Бесплатный автореферат и диссертация по биологии на тему

Эволюционный консерватизм и композиционная гетерогенность хромосом птиц

ВАК РФ 03.00.15, Генетика

Автореферат диссертации по теме "Эволюционный консерватизм и композиционная гетерогенность хромосом птиц"

САНКТ-ПЕТЕРБУРГСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ

на правах рукописи УДК 576.312.32:575.113

САЗАНОВА Анна Львовна

ЭВОЛЮЦИОННЫЙ КОНСЕРВАТИЗМ И КОМПОЗИЦИОННАЯ ГЕТЕРОГЕННОСТЬ ХРОМОСОМ ПТИЦ

Специальность 03.00.15 - генетика

Автореферат диссертации на соискание ученой степени • кандидата биологических наук

Санкт-Петербург 2005

Работа выполнена в лаборатории генетики животных Биологического НИИ Санкт-Петербургского государственного университета

Научный руководитель: профессор, доктор биологических наук

Смирнов Александр Федорович

Официальные оппоненты: доктор биологических наук

Кузнецова Татьяна Владимировна

кандидат биологических наук Козикова Лариса Васильевна

Ведущее учреждение: Институт экспериментальной медицины

РАМН

Защита состоится 2005 г. в ^-шсов на заседании

Диссертационного совета Д.212.232.12 по защите диссертаций на соискание ученой степени доктора биологических наук при Санкт-Петербургском Государственном университете по адресу: 199034 Санкт-Петербург, Университетская наб. 7/9, СПбГУ, биолого-почвенный факультет, кафедра генетики и селекции, аудитория 1.

С диссертацией можно ознакомиться в центральной библиотеке

Санкт-Петербургского государственного университета

^—

Автореферат разослан « * " ч-сесхЛ 2005 г.

Ученый секретарь Диссертационного совета кандидат биологических наук / Л.А. Мамон

г 2>S Г6 SS

ОБЩАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА РАБОТЫ

Актуальность проблемы Среди позвоночных животных класс Aves отличается наибольшей консервативностью величины геномов: для изученных в этом отношении видов птиц содержание ДНК на клеточное ядро варьирует от 17 до 3.5 пг, , что в среднем в 2 75 раза меньше, чем у млекопитающих (Kadi et al, 1993) Сравнительно низкое содержание ДНК в геномах птиц объясняют "необходимостью полета", а высокий эволюционный консерватизм этого показателя - монофилетическим происхождением класса Aves (Kadi et al, 1993) Главной отличительной особенностью кариотипов птиц является многочисленность и гетерогенность входящих в их состав хромосом Ввиду того, что хромосомы в классе Aves различаются по размеру, их принято условно делить на 2 группы: группу макрохромосом, состоящую из шести - восьми пар относительно крупных по размеру (3-8 мкм) хромосом и группу микрохромосом - мелких трудноидентифицируемых хромосом (03-3 мкм) (Schmid et al., 2000)

Несмотря на то, что представитель класса Aves - домашняя курица -стала первым объектом генетики животных (Bateson and Sounders, 1902), ограниченное число молекулярно-цитогенетических работ на момент начала исследований в рамках представленной работы (1993) было проведено на небольшом числе видов птиц Несмотря на то, что геном домашней курицы в настоящее время полностью секвенирован, генетические и физические карты хромосом птиц, являющиеся своего рода путеводителем по геному, остаются сравнительно малонасыщенными по причине недостаточного количества полиморфных ДНК-маркеров (www thearkdb org; Hillier et al, 2004; Wallis et

Наиболее изученным с генетической точки зрения видом птиц является домашняя курица Gallus gallus, что обусловлено как хозяйственным значением этого вида, так и удобством ее использования в качестве модельного лабораторного объекта Способность к размножению круглый

al, 2004).

год и сравнительно быстрая смена поколений существенно упрощает эксперименты по гибридологическому анализу Детальная информация по биологии развития этого вида позволяет обсуждать генетические данные в общебиологическом контексте (Stern, 2004, Burt, 2004; Stern, 2005).

Своеобразие организации кариотипов птиц - структурная компартментализация генома (наличие микро- и макрохромосом) - давно привлекает внимание цитогенетиков в отношении изучения возможной функциональной специализации хромосом В последнее время показана высокая генетическая активность микрохромосом, (плотная^ насыщенность их кодирующими последовательностями ДНК, в первую очередь, генами «домашнего хозяйства» и онкогенами (McQueen et al, 1998; Burt, 2002)

В настоящее время известно более ста ортологичных районов курицы и человека (Schmid et al, 2000; Burt, 2002). С точки зрения сравнительного картирования, ортологии хромосомных районов, домашняя курица оказалась более близкой к человеку, чем даже домовая мышь (Burt et al, 1999). Это, с одной стороны, позволяет экстраполировать данные полного секвенирования 1енома человека на значительное число хромосомных районов птиц, с другой стороны определяет ценность данных геномики курицы для генетики человека и медицинской генетики

Цели и задачи исследования Целью данной работы является изучение ортологии хромосом птиц и млекопитающих и характеристика молекулярной гетерогенности генома птиц Сформулированы следующие задачи'

- локализация на хромосомах курицы маркеров первого типа (кодирующих последовательностей ДНК)

- «заякоривание» маркеров первого типа на сравнительных генетических и физических картах хромосом человека и выявление ортологии хромосомных районов

- композиционное картирование хромосом курицы и перепела

- характеристика функциональной специализации микро- и макрохромосом

Научная новизна работы. Впервые установлена локализация гена EDNRA на хромосомах домашней курицы. С использованием протяженных ДНК-зондов подтверждена ранее установленная другими авторами локализация генов ALB, ANX5, MGF, MGP и TYR Впервые проведено композиционное картирование митотических хромосом домашней курицы и японского перепела и продемонстрирована структурно-функциональная компартментализация генома птиц

Теоретическая и практическая ценность работы Результаты представленной к защите работы использованы при составлении баз данных по генетическим и физическим картам хромосом курицы и сравнительным картам человека, мыши и курицы (www thearkdb.org) и банка данных нуклеотидных последовательностей (www nlm ncbi nih gov) в сети Интернет Материалы диссертации используются при чтении лекций на кафедре генетики и селекции Санкт-Петербургского государственного университете в рамках магистерской программы «Эволюционная цитогенетика» Поскольку домашняя курица и японский перепел являются ценными сельскохозяйственными видами, данные по картированию нуклеотидных последовательностей на хромосомах этих видов могут быть использованы в работах по позиционному клонированию хозяйственно ценных признаков и селекции при помощи молекулярных маркеров (marker-assisted selection) Данные по эволюционному консерватизму районов хромосом человека и домашней курицы могут быть использованы для моделирования хромосомных болезней человека

Апробация работы Материалы работы были представлены на 1-ой международной конференции по молекулярно-генетическим маркерам животных (Киев, 1994), 1-ом съезде Российского общества генетиков и селекционеров им Н И Вавилова (Саратов, 1995), международной конференции «ДНК-технологии в клеточной инженерии и маркировании признаков сельскохозяйственных животных» (Дубровицы, 2001), II-ой конференции Московского общества генетиков и селекционеров «Актуальные проблемы генетики»

(Москва, 2003), TII-ем Съезде Всероссийского общества генетиков и селекционеров (Москва, 2004), а также за рубежом на X VII-ом Международном съезде генетиков (Бирмингем, Великобритания, 1993), XI-ой Европейской Ппщеводческой конференции (Айр, Великобритания, 1994), XI-ом Североамериканском коллоквиуме по цитогенетике и генетическому картированию домашних животных (Техас, США, 1995), XlV-ом Европейском коллоквиуме по цитогенетике и генетическому картированию животных (Брно, Чешская Республика, 2000), XI-ой Европейской цитогенетической конференции (Болонья, Италия, 2001), 12 Североамериканской конференции по цитогенетике и генному картированию (Беркли, США, 2001); XV-om Европейском коллоквиуме по цитогенетике и генетическому картированию животных (Неаполь, Италия, 2002); Европейской конференции по молекулярной эволюции (Сорренто-Неаполь, Италия, 2002); Х-ой Международной конференции по геномам животных, растений и микроорганизмов (Сан-Диего, США, 2002), 4-ой Европейской цитогенетической конференции (Болонья, Италия, 2004); 16-ой Европейской конференции по цитогенетике животных и генному картированию (Жойе ен Жосас, Франция,2004); XIl-ой Международной конференции по геномам животных, растений и микроорганизмов (Сан-Диего, США, 2004, ХШ-ой Международной конференции по геномам животных, растений и микроорганизмов (Сан-Диего, США, 2005) Результаты периодически докладывались на семинарах кафедры генетики и селекции СПбГУ Публикация результатов Материалы, представленные в диссертации были опубликованы в научных журналах "Animal Genetics", "Chromosome Research", «Генетика» Всего по теме работы опубликована 21 печатная работа, из них 7 статей и 14 тезисов

Структура и объем диссертации Диссертация изложена на 170 страницах машинописного текста, включает 6 таблиц, 30 рисунков и состоит из следующих разделов «Введение», «Обзор литературы», «Материал и методы», «Результаты», «Обсуждение», «Заключение», «Выводы» и

«Литература». Список цитированной литературы насчитывает 5 русских и 173 иностранных названий

СОДЕРЖАНИЕ РАБОТЫ Материал и методы

Материал Материалом для приготовления культур эмбриональных фибробластов и препаратов митотических хромосом послужили эмбрионы домашней курицы породной группы Бурый Леггорн из генетической коллекции Биологического НИИ Санкт-Петербургского государственного университета (С. Петербург - Старый Петергоф) и эмбрионы японского перепела из частного хозяйства А.Л. Вахромеевой (С Петербург).

Для флуоресцентной гибридизации ДНК-ДНК in situ в качестве ДНК-зондов были использованы фракции геномной ДНК домашней курицы, предоставленные проф Дж Бернарди (Неаполь, Италия) и проф С Сакконе (Катания, Италия) и геномные клоны джунглевой курицы, предоставленные др M Романовым (Ист-Лансинг, США) - ALB, ANX5, MGF, MGP и TYR.

