Бесплатный автореферат и диссертация по биологии на тему
Изучение структуры и молекулярного механизма сокращения чехла бактериофага Т4
ВАК РФ 03.00.04, Биохимия
Содержание диссертации, кандидата биологических наук, Серышева, Ирина Ивановна
ВВЕДЕНИЕ
ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
I. СТРУКТУРА БАКТЕРИОФАГА Т4 И ОСНОВНЫЕ ЗАКОНОМЕРНОСТИ ЕГО СБОРКИ
1. Структурная организация и функции компонентов частицы фага Т
2. Основные принципы и закономерности морфогенеза бактериофага Т4.
П. МОРФОГЕНЕЗ ХВОСТОВОГО ОТРОСТКА БАКТЕРИОФАГА Т
1. Морфогенез базальной пластинки
2. Сборка хвостового стержня и чехла
Ш. СТРУКТУРА И ФИЗИКО-ХИМИЧЕСКИЕ СВОЙСТВА СТЕРЖНЯ БАКТЕРИОФАГА Т4.
17. ХВОСТОВОЙ ЧЕХОЛ БАКТЕРИОФАГА Т4 КАК ПРОСТЕЙШАЯ СОКРАТИТЕЛЬНАЯ СИСТЕМА
1. Физико-химические и агрегационные свойства белка хвостовых чехлов.
2. Молекулярная организация хвостового чехла
3. Молекулярный механизм сокращения хвостового чехла
ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ.
I. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЙ
1. Штаммы бактериальных культур и бактериофагов
2. Среды для культивирования бактерий и бактериофагов
3. Выращивание и очистка бактериофагов.
4. Определение титра фага
5. Выделение хвостов бактериофага Т
6. Получение чехольного белка бактериофага Т4 в мономерном состоянии.
7. Очистка "вил".
8. Комплементация in vitro.
9. Выделение и очистка сокращенных чехлов
10. Электрофорез в полиакриламидном геле в присутствии додецилсульфата натрия.
11. Аминокислотный анализ
12. Аналитическое ультрацентрифугирование
13. Аналитическое изоэлектрофокусирование в полиакриламидном геле.
14. Экстракция связанных с белком нуклеозидтрифосфатов
15. Тонкослойная хроматография.
16. Метод кругового дихроизма
17. Оптическая дифракция электронномикроскопических изображений
18. Спектрофотометрические измерения
19. Метод электронной микроскопии
20. Определение концентрации белка
21. Определение общего фосфора
П. РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЙ
1. Выделение и очистка продукта гена 18.
A. Получение и очистка хвостов фага Т
Б. Получение и очистка мономера пг18.
B. Проверка биологической активности препарата чехольного белка.
2. Физико-химические характеристики чехольного белка
A. Определение молекулярной массы пг
Б. Изучение аминокислотного состава пг18.
B. Определение изоэлектрической точки пг18 . 82 Г. Агрегационные свойства чехольного белка фага Т
3. Определение нуклеозидтрифосфата, связанного с чехольным белком.
А. Идентификация связанного нуклеотида
Б. Определение количественного соотношения между пг18 и нуклеотидом.
4. Изучение молекулярной организации изомерных форм чехольного белка методом оптической дифракции
5. Сравнительное изучение спектральных характеристик мономера пг18 и его полимеризационных форм
А. Измерение поглощения изомерных форм чехольного белка в ультрафиолетовой области
Б. Изучение структурных перестроек чехольного белка при полимеризации и в процессе сокращения
ОБСУЖДЕНИЕ
ВЫВОДЫ
Принятые сокращения
Введение Диссертация по биологии, на тему "Изучение структуры и молекулярного механизма сокращения чехла бактериофага Т4"
Актуальность проблемы. Изучение механизмов генетического детерминирования формы и размеров сложных надмолекулярных биологических структур, процессов их сборки и структурной организации представляет собой один из самых привлекательных разделов современной молекулярной биологии. Классической моделью для исследования на молекулярном уровне процессов морфогенеза является бактериофаг Т4. Этот сложноустроенный вирус состоит из трех основных структурных компонентов: головки, в которой хранится двухцепочечная молекула ДНК; длинных хвостовых фибрилл, ответственных за специфическое узнавание клетки-хозяина, и хвостового отростка, обеспечивающего введение генетической информации фага в бактерию. Сборка этих компонентов частицы фага Т4 осуществляется независимо и находится под контролем дополнительных регуляторных факторов как вирусной, так и клеточной природы (II, 161).
Особый интерес для решения фундаментальных проблем морфогенеза и функционирования надмолекулярных структур представляет хвост бактериофага Т4. Хвостовой отросток состоит из гексагональной базальной пластинки, к вершинам которой прикрепляются длинные хвостовые фибриллы; стержня и сократительного чехла. В формировании хвоста принимает участие 21 ген фага (109). Хвостовой отросток обладает метастабильной структурой, которая в процессе инфекции подвергается ряду последовательных перестроек (75, 137, 138). Взаимодействие длинных хвостовых фибрилл с липополисахаридными рецепторами приводит к разворачиванию коротких хвостовых фибрилл и необратимому связыванию их с другим бактериальным рецептором. После этого происходит трансформация базальной пластинки из гексагональной формы в шестилучевую звезду, сокращается чехол и ДНК фага вводится в клетку.
