Бесплатный автореферат и диссертация по биологии на тему

Детектирование молекулярных маркеров бактерий в ткани клапанов сердца при инфекционном эндодкардите с применением метода газовой хроматографии масс-спектрометрии

ВАК РФ 03.00.07, Микробиология

Содержание диссертации, кандидата медицинских наук, Хабиб, Оксана Николаевна

Введение

Актуальность темы

Цели и задачи

Научная новизна работы

Практическая значимость. Внедрение в практику

Основные положения, выносимые на защиту

Апробация

Публикации

Глава 1. Актуальные вопросы этиологии и диагностики ИЭ. Обзор литературы.

1.1 Эпидемиология и этиология инфекционного эндокардита

1.2 Происхождение гемокультуры и ее диагностическая значимость. Анаэробные бактерии в этиологии и патогенезе инфекционного эндокардита

1.3 Современные методы диагностики инфекционных заболеваний 27 1.3.1 Обзор и сравнение современных методов диагностики. Ограничения классического бактериологического метода

1.3.2 Газовая хроматография масс-спектрометрия как современный универсальный способ экспресс-диагностики инфекции Литературный обзор применения метода в отечественной и зарубежной клинической практике. Содержание и суть метода

Глава 2. Материалы и методы исследования

2.1. Материалы и группы исследованя

2.2. Хромато-масс-спекторметрический анализ

2.2.1 Подготовка образцов и режим хромато-масс-спектрометрического анализа

2.2.2 Выявление таксономически-значимых жирных кислот

2.2.3 Обоснование корреляции «маркер- микроорганизм»

2.2.4 Схемы расчета для вычисления концентрации маркеров

2.2.5 Методика расчета состава микст-инфекции клапана при инфекционном эндокардите по индивидуальным микробным маркерам и в условиях их суперпозиции

2.3 Микробиологическое исследование

Глава 3. Экспериментальная часть

3.1 Изучение состава жирных кислот инфицированных и контрольных клапанов сердца и выявление микробной составляющей

3.2. Исследование статистической достоверности различий в концентрации жирных кислот микробного происхождения в норме и патологии.

3.3. Расчет микробного сообщества пораженных клапанов при инфекционном эндокардите и врожденных пороках сердца с использованием уравнений баланса бактериальных жирных кислот.

Глава 4, Обсуждение

4.1 Анализ и комментарии к сводным данным по превышению маркеров

4.2 Комментарии к колонизации эндокарда при врожденных пороках сердца

4.3 Сопоставление данных ГХ-МС анализа с данными микробиологических исследований

4.4 Состав микробиоценоза инфекционного эндокардита по данным масс-спектрометрического анализа ткани пораженных клапанов в сопоставлении с данными других исследований

4.5 Этиологическое разнообразие инфекционного эндокардита и этиологическое единство микробного сообщества клапанов сердца. Определение ведущих возбудителей инфекционного эндокардита по данным масс-спектрометрического анализа ткани пораженных клапанов

4.6 Комментарии к клиническим случаям

4.7 Перспективы практической реализации полученных данных при диагностике и лечении инфекционного эндокардита 115 Выводы 118 Список литературы. 120 Приложения.

Введение Диссертация по биологии, на тему "Детектирование молекулярных маркеров бактерий в ткани клапанов сердца при инфекционном эндодкардите с применением метода газовой хроматографии масс-спектрометрии"

Актуальность темы исследования

Инфекционный эндокардит (ИЭ) остается потенциально-летальным заболеванием, несмотря на достижения современной медицины: даже на фоне использования новейших антибактериальных препаратов показатели смертности остаются тревожно высокими - от 11 до 40% - в зависимости от сроков наблюдения. Показатели выживаемости больных с ИЭ в социально благополучных странах также не удовлетворяют специалистов: послеоперационная составляет в среднем 82%, при 5-летнем периоде наблюдения - 73% [139], а при 7-летнем - 58,2% ± 9,5% [213].

Не секрет, что в большинстве случаев ИЭ исход заболевания и ранняя послеоперационная выживаемость определяется не столько мастерством хирургов, сколько адекватностью/этиотропностью и своевременностью антибактериальной терапии. Основным ориентиром для выбора этиотропной терапии в современной клинической практике является гемокультура (с возможной коррекцией по тканевой культуре при принятой практике бактериологического исследования резецированных клапанов), определяемая классическим бактериологическим методом.

Сложившаяся на сегодняшний день в клинической практике ИЭ ситуация предполагает пересмотр статуса гемокультуры и адекватности микробиологической диагностики.

По данным большого количества исследований ориентированная на гемокультуру антибактериальная терапия неэффективна. Более того, в значительном числе случаев ориентир как таковой отсутствует: частота отрицательных гемокультур при клинически доказанном ИЭ колеблется от 10,7% до 35% [106], что лишь в 45 % случаев может быть объяснено предшествующей антибиотикотерапией [24 6]. По принятым в отечественной лабораторной практике правилам при получении гемокультуры S.epidermidis результат не зачитывается [111].

Ставка на гемокультуру несостоятельна еще и потому, что феномен бактериемии как таковой - спонтанной и индуцированной - у отдельного индивида наблюдается на протяжении жизни сотни и тысячи раз, как-то: после чистки зубов, пережевывания грубой пищи, после экстракции зуба (< чем в 75% случаев по данным тематических исследований). Мировые данные по заболеваемости ИЭ гласят, что бактериемия, в том числе вызванная традиционными эндокардитными штаммами, реализуется в заболевание лишь в 0,0001-0,0006% случаев.

Множественные публикации о несовпадении гемокультуры с микробиологическими находками в ткани пораженного клапана [162,206,229] также свидетельствуют о том, что гемокультура не может служить абсолютным ориентиром для принятия клинических решений.

На сегодняшний день перечень описанных по гемокультурам потенциальных возбудителей ИЭ (из сводных данных по публикациям последних лет и материалам 5th International Symposium on Modern Concepts in Endocarditis and Cardiovascular Infections, 1999) включает чуть ли не всех известных патогенов человека - более 100 видов микроорганизмов. Сохранение лидерства за традиционными возбудителями ИЭ - в 70-75% - за кокками и в 5-10% - за бактериями группы НАСЕК [19] с одной стороны, и этиологическая пестрота - с другой, свидетельствует о серьезном пробеле в знаниях об истинных механизмах инициации ИЭ и его ключевых возбудителях. (НАСЕК - Haemophilus infliuenzae, Actinobacillus actinomycetemcomitans,

Cardiobacterium hominis, Eikenella corrodens, Kingella kingae) Вероятнее всего, речь идет о группе микроорганизмов, редко определяемых в силу различных ограничивающих обстоятельств, в традиционной клинической практике, включая анаэробов и бактерий группы НАСЕК. Этиологическое разнообразие может свидетельствовать о полиэтиологичности ИЭ, в то время как, персистирующее доминирование кокковых возбудителей, скорее всего, - о практической ориентированности (ограниченных возможностях) большинства лабораторий на диагностику этой группы возбудителей.

По данным проспективного анализа всех публикаций по ИЭ за период 1930-1996 гг. в 9 медицинских базах данных, включая MEDLINE, CATLINE, WORLDCAT ИЭ в 80% случаев вызван индигенной микрофлорой (не будучи в половине случаев спровоцированным инфекцией/медицинской инвазией) [93]. Установлено, что среди представителей нормальной микрофлоры организма человека в современной патологии этиологическая роль отводится более 100 видам условно-патогенных микробов. В этом списке доминируют неспорообразующие (неклостридиальные) анаэробные бактерии, представленные на 70-80% Bacteroides spp., Fusobacterium spp., Peptostreptococcus spp., Peptococcus spp., Prevotella spp. и др. [9].

Основу нормальной микрофлоры человека составляют облигатно-анаэробные бактерии. [208,217,21]. Доказано их абсолютное превосходство во всех обитаемых средах человеческого организма с преимуществом над аэробами в 10-1000 раз: только в полости рта, например, обитает 500 известных видов анаэробов.

Сотни исследований в базе Medline (авторский анализ профильных публикаций, начиная с 1966 года), свидетельствуют о существенном вкладе анаэробов в развитие наиболее тяжелых инфекционных заболеваний человека, включая ИЭ, вызванный бактериями Peptostreptococcus spp. [Halevy J., et al., 1980 [123]; Pineiro D.J., et al., 1981 [187]; Zjang J., 1997 [251] и другие], Propionibacterium spp. [O'Neil T.M., et al., 1988 [179]; Abraczuk E., et al., 1992 [25]; Durupt S., et al., 1998 [96] и другие, Eubacterium spp. [Adler A.G., et al., 1991 [27]; Garavelli P.L., et al., 1998 [113] и другие], Fusobacterium spp. [Stuart G., et al., 1992 [224]; Shammas

N.W., et al., 1993 [215] и другие], Bacteroides spp., В. fragilis [Jackson R.T., et al., 1988 [135]; Esteban A., et al., 1983 [100]; Montejo M., et al., 1995 [167] и другие], Gemelld [Mosquera J.D. et al., 2000 [169]; Brouqui P. et al., 2001 [79]; Espinosa-Villarreal J.G. et al., 2000 [99]; Farmaki

E., et al., 2000 [103] и другие] Peptococcus [Reyes Bribieska R., et al., 1989 [196]; Singhi S.C., et al., 1988 [218] и другие], Veillonella [Prpic-Mehicic G., et al., 1998 [190]; Houston S., et al., 1997 [132]и другие], Actinomyces [Delahayt

F., et al., 2002 [90];Taubert K.A., et al., 2001 [228]; Steelman R., et al., 2000 [223]и другие], Prevotella [Domiguez-Castellano A., et al., 2001 [92]; Quaglio G., et al., 1999 [192] и другие] Porphyromonas [van Winkelhoff A.J., et al., 2000 [241]; Revankar S.G., et al., 1998 [195] и другие], Campylobacter [Mahe I., et al., 2001 [155]; Akutagawa 0., et al., 2001 [28]; Brouqui P., et al., 2001 [79]и другие]. Прокомментированные факты являются серьезной мотивацией для продолжения поиска и уточнения этио-патогенетической роли различных микроорганизмов, включая анаэробные бактерии, в развитии ИЭ.

