Бесплатный автореферат и диссертация по биологии на тему

ПИРИМИДИНОВЫЕ БЛОКИ И НУКЛЕОТИДНЫЙ СОСТАВ ДНК НЕКОТОРЫХ ГРУПП МИКРООРГАНИЗМОВ

ВАК РФ 03.00.07, Микробиология

Автореферат диссертации по теме "ПИРИМИДИНОВЫЕ БЛОКИ И НУКЛЕОТИДНЫЙ СОСТАВ ДНК НЕКОТОРЫХ ГРУПП МИКРООРГАНИЗМОВ"



Биологический факультет

Кафедра микробиологии ? Л ; ; / , , - На правах рукописи

НАДЕЖДА ИВАНОВНА. АЛЕКСАНДРУШКИНА ' ' 5 '

ПИРШИДИНОВЫЕ БЛОКИ И НУКЛЕОТИДНЫЙ СОСТАВ ДНК НЕКОТОРЫХ ГРУПП МИКРООРГАНИЗМОВ

Микробиология (03,00,07) ;

\.ч

А вт о ре $ ера т -диссертации на соискание ученой степени : кандидата биологических наук

ИЗДАТЕЛЬСТВО МОСКОВСКОГО УНИВЕРСИТЕТА • 197«

Работа выполнена на кафедре микробиологии Биологического факультета ИГУ /аав. кафедрой - профессор Н.С»Егоров/ R в лаборатории биоорганичеоков химии ИГУ /вав.лаборатори-■ ей -профессор В.П.Скулачев/.

. НаучяыВ руководитель - доктор биологических наук , В.Ф.Вадода.

Официальные оппоненты: доктор биологических наук ■■ -. ■ БД. Рубак, кандидат биологических наук С.В.Шестаков.

- , Диссертация направлена ий.отзыв в Институт физиологии и биохимии микроорганизмов ЛН CCCÎ /г.Пущино-на Оке/. * Автореферат разослан " <$Х) " Ç^fy ^CuJ<JL 197Д"""г. Зашита диссертадии состоится " 197<~г.

в •" ™ час. на заседав» Секционного Совета по ботанике фиэиолого-биохимического отделения Биологического факультета МГУ /Москва, Ленинские горн, Биологический ф-т МГУ/. ■.': '

С диссертацией можно ознакомиться а библиотеке Биологического' факультет а. МГУ. ' ' ' V -

, Ученый секретарь Совета.

■': Л.О.il;"* •■оева . f■

; ' Работы Чартаффа н широкий фронт исследований иколы А.Н.Бело- -к':; :/'' -О, зерсхого показали существование видовой специфичности ДНК по цук- "

- • ' леотидному составу» Сегодня уже общепризнанным является важное так- v

- сономическоезначеняе этого структурного признака генома. , 4 < ! ' В настоящее время описание номенклатурного вида и типа счита-

-.'втся ■ неполным при-отсутствии данных о.содержанни ГЦ-пар оснований

- в ДНК рассматриваемого-микроорганизма»'

; Вместе с тем нуклеотидный состав несомненно остается все же

весьма ограниченнойхарактеристикой структуры ДНК.: ■ ;

^'/v : Помимо обычных азотистых оснований а молекуле ДНК имеются так

г ; ^называемые пминоршеп основания, количество которш: неэначательно» • ; . Наличие и природа дополнительных оснований в ДНЕ организмов разяич- ■■ * ного происхождения также могут/послужить дополнительным таксоноии-ческим критерием. ; "*'" ;. ;

. Указанные характеристики дают лишь, самое предварительное пред- ■>

. , : - ставление об особенностях структура ДНК. Что же касается -распшфров-\ ; 'v^.i ки нуклеотидной. последовательности ■ в ' цепи ДНЕ, то сейчас пока еще •Д ■.-■ нет методов, позволяющих полностью решить эту задачу. Однако, мы V , можем судить о частоте встречаемости определенных фрагментов, вы- •

цепляемых в результате специфической химической и энзиматической г• ; деградации ДНК. Результаты этих исследований могут служить основой ' - -V для определения степени сходства и различия в нуклеотидной последо^ -

вательности ДНК у разных организмов. .'■■'. , Изучение организации ДНК микроорганизмов (определение нукяео-

тидного состава, степени и характера метилирования, частоты встречаемости пиримидиновых блоков) ' имеет большое значение не только в , ' связи с решением ряда частных проблем филогении бактерий* Выявле-< ■ вие особенностей построения ДНК у прокариот могут внести ценный

• . 1-2120 ' -

■■ - ^ ' ¡Hiciwatii-iii' -, . i-

■ ; V :ч; ■ Xv.ir;.~.:z л ;. л ». . '

: .вклад в понимание общих закономерностей эволюции. •.. • •• 'л' _

В дайной работе вами был осуществлен сравнитаяьный. анализ'. нуж-.к, ; ; •'•-. яеотидного состава« природы минорных оснований, степени мвтилирова-'"^ л \„ • *• :.нвя и" характера распределения пирющдиновнх блоков в ДНК мнкроорга-. ..'j ;

. • низиов, относимых в разным систематическим группам. Основная.задача î

! : : исследования состояла в выявлении особенностей организации.ДШС про- .••• .;':/>.•; ' » УЙкариот по 'сравнению с. эукариотамн. Помимо этого, рассматривалась гу

возможность 'использовавия указанЛых характеристик первичной струн- ^ ; : ^ "V;; хуры ДНЯ для решение некоторых частннх вопросов таксономия бактерий» . . .v: ' Эта работа является'частью многолетних исследований по специфичности • у,. нуклеиновых кислот, начатых на кафедре; биохимии 'растений и^провод^Л:^;;^^ ■'•■ долгое время под руководством Андрея Николаевича Белозерского.. - ;

".." ; v;;; : ' • ниткмшш " й -методы '..

• Культур» использованных бактерий были получены нами из музея ... •.: ' ' живых культур микроорганизмов кафедры микробиологии мгу, из ннсти- : .. ^ -, т^та эпидемиологии и микробиологии им.' Гамалеи А1Ш СССР, института *,'' '•;

. микробиологии АН СССР, а также "от профессора Хендри (Антаня) и Эе—- • ; , -;.'елигера Выращивание "культур" исследованных, микроорганизмов ; - ; . , • .. - •

проводилось нами на средах V при:режиме, соответствующих физиологи-

• „ческим особенностям каждой из них. ' •v'V'vWi'l V',-1".

i^y^i ДШС из : бактериальной" массы выделяли по мйдифипировапному вето-'V/.-v»-."-''' , ду Иармура (магоаг,19&1 )• Бактериальные клетки разрушади растирани- ;'. • > ' ."ем в'жидком азоте, суспендировала л стандартном солевом растворе..^ - : у ,'

• . i(CCP) (0,15 il Maci 0,015 11 цитрат натрия) с 0,1 M ЭДТА при. . : ' . , ' рН «'8,2-8,5 и лизироваяи детергентами (додецилсульфат натрия

"Л 0,5-S&î Бридж-35 - 1-4%;'Тратой X-IOO - 4%гдезокскхалат нагрмя-.♦.•;..'; '."•' '.-Депротеинизацию лизата проводили 3-4- раза смесьй ?лоро$орм-изоамило-.. ; ' . „ вый спирт (24;I); ДНК из водной "фазы, отделенпоЯ центрифугированЕец,

^;/'Хг.г* Обахдали^$6$■ "увтанмюм;«;перераотворяд* б.сср*' дм'очистки' препара-/;^*

• низироваи смесьи июрофори-язоамжюннй. спирт ж осаждали 96^ мало- ' ' ЛОИ.'ДНК раётворндн в СС?* цент рюфутнровали прд 40.000 £ в течение " 1,5-2 часов,'вновь осаждали этанолом и растворах* в 0,1 ССР; х 9 ов»е-нам раствора добавляли I объем 3 и ацетата натрия в О,ОХ ЭД1А х осаж-даля ДНК ДОЙазлвшем 0,54 объемаизопропаножа. ЗатенДНК промывай ;70^-этанолои, %% «анолом н'хранили в ВСЯ этаноде ва хоходу (0-4°). \

Для определения нукл еотидного состава ДНК • использовеня' лах га'. деленные-иотащенши вноовопоашнерше препарат ДНЕ та* ж воздух- ' -

; но-сухул йионассу бактерий.

