Бесплатный автореферат и диссертация по биологии на тему

Характеристика митотипов представителей трех этнических групп европейской части России

ВАК РФ 03.00.15, Генетика

Содержание диссертации, кандидата биологических наук, Орехов, Владимир Александрович

ВВЕДЕНИЕ. лава 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.

1.1 Структурная организация мтДНК.

1.2. Генетика мтДНК.

1.2.1. Скорость мутирования и гетероплазмия.

1.3. Концепция "молекулярных часов" и ее ограничения при анализе мтДНК.

1.4. Филогенетический анализ нерекомбинирующих маркеров.

1.5 Изменчивость мтДНК в популяциях человека.

1.5.2. Классификация азиатских гаплогрупп.

1.5.3. Изменчивость мтДНК в Европе.

1.5.4. Изменчивость мтДНК народов России.

1.6. Использование мтДНК в криминалистических исследованиях.

1.6.1. Особенности использования мтДНК в сравнении с аутосомными маркерами.

1.6.2. Спорные вопросы типирования мтДНК.

1.6.3. Экспериментальные методы, используемые при типировании мтДНК в. криминалистических исследованиях.

1.6.4. Накопление референтных баз данных гаплотипов мтДНК.

1.6.5. Примеры использования мтДНК в экспертных исследованиях. лава 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ.

2.1. Материалы.

2.2. Методы. лава 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ.:.

3.1 Изменчивость нуклеотидных последовательностей ГВС1 мтДНК в популяциях русских мари и татар.

3.2. Генетическое положение исследованных популяций русских, мари и татар среди соседствующий с ними народов.

3.3 Частоты основных гаплогрупп в популяциях русских мари и татар.

3.4 Анализ митотипов, общих для русских, мари и татар.

3.5. Анализ разнообразия мтДНК в российских выборках в аспекте судебно-экспертной идентификации личности.

3.5.1. Обоснование возможности и оптимизация схемы идентификации индивидов в больших группах с помощью типирования ГВС1 мтДНК.

3.5.2. Анализ гаплотипов мтДНК в случайной выборке российских граждан.

3.5.3. Сравнение показателей генетического разнообразия случайной выборки российских граждан и популяционной выборки русских.

3.5.4. Сравнительный анализ дискриминирующего потенциала ГВС1, ГВСП и их совместного использования.

3.5.5. Частоты основных гаплогрупп в сравнении с популяционными выборками России и Европы.

ВЫВОДЫ.

Благодарности.

Введение Диссертация по биологии, на тему "Характеристика митотипов представителей трех этнических групп европейской части России"

Актуальность проблемы. В настоящее время, когда прочитана нуклео-идная последовательность всего генома человека, особую важность приобретают ис-ледования, связанные с изучением межиндивидуальных и межпопуляционных гене-ических различий человека основанные на анализе ДНК маркеров. В последнее вре-1я, в связи с существенным прогрессом в развитии техники автоматического секвестрования, в мире стали широко доступны массовые исследования изменчивости ЩК. В связи с тем, что уровень изменчивости ДНК маркеров в несколько раз пре-!ышает изменчивость морфометрических и белковых маркеров, в популяционной ге-[етике стали интенсивно развиваться подходы, обладающие существенно более вы-окой разрешающей способностью, чем классические методы. Это ознаменовало но-!ый этап в молекулярно-генетическом изучении полиморфизма в популяциях челове-;а по всему миру.

Население России, крайне разнообразное в этническом отношении, глубоко и ;истематически изучалось методами антропологии, этнографии и генетики. Генетиче-:кие исследования базировались главным образом на белковых маркерах, а в послед-ше годы на биаллельных ДНК маркерах, тестируемых методом ПДРФ. Эти исследо-!ания стали источником обширной информации о генетическом разнообразии насе-гения России.

Для решения эволюционных и микроэволюционных задач наиболее подходят шрекомбинирующие участки генома человека, такие как митохондриальная ДНК и шрекомбинирующая часть Y хромосомы. Изменчивость этих маркеров связана исключительно с постепенным накоплением мутаций. Отсутствие рекомбинации позво-иет с помощью филогенетического анализа восстановить последовательность мутационных событий, сформировавших гаплотип, и проследить происхождение и гео-рафическое распространение каждой отдельной линии. В настоящее время филогео-рафия мтДНК и Y хромосомы человека хорошо изучена, что позволяет каждой вновь юследованной популяции дать подробную молекулярно-генетическую характеристи-у в контексте других народов мира. Это обусловило большой интерес к анализу не->екомбинирующих полиморфных маркеров во многих лабораториях мира.

