Исследование процессов адресной доставки генетического материала в раковые клетки и в опухоли меланомы

Дурыманов, Михаил Олегович

Бесплатный автореферат и диссертация по биологии на тему
Исследование процессов адресной доставки генетического материала в раковые клетки и в опухоли меланомы
ВАК РФ 03.01.02, Биофизика

Автореферат диссертации по теме "Исследование процессов адресной доставки генетического материала в раковые клетки и в опухоли меланомы"

005536543

на правах рукописи

ДУРЫМАНОВ МИХАИЛ ОЛЕГОВИЧ

Исследование процессов адресной доставки генетического материала в раковые клетки и в опухоли меланомы

Специальность 03.01.02 - биофизика

АВТОРЕФЕРАТ

Диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук

31 ОКТ 2013

Москва 2013

005536543

Работа выполнена в лаборатории молекулярной генетики внутриклеточного транспорта Федерального государственного бюджетного учреждения науки Института биологии гена Российской академии наук и на биологическом факультете Московского государственного университета имени М.В.Ломоносова

Научный руководитель:

доктор биологических наук, профессор Соболев Александр Сергеевич

Официальные оппоненты:

Деев Сергей Михайлович, доктор биологических наук, член-корреспондент РАН, профессор, Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова Российской академии наук, заведующий лабораторией молекулярной иммунологии

Ярославов Александр Анатольевич, доктор химических наук, профессор, Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования «Московский государственный университет им. М.В.Ломоносова», заведующий группой нанобиоструктур лаборатории полимеризационных процессов кафедры высокомолекулярных соединений химического факультета

Ведущая организация:

Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт биофизики клетки Российской академии наук

Защита диссертации состоится «21» ноября 2013 года в 14 часов на заседании диссертационного совета Д 501.001.96 на базе Московского государственного университета имени М.В.Ломоносова по адресу: 119234, Москва, Ленинские горы, д.1, стр.12, МГУ, биологический факультет, аудитория 389.

С диссертацией можно ознакомиться в научной библиотеке Московского государственного университета имени М.В.Ломоносова.

Автореферат разослан « октября 2013 года.

Ученый секретарь диссертационного совета, доктор биологических наук

Страховская М.Г.

ОБЩАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА РАБОТЫ

Актуальность проблемы. Нуклеиновые кислоты являются очень привлекательными с точки зрения терапии молекулами, поскольку способны воздействовать на саму причину заболевания в случае непосредственной доставки к клеткам-мишеням. Кроме того, генно-терапевтические препараты могут быть адаптированы для лечения многих нарушений, как врождённых, так и приобретённых (в том числе рака), путём изменения последовательности переносимого генетического материала [Yousefi et al., 2013].

Тем не менее, клиническое применение нуклеиновых кислот ограничено отсутствием эффективных и безопасных систем их адресной доставки. В настоящее время большинство клинических испытаний проводятся с использованием вирусных систем доставки, главным образом, аденовирусов. Основным преимуществом вирусных векторов является высокая эффективность трансфекции, то есть доставки ДНК в ядра клеток-мишеней. Однако их применение встречает целый ряд ограничений, к которым относятся малая ёмкость переносимого генетического материала, свойственная вирусам собственная клеточная специфичность, способность реверсии к дикому типу в результате рекомбинации или мутаций, иммуногенность и другие. Разрабатываемые в качестве альтернативы невирусные системы доставки генетического материала лишены большей части этих недостатков, но в то же время демонстрируют, как правило, более низкую трансфицирующую способность, многие из них токсичны, а потому неприменимы для клинического использования [Park et al., 2006]. При создании такого рода конструкций одной из основных задач является оптимизация их состава и физико-химических свойств, от которых зависит эффективность доставки нуклеиновых кислот.

Полиплексы представляются одними из наиболее перспективных вариантов невирусных систем доставки генетического материала благодаря низкой токсичности, простоте синтеза и возможности модификации различными функциональными молекулами. Одной из часто используемых модификаций полиплексов для направленной доставки является включение в их состав специфического лиганда к рецепторам, сверхэкспрессированным на поверхности раковых клеток [Holgado et al., 2012, Mehra et al., 2013]. Данный подход применялся для доставки генетического материала с помощью полиплексов путём включения в их состав лигандных молекул к а(у)р(3)-интегриновым рецепторам [Ng et al., 2009], рецепторам эпидермального фактора роста [de Bruin et al., 2007], трансферрина [Kursa et al., 2003], фолата [Cheng et al., 2009] и других, в зависимости от типа опухоли. В частности, в случае опухоли меланомы на роль такого лиганда может претендовать синтетический МСISP-пептид, являющийся агонистом меланокортиновых рецепторов первого типа [Szardenings et al., 2000], которые сверхэкспрессированы на

3 Г

поверхности меланомных клеток в подавляющем большинстве случаев [Salazar-Onfray et al., 2002]. Возможность включения лиганда к меланокортиновым рецепторам в состав полиплексов позволит придать им дополнительный уровень специфичности при доставке в клетки опухоли меланомы, а, следовательно, более выраженный терапевтический эффект.

Кроме того, с целью повышения эффективности доставки ДНК в раковые клетки in vivo с помощью такого рода конструкций актуальной задачей является также изучение транспорта полиплексов на пути в ядра меланомных клеток. При внутривенном введении наночастицам полиплексов нужно преодолеть, во-первых, сосудистый барьер в опухоли, а, во-вторых, внутриклеточные мембранные барьеры, включающие внешний мембранный, эндосомальный и ядерный мембранный барьеры, что является необходимым условием успешной экспрессии переносимого терапевтического гена. Следует отметить, что в настоящее время отсутствуют работы, связанные с комплексным изучением транспорта ДНК в составе наночастиц полиплексов на всём их пути с момента введения в кровь вплоть до переноса в ядра клеток-мишеней, а также сведения о влиянии включения лиганда в состав полиплексов на процессы их транспорта. Комплексные исследования, включающие анализ физико-химических свойств частиц полиплексов и изучение их поведения в организме, крайне необходимы при поиске новых подходов для увеличения эффективности доставки генетического материала.

Цель и задачи исследования. В рамках настоящей работы была поставлена цель исследовать процессы транспорта и эффективность доставки генетического материала с помощью полиплексов с лигандом к меланокортиновым рецепторам первого типа в раковые клетки и в опухоли меланомы.

Для достижения цели работы был поставлен следующий ряд задач:

• Получить полиплексы с лигандом к меланокортиновым рецепторам 1 типа и контрольные полиплексы без лиганда, а также оценить их физико-химические свойства.

• Исследовать процессы внутриклеточного транспорта данных полиплексов и эффективности доставки с их помощью генов в раковые клетки меланомы in vitro.

• Проанализировать процессы накопления и микрораспределания полиплексов в опухоли меланомы и в нормальной подкожной соединительной ткани в качестве контроля.

• Оценить на уровне целого организма эффективность доставки генов в составе лигандированных и контрольных (безлигандных) полиплексов.

Научная новизна и практическая значимость. Настоящая работа посвящена изучению влияния внеклеточных и внутриклеточных барьеров на процесс доставки полиплексов на модели мышиной опухоли меланомы с использованием полиплексов на основе блок-сополимера полиэтиленимина с полиэтиленгликолем (ПЭИ-ПЭГ) и пептидным лигандом MC1SP к меланокортиновым рецепторам 1 типа, сверхэкспрессированным на поверхности подавляющего большинства меланом человека и мыши.

В рамках данной работы впервые были получены полиплексы с лигандом, обладающие специфичностью к раковым клеткам меланомы. Такого рода полиплексы продемонстрировали более высокую эффективность доставки различных генов по сравнению с контрольными полиплексами без лиганда, что может быть связано с более высокой скоростью поступления лигандированных полиплексов в клетки меланомы.

Впервые были детально изучены процессы накопления и микрораспределения полиплексов в опухоли и в нормальной подкожной соединительной ткани в качестве контроля. Данный процесс включает несколько стадий: связывание с поверхностью кровеносных сосудов, выход из сосудов в ткань и дальнейшую диффузию в межклеточном матриксе. Сосудистый барьер является серьёзным препятствием на пути полиплексов, несмотря на гораздо более высокую скорость его преодоления в опухолевых сосудах по сравнению с нормальными капиллярами, что было показано с помощью математического моделирования. Согласно полученным данным, присутствие лиганда в составе полиплексов не влияет на процессы их накопления и микрораспределения в опухоли, но в то же время увеличивает эффективность доставки генов, что, скорее всего, связано с различиями в транспорте на внутриклеточном этапе.

Полученные данные важны не только с точки зрения разработки невирусных векторов на основе поликатионов, но и для других наноразмерных систем доставки генетического материала, включая вирусные векторы, поскольку как вне-, так и внутриклеточные барьеры являются для них общими.

Апробация работы. Основные результаты диссертационной работы были представлены на конференциях: 1) 2nd International School "Nanomaterials and Nanotechnologies in Living Systems. Safety and Nanomedicine", September, 19-24, 2011, Moscow region, Russia; 2) IV съезд биофизиков России, 20-26 августа, 2012, Нижний Новгород, Россия; 3) 4th International Congress "Nanotechnology, Medicine & Biology", March, 13-15, 2013, Krems, Austria; 4) 21st International Symposium "Nanostructures: Physics and Technology", June, 24-28, 2013, St.-Petersburg, Russia; 5) 25th European Conference on Biomaterials, September, 8-12,2013, Madrid, Spain.

Публикации. По материалам работы опубликовано 10 печатных работ. Из них 4 статьи в международных рецензируемых журналах и 6 тезисов докладов и материалов конференций.

Структура и объем работы. Диссертация изложена на 99 страницах, включает 2 таблицы, 39 рисунков и состоит из введения, обзора литературы, материалов и методов, результатов, обсуждения результатов, выводов и списка литературы, включающего 186 источников.

СОДЕРЖАНИЕ РАБОТЫ

1. Получение полиплексов и анализ их физико-химических свойств.

Для приготовления полиплексов использовали плазмидную ДНК и синтезированные ранее блок-сополимеры полиэтиленимина и полиэтиленгликоля с пептидным лигандом МОБР, являющимся агонистом меланокортиновых рецепторов первого типа (МС1Я) [Бгагдепц^ е1 а1., 2000], сверхэкспрессированных на поверхности клеток большинства меланом [За1агаг-Оп&ау е1 а1., 2002]. В качестве контроля бьии использованы полиплексы на основе нелигандированных блок-сополимеров ПЭИ-ПЭГ.

На первом этапе были определены физико-химические характеристики полученных полиплексов, так как от них сильно зависит способность полиплексов, как и любых других наноразмерных частиц, диффундировать в ткани и проникать в клетки-мишени [Ророук е1 а1., 2010; БеШап е1 а1., 2000]. Измеренные с помощью метода динамического светорассеяния ¡¡-потенциалы полученных полиплексов изменялись в интервале от + 10 до + 20 мВ, возрастая с увеличением соотношения поликатион/ДНК. Наличие положительного заряда на поверхности комплекса позволяет им эффективнее взаимодействовать с отрицательно заряженными компонентами мембраны клеток-мишеней [Ое 8те& е1 а1., 2005]. Полиплексы с лигандом показали сравнительно больший поверхностный потенциал, чем контрольные полиплексы (Рис. 1). Данный факт косвенно указывает [О^в е1 а1., 2003] на то, что в составе лигандированных полиплексов положительно заряженный МСЛБР-пептид экспонирован на поверхности комплекса. Подобное строение полиплекса позволяет молекулам ПЭГ минимизировать неспецифическое взаимодействие полиплексов с компонентами крови, а лягандному пептиду - обеспечивать взаимодействие с рецепторами на клетках.

Результаты измерения размеров полиплексов методом динамического светорассеяния показали, что в растворе полиплексов присутствуют две фракции: превалирующая по числу частиц (> 99,9 %) фракция полиплексов имеет размеры в среднем около 45 нм, а минорная (< 0,01 %) - 120-150 нм (Рис. 2А). При этом не было выявлено достоверных различий в размерах для контрольных и лигандированных полиплексов для

разных соотношений поликатион/ДНК (от N/P 10 до 40) (Рис. 2Б). Такие размеры частиц препятствуют их выходу из нормальных сосудов, где ширина промежутков между клетками эндотелия составляет 5-12 нм, а также быстрому узнаванию и поглощению клетками ретикуло-эвдотелиальной системы, которое наблюдается для частиц, размеры которых превышают 200 нм [Hillaireau et al., 2009], что может привести к их быстрому выведению из кровотока и существенному уменьшению эффективности доставки генов [Smrekar et al., 2003]. Кроме того, полиплексы такого размера способны проникать в клетки по клатрин-зависимому пути эндоцитоза, условием реализации которого является размер поглощаемых частиц менее 150 нм [Grayson et al„ 2006].

m 20 5

5 15'

| ЮН

н o

с 5

ПЭИ-ПЭГ-МС18РЩНК ПЭИ-ПЭГ/ДНК

10 20 30 40 Поликатион/ДНК (N/P)

Рис. 1. Измеренные с помощью метода динамического светорассеяния ^-потенциалы лигандированных (ПЭИ-ПЭГ-МОЭР/ДНК) и контрольных (ПЭИ-ПЭГ/ДНК) полиплексов, приготовленных при разных соотношениях поликатион/ДНК или азот/фосфат Ы/Р (Б). Значения даны в виде среднего ± ст. ош. [совместно с Ю.В.Храмцовым]

60 80 100 НО 140 1«0 Гидродинамический диаметр, им

: ? 30

-^ПЭИ-ПЭГ/ДНК -в-ПЭИ-ПЭГ-МС15!УДНН

Полимер/ДНК (N/P)

Рис. 2. Измеренные с помощью метода динамического светорассеяния гидродинамические диаметры полиплексов. Распределение по размерам (А) и гидродинамические диаметры превалирующей фракции лигандированных (ПЭИ-ПЭГ-МС18Р/ДНК) и контрольных (ПЭИ-ПЭГ/ДНК) полиплексов, приготовленных при разных соотношениях поликатион/ДНК или азот/фосфат Ы/Р (Б). Значения даны в виде среднего ± ст. откл.

2. Анализ эффективности доставки генов в раковые клетки меланомы in vitro с помощью контрольных и лигандированных полиплексов, а также процессов их внутриклеточного транспорта.

Как показала оценка эффективности доставки генов, полиплексы с лигандом продемонстрировали в два раза более высокую эффективность доставки генов, чем контрольные полиплексы (Рис. ЗА).

Для понимания этого явления нами были проанализированы механизмы поступления полиплексов внутрь меланомных клеток М-3, а также кинетика их внутриклеточного транспорта и распаковки. Было показано, что присутствие в клеточной среде альфа меланоцит-стимулирующего гормона (aMSH), естественного агониста MC1R, сильно снижает скорость поглощения полиплексов с лигандом (Рис. ЗБ), а также эффективность их трансфекции до уровня, демонстрируемого контрольными полиплексами (Рис. ЗА). На эффективность трансфекции клеток линии почки эмбриона человека НЕК293, не имеющих на своей поверхности MCR1 и часто используемых в качестве контроля, не влияло ни присутствие свободного aMSH, ни наличие лиганда в составе полиплексов (Рис. ЗА). Все это говорит о высокой степени влияния присутствия лигандного пептида MC1SP в составе полиплексов на эффективность доставки переносимой ими ДНК в ядра клеток-мишеней.

Рис. 3. Эффективность трансфекции клеток линий М-3 и НЕК293 с помощью контрольных (ПЭИ-ПЭГ/ДНК) и лигандированных (ПЭИ-ПЭГ-МС1БР/ДНК) полиплексов (А), а также влияние свободного аМСГ (1 мкМ) в среде на эффективность трансфекции и поглощение клетками М-3 полиплексов с лигандом (Б). Ген £GFP был выбран в качестве репортерного гена для оценки эффективности трансфекции. Уровень поглощения меченных квантовыми точками полиплексов определяли с помощью проточной цитометрии. Полиплексы добавляли в количестве 0,5 мкг/мл по ДНК. Значения даны в виде среднего ± ст. ош. *р < 0,05, **р < 0,03 (однофакторный дисперсионный анализ АЖЭУА с последующим апостериорным ^тестом Даннета).

Время, ч

Cloudman S91 (clone М-3)

НЕК293

С помощью ингибиторного анализа эндоцитоза выяснилось, что лигандированные полиплексы накапливаются в клетках меланомы преимущественно путём более быстрого клатрин-зависимого эндоцитоза, в то время как контрольные - с помощью рафт-зависимого неспецифического эндоцитоза (Рис. 4).

ПЭИ-ПЭГ-МС1вР/ДНК

і ш

ПЭИ-ПЭГ-МС18Р/ДНК пэи-пэг/днк

Рис. 4. Эффективность трансфекции (А) и поглощения (Б) контрольных (ПЭИ-ПЭГ/ДНК) и лигандированных (ПЭИ-ПЭГ-МСISP/ДНК) полиплексов клетками М-3 в присутствии ингибиторов эндоцитоза: хлорпромазина (СР), нистатина (N), филипина III (F) или их совместного присутствия. Ген EGFP был выбран в качестве репортёрного гена для оценки эффективности трансфекции. Уровень поглощения меченных квантовыми точками полиплексов определяли с помощью проточной цитометрии. Полиплексы добавляли в количестве 0,5 мкг/мл по ДНК. Хлорпромазин, нистатин и филипин III добавляли к клеткам в конечных концентрациях 15, 25 и 1 мкМ соответственно. Значения даны в виде среднего ± ст. ош. *р < 0,05, **р < 0,01, ***р < 0,0001 (однофакторный дисперсионный анализ ANOVA с последующим апостериорным t-тестом Даннета).

С помощью метода конфокальной лазерной сканирующей микроскопии (KJICM) был проведён сравнительный анализ кинетики внутриклеточного транспорта лигандированных и контрольных полиплексов. Применение технологии резонансного переноса энергии по Фёрстеру (FRET) позволило оценить кинетику распаковки данных частиц в клетках. ДНК в составе полиплексов была помечена квантовыми точками QD605 (донор), а блок-сополимер - красителем А1еха647 (акцептор) (Рис. 5А). Предварительно в буферном растворе с помощью KJICM при возбуждении донора были измерены спектры флуоресценции полиплексов, в составе которых была помечена ДНК, либо ДНК и блок-сополимер (Рис. 5Б). Во втором варианте помимо пика на 605 нм, соответствующего флуоресценции квантовых точек (донора), наблюдался также пик на 647 нм, соответствующий красителю А1еха647 (акцептору), что свидетельствует о наличии безызлучательного резонансного переноса энергии по Фёрстеру между донором и акцептором.

Для визуализации ядер и закисляемых компартментов (эндо/лизосом) использовали красители Hoechst 33258 и LysoTracker Green соответственно. Регистрацию изображений

клеток М-3 проводили спустя 2, 4, 6 и 8 ч после добавления полиплексов в режиме Z-stack,

регистрируя сигнал в четырёх каналах (Рис. 6).

Рис. 5. Схема двойного мечения компонентов полиплексов: ДНК помечена квантовыми точками С>0605 (донор), а поликатион ПЭИ-ПЭГ-МС18Р - красителем А1еха647 (акцептор) (А) и спектры флуоресценции полиплексов с двойным мечением (синяя линия), а также полиплексов, в составе которых помечена только ДНК (красная линия), при возбуждении донора (X = 458 нм) (Б).

Рис. 6. Типичное изображение клеток М-3 для анализа транспорта и распаковки полиплексов, полученное путём регистрации флуоресцентного сигнала в четырёх каналах: квантовых точек QD605 (распакованные и нераспакованные полшшексы) (А); канал сигнала FRET от Qdot605 к А1еха647 (нераспакованные полиплексы) (Б); канал LysoTracker Green (окрашивает закисляемые компартменты - эндо/лизосомы) (В); канал Hoechst 33258 (окрашивает ядра клеток) (Г); наложение каналов А - Г (Д). Масштабная чёрточка соответствует 10 мкм.

Для количественного анализа накопления полиплексов в клетке был определён объём поглощенных полиплексов, Q, как вексельный объём сигнала квантовых точек в расчёте на одну клетку. Данная характеристика соответствует количеству поглощённой клеткой ДНК [Akita et al., 2004], и такое приближение может быть использовано для количественных оценок. Количество нераспакованных полиплексов, обладающих сигналом FRET, определяли как воксельный объём сигнала AlexaFluor647, возникающего в результате безызлучательного переноса энергии с QD605.

Для оценки скоростей поглощения и распаковки полиплексов внутри клеток были использованы математические модели (Рис. 7).

Поглощение полиплексов

Б Поглощение Поглощение нераспакованных распакованных полиплексов полиплексов

Поверхность клетки

Цитозоль

И'

Распаковка

§0, de

— ÎV + - <2м

Рис. 7. Математические модели, описывающие общее накопление полиплексов в клетках (А), а также общее накопление нераспакованных и распакованных полиплексов и кинетику процесса распаковки (Б). S - эффективная концентрация полиплексов на клеточной поверхности; Q — объём сигнала квантовых точек в расчете на одну клетку; кт -константа входа полиплексов в клетку. Общее количество поступивших внутрь клетки полиплексов, Q, можно представить в виде суммы нераспакованных полиплексов Qp (наблюдался сигнал FRET, обусловленный переносом энергии) и распакованных - Qu (сигнал FRET отсутствовал). vp и v„ - скорости входа нераспакованных и распакованных полиплексов, соответственно, и ки„ — константа распаковки полиплексов в клетке.

Первая модель описывает общее накопление полиплексов в клетках (Рис. 7А), а вторая - общее накопление нераспакованных и распакованных полиплексов, а также кинетику процесса распаковки (Рис. 7Б). Как показали расчеты, скорость накопления нераспакованных полиплексов с лигандом значительно превышает скорость накопления распакованных (Табл. 1). Полиплексы без лиганда поступают в клетки с временной задержкой, что, по-видимому, приводит к их распаковке на клеточной поверхности и обуславливает преимущественное накопление в распакованном состоянии (как следует из полученных констант скоростей), что, возможно, негативно сказывается на эффективности трансфекции из-за большей вероятности деградации ДНК в распакованном состоянии.

Кроме того, лигандированные полиплексы быстрее накапливаются в клеточном ядре, что существенно для обеспечения эффективной доставки генов.

Таким образом, лигандированные полиплексы быстро поглощаются клетками меланомы путем рецептор-опосредованного клатрин-зависимого эндоцитоза, в результате чего они практически не претерпевают распаковки на поверхности клеток в отличие от контрольных полиплексов, что, возможно, позволяет им избежать деградации ДНК в закисляемых компартментах.

Таблица 1. Кинетические характеристики накопления полиплексов в клетках и процесса

ПЭИ-ПЭГ-МС15Р/ДНК ПЭИ-ПЭГ/ДНК

V (вокс./час) 10,56 ±0,40 10,76 ±0,40

(вокс./час) 9,01 ± 1,54 1,73 ±0,31

уц (вокс./час) 0* 9,03 ±0,51

-і к (час ) ЦП 4 1 0,27 ± 0,08 0*

* - значение неотличимо от нуля.

3. Изучение кинетики накопления и микрораспределения полиплексов в опухоли и в нормальной подкожной соединительной ткани в качестве контроля с помощью прижизненной микроскопии.

Изучение кинетики накопления и микрораспределения полиплексов проводили с использованием дорзальной накожной камеры методом прижизненной КЛСМ. Концентрацию полиплексов с меченной квантовыми точками ДНК в ткани определяли как суммарный воксельный объём сигнала квантовых точек <30605 на 1 мм3 ткани. Предварительно вычитали фоновый уровень сигнала в данном канале, который измеряли до введения меченых полиплексов в кровь. Кинетику накопления полиплексов оценивали в опухоли, а также в подкожной соединительной ткани, содержащей нормальные кровеносные сосуды (в отличие от опухоли), а потому используемой в качестве контроля.

Как в опухоли, так и в контрольной соединительной ткани (включая кровеносные сосуды) наблюдалось быстрое накопление полиплексов, а затем снижение их общей концентрации на 75 % от 15 мин до 4 часов после внутривенного введения (Рис. 8).

Время, ч

Рис. 8. Кинетики изменения концентрации лигандированных полиплексов в крови (чу), опухоли (А) и в нормальной подкожной соединительной ткани (М), выраженной в единицах воксельных объёмов в канале QD605 на мм3 ткани. Полиплексы (80 мкг по ДНК) с меченной QD605 ДНК вводили внутривенно. Значения даны в виде среднего ± ст. откл.

Анализ колокализации меченных квантовыми точками полиплексов с окрашенными с помощью FITC-декстрана кровеносными сосудами показал, что большая часть накопившихся в опухоли полиплексов образует скопления на поверхности выстилающего сосуды эндотелия (Рис. 9). На поверхности капилляров в нормальной подкожной соединительной ткани размеры и количество агрегатов полиплексов было значительно меньше (Рис. 9). Механизмы, объясняющие селективное связывание положительно заряженных частиц с поверхностью эндотелия опухоли, до сих пор остаются в значительной мере гипотетическими. Причиной такой разницы в накоплении могут быть сильные структурные и функциональные различия в строении опухолевых и нормальных капилляров. Нормальные капилляры покрыты слоем клеток эндотелия и перицитов и подлежащей под ними базальной мембраной, содержащей в своём составе отрицательно заряженные полисахариды, в особенности гиалурононан [Gao et al., 2005]. В стенках сосудов опухоли имеются широкие промежутки между клетками эндотелия, где матрикс базальной мембраны может контактировать с кровью [Hashizume et al., 2000]. Взаимодействие гиалурононана или других отрицательно заряженных компонентов матрикса базальной мембраны с положительно заряженными полиплексами, возможно, обуславливает большее связывание и агрегирование полиплексов на поверхности сосудов опухоли в отличие от нормальных капилляров, где базальная мембрана изолирована от крови слоем эндотелия с небольшими промежутками между клетками. Другой возможной причиной селективной задержки катионных наночастиц на поверхности сосудов опухоли может быть отличающийся состав гликокаликса эндотелия в опухоли по сравнению с нормальными сосудами [Schmitt-Sody et al., 2003]. Ещё одной вероятной причиной может

быть наличие участков сосудов с мозаичной структурой в опухоли, где раковые клетки непосредственно экспонированы в просвет сосуда [Chang et al., 2000]. Так как на поверхности раковых клеток меланомы зачастую наблюдается сверхэкспрессия отрицательно заряженного протеогликана синдекана-2 [Chung et al., 2012], то на участках с мозаичной структурой также за счёт зарядовых взаимодействий может наблюдаться усиленное связывание с частицами полиплексов. В любом случае, эти предположения о возможных механизмах требуют дальнейших исследований.

15 мин 60 мин 240 мин

.о х

(К ге X У

ш 3

■О

X >-

Рис. 9. Микрораспределение лигандированных полиплексов в контрольной соединительной ткани (верхняя панель) и в ткани опухоли (нижняя панель) спустя 15, 60 и 240 мин после внутривенного введения. Кровеносные сосуды были окрашены с помощью введённого 150 кД FITC-декстрана перед введением полиплексов (80 мкг по ДНК) с меченной QD605 ДНК. Голубые стрелки показывают на большие агрегаты полиплексов на поверхности эндотелия, пурпурные - на вышедшие из сосудов частицы. Масштабная чёрточка соответствует 20 мкм.

Наблюдаемое впоследствии вымывание полиплексов и их агрегатов с поверхности стенок сосудов происходит как в опухоли (Рис. 9, 10Б), так и в контрольной соединительной ткани (Рис. 9, 10А). Возможно, это является результатом распаковки полиплексов при взаимодействии с отрицательно заряженным гликокаликсом на поверхности эндотелия с последующим поступлением освободившейся меченой ДНК обратно в кровь. Другой возможной причиной данного явления может быть взаимодействие ПЭИ в составе полиплексов с белками плазмы крови [Zhong et al., 2013; Owens et al., 2006], что приводит к их опсонизации и поглощению клетками врождённого иммунитета [Owens et al., 2006]. Наконец, выход полиплексов обратно в кровь может быть

ft щ. N ■ • • • • •• « • v

N ' АЧ ^ -Г , ■••..-.VN ■ С ,

связан с процессами рециркуляции [ХЗопєаІуез ег а1., 2004; Міскіег еі аі., 2011; Вагиа ег аі., 2010] из клеток эндотелия после поглощения путём эндоцитоза.

Время, мин Время, мин

Рис. 10. Кинетика микрораспределения полиплексов с лигандом в нормальной подкожной соединительной ткани (А) и в опухоли (Б), выраженная в единицах воксельных объёмов в канале QD605 на 1 мм3 ткани. Полиплексы (80 мкг по ДНК) с меченной QD605 ДНК вводили внутривенно. Кровеносные сосуды были окрашены с помощью внутривенно введённого 150 кД FITC-декстрана. Анализ микрораспределения выявил на связавшихся с поверхностью сосудов лигандированные (■) и контрольные (♦) полиплексы и вышедшие из сосудов в ткань лигандированные (U) и контрольные (чх) полиплексы. Значения даны в виде среднего ± ст. ош.

Оценка эффективности выхода полиплексов из сосудов в ткань опухоли показала, что спустя 4 часа после только небольшая доля от изначально накопившегося количества полиплексов проникает в ткань. При этом 60 % от этого количества выходят из сосудов в течение первых 15 минут. Ограниченный выход полиплексов из сосудов в ткань связан, скорее всего, с наличием сосудистого барьера в опухоли, вызванного высокой плотностью клеток и межклеточного матрикса, а также высоким внутриопухолевым давлением. Тем не менее, в контрольной соединительной ткани доля проникших в ткань полиплексов составила 0,2 % от первоначально накопившихся, что в 400 раз меньше, чем в опухоли (Рис. 10). Это доказывает наличие в опухоли так называемого эффекта "повышенной проницаемости и удерживания" — "enhanced permeability and retention" (EPR) [Iyer et al., 2006], который связан с неспецифическим накоплением наночастиц в опухоли, где наблюдается замедленный ток крови из-за неправильной формы кровеносных сосудов, а также дефекты в строении эндотелия, который имеет достаточно широкие промежутки между клетками (до 600 нм и более) [Yuan et al., 1995; Hashizume et al., 2000], в то время как в большинстве нормальных тканей размер щелей между клетками выстилающего сосуды эндотелия не превышает 5-12 нм [Sarin et al., 2010].

Для оценки эффективности проникновения полиплексов вглубь ткани были построены количественные распределения (в воксельных объёмах на 1 мм3) в зависимости

от расстояния от сосудов и времени после введения (Рис. 11). Согласно полученным данным, максимальная глубина проникновения полиплексов вглубь ткани опухоли составила 20 мкм (Рис. 11 А, Б). В отличие от опухоли, в нормальной подкожной соединительной ткани полиплексы не распространялись дальше 5 мкм от границы капилляров (Рис. 11В).

Рис. 11. Кинетика микрораспределения в ткани опухоли (А, Б) и в нормальной подкожной соединительной ткани (В) вышедших из сосудов лигандированных (А, В) и контрольных (Б) полиплексов, выраженная в единицах воксельных объёмов в канале QD605 на 1 мм3 ткани. Полиплексы (80 мкг по ДНК) с меченной QD605 ДНК вводили внутривенно. Кровеносные сосуды были окрашены с помощью внутривенно введённого 150 кД FITC-декстрана. Последующий анализ микрораспределения позволил выявить вышедшие из сосудов полиплексы на различном расстоянии от сосуда.

Для оценки и сравнения кинетических параметров процессов накопления и микрораспределения полиплексов в опухоли и в нормальной подкожной соединительной ткани, нами была разработана математическая модель (Рис. 12), описывающая данные процессы.

Модель описывает кинетику изменения концентрации полиплексов в крови, адгезию на поверхности сосудов и выход в ткань. На первом этапе полиплексы из крови (5) связываются с поверхностью кровеносных сосудов (V) за счёт электростатических взаимодействий между положительно заряженными частицами полиплексов и отрицательно заряженным гликокаликсом на клетках эндотелия [van den Berg et al., 2006] с константой скорости fe, которая спустя 15 мин после введения полиплексов становится близкой к нулю. Согласно нашему предположению, слабо связавшиеся частицы (Р") могут диссоциировать обратно в кровь с константой к.2, выходить в ткань (Т) с константой кз, либо поглощаться путём клатрин-зависимого эндоцитоза эндотелиальными клетками (У) [Mennesson et al., 2005] с константой скорости fe. Последние (Vs') представляют собой вторую группу удерживаемых на поверхности сосудов полиплексов, которые также могут поступать обратно в русло сосуда с константой скорости fc за счёт процесса рециркуляции после их эндоцитоза, наблюдаемом на многих клеточных линиях [Gonfalves et al., 2004;

1УНск1ег й а1., 2011; Ваша е1 а1., 2010]. Данная математическая модель наилучшим образом описывает экспериментальные данные.

а1

Ткань

¿V "

-— = кг-В-{к_1+къ+к^)-У

Рис. 12. Модель, описывающая распределение полиплексов в ткани. 5 - концентрация полиплексов в крови; К - концентрация полиплексов на поверхности стенки сосудов, включающая связывающиеся с поверхностью эндотелия V, или поглощенные эндотелиальными клетками частицы, V"; Т - концентрация вышедших из сосудов в ткань полиплексов. к] - константа скорости выведения полиплексов из крови; к2 - константа скорости связывания полиплексов со стенками сосудов; к.2 - константа скорости диссоциации адсорбировавшихся на поверхности сосудов полиплексов; кз - константа выхода полиплексов в ткань к4 - константа скорости эндоцитоза полиплексов эндотелиальными клетками; к; - константа скорости экзоцитоза полиплексов клетками эндотелия (детали см. в описании модели). Эффективная концентрация полиплексов выражена как вексельный объем сигнала в канале квантовых точек ($0605 на мм3 ткани.

Вычисления на основе модели показали, что константа скорости связывания полиплексов с поверхностью сосудов в опухоли на порядок выше, чем для нормальных капилляров (Табл. 2), что подтверждает наше предположение о структурных различиях опухолевых и нормальных капилляров, в результате чего полиплексы связываются с ними с разным сродством. Рассчитанные константы диссоциации связавшихся с поверхностью сосудов полиплексов как в опухоли, так и в контрольной соединительной ткани оказались практически одинаковыми (Табл. 2). Это свидетельствует о схожести механизмов данных процессов в том и в другом случае. Кроме того, математическое моделирование показало, что полиплексы выходят из опухолевых сосудов в ткань на два порядка быстрее, чем из нормальных капилляров (Табл. 2). Таким образом, структурные аномалии сосудов опухоли обеспечивают более быстрое связывание и проникновение частиц полиплексов в ткань, чем в здоровой подкожной соединительной ткани.

Таблица 2. Полученные из экспериментальных данных с помощью математического моделирования константы скоростей накопления и микрораспределения полиплексов в опухоли и в нормальной подкожной соединительной ткани.

Константа скорости, мин"1 Нормальная подкожная соединительная ткань Опухоль

к, 0,041 ± 0,002 0,053 ± 0,004

k¡ (до 15 мин) > 0,006 >0,03

k¡ (после 15 мин) 0* 0*

к-2 0,024 ± 0,007 0,017 ± 0,002

h (5,5 ± 1,0)х10"5 (2,0 ± 0,6) xl О"3

к4 0,012 + 0,001 0,013 ± 0,004

ks 0,0072 ±0,0012 0,0055 ± 0,0009

* — значение неотличимо от нуля

Сравнение накопления и кинетики выхода из сосудов контрольных и лигандированных полиплексов в опухоли не выявило существенных различий. Скорее всего, это связано с преимущественным вкладом пассивного транспорта и накопления полиплексов в результате упомянутого выше эффекта EPR. Похожие результаты были получены и для других наночасгиц после включения в их состав лиганда, специфичного к рецепторам на поверхности раковых клеток [Kirpotin et al., 2006; Lee et al., 2010]. Тем не менее, подобная модификация может привести к усилению захвата наночасгиц клетками опухоли [Kwon et al., 2012]. В частности, было показано, что присоединение к полиплексам лиганда к рецепторам эпидермального фактора роста [von Gersdorff et al., 2005] привело к их более быстрому поглощению клетками в культуре путём рецептор-опосредованного эндоцигоза и усилению эффективности трансфекции. Следовательно, более быстрое поглощение клетками является важным условием для успешной доставки генов.

Нами не было найдено различий в накоплении (Рис. 10Б), а также в микрораспределении вышедших из сосудов лигандированных и контрольных полиплексов (Рис. 11А, Б). Как известно из литературных данных, в условиях in vivo модификация макромолекул или наночасгиц лигандом может привести к появлению так называемого эффекта "барьерного связывания" [Lammers et al., 2012]. Это явление обусловлено сильным связыванием содержащих лиганд макромолекул и наночасгиц с клетками-мишенями, что препятствует их дальнейшему распространению по опухоли, в то время как немодифицированные частицы глубже проникают в ткань опухоли. Эффект "барьерного связывания" полимерных наночасгиц наблюдался в том случае, если их размер не превышал 25 нм [Lee et al., 2010], что свидетельствует о зависимости глубины

проникновения данных частиц в ткань опухоли не только от наличия в их составе лиганда, но и от их размеров. При сравнении распределения лигандированных и контрольных полиплексов мы не наблюдали эффекта "барьерного связывания" (Рис. 11), что может быть связано с их относительно большими размерами (Рис. 2), существенно ограничивающими диффузию такого рода частиц. Ещё одним фактором, ограничивающим диффузию макромолекул и наночастиц, является отрицательно заряженный внеклеточный матрикс [Wiig et al., 2008]. Согласно литературным данным, межклеточное вещество большинства солидных опухолей имеет повышенное содержание глюкозаминогликанов и гиалурононана [Rennov-Jessen et al., 1996, Toole, 2004]. Используемые нами лигандированные и контрольные полиплексы имеют положительные ^-потенциалы (Рис. 1), что также снижает подвижность полиплексов, а, следовательно, их проникновение вглубь ткани опухоли [Rrasnici et al., 2003].

4. Оценка эффективности доставки гена натрий-йодид симпортёра (НИС) в опухоли меланомы с помощью контрольных и лигандированных полиплексов.

Оценку эффективности доставки гена НИС в опухоли меланомы с помощью контрольных и лигандированных полиплексов проводили с помощью однофотонной эмиссионной компьютерной томографии (ОФЭКТ). На первом этапе необходимо было оценить экспрессию доставленного с помощью полиплексов гена НИС в опухоли во времени. Согласно полученным данным, максимальный уровень накопленного в опухоли ш1, вызванного экспрессией гена НИС, наблюдался спустя 24 ч после введения полиплексов с лигандом и составил 6,8 ± 1,1 % введённой дозы на грамм ткани (Рис. 13А). Похожая кинетика экспрессии была получена при использовании в качестве векторов полиплексов на основе дендримеров полипропиленимина [Chisholm et al., 2009]. Таким образом, эти данные наряду с нашими результатами подтверждают временную природу экспрессии трансгена в результате доставки с помощью векторов на основе катионных полимеров. Как показала обработка реконструированных 3D проекций, достигнутого уровня поглощения йодида оказалось достаточно, чтобы визуализировать опухоль (Рис. 13Б, В). Кроме того, накопление йодида наблюдалось также в органах с естественной экспрессией НИС (в частности, в щитовидной железе, желудке, слюнных железах) и в моче, содержащейся в мочевом пузыре (Рис. 13Б, В).

Рис. 13. Выявление накопления 1231 в опухоли мышиной меланомы М-3 после доставки гена НИС с помощью ОФЭКТ/КТ томографии. Кинетика изменения экспрессии гена НИС в опухоли, измеренная по накоплению 231, доставленного с помощью лигандированных полиплексов (80 мкг по ДНК) (А). Реконструированные ЗО-проекции мышей спустя 24 ч после введения полиплексов с лигандом, несущих плазмиду с геном НИС (слева), либо те же полиплексы, несущие беспромоторную плазмиду в качестве контроля (справа) (Б). Реконструированные изображения пяти сагитальных срезов, проходящих через область опухоли разных мышей спустя 24 ч после введения полиплексов с лигандом, несущих плазмиду с геном НИС (В). Накопление 1231 в опухоли спустя 24 ч после введения полиплексов с лигандом, несущих плазмиду с геном НИС (ПЭИ-ПЭГ-МС1SP/ДНК), полиплексов без лиганда, несущих плазмиду с геном НИС (ПЭИ-ПЭГ/ДНК), либо полиплексов с лигандом, несущих беспромоторную плазмиду (контрольные полиплексы) (Г). Уровень накопления 1231 в опухоли нетрансфицированного контроля (2,4 ± 0,4 % ID/r) был вычтен в случае (Г). 18,5 МБк Ш1 вводили внутривенно для визуализации экспрессии гена НИС с помощью ОФЭКТ/КТ томографии. Значения даны в виде среднего ± ст. откл. % введ. дозы/г. *р < 0,001, **р < 0,0001 (однофакторный дисперсионный анализ ANO VA с последующим апостериорным t-тестом Даннета).

Несмотря на отсутствие различий в накоплении и микрораспределении контрольных и лигандированных полиплексов в опухоли, мы наблюдали в 2 раза большее накопление 1231 в опухоли после введения лигандированных полиплексов, несущих ген НИС, чем при введении контрольных (Рис. 13Г). Возможно, этот эффект можно объяснить различиями в механизмах поступления, внутриклеточного транспорта и распаковки

данных полиплексов в раковых клетках, которые в свою очередь определяют эффективность доставки переносимого генетического материала в ядра клеток. Как было показано в экспериментах на клетках М-3, различия в эффективности доставки ДНК между лигандированными и контрольными полиплексами были связаны с разницей в скоростях поглощения нераспакованных полиплексов между данными типами частиц. Согласно литературным данным [Stramhaug et al., 1997], рецептор-опосредованный эндоцитоз происходит гораздо быстрее, чем неспецифический адсорбтивный. Эксперименты по ингибиторному анализу путей эндоцитоза подтвердили существенный вклад клатрин-зависимого рецептор-опосредованного эндоцитоза для интернализации лигандированных полиплексов, что обеспечивает их быстрое накопление в клетках меланомы и, по-видимому, благодаря этому предотвращает взаимодействие полиплексов с протеогликанами на поверхности клеток, которое может привести к их распаковке [Hanzlikova et al., 2011] и дальнейшей деградации в эндо- и лизосомах. Кроме того, увеличение скорости поглощения полиплексов за счёт присоединения специфического лиганда позволяет обойти проблему, известную под названием "ПЭГ-дилеммы" [Zhang et al., 2012], которая связана с ослаблением взаимодействия покрытых ПЭГ полиплексов с клетками-мишенями, в результате чего частицы хуже поглощаются и быстрее деградируют в эндо-/лизосомах, а, следовательно, уменьшается эффективность трансфекции. Суммируя все эти доводы, можно заключить, что увеличение скорости поглощения полиплексов благодаря наличию в их составе лиганда к рецепторам на поверхности клеток-мишеней способствует повышению эффективности доставки генов.

Как уже отмечалось выше, с помощью введения полиплексов с лигандом, доставляющих ген НИС, нам удалось добиться уровня экспрессии симпортёра, достаточным для визуализации опухоли и составляющим 6,8 ± 1,1 % от введённой дозы на грамм ткани. При этом максимально достижимый уровень захвата йодида в опухоли, наблюдаемый на меланоме М-3 NIS, стабильно трансфицированной геном НИС, составил 24,3 ± 3,5 % от введённой дозы на грамм ткани. Вероятнее всего, причиной такой разницы является сосудистый барьер, препятствующий выходу полиплексов в ткань, а также ограниченная диффузия полиплексов в самой ткани опухоли, затрудняющая их продвижение вглубь ткани. Не исключено, что при доставке терапевтического гена с помощью полиплексов трансфицированными оказываются преимущественно клетки областей ткани опухоли, непосредственно прилегающие к кровеносным сосудам, что было продемонстрировано для невирусных систем доставки siRNA на основе катионных липидов [Li et al., 2012].

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

Таким образом, в работе было показано, что полиплексы с лигандом к меланокортиновым рецепторам первого типа оказались гораздо более эффективными для доставки генов в раковые клетки меланомы в культуре и в опухоли меланомы на мышиной модели по сравнению с нелигандированными аналогами. В то же время сосудистый барьер является существенным препятствием, ограничивающим проникновение полиплексов в ткань опухоли, что требует поиска новых подходов для его преодоления. Совокупность полученных результатов говорит о перспективности использования полиплексов для доставки генов и целесообразности дальнейшего улучшения их свойств.

ВЫВОДЫ:

1. Впервые получены полиплексы с лигандом к меланокортиновым рецепторам первого типа и проведена оценка их физико-химических свойств.

2. Полиплексы с лигандом продемонстрировали в 2 и более раза высокую эффективность доставки генов в клетки меланомы М-3 в культуре по сравнению с нелигандированными аналогами.

3. Лигандированные полиплексы поступают в клетки меланомы без задержки преимущественно путём рецептор-опосредованного клатрин-зависимого эндоцитоза и практически не претерпевают распаковки на поверхности клеток в отличие от нелигандированных, что, возможно, позволяет им избегать деградации ДНК в закисляемых компартментах.

4. Полиплексы накапливаются в ткани опухоли в 400 раз эффективнее, чем в контрольной подкожной соединительной ткани, однако присутствие лиганда в их составе не оказывает влияния на их накопление и распределение в опухоли.

5. Лигандированные полиплексы продемонстрировали более высокую эффективность доставки гена НИС в опухоли меланомы при внутривенном введении, чем нелигандированные аналоги (6,8 ± 1,1 % против 4,5 ± 0,8 % введённой дозы 12Ч на грамм ткани), что позволило визуализировать опухоль с помощью ОФЭКТ/КТ томографии.

СПИСОК РАБОТ, ОПУБЛИКОВАННЫХ ПО ТЕМЕ ДИССЕРТАЦИИ

Статьи в рецензируемых научных журналах, включённых в перечень ВАК:

1. Трусов Г.А., Уласов A.B., Белецкая Е.А., Храмцов Ю.В., Дупыманов М.О.. Розенкранц A.A., Свердлов Е.Д., Соболев A.C. Исследование влияния механизмов транспорта и распаковки полиплексов на эффективность трансфекции различных клеточных линий//Докл. Акад. Наук РФ - 2011. - Т.437(2). - С.226-228.

2. Durymanov М.О., Beletkaia Е.А., Ulasov A.V., Khramtsov Y.V., Trusov G.A., Rodichenko N.S., Slastnikova T.A., Vinogradova T.V., Uspenskaya N.Y., Kopantsev E.P., Rosenkranz A.A., Sverdlov E.D., Sobolev A.S. Subcellular trafficking and transfection efficacy of polyethylenimine-polyethylene glycol polyplex nanoparticles with a ligand to melanocortin receptor-l//J. Control. Release - 2012. - V.163 - P.211-219.

3. Durymanov M.O., Slastnikova T.A., Kuzmich A.I., Khramtsov Y.V., Ulasov A.V., Rosenkranz A.A., Egorov S.Y., Sverdlov E.D., Sobolev A.S. Microdistribution of MC1R-targeted polyplexes in murine melanoma tumor tissue.//Biomaterials - 2013. - V.34 (38) -P.10209-10216.

4. Розенкранц A.A., Сластникова T.A., Дупыманов M.O., Соболев A.C. Меланокортиновые рецепторы первого типа и меланома.//Биохимия - 2013. -Т.78(11) -DOI: 10.1134/S0006297913110035 (в печати).

Тезисы конференций:

1. Durymanov М.О.. Ulasov A.V., Beletkaia Е.А., Rodichenko N.S., Khramtsov Y.V., Trusov G.A., Rosenkranz A.A., Sverdlov E.D., Sobolev A.S. Targeted polyplex nanoparticles for gene delivery into melanoma cells. — 2nd International School "Nanomaterials and Nanotechnologies in Living Systems. Safety and Nanomedicine", September, 19-24,2011, Moscow region, Russia, p. 170.

2. Розенкранц A.A., Дурыманов M.O., Сластникова T.A., Кузьмич А.И., Свердлов Е.Д., Соболев A.C. Использование однофотонной эмиссионной компьютерной томографии для определения эффективности доставки генов при помощи наночастиц и диагностики опухолей. — IV съезд биофизиков России, 20-26 августа, 2012, Нижний Новгород, «Новые тенденции и методы в биофизике», стр.79.

3. Дурыманов М.О.. Уласов A.B., Белецкая Т.А., Родиченко Н.С., Храмцов Ю.В., Розенкранц A.A., Соболев A.C. Наночастицы полиплексов с лигандом для доставки генов в раковые клетки меланомы. — IV съезд биофизиков России, 20-26 августа, 2012, Нижний Новгород, «Физика — медицине и экологии», стр.80.

4. Durymanov М.О., Slastnikova Т.А., Rosenkranz A.A., Kuzmich A.I., Sverdlov E.D., Sobolev A.S. Specific polyplexes for intravital targeting of murine melanoma tumors. — 4th International Congress "Nanotechnology, Medicine & Biology", March, 13-15, 2013, Krems, Austria, P25.

5. Durymanov M.O., Ulasov A.V., Rosenkranz A.A., Khramtsov Y.V., Slastnikova T.A., Alekseenko I.V., Kuzmich A.I., Bezborodova O.A., Nemtsova E.R., Yakubovskaya R.I., Sverdlov E.D., Sobolev A.S. Polyplex nanoparticles for cancer gene therapy. — 21st International Symposium "Nanostructures: Physics and Technology", June, 24-28, 2013, St.-Petersburg, Russia, p. 113.

6. Durymanov M.O.. Slastnikova T.A., Rosenkranz A.A., Kuzmich A.I., Sverdlov E.D., Sobolev A.S. Distribution of targeted PEI-PEG-based polyplexes in melanoma tumor tissue. — 25th European Conference on Biomaterials, September, 8-12, 2013, Madrid, Spain, OP0048.

Формат 60x90/16. Заказ 1719. Тираж 100 экз. Печать офсетная. Бумага для множительных аппаратов. Отпечатано в ООО "ФЭД+", Москва, Ленинский пр. 42, тел. (495)774-26-96

Текст научной работыДиссертация по биологии, кандидата биологических наук, Дурыманов, Михаил Олегович, Москва

МОСКОВСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ ИМЕНИ М.В. ЛОМОНОСОВА БИОЛОГИЧЕСКИЙ ФАКУЛЬТЕТ КАФЕДРА БИОФИЗИКИ

ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ НАУКИ ИНСТИТУТ БИОЛОГИИ ГЕНА РОССИЙСКОЙ АКАДЕМИИ НАУК

Исследование процессов адресной доставки генетического материала в раковые клетки и в опухоли меланомы

на правах рукописи

ДУРЫМАНОВ МИХАИЛ ОЛЕГОВИЧ

Диссертация на соискание ученой степени кандидата биологических наук по специальности 03.01.02 - биофизика

Научный руководитель: доктор биологических наук профессор Соболев Александр Сергеевич

Москва 2013

Оглавление

Список сокращений.......................................................................................................................4

1. Введение.....................................................................................................................................6

2. Обзор литературы.....................................................................................................................9

2.1. Системы доставки НК, их преимущества и недостатки.................................................9

2.2. Обзор используемых полимеров для доставки генов...................................................10

2.3. Препятствия на пути полиплексов в организме и возможные подходы для увеличения эффективности доставки НК.............................................................................15

2.4. Обзор генов, используемых для терапии рака...............................................................22

2.4.1. Терапия с помощью генов суицида.........................................................................22

2.4.2. Корректирующая генная терапия............................................................................27

2.4.3. Иммуномодуляторная генная терапия....................................................................28

2.4.4. Использование транспортирующих молекул в генной терапии и диагностике рака........................................................................................................................................29

3. Материалы и методы...............................................................................................................33

3.1. Блок-сополимеры для приготовления полиплексов.....................................................33

3.2. Плазмиды...........................................................................................................................34

3.3. Приготовление полиплексов...........................................................................................34

3.4. Измерение размеров и ^-потенциалов полиплексов.....................................................35

3.5. Получение изображений полиплексов на слюде с помощью атомно-силовой микроскопии............................................................................................................................35

3.6. Флуоресцентное мечение компонентов полиплексов..................................................35

3.7. Культивирование клеток..................................................................................................36

3.8. Определение цитотоксичности полиплексов и ингибиторов эндоцитоза..................36

3.9. Доставка гена £'GFP с помощью полиплексов в клетки и определение доли трансфицированных клеток....................................................................................................37

3.10. Доставка гена люциферазы с помощью полиплексов в клетки и определение уровня её экспрессии...............................................................................................................37

3.11. Доставка гена НИС с помощью полиплексов в клетки и определение уровня его

125

экспрессии по поглощению радиоизотопа 1.....................................................................38

3.12. Обработка клеток ингибиторами эндоцитоза..............................................................38

3.13. Измерение эффективности поглощения полиплексов раковыми клетками в культуре....................................................................................................................................39

3.14. Съемка изображений клеток на конфокальном микроскопе при добавлении полиплексов с флуоресцентно меченными ДНК и блок-сополимером.............................39

3.15. Внутриклеточная локализация и распаковка полиплексов........................................40

3.16. Постановка накожных камер мышам для прижизненной микроскопии и инокуляция опухолевых клеток под камеры........................................................................41

3.17. Прижизненная микроскопии и количественная оценка кинетики накопления и микрораспределения полиплексов в опухоли и в нормальной подкожной соединительной ткани.............................................................................................................42

3.18. Выявление взаимного расположения сосудов и раковых клеток в опухоли с помощью прижизненной микроскопии.................................................................................43

3.19. Выявление распределения изотопа 1231 и его накопления в опухолях с помощью однофотонной эмиссионной компьютерной томографии...................................................44

4. Результаты................................................................................................................................46

4.1. Физико-химические характеристики полиплексов.......................................................46

4.2. Цитотоксичность полиплексов.......................................................................................47

4.3. Эффективность поглощения и доставки генов с помощью полиплексов...................48

4.4. Ингибиторный анализ путей эндоцитоза полиплексов................................................51

4.5. Изучение кинетики внутриклеточного транспорта и распаковки полиплексов........54

4.6. Изучение кинетики накопления полиплексов в опухоли и в нормальной подкожной

соединительной ткани.............................................................................................................59

4.7. Детальный анализ микрораспределения полиплексов.................................................61

4.8. Модельное описание микрораспределения полиплексов.............................................65

4.9. Влияние наличия лиганда на микрораспределение полиплексов в опухоли.............67

5. Обсуждение..............................................................................................................................72

6. Заключение...............................................................................................................................84

7. Выводы.....................................................................................................................................86

Благодарности..............................................................................................................................87

Список литературы......................................................................................................................88

Список сокращений

ACM - атомно-силовая микроскопия ДС - динамическое светорассеяние

KJ1CM - конфокальная лазерная сканирующая микроскопия

KT - рентгеновская компьютерная томография

HAT - нарадреналиновый транспортёр

НИС - натрий-йод симпортёр

HK - нуклеиновые кислоты

н.п. - нуклеотидные пары

ОФЭКТ - однофотонная эмиссионная компьютерная томография ПАМАМ - полиамидоамин ПЛ - поли-Ь-лизин

ПСД - поли(метакрилоил сульфодиметоксина)

ПЭГ - полиэтиленгликоль

ПЭИ - полиэтиленимин

ФС - фотосенсибилизатор

ЯПК - ядерный поровый комплекс

аМСГ - а-меланоцит-стимулирующий гормон

CD - цитозиндезаминаза (cytosine deaminase)

CMV - цитомегаловирусный промотор

EPR - эффект "повышенной проницаемости и удерживания" ("enhanced permeability and retention")

FRET - безызлучательный резонансный перенос энергии по Фёрстеру (Förster resonance energy transfer)

GCV - ганцикловир (ganciclovir)

GFP - зелёный флуоресцирующий белок (green fluorescent protein) HRP - пероксидаза хрена (horseradish peroxidase)

HSVi& - тимидинкиназа вируса простого герпеса (Heres simplex virus thymidine kinase)

IAA - индолил-уксусная кислота (indolyl acetic acid)

MC1R - меланокортиновые рецепторы 1 типа (melanocortin receptors-1)

MC ISP - пептид, имеющий в своем составе последовательность, связывающуюся с

меланокортиновыми рецепторами первого типа, и минимальную последовательность

ядерной локализации большого Т-антигена вируса SV-40

NFkB - транскрипционный фактор (nuclear factor kappa-light-chain-enhancer of activated В cells)

QD - квантовые точки (quantum dots)

TCR - Т-клеточные рецепторы (T-cell receptors)

TNF-a - фактор некроза опухоли-a (tumor necrosis factor-a)

1. Введение

Генная терапия - это лечение наследственных, онкологических и других заболеваний путём внесения в клетки пациента необходимого генетического материала с целью направленного изменения генных дефектов или придания клеткам новых функций [Горбунова и др., 1997]. Одним из направлений генной терапии является терапия рака, в основе которой лежит доставка генов, либо коротких олигонуклеотидов в опухолевые клетки, например, для изменения уровня экспрессии онкогенов, для увеличения экспрессии цитотоксических белков, активизирующих пропрепараты ферментов и т.д. В основе успешности генной терапии лежит эффективная, безопасная и специфичная доставка необходимого генетического материала в раковые клетки.

В условиях in vivo нуклеиновые кислоты (НК) способны подвергаться деградации сывороточными нуклеазами [Boeckle, 2005], поэтому для их транспорта в клетки-мишени используют носители (векторы), которые обеспечивают защиту генетического материала. Кроме того, используемые системы доставки должны облегчать транспорт НК в определённые типы клеток. Существует два типа векторов, предназначенных для доставки НК: вирусные и невирусные. Основным преимуществом вирусных векторов является высокая эффективность трансфекции, то есть доставки ДНК в ядра клеток-мишеней. Однако их применение встречает целый ряд ограничений: во-первых, это малая ёмкость переносимого генетического материала и свойственная вирусам собственная клеточная специфичность, во-вторых, это способность реверсии к дикому типу в результате рекомбинации или мутаций, в-третьих, белки вирусных частиц обладают высокой иммуногенностью, в результате чего повторное их введение вызывает иммунный ответ, в-четвёртых, это способность некоторых вирусов (например, ретровирусов) встраиваться в геном, что может привести к образованию опухолей в результате активации онкогенов, и, наконец, массовое производство вирусных векторов всё ещё достаточно проблематично и требует больших затрат. Невирусные векторы лишены большей части этих недостатков, но в то же время демонстрируют, как правило, более низкую трансфицирующую способность, многие из них обладают токсичностью [Park et al., 2006]. Среди невирусных систем доставки наибольшее распространение получили катионные липиды (их комплексы с переносимой ДНК называются липоплексами), а также катионные полимеры и сополимеры (их комплексы с переносимой ДНК называются полиплексами) [Park et al., 2006].

Полиплексы представляются одними из наиболее перспективных вариантов невирусных векторов благодаря низкой токсичности, простоте синтеза и возможности модификации различными функциональными молекулами. Одной из часто используемых

модификаций полиплексов для направленной доставки является включение в их состав специфического лиганда к рецепторам, сверхэкспрессированным на поверхности раковых клеток [Holgado et al., 2012, Mehra et al., 2013]. Данный подход применялся для доставки генетического материала с помощью полиплексов путём включения в их состав лигандных молекул к а(у)(3(3)-интегриновым рецепторам [Ng et al., 2009], рецепторам эпидермального фактора роста [de Bruin et al., 2007], трансферрина [Kursa et al., 2003], фолата [Cheng et al., 2009] и других, в зависимости от типа опухоли. В частности, в случае опухоли меланомы на роль такого лиганда может претендовать синтетический МСISP-пептид, являющийся агонистом меланокортиновых рецепторов первого типа [Szardenings et al., 2000], которые сверхэкспрессированы на поверхности меланомных клеток в подавляющем большинстве случаев [Salazar-Onfray et al., 2002]. Возможность включения лиганда к меланокортиновым рецепторам в состав полиплексов позволит придать им дополнительный уровень специфичности при доставке в клетки опухоли меланомы, а, следовательно, более выраженный терапевтический эффект.

С учетом всего вышеизложенного, целью настоящей работы было исследование процессов транспорта и эффективности доставки генетического материала с помощью полиплексов с лигандом к меланокортиновым рецепторам первого типа в раковые клетки и в опухоли меланомы.

Для достижения цели работы был поставлен следующий ряд задач:

2. Обзор литературы

2.1. Системы доставки НК, их преимущества и недостатки

В природе существуют специализированные структуры для доставки генетической информации в клетки - вирусы. Именно поэтому они первыми нашли широкое применение в качестве транспортёров генов.

Несмотря на привлекательность вирусных векторов (например, ретро-, адено-, адено-ассоциированных вирусов) с точки зрения высокой эффективности трансфекции клеток-мишеней, они обладают рядом существенных недостатков, накладывающих ограничения на их использование. К ним относятся малая ёмкость переносимого генетического материала, свойственная вирусам собственная клеточная специфичность, способность реверсии к дикому типу в результате рекомбинации или мутаций, иммуногенность и другие [Hart, 2010, Wang et al., 2012].

Невирусные векторы лишены большей части недостатков вирусных систем доставки, но в то же время демонстрируют, как правило, гораздо более низкую трансфицирующую способность [Pathak et al., 2009], многие из них обладают токсичностью [Glover et al., 2005]. Среди невирусных систем доставки наибольшее распространение получили катионные липиды (их комплексы с переносимой ДНК называются липоплексами), катионные полимеры (их комплексы с переносимой ДНК -полиплексы) на основе полиэтиленимина, поли-Ь-лизина и других синтетических поликатионов, а также полисахаридов (хитозана, циклодекстрина и т.д.) [Park et al., 2006], и прочие гибридные конструкции, включающие, например, липосомы, покрытые полимерным слоем, либо липосомы, нагруженные полиплексными частицами [Channarong et al., 2011]. Связывание ДНК с катионными липидами или полимерами и образование путём спонтанной самосборки наноразмерных комплексов происходит за счёт, главным образом, электростатических взаимодействий и в меньшей степени за счёт водородных связей и Ван-дер-Ваальсовых сил. В случае липоплексов большой вклад вносят также гидрофобные взаимодействия. Идеи использовать катионные липиды и катионные полимеры появились практически одновременно в 1987 г. [Feigner et al., 1987, Wu et al., 1987]. Данные системы доставки генетического материала обладают низкой иммуногенностью, лишены ограничений по размерами переносимой ДНК, несколько дешевле и проще в производстве относительно вирусных векторов.

2.2. Обзор используемых полимеров для доставки генов

Полиплексы впервые были использованы для доставки генов в 1987 г. [Wu et al., 1987]. С тех пор появилось огромное количество вариантов полимеров для создания полиплексов.

Поли-Ь-лизины (ПЛ) (Рис. 1) были в числе первых полимеров, используемых для невирусной доставки генов [Wu et al., 1987, Розенкранц и др., 1990]. Комплексы ПЛ с ДНК формируют тороиды диаметром 25-50 нм или палочки длиной 40-80 нм [Kang et al., 2005]. ПЛ быстро связываются с белками плазмы и выводятся из циркуляции в крови [Zhang et al., 2004]. Эффективность доставки генов с помощью полиплексов на основе ПЛ несколько ниже, чем, например, на основе полиэтиленимина (ПЭИ), что скорее всего связано с высокой степенью деградации НК в их составе в эндосомах клеток после поглощения [Eliyahu et al., 2005]. Одна из попыток улучшить свойства полиплексов на основе ПЛ привела к созданию производного полимера поли(циклооктен-у-олиголизина), содержащего в своём составе несколько участков олиголизина. В отличие от обычного полилизина, полиплексы на основе олиголизин-содержащих полимеров демонстрировали во много раз превосходящую эффективность трансфекции и низкую цитотоксичность [Parelkaretal., 2011].

Ещё одну группу полимеров для доставки НК составляют хитозаны (Рис. 1), представляющие собой линейные аминополисахариды, производные биополимера хитина, соединенные сшивками из глюкозамина. В зависимости от молекулярного веса и степени дезацетилирования, хитозаны формируют маленькие (менее 100 нм) стабильные комплексы с плазмидной ДНК. Для получения стабильных, трансфицирующих комплексов количество положительно заряженных мономеров

Информация о работе

Дурыманов, Михаил Олегович
кандидата биологических наук
Москва, 2013
ВАК 03.01.02

Диссертация

Исследование процессов адресной доставки генетического материала в раковые клетки и в опухоли меланомы - тема диссертации по биологии, скачайте бесплатно

Автореферат

Похожие работы