Бесплатный автореферат и диссертация по биологии на тему

Генетическая изменчивость вируса иммунодефицита человека первого типа (ВИЧ-1), циркулирующего на территории России в группах лиц, практикующих внутривенное введение психоактивных препаратов

ВАК РФ 03.00.03, Молекулярная биология

Содержание диссертации, кандидата биологических наук, Ханина, Татьяна Аркадьевна

Генетическая изменчивость вируса иммунодефицита человека первого типа (ВИЧ-1), циркулирующего на территории России в группах лиц, практикующих внутривенное введение психоактивных препаратов

03.00.03 - молекулярная биология

Диссертация на соискание ученой степени кандидата биологических наук

Научный руководитель -доктор биологических наук А.Ф. Бобков

Москва

Оглавление

ВВЕДЕНИЕ.

ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.

Глава 1. Вирус иммунодефицита человека первого типа (ВИЧ-1): структурные особенности и функциональная организация генома

1.1. Строение вириона ВИЧ-1.

1.2. Структура и стратегия генома ВИЧ-1.

1.3. Взаимодействие ВИЧ-1 с клеткой-мишенью.

Глава 2. Генетическая вариабельность ВИЧ-1.

2.1. Роль смысловых и несмысловых замен в эволюции ВИЧ-1.

2.2. Генетический полиморфизм V3 области.

2.3. Подтипы ВИЧ

2.4. Эволюция подтипов ВИЧ-1.

2.5. Рекомбинация ВИЧ-1.

2.6. Происхождение ВИЧ-1.

Глава 3. Особенности эволюции ВИЧ-1 в группах лиц, практикующих внутривенное введение психоактивных препаратов.

Глава 4. ВИЧ-инфекция в Российской Федерации.

4.1. ВИЧ-1 в России и других республиках бывшего СССР до 1995 года.

4.2. ВИЧ-1 в России и других республиках бывшего СССР после 1995 года.

ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ.

Глава 1. Материалы и методы.

1.1. Бактериальные штаммы.

1.2. Питательные среды.

1.3. Культура клеток.

1.4. Получение грубого лизата мононуклеарных клеток периферической крови (МКПК).

1.5. Амплификация фрагментов генов gag и env методом полимеразной цепной реакции (ПЦР).

1.6. Сравнительная оценка электрофоретической подвижности гетеродуплексов (НМА).

1.7. Препаративное выделение индивидуальных фрагментов ДНК.

1.8. Обработка выделенного фрагмента ДНК специфическими ферментами.

1.9. Получение рекомбинантных молекул in vitro.

1.10. Получение компетентных клеток Escherichia coli.

- 1.11 .Трансформация компетентных клеток Escherichia coli препаратами плазмидной ДНК.

1.12. Выделение рекомбинантной плазмидной ДНК.

1.13. Гидролиз ДНК специфическими эндонуклеазами.

1.14. Выделение плазмидной ДНК в градиенте плотности хлористого цезия.

1.15. Серологический метод определения генотипов вируса иммунодефицита человека 1-го типа (PEIA - peptide-based enzyme immunoassay).

1.16. Изоляция вируса иммунодефицита человека первого типа.

1.17. Выделение вирусной РНК из плазмы.

1.18. Синтез кДНК молекул.

1.19. Определение спектра используемых ВИЧ хемокиновых рецепторов.

1.20. Определение уровня синтеза белка р24 с помощью ИФА.

1.21. Определение нуклеотидной последовательности фрагментов ДНК.

1.22. Статистическая обработка данных.

Глава 2. Определение подтипов ВИЧ-1 у лиц, практикующих внутривенное введение психоактивных препаратов, на территории Российской Федерации.

2.1. Серологический и генетический анализ вариантов ВИЧ-1, циркулирующих среди наркоманов в Москве и Московской области.

2.2. Серологический и генетический анализ вариантов ВИЧ-1, циркулирующих среди наркоманов в Иркутской области.

2.3. Серологический и генетический анализ вариантов ВИЧ-1, циркулирующих среди наркоманов в Пермской области.

2.3.1. «Нетипируемость» отдельных сывороток с помощью ИФА

2.4. Анализ вариантов ВИЧ-1, циркулирующих среди наркоманов в других регионах Российской Федерации.

2.5. Серологический анализ образцов сывороток, полученных от ВИЧинфицированных наркоманов, находящихся в местах заключения

Глава 3. Изучение биологических свойств вирусов, циркулирующих среди наркоманов в России.

3.1. Предварительная характеристика пациентов, образцы

- периферической крови которых были использованы для изоляции ВИЧ

3.2. Изоляция ВИЧ-1.

3.3. Анализ первичной структуры области гена епу, кодирующей участок С2-УЗ гликопротеина СР120 первичных изолятов

ВИЧ-1.

3.4. Изучение спектра используемых корецепторов в инфекционном процессе.

Глава 4. Генетическая изменчивость ВИЧ-1 у наркоманов, инфицированных из одного источника.

4.1. Генетическая изменчивость вариантов ВИЧ-1, циркулирующих среди наркоманов в Москве, Московской области и Иркутске.

4.2. Генетические различия вариантов ВИЧ-1 в образцах, выделенных от пациента 1Ш025.

ОБСУЖДЕНИЕ.

Введение Диссертация по биологии, на тему "Генетическая изменчивость вируса иммунодефицита человека первого типа (ВИЧ-1), циркулирующего на территории России в группах лиц, практикующих внутривенное введение психоактивных препаратов"

Актуальность проблемы. Вирус иммунодефицита человека первого типа (ВИЧ-1), впервые описанный в 1983 году, сразу же привлек пристальное внимание исследователей в разных странах мира. В первую очередь это было связано с тем, что этот вирус ассоциирован с тяжелыми поражениями иммунной системы, приводящими к развитию так называемого синдрома приобретенного иммунодефицита (СПИД) и, как следствие, к летальному исходу. На сегодняшний день отсутствуют эффективные способы борьбы с этим опасным заболеванием. Одной из причин является высокая генетическая вариабельность этого вируса, которая позволяет ему уходить от специфического иммунного ответа и определяет быструю селекцию устойчивых к лекарственным препаратам вариантов. В связи с этим, изучение генетической изменчивости этого вируса (в разных странах и различных группах риска) является одним из основных направлений современной молекулярной вирусологии.

ВИЧ-1, являющийся одним из наиболее социально значимых инфекционных агентов, обнаруженных в двадцатом столетии, продолжает быстро распространяться во всем мире. В некоторых районах Африки этот вирус уже является главной причиной смерти взрослого населения в возрасте 15-49 лет и продолжает распространяться в мало затронутых эпидемией регионах. К наиболее пораженным ВИЧ-инфекцией территориям также относится Южная и Юго-Восточная Азия, Латинская Америка. В разных странах мира ВИЧ-1 обнаруживается в различных группах риска. При этом если в Африке и большинстве стран Азиатского континента вирус преимущественно передается в результате половых контактов, то в странах Западной Европы и в Северной Америке одной из основных групп риска являются лица, практикующие внутривенное введение психоактивных препаратов.

