Бесплатный автореферат и диссертация по биологии на тему
Изучение АТР-связывающего участка активного центра ацетил-СоА-карбоксилазы из печени крысы
ВАК РФ 03.00.03, Молекулярная биология
Автореферат диссертации по теме "Изучение АТР-связывающего участка активного центра ацетил-СоА-карбоксилазы из печени крысы"
АКАДЕМИЯ НАУК СССР ИНСТИТУТ МОЛЕКУЛЯРНОЙ БИОЛОГИИ ИМ. В.А.ЭНГЕЛЬГАРДТА
ИЗУЧЕНИЕ АТР-СВЯЗЫВАЮШЕГО УЧАСТКА АКТИВНОГО ЦЕНТРА АЦЕТИЛ-СоА-КАРБОКСИЛАЗЫ ИЗ ПЕЧЕНИ КРЫСЫ.
03.00.03 - Молекулярная биология
АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук
На правах рукописи
АМОНТОВ Сергей Всеволодович
УДК.577.152.3
Москва - 1990
Работа . выполнена в Институте молекулярной биологии им.В.А.Энгельгардта АН СССР
Научные руководители: доктор биологических наук,
Е.В.ГОРЯЧЕНКОВА
, I
кандидат биологических наук, А.Г.Рабинков Официальные оппоненты: доктор химических наук
С.Н.Кочетков
кандидат химических наук, В.И.Тишков
Ведущая организация: Институт биоорганической химии им.М.М.Шемякина АН СССР
Защита состоится /УД.'-гХ^.'З- 1990 г. в часов
на заседании Специализированного совета Д 002.79.01 при Институте молекулярной биологии им.В.А.Энгельгардта АН СССР по адресу: 117984, Москва, ул.Вавилова, 32.
С диссертацией можно ознакомиться в библиотеке
Института молекулярной биологии им.В.А.Энгельгардта АН СССР
Автореферат разослан ШСШ--Яг 1
990 года
Ученый секретарь Специализированного /' /)/ С ¿/V _
у/7 - •/"
совета кандидат химических наук '/ -- у А.М.Крицын
ОБЩАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА РАБОТЫ
Актуальность проблемы. В настоящее время хорошо известно, что биотикзависимые процессы играет существенную роль в метаболизме любой живой клетки. Достигнуты значительные успехи в изучении роли биотинзависимых ферментов в липогенезе, глюконеогенезе, в синтезе пиримидиновых нуклеотидов, аминокислот и мочевины, а также в ряде катаболических процессов.
В основе процессов, протекающих при участии биотина, лежит реакция карбоксилирования. При этом большинство биотинзависимых ферментов в процессе карбоксилирования используют энергию АТР. АТР-зависимый синтез карбоксибиотина (первая1 полуреакция ферментативного процесса):
HCOj + биотинилгЕ + ATP * СО^-Окотинил-Е + ADP + Pj является общим для ферментов, относящихся к группе биотинзависимых карбоксилаз и имеет принципиальное значение в живой природе как процесс, обеспечивавший перенос и включение в молекулу одноуглеродного фрагмента. Это относится и к ацетил-СоА-карбоксилазе, биотинзависиыои карбоксилазе, ферменту, имеющему универсальное распространение в живой природе, что свидетельствует о принципиальной роли в метаболизме процесса, катализируемого этим ферментом. (Ацетил-СоА-карбоксилаза ключевой фермент в цепи биосинтеза лирных кислот.) Ацетил-СоА-карбоксилаза из печени крысы и явилась ■ объектом данного исследования;
АТР-зависимый синтез карбоксибиотина - фундаментальная проблема для биотинового катализа. Однако, со времени доказательства Линеном образования в процессе реакции карбоксибиотина механизм этого процесса остается невыясненным.
Цель работы. Основной задачей данного исследования была попытка приблизиться к пониманию событий, происходящих при АТР-зависимом карбоксилировании биотиновой простетической группы в АТР-связывающем центре ацетил-СоА-карбоксилаэы. С этой целью было предпринято изучение функциональных групп и топографии активного центра фермента методами ингибиторного анализа и, в частности, аффинной модификации, с использованием аналогов АТР, субстрата первой полуреакции, протекающая в АТР-связывающеи участке активного центра фермента, и влияние бикарбонат-иона на процессы инактивации фермента.
