Бесплатный автореферат и диссертация по биологии на тему
Генотипы штаммов Yersinia pseudotuberculosis и их клиническое и диагностическое значение
ВАК РФ 03.02.03, Микробиология
Автореферат диссертации по теме "Генотипы штаммов Yersinia pseudotuberculosis и их клиническое и диагностическое значение"
На правах рукописи
КОКОРИНА Галина Ивановна
ГЕНОТИПЫ ШТАММОВ YERSINIA PSEUDOTUBERCULOSIS И ИХ КЛИНИЧЕСКОЕ И ДИАГНОСТИЧЕСКОЕ ЗНАЧЕНИЕ
03.02.03 - микробиология
АВТОРЕФЕРАТ Диссертации на соискание ученой степени кандидата медицинских наук
005059635
i 6 ПАП 2013
Санкт-Петербург 2012
005059635
Работа выполнена в Федеральном бюджетном учреждении науки «Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Пастера»
Научный руководитель:
Заслуженный деятель науки РФ, доктор медицинских наук, профессор Ценева Галина Яковлевна
Официальные оппоненты:
Сбойчаков Виктор Борисович - доктор медицинских наук, профессор, ФГКВОУ ВПО «Военно-медицинская академия имени С.М. Кирова» Министерства обороны Российской Федерации, кафедра микробиологии, начальник кафедры.
Суворов Александр Николаевич - доктор медицинских наук, профессор, ФГБУ "НИИЭМ" Северо-Западного отделения Российской академии медицинских наук, отдел молекулярной микробиологии, руководитель отдела.
Ведущее учреждение: ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора.
Защита диссертации состоится 28 мая 2013 года в УЗ часов на заседании диссертационного совета Д 215.002.08 на базе ФГКВОУ ВПО «Военно-медицинская академия имени С.М. Кирова» Министерства обороны Российской Федерации (194044, Санкт-Петербург, ул. Акад. Лебедева, дом 6).
С диссертацией можно ознакомиться в фундаментальной библиотеке ФГКВОУ ВПО «Военно-медицинская академия имени С.М. Кирова» Министерства обороны Российской Федерации.
Автореферат разослан «/сЬ> апреля 2013 г.
Ученый секретарь диссертационного совета
Доктор медицинских наук, профес™" Митин Юрий Алексеевич
ОБЩАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА РАБОТЫ
Актуальность темы исследования
Псевдотуберкулез остается актуальной проблемой здравоохранения в России и во многих странах мира. Заболевание отличают выраженный полиморфизм клинических проявлений, отсутствие четких патогномоничных симптомов, склонность к затяжному и хроническому течению. Между тем причины, обуславливающие данное многообразие и сложность патогенеза, остаются невыясненными.
Инфекционный процесс представляет собой ограниченное во времени сложное взаимодействие биологических систем микроорганизма и макроорганизма, протекающее в определенных условиях внешней среды. В этой связи чрезвычайно актуально изучение роли детерминант вирулентности Y. pseudotuberculosis, влияния их продуктов на течение инфекционного процесса и территориальное распространение бактерий.
В отдельных работах предприняты попытки объяснить разнообразие клинических форм псевдотуберкулеза за счет наличия у возбудителя тех или иных генетических детерминант вирулентности (Fukushima Н. et al., 2001; Carniel Е., 2001; Mollaret Н., 1990; Чеснокова М.В. и соавт., 2006). Типичный для России симптомокомплекс псевдотуберкулеза получил название - дальневосточная скарлатиноподобная лихорадка. Основные клинические симптомы инфекции, вызванной Y.pseudotuberculosis в России, Японии и Южной Корее разнообразнее и тяжелее, чем на Европейских территориях и характеризуются системными проявлениями болезни.
Открытие способности к синтезу суперантигена и установление его роли в патогенезе инфекции позволили пересмотреть механизм появления некоторых симптомов при псевдотуберкулезе. В настоящее время с продукцией Y. pseudotuberculosis суперантигена YPMa связывают такие иммунопатологические осложнения псевдотуберкулеза, как реактивный артрит, синдром Рейтера, острый увеит и синдром Кавасаки (Sato К. et al., 1983; Treacher D. et al., 1986; Baba K. et al., 1991).
Хорошо изучен «остров» высокой патогенности Y. pseudotuberculosis, ответственный за биосинтез и регуляцию системы утилизации железа. Считают, что он необходим для проявления высоковирулентного фенотипа возбудителя (Carniel Е„ 2001).
Особый интерес представляет плазмида с молекулярной массой 82 МДа (pVM82), обнаруживаемая до настоящего времени у штаммов Y. pseudotuberculosis серотипа 0:1Ь только в России, и не встречающаяся у других представителей рода Yersinia. Доказано, что наличие плазмиды pVM82 у возбудителя способствует более тяжелому течению инфекции (Шурыгина И.А., 2007).
К настоящему времени выявлены особенности распространения штаммов Y. pseudotuberculosis, содержащих ургпА или «остров» высокой патогенности, связанные с географическими регионами (Fukushima Н. et al. 2001).
Учитывая многообразие вариантов течения болезни,
обусловленного различиями в патогенных свойствах возбудителя псевдотуберкулеза, для клинической практики актуально, прежде всего, изучение биологических характеристик штаммов Y. pseudotuberculosis циркулирующих на различных территориях. Вместе с тем, для оптимизации мониторинга за возбудителем, а также выбора тактики обследования больных требуются наиболее полные знания о влиянии возбудителя псевдотуберкулеза с различным набором генетических детерминант вирулентности на патогенез и совершенствование специфической диагностики инфекции.
Ограниченные возможности распознавания случаев заболевания иерсиниозами, в частности псевдотуберкулеза, на поздних сроках приводят к гиподиагностике, развитию хронических форм (до 30% случаев) и осложнений. Это обуславливает необходимость поиска новых более чувствительных методов этиологической диагностики заболевания.
В связи с изложенным, представлялось актуальным изучение генетических характеристик штаммов возбудителя псевдотуберкулеза и разработка набора для серологической диагностики иерсиниозов.
Степень разработанности темы исследования
До настоящего времени не определена последовательность нуклеотидов плазмиды Y. pseudotuberculosis pVM82, способствующей более тяжелому течению инфекции, не установлены гены плазмиды, оказывающие влияние на вирулентность бактерии. Методом дот-блот гибридизации не была исследована коллекция штаммов Y. pseudotuberculosis на наличие генов вирулентности icm/dot системы секреции IVB типа и umuDC плазмиды pVM82, выделенных в разных регионах мира.
Ранее изучена коллекция штаммов Y. pseudotuberculosis, выделенных на пяти континентах на наличие генетических детерминант вирулентности: генов суперантигена уртА, уршВ и ypmC; HPI и R-HPI и pVM 46 МДа. При этом исследований на выявление плазмиды pVM82; YAPI и L-YAPI не проводилось. Фрагментарные сведения имеются относительно определения плазмиды pVM82, генов суперантигена и HPI у штаммов Y. pseudotuberculosis, выделенных на территории Сибири и Дальнего Востока. Штаммы из Северо-Западного региона, Украины на наличие генетических детерминант вирулентности не изучались.
При генотипировании штаммов Y. pseudotuberculosis по содержанию уртА, уртВ и ypmC; HPI и R-HPI и pVM 46 МДа, выделенных на пяти континентах, охарактеризовано 6 генетических групп штаммов. Было установлено, что для территорий России (исследованы только дальневосточные штаммы), Японии и Кореи для штаммов Y. pseudotuberculosis характерно содержание уртА и отсутствие HPI. В то же время для штаммов Y. pseudotuberculosis, выделенных на всех остальных территориях мира, главным образом, характерно содержание HPI и отсутствие уртА, что свидетельствует о взаимосвязи наличия этих детерминант вирулентности с клиническими симптомами псевдотуберкулеза, различными для этих территорий. Описаны клинические проявления псевдотуберкулеза у больных, от которых выделены штаммы 2 (НРГ), 3 (уртА+) и 5 (R-НРГ уртС+)
генетических групп. В то же время по содержанию генов pVM82, YAPI и L-YAPI генотипирование не проводилось, хотя ранее было доказано, что наличие плазмиды pVM82 оказывает влияние на тяжесть течения псевдотуберкулеза.
Существующие отечественные препараты и тест-системы для диагностики иерсиниозов недостаточно эффективны, особенно при хроническом течении заболеваний. В мировой практике «золотым» стандартом серологической диагностики иерсиниозов признан метод иммуноблота. В настоящее время на основе этого метода существуют зарубежные наборы. В РФ до настоящего времени не разработана методика конструирования набора для определения антител классов А, М и G методом иммуноблота.
Цель исследования
Молекулярно-генетическая характеристика штаммов Y. pseudotuberculosis и совершенствование этиологической диагностики иерсиниозов.
Задачи работы:
1. Изучить наличие генетических детерминант вирулентности у штаммов Y. pseudotuberculosis, выделенных в различных географических регионах мира.
2. Охарактеризовать генотипы штаммов Y. pseudotuberculosis различного происхождения и их распространенность в разных регионах мира.
3. Установить особенности клинического течения псевдотуберкулеза, вызванного штаммами Y. pseudotuberculosis различных генотипов.
4. Разработать набор для серологической диагностики иерсиниозов.
Научная новизна:
С использованием метода дот-блот гибридизации у штаммов Y. pseudotuberculosis различного происхождения выявлена плазмида pVM82, несущая гены вирулентности, основные из них - гены icm/dot системы секреции IVB типа, опосредующие внутриклеточное персистирование микроорганизма в эпителиальных клетках, что может обуславливать скарлатиноподобные проявления заболевания.
Впервые изучена распространенность pVM82 у представителей мировой популяции Y. pseudotuberculosis.
