Бесплатный автореферат и диссертация по биологии на тему
Транскрипция повторяющихся последовательностей В1 и В2 генома мыши
ВАК РФ 03.00.03, Молекулярная биология
Содержание диссертации, кандидата биологических наук, Леках, Ирина Викторовна
ВВЕДЕНИЕ.
Глава I. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
I. Прерывистые гены эукариот.
2ф Низкомолекулярные РНК.
3. Повторяющиеся последовательности генома эукариот.
За. Длинные повторяющиеся повледовательности.
36. Короткие повторяющиеся последовательности.
Глава П. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
1. Клоны.
2. Введение метки в ДНК
3. Клетки.
4. Введение радиоактивной метки.
5. Выделение ядерной и цитоплазматической РНК. 32 из клеток асцитной карциномы Эрлиха.
6. Выделение ядерной, цитоплазцатической и полисом-ной РНК из печени мышей и плазмоцитомы M0PC-I04E.
7. Дополнительная очистка препаратов РНК.
8. Выделение поли(А) содержащей РНК на поли(^)-сефарозе.
9. Электрофорез РНК в агарозном геле.
10. Приготовление диазобензилоксиметил (ДБМ) -бумаги.
11. Перенос РНК на ДБМ-бумагу.
12. Гибридизационные эксперименты.
13. Контактная гибридизация.
14. Элюция РНК из агарозного геля.
15 • Посадка ДНК на нитроцеллюлозные фильтры.
16. Гибридизация РНК с нитроцеллюлозными фильтрами.
17. Элюция гибридов и обработка их РНКазой.
18. Электрофорез РНК в геле полиакриламида с мочевиной.
19. Определение длины поли(А)-последовательностей.
20. Радиоавтография.
21. Просчет радиоактивности в пробах.
22. Реактивы и материалы.
Глава Ш. РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЙ
1. Исследование гомологии повторяющихся последовательностей BI и Б2 с малыми ядерными и цитоплазма-тическими РНК.
2. Изучение характера транскрипции повторяющихся последовательностей BI и В2.
3. Доказательство наличия поли(А)-последовательностей в составе малых В2 + РНК.
4. Исследование малых BI* й В2+ РНК с помощью электрофореза высокого разрешения.
5. Изучение путей биосинтеза малых В1+ и В2+ РНК.
Глава 1У. ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ
ВЫВОДЫ.
Введение Диссертация по биологии, на тему "Транскрипция повторяющихся последовательностей В1 и В2 генома мыши"
Проблема организации и функционирования генома эукариот является центральной в молекулярной биологии. Ее решение позволит выяснить такие общие вопросы как регуляция действия генов, механизмы клеточной дифференциации, онкогенеза и друше. Благодаря новым методическим подходам достигнуты значительные успехи как в изучении тонкой структуры некоторых генов, так и в понимании общих принципов строения эукариотического генома. Наряду с этим обнаружено большое разнообразие способов организации генетического материала клетки и его функционирования, Это характерно и для повторяющихся генов, которые особенно широко распространены у эукариот.
В настоящее время в геномах эукариот обнаружены различные классы повторяющихся последовательностей. Значительный интерес среди них представляют короткие повторы, обнаруженные, в основному млекопитающих. Детальное исследование структуры и функции таких последовательностей стало возможным благодаря методам генной инженерии, позволяющим исследовать клонированные фрагменты ДНК.
В данной работе изучался характер и особенности транскрипции двух основных коротких повторяющихся последовательностей генома мыши - BI и В2. Исследованы некоторые структурные особенности наиболее интересных транскриптов этих повторов и пути их синтеза, а также гомология коротких повторяющихся последовательностей и низкомолекулярных РНК.
Полученные результаты позволяют предположить, что короткие повторяющиеся последовательности могут выполнять важные функции в геномах эукариот.
Заключение Диссертация по теме "Молекулярная биология", Леках, Ирина Викторовна
ВЫВОДЫ
I. Исследованы закономерности транскрипции двух основных коротких повторов генома мыши - BI и В2. Показано, что эти последовательности содержатся в составе гяРНК. Основная часть повторов, по-видимому, находится в интронах и элиминируется в ходе процессинга. Некоторая часть повторяющихся последовательностей остается в составе зрелых мРНК, очевидно, в их нетрансли-руемых районах. 2. По данным гибридизационных экспериментов BI - повтор имеет гомологию с 4,5S и 75РНК, а В2 - повтор - с 4,551 РНК.
3. Обнаружены малые поли(А)+ РНК, гомологичные повторяющимся последовательностям BI и В2. Эти гетерогенные по длине РНК , имеют размер от 150 до 400 нуклеотидов. Они содержат поли(А) последовательности длиной от 15 до 120 нуклеотидов. Предполагается посттранскрипционное происхождение основной массы этих поли(А) последовательностей.