Сократительный чехол фага Т4 представляет собой простейшую однокомпонентную двигательную систему, состоящую из белковых молекул одного типа. Чехол построен из 144 субъединиц продукта гена 18 с молекулярной массой 70 ООО (115, 150). В процессе сокращения чехла его длина уменьшается от 950 £ до 380 2, а диаметр увеличивается на 30$ (35). Сокращение чехла характеризуется необратимостью и отсутствием экзогенного источника энергии.
Детальное изучение молекулярного механизма сокращения хвостового чехла имеет фундаментальный характер и очень важно для понимания функционирования других более сложноорганизованных двигательных систем.
Цель и задачи работы. Настоящая работа была направлена на изучение структуры чехольного белка и молекулярного механизма процесса сокращения хвостового чехла бактериофага Т4. Основными задачами исследования были:
1. Выделить в мономерном и биологически активном состоянии продукт гена 18, изучить его физико-химические и агрегационные свойства.
2. Определить характер упаковки субъединиц чехольного белка в аберрантных формах чехла и в сокращенном чехле.
3. Изучить возможность конформационных перестроек чехольного белка в процессе его полимеризации и при сокращении чехла.
Научная новизна и практическая ценность -работы. Впервые установлено, что в интактном состоянии кадцая субъединица чехольного белка связана с одной молекулой гуанозинтрифосфата. Показано, что при полимеризации продукта гена 18 в условиях in vitro с образованием спиралей вторичная структура белка остается практически без изменения. Обнаружено уменьшение сС -спиральной структуры в белке при сокращении чехла, что обусловлено переходом части сС -спиральных участков в -форму и неупорядоченную структуру. Впервые показано, что чехольный белок может находиться в трех различных конформадионных состояниях, которые характерны для мономера, поличехлов и сокращенных чехлов. Методом оптической дифракции изучен характер упаковки субъединиц чехольного белка в аберрантных формах чехла и в сокращенном чехле.
Полученные важные результаты о структурных перестройках в сократительном беже в процессе его функционирования расширяют наши представления о молекулярных механизмах движения. Результаты данного исследования могут найти применение в фундаменталь -ных разработках научно-исследовательских институтов АН СССР и АМН СССР.
Структура и объем диссертации. Диссертационная работа состоит из введения, обзора литературы, экспериментальной части, результатов исследований, их обсуждения, выводов и списка цитируемой литературы (169 источников). Диссертация изложена на 152 страницах машинописного текста, содержит 36 рисунков и 5 таблиц.
Заключение Диссертация по теме "Биохимия", Серышева, Ирина Ивановна
ВЫВОДЫ
1. Выделен в электрофоретически гомогенном и биологически активном состоянии мономер чехольного белка бактериофага Т4. Предложена методика выделения пг18, которая позволяет, в 2-3 раза увеличить конечный выход белка, по сравнению с ранее описанными способами.
2. Изучены физико-химические свойства пг18. Определены его аминокислотный состав, молекулярная масса, константа седиментации, изоэлектрическая точка.
3. Подобраны условия образования аберрантных полимеризационных форм пг18 - спиралей и поличехлов. Показано, что образование поличехлов происходит через стадию ленточных спиралей. Обсуждается возможность динамического равновесия в клетке между мономером пг18, поличехлами и растянутыми чехлами.
4. Показано наличие гуанозинтрифосфата, связанного в эквимоляр-ном соотношении с субъединицами чехла фага Т4.
5. Методом оптической дифракции изучена структурная организация, сокращенных чехлов, поличехлов и спиралей. Установлена идентичность молекулярной организации изолированных сокращенных чехлов и чехлов сокращенных в составе целого фага под действием клеточных рецепторов.
6. Определены коэффициенты экстинкции всех изомерных форм пг18.
7. Из спектров кругового дихроизма рассчитано содержание элементов вторичной структуры в мономере пг18, спиралях, поличехлах и сокращенных чехлах. Показано, что при сокращении чехла происходит изменение вторичной структуры пг18, выражающееся в уменьшении на 14% с£-спиральной конформации и возрастании доли неупорядоченной структуры и jb -формы.
Считаю своим приятным долгом выразить глубокую благодарность своему научному руководителю - доктору биологических наук, профессору Б.Ф.Поглазову за постоянное внимание и руководство моей работой.
Выражаю искреннюю благодарность кандидату физико-математических наук Веньяминову С.Ю. и кандидатам биологических наук Родиковой Л.П. и Селиванову Н.А. за всестороннюю помощь и ценные советы в работе.
Благодарю всех сотрудников отдела функциональной биохимии биополимеров Межфакультетской проблемной НИЛ им. А.Н.Белозерского МГУ и сотрудников лаборатории молекулярной организации биологических структур Института биохимии им. А.Н.Баха АН СССР за поддержку и помощь, оказанную при выполнении работы. пг
НТФ
ПААГ
ДОС натрия
ЭДТА
М.м.
