Бесплатный автореферат и диссертация по биологии на тему
Исследование взаимосвязи между биологическими свойствами и структурой белка оболочки вируса табачной мозаики
ВАК РФ 03.00.03, Молекулярная биология
Содержание диссертации, кандидата биологических наук, Кошкина, Татьяна Евгеньевна
Список сокращений
ВВЕДЕНИЕ
ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1. Общая характеристика группы тобамовирусов.
1.1. Морфология вирионов.
1.2. Распространение, симптомы, круг хозяев, перенос
1.3. Транспорт.
1.4. Цитопатология, тельца включений ф 1.5. Структура генома
2. Классификация тобамовирусов.
3. Полные инфекционные кДНК-копии тобамовирусов, транскрибируемые in vivo и in vitro.
4. Белки кодируемые геномом тобамовирусов и их функциональная
Ф роль.
4.1. Репликативные белки.
4.2. Транспортный белок
4.2.1. ОРСТБ.
4.2.2. Роль ТБ в тобамовирусной инфекции.
4.2.3. Обеспечение межклеточного транспорта взаимодействие с плазмодесмами и цитоскелетом.
4.3. Белок оболочки (БО^
4.3.1. ОРСБО.
4.3.2. Структура БО
4.3.3. Депротеинизация вирионов
4.3.4. Влияние мутаций в БО на характер симптомов, круг растений хозяев и гиперчувствительный ответ.
4.3.5. Устойчивость трансгенных по БО растений к вирусной инфекции.
5. Казахские изоляты ВТМ.
5.1. Биологические свойства
5.2. Сравнение аминокислотных последовательностей.
5.3. Корреляция между проявлением биологических свойств и структурой капсидного белка
МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ. ф 1. Реактивы.
2. Ферменты и наборы
3. Векторы и бактериальные штаммы.
4. Определение спектра растений-хозяев.
5. Выделение и очистка препарата изолята ВТМ-КЗ
6. Выделение РНК
7. Синтез первой цепи кДНК
8. Полимеразная цепная реакция.
9. Очистка ПЦР-фрагментов электрофорезом в агарозном геле
10. Получение генно-инженерных конструкций
11. Выделение плазмидной ДНК.
12. Транскрипция in vitro
13. Инокуляция растений РНК-транскриптами.
14. Электрофорез в сочетании с ИФА (Вестерн-блоттинг).
15. Определение нуклеотидной последовательности ДНК.
16. Электронная микроскопия
РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЙ.
1. Биологические свойства ВТМ-КЗ
2. Клонирование и секвенирование З'-концевой области генома
ВТМ-КЗ
3. Сравнительный анализ аминокислотных последовательностей
ТБ и БО Казахских изолятов и ВМТо.
4. Стратегия проведения мутагенеза.
5. Исследование кинетики дальнего транспорта MUT-53E и 304L.
6. Электронно-микроскопические исследования
ОБСУЖДЕНИЯ РЕЗУЛЬТАТОВ
ВЫВОДЫ
Введение Диссертация по биологии, на тему "Исследование взаимосвязи между биологическими свойствами и структурой белка оболочки вируса табачной мозаики"
Тобамовирусы заражают большое количество видов растений, особенно существенный ущерб они наносят семейству пасленовых. Начало исследований феномена вирусов положили работы Ивановского с вызывающим инфекцию агентом на примере мозаичного заболевания табака. В первых биологических испытаниях с растительными вирусами были использованы растения Nicotiana glutinosa, симптомы инфекции на которых были обнаружены на инокулированных листьях. ВТМ первый вирус, который был выделен и очищен, что позволило установить Баудену и Пирье в 1935 г. нуклеопротеиновую природу вирусов, структуру вириона и белка оболочки (Webster and Granoff, 1995). ВТМ первый вирус, палочковидные частицы которого были обнаружены с помощью электронного микроскопа (Webster and Granoff, 1995). Исследования показали, что генетическим материалом ВТМ является РНК. ВТМ был первым вирусом, на котором был проведен мутагенез. Первый вирусный белок, для которого была определена аминокислотная последовательность, был белок оболочки ВТМ. Последующее определение последовательности аминокислот белка оболочки для некоторых штаммов и мутантов помогли установить универсальность генетического кода. Методы инфицирования протопластов растений были отработаны на комбинации табак-ВТМ, создавшей синхронную систему для изучения инфекционного цикла. Таким образом, вирус табачной мозаики является классическим и, пожалуй, одним из наиболее изученных объектов вирусологии. С тех пор вирус табачной мозаики (ВТМ) играет центральную роль в современных фундаментальных исследованиях вирусологии.
