Бесплатный автореферат и диссертация по биологии на тему

Исследование области начала репликации некоторых экстрахромосомных ДНК эукариот

ВАК РФ 03.00.03, Молекулярная биология

Содержание диссертации, кандидата биологических наук, Эльдаров, Михаил Анатольевич

ВБВДЕНИЕ.

ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.

Глава I. УЧАСТКИ НАЧАЛА РЕПЛИКАЦИИ ДНК ЭУКАРИОТ

1.1. Особенности репликации хромосом эукариот.

1.2. Репликация экстрахромосомных ДНК . II

1.3. Репликация ДНК у дрожжей-сахаромицетов

1.4. Роль репликаторных участков эукариот в процессах, связанных с дестабилизацией генома клетки.

Введение Диссертация по биологии, на тему "Исследование области начала репликации некоторых экстрахромосомных ДНК эукариот"

С момента установления пространственной структуры ДНК внимание исследователей было направлено на расшифровку механизмов,обеспечивающих точную редупликацию генетического материала в клетке /I/. Основные сведения об энзиматических, факторах и стадиях репликации ДНК были получены на прокариотических. системах. Трудности в изучении процесса репликации ДНК в эукариотической клетке определяются гораздо более сложной организацией хромосом эукариот, недоступностью в использовании простых биохимических и генетических методов исследования репликации ДНК для большинства эукариотических организмов.

Развитие методов молекулярного клонирования и расшифровки первичной структуры нуклеиновых, кислот /2/ в последнее время значительно расширило наши знания об организации и механизмах функционирования генетического аппарата клетки. Важным следствием прогресса в структурных, исследованиях нуклеиновых кислот явилась возможность изучения регуляторных элементов ДНК. и среди них - последовательностей, функционально важных для репликации.

Перспективными модельными системами для исследования структурных компонентов аппарата репликации являются просто организованные автономно реплицирующиеся экстрахромосомные ДНК эукариот, имеющие вирусное, органелльное или плазмидное происхождение. Изучение этих репликонов имеет важное значение для создания генно-инженерных, систем трансформации клеток высших.

В результате исследований, выполненных на различных объектах, в составе экстрахромосомных генетических элементов был выявлен специфический участок ДНК, необходимый для эффективной инициации синтеза ДНК.- участок начала репликации или "репликатор". Знание первичной структуры этих важных участков ДНК,очевидно, должно способствовать пониманию молекулярных механизмов процессов инициации и регуляции синтеза ДНК.

Митохондриальная ДНК (мтДНК) млекопитающих - высших эукариот, и рибосомная ДНК, (рДНК) низших эукариот - дрожжей-сахаромицетов, представляют собой пример репликонов с хорошо известной физической и генетической структурой. Ряд особенностей репликации мтДНК делает, этот объект исключительно удобным для тонкого картирования мест инициации синтеза ДНК с помощью методов определения первичной структуры нуклеиновых кислот.

Гены рРНК пекарских дрожжей Saccharomycea cerevisiae на протяжении ряда лет являлись предметом исследования в лаборатории функциональной энзимологии Института молекулярной биологии AR СССР, благодаря чему в настоящее время установлена полная первичная структура повтора рДНК, определены места инициации и терминации транскрипции предшественников рРНК.

Результаты этих исследований в сочетании с новыми методами молекулярного клонирования на дрожжах-сахаромицетах послужили основой для настоящей работы по картированию репликатора рДНК.

Целью настоящей работы явилось картирование и исследование с/труктурной организации участков начала репликации мтДНК крысы и рДНК дрожжей, а также анализ особенностей функционирования этих репликаторов В клетках Saccharomyces cerevisiae.

Мы сконструировали серию гибридных плазмид, несущих фрагменты мтДНК и рДНК. Для фрагмента мтДНК, содержащего область начала репликации, установлена первичная структура,, осуществлена точная, локализация точек инициации синтеза ДШС in vivo.

С использованием системы трансформации дрожжей установлена' локализация репликатора в пределах известной нуклеотидной последовательности нетранскрибируемого спейсера повтора рДНК s.cerevisiae . Проведено сравнение свойств репликатора рДНК с другими известными репликаторными последовательностями ДНК дрожжей.

Сравнение структурной организации и механизмов репликации мтДНК и рДЩ позволило высказать некоторые предположения о функции участка области начала репликации, а также о механизмах амплификации генов рРНК в составе хромосом дрожжей.