Принятые сокращения продукт гена нуклеозидтрифосфат полиакриламидный гель додецилсульфат натрия этилецциаминтетраацетат молекулярная масса
Библиография Диссертация по биологии, кандидата биологических наук, Серышева, Ирина Ивановна, Москва
1. Адаме М. 1961. Бактериофаги. М., "Мир".
2. Алимов Г.А., А.И.Китайгородский, Е.М.Белавцева, Б.Ф.Поглазов. 1968. О кинетике образования цепочек хвостовых чехлов фага Т2.- Биохимия, 33, № 2, с. 203-213.
3. Бейли Д. 1965. Методы белковой химии. М., "Мир".
4. Борхсениус С.Н., Е.М.Белавцева, Б.Ф.Поглазов. 1966. Начальные этапы агрегации хвостовых чехлов фага Т2. Докл. АН СССР,166, № 2, с. 476-479.
5. ГендонЮ.З., Б.Ф.Поглазов, Т.И.Тихоненко. 1975. Нуклеиновые кислоты и белки вирионов. М., "Наука", с. 124.
6. Иваницкий Г.Р., А.С.Куниский. 1981. Исследование микроструктуры объектов методами когерентной оптики.- М., "Наука",с. 60.
7. Киселев Н.А., Б.Ф.Поглазов. 1964. Молекулярная организация хвостового чехла фага Т2. Докл. АН СССР, 155, 1Ь 2, с.442-444.
8. Косоуров Г.И., Б.Ф.Поглазов, Т.И.Никольская. 1970. Молекулярная организация хвостового стержня бактериофага Т2. Биохимия, 35, № 2, с. 419-421.
9. Куниский А.С., Б.Ф.Поглазов, А.И.Туркин. 1979. Трехмерная организация пиоцина Rl . Докл. АН СССР, 247, № 2, с.1272-1274.
10. Поглазов Б.Ф. 1965. Структура и функции сократительных белков.- М., "Наука".
11. Поглазов Б.Ф. 1977. Закономерности сборки биологических структур. М., "Наука".
12. Поглазов Б.Ф., С.Н.Борхсениус, Н.А.Белозерская, Е.М.Белавцева. 1966. Изучение агрегации хвостовых чехлов фага Т2,-Биохимия, 31. ^ 2, с. 348-354.
13. Поглазов Б.Ф., С.Н.Борхсениус. 1964. Кристаллизация хвостовых чехлов бактериофага Т2. Биофизика, 9, № 3, с. 388-389.
14. Поглазов Б.Ф., Т.И.Никольская. 1967. Дальнейшее изучение самосборки хвостовых чехлов фага Т2. Биохимия, 32, № 5, с. I079-1083.
15. Поглазов Б.Ф., А.С.Тихоненко. 1963. Изучение свойств сократительного белка фага Т2.- Биохимия, 28, № 2, с. 288-294.
16. Селиванов Н.А., Н.Л.Голицина, О.С.Рустембеков, В.В.Месянжи-нов. 1981. Регуляция сборки и прикрепления фибрилл бактериофага Т4. -Докл. АН СССР, 260, № 5, с. 1262-1265.
17. Тихоненко А.С.» Н.Н.Беляева. 1968. "Полимеризация" стержневого белка отростка фага Т2.- Докл. АН СССР, 183, № 3,с. 722-724.
18. Тихоненко А.С., Б.Ф.Поглазов. 1962. Аденозинтрифосфатазная активность различных фагов. -Докл.АН СССР, 145, J£ I,с. 218-221.
19. J.Supramol.Structure, 2, N 1,p. 253-275.
20. Amos L.A., A.Klug. 1975. Three-dimensional image reconstructions of the contractile tail of T4 bacteriophage. -J.Mol., Biol., N 1, p. 51-73.
21. Anderson T.F. 1963. XVII Sympos. Fundamental Cancer.Res., Abstr., p.8-9.
22. Arisaka F., J.Tschopp, R.van Driel, J.Engel. 1979. Reassem -bly of the bacteriophage T4 tail from the core-baseplate and the monomeric sheath protein P18 : a cooperative association process. J.Mol.Biol., N 3, p. 369-386, 132.
23. Arscott P.G., E.Goldberg. 1976. Cooperative action of the T4 tail fibers and baseplate in triggering conformational change and in determining host range. Virology, 6£, N 1, p. 15-21.
24. Benz W.C., E.B.Goldberg. 1973. Interactions between modified phage T4 particles and spheroplasts. Virology, 25» N 1, p.225-235.
25. Berger J.E, 1969. Optical difraction studies of crystalline structures in electron micrographs. I. Theoretical considerations. J.Cell.Biol., 4j}, N 3, p. 442-447.
26. Berget P.B., J.King. 1978. Isolation and characterization of precursors in T4 baseplate assembly. The complex of gene 10 and gene 11 products. J.Mol.Biol., 124. IT 3, p. 469486.
27. Bishop R.J., M.P.Conley, W.B.V/ood. 1974. Assembly and attachment of bacteriophage T4 tail fibers. J.Supramol.
28. Struct., 2, N 1, p. 196-205.
29. Bradley D,E. 1963. The structure of coliphages. J.Gen. Microbiol., 21t N 3, p. 435-445.
30. Branton D., A.IClug. 1975* Gapsid geometry of bacteriophage T2 : a freeze-etching study. J.Mol.Biol., £2, N 4, p. 559565.