Возможности классического метода ограничивают число культивируемых видов анаэробных бактерий, населяющих организм человека, до 7-50% от их истинного количества. [38, 250].

Т.е., существенным недостатком бактериологического метода является невозможность оценить роль многих некультивируемых организмов. Кроме этого, классические методы исследования клинического материала трудоемки, дорогостоящи и длительны, особенно в плане диагностики анаэробной и микст-инфекций. Время от момента представления клинического образца на исследование в лабораторию до получения ответа составляет 7-10 суток, что является неприемлемым для ургентных ситуаций и принятия жизнеспасающих решений.

Сложившаяся ситуация настоятельно требует решения вопроса о своевременной надежной и оперативной диагностике возбудителя(ей), предопределяющей адекватность последующей терапии и исход каждого клинического случая.

Низкая клиническая эффективность и ограниченные возможности традиционных бактериологических методов исследования, а также . неудовлетворенность временными параметрами стимулируют поиск и внедрение альтернативных методов, особенно методов экспресс-диагностики инфекции с целью оптимизации терапии и мониторинга инфекционного процесса.

Одной из наиболее перспективных альтернатив является газовая хромато-масспектрометрия (ГХ-МС), позволяющая в ускоренном режиме верифицировать полный спектр имеющихся в клиническом образце микроорганизмов по молекулярным жирно-кислотным маркерам.

Метод ГХ-МС представляет собой вариант генетического анализа сродни ПЦР, определению последовательности нуклеотидов 16бРНК и пр., поскольку базируется на определении генетически детерминированных структур - жирных кислот (ЖК) клеточной стенки бактерий. ЖК профиль бактерий закодирован в ДНК, поэтому является их «визитной карточкой» по аналогии с отпечатком пальцев у человека [10] . Состав бактериальных ЖК воспроизводится путем репликации участка генома транспортными РНК и последующего синтеза жирных кислот в митохондриях по матричным РНК [1] . Состав ЖК также консервативен, как строение ДНК, хотя по аналогии с ДНК, может быть подвержен мутациям под действием факторов окружающей среды. Однако, палеомикробиологические исследования показывают, что состав ЖК отдельных бактерий и пула их жирных кислот остается постоянным на протяжении 2,5 млрд. лет [23].

На постоянстве ЖК-профиля бактерий построена хемодифференциация микроорганизмов, которая широко используется как метод их идентификации и подтверждения таксономического положения [120]. Метод применяется для работы с микроорганизмами, изолированными в чистых культурах, и основан на использовании баз данных, содержащих сведения о составе жирных кислот нескольких тысяч штаммов бактерий и микроскопических грибов. Примером хемодифференцирующей системы является специализированный хроматограф Microbial

Identification System, выпускаемый фирмой MIDI Inc., Делавер, США [222] . Особенности состава жирных кислот 'теперь используют, наряду с другими параметрами, в бактериальной таксономии [Определитель бактерий Берджи, перевод с англ., 1997 [11] и клинической бактериальной диагностике [5].

В последнее десятилетие метод адаптирован для количественного анализа состава микробных сообществ в организме человека в целом и в отдельных органах/тканях в норме и при инфекционно-воспалительных процессах [2, 13, 14, 15, 181].

Адаптация ГХ-МС анализа к клинической диагностической практике, а также консультации по вс jM ГХ-МС исследованиям в рамках представляемой работы выполнены руководителем лаборатории газовой хроматографии масс-спектрометрии академической группы академика РАМН Ю.Ф. Исакова при НЦ ССХ им. А.Н. Бакулева д.б.н. Осиповым Г.А.

Цель исследования:

Изучение спектра потенциальных возбудителей инфекционного эндокардита методом газо-хроматографического масс-спектрометрического детектирования молекулярных маркеров бактерий в интраоперационных образцах клапанного эндокарда.

Задачи:

1. Создать и адаптировать к цели исследования базу данных по молекулярным маркерам клинически значимых микроорганизмов для проведения хромато-масс-спектрометрического анализа образцов клапанного эндокарда.

2. Провести качественный и количественный анализ содержания молекулярных маркеров микроорганизмов в ткани клапанов здорового сердца человека на материалах аутопсии (контрольная группа).

3. Изучить спектр и провести количественный анализ содержания молекулярных маркеров бактерий в ткани пораженных клапанов у пациентов с инфекционным эндокардитом на интраопераиионном материале (исследуемая группа).

4. Оценить качественный и количественный состав молекулярных маркеров бактерий в ткани измененых клапанов у пациентов с врожденными пороками сердца без клинико-лабораторных признаков инфекционного процесса на интраоперационном материале (группа сравнения).

5. Обработать полученные результаты с применением методов медицинской статистики.

6. Верифицировать спектр микроорганизмов - участников воспалительного процесса при ИЭ по определяемым методом газовой хроматографии - масс-спектрометрии молекулярным маркерам бактерий.

Научная новизна работы

Получены неизвестные ранее данные о качественном и количественном составе молекулярных маркеров микроорганизмов -жирных кислот, альдегидов и стеролов клеточной стенки микроорганизмов в ткани клапанов здорового сердца и при патологии, включая врожденные пороки сердца и инфекционный эндокардит.

Получены доказательства участия труднокультивируемых бактерий в этио-патогенезе инфекционного эндокардита. Уточнена этиотропная роль анаэробных бактерий Eubacterium spp., Bacteroides spp., Fusobacterium spp., Peptostreptococcus spp., Actinomyces sp., бактерий группы НАСЕК и др.

Показана полиэтиологическая природа инфекционного эндокардита.

Продемонстрирована роль индигенных микроорганизмов в патологическом процессе инициации и развития инфекционного эндокардита.

Практическая значимость

Установленая полиэтиологическая сущность инфекционного эндокардита и участие в инфекционно-воспалительном процессе индигенных оппортунистических организмов свидетельствуют о необходимости комплексной антибактериальной терапии инфекционного эндокардита с охватом всего спектра выявленных возбудителей инфекционно-воспалительного процесса.

Метод газовой хроматографии масс-спектрометрии позволил оценить качественно-количественное участие в реализации инфекционно-воспалительного процесса в эндокарде как традиционных возбудителей, так и группы потенциально-патогенных, трудно-культивируемых или некультивируемых классическими методами микроорганизмов.

Проведенное исследование подтвердило, что структурно-измененные клапаны при врожденных пороках сердца являются зоной повышенного микробиологического риска: состав микробных маркеров при врожденных пороках сердца достоверно отличается от состава маркеров здорового эндокарда и пораженного инфекционным эндокардитом, будучи ближе к последнему по качественно-количественным характеристикам, несмотря на отсутствие клинико-лабораторно-инструментальных симптомов инфекционно-воспалительного процесса.

Метод газовой хроматографии - масс-спектрометрии диагностики может быть использован для изучения инфекции неустановленной этиологии, для уточнения этио-патогенетической роли тех или иных микроорганизмов в составе микробных ассоциаций.

Выявление химических маркеров трудно-культивируемых и некультивируемых микроорганизмов методом газовой хроматографии - масс-спектрометрии позволяет значительно расширить знания о роли ряда индигенных микроорганизмов в генезе многих заболеваний человека, а также пополнить научно-практический методологический арсенал.

Внедрение диагностического экспресс-метода в клиническую практику позволит осуществлять этиотропную антибактериальную терапию, а в перспективе - проводить мониторинг инфекционно-воспалительного процесса в динамике.

Внедрение в практику

Метод газо-хроматографического - масс-спектрометрического анализа внедрен в клиническую практику НЦ ССХ РАМН им. А.Н. Бакулева с 2002 года1: полученные данные о наличии микст-инфекции при инфекицонном эндокардите нашли отражение в алгоритмах микробиологической диагностики и режимах антибиотикотерапии.

Информация о возможностях нового метода ГХ-МС диагностики совещена на медицинских форумах и конференциях в виде устных и постерных докладов.

Материалы исследования опубликованы в профессиональных медицинских периодических изданиях в России и подготовлены к публикации за рубежом.

1 Белббородова Н.В. Маркова Т.В., Бачинская Е.Н.

Основные положения, выносимые на защиту:

1.Метод ГХ-МС позволяет определять специфичные для микроорганизмов химические маркеры: разветвленные, окси- и циклопропановые жирные кислоты, альдегиды в ткани клапанного эндокарда.

2.Метод ГХ-МС позволяет детектировать в инфекционно-воспалительном процессу не только маркеры традиционных возбудителей, но и группы потенциально-патогенных, трудно-культивируемых или некультивируемых методами классической микробиологии индигенных микроорганизмов.

3.Высокая чувствительность и разрешающая способность метода ГХ-МС позволяет верифицировать полный состав участников микробной ассоциации в исследуемом образце клинического материала.

