Бесплатный автореферат и диссертация по биологии на тему

Биосинтез, очистка и практическое применение продигиозина-пигмента Serratia Marcescens

ВАК РФ 03.00.07, Микробиология

Автореферат диссертации по теме "Биосинтез, очистка и практическое применение продигиозина-пигмента Serratia Marcescens"

На правах рукописи

ГУРЬЯНОВ Иван Дмитриевич

БИОСИНТЕЗ, ОЧИСТКА И ПРАКТИЧЕСКОЕ ПРИМЕНЕНИЕ ПРОДИГИОЗИНА - ПИГМЕНТА SERRATIA MARCESCENS

03 00 07 - микробиология

АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук

UU344GÖ42

Казань-2008

003446842

Работа выполнена на кафедре микробиологии государственного университета им В. И. Ульянова-Ленина

Казанского

Научный руководитель'

Официальные оппоненты-

кандидат биологических наук, ведущий научный сотрудник Юсупова Дельбэр Вафовна

доктор ветеринарных наук, профессор Госманов Рауис Госманович (Казанская государственная академия ветеринарной медицины им Н Э Баумана, г. Казань)

доктор биологических наук, профессор Морозов Николай Васильевич (Татарский государственный гуманитарно-педагогический университет, г. Казань)

Ведущая организация

Институт биологии УНЦ РАН, г Уфа

Защита диссертации состоится «25» сентября 2008 г в Д часов на заседании диссертационного совета Д 212.081 08 при Казанском государственном университете по адресу. 420008, г. Казань, ул Кремлевская, д 18, главное здание, ауд 211

С диссертацией можно ознакомиться в научной библиотеке им Н И Лобачевского при Казанском государственном университете

Автореферат разослан «¿5» августа 2008 г.

Ученый секретарь диссертационного совета,

доктор биологических наук ^^ 3 И Абрамова

Актуальность проблемы. Большинство работ, в области изучения бактериальных пигментов посвящено фототрофам, в то время как пигменты нефотосинтезирующих микроорганизмов изучены в значительно меньшей степени Ярко-красный пигмент продигиозин, синтезируемый энтеробактериями Serrada marcescens, представляет собой линейный трипиррол (пиррол, 3-метоксипиррол, 2-метил-З-амилпиррол). Как и многие вторичные метаболиты бактерий, продигиозин приобретает практическое значение в промышленности и медицине. В промышленности продигиозин рекомендуется в качестве красителя для полимеров, поскольку он обладает рядом преимуществ по сравнению с применяемыми в настоящее время органическими и неорганическими пигментами Разработан способ использования продигиозина для маркирования нефтепродуктов [Гарейшина с соавт., 2003]. Пигмент хорошо растворим в различных марках топлива и легко обнаруживается по характерному спектру поглощения Продигиозин и продигиозинподобные пигменты, синтезируемые некоторыми видами микроорганизмов, рассматриваются как новое семейство противоопухолевых лекарственных препаратов [Montaner et al, 2000, Llagostera et al, 2005] Показано, что продигиозин действует, как иммунодепрессант, селективно блокируя пролиферацию Т-клеток киллеров [Han et al, 1998, Azuma et al, 2000], избирательно индуцирует апоптоз различных типов злокачественных клеток [Montaner, Pérez-Tomás, 2001, Campás et al, 2003], ингибирует образование метастаз, обладает антиинвазивными свойствами [Pérez-Tomás et al, 2003]

В связи с большой практической значимостью продигиозина возникает необходимость в наработке больших количеств пигмента и снижении его стоимости Высокая стоимость пигмента тормозит, в частности, использование его в качестве маркера нефтепродуктов Кроме того, неизученным остается вопрос о мутагенности, генетической токсичности продигиозина Для изучения этих свойств необходимы высокоочищенные препараты продигиозина В представленной работе предполагается разработать эффективную схему получения продигиозина и изучить некоторые биологические эффекты пигмента.

Цель и задачи исследований Цель данной работы состояла в следующем разработать эффективную схему получения бактериального пигмента продигиозина; определить его токсические и генотоксические свойства и установить возможности практического применения. В соответствии с поставленной целью решались следующие задачи:

• подобрать высокопродуктивные по биосинтезу пигмента продигиозина штаммы Serratia marcescens, оптимизировать питательную среду и условия культивирования для получения продигиозина в лабораторных и полупромышленных масштабах;

• получить и охарактеризовать высокоочшценный пигментный препарат с привлечением физико-химических методов;

• установить токсичные и безопасные концентрации продигиозина для растений, простейших и микроорганизмов,

• определить мутагенные свойства препаратов продигиозина с использованием основных методов генетической токсикологии,

• определить возможность применения пигмента в качестве фунгицидного агента для защиты растений от фитопатогенных микромицетов,

• оценить возможность и перспективность использования продигиозина в качестве биологического маркера нефтепродуктов и разработать более точный метод идентификации маркера Научная новизна. Проведена сравнительная оценка токсичности

пигментных препаратов по отношению к прокариотическим и эукариотическим организмам Получены приоритетные данные о генотоксических эффектах продигиозина Показано отсутствие генотоксического воздействия очищенного продигиозина в тесте Эймса и микроядерном тесте in vivo Определены антагонистические свойства продигиозина в отношении фитопатогенных микромицетов Оценка возможности применения пигмента в качестве фунгицидного агента для защиты растений проведена с учетом определения эффективной и безопасной концентрации продигиозина

Практическая значимость. Разработана дешевая, простая в приготовлении питательная среда для культивирования Serratia marcescens - штамма-продуцента продигиозина, способствующая высокому выходу пигмента Разработан метод получения высокоочищенного пигментного препарата С учетом использования продигиозина в различных отраслях биотехнологии (красителя полимеров, маркера нефтепродуктов) результаты, полученные в данной работе, позволяют определить возможную экологическую опасность при попадании пигмента и связанных с ним продуктов производства в окружающую среду Выявленная фунгицидная активность продигиозина, как одно из проявлений токсического эффекта, может служить аргументом в пользу разработки методов применения данного препарата для защиты сельскохозяйственных растений от фитопатогенов Упрощенный метод идентификации продигиозина и хорошая растворимость в различных марках топлива позволяют рекомендовать пигмент в качестве маркера нефтепродуктов

Связь работы с научными программами и собственный вклад автора в исследования. Исследования автора по тематике диссертационной работы поддержаны федеральными программами «Развитие научного потенциала высшей школы» РНП2 1 1 1005, РНП 2 1 1 3222 Грант АН РТ, № 03-3 5-33/ 2006 (Г) 2006 г Индивидуальный грант КГУ (2008) Научные положения диссертации и выводы базируются на результатах собственных исследований автора Масс-спектроскопические исследования проведены в лаборатории ИОФХ

им Арбузова Микроядерный тест проведен в лаборатории ИОФХ им Арбузова.

Положения, выносимые на защиту:

1 Разработана эффективная схема получения продигиозина, с применением хроматографических методов получен и охарактеризован препарат продигиозина высокой степени очистки

2. В тестах ш vitro и т vivo впервые установлены особенности генотоксического влияния продигиозина, определена возможность возникновения мутаций в клетках Salmonella typhimurium ТА 100 и индукции хромосомных повреждений эритробластов у млекопитающих

3 Установлены антагонистическая активность штамма Serratia marcescens АТСС 9986 и фунгицидная активность продигиозина Определены эффективные нетоксичные концентрации пигмента при использовании продигиозина для защиты растений

4 Разработан и рекомендуется к применению новый способ идентификации нефтепродуктов, маркированных пигментом

Апробация работы Материалы диссертации доложены и обсуждены на 2-й международной конференции «Наука-бизнес-образование биотехнология-биомедицина-окружающая среда» (Пущино, 2005), 10-й Пущинской школе-конференции молодых ученых «Биология наука XXI века» (Пущино, 2006), XLV международной научной студенческой конференции «Студент и научно-технический прогресс» (Новосибирск, 2007), Региональной научно-практической конференции «Синтез и перспективы использования новых биологически активных соединений» (Казань, 2007), Научной конференции молодых ученых, аспирантов и студентов научно-образовательного центра КГУ «Материалы и технологии XXI века» (Казань, 2007), I международной практическая конференция «Микробная биотехнология — новые подходы и решения» (Казань, 2007)

Публикации По теме диссертации опубликовано 11 научных работ.

Благодарности. Автор выражает огромную благодарность своему научному руководителю к б н Юсуповой Дельбэр Вафовне за предоставление интересной темы диссертационной работы и научное руководство Автор также благодарит Клочкова В В за проведение ЯМР-спектроскопии, Карамову НС и Маргулис А Б. за помощь в освоении методов генетической токсикологии

Структура и объем диссертации. Работа изложена на 142 страницах, содержит 8 таблиц и 44 рисунка и состоит из введения, обзора литературы, описания материалов и методов, результатов исследований, обсуждения результатов, выводов, списка литературы, включающего 163 источников, из них 133 на иностранном языке и приложения.

СОДЕРЖАНИЕ РАБОТЫ

Материалы и методы исследования

Объекты исследования. Оптимизацию питательных сред и определение высокоэффективных продуцентов пигмента, проводили с использованием штаммов Serratia marcescens, полученных из различных коллекций Оценку антагонистической активности, проводили с использованием пигментобразующего штамма S marcescens АТСС 9986 и апигментного его варианта, полученного отбором посевного материала из стабильно непигментирующих колоний В тесте на токсичность по отношению к микроорганизмам и в тесте Эймса использовали мутантный штамм Salmonella typhimurium ТА 100 - his G46 , rfa, uvr, bio, pKMIOI В качестве тест-объектов при определении антагонистического спектра, а также исследовании фунгицидной активности препаратов продигиозина использовали следующие культуры фитопатогенных грибов Fusarium sp, Fvsarium solam, Alternaría alternarium, Alternaría sambaticum из коллекции НИЛ ББФ Казанского университета Токсическое влияние продигиозина на рост корней и накопление биомассы растений проводили с использованием высушенных цельных семян гороха, кукурузы, ячменя и овса, предоставленных «ТатНИИСХ» Определение острой летальной токсичности проводили с использованием в качестве тест-объекта монокультуры Parameciitm caudatum, выделенной из активного ила очистных сооружений предприятия «Казаньоргсинтез»

Условия культивирования, питательные среды. В работе использовали пептон производства Семипалатинского мясокомбината, содержащий Pi в количестве 0 8 мг/% [Знаменская с соавт, 1982], гидролизат коллагена Щелковского биокомбината, кукурузный глютен (шрот) производства ООО "Рыбфлотпром", г Калининград Бактерии культивировали на жидких и агаризованных питательных средах (среда Кинга A [Kmg et al, 1954] (г/л) пептон - 20, глицерин - 10, K2SO4 - 10, MgClj - 1 4, рН 7 6-7 9, среда Кинга А, с заменой пептона гидролизатом коллагена в количестве - 20, 10, 5 0, 2 5 г/л, пептон-глицериновая среда [Katz, 1979] (г/л) пептон - 5, глицерин - 20, рН 7 6, пептон-глицериновая среда, с заменой пептона гидролизатом коллагена в количестве 5 0,2 5 г/л, овсяная среда [Юсупова с соавт, 1983] (г/л) пептон - 10, галактоза - 1, овсяная мука - 4, NaCI - 5, рН 7 6-7 9) В жидких средах бактерии культивировали в конических колбах (отношение объема среды к объему колбы 1 5), на качалке (200 об/мин) при температуре 28-30°С в течение 4872 ч Культивирование бактерий иа агаризованных питательных средах проводили при одинаковых условиях с учетом размеров чашек Петри и объема сред в них Скорость роста культуры определяли по изменению оптической плотности культуральной жидкости и веса сухой биомассы Полученную биомассу бактерий запивали 1N раствором NaOH в

