Бесплатный автореферат и диссертация по биологии на тему
Генетический контроль репарационной и мутаторной функций плазмиды Col Ib-P9
ВАК РФ 03.00.15, Генетика
Содержание диссертации, кандидата биологических наук, Копылов, Владимир Михайлович
ВВЕДЕНИЕ
ЧАСТЬ I. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.
Глава I. Общие представления об основных путях репарации бактерий . Ю
1.1. Фотореактивация.
1.2. Эксцизионная репарация. II
1.3. Пострепликативная репарация
1.4. Индуциб,ельная репарация, сопровождающаяся ошибками, или SOS репарация.
1.5. Генетический контроль УФ-индуцированного мутагенеза и его связь с репарацией ДНК.
Глава 2. Действие плазмид на репарацию ДНК клетки и связанные с ней процессы
2.1. Связь действия плазмид с различными репаратив-ными путями клетки
2.2. О возможной роли интегративной супрессии в действии плазмид на выживаемость клеток и индуцированный мутагенез . 4
2.3. Анализ плазмидных мутаций, влияющих на эффект плазмид.
2.4. Изучение продуктов плазмидных генов, ответственных за эффект плазмид на репарацию ДНК и связанные с ней процессы.
ЧАСТЬ II. ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ.
Глава I. Материалы и методы.
Глава 2. Характеристика плазмиды Col ГЬ-Р
Глава 3. Влияние плазмиды Col 1Ъ-Р9 на выживаемость клеток E.coli при действии различных агентов, повреждающих ДНК.
3.1. Влияние плазмиды Col 1Ъ-Р9 на выживаемость клеток дикого типа.
3.2. Действие плазмиды Col 1Ъ-Р9 на выживаемость клеток, дефектных по эксцизионной репарации
3.3. Действие плазмиды на выживаемость клетокЕ.соИ , дефектных по рекомбинации и репарации
3.4. Действие плазмиды Col 1Ъ-Р9 на выживаемость после УФ-облучения мутантов uimiC и uvm. IOO
3.5. Действие аминокислотного голодания на защитный эффект Col ГЬ-Р
Глава 4. Влияние плазмиды на индуцированный мутагенез . 1044.1. Индукция мутаций под действием УФ-облучения
4.2. Индукция мутаций под действием НГ и 2-АП. НО
4.3. Влияние плазмиды Col ГЬ-Р9 на условно-спонтанный мутагенез в штамме DM1187 . НО
Глава 5. Влияние плазмиды Col ГЬ-Р9 на индукцию синтеза колицина EI.
Глава б. Реактивация облученного ультрафиолетом фага 2 в клетках E.coli , содержащих плазмиду Col ГЬ-Р9 •• П6 6.1. Реактивация УФ-облученного фага Л с1857 в необлученных клетках
6.2. Реактивация фага Л с1857 после УФ-облучения в облученных клетках
Глава 7. Рекомбинация в клетках E.coli , содержащих плазмидуСо1 1Ъ-Р
Глава 8. Анализ мутаций плазмиды Col Ib-P9 , изменяющих ее действие на УФ-индуциро ванный мутагенез
8.1. Получение и характеристика Col Ib:tQ?n5 мутант-ных плазмид.
8.2. Локализация Col 1Ъ 6-13: :Шп5 мутации, снимающей действие плазмиды на УФ-мутагенез
8.3. Влияние плазмиды Col 1Ъ-Р9 drdl на выживаемость и мутагенез клеток E»coli после УФ-об-лучения .14
Глава 9. Сравнение действия плазмид Col 1Ъ-Р9 и pKMLOl и их мутантов на ИСК EI и выживаемость клеток при действии МС и УФ-облучения.14
9.1. Действие плазмиды рКШ.01 на ИСК EI .14
9.2. Влияние плазмиды pML01 на выживаемость клеток после их обработки МС.14
9.3. Действие мутантных плазмид PGW12 и Col lb: tTn5 на ИСК EI и выживаемость клеток после обработки МС .14
ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ.14
ВЫВОДЫ.
Введение Диссертация по биологии, на тему "Генетический контроль репарационной и мутаторной функций плазмиды Col Ib-P9"
Актуальность темы. Открытие репарации, как нового матричного молекулярного процесса органического мира, произошло относительно недавно /Howard-Flanders , 1966; Hupp , Howard-Flanders , 1968; Rupert , I975;Witkin , 1976/. Репарация ДНК, процесс направленный на сохранение целостности генома клетки, является одним из самых сложных и жизненно важных процессов в живой природе. В настоящее время репарация рассматривается как более общий процесс по отношению к таким фундаментальным генетическим процессам, как репликации и рекомбинация; последние входят в состав процесса репарации ДНК в целом. Ошибки репарации вносят существенный вклад в мутагенез.
Неудивительно, что любой новый путь и ветвь репарации, факторы, влияющие на репарацию и мутагенез, рассматриваются самым внимательным образом. Именно поэтому большой интерес вызвало открытие Ховарт; она обнаружила увеличение выживаемости и индуцированного мутагенеза после УФ-облучения бактерий, в которые была передана плазмида Col I / Howarth, 1965; 1966/.
