Бесплатный автореферат и диссертация по биологии на тему

Роль мобильных генетических элементов в отклике на селекцию по количественным признакам у Drosophila melanogaster

ВАК РФ 03.00.15, Генетика

Автореферат диссертации по теме "Роль мобильных генетических элементов в отклике на селекцию по количественным признакам у Drosophila melanogaster"

На правах рукописи

Антоненко Оксана Викторовна

РОЛЬ МОБИЛЬНЫХ ГЕНЕТИЧЕСКИХ ЭЛЕМЕНТОВ В ОТКЛИКЕ НА СЕЛЕКЦИЮ ПО КОЛИЧЕСТВЕННЫМ ПРИЗНАКАМ

У ИгоБоркИа melanogaster

03.00.15 - генетика

АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук

Новосибирск 2008

003452677

Работа выполнена в лаборатории генетики популяций Института цитологии и генетики СО РАН, г. Новосибирск

Научный руководитель: доктор биологических наук, профессор

Васильева Любовь Антоновна Институт цитологии и генетики СО РАН, г. Новосибирск

Официальные оппоненты: доктор биологических наук,

Беляева Елена Сергеевна

доктор биологических наук, профессор Бугров Александр Геннадьевич

Ведущее учреждение: НИИ биологии и биофизики при

Томском государственном университете, г. Томск

Защита диссертации состоится 3 2008 года на утреннем

заседании диссертационного совета Д-003.011.01 в Институте цитологии и генетики СО РАН в конференц-зале Института по адресу: проспект акад. Лаврентьева 10, г. Новосибирск, 630090, тел/факс: (383)3331278, e-mail: dissov@bionet.nsc.ru

С диссертацией можно ознакомиться в библиотеке Института цитологии и генетики СО РАН.

Автореферат разослан «IS ъСШЩиь 2008 г.

Ученый секретарь Диссертационного совета, доктор биологических наук

А.Д.Груздев

ОБЩАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА РАБОТЫ

Актуальность проблемы.

Генетика количественных признаков - традиционное направление классических генетических исследований. В силу необычайно сложной генетической организации количественных признаков, это направление исследований пока существенно отстаёт от других генетических направлений. Кроме слабой изученности механизмов генетического контроля количественных признаков, также недостаточно изучены пути их онтогенетического формирования, популяционной динамики ответов на прямое и косвенное давление искусственного отбора и роли в эволюции видов. Поэтому в предыдущие десятилетия преобладало два направления в изучении генетики количественных признаков. Один из них -гибридологический анализ, позволяющий оценить характер наследования конкретных количественных признаков и грубо оценить число сегрегирующих генов в конкретном скрещивании, не расчленяя гены на майор-гены и минорные гены. Второй, пожалуй, наиболее широко используемый метод анализа количественных признаков, это генетико-статистический анализ. Однако прогностические способности теоретических генетико-статистических моделей скромны, так как модели построены на упрощениях: они линейны, построены для однолокусной модели детерминации количественного признака и для равновесной популяции. Поэтому статистические гипотезы и генетико-статистические модели всегда имеют характер аппроксимации, т.е. приближенного описания. В связи с этим, сфера использования параметров, построенных на этих моделях, в практических целях весьма ограничена.

В последнее десятилетие внимание генетиков сосредоточено в основном «на прямом» изучении генетики количественных признаков с использованием как генетических, так и цитогенетических, и молекулярных методов исследования. В ряде лабораторий нашей страны и за рубежом ведутся исследования по анализу сложных генетических систем экспрессии количественных признаков, маркирования локусов, контролирующих количественное проявление признаков (<ЗТЬ), анализу участия различных генетических объектов (полигены, мобильные генетические элементы) в фенотипическом проявлении количественных признаков и в ответе на селекционное давление. Однако до настоящего времени в мире имеется достаточно ограниченное количество исследований, посвященных описанию генетики конкретных количественных признаков.

Целью исследования являлось выяснение роли мобильных генетических элементов (МГЭ) в геноме ИгозоркПа melanogaster как участников селекционного процесса по количественному признаку.

Задачи исследования:

1.Оценить величину изменения среднего фенотипического значения количественного признака, размеров проксимального и дистального фрагментов радиальной жилки крыла D.melanogaster, в ответ на жесткое селекционное давление в позитивном, направленном на увеличение размеров фрагментов, и негативном, направленном на уменьшение фрагментов, направлениях отбора.

2. Исследовать паттерн мобильных генетических элементов и mdg2 в исходных линиях до отбора и в финальных поколениях разнонаправленной селекции.

3. Оценить паттерн мобильных генетических элементов и тс1%2 в исходных и финальных поколениях в двух повторностях позитивного и негативного вариантов отбора.

4. Оценить коэффициенты корреляции по паттернам двух мобильных генетических элементов в финальных поколениях отбора между позитивным (б+) и негативным (е-) вариантами отбора.

5. Оценить коэффициенты корреляции по паттернам двух мобильных генетических элементов в финальных поколениях отбора между повторностями позитивного (б1+) и (б2+) и негативного (з1-) и (б2-) вариантов отбора.

Научная новизна и практическая ценность работы.

Для выполнения поставленных задач, впервые селекционно-генетический эксперимент был организован таким образом, чтобы были получены аргументы в пользу принятия или отвержения гипотезы об участии мобильных генетических элементов в селекционном процессе. Впервые были использованы изогенные линии, на которых была осуществлена длительная массовая разнонаправленная селекция по фенотипу количественного признака в двух повторностях каждого селекционного варианта. Впервые показано, что селекция по количественному признаку сопровождалась быстрой фиксацией некоторых сайтов локализации мобильных генетических элементов в одном направлении отбора и элиминацией этих сайтов в противоположном направлении селекции. Впервые продемонстрировано явление синхронного ответа на отбор в двух независимо селектируемых повторностях не только по селектируемому признаку, но по паттерну мобильных генетических элементов. Впервые были оценены коэффициенты корреляции по паттернам мобильных генетических элементов в финальных поколениях селекции между вариантом позитивной и негативной селекции и между повторностями внутри позитивного и внутри негативного вариантов отбора.

Эти исследования весьма актуальны для понимания механизмов реорганизации генома в ходе отбора, регуляции экспрессии генов, роли МГЭ в селекции и эволюции.

Положения, выносимые на защиту.

В ходе разнонаправленной селекции (s+) и (s-) и по двум повторностям в каждом варианте селекции, по ряду сегментов ретротранспозонов mdgl и mdg2 складывается противоположный паттерн обоих мобильных генетических элементов в ответ на селекционное давление по количественному признаку. Такие результаты могут свидетельствовать в пользу гипотезы о сопряженном ответе на отбор количественного признака и паттерна МГЭ, т.е. имеет место взаимодействие генов (полигенов), экспрессирующих ген главного эффекта radius incompletus, и копий МГЭ.

Апробация работы.

Основные результаты исследования были представлены на Международной конференции, посвященной современным проблемам радиобиологии, радиоэкологии и эволюции (Дубна, 2000), Второй международной конференции по биоинформатике, структуре и регуляции генома (BGRS, Новосибирск, 2000), 8ом SMBE (Афины, США, 2001), на IX Молодежной школе-конференции по актуальным проблемам химии и биологии (Владивосток, 2005), Третьем съезде Вавиловского общества генетиков и селекционеров (Москва, 2004), на Отчетной конференции «Динамика генофондов растений, животных и человека» (Москва, 2005), на Отчетной конференции «Динамика генофондов и биоразнообразие» (Москва, 2007), Международной молодежной конференции «Проблемы молекулярной и клеточной биологии» (Томск, 2007), I Международной конференции «Дрозофила в экспериментальной генетике и биологии» (Харьков, Украина, 2008), а также на Отчетных сессиях Института Цитологии и Генетики в 2002 и 2005 гг.

Публикации.

По материалам диссертации опубликовано 5 работ в отечественной печати.

Структура и объем работы.

Диссертация включает Введение, 4 главы (Литературный обзор, Материалы и методы, Результаты, Обсуждение), Выводы и Список использованной литературы, состоящий из 222 наименований. Работа объемом 111 страниц проиллюстрирована 12 рисунками и 11 таблицами.

МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

В качестве объекта исследования была взята лабораторная гетерогенная линия Drosophila melanogaster, генотипы в которой несли рецессивную мутацию radius incompletus (ri, III-xp., 47.0 сМ). Мутация ri является супрессором центральной части радиальной жилки крыла, в результате чего в центре этой жилки образуется разрыв, делящий жилочный луч на проксимальный и дистальный фрагменты (рис.1). Оба фрагмента характеризуются значительной фенотипической изменчивостью, присущей классическим количественным признакам.

1 2

Рисунок 1. Крыло ОгояорИНа те1апо%ая1ег в контрольной линии, пС .

1- Проксимальный фрагмент радиальной жилки крыла.

2- Дистальный фрагмент радиальной жилки крыла.

Из гетерогенной линии г/С была выведена с помощью балансерных хромосом изогенная линия № 51 (рис.2). В таблице 1 представлена фенотипическая характеристика гетерогенной линии пС и изогенной линии №51.

Таблица 1. Средние значения длины проксимального и дистального фрагментов радиальной жилки крыла в исходной гетерогенной линии (пС) и в выведенной из пС изогенной линии № 51. _ _ _ _

Линии п Проксимальный фрагмент L2 о Дистальный фрагмент L2 X±sx <У

Исходная гетерогенная 100 1,96+0,05 0,50 0,30±0,06 0,60

Изогенная №51 100 2,6 8 ±0,03 0,30 0,26 ± 0,04 0,40

Примечание: Данные представлены по самкам.

Схема изогеннзации:

Р^ М1. О— Л— у 1__к__к—

Рт 56 / к к к

к' к' к' М5 Су й

Х Су й М5 Рт 56

1

М5 Су О М5 Су О

^ ¥ ~ ~кГ ~ 1

Л' к' к' М5 к' к'

^ ~~к' ~кГ Т ИГ ~¥~ 1Г~

▼ *

к' к' к' к' к' к'

к' ~ ~ К к'

к' к' к'

----изогенная

к' к' к' линия

Рисунок 2. Обозначения, к - варианты хромосом гетерогенной контрольной линии п'С, к' - гаплоидный набор конкретных хромосом из гетерогенной линии, который будут зафиксирован в конкретной изогенной линии (Ратнер, Васильева, 1996; Аникеева с соавт., 1994; АзЬЬигпег, 1989).

Тяжелый температурный шок

Поскольку изогенная линия представлена гомогенными генотипами, то предполагалось, что обработка мух тяжелым температурным шоком (ТТШ) (см. рис.3) возможно приведет к активации транспозиций МГЭ, что, в свою очередь, скажется на генетическом разнообразии количественного признака, и после этого изогенная линия будет способна отвечать на селекционное давление по количественному признаку.