4. Малые В2 содержащие РНК црисутствуют в клетках в значительно большем количестве, чем BI-содержащие. Преимущественно эти РНК локализованы в цитоплазме. Отмечено значительно более высокое содержание этих РНК в асцитной карциноме и плазмоцитоме по сравнению с клетками печени.
5. Получены данные, указывающие на то, что эти РНК синте--— зируются РНК-полимеразой Ш в виде коротких первичных транскриптов, а не образуются при процессинге про-мРНК.
- 85
Библиография Диссертация по биологии, кандидата биологических наук, Леках, Ирина Викторовна, Москва
1. Ананьев Е.В., Ильин Ю.В., Чуриков Н.А. Множественные рассеянные по хромосомам гены Drosophila melanogaster с варьирующей локализацией. Сообщение Ш. Определение сайтов локализации фрагментов Dm 1.8A и Dm II8B. - Генетика, 1979, т. 15, с. 1360-1369.
2. Ильин Ю.В. Повторяющиеся гены эукариот. Мол. биология, 1982, т. 16, 2, с. 229-258.
3. Alwine J.C., Kemp D.J., Stark G.R. Method for detection of specific RNAs in agarose gels by transfer to diazobenzyloxy-methyl-paper and hybridization with DBA probes. Proc. Nat. Acad. Sci. USA, 1977, v. 74, p. 5350-5354.
4. Ashbumer M., Bonner J.J* The induction of gene activity in Drosophila by heat shock. Cell, 1979, v. 17, p. 241-254.
5. Balmain A*, Krumlauf R., Vass J.K., Birnie G.D. Cloning and characterisation of the abundant cytoplasmic 7S UNA from mouse cell. Hucl. Acid Res., 1982, v. 10, 14, p. 4259-4270.
6. Banerges A., Reusing U., August J. Replication of RHA viruses. J. Mol. Biol., 1969, v. 45, p. 181.
7. Barta A., Richards R.J., Baxter J.D., Shine J. Primary structure and evolution of rat growth hormone gene. Proc. Nat. Acad. Sci. USA, 1981, v. 78, 8, p. 4867-4871.
8. Bell G.J., Pictet R., Ratter W.J. Analysis of the regions flanking the human insulin gene and sequence of an Alu family member. Nucl. Acids Res., 1980, v. 8, p. 4091-4109.
9. Benz E.W., Wydro B.M., Nadal-Grinard В., Dino D. Moloney murine sarcoma proviral DMA is a transcriptional unit. Nature, 1980, v. 288, p. 665-669.
10. Bishop J., Levinson W., Sallivan D., Fanskiev L., Quintrell N., Jackson J.- Virology, 1970, v. 42, p. 927.
11. Busslingrer M., Portmann K., Birnstiel M.L. A regulatory sequence near З'-end of sea urchin histone genes of eucaryo-tes. Nucl. Acids Res., v. 6, p. 2997-3008.
12. Bos J.L., Hegting C., Borst P., Arnberg A.C., Van Bruggen E.P.J. An insert in the single gene for the large ribosomal RNA in yeast mitochondrial DNA.-Nature, 1978, v. 275, p. 336338.
13. Branlant C., Krol A., Ebel J.P., Lazar E., Gallinaro н., Jacob M., Sri-Widada J., Jeanteur p. Nucleotide sequence of nuclear U1 a RNAs from chicken, rat and man. Nucl. Acids Res., 1980, v. 8, p. 4143-4154.
14. Britten R.J., Kobne D.E. Repeated sequences in DNA. -Science, 1968, v. 161, p. 529.
15. Burdon R.H., Shenkin A. Uridilate-rich sequences in rapidly labelled RNA of mammalian cells. PEBS Lett., 1972, v. 24, P. 11-17.
16. Cameron J.E., LohE.J., Davis R.ff, Evidence for transposition of dispersed repetitive DNA family in yeast. cell, 1979, v. 16, p. 739-750.
17. Campo M.S., Bishop J.O. (Two classes of messenger ENA in cultured rat cells: repetitive sequence transcripts and unique sequence transcripts. J. Mol. Biol., 1974, v. 90, p. 649-663.
18. Chech Т.К., Kio D.C. Localisation of transcribed regions on the extrachromosomal ribosomal ENA genes of Tetrahymena thermophila by K-loop mapping. Proc. Nat. Acad. Sci. USA, 1979, v. 76, p. 5051-5055.
19. Childs G., Maxson E., Cohn E., Kedes L. Orphons: dispersed genetic elements derived from tandem repetitive genes of eucaryotes. Cell, 1981, v. 23, p. 651-663.
20. Cochet M., Gannon 3?., Hen R., Maroteaux L., Perrin F. , Chambon P. Organization and sequence studies of the 17-piece chicken conalbumin gene. Nature, 1979, v. 282, P. 567-574.
21. Cooke N.B., Gutierres-Hartmann A., Baxter J.D. The structure of rat prolaktin gene. J. Cell Biochem., 1982,v. 6, p. 274.