На территории Российской Федерации, а также других стран бывшего Советского Союза распространение ВИЧ-1 в 1987-1995 гг. происходило относительно медленно. Первый случай обнаружения инфицированного ВИЧ-1 и больного с синдромом приобретенного иммунодефицита у гражданина СССР был описан в 1987 г. (Покровский и др., 1987). На 1 января 1996 г., по данным Федерального центра по профилактике и борьбе со СПИДом, на территории России было идентифицировано 1062 случая. При этом основным путем распространения ВИЧ-инфекции на тот момент являлись половые контакты. Однако с конца 1995 г., в связи" с тем, что вирус был занесен в среду наркоманов, практикующих внутривенное введение психоактивных препаратов, эпидемиологическая ситуация начала резко меняться, что привело к быстрому росту числа регистрируемых случаев ВИЧ-инфекции. На 25 октября 1999г. в стране было зарегистрировано уже 21572 ВИЧ-инфицированных, причем 20500 людей, зараженных вирусом, были выявлены в 1996-1999гг., а внутривенное введение психоактивных препаратов отмечалось как главный фактор риска заражения у 91% ВИЧ-инфицированных с известным фактором риска заражения. Первые вспышки ВИЧ-инфекции, связанные с этой группой риска, наблюдались в городах юга России, Поволжья, в Калининградской области.

В 1997 г. в совместных исследованиях, проведенных сотрудниками НИИ вирусологии имени Д.И.Ивановского и Российского научно-методического центра по профилактике и борьбе со СПИДом, было показано, что в среде наркоманов, практикующих внутривенное введение психоактивных препаратов, на территории России, а также в большинстве других стран бывшего Советского Союза происходит распространение трех вариантов ВИЧ-1, один из которых относится к подтипу А, другой - к подтипу В, а третий имеет мозаичный генотип gagA/envB, образовавшийся в результате рекомбинации между двумя первыми вирусами (Bobkov et al., 1998). Однако в последующие годы зарегистрированное в нашей стране число случаев ВИЧ-инфекции превысило 200 тысяч. При этом лица, практикующие внутривенное введение психоактивных препаратов, по-прежнему остаются основной группой риска. В связи с этим представляло интерес выяснить, как за этот период эпидемии изменились соотношения между первоначально выявленными в этой группе риска вариантами ВИЧ-1, а также охарактеризовать биологические свойства вирусов, доминирующих в нашей стране. Такие исследования необходимы для лучшего понимания механизмов, лежащих в основе эволюции ВИЧ-1, в частности, для выявления возможных закономерностей взаимоотношения различных вариантов вируса, циркулирующих в одной популяции. С другой стороны, информация о вариантах ВИЧ-1, характерных для России, необходима при совершенствовании методов молекулярной диагностики ВИЧинфекции, а также при разработке стратегии создания потенциальных вакцинных препаратов.

Цели и задачи исследования. Основной целью настоящей работы явилась биологическая и генетическая характеристика вариантов вируса иммунодефицита человека первого типа, циркулирующих в среде лиц, практикующих внутривенное введение психоактивных препаратов, на территории Российской Федерации в период с 1999 г. по 2002 г.

В связи с этим в задачи исследования входило:

1. Генотипирование вариантов ВИЧ-1, выделенных от лиц, практикующих внутривенное введение психоактивных препаратов, на территории 8 субъектов Российской Федерации.

2. Изучение генетической изменчивости вариантов ВИЧ-1, циркулирующих в среде наркоманов.

3. Получение изолятов ВИЧ-1 in vitro.

4. Генетический анализ и изучение биологических свойств изолятов ВИЧ-1. Научная новизна работы. В результате проведенной работы с использованием методов иммуноферментного анализа, анализа электрофоретической подвижности гетеродуплексов генов gag и env и анализа нуклеотидной последовательности отдельных участков генома вируса были определены генетические варианты вируса иммунодефицита человека первого типа (ВИЧ-1), циркулирующие в популяции наркоманов, практикующих внутривенное введение психоактивных препаратов, в различных регионах Российской Федерации. Проведена оценка генетической изменчивости вариантов вируса, полученных от пациентов, инфицированных из одного источника, на модели двух крупнейших вспышек ВИЧ-инфекции в Москве и Московской области и в Иркутской области. Получены изоляты ВИЧ-1 подтипа А и CRF03AB, проведен их генетический анализ и определены некоторые биологические свойства.

Практическая ценность.

1. Информация о вариантах ВИЧ-1, характерных для России, может быть использована при совершенствовании методов молекулярной диагностики ВИЧ-инфекции, а также при разработке стратегии создания потенциальных вакцинных препаратов.

2. Данные о нуклеотидных последовательностях 48 вариантов ВИЧ-1, обнаруженных на территории России, депонированы в Международный банк генов GenBank.

Обзор литературы Глава 1

Вирус иммунодефицита человека первого типа (ВИЧ-1): структурные особенности и функциональная - организация генома.

Синдром приобретенного иммунодефицита (СПИД) впервые был описан в 1981 году у мужчин, практиковавших половые контакты с мужчинами (МППКМ) в Нью-Йорке и Калифорнии (США) (Masur et al., 1981; Centers for Disease Control & Prevention, 1981). Эпидемиологические данные уже тогда позволили предположить инфекционную природу этого заболевания. Вскоре независимо двумя группами исследователей от пациентов с характерными клиническими признаками был изолирован вирус - этиологический агент СПИДа (Barre-Sinoussi et al., 1983, Gallo et al., 1984). Впоследствии в разных лабораториях мира была выделена целая группа близкородственных вирусов, которые описывались в научной литературе под разными названиями: «Lymphoadenopathy associated virus» (LAV), «Human T-cell Lymphotropic Virus Type III» (HTLV-III)», «AIDS Related Virus» (ARV), (Barre-Sinoussi et al., 1983, Gallo et al., 1984, Levy et al., 1984). Позже для этого вируса было введено единое название - вирус иммунодефицита человека первого типа (ВИЧ-1) (Human Immunodeficiency Virus Type 1, HIV-1). ВИЧ-1 был отнесен к подсемейству лентивирусов семейства ретровирусов (Бюллетень ВОЗ, 1986) Тремя годами позднее от пациентов - выходцев из Западной Африки был выделен ВИЧ 2-ого типа. ВИЧ-2 (Clavel et al., 1986). Однако на сегодняшний день, этот вирус не играет столь существенной роли в глобальном эпидемическом процессе, как ВИЧ-1.

