Бесплатный автореферат и диссертация по биологии на тему

Автоматический количественный анализ электрофоретических спектров белков и их комплексов (аппаратура, математическое обеспечение, эксперимент)

ВАК РФ 03.00.02, Биофизика

Содержание диссертации, кандидата технических наук, Брикач, Георгий Евгеньевич

ВВЕДЕ Н И Е.

ГЛАВА I. УСТРОЙСТВО АВТОМАТИЧЕСКОГО АНАЛИЗА ГЕЛЕВЫХ

ЭЛЕКТРОФОРЕГРАММ НА БАЗЕ ЭВМ. Ю

§ I.I. Электрофорез белков и их комплексов в полиакриламидном геле.

§ 1.2. Фотометрирование гелевых электрофореграмм.

§ 1.3. Структура и основные характеристики устройства ввода электрофореграмм в ЭВМ.®.

§ 1.4. Блок фотометрирования устройства ввода электрофореграмм.

§ 1,5. Блок сканирования устройства ввода электрофореграмм.

§ 1.6. Блок сопряжения устройства ввода электрофореграмм.

ГЛАВА 2. МАШИННЫЙ КОЛИЧЕСТВЕННЫЙ АНАЛИЗ ЭЛЕКТРОФОРЕТИЧЕСКИХ

СПЕКТРОВ БЕЛКОВ И ИХ КОМПЛЕКСОВ.

§ 2.1. Постановка задачи машинной обработки электрофореграмм на ЭВМ "Электроника-100".

§ 2.2. Математическое описание денситометрической реализации.

§2.3. Аналого-цифровое преобразование денситометрической реализации.

§ 2.4. Математическое обеспечение автоматического анализа электрофоретических спектров.

§ 2.5. Оценка погрешности измерения характеристик электрофореграмм.

ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ АПРОБАЦИИ АВТОМАТИЧЕСКОГО КОЛИЧЕСТВЕННОГО АНАЛИЗА ЭЛЕКТРОФОРЕТИЧЕСКИХ СПЕКТРОВ В БИО

ЛОГИЧЕСКИХ ИССЛЕДОВАНИЯХ.

§ 3.1. Структурная схема использования программно-алгоритмического обеспечения автоанализатора в биологических исследованиях.

§ 3.2. Применение автоанализатора в сравнительных исследованиях микроорганизмов.8°

§ 3.3. Применение автоанализатора в типировании липопротеидемий популяционной выборки.

Введение Диссертация по биологии, на тему "Автоматический количественный анализ электрофоретических спектров белков и их комплексов (аппаратура, математическое обеспечение, эксперимент)"

Актуальность темы. Решение многих биологических и медицинских задач требует проведения широких исследований больших групп организмов. Это необходимо при таксономическом анализе микроорганизмов, при реализации программ лабораторных обследований в клинике в процессе диспансерных и эпидемиологических наблюдений. При этом исследователи активно используют сравнительные характеристики белков и их комплексов, получаемые методом диск-электрофореза в полиакриламидном геле.

Аналитическое электрофоретическое фракционирование призвано решать многие современные задачи белковой химии: количественный анализ спектров белков и их комплексов, выявление и сравнительное типирование множественных молекулярных форм белков, определение чистоты и однородности белковых препаратов и др. Широкое и необходимое внедрение гелевых электрофорезов в практику биологических и медицинских исследований больших групп организмов требует биофизических подходов к решению этого вопроса. Для решения данной проблемы необходимы разработка и создание комплекса аппаратуры автоматического анализа (имещего в своем составе ЭВМ) гелевых электрофореграмм биополимеров, который обеспечивает высокопроизводительное надежное изучение протеинограмм биологических объектов, включающего в себя количественную оценку состава спектров белков и их комплексов. Решение этой проблемы особенно необходимо для обеспечения возможности проведения популяционных исследований.

Цель работы. Создание комплекса аппаратуры автоматического анализа гелевых электрофореграмм биополимеров для получения количественной оценки состава спектров белков и их комплексов.