Методы Препараты митотических хромосом домашней курицы и японского перепела приготавливали из культур ранних эмбриональных фибробластов (Ponce de Leon et al, 1992) или из 96-часовых и 72-часовых эмбрионов (Родионов и др , 1981) согласно общепринятым методикам

Процедуры мечения ДНК зондов для гибридизации in situ проводили при помощи набора для ник-трансляции ("Ферментас", Вильнюс, Литва) с использованием biotin-11-dUTP. Преципитацию ДНК-зондов проводили путем переосаждения этанолом в присутствии конкурирующей ДНК в целях супрессии неспецифической гибридизации Гибридизацию ДНК/ДНК in situ проводили по стандартной методике (Lichter et а!, 1991) с некоторыми модификациями Детекцию сигнала проводили при помощи авидин-FITC флуоресцентной системы детекции После чего препараты окрашивали раствором пропидиум иодида в антифейде Vectashield фирмы «Vector» и анализировали с использованием системы люминесцентного микроскопа

«Люмам» при увеличении об.ЮОх, ок 10х, CCD-камеры «CHIPER» и компьютерной программы Ista VideoTest-FISH 1.0.

Внутрихромосомную локализацию проводили на основании измерений фракционных расстояний от сигнала до теломера короткого плеча (FLpter) Полученные значения соотносили со стандартными идиограммами RBG- и GTG-исчерченности хромосом домашней курицы (Ladjali-Mohammedi et al., 1999)

При композиционном картировании распределение гибридизационных сигналов по хромосомам курицы и перепела оценивали следующим образом:

- измеряли FLpter для каждого гибридизационного сигнала

- на основании измерений наносили координаты гибридизационных сигналов на стандартные идиограммы дифференциальной RBG-исчерченности хромосом курицы (Ladjali-Mohammedi et al., 1999)

- вычисляли теоретически ожидаемые значения числа биотинилированных комплексов исходя из гипотезы их равномерного распределения по длине хромосом

- проводили сравнение теоретически ожидаемых и наблюдаемых значений при помощи критерия х~

Результаты исследований

1. Прямое физическое картирование маркеров первого типа на митотических хромосомах домашней курицы

Гены ALB. ANX5. EDNRA. MGF. MGP и TYR. Результаты локализации на митотических хромосомах курицы генов ALB, ANX5, EDNRA, MGF, MGP и TYR представлены в таблице 2.

Таблица 1. Результаты флуоресцентной гибридизации in situ на митотических хромосомах курицы ДНК геномных клонов, содержащих гены ALB, ANX5, EDNRA, MGF, MGP и TYR

Локус Клон Библиотека Всего хромосом FLpter * Хромосомный район

ALB B051J16 03I-JTF256-BT 25 0,36±0,089 4qll-ql2

ANX5 B082B13 031-JF256-BI 14 0,72±0,047 4ql3-q21

EDNRA B001H03 031-JF256-BI 17 0,40±0,033 4qll-ql2

EDNRA B003M06 031-JF256-BI 10 0,374:0,063 4ql 1

MGF B071F17 031-JF256-BI 14 0,38±0,041 lpll-ql 1

MGP B039L1 031-.TF256-BI 14 0,43+0,039 lpll-qll

TYR B067F22 031-JF256-BI 11 0,84 tO,043 Iq32-q36

TYR B089I5 031-JF256-BI 16 0,90±0,029 1 q36-q42

* - Среднее относительное расстояние от сигнала до теломера длинного плеча, выраженное в долях единицы, ± стандартное отклонение

2. Композиционное картирование митотических хромосом домашней курицы и японского перепела

Самая тяжелая, наиболее ГЦ-богатая фракция 7 генома курицы, которая содержит почти исключительно изохоры семейства Н4, распределена но хромосомам следующим образом.

- как у курицы, так и у перепела большое число микрохромосом, преимущественно самых коротких, почти полностью покрыты гибридизационными сигналами

- несколько меньшее число микрохромосом обоих видов птиц частично покрыты сигналами, преимущественно в теломерной области

- теломеры большинства макрохромосом курицы и перепела выявлены как позитивные районы гибридизации

- у курицы большой светящийся блок находится в районе расположения конститутивного ГЦ-богатого гетерохроматина в длинном плече Ъ хромосомы При этом у перепела интенсивность флуоресценции в этом районе существенно ниже.

Вторая по плавучей плотности фракция ДНК - 6, содержащая изохоры семейств НЗ и Н4, характеризуется у обоих исследованных в данной работе видов птиц наличием всех вышеперечисленных районов локализации и, дополнительно, слабым мечением интерстициальных районов макрохромосом

Фракция 5, представленная изохорами семейств НЗ и Н2, локализована у курицы и перепела практически в тех же районах что и фракция 6.

Фракции 3 и 4 содержат изохоры семейств Ь2, Н1 и Н1, Н2 соответственно. ДНК этих фракций локализуется большей частью в микрохромосомах Микрохромосомы маленького и среднего размера полностью покрыты гибридизационными сигналами На крупных микрохромосомах сигналы расположены преимущественно в теломерных областях На макрохромосомах перепела и курицы имеются сайты гибридизации в теломерных и некоторых интерстициальных районах

Наконец, фракции 2 и 1, содержащие преимущественно легкие изохоры семейств Ы и Ь2, не выявляются ни в микрохромосомах, ни в теломерных районах макрохромосом курицы и перепела, а распределены по длине макрохромосом с более или менее выраженной приуроченностью к в-дискам

Обсуждение

1. Эволюционный консерватизм районов хромосом домашней курицы и человека

Ортология GGA 1р21-д12 и HSA 12р13-о23 Хромосомная локализация двух локусов (MGF и MGP) из этого района эволюционного консерватизма была исследована в нашей работе (Табл 3) Всего в настоящее время известно 25 генов, проявляющих ортологито нуклеотидных последовательностей хромосомы 12 человека и хромосомы 1 домашней курицы (Burt, 2002) При этом у домовой мыши указанный район представлен тремя районами хромосом 6, 10 и 15, что иллюстрирует более высокий уровень гомологии хромосом Homo sapiens и Gallus gallus Интересно отметить, что эволюционный консерватизм наблюдается, несмотря на отдаленное таксономическое положение этих видок (Burt, 2002) При этом данный район включает также важный морфологический маркер - центромер - у обоих видов, положение которого относительно маркеров первого типа (кодирующих последовательностей ДНК) не сохранилось постоянным Ортология GGA Iq23-q44 и HSA 11р15-д22 В настоящее время известно 10 генов, проявляющих консерватизм локализации на хромосомах 1 и 11, домашней курицы и человека, соответственно (Burt, 2002). Ген TYR был локализован в районе GGA Iq42-q44 Сузуки и соавторами в 1999 году (Suzuki et al, 1999) с использованием в качестве зонда кДНК длиной 2 т п.н Получение геномных ВАС-клонов и применение их для прямого физического картирования гена TYR позволило не только уточнить его локализацию в районе GGA Iq32-q42, но и предоставило два протяженных фрагмента генома (суммарной длиной 300 т.п.н.), которые могут быть использованы для изолирования и характеристики последовательностей ДНК района эволюционного консерватизма GGA Iq23-q44 - HSA Ilpl5-q22. Следует отметить, что у домовой мыши указанный район гомологичен районам двух хромосом MMU 7 и MMU 9 (Burt, 2002).

Ортология GGA 4q11-q24 и HSA 4pl6-q28. Данный район является одним из самых протяженных и наиболее изученным, как путем сравнительного картирования молекулярных маркеров первого типа, так и методом микродиссекции и гетерологичного хромосомного пэйнтинга (Chowdhary and Raudsepp, 2000), районом ортологии хромосом человека и домашней курицы (Рисунок 5) Кроме того, большинство известных QTL качества яйца локализованы в пределах GGA 4qll-q24 (Tuiskila-Haavisto et al., 2002; Wardecka et al, 2002), что определяет потенциальную значимость этого района для позиционного клонирования, проведение которого может быть существенно ускорено экстраполированием данных полного секвенирования генома человека на ортологичный район GGA 4 У домовой мыши это г район ортологии соответствует районам хромосом MMU 3, MMU 5, MMU 8 и MMU 13 (Burt, 2002) Из трех локализованных нами маркеров GGA 4ql I-q24 (Табл 2 и 3) два были впервые физически картированы на хромосомах домашней курицы - ANX5 и EDNRA, а ген ALB ранее был отнесен Сузуки и соавторами (Suzuki et al., 1999) к району GGA 4ql6-q21 на основании результатов гибридизации in situ с использованием в качестве зонда кДНК длиной всего 1,3 т.п.н Применение в качестве ДНК-зонда геномной последовательности длиной 150 тпн позволило уточнить локализацию этого гена в GGA 4qll-ql2. Особое значение имеет локализация гена ALB, поскольку в соседнем районе GGA 4ql6-q21 находится ген CLOCK, продукт которого контролирует циркадные ритмы (Yoshimura et al, 2000) Существуют веские основания считать ген CLOCK наиболее вероятным геном-кандидатом для картированных на хромомосоме 4 QTL яйценоскости и массы яйца (Tuiskila-Haavisto et al, 2002)

Рисунок 1. Эволюционный консерватизм районов GGA 4ql l-q24 и HSA 4pl6-q28. Звездочками отмечены символы генов, картированных на хромосомах домашней курицы в представленной работе Указаны только те маркеры первого типа, для которых известна физическая внутрихромосомная локализация на GGA 4 (Chicken Genome Database, www thearkdb.org)

Таблица 2. Сравнительная локализация генов ALB, ANX5, EDNRA, MGF, MGP и TYR на хромосомах человека (HSA) и домашней курицы (GGA) Локализация генов на хромосомах человека приведена на основании данных Human Genome Database (www.gdb.org).

