Бесплатный автореферат и диссертация по биологии на тему
Молекулярно-генетические особенности семейного аденоматозного полипоза
ВАК РФ 03.00.15, Генетика
Содержание диссертации, кандидата медицинских наук, Музаффарова, Татьяна Александровна
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ.
ВВЕДЕНИЕ.
ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.
1. Семейный аденоматозный полипоз (САП).
2. Структура гена АРС.
3. Функции гена АРС.
3.1.Ген АРС — супрессор опухолевого роста.
3.2. Функция гена АРС в Wnt-nymu.
3.3.Влияние белка АРС на клеточную миграцию и адгезию.
3.4.Мутации в гене АРС и хромосомная нестабильность.
4. Структура белка АРС.
5. Терминальные мутации в гене АРС.
5.1 .Номенклатура мутаций.
5.2. Спектр герминальных мутаций в гене АРС.
5.3.Происхождение мутаций в гене АРС.
6. Анализ гаплотипов гена АРС.
7. Связь генотипа с фенотипическими проявлениями САП.
8. САП без мутаций в гене АРС.
9. АРС миссенс-варианты.
МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ.
1. Пациенты.
2. Анализ первичной структуры гена АРС и гена MYH.
2.1. Выделение ДНК.
2.2. ПЦР (полимеразная цепная реакция).
2.3. Оценка качества ПЦР.
2.4. Образование гетеродуплексных фрагментов ДНК.
2.5. Электрофорез.
2.6. Окраска геля.
2.7. Секвенирование.
2.8. Анализ гаплотипов гена АРС.
3. Статистическая обработка результатов.
РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ.
1. Выявление особенностей первичной структуры ДНК в гене АРС.
2. Спектр и характеристики мутаций в гене АРС при САП.
2.1. Типы мутаций в гене АРС.
2.2. Распределение мутаций по гену АРС.
2.3. Новые мутации в гене АРС.
2.4. Повторяющиеся мутации в гене АРС.
2.5. Миссенс-мутации в гене АРС.
3. Генетическая и фенотипическая гетерогенность САП.
4. Однонуклеотидные полиморфизмы (ОНП) в гене АРС.
4.1.0НП в гене АРС в контрольной выборке.
4.2. ОНИ в гене АРС при повторяющихся мутациях
1061del5 и 1309del5.
4.3. ОНП в гене АРС при САП с отсутствием мутаций в этом гене.
5. Исследование вариантов гена MYH у пациентов с САП без мутаций в гене АРС.
6. ДНК-диагностика САП.
ВЫВОДЫ.
Введение Диссертация по биологии, на тему "Молекулярно-генетические особенности семейного аденоматозного полипоза"
Ежегодно в мире регистрируют около 800 ООО больных раком толстой кишки (РТК, или колоректальный рак) и 440 ООО случаев смерти от него. В США и Канаде 1 из 18 родившихся на протяжении жизни заболевает РТК [Narayan S., Roy D., 2003]. В России в 2000 году выявили более 47 000 новых случаев РТК, что на 23% превысило число заболевших в 1990 году. Среди онкологических заболеваний РТК занимает примерно 10% [Аксель Е.М., Давыдов М.И., 2002]. На рис.1 показана доля РТК в структуре онкозаболеваний в России. В США количество новых случаев примерно в два раза выше [Narayan S., Roy D., 2003], но в расчете на душу населения число новых заболеваний близко к наблюдаемому в России.
Одним из основных наследственных синдромов, связанным с РТК, является семейный аденоматозный полипоз (САП). Анализ сцепления в семьях с САП привел к картированию гена АРС (Adenomatous Polyposis Coli) в участке 5q21 [Herrera L et al.,1986; Bodmer W.F. et al., 1987]. Затем ген был клонирован и охарактеризован [Groden J. et al., 1991]. Наибольшая доля случаев семейного аденоматозного полипоза толстой кишки связана с мутациями в гене АРС. Мутации данного гена приводят почти к 100% риску возникновения заболевания. За прошедший после выделения гена период накоплена значительная информация о наследуемых мутациях в гене АРС. Известно, в частности, что мутации распределены по всему гену. мсгто'+ол * е- те з гчмсйлас ^соы год *е ЧУДО1*« и железа
Я» 25 30
Рис, 1. Структура заболеваемости населения России злокачественными новообразованиями в 2000 году (%). [Аксель Е.М., Давыдов М.И., 2002]
Определение спектра мутаций в различных популяциях важно как с точки зрения фундаментальных знаний об особенностях мутационного процесса в разных популяциях, так и для решения практических задач медицинской генетики. Изучение характеристик мутаций на выборках из разных популяций позволит получить фундаментальную информацию по возникновению и распространению мутаций, их связи с клиническими проявлениями в составе разных генотипов. Требуют исследования характеристики и молекулярные механизмы происхождения так называемых «новых» мутаций, в значительном числе обнаруживаемых в различных популяциях.
Проявления семейного аденоматозного полипоза в разных семьях гетерогенны по тяжести заболевания, распространенности процесса, возрасту начала заболевания. Изучение вариантов структуры гена АРС в связи с генетическими и клиническими характеристиками САП может дать новую информацию о взаимосвязи генотип-фенотип. Помимо мутаций в гене АРС обнаруживают ряд полиморфизмов. В ряде работ представлена информация по полиморфизмам в этом гене, но их анализ при САП пока нельзя признать достаточным. Роль основного числа миссенс-мутаций и однонуклеотидных полиморфизмов (ОНП) в гене АРС в возникновении и модификации проявлений САП и РТК не исследована. Между тем, такие варианты, возможно в качестве аллелей низкой пенетрантности, могут внести заметный вклад в понимание генетических оснований возникновения рассматриваемого заболевания. Немногочисленные пока данные по анализу гаплотипов по ОНП при повторяющихся мутациях в гене АРС не дают возможности для прояснения роли эффекта основателя в их распространении. В рассматриваемом направлении необходимы дальнейшие исследования, расширяющие объем данных и охватывающие больший круг различных популяций.