В изогенной линии № 51, развивавшейся при температуре 25°С, отбирали несколько сотен самцов 3-дневного возраста. Самцов помещали в термостат при температуре 37°С на 1 ч., а затем их перемещали в термостат при 4°С на 1 ч. Как показано на рисунке 3, такая процедура проводилась трехкратно.

37 °С 37 °С 37 °С

4 °С 4°С

1 час I час 1 час 1 час 1 час 1 час

Рисунок 3. Схема проведения шоковой температурной обработки самцов изогенной линии №51.

Выживших после тяжелой температурной обработки самцов через одни сутки по одному подсаживали к трем виргинным необработанным ТТШ самкам на одни сутки. Рисунок МГЭ исследовали у потомков от этих скрещиваний.

Схема проведения селекционно-генетических экспериментов

Всего было проведено три серии селекционно-генетических экспериментов. В целом сама процедура отбора в трех селекционно-генетически-х экспериментах была одной и той же. В каждом поколении у 100 самок и 100 самцов измеряли длину проксимального и дистального фрагментов и на размножение выбирали 10% самок и самцов, у которых был самый большой суммарный размер проксимального и дистального фрагментов радиальной жилки крыла, позитивная селекция (б+). В противоположном варианте отбора каждое поколение отбирали 10% родителей с самым низким значением радиальной жилки крыла, негативная селекция, (а-).

Гибридизация

Для локализации сайтов применяли метод гибридизации in situ Н3-меченого зонда, содержащего копии МГЭ mdg2 и метод флуоресцентной гибридизации (FISH) меченого зонда, содержащего копии МГЭ mdgl, с политенными хромосомами слюнных желез Drosophila melanogaster. Мечение зондов проводили методом НИК-трансляции.

Сайты включения метки в политенные хромосомы D. melanogaster локализовали согласно цитологической карте Бриджеса.

РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ

Первый селекционный эксперимент. Разнонаправленная селекция по количественному признаку в гетерогенной линии

Задачи первого селекционного эксперимента сводились к тому, чтобы выяснить масштабы селекционного преобразования количественного признака в результате селекции, направленной на восстановление радиальной жилки крыла и на её элиминацию, а также исследовать рисунок МГЭ в начальных и финальных поколениях отбора.

В ходе эксперимента было установлено, что гетерогенная линия riC характеризуется 48-ю сайтами гибридизации in situ с mdg2. Всего было проанализировано 33 цитологических препарата. Было выявлено 17 «стабильных» сайтов (эти сайты присутствовали на всех исследованных препаратах) и 31 «нестабильный» сайт (эти сайты присутствовали не на всех исследованных препаратах). Эти данные свидетельствуют о высокой гетерогенности линии.

Анализ результатов длительной разнонаправленной селекции показал, что в ходе селекции, продолжавшейся 70 поколений, анализируемый признак претерпел существенные изменения (рис.4, таб.2).

На рисунке 4(a) представлена фотография крыла Drosophila melanogaster в финальных поколениях негативного отбора. Видно, что радиальная жилка практически элиминирована. На рисунке 4(6) представлена фотография крыла из линии позитивного отбора. Радиальная жилка в результате селекции восстановлена.

Кроме того, был исследован рисунок mdg2 в контроле riC и в «селекционных» линиях. Оказалось, что паттерн mdg2 в линиях (s—) и (s+) отличен друг от друга и от НС. Однако сделать твёрдый вывод о том, что имеет место сопряженное изменение количественного признака и рисунка мобильных генетических элементов по результатам этого эксперимента, было бы большой натяжкой. Поэтому была предпринята попытка избежать гетерогенности исходного экспериментального материала. Для этого из гетерогенной линии riC была выведена изогенная линия № 51 (см. рис. 2).

а).

б).

Рисунок 4. Крыло D.melanogaster с различной экспрессией гена radius incompletus, ri.

а). Крыло в линии негативной селекции (s-)

б). Крыло в линии позитивной селекции (s+)

Таблица 2. Средние значения проксимального и дистального фрагментов радиальной жилки крыла в линиях пС, (б—) и (з+)._

Линии п Проксимальный фрагмент Дистальный фрагмент

а CV о CV

riC 300 1.96±0.05 0.87 44.4 0.39±0.03 0,22 56,4

(s-) 300 0.10±0.001*** 0.02 20.0 Q*** 0

(S+) 300 3.80±0.001*** 0.02 0.02 2.20±0.02*** 0.02 20.0

Примечание. *** — Р > 0.999 по сравнению с контролем.

Второй селекционный эксперимент. Разнонаправленная селекция по количественному признаку в. изогенной линии• после тяжелого температурного шока.

Во втором селекционном эксперименте исследовали изогенную линию № 51. Селекционный эксперимент состоял в том, что изогенную линию подвергали разнонаправленной селекции, как и в предыдущем эксперименте, но с тем отличием, что отбор проводили отдельно в линии без температурного шока и в линии, где самцов однократно подвергали тяжелому температурному шоку.

Результаты эксперимента представлены в таблице 3. В изогенной линии № 51, самцов в которой не повергали температурной обработке, отбор по признакам был неэффективен. С другой стороны, после обработки самцов этой линии хит-шоком отбор был эффективен и в финальных поколениях селекции был получена селекционная линия, полностью лишенная радиальной жилки (е-), а также «селекционная» линия с полностью восстановленной радиальной жилкой крыла (з+).

Таблица 3. Изменение среднего фенотипического значения проксимального (рх) и дистального (ск) фрагментов радиальной жилки крыла БгохоркПа melanogaster при длительной массовой селекции по

Поколения Изогенная линия без Изогенная линия после

селекции хит-шока хит-шока

Хрх Xdt Хрх Xdt

FoH 2.15±0.04 0.70±0.05 1.85±0.0.6 0.30±0.05

Fo(+) 2.20±0.04 0.85±0.05 2.20±0.06 1.00±0.05

F u(-) 2.16±0.05 0.69±0.07 0.99±0.04 0.00

FH(+) 2.17±0.06 0.99±0.06 2.31±0.06 1.14±0.09

F21H 1.85±0.03 0.72±0.05 0.58±0.03 0.00

F2.(+) 2.04±0.08 0.95±0.10 2.36±0.06 1.87*0.07

F3.H 2.15±0.04 0.63±0.04 0.71±0.04 0.00

F3i(+) 2.14±0.03 0.79±0.04 2.69±0.11 1.90±0.05

F41H 2.18±0.03 0.32±0.07 0.67±0.03 0.00

F4.(+) 2.29±0.06 0.80±0.03 3.70±0.02 2.16±0.01

Fs.H 1.96±0.02 0.89±0.03 0.54±0.03 0.00

FJI(+) 2.00±0.02 1.0Ш.04 3.77±0.01 2.17±0.01

Примечание, достоверны, Р> 0.999.

В изогенной линии после хит-шока

без хит-шока между Р0 и Рц различия не различия между Р0 и Рц достоверны,

Третий селекционный эксперимент. Разнонаправленная селекция по количественному признаку в изогенной линии после тяжелого температурного шока и в двух повторностях кавдого варианта отбора.

Этот эксперимент также был проведен на изогенной линии № 51, самцы которой предварительно были однократно подвергнуты тяжелому температурному шоку. В отличие от предыдущего эксперимента здесь каждое направление разнонаправленного отбора осуществлялось в двух повторностях. Кроме того, решено было в динамике через определенное число поколений селекции фиксировать величину признака и в финале отбора - рисунок МГЭ. Идея состояла в том, что, если в процессе отбора сформируется различный паттерн МГЭ в противоположных вариантах отбора, а между повторностями одного направления селекции сходный рисунок МГЭ, тогда с определенной долей уверенности можно будет говорить об участии МГЭ в селекции.

В таблицах 4 и 5 приведены начальные паттерны МГЭ mdgl и mdg2 и финальные паттерны этих МГЭ в 4-х повторностях двух направлений селекции. Для наглядности в таблицах приведены только те сайты политенных хромосом, в которых произошли какие-либо изменения в локализации МГЭ в процессе селекции.

Анализ рисунка МГЭ показал, что до начала селекционного эксперимента изогенная линия №51 характеризовалась 31-им стабильным сайтом локализации МГЭ mdg2 и 16-ю стабильными сайтами mdgl.

После индукции транспозиций тяжелым температурным шоком (ТТШ) появилось 18 новых меченых сегментов (в случае с mdgl), причем 2 из них (43В и 97DE) были названы горячими, поскольку содержали 70% всех транспозиций.

В процессе селекции произошли существенные изменения в паттернах анализируемых мобильных генетических элементов. Во-первых, отмечается быстрая элиминация сайтов локализации mdg2, имеющих очень низкую исходную частоту. Это сайты: ЗС, 4В, 22В, 63А, 67А, 75С, 83В, 87F, 94D и они достаточно быстро в процессе селекции утрачиваются в обоих вариантах отбора.

Во-вторых, финальные рисунки и mdgl и mdg2 после 80-и поколений разнонаправленного отбора заметно отличаются от исходного рисунка.

Как видно из данных таблиц 4 и 5, степень сходства паттернов в двух повторностях как позитивной, так и негативной селекции очень высока. Коэффициент корреляции по паттерну mdgl между повторностями (51-ls-) и (51-2s-) г=0.982, р<0.001; между повторностями (51-ls+) и (51-2s+), r=0.571, pO.OOl. Для mdg2 коэффициенты корреляции равны между повторностями (51-ls-) и (51-2s-) г=0.946, р<0.001; между повторностями (51-ls+) и (51-2s+) г=0.912, р<0.001.