Локус HSA GGA

ALB 4qll-ql3 4ql1-ql2

ANX5 4q26-q28 4ql3-q21

EDNRA 4pter - qter 4qll-ql2

MGF 12q22 lpll-ql I

MGP 12pl3.1-pl2.3 lpll-qll

TYR llq21 Iq32-q42

2. Сравнительное композиционное картирование хромосом домашней курицы и японского перепела. Функциональная компартментализация генома птиц

Специфическая для теплокровных организация геномов птиц -гетероморфность хромосом, своего рода компартментализация кариотипа -давно привлекает внимание исследователей В разное время показаны основные структурно-функциональные черты микро - и макрохромосом Для первых характерна сравнительная обогащенность тепами, раннее время репликации ДНК в ходе клеточного цикла, высокая концентрация CpG-островков, низкий уровень метилирования ГЦ-пар оснований, высокая степень апетилирования гистонов (McQueen et al, 1998, Smith and Burt, 1998) С точки зрения композиционного картирования, нами показана обогащенность микрохромосом тяжелыми изохорами Эта закономерность наблюдается у обоих исследованных в данной работе видов птиц - курицы и перепела Можно заключить, что микрохромосомы напоминают по этому критерию Т-дисковые участки хромосом млекопитающих В рамках данного исследования можно говорить о микрохромосомах как об особом классе Т-дисков, в которых всегда отсутствуют легкие изохоры семейств L1 и L2 Указанные особенности микрохромосом делают их сходными с теломерными участками макрохромосом Полученные нами данные подтверждает предположение о функциональной специализации микрохромосом птиц

Следует о i мети гь принципиально противоположный характер распределения в геномах обоих исследуемых нами птиц самой легкой фракции 1 и самой тяжелой фракции 7

Сильный гибридизационный сигнал с тяжелыми изохорами наблюдается в гетерохроматиновом районе Z хромосомы курицы, что может быть объяснено наличием ГЦ богатых сателлитных последовательностей ДНК в «тяжелых» фракциях изохор (Caccio et al, 1994), или, что менее вероятно, недостаточной степенью супрессии неспецифической гибридизации повторяющихся нуклеотидных последовательностей

Следует отметить, что характер распределения фракций изохор у курицы и перепела практически одинаков, что, скорее всего, определяется близким таксономическим положением этих видов и близостью их кариотипов (8с1ншс1 а1, 1995) Единственное отмеченное различие - более слабое мечение гетерохроматинового района /-хромосомы перепела - имеет количественный характер и может быть связано с различием состава сателлитной ДНК в этом районе у этих видов птиц

Интересно, что рисунок распределения фракций ДНК 3 - 6 по макрохромосомам курицы и перепела моделирует дифференциальную Я-окраску, так как обнаруживает некоторую предпочтительность локализации в И-дисках, давая несовершенный рисунок дифференциального окрашивания

Макрохромосомы исследованных нами двух видов птиц в отношении локализации тяжелых изохор оказались сходными с хромосомами млекопитающих - для них характерно преимущественно теломерное расположение самых тяжелых изохор и приуроченность к положительным ИЗО-блокам минорных сайтов локализации более легких

Несмотря на существенные различия в организации кариотипов млекопитающих и птиц, принципиальный характер распределения семейств изохор сохраняется в геномах этих двух линий теплокровных животных Основная особенность организации генома птиц - наличие большого числа микрохромосом (около 30% генома), имеющих очень много общих черт с наиболее функционально активными Т-дисками млекопитающих - находит свое отражение и в присутствии в них наиболее тяжелых изохор Это позволяет говорить о наличии не только структурной, но и функциональной компартментализации геномов птиц

выводы

1 Гены MGF и MGP находятся в районе GGA Ip21-ql2 хромосом домашней курицы и HS А 12pl3-q23 человека, что свидетельствует об ортологии указанных районов хромосом

2 Ген TYR локализован в районе GGA Iq23-q44 домашней курицы и HSA Upl5-q22 человека, что подтверждает наличие межгеномной гомологии в этих районах

3 Гены ALB, ANX5, EDNRA находятся в районе GGA 4qll-q24 хромосом домашней курицы и HS А 4p!6-q28 человека, что свидетельствует об ортологии указанных районов хромосом

4 Эволюционный консерватизм локализации генов ALB, ANX5, EDNRA, MGF, MGP и TYR относительно других маркеров подтверждает высокую степень гомологии хромосом человека и домашней курицы

5 Данные сравнительного композиционного картирования митотических хромосом домашней курицы и японского перепела свидетельствуют о принципиальном сходстве распределения фракций изохор на хромосомах этих видов

6 Тяжелые фракции изохор птиц приурочены к микрохромосомам и теломерным районам макрохромосом, а легкие - к интерстициальным районам макрохромосом, что говорит о наличие структурно-функциональной компартментализации генома птиц

Список публикаций по теме диссертации

1 Сазанов А А, Алексеевич JIА, Сазанова A JI.. Смирнов А.Ф. Картирование генома курицы - проблемы и перспективы // Генетика. 1996 Т 32 С 861-864.

2 Sazanova А, Sazanov А, Smirnov А, Federico С Andreozzi L., Saccone S., Bemardi G. Chromosomal distributionof the GC-rich isochore families on chicken chromosomes // Proceedings of 14th European Colloquium on Cytogenetics of Domestic Animals. Bmo. 2000 P 31-32

3 Сазанов АЛ, Сазанова AJI. Смирнов АФ Композиционное картирование хромосом птиц // Материалы международной конференции «ДНК-технологии в клеточной инженерии и маркировании признаков сельскохозяйственных животных», Дубровицы 2001. С 85-90

4 Sazanova А, Kozireva А, Sazanov А , Smirnov А, Federico С , Andreozzi L., Saccone S, Corel N, Bernardi G The destribution of the isochore fraction on chicken and quail chromosomes // 12й1 North American Colloq For Animal Cytogenetics and Gene Mapping, Berkeley 2001 P 14

5 Andreozzi L, Federico С, Motta S, Saccone S, Sazanova A, Sazanov A, Smirnov A., Galkina S A, Lukina N A., Rodionov A.V, Careis N, Bemardi G. Identification of the gene-richest and gene-poorest chromosomal regions in chicken genome // Ann de Genetique 2001 V 44 Supplement 1 P s31

6 Sazanova A, Kozireva A., Sazanov A, Smirnov A, Federico С, Andreozzi L., Saccone S, Carel N, Bernardi G The distribution of the isochore families on the bird chromosomes //ChromosomeResearch 2001 V 9. Supplement 1 P 80

7 Andreozzi L, Federico C, Motta S, Saccone S, Sazanova AL, Sazanov AA, Smirnov AF, Galkina SA, Lukina NA, Rodionov AV, Careis N, Bemardi G. Compositional mapping of chicken chromosomes and identification of the gene-richest regions // Chromosome Research 2001 V.9 P 521-532.

8 Sazanova A, Kozireva A, Sazanov A., Smirnov A, Fedenco С, Andreozzi L, Saccone S, Carel N, Bemardi G Distribution of the isochore families on chicken and

quail chromosomes // Plant, Animal and Microbe Genomes X Conference San Diego CA

2002 P W268.

9 Sazanov A A, Sazanova A L , Trukhina A V , Kozireva A V , Smirnov A F , Federico С , Andreozzi L , Saccone S , Carel N , Bernardi G The distribution of DNA probes on chicken and quail chromosomes // European Conference on Molecular Evolution Sorrento-Naples 2002 P 166

10 Sazanova A L. Kozireva AV, Sazanov A. A, Smirnov AF, Federico C., Andreozzi L, Saccone S , Carel N , Bernardi G The distribution of DNA-probes on chicken and quail chromosomes // Plant, Animal and Microbe Genome X San Diego CA 2002 P 145

11 Сазанов A A , Сазанова A JI, Трухина А В , Царева В А , Козырева А А., Смирнов А Ф Молекулярно-цитогенетический анализ генома птиц // Материалы 2-ой конференции Московского общества генетиков и селекционеров «Актуальные проблемы генетики» Москва 2003 С. 328-329

12 Сазанов А А , Сазанова А Л , Козырева А А , Смирнов А Ф , Андреоцци Л, Федерико К, Мотга С, Сакконе С, Бернарди Г. Сравнительное композиционное картирование хромосом курицы и перепела // Генетика

2003 Т 39. С. 819 - 825

13 Sazanov А А , Sazanova A L , Kozyreva A.V , Smirnov A.F., Andreozzi L., Federico С , Saccone S , Bernardi G Comparative compositional mapping of the chicken and quail chromosomes // Abstracts of 4th European Cytogenetics Conference Bologna 2003 Chapter 1 "Animal Cytogenetics" P 26.

14 Sazanov A A , Romanov M N , Sazanova A.L, Tzareva V A, Kozyreva A A , Smirnov A F , Price J A , Dodgson J В Chromosomal localization of large-insert clones of the chicken genome expanding the comparative map // Plant, Animal and Microbe Genome XII San Diego. CA. 2004 P. 234.

15 Sazanov A A , Sazanova A L , Tzareva V A , Kozyreva A A , Smirnov A F , Romanov M.N , Price J. A , Dodgson J В Refined localization of the chicken KITLG, MGP and TYR genes on GGA1 by FISH mapping using BACs // Animal Genetics 2004 V 35 P 148-150.

16 Сазанов А А, Сазанова A J1, Царева В.А., Козырева А А., Смирнов А.Ф. Локализация генов ANX5, ALB и EDNRA на хромосоме 4 домашней курицы, ортология с хромосомой 4 человека // Селекционно-генетические методы повышения продуктивности сельскохозяйственных животных: Сб науч тр / ГНУ ВНИИГРЖ - С -П , 2004 - С. 200 - 203

17 Sazanov А А , Sazanova A L , Tzareva V A., Kozyreva A.A., Smirnov A.F., Romanov M.N , Price J A, Dodgson J В Chromosomal localization of three GGA4 genes using BAC-based FISH mapping a region of conserved synteny between the chicken and human genomes // Hereditas 2004. V. 140 V. 140. P. 249-251.

