Бесплатный автореферат и диссертация по биологии на тему

Исследование локуса гена ВС200 РНК в геноме человека и полуобезьян

ВАК РФ 03.00.04, Биохимия

Содержание диссертации, кандидата биологических наук, Курышев, Владимир Юрьевич

СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННЫХ СОКРАЩЕНИЙ.

ВВЕДЕНИЕ.

ЛИТЕРАТУРНЫЙ ОБЗОР.

Повторяющиеся элементы генома и их значение для эволюционной (молекулярной) систематики.

Классификация повторов.

Две модели эволюции SINE.

Динамика инсерций SINE.

Alu-повторы.

A/w-элемент как повторяющаяся ДНК.

Происхождение Л/и-повторов.

Эволюция /Ш-повторов.

Предполагаемые функции А/и-повторов.

Ген ВС200 и этапы его изучения.

Открытие ВС1 и ВС200 РНК, особенности их структуры.

Эволюционная консервативность ВС1 и ВС200.

Нейроспецифическая экспрессия генов ВС1 и ВС200.

Предполагаемые функции ВС1 и ВС200 РНК.

Регуляция транскрипции ВС1 и ВС200.

Оценка времени интеграции предшественника гена ВС200 и альтернативные гипотезы эволюции приматов.

Когда ген ВС200 стал транскрибироваться?.

МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ.

Источники животных тканей.

Источник геномной ДНК и фаговых геномных клонотек.

Методы молекулярного клонирования, трансформации бактериальных клеток и выделения плазмидной ДНК.

Скрининг геномных клонотек.

ПЦР амплификация и выделение геномных клонов.

Выделение фаговой ДНК в мини-количествах.

Сиквенирование.

Нозерн-гибридизация.

Компьютерный анализ.

РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЯ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ.

Выделение и сиквенирование локуса гена ВС200 из геномов трёх полуобезьян и человека.

Нуклеотидная последовательность локуса ВС200 и филогения приматов.

Отсутствие гена ВС200 в геномах полуобезьян.

Распределение повторяющихся элементов в локусе ВС200.

Построение филогенетического дерева для Рга&тН и человека методом молекулярных часов.

Повторяющиеся элементы и филогения приматов.

Неизвестные" последовательности и гипотезы их происхождения. 49 Новые консенсусные последовательности для А/и-повторов полуобезьян.

Повторяющиеся элементы как временные маркёры для установления филогенетических отношений среди приматов.

Ген ВС200 и димерные А1и-повторы гапаго и лемура - результат двух независимых ретропозонных событий.

Тканеспецифическая экспрессия А1и-повтора, интегрированного в локус ВС200 у галаго.

Ген ВС200 - активный мастер-ген для мономерных А1и-элементов.

Поиск гомологов гена ВС200.

Ретропозонные копии ВС200 или История гена, отражённая в его ретрогенах.

Сходство нуклеотидных последовательностей активных генов ВС200 высших приматов с ретропозонами ВС200 у человека.

Как мог бы выглядеть предшественник гена ВС200?.

ВЫВОДЫ.

БЛАГОДАРНОСТИ.

Заключение Диссертация по теме "Биохимия", Курышев, Владимир Юрьевич

ВЫВОДЫ

1. Клонированы и определены нуклеотидные последовательности протяжённых фрагментов геномной ДНК, соответствующих локусу гена ВС200 у человека, галаго, лемура и долгопята. Новые нуклеотидные последовательности введены в базу данных ОепеВапк.

2. С помощью аналитических компьютерных программ проведено сопоставление исследуемых нуклеотидных последовательностей и установлена общая геномная организация локуса ВС200 предполагаемого предка приматов.

3. В результате анализа выравненных нуклеотидных последовательностей установлено, что ген ВС200 отсутствует в геномах исследуемых полуобезьян (Рга&тН) и является специфичным для высших приматов. Таким образом, выяснено приблизительное время возникновения этого гена, соответствующее периоду после эволюционного расхождения полуобезьян и высших приматов, но до начала дивергенции последних, т.е. около 35-55 млн. лет назад.

4. Проведён сравнительный анализ последовательностей гена ВС200 и димерного /4/и-повтора, обнаруженного в ортологичном сайте у галаго и лемура. Методом диагностических мутаций показано, что мономер ВС200 и /4/и-димеры полуобезьян имеют различное происхождение и были образованы в результате независимой интеграции соответствующих ретроэлементов. Таким образом, локус ВС200 приматов может быть охарактеризован как "горячая точка" для ретропозиции.

