Бесплатный автореферат и диссертация по биологии на тему
Биогенные амины в динамике роста микроорганизмов
ВАК РФ 03.02.03, Микробиология
Автореферат диссертации по теме "Биогенные амины в динамике роста микроорганизмов"
МОСКОВСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ
имени М.В. Ломоносова Биологический факультет
На правах рукописи
БИОГЕННЫЕ АМИНЫ В ДИНАМИКЕ РОСТА МИКРООРГАНИЗМОВ
Специальность 03.02.03 - микробиология
Автореферат диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук
ШИШОВ Владимир Александрович
Москва
2010
- 2 ЛЕК 2010
004615614
Работа выполнена на кафедре иммунологии Биологического факультета Московского государственного университета имени М.В. Ломоносова
Научный руководитель
доктор биологических наук ОЛЕСКИН Алескандр Владимирович Официальные оппоненты:
доктор биологических наук ЮДИНА Татьяна Георгиевна кандидат биологических наук НИКОЛАЕВ Юрий Александрович Ведущая организация:
Институт экологии и генетики микроорганизмов Уральского отделения Российской Академии наук
Защита диссертации состоится: «7» декабря 2010 г. в 25.30 на заседании диссертационного совета Д.501.001.21 при Московском государственном университете имени М.В. Ломоносова по адресу: 119991, Москва, Ленинские горы., д.1, корп. 12, Биологический факультет МГУ имени М.В. Ломоносова, ауд. М-1.
С диссертацией можно ознакомиться в библиотеке Биологического факультета МГУ
Автореферат разослан «2» ноября 2010 г. Ученый секретарь ^
диссертационного совета, к.б.н. ^ Н.Ф. ПИСКУНКОВА
Актуальность темы диссертации. Тема диссертации
исследование ростовой динамики накопления биогенных аминов (БА)' в биомассе и культуральной жидкости микроорганизмов - отличается несомненной актуальностью. Она непосредственно связана с одной из самых «горячих» областей современной микробиологии - изучением механизмов межклеточной коммуникации у микроорганизмов. Важным частным случаем межклеточной коммуникации являются quorum sensing-системы, ставящие протекающие в микробной клетке процессы под контроль плотности популяции микроорганизмов. Были охарактеризованы важнейшие типы quorum sensing-феромонов, в том числе функционирующие у энтеробактерий и ряда других микроорганизмов ароматические сигнальные вещества (аутоиндуктор(ы) AI-3), напоминающие по химической структуре катехоламины - одну из групп БА, функционирующих в качестве нейромедиаторов и гормонов у животных и человека.
Вопрос о роли БА в микробных системах был длительное время предметом внимания исследователей - проф. М. Лайта (университет Манкато, США), групп Г.И. Фрайкина и А.В. Олескина (биологический факультет, МГУ) и др. Продемонстрировано, что БА вызывают стимуляцию роста микроорганизмов, обусловливают структурные эффекты в микробных системах, в частности, усиливают или, напротив, ослабляют агрегацию клеток в колониях, влияют на подвижность и (в случае патогенов) вирулентность микроорганизмов, а также на формирование микробных биоплёнок (Sperandio et al., 2003; Clarke et al., 2006; Анучин и др., 2008). Клетки про- и эукариотических микроорганизмов содержат БА,
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
БА - биогенные амины; ВЭЖХ - высокоэффективная жидкостная хроматография; ГВК -гомованилиновая кислота; 5-ГИУК - 5-гидроксииндолилуксусная кислота; 5-ГТ -серотонин (5-гидрокситриптамин); ДА - дофамин; ДГФУК - дигидроксифенилуксусная кислота; ЖКТ - желудочно-кишечный тракт; МАО - моноамииооксидаза; НА -норадреналин; КЖ -культуральная жидкость; QS - quorum sensing (система плотностно-зависимой коммуникации у микроорганизмов).
определённые (Цавкелова и др., 2000) методом высокоэффективной жидкостной хроматографии (ВЭЖХ).
Несмотря на эти данные, в наших знаниях о БА у микроорганизмов остаются серьёзные пробелы. В частности, в литературе не были представлены данные о возрастной динамике внутриклеточного содержания нейромедиаторных аминов, т. е. об изменении их концентраций по мере прохождения микробной культурой различных фаз своего роста. Не был решён имеющий теоретическое и прикладное значение вопрос, высвобождаются ли биогенные амины или их продукты в среду культивирования или остаются внутри клеток или во фракции межклеточного матрикса.
Цель диссертации: провести идентификацию нейромедиаторных аминов, а также их предшественников и окисленных продуктов в клетках и культуральной жидкости и выяснить возрастную динамику их содержания в культурах грамотрицательных и грамположительных бактерий, а также одноклеточных эукариот. Задачи диссертации:
1. Количественно определить методом ВЭЖХ биогенные амины (серотонин, дофамин, норадреналин) в биомассе и культуральной жидкости на разных стадиях роста Escherichia coli К-12, Saccharomyces cerevisiae 230 и Bacillus cereus IVB.
2. Количественно определить предшественники и продукты окислительного дезаминирования биогенных аминов в биомассе и культуральной жидкости в динамике роста исследуемых микроорганизмов.
Научная новизна диссертации. В диссертационной работе впервые прослежена динамика концентраций БА, их предшественников и продуктов окисления в биомассе и супернатанте культуральной жикости (КЖ) грамотрицательной (Е. coli) и грамположительной (В. cereus) бактерий, а также одноклеточного эукариота S. cerevisiae. На базе полученных данных сделан вывод о биосинтезе и деградации БА в микробных системах с
участием характерных для животных ферментов или их аналогов. В сочетании с данными литературы, наши результаты позволяют выдвинуть гипотезу об ауторегуляторной роли БА в популяциях прокариот и об односторонней регуляции эукариотических объектов (на примере дрожжей) прочими компонентами экосистемы посредством БА и их производных. Практическое значение диссертации. Полученные результаты свидетельствуют о выработке БА, их предшественников и окисленных продуктов важными для человека микроорганизмами - симбионтом Е. coli, потенциальным патогеном В. cereus, а также биотехнологическим объектом S. cerevisiae. Встаёт существенный с медицинской точки зрения вопрос о воздействии микробных БА на организм человека в норме и патологии, а также об опосредованных БА взаимодействиях в пределах населяющего организм микробного сообщества. Некоторые из вырабатываемых взаимодействующими с человеком микроорганизмами соединений проникают через гемато-энцефалический барьер и могут оказывать влияние на деятельность функциональных зон мозга, включая высшие психические функции и социальное поведение людей. Обнаружение БА в КЖ микроорганизмов обусловливает потенциальную перспективность биотехнологического проекта по превращению микробных клеток в фабрики нейромедиаторов или родственных им соединений.
Апробация диссертации. Основные положения диссертации были доложены на конференции по микробиологии на кафедре физиологии микроорганизмов Биологического факультета МГУ (2009), на конференции Микробиологического общества при РАН (2009), неоднократно на заседаниях семинара «Биополитика» (секция МОИП) в 2008-2010 гг. Структура и объем диссертации. Диссертация включает 122 страницы и состоит из введения, обзора литературы, методического раздела, разделов о результатах исследований и их обсуждения, заключения, выводов и списка литературы. Библиография включает 114 источников, в том числе 38 на русском языке и 76 на иностранных языках.
ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
В обзоре литературы тематика экспериментальной части - эндогенные нейромедиаторные амины у микроорганизмов - ставится в контекст популяционно-коммуникативного направления в микробиологии, занятого надклеточной организацией микроорганизмов (причём особое внимание в обзоре уделено биоплёнкам) и межклеточной коммуникацией. В частности, детально обсуждены феромоны (аутоиндукторы) quorum sensing-систем, участвующих в формировании, развитии и распаде биоплёнок, в том числе и существующих в организме человека, в особенности в кишечнике. Отдельно рассматривается воздействие на микроорганизмы биогенных аминов (БА), функционирующих как нейромедиаторы в организме животных и человека. В частности, влияние одной из групп БА - катехоламинов - на рост микробных культур, подвижность клеток, вирулентность (в случае патогенной микрофлоры), образование биоплёнок и др. связано с quorum sensing-системой с аутоиндуктором AI-3 - аналогом катехоламинов (Clarke et al., 2006). Изложены данные предшествующих исследований эффектов БА в микробных системах, выполненных в лаборатории А.В. Олескина (Олескин и др., 1998а, б; 2009а; Цавкелова и др., 2000; Кагарлицкий и др., 2003; Олескин, Кировская, 2006; Анучин и др., 2008).
Завершающий подраздел обзора литературы посвящён имеющимся в литературе данным о содержании БА и их метаболитов в клетках микроорганизмов, в частности, определяемых методом высокоэффективной жидкостной хроматографии (Цавкелова и др., 2000). Показано наличие серотонина в биомассе грамположительных бактерий Bacillus subtilis и Staphylococcus aureus, а катехоламины оказались широко распространены у тестированных прокариот. Однако в литературе до сих пор не представлены данные о возрастной динамике внутриклеточного содержания БА, т. е. об изменении их концентраций по мере прохождения микробной культурой различных фаз своего роста. Не ясно, синтезируются ли детектированные внутри клеток микроорганизмов амины de novo или захватываются клетками
из среды. Не решён вопрос, высвобождаются ли БА или их продукты в среду культивирования или остаются внутри клеток или во фракции межклеточного матрикса. Поиск ответов на все эти вопросы послужил отправной точкой для экспериментальной части настоящей диссертационной работы.
МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
В начале данного раздела охарактеризованы свойства объектов настоящей работы - представители грамотрицательных (Escherichia coli, симбиотический штамм К-12 МС4100) и грамположительных (Bacillus cereus штамм IVB) бактерий, а также одноклеточных эукариот (дрожжи Saccharomyces cerevisiae штамм 230). Эти микроорганизмы имеют очевидное биотехнологическое и биомедицинское значение: кишечная палочка как симбионт в толстом кишечнике человека и продуцент генноинженерных продуктов (инсулин, интерфероны и др.), дрожжи как пробиотик и весьма важный биотехнологический объект, а В. cereus как фактор порчи пищевых продуктов и потенциальный патоген.
Бактерию E.coli К-12 культивировали при 37°С на богатой органической среде Luria-Bertani (LB) или, альтернативно, на синтетической среде М-9 с глюкозой; В. cereus - при 30°С на богатой среде Сабуро; дрожжи S. cerevisiae - при 32°С на среде Сабуро или на синтетической сахарозо-аммонийной среде. Для всех объектов были исследованы кривые их роста (в случае Е. coli и S. cerevisiae - отдельно для каждой из использованных сред), по трём параметрам: 1) оптическая плотность; 2) вес плотного осадка биомассы; 3) вес абсолютно сухой биомассы (АСБ), полученной доведением образца до постоянного веса по стандартной методике (графики приведены в диссертации).