Предшествующие работы, посвященные анализу мтДНК в европейских попу-[яциях России, базировались главным образом на ПДРФ анализе контрольного ре-иона. Разрешающая способность этого метода ограничена, поскольку в сферу анали-а попадает лишь незначительная часть последовательности исследуемого фрагмента. Три этом идентифицируется только часть полиморфных сайтов ДНК, и далеко не все аплотипы, представленные на отрезке исследуемого фрагмента могут быть выявле-1Ы. Кроме того, разные исследователи часто используют разный набор ферментов ре-;трикции и накопленные данные, как правило, не поддаются сравнительному анализу.

Значительно более информативен и универсален подход, основанный на анали-;е всей нуклеотидной последовательности исследуемого фрагмента ДНК. Анализ изменчивости нуклеотидной последовательности гипервариабельного сегмента I (ГВС1) лтДНК в настоящее время стал одним из стандартных подходов в популяционных и (волюционных исследованиях. Данные о популяционном разнообразии мтДНК евро-1ейской части России должны стать важным вкладом в сумму знаний о молекулярно-^енетическом разнообразии человека

На территории бассейна верхней и средней Волги в течение длительного времени совместно проживают народы, языки которых принадлежат трем языковым группам: славянской, финно-угорской и тюркской. Эти языковые группы относятся к зазличным языковым семьям - индоевропейской, уральской и алтайской соответст-зенно. С этой точки зрения эта территория является одной из уникальных в ойкуме-ie. Генетический профиль данной территории сложился в результате взаимного влияния представителей этих трех языковых групп. Сравнительный анализ генетических и лингвистических характеристик народов давно является предметом активных ^следований и остается одной из интереснейших проблем популяционной генетики кловека. Генетические отношения этнических групп Поволжья окончательно не оха-эактеризованы. Молекулярно-генетическая характеристика населения бассейна верх-1ей и средней Волги, может прояснить происхождение этих групп и степень их родства.

В настоящее время все более широкое распространение получает использова-ше мтДНК в целях индивидуализации личности. Биологические особенности этой молекулы, обусловившие использование мтДНК в популяционной и эволюционной ^енетике для решения фундаментальных проблем являются также причиной высокой нформативности мтДНК в криминалистических исследованиях. Фундаментальные и [рикладные исследования изменчивости мтДНК взаимодополняют друг друга. В ре-ультате криминалистических исследований накапливаются большие массивы дан-[ых, являющихся ценным материалом для филогенетического анализа митохондри-льных линий. С другой стороны информация, накопленная в результате эволюцион-[ых исследований, позволяет развивать новые подходы анализа молекулярных данных в криминалистике. Необходимым условием корректного использования мтДНК [ля ДНК-индивидуализации является накопление референтных баз данных, которые [ля территории России пока отсутствуют. Анализ изменчивости мтДНК в популяциях европейской части России является важной основой для использования полиморфиз-ia мтДНК в судебно-экспертных исследованиях.

Цели и задачи исследования. Цель работы - охарактеризовать разнообразие аплотипов мтДНК населения Европейской части России на примере трех этнических рупп, принадлежащих разным языковым семьям: русских (индоевропейская семья), 1ари (уральская семья) и татар (алтайская семья).

В связи с поставленной целью были сформулированы следующие задачи:

1. Определить нуклеотидную последовательность гипервариабельного сегмента в репрезентативных выборках русских, мари и татар.

2. Рассчитать показатели генетического разнообразия в популяциях русских, iapи и татар на основании нукпеотидных последовательностей ГВС1.

3. Провести филогенетический анализ выявленных гаплотипов и оценить генетическое положение русских, мари и татар среди других народов Европы.

4. Охарактеризовать разнообразие мтДНК в случайной выборке российских гра-кдан и сравнить с таковым в этнически однородных выборках русских, мари и татар.

5. Оценить дискриминирующий потенциал мтДНК для целей ДНК-щентификации на территории России.

