Бесплатный автореферат и диссертация по биологии на тему

Математические и экспериментальные методы в конформационном ЯМР-анализе пептидов и белков

ВАК РФ 03.00.02, Биофизика

Содержание диссертации, кандидата физико-математических наук, Гуревич, Александр Зельманович

ВВЕДЕНИЕ.

ГЛАВА I. ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНЫЕ И МАТЕМАТИЧЕСКИЕ МЕТОДЫ ВЫДЕЛЕНИЯ СИГНАЛОВ В ЯМР-СПЕКГРАХ ПЕПТИДОВ И БЕЛКОВ (ЛИТЕРАТУРНЫЙ ОБЗОР).

§ I-I. Методы выделения сигналов ЯМР из шума

Чувствительность спектрометра).

§ 1-2. Методы выделения малых сигналов в присутствии интенсивных сигналов растворителя. (Динамический диапазон спектрометра)

§ 1-3. Методы выделения индивидуальных сигналов в спектрах ЯМР пептидов и белков

ГЛАВА П. ПОВЫШЕНИЕ РАЗРЕШЕНИЯ В СПЕКТРАХ ЯМР

§ П-1. Общий случай.

§ П-2. Случай ограниченного времени наблкщения.

Алодизация.

§ П-3. Проектирование цифровых фильтров

§ П-4. Изменение отношения сигнал/шум при использовании весовой функции произвольной формы

§ П-5. Максимальный коэффициент сужения при цифровой фильтрации.

§ П-6. Математическое обеспечение для исследования методов цифровой фильтрации с целью повышения разрешения в спектрах ЯМР и его практическая реализация.

ГЛАВА Ш. РАСЧЕТ ПАРАМЕТРОВ КРИВЫХ рН-ТИГРОВАНИЯ

§ Ш-1. Математические модели для определения параметров кривых рН-титрования.

§ Ш-2. Определение параметров кривых рН-титрования и их погрешностей

§ Ш-3. Выбор математической модели.

§ Ш-4. Пример использования значений параметров кривых рН-титрования для определения расстояния между остатками Cys'1 и Glu7 ал амина

§ Ш-5. Описание црограммы расчета параметров кривых рН-титрования.

ГЛАВА 1У. РАСЧЕТ КОНСТАНТ К0МШШКС00ЕРА30ВАНШ ЦИМО

ПЕПТВДНЫХ И0Н0Ф0Р0В.

§ 1У-1. Математические модели.

§ ГУ-2. Расчет констант комплексообразования и спектральных параметров по экспериментальным данным. III

§ 1У-3. Выбор математической модели и частные случаи определения содержания отдельных форм в смеси

§ 1У-4. Результаты расчетов параметров комплексообразования некоторых ионофорных комплексов

§ 1У-5. Описание программы расчета констант комплексообразования

ГЛАВА У. МЕТОД ОДНОВРЕМЕННОГО НАКОПЛЕНИЯ ^-г-О-СПЕКГРОВ С КОРРЕЛЯЦИЕЙ ПО СКАЛЯРНОМУ СПИН^СПИНОВОМУ ВЗАИМОДЕЙСТВИЮ (COSY) И ПО ЯДЕРНОМУ ЭФФЕКТУ ОВЕР-ХАУЗЕРА (NOESY)

§ У-1. Базовая схема.

§ У-2. Фазовая последовательность.

§ У-3. Описание эксперимента одновременного накопления %-2-D~COSY и "^-D-NOESY спектров

ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ.

ВЫВОДЫ.

Введение Диссертация по биологии, на тему "Математические и экспериментальные методы в конформационном ЯМР-анализе пептидов и белков"

Интенсивное развитие методики и экспериментальной техники ядерного магнитного резонанса (ЯМР) связано прежде всего с тем, что эта область спектроскопии стала эффективным инструментом исследования строения вещества. В частности, спектроскопия ЯМР широко используется в исследованиях свойств и механизма биологического действия белков и пептидов. Особое внимание привлекает способность ЯМР спектроскопии устанавливать цространственную структуру и ее динамику в растворах, в том числе, в физиологических условиях. Для этой цели используют химические сдвиги различных ядер, константы спин-спинового взаимодействия между ядрами и релаксационные параметры отдельных резонансных сигналов. Ключевым этапом этих исследований является выделение сигналов ЯМР и их отнесение к определенным структурным элементам биополимера. Возникающие, как правило, при этом существенные трудности могут быть преодолены путем црямого анализа спектров со специальной математической обработкой, а также с помощью экспериментальных методов возмущений.