отношении 1 2 к объему питательной среды, из которой были собраны бактерии Суспензию клеток кипятили на водяной бане в течение 1 часа Пигмент экстрагировали 98% этанолом или подкисленным этанолом, или этанолом без предварительного добавления IN раствора NaOH и кипячения, в соотношении 1 2 к объему среды суспензии, встряхивая на качалке при 200 об/мин в течение 3-х часов Повторную экстракцию проводили до полного обесцвечивания осадка Выход продигиозина пересчитывали на 1л среды или к величине сухой биомассы

Определение количества продигиозина. Количество пигмента рассчитывали с использованием удельного коэффициента поглощения, который при ). = 535 нм составляет величину 51 5*103 см2/мг [Williams et al, 1971], на спектрофотометре Lambda 35 (Perkin Elmer instruments, США) Для этого полученный спиртовой экстракт пигмента разводили подкисленным этанолом (9 мл этанола + 1мл IN HCl)

Получение продигиозина и его экстракционная очистка. Для получения пигмента продигиозина штамм-продуцент S marcescens АТСС 9986 культивировали на агаризованной пептоно-глицериновой среде (ПГС) Экстракцию продигиозина из биомассы бактерий проводили кислым этанолом (100мл 96% этилового спирта + 1мл НС1конц), до полного обесцвечивания биомассы Полученный препарат высушивали на воздухе и повторно элюировали. Процедуру повторяли несколько раз до освобождения от нерастворимых примесей Полученный однородный раствор был обозначен, как неочищенный пигментный препарат (НПП) и использован для маркирования нефтепродуктов (в качестве маркера)

Очистка пигментного препарата Этанольный экстракт выпаривали в вакуумном шкафу при температуре 45-50°С и перерастворяли пигмент в хлороформе Полученный раствор смешивали с равной по объему водно-этанольной смесью (объемное соотношение этанол-вода - 1 4) и эмульгировали на магнитной мешалке в течение 1ч От водорастворимых примесей и водно-этанольной смеси освобождались на делительной воронке Процедуру повторяли, увеличив объемное соотношение этанола вдвое Затем пигментный препарат повторно высушивали в вакуумном шкафу и перерастворяли в этаноле

Жидкостная хроматография Жидкостную хроматографию проводили на стеклянной колонке общим объемом 628 см с использованием силикагеля марки КСК Однородную суспензию сорбента готовили из расчета 5 г силикагеля на 20-30 мл смеси гексан - ацетон 90 10 (об/об) После наполнения колонки уровень растворителя опускали до верхней границы столбика силикагеля и дважды промывали смесью гексан - ацетон 90 30 (об/об) Раствор пигмента в этаноле наносили на поверхность сорбента Колонку промывали следующими растворителями 350 мл смеси гексана с ацетоном в соотношении 90 30 (об/об), 200 мл ацетона Скорость движения подвижной фазы (растворителя) в колонке

О 03 мл/сек Все полученные фракции были по отдельности собраны и проанализированы

Тонкослойная хроматография (ТСХ) Тонкослойную хроматографию проводили на стеклянных пластинках для препаративного разделения, с силикагелем марки 60 F254 (Merck, Германия) Смесь для разделения гексан - этиловый эфир - уксусная кислота в соотношении 70 30 1 (об/об/об) Для количественной и качественной характеристики измеряли величины Rf полученных полос, затем их по отдельности снимали с пластин вместе с сорбентом и последовательно элюировали следующими растворителями 96% этанол, ацетон, хлороформ

Хроматографические полосы анализировали с использованием реактивов для определения фосфолипидов 0 5% раствор родамина В в этаноле, реактив Драгендорфа, нингидрин, пары йода [Хроматография в тонких слоях, 1965]

Каждый этап очистки завершали анализом оптических спектров поглощения полученных фракций в ультрафиолетовой и видимой областях спектра

Физико-химические методы анализа очищенного пигмента продигиозина. ЯМР спектр на ядрах 'Н записывали на ЯМР спектрометре Bruker Avance II (500 MHz), с использованием в качестве растворителя дейтерированного хлороформа (CDC13)

Анализ оптических спектров поглощения полученных в работе фракций продигиозина проведен с использованием двулучевого спектрофотометра Lambda 35 (Perkin Elmer instruments, США) в диапазоне длин волн 200 700 им Масс-спектрометрию проводили на приборе ВПМС МХ-5303 (ИАП РАН, Россия)

Оценку антагонистической активности Serratia marcescens по отношению к фитопатогенным микромицетам проводили с использованием метода встречных культур на картофельно-глюкозном агаре (КГА)

Фунгицидная активность препаратов продигиозина. Сравнение фунгицидной активности неочищенного пигментного препарата (НПП) и очищенного пигмента проводили посевом исследуемого микромицета на КГА с добавлением различных концентраций пигмента Контролем служил рост грибов на среде без продигиозина Методы оценки токсичности

Токсическое влияние препаратов продигиозина на рост корней растений Оценку токсического влияния продигиозина на рост корней растений проводили по модифицированному методу ISO 1I269-I [ISO 11269-1, 1993]

Оценку влияния препаратов продигиозина на накопление биомассы растений осуществляли с использованием метода рекомендованного Международной организацией стандартизации по протоколу ISO 1269-2 [ISO 1269-2, 1993]

Определение острой легальной токсичности на тест-объекте Paramecium caudatum проводили согласно методу, разработанному на кафедре микробиологии КГУ [Наумова с соавт, 2000]

Тест на токсичность по отношению к Salmonella typhimurium проводили согласно [Ильинская, Маргулис, 2005] Методы оценки генотокснчности

Полуколичественный метод учета генных мутаций (тест Эймса) проводили по стандартной процедуре [Ames, Lee, 1973] Учет результатов проводили по индукции обратных мутаций к гистидиновой прототрофности через 48ч инкубации Сравнивали число колоний-ревертантов в опыте и контроле

Микроядерный тест на эритроцитах периферической крови мышей m vivo Опытные концентрации продигиозина (25, 8, 4 мкг/кг) вводили мышам подкожно Образцы крови из хвостовой вены животного отбирались через 48, 72 ч после введения исследуемых концентраций Препараты окрашивали красителем Романовского-Гимза

Маркирование и идентификация маркированных нефтепродуктов. В работе использовали бензины различных марок, дизельное топливо производства «Татнефть», авиационный бензин и авиационный керосин, которые маркировали этанольным раствором продигиозина С целью идентификации маркированных нефтепродуктов снимали оптический спектр поглощения в области длин волн А.=350 600 нм на регистрирующем спектрофотометре Lambda 35 (Регкт Elmer instruments, США)

Статистическая обработка результатов. Математическую обработку данных проводили в стандартной компьютерной программе "Microsoft Excel" Группу данных считали однородной, если среднеквадратическое отклонение ст в группе не превышало 13% Различие между группами считали достоверным при критерии вероятности р < 0 05

Результаты исследования Сравнительная характеристика роста и пнгментообразования исследуемых штаммов S. marcescens. Среди 22-х изученных представителей вида S marcescens наибольшие количества продигиозина образовывали два штамма S marcescens АТСС 9986 и S marcescens ВКМБ-851, которые были отобраны для дальнейших исследований Остальные пигментообразующие штаммы синтезировали незначительные количества продигиозина Результаты проведенной работы позволяют рекомендовать штаммы S marcescens АТСС 9986 и S marcescens ВКМБ-851 в качестве перспективных продуцентов продигиозина

Образование продигиозина при культивировании бактерий на различных средах. Рост и пигментообразование отобранных штаммов изучали на трех средах, рекомендованных ранее для получения продигиозина среда Кинга А, пептон-глицериновая и овсяная

Наибольшее накопление биомассы происходило на среде Кинга А. При этом штамм 5. тагсеясет ВКМБ-851 отличался более интенсивным ростом. Штамм 5. тагсеэсет АТСС 9986 менее интенсивно накапливал биомассу на среде Кинга А, но синтезировал значительно большее количество пигмента. На среде Кинга А биосинтез продигиозина штаммом 5. тагсеясеп5 АТСС 9986 был в четыре раза выше чем на пептон-глицериновой среде (рис. 1).

Б

□ АТСС9986 ■ ВКМБ-851 ПАТСС 9986 1ВКММ51

600 500 «00 300

100

о

- 5*1

т

_ ¡^"ГРСГ.

1 2 3

□АТСС 9986 ВВКМБ-851

Рис. 1 Сравнительная характеристика роста и пигментообразования штаммов 5. тагсезсет АТСС 9986 и ВКМБ-851 на питательных средах: 1 - среда Кинга А, 2 - пептон-глицериновая (ПГС), 3 -овсяная среда; А - биомасса; Б -пигмент; В - продуктивность.

В связи с высокой стоимостью данных питательных сред была предпринята попытка заменить в них пептон на гидролизат коллагена или кукурузный шрот. Замена пептона на гидролизат коллагена в среде Кинга А приводило к стимуляции роста обоих штаммов. При этом у штамма 5. тагсехсеп.ч ВКМБ-851 общий выход пигмента увеличивался в 8 раз, достигая своего наибольшего значения при концентрации гидролизата коллагена 5 г/л (рис.2). Аналогично увеличивалось накопление биомассы. Модификация пептон-глицериновой среды путем замены пептона на гидролизат коллагена (5 г/л) стимулировала рост штаммов, увеличивала общий выход продигиозина, и увеличивала продуктивность штамма 5. тагсезсгт ВКМБ-851. Продуктивность штамма 5. тагсезсет АТСС 9986 не увеличивалась. При использовании кукурузного шрота наблюдался слабый рост бактерий, пигментообразование отсутствовало.

1 2 3

□А 100 9986 Ш ВКМБ-851

800 600 400 200 О

1 2 3

О А ТСС 9986 Я ВКМБ-851

600 500 400 300 200 100 0

Л , г! I Г'~'Ш

1 2 3

□ АТСС9986 ■ ВКМБ-851

Рис 2 Рост и биосинтез продигиозина штаммами 5. тагсехсет АТСС 9986 и ВКМБ-851 на модифицированной среде Кинга А. ) - с добавлением гидролизата коллагена в количестве 20г/л, 2 - Юг/л, 3 - 5г/л; А - биомасса; Б - пигмент; В -продуктивность.

Оптимальными условиями для биосинтеза продигиозина отобранными штаммами на модифицированной среде Кинга А были следующие; продолжительность культивирования - 48 ч, количество инокулята - 2% от объема среды, температура - 28±0.2°С, аэробные условия. Продигиозин не выделяется в среду и локализован в поверхностных структурах клетки. С целью подбора менее трудоемкого и более эффективного метода экстракции пигмента из клеток сравнивали различные методы экстракции (табл. 1). Наиболее результативным оказался метод экстракции пигмента из клеток этанолом без предварительной обработки клеток щелочью.

Таблица I.

№ метод экстракции биомасса, г пигмент, мкг %

1 Разрушение клеток кипячением с ЫаОН, с последующей экстракцией пигмента этанолом 4.4 189 100

2 Экстракция пигмента этанолом без предварительной обработки клеток 4.4 259 156±7

3 Экстракция пигмента подкисленным этанолом без предварительной обработки клеток 4.4 240 147±6

4 Экстракция пигмента изопропанолом без предварительной обработки клеток 4 4 240 147±6

Выделение и очистка пигментного препарата продигиозина, его характеристика. Неочищенный пигментный препарат (НПП) в подкисленном этаноле имел типичный для продигиозина спектр поглощения в видимой области в кислых и щелочных условиях (рис. 4).

650 700

Рис. 4. Оптические спектры поглощения неочищенного пигментного препарата в этаноле: А - при рН 3.0, Б -при рН 9.0.

На колонке с силикагелем пигмент делился на три основные фракции: желто-оранжевую, красную и сиреневую, спектры поглощения которых представлены на рисунке (рис.5).

Рис. 5, Оптические спектры поглощения фракций, полученных при хроматографии неочищенного

пигментного препарата на колонке: i -желто-оранжевой, 2 - красной (с максимумом поглощения 535 нм и плечом 485 - 515 нм), 3 - сиреневой (с максимумом поглощения 488-500 нм).

