Бесплатный автореферат и диссертация по биологии на тему
Анализ генов 12SrRNA, tRNASer(UCN), MYO7A и USH2A у пациентов с наследственными формами нарушения зрения и слуха
ВАК РФ 03.00.15, Генетика
Автореферат диссертации по теме "Анализ генов 12SrRNA, tRNASer(UCN), MYO7A и USH2A у пациентов с наследственными формами нарушения зрения и слуха"
На правах рукописи
ТАЗЕТДИНОВ АНДРЕИ МАУЛЕТЗЯНОВИЧ
АНАЛИЗ ГЕНОВ ШгША, {ЯШ^00^, М¥07А И ШН2А У ПАЦИЕНТОВ С НАСЛЕДСТВЕННЫМИ ФОРМАМИ НАРУШЕНИЯ ЗРЕНИЯ И СЛУХА
03.00.15 - генетика
АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук
Уфа-2008
003455993
Работа выполнена в Институте биохимии и генетики Уфимского научного центра Российской Академии наук
Научный руководитель:
доктор биологических наук, профессор Хуснутдинова Эльза Камилевна
Официальные оппоненты: доктор биологических наук, профессор
Чемерис Алексей Викторович Институт биохимии и генетики УНЦ РАН
доктор биологических наук, Голденкова-Павлова Ирина Васильевна Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН
Ведущая организация:
Медико-генетический научный центр, РАМН, г. Москва
Защита состоится « 3 <Г» декабря 2008 г. в Ц ^^ часов на заседании Объединенного диссертационного совета ДМ 002.133.01 при Институте биохимии и генетики Уфимского научного центра РАН по адресу: 450054, г. Уфа, пр. Октября, Д.71.
С диссертацией и авторефератом можно ознакомиться в Научной библиотеке Уфимского научного центра РАН и на сайте Института биохимии и генетики: http:www.anrb.ru/molgen/dissov.html Автореферат разослан «Д<Г » ноября 2008 г.
Ученый секретарь диссертационного совета
Бикбулатова С.М.
ОБЩАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА РАБОТЫ Актуальность проблемы. Нарушения зрения и слуха относятся к частым заболеваниям органов чувств, нередко приводящих к инвалидизации, и осложняющих адаптацию человека в обществе. Данные о распространенности врожденных форм нарушения зрения и слуха, а также их сочетанных форм, в различных странах неоднозначны и сильно варьируют. Общепринято, что распространенность наследственных нарушений слуха составляет - 100:10s населения, зрения- 20-28:105, а сочетанных дефектов зрения и слуха- 6:105 [www.genetests.org]. По данным ВОЗ, около 13-20 млн. людей в России имеют различные формы тугоухости и глухоты [Гинтер с соавт., 2002; Зинченко, 2007]. Считается, что 50-60% всех случаев врожденной глухоты имеет наследственную этиологию. Около 75% всех случаев наследственной несиндромальной глухоты приходится на аутосомно-рецессивные формы, 10-15%- на аутосомно-доминантные, и несколько процентов - на сцепленную с Х-хромосомой и митохондриальную формы потери слуха [Morton et al., 2006]. Однако, в последнее время, предполагается, что вклад мутаций генов 12SrRNA и tRNASer(UCN) мтДНК, ассоциированных, как с врожденной, так и с острой нейросенсорной тугоухостью/глухотой (ОНТ), инициированной приемом аминогликозидов, возможно, более высокий, чем оценивалось ранее [Jacobs et al., 2005]. Исследования последних лет показали, что митохондриальные мутации составляют, по крайней мере, 1% случаев доречевой потери слуха и 5% случаев послеречевой несиндромальной глухоты во многих популяциях Европы и Азии, занимая второе место после гена GJB2 [Jacobs et al., 2005].
В связи с особой актуальностью и значимостью проблемы ОНТ, отсутствия ее ранней диагностики, системы профилактических мероприятий на фоне частой аминогликозидной терапии, и отсутствия точных данных о распространенности различных митохондриальных дефектов у больных с потерей слуха из различных этнических групп России, актуальным является изучение частот и спектра мутаций генов 12SrRNA и tRNASer(UCN> мтДНК для оценки риска возникновения нейросенсорной глухоты в семьях с отягощенным наследственным анамнезом, а также разработки схемы дородовой ДНК диагностики у плода.
Среди 400 известных синдромов, сочетающихся с патологией слуха, одной из наиболее распространенных является синдром Ушера (СУ). СУ- это аутосомно-рецессивное заболевание, характеризующееся клинической и генетической гетерогенностью, при различных формах которого наблюдаются сочетания нарушения слуха и зрения, встречается у 3-10% больных с врожденной глухотой и у 50% детей со слепоглухотой [Ahmed et al., 2003; www.genetests.org]. К настоящему времени известно, что для каждой популяции характерны свои спектр и частота мутаций, и что повреждение 8 разных генов могут быть причиной развития 3 типов СУ.
Наиболее частой причиной развития синдрома являются мутации в генах неконвенционалыгого миозина VIIA (MY07A) и ушерина (USH2A), обуславливающих, 75% случаев USH1B и 70-80%- USH2A, соответственно, белковые продукты которых играют чрезвычайно важную роль в функционировании сетчатки и внутреннего уха. Известно, что различные мутации в гене MY07A также могут вызывать аутосомно-доминантную (DFNA11) и аутосомно-рецессивную глухоту (DFNB2) [www.genetests.org].
Целью исследования явилось изучение структурных особенностей генов I2SrRNA, tRNASer(UCN} мтДНК, MY07A и USH2A у пациентов с наследственными формами нарушения зрения и слуха.
В соответствии с целью были сформулированы следующие задачи:
1. провести поиск изменений нуклеотидной последовательности в генах I2SrRNA и мтДНК у больных с врожденной и острой нёйросенсорной несиндромальной тугоухостью/глухотой из Республик Башкортостан, Саха (Якутия), Алтай и г. Санкт-Петербурга;
2. провести поиск изменений нуклеотидной последовательности в гене MY07A у больных с несиндромальной глухотой и синдромом Ушера;
3. разработать мультиплексные системы для детекции изменений нуклеотидной последовательности в гене MY07A;
4. провести скрининг мутации p.Cys759Phe гена ушерина (USH2A) у больных с синдромом Ушера;
5. оптимизировать алгоритм молекулярно-генетической диагностики наследственной несиндромальной глухоты в исследованных регионах.
Научная новизна. Проведен молекулярно-генетический анализ несиндромальной (врожденной и острой) и сиидромальной нейросенсорной тугоухости у пациентов из разных регионов. Впервые получены данные о спектре и частоте патогенных и полиморфных вариантов нуклеотидной последовательности в генах 12SrRNA, tRNASer<VCN> мтДНК, MY07A у больных с наследственными формами нарушения зрения и слуха из разных регионов РФ. Проведенный анализ генов 12SrRNA и MY07A выявил ряд изменений нуклеотидной последовательности, обнаруженных впервые - m.930G>C, m.961T>A, m.l027A>G в гене 12SrKNA, и с.4074С>Т (p.Serl358Ser) в гене MY07A.
Практическая значимость. Оптимизирован алгоритм для выявления мутаций в генах GJB2, GJB6, I2SrRNA и tRNASer°JCN) мтДНК и проведения ДНК-диагностики наследственной несиндромальной глухоты в семьях высокого риска в исследованных регионах РФ. Полученные данные о частоте и спектре мутаций в генах 12SrRNA и tRNASer(UCN} мтДНК представляют практический интерес для понимания молекулярно-генетических основ функционирования процесса звуковосприятия, и являются необходимым условием для повышения эффективности работы медико-генетического консультирования и профилактики наследственной патологии в исследованных регионах.
Апробация работы. Основные результаты диссертационной работы были представлены на международных конференциях: «VII Balkan Meeting of Human Genetics» (Skopje, 2006), «ESHG» (France, 2007), «Newborn Hearing Screening» (Cernobbio, 2008), школе- семинаре «Биомика - наука XXI века» (Уфа, 2007), XI-ой школе-конференции «БИОЛОГИЯ- НАУКА XXI ВЕКА» (Пущино, 2007), и VI-ой всероссийской ежегодной конференции «Наука и практика в оториноларингологии» (Москва, 2007).
Публикации. По теме диссертации опубликовано 12 работ, в том числе 3 статьи в журналах из перечня рекомендованных ВАК, 2 патента (№2317547 от 20.02.2008, МПК G01№33/48- Решение о выдаче патента на изобретение по заявке №2007115659/13(017017)).
Структура и объем диссертации. Диссертация состоит из введения, литературного обзора, описания материала, методов, результатов исследования
и обсуждения, заключения, выводов, списка литературы, приложения. Работа изложена на 146 страницах машинописного текста, содержит 12 таблиц и 45 рисунков. Список литературы включает 256 источников.
Материалы и методы исследования. В качестве материала были использованы образцы ДНК пациентов, а также членов их семей, с диагнозом врожденная и острая нейросенсорная тугоухость/глухота, СУ, и индивидов с нормальным слухом из различных регионов РФ (табл. 1).
Таблица!
Численность групп больных и здоровых индивидов из разных регионов
Регион Кол-во больных с нет Кол-во больных с ОНТ Кол-во больных с СУ Кол-во индивидов с нормальным слухом
Башкортостан1 279 0 18 150
С.Петербург^ 51 71 22 100
Якутия"1 83 0 0 120
Алтай4 58 0 0 102
Степень потери слуха была установлена на основе данных тональной пороговой аудиометрии (по критериям Российской классификации тугоухости), акустической импедансометрии и регистрации отоакустической эмиссии, а диагноз СУ - на основании аудиологических, офтальмологических данных, а также анализа вестибулярной функции (электронистагмографии). Наследственный характер глухоты в семьях устанавливали на основании генеалогических данных и ретроспективного анализа анамнеза больных, с целью исключения возможного влияния факторов внешней среды (инфекции, травмы слухового аппарата) во время пренаталыюго и постнатального развития. При изучении анамнеза пациентов особое внимание обращалось на факт
1 Сурдологический центр РДКБ, Перинатальный центр МЗ РБ (г. Уфа);
2 Кафедра оториноларингологии Военно-медицинской академии имени С.М. Кирова, лаборатория слуха и речи НИЦ Государственного медицинского университета им. акад. И.П. Павлова (г. Санкт-Петербург);
3 Якутский научный центр Сибирского отделения РАМН, Медико-генетическая консультация РБ№1-НЦМ, Сурдологопедический центр РБМ1-НЦМ (г. Якутск);
4 Республиканский сурдологопедический кабинет, Республиканское общество глухих, специализированная школа для глухих детей (г. Горно-Алтайск).
применения ототоксичных антибиотиков и/или перенесенным в детстве заболеваниям, предполагающим возможную аминогликозидную терапию. В качестве контроля использованы ДНК здоровых индивидов, сопоставимых по полу, возрасту и этнической принадлежности с исследуемой группой.
Молекулярно-генетические методы исследовании. Геномная ДНК была выделена методом последовательной фенольно-хлоформной экстракции [Mathew et al., 1984]. На основе первичной последовательности генов 12SrRNA, MY07A, полученной из баз GenBank® и Genatlas, с помощью пакета биологических программ были подобраны 3 пары обычных и 6 мультиплексных (триплексных) систем синтетических олигонуклеотидов. Предложенные программой праймеры были оценены на степень гомологии с ДНК Homo sapiens посредством сравнения последовательностей праймеров и баз биологических данных [wvw.genebee.msu.su/blast_new/blast.html].
Для детекции известных мутаций в образцах ДНК пациентов и контрольных выборок, с использованием эндонуклеаз НаеШ, Xbal, MboII, Hinfl, CviRI был проведен рестрикционный анализ генов 12SrRNA, tRNASer(UCN}, USH2A. Результаты ПДРФ-анализа оценивались проведением вертикального электрофореза в 7% ПААГ при напряжении 300V в IxTBE буфере с последующим окрашиванием бромистым этидием и визуализацией при ультрафиолетовом облучении. В качестве маркера молекулярного веса использовали ДНК фага XpUC19IMspI. Для выявления изменений нуклеотидной последовательности в гене 12SrRNA бйл проведен SSCP-аналйз трех амшшфицированных фрагментов, фланкирующих позиции- 616-938, 894- 1140 и 1247- 1585, соответственно. Для идентификации известных и неизвестных изменений нуклеотидной последовательности в гене MY07A был использован SSCP-анализ ПЦР продуктов, синтезированных с использованием мультиплексных систем. Определение последовательности нуклеотидов в образцах ДНК с конформадионными полиморфизмами проводили с помощью автоматического секвенатора ABI PRISM 310 (Applied Biosystems). Результаты секвенировапия оценивали в программе BioEdit v.5.0.9 (1997-2001), MegAlign из пакета программ DNAStar Inc. (1993-2002). Статистическая обработка полученных данных проводилась с использованием пакета программ
"STATISTICA 5.0" (StatSoft), MS Excel 2003 (Microsoft). При . попарном сравнении частот аллелей в популяционной выборке использовался двусторонний критерий Фишера Р (F2), а также х2(Р) с поправкой Йетса на непрерывность. Статистически значимыми считали различия частот аллелей при значении Р<0.05.
РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ Анализ генов 12SrRNA и tRNASa(UCN> мтДНК у больных с врожденной и острой несицоромальной нейросенсорной тугоухостью/глухотой из различных регионов РФ. У пациента с нейросенсорной тугоухостью (НСТ) из Республики Башкортостан русской этнической принадлежности в гене 12SrRNA наряду с мутацией m.827A>G, обнаружен полиморфизм m.750A>G, согласно литературным данным, идентифицированный в популяциях Африки, Сев. Америки и Европы [Kivisild et al., 2006]. Дальнейшие исследования позволили выявить данный полиморфизм среди пациентов с нарушениями слуха из Туниса и Китая [Li et al., 2005; Mkaouar-Rebai et al., 2006]. Изменение нуклеотидной последовательности в 827 положении гена l2SrRNA было впервые обнаружено Li et al. в 2005 году при исследовании пациентов из Китая, потерявших слух после аминогликозидной терапии. Вариант m.827A>G считается патогенетически значимым на основании его отсутствия в группе контроля и локализации в А сайте 12 S субъединицы рРНК, высоко консервативной области мтДНК, ответственной за инициацию трансляции [Li et al., 2005]. Мутация m.827A>G была выявлена у индивида, имеющего диагноз «наследственная несиндромальная тугоухость IV степени».
У 8 пациентов с тугоухостью/глухотой и 3 индивидов с нормальным слухом разной этнической принадлежности в гене 12SrRNA мтДНК обнаружен полиморфизм m.930G>A, широко распространенный в популяциях Сев. Америки, Европы и Азии [www.mitomap.org].
У 1 индивида из группы контроля, якута по этнической принадлежности, выявлено сочетание полиморфных вариантов m.930G>C и m.951G>A в гене 12SrRNA (рис. 1) [www.mitomap.org].
Анализ литературных данных свидетельствует о том, что полиморфизм m.930G>C ранее не описан, a- m.951G>A является достаточно редким (менее
0,01%), и выявляется у нормально слышащих индивидов из Японии, Финляндии, Сев. Америки [МоПапеп е1 а1., 2003; Тапака е1 а1., 2004].
А Б
** Я 3 4 _ /СЧ .. _
Щ/ЬФШ'1 т>& ^¿тгЫг ■-
Рис. 1. А. 88СР-анализ участка гена ПБгКЫА: 2- образец с измененной электрофоретической подвижностью; Б) фрагмент сиквенса образца с полиморфизмом т.9300>С.
Инсерция цитозинов и делеция тимина в 961 положении в гене ]2ЯгША (т.961_962с)е1Тт5С(п)), ассоциированных с потерей слуха - идентифицированы у грех неродственных русских пациентов из г. Санкт-Петербурга (у двух из них, имеющих т.961_962т5С в состоянии гетероплазмии, ОНТ IV степени возникла в раннем детстве после пневмонии на фоне антибиотикотерапии) и у 6 пациентов с диагнозом НСТ Ш-1У степени из Республики Башкортостан (3-х русских, 2-х татар, 1-го эстонца). К сожалению, детальную информацию по анамнезу пациентов получить не удалось.
У трех русских индивидов, одного с нормальным слухом, у двух других из Республики Алтай с НСТ неясной этиологии, возникшей в раннем возрасте, была выявлена мутация- ГП.96ПХ}, впервые обнаруженная у пациентов с НСТ европейского происхождения [1л е1 а1., 2004]. У одного пациента русской этнической принадлежности с врожденной НСТ идентифицировано новое изменение нуклеотидной последовательности - т.961Т>А-|Мр ://www.шitomap.org/cgi-bin/tbl 15§еп.р1#20060913001].
Поскольку изменения нуклеотидной последовательности вблизи 961 позиции гена ШгША (т.962_963тяС, т.961_962т8С(п), т.961_962с1етпзС(п) и т.961Т>0), локализованы в неконсервативной области между петлями 21 и 22 С кластера ИБгЯМА и, в основном, обнаруживаются у пациентов, потерявших слух после аминогликозидной терапии, многие исследователи предполагают, что они косвенно влияют на сайты взаимодействия ИБгША с
аминогликозидами, посредством изменения пространственной структуры 12 S субъединицы рРНК, тем самым, усиливая ототоксический эффект данных препаратов, приводя к дефектам трансляции в митохондриях [Kokotas et al., 2007; Xing et al., 2007]. Исследования, проведенные в 2002 году у глухих пациентов из Техаса, свидетельствуют о том, что частота мутаций т.96 l_962delTinsC(n) в гене 12SrRNA равна 1 % [Pandya et al., 2004], однако, по данным других авторов, она составляет от 10 до 50% у больных с ОНТ, возникающей на фоне аминогликозидной терапии [www.genetests.org].
Ввиду обнаружения данных изменений нуклеотидной последовательности у пациентов с нарушениями слуха из разных этнических групп- Италии и Китая, с учетом высокой частоты вариаций в 961 положении гена 12SrRNA в группе пациентов (ОНТ- 4,22% и НСТ- 3,17%) и их отсутствия в группе контроля, можно предположить, что вышеперечисленные изменения нуклеотидной последовательности являются мутациями [www.mitomap.org]. Исследование анамнеза у некоторых пациентов свидетельствует о ряде перенесенных заболеваний в детстве, что предполагает возможную аминогликозидную терапию. Также, вполне возможно, что для фенотипического проявления мутации m.961T>G требуется наличие модифицирующих факторов. Недавние работы, показавшие, что некоторые вариации в позиции 961 мтДНК являются характеристическими для ряда митохондриальных гаплогрупп [Yao, 2006], подчеркивают необходимость проведения дальнейших исследований, направленных на выяснение роли этих изменений в возникновении нарушений слуха посредством оценки их вклада в дефекты системы окислительного фосфорилирования и нарушения трансляции [Li et al., 2005].
Полиморфизм m.980I>C в гене 12SrRNA, идентифицированный в популяциях армян, финнов, испанцев, индийцев, пакистанцев [Palanichamy et al., 2004; Achilli et al., 2005], обнаружен у 1-го индивида алтайской этнической принадлежности в выборке пациентов. На основании полученных результатов можно предположить, что выявленная низкая частота полиморфизма т.980Т>С скорее всего, свидетельствует о необходимости проведения дальнейших молекулярно-генетических исследований для оценки его распространенности в различных популяциях и у больных.
Полиморфный вариант ш.9880>А гена 12Бг к,\'Л, обнаруженный в популяциях американцев и индийцев [www.mitomap.org], был выявлен у 12-ти индивидов различной этнической принадлежности: у 10-ти человек из группы пациентов, и у 2-х - из контрольной выборки. Полученные нами результаты согласуются с литературными данными, свидетельствующими о его достаточно широкой распространенности в разных популяциях мира [www.mitomap.org].
Мутация т.1005Т>С, обнаруженная нами у одного индивида из Республики Алтай, ранее была выявлена семье из Китая с потерей слуха, обусловленной применением аминогликозидов [Оиап й а1, 2004]. Полученные данные ставят под сомнение патогенность мутации, ввиду ее обнаружения у индивида с нормальным слухом.
У 1-го индивида алтайской этнической принадлежности из контрольной выборки обнаружен полиморфный вариант т.1027А>0, ранее не описанный в литературе [www.mitomap.Org/cgi-bm/tbll5gen.pI#20070709001] (рис. 2).
Рис. 2. А) SSCP-анализ участка гена 12SrRNA: 2- образец с аномальной подвижностью; Б) фрагмент сиквенса образца с неописанным ранее полиморфизмом- т. 1027A>G.
У двух индивидов алтайской этнической принадлежности (пациента и индивида с нормальным слухом) обнаружен полиморфизм m.l041A>G, с высокой частотой встречающийся в популяциях японцев, китайцев, реже, американцев [Ingman et al., 2000; Tanaka et al., 2004]. Поскольку m.l041A>G выявляется наиболее часто у индивидов из азиатских популяций, можно сделать предположение об его расовой и/или этнической специфичности.
Изменение нуклеотидной последовательности в 1095 положении гена l2SrRNA- т.1095Т>С, впервые обнаруженное в нескольких неродственных семьях с потерей слуха [Tessa et al., 2001; Kokotas et al., 2007], было выявлено у
1 2 A 3 4
( ")
Б
c^o
— -г*
двух индивидов, алтайцев: у пациента.с НСТ IV степени и у здорового индивида из Республики Алтай. Ввиду изменения им пространственной локализации консервативного участка 12Б рРНК, играющего важную роль в инициации белкового синтеза [ТЬуа§ага]ап й а!., 2000], в базе данных М1ТОМАР т.1095Т>С рассматривается как мутация, ассоциированная с потерей слуха.
С другой стороны, уточнение филогении мтДНК на основе постоянно расширяющихся данных о полностью секвенированных геномах мтДНК из разных этнических групп позволило выяснить, что транзиция ш.1095Т>С, наряду с некоторыми другими вариациями последовательности мтДНК, является базовым полиморфным вариантом для гаплогруппы М11, характеризующей одну из восточно-азиатских ветвей филогенетического древа мтДНК [Уао е1 а1., 2006].
Таким образом, полученные нами данные свидетельствуют о неоднозначности оценки патогенности мутации т.1095Т>С. Возможно, ее патогенный эффект проявляется под действием каких- либо модифицирующих факторов [www.mitomap.org].
Полиморфизм т.14150>А, описанный в популяции Сев. Америки [Г^Итат ег а1., 2003], обнаружен у здорового индивида татарской этнической принадлежности. Анализ литературных данных свидетельствует о редкой встречаемости данного полиморфизма (менее 0,01%) в различных популяциях мира.
ББСР-анализ участка гена 128гША выявил транзицию- т.1438А>С в образцах ДНК индивидов из выборки пациентов и контрольной группы. Данное изменение нуклеотидной последовательности, идентифицированное во многих африканских, европейских (финских, итальянских), азиатских (японских, китайских) популяциях [01меп й а!., 2006; www.mitomap.org], считается полиморфным вариантом, не вовлеченным в патогенез глухоты.
Другой полиморфизм в гене 12ЯгША- т.1442С>А, описанный в популяциях Африки, Сев. Америки и Азии [www.mitomap.org], обнаружен у двух индивидов алтайской этнической принадлежности.
Полиморфизм в 1462 положении гена 12БгША - т.14620>А, идентифицирован в популяциях США, а также у пациентов из Канады с сахарным диабетом и нарушением слуха [www.mitomap.org]. Данный
полиморфный вариант был обнаружен у одного индивида алтайской этнической принадлежности и у четырех индивидов с нормальным слухом якутов по этнической принадлежности.
Для детекции известных мутаций- т.1555А>0, т.7510Т>С, ш.7511Т>С, ш.7445А>С, т.7445А>С, т.7444С>А, ассоциированных с потерей слуха, мы провели ПДРФ-анализ гена 1ША*ег(ис") и участка гена 128гКЫА (1247-1585 п.н.) в образцах ДНК пациентов и контрольных выборок.
А Б В Г
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14
»мм
Рис. 3. ПДРФ-анализ генов 128гША и 1МА5<т(исм) мтДНК. Скрининг мутаций: А) т.1555А>0 (125гША): 1- мутация т.1555А>С в состоянии гетерогшазмии (216,93), 2- норма (216 и 123 п.н.); 3- не обработанный НаеШ образец (339 п.н.); Б) т.7510Т>С: 5- отсутствие мутации ш.7510Т>С (148 и 67 п.н.), 6- не обработанный Нт/[ образец (215 п.н.); В) ш.7511Т>С: 8- отсутствие мутации т.7511Т>С (175 п.н.), 9- не обработанный МЬоП образец (215 п.н.); Г) ш.7445А>0, т.7445А>С, т.74440>А: 11, 12- отсутствие сайта рестрикции ХЬа1 (мутации т.7445А>С и т.74440>А, соответственно) (215 п.н.), 13- норма (166 и 49 п.н.); 14- не обработанный ХЬа1 образец (215 п.н.),- 4, 7, 10- маркер молекулярного веса риС19/Мзр1.
Из литературы известно, что транзиция т.1555А>С была идентифицирована во многих регионах мира, что свидетельствует о широкой распространенности нейросенсорной глухоты и тугоухости, вызванной данной мутацией в различных этнических группах [Ргегап1 е1 а1., 1993; Рап<1уа е1 а1., 1997; Тект е1 а1., 2003]. Анализ многочисленных литературных данных показал, что ее распространенность составляет 0,5-2,4% у пациентов с тугоухостью и глухотой из европейских стран, за исключением необычно высокой частоты, достигающей 27%, выявленной в группе пациентов с НСТ из Испании [ЕзйуШ et а1., 1998]. В азиатских странах частота т. 1555А>0, несколько выше: в Китае-2,9% [Ы е1 а!., 2005], в Японии- 3%, среди пациентов с НСТ [Шагм е1 а1., 2000],
в Индонезии- 5,3% [Malik et al., 2003]. Обычно мутация m.I555A>G выявляется в состоянии гомоплазмии, более редко с разной степенью гетероплазмии [Kokotas et al., 2007]. Хотя мутация m.l555A>G в гене l2SrRNA увеличивает чувствительность организма к антибиотикам из группы аминогликозидов, многочисленные исследования по распространенности нейросенсорной глухоты и тугоухости в различных этнических группах показали, что в некоторых случаях различные формы потери слуха возникают у людей- носителей мутации m,1555A>G, но не подвергавшихся воздействию аминогликозидов [Kokotas et al., 2007; Xing et al., 2007]. В связи с тем, что патогенный эффект изменений нуклеотидной последовательности, вызывающих конформационные нарушения 12SrRNA, часто проявляется после применения аминогликозидов, а начало и течение заболевания варьирует - от врожденной потери слуха до возникновения нарушений слуха в зрелом возрасте, многими исследователями были предложены различные гипотезы для объяснения данного феномена. В настоящее время принято считать, что экспрессию патологического фенотипа (потерю слуха), вероятно, могут модулировать как экзогенные, так и генетические факторы [Xing et al., 2007; Посух с соавт., 2008]. Интенсивные исследования по поиску ядерных генов, модулирующих фенотипическое проявление мутаций в гене 12SrRNA, выявили несколько потенциальных генов-кандидатов [Byhovskaya et al., 2004]. Сравнительно недавно, при изучении индивидов различного этнического происхождения с нейросенсорной глухотой и мутациями m,1555A>G и Ш.14940Т в ядерном гене TRMU, кодирующем митохондриальный белок-модификатор некоторых митохондриальных тРНК, была найдена точковая мутация p.Glu28Thr [Guan et al., 2006]. Дальнейшие исследования показали, что данный дефект тРНК, возникающий у гомозигот по этой мутации и усиленный действием мутаций мтДНК, существенно снижает эффективность трансляции [Guan et al., 2006].