Статистические данные свидетельствовали о том, что ежегодно происходило удвоение числа больных СПИДом и инфицированных ВИЧ (Piot et al., 2001). Таким образом, СПИД приобрел характер пандемии. В течение последующих 20 лет этот вирус стал причиной смерти около 23 миллионов человек; 37 миллионов человек в настоящее время инфицированы ВИЧ (Weiss, 2001). Эпидемия ВИЧ-инфекции породила серьезные проблемы социального и экономического характера, привела к росту социальной напряженности в обществе, вызвав антигуманные, дискриминационные отношения к людям, пораженным ВИЧ. Помимо прямых финансовых потерь, связанных с расходами на диагностику, лечение и профилактику, эпидемия может явиться причиной разрушительных долгосрочных широкомасштабных экономических кризисов, поскольку болезнь поражает, прежде всего, людей, находящихся в репродуктивном и наиболее работоспособном возрасте, и, таким образом, может катастрофически изменить демографическую ситуацию во многих странах. СПИД был признан мировым сообществом одной из главных проблем, стоящих перед человечеством.

Заключение Диссертация по теме "Молекулярная биология", Ханина, Татьяна Аркадьевна

Выводы

1. Использование комбинации методов серологического анализа, сравнения электрофоретической подвижности гетеродуплексов и анализа нуклеотидной последовательности позволило установить, что в восьми субъектах Российской Федерации среди лиц, практикующих внутривенное введение психоактивных препаратов, доминирует вариант ВИЧ-1 подтипа А, выявленный в 725 из 748 (96,9%) случаев.

2. Показана низкая генетическая вариабельность вариантов ВИЧ-1 ЮИ- А, которая для области гена епу, кодирующей участок С2-УЗ гликопротеина СР120, составила 1,75±0,83 и 2,35±1,59 для инфицированных наркоманов Москвы (п=11) и Иркутска (п=12), соответственно.

3. Варианты ВИЧ-1 ГОИ-В и ГОи-А/В, выявленные в 3,1% случаев, в настоящее время вносят лишь незначительный вклад в эпидемию ВИЧ-инфекции в России, по крайней мере, в девяти изученных субъектах Федерации.

4. Получены и охарактеризованы изоляты ВИЧ-1 ГОЦ-А (п=8) и ГОи-А/В (п=2), выделенные от ВИЧ-инфицированных пациентов в Московской и Пермской областях.

5. Показано, что для всех изученных изолятов ВИЧ-1 ГОЦ-А и ГОи-А/В характерны низкая репликативная активность, невысокий уровень синцитиеобразования и использование в качестве вторичных рецепторов белков ССЫ5 и СХСЯ4.

Заключение

Таким образом, в результате проведенных исследований было показано, что вариант вируса подтипа А (IDU-A) является доминирующим в популяциях наркоманов, практикующих внутривенное введение психоактивных препаратов на территории Российской Федерации. Массовое распространение данного варианта вируса в первую очередь, по-видимому, связано с наличием устойчивых экономических и социальных связей между различными регионами России и Украины, где эпидемия ВИЧ-инфекции началась несколько раньше. Географическое соседство отдельных субъектов Российской Федерации с другими странами, по-видимому, само по себе не является достаточным условием «передачи» вируса с одной территории на другую, так как в Иркутской области циркулируют те же варианты ВИЧ-1 1DU-A, что и в Европейской части России, а не вирусы подтипа С, характерные для Китая. Сходство в биологических свойствах между вариантами IDU-A и IDU-A/B, по-видимому, также дает возможность утверждать, что доминирование вирусов подтипа А не связано с какими-то фенотипическими отличиями этих вирусов.

Вариант вируса подтипа А был обнаружен нами в 96,9% случаев ВИЧ-инфекции среди наркоманов. По данным Российского центра по профилактике и борьбе со СПИДом, представители данной группы риска составляют около 94% от общего числа ВИЧ-инфицированных с известным фактором риска заражения. Вероятно, можно, таким образом, предполагать, что этот вирус вызвал не менее 200 тыс. случаев ВИЧ-инфекции в России. Более того, популяция вирусов подтипа А, циркулирующих в нашей стране, характеризуется низким уровнем генетической изменчивости. Очевидно, что такое широкое распространение варианта вируса IDU-А оказывается важным для практической медицины, и это обстоятельство, вероятно, необходимо принимать во внимание при разработке, как диагностических средств, так и методов лечения и специфической профилактики ВИЧ-инфекции в нашей стране. Циркуляцию в России достаточно генетически гомогенного варианта одного подтипа необходимо, во-первых, принимать во внимание при разработке новых, а также при проверке уже имеющихся диагностических тестов, в первую очередь, основанных на выявлении генома вируса. Панель образцов ВИЧ-1 подтипа А, характерного для России, должна быть обязательным инструментом при контроле качества таких тестов. Во-вторых, доминирование варианта вируса подтипа А имеет важное значение при разработке новых химиопрепаратов, так как их создание, клинические испытания, а также изучение лекарственной устойчивости должны

121

Библиография Диссертация по биологии, кандидата биологических наук, Ханина, Татьяна Аркадьевна, Москва

1. Бобков А.Ф., Покровский В.В., Селимова J1.. и др. Генетическое разнообразие вирусов иммунодефицита человека первого типа (ВИЧ-1) на территории России//ДАН.- 1997.- Т.353.- С.822-824.

2. Бобков А.Ф., Покровский В.В., Селимова JIM., и др. Генетическая характеристика вариантов вируса иммунодефицита человека первого типа, вызвавших эпидемию среди наркоманов в странах СНГ//Вопр.Вирусол.1998.-Т.43.-С.253-256.

3. Бобков А.Ф., Казеннова Е.В., Селимова Л.М., и др. Субтипы ВИЧ-1 в России// Журн.микробиол,-1999.-№ 1 .-С.43 -45.

4. Бобков А.Ф., Зверев С .Я., Бобкова М.Р. и др. Эпидемиологическая и генетическая характеристика первых 40 случаев ВИЧ-инфекции на территории пермской области// Вопр.вирусол.-2000.- Т.47- С. 18-21.

5. Бобков А.Ф., Казеннова Е.В., Бобкова М.Р., и др. Молекулярно-эпидемиологическая характеристика ВИЧ-1 на территории России//Вестник Российской Академии Медицинских наук.-2002.-Т.8.-С. 18-20.

6. Бобкова М.Р., Бобков А.Ф., Буравцова Е.В., Селимова JIM., Казеннова Е.В. Молекулярно- эпидемиологическая характеристика основных очагов эпидемии ВИЧ-инфекции среди наркоманов в России// Вопр. Вирусол.1999. Т.44. - С.220-224.

7. Галегов Г.А. Лекарственная устойчивость и ее значение в процессе лечения ВИЧ-инфекции//СошШит medicum.-2001.- Экстра выпуск, ВИЧ-инфекция. -С.11-13.