Для проведения дальнейшей очистки с использованием ТСХ была отобрана красная фракция, которая на пластинках с силикагелем также разделялась на три вышеуказанные фракции с описанными характеристиками (сиреневая - Я/= 0.058, красная - Я/ = 0.312, желто-оранжевая - /?/"= 0.824). Таким образом, выход интересующей нас красной фракции пигмента в процентном соотношении от используемого в

процессе очистки пигментного препарата составил величину - 7.6% (табл. 2).

Таблица 2

Выделение и очистка препарата продигиозина

Этапы очистки Количество продигиозина, мг/л Выход, %

Этанольный экстракт 0.64 100

Колоночная хроматография 0.22 34.2

Тонкослойная хроматография 0.05 7.6

Красная фракция пигмента была отобрана как наиболее соответствующая нативному пигменту продигиозину и проанализирована с использованием методов ТСХ, масс-спектрометрии и ЯМР-спектрометрии (рис. 6, 7), что позволило подтвердить принадлежность данной фракции к продигиозину и детектировать её чистоту.

Рис. 6. Масс-спектр красной фракции пигмента (Мг полученной фракции 322,9 Иа).

У,

.и____

V11

Рис. 7. ЯМР-спектр очищенного пигментного

препарата. ЯМР-химические сдвиги продигиозина были следующими: 0.92 p.p.т., 1.31 p.p.т., 1.33 р.р.т., 1.60 р.р.т, 2.40 р.р.т., 2.55 р.р.т., 4.00 р.р.т., 6.08 р.р.т., 6.35 р.р.т., 6.68 р.р.т., 6.99 р.р.т., 7.27 р.р.т., 7.55 р.р.т.

Проявление хроматографических пластинок после опрыскивания раствором нингидрина, реактивом Драгендорфа, раствором родамина В и экспозиции в йодной камере показало общее наличие фосфатидов и, в частности, аминофосфатидов в НПП и их отсутствие в пигментном образце, прошедшем все этапы очистки.

Продигиозин, как фактор антагонистической активности S. marcescens. При посеве методом встречных культур А. sambaticum и S. marcescens АТСС 9986, Fusarium solani и S. marcescens АТСС 9986 выявлено значительное ингибирование роста фитопатогенного микромицета с ярко выраженной зоной лизиса (рис. 8). Факторы фунгицидной активности S. marcescens АТСС 9986 не влияли на рост колонии Fusarium sp. Штамм S. marcescens 24 (апигментный) не проявлял антагонистическую активность в отношении микромицетов, используемых в опыте.

Рис. 8. Антагонистическая активность 5. тагсеьсет АТСС 9986 но отношению к Р. зо!ап!: А - контроль - рост Р. $о1ат, Б -совместное культивирование /г. хо/аш с пигментобразующим штаммом £ тагсевсет АТСС 9986.

Добавление в питательную среду НПП или очищенного пигмента продигиозина в ряду концентраций 0.1, 0.5, 1.0 мкг/мл приводило к ингибированию роста патогенных микромицетов (рис.9).

Рис.9. Фунгицидное действие очищенного пигментного препарата по отношению к Fusarium sp. А - контроль (рост колонии Fusarium sp. на КГА), Б - рост колонии Fusarium sp. на среде с концентрацией продигиозина 0.1мкг/мл, В - 0.5мкг/мл, Г -1 мкг/мл.

Таким образом, проведенные исследования показали, что фактором антагонистической активности 5. дайт-сглседа является продигиозин.

Токсическое воздействие препаратов продигиозина на прорастание семян и накопление биомассы растений. Результаты работы по установлению токсического влияния НПП и очищенного пигмента продигиозина на прорастание семян растений представлены в таблице (табл. 3).

Таблица 3

Токсическое влияние продигиозина на прорастание семян_

Концентрация, мкг/мл ингибирование роста корней, %

куку руза горох

неочищенный пигментный препарат очищенный пигмент неочищенный пигментный препарат очищенный пигмент

2 1 0,5 0,2 0,1 98.6±1.6 97.5±2.0 82.0±3 3 13.0±28 4.2±2.0 100 100 94.0±1 8 21.5±3.1 8.0±2.3 94.0±2.0 93.0±3.0 75.0±3.5 11.7±2.4 3.&Ы.1 98.2±1.5 96.0±3.4 88.0±3.0 16.0*3.17 5.7±1.8

Характерно, что очистка продигиозина приводит к возрастанию его токсического воздействия на прорастание корней растений. Эти результаты косвенно подтверждаются особенностями токсического влияния препаратов продигиозина на способность растений накапливать биомассу (рис. 10).

НПП Oil НПП ОП НПГ1 on

Рис. 10. Ингибирование (% от контроля) накопления биомассы растением при суточной экспозиции семян в растворе с различной концентрацией пигмента (0.05, 0.1, 0.5, 1 мкг/мл)

Определение острой летальной токсичности на тест-объекте Paramecium caudatum. Наиболее токсичным оказался неочищенный пигментный препарат, который уже при концентрации 0.009 мкг/мл вызывал 50% гибель инфузорий, а в концентрации 0.046 мкг/мл данное соединение вызывало гибель 90-100% особей тест-объекта. Наименее токсичным оказался очищенный пигментный препарат, LD50 которого установлена для концентрации 0.05 мкг/мл (табл. 4).

Таблица 4.

Смертность Paramecium caudatum (% от контроля) при действии неочищенного пигментного препарата (НПП) и очищенного продигиозина (ОП)______

концентрация, мкг/мл смертность, %

НПП ОП

0 0 0

0.01 56 5±3.4 180±1.6

0.05 100 49.5±2.7

0.1 100 100

Токсические эффекты продигиозина по отношению к бактериям.

Токсический эффект определяли по выживанию тестерного штамма 5.1урЫтигтт ТА 100 в опытных вариантах по сравнению с контрольным. Продигиозин обладал сильным токсическим действием по отношению к тестерному штамму в концентрациях 1 мкг/мл и выше. Эти данные были учтены при изучении генотоксичности пигментных препаратов.

Индукция генных мутаций пигментными препаратами в тесте Эймса. Результаты исследования мутагенной активности пигментного препарата на штамме 5.1урЫтигшт ТА 100 без метаболической активации представлены на рисунках (рис. 11, 12).

r4jN

О

о :о 40 60 80 1СЮ 120 Числоколоний реверикюв

Рис. 11. Мутагенное действие различных концентраций (0.05, 0.1, 0.5 мкг/мл) НПП и ОП в тесте Эймса без метаболической активации. К - негативный контроль (количество колоний ревертантов при спонтанной реверсии), ЫаЫз - позитивный контроль (количество колоний ревертантов на среде с добавлением азида Ыа в концентрации 10 мкг/чашку).

«ОП

О 10 20 10 40 S0 60 70 Число колоний реадртактоз

Рис. 12. Мутагенное действие различных концентраций (0.05, 0.1, 0.5 мкг/мл) НПП и ОП в тесте Эймса с метаболической активацией. К - негативный контроль (количество колоний ревертантов при спонтанной реверсий).

Мутагенность оценивали по превышению количества ревертантов в опыте над контролем Для НПП в тесте Эймса без метаболической активации это превышение составило 5 25 раз при концентрации О 5мкг/мл, 4 5 и 3 0 раза в концентрациях 0 1 и 0 05 мкг/мл соответственно В варианте опыта с метаболической активацией количество ревертантов на среде с 0 5 мкг/мл НПП снизилось до 4 8 раз по сравнению с контролем, в 4.12 и 3 1 раза в концентрациях 0 1 и 0 05 мкг/мл

Таким образом, тест Эймса показал слабую мутагенную активность неочищенного пигментного препарата продигиозина в ряду концентраций 0 5 - 0 1 - 0 05 мкг/мл Очищенный продигиозин не проявил мутагенной активности во всех вариантах опыта

Микроядернын тест на эритроцитах периферической крови мышеи ut vivo. Анализ 1350 нормохромных эритроцитов (НХЭ) в контрольных образцах препаратов крови мышей, и опытных вариантах с различными концентрациями очищенного продигиозина проводился с целью установления отношения НХЭ к полихромным эритроцитам (ПХЭ), которое отражает уровень хромосомных повреждений и генотоксический потенциал исследуемых соединений Частота встречаемости ПХЭ в контрольном образце, на 48 час проведения опыта, была равна 4-8, что несколько выше данных литературы Отбор пробы контрольного образца еще через 24 часа, показал идентичные результаты - количество микроядер в периферической крови мышей не увеличилось Результаты анализа влияния опытных концентраций очищенного продигиозина на частоту образования ПХЭ представлены в таблице (табл 5)

Таблица 5

Влияние продигиозина на частоту образования ПХЭ в периферической крови мышей

концентрация, мкг/кг веса кочичество ПХЭ

животного 48ч 72ч

0 (негатив контроль) 5 8±1 9 5 6±2 1

4 6 7±2 3 6 6±1 5

8 6 UI 7 7 7

25 5 0±1 2 3 6±1 5

1 5(колхицин) 15 4±1 1 22 3±0 9

Таким образом, проведенное изучение генотоксичности продигиозина с использованием микроядерного теста показало незначительную индукцию микроядер в ПХЭ у обработанных животных и отсутствие дозозависимого эффекта во всех используемых концентрациях Очищенный продигиозин в изученных концентрациях не является позитивным индуктором микроядер и не обладает существенным генотоксическим эффектом т vivo

Маркирование нефтепродуктов продигиозином и способ идентификации маркированных нефтепродуктов.

Нами разработан способ идентификации маркированного нефтепродукта, основанный не на измерении поглощения нефтепродукта только в одной точке, при длине волны Я = 535 пш, а на снятии всего оптического спектра маркированного бензина в области длин волн к = 300600 нм, без добавления проявителя Немаркированный нефтепродукт при аналогичных условиях исследования демонстрирует отсутствие спектра поглощения в данной области (рис 13) Предлагаемый нами способ идентификации делает возможным идентификацию маркированного нефтепродукта в условиях потока вещества

А Б

Рис 13 Спектр бензина АИ 92 А - немаркированного бензина, Б -

маркированного, контроль немаркированный бензин

Спектры маркированных бензинов А 76, АИ 95, АИ98 и дизельного топлива производства «Татнефть», авиационный бензина и авиационный керосина аналогичны спектру АИ 92 Во всех маркированных образцах бензинов и керосина в области длин волн А. = 300-600 нм наблюдается ярко выраженный пик, характерный для спектра пигмента

Хранение в течение 6 месяцев не оказывало существенного влияния на маркированные бензины

Обсуждение результатов

Эффективность биотехнологического производства, связанного с использованием микроорганизмов в первую очередь определяется правильным подбором штаммов-продуцентов продуктов производства, а также оптимальностью условий биосинтеза Кроме того, важным критерием является сравнительная дешевизна сырья для приготовления питательной среды Решающее значение для жизнедеятельности продуцентов имеют набор и соотношение компонентов среды

18

культивирования (качество сырья, отношение С N, содержание примесей) S marcescens является прототрофным организмом и может расти на средах с единственным органическим источником углерода Для получения пигмента 5 marcescens в литературе предложены разнообразные среды [King et al, 1954, Williams et al, 1961,1971, Трутко, Акименко,1989, Kats, Sobleski,1979, Chang et al, 2000, Gin et al, 2004] На сегодняшний день относительно дешевой и экономически выгодной является пептон-глицериновая среда, содержащая всего 5г пептона и 20г глицерина на 1 л Однако поиски высокопродуктивных штаммов и дешевых питательных сред проводятся широким фронтом и в настоящее время [Chang et al, 2000, Gin et al, 2004, Tao et al, 2005, Oller, 2006] Направление исследований перспективно и может снизить стоимость препарата Большинство рекомендуемых сред содержит дорогостоящий пептон, который необходимо заменить каким-либо более дешевым аналогом, способным обеспечить соизмеримый биосинтез продигиозина