Ввиду высокого гетерозиготного носительства мутаций в гене GJB2 (особенно, c.35_36delG) во многих популяциях мира некоторыми исследователями были изучены гены коннексинов, как потенциальных модификаторов фенотипической экспрессии мутаций в гене 12SrRNA. В своих исследованиях они исходили из двухлокусной модели, предполагающей
взаимодействие ядерного и митохондриального геномов в развитии глухоты, впервые предложенной Bu X. [Ви et al., 1993]. Исследование большой семьи, у одного члена которой была обнаружена c.35_36delG в гене GJB2 в гомозиготном состоянии, показало, что данная делеция, наряду с другими мутациями в генах коннексинов, не является фенотипическим модификатором обнаруженной митохондриальной мутации m.l555A>G [Mkaouar-Rebai et al., 2006]. Полученные Mkaouar-Rebai E. выводы согласуются с результатами, полученными ранее Lopez-Bigas et al. в 2000 году [Lopez-Bigas et al., 2000]. Обнаруженное нами сочетание мутаций m.827A>G и c.35_36delG, наряду с полиморфизмом в 750 положении мтДНК, оставляет открытым вопрос о возможной модулирующей роли коннексиновых дефектов в фенотипической экспрессии некоторых митохондриальных мутаций.
Ввиду низкой частоты мутации m.l555A>G в общей выборке обследованных пациентов из г. Санкт-Петербурга, составившей 2%, и ее отсутствия в выборке пациентов из республик Башкортостан и Алтай, можно предположить, что глухота у данных пациентов, скорее всего, обусловлена наличием еще не идентифицированных мутаций в других генах.
ПДРФ-анализ гена (7392-7606 п.н.) с использованием
эндонуклеаз Xbal, MboII и Hinfl для детекции известных мутаций мтДНК, ассоциированных с несиндромалыюй потерей слуха, выявил отсутствие сайта рестрикции Xbal у пациентов из трех неродственных семей, в то время как изменений сайтов рестрикции для MboII и Hinfl обнаружено не было (рис. 3). Последующее секвенирование образцов ДНК двух неродственных русских пациентов (с ОНТ и HCT III-IV степени) и трех сибсов из одной казахской семьи (с прогрессирующей HCT II-III степени), позволило идентифицировать две мутации: m.7444G>A и ш.7445А>С (ген tRNASer(ÜCN)) (рис. 3).
Впервые нуклеотидные замены m.7444G>A, в сочетании с мутацией m.l555A>G (ген 12SrRNA) а также m.7443A>G (0.33%) и т.7445А>С (0.33%) с частотой 1.33% были обнаружены при исследовании глухих пациентов из Монголии [Pandya et al., 1999].
Авторы предположили, что пациенты с обеими мутациями могут иметь более выраженное нарушение процесса звуковосприятия, вследствие эпистатического
взаимодействия генов 12SrRNA и lRNASerflJCN) [Pandya et al., 1999]. Было сделано предположение о том, что механизм их патогенного влияния может быть схож с последствиями известной мутации m.7445A>G, нарушающей нормальный процессинг предшественника tRNASer(l>CN> и мРНК гена ND6, совместно транскрибируемой с легкой цепи, и приводят к изменениям белковой последовательности цитохром-оксидазы I [Pandya et al., 1999].
Позднее, m.7444G>A (изолированно или в сочетании с m.l555A>G) была выявлена у некоторых пациентов разного этнического происхождения с потерей слуха [Jin et al., 2007].
Кроме этого выяснилось, что мутация m.7444G>A является одним из полиморфных вариантов, характеризующих ряд митохондриальных гаплогрупп, в том числе и широко распространенную западно-евразийскую V, что требует уточнения ее роли в молекулярном патогенезе слуховой дисфункции [Yao et al.,
2006]. Редкость обнаружения замены т.7445А>С не позволяет в настоящий момент подтвердить или опровергнуть ее патогенную роль в развитии нарушений слуха. Следует отметить, что у индивидов с мутациями в гене
изменений в гене 12SrRNA обнаружено не было.
Полученные нами данные согласуются с литературными, свидетельствующими о достаточно низкой частоте данных изменений нуклеотвдной последовательности митохондриалького генома в общем спектре мутаций среди больных с врожденной глухотой [Kokotas et al., 2007; Xing et al.,
2007], за исключением некоторых популяций, например, испанской, в которой обнаружены митохондриальные мутации с очень высокой частотой (27%) [Estivill et al., 1998; Torroni et al., 1999].
При ПДРФ-анализе гена tRNASer(UCN) нами идентифицирован полиморфный вариант- m.7569A>G гена tRNAAsp. Литературные данные свидетельствуют об отсутствии ассоциации между мутациями в данном гене и глухотой, как синдромальной, так и несиндромальной [www.mitomap.org].
В табл. 2 приведен спектр и частота идентифицированных изменений нуклеотвдной последовательности в генах 12SrRNA,
tRNASer(UCNJ, tRNA^ мтДНК у индивидов с несиндромальной тугоухостью/глухотой и с нормальным слухом из Республик Башкортостан, Алтай, Саха (Якутия) и г. Санкт- Петербурга.
Таблица 2
Изменения нуклеотидной последовательности в генах /25У7Ш, /ША3ег(исю, 1ШАМр мтДНК у индивидов с несиндромальной гугоухостью/глухотой и с нормальным слухом из Республик Башкортостан, Алтай, Саха (Якутия) и г. Санкт- Петербурга
Ген Полиморфизм Частота в группе пациентов (%) Частота в группе контроля (%)
ПБгША т.750А>С 0,53 0
т.ЯЗООА 2,12 1
т.93<Ю>С+т.95Ю>А 0 0,83
т.961Т>А 0,53 0
т.980Т>С 2,08 0
Ш.9880А 1,41 1,33
ш.1005Т>С 0 0,98
т.1027А>С 0 0,98
т.1041 А>й 2,08 0,98
Ш.14150А 0 0,67
т.1438А>0 3,7 3,33
т.14420>А 2,08 0,98
Ш.14620А 0 3,33
т.1555А>С 2 0
тТА*г<иио Ш.74440А 2,1 (НСТ), 1,4 (ОНТ) 0
ш.7445А>С 2,1 0
1ШАМр т.7569А>0 0 0,67
Анализ гена МУ07А. Для анализа гена МУ07А мы применили следующую стратегию: исследовались участки гена, где по литературным данным было выявлено наибольшее количество мутаций, ассоциированных с наследственными формами нарушения свето- и звуковосприятия.
После составления карты распределения мутаций, нами был произведен подбор праймеров для избирательной амплификации 19 экзонных последовательностей данного гена.
В качестве основного метода поиска мутаций был использован метод ЗБСР, основным преимуществом которого является его простота и достаточно высокая чувствительность [Огка е! а!., 1989] (рис. 4).
?50|, н - __ ...... * ' ' • - ьэтн
_____ . .220 п.н. .
О
¡1 и - , 4: '—3 экзон
172 п.н. -»- * * -щ г ^ . * « . , . а* - __7 ЭКЗОН
г • ' < МШ - ^ляч« * * - . , ..^яу
-..у ;,:-,-'.-'-,-;- . ■>•_.<. - • •
Рис. 4. Пример ЭЗСР-анализа мультиплексной (триплексной) системы из трех экзонов гена МУ07А.
ЭЗСР-анализ 5, 9, 13, 17, 18, 22, 36 экзонов гена МУ07А не выявил изменений электрофоретической подвижности в образцах ДНК больных. В экзоне 7 наблюдалось изменение конформационной подвижности ДНК у одного пациента с нарушением слуха. Однако последующий секвенционный анализ не выявил каких-либо изменений в нуклеотидной последовательности ни в самом экзоне, ни в прилегающих к нему интронных областях.
В экзоне 3 нами было зафиксировано одинаковое изменение подвижности у 110 неродственных больных. Секвенционный анализ 3 экзона позволил обнаружить известный полиморфный вариант р.Ьеи168ег. Статистический анализ распределения частот аллелей полиморфных вариантов в контрольных выборках и группах пациентов с нарушениями зрения и слуха не выявил достоверных различий (х2= 0,113270955; р>0,05).
Полученные нами данные согласуются с литературными и подтверждают предположение об отсутствии функциональной роли найденной нуклеотидной замены в патогенезе нарушений слуха и зрения. Идентифицированные нами частоты аллелей Т* и С* (0,7 и 0,3) совпадают с данными, полученными при исследовании СЕРН коллекции, где частым аллелем является Т.
Данное соотношение частот аллелей, возможно, объясняется этническим своеобразием индивидов, составивших исследуемые выборки пациентов и группу контроля.
ввСР-анализ ПЦР продуктов, синтезированных с использованием триплекса на 13, 17, 31 экзоны гена МУ07А, выявил изменение электрофоретической подвижности в 31 экзоне, последующее секвенирование которого выявило
изменение нуклеотидной последовательности в 4074 положении- с.4074С>Т, ранее не описанное в литературе.
Данный полиморфный вариант был обнаружен у двух пациентов русской этнической принадлежности из РБ с диагнозом врожденной нейросенсорной тугоухости IV степени. В группе контроля С.40740Т (р.8ег13588ег) обнаружен не был. Данная нуклеотидная замена является синонимичной, на основании чего ее можно считать полиморфизмом.
Анализ гена иБН2А. Проведенный скрининг мутации р.Суз759РЬе в гене иБН2А не выявил данного изменения нуклеотидной последовательности в выборке пациентов с синдромом Ушера.
На основании данных исследования полиморфных гаплотщгов и мутаций в гене СЛ}2 был оптимизирован предложенный ранее алгоритм молекулярной диагностики наследственной глухоты в семьях высокого риска в Республике Башкортостан [ОгЪетИсуа й а1., 2003; Хуснутдинова с соавт., 2005] и Республике Саха (Якутия) [Барашков, 2007].
Согласно этому алгоритму, обследование следует начинать с прямой диагностики на наличие частых для популяций Республик Башкортостан и Республики Саха (Якутия) мутаций с.35_36с!еЮ, с.235_236с!е1С, с.312 326ёе114, с.299_300(1е1АТ, р.аи47Х, р.Уа13711е гена СШ.
В случае полной информативности семьи ДНК-диагностика ограничивается прямым методом. В случае частичной информативности или абсолютной нсинформативности, проводится анализ генов 12$гША и 1ША5сг(иач> мтДНК для выявления следующих мутаций: ш.1555А>0, ш.Ю95Т>С, т.Ю051>С, т.961_9б2шзС, т.961_962тзС(п), т.961_962с!е1ТтзС(п), т.7445А>С, тЛШа>А.
Если эти мутации не выявляются, или же обнаруживается какой-либо новый конформационный полиморфизм ДНК, то проводится секвенирование образца по модифицированному методу Сенгера.
При неинформативности исследования проводится поиск мутаций в генах вШ, йЛ16, ШО7А (рис. 4).
Анализ мутаций с.35_36гЫв, с.235 2360еЮ, с.312 32в<Ь>114, с.29Э300сЫЛТ, р.вМТХ, рЛГаОТВе гена 01В2
Проведение анализа кодирующих регионов генов 125гНЫА и ЖНАЗсСх^на наличие других мутаций
100% Частичная и полная
информа- тинформатовность
тивность (при наличии
генотипов с.35 ЗМвКЗМ,
с^35 гЗМеЮН,
с.312 32МЫ14/Ы.
с.299 ЗООсМАТМ,
рем 7Ш
р.УаОТНв/Н
и нарушениях
процесса
зеукюеосприятия)
Обнаружения мутаций в вене Т25гЯМ4 т.961_9в2*1вПТп»С(п) тЛ61Т>С тп.ЮТ5Т>С ГП.15550А т.Я27АХл т.1005Т>С
Обнаружение мутаций е гена ЖЫА*-***! 1П74440Л Ш.7445А7С
100% информативность
Частичная и полная неинфориативность (нутации в гене &/В2 и в генах 12вгКЫА, ШИА3*"0* не _обнаруживаются)_
Поиск мутаиий а других генах вивЗ. (ЗЛЗб. МУОТД
Рис. 4. Алгоритм ДНК- диагностики наследственной несиндромальной глухоты
ВЫВОДЫ:
1. Обнаружена мутация т.9б1_962с1е1Тт5С(п) (4,22%) в гене 12БгША мтДНК у 3-х больных русской этнической принадлежности с острой нейросенсорной тугоухостью.
2. Выявлены мутации ш.827А>0 (0,53%), т.961Т>0 (4,17%), т.961_962(]еШп5С(п) (3,17%), т.1095Т>С (2,1%), ш.1555А>0 (2%) в гене 12БгША мтДНК у больных с врожденной нейросенсорной тугоухостью/глухотой.
3. Обнаружена транзиция- ш.7444С>А в гене ¡ША8"^0'^ мтДНК у пациентов русской этнической принадлежности с острой нейросенсорной тугоухостью (1,4%) и с врожденной несиндромалыюй нейросенсорной тугоухостью (2,1%), и трансверсия- ш.7445А>С- в казахской семье из Республики Алтай (2,1%).
4. Идентифицировано 9 полиморфных вариантов (т.930С>А, т.95Ю>А, т.9801>С, т.9880>А, ш.Ю41А>0, т.1415С>А, т.1438А>С, Ш.14420А, т.14620А) в гене 12БгША мтДНК в исследованных группах больных и контроля. Три полиморфных варианта (ш.930С>С, ш.961Т>А, т.1027А>0) обнаружены впервые.