Основные задачи исследования. В задачу работы входит:

1. Разработка технического и математического обеспечения для обработки результатов электрофоретических исследований биополимеров, включающего в себя комплекс аппаратуры и совокупность программ, которые позволяют наиболее эффективно решать задачи денситометрирования гелевых электрофореграмм, сбора денсито-метрической информации на ЭВМ, количественной обработки электрофоретических спектров белков и их комплексов с дальнейшим типи-рованием комплексных результатов их анализа.

2. Апробация разработанного комплекса аппаратуры и математического обеспечения на примерах исследования: а) электрофоретических спектров белковых систем (мембранных и внеклеточных) микроорганизмов; б) электрофоретических спектров липопротеидов сыворотки крови здоровых и больных людей.

Общая характеристика работы. Техническое обеспечение для обработки результатов электрофоретических исследований в данной работе реализовано в виде специально разработанного автоматического анализатора электрофоретических спектров белков и их комплексов на базе мини-ЭВМ "Электроника-100И. В состав комплекса технических средств анализатора включены: денситометрический преобразователь, преобразователь аналог-код, мультиплексер и ЭВМ "Электроника-100".

Особенностью разработанного анализатора в отличие от других автоматических денситометров ( Scan -400Д1)Г-5, Inte^raf ) является то, что впервые ЭВМ использована не только в режиме сбора обработки, но и в режиме управления основными узлами денси-тометрического преобразователя (преобразователем аналог-код и высоковольтным [ источником питания). Это позволило в автоанализаторе расширить диапазон измерения оптической плотности до 4 Д. Использование индикатора на базе электроннолучевой трубки, сопряженной с ЭВМ, вместо традиционных регистрирующих устройств (потенциометрических самописцев) позволило на порядок повысить скорость перемещения предметного стола в денситометрическом преобразователе. Это значительно уменьшило диспропорцию между- временем ввода электрофореграмм в ЭВМ и временем ее обработки на вычислительной машине, что в целом позволило существенно сократить общее время анализа электрофоретических спектров.

Принцип работы автоанализатора состоит в дискретизации растр-элементом электрофореграммы на отдельные элементы разложения, измерении и преобразовании в цифровой код значений оптической плотности каждого элемента разложения электрофореграммы, формирование в ОЗУ ЭВМ массивов цифровых значений денситограмм, которые в дальнейшем обрабатываются алгоритмами количественного и сравнительного анализа.

Машинная количественная обработка электрофоретических спектров биополимеров реализована в виде специально разработанного математического обеспечения, в состав которого включены пакет программ обработки денситограмм в масштабе реального времени и пакет программ обработки информации в режиме "свободного времени". Пакетом программ обработки денситограмм в масштабе реального времени решаются следующие задачи:

1. Непосредственный ввод от денеитометрического преобразователя цифровых значений оптической плотности элементов разложения электрофореграмм в ЭВМ.

2. Организация массивов цифровых значений оптической плотности вводимых в ОЗУ ЭВМ электрофореграмм.

3. Дистанционное управление преобразователем аналог-код и высоковольтным источником питания ФЭУ с помощью ЭВМ.

-74. Проверка достоверности ввода информации в ОЗУ ЭВМ путем формирования дискретных амплитудных значений денситограмм на экране ЭЛТ.

Пакетом программ обработки фонового режима решаются следующие задачи:

1. Формирование "нулевого" уровня денситограммы (для градиентных гелей - несколько "нулевых" уровней).

2. Определение координат и высот пиков денситограммы.

3. Вычисление процентных количественных содержаний вещества в идентифицированных фракциях и расчет относительных координат.

4. Сравнительный анализ денситограмм по параметру Rf и коэффициентам их автокорреляционных функций.

5. Вывод результатов количественной обработки ( Rf - параметра, процентных количественных содержаний вещества во фракциях, коэффициентов близости) на ЭПМ "Консул-254".

С помощью разработанного анализатора с целью его апробации методом автокорреляционного анализа проведено сравнительное изучение электрофоретических спектров мембранных белков (14 штаммов стафилококков), внеклеточных белков (12 штаммов стафилококков) и исследование электрофоретических спектров липопротеидов сыворотки крови 237 людей.