Научная новизна и практическая ценность работы. Показано, что о-АТР (высокоспецифический модификатор аминогрупп осуществляет аффинную модификацию АТР-связывающего участкг активного центра ацетил-СоА-карбоксилазы. Установлено, чтс алкилирующие амиды АТР и ADP обратимо взаимодействуя с АТР-связывающим участком активного центра модифицируют группу находящуюся в ацетил-СоА-сяэывающэм участке активного центра Показано , что в результате взаимодействия косубстрата перво: полуреакций - бикарбонат-иона, с активным центром фермента увеличивается реакционная способность групп активного центра являющихся объектом модификации.
Публикации. По материалам диссертации опубликовано 4 статьи
Объем работы. Диссертационная состоит из введения, обзор литературы, материалов и методов, результатов и обсуждения выводов, списка цитированной литературы. Диссертация изложена н 60 страницах машинописного текста и содержит 4 таблицы 16 рисунков и список цитированной литературы (75 ссылок).
СОДЕРЖАНИЕ РАБОТЫ.
Аффинная модификация активного центра ацетил-СоА-карбоксилазы
2',3'-диоксо-АТР.
2* ,3'-диоксо-АТР в настоящее время хорошо изучен в качестве модификатора белков и, в частности, аффинного модификатора активных центров целого ряда ферментов. Как было показано в ряде работ, это соединение высокоспецифично модифицирует аминогруппы.
Рис.1. 2',3'-диоксо-аденозин-5'-трифосфат
Таким образом,' благодаря высокой специфичности этого аффинного агента удалось для ряда АТР-зависимых ферментов показать наличие в активном центре функционально важной аминогруппы. Поэтому и в случае ацетил-СоА-карбоксилазы, для которой АТР также является субстратом, было логично изучить взаимодействие этого фермента с 2',3'-диоксо-АТР.
Нами было покэано, что степень инактивации возрастает со временем (рис. 2) и при этом заингибированный фермент не реактивируется при диализе. Это свидетельствует о необратимом
характере ингибирования фермента 2 ,3 -диоксо-АТР.
Из рисунка 3 видно,, что прямые, отражающие зависимость
обратной величины начальной скорости инактивации от обратной
величины концентрации ингибитора, не проходят через начало
координат и отсекают на оси ординат в положительной области
отрезок, соответствующий предельной скорости процесса
инактивации. Такой характер кинетики позволяет сделать вывод о
существовании в процессе модификации фермента начальной стадии,
на которой происходит образования обратимого комплекса фермента с
ингибитором. Величина К^ составила 0.35±0.04 мМ, а константа
-1
модификации (к) 0.11±0.008 мин .
% остаточная активность
Рмс.2. Зависимость активности ацетил-СоА-карбоксилазы от времени инкубации с 2',3*-диоксо-АТР. Концентрация 23'-диоксо-АТР: о - 0.4 мИ; а - 0.2 мМ; • - 0.15 мМ: ■ - 0.1 мМ; + - 0.06 мМ
Рис.4. Влияние ATP (0.5мН>- о; бикарбоната (ЮнН)- в; СоАЗН (1мМ)- о;
I I
на инактивацию ацетмл-СоА-карбоксилазы 2.3-диоксо-АТР. Контроль- +
Важнейший признаком того, что процесс ингибирования имеет аффинный характер, является защита фермента от инактивации субстратом. На рисунке 4 показано влияние субстратов реакции, катализируемой ацетил-СоА-карбоксилазой, на скорость инактивации фермента. CoASAc не влияет на динамику процесса.
Это, очевидно, свидетельствует о том, что 2*,3'-диоксо-АТР в процессе модификации не взаимодействует с областью CoASAc-связывающего участка активного центра, а также о том, что CoASAc не обладает заметным сродством к АТР-связывающему участку активного центра. Бикарбонат-ион ускоряет инактивацию и лишь АТР оказывает выраженный защитный эффект. АТР в данном опыте был взят в концентрации 0.5 тМ (то есть приблизительно 2 1^). Мы не ставили перед собой задачи продемонстрировать полное ЮОХ-ное подавление процесса инактивации, за счет использования насыщающих концентраций субстрата,поскольку при более высоких концентрациях АТР начинает проявляться ингибирование ацетил-СоА-карбоксилазы субстратом.