На основании содержания основных генетических детерминант вирулентности: pVM82, генов суперантигена, YAPI и HPI выделено 14 генотипов штаммов Y. pseudotuberculosis. Показано распространение штаммов Y. pseudotuberculosis различных генотипов на -территориях 25 стран пяти континентов.
Установлено, что псевдотуберкулез с симптомами ДСЛ вызывают все штаммы Y. pseudotuberculosis, обладающие геном уртА, кодирующим YPMa.
Получены новые знания о тяжести течения псевдотуберкулеза, обусловленного штаммами Y. pseudotuberculosis генотипов За, ЗЬ, Зс. Полученные данные могут свидетельствовать о более тяжелом течении инфекции, вызванной штаммами Y. pseudotuberculosis генотипов 3b (ypmA+L-YAPI+) и Зс (ypmA+L-
YAPI+pVM82+), по сравнению с инфекцией, обусловленной штаммами Y. pseudotuberculosis генотипа За (уртА+).
Практическая значимость работы:
Изученные российские штаммы Y. pseudotuberculosis и их характеристики представлены в коллекции лаборатории бактериальных капельных инфекций ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, Санкт-Петербург.
Для повышения эффективности диагностики псевдотуберкулеза обоснованы показания к обследованию больных с симптомами острого аппендицита, мезентериального лимфаденита и гастроэнтеральными симптомами с целью выявления их инфицированное™ Y. pseudotuberculosis генотипов 2а и 2Ь, вызывающих инфекцию с абдоминальными проявлениями.
Для микробиологического мониторинга за возбудителем псевдотуберкулеза предложена методика генотипирования штаммов Y. pseudotuberculosis.
Разработана методика конструирования набора для выявления специфических противоиерсиниозных иммуноглобулинов G, А, и М в крови или плазме человека методом иммуноблота.
На основе результатов работы подготовлены следующие документы:
1. Методические рекомендации для эпидемиологов, инфекционистов, педиатров и микробиологов «Псевдотуберкулез и иерсиниоз» Г.Я. Ценева, Г.И. Кокорина, Е.А. Воскресенская и др. СПб, 2005. - 49 с.
2. Материалы диссертации представлены в монографии «Иерсинии и иерсиниозы» (Глава 8, «Современные возможности лабораторной диагностики псевдотуберкулеза и иерсиниоза» ГЛ. Ценева, Г.И. Кокорина, Е.А. Воскресенская и др.) СПб.: ООО «Бастион», 2006. - 168 с.
3. СП 3.1.7.2615-10 «Профилактика иерсиниоза» М., 18 с.
4. Патент на изобретение «Тест-штамм Yersinia pseudotuberculosis для дифференциации бактерий Yersinia pseudotuberculosis генетической группы I». -№ 2465319 от 16.09.2011. - Авторы: Кокорина Г.И.
5. Патент на изобретение «Тест-штамм Yersinia pseudotuberculosis для дифференциации бактерий Yersinia pseudotuberculosis генетической группы 1а». -№ 2465321 от 16.09.2011.-Авторы: Ценева Г.Я., Кокорина Г.И., Климов В.Т.
6. Патент на изобретение «Тест-штамм Yersinia pseudotuberculosis для дифференциации бактерий Yersinia pseudotuberculosis генетической группы II». -№ 2465317 от 16.09.2011. - Авторы: Кокорина Г.И., Воскресенская Е.А., Чеснокова М.В.
7. Патент на изобретение «Тест-штамм Yersinia pseudotuberculosis для дифференциации бактерий Yersinia pseudotuberculosis генетической группы На». -№ 2465318 от 16.09.2011. - Авторы: Кокорина Г.И., Воскресенская Е.А., Климов В.Т.
8. Материалы диссертации представлены в «Национальном руководстве по клинической лабораторной диагностике» (Раздел: «Иерсинии»), - М.: ГЭОТАР-Медиа, 2011.- 2т.
Методология и методы исследования
В соответствии с целью и задачами исследования был использован следующий материал и применены методы, представленные в таблице 1.
Таблица 1. Объем проведенных исследований различными методами
Методы Объем
1. Бактериологический: 1.1 Изучение характеристик циркулирующих штаммов Y. pseudotuberculosis 1.2 Культивирование на питательных средах Y. pseudotuberculosis и Y. enterocolitica 232 штамма 314 штаммов
2. Молекулярно-генетический: 2.1. Определение нуклеотидной последовательности плазмиды pVM 82 (секвенирование) методом «дробовика» 2.2. Секвенирование участка генов урш локуса Y. pseudotuberculosis 2.3. Выделение тотальной ДНК методом фенол-хлороформной эсктракции 2.4. Выделение плазмидной ДНК методом щелочной экстракции по Бирнбоу-Долли с модификацией 2.5. Дот-блот гибридизация ДНК каждого штамма с 10-ю зондами 2.6. ПЦР 1 плазмида 23 штамма 313 штаммов 1 штамм 2770 реакций 650 реакций
3. Иммунологический: 3.1. Определение уровня антител в сыворотках крови людей методами РА, РИГА, ИФА, иммуноблота 3.2. Определение уровня антител в сыворотках крови иммунизированных животных методами РА, РИГА, ИФА, иммуноблота 241 ОСК бОСК
4. Экспериментальный: получение гипериммунных кроличьих иерсиниозных сывороток и сывороток на композицию рекомбинантных белков Yops бОКС
5. Анализ историй болезни 256 историй болезни
6. Биоинформатические: - обработка данных с использованием компьютерных программ: BlastN - для сравнения исследуемой нуклеотидной последовательности с имеющимися в GenBank, Choice of Primers by the Octamer Frequency Disparity (OFD) Method - для выбора праймеров при постановке ПЦР; TIGR Manatee system - сборка и аннотация генома плазмиды.
б
Для выполнения исследований использовано 309 штаммов
Y. pseudotuberculosis: 232 из коллекции Национального Референс-центра по мониторингу за иерсиниозами и 77 штаммов из Коллекции Национального Yersinia референс-центра и Центра сотрудничества с ВОЗ Парижского института Пастера за период 1989 по 2008 гг. В работе использовано 4 референс-штамма, содержащие различные детерминанты вирулентности Y. pseudotuberculosis из Национального Yersinia референс-центра и Центра сотрудничества с ВОЗ Парижского института Пастера. Плазмида pVM82 выделена из штамма Y. pseudotuberculosis IP31758, изолированного от больного псевдотуберкулезом с типичными симптомами ДСЛ.
Для иммунизации кроликов использован охраноспособный штамм Y. enterocolitica 0:3 КМ 174 (Государственной коллекции патогенных бактерий «Микроб», Саратов), содержащий плазмиду pYV 46 МДа.
Выделение, идентификацию и культивирование микроорганизмов проводили в соответствии с Методическими рекомендациями «Псевдотуберкулез и иерсиниоз» № 11-3/8-09 (2005).
Серотипирование культур Y. pseudotuberculosis осуществляли в мультиплексной ПЦР с использованием специфичных праймеров по методике Bogdanovich Т. (2003) или с применением набора коммерческих моновалентных сывороток (производства ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера) к серотипам Y. pseudotuberculosis 0:1 и 0:3 с помощью реакции агглютинации на стекле.
Выделение тотальной бактериальной ДНК осуществляли методом фенол-хлороформной экстракции (Carniel Е., 1989).
Методом дот-блот гибридизации или ПЦР проведена детекция генов уртВ, уртА/С, irp2, fyuA, pilPQ, api 74, уорМ, yscQ, dot О, mucAB.
Для дот-блот гибридизации денатурированную ДНК штаммов наносили по 5 мкл на положительно заряженную нейлоновую мембрану (Hybond N+; Amersham, Англия), фиксировали, облучая ультрафиолетовыми лучами в течение 4 минут с использованием прибора GS Gene Linker UV Chamber (Bio Rad) в режиме СЗ. Зонды получали с помощью ранее известных (Сагпоу С., 1999; Schubert S., 1998; Coliyn F„ 2004; Collyn F. 2005; Tsukano H„ 1996) и сконструированных праймеров, синтезируя их методом ПЦР. Праймеры разработаны с помощью программы OFD Method и BlastN. Продукты амплификации были очищены от агарозы и примесей с помощью набора микроколонок QIAquick Gel Extraction Kit (Qiagen). Мечение продукта ПЦР пероксидазой и использование его в качестве комплементарного ДНК-зонда для гибридизации с фиксированными на мембране ДНК исследуемых штаммов осуществляли при 42 °С с помощью набора реагентов для мечения ECL (ECL Direct Nucleic Acid Labelling and Detection Systems; Amersham, Англия). Для выявления ДНК иерсиний, гибридизованных с зондами, мембрану обрабатывали с помощью набора реагентов ECL и экспонировали в течение 30 минут на светочувствительной пленке Hyperfilm ECL, помещенной в кассету.
ПЦР проводили в режиме автоматической амплификации на приборе РТС-100 (MJ Pesearch, Inc). Финальный объем реакционной смеси составил 50 мкл и
содержал 1,25 U Taq ДНК полимеразы (Roche/Cetus) с прилагаемым буфером, MgCl2 в концентрации 2 мМ и по 200 мкМ каждого из четырех дезоксинуклеозид-трифосфатов. Все праймеры использовали в финальной концентрации 0,3 мкМ. ПЦР проводили по программе: 1 цикл 94 °С -3 мин; 30 циклов амплификации 94 °С - 30 сек, 55 °С - 1 мин, 72 °С - 2 мин; 72 °С - 10 мин. Продукты ПЦР разделяли методом электрофореза в 1% агарозном геле с окрашиванием этидий бромидом и последующей визуализацией в ультрафиолетовом свете.