Метод возмущений, заключающийся в индуцировании спектральных изменений путем введения в раствор целевых реагентов, позволяет изучать не только цространственную структуру исследуемого объекта, но и возможности конформационных перестроек при смене внешних условий. Факторами, влияющими на пространственную структуру могут быть кислотность (рН) и состав среды, температура, взаимодействие с молекулярными лигандами и ионами, эффекты уширяющих или сдвигающих ионов и реагентов, а также селективная химическая модификация. Однако метод возмущений таит в себе опасность нарушения нативной цространственной структуры молекулы и поэтому его с осторожностью следует применять дои отнесения сигналов. Вследствие этого, а также в связи с совершенствованием вычислительной техники, возрастает значение прямого анализа сложных спектров биополимеров с использованием богатого набора приемов самого метода ЯМР. К наиболее эффективным методам анализа относятся дифференциальная спектроскопия в сочетании с гомо- и гетероядерным многочастотным резонансом, двумерная (2-D) спектроскопия с корреляцией по скалярному и дипольному взаимодействию ядер, прямой и обратный расчет мультиплетности. Однако потенциальные возможности этих методов не всегда могут быть полностью реализованы из-за ряда аппаратурных причин: низкое отношение сигнал/шум, ограниченный динамический диапазон приемной части спектрометра, сильное уширение линий в ЯМР-спектрах макромолекул, приводящее к их перекрыванию. Эти проблемы могут быть в значительной мере решены путем математической обработки спектров на ЭВМ.

Целью диссертационной работы является базирующийся на математических методах комплексный подход к решению основных проблем спектрального анализа, встречающихся при ЯМР-исследованиях белков и пептидов. К наиболее существенным результатам относятся: а) общий способ повышения информативности ЯМР-спектров с помощью цифровых фильтров; б) алгоритм и математическое обеспечение для обработки экспериментальных ЯМР-данных при рН-титровании с целью определения констант диссоциации для форм, участвующих в равновесии, и выбора модельной схемы, которая описывает происходящие в растворе процессы; в) алгоритм и математическое обеспечение для расчета ЯМР-спектров метал -ионофорных комплексов для вычисления констант устойчивости комплексов и их стехиометрии, а также для построения системы равновесных реакций комплексообразования; г) разработка метода одновременного накопления IH-24D-Koppe-ляционных спектров (COSY), с помощью которых получают сведения об основных системах, связанных скалярным спин-спиновым взаимот действием (J -связи) и Н-2-О-спектров ядерного эффекта Оверхау-зера, позволяющих выявлять диполь-дипольные магнитные взаимодействия между пространственно сближенными ядрами (ЯЭО-связи), при абсолютно идентичных условиях проведения эксперимента (температура, значение рН, спектральное разрешение и т.д.) при меньших затратах приборного времени.

Диссертационная работа состоит из пяти глав.

Первая глава содержит литературный обзор существующих экспериментальных и математических методов выделения сигналов в ЯМР-спектроскопии.

Вторая глава посвящена проблеме цифровой фильтрации в ЯМР-спектроскопии для сужения спектральных линий, а также влияния фильтрации на изменение отношения сигнал/шум. В результате проведенного анализа получено значение максимального коэффициента сужения в реальных условиях - ограниченный динамический диапазон, заданная разрядная сетка ЭВМ и отношение сигнал/шум на входе приемного устройства спектрометра. Предложены практические рекомендации для обработки спектров ЯМР пептидно-белковых веществ.

В третьей главе представлена методика определения параметров рН-зависимостей химических сдвигов в спектрах белков и пептидов и построения математической модели для форм, участвующих в равновесии.

В четвертой главе изложена методика расчета констант комплексообразования и стехиометрии металл-ионофорных комплексов.

Пятая глава посвящена методу одновременного накопления %-2-O-J -корреляционных спектров и %-2-D-спектров, основанных на эффекте Оверхаузера, с использованием фазо-циклических импульсных последовательностей.

Экспериментальная часть представляет собой описание практических систем обработки данных ЯМР-спектроскопии на базе ЭВМ различных классов.

Заключение Диссертация по теме "Биофизика", Гуревич, Александр Зельманович

ВЫВОДЫ

1. Теоретически обоснованы и апробированы разработанные на базе итерационного алгоритма цифровые фильтры с использованием треугольной весовой функции для сужения линий в ЯМР-спектрах белков и пептидов. Доказана эффективность таких фильтров при работе в реальных условиях проведения эксперимента (ограниченный динамический диапазон, низкое отношение сигнал/шум), характерных для исследований биологических макромолекул в растворе методом ЯМР-спектроскопии.

2. Разработаны и применены алгоритм и математическое обеспечение для обработки экспериментальных данных при рН-титровании с целью определения констант диссоциации для форм, участвующих в равновесии. Предложена и апробирована стратегия выбора математической модели по значению коэффициента Хилла.