22. Cooper A.D., Grain Complete nucleotide sequence of sea urchin actin gene. Nucl. Acids Res., 1982, v. 10, 13, p. 4081-4092.
23. Crick P.B.C. Split genes and ENA splicing. Science, 1979, v. 204, p. 264-271.
24. Christophe D., Pohl V., Van Heuverswign В., De Martynoff G., Brocas H., Dumont E., Pasteels J.L., Vossart G. Isolation and characterisation of a fragment of rat thyroglobin gene. Biochem. and Biophys. Res. Commn., 1982, v. 105, 3, p. 1166-1175.
25. Davidson E.H., Hough B.R., Amenson Ch.H., Britten R.J. General interspersion of repetitive with non-repetitive sequence elements in the DNA of Xenopus. J. Mol. Biol., 1973, v. 77, P. 1-23.
26. Darnell J.E. Implications of RNA-RNA-splicing in evolution of eucaryotic cells. Science, 1978, v. 202, 1257-1260.
27. Denison R.A., Van Arsdell S.W., Bernstein L.B., Weiner A.M. Abundant pseudogenes for small ENAs are dispersed in the human genome. Proc. Nat. Acad. Sci. USA, 1981, v. 78, 10.
28. Denison R.A., weiner A.M. Human U1-RNA pseudogenes may be generated by both DNA- and RNA-mediated mechanisms.
29. Mol. Cell Biol., 1982, v. 2, 7, p. 815-828.
30. Deininger P.L., Jolly D.J., Rubin C.M., Friedman P., Schmid c. Base sequence studies of 300 nucleotide renatur-ed repeated human DNA clones. J. Mol. Biol., 1981, v. 151, p. 17-33.
31. Doolittle W.F., sapienza C. Selfish genes, the phenotype paradigm and genome evolution. Nature, 1980, v. 284, p.601.603.
32. Doolittle W.F. Genes in pieces? were they ever together? -Nature, 1978, v. 272, p. 581-582.
33. Di Segni G. Selective in vitro transcription of one of the two Alu family repeats present in the 5'-flanking region of the human E-globin gene. Nucl. Acids Ees., 1981, v. 9, 24, p. 6709-6722.
34. Dubroff L.M., Nemer M. Molecular classes of heterogeneous nuclear RM in sea urchin embryous.- J. Mol, Biol., 1975, v. 95, p. 455-476.
35. Duncan C.H., Jagadeeswaran P., wang B.C., weissman S.M. Structural analysis of templates and RNA polymerase ill transcripts of Alu family sequences interspersed among the human B-like globin genes. Gene, 1981, v. 13, 2, p. 185196.
36. Elder J.Т., Pan J., Duncan C.H., weissman S.M. Transcriptional analysis of interspersed repetitive polymerase-iil transcription units in human DNA. Nucl. Acids Res., 1981, v. 9, 5, p. 1171-4189.
37. Eliceiri G.L. Sensitivity of low molecular weight ША synthesis to uv radiation. Nature, 1979, v. 279, 5708, p. 80-81.
38. Engel J.D., Sugarman B.J,, Dodgson J.B, A chicken histone H3 gene contains intervening sequences. Nature, 1982, v. 297, 5864, p. 434-436.
39. Epstein P., Keddy к. The nucleotide sequence of nuclear
40. U6 (4,7S) RNA. J. Biol. Chem., 1980, v. 255, 18, p. 89018906.
41. Erikson E. Comparison of oligonucleotides produced by ENAse T1 digestion of ?s RNA from avian and marine oncornaviruses and from uninfected cells, Virology, 1973, v. 53, P. 40-46.
42. Falkenthal S., Lenguel J.A. Structure, translation and metabolism of the cytoplasmic copia ribonucleic acid of Dro-sophila melanogaster. Biochem., 1980, v. 19, p. 58425850.
43. Fedoroff N.V. On spacers. Cell, 1979, v. 16, p. 697-7Ю.
44. Efstratiadis A.,Porter F., Lomedico P., Gilbert Y/., Kolodner R, Dodgson I. The evolution of genes: the chicken preproinsulin gene. Cell, 1980, v. 20,p. 555-566.
45. Finnegan D.J,, Eubin G.M., Young M.W., Hogness D. Repeated genes families in Drosophila melanogaster. Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol., 1978, v. 42, p. 1053-1064.
46. Prederiksen S., Heilung-Larsen P., Jensen E.G. The different inhibitory effect of<^—amanitin on the synthesis of low molecular weight RNA components in BHK cells. FEBS Lett., 1978, v. 87, p. 227-231.
47. Frederiksen S., Hellung-Larsen P. Small molecular weight RNA components in sea urchin eggs.- Exp. cell Res., 1972, v. 71, p. 289.