Научная новизна и основные результаты работы. Впервые на базе отечественных средств измерительной и вычислительной техники создан автоматический анализатор гелевых электрофореграмм. Разработанное устройство защищено двумя авторскими свидетельствами^. Создано из программ для ЭВМ "Электроника-100" математическое обеспечение, позволяющее в режиме "он-лайн" осуществлять х/ А.С. № 738602 и № 805998 обработку электрофоретических спектров белков и их комплексов.

С помощью разработанного анализатора совместно с клиницистами и клиническими биохимиками исследованы электрофоретические спектры липопротеидов сыворотки крови людей. При этом определены процентные количественные содержания вещества в электрофоре-тически разделенных фракциях пре-бета-, бета- и альфа-липопроте-идов, Показана целесообразность включения такого количественного определения состава липопротеидов в комплекс широких (популяци-онных) обследований людей.

Использование автоанализатора для получения данных по сравнительному анализу денситограмм электрофоретических спектров белковых систем микроорганизмов положительно оценено микробиологами. На основании автокорреляционной оценки степени близости сопоставленных денситограмм было проведено группирование 14-ти штаммов стафилококков, которое согласовалось с видовыми признаками 6. aures и epidermis, . Хорошее согласование со штаммовыми характеристиками стафилококков также было получено по результатам автокорреляционного анализа денситограмм электрофоретических спектров внеклеточных белков 12 штаммов стафилококков. Дальнейшее развитие этих наблюдений представляет большой интерес для эпидемиологических исследований.

Практическое внедрение. На базе ГНИИЭМ для использования разработанного автоанализатора в 1978 году был создан центр, который по мере необходимости обслуживал (кроме лабораторий института) три терапевтические клиники Горьковского медицинского института им. С.М.Кирова (на базе областной и двух городских больниц) и медицинский пункт одного предприятия г. Горького.

Результаты исследования спектров белков и их комплексов с помощью автоматического количественного анализа электрофореграмм включены в программу обучения студентов кафедры молекулярной биологии Горьковского госуниверситета им. Н.И.Лобачевского и используются в учебном практикуме, а также в научно-исследовательской работе сотрудников биологического факультета ГГУ.

Автор защищает следующие положения:

1. Устройство для автоматического количественного анализа электрофоретических спектров белков и их комплексов.

2. Математическое обеспечение для количественной обработки электрофоретических спектров белков и ш. комплексов.

3. Результат апробации системы на нескольких конкретных задачах, показывающие возможность ее дальнейшего использования в широких (популяционных) биологических и медицинских исследованиях.

Заключение Диссертация по теме "Биофизика", Брикач, Георгий Евгеньевич

вывода

1. Для улучшения основных технических характеристик (расширение диапазона измерения оптической плотности и быстродействия) показана целесообразность и эффективность использования ЭВМ в структуре данного класса анализаторов не только в режиме сбора и обработки, но и в режиме управления основными функциональными узлами денеитометрического преобразователя (высоковольтным источником питания и аналого-цифровым преобразователем).

2. Разработанная операционная система, представляющая собой комплекс программ для ЭВМ "Электроника-100", вполне пригодна для решения задач по автоматической обработке электрофоретических спектров белков и их комплексов.

3. Показана целесообразность использования в сравнительных исследованиях белковых систем микроорганизмов количественной оценки степени близости электрофоретических спектров, базирующейся на методе автокорреляционного анализа многоэкстремальных денситограмм.

4. Показана возможность выявления гиперлипопротеидемии у людей по процентным количественным содержаниям вещества в электрофо-ретически разделенных фракциях пре-бета-, бета-, альфа-липопроте-идах сыворотки крови и целесообразность использования количественных соотношений этих фракций в комплексе анализов, применяемых для типирования гиперлипопротеидемий.