Научная новизна работы. В работе впервые в репрезентативных выборках )пределены нуклеотидные последовательности гипервариабельного сегмента I контрольного региона мтДНК у русских (103 индивида), мари (85 индивидов) и татар (80 шдивидов). Впервые описаны филогенетические отношения гаплотипов в каждой из сследованных популяций и оценена степень родства русских, мари и татар по мате-(ИНСКОЙ линии.

Научно-практическое значение. Молекулярно-генетическая характеристика юпуляций русских, мари и татар по данным о полиморфизме ГВС1 мтДНК является :ажным вкладом в сумму знаний об особенностях генофондов населения Европы и лужит важным фактическим дополнением к информации, накапливаемой в рамках !Ыполнения Международной программы "Геном человека". Полученные результаты смеют междисциплинарное значение и могут быть использованы как в генетике че-ювека, так и в антропологии, археологии и этнографии. Проведенный в работе анализ юлиморфизма мтДНК в выборке российских граждан может служить основой созда-шя референтной базы данных для проведения криминалистических исследований на юнове типирования мтДНК на территории России. Результаты работы нашли приме-[ение при проведении идентификационных исследований по установлению личности кертв террористических актов в Москве в 1999 году и военнослужащих, погибших в ;оде боевых действий в Чеченской республике в период 1994-1996 г.

Апробация работы. Основные результаты работы докладывались на следующих научных конференциях и семинарах: . Human Genome Meeting 1999. Brisbane, Australia, March 27-30. 1. Human Diversity in Europe and Beyond: Retrospect and Prospect. Cambridge: The Third Hernial Euroconference of the European human Genome Diversity Project", 9-13 Septem->er 1999. II съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, Санкт-Петербург, 1-5 эевраля 2000. Human Genome Meeting 2000. Vancouver, Canada, April 9-12, 2000.

J. Human Origins&Disease. CSHL Meeting. Cold Spring Harbor, New York. Octoer 25-29, 2000 i. II (IV) съезд Российского общества медицинских генетиков. Курск: 17-19 мая 2000. V Всероссийский съезд судебных медиков. Астрахань. 2000 Отчетная конференция по ГНТП «Геном человека».Черноголовка. Семинар «Общая и молекулярная генетика» в ИОГене. 14 июня 2001г. 0. Научный семинар Российского центра судебно-медицинской экспертизы Мин-драва РФ. Июнь 2002.

Заключение Диссертация по теме "Генетика", Орехов, Владимир Александрович

выводы.

В выборках из 103 русских, 85 мари и 80 татар были определены нуклеотидные последовательности ГВС1 мтДНК (позиции 16024-16400 для татар и мари, 1602416083 для русских).

На основе полученных последовательностей ГВС1 мтДНК были рассчитаны показатели генетического разнообразия в популяциях русских, мари и татар. Выборка русских имеет средние для европейских популяций значения генетического разнообразия (Dj = 4.27; Н = 0.965). Те же показатели для мари и татар оказались не типичными для Европы. Татары характеризуются максимальными в Европе показателями разнообразия (D; = 5.41; Н = 0.986), в то время как у мари выявлен один из минимальных уровней генетического разнообразия (Dj = 3.84; Н = 0.930).

Проведен детальный филогенетический анализ выявленных гаплотипов Большая часть гаплотипов русских, мари и татар имеет европейское происхождение и относятся к европейским гаплогруппам (96,2 % у русских, 95,3% у мари и 77,8% у татар), что свидетельствует о преимущественно европейском происхождении исследованных народов, хотя во всех трех популяциях были выявлены также митотипы монголоидного происхождения (2,9% у русских, 4,7% у мари и 13,8% у татар). У русских, татар и мари выявлена существенная степень родства по материнской линии. От 64% до 34% индивидов в каждой выборке являются носителями гаплотипов, выявленных в одной из двух других популяций. Родство отражает общность европейского происхождения русских, мари и татар.

Проведен анализ нуклеотидных последовательностей ГВС1 и ГВСП в случайной выборке российских граждан. Показано, что случайная выборка существенно отличается от этнически однородных популяционных выборок русских, мари и татар как повышенным уровнем генетического разнообразия (Н=0.980), так и составом митохондриальных линий. Значение генетического разнообразия, полученное для случайной выборки российских граждан является одним из самых высоких в Европе.