48. Pyrberg E.A., Kindle K.B., Davidson N., Sodja A. The actin genes of Drosophila: a dispersed multigen family. Cell, 1980, v. 19, p. 365-378.
49. Gain G., Hofoteiier н., Birnstiei M.L. The conserved sequence blocks within eucaryotic tRNA genes are major promoter elements. Nature, 1981, v. 294, p. 626-631.
50. Gallinaro H., Jacob M. An evaluation of small nuclear RNA in hu RNP. PEBS Lett., 1979, v. 104, p. 176-181.
51. Garapin A.C., Cami В., Reskam V., Kourilsky P., Le Pennee
52. J.P., Perrin P., Gerlinger P., Cochet м., Chambon P. cell, 1978, v. 14, p. 629-639.
53. Gebhardt W., Meitinger Т., Hochtl J., zachaw H.G. A new family of interspersed repetitive DNA sequences in the human genome. J. Mol. Biol., 1982, v. 157, p. 453-471.
54. Goodman H.M., Olson M.V., Hall B.D. Nucleotide sequence of a mutant eucaryotic gene: The yeast tyrosine-inserting ochre suppressor sup 4-0. Proc. Nat. Acad. Sci. USA, 1977, v. 74, 2, p. 5453-5457.
55. Gross K., Schaffner W., Telford J., Birnstiel M.L. Molecular analysis of the histone gene cluster of psammechinus miliaris: III. Polarity and assymetry of the histone coding sequences. cell, 1976, v. 8, p. 479-484.
56. Grimaldi G., Queen C., Singer M.P. Interspersed repeated sequences in the african green monkey genome that are homologous to the human Alu family. Nucl. Acids Bes., 1981, v. 9, 21, p. 5553-5569.
57. Eden F.C., Hendrick J.P. Unusual organisation of DNA sequences in the chicken. Biochemistry, 1978, v. 17, 26, p. 5838-5844.
58. Hahn U., Lazaru C.M., Lundsdorf H., Huntzel H. Split gene for mitochondrial 24S ribosomal ENA of neurospora crassa.
59. Cell, 1979, v. 17, p. 191-200.
60. Harada P., Ikawa J. A new series of ENAs associated with the genome of spleen focus forming virus (SFFV) and poly(A)-containing SNA from SFFV-infected cells. Nucl. Acids Ees., 1979, v. 7, P. 895-908.
61. Harada E., Kato N. Nucleotide sequences of 4,5S ENAs associated with poly(A)-containing ENAs of mouse and hamster cells. Nucl. Acids Ees., 1980, v. 8, p. 1273-1285.
62. Harada P., Kato N., Nishimura S. The nucleotide sequence of nuclear 4,8 S ENA of mouse cells. Biochim. Biophys. Ees. Commn., I98O, v. 95, 3, P- 1332-1340.
63. Hardison К.С., Butler Е.Р., Lacy Е., Maniatis Т., Roden-thai N., Efstradiadis A. The structure and transcription of four linked rabbit B-iike globine genes. cell, 1979, v. 18, p. 1285-1297.
64. Haigwood N.L., Jahn C.L., Hutchison C.A., Edgell M.H. Location of three repetitive sequence families found in BALB/c adult B-globin clones. Nucl. Acids Res., 1981, v. 9, 5,p. И33-115О.
65. Hanges S.R., Jelinek W.R. Low molecular weight RNAs transcribed in vitro by RNA polymerase III from Aly -type dispersed repeats in Chinese hamster ША are also found in vitro. Proc. Nat. Acad. Sci. USA, 1982.
66. Hatlen L., Attardi C.J. Proportion of the HeLa cell genome complementary to transfer RNA and 5S RNA. J. Mol. Biol.,* 1971, v. 56, p. 535.
67. Hellung-Larsen P. Low molecular weight RNA components in eucaryotic cells. PADL1s Forlag, Copenhagen, 1977» p. 68-78.
68. Higuchi R., Stang H.D., Browne J.K., Martin M.O., Huot M., Lipeles J., Salser W. Human ribosomal ENA gene spacer sequences are found interspersed elsewhere in the genome. -Gene, 1981, v. 15, p. 177-186.
69. Hitzeman R.A., Hagic E., Hayfick J.S., Chen C.J., Leeburg ■ P.H., Derynck R. The primary structure of the S.cerevisiaegene for 3-phosphoglycerate kinase. Nucl. Acids Ees., 1982, v. 10, 23, p. 7791-7808.
70. Howard E. Small nuclear ША molecules in nuclear ribonuc-leoprotein complexes from mouse erythroleukoma cells. -Biochem., 1978, v. 17, p. 3228-3236.
71. Ilyin J.V., Chmeliouskaite V.G., Georgiev G.P. Double stranded sequences in ША of Drosophila melanogasters relationto mobile dispersed genes. Nucl. Acids Ees., 1980, v. 8,1. P. 3439-3457.