Таким образом, используя относительно низкие концентрации АТР, мы старались наблюдать кинетику процесса инактивации в чистом виде, избежать наложения побочных эффектов. Тем не менее, если сопоставить продемонстрированный в опыте защитный эффект с расчетным, сответствуюшим данным концентрациям лигандов, который можно вычислить, используя элементарное соотношение для случая конкурирующих лигандов:
(CLE] - относительная (11
Фермент-лиганд; С - ——
lLEJ " сТГ
концентрация обратимого комплекса нормированная концентрация),
то Ыожно сделать заключение, что ожидаемая и полученная в эксперименте величины защитного эффекта достаточно хорошо совпадают (см.таблицу 1). (Под защитным эффектом мы понимали отношение начальной скорости инактивации в контрольном опыте к этой величине определенной в присутствии субстрата). (Поскольку мы исходили из предположения о конкурентности лигандов, то данный результат является дополнительным подтверждением того, что 2',3'-диоксо-АТР является конкурентным по отношению к АТР ингибитором ацетил-СоА-карбоксилазы.)
Таблица 1.
Контроль АТР Защита
О-АТР 0.35 Kj 0.35 Kj
АТР - 2 Kj
II-E1 26Х 11*
IS-EI 0 S9X
IL-EI 262 70%
I - оАТР; 3 - ATP; Е т- фермент Задитний эффект : ожидаемый - 26.XN11X = 2.4 ;
экспериментальный - 2 (33*)
На рисунке 5 представлены результаты, полученные при
з ' 1
исследовании стехиометрии включения. 0-1 Н1-2 ,3 -диоксо-АТР в нативныя фермент. Кинетика включения метки совпадает с процессом инактивации фермента. Эти два процессы развиваются во времени синхронно. Это позволяет с достаточной долей уверенности утверждать, что включение в молекулу фермента 2'3'-диоксо-АТР является непосредственной и единственной причиной необратимой инактивации фермента.
График включения метки демонстрирует также тот существенный
факт, что полной потере активности ацетил-СоА-карбоксилазы
» » _
соответствует включение 1.06±0.08 экв 2 ,3 -диоксо-АТР на субъединицу фермента (240-кДа). Случай, когда максимальное количество включенной в белок метки соответствует 100*-ноя
инактивации и состав ляет^еличину - 1 молекула модификатора на
1 субъединицу, позволяет сделать вывод о том, что модификация имеет" строго аффинный характер (т.е. не идет параллельно неспецифическая модификация), и, таким образом, модификации
подвергается один сайт, находящийся в активном центре.
* *
При изучении' влияния 2 ,3 -диоксо-АТР на перЕую и вторую
полуреакции ферментативного процесса было показано, что • ! 1
2 ,3 -диоксо-АТР полностью ингибирует первую полуреакцию
(ADP/ATP-обмен), и, при этом, модифицированный фермент продолжает
катализировать вторую полуреакцию (CoASAc/CoASMal-обмен)
(Таблица 2). Таким образом, наличие стадии обратимого комплекса
фермент-ингибитор, защитный эффект субстрата первой полуреакции,
АТР, соответствие полной инактивации фермента включению 1 экв 3 1 1
в— [ Н ]—2 ,3 -диоксо-АТР на субъединицу фермента, необратимое ингибирование избирательно первой полуреакции доказывает, что
1 I
2 ,3 -диоксо-АТР является аффинным модификатором АТР-связывающего участка активного центра фермента, не затрагивает биотиновую простетическую группу и оставляет в интактном состоянии ацетил-СоА-связывающия участок активного центра.