После открытия Ховарт, плазмиды с аналогичным действием были обнаружены у различных родов энтеробактерий: Escherichia coli /Siccardi , 1969; Marsh , Smith , 1969; Axelrod ,Adler , 1969/, Salmonella/Drahle , Stocker , 1968; Aral , Ando , 1980/, Proteus /Hofmeister et al., 1979/,Enterohacter /Aral ,Ando , 1980/, Serratia /Aral , Ando , 1980/ и у микроорганизмов других таксономических групп-Pseudomonas aeruginosa /Krishnapillai , 1975; Lehrbach et al •» 1978/, Streptococcus faecalis / Meiehl et al ., 1980/.
Первое время исследования влияния плазмид на репарацию ДНК и мутагенез оставались в рамках фундаментальных исследований, пока в 1975 году МакКэнн с соавт. /МсСапп et al 1975/ не показали способность плазмиды pKMIOI, увеличивающей мутагенез, повшать чувствительность теста Эймса при определении мутагенной активности различных соединений. Возможность использования подобных плазмид в практике еще более увеличила интерес к изучению механизма их взаимодействия с клеточными процессами, обеспечивающими сохранение генома клетки. Недавно получены интересные данные о том, что плазмида рВ , увеличивающая устойчивость бактерий к УФ-облучению, при введении в клетки млекопитающих (мыши) также увеличивает их выживаемость / Elli et al ., 1983/.
Состояние вопроса. Несмотря на серьезные успехи в изучении генетики плазмид и их молекулярной природы /Мейнелл, 1976; Брода, 1982/, пока очень мало известно о механизмах действия плазмид на репарацию ДНК и связанные с ней процессы.
В настоящее время наиболее полно исследовано действие на репарацию ДНК и связанные с ней процессы "плазмид fi46, pKMIOI и N3 Для всех трех плазмид построены рестрикционные и генетические карты /Brown , Willets » 1981; Langer et al., I98I;Ando ,Arai , 1981/ и определена локализация генов, отвечающих за эффект плазмид.
Была обнаружена строгая зависимость действия плазмид В46, pKMIOI и N5 на репарацию и УФ-индуциро ванный мутагенез от recA+ v 1ехА+ генотипа клеток E.coli . Это позволило исследователям вццви-нуть предположение о тесной взаимосвязи плазмид cSQS репарацией клетки E.coli /Mortelmans ,Stocer , 1976; Walker , 1977/. Обнаружение супрессии плазмидами В46 и pKMIOI аллельных мутаций шшС и uvm , которые блокируют УФ- и ММС индуцированный мутагенез клеток E.coli , связанный cSOS репарацией, подтвердили это предположение. Подобные исследования позволяют глубже раскрыть механизм действия клеточной SOS системы, с которой, как оказалось, связаны многие жизненно важные функции клетки E.coli / Witkin , 1976/.
К началу настоящей работы /1978 г./ было изучено в определенной степени действие лишь одной плазмиды R46 и ее делеционной производной рКШ.01 / Mortelmans , Stocker , I976;Walker , 1977/. Представляло интерес исследовать механизмы действия других плазмид на выживаемость клеток и мутагенез и выяснить сходны ли они с механизмами, определяющими эффект плазмиды Е4б/ pKMLOl/.
Настоящая работа посвящена актуальной проблеме генетики микроорганизмов - изучению взаимодействия плазмид с клеточными процессами, связанными с репарацией ДНК. Цель работы - выяснение механизма влияния плазмиды Col гь-Р9 на репарацию и мутагенез. До начала наших исследований генетического контроля репарационной и мутаторной функций плазмиды Col Гь-*Р9 был известен только факт увеличения плазмидой выживаемости и УФ-индуцированного мутагенеза бактерий.
Конкретными задачами работы были: I - изучение взаимосвязи действия плазмиды с различными путями репарации клетки; 2 - изучение влияния плазмиды на различные клеточные функции, связанные с репарацией ДНК; 3 - получение и анализ мутаций плазмиды, приводящих к изменению ее репаративной и мутаторной функций; 4 - сравнение действия плазмид рКЮ.01 и Col ГЬ-Р9 на процессы, связанные с репарацией ДНК.
Научная новизна диссертации состоит в следующем: - показано, что увеличивающее репарацию и мутагенез действие плазмиды Col 1Ъ-Р9 строго зависит от генов гесА+ и 1ехА+ , что свидетельствует об участии плазмиды в клеточной индуцибельной репарации, сопровождающейся ошибками;
- показано, что плазмида полностью супрессируетишиС мутацию, и, по-видимому, кодирует продукт, функционально аналогичный продукту хромосомного гена хшиС ;
- анализ полученных с помощью инсерции транспозона Тп5 плаз-мидных мутаций показал, что одна и та же мутация снимает действие плазмиды на ряд процессов, связанных с репарацией ДНК, т.е. все эти функции плазмиды тесно связаны;
- получены данные о локализации гена/ов/ плазмиды Col 1Ъ-Р9 , ответственных за ее влияние на репарацию и мутагенез;
- обнаружены различия в действии плазмид Col 1Ъ-Р9 и ркш.01 на репарацию ДНК.
В целом работа, расширяет наши представления о механизмах взаимодействия плазмид с репарацией ДНК и их влияния на способность клеток мутировать при действии агентов, повреждающих ДНК. Полученные данные позволяют начать работу по биохимическому изучению конкретных продуктов, кодируемых плазмидными генами, исследовать их участие в репарации и мутагенезе.