Проведено секвенирование генома плазмиды pVM82 по методике «дробовика» (работа проводилась в рамках совместного проекта с Институтом геномных исследований, (США)). Выделение плазмидной ДНК проводили методом щелочной экстракции ДНК по Бирнбоу-Долли с модификацией (Feliciello I., 1993). Плазмидную ДНК подвергали случайному дроблению (Nelson К.Е., 1999), последовательность генома плазмиды была собрана используя Celera assembler (Huson D.H., 2001). Для аннотации генома использовали TIGR Manatee system.
Для секвенирования генов уртА и уртС проводили ПЦР со штаммами Y. pseudotuberculosis с использованием праймеров к гену уртА. Продукт ПЦР очищали, применяя набор микроколонок QIAquick PCR purufication Kit (Qiagen). Секвенирование проводили, используя Big Dye terminator cycle sequencing FS Ready Reaction kit (Perkin-Elmer) и ABI Prism 310 genetic analyzer (Perkin-Elmer).
В ходе разработки тест системы получены гипериммунные сыворотки. Для этого штамм Y. enterocolitica 0:3 культивировали 24 ч в мясопептонном бульоне, затем 24 ч на агаре Хоттингера (pH 7,2) при 28 °С, готовили взвесь бактерий в физиологическом растворе с концентрацией 109кл/мл. Кроликам массой 2,5 - 3 кг вводили взвесь бактерий по схеме: под конъюнктиву - 0,1 мл, через 3 дня и далее вводили такую же дозу внутривенно трехкратно с интервалом 3 дня, через 7 дней - под конъюнктиву, через 3 дня однократно внутривенно. Также готовили гипериммунные сыворотки к комплексу рекомбинантных белков (Yops) YopM Y. enterocolitica, YopE Y. enterocolitica, YopH Y. enterocolitica, YopD Y. enterocolitica (Cat. No. #RPY003, #RPY004, $RPY005, #RPY006 «Omnio AB», Швеция). Кроликов иммунизировали по схеме: внутримышечно - 10 мкг двукратно с интервалом в 7 дней, внутрибрюшинно - 2,5 мкг через 14 дней, подкожно - 15 мкг через сутки, внутрибрюшинно двукратно по 15 мкг через 3 дня, внутривенно по 15 мкг через 4,2, и 2 дня соответственно.
Электрофорез белков проводили по Laemmli (1970), с использованием камеры для вертикального электрофореза Mini-Protean Tetra Cell; Bio-Rad, США. Для переноса белков на НЦМ по Towbin Н (1992) полусухим методом применяли аппарат Trans-Blot Semi-Dry Transfer Cell; Bio-Rad, США.
Для выявления антител к иерсиниям методом иммуноблота использован диагностический набор Иммуноблот (А), разработанный в ходе настоящего исследования.
В качестве препарата сравнения использован коммерческий набор (Иммуноблот (К)) «Иерсинии IgG Вестерн-блот» и «Иерсинии IgA Вестерн-блот» производства «Euroimmun», Германия.
s
Применяли РИГА с коммерческими эритроцитарными
диагностикумами: псевдотуберкулезным и кишечноиерсиниозными 0:3 и 0:9 (НИИВС, Санкт-Петербург). •
Для постановки РА использовали иерсиниозные корпускулярные антигены серотипов: Y. pseudotuberculosis серотипа 0:1 и 0:3, Y. enterocolitica серотипов 0:3; 0:5,27; 09 (ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера).
Для выявления иерсиниозных антител методом ИФА применены коммерческие тест-системы «Иерсиниоз-ИФА-IgA», «Иерсиниоз-ИФА-IgA», «Иерсиниоз-ИФА-IgM» (ООО «Омникс», Санкт-Петербург), предназначенные для выявления антител классов А, М и G к белкам наружной мембраны иерсиний.
Основные положения диссертации, выносимые на защиту
1. Для штаммов Y. pseudotuberculosis, выделенных на территории России и Японии, в сравнении со штаммами, выделенными на территории Европы, Северной и Южной Америк, Австралии и Африки характерно наличие различных генетических детерминант вирулентности (уртА, уршВ, уртС, HPI, R-HPI, YAPI, L-YAPI, pVM82).
2. У штаммов Y. pseudotuberculosis охарактеризовано 14 генотипов: 1а (НР1+ ypmA+), 2а (HPI+), 2b (HPI+L-YAPI+), 2с (HPI+YAPI+), За (уршА+), ЗЬ (ypmA+L-YAPI+), Зс (ypmA+L-YAPI+pVM82+), 3d (уртА+ pVM82+), 4 (уртВ+), 5а (R-НРГуртС+), 5b (R-HPI+ ypmC+L-YAPI+), 6а (НРГургпУАРГ pVM82"), 6b (L-YAPI+), 6с (pVM82+). Установлена особенность распространенности штаммов Y. pseudotuberculosis различных генотипов на территориях 25 стран мира пяти континентов.
3. У больных псевдотуберкулезом, от которых выделены штаммы генотипов ЗЬ и Зс достоверно чаще выявляются поражения печени, что утяжеляет течение болезни, по сравнению с пациентами, заболевание которых обусловлено Y. pseudotuberculosis генотипа За.
4. Применение набора, разработанного для выявления специфических противоиерсиниозных иммуноглобулинов G, А, и М в образцах крови или плазмы человека методом иммуноблота, позволяет проводить этиологическую диагностику иерсиниозов, в том числе с хроническим течением. Чувствительность диагностического набора составляет 90,9±2,7%, специфичность 95,2±3,3%.
Степень достоверности и апробация результатов:
Штаммы Y. pseudotuberculosis, использованные в работе выделены от больных, животных, с продуктов питания в ходе расследования вспышек псевдотуберкулеза, а также спорадических случаев заболевания и при текущем эпидемиологическом надзоре. Больные включены в исследование на основании лабораторного подтверждения диагноза иерсиниозной инфекции при отрицательных результатах обследования на другие инфекции вирусной и/или бактериальной этиологии, за исключением сопутствующих инвазий, а также при отсутствии соматической патологии.
Статистическая обработка данных проведена методами статистического анализа при помощи стандартных пакетов программ STATISTICA 6.0. Для оценки достоверности различий между несколькими группами наблюдений использованы методы дисперсионного анализа. Достоверность различий оценивали по критерию Стыодента (t) и величины вероятности (р). За достоверность различий принимали значение р<0,05, вероятность различий составляла 95% и более.
По теме диссертации опубликованы: 18 работ, в том числе 4 - в изданиях, рекомендуемых ВАК, получено 4 патента.
Основные результаты исследований доложены и обсуждены на российских и международных конференциях в 2006 -2011 гг.: 22-24 марта 2006 г. СПб, Российская научно-практическая конференция, посвященная 110-летию кафедры инфекционных болезней Военно-медицинской академии им. С.М. Кирова «Инфекционные болезни: проблемы здравоохранения и военной медицины»; 1213 октября 2006 г. СПб, II Всероссийская научно-практическая конференция с международным участием «Инфекции, обусловленные иерсиниями»; 11 апреля 2006 г. НИИЭМ им. Пастера, СПб, заседание общества эпидемиологов, микробиологов и паразитологов в Санкт-Петербурге и Ленинградской области; 24 июня 2008 г. СПб, Четвертая международная конференция «Идеи Пастера в борьбе с инфекциями»; 18-20 мая 2010 г. СПб, НИИЭМ им. Пастера, Международная конференция «Развитие научных исследований и надзор за инфекционными заболеваниями»; 10-12 ноября 2010 г. СПб, НИИЭМ им. Пастера Семинар «Унификация лабораторных методов индикации и идентификации иерсиний и антител к ним»;24-25 ноября 2011 г. СПб, 8-я Северо-Западная научная гастроэнтерологическая сессия «Гастроэнтнрология. Гепатология. Колопроктология. Фармакотерапия. Питание.»; 12-15 октября 2011 г. СПб, Третья всероссийская научно-практическая конференция с международным участием «Инфекции, обусловленные иерсиниями».
Личный вклад автора
Основные результаты получены лично автором. Выделение штаммов проведено в Национальных Yersinia референс-центрах ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера и Парижского института Пастера, ГБОУ ВПО СПбГПМУ Минздрава Россил, ФГУЗ Иркутский НИПЧИ Сибири и Дальнего Востока и ЦГЭ Республики Карелия.
Исследования по генотипированию штаммов Y. pseudotuberculosis, секвенированию участков гена уртА/С проведены автором на базе Парижского института Пастера и ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера в Санкт-Петербурге.
Микробиологические, серологические, экспериментальные исследования, систематизация и анализ полученных данных, статистический анализ данных проведен автором в лаборатории бактериальных инфекций ФБУН «Санкт-Петербургский институт эпидемиологии и микробиологии имени Пастера».
Секвенирование плазмидой ДНК штамма Y. pseudotuberculosis проведено сотрудниками института геномных исследований, США, в рамках совместного проекта.
Структура и объем диссертации
Основной текст диссертации изложен на 142 страницах машинописного текста и состоит из введения, 3 глав собственных исследований, заключения, приложений.
Диссертация иллюстрирована 23 таблицами и 9 рисунками. Список литературы содержит 157 источников, в том числе 39 отечественных авторов и 118 источников зарубежных авторов.
