Бесплатный автореферат и диссертация по биологии на тему

Создание ДНК-иммуногена, экспрессирующего белок GAG ВИЧ-1

ВАК РФ 03.00.04, Биохимия

Содержание диссертации, кандидата биологических наук, Духовлинов, Илья Владимирович

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ И ОБОЗНАЧЕНИЙ.

ВВЕДЕНИЕ.

1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.

1.1. Эпидемия ВИЧ/СПИД.

1.2. Вирус иммунодефицита человека первого типа (ВИЧ-1).

1.2.1. Морфология и структура ВИЧ.

1.2.2. Организация генома ВИЧ-1.

1.2.3. Белки ВИЧ-1.

1.3. Жизненный цикл ВИЧ-1.

1.3.1. Взаимодействие ВИЧ с белками клетки-хозяина.

1.3.2. Роль белка Gag в лсизненном цикле ВИЧ-1.

1.4. Экспрессия генов ВИЧ в процессе жизненного цикла.

1.4.1. Ранняя и поздняя фазы экспрессии генов ВИЧ.

1.4.2. Rev-система ВИЧ-1.

1.5. Дестабилизирующие нуклеотидные последовательности, содержащиеся в мРНК ВИЧ-1.

1.6. Влияние нуклеотидного состава генов на их экспрессию.

1.7. Состояние проблемы создания вакцины против ВИЧ/СПИДа в мире.

1.8. Иммунологические аспекты ВИЧ-инфекции.

1.8.1. Роль цитотоксических Т-лимфоцитов.

1.8.2.Роль( Сй4+)-субпопуляции Т-лимфоцитов.

1.8.3. Гуморальный ответ.

1.8.4. Антителозависимая цитотоксичность.

1.9. ДНК-вакцинация.

1.10. Белок Gag как перспективный антиген в составе вакцины против

1.11. Повышение эффективности ДНК-вакцинации путем оптимизации состава кодонов.

1.12. Использование генов дефенсинов в составе ДНК-вакцин.

2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ.

2.1. Рекомбинантные плазмиды.

2.1.1. Плазмида pGEM-T Easy.

2.1.2. Плазмида рВМС.

2.1.3. Плазмида pGmsf.

2.1.4. Плазмида pIRES-EYFP.

2.1.5. Плазмида pETl51/D-TOPO.

2.2. Бактериальные штаммы.

2.3. Эукариотические клеточные линии.

2.4. Выделение и стимуляция перитонеальных макрофагов мыши.

2.5. Выделение РНК из перитонеальных макрофагов мыши.

2.6. Постановка реакции обратной транскрипции.

2.7. Амплификация последовательности гена дефенсина-2р.

2.8. Амплификация фрагментов ДНК гена gag.

2.9. Быстрый скрининг рекомбинантных клонов методом ПЦР.

2.10. Очистка ДНК между ферментативными реакциями.

2.11. Электрофорез в агарозном геле.

2.12. Выделение плазмидной ДНК с помощью набора Wizard Plus Mini-Preps DNA Purification System (Promega, США).

2.13. Выделение плазмидной ДНК в градиенте хлористого цезия.

2.14. Определение количества ДНК.

2.15. Извлечение ДНК из легкоплавкой агарозы.

2.16. Лигирование фрагментов ДНК.

2.17. Рестрикция амплифицированных фрагментов ДНК и плазмид.

2.18. Концентрирование нуклеиновых кислот.

2.19. Метод введения нуклеотидных замен в нуклеотидную последовательность, кодирующую белок Gag, с помощью ПЦР.

2.20. Синтез гуманизированной последовательности гена gag ВИЧсубтипа А.

2.21. Приготовление компетентных клеток для трансформации.

2.22. Трансформация бактериальных клеток.

2.23. Трансформация эукариотических клеток.

2.24. Секвенирование клонированных фрагментов ДНК по методу Сенджера.

2.25. Методы анализа нуклеотидных последовательностей.

2.26. Электрофорез белков в денатурирующих условиях по Леммле.

2.27. Электрофоретический перенос белков лизата клеток линии 293Т с последующим ИФА.

2.28. Выделение спленоцитов мышей.

2.29. Окрашивание поверхностных антигенов.

2.30. Окрашивание внутриклеточных цитокинов.

2.31. Анализ на проточном цитофлуориметре.

2.32. Иммуноферментный анализ.

2.33. Модификация метода ИФА для анализа титра антител к рекомбинантному белку р24.

2.34. Пептид, используемый для анализа цитотоксической активности лимфоцитов

2.35. Цитотоксический анализ.

2.36. Условия культивирования BL21 Star и индукции экспрессии белка

2.37. Электрофоретический перенос белков клеточного лизата Е. coli с последующим ИФА.

2.38. Построение калибровочной кривой для количественного определения концентрации белка р24.

2.39. Лабораторные животные.

2.40. Приготовление лизата клеток E.coli BL21 Star, содержащих белок

2.41. Схема иммунизации лабораторных животных.

2.42. Статистический анализ полученных результатов.

2.43. Компьютерные методы анализа данных.

3. РЕЗУЛЬТАТЫ.

3.1. Создание эукариотических экспрессионных плазмид.

3.1.1. Клонирование полноразмерной последовательности гена gag в плазмиде pGEM-T Easy.

3.1.2. Секвенирование клонов, содержащих полноразмерную последовательность гена gag ВИЧ-1 субтипа А.

3.1.3. Компьютерная обработка результатов секвенирования.

3.1.4. Создание экспрессионной конструкции на основе вектора рВМС, содержащего последовательность гена gag ВИЧ-1 субтипа А.

3.1.5. Результат секвенирования клонов, содержащих полноразмерную последовательность гена gag ВИЧ-1 субтипа А.

3.1.6. Расчет синтетической последовательности гена gag.

3.1.7. Дизайн праймеров для внесения нуклеотидных замен.

3.1.8. Результат секвенирования полученной синтетической нуклеотидной последовательности , кодирующей белок р55.

3.1.9. Сравнение полученной синтетической последовательности gagSynt с нативной последовательностью, кодирующей белок Gag.

3.1.10. Клонирование синтетической нуклеотидной последовательности, кодирующей белок Gag, в экпрессионный вектор рВМС.

3.1.11. Дизайн и синтез гуманизированной последовательности гена

3.1.12. Синтез кДНК дефенсина-2р мыши.

3.1.13. Создание экспрессионной плазмиды, содержащей кДНК дефенсина-2р мыши.

3.2. Анализ экспрессии дефенсина-2р , нативного, синтетического и . гуманизированного генов gag.

3.2.1. Экспрессия дефенсина-2р в клетках линии 293Т.

3.2.2. Сравнение уровня экспрессии белка Gag в культурах клеток 293Т, трансформированных плазмидами pBMCgagA и pBMCgagSynt, с помощью метода иммуноблотта.

3.2.3. Сравнение уровня экспрессии белка Gag в клетках 293Т, трансформированных плазмидами pBMCgagA, pBMCgagSynt и pBMCgagHum.

3.2.4. Иммуноферментный анализ культуральной среды клеток 293Т, трансформированных плазмидными ДНК, экспрессирующими различные модификации гена gag.

3.2.5. Концентрация антигена р24 в сыворотке мышей после иммунизации плазмидными ДНК, экспрессирующими нативный и гуманизированный гены gag ВИЧ-1 субтипа А.

I 3.3. Экспрессия рекомбинантного белка р24.

3.3.1. Клонирование нуклеотидной последовательности белка р24 в прокариотической экспрессионной плазмиде рЕТ151.

3.3.2. Экспрессия рекомбинантного белка р24 в бактериальных клетках.

3.4. Анализ иммуногенных свойств созданных рекомбинантных ДНК.

3.4.1. Уровень гуморального иммунного ответа, возникающего у ^ мышей после иммунизации плазмидными ДНК, экспрессирующими нативный и гуманизированный гены gag ВИЧ-1 субтипа А.

3.4.2. Уровень гуморального иммуного ответа, возникающего у мышей после иммунизации плазмидой pBMCgagA или после совместной иммунизации плазмидами pBMCgagA и pBMCdef.

3.4.3. Цитотоксический иммунный ответ, возникающий при иммунизации плазмидными ДНК, экспрессирующими нативный и гуманизированный гены gag ВИЧ-1 субтипа А.

3.4.4. Цитотоксический иммунный ответ, возникающий при иммунизации препаратом, экспрессирующими нативный ген gag ВИЧ-1 субтипа А и дефенсин-2Р.

3.4.5. Уровень INF-y, продуцируемый С08+-лимфоцитами мышей после иммунизации ДНК-иммуногенами, имеющими различный уровень экспрессии гена gag.

3.4.6. Уровень INF-y, продуцируемый CD8+ лимфоцитами мышей после иммунизации ДНК-иммуногенами, экспрессирующими ген gag и дефенсин-2(3.

4. ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ.

4.1. Влияние нуклеотидного состава гена gag на его экспрессию в клетках млекопитающих.

4.2. Экстраклеточная локализация белка Gag в зависимости от уровня экспрессии гена gag в эукариотических клетках in vitro и in vivo.

4.3. Экспрессия рекомбинантного белка р24 в клетках E.coli.

4.4. Гуморальный ответ, возникающий после иммунизации плазмидными ДНК, экспрессирующими различные модификации гена gag.

4.5. Цитотоксичекий ответ, возникающий после иммунизации плазмидными ДНК, экспрессирующими различные модификации гена gag.

4.6. Изменение уровня INF-y, продуцируемого С08+-лимфоцитами мышей после иммунизации ДНК-иммуногенами.

4.7. Динамика цитотоксического и гуморального ответа.