Разработанная питательная среда (модифицированная среда Кинга А, в которой пептон (20 г/л) заменен гидролизатом коллагена в концентрации 5 г/л), обеспечивает хороший рост и высокий выход пигмента при использовании рекомендуемых штаммов-продуцентов (S marcescens АТСС 9986 и ВКМБ-851) Использование штамма S marcescens АТСС 9986 и модифицированной питательной среды (5 г/л гидролизата коллагена), удешевляет получение продигиозина в 5 раз Мы предполагаем, что отношение источника азота к источнику углерода 2 1 (в среде Кинга А) не оптимально для роста и синтеза продигиозина S marcescens По мере уменьшения концентрации гидролизата коллагена в среде достигается соотношение источника азота и углерода, равное 1 2, что более благоприятно для биосинтеза продигиозина

Очистка продигиозина - органического вещества природного происхождения - сложная задача, так как бактериальный пигментный препарат является, по сути, пигментным комплексом, состоящим из множества фракций, кроме того, используемый способ выделения пигмента из бактериальной биомассы не исключает возможности одновременного извлечения из клеток и других соединений, в особенности соединений липидной природы Известно, что пигмент связан с клеточной оболочкой, содержится в периплазматическом пространстве и/или на поверхности цитоплазматической мембраны [Vinas et al, 1983, Matsuyama et al, 1986], a, значит, может быть связан с некоторыми компонентами клеточной стенки Поэтому приоритетной задачей при очистке пигмента было освобождение пигментного раствора от липидов и сопутствующих примесей Необходимо учитывать нестабильную природу пигмента и подобрать наиболее щадящий метод очистки, приводящий к разделению пигментного препарата на минимальное количество основных фракций Сложность применения высокотехнологичных методов очистки с жесткими условиями по отношению к продигиозину заключается в том,

что этот вторичный метаболит чрезвычайно нестабилен даже в высокоочищеином состоянии и при хранении продолжает разделяться с появлением множества минорных фракций, которые обнаруживаются при рехроматографии уже очищенного пигмента [Walter et al, 1972] Степень чистоты полученного нами в процессе очистки пигмента продигиозина анализировали с использованием метода ЯМР Особые преимущества этого метода заключаются в том, что он позволяет однозначно определить число и расположение индивидуальных атомов в молекуле исследуемого вещества Анализ ЯМР спектров пигмента продигиозина, молекулярная масса которого 323 Da достаточно прост, что объясняется небольшим количеством спектральных линий, вследствие небольшой его молекулярной массы Общий анализ записанного спектра ЯМР позволяет сделать положительные выводы о чистоте полученного пигментного образца Таким образом, разработанный способ очистки пигментного препарата позволяет достичь поставленной цели при незначительных материальных затратах и может быть использован для дальнейшей работы с пигментом продигиозином в лабораторных исследованиях

Потенциальную экологическую и токсикологическую опасность пигмента необходимо установить для безопасного использования его в различных отраслях биотехнологии, медицине, сельском хозяйстве Обработка растений бактериальной суспензией 5 marcescens эффективна против таких возбудителей заболеваний, как Botrytis cinerea, Rhizoctonia solani [Someya et al, 2003, Someya et al, 2005] Однако, факторы антагонистической активности S marcescens изучены недостаточно Предполагается, что таковыми являются ярко-красный пигмент продигиозин синтезируемый S marcescens и комплекс хитинолитических ферментов секретируемых бактериями в среду В некоторых работах отмечается, что продигиозин способен оказывать фунгицидное воздействие, которое наиболее явно проявляется лишь в присутствии хитинолитического комплекса ферментов Конкурентное взаимодействие 2-х штаммов 5 marcescens АТСС 9986 (пигментобразующий) и 5 marcescens 24 (апигментный) с фитопатогенными микромицетами, показало возможность использования пигментобразующего штамма в качестве фунгицидного агента для защиты растений и сформировало представление о роли пигмента продигиозина, как основного фактора антагонистической активности продуцента Анализ фунгицидной активности неочищенного пигментного препарата и очищенного пигмента позволил установить пропорциональную зависимость угнетения роста колоний фитопатогенных микромицетов от концентрации продигиозина Возможность использования продигиозина 5 marcescens в качестве нового фунгицидного агента должна рассматриваться с позиции безопасности его применения для сельскохозяйственных культур и условий окружающей среды Мы установили, что эффективные концентрации продигиозина, как фитопротекторного вещества, находятся в диапазоне от 0 05 до 0 3 мкг/мл

В то же время авторы, предлагающие использовать продигиозин в качестве фунгицидпого агента, указывают эффективные концентрации пигмента в пределах 1-100 мкг/мл [Someya et al, 1997, Someya et al, 2001] Однако, применение пигмента для защиты растений, в указанных концентрациях не оправдано вследствие ингибирования продигиозином роста корней и способности растений накапливать биомассу, что показано в нашей работе Основными задачами данной работы были установление и изучение возможных токсических и генотоксических эффектов пигмента продигиозина Цитотоксическое действие продигиозина установлено многими исследователями, при изучении противоопухолевого действия пигмента, на линиях раковых клеток [Montaner et al, 2000, Llagostera et al, 2005], при изучении фунгицидного потенциала продуцента Serratia marcescens [Someya et al, 2003, Someya et al, 2005] Одним из современных и высокочувствительных методов изучения токсичности даже при очень низкой концентрации исследуемых веществ является тест на Paramecium caudatum Результаты нашей работы подтверждают высокую чувствительность простейших к цитотоксическому действию продигиозина и сопоставимы с данными литературы, в которых также отмечается возможность применения этого пигмента для лечения протозойных инфекции [Melo et al, 2000] Такие свойства пигмента могут объяснять его цитотоксическое действие в отношении бактерий и позволяют предполагать наличие у продигиозина генотоксического потенциала Исследование мутагенной активности пигментного препарата на тестерном штамме S typhimurium ТА 100 проводили в диапазоне концентраций 0 005 - 0 5 мкг/мл, что объясняется результатами предварительного изучения токсичности препаратов продигиозина Неочищенный пигментный препарат в используемом диапазоне концентраций индуцирует генные мутации типа замены пар оснований в клетках S typhimurium ТА 100 Обнаруженный эффект носит дозозависимый характер, однако он незначителен и свидетельствует о слабой мутагенной активности соединения [Фонштейн с соавт, 1985] Очистка пигментного препарата снижает описанный мутагенный эффект до уровня фоновой частоты реверсий в негативном контроле Таким образом, проявляемый генотоксический потенциал неочищенного пигментного препарата может быть связан с загрязняющими его компонентами, способными вызывать реверсию микроорганизмов опытного штамма к прототрофности Метаболическая активация пигментных препаратов при использовании фракции S9 не способствует возникновению мутагенного эффекта в тесте Эймса Возможно, что система монооксигеназ фракции S9 не способна трансформировать такое соединение как продигиозин, либо интермедиаты, образующиеся при его метаболизме не отличаются по степени своей генотоксичности от исходного соединения

Наиболее распространенным методом изучения генотоксического потенциала соединений in vivo является учет микроядер в полихромных эритроцитах периферической крови мышей Результаты изучения генотоксического потенциала продигиозина, представленные в данной работе, основываются на анализе 1350 НХЭ в контрольных образцах препаратов крови мышей, и опытных вариантах с различными концентрациями очищенного пигмента Проведенное изучение генотоксичности продигиозина с использованием микроядерного теста показало незначительную индукцию микроядер в ПХЭ у обработанных животных При этом дозозависимый эффект во всех используемых концентрациях отсутствовал Таким образом, очищенный продигиозин в изученных концентрациях не является позитивным индуктором микроядер и не обладает существенным генотоксическим эффектом ш vitro

ВЫВОДЫ

1 Штаммы Serrada marcescens АТСС 9986 и ВКМБ-851 являются перспективными продуцентами продигиозина Модифицированная среда Кинга А рекомендуется для получения продигиозина при использовании в качестве продуцентов штаммов Serrana marcescens АТСС 9986 и ВКМБ-851

2 Применяемый в работе метод очистки пигментного препарата позволяет получить высокоочищенный продигиозин, что подтверждено методами тонкослойной хроматографии, ядерного магнитного резонанса и масс-спектрометрии

3 Продигиозин (0 1мкг/мл - 2мкг/мл) оказывает существенное токсическое воздействие на растения, выражающееся в ингибировании прорастания корней и накопления биомассы, на тестерный штамм Paramecium caudatum и фитопатогенные микромицеты родов Fusarium и Alternaría Очистка продигиозина приводит к усилению его фунгицидного эффекта и фитотоксичности, но снижает токсический потенциал по отношению к простейшим

4 Результаты изучения генотоксичности очищенного продигиозина в тесте Эймса и микроядерном тесте на эритроцитах мышей позволяют причислить продигиозин к веществам с незначительной мутагенной активностью

5 Возможно использование продигиозина в качестве фунгицидного агента для защиты растений от фитопатогенных микромицетов в концентрациях от 0 05 мкг/мл до 0 1 мкг/мл, не оказывающих фитотоксическое воздействие

6 Препарат продигиозина может быть использован для маркирования различных нефтепродуктов, где его содержание определяется по интенсивности характерных спектральных линий в области длин волн Л.=300 бООнм при рН ниже 7, в отсутствие проявляющих реактивов

Список работ, опубликованных по теме диссертации

1. Гурьянов И.Д. Токсикологические эффекты продигиозина / ИД Гурьянов, Д В Юсупова // Ученые записки Казанского государственного университета Сер Естественные науки - 2008 -Т150, Кн 2 - С 120125

2 Гурьянов И.Д. Очистка и характеристика пигментного препарата продигиозина /ИД Гурьянов, Д В Юсупова, В В Клочков, А Р Юльметов // Естественные и технические науки — 2008 - №3 - С 64-65

3 Гурьянов И.Д. Фитотоксические свойства продигиозина Serratia marcescens /ИД Гурьянов, Д В Юсупова // Защита и карантин растений -2008 - №4 - С 58

4 Гурьянов И.Д., Науменко Е А Токсикологические эффекты продигиозина Serratia marcescens / Казанск roc ун-т - Казань, - 2007 — 9 с - Деп в ВИНИТИ 11 01 07, № 27

5 Юсупова Д В Способ идентификации маркированных нефтепродуктов / Д В Юсупова, Л А Габдрахманова, M А Куркина, И.Д. Гурьянов // Заявка на патент C10L1/00, С10М159/02, C10N30 20, Заявка № 2007135940/04(039293), с приоритетом от 27 09 07

6 Юсупова Д В Способ получения пигмента / Д В Юсупова, Л А Габдрахманова, И.Д. Гурьянов, M А Куркина, А И Албулов, M А Фролова, И Г Ермишина // Заявка на патент С10М159/02, С12 N 1/20 , Заявка № 2007138501/13(042117), с приоритетом от 08 10 07

7 Рязанцева И H Бактериальные пигменты в биотехнологии / И H Рязанцева, И H Андреева, Ч Б Медведева, Т И Огородникова, H H Валиева, И Д. Гурьянов // Тез докл 2-я международная конференция «Наука-бизнес-образование биотехнология-биомедицина-окружающая среда» -Пущино, -2005 -С42

8 Иванчина Ю В Подбор условий оптимальных для биосинтеза пигмента продигиозина энтеробактериями Serratia marcescens / Ю В Иванчина, MA Куркина, И.Д. Гурьянов // Тез докл 10-я Пущинская школа-конференция молодых ученых «Биология наука XXI века» -Пущино, - 2006 - С 372

9 Гурьянов И.Д. Оптимизация питательных сред для получения пигмента продигиозина Serratia marcescens /ИД Гурьянов, M А Куркина // Тез докл XLV международной научной студенческой конференции «Студент и научно-технический прогресс» - Новосибирск, - 2007 -С 109-111

10 Гурьянов И.Д. Токсические и мутагенные эффекты бактериального пигмента продигиозина /ИД Гурьянов, Д В Юсупова // Тез докл региональной научно-практической конференции «Синтез и перспективы использования новых биологически активных соединений» - Казань, -2007 - С.73-75

11 Куркина M А Разработка эффективной биотехнологии получения бактериального пигмента продигиозина / M А Куркина, И.Д. Гурьянов,