5. Разработаны 6 мультиплексных систем для детекции изменений нуклеотидной последовательности в гене МУ07А.
6. Выявлено 2 полиморфных варианта в гене МУ07А- с.47Т>С (р.Ьеи165ег) в 3 экзоне и С.40740Т (р.5ег13585ег) в 31 экзоне, у больных с несиндромальной нейросенсорной тугоухостью и синдромом Ушера.
7. Оптимизирован алгоритм ДНК-диагностики наследственной несиндромальной глухоты для исследованных регионов РФ.
СПИСОК РАБОТ, ОПУБЛИКОВАННЫХ ПО ТЕМЕ ДИССЕРТАЦИИ:
1. Джемилева Л.У., Гринберг Э.Р., Тазетдинов А.М., Завдуллин И. С., Бикбов М.М., Мусина В.В., Хуснутдинова Э.К. «Молекулярные основы
дегенеративных процессов в сетчатке при тапеторетинальной абиотрофии» // Молекулярная биология.- 2007.- Т. 41.- № 6,- С. 1- 9.
2. Тазетдянов А.М., Джемилева Л.У., Хуснутдинова Э.К. Молекулярная генетика синдрома Ушера // Генетика.- 2008,- Т.44. - № 6,- С. 725- 733.
3. Tazetdinov А.М., Dzehemileva L.U., Khusnutdinova E.K. Molecular Genetics of Usher Syndrome // Russian Journal of Genetics, 2008, Vol. 44, № 6. - P. 627634.
4. Способ выявления мутаций в гене GJB2, сопровождающихся развитием несиндромальной аутосомно-рецессивной глухоты. Патент №2317547 от 20.02.2008.
5. Способ определения мутаций гена MTRNR1 при острой нейросенсорной тугоухости, вызванной применением антибиотиков из группы аминогликозидов МПК G01№33/48 Решение о выдаче патента на изобретение по заявке №2007115659/13(017017).
6. Dzhemileva L.U., Tazetdinov А.М., Baimiev А.Н., Khabibulin R.M., Khusnutdinova E.K. Molecular screening of deafness in populations and patients with nonsyndromic congenital deafness in Volga- Ural region // 7th Balkan Meeting of Human Genetics, Skopje 29 September - 2 August, 2006.- P. 41.
7. Tazetdinov A.M., Dzhemileva L.U., Ponidelko S.N., Khusnutdinova E.K. Molecular analysis of MTRNR1 and MTTS1 genes in patients with suddenly deafness from Russia // 7th Balkan Meeting of Human Genetics, Skopje 29 September - 2.August, 2006.- P. 96.
8. Dzhemileva L.U., Posukh O.L., Barashkov N.A., Tazetdinov A.M. Mutational analysis of the mitochondrial 12SrRNA and tRNASer(UCN) genes in patients with aminoglycoside-induced and nonsyndromic hearing loss from Volga-Ural region and Siberia (Russia) // European Human Genetics Conference 16- 19 June 2007 Nice, France.- P. 253.
9. Dzhemileva L.U., Posukh O.L., Barashkov N.A., Tazetdinov A.M., Khusnutdinova E.K. Molecular analysis of the 12SrRNA and tRNASer(UCN) genes (mtDNA) in patients with nonsyndromic hearing loss from different Russia regions // ESF Research Conference on Rare Diseases. 8-12 March- 2008. Sant Feliu de Guixols, Spain.- P. 114.
. 10. Tazetdinov A.M., D/hemileva L.U., Ponidelko S.N., Khusnutdinova E.K.. Mutational analysis of the 12SrRNA and tRNASer(UCN) genes in patients with nonsyndromic hearing loss from Volga-Ural region (Russia). // Newborn Hearing Screening 2008.-June 19-21.- 2008 - Cernobbio (Italy).- P. 59.
11. Тазетдинов A.M. «Анализ спектра и частот мутаций в генах l2SrRNA и tRNASer(UCH) мтДНК у боЛЬНЫХ с острой нейросенсорной тугоухостью» // Вестник оториноларингологии. Приложение. № 5.- 2007.- С. 324- 327.
12. Тазетдинов AJVL, Джемилева Л.У., Посух OJL, Барашков Н.А., Хуснутдинова Э.К. Анализ генов MTRNR1 (12SrRNA) и MTTS1 (tRNASa<UCN)) у больных с острой нейросенсорной тугоухостью // Материалы докладов 11-ой международной Пущинской школы-конференции молодых ученых «БИОЛОГИЯ - НАУКА XXI ВЕКА». 2007
13. Джемилева Л.У., Тазетдинов АЛ1., Посух OJL, Барашков Н.А., Хуснутдинова Э.К. «Спектр мутаций в HSrRNA и tRNASaiUCN) генах мтДНК у больных наследственными формами несиндромальной потери слуха, проживающих в различных регионах России» // Материалы школы семинара по физико-химической биологии и биотехнологии «Биомика - наука XXI века»- 2007.- С. 39- 40.
14. Тазетдинов AJVL, Джемилева Л.У., Пониделко С.Н., Хуснутдинова Э.К Анализ генов 12SrRNA и tRNASe/"0^ мтДНК у больных с острой нейросенсорной тугоухостью // Материалы школы семинара по физико-химической биологии и биотехнологии «Биомика - наука XXI века»- 2007.-С. 122- 123.
СПИСОК ОСНОВНЫХ СОКРАЩЕНИЙ:
ОНТ- острая нейросенсорная тугоухость
ПДРФ - полиморфизм длины рестрнкциош/ых фрагментов
GJR2, GJB6 - гены коннексинов 26,30
tRNASer(UCN)- ген тРНК серина
12SrRNA- ген 12 S субъедишщы рРНК
Подписано а петь 20.11.08 г. Формат 60x84 1/16. Бумага офсетная. Печать ризогрэфичсская. Тираж 120 экз. Заказ 206. Гарнитура «Тши^еиКотап». Отшагано в типографии «ПЕЧАТНЫЙ ДОМЪ» ИП ВЕРКО. Объем 0,9 пл. Уфа, Карла Маркса 12 корн. 4, т/ф; 27-27-600, 27-29-123
Содержание диссертации, кандидата биологических наук, Тазетдинов, Андрей Маулетзянович
Список сокращений
ВВЕДЕНИЕ
Глава 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1.1 .ГЕТЕРОГЕННОСТЬ НАСЛЕДСТВЕННОЙ ПАТОЛОГИИ СЛУХА
1.2.КЛАССИФИКАЦИЯ НАРУШЕНИЙ СЛУХА
1.2.1 .Несиндромальные формы потери слуха
1.2.2.Синдромальные формы потери слуха
1.3 .ФИЗИОЛОГИЯ СЛУХОВОГО И ВЕСТИБУЛЯРНОГО 18 АНАЛИЗАТОРОВ
1.3.1 .Механизм звуковой перцепции
1.4.ЭТИОЛОГИЯ И ПАТОГЕНЕЗ ГЛУХОТЫ
1.5.МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ОСНОВЫ ГЛУХОТЫ
1.5.1 .Гены белков, участвующих в поддерживании структуры и 29 организации волосковых клеток
1.5.1.1 .Неконвенциальные миозины
1.5.1.2.Кадхерин
1.5.2.Белки, экспрессирующиеся в волосковых клетках ив 35 фоторецепторах
1.5.3 .Гены и белки мтДНК, повреждение которых приводит к нарушению 3 8 процесса звуковосприятия
1.5.3.1 .Мутации в генах рРНК
1,5.3.2.Мутации в генах тРНК
Глава 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ 5О
2.1.ОБЪЕКТЫ ИССЛЕДОВАНИЯ
2.1.1 .Выборка обследованных пациентов с глухотой
2.1.1.1 .Республика Башкортостан
2.1.1.2.Г. Санкт-Петербург
2.1.1.3.Республика Саха (Якутия)
2.1.1.4.Республика Алтай 53 2.1.2.Выборка пациентов с синдромом Ушера 54 2.2.МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЕ МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ 55 2.2.1 .Выделение геномной ДНК человека
2.2.2.Полимеразная цепная реакция (ПЦР)
2.2.3.Рестрикционный анализ (ПДРФ-анализ) 57 2.2.4.88СР-анализ 58 2.2.5.Секвенирование 59 2.3 .ИССЛЕДОВАНИЕ ГЕНА MY07A
2.4.ИССЛЕДОВАНИЕ ГЕНА 12SrRNA
2.5.ИССЛЕДОВАНИЕ ГЕНА tRNASer(UCN)
2.6.ИССЛЕДОВАНИЕ 13 ЭКЗОНА ГЕНА USH2A
2.7.МЕТОДЫ СТАТИСТИЧЕСКОГО АНАЛИЗА
Глава 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ 67 3.1.Анализ генов 12SrRNA, tRNASer(UCN) в выборке пациентов с несиндромальной потерей слуха из разных регионов России
3.1.1 .Результаты молекулярно-генетического изучения генов 12SrRNA и 69 tRNASer(UCN) мтДНК в выборках пациентов с нарушением процесса звуковосприятия и в группах контроля
3.2.Анализ гена MY07A у больных с нарушениями процессов звуко- и 101 световосприятия
3.2.1.Результаты молекулярно-генетического изучения гена MY07A в 101 выборках пациентов с нарушениями процессов звуко- и световосприятия и в группах контроля
3.3.Анализ гена USH2A у пациентов с синдромом Ушера
3.3.1.Результаты молекулярно-генетического изучения гена USH2A у, пациентов с синдромом Ушера
3.4.0птимизация алгоритма ДНК-диагностики наследственных форм 107 тугоухости/глухоты
Введение Диссертация по биологии, на тему "Анализ генов 12SrRNA, tRNASer(UCN), MYO7A и USH2A у пациентов с наследственными формами нарушения зрения и слуха"
Нарушения зрения и слуха относятся к частым заболеваниям органов чувств, нередко приводящих к инвалидизации и осложняющих адаптацию человека в обществе. Данные о распространенности врожденных форм нарушения зрения и слуха, а также их сочетанных форм, в различных странах неоднозначны и сильно варьируют. Общепринято, что распространенность наследственных нарушений слуха составляет- 100: 10D населения, зрения- 2028: 105, а сочетанных дефектов зрения и слуха- 6- 105 [Mehl A. et. al., 2002; Chalestori Н. et. al., 2007; www.genetests.org].
По данным ВОЗ, около 13-20 млн. людей в России имеют различные формы тугоухости и глухоты [Гинтер Е.К. с соавт., 2002; Зинченко С.П., 2007]. Считается, что примерно половина всех случаев врожденной глухоты имеет наследственную этиологию. Около 75% всех случаев несиндромальной наследственной глухоты приходится на аутосомно-рецессивные формы, 2025%- на аутосомно-доминантные, и несколько процентов - на сцепленную с Х-хромосомой и митохондриальную формы потери слуха [Piatto V.B. et al., 2005; Morton C.C. et al., 2006].
Наиболее частой причиной заболевания являются мутации в гене GJB2 (gap junction (32), локализованном в области 13qll-ql2 и кодирующем коннексин 26 (Сх26)- трансмембранный белок, обеспечивающий полноценный ионный обмен между клетками внутреннего уха [Connexins and deafness Homepage; Hereditary Hearing Loss Homepage].
Однако, в последнее время, предполагается, что вклад мутаций генов 12SrRNA и tRNASer(UCN) мтДНК, ассоциированных как с врожденной, так и острой нейросенсорной тугоухостью/глухотой, инициированной приемом аминогликозидов, возможно, более высокий, чем оценивалось ранее [Jacobs Н.Т. et al., 2005; Xing G. et al., 2007].
Антибиотики из группы аминогликозидов широко применяются в медицинской практике как бактерицидные препараты при различных тяжелых, ' в том числе анаэробных, инфекциях. Использование ототоксических антибиотиков приводит к возникновению острой нейросенсорной тугоухости (ОНТ) у 12% пациентов. Преобладает, как правило, тяжелая степень нейросенсорной тугоухости (III степень потери слуха наблюдается в 44% случаев, IV- в 35%) [Чистякова В.Р. с соавт.,1999].
Острая нейросенсорная тугоухость/глухота, наряду с врожденной, относится к числу наиболее распространенных и тяжелых заболеваний, как среди детей, так и среди взрослых. Однако, несмотря на актуальность и острую социальную значимость проблемы, до сих пор не разработаны способы ранней диагностики и система профилактических мероприятий ОНТ на фоне лечения антибиотиками из группы аминогликозидов, а также не существует точных данных о частоте и спектре различных митохондриальных дефектов у больных с потерей слуха из различных этнических групп России.
Поскольку применение антибиотиков аминогликозидного ряда, таких как стрептомицин, канамицин, гентамицин, клиндомицин и др., широко распространено в нашей стране, актуальным является изучение частот и спектра мутаций генов 12SrRNA и tRNASer(UCN) мтДНК для оценки риска возникновения нейросенсорной глухоты в семьях, где данные мутации находятся в состоянии гетероплазмии и клинически себя не проявляют, а также разработки схемы ДНК-диагностики у плода.
Синдром Ушера (СУ)- самая распространенная патология среди больных с сочетанными повреждениями зрения и слуха. Распространенность заболевания- 6: 105 населения [Boughman J.A. et al., 1983; www.genetests.org]. 8-33% больных с диагнозом «Тапеторетинальная абиотрофия сетчатки» (TPА) имеют различную степень потери слуха и страдают синдромом Ушера. СУ является причиной потери слуха у 3-10% детей с глухотой и у 50% детей со слепоглухотой [Boughman J.A. et al., 1983; www.genetests.org].