Сконструированные в процессе выполнения данной работы плазми-ды могут использоваться в качестве векторных молекул ДНК для специфического включения чужеродных последовательностей в состав хромосомного повтора рЦНК, дрожжей. Нам кажется, что принцип создания векторов на основе рДНК может иметь и более широкое значение при разработке систем переноса генетической информации в клетки других эукариотических микроорганизмов, в том числе промышленных ввдов дрожжей. 8

Заключение Диссертация по теме "Молекулярная биология", Эльдаров, Михаил Анатольевич

выводы

1. Осуществлено клонирование и определена нуклеотидная последовательность фрагмента мтДНК печени крысы, содержащего область начала репликации.

2. Выяснена природа гетерогенности Е-тяжа, инициирующего синтез мтДНК. На последовательности ДНК в области начала репликации установлена точная локализация 5-концевых нуклеотидов Е-тяжа.

3. Получена коллекция гибридных плазмид, несущих набор фрагментов нетранскрибируемого спейсера повтора генов рРНК дрожжей в составе бифункциональных векторов.

4. С использованием системы трансформации дрожжей-сахаромицетов установлена локализация автономно реплицирующейся последовательности повтора рДНК дрожжей.

5. Проведено сравнение нуклеотидной последовательности и эффективности функционирования арп рДНК с другими репликаторами хромосом дрожжей. Установлено, что область начала репликации мтДНК крысы неспособна поддерживать автономную репликацию плазмид в клетках дрожжей. к к

Автор выражает глубокую благодарность своим научным руководителям академику А.А.Баеву, докт.биол.наук .К.Г.Скрябину за предоставленную счастливую возможность работать в отделе генетической инженерии Института молекулярной биологии АН СССР, за постоянное внимание, помощь и поддержку, оказанные на всех этапах работы.

Автор приносит благодарность коллегам по проведению совместных исследований-докт.биол.наук Г.Г.Гаузе, канд.биол.наук В.Л.Ларионову, канд.биол.наук С.И.Томареву, канд.хим.наук В.М.Захарье-ву, без помощи которых данная работа не была бы выполнена. Я также признателен всем сотрудникам лаборатории за консультации, доброе отношение и внимание к работе.

Библиография Диссертация по биологии, кандидата биологических наук, Эльдаров, Михаил Анатольевич, Москва

1. Корнберг А. Синтез ДНК. М.: Мир., 1975, 359 с.

2. Журнал ВХО им. Д.И.Менделеева, 1984, XXIX. Номер посвящен генетической инженерии.

3. Callan H.G. DNA replication in the chromosomes of eufearyotes. Cold Spring Harbour Symp.Quant.Biol., 1973, j58, 195-203.

4. Blumenthal А.В., Kriegstein H.J., Hogness D.S. The units of DNA replication in Drosophila melanogaster chromosomes. Ibid., 205-223.

5. De Pamphilis M.G., Wassarman P.M. Replication of eukaryotic chromosomes: a close-up of the replication fork. Annu.Rev. Bio-chem., 1980, 6276. Harland R. Initiation of DNA replication in eukaryotic chromosomes. TIBS, 1981, March, 71-74.

6. Goldman M.A., Holmquist G.P., McGray M.C., Caston L.A., Nag A. Replication timing of genes and middle repetitive sequences. Science, 1934, 224, 686-698.

7. Laskey R.A., Harland R.M. Replication origins in the eukaryotic chromosomes. Cell, 1981, 24, 283-284.

8. Cook P.R., Lang J. The spatial organisation of sequences involved in initiation and termination of eukaryotic DNA replication. Nucl.Acids Res., 1984, 12, 1069-Ю75.

9. Russev G. and Vassilev L. Isolation of a DNA fraction from Ehrlich ascites tumour cells containing the putative origin of replication. J.Mol.Biol., 1982, 161,77-87.

10. Hines P.J., Benbow R.M. Initiation of replication at specific origins in DNA molecules microinjected into unfertilized eggs of the frog Xenopus laevis. Cell, 1983, ¿1, 503.

11. Laskey R.A., Harland R.M. Replication origins in the Xenopus eggs. Cell, 1982, ¿0, 455 468.

12. Challberg M.D., Kelly T.D. Eukaryotic DNA replication: viraland. plasmid model system.Annu.Rev.Biochem.,1982,^2^

13. DNA tumor viruses:molecular biology tumor viruses. Second ed,

14. Part 2/Revised,CSHL-CSH, 1982, 1072 p., 15-Хилько С.Н.Онкогены и онкобелки паповавирусов.В кн.:Итоги науки и техники.Молекулярная биология.М.:ВИНИТИ.1982ДГК, 183-234.

15. Acheson N.H.,Lytic cycle of SV-40 and polyoma viruses.In:"DNA tumor viruses:molecular biology of tumor viruses."CSHL-CSH, 1982,125-204.