5. Применив два независимых подхода в эволюционном анализе локуса ВС200, мы показали преимущество использования повторяющихся элементов7 как временных маркёров эволюции для установления филогенетических связей близкородственных видов. В результате получены дополнительные доказательства принадлежности долгопята к группе Haplorhini (человекоподобные обезьяны), а не к Strepsirhini (лемуроподобные и лориевые обезьяны).

6. Путём сравнительного анализа нуклеотидных последовательностей повторов, обнаруженных в локусе гена ВС200, идентифицированы новые специфичные для полуобезьян A/u-подобные повторяющиеся элементы. Построенные их консенсусные последовательности введены в базу данных повторов Repbase.

7. В результате поиска гомологов гена ВС200 в современных базах данных идентифицированы более 200 его ретропозонных копий. Таким образом,показано, что ген ВС200 является мастер-геном для отдельного подсемейства мономерных А/и-повторов.

8. Анализ транскрипционной активности A/u-повторов, обнаруженных у Strepsirhini в сайте, ортологичном району локализации гена ВС200 у человека, позволил предположить, что соответствующий локус обладает эволюционно консервативными регуляторными элементами, способными поддерживать нейроспецифическую транскрипцию РНК-полимеразы III.

БЛАГОДАРНОСТИ

Прежде всего, я хотел бы выразить свою глубокую признательность моим двум руководителям, профессору Университета города Мюнстера, Юргену Брозиусу, за предложенную интересную тему диссертационной работы, постоянное и живое участие в обсуждении её результатов, и доктору биологических наук, Андрею Петровичу Перевозчикову, чья молекулярно-генетическая школа позволила мне без особых проблем адаптироваться в условиях зарубежной лаборатории, а врождённое качество учителя и дружеская поддержка неоднократно помогали мне в разрешении спорных как научных, так и методических вопросов, возникавших в процессе выполнения и написания диссертации.

Хочу выразить свою благодарность Джерзи Юрка и Полу Клоновскому за первые уроки по основам биоинформатики и постоянное курирование по всем вопросам, касающимся компьютерного анализа нуклеотидных последовательностей, Борису Скрябину за помощь на самых первых этапах экспериментальной работы и в освоении методов сиквенирования и скринирования геномных клонотек.

Особую благодарность мне хочетвся выразить всем моим друзьям, кто создал ту удивительную полную энтузиазма и творчества атмосферу, в которой мне посчастливилось выполнять данную работу. Среди них Евгений Воробьёв, чьи идеи нашли отражение в данной рукописи и легли в основу самых интригующих результатов этой работы, Тимофей Рождественский, оказавший своевременную помощь и принявший непосредственное участие в экспериментах с РНК, результаты которых существенно обогатили экспериментальную часть диссертации, Александр Кондрашов и Карстен Раабе, ставшие моими постоянными аппонентами в чрезвычайно интересных и плодотворных дис^кусиях на различных этапах экспериментальной и теоретической части работы, Валентина Суконина и Александр Людвиг, без чьих рук и дружеской поддержки было бы крайне сложно преодолеть рутину сиквенирования и скрининга геномной клонотеки долгопята. Я крайне признателен Инне Чирковой, Елене Карповой, Арине Дзенискевич, Андрею Кропотову, Сергею Орлову и моей маме за непростой труд по прочтению и коррекции рукописи, Геннадию Чуракову и Андрею Головину за техническую поддержку при оформлении печатного варианта диссертации.

Библиография Диссертация по биологии, кандидата биологических наук, Курышев, Владимир Юрьевич, Санкт-Петербург

1. Altschul, S.F., et al., Basic local alignment search tool. J Mol Biol, 1990. 215(3): p. 403-410.

2. Bailey, A.D. and C.K. Shen, Sequential insertion of Alu family repeats into specific genomic sites of higher primates. Proc Natl Acad Sci U S A, 1993. 90(1): p. 7205-7209.

3. Batzer, M.A., et al., Standardized nomenclature for Alu repeats. J Mol Evol, 1996. 42(1): p. 3-6.

4. Baxendale, S., et al., Comparative sequence analysis of the human and pufferfish Huntington's disease genes. Nat Genet, 1995. 10(1): p. 67-76.

5. Bird, A.P., CpG-rich islands and the function of DNA methylation. Nature, 1986. 321(6067): p. 209-213.

6. Britten, R.J., Cases of ancient mobile element DNA insertions that now affect gene regulation. Mol Phylogenet Evol, 1996. 5(1): p. 13-17.