Практическое значение полученных в диссертационной работе данных связано с использованием плазмид в системах по определению мутагенов и канцерогенов. Применение различных плазмид в этих системах, на основе детального изучения механизмов их взаимодействия с клеточными процессами репарации и мутагенеза, позволяет повысить чувствительность и расширить возможности метода при выявлении мутагенов в окружающей среде.
ЧАСТЬ I. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
Заключение Диссертация по теме "Генетика", Копылов, Владимир Михайлович
ВЫВОДЫ
1. Присутствие плазмиды Col 1Ъ-Р9 в клетках E.coliKL2 вызывает увеличение выживаемости клеток при действии УФ-облучения, митомицина С и нитрозогуанидина; увеличение УФ-индуцированного и НГ-индуцированного мутагенеза; повышение реактивации УФ-облученно-го фага Д в необлученных и облученных клетках; снижение индукции синтеза колицина EI при действии УФ, МС и НГ. Плазмида не увеличивает частоту мутаций, индуцированных 2-аминопурином.
2. Эффект плазмиды Col ГЬ-Р9 строго зависит от гесА+ и 1ехА+ генотипа и не зависит от ряда генов, принимающих участие в процессах эксцизионной и пострепликативной репарации. На основании полученных данных высказано предположение об участии продуктов плазмиды Col 1Ъ-Р9 в клеточной индуцибельной репарации, сопровождающейся ошибками.
3. Плазмида Col 1Ъ-Р9 супрессирует шшС и uvm мутации, подавляющие УФ-индуцированный мутагенез в клетках E.coli . Эти данные позволяют предположить, что плазмида кодирует продукт, функционально сходный с продуктом гена ишиС .
4. Плазмида Col I-b-P9 не оказывает влияния на рекомбинацию при трансдукции и конъюгации в обычных условиях и в условиях проявления рекомбиногенного действия УФ-света; т.о., эффект плазмиды не определяется ее влиянием на рекомбинацию.
5. С помощью инсерции транспозона Шп5 получены 10 мутантов плазмиды Col 1Ъ-Р9 с измененной способностью восстанавливать УФ-индуцированный мутагенез в клетках шшС мутантов. Показано, что одни и те же мутации снимают одновременно действие плазмиды на выживаемость и мутагенез клеток, реактивацию фага Л в необлученных клетках, реактивацию Вейгля, индукцию синтеза колицина EI; т.о. все эти функции плазмиды тесно связаны.
6. С помощью рестрикционного анализа одной из мутантных плазмид и клонирования генов получены данные о локализации участка ДНК, ответственного за эффект плазмиды, в Sail фрагменте с мол. массой 14 мегадальтон.
7. Показано противоположное действие плазмид Col 1Ъ-Р9 и рКШ.01 на выживаемость и индукцию синтеза колицина EI при обработке клеток митомицином С. Эти различия связаны с функционированием генов плазмид, ответственных за их защитное и повышающее мутагенез действие при УФ-облучении.
Библиография Диссертация по биологии, кандидата биологических наук, Копылов, Владимир Михайлович, Москва
1. Алешкин Г.И., Самойленко И.И., Скавронская А.Г. Сенсибилизация плазмидой pKMLOl штаммов Escherichia coli к действию ионизирующего излучения: эффект плазмиды на выживаемость и индуцированный мутагенез. Генетика, 1981, т.17, II, с.1904-1908.
2. Алешкин Г.И., Евдокимова Н.М., Драмкян А.Х., Скавронская А.Г. Множественность сайтов интеграции в хромосому плазмиды рКШ.01 , В кн.: Рабочее совещание по программе "Плазмида". 6-е. Тезисы. М., 1981, с.127.
3. Алешкин Г.И., Скавронская А.Г. Интегративная супрессия мутации dnaA плазмидами на бактериальный мутагенез. Мол.генетика, микробиол. вирусол., №3, с.3-10, 1983.
4. Андреева И.В., Абдухалыкова Г.Ф., Скавронская А.Г. Изменение спонтанной и индуцированной мутабильности салмонелл под влиянием плазмид Col I и pKMLOl , присутствующих в бактериях раздельно или совместно. Генетика, 1980, т.16, 7, с.1182-1187.
5. Бакай Т.С., Фонштейн Л.М. Влияние плазмиды pKMLOl на мутагенное действие диоксидина у E.coliK12 . Генетика, 1982, т. 18, 8, с.1231-1235.
6. Богданова С.Л., Фетисова И.В., Гаврилов В.Ю. Индукция синтеза колицина Е1 брунеомицином и N-метил- вг'-нитро- N -нитрозогуа-нидином. Микробиология, 1970, т.39, 4, с.622-625.
7. Брода П. Плазмиды. М.; Мир, 1982.8. /Бреслер С.Е./Bresler S.E* Theory of.misrepair mutagenesis. Ma tat. Ees., 1975» v.29, 5, p. 7-472.
8. Воробьева И.П., Хмель И.A., Фетисова И.В. Индукция колициноген-ного факторам под действием ингибиторов белкового синтеза. -Мол.биол., 1973, т.7, 5, с.738-744.
9. Жакоб Ф, Вольман Э. Пол и генетика бактерий. М.; ИЛ., 1962.