...:' . ■ •В случае использования воэяукпо-сухой биомасса для определения -'.;.' состава ДНК проводках;гидролиз по Шмидту ■ Тангаузеру (0«75я}МаШ •

. ;18 часов, 37°) и последующие'процедуре выделения и очистка ДНК осу-> • ' ~цествляли по методу, ооясанпому Ванюшиным (1964)« -Л*;''3 ■

;, :. > :', препараты ДНК висуиэнные спиртом х эфиром гидролизовалв До ^оср^ ^ • • Г . нований 57^ НСЮ^ при 100°; I чао в аапаяных ампулах» Остовав*я;рад-' ':-' ^ < ■ делили ¿ помощью хроматографии на бумаге (Ванюшин, 1964) ж восходя- , .у, V.; V .;-".■ цей одномерной тонкослойной хроматографии ва ДЭАЭ-двлл*яозв (Ва®®*". ^ •. %.:'.: ев, 1971) ♦ Количественное определение оснований проводили' спект^Ь|о-, ; л;' 'тои^ргявста СВаыяиа, 1964)« В ряде случаев содержание ГЦ-пар в; •

- дшс определял* поТпя.<Махтиг,1>оЪу ;19б2" ).' Выделение и иденгифи- ;.*')" " •'* 'у ' • • »«ар® ииворнах »оппонентов * Ц& проводили" после гидролиза 50-Ю0 «г •-.'':

ДНК (57£ НСГО^, 100°, I час), хроматографического разделения основа.:, " • нхй иа бумаге, многократной рвхроматографва и доследугаей: спектрофо-;';.;^ '.V:. "'тометрии (ТапуивЫп аХ.,1960). -.■."(■..; 1

- Для анализа частоты встречаемости пирииидиновых блоков ДНЕ

■ * . - ' .. ■

намк был - использован метод колоночной ионообменной хроматографии ■ ' - (Казна, Ванюшин, 1%?). Пиринидиновые олигонуклеотидн мн получала путемгидролиза навесви воздувдо-сухой ДНЕ _ муравьиной вислстой в присутствии дифениламина - 18 часов, при 37° С Вщ^оп'.Рв^егаев,^ '1960). Разделение олагонуклеотидов по длине проводили на ДЭАЗ-Свфа-дексв А-25 здвцией с ис польз о вашем линейного градиента концентрации. НаС1 '' от 0,05 V до К в 0,05 Ц ацетате натрия х 7 К ио-чевиае при рй» 5,5-5,6*' Количество олигонуялеотидов в полученных ; однородных фракциях пиримидиновых из оплат ов определяли сдентрофото-иетрически (Пазив, 1972), Разделение пирииидиновых олигонуялеотидов по составу осуществляли на ДЭАЭ-Сефедексе А-25 с использованием Градиента концентрации ггаС1 в 0,01 Ы ацетате натрия от 0.до 0,2 Н (ддямонопншшидинов); от 0, до 0,25 Ц (для дипиримидидов); от 0 до' 0,3 11, (для' тршшриыидинов); от О до 0,35 II (для более длинны! сдиго нуклеотидов).;Количественное определение олигонуклеотидов осуществляли спектрофотонетрически (Мазин,-1972) ».4* .* /

- ^ пиримщщновыв блоки "в днк микроорганизмов» относимых -к разным' систвиатичизом- группам

Сравнительное изучение частот встречаемости разных пиримидиновых фрагментов представляет большой интерес не только для оценка таксономической значимости этого критерия, во и для выяснения общих и поиска' специфических.черт нуклеотндной последоват евьно от и ДНК. раз ного происхождения» V 7

: , ^ Нами был проведен анализ содержания пирииидиновых блоков'в ДЕК 40 Твидов микроорганизмов, относящихся к разный систематический груп 'нам. Полученные данные представлены в таблице К I. Наши результаты .'прежде всего позволяют утверждать, что характер распределения ляри-

иидяяов в ЛНК изученных шосрооргашз нов существенно: отличается ст:. случайного (хаотического), - ;'■. ■;■■ '■ ' '. * v

V/; J&H^Bcex изученных бактериальных ДНК характерна низкая степень , сплоченности парииидинов но сравнению с изученными ДНК эукариот . {11азш,19б9; )1азин,Судимова, 1971). Все это бесспорно унаэывает на то, что бактериальные ДНК в отличаа от ДНЕ хивотныхи высших растений обладаю®некими обеими специфическими чертами организации первичной структур,которые t по-видимому, могут служить отличитель— :ныыи признаками ДНК прокариотического тина. .

Кроме того, отличительной особенностью ДНК:большинства изученных видов бактерий является преобладание встречаемости дипиримиди-, новых Фрагментов над иовопиримидиновшш в полинуете отидных цепях. "Как известно, в ДНК животного в растительного происхождения коли- -чество одиночных пярииидииов ^больше количества дипиримидиновых фрагментов и убывание содержания нуклеотидного материала а увеличением длины олигонуклеотида в этих ДНК носит более или менее данейвый ха-, рактер (Назин, Ванюшин, 1959; Мазин, Сулнмова, 1971).

. Характер сблоченности пирииидинов в ДНК, как-свойство органи-> эадии ее нуклеотидной последовательности, несомненно обладает определенной ценность» в качестве.таксономического критерия. Как видно из таблицы № I нуклеотидный состав IHK у изученных нами видов микроорганизмов варьирует в широкие пределах (32*7-74,2 уолД ГЦ). Тем не менее, нередко в ДНК микроорганизмов из. разных семейств и - ( порядков часто очень сходны по нуклеотидному составу. Вместе с тем, -. : из таблицы. IS I лио видеть,' что практически неотличимые по составу ДНК виды из разных таксонов, могут достоверно отличаться по степени сблоченности пиримидинов в их ДНК.-Так, например,'ДНК представителей фотосинтетиков - ТЫ ос ар s а го se ope га le Ina . -S истиных бактерий -.2-2130 .

хайлкца' e-I*' Пиримидине вые блоки в' ДНК некоторых микроорганизмов С

i'- .1- Tblocapsa ' Rbodoepl- Peeudomonas Xantbomonáa :.-Xanthome- •.";;: - Яидйговеорег*^ ' rillui» ' -. savastenol" fcetlwrta nas • •', ■f^'V/ eicina rubrun Г V' . f; í/ ' • hyoclûti ' : ^

I 10,93+0,20 П '. 13,83^0,20 Ш • 7,02+0,16

'. iy " 5,21^0, io ;

' y ; 4,37¿0,I8 П, . 3,9I.±0,24

711 я 4,73±0,20 более . ...