31. Brenner s., R.W.Horne. 1959. Л negative staining method for high resolution electron microscopy of viruses. Biochim. et Biophys.Acta, 34, N 1, p. 103-110.
32. Brenner S, , G.Streisenger, R.V/.Horne, S.P.Champe, L.Barnett, S.Benzer, M.W.Rees. 1959. Structural components of bacteriophage. J.Mol.Biol., 1, II 1, p. 281-294.
33. Caspar D.L.1980. Movement and self-control in protein assemblies. Quasi-efceivalence revisited. Biophys.J. , ^32, N 1, p. 103-135.
34. Coombs D.H., F.A.Eiserling. 1977. Studies on the structure protein composition and assembly of the neck of bacteriophage T4. J.Mol.Biol., Ц6, N 3, p. 375-405.
35. Crick F.H.C., J.D.Watson. 1957. Virus structure : general principles. In G.E.W,Wolstenholme and E.C.P. Millar (eds.), The Nature of Viruses, p. 5-13 ( Ciba Foundation Symposium), London.
36. Crawford J.T., E.B.Goldberg. 1980. The function of tail fibers in triggering baseplate expansion of bacteriophage T4. -J.Mol.Biol., 122, N4, p. 679-690.
37. Crowther R.A., E.V.Lenk, Y.Kikuchi, J.King. 1977. Molecular reorganization in the hexagon to star-transition of the baseplate of bacteriophage T4. J.Mol.Biol., Tj6t 1J3, p.489-523.
38. Cummings D.J., A.R.Kusy, V.A.Chapman, S.S.De Long, K.R.Stone. 1970, Characterization of T-even bacteriophage substructures. I. Tail fibers and tail tubes. J.Virol,, 6, U 4, p. 534-544.
39. De Rosier D.J,, A.Klug. 1968. Reconstruction of the three dimentional structures from electron micrographs. Nature, 217, И 5124, p. 130-134.
40. Dickson R.C. 1973. Assembly of bacteriophages T4 tail fibers. IV. Subunit composition of tail fibers and fiber precursors. J.Mol.Biol., 79, IT 4, p. 633-647.
41. Dickson R.C. 1974. Protein composition of the tail and contracted sheath of bacteriophage T4. Virology, IT f, p. 123-138.
42. Dickson R.C., S.L.Barnes, F.A.Eiserling. 1970. Structural proteins of bacteriophage T4. J.Mol.Biol., N 3, p.461-473.
43. Dukes P.P., L.M.Kozloff. 1959. Phosphatases in bacteriophages T2, T4 and T5« J.Mol.Biol., 234, К 3, p. 534-538.
44. Earnshaw W.C., E.B.Goldberg, R.A.Crowther. 1979. The dis -tal half of the tail fiber of bacteriophage T4. Rigidly linked domains and cross- -structure. J.Mol.Biol.,132. N 1 , p. 101-131.
45. Edgar R.S., I.Lielausis. 1968. Some steps in the assembly of bacteriophage 14. J.Mol.Biol., J32, N 1, p. 263-271.
46. Edgar R.S., W.B.Wood. 1966. Morphogenesis of bacteriophage T4 in extracts of mutant-infected cells. Proc.Nat.Acad. Sci.USA, N 1, p. 498-505.
47. Eiserling F.A. 1967. The structure of bacillus bacterio -phage PBS 1. J.Ultrastr.Res., Ц, N 3-4, p. 342-347.
48. Epstein R.H., A.Bolle, C.M.Steinberg, E.Kellenberger, E. Boy de la Tour, R.Chevalley. 1963. Physiological studies of conditional lethal mutants of bacteriophage T4D. -Cold.Spr.Harb.Symp.Quant.Biol., 28, p. 375-394.
49. Georgopoulos C.P., R.W.Hendrix, A.D.Kaiser. 1972. Role of the host cell in bacteriophage morphogenesis: effects of a bacterial mutation on T4 head assembly.- Nature New Biol., 239. N 89, p. 38-41.
50. Goldberg E.B. 1980. Bacteriophage nucleic acid penetration. In L.L.Randall and L.Phillipson (eds.) Receptors and re-corgnition, series B.V.Z.Virus receptors, part 1:Bacterialviruses, Chapman and Hall, London, p. 115-141.
51. Gratia A. 1936. De relations nummerriques entre bacteries lysogenes et particles de bacteriophagie.- Camp.Rend.Soc. Biol., 122, N 22, p. 812-820.
52. Grinius L. 1982. Protonmotive-force-dependent ША transport across bacterial membranes. -In Mertonos A,N. (ed.) Membranes and transport, Plenum press, New York and London, p. 129-132.
53. Guha A., W.Szybalski, W.Salser, A.Bolle, E.F.Geiduschek, J.P.Pulitzer. 1971. Controls and polarity of transcription during bacteriophage T4 developments.- J.Mol.Biol.,1. N 2, p. 329-343.
54. Hendrix R.W., S.R.Casjens. 1974. Protein fusion : a novel reaction in bacteriophage head assembly.- Proc.Nat.Acad. Sci.USA, 71» N 4, p. 1451-1455.