На основе кривых роста выбраны характерные точки, соответствовавшие лаг-фазе, ранней и поздней экспоненциальной фазе и стационарной фазе роста культур: 1) Е. coli, среда LB: 1.5; 3; 6; 24 часа; 2) Е. coli, среда М-9: 2; 5;
8; 24 часа; 3) В. сегеи.ч: 1; 3; 8; 24 часа; 4) 5. сеге\ч5!ае, среда Сабуро: 2; 4.5; 8; 24 часа; 5) 5. сеге\т1ае, сахарозо-аммонийная среда: 2; 5; 9; 24 часа. За время культивирования (24 часа) избранного штамма В. сегеиз не наблюдалось формирования эндоспор - культура содержала лишь вегетативные клетки. Дрожжевая культура не образовывала псевдомицелий за 24 часа на испытанных средах. Большинство клеток дрожжей на всех стадиях роста были диплоидными (крупными эллипсоидными почкующимися) клетками.
Для количественной детекции низких (в том числе следовых) концентраций веществ необходимы методы, обеспечивающие высокую чувствительность определения примесей при слабой чувствительности к основным веществам в сложных смесях, характерных для микробных систем (бактериальные и дрожжевые клетки), изученных в настоящей работе. Избранный в работе метод амперометрической детекции «основан на измерении электрического тока, возникшего при окислении... анализируемого вещества на поверхности рабочего электрода, находящего под определённым потенциалом» (Яшин, Яшин, 2002. С. 109). БА и их дериваты окисляются при контакте с рабочим стеклоугольным электродом; в частности, катехоламины переходят в ^-хинонимины. Наряду с разделяемыми и регистрируемыми с помощью электрохимической детекции (электродетекции) веществами, анализируемый раствор содержит внутренний стандарт - 3.4-дигидроксибензиламин (ДГБА) в заранее заданной концентрации. Электродетекции предшествует обращенно-фазовая ВЭЖХ в изократическом режиме.
Клетки всех исследованных микроорганизмов отделяли от биомассы центрифугированием в течение 15 мин при 5000 Супернатант
культуральной жидкости (КЖ) собирали, чтобы определить содержание БА также и в ней.
Осаждённую биомассу суспендировали в дистиллированной воде, после чего вновь центрифугировали в течение 15 мин при 5000 g для отмывания компонентов КЖ. Данная методика обеспечивала получение очищенного и
достаточно плотного осадка биомассы влажностью 80-90%, как показало сравнение данных о весе АСБ и сырой биомассы. Биомассу ресуспендировали в буферном растворе, содержавшем 0.5 мкМ 3,4-диоксибензиламин в качестве внутреннего стандарта для последующего определения БА, их предшественников и метаболитов методом ВЭЖХ с электродетекцией. Биомассу охлаждали до 0°С и далее разрушали ультразвуковой обработкой (22 кГц) в течение 2.5 мин (бактерии) или 8 мин (дрожжи), после чего отделяли неразрушенные клетки и фрагменты клеток центрифугированием в течение 15 мин при 10000 g; полноту разрушения клеток контролировали микроскопическим методом. В полученном супернатанте определяли БА.
Необходимо было также определить «фоновые» БА, их предшественники и продукты, вносимые в момент посева культуры со средой и инокулятом. Для этой цели образец среды с только что внесенным инокулятом клеток центрифугировали в течение 15 мин при 5000 g для осаждения клеток. Супернатант собирали для определения БА.
Образцы КЖ, среды или супернатанта разрушенной биомассы в количестве 20 мкл наносили на аналитическую колонку Ultrasphera Cjg, методом прямой инъекции. Определение БА, их предшественников и метаболитов проводили методом ВЭЖХ с электродетекцией на хроматографе LC-304T ("BAS", West Lafayette, США) с инжектором Rheodyne 7125, петля для нанесения образцов 20 мкл.
Изучаемые вещества разделяли на термостатируемой при 25°С обращённо-фазной колонке ReproSil-Pur, ODS-3, 4x100 мм, размер частиц 3 мкм ("Dr.Majsch GMBH", «Элсико», Москва). Был использован насос РМ-80 (BAS, США), скорость элюции подвижной фазы - 1.0 мл/мин, давление 2.0 атм. Мобильная фаза содержала 0.1 М цитратно-фосфатный буфер, с 1.1 мМ октансульфоновой кислоты, 0.1 мМ ЭДТА и 9% ацетонитрила (рН 3.0). Измерение проводили на стеклоугольном электроде (+0.85 V) против Ag/AgCl электрода (Кудрин и др., 1988).
Результаты представляют собой медианы, вычисленные на базе 4-5 опытов, статистическую обработку результатов производили, используя методы экспресс-анализа (Ашмарин, Воробьёв, 1962): метод медианы и критерий Менн-Уитнея. Все концентрации биогенных аминов, их окисленных продуктов и предшественника ДОФА, в КЖ и среде выражали в мкмоль/л (мкМ), в биомассе — в нмолъ/г сырой биомассы (плотный осадок), что соответствует, очевидно, мкмоль/кг биомассы. Эти единицы позволяют сравнивать данные в биомассе и КЖ, ибо 1 л воды имеет вес 1 кг. В диссертации приведены коэффициенты влажности (в %) для каждой культуры, среды и точки кривой роста (всюду - в диапазоне 80-90%).
РЕЗУЛЬТАТЫ
Биогенные амины, их предшественники и продукты в клетках и культуральной жидкости Е. coli К-12. Клетки культуры Е. coli К-12, выращенные на органической среде LB или на синтетической среде М-9, содержали во всех ростовых фазах, помимо детектированного в работе (Цавкелова и др., 2000) дофамина (ДА), также норадреналин (НА) и серотонин (5-ГТ) (рис. 1, А и Б). Биомасса Е. coli содержала вещества, служащие предшественниками БА в организме животных и человека (рис. 2) - 5-гидрокситриптофан (5-ГТР) и диоксифенилаланин (ДОФА), а также характерные продукты окислительного дезаминирования катехоламинов (рис. 3) - дигидродксифенилуксусную кислоту (ДГФУК) и гомованилиновую кислоту (ГВК) и серотонина - 5-гидроксииндолилуксусную кислоту (5-ГИУК). Из рис. 1 видно, что максимальные концентрации нейромедиаторов присутствуют в биомассе в начальных фазах роста культуры Е. coli - в лагфазе или, в случае ДА на среде LB, в ранней экспоненциальной фазе. По мере «старения» культуры наблюдается тенденция к снижению концентраций БА внутри клеток Е. coli.
Преобладающим БА в клетках культуры Е. coli на обеих средах был НА, его максимальная концентрация составляла, по медианам, 1.5 нмоль/г биомассы на среде М-9 и 2.6 нмоль/г биомассы на среде LB. Другой катехоламин, ДА, присутствовал в клетках Е. coli в меньших концентрациях, за исключением только ранней экспоненциальной фазы на среде М-9, когда
1,5
fe 1
=0,5
1
1 •
1
4
Рис. 1. Концентрации БА в биомассе Е. соЧ К-12 на средах М-9 (А) и ЬВ (Б). Подписи на оси абцисс здесь и далее: 1 - лагфаза; 2 - ранняя экспоненциальная фаза; 3 - поздняя экспоненциальная фаза; 4 - стационарная фаза роста.
концентрация ДА незначительно превышала таковую НА. 5-ГТ присутствовал в биомассе Е. coli на обеих средах приблизительно в тех же концентрациях, что ДА, и его содержание также снижалось по мере «старения» культуры.
15 г
10 -
5 -
1
Рис. 2. Концентрации предшественников БА в биомассе Е. coli К-12 на средах М-9 (А) и LB (Б).
Аналогичная закономерность прослеживается и в отношении предшественника серотонина (5-ГТР). Предшественник катехоламинов ДОФА присутствовал на среде М-9 в концентрациях порядка 1 нмоль/г во время лагфазы; эта концентрация возрастала при переходе к экспоненциальной фазе и снижалась к стационарной фазе. Концентрация ДОФА в клетках на стадии лагфазы на среде ЬВ была того же порядка, что и на среде М-9; в дальнейшем эта концентрация снижалась, вновь достигая «лагфазного» уровня в стационарной фазе.
лП
□ ДГФУК
□ гвк
□ 5-ГИУК
И , I
-
.п. FL
Рис. 3. Концентрации продуктов окислительного дезаминирования БА в биомассе Е. соИ К-12 на средах М-9 (А) и ЬВ (Б).
0,03
0,02
0,01
1
I НА ДА 5-ГТ
0,4 0,3 0,2 ОД О
Рис. 4. Концентрации БА в КЖ Е. coli К-12 на средах М-9 (А) и LB (Б). Подписи на оси абцисс здесь и далее: 1 - лагфаза; 2 - ранняя экспоненциальная фаза; 3 -поздняя экспоненциальная фаза; 4 - стационарная фаза роста; 5 - супернатант среды с инокулятом.
i
5-ГТР ДОФА
1,2 0,8 0,4
i
Рис. 5. Концентрации предшественников БА в КЖ Е. coli К-12 на средах М-9 (А) и LB (Б).
,16
|
),12 р>8 ,04 О
Рис. 6. Концентрации продуктов окислительного дезаминирования БА в КЖ Е. coli К-12 на средах М-9 (А) и LB (Б).
Обратимся к данным, полученным с КЖ Е. coli. При росте на синтетической среде М-9 КЖ не содержал БА во время лагфазы (рис. 4). В КЖ ранней экспоненциальной фазы нами детектированы низкие (наномолярные) концентрации НА, поздней экспоненциальной фазы - НА и ДА, стационарной фазы - 5-ГТ. Продукты окислительного дезаминирования БА присутствуют в КЖ Е. coli, растущей на среде М-9 (рис.6), в поздних фазах роста культуры в наномолярных концентрациях (кроме ДГФУК, который достигает субмикромолярного уровня в стационарной фазе). Предшественник 5-ГТ 5-гидрокистриптофан не был детектирован нами в КЖ на среде М-9 ни в какой фазе роста культуры (рис. 5). В то же время
предшественник дофамина ДОФА присутствует в КЖ в микромолярных концентрациях.
В отличие от среды М-9, среда LB изначально содержала субмикромолярные концентрации ДА, 5-ГТ, ДОФА и продуктов окисления БА. В этих условиях культура не выделяла значительных дополнительных количеств изучаемых веществ в КЖ. Концентрации этих веществ в КЖ во всех фазах роста на среде LB в большинстве случаев были примерно равны концентрациям в среде сразу после инокуляции или даже ниже их, т.е. можно предположить поглощение соответствующих соединений клетками Е. coli из среды (рис. 5 и 6).
Биогенные амины, их предшественники и продукты в клетках и культуральной жидкости S. cerev/s/ae. Две среды, использованные нами для культивирования дрожжей - среда Сабуро и синтетическая сахарозо-аммонийная среда, различались по концентрациям изучаемых соединений в момент инокуляции. Среда Сабуро содержала микромолярные концентрации НА, предшественника катехоламинов ДОФА и одного из детектируемых методом ВЭЖХ продуктов окислительного дезаминирования катехоламинов - ДГФУК; другие тестируемые вещества -нейромедиаторы ДА и 5-ГТ, ГВК и 5-ГИУК - присутствовали в среде Сабуро в концентрациях ~ 10"7М. В синтетической среде тотчас после посева дрожжевой культуры были детектированы лишь наномолярные количества ДОФА, НА, 5-ГИУК и ГВК, очевидно, внесённые вместе с инокулятом.