II,04¿0,25 13,48+0,10 6,62¿0,22 5,04¿0,II 4,52¿0,I6 4,03^0,19

5,27+0,12

II,24¿0,I7 ,'12,01*0,11 : I3,09±0,I2 I3,3$+0,23-9,75+0,08' • 8,I3±0,I5 6,I2±0,24 .6,06+0,10 4,56+0,10 4,48*0,22 2,35+0,28 . 2,12+0,30 •

'2,89+0,17 4 -, 3,85+0,09

. 11,96+0,24 13,42+0,13 8,51+0,09 5,80*0,12 4,23+0,18 2,26+0,14

.'3,92+0,16

$ 1,86+0 ,04 2,12*0,04 2,11+0,03 2,22+0,05 2,28+0,04

;' Я „ ..V66,8 .66,2: • : ' 62,0 64,9 ;. ! . 67,2 .

Achromobac— ''',.. Вид ter asile ^ PlHTobac- " : terlum flavum ..' , Listeria :. , monocyto-"■■ genes . Listeria '. : gráyl Ai throbachter citreus

t n,36+P,i8 : • Л 12,84*0,21 12' '9,31+0,15 ^ 1У >• '6,29*0,24 '■i'. -"У - ^»43*0,20 У1 2,57+0,18 ■

У 711 и 3^20*0,19 ; более ■.:

15,31^0,19 16,18.10,33 8,23+0,21 '5,16+0,18 '"2,85*0,17 1,03+0,25

I,24iO,I2

■12,09+0,23 12,21+0,20 .8,23+0,07 L: 5,78+0,22 3,97+0,12 ; 2,45*0,06

5,22+0,19

.11,93*0,50 12,23+0,27 8,07+0,42 . 5,40+0,34' 4,00+0,46' 2,43+0,16

• 5,94+0,09

12,24+0,18 14,20+0,23 8,36+0,02 . 5,61+0,10 3,66*0,07 ' 2,67+0,20 •

3,29+0,42

-Л

"r1

лод.%. • . • , . .. 67,8 42,6 : 43,5 . 65,o •

.£•.,2,06+0,05 ! X3,27+0,08 У 2,16+0,11 : f l • " V . ' 2,14+0,16 . .2,35+0,05

• ■. ■ * "í'

СогупвЪас-* , Bacillus : > : Bact©riua;. . ■ - 'Faàteuréllâ :¿ Lac to- . .

Над .teriünr '■"; : megaterlœ« Л ¿cabigenum ' .Pestis k ; - báolllúa

t •fesciena '-ГЛ' вр^• v ;

■r I 12,35^0,24 11,57+0,11 • П,Ц±0,29■ ■ I2,3^0,96:í I2,87¿0,20

П -I4,02iP,I8 12,09+0,11 14,23^0,11 15,82^0,14 13,23^0,32

III • -9,7^0,12 ' ' : 8,IOJO,18 8,26+0,06 7,74JP,I9^ - 9,I4±0,I8

5,5^0,23 S,8I±0,I5 1 6,03±0,40' ' 'I 5,64^0,04.. " - 6,25.10,27

- У 3,22¿0,II 3,6I±0,I7 - 3,99+0,09 з,з$±о,7о ; 3,97jp,I4

У1-, I,36¿0,17: 2,34¿0,I5 3,09¿0,59 . 1,72+0,10 2,64¿0,H

: 6,48¿0,27 3,28+0,19 . 3,43+0,13 I,90lO,n

Л 2,61+0,05 / 2,11+0,04 : 2,09t0,07. 2,65+0,12 : ; 2,34¿0,03

■ ГЦ „ : 63,4 ; ; 38,6 52,3 ' 48,6 < 39,i '

кол.% • »

Lac to- Ulcrococcus ."Sarcina Staphylo— Staphylo-

Вид: bacillus ', luteus ■ . flava \ coccus 'coecu'f i-.

V lactie' •;■',• * • '- • у . 'r Л' > •• ' ■■■ '.u *; - . \ - ^ ■ . albus ; ■ ■■ " aureus - . V;

>ч-.-. ■■ ' I .■-"■ ' II,34jr0,28 13,13+0,24 13,97+0,27 12,28^0,17 I2,23iP,49

П . ' 12,7-9+0,13 ' X I3,07±0,24:' I4,I8¿0,24. I2,64¿p,I7

; ш. ■9,79+0,21, 9,08,^0,03 -8,07+0,27 : 8,74^0,34 г ; 8,5Qtp,06.

: 1У : •6,65+0,18 6,10^0,04 . 5,50^0,21 5,95*0,67 5,55(10,13

- 5,03+0,15 - 3,77+0,11 3,44¿0,I3. 4,I3¿0,22. 4,10*0,07

У1 V .3,6I¿0,I8 I,65¿0,07 , 2,I5±0,27 ! -2,5б1Р,П^ • 2»51¿p,28

i11 и 0,79+ 0,04- ■ болев • ; , ■ . . 3,20+0,15 ; 2,69*0,23; • 3,7I¿0,28

,JV 1,86^0,04 2,52±0,02 . ■ ■ ... -i г.- 2,68±0,06 2,20*0,06 2,23^0,03

:_ГЦ : .: ; 43.5 - V 71,9 67,8 ,>V:' 32,7. ='-". 32,7

■ ИОЛ.¡6. -.s " ■ ~ i I

ЕзсЬег1сЫа За1топе11 а ,,

Вия соосиа .НКЕ-бОО с г1рЬупиг1и1п

1 су-Ьгеиз " ■ ■

г'-: 12,2010,24 13,64^0,06 13,54+0,19 II,66^0,01 ,

П" 12,43+0,36 14,35+0,18 ' 14,73^0,43 14,81+0,09

ш 9,21+0,56 7,74^0,34 7,87+0,31 8,29+0,03. ^ '■;

1У 5,98*0,17 5,30±0,13 5,0%0»08 6,21^0,12

у ,3,86^3,19 З;б1д0,12 3,67±0,09 3,57+0,03

У1 ,2,21+0,17 .2,01+0,45 . . , 2,16±0,21 г-,1^+р,08 ,

УП и более ,4,12±0,Ю . 3,35+0,23 2,9410,10 3,34^0,25 4

•Р г,2540,10- 2,6510,07 2,6210,04 2,3910,01

■ ГЦ 33, 9 . " >Ч 51,0 ■ " 51,2 50,2 - •

ыол.%

Вид " Ртор^оаПэас— Рго51оп1Ьае— Ргор1оп1Ъас- рЕор1о»1Ъас—

tвгIш<l ре"Ьег- teгíш еойег— . Ъег1хш гиЬгшц

воп11 йеагвКЛИ . пел 11 " - ■ | ,

• > X 13,16^0,18 . 13,26+0,1? 12,6510,31 12,1410,19-

п ; 15*2110,24 ■ : Д5,8б1Р,12 . 15,85;±0,20 16,10^3,35

ш. 8,94^0,19 8,2910,18 9,5210,17 8,90+0,15

и 1 5,82+0,27 „ 5,60+0,12 5,7^+0,18. 6,1410»21

,' 7, ■ ■ 3,50+0,19 г- 3,68+0,20 3,47±0,19 3,9510,18.

71 ■ 1,7010,30 - ; 2,15^,16 1,7^+0,15 2,1710,17 :

УП И более 1,67+0,19 1,1610,26 .. 1,05+0,24 0,60+0,09

■ : 2,731.0,04 . 2,71±0,04 2,7310,05 2,5510,06

гц!; 67,5 67,4 ■ '■ 68,2 " ¿7,9

110Л.%

v .Proplônibac- • Agrob ас te-' •'.Wocerdla '• .•• -Nocanila .*•;

. » teriura van-4•. rium . •.-'. ' eytrea "•.•.•".".'. polichromo-; \ nielle " í : :.tumefaclena ' • ". •/ • ' . ' 1 ••• ■'.;■..'.