7. Britten, R.J., DNA sequence insertion and evolutionary variation in gene regulation. Proc Natl Acad Sci USA, 1996. 93: p. 9374-9377.

8. Britten, R.J., Evidence that most human Alu sequences were inserted in a process that ceased about 30 million years ago. Proc Natl Acad Sci USA, 1994. 91(13): p. 6148-6150.

9. Brosius, J., RNAs from all categories generate retrosequences that may be exapted as novel genes or regulatory elements. Gene, 1999. 238: p. 115-134.

10. Brosius, J. and H. Tiedge, Reverse transcriptase: mediator of genomic plasticity. Virus Genes, 1995. 11(2-3): p. 163-179.

11. Burgin, K.E., et al., In situ hybridization histochemistry of Ca2+/calmodulin-dependent protein kinase in developing rat brain. J Neurosci, 1990. 10(6): p. 1788-98.

12. Cheng, J.G., H. "Hedge, and J. Brosius, Expression of dendritic BC200 RNA, component of a 11.4S ribonucleoprotein particle, is conserved in humans and simians. Neurosci Lett, 1997. 224(3): p. 206-10.

13. Cheng, J.G., H. Tiedge, and J. Brosius, Identification and characterization of BC1 RNP particles. DNA Cell Biol, 1996. 15(7): p. 549-59.

14. Culotta, E., A new take on anthropoid origins. Science, 1992. 256: p. 1516-1517.

15. Daniels, G.R. and P.L. Deininger, Characterization of a third major SINE family of repetitive sequences in the galago genome. Nucleic Acids Res, 1991. 19: p. 1649-1656.

16. Daniels, G.R. and P.L. Deininger, Repeat sequence families derived from mammalian tRNA genes. Nature, 1985. 317(6040): p. 819-822.

17. Daniels, G.R. and P.L. Deininger, A second major class of Alu family repeated DNA sequences in a primate genome. Nucleic Acids Res, 1983. 11(21): p. 7595-7610.

18. DeChiara, T.M. and J. Brosius, Neural BC1 RNA: cDNA clones reveal nonrepetitive sequence content published erratum appears in Proc Natl Acad Sci USA 1987 Jul;84(14):4895J. Proc Natl Acad Sci USA, 1987. 84(9): p. 2624-2628.

19. Deininger, P., in Mobile DNA, D. Berg and M. Howe, Editors. 1989, American Society of Microbiology: Washington, DC. p. 619-636.

20. Doolittle, W.F. and C. Sapienza, Selfish genes, the phenotype paradigm and genome evolution. Nature, 1980. 284(5757): p. 601 -603.

21. Eickbush, T.H., Origin and evolutionary relationships of retroelements, in The Evolutionary biology of viruses, S.S. Morse, Editor. 1994, Raven Press: New York. p. 121-157.

22. Eickbush, T.H., Transposing without ends: the non-LTR retrotransposable elements. New Biol, 1992. 4(5): p. 430-40.

23. Faulkner, D.V. and J. Jurka, Multiple aligned sequence editor (MASE). Trends Biochem Sci, 1988. 13(8): p. 321-322.

24. Felsenstein, J., Phytogenies from molecular sequences: inference and reliability. Annu Rev Genet, 1988. 22: p. 521-65.

25. Fuhrman, S.A., et al., Analysis of transcription of the human Alu family ubiquitous repeating element by eukaryotic RNA polymerase III. Nucleic Acids Res, 1981. 9(23): p. 6439-56.

26. Garner, C.C., R.P. Tucker, and A. Matus, Selective localization of messenger RNA for cytoskeletal protein MAP2 in dendrites. Nature, 1988. 336(6200): p. 674-7.

27. Grandbastien, M.A., Retroelements in higher plants. Trends Genet, 1992. 8(3): p. 103-8.

28. Hamdi, H., et al., Origin and phylogenetic distribution of Alu DNA repeats: irreversible events in the evolution of primates. J Mol Biol, 1999. 289(4): p. 861-871.

29. Jurka, J., Origin and evolution of Alu repetitive elements, in The impact of short interspersed elements (SINEs) on the host genome, R. Maraia, Editor. 1995, R.G. Landes: Austin, TX. p. 25-41.

30. Jurka, J., Repbase update: a database and an electronic journal of repetitive elements In Process Citation. Trends Genet, 2000. 16(9): p. 418-420.

31. Jurka, J. and P. Klonowski, Integration of retroposable elements in mammals: selection of target sites letter. J Mol Evol, 1996. 43(6): p. 685-689.