Таблица 4. Паттерн локализации МГЭ mdgl на политенных хромосомах в

Сегменты Контроль Негативная Позитивная

политенных до селекция (s-) селекция (s+)

хромосом отбора, (51-ls-) (51-2s-) (51-ls+) (51-2s+)

карты линия n=10 п=10 п=10 п=10

Бриджеса №51 п=10

X 20А + + + + 48)

2L 24Е + + + + 48)

26С + + + + 47)

34D - *(5) *(4) - 44)

2R 42Е *(6) *(5) - 46)

42F - ■46) - 46)

43В - - - 43)

45С - - - - 47)

47В - *(5) + *(3) -

49С + A А А А

51D - - **(10) **(10)

56Е - - **(8) **(7)

3L 65С - - *(1) - -

66В + А А А А /

69D - - - - 43)

71А + **(Ю) -

75А - *(3) - 43) -

76В - - - *(3) -

3R 82F - - - *(3) -

86D - - - *(1) -

87В + - - **(10) **(10)

92А - - *(1) - -

97Е - **(1) - -

98D - *(10) *(10) *(7) 49)

99В - - - 41) -

Всего 7 И 12 12 13

сайтов

Примечание. В таб. 4 и 5:

+ - означает присутствие сайта гибридизации на всех препаратах; *() — число полиморфных сайтов;

**() — сайты и их число, имеющие достоверно противоположный рисунок в двух вариантах отбора;

- ~ отсутствие гибридизационной метки; А -эксцизия;

Таблица 5. Паттерн локализации МГЭ mdg2 на политенных хромосомах в

Сегменты Контроль Негативная Позитивная

политенных изогенная селекция селекция

хромосом линия до (s-) (S+)

карты отбора (51-ls-) (51-2S-) (51-1S+) (51-2s+)

Бриджеса №51 п=10 п=10 п=10 п=10

п=85

X ЗС *(1) - - - -

4В *(1) - - - -

6Е + *(8) *(8) *(8) *(8)

16F + Д Д д А

17С + *(8) 48) *(8) *(8)

19А + А Д Д Д

20А + А д Д Д

2L 21D + + + + +

22В *(1) - - - -

24Е + + + + +

25F + + + + +

26С + + + + +

28 А *(8) - - - -

ЗОА - + А д д А

32С + Д А д Д

34В *(4) **(_) **(_) **(5) **(6)

39С + А д Д А

2R 42Е + А д А А

42F + Д д А А

43В *(58) + + + +

45С + + + + *(7)

49С + Д А А А

56А - - - - 43)

56Е *(4) **(2) **(7)

60В 417) **(Ю) **(10)

60С + **(Ю) **(10)

3L 63А *(1) - - - -

64А + **(10) **(10)

65Е + д д д д

67А *(1) - - - -

67DE + д д А д

75А + + + + +

75С *(2) - - - -

76А + А д А д

3R 82Е + Д д д д

83В *(1) - - - -

84D + - + + +

85Е + - + + +

86D *(6) - - - - *

87В *(2) - •(1) - -

87F *(2) - - - -

88Е + д д д д

88F + д д д д

94D *(1) - - - -

96А + д д д д

97DE *(77) **(10) **(7) **(-) **(1)

98CD + д д д д

98Е *(6) - - - -

99А + д д д д

99В + д д д д

Всего сайтов 49 10 13 16 18

Следует особо подчеркнуть, чго две повторности в позитивном направлении отбора (51-ls+) и (51-2s+) и две повторности в негативном направлении отбора (51-Is-) и (51-2s-) разводили как независимые линии, однако в процессе селекции в них сформировался практически одинаковый паттерн МГЭ внутри варианта отбора.

Между тем, особый интерес представляют районы хромосом, в которых зафиксирован противоположный рисунок МГЭ в двух вариантах отбора. Такими сайтами являются 51D, 56Е, 87В, в которых отмечена с очень высокой частотой локализация mdgl в обеих повторностях (s+) и отсутствие локализации mdgl в обеих повторностях (s-). Аналогичное поведение обнаружено для mdg2 по сайтам 34В, 56Е, 60В, 60С, 64А.

Напротив, практически стабильное присутствие метки в обеих повторностях в линии (s-) и отсутствие в обеих повторностях в линии (s+) характерно для сайта 71А и частично для сайта 97Е при гибридизации in situ с mdgl и для сайта 97DE по mdg2.

В целом коэффициенты корреляции между (s+) и (s-) вариантами отбора для mdgl и mdg2 соответственно равны 0.021 и - 0.567, р<0.001.

Таким образом, по данным трех селекционно-генетических экспериментов можно заключить, что во всех случаях селекция признака в обоих направлениях была весьма эффективна. Однако наиболее показательные и существенные результаты получены в третьем селекционно-генетическом эксперименте.

выводы

1. Анализ результатов селекционно-генетического эксперимента на гетерогенной линии показал, что разнонаправленная длительная массовая селекция по фенотипу количественного признака была эффективна. Удалось получить «селекционную» линию, в которых на крыльях у всех особей этих линий радиальная жилка была полностью элиминирована, а также «селекционную» линию, где все особи имели полностью восстановленную жилку крыла.

2. В селекционном эксперименте на гетерогенном материале кроме изменения фенотипического проявления селектируемого признака отмечается и изменение рисунка mdg2 по сравнению, как с исходным рисунком, так и с рисунком в «селекционных» линиях (s+) и (s-), в которых формируется резко различный паттерн МГЭ.

3. Шоковая температурная обработка самцов изогенной линии № 51 привела не только к увеличению числа транспозиций ретротранспозонов, но к появлению нового генетического разнообразия по полигенам, контролирующим экспрессию гена radius incompletus, что позволило получить эффективные ответы на отбор по количественному признаку, контролируемому геном radius incompletus.

4. Разнонаправленная длительная массовая селекция (в двух повторностях каждого варианта) по количественному признаку на изогенной линии № 51, самцов которой предварительно подвергали тяжелой температурной обработке, была эффективной в обоих вариантах отбора и в повторностях:

а). Две повторности как позитивного так негативного вариантов отбора в течение 80-и поколений практически синхронно отвечали на отбор по селектируемому признаку.

б). Между вариантами разнонаправленного отбора получены резко различные по признаку «селекционные» линии: в негативном варианте отбора получены две «селекционные» линии с полностью элиминированной радиальной жилкой крыла. В позитивном варианте отбора получены две «селекционные» линии с полностью восстановленной радиальной жилкой крыла.

5. В результате разнонаправленной селекции между двумя вариантами отбора на изогенной линии № 51 по mdgl и mdg2 также формируется различный паттерн. Коэффициент корреляции между вариантами отбора (s+) и (s-) по mdgl равен 0.021, по mdg2 г= - 0.567, р<0.001.

6. Между повторностями внутри позитивного варианта отбора (51-ls+) и (51-2s+) получен сходный рисунок mdgl и mdg2, коэффициенты корреляции соответственно равны 0.571, р<0.001 и 0.912, р<0.001. Между повторностями негативного варианта отбора (51-Is-) и (5Г-2 s-) коэффициенты корреляции соответственно равны 0.982, р<0.001 и 0.946, р<0.001.

СПИСОК РАБОТ, ОПУБЛИКОВАННЫХ ПО ТЕМЕ ДИССЕРТАЦИИ

1. Vasilyeva L.A., Bubenshchikova E.V., Antonenko O.V., Ratner V.A. Population dynamics of the pattern of mobile genetic element (MGE) localization: response to selection vs. Genetic drift // Modern problems of radiobiology, radioecology and evolution. 2000. Dubna. Russia. JINR. P. 85.

2. Ratner V.A., Vasilyeva L.A., Bubenshchikova E.V., Antonenko O.V. Patterns of mobile genetic elements (MGEs) genomic localization; induction of transpositions by stress factors, response to selection and possible evolutionary consequences // Proceedings of the second international conference on bioinformatics of genome regulation and structure (BGRS). 2000. Novosibirsk. Russia. P. 109-110.

3. Васильева Л.А., Бубенщикова E.B., Антоненко О.В.. Ратнер В.А. Отклик паттерна МГЭ 412 на отсекающий отбор количественного признака в изогенной линии дрозофил после тяжелого теплового шока (ТТШ) // Генетика. 2000. Т. 36. № 6. С. 774-781.

4. Васильева Л.А., Бубенщикова Е.В., Антоненко О .В., Ратнер В.А. Изучение паттернов МГЭ создает новые возможности для понимания процесса эволюции геномов // Тезисы первого международного рабочего совещания «Биоразнообразие и динамика экосистем Северной Евразии: информационные технологии и моделирование». WITA. Новосибирск. 2001. С. 21.

5. Ratner V.A., Vasilyeva L.A., Bubenshchikova E.V., Antonenko O.V. Induction of ТЕ transpositions by heavy heat shock and response of induced ТЕ patterns to truncation selection in Drosophila // 8-th SMBE Annual Meeting Athens, GA University of Georgia. USA. 2001. P. 64.

6. Антоненко O.B., Васильева Л.А. Сопряженный отклик паттерна МГЭ mdgl и количественного признака в условиях давления селекции // Тезисы докладов III съезда Вавиловского общества генетиков и селекционеров. Москва. 2004. Т. 1. С. 24.

7. Антоненко О.В.. Васильева Л.А. Анализ паттернов МГЭ mdgl и mdg2 при разнонаправленной селекции по количественному признаку в изогенной линии Drosophila melanogaster II Тезисы IX Школы-конференции по актуальным проблемам химии и биологии. Владивосток. 2005. Т. 1. С. 5.

Антоненко О.В.. Васильева Л.А. Изменение рисунка локализации МГЭ mdgl и mdg2 при разнонаправленной селекции по количественному признаку в изогенной линии Drosophila melanogaster II Доклады академии наук. 2006. Т. 406. № 1. С. 129-133.

9. Антоненко О.В.. Васильева Л.А. Анализ роли мобильных генетических элементов (МГЭ) в геноме Drosophila melanogaster // Тезисы. Международной молодежной конференции «Проблемы молекулярной и клеточной биологии» Томск.-2007. С. 9.

10. Васильева Л.А., Антоненко О.В.. Выхристюк О.В. Отклик геномного рисунка МГЭ412 на отбор по количественному признаку у Drosophila melanogaster II Журн. общ. биол. 2007. Т.68. № 5. С. 341-349.

11. Васильева Л.А., Антоненко О.В.. Выхристюк О.В., Захаров И.К. Индукция транспозиций мобильных генетических элементов в геноме Drosophila melanogaster различными стрессовыми факторами // Вестник ВОГиС. 2007. Т. 11. № 3/4. С. 662-671.

12. Васильева Л.А., Антоненко О.В.. Выхристюк О.В., Захаров И.К. Селекция изменяет паттерн мобильных генетических элементов (МГЭ) в геноме Drosophila melanogaster II Вестник ВОГиС. 2008. Т. 12. №3. С. 142-155.

13. Антоненко О.В.. Васильева Л.А. Анализ рисунка МГЭ mdgl и mdg2 при разнонаправленной селекции у Drosophila melanogaster II Тезисы I Международной конференции «Дрозофила в экспериментальной генетике и биологии» Украина. Харьков. 2008. С. 23-26.

Подписано к печати 20.10.2008

Формат бумаги 60 х 90 1/16. Печ. Л. 1 Уч. изд. л.0,7.

Тираж 100 зкз. Заказ 112.

Ротапринт Института цитологии и генетики СО РАН 630090, Новосибирск, пр. ак. Лаврентьева, 10.

Содержание диссертации, кандидата биологических наук, Антоненко, Оксана Викторовна

ВВЕДЕНИЕ.

ГЛАВА 1. Обзор литературы

1.1. Мобильные генетические элементы.

1.2. Классификация мобильных элементов.

1.3. Мотивы функциональных сайтов МГЭ.

1.4. Индукция транспозиций МГЭ внешними и физиологическими стрессовыми воздействиями.

1.5. Генетические свойства количественных признаков.

1.6. Количественные признаки и мобильные генетические элементы.

1.7. Маркирование локусов количественных признаков ((^ТЬ).

ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

2.1. Материал

2.1.1.Линии ВгоБоркИа те1апо^аз1ег.

2.1.2. Схема изогенизации.

2.2. Методы исследования.

2.2.1. Схема селекционно-генетических экспериментов.

2.2.2. Молекулярно-генетические методы.

2.2.3. Статистическая обработка полученных результатов.

ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЙ.

3.1. Разнонаправленная селекция по количественному признаку в гетерогенной линии.

3.2. Разнонаправленная селекция по количественному признаку в изогенной линии после тяжелого температурного шока.

3.3. Разнонаправленная селекция по количественному признаку в изогенной линии после тяжелого температурного шока и в двух повторностях каждого варианта отбора.

ГЛАВА 4. ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ.

ВЫВОДЫ.

Введение Диссертация по биологии, на тему "Роль мобильных генетических элементов в отклике на селекцию по количественным признакам у Drosophila melanogaster"

Актуальность проблемы. Генетика количественных признаков -традиционное направление классических генетических исследований. В силу необычайно сложной генетической организации количественных признаков это направление исследований пока существенно отстаёт от других классических генетических направлений. Кроме слабой изученности механизмов генетического контроля количественных признаков, также недостаточно изучены пути их онтогенетического формирования, популяционной динамики ответов на прямое и косвенное давление искусственного отбора и роли в эволюции видов. Поэтому в предыдущие десятилетия преобладало два направления в изучении генетики количественных признаков. Один из них - гибридологический анализ, позволяющий оценить характер наследования конкретных количественных признаков и грубо оценить число сегрегирующих генов в конкретном скрещивании, не расчленяя гены на майор-гены и минорные гены. Второй, пожалуй, наиболее широко используемый метод анализа количественных признаков, это генетико-статистический анализ. Однако прогностические способности теоретических генетико-статистических моделей скромны, так как модели построены на упрощениях: они линейны, построены для однолокусной модели детерминации количественного признака и для равновесной популяции. Поэтому статистические гипотезы и генетико-статистические модели всегда имеют характер аппроксимации, т.е. приближенного описания. Поэтому сфера использования параметров, построенных на этих моделях, в практических целях весьма ограничена.

В последнее десятилетие внимание генетиков сосредоточено в основном «на прямом» изучении генетики количественных признаков с использованием как генетических, так и цитогенетических, и молекулярных методов исследования. В ряде лабораторий нашей страны и за рубежом ведутся исследования по анализу систем экспрессии количественных признаков, маркирования локусов, контролирующих проявление количественных признаков (С>ТЪ), анализу участия различных генетических объектов (полигены, мобильные генетические элементы) в фенотипическом проявлении количественных признаков и в ответе на селекционное давление. Однако до настоящего времени в мире имеется достаточно ограниченное количество исследований, посвященных описанию генетики конкретных количественных признаков.

В подобного рода исследованиях, такой объект, как ВгоБорНИа melanogaster, исключительно удобен. Это объект, у которого достаточно сложная организация сочетается с возможностью комплексного изучения генетических, онтогенетических, цитогенетических и популяционных процессов.

Целью исследования являлось выяснение роли мобильных генетических элементов (МГЭ) в геноме Drosoph.Ua melanogaster как участников селекционного процесса по количественному признаку.

Задачи исследования:

Оценить величину изменения среднего фенотипического значения количественного признака (размер проксимального и дистального фрагментов радиальной жилки крыла) в ответ на жесткое селекционное давление в позитивном, направленном на увеличение размеров фрагментов, и негативном, направленном на уменьшение фрагментов, вариантах отбора.

2. Исследовать паттерн мобильных генетических элементов тс1§1 и тс1$2 в исходных линиях до отбора и в финальных поколениях разнонаправленной селекции.

3. Оценить паттерн мобильных генетических элементов mdgl и mdg2 в исходных и финальных поколениях в двух повторностях позитивного и негативного вариантов отбора.

4. Оценить коэффициенты корреляции по паттернам двух мобильных генетических элементов в финальных поколениях отбора между позитивным (б+) и негативным (б—) вариантами отбора.

5. Оценить коэффициенты корреляции по паттернам двух мобильных генетических элементов в финальных поколениях отбора между повторностями позитивного (Э1+) и (Б2+) и негативного (81-) и (з2-) вариантов отбора.

6. Обсудить гипотезу возможной роли мобильных генетических элементов в ответе популяции БгоБоркИа melanogaster на длительную массовую селекцию по фенотипу количественного признака.

Научная новизна и практическая ценность работы. Для выполнения поставленных задач впервые селекционно-генетический эксперимент был организован таким образом, чтобы были получены аргументы в пользу принятия или отвержения гипотезы об участии мобильных генетических элементов в селекционном процессе. Впервые была осуществлена длительная массовая разнонаправленная селекция по фенотипу количественного признака в двух повторностях каждого селекционного варианта. Впервые показано, что селекция по количественному признаку сопровождалась быстрой фиксацией некоторых сайтов локализации мобильных генетических элементов в одном направлении отбора и элиминацией этих сайтов в противоположном направлении селекции. Впервые продемонстрировано явление синхронного ответа на отбор в двух независимо селектируемых повторностях не только по селектируемому признаку, но по паттерну мобильных генетических элементов. Впервые были оценены коэффициенты корреляции по паттернам мобильных генетических элементов в финальных поколениях селекции между повторностями внутри позитивного и внутри негативного вариантов отбора. Впервые были оценены коэффициенты корреляции по паттернам мобильных генетических элементов в финальных поколениях селекции между вариантом позитивной и негативной селекции. На основании полученных результатов сформулирована гипотеза о возможной роли мобильных генетических элементов в селекционном процессе.

Эти исследования весьма актуальны для понимания механизмов реорганизации генома в ходе отбора, регуляции экспрессии генов, роли МГЭ в селекции и эволюции.

Апробация работы. Основные результаты исследования были представлены на Международной конференции, посвященной современным проблемам радиобиологии, радиоэкологии и эволюции (Дубна, 2000), Второй международной конференции по биоинформатике, структуре и регуляции генома (ВвЯЗ, Новосибирск, 2000), Восьмом 8МВЕ (Афины, США, 2001), на IX Молодежной школе-конференции по актуальным проблемам химии и биологии (Владивосток, 2005), Третьем съезде Вавиловского общества генетиков и селекционеров (Москва, 2004), на Отчетной конференции «Динамика генофондов растений, животных и человека» (Москва, 2005), на Отчетной конференции «Динамика генофондов и биоразнообразие» (Москва,

2007), Международной молодежной конференции «Проблемы молекулярной и клеточной биологии» (Томск, 2007), I Международной конференции «Дрозофила в экспериментальной генетике и биологии» (Харьков, Украина,

2008), а также на Отчетных сессиях Института цитологии и генетики в 2002 и 2005 гг.

Структура и объем работы. Диссертация включает Введение, 4 стандартные главы (Литературный обзор, Материалы и методы, Результаты, Обсуждение), Выводы и Список использованной литературы, состоящий из 222 наименований. Работа проиллюстрирована 12 рисунками и 11 таблицами.

Заключение Диссертация по теме "Генетика", Антоненко, Оксана Викторовна

ВЫВОДЫ

1. Анализ результатов селекционно-генетического эксперимента на гетерогенной линии показал, что разнонаправленная длительная массовая селекция по фенотипу количественного признака была эффективна.' Удалось получить «селекционную» линию, в которых на крыльях у всех особей этих линий радиальная жилка была полностью элиминирована, а также линию, где все особи имели полностью восстановленную жилку крыла.

2. В селекционном эксперименте на гетерогенном материале кроме изменения фенотипического проявления селектируемого признака отмечается и изменение рисунка mdg2 по сравнению, как с исходным рисунком, так и с рисунком в «селекционных» линиях (s+) и (s-), в которых формируется резко различный паттерн МГЭ.

3. Шоковая температурная обработка самцов изогенной линии № 51 привела не только к увеличению числа транспозиций ретротранспозонов, но к появлению нового генетического разнообразия по полигенам, контролирующим экспрессию гена radius incompletus. Наличие генетического разнообразия по полигенам позволило получить эффективные ответы на отбор по количественному признаку, контролируемому геном radius incompletus.

4. Разнонаправленная длительная массовая селекция (в двух повторностях каждого варианта) по количественному признаку на изогенной линии № 51, самцов которой предварительно подвергали тяжелой температурной обработке, была эффективной в обоих вариантах отбора и в повторностях: а). Две повторности как позитивного так негативного вариантов отбора в течение 80-и поколений практически синхронно отвечали на отбор по селектируемому признаку. б). Между вариантами разнонаправленного отбора получены резко различные по признаку «селекционные» линии: в негативном варианте отбора получены две «селекционные» линии с полностью элиминированной радиальной жилкой крыла. В позитивном варианте отбора получены две селекционные» линии с полностью восстановленной радиальной жилкой крыла.

5. В результате разнонаправленной селекции между двумя вариантами отбора на изогенной линии № 51 по mdgl и mdg2 также формируется различный паттерн. Коэффициент корреляции между вариантами отбора и (б-) по mdgl равен 0.021, по mdg2 г= - 0.567, р<0.001.

6. Между повторностями внутри позитивного варианта отбора (51-1з+) и (51-2з+) получен сходный рисунок mdgl и mdg2, коэффициенты корреляции соответственно равны 0.571, р<0.001 и 0.912, р<0.001. Между повторностями негативного варианта отбора (51-1 э—) и (51-2 в—) коэффициенты корреляции соответственно равны 0.982, р<0.001 и 0.946, р<0.001.

Библиография Диссертация по биологии, кандидата биологических наук, Антоненко, Оксана Викторовна, Новосибирск

1. Аникеева Н.В., Забанов С.А., Васильева Л.А., Ратнер В.А. Влияние теплового шока на транспозиции МГЭ От 412 в трех изогенных линиях ВгоБоркИа melanogaster // Генетика. 1994. Т. 30. № 2. С. 212217.

2. Антоненко О.В., Васильева Л.А. Изменение рисунка локализации МГЭ mdgl и mdg2 при разнонаправленной селекции по количественному признаку в изогенной линии ОгоБорНИа melanogaster // Доклады академии наук. 2006. Т. 406 № 1 С. 29-133.

3. Беляева Е.Сп. Мобильные генетические элементы БгоБоркИа melanogaster'. особенности локализации и транспозиции, коррелирующие с изменением фенотипа Автореф. дис. на соискание уч. ст. канд. биол. наук. М.: Ин-т Биол. разв. АН СССР. 1984. 23 с.

4. Беляева Е.Сп., Пасюкова Е.Г., Гвоздев В.А., Ильин Ю.В., Амосова И.С., Кайданов Л.З. Транспозиции мобильных диспергированных генов у ВгояоркИа melanogasteг, выявляемые с помощью селекции // Генетика. 1981. Т. 17. С. 1566-1580.