ОСНОВНОЕ СОДЕРЖАНИЕ РАБОТЫ Определение генетических детерминант вирулентности у штаммов Y. pseudotuberculosis, выделенных в различных географических регионах
Отсутствие данных о нуклеотидной последовательности генома плазмиды pVM82, обусловило проведение её секвенирования. Определены гены вирулентности плазмиды pVM82, кодирущей несколько факторов, которые могут играть роль в патогенности Y. pseudotuberculosis, основным из которых являются гены icm/dot системы секреции IVB типа (Segal G., 2005). icm/dot система секреции, ранее обнаруженная у Legionella pneumophila и Coxieila burnetti, опосредует внутриклеточное персистирование микроорганизмов в эпителиальных клетках, является триггером для иммунной системы макроорганизма, и, соответственно, может вызывать скарлатиноподобные проявления заболевания (Wren B.W., 2003). Также плазмида несет оперон umuDC, гомологичный таковому у Е. Coli, который придает бактерии устойчивость к ультрафиолетовым лучам, что способствует ее выживанию в окружающей среде (Penny J., 2009).
С помощью методов дот-блот гибридизации и ПЦР исследовано 309 штаммов Y. pseudotuberculosis, выделенных на пяти континентах, на наличие генов плазмид pVM82 и pYV 46 МДа, а также хромосомных генов урт суперантигена, HPI и YAPI. Невозможность дифференциации генов уртА и уртС методами дот-блот гибридизации или ПЦР из-за различий в их последовательностях друг от друга на один нуклеотид (Сагпоу С., 1999) послужило предпосылкой к секвенированию участка генов уртА/С 23 штаммов, выделенных на различных мировых территориях.
Среди представителей популяции возбудителя псевдотуберкулеза выявлены особенности циркуляции штаммов, содержащих разные генетические детерминанты вирулентности, связанные с географическими регионами мира. Данные представлены в таблице 2.
Показано, что в I группе штаммов (выделены на территориях России и Японии) доминируют изоляты серотипа 0:1Ь, несущие ypmA - 95,5±1,4%, L-YAPI - 70±3,2%, а также содержащие плазмиду pVM82 - 58,5±3,4%.
У штаммов II группы (выделены на территориях Южной и Северной Америк, Африки, Австралии и стран Европы) напротив, вышеуказанные гены вирулентности встречаются довольно редко за исключением L-YAPI - 23,8±4%. Среди изолятов II группы превалируют штаммы серотипов 0:1а и О:lb, обладающие HPI - 46,7±4,7% штаммов. Такие детерминанты вирулентности как
Таблица 2. Результаты определения генетических детерминант вирулентности у штаммов Y. pseudotuberculosis, изолированных в различных странах мира. __
Генетические Штаммы I группы, n=200 Штаммы II группы, п=109
детерминанты (Россия, Япония) (Сев. и Юж. Америки,
вирулентности Африка, Австралия, Европа)
абс. %±ш абс. %±т
уртА 191 95,5±1,4 7 6,4±2,3
уртВ - - - -
уртС - - 10 9,1±2,7
HPI 12 6±1,6 51 46,7±4,7
R-HPI - - 10 9,1±2,7
YAPI - - 8 7,3±2,4
L-YAPI 140 70±3,2 26 23,8±4
pVM82 117 58,5±3,4 6 5,5±2,2
полный YAPI, ургпС, R-HPI у штаммов I группы не обнаружены, у штаммов II группы встречаются редко.
Генотипическая характеристика штаммов Y .pseudotuberculosis различного происхождения, выделенных в разных регионах мира
По результатам определения генетических детерминант вирулентности проведено внутривидовое типирование возбудителя псевдотуберкулеза. Все изученные штаммы Y. pseudotuberculosis разделены на генотипы, в соответствии с данными, опубликованными ранее (Fukushima Н., 2001 г.) и дополнены новыми подгруппами, выявленными в настоящем исследовании, за счет ранее не изученных маркеров: хромосомных генов YAPI и плазмиды pVM82. Учитывали содержание штаммами полного YAPI - по наличию генов pilPQ, api 74 и так называемого Left - YAPI (L-YAPI), состоящего из консервативной левой части, в которую входит pil локус; а также содержание полного HPI - по наличию генов irp2, fyuA и Right - HPI (R-HPI), с утраченной левой частью - по наличию гена irp2. В зависимости от содержания генетических детерминант вирулентности впервые выделены 14 генотипов: 1а(НР1 +уршА+), 2а (HPI +), 2b (HPI + L-YAPI+), 2с (HPI + YAPI+), За (ypmA+), 3b (уртА+ L-YAPI+), Зс (уртА+ L-YAPI+ pVM82+), 3d (уртА+ L-YAPI+), 4 (уртВ+), 5а (R-HPI +уртС+), 5b (R-HPI + уртС+ L-YAPf), 6а (НРГурт' YAPI" pVM82"), 6b (L-YAPI+), 6c (pVM82+).
Анализ данных распределения штаммов Y. pseudotuberculosis из I и II групп по генотипам выявил различия в их распространенности в различных регионах мира, рисунок 1.
60 50 40 30 20 10 0
; II группа I группа
1а 2а 2Ь 2с За ЗЬ Зс 3d 5а 5Ь 6а 6Ь 6с
Генотипы штаммов Y. pseudotuberculosis
Рисунок 1 - Данные распределения штаммов Y. pseudotuberculosis из 1 и 11 групп по генотипам, (%).
Для территорий России и Японии характерно доминирование штаммов Y. pseudotuberculosis генотипов За, ЗЬ и Зс - в 21±2,8%, 14,5±2,4% и 55±3,5% соответственно. Штаммы Y. pseudotuberculosis генотипа 1а обнаружены только на территории РФ в единичных случаях (1,5±0,8%), редко встречаются также штаммы генотипа 3d - в 3,5±1,2% случаев. Штаммы вышеперечисленных генотипов вызывают заболевания псевдотуберкулезом с симптомами ДСЛ. На территории остальных стран мира, где были выделены штаммы Y. pseudotuberculosis, напротив, распространены, главным образом, штаммы генотипов: 2а - в 29,3±4,3%; 2Ь в 10±2,8% и 2с в 7,4±2,5% случаев. Показано, что эти штаммы вызывают псевдотуберкулез с симптомами, характерными для европейских территорий: с гастроинтестинальными проявлениями, лихорадкой, мезаденитом, аппендицитом (Fukushima Н., 2001). Так же для этих территорий характерно распространение штаммов возбудителя псевдотуберкулеза генотипов 6а и 6Ь - в 25,8±4,1 и 9,2±2,7% случаев, соответственно. Только у изолятов II группы определены генотипы 2с, 5а, 5Ь, 6а, 6Ь, 6с.
Штаммы 4 генотипа не обнаружены.
Наиболее углубленно изучены характеристики 196 штаммов, выделенных на территориях РФ. Данные распространения штаммов Y. pseudotuberculosis различных генотипов в регионах РФ в сравнении с данными распространения штаммов, выделенных на территории Европы (61 штамм), представлены на рисунке 2. Впервые показано, что на территориях Северо-Западного региона доминируют штаммы Y. pseudotuberculosis серотипа О:lb генотипаЗс - в 87,8±5,1% случаев; Сибири - штаммы серотипа О:lb генотипа Зс, За и ЗЬ - в 49,3±4,1%, 30±3,7%, и 19,9±3,3%, соответственно.
В Дальневосточном регионе, наряду со штаммами генотипа Зс (11,1±10,4% случаев), часто встречаются штаммы генотипов За (55,6±16,5% случаев) и 2а (33,3±15,7% случаев).
случаев; значительно реже За и ЗЬ - в 16,3±2,8 и 17,6±2,9% соответственно. В то же время от одного больного из Северо-Западного региона выделен штамм генотипа 2Ь. Среди штаммов, выделенных из продуктов питания и от грызунов превалируют типичные для России штаммы генотипов За и Зс, но в то же время 40±12,6% штаммов, выделенных от грызунов имеют генотип 2а, что свидетельствует о циркуляции возбудителя псевдотуберкулеза данного генотипа на территориях РФ.
При ретроспективном расследовании 20 вспышек псевдотуберкулеза на территории Сибири (17 вспышек) и Северо-Западного региона РФ (3 вспышки) установлено, что на Северо-Западных территориях РФ и в Сибири наиболее эпидемически значимыми являются штаммы Y. pseudotuberculosis серотипа О:lb генотипа Зс. В ходе вспышек также выделены штаммы генотипов 1а, За, ЗЬ, 3d, являющиеся типичными для России. В тоже время обнаружены нехарактерные штаммы бактерий генотипов 2а и 2Ь. Значимость штаммов этих генотипов в настоящее время, надо полагать, недооценена из-за недостаточного обследования пациентов, так как клинические симптомы псевдотуберкулеза, вызванного этими штаммами весьма близки к проявлениям ОКИ неустановленной этиологии. Наблюдение за генотипической характеристикой Y. pseudotuberculosis позволяет определить циркуляцию доминирующих генотипов и появление на определенной территории штаммов других генетических вариантов, что важно для выявления путей и факторов передачи возбудителя, своевременного выявления заболеваний псевдотуберкулезом при возможной смене генотипа возбудителя.
Характеристика псевдотуберкулезной инфекции, вызванной Y. pseudotuberculosis различных генотипов
Проведен анализ 142 историй болезни пациентов, от которых были выделены исследованные штаммы. Установлено, что 60±3,8% случаев заболевания обусловлено штаммами генотипа Зс; 17,6±2,9% - генотипа ЗЬ; 16,3±2,8% - генотипа За. При проведении сравнительного анализа клинических симптомов псевдотуберкулеза, вызванного штаммами указанных генотипов установлено, что все штаммы обуславливают проявление у пациентов тех или иных симптомов, характерных для ДСП: лихорадки, сыпи, симптома «перчаток» и/или «носков», симптома «малинового» языка, проявлений со стороны желудочно-кишечного тракта.