8. Гараев М.М., Бобков А.Ф., Бобкова М.Р., Калинин В.Н., Кислина О.С., Лобов В.Г., Файзуллин Л.З., Народицкий Б.С., Тихоненко Т.И. Сайт-специфические делеции векторной плазмиды pBR322// Докл. АН СССР.- 1980.- т. 253.- с. 1232-1235.

9. Гланц С. Медико-биологическая статистика.- М: Практика, 1999.

10. Казеннова Е.В., Бобков А.Ф., Селимова Л.М., и др. Анализ субипов гена gag вариантов ВИЧ-1, выделенных в России, методом сравнительной оценки электрофоретической подвижности гетеродуплексов // Вопр. Вирусол.-2001.-Т.46.-С.12-16.

11. П.Маниатис Т., Фрич Э., Сэмбрук Д. Методы генетической инженерии. Молекулярное клонирование.- М.: Мир, 1984.

12. Научная деятельность ВОЗ. Вирус иммунодефицита человека// Бюллетень ВОЗ.- 1986,- Т.64, № I.-C.8-9.

13. Покровский В.В., Янкина З.К. Эпидемиологическое расследование первого случая СПИД, выявленного у гражданина СССР// Журнал микробиологии.-1987,-№12,- С.8-11.

14. М. Покровский В.В. Эпидемиология и профилактика ВИЧ-инфекции и СПИД// М:Медицина, 1996.

15. Покровский В.В., Ладная Н.Н., Буравцова Е.В. ВИЧ-инфекция// Информационный бюллетень-1999.-№ 15.- С.8-13.

16. Селимова Л.М., Бобков А.Ф., Серебровская Л.В., и др. Фенотипический и генетический анализ варианта вируса иммунодефицита человека (ВИЧ-1) субтипа В, выделенного в России//Вопр.Вирусол.-1998.-Т.43.-С.110-113.

17. Смольская Т.Т//Журн.микробиол.-1997.-№ 1.-С.45-48

18. Эккерт//Иммунологические методы. Под ред. Г. Фримеля.- М.,1987.-с.226-253.

19. Asante-Appiah Е., Skalsa М. Molecular mechanisms in retrovirus DNA integration// Antiviral Res.-1997.-V.36.-P. 139-156.

20. Ayyavoo V., Muthumani K., Kudchodkar S., et al. H3V-1 viral protein R compromises cellular immune junction in vivo/Ant Immunol.- 2002.- V.14.- P.1322.

21. Barnarelli P., Mazzola F., Menzo S., et al. Host-specific modulation of the selective constraints driving human immunodeficiency virus type 1 env gene evolution//! Virol.-1999.-V.73.-P.3764-3777.

22. Balitta C., Bagnarelli., Violin M., et al. Homozygous delta 32 deletion of the CCR-5 chemokine receptor gene in an HIV-1-infected patient//AIDS.-l997.-V.11.-P.67-71.

23. Barre-Sinussi F., Cherman J.C., Rey F. et al. Isolation of T-lymphotrofic retrovirus from patient at risk to AIDS// Science.-1983,- V.220.- P.868-871.

24. Baudin F., Marquet R., Isel C., et al. Functional sites in the 5' region of human immunodeficiency virus type 1 RNA form defined structural domains// J.mol.Biol.-1993.-V.229.-P.382-397.

25. Bazan H., Alkhatib G., Broder C., et al. Patterns of CCR5, CXCR4 and CCR3 usage by envelope glycoproteins from human immunodeficiency virus typel- primary isolates//!Virol.-1998.-V.72.-P.4485-4491.

26. Bazaral M., Helinski DR. Circular DNA forms of colicinogenic factors El, E2 and E3 from Escherichia coli//J.Mol.Biol.-l 968.-V.36.-P. 185-194.

27. Berson J., Doms R.W. Structure-function of the HIV-1 coreceptors// Semin.Immunol.-1998.- V. 10.-P.237-248.

28. Berthoux L., Pechoux Ch., Darlix J. Multiple effects of an anti-human immunodeficiency virus nucleocapsid inhibitor on virus morphology and replication//J.Virol.- 1999.- V.73.-P. 10000-10009.

29. Bobkov A., Cheingsong-Popov R., Selimova L., et al. Genetic heterogeneity of HIV-1 type 1 in Russia: identification of H variants and relationship with epidemiological data// AIDS Res.Hum.Retroviruses.-1996.-V. 12.-P. 1687-1690.

30. Bobkov A. Cheingsong-Popov R., Selimiva L., et al. An HIV type 1 epidemic among injecting drug users in the former Soviet Union caused by a homogeneous subtype A strain// AIDS Res.Hum.Retroviruses.-1997.-V.13.-P.l 195-1201.

31. Bobkov A., Lukashov V., Goudsmit J., et al. Silent mutation in the V3 region characteristic if HIV type 1 env subtype strains from injecting drug users in the former Soviet Union// AIDS Res.Hum.Retroviruses.-2000.-V.16.-P.291-294.

32. Bobkova M., Kazennova E., Selimova L., et al. Serological approaches to subtyping of HIV-1 in injecting drug users in Russia: evidence of subtype homogeneity at the main sites of the epidemic//Int J STD&AIDS.-2001.-V.12.-P.34-40.

33. Bukrinskaya A., Ghorpade A. Heizinger N., et al. Phosphorylation-dependent human immunodeficiency virus type I infection and nuclear targeting of viral DNA//Proc.Natl. Acad. Sci.-1996.-V.93.-P.367-371.

34. Campos-Lopez PI., Vila del Castillo J., Petersen-Farah A., et al. Open air rock and roll concert: beyond of the HIV/AIDS and substance misuse prevention//XIV- International AIDS Conference.-2002.- July 7-12.- ThPeF8098.

35. Carr JK., Salminen MO., Albert J., et al. Full genome sequences of human immunodeficiency virus type 1 subtypes G and A/G inter-subtype recombinants//Virology .-1998.-V.247.-P.22-31.

36. Centers for Disease Control & Prevention. Kaposi's sarcoma and Pneumocystispneumonia among homosexual men in New York city and California. Mort.Morb.Wkly.Rep. -1981.-V.30.-P. 305-308.

37. Cheingsong-Popov R., Chappey C., Callow D., et al. HIV-1 V3 serotypes: distribution and correlation with genotypes//International Conference on AIDS, 10th.- Yokohama, 1994.- Abstr.PC0430.

38. Cheingsong-Popov R., CallowD., Beddows S., et al. Serotyping HIV-1 by antibody binding to the V3-loop: relationship to viral genotype// Ibid.- 1994,- Vol.- 10-P.1379-1386.

39. Chen Z. Human immunodeficiency virus type 2 (HIV-2) seroprevalence and characterization of a distinct subtype from the natural range simian immunodeficiency virus-infected sooty mangabeys//J.Virol.-1997.-V.71.-P.3953-3960.