3. Предложен и использован алгоритм и математическое обеспечение для расчета равновесных констант комплексообразования ряда ионофоров с соотношениями лиганд-катион 1:1 и 2:1, а также с последовательным образованием комплексов состава 1:1 и 2:1 и 1:1 и 1:2. Оценены параметры комплексообразования некоторых металл-ионофорных комплексов по спектральным данным, вычислены их погрешности, проведен выбор математической модели по F -критерию.

4. Предложен, теоретически обоснован и апробирован метод одновременного накопления 1Н-ЯМР-корреляционных 2- D -спектров (COSY) , позволяющий получить сведения о протонных системах, связанных скалярным спин-спиновым взаимодействием (J -связи) и

D-спектров ядерного эффекта Оверхаузера ( NOESY) f выявляющих диполь-дипольные магнитные взаимодействия между пространственно сближенными ядрами (ЯЭО-связи), при абсолютно идентичных условиях проведения эксперимента (температура, значение рН, спектральное разрешение и т.д.) и при уменьшении затрат приборного времени в 1,5 раза.

Библиография Диссертация по биологии, кандидата физико-математических наук, Гуревич, Александр Зельманович, Москва

1. Hull W.E. Sensitivity in NMR: Can it be accurately messured. Bruker report, 1983, 1, p. 23-25.

2. Ernst R.R. Sensitivity Enhancement in Magnetic Resonance.1.: Advances in Magnetic Resonance. Academic Press, New-York and London, 1966. - 135 p.

3. Лундин А.Г., Федин Э.И. Ядерный магнитный резонанс. -Новосибирск: Наука, 1980. 192 с.

4. Sauzade M.D., Kan S.K. High Resobetion Nuclear Magnetic Resonance Spectroscopy in High Magnetic Fields. Advances in Electronics and Electron Physics, 1973, 34, p.1-92.

5. Redfield A.G., Kunz S.D. Quadrature Fourier NMR Detection and Discussion. J.Magn.Res., 1975, 19, p.250-254.

6. Martin M.L., Martin G.J. Delpuech J .-J., Practical NMR Spectroscopy.- Heyden, London, 1980. 460 p.

7. Фаррар Т., Беккер Э. Импульсная и Фурье-спектроскопия ЯМР.-М., Мир, 1973-164 с.

8. Леви Г., Нельсон Г. Руководство по ядерному магнитному резонансу углерода 13 для химиков органиков. - М., Мир, 1975. -295 с.

9. Ernst R.R. Magnetic Resonance with stochastic exitation. -J.Magn. Res., 1970, v.3, p. 10-15.

10. Kaiser R. Cogerents spectrometry with noise Signals. J.Magn. Res. 1970, v. 3, p.28-33.

11. Dadok J., Sprecher R.F. Correlation NMR spectroscopy. J.Magn. Res., 1974, v.13; p.243-248.

12. Becker E.D., Ferretti J.A., Gambhir P.N. Selection of Optimal Parameters for Pulse Fourier Transform Nuclear Magnetic Resonance. Anal. Chem., 1979, v.51, p. I4I3-I420.

13. Ernst R.R. Nuclear Magnetic Double Resonance with on Incoherent Radio-Frequency Field. J.Chem.Phys., 1966, v. 45, p.3845-3861.

14. Noggle J.H., Shcirmer R.E. The Nuclear Overhauser Effect. -Academic Press, New-York, 1971. 300 p.

15. Chingas G.C., Garroway A.N., Moniz W.B., Bertrand R.D. Adiaba-tic J Cross-Polarization in Liquids for Signal Enhancement in NMR.--J.A.C.S., 1980, v. 102, p. 2526-2528 .

16. Bertrand R.D., Moniz W.B., Garroway A.N., Chingas G.C. I3c-Ih crosspolarization in liquids J.A.C.S., 1978 , v.100, p. 5227-5229.

17. Chingas G.C., Garroway A.N., Bertrand R.D., Moniz W.B. Zero quantum NMR in the frame: J cross polarization in AXn systems.-J. Chem. Phys., 1980, v.74, p. 127-156.

18. Bertrand R.D., Moniz W.B., Garroway A.N., Chibgos G.C. Sensitivity Enhancement in I5n NMR Spectroscopy of Liquids Using the J Cross-Polarization Technique. J.Magn. Res., 1978, v.32, p. 465-467.

19. Jakobson H.J., Brey W.S. I3C- I4N Selective Population Transfer (SPT) Experiments and Comments on I3C- IH SPT in Methylisocyanide. J. Magn. Res., 1977, v.26, p. 183-188.

20. Jakobson H.J., Brey W.S. Sensitivity Enhancement in Natural Abudance Proton-Coupled NMR Spectra Using the Selective Population Transfer Method.- J.A.C.S.,1979 , v.IOI, p. 774-775.