Рассчитаны частоты основных гаплогрупп в случайной выборке российских граждан. Показано, что частоты европейских гаплогрупп в данной выборке достоверно не отличаются от частот в выборках этнических русских и других народов Восточной Европы. В то же время, спектр выявленных азиатских гаплогрупп шире, чем в любой из исследованных этнически однородных выборок (кроме галогрупп С и Z, встретившихся у русских, в случайной выборке были выявлены азиатские гаплогруппы A, D, F, G и Y). Анализ случайной выборки может являться основой для создания референтной базы данных для проведения экспертно-криминалистических исследований на основе типирования мтДНК на территории России.

Определены значения и проведена сравнительная оценка дискриминирующих характеристик для локусов ГВС1 и ГВСП раздельно и в составе сцепленного сегмента ГВС1+ГВСП. Установлено, что наименьшим дискриминирующим потенциалом обладает система типирования на основе ГВСП (mw=0,098); наибольшая информативность достигается при анализе ГВС1 (mw=0,02) и совместном анализе ГВС1 и ГВСП (mw=0,007). Полученные данные позволяют определить наиболее рациональный алгоритм исследования при судебно-экспертном анализе мтДНК.

Благодарности.

Я благодарен своим руководителям Николаю Казимировичу Янковскому и авлу Леонидовичу Иванову за руководство и проявленное терпение во время работы ) мной. Я также благодарен Эльзе Камилевне Хуснутдиновой, Евгению Константи-эвичу Гинтеру и Виктору Алексеевичу Спицину за предоставленные коллекции об-13Ц0В и помощь в процессе работы. Я благодарю Рихарда Виллемса и коллектив его Моратории за возможность выполнить часть работы в Эстонском Биоцентре и за эмощь в теоретическом освоении темы моей диссертации. Я выражаю признатель-ость Жанне Кожекбаевой за помощь в экспериментальной работе. Я также благодари коллективу лаборатории анализа генома Института Общей Генетики РАН за ат-осферу творческого поиска, в которой я находился во время выполнения этой рабо-л.

Библиография Диссертация по биологии, кандидата биологических наук, Орехов, Владимир Александрович, Москва

1. Алексеева Т.И. Этногенез восточных славян // М. 1973.

2. Балановская Е.В., Нурбаев С.Д., Компьютерная геногеография. IV. Популяции в пространстве главных компонент. // Генетика. 1997. Т.ЗЗ. № 12, С.1693-1710.

3. Балановский О.П., Нурбаев С.Д., Кравчук О.И., Макаров С.В., Спицын В.А., Гинтер Е.К. "Синтетические" карты генофонда мари (по данным об иммунобио-химическом полиморфизме) // Генетика. 1999. Т.35. № 1, С.74-827.

4. Голубенко М.В., Пузырев В.П., Салюков В.Б., Кучер А.Н., Санчат Н.О. Рестрик-ционный полиморфизм главной некодирующей области мтДНК среди коренного населения республики Тува // Генетика. 1999. Т. 36. № 3. С. 371-376.

5. Голубенко М.В., Пузырев В.П., Салюков В.Б., Кучер А.Н., Санчат Н.О. Анализ распространенности "монголоидных" гаплогрупп митохондриальной ДНК среди коренного населения Тувы // Генетика. 2001. Т. 37. № 5. С. 371-376.

6. Деренко М.В., Дамбуева И.К., Малярчук Б.А., Доржу Ц.М., Захаров И.А. Структура и разнообразие митохондриального генофонда коренного населения Тувы и Бурятии по данным рестрикционного полиморфизма // Генетика. 1999. Т. 35. № 12. С. 1706-1712.

7. Деренко М.В., Малярчук Б.А. Сравнительный анализ ПДРФ митохондриальной ДНК в популяциях восточных славян России // Генетика. 1996. Т. 32. № 6. С. 815821.

8. Деренко М.В., Шилдс Дж.Ф. Изменчивость митохондриальной ДНК в трех группах коренного населения северной Азии // Генетика. 1998. Т. 34. № 5. С. 676-681.

9. Деренко М.В., Шилдс Дж.Ф. Разнообразие нуклеотидных последовательностей митохондриальной ДНК в трех группах коренного населения северной Азии // Молекулярная биология. 1997. Т. 31. № 5. С. 784-789.