Установлено, что частота отдельных симптомов заболевания, вызванного штаммами разных генотипов существенно различалась. Повышение температуры тела выше 38,5 °С достоверно чаще наблюдалось у больных с заболеванием, обусловленным штаммами генотипов ЗЬ и Зс по сравнению с аналогичной патологией, вызванной штаммами генотипа За (72,4±8,4%; 68,9±4,9% и 23,1±8,4%, соответственно); симптомы поражения верхних дыхательных путей достоверно реже наблюдались у больных, от которых выделены штаммы генотипа За, по сравнению с больными, от которых выделены штаммы генотипов ЗЬ и Зс (53,8±9,9% и 79,3±7,6%; 80,5±4.2%, соответственно); частое вовлечение в патологический процесс печени, наблюдалось как у больных с заболеваниями, обусловленными штаммами генотипа ЗЬ, так и генотипа Зс - 65.5±8,9%;
57,5±5,3%, по сравнению с пациентами от которых выделены штаммы генотипа За - в 7,7±5,3% случаев (р < 0,001). У больных с заболеванием, обусловленным штаммами генотипов ЗЬ или Зс характерна тенденция к увеличению частоты поражения селезенки.
Разработка варианта тест-системы для диагностики иерсиниозов методом иммуноблота
В качестве антигена для нанесения на НЦМ применена композиция рекомбинантных белков (Уорэ) УорМ У. еЩегосо1Шса, УорЕ У. егиегосоШюа, УорН У. егНсгосоПНса, УорЭ У. етегосоНИса (Са1. N0. #ЯРУ003, #ЯРУ004, #11РУ005, #ЯРУ006 «Ошпю АВ», Швеция). Известно, что Уорэ встречаются только у патогенных иерсиний (РикиэЫта Н., 1998; СогпеНэ О.Я., 1989).
При разработке условий постановки метода исследован интервал концентраций композиции рекомбинантных белков от 10 мкг до 100 мкг на 1 карман ПААГ шириной 5 мм. Оптимальную концентрацию композиции рекомбинантных белков определяли визуально по наличие четких полос антигенов после окрашивания блотовых стрипов. Установлено, что минимальная концентрация, обеспечивающая достаточную чувствительность набора, составляет 12,5 мкг при внесении в карман ПААГ шириной 5 мм, и, соответственно, 162,5 мкг при внесении в карман шириной 65 мм. Использован 4% концентрирующий и 12% разделяющий ПААГ. После электрофореза белковые профили переносили на НЦМ. Мембрану разрезали на 26 блотовых стрипов. Для контроля переноса белков один стрип из каждой мембраны окрашивали амидо черным; один стрип в дальнейшем инкубировали с кроличьей сывороткой, содержащей суммарные антитела против Уорэ, и использовали его как контрольный шаблон, по 3 стрипа использовали на исследование одной сыворотки для поиска иммуноглобулинов А, М и О (всего исследовали 8 сывороток на стрипах НЦМ одной серии).
На этапе проведения ИФА определяли специфические антитела, представленные различными классами иммуноглобулинов (А, М и О) и направленные к отдельным антигенам иерсиний. В качестве конъюгатов применены пероксидазные конъюгаты моноклональных антител, направленных к эпитопам иммуноглобулинов человека классов А, М или в; ООО Полигност, Санкт-Петербург (в разведении 1:100 (по прилагаемой инструкции) и 1:50); и конъюгаты антител козы к иммуноглобулинам человека классов А, М и в со щелочной фосфатазой; 1пукго§еп, Новая Зеландия (в разведении 1:10000 и 1:15000 (по инструкции)). Оценка чувствительности конъюгатов проведена на этапе внесения субстратной смеси, визуально, по появлению четких полос окрашенного комплекса антитиген-антитело на блотовых стрипах. В опыте использован положительный в РНГА с эритроцитарным псевдотуберкулезным диагностикумом человеческий ОСК в титре 1/800. Определена высокая эффективность конъюгатов меченых фосфатазой, положительный результат получен при разведении сыворотки 1:51, тогда как при использовании пероксидазных конъюгатов 1:2,5. В дальнейших лабораторных исследованиях применены конъюгаты антител козы к иммуноглобулинам человека классов А, М
преимущество имеет Иммуноблот (А) (91,4±2,9% положительных
результатов) перед РИГА и РА (82,7±3,9% и 83,9±3,8% положительных результатов соответственно).
При обследовании больных с ХИ частота обнаружения специфических антител в иммуноблоте достоверно превышает частоту обнаружения специфических антител по сравнению с другими методами (р < 0,001 по сравнению с ИФА и РИГА и р < 0,05 по сравнению с РА) и составляет 94,4±5,4% при суммарном определении иммуноглобулинов, рисунок 5. Наиболее часто определены - 88,8±7,6%, ^А в 44,4±12%, ^М обнаружены у одного пациента (5,5±5,5%).
100 80 60 40
20 -Н
88,8
f
5,5
72,2
22,2
VW^'
обпо^*
РС-
ЗВ,8 38,8
ш
41,4-
Вантитела суммарно BlgM DlgG DlgA
Рисунок 5 - Частота лабораторного подтверждения диагноза иерсиниоз различными методами среди пациентов с ХИ.
Определение отдельных классов иммуноглобулинов дает дополнительные возможности для постановки правильного диагноза в сочетании с клиническими данными. Частота обнаружения специфических антител другими методами была существенно ниже Иммуноблот (А) (в РА составила 72,2±10,5%, ИФА 38,8±11,8% и РИГА 22,2±10% соответственно).
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
Таким образом, при секвенировании плазмиды pVM82 определены гены, оказывающие влияние на проявления вирулентных свойств возбудителя псевдотуберкулеза, основные из них - гены icm/dot системы секреции IVB типа. Методом дот-блот гибридизации у штаммов Y. pseudotuberculosis обнаружены гены вирулентности icm/dot системы секреции IVB типа, umuDC.
Установлено, что у штаммов Y. pseudotuberculosis, выделенных на территориях России и Японии, преобладают хромосомные генетические детерминанты вирулентности - ypmA (95,5±1,4%), L-YAP1 (70±3,2%) и плазмида
pVM82 (58,5±3,4%). У штаммов Y. pseudotuberculosis, выделенных на территориях Европы, Северной и Южной Америк, Австралии и Африки наиболее часто выявлены HPI (46,7±4,7%) и L-YAPI (23,8±4%).
У штаммов Y. pseudotuberculosis различного географического происхождения определено 14 генотипов. На территориях Европы, Северной и Южной Америк, Австралии и Африки широко распространены генотипы 2а (НРГ), 2Ь (НРГ L-YAPI+) и 6а (НРГ ypm" YAPI" pVM82'), 6b (L-YAPI+). На территориях России, у изученных штаммов, выделенных из различных источников выявлено 7 генотипов, доминирующими являются генотипы За (ypmA+), 3b (ypmA+ L-YAPf) и Зс (ypmA L-YAPI+ pVM82+). Обнаружение на территории России штаммов Y. pseudotuberculosis генотипов 2а и 2Ь обосновывает необходимость расширения групп больных для обследования на псевдотуберкулез, особенно из числа ОКИ.
При изучении клинических проявлений псевдотуберкулеза, обусловленного штаммами За, ЗЬ и Зс генотипов нами установлено, что симптомы, характерные для ДСЛ, наблюдались у больных всех 3-х групп. Штаммы генотипов ЗЬ (уршА+ L-YAPI+) и Зс (ypmA+ L-YAPI+ pVM82+) по сравнению со штаммами генотипа За (ypmA ) вызывают псевдотуберкулез, сопровождающийся более тяжелым течением заболевания, с вовлечением в патологический процесс печени и селезенки, с большей выраженностью симптомов интоксикации. Наличие у штаммов Y. pseudotuberculosis таких генетических детерминант вирулентности как L-YAPI и pVM82 способствует более тяжелому течению заболевания и требует дальнейшего изучения влияния каждого из них. Характерна тенденция более тяжелого течения псевдотуберкулеза, обусловленного штаммами Y. pseudotuberculosis генотипа Зс, содержащего все три генетические детерминанты вирулентности - уршА+ L-YAPI+ pVM82+.
Нами сконструирован отечественный диагностический набор, состоящий из ингредиентов для иммуноферментного анализа на твердофазном носителе, предназначенный для качественного определения антител классов G, М и А человека к антигенам патогенных Yersinia в образцах сыворотки или плазмы крови методом Лайн-блота; разработана методика производства препарата, подобраны оптимальные условия проведения анализа и физико-химические параметры, обеспечивающие высокую чувствительность, специфичность набора и стандартность метода. Установлена высокая диагностическая эффективность препарата: чувствительность 90,9±2,7%, специфичность 95,2±3,3%. При обследовании больных с ХИ частота обнаружения специфических антител в иммуноблоте достоверно выше по сравнению с ИФА, РА, РНГА (р<0,001 по сравнению с ИФА и РНГА и р<0,05 по сравнению с РА).
Выводы
1. Методом дот-блот гибридизации у штаммов Y. pseudotuberculosis обнаружены нуклеотидные последовательности плазмиды pVM82, несущей гены вирулентности icm/dot системы секреции IVB типа, umuDC.
2. У штаммов Y. pseudotuberculosis, выделенных на территориях России и Японии, наиболее часто выявлены хромосомные генетические детерминанты вирулентности: ypmA (95,5±1,4%), L-YAPI (70±3,2%) и
плазмида pVM82 (58,5±3,4%). У штаммов Y. pseudotuberculosis,
выделенных на территориях Европы, Северной и Южной Америк, Австралии и Африки наиболее часто выявлены HPI (46,7±4,7 %) и L-YAPI (23,8±4 %).