;• /.Вид , ter Iura • ' • _ j- ^'nielle

;•' -. I' , . 12,71+0,06 , 11,76+0,27 13,59+0,14 . .. 14,Ц+0,15 Д .

.••••' , :П - 15,39+0,31 ' 12,40+0,45* ч 14,4]¿0,31-. 15,31+0,25; ' '•"•;•

V-, '0 • 'v.8,2I¿0,02 ' ' '8,35+0,23 : • 9¿12+0,18 rv \ 9,64+0,27 - , :-' ' " .1У •• 6,02+0,13 5,80+0,15 5,47+0,24 :: 5,50+0,31 Л"'.

.•' /'У • ,4,20+0,15 , 3,80i0,36 : • 3,65¿0,I3.- ' 3,00±0,I6;v... ; ' ДУ1 2,07+0,12 ;' .• 2,33+0,08' ;2,66+0,I7; 1,38+0,35 :' • '•'.•:.

и ' 1,40+0,17. , 5,56+0,19 . 2,Ю±0,18- ' /'¿,05+0,12 ,'i

• . . более4,. • . . , ... — . . s.; ■ ■:.■;:■ ■■ iv -V^"':"

JV 2,54¿0,02 • . .2,16+0,07 2,73+0,14 : ..«3,00+0,06

мол.36...... : ' 58,6 ' 71,4 ; -' : 68,6;

■ - V .y-"*-"' I.-VHycobecte-' '¿•.f■••!.• : -Ç i Вид •. г1ша ". - -.: Л - : - '-Ц' i;'.. ecadeota . " ; Kyeobacta^ у .rium У albus УУ';Уу.: У -îlycobaote— ■ riUID :\ censacy' , : • ; ' ' BCG .

.. \ ' ' I.'. ! .12,16+0,47. ' ; 13,26+0,19 ; 12,59+0,08' : :N -, 12,10+0,25' -, . ,

■V^i-^'j П . 15,75+0,24' • 16,72+0,26 16,20+0,59 • ' • 15,13+0,36.

;' ;;; , ш .,' .8,82+0,10 :■■" 9,79+0,39 ' . 8,80+p, 11 : '.. e,44±o,2i'••; : , ;

Г /.'; 1У •• .'5,44¿0,26 ' 5,50+0,28 - 5,II±0,0? . -5,21+0,14'. .'• ..

[ ' .»•; ' У' . 3,?8+0,I8 2,88+0,П. - 3,08+0,22 : 3,05+0,26 Ü-';-

- 4 У1 1,23+0,09 0,92+0,08', •. 1,66+0,35 •'' 1,62+0,12' ♦ •

í*1 и 3,22+0,13 0,94+0,11 ' '- 2,56+0,80 .. j 4,4I+0,'l4<rV'"': .

более, i-.-,---; ■■-_■..., ■. -¡.,l j/ • ^'у-'л * * 1 '

.2,72+0,08 -- - 3,14+0,10 V 2,79+0,07 ; • 2,48+0, IJ— -

•;• . ' • . • Гц ij-V-.'.- мол.^ . •' .68,8 ч ' ■г ' " . , 1 .-. • ;• 70,0 • . • • -.■■'*■;■-- - ■ ..IV i C9,4.4 ' - Г-- .66¿9 v.'v';

- ' .. .t . '' tr; .. I . ' ' ' '" ' + • ' " " • ' Г. " - \ " ' - ■

.-/"".-i ■' -"'/-,'." ■■"■" Si'- :'". J - ' ''. V ■vv '.V,'•' .r* ; • •

;— PIavobacterium flavum . , Artbrot)ac ter eltreus , Propionibacterium г schexoanil , - по составу почти идентичны (66, 4;67, 8; 65, О, v 67,4 иож*% ГЦ соответственно) * Сравнение *в .'распределения1 пирими- ■ динов в ДНК этих форм выявлеет существенные различия в построении; ■': их нуклеотидной последовательности (см. табл.1) . Таким образом, - ' ;'■' этот критерий (степень сблоченности пириыиданов) иногда может об- -ладать более высокой разрешающей способностью, чей определение нук-леотидного состава ДНК, для решения таксономических вопросов на уровне'рода» ' ..':'■.■',

' МЕТМЙ^ОВАНШЕ ОСНОВАНИЯ В ДНК ПРЕДСТАВИТЕЛЕЙ РАЗЛИЧНЫХ 1 СИСТЕМАТИЧЕСКИХ ГРУПП МИКРООРГАНИЗМОВ

Данные о содержании дополнительных минорных оснований в ДНК рвда микроорганизмов приведены в таблице № 2.

.'Полученные, нами результаты дополняют имеющиеся на сегодняшний;1 .день сведения о наличии и природе минорных компонентов в бактери-> альных ДНК (Ванюшин, 1972)* В ДНК представителей родов Thiooapsa, ■ Lac tob ас illas, AchrотоЪас ter, Fl evob sc té r itm, Sarc iaa , Proteus, Senthoíflottas,Hocardia метилированные основания были выявлены впервые* 11ы показали, что в ДНК бактерий в качестве "минорных" оснований могут содержаться как и6 -^етвладекин (НА), так и 5-метилцитозин (ЫЦ). Из изученных наыи 28 видов .микроорганизмов"н6 -иетиладенин был обнаружен в ДНК 26 бактерий.;5-метилцитозия встречается значи-* таиьно реке и был нами найден в Í7 бактериальных ДНК. В бактериальных ДНК может встречаться как одно, так и оба эти минорные основа- -ВИЯ. Например, в ДНК S.flava, Th.тоsвopersleIna, Халth.beticola И , Вас.œegatетium 'нами обнаружен только и6 -метиладенин, У боль- . шанства изученных нами.бактерий в ДНК присутствуют; оба минорных компонента - это Представители родов Propionibacterium, Flavobacte-'

V ■ .'"^ ..'<'.■'--А/'.';-- Таблица * г

- Содержание 5м1етилцитозяна иб-иетилаиинодурина --' ; ' ■ в ДНЕ некоторых бактерий '

Источник ДНК" _ * Содержание в иод.* - .

' ; ' : : Гц-иар г М1 : ЦЦ /

I. пор.ЗДюЗз8р1г111а1еа 1 ■■._.'■ ' 1 V -л':"

1 с«и,Е1то<1о8р1г1. Навело ;

КЬ.гиЪгиш • 66,2 0,20+0,06 ! -^.сец.СЬгФяа-иасеав

, ТЬ.Хйа«орегв1с1ш ' 64,4 0,16+0,05

3.аор.Реэи4отоао4а1«а ! ■ _ ' вем.Рвеи&олопод.аоеав .'-■■ + - ..'

Ва.в&У&а«апо1 62,0 0,12+0,07 0,14+0,08

4. , X «ЪвисоХа - 64,9 0,10+0,05 0,09+0,04; 5« X ' ч 67,2 0,06+0,04- -

' 6.аор.БиЪасЪег:1а1ев ■. . ч , V ' '"" ■ -, ■ '■'

■ ев 1ЬВЫ2оЪ1асвае , . ' ■ ; ■

Г ; Аег»"Ьиш»рЬао1впя .... 59,6 0,10+0,06 0,17+0,08

7. се ми АсЬгошоЪасгвг1асвав V .'.-■ ~

\сЬ.аа11а 41,3 - 0,31+0,05 0,09+0,04

8. ; Г1,£1атйт 67,3 0,27+0,05 0,03+0,04

" Вг».аеаЪ1геата>- ... 53,6 . . 0,36+0,07 . , - .

