лдг 1,33-7,5 1. АлАТ 0,1-0,68 1. АсАТ 0,1-0,46 1. Сахар 3,5-6,3 1. Общ.белок 60-80 1. Креатинин 0,053-0,097 1. Лактат/пирув ат
397. Функциональные методы: Электромиография:1. ЭКГ:1. ЭхоКГ:1. УЗИ абдоминальное:
398. VI Консультации специалистов:1. Консультация окулиста:
399. Консультация нейрогенетика:1. VII. ДНК анализ: №ДНК1. Дата Где Результат1. Сиквенирование (Оепевсап) 1. Прямое сиквенирование 1. ПЦР-анализ 1. Гаплотипирование
400. VIII. Генеалогический анамнез:1. Родословная:1. Родители пробанда:1. Мать Отец1. Ф.И.О. (девичья) 1. Год рождения 1. Национальность
401. Место жительства (район, город, село)1. Состояние здоровья 1. Наличие ОФМД 1. Возраст смерти, причина 1. Родители родителей:1. Матери Отца
402. Бабушка Дедушка Бабушка Дедушка1. Ф.И.О. (девичья) 1. Национальность
403. Место рождения (район, город, село)
404. Место жительства (район, город, село)1. Состояние здоровья 1. Наличие ОФМД 1. Возраст смерти, причина 1. Сибсы:
405. Год рожд. Имя №ДНК Место жительства Сем. положение Сост. здоровья
- Максимова, Надежда Романовна
- доктора медицинских наук
- Томск, 2009
- ВАК 03.00.15
- Биоэтические проблемы применения ДНК-диагностики моногенных заболеваний в практике медико-генетической консультации Якутии
- Окулофарингеальная миодистрофия и вариабельность локуса ОФМД в популяциях Якутии
- Генетическая эпидемиология моногенных болезней нервной системы у населения Ростовской области
- Моделирование распространенности спиноцеребеллярной атаксии I типа в зависимости от особенностей генетико-демографических процессов в якутских популяциях
- Молекулярно-генетическая природа наследственной метгемоглобинемии