Библиография Диссертация по биологии, кандидата технических наук, Брикач, Георгий Евгеньевич, Горький

1. Raymond S. Acrylamidegel electrophoresis.-Ann.N.Y. Sci., 1964,v.121,N2,p.350-365.

2. Сафонов В.И., Сафонова М.П. Анализ бежов растений методом вертикального микроэлектрофореза в полиакриламидном геле. -Физиология растений, 1969, т. 16, J6 2, с.350-357.

3. Успенская В.Д., Николаев Е.А., Смирнов М.Н. Электрофорез белков в крахмальном и полиакриламидных гелях. В кн.: Современные методы в биохимии» - М.: Медицина. 1968, с. 276-300.-1132

4. Подильчак Э.М. Показатели электрофореза и им^уноэлектрофоре за белков сыворотки крови у больных раком желудка. -Клиническая хирургия. 1972, 12, с.32-36.

5. Гарькавыи М.И., Ковнер Ф.Я., Нарбутене Г.Л. Изоферментный спектр лактатдегицрогеназы сыворотки крови больных злокачественными опухолями. Вопросы онкологии, 1978, т.24, iS I, с.З^ -38.

6. Зельвин Б.М., Белоусов А.П. Электрофоретическое исследование белковых фракций сыворотки крови крыс аспидной гепатомой Зайделя и эмбрионов. Вопросы Онкологии, 1971, т.17, № 9, с. 61-65.

7. Алебалов Ю.М., Карташев В.В. Исследование оелков сыворотки крови методом дискового электрофореза в ПААГе у больных вирусным гепатитом. Клиническая медицина, 1977, т. 55, IS 2, с. 12 6-131.

8. Пирогова Т.Ф. Теория и практика применения метода диск-электрофореза в полиакриламицном геле в клинико-биохимическиз исследованиях: Автореф. Дис. . док.мед.наук Рига, 1975.30 с.

9. Скачков А.П. улектрофоретическое изучение белков сывороткикрови на ранних стадиях действия J3 нафтиламина. - Вопросы онкологии, 1973, т.19, & 6, с.72-89.

10. Апанащенко Н.И., Филиппова Л.М., Хлебникова Н.Н. Изучение дифтерийных токсинов методом дискового электрофреза в полиак-риламидном геле. ЬМЭИ, 1971, & 9, с.37-42.

11. Маурер Г. Диск электрофорез. - М.: Мир, 1971. - 247 е., ил.

12. Фриш С.Е. Оптические методы измерения. Л.: ЛГУ, 1976. - 80ил.

13. Сакин И.Л. Инженерная оптика. Л.: Машиностроение, Ленингр. отд-ние, 1976. - 150 е., ил.

14. Гришин М.П., Курбанов Ш.М., Маркелов В. П. Автоматический ввод и обработка фотографических изображений на ЭВМ.-М.: Энергия, 1976. 231 е., ил.

15. Петренко А.И. Автоматический ввод графиков в электронные вычислительные машины. М.: Энергия, 1968. - 480 с.ил.

16. Устройство съема информации для световой микросю пии "Протва-( Техническое описание и инструкции по эксплуатации. - JI.: Л0М0, 1979 - 120 с.

17. Унифицированная аппаратура /микроскоп ЭВМ/ для съема информации в комплексе "Протва" /К.А.Яновский, Д.П.Беляй, М.И. Давыдова и др. - В кн.: Статистические свойства микрострукту. Тез.докл.I Всесоюзной конференции. - М., 1978, с.102.

18. Красильников Н.Н. Статистическая теория передачи изображений. М.: Связь, 1976. 198 е., ил.

19. КАМАК системы автоматизации в экспериментальной биологиии медицине /под общей редакцией Ю.Е. Нестерихина и др. Новосибирск: Наука, Сибирское отделение, 1979 - 265 с. ил.

20. Построение комплексных интегрированных АСУ ТП/Б.А.Клюшин, А.И.Савин и др. Электронная промышленность, 1974, № I, с.12-19.

21. Дегтева Г.К. Сопоставление белковых спектров при сравнительно-физиологическом изучении микроорганизмов ни модели стафилококков. Дис. . канд.биол.наук - Горький, 1971 - 150 с.