18 Сазанов А А., Сазанова А Л , Царева В A , Козырева A.A, Смирнов А.Ф. Выявление и характеристика районов хромосом домашней курицы, ортологичных наиболее обогащенным генами районам хромосомы 3 человека // Материалы 111 съезда ВОГиС Москва 2004. Т. 2. С. 270.

19 Сазанов А А., Романов М Н„ Сазанова А Л , Царева В.А, Козырева А.А., Прайс Дж А., Смирнов А.Ф, Додсон Дж Б. Локализация на хромосомах протяженных геномных клонов домашней курицы в целях сравнительного картирования//Материалы III съезда ВОГиС Москва. 2004 Т 2. С. 271.

20. Sazanov А А , Romanov M.N , Wardecka В , Sazanova A.L , Korczak M , Stekol'nikova V A , Kozyreva A A, Smirnov A F , Dodgson J В , Jaszczak К Chromosomal localization of GGA4 BACs containing QTL-linked microsatellites // Cytogenetic and Genome Research 2004 V 106 N 1 P 19 21 Sazanov A A , Romanov M N , Wardecka В , Sazanova A.L , Korczak M., Stekol'nikova V A., Kozyreva A.A, Smirnov A.F., Jaszczak K., Dodgson J.B. Chromosomal localization of fifteen large insert ВАС clones containing three microsatellites on chicken chromosome 4 (GGA4) which refine its centromere position//Animal Genetics. 2005 V. 35 P 161-163

РНБ Русский фонд

2007-4 5601

Подписано в печать 14 04 2005 г. Формат бумаги 60X84 1/16. Бумага офсетная Печать ризографическая. Объем 1 уел п. л Тираж 100 экз Заказ 3557. Отпечатано в отделе оперативной полиграфии НИИХ СПбГУ с оригинал-макета заказчика. 198504, Санкт-Петербург, Старый Петергоф, Университетский пр , 26.

с

09 ИЮН 2005

Содержание диссертации, кандидата биологических наук, Сазанова, Анна Львовна

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

ВВЕДЕНИЕ

ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Особенности организации генома птиц

1.2. Генетические и физические карты хромосом птиц Z

1.3. Отношения гомологии (ортологии и паралогии) нуклеотидных последовательностей и хромосомных районов

1.4. Композиционная гетерогенность ДНК и функциональная специализация геномных фракций ££ МАТЕРИАЛ И МЕТОДЫ

2.1. Материал

2.2. Трансформация клеток Е. coli и выделение эписомной ДНК

2.3. Приготовление препаратов митотических хромосом птиц

2.3.1. Приготовление препаратов митотических хромосом из 96 (72) -часовых эмбрионов

2.3.2. Приготовление препаратов митотических хромосом из культуры эмбриональных фибробластов

2.4. Флуоресцентная гибридизация ДНК-ДНК in situ (FISH) ¥

2.4.1. Мечение ДНК-зондов при помощи ник-трансляции с использованием нерадиоактивных дезоксинуклеотидтрифосфатов рд

2.4.2. Преципитация ДНК-зондов в присутствии конкурирующей ДНК и супрессия неспецифической гибридизации

2.4.3. Гибридизация меченых ДНК-зондов с ДНК митотических хромосом птиц

2.4.4. Детекция гибридизационных сигналов с использованием флуоресцентных красителей

2.4.5. Анализ результатов гибридизации

РЕЗУЛЬТАТЫ

3.1. Прямое физическое картирование генов ALB, ANX5, EDNRA, MGF, MGP и TYR на митотических хромосомах домашней курицы QQ

3.2. Композиционное картирование митотических хромосом домашней курицы и японского перепела jffl ОБСУЖДЕНИЕ -f&

4.1. Эволюционный консерватизм районов хромосом домашней курицы и человека

4.1.1. Ортология GGA Ip21-ql2 и HSA 12pl3-q23 <L&

4.1.2. Ортология GGA Iq23-q44 и HSA 1 Ipl5-q22 j&f

4.1.3. Ортология GGA 4ql l-q24 и HSA 4pl6-q28 <12,

4.2. Сравнительное композиционное картирование хромосом домашней курицы и японского перепела. Функциональная компартментализация генома птиц 4.3Z ВЫВОДЫ 438 СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

ALB - альбумин ANX5 - аннексии

ВАС - искусственная бактериальная хромосома

EDNRA - эндотелиновый рецептор А-типа

GGA - хромосомы (районы хромосом) домашней курицы

HSA - хромосомы (районы хромосом) человека '

MGF - ростовой фактор клеток молочной железы

MGP - Gla-белок ядерного матрикса

QTL - локус, контролирующий количественный признак

TYR - тирозиназа

Введение Диссертация по биологии, на тему "Эволюционный консерватизм и композиционная гетерогенность хромосом птиц"

Актуальность проблемы. Среди позвоночных животных класс Aves отличается наибольшей консервативностью величины геномов: для изученных в этом отношении видов птиц содержание ДНК на клеточное ядро варьирует от 1.7 до 3.5 пг. Гаплоидный геном птиц в среднем состоит из 1.2 х 109 пар нуклеотидов, что в 2.75 раза меньше, чем у млекопитающих (Kadi et al., 1993). Сравнительно низкое содержание ДНК в геномах птиц объясняют "необходимостью полета", а высокий эволюционный консерватизм этого показателя - монофилетическим происхождением класса Aves (Kadi et al., 1993). Главной отличительной особенностью кариотипов птиц является многочисленность и гетерогенность входящих в их состав хромосом. Ввиду того, что хромосомы в классе Aves различаются по размеру, их принято условно делить на 2 группы: группу макрохромосом, состоящую из шести -восьми пар относительно крупных по размеру (3-8 мкм) хромосом и группу микрохромосом - мелких трудноидентифицируемых хромосом (0.3 - 3 мкм) (Schmid et al., 2000).

Несмотря на то, что представитель класса Aves - домашняя курица стала первым объектом генетики животных (Bateson and Sounders, 1902), ограниченное число молекулярно-цитогенетических работ на момент начала исследований в рамках представленной работы (1990) было проведено на небольшом числе видов птиц. Несмотря на то, что геном домашней курицы в настоящее время полностью секвенирован, генетические и физические карты хромосом птиц, являющиеся своего рода путеводителем по геному, остаются сравнительно малонасыщенными по причине недостаточного количества полиморфных ДНК-маркеров (www.thearkdb.org; Hillier et al, 2004; Wallis et al., 2004).

Наиболее изученным с генетической точки зрения видом птиц является домашняя курица Gallus gallus, что обусловлено как хозяйственным значением этого вида, так и удобством ее использования в качестве модельного лабораторного объекта. Способность к размножению круглый год и сравнительно быстрая смена поколений существенно упрощает эксперименты по гибридологическому анализу. Детальная информация по биологии развития этого вида позволяет обсуждать генетические данные в общебиологическом контексте (Stern, 2004; Burt, 2004; Stern, 2005).

Своеобразие организации кариотипов птиц - структурная компартментализация генома (наличие микро- и макрохромосом) - давно привлекает внимание цитогенетиков в отношении изучения возможной функциональной специализации хромосом. В последнее время показана высокая генетическая активность микрохромосом, плотная насыщенность их кодирующими последовательностями ДНК, в первую очередь генами «домашнего хозяйства» и онкогенами (McQueen et al., 1998; Burt, 2002/

В настоящее время известно более ста ортологичных районов курицы и человека (Schmid et al., 2000; Burt, 2002). С точки зрения сравнительного картирования, ортологии хромосомных районов, домашняя курица оказалась более близкой к человеку, чем даже домовая мышь (Burt et al., 1999). Это, с одной стороны, позволяет экстраполировать данные полного секвенирования генома человека на значительное число хромосомных районов птиц, с другой стороны определяет ценность данных геномики курицы для генетики человека и медицинской генетики.

Цели и задачи исследования. Целью данной работы является изучение ортологии хромосом птиц и млекопитающих и характеристика молекулярной гетерогенности генома птиц. Сформулированы следующие задачи:

- локализация на хромосомах маркеров первого типа (кодирующих последовательностей ДНК)

- «заякоривание» маркеров первого типа на сравнительных генетических и физических картах хромосом человека и выявление ортологии хромосомных районов

- композиционное картирование хромосом курицы и перепела

- характеристика функциональной специализации микро- и макрохромосом. Научная новизна работы. Впервые установлена локализация гена EDNRA на хромосомах домашней курицы. С использованием протяженных ДНК-зондов подтверждена ранее установленная другими авторами локализация генов ALB, ANX5, MGF, MGP и TYR. Впервые проведено композиционное картирование митотических хромосом домашней курицы и японского перепела и продемонстрирована структурно-функциональная компартментализация генома птиц.

Теоретическая и практическая ценность работы. Результаты представленной к защите работы использованы при составлении баз данных по генетическим и физическим картам хромосом курицы и сравнительным картам человека, мыши и курицы (www.thearkdb.org) и банка данных нуклеотидных последовательностей (www.nlm.ncbi.nih.gov) в сети Интернет. Материалы диссертации используются при чтении лекций на кафедре генетики и селекции Санкт-Петербургского государственного университете в рамках магистерской программы «Эволюционная цитогенетика». Поскольку домашняя курица и японский перепел являются ценными сельскохозяйственными видами, данные по картированию нуклеотидных последовательностей на хромосомах этих видов могут быть использованы в работах по позиционному клонированию хозяйственно ценных признаков и селекции при помощи молекулярных маркеров (marker-assisted selection). Данные по эволюционному консерватизму районов хромосом человека и домашней курицы могут быть использованы для моделирования хромосомных болезней человека.