В настоящее время по клиническим проявлениям выделяют три основных типа синдрома Ушера, которые представляют собой группу 8 генетически гетерогенных заболеваний, наследуемых аутосомно-рецессивно. Наиболее распространенным является первый тип заболевания, который характеризуется врожденной глухотой, вестибулярными дисфункциями и перераспределением пигмента на глазном дне. Сравнительно недавно было установлено, что в некоторых популяциях синдром Ушера II типа (USH2) является наиболее распространённой формой СУ и отвечает за более чем 50% всех его случаев [Ahmed Z.M. et al., 2003; Kremer H. et al., 2006; www.genetests.org]. Вторая форма I типа синдрома- USH1B, вызываемая мутациями в гене MY07A, является наиболее распространенной, и составляет около 75% от общего количества больных с первым типом заболевания [Ahmed Z.M. et al., 2003; www.genetests.org].
Weston M.D. с соавторами в 2000 году выяснил, что мутации в гене USH2A обусловливают глухоту у пациентов с СУ типа IIA, а также несиндромальный пигментный ретинит (ПР). В сетчатке повреждение ушерина вызывает преждевременную гибель фоторецепторов из-за невозможности адекватного транспорта фотопигментов в диски наружных сегментов клеток. На сегодняшний день в гене USH2A описано более 80 мутаций. Мутация p.Cys759Phe, ассоциированная с пигментным ретинитом без глухоты и локализованная в 13 экзоне, наряду с другой мажорной-c.22992230delG, которая выявляется, приблизительно, на 44% всех хромосом пациентов с синдромом Ушера (форма IIA), обнаруживается с частотой 4,5% среди пациентов с ПДС [Ouyang Х.М. et al., 2004].
Таким образом, целью нашего исследования явилось изучение структурных особенностей генов 12SrRNA, tRNASer(UCN) мтДНК, MY07A и USH2A у пациентов с наследственными формами нарушения зрения и слуха.
В соответствии с целью исследования были поставлены следующие задачи:
1. провести поиск изменений нуклеотидной последовательности в генах 12SrRNA и tRNASer(UCN) мтДНК у больных с несиндромальной нейросенсорной тугоухостью и острой нейросенсорной тугоухостью из Республик Башкортостан, Саха (Якутия), Алтай и г. Санкт-Петербурга;
2. провести поиск изменений нуклеотидной последовательности в гене неконвенционального миозина VIIA {MY07A) у больных с несиндромальной глухотой и синдромом Ушера;
3. разработать мультиплексные системы для детекции изменений нуклеотидной последовательности в гене MY07A;
4. провести скрининг мутации p.Cys759Phe гена ушерина (USH2A) у больных с синдромом Ушера;
5. оптимизировать алгоритм молекулярно-генетической диагностики наследственной несиндромальной глухоты в исследованных регионах.
Заключение Диссертация по теме "Генетика", Тазетдинов, Андрей Маулетзянович
выводы
1. Обнаружена мутация m.961962delTinsC(n) (4,23%) в гене 12SrRNA мтДНК у 3 больных русской этнической принадлежности с острой нейросенсорной тугоухостью.
2. Выявлены мутации m.827A>G (0,53%), m.961T>G (4,17%), m.96l962delTinsC(n) (3,17%), т.1095Т>С (2,1%), m.l555A>G (2%) в гене 12SrRNA мтДНК у больных с врожденной нейросенсорной тугоухостью/глухотой.
3. Обнаружена транзиция m.7444G>A в гене tRNASer(UCN) мтДНК у пациентов русской этнической принадлежности с острой нейросенсорной тугоухостью (1,4%) и с врожденной несиндромальной нейросенсорной тугоухостью (2,1%), и трансверсия ш.7445А>С- в казахской семье из Республики Алтай (2,1%).
4. Идентифицированы 8 полиморфных вариантов (m.930G>A, m.951G>A, m.980T>C, m.988G>A, m,1041A>G, m.l415G>A, m.l442G>A, m.l462G>A) гена 12SrRNA мтДНК в исследованных группах больных и контроля. Три (m.930G>C, m.961T>A, m.l027A>G) обнаружены впервые.
5. Разработаны б мультиплексных систем для детекции изменений нуклеотидной последовательности в гене MY07A.
6. Выявлено 2 полиморфных варианта в гене MY07A- с.47Т>С (p.Leul6Ser) в 3 экзоне и с.4074С>Т (p.Serl358Ser) в 31 экзоне у больных с несиндромальной нейросенсорной тугоухостью и синдромом Ушера.
7. Оптимизирован алгоритм ДНК-диагностики наследственной несиндромальной глухоты для исследованных регионов РФ.
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
Проблема диагностики врожденной тугоухости/глухоты и потери зрения была и остается актуальной как в медицинском, так и в социальном отношении. Особое значение она имеет в детской практике, так как от состояния слуха и зрения ребенка зависит развитие второй сигнальной системы, то есть речи. Посредством слухового и зрительного анализатора ребенок получает огромный поток информации из внешнего мира. Между состоянием слуха, зрения, развитием речи и координации в пространстве имеется теснейшая связь, и поэтому любое, а тем более грубое нарушение слуха и зрения в виде тугоухости, глухоты и/или слепоты у новорожденных и детей грудного возраста оказывает большое влияние на их общее и психическое развитие.
На сегодняшний день, по данным ВОЗ в России более 13 миллионов людей, страдающих тугоухостью и глухотой, и более одного миллиона из них - это больные детского возраста. Считается, что на 1000 нормально слышащих новорожденных приходится один ребенок с выраженной степенью потери слуха. В раннем детском возрасте понижение слуха встречается в 0,64 случаях на 1000 детей. Нарушение слуха у 27,7% детей раннего возраста носит перцептивный характер, возникает во внутриутробном периоде и проявляется в первые месяцы и годы жизни. По данным статистики в России, выявляемость детей первого года жизни с нарушениями слуха составляет всего 10%. В Российской Федерации уровень полной слепоты по данным на 2006 год составляет 7,1 на 10000 населения, а уровень слабовидения — 8,1 на 10000.
При столь высокой встречаемости данных нозологий на территории РФ выяснение их этиологических и генетических механизмов крайне необходимо для разработки методов профилактики данных патологий.
Высокий удельный вес дефектов свето- и звуковосприятия в общей структуре наследственной патологии, их тяжелое инвалидизирующее течение, отсутствие эффективных терапевтических методов ставит проблему но изучения таких заболеваний в число первостепенных и социально-значимых. Решение данной проблемы необходимо для проведения профилактических мероприятий, направленных на предотвращение возникновения повторных случаев заболевания в семьях высокого риска
Последние два десятилетия ознаменованы началом новой научной эры в связи с достижениями молекулярной биологии, генетики и электрофизиологии в изучении процессов функционирования звуковосприятия, а также картирования большого количества генов, отвечающих за слух у человека. С интенсивным накоплением знаний об основных этиологических, патогенетических механизмах на молекулярно-генетическом уровне, существенно расширяются возможности проведения дополнительных методов исследования, среди которых особенно актуальными становятся методы ДНК-диагностики.
В настоящее время особый интерес представляют работы по изучению распространенности наследственных форм нарушения зрения и слуха, определению гено-фенотипической корреляции между определенным мутантным генотипом и патологическим фенотипом с одновременным проведением их молекулярно-генетического, эпидемиологического исследований с целью получения данных о частоте встречаемости патологии в конкретном регионе, а также выяснению возможных этиологических факторов патологии.
Для оптимизации существующих способов диагностики и профилактики наследственных форм потери слуха и зрения в ряде регионов России (Республика Башкортостан, г. С.Петербург, Республики Алтай и Саха (Якутия), было проведено изучение структурных особенностей генов 12SrRNA, tRNASer(UCN) мтДНК, MY07A и USH2A у пациентов с наследственными формами нарушения слуха и зрения.
В качестве материала были использованы образцы ДНК пациентов с диагнозом «врожденная нейросенсорная тугоухость/глухота», «острая нейросенсорная тугоухость/глухота», «синдром Ушера», членов их семей, и индивидов с нормальным слухом из различных этнических групп РФ.
В работе представлены данные о спектре и частоте патогенных и полиморфных вариантов нуклеотидной последовательности в генах 12SrRNA, tRNASer(UCN) мтДНК, MY07A у больных с наследственными формами нарушения зрения и слуха из разных регионов РФ.
В гене 12SrRNA мтДНК у 1 больного ННСТ из г. Санкт-Петербурга, русского по этнической принадлежности, идентифицирована мутация m.l555A>G (2%), и у трех пациентов с ННСТ, алтайцев по этнической принадлежности - мутации т.1095Т>С (3,4%) и т.1005Т>С (1,7%). В гене 12SrRNA мтДНК у трех неродственных русских пациентов из г. Санкт-Петербурга обнаружена инсерция m.961962insC (2,4%). Мутации m.961962insC(n) (0,5%) и m.961962delTinsC(n) (1,6%) были выявлены у пациентов татарской и русской этнической принадлежности, соответственно, из Республики Башкортостан. Трансверсия m.961T>G была выявлена у трех несвязанных родством русских пациентов (1,6%), у одного из них (из г. Санкт-Петербурга) диагностирована ОНТ неясной этиологии, у двух других (Республика Алтай) - НСТ неясной этиологии, возникшей в раннем возрасте. Замена т.961Т>А идентифицирована у одного русского больного из г. Санкт-Петербурга с врожденной НСТ (0,8%), причем данное изменение мтДНК было выявлено впервые.
В гене 12SrRNA мтДНК у пациентов и в контрольных группах были идентифицированы другие вариации нуклеотидной последовательности с частотой менее 1%, как описанные ранее (m.930G>A, m.951G>A, m.980T>C, m.988G>A, m.l041A>G, m.l415G>A, m.l442G>A, m.l462G>A), так и обнаруженные впервые (m.930G>C, m.l027A>G).
В гене tRNASer(UCN) мтДНК транзиция m.7444G>A выявлена у русского пациента с ОНТ (г. Санкт-Петербург) (0,8%) и у пациента смешанного этнического происхождения (русского по материнской линии) с ННСТ III-IV степени (Республика Алтай) (1,7%). Трансверсия т.7445А>С обнаружена у
112 трех членов казахской семьи, пробанда и его сибсов (Республика Алтай) (1,7%), у которых НСТ II-III степени возникла во взрослом возрасте и имеет прогрессирующий характер.
Скрининг 8 экзонов гена MY07A у больных с ННСТ из РБ выявил 2 полиморфных варианта - с.47Т>С (p.Leul6Ser) в третьем экзоне и с.4074С>Т (p.Serl358Ser) в 31 экзоне. Установлены статистически значимые различия в характере распределения частот аллелей полиморфного локуса с.4074С>Т гена MY07A у больных ННСТ и в контрольной группе здоровых индивидов из РБ. Разработаны 6 мультиплексных систем для детекции изменений нуклеотидной последовательности в гене MY07A. Оптимизирован алгоритм выявления мутаций в генах GJB2, GJB6, HSrRNA и tRNASer(UCN) для проведения ДНК-диагностики наследственной несиндромальной глухоты в семьях высокого риска в исследованных регионах РФ. Значительная генетическая гетерогенность наследственных форм нарушений зрения и слуха, объясняет тот факт, что пока еще не созданы универсальные схемы ДНК-диагностики данных дефектов и не разработаны принципы лечения данных тяжелых и инвалидизирующих заболеваний. Кроме того, этнические различия также затрудняют поиск мажорных мутаций генов, ответственных за свето- и звуковосприятие у человека. Выявленные генетические особенности вносят вклад в исследование патогенеза нарушения зрения и слуха и могут быть использованы для разработки наиболее оптимальных методов дородовой диагностики данных заболеваний. Перспективным направлением в изучении как врожденных дефектов зрения и слуха, так и других наследственных болезней, является разработка генной терапии, использование которой будет строго индивидуально в зависимости от генетического дефекта каждого пациента. Все вышесказанное определяет актуальность и значимость подобных исследований, являясь научной базой для дальнейшего этапа развития медицинской помощи на основе генной терапии.
Библиография Диссертация по биологии, кандидата биологических наук, Тазетдинов, Андрей Маулетзянович, Уфа
1. Агаджанян Н.А. Основы физиологии человека М.: РУДН, 2001. 408с.
2. Барашков Н.А. Молекулярно-генетическое изучение наследственной несиндромальной сенсоневральной глухоты в Республике Саха (Якутия): Автореф:. дис. канд. биол. наук. Уфа. - 2007. - 24с.
3. Васильев Ю.М. Клетка как архитектурное чудо // СОЖ 1996.- № 2.-С.36- 43.
4. Всероссийская перепись населения 2002 года. www.perepis2002.ru/index.html.
5. Гоголев А.И. Этническая история народов Якутии (до начала XX в.): Якутск, изд. ЯГУ, 2004.- 104с.
6. Горбунова В.Н, Баранов B.C. Введение в молекулярную диагностику и генотерапию наследственных заболеваний СПб.: Спецлитература, 1996.- 286с.
7. Гурвич И.С. Этническая история северо-восточной Сибири. М.: Наука, 1966.- 269с.
8. Джемилева Л.У. Анализ генов GJB2 и GJB3 у больных несиндромальной наследственной глухотой и в некоторых популяциях Волго-Уральского региона: Автореф:. дис. канд. мед. наук. Уфа. -2002. - 24с.
9. Зинченко С.П. Генетико-эпидемиологическое исследование наследственной глухоты в Республике Чувашия: Автореф:. дис. канд. мед. наук. Москва.- 2007. - 24с.
10. Тарская Л.А, Зинченко Р.А, Ельчинова Г.И. Структура и разнообразие наследственной патологии в Республике Саха (Якутия) // Генетика -2004.-Т. 40.- №11.- С.1530- 1539.
11. Максимов Г.Н. Родная Якутия: Природа, люди, природопользование. Якутск: Бичик, 2003.-168с.