16. Subramanian K.N. ,Dhar R.,Weismann S. V/.Nucleotid sequence of a fragment of SV-40 ША that contains the origin of replication and specifies the 5-ends of 2earlyJ? and "late" viral RNA.J.Biol. Chem.,1977,252, 355-367.

17. Soeda E.,Kimura G.,Miura К.-I.Similarity of nucleotide sequences around the origin of DNA replication in mouse polyoma virus and simian virus 40.Proc.Natl.Acad.Sci.USA,1978, 7£, 162-166.

18. Dhar E.,Lai C.-J.,Khouri G. Nucleotide sequence of the DNA replication origin for human papovavirus BKV: sequence and structural homology with SV-40. Cell, 1978, 13, 345-358.

19. Rio B.C., To'ian R. Multiple control elements involved in the initiation of SV-40 late transcription. J.Mol.Applied Genetics, 1984,2, 423-435.

20. Tjian R. Protein-DNA interactions at the origin of simian virus 40 DNA replication. Cold Spring Harbour Symp. Quant.Biol., 1978, 43,

21. Myeres R.M., Tjian R. Construction and analysis of simian virus 40 origins defective in tumor antigen binding and DNA replication.Proc.Natl.Acad.Sci.USA. , 1980, 71, 6491-6495.

22. Scortle D.R., Magnoleskee R.P., Nathans P. Mutational analysis of the simian virus 40 ref)licon: pseudorevertans of mutants with a defective replication origin. Proc.Natl.Acad.Sci.USA., 1978, 78, 6128-6131.

23. Bergsma D.J., Olive D.M., Hartzell S.W., Subramanian K.N. Territorial limits and functional anatomy of the simian virus 4-0 replication origin. Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 1982, 22*381 385.

24. Gluzman Y. SV-40 transformed simian cells support the replication of early SV-40 mutants. Cell, 1981, 2£, 175 193.

25. Cuthman H., Nillsson M.G., Magnusson G. Non-contiguos segments of the polyoma genome required in cis for DNA replication. J.Mol.Biol., 1982, 161, 533 550.

26. Hay R.T. and de Pamphilis M.Li Initiation of SV-40 replication in vivo: location and structure of 5'ends of DNA synthesized in the ori region. Cell, 1982, 28, 767 779.

27. Contreras R., Gheysen D., Knowland J., Van de Voorde A,, and Friers \h Evidens for the direct involvement of DNA replication origin in synthesis of late SV-40 RNA. Nature, 1982, 302,500 &06.

28. Wasylyk В., Wasylyk C., Mattias H., V/intzer M. and Chambon P. Transcription from the SV-40 early-early and late-early overlapping promoters in the absence of DNA replication. The EMBO J., 1983, 2, 1487 1492.30. Scott

29. Бендукидзе К.А., Фодор И.И, Векторы и генетическая клетокживотных. Там же, 23 27.

30. Гаузе Г.Г. Митохондриальная ДНК.М.: Наука, 1977, 288 с.

31. Шугалий A.B. Организация митохондриального генома. В кн. Итоги науки и техники. Молекулярная биология, М,: ВИНИТИ, 1982, |8, 235 294.

32. Kasamatsu H., Robberson D.L., Vinograd J. A novel closed-circular mitochondrial DNA with properties of a replicating inter mediate. Proc.Natl.Acad.Sei.USA., 19711 68, 2252 2257.

33. Bogenhagen D., Clayton D.A. Mechanism of mitochondrial DNA rep lication in mouse L cells: kinetics of synthesis and turnover of the initiation sequence. J.Mol.Biol., 1978, 119, 49 81T

34. Bibb. M. J., Van Etten, R. A., Wright, C. T., Vialberg, M. W. and Clayton, D. A. Sequence and gene organization of mouse mitochondrial DNA. Cell, 1981, 26, 167-180.

35. Kroon A. M., Pepe G., Bakker U., IlOltrop M. , Bollen J. E., van Brüggen E. P. J., Cantatore P., Terpstra P. and Saccone C. The restriction fragment map of rat-liver mitochondrial JKA: a reconsideration. Biochim. Biophys. Acta, 1977, 478, 128 145.

36. Molecular Biology of the yeast Saccharomyces: life cycle and inheritance. Cold Spring Harbor. Ed. by S. Prakash et al., 1981

37. Struhl K. The new yeast genetics. Nature, 1983, 30£, 391 397.

38. Mortimer R. K., Schild D. Genetic map of Saccharomyces cerevi-siae. Microbiological Reviews, 1980, 44, 519 571.

39. Petes T. D. Molecular biology of yeast. Ann. Rev. Biochem., 1980, 49, 847 876.

40. Pangma L., Zakian V. A. Genome structure and replication. In: Mol. Biology of the yeast Saccharomyces: life cycle and inheritance. Cold Spring Harbour. Ed. by S. Prakash et al., 1981, 27 57.