21. Morris G.A., Freeman R. Enhancement of Nuclear Magnetic Resonance Signals by Polarization Transfer.- J. A. C.S. ,1979, v.IOI, p. 760-762.

22. Bolton P.H., James T.L. Population Redistribution to Enhance NMR Selectivity and Allow Decoupling of Low Gyromagnetic Ratio Nuclei- J.A.C.S., 1980, v.102, p. 1449-1450.

23. Pegg D.T., Dodrell D.M., Bendall M.R. Proton-polarization transfer enhancement of a heteronuclear spin multiplet with preservation of phase coherency and relative component intensities. -J. Chem. Phys., 1982, v.77, N- 6, p. 2745-2752.

24. Bolton P.H. Enhancement of Signals from Insensitive Nuclei by Magnetization Transfer via J Couplings. J.Magn. Res., 1980, v. 41, p. 287-292.

25. Deutsch M., Beniaminy I. High accuracy deconvolution method using spline functions. Rev.Sci. Instrum., 1982, v.53, № 1, p. 90-97.

26. Savitzky A., Golay M.J.E. Smoothing and Differentiation of Data by Simplitied Least Squares Procedures. Anal.Chem., 1964, v.36, p.1627-1638.

27. Cooper J.W. Computers in NMR-I: Signal Averaging in Fourier Transform NMR.-Computers and Chemistry, 1976, v.1, p. 55-60.

28. Cooper J.W. Computers in NMR-II. Experimental Investigationof Noise and Dynamic Range in the Fourier Transform Process. -J. Magn. Res., 1976, v.22, p. 345-357.

29. Kaiser R., Knight W.R. Digital signal Averaging. J. Magn. Res., 1979, v.36, p. 215-220.

30. Kimber B.J., Roth K., Feeney J. Signal-to-Noise Ratio in Accumulation of Fourier Transform Nuclear Magnetic Resonance Spectra.-J.A.C.S., 1981, v.53, p. 1026-1030.

31. Roth K., Kimber B.J., Feeney J. Data Shift Accumulation and Alternate Deley Accumulation Techniques for Overcoming the Dynamic Range Problem. J. Magn. Res., 1980, v.41, p.302-309.

32. Tomlinson B.C., Hill H.D.W. Fourier synthesized exitation of nuclear magnetic resonance with application to homonuclear decoupling and solvent line suppression. J.Chem.Phys., 1973, v.59, p. 1775-1784.

33. Gupta R.K., Ferretti J.A., Becker E.D. Rapid Scan Fourier Transform NMR Spectroscopy. J. Magn. Res., 1974, v.13, p. 275-290.

34. Patt S.L., Sykes B.D. Water eliminated FT NMR spectroscopy. -J. Chem.Phys., 1972, v.56, p. 3182-3184.

35. Benz F.W., Feeney J., Roberts G.C.K. FT proton NMR spectroscopy in aqueous solution. J. Magn. Res., 1972, v.8,p.II4-I2I.

36. Gupta R.K. Dynamic Range Problem in-Fourier Transform NMR. Modified WEFT Pulse Sequence. J. Magn. Res., 1976, v.24, p. 461-465.i

37. Haasnoor C.A. Selective Solvent Suppresion m H FT NMR Using a DANTE Pulse: Its Application in Normal and NOE Measurements.-J. Magn. Res., 1983, v.52, p. 153-158.

38. Morris C.A., Freeman R. Selective Excitation in Fourier Transform Nuclear Magnetic Resonance. J. Magn. Res., 1978, v.29, p. 433-462.

39. Redfield A.G., Kunz S.D., Ralph E.K. Dynamic Range in Fourier Tranform Proton Magnetic Resonance. J.Magn.Res., 1975, v.19, p. 114-117.

40. Sklenar V., Starcuk 1-2-1 Pulse Train: A New Effective Method of Selective Excitation for Proton NMR in Water. J.Magn.Res., 1982, № 50, p. 495-501.

41. Turner D.L. Binomial Solvent Suppression. J.Magn.Res., 1983, v. 54, p. 146-148.

42. Ноге P.J. A New Method for Water Suppression in the Proton NMR Spectra of Aqueous Solutions. J. Magn. Res., 1983, v.54, p. 539-542.

43. Clore G.M., Kimber B.J., Gronenborn A.M. The 1-1 Hard Pulse: A Simple and Effective Method of Water Resonance Suppression in FT 1H NMR. I. Magn. Res., 1983, v.54, p. 170-173.

44. Campbell I.D., Dobson C.M. The Application of High Resolution Nuclear Magnetic Resonance to Biological Systems. Wiley, New-York,. 1979.-I33p.

45. Thibault C., Cooper J.W. Applecation of Computers in Nuclear Magnetic Resonance. Magn. Res., Rev., 1980, v.5, p.I0I-II9.