4.Превышение концентрации ряда маркеров в ткани клапанного эндокарда при ВПС является подтверждением того, что структурно-измененный клапан представляет собой зону микробиологического риска по развитию инфекционно-воспалительного процесса.

Апробация работы

Материалы диссертации доложены и обсуждены на б международных симпозиумах и конференциях (опубликованы), включая:

1. 5 ISCVID - 5th International symposium on Modern concepts in endocarditis and cardiovascular infections. 1-3 июля, 1999 г., Амстердам. Доклад Р-03 С. 47 материалов симпозиума// Beloborodova N.V., Osipov G.A., Khabib O.N., Bobrikov 0.A."Chemical markers of anaerobic microorganisms in affected valve tissue under infective endocarditis (IE))

2. Пятый всероссийский съезд сердечно-сосудистых хирургов, 2326 ноября 1999 г., Новосибирск. Доклад на секционном заседании «Проблемы инфекции в кардиохирургии». С. 95 материалов съезда// Белобородова Н.В., Осипов Г.А., Хабиб О.Н., Бобриков

O.A. «Химические маркеры анаэробных микроорганизмов в ткани пораженного клапана при инфекционном эндокардите (ИЭ)».

3. ANAEROBE 2000 - International Congress of the Confederation of Anaerobic Societies. 10-12 июля 2000 г, Манчестер. Доклад Ха-Р2. С.230 материалов конгресса// Beloborodova N.V., Khabib O.N., Osipov G.A., Garaschenko T.I. "Molecular markers of anaerobic bacteria in endocardial valvular tissue in patients with infective endocarditis)

4. Шестой всероссийский съезд сердечно-сосудистых хирургов, 58 декабря 2000 г., Москва. Доклад на секционном заседании «Инфекция в кардиохирургии». С. 233 материалов съезда// Белобородова Н.В., Осипов Г.А., Хабиб О.Н., Бобриков O.A. «Химические маркеры анаэробных микроорганизмов в ткани пораженного клапана при инфекционном эндокардите (ИЭ)».

5. Седьмой всероссийский съезд сердечно-сосудистых хирургов, 27-30 ноября 2001 г., Москва. Доклад на секционном заседании «Инфекция в сердечно-сосудистой хирургии» С. 205 материалов съезда// Белобородова Н.В., Бобриков O.A., Хабиб О.Н., Маркова Т. В. «Влияние адекватной антибиотикотерапии на течение послеоперационного периода у пациентов с инфекционным эндокардитом».

6. Седьмой всероссийский съезд сердечно-сосудистых хирургов, 27-30 ноября 2001 г., Москва. Доклад на секционном заседании «Инфекция в сердечно-сосудистой хирургии» С. 207 материалов съезда// Хабиб О.Н., Белобородова Н.В., Осипов Г.А., Осипов Д.Г. «Маркеры бактерий в клапанах эндокарда при инфекционном эндокардите».

Публикации

Дополнительно к перечисленным выше по материалам диссертации опубликованы 3 статьи в центральных журналах (всего 9 работ): 7. Белобородова Н.В., Хабиб О.Н. «Современные представления об этиопатогенезе и антибактериальной терапии инфекционного эндокардита».// Анналы хирургии.- 1999.№6.-С. 67-77.

8. Белобородова Н.В., Бачинская Е.Н, Хабиб О.Н «Левофлоксацин: перспективы в лечении сепсиса и инфекционного эндокардита».// Хирургия Consilium Medicum. -2002. Приложение №1. -С. 29-32.

9. Хабиб О.Н., Белобородова Н.В., Осипов Г. А. «Детекция молекулярных маркеров бактерий в ткани клапанов сердца в норме и при патологии с помощью метода газовой хроматографии масс-спектрометрии».// ЖМЭИ. - 2004. №3. -С.10-15 (принята в публикацию).

Структура и объем и диссертации.

Диссертация написана на русском языке, на 167 страницах машинописи, состоит из введения, 4 глав, заключения, выводов, указателя литературы и б приложений. Библиография включает 254 источника, в том числе 23 работы отечественных авторов и 231 работу зарубежных авторов. Диссертация иллюстрирована 37 таблицами и 40 рисунками.

Заключение Диссертация по теме "Микробиология", Хабиб, Оксана Николаевна

выводы

1. Метод газовой хроматографии - масс-спектрометрии позволяет идентифицировать специфические молекулярные маркеры - продукты метаболизма и компоненты клеточной стенки микроорганизмов - в биологических жидких средах и тканях человеческого организма, включая клапанный эндокард, и может использоваться для детекции микроорганизмов альтернативным способом.

2. Хромато-масс-спектрометрическая диагностика микроорганизмов осуществляется по ненасыщенным высшим циклопропановым и разветвленным жирным кислотам, альдегидам, стеролам, спиртам и пр., присущим только микроорганизмам.

3. Качественно-количественный состав микробных маркеров ткани эндокарда без патологии (аутопсийные образцы клапанного эндокарда от внезапно погибших здоровых людей) в контрольной группе идентичен составу микробных маркеров в крови доноров, т.е., отражает состояние микробиоценоза организма человека в целом.

4. В ткани эндокарда больных инфекционным эндокардитом и врожденными пороками сердца концентрация 18 маркеров различных микроорганизмов (включая 10Ме15 - 10-метилпентадекановую, ±16:1— изо-гексадеценовую, 3hl4 - 3-гидрокситетрадекановую, 18:ldll— 11-октадеценовую, 17сус циклогептадекановую, 2hl4- 2-гидрокси-тетрадекановую, 3hil7-3-гидрокси-гептадекановую, а19- антеизо-нонадекановую кислоты, копростанол, 16:1а - гексадеценовый альдегид и пр.) превышает норму в десятки - тысячи раз, формируя ассоциацию: аэробных: грамположительных кокков: S.intermedius, Staphylococcus spp.,

Enterococcus spp.; грамположительных палочек: Nocardia spp., Pseudonocardia spp.', грамотрицательных палочек: Klebsiella sp., E.coli; бактерий группы НАСЕК: Cardiobacterium hominis, Kingella sp., Eikenella sp., Haemophilus/Actinobacillus spp.; и анаэробных грамположительных кокков: Peptostreptococcus spp., грамположительных палочек: Eubacterium spp., Clostridium spp., Bifidobacterium spp. грамотрицательных палочек: Bacteroides spp., Fusobacterium spp.

5. Для пораженного инфекционным эндокардитом клапанного эндокарда характерно статистически подтвержденное количественное преобладание микробных маркеров С.hominis, Kingella/Eikenella spp., Eubacterium spp., B.ureolyticus, S.intermed!us, Staphylococcus spp., Enterobacteriaceae no сравнению с врожденными пороками сердца.

6. В структурно-измененном клапанном эндокарде при врожденных пороках сердца зафиксировано количественное преобладание маркеров Nocardia spp., Pseudonocardia spp., E. coli, Bifidobacterium spp., C.histolyticum и B.cereus по сравнению с инфекционным эндокардитом, подтвержденное статистически. Выявленные качественно-количественные отклонения в составе микробных маркеров в ткани клапанного эндокарда при врожденных пороках сердца свидетельствуют о риске развития инфекционно-воспалительного процесса в структурно-измененном клапане.

7. Газо-хроматографическое - масс-спектрометрическое исследование является инструментом качественно-количественной оценки участия в инфекционно-воспалительном процессе трудно-культивируемых рутинными методами микроорганизмов (анаэробов, неферментирующих и пр.).

Библиография Диссертация по биологии, кандидата медицинских наук, Хабиб, Оксана Николаевна, Москва

1. Албертс Б., Брей Д., Льюис Дж, Рэфф М., Роберте К., Уотсон Дж. Молекулярная биология клетки. М. Мир. 1986

2. Белобородова Н.В., Осипов Г.А. Гомеостаз малых молекул микробного происхождения и его роль во взаимоотношениях микроорганизмов с организмом хозяина. «Вестник Российской академии медицинских наук», 1999;7:25

3. Белобородова Н.В., Хабиб О.Н. «Современные представления об этиопатогенезе и антибактериальной терапии инфекционного эндокардита». Анналы хирургии 1999;6:67-77

4. Бонецкий A.A., Тухватшин P.P., Филипченко А.И., Митина A.M. Метод полимеразной цепной реакции (ПЦР) новоеслово в диагностике инфекционных заболеваний. Здравоохранение Кыргызстана.1999:1:42-5

5. Вейант Р., Мосс У., Холлис Д., Джордан Дж., Кук Э., Дейншвар М. Определитель нетривиальных патогенных грамотрицательных бактерий. М. Мир, 1999, С. 612-783

6. Горская Е.М. Механизмы развития микроэкологических нарушений в кишечнике и новые подходы к их коррекции. Дис. Докт.меднаук. М., 1994 г.

7. Грачева Н.М., Ющук Н.Д., Чуприна Р.П. и др. Дисбактериозы кишечника, причины возникновения. Диагностика. Применение бактерийных биологических препаратов. Пособие для врачей и студентов, М, 1999, с.44;

8. Добрынин В.М. с соавт., Каргальцева Н.М., Добрынина И.А. Микробиологическая диагностика дисбактериозов кишечника. Рекомендации для врачей, С-П, 1996:20

9. Миронов А.Ю. Основы клинической микробиологии и иммунологии под ред. Воробьева A.A., М., 1997:160

10. Митрука Б.М. Применение газовой хроматографии в микробиологии и медицине. М. Медицина, 1978.