Ю. ■ 37,6 ] 0,41+0,08 -

II.с#м»1*асЪоЪас11Хасеае ■ ' "/'■■'.' 1.1ас«.в . 43,5 0,16+0,03 0,11+0,03

12.с§ц.Вас111арвае

; В&е.виЗДШв 42,0 . - ч - ,■ .-"-■

1?. ■ , Вас.тева(Ь»г1ш ■ 37,3 0,09+0,03 ■ '■

. 14.свы.С0Г7П«ЬасЪ«1Масеае , ' - ^я^пооосуи^епвв

: ' • ЫТ. 766 42,6 .. - -

15..' ч вга-э-хзо -'—" . 4х,о ■'" _

16,сеы.Ггор1оа:1ЬасЬег1асеае \ . '' '

■ ■л-; Ргор^аеЬегоапИ 68,2 0,04+0,06 0,52+0,05

17. ч1 Рмр".£гвиавагв1сЫ1; 67,4 0,05+0,02 0,50+0,03

; ■ . • 67,5 0,07+0,04, 0,49+0,03; , ,

719.' • Ргор.гаЪгит > \ ';.- 67,9 '' -0,06«.,04" \ 0,^,05.. .

V 20. ' "Т Ггор.Уааа1«1и ' ': • • ' 7'-" ' 63,4 ^ ; 0,04+0,05 . 0,4?+0,06 . : .д: },.'•<:

•; а," •••..•<••' 39,1 .:о,1*+о,оз ^.0,09^,04, ; ^^

¿Г' 2а,с^<«1и.ёгос<>сслевав.:;. : у": 1 '■ ' \-.v- < "й

2?. - ; а.Пвта '."• '/.. Ч.'ч^ '•. Ь?«8 .• 0,06+0,06 л

' 'свм^ИусоЪас Ъе г 1ав еав ^ - 'Л ■'■"'/:■■' ^ ■ -.

'"••:.'..."..; и.ахьш1 ' ■ " '. '70,о • * о,об+о,оз , 0,14+0,02 -'; ч.;

: • ;. •; ¡Кос.роисЬг1»1гвав» • '/. 68,6 " 0,14+0,02 " 0,21^,01 уЛ> \ . ::26. г Мос^су^а .л-.«-." ' ■■'■■■■■.. V'- :-- -■■Т

шз. I, •• •• : 71,4 Л ' 0,17^,02. 0,2^,04

/.2?.' ' . с : V •. * • • 71,2 • . •о,1б+о,о* ' о,го+о,о3 \ . .. • •

. 28.''. -.у.'./- -л:; ''- ВТ.17 .. Л: ..71,1' . 0,18+0,05 у 0,21^,03 у../-,

>1иа лсЬ^ошоЪасЪег ' и другие (си. табл. 2). Среди вс ех .. . . • >'•.

- изученных бактерий ве было найдено ни одного организма, ДНК которо^ • •.. ;,: го содержала бы только ^-метилцитоэин. Следует отметить, что у не- - ' . которых задов в ДНК минорные основания вообде не были выявлены- "V . ,' 9*0 ДНКлистерий, нАс.илеив -.'. Наибольшее, количество ". айна бшсо найдено нами в ДЯК оропконовых бактерий (от 0,47 до 0,54 .'' * моэ.%),; а ввиболыпве. количество' в6 ',-метиладенвна - в ДНК предста- - , . . -

• ' ВИТелей сеи»Еп*вгоЬао^г1асвав< Р.ги1ваг1в. Eг.эвтagtвiloi)♦ • ^ ч' • "

; , Наши данные позволят! говорить .о вироком-распространении ми-:-

\ норных оспований в' ДШС'бактерий. Однако трудно еве говорить о харак- : ;.. ;;.;г:'терэ связи ивяду со держанием минорных оснований! и составом" ДНК /Так, ' _силькоразлича>мреся по составу, ДНК могут иметь одишсовое количество '

•• ' того или иного минорного основания.' Например, в ДНК: N0«.роИсЬгото-. " ,

.^содержание Ги6 -мегиладенина [одинаково,--а;.• ..-.' '■/Л": яо, количеству/ ГЦ—пар' они' сильно различаются.'. ДНК Нос." ро11скговю - , У.

'. : Г . сепвв.: относит<м V вы^

дает,почти эквимодярныц соотношением оснозаний.Сдругой.стороны,; ?; в ДНХ с близким составом содержание минорных оснований может .быть с .' .самым различным.;Так в ДНК пропионовых,_'фотосинтезирующих бактерий л; : И ПС евдомонад, имеющих; близкий нукл е от идный состазметилированные",,:

основания встречаются в самых различных сочетаниях. .'.'; .*:',„,.-'Г'.;.5-» . " ■; в ДНК высокого ГЦ-типа 5-метилцитоэин может отсутствовать пол- . .•,'„'/•'••' .. востью, а.содержание 'N 6.-иетикаденииа можетбыть достаточно веди- ^ д:;/-^ ■: л к о ( ваге 1юа пата , ньой7 гиъги®: тыос араа говвс1рвге1с111в) .в ДНК ; . :'. / V :'же АТ-тияа наряду о величием ; м.6 -^метиладенива отмвчаетсн вначи-. " % тельное количество 5-метялцитоэина ( АсЬг. а£11е,';1*<>^. ти1ваг1в). ' -' Таким' образом, сопоставление ДНК по составу и по степени и характе- . - ру метияирования не позволяет выявить к^ую-либо определеиау» связь / -. : ! ' нежду\-этими - параметрами,' Оно; несомненно указывает^ лат'ва; то» ! что * ■метилирование: следует 5 ра с сматривать как строго видоспецифичну» моди--фикацию ДНК. Для*некоторых групп бактерий, которые"считаются достаг.; • ¿^Л-'-.'^ точно однородными, удаётся выявить.вполне опредеденше^'хар^терные• ' .'•• ' 'тапго иаччпплг гге акия ПИК." Так. . 1ШЯ ПОвЛСТаВЕТеЛеЙ ¿„ГРгвргогАЬ'асг«^.

,, Л;,..; содержится; большое КОДИЧвСТВО И .--метииадешана.' лап дп».ртиыиив-

7 > ¿тиков весьма специфично наличие только небольшого количества 1Г,-М9-: - : 'тиладенина (около о^ми&У^^в'ЗДо-'яесо^

" .'ч ; : высокой биологической специфичности метилирования ДНК. •„•\.;

/-■ о'-1-Таким" обрезом,', наличие,. природа^" количественное, содержайие ■ и^;'-.': '• , .-'характер распределения минорных оснований, мо^т служить важными ха-, рактерным-^я • признаками многах ДОК, бввгериального 'происхождения/-Д;

НУКЗЕОТЩНЙЙ СОСТАВ ДНК И ВОДРОСЫ ТАКСОНОМИИ

НЕКОТОРЫХ ГРуШ МИКРООРГАНИЗМОВ ' '■■ ■ " ' . ■ ' ; ■ "

Для идентификация и характеристики некоторшгновых выделенных ' видов бактерий и мало изученных групп, для реяенив некоторых вопросов хх тахсономии иы провали определение нуклеотидного состава их : • ДНК. . . .". . У-....■■■-■'.'