Сейчас известно, что в результате взаимодействия
* *
2 ,3 -диоксо-АТР с аминогруппой лизина могут реализоваться различные варианты продукта (Рис. б). Может образоваться малостабильное основание Шиффа с 2 или 3 -углеродными атомами рибозного кольца (1), которое при восстановлении NaBH^ дает стабильное производное. В другом случае реакция сопровождается элиминацией трифосфатной цепочки, при этом образуется либо стабильное конъюгированное основание Шиффа.(2), либо стабильное 4',5'-дидегидро-2',3'-дигидроксиморфолиновое производное (3).
но
ж
о
I 1 ■
Аск
ХУ,
N
I
К
"ОН
О
Ас1е
V ^
И \\ N О I
Я
Ас1е
11
N о
Рис.6. Варианты продукта, образующегося при модификации аминогруппы 2',3'-диоксо-АТР.
Нами было показано, что модифицированный фермент не реактивируется в присутствии триса или 2-меркаптоэтанола в концентрации 0.05 мМ, хотя этого следовало бы ожидать в случае образования производного типа(1).
Ч • 1
При модификации фермента смесью 6-1 Н1-2 ,3 -диоксо-АТР и
32 ' ' 3
а- Р-2 ,3 -диоксо-АТР включение Н составило 1.0 экв на
32
субъеднницу, включение Р составило менее 0.03 экв на субъединицу. Следовательно в результате модификации происходит элиминирование трифосфатной цепочки. Из этих фактов
(невозможность реактивировать модифицирований фермент аминами или
тиолами, элиминация трифосфатной цепочки 2 ,3 -диоксо-АТР в процессе модификации фермента) можно заключить, что в данном
I I
-случае, при модификации ацетил-СоА-карбоксилаэы 2 ,3 -диоксо-АТР, по всей вероятности, образуется конъюгированное основание Шиффа (2) либо морфолиноподобная структура (3).
Таким образом, резюмируя изложенные факты можно сказать
I I
следующее. 2 ,3 -диксо-АТР является аффинным необратимым ингибитором ацетил-СоА-карбоксилазы, з результате взаимодействия с АТР-связывающим участком активного центра модифицирует, по всей вероятности, аминогруппу, находящуюся в этом участке.
ТАБЛИЦА.2 Влияние аффинных модификаторов на стадии
Ферментативной реакции, катализируемой ацетил-СоА-карбоксилазой.
Обмен [ИСШР\АТР 1полуреакция Обмен [14С1СоАЗАс\СоАЗКа1 Иполуреакция Активность ! фермента ! в полной реакции !
¡СИШНрррА 100* <10* <0.3* !
! СШННррА 100* <5* <0.2* |
| о-АТР <0.5* 80* <0.2* !
! Контроль 100* 100* 100* !
Аффинная модификация ацеткл-СоА карбоксилази алкилмруювдмм
амидами ADP к А ТР.
Нами было также предпринято сравнительное изучение взаимодействия ароматических 2-хлорэтиламинопроизводных АТР и ADP (4-(Н-хлорэтил-К-метиламино)-бензйл-г-амиды АТР и ADP) с ацетил-СоА-карбоксилазой. Соединения этого ряда также как и 2',3'-диоксо-АТР неоднократно использовались при исследовании активных центров ферментов в качестве аффинных модификаторов аналогов нуклеотидов. В отличие от 2',3'-диоксо-АТР эти аффинные инактиваторы принципиально иного типа. Их аффинные свойства и модифицирующая функция пространственно разделены. Нуклеотидная часть молекулы выполняет функцию своего рода якоря, а R-Cl-радикал является щупом, который зондирует окружение активного центра и при наличии подходящей группы осуществляет пришивку.
Следует отметить также, что эти реагенты в отличие от 2*,3'-диоксо-АТР парраллельно со' специфической реакцией в комплексе с ферментом расходуются на превращения вне комплекса. Лимитирующей стадией реакции является отщепление иона С в результате внутримолекулярного замещения у атома углерода C-Cl-свяэи с образованием активного промежуточного этилен-иммониевого катиона, причем, эта стадия имеет одинаковую константу как в комплексе так и в растворе.