72. Jagadeeswaran P., Forget B.G., weissman S.M. Short interspersed repetitive DNA elements in eucaryotes: transposable elements generated by reverse transcription of ENA polymerase III transcripts? Cell, 1982, v. 26, 2, p. 141-142.
73. Jagadaswaran P., Tuan d., Forget B.G., weissman S.M. A gene deletion ending at the midpoint of a repetitive DNA sequence in one form of hereditory persistence of fetal haemoglobin. Nature, 1982, v. 296, 5856, p. 469-470.
74. Jeffreys A.J., Flavell R.A. The rabbit B-globin gene contains a large insert in the coding sequence. cell, 1977, v. 12, p. 1097-1108.
75. Jelinek w.E. Specific nucleotide sequences in неьа cell inverted repeated DNA. J. Mol. Biol., 1977, v. 115, p. 571-601.
76. Jelinek W.R., Schmid c.w. The Alu family of dispersed repetitive sequences. Science, 1981, v. 216, p. Ю65-Ю70.
77. Jones W.W. Chromosomal and nuclear location of mouse satellite DNA in individual cells.- Nature, 1970, v. 225, p. 912.
78. Kedes L.H. Histone genes and histone messenger. Ann. Rev. Biochem., 1979, v. 49, p. 837-870.
79. Kroussis D., Eiferman P., Van de RiQn, Gorin M.B., Inyram R.S., Tilyhman S.M. Evolution of«4 -fetoprotein and albumin. II. J. Biol. Chem., 1981, v. 256, p. 1960-1967.
80. Knapp G., Beckmann J.S., Johnson P.E., Fuhrman S.A., Abel-son J. Transcription and processing of intervening sequences in yeast tBNA genes. Cell, 1978, v. 14, p. 221-236.
81. Kraev A.S., Kramerov D.A., Skryahin K.G., Ryskov A.P.,
82. Bayev A-*A., Georgiev G.P. The nucleotide sequence of the ubiquitous repetitive DNA sequence B1 complementary to the most abundant class of the mouse fold-back DNA. Nucl.
83. Krayev A.S., Markusheva T.V., Kramerov D.A., Ryskov A.P., Skryabin K.G., Bayev A.A., Georgiev G.P. Ubiquitous trans-poson-like repeats B1 and B2 in mouse genome; B2 sequencing.- Nucl. Acids Res., 1982, v. 10, 23, p. 7461-7475.
84. Kramerov D.A., Ryskov A.P., Georgiev G.P. The structural organisation of nuclear pre-mENA. II. Very long double-stranded structures in nuclear pre-mRNA. Biochim. Biophys. Acta, 1977, V. 475, P. 461-475.
85. Krolewski J., Bertelsen A.H., Humayun M.Z., Kush ivi.G. Members of the Alu family of intersoersed repetitive DNA sequences are in the small circular DNA population of monkey cell grown in culture. J. Mol. Biol., 1982, v. 154, p. 399415.
86. Kuff E.L., Lueders K.K., Scolnick E.M. Nucleotide sequence relationship between intracisternal type A particles of mus musculus and endogeneous retrovirus-of mus. cervicolor.- J. Virol., 1978, v. 28, 1, p. 66-74.
87. Laug A.J., Cech Т.Е. In vitro splicing of ribosomal ША precursor in nuclei of Tetrahymena. Cell, 1980, v. 19, P. 331-338.
88. Lawn B.M., Adelman J., Franke A.E., Houck C.M., Gross M., Narajan к., Doeddel D.V. Human fibroblast interferone gene lacks introns. Nucl. Acids Res., 1981, v. 9, p. 10451052.
89. Lerner M.R., Boyle J.A., Mount S.M., Wolin S.L,, Steitz J.A. Are so-RNPs involved in splicing? Nature, 1980, v. 283, p. 220-224.
90. Lerner M.R., Steitz J.A. Antibodies to small nucleus BNAs- 97 completed with proteins are produced by patients with systemic lupus erythematosus. Proc. Nat, Acad. Sci. USA, 1979, v. 76, p. 5495-5499.
91. Lerner M.R., Steits J.A. Snurps and Scyrps. cell, 198I, v. 25, p. 298-300.
92. Levy V.B., McCarthy B.J. Messendger RNA complexity in Drosophila melanogaster.- Biochem., 1975, v. 14, p. 2440-2446.
93. Lolanne J.L., Bregelere P., Deiarbre c., Abastado J.p., Gachelin G., Kourilslsy P. Comparison of nucleotide sequences of mRNAs belonging to the mouse H-2 multigen family.- Nucl. Acid Res., 1982, с. Ю, 3» Ю39-Ю49.
94. Li W.Y., Reddy R., Henning Т., Epstein P., Busch H. Nucleotide sequence of 7S RNA. J. Biol. Chem., 1982, v. 257, P. 5136-5142.