^ • Род Listarla . .4 ' ,'

^ Нами был изучен нуклеотидный. состав ДИК ?. штаммов: Listeria -monocytogenes возбудителя листеряоза, И Listeria' grayi . Содер-жание.ГЦ-пар оснований в этих ДШС варьирует от 38,6 до 43,5 мол.$., 'Выявлена, штаммовые различия ДНК по этому признаку у культур l. monocytogenes относящихся, как к одной, так и к разным серологическим ; типам.{табл. 3). Данные по нуклеотиднону составу. ДНК листерий свидетельствуют о выраженной обособленности рода".¿latería от других' родов семейства СогулеЬacteri асеав . Неоднократно отмечалось неопределенное систематическое положение рода Listeria'(Frevot,t94öt Davis et al, ,1969¡Stuart^Pease, 1972 ) . Результаты сравнения фенотипов методом числовой таксономии говорят в-пользу непосредствен- : кого-родства листерий о молочнокислыми бактериями рода streptococcus ( Davis et ai.,1969 ). Сравнение данных о куклеотвдноы составе ДНК „ листерий и стрептококков -говорит в пользу указанного родства этих трупа* Таким образом, полученные вами данные по составу ДНЯ могут . ч иметь определенное значение для формирования более четких представлений . о таксономическом положении рода Listeria.' 7 \ ' ' Прос^екатные_байтарии. ■ .

. Вопрос о систематическом положении недавно выделенного (Васильева, I970J простекатного микроорганизма, имеюдегофорыуб-лучевой звезды, Stella humosa . , остается до настоящего времени открытым*

"t '.'■..■ "

Тайисца fe 3; Нумеогидный состав ДНК истерий. "

" Вида: :Серояог«-; : чесгае : тшш : * т • • * ■ * • • >: Штшпга ■: CooTHOffiBze осзогагий s . молярных % % гц И-: И + ш ; :*пг ; : по Т и.

» • * : Г -А ■'■■■ Ц ' Ï -

¿latería I 9-127 19,1 31,2 19,5 30,2 - 38,6 ¿ 0,29 /v": ' ■ '■■'.",'■'

monocytogenes . I 22 20,0 ; 50,0 •20,5 29,5 40,5 + 0,16 -V -• "

1 • ■■■ 1472 V" 20,0 . 29,5 . 20,2 50,3 . 40,2 ¿0,2

766 21,5 .28,9 : 2i,i 28,5 42,6 ± 0,15 41,9

в 9-128: >19,7 ' 30,5' 19,4 30,4 39,0 i 0,3 ; 39,3

■'■ - " -- ■ 9-129 20,1 29,9 28,4 41,7 X 0,35 . 39,7 Я

1Уа ' 9-130 ' 20,4 30,3 20,6 28,7 ' 41,0 ¿ 0,2

■ ' ■ - > ■■ Ш Ж1/53 21,5 28,7 21,9 27,9 . 43,4 * 0,35

Listeria 21,7 . 28,8 21,8 27,7 43,5 ¿0,3 : 42,8' • ч V .

grayl

•л *

, ' V • * -, ' '•

" \ \С ' . Л4-. 1 ' 'Г .1 Ч. .'

^ По этому изучение нуклеотидного 'состава ДНКряда'штаммов э^и.» .

' Ьитоел . представляло особый интерес»' ДНК Ьишоаа относит-

'- : ся н Гц^типу и содержание ГЦ-пар для изучении* штаммов варьирует '.'..' . • . * * от 64*8 до 66,2 иол.%(табл. 4)* По составу ДНК'ати иккроорганаэмы : .. ' ..довольно близки представителям рода<• Ргоекесот1сгоЪ1ит• (• гьа1еу , *

1973). 'л^;- V.-,; ; таблиц*

; Нуклеотидный состав ДНК втамиов^Зк»11а Ышоаа. */•'"•;>*

Соотношение. основаиийэ мол.% ' ноя.* 'Ы^.

".■ Г" . гц-

' шт.'2 31,6+0,40 33, ^±р,30. 18,^+0,22- . 64,8^Р,5 ; :

' .от. 5"' 32,4аР,35 33,810,21 17,3^0,25 16,5*0,50 66,210,51 •, .•

вт.10', ' 32,?+р,30 33,*1р,20 -Г7,%<0,35' 16,6^0,48 ■ 65,510,42 ' , \

,•' шт.15 31, 8+0; 50 33,510,22 17,810,20 16,9+0,37 65,310,52 ; '

Ме1& апоа атс1па' ю» ць«п1с а.

'. ' Таксономическое положение Ые«1алоаагс 1па а«Шап1са 'продолу жает оставаться неясным.' Проведенная ревизия сен I' Шсгосоосасвае - ; ■ -у '•. .; еве более усложняла-втот "вопрос (Сапа1е-Раго1а ©г' «1., 1967» 1970).

;..■Был о; предл ожено поместить этот микроорганизм в самостоятельное се-' ' ' "меЯство«е*ЬапоЬас*ег1асеаа . » Тем не менее отмечается (Яилияа, - / ' 1971; 1973), что метаносарцява имеет целый ряд общих черт физиоло- , . • •/•. ->гии и ультраструктурной организации с такими»группами микроорганиз-. . нов, кок бродящие 'сарцияы, микококки, сине-эелоные водоросли. Ыы : ■■ установили, что ДНК МеШ. тв№ап1са: . содержит 51,0 ¿ 0,5 мол.£ 111» ■,■ ; По' этому признаву метаносарцина ближе стоит к сине-зеленым водороо-' > ... ням^ С V ЗЪап1ег е* е1., 1971). У ¡- , . '' ^ ■ :■

' Пропиояовокислые кокки. . ■ '■'."

Нами был определен нуклеотидяый состав ДНК-грушщ пропионово-кислых.бактерий куда включена также я культура яропионововислых 1 ■..;'..' кокков, которую предложено рассматривать в качестве нового'вида~т v Propionlbacterium vaonielll ' (Воробьева, 19?3).ДНХ типичных про-' пионовых бактерий содержит 67,5-68,2 мол.^ ГЦ, а ДНК кокковых фори-63,4 мол.% ГЦ (табл. 5). Эти данные позволяют поддержать предложе- ' ние об отнесении кокковых фог« ( Prop, yatmlelii ) к роду Ргорющ

bacterium. - . 'i ■.

- ' Таблица № Р. Нуклеотидный состав ДНК группы пропаоновокислых бактерий

Вид • ; Содержащие в мов.% . : гц jicji.ss

: Г H - . A - T

1.РГОР. achermanil 33,910,4 34,3*0,3 I6,3±0,3 15,5x0,5 68,^0,5;

2,Frop. freudenrelcitli 33,0*0,6 34,4+0,4' 16,9*0,3 ' I5,7*p,4 67.4*0,6

З.Ргор., petersonll. ' 33,I±0,5 34,3*0,3 16,7*0,4 67,5±0,5

4.Prop. ■ rubrum 33,0+0,7 34,=>¿3,4 16,4*0,5 ■15,7+0,6 67,&t0,7

5.Prop. vanalelil 30,8±p,5 32;6ip,3 -18,8*0,4 17,8+0,4 63,4*0,5

P. Thiocapsa. -

Нами был определен нуклеотидный состав ДНК :нескольних штаммов Thiocapsa roseopersicina- BBS {БОгоров, 1974). ДНК этих микроор-"-ганизков относится к ГЦ-типу и содержит 66,3^66,9 мод.55 ГЦ.. .