40. Chen H., Young NL., Subbarao S., et al. HIV type 1 subtypes in Guangxi Province, China, 1996//AIDS Res Hum Retroviruses.-1999.-V.15.-P.81-84.

41. Chesebro B„ Nishio J., Perryman S., et al. Identification of human immunodeficiency virus envelope gene sequences influencing viral entry into CD-4 positive Hela cells, T-leukemia cells, and macrophages//!.Virol.-1991.-V.65.-P.5782-5789.

42. Cho M., Lee M., Carney M., et al. Identification of determinants on a dualtropic human immunodeficiency virus typel envelope glycoprotein that confer usage of CXCR4//J. Virol.-1998.-V.72.-P.2509-2515.

43. Choe H., Farzan M., Sun Y., et al. The beta chemokine receptors CCR3 and CCR5 facilitate infection by primary HIV-1 isolates//Cell.-1996.-V.85.-P.621-628.

44. Clavel F., Guetard F., Brun-Vezinet S., et al. Isolation of a new human retrovirus from West African patients with AIDS//Science.-1986.-V.233.-P.343-346.

45. Clavel F., Mansinho K., Chamaret S., et al. Human immunodeficiency virus type 2 infection associated with AIDS in West Africa// N Engl J Med.- 1987.-V. 316.-P. 1180-1185.

46. Coffin JM. Retroviridae and their replication//in Virology, New York, Raven Press.-1990.-P. 1437-1450

47. Cohen S.N., Chang A., Hsu L. Nonghromosomal antibiotic resistance in bacteria: genetic transformation of Escherichia coli by R-factor DNA//Proc.Natl.Acsd.Sci.- 1972.- Vol.69.- No.8.- P.2110-2114.

48. Cohen EA., Dehni G., Sodroski JG., et al. Human immunodeficiency virus vpr product is a virion-associated regulatory protein//J.Virol.-1990.-V.64.-P.3097-3099.

49. Cudmore S., Reckman I., Way M. Viral manipulations of the actin cytoskeleton// Trends Microbiol.-l 997.-V.5.-P. 142-148.

50. Darlix JL., Gabus C., Nugeyre M., et al. Cis elements and trans-acting factors involved in the RNA dimerization of the human immunodeficiency virus HIV-l//J.Mol.Biol.-1990.-V.216.-P.689-699.

51. Delwart E., Shpaer E.G., Louwagie J. Genetic relationships determined by a DNA heteroduplex mobility assay analysis of HIV-1 env genes//Science.- 1993.-Vol.262.- P.1257-1261.

52. Delwart EL., Sheppard HW., Walker BD., et al. Human immunodeficiency virus type 1 evolution in vivo tracked by DNA heteroduplex mobility assays//J. Virol. -1994.-V.68.-P.6672- 6683.

53. Deng H., Liu R., Ellmier W., et al. Identification of a major co-receptor for primary isolates of HIV-l//Nature.-1996.-V.381 .-P.661-666.

54. De Silva F., Venturini D., Wagner E., et al. CD4-independent infection of human B cells with HIV type 1: detection of unintegrated viral DNA//AIDS Res.Hum.Retroviruses.-2001 .-V. 17.-P. 1585-1598.

55. Dofman T., Mammano F., Haseltine W. A., et al. Role of the matrix protein in the virion assosiation of the human immunodeficiency virus type 1 envelope glycoprotein// J.Virol.-1994,- V.68.-P. 1689-1696.

56. Dorman KS., Kaplan AH., Sinsheimer JS. Bootstrap confidence levels for HIV-1 recombination//J.Mol.Evol.-2002.-V.54.-P.200-209.

57. Dragic T., Litwin V., Allaway G., et al. HIV-1 entry into CD4 cells is mediated by the chemokine receptor CC-CKR-5//Nature.-1996.-V.381.-P.667-673.

58. Dumonceaux J., Nosole S., Chanel L., et al. Spontaneous mutation in the env gene of the human immunodeficiency virus type 1 NDK isolate are associated with a CD4-independent entry phenotype//J.Virol.-1998.-V.72.-P.512-519.

59. Ensoli B„ Gendelman R., Markham P., et al. Synergy betweenbasic fibroblast growth factor and HIV-1 Tat protein in induction of Kaposi's sarcoma//Nature.-1994.-V.371 .-P.674-680.

60. Felsenstein J. PHYLIP phylogenetic interference package (version 3.2)// Cladistics. - 1989,- Vol. 5,- P. 164-166.

61. Feng Y., Broder C., Kennedy P., et al. HIV-1 entry cofactorrFunctional cDNA cloning of a seven-transmembrane G protein-coupled receptor//Science.-1996.-V.272.-P.872-877.

62. Fouchier R., Groenink N., Kootstra A., et al. Phenotype-associated sequence variation in the third variable domain of the human immunodeficiency virus type 1 gp 120 molecule// J.Virol.- 1992.-V.66.-P.3183-3187

63. Freed E.O., Martin M.A. Domains of the human immunodeficiency virus type 1 matrix and gp41 cytoplasmic tail required for envelope incorporation into virions// J.Virol.-1996.-V.70.-P.341-351.

64. Freed E.O. Gag proteins diverse functions in the virus life eyele//Virology.- 1998.-V.251.-P.1-15.

65. Gallo R.C. Frequent detection and isolation of cytopathic retroviruses (HTLV-III) from patient with AIDS and at risk for AIDS// Science.- 1984.- V.224.- P.500-503.

66. Ganeshan S., Dickover R., Korber B., et al. Human immunodeficiency virus type 1 genetic evolution in children with different rates of development of disesase//J. Virol.-1997.-V.71.-P.663-677.

67. Gao F. Origin of HIV-1 in the chimpanzee Pan troglodytes troglodytes!/Nature.-1999.-V.397.-P.436-441.

68. Gao F., Robertson DL., Morrison SG., et al. The hetrosexual human immunodeficiency virus type 1 epidemic in Thailand is caused by an intersubtype (A/E) recombinant of African origin// J.Virol.-l 996.-V.70.-P.7013-7029.

69. Garcia J., Miller A. Serine phosphorylation-independent downregulation of cell-surface CD4 by nef//Nature.-1991.-V.350.-P.508-511.

70. Gerderblom Hans R. Assembly and morphology of HIV: potential effect of structure on viral function// AIDS.- 1991.- V.5.- P.617-638.

71. Gojobori T., Moriyama E. Molecular clock of viral evolution, and neutral theory//Proc.Natl.Acad.Sci.-1990.-V.87.-P. 10015-10018.

72. Goldstein G. HIV-1 Tat protein is a potential AIDS vassine//Nature Med.-1996.-V.2.-P.960-964.

73. Gromyko A. Epidemiological trends of AIDS and other sexually transmitted diseases in the eastern part of Europe//XI International Conference on AIDS.-1996.-P.205.