41. Carter B. L. A. The organisation and replication of genetic material in yeast. Cell, 1975, 6, 259 268.

42. Rivin G. J., Fangman W. L. Replication fork rate and origin activation during the Svphase of Saccharomyces cerevisiae. J. Cell. Biology, 1980, 108- 115.

43. Beggs u. D. Transformation of yeast by replicating hybrid plas-mid. nature, 1978, 104 109.

44. Ларионов БД. Плазмиды и векторы дрожжей-сахаромицетов. Генетика .1980, 16, 2085-2106.61'. otorms R. К., McfJ eil J. и., Khandekar P. S., Parker G. J.,

45. Friesen J. D. Chimeric plasmids for cloning of deoxyribonucleic acid sequences in Saccharomyces cerevisiae. J. Bacteriology, 1979, 140, 73 82.

46. Botstein D., Falco S. C., Stewart S. E., Brennan M., Scherer S., Stinchcomb D. Т., Struhl K., Davis R. W. Sterile host yeasts (shy): a eukaryotic system of biological containment for recombinant DNA experiments. Gene, 1979, 8, 17 24.

47. Hicks J. В., Hinnen A., Fink G. R. Properties of yeast transformation. Cold Spring Harbour Sympos. Quant. Biol., 1979, 43, 1305 1314.

48. Scherer S., Davis R. W. Replacement of chromosome segments with altered DNA sequences constructed in vitrol Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1979, ^951 4-955.

49. Stinchcomb D. T., Mann C., Selker E. and Davis R. W. DNA sequences that allow the replication and segregation of yeast chromosomes. ICN-UCLA. Symp. Mol. Cell. Biol., 1981, 22, 473 -48C.

50. Chan C. S. M., Tye B.-K. Autonomously replicating sequences in

51. S. cerevisiae. Pros. Natl. Acad. Sci. USA, 1980, 7Z» 6529 65335

52. Celniker S. E. and Cambell J. L. yeast DNA replication in vitro: initiation and elongation events mimic in vivo processes. Cell, 1982, 31, 201 213.

53. Ko jo II., Greenberg B. D., Sugino A. Yeast 2 jm plasnid vi\A replication in vitro: origin said direction. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1981, £8, 7261 7265.

54. Jazwinski S. K. and Edelman G. M. Protein complexes from active replication fractions associate in vitro v/ith the replication origins of yeast 2jam DNA plasmid. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1982, 29, 34-28 3432.

55. Jazwinski S. M., Niedzwiecka A. and Edelman G. M. In vitro association of a replication complex with a yeast chromosomal replicator» «7. Biol. Chem. 1983, 2^8, 2754- 2757.

56. Jazwinski S. M., Edelman G. M. Evidence for participation ofa multiprotein complex in yeast DM replication. J. Biol. Chem.i984, 2^9, 6852 6857.

57. FangmaiW. L., Hice R. U. and Chlebowicz-Zledziewska E. ARS replication during the yeast S phase. Cell, 1983, j>2, 831 838.

58. Zakian V. A., Brewer B. J., Fangman W. L. Replication of each copy of the yeast 2 micron DNA plasmid occurs during the S-phase. Cell, 1978, 12, 923 934.

59. Zakian V. A., Kupfer D. I-i. Replication and segregation of an •unstable plasmid in yeast. Plasnid," «3982, 8, 15 28.

60. Murray A. W. and Szostak J. W. Pedigree analysis of plasmid segregation in yeast. Cell, 1983, 34, 961 970.

61. LarionovV., Kouprina N. and. Karpova T. Stability of recombinant plasraids containing the ars sequence of yeast extrachromosoraal rDNA in several strains Saccharomyces cerevisiae. Gene, 1984, 28, 229 235.

62. Hsiao C.-L., Carbon J. Direct selection procedure for the isolation of functional centromeric UNA. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1981, 7§jl 3760 3764.

63. Hsiao C.-L., Carbon J. Characterization of yeast replication origin (ars 2) and construction of stable minichrosomes containing cloned yeast centromere DNA (CEN 3). Gene, 1981, 15, 157 166.

64. Clarke L., Carbon J. Isolation of a yeast centromere and construction of functional small circular chromosomes. Nature, 1980, 287, 504 509,

65. Fitzeraid-Hayes M., Buhler J.-M., Cooper T. G., Carbon J. Isolation and subcloning analysis of functional centromere UNA (CEN 11) from yeast chromosome XI. I-lol. Cell. Biol., 1982, 2 , 82 87.

66. Fitzgerald-Hayes HI, Clarke L., Carbon J. Nucleotide sequence comparisons and functional analysis of yeast centromere UNAs.1. Cell, 1982, 29, 235 244.