4.8. Использование иммуномодулятора pBMCdef совместно с ДНК-иммуногеном на основе гена gag. ц- 4.9. Перспективность использования созданных плазмид в составе кандидатной ДНК-вакцины против ВИЧ-1.

ВЫВОДЫ.

Введение Диссертация по биологии, на тему "Создание ДНК-иммуногена, экспрессирующего белок GAG ВИЧ-1"

Ген gag вируса иммунодефицита человека первого типа кодирует структурные компоненты оболочки вируса. Известно, что Gag является одним из относительно консервативных белков лентивирусов, поэтому считается, что иммунный ответ на Gag может быть действенным против различных субтипов ВИЧ-1. При изучении иммунного ответа ВИЧ-1 инфицированных пациентов было показано, что высокое содержание Gag-специфических С08+Т-лимфоцитов коррелирует с низкой вирусной нагрузкой. Антитела к некоторым участкам белка Gag также снижают вирусную нагрузку и вызывают нейтрализацию вируса.

Следовательно, можно полагать, что развитие клеточного и гуморального иммунитета на эпитопы gag при ДНК-вакцинации организма может иметь протективный эффект. Однако, создание ДНК-вакцины на основе последовательности gag представляет собой сложную задачу. Было показано, что экспрессия гена gag в эукариотических клетках жестко регулируется другим вирусным белком - Rev, регуляция экспрессии которого представляет собой сложный процесс. Таким образом, для создания ДНК-вакцины на основе последовательностей gag необходимо регуляцию экспрессии гена gag сделать независимой от белка Rev. В генах ВИЧ-1 используются кодоны, редко встречающиеся в генах человека, следовательно, при конструировании ДНК-вакцины для оптимизации экспрессии целевого белка необходимо произвести частичную замену кодонов.

Было показано, что эффективность ДНК-иммунизации значительно возрастает при использовании в составе вакцины генов, кодирующих различные хемокины и дефенсины, стимулирующие CD8+ Т-лимфоциты и дендритные клетки. Дефенсин-2(3 также является сильным хемоаттрактантом для дендритных клеток, стимулирующим их созревание.

Цель и задачи исследования

Исходя из вышеизложенного, целью нашей работы является оптимизация нуклеотидной последовательности, кодирующей белок Gag ВИЧ-1 субтипа А для увеличения его экспрессии in vivo и создание ДНК-иммуногена против ВИЧ на основе оптимизированного гена с дополнительным использованием гена, кодирующего дефенсин-2р. Задачи исследования:

1 .Оптимизировать нуклеотидную последовательность, кодирующую белок Gag ВИЧ-1 субтипа А.

2. Изучить экспрессию различных вариантов оптимизированного гена gag в клетках млекопитающих in vivo и in vitro.

3. Изучить иммунный ответ, вызываемый при иммунизации лабораторных животных плазмидными ДНК, экспрессирующими различные варианты модифицированного гена gag.

4. Изучить иммунный ответ, вызываемый при иммунизации лабораторных животных плазмидной ДНК, кодирующей целевой антиген Gag и плазмидной ДНК, кодирующей пептидный иммуномодулятор дефенсин-2р.

Научная новизна работы

Впервые установлена зависимость между нуклеотидным составом и уровнем экспрессии гена gag ВИЧ-1 российского варианта субтипа А. Оценена роль дестабилизирующих участков нуклеотидной последовательности гена gag и состава кодонов в эффективности трансляции белка Gag.

Впервые изучена динамика образования антигена Gag in vivo после введения

ДНК-иммуногена.

Впервые показано отличие в формировании клеточного и гуморального иммунных ответов в зависимости от интенсивности экспрессии внутриклеточного иммуногена.

Исследовано влияние белкового иммуномодулятора дефенсина-2|3, кодируемого плазмидной ДНК, на развитие иммунного ответа при совместном введении с ДНК-иммуногеном на основе гена gag.

Научно-практическое значение работы

Данные проведенного исследования представляют собой часть большой работы, проводимой в Биомедицинском центре и лаборатории молекулярной вирусологии Гос НИИ Особо Чистых Биопрепаратов, по созданию вакцин против ВИЧ. Один из подходов к созданию вакцины основан на иммунизации организма плазмидной ДНК, экспрессирующей гены ВИЧ-1. В связи с этим большое значение имеет изучение механизмов и факторов, влияющих на экспрессию гетерологичных генов в клетках млекопитающих. Зависимость уровня экспрессии гена от его нуклеотидного состава делает возможным использование искусственных генов с целью повышения их экспрессии. Сконструированные химерные гены могут быть использованы в практических целях для модуляции уровня экспрессии трансгенов. В процессе модулирования экспрессии иммуногенов, кодируемых ДНК-вакциной, получены данные о влиянии уровня экспрессии антигена на формирование иммунного ответа, которые позволяют создавать ДНК-иммуногены с различными иммуногенными свойствами. Созданная в ходе настоящей работы плазмида pBMCdef2b, экспрессирующая дефенсин- 20, может быть использована как адьювант к различным ДНК-вакцинам для модуляции и усиления их иммуногенных свойств. Полученая в ходе представленной работы нуклеотидная последовательность gagHum входит в состав ДНК-вакцины против ВИЧ, а также в состав вакцины на основе аттенуированных клеток сальмонеллы. Препараты успешно прошли фазу доклинических испытаний, которые позволяют отнести их к V классу практически безопасных лекарственных веществ. В дальнейшем планируются клинические испытания созданных иммуногенов.

Форма выполнения диссертационной работы

Работа выполнялась в рамках финансирования Негосударственного Научно-исследовательского Учреждения "Биомедицинский центр" и ФГУП "ГосНИИ особо чистых биопрепаратов" по проекту Межведомственной научно-технической программы "Вакцины нового поколения и медицинские диагностические системы будущего" и научно-техническому проекту МНТЦ №2344.

Апробация работы

Материалы диссертации были представлены на 9-Й-15-Й Международных конференциях "СПИД, рак и общественное здоровье", Санкт-Петербург, Россия, 1999-2006; Барселона, Испания, 2002; конференциях "Вакцина против СПИДа", Филадельфия, США, 2001 и Нью-Йорк, США, 2003; 10-й конференции по ретровирусам и оппортунистическим инфекциям, Бостон, США, 2003; 2-й конференции по патогенезу и лечению СПИДа Международного Общества по СПИДу, Париж, Франция, 2003. По теме диссертации опубликованы 2 статьи, 3 патента и 13 тезисов докладов.

Объем и структура диссертации

Диссертация состоит из введения, обзора литературы, описания материалов и методов, результатов исследования, обсуждения полученных результатов, выводов и списка литературы. Работа изложена на 244 страницах машинописного текста, иллюстрирована 63 рисунками, 21 таблицой и 4 приложениями. Список литературы содержит 349 литературных источников.

Заключение Диссертация по теме "Биохимия", Духовлинов, Илья Владимирович

выводы

1. Уровень экспрессии гена gag вируса иммунодефицита человека в культивируемых клетках человека значительно возрастает при гуманизации гена, и в меньшей степени при разрушении дестабилизирующих последовательностей в мРНК.

2. Использование в составе экспрессионного вектора синтетического гена gagHum с максимально высокой частотой использования GC-богатых кодонов и максимальным разрушением дестабилизирующих участков позволяет увеличить синтез белка Gag в культуре клеток человека примерно в 100 раз по сравнению с природным геном.

3. При внутримышечном введении лабораторным животным плазмидной ДНК, экспрессирующей различные варианты гена gag, в сыворотке крови мышей обнаруживается белок, связывающийся с моноклональными антителами к белку р24. Максимальная концентрация белка наблюдается при использовании gagHum и достигает 20 пг/мл.

4. Иммунизация мышей ДНК, экспрессирующей gagHum, вызывает образование более сильного гуморального иммунного ответа по сравнению с иммунизацией природным геном.

5. Иммунизация мышей ДНК, экспрессирующей природный ген gag А, вызывает образование более выраженного цитотоксического иммунного ответа по сравнению с иммунизацией геном gagHum.

6. Совместное введение плазмиды, экспрессирующей дефенсин-2р, и ДНК-иммуногена на основе природного гена gag, вызывает более сильную стимуляцию цитотоксического и гуморального ответов по сравнению с иммунизацией только ДНК, экспрессирующей ген gag.

7. Все данные свидетельствуют, что созданные плазмидные конструкции (pBMCgagA, pBMCgagHum, pBMCdef) являются перспективными для включения в состав кандидатной ДНК-вакцины против ВИЧ.

Библиография Диссертация по биологии, кандидата биологических наук, Духовлинов, Илья Владимирович, Санкт-Петербург

1. Букринская А. Г., Воркунов Г. К., Бурштейн М. Е., Городничева Т. В., Стивенсон М. Молекулярные факторы инфекционности вируса иммунодефицита человека // ДАН. 2005. - Т. 403. - С. 320-322.

2. Дебабов В. Г. ДНК-вакцинация и генотерапия на основе транзиентной экспрессии нуклеиновых кислот в соматических клетках человека и животных // Молекулярная биология. 1997.-Т.31. №2.- С. 209-215.

3. Зеленин А.В., В.А. Кайгородов, B.C. Прасолов. Генная терапия сегодня и завтра // Молекулярная биология. 1998.-Т. 32, № 2.-С. 219-228.

4. Маниатис Т., Фрич Э., Сэмбрук Дж. Молекулярное клонирование. -М.: Мир, 1984.-356 с.

5. Рыбчин В.Н. Основы генетической инженерии. Минск, 1986.

6. Afonina E., Neumann M., Pavlakis G. Preferential binding of poly(A)-binding protein 1 to an inhibitory RNA element in the human immunodeficiency virus type 1 gag mRNA // JBC. 1997. - V. 272, N.4. -P. 2307-2311.