74. Hamers F., Downs A., Infiiso A., et al. Diversity of the HIV/AIDS epidemic in Europe//AIDS.-1998.-V. 12.-P.63-70.

75. Hamers FF., Semaille CH., Alix J., et al. Increasing geographic disparity in the HIV situation in the WHO European region// XIV International AIDS Conference.-2002.- July 7-12,- ThPeC.4699.

76. Hamm T., Rekosh D., Hammarskjold M. Selection and characterisation of Human immunodeficiency virus type 1 mutants tha are resistant to inhibition by the transdominant negative RevMlO protein// J.Virol.-1999.- V.73.-P.5741-5747.

77. Harrich D, Hooker B. Mechanistic aspects of HIV-1 reverse transcription initiation// Rev Med Virol.- 2002.- V.-12.- P.31-45.

78. Helga-Maria C., Hammarskjold M., Rekosh D. An intact TAR element and cytoplasmic localisation are necessary for efficient packing of human immunodeficiency virus type 1 genomic RNA// J.Virol.-1999.- V.73.- P.4127-4135.

79. Heyndrickx L, Janssens W, Zekeng L et al. Simplified Strategy for detection of recombinant human immunodeficiency virus type 1 Group M isolates by gag/env heteroduplex mobility assay// J. Virol. -2000. -Vol.74. -P. 363-370.

80. HIV-infection in Eastern Europe and Central Asia in 1993-1998//Russian Federal AIDS Centre.-1999,-Moscow.

81. Hofman B., Hasetline W.A. Molecular biology of the AIDS virus: ten years of discovery hope for the future// Science Challenging AIDS, Basel, Karger.- 1992-V.1.-P.71-106.

82. Hoglund S., Ohagen A., Goncalves J., et al. Ultrastructure of HIV-1 genomic RNA// Virol.-1997,- V.233.-P.271-279.

83. Holmes DC and Guidley M. A rapid boiling method for the preparation of bacteria plasmods// Anal Biochem.- 1981.-114,- P.193-197.

84. Hrimech M„ Yao X., BachandF., et al. Human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) Vpr functions as an immediate-early protein during HIV-1 infection//J/Virol.-1999.-V.73.-P.4101-4109.

85. Huang Y., Zhang L., Ho D. Characterization of nef sequences in long-term survivors of human immunodeficiency virus type 1 infection// J.Virol.- 1995-V.69.-P.93-100.

86. Huang L., Bosch I., HofmannW., et al. Tat protein induces human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) coreceptors and promotes infection with both macrophage-tropic and T-lymphotropic HIV-1 strain//J.Virol.-1998.-V.72.-P.8952-8960.

87. Ichimura H„ Kliks S., Visrutaranta S., et al. Biological, serological and genetic characterization of HIV-1 subtype E isolates from Northern Thailand// AIDS Res Hum Retroviruses.-1994.-V. 10.-P.263-269.

88. Jacks T., Power M., Masiaxs R., et al. Characterization of ribosomal frameshifting in HIV-1 gag-pol expression//Nature.-1988.-V.331 .-P.280-283.

89. Janssens W., Buve A., Nkengasong JN. The puzzle of HIV-1 subtypes in Africa// AIDS.-1997.- V. 11 .-P.705-711.

90. Ji H., Shu W., Burling T., et al. Inhibition of human immunodeficiency virus type 1 infectivity by the gp41 core: role of a conserved hydrophobic cavity in membrane fiision//J.Virol.-1999.-V.73.-P.8578-8586.

91. Johnson J. HIV infection is blocked in vitro by recombinant soluble CD4//Nature.-1990.-V.331 .-P.76-78.

92. Jowett J.B., Planelles V., Poon B., et al. The human immunodeficiency virus type 1 vpr gene arrests infected t cells in the G2 +M phase of the cell cycle//J.Virol.-1995.-V.69.-P.6304-6313.

93. Kageyama S., Hoekzema D.T., Murakava Y,, et al. A C2 symmetry-based HIV protease inhibitor, A77003, irreversibly infectivity of HIV-1 in vitro// AIDS Res.Hum.Retro viruses.- 1994.-V.10,- P.735-743/

94. Kato K., Shiino T., Kusagawa S., et al. Genetic similarity of HIV typel subtype E in a recent outbreak among injecting drug user in Northern Vietnam to strains in Guangxi province of Southern China//AIDS Res.Hum.Retroviruses.-1999.-V.15.-P. 1157-1168.

95. Kaushik N., Basu A., Palumbo P., et al. Anti-TAR Polyamide Nucleotide Analog Conjugated with a Membrane-Permeating Peptide Inhibits Human Immunodeficiency Virus Type 1 Production// J Virol.-2002.- V. 76.-P.3881-3891.

96. Klasse P.J., Bron R., Marsh M. Mechanisms of enveloped virus entry into animal cells// Adv.Drug Rev.- 1998.- V.34.- P.65-91.

97. Kliks S., Shioda T., Haigwood N., et al. V3 variability can influence the ability of an antibody to neutralize or enhance infection by diverse strains of human immunodeficiency virus type l//Proc. Natl. Acad. Sci. US.- 1993.-V.90.-P.11518-11522.

98. Kobyshcha Y., Sherbinskaya A., Khodakevich L., et al. HIV infection among drug users in Ukraine beginning of the epidemic// XI International Conference on AIDS.-1996.-P.204.

99. Kolchinsky P., Mirzabekov T., Farzan M., et al. Adaptation of a CCR5-using, primary human immunodeficiency virus typel isolate for CD4-independent replication//J. Virol.-1999.-V.73.-P.8120-8126.

100. Kolchinsky P., Kiprilov E., Bartley P., et al. Loss of single N-linked glycan allows CD4-independent human immunodeficiency virus type 1 infection by- altering the position of the gpl20 V1/V2 variable loops/J.Virol.-2001.-V.75.-P.3435-3443.

101. Kondo E., Mammano F., Cohen E., et al. The p6Gag domain of human immunodeficiency virus type 1 is sufficient for the incorporation of Vpr into heterologous viral particles//J.Virol.-1995.-V.69.-P.2759-2764.

102. Korber B., Maclnnes K., Smith R., et al. Mutational trends in V3 loop protein sequences observed in different genetic lineages of human immunodeficiency virus type l//J.Virol.-1994.-V.68.-P.6730-6744.

103. Korber B., Theiler J., Wolinsky S. Limitations of a molecular clock applied to considerations ofthe origin of fflV-l//Science.-1998.-V.280.-P.1868-1871.

104. Kotov A., Zhou J., Flicker P., et al. Association of Nef with the human immunodeficiency virus type 1 core//J.Virol.-1999.V.73.-P.8824-8830.

105. Kuiken CL., Goudsmit J. Silent mutation pattern in V3 sequences distinguished virus according to risk group in Europe//AIDS Res.Hum.Retro viruses. -1994.-V. 10. -P.319-320.