67. Stinchcomb D. Т., Mann C., Davis R. W. Centromeric DNA from Saccharomyces cerevisiae. J. Mol. Biol., 182, 158, 157 179.

68. Porte M. A., Fangman W. L. Yeast chromosomal DNA molecules have strands which are cross-linked at their termini. Chromosoma, 1979, 72, 131 150.

69. Szostak J. V/., Blackburn E. N. Gloning yeast telomeres on linear plasmid vectors. Cell, 1982, 29, 24-5 255.

70. Murray А. V/. and Szostak J. V/. Construction of artificial chromosomes in yeast. Nature, 1983, 30£, 189 193.

71. Gerbaud C., Fournier Ph., Blanc H., Heslot H., Guerineau M. High frequency of yeast transformation by plasmids carrying part or entire 2yum yeast plasmid. Gene, 1979, 233 253.

72. Broach J. R. The yeast plasmid 2 jx circle. Cell, 1982, 28, 203 204-.

73. Broach J. R., Strathern J. N., Hicks J. B. Transformation in yeast: development of a hybrid cloning vector and isolation of the CAN1 gene. Gene, 1979, 8, 121 133.

74. Blanc H., Dijon B. Replicator regions of the yeast mitochondrial DNA active in vivo and in yeast transformants. In: Mitochondrial genes. Cold Spring Harbour Laboratory. N. Y., 1982, 279 294.

75. Hyman В. C., Cramer J. H., Rownd R. H. Properties of a S. cerevisiae mt DNA segment conferring high frequency yeast trans- ' formation. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1982, 79, 1578 1582.

76. Копылова-Свиридова Т.Н.»Бельков В.В., Фодор И.И., Баев А.А. Новые дрожжевые векторы на основе митохондриальной ДНК Saccharomyces cerevisiae. Докл. АН СССР,1981, 259, 990-993.

77. Szostak J. V/., V/u R. Insertion of a genetic marker into the ribosomal DNA of yeast. Plasmid, 1979, 2, 536 554.

78. Ларионов В.Л., Шубочкина Е.А. Конструирование гибридных плаз-мид, содержащих репликатор дрожжей. Молекулярная биология, 1982, 16, 948-984.

79. Stinchcomb D. Т., Thomas М., Kelly J., Selker Е., Davis R. W. Eukaryotic DIJA segments capable of autonomous replication in yeast. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1980, 2Z» 4559 4565.

80. Zakian V. A. Origin of replication from Zenopus laevis mitochondrial ША promotes high-frequency transformation of yeast. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1981, 78, 3128 3152.

81. Mol. Gen. Genetic., 1981, 18£, 306 313.

82. Kim т., Ray D. ¡5. A 189 bp fragment of Orithidia fasciaulatamaxicircle jjNA confers autonomous replication in Saccharomy-ces cerevisiae. Gene, 1984-, 29, 103

83. Kochaix d.-P., van Dillewijyn <j . and Rahire и. uonstruction and characterisation of autonomously replicating plasmids in the green unicellular alga Ghlamydomonas reinhardii. (Jell, ' 1984, j56, 925 931.

84. Henry 11, В. В., Raab-Traub N. J. and Pagano J. S. Detection of autonomous replicating sequences in the genome of Epstein-Barr yirus. Proc. Natl. Acad. Sci. USA., 1983, 80, 1096 1100.

85. Оганесян H.A., Бельков В.В., Копылова-Свиридова Т.Н., Чепур-ной А.И., Фодор И,И. Репликация гибридных плазмид, содержащих гены вируса полиомы в дрожжевой клетке. Докл. АН ССОР, 1982, 267, 1237-1239.

86. Hollenberg С. PI, Degelmann A., Kustermann-Kuhn В., Royer Н. Б. Characterization of 2 jm DUA of S. cerevisiae by restriction fragment analysis and integration in an E. coli plasmid. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1976, 73, 2072 2076.

87. Petes T. D., Williamson D. N. Replicating circular DNA molecules in yeast. Cell, 1975, ±, 24-9 253.

88. Beggs J. D., Guerineau M., Atkins J. F. A map of the restriction targets in yeast 2 pm plasmid DNA cloned on bac- ,teriophage lambda. Mol. Gen. Genet., 1976, 148, 287 294.

89. Seligy V. L., Thomas D. I., Hiki 3. L. A. Saccharomyces ce-revisiae plasmid, Sep or 2 jim: intracellular distribution, stability and nucleosomal-like packaging. Nucl. Acids Res., 1980, 8, 3371 3389.

90. Livingston D. M., Hahne S. Isolation of condensed intracellular form of the 2 yum DNA plasmid of Saccharomyces cerevi-siae. Proc. Nat., Acad. Sci. USA, 1979, 2£, 3727 3731.