55. Hershey A.D., H.Davidson. 1951. Allelic and non-allelic genes controling host specificity in bacteriophage. -Genetics, J36, N 4/6, p. 667-677.
56. Holland J.J., E.D.Kiehn. 1968. Specific cleavage of viral proteins as steps in the synthesis and maturation of enteroviruses.-Proc.Nat. Acad. Sci.USA, 60, N3, p.1015-1022.
57. Home R.W., P.Wildy, 1961. Symmetry in virus architecture. Virology, 1^, N 3, p. 348-357.
58. Horvitz H.R. 1973. Polypeptid bound to the host RNA polymerase in specified by T4 control gene 33.- Nature New Biol., 244, N 135, p. 137-140.
59. Jaenicke L. 1974. A rapid micromethod for the determination of nitrogen and phosphate in biological material.-Anal.Biochem., 6±, N 2, p. 623-627.
60. Kao S., W.H.McClain. 1980. Baseplate protein of bacteriophage
61. Т4 with both structural and lytic functions.- J.Virol., 11, p. 95-ЮЗ.
62. Katz E., B.Moss. 1970. Vaccinia virus structural polypep -tide derived from a high-molecular-weight precursor: for -mation and integration into virus particles.- J.Virol., 6 , N 6, p.717-726.
63. Kellenberger E.,1968. Studies on the morphopoesis of the head of phage T4 capsid and of other capsid-related structures.-Virology, IT 3, p. 549-560.
64. Kellenberger E. 1972. Assembly in biological systems. In "Polymerization reactions in biologycal systems"(Giba Symp.), ed. G.E.W.Wolstenholme (Ass,Scientific Publishers, Amsterdam), p. 189-206.
65. Kellenberger E. 1972. Discussion, p.295-299. In G.N.W.Wol-stenholme and M.O'Connor (eds.)"Polymerization reactions in biological systems". J. and A.Churchill Ltd., London.
66. Kellenberger E., W.Arber. 1955. Die struktur des Schwanzes der Phagen T2 und der mechanismus der irreversillen absorption. Z.ITaturforch., 10b. p. 598-611.
67. Kellenberger E., E.Boy de la Tour. 1964. On the fine structure of normal and "polymerized" tail sheath of phage T4.-J.Ultrastr.Research., JM., IT 5-6, p. 545-563.
68. Kells S.S., R.Haselkorn. 1974. Bacteriophage T4 short tail fibers and the product of gene 12. J.Mol.Biol., 8^, IT 2, p. 473-485.
69. Kikuchi Y., J.King. 1975. Genetic control of bacteriophage T4 baseplate morphogenesis. I.Sequential assembly of the major precursor in vivo and in vitro.-J.Mol.Biol., 4, p. 645-672.
70. Kikuchi Y. , J.King. 1975. Genetic control of bacteriophage T4 baseplate morphogenesis. II. Mutants unable to form the central part of the baseplate. J.Mol.Biol., £9, IT 4, p. 673-694.
71. Kikuchi Y., J.King. 1975» Genetic control of bacteriophage
72. T4 baseplate morphogenesis. III. Formation of the central plug and overal assembly pathway. J.Mol.Biol., IT 4, p. 695716.
73. King J. 1968. Assembly of the tail of bacteriophage T4. -J.Mol.Biol., J32, IT 1, p. 231-262.
74. King J. 1971. Bacteriophage T4 tail assembly : four steps in core formation. J.Mol.Biol., £8, IT 3, p. 693-709.
75. King J. 1980. Regulation of protein interactions.- In Biological regulations and development, E.Goldberg (ed.), 2, plenum 3, p. 111-134.
76. King J., R.Griffin-Shea, M.T.Fuller. 1980. Scaffolding proteins and the gemetic control of virus shell assembly.-The Quarterly review of biology, p. 369-393.
77. King J., C.IIall, S.Casjens. 1978. Control of the synthesis of phage P22 scaffolding protein is coupled capsid assembly, Cell., 15, IT 2, p 551-560.
78. King J,, U.K.Laemmli. 1971. Polypeptides of the tailfibers of bacteriophage T4. J.Mol.Biol., §2, N 3, p. 465-477.
79. King J., U.K.Laemmly. 1973. Bacteriophage T4 tail assembly: structural proteins and their genetic identification. -J.Mol.Biol., 7£, IT 2, p. 315-337.
80. King J., IT.Mykolajewicz. 1973. Bacteriophage T4 tail assembly : proteins of the sheath, core and baseplate. J.Mol. Biol., 7£, N 2, p. 339-358.
81. Klug A., J.E.Berger. 1964. An optical method for the analysis of periodicities in electron micrographs and some observations on the mechanism of negative staining. J.Mol.Biol., 10, ЖЗ, p. 565-569.
82. Klug A., D.J.De Rosier. 1966, Optical filtering of electron micrographs : reconstruction of one-sided images.- Nature, 212. N 5057, p. 29-32.
83. Kozloff L.M., 1980. Folyl polyglutamate and folate-requiring ensyme as bacteriophage T4D baseplate structural components. -Biosystems, 12, N 3-4, p. 239-247.