7. Ahmad A., Menezes J. Antibody-dependent cellular cytotoxicity in HIV infections // FASEB J. 1996. - V. 10, N. 2. - P. 258-66.

8. Ako-Adjei D., Johnson M. C. The retroviral capsid domain dictates virion size, morphology, and coassembly of gag into virus-like particles // J Virol. 2005. - V. 79, N. 21. - P. 13463-72.

9. Alexandra Т., Herbert K., Christine L., Annette O., Catherine F., Hansjakob F., Manuel В., Pietro V., Enos В., Rainer W., Bernard H.,

10. Sebastian B. Humoral immunity to HIV-1: kinetics of antibody responses in chronic infection reflects capacity of immune system to improve viral set point // Blood. 2004. - V. 104, N. 6. - P. 1784-1792.

11. Andre S., Seed B., Eberle J., Schraut W., Bultman A., Haas J. Increased immune response elicited by DNA vaccination with a synthetic gpl20 sequence with optimized codon usage // J Virol.-1998.-V.72, N. 2.-P. 1497-1503.

12. Arrigo S. J., Chen I.S. Rev is necessary for translation but not cytoplasmic accumulation of HIV-1 vif, vpr, and env/vpu 2 RNAs // Genes Dev. 1991. - V. 5, N. 5. - P. 808-819.

13. Au L. C., Yang F. Y., Yang W. J., Lo S. H., Kao C. F. Gene synthesis by a LCR-based approach: high-level production of leptin-L54 using synthetic gene in Escherichia coli // Biochem Biophys Res Commun. -1998. V. 248, N. 1. - P. 200-203.

14. Ayouba A. HIV-1 group N among HIV-1-seropositive individuals in Cameroon // AIDS. 2000. - V. 14. - P. 2623-2625.

15. Babe L. M., Unal A., Craik C. S. Obstruction of HIV-1 particle release by interferon-alpha occurs before viral protease processing and is independent of envelope glycoprotein // J Interferon Cytokine Res. -1997. V. 17, N. 5. - P. 287-293.

16. Bakheet T., Frevel M., Williams B. R., Greer W., Khabar K. S. ARED: human AU-rich element-containing mRNA database reveals an unexpectedly diverse functional repertoire of encoded proteins // Nucleic Acids Res. 2001. - V. 29, N. 1. - P. 246-254.

17. Banks N. D., Kinsey N., Clements J., Hildreth J. E. Sustained antibody-dependent cell-mediated cytotoxicity (ADCC) in SIV-infected macaques correlates with delayed progression to AIDS // AIDS Res Hum Retroviruses. 2002. - V. 16. - P. 1197-1205.

18. Barak O., Treat J. R., James W. D. Antimicrobial peptides: effectors of innate immunity in the skin // Adv Dermatol. 2005. - V. 21. - P. 357374.

19. Barnett S. W., Liu M. A. DNA vaccines coming of age// Annu. Rep. Med. Chem. -1999.-V. 34. P. 149-158.

20. Barouch D. H., Yang Z. Y., Kong W. P., Korioth-Schmitz B., Sumida S.

21. Beer B.E. Diversity and Evolution of Primate Lentiviruses / B.E. Beer, E. Bailes, P.M. Sharp, V.M. Hirsch // Human Retroviruses and AIDS. -1999.-P. 460-474.

22. Berg O. G, Kurland C. G. Growth rate-optimised tRNA abundance and codon usage // J Mol Biol. 1997. - V. 270, N. 4. - P. 544-550.

23. Berkhout B., Andrei G., Margreet B., and Lukashov V. Codon and Amino Acid Usage in Retroviral Genomes Is Consistent with Virus-Specific Nucleotide Pressure // AIDS RESEARCH AND HUMAN RETROVIRUSES. 2002. - V. 18, N. 2. - P. 133-141.

24. Betts M.R., Yusim K., Koup R.A. Optimal antigens for HIV vaccines based on CD8+ T response, protein length, and seguence variability // DNA and CELL BIOLOGY. 2002. - V. 21, N. 9. - P. 665-670.

25. Binley J. M., Klasse P. J., Cao Y., Jones I., Markowitz M., Ho D. D., Moore J. P. Differential regulation of the antibody responses to Gag and Env proteins of human immunodeficiency virus type 1 // J. Virol. 1997. -V.71.-P. 2799-2809.

26. Biragyn A., Pier A., Marta C., Linda K., Sattva S. Chemokine receptor-mediated delivery directs self-tumor antigen efficiently into the class II processing pathway in vitro and induces protective immunity in vivo // Blood. 2004. - V. 2. - P.0637.

27. Bojak A., Wild J., Demi L., Wagner R. Impact of codon usage modification on T cell immunogenicity and longevity of HIV-1 gag-specific DNA vaccines // Intervirology. 2002. - V. 45. - P. 275-286.

28. Brewer G. An A + U-rich element RNA-binding factor regulates c-myc mRNA stability in vitro // Mol Cell Biol. 1991. - V. 11, N. 5. - P. 2460-2466.

29. Briggs J. A., Simon M. N., Gross I., Krausslich H. G., Fuller S. D., Vogt V. M., Johnson M. C. The stoichiometry of Gag protein in HIV-1 // Nat. Struct. Mol. Biol. 2004. - V. 11. - P. 672-675.

30. Briggs J. A., Wilk T., Welker R., Krausslich H. G., Fuller S. D. Structural organization of authentic, mature HIV-1 virions and cores // EMBO J. 2003. - V. 22, N. 7. - P. 1707-1715.

31. Brodie F., Lewinsohn K., Paterson M., Jiyamapa O. In vivo migration and function of transferred HIV-1- specific cytotoxic T cells // Nat. Med. 1999.-V. 5.-P. 34-41.

32. Busch M., Abel K., Li J., Piatak M., Lifson D., Miller J. Efficacy of a SHIV 89.6 pro viral DNA vaccine against mucosal SIVmac239 challenge // Vaccine. 2005. - V. 23, N. 31. - P. 4036-4047.

33. Callan M. Large clonal expansion of CD8+ T cells in acute infectious mononucleosis // Nature Med. 1996. - V. 2. - P. 205-211.

34. Calogero R. A., Aulicino A. Purification of recombinant proteins with high isoelectric points // Methods Mol Med. 2004. - V. 94. - P. 225238.

35. Camaur D., Trono D. Characterization of human immunodeficiency virus type 1 Vif particle incorporation // J. Virol. 1996. -V. 70.-P. 61066111.

36. Campbell G. L., Marfin A. A., Lanciotti R. S., Gubler D. J. West Nile virus // Lancet Infect Dis. 2002. - V. 2. - P. 519-529.

37. Campbell S., Fisher R. J., Towler E. M. Modulation of HIV-like particle assembly in vitro by inositol phosphates // Proc. Natl. Acad. Sei. USA. 2001. - V. 98. - P. 10875-10879.

38. Campbell S. M., Crowe S. M., Mak J. Lipid rafts and HIV-1: from viral entry to assembly of progeny virions // J. Clin. Virol. 2001. - V. 22. -P. 217-227.

39. Carpousis A.J, Vanzo G. S., Raynal L. C. mRNA degradation. A tale of poly(A) and multiprotein machines // Trends Genet. -1999.- V. 15, N 1. P.24-28.

40. Carrington A. HLA and HIV-1: heterozygote advantage and B*35-Cw*04 disadvantage // Science. 1999. - V. 283. - P. 1748-1752.

41. Cassan M. Translational frameshifting at the gag-pol junction of human immunodeficiency virus type 1 is not increased in infected T-lymphoid cells / M. Cassan, N. Delaunay, C. Vaquero et al. // J. Virol. 1994. -V.68. - P.1501-8.

42. Center R.J. Oligomeric structure of the human immunodeficiency virus type 1 envelope protein on the virion surface / R.J. Center, R.D. Leapman, J. Lebowitz et al. // J. Virol. 2002. - V.76. - P.7863-7.

43. Chang S. Y., Lee K. C., Ko S. Y., Ko H. J., Kang C. Y. Enhanced efficacy of DNA vaccination against Her-2/neu tumor antigen by genetic adjuvants // Int. J. Cancer. 2004. - V. 111, N. 1. - P. 86-95.

44. Charini W.A., Marcelo J., Jörn E., Kristin R., Wenyu L., Michelle A., Georgia R. Clonally diverse CTL response to a dominant viral epitope recognizes potential epitope variants // The J. of Immunology. 2001. -V. 167.-P. 4996-5003.

45. Chiapello H, Ollivier E, Landes-Devauchelle C, Nitschke P, Risler JL. Codon usage as a tool to predict the cellular location of eukaryotic ribosomal proteins and aminoacyl-tRNA synthetases // Nucleic Acids Res. 1999. - V. 27, N. 14. - P. 2848-2851.

46. Cimarelli A, Sandin S, Hoglund S, Luban J. Basic residues in human immunodeficiency virus type 1 nucleocapsid promotes virion assembly via interaction with RNA // Virol. 2000. - V. 74. - P. 3046-3057.

47. Clerici, M., and G. Shearer. Correlates of protection in HIV infection and the progression of HIV infection to AIDS // Immunol. Lett. 1996. - V. 51.-P. 69-73.

48. Clever J.L., Miranda J.D., Parslow T.G. RNA structure and packaging signals in the 5' leader region of the human immunodeficiency virus type 1 genome//J. Virol. 2002. - V. 76, N. 23.-P. 12381-12387.

49. Comeron JM, Aguade M. An evaluation of measures of synonymous codon usage bias // J. Mol Evol. 1998. - V. 47, N. 3. - P. 268-274.