10. Жестяников В.Д. Репарация ДНК и ее биологическое значение. Л.; Наука, 1979.
11. Калашников Н.В., Поверенный A.M., Алешкин Г.И. Повышенная чувствительность к формальдегиду клеток E.coli , несущих плазмиду pKMlOl или ее производные плазмиды. В кн.: Рабочее совещание по программе "Плазмида". 6-е. Тезисы. М., 1981, с.131.
12. Кривиский А.С., Есипова В.В., Будовский Э.И. Роль фотогидратов цитозина в УФ-индуцированном мутагенезе фага Сд . Генетика, 1975, т.И, 9, с.98-103.
13. Ланцов В.А. Генетическая рекомбинация в процессе конъюгации у Escherichia coliKL2 . Автореф.докт.дисс., Л., 1981.
14. Лиходед В.Г. Функциональный анализ колициногенных систем у энтеробактерий. Автореф.докт.дисс., М., 1971.
15. Мейнелл Г. Бактериальные плазмиды. М., Мир, 1976.
16. Миллер Дж. Эксперименты в молекулярной генетике. М.; Мир, 1976.
17. Скавронская А.Г., Смирнов Г.Б. УФ-индуцированный мутагенез в polAl и uvrE502 мутантах E.coli , дефектных по ресинтети-ческому этапу эксцизионной репарации ДНК. Генетика, 1974, т.10 б, C.I02-II3.
18. Скавронская А.Г. Молекулярно-генетические механизмы бактериальной мутабильности. Мол.генетика, микробиол. вирусол., 1983, №1, с.6-14.
19. Смирнов Г.Б., Скавронская А.Г. Летальное и мутагенное действие ультрафиолетовых лучей и митомицина С на мутанты E.coli с повышенной способностью к тиминовому восстановлению. Генетика, 1968, т.4, 9, с.105-110.
20. Смирнов Г.Б., Абдухалыкова Г.Ф. Изучение генотипического контроля recF -пути рекомбинации. Сообщение II. Эффект мутаций recL" u uvrE" . Генетика, 1976, т.12, 4, с.100-108.
21. Тарасов В.А. Молекулярные механизмы репарации и мутагенеза. М.; Наука, 1982.
22. Томилин Н.В. Генетическая стабильность клетки. Л.; Наука,1983.
23. Фонштейн Л.М., Абилев С.К., Облаченко Н.Г. О характере мутагенного действия диоксидина на бактерии. Цитология и генетика, 1980, т.14, 5, с.60-65.
24. Ханбекян Л.М. Репарация лучевых повреждений ДНК у темочувстви-тельных мутантов Escherichia coli dnaG и dnaZ . Автореф. канд.дисс., Л.; 1980.
25. Effects of pLasmids on chromosom metabolism in bacteria.
26. Plasmid, 1981, v.6, 2, p.119-140.
27. Чернин Л.С. Участие плазмид в генетических процессах бактериальной клетки. Автореф.докт.дисс., М., 1981.41» Ando Т», Aral Т. Mechanisms of plasmid-mediated enhancements of ultraviolet resistance and mutability.- Kejo J. Med.,1980, v.29, p.55-66.
28. Ando Т., Arai T. Genetic structure of the Inc N plasmid N3.
29. Plasmid, 1981, v.6, p.293-301. 45« Attfield P.Y., Pinney E.J. Plasmid R46-mediated protection against bleomycin is polA+— dependent.- J. Gen. Microbiol.,1982, v.128, 3, p.539-547•
30. Attfield P.Y., Pinney R.J. Plasmid R46 fails to protect Escherichia coli against double-strand ША-binding agents but increases their mutagenic activities.- Mutat. Res.,1983, v.107, 3, p.1-12.
31. Arai Т., Ando T. Plasmids which make their host bacteria mutable as well as resistant to ultraviolet irradiation. Kejo J. Med., 1980, v.29, p.47-54.
32. Axelrod D.E., Adler B.J. Influence of the fertility episome on the survival of X-irradiated Escherichia coli.
33. J. Bacterid., 1969, v.98, 2, p.329-330.
34. Babudri N., Monti-Bragadin C. Restoration of mutability in nonmutable E.coli carrying, different plasmids.- Mol. (Jen. Genet., 1977, v.155, 3, p.287-290.
35. Bachmann B.J. Linkage map of Escherichia coli Z-12. Edition 7.- Microbiol. Rev., 1983, v.47» 2, p.180-230.
36. Bagg A., Kenyon C.J., Walker G. Inducibility of a gene product requered for UV and chemical mutagenesis in E.coli.- Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1981, v.78, 9, P*5749-5753»
37. Bird R.E., Chandler M., Caro L. Suppression of an Escherichia coli dnaA mutation by the integrated R factor R100.1; Change of chromosome replication origin in synchronized cultures.- J.Bacterid., 1976, v.126, p.1215-12 23.
38. Blanco M., Rebollo J.E. Plasmid pKMlOl-dependent repair and mutagenesis in E.coli cells with mutations lexB3G tif and zab53 in the recA gene.- Mutat. Res., 1981, v.81, 3, p.265-275*
39. Boulnois G.J. Colicin lb does not cause plasmid-promoted abortive phage infection of Escherichia coli K-12.— Mol. Gen. Genet., 1981, v.182, 3, P.5O8-5IO.