84. Kozloff L.M. 1981. Composition of the T4D bacteriophage baseplate and the binding of the central tail plug. Bacteriophage assembly, Alan.E.Liss.Inc., New York,p. 327-342.
85. Kozloff L.M., L.K.Crosby, C.M.Baugh. 1979. Structural role of the polyglutamate portion of the folate bound in T4D bacteriophage baseplate.- J.Virol., N 2, p. 497-506.
86. Kozloff L.M., M.Lute. 1959. A contractile protein in the tail of bacteriophage T2. -J.Biol.Chem., 2^, N 3, p. 539547.
87. Kozloff L.M., M.Lute. 1960. Calcium content of bacteriophage T2. -Biochim.et Biophys. Acta, ^ 3, p. 420-424.
88. Kozloff L.M., M.Lute. 1965. Folic Acid, a structural component of T4 bacteriophage. -J.Mol.Biol., 1J2, N 3, p. 780-792.
89. Kozloff L.M., M.Lute. 1977. Zinc an essential component of the baseplate of T4 bacteriophage. -J.Biol.Chem., 252. N 21, p. 7715-7724.
90. Kozloff L.M., M.Lute, L.K.Crosby, R.Wong, B.Stern. 1969. Critical arginine residue for maintaining the bacteriophage tail structure.- J.Virol., N 2, p.217-227.
91. Kozloff L.M., M.Lute, L.K.Crosby. 1977. Bacteriophage T4 virion baseplate thymidylate synthetase and diliydrofolate reductase. J.Virol., 23, 113, p. 637-644.
92. Kozloff L.M., M.Lute, K.IIenderson. 1957. Viral invasion. I. Rupture of thriol ester bonds in bacteriophage tail. J. Biol.Chem., 228, H 1, p. 511-522.
93. Kozloff L.M., Zorzopulos J. 1978. Zinc uptake and incorporation into proteins in T4D bacteriophage-infected E.coli. -J.Biol.Chem., 2£3, H 15, p. 5548-5550.
94. Krimm S., T.F.Anderson. 1967. Structure of normal and con -tracted tail sheaths of T4 bacteriophage. J.Mol.Biol., 27, H 1, p. 197-210.
95. Laemmli U.K. 1970. Cleavage of structural proteins during the assembly of head of bacteriophage T4. Hature (London), 227, H 5259, p. 680-685.
96. Lengyel J.A., R.H.Goldstein, M.Marsh, M.G.Sunshine, R.Calen-der. 1973. Bacteriophage P2 head morphogenesis : cleavage of the major capsid protein. Virology, H 1, p.1-23.
97. Lengyel J.A., R.W.Goldstein, Ы.Harsh, R.Calender. 1974. Structure of the bacteriophage P2 tail. Virology, б£, H 1, p. 161-174.
98. Lindberg A.A. 1973. Bacteriophage receptors. Ann.Rev.Microbiol. , 27, p. 205-241.
99. Lowry O.H., H.G.Rosbrough, A.L.Parr, R.J.Bobdall. 1951.
100. Protein measurement with the phenol reagent. J.Biol,Chem., 193, И 1, p. 265-272.
101. Luria S.E., T.P.Anderson. 1942. Identification and characterization of bacteriophages with electrone microscope. Proc. Nat.Acad.Sci.USA, 28, H 1, p. 127-138.
102. Male C.J., L.M.Kozloff. 1973. Function of T4D structural di-hydrofolate reductase in bacteriophage infection.- J.Virol., Ц, N 6, p. 840-847.
103. Meezan E., V/.B.V/ood. 1971. The seqeunce of gene product interaction in bacteriophage T4 tail core assembly. J.Mol. Biol., £8, II 3, p. 685-692.
104. Moody M.F. 1965. The shape of the T-even bacteriophage head.- Virology, 26, II 4, p. 567-576.
105. Moody M.F. 1967. Structure of the sheath of bacteriophage T4.
106. Structure of the contracted sheath and polysheath. -J.Mol.Biol., 2£, II 1, p. 167-200.
107. Moody M.F. 1967. Structure of the sheath of bacteriophage T4.1.. Rearrangment of the sheath subunits during contraction.- J.Mol.Biol., 2£, N 1, p. 201-208.
108. Moody M.F. 1971. Optical diffraction of electron micrographs of argininosuccinase tubules. Biochim.et Biophys.Acta, 229 » II 3, p. 779-784.
109. Moody M.F. 1973. Sheath of bacteriophage T4. III. Contraction mechanism deduced from partially contracted sheaths. J. IIol. Biol., 80, N 4, p. 613-635.
110. Moody M.F. 1981. X-ray diffraction study of tail-tubes from bacteriophage T21. J.Mol.Biol., 150, 111, p. 217-244.
111. Mosher R.A., A.B.DiRenzo, C.K.Mathews. 1977. Bacteriophage T4 virion dihydrofolate reductase : approaches to quantitationand assessment of function. J.Virol., 2^, N 3,p.645-658.
112. Muller-Jensen K., P.H.HofSchneider. 1964. Infections substructures of E.coli bacteriophages. IV.The nature of infections urea-T2 particles. -Biochim.et Biophys.Acta,80t U 3, p.422-430.