32. Jurka, J., et al., CENSOR-a program for identification and elimination of repetitive elements from DNA sequences. Comput Chem, 1996. 20(1): p. 119-121.

33. Jurka, J. and A. Milosavljevic, Reconstruction and analysis of human Alu genes. J Mol Evol, 1991. 32(2): p. 105-121.

34. Jurka, J. and T. Smith, A fundamental division in the Alu family of repeated sequences. Proc Natl Acad Sci USA, 1988. 85(13): p. 47754778.

35. Jurka, J. and E. Zuckerkandl, Free left arms as precursor molecules in the evolution ofAlu sequences. J Mol Evol, 1991. 33: p. 49-56.

36. Kim, J., et al., Rodent BC1 RNA gene as a master gene for ID element amplification. Proc Natl Acad Sci USA, 1994. 91: p. 3607-3611.

37. Kimura, M., A simple method for estimating evolutionary rates of base substitutions through comparative studies of nucleotide sequences. J Mol Evol, 1980. 16: p. 111-120.

38. Kobayashi, S., S. Goto, and K. Anzai, Brain-specific small RNA transcript of the identifier sequences is present as a 10 S ribonucleoprotein particle. J Biol Chem, 1991. 266(8): p. 4726-30.

39. Korenberg, J.R. and M.C. Rykowski, Human genome organization: Alu, lines, and the molecular structure of metaphase chromosome bands. Cell, 1988. 53(3): p. 391-400.

40. Kumar, S., et al., MEGA2: Molecular Evolutionary Genetics Analysis software. 2001, Bioinformatics.

41. Kuryshev, V.Y., et al., Birth of a Gene: Locus of Neuronal BC200 snmRNA in Three Prosimians and Human BC200 Pseudogenes as Archives of Change in the Anthropoidea Lineage. J Mol Biol, 2001. 309: p. 1049-1066.

42. Labuda, D. and E. Zietkiewicz, Evolution of secondary structure in the family of 7SL-like RNAs. J Mol Evol, 1994. 39(5): p. 506-18.

43. Leeflang, E.P., et al., Phylogenetic evidence for multiple Alu source genes. J Mol Evol, 1992. 35(1): p. 7-16.

44. Luan, D.D., et al., Reverse transcription of R2Bm RNA is primed by a nick at the chromosomal target site: a mechanism for non-LTR retrotransposition. Cell, 1993. 72(4): p. 595-605.

45. Martignetti, J.A. and J. Brosius, BC1 RNA: transcriptional analysis of a neural cell-specific RNA polymerase III transcript. Mol Cell Biol, 1995. 15: p. 1642-1650.

46. Martignetti, J.A. and J. Brosius, BC200 RNA: a neural RNA polymerase III product encoded by a monomelic Alu element. Proc Natl Acad Sci U S A, 1993. 90(24): p. 11563-11567.

47. Martignetti, J.A. and J. Brosius, Neural BC1 RNA as an evolutionary marker: guinea pig remains a rodent. Proc Natl Acad Sci USA, 1993. 90: p. 9698-9702.

48. Matera, A.G., U. Hellmann, and C.W. Schmid, A transpositionally and transcriptionally competent Alu subfamily. Mol Cell Biol, 1990. 10(10): p. 5424-32.

49. McKinnon, R.D., et al., Expression of small cytoplasmic transcripts of the rat identifier element in vivo and in cultured cells. Mol Cell Biol, 1987. 7(6): p. 2148-2154.

50. McPhee, R.D.E. and M. Cartmiil, Basicranial structures and primate systematics, in Comparative Primate Biology, D.R. Swindler and J. Erwin, Editors. 1986, Liss: NY. p. 219-275.

51. Mighell, A.J., A.F. Markham, and P.A. Robinson, Alu sequences. FEBS Lett, 1997. 417(1): p. 1-5.

52. Morgan, R.O. and M.P. Fernandez, A BC200-derived element and Z-DNA as structural markers in annexin I genes: relevance to Alu evolution and annexin tetrad formation. J Mol Evol, 1995. 41(6): p. 979985.

53. Morgenstern, B., DIALIGN 2: improvement of the segment-to-segment approach to multiple sequence alignment. Bioinformatics, 1999. 15(3): p. 211-218.

54. Murata, S., et al., Determination of the phylogenetic relationships among Pacific salmonids by using short interspersed elements (SINEs) as temporal landmarks of evolution. Proc Natl Acad Sci U S A, 1993. 90(15): p. 6995-9.