23

Д.В Юсупова // Тез докл VII научная конференция молодых ученых, аспирантов и студентов научно-образовательного центра КГУ «Материалы и технологии XXI века» - Казань, - 2007 - С 67

Отпечатано « ООО «Печатный двор» г Казань, уя Журналистов, 1/16, оф 207

Тел 272-74-59,541-76-41,541-76-51 Лицензия ПД№7-0215 от Ol 11 2001 г Выдана Поволжским межрегиональным территориальнымуправчением МПТР РФ Подписано в печать 21 08.2008г Уел п л 1,5 Заказ МК-6561 Тираж 100 зкз Формат 60x841/16 Бумага офсетная Печать - ризография

Содержание диссертации, кандидата биологических наук, Гурьянов, Иван Дмитриевич

Список сокращений

ВВЕДЕНИЕ

1 ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1 Характеристика Serratia marcescens

1.2 Бактериальный пигмент продигиозин

1.2.1 Биосинтез продигиозина

1.2.2 Питательные среды и условия культивирования ^ оптимальные для биосинтеза продигиозина

1.2.3 Локализация пигмента в клетках S. marcescens

1.2.4 Методы экстракции и идентификации продигиозина

1.2.5 Биологическое значение продигиозина в жизни продуцента и ^ практическое использование

1.2.6 Цитотоксичность продигиозина

1.3 Продигиозинподобные пигменты

1.4 Биологические маркеры для нефтепродуктов

1.5 Стратегия исследований генотоксичности соединений 46 ЗАКЛЮЧЕНИЕ 48 ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ

2 МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

2.1 Объекты исследования

2.2 Использованные материалы

2.3 Условия культивирования, определение продуктивности

2.4 Определение концентрации продигиозина

2.5 Получение продигиозина и его экстракционная очистка

2.6 Очистка пигментного препарата

2.6.1 Жидкостная хроматография

2.6.2 Тонкослойная хроматография (ТСХ)

2.7 Физико-химические методы анализа очищенного продигиозина

2.8 Оценка антагонистической активности Serratia marcescens

2.9 Оценка фунгицидной активности препаратов продигиозина

2.10 Методы оценки токсичности

2.10.1 Оценка влияния препаратов продигиозина на рост корней растении

2.10.2 Оценка влияния препаратов продигиозина на накопление биомассы растений

2.10.3 Определение острой летальной токсичности на тест-объекте Paramecium caudatum

2.11 Методы оценки генотоксичности

2.11.1 Тест на токсичность по отношению к Salmonella typhimurium

2.11.2 Полуколичественный метод учета генных мутаций (тест Эймса)

2.11.3 Микроядерный тест на эритроцитах периферической крови мышей in vivo

2.12 Маркирование и идентификация маркированных нефтепродуктов

2.13 Статистическая обработка результатов 3 РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЙ

3.1 Подбор высокопродуктивных штаммов

3.1.1 Сравнительная характеристика роста и пигментообразования исследуемых штаммов S. marcescens

3.2 Подбор оптимальной питательной среды

3.2.1 Образование продигиозина при культивировании бактерий на различных средах

3.2.2 Рост и образование продигиозина

Serratia marcescens на модифицированной среде Кинга А

3.2.3 Рост и образование продигиозина Serratia marcescens на модифицированной пептон-глицериновой среде

3.3 Определение оптимального количества посевного материала

3.4 Подбор метода экстракции пигмента из клеток

3.5 Выделение и очистка пигментного препарата продигиозина, его характеристика

3.5.1 Жидкостная хроматография

3.5.2 Тонкослойная хроматография

3.6 Продигиозин, как фактор антагонистической активности S. marcescens

3.6.1 Антагонистическая активность S. marcescens

3.6.2 Характеристика роста фитопатогенных микромицетов на питательных средах с добавлением пигментных препаратов

3.7 Токсическое воздействие препаратов продигиозина на прорастание семян и накопление биомассы растений

3.8 Определение острой летальной токсичности ^ на тест-объекте Paramecium caudatum

3.9 Токсические эффекты продигиозина ^ по отношению к микроорганизмам

3.10 Индукция генных мутаций пигментными препаратами в тесте ^ Эймса

3.11 Микроядерный тест на эритроцитах ^у периферической крови мышей in vivo

3.12 Возможное практическое применение продигиозина 98 3.12.1 Маркирование нефтепродуктов продигиозином ^g и способ идентификации маркированных нефтепродуктов

4 ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ

ВЫВОДЫ

Благодарности

Введение Диссертация по биологии, на тему "Биосинтез, очистка и практическое применение продигиозина-пигмента Serratia Marcescens"

Актуальность проблемы. Большинство работ, в области изучения бактериальных пигментов посвящено фототрофам, в то время, как пигменты нефотосинтезирующих микроорганизмов изучены в значительно меньшей степени. Ярко-красный пигмент продигиозин, синтезируемый энтеробактериями Serratia marcescens, представляет собой линейный трипиррол (пиррол, 3-метоксипиррол, 2-метил-З-амилпиррол). Как и многие вторичные метаболиты бактерий, продигиозин приобретает практическое значение в промышленности и медицине. В промышленности продигиозин рекомендуется в качестве красителя для полимеров, поскольку он обладает рядом преимуществ по сравнению с применяемыми в настоящее время органическими и неорганическими пигментами. Разработан способ использования продигиозина для маркирования нефтепродуктов [Гарейшина с соавт., 2003]. Пигмент хорошо растворим в различных марках топлива и легко обнаруживается по характерному спектру поглощения. Продигиозин и продигиозинподобные пигменты, синтезируемые некоторыми видами микроорганизмов, рассматриваются как новое семейство противоопухолевых лекарственных препаратов [Montaner et al., 2000; Llagostera et al., 2005]. Показано, что продигиозин действует, как иммунодепрессант, селективно блокируя пролиферацию Т-клеток киллеров [Han et al., 1998; Azuma et al., 2000], избирательно индуцирует апоптоз различных типов злокачественных клеток [Montaner, Perez-Tomas, 2001; Campas et al., 2003], ингибирует образование метастаз, обладает антиинвазивными свойствами [Perez-Tomas et al., 2003].

В связи с большой практической значимостью продигиозина возникает необходимость в наработке больших количеств пигмента и снижении его стоимости. Высокая стоимость пигмента тормозит, в частности, использование его в качестве маркера нефтепродуктов. Кроме 6 того, неизученным остается вопрос о мутагенности, генетической токсичности продигиозина. Для изучения этих свойств необходимы высокоочищенные препараты продигиозина. В представленной работе предполагается разработать эффективную схему получения продигиозина и изучить некоторые биологические эффекты пигмента.

Цель и задачи исследований. Цель данной работы состояла в следующем: разработать эффективную схему получения бактериального пигмента продигиозина; определить его токсические и генотоксические свойства и установить возможности практического применения. В соответствии с поставленной целью решались следующие задачи:

• подобрать высокопродуктивные по биосинтезу пигмента продигиозина штаммы Serratia marcescens, оптимизировать питательную среду и условия культивирования для получения продигиозина в лабораторных и полупромышленных масштабах;

• получить и охарактеризовать высокоочищенный пигментный препарат с привлечением физико-химических методов;

• установить токсичные и безопасные концентрации продигиозина для растений, простейших и микроорганизмов;

• определить мутагенные свойства препаратов продигиозина с использованием основных методов генетической токсикологии;

• определить возможность применения пигмента в качестве фунгицидного агента для защиты растений от фитопатогенных микромицетов;

• оценить возможность и перспективность использования продигиозина в качестве биологического маркера нефтепродуктов и разработать более точный метод идентификации маркера. Научная новизна. Проведена сравнительная оценка токсичности пигментных препаратов по отношению к прокариотическим и эукариотическим организмам. Получены приоритетные данные о генотоксических эффектах продигиозина. Показано отсутствие генотоксического воздействия очищенного продигиозина в тесте Эймса и микроядерном тесте in vivo. Определены антагонистические свойства продигиозина в отношении фитопатогенных микромицетов, Оценка возможности применения пигмента в качестве фунгицидного агента для защиты растений проведена с учетом определения эффективной и безопасной концентрации продигиозина.

Практическая значимость. Разработана дешевая, простая в приготовлении питательная среда для культивирования Serratia marcescens — штамма-продуцента продигиозина, способствующая высокому выходу пигмента. Разработан метод получения высокоочищенного пигментного препарата. С учетом использования продигиозина в различных отраслях биотехнологии (красителя полимеров, маркера нефтепродуктов) результаты, полученные в данной работе, позволяют определить возможную экологическую опасность при попадании пигмента и связанных с ним продуктов производства в окружающую среду. Выявленная фунгицидная активность продигиозина, как одно из проявлений токсического эффекта, может служить аргументом в пользу разработки методов применения данного препарата для защиты сельскохозяйственных растений от фитопатогенов. Упрощенный метод идентификации продигиозина и хорошая растворимость в различных марках топлива позволяют рекомендовать пигмент в качестве маркера нефтепродуктов.

Связь работы с научными программами и собственный вклад автора в исследования. Исследования автора по тематике диссертационной работы поддержаны федеральными программами «Развитие научного потенциала высшей школы» РНП.2.1.1.1005, РНП.2.1.1.3222. Грант АН РТ, № 03-3.5-33/ 2006 (Г) 2006 г. Индивидуальный грант КГУ (2008). Научные положения диссертации и выводы базируются на результатах собственных исследований автора. 8

Масс-спектроскопические исследования проведены в лаборатории ИОФХ им. Арбузова. Микроядерный тест проведен в лаборатории ИОФХ им. Арбузова.

Положения, выносимые на защиту:

1. Разработана эффективная схема получения продигиозина; с применением хроматографических методов получен и охарактеризован препарат продигиозина высокой степени очистки.

2. В тестах in vitro и in vivo впервые установлены особенности генотоксического влияния продигиозина, определена возможность возникновения мутаций в клетках Salmonella typhimurium ТА 100 и индукции хромосомных повреждений эритробластов у млекопитающих.

3. Установлены антагонистическая активность штамма Serratia marcescens АТСС 9986 и фунгицидная активность продигиозина. Определены эффективные нетоксичные концентрации пигмента при использовании продигиозина для защиты растений. ^

4. Разработан и рекомендуется к применению новый способ идентификации нефтепродуктов, маркированных пигментом.

Апробация работы. Материалы диссертации доложены и обсуждены на: 2-й международной конференции «Наука-бизнес-образование биотехнология-биомедицина-окружающая среда» (Пущино, 2005), 10-й Пущинской школе-конференции молодых ученых «Биология наука XXI века» (Пущино, 2006), XLV международной научной студенческой конференции «Студент и научно-технический прогресс» (Новосибирск, 2007), Региональной научно-практической конференции «Синтез и перспективы использования новых биологически активных соединений» (Казань, 2007), Научной конференции молодых ученых, аспирантов и студентов научно-образовательного центра КГУ «Материалы и технологии XXI века» (Казань, 2007), I международной практическая конференция «Микробная биотехнология - новые подходы и решения» (Казань, 2007).

Публикации. По теме диссертации опубликовано 11 научных работ. 9

Структура и объем диссертации. Работа изложена на 142 страницах, содержит 8 таблиц и 44 рисунка и состоит из введения, обзора литературы, описания материалов и методов, результатов исследований, обсуждения результатов, выводов и списка литературы, включающего 163 источников, из них 133 на иностранном языке и приложения.

Заключение Диссертация по теме "Микробиология", Гурьянов, Иван Дмитриевич

выводы

1. Штаммы Serratia marcescens АТСС 9986 и ВКМ В-851 являются перспективными продуцентами продигиозина. Модифицированная среда Кинга А рекомендуется для получения продигиозина при использовании в качестве продуцентов штаммов Serratia marcescens АТСС 9986 и ВКМ В-851.

2. Применяемый в работе метод очистки пигментного препарата позволяет получить высокоочищенный продигиозин, что подтверждено методами тонкослойной хроматографии, ядерного магнитного резонанса и масс-спектрометр ии.