10. Иванова А.В. Полиморфизм митохондриальной ДНК в популяциях коренных жителей Чукотки: автореф. дис. . канд. биол. наук. Новосибирск: ИЦиГ СО РАН, 1993. 16 с.

11. Лемза С.В., Соколова О.В. Рестрикционный полиморфизм митохондриальной ДНК среди русского населения //Генетика. 1992. Т. 28, N. 5. С. 136-140

12. Малярчук Б.А. Митохондриальный портрет восточных славян // Генетика. 1997. Т. 33, N. 1.С. 101-105

13. Малярчук Б.А., Деренко М.В., Балмышева Н.П. и др. Рестрикционный полиморфизм главной некодирующей области митохондриальной ДНК у коренного и пришлого населения Северо-Восточной Азии // Генетика. 1994. Т30. №4. С 542545.

14. Малярчук Б.А., Деренко М.В., Соловенчук Л.Л. Рестрикционные типы главной некодирующей области митохондриальной ДНК у коренного и пришлого населения Северо-Восточной Азии // Генетика. 1994. Т30. №6. С 851-857.

15. Малярчук Б.А., Деренко М.В., Соловенчук Л.Л. Типы контрольного региона митохондриальной ДНК у восточных славян//Генетика. 1995. Т. 31, N. 6. С. 846-851.

16. Петрищев В.Н., Кутуева А.Б. Полиморфизм митохондриальной днк в русском населении России // Генетика. 1993. Т. 29, N. 8. С. 1382-1390

17. Петрищев В.Н., Кутуева А.Б., Рычков Ю.Г. Делеционно-инсерционный полиморфизм в V-области мтДНК в десяти монголоидных популяциях Сибири. Частота делеции коррелирует с географическими координатами местности // Генетика. 1993. Т. 29. N. 7. С. 1196-1203.

18. Рычков С.Ю., Наумова О.Ю., Фалунин Д.А. и др. Генофонд населения СевероВосточной Евразии в свете данных о полиморфизме митохондриальной ДНК. I.

19. Новые данные о полиморфизме сайтов рестрикции D-петли мтДНК в коренном населении Кавказа и Сибири // Генетика. 1995. Т. 31. N. 1. С. 118-127.

20. Хуснутдинова Э.К., Викторова Т.В., Фатхлисламова Р.И. Рестрикционный полиморфизм главной некодирующей области митохондриальной ДНК в популяциях Волго-Уральскогорегиона//Генетика. 1999. №5, С.695-702.

21. Хуснутдинова ЭХ, Фатхлисламова Р.И., Хидиятова И.М., Викторова Т.В., Грин-чук О.В. Рестрикционно-делеционный полиморфизм V-области митохондриальной ДНК в популяциях народов Волго-Уральского региона // Генетика, 1997, Т. 33, №7, с. 996-1000.

22. Хуснутдинова Э.К.,Викторова Т.В., Фатхлисламова Р.И., Галеева А.Р. Оценка относительного вклада европеоидного и монголоидного компонентов в формирование народов Волго-Уральского региона по данным полиморфизма ДНК // Генетика. 1999. №8, С.1132-1137.

23. Ammerman AJ, Cavalli-Sforza LL (1984) The Neolithic transition and the genetics of populations in Europe. Princeton University Press, Princeton

24. Anderson S, Banlcier AT, Barrell BG, de Bruijn MH, Coulson AR, Drouin J, Eperon 1С, et al (1981) Sequence and organization of the human mitochondrial genome. Nature 290:457-65

25. Anslinger K, Weichhold G, Keil W, Bayer B, Eisenmenger W (2001) Identification of the skeletal remains of Martin Bormann by mtDNA analysis. Int J Legal Med 114:1946

26. Awadalla P, Eyre-Walker A, Smith JM (1999) Linkage disequilibrium and recombination in hominid mitochondrial DNA. Science 286:2524-5

27. Bandelt HJ (1994) Phylogenetic networks. Verh. Naturwiss. Ver. Hamburg 34:51-71

28. Bandelt HJ, Forster P, Sykes ВС, Richards MB (1995) Mitochondrial portraits of human populations using median networks. Genetics 141:743-53

29. Bandelt HJ, Lahermo P, Richards M, Macaulay V (2001) Detecting errors in mtDNA data by phylogenetic analysis. Int J Legal Med 115:64-9.