50. Coney, L., B. Wang, K. E. Ugen, J. Boyer, D. McCallus, V. Srikantan, M. Agadjanyan, C. J. Pachuk, K. Herold, M. Merva. Facilitated DNA inoculation induces anti-HIV-1 immunity in-vivo // Vaccine. 1994. -V. 12.-P. 1545-1550.

51. Corr M., D. J. Lee, D. A. Carson, and H. Tighe. Gene vaccination with naked plasmid DNA: mechanism of CTL priming // J. Exp. Med. 1996. -V. 184.-P. 1555-1560.

52. Cullen B. Nuclear RNA export pathways // Mol Cell Biol-2000.-V.20.№12.-p. 4181-4187.

53. Cullen Bryan R. Nuclear mRNA export: insights from virology // TRENDS in Biochemical Sciences. 2003. - V. 28, N.8. - P. 315-327.

54. D'Agostino DM, Felber BK, Harrison JE, Pavlakis GN. The Rev protein of human immunodeficiency virus type 1 promotes polysomal association and translation of gag/pol and vpu/env mRNAs // Mol. Cell. Biol. 1992. - V. 12, N. 3. - P. 1375-1386.

55. Dangerfield JA, Hohenadl C, Egerbacher M, Kodajova P, Salmons B, Gunzburg WH. HIV-1 Rev can specifically interact with MMTV RNA and upregulate gene expression // Gene. 2005. - V. 358. - P. 17-30.

56. Davis, H. L., M. L. Michel, and R. G. Whalen. DNA-based immunization induces continuous secretion of hepatitis B surface antigen and highlevels of circulating antibody // Hum. Mol. Genet. 1993. - V. 2. - P. 1847-1851.

57. De Smet K, Contreras R. Human antimicrobial peptides: defensins, cathelicidins and histatins // Biotechnol. Lett. 2005. - V. 27, N. 18. - P. 1337-1347.

58. H. Deng, R. Liu, W. Ellmeier. Identification of a major co-receptor for primary isolates of HIV-1 // Nature. 1996. - V.381. - P.661-666.

59. Dettin M., Scarinci C.,Pasquato A., Di Bello C.Synthetic peptides for study of human immunodeficiency virus infection // Appl Biochem. Biotechnol. 2002. - V. 102. - P. 41-47.

60. Donnely J., Ulmer J., Shiver J., Liu M. DNA vaccines // Annu. Rev. Immunol. 1997.-V.15. - P. 617-648.

61. D'Souza M.P. Chemokines and HIV-1 second receptors. Confluence of two fields generates optimism in AIDS research // Nat. Med. 1996. -V.2.-P. 1293-1300.

62. Duits L.A., Ravensbergen B., Rademarker M., Heimstra P.S., Nibbering P.H. Expression of beta-defensin 1 and 2 mRNA by human monocytes, macrophages and dendritic cells // Immunology. 2002. - V. 106, N. 4. -P. 517-525.

63. Duits L.A., Ravensbergen B., Rademarker M., Heimstra P.S., Nibbering P.H. Expression of beta-defensin 1 and 2 mRNA by human monocytes, macrophages and dendritic cells // Immunology. 2002. - V. 106, N. 4. -P. 517-525.

64. Duret L. tRNA gene number and codon usage in the C. elegans genome are co-adapted for optimal translation of highly expressed genes // Trends Genet. 2000. - V. 16, N. 7. - P. 287-289.

65. Eckert D.M., P.S. Kim. Mechanisms of viral membrane fusion and its inhibition // Annu. Rev. Biochem. 2001. - V.70. - P.777-810.

66. Elfgang C., Rosorius O., Hofer L., Jaksche H., hauber J., Bevec D. Evidence for specific nucleocytoplasmic transport pathways used by leucine-rich nuclear export signals // Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. -1999.- V. 96. P. 6229-6224.

67. Emini, E.A. et al. Prevention of HIV-1 infection in chimpanzees by gpl20 V3 domain-specific monoclonal antibody // Nature. 1992. - V. 355.-P. 728-730.

68. Erickson J.W., S.V. Gulnik, M. Markowitz. Protease inhibitors: resistance, cross-resistance, fitness and the choice of initial and salvage therapies // AIDS. 1999. - V.13 Suppl A. - P. S189-S204.

69. Esche C, Stellato C, Beck LA. Chemokines: key players in innate and adaptive immunity // J. Invest. Dermatol. 2005. - V. 125. - P. 615-628.

70. Eyre-Walker AC. An analysis of codon usage in mammals: selection or mutation bias? // J. Mol Evol. 1991. - V. 33, N. 5. - P. 442-449.

71. Feng Y., C.C. Broder, P.E. Kennedyl. HIV-1 entry cofactor: functional cDNA cloning of a seven-transmembrane, G protein-coupled receptor // Science. 1996. - V.272. - P.872-877.

72. Fennoy SL, Bailey-Serres J. Synonymous codon usage in Zea mays L. nuclear genes is varied by levels of C and G-ending codons // Nucleic. Acids Res. 1993. - V. 21. - P. 5294-5300.

73. Ferrari, M. E., G. Hermanson, and A. Rolland. Development of anthrax DNA vaccines // Curr. Opin. Mol. Ther. 2004. - V. 6. - P. 506-512.

74. Finnegan C.M., Berg W., Lewis G.K., DeVico A.L.Antigenic Properties of the Human Immunodeficiency Virus Transmembrane Glycoprotein during Cell-Cell Fusion // J. Virol. 2002. - V. 23. - P. 12123-12134.

75. Fiorentini Simona 1 \ Elena Marini \ Luisa Bozzo \ Laura Trainini \1 1 O1.miaa Saadoune , Manuela Avolio , Angela Pontillo , Carlo Bonfanti 1 0 \

76. Paolo Sarmientos , Arnaldo Caruso Preclinical studies on immunogenicity of the HIV-1 pl7-based synthetic peptide AT20-KLH // Biopolymers. 2004. - V. 76, N. 4. - P. 334-343.

77. Forthal DN, Landucci G, Keenan B. Relationship between antibody-dependent cellular cytotoxicity, plasma HIV type 1 RNA, and CD4+ lymphocyte count // AIDS Res Hum Retroviruses. 2001. - V. 6. - P. 553-561.

78. Freed EO. HIV-1 gag proteins: diverse functions in the virus life cycle // Virology. 1998. - V. 251. - P. 1-15.

79. Freed EO. Viral late domains // Virol. 2002. - V. 76. - P. 4679-4687.

80. Freed Eric O. HIV-1 and the host cell: an intimate association I I TRENDS in Microbiology. 2004. - V. 12, N. 4. - P. 37-44.

81. Friesen W.J., Darby M.K. Srecific RNA Binding by a Single C2H2 Zinc Finger// J.Biol.Chem. 2001. - V. 276. - P. 1968-1973.

82. Gallay P., T. Hope, D. Chin. HIV-1 infection of nondividing cells through the recognition of integrase by the importin/karyopherin pathway // Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1997. - V.94. - P. 9825-9830.

83. Gamble TR, Yoo S, Vajdos FF. Structure of the carboxyl-terminal dimerization domain of the HIV-1 capsid protein // Science. 1997. - V. 278.-P. 849-853.

84. Ganser, B. K., S. Li, V. Y. Klishko, J. T. Finch, and W. I. Sundquist. Assembly and analysis of conical models for the HIV-1 core // Science. -1999.-V. 283.-P. 80-83.

85. Garrus JE, von Schwedler UK, Pornillos OW, et al.TsglOl and the vacuolar protein sorting pathway are essential for HIV-1 budding // Cell. 2001. - V. 107. - P. 55-65.

86. Gheysen D., Jakobs E., de Foresta F., Thiriart C., Francotte M., Thines D., de Wilde M. Assembly and release of HIV-1 precursor Pr55Gag virus-like partikles from recombinant baculovirus-infected cells //Cell.-1989.-V. 18.-P. 103-112.

87. Gluschankof P, Suzan M. HIV-1 gag polyprotein rescues HLA-DR intracellular transport in a human CD4+ cell line // Virology. 2002. -V. 300, N. l.-P. 160-169.

88. Goff, S. Retroviridae: the retroviruses and their replication. In Fields Virology, 4th edn, (Knipe, D.M. and Howley, P.M., eds) // Lippincott Williams and Wilkins. -2001. P. 1871-1940.

89. Gorlich D., Kutay U. Transport between the cell nuclear and the cytoplasm// Annu.Rev.Cell Dev.Biol. 1999. - V. 15. - P. 607-660.

90. Goulder, P.J., Functionally inert HIV-specific cytotoxic T lymphocytes do not play a major role in chronically infected adults and children // J. Exp. Med. 2000. - V. 192.-P. 1819-1832.

91. Graf M, Demi L, Wagner R. Codon-optimized genes that enable increased heterologous expression in mammalian cells and elicit efficient immune responses in mice after vaccination of naked DNA // Methods Mol. Med. 2004. - V. 94. - P. 197-210.

92. Graf M., Bojak A., Demi L., Bieler K., Wolf H., Wagner R. Concerted Action of Multiple cis-Acting Sequences Is Required for Rev Dependence of Late Human Immunodeficiency Virus Type 1 Gene Expression // J. Virol. 2000. - V. 74. - P. 10822-10826.

93. Grantham R., Gautier C., Gouy M., Mercier R. and Pave A. Codon catalog usage and the genome hypotesis // Nuleic Acids Res. 1980. -V. 8, N. 1. - P. 49-62.

94. Greenway A., A. Azad, D. McPhee. Human immunodeficiency virus type 1 Nef protein inhibits activation pathways in peripheral blood mononuclear cells and T-cell lines // J. Virol. 1995. - V.69. - P.1842-1850.