40. Boyce R.P., Howard-Flanders P. Release of ultraviolet light induced thymine dimers from DNA in E.coli K-12.- Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1964, v.51, 2, p.293-300.
41. Brash D.E., Haseltine W.A. Induced mutation hotspots occurat DNA damage hotspots.- Nature, 1982, v.298, 5870, p.189-192.
42. Brent R., Ptashne M. The lexA gene product represses its own promoter.- Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1980, v.77, 4, p.1932-1936.
43. Bridges B.A., Dennis R.E., Minson R.J. Differential induction and repair of ultraviolet damage leading to true reversiones and external suppressor mutation of an cchre codon in Escherichia coli B/r WR2.- Genetics, 1967» v.57, p.897-908.
44. Bridges B.A., Motteshea R.P., Green M.H.L., Gray W.J.H. Mutagenicity of dichlorvos and methyl methane-sulphonate for Escherichia coli WP^ and some derivatives dificient in .DNA repair.- Mutat. Rea., 1973» v.19, 3, p.295-303.
45. Brown A.M.C., Willetts N«S. A physical and genetic map of the IncN plasmid R46.- Plasmid, 1981, v.5, 2, p.188-201.
46. Carlson K.M., Smith K.C. The genetic control of repair replication after UV-irradiation.- J. Supramol. Struct, suppl.,1978, v.2, p.59.
47. Clewell D.B., Helinski D.R. Existence of the colicinogenic factor- sex factor Col Ib-P9 as a supercoiled circular DNA-protein relaxation complex.- Biochem. Biqphys. Res.
48. Commun., 1970, v.41, 1, p.150-156.
49. Cohen S.N., Chang A.C.T., Hsu L. Nonchromosomal antibiotic resistance in bacteria: genetic transformation of Escherichia coli by R-factor DMA.- Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1972,v.69» 8, p.2110-2114.
50. Degnen G.E., Cox E.C. Conditioned mutator gene in Escherichia coli isolation, mapping and effector studies.- J. Bacterid., 1974, v.117, 2, p.477-487.
51. Dobson P.P., Walker G.C. Plasmid (pKMLOl) mediated Weigele reactivation in Escherichia coli K-12 and Salmonella typhi-murium LT2. Genetic dependence, kinetics of induction, and effect of chloramphenicol.- Mutat. Res., 1980, v.71, 1,p.25-41.
52. DowdSn S.B., Strike P. R46-derived recombinant plasmids ША repair and mutation in E.coli.- Mol. Gen. Genet., 1982, v.186, p.140-144.
53. Dowman J.E., Meynell G.G. Pleiotrople effects of de-repressed bacterial sex factors on colicinogeny and cell wall structure.- Mol. Gen. Genet., 1970, v.109, 1, p.57-68.
54. Drabble W.T., Stocker B.A.D. R/transmissible drug-resistance/ factors in Salmonella typhimurium; pattern of transduction by phage P22 and ultraviolet effect.- J. Gen. Microbiol., 1968, v.53, 1, p.109-123.
55. Duckworth D.H., Glena J., McCorquodale D.J. Inhibition of bacteriophage replication by extrachromosomal genetic elements.- Microbiol. Rev., 1981, v.45, 1, p.52-71*
56. Elledge S.J., Walker G.C. Proteins required for ultraviolet light and chemical mutagenesis.- Identification of the products of the umuC locus of Escherichia coli.- J. Mol. Biol., 1983a, v.164, 2, p.175-192.
57. Elledge S.J., Walker G.C. The muc genes of pKMlOi are induced by DNA damage.- J. Bacterid., 1983b, v.155» 3» p.I3O6-I3I5.
58. Ganesan A.K., Seawell P.C. The effect of lexA and recF mutations on postreplication repair and DNA synthesis in Escherichia coli K-12.- Mol. Gen. Genet., 1975, v. 141, 3, p.189-206.
59. Gichner Т., Veleminsky J. Genetic effects of N-methyl-N1-nitro-N-nitrosoguanidine and its homologs.- Mutat. Res., 1982, v.99, p.129-242.
60. Goebl W. Studies on the initiation of plasmid DNA replication.- Eur. J. Biochem., 1974, v.41, 1, p.51-62.
61. Goze A., Devoret R. Repair promoted by plasmid pKMLOl is different from SOS repair.- Mutat. Res., 1979, v.61, 2, p.163-179*
62. Hedges R.W., Datta N. Plasmids determing I pili constitute a compatibility complex.— J. Gen. Microbiol., 1973, v«77» 1, p.19-25.
63. Hickson I.D., Arthur H.M., BramTiill D., Emmerson P.T. The E.coli uvrD gene is DNA helicase II.- Mol. Gen. Genet., 1983, v.190, 2, p.265-27°«
64. Hofmeister J., Kuhler H., Filbippor Y.D. DNA repair in Proteus mirabilis VI. Plasmid (R46)-mediated and UV mutagenesis.- Mol. Gen. Genet., 1979,v.176, 2, p.265-273.
65. Howard-Flanders P., Boyce R.P., Theriot L. Three loci Escherichia coli K-12 that control the excision of pyrimi-dine dimers and certain other mutagen products from DNA.— Genetics, 1966, v.5J, 6, p.1119-1136.