11. Определитель бактерий Берджи. Под ред. Дж. Хоулта и др. М., Мир, 1997, т.1,2, 638с.

12. Осипов Г.А., Белобородова Н.В., Патент на изобретение №2146368 «Способ выявления возбудителя инфекционного процесса в стерильных биологических средах макроорганизма. 21.10.1997 (регистрация в Госреестре избретений РФ от 10.03.2000)

13. Осипов Г.А. Демина A.M. Хромато-масс-спектрометрическое обнаружение микроорганизмов в анаэробных инфекционных процессах. Вестник РАМН, 1996:№2.

14. Осипов Г.А., Парфенов А.И., Богомолов П.О. Сравнительное хромато-масс-спектрометрическое исследование состава химических маркеров микроорганизмовв крови и биоптатах слизистой оболочки кишечника. Российский гастроэнтерол.журнал. 2001, 1: 54-69.

15. Поздеев O.K. Медицинская микробиология. М. ГЭОТАР-МЕД. 2001, стр 625

16. Покровский В.И., Рубцов И.В. Инфекционный процесс. В книге «Иммунология инфекционного процесса» под ред. В.И. Покровского. М., 1994.

17. Седов В.И., Пинчук JI.M. Состав высших жирных кислот энтерококков. Журн. Микроб.Эпидем.Иммун., 1982, 9 , 49-59

18. Страчунский JI.C., Белоусов Ю.Б., Козлов С.Н. «Практическое руководство по антиинфекционной химиотерапии» Москва 2002 г. Раздел «Инфекции сердечнососудистой системы», Инфекционный эндокардит; стр. 261 -264

19. Шеховцова Н.В., Осипов Г.А., Верховцева Н.В., Певзнер JI.A. Анализ липидных биомаркеров в породах архейского кристаллического фундамента. Международная конференция по бактериальной палеонтологии. Тезисы докладов. Москва, 24-25 мая 2002г.

20. Abraczuk E., Rawczynska-Englert I., Meszros J. "Propionibacterium acnes in the etiology of endocarditis". Pol Tyg Lek 1992 Jun l-8;47 (22-23):496-7.

21. Adelus S: "Nursing care study: subacute bacterial endocarditis". Nurs Times.1981 Aug 26- Sepl; 77(35):1497-500.

22. Adler A.G., Blumberg E.A., Schwartz D.A., Russin S.J., Pepe R. "Seven-pathogen tricuspid endocarditis in an intravenous drug abuser. Pitfalls in laboratory diagnosis". Chest,1991 Feb;99(2):490-1.

23. Akutagawa 0., Tanaka K., Miyajima M., Abe Y., Omori M. "Aortic valve infective endocarditis due to Campylobacter fetus". Nippon Naika Gakkai Zasshi. 2001 Jan 10;90 (1):136-8.

24. Aldridge K.E., Ashcraft D., O'Brien M, Sanders C.V. "Bacteremia due to Bacteroides fragilis group: distribution of species, beta-lactamase production, andantimicrobial susceptibility patterns". Antimicrob Agents Chemother. 2003 Jan;47(1):148-53.

25. Al-Khuwaitir T.S., Wani B.A., Sherbeeni S.M. "Combined brucella melitensis and streptococcal viridans endocarditis". Saudi Med J 2002 Jan;23(1):99-103.

26. Allugupalli S., Portaels F., Larsson L. "Systematic study of the 3-hydroxy fatty acid composition ofmycobacteria". J.Bacterid. May 1994; 176 (10) :2962-2969.

27. Amoako K.K., Goto Y., Shinjo T. "Studies on the factors affecting the hemolytic activity of Fusobacterium necrophorum". Vet Microbiol 1994 Jul;41(1-2):11-8.

28. Armfield A.Y. "Differentiation of Peptococcus and Peptostreptococcus by gas-liquid chromatography of cellular fatty acids and metabolic products".

29. J.Clin.Microbiol. 1979 Oct;10(4):464-76.

30. Armstrong R.W., Wuerflien R.D. "Endocarditis due to Propionibacterium granulosum". Clin Infect Dis. 1996 Nov;2 3(5):1178-9.

31. Asselineau C., Asselineau J. "Lipid analysis in bacterial taxonomy proposal for a standardized method". Biochem.Cell Biol. 1990;V 68 (l):379-86.

32. Axelsson B.O., Saraf A., Larsson L. "Determination of ergosterol in organic dust by gas chromatography-mass spectrometry". Journal of chromatography, B,1995;666 (1):77-84.

33. Baquero F., Fernandes-Jorge A., Visente V.F., et al. "Diversity Analysis of the Human intestinal flora. A simple method based on bacterial morphotypes". Microb. Ecol. Health Disease, 1998, vol 1.

34. Baty V., Hoen B., Selton-Suty C.,Schuhmacher H., Peiffert B., Danchin N., Cherrier F. "Campylobacter fetus endocarditis manifested by a popliteal mycotic aneurysm". Presse Med. 1998 Feb 28;27 (8):357-8.

35. Baumann H., Tzianabos A., Brisson J.-R., Kasper D., Jennings H. "The capsular polysaccharide of Bacteroides fragilis comprises two ionically linked polysaccharides". 1992; Biochemistry 31:4081-4089.

36. Beena V.K., Kumari N., Shivananda P.G. "Inhibition of phagocytosis of E. coli by B. fragilis group—an in vitro study". Indian J Pathol Microbiol. 19971. Jul;40(3):373-6.

37. Belloch S.L., Salavert M., Lacruz J.,Lopez-Aldeguer J., Perez-Belles C. "Subacute endocarditis caused by Actinobacillus actinomycetemcomitans". Enferm Infecc Microbiol Clin. 2000 Oct;18(8):379-84.

38. Beloborodova N.V., Osipov, G.A. "Small molecules originating from microbes (SMOM) and their role in microbes-host relationship". Microbial Ecology in Health and Disese,2000;12:12-21.

39. Berg R.D. "Bacterial translocation from the gastrointestinal tract". Medical Aspects of Microbial Ecology. Moscow, 1994, vol 7/8.

40. Berg R.D. "Bacterial translocation from the gastrointestinal tract to extraintestinal sites". Abstr. XII Intern Symp Gnotobiology, Honolulu, 1996.

41. Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. Baltimore,London:Wilians&Wilkins, 1984 .

42. Bishara J., Sagie A., Samra Z., Pitlik S. "Polymicrobial endocarditis caused by methicillin-resistant Staphylococcus aureus and glycopeptide-resistant enterococci". Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 1999 Sep;18 (9):674-5.

43. Brezinova 1., Bigl P., Pavek V. "Eikenella corrodens as part of the polymicrobial flora in infectious endocarditis". Cesk Epidemiol Mikrobiol Imunol. 1990 Sep;39(5):303-9.

44. Briedigkeit H., Gobel U. "Anaerobic bacteria as the cause of endogenous infections". Z Arztl Fortbild Qualitatssich. 1997 Mar;91(2):165-70. Review.

45. Brondz J., Olsen I. "Chemotaxonomy at a crossroads? Gas chromatographic analysis of a single colony from the bacterium Haemophylus aphrophilus". J.Chrom.,Biomed.Appl. 1986.Vol.374;1:119-124.

46. Brondz J., Olsen I. "Multivariate analyses of cellular fatty acids in Bacteroides, Prevotella, Porhyromonas, Wolinella and Campylobacter spp". J.Clin.Microb., 1991.V 29;1:183-89.

47. Brondz J., Olsen I. "Microbial chemotaxonomy. Chromatography, electrophoresis and relevant profiling techniques". J. Chrom., Biomed. Appl., 1986; 379: 367411.

48. Brook I. "Enhancement of growth of aerobic and facultative bacteria in mixed infections with Bacteroidesspecies". Infect Immun 1985 Dec;50(3):929-31.

49. Brook I. "Aerobic and anaerobic bacteriology of intracranial abscesses". Pediatr Neurol. 1992 May-Jun;8(3):210-4.

50. Brook I. "Aerobic and anaerobic microbiology of gastrostomy-site wound infections in children". Clin Infect Dis. 1995 Jun;20 Suppl 2:S257-8.

51. Brook I. "Bacterial synergy in pelvic inflammatory disease". Arch Gynecol Obstet. 1987;241(3):133-43. Review.

52. Brook I. "Effect of encapsulated Bacteroides asaccharolyticus and Bacteroides fragilis on the growth of aerobic and facultative bacteria in mixed infections". J Surg Res. 1989 Jul;47(1):92-5.

53. Brook I. "Encapsulated anaerobic bacteria in synergistic infections". Microbiol Rev. 1986 Dec;50(4):452-7. Review.

54. Brook I. "Enhancement of growth of aerobic, anaerobic, and facultative bacteria in mixed infections with anaerobic and facultative gram-positive cocci". J Surg Res. 1988 Aug;45(2):222-7.

55. Brook I. "Importance of encapsulated anaerobic bacteria in mixed infection". Arch Intern Med. 1984 Apr;144(4):701-2.

56. Brook I. "Pathogenesis and management of polymicrobial infections due to aerobic and anaerobic bacteria".Med Res Rev. 1995 Jan;15(1):73-82. Review.

57. Brook I. "Pathogenicity of capsulate and non-capsulate members of Bacteroides fragilis and B. melaninogenicus groups in mixed infection with Escherichia coli and Streptococcus pyogenes". J Med Microbiol 1988 Nov;27(3) :191-8 .