1 t
И в данном случае, как и в случае с 2 ,3 -диоксо-АТР удалось убедительно продемонстрировать, что оба алкилирующих
агента являются аффинными необратимыми ингибиторами фермента. Из
-1 -1 -1 линейной анаморфозы к„._ от [II ,(мМ ) (рис 7) видно, что
К&Ж
зависимость начальной скорости инактивации от концентрации
Рис.7. Зависимость кахувеяся константы скорости инактивации ацетил-Со Агкарбоксилазы ,кказс' от концентрации аналогов: АТР-аналог (А) и АБР-аналог СБ) в обратных координатах.
Рис.8. Образование этмлениммониевого катиона.
ингибитора имеет гиперболический характер, при этом на оси абсцисс прямые отсекают отрезки храктеризующие степень аффинности ингибиторов(Kj-1 ). В результате были расчитаны значения констант (- 0 .16±0.02 мМ и 1.1 ±0 .4 мМ для аналога АТР и ADP соответственно. к модификации - 0.027±0.002 Ыин"1 и О.45±0.07 мин-1 для аналога АТР и ADP соответственно.)
Таким образом, алкилирующий аналог ADP, обладая существенно меньшим сродством к ферменту имеет значительно более высокую константу алкилировалия по сравнению с алкилирующим аналогом АТР. Величина к для аналога АТР близка к величине константы скорости лимитирующей стадии алкилирования хлорэтилалкилариламинами -ионизация С-С1-связи(к0), определенной для 4-(М-хлорэтил-Ы-метил-амино)-бензил-а-амида UMP(0.023 мин-1). Учитывая, что соединения этого типа нестабильны и подвергаются спонтанному гидролизу по S^j-механизму, можно предположить, что реакция алкилирования ацетил-CoА-карбоксилазы алкилирующим аналогом АТР, вероятнее всего,' поисходит по механизму SN1 через образование промежуточных высокореакционноспособных этилениммониевых катионов, возникающих в результате внутримолекулярного замещения у атома углерода С-С1-связи Рис. 8).
Увеличение максимальнря скорости модификации аналогом ADP на порядок, по сравнению с величиной , связано, по-видимому, с изменением механизма реакции, при котором ковалентное присоединение протекает по S^-механизму без предварительного образования этилениммониевого катиона. Таким образом, можно предположить, что алкилируюшие аналоги АТР и ADP модифицируют одну и ту же группу (хотя и нельзя это утверждать категорически), так как общая' длина аналога ADP по сравнению с аналогом АТР
практически не меняется: размер исключенного из АТР Р02"0-фрагмента (0.28нм) равен длине СН2-СН2-<ррагмента (0.3 нм) химически активной группы реагента при прямом алкилировании амиинокислотного остатка с помощью аналога ADP по Э^-механизму.
Поскольку изучаемые ингибиторы являются аналогами АТР и ADP и, следовательно, способны взаимодействовать с АТР-связывающим участком активного центра, защитное действие АТР вполне закономерно. CoASAc благодаря нуклеотидному фрагменту в его молекуле также мог бы обладать определенным сродством к АТР-связывающему участку активного центра.
Рис.9. Зависимость остаточной активности ацетил-СоА-карбоксилази
—4
от времени предынкуОацхм с С1ИСН> ННрррА, 4*10 N (А) и ClRCH2NHppA, 2"10"2М (Б): 1- в отсутствие субстратов; 2 и 3 в присутствии АТР (1иМ) м СоАЗН (ОЛмМ) соответственно.
Однако отсутствие у даного субстрата, в отличие от АТР, защитных
I I
свойств при инактивации фермента 2 ,3 -диоксо-АТР, как было описано выше, позволяет исключить такую возможность. Поэтому защитный эффект при инактивации фермента данными алкилируюшими аналогами АТР и ADP можно объяснить лишь тем, что располагаясь в АТР-связывающем участке нуклеотидной своей частью модификатор алкилирует группу, находящуюся в области CoASAc-евязывающего участка активного центра фермента. Это было подтверждено при исследовании влияния модификации ацетил-СоА-карбоксилазы на первую и вторую полуреакции, т.е. на реакцию бикарбонат-зависимого [ 14С ЬАБР/АТР обмена и на реакцию [ 14С 1-CoASAc/CoASMal обмена. .Данные по влиянию алкилируюиих аналогов АТР (CIRCHgNHpppA) и ADP (ClRCH2NHppA), в процентах от активности нативного фермента, приведены в таблице2. Оба аналога добавляли в реакционную смесь в концентрациях, практически полностью инактивйруюиих фермент в полной реакции (1 и 10 мМ для аналога АТР и ADP соответственно).