Апробация работы. Материалы работы были представлены на 1-ой международной конференции по молекулярно-генетическим маркерам животных (Киев, 1994), 1-ом съезде Российского общества генетиков и селекционеров им. Н.И.Вавилова (Саратов, 1995), международной конференции

ДНК-технологии в клеточной инженерии и маркировании признаков сельскохозяйственных животных» (Дубровицы, 2001), П-ой конференции

Московского общества генетиков и селекционеров «Актуальные проблемы генетики» 8

Москва, 2003), Щ-ем Съезде Всероссийского общества генетиков и селекционеров (Москва, 2004), а также за рубежом наХУП-ом Международном съезде генетиков (Бирмингем, Великобритания, 1993), XI-ой Европейской Птицеводческой конференции (Айр, Великобритания, 1994), XI-ом Североамериканском коллоквиуме по цитогенетике и генетическому картированию домашних животных (Техас, США, 1995), XlV-ом Европейском коллоквиуме по цитогенетике и генетическому картированию животных (Брно, Чешская Республика, 2000), XI-ой Европейской цитогенетической конференции (Болонья, Италия, 2001), 12 Североамериканской конференции по цитогенетике и генному картированию (Беркли, США, 2001); XV-om Европейском коллоквиуме по цитогенетике и генетическому картированию животных (Неаполь, Италия, 2002); Европейской конференции по молекулярной эволюции (Сорренто-Неаполь, Италия, 2002); Х-ой Международной конференции по геномам животных, растений и микроорганизмов (Сан-Диего, США, 2002); 4-ой Европейской цитогенетической конференции (Болонья, Италия, 2004); 16-ой Европейской конференции по цитогенетике животных и генному картированию (Жойе ен Жосас, Франция,2004); ХП-ой Международной конференции по геномам животных, растений и микроорганизмов (Сан-Диего, США, 2004; ХШ-ой Международной конференции по геномам животных, растений и микроорганизмов (Сан-Диего, США, 2005). Результаты периодически докладывались на семинарах кафедры генетики и селекции СПбГУ.

Публикация результатов. Материалы, представленные в диссертации, были опубликованы в научных журналах "Animal Genetics", "Chromosome Research", «Генетика». Всего по теме работы опубликована 21 печатная работа, из них 7 статей и 14 тезисов.

Структура и объем диссертации. Диссертация изложена на 167 страницах машинописного текста, включает 6 таблиц, 30 рисунков и состоит из следующих разделов: «Введение», «Обзор литературы», «Материал и методы», «Результаты», «Обсуждение», «Заключение», «Выводы» и «Литература». Список цитированной литературы насчитывает 5 русских и 173 иностранных названия.

Заключение Диссертация по теме "Генетика", Сазанова, Анна Львовна

выводы

1. Гены MGF и MGP находятся в районе GGA Ip21-ql2 хромосом домашней курицы и HSA 12pl3-q23 человека, что свидетельствует об ортологии указанных районов хромосом.

2. Ген TYR локализован в районе GGA Iq23-q44 домашней курицы и HSA Ilpl5-q22 человека, что подтверждает наличие межгеномной гомологии в этих районах.

3. Гены ALB, ANX5, EDNRA находятся в районе GGA 4qll-q24 хромосом домашней курицы и HSA 4pl6-q28 человека, что свидетельствует об ортологии указанных районов хромосом.

4. Эволюционный консерватизм локализации генов ALB, ANX5, EDNRA, MGF, MGP и TYR относительно других маркеров подтверждает высокую степень гомологии хромосом человека и домашней курицы.

5. Данные сравнительного композиционного картирования митотических хромосом домашней курицы и японского перепела свидетельствуют о принципиальном сходстве распределения фракций изохор на хромосомах этих видов.

6. Тяжелые фракции изохор птиц приурочены к микрохромосомам и теломерным районам макрохромосом, а легкие - к интерстициальным районам макрохромосом, что говорит о наличие структурно-функциональной компартментализации генома птиц.

Библиография Диссертация по биологии, кандидата биологических наук, Сазанова, Анна Львовна, Санкт-Петербург

1. Маниатис Т., Фрич Э., Сэмбрук Дж. Молекулярное клонирование // М. «Мир». 1984. 479 С.

2. Родионов А.В., Дукельская А.В., Кузнецова Т.В. Характер флуоресценции макрохромосом цыпленка, обработанных флуорохромом Хехст 33258 // Бюл. ВНИИГРЖ. 1981. Т.51. С.11-14.

3. Родионов А. В. Цитохимический анализ молекулярной гетерогенности хромосом курицы // Дисс. на соиск. уч. ст. канд. биол. наук. Л: ВНИИРГЖ. 1985.

4. Родионов А. В. Micro vs macro: структурно функциональная организация микро - и макрохромосом птиц // Генетика. 1996. Т. 32. С. 597 -608.

5. Родионов А.В. Цитогенетика доместицированных птиц: физические и генетические карты хромосом и проблема эволюции кариотипа // Автореф. дисс. на соиск. уч. ст. докт. биол. наук. СПб: СПбГУ. 2001. 42 С.

6. Au W., Fechheimer N.S., Soukup S. Identification of the sex chromosomes in the bald eagle // Can. J. Genet. Cytol. 1975. V. 17. P. 187-191.

7. Axelsson E., Webster M.T., Smith N.G., Burt D.W., Ellegren H. Comparison of the chicken and turkey genomes reveals a higher rate of nucleotide divergence on microchromosomes than macrochromosomes // Genome Res. 2005. V. 15. P. 120-125.

8. Bateson W., Saunders E. R. Experimental studies in the physiology of heredity // Reports to the Evolution Committee of the Royal Society I. 1902. P. 1160.

9. Berlin S., Ellegren H. Chicken W: a genetically uniform chromosome in a highly variable genome // PNAS USA. 2004. V. 101. P. 15967-15969.

10. Bernardi G. The organization of the vertebrate genome and the problem of the CpG shortage //Prog. Clin. Biol. Res. 1985. V. 198. P. 3-10. Bernardi G. The vertebrate genome: isochores and evolution // Mol Biol Evol. 1993. V. 10. P. 186-204.

11. Bernardi G. Isochores and the evolutionary genomics of vertebrates // Gene. 2000. V. 241. P. 3-17

12. Bernardi G. Misunderstandings about isochores. Part 1 // Gene. 2001. V. 276. P. 3-13.

13. Bitgood J.J. Additional linkage relationships within the Z chromosome of the chicken // Poult. Sci. 1985. V. 64. P. 2234-2238.

14. Bitgood J.J., Somes R.G. Linkage relationships and gene mapping // In: Poultry Breeding and Genetics (R.D. Crawford ed.). Elsevier: Amsterdam. 1990. P. 469-495.

15. Bitgood J. J., Somes R.G. Gene map of the chicken (Gallus gallus) // In: Genetic Maps, 6th ed. (S. O'Brien ed.). Cold Spring Harbor Laboratory Press. 1993. P. 4333-4342.

16. Bloom S.E., Buss E.G. Ammoniacal silver staining of embryonic chickencells and chromosomes // Poult. Sci. 1969. V. 48. P. 1114-1116.140

17. Bloom S.E., Bacon L.D. Linkage of the major histocompatibility (B) complex and the nucleolar organizer in the chicken. Assignment to a microchromosome //J. Hered. 1985. V. 76. P. 146-154.

18. Boardman P.E., Sanz-Ezquerro J., Overton I.M.,^Burt D.W., Bosch E., Fong W.T., Tickle C., Brown W.R., Wilson S.A., Hubbard S.J. A comprehensive collection of chicken cDNAs // Curr. Biol. 2002. V. 12. P. 1965-1969.

19. Bourque G., Zdobnov E.M., Bork P., Pevzner P.A., Tesler G. Comparative architectures of mammalian and chicken genomes reveal highly variable rates of genomic rearrangements across different lineages // Genome Res. 2005. V. 15. P. 98-110.

20. Brown W.R., Hubbard S.J., Tickle C., Wilson S.A. The chicken as a model for large-scale analysis of vertebrate gene function // Nat. Rev. Genet. 2003. V. 4. P. 87-98.

21. Buitkamp J, Ewald D, Schalkwyk L, Weiher M, Masabanda J, Sazanov A, Lehrach H, Fries R. Construction and characterisation of a gridded chicken cosmid library with four-fold genomic coverage // Anim. Genet. 1998. V. 29. P. 295-301.

22. Bumstead N., Palyga J. A preliminary linkage map of the chicken genome // Genomics. 1992. V. 13. P. 690-697.

23. Burt D.W., Bruley C., Dunn I.C., Jones C.T., Ramage A., Law A.S., Morrice D.R., Paton I.R., Smith J., Windsor D., Sazanov A., Fries R., Waddington D. The dynamics of chromosome evolution in birds and mammals // Nature. 1999. V. 402. P. 411-413.

24. Burt D.W. Origin and evolution of avian microchromosomes // Cytogenet. Genome Res. 2002. V. 96. P. 97-112.

25. Burt D.W. The chicken genome and the developmental biologist // Mechanisms of Development. 2004. V. 121. P. 1129-1135.

26. Buschges R., Weber R.G., Actor В., Lichter P., Collins V.P., Reifenberger G. Amplification and expression of cyclin D genes (CCND1, CCND2 and CCND3) in human malignant gliomas // Brain. Pathol. 1999. V. 9. P. 435 442.

27. Caccio S., Jabbari K., Matassi G., Guermonprez F. Desgres J., Bernardi G. Methylation patterns in the isochores of vertebrate genomes // Gene. 1997. V. 205. P.119-124.

28. Cancela L., Hsieh C.L., Francke U., Price P.A. Molecular structure, chromosome assignment, and promoter organization of the human matrix Gla protein gene // J. Biol. Chem. 1990. V. 265. P. 15040 15048.

29. Chandra H. S. Proposed role of W chromosome inactivation and the absence of dosage compensation in avian sex determination // Proc. Roy. Soc. Lond. B. 1994. V. 258. P. 79-82.

30. Chiusano M.L., D'Onofrio G., Alvarez-Valin F., Jabbari K., Colonna G., Bernardi G. Correlations of nucleotide substitution rates and base composition of mammalian coding sequences with protein structure // Gene. 1999. V. 238. P. 2331.

31. Chowdhary B.P., Raudsepp T. HSA4 and GGA4: remarkable conservation despite 300-Myr divergence // Genomics. 2000. V. 64. P. 102 105.