3. У штаммов Y. pseudotuberculosis различного географического происхождения охарактеризовано 14 генотипов. На территориях Европы, Северной и Южной Америк, Австралии и Африки широко распространены генотипы 2а (НР1+) - 29,3±4,3%, 2Ь (НРГ L-YAPI+) - 10±2,8% и 6а (HPI'yprn YAPI" pVM82") - 25,8±4,1%, 6b (L-YAPI+) - 9,2±2,7%. На территориях России у изученных штаммов, выделенных их различных источников, выявлено 7 генотипов, доминирующими являются генотипы За (уртА+) -21±2,8%, 3b (yprnA+ L-YAPI+) - 14,5±2,4% и Зс (ypmA+ L-YAPI+ pVM82+) -55±3,5%.
4. На территориях России распространенность штаммов Y. pseudotuberculosis генотипов 2а и 2Ь (обуславливающих псевдотуберкулез с симптомами мезентериального лимфаденита, острого аппендицита и гастроинтестинальными проявлениями) составляет 6,1±1,7%.
5. На территориях России от больных псевдотуберкулезом выделены штаммы Y. pseudotuberculosis генотипов Зс в 60±3,8% случаев, ЗЬ в 17,6±2,9%, За в 16,3±2,8%. Установлена зависимость частоты развития поражений печени и тяжести течения болезни от генотипа возбудителя. Развитие поражений печени у больных достоверно чаще (р<0,001) в 65,5±8,9% и 57,5±5,3% случаев возникает под влиянием Y. pseudotuberculosis генотипов ЗЬ и Зс по сравнению с Y. pseudotuberculosis генотипа За.
6. Сконструирован отечественный диагностический набор, предназначенный для качественного определения специфических противоиерсиниозных атител G, М и А в сыворотке или плазме крови человека методом Лайн-блот для лабораторной диагностики иерсиниозов с острым и хроническим течением. Чувствительность диагностического набора 90,9±2,7%, специфичность 95,2±3,3%.
Практические рекомендации
1. Для микробиологического мониторинга за псевдотуберкулезом с целью прогнозирования эпидемической ситуации рекомендуется определять основные генетические детерминанты вируленности (уртА, уртВ, уртС, YAPI, L-YAPI, HPI, R-HPI, pVM82, pYV 46 МДа) и определять генотипы у штаммов Y. pseudotuberculosis, циркулирующих на территории наблюдения, методом дот-блот гибридизации или ПЦР.
2. С целью выявления заболевания, обусловленного штаммами Y. pseudotuberculosis генотипов 2а и 2Ь, рекомендуется проводить диагностические исследования на псевдотуберкулез у больных с симптомами мезентериального лимфаденита, острого аппендицита и гастроинтестинальными проявлениями.
3. Для повышения эффективности этиологической диагностики иерсиниозов, особенно с хроническим течением заболевания, рекомендуется использовать диагностический набор для определения специфических противоиерсиниозных IgG, IgM или IgA к антигенам патогенных Yersinia методом Лайн-блота.
Перспективы дальнейшей разработки темы
В дальнейшем планируется продолжить изучение распространения штаммов Y. pseudotuberculosis на не исследованных территориях России с определением генотипа возбудителя псевдотуберкулеза. Необходимо проводить исследования для изучения влияния отдельных генетических детерминант вирулентности на клиническое течение болезни.
Список работ, опубликованных по теме диссертации
1. Кокорина, Г.И. Применение иммуноблота в диагностике затяжных форм иерсиниозов и изучении вопросов патогенеза (обзор литературы) / Г.И. Кокорина, О.А. Шендерович, Г.Я. Ценева // Журн. клин. лаб. диагностика. - 2006. - № 11. - С. 47-50.
2. Кокорина, Г.И. Патотипы возбудителя псевдотуберкулеза и их значение в инфекционном процессе / Г.И. Кокорина [и др.] // Мат-лы Росс, научно-пракгг. конф., посвященной 100-летию кафедры инфекционных болезней Военно-медицинской Академии им. С.М. Кирова «Инфекционные болезни: проблемы здравоохранения и военной медицины». - СПб., 2006. - С. 154.
3. Бургасова, О.А. К вопросу о поражении опорно-двигательного аппарата у больных иерсиниозами / О.А. Бургасова, Г.И. Кокорина, А.А. Яковлев // Мат-лы П-й Всеросс. научно-практ. конф. «Инфекции, обусловленные иерсиниями». - СПб., 2006. - С. 51.
4. Ценева, Г.Я. Современные возможности лабораторной диагностики псевдотуберкулеза и иерсиниоза / Г.Я. Ценева [и др.] // В кн: Иерсинии и иерсиниозы: под ред. Г.Я. Ценевой. - СПб., 2006,- С. 85-163.
5. Кокорина, Г.И. Сравнительная оценка вирулентности Y. pseudotuberculosis с разным набором факторов патогенности в опытах in vivo / Г.И. Кокорина, Г.Я. Ценева, Е.А. Воскресенская // Мат-лы Н-й Всеросс. научно-практ. конф. «Инфекции, обусловленные иерсиниями». - СПб., 2006, - С. 85-86.
6. Кокорина, Г.И. К вопросу о генетических маркерах патогенности Y. pseudotuberculosis, циркулирующих в различных географических зонах / Г.И. Кокорина [и др.] // Мат-лы П-й Всеросс. научно-практ. конф. «Инфекции, обусловленные иерсиниями». - СПб., 2006. - С. 87-88.
7. Eppinger, М. The complete genome sequence of Yersinia pseudotuberculosis IP31758, the causative agent of Far East scarlet-like fever / M. Eppinger [et. al] // PLoS Genet. - 2007. - Vol. 3, № 8. -el42 doi: 10.1371/0030142
8. Кокорина, Г.И. Новое в диагностике затяжных форм иерсиниозных инфекций / Г.И. Кокорина, Г.Я. Ценева, О.А. Бургасова // Мат-лы IV межд.
конф. «Идеи Пастера в борьбе с инфекциями». - СПб.: ООО
«БАСТИОН»,- 2008. - С. 95.
9. Кокорина, Г.И. Распространение штаммов Yersinia pseudotuberculosis, содержащих плазмиду pVM82 MDa, в Украине и Северо-Западном регионе РФ Z Г.И. Кокорина, Выдайко Н.Б. ZZ Мат-лы межд. конф. «Развитие научных исследований и надзор за инфекционными заболеваниями». -СПб., 2010.-С. 99.
Ю.Воскресенская, Е.А. Генетические особенности Yersinia pseudotuberculosis, клинические варианты течения псевдотуберкулезной инфекции и оптимизация ее диагностики Z Е.А. Воскресенская [и др.] ZZ Мат-лы межд. конф. «Развитие научных исследований и надзор за инфекционными заболеваниями». - СПб., 2010. - С. 92.
11. Кокорина, Г.И. Разработка тест-системы для серодиагностики иерсиниозов методом иммуноблота Z Г.И. Кокорина[и др.] ZZ Эпидемиол. и инфекц. болезни. - 2011. - № 4. - С. 18-23.
12.Шестакова, М.Д. Абдоминальная форма иерсиниозных инфекций у детей на современном этапе Z М.Д. Шестакова, Е.А. Воскресенская, Г.И. Кокорина ZZ Мат-лы 8-й Северо-Западной научной гастроэнтерологической сессии «Гастроэнтерология. Гепатология. Колопроктология. Фармакотерапия. Питание». - СПб., 2011. - С. 42.
13.Шестакова, М.Д. Острый аппендицит иерсиниозной этиологии у детей Z М.Д. Шестакова, А.А. Денисова, Г.И. Кокорина ZZ Мат-лы 8-й СевероЗападной научной гастроэнтерологической сессии «Гастроэнтерология. Гепатология. Колопроктология. Фармакотерапия. Питание». — СПб., 2011. -С. 43.
14.Патент на изобретение «Тест-штамм Yersinia pseudotuberculosis для дифференциации бактерий Yersinia pseudotuberculosis генетической группы I» № 2465319 от 16.09.2011. - Авторы: Кокорина Г.И.
15.Патент на изобретение «Тест-штамм Yersinia pseudotuberculosis для дифференциации бактерий Yersinia pseudotuberculosis генетической группы 1а» № 2465321 от 16.09.2011. - Авторы: Ценева Г.Я., Кокорина Г.И., Климов В.Т.
16.Патент на изобретение «Тест-штамм Yersinia pseudotuberculosis для дифференциации бактерий Yersinia pseudotuberculosis генетической группы II» № 2465317 от 16.09.2011. - Авторы: Кокорина Г.И., Воскресенская Е.А., Чеснокова М.В.
17.Патент на изобретение «Тест-штамм Yersinia pseudotuberculosis для дифференциации бактерий Yersinia pseudotuberculosis генетической группы На» № 2465318 от 16.09.2011. - Авторы: Кокорина Г.И., Воскресенская Е.А., Климов В.Т.
18.Шестакова, М.Д. Абдоминальная форма иерсиниозов у детей и возможности лабораторной диагностики Z М.Д. Шестакова [и др.] ZZ Педиатрия. - 2012. - № 4. - С. 37-42.