Несмотря на различия в составе среды, в разрушенной ультразвуковой обработкой биомассе дрожжей, выращенной на обеих питательных средах, содержались 5-ГТ, НА, ДА (рис. 7), ДОФА, ДГФУК, ГВК и 5-ГИУК (Табл. 1 и 2) в концентрационном диапазоне от 0.1 до 10 нмоль/г2. Максимальные концентрации 5-ГТ, ДГФУК, ГВК и 5-ГИУК на обеих средах приходились на начало экспоненциальной фазы роста, их концентрации снижались по мере
2 За исключением ДГФУК в поздней экспоненциальной фазе на синтетической среде, чья концентрация была равна нулю.
старения культуры. Концентрации катехоламинов на среде Сабуро достигали максимума в лаг-фазе. На синтетической среде максимальная концентрация НА наблюдалась в начале экспоненциальной фазы роста, а максимальная концентрация ДА - в лаг-фазе; эти концентрации снижались к стационарной фазе почти до нуля.
Концентрация ДОФА внутри клеток 5.сегеуиг'ае на среде Сабуро (табл. 2) была максимальной в ранней экспоненциальной фазе и снижалась при переходе к поздней экспоненциальной фазе, а на синтетической (сахарозро-аммонийной) среде (табл. 1) внутриклеточная концентрация ДОФА монотонно нарастала по мере старения культуры. На синтетической среде, где сразу после добавки инокулята были детектированы только НА, ДОФА, ГВК и 5-ГИУК в низких (наномолярных) концентрациях, в биомассе были детектированы все тестированные вещества в значительных количествах (рис. 7, Табл. 1)
Рис. 7. Концентрации ЬА в Оиомассе Л', сегеуШае на сахарозо-аммонийной среде (А) и среде Сабуро (Б). Подписи на оси абцисс здесь и далее: 1 - лагфаза; 2 -ранняя экспоненциальная фаза; 3 - поздняя экспоненциальная фаза; 4 -стационарная фаза роста; 5 - супернатант среды с инокулятом
На среде Сабуро содержание БА (рис. 8), продуктов дезаминирования и предшественника ДОФА в КЖ (Табл. 2) на всех стадиях роста культуры было ниже, чем в среде в момент инокуляции, т. е. клетки дрожжей активно поглощали данные соединения в процессе роста из среды.
^ 0,03
5С §
| 0,02
1Г го О.
I 0,01 01 а" х о
* о
1 2 3 4 5 1 2 3 4 5
Рис. 8. Концентрации БА в КЖ & сегеушае на сахарозо-аммонийной среде (А) и среде Сабуро (Б).
Таблица 1. Концентрации предшественников и продуктов дезаминирования БА в биомассе (нмоль/г) и КЖ (мкМ) 5. cerevisiae на сахарозо-аммонийной среде. Примечание к табл. 1 и 2.: 5-ГТР не был детектирован ни в биомассе, ни в КЖ 5. сегеушде
Фаза ДОФА ДГФУК ГВК 5-ГИУК
Биомасса
Лаг-фаза 0,82±0,1 0,06±0,007 0,58±0,06 0,16±0,02
Ранн. экспоненц. 0,94±0,1 0,3±0,03 0,59±0,06 0,71±0,07
Поздн. экспоненц. 1,25±0,2 0 0,39±0,04 0,44±0,05
Стационарная 2,05±0,4 0,02±0,002 0,23±0,02 0,37±0,04
Культуральная жидкость
Лаг-фаза 0,01±0,001 0 0 0
Ранн. экспоненц. 0,03±0,004 0 0,01±0,001 0,01±0,001
Поздн. экспоненц. 0,02±0,003 0,01 ±0,001 0 0,02±0,002
Стационарная 0,01±0,001 0 0 0,01±0,001
Среда + инокулят 0,02±0,002 0,000 0,01±0,001 0,01 ±0,001
Максимальные концентрации БА, ДОФА и продуктов дезаминирования в КЖ на синтетической среде или соответствуют тем наномолярным концентрациям, которые содержались в супернатанте среды с инокулятом -ДОФА, НА, 5-ГИУК, ГВК, или равны нулю, если соответствующие соединения не детектированы в супернатанте в момент инокуляции - ДА, 5-ГТ, ДГФУК. Эти данные свидетельствует против выделения из клеток в среду каких-либо из исследованных веществ, тем более что на богатой среде,
НА 'ДА I 5-ГТ
1
1,5 1 0,5
п
I
1^1 I
как уже было указано, их концентрации в КЖ не возрастали, а снижались при росте культуры по сравнению с моментом инокуляции.
Таблица 2. Концентрации предшественников и продуктов дезаминирования БА в биомассе (нмоль/г) и КЖ (мкМ) 5. сегеуише на среде Сабуро
Фаза ДОФА ДГФУК гвк 5-ГИУК
Биомасса
Лаг-фаза 16,7±1,7 0,79±0,09 1,97±0,2 0,73±0,1
Ранн. экспоненц. 22±2,6 0,98±0,1 2,74±0,5 1,27±0,15
Поздн. экспоненц. 6,1±0,9 0,1±0,02 0,18±0,3 0,93±0,1
Стационарная 7,2±0,9 0,11 ±0,02 0,15±0,03 0,84±0,1
Культуральная жидкость
Лаг-фаза 0,8±0,08 0,48±0,05 0,12±0,01 0,1 ±0,01
Ранн. экспоненц. 0,49±0,05 0,29±0,03 0,18±0,02 0,03±0,003
Поздн. экспоненц. 0,78±0,08 0,26±0,03 0,17±0,02 0,07±0,008
Стационарная озз±о/в 0,17±0,02 0,16±0,02 0,04±0,005
Среда + инокулят 0/77±0Д)8 1,79±0,2 0,19±0,02 0,15±0,02
Биогенные амины, их предшественники и продукты в клетках и культуральной жидкости В. сегеиэ Судя по данным ВЭЖХ (рис. 9; Табл. 3), использованная для культивирования В. сегеиб' среда Сабуро с сахарозой содержала лишь 22 нМ НА (медиана; в масштабе гистограммы рис. 9, Б не отличимо от нуля) и в ней не было детектируемых количеств других тестированных веществ. Подобно системе Е. соН, максимальные концентрации преобладавшего внутри клеток НА (2.3 нмоль/г по медиане) и ДА (0.24 нмоль/г) содержались на этапе лаг-фазы; однако ДОФА присутствовал в высоких концентрациях на поздних стадиях - в поздней экспоненциальной фазе его внутриклеточное содержание достигало 13 нмоль/г биомассы В. сегеш. Прочие тестируемые компоненты присутствовали в незначительных количествах, например, 5-ГТ накапливался лишь до уровня 42 пкмоль/г на стадии ранней экспоненциальной фазы. В культуральной жидкости на поздних стадиях были детектированы НА и ДОФА - оба вещества в микромолярных концентрациях.
Рис. 9. Концентрации БА в биомассе в нмоль/г (А) и КЖ в мкМ (Б) В. сегет. Подписи на оси абцисс: 1 - лагфаза; 2 - ранняя экспоненциальная фаза; 3 - поздняя экспоненциальная фаза; 4 - стационарная фаза роста; 5 - супернатант среды с инокулятом.
Таблица 3. Концентрации предшественников и продуктов дезаминирования БА в биомассе (нмоль/г) и КЖ (мкМ) В. сегет. Примечание: 5-ГТР не был детектирован ни в биомассе, ни в КЖ В. сегеш
Фаза ДОФА ДГФУК гвк 5-ГИУК
Биомасса
Лаг-фаза 1,7±0,2 0,097±0,01 0,18±0,02 0,15±0,02
Ранн. экспоненц. 4,9±0,5 0,13±0,02 0,23±0,03 0,45±0,05
Поздн. экспоненц. 13,1±1,4 0,039±0,004 0,06±0,01 0,17±0,02
Стационарная 8,72±0,9 0,2±0,02 0,25±0,03 0,25±0,03
Культуральная жидкость
Лаг-фаза 0,14±0,02 0 0 0,1±0,01
Ранн. экспоненц. 0,07±0,01 0 0,03±0,004 0,03±0,004
Поздн. экспоненц. ОД 8±0,02 0,02±0,002 0 0,04±0,005
Стационарная 1,15±0,2 0,36±0,04 0,02±0,002 0,01±0,001
Среда + инокулят 0,005±0,001 0 0,03±0,004 0
ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ
В настоящей диссертационной работе мы обсуждаем не только собственные экспериментальные данные, но и сведения из литературных источников, включая работы группы А.В. Олескина. Примечательным с точки зрения консерватизма живого на химическом уровне является сам факт наличия в клетках микроорганизмов важнейших нейромедиаторов нервной системы и, что особенно актуально, головного мозга животных и человека -5-ГТ, НА и ДА. Данный факт был ранее продемонстрирован Цавкеловой и др. (2000).
Однако в экспериментальной части настоящей диссертационной работы информация о нейромедиаторных аминах в микробных системах существенно детализирована и дополнена данными о ростовой динамике их накопления в биомассе и КЖ применительно к представителям грамотрицательных (Е. col) и грамположительных (В. cereus) бактерий, а также одноклеточных эукариот (S. cerevisiae).
Следует поставить вопрос, являются ли обнаруженные нами амины эндогенными? Синтезируются ли они внутри клеток микроорганизмов или поглощаются из среды? Ответ на этот вопрос дают результаты опытов по культивированию Е. coli и S. cerevisiae не только на богатых органических средах (среде LB и среде Сабуро, соответственно), но и на синтетических средах (среде М-9 и сахарозо-аммонийной среде, соответственно), где БА и их предшественники могут быть внесены в незначительных количествах лишь с инокулятом. Клетки микроорганизмов содержат нейромедиаторные амины НА, ДА и 5-ГТ в концентрациях порядка 0.1-1 нмоль/г биомассы на синтетических средах, вполне сопоставимым с их содержанием в клетках на богатых органических средах. Бактерия В. cereus была выращена нами только на богатой органической среде Сабуро, однако из числа БА эта среда содержала лишь 22 нмоль/л НА; тем не менее, биомасса содержала до 2 нмоль/г, т.е. 2 мкмоль/кг НА и вовсе не содержавшиеся в среде в момент инокуляции ДА и 5-ГТ. Таким образом, внутриклеточное накопление нейромедиаторов по крайней мере частично является результатом их биосинтеза de novo, а не только захвата из среды.
Поскольку в клетках микроорганизмов содержались вещества, которые служат предшественниками БА в организме животных и человека - ДОФА, предшественник катехоламинов, и 5-гидрокситриптофан, предшественник серотонина (правда, детектированный только в клетках Е. coli) и продукты окислительного дезаминирования нейромедиаторов - ДГФУК, ГВК и 5-ГИУК, синтез нейромедиаторных аминов и их деградация в бактериальных
клетках, вероятно, включает типичные для животных ферментативные реакции
Триптофан —> 5-Гидрокситриптофан —► 5-ГТ —> 5-ГИУК Тирозин -» ДОФА —>ДА "А
Наши данные указывают, таким образом, на функционирование в бактериальных клетках ферментов, гомологичных или, по крайней мере, функционально аналогичных 1) ферментам синтеза нейромедиаторных аминов - триптофангидрокилазе (превращение триптофан —» 5-гидрокситриптофан), тирозингидроксилазе (реация тирозин —► ДОФА) и декарбоксилазам ароматических аминокислот (процессы:
5-гидрокситриптофан —♦ 5-ГТ и ДОФА —> ДА); 2) дофамин-р-гидроксилазе, катализирующей переход ДА —> НА) и 3) моноаминооксидазам (МАО), катализирующим окислительное дезаминирование нейромедиаторов в ЦНС позвоночных животных.