95. Lifton R.P., Goldberg M.C., Carp R.W., Hogness D.S. The organization of the histone genes in Drosophila melanogaster: functional and evolutionary implications. Cold Spiing Harbor Symp. Quant. Biol., 1978, v. 42, p. 10471051.
96. Long E.G., Dawid J.B. Expression of ribosomal DNA insertions in Drosophila melanogaster. cell, 1979, v. 18, p. 1185-1196.
97. Long E.O., Dawid J.B. Repeated genes in eucaryotes. Ann. Rev. Biochem., 198О, v. 49, p. 727-764.
98. Lueders K.K., Patterson B.M. A short interspersed repetitive element found near some mouse structural genes. -Nucl. Acid Res., 1982, v. 23, p. 7715-7724.
99. Maniatis т., Jeffrey A., Kleid D.G. Nucleotide sequence of the Bightward operator of phage .-Proc. Nat. Acad, Sci. USA, 1975, v. 72, p. 1184-1187.
100. Manning J.E., Schmid C.W., Davidson N. Interspersion of repetitive and non-repetitive DNA sequences in the Dro-sophila melanogaster genome. cell, 1975, v. 4, p. 141156.
101. Manser т., Gesteland p.p. Human U1 loci: genes for human U1 ENA have dramatically similar genomic environments. -Cell, 1982, v. 29, 1, p. 257-264.
102. Means A.E., Lagace L., Stein J.P. Structure organization of the calmodulin gene. J. Cell Biochem., 1982, Suppl.6, p. 113.
103. Musti A.M., Sobreski D.A., Chen B.B., Eden P.c. Repeated DNA clusters in chicken genome contain homologous sequence elements in scrambled order. Biochemistry, 1981, v. 20, 11, p. 2989-2998.
104. Uguen-Hun M.C., stratmann M., Groner В., Wurtz Т., Land H., Giesecke K., Sippel A.E., Schutz G. Chicken lysozyme gene contains several intevening sequences. Proc. Nat. Acad. Sci. USA, 1979, v. 76, p. 76-80.
105. Noda M., Teraniski Y., Takahashi H., Togosato M., Notake M., Nakanishi S., Numa S. Isolation and structural organization of the human preproenkephalin gene. Nature, 1982, v. 297, 5865, p. 431-434.
106. Nunberg J.H., Kaufman K.J., Chang A.C.Y., Cohen B.N., Schimke E.T. Structure and genomic organization of the mouse dihydrofolate reductase gene. cell, 198O, v. 19, P. 355-364.
107. Ohshima J., Okada H., Tani P., it oh J., itoh M. Nucleotide sequence of mouse genomic loci including a gene or pseudogene for U6 (4,8S) nuclear ENA. Nucl. Acids Res., 1981, v. 9, 19, p. 5145-5158.
108. Ohshima J. , Suzuki Y., Cloning of silk fibroin gene andits flanking sequences. Proc. Acad. Sci. USA. 1977, v.74.12, p. 5363- 5367.
109. Ohshima J., Itoh M., Okada W., Miyata T. Novel models for ENA splicing that involve a small nuclear ENA. -Proc. Nat. Acad. Sci. USA, 1981, v. 78, p. 4771-4774.
110. Okada N., Sakamoto K., itoh. J., Ohshima X. Sequence determination of rat U5 ENA using a chemical modification procedure for counteracting sequence compression. J. Biochem., 1982, v. 91, 4, p. 1281-1291.
111. Ono m. , Cole m.i., white а.т., Byang r.c.c. sequence organization of cloned intracisternal A particle genes. -Cell, 198o, v. 21, p. 465-473.
112. Orgel E.E., Crick E.R.C. Selfish DNA: the ultimate parasite. Nature, 1980, v. 284, 604-607.
113. Ottolenghi s., Gigiioni в. The deletion in a type ofl- B°-thalassemia begins in an inverted Alu I repeat. Nature, 1982, v. 300, p. 770-771.
114. Page G.S., Smith S., Goodman H. DNA sequence of the rat growth hormone gene: location of the 5f-terminus of the growth hormone mRNA and identification of an internal transposon-like elements. Nucl. Acids Res., 1981, v. 9, p. 2087-2104.
115. Pan J., Elder J.Т., Duncan C.H., Weissman S.M. Structural analysis of interspersed repetitive polymerase III transcription units in human DNA. Nucl. Acids Res., 1981, v. 9, 5, p. 1151-1170.
116. Pavlakis G.fi., Jourdan B.R., Wurst R.M., Vournakis J.N. Sequence and secondary structure of Drosophila melano-gaster 5,8 s and 2S rENA and of the processing site between them. Nucl. Acids Res., 1979, v. 9, 5, 1151-1170.
117. Peacock A.C., Dingman C. Resolution of the multiple ribonucleic acid species by polyaerylamide gel electrophoresis. -Biochemistry, 1967, v. 6, p. 1818-1827.