30. Bar W, Brinkmann B, Budowle B, Cairacedo A, Gill P, Holland M, Lincoln PJ, et al (2000) DNA Commission of the International Society for Forensic Genetics: guidelines for mitochondrial DNA typing. Int J Legal Med 113:193-6

31. Barbujani G, Bertorelle G, Chiklii L (1998) Evidence for Paleolithic and Neolithic gene flow in Europe. Am J Hum Genet 62:488-92

32. Bendall KE, Macaulay VA, Sykes ВС (1997) Variable levels of a heteroplasmic point mutation in individual hair roots. Am J Hum Genet 61:1303-8.

33. Bertranpetit J, Sala J, Calafell F, Underhill PA, Moral P, Comas D (1995) Human mitochondrial DNA variation and the origin of Basques. Ann Hum Genet 59:63-81

34. Boles TC, Snow CC, Stover E (1995) Forensic DNA testing on skeletal remains from mass graves: a pilot project in Guatemala. J Forensic Sci 40:349-55.

35. Brown WM (1980) Polymorphism in mitochondrial DNA of humans as revealed by restriction endonuclease analysis. Proc Natl Acad Sci U S A 77:3605-9

36. Brown WM, George M, Jr., Wilson AC (1979) Rapid evolution of animal mitochondrial DNA. Proc Natl Acad Sci U S A 76:1967-71

37. Cali F, Le Roux MG, D'Anna R, Flugy A, De Leo G, Chiavetta V, Ayala GF, et al (2001) MtDNA control region and RFLP data for Sicily and France. Int J Legal Med 114:229-31

38. Cann RL, Stoneking M, Wilson AC (1987) Mitochondrial DNA and human evolution. Nature 325:31-6

39. Carracedo A, W Ba, Lincoln P, Mayr W, Morling N, Olaisen B, Schneider P, et al (2000) DNA commission of the international society for forensic genetics: guidelines for mitochondrial DNA typing. Forensic Sci Int 110:79-85.

40. Cavalli-Sforza LL, Minch E (1997) Paleolithic and Neolithic lineages in the European mitochondrial gene pool. Am J Hum Genet 61:247-54

41. Chee M, Yang R, Hubbell E, Berno A, Huang XC, Stem D, Winkler J, et al (1996) Accessing genetic information with high-density DNA arrays. Science 274:610-4.

42. Chen YS, Olckers A, Schurr TG, Kogelnik AM, Huoponen K, Wallace DC (2000) mtDNA variation in the South African Kung and Khwe-and their genetic relationships to other African populations. Am J Hum Genet 66:1362-83

43. Chen YS, Torroni A, Excoffier L, Santachiara-Benerecetti AS, Wallace DC (1995) Analysis of mtDNA variation in African populations reveals the most ancient of all human continent-specific haplogroups. Am J Hum Genet 57:133-49

44. Cummins JM (2000) Fertilization and elimination of the paternal mitochondrial genome. Hum Reprod 15 Suppl 2:92-101.

45. Denaro M, Blanc H, Johnson MJ, Chen KH, Wilmsen E, Cavalli-Sforza LL, Wallace DC (1981) Ethnic variation in Hpa 1 endonuclease cleavage patterns of human mitochondrial DNA. Proc Natl Acad Sci U S A 78:5768-72

46. Derbeneva OA, Starikovskaya EB, Wallace DC, Sukernik RI (2002) Traces of Early Eurasians in the Mansi of Northwest Siberia Revealed by Mitochondrial DNA Analysis. Am J Hum Genet 70:4

47. Derenko MV, Malyarchuk BA, Dambueva IK, Shaikhaev GO, Dorzhu CM, Nimaev DD, Zakharov IA (2000) Mitochondrial DNA variation in two South Siberian Aboriginal populations: implications for the genetic history of North Asia. Hum Biol 72:94573.

48. Elson JL, Andrews RM, Chinneiy PF, Lightowlers RN, Turnbull DM, Howell N (2001) Analysis of European mtDNAs for recombination. Am J Hum Genet 68:145153.

49. Erdogan F, Kirchner R, Mann W, Ropers HH, Nuber UA (2001) Detection of mitochondrial single nucleotide polymorphisms using a primer elongation reaction on oligonucleotide microarrays. Nucleic Acids Res 29:E36.