91. Taketo M., Jazwinski S. M., Edelman G. r-i. Associatioa o£ -uiie 2jm liiiA plasmid with yeast folded chromosome. Proc. iNatl. Acad. aci. USA, 1980, 22> 3144 31^8.

92. Livingston u. ri. inheritance of 2 yum jma plasmid from oaccha-romyces. genetics, 1977, 96, 73 84.

93. Martiej J. 1j. , uonelson o. nucleotide sequence or vne yeast plasmid. Mature, 198u, 286, 86u- 865.119. iiolM o. clonal lethality caused by the yeast plasmid 2 yum I a>mw well, 1982, 29, 585 59^.

94. Guerineau M., Grandchamp C., Slonimski P. P. Circular DM of a yeast episome with two inverted repeats: structural analysis by restriction enzymes and electron microscopy. Proc. Natl.,,Acad. Sci. USA, 1976, 22» 3030 303^. I

95. Gubbins E. <1., Newlon C. S., Kann M. D., Donelson J. E. Sequence organization and expression of a yeast plasmid DNA . Gene, 1977, 1, 185 207.

96. Broach J. R., Hicks J. B. Replication and recombination functions associated with the yeast Dlasmid 2yum circle. Cell,1980, 21, 501 508.

97. Reynolds A.,Murray A. and Szostak J. ELP-Mediated recombination between inverted repeats causes 2 pm DNA amplification. In: Abstacts of XII Intern.Conference on yeast genetics and molecular biology, Edinburgh984,p.55.

98. Kikuchi I. Yeast plasmid requires a cis-acting locus andtwo plasmid proteins for its stable maintenance. Cell, 1983, ' 35, 487 499.

99. Schweizer E., KacKechnie C„, Halvorson H. D. The redundancy of ribosomal and transfer RNA genes in S. cerevisiae. J. "ol. Tliol., 1969, fK>, 261 277.

100. Petes t. jj., »otstein jj. Simple Mendelian inheritance of the reiterated ribosomal in yeast. Proc. Natl. Acad.sci. USA, 1^77, ¿4, 5091 5095.

101. Petes T. D., Smolik-utlaut Evidence that the ribosomal DNA genes of yeast are not on chromosome I. Mol. Gen. Genet. 1979, 187 193.

102. Zamb T. J., Petes T. D. Analysis of the ¿junction between ribosomal RNA genes and single-copy chromosomal sequences in the yeast Saccharomyces cerevisiae. Cell, 1982, 28, 355364.

103. Petes T. D. Yeast ribosomal DliA genes are located on chro-mosomalXII. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1979, £6, 410 414. I

104. Meyerink J. H., Klootwi;jk J., Planta R. J., van der Ende A., van Bruggen E. F. J. Extrachromosomal circular ribosomal DNA in the yeast S. carlsbergensis. Nucl. Acids. Res., 1979, Z, 69 76.

105. Clark-Walker G. D., Azaa A. A. Hybridizable sequences between cytoplasmic ribosomal Rl^As and 3 micron circular DNAs of Saccharomyces cerevisiae and Torulopsis glabrata. Nucl. Acids Res., 1980, 8, 1008 1022.

106. Larionov V. L., Grishin A. V., Smirnov M. N. 3 ;um DNA an extrachromosomal ribosomal DNA in yeast Saccharomyces cerevisiae. Gene, 1981, 12, 41 - 49.

107. Nath, K. and Bollon A. P. Organization of the ribosomal RNA gene cluster via cloning and restriction analysis. J. Biol. Chem., 1977, 2^2, 6562 6571.

108. Bell G. K., DeGennaro L. J., Gelfand D. II., Bishop R. J., Valenzuela P. and Rutter W. J. Ribosomal RNA genes of S. cerevisiae. J. Biol. Chem., 1977, 2^2, 8118 8125.

109. Philippsen, P., Thomas, M., Kramer, R. A. and Davis R. W.

110. Unique arra&ement of coding sequences of 5S, S, 18 S and 25 S rDNA in Saccharomyces cerevisiae as determined by R-loop and hybridization analysis. J. Mol. Biol., 1978, 123, 387 ¿KM-.

111. Cramer J. II., Farrelly F. W., Barnitz J. T. and Rownd, R. H. Construction and restriction enzyme mapping of hybrid plasmids containing S. cerevisiae ribosomal D^A. Mol. Gen. Genet., 1977, 151, 229 244.

112. Petes T. D., Hereford L. M. and Skryabin K. G. Characterization of two types of yeast ribosomal DMA genes. J. Bacte-riol., 1978, 1J54, 295 305.