5. Бубенщикова Е.В., Антоненко О.В., Васильева Л.А., Ратнер В.А. Индукция транспозиций МГЭ 412 раздельно тепловым и Холодовым шоком в сперматогенезе у самцов дрозофилы // Генетика. 2002. Т. 38. № 1. С. 46-55.

6. Васильева Л.А. Анализ системы жилкования крыла ИгозоркПа melanogaster под действием температурного шока и селекции // Журнал общ. биологии // 2005. Т. 66. № 1. С. 68-74.

7. Васильева Л.А., Антоненко О.В., Выхристюк О.В., Захаров И.К. Индукция транспозиций мобильных генетических элементов в геноме Drosophila melanogaster различными стрессовыми факторами // Вестник ВОГиС. 2007. Т. 11. № 3/4. с. 662-671.

8. Васильева Л.А., Антоненко О.В., Выхристюк О.В., Захаров И.К. Селекция изменяет паттерн мобильных генетических элементов (МГЭ) в геноме Drosophila melanogaster II Вестник ВОГиС. 2008. Т. 12. №3. С. 412-425.

9. Васильева JI.A., Бубенщикова Е.В., Антоненко О.В., Ратнер В.А. Отклик паттерна МГЭ 412 на отсекающий отбор количественного признака в изогенной линии дрозофил после тяжелого теплового шока (ТТШ) // Генетика. 2000. Т. 36. № 6, С. 774-781.

10. Васильева JI.A., Бубенщикова Е.В., Захаренко Л.П., Ратнер В.А. Популяционная динамика отклика геномного патерна МГЭ Dm412 на отбор по количественному признаку // Генетика. 1998. Т. 34. № 7. С. 929-940.

11. Васильева Л.А., Забанов С.А. Тепловой шок и гамма-облучение — факторы индуцирующие транспозиции и генетическое разнообразие количественных признаков в изогенных линиях дрозофилы // Генетика. 1994. Т.ЗО (приложение). С. 23.

12. Васильева Л.А., Ратнер В.А. Генетический анализ полигенной системы количественного признака после негативной и позитивной селекции. I Общая характеристика полигенной системы // Генетика. 1994а. Т. 30. № 1.С. 62-65.

13. Васильева Л.А., Ратиер В.А. Генетический анализ полигенной системы количественного признака после негативной и позитивной селекции. II Вклады хромосом в экспрессию фрагментов радиальной жилки крыла // Генетика. 19946. Т. 30. № 2. С. 185-191.

14. Васильева JI.A., Ратнер В.А. Сравнительный анализ паттернов МГЭ 412 в 18 изогенных линиях Drosophila melanogaster И Генетика. 2003. Т. 39. № 3. С. 349-356.

15. Васильева Л.А., Ратнер В.А. Анализ системы экспрессии гена radius incompletus у Drosophila melanogaster II Генетика. 2004. Т. 40. № 5. С. 624-630.

16. Васильева Л.А., Ратнер В.А., Антоненко О.В., Лопухова Е.Д., Бубенщикова Е.В. Индукция транспозиций МГЭ 412 различными дозами паров этанола в изогенной линии Drosophila melanogaster II Генетика. 2003. Т. 39. № 5. С. 717-720.

17. Васильева Л.А., Ратнер В.А., Бубенщикова Е.В. Сравнительные вклады различных генетических факторов в индукцию транспозиций МГЭ при изогенизации //Генетика. 1998. Т. 34. № 11. С. 1484-1492.

18. Васильева Л.А., Ратнер В.А., Забанов С.А. Экспрессия количественного признака radius incompletus, температурные эффекты и локализация мобильных элементов у дрозофилы. Сообщение I. Свойства исследуемых субпопуляций // Генетика. 1987. Т.23. №1. С.71-80.

19. Васильева JI.А., Ратнер В.А., Забанов С.А., Юданин А.Я. Сравнительный анализ паттернов локализации мобильных генетических элементов в селекционно-генетических экспериментах на Drosophüa melanogaster II Генетика. 1995. Т. 31. № 7. С. 920-931.

20. Гаврилова Е.Д., Антоненко О.В., Васильева JI.A. Пары этанола индуцируют транспозиции МГЭ 412 у Drosophüa melanogaster И Экологическая генетика. 2004. Т. 2. № 3. С. 3-7.

21. Гвоздев В.А. Подвижная ДНК эукариот. Часть I. Структура, механизмы перемещения и роль подвижных элементов в поддержании целостности хромосом // Соросовский образовательный журнал. 1998а. Т. 33. № 8. С. 8-14.

22. Гвоздев В.А. Подвижная ДНК эукариот. Часть II. Роль в регуляции активности генов и эволюции генома // Соросовский образовательный журнал. 19986. Т. 33. № 8. С. 15-21.

23. Гвоздев В.А., Кайданов JI.3. Геномная изменчивость, обусловленная транспозициями мобильных элементов, и приспособленность особей Drosophüa melanogaster II Журн.общ.биологии. 1986. Т. XLVII. С. 5163.

24. Георгиев Г.П., Гвоздев В.А. Мобильные диспергированные гены эукариот // Вестник АН СССР. 1980. № 8. С. 19-27.

25. Георгиев Г.П., Корочкина С.Е., Могила В.А., Герасимова Т.И. Индукция одиночных транспозиций мобильных генетических элементов у Drosophüa melanogaster с помощью митомицина С // Генетика. 1988. Т. 24. № 3. С. 461-467.

26. Георгиев П.Г. Роль мобильных генетических элементов в мутагенезе, индуцированном химическими и физиологическими агентами. Автореф. дис. на соискание уч. ст. канд. биол. наук. М. 1991. 16 с.

27. Герасимова Т.И. «Транспозиционные взрывы» при дестабилизации генома у Drosophila melanogaster / Молекулярные механизмы генетических процессов: молекулярная генетика, эволюция и молекулярно-генетические основы селекции. М.: Наука. 1985. С. 1320.

28. Герасимова Т.И. Транспозиционные взрывы, транспозионная память и их возможное эволюционное значение // Молекулярные механизмы генетических процессов / Ред. Созинов A.A., Шуппе Н.Г. М: Наука. 1990. С. 99-109.

29. Герасимова Т.Н., Мизрохи Л.Ю., Георгиев Г.П. «Транспозиционные взрывы» в генетически нестабильных линиях Drosophila melanogaster //Докл. Ан. СССР. 1984. Т. 274. № 6. С. 1476-1477.

30. Гинзбург Э.Х. Описание наследования количественных признаков. Новосибирск: Наука. 1984. 249 с.

31. Горячковская Т.Н., Васильева JI.A. Анализ спектра локализации МГЭ Dm-412 в линиях Drosophila melanogaster, подвергавшихся длительной селекции по количественному признаку // Генетика. 1991. Т. 27. №8. С. 1350-1358.

32. Егорова A.B., Ратнер В.А., Юданпн А .Я. Негативный отбор в компьютерной модели совместной эволюции паттерна полигенов, МГЭ и МИЛ // Генетика. 2003. Т. 39. № 3. С. 540-549.

33. Забанов С.А., Васильева JI.A., Ратнер В.А. Экспрессия количественного признака radius incompletus у дрозофилы и локализация мобильных элементов МДГ-1 и copia // Генетика. 1990. Т. 26. №7. С. 1144-1153.

34. Забанов С.А., Васильева Л.А., Ратнер В.А. Множественная индукция транспозиций МГЭ В104 у дрозофилы тяжелым тепловым шоком // Генетика. 1994. Т. 30. № 2. С. 218-224.

35. Забанов С.А., Васильева Л.А., Ратнер В.А. Индукция транспозиций МГЭ Dm 412 при помощи у-облучения в изогенной линии Drosophila melanogaster II Генетика. 1995. Т.31. № 6. С. 798-803.

36. Зайнуллин В.Г., Шапошников М.В., Юранева И.Н. Генетические эффекты у Drosophila melanogaster, индуцированные хроническим облучением в малых дозах // Радиац.биол. Радиоэкол. 2000. Т. 40. С. 567-575.

37. Иващенко Н.И., Гришаева Т.М. Современные представления и характеристики систем генетической нестабильности в геноме эукариотических клеток // рукопись. 2007.

38. Иовлева О.В., Мыльников C.B. Последствия отбора в высокоинбредных линиях Дрозофилы // Генетика. 2007. Т. 43. № 10. С. 1328-1340.

39. Кайданов Л.З., Галкин А.П., Иовлева О.В., Сиделова О.Г. Направленные перемещения по геному мобильного элемента hobo в длительно селектируемой линии НА Drosophila melanogaster II Цитология и генетика. 1996. Т. 30. № 1. С. 23-30.

40. Кайданов JI.3., Мыльников C.B., Галкин А.П. и др. Генетические эффекты дестабилизирующего отбора при селекции по адаптивно важным признакам в линиях Drosophila melanogaster II Генетика. 1997. T. 33. №8. С. 1102-1109.

41. Кайданов JI.3., Мыльников C.B., Иовлева О.В., Галкин А.П. Направленный характер генетических изменений при длительном отборе линий Drosophila melanogaster по адаптивно важным признакам//Генетика. 1996. Т. 30. № 8. С. 1085-1096.

42. Кайданов JI. 3., Рязанова JI.A. Характеристика процессов спонтанного мутирования в хромосомах 2 высокоинбредных линий Drosophila melanogaster II Вестник ЛГУ. Сер. Биол. 1987. Вып. 3. № 17. С. 84-90.

43. Колесникова О.В., Забанов С.А., Васильева Л.А., Ратнер В.А. Индукция транспозиций МГЭ Dm 412 в геноме дрозофилы при помощи теплового шока // Генетика. 1991. Т. 27. № 9. С. 1547-1555.

44. Корочкин Л.И., Евгеньев М.Б. Эволюционизм и «научный» креационизм. М.: изд-во МИОО. 2003. 103 с.

45. Лобашев М.Е. Физиологическая (паранекротическая) гипотеза мутационного процесса // Вестн. ЛГУ. 1947. № 8. С. 10-29.

46. Мазер К., Джинкс Дж. Биометрическая генетика. М.: Мир. 1985. 463 с.

47. Макгрегор Г., Варли Дж. Методы работы с хромосомами животных. М.: Мир. 1986. 268 с.

48. Маниатис Т., Фрич Э., Сэмбрук Дж. Методы генетической инженерии. Молекулярное клонирование. М.: Мир. 1984. 479 с.

49. Матюнина Л.В., Мизрохи Л.Ю., Герасимова Т.И., Георгиев Г.П. Транспозиционные взрывы в ряду мутационных переходов в дестабилизированных линиях Drosophila melanogaster II Генетика. 1985. T. 21. № 10. С. 1608-1617.

50. Мизрохи Л.Ю., Георгиева С.Г., Оболенскова Л.А. и др. Природа нестабильных инсерционных мутаций и реверсий в локусе Drosophila melanogaster // Генетика. 1988. Т. 24. № 2. С. 216-226.