32. Christidis L. Aves. In: Animal Cytogenetics. Ed. by John В., Kayano H., Levan A. 1990. Berlin. Gebrueder Borntraeger. 356 P.

33. Clement W.M.J. DNA replication patterns in the chromosomes of the domestic fowl // Cytologia. (Tokyo). 1971. V. 36. P. 168-172.

34. Clinton M. Sex determination and gonadal development: a bird's eye view // J. Exp. Zool. 1998. V. 281. P. 457-465.

35. Comings D.E, Mattoccia E. Studies of microchromosomes and a G-C rich DNA satellite in the quail // Chromosoma. 1970. V. 30. P. 202-214.

36. Crooijmans R.P., Vrebalov J., Dijkhof R.J., van der Poel J.J., Groenen M.A. Two-dimensional screening of the Wageningen chicken ВАС library // Mamm. Genome. 2000. V. 11. P. 360-363.

37. Cross S.H., Bird A.P. CpG islands and genes // Curr. Opin. Genet. Dev. 1995. V. 5. P. 309-314.

38. Cruveiller S., D'Onofrio G., Bernardi G. The compositional transition between the genomes of cold- and warm- blooded vertebrates: codon frequencies in orthologous genes // Gene. 2000. V. 261. P. 71 83.

39. Cruveiller S., Jabbari K., Clay O., Bernardi G. Compositional gene landscapes in vertebrates // Genome Res. 2004. V. 14. P. 886-892.

40. Derjusheva S., Kurganova A., Habermann F., Gaginskaya E. Highchromosome conservation detected by comparative chromosome painting inchicken, pigeon and passerine birds // Chromosome Res. 2004. V. 12. P. 715-723.

41. Dominguez-Steglich M., Meng G., Bettecken Т., Muller C.R., Schmid M.

42. The dystrophin gene is autosomally located on a microchromosome in chicken //

43. Genomics. 1990. V. 8. P. 536-540.

44. Dominguez-Steglich M., Auffray C., Schmid M. Linkage of the chicken

45. MHC to the nucleolus organizer region visualized using non-isotopic in situhybridization// J. Hered. 1991. V. 82. P. 503-505.

46. Dominguez-Steglich M, Jeltsch J.M, Gamier J.M, Schmid M. In situmapping of the chicken progesterone receptor gene and the ovalbumin gene //

47. Genomics. 1992a. V. 13. P. 1343-1344.

48. Dominguez-Steglich M, Carrier A, Auffray C, Schmid M. Assignment ofthe chicken tyrosine hydroxylase gene to chromosome 6 by FISH // Cytogenet.

49. Cell Genet. 1992b. V. 60. P. 138-139.

50. Dominguez-Steglich M., Lichter P., Carrier A., Auffray C., Schmid M.

51. Mapping the beta NGF gene in situ to a microchromosome in chicken // Genomics.1992c. V. 12. P. 829-832.

52. Dominguez-Steglich M., Schmid M. Sex-linkage of the chicken ornithinetranscarbamylase gene //Hereditas. 1993. P. 118. P. 1-5.

53. D'Onofrio G. Expression patterns and gene distribution in the human genome // Gene. 2002. V. 300. P. 155-160.

54. D'Onofrio G., Ghosh T.C., Bernardi G. The base composition of the genes is correlated with the secondary structures of the encoded proteins // Gene. 2002. V. 300. P. 179-187.

55. Ellegren H. Evolution of the avian sex chromosomes and their role in sex chromosomes // TREE. 2000. V. 13. P. 188-192.

56. Ellegren H. Dosage compensation: do birds do it as well? // Trends in Genetics. 2002. V. 18. P. 25-28.

57. Ellegren H., Carmihael A. Multiple and independent cessasions of recombination between avian sex chromosomes // Genetics. 2002. V. 158. P. 525531.

58. Eyre-Walker A., Hurst L.D. The evolution of isochores // Nat. Rev. Genet. 2001. V. 2. P. 549-555.

59. Ferguson C.A., Kidson S.H. The regulation of tyrosinase gene transcription //Pigment Cell Res. 1997. V. 10. P. 127 138.

60. Fernandez M.P., Fernandez M.R., Morgan R.O. Structure of the gene encoding anchorin CII (chick annexin V) // Gene. 1994. V. 141. P. 179 186.

61. Fitch W.M. Distinguishing homologous from analogous proteins // Syst. Zool. 1970. V. 19. P. 99-113.

62. Gogarten J.P., Olendzenski L. Orthologs, paralogs and genome comparisons // Curr. Opin. Genet. 1999. V. 9. P. 630-636.

63. Graves J.A. Sex and death in birds: a model of dosage compensation that predicts lethality of sex chromosome aneuploids // Cytogenet Genome Res. 2003. V. 101. P. 278-282.

64. Groenen M.A., Crooijmans R.P., Veenendaal A., Cheng H.H., Siwek M. van der Poel J.J. A comprehensive microsatellite linkage map of the chicken genome // Genomics. 1998. V. 49. P. 265 274.

65. Guillier Gencik Z., Bernheim A. and Coullin Ph. Generation of whole -chromosome painting probes specific to each chicken macrochromosome // Cytogenet. Cell Genet. 1999. V. 87. P. 282 - 285.

66. Habermann F., Cremer M., Walter J., Kreth G., von Hase J., Bauer K., Wienberg J., Cremer C., Cremer T., Solovei I. Arrangement of macro- and microchromosomes in chicken cells // Chromosome Research. 2001. V. 9. P. 569584.

67. Habermann F., Biet C., Fries R. Physical mapping of the genes encoding tryptophan hydroxylase and insulin to chicken chromosome 5 // Animal Genetics. 2001. V. 32. P. 316-331.

68. Hillier L.W., Miller W., Birney E., Warren W., Hardison R.C., Ponting C.P.,

69. Bork P., Burt D.W., Groenen M.A., Delany M.E., Dodgson J.B., Chinwalla A.T.,

70. Cliften P.F., Clifton S.W., Delehaunty K.D., Fronick C., Fulton R.S., Graves T.A.,

71. Kremitzki C., Layman D., Magrini V., McPherson J.D., Miner T.L., Minx P., Nash

72. W.E., Nhan M.N., Nelson J.O., Oddy L.G., Pohl C.S., Randall-Maher J., Smith

73. S.M., Wallis J.W., Yang S.P., Romanov M.N., Rondelli C.M., Paton В., Smith J.,

74. Morrice D., Daniels L., Tempest H.G., Robertson L., Masabanda J.S., Griffin D.K.,

75. Vignal A., Fillon V., Jacobbson L., Kerje S., Andersson L., Crooijmans R.P., Aerts

76. J., van der Poel J.J., Ellegren H., Caldwell R.B., Hubbard S.J., Grafham D.V.,

77. Kierzek A.M., McLaren S.R., Overton I.M., Arakawa H., Beattie K.J., Bezzubov

78. Y., Boardman P.E., Bonfield J.K., Croning M.D., Davies R.M., Francis M.D.,

79. Humphray S.J., Scott C.E., Taylor R.G., Tickle C., Brown W.R., Rogers J.,

80. Buerstedde J.M., Wilson S.A., Stubbs L., Ovcharenko I., Gordon L., Lucas S.,

81. Hosoda К., Nakao К., Tamura N., Arai H., Ogawa Y., Suga S., Nakanishi S., Imura H. Organization, structure, chromosomal assignment, and expression of the gene encoding the human endothelin-A receptor // J. Biol. Chem. 1992. V. 267. P. 18797- 18804.

82. Hughes A., Piontkivska H. DNA repeats arrays in chicken and human genomes and the adaptive evolution of avian genome size // BMC Evolutionary Biology. 2005. V. 5. P. 1-6.

83. Hutchison N. Lampbrush chromosomes of the chicken, Gallus domesticus // J. Cell Biol. 1987. V. 105. P. 1493 1500.

84. Hutchison N.J., Le Ciel C. Gene mapping in chicken via fluorescent in situ hybridization to mitotic and meiotic chromosomes // In: Manipulation of the avian genome. Paris. Gibbins. 1991. P. 205.

85. Kadi F., Mouchiroud D., Sabeur G., Bernardi G. The compositional patterns of the avian genomes and their evolutionary implications // J. Mol. Evol. 1993. V. 37. P. 544-551.

86. Kaelbling M., Fechheimer N.S. Synaptonemal complexes and the chromosome complement of domestic fowl, Gallus domesticus // Cytogenet. Cell Genet. 1983a. V. 35. P. 87 -92.

87. Kaelbling M., Fechheimer N.S. Synaptonemal complex analysis of chromosome rearrangements in domestic fowl, Gallus domesticus // Cytogenet. Cell Genet. 1983b. V. 36. P. 567 572.

88. Kayang B.B., Inoue-Murayama M., Nomura A., Kimura K., Takahashi H., Mizutani M., Ito S. Fifty microsatellite markers for Japanese quail // J. Hered. 2000. V. 91. P. 502-505.

89. Krasikova A., Kulikova Т., Saifitdinova A., Derjusheva S., Gaginskaya E. Centromeric protein bodies on avian lampbrush chromosomes contain a protein detectable with an antibody against DNA topoisomerase II //Chromosoma. 2004. V. 113. P. 316-323.