113. Valenzuela, P., Bell G. I., Masiarz F. R., De Gennaro L. J. and Rutter W. J. nucleotide sequence of the yeast 5 S ribosomal RNA gene and adjacent putative control regions. Nature, 1977, 267, 641 643.

114. Veldman G. M., Klootivij'k, J. De Jonge P., Leer R. J. and Planta R. J. The transcription termination site of the ribosomal R^A operon in yeast. Nucl. Acids Res., 1980, 8, 5179 5192.

115. Bayev A. A., Georgiev 0. I., Hadjiolov A. A., Kermekchiev

116. M. B., Hikolaev il., Skryabin K. G. and Zakharyev V. M. (

117. The structure of the yeast ribosomal R^A genes.2. The nucleotide sequence of the initiation site for ribosomal RNA transcription. Hucl. Acids Res., 1980, 8, 4919 4926.

118. Скрябин К.Г., Краев А.С., Рубцов П.М., Баев А.А. Полная последовательность нуклеотидов спейсерной области, располоя; женной между генами 18 и 5,8 РНК дрожжей. Докл.АН СССР, 1979, 247, 761-765.

119. Скрябин К.Г., Захарьев В.М., Баев А.А. Структура внешнего транскрибируемого спейсера рибосомальной ДНК дрожжей. Докл. АН СССР, 1980, 241, 488-490.

120. Maxam A.M., Tizard K.G. and Gilbert W. Promoter region for yeast 5S ribosomal RNA. Nature, 1977, 267, 645-645.

121. Long E.O., Dawid I.B. Repeated genes in eukaryotes. Ann. Rev. Biochem., 1980, 727-764.

122. HocfeoB B.B., Брага Э.А. Гены рибосомных РНК. В кн.: Итоги науки и техники. Молекулярная биология, 18 , II0-2I5, М., ВИНИТИ, 1982.

123. McMahon М.Е., Stamenkovich D. and Petes T.D. ïandemly arranged variant 5S ribosomal RNA genes in the yeast Saccharomy-ces cerevisiae. Nucl.Acids Res., 12, 1984, 8001-8016.142.143.144.45.

124. Tschumper G., Carbon J. Sequence of yeast DNA fragment containing a chromosomal replicator and TRP1 gene. Gene, 1980, 10, 157-166.

125. Tschumper G. and Carbon J. Delta sequences and double symmetry in yeast chromosomal replication region. J.Mol.Biol. 1982, 1^6, 295-307.

126. Feldman II., Aah I., and Friederreich H. Sequence of a yeast DNA fragment containing a chromosomal replicator and a RNA^ gene. Nucl. Acids Res., 1981., 9, 2949-2956.

127. Kearsey S. Analysis of sequences conferring autonomous replication in baker's yeast. The EMBO J., 1983, 2, 1571-1575.

128. Broach J.R., Li Y.Y., Feldman J., Jayaram M., Abraham J., Nasmyth K.A. and Hocks J.B. Localisation and sequence analysis of yeast origins of DNA replication. Cold Spring Harbour Symp. Quant.Biol., 1983, 4Z, 1165-1173.

129. Kearsey S. Structural requirements for the function of a yeast chromosomal replicator. Cell, 1984, 37, 299-307.

130. Singh H., Bieker J.J., Dumas L.B. Genetic transformation of Saccharomyces cerevisiae with single-stranded circular DNA vectors. Gene, 1982, 20, 441-449.

131. David M.J. and Cilley J.U. In vivo consequences of plasmid topology. Nature, 1981, 292, 380-382.

132. Johnston J., Hilger .?., Mortimer R. Variation in frequency of transformation by plasmid YRp7 in Saccharomyces cerevisiae. Gene, 1981, 16, 325-329.

133. Erhart E., Hollenberg C.P. The presence of defective LEU2 gene on 2yi DNA recombinant plasmids of Saccharomyces cerevisiae is responsible for curing and. high copy number. J. Bacteriol., 1983, 156, 625-635.

134. Osley M.A., Hereford L. Identification of a sequence responsible for periodic synthesis of yeast histone 2A mRNA. Proc. Natl Acad. Sci. USA, 1982, 79, 7689-7693.

135. Scott J.F., Brajkovich C.M. Chromatin organisation of T'rpl-R1-circle: a high-copy-number yeast chromosomal DNA plas-mid. In: Thesis Conference: Molecular Biology of yeast. Cold Spring Harbour, 1981, CSH (USA), p.93.

136. Livingston D.M. A sequence of the yeast 2u plasmid chromosome near the origin of replication is exposed to restrictionendonuclease digestion. H.Mol.Biol.,1982, 160, 397-410.

137. Хесин P.Б, Непостоянство генома. Наука. М.:1924,723 с.