Из приведенных данных можно видеть, что оба аналога, не влияя на первую полуреакцию, практически полностью ингибируют вторую полуреакцию (С14СJ-CoASAc/CoASMal обмен). Это является прямым доказательством локализации модифицируемой группы в CoASAc-евязывающем участке активного центра. Возможно, алкилирование фермента нарушает связь нуклеотидного фрагмента аналогов в АТР-связываютем участке, что приводит в конечном итоге к полному освобождению АТР-связываюшего участка активного центра фермента, чем и объясняется сохранение активности фермента в первой полуреакции фактически в полной мере после модификации. Можно также утверждать, что модификация не затрагивает биотин,
так как в противном случае ингибировались бы обе полуреакции.
Полученные результаты позволяют провести ориентировочную оценку расстояния между местом связывания )-фосфатной группой реагента в нуклеотидсвязывающем участке активного центра и модифицируемой группой в участке связывания СоАЭАс в активном центре карбоксилазы. Учитывая динамическое поведение фермента и лиганда, когда реакционноспособная группа реагента атакует химически активную группу белка в данном, конформационном состоянии, возможно отличающемся от основного, это расстояние можно оценить в пределах 0.6-1.2 нм
Рис.9. Схематическое изображение активного центра ацетил-СоА-карОоксилази.
Влияние бикарбонат-иона на инактивацию ацетил-СоА-карбоксилазы аффинными модификаторами.
Как уже отмечалось выше, нами было обнаружено, что в отличие от субстратов АТР и ацетил-СрА бикарбонат-ион не оказывает защитного действия при модификации ацетил-СоА-карбоксилазы как 2',3'-диоксо-АТР так и алкилируюшими амидами АТР и ADP. Напротив, в присутствии бикарбонат-иона скорость инактивации фермента во всех трех случаях значительно возрастала. Мы предприняли изучение влияния бикарбонат-иона на кинетику модификации фермента. Результаты этих исследований представлены на следующих рисунках. Оказалось, в частности, что бикарбонат-ион практически не влияет на сродство аффинных модификаторов к ферменту, поскольку значения константы ингибирования (К^) расчйтанные для процесса инактивации в присутствии и в отсутсвие бикарбонат-иона совпадают в пределах ошибки (в случае 2',3'-диоксо-АТР значение К^ , видимо, даже несколько ухудшается (см.таблицу 4). С другой стороны, во всех трех случаях происходит увеличение значений констант модификации (к) в присутствии бикарбонат-иона. Так, в... случае 2',3'-диоксотАТР константа модификации (к) в присутствии бикарбоната увеличивается приблизительно в 2 раза (от 0.11 до 0.21. мин-1), а в случае алкилируюших амидов ADP в 1.5 раза (от 0.45 до 0.79 мин-1 ) и АТР даже в 3 раза (от 0.027 до 0.087мин-1).
Таким образом, из кинетического анализа становится ясно, что ускорение процесса инактивации фермента в присутствии бикарбонат-иона во всех трех случаях обусловлена не увеличением сродства
2',3'-диоксо-АТР к ферменту, а возрастанием константы модификации (к), то есть, по всея вероятности, повышением реакционной способности модифицируемой группы ацетил-СоА-карбоксилаэы. Тонкий механизм этого явления не ясен, но это с полной определенностью свидетельствует о том, что роль бикарбоната не сводится лишь непосредственно к карбоксилированию биотина. Взаимодействуя с активным центром фермента, бикарбонат-ион приводит к значительной перестройке активного, центра.
Таблица 4. Значения кинетических констант процесса инактивации для исследованных аффинных кодификаторов в отсутствие и в присутствии бикарбонат-иона (10 мИ>.