22. Блохина И.Н. 0 сочетании биохимических и математических метод! исследования при сравнительно-физиологическом изучении микроорганизмов. В кн.: Материалы П Всесоюзного биохимического съезда . - Ташкент ФАН, 1969, с.5-6.

23. Клопфенштейн Ч.Е.,Уилкинс Ч.А. Применение ЭВМ в химических и биохимических исследованиях. М.: Химия, 1976. - 266 е., ил.

24. Темников Ф.Е. Автоматические регистрирующие приборы. М.: Машгиз, I960. 352 е., ил.

25. Хлистунов В.Н. Основы цифровой электроизмерительной техники.- М.: Энергия, 1966. 301 е., ил.

26. Чеголин П.М. Автоматизация спектрального и корреляционного анализа. М.: Энергия, 1969. - 239 е., ил.

27. Алгоритмы автоматической обработки денситограмм растворимых белков микроорганизмов на ЭЦВМ (Г.Е.Брикач, Б.А.Илюшин м др.)- В кн.: Динамика биологических систем. Горький, ГГУ, 1977, с. 122-123.

28. Коллик Э.А., Кальюранд М.Р., Коэль М.Н. Применение ЭВМ в газовой хроматографии. М.: Наука, 1978. - 126 с.

29. Заварзин Г.А. Феногенетическая систематика бактерий. Пространство логических возможностей. М.: Наука, 1974. - 126 с.

30. Стейниер Р., Эдельберг Э., Ингрем Дк. Мир микробов. М.: Мир, 1979, т.З, с. 5-26.

31. Colwell R.R. Polyphasic taxonomy of the genus Vibrio: numerical taxonomy of Vibrio eholerea, Vibrio parahaemoly-ticus and related Vibrio species.- T,Bacterid., 1970, Ю4, N 1, p.410-433.

32. Ubel K.,Deschmertzing H.,Peterson J.I. Classification of microorganisms by analysis of chemical composition.~ J.Bacteriol, 1963, 85, р.Ю39~Ю44#

33. Атарова Г.Т. Сравнительное изучение протеинограмм вибрионов и близкородственных микроорганизмов методом диск-электрофореза в полиакриламидном геле. Ж. микробиол., 1976, $ 6, с. 89-94.

34. Дегтева Г.К., Беляев Е.И., Калина А.П. Некоторые данные сравнительно-физиологического изучения стафилококков различного происхождения с использованием характеристик их белковых спектров. Ж. микробиол., 1971, № 8, с. II2-II6.

35. Зайцева Г.И., Белозерский А.Н. Электрофоретическое изучение белковых компонентов азотобактера в зависимости от вида, возраста культуры и источника азотистого питания. Биохимия, 1959, № I, с. 133-143.

36. Дегтева Г.К., Белковые системы клетки стафилококковв таксономическом аспекте. В кн.: Стафилококковые инфекции и пер-систенция микроорганизмов. - Материалы Всесоюзного пленума Проблемной комиссии "Медицинская микробиология". М.: 1980, с. 8-9.

37. Macoto Y.,Matheson А. Т.,Visentin L.P. Procaryotic ribosomal proteins: N -terminal seguence homologies and structural correspondence of 30^ ribosomal proteins from E.coli and Bacillus streurothemophilus.~FEBS.Lett,1974,46,N1,p.296-300

38. Norman W.Sch. Comparative immulogy of ribosomes and disk gel electrophoresis of ribosomal proteins from erwinial other members of the family Enterobacteriacease.- Int.T. Syst.Bacterid., 1974, 24, N 1, p.42-53.

39. Ocawa S.,0taka E.,Takata K. Ribosomal protein genes in bacteria.-In:Fuct.Units Protein Biosynth.Fed.Fur Biochem. Soc. 7th.Melt Varna,1971

40. Дегтева Г.К. Сопоставление белковых спектров стафилококков при сравнительно-физиологическом изучении. В кн.: Стафилококки и стафилококковая инфекция. Саратов, 1980, с. II9-I28.