50. Foley R (1998) The context of human genetic evolution. Genome Res 8:339-47

51. Forster P, Harding R, Torroni A, Bandelt H-J (1996) Origin and evolution of Native American mtDNA variation: a reappraisal. Am J Hum Genet 59:935-45

52. Fridez F, Rochat S, Coquoz R (1999) Individual identification of cats and dogs using mitochondrial DNA tandem repeats? Sci Justice 39:167-71.

53. Giles RE, Blanc H, Cann HM, Wallace DC (1980) Maternal inheritance of human mitochondrial DNA. Proc Natl Acad Sci U S A 77:6715-9

54. Gill P, Ivanov PL, Kimpton C, Piercy R, Benson N, Tully G, Evett I, et al (1994) Identification of the remains of the Romanov family by DNA analysis. Nat Genet

55. ШйИе$.С, Issel-Tarver L, King MC (1992) Identifying individuals by sequencing mitochondrial DNA from teeth. Nat Genet 2:135-8.

56. Gyllensten U, Wharton D, Josefsson A, Wilson AC (1991) Paternal inheritance of mitochondrial DNA in mice. Nature 352:255-7

57. Hagelberg E, Goldman N, Lio P, Whelan S, Schiefenhovel W, Clegg JB, Bowden DK (1999) Evidence for mitochondrial DNA recombination in a human population of island Melanesia. Proc R Soc bond В Biol Sci 266:485-92

58. Handt O, Meyer S, von Haeseler A (1998) Compilation of human mtDNA control region sequences. Nucleic Acids Res 26:126-9

59. Handt O, Richards M, Trommsdorff M, Kilger C, Simanainen J, Georgiev O, Bauer K, et al (1994) Molecular genetic analyses of the Tyrolean Ice Man. Science 264:1775-8

60. Harihara S, Saitou N, Hirai M, Gojobori T, Park KS, Misawa S, Ellepola SB, et al (1988) Mitochondrial DNA polymorphism among five Asian populations. Am J Hum Genet 43:134-43

61. Hedges SB, Kumar S, Tamura K, Stoneking M (1992) Human origins and analysis of mitochondrial DNA sequences. Science 255:737-9

62. Helgason A, Sigurdadottir S, Gulcher J, Ward R, Stefanson К (2000) mtDNA and the origins of the Icelanders: deciphering signals of recent population history. Am J Hum Genet 66

63. Holland MM, Fisher DL, Mitchell LG, Rodriquez WC, Canik JJ, Merril CR, Weedn VW (1993) Mitochondrial DNA sequence analysis of human skeletal remains: identification of remains from the Vietnam War. J Forensic Sci 38:542-53.

64. Hopgood R, Sullivan KM, Gill P (1992) Strategies for automated sequencing of human mitochondrial DNA directly from PCR products. Biotechniques 13:82-92.

65. Hopwood AJ, Mannucci A, Sullivan KM (1996) DNA typing from human faeces. Int J Legal Med 108:237-43

66. Horai S, Gojobori T, Matsunaga E (1984) Mitochondrial DNA polymorphism in Japanese. I. Analysis with restriction enzymes of six base pair recognition. Hum Genet 68:324-32

67. Horai S, Hayasaka K, Kondo R, Tsugane K, Takahata N (1995) Recent African origin of modern humans revealed by complete sequences of hominoid mitochondrial DNAs. Proc Natl Acad Sci U S A 92:532-6

68. Howell N, Kubacka I, Mackey DA (1996) How rapidly does the human mitochondrial genome evolve? Am J Hum Genet 59:501-9

69. Ivanov PL, Wadhams MJ, Roby RK, Holland MM, Weedn VW, Parsons TJ (1996) Mitochondrial DNA sequence heteroplasmy in the Grand Duke of Russia Georgij Romanov establishes the authenticity of the remains of Tsar Nicholas II. Nat Genet 12:417-20.