Выяснение молекулярных механизмов, лежащих в основе корреляции между биологическими свойствами вируса и структурой его генома является не только важным с точки зрения фундаментальных исследований, но и имеет существенное значение для разработки эффективных систем защиты растений от вирусной инфекции. Ключевую роль в формировании биологических свойств вирусов (круг растений-хозяев, симптомы, транспорт и др.) может играть структура вирусного белка оболочки (БО), который по своей природе полифункционален и кроме формирования вирионов вовлечен в другие вирус зависимые процессы.
Объектом настоящей работы являются Казахские изоляты ВТМ (Гольдин, 1963; Беленович и др., 1997; Новиков и др., 2000): БО этих вирусов и, как экспериментальная система для введения точечных мутаций, классический дикий штамм BTM-U1. От силы межсубъединичного взаимодействия БО в структуре вириона в значительной степени зависит эффективность депротеинизации вирусной частицы и, как следствие, эффективность экспрессии вирусного генома (Wilson, 1984; Namba et al., 1989).
Актуальность исследования определяется необходимостью получения четких экспериментальных данных о роли и влиянии тех или иных аминокислотных остатков БО на структуру, биологические свойства и стабильность вирионов.
ЛИТЕРАТУРНЫЙ ОБЗОР Общая характеристика группы тобамовирусов
Тобамовирусы входят в супергруппу синдбисподобных вирусов ("Sindbis virus supergroup"), которая включает альфа вирусы животных и большинство групп растительных вирусов, включая гордеивирусы с трехкомпонентным геномом, тобра- и потексвирусы. Группа тобамовирусов включает около 12 вирусов (табл. 1), для многих из которых идентифицированы различные штаммы (Webster et al., 1995).
Таблица 1. Вирусы, относящиеся к группе тобамовирусов.
TMV tobacco mosaic tobamovirus BTM вирус табачной мозаики
ToMV tomato mosaic tobamovirus BMTo вирус мозаики томатов
TMGMV tobacco mild green mosaic tobamovirus BM3MT вирус мягкой зеленой мозаики табака
ORSV Odontoglossum ringspot tobamovirus ВКПО вирус кольцевой пятнистост орхидеи
PMMV pepper mild mottle tobamovirus ВМКП вирус мягкой крапчатости перца
CGMMV cucumber green mottle mosaic tobamovirus B3KMO вирус зеленой крапчатости мозаики огурцов
SHMV sunn-hemp mosaic tobamovirus ВМКИ вирус мозаики конопли индийской
RMV ribgrass mosaic tobamovirus ВМП вирус мозаики подорожника
FrMV frangipani mosaic tobamovirus ВМФ вирус мозаики франжипани
MaMV maracuja mosaic tobamovirus в MM вирус мозаики маракуй sov Sammon's Opuntia tobamovirus BOC вирус опунции Сэммонса
UMMV Ullucus mild mottle tobamovirus ВМКУ вирус мягкой крапчатости уллюко
Заключение Диссертация по теме "Молекулярная биология", Кошкина, Татьяна Евгеньевна
ВЫВОДЫ
1. Исследован новый изолят Казахского штамма ВТМ, обозначенный как ВТМ-КЗ. Обнаружено, что по своим биологическим свойствам и структуре З'-концевой области генома ВТМ-КЗ наиболее близок к ранее изученному изоляту ВТМ-К2 и, как и все Казахские изоляты, родственен тобамовирусу мозаики томатов.
2. На основании сопоставления биологических и биохимических свойств Казахских изолятов ВТМ и установленной последовательности аминокислот их белков оболочек, сделан вывод о ключевой роли аминокислотной замены К53—»Е в аномальных биологических и структурных характеристиках ВТМ-К1
3. Введение одиночной мутации A5871->G в контекст генома классического штамма BTM-U1, приводящей к замене К53—»Е в гене БО, приводит к утрате жизнеспособности вируса и одновременному накоплению в растениях жизнеспособного мутанта MUT-53E:50K с компенсаторной заменой в БО Е50—>К.
4. Исследование свойств мутанта MUT-53E:50K показало, что он отличается от исходного штамма BTM-U1 замедлением системного транспорта, существенным изменениям структуры вирионов и индукцией двух необычных типов включений в интерхроматиновом пространстве ядер зараженных клеток.