3. Продигиозин (0.1мкг/мл - 2мкг/мл) оказывает существенное токсическое воздействие на растения, выражающееся в ингибировании прорастания корней и накопления биомассы; на тестерный штамм Paramecium caudatum и фитопатогенные микромицеты родов Fusarium и Alternaria. Очистка продигиозина приводит к усилению его фунгицидного эффекта и фитотоксичности, но снижает токсический потенциал по отношению к простейшим.

4. Результаты изучения генотоксичности очищенного продигиозина в тесте Эймса и микроядерном тесте на эритроцитах мышей позволяют причислить продигиозин к веществам с незначительной мутагенной активностью.

5. Возможно использование продигиозина в качестве фунгицидного агента для защиты растений от фитопатогенных микромицетов в концентрациях от 0.05 мкг/мл до 0.1 мкг/мл, не оказывающих фитотоксическое воздействие.

6. Препарат продигиозина может быть использован для маркирования различных нефтепродуктов, где его содержание определяется по интенсивности характерных спектральных линий в области длин волн

А=300.600нм при рН ниже 7, в отсутствие проявляющих реактивов.

114

Благодарности

Автор выражает огромную благодарность своему научному руководителю к.б.н. Юсуповой Дельбэр Вафовне за предоставление интересной темы диссертационной работы и научное руководство.

Автор также благодарит:

Клочкова В.В. за проведение ЯМР-спектроскопии,

Карамову Н.С. и Маргулис А.Б. за помощь в освоении методов генетической токсикологии

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

Обзор литературы показывает, что основные сведения о продигиозине были получены исследователями в первой половине прошлого столетия: расшифрована структурная формула пигмента, получены высокоочищенные препараты пигмента и изучены его основные свойства, установлены основные этапы биосинтеза.

В 90-е годы прошлого века исследователи вновь заинтересовались продигиозином и продигиозинподобными пигментами в связи с обнаружением иммунносупрессивной и противоопухолевой активности этих соединений. В многочисленных работах исследуются механизмы противоопухолевого действия продигиозинов, регуляции биосинтеза на генетическом уровне, клонирован кластер генов, кодирующих пигмент. Результаты изучения противоопухолевой активности продигиозинов говорят о том, что продигиозины представляют собой новый многообещающий класс противоопухолевых препаратов для фармакологической индустрии. Разрабатывается программа по созданию синтетических продигиозинов с меньшей токсичностью. Одновременно разрабатываются методы использования продигиозина в промышленности в качестве красителя и маркера.

Из всего выше сказанного следует, что на сегодняшний день продигиозин имеет практическую значимость, и актуальными становятся работы по разработке новых дешевых производственных питательных сред и новых методов, стимулирующих рост и биосинтез пигмента бактериями. Большое значение приобретает также изучение влияния продигиозина на организмы различного эволюционного уровня при попадании пигмента в окружающую среду, выяснение его токсических и генотоксических эффектов.

ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ

2 МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

2.1 Объекты исследования

Отбор высокоэффективных продуцентов пигмента, проводили среди штаммов Serratia marcescens из коллекции НИЛ ББФ Казанского университета (табл. 1).

Библиография Диссертация по биологии, кандидата биологических наук, Гурьянов, Иван Дмитриевич, Казань

1. Воробьева, Л.И. Промышленная микробиология Текст. / Л.И.Воробьева.- Москва: Изд-во Моск. ун-та, 1989.-С.115-118.

2. Габутдинов, М.С. Полимерная красящая композиция-концентрат Текст. / М.С. Габутдинов, И.Н. Рязанцева, И.Ф. Черевин и др. -Патент Р.Ф. № 2129136,по заявке № 97106747 с приоритетом от 23.04.97.

3. Дубинин, Н.П. Новое в современной генетике Текст. / Н.П.Дубинин //- М.: 1986. -С. 12-15.

4. Егоров, Н.С. Практикум по микробиологии Текст. / Н.С. Егоров.-Москва: Изд-во Моск. ун-та, 1976.-С.153-154.

5. Знаменская, Л.В. Влияние неорганического фосфата на рост и биосинтез щелочной внеклеточной РНКазы Bacillus intermedius Текст. / Л.В. Знаменская, М. Н. Капранова, Г.И. Клейнер, И.Б. Лещинская // Микробиология. 1982. - Т.51, №5. - С.776-779.

6. Ильинская, О.Н. Краткосрочные тест-системы для определения генотоксичности. Методическое руководство / О.Н. Ильинская, А.Б. Маргулис. Казань: Изд-во Казан, ун-та, 2005. - 31с.

7. Казанская, Т.Б. Микробиология Текст. // Т.Б. Казанская, Р.П. Анохина. 1974. - Т.43. - С.546-547.

8. Красители для бензинов и ДТ. ООО «РУСКОЛОР» Электронныйресурс. 2008. — Режим доступа :http://www.euromarker.ru/kras benzin/ Дата доступа : 12.05.2008.116

9. Красители и маркеры для дизельного топлива и бензинов.

10. Компания «НАТЭК-КОЛОР».- 2008.- Режим доступа : http://www.natec-color.ru/prod.php?id=3 Дата доступа : 12.05.2008.

11. Лещинская, И.Б. Нуклеазы бактерий / И.Б. Лещинская, В.И. Варламов, Б.М. Куриненко Текст. // Нуклеазы бактерий, Казань: Изд-во Казанского университета, 1991, - 232с.

12. Лория, Ж.К., Микробиология Текст. // Ж.К. Лория, Б. Брюннер, Н.С. Егоров. 1977. - Т.46. - С.440-446.

13. Маркеры для нефтепродуктов. ООО «РУСКОЛОР» Электронный ресурс. 2008. - Режим доступа : http://www.euromarker.ru/marker/ -Дата доступа : 12.05.2008.

14. МЗ СССР. Руководящие методические материалы по экспериментальному и клиническому испытанию новых лекарственных средств. — М.: 1982. С.21-59.

15. Определитель бактерий Берджи в 2-х томах / перевод с англ. под ред. Дж. Хоулта, Н. Крига, П. Снипа, Дж. Стейли, С. Уильямса // М.: Мир (перевод 9 американского издания, 1994), 1997, Т.1, - 432с.

16. Официальный сайт компании «ЛУКОЙЛ» Электронный ресурс. -2008. Режим доступа : http://www.lukoil.ru.- Дата доступа : 12.05.08.

17. Северина, Л.О. Липазы грамотрицательных бактерий Текст. / Л.О. Северина, Н.А. Башкатова // Прикладная биохим.микробиол., 1981, -Т. 17, вып.2,-С.181-196.

18. Трутко, С.М. Роль процесса биосинтеза продигиозина в регуляции окислительного обмена продуцента Текст. / С.М. Трутко, В.К. Акименко // Микробиология. 1989. - Т.58, №3. - С. 723-729.

19. Феофилова, Е.П. Пигменты микроорганизмов Текст. / Е.П. Феофилова. М.: Наука, 1974. - 218 с.

20. Филимонова, М.Н. Эндонуклеаза Serratia marcescens. Характеристика фермента Текст. / М.Н. Филимонова J1.A. Боратова, И.Б. Воспельникова, О.В. Желтова // Биохимия, 1981, - Т.46, №9, -С.1660-1665.

21. Фонштейн, JLM. Методы первичного выявления генетической активности загрязнителей среды с помощью бактериальных тест-систем Текст. / JI.M. Фонштейн, С.К. Абилев, Е.В. Бобринев // Методические указания. М.- 1985.- 34с.

22. Фонштейн, JI.M. Микроорганизмы как индикаторы мутагенной активности химических соединений и их метаболитов Текст. / JI.M. Фонштейн, А.А. Шапиро, С.К. Абилев // Итоги науки и техники ВИНИТИ, сер. Биология.-1975,- №5,- 690с.

23. Хроматография в тонких слоях Текст. / под ред. Э. Шталя, пер. с нем. канд. техн. наук М.И. Яновского. М.:Мир, 1965. - 508 с.

24. Чигалейчик, А.Г., Хитиназа Serratia marcescens ВКМБ-851 / А.Г. Чигалейчик, Д.Л. Пириева, С.С. Рылкин // Прикладная биохимия и микробиология. 1976. - Т.12. — С.581-586.

25. Энтеробактерии. Руководство для врачей Текст. / под ред. акад. В.И. Покровского. М.Медицина, 1985. - 319с.

26. Юсупова, Д.В. Индукция синтеза внеклеточной эндонуклеазы Serratia marcescens агентами, подавляющими репликацию ДНК Текст. / Д.В. Юсупова, Р.Б. Соколова, О.В. Порфирьева, А.З. Пономарева//Микробиология, 1991, Т.60, вып.2, - С.279-284.

27. Юсупова, Д.В. Нуклеодеполимеразная активность бактерий в связи с некоторыми особенностями их физиологии Текст. / Д.В. Юсупова //- Казань. Изд.КГУ. 1978. - с.204.

28. Юсупова, Д.В. Питательная среда для выращивания Serratia marcescens 24 — продуцента нуклеазы Текст. / Д.В. Юсупова, Р.Б. Соколова, З.А. Виестуре // Авторское свидетельство №992568, опубликовано 30.01.83. Бюллетень №4.

29. Яснова, JI.H. Изучение динамики накопления экстрацеллюлярных белков Serratia marcescens и их нуклеазной активности в процессе роста клеток Текст. / JI.H. Яснова, Л.И. Пучкова // Микробиология. -1976. Т.45. - С.979-983.

30. Akatsuka, Н. Lipase secretion by bacterial hybrid ATP-binding cassette exporters: molecular recognition of the Lip BCD, Prt DE Fand Has DEF exportes Text. / H. Akatsuka, R. Biner, E. Kawai, et al. // J.Bacteriol. -1997. V.179. P.4754-4760.

31. Akatsuka, H. Overproduction of the extracellular lipase is closely related to that of metallopotease in Serratia marcescens Text. / H. Akatsuka, E. Kawai, K. Omori, S. Komatsubara et al. // J. Ferment.Bioeng. 1996. V.81. - P.l 15-120.

32. Ames, B. N. Mutagenesis and carcinogenesis: endogenous and exogenous factors Text. / B. N. Ames // Environ. Mol. Mutagen. 1989. - V. 14. N. 16.- P. 66-77.

33. Ames, B.N. Durston An improved bacterial test system for defection and classification of mutagens and carcinogens Text. / B.N. Ames, F.D. Lee // Procl. Nac. Akad. Sci. USA. 1973. - V.70.N.3. - P.782.

34. Ang, S. The role of RsmA in the regulation of swarming motility in Serratia marcescens Text. / S. Ang, Yu-Tze Horng, Jwu-Ching Shu, Po-Chi Soo, Jia-Hurng Liu // J. Biomed. Sci. 2001. - V.8. N2. - P.160-169.

35. Arab, S. Verotoxin induces apoptosis and the complete, rapid, long-term elimination of human astrocytoma xenografts in nude mice Text. / S. Arab, J. Rutka, C. Lingwood // Oncol. Res. 1999. - V.l 1. - P.33-39.

36. Arab, S. Verotoxins inhibit the growth of and induce apoptosis in human astrocytoma cells Text. / S. Arab, M. Murakami, P. Dirks, B. Boyd, S. Hubbard, D. Lingwood, J. Rutka // J. Neurol. Oncol. 1998. - V.40. -P.137-150.

37. Ashby J., Tennant R.W. Definitive relationships among chemical structure, carcinogenicity and mutagenesity for 301 chemicals tested by the US NTP Text. / J. Ashby, R.W. Tennant // Mut. Res. 1991. - V.257. -P.229-306.

38. Azuma, T. Induction of apoptosis of activated murine splenic T-cells by cycloprodigiosin hydrochloride, a novel immunosuppressant Text. / T. Azuma, N. Watanabe, H. Jagisawa, M. Iwamura, J. Kobayashi // Immunopharmacology. 2000. - V.46. N.l. - P. 29-37.