46. Быстров В.Ф., Оханов В.В., Арсеньев А.С., Афанасьев В.А.,

47. Гуревич А.З. Мультирезонансный метод полного отнесения сиг1 13налов в спектрах Н- и С- ЯМР пептидов и белков. Биоорганическая химия, 1980, т.6, № 3, с. 386-392.

48. Leigh J.S. Nuclear magnetic resonance. In: Introdaction to the spectroscopy of biological polymers. Academic Press, London, 1976, p. 189-219.

49. Mc Donald C.C., Phillips W.D. Proton Magnetic Resonance Spectra of Proteins in Random Coil Configurations.- J.A.C.S. 1969, v.91, № 6, p. I5I3-I52I.

50. Wuthrich K. NMR in Biological Research: Peptides and Proteins.-American Elsevier, New-York, 1976. p.379.

51. Glickson J.D., Cunningham W.D., Marshall G.R. PMR Study of angiotensin II (Asn^, Val^) in aqueous solution. Biochem., 1973, v.12, p. 3684-3692.

52. Bartle K.D., Jones D.W., Lamil R. Studies of wool proteins by high resobetion PMR spectroscopy. - Applied Polymer Symposium, 1971, № 18, p. 85-99.

53. Coleman J.E., Anderson R.A., Ratchiffe R.G., Armitage I.M. Structure of gene S protein-oligodeoxynucleotide complexes as determined by 1H, 19F and 31F NMR. Biochem., 1976, v.15,25, p. 5419-5430.

54. Hill H.A.0. The Proton Magnetic Resonance Spectroscopy of Proteins. In: NMR (Eds. Diehl P. etc) New-York, 1971, v.4, p. 167-179.

55. Campbell I.D., Dobson C.M., Williams R.J.P., Wright P.E. Pulse method for the simplification of protein NMR spectra. FEBS1.tt., 1975, v. 57, № 1, p. 96-99.

56. Bolton P.H. Simplification of the Proton Magnetic Resonance Spectra of Large Molecules Such as Proteins. J. Magn. Res., 1981, v. 45, p. 418-421.

57. LeCocq C., Lallemand J.Y. Precise Carbon-I3, N.M.R. Multiplicity Determination. J.C.S. Chem. Commun., 1981, p. 150-152.

58. Brown F.F., Campbell I.D. Cross correlation of titrating histidines in oxy-and deoxy haemoglobin. An NMR study. FEBS Lett., 1976, v. 65, p. 322-326.

59. Freeman R.C., Morris C.A., Ramshaw J.A.M., Wright P.E. High resolution PMR studies of plastocyanin. FEBS Lett., 1978, v. 86, № 1, p. I3I-I35.

60. Moore G.R., Pitt R.C., Williams R.J.P. NMR studies of Pseudomonas aeruginosa citochrome c-55I. Eur. J.Biochem., 1977, v. 77, p. 53-60.

61. Campbell I.D., Dobson C.M., Williams R.J.P. Assiqnement ofithe H NMR spectra of proteins. Proc. R. Soc. Lond. A., 1975, v. 345, p. 23-40.

62. Dwek R.A. Nuclear Magnetic Resonance (N.M.R.) in Biochemistry. Clarendon Press, Oxford, 1973. - 395 p.

63. Inagaki F., Miyazawa Т., Ногу H., Tamiya N. Conformation of erabutoxins A u b in aqueous solution as studied by NMR and CD. Eur. Y.Biochem., 1978, v. 89, p. 433-442.

64. Tanswell P., Westhead E.W., Williams R.J.P. NMR study of the active-site structure of yeast phosphoglycerate kinase. Eur. J.Biochem., 1976, v. 63, p. 249-262.

65. Bradfury J.H., Brown L.R. Determination of the dissociation Constants of the lysine residue of lysozymeby PMR. Eur. J.Biochem., 1973, v. 40, p. 565-576.

66. Campbell I.D., Dobson C.M., Williams R.J.P., Xavier A.V. Resolution enhaucement of protein PMR spectra using the difference between a broadend and normal spectrum. J. Magn. Res., 1973, v.II, p. I72-I8I.

67. Campbell I.D., Dobson C.M., Williams R.J.P. Studies of exchangeable hadrogen in lysozyme by means of PMR. Proc. R.Soc.Lond. В., 1975, v.189, p. 485-502.

68. Wagner G., Wuthrich K., Tschesche H. A 1H NMR study of the solution conformation of the isoinhibitor К fron Helix poma-tia. Eur. J. Biochem., 1978, v. 89, p. 367-377.

69. Kaptein R. Structural information from Phor-CIDNP in proteins. In: NMR spectroscopy in molecular biology (Ed. Pullman В.), Holland, 1978, p. 211-229.