95. Guhaniyogi J, Brewer G. Regulation of mRNA stability in mammalian cells // Gene. 2001. - V. 265. - P. 11-23.

96. Guo X., M. Kameoka, X. Wei. Suppression of an intrinsic strand transfer activity of HIV-1 Tat protein by its second-exon sequences // Virology. -2003. V.307. -P.154-163.

97. Gupta SK, Ghosh TC. Gene expressivity is the main factor in dictating the codon usage variation among the genes in Pseudomonas aeruginosa // Gene. 2001. - V. 273. - P. 63-70.

98. Gurer C, Cimarelli A, Luban J. Specific incorporation of heat shock protein 70 family members into primate lentiviral virions // J. Virol. -2002. V. 76. - P. 4666-4670.

99. Haas J., Park EC., Seed B., Codone usage limitation in the expression of HIV-1 envelope glycoprotein // Curr. Biol. 1996. - V. 6. - P. 315324.

100. Hanke T. On DNA vaccines and prolonged expression of immunogens // Eur. J. Immunol. 2006. - V. 36, N. 4. - P. 806-809.

101. Haseltine W.A. Studies of HIV-1 replication. The role of p6, integration, and growth in peripheral blood dendritic cells // Retroviruses of human AIDS and related animal dis. 1991.- P. 201-212.

102. Haynes, J. R., D. H. Fuller, M. D. Eisenbraun, M. J. Ford, and T. M. Pertmer. Accell particle-mediated DNA immunization elicits humoral, cytotoxic, and protective immune responses // AIDS Res Hum Retroviruses. 1994. - V.10. - P. 43-45.

103. He J., Choe, R. Walker M. Human immunodeficiency virus type 1 viral protein R (Vpr) arrests cells in the G2 phase of the cell cycle by inhibiting p34cdc2 activity // J. Virol. 1995. - V.69. - P. 6705-6711.

104. Hentze, M.V. Determinants and regulation of cytoplasmic mRNA stability in eucariotic cells // Biochim. Biophys. Acta. 1991. - V. 1090. -P. 281-292.

105. Hermida-Matsumoto, L., and M. D. Resh. Localization of human immunodeficiency virus type 1 Gag and Env at the plasma membrane by confocal imaging // J. Virol. 2000. - V. 74. - P. 8670-8679.

106. Hooper Edward. Search for the Origin of HIV and AIDS // Science. -2000. V. 289, N. 5482. - P. 1140 - 1141.

107. Hooper SD, Berg OG. Gradients in nucleotide and codon usage along Escherichia coli genes // Nucleic Acids Res. 2000. - V. 28, N. 18. - P. 3517-3523.

108. Hope TJ. The ins and outs of HIV Rev // Arch. Biochem. Biophys. -1999. V. 365, N. 2. - P. 186-191.

109. Huang H., R. Chopra, G.L. Verdine. Structure of a covalently trapped catalytic complex of HIV-1 reverse transcriptase: implications for drug resistance // Science. 1998. - V. 282. - P. 1669-1675.

110. Huang Y., Kong W., Nabel G. Human immunodeficiency virus type 1-specific immunity after genetic immunization is enhanced bymodification of Gag and Pol expression // J. Virol.- 2001. V. 75, N. 1.1. P. 4947.4951.

111. Immune responses in HIV-exposed seronegatives: have they repelled the virus? // Curr. Opin. Immunol. 1995. - V. 7, N. 4. - P. 448-455.

112. Iwasaki, A., C. A. Torres, P. S. Ohashi, H. L. Robinson, and B. H. Barber. The dominant role of bone marrow-derived cells in CTL induction following plasmid DNA immunization at different sites // J. Immunol. 1997. - V. 159. - P. 11-14.

113. Izaurralde E, Kutay U, von Kobbe C, Mattaj IW, Gorlich D. The asymmetric distribution of the constituents of the Ran system is essential for transport into and out of the nucleus // EMBO J. 1997. - V. 16, N. 21.-P. 6535-6547.

114. Javanbakht H, Halwani R, Cen S, Saadatmand J, Musier-Forsyth K, Gottlinger H, Kleiman L. The interaction between HIV-1 Gag and human lysyl-tRNA synthetase during viral assembly // J. Biol. Chem. 2003. -V. 278, N. 30. - P. 27644-27651.

115. Jayakar HR, Murti KG, Whitt MA. Mutations in the PPPY motif of vesicular stomatitis virus matrix protein reduce virus budding by inhibiting a late step in virion release // Virol. 2000. - V. 74. - P. 9818-9827.

116. Jens Wild, Alexandra Bojak, Ludwig Demi, Ralf Wagner. Influence of polypeptide size and intracellular sorting on the induction of epitope-specific CTL responses by DNA vaccines in a mouse model // Vaccine. -V. 22.-P. 1732-1743.

117. Johns, D. G., Gao W.Y. Selective depletion of DNA precursors. An evolving strategy for potentiation of dideoxynucleoside activity against human immunodeficiency virus // Biochem. Pharmacol. 1998. - V. 55. - P. 1551-1556.

118. Jowett J.B., Hockley D.J., Nermut M.V., Jones I.M. Distinct signals in human immunodeficiency virus type 1 Pr55 necessary for RNA binding and particle formation // Gen. Virol. 1992. - V. 73. - P. 30793086.

119. Kagi D., Ledermann B., Burki K., Zinkernagel R., Hengartner H. Molecular mechanisms of lymphocyte-mediated cytotoxicity and their role in immunological protection and pathogenesis in vivo // Annu. Rev. Immunol. 1996. - V. 14. - P. 207-232.

120. Kane JF. Effects of rare codon clusters on high-level expression of heterologous proteins in Escherichia coli // Curr Opin Biotechnol. -1995.-V. 6.-P. 494-500.

121. Karlin S, Mrazek J. What drives codon choices in human genes? // J. Mol. Biol. 1996. - V. 262, N. 4. - P. 459-472.

122. Karn J. Tat, a novel regulator of HIV transcription and latency / J. Karn // Theoretical Biology and Biophysics Group, Los Alamos National1.boratory, Los Alamos, NM. 2000. - P. 2-18.

123. Kaslow, Influence of combinations of human major histocompatibility complex genes on the course of HIV-1 infection // Nature Med. 1996. -V. 2.-P. 405-411.

124. Katzmann DJ, Babst M, Emr SD. Ubiquitin-depen-dent sorting into the multivesicular body pathway requires the function of a conserved endosomal protein sorting complex, ESCRT-I // Cell. 2001. - V. 106. -P. 145-155.

125. Katzmann DJ, Odorizzi G, Emr SD. Receptor downregulation and multivesicular-body sorting // Nat. Rev. Mol. Cell. Biol. 2002. - V. 3, N. 12.-P. 893-905.

126. Keith Mayol, Doug Husebyl, Jason McDermott2, Brian Arvidsonl Liam Finlayl and Eric Barklisl. Retrovirus Capsid Protein Assembly Arrangements // J. Mol. Biol. 2003. - V. 325. - P. 225-237.

127. Kerkau T., Bacik I., Bennink J. The human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) Vpu protein interferes with an early step in the biosynthesis of major histocompatibility complex (MHC) class I molecules // J. Exp. Med. 1997. - V. 185. - P. 1295-1305.

128. Khan M.A., Aberham C., Kao S. Human immunodeficiency virus type 1 Vif protein is packaged into the nucleoprotein complex through an interaction with viral genomic RNA // J. Virol. 2001. - V.75. - P. 7252-7265.

129. Kim CH, Oh Y, Lee TH. Codon optimization for high-level expression of human erythropoietin (EPO) in mammalian cells // Gene. -1997. V. 199, N. 2. - P. 293-301.

130. Kim S., Byrn R., Groopman J., Baltimore D. Temporal aspects of DNA and RNA synthesis during human immunodeficiency virus infection: evidence for differential gene expression // J Virol -1989. -V. 63.-P. 3708-3713.

131. Kitsis R.N., Buttrick P.M., Kass A.A. // Methods Mol. Genet. 1993. - V.l.-P. 374-392.

132. Kjems J., Brown M., Chang D., Sharp P. Structural analysis of the interaction between the c Rev protein and the Rev response element // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1991. - V. 88. - P. 683-687.

133. Klatzmann D., Barre-Sinoussi F., Nugeyre M. Selective tropism of lymphadenopathy associated virus (LAV) for helper-inducer T lymphocytes // Science. 1984. - V. 225. - P. 59-63.

134. Ko HJ, Ko SY, Kim YJ, Lee EG, Cho SN, Kang CY. Optimization of codon usage enhances the immunogenicity of a DNA vaccine encoding mycobacterial antigen Ag85B // Infect Immun. 2005. - V. 73, N. 9. - P. 5666-5674.

135. Koffman a., Graf M., Boyak A., Demi L., Kharazova A., Wolf H., Wagner R. HIV-1 gag epression is quantitatively dependent on the ratio of native and optimazed codons // Tzitologiya. 2003. - V.45, N. 1. - P. 90-97.

136. Kofman A, Graf M, Bojak A, Demi L, Bieler K, Kharazova A, Wolf H, Wagner R. HIV-1 gag expression is quantitatively dependent on theratio of native and optimized codons // Tsitologiia. 2003. - V. 45, N. 1. -P. 86-93.

137. Korber, B.T.M., Brander, C., Walker, B.D., Koup, R.A., Moore, J.P., and Myers, G. HIV molecular Immunology Database. 2000.

138. Kotler M., Simm M., Zhao Y. Human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) protein Vif inhibits the activity of HIV-1 protease in bacteria and in vitro // J. Virol. 1997. - V. 71. - P. 5774-5781.

139. Kotula L, Curtis PJ. Evaluation of foreign gene codon optimization in yeast: expression of a mouse IG kappa chain // Biotechnology. 1991. -V. 9, N. 12.-P. 1386-1389.