Список сокращений:
ДСЛ - Дальневосточная скарлатиноподобная лихорадка ЗИ - Затяжное течение иерсиниозов
Иммуноблот (А) - Авторский набор для определения IgG, IgM или IgA к антигенам патогенных Yersinia методом Лайн-блота
Иммуноблот (К) - Коммерческий набор для определения IgG или IgA к антигенам
патогенных Yersinia методом Вестерн-блота
ИФА — Иммуноферментный анализ
НЦМ - Нитроцеллюлозная мембрана
ОИ - Острое течение иерсиниозов
ОСК - Образцы сыворотки крови
ПААГ — Полиакриламидный гель
ПЦР - Полимеразная цепная реакция
РА - Реакция агглютинации
РИГА - Реакция гемагглютинации
ТБР - Трис-HCl буферный раствор
ФСБ - Фосфатно-солевой буферный раствор
ХИ - Хроническое течение иерсиниозов
ХС - Хромогенный субстрат (нитроголубой тетразолий хлорид/5-бром-4-хлор-3-и ндолил-фосфат)
HPI - «Остров» высокой патогенности (High Pathogenicity Island) pVM82 - Плазмида с мол. массой 82 МДа
pYV 46 МДа - Плазмида вирулентности иерсиний (Plasmid associated with Yersinia virulence)
SDS - Додецилсульфат натрия (Sodium dodecyl sulfate)
Yops - Белки наружной мембраны иерсиний (Yersinia outer membrane proteins) YAPI - Адгезивный «остров» патогенности иерсиний (Yersinia Adhesion Pathogenicity Island)
YPM- Суперантигенный токсин Y. pseudotuberculosis ОТ АВТОРА
Автор выражает искреннюю благодарность научному руководителю - Галине Яковлевне Ценевой за помощь в организации и выполнении работы и благодарит сотрудников лаборатории бактериальных инфекций ФБУН НИИ им. Пастера за помощь и поддержку.
Автор благодарит сотрудников ФГУЗ «Иркутский НИПЧИ Сибири и Дальнего Востока» д.м.н. Чеснокову М.В. и к.м.н. Климова В.Т. за предоставление штаммов У pseudotuberculosis, а также всех специалистов, предоставивших штаммы и ОКС для углубленного изучения.
Автор признателен руководителю Национального Yersinia референс-центра Парижского института Пастера Элизабет Карниэль за предоставление базы для выполнения ряда исследований и коллекции штаммов.
Автор благодарит сотрудников ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера Куляшову Л.Б. и Мокроусова И.С. за ценные замечания по тексту диссертации.
Подписано в печать! 2.04)3 Формат 60x84/16
Обьем 1 п.л. Тираж 100 экз. Заказ № 264
Типография ВМедА, 194044, СПб., ул. Академика Лебедева, 6.
Текст научной работыДиссертация по биологии, кандидата медицинских наук, Кокорина, Галина Ивановна, Санкт-Петербург
Федеральное бюджетное учреждение науки «Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Пастера»
На правах рукописи
04201355655
КОКОРИНА Галина Ивановна
Генотипы штаммов Yersinia pseudotuberculosis и их клиническое и диагностическое значение
03.02.03 - микробиология
Диссертация на соискание ученой степени кандидата медицинских наук
Научный руководитель: д.м.н., профессор Ценева Г.Я.
Санкт-Петербург 2012
ОГЛАВЛЕНИЕ
ВВЕДЕНИЕ....................................................................................4
Актуальность темы исследования................................................4
Степень разработанности темы исследования..................................6
Клинические особенности проявлений псевдотуберкулеза в различных регионах мира. Роль отдельных генетических
детерминант патогенности в инфекционном процессе...............6
Молекулярно-генетические методы определения детерминант
вирулентности...............................................................17
Классы специфических антител, их обнаружение у
экспериментальных животных и у больных иерсиниозами.......23
Серологическая диагностика иерсиниозной инфекции на разных
стадиях заболевания........................................................30
Цели и задачи........................................................................34
Научная новизна....................................................................34
Теоретическая и практическая значимость работы..........................35
Методология и методы исследования............................................37
Положения, выносимые на защиту.............................................49
Степень достоверности и апробация результатов...........................49
Глава 1. Генотипическая характеристика штаммов Y. pseudotuberculosis,
выделенных в различных регионах мира.....................................53
1.1. Детерминанты вирулентности, локализованные на плазмиде pVM82..53
1.2. Характеристика некоторых генетических детерминант вирулентности у представителей мировой популяции Y. pseudotuberculosis............55
1.3. Распространение штаммов Y. pseudotuberculosis различных генотипов на мировой территории.............................................62
1.4. Распространение штаммов Y. pseudotuberculosis различных генотипов на территории России................................................65
1.5. Применение генотипирования штаммов Y. pseudotuberculosis в
эпидемиологической практике.....................................................68
Глава 2. Характеристика псевдотуберкулезной инфекции, вызванной
Y. pseudotuberculosis различных генотипов.................................73
Глава 3. Разработка варианта тест-системы для диагностики
иерсиниозов методом иммуноблота...............................................79
3.1. Получение гипериммунных кроличьих сывороток...........................79
3.2. Разработка условий постановки метода иммуноблота......................82
3.2.1. Приготовление блотовых стрипов с антигенами.....................82
3.2.2. Выявление специфических антител методом ИФА..................84
3.2.3. Учет результатов............................................................86
3.3. Характеристика диагностической ценности набора Иммуноблот (А)
в модельных опытах..................................................................90
3.3.1. Испытание лабораторного образца набора с кроличьей гипериммунной сывороткой................................................90
3.3.2. Результаты испытания набора в модельных опытах.................92
3.4. Оценка диагностической эффективности набора Иммуноблот (А)......93
3.5. Применение метода иммуноблота для диагностики иерсиниозов.......99
ЗАКЛЮЧЕНИЕ...........................................................................108
Выводы..............................................................................116
Практические рекомендации.....................................................118
Персперктивы дальнейшей разработки темы...............................118
Список использованных сокращений................................................119
Список использованной литературы..................................................121
Приложения................................................................................138
ВВЕДЕНИЕ
Актуальность темы исследования
Псевдотуберкулез остается актуальной проблемой здравоохранения в России и во многих странах мира. Заболевание отличают выраженный полиморфизм клинических проявлений, отсуствие четких патогномоничных симптомов, склонность к затяжному и хроническому течению. Между тем причины, обуславливающие данное многообразие и сложность патогенеза остаются невыясненными.
Инфекционный процесс представляет собой ограниченное во времени сложное взаимодействие биологических систем микроорганизма и макроорганизма, протекающее в определенных условиях внешней среды. В этой связи чрезвычайно актуально изучение роли генетических детерминант вирулентности бактерий Y. pseudotuberculosis и влияния их продуктов на течение инфекционного процесса, территориальное распространение болезни.
В отдельных работах предприняты попытки объяснить разнообразие клинических форм псевдотуберкулеза за счет наличия у возбудителя тех или иных детерминант вирулентности (Fukushima Н. et al., 2001; Carniel Е., 2001; Mollaret Н., 1990; Чеснокова М.В. и соавт., 2006). В то же время среди популяции возбудителя псевдотуберкулеза выявлены особенности циркуляции штаммов Y. pseudotuberculosis, содержащих уршА или «остров» высокой па-тогенности, связанные с географическими регионами (Fukushima Н. et al., 2001). Основные клинические симптомы инфекции, вызванной Y. pseudotuberculosis в России, Японии и Южной Корее разнообразнее и тяжелее, чем на Европейских территориях и характеризуются системными проявлениями болезни. Типичный для России симптомокомплекс псевдотуберкулеза получил название - дальневосточная скарлатиноподобная лихорадка (ДСЛ).
Открытие способности к синтезу суперантигена и установление его роли в патогенезе инфекции позволили пересмотреть механизм появления некоторых симптомов при псевдотуберкулезе. В настоящее время с продукцией Y. pseudotuberculosis суперантигена YPMa связывают такие иммунопатологические осложнения псевдотуберкулеза, как реактивный артрит, синдром Рейтера, острый увеит и синдром Кавасаки (Sato К. et al., 1983; Treacher D. et al, 1986; BabaK. et al., 1991).
Хорошо изучен «остров» высокой патогенности Y. pseudotuberculosis, ответственный за биосинтез и регуляцию системы утилизации железа. Считают, что он необходим для проявления высоковирулентного фенотипа возбудителя (Carniel Е., 2001).
Особый интерес представляет плазмида с молекулярной массой 82 МДа (pVM82), обнаруживаемая до настоящего времени у штаммов Y. pseudotuberculosis серотипа О: lb только в России, и не встречающаяся у других представителей рода Yersinia. Доказано, что наличие плазмиды pVM82 у возбудителя способствует более тяжелому течению инфекции (Шу-рыгина И.А., 2007). Однако, ее нуклеотидная последовательность до настоящего времени не расшифрована, равно как не исследовано её наличие у штаммов Y. pseudotuberculosis, циркулирующих в различных регионах мира.
Учитывая многообразие вариантов течения болезни, обусловленного различиями в патогенных свойствах возбудителя псевдотуберкулеза, для клинической практики актуально, прежде всего, изучение биологических характеристик штаммов Y. pseudotuberculosis циркулирующих на различных территориях. Вместе с тем для оптимизации мониторинга за возбудителем, а также выбора тактики обследования больных требуются наиболее полные знания о влиянии возбудителя псевдотуберкулеза с различным набором генетических детерминант вирулентности на особенности течения инфекции и совершенствование специфической диагностики заболевания.
Ограниченные возможности распознавания случаев заболевания иер-синиозами, в частности псевдотуберкулеза, на поздних сроках приводят к ги-
подиагностике, развитию хронических форм (до 30% случаев) и осложнений. Это обуславливает необходимость поиска новых, более чувствительных методов этиологической диагностики заболевания.
В связи с изложенным, представлялось актуальным изучение генетических характеристик штаммов возбудителя псевдотуберкулеза и разработка набора для серологической диагностики иерсиниозов.
Степень разработанности темы исследования
Клинические особенности проявлений псевдотуберкулеза в различных регионах мира. Роль отдельных факторов вирулентности в инфекционном
процессе
Псевдотуберкулез, вызываемый Y. pseudotuberculosis, поражает человека и многие виды диких и сельскохозяйственных животных. Это заболевание широко распространено в мире, но более характерно для стран с холодным климатом. В России, Китае, Японии и Корее заболеваемость носит эпидемический и спорадический характер и регистрируется на высоком уровне, клинические проявления тяжелее, чем на американских и австралийском континентах, скандинавских и европейских странах, ряде южноазиатских стран, где заболевания чаще носят спорадический характер, а клинические проявления менее выражены [8, 21, 86].