70. Gibbons W.A., Beyer C.F., Dadok J., Sprecher R.F., Wyssbrod H.R. Studies of individual amino acde residues of the deca-peptide tirocidine A by proton double resonance difference. -Biochem., 1975, v. 14, № 2, p. 420-429.

71. Moore G.R., Williams R.J.P. Assignement of aromatic amino acid PMR resonance of horse ferrocytochrome C. FEBS Lett., 1975, v. 53, W 3,p. 334-338.

72. Bystrov V.F., Arseniev A.S., Gavrilov Yu.D. NMP spectroscopy of large peptides and small proteins. J.Magn. Res., 1978, v. 30, p. I5I-I84.

73. Bock K., Burton R., Hall L.D. A pulse Fourier transform equivalent of the homonuclear (proton-proton) INDOR experiment.-Can.J.Chem., 1976, v. 54, p. 3526-3535.

74. Jeener J. International Summer School. Basko Polje, Yugoala-via, 1971. - 100 p.

75. Aue W.P., Bartholdi E., Enst R.R. Two-dimensional spectroscopy. Application to NMR. J.Chem.Phys., 1976, v. 64,p.2229-2246.

76. Bodenhausen G., Freeman R., Niedermeyer R., Turner D.L. Double Fourier Transformation in High Resolution NMR. J.Magn. Res., 1977, v. 26, p. 133-164.

77. Naqayama K. , Wuthrich K. , Bachmann P., Erust R.,R. Two-dimensioinal J-resolved H NMR spectroscopy for studies of biological macromolecules.-Biochem. Biophys.Res.Commun., 1977, v. 78, p. 99-105.

78. Bodenhausen G., Freenam R., Morris G.A., Turner D.L. NMR Spectra of some Simple Spin Systems Studied by Two-Dimensional Fourier Transformation of Spin Echoes. J.Magn.Res., 1978, v. 31, 75-95.

79. Naqayama K., Wuthrich K. Systematic Application of Two-Diimensional H Nuclear-Magnetic-Resonance Techniques for Studies of Proteins.

80. Combined Use of Spin-Echo-Correlated Spectroscopy and

81. J-Resolved Spectroscopy for the Identification of Complete Spin Systems of Non-labile Protons in Amino-Acid Residues. -Eur. J.Biochem., 1981, v. 114, p. 365-374.

82. Kumar A. Two-dimensional Spin-Echo NMR Spectroscopy. A General Method for Calculation of Spectra. J.Magn.Res., 1978, v. 30, p. 227-249.

83. Nagayama K., Bachman P., Ernst R.K., Wuthrich K. Selectiveispin decoupling in the J-resolved two-dimensional H NMR spectra of proteins. Biochem. Biophis. Res. Commun, 1979, v. 86, p. 218-225.

84. Nagayama K., Wuthrich K., Erns R.R. Two-dimensional spin echo1 correlated spectroscopy (SECSY) for H NMR studies of biological macromolecules. Biochem.Biophis.Res.Commun., 1979, v. 90, p. 305-311.

85. Nagayama K., Kumar A., Wuthrich K., Ernst R.R. Experimental Techniques of Two-Dimensional Correlated Spectroscopy. -J.Magn.Res., 1980, v. 40, p. 321-334.

86. Wagner G., Kumar A, Wuthrich K. Systematic Application of Two-Dimensional ^H Nuclear-Magnetic-Resonance Techniques for Studies of Proteins.

87. Combined Use of Correlated Spectrossopy and Nuclear Ovechauser Spectroscopy for Sequential Assignments of Backbone Resonances and Eludication of Polypeptide Secondary Structures. Eur. J. Biochem., 1981, v. 114, p. 375-384.

88. Macura S., Wuthrich K., Ernst R.R. Separation and Suppression of Coherent Transfer Effects in Two-Dimensional NOE and Chemical Exchange Spectroscopy. J.Magn.Res., 1982, v. 46, p. 269-282.

89. Bodenhausen G., Freeman R., Turner D.L. Suppression of Artifacts in Two-Dimensional J Spectroscopy. J.Magn.Res., 1977, v. 27, p. 5II-5I4.

90. Bodenhausen G., Void R.L., Void R.R. Multiple Quantum Spin-Echo Spectroscopy. J.Magn.Res., 1980, v. 37, p. 93-106.

91. Naqayama K., Bachmann P., Wuthrich K., Ernst R.R. The Use of Cross-Sections of Projections in Two-dimensional NMR Spectroscopy. J.Magn.Res., 1978, v. 31, p. 133-148.

92. Bruker Report, 1979, v. 2, p. 4-6.

93. Aue W.P., Bachmann P., Wokaun A., Ernst R.R. Sensitivity of Two-Dimensional NMR spectroscopy. J.Magn.Res., 1978, v. 29, p. 523-533.