118. Peebles C.L., Ogden R.C., Knapp G., Abelson J. Splicing of yeast tRNA precursors: a two-stage reaction. cell, 1979, v. 18, p. 27-35.
119. Pederson Т., Bhorjee G., In vivo association of 111 and U2 RITA with hn RNA.- J. Mol. Biol., 1979, v. 128, p. 451-480.
120. Penman S. RNA metabolism in the HeLa cell nucleus. J. Mol. Biol., 1980, v. 17, p. 117.
121. Potter S.S., Pruett M., Phillips M., Maker A. Eucaryotic transposable genetic elements with inverted terminal repeats. cell, 1980, v. 20, p. 639-647.
122. Potter S.S. DNA sequence of a foldback transposable element sin Drosophila. Nature, 1982, v. 297, p. 201-204.
123. Prestayko A.W., Tonato M., Busch H. Low molecular weight ENA, associated with 28S nucleolar ENA. J. Mol. Biol., 1970, v. 47, p. 505-515.
124. Rein A., Penman S. Species specificity of the low molecular weight nuclear RNA's. Biochim. Biophys. Acta, 1969, v, 190, p. 1-10.
125. Pern A., Ro-Chor T.S., Busch H. The small molecular weight monodisperse nuclear RNA2f1 in mitotic cells. -Biochim. Biophys. Acta, 1970, v. 232, p. 3O6-313.
126. Reddy R., Henning D., Epstein P., Busch H.Primary and secondary structure of U2 SqRNA. Nucl, Acids Res., 1981, v. 9, 21, p. 5645-5671.
127. Reddy R., Henning D., Bush H. The primary nucleotide sequence of nucleolar RNA U3B. J. Biol. Chem., 1979, v. 254, p. 1097-1105.
128. Reddy R., Ro-Choi T.S., Shibata H., Choi Y.C. , Henning D., Busch H. The primary nucleotide sequence of nuclear U-2 ribonucleic acid. The 5*-terminal portion of the molecule. J. Biol. Chem., 1975, V. 250, p. 3909-3920.
129. Rogers J., Wall R. A mechanism for RNA splicing. Proc. Nat. Acad. Sci. USA, 1980, v. 77, p. 1877-1879.
130. Roop D.R., Kristo P., StumphW.E., Tsai M.J., O'Malley B.W. Structure and expression of a chicken gene coding for U1 RNA. Cell, 1981, v. 23, p. 671-680.
131. Ross J., Knecht D.A. Precursors of alpha- and Beta-globins messenger RNAs. J. Mol. Biol., 1978, v. 119, p. 1-20.
132. Rosen J.M., Woo S.L.C., Holder J.W., Means A.K., O'Mal-ley B.W. Preparation and preliminaiy characterisationof purified ovalbumin messenger RNA from the hen oviduct. Biochemistry, 1975, v. 14, p, 69-78.
133. Ro-Choi P.S., Choi J., Henning D., McCloskey J., Busch H. Nucleotide sequence of U-2 ribonucleic acid. J. Biol. Chem., 1975, v. 250, p. 3921-3928.
134. Ro-Choi T.S., Moriyama Y., Choi Y.C., Bush H. Isolation and purification of a nuclear 4,5 S ribonucleic acid ofthe Novikoff hepatoma. J. Biol. Chem., 1970, v. 245, p. 1970-1977.
135. Runberg J.H., Kaufman K.J., Chang A.C.Y., Cohen B.N., Schinke R.T. Structure and genomic organisation of the mouse dohydropholate reductase gene. cell, 1980, v. 19, P. 355-364.
136. Rubin G.M., Spradling A.C. Genetic transformation of Dro-sophila with transposable elements vectors. Science, 1982, v. 218, p. 348-353.
137. Runger D., Grippa M. The primary ribosomal ша transcripts in eucaryotes.- Progr. Biophys. Mol. Biol., 1977, v. 34, p. 247-269.
138. Euffel G., Weber R. Transcription of single-copy vitellogenin gene of xenopus involves expression of middle repetitive DNA. Nature, 1981, v. 291, 5814, p. 429-431.
139. Sakano H., Maki R., Kurosawa Y., Roeder W., Tonegawa S.
140. Two types of somatic recombination are necessary for the gener148. sakano H., Hoppy K., HeinrichG., Tonegawa S. Sequence and somatic recombination sites of immunoglobin light-chain genes. Nature, 1979, v. 280, p. 288-294.
141. Samarina o.P., Krichevskaya A.A. The heterogeous nuclear RNP. In the Cell Nucleus, 1981, Acad. Press, N.Y., p.
142. Spradling A.G., Rubin G.M. Transposition of cloned p-elements into Drosophila germ line chromosome, Science, 1982, v. 218, 4570, 341-347.
143. Ahafit-zagardo В., Majo J.J., Brown P.L. Kpn-I families of long interspersed repetitive DNA's in human and other primate genomes. Nucl. Acid Res., 1982, v. 10, 10, p. 3175-3193.