С момента первого выделения псевдотуберкулезного микроба L. Malassez и V. Vingal в 1883 г. от морских свинок и до начала 50-х годов XX века у людей описано 30 случаев заболевания, среди которых только 12 являются бесспорно доказанными [32]. Как самостоятельная нозологическая форма псевдотуберкулез был признан после сообщения W. Кпарр и W. Masshoff в 1953 г. о группе мезентериальных лимфаденитов (наблюдаемых у детей с клиникой острого аппендицита) псевдотуберкулезной этиологии, то есть через 70 лет после открытия возбудителя [30].
Официально о первых случаях заболевания псевдотуберкулезом сообщил W. Knapp в 1958 в Великобритании. В Канаде псевдотуберкулез регистрируется с 1962 г. [148], в США - с 1969 г. [81]. Псевдотуберкулез описан в Бразилии [117], Новой Зеландии [108], Австралии [133], Швеции [49], Дании [43], Финляндии, Норвегии [83, 103, 139], Бельгии [116], Германии [102], Австрии [149], Франции [128, 122], Испании, Италии [156], Польше [144], Болгарии [129]. В этих странах у большей части пациентов заболевания протекали с клинической картиной мезаденита, аппендицита, реже гастроэнтерита, узловой эритемы [38]. Также псевдотуберкулез регистрируется в Прибалтике [125], Казахстане [25], Японии, Китае, Корее [86] и Иордании [47]. Можно утверждать, что псевдотуберкулез распространен повсеместно.
В России клинические проявления псевдотуберкулеза настолько кардинально отличаются от симптомов заболевания в европейских странах, что Знаменскому В.Н. и Вишнякову А.К. только в 1966-1967 гг. опытом самозаражения удалось доказать псевдотуберкулезную этиологию одного из наиболее часто встречающегося на российской территории симптомокомплекса псевдотуберкулеза, так называемой, дальневосточной скарлатиноподобной лихорадки (ДСЛ) [15, 16, 23]. Название этого заболевания указывает на его клиническое сходство со скарлатиной.
Многообразие клинических симптомов является причиной отсуствия единой классификации псевдотуберкулеза в России. Васильев C.B. с соавт. (1993) [5] приводит одну классификацию - Залмовера И.Ю. (1969), в ней различают следующие формы заболевания: генерализованную, абдоминальную, желтушную, артралгическую, скарлатиноподобную и катаральную. В монографии Бутяновой Н.Г. с соавт. (1991) приводится 12 классификаций, каждая из которых по своему актуальна, но в клинике обычно используется классификация Матковского B.C. (1977). [4, 24]. По основным клиническим проявлениям в ней различают генерализованную, абдоминальную, желтушную, артралгическую, скарлатиноподобную, смешанную, катаральную и стертую формы; по степени тяжести - тяжелое, средней тяжести и легкое течение
псевдотуберкулезной инфекции, которая может протекать с рецидивами или без.
Существуют классификации, общие для псевдотуберкулеза и иерси-ниоза. Так, Покровский В. И. и соавт. (1986) приводят такую классификацию клинических форм иерсиниозов: гастроинтестинальная (проявляется в виде гастроэнтерита, энтероколита или гастроэнтероколита), абдоминальная (проявляется в виде мезентериального лимфаденита, терминального илеита или острого аппендицита), генерализованная (смешанная, септическая, септико-пиемическая), вторично-очаговая (артрит, узловатая эритема, миокардит, гепатит, менингит, синдром Рейтара). Проявления псевдотуберкулеза и иерси-ниоза в остром периоде и исходы болезней имеют значительное сходство.
В течении заболевания псевдотуберкулезом выделяют несколько периодов: инкубационный (4-21 день), начальный (от нескольких часов до 5 дней), разгар болезни (3-10 дней и более), ремиссия (у 2/3 больных совпадает с периодом реконвалесценции), рецидивов и обострений, реконвалесцен-ции [26].
Начало заболевания чаще всего острое, с повышения температуры до 37,5 - 39,7 0 С. Наиболее часто встречаются симптомы интоксикации: общей слабости - 97,3%, лихорадки - 96,1%, головной боли - 92,5%; боли в суставах - 59,4%; гиперемии слизистой оболочки зева - 49,8%; боли в животе -33,4 - 71,4%, увеличения печени - 31,9 - 85%, артралгии - 14-97%, которые не являются патогмоничными [21, 28]. Может наблюдаться развитие конъюнктивита, аппендицита, терминального илеита, мезаденита, артрита, гепа-типа и т.д. Характерным для псевдотуберкулеза в России является отечно-гиперемический синдром, который проявляется в виде одутловатости и красноты кожи лица и шеи - симптом «капюшона»; кистей и стоп - симптом «перчаток» и «носков», бледного носогубного треугольника, зудом ладоней и подошв, сопровождающимся появлением экзантемы с последующим отрубе-видным шелушением. По литературным данным сыпь и симптом «перчаток» и «носков» наблюдались в 42, 3 - 85% случаев [26].
В европейских странах для проявлений псевдотуберкулеза наиболее характерно возникновение лихорадки и болей в животе, иногда тошноты и рвоты. Боли внизу живота справа могут привести к хирургической операции по удалению аппендикса. При вскрытии чаще всего оказывается, что червеобразный отросток не изменен, хотя наблюдается ярко выраженный мезенте-риальный аденит и/или острый терминальный илеит. У ослабленных больных, особенно с циррозом печени вследствие алкоголизма, или с гемохрома-тозами и другими заболеваниями печени, возбудитель псевдотуберкулеза имеет особенность распространяться из пищеварительного тракта в другие органы через кровь, вызывая при этом сепсис. В целом заболевания псевдотуберкулезом в европейских странах протекают легче, чем в России, Японии и Корее [61].
В большинстве случаев заболевание имеет благоприятный прогноз и заканчивается выздоровлением. Однако проблема затяжного и хронического течения болезни с вовлечением в процесс ряда органов и систем больного остается актуальной до настоящего времени [6, 11]. При этом формирование хронических заболеваний характерно после острой инфекции как псевдотуберкулезной, так и кишечноиерсиниозной этиологии, и на данном этапе практическому врачу нередко очень трудно или даже невозможно клинически проводить между ними дифференциальную диагностику. Так, среди взрослых больных Скандинавии и России высока частота артритов иерсини-озной этиологии (от 10 до 30%) [3, 88, 110]. Чаще поражаются суставы коленей и лодыжек, но могут вовлекаться другие, в частности, межфаланговые суставы рук и стоп. Нередко поражения суставов сопровождаются уретритом, конъюнктивитом (болезнь Рейтера) и встречаются у пациентов с артритом, обусловленным Yersinia, в 5 - 10% случаев; другие заболевания - увеит, ирит, конъюнктивит, гломерулонефрит, уретрит - выявляются реже [54]. Для иерсиниозов с хроническим течением наиболее характерно возникновение эритемы нодозум, хронического поражения желудочно-кишечного тракта [28, 88,31].
Инфекционный процесс представляет собой ограниченное во времени сложное взаимодействие биологических систем микроорганизма и макроорганизма, протекающее в определенных условиях внешней среды, поэтому постоянно требуется изучение генетических детерминант вирулентности бактерий Y. pseudotuberculosis и влияния их продуктов на течение инфекционного процесса, территориальное распространение болезни.
Наиболее изученным из известных генетических детерминант вирулентности Yersinia является плазмида вирулентности иерсиний pYV 46 МДа (Plasmid associated with Yersinia virulence), обнаруженная у патогенных иерсиний: Y. pseudotuberculosis, Y. enterocolitica; у Y. pestis названа рСД1 (Calcium Dependence plasmid). Полагают, что основное значение в формировании патогенных свойств принадлежит плазмиде, которая кодирует белки наружной мембраны иерсиний Yops (Yersinia outer membrane proteins), способствующие подавлению фагоцитарной активности клеток иммунной системы макроорганизма, оказывающие воздействие на адгезию и инвазию бактерий. В таблице 1. приведены основные Yops иерсиний и их функции. При непосредственном взаимодействии с клетками макроорганизма Y. pseudotuberculosis осуществляет введение эффекторных молекул внутрь клеток лимфоидной ткани, используя при этом систему секреции III типа. Гены, ответственные за функционирование этой системы локализуются, главным образом, на плазмиде вирулентности. pYV 46 МДа определяется во всех свежевыделенных штаммах Y. pseudotuberculosis, и, по ее присутствию дифференцируют патогенные иерсинии от не патогенных [55, 71, 72, 86]. При культивировании in vitro, особенно, при 37 °С Y. pseudotuberculosis может утрачивать эту плазмиду [84].
«Остров» высокой патогенности HPI (High Pathogenicity Island), ответственный за биосинтез и регуляцию системы утилизации железа, расположен на хромосоме. Впервые «остров» высокой патогенности HPI обнаружен у бактерий рода Yersinia. Его разме�
- Кокорина, Галина Ивановна
- кандидата медицинских наук
- Санкт-Петербург, 2013
- ВАК 03.02.03
- Разработка и применение диагностического биопрепарата "YP-09 УГСХА" на основе бактериофагов Yersinia Pseudotuberculosis
- Использование бактериофагов для диагностики иерсиниозов и внутривидовой дифференциации Yersinia enterocolitica
- Морфологическая характеристика иммунной системы птиц при заражении токсигенными бактериями Yersinia pseudotuberculosis
- Выявление циркуляции Yersinia pseudotuberculosis среди сельскохозяйственных животных в Саратовской области и создание диагностических препаратов на основе мембранных белков
- Совершенствование лабораторного обеспечения системы эпидемиологического надзора за иерсиниозами