55. Nicholas, K.B., and H. B. Nicholas Jr., GeneDoc: a tool for editing and annotating multiple sequence aligment. 1997.

56. Nicholas, K.B., Nicholas H.B. Jr., and Deerfield, D.W., GeneDoc: Analysis and Visualization of Genetic Variation. EMBNEW.NEWS, 1997. 4(14).

57. Ohshima, K., et al., The 3' ends of tRNA-derived short interspersed repetitive elements are derived from the 3' ends of long interspersed repetitive elements. Mol Cell Biol, 1996.16(7): p. 3756-64.

58. Okada, N., SINE: short interspersed repeated elements of eukaryotic genome. TREE, 1991. 6: p. 358-361.

59. Okada, N„ SINEs. Curr Opin Genet Dev, 1991.1(4): p. 498-504.

60. Okada, N., et al., SINEs and LINEs share common 3' sequences: a review. Gene, 1997. 205(1-2): p. 229-43.

61. Okada, N. and K. Ohshima, Evolution of tRNA-derived SINEs, in The impact of short interspersed elements (SINEs) on the host genome, R. Maraia, Editor. 1995, R.G. Landes: Austin, TX. p. 62-79.

62. Orgel, L.E., F.H. Crick, and C. Sapienza, Selfish DNA. Nature, 1980. 288(5792): p. 645-646.

63. Patterson, C., Homology in classical and molecular biology. Mol Biol Evol, 1988. 5(6): p. 603-25.

64. Quentin, Y., Emergence of master sequences in families of retroposons derived from 7sl RNA. Genetica, 1994. 93(1-3): p. 203215.

65. Quentin, Y., Fusion of a free left Alu monomer and a free right Alu monomer at the origin of the Alu family in the primate genomes. Nucleic Acids Res, 1992. 20(3): p. 487-493.

66. Quentin, Y., Origin of the Alu family: a family of Alu-like monomers gave birth to the left and the right arms of the Alu elements. Nucleic Acids Res, 1992. 20(13): p. 3397-3401.

67. Quentin, Y., Successive waves of fixation of B1 variants in rodent lineage history. J Mol Evol, 1989. 28(4): p. 299-305.

68. Rao, A. and O. Steward, Evidence that protein constituents of postsynaptic membrane specializations are locally synthesized:analysis of proteins synthesized within synaptosomes. J Neurosci, 1991. 11(9): p. 2881-95.

69. Renwick, P.J., A.J. Birley, and M.A. Hulten, Study of Alu sequences at the hypoxanthine phosphoribosyltransferase (hprt) encoding region of man. Gene, 1997. 184(2): p. 155-162.

70. Rogers, J., Retroposons defined. Nature, 1983. 301(5900): p. 460.

71. Ross, C., B. Williams, and R.F. Kay, Phylogenetic analysis of anthropoid relationships. J Hum Evol, 1998. 35: p. 221-306.

72. Ryan, S.C. and A. Dugaiczyk, Newly arisen DNA repeats in primate phytogeny. Proc Natl Acad Sci USA, 1989. 86: p. 9360-9364.

73. Saitou, N. and M. Nei, The neighbor-joining method: a new method for reconstructing phylogenetic trees. Mol Biol Evol, 1987. 4(4): p. 406425.

74. Sakamoto, K. and N. Okada, Rodent type 2 Alu family, rat identifier sequence, rabbit C family, and bovine or goat 73-bp repeat may have evolved from tRNA genes. J Mol Evol, 1985. 22(2): p. 134-40.

75. Sambrook, J., E. Fritsch, and T. Maniatis, Molecular Cloning: A Laboratory Manual. 2nd ed. 1989, NY: Cold Spring Harbor Laboratory.

76. Sapienza, C. and B. St-Jacques, 'Brain-specific' transcription and evolution of the identifier sequence. Nature, 1986. 319(6052): p. 418420.

77. Schmid, C. and R. Maraia, Transcriptional regulation and transpositional selection of active SINE sequences. Curr Opin Genet Dev, 1992. 2(6): p. 874-82.

78. Schmid, C.W., Alu: structure, origin, evolution, significance and function of one- tenth of human DNA. Prog Nucleic Acid Res Mol Biol, 1996. 53: p. 283-319.

79. Shaikh, T.H. and P.L. Deininger, The role and amplification of the HS Alu subfamily founder gene. J Mol Evol, 1996. 42(1): p. 15-21.

80. Shedloclc, A.M. and N. Okada, SINE insertions: powerful tools for molecular systematics. Bioessays, 2000. 22: p. 148-160.