113. Poglazov B.P., S.M.Borhsenius, E.M.Belavtseva. 1965. Recon-stitution and crystallization of tail sheaths of phage T2. Virology, 2£, N 4, p.650-659.
114. Poglazov B.P. 1966. Structure and function of contractile proteins. N.Y., London, Academic Press.
115. Provencher S.W., J.Glockner. 1981. Estimation of globular protein secondary structure from circular dichroism. -Biochemistry, 20, К 1, p. 33-37.
116. Rather D. 1974* Bacteriophage T4 transcriptional control gene 55 codes for a protein bound to Escherichia coli RNA-polymerase. J.Mol.Biol., 8£, N 4, p. 803-807.
117. Reddy G.P., C.K.Mathews. 1978. Functional compartmentation of MA precursors in T4 phage-infected bacteria. J.
118. Biol.Chem., 2£3, N 10, p. 3461-3469.
119. Revel H.R., R.Hermann, R.J.Bishop. 1976, Genetic analysis of T4 tail fiber assembly.II. Bacterial host mutants allow bypass of T4 gene 57 function.-Virology, 72,N 1,p.255-265.
120. Riva S., A.Cascino, E.P.Geiduschek. 1970. Coupling of late transcription to viral replication in bacteriophage T4 development. J.Mol.Biol., N 1, p. 85-102.
121. Rubenstein J., C.A.Thomas, A.D.Hershey. 1961. The molecular weight of T2 bacteriophage DNA and its first and second breakproducts.-Proc.Nat.Acad.Sci,USA,£7, H 1, p, 113-119.
122. SarkarH., S.Sarcar, L.M.Kozloff. 1964. Tail components of T2 bacteriophage.I. Properties of the isolated contracted tail sheaths.- Biochemistry, N 4, p. 511-522.
123. Schachman H.K. 1959. Ultracentrifugation in biochemistry.-Acad.Press., New York and London.
124. Shcherbukhin V.V., C.Guermant. 1975. Anamalous sedimenta -tion behaviour of the E.coli ribosomal sistem.- Biophys. Chem., N1, p, 21-34.
125. Shapiro D., L.M.Kozloff. 1970. A C-terminal residue necessary for bacteriophage T4D tail assembly. -J.Mol.Biol.,51« N 2, p. 185-191.
126. Showe M.K., E.Isobe, L.Onorato. 1976. Bacteriophage T4 prehead proteinase. II.Its cleavage from the product of gene 21 and regulation in phage infected cells.-J.Mol.Biol., 107. N 1, p. 55-69.
127. Showe M.K., L.Onorato. 1978. Kinatic factors and form determination of the head of bacteriophage T4.-Proc.Nat. Acad.Sci.USA, И 9, p. 4165-4169.
128. Simon L.I)., T.F. Anderson. 1967. The infection of Escherichiacoli by T2 and T4 bacteriophages as seen in the electron microscope, I,Attachment and penetration, Virology, 32, N 1, p. 279-297.
129. Simon b.D., T.P.Anderson. 1967. The infection of Escherichia coli by T2 and T4 bacetriophages as seen in the electron microscope. II.Structure and function of the baseplate. Virology, j32, N 2, p. 298-305.
130. Smith P.R., U.Aebi, R.Josephs, M.Kessel. 1976. Studies of the structure of the T4 bacteriophage tail sheath. I. The recovery of three-dimensional structural information from the extended sheath.- J.Mol.Biol., 1J36, N 1 , p. 243-275.
131. Snopek T.J., W.B.Wood, M.P.Conley, P.Chen, N.P.Cozarelly. 1977. Bacteriophage T4 RNA-ligase is gene 63 product the protein that promote tail fiber attachment to the base -plate.- Proc.Nat,Acad.Sci.USA, 74, N 8, p. 3355-3359.
132. Spackman D.H., W.H.Stein, S.Moore. 1958. Automatic recording apparatus for use in the chromatography of amino -acids.- Anal.Chem., J30, N 7, p. 1190-1197.
133. Stimpson D.J., V.A.Bloomfield. 1982. Length regulation and polymerization of T4 phage tail cores. 8th Bienniel conf. on bacteriophage assembly, Tennessee, USA, p.17.
134. Strzelecka-Golaszewska H., E.Prochniewicz, E.Nowak, S.Zmor-zynski, W.Drabikowski. 1980. Chicken-Gizzard actin: polymerization and stability. Eur.J.Biochem., 104» N 1, p. 41- 52.
135. Studier F.W. 1973. Analysis of bacteriophage T7 early RNAs and proteins on slab gels.-J.Mol.Biol.N2,p.237-248.
136. Tamaki S., M.Matseehashi. 1973.Increase in sensitivity toantibiotics and lysozyme on deletion of lipopolysaccharides in Escherichia coli strains. J.Bacterid., 114, IT 1 , p. 453-454.
137. Tacata R., A.Tsugita. 1970. Morphogenesis of the tail fiber of bacteriophage T4. I.Isolation and characterization of component (the gene 34 product). J.Mol.Biol., £4, N 1, p. 45-59.