66. Howarth S. Resistance to the bacteriocidal effect of ultraviolet radiation conferred on enterobacteria by the colicin factor Col I.- J. Gen. Microbiol., 1965, v.40, 1, p.43-55.
67. Howarth S. Increase in the frequency of ultraviolet-induced mutation brouht about by the colicin factor Col I in Salmonella typhimurium.- Mutat. Res., 1966, v»3, 2,p.129-134.
68. Humphreys G.O., Willshan G.A., Anderson E.S. A simple method for the preparation of largequantities of pure DNA.— Biochem. Biophys. Acta, 1975, v.383, 4, p.457-^463.
69. Ishii Y. Nature of the mitomycin С induced lesion causing sisterchromatid exchange.— Mutat. Res., 1981f v»91, 1, p.51-55.
70. Iyer V.N., Rupp W.D. Usefulness of benzoylated napthoylated DEAE-cellulose to distinguish and fractionate doublc--stranded DNA bearing different of single-stranded regions.— Biochem. Biophys. Acta, 1971, v.228, p.117-126.
71. Kacinski B.M., Rupp W.D. E.coli uvrB protein binds to DNA in the presence of uvrA protein.- Nature, 1981, v.294,5840, p.480-481.
72. Kelner A. Effect of visible light on the recovery of
73. Kenyon C.J., Brent R., Ptashne M., Walker G.C. Regulation of damage-inducible genes in Escherichia coli.— J. Mol. Biol., 1982, v.160, 3, p.445-457*
74. Kimball R.P. The relation of repair phenomena to mutation induction in bacteria.- Mutat. Res., 1978, v.55, 1, p.85-120.
75. Kingsbury D.T., Helinski D.R. DNA polymerase as a requirement for the maintenance of the bacterial plasmid colicino— genie factor El.- Biochem. Biophys. Res. Commun., 1970, v.4l, б, p.1538-1544.
76. Krishnapillai V. Resistance to ultraviolet ligth and enhanced mutagenesis conferred by Pseudomonas aeruginosa plasmids.- Mutat. Res., 1975» v.29, 3, p-363-372.
77. Kronish J.W., Walker G.C. OJhe effects of the UV-protecting plasmids рКШ.01 and R205 on DNA polymerase Iactiv% in E.coli K-12.- Mutat. Res., 1979, v.60, 2, p.135-142.
78. Kushner S.R. Differntial thermolability of exonuclease and endonuclease activities of recBC nuclease isolated from thermosensitive recB and recC mutants.- J. Bacteriol., 1974, v.120, 3, p.1219-1222.
79. Kushner S.R., Shpherd J., Edwards G., Maples V.P. UVRDj UVRE and RECL represent a single gene. In; Hanawalt P.O., Priedberg E., Pox C.P./Eds./, DNA repair mechanisms, N.T., Academic Pr., 1978, p.251-254.
80. Lackey D., Waker G.C., Keng Т., Zinn S. Characterization of an endonuclease associated with the drug resistance plasmid pKMlOl.- J. Bacteriol., 1977» v.131, 2, p.583-588.
81. Lanka E., Scherzinger E., Gunther E., Shuster H. A DNA primase specifieed by I-like plasmids.— Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1979, v.76, 8, p.3632-3636.
82. Little J.W., Harper J.E. Identification of the lexA gene product of Escherichia coli K-12.- Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1979, v.76, 12, p.6147-6151»
83. Little J.W., Mount D.W., Yanisch-Rerron C.R. Purified lexA protein is a repressor of the recA and lexA genes.— Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1981, v.78, 7, p.4199-4203.
84. Little J.W., Mount D.W. The SOS regulatory system of Escherichia coli.- Cell, 1982, v.29, 1, p.11-22.149* Little J.W. The SOS regulatory system: control of its state by the level of recA protease.- J. Mol. Biol., 1983, v.167, 4, p.791-808.
85. Livingston D.M., Hinkler D.S., Richardson C.C. Deoxyribonucleic acid polymerase III of E.coli. Purification and properties.- J. Biol. Chem., 1975» v.250, 2, p.461-469.
86. Lupski J.R., Smiley B.L., Godson G.N. Regulation of the rpsU-dnaG-rpoD macromolecular synthesis operon and the initiation of DNA replication in Escherichia coli K12.
87. Mol. Gen. Genet., 1983, v.189, 1, p.48-57.
88. Masker W.E., Hanswalt P.C., Shisuya H. Rol© of DNA polymerase II in replication in Escherichia coli.- Nature New Biol., 1973, v.244, I38, p.242-243
89. Pattern I.E., Zwerk H., Rorsch A. The genetic constitution of the radiation-sensitive mutant Escherichia coli Bs-1.-Mutat. Res., 1966, v.3, 5, p.374-380.
90. Maxam A., Gilbert W. Sequencing end-labeled DNA with base-specific chemical cleavages»- Methods Enzymology, 1980, v.65, p.499-560.
91. Meiehl R., Miller M., Yashin R.E. Plasmld-mediated enhancement of UV resistance in Streptococcus faecalis.- Plasmid, 1980, v.3, 2, p.128-154.
92. Meyer R.R., Voegela D.W., Ruben S.M., Rein D.G., Trela J.M. Influence of single stranged DNA -binding protein on recA induction in Escherichia coli.- Mutat. Res., 1982, v»94,3, p.299-313.