У дрожжей S. cerevisiae при росте на среде Сабуро наблюдалось активное поглощение клетками дрожжей тестируемых соединений в процессе культивирования, так что внутриклеточное накопление нейромедиаторных аминов, ДОФА и продуктов дезаминирования аминов есть, вероятно, результат комбинированного действия 1) внутриклеточного биосинтеза этих соединений и 2) поглощения их из среды культивирования.
Необходимо отметить, что полученные данные не позволяют нам дать однозначный ответ на вопрос о возможности захвата БА из среды клетками бактерии Е. coli и В. cereus. В КЖ Е. coli на богатой среде (LB) мы наблюдали лишь несущественное снижение концентраций ДА и 5-ГТ в процессе роста культуры, в то время как НА, не детектированный в среде в момент посева, наоборот, появлялся в КЖ в процессе роста культуры. В системе В. cereus рост бактериальной культуры сопровождался повышением концентрации НА и появлением в супернатанте отсутствовавших в среде ДА
1ДГФУК — ГВК
и 5-ГТ.
Наибольшие количества БА содержались внутри клеток на ранних стадиях роста микробных культур - в лагфазе или, в случае ДА у В. cereus и Е. coli (на среде LB) и 5-ГТ у S. cerevisiae (на обеих использованных средах), в ранней экспоненциальной фазе. Эти данные следует сопоставить с тем фактом, что добавленные нейромедиаторы эффективно стимулируют рост культур Е. coli К-12 (Олескин и др., 1998а, б; Кагарлицкий и др., 2003; Анучин и др., 2008) и S. cerevisiae (Кагарлицкий и др., 2003; Маликина и др., 2010) лишь в ранние фазы роста. Можно предположить, что эндогенные амины присутствуют в клетках бактерий в максимальных концентрациях именно в тех ростовых фазах, во время которых они оказывают свое регуляторное действие. В этом случае БА, вероятно, функционируют как «триггеры», активирующие рост и деление клеток в начальных фазах онтогенеза культуры, по аналогии с известными ауторегуляторными соединениями.
Преобладающим БА в клетках всех микробных культур в большинстве случаев был НА. ДА присутствовал в клетках в значительно меньших концентрациях, чем НА, за исключением только ранней экспоненциальной фазы у Е. coli на среде М-9 и лаг-фазы у S. cerevisiae на сахарозо-аммонийной среде, когда концентрация ДА несколько превышала таковую НА. 5-ГТ присутствовал в биомассе тестируемых микробных объектов примерно в тех же концентрациях, что и ДА.
Эффективность БА в роли стимуляторов роста у Е. coli (Олескин и др., 1998а, б; Кагарлицкий и др., 2003; Анучин и др., 2008) и S. cerevisiae (Маликина и др., 2010), убывает в последовательности: ДА > 5-ГТ > НА. Можно поэтому предположить, что НА присутствует в клетках Е. coli в концентрациях, почти достаточных для полного проявления его регуляторного воздействия, и дополнительная добавка вызывает поэтому лишь мизерный эффект (что и наблюдалось в работе: Анучин и др., 2008). Больший ростстимулирующий эффект 5-ГТ (Олескин и др., 1998а; Анучин и
др., 2008) и особенно ДА (Кагарлицкий и др., 2003; Анучин и др., 2008) коррелирует с их сравнительно низкой концентрацией в биомассе.
Приведенные данные подкрепляют высказанную в работе (Анучин и др., 2008) идею о специфических рецепторах для каждого из аминов. В частности, насыщение эндогенным норадреналином специфических к нему рецепторов не препятствует проявлению эффекта экзогенного ДА, т.е. можно предположить наличие как дофаминовых, так и норадреналиновых рецепторов. В пользу наличия специфических рецепторов для каждого из аминов свидетельствует и то, что тестированные амины по-разному влияют на агрегацию клеток Е. coli: ДА ингибирует, а НА и 5-ГТ (а также гистамин) стимулируют этот процесс (Анучин и др., 2008).
Представляют значительный интерес наши данные о выделении Е. coli в синтетическую среду М-9 НА, ДА и 5-ГТ в концентрациях порядка 10 нМ. Хотя концентрации нейромедиаторных аминов в культуральной жидкости низки, они вполне достаточны для специфического ответа клеток хозяина, несущих соответствующие рецепторы (например, D-рецепторы к ДА, а-адренорецепторы для НА). Некоторые из этих рецепторов узнают не только наномолярные, но даже пикомолярные концентрации нейромедиаторов. Наномолярные или субнаномолярные концентрации нейромедиаторных аминов характерны для внутренних сред животного организма. Например, в крови крыс содержится 0.1-0.3 нМ катехоламинов (Сейдахметова, Ташенова, 2005). Все это указывает на возможные физиологические эффекты аминов, вырабатываемых кишечным симбионтом Е. coli.
Концентрация клеток Е. coli в наших опытах на среде М-9 составляла порядка 5x108 клеток (данные получены прямым подсчётом клеток в полях зрения микроскопа) в поздней экспоненциальной фазе, когда в среде содержались максимальные концентрации катехоламинов. Эта плотность клеточной популяции сопоставима с той, которая характерна для толстого кишечника человека (где содержится до 108 колониеобразующих единиц Е. coli в 1 мл, тендеров, 2001).
Особый интерес представляет тот факт, что предшественник ДА ДОФА присутствует не только внутри клеток Е. coli (см. выше), но и в КЖ в микромолярных концентрациях на синтетической среде. Как отмечено выше, данные о внутриклеточном содержании ДОФА, ДА и НА указывают на ферментативное превращение ДОФА —* ДА —> НА в клетках Е. coli. Можно предположить, что ДОФА выступает в качестве сигнала дальнего радиуса действия, диффундируя от одной колонии или локальной группы клеток к другой. Его превращение в ДА, который является стимулятором роста культуры Е. coli К-12 (Кагарлицкий и др., 2003; Анучин и др., 2008), может происходить внутри поглотившей ДОФА клетки. Известный уже более ста лет феномен сокращения лаг-фазы бактериальной культуры под воздействием КЖ другой культуры во время экспоненциальной фазы роста (Rahn, 1904; Penfold, 1914) может быть объяснен, наряду с другими уже найденными аутостимуляторами (см. Вахитов, Петров, 2006), также и воздействием ДОФА, выделенного «экспоненциальной» культурой и рецептированного чувствительной культурой во время лаг-фазы.
Аналогично Е. coli, в КЖ В. cereus на поздних стадиях роста культуры нами были обнаружены НА и ДОФА. Поэтому всё сказанное выше о гипотетической роли ДОФА как стимулятора роста клеток в микробном сообществе (одно- или многовидовом) и его воздействии на организм-хозяин приложимо и к бактерии В. cereus. Эта бацилла портит пищевые продукты и входит в состав микрофлоры человека. Поэтому продуцируемый бациллой НА может оказывать влияние на другие населяющие различные ниши человеческого организма бактерии, в том числе патогенные. НА эффективно стимулирует рост и вирулентность патогенной микрофлоры, в частности, сальмонелл, шигелл, синегнойной палочки Pseudomonas aeruginosa (Lyte, Ernst, 1993; Burton et al., 2002; Freestone et al., 2007). Итак, будучи условно патогенной сама, бацилла В. cereus может причинять дополнительный вред, способствуя развитию других инфекций.
В отличие от Е. coli, S. cerevisiae не выделяет в КЖ сколь-нибудь существенных количествах ни БА, ни их предшественник ДОФА. Например, если даже предположить что весь присутствующий в КЖ ДОФА будет ферментативно превращен поглотившей его клеткой дрожжей в дофамин, то и тогда его концентрация не превысит 0.03 мкМ (максимальная концентрация ДОФА в КЖ), что в -30 раз меньше ростстимулирующей концентрации дофамина по данным работы A.B. Олескина с соавторами (2009а). Вероятно, ДОФА, как и другие детектированные вещества (БА и их продукты), не функционируют в популяциях дрожжей S. cerevisiae в качестве ауторегуляторов.
Можно поставить вопрос, зачем дрожжевые клетки поглощают из среды нейромедиаторные амины и специфически реагируют на них, если они не служат ауторегуляторами? В естественных условиях дрожжи формируют биоплёнки на кожуре винограда, слив и других плодов. Следует ожидать, что в природных экосистемах дрожжевые клетки вступают в обмен регуляторными веществами с другими видами про- и эукариотических микроорганизмов, а также с клетками растения-хозяина. Можно предполагать, что нейромедиаторы служат односторонне действующими регуляторами, воспринимаемыми дрожжами и вырабатываемыми другими компонентами экосистемы. БА обнаружены у растений и могли бы служить одним из каналов коммуникации растения и растущей на нём дрожжевой биоплёнки. Источниками аминов могут быть и бактерии: они, по нашим данным, не только накапливают нейромедиаторные амины внутриклеточно, но и выделяют их в среду.
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
Наряду с данными литературы о распространённости нейромедиаторных аминов у различных животных (Дубынин и др., 2003), растений (Рощина, 1991), грибов, простейших (Бузников, 1987, 2007), наши результаты свидетельствуют об эволюционно-консервативном характере рассматриваемых соединений, по-видимому, возникших на заре эволюции жизни на нашей
планете. Причём, полученные нами данные о БА внутри микробных клеток дополняют собой описанные в литературных источниках (Lyte, Ernst, 1993; Страховская и др., 1993; Олескин и др., 1998а, б, 2009а; Kinney et al., 1999; Burton et al., 2002; Кагарлицкий и др., 2003; Олескин, Кировская, 2006, 2007; Freestone et al., 2007а, b; Анучин и др., 2008) факты, говорящие о специфических эффектах экзогенных БА в микробных системах.
В диссертационной работе нами были избраны объекты, так или иначе взаимодействующие с человеческим организмом и влияющие на его состояние здоровья, включая деятельность мозга, и тем самым на мышление, психику, социальное поведение. Не случайно исследуемые нами вещества служат нейромедиаторами в важных функциональных зонах мозга.
Поэтому существенное значение имеют отмеченные выше факты выделения микроорганизмами, а именно бактериями Е. coli и В. cereus концентраций БА, достаточных для специфической реакции со стороны клеток хозяина. Правда, ДА, НА и 5-ГТ не проходят гемато-энцефалический барьер и в основном действуют на человеческий организм локально (в случае кишечного симбионта Е. coli - только в пределах кишечника).