51. Нуждин C.B., Пасюкова Е.Г. Новый подход к картированию полигенов. Локализация генов, контролирующих уровень приспособленности близкородственных линий Drosophila melanogaster //Генетика. 1991. Т. 27. № 5. С. 849-859.

52. Пасюкова Е.Г. Закономерности и биологические эффекты процесса транспозиций ретротранспозонов у Drosophila melanogaster. Автореф. дис. на соискание уч. ст. доктора биол. наук. М. 1999. 43 с.

53. Пасюкова Е.Г., Беляева Е.С., Коган Г.Л, Павлова М.Б., Кайданов Л.З., Гвоздев В.А. Транспозиции мобильных диспергированных генов (МДГ), коррелирующие с изменением приспособленности у Drosophila melanogaster 11 Генетика. 1984. Т. 20. № 11. С. 1772-1782.

54. Пасюкова Е.Г., Беляева Е.С., Ильинская Л.Е., Гвоздев В.А. Транспозиции мобильных диспергированных генов (МДГ) при замещении отдельных пар хромосом в инбредной линии Drosophila melanogaster II Генетика. 1987. Т. 23. № 11. С. 605-615.

55. Пасюкова Е.Г., Нуждин С.В., Филатов Д.А., Гвоздев В.А. Ретротранспозон геном хозяина: механизмы и эффекты взаимодействия //Мол. Биология. 1999. Т. 33. № 1. С. 26-37.

56. Ратнер В.А., Бубенщикова Е.В., Васильева Л.А. Пролонгация индукции транспозиций МГЭ 412 после у-облучения в изогенной линии Drosophila melanogaster 11 Генетика. 2001. Т. 37. № 4. С. 485493.

57. Ратнер В.А., Васильева Л.А. Количественный признак у дрозофилы: генетические, онтогенетические, цитогенетические и популяционный аспекты//Генетика. 1987. Т.23. № 6. С. 1070-1081.

58. Ратнер В.А., Васильева Л.А. Мобильные генетические элементы и количественные признаки у Дрозофилы: факты и гипотезы // Генетика. 1992. Т. 28. № 11. С. 15-27.

59. Ратнер В.А., Васильева Л.А. Мобильные генетические элементы (МГЭ) и эволюция геномов "Современные проблемы теории Эволюции" (ред. Л.П.Татаринов). М.: Наука. 1993.

60. Ратнер В.А., Васильева JI.A. Индукция транспозиций и эксцизий мобильных генетических элементов у дрозофилы в процессе изогенизации // Генетика. 1996. Т. 32. № 7. С. 933-944.

61. Ратнер В.А., Васильева JI.A. Мобильные генетические элементы (МГЭ): "эгоистическая ДНК" или функциональная часть генома? //Современные концепции эволюционной генетики. В. К. Шумный, А. Л. Маркель (ред.). 2000. ИЦиГ СО РАН. Новосибирск. С. 128-150.

62. Ратнер В.А., Егорова А.В., Юданин А.Я. Стабилизирующий отбор в компьютерной модели совместной эволюции паттернов полигенов, МГЭ и МИЛ //Генетика. 2003. Т. 39. № 4. С. 550-561.

63. Фурман Д.П., Бухарина Т.А. Мобильные элементы генома дрозофилы как маркеры кроссинговера в изогенизирующих скрещиваниях с балансерной линией // Генетика. 1996а. Т. 32. № 9. С. 1291-1294.

64. Фурман Д.П., Бухарина Т.А. Увеличение частоты перемещения сорга-подобных элементов в процессе получения изогенных линий Drosophila melanogaster II Докл. РАН. 19966. Т. 348. № 5. С. 711-715.

65. Фурман Д.П., Бухарина Т.А. Увеличение частоты транспозиций со/л'я-подобных элементов при изогенизирующих скрещиваниях с балансерной линией //Генетика. 1997. Т. 33. № 11. С. 1510-1516.

66. Хесин Р.Б. Непостоянство генома. М.: Наука. 1984. 472 с.

67. Шахмурадов И.А., Капитонов В.В., Колчанов Н.А., Омельянчук JI.B. Эволюция повторов Alu: динамика распространения в геноме // Генетика. 1989. Т. 25. № 9. С. 1682-1689.

68. Шоханов С.О., Щербата Г.Р., Черник Я.И. Геномная изменчивость лабораторных линий и природных популяций Drosophila melanogaster при действии рентгеновского облучения // Генетика. 1997. Т. 33. № 1. С. 25-30.

69. Ade J., Belzile F.J. Hairpin elements, the first family of foldback transposons (FTs) in Arabidopsis thaliana //Plant J. 1999. V. 19. № 5. P. 591-597.

70. Ananniev E.V., Gvozdev V.A., Ilyin Y.V. et al. Reiterated genes with varying location in intercalary heterochromatin of Drosophila melanogaster polytene chromosomes // Chromosoma. 1978. V. 70. P. 117.

71. Ananthan J., Goldberg A.L., Voellmy R. Abnormal proteins serve as eukaryotic stress signals and trigger the activation of heat shock genes // Science. 1986. V. 232(4749). P. 522-524.

72. Arkhipova I.R. Distribution and phylogeny of Penelope-like elements in eukaryotes // Syst. Biol. 2006. V. 55. № 6. P. 875-885.

73. Arkhipova I.R., Lyubomirskaya N.V., Ilyin Y. V. Drosophila retrotransposons. USA. Texas, Austin: Landes Bioscience. 1995. 134 p.

74. Arkhipova I.R., Pyatkov K.I., Meselson M., et al. Retroelements containing introns in diverse invertebrate taxa // Nat. Genet. 2003. V. 33. №2. P. 123-124.

75. Arnault C., Biemont C. Heat shock do not mobileze mobile elements in genome of Drosophila melanogaster II J. Mol. Evol. 1989. V. 28. P. 388390.

76. Arnault C., Dufournel I. Genome and stress: reaction against aggression, behavior of transposable elements // Genetika (Ned.). 1994. V. 93. P. 149160.

77. Arnault C., Heizmann A., Loevenbruck C., Biemont C. Environmental stresses and mobilization of transposable elements in inbred lines of Drosophila melanogaster II Mutat. Res. 1991. V. 248(1). P. 51-60.

78. Arnault C., Loevenbruck C., Biemont C. Transposable element mobilization is not induced by heat shocks in Drosophila melanogaster II Naturwissenschaften. 1997. V. 84(9). P. 410-414.

79. Ashburner M. Drosophila a Laboratory Handbook. N.Y.: Cold Spring Harbor Lab. Press. 1989. 1331 p.

80. Barsanti P., Palumbo G. Heat Shock or hybrid dysgenesis induced instability in the wa mutation of Drosophila melanogaster / Proceeding of the IX-th European Drosophila research conference. 1985. P. 53.

81. Batzer M.A., Deininger P.L., Hellmann-Blumberg U., Jurka J., Labuda D., Rubin C.M., Sclimid C.W., Zietkiewicz E., Zuckerkandl EJ. Standardized nomenclature for Alu repeats // Mol.Evol. 1996. Y. 42(1). P. 3-6.

82. Belyaeva E.Sp., Pasyukova E.G., Ilyin Y.Y. et al. Transposition of mobile dispersed genes in Drosophila melanogaster and fitness of stocks // Mol. Gen. Genet. 1982. V. 185. P. 324-328.

83. Biemont C. Population genetics of transposable DNA element. A Drosophila point of view // Genetica (Ned.). 1992. Y. 86. P. 67-84.

84. Biemont C., Aouar A., Arnault C. Genome reshuffling of the copia element in an inbred line of Drosophila melanogaster II Nature. 1987. V. 329. P. 742-744.

85. Biemont C., Arnault C., Heirzmann A., Ronssrray S. Massive changes in genomic location of P elements in an inbred line of Drosophila melanogaster //Naturwissenschaften. 1990. V. 77. P. 485-488.

86. Biemont C., Gautier C. Localization polymorphism of mdg-1, copia, I and P mobile elements in genomes of Drosophila melanogaster, from data of inbred lines // Heredity. 1988. V. 60. P. 335-346.

87. Biemont C., Gautier C. Interactions between transposable elements for insertion in the Drosophila melanogaster genome // Heredity. 1989. V. 63. P. 335-346.

88. Biemont C., Gautier C., Heizmann A. Independent regulation of mobile element copy number in Drosophila melanogaster inbred lines // Chromosoma. 1988. V. 96. P. 219-294.

89. Biemont C., Terzian C. MDG-1 mobile element polymorphism in selected Drosophila melanogaster population // Genetica (Ned.). 1988. V. 76. № 1. P. 7-14.

90. Biessmann H., Mason J.M. Genetics and molecular biology of telomeres // Adv. Genet. 1992. V. 30. P. 185-249.

91. Biessmann H., Valgeirsdottir K., Lofsky A., Chin C., Ginther B. et al. HeT-A, a transposable element specifically involved in "healing" broken chromosome ends in Drosophila melanogaster II Mol. Cell Biol. 1992. V. 12. P. 3910-8.

92. Bolshakov V.N., Galkin A.P., Kaidanov L.Z. et al. Closely related Drosophila melanogaster strains with altered fitness also depict changes in their hobo element properties // Genet. Sel. Evol. 1994. V. 26. P. 205-216.

93. Britten R.J. Mobile elements inserted in the distant past have taken on important functions // Gene. 1997. V. 205. P. 177-182.

94. Bucheton A. I transposable elements and I-R hybrid dysgenesis in Drosophila//Trends Genet. 1990. V. 6. P. 16-21.

95. Caceres M., Puig M., Ruiz A. Molecular characterization of two natural hotspots in the Drosophila buzzatii genome induced by transposon insertions//Genome Res. 2001. V. 11. № 8. P. 1353-1364.

96. Cai H., Levine M. The gypsy insulator can function as a promoter-specific silencer in the Drosophila embryo // EMBO J. 1997. V. 16. P. 1732-1741.

97. Capy P., Bazin C., Hiquet D., Langin T. Dynamics and evolution of transposable elements. USA. New York: Landes Bioscience. 1998. 197 p.

98. Charles worth B., Langley C. The population genetics of Drosophila transposable elements // Annu. Rev. Genet. 1989. V. 23. P. 251-287.

99. Corces V.G., Geyer P.K. Interactions of retrotransposons with the host genome: the case of the gypsy element of Drosophila // Trends Genet. 1991. V. 7. P. 86-90.

100. Cost G.J., Feng Q., Jacquier A., Boeke J.D. Human LI element target-primed reverse transcription in vitro // EMBO J. 2002. V. 21. № 21. P. 5899-5910.