Благодарности
Автор глубоко признателен своему научному руководителю Сергею Кириаковичу Завриеву за постоянное внимание, терпение и неизменную поддержку при выполнении этой работы. Приношу большую благодарность Доброву Евгению Николаевичу за подробное обсуждение результатов работы и ценные советы и Полякову Владимиру Юрьевичу, Новикову Виктору Константиновичу за помощь в постановке экспериментов .и обсуждение результатов. Карягиной Анне Станиславовне и Ершовой Анне Степановне хотелось бы выразить особую благодарность за помощь в создании трехмерных моделей белка оболочки ВТМ и подробное обсуждение. Особую признательность хотелось бы выразить сотрудникам лаборатории молекулярной вирусологии растений Вишниченко В.К., Аршава Н.В. за постоянную поддержку и внимание. Автор признателен сотрудникам лаборатории биофизических методов анализа за сотрудничество в электронно-микроскопических исследованиях. Автор благодарен Дорохову Юрию Леонидовичу за предоставление полной кДНК-копии BTM-U1, лаборатории молекулярной диагностики и генно-инженерных конструкций ВНИИ СБ РАСХН за предоставленные наборы и ферменты, необходимые для выполнения данной работы.
Библиография Диссертация по биологии, кандидата биологических наук, Кошкина, Татьяна Евгеньевна, Москва
1. Беленович Е.В., Генерозов Э.В., Новиков В.К. и Завриев С.К. (1997). Свойства и структура генома штамма К2 вируса табачной мозаики. Молекулярная биология. 31, 826-830.
2. Гольдин М. И. Вирусные включения в растительной клетке и природа вирусов. М. 1963.
3. Гиббс А. Харрисон Б. Основы вирусологии растений. Москва: «Мир». 1978.
4. Маниатис Т., Фрич Е., Сэмбрук Дж. Методы генной инженерии. Молекулярное клонирование. Москва. «Мир». 1984
5. Новиков В.К., Добров Е.В., Беленович Е.В. и Завриев С.К. (2000). ^ Биологические свойства и структура генома казахского изолята К1вируса табачной мозаики. Молекулярная биология. 34, 326-331
6. Уикли Б. 1975. Электронная микроскопия для начинающих. М.: Мир. с. 62.
7. Ханаан Д. Методы трансформации Е. coli. В книге: клонирование ДНК: # методы, под редакцией Д.Гловера. Москва, «Мир». 1988
8. Arce-Johnson P., Reimann-Philipp U., Padgett H.S., Rivera-Bustamante R., Beachy R.N. (1997). Requirement of the movement protein for long distance spread of tobacco mosaic virus in grafted plants. Mol. Plant. Microbe Interact. 10, 691-699.
9. Atabecov J.G., Taliansky M.E. (1990). Expression of a plant virus coded transport function by different virus genomes. Adv. Virus Res. 39, 201-248.
10. Beachy R. N., Loesch-Fries S., and Turner N. E. (1990). Coat protein mediatedmresistance against virus infection. Annu. Rev. Phytopatol. 28, 451.
11. Beachy R.N., Heinlein M. (2000). Role of P30 in replication and spread of TMV. Traffic. 7, 540-544.
12. Beachy R.N., Zaitlin M. (1977) Characterization and in vitro translation of the RNAs from less-than-fiill-length, virus-related, nucleoprotein rods present intobacco mosaic virus preparations. Virology. 81, 160-169.
13. Berzal-Herranz A., de la Crus A., Tenllado F., Diaz-Ruiz J. R., Lopez L., Sanzо
14. A.I., Vaquero C., Serra M. Т., and Garcia-Luque I. (1995). The Capsicum L gene-mediated resistance against the tobamoviruses is elicited by the coat protein. Virology. 209, 498-505.
15. Bhyravbhatla B, Watowich SJ, Caspar DL. (1998). Refined atomic model ofmthe four-layer aggregate of the tobacco mosaic virus coat protein at 2.4-A resolution. Biophys. J. 74, 604-615.
16. Blooomer A. C., Champness J. N., Bricogne G., Staden R., Klug A. (1978). Protein disk of tobacco mosaic virus at 2,8 A0 resolution showing the interaction within and between subunits. Nature. 26, 362-368.