12. Маркова Т.Г, Мегрелишвилли С.М, Шевцов С.П. Клиническое и молекулярно-генетическое исследование синдрома Ваарденбурга // Вестник оторинолар.-2003 № 1. - С. 17- 19
13. Маркова Т.Г. Наследственные формы тугоухости и медико-генетическое консультирование // Медицинская генетика 2004 - Т. 3 .-№ 2. - С.50- 69.
14. Маркова Т.Г. Клинико-генетический анализ врожденной и доречевой тугоухости: Автореф:. дис. докт. мед. наук. Москва. - 2008. - 43с.
15. Наследственные болезни в популяциях человека / Под редакцией Е.К. Гинтера. М.: Медицина, 2002. -268 с.
16. Покровский В.М, Коротько Г.М. Физиология человека в 2-х томах: том И. М.: Медицина, 1997, -368с.
17. Посух O.JI, Джемилева Л.У, Хуснутдинова Э.К. Митохондриальные мутации в этиологии наследственной глухоты // Медицинская генетика -2008,-№ 1.- С.12- 20.
18. Сукерник Р.И, Дербенева О.А, Стариковская Е.Б, Володько Н. В, Михайловская И. Е, Бычков И. Ю, Лотт М. Т, Браун М. Д, Уоллес Д. К. Митохондриальный геном и митохондриальные болезни человека // Генетика -2002.- Т. 38.- № 2.- С.161- 170.
19. Таварткиладзе Г.А, Гвелесиани Т.Г. Клиническая аудиология, М.: 1996
20. Тазетдинов A.M., Джемилева Л.У, Хуснутдинова Э.К. Молекулярная генетика синдрома Ушера // Генетика.- 2008- Т. 44.- № 6.- С.725- 733.
21. Чистякова В.Р, Ковшенкова Ю.Д. Возможности восстановления слуха в остром периоде нейросенсорной тугоухости в детском возрасте // РГМУ, Лечащий врач- 1999.- С.4.
22. Шмидт Р, Тевс Г. Физиология человека: в 3 томах- Т. I.- М.: Мир, 1996 -323с.
23. Шокарев Р. А, Амелина С.С, Кривенцова Н.В. Генетико-эпидемиологическое и молекулярно-генетическое исследованиенаследственной тугоухости в Ростовской области // Медицинская генетика- 2005.- Т. 4.- № 12.- С.556- 567.
24. Adato A, Michel V, Kikkawa Y. Interactions in the network of Usher syndrome type 1 proteins // Hum. Mol. Genet.- 2005.- Vol. 14.- № 3.- P. 347-356.
25. Achilli A, Rengo C, Battaglia V, Pala M, Olivieri A, Fornarino S, Magri C, Scozzari R, Babudri N, Santachiara-Benerecetti A.S. Saami and Berbers- an unexpected mitochondrial DNA link // Am. J. Hum. Genet.-2005.-№76.-P. 883- 886.
26. Ahmed Z.M, Riazuddin S, Wilcox E.R. The molecular genetics of Usher syndrome // Clin. Genet.- 2003.- № 63.- P. 431- 444.
27. Alsaber R, Tabone С J, Kandpal R.P. Predicting candidate genes for human deafness disorders: a bioinformatics approach // BMC Genomics -2006.-№ 7.- P. 180- 190.
28. Astuto L.M, Weston M.D, Carney C.A, Hoover D, Cremers C, Wagenaar M, Moller M, Smith R. Genetic heterogeneity of Usher syndrome: Analysis of 151 families with Usher type I // Am. J. Hum. Genet. -2000. -№ 67.- P. 1569- 1574.
29. Battey F.J.J. A genetic approach to understanding inner ear function // The Journal of Clinical Investigation.- 2000 .-Vol. 106.- № 12.- P. 431- 432.
30. Bharadwaj A.K, Kasztejna J.P, Huq S, Berson E.L, Dryja T.P. Evaluation of the myosin VIIA gene and visual function in patients with Usher syndrome type I // Exp. Eye Res. -2000.- Vol.-71.- №2.- P. 173- 181.
31. Bhatti A, Lee K, McDonald M.L, Hassan M.J, Gutala R, Ansar M, Ahmad W, Leal S.M. Mapping of a new autosomal recessive nonsyndromic hearing impairment locus (DFNB45) to chromosome Iq43-q44 // Clin. Genet.- 2008.-Vol. 73.- № 4.- P. 395- 398.118
32. Bitner-Glindzicz M. Hereditary deafness and phenotyping in humans // Br. Med. Bull.- 2002,- № 63.- P. 73- 94.
33. Boggon T.J, Murray J, Chappuis-Flament S, Wong E, Gumbiner B.M, Shapiro M. C-cadherin ectodomain structure and implications for cell adhesion mechanisms // Science -2002.- № 296.- P. 1308- 1313.
34. Boughman J.A, Vernon M, Shaver K.A. Usher syndrome: definition and estimate of prevalence from two high-risk populations // J. Chronic. Dis.-1983.-№36.-P. 595- 603.
35. Brobby G.W, Muller-Myhsok B, Horstmann R.D. Connexin 26 R143W mutation associated with recessive nonsyndromic sensorineural deafness in Africa // N. Engl. J. Med.- 1998.- № 338.- P. 548- 550.
36. Brown M.D, Torroni A, Reckord C.L, Wallace D.C. Phylogenetic analysis of Leber's hereditary optic neuropathy mitochondrial DNA's indicates multiple independent occurrences of the common mutations // Hum. Mutat. -1995,- Vol. 6.- P. 311- 325.
37. Brown M.R, Tomek M.S., Van Laer L, Smith S, Kenyon J.B, Van Camp G, Smith R.J. A novel locus for autosomal dominant nonsyndromic hearing loss, DFNA13, maps to chromosome 6p // Am. J. Hum. Genet.- 1997.- Vol. 61.-№4.- P. 924- 927.
38. Bu X, Shohat M, Jaber L, Rotter J.I. A form of sensorineural deafness is determined by a mitochondrial and an autosomal locus: evidence from pedigree segregation analysis // Genet. Epidemiol.- 1993.- № 10.- P. 3- 15.
39. Bykhovskaya Y, Estivill X., Taylor K, Hang T, Hamon M, Casano R.A, Yang H. Candidate locus for a nuclear modifier gene for maternally inherited deaftiess // Am. J. Hum. Genet.- 2000.- Vol. 66.- P. 1905- 1910.
40. Canlon B, Henderson D, Salvi R. Pharmacological strategies for prevention and treatment of hearing loss and tinnitus // Hear Res.- 2007.- № 226.- P. 12.
41. Casano R.A, Johnson D.F, Bykhovskaya Y, Torricelli F, Bigozzi M, Fischel-Ghodsian N. Inherited susceptibility to aminoglycoside ototoxicity: genetic heterogeneity and clinical implications // Am. J. Otolaryng. -1999.-Vol. 20.- P. 151- 156.
42. Chaib H, Place C, Salem N, Chardenoux S, Vincent C, Weissenbach J, El-Zir E, Loiselet J, Petit C. A gene responsible for a sensorineural nonsyndromic recessive deafness maps to chromosome 2p22-23 // Hum. Mol. Genet.- 1996.- Vol. 5.- № 1.- P. 155- 158.
43. Chalestori H, Farthud D, Patton E. Familial and sporadic GJB2-related deafness in Iran: Review of gene mutations // Iranian J. Publ. Helth.- 2007.-Vol. 36.- № l.-P. 1- 14.
44. Chen W, Kahrizi K, Meyer N.C, Riazalhosseini Y, Van Camp G, Najmabadi H, Smith R.J. Mutation of COL11A2 causes autosomal recessive non-syndromic hearing loss at the DFNB53 locus // J. Med. Genet.- 2005.- Vol. 42.- № 10.- P. 61.
45. Chen Z.Y, Hasson T, Kelley P.M., Schwenderd B.J, Schwartzb M.F, Ramakrishnan M, Kimberling W.J. Molecular cloning and domain structure of human myosin-Vila, the gene product defective in Usher syndrome IB // Genomics.-1996.- № 36.-P. 440- 448.
46. Corwin J.T. Identifying the genes of hearing, deafness, and disequilibrium // Proc. Natl. Acad. Sci. USA- 1998.- Vol. 95.- P. 12080- 12082.58. . Coucke P, Van Camp G, Djoyodiharjo B, Smith S.D, Frants R.R,
47. Padberg G.W, Darby J.K, Huizing E.H, Cremers C.W, Kimberling W.J. Linkage of autosomal dominant hearing loss to the short arm of chromosome 1 in two families //N. Engl. J. Med.- 1994.- Vol. 331.- № 7.- P. 425- 431.
48. Cremers F.P.M, Kimberling W.J, Kulm M. Development of a genotyping microarray for Usher syndrome // J. Med. Genet.- 2007.- № 44.- P. 153160.
49. Denoyelle F, Lina-Granade G, Plauchu H, Bruzzone R, Chaib H, Levi-Acobas F, Weil D, Petit C. Connexin 26 gene linked to a dominant deafness //Nature.- 1998.- Vol. 393.- № 6683.- P. 319- 320.
50. Eisen M.D, Ryugo D.K. Hearing molecules: contributions from genetic deafness // Cell. Mol. Life Sci.- 2007,- № 64.- P. 566- 580.
51. Eudy J.D, Sumegi J. Molecular genetics of Usher syndrome // Cell. Mol. Life Sci.- 1999.- Vol. 56,- P. 258- 267.
52. Finsterer J, Fellinger J. Nuclear and mitochondrial genes mutated in nonsyndromic impaired hearing // International Journal of Pediatric Otorhinolaryngology.- 2005.- № 69.- P. 621- 647.
53. Fischel-Ghodsian N, Prezant T.R, Chaltraw W.E, Wendt K.A, Nelson R.A, Arnos K.S, Falk R.E. Mitochondrial gene mutation is a significant predisposing factor in aminoglycoside ototoxicity // Am. J. Otolaryngol.-1997.-№ 18.-P. 17317- 17318.
54. Friedman T.B, Griffith A.J. Human nonsyndromic sensorineural deafness // Annu. Rev. Genomics Hum. Genet.- 2003.- Vol. 4.- P. 341- 402.123
55. Friedman T.B, Liang Y, Weber J.L, Hinnant J.T, Barber T.D, Winata S, Arhya I.N, Asher J.H.J. A gene for congenital, recessive deafness DFNB3 maps to the pericentromeric region of chromosome 17 // Nat Genet.- 1995.-Vol. 9.-№ l.-P. 86-91.
56. Frolenkov G.I, Belyantseva I.A, Friedman T.B, Griffith A.J. Genetic insights into the morphogenesis of inner ear hair cells // Nature Reviews | Genetics.- 2004.- Vol. 5.- P. 489- 498.
57. Fuse Y, Doi K, Hasegawa T, Sugii A, Hibino H, Kubo T. Three novel connexin26 gene mutations in autosomal recessive non-syndromic deafness //NeuroReport.- 1999.-№ 10.-P. 1853- 1857.
58. Gorlin R.J, Toriello H.V, Cohen M.M. Hereditary Hearing Loss and its Syndromes // Oxford University Press NY.- 1995.- P. 9- 21.
59. Goto Y, Nonaka I, Horai S. A mutation in the tRNALeu(UUR) gene associated with the MELAS subgroup of mitochondrial encephalomyopathies //Nature.- 1990.- № 348.- P. 651- 653.
60. Greene C.C, McMillan P.M., Barker S.E, ICurnool P, Lomax M.I, Burmeister M, Lesperance M.M. DFNA25, a novel locus for dominant nonsyndromic hereditary hearing impairment, maps to 12q21-24 // Am. J. Hum. Genet.- 2001.-Vol. 68.- № 1,- P. 254- 260.
61. Guan M.X. Mitochondrial DNA mutations associated with aminoglycoside ototoxicity // Audiological Medicine -2006.- Vol. 4.- № 4,- P. 170- 178.
62. Guilford P, Ben Arab S, Blanchard S, Levilliers J, Weissenbach J, Belkahia A, Petit C. A non-syndrome form of neurosensory, recessive deafness maps to the pericentromeric region of chromosome 13q // Nat. Genet.- 1994.- Vol. 6,- № 1.- P. 24- 28.
63. Haim M. Prevalence of retinitis pigmentosa and allied disorders in Denmark. II. Systemic involvement and age at onset // Acta Ophthalmol. (Copenh).-1992.-№70.-P. 417- 426.
64. Hao H, Bonilla E, Manfredi G, DiMauro S, Moraes C.T. Segregation patterns of a novel mutation in the mitochondrial tRNA glutamic acid geneassociated with myopathy and diabetes mellitus // Am. J. Hum. Genet.-1995.-№56.-P. 1017- 1025.
65. Heller S. Application of physiological genomics to the study of hearing disorders // Journal of Physiology- 2002.- Vol. 543.- № 1.- P. 3- 12.
66. Hmani M, Ghorbel A, Boulila-Elgaied A, Zina Z.B, Kammoun W, Drira M. A novel locus for Usher syndrome type II, USH2B, maps to chromosome 3 at p23-24.2 // Eur. J. Hum. Genet.- 1999.- № 7.- P. 363- 367.
67. Hone S.W, Smith R.J.H. Genetic screening for hearing loss // Clin. Otolaryngol.- 2003.- Vol. 28.- P. 285- 290.
68. Hutchin T.P, Cortopassi G.A. Mitochondrial defects and hearing loss // Cell. Mol. Life Sci.- 2000.- № 57.- P. 1927- 1937.
69. Hutchin T.P, Thompson K.R, Parker M, Newton V, Bitner-Glindzicz M, Mueller R.F. Prevalence of mitochondrial DNA mutations in childhood/congenital onset non-syndromal sensorineural hearing impairment // J. Med. Genet.- 2001.- № 38.- P. 229- 231.