140. Koup R. Temporal association of cellular immune responses with the initial control of viremia in primary HIV-1 syndrome // J. Virol. 1994. -V. 68.-P. 4650-4655.

141. Kovacsovics-Bankowski, M., K. Clark, B. Benacerraf, and K. L. Rock. Efficient major histocompatibility complex class I presentation of exogenous antigen upon phagocytosis by macrophages // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2003. - V. 90. - P. 4942-4946.

142. Kozak, M. An analysis of vertebrate mRNA sequences: intimations of translational control // J. Cell Biol. 1991. - V. 115. - P. 887-890.

143. Krieg AM, Wagner H. Causing a commotion in the blood: immunotherapy progresses from bacteria to bacterial DNA // Immunol. Today. 2000. - V. 21. - P. 521-526.

144. Krieg AM. The role of CpG motifs in innate immunity // Curr. Opin. Immunol. 2000. - Vol. 12. - P. 35-43.

145. Kuiken C., Foley B. et al. Human retroviruses and AIDS: a compilation and analysis of nucleic acid and amino acid sequences // Theoretical Biology and Biophysics Group, Los Alamos National Laboratory, Los Alamos, N.Mex. 1999.

146. Kutzler MA, Weiner DB. Developing DNA vaccines that call to dendritic cells // J. Clin. Invest. 2004. - V. 114, N. 9. - P. 1241-1244.

147. Lecossier D. Hypermutation of HIV-1 DNA in the absence of the Vif protein // Science. 2003. - V. 300. - P. 1112.

148. Leifert, J. A., M. P. Rodriguez-Carreno, F. Rodriguez, and J. L. Whitton. 2004. Targeting plasmid-encoded proteins to the antigen presentation pathways // Immunol. Rev. 2004. - V. 199. - P. 40-53.

149. Chem. 1990. - V. 265. - P. 10373-10382.

150. Levy J.A., Mackewicz C.E. & Barker E.; Controlling HIV pathogenesis: the role of noncytotoxic anti-HIV response of CD8+T-cells // Immunol. Today. 1996. - V. 17. - P. 217-224.

151. Li L, Cohen SN. TsglOl: a novel tumour susceptibility gene isolated by controlled homozygous functional knockout of allelic loci in mammalian cells // Cell. 1996. - V. 85. - P. 319-329.

152. Lipford GB, Heeg K, Wagner H. Bacterial DNA as immune cell activator // Trends Microbiol. 1998. - Vol. 6. - P. 496-500.

153. Liu W. J., Zhao K. N., Gao F. G., Leggatt G. R., Fernando G. J., Frazer I. H. Polynucleotide viral vaccines: codon optimisation and ubiquitin conjugation enhances prophylactic and therapeutic efficacy // Vaccine. 2001. - V. 20, N. 6. - P.862-869.

154. Long JE, Huang LN, Qin ZQ, Wang WY, Qu D. IFN-gamma increases efficiency of DNA vaccine in protecting ducks against infection // World J. Gastroenterol. 2005. - V. 11, N. 32. - P. 4967-4973.

155. Lusso P. HIV and chemokines: implications for therapy and vaccine // Vaccine. 2002. - V. 20, N. 15. - P. 1964-1967.

156. Maarten H. de Smit* and Jan van Duin. Translational Standby Sites: How Ribosomes MayDeal with the Rapid Folding Kinetics of Mrna // J. Mol. Biol. 2003. - V. 331. - P. 737-743.

157. Maldarelli, F., M. A. Martin, and K. Strebel. Identification of posttranscriptionally active inhibitory sequences in human immunodeficiency virus type 1RNA: novel level of gene regulation // J. Virol. 1991. - V. 65. - P. 5732-5743.

158. Mansky L.M., Mansky L. V., Temin H.M. Lower in vivo mutationrate of human immunodeficiency virus type 1 than that predicted from the fidelity of purified reverse transcriptase // J. Virol. 1995. - V. 69. -P. 5087-5094.

159. Marais G, Duret L. Synonymous codon usage, accuracy of translation, and gene length in Caenorhabditis elegans // J. Mol. Evol. 2001. - V. 52, N. 3.-P. 275-280.

160. Martin-Serrano J, Zang T, Bieniasz PD. HIV-1 and Ebola virus encode small peptide motifs that recruit TsglOl to sites of particle assembly to facilitate egress // Nat. Med. 2001. - V. 7. - P. 13131319.

161. Martin-Serrano J, Zang T, Bieniasz PD. Role of ESCRT-I in retroviral budding // Virol. 2003. - V. 77. - P. 4794-4804.

162. Mascola, J.R. Defining the protective antibody response for HIV-1 // Curr. Mol. Med. 2003. - V. 3. - P. 209-216.

163. McCune J.M., Rabin L.B., Feinberg M.B. Endoproteolytic cleavage of gpl60 is required for the activation of human immunodeficiency virus // Cell. 1988. - V. 53. - P. 55-67.

164. McMichael A.J., Rowland-Jones S.L. Cellular immune responses to HIV // Nature. 2001. - V. 410. - P. 980-987.

165. Megede J., Chen M., Doe B., Schaefer M., Greer C., Selby M., Otten G., Barnett S. Increased expression and immunogenicity of sequence-modified human immunodeficiency virus type 1 gag gene // J. Virol. -2000.-V. 74, N. 6. P. 2628-2635.

166. Meylan P.R., Guatelli J., Muunis J.R., Richman D.D. & Kornbluth R.S. Mechanisms for the inhibition of HIV replication by interferons-a,and -y in primary human macrophages // Virology. 1993. - V. 193. -P. 138-148.

167. Milek R. L., Stunnenberg H. G., Konings R. N. Assembly and expression of a synthetic gene encoding the antigen Pfs48/45 of the human malaria parasite Plasmodium falciparum in yeast // Vaccine.2000.-V. 18, N. 14.-P. 1402-1411.

168. Miller M.D., Warmerdam T., Gaston I. The human immunodeficiency virus-1 nef gene product: a positive factor for viral infection and replication in primary lymphocytes and macrophages // J. Exp. Med. -1994.-V. 179.-P. 101-113.

169. Miller V. International perspectives on antiretroviral resistance. Resistance to protease inhibitors // J. Acquir. Immune. Defic. Syndr.2001.-V.26 Suppl 1. P. S34-S50.

170. Mitchell P, Tollervey D. mRNA stability in eukaryotes // Curr. Opin. Genet. Dev. 2000. - V. 10, N. 2. - P. 193-198.

171. Moreno S., Lopez-Fuertes L., Vila-Coro A. J., Sack F., Smith C. A., Konig S. A. DNA immunisation with minimalistic expression constructs // Vaccine. 2004. - V. 22, N. 13-14. - P. 1709-1716.

172. Morikawa Y., Hockley D. J., Nermut M. V., Jones I. M. Roles of matrix, p2, and N-terminal myristoylation in human immunodeficiency virus type 1 Gag assembly // Virol. 2000. - V. 74.-P. 16-23.

173. Morton BR, So BG. Codon usage in plastid genes is correlated with context, position within the gene, and amino acid content // J. Mol. Evol. 2000. - V. 50, N. 2. - P. 184-193.

174. Moyer JD, Henderson JF. Ultrasensitive assay for ribonucleoside triphosphates in 50-1000 cells. Application to studies with pyrazofurin and mycophenolic acid // Biochem. Pharmacol. 1983. - V. 32, N. 24.-P. 3831-3834.

175. Mrazek J, Karlin S. A new significant recurrent dyad pairing in Haemophilus influenzae // Trends Biochem. Sci. 1996. - V. 21, N. 6. -P. 201-202.

176. Myers G., Korber B., Foley B., Jeang K.-T., Mellors J.W., and Wain-Hobson S. Human Retroviruses and AIDS: A Compilation and Analysis of Nucleic Acid and Amino Acid Sequences // Los Alamos National Laboratory, Los Alamos, New Mexico 1996.

177. Nakamura T, Suyama A, Wada A. Two types of linkage between codon usage and gene-expression levels // FEBS Lett. 1991. - V. 289, N. l.-P. 123-125.

178. Nakamura Y, Gojobori T, Ikemura T. Codon usage tabulated from international DNA sequence databases: status for the year 2000 // Nucleic Acids Res. 2000. - V. 28, N. 1. - P. 292.

179. Natanson N., Mathieson B. Biological consideration in the development of a human immunodeficiency virus vaccine // J. Inf. Diseases. 2000. - V. 182. - P. 579-589.

180. Naya H., Romero H., Carels N., Zavala A., Musto H. Translational selection shapes codon usage in the GC-rich genome of Chlamydomonas reinhardtii // FEBS Lett. 2001. - V. 501, N. 2-3. - P. 127-130.

181. Nermut M.V., Grief C., Hashmi S., Hockley D.J. Further evidebce of icosahedral symmetry in human and simian immunodeficiency virus // AIDS Res. Hum. Retrovir. 1993. - V. 9. - P. 929-938.

182. Nguyen KL, llano M, Akari H, Miyagi E, Poeschla EM, Strebel K, Bour S. Codon optimization of the HIV-1 vpu and vif genes stabilizes their mRNA and allows for highly efficient Rev-independent expression // Virology. 2004. - V. 319, N. 2. - P. 163-175.

183. O'Hagan, D. T., M. Singh, and J. B. Ulmer. Microparticles for the delivery of DNA vaccines // Immunol. Rev. 2004. - V. 199. - P. 191— 200.

184. Ogg G. S. Quantitation of HIV-1 specific cytotoxic T lymphocytes and plasma viral RNA load // Science. 1998. - V. 279. - P. 2103-2106.