106. Kuiken CL., Lukashov V., Baan E., et al. Evidence for limited within-person evolution of the V3 domain of the HTV-1 envelope in the Amsterdam population//AIDS.-1996.-V. 10.P.31 -37.

107. Kwong P.D., Wyatt R., Robinson J., et al. Structure of an fflV gp 120 envelope glycoprotein I complex with the CD4 receptor and neutralizing human antibody//Nature.- 1998,- V.393.- P.648-659.

108. Leitner T., Korovina G., Marquina S., et al. Molecular and biological characterization of Russian HIV-1 strains//AIDS Res.Hum.retroviruses.-1996.-V.12.-P. 1595-1603.

109. Lennox ES. Transduction of linked genetic characters of the host by bacteriophage P1 //Virology.-l955.-V. 1 .-P. 190-206.

110. Levy J., Hoffman S., Kramer J., et al. Isolation of lymphocytopathic retroviruses from San Francisco patients with AIDS//Science.-1984.-V.225.-P.840-842.

111. Liitsola K., Tashkinova I., Laukkanen G., et al. HIV-11 genetic subtype A/B- recombinant strain causing an explosive epidemic in injecting drug users in

112. Kaliningrad//AIDS/-1998.-V/12.-P. 1907-1919.

113. Liu B., Dai R., Tian Ch., et al. Interaction of the human immunodeficiency virus type 1 nucleocapsid with actin//J.Virol.- 1999.- V.73.-P.2901-2908.

114. Lu M., Blackow S., Kim P. A trimeric structural domain of the HIV-1 transmembrane glycoprotein//Nature Struct.Biol.-l 995.-V.2.-P. 1075-1082.

115. Lu M., Ji H., Shen S. Subdomain folding and biological activity of the core structure from human ummunodeficiency virus type 1 gp41:implications for viral membrane fusion// J.Virol.- 1999.- V.73. P.4433-4438.

116. Lu Y., Spearman P., Ratner L. Human immunodeficiency virus type 1 viral protein R localization in infected cells and virions//J.Virol.-1993.-V.67.-P.6542-6551.

117. Lukashov V., Comelissen M., Goudsmit J., et al. Simultaneous introduction of distinct HIV-1 subtypes into different risk groups in Russia, Beylorussia and Lithuania//AIDS.-1995.-V.9.-P.435-439.

118. Lukashov V., Kuiken K., Goudsmit J. Intrahost human immunodeficiency virus type 1 evolution is related to length of the immunocompetent period//J.Virol.-1995.-V.69.-P.6911-6916.

119. Lukashov VV., Goudsmit J. Foundef virus population related to route of virus transmission: A determinant of intrahost human immunodeficiency virus type 1 evolution?//! Viro1.-1997.-V.71.-P.2023-2030.

120. Lukashov V., Karamov E., Eremin V., et al. Extreme founder effect in an HIV type 1 subtype A epidemic among drug users in Svetlogorsk, Belarus// AIDS Res.Hum.Retroviruses.-1998.-V.14.-P. 1299-1302.

121. Mak J., Kleiman L. Primer tRNAs for reverse transcription// J.Virol.-1997.-V.71.-P.8087-8095.

122. Masur H., Michelis M.A., Greene J.B. et al. An outbreak of community-acquired Pneumocystis carinii pneumonia: initial manifestation of cellular immune dysfunction// N. Eng. J. Med.-1981.- V.305.-P. 1431-1438.

123. Milich 1., Margolin B., Swanstrom R. Patterns of amino acid variability in NSI-like and Si-like V3 sequences and a linked change in the CD4 binding domain- of the HIV-1 env protein//Virology.-1997.-V.239.-P. 108-118.

124. Miller R., Sarver N. HIV accessory proteins as therapeutic targets// Nat.Med.- 1997.-V.3.-P.389-394.

125. Murphy E., Korber B., Feorges-Courbut M-C., et al. Diversity of V3 region sequences of human immunodeficiency virus type 1 from the Central African Republic//ARHR. -1993 .-V.9.-P.997-1007.

126. Nath A., Conant K., Chen P., et al. Transient exposure to HIV-1 Tat protein results in cytokine production in macrophages and astrocytes//J.Biol.Chem.-1999.-V.274.-P. 17098-17102.

127. Novitsky VA, Montano MA, Essex M. Molecular epidemiology of an HIV-1 subtype A subcluster among injection drug users in the Southern Ukraine//AIDS Res Hum Retroviruses.- 1998,- V.14.-P.1079-1085.

128. Nowak MA., Anderson RM., McLean AR., et al. Antigenetic diversity thresholds and the development of AIDS//Science.-1991.-V.254.-P.963-969.

129. Nowak MA. Variability of HIV-1 infection//J.Theor.Biol.-1992.-V.155.P.l-2.

130. O'Brien TR., Winkler C., Dean M., et al. HIV-1 infection in a man homozygous for CCR5 delta 32//Lancet.-1987.-V.349.-P.1219-1224.

131. Ono Akia, Eric O. Frid. Binding of Human immunodeficiency virus type 1 gag to membrane: role of the metrix amino terminus//J.Virol.-1999.- V.73.-P.4136-4144.

132. Pandori M., Fitch N., Craig H., et al. Producer-cell modification of human immunodeficiency virus type 1: Nef is a virion protein//J.Virol.-1996.-V.70.-P.4283-4290.

133. Pandrea I., Descamps D., Cllin G., et al. HIV type 1 genetic diversity and genotyping drug susceptibility in the Republic of Moldova//AID S Res Hum- Retro viruses.-2001.-V.17.-P. 1297-1304.

134. Paxton WA., Martin SR., Tse D., et al. Relative resistance to HIV-1 infection of CD4 lymphocytes from persons who remain uninfected despite multiple high-risk sexual exposures//Nature Med.-1996.-V.2.-P.412-417.

135. Peeters M., Liegeois F., Torimiro N., et al. Characterization of a highly replicative intergroup M/O human immunodeficiency virus type 1 recombinant isolated from a Cameroonian patient//!Virol.-1999,-V.73.-P.7368-7375

136. Piot P., Bartos M., Ghys P., et al. The global impact of HIV/AIDS// Nature.-2001.-V.410.-P.968-973.

137. Poon D., Li G., Aldovini A. Nucleocapsid and matrix protein contributions to selective human immunodeficiency virus type 1 genomic RNA packaging//! Virol.- 1998.-V.72.-P. 1983-1993.

138. Poulin L., Evans L., Tang S., et al. Several CD4 domains can play a role in human immunodeficiency virus infection of cells//!Virol.- 1991.- V.65.-P.4893-4901.

139. Priimagi L., Ustina V., Malogin S., et al. Model of HIV infection spreading in Estonia//Health protection 1995.- 1996.-Tallin.-P.59-65.