58. Brook I. "Pericarditis due to anaerobic bacteria". Cardiology, 2002;97: 55-8

59. Brook I. "Role of encapsulated anaerobic bacteria in synergistic infections". Crit Rev Microbiol.1987;14(3):171-93. Review.

60. Brook I. "Synergistic aerobic and anaerobic infections". Clin Ther. 1987;10 Suppl A:19-35. Review.

61. Brook I. "The role of encapsulated anaerobic bacteria in synergistic infections". FEMS Microbiol Rev. 1994 Jan;13(1):65-74. Review.

62. Brook I. "The effect of antimicrobial therapy on mixed infections with Bacteroides species. Is eradication of the anaerobes important?" J Infect. 1991 Jan;22(1):27-35.

63. Brook I. "Pediatric Anaerobic infection Diagnosis and Management". Second edition. The C.V. Mosby Company, 1989

64. Brook I., Coolbaugh J.C., Walker R.I. "Pathogenicity of piliated and encapsulated Bacteroides fragilis". Eur J Clin Microbiol. 1984 Jun;3(3):207-9.

65. Brook I., Frazier E.H., Thompson D.H. "Aerobic and anaerobic microbiology of external otitis". Clin Infect Dis. 1992 Dec;15(6):955-8.

66. Brook I., Frazier E.H. "Aerobic and anaerobic microbiology of infected hemorrhoids". Am J

67. Gastroenterol. 1996 Feb;91(2):333-5.

68. Brook I., Frazier E.H. "The aerobic and anaerobic bacteriology of perirectal abscesses". J Clin Microbiol.1997 Nov;35(ll):2974-6.

69. Brook I., Frazier H. "Aerobic and anaerobic microbiology of chronic venous ulcers". Int J Dermatol.1998 Jun;37(6):426-8.

70. Brook I., Hunter V., Walker R.I. "Synergistic effect of Bacteroides, Clostridium, Fusobacterium, anaerobiccocci, and aerobic bacteria on mortality and induction of subcutaneous abscesses in mice".J Infect Dis. 1984 Jun;149(6):924-8.

71. Brook I., Myhal L.A., Dorsey C.H. "Encapsulation and pilus formation of Bacteroides spp. in normal flora abscesses and blood". J Infect. 1992 Nov;25(3):251-7.

72. Brook I., Walker R.I. "The relationship between Fusobacterium species and other flora in mixed infection". J Med Microbiol 1986 Mar;21(2):93-100.

73. Brook I., Walker R.I. "Significance of encapsulated Bacteroides melaninogenicus and Bacteroides fragilis groups in mixed infections". Infect Immun. 19841. Apr;44 (1):12-5.

74. Brouqui P., Raoult D. "Endocarditis due to rare and fastidious bacteria". Clin Microbiol Rev. 2001

75. Jan;14(1):177-207. Review.

76. Brouqui P., Dumler J.S., Raoult D. "Immunohistologic demonstration of Coxiella burnetii in the valves of patients with Q fever endocarditis", m.J.Med.1994;97:451-458.

77. Carroizosa J., Tanphaichitra D., Levison M.E. "Experimental bacteroides fragilis endocarditis in rabbits". Infect Immun 1977 Mar; 15(3):871-3.

78. Camara M., Williams P., Hardman A. "Controlling infection by tuning in and turning down the volume of bacterial small-talk". Lancet Infect Dis2002;Nov;2(11):667-76.

79. Casalta J.P., Habib G., La Scola B., Drancourt M., Caus T., Raoult D. "Molecular diagnosis of Granulicatella elegans on the cardiac valve of a patient with culture-negative endocarditis". J Clin Microbiol. 20021. May;40(5):1845-7.

80. Christenson B., Wiebe T., Pehrson C., Larsson L. "Diagnosis of invasive candidiasis in neutropenic children with cancer by determination of D-arabinitol/L-arabinitol ratios in urine". J.Clin.Microbiol. 35(3), 636-640, 1997.

81. Chua A.G., Ding J., Schoch P.E., Cunha B.A. "Pacemaker-induced endocarditis due to Propionibacterium acnes". Clin Infect Dis.1998 Dec;27(6):1541-2.

82. Cicalini S., Francavilla R., Massaroni K., De Rosa F.G. "Polymicrobial infective endocarditis in Italy". Recenti Prog Med. 2002 Feb;93(2):92-5.

83. Cofsky R.D., Seligman S.J. "Peptococcus magnus endocarditis". South Med J. 1985 Mar;78(3):361-2.

84. Connaughton M., Lang S., Tebbs S.E., Livesley M.A., Lambert P.A., Elliott T.S.J., Littler W.A. "Prediction of infecting organism and clinical outcome in endocarditis is aided by quantitative serodiagnosis". 5th ISCVID abstract-book, 2-05, p.18.

85. De Ancos Aracil C., Estrada Perez V., Alvarez de Arcaya A., et al. "Endocarditis caused by Actinobacillus actinomycetemcomitans". An Med Interna.1999Dec;16(12):633-4.

86. Delahaye F., Hoen B., McFadden E., Roth 0., de Gevigney G. "Treatment and prevention of infective•endocarditis". Expert Opin Pharmacother. 2002 Feb;3(2):131-45.

87. Domiguez-Castellano A., Angel Muniain M., Jose Rios-Villegas M., et al. "Prevotella denticola endocarditis in an intravenous drug abuser". Enferm Infecc Microbiol Clin. 2001 Jun-Jul;19(6):280-1. Review.

88. Drangsholt M.T. "A new causal model of dental diseases associated with endocarditis" Ann Periodontal 1998 Jul;3(1):184-96.

89. Drucker D.B. "Comparison of fatty acid fingerprints of streptococci of Lancefield groups A, D, E, F, G, H, K, 0, P and Q". Microbios, 1981;31(125-126) :183-8 .

90. Durack D.T., Lukes A.S., Bright D.K. "New criteria for diagnosis of infective endocarditis: utilization of specific echocardiographic findings. Duke Endocarditis Service". Am.J.Med. 1994;96:200-209.

91. Durupt S., Boibieux A., Ballet-Mechain M., Chaumentin G., Tremeau G., Roure C., Peyramond D. "Propionibacterium acnes infectious endocarditis." Press Med. 1998 Nov 21; 27 (36):1839-41.

92. Eliaou J.F., Montoya F., Sibille G., Adda M., Grolleau R., Bonnet H. "Infectious endocarditis in the neonatal period". Pediatrie.1983;38(8, Dec):561-6.

93. Espinosa-Villarreal J.G., Gonzalez-Reimers E., Lecuona M., Rodriguez-Gaspar M. "Endocarditis caused by Gemella morbillorum". Enferm Infecc Microbiol Clin. 2000 Jun-Jul;18(6):293.

94. Esteban A., Wilson W.R., Ruiz-Santana S., Fernandez-Segoviano P., Martinez Cabruja R. " Endocarditis caused by B. fragilis". Chest 1983 Jul;84(1):104-7.

95. Etienne J., Ory D., Thouvenot F.Eb., Raoult D., Loire R., Delahaye J.P., Beaune J. "Chlamydial endocarditis: a report on ten cases". Eur.Heart1. J.,1992;13:1422-26.

96. Fang H., Edlund C., Hedberg M., Nord C.E. "New findings in beta-lactam and metronidazole resistant Bacteroides fragilis group". Int J Antimicrob Agents. 2002 May;19(5):361-70.

97. Farmaki E., Roilides E., Darilis E., Tsivitanidou M., Panteliadis C., Sofianou D. "Gemella morbillorum endocarditis in a child". Pediatr Infect Dis J. 2000 Aug;19(8):751-3.

98. Feltis B.A., Garni R.M., Wells C.L. "Clostridium difficile toxins and enterococcal translocation in vivo and in vitro'. J Surg Res 2001 May 1;97(1):97-102.

99. Fichelle A., Nimier M. "Infections of soft tissues by bacterial synergism". Ann Fr Anesth Reanim.1990;9(3):269-74.

100. Finkelstein R., Oren I., Hashman N. "Infective endocarditis in the 90s¡report from an Israeli University hospital". 5th International Symposium on modern concepts in endocarditis and cardiovascular infections. 1999. Abstracts 5-13, p.57.

101. Fornaciari G., Castagnetti E., Maccari S., Ragni P., Carmeli G., Parmeggiani M.A., Plancher A.C "A case of infectious Propionibacterium acnes endocarditis". Clin Ter.1985 Dec 15; 115 (5) :389-92.

102. Fournier P.E., Casalta J.P., Habib G., Messana T., Raoult D. "Modification of the diagnostic criteria proposed by the Duke Endocarditis Service to permit improved diagnosis of Q fever endocarditis".1. Am.J.Med.1996;100:629-33.

103. Fournier P.E., Raoult D. "Non-culture laboratory methods for the diagnosis of infectious endocarditis". Curr.Infect.Dis.1999.rep.1:136-141.

104. Franzek D.A., Engle W.A., Caldwell R.L. "Neonatal bacterial endocarditis of the pulmonary valve: report of two cases". J Perinatol 1987 Fall;7(4):292-5.

105. Galdbart J.O., Allignet J., Tung H.S., Ryden C., El Solh N. "Screening for Staphylococcus epidermidis markers discriminating between skin-flora strains and those responsible for infections of joint prostheses". J Infect Dis 2000 Jul;182(1):351-5).

106. Galgiani J.N., Busch D.F., Brass C., Rumans L.W., Mangels J.I., Stevens D.A. "Bacteroides fragilis endocarditis, bacteremia and other infections treated with oral or intravenous metronidazole". Am J Med. 19781. Aug;65(2):284-9.