101. Crow J., Kimura M. An introduction to population genetic theory / N.Y.: Harper and Row. 1970. 591 p.

102. Di Franco C., Galuppi D., Junakovic N. Genomic distribution of transposable elements among individuals of an inbred Drosophila lines // Transposable Elements and Evolution / Eds. McDonald J.F. Dordrecht (Ned.): Kluwer Acad. Pabls. 1993. P. 95-105.

103. Doolittle W.F., Sapienza C. Selfish genes, the phenotype paradigm and genome evolution //Nature. 1980. V. 284(5757). P. 601-603.

104. Duret L., Marais G., Biemont C. Transposons but not retrotransposons are located preferentially in regions of high recombination rate in Caenorhabditis elegans // Genetics. 2000. V. 156(4). P. 1661-1669.

105. Engels W.R. P-elements in Drosophila // Mobile DNA / Eds. Berg D.E., Howe.M.M. 1989. Washington D.C.: Amer.Soc. Microbiol. P. 437-484.

106. Engels W.R., Preston C.R. Formation of chromosome rearrangements by P factor in Drosophila // Genetics. 1984. V. 107. P. 657-678.

107. Evgen'ev M.B., Arkhipova I.R. Penelope-like elements—a new class of retroelements: distribution, function and possible evolutionary significance // Cytogenet. Genome Res. 2005. V. 110. № 1-4. P. 510-521.

108. Federoff N.V. Barbara McClintok (June 16, 1902 September 2, 1992) // Genetics. 1994. V.136. P. 1-10.

109. Finnegan D.J. Eucariotic transposable elements and genome evolution // Trends in Genet. 1989. V. 5. P. 103-107.

110. Finnegan D.J. The genome of Drosophila melanogaster / Eds. Lindsley D.L., Zimm G.G. San Diego. Academic press. 1992. P. 1096-1107.

111. Finnegan D.J., Rubin G.M., Young M.W., Hogness D.S. Repeated gene families in Drosophila melanogaster II Cold Spring Harb Symp Quant Biol. 1978. V. 42. P. 1053-1063.

112. Fontdevila A. Genetic instability and rapid speciation: are they coupled? // Genetica. 1992. V. 86. P. 247-258.

113. Georgiev P., Corces V. The su(Hw) protein bound to gypsy sequences in one chromosome can repress enhancer-promoter interactions in the paired gene located in the other homolog // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. 1995. V. 92. P. 5184-5188.

114. Gerasimova T.I., Matyunina L.V., Ilyin Y.V., Georgiev G.P. Simultaneous transposition of different mobile elements: relation of multiple mutagenesis in Drosophila melanogaster II Mol. Gen. Genet. 1984. V. 194. P. 517-522.

115. Gerasimova T.I., Matyunina L.V., Mizrokhi L.J., Georgiev G.P. Successive transposition explosions in Drosophila melanogaster and reverse transposition of mobile dispersed genetic elements // EMBO J. 1985. V. 4. P. 3773-3779.

116. Goldschmidt R. The material basis of evolution. 1940. Yale: Univ. Press. 1015 p.

117. Goldschmidt R. Theoretical genetics. Berkley: Univ. of California Press. 1955. 501 p.

118. Guerriero M.P.A., Biemont C. Changes in the chromosomal insertion pattern of the copia element during the process of making chromosomes homozygous in Drosophila melanogaster II Mol. Gen. Genet. 1995. V. 246. P. 206-211.

119. Gurganus M.C., Fry J.D., Nuzhdin S.V., Pasyukova E.G., Lyman R.F., Mackay T.F.C. Genotype-environment interaction at quantitative trait loci affecting sensory bristle number in Drosophila melanogaster II Genetics. 1998. V. 149(4). P. 1883-1898.

120. Gurganus M.C., Nuzhdin S.V., Leips J.W., Mackay T.F.C. HighResolution Mapping of Quantitative Trait Loci for Sternopleural Bristle Number in Drosophila melanogaster II Genetics. 1999. V. 152. P. 15851604.

121. Gvozdev V.A., Belyaeva E.Sp., Ilyin Y.V. et al. Selection and transposition of mobile dispersed genes in Drosophila melanogaster II Cold Spring Harbor Symp.Quant.Biol. 1981. V. 65. P. 673-685.

122. Hoskins R.A., Smith C.D., Carlson J.W. et al. Heterochromatic sequences in a Drosophila whole-genome shotgun assembly // Genome Biol. 2002. V. 3. № 12. RESEARCH 0085.

123. Ilyin Y.V., ChmeliauskaiteV.G., Georgiev G.P. Double-stranded sequences in RNA of Drosophila melanogaster. relation to mobile dispersed genes //Nucl. Acids Res. 1980. V. 8. P. 3439-3457.

124. International Human Genome Sequencing Consortium. Initial sequencing and analysis of the human genome // Nature. 2001. V. 409. P. 860-921.

125. Johannsen W. Elemente der exakten Erblichkeitslehre. — Jena: G. Fischer, 1909. 516 p. (3rU ed., 1926).

126. Jouan-Dufournel I., Cosset F.L., Contamine D., Verdier G., Biemont C. Transposable elements behavior following viral genomic stress in Drosophila melanogaster inbred line // J. Mol. Evol. 1996. V. 43(1). P. 1927.

127. Junakovic N., Angelucci V. Polymorphism in the genomic distribution of copia-Wkz elements in related laboratory stocks of Drosophila melanogaster // J. Mol. Evol. 1986. V. 24. P. 83-88.

128. Junakovic N., Di Franco C., Barsanti P., Palumbo G. Transpositions of copia-Wkz elements can be induced by heat shock // J. Mol. Evol. 1986. V. 24. P. 89-93.

129. Junakovic N., Di Franco C., Best-Belpomme M., Echalier G. On the transposition of copia-like nomadic elements in cultured Drosophila cells // Chromosoma. 1988. V. 97. P. 212-218.

130. Kaidanov L.Z., Bolshakov V.N., Tzygvintzev P.N., Gvozdev V.A. The sources of genetic variability in highly inbred long-term selected strains of Drosophila melanogaster II Genetica (Ned). 1991. V. 85. P. 73-78.

131. Kaminlcer J.S., Bergman C.M., Kronmiller B. et al. The transposable elements of the Drosophila melanogaster euchromatin: a genomics perspective // Genome Biol. 2002. V. 3. № 12. RESEARCH 0084.

132. Kapitonov V.V., Jurka J. Molecular paleontology of transposable elements in the Drosophila melanogaster genome // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2003. V. 100. № 11. P. 6569-6574.

133. Kazazian H.H. Jr. Mobile elements: drivers of genome evolution // Science. 2004. V. 303(5664) P. 1626-1632.

134. Khouri G., Gruss P. Enhancer elements II Cell. 1983. V. 33(2). P. 313-314.

135. Kidwell M.G., Lisch D. Transposable elements as sources of variation in animals and plants II Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1997. V. 94(15). P. 7704-7711.

136. Kumar A. The adventures of the Tyl-copia group of retrotransposons in plants // Trends Genet. 1996. V. 12. № 2. P.41-43.

137. Lai C., Mackay T.F.C. Hybrid dysgenesis-induced quantitative variation on the X chromosome of Drosophila melanogaster 11 Genetics. 1990. V. 124. P. 627-636.

138. Langley C.H., Montgomery E., Hudson R., Kaplan N., Charlesworth B. On the role of unequal exchange in the containment of transposable element copy number// Genet. Res. 1988. V. 52. № 3. P. 223-235.

139. Levis R.W., Ganesan R., Houtchens K., Tolar L.A., Sheen F.M. Transposons in place of telomeric repeats at a Drosophila telomere // Cell. 1993. V. 75. № 6. 1083-1093.

140. Luan D.D., IConnan M.H., Jakubczak J.L., Eickbush T.H. Reverse transcription of R2Bm RNA is primed by a nick at the chromosomal target site: a mechanism for non-LTR retrotransposition // Cell. 1993. V. 72. № 4. P. 595-605.

141. Lunde K., Biehs B., Nauber U., Bier E. The knirps and knirps-related genes organize development of the second wing vein in Drosophila // Development. 1998. V. 125. № 21. P. 4145-4154.

142. Lyman R.F., Lawrence F., Nuzhdin S.V., Mackay T.F.C. Effects of single P element insertions on bristle number and viability in Drosophila melanogaster II Genetics. 1996. V. 143. P. 277-292.

143. Macas J., Neumann P., Pozarkova D. Zaba\ a novel miniature transposable element present in genomes of legume plants // Mol. Genet. Genomics. 2003. V. 269. № 5. P. 624-631.

144. Mackay T.F.C. Transposable element-induced response to artificial selection in Drosophila melanogaster II Genetics. 1985. V. 111(2). P. 351374.

145. Mackay T.F.C. Transposable element-induced quantitative genetic variation in Drosophila // Proc.of the 2nd Internat.Conf on Quant. Genet. Sunderland: Sinauer. Mas. 1988. P. 219-235.

146. Mackay T.F.C. Transposable elements and fitness in Drosophila melanogaster II Genome. 1989. V. 31. P. 284-295.

147. Mackay T.F.C., Lyman R.F., Jackson M. S. Effects of P-element insertion on quantitative traits in Drosophila melanogaster II Genetics. 1992. V. 130. P. 315-332.

148. Mackay T.F.C., Fry J.D., Lyman R.F., Nuzhdin S.V. Polygenic mutation in Drosophila melanogaster. estimates from response to selection of inbred strains // Genetics. 1994. V. 136(3). P. 937-951.

149. Mackay T.F.C. The nature of quantitative genetic variation for Drosophila longevity // Mech. Ageing Dev. 2002. V. 123. P. 95-104.

150. McClintock B. The origin and behavior of mutable loci in maize // Proc Natl Acad Sci USA. 1950. V. 36. P. 344-355.

151. McClintok B. Chromosome organization and genetic expression // Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol. 1951. V. 16. P. 13-47.

152. McClintok B. Controlling elements and gene // Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol. 1956. V. 21. P. 196-216.

153. McClintock B. Mechanisms that rapidly reorganize the genome // Stadler Symp. 1978. V. 10. P. 25-48. ' .

154. McClintock B. Modified gene expressions induced by transposable elements / Miami Winter Symposium. Eds Scott W.A., Wemer R., Joseph D.R., Schultz J. New York: Acad. Press. 1980. V. 17. P. 11-19.

155. McClintock B. The significance of responses of the genome to challenge // Science. 1984. V. 226(4676). P. 792-801.

156. McDonald J.F., Strand D.J., Lambert M.E., Weinstein I.B. The Responsive Genome: Evidence and Evolutionary Implication // Development as an Evolutionary process / Eds. Raff R.A., Raff E.C. N.Y.: Alan R. Liss. Inc. 1987. P. 239-263.

157. McDonald J.F., Josephs S.F., Wong-Staal F., Strand D.J. HIV-1 expression is posttranscriptionally repressed in Drosophila cells // AIDS Res. Hum. Retroviruses. 1989. V. 5(1). P. 79-85.