41. Структура и функции биологических мембран. Под ред. А.С. Тро-шина. M.I Наука, 1975.

42. Razin S.,Rottem S. Identification of %coplasma and other microorganisms by polyacrylamide-gel electroforesis of cell proteins.-J.Васteriol, 1967, 94,p.1807-1810.

43. Razin Sh. %coplasma taxonomy studied by electrophoresis of cell proteins.-J.Baktariol.,1968, 98, N 3, p.687-694.

44. Poxton I.R.,Brown R. Sodium dodecyl sulphatepolyacrylamide gel electrophoresis of cell-surface proteins as an aid to the indentification of the Bacteroides fragillis group.-T.Fen.Microbiol., 1979, 112, N 2,p.211-217.

45. Thomspon D.A. Mould D.L. Protein electrophoretic patternof Pasteurelle haemolytica.-Rev. Vet., Sei., 1975, 18, H 3, p.341-343.

46. Darvean R.P. ,Chametzky W.T.,Nurbert R.E. Outer membrane protein composition of Yersinia pestis at different growth stages an incubation temperatures.-Т.Васteriol., 1980, 143, N 2, p.942-949.

47. Loeb M.R.,Smithe D.H. Outher membrane composition in dise-anse isolates of Haemophilus influensae pathogenic and epidemiological implication.-Infect. I™11111*, 1980,30,КЗ,p.709-711.

48. Григорьева Г.И., Дегтева Г.К. Изучение мембранных белковых спектров стафилококков в сравнительно-физиологическом аспекте. Ж. Микробиол., 1979, № 4, с. 71-75.

49. Ames T.F. Resolution of bacterial proteins by polyacrylamide gel electrophoresis on slabs.- T.Biol.Chem.,1974, 249, N 2, p.634-644.

50. Фадеева Н.И., Кочемасова 3.H., Сарычева И.М. Протеинограммы ацетоновых препаратов микробактерий. Лаб. дело, 1975, $ 8, с. 500-502.

51. Куренная И.И., Шиманюк Н.Я. К таксономическому изучению холерных и холероподобных вибрионов. Мат. ХУ Всес. съезда эпидемиол., микробиол. и инфекц. Тез. докл. М., 1970, ч. I, с. 186-187.

52. Карпов А.В., Скрипаль И.Г., Малиновская Л.П. Электрофорез белков как средство таксономического анализа фитопатогенных микоплазм. Вирусные болезни сельскохозяйственных культур. М., 1980, с. 50-56.

53. Ferguson D.A.,Cummins C.S. Differentiation of anaerobic cory-neforms by protein banding patterns in polyacrylamide slab gels.~Abs.trs.Annu.Meet.Amer.Soe.Microbiol.,N4,Washington, 1976,p.117.

54. Fox R.H. Taxonomic characterization of some yellow pigmented miorococei by polyacrylamide gel electrophores of soluble protens. Miorobios, 1975, 13, N 53, p«105-110.

55. Котова А.Л. Изоэнзимы малатдегидрогеназы у сальмонелл и бактерий аризона. Ж.микробиол., 1976,Р 2,с. 131-132.

56. Горшкова В.И. ,Ленцер А.А. ,Лизько Н.Н. Электрофоретическая характеристика изоферментов лактатдегидрогеназы у лактоба-цилл,определение их активности. Прикладная биохимия и микробиол., 1У75,№ 1,с. 49-51.

57. Lund В.М. A comparison by the use of gel electrophoresis of doluble protein components and esterose enzymes of some group D.Streptococci.-T.Gen.Microbiol.,1965,40.N3,p'.413-419.

58. Williams R.A.D.,Hutchins K.I. Electrococous of glucose-6phosphabe dehydrogenase of streptococcus mitis and Streptococcus salwarius. Arch. Oral.Biol,1969,14,N2,p.219-221.

59. AdamonL.,Brucker J., Blobel H.Weitere Analysen von Pausteu-rella-Protein mit devertilalen Poliacrylamide gel-Disk-Elec-trophorese. Zbl.Vterinarmed., 1972,IT 5,p.412-415.