17. Ш 17. Caspar D.L.D. (1963). Assembly and stability of the tobacco mosaictobamovirus particle. Adv. Protein Chem. 18, 37-121.
18. Caspar D.L.D., Namba K. (1990). Switching in the self-assembly of the tobacco vosaic virus. Adv. Byophys. 26, 157-185.
19. Chen J., Watanabe Y., Sako N., Oshima K., and Okada Y. (1996). Complete nucleotide sequence and synthesis of infectious in vitro transcripts from a full— length cDNA clone of a rakkyo strain of tobacco mosaic virus. Archives of Virology. 141, 885-900.
20. Culver J.N., Dawson W.O., Plonk K., Stubbs G. (1995). Site-directed mutagenesis confirms the involvement of carboxilate groups in the disassembly of tobacco mosaic virus. Virology. 206, 724-730.
21. Culver J.N. (2002). Tobacco mosaic virus assembly and disassembly: .«I determinants in pathogenicity and resistance. Annu. Rev. Phytopathol. 40, 287308.
22. Dawson W. O., Beck D.L., Knorr D.A. and Grantham G. L. (1986). cDNA cloning of the complete genom of tobacco mosaic virus and production of infectious transcripts. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 83, 1932-1836.
23. Dawson W. O., Bubrick P., and Grantham G. L. (1988). Modifications of thetobacco mosaic virus coat protein gene affecting replication, movement, and symptomalogy. Phytopathology. 78, 783-789.
24. Deom C.M., Oliver M.J., Beachy R.N. (1987). The 30-kilodalton gene product of tobacco mosaic virus potentiates virus movement. Scince. 237, 389-394.
25. Ding В., Haudenshield J.S., Hull R.J., Wolf S., Beachy R.N., Lucas W.J.1992). Secondary plasmodesmata are specific sites of localization of thetobacco mosaic virus movement protein in transgenic tobacco plants. Plant Cell. 4,915-928.
26. Dorokhov Yu.L., Ivanov P.A., Novikov V.K., Agranovsky A.A., Morozov S.Yu., Efimov V.A., Casper R., Atabekov J.G. (1994). Complete nucleotide
27. Ф sequence and genome organization of a tobamovirus infecting cruciferaeplants. FEBSLett. 350, 5-8.
28. Dunigan D.D., and Zaitlin M. (1990). Capping of tobacco mosaic virus RNA. Analysis of viral coded guanililtransferase-like activity. J. Biological Chemistry. 265, 7779-7786.
29. Frale A. and Garsia-Arenal F. (1990). A classification of tobamoviruses based on comparison among their 126K proteins. J. Gen. Virol. 71, 2223-2228.
30. Goelet P., Lomonossoff G.P., Butler P.J.G. et al. (1982). Nucleotide sequence of tobacco mosaic virus RNA. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 79, 5818-5822.
31. Gorbalenya A.E., Koonin E.V., Donchenko A.P., Blinov V.M. (1988a). A novel superfamily of nucleoside triphosphate-binding motif containing
32. Gorbalenya A.E., Koonin E.V., Donchenko A.P., Blinov V.M. (19886). A conserved NTP-motif in putative helicases. Nature. 333, 22.
33. Gorbalenya A.E. and Koonin E.V. (1989). Viral proteins containing the purine NTP-bindingsequence pattern. Nucl. Acids Res. 17, 8413-8440.
34. Goregaoker S.P., Lewandowski D.J., Culver J.N. (2001). Identification and functional analysis of an interaction between domains of the 126/183-kDa replicase-associated proteins of tobacco mosaic virus. Virology. 282, 320-328.
35. Heinlein M., Padgett H.S., Gens J.S., Pickard B.G., Casper S.J., Epel B.L., Beachy R.N. (1998). Changing patterns of localization of the tobacco mosaic
36. Щ virus movement protein and replicase to the endoplasmic reticulum andmicrotubules during infection. Plant Cell. 7,1107-1120.
37. Hilf M.E., Dawson W.O. (1993). The tobamovirus capsid protein functions as a host-specific determinant of long-distance movement. Virology. 193, 106114.
38. Holmes K.S. (1979). Protein-RNA interactions during TMV assembly. J.
39. Supramol Struct. 12, 305-320.
40. Ishikawa M., Meshi Т., Motoyoshi F., Takamatsu N., Okada Y. (1986). Invitro mutagenesis of the putative replicase genes of tobacco mosaic virus. Nucleic Acids Res. 14, 8291-8305.