138. Schimke R.T. Gene amplification in cultered animal cells. Cell, 1984,

139. Pellegrini S., Payley L., Basilico C. Amplification and excision of integrated polyoma DNA sequence require a functional origin of replication. Cell, 1984, J36 , 943-949.

140. Botchan M., Торр V/., Sambrook J. Studies on SV40 excision from cellular chromosomes. Cold.Spring Harbour Symp.Quant. Biol. 1978, 43, 709-715.

141. Bernardi G. The origins of replication of the mitochondrial genome of yeast. TIBS, 1982, 7, 404-408.

142. Blanc II., and Dujon B. Replicator regions of the yeast mitochondrial DNA responsible for suppressiveness. Proc.Natl. Acad.Sci.USA, 1980, 2Z> 3942-3946.

143. Esser K., Kiick 0., Stahl V. and Tudrynski P. Cloning vectors of mitochondrial origin for eukariotes: a new concept in genetic engineering.Current Genetics,^983, £> 239-243.

144. Stahl V.,Tudzynski P.,Kiick V., Esser K. Replication and expression of a bacterial-mitochondrial hybrid plasmid in the fungus Podospora anserina.Proc.Natl.Acad.Sci.USA,1982,29, 3642-3645.

145. Stohl L.L. and Lambowitz A.M. Construction of a shuttle vector for the filamentous fungous Neurospora crassa. Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 1983, 80, 1058-1062.

146. Stern D. and Lonsdale D.M. Mitochondrial and chloroplast genomes of maize have a 12 kb DNA segment in common. Nature, 1982, 299, 699-704.

147. Ratzkin В., Carbon J. Functional expression of cloned yeast DNA in Escherichia coli. Proc. Natl. Ac ad. Sci. USA, 1977,2ft, 487-491.

148. Скрябин К.Г., Томарев С.И., Гаузе Г.Г.,Баев АД. Клонирование митохондриальной ДНК крысы с использованием вектора с различающимися липкими концами. Докл. АН СССР, 1978, 241, 1220-1223.

149. Миллер Дж. Эксперименты в молекулярной генетике.Мир,1976.

150. Захарьев И.А.,Кожин С.А.,Кожина Т.Н.»Федорова И.В.Сборникметодик по генетике дрожжей-сахаромицетов.Ленинград. 1976.

151. Scherman P., Lawrence C.W. Methods in yeast genetics. In: Handbook of Genetics: Saccharomyces. Ed.by King R.C. Plenum Press, N.Y., 1975, 1, 359-394.

152. Tanaka Ш. and Weisblum B. Construction of a colicin EI-R factor composite plasmid in vitro: moans for amplification of deoxyribo .ucleic acids. J.Bacterid. ,1975, 121, 354-362.

153. Birnboim H.C., Doly I. A rapid alkyline extraction procedure for screening recombinant plasmid DNA. Nucl. Acids Res. 1976, 7, 1513-1523.

154. Roberts R.J. Restriction and modification enzymes and their recognition sequences. Nucl.Acids Res.,1982, 10,

155. Maxam A.M.,Gilbert W. Sequencing end-labeled. DNA with base-specific chemical cleavages. Methods Enzymol., 1980, 65, part 1, 499-560.

156. Scarp P.A., Sugden B. and Sambrook J. Detection of two restriction endonuclease activities in Haemophilus parain-fluenzae using analytical agarose-ethidium bromid electrophoresis. Biochemistry, 1975, 12, 3055-5063.

157. Young Y.P.L., Young R.J. A method for the recovery of nucleic acids from polyacrylamide gels. Anal.Biochem., 1974, 58, 186-293.

158. Tagers M., Erlich S.D. Prolonged incubatin in calcium chloride improves the competence of E.coli cells.Gene, 1979,6, 23-28.

159. Hgen 0. ,Farbaugh P.L., Hinnen A., V7alsh J. M., Pink G.R. Transformation of yeast. In: Genetic engineering, v.I.Ed. by J.K.Seflow and A.Hollaender.Plenum Press, N.Y, and London, 1979, 117-132.

160. Van Solingen P., van der Plaat J.B. Fusion of yeast sphe-ropasts. J.Bacteriol., 1977, 130, 946-947.

161. Ito II., Fukuda Y., Murata K. Transformation of intact yeast cells treated with alkali cations. J.Bacteriol., 1983, 153, 163-168.

162. Orr-Weaver T.L., Szostak J.W. Yeast recombination: the association between double-strand gap repair and crossing-over. Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 1983, 80, 4417 4421.

163. Kafcak D.B., Ilalvorson H.O. Ribosomal DNA magnification in Saccharomyces cerevisiae. J.Bacteriol., 1978, 1,34, 237 245.