140. Rasola A., Gramaglia D., Baccaccio C., et al. Apoptosis enhancement by the HIV-1 Nef protein//!Immunol.-2001 .-V. 166.-P.81 -88.

141. Robert-GuroffM., Popovic M., Gartner S., et al. Structure and expression of tat-, rev-, and nef-specific transcripts of human immunodeficiency virus type 1 in infected lymphocytes and macrophages//!Virol.-1990.-V.64.-P.3391-3398.

142. Robertson DL., Sharp PM., McCutchan FE., et al. Recombination in HIV-1//Nature.-1995.-V.374.-P. 124-126.

143. Robertson DL., Anderson JP., Bradac JA., et al. HIV-1 nomenclature proposal//Science.-2000.-V .288.-P.55-56.

144. Robertson DL., Anderson JP., Bradac JA., et al. A reference guide to HIV-1 classification//hiv-web. lanl.gov, 2002.

145. Rodenburg CM., Li Y., Trask SA., et al. Near full-length clones and reference sequences for subtype C isolates of HIV type 1 from three different continents//AIDS Res.Hum.Retroviruses.-2001.-V. 17.-P. 161 -168.

146. Sabino E., Shpaer E., Morgado M., et al. Identification of human immunodeficiency virus type 1 envelope genes recombinant between subtypes B and F in two epidemiologically linked individuals from Brazil//J.Virol.-1994.-V.68.-P.6340-6346.

147. Sahni AK., Prasad VV., Seth P. Genomic diversity of human immunodeficiency virus type 1 in India//International Journal of STD&AIDS.-2002.-V.13.-P.115-118.

148. Samson M., Libert F., Doranz B., et al. Resistance to HIV-1 infection in caucasian individuals bearing mutant alleles of the CCR5 chemokine receptor gene//Nature.-1996.-V.382.-P.722-725.

149. Sattentau QJ., Weiss RA. The CD4 antigen: physiological ligand and HIV receptor//Cell.-1988.-V.52.-P.631-633

150. Schroder AR, Shinn P, Chen H., et al. HIV-1 integration in the human genome favors active genes and local hotspots//Cell.-2002.-V.l 10.-P.521-529.

151. Schwartz S., Felber B., Fenyo E., et al. Env and Vpu proteins of human immunodeficiency virus type 1 are produced from multiple bicistronic mRNAs//J.Virol.-1990.-V.64.-P.5448-5456.

152. Schwartz O., Marechal O., Danos O., et al. Human immunodeficiency virus type 1 Nef increases the efficiency of reverse transcriptation i the infected cel//J. Virol.-1995.-V.69.-P.4053-4059.

153. Simmons G., Wilkinson J., Reeves M., et al. Primary , syncytium-inducing human immunodeficiency virus type 1 isolates are dual-tropic and most can use either Lestr or CCR5 as coreceptors for virus entry// J.Virol.-1996.-V.70.-P.8355-8360.

154. Simon F., Mauclure P., Roques P., et al. Identification of a new human immunodeficiency virus type 1 distinct from group M and group O// Nature.-1998.-V.4.-P.1032-1037.

155. Shaheduzzaman S., Krishnan V., Petrovic A., et al. Effects of HIV-1 Nef on cellular gene expression profiles//J Biomed Sci.-2002.-V.9 (l).-P.82-96.

156. Sharp P., Bailes E., Chaudhuri R., et al. The origins of acquired immune deficiency syndrome viruses: where and when//Phil.Trans.R.Soc.Lond.-2001.-V.356.-P.867-876.

157. Simon J., Sheeny A., Carpenter E., et al. Mutational analyses of the human immunodeficiency virus type 1 Vifprotein//J.Virol.-1999.-V.73.-P.2675-2681.

158. Starcich B.R., et al. Identification and characterization of conserved and variable regions of the envelope gene HTLV-III/LAV, the retrovirus of AIDS// Cell.- 1986.- V.45.- P.637-648.

159. Stein B., Gowda S., Lifson J. et al. ph-Independent HIV entry into CD4-positive T cells via virus envelope fusion to the plasma membrane//Cell.-1987.-V.49.-P.659-668.

160. Subata E. HIV prevention among intravenous drug users: influencing policies through the networking in the Central and Eastern Europe// XIV International AIDS Conference.-2002.- July 7-12.- ThPeG5604.

161. Takenisa J., Zekeng L., Ido E., et al. Human immunodeficiency virus type lintergroup (M/O) recombination in Cameroon//J.Virol.-1999.-V.73.P.6810-6820.

162. Temin HM. Retrovirus variation and reverse transcription: abnormal strand transfers result in retrovirus genetic variation//Proc.Natl.Acad.Sci.USA.-1993.-V90.-P.6900-6903.

163. Turville SG., Cameran PU., Handley A., et al. Diversity of receptors binding HIV on dendritic cell subsets// Nat Immunol.-2002.-V.-10.- P.975-983.

164. Weeks KM., Ampe C., Schultz SC., et al. Fragments of the HIV-1 Tat- protein specifically bind TAR RNA//Science.-1990.-V.249.-P. 1281-1285.

165. Weiss Robin. Gulliver's travels in HIVland//Nature insight.-2001.-V.410.-P.963-967.

166. WHO Guidelines for Standart HIV Isolation Procedures, 1994.

167. Willey R.L., Maldarelli F., Martin M.A., et al. Human immunodeficiency virus type 1 Vpu protein induces rapid degradation of CD4// J.Virol.-1992.- V.66.-P.7193-7200.

168. Wolf TF., Zwart G., M., et al. Naturally occuring mutations within HIV-1 V3 genomic RNA lead to antigenic variation depend on a single amino acid substitution/TVirology.-1991 .-V. 185.-P. 195-205.

169. Wong-Staal F. Cellular factors for Tat and Rev transactivation//Key-stone Symposium, prevention and treatment.-1992.

170. Yu X., Liu W., Chen J., et al. Maintaining low HIV type 1 env genetic diversity among injecting drug users infected with B/C recombinant and CRF01AE HIV type 1 in Southern China// AIDS Res Hum Retroviruses.-2002.-V.18.-P.167-170.

171. Zeterberg V., Ustina V., Liitsola K et al. CRF06-cpx and subtype A (Eastern European strain) are responsible for the explosive injecting drug use-associated HIV-lepidemic in Estonia// XIV International AIDS Conference.-2002.- July 7-12.-TuPeC4799.

172. Zhou C, Rana TM. A bimolecular mechanism of HIV-1 Tat protein interaction with RNA polymerase II transcription elongation complexes// J Mol Biol.- 2002,- V.320.-P.925-942.

173. Zwart G., Wolfs T., Valk M., et al. Characterization of the specificity of the human antibody response to the V3 neutralization domain of HIV-1 //AIDS.Res.Hum.Retro viruses. -1992. V. 8.-P. 1897-1908.