144. Strobel E., Dunsmuir P., Rubin G.M. Polymorphism in the chromosomal locations of elements of the 442 copia and 297 dispersed repeated gene families in Drosophila. -cell, 1979» v. 17, p. 429-439.
145. Stumph W.E., Kristo P., Tsai M.-J., O'Malley W. A chicken middle-repetitive DNA sequence which shares homology with mammalian ubiquitous repeats. Nucl. Acids Res., 1981, v. 9, P. 5383-5397.
146. Suttcliffe J.G., Milner R.J., Bloom P.O., Lerner R.A. Common 82-nucleotide sequence unique to brain RNA. Proc. Nat. Acad. Sci. USA, 1982, v. 79, 16, p. 4942-4946.
147. Temin H.M. Origin of retroviruses from cellular moveable genetic elements, cell, 198o, v. 21, p. 599-600.
148. Tchurikov N.A., Naumova A.L., Zelentsova E.S., Georgiev G.P. A cloned unique gene of Drosophila melanogaster contains a repetitive 3' exon whose sequence is present at the 3»-ends of many different mRNA's. Cell, 1982, v. 28, P. 365-373.
149. Tilghman S.A., Tiemlier B.C., Seidman J.G., Peterlin B.M., Sullivan M., Maizel J.Y., Leder P. Intervening sequence of DNA identified in the structural portion of a mouse globine gene. Proc. Nat. Acad. Sci. USA, 1978, v. 75, P. 725-729.
150. Truett M.A., Jones R.S., Potter S.S. Unusual structure of the PB family of transposable elements in Drosophila. Cell:,- 1981, v. 24, p. 753-763.
151. Psujimoto Y., Suzuki Y. The DNA sequence of Bombyx mori fibroin gene including the 5'-flanking, mENA coding, entire intervening and fibroin protein coding regions. -cell, 1979, v. 18, p. 591-600.
152. Ullu E., Melli M. Cloning and characterization of cDNA copies of the 7S ENAs of HeLa cells. Nucl. Acids Ees., 1982, v. 10, 7, p. 2209-2224.
153. Ullu E., Esposite Y., Melli M. Evolutionary conservation of the human 7S ENA sequences. J. Mol. Biol., 1982,v. 161, 1, p. 195-202.
154. Van Arsdell S.W., Denison E.A., Bernstein L.B., Weiner A.M., Manser т., Gesteland e.p. Direct repeats flank three small nuclear ENA pseudogenes in the human genome. Cell,1981, v. 26, 1, p. 11-17.
155. V/ensink O.C., Tabata s., Pachl c. The clustered and scrambled arrangement of modurately repetitive elements in Drosophila DNA. cell, 1979, v. 18, p. 1231-1246.
156. Weiner A.M. An abundant cytoplasmic 7S RNA is complementary to the dominant inter spersed middle repetitive DNA sequence family in human genome. Cell, 198о, v. 22, 1, p. 209-218.
157. Wellauer P.R., David J.B. The structural organization of ribosomal DNA in Drosophila melanogaster. Cell, 1977, v. 16, 1, p. 193-212.
158. Weinberg R.A., Penman S. Metabolism of small molecular weight monodisperse nuclear RNA. Biochim. Biophys. Acta, 1969, v. 190, p. 10.
159. Wise J.A., weiner A.M. Distiostelium small nuclear RNA D2 is homologous to rat nucleolar ENA U3 is encoded by a dispersed maltigene family. Cell, 1980, v. 22, 1, p. 109-118.
160. Wimber d.E., Steffenson D.M.- Ann. Rev. Genet., 1979.
161. Woy chik G.P., camper S.A., Lyons R.H., Horowitz S., Goodwin E.G. , Rottman F.M. Cloning and nucleotide sequencing of the bovine growth gormone gene. Nucl. Acids Res., 1982, v. 10, 22, p. 7197-7210.
162. Yang V,W., Lerner M.R., Steitz J.A., Flint S.J. A small nuclear ribonucieoprotein is required for splicing of adenoviral early RNA sequences. Proc. Nat. Acad. Sci. USA, 1981, v. 78, p. 1371-1375.
163. Ziewe G.w. Two groups of small stable BNAs. cell, 1981, v. 25, p. 296-297.
- Леках, Ирина Викторовна
- кандидата биологических наук
- Москва, 1984
- ВАК 03.00.03
- Молекулярная организация и транскрипция генома теплокровных животных
- Изучение чужеродных ДНК и прилегающих к ним последовательностей генома у трансгенных мышей
- Картирование регуляторных последовательностей в составе ретротранспозонов HERV-K (HML-2) и L1
- Клонирование и характеристика мРНК, содержащей повторяющийся элемент В2 и богато представленной в печени мыши
- Организация и хромосомная локализация повторяющихся последовательностей ДНК у обыкновенных полевок рода Microtus