41. Koenig R., Paul H.L. (1982). Variants of ELISA in plant virus diagnosis. J. Virol. Meth. 5,113-125.
42. Koonin E.V. (1991). The phylogeny of RNA-dependent RNA polymerases of ^ positive-strand RNA viruses. J. Gen. Virol. 72, 2197-2206.
43. Koonin E.V., Dolja V.V. (1993). Evolution and taxonomy of positive-strand RNA viruses: implications of comparative analysis of amino acid sequences. Crit. Rev. Biochem. Mol. Biol. 28, 375-430.
44. Laemmli U.K. (1970). Cleavage of structural proteins during the assembly of W the head of bacteriophage T4. Nature. 227, 680-685.
45. Lewandowski D. J. and Dawson W.O. Enciclopedia of Virology plus.0
46. Copyright Academic Press, 1995.
47. Lewandowski D.J., Dawson W O. (2000). Functions of the 126- and 183-kDa proteins of tobacco mosaic virus. Virology. 25, 90-98.
48. Lu В., Stubbs G., Culver J.N. (1996). Carboxylate interactions involved in the dissasembly of tobacco mosaic tobamovirus. Virology. 225, 11-20.
49. Lu В., Stubbs G., Culver J.N. (1998). Coat protein interactions involved in tobacco mosaic tobamovirus cross-protection. Virology. 248, 188-198.
50. Mas P., Beachy R.N. (1998). Distribution of TMV movement protein in single living protoplasts immobilized in agarose. Plant J. 15, 835-842.
51. Mas P., Beachy R.N. (1999). Replication of tobacco mosaic virus on endoplasmic reticulum and role of the cytoskeleton and virus movement protein in intracellular distribution of viral RNA. J. Cell Biol. 147,945-958.
52. Meshi Т., Ohno Т., Iba H., Okada Y. (1981). Nucleotide sequence of a cloned cDNA copy of TMV (cowpea strain) RNA, including the assembly origin, the coat protein cistron, and the 3' non-coding region. Mol. Gen. Genet. 184, 2025.
53. Meshi Т., Ohno Т., Okada Y. (1982). Nucleotide sequence and its character of cistron coding for the 30 К protein of tobacco mosaic virus (OM strain). J. Biochem. 91,1441-1444.
54. Meshi Т., Ishikava M., Motoyoshi F., Semba K., and Okada Y. (1986). In vitro transcription of infections RNAs from full-length cDNAs of tobacco mosaic virus. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 83, 5043-5047.
55. Meshi Т., Watanabe H., Saito Т., Sugimoto A., Maeda Т., Okada Y. (1987). Function of the 30-kDa protein of tobacco mosaic virus: involvement in cell-to-cell movement and dispensability for replication. EMBOJ. 6, 2557-2563
56. Moore P.J., Fenczik C.A., Deom C.M., Beachy R.N. (1992). Developmental changes in the structure of plasmodesmata in transgenic tobacco expressing the movement proteins of tobacco mosaic virus. Protoplasma. 170, 115-127
57. Namba K., Pattanaek R., Stubbs G. (1989). Visualisation of intact tobacco mosaic virus at 2,8 A0 resolution dy X-ray fiber diffraction. J. Mol. Biol. 208, 307-325.
58. Nelson R. S., Powell Abel P., and Beachy R. N. (1987). Lisions and accumulation in inoculated transgenic plants expressing the coat protein gene of tobacco mosaic virus. Virology. 158, 126-132.
59. Nishiguchi M., Kikuchi S., Kiho Y., Ohno Т., Meshi Т., Okada Y. (1985). Molecular basis of plant viral virulence; the complete nucleotide sequence of an attenuated strain of tobacco mosaic virus. Nucleic Acids Res. 13, 55855590.
60. Novikov V.K., Belenovich E.V., Dobrov E.N., Zavriev S.K. (2000). Kazakh strains of tobacco mosaic virus: two strains with potentially destabilizing amino acid substitutions in the coat protein. Physiol. Mol. Plant Pathol. 56, 71-77.
61. Ohno Т., Okada Y., Nomomura Y., Inoue H. (1975). Disk aggregtes of cucumber green mottle mosaic virus protein and its function. J. Biochem. 77, 313-319.