185. Ono A., Freed O. Cell-type-dependent targeting of human immunodeficiency virus type 1 assembly to the plasma membrane and the multivesicular body // J. Virol. 2004. - V. 78, N. 3. - P. 1552-1563.

186. Ono A., Orenstein J. M., Freed E. O. Role of the Gag matrix domain in targeting human immunodeficiency virus type 1 assembly // J. Virol. -2000. V. 74. - P. 2855-2866.

187. Ott D. E., Coren L. V., Chertova E. N. Elimination of protease activity restores efficient virion production to a human immunodeficiency virus type 1 nucleocapsid deletion mutant // Virol. 2003. - V. 77. - P. 55475556.

188. Ott D. E., Coren L. V., Kane B. P., Busch L. K., Johnson D. G., Sowder R. C., Chertova E. N., Arthur L. O., Henderson L. E.

189. Cytoskeletal proteins inside human immunodeficiency virus type 1 virions // J. Virol. 1996. - V. 70, N. 11. - P. 7734-7743.

190. Otten G. R., Schaefer M., Doe B., Liu H., Srivastava I., Megede J.,

191. Kazzaz J., Lian Y., Singh M., Ugozzoli M., Montefiori D., Lewis M.,

192. Otten, G. R., B. Doe, M. Schaefer, M. Chen, M. J. Selby, C. Goldbeck, M. Hong, F. Xu, and J. B. Ulmer. Relative potency of cellular and humoral immune responses induced by DNA vaccination // Intervirology. 2000. - V. 43. - P. 227-232.

193. Pal R., Reitz M.S., Tschachler E., Gallo R. C., Sarngadharan M. G., Veronese F. D. Myristoylation of gag proteins of HIV-1 plays an important role in virus assembly // AIDS Res. Hum. Retroviruses. -1990.-V. 6.-P. 721-730.

194. Palmeri D., Malim M. H. Importin beta-Can Mediate the Nuclear Import of an Arginine-Rich Nuclear Localization Signal in the Absenca of Inportin alpha//Mol. Cell. Biol. 1999.-V. 19.-P. 1218-1225.

195. Park J., Morrow C. D. The nonmyristylated Prl60gag-pol polyprotein of human immunodeficiency virus type 1 interacts with Pr55gag and isincorporated into viruslike particles // Virol. 1992. - V. 66. - P. 63046313.

196. Pesole G., Gissi C., Grillo G., Licciulli F., Liuni S., Saccone C. Analysis of oligonucleotide AUG start codon context in eukariotic mRNAs//Gene.-2000.-V. 261, N. l.-P. 85-91.

197. Phillips R. Back to the past: new drugs from ancient molecules? // Nat. Immunol. 2005. - V. 6, N. 10. - P. 963-964.

198. Phuphuakrat A, Auewarakul P. Functional variability of Rev response element in HIV-1 primary isolates // Virus. Genes. 2005. - V. 30, N. 1. P. 23-29.

199. Pollard V., Malin M. The HIV-1 Rev protein //Annu Rev Microbiol -1998. -V. 52.-P. 491-532.

200. Pornillos O., Jennifer E., Garrus I., Wesley I. Mechanisms of enveloped RNA virus budding // TRENDS in Cell Biology. 2002. - V. 12, N. 12.-P. 1624-1635.

201. Preston, B. D., Dougherty J. P. Mechanisms of retroviral mutation // Trends Microbiol. 1996. - V. 4. P. 16-21.

202. Priti C., Prader S. Induction of Broad-Based Immune Response Against HIV-1 Subtype C gag DNA Vaccine in Mice // Viral Immunology. 2004. - V. 17, N. 3. - P. 423^135.

203. Provitera P., Goff A., Harenberg A., Bouamr F., Carter C., Scarlata S. Role of the major homology region in assembly of HIV-1 Gag // Biochemistry. 2001. - V. 40. - P. 5565-5572.

204. Puaux AL, Michel ML. New gene-based approaches for an AIDS vaccine // Comp. Immunol. Microbiol. Infect. Dis. 2003. - V. 26, N. 56. - P. 357-372.

205. Ribergo R. M., Monhri H., Ho D. D., and Perelson A. S. In vivo dynamics of T cell activation, proliferation, and death in HIV-1 infection: Why are CD4+ but not CD8+ T cells depleted? // Proc. Natl. Acad. Sci. USA.-2002.-V. 14.-P. 314-321.

206. Mariani R., Gabriel R., Matthew E., Harris A. Block to Human Immunodeficiency Virus Type 1 Assembly in Murine Cells // Journal of Virology. 2000. - V. 74. - P. 3859-3870.

207. Robinson M., Lilley R., Little S., Emtage S., Yarranton G., Stephens P., Millican A., Eaton M., Humphreys G. Codon usage can affect efficiency of translation of genes in Escherichia coli // Nucleic Acids Res.- 1984.-V. 12, N. 17.-P. 6663-6671.

208. Rompato G., Ling E., Chen Z., Van Kruiningen H., Garmendia E. Positive inductive effect of IL-2 on virus-specific cellular responses elicited by a PRRSV-ORF7 DNA vaccine in swine // Vet. Immunol. Immunopathol. 2006. - V. 109, N. 1-2. - P. 151-160.

209. Rosenberg E.S. Vigorous HIV-1-specific CD4+ T-cell responses associated with control of viremia // Science. 1997. - V. 278. - P. 1447-1450.

210. Rowland-Jones S., Sutton J., Ariyoshi K., Dong T., Gotch F., McAdam S., Whitby D., Sabally S., Gallimore A., Corrah T. HIV-specific cytotoxic T-cells in HIV-exposed but uninfected Gambian women // Nat. Med. 1995. - V. 1. - P. 59-64.

211. Rykova E., Laktionov P., Vlassov V. Activation of spleen lymphocytes by plasmid DNA // Vaccine. 1999. - V. 17. - P. 193-200.

212. Saier MH Jr. Differential codon usage: a safeguard against inappropriate expression of specialized genes? // FEBS Lett. 1995. - V. 362, N. l.-P. 1-4.

213. Schmitz J.E. Effect of humoral immune responses on controlling viremia during primary infection of rhesus monkeys with simian immunodeficiency virus // J. Virol. 2003. - V. 77. - P. 2165-2173.

214. Schneider J. J., Unholzer A., Schaller M., Schafer-Korting M., Körting H. C. Human defensins // J. Mol. Med. 2005. - V. 83, N. 8. -P. 587-595.

215. Schroder A. R., Shinn P., Chen H., Berry C., Ecker J. R., Bushman F. HIV-1 integration in the human genome favors active genes and local hotspots // Cell. 2002. - V. 110, N. 4. - P. 521-529.

216. Schwartz S., Felber B. K., Pavlakis G. N. Distinct RNA sequences in the gag region of human immunodeficiency virus type 1 decrease RNA stability and inhibit expression in the absence of Rev protein // J. Virol. -1992.-V. 66.-P. 150-159.

217. Selig L. Interaction with the p6 domain of the gag precursor mediates incorporation into virions of Vpr and Vpx proteins from primate lentiviruses // J. Virol. 1999. - V. 73. - P. 592-600.

218. Selsted M. E., Ouellette A. J. Mammalian defensins in the antimicrobial immune response // Nat. Immunol. 2005. - V. 6, N. 6. -P. 551-557.

219. Sanger F., Nicklen S., Coulson R. DNA sequencing with chain-terminating inhibitors // Biotechnology. 1997. - V. 24. - P. 104-108.

220. Sharp P. M., Devine K. M. Codon usage and gene expression level in Dictyostelium discoideum: highly expressed genes do 'prefer' optimal codons // Nucleic Acids Res. 1989. - V. 17, N. 13. - P. 5029-5039.

221. Sharp P. M., Stenico M., Peden J. F., Lloyd A.T. Codon usage: mutational bias, translational selection, or both? // Biochem. Soc. Trans. 1993.-V. 4.-P. 835-841.

222. Sheehy A. M., Gaddis N.C., Malim M.H. The antiretroviral enzyme APOBEC3G is degraded by the proteasome in response to HIV-1 Vif // Nat. Med. 2003. - V.9. - P. 1404-1407.

223. Shiver J. W., Davies M. E., Yasutomi Y., Perry H. C., Freed D. C., Letvin N. L., Liu M. A. Anti-HIV env immunities elicited by nucleic acid vaccines // Vaccine. 1997. - V. 15. - P. 884-887.

224. Sigal L. J., Crotty S., Andino R., Rock K. L. Cytotoxic T-cell immunity to virus-infected non-haematopoietic cells requires presentation of exogenous antigen // Nature. 1999. - V. 398. - P. 7780.

225. Smith S. M., M. Makuwa, F. Lee, A. Gettie, C. Russo, P.A. Marx. SIVrcm infection of macaques // J. Med. Primatol. 1998. - V. 27. - P. 94-98.

226. Stefas E, Rucheton M, Graafland H, Moynier M, Sompeyrac C, Bahraoui EM, Veas F. Human plasmatic apolipoprotein H binds human immunodeficiency virus type 1 and type 2 proteins // AIDS Res. Hum. Retroviruses. 1997. - V. 13, N. 1. - P. 97-104.

227. Stratford R., Douce G., Zhang-Barber L., Fairweather N., Eskola J., Dougan G. Influence of codon usage on the immunogenicity of a DNA vaccine against tetanus // Vaccine. 2000. - V. 19, N. 7-8. - P. 810-815.

228. Strebel K. The HIV A' (sor) gene product is essential for virus infectivity // Nature. 1987. - V. 328. - P. 728-730.

229. Sueoka N, Kawanishi Y. DNA G+C content of the third codon position and codon usage biases of human genes // Gene. 2000. - V. 261, N. l.-P. 53-62.