107. Garavelli P.L. "Endocarditis caused by Eubacterium spp.". Recenti Prog Med.1998 Mar;89(3):130-1.

108. Geis G., Leying H., Suerbaum S., Opferkuch W. "Unusual fatty acid substitution in lipids and lipopolysaccharides of Helicobacter pylori".

109. J.Clin.Microbiol. 28(5), 930-932, 1990.

110. Geraci J.E., Wilson W.R. " Symposium on infective endocarditis. III. Endocarditis due to gram-negative bacteria. Report of 56 cases". Mayo Clin Proc 19821. Mar;57(3):145-8.

111. Giles M.W., Andrew J.H., Tellus M.M. "A case of polymicrobial infective endocarditis involving Neisseria mucosa occurring in an intravenous drug abuser". Aust N Z J Med. 1988 Dec;18(7):874-6.

112. Goldenberger D., Kunzli A., Vogt P., Zbinden R., Altwegg M. "Molecular diagnosis of bacterial endocarditis by broad-range PCR amplification and direct sequencing". J Clin Microbiol 1997 Nov;35(11):2733-9.

113. Goldman P.L., Durack D.T., Petersdorf R.G. " Effect of antibiotics on the prevention of experimental Bacteroides fragilis endocarditis". Antimicrob Agents Chemother 197 8 Nov;14(5):755-60.

114. Gonzales Cocina E., Espinoza Caliani J.S., Cabrerizo Comitre E., Arana Romero C., Perez Peinado M., Gonzalez Santos P. "Right-sided endocarditis due to Fusobacterium Nucleatum". Rev Esp Cardiol. 1991 Mr; 44(3):207-9.

115. Goodfellow, M., O'Donnell, A.G. "Chemical methods in Procariotic Systematics". Eds., John Willey and Sons, Chiduster ,UK.,1994.

116. Goodfellow M., Minnikin D.E. "Chemical Methods in Bacterial Systematics". Eds., Acad. Press, London -Toronto, 1985.

117. Guzman C.A., Plate M., Pruzzo C. "Role of neuraminidase-dependent adherence in Bactroides fragilis attachment to human epithelial cells". Istituto di Microbiología, Universita di Genova, Italy; FEMS Microbiol Lett 1990, Sep;l;59 (1-1):187-92.

118. Halevy J., Pitlik S., Rosenfeld J. "Endocarditis due to the anaerobe Peptostreptococcus". Harefuah.1980 Jul;99(1-2):14-15.

119. Hardman A.M., Stewart G.S., Williams P. "Quorum sensing and the cel-cel communication dependent regulation of gene expression in pathogenic and nonpathogenic bacteria". Antonie Van Leeuwenhoek,1998; 74 (4Nov) -.199-210.

120. Hernandez J.A., Pigrau C., Planes A., Fermandez de Sevilla T. "Propionibacterium acnes endocarditis on a natural valve". Rev Clin Esp.,1988 Apr; 182(6):339-40.

121. Hirt H., Schlievert P.M., Dunny G.M. "In vivo induction of virulence and antibiotic resistance transfer in Enterococcus faecalis mediated by the sex pheromonesensing system of pCFlO". Infect Immun 2002 Feb;7 0(2):716-23.

122. Hobbs R.D., Dowing S.E., Andriole V.T. "Four-valve polymicrobial endocarditis caused by Pseudomonas aeruginosa and Serratia marcescens". Am J Med. 1982 Jan;7 2(1):164-8.

123. Hofstad T., Kalvenes M.B. "Adhesion of anaerobic gram-negative bacteria to mucosal surfaces". Scand J Infect Dis Suppl 1985;46:33-6.

124. Holland J., Wilson R., Cumpston N. "Gemella morbillorum prosthetic valve endocarditis". N Z Med J. 1996 Sep 27;109(1030):367.

125. Houpikian P., Raoult D. "Diagnostic methods current best practices and guidelines for identification of• difficult-to-culture pathogens in infective endocarditis". Infect Dis Clin North Am 2002 Jun;16 (2):377-92.

126. Houry D., Crisman T. "Bivalve polymicrobial infective endocarditis". South Med J. 19991. Nov;92(11):1098-9.

127. Houston S., Taylor D., Rennie R. "Prosthetic valve endocarditis due to Veillonella dispar: successful medical treatment following penicillin desensitization". Clin Infect Dis. 1997 May;24(5):1013-4.

128. Huynh T.T., Walling A.D., Miller M.A., Leung T.K., Leclerc Y., Dragtakis L. "Propionibacterium acnes endocarditis". Can J Cardiol.1995 Oct; 11(9) : 785-7.

129. Iglesias L.A., Lopez-Lopategui M.C., Almagro F.,Beristain X., Vidal M.A. "Endocarditis due to Gemella haemolysans". Enferm Infecc Microbiol Clin. 19991. Dec;17(10):538-9. Review.

130. Jantzen E., Bryn K., Hagen N., Bergan T., Bovre K. "Cellular fatty acid composition of Francisella tularensis". J.Clin.Microbiol. 12, 928-930, 1979.

131. Jantzen E., Tangen T., Eng I. "Identification of Bacteroides species by cellular fatty acid profiles' .Int.J.Syst.Bacterid.1982 Vol.32; 1:21-27.

132. Jones G.R. "Bacterial synergy in mixed aerobic/anaerobic infections". Lancet. 1980 Apr 12;1 (8172):829.

133. Kasper Dennis L. "Infections due to mixed anaerobic organisms", ch 169; Harrison's principles of internal medicine; 14th edition Dis Suppl 1982; 31:95-104.

134. Kasper D.L., Onderbonk A.B. "Infection with Bacteroides frafilis: pathogenesis and immunoprophylaxis in an animal model". Scand J Infect Dis Suppl 1982; 31:28-33.

135. Kentos A., Motte S., Nonhoff C., Jacobs F., De Smet J.M., Serruys E., Thys J.P. "Prevotella bivia as an unusual cause of endocarditis". Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 1994 Feb;13(2):142-5.

136. Koichi T. "On the production of hydroxy fatty acids and fatty acids oligomers in the course of adipocere formation". Nippon Hoigaku Zasshi.1984.Vol.38;3:257-272.

137. La Scola B., Raoult D. "Molecular identification of Gemella species from three patients with endocarditis". J Clin Microbiol. 1998 Apr;36(4):866-71. Review.

138. Lazar J.M., Sculman D.S. "Propionobacterium acnes prosthetic valve endocarditis: a case of severe aortic insufficiency". Clin Cardiol 1992 Apr; 15(4):299-300.

139. Lazazzera B.A. "The intracellular function of extracellular signaling peptides". Peptides 2001 Oct;22 (10) :1519-27.

140. Lehtonen L., Eerola E., Oksman P. "Muramic acid in peripherial blood leukocytes of healthy human subjects". J.Infect.Dis. 1995;171:1060-1064.

141. Lewis J.F., Abramson J.H. "Endocarditis due to Propionibacterium acnes." Am J Clin Pathol.,1980 Nov; 74(5):690-6.

142. Lisby G., Gitchik E., Durack D.T. "Molecular methods for diagnosis of infective endocarditis". Infect Dis Clin North Am. 2002 Jun;16(2):393-412, x. Review.

143. Lopez-Dupla M., Creus C., Navaro 0., Raga X. "Association of Gemella morbillorum endocarditis with adenomatous polyps and carcinoma of the colon: case report and review". Clin Infect Dis. 1996 Feb;22(2):379-80.

144. Luquin M., Ausina V., Lopez Calahorra F., Belda F., Garcia Barcelo M., Celma C., Prats G. "Evaluation of practical chromatographic procedures for identification of clinical isolates of MycobacteriaJ.Clin.Microb., 1991;V 29 (1):120-30.

145. Macfarlane G.T., Gibson G.R. "Formation of glycoprotein degrading enzymes by Bacteroides fragilis". FEMS Microbiol Lett 1991 Jan 15;61 (2-3):289-93.

146. Mah M.W., Shafran S.D. "Polymicrobial endocarditis with eight pathogens in an intravenous drug abuser". Scand J Infect Dis. 1990;22(6):735-7.

147. Mahe I., Perdix C., Maniere T., Holeman A., Diemer M., Bergmann J.F. "A case of Campylobacter fetus endocarditis of the tricuspid valve unaccompanied by fever". Am J Med. 2001 Oct 1;111(5):418.

148. Maitza S.K., Scholtz M.C. Proc. "Detection of microorganisms by beta-oxymiristinic acid". Nat.Acad. Sci. USA. 1978;75:3993.

149. Maliwan N., Reid R., Katzen R. "Rapid diagnosis of beta-haemolytic streptococcus group B endocarditis by buffv-coat examination and gas-liquid chromatography". J Clin Pathol 1979,Aug;32(8):760-3.

150. Mangan D.F., Novak M.J., Vora S.A., Mourad J., Kriger P.S. "Lectinlike interactions of Fusobacterium nucleatum with human neutrophils". Infect Immun 1989 Nov;57(11):3601-11.

151. Maurin M.F.Eb., Etienne J., Raoult D. "Serological cross-reactions between Bartonella and Chlamydia species implications for diagnosis". J.Clin.Microbiol.Infect.Dis 1997;16:487-506.