90. Devon K., Dewar K., Doyle M., FitzHugh W., Funke R., Gage D., Harris K.,

91. Heaford A., Howland J., Kann L., Lehoczky J., LeVine R., McEwan P., McKernan

92. K., Meldrim J., Mesirov J.P., Miranda C., Morris W., Naylor J., Raymond C.,

93. Rosetti M., Santos R., Sheridan A., Sougnez C., Stange-Thomann N., Stojanovic

94. N., Subramanian A., Wyman D., Rogers J., Sulston J., Ainscough R., Beck S.,

95. Bentley D., Burton J., Clee C., Carter N., Coulson A., Deadman R., Deloukas P.,

96. Dunham A., Dunham I., Durbin R., French L., Grafham D., Gregory S., Hubbard

97. Т., Humphray S., Hunt A., Jones M., Lloyd C., McMurray A., Matthews L.,

98. Mercer S., Milne S., Mullikin J.C., Mungall A., Plumb R., Ross M., Shownkeen R.,

99. Sims S., Waterston R.H, Wilson R.K., Hillier L.W., McPherson J.D., Marra M.A.,

100. Mardis E.R., Fulton L.A., Chinwalla A.T., Pepin K.H., Gish W.R., Chissoe S.L.,

101. Wendl M.C., Delehaunty K.D., Miner T.L., Delehaunty A., Kramer J.B., Cook

102. L., Fulton R.S., Johnson D.L., Minx P.J., Clifton S.W., Hawkins Т., Branscomb

103. E, Predki P., Richardson P., Wenning S, Slezak Т., Doggett N., Cheng J.F., Olsen

104. A., Lucas S., Elkin C., Uberbacher E., Frazier M., Gibbs R.A., Muzny D.M.,

105. Scherer S.E., Bouck J.B., Sodergren E.J., Worley K.C., Rives C.M., Gorrell J.H.,

106. Metzker M.L., Naylor S.L., Kucherlapati R.S., Nelson DL, Weinstock G.M.,

107. Sakaki Y., Fujiyama A., Hattori M., Yada Т., Toyoda A., Itoh Т., Kawagoe C.,151

108. E.V., Korf I., Kulp D., Lancet D., Lowe T.M., McLysaght A., Mikkelsen Т.,

109. Moran J.V., Mulder N., Pollara V.J., Ponting C.P., Schuler G., Schultz J., Slater G.,

110. Smit A.F., StupkaE., Szustakowski J., Thierry-Mieg D., Thierry-Mieg J., Wagner1., Wallis J., Wheeler R., Williams A., Wolf Y.I., Wolfe K.H., Yang S.P., Yeh

111. R.F., Collins F., Guyer M.S., Peterson J., Felsenfeld A., Wetterstrand K.A.,

112. Patrinos A., Morgan M. J., Szustakowki J., de Jong P., Catanese J.J., Osoegawa K.,

113. McQueen H.A., Fantes J., Cross S.H., Clark V.H., Archibald A.L., Bird A.P. CpG islands of chicken are concentrated on microchromosomes // Nat. Genet. 1996. V. 12. P. 321-324.

114. McQueen H. A., Siriaco G., Bird A. P. Chicken microchromosomes are hyperacetylated, early replicating, and gene rich // Genome Research. 1998. V. 8. P. 621 -628.

115. Minghetti P.P., Ruffner D.E., Kuang W.J., Dennison O.E., Hawkins J.W.,

116. Beattie W.G., Dugaiczyk A. Molecular structure of the human albumin gene isrevealed by nucleotide sequence within ql 1-22 of chromosome 4 // J. Biol. Chem.1986. V. 261. P. 6747-6757.

117. Mizuno S., Macgregor H. The ZW lampbrush chromosomesof birds: a unique opportunity to look at the molecular cytogenetics of sexchromosomes // Cytogenet. Cell Genet. 1998. V. 80. P. 149 157.

118. Morisson M., Pitel F., Fillon V., Pouzadoux A., Berg R., Vit J.P., Zoorob R.,

119. Auffray C., Gellin J., Vignal A. Integration of chicken cytogenetic and geneticmaps: 18 new polymorphic markers isolated from ВАС and РАС clones // Anim.

120. Genet. 1998. V. 29. P. 348 355.

121. Morisson M., Lemiere A., Bosc S., Galan M., Plisson-Petit F., Pinton P.,

122. Delcros C., Feve K., Pitel F., Fillon V., Yerle M., Vignal A. Chick RH: a chickenwhole-genome radiation hybrid panel // Genet. Sel. Evol. 2002. V. 34. P. 521-533.

123. Mural R.J., Adams M.D., Myers E.W., Smith H.O., Miklos G.L., Wides R.,

124. Halpern A., Li P.W., Sutton G.G., Nadeau J., Salzberg S.L., Holt R.A., Kodira

125. C.D., Lu F., Chen L., Deng Z., Evangelista C.C., Gan W., Heiman T.J., Li J., Li Z.,

126. Merkulov G.V., Milshina N.V., Naik A.K., Qi R., Shue B.C., Wang A., Wang J.,

127. Wang X., Yan X., Ye J., Yooseph S., Zhao Q., Zheng L., Zhu S.C., Biddick K.,

128. Bolanos R., Delcher A.L., Dew I.M., Fasulo D., Flanigan M.J., Huson D.H.,

129. Nakagawa S. Is avian sex determination unique?: clues from a warbler and from chickens //Trends Genet. 2004. V. 20. P. 479-480.

130. Oetting W.S. The tyrosinase gene and oculocutaneous albinism type 1 (OCA1): A model for understanding the molecular biology of melanin formation // Pigment Cell Res. 2000. V. 13. P. 320 325.

131. Ohno S., Christian C., Stenins C. Nuclear organization of microchromosomes Gallus domesticus // Exp. Cell Res. 1962. V. 27. P. 612 614.

132. Oloffson В., Bernardi G. Organization of nucleotide sequences in the chicken genome // Eur. J. Biochem. 1983. V. 130. P. 241 245.

133. O'Neill M., Binder M., Smith C., Andrews J,.Reed K., Smith M., Millar C., Lambert D., Sinclair A. ASW: a gene with conserved avian linkage and female specific expression in chick embryonic gonad // Dev. Genes Evol. 2000. V. 210. P. 243-249.

134. Ovcharenko I., Loots G.G., Nobrega M.A., Hardison R.C., Miller W., Stubbs L. Evolution and functional classification of vertebrate gene deserts // Genome Res. 2005. V. 15. P. 137-145.

135. Palmer D.K., Jones C. Gene mapping in chicken-Chinese hamster somatic cell hybrids. Serum albumin and phosphoglucomutase-2 structural genes on chicken chromosome 6 // J. Hered. 1986. V. 77. P. 106 108.

136. Pesole G., Bernardi G., Saccone S. Isochore specificity of AUG initiator context of human genes // FEBS Letters. 1999. V. 464. P. 60 62.

137. Pitel F., Berg R., Coquerelle G., Crooijmans R.P.M.A., GroenenM.A.M.,

138. Vignal A., Tixier-Boichard M. Mapping the Naked Neck (NA) and Polydactyly156

139. PO) mutants of the chicken with microsatellite molecular markers // Genet. Sel. Evol. 2000. V. 32. P. 73 86.

140. Ponce de Leon F.A., Burt D.W. Physical map of the chicken // In: Manipulation of the avian genome. 1993. P. 203.

141. Ponce de Leon F.A., Y. Li and Z. Weng. Early and late replicative chromosomal banding patterns of Gallus domesticus // Journal of Heredity. 1992. V.83. P.36-42.

142. Popovici C., Leveugle M., Birnbaum D., Coulier F. Coparalogy: physical and functional clusterings in the human genome // Biochem. Biophys. Res. Commun. 2001. V. 288. P. 362 370.

143. Reed K.J., Sinclair A.H. FET-1: a novel W-linked, female specific gene up-regulated in the embryonic chicken ovary // Gene Expr Patterns. 2002. V. 2. P. 8386.

144. Rodionov A.V., LukinaN.A., Galkina S.A., Solovei I., Saccone S. Crossing over in chicken oogenesis: cytological and chiasma-based genetic maps of chicken lampbrush chromosome 1 // J. Hered. 2002. V. 93. P. 125-129.

145. Rotschild M.F. Genome mapping in lifestock: a jorney, not a destination // Rep. Aowa Univ. 1994. P. 13.

146. Saccone S., Caccio S., Perani P., Andreozzi L., Rapisarda A., Motta S., Bernardi G. Compositional mapping of mouse chromosomes and identification of the gene-rich regions // Chromosome Res. 1997. V. 5. P. 293 300.

147. Saccone S., Federico C., Solovei I., Croquette M. F., Delia Valle G., Bernardi G. Identification of the gene richest bands in human prometaphase chromosomes // Chromosome Res. 1999. V .7. P. 379 - 386.

148. Saccone S., Pavlichek A., Federico C., Paces J., Bernardi G. Gene, isochores and bands in human chromosomes 21 and 22 // Chrom. Res. 2001. V. 9. P. 533-539.

149. Saccone S., Federico C., Bernardi G. Localization of the gene-richest and thegene-poorest isochores in the interphase nuclei of mammals and birds // Gene.2002. V. 300. P. 169 178.

150. Schartl M. Sex chromosome evolution in non-mammalian vertebrates //

151. Current Opinion in Genetics & Development. 2004. V. 14. P. 634-641.

152. Schmid W. DNA replication patterns of the heterochromosomes in Gallusdomesticus // Cytogenetics. 1962. V. 1. P. 344 352.

153. Schmid M., Enderle E., Schindler D., Schempp W. Chromosome bandingand DNA replication patterns in bird karyotypes // Cytogenet Cell Genet. 1989.1. V.52. P. 139- 146.

154. Schmid M., Nanda I., Guttenbach M., Steinlein C., Hoehn H., Shartl M.,

155. Haaf Т., Weigend S., Fries R., Buerstedde J. M., Wimmers K., Burt D. W., Smith

156. J., A'Hara S., Law A., Griffin D. K., Bumstead N., Kaufman J., Thomson P. A.,

157. Burke Т., Groenen M., Crooijmans R. P. M. A., Vignal A., Fillon V., Morrison M.,158

158. Pitel F., Tixier Boichard M., Ladjali - Mohammedi K., Hillel J., Maki - Tanila A., Cheng H. H., Delany M. E., Burnisde J., Mizuno S. First report on chicken genes and chromosomes 2000 // Cytogenet. Cell Genet. 2000. V. 90. P. 169 - 218.

159. Serebrovsky A.S., Petrov S.G. A case of close autosomal linkage in the fowl // J. Heredity. 1928. V. 19. P. 306-315.