л;: < -.¡у-'-y...-' \

' -wo-.. у у v i, '-'y.:; V:

■•••.. Светящиеся бактерии. . ■ ^ . ■ ■■. -у/у"-\У, .'j-у ■■'■>■ ■<

; v L .' : Таксономия дшивисцирующих бактьрий все евд слишком (спорна; и ' Я -., неопределенна. В эту сборную группу микроорганизмов часто попадай у ■ У; У ;бак!герии не имеющие генетического родства.('Hendrik et ai.,I970; ' • , . .Reichelt,Baumann, 1972, 1973). ■ : " У ■ ".У<-У'. ,;УУ' . у .-УЧУ'УУЧУУ'л V'iv^: Uu провели анализ нуклеотидного состава, характера метилиро- . • ,v " :.'.вапия и частоты встречаемости пиримидиновых блоков в ДНК ряда итам-; мов,светящихся бактерай, выделенных из вод Тихого океана» Для срав-.. .у./лу.;-.' 'нения avH параметры структуры ДНК изучены нами также у некоторых s ; .1 . типовых видов (ятаммов) фотобактерий. v - .'у>у,-уу ,■■.■■ ■уу,;* .•; • •

:'?„■-'■:-■ По ^составу ДНК всех: изученных л шинке цируедих бактерий отно- v-(У / сятся р АТ-типу, содержание ГЦ^пар в ких варьирует от 39,7*0,3 мол.^.'- у;-У 4* (шт.60) до 48,3±0,21мол.£ (шт. С) (табл. б) . Изученную, группу фото- У Z -' бактерий можно объединить по .этому признаку'на уровне такого таксо- '. -■,'< ' на как род ( Kandel, 1969). . ■ У о? "'у-.-; у у'У

Кроме обычных'оснований у светящихся бактерий в ДНК обнаружен • /. к^.-метиладенин, ,а S-метклцитозин выяглен не был. Количество н^-ме- у.,' v утиладенина в ДНК всех изученных видов и штаммов фотобактерий весьма. : -; близко (0,20-0,33 мол.%) (тобл. 6).. —'У У, ■:

■ УУ':Анализ частоты встречаемости-пиримидиновых блоков в ДНК ткпо- . ; • ; !вых видов светящихся бактерий и двух штаммов из исследованной кол- • ^ "•••' лехции (5а и 42) говорит о том, что характер распределения пирими-' , у у ; ' динов в ДНК Ph.mandapamensia,Pb.phosplioreum.'; - й_шт.'5а , 42,очень сходен и отличается от такового для ДНК Luc.harvei -,'. И - Vibrio '- fi-• У acheri у ■ (таблица К 7). у •• У ;■'.*•У /--"У','.у." ;У У'УууУУУ;

УЧУ Полученные нами данные о иуклеотидном.составе и степеш сбло-! •.••У. • ; ченяоети пиримидвяов в ДНК исследованной группы фотобактерий и со- . г . • поставление их с фенотиплческими характеристиками (Чумакова и др.", ;'.' '.-,>'

-ч.■

/ Ь ;'■■ Таблица'& 6; ■■'- л- • ;

• , Нуклеотидный. состав Д10Г группы светящихся бактерий ■Ч"".

К; штамма : Содарвоние Гц-пар . азамиа . Содержание ГЦ-пар-. - •. ;; V, -'. ■" . - У оснований /М0Л«#/ : ■■ :' ' ; оскований /иол.%/ '; ':'-■> ; > >

■Л:

■ \ 8 а

23 \ 17 '.1 13а

.: .62 ■

■'■";. 2 Г-'-'53 ' , 20. V • Л2: -.

46

.. ' С

44,3 ± 0,80 ' 44,7 + 0,10 ; 45,0 + 0,70 , . 45,2 + 1,60 ■ 45,3 1 1,25.-;

46,1 ± 0,81, ■ ■■■'. '46,8 * 0,24 47,0 * 0,65 7.47,2+0,21 ( .47,2* 0,27 : ' 48,2 + 0,21 ^

60 .8

7.26 7-::

' 5<Ч

. хз >'.

:,; 54 • ' 44

39,6 * 0,31' < 39;8 + 2,20 740,1 + 1,50 • • V 41,5 + 1,00 ' :: 42,2 * 0,70 • 42,8 +' 0,29 ч ' 43,5 * 0,45 . .

43.8 + 0,60 V

43.9 + 0,35 ' 7 • 44,1 + 0,35 (

:7л — чА';.^' 7 '.■'.' Темные; мутанты.■ ,

51 '7''"''' ь,ъ*1 ± °>58 . .:■ 44Г ' Л;. ■" 43,8 * 0,57'7гг7";г77'-:;.Г^И,'

- ;' • Вид ■ . '■' Содерзаййе ГЦ-лор Содержание м;шорных

.-:--..)■-■■■- ■ - V. оснований /молщ \ компонентов■ /мол.%/ : -

еь; рЬозрЬогеит '■■ 1 ,2,4 0,71 " Ь1дс1ЪвсЪег1.ит • 46,4 + 0,61

• 59,9 + 0,49 .

7 0,24 £0,06 ' -0,27 + 0,11 0,28 + 0,08 :

0,19 + 0,05т - ':.д-'-7.■'■

> 1972) указывает на то; что: группу штаммов ( 8,\23, 17, 13а*- 62, 2, ; . ' -53,' 20, '42, 4С, С ) рассматриваемой коллекции'1 нельзя отнести ни к >; 77: одному из существующих видов рода- гъо^оъас^епии их было предло-, ■7 ■;■.'-■'".' »ено'выделить в ■ самостоятельный: вид рь. Ъс1огег'ак11 -7 (Чумакова и др.,, ...■' 1972)Для того, чтобы уЗедитьоя в индивидуальном и особом харокто- . "-7- ре ДНК зтого7виданаыи был проведен .детальный анализ пи!'имидин0вых ' '

с---

'У,. -¿',

• • ♦ ' ' • с' '■ *

-- Таблица й 7. • Содержание пирадидиновых изоплит разной ддивд в ДНК ряда светяцкгся бактерий

Иэошгат' РЬо^о-■ ' зр.Сшт.5а)

ГИ.рЬоврЬо- рЬ.тагкЗара- РЬо1ю- 1Г1Ьг1о 1ио1Ъас^г11Ш

геид - вепв!а ЪаеЪех1ш Г1вс11ег1 Ьагтеу!

ар.(штЛ2) ■ :;■

I 11,53^,27 •Г-''.' 13,83^3,35 Ш . , 8,13^0,18 17 5,9210,34 У/ Ц53±р,2Г УХ- 3,14^0,17 2,8710,25

11,4^0,41 13,91^,28 ' 8,23^0,20 5,81^0,31 4,4^0,18 . 3,0^,26

3,20^,23;

П, 2110,25 13,99+0,19

8,3^0,43

\

■ 5,3&0,16 4,8310,20 . 2,9110,31

3,3^0,17

11,04^0, К

■

6,06+0.51 5,0710,19 3,3110,25 -3,3010,29^

11,62+0,19 14,5110,21 '9,25±р,34

4,6210,16 1,2510,32.

12,42+0,24 13,4^+0,18 9,0010,33

5,82+0,23

.:.. ,: ...

3,85+0,40 2»7^р,21,

3,7510,10- :

V .■/. Ч ■/' -'г к

4 - ' ■■. s.

".'.■'-.' Таблица ft 8. Содержание пиримидиновых сшигояуклеотидов разного соотава в ДНК Fhotobacterium штамм 5а и штамп 42-

Из отшиты

t.-!'

'"'i'

Состав Содержание олигоцуклеотидов

олягонуялао- мол.%

тидов ит. 5а ит. 42 -

СФ2

■И?