230. Tang Y., Winkler U., Freed O., Torrey A., Kim W., Li H., Goff P., Morse C. Cellular motor protein KIF-4 associates with retroviral Gag // J. Virol. 1999. - V. 73, N. 12. - P. 10508-10513.

231. Teleshova N., Jones J., Kenney J., Purcell J., Bohm R., Gettie A., Pope M. Short-term Flt3L treatment effectively mobilizes functional macaque dendritic cells // J. Leukoc. Biol. 2004. - V. 75, N. 6. - P. 1102-1110.

232. Tritel M, Resh M. D. The late stage of human immunodeficiency virus type 1 assembly is an energy-dependent process // Virol. 2001. -V. 75.-P. 5473-5481.

233. Turner B., Summers M. Structural biology of HIV // J. Mol. Biol. -1999.-V. 285.-P. 1-32.

234. Vieillard V., Strominger L., Debre P. NK cytotoxicity against CD4+ T cells during HIV-1 infection: a gp41 peptide induces the expression of an NKp44 ligand // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2005. - V. 102, N. 31. -P. 10981-10986.

235. Villinger F. Cytokines as clinical adjuvants: how far are we? // Expert Rev. Vaccines. 2003. - V. 2, N. 2. - P. 317-326.

236. Vinner L., Nielsen H., Bryder K., Corbet S., Nielsen C., Fomsgaard A. Gene gun DNA vaccination with Rev-independent synthetic HIV-1 gpl20 envelope gene using mammalian codons // Vaccine. 1999.- V. 17.-P. 2166-2175.

237. Vogt V. M., Simon M. N. Mass determination of Rous sarcoma virus virions by scanning transmission electron microscopy // Virol. -1999.-V. 73.-P. 7050-7055.

238. Von Schwedler U. K., Stray К. M., Garrus J. E., Sundquist W. I. Functional surfaces of the human immunodefi ciency virus type 1 capsid protein // Virol. 2003. - V. 77. - P. 5439-5450.

239. Wada M., Wada A., Shirono H., Taniguchi K., Tsuchie H., Koga J. Amino-terminal fragment of urokinase-type plasminogen activatorinhibits HIV-1 replication // Biochem. Biophys. Res. Commun. 2001. -V. 284, N. 2.-P. 346-351.

240. Wagner H., Bauer S. All is not Toll: new pathways in DNA recognition // JEM. 2006. - www.iem.org/cgi/doi/10.1084/iem.

241. Warnke P. H., Springer I. N., Russo P. A., Wiltfang J., Essig H., Kosmahl M., Sherry E., Acil Y. Innate immunity in human bone // Bone. 2005. - Epub ahead of print.

242. Weiss C. D. HIV-1 gp41: mediator of fusion and target for inhibition // AIDS Rev. 2003. - V. 5. - P. 214-221.

243. Welker R., Hohenberg H., Tessmer U., Huckhagel C., Krausslich G. Biochemical and structural analysis of isolated mature cores of human immunodeficiency virus type 1 // J. Virol. 2000. - V. 74, N. 3. - P. 1168-1177.

244. Westendorp M. O. Human immunodeficiency virus type 1 Tat upregulates interleukin-2 secretion in activated T cells // J. Virol. 1994. -V. 68.-P. 4177-4185.

245. Widera G., Austin M., Rabussay D., Goldbeck C., Barnett W., Chen M., Leung L., Otten R., Thudium K., Selby J., Ulmer B. Increased DNA vaccine delivery and immunogenicity by electroporation in vivo // J. Immunol. 2000. - V. 164. - P. 4635^1640.

246. Wilk T., Gross I., Gowen B., Rutten T., de Haas F., Welker R. Organization of immature human immunodeficiency virus type 1 // J. Virol. 2001. - V. 75. - P. 759-771.

247. Wills J W. Form, function, and use of retroviral gag proteins // AIDS. 1991.-V. 5.-P. 639-654.

248. Wittig M., Schroff C, Juhls C., Timon M. DNA immunization with minimalistic expression constructs // Vaccine. 2004. - V. 22. - P. 1709-1716.

249. Wodarz D. The persistence of CTL memory // Neth. J. Med. 2002. -V. 4. - P. 14-16.

250. Wolff J.A., Malone R.W., Williams P. Direct gene transfer into mouse muscle in vivo // Science. 1990. - V. 247. - P. 1465-1468.

251. Wong S. B., Justin F., Robert F. Contribution of Virus-Like Particles to the Immunogenicity of Human Immunodeficiency Virus Type 1 Gag-Derived Vaccines in Mice // J. Virol. 2005. - V. 79, N. 3. - P. 17011712.

252. Wu L. CD4-induced interaction of primary HIV-1 gpl20 glycoproteins with the chemokine receptor CCR-5 // Nature. 1996. - V. 384.-P. 179-83.

253. Xia X. Maximizing transcription efficiency causes codon usage bias // Genetics. 1996. - V. 144, N. 3. - P. 1309-1320.

254. Xie W., Li L., Cohen S. N. Cell cycle-dependent subcellular localization of the TSG101 protein and mitotic and nuclear abnormalities associated with TSG101 deficiency // Proc. Natl. Acad. Sci USA. 1998. -V. 95.-P. 1595-1600.

255. Yang D., Biragyn A., Hoover D. M., Lubkowski J., Oppenheim J. J. Multiple roles of antimicrobal defensins, cathelicidins, and eosinophil-derived neurotoxin in host defence // Annual Review of Immunology. -2004.-V. 22.-P. 181-215.

256. Yang L., Rather L. Interaction of HIV-1 Gag and Membranes in a Cell-Free System//Virology. -2002. V. 302, N. l.-P. 164-73.

257. Yang T, Cheng L., Kain R. Optimized codon usage and chromophore mutations provide enhanced sensitivity with the green fluorescent protein // Nucleic Acids Res. 1996. - V. 24, N. 22. - P. 4592-4593.

258. Yi R., Bogerd H., Cullen B. Recruitment of the Crml nuclear export factor is sufficient to induce cytoplasmic expression of incompletely spliced human immunodeficiency virus mRNAs // J. Virol. 2002. - V. 76, N. 5.-P. 2036-2042.

259. Yu X. Induction of APOBEC3G ubiquitination and degradation by an

260. HIV-1 Vif-Cul5-SCF complex // Science. 2003. - V. 302. - P. 10561060.

261. Yuan B., Campbell S., Bacharach E., Rein A., Goff P. Infectivity of Moloney murine leukemia virus defective in late assembly events is restored by late assembly domains of other retro viruses // Virol. -2000. V. 74. - P. 7250-7260.

262. Yusim K., Kesmir C., Addo M., Altfeld M., Brunack S„ Gaschen B., Chigaev A., Detours V. Clustering patterns of CTL epitopes in HIV-1 proteins reveal imprints of immune evasion on HIV-1 global variation // J. Virol. 2002. - V. 76. - P. 8757-8768.

263. Zabransky A., Hunter E., Sakalian M. Identification of a minimal HIV-1 gag domain sufficient for self-association // Virology. 2002. -V. 294.-P. 141-150.

264. Zanetti M., Castiglioni P., Rizzi M., Wheeler M., Gerloni M. B lymphocytes as antigen-presenting cell-based genetic vaccines // Immunol. Rev. 2004. - V. 199. - P. 264-278.

265. Zauli G. tat protein stimulates production of transforming growth factor-beta 1 by marrow macrophages: a potential mechanism for human immunodeficiency virus-1-induced hematopoietic suppression // Blood. -1992. V. 80. - P. 3036-3043.

266. Zhang J. Most retroviral recombinations occur during minus-strand DNA synthesis // J. Virol. 2000. - V.74. - P. 2313-2322.

267. Zhang M. Y., Schillberg S., Prins M., Fischer R. Optimizing expression of a rare codon-rich viral protein in Escherichia coli using the IMPACT system // Anal Biochem. 1999. - V. 271, N. 2. - P. 202-204.

268. Zhang S. P., Zubay G., Goldman E. Low-usage codons in Escherichia coli, yeast, fruit fly and primates // Gene. 1991. - V. 105, N. 1. - P. 6172.

269. Zhongguo Y. In vivo expression of green fluorescent protein gene and immunogenicity of ES312 vaccine both mediated by starburstpolyamidoamine dendrimers // Article in Chinese. 2005. - V. 27, N. 4. -P. 499-503.

270. Zhou J., Liu J., Peng W., Sun Y., Frazer I. Papillomavirus capsid protein expression level depends on the match between codon usage and tRNA availability // J. Virol. 1999. - V. 73, N. 6. - P. 4972-4982.

271. Zhu G., Gilchrist R., Borley N., Chng W., Morgan M., Marshall F., Camplejohn S., Muir H., Hart R. Reduction of TSG101 protein has a negative impact on tumor cell growth // Int. J. Cancer. 2004. - V. 109, N. 4.-P. 541-547.

272. Zimmerman C., Klein C., Kiser K., Singh R., Firestein L., Riba C., Lingappa J. Identification of a host protein essential for assembly of immature HIV-1 capsids // Nature. 2002. - V. 415. - P. 88-92.

273. Zuber G. Atomic force microscopy and electron microscopy analysis of retrovirus Gag proteins assembled in vitro on lipid bilayers // Biophys. J. 2000. - V. 78. - P. 373-384.

274. Хроматограмма продуктов реакции секвенирования по Сенджеру участка генов gagA, gagSynt и gagHumgagHum100 105 110 115 120 125 130 135 Basos

275. G CGCCCCG G CGGCAA G A A G A A GTACC G С A T С A AGCACCT G G TG T

276. Уровень lNF-у, продуцируемый С08+-лимфоцитами мышей после иммунизации ДНК- иммуногенами, имеющими различный уровень экспрессии гена gagконтрольрВМСpBMCgagHumU