93. Meynell G.G., Lawn A.M. Filamentous phages specific for the I sex factor.- Nature, 1968, v.217, 5130, p.1184-1186.
94. McCann J., Spingarn N.E., Kobori J., Ames B.N. Detection of carcinogenes as mutagens: bacterial tester strains with R-factor plasmids.- Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1975» v.72, 3» P«979-983.
95. Miura A., Tomizawa J.I. Studies on radiation-sensitive mutants of E.coli. III. Participation of the rec system in induction of mutation by ultraviolet irradiation.-Mol. Gen. Genet., 1968, v.113, 1, p.1-12.
96. Monti-Bragadin C., Babudri N., Samer Z. Expression of the plasmid pKMlOl determined DNA repair sistem in recA"" and lex"" strains of E.coli.- Mol. Gen. Genet., 1976, v. 145, 3» p.303*306.169» Monti-Bragadin C., Babudri N., Tamaro M., Cinco M.,
97. Moody E.E.M., Hayes W. Chromosome transfer by autonomous transmissible plasmidss the role of the bacterial recombination (rec) system.- J. Bacterid., 1972, v.lll, 1, p.8O-85.
98. Moody E.E.M., Runge R. The integration of autonomous transmissible plasmids into the chromosome of E.coli K-12.— Genet. Res., 1972, v.19, 2, p.181-186.
99. Mortelmans K.E., Stocker B.A.D. Ultraviolet light protection, enhancement of ultraviolet light mutagenesis, and mutator effect of plasmid R46 in Salmonella typhimurium.-J. Bacterid^ 1976, v.128, 1, p.271-282.
100. Mount D.W., Low K.B., Edmiston S.Y. Dominant mutations (lex) in Escherichia coli K-12 which affect radiation sensitivity and frequency of ultraviolet light-induced mutations.
101. J. Bacterid., 1972, v.112, 2, p.886-893.
102. Moyer R.W., Fu A.S., Szabo C. Regulation of bacteriophage T5 development by Col Ib factors.- J. Virol., 1972, v.9, 5, p.804-812.
103. Nishimura Y., Caeo C., Berg C.M., Mirota T. Chromosome replication in Escherichia coli. IV. Control of chromosome replication and cell division by an integrated episome.-J. Mol. Biol., 1971, v.55, p.441—456.
104. Oeda K., Horiuchi T. The uvrD gene E.coli encodes a DNA-dependens ATPase.- Nature, 1982, v.298, 5869, p.98-100.
105. Ozeki H., Stocker B.A.D., Margerie de H. Production of coli-cin by single bacteria.- Naturp, 159» v.184, p.337-339*
106. Pacelli L.Z., Edmiston S.H., Mount D.W. Isolation and characterization of amber mutations in the lexA gene of Escherichia coli K-12.- J. Bacteriol., 1979, v.I37, 1,p.568-573*
107. Perry K.L., Walker G.C. Identification of plasmid (pKMlOl) -coded proteins involved in mutagenesis and resistance•-Nature, 1982, v.3OO, 5889, p.278-281.
108. Pinney R.J. Distribution among incompatibility groups of plasmids that confer UV mutability and UV resistance.-Mutat. Res., 1980, v.72, 2, p.155-159
109. Rupert C.S. Enzymatic photoreactivation s Overvieve.1.? Hanawalt P.C., Setlow R.B. (Eds). Molecular mechanisms for repair of DNA, Plenum Pr., N.Y., 1975, p«A, p.73-87.
110. Rupp W.X., Howard-Flanders P. Discontinuties in the DNA synthesized in an excision-defective strain of Escherichia coli following ultraviolet irradiation.- J. Hoi. Biol., 1968, v.31, 2, p.291-304.
111. Rupp D., Wilde C., Reno D.L. Exchanges between DNA strands in ultraviolet-irradiated Escherichia coli.- J. Mol. Biol., I97I, v.61, 1, p.25-44.
112. Sancar A., Rupp W.D. A novel repair enzyme: UVR ABC excision nuclease of E.coli cuts a DNA strand on both sides of the damaged region.- Cell, 1983, v.33, p.249-260.
113. Sancar A»j Kacinski B.M., Lawrie M.D., Rupp W.D. Identification of the uvrC gene product.- Proc. Natl.
114. Sedgwick S.G. Inducible error-prone repair in Escherichia coli.- Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1975, v.73, 7, p.2753-2757.
115. Sedgwick S.G., Tarranton G.T. How cells in distress use SOS.- Nature, 1982, v.296, p.606-$07.
116. Sedliakova M., Prachar J., Masck P. Dependence of DNA dark repair on protein synthesis in E.coli.- Mol.Gen.Genet., 1977, v.153, 1, P.23-27.
117. Seeberg E., Steinum A.L. Purification and properties of the uvrA protein from E.coli.- Proc. Natl. Acad. Sci. USA., 1982, v.79, 4, p.988-992.
118. Setlow R.B., Carrier W.L. The disappearance of thymine dimers from DNA: an error-correcting mechanism.- Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1964, v.51, 2, p.226-231.
119. Steinborn G. Uvm mutants of Escherichia coli K-12 deficient in UV mutagenesis. II. Further evidence for a novel function in error prone repair.- Mol. Gen. Genet., 1979, V.175, 2, p.203-208.