В этом контексте необходимо привлечь особое внимание к нашим данным о выделении обеими бактериями микромолярных количеств ДОФА в культуральную жидкость. ДОФА проходит барьер между кишкой и кровяным руслом, между кровяным руслом и мозгом. В мозгу ДОФА превращается в ДА и далее НА, которые регулируют мозговые процессы, связанные с поддержанием общего уровня двигательной активности, эмоциональными реакциями на окружающий мир, социабельностью (коммуникативностью), лидерскими качествами, степенью агрессивности и др. Таким образом, выделение кишечным симбионтом Е. coli микромолярных количеств ДОФА из клеток в среду позволяет нам поставить вопрос о возможности влияния этой бактерии на психику и социальное поведение человека.
По контрасту с тестированными бактериальными объектами, дрожжи S. cerevisiae накапливают БА внутриклеточно, но не высвобождают их в КЖ. Этот факт имеет определённое значение с точки зрения влияния дрожжевых продуктов на организм человека. Человек издавна использует КЖ дрожжей (вино, пиво и др.). Если при приготовлении напитка КЖ отфильтровывается от клеток дрожжей, то полученный продукт не содержит нейромедиаторов (и остальных тестированных нами соединений). Однако если в пищеварительный тракт поступают дрожжевые клетки без термической обработки, то следует ожидать воздействия на организм человека нейромедиаторов, их предшественников и продуктов.
Полученные в настоящей работе результаты в сочетании с данными литературы характеризуют БА как весьма эволюционно-консервативные соединения и в то же время обогащают наши представления о механизмах «диалога» между человеческим организмом и его симбиотической и паразитической микробиотой важным новым - нейрохимическим - аспектом.
ВЫВОДЫ
1. Методом высокоэффективной жидкостной хроматографии с электродетекцией продемонстрировано наличие биогенных аминов (серотонина, дофамина, норадреналина) в биомассе бактерий Escherichia coli К-12 и Bacillus cereus, а также дрожжей Saccharomyces cerevisiae.
2. Впервые исследована ростовая динамика накопления биогенных аминов в микробных клетках и показано, что максимальные концентрации биогенных аминов обнаруживаются на ранних стадиях роста изученных микробных культур, т.е. именно в те ростовые фазы, в которые они оказывают максимальные рост-стимулирующие эффекты, по данным литературы.
3. По-видимому, биогенные амины синтезируются в микробных клетках de novo, так как присутствуют в биомассе микроорганизмов при культивировании на не содержащих этих соединений средах; в то же
время на средах неопределенного состава наши данные указывают на захват биогенных аминов из среды, по крайней мере, в случае S. cerevisiae.
4. В клетках исследованных микроорганизмов обнаружены характерные для животных клеток предшественники (ЦОФА, 5-гидрокситриптофан) и окисленные продукты (дигидроксифенилуксусная кислота, гомованилиновая кислота, 5-гидроксииндолилуксусная кислота) биогенных аминов. Вероятно, пути ферментативного синтеза и деградации аминов в микробных клетках сходны с таковыми у животных и человека.
5. Биогенные амины, их предшественники и продукты обнаружены нами в культуральной жидкости Е. coli и В. cereus, но не S. cerevisiae. Возможно, эти соединения функционируют в качестве ауторегуляторов в популяциях бактерий, но не дрожжей. Дрожжи в естественных экосистемах могут поглощать биогенные амины, вырабатываемые другими организмами и, возможно, находиться под их регуляторным влиянием.
СПИСОК РАБОТ, ОПУБЛИКОВАННЫХ ПО ТЕМЕ ДИССЕРТАЦИИ
1. В.А. Шишов, Т.А. Кировская, B.C. Кудрин, A.B. Олескин. Нейромедиаторные амины, их предшественники и продукты окисления в биомассе и супернатанте культуры Escherichia coli К-12 // Прикл. биохим. микробиол. 2009. Т.45. № 5. С.550-554.
2. К.Д. Маликина, В.А Шишов, Д.И. Чувелёв, В.С.Кудрин, A.B.Олескин. Регуляторная роль нейромедиаторных аминов в клетках Saccharomyces cerevisiae!I Прикл. биохим. микробиол. 2010. Т.46. № 6. С.672-677.
3. A.B. Олескин, В.А. Шишов. Микробные биоплёнки как сетевые структуры // Современные проблемы физиологии, экологии и биотехнологии микроорганизмов. Всероссийский симпозиум с международным участием /Отв. ред. А.И. Нетрусов, H.H. Колотилова. М.: МАКС Пресс. 2009. С. 139
4. A.B. Олескин, В.А. Шишов, Т.А. Кировская, B.C. Кудрин. Нейромедиаторные амины, их предшественники и продукты окисления в биомассе и супернатанте культуры Saccharomyces cerevisiae. // Бюлл. МОИП. Отдел биологический. 2009. Т.114. № 2. С.78-82.
5. A.V. Oleskin, V.A Shishov, K.D. Malikina. Symbiotic biofilms and brain neurochemistry //Biofilms. Hauppage (N.Y.): Novapublishers. 2010. In print.
Подписано в печать: 28.10.2010
Заказ № 4386 Тираж - 100 экз. Печать трафаретная. Типография «11-й ФОРМАТ» ИНН 7726330900 115230, Москва, Варшавское ш., 36 (499) 788-78-56 www.autoreferat.ru
Содержание диссертации, кандидата биологических наук, Шишов, Владимир Александрович
ОБЩАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА РАБОТЫ
ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
МИКРОБНЫЕ БИОПЛЁНКИ: ОСНОВНЫЕ ХАРАКТЕРИСТИКИ
QUORUM SENSING И ФОРМИРОВАНИЕ НАДКЛЕТОЧНЫХ СТРУКТУР В МИКРОБНЫХ ПОПУЛЯЦИЯХ
СИМБИОТИЧЕСКАЯ МИКРОФЛОРА И ЕЁ НАДКЛЕТОЧНЫЕ СТРУКТУРЫ 20 ВЛИЯНИЕ НЕЙРОМЕДИАТОРОВ НА МИКРООРГАНИЗМЫ И ИХ НАДКЛЕТОЧНЫЕ СТРУКТУРЫ
БИОСИНТЕЗ И ВЫДЕЛЕНИЕ В СРЕДУ НЕЙРОМЕДИАТОРОВ КЛЕТКАМИ МИКРООРГАНИЗМОВ
ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ
МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
ОБЪЕКТЫ
КУЛЬТИВИРОВАНИЕ ОБЪЕКТОВ
ПОДГОТОВКА ОБЪЕКТОВ К ИЗМЕРЕНИЮ КОНЦЕНТРАЦИЙ БИОГЕННЫХ АМИНОВ
ОПРЕДЕЛЕНИЕ БИОГЕННЫХ АМИНОВ МЕТОДОМ ВЫСОКОЭФФЕКТИВНОЙ ЖИДКОСТНОЙ ХРОМАТОГРАФИИ С ЭЛЕКТРОДЕТЕКЦИЕЙ
РЕЗУЛЬТАТЫ
БИОГЕННЫЕ АМИНЫ, ИХ ПРЕДШЕСТВЕННИКИ И ПРОДУКТЫ ОКИСЛИТЕЛЬНОГО ДЕЗАМИНИРОВАНИЯ В КЛЕТКАХ И КУЛЬТУРАЛЬНОЙ ЖИДКОСТИ Е. COLI К
БИОГЕННЫЕ АМИНЫ, ИХ ПРЕДШЕСТВЕННИКИ И ПРОДУКТЫ ОКИСЛИТЕЛЬНОГО ДЕЗАМИНИРОВАНИЯ В КЛЕТКАХ И КУЛЬТУРАЛЬНОЙ ЖИДКОСТИ S. CEREVISIAE
БИОГЕННЫЕ АМИНЫ, ИХ ПРЕДШЕСТВЕННИКИ И ПРОДУКТЫ ОКИСЛИТЕЛЬНОГО ДЕЗАМИНИРОВАНИЯ В КЛЕТКАХ И КУЛЬТУРАЛЬНОЙ ЖИДКОСТИ В. CEREUS
ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ
Введение Диссертация по биологии, на тему "Биогенные амины в динамике роста микроорганизмов"
Актуальность темы диссертации. Тема диссертации исследование ростовой динамики накопления биогенных аминов (БА) в биомассе и культуральной жидкости микроорганизмов — связана с одной из самых «горячих» областей современной микробиологии — изучением механизмов межклеточной коммуникации у микроорганизмов. Важным частным случаем межклеточной коммуникации являются quorum sensing-системы, ставящие протекающие в микробной клетке процессы под контроль плотности популяции микроорганизмов. Были охарактеризованы важнейшие типы quorum sensing-феромонов, в том числе функционирующие у энтеробактерий и ряда других микроорганизмов ароматические сигнальные вещества (аутоиндуктор(ы) AI-3), напоминающие по химической структуре
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
БА - биогенные амины; ВЭЖХ - высокоэффективная жидкостная хроматография; ГАМК — у-аминомасляная кислота; ГВК - гомованилиновая кислота; 5-ГИУК - 5-гидроксииндолилуксусная кислота; 5-ГТ - серотонин (5-гидрокситриптамин); ДА - дофамин; ДГФУК - дигидроксифенилуксусная кислота; ДОФА - диоксифенилаланин; ЖКТ - желудочно-кишечный тракт; ИУК - 3-индолилуксусная кислота (ауксин); КЖ - культуральная жидкость (супернатант); МАО - моноаминооксидаза; НА — норадреналин; AI-1, AI-2, AI-3 - аутоиндукторы-1, -2 и -3, соответственно; AIP, autoinducer peptide (пептидный аутоиндуктор); c-di-GMP - cyclic diguanylmonophosphate (циклический дигуанилмонофосфат); N-AHL — N-acyl homoserine lactone (N-ацилированный гомосеринлактон); QS - quorum sensing (система плотностно-зависимой коммуникации у микроорганизмов). катехоламины - одну из групп БА, функционирующих в качестве нейромедиаторов и гормонов у животных и человека.
Вопрос о роли БА в микробных системах, в особенности у симбиотической микрофлоры животных/человека, был длительное время предметом внимания исследователей - проф. М. Лайта (университет Манкато, США), групп Г.И. Фрайкина и А.В. Олескина (биологический факультет, МГУ) и др. Было продемонстрировано, что БА вызывают стимуляцию роста микроорганизмов, обусловливают структурные эффекты в микробных системах, в частности, усиливают или, напротив, ослабляют агрегацию клеток в колониях, влияют на подвижность и (в случае патогенов) вирулентность микроорганизмов, а также на формирование микробных биоплёнок (Sperandio et al., 2003; Clarke et al., 2006; Анучин и др., 2008) . Клетки про- и эукариотических микроорганизмов содержат БА, определённые (Цавкелова и др., 2000) методом высокоэффективной жидкостной хроматографии (ВЭЖХ).
Несмотря на эти данные, в наших знаниях о БА у микроорганизмов остаются серьёзные пробелы. В частности, в литературе не были N представлены данные о возрастной динамике внутриклеточного содержания нейромедиаторных аминов, т. е. об изменении их концентраций по мере прохождения микробной культурой различных фаз своего роста. Не был решён имеющий теоретическое и прикладное значение вопрос, высвобождаются ли биогенные амины или их продукты в среду культивирования или остаются внутри клеток или во фракции межклеточного матрикса.