158. McDonald J.F. The potencial evolutionary significance of retro viral-like transposable elements in peripheral populations // Evolutionary Biology of Transient Unstable Populations / Eds. Fontdevila A. Berlin e.a.: SpringerVerlag. 1989. P. 190-205.

159. Maniatis T., Goodbourn S., Fischer J.A.Regulation of inducible and tissue-specific gene expression // Science. 1987. V. 236(4806). P. 1237-1245.

160. Mather K. Variation and selection of polygenic character // J. Genet. 1941. V. 41. № l.P. 159-193.

161. Mather K. Historical overview: quantitative variation and polygenic systems. In: Quantitative Genetic Variation / Eds Thompson J.N., Thoday J.M. N.Y.: Acad.Press. 1979. P. 5-19.

162. Mikkelsen T.S., Wakefield M.J., Aken B. et al. Genome of the marsupial Monodelphis domestica reveals innovation in non-coding sequences // Nature. 2007. V. 447. P. 167-177.

163. Mouse Genome Sequencing Consortium. Initial sequencing and comparative analysis of the mouse genome // Nature. 2002. V. 420. P. 520562.

164. Mobile DNA / Eds. Berg D.E., Howe.M.M. Washington D.C.: Amer.Soc. Microbiol. 1989. 972 p.

165. Mobile DNA II / Eds. Craig N.L., Craigie R., Gellert M., Lambowitz A.M. Washington. DC: American Society for Microbiology. 2002. 1204 p.

166. Moore J.K., Haber J.E. Capture of retrotransposon DNA at the sites of chromosomal double-strand breaks //Nature. 1996. V. 383(6601). P. 644646.

167. Neidhardt F.C., VanBogelen R.A., Vaughn V. The genetics and regulation of heat-shock proteins // Annu. Rev. Genet. 1984. V. 18. P. 295-329.

168. Neumann D., Scharf K.D., Nover L. Heat shock induced changes of plant cell ultrastructure and autoradiographic localization of heat shock proteins // Eur. J. Cell Biol. 1984. V. 34(2). P. 254-64.

169. Nuzhdin S.V., Dilda C.L., Mackay T.F.C. The Genetic Architecture of Selection Response: Inferences From Fine-Scale Mapping of Bristle Number Quantitative Trait Loci in Drosophila melanogaster II Genetics. 1999. V. 153. P. 1317-1331.

170. Nuzhdin S.V., Mackay T.F.C. The genomic rate of transposable element movement in Drosophila melanogaster II Mol. Biol. Evol. 1995. V. 21. P. 180-181.

171. Nuzhdin S.V., Fry J., Mackay T.F.C. Polygenic mutation in Drosophila melanogaster: the causal relationship of bristle number to fitness // Genetics. 1995. V. 139(2). P. 861-872.

172. Ogiwara I., Miya M., Ohshima K., et al. V-SINEs: a new superfamily of vertebrate SINEs that are widespread in vertebrate genomes and retain a strongly conserved segment within each repetitive unit // Genome Res. 2002. V. 12. №2. P. 316-324.

173. Pasyukova E.G., Belyaeva E.Sp., Kogan G.L., Kaidanov L.Z., Gvozdev V.A. Concerted transpositions of mobile genetic elements coupled with fitness chagnes in Drosophila melanogaster II Mol. Biol. Evol. 1986. V. 3. P. 299-312.

174. Pasyukova E.G., Belyaeva E.S., Ilyinskaya L.E., Gvozdev V.A. Outcross-dependent transpositions of copia-like mobile genetic elements in chromosomes of an inbred Drosophila melanogaster stock // Mol. Gen. Genet. 1988. V. 212. P. 281-286.

175. Pasyukova E.G., Vieira C., Mackay T.F. Deficiency mapping of quantitative trait loci affecting longevity in Drosophila melanogaster // Genetics. 2000. V. 156(3). P. 1129-1146.

176. Pasyukova E.G., Nuzhdin S.V., Morozova T.V., Mackay T.F. Accumulation of transposable elements in the genome of Drosophila melanogaster is associated with a decrease in fitness // J.Hered. 2004. V. 95(4). P. 284-290.

177. Pignatelli P.M., Mackay T.F.C. Hybrid disgenesis-induced response to selection in Drosophila melanogaster // Genet.Res. 1989. V. 54. P. 183— 195.

178. Pinkel D., Straume T., Gray J.W. Cytogenetic analysis using quantitative, high-sensitivity, fluorescence hybridization // Proc. Nat. Acad. USA. 1986. V. 83. P. 2934-2938.

179. Ratner V.A., Zabanov S.A., Kolesnikova O.V., Vasilyeva L.A. Induction of mobile genetic element Dm 412 transposition in Drosophila genome by heat shock treatment // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. 1992. V. 89. № 12. P. 5650-5654.

180. Ratner V.A., Zabanov S.A., Kolesnikova O.V., Vasilyeva L.A. Induction of mobile genetic element Dm 412 transposition in Drosophila genome by heat shock treatment Proc. Nat. Acad. Sci. USA. 1992. V. 89. № 12. P. 5650-5654.

181. Rebatchouk D., Narita J.O. Foldback transposable elements in plants // Plant Mol. Biol. 1997. V. 34. № 5. P. 831-835.

182. Rendel J.M. A model relating gene replicas and gene repression to phenotypic expression and variability // Proc.Nat.Acad.Sci.Wash. 1969. V. 64. №2. P. 578-583.

183. Rubin G.M., Finnegan D.J., Hogness D.S. The chromosomal arrangement of coding sequences in a family of repeated genes // Prog Nucleic Acid Res Mol Biol. 1976. V. 19. P. 221-226.

184. Seager R.P., Ayala F.J., Marks R.W. Chromosome interactions in Drosophila melanogaster Total fitness. Genetics. 1982. V. 102. № 3. P. 485-498.

185. Shrimpton A.E., Mackay T.F.C., Leigh Brown A.J. A molecular genetic analysis of the response to selection for bristle number in Drosophila // abstr 2nd Internat. Conf. Of Quant. Genet. Raleigh. 1987. P. 102.

186. Shrimpton A.E., Mackay T.F.C., Leigh Brown A.J. Transposable element induced response to artificial selection in Drosophila melanogaster molecular analysis of selection lines // Genetics. 1990. V. 125. № 4. P. 803-811.

187. Stern D.L., Sucena E. Drosophila: a laboratory manual / Eds. Ashburner M., Hawley S., Sullivan B. NY:. Cold Spring Harbor Lab. Press. Plainview. 2000. P. 601-615.

188. Strand D.J., McDonald J.F. Copia is transcriptionally responsive to environmental stress //Nucl. Acids Res. 1985. V.13. №2. P. 4401-4410.

189. Strand D., McDonald J.F. Insertion of a copia element 5' D.melanogaster (adh) alcohol degydrogenase gen ^is associated with altered developmental and tissue specific patterns of expression // Genetics. 1989. V. 121(4). P. 787-94.

190. Strobel E., Dunsmuir P., Rubin G.M. Polymorphisms in the chromosomal locations of elements of the 412, copia and 297 dispersed repeated gene families in Drosophila // Cell 1979. V. 17. P. 429-439.

191. Terzian C., Biemont C. The founder effect theory: quantitative variation and mdg-1 mobile element polymorphism in experimental populations of Drosophila melanogaster II Genetica. 1988. V. 76(1). P. 53-63.

192. Terzian C., Ferraz C., Demaille J., Bucheton A. Evolution of the Gypsy endogenous retrovirus in the Drosophila melanogaster subgroup // Mol. Biol. Evol. 2000. V. 17(6). P. 908-914.

193. Thoday J.M. Polygene mapping; use and limitations. In: Quantitative Genetic Variation / Eds Thompson J.N., Thoday J.M. N.Y.: Acad. Press. 1979. P. 219-240.

194. Viera C., Biemont C. Selection against transposable elements in D.simulans and Drosophila melanogaster II Genet. Res. Cambr. 1996. V. 68. P. 9-15.

195. Vieira C., Pasyukova E.G., Zeng Z.-B., Hackett J.B., Lyman R.F., Mackay T.F. Genotype-environment interaction for quantitative trait loci affecting life span in Drosophila melanogaster II Genetics. 2000. V. 154(1). P. 213227.

196. Vivas M.V., Garcia-Planells J., Ruiz C., Marfany G., et al. GEM, a cluster of repetitive sequences in the Drosophila subobscura genome // Gene. 1999. V. 229. № 1-2. P. 47-57.

197. Waddington C. H. Preliminary Notes on the Development of the Wings in Normal and Mutant Strains of Drosophila // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1939. № 7. P. 299-307.

198. Wang J.C., Giaever G.N. Action at a distance along a DNA // Science. 1988. V. 240(4850). P. 300-304.

199. Wilson R.H., Morgan T.J., Mackay T.F. High-resolution mapping of quantitative trait loci affecting increased life span in Drosophila melanogaster II Genetics. 2006. V. 173(3). P. 1455-1463.

200. Woodruff R. C., Slatko B.E. Factors affecting mutation rates in natural populations. In: Genetics and Biology of Drosophila / Eds. Ashburner M., Carson H.L., Thomson J.N. L.; N.Y.: Acad. Press. 1983. V. 3c. P. 37-61.

201. Wright S. The shifting balance theory and macroevolution. Ann. Rev. Genet. 1982. V.16.P. 1-15.

202. Xiong Y., Eikbush T.N. Origin and evolution of retroelements based upon their reverse transcriptase sequences // EMBO J. 1990. V. 9. № 10. P. 3353-3362.

203. Young M.W. Middle repetitive DNA: a fluid component of the Drosophila genome // Proc Natl Acad Sci USA. 1979. V. 76. P. 6274-6278.

204. Yuki S., Inouye S., Ishimaru S., Saigo K. Nucleotide sequence characterization of a Drosophila retrotransposon 412 // Eur. J. Biochem. 1986. V. 158(2). P. 403-410.

205. Zachar Z., Davison D., Garza D., Bingham P. A detailed developmental and structural study of the transcriptional effects of insertion of the copia transposon into the white locus of Drosophila melanogaster II Genetics. 1985. V. III. P. 495-515.

206. Zeng Z.-B. Precision mapping of quantitative trait loci // Genetics. 1994. V. 136. P. 1457-1468.

207. Zupunski V., Gubensek F., Kordis D. Evolutionary dynamics and evolutionary history in the RTE clade of non-LTR retrotransposons // Mol. Biol. Evol. 2001. V. 18(10). P. 1849-1863.

208. Zur Lage P., Shrimpton A.E., Flavell A .J., Mackay T.F.C., Brown A.J. Genetic and molecular analysis of smooth, a quantitative trait locus affecting bristle number in Drosophila melanogaster II Genetics. 1997. V. 146. №2. P. 607-618.