94. Pegg D.T., Doddrell D.M., Brooks W.M., Bendall M.R. Proton Polarization Transfer Enhancement for a Nucleus with Arbitrary Spin Quantum Number from n Scalar Coupled Protons for Arbitrary Preparation Times. J.Magn.Res., 1981, v. 44, p. 32-40.

95. Sorensen O.W., Freeman R., Frenkel Т., Mareci Т.Н. Observation13 13of С- С Couplinqs with Enhanced Sensitivity. J.Magn.Res., 1982, v. 46, p. 180-184.

96. Morris G.A. Indirect Measurement of Profon Relaxation Rates by "INEPT" Polarisation Transfer to Carbon-13. Proton spin-Lattice Relaxation in Cholestiryl Acetate Solutions. J.Magn. Res., 1980, v. 41, p. 185-188.

97. Bendall M.R., Pegg D.T., Doddrell D.M. Polarisation Transfer Pulse Sequences for Two-Dimensional NMR by Heisinberg Vector Analysis. J.Magn.Res., 1981, v. 45, p. 8-29.

98. Levitt M.H., Freeman R. Simplification of NMR Spectra by Masking in a Second Frequency Dimension. J.Magn.Res., 1980, v. 39, p. 533-538.

99. Canybell I.D., Dobson C.M., Williams R.J.P. Xavier A.V. Resolution Enhancement of Protein PMR Spectra Using the Difference Between a Broadened and a Normal Spectrum. J.Magn. Res., 1973, v. II, p. I72-I8I.

100. Semendyaev N.N. Technique for improving the resolution of macromolecule NMR spectra. Stud,biophis, 1974, v. 47,p. 151-159.

101. De Marco A., Wuthrich K. Digital Filtering with a Sinusoidal Window. Funktion: An Alternative Technique for Resolution Enhancement in FT NMR. J.Magn. Res., 1976, v. 24, p. 201-204.

102. Gueron M. Line Narrowing and Line Broadening Using Trigonometric Functions. J.Magn.Res., 1978, v. 30, p. 515-520.

103. Clin В., De Bony J., Lalanne P., Biais J., Lemanceon В. A Neu Scheme for Resolution Enhancement in Fourier Transform NMR. J.Magn.Res., 1979, v. 33, p. 457-463.

104. Ferrige A.G., Lindon J.C. Resolution Enhancement in FT NMR Through the Use of a Double Exponential Function. J.Magn.Res., 1978, v. 31, p. 337-340.1011021031041051061071081091101.I112113114115116117

105. Gassner M., Jardetzky 0., Gonover W. Comparision of Convolution and Pulse Methods for Line Narrowing in Proton NMR Spectra. J.Magn.Res., 1978, v. 30, p. I4I-I46. Харкевич А.А. Спектры и анализ. - M.: Гос.изд.технико-теоре-тич. литературы, 1957- 236 с.

106. Тихонов А.Н., Арсенин В.Я. Методы решения некорректных задач. М.: Наука, 1974-223 с.

107. Blass W.E., Halsey G.W. Deconvolution of absorbtion Spectra.-Academic Press, New-York, I98I.-I58 p.

108. Numerical Methids/Ed. R.F.Churchhouse New-York, Wiley, I98I.-645 p.

109. Хемминг P.В. Цифровые фильтры. M.: Сов. радио, 1980.-224 с. Рабинер Л., Гоулд Б. Теория и применение цифровой обработки сигналов. - М.: Мир, 1978.-848 с.

110. Белл Р.Дж. Введение в Фурье спектроскопию. М., Мир, 1975.380 с.

111. Лавреньев М.М. О некоторых некорректных задачах математической физики. Новосибирск, 1962.-92 с.

112. Левкович М.Г., Леонтьев В.Б., Садыков А.С. Регуляризованные методы для анализа спектров ЯМР. В сб.: Современные достижения ЯМР-спектроскопии: Тез.докл. Всесоюзн.конф. Ташкент, 1979, с. 15,16.

113. Бронштейн И.Н., Семендяев К.А. Справочник по математике. -М.: Гос.изд.техн.-теор.лит., 1955.-608 с. Beauchamp K.G. Signal proceccing. Allen and Unwin LTD, London, 1973.-547 p.

114. Bundi A., Wuthrich K. Use of Amide 1H-NMR Titration Shifts for Studies of Polypeptide Conformation.-Biopolimers, 1979, v. 18, p. 299-311.

115. Markley J.L.,, Findenstadt W.R. Correlation Proton Magnetic118119120121122123124125126127128129130131

116. Shrager R. J., Cohem J.S., Heller S.R. , Sachs D.H., Schechter A.,N. Mathematical Models for Interacting Groups in Nuclear Magnetic Resonance Titration Curve., Biochem., 1972, v. II, p. 541-547.