Цель диссертации: провести идентификацию нейромедиаторных аминов, а также их предшественников и окисленных продуктов в клетках и культуральной жидкости и выяснить возрастную динамику их содержания в культурах грамотрицательных и грамположительных бактерий, а также одноклеточных эукариот.
Задачи диссертации:
1. Количественно определить методом ВЭЖХ биогенные амины (серотонин, дофамин, норадреналин) в биомассе и культуральной жидкости на разных стадиях роста Escherichia coli К-12, Saccharomyces cerevisiae 230 и Bacillus cereus IVB.
2. Количественно определить предшественники и продукты окислительного дезаминирования биогенных аминов в биомассе и культуральной жидкости в динамике роста исследуемых микроорганизмов.
Научная новизна диссертации. В диссертационной работе впервые прослежена динамика концентраций БА, их предшественников и продуктов окисления в биомассе и супернатанте культуральной жидкости (КЖ) грамотрицательной (Е. coli) и грамположительной (В. cereus) бактерий , а также одноклеточного эукариота S. cerevisiae. На базе полученных данных сделан вывод о биосинтезе и деградации БА в микробных системах с участием характерных для животных ферментов или их аналогов. Не было выяснено, образуются ли БА внутри клеток микроорганизмов амины de novo или поглощаются клетками из среды. В сочетании с данными литературы, наши результаты позволяют выдвинуть гипотезу об ауторегуляторной роли БА в популяциях прокариот и об односторонней регуляции эукариотических объектов (на примере дрожжей) прочими компонентами экосистемы посредством БА и их производных.
Практическое значение диссертации. Полученные результаты свидетельствуют о выработке БА, их предшественников и окисленных продуктов важными для человека микроорганизмами - симбионтом Е. coli, потенциальным патогеном В. cereus, а также биотехнологическим объектом S. cerevisiae. Встаёт существенный с медицинской точки зрения вопрос о воздействии микробных БА на организм человека в норме и патологии, а также об опосредованных БА взаимодействиях в пределах населяющего организм микробного сообщества. Некоторые из вырабатываемых взаимодействующими с человеком микроорганизмами соединений проникают через гемато-энцефалический барьер и могут оказывать влияние на деятельность функциональных зон мозга, включая высшие психические функции и социальное поведение людей. Обнаружение БА в КЖ микроорганизмов обусловливает потенциальную перспективность биотехнологического проекта по превращению микробных клеток в фабрики нейромедиаторов или родственных им соединений.
Апробация диссертации. Основные положения диссертации были доложены на конференции по микробиологии на кафедре физиологии микроорганизмов Биологического факультета МГУ (2009), на конференции Микробиологического общества при РАН (2009), неоднократно на заседаниях семинара «Биополитика» (секция МОИП) в 2008-2010 гг.
Структура и объем диссертации. Диссертация включает 122 страницы и состоит из введения (общая характеристика работы), обзора литературы, раздела о материалах и методах, разделов о результатах исследований и их обсуждения, заключения, выводов и списка литературы. Библиография включает 114 источников, в том числе 38 на русском языке и 76 на иностранных языках.
Заключение Диссертация по теме "Микробиология", Шишов, Владимир Александрович
ВЫВОДЫ
1. Методом высокоэффективной жидкостной хроматографии с электродетекцией продемонстрировано наличие биогенных аминов (серотонина, дофамина, норадреналина) в биомассе бактерий Escherichia coli К-12 и Bacillus cereus, а также дрожжей Saccharomyces cerevisiae.
2. Впервые исследована ростовая динамика накопления биогенных аминов в микробных клетках и показано, что максимальные концентрации биогенных аминов обнаруживаются на ранних стадиях роста изученных микробных культур, т.е. именно в те ростовые фазы, в которые они оказывают максимальные рост-стимулирующие эффекты, по данным литературы.
3. По-видимому, биогенные амины синтезируются в микробных клетках de novo, так как присутствуют в биомассе микроорганизмов при культивировании на не содержащих этих соединений средах; в то же время на средах неопределенного состава наши данные указывают на захват биогенных аминов из среды, по крайней мере, в случае S. cerevisiae.
4. В клетках исследованных микроорганизмов обнаружены характерные для животных клеток предшественники (ДОФА, 5-гидрокситриптофан) и окисленные продукты (дигидроксифенилуксусная кислота, гомованилиновая кислота, 5-гидроксииндолилуксусная кислота) биогенных аминов. Вероятно, пути ферментативного синтеза и деградации аминов в микробных клетках сходны с таковыми у животных и человека.
5. Биогенные амины, их предшественники и продукты обнаружены нами в культуральной жидкости Е. coli и В. cereus, но не S. cerevisiae. Возможно, эти соединения функционируют в качестве ауторегуляторов в популяциях бактерий, но не дрожжей. Дрожжи в естественных экосистемах могут поглощать биогенные амины, вырабатываемые другими организмами и, возможно, находиться под их регуляторным влиянием.
БЛАГОДАРНОСТЬ
Автор выражает глубокую и искреннюю благодарность проф. ОЛЕСКИНУ A.B. за заботливое руководство, проф. САМУИЛОВУ В.Д., к.б.н. ВОРОБЬЕВОЙ Н.В„ к.б.н. КИСЕЛЕВСКОМУ Д,И. и всему коллективу кафедр иммунологии и микробиологии Биологического факультета МГУ за конструктивную критику и постоянную поддержку в период подготовки настоящей диссертационной работы.
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
Наряду с данными литературы о распространённости биогенных аминов у различных животных (Дубынин и др., 2003), растений (Рощина, 1991), грибов, простейших (Бузников, 1987, 2007), наши результаты свидетельствуют об эволюционно-консервативном характере рассматриваемых соединений, по-видимому, возникших на заре эволюции жизни на нашей планете. Причём, полученные нами данные о БА внутри микробных клеток дополняют собой описанные в литературных источниках (Lyte, Ernst, 1993; Страховская и др., 1993; Олескин и др., 1998а, б, 2009а; Kinney et al., 1999; Burton et al., 2002; Кагарлицкий и др., 2003; Freestone et al., 2007a, b; Анучин и др., 2008) факты, говорящие о специфических эффектах экзогенных БА в микробных системах.
Помимо поиска примеров консерватизма живой природы на химическом уровне на гигантской эволюционной дистанции - от бактерий до человека -настоящая диссертационная работа имела ещё один важный аспект — биомедицинский и в то же время биополитический. Нами были избраны объекты, так или иначе взаимодействующие с человеческим организмом и влияющие на его состояние здоровья, включая деятельность мозга, и тем самым на мышление, психику, социальное поведение. Не случайно исследуемые нами вещества выполняют нейромедиаторные функции в важнейших функциональных зонах мозга.
Поэтому существенное значение имеют отмеченные выше факты выделения микроорганизмами, а именно бактериями Е. coli и В. cereus концентраций БА, достаточных для специфической реакции со стороны организма-хозяина. Правда, ДА, НА и 5-ГТ не проходят гемато-энцефалический барьер и в основном действуют на человеческий организм локально (в случае кишечного симбионта Е. coli — только в пределах кишечника).
В этом контексте необходимо привлечь особое внимание к нашим данным о выделении обеими бактериями микромолярных количеств ДОФА в культуральную жидкость. ДОФА проходит барьер между кишкой и кровяным руслом, между кровяным руслом и мозгом, и именно поэтому её коммерческие препараты (Леводофа) применяются для лечения мозговых заболеваний, например, болезни Паркинсона (Дубынин и др., 2003). В мозгу ДОФА превращается в дофамин и далее норадреналин, которые регулируют мозговые процессы, связанные с поддержанием общего уровня двигательной активности, эмоциональными реакциями на окружающий мир, социабельностью (коммуникативностью), лидерскими качествами, степенью агрессивности и др. Таким образом, выделение кишечным симбионтом Е. coli микромолярных количеств ДОФА из клеток в среду позволяет нам поставить вопрос о возможности влияния биоплёнок этой бактерии на психику и социальное поведение человека.
По контрасту с тестированными бактериальными объектами, дрожжи S. cerevisiae накапливают БА внутриклеточно, но не высвобождают их в культуральную жидкость. Этот установленный нами факт также имеет определённое прикладное значение с точки зрения влияния дрожжевых продуктов на организм человека. Человек издавна использует культуральную жидкость дрожжей (вино, пиво и др.). Если при приготовлении напитка КЖ тщательно отфильтровывается от клеток дрожжей, то полученный продукт не содержит нейромедиаторов (и остальных тестированных нами соединений). Однако если в пищеварительный тракт человека непосредственно поступают дрожжевые клетки без термической обработки15, то следует ожидать воздействия на организм человека высвобождаемых при переваривании клеток нейромедиаторов, их предшественников и окисленных продуктов.
15 Нагревание разрушает нейромедиаторные амины и родственные им соединения.
108
В заключительном разделе целесообразно кратко остановиться на дальнейших планах диссертанта, которые логически вытекают из полученных в настоящей работе результатов.
Во-первых, микробные культуры, по введенной Н.Д. Иерусалимским терминологии, имеют сложный цикл развития (онтогенез). Он не сводится только к изменениям скорости роста культуры, но включает в себя процессы клеточной дифференциации и морфогенеза. Однако, как указано в подразделе «Объекты» выше, мы не ставили задачу проследить развитие этих процессов, что представляло бы интерес в связи с выяснением морфогенетических аспектов регуляторной роли БА в микробных системах. В частности, не ставился вопрос о взаимосвязи между динамикой концентраций БА, их предшественников и продуктов дезаминирования - и спорообразованием у ' бациллы или гапло/диплоидным переходом и формированием псевдомицелия у дрожжей. Мы даже предварительно установили, что при наших условиях культивирования бацилла представлена вегетативными клетками, а дрожжи — одиночными клетками с доминированием (у данного штамма при заданных условиях) диплоидных клеток. Автор берёт на себя обязательство изучить связь дифференциации и морфогенеза с динамикой накопления в клетках и выделения в среду всех тестированных соединений в дальнейшей научной работе.
Во-вторых, геномы многих микроорганизмов, в том числе Е. coli и S. cerevisiae, были полностью секвенированы. Представляет интерес сравнить эти геномы с нуклеотидными последовательностями генов, кодирующих ключевые ферменты синтеза и деградации БА, а также белки, отвечающие за транспорт этих соединений в клетку и из клетки. Решение этой задачи также остаётся пока делом ближайшего будущего.
Полученные в настоящей работе результаты в сочетании с данными литературы характеризуют БА как весьма эволюционно-консервативные соединения и в то же время обогащают наши представления о механизмах диалога» между человеческим организмом и его симбиотической и паразитической микробиотой важным новым — нейрохимическим — аспектом.
Библиография Диссертация по биологии, кандидата биологических наук, Шишов, Владимир Александрович, Москва
1. Анучин A.M., Чувелев Д.И., Шишов В.В., Кировская Т.А., Олескин A.B. Действие нейромедиаторных моноаминов на ростовые характеристики Escherichia coli К-12 // Микробиология. 2008. Т.77. № 6. С.758-765.