160. Serebrovsky, A.S. and Petrov, S.G. On the composition of the plan of the chromosomes of the domestic hen // Zhurn. Exp. Biol. 1930. V. 6. P. 157-180.

161. Sheldon B.L., Thorne M.N. Poultry genome mapping // In: Manipulation of avian genome. 1993. P. 12.

162. Shetty S., Griffin D. K. and Marshall Graves J. A. Comparative painting reveals strong chromosome homology over 80 million years of bird evolution // Chromosome Research. 1999. V.7. P. 289 295.

163. Shibusawa M., Minai S., Nishida-Umehara C., Suzuki Т., Mano Т., Yamada K., Namikawa Т., Matsuda Y. A comparative cytogenetic study of chromosome homology between chicken and Japanese quail // Cytogenet. Cell Genet. 2001. V. 95. P. 103 109.

164. Shibusawa M., Nishibori M., Nishida-Umehara C., Tsudzuki M., Masabanda

165. Shoffner R. N. Chromosomes of Birds // The Cell Nucleus. 1974. V. 2. P. 223-261.

166. Show E.M., Shoffner R.N., Foster D.N., Guise K.S. Mapping of the growth hormone gene by in situ hybridization to chicken chromosome 1. // J. Hered. 1991. V. 82. P. 505-508.

167. Smith J., Burt D.W. Parameters of the chicken genome (Gallus gallus) // Anim. Genet. 1998. V. 29. P. 290-304.

168. Smith C.A., Katz M., Sinclair A.H. DMRT1 Is Upregulated in the Gonads During Female-to-Male Sex Reversal in ZW Chicken Embryos // Biol. Reprod. 2003. V. 68. P. 560-570.

169. Smith C., Sinclair A. Sex determination in the chicken embryos // J. Exp.Zool. 2001. V. 290. P. 691-699.

170. Smith C.A., Sinclair AH. Sex determination: insights from the chicken // Bioessays. 2004. V. 26. P. 120-132.

171. Smyth J.R., Ponce de Leon F.F. Research note: linkage relationship between the pea comb (P) and the extended black (E) loci in chicken // Poltry Sci. 1992. V. 71. P. 208-210.

172. Solovei I.V., Joffe B.I., Gaginskaya E.R., Macgregor H.C. Transcription of lampbrush chromosomes of a centromerically localized highly repeated DNA in pigeon (Columba) relates to sequence arrangement // Chromosome Res. 1996. V. 4. P. 588-603.

173. Soret J., Vellard M., Viegas-Pequignot E., Apion F., Dutrillaux В., Perbol B. Chromosomal realocation of the chicken c-myb locus and organization of 3'-proximal coding exons. //FEBS. 1991. V. 263. P. 254-260.

174. Spillman W.J. Spurious allelomorphism: results of some recent investigations // American Naturalist. 1908. V. 42. P. 610 615.

175. Stern C. The chick embryo past, present and future as a model system in developmental biology // Mechanism of development. 2004. V. 121. P. 1011-1013.

176. Stern C. The chick: a great model system becomes ever greater // Developmental Cell. 2005. V. 8. P. 9-15.

177. Stock A.D., Arrighi F.E., Stefos K. Chromosome homology in birds: banding patterns of the chromosomes of the domestic chicken, ring-necked dove, and domestic pigeon // Cytogenet Cell Genet. 1974. V. 13. P. 410 418.

178. Stock A.D., Mengden G.A. Chromosome banding pattern conservatism in birds and nonhomology of chromosome banding patterns between birds, turtles, snakes and amphibians // Chromosoma. 1975. V. 50. P. 69 77.

179. Stock A.D., Bunch T.D. The evolutionary implications of chromosome banding pattern homologies in the bird order Galliformes // Cytogenet. Cell Genet. 1982. V. 34. P. 134-148.

180. Sueoka N. Wide intra-genomic GC heterogeneity in human and chicken is mainly due to strand-symmetric directional mutation pressures: dGTP-oxidation and symmetric cytosine-deamination hypotheses // Gene. 2002. V. 300. P. 141 -154.

181. Sumner A.T., de la Torre J., Stuppia L. The distribution of genes on chromosomes: a cytological approach // J. Mol. Evol. 1993. V. 37. P. 117 -122.

182. Symonds G., Stubblefield E., Guyaux M., Bishop J.M. Cellular oncogenes (c-erb-A and c-erb-B) located on different chicken chromosomes can be transduced into the same retroviral genome // Mol. Cell Biol. 1984. V. 4. P. 1627 -1630.

183. Takagi N., Sasaki M. A phylogenetic study of bird karyotypes // Chromosoma. 1974. V. 46. P. 91 120.

184. Tegelstrom H., Ebenhard Т., Ryttman H. Rate of karyotype evolution and speciation in birds //Hereditas. 1983. V. 98. P. 235 239.

185. Tereba A., Lai M.M., Murti K.G. Chromosome 1 contains the endogenous RAV-0 retrovirus sequences in chicken cells // Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1979. V. 76. P. 6486-6490.

186. Tereba A., McPhaul M J., Wilson J.D. The gene for aromatase (P450 arom) in the chicken is located on the long arm of chromosome 1. // J. Hered. 1991. V. 82. P. 80-81.

187. Tixier-Boichard M. Current state of the art in poultry genome mapping // In: Manipulation of avian genome. 1993. P. 9.

188. Tobita-Teramoto Т., Jang G.Y., Kino K., Salter D.W., Brumbaugh J., Akiyama T. Autosomal albino chicken mutation (ca/ca) deletes hexanucleotide (-deltaGACTGG817) at a copper-binding site of the tyrosinase gene // Poult. Sci. 2000. V. 79. P. 46 50.

189. Tuiskula-Haavisto M., Honkatukia M., Vikki J., De Konig D., Schulman N., Maki-Tanila A. Mapping of quantitative trait loci affecting quality and production traits in eggs layers // Poultry Sci. 2002. V. 81. P. 919 927.

190. Wada A., Suyama A. Third letters in codons counterbalance the (G + C)-content of their first and second letters // FEBS Lett. 1985. V. 188. P. 291 294.

191. Wada A., Suyama A. Local stability of DNA and RNA secondary structure and its relation to biological functions // Prog. Biophys. Mol. 1986. V. 47. P. 113-157.

192. Wang N., Shoffner R.N. Trypsin G- and C-banding for interchange analysis and sex identification in the chicken // Chromosoma. 1974. V. 47. P. 61 69.

193. Wehrle-Haller В., Imhof В.A. Stem cell factor presentation to c-Kit. Identification of a basolateral targeting domain // Journal of Biological Chemistry. 2001. V. 276. P. 12667 12674.

194. Wicker Т., Robertson J.S., Schulze S.R., Feltus F.A., Magrini V., Morrison J.A., Mardis E.R., Wilson R.K., Peterson D.G., Paterson A.H., Ivarie R. The repetitive landscape of the chicken genome // Genome Res. 2005. P. 15. P. 126136.

195. Wiedemann M., Trueb В., Belluoccio D. Molecular cloning of avian matrix

196. Gla protein // Biochim. Biophys. Acta. 1998. V. 1395. P. 47 49.

197. Wilchek M., Bayer E.A. Introduction to avidin-biotin technology // Meth.

198. Enzymol. 1990. V. 184. P. 5 13.

199. Wong G.K., Liu В., Wang J., Zhang Y., Yang X., Zhang Z., Meng Q., Zhou

200. J., Li D., Zhang J., Ni P., Li S., Ran L., Li H., Zhang J., Li R., Li S., Zheng H., Lin

201. W., Li G., Wang X, Zhao W., Li J., Ye C., Dai M., Ruan J., Zhou Y., Li Y., He X.,

202. Zhang Y., Wang J., Huang X., Tong W„ Chen J., Ye J., Chen C., Wei N., Li G.,

203. Dong L., Lan F„ Sun Y., Zhang Z., Yang Z., Yu Y., Huang Y., He D., Xi Y., Wei

204. D., Qi Q., Li W., Shi J., Wang M., Xie F., Wang J., Zhang X., Wang P., Zhao Y.,

205. N., Yang N., Dong W., Hu S., Zeng C., Zheng W., Нао В., Hillier L.W., Yang

206. S.P., Warren W.C., Wilson R.K., Brandstrom M., Ellegren H., Crooijmans R.P.,van der Poel J.J., Bovenhuis H., Groenen M.A., Ovcharenko I., Gordon L., Stubbs1., Lucas S., Glavina Т., Aerts A., Kaiser P., Rothwell L., Young J.R., Rogers S.,

207. Walker B.A., van Hateren A., Kaufman J., Bumstead N., Lamont S.J., Zhou H.,

208. Hocking P.M., Morrice D., de Koning D.J., Law A., Bartley N., Burt D.W., Hunt165

209. Yoshimura Т., Suzuki Y., Makino E., Suzuki Т., Kuroiwa A., Matsuda Y., Namikawa Т., Ebihara S. Molecular analysis of avian circadian clock genes // Brain Res. Mol. Brain Res. 2000. V. 78. P. 207 215.

210. Zhang C.T., Zhang R. Isochore structures in the mouse genome // Genomics. 2004. V. 83. V. 384-394.

211. Zhou J.H., Ohtaki M., Sakurai M. Sequence of a cDNA encoding chicken stem cell factor // Gene. 1993. V. 127. P. 269 270.

212. Zimmer R., Gibbins A. Construction and characterization of a large-fragment chicken bacterial artificial chromosome library // Genomics. 1997. V. 42. P. 217 226.

213. Zimmer R., King W., Verrinder-Gibbins A. Generation of chicken Zchromosome painting probes by microdissection for screening large-insertgenomic libraries // Cytogenet. Cell Genet. 1997. V. 78. P. 124 -130.

214. Zoorob R., Billault A., Severac V., Fillon V., Vignal A., Auffray C. Two chicken genomic libraries in the РАС and ВАС cloning systems: organization and characterization// Anim. Genet. 1996. V. 27. P. 69.

215. Zoubak S., Clay O., Bernardi G. The gene distribution of the human genome // Gene. 1996. V. 174. P. 95 102.