5,83 ± 0,01 5,61 ¿ 0,02

5,92 ± 0,02 5,12 ¿ 0,03

П ,

rV'V

МУ

У

J-,

«2Ф3 ,ЦГФ3

T2®3

%ф3 . Ü2TÍ4 ?2Ф4 T3*4

W

Ц3ТФ5

щн

'Т4®5 «5*6

W %Т2фб

AV

2,48 ± 0,01

7.13 ± 0,03. 4,22 +0,01

; i,oó ± 0,01

4,03 ± 0,04 2,01 ± 0,02 1,09 ± 0,03

0,14 ± 0,03 1,30 X 0,02

1,3§ ± 0,02 1,87 ± 0,03 0,69 ± 0.04

0,32,± 0,07 0,55 i 0,01

1.14 ± 0,04 ; 1,29 ± 0,05 0,69 ± 0,02 0,54 ± 0,03

2,42 ±0,04 6,79 ±0,01 3,se ±0,01

1,07 ± 0,03 4,42 ± 0,-04 2,57 ± 0,03 1,14 ± 0,01

0,30 ± 0,02 0,53 ± 0,03

1,90 ± 0,01 .2,15 ± 0,04 1,18 ± 0,05

'0,36.¿ 0,04 0,В2 ± 0,02 1,06 ± 0,03 1,25 ± 0,01 1,00 ± 0,04 0,55 ± 0,06

--г-,;-'

Г ч блоков, отличающихся не: только по длине, во и.по составу. При атом .".V ' 'V / выявлены строгие,.достоверные различия в организации:генома унтам-^„У; мов 42 и 5а (табл. 8). Это свидетельствует в пользу представления V -о том, что изученные микроорганизмы образуют новый вид РЬо-ЬоЪасЪег1шп

.','?... Р н в 0 Д Н • / ''Л

-ч I. I. Изучена частота встречаемости пиримидиновых блоков разной г:-.;;!1-,\ ; ДЛИНЫ В ДНК ВИДОВ И ШТаММОВ МИКРООРГАНИЗМОВ, ОТНОСЯЩИХ- " • ; . = ' , " ■ сяк 25 родам."' ^ ■' "ч-'-"ч 'у-^у'-^-.:

г'ч ч"ч-..' '.'■: 2» Установлено, что характер распределения пиримидипов в ДНК - . ч •^Д:» бактерий'отличается от случайного;'У. всех'изученных видов ^¿к*

' -'Количество дипиримидиновых фрагментов в ДНК преобладает "у".. ч. Уч-:, над монопиримидизовыии или очень сходно. ч ; '-.У У" ... . З.'Все изученные бактерии обладают более низкой степенью " • ' : " л", уч*-'у Г/ сблочеппости сиримидинов в ДНК, чем высшие растения и ' - уч. --УУч л " животные. Более половины пиримидинов в бактериальных ДНК У'-У.: . '■ сосредоточено во фракциях моно- и дипирнмидинов. Указатель у

; сблоченностн (величина £ ) варьирует для ДНК изученных ; - уЙЙу"' '^■Ч'-'-'чбактерий от 1,86 до 3,27. Все.это позволяет говорить о су-' ; ; шествовании некоей особой специфической организации нутаео-' V -У

* ' ч; ^ тидной-последовательности ДНК.прокариотического типа. ч Д-'^У^О-у • Уу . п. Исследовано .содержание минорных оснований в ДНК 28 видов • Ч ' ¡ Ч • микроорганизмов, относящихся к. самым. различным системам-

ческим группам* В'ДНК многих.бактерий обнаружены 5-метил- у/ цитозиа и н 6-метидаденнн. Наличие, природа я количественное содержание минорных оснований в ДНК микроорганизмов ч-- ':: • может. служить важный таксономическим критерием»

Ч ■ ■ ■ ■,

У V ■

'¡л л Д ' \\ \ • '22:'" у у..'. '■*" Лу. у '••', -уС'

'. " Ш.Я.Изучея нукдеотидный состав ДНК у. вновь выделенных штаммов, :\у; ^уг^УУ-- У увидов и малоизученных групп микроорганизмов ( р." Liateria, • ....• • • У У/ у p.stella, p.Methainoaarcina, p.Froplönlbacterlwi, "p.Thlocep- >;У.-",' ' • 'у sa,p» Photobacterium.) с цель» идентификации>и специального . ^ Ж;;' решения вопросов о систематическом подоженивэтих бактерий.

а) Показано, что ДНК 9 штаммов p.Lieterie относятся к • ;

- •; АТ-типу я ооДержалие ГЦ пар в них варьирует от 38,9. у . Ciy^

- ¿iyV |f •. до 43,5 мол.*. У /у-.У у ■ V ■ - Д; Ц :..у;, у Л"-;у <у' У,О' : •.' ' <У у. у б) ДНК проотекатных бактерий вновь выделенных форм . • ч Д.- ;.':'<УЛ. ''.•''.<•:• Stella humosa содержа* 64,8-66^2 мол.% ГЦ. . у.', '

.'•у ' . . ; . . в) Methanoaarotna metoianlca' : обладает ДНК с 8квимоля1Н *, • • .. ^у-УПУу^Д-"у ,у; ' ным содержанием оснований 51,0 мол.% ГЦ и по этому ' • « У /У У признаку близка сине-зеленым водорослям. . ;: у- ;. у. -лл.-^Кч^ /¡'.' "'У '. 2. Установлено, что по нуклеотидному составу, характеру ме-

! тилирования, частот/) встречаемости пирвмиджнових блоков •. ' . ' •• * .:•; ' у в ДНК, группа изученных жтаммо® светящихся бактерий (8,. 23,.-'

Ш, €2, 2,' 53, 20j 42, 46, С; четко обособлена от всех у . у У." ~ других фотобактерий. Это свидетельствует в пользу представ-'-', \ ;'. ' ' ; ления.о том, что изученные микроорганизмы образуют новый •

iyf^yyу* вид?- Photobacteriua b*lo«erakli. -у У ■ У; -..У- уУ-УУ .ууДУ.;у

г'::;У ■•''•' Материал» ™ таив диссертации ошгбликовада

■>■.- -У ■'■:■'■ ■■' - • в сдеагпмшх 'работах ■-..";.:.■ у Уу-"-;. .■>■■'";''Ч.-^/у У^-. " • • • Александрушкина Н.И. Особенности первичной структуры'бамесп-.' у' .

"'У . ; ./ У альта ДНК (пяримидиновые блоки и нуклеотид-,yv, ; у Д У ' ' . ; иый состав). Тезисы.си*позиума:"(йруктура иУ/У«Ууу-Д' "У'7*' функции нуклеиновых виол от ж куклеопротэидов",

■ r-.-.-J '

Л .у-

.'s: k».

г^'-' ' ' ■■■ О-'V ' /24 ' ■"■■V V" :'!Г-'

Иноков А.Х., Алексапдрувкина Н.И.,'Ваншин'Б.Ф. Нуклеотидный ; .■■ -' . *'■■ состав-ДНК листерий.Ж.ишсробиол., эпидемиои.. ■

и иымунол., .12, 127-151, 1974. :„:

- Хилина Т.Н., Александрущеина Н.И. К таксономии метаносарцинн.

' _ Кикробиология, 4 , 726-728, 1974. , ' .> Иазин ¿.Д., Аленсандрушкина Н.И.,. Ванюшин Б.ф. Нуклеотидный ~ состав и пиримидиновые олигонуклеотиды в ДНК1 иикроорганизмов• В1ооге. СЬепи , 1975, 2. '

' '■'■ И доложены на Международной симпозиуме' "Структура и функции --; ; - - нуклеиновых кислот и нуклеопротеидов°, посвященном памяти ■ : г. академика А.Н. Белозерского. • ; - ■ .

' - ' 'I . - Л "- ..." : '

ПОЯ П. К ПЕЧАТИ 5/Х1-74 Г. ФОРМАТ 60x00/13 ФИЭ.ПЛ. 1.5. УЧ.-^ЗПЛ. 1,0. ЗАКАЗ 2120. ТИР, 200

.ОТПЕЧАТАНО НА РОТАПРИНТАХ В ТИП. ИЗД. МГУ МОСКВА, ЛЕНГОРЫ '

■;.'■• ■ . • ■ ■ \