60. Брикач Г E Применение метода'автоматической обработки фотографий на ЭЦВМ ддя сопоставления белковых спектров микроорганизмов . В кн.: Физиология и биохимия микроорганизмов, Горький, НУ, 1974,с.29-34.,

61. Брикач Г.Е. ,Клюшн Б.А, Автоматический ввод и обработка данных диск-электрофореза в полиакриламидном геле на ЭШ В кн : Биохимия и биофизика микроорганизмов, Горький, 1ТУ, 1977,с.35-38.

62. A.cJ£ 7386П2 /СССР/. Устройство для анализа, электрофореграмм / Г.Е. Брикач и др./- Опубл. в Б.И. 1980, ЖГ.79. а.с. 805998 / ссср/. Устройство для анализа электрофореграмм / Г.Е. Брикач и др. /.- Опубл. в Б.И. ,1980, JS 42.

63. Kersters К.,De Ley t. Identification and groopig of bakteria by numerical analysis of their electroforetic protein patterns.- J.P. microbiol.,1975»87, N 2,p.333-342.

64. Kersters K.,De Ley T. Classification and identification of bactria by electroforesis of their proteins. In: Microbiol. Classif. and Identif. Symp. Impact. Mod. Meth. Conf. Birmingham, 1978,London,1980,p.273-297.

65. Дегтева. Г К,, Блохина И.Н. Сопоставление белковых спектров стафилококков с помощью некоторых математических приемов.-В кн.: Стафилококковые инфекции. Л.,1972, I, с.28

66. Богословский С.Н., Григорьева Г.И. Применение многомерного статистического анализа для сравнительного изучения белковых спектров. В сб.: Биохимия и биофизика микроорганизмов. Горький, 1982, с. 116—119.

67. Morisett J.D., Jackson R.L.,Yosso A.M. Lipid-protein interaction in plasma lipoprotein. Biochem et hiophysacta, 1977, Т.Ч72, N2, p.93-133.

68. Карманский И.М., Шпикитер В.А., Левитова E.H., Свойства, строение и роль липопротеидов сыворотки крови. Успехи биологической химии. 1975, № 16, с. 8-20.

69. Климов А.Н. Новые данные о структуре липопротеидов. В кн.: Структура, биосинтез и превращение липидов в организме животных и человека: Тез. докл. III Всесоюзного симпозиума. -Л.: Наука, Ленинград, отд-ние, 1978, с. 9.

70. Михайлов М.Л. Изменение спектра свободных жирных кислот в плазме при экспериментальной гипертонии у крыс. Кардиология, 1972, № I, с. 88-91.

71. Zaggher P., Dedovis G., Muller К. Molekular paroing and fluidity of lipids in human serum low density lipoproteins.

72. Hoppe-seylers Z.-Physiol* chem., 1977,т.358, N7,p.771 -778.

73. Карманский И.М., Шпикитер B.O. Действие липаз на сывороточные липопротеиды низкой плотности. Бюллетень экспериментальной биологии и медицины, 1977, № 3, с. 33.

74. Климов А.Н., Некоторые вопросы патогенеза атеросклероза, -Кардиология, 1976, if0 2, с. 7-15.

75. Никульчева Н.Г. Фенотипирование редких типов гиперлипопро-теидемий. Кардиология, 1976, № 2, с. 55-60.

76. Герасимова Е.Н. 0 некоторых проблемах патогенеза атеросклероза. Терапевтический архив, 1975, # 7, с. 15-23.

77. Левитова Е.Н. Выделение фракций ЛП из сыворотки крови человека с помощью ультрацентрифугирования. В кн.: Современные методы в биохимии. М.: Медицина, 1977, с. 77-85.

78. Климов А.Н., Попов А.В. О механизмах транспорта ЛП и ХС в сосудистую стенку. Кардиология, 1976, № 2, с. 30-37.