138. Terzaghi B.E., E.Terzaghi, D.Coombs. 1979. The role of the collar/\vhi3lcer complex in bacteriophage T4D tail fiber at -tachment. J.Mol.Biol., 127, IT 1, p. 1-14.
139. To C.M., E.Kellenberger, A.Eisenstark. 1969. Disassembly of T-even bacteriophage into structural parts and subunits. -J.Mol.Biol., 46, IT 3, p. 493-511 .
140. Streisinger G., J.Emrich, M.M.Stahl. 1967. Chromosome structure in phage T4. III. Terminal redudancy and length deter -mination. Proc.lTat.Acad.Sci.USA, IT 1, p. 292-295.
141. Tschopp J., E.Arisalca, It.van Drael, J.Engel. 1979. Purification, characterization and reassembly of the bacteriophage T4D tail sheath protein P18. J.Mol.Biol., 128, IT 1 , p. 247258.
142. Tschopp J., P.R.Smith. 1977. Extra-long bacteriophage T4 tail produced in vitro conditions. J.Mol.Biol., 114, IT 2, p. 281-286.
143. Venyaminov S.Yu., Z.V.Gogia. 1982. Optical characteristics of all individual proteins from the small subunit of Escherichia coli ribosomes.- Eur. J.Biochem., 12б, N 2, p. 299-309.
144. Venyaminov S.Yu., L.P.Itodikova, A.L.Metlina, B.F.Poglazov. 1975. Secondary structure change of bacteriophage T4 sheath protein during sheath contraction. J.Mol.Biol., £8, IT 4,p. 657-664.
145. Wagenknecht Т., V.A.Bloomfield. 1975. Equilibrium mecha -nisms of length regulation in linear protein aggregates.- Biopolymers, 14, N 11, p. 2296- 2309.
146. Wagenknecht Т., V.A.Bloomfield. 1977. In vitro polymerization of bacteriophage T4D tail core subunits.- J.Mol.Biol., 116. U 3, p. 347-359.
147. Wagenknecht Т., V.A.Bloomfield. 1978. Bacteriophage T4 tail length is controlled by its baseplate.- Biochem.Biophys.Res. Commun., 82, N 3, p. Ю49-Ю55.
148. Wahl R., L.M.Kozloff. 1962. The nucleoside triphosphate content of various:, bacteriophages. -J.Biol.Chem., 237» H 6,p. 1953-1964.
149. Wilson J.H., R.B.Luftig, W.B.Wood. 1970. Interaction of- bacteriophage T4 tail fiber components with a lipopolysacha-ride fraction from E.coli.- J.Mol.Biol., N 2, p. 423434.
150. Winder A.F., W.L.G.Gent. 1971. Correction of light-scattering errors in spectrophotometric protein determinations.- Biopolymers, 10, N 7» p. 1243-1251.
151. Winkler U., H.E.Johns, E.Kellenberger. 1962. Comparative study of some properties of bacteriophage T4D irradiated with monochromatic ultraviolet light.-Virology, 18, N 34, p.343-358.
152. Wood W.B.,1979. Bacteriophage T4 assembly and morphogene -sis of subcellular structure.-The Harley Lect. September,22, p. 203-223.
153. Wood W.B. 1980. Bacteriophage T4 morphogenesis as a model for assembly of subcellular structure. The Quartely Reviewof Biology, N 4, p. 353-367.
154. Wood W.B., M.P.Conley. 1979. Attachment of tail fibers in bacteriophage T4 assembly : role of the phage whiskers.-J.Mol.Biol., 127, N 1, p. 15-29.
155. Wood W.B., E.Henninger. 1969. Attachment of tail fibers in bacteriophage T4 assembly : some properties of the reaction in vitro and its genetic control.- J.Mol.Biol., 22*p. 603-618.
156. Wood W.B., H.R.Revel. 1976. The genome of bacteriophage T4. Bacter.Rev., 40, N 4, p. 847-868.
157. Yamamoto M., H.Uchida. 1975. Organization and function of the tail of bacteriophage T4. II.Structural control of the tail contraction.-J.Mol.Biol., £2, n 1, p. 207-223.
158. Zorzopulos J., S.De Long, V.Chapman, L.M.Kozloff. 1982. -Structural characteristics of the short-tail fibers of T4 bacteriophage.- J.Cell.Biochem., 18, N 3, p. 363-375.
159. Zorzopulos J., S.De Long, V.Chapman, L.M.Kozloff. 1982. Host receptor site for short tail fibers of bacteriophage T4.- Virology, 120, N 1, p. 33-41.
- Серышева, Ирина Ивановна
- кандидата биологических наук
- Москва, 1984
- ВАК 03.00.04
- Структурная организация хвостового чехла бактериофагов Т4 и φ KZ
- Геномика и протеомика литических бактериофагов Pseudomonas aeruginosa
- МОЛЕКУЛЯРНАЯ ОРГАНИЗАЦИЯ СОКРАТИТЕЛЬНОГО ЧИСЛА ПИОЦИНА R1
- Детекция бактерий рода Azospirillum с помощью бактериофагов, выделенных из Azospirillum brasilense штаммов Sp7 и SR75
- Инженерия гомотримерных фибриллярных белков