62. Ohno Т., Aoyagi M., Yamanashi Y., Saito H., Ikawa S., Meshi Т., Okada Y. (1984). Nucleotide sequence of the tobacco mosaic virus (tomato strain) genome and comparison with the common strain genome. J Biochem (Tokyo). 96, 1915-1923.
63. Osman T.A., Buck K.W. (1996). Complete replication in vitro of tobacco mosaic virus RNA by a template-dependent, membrane-bound RNA polymerase. J Virol 70, 6227-6234.
64. Padgett H. S. and Beachy R. N. (1993). Analysis of a tobacco mosaic virus strain capable of overcoming N-gene-mediated resistance. Plant Cell. 5, 577586.
65. Pelham H.R., Jackson R.J. (1976) An efficient mRNA-dependent translation system from reticulocyte lysates. Eur. J. Biochem. 67, 247-256.
66. Pelham H. R. B. (1978). Leary UAG termination codon in tobacco mosaic virus RNA. Nature (London). 272, 469.
67. Powell Abel P., Nelson R. S., De В., Hoffman N., Rogers S., G., Fraley R. Т., and Beachy R. N. (1986). Delay of desiase development in transgenic plants that express the tobacco mosaic virus coat protein. Science. 232, 738-743.
68. Powell P.A., Stark D.M., Sanders P.R., Beachy R.N. (1989). Protection against tobacco mosaic virus in transgenic plants that express tobacco mosaic virus antisense RNA. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 86, 6949-6952.
69. Powell P. A., Sanders P. R., Turner N., Fraley R. Т., and Beachy R. N. (1990). Protection against tobacco mosaic virus infection in transgenic plants requires accumulation of coat protein rather than coat protein RNA sequence. Virology. 175, 124-130.
70. Reichel C. and Beachy R.N. (1998). Tobacco mosaic virus infection induces severe morphological changes of the endoplasmic reticulum. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 95, 11169-11174.
71. Reynolds E.S. (1963). The use of lead citrate at high pH as an electron opaque stain in electron microscopy. J. Cell Biol. 17, 208-212.
72. Rosanov M.N., Koonin E.V., Gorbalenia A.E. (1992). Conservation of the putative methyltransferase domain: a halmark of the "Sindbis-like" supergroup of positive-strand RNA viruses. J. Gen. Virol. 73, 2129-2134.
73. Saito Т., Yamanaka K. and Okada Y. (1990). Long-distance movement and viral assembly of tobacco mosaic virus mutants. Virology. 176, 329-336.
74. Sanger F., Nicklen S., Coulson A.R. (1977). DNA sequencing with chain terminating inhibitors. Proc. Natl Acad. Sci USA. 74, 5463-5467.
75. Sambrook J., Fritch E.F. and Masniatis T. Molecular cloning: a laboratory manual, 2nd edn. New York: Cold Spring Harbor Laboratory, 1989.
76. Siegel A., Zaitlin M., Sehgal O.P. (1962). The isolation of defective tobacco mosaic virus strain. Proc. Natl Acad. Sci. USA. 48, 1845-1851.
77. Siegel A., Hari V., Montgomery I., Kolacz K. (1976). A messenger RNA for capsid protein isolated from tobacco mosaic virus-infected tissue. Virology. 73,363-371.
78. Siegel A., Hari V., Kolacz K. (1978). The effect of tobacco mosaic virus infection on host and virus-specific protein synthesis in protoplasts. Virology. 85,494-503.
79. Skuzeski J. M., Nichols L. M., Gesteland R.F., and Atkins J. F. (1991). The signal for a leacu UAG stop codon in several plant viruses includes the two downstream codons. J. Mol. Biol 218, 365-373.
80. Sleat D.E., Gallie D.R., Jefferson R.A., Bevan M.W., Turner P.C., Wilson T.M. (1987). Characterisation of the 5-leader sequence of tobacco mosaic virus RNA as a general enhancer of translation in vitro. Gene. 60, 217-225.
81. Solis I., Garsia-Arenal F. (1990). The complete nucleotide sequence of the genomic RNA of the tobamovirus tobacco mild green mosaic virus. Virology. 177, 553-558.
82. Steckert J.J., Schuster T.M. (1982). Sequence specificity of trinucleoside difosphate binding to polymerized tobacco mosaic virus protein. Nature. 299, 32-36.
83. Tabor S. and Richardson Ch.C. (1987). DNA sequence analysis with a1. J*modified bacteriophage T7 polymerase. Proc. Natl Acad. Sci. USA. 84, 47674772.