79. Комаров Ф.И., Коровкин Б.Ф. Диагностическая ценность исследования показателей липидного обмена. В кн.: Биохимические исследования в клинике. - Л.: Медицина. Ленинград, отд-ние, 1976, с. 183-218.

80. Rubenstein В., Steiner G. Fractionation of human low density lipoprotein Ъу column cromatography. Can J.Biochem,1976, т.54, N12, р.1023-Ю28#

81. Климов A.H., Никульчева Н.Г. Типы гиперлипопротеидемий иих связь с атеросклерозом и их лечение. Кардиология, 1972, № 6, с. 133-149.

82. Климов А.Н. Ганелина И.Е. Фенотипирование гиперлипопротеидемий. Методические рекомендации. М.: МЗ СССР, 1975. - 33 с.

83. Чазов Е.И., Вихерт A.M., Метелида В.И. Эпидемиология ишеми-ческой болезни сердца. Кардиология, 1972, № I, с. 7-18.

84. Климов А.Н., Никульчева Н.Г., Криворученко Н.В. Фенотипирование гиперлипопротеидемий. Кардиология, 1974, № 12, с. 42- 45.

85. Шпикитер В.О., Лобова Н.М., Бавина М.В. Спектры ЛП сыворотки крови при атеросклерозе. Терапевтический архив, 1974, т. 46, № 3, с. 28-35.

86. Маграчева Е.А. Разделение липопротеидов сыворотки крови методом диск-электрофореза в ПААГ. Вопросы медицинской химии, 1973, If 6, 56-62.

87. Попов А.В., Андреева Л.И., Кузнецов А.С. Быстрый метод препаративного разделения ЛП на основные классы при ультрацентрифугировании в градиенте плотности. Вопросы медицинской химии, 1975, № 4, с. 434-437.

88. Асланян Н.Л., Щухлян В.М. Определение фракций (классов) липопротеидов методом электрофореза в ЛААГе. Журнал экспериментальной и клинической медицины, 1976 , if0 4, с. 47.

89. Применение количественного автоматического анализа электро-фореграмм при типировании липопротеидемий (Н.А.Добротина, Г.Е.Брикач и др. Лабораторное дело, 1979, $ 3, с. 172-175.

90. Автоматизированная система сбора и анализа электрофорети-ческих спектров сывороточных белков и их комплексов на базе мини и микро ЭВМ ( Г.Е.Брикач, С.Н.Богословский и др.

91. В кн.: Материалы III Всесоюзной конференции по биологической и медицинской кибернетике. М., 1978, т. 4, с. 81.1. ПРИЛОЖЕН И Е-125

92. ПРОГРАШЮЕ ОБЕСПЕЧЕНИЕ АВТиАНМИЗАТиРА ГЕЛЕВЫХ ЭЛЕКТРОФОРЕГРАММ

93. Ввод слова инфор 'мацин на1. СМлСг— Ra1. Ввод слово* информации на1. СМлСг — R?

94. Описанный цикл операций выполняется до тех пор пока вся информация считываемая в блоке сканирования с одной электрофореграммы не будет введена в ОЗУ ЭВМ.

95. Программа фильтрации высокочастотных составляющих производат цикл операций» реализующий метод дискретного Фурье-преобразования:1. Zc (i) —- а (л) -- а2(л)i) —- ь(п) — ьг(п)1. Zu(i) = У(п)

96. Рис. П.2. Блок-схема программы фильтрации

97. По условию X s 0 осуществляется переход к первому циклу,который вычисляет спектр шумовой составляющей, после чегозначения вычисленных коэффициентов спектра заносятся в зону Ъ(п) (п = О . . т-1)

98. Ь(л) массив коэффициентов спектра шумовой составляющей.

99. У(i)- амплитудные значения оптической плотностиэлементов разложения электрофореграммы7. j порядковый номер максимума и минимума

100. N-кр" координата экстремума краски-свидетеля Программа, реализующая алгоритм сравнительного анализа,определяет число совпавших значений координат экстремумов1. ВХОД

101. К текущий адрес массива координат эталоннойкривой.вход0 — &4 — к— 1