120. Stokes H.W., Krishnapillai V. Prevalence of Pseudomonas aeruginosa FP plasmids which enhance spontaneous and UV-induced mutagenesis.- Mutat. Res., 1978, v.50, 1, p.19-28.
121. Strobel M., Nomura M. Restriction of the growth of bacteriophage BF23 by coMcin I ( Col Ib-P9 ) factor.- Virology, 1966, v.28, 3 p.763-764.
122. Swenson P.A. The muc+ gene of plasmid pKMLOl prevents respiration shut off in for ultraviolet-irradiated Salmonella typhimurium.- Mol. Gen. Genet., 1981, v.182, 3, p.422-425.
123. Szabo Ch., Dharm©grongartama В., Moyer E.W. The regulation of transcription in bacteriophage T5~infected Escherichia coli,- Biochemistry, 1975» v.14, 5, p.989*997.
124. Szybalski W., Iyer V.N. Crоssiinking of DNA by enzymatically or chemically activated mitomyvins and porfiromycins, bifunctionally "alkylating" antibiotics.- Fed. ^roc.,1964, v.23» 2, p.946-955
125. Tanaka J.-I., Sekiguchi M. Action of exonuclease V (the recBC enzyme) on ultraviolet irradiated DNA.- Biochem. Biophys. Acta, 1975» v.383, 2, p.178-187.
126. Terawaki Y., Kobayashi Y., Matsumoto H., Kami о J. An Rts 1 -derivative plasmid conferring UV sensitivity on Escherichia coli host.- Biochem. Biophys. Kes, Communic., 1980, v.97»2, p.694-699.
127. Te6sman E.S., Gritzmacher C.A., Petrson P.K. Derepression of colicin El synthesis in the constitutive tif mutant strain (spr tif sfi) in a tif spr mutant strain of Escherichia coli K-12.- J. Bacterid., 1978, v.I35, 1, p.29-38.
128. Todd P.A., Glickman B.W. UV-protection and mutagenesis in uvrD, uvrE and recL strains of E.coli carrying the pKMlOl plasmid.- Mutat. Res., 1979, v.62, 3, р.451т457.
129. Tomasz M., Mercado C.M., °lson J., Ghatterjie N. The mode of interaction of mitomycin С with deoxyribonucleic acid and other polynucleotides in vitro.- Biochemistry, 1974, v.13, 24, p.4878-4887•
130. Sweats D.J., Tompson M.J., Pinney R.J., Smith J.T. R-factor mediated resistance to ultraviolet light in strains of E.coli deficient in known repair functions.- J. Gen. Microbiol., 1976, v.93, 1, p.IO3-IIO.
131. Uemura H., Mizobuchi inhibition of growth of bacteriophage BF23 by the Col lb plasmid: identification of the ibfA and ibfB genes of the Col lb plasmid. Mol. Gen. Genet., 1982, v.185, 1, p.13-20.
132. Upton C., Pinney R.J. Absence of ultraviolet-inducible DNA polymerase I-like activity in E.coli strains harbouring
133. R plasmids.- J. Gen. Microbiol., 1981, v.125, 1, p.131-137*
134. Upton C., Pinney R.J; Expression of eight unrelated Muc+ plasmids in eleven DNA repair-deficient E.coli strains.-Mutat. Res., 1983, v.112, p.261-3273*
135. Venturini S«, Monti-Bragadin C. R plasmid-mediated enhancement of mutagenesis in strains of Escherichia coli deficient in known repair functions.- Mutat. Res., 1978,v.50, 1, p.1-8.
136. West S.C., Cassuto E., Howard-Flanders P. Postreplication repair in E.colij strand exshange reactions of gapped DNA by recA protein.- Mol. Gen. Genet., 1982, v.187, 2,p.209-217.
137. Wickner S., Wirght M., Hurwitz J. Studies on in vitro DNA synthesis. Purification of the dnaG gene product from Escherichia coli.- Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1973» v.70, 5, p.1613-1618.
138. Wilkins H.J., Macleod H.D. Formaldehyde induced DNA-protein crosslinks in Escherichia coli.- Mutat. Res., 1976, v*36, 1, p.11-16.
139. Winans S.C., Walker G.C. Genetic localization and characterization of a pKMlOl-coded endonuclease.- J. Bacteriol., 1983, v.154, 3, p.1117-1125.
140. Настоящая работа не была бы возможна, если бы не чуткое и внимательное отношение ко мне и к настоящей работе со стороны всех,без исключения, сотрудников ГВХН ИМГ АН СССР.
- Копылов, Владимир Михайлович
- кандидата биологических наук
- Москва, 1984
- ВАК 03.00.15
- Генетический анализ явления нестабильности в системе мутаторной линии DRОSОРHILА MELANOGASTER.
- Новые системы генетической регуляции конъюгационного переноса F-подобных плазмид
- Молекулярное клонирование гена recA Propionibacterium shermanii, изучение его структуры и экспрессии в клетках E. coli
- Организация и эксперессия генов плазмид COLD и COLIb, связанных с синтезом колицина
- Радиорезистентность бактериальных клеток Salmonella derby и Escherichia coli, обуславливаемая природной R-плазмидой из AMMA Salmonella derby K89