39. Ball Т.К. Disulfide bound are required for Serratia marcescens nuclease activity Text. / Т.К. Ball, J. Suh, M.Y. Benedik // Nac. Acids. Res. -1992. V.20. - P.4971-4974.

40. Ball, Т.К. Expression of Serratia marcescens extracellular proteins required recA Text. / Т.К. Ball, C.H. Washmuth, S.C. Braunagel, M.Y. Benedik//J. Bacterid., 1990, V.l72. N.l. - P.342-349.

41. Ball, Т.К. The extracellular nuclease gene of Serratia marcescens and its secretion from Esherichia coli Text. / Т.К. Ball, P.H. Saurugger, M.Y. Benedik// Gene, 1987. V.57. - P.l 15-120.

42. Banat, I.M. Potential applications of microbial surfactants Text. / I.M. Banat, R.S. Makkar, S.S. Cameotra // Appl. Microbiol. Biotechnol. 2000. -V.53.-P. 495-508.

43. Barret J.C. Mechanisms of multistep cancerogenesis and carcinogen risk assessment Text. / J.C. Barret // Environ. Heals. Perspect. 1993. -V.100. - P.9-20.

44. Benedik, M.Y. Serratia marcescens and its extracellular nuclease Text. / M.Y. Benedik, U. Struch // FEMS Microbiol.Lett., 1998. - V.165. N.l. -P.l-13.

45. Bradford, M.M. A rapid and sensitive method for quantitation of microgram quantities of protein utilizing the principles of protein-dye binding Text. / M.M. Bradford // Anal.Biochem. V.2. - P.248-254.

46. Brown, J.M. Apoptosis, p53 and tumor cell sensitivity to anticancer agents Text. / J.M. Brown, B.G. Wouters // Cancer Res. 1999. - V.59. -P.1391-1399.

47. Brown, M.R.W. Low magnesium and phospholipid content of cell wall of Pseudomonas aeruginosa resistant to polymyxin Text. / M.R.W. Brown, W.M. Watkins // Nature (London) 1970. - V. 227. - P. 13601361.

48. Brurberg, M.B. Chitinase В from Serratia marcescens BYJ 200 is exportet to the periplasm without processing Text. / M.B. Brurberg, J.H. Eijsink, A.Y. Heandrik et al. // Microbiol., 1995. - V.141. N.2. - P.123-131.

49. Bunting, M.J. A description of some color variants produced by Serratia marcescens strain 274 Text. / M.J. Bunting// J.Bacteriol.-1940. -V.40. N.2 P.57-62.

50. Cameron, R. Mollecular cellular and tissue reactions of apoptosis and their modulation by drugs Text. / R. Cameron, G. Feuer // Exp. Pharmacol. 2000. - V.142. - P.37-57.

51. Campas, С. Prodigiosin induces apoptosisof В and T cells from B-cell chronic lymphocytic leukemia Text. / C. Campas, M. Dalmau, B. Montaner, M. Barragan, B. Bellosillo, D. Colomer, G. Pons, R. Perez-Tomas, J. Gil, //Leukemia. -2003. V.17. - P.746-750.

52. Castro, A.J. Products from Serratia marcescens Text. / A.J. Castro, A.H. Corwin, FJ. Waxham, A.Z. Beilby // J. Organic. Chem. 1959. -V.24.N.4.-P. 455-459.

53. Chawrai, S.R. Chemoenzymatic synthesis of prodigiosin analogues -exploring the substrate specificity of Pig С Text. / S.R. Chawrai, N.R. Williamson, G.P.C. Salmond, F.J. Leeper // Chem. Commun. Camb. -2008. V.28. N.16. — P. 1862-1864.

54. Chang, S. High production of prodigiosin by Serratia marcescens grown on ethanol Text. / S Chang, M Sanada, О Johdo, S Ohta, Y Nagamatsu, A Yoshimoto // Biotech Lett. 2000. - V.22. - P. 1761-1765

55. Chen, E. Frequent mutations in the p53 tumor suppressor gene in human leukemia T-cell lines Text. / E. Chen, M. Haas // Mol. Cell Biol. 1990. -V.10. -,P.5502-5509.

56. Dfaz-Ruiz, C. Prodigiosin induces cell death and morphological changes indicative of apoptosis in gastric cancer cell line HGT-1 Text. / C. Diaz-Ruiz, B. Montaner, R. Perez-Tomas // Histol. Histopathol. 2001, - V. 16. -P.415^121.

57. Filimonova, M.N. Kinetic studies of the Serratia marcescens extracellular nuclease isoforms Text. / M.N. Filimonova, K.L. Krause, MJ. Benedik // Biochem. Mol. Biol. Int. 1994. -V.33. N.6. - P.1229-1236.

58. Francisco, R. Mechanisms of prodigiosin cytotoxicity in human neuroblastoma cell lines Text. / R. Francisco, R. Perez-Tomas, P. Gimenez-Bonafe, V. Soto-Cerrato, P. Gim6nez-Xavier, S. Ambrosio // European J. Pharmacol. 2007. - V.572. - P.l 11-119.

59. Friedhoff P. Kinetic analisis of the cleavage of natural and synthetic substrates by the Serratia marcescens Text. / P. Friedhoff, Y. Meiss, B. Kolmes et al. // Ew. J. Biochem. 1996. - V.241. - P.572-580.

60. Fuqua, C. Census and consensus in bacterial ecosystems: the LuxR-LuxI family of quorum-sensing transcriptional regulators Text. / C. Fuqua, S.C. Winans, E.P. Greenberg // Annu. Rev. Microbiol. 1996. - v.50. - P.727-751.

61. Garthoff, B. Alternative testing drug research and development the validation issue Text. / B. Garthoff// Toxicol., - 1995, - V.9, - P.789-793.

62. Giri, A. V. A novel medium for the enhanced cell growth and production of prodigiosin from Serratia marcescens isolated from soil Text. / A. V. Giri, N. Anandkumar, G. Muthukumaran, G. Pennathur // BMC Microbiol. 2004. - V.4. N1. - P.1-11.

63. Gold L.S. Comparison of target organs of carcinogenicity for mutagenic and non-mutagenic chemicals Text. / L.S. Gold, Т.Н. Slone, B.R. Stern, L. Bernstein // Mut. Res. 1993. - V.286. -P.75-100.

64. Goldschmidt, M.C. Inhibition by temperature of the terminal step in biosynthesis of prodigiosine Text. / M.C. Goldschmidt, C.L. Gott, R.P. Williams // J. Bacteriol. Proc. 1965. -P.92 - 94.

65. Gott, C.L. Amino acid requirement for temperature induced pigmentation in Serratia marcescens Text. / C.L. Gott, R.P. Williams // Texas Rept. Biol. Med. 1964. - V. 22. - P. 225-230.

66. Green, J.A. Studies on pigmentation of Serratia marcescens. IV. Analysis of syntrophic pigment Text. / J.A. Green, R.P. Williams // J. Bacteriol. 1957. - V. 74. N.4. - P. 633-636.

67. Grimont, P.A.D. Biotyping of Serratia marcescens and Its Use in Epidemiological Studies Text. / P.A. D. Grimomt, F. Grimont // J. Clinical Microb., 1978. - V.8. —N.l. - P.73-83.

68. Grimont, P.A.D. The genus Serratia Text. / P.A.D. Grimont, F. Grimont //Annu. Rev. Microbiol. 1978. - V.32. -P.221-248.

69. Haddix, P.L. Measurement of mutation to antibiotic resistance: ampicillin resistance in Serratia marcescens Text. / P.L. Haddix, E.T. Paulsen, T.F. Werner // J. College Biology Teaching. 2000. - V.26. - P. 17-21.

70. Hajazi, A. Serratia marcescens Text. / A. Hajazi, F.R. Falkiner // J. Med. Microbiol. 1997. - V.46. - P.903-912.

71. Han, S.B. T-cell specific immunosuppression by prodigiosin isolated from Serratia marcescens Text. /S.B. Han H.M. Kim, Y.H. Kim, C.W. Lee, E.S. Jang and K.H. Son et al. II Int J. Immunopharmacol. 1998. - V. 20.-P.1-13.

72. Haun, M. Biological activities and cytotoxicity of l,3-dihydro-2H-indol-2-one derivatives Text. / M. Haun, M.F. Pereira, M.E. Hofrnann, A. Joyas, V. Campos, L.D. Filardy, S.L. De Castro, N. Duran // Bact.Hemistry, -1992.-V.25.-P.21-25.

73. Hertle, R. Serratia type pore forming toxins Text. / R. Hertle, // Curr Protein Pept Sci. 2000. - V.l. N.l. - P.75-89.

74. Hirakata Y. Serratia species, in particular, Serratia marcescens frequently causes bloodstream infections Text. / Y. Hirakata // Nippon Rinsho. — 2002. V.60. N.l 1. -P.2156-2160.

75. Hoive, W. Transgenic tobacco plants which express the chi A gene from

76. Serratia marcescens have enhanced tolerance to Rhizoctonia solani Text. /124

77. W. Hoive, L. Joe, E. Newbiogin et al. // Transgenic Res., 1994 V.3. -P.90-98.

78. Hubert, R.G. Pigment formation in L-forms of Serratia marcescens / R.G. Hubert, C.S. Potter, G.M. Kalmanson, L.B. Guze // J. Gen. Microb. -1969. V.55. N.2. -P.165-167.

79. Hubbard, R. The biosynthesis of Prodigiosin, the tripyrrylmethene pigment from Bacillus prodigiosus (Serratia marcescens) Text. / R. Hubbard, C. Rimington // Biochem. 1950. - V.46. N.2. - P. 220-225.

80. International Organization for Standardization ISO 11269-1: Soil quality-determination of the effect of pollutans on soil flora. Part 1: Methods for the measurement of inhibition of root growth, 1993.

81. Jones, P. A. Performance of the neutral red uptake assay in the COL-IP A international validation study on alternatives to the rabbit eye irritation test Text. / P.A. Jones // Toxicol. 1999. - V.13. - P.325-333.

82. Kataoka, T. Prodigiosin 25-C uncouples vacuolar type H+-ATPase,inhibits vacuolar acidification and affects glycoprotein processing Text. /125

83. Т. Kataoka, М. Muroi, S. Ohkuma, Т. Waritani, J. Magae, A. Takatsulci, S. Kondo, M. Yamasaki, K. Nagai // FEBS Lett. 1995. - V.359. - P.53-59.

84. Katz, D.S. Detection of pigment precursors in white clinical strains of Serratia marcescens Text. / D.S Katz, RJ. Sobleski // J. Cein. Microbiol. -1979. V.9. N.2. - P. 301-303.

85. King, E.O. Pseudomonas P Agar/King A Medium Text. / O.E. King, M.K. Ward, D.E. Raney // J. Lab. And Clin Med. 1954. - V.44. - P. 301307.

86. Lannigan, R. Increased frequency of acceptance of plasmid deoxyribonucleic acid by a nonpigmented strain of Serratia marcescens Text. / R. Lannigan, L.E. Bryan // Microbios Lett. 1980. - V.13. - P. 123 - 127.

87. Makkar, R.S. An update on the use of unconventional substrates for biosurfactant production and their new applications Text. /R.S. Makkar, S.S. Cameotra // Appl. Microbiol. Biotechnol. 2002. - V.58. - P. 428434.

88. Manderville, R.A. Synthesis, proton-affinity and anti-cancer properties of the prodigiosin-group natural products Text. / R.A. Manderville // Curr. Med. Chem. 2001. - V.l. - P. 195-218.

89. Marks, G.S. Studies of the biosynthesis of prodigiozin in Serratia marcescens Text. / G.S. Marks, L. Bogorad // Proc. Nac. Acad. Sci. U. S. I960.-V. 46. N.l.-P. 25-28.

90. Maron, D.M., Revised methods for the Salmonella mutagenicity test Text. / D.M. Maron, B.N. Ames // Mutat. Res. 1983. - V.l 13. -P.173-215.