САП в некоторых семьях не сцеплен с локусом 5q21. Недавно было обнаружено, что часть заболеваний САП обусловлена мутациями в гене MYH (MutY homologue) [Al-Tassan N., 2002]. Однако к настоящему времени имеется мало данных об особенностях вариаций первичной структуры в данном гене при САП и РТК. Их расширение, особенно для разных популяций, необходимо.
С учетом склонности семейного аденоматоза к развитию рака толстой кишки, чрезвычайно важна ранняя диагностика заболевания у пациентов и членов их семей, позволяющая вести за больными регулярное динамическое наблюдение и предпринимать лечебные мероприятия до возникновения озлокачествления полипов [Кузьминов и др., 2004]. Запоздалая клиническая диагностика во многих случаях этого онкологического заболевания обусловливает существенное сокращение продолжительности жизни, несмотря на лечение. Выявление мутаций в генах АРС и MYH обеспечивает объективный критерий для формирования групп риска САП с целью его профилактики и своевременной диагностики в случае возникновения заболевания.
В связи со сказанным, целью настоящей работы было исследование молекулярно-генетических особенностей семейного аденоматозного полипоза, основанное на анализе изменений первичной структуры генов АРС иМУН.
Были поставлены следующие задачи:
• изучить спектр мутаций в гене АРС при семейном аденоматозном полипозе;
• изучить однонуклеотидные полиморфизмы в гене АРС при семейном аденоматозном полипозе и в контрольной выборке;
• проанализировать связь вариаций в гене АРС с генетическими и клиническими характеристиками семей при САП;
• исследовать мутации в гене MYH среди больных САП при отсутствии мутаций в гене АРС.
Научно-практическая значимость работы.
Научно-практическая значимость результатов настоящей работы обусловлена выявлением спектра и характеристик мутаций в генах АРС и MYH при семейном аденоматозном полипозе на российской выборке больных. Выявленная доля (около 30%) двух мутаций в спектре имеет существенное значение для практической ДНК-диагностики САП. Разработан оптимизированный способ обнаружения мутаций в гене АРС. Способ был применен для выявления мутаций в семьях с САП.
Новизна полученных результатов.
Впервые выявлен спектр мутаций в генах АРС и MYH на выборке больных САП в России. Показано, что частота мутаций 1061del5, 1309del5 составляет около трети в спектре мутаций в гене АРС. Преимущественная связь этих мутаций с определенным гаплотипом указывает на возможную роль эффекта основателя в их распространении. Обнаружено 18 новых мутаций в гене АРС и одна в гене MYH. Впервые выявлены структурные особенности новых делеций в гене АРС, которые, как показано в работе, присущи выборкам больных из ряда популяций. Среди больных САП без мутаций в гене АРС по генетическим признакам выделены две подгруппы. Показано фенотипическое и генотипическое различие указанных подгрупп. При анализе ОНП в гене АРС без мутаций в данном гене выявлены варианты этого гена, ассоциированные с САП.
Положения, выносимые на защиту.
Выявлены спектр и характеристики мутаций в гене АРС при САП. Новые мутации составили около половины от всех мутаций. 90% новых делеций в выборке связаны с потерей 1 -2 нуклеотидов, тогда как все обнаруженные известные делеции обусловлены потерей 4 или 5 нуклеотидов (Р = 0,0008).
Показана статистически значимая ассоциация повторяющихся мутаций 1061del5 и 1309del5 с ближайшим к ним полиморфизмом, что указывает на возможную роль эффекта основателя в их распространении.
Выделенная среди больных САП без мутаций в гене АРС подгруппа пробандов, имеющих в семье не более одного больного родственника, отличается по фенотипическим и генотипическим признакам от остальных больных в выборке, имеющих и не имеющих мутации в гене АРС.
Среди больных САП без мутаций в гене АРС обнаружена биаллельная мутация Y165C в гене MYH и три гетерозиготные мутации.
ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.
Заключение Диссертация по теме "Генетика", Музаффарова, Татьяна Александровна
выводы.
1. Среди 65 пробандов с САП мутации в гене АРС выявлены у 37 больных (57%). Выявленные мутации распределены практически по всему гену: между кодонами 232 - 2621. Основную долю мутаций в гене АРС (90%) составили мутации, приводящие к укорачиванию кодируемого геном белка. Среди мутаций преобладают делеции 1-5 нуклеотидов (65%). Точковые замены (30% в спектре) преимущественно обусловлены изменением нуклеотида С на Т (46%).
2. Обнаружено 18 новых мутаций (49% от всех мутаций). Среди новых мутаций, как и во всем спектре, преобладают делеции (55%). 90% новых делеций в нашей выборке связаны с потерей 1 -2 нуклеотидов, тогда как все известные делеции, обнаруженные нами, обусловлены потерей 4 или 5 нуклеотидов (Р = 0,0008). Выявлено, что найденное различие характеристик делеций в гене АРС между уникальными и повторяющимися мутациями присуще выборкам больных из ряда, но не всех, популяций. Новые миссенс-мутации T1556S, P1780S и Т2160А, обнаруженные у пациентов с САП, не были выявлены в контрольной выборке из 89 индивидуумов. Полученные данные свидетельствуют в пользу патогенного значения новых миссенс-мутаций.