К1 (гаМ) к <01п-1> х102
- НСО" - нсо;
о-АТР 0,35±0.04 0.50±0.06 11 21
АОР-ШП 11 ±4 13±2 45±7 79 ±3
АТР-ПС1 0.21±0.03 0.18±0.02 2.7±0.2 8.7±0.8
4-(Н-хлорэтил-И-метилаиино)-бензил-а-амид 1ЖР
[константа ионизации С-С1 связи к0 = 2.3 ' 10~2 (в1п_1)1
Выводи
1.Показано, что 2',3'-диоксо-АТР (высокоспецифический модификатор аминогрупп) осуществляет аффинную модификацию АТР-связывающего участка активного центра ацетил-СоА-карбоксилаэы. При этом в результате модификации отщепляется трифосфатная часть молекулы 2*,3'-диоксо-АТР и образуется стабильное производное (конъюгированное основание Шиффа, либо морфолиноподобная структура). Определены значения констант К^ и константы модификации .
2.Показано, что 4(Ы-хлорэтил-Н-метилаыино )-бензил-г-амид-АТР и аналогичный В-амид ADP являются аффинными, необратимыми ингибиторами ацетил-СоА-карбоксилазы. Обратимо связываясь нуклеотидной частью молекулы с АТР- участком активного центра эти соединения модифицируют функциональную группу, находящуюся в области ацетил-CoА-связывающего участка активного центра, при этом модифицированный фермент сохраняет способность катализировать первую полуреакцию ферментативного процесса (биотинэависимый ADP/ATP обмен). Определены значения констант процесса инактивации. Оценено расстояние между участком связывания г-ф°сфата и ... ацетил-СоА-связывающим участком 0.6-1.2нм.
3.Показано, что роль бикарбонат-иона не сводится лишь непосредственно к карбоксилированию биотина. Взаимодействуя с активным центром фермента бикарбонат-ион приводит к увеличение реакционной способности модифицируемых групп, находящихся в АТР-связывающвм участке активного центра, и в ацетил-СоА-участке активного центра. Определены значения констант процесса
инактивации фермента аффинными модификаторами в присутствии бикарбонат-иона.
Материалы диссертации опубликованы в следующих работах:
1. Амонтов С.В., Бунева В.Н., Рабинков А.Г., Горяченкова Е.В. Исследование взаимодействия ацетил-СоА-карбоксилазы из печени крысы с алкилирующими амидами АТР и ADP.- Биохимия, 1986, т.53, N.10, с.1654-1659
2. Рабинков А.Г., Позднев В.Ф., Амонтов С.В., Копелевич В.М., Гунар В.И.
Биотинилирование аминов пентафторфениловым эфиром D-биотина. Химия природных соединения, п.З, с.403-408, (1989)
3. Амонтов С.В., Рабинков А.Г.
Ацетил-СоА-карбоксилаза: модификация АТР-связывавшего участка активного центра 2'-3'-диальдегидныы производным АТР.-Мол.биол., 1989, т.23, N6, с.1516-1522
4. A.G. Rabinkov, S.V. Amontov
Affinity labelling of rat liver acetyl-CoA carboxylase by a 2' ,3'-dialdehyde' derivative of ATP. - BBA, 1990, 1013, p.216-220
Черметинформавия, зак.824, тир.100, уч.-издл.0,95, печл.1,5, усл.кр.-оп.1,75, подписано к печати 21.08.90 г.
- Амонтов, Сергей Всеволодович
- кандидата биологических наук
- Москва, 1990
- ВАК 03.00.03
- Ацетил - СоА - карбоксилаза: изучение субстратной специфичности и регуляции каталитической активности
- Биосинтез кофермента А в метаболической активности производных пантотеновой кислоты
- Повышение уровня секреции внеклеточного полисахарида и выхода биомассы облигатной метилотрофной бактерии Methylophilus quaylei в присутствии экзогенных жирных кислот и их сложных эфиров
- Фосфорорганические аналоги фосфатов - субстратов и интермедиатов ферментативных реакций
- Сравнительная характеристика РБФ-карбоксилазы различных по продуктивности форм хлопчатника. Множественные молекулярные формы фермента