70. Johnson MJ, Wallace DC, Ferris SD, Rattazzi MC, Cavalli-Sforza LL (1983) Radiation of human mitochondria DNA types analyzed by restriction endonuclease cleavage patterns. J Mol Evol 19:255-71

71. Kaneda H, Hayashi J, Takahama S, Taya C, Lindahl KF, Yonekawa H (1995) Elimination of paternal mitochondrial DNA in intraspecific crosses during early mouse em-bryogenesis. Proc Natl Acad Sci U S A 92:4542-6

72. Kivisild T, Villems R (2000) Questioning evidence for recombination in human mitochondrial DNA. Science 288:1931

73. Kogelnik A, Lott M, Brown M, Navathe S, DC W (1997) MITOMAP: an update on the status of the human mitochondrial genome database. Nucleic Acids Res 25:196-9

74. Krings M, Stone A, Schmitz RW, Krainitzki H, Stoneking M, Paabo S (1997) Neander-tal DNA sequences and the origin of modern humans. Cell 90:19-30

75. Kurosaki K, Matsushita T, Ueda S (1993) Individual DNA identification from ancient human remains. Am J Hum Genet 53:638-43.

76. Lagerstrom-Fermer M, Olsson С, Forsgren L, Syvanen AC (2001) Heteroplasray of the human mtDNA control region remains constant during life. Am J Hum Genet 68:1299301.

77. Lareu MV SA, Barros F, Rodriguez MS, Carracedo A (1998) A strategy for mt-DNA analysis of hair shafts in practical casework: RE-SSCP. In: Olaisen В BB, Lincoln PJ (ed) Progress in forensic genetics 7. Vol. 7. Elsevier Science, Amsterdam, pp 68-70

78. Linch С A, Whiting DA, Holland MM (2001) Human hair histogenesis for the mitochondrial DNA forensic scientist. J Forensic Sci 46:844-53.

79. Macaulay V, Richards M, Sykes В (1999a) Mitochondrial DNA recombination no need to panic. Proc R Soc Lond В Biol Sci 266:2037-2039

80. Macaulay VA, Richards MB, Hickey E, Vega E, Cruciani F, Guida V, Scozzari R, et al (1999b) The emerging tree of west Eurasian mtDNAs: a synthesis of control-region sequences and RFLPs. Am J Hum Genet 64:232-49

81. Maddison D (1991) African origin of human mitochondrial DNA reexamined. Syst Zool 40:355-363

82. Mateu E, Comas D, Calafell F, Perez-Lezaun A, Abade A, Bertranpetit J (1997) A tale of two islands: population history and mitochondrial DNA sequence variation of Bioko and Sao Tome, Gulf of Guinea. Ann Hum Genet 61:507-18

83. Meyer S, Weiss G„ A. H (1999) Pattern of Nucleotide Substitution and Rate Heterogeneity in the Hypervariable Regions I and II of Human mtDNA. Genetics 152:11031110

84. Michaels GS, Hauswirth WW, Laipis PJ (1982) Mitochondrial DNA copy number in bovine oocytes and somatic cells. Dev Biol 94:246-51

85. Miller KW, Dawson JL, Hagelberg E (1996) A concordance of nucleotide substitutions in the first and second hypervariable segments of the human mtDNA control region. Int J Legal Med 109:107-13

86. Morley JM, Bark JE, Evans СЕ, Репу JG, Hewitt С A, Tully G (1999) Validation of mitochondrial DNA minisequencing for forensic casework. Int J Legal Med 112:241-8

87. Nei M (1987) Molecular Evolutionary Genetics. Columbia University Press, New York, pp 145-63

88. Parsons TJ, Coble MD (2001) Increasing the forensic discrimination of mitochondrial DNA testing through analysis of the entire mitochondrial DNA genome. Croat Med J 42:304-9.

89. Parsons TJ, Muniec DS, Sullivan K, Woodyatt N, Alliston-Greiner R, Wilson MR, Berry DL, et al (1997) A high observed substitution rate in the human mitochondrial DNA control region. Nat Genet 15:363-8

90. Penny D, Steel M, Waddell PJ, Hendy MD (.1995) Improved analyses of human mtDNA sequences support a recent African origin for Homo sapiens. Mol Biol Evol 12:863-82

91. Piercy R, Sullivan KM, Benson N, Gill P (1993) The application of mitochondrial DNA typing to the study of white Caucasian genetic identification. Int J Legal Med 106:85-90

92. Richards M, Corte-Real H, Forster P, Macaulay V, Wilkinson-Herbots H, Demaine A, Papiha S, