Бесплатный автореферат и диссертация по биологии на тему
Изучение структурного полиморфизма мобильного генетического элемента МДГ4 (GYPSY) в линиях Drosophila melanogaster
ВАК РФ 03.00.15, Генетика
Содержание диссертации, кандидата биологических наук, Кусулиду Людмила Кириаку
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ И УСЛОВНЫХ ОБОЗНАЧЕНИЙ
I. ВВЕДЕНИЕ
II. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
П. 1. МОБИЛЬНЫЕ ЭЛЕМЕНТЫ ГЕНОМА ДРОЗОФИЛЫ. 8 П.1.1. КЛАССИФИКАЦИЯ МОБИЛЬНЫХ ГЕНЕТИЧЕСКИХ
ЭЛЕМЕНТОВ.
П. 1.2. ОБЩАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА ДКП-РЕТРОТРАНСПОЗОНОВ.
П. 1. 3. ЛОКАЛИЗАЦИЯ РЕТРОТРАНСПОЗОНОВ В ГЕНОМЕ.
П. 1.4. РЕГУЛЯЦИЯ ЭКСПРЕССИИ РЕТРОТРАНСПОЗОНОВ
П. 1.4.1 .Транскрипционная регуляция.
П. 1.4.2.Посттранскрипционная регуляция экспрессии ретротранспозонов.
П. 1.4.3. Модификаторы экспрессии МДГ4.
П. 1.5. РОЛЬ МОБИЛЬНЫХ ЭЛЕМЕНТОВ В МУТАГЕНЕЗЕ.
П. 1.5.1. МДГ4 (gypsy)-индуцируемый мутагенез в локусе yellow.
П.2. СТРУКТУРА РЕТРОТРАНСПОЗОНА МДГ4 (GYPSY). 23 П.2.1. БЕЛКОВЫЕ ПРОДУКТЫ ОТКРЫТЫХ РАМОК СЧИТЫВАНИЯ МДГ4 И ИХ СХОДСТВО С ПРОДУКТАМИ РЕТРОВИРУСОВ и
ДРУГИХ РЕТРОЭЛЕМЕНТОВ.
П.2.1.1. Ген gag и его продукты
П.2.1.2 .Генро1.
П.2.1.3. Гек env. 28 П.З. ГЕНЕТИЧЕСКАЯ НЕСТАБИЛЬНОСТЬ ,- И МОБИЛЬНЫЕ
ЭЛЕМЕНТЫ.
II.3.1. СИСТЕМА ГЕНЕТИЧЕСКОЙ НЕСТАБИЛЬНОСТИ МУТАТОРНОЙ ЛИНИИ MS D.MELANOGASTER. 29 П.3.1.1. История получения мутаторной линии MS.
П.3.2. ГЕН FLAMENCO -РЕГУЛЯТОР ТРАНСПОЗИЦИИ МДГ4. 30 П.3.3. OVOd-TECT - ГЕНЕТИЧЕСКАЯ СИСТЕМА
КОЛИЧЕСТВЕННОЙ ОЦЕНКИ ТРАНСПОЗИЦИЙ МДГ4.
П.4. "АКТИВНАЯ" И "НЕАКТИВНАЯ" КОПИИ МДГ4. 34 П.4.1. СРАВНЕНИЕ НУКЛЕОТИДНОЙ И АМИНОКИСЛОТНОЙ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ ДВУХ ВАРИАНТОВ
КЛОНИРОВАННЫХ КОПИЙ МДГ4. 36 П.4.2. СРАВНЕНИЕ ТРАНСПОЗИЦИОННОЙ АКТИВНОСТИ ГИБРИДНЫХ КОНСТРУКЦИЙ, СОДЕРЖАЩИХ РАЗЛИЧНЫЕ КОМБИНАЦИИ УЧАСТКОВ "АКТИВНОГО" И "НЕАКТИВНОГО"
МДГ4.
III. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ 42 Ш.1. ЛИНИИ DROSOPH1LA MELANOGASTER, ИСПОЛЬЗОВАННЫЕ В ЭКСПЕРИМЕНТАХ. 42 Ш.2. ПЛАЗМИДЫ И ШТАММЫ E.COL1, ИСПОЛЬЗОВАННЫЕ В ЭКСПЕРИМЕНТАХ. 42 Ш.З. РЕАКТИВЫ 44 Ш.4. БАКТЕРИАЛЬНЫЕ СРЕДЫ 44 Ш.5. ВЫДЕЛЕНИЕ ДНК. 45 Ш.5.1. ВЫДЕЛЕНИЕ ДНК ИЗ МУХ.
Ш.5.2. ВЫДЕЛЕНИЕ ПЛАЗМИДНОЙ ДНК. 45 Ш.6. ТРАНСФОРМАЦИЯ КОМПЕТЕНТНЫХ КЛЕТОК E.COLI
ПЛАЗМИДНОЙ ДНК.
Ш.6.1. ПРИГОТОВЛЕНИЕ КОМПЕТЕНТНЫХ КЛЕТОК.
Ш.6.2. ТРАНСФОРМАЦИЯ
Ш.7. РЕСТРИКЦИЯ ДНК.
Ш.7.1. РЕСТРИКЦИЯ ПЛАЗМИДНОЙ ДНК.
Ш.7.2. РЕСТРИКЦИЯ ГЕНОМНОЙ ДНК ИЗ МУХ.
Ш.8. САУЗЕРН-БЛОТ ГИБРИДИЗАЦИЯ.
Ш.8.1. ПЕРЕНОС ДНК НА НЕЙЛОНОВЫЕ ФИЛЬТРЫ. 48 Ш.8.2. МЕТОД ВЫДЕЛЕНИЯ ФРАГМЕНТА ДНК ИЗ АГАРОЗНОГО ГЕЛЯ С ПОМОЩЬЮ MBIFERMENTAS DNA EXTRACTION
КШК0513. 49 Ш.8.3. МЕЧЕНИЕ ДНК-ЗОНДА МЕТОДОМ РАССЕЯННОЙ
ЗАТРАВКИ.
Ш.8.4. ГИБРИДИЗАЦИЯ.
Ш.9. OVOd-TECT.
Ш.9.1. ОДНОЭТАПНЫЙ OVO°-TECT.
Ш.9.2. ДВУХЭТАПНЫЙ OVOd-TECT.
Ш. 10. КЛОНИРОВАНИЕ ФРАГМЕНТА КОНСТРУКЦИИ рбК Pstl-EcoRI.
Ш. 10.1. ПОДГОТОВКА ФРАГМЕНТА ДЛЯ ЛИГИРОВАНИЯ.
Ш. 10.2. ПОДГОТОВКА ВЕКТОРА К ЛЕГИРОВАНИЮ.
Ш. 10.2.1. ДЕФОСФОРИЛИРОВАНИЕ ВЕКТОРА.
Ш.10.3. ЛИГИРОВАНИЕ. 53 Ш. 11. ГИБРИДИЗАЦИЯ IN ШТ/ПОЛИТЕННЫХ ХРОМОСОМ ИЗ СЛЮННЫХ ЖЕЛЕЗ ДРОЗОФИЛЫ С БИОТИНИЛИРОВАННЫМ
ДНК-ЗОНДОМ. 54 Ш.11.1. ПРИГОТОВЛЕНИЕ ПРЕПАРАТОВ ПОЛИТЕННЫХ
ХРОМОСОМ.
III. 11.2. ВВЕДЕНИЕ БИОТИНИЛИРОВАННОЙ МЕТКИ В
ПРЕПАРАТЫ ДНК (НИК -ТРАНСЛЯЦИЯ).
Ш. 11.3. ГИБРИДИЗАЦИЯ.
IV. РЕЗУЛЬТАТЫ 57 IV. 1. РАСПРЕДЕЛЕНИЕ ДВУХ ВАРИАНТОВ МДГ4 В ЛИНИЯХ D.MELANOGASTER 57 IV.2. ОПРЕДЕЛЕНИЕ ЧИСЛА КОПИЙ МДГ4 В КАЖДОЙ ЛИНИИ. 63 IV.3. ВЫЯВЛЕНИЕ И КОЛИЧЕСТВЕННАЯ ОЦЕНКА ПЕРЕМЕЩЕНИЯ МДГ4 С ПОМОЩЬЮ OVO°-TECTA.
IV.4. ЛОКАЛИЗАЦИЯ МДГ4 НА ХРОМОСОМАХ ЛИНИЙ D.MELANOGASTER.
V. ОБСУЖДЕНИЕ 76 V. 1. МДГ4 И ЭВОЛЮЦИЯ. 77 V.I.I. ЭВОЛЮЦИОННЫЕ ВЗАИМООТНОШЕНИЯ ДВУХ ПОДСЕМЕЙСТВ МДГ4. 78 V.I.2. КОЭВОЛЮЦИЯ ГЕНА flamenco И МОБИЛЬНОГО ЭЛЕМЕНТА
МДГ4. 79 V.2. ПОИСК МОДЕЛЕЙ ДЛЯ ИЗУЧЕНИЯ ГЕНЕТИЧЕСКОГО
КОНТРОЛЯ ПЕРЕМЕЩЕНИЙ МДГ4.
V.2.1. АЛЛЕЛЬНЫЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ И ГЕНЕТИЧЕСКАЯ
НЕСТАБИЛЬНОСТЬ.
V.2.2. НЕИЗМЕННОСТЬ ГЕНОМНОГО ОКРУЖЕНИЯ МДГ4 В
ЛИНИЯХ С БОЛЬШИМ ЧИСЛОМ КОПИЙ ЭЛЕМЕНТА.
V.2.3. ЛОКАЛИЗАЦИЯ МДГ4 НА ХРОМОСОМАХ ЛИНИЙ D.MELANOGASTER.
Введение Диссертация по биологии, на тему "Изучение структурного полиморфизма мобильного генетического элемента МДГ4 (GYPSY) в линиях Drosophila melanogaster"
Мобильные генетические элементы (МГЭ) являются составной частью генетического аппарата высших организмов [Хесин, 1985]. Нарушая консервативность эукариотического генома, они обеспечивают подвижность, необходимую для успешной адаптации особей к изменениям, происходящим в среде обитания. У Drosophila melanogaster на долю МГЭ приходится около 10% ДНК [Pimpinelly et al., 1995] и известно, что большая часть спонтанных мутаций вызвана инсерциями мобильных элементов [Green, 1988].
В процессе эволюции установлен сложный характер взаимодействия МГЭ с хозяйскими генами. С одной стороны, мобильные элементы, встраиваясь в различные участки генов, в большей или меньшей степени влияют на их экспрессию [Parkhurst S.M., Corces KG. 1986Ь]. С другой стороны, в клетке существуют контролирующие механизмы, подавляющие транспозиц ию, не давая ей достигнуть уровня, опасного для жизни особи.
Последние годы активно изучается мобильный элемент D. melanogaster МДГ4, именуемый в зарубежной литературе "gypsy". Особенности его структуры и инфекционные свойства позволяют говорить о МДГ4 как о первом ретровирусе беспозвоночных, обнаруженным на сегодняшний день [Kim et al. 1994а, Song et al. 1994, Lecher et al, 1997]. Подобно ретровирусам, цикл его транспозиции проходит через стадию обратной транскрипции [Arkhipova et al, 1995]. МДГ4 имеет сложную структуру и содержит в своем составе промотор, энхансер, сигнал полиаденилирования, а также инсулятор [Gdula et al., 1996], поэтому при внедрении элемента в регуляторную область гена могут происходить различные мутации данного локуса. Встраивание же элемента в кодирующую часть гена обычно приводит к полной потере генной функции.
Несмотря на то, что ретровирусы были предметом пристального внимания исследователей, на данный момент очень мало сведений об их генетической связи с хозяином. Это обусловлено тем, что в роли хозяина выступали позвоночные - трудные объекты для генетического анализа. Появление ретротранспозона МДГ4 в геноме такого удобного объекта^как D.melanogaster, дает уникальную возможность детального изучения взаимоотношений ретровируса и клетки.
Спонтанные транспозиции мобильных элементов, как правило, происходят чрезвычайно редко (с частотой примерно 10"6 перемещений на гамету за поколение), но в некоторых системах перемещения наблюдаются с повышенной частотой. Одна из таких систем генетической нестабильности - линия MS (Mutator Strain) - была описана А.И. Кимом. Эта нестабильная мутаторная линия (МЛ) характеризуется продолженной нестабильностью: увеличенной до 1(Г3 - 10"4 частотой спонтанного мутирования, нестабильным характером мутаций и активными, независимыми друг от друга перемещениями двух МГЭ - МДГ4 (gypsy) и hobo [Kim et al, 1990; Kim, Belyaeva, 1991].
Молекулярный анализ МДГ4, клонированного из мух как мутаторной линии MS, так и исходной для нее стабильной линии SS (Stable Strain), выявил существование двух подсемейств ретротранспозона, имеющих четкие структурные различия. Эти два подсемейства были условно названы «активным» и «неактивным». Наличие некоторых сайтов рестрикции характерно для "активной" копии, в то время как по другим наблюдается полиморфизм, то есть они могут встречаться как в "активной", так и в "неактивной" копиях [Lyubomirskaya et al., 1990].
В недавних работах было показано, что генетическая нестабильность в линии MS обусловлена не только присутствием в геноме "активного" подсемейства МДГ4. Необходимо также наличие мутации в клеточном гене flamenco, контролирующем частоту транспозиций gypsy [Lyubomirskaya et al., 1990; Prud'homme et al., 1995].
Линии, подобные MS, могут служить хорошей моделью для дальнейшего изучения механизмов регуляции ретротранспозиции. Актуальность этого вопроса вызвана явным сходством МДГ4 с ретровирусами позвоночных и, следовательно, возможностью экстраполяции полученных результатов на системы паразит - хозяин, существующие у более высокоразвитых организмов. Особый фундаментальный интерес представляет исследование эволюционных связей двух вариантов МДГ4, а также коэволюции ретротранспозонов и клеточных генов. Освещение проблемы происхождения и развития МГЭ приблизит нас к пониманию закономерностей сосуществования и взаимодействия клетки с вирусоподобными элементами.
Целью данной работы было: 1- исследование эволюционных взаимоотношений между двумя вариантами МДГ4 и геномом дрозофилы ;2- поиск новых систем генетической нестабильности, связанной с перемещениемМДГ4.
В соответствии с целью в работе были поставлены следующие задачи:1. Исследовать особенности распределения двух вариантов МДГ4 в линиях D. melanogaster разного происхождения.
2. Выявить генетически нестабильные линии с помощью генетического теста на транспозиционную активность.
3. Определить аллельное состояние гена flamenco в линиях D. melanogaster.
4. Определить число копий и локализацию МДГ4 на хромосомах линий D.melanogaster.
Заключение Диссертация по теме "Генетика", Кусулиду Людмила Кириаку
VII. выводы
1. Скрининг 44-х линий D.melanogaster разного происхождения указал на следующие особенности распределения двух вариантов мобильного элемента МДГ4 : а) Неактивный в транспозиционном отношении вариант МДГ4 содержится во всех без исключения исследованных линиях . Активный вариант присутствует не во всех линиях и, как правило, представлен меньшим числом копий. По - видимому, "неактивный" вариант эволюционно более древний. б) Обнаружено пять линий, в которых "активный" вариант МДГ4 преобладает над "неактивным".
2. Для линий 19мг и 89мг характерна генетическая нестабильность, связанная с перемещением МДГ4} но не зависящая от гена flamenco, известного своим участием в проявлении генетической нестабильности мутаторной линии MS D.melanogaster. Возможно, они содержат мутации в другом гене или генах, регулирующих транспозиции МДГ4.
3. Обнаружено, что генетически стабильные линии 131мг и 242мг несут мутацию flam, вызывающую активные перемещения МДГ4. Отсутствие генетической нестабильности свидетельствует о том, что они содержат супрессор или супрессоры мутации flam'.
4. Линии 31мг, 19мг, 89мг, 131мг и 242мг могут быть использованы в качестве моделей для дальнейших исследований, касающихся механизмов регуляции ретротранспозиции и проявления генетической нестабильности.
VI. ЗАКЛЮЧЕНИЕ
В данной работе была предпринята попытка приблизиться к пониманию некоторых вопросов, связанных с проявлением генетической нестабильности у D.melanogaster, обусловленной перемещениями ретротранспозона МДГ4.
В эксперимент были вовлечены линии разного происхождения, на которых до сих пор не проводились такого рода исследования. Предполагалось, что в природе существуют неизвестные на сегодняшний день механизмы взаимодействия генетического аппарата клетки с мобильными элементами, входящими в его состав. Отсюда необходимость расширения наших представлений об этих жизненно важных, но мало изученых процессах.
Специфика поставленных задач определила схему построения данного исследования, каждый этап которого призван подтвердить или уточнить результат предыдущего. Так, первичный скрининг большого числа линий позволил отобрать некоторые из них, представляющие для нас особый интерес. В ходе более детального анализа выяснилось, что несмотря на ограничения метода Саузерн-блот гибридизации, он вполне пригоден для поиска перспективных объектов, имеющих нужные нам свойства. В частности, оказалось, что каждая из отобранных линий имеет уникальные сочетания клеточных генов и функционального состояния МДГ4.
Итогом данного исследования является постановка задач и выбор моделей, с помощью которых эти задачи можно решить. При этом структурный полиморфизм был не столько объектом, сколько удобной и доступной призмой, через которую рассматривался имеющийся материал.
Итак, структурный полиморфизм МДГ4 позволил разделить все исследованные линии на три группы согласно количественному соотношению содержащихся в них вариантов ретротранспозона. Оказалось, что в большинстве линий преобладает структура МДГ4, характерная для транспозиционно неактивного элемента. Присутствие "неактивной" копии зафиксировано во всех исследованных линиях. "Активный" вариант обнаружен не во всех линиях и, как правило, в небольшом количестве. Это наводит на мысль о консервативности и, следовательно, об эволюционной древности "неактивного" МДГ4.
Показано, что в некоторых линиях, введенных в коллекцию сравнительно недавно, "активный" МДГ4 преобладает над "неактивным". Поскольку известно, что увеличение численности МДГ4 происходит за счет его перемещения, логично предположить наличие свойства генетической нестабильности в этих линиях. Это свойство может приобретаться или теряться в процессе взаимодействия мобильного элемента с геномом клетки, поэтому вполне возможно, что некоторые из этих линий, в настоящее время, могут не проявлять признаков нестабильности.
В результате более детального изучения вышеупомянутых пяти линий удалось несколько прояснить картину, наблюдаемую на первом этапе работы. Две из них (89мг и 19мг), действительно оказались генетически нестабильными. Однако вопреки ожиданиям ген flamenco, известный своим участием в проявлении генетической нестабильности в линии MS [Prud'homme et al. 1995], не играл определяющей роли в регуляции перемещений МДГ4. По-видимому, здесь присутствует мутация в другом, неизвестном нам гене (или генах), контролирующем, подобно flamenco, ретротранспозиции МДГ4.
Интересно то, что линии 131мг и 242мг, напротив, оказались генетически стабильными, несмотря наличие мутации flam". Очевидно, мутантный аллель не способен вызывать перемещения МДГ4 из-за подавления его действия другим фактором. Этим фактором может быть супрессор (или супрессоры) мутации flam, входящий в состав
89 клеточного генетического аппарата и защищающий особь от чрезмерного распостранения ретротранспозонов.
Выявленные таким образом особенности исследованых линий, впервые указали на то, что большое количество транспозиционно активных копий МДГ4 и мутация в клеточном гене flamenco еще не являются необходимым и достаточным условием возникновения генетической нестабильности. Отобранные в ходе работы линии D. melanogaster представляют собой ценный материал для исследователей, поскольку демонстрируют малоизученные на сегодняшний день аспекты взаимоотношений ретровируса и "хозяйского" генома. Использование в качестве моделей линий 19мг, 89мг, 131мг и 242мг даст новый импульс к дальнейшему изучению механизмов регуляции ретротранспозиции.
Библиография Диссертация по биологии, кандидата биологических наук, Кусулиду Людмила Кириаку, Москва
1. Асланян М.М., Ким А.И. Мутанты дрозофилы, чувствительные к метилметансульфонату. I. Выделение и генетический анализ. 1981. Доклады Высшей Школы, Биол Науки, Т.11, С.83-88
2. Гвоздев В.А. Организация генома эукариот. // Молекулярная биология. 1978. Т.12. С.5 -35.
3. Гловер Д.,ред. Клонирование ДНК. Методы. М: Мир, 1988. 538с. АДержавец Е., Ким А., Асланян М. Анализ спонтанных хромосомных перестроекв нейробластах генетически нестабильной мутаторной линии Drosophila melanogaster. 1988. Генетика, Т.24, С.857-866.
4. JCecun Р. Б. Непостоянство генома. Наука, 1983 262с.
5. Adams М., Mellor /., Gull К., Sim R., Tuite M.,Kingsman S., et al The functions and relationships of Ty-VLP proteins in yeast reflect those of mammalian proteins.- Cell., 1987, V.49, P.lll-119.
6. Arkhipova I. and Ilyin J. Control of transcription of Drosophila retrotransposons. Bioessays, 1992, V.14, P.161-168.
7. Arkhipova I.R., Lyubomirskaya N. V., Ilyin Y. V. Drosophila retrotransposons. Austin, Tx Molecular Biology Intelligence Unit. R.G. Landes Company,. 1995, P. 130
8. Arkhipova I.R., Mazo A.M., Cherkasova V.A., et al. The steps of reverse transcription of Drosophila mobile dispersed genetic elements and U3-R-U5 structure of their LTRs. 1986,V.44, P.555-563.
9. Arkhipova IR and Ilyin Yu. Properties of promoter regions of mdgl Drosophila retrotransposon indicate that it belongs to a specific class of promoters. EMBO J 1991, V.10 P.1169-1177.
10. Berg J.M. Zinc fingers and other metal-binding domains.-J.Biol.Chem., 1990, V.265, P 6513-6516.
11. Bingham P., Judd B. A copy of the copia transposition is very tightly linked to the wa allele at the white locus of D.melanogaster. Cell. 1981. V.25. P. 705-711.
12. Cavarec L. and Heidmann T. The Drosophila copia retrotransposon contains binding sites for transcriptional regulation by homeoproteins. Nucleic. Acids Res., 1993, V.21 P: 50415049.
13. Cherkasova V., Sedkov Yu,, Ilyin Yu The leader region of the Drosophila transposon MDG1 contains transcription termination sites. Genetika 1990,V. 26, P. 1893-1904
14. Corces and Geyer P. Interaction of retrotransposons with the host genome: the case of the gypsy element of DrosophiIa.Reviews.1991. V.7(3) P. 86-90.
15. Evgene'ev M., Corces V. and Lankenau D. Ulysses transposable element of Drosophila shows high structural similarities to functional domains of retroviruses. J. Mol. Biol.,1992, V.225, P. 917-924.
16. Freund R., Meselson M. Long terminal repeat nucleotide sequence and specific insertion of the gypsy transposon. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1984. V.81. P.4462 4464.
17. Gdula D., Gerasimova Г., Corces V. Genetic and molecular analysis of the gypsy chromatin insulator of Drosophila. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1996,Y.93, P. 9378-9383.
18. Georgiev P., Gerasimova T. Novel genes influencing the expression of the yellow locus and mdg 4 in Drosophila melanogaster Mol Gen Genet. 1989 V. 220 P: 121-126.
19. Green M. Mobile Dna elements and spontaneous gene mutation. Bundary report 30: Eukariotic transposable elements as mutagenic agents. 1988. P: 41-50.
20. Katoh /., Yasunaga Т., Ikawa Y., Yoshinaka Y. Inhibition of retroviral proteaseactivity by an aspartylproteinase inhibitor. Nature.,1987, V.329, P.654-656
21. A3.Katzman M., Mack J.P.G., Skalka A., Leis J. A covalent complex between retroviral integrase and nicked substrate DNA. Proc.Natl.Acad. Sci., USA, 1991, V.88, P. 4695-4699
22. Kim A., Lyubomirskaya N., Belyaeva E., Shostak N., Ilyin Y. The introduction of a transpositionally active copy of retrotransposon gypsy into Stable Strain of Drosophila melanogaster causes genetic instability. 1994b. Mol Gen Genet, V.242, P.472-477.
23. Al .Kim A.I. Terzian C., Santamaria P., Pelisson A et al. Retroviruses in invertebrates: The gypsy retrotransposon is apparently an infectious retrovirus of D. melanogaster. Proc Natl Acad Sci USA 1994a. V.91, P.1285-1289
24. AZ.Kuzin A.B., Lyubomirskaya N.V., Khudaibergenova B.M., Ilyin Y.V., Kim A.I. Precise excision of the retrotransposon gypsy from the forked and cut loci in a genetically unstable D.melanogaster strain. // Nucl. Acids Res. 1994. V.22. P.4641 4645.
25. Lacoste J., Codani-Simonart S., Best-Belpomme M. and F. Peronnet, Characterisation and cloning of pll, a transrepressor of Drosophila melanogaster retrotransposition 1731. Nucleic Acids Res 1995, V. 23. P: 5073-5079.
26. Lecher P., Bucheton A., Pelisson A. Expression of Drosophila retrovirus gypsy as ultrastructurally detectable particles in the ovaries of flies carrying a permissive flamenco allele. // J. Gener. Vir. 1997. V.78. P.2379 2388.
27. Lyubomirskaya TV., Avedisov S., Surkov S. et al. Two Drosophila retrotransposon gypsy subfamilies differ in ability to produce new DNA copies via reverse transcription in Drosophila cultured cells. 1993. Nucl Acids Res, V.21, P.3265-3268.
28. Maso A., MisrohiL., Karavanov A., Sedkov Y., Krichevskaja A. et al., Suppresson in Drosophila: su(Hw) and su(f) gene products interact with a region of gypsy regulating its transcriptional activity. EMBO J., 1989. V. 8. P: 903-911.
29. Mc Clintok B. The origin and behavior of mutable loci in maze. Proc. Natl. Sci., 1950. V. 36, P; 344-355.
30. Mc Clintok B. Chromosome organisation and genie expression. Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol. 1952. V.16. P; 13-47.
31. Mc Clintok B. Mutable loci in maize. Carnegie Inst. Year Book. 1948. V.47. P: 155161.
32. Parkhurst S.M., Corces V.G. Interaction among the gypsy transposable element and the yellow and suppressor of hairy-wing loci in Drosophila melanogaster. Mol. Cell. Biol. 1986a. V. 6, P.46-53.
33. Pelisson A., Teysset L., Chalvet F., Kim A., Prud'homme AC, Tertian C., Bucheton
34. A. About the origin of retroviruses and the co-evolution of the gypsy retrovirus with the Drosophila flamenco host gene. // Genetica. 1997. V.100. P.29 37.
35. Peng X, MountS. Characterization of enhacer-of-apricot in Drosophila melanogaster. Genetics, 1990, V.126, P.1061-69.
36. Z.Smith P., Corces V. The suppressor of Hairy-wing protein regulates the tissue-specific expression of the Drosophila gypsy retrotransposon. Genetics. 1995. V. 139. P: 215-128.
37. Sneddon A.and Flavell A. The transcriptional control regions of the copia retrotransposon. Nucleic acids Res 1989, V.17.P.4025-4035.
38. Song S., Gerasimova Т., Corces V., et al. An env-like protein by a Drosophila retroelement: evidence that gypsy is an infection retrovirus. Genes Deb 1994. V.8, P.2046-2057
39. M.Strand D.J., McDonald J.F. Copia in transcriptional responsive to enviromental stress. 1985. Nucl Acids Res, V.13, P.4401-4410
40. Syomin В., Surkov S., Ilyin Yu Presence of the gypsy (mdg4) retrotransposon in extracellular virus-like particles. FEBS Lett 1993, V.323, P.285-288
41. Tchurikov N.A., Zelentsova E.S., Georgiev G.P. Clusters containing different dispersed genes in the genome of D.melanogaster. II Nucl. Acids Res. 1980. Y.8. P.1243 1258.
42. Yoshika K., Kanda H., Takamatsu N., Togashi S., Kondo S. et al Efficient amplication of Drosophila simulans copia directed by hygh-level reverse transcriptase activity associated with copia virus-like particles. Gene, 1992,V.120, P.191-196.
- Кусулиду Людмила Кириаку
- кандидата биологических наук
- Москва, 2001
- ВАК 03.00.15
- Молекулярно-генетическая характеристика двух подсемейств ретротранспозона МДГ4
- Полиморфизм эндогенного ретровируса МДГ4 (gypsy) в линиях рода Drosophila подгруппы melanogaster
- Канонические и неканонические последовательности эндогенного ретровируса МДГ4 (gypsy) в геноме дрозофилы
- Исследование некоторых поведенческих и биохимических особенностей в линиях Drosophila melanogaster, мутантных по гену flamenko
- Ретротранспозон МДГ4 и его роль в генетической нестабильности в мутаторной линии Drosophila melanogaster