70. Ingman M, Gyllensten U. MtDB: Human Mitochondrial Genome Database, a resource for population genetics and medical sciences // Nucleic Acids Res.- 2006.- Vol. 34.- P. 749- 751.
71. Ingman M, Kaessmann H, Paabo S, Gyllensten U. Mitochondrial genome variation and the origin of modern humans // Nature.- 2000.- № 408.- P. 708-713.
72. Ishikawa K, Tamagawa Y, Takahashi K, Kimura H, Kusakari J, Hara A, Ichimura K. Nonsyndromic hearing loss caused by a mitochondrial T7511С mutation//Laryngoscope.-2002.-№ 112.-P. 1494- 1499.
73. Jacobs H.T, Hutchin T.P, Kappi T, Gillies G., Minkkinen K, Walker J. Mitochondrial DNA mutations with postlingual, nonsyndromic hearing impairment // Eur. J. Hum. Genet.- 2005.- № 13.- P. 26- 33.
74. Jaksch M, Klopstock T, Kurlemann G., Dorner M, Hofmann S., Kleinle S, Hegemann S. Progressive myoclonus epilepsy and mitochondrial myopathy associated with mutations in the tRNASer(UCN)) gene // Ann. Neurol.-1998.-№44.-P. 635- 640.
75. Kalatzis V, Petit C. The fundamental and medical impacts of recent progress in research on hereditary hearing loss // Hum. Mol. Genet.- 1998.-Vol. 7.- № 10.-P. 1589- 1597.
76. Kalkandelen S, Selimoglu E, Erdogan F, Ucuncu H, Altas E. Comparative cochlear toxicities of streptomycin, gentamicin, amikacin and netilmicin in Guinea-pigs // J. Int. Med. Res.- 2002.- № 30.- P. 406 -412.
77. Keats B.J.B, Berlin C.I. Genomics and hearing impairment // Genome Res.-1999.-№9.-P. 7- 16.
78. Kelley P, Weston M, Chen Z. The genomic structure of the gene defective in Usher syndrome type lb (MY07A) // Genomics -1997.- №40.- P. 73- 79.
79. Kelsell D.P, Dunlop J, Stevens H.P, bench N.J, Liang J.N, Parry G, Mueller R.F, Leigh I.M. Connexin 26 mutations in hereditary nonsyndromic sensorineural deafness // Nature- 1997.-Vol. 387.- № 6628.- P. 80- 83.
80. Kimberling W.J, Moller C. Clinical and molecular genetics of Usher syndrome // J. Am. Acad. Audiol.- 1995.- № 6.- P. 63- 72.
81. Kimberling W.J, Weston M.D, Moller C, Davenport S.L, Shugart Y.Y, Priluck I.A, Martini A. Localization of Usher syndrome type II to chromosome lq // Genomics.- 1990.- № 7.- P. 245- 249.
82. Kohanski M.A, Dwyer D.J, Hayete B, Lawrence C.E, Collins J.J. A Common Mechanism of Cellular Death Induced by Bactericidal Antibiotics // Cell- 2007.- № 130.- P. 797- 810.
83. Kokotas H, Petersen M.B, Willems P.J. Mitochondrial deafness // Clin. Genet.- 2007.- № 71.- P. 379- 391.128
84. Konno T, Takahashi T, Kurita D, Muto A, Himeno H. A minimum structure of aminoglycosides that causes an initiation shift of trans-translation // Nucleic Acids Research- 2004.- Vol. 32.- № 14.- P. 41194126.
85. Kremer H, van Wijk E, Marker T, Wolfrum U, Roepman R. Usher syndrome: Molecular links of pathogenesis, proteins and pathways // Hum. Mol. Genet.- 2006.- № 15.- p. 262- 270.
86. Krendel M, Mark S, Mooseker M.S. Myosins: Tails (and Heads) of Functional Diversity // Physiology- 2005.- № 20.- P. 239- 251.
87. Kubisch C, Schroeder B.C., Friedrich T, Lutjohann B, El-Amraoui A, Marlin S, Petit C, Jentsch T.J. KCNQ4, a novel potassium channel expressed in sensory outer hair cells, is mutated in dominant deafness // Cell -1999,- Vol. 96.- № 3.- P. 437- 446.
88. Kupka S, Toth T, Wrobel M, Zeissler U, Szyfter W. Mutation A1555G in the 12S rRNA gene and its epidemiological importance in German, Hungarian, and Polish patients // Hum. Mutat.- 2002.- Vol. 19.- P. 308- 309.
89. Kurima K, Peters L.M, Yang Y, Riazuddin S, Ahmed Z.M, Naz S, Arnaud D, Drury S, Mo J, Makishima T, Ghosh M, Menon P.S. Dominant and recessive deafness caused by mutations of a novel gene,
90. ТМС1, required for cochlear hair-cell function // Nat. Genet.- 2002.- № 30.-P. 277- 284.
91. Lalwani A.K, Brister J.R, Fex J, Grundfast K.M, Pikus A.T, Ploplis B, San Agustin T, Skarka H, Wilcox E.R. A new nonsyndromic X-linked sensorineural hearing impairment linked to Xp21.2 // Am. J. Hum. Genet.-1994.- Vol. 55.- № 4.- P. 685- 694.
92. Lalwani A.K, Goldstein J.A, Kelley M.J, Luxford W, Castelein C.M, Mhatre A.N. Human nonsyndromic hereditary deafness DFNA17 is due to a mutation in nonmuscle myosin MYH9 // J. Hum. Genet.- 2000.- Vol. 67.- № 5,-P. 1121- 1128.
93. Leon P.E, Raventos H, Lynch E, Morrow J, King M.C. The gene for an inherited form of deafness maps to chromosome 5q31 // Proc Natl Acad Sci USA- 1992,-Vol. 89.-№ 11.-P. 5181-5184.
94. Li R, Greinwald J.H.J, Yang L, Choo D.I, Wenstrup R.J, Guan M.X. Molecular analysis of the mitochondrial 12S rRNA and tRNASer(UCN) genes in paediatric subjects with nonsyndromic hearing loss // J. Med. Genet.- 2004.- № 41,- P. 615- 620.
95. Li X., Li R, Lin X, Guan M.X. Isolation and characterization of the putative nuclear modifier gene MTOl involved in the pathogenesis of the deafness-associated mitochondrial 12S RNA A1555G mutation // J. Biol. Chem.- 2002.- Vol. 277.- P. 27256- 27264.
96. Liu X.Z, Hope C., Walsh J, Newton V., Ke X.M., Liang C.Y. Mutations in the myosin VIIA gene cause a wide phenotypic spectrum, including atypical Usher syndrome // Am. J. Hum. Genet.- 1998.- Vol. 63.- № 3.- P. 909- 912.
97. Li X, Zhang L.S, Fischel-Ghodsian N., Guan M.X. Biochemical characterization of the deafness-associated mitochondrial tRNASer(UCN) A7445G mutation in osteosarcoma cell cybrids // Biochem. Biophys. Res. Commun. -2005.- Vol. 328.- № 2,- P. 491- 498.
98. Lynch E.D, Lee M.K, Morrow J.E, Welcsh P.L, Leon P.E, King M.C. Nonsyndromic deafness DFNA1 associated with mutation of a human homolog of the Drosophila gene diaphanous // Science- 1997. -Vol. 278.- № 5341.-P. 1315- 1318.
99. Maca-Meyer N, Gonzalez A.M., Larruga J.M, Flores C, Cabrera V.M. Major genomic mitochondrial lineages delineate early human expansions // BMC Genet.- 2001 № 2,- P. 13.
100. Malik S, Sudoyo H, Sasmono T, Kadir A, Marzuki S. Nonsyndromic sensorineural deafness associated with the A1555G mutation in the mitochondrial small subunit ribosomal RNA in a Balinese family // J. Hum. Genet.- 2003.- Vol. 48.- P. 119- 124.
101. Manwaring N, Jones M.M, Wang J.J, Rochtchina E, Howard C, Newall P, Mitchell P, Sue C.M. Mitochondrial DNA haplogroups and age-related hearing loss // Arch. Otolaryngol. Head Neck Surg.- 2007.- Vol. 133.- № 9.-P. 929- 933.
102. Marazita M.L, Ploughman L.M, Rawlings B, Remington E, Arnos K.S, Nance W.E. Genetic epidemiological studies of early-onset deafness in the U.S. school-age population // Am. J. Hum. Genet.- 1993,- № 46.- P. 486491.
103. Mathew C.C. The isolation of high molecular weight eucaryotic DNA. Methods in Molecular Biology //Humana Press- 1984.- № 2- P. 31 34.
104. Mehl A, Thompson V. Newborn hearing screening: the great omission // Pediatrics- 1998.- № 101.- P. 114
105. Mehl A, Thompson V. The Colorado newborn screening project, 19921999: on the threshold of effective of population based universal newborn hearing screening // Pediatrics- 2002,- № 109.- P. 7.
106. Mermall V, Post P.L, Mooseker M.S. Unconventional myosins in cell movement, membrane traffic, and signal transduction // Science- 1998.- № 279.-P. 527- 533.
107. Merriwether D.A, Hodgson J.A, Friedlaender F.R, Allaby R, Cerchio S, Koki G, Friedlaender J.S. Ancient mitochondrial M haplogroups identified in the Southwest Pacific. // Proc. Natl Acad. Sci. USA- 2005.- № 102.- P. 13034- 13039.
108. Mishmar D, Ruiz-Pesini E, Golik P, Macaulay V, Clark A.G. Natural selection shaped regional mtDNA variation in humans // Proc. Natl. Acad. Sci. USA.- 2003.- № 100.- P. 171- 176.
109. Moilanen J.S, Majamaa K. Phylogenetic network and physicochemical properties of nonsynonymous mutations in the protein-coding genes of human mitochondrial DNA // Mol. Biol. Evol. -2003.- № 20.- P. 11951210.
110. Moller C.G, Kimberling W.J, Davenport S.L, Priluck I, White V. Usher syndrome: an otoneurologic study // Laryngoscope- 1989.- № 99.- P. 73- 79.
111. Morell R.J, Friderici K.H, Wei S, Elfenbein J.L, Friedman T.B, Fisher R.A. A new locus for late-onset, progressive, hereditary hearing loss DFNA20 maps to 17q25 // Genomics- 2000.- Vol. 1.- № 63.- P. 1 -6.
112. Morell R.J, Kim H.J, Hood L.J, Goforth L, Friderici K. Mutations in the connexin 26 gene (GJB2) among Ashkenazi Jews with nonsyndromic recessive deafness //N. Engl. J. Med.- 1998.- № 339.- P. 1500- 1505.
113. Morton C.C. Genetics, genomics and gene discovery in the auditory system // Hum. Mol. Genet.- 2002,- Vol. 11.- № 10.- P. 1229- 1240.
114. Morton C.C, Nance W.E. Newborn hearing screening- a silent revolution // N. Engl. J. Med.- 2006.- № 354.- P. 2151- 2164.
115. Naz S, Griffith A.J, Riazuddin S, Hampton L.L, Battey J.F.J, Khan S.N, Riazuddin S, Wilcox E.R, Friedman T.B. Mutations of ESPN cause autosomal recessive deafness and vestibular dysfunction // J. Med. Genet.-2004.- Vol. 41.- № 8.- P. 591- 595.
116. Neefs J.M, Van de Peer Y, De Rijik P, Goris A, De Wachter R. Compilation of small ribosomal subunit RNA sequences // Nucleic Acids Res.- 1991.-№ 19.-p. 1987-2018.
117. Oliveira С.A, Alexandrino F, Christiani T.V, Steiner C.E, Cunha J.L.R, Guerra A.T.M, Sartorato E.L. Molecular genetics study of deafness in Brazil: 8-year experience // Am. J. Med. Genet.- 2007.- № 143A.- P. 15741579.
118. Orita M, Iwahana H, Kanazawa H, Sekya T. Detection of polymorphism of human DNA by gel electrophoresis as single cell conformation polymorphism // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. -1989.- Vol. 86.- P. 27662770.
119. Nance W.E. The genetics of deafness // Mental retardation and developmental disabilities research reviews- 2003.- № 9.- P. 109- 119.
120. Niceta M, Fabiano C, Sammarco P, Piccione M, Antona V, Giuffre M, Corsello G. Epidemiological study of nonsyndromic hearing loss in Sicilian newborns // Am. J. Med. Genet.- 2007.- № 143A.- P. 1666- 1670.
121. Ohtsuka A, Yuge I, Kimura S, Namba A, Abe S, Van Laer L, Van Camp G, Usami S. GJB2 deafness gene shows a specific spectrum of mutations in Japan, including a frequent founder mutation // Hum. Genet.- 2003.- № 112.- P. 329-333.
122. Ouyang X.M, Yam D, Hejtmancik J.F, Jacobson S.G. Mutational spectrum in Usher syndrome type II // Clin. Genet.- 2004.- № 65.- P. 288- 293.
123. Palanichamy M, Sun С, Agrawal S, Bandelt H.J, Kong Q.P. Phylogeny of mtDNA macrohaplogroup N in India based on complete sequencing: implications for the peopling of South Asia // Am. J. Hum. Genet.- 2004.- № 75.-P. 966-978.
124. Pandya A. Nonsyndromic hearing loss and deafness, mitochondrial .- 2004,-(www.genetests.org)
125. Pandya A, Xia X, Radnaabazar J, Dangaansuren B, Fischel-Ghodsian N, Nance W.E. Mutation in the mitochondrial 12S rRNA gene in two families from Mongolia with matrilineal aminoglycoside ototoxicity // J. Med. Genet.- 1997,-Vol. 34.-№ 2.-P. 169- 172.
126. Pennings R.J. Changing horizons for people with Usher in the 21st century. Clinical and genetic research in Usher syndrome // Genetic research in Usher syndrome.-2005.-№2;-P. 17-21.