2. Ашмарин И.П., Воробьев A.A. Статистические методы в микробиологических исследованиях. JL: Гос. изд-во мед. лит. 1962. 188 с.
3. Бабин В.Н., Домарадский И.В., Дубинин A.B., Кондракова O.A. Биохимические и молекулярные аспекты симбиоза человека и его микрофлоры // Российск. хим. журн. 1994. Т.38. С. 66-78.
4. Батраков С.Г., Эль-Регистан Г.И., Придачина H.H., Ненашев В.А., Козлова А.Н., Грязнова М.Н., Золотарева H.H. Тирозол -ауторегуляторный фактор di дрожжей Saccharomyces cerevisiae II Микробиология. 1993. Т.62. № 4. С.633—638.
5. Бузников Г.А. Нейротрансмиттеры в эмбриогенезе. М.: Наука. 1987. 206 с.
6. Бузников Г.А. Донервные трансмиттеры как регуляторы эмбриогенеза. Современное состояние проблемы // Онтогенез. 2007. Т.38. № 4. С.262-270.
7. Валышев A.B., Гильмутдинова Ф.Г. Микробная экология пищеварительного тракта человека // Экология микроорганизмов человека /Под ред. О.В. Бухарина. Екатеринбург: Институт клеточного и внутриклеточного симбиоза. 2006. С.169—290.
8. Васильев Ю. М. Нормальные и опухолевые клетки // Энциклопедия «современное естествознание». М.: Магистер-Пресс. 2000, Т. 2. Общая биология. С. 189-194.
9. Вахитов Т.Я., Петров JI.H. Регуляторные функции экзометаболитов бактерий // Микробиология. 2006. Т. 75. № 4. С. 483-488.
10. Дубынин В.А., Каменский A.A., Сапин М.Р., Сивоглазов В.Н. Регуляторные системы организма человека. М.: Дрофа. 2003.
11. Дуда В.И., Выпов М.Г., Сорокин В.В., Митюшина JI.JL, Лебединский A.B. Образование бактериями экстрацеллюлярных структур, содержащих гемопротеины//Микробиология. 1995. Т.64. № 1. С.69-73.
12. Иерусалимский Н.Д. Физиология развития чистых бактериальных культур. Диссертация на соискание степени доктора биологических наук. М.: Институт микробиологии АН СССР. 1952. 775 с. (в двух томах).
13. Кондашевская М.В., Ляпина Л.А., Смолина Т.Ю. Комплексы высоко- и низкомолекулярного гепарина с серотонином и их физиологические свойства// Вестн. Моск. ун-та. Сер. 16 (Биол.). 1996. № 2. С. 17-20.
14. Кудрин B.C., Мирошниченко И.И., Раевский К.С. Различия в механизмах ауторецепторной регуляции биосинтеза и высвобождения дофамина в подкорковых структурах мозга крыс // Нейрохимия. 1988. Т. 7. № 1. С. 38.
15. Лаздин O.A., Червинец В.М., Табаков Т.Д. Микробиоценоз кишечника и его коррекция. Тверь: Тверская гос. мед. Академия. 1999. 60 с.
16. Маликина К.Д., Шишов В.И., Чувелёв Д.И., Кудрин B.C., Олескин A.B. Регуляторная роль нейромедиаторных аминов в клетках Saccharomyces cerevisiae //Прикл. биохим. микробиол. 2010. № 6. С. 1-6.
17. Николаев Ю.А., Плакунов В.К. Биопленка — «город микробов» или аналог многоклеточного организма // Микробиология. 2007. Т.76. № 2. С. 148— 163.
18. Олескин A.B. Экологически важные свойства популяций микроорганизмов // Соросовский образовательный журнал. 2001. Т.7. № 8. С.7-12.
19. Олескин A.B. Биополитика. Политический потенциал современной биологии. М.: Научный мир, 2007. 508 с.
20. Олескин A.B. Нейрохимия и симбиотическая микрофлора: биополитические аспекты // Вестн. Росс. Акад. наук. 2009. № 5. С.431-438.
21. Олескин A.B., Кировская Т.А., Ботвинко И.В., Лысак Л.В. Действие серотонина (5-окситриптамина) на рост и дифференциацию микроорганизмов // Микробиология. 1998а. Т.67. №3. С.306-311.
22. Олескин A.B., Ботвинко И.В., Кировская Т.А. Микробная эндокринология и биополитика // Вестн. Моск. Ун-та. Сер. Биология. 19986. № 4. С.3-10.
23. Олескин A.B., Маликина К.Д., Кировская Т.А., Чувелёв Д.И. Действие моноаминных нейромедиаторов на пролиферацию клеток Saccharomycescerevisiae II Бюлл.МОИП. Отдел биологический, 2009а. Т.114. № 2. С.75-77.
24. Олескин A.B., Шишов В.А., Кировская Т.А., Кудрин B.C. Нейромедиаторные амины, их предшественники и продукты окисления в биомассе и супернатанте культуры Saccharomyces cerevisiae. II Бюлл.МОИП. Отдел биологический, 20096. Т.114. № 2. С.78-82.
25. Павлова И.Б., Левченко K.M., Банникова Д.А. Атлас морфологии популяции патогенных бактерий. М.: Колос. 2007. 180 с.
26. Рощина В. В. Биомедиаторы в растениях. Ацетилхолин и биогенные амины. Пущино: НЦ. 1991 111 с.
27. Сейдахметова З.Ж., Ташенова Г.К. Влияние иммобилизационного стресса на реактивность симпато-адреналовой системы и резистентность эритроцитов у крыс в периоды маммо- и лактогенеза // Бюллетень СО РАМН. 2005. Т. 118. № 4. С. 93-95.
28. Страховская М.Г., Иванова Е.В., Фрайкин Г.Я. Стимулирующее влияние серотонина на рост дрожжей Candida guillermondii и бактерий Streptococcus faecalis II Микробиология. 1993. Т.62. С.46-49.
29. Скулачев В.П. Феноптоз: запрограммированная смерть организма // Биохимия. 1999. Т.64. № 12. С.1679—1688.
30. Сумина E.JI. Поведение нитчатых цианобактерий в лабораторной культуре //Микробиология. 2006. Т.75. № 4. С.532—537.
31. Цавкелова Е.А., Ботвинко И.Б., Кудрин B.C., Олескин A.B. Детекция нейромедиаторных аминов у микроорганизмов методом высокоэффективной жидкостной хроматографии // Докл. Росс. Акад. Наук. 2000. Т.372. С.840—842.
32. Шендеров Б.А. Медицинская микробная экология и функциональное питание. М.: Грантъ. Т.З. Пробиотики и функциональное питание. 2001. 288 с.
33. Шпаков А.О. Сигнальные молекулы бактерий непептидной природы QS-типа//Микробиология. 2009. Т. 78. № 2. С.163-175.
34. Эль-Регистан Г.И. Роль мембранотропных ауторегуляторных факторов в процессах роста и развития микроорганизмов. Диссертация на соискание ученой степени доктора биологических наук. М.: Институт микробиологии АН СССР. 1989. 361 с.
35. Юркевич Д.И., Кутышенко В.П. Медузомицет (чайный гриб): научная история, состав, особенности физиологии и метаболизма // Биофизика. 2002. Т.47. № 6. С. 1116-1129.
36. Яшин А.Я., Яшин Я.И. Аналитические возможности жидкостного хроматографа «ЦветЯуза» с электрохимическими детекторами // Рос. хим. журн. 2002. Т.66. № 4. С.1090-115.
37. Amano К., Hazama S., Akarari Y., Ito E. Isolation and characterization of structural components of Bacillus cereus AHU 1356 cell walls // Europ. J. Biochem. 1977. V.75. N. 2. P. 513-522.
38. Bansal Т., Englert D., Lee J., Hegde M., Wood Т. K., Jayaraman A. Differential effects of epinephrine, norepinephrine, and indole on Escherichia coli 0157:H7 Chemotaxis, colonization, and gene expression // Infect. Immun., 2007. V.75. P. 4597-4607.
39. Barraud N., Hassett D. J., Hwang S.-H., Rice S. A., Kjelleberg S., Webb J. S. Involvement of nitric oxide in biofilm dispersal of Pseudomonas aeruginosa II J. Bacterid. 2006. V.188. P.7344-7353.
40. Barraud N., Storey M. V., Moore Z. P., Webb J. S., Rice S. A., Kjelleberg S. Nitric oxide-mediated dispersal in single- and multi-species biofilms of clinically and industrially relevant microorganisms // Mol. Microbiol. 2009b. V. 2. P.370-378.
41. Berridge K.C., Robinson T.E. What is the role of dopamine in reward: hedonic impact, reward learning or incentive salience? //Brain Res.: Brain Res. Rev. 1998. V.28. N 3. P.309—369.
42. Brussow H, Canchaya C, Hardt W.D. Phages and the evolution of bacterial pathogens: from genomic rearrangements to lysogenic conversion // Microbiol. Mol. Biol. Rev. 2004. V.68 N.3. P.560-602.
43. Budrene E. O., Berg H. C. Complex patterns formed by motile cells of Escherichia coll //Nature. 1991. V. 349. P.630-633.
44. Budrene E. O., Berg H. Dynamics of formation of symmetrical patterns by chemotactic bacteria. Nature. 2002. V.376. P.49-53.
45. Chen C., Brown D. R., Xie Y., Green B. T., Lyte M. Catecholamines modulate Escherichia coli 0157:H7 adherence to murine cecal mucosa // Shock. 2003. V.20. P.183-188.
46. Chen H., Fink G.R. Feedback control of morphogenesis in fungi by aromatic alcohols //Genes and Development. 2006. V.20. P.l 150—1161.
47. Chen H., Fujita M., Feng Q., Clardy J., Fink G. R. Tyrosol is a quorum-sensing molecule in Candida albicans.// Proc. Natl. Acad. Sci. US. 2004. V.101.P. 5048-5052.
48. Clarke M. B., Hughes D. T., Zhu C., Boedeker E. C., Sperandio V. The QseC sensor kinase: A bacterial adrenergic receptor // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2006. V.103. P. 10420-10425.
49. Davies D. G., Parsek M. R., Pearson J. P., Iglewski B. H., Costerton J. W., Greenberg E. P. The involvement of cell-to-cell signaling in the development of a bacterial biofilm // Science. 1998. V. 280. P.295-298.
50. DelVecchio V., Connolly J., Alefantis T., Walz A., Quan M., Patra G., Ashton J., Whittington J., Chafin R., Liang X., Grewal P., Khan A., Mujer C.
51. Proteomic profiling and identification of immunodominant spore antigens of Bacillus anthracis, Bacillus cereus, and Bacillus thuringiensis // Appl. Environ. Microbiol. 2006. V.72. N.9. P. 6355-6363.
52. Domka J., Lee J., Wood T. K. YliH (BssR) and YceP (BssS) regulate Escherichia coli K-12 biofilm formation by influencing cell signaling // Appl. Environ Microbiol. 2006. V. 72. P.2449-2459.
53. Duan K. M., Dammel C., Stein J., Rabin H., Surette M. G. Modulation of Pseudomonas aeruginosa gene expression by host microflora through interspecies communication // Mol. Microbiol. 2003. V.50. P.1477-1491.