152. Mayberry W.R., Lambe D.W.,Jr., Ferguson H.P.1.entification of Bacteroides species by cellular fattyacid profiles". Int. J. Syst.Bacterid. 1982 Vol. 32; 1:21-27 .

153. Millar B.C., Moore J.R., Mallon P., McClurg R., Curran M.D. "Molecular diagnosis of culturable and non-culturable agents of infective endocaditis". 5th ISCVID abstract-book, P-26, p.70., 1999.

154. Millar B, Moore J, Mallon P, Xu J, Crowe M, Mcclurg R, Raoult D, Earle J, Hone R, Murphy P.Molecular diagnosis of infective endocarditis—a new Duke's criterion. Scand J Infect Dis 2001;33 (9):673-80.

155. Milovanov S., Bunovic T., malenkovic M. "Subacute bacterial endocarditis caused by anaerobic Peptostreptococcus with brief review of general clinical picture". Med Pregl.1969;22(5-6):267-71.

156. Miyagawa E., Azuma R., Suto T. "Cellular fatty acid composition in gram-negative obligately anaerobic rods". J.Gen.Appl.Microbiol. 25, 41-51, 1979.

157. Montejo M., Agurribengoa K., Ruiz Irastorza G., Solis A., Miguel Ruiz L., Gonzalez dfj Zarate P.

158. Bacteroides fragilis endocarditis". Enferm Infecc Microbiol Clin. 1995 0ct;13(8):498-9:

159. Morgan S.L., Fox A., Gilbart J. "Profiling, structural characterization, and trace detection of chemical markers for microorganisms by gas chromatography mass spectrometry". J.Microbiol.Methods. 1989/9: 57-69.

160. Mosquera J.D., Zabalza M., Lantero M., Blanco J.R. "Endocarditis due to Gemella haemolysans in a patient with hemochromatosis". Clin Microbiol Infect. 20001. Oct;6(10):566-8.

161. Moss C.W., Lambert M.A. Lombard G.L. "Cellular fatty acids of Peptococcus variabilis and Peptostreptococcus anaerobius". J.Clin.Microbiol. 1977, 5(6), 665-7.

162. Mott G.E., Brinkley A.W. "Plasmonylethanolamin: growth factor for cholesterol-reducing Eubacterium".

163. J.Bacterid., 197 9, 139 (3), 755-760.

164. Murdoch D.A. "Gram-Positive Anaerobic Cocci." Clinical Microbiology Revews, Jan 1998:81-120.

165. Nakamura I., Takahira Y., Inoue K. "Subacute bacterial endocarditis due to Peptostreptococcus." Saishin Igaku., 1970 Sep/25(9):1996-200.

166. Nichols P.D., Leeming R., Rayner M.S., Latham V. "Use of capillary gas chromatography for measuring fecal-derived sterols". J.Chrom.,A 1996/733:497-509.

167. Nord C.E. "Incidence and significance of intraperitoneal aerobic and anaerobic bacteria". Clin Ther. 1990/12 Suppl B:9-20. Review.

168. Nord C.E.«Anaerobic bacteria in septicemia and endocarditis»/ Scand J Infect Dis Suppl 1982/ 31:95-104.

169. Nurminen M. "Chemical characterization of Chlamydia trachomatis LPS". Infection and Immunity. V48, 2: 573-75.Bidavid, 1989.

170. O'Neill T.M., Hone R., Blake S."Prosthetic valve endocarditis caused by Propionibacterium acnes". Br Med J (Clin Res Ed.) 1988 May 21;296 (6634):1444.

171. Olle-Goig. J.E."Possible pathogenic implications of right-sided polymicrobial endocarditis in a heroin abuser".Eur J Clin Microbiol. 1986 Aug/5(4):449-51.

172. Osipov G.A., Turova E.S. "Studying species composition of microbial communities with the UL.'e of gas chromatography-mass spectrometry. Microbial community ofkaolin". FEMS Microbiol.Rev. 1997:1-10.

173. Oyen W.J.G., Brouwers F.M., Boerman O.C., Barrett J.A. "Scintigraphic detection of endocarditis". 5th ISCVID abstract book, 4-04, p.29.

174. Parsek M.R., Greenberg F.P. "Acyl-homoserine lactone quorum sensing in gram-negative bacteria: a signaling mechanism involved in associations with higher organisms". Proc Natl Acad Sci USA, 2000/97(16,1. Aug):8789-93.

175. Pineiro D.J., Blanco M.V., Fernandez A.J. "Infectious Peptostreptococcus endocarditis after heart cetheterization". Medicina (B Aires). 1981;41(1):71-4.

176. Pollock A.V. "Wound infection: synergy between aerobic and anaerobic bacteria". Ann R Coll Surg Engl. 1980 May; 62 (3):243-4.

177. Ponce de Leon S., Sada diaz E., Ruiz Palacios G. "Polymicrobial endocarditis. Report of a case and review of the literature". Arch Inst Cardiol Mex. 1983 Jan-Feb;53(1):45-8.

178. Prpic-Mehicic G., Marsan T., Miletic I., Buntak-Cobler D. "Infective endocarditis caused by Veillonella of dental origin". Coll Antropol. 1998 Dec;22 Suppl:39-43.

179. Pujadas R., Escriva E., Rossel F., Faba P., argimon J., Galvan J., Berenquer J., Jane J. "Polymicrobial endocarditicaused by Haemophilus influenzae and Streptoco -us viridans. A chance association?". Med Clin (Bare), i 1 Jun 16;83(3):116-8.

180. Quaglio G., Anguera I., Miro J.M., Sureda C., Marco F., Battle t,, Heras M. "Prevotella oralis homograft-valve e' arditis complicated by aortic-root abscess, intraccii diac fistula, and complete heart block". Clin Infect Dis. 1999 Mar;28(3):685-6.

181. Radosz-Komonievska H., Kapp-Burzynska Z., Klaptocz B., Wilk I., Ekiel A. "Aerobic and anaerobic bacterial flora in chronic sinusitis in adults". Med Dosw Mikrobiol. 1997;49(l-2):89-94.

182. Raoult D., Fournier P.E., Drancourt M., Marrie T.J., Etienne J. "Diagnosis of 22 cases of Bartonella endocarditis". Ann.Intern.Med. 1996;125:646-52.

183. Revankar S.G., Clark R.A. "Infected cardiac myxoma. Case report and literature review". Medicine (Baltimore). 1998 Sep;77(5):337-44. Review.

184. Reyes Bribieska R. "Etiology of infectious endocarditis at the Instituto Nacional de Cardiologia Ignacio Chavez from 1976 to 1986". Arch Inst Cardiol Mex. 1989 May-Jun;59(3):287-92.

185. Rocha E.R., Smith C.J. "Biochemical and genetic • analyses of a catalase from the anaerobic bacterium

186. Bacteroides fragilis". J Bacteriol 1995 Jun; 177(11):3111-9.

187. Rodgers G.L., Mortensen J.E., Fisher M.S., Long S.S. "Polymicrobial soft tissue abscesses in patients with cyanotic congenital heart disease". Pediatr Infect Dis J. 1996 Nov;15(11):1046-8.

188. Rodloff A.C., Becker J., Blanchard D.K., Klein T.W. "Inhibition of macrophage phagocytosis by bacter fragilis in vivo and in vitro". Infect Immun 1986 May;52(2):488-92.

189. Rogemond V., Guinet R.M. "Lectinlike adhesins in the Bacteroides fragilis group". Infect Immun 1986 Jul;53 (1) :99-102.

190. Saavedra J., Merino D., Vega D, Galvez J., Pascual L., Pujol E. "Polymicrobial endocarditis in an intravenous drug addict with isolation of Eikenella corrodens". Enferm Infecc Microbiol Clin. 1996 Aug-Sep;14(7):454-6. Review.

191. Sailler L., Marchou B., Lemozy J., Bonnet E., Elias Z., Cusin L., Massip P. "Successful treatment of Actinobacillus actinomycetemcomitans endocarditis with ofloxacin". Clin Microbiol Infect. 2000 Jan;6(1):55-6.

192. Sanchez Molini P., Inchhaustegui Becerra L., Ruiz Diaz L. "Infective endocarditis and pulmonary abscess in an intravenous drug addict caused by Veillonella parvula". Rev Clin Esp. 1991 Apr;188(7):382-3.

193. Sans M.D., et al. "Subacute bacterial endocarditis caused by eubacterium aerofaciens: report of a case". Am J Clin Pathol.1973 Apr;59(4) : 576-80.

194. Sarria Cepeda C., San Martin J., Palacios E., Mendez J. "Value'of blood cultures in the follow up of infectious endocarditis". 5 th International Symposium on modern concepts in endocarditis and cardiovascular infections. 1999. Abstracts P-41, p.85.

195. Sasaki Y., Suehiro S., Shibata T., Minamimura H., Kumano H., Kinoshita H. "A case of isolated tricuspidvalve endocarditis caused by Campylobacter fetus". Nippon Kyobu Geka Gakkai Zasshi. 1997 Nov;45(11):1844-7.

196. Savage D.C. "The normal human microflora composition: The regulatory and protective role of normal microflora" (eds Grubb R.) M-Stocton Press, N-Y, 1989.

197. Sawada S., Suguro C., Matsuzaki M. "Case of peptostreptococcal subacute bacterial endocarditis with PDA". Naika 1969 Nov;245:969-73.

198. Schaal K.P., Schofield G.M., Pulverer G. "Taxonomy and clinical significance of Actinomycetaceae and Propionibacteriaceae". Infection 1980;8 Suppl 2:S122-30.