81. Shen, M.R., M.A. Batzer, and P.L. Deininger, Evolution of the master Alu gene(s). J Mol Evol, 1991. 33(4): p. 311-20.

82. Shoshani, J., et al., Primate phylogeny: morphological vs. molecular results. Mol Phylogenet Evol, 1996. 5(1): p. 102-154.

83. Singer, M. and P. Berg, Genes and genomes. 1991, Mill Valley, CA: University Science Books.

84. Skryabin, B.V., et al., The BC200 RNA gene and its neural expression are conserved in Anthropoidea (Primates). J Mol Evol, 1998. 47(6): p. 677-685.

85. Smit, A.F. and A.D. Riggs, MIRs are classic, tRNA-derived SINEs that amplified before the mammalian radiation. Nucleic Acids Res, 1995. 23(1): p. 98-102.

86. Smit, A.F., et al., Ancestral, mammalian-wide subfamilies of LINE-1 repetitive sequences. J Mol Biol, 1995. 246(3): p. 401-417.

87. Smit, A.F.A. and P. Green, RepeatMasker. 1996.

88. Steward, O. and P.M. Falk, Protein-synthetic machinery at postsynaptic sites during synaptogenesis: a quantitative study of the association between polyribosomes and developing synapses. J Neurosci, 1986. 6(2): p. 412-23.

89. Steward, O. and W.B. Levy, Preferential localization of polyribosomes under the base of dendritic spines in granule cells of the dentate gyrus. J Neurosci, 1982. 2(3): p. 284-91.

90. Sutcliffe, J.G., et al., Common 82-nucleotide sequence unique to brain RNA. Proc Natl Acad Sci USA, 1982. 79(16): p. 4942-4946.

91. Sutcliffe, J.G., et al., Identifier sequences are transcribed specifically in brain. Nature, 1984. 308(5956): p. 237-41.

92. Tatusova, T.A. and T.L. Madden, BLAST 2 Sequences, a new tool for comparing protein and nucleotide sequences published erratum appears in FEMS Microbiol Lett 1999 Aug 1;177(1):187-8. FEMS Microbiol Lett, 1999. 174(2): p. 247-250.

93. Tiedge, H., W. Chen, and J. Brosius, Primary structure, neural-specific expression, and dendritic location of human BC200 RNA. J Neurosci, 1993. 13(6): p. 2382-2390.

94. Tiedge, H., et al., Dendritic location of neural BC1 RNA. Proc Natl Acad Sci U S A, 1991. 88: p. 2093-2097.

95. Torre, E.R. and O. Steward, Demonstration of local protein synthesis within dendrites using a new cell culture system that permits the isolation of living axons and dendrites from their cell bodies. J Neurosci, 1992. 12(3): p. 762-72.

96. Ullu, E. and C. Tschudi, Alu sequences are processed 7SL RNA genes. Nature, 1984. 312(5990): p. 171-172.

97. Ullu, E. and A.M. Weiner, Human genes and pseudogenes for the 7SL RNA component of signal recognition particle. Embo J, 1984. 3(13): p. 3303-10.

98. Varmus, H.E., Reverse transcription in bacteria. Cell, 1989. 56(5): p. 721-724.

99. Venter, J.C., et al., The sequence of the human genome. Science, 2001. 291(5507): p. 1304-51.

100. Walter, P. and G. Blobel, Signal recognition particle contains a 7S RNA essential for protein translocation across the endoplasmic reticulum. Nature, 1982. 299(5885): p. 691-8.

101. Watson, J.B. and J.G. Sutcliffe, Primate brain-specific cytoplasmic transcript of the Alu repeat family. Mol Cell Biol, 1987. 7(9): p. 33243327.

102. Weiner, A.M., P.L. Deininger, and A. Efstratiadis, Nonviralretroposons: genes, pseudogenes, and transposable elements generated by the reverse flow of genetic information. Annu Rev Biochem, 1986. 55: p. 631-61.

103. Zietkiewicz, E., C. Richer, and D. Labuda, Phylogenetic affinities of tarsier in the context of primate Alu repeats. Mol Phylogenet Evol, 1999. 11(1): p. 77-83.

104. Zietkiewicz, E., et al., Monophyletic origin of Alu elements in primates. J Mol Evol, 1998. 47: p. 172-182.

105. Zwieb, C. and N. Larsen, The signal recognition particle (SRP) database. Nucleic Acids Res, 1992. 20 Suppl: p. 2207.