127. Perletti G, Vral A, Patrosso M.C, Marras E, Ceriani I, Willems P, Fasano M, Magri V. Prevention and modulation of aminoglycoside ototoxicity(Review) // Molecular Medicine Reports- 2008.- № 1;- P. 3- 13.
128. Petersen M, Willems P. Non-syndromic, autosomal-recessive deafness // Clin. Genet.-2006.-№.69.-P. 371-392. '
129. Posukh O.L, Pallares-Ruiz N, Tadinova V, Osipova L, Claustres M, Roux A.F. First molecular screening of deafness in the Altai Republic population //BMC Medical Genetics-2005." № 6,-P. 12-18.
130. Prezant T.R, Agapian J.V, Bohlman M.C. Mitochondrial ribosomal RNA mutation associated with both antibiotic-induced and non-syndromic deafness //Nat. Genet.- 1993.- Vol. 4.- P. 289- 294.
131. Piatto V.B, Nascimento E.C.T, Alexandrino F, Oliveira C.A, Lopes A.C.P, Sartorato E.L, Maniglia J.V. Molecular genetics of nonsyndromic deafness // Rev. Bras. Otorrinolaringol.- 2005,- Vol. 71, № 2, P. 216- 223.
132. Recht M.I, Fourmy D, Blanchard S.C, Dahlquist K.D, Puglisi J.D. RNA sequence determinants for aminoglycoside binding to an A-site rRNA model oligonucleotide // J. Mol. Biol.- 1996,- Vol. 262.- № 4,- P. 421- 436.
133. Redowicz M.J. Myosins and pathology: genetics and biology // Acta Biochimika Polonica- 2002.- Vol. 49.- № 4.- P. 789- 804.
134. Reid F.M, Vernham G.A, Jacobs H.T. A novel mitochondrial point mutation in a maternal pedigree with sensorineural deafness // Hum. Mutat.-1994.- Vol. 3,- № 3.- P. 243- 247.
135. Reiners J, van Wijk E, Marker T, Jurgens K, Brinke H, Overlack N, Roepman R, Knipper M. Scaffold protein harmonin (USH1C) provides molecular links between Usher syndrome type 1 and type 2 // Hum. Mol. Genet.- 2005.- № 14,- P. 3933- 3943.
136. Resendes B, Williamson R, Morton C.C. At the speed of sound: Gene discovery in the Auditory system // Am. J. Hum. Genet.-2001.- № 69.- P. 923-935.
137. Rivas A, Francis H.W. Inner ear abnormalities in a Kcnql (Kvlqtl) knockout mouse: a model of Jervell and Lange-Nielsen syndrome // Otol. Neurotol.- 2005.- № 26.- P. 415- 424.
138. Rivolta C, Sweklo E.A, Berson E.L, Dryja T.P. Missense mutation in the USH2A gene: association with recessive retinitis pigmentosa without hearing loss // Am. J. Hum. Genet.- 2000.- № 66.- P. 1975- 1978.
139. Schrijver I, Gardner P. Hereditary sensorineural hearing loss: advances in molecular genetics and mutation analysis // Exp. Rev. Mol. Diagn.- 2006.-Vol. 6.-№3.-P. 375 -386.
140. Seeliger M, Pfister M, Gendo K. Comparative study of visual, auditory, and olfactory function in Usher syndrome // Graefes Arch Clin Exp Ophthalmol.- 1999.- № 231.- P. 301- 307.
141. Shaikh R.S, Ramzan K, Nazli S, Sattar S, Khan S.N, Riazuddin S, Ahmed Z.M, Friedman T.B. A new locus for nonsyndromic deafness DFNB51 maps to chromosome Ilpl3-pl2 // Am. J. Med. Genet.- 2005.-Vol. 138.-№4.-P. 392-395.
142. Shoffner J.M, Wallace D.C. Oxidative phosphorylation diseases. Disorders of two genomes // Adv. Hum. Genet.- 1990.- № 19.- P. 267- 330.
143. Sevior K.B, Hatamochi A, Stewart I.A, Bykhovskaya Y, Allen-Powell D.R, Fischel-Ghodsian N, Maw M.A. Mitochondrial A7445G mutation in two pedigrees with palmoplantar keratoderma and deafness // Am. J. Med. Genet.- 1998,- Vol. 75.- № 2.- P. 179- 185.139
144. Smith R.J.H, Van Camp G. Deafness and hereditary hearing loss overview (www.genetests. org)
145. Snoeckx R.L, Kremer H, Ensink R.J, Flothmann K, de Brouwer A, Smith R.J, Cremers C.W, Van Camp G. A novel locus for autosomal dominant non-syndromic hearing loss, DFNA31, maps to chromosome 6p21.3 // J. Med. Genet.- 2004.- Vol. 41.- № l.-P. 11-13.
146. Spandau U.H, Rohrschneider K. Prevalence and geographical distribution of Usher syndrome in Germany // Graefes Arch Clin Exp Ophthalmol.- 2002.-№ 240.- P. 495- 498.
147. Stanchina L, Baral V, Robert F, Pingault V, Lemort N, Pachnis V, Goossens M, Bondurand N. Interactions between SoxlO, Edn3 and Ednrb during enteric nervous system and melanocyte development // Dev. Biol.-2006.-№ 295,-P. 232- 249.
148. Steel K.P. New interventions in hearing impairment // BMJ.- 2000.- № 320.-P. 622- 625.
149. Steel K.P, Kros C.J. A genetic approach to understanding auditory function //Nat. genetics.- 2001.-Vol. 27.-P. 143- 149.
150. Stephens S.D.G. Genetic hearing loss: A historical overview // Adv. Audiol.-1985.-№3.-P. 3- 17.
151. Street V.A, Kallman J.C, Kiemele K.L. Modifier controls severity of a novel dominant low-frequency Myosin VIIA (MY07A) auditory mutation // J. Med. Genet.- 2004.- № 41.- P. 62.
152. Sue C.M, Tanji K, Hadjigeorgiou G. Maternally inherited hearing loss in a large kindred with a novel T7511C mutation in the mitochondrial DNA tRNASer(UCN) gene //Neurology- 1999.- № 52.- P. 1905- 1908.
153. Tanaka M, Cabrera V.M, Gonzalez A.M., Larruga J.M, Takeyasu T. Mitochondrial genome variation in eastern Asia and the peopling of Japan // Genome Res.-2004.-№ 14.-P. 1832- 1850.
154. Tassabehji M, Newton V.E, Read A.P. Waardenburg syndrome type 2 caused by mutations in the human microphthalmia (MITF) gene // Nat. Genet.- 1994.- № 8.- P. 251- 255.
155. Taylor R.W, Turnbull D.M. Mitochondrial DNA mutations in human disease // Nat. Rev. Genet.- 2005.- Vol. 6,- № 5.- P. 389- 402.
156. Tekin M, Arici Z.S. Genetic epidemiological studies of congenital/prelingual deafness in Turkey: population structure and mating type are major determinants of mutation identification // Am. J. Med. Genet.-2007.-№ 143A.-P. 1583- 1591.
157. Tekin M, Duman T, Bogoclu G. Frequency of mtDNA A1555G and ", A7445G mutations among children with prelingual deafness in Turkey // Eur. J. Pediatr.- 2003.- Vol. 162,- № 3.- P. 154- 158. ;
158. Tessa A, Giannotti A, Tieri L, Vilarinho L, Marotta G, Santorelli F.M. Maternally inherited deafness associated with a T1095С mutation in the mDNA // Eur. J. of Hum. Genet.- 2001.- № 9.- P. 147- 149.
159. Thyagarajan D, Bressman S, Bruno C. A novel mitochondrial 12SrRNA point mutation in parkinsonism, deafness, and neuropathy // Ann. Neurol.-2000.- Vol. 48.- № 5.- P. 730- 736.
160. Toompuu M, Yasukawa T, Suzuki T. The 7472insC mitochondrial DNA mutation impairs the synthesis and extent of aminoacylation of tRNASer(UCN) but not its structure or rate of turnover // J. Biol. Chem.-2002.- № 277.- P. 22240- 22250.
161. Tyson J., Bellman S, Newton V, Simpson P, Malcolm S, Pembrey M.E, Bitner-Glindzicz M. Mapping of DFN2 to Xq22 // Hum. Mol. Genet.- 1996.-Vol. 5.- № 12.- P. 2055- 2060.
162. Usami S, Abe S, Akita J. Prevalence of mitochondrial gene mutations among hearing impaired patients // J Med Genet.- 2000.- Vol. 37.- P. 38- 40.
163. Van den Ouweland J.M, Lemkes H.H.P, Ruitenbeek W. Mutation in mitochondrial tRNALeu(UUR) gene in a large pedigree with maternally transmitted type II diabetes mellitus and deafness // Nat. Genet- 1992.- № 1.- P. 368-371.
164. Van Laer L, Huizing E.H, Verstreken M, van Zuijlen D, Wauters J.G, Bossuyt P.J, Van de Heyning P, McGuirt W.T, Smith R.J. Nonsyndromic hearing impairment is associated with a mutation in DFNA5 // Nat. Genet.-1998,-№2.-P. 194- 197.
165. Verhoeven K, Ensink R.J.H, Tiranti V. Hearing impairment and neurological dysfunction associated with a mutation in the mitochondrial tRNASer(UCN) gene // Eur. J. Hum. Genet.- 1999.- Vol.7.- P. 45-51.142
166. Verhoeven К, Van Laer L, Kirschhofer K, Legan P.K, Hughes D.C, Schatteman I, Verstreken M. Mutations in the human alpha-tectorin gene cause autosomal dominant non-syndromic hearing impairment // Nat. Genet.- 1998.- Vol. 19.- № 1.- P. 60- 62.
167. Vialettes B.H, Paquis-Flucklinger V, Pelissier J.F. Phenotypic expressionof diabetes secondary to a T14709C mutation of mitochondrial DNA.i
168. Comparison with MIDD syndrome (A3243G mutation): a case report. // Diabetes Care.- 1997.- № 20.- P. 1731- 1737.
169. Wangemann P, Liu J, Marcus D.C. Ion transport mechanisms responsible for K+ secretion and the transepithelial voltage across marginal cells of stria vascularis in vitro // Hear. Res.- 1995.- № 84.- P. 19- 29.
170. Weston M.D., Eudy J.D, Fujita S. Genomic structure and identification of novel mutations in usherin, the gene responsible for Usher syndrome type Ha // Am. J. Hum. Genet. -2000. -№ 66.- P. 1199- 1210.
171. Willems P.J. Genetic causes of hearing loss // N. Engl. J. Med.- 2000.- Vol. 342.-№ 15.-P. 1101- 1109.
172. Xing G, Chen Z, Cao X. Mitochondrial rRNA and tRNA and hearing function // Cell Research- 2007,- № 1.- P. 1- 13.
173. Xing G, Chen Z, Wei Q, Tian H, Li X, Zhou A, Bu X, Cao X. Mitochondrial 12S rRNA A827G mutation is involved in the genetic susceptibility to aminoglycoside ototoxicity // Biochem. Biophys. Res. Commun.- 2006.-Vol. 346.- № 4,- P.l 131- 1135.
174. Yan D, Ke X, Blanton S.H, Ouyang X.M, Pandya A, Du L.L, Nance W.E, Liu X.Z. A novel locus for autosomal dominant non-syndromic deafness, DFNA53, maps to chromosome 14qll.2-ql2 // J. Med. Genet.-2006,- Vol. 43.- № 2.- P. 170- 174.
175. Yao Y.G, Salas A, Bravi C.M, Bandelt H.J. A reappraisal of complete mtDNA variation in East Asian families with hearing impairment // Hum. Genet.- 2006.- Vol. 119.- № 5.- P. 505-515.
176. Yoshizawa S., Fourmy D, Puglisi D.J. Structural origins of gentamicin antibiotic action // The EMBO Journal.-1998.- Vol. 17.- № 22.- P. 64376448.
177. Zeviani M, Muntoni F, Savarese N. A MERRF/MELAS overlap syndrome associated with a new point mutation in the mitochondrial DNA tRNALys gene // Eur. J. Hum. Genet.- 1993,- № 1,- P. 80- 87.
178. Zhao H.B, Kikuchi T, Ngezahayo A, White T.W. Gap junctions and. cochlear homeostasis // J. Membr. Biol.- 2006.- № 209.- P. 177- 186.
179. BLAST- www.blast.ncbi.nlm.nih.gov/blast.cgi;
180. BLAST- www.genebee.msu.su/blastnew/blast.html.
181. Connexins and deafness Homepage- www.davinci.crg.es/deafness/
182. GenAtlas- www.genatlas.medecine.univ-paris5.fr/1. GENECARDS1. Haplotype Mapping Project
183. Harvard Medical School Center
184. Hereditary Hearing Loss Homepage1. Human Genome Project1. MITOMAP1. NCBIhttp://www.genecards.org/http://www.hapmap.org/www.hearing.harvard.eduhttp://webh01.ua.ac.be/hhhhttp ://www. gdb. org /www.mitomap.orghttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/
185. OMIM- Online Mendelian Inheritance in Man)- www.ncbi.nlm.nih.gov/omim/ GeneTests Home Page- www.genetests.org
-
Тазетдинов, Андрей Маулетзянович
-
кандидата биологических наук
-
Уфа, 2008
-
ВАК 03.00.15
- Молекулярно-генетическое изучение наследственной несиндромальной сенсоневральной глухоты в Республике Саха (Якутия)
- Молекулярно-генетический анализ наследственной несиндромальной сенсоневральной тугоухости
- Медико-генетическое исследование народонаселения Республики Алтай
- Наследственные болезни в Чувашской Республике
- Распространенность и генетическая гетерогенность наследственной тугоухости в Ростовской обл.