84. Takamatsu N., Ohno Т., Meshi Т., Okada Y. (1987). Expression of bacterial chloramfenicol acetyltransferase gene in tobacco plants mediated by TMV RNA. EMBOJ. 6, 307-311.
85. Takamatsu N., Watanabe Y., Meshi Т., Okada Y. (1990). Mutational analysisof the pseudoknot region in the 3' noncoding region of tobacco mosaic virus RNA. J. Virol 64, 3686-3693.
86. Takamatsu N., Ohno Т., Meshi T. and Okada Y. (1993). Molecular cloning and nucleotide sequence of 30K and coat protein cistron of TMV (tomato strain) genome. Nucl. Acids Res. 11, 3767-3778.
87. Taraporewala Z.F., Culver J.N. (1996). Identification of an elicitor active site within the three-dimensional structure of the tobacco mosaic tobamovirus coat protein. Plant Cell 8, 169-178.
88. Tomenius K., Clapham D., and Meshi T. (1987). Localisation by immunogold cytochemistry of the virus-coded 30K protein in plasmodesmata of leavesinfected with tobacco mosaic virus. Virology. 160, 363-371.
89. Ugaki M., Tomiyama M., Kakutani Т., Hidaka S., Kiguchi Т., Nagata R., Sato Т., Motoyoshi F., Nishiguchi M. (1991). The complete nucleotide sequence of cucumber green mottle mosaic virus (SH strain) genomic RNA. J. Gen. Virol. 72,1487-1495.
90. Van Belkum A., Abrahams J.P., Pleij C.W., Bosch L. (1985). Fivepseudoknots are present at the 204 nucleotides long 3' noncoding region of tobacco mosaic virus RNA. Nucleic Acids Res. 13, 7673-7686.
91. Waigmann E. and Zambrovski P. (1995). Tobacco mosaic virus movement protein-mediated protein transport between trichoma cells. The Plant Cell 7, 2069-2079.
92. Watanabe Y., Emori Y., Ooshika I., Meshi Т., Ohno T. and Okada Y. (1984). ^ Sinthesis of TMV-specific RNAs and proteins at the early stage of infection intobacco protoplasts: Transient expression of the 30K protein and its mRNA. Virology. 133, 18-24.
93. Weber H., Haeckel P. and Pfitzner A.J.P. (1993). A cDNA clone of tomfto mosaic virus is infections in plants. J. Virol. 66, 3909-3912.
94. Webster R., Granoff A. Enciclopedia of virology plus. Copyright Academic Press. 1995.
95. Wilson T.M.A. (1984). Cotranslational disassembly of tobacco mosaic virus in vitro. Virology. 137,371-384.
96. Wittman-Liebold В., Wittman H.G. (1963). Die primare Structure von Stammen des Tabakmosaikvirus. Amino Saure Sequenzen des Proteins des Tabakmosaikvirus stammes Dahlemense. Tiel III: Diskussion der Ergebnisse.
97. Z. Vererbungsl. 94, 427-435.
98. Wolf S., Deom С. M., Beachy R. N., and Lucas W. L. (1989). Movement protein in tobacco mosaic virus modifies plasmodesmatal size exclusion limit. Science. 246,377-379.
99. Wu X., Shaw J.G. (1996). Bidirectional uncoating of the genomic RNA of a helical virus. Proc. Natl Acad. Sci. USA. 93, 2981-2984.
100. Wu X., Shaw J.G. (1997). Evidence that a viral replicase protein is involved in the disassembly of tobacco mosaic virus particles in vitro. Virology. 239, 426434.
101. Young N., Forney J., Zaitlin M. (1987). Tobacco mosaic virus replicase and replicative structures. J. Cell. Sci. Suppl. 7, 277-285.
- Кошкина, Татьяна Евгеньевна
- кандидата биологических наук
- Москва, 2003
- ВАК 03.00.03
- Изучение сферических частиц, образующихся при термической перестройке вируса табачной мозаики, и области их применения
- Особенности структуры, экспрессии и взаимодействия с патогенами белка табака Nt-4/1
- Биохимические свойства транспортных белков потекс- и гордеивирусов, кодируемых первым из трех генов транспортного модуля
- Исследование круга хозяев, полиморфизма и клонирование генома Х вируса шалота
- Вирусные болезни растений Дальнего Востока (диагностика, идентификация, особенности биологии патогенов)