199. Schlecht S., Freudenberg M.A., Galanos C. "Culture and biological activity of Propionibacterium acnes". Infection 1997 Jul-Aug; 25(4):247-9.

200. Seggie J. "Fusobactrium endocarditis treated with metronidazole". Br Med J.1978 Apr 15; 1 (6118):960-1.

201. Severijen A.J., van Kleef R., Hazenberg M.P., van de Merwe J.P. "Chronic arthritis induced in rats by cell wall fragments of Eubacterium Species from the human intestinal flora". Infect Immune 1990 Feb;58(2):523-8.

202. Shammas N.W., Murphy G.W., Eichelberger J., Klee D., Schwartz R., Bachman W. "Infective endocarditis due to Fusobacterium nucleatum: case report and review of the literature." Clin Cardiol., 1993 Jan;16(1):72-5.

203. Shinhar E., Silver J., Yeivin R., Shapiro M. "Polymicrobial endocarditis due to Eikenella corrodens and group B beta-hemolytic streptococcus". Isr J Med Sci. 1980 Jun;16(6):458-9.

204. Simon G.L., Gorbach S.L. "Intestinal flora in health and disease". Gastroenterology, 1984, vol.86.

205. Singhi S.C. "Peptococcus endocarditis". Indian Pediatr. 1988 Sep;25(9):876-8.

206. Smith G.R., Barton S.A., Wallace L.M. "Further observation on enhancement of the infectivity of Fusobacterium necrophorum by other bacteria". Epidemiol Infect 1991 Apr;106(2):305-10.

207. Sobel J.D., Carrizosa J., Ziobrowski T.F., Gluckman ,S.J. "Polymicrobial endocarditis involving Eikenellacorrodens". Am J Med Sci. 1981 Jul-Aug;282(1):41-4.

208. Spellberg B., Steidel K., Lutticken R., Haase G. "Isolation of Staphylococcus caprae from blood cultures of a neonate with congenital heart disease". Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 1998 Jan;17(1):61-2.

209. Stead D.E., Sellwood J.E., Wilson J., Viney J."Evaluation of a commercial microbial identification system based on fatty acid profiles for rapid, accurate identification of plant pathogenic bacteria". J.Appl. Bacteriol. 1992/72:315-321.

210. Steelman R., Einzig S., Balian A., Thomas J., Rosen D., Gustafson R., Gochenour L. "Increased susceptibility to gingival colonization by specific HACEK microbes in children with congenital heart disease". J Clin Pediatr Dent. 2000 Fall;25(1):91-4.

211. Stuart G., Wren C. "Endocarditis with acute mitral regurgitation caused by Fusobacterium necrophorum". Pediatr Cardiol. 1992 Oct;13(4):230-2.

212. Sud J.J., Feingold D.S. "Detection 3-hydroxy fatty acids of picogram levels in biologic specimens. A chemical method of the detection of Neisseria gonorhoeael" J.Investigative Dermatology. 1979;73:521• 526.

213. Sugimoto C., Miyagawa E., Nitani K., Nakazawa M., Isayama Y. "Cellular fatty acid composition of Haemophilus equigenitalis". J.Clin.Microbiol. 1982, vol.15/5:791-794.

214. Swanston W.H., Cameron E.S., Ramchander V. "Eikenella corrodens brain abscess in a child with congenital heart disease". West Indian Med J. 1988 Dec;37(4):243-5.

215. Taubert K.A., Dajani A.S. "Optimization of the prevention and treatment of bacterial endocarditis". Drugs Aging. 2001;18 (6) :415-24. Review.

216. Thiele H., Hambrecht R., Lauer B., Weinert M., Mohr F.W., Schuler G. "Diagnostic value of intraoperative swabs of heart valves in infective endocarditis". J Heart Valve Dis 2001 Jan;10(1):129-35.

217. Tsuchiya H., Masaru S., Kato M. et al., "High-Perfomance Liquid Chromatographic analysis of bacterial fatty acid composition for chemotaxonomic characterization of oral streptococci". Clin.Microbiol., 1986, 24;1:81-85.

218. Tuttle R.S., Strubel N.A."A non-lectin-like mechaninsm by which Fusobacterium nucleatum 10953 adheres to and activates human lymphocytes". Oral Microbiol Immunol 1992 Apr;7(2):78-83.

219. Tzianabos A.O., Kasper D.L., Cisneros R.L., Smith R.S., Onderbonk A.B. "Polysaccharide-mediated protection against abscess formation in experimental intra-abdominal sepsis". J Clin Invest 1995 Dec;96(6):2727-31.

220. Tzianabos A.O., Pantosti A., Baumann H., Brisson J.R., Jennings H.J., Kasper D.L. "The capsular polysacharide of Bcteroides fragilis comprises twoionically linked polysaccharides". J Biol Chem 1992 Sep 5;267(25):18230-5.

221. Tzianabos A.O., Onderbonk A.B., Smith R.S., Kasper D.L. "Structure-function relationship for polysaccharide-induced intra-abdominal abscesses". Infect Immun 1994 aug;62(8):3590-3.

222. Ubeda P., Todoli J., Saro E., Gomez M.D., Perez Belles C., Gobernado M. "Subacute infectious endocarditis in prosthetic valve by Peptostreptococcus micros". Enferm Infecc Microbiol Clin.1998 Feb;16(2):101-2.

223. Ubeda Ruiz P., Gutierrez Martin I., Ramirez Galleymore P., Perez Belles C., Gobernado Serrano M. "Endocarditis due to Gemella morbillorum in a parenteral drug-abuse addict". Rev Clin Esp. 2000 Mar;200 (3):176-7. Review.

224. Ukimura A., Nishihara S, Suwa M., Hirota Y., Kitaura Y., kawamura K., Sasaki S. "Prosthetic ball valve endocarditis due to Gemella species". Jpn Circ J. 1998 Aug;62(8):62 6-8.

225. Uraz G, Turkmen L. "Beta-lactamase activity of anaerobic bacteroides strains isolated from clinical samples and their susceptibility to antimicrobial agents". Drug Metabol Drug Interact. 1999;15 (2-3):181-6.

226. Valderas M.W., Gatson J.W., Wreyford N., Hart M.E."The superoxide dismutase gene sodM is unique to Staphylococcus aureus: absence of sodM in coagulase-negative staphylococci". J Bacteriol 20021. May;184(9):2465-72.

227. Watanabe Y., Ueno K. "Case of subacute bacterial endocarditis due to Eubacterium". Nippon Densenbyo Gakkai Zasshi.1968 Jul; 42(4):78-83.

228. Webb D., Thadepalli H., Bach V. " Cefoxitin therapy for bacterial endocarditis.". Rev Infect Dis 1979 Jan-Feb;1(1):170-4.

229. Wendler D., Mendoza E., Schleiffer T., Zander M., Maier M. "Tropheryma whippelii endocarditis confirmed by polymerase chain reaction". Eur Hert J.1995;16:424-5.

230. Werder E.A. "Neonatal infections with Streptomyces pelletieri". Am.J.Dis.Child. 1973;125 (3):439-441.

231. Werner M., Andersson R., Olaison L., Hogevik H. "A clinical epidemiological study of patients with culture negative infective endocarditis including an evaluation according to the Duke criteria". 5th International

232. Symposium on modern concepts in endocarditis and cardiovascular infections. 1999. Abstracts P-51, p.96.

233. Weyant R.S., Moss C.W., Weaver R.E., Hollis D.G., Jordan J.G., Cook E.C., Daneshvar M.J. "Identification of Unusual Pathogenic Gram-Negativ Aerobic and Facultatively Anaerobic bacteria". Second edition. Williams and Wilkins, 1996.

234. White D.C. "Validation of quantitative analysis for microbial biomass, community structure, and metabolic activity". Adv. Limnol. 1988;31:1-18.

235. Williams P., Camara M., Hardman A., Swift S., Milton

236. D., Hope V.J., Winzer K., Middleton B., Pritchard D.I., Bycroft B.W. "Quorum sensing and the population-dependent control of virulence". Philos Trans R Soc Lond B Biol Sei 2000 May 29;355(1397):667-80.

237. Wilson K.H., Wade W.G., Weightman A.J. "The analysis of previously uncharacterised oral bacteria by 16S ribosomal RNA sequencing". Microecol Therapy, 1995, vol 25.

238. Zhang J. "A case of subacute bacterial endocarditis caused by anaerobic Peptostreptococcus". Hunan I Ko Ta Hsueh Hsueh Pao.1997;22 (2) .

239. Zhilina T.N., Zavarzin G.A., Bulygina E.S., Kevbrin V.V., Osipov G.A., Chumakov K.M. "Ecology, physiology and taxonomic studies on a new taxon of Haloanaerobiaceae, Haloincola saccharolytica gen. nov., sp. nov."

240. Syst.Appl.Microbiol. 1992;15:275-284.

241. Zilina T.N., Zavarzin G.A., Rainey F.A., Pikuta

242. E.N., Osipov G.A., Kostrikina N.A. "Desulfonatronovibrio hydrogenovorans gen.nov., sp.nov., an alkalophilic, sulfate-reducing bacterium". Int.J.Syst.Bact. 1997, Vol.47;1:144-149.

243. Zussa C., Ius P., Cesari F., valfre C., Totis 0., Canova C., Pugina P."Fortuitous detection of prosthetic valve endocarditis caused by an uncommon etiologic agent". J Thorac Cardiovasc Surg. 1994 Apr;107(4):1167-8.