54. FDA (United States Food and Drug Administration). Bacillus cereus. Center for food safety and applied nutrition. 2007. 94 p.
55. Filmore D. It's a GPCR world // Modern Drug Discovery. 2004. V.7. N 11. P.40-46.
56. Fotadar U., Zaveloff P., Terracio L. Growth of Escherichia coli at elevated temperatures // J. Basic Microbiol. 2005. V.45. N.5. P.403-404.
57. Freestone P. P, Haigh R. D., Williams P. H., Lyte M. Stimulation of bacterial growth by heat-stable, norepinephrine-induced autoinducers // FEMS Microbiol. Lett. 1999: V.172. P.53-60.
58. Freestone P.P.E., Haigh R.D., Lyte M. Blockade of catecholamine-induced growth by adrenergic and dopaminergic receptor antagonists in Escherichia coli 0157:H7, Salmonella enterica and Yersinia enterocolitica // BMC Microbiol. 2007. V.7. P.8.
59. Freestone P. P., Lyte M. Microbial endocrinology: Experimental design issues in the study of interkingdom signaling in infectious disease // Adv. Appl. Microbiol. 2008. V.64. P.75-108.
60. Fuqua W.C., Winans S.C., Greenberg E.P. Quorum sensing in bacteria: the LuxR-LuxI family of cell density-responsive transcriptional regulators // J. Bacteriol. 1994. V.176. N. 2. P.269-275.
61. Green B. T., Lyte M, Chen C, Xie Y., Casey M. A., Kulkarni-Narla A., Vulchanova L., Brown D. R. Adrenergic modulation of Escherichia coli0157:H7 adherence to the colonic mucosa // Am. J. Physiol. Gastrointest. Liver Physiol. 2004. V. 287. P.G1238-1246.
62. Grozdanov L.; Raasch C.; Schulze J.; Sonnenborn U.; Gottschalk G.; Hacker J.; Dobrindt U. Analysis of the genome structure of the nonpathogenic probiotic Escherichia coli strain Nissle 1917 // J Bacteriol. 2004. V.186. N.16. P.5432-5441.
63. Gruter M. Law and the mind. Biological origins of social behavior. Newbury Park: L, New Delhi. 1991'. 146 p.
64. Hawrelak J.A. The causes of intestinal dysbiosis: a review. http://findarticles.eom/p/articles/mimOFDN/is29/ain6112781 /print?tag=artBod y;coll. 2008.
65. Hoffman L. R., D'Argenio D. A., MacCoss M. J., Zheng Z., Jones R. A., Miller S. I. Aminoglycoside antibiotics induce bacterial biofilm formation. // Nature. 2005. V.436. P.l 171-1175.
66. Hsu S. C., Johansson K. R., Donahne M. J. The bacterial flora of the intestine of Ascaris suum and 5-hydroxytryptamine production. // J. Parasitol. 1986. V.72. P.545-549.
67. James S. L. Role of nitric oxide in parasitic infections // Microbiol. Rev. 1995. V.59. P.533-547.
68. Jefferson K. K. What drives bacteria to produce a biofilm? // FEMS Microbiol. Lett. 2004. V. 236. P. 163-173.
69. Kaper J.B., Sperandio V. Bacterial cell-to-cell signaling in the gastrointestinal tract // Infect. Immmun. 2005. V.73, P.3197-3209.
70. Karatan E., Watnick P. Signals, regulatory networks, and materials that build and break bacterial biofilms. // Microbiol. Mol. Biol. Rev. 2009. V. 73. P. 310347.
71. Kinney K.S., Austin C.E., Morton D.S., Sonnenfeld G. Catecholamine enhancement of Aeromonas hydrophila growth // Microbial Pathogenesis. 1999. V.25.P.85—91.
72. Kruk Z. L., Pycock C. J. Neurotransmitters and Drugs. L., N.Y., Tokyo: Chapman & Hall. 1990.
73. Lee J., Jayaraman A., Wood T. K. Indole is an inter-species biofilm signal mediated by SdiA // BMC Microbiol. 2007a. V. 7. P.42.
74. Lee J., Bansal T., Jayaraman A., Bentley W. E., Wood T. K. Enterohemorrhagic Escherichia coli biofilms are inhibited by 7-hydroxyindole and stimulated by isatin. Appl. Environ. Microbiol. 2007b. V.73. P.4100-4109.
75. Leveau J.H.J., Lindow S.E. Utilization of the plant hormone indole-3-acetic acid for the growth by a Pseudomonas putida strain // Appl. Environ. Microbiol. 2005. V.71. P.2365-2371.
76. Lyte M. The role of microbial endocrinology in infectious disease // J. Endocrinol. 1993. V.137. P.343-345.
77. Lyte M., Ernst S. Alpha and beta adrenergetic receptor involvement in catecholamine-induced growth of gram-negative bacteria // Biochem. Biophys. Res. Commun. 1993. V. 190. № 2. P. 447-452.
78. Lyte M., Bailey M.T. Neuroendocrine-behavior interactions in a neurotoxin-induced model of trauma // Journal of Surgical Research. 1997. V.70. P. 195— 201.
79. Lyte M., Frank C.D., Green B.T. Production of an autoinducer of growth by norepinephrine-cultured Escherichia coli 0157:H7 // FEMS Microbiol. Lett. 1996. V.139. N 2—3. P.155—159.
80. Lyte M., Freestone P. P. E., Neal C. P., Olson B. A., Haigh R. D., Baystone R., Willams P. H. Stimulation of Staphylococcus epidermidis growth and biofilm formation by catecholamine ionotropes // Lancet. 2003. V.361. P. 130-135.
81. Madigan M.T., Martinko J.M. Biology of microorganisms. N.Y.: Pearson. 2006.
82. Masters R.D. Biology and politics: linking nature and nurture // Ann. Rev. Polit. Sei. 2001. V.4. P.345-369.
83. Masters R.D., McGuire M.T. /Eds. The Neurotransmitter Revolution. Serotonin, Social Behavior and the Law Southern Illinois University Press. Carbondale and Edwardsville: Southern Illinois University Press. 1994
84. Morgan R., Kohn S., Hwang S. H., Hassett D. J., Sauer K. BdlA, a Chemotaxis regulator essential for biofilm dispersal in Pseudomonas aeruginosa. II J. Bacterid. 2006. V.188. P. 7335-7343.
85. Penfold W.J. On the nature of the bacterial lag // J. Hygiene. 1914. V.14. P.215—241.
86. Rahn O. Über den Einfluß der Stoffwechselprodukte auf das Wachstum der Bakterien // Zbl. Bakteriol. Parasitenk. 1906. Bd. 16. S.417—429.
87. Reisner A., Krogfelt K.A., Klein B.M., Zechner E.L., Molin S. In vitro biofilm formation of commensal and pathogenic Escherichia coli strains: impact of environmental and genetic factors // J. Bacteriol. 2006. V.188. N. 10. P.3572-3581.
88. Romeo T. When the party is over: a signal for dispersal of Pseudomonas aeruginosa biofilms // J. Bacterid. 2006. V.188. P.7325-7327.
89. Ryan R. P., Dow J. M. Diffusible signals and interspecies communication in bacteria // Microbiology. 2008. V.154. P.1845-1858.
90. Sircili M. P., Walters M., Trabulsi L. R., Sperandio V. Modulation of enteropathogenic Escherichia coli virulence by quorum sensing // Infect. Immun. 2004. V.72. P.2329-2337.
91. Sperandio V., Torrres A. G., Jarvis B., Nataro J. P., Kaper J. Bacteria-host communication. The language of hormones // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2003. V.100. P.8951-8956.
92. Stoodley P., Sauer K., Davies D.G., Costerton J.W. Biofilms as complex differentiated communities // Ann. Rev. Microbiol. 2002. V.56. P. 187—209.
93. Tecott L. H., Barondes S. H. Behavioral genetics: genes and aggressiveness // Curr. Biol. 1996. V.6. P. 238-240.
94. Tetz V.V., Rybalchenko O.V., Savkova G.A. Ultrastructural features of microbial colony organization // J. Basic. Microbiol. 1990. V.30. P.597—607
95. Tetz V.V., Rybalchenko O.V., Savkova G.A. Ultrastructure of the surface film // J. Gen. Microbiol. 1993. V.139. P.855—858.
96. Tetz V.V., Korobov V.P., Artemenko N.K, Lemkina L.M., Panjkova N.V., Tetz G.V. Extracellular phospholipids of isolated bacterial communities // Biofilms. 2004. V. 1. N. 3. P. 149-155.
97. Todar K. Pathogenic E. coli. Online Textbook of Bacteriology. University of Wisconsin-Madison Department of Bacteriology. http://www.textbookof bacteriology.net/e.coli.html. 2007
98. Vilain S., Luo Y., Hildreth M., Brozel V. Analysis of the life cycle of the soil saprophyte Bacillus cereus in liquid soil extract and in soil // Appl. Environ. Microbiol. 2006. V.72. N.7. P. 4970-4977.
99. Vlisidou I., Lyte M, van piemen P. M., Hawes P., Monaghan P., Wallis T. S., Stevens M. P. The neuroendocrine stress hormone norepinephrine augments
100. Escherichia coli 0157:H7-induced enteritis and adherence in a bovine ligated ileal loop model of infection. Infect. Immun. 2004. V.72. P. 5446-5451.
101. Walters M., Sperandio V. Autoinducer 3 and epinephrine signaling in the kinetics of locus of enterocyte effacement gene expression in enterohemorrhagic Escherichia coli // Infect. Immun. 2006. V.74. P.5445-5455.
102. Watnick P. I., Kolter R. Biofilm, city of microbes. // J. Bacterid. 2000. V.182. P.2675-2679.
103. Wenner M. Going with his gut bacteria // Sei. Amer. 2008. July. P.90—92.
104. Whimpenny J., Manz W., Szewzyk U. Heterogeneity in biofilms. FEMS Microbiol. Rev. 2000. V. 24. P.661-671.
105. Xu J., Bjursell M. K., Himrod J., Deng S., Carmichael L. K., Chiang H. C., Hooper L. V., Gordon J. I. A genomic view of the human-Bacteroides thetaiomicron symbiosis // Science. 2003. V.299. P.2074-2076.
106. Zumft W. G. The biological role of nitric oxide in bacteria. Arch. Microbiol. 1993. V.160.P. 253-264.
- Шишов, Владимир Александрович
- кандидата биологических наук
- Москва, 2010
- ВАК 03.02.03
- Влияние эндогенных и экзогенных факторов на образование органических ксенобиотиков в сырье и продуктах животного происхождения
- Биогенный рельеф лесной зоны Европейской территории России
- Влияние нейротоксических соединений и мелатонина на гипоталамическую регуляцию репродуктивной системы
- О связи содержания биогенных аминов в форменных элементах периферической крови, надпочечниках и эпифизе с характером и напряженностью общих неспецифических адаптационных реакций организма
- Влияние серотонина на свойства возбудителя чумы, индуцированный апоптоз и пролиферацию иммунокомпетентных клеток