117. Химмельблау Д. Прикладное нелинейное программирование. М.: Мир, 1975.-534 с.

118. Демюдович Б.П., Марон И.А. Основы вычислительной математики.-М.: Наука, 1966.-662 с.

119. Reich J.G., Wangermann G., Falck M., Rohde К. A General Strategy for Parameter Estimation from Isosteric and Alloste-ric-Kinetic Data and Binding Measurements. Eur.J.Biochem., 1972, v. 26, p. 368-379.

120. Fraser R.D.B., Suzuki E. Physikal Principles and Techniques of Protein Chemistry. Part С.-Academ.Press, New-York and London, 1973, p. 301-355.

121. Худсон Д. Статистика для физиков. М.: Мир, 1967.-242 с. Румшский JI.3. Математическая обработка результатов эксперимента. - М.,Наука, 1971.-192 с.

122. Карманов В.Г. Математическое программирование. М., Наука, 1975.-269 с.

123. Tanford С., Roxby R. Interpretation of Protein Titration Curfes. Application lisozyme.-Biochem., 1972, v. II, № II, p. 2192-2198.

124. Сумская JI.В., Балашова Т.Е., Чумбуридзе Т.С., Мельник Е.И., Михалева И.И., Иванов В.Т., Овчинников Ю.А. Бис-производные валиномицина и энниатина В как комплексоны и ионофоры.-Биоорган. хим., 1977, т.З, № 1, с. 5-21.

125. Грунд Ф. Программирование на языке Фортран IV.-М., Мир, 1976.-182 с.

126. Россотти Ф., Россотти X. Определение констант устойчивости и других констант равновесия в растворах. -М., Мир, 1965.564 с.

127. Взаимодействия в растворах окислительно-восстановительных систем '/Под ред. Б.П.Никольского и В.В.Пальчевского JI. , ЛГУ, 1977. - 196 с.

128. Гурьянова Е.Н., Гольдштейн И.П., Ромм И.Г. Доннорно-акцептор-ная связь. М., Химия, 1973.-150 с.

129. Ellis K.J., Duggleby R.G. What Happens when Data are Fitted to the wrong Equation?- Biochem., 1978, v. 171, p. 513-517.

130. Афифи А., Эйзен С. Статичтический анализ. -М., Мир, 1982488 с.

131. Бек М. Химия равновесий реакций комплексообразования. М., Мир, 1973.-359 с.

132. Frensdorff Н.К. Stability Constants of Cyclic Polyether Complexes with Univalent Cations. J.A.C.S.I97I, v. 193, № 3, p. 600-606.

133. Wuthrich K., Wider G., Wagner G., Braun W. Sequential Resonance Assignements as a Basic for Determination of Spatial Protein Structures by High Resolution Proton Nuclear Magnetic Resonance.-J.Mol.Biol., 1982, v. 155, p. 3II-3I9.

134. Bax A., Freeman R. Investigation of Complex Networks of Spin-spin Coupling by Two-Dimensional NMR.-J.Magn.Res., 1981, v. 44, p. 542-561.

135. Macuza S., Ernst R.R. Eludication of cross relaxation in liquids by two-dimensional N.M.R. spectroscopy.-Molecul. Phys., 1980, v. 41, № 1, p. 95-117.

136. Hosur R.V., Wider G., Wuthrich K. Sequential Individuali

137. Resonance Assignements in the H Nuclear-Magnetic-Resonance Spectrum of Cardiotoxin V from Naja mossambica mossamcica.

138. Eur. J.Biochem., 1983, v. 130, p. 497-508.

139. Арсеньев А.С., Кондаков В.И., Майоров В.Н., Волкова Т.М., Гришин Е.В., Быстров В.Ф., Овчинников Ю.А., Биоорган, хим., 1983, т. 9, № 6, с. 768-793.

140. Kumar A., Wagner G.s Ernst R.R., Wuthrich К, Build Ratesof the Nuclear Overhauser Effect Measured by Two-Dimensional Proton Magnetic Resonance Spectroscopy: Implications for Studies of Protein Conformation.- J.A.C.S. 1981, v. 103, p. 3654-3658.

141. Stejskal E.O., Shaefer J. Comparisons of Quadrature and Single-Phase Fourier Transform NMR. J.Magn.Res. , 1974, v. 14, p. 160-169.

142. Wokaun A., Ernst R.R. Selective Detection of Multiple Quantum Transitions in NMR by Two-Dimensional Spectroscopy. Chem. Phys.Lett., 1977, v. 52, p. 407-412.

143. Macura S., Huang Y., Suter D., Ernst R.R. Two-Dimensional Chemical Exchange and Cross-Relaxation Spectroscopy of Coupled Nuclear Spins., J.Magn.Res., 1981, v. 43, p. 259-281 .