91. Matsuyama, T. Extracellular vesicle formation and biosufractant production by Serratia marcescens Text. / T. Matsuyama, T.Murakami, M. Fujita et al. // J. Gen. Microbiol. 1986. - V.132. N.4 - P. 865-875.

92. McGowan, S.J. Bacterial production of carbapenems and clavams: evolution of |3 lactam antibiotic pathways Text. / S.J. McGowan // Trends of Microbiol. - 1998. - V.6. - P.203-208.

93. Melo, P.S. Cytotoxicity of prodigiosin and benznidazole on V79 cells Text. / P.S. Melo, N. Duran, M. Haun // Toxicol.Lett., 2000. -V.l 16. - P.237-242.

94. Melvin, M.S. DNA binding by 4-methoxypyrrolic natural products. Preference for intercalation at AT sites by tambjamine E and prodigiosin Text. / M.S. Melvin, D.C. Ferguson, N. Lindquist, R.A. Manderville // J. Org. Chem. 1999. - V.64. - P.6861-6869.

95. Miller, M.D. 2.A.A0 Structure for binding to doubl-strendid DNA Text. / M.D. Miller, Y. Tanmer, M. Alpaugh et al. // Nat. Structural. Biology. 1994.-V.l.-P.461-468.

96. Miller, M.D. Identification of the Serratia endonuclease dimer: structural basis and implication for catalysis Text. / M.D. Miller, K.L. Krause // Protein. Sci. 1996. - V.5. - P.24-33.

97. Monreal, Y. The chitinase of Serratia marcescens Text. / Y. Monreal, E. Rese // Can J.Microbiol. 1969. - V.l 5. N.7. - P.689-696.

98. Montaner, B. Activation of protein kinase С is required for protection of cells against apoptosis induced by the immunosuppressor prodigiosin Text. / B. Montaner, R. Perez-Tomas // Biochem Pharmcol. — 2002.-V.63. -P.l-7.

99. Montaner, B. DNA Interaction and Dual Topoisomerase I and II1.hibition Properties of the Anti-Tumor Drug Prodigiosin Text. / B.128

100. Montaner, W Castillo-Avila, M. Martinell, R. Ollinger, J Aymami, E. Giralt, R. Perez-Tomas // Toxicol Sci. 2005. - V.85. N.2. - P.870-879.

101. Montaner, B. Prodigiosin from the supernatant of Serratia marcescens induces apoptosis in hematopoietic cancer cell lines Text. / B. Montaner, S. Navarro, M. Piqu<3, M. Viaseca, M. Martinell, E. Giralt // J. Pharmacol. -2000. -V.131. P.585-593.

102. Montaner, B. Prodigiosin induced apoptosis in human colon cancer cell Text. / B. Montaner, R. Perez-Tomas // Life Sci. 2001. - V. 68. N.17.-P. 2025-2036.

103. Montaner, B. The prodigiosins: a new family of anticancer drugs Text. / B. Montaner, R. Perez-Tomas // Curr. Cancer Drug Targets. -2003.-V. 3.N.1.-P. 57-65.

104. Nassif, N. Bacteria quorum sensing in silica matrices Text. / N.Nassif, C.Roux., T.Coradin et al// Materials Chemistry. 2004. - V.14. -P.2264-2268.

105. Ohnishi, Y. Extracellular production of a Serratia marcescens serine protease of in Echerichia coli Text. / Y.Ohnishi, S. Horinouchi // Biosci.Biotechnol.Biochem. 1996. - V.60. N.10. - P.1551-1558.

106. Oiler, A.R. Media effects of sugars on pigmentation and antibioticsusceptibility in Serratia marcescens Text. / A.R Oiler // J. Gen. Appl.

107. Microbiol.- 2006.-V. 52. N. 2. P.l 13-117.129

108. Ordentlich, A. Rhisosphere colonization by Serratia marcescens for the control of sclerotium rolfsii Text. / A. Ordentlich, Y. Eland, J. Chet // Sir.Biol.Biochem. 1987. - V.19. - P.744-751.

109. Perez-Tomas, R. The prodigiosins, proapoptotic drugs with anticancer properties Text. / R. Perez-Tomas, B. Montaner, E. Llagostera, V. Soto-Cerrato // Biochem. Pharm. 2003. - V.66. N.8. - P. 1447-1452.

110. Peter, M.Y. Chitin and chitosan from animal sourses Text. / M.Y. Peter // Biopolimers: Polysaccharides II, Wenheim: Wiley, - VCH, -2002. -P.499-512.

111. Purkayastha, M. Association of pigment with the cell envelop of Serratia marcescens Text. / M.Purkayastha, R.P.Williams//Nature. 1960. - V.187.N.4734. -P.349-350.

112. Qadri, S.M. Induction of prodigiozin biosyntesis after shift-down in temperature of nonprouferation cells of Serratia marcescens Text. / S.M. Qadri, R.P. Williams // Appl. Microbial. 1972. - V. 23. - P. 704709.

113. Raimondi, A. Mutation in Serratia marcescens Amp.С |3 — lactamase producting Text. / A. Raimondi, F. Sistro, H. Nikaido // Aint. Agent. Chemother. 2001. V.45. - P.2231-2339.

114. Rapoport, H. The synthesis of Prodigiosin Text. / H. Rapoport, K.Y. Holden // Proc. National. Acad. Sci. USA. 1962. - V.84. N.20. -P.635-642.

115. Reisner, G.S. Prodigiosin and the metabolism of free amino compounds in Serratia marcescens as a function of iron, marganese and aging Text. / G.S.Reisner// J. Microbiol. 1969. - V.15.-P.405- 408.

116. Rizzo V. Equilibrium and kinetics of rotamer interconversion in immunosuppressant prodigiosin derivatives in solution Text. / V. Rizzo, A. Morelli, V. Pinciroli, D. Sciangula, R. D'Alessio // J. Pharmacol. Sci. -1998. V.88. - P.73-78.

117. Rodrigues, J.A. Cytotoxicity of trans-dehydrocrotonin from Croton cajucara on V79 cells and rat hepatocytes Text. / J.A. Rodrigues, M. Haun, // Planta.Med. 1999. - V.65. - P. 1-5.

118. Santer U. Prodigiosin synthesis in Serratia marcescens: isolation of a pyrrolecontaining precursor Text. / U. Santer, Y. Vogel // BBA. -1956. V.19. N.3. - P.578-579.

119. Sato, T. Prodigiosins as a new group of H+/C1— symporters that uncouple proton translocators Text. / T. Sato, H. Konno, Y. Tanaka, T. Kataoka, K. Nagai, H.H. Wasserman, S. Ohkuma // J. Biol. Chem. 1998. - V.273. - P.21455-21462.

120. Shapira, R. Control of plants diseases by chitinase empulsed from cloned DNA in Echerichia coli Text. / R. Shapira, A. Ordenlich, J. Chet, A. Oppenheim // Phytopat. 1989. - V.79. - P. 1246-1249.

121. Sole, M. The effect of pH on prodigiosin production by non-proliferating cells of Serratia marcescens Text. / M. Sole, N. Plus, A. Francia et al. // Letters in Applied Microbiology. 1994. - V.19. - P. 341344.

122. Sole, M. The role of pH in 'glucose effect' on prodigiosin production by non-proliferating cells of Serratia marcescens Text. / M.Sole, A.Francia, N.Rius et al.// Letter in Microbiology. 1994. -V.25.-P.81-84.

123. Someya, N. Potential of Serratia marcescens strain B2 for biological control of rice sheath blight Text. / N. Someya, M. Nakajima, T. Hibi, K. Akutsu// Biocontrol science and technology. 2005. - V.l5. N. 1. - P.105-109.

124. Suzuki, K. Serratia marcescens 2170 on chitin degradation Text. / K. Suzuki, N. Sugawara, M. Suzuki et al. // Biosci.Biochem., 2005. -V.66. N.2. - P.1075-1083.

125. Tao. Strategy for the Improvement of Prodigiosin Production by a Serratia marcescens Mutant through Fed-Batch Fermentation Text. / Tao, Jin-li, Wang, Xue-dong, Shen, Ya-ling, Wei, Dong-zhi// W. J. Microbiol.

126. Biotechnol. 2005. - V. 21. N.6-7. - P. 969-972.132

127. Thomson, N.R. Biosynthesis of carbapenem antibiotic and prodigiosin pigment in Serratia is under quorum sensing control Text. / N.R. Thomson, M. A. Crow, S.J. McGowan, A. Cox, G.P.C. Salmond // Molecular Microbiology. 2000. - V.36. N.3. - P.539-556.

128. Trias, J. Induction of Yellow Pigmentation in Serratia marcescens Text. / J. Trias, M. Vinas, J. Guinea, J. G. Loren // Apl.Enviroment.Microb, 1988. - V.54. N.12. - P.3138-3141.

129. Vinas, M. Particulate-bound pigment of Serratia marcescens and its association with the cellular enveloped Text. / M. Vinas, J.G. Loren, J. Guinea // Microbios Letters. 1983. - V. 24. N.93. - P. 19-26.

130. Wasserman, H.H. Studies related to the biosinthesis of prodigiosin in Serratia marcescens Text. / H.H. Wasserman, Y.E. Mckeon, U.V. Santer // Biochem. Biophys. Res. Commun. 1960. - V.3. N.2. - P.146-149.

131. Watanabe, T. Genetic analysis of the chitinase system of Serratia marcescens 2170 Text. / T. Watanabe, M. Suzuki, M. Taiyoji, S. Ferrer, M. Regue // J. Bacteriol. 1997. - V. 179. N.22. - P.7111 -7117.

132. Wei, J.H. Enhanced production of prodigiosin like pigment from Serratia marcescens SM delta R by medium improvement and oil — supplementation strategies Text. / J.H Wei, W.C. Chen // J. BiosciBioeng. -2005.-V. 6.-P.616-622.

133. Williams, R.P. Influence of temperature of incubation and type of growth medium on pigmentation in Serratia marcescens Text. / R.P. Williams, C.L. Gott, S.M. Qadri // J.Bacteriol. 1971. - V. 106. N. 2. - P. 438-443.

134. Williams, R.P. Prodigiosin. In Antibiotics Text. / R.P. Williams, W.R. Hearn, D. Gottlieb and P.D. Shaw (ed.) // Springer Verlag., Berlin. - 1967. -V. 2.-P. 410-432.

135. Williams, R.P. Studies on pigmentation of Serratia marcescens Text. / R.P. Williams,C.L.Gott, J.A.Green//J.Bacteriol. 1961. -V.81. N. 3.- P.376-379.

136. Williams, R.P. Ynhibition by temperature of the terminal step in biosinthesis of prodigiosin Text. / R.P. Williams, M.C. Goldschmidt, C.L. Gott // Biochem. Biophys. Res. Commun. 1965. - V.19. N.2. - P. 177181.

137. Williamson, N.R. The biosynthesis and regulation of bacterial prodigiosines Text. / N.R. Williamson, P.C. Fineran, F.J. Leeper, G.P.C. Salmond // Nat. Rev. Microbiol. 2006. - V.4. - P.887-899.

138. Wrede, F. Uber das prodigiosin, der rotten farbstoff dess Bacillus prodigiosus Text. / F. Wrede, O. Hettche // J. Chem. Ber. 1929. - V. 62. -P. 438-443.

139. Yamashita, M. Silika Gel- dependent Production of Prodigiosin and Serrawettins by Serration marcescens in a Liquid Culture Text. / M. Yamashita, Y.Nacagawa, H. and T. Matsuyama// Microbes and Environments. 2001. - V. 16. N. 4. - P.250-254.

140. Yanagida, N.T. Specific excretion of Serratia marcescens protease trough the outer membrane of Esherichia coli Text. / N.T. Yanagida, T. Kosumi, T. Beppu // J.Bacteriol., 1986. - V.166. N.3. -P.937-944.

141. Zhang, J. Antimetastatic effect of prodigiosin through inhibition of tumor invasion Text. / J. Zhang, Y. Shen, J. Liu, D. Wei // Biochem. Pharmacol. 2005. - V.69. N.3. - P.407-414.