3. Выявлена статистически значимая ассоциация повторяющихся мутаций 1061del5 и 1309del5 с ближайшим к ним полиморфизмом (OR=3,95,
Р=0,047). Полученный результат и анализ встречаемости мутаций 1061 del5 и 1309del5 в выборках больных из других популяций указывают в пользу определенной роли эффекта основателя в значениях частот указанных мутаций.
4. Выборки больных САП с мутациями и без мутаций в гене АРС имеют фенотипические различия в проявлении заболевания. Указанные выборки больных различаются по дисперсии возраста возникновения САП (F=3,24; Р=0,003). Среди больных САП без мутаций в гене АРС выше частота встречаемости аттенуированной формы (OR=5,l; Р=0,041).
5. Среди больных САП без мутаций в гене АРС выделена подгруппа пробандов, имеющих в семье не более одного больного родственника. В выделенной подгруппе частота встречаемости аттенуированного САП существенно превосходит таковую как среди больных с мутациями в гене АРС (OR=10,9; Р=0,007), так и среди больных без мутаций в гене АРС и с более чем одним больным САП родственником (OR=9,0; Р=0,037). Средний возраст заболевания в подгруппе на 50% выше по сравнению со средним возрастом возникновения САП среди остальных больных в выборке, имеющих и не имеющих мутации в гене АРС.
6. Однонуклеотидные полиморфизмы в 11, 13 и 15 экзонах гена АРС и в нетранслируемом 3'-конце гена преимущественно находятся в составе двух гаплотипов, обозначенных как Аа и Вв. Образуемые ими генотипы составляют около 75% всех генотипов. Следующий по частоте генотип
112
15%) включает гаплотип Ав. Частота генотипов, включающих этот гаплотип, в рассматриваемой подгруппе повышена по сравнению с контролем (OR = 4,9; Р = 0,015).
7. Больные САП без мутаций в гене АРС (28 человек) исследованы на наличие мутаций в гене MYH. Биаллельная мутация Y165C в гене MYH выявлена у одного больного (3,6%). Трое больных имели гетерозиготные мутации в указанном гене.
Библиография Диссертация по биологии, кандидата медицинских наук, Музаффарова, Татьяна Александровна, Москва
1. Музаффарова Т.А., Поспехова Н.И., Сачков И.Ю., Кузьминов A.M.,
2. Гинтер Е.К., Карпухин А.В. Новые мутации в гене АРС при семейномаденоматозном полипозе: обнаружение, характеристика и анализ//
3. Бюлл. Эксп. Биол. Мед. -2005. -Т.139.-С.334-336.
4. Ahmed Y., Hayashi S., Levine A. & Wieschaus E. Regulation of armadilloby a Drosophila APC inhibits neuronal apoptosis during retinaldevelopment//Cell. 1998.-V.93.-P. 1171 -1182.
5. Al-Tassan N., Chmiel N.H., Maynard J., et al. Inherited variants of MYHassociated with somatic G:C~»T:A mutations in colorectal tumors//Nat.
6. Genet. 2002. - V.30. - P.227-32.
7. Ames B.N., Gold L.S. Endogenous mutagens and the causes of aging and cancer// Mutat. Res. 1991. - V.250. - P.3-16.
8. Aretz S., Uhlhaas S., Caspari R., et al. Frequency and parental origin of de novo APC mutations in familial adenomatous polyposis// Eur. J. Hum.Gen. -2003. V.12, №1. - P.52-58.
9. Aretz S., Uhlhaas S., Sun Y., et al. Familial adenomatous polyposis: aberrant splising due to missense or silent mutations in the APC gene// Human mutation. 2004. - V.24. - P.370-380.
10. Beaudet A.L., Tsui L.C. A suggested nomenclature for designating mutations// Hum. Mutat. 1993. - V.2. - P.245-248.
11. Behrens J. Cadherins and catenins: role in signal transduction and tumor progression// Cancer Metastasis Rev. 1999. - V. 18. - P. 15-30.
12. Beinz M., and Clevers H. Linking colorectal cancer to Wnt signaling// Cell. -2000.-V.103.-P.311-320.
13. Beroud C, Soussi T. APC gene: Database of germline and somatic mutations in human tumors and cell lines//Nucleic Acids Res.- 1996. V.24. - P. 121124.
14. Bertario L., Russo A., Sala P., et al. Multiple approach to the exploration of genotype phenotype correlations in familial adenomatous polyposis// J. Clin. Oncol. - 2003. - V.21, №9. - P. 1698-1707.
15. Birchmeier W. & Behrens J. Cadherin expression in carcinomas: role in the formation of cell junctions and the prevention of invasiveness// Biochim. Biophys. Acta. 1994. - V. 1198. - P. 11 -26.
16. Bisgaard M.L., Fenger K., Bulow S., Niebuhr E., and Mohr J. Familialadenomatous polyposis (FAP): frequency, penetrance, and mutation rate//
17. Hum. Mutât.- 1994.- V3. P.121-125.
18. Bisgaard M.L., Ripa R., Knudsen A.L., Biilow S. Familial adenomatous polyposis patients without an identified APC germline mutation have a severe phenotype// Gut. 2004. - V.53. - P.266-270.
19. Bishop D.T., Thomas H.J.W. The genetics of colorectal cancer// Cancer Surveys. 1990. - V.4. - P.585-604.
20. Boardman L., Schmidt S., Lindor N., et al. A search for germline APC mutations in early onset colorectal cancer or familial colorectal cancer with normal DNA mismatch repair// Genes, Chromosomes & Cancer. 2001. -V.30.-P.181-186.
21. Bodmer W. Familial adenomatous polyposis (FAP) and its gene, APC// Cytogenet. Cell Genet. 1999. - V.86. - P.99-104.
22. Bodmer W.F., et al. Localization of the gene for familial adenomatous polyposis on chromosome 5// Nature. 1987. - V.328. - P.614-616.
23. Cadigan K.M., and Nusse R. Wnt signalling: a common theme in animal development// Genes Dev. 1997. - V.77. - P.3286-3305.
24. Cao X., Eu K.W., Seow-Choen F., Zao Y., Cheah P.Y. APC mutation and phenotypic spectrum of Singapore familial adenomatous polyposis patients// Eur. J. Hum. Genet. 2000. - V.8, №1. - P.42-8.
25. Cartegni L., Chew S., Krainer A. Listening to silence and understanding nonsense: exonic mutations that affect splicing// Nat. Rev. Genet. 2002. -V.3. - P.285-298.
26. Caspari R., et al. Familial adenomatous polyposis: desmoid tumours and116lack of ophthalmic lesions (CHRPE) associated with APC mutations beyond codon 1444// Hum. Mol. Genet. -1995. V.4. - P.337-340.
27. Crabtree M.D., Fletcher C., Churchman M., et al. Analysis of candidate modifier loci for the severity of colonic familial adenomatous polyposis, with evidence for the importance of the N-acetyl transferases// Gut. — 2004. V.53. - P.271-276.
28. Crawford H.C., Fingleton B.M., Rudolph-Owen L.A., Goss K.J., Rubinfeld B., Polakis P. The metalloproteinase matrilysin is a target of p-catenin transactivation in intestinal tumors// Oncogene. 1999. - V.18. - P.2883-2891.
29. Croner R.S., Brueckl W.M., Reingruber B., Hohenberger W., Guenther K. Age and manifestation related symptoms in familial adenomatous polyposis// BMC Cancer. 2005. - V.5. - P.24.
30. Croitoru M.E., Cleary S.P., Di Nicola N., et al., Association between biallelic and monoallelic germline MYH gene mutations and colorectal cancer risk// J. Nat. Cancer Inst. 2004.- V.96. -P. 1631 -1634.
31. Cruz-Bustillo Clarens D. Molecular genetics of colorectal cancer// Rev.Esp.Enferm.Dig (Madrid). 2004. - V.96,№1. - P.48-59.
32. Dale T.C. Signal transduction by the Wnt family of ligands// Biochem. J. -1998. V.329. — P.209-223.
33. Dobbie Z., et al. Mutational analysis of the first 14 exons of the adenomatous polyposis coli (APC) gene// Eur. J. Cancer. 1994. - V.30A. -P. 1709-1713.
34. Eccles D.M., et al. An unusually severe phenotype for familial adenomatous polyposis//Arch. Dis. Child. 1997. - V.77. - P.431-35.
35. Enholm S., Hienonen T., Suomalainen A. et al. Proportion and phenotype of MYH-associated colorectal neoplasia in a population-based series of Finnish colorectal cancer patients// American Journal of Pathology. 2003. -V.163,№3.-P.827-832.
36. Fearnhead N.S., Britton M.P. and Bodmer W.F. The ABC of APC// Human Molecular Genetics. 2001. - V.10,№7. - P.721-733.
37. Fjdde R., Kuipers J., Rosenberg C., et al. Mutation in the APC tumor suppressor gene cause chromosomal instability// Nat. Cell Biol. 2001. -V.3. - P.433-438.
38. Fodde R., Kuipers J., Rosenberg C., et al. Mutations in the APC tumour suppressor gene cause chromosomal instability// Nat. Cell Biol. 2001. -V.3.-P.433-438.
39. Frayling I.M., et al.The APC variants I1307K and E1317Q are associated with colorectal tumors, but not always with a family history// Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1998. - V.95.-P. 10722-10727.
40. Friedl W., Caspari R., Sengteller M., et al. Can APC mutation analysis contribute to therapeutic decisions in familial adenomatous polyposis? Experience from 680 FAP families// Gut. 2001. - V.48. - P.515-521.
41. Friedl W., et al. Attenuated familial adenomatous polyposis due to a mutation in the 3' part of the APC gene. A clue for understanding thefunction of the APC protein// Hum. Genet. 1996. - V.97. - P.579-584.
42. Gavert N., Yaron Y., Naiman T., et al. Molecular analysis of the APC gene in 71 Israeli families: 17 novel mutations// Hum. Mut. Mutation in Brief. Online. 2002. - V.508. - P. 1-7.
43. Giardiello F.M., et al. Hepatoblastoma and APC gene mutation in familial adenomatous polyposis// Gut. 1996. - V.39. - P.867-869.
44. Giardiello F.M., Krush A.J., Petersen G.M., et al. Phenotypic variability of familial adenomatous polyposis in 11 unrelated families with identical APC gene mutation// Gastroenterology. 1994. - V. 106.- P. 1542-1547.
45. Gismondi V., Meta M., Bonelli L. et al. Prevalence of the Y165C, G382Dand 1395delGGA germline mutations with adenomatous polyposis coli and colorectal adenomas// Int. J. Cancer. 2004. - V.109,№5. - P.680-4.
46. Grobelaar J.J. Screening South African familial adenomatous polyposis families for the 5 nucleotide deletion at codon 1309 of the APC gene// Mol. Cell Probes. 1995. - V.9. - P.49-51.
47. Groden J., et al. Identification and characterization of the familial adenomatous polyposis coli gene// Cell. 1991. - V.66. - P.589-600.
48. Groden J., Joslyn G., Samowitz W., et al. Response of colon cancer cell lines to the introduction of APC a colon specific tumor suppressor gene// Cancer Res. 1995. - V.55. - P. 1531-9.
49. Hamada F., et al. Identification and characterization of E-APC, a novel Drosophila homologue of the tumour suppressor APC// Genes Cells. 1999. - V.4. — P.465-74.
50. Hamilton S.R., et al. The molecular basis of Turcot's syndrome// N. Engl. J. Med. 1995. - V.332. - P.839-847.
51. Hayashi S., et al. A Drosophila homolog of the tumor suppressor gene adenomatous polyposis coli down-regulates P-catenin but its zygotic expression is not essential for the regulation of Armadillo// Proc. Natl.Acad. Sci. USA. 1997-V.94.-P. 242-247.
52. He T.C., Sparks A.B., Rago C., et al. Identification of c-MYC as a target of the APC pathway//Science.- 1998.-V. 281. -P. 1509-1512.
53. Heighway J., Hoban P.R. and Wyllie A.H. Sspl polymorphism in sequenceencoding 3' untranslated region of the APC gene// Nucleic Acids Research.- 1991. V. 19, №24. - P.6966.
54. Heinimann K., Miillhaupt B., Weber W., et al. Phenotypic differences in familial ademomatous polyposis based on APC gene mutation status// Gut. -1998. — V.43. P.675-679.
55. Heinimann K.,Thompson A., Locher A., et al. Nontruncating APC germ-line mutations and mismatch repair deficiency play a minor role in APC mutation-negative polyposis// Cancer Research. 2001. - V.61. - P.7616-7622.
56. Henderson B. R. Nuclear-cytoplasmic shuttling of APC regulates P-catenin subcellular localization and turnover// Nature Cell Biol. 2000. - V.2.1. P.653-660.
57. Herrera L., Kakati S., Gibas L., Pietrzak E., and Sandberg A.A. Gardner syndrome in a man with an interstitial deletion of 5q// Am. J. Med.Genet. -1986. -V.25. P.473-476.
58. Hodgson S.V., Fagg N.R.L., Talbot I.C., Wilconson M. Deletions of the entire APC gene are associated with sessile colonic polyps// J. Med. Genet.- 1994.-V.31.-P.426.
59. Horii A., Nakatsuru S., Ichii S., Nagase H., and Nakamura Y. Multiple forms of the APC gene transcripts and their tissue-specific expression// Hum. Mol. Genet. 1993. - V.2. - P. 283-287.
60. Houlston R., Crabtree, M., Philips, R., et al. Explaining differences in theseverity of familial adenomatous polyposis and the search for modifiergenes// Gut. 2001.-V.48.-P.1-5.121
61. Hutter P.,Rey-Berthod C., Chappuis P.O., et al. Molecular and clinical characteristics in 32 families affected with familial adenomatous polyposis// Hum. Mutat. 2001. - V. 18, №.6 - P.550.
62. Ichii S., et al. Detailed analysis of genetic alterations in colorectal tumors from patients with and without familial adenomatous polyposis (FAP)// Oncogene 1993. - V.8. - P.2399-2405.
63. Ishidate T., Matsumine A., Toyoshima K., Akiyama T. The APC-hDLG complex negatively regulates cell cycle progression from the G0/G1 to S phase// Oncogene. 2000. - V.19, №3. - P.365-72.
64. Isidro G., Laranjeira F., Pires A., et al. Germline MUTYH (MYH) mutations in Portuguese individuals with multiple colorectal adenomas// Hum. Mut. Mutation in Brief. Online. 2004. - V.753. - P. 1-7.
65. Isidro G., Matos P., Almeida S. et al. Eleven novel APC mutations identified in Portuguese FAP families// Hum. Mut. Mutation in Brief. Online. 2000. -V.350.-P.1-3.
66. Jagelman D.G. Choise of operation in familial adenomatous polyposis// World J. Surg. 1991. - V. 15. - P.47-49.
67. Jaiswal A.S., Narayan S. P53-dependent transcriptional regulation of the
68. APC promoter in colon cancer cells treated with DNA-alkylating agents// J. Biol. Chem. -2001.- V.276. P. 18193-18199.
69. Jones S., Emmerson P., Maynard J., et al. Biallelic germline mutations in MYH predispose to multiple colorectal adenoma and somatic G:C-»T:A mutations// Hum. Mol. Genet. 2002. - V.l 1. - P. 2961-7.
70. Jones S., Emmerson P., Maynard J., et al. Biallelic germline mutations in MYH predispose to multiple colorectal adenoma and somatic G:C-T:A mutations// Hum. Mol. Genet. 2002. - V.l 1. - P.2961-67.
71. Juwana J.P, et al. EB/RP gene family encodes tubulin binding proteins// Int. J. Cancer. 1999. - V.81. - P.275-284.
72. Kaplan K.B., Burds A.A., Swedlow J.R., Bekir S.S., Sorger P.K., Nathke I.S. A role for the Adenomatous Polyposis Coli protein in chromosome segregation// Nat. Cell Biol. 2001. - V.3. - P.429-432.
73. Kairupan C.F., Meldrum C.J., Crooks R. et al. Mutation analysis of the MYH gene in an Australian series of colorectal polyposis patients with or without germline APC mutations//Int. J. Cancer. 2005. - V. 116, №1. -P.73-7.
74. Kawasaki Y., et al. Asef, a link between the tumor suppressor APC and G-protein signaling// Science. 2000. - V.289. - P. 1194-1197.
75. Kinzler K. W. & Vogelstein B. Lessons from hereditary colorectal cancer// Cell.-1996.- V.87. -P.159-170.
76. Kinzler K.V. and Vogelstein B. Cancer susceptibility genes. Gatekeepersand caretakers. //Nature. 1997. - V. 386. - P. 761-763.
77. Kishida S., et al. DIX domains of Dvl and axin are necessary for protein interactions and their ability to regulate beta-catenin stability// Mol.Cell. Biol. 1999. - V.19. -P.4414-4422.
78. Knudson A.G. Mutation and cancer. Statistical study of retinoblastoma// Proc. Natl. Acad. Sei. USA. 1971.- V.68. - P.820-3.
79. Laird P. W., et al. Suppression of intestinal neoplasia by DNA hypomethylation// Cell. 1995. - V.81.-P.197-205.
80. Laken S.J., Papadopoulos N., Petersen G.M., et al. Analysis of masked mutations in familial adenomatous polyposis// Proc. Natl. Acad. Sei. USA. -1999. V.9, №6. - P.2322-6.
81. Laken S.J., Petersen G.M., Gruber S.B., et al. Familial colorectal cancer in Ashkenazim due to a hypermutable tract in APC// Nat. Genet. 1997. -V.17. - P.79-83.
82. Lai G. and Gallinger S. Familial adenomatous polyposis// Seminars in Surgical Oncology. 2000. - V.18. - P.314-323.
83. Lamlum H., et al. Germline APC variants in patients with multiple colorectal adenomas, with evidence for the particular importance of E1317Q In Process Citation.// Hum. Mol. Genet. 2000. - V.9. - P.2215-2221.
84. Lamlum H., et al.The type of somatic mutation at APC in familial adenomatous polyposis is determined by the site of the germline mutation: a new facet to Knudson's 'two-hit' hypothesis// Nature Med. 1999. - V.5. -P.1071-1075.
85. Laurent-Puig P., Beroud C., and Soussi T. APC gene: database of germlineand somatic mutations in human tumors and cell lines// Nucleic Acids Research. 1998. - V.26,№1. - P.269-270.
86. Liu X., Shan X., Friedl W., Uhlhaas S., Propping P., Wang Y. Analysis of germline mutations in the APC gene in familial adenomatous polyposis patients// Zhonghua Yi Xue Yi Chuan Xue Za Zhi. 2005. - V.22, №3. -P.261-4.
87. MacFee M., Chepenik K.P., Liddell R.A., et al. The secretory phospholipase A2 gene is a candidate for the Monl locus, a major modifier of ApcMin-induced intestinal neoplasia// Cell. 1995. - P.81. - P.957-66.
88. McCartney B. M., et al. Drosophila APC2 is a cytoskeletally-associated protein that regulates wingless signaling in the embryonic epidermis// J. Cell Biol. 1999.- V.146.-P.1303-1318.
89. McGoldrick J. P., Yeh Y. C., Solomon M., et al. Characterization of a mammalian homolog of the Escherichia coli MutY mismatch repair protein// Mol. Cell Biol. 1995. - V. 15. - P.989-96.
90. Michils G., Tejpar S., Thoelen R. et al. Large deletions of APC gene in 15% of mutation-negative patients with classical polyposis (FAP): a Belgian study// Hum. Mutat. 2005. - V.25, №2. - P. 125-34.
91. Mihalatos M., Apessos A., Dauwerse H. et al. Rare mutations predisposing to familial adenomatous polyposis in Greek FAP patients// BMC Cancer. -2005. V.5, № 1. - P.40.
92. Mihalatos M., Danielides I., Belogianni J., et al. Novel mutations of the
93. APC gene in familial adenomatous polyposis in Greek patients// Cancer
94. Genetics and Cytogenetics. -2003. V. 141. -P.65-70.
95. Miller J.R., Moon R.T. Signal transduction through p-catenin and specification of cell fate during embryogenesis// Genes Dev. 1996. - V.10.- P.2527-2539.
96. Mimori-Kiyosue Y, Shiina N. &Tsukita S. Adenomatous polyposis coli (APC) protein moves along microtubules and concentrates at their growing ends in epithelial cells// J. Cell Biol. 2000. - V. 148. - P.505-518.
97. Miyoshi Y., Ando H., Nagase H., et al. Germ-line mutations of the APC gene in 53 familial adenomatous polyposis patients// Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1992. - V.89. - P.4452-4456.
98. Miyoshi Y., et al. Somatic mutations of the APC gene in colorectal tumors: mutation cluster region in the APC gene// Hum. Mol. Genet. 1992. -V.l,№70. -P.229-233.
99. Moisio A-L., Jârvinen H., Peltomâki P. Genetic and clinical characterization of familial adenomatous polyposis: a population based study// Gut. 2002.- V.50. P.845-850.
100. Molenaar M., van de Wetering M., Oosterwegel M., et al. XTcf-3 transcription factor mediates p-catenin-induced axis formation in Xenopus embryos// Cell. 1996. - V.86. - P.391-399.
101. Montera M., Piaggio F., Marchese C., et al. A silent mutation in exonl4 of the APC gene is associated with exon skipping in FAP family// J. Med. Genet. 2001. - V.38. - P.863-867.
102. Morin P.J., Sparks A.B., Korinek V., et al. Activation of (3-catenin-Tcf signaling in colon cancer by mutations in (3-catenin or APC// Science.1997. V.275. - P. 1787-1790.
103. Moser A.R., Dove W.F., Roth K.A., Gordon J.I. The MIN multiple intestinal neoplasia mutation: its effects on gut epithelium cell differentiation and interaction with a modifier system// J. Cell. Biol. 1992. - V.l 16. - P.517-26.
104. Moss S.F., Liu T.C., Petrotos A., Hsu T.M., Gold L.I., Holt P.R. Inward growth of colonic adenomatous polyps// Gastroenterology. 1996. - V. 111. -P. 1425-1432.
105. Munemitsu S., Albert I., Souza B., Rubinfeld B., and Polakis P. Regulation of intracellular beta-catenin levels by the adenomatous polyposis coli (APC) tumor-suppressor proteinIt Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1995. - V.92. -P.3046-3050.
106. Nagase H., and Nakamura Y. Mutations of the APC (Adenomatous polyposis coli) gene// Hum. Mutat. 1993. - V.2. - P.425-434.
107. Nagase, H. et al. Correlation between the location of germ-line mutations in the APC gene and the number of colorectal polyps in familial adenomatous polyposis patients// Cancer Res. 1992. - V.52. - P.4055-4057.
108. Nakagawa H., Murata Y., Koyama K., et al. Identification of a brain-specific APC homologue, APCL, and its interaction with (3-catenin// Cancer Res.1998. — V.58. -P.5176-5181.
109. Narayan S., Roy D. Role of APC and DNA mismatch repair genes in the development of colorectal cancers// Molecular cancer. 2003. - V.2. - P.2-41.
110. Nathke I.S., Adams C.L., Polakis P., Sellin J.H., and Nelson W.J. The adenomatous polyposis coli tumor suppressor protein localizes to plasma membrane sites involved in active cell migration// J. Cell Biol. V. 134. -P.165-179.
111. Nghiem Y., Cabrera M., Cupples C.G., Miller J.H. The mutY gene: a mutator locus in Escherichia coli that generates G:C-T:A transversions// Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1988. - V.85.-P.2709-13.
112. Nugent K.P., et al. Phenotypic expression in familial adenomatous polyposis: partial prediction by mutation analysis// Gut. 1994.- V.35.-P.1622-1623.
113. Olmeda D., Castel S., Vilaro S., Cano A. Beta-catenin regulation during the cell cycle: implications in G2/M and apoptosis// Mol. Biol. Cell. 2003. -V.14. - P.2844-2860.
114. Olschwang S., et al. Restriction of ocular fundus lesions to a specific subgroup of APC mutations in adenomatous polyposis coli patients// Cell. -1993. V.75. - P.959-968.
115. Plawski A., Lubinski J., Banasiewicz T., et al. Novel germline mutations in the adenomatous polyposis coli gene in Polish families with familial adenomatous polyposis// J. Med. Genet. -2004. V.41:el 1.
116. Polakis P. The adenomatous polyposis coli (APC) tumorsuppressor//Biochim. Biophys. Acta. 1997. - V. 1332. F127-F147.
117. Ponz de Leon M., Benatti P., Percesepe A., et al. Clinical features and genotype-phenotype correlations in 41 Italian families with adenomatosis coli// Ital. J. Gastroenterol. Hepatol. 1999. - V.31. - P. 850-60.
118. Popat S., et al. Prevalence of the APC E1317Q variant in colorectal cancer patients// Cancer Lett. 2000. - V.149. - P.203-206.
119. Ripa R., Bisgaard M.L., Bulow S. and Nielsen F.C. De novo mutations in familial adenomatous polyposis (FAP)// Eur. J. Hum. Gen. 2002. - V.10. -P.631-637.
120. Rosa M., Dourisboure R., Morelli G. et al. First genotype characterization of Argentinean FAP patients: identification of 14 novel APC mutations// Hum. Mut. Mutation in Brief. Online. 2004. - V.708. - P. 1-9.
121. Rozen P. et al. Prevalence of the I1307K APC gene variant in Israeli Jews of differing ethnic origin and risk for colorectal cancer// Gastroenterology. -1999. V.116.-P.54-57.
122. Rubinfeld B., Tice D. A. & Polakis R. Axin-dependent phosphorylation of the adenomatous polyposis coli protein mediated by casein kinase Is// J. Biol. Chem. 2001. - V.276. - P.39037-39045.
123. Ruiz-Ponte C., Vega A., Conde R., Barros F., Carracedo A. The Aspl822Val variant of the APC gene is a common polymorphism without clinical implications// JMG. 2001. - V.38. - P. 1-3.
124. Sambrook J., Fritch E.F., Maniatis T. Molecular cloning: a laboratorymanual, 2nd edn. Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, NY. 1291989.
125. Sampson J.R., Dolwani S., Jones S., et al. Autosomal recessive colorectal adenomatous polyposis due to inherited mutations of MYH// Lancet. — 2003. V.362, № 9377. -P.39-41.
126. Scott R.J., Meldrum C., Crooks R.,et al. Familial adenomatous polyposis: more evidence for disease diversity and genetic heterogeneity// Gut. — 2000. -V. 48.-P. 508-514.
127. Sieber O.M., Heinimann K., Gorman P., et al. Analysis of chromosomal instability in human colorectal adenomas with two mutational hits at APC// Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2002. - V.99, №26. - P. 1691-5.
128. Sieber O.M., Lipton L., Crabtree M., et al. Multiple colorectal adenomas, classic adenomatous polyposis, and germ-line mutations in MYH// N.Engl. J. Med. 2003. - V.348. - P.791-9.
129. Slattery M., Samowitz W., BallardL., Schaffer D., Leppert M., and Potter J. A molecular variant of the APC gene at codon 1822: its association with diet, lifestyle, and risk of colon cancer// Cancer research. 2001. -V.61,№1.-P. 1000-1004.1/1 oy
130. Smits R., Kielman M.F., Breukel C., et al. Ape : a mouse model delineating critical domains of the adenomatous polyposis coli protein involved in tumorigenesis and development// Genes Dev. 1999. - V73. -P.1309-1321.
131. Solomon E., et al. Chromosome 5 allele loss in human colorectalcarcinomas// Nature. 1987. - V.328. - P.616-619.
132. Soravia C., Berk T., Madlensky L., et al. Genotype-phenotype correlations in attenuated adenomatous polyposis coli//Am. J. Hum. Genet. 1998. -V.62. - P. 1290-1301.
133. Spirio L., et al. Alleles of the APC gene: an attenuated form of familial polyposis// Cell. 1993. - V.75. - P.951-957.
134. Stella A., Resta N., Polizzi A., et al. The familial adenomatous polyposis region exhibits many different haplotypes// Hum. Genet. 1998. — V.102. — P.624-628.
135. Su, L.K., Vogelstein, B. and Kinzler, K.W. Association of the APC tumor suppressor protein with catenins// Science. 1993 - V.262. - P. 1734-1737.
136. Sulekova Z., Reina-Sanchez J., and Ballhausen W.G. Multiple APC messenger RNA isoforms encoding exon 15 short open reading frames are expressed in the context of a novel exon lOA-derived sequence// Int. J. Cancer. 1995. - V.63. - P.435-441.
137. Sved J., Bird A. The expected equilibrium of the CpG dinucleotide in vertebrate genomes under a mutation model// Proc. Natnl. Acad. Sci. USA. -1990.-V. 87. P.4692-6.
138. Tetsu O., McCormick F. P-catenin regulates expression of cyclin D1 in colon carcinoma cells// Nature. 1999. - V. 398. - P. 422-426.
139. Tirnauer J.S., and Bierer B.E. EB1 proteins regulate microtubule dynamics, cell polarity, and chromosome stability// J. Cell Biol. 2000. - V. 149. -P.761-766.
140. Topal M.D. & Fresco J.R. Complementary base pairing and the origin of131substitution mutations// Nature. 1976. - P.285-289.
141. Tranah G.J., Giovannucci E., Ma J., Fuchs C. and Hunter D.J. APC
142. Aspl 822Val and Gly2502Ser polymorphisms and risk of colorectal cancer and adenoma// Cancer Epidemiol. Biomarkers Prev. 2005. - V.14,№4. -P.863-870.
143. Vandrovcova J., Sterkova J., Kebrdlova V., and Kohoutova M. Molecular analysis of the APC and MYH genes in Czech families affected by FAP or multiple adenomas: 13 novel mutations// Hum. Mut. Mutation in Brief. Online. 2004. - V.695. - P. 1-8.
144. Wallis Y.L., et al. Genotype-phenotype correlation between position of constitutional APC gene mutation and CHRPE expression in familial adenomatous polyposis// Hum. Genet. -1994. V.94. - P.543-548.
145. Walon C., Kartheuser A., Michils G., et al. Novel germline mutations in the132
146. APC gene and their phenotypic spectrum in familial adenomatous polyposis kindreds// Hum. Genet. 1997. - V.100. - P.601-605.
147. Woodage T., et al. The APCI1307K allele and cancer risk in a community-based study of Ashkenazi Jews// Nature Genet. 1998. - V.20. - P.62-65.
148. Wu J.S., Paul P., McGannon E.A., and Church J.M. APC genotype, polyp number, and surgical options in familial adenomatous polyposis// Ann. Surg.- 1998. V.227. - P.57-62.
149. Yu X. & Bienz M. Ubiquitous expression of a Drosophila adenomatous polyposis coli homolog and its localisation in cortical actin caps// Mech. Develop. 1999. - V.84. - P.69-73.
150. Yu. X., Waltzer L., and Bienz M. A new Drosophila APC homologue associated with adhesive zones of epithelial cells// Nature Cell Biol. 1999. -V.I. -P.144-151.
151. Zeng L., et al. The mouse Fused locus encodes Axin, an inhibitor of the Wnt signaling pathway that regulates embryonic axis formation// Cell. 1997. -V.90. -P.181-192.
152. Zhang F, White R. L. & Neufeld K. L. Phosphorylation near nuclear localization signal regulates nuclear import of adenomatous polyposis coli protein// Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2000. - V.97. - P.12577-12582.
- Музаффарова, Татьяна Александровна
- кандидата медицинских наук
- Москва, 2005
- ВАК 03.00.15
- Разработка мишеней для терапии колоректального рака на основе функциональной геномики
- Статистические и прикладные аспекты генетического анализа альтернативных признаков по выборкам родословных
- Формирование дисбактериоза у больных полипозом толстого кишечника
- Влияние WNT лигандов на формирование фенотипа клеточных линий меланомы человека
- Экспрессия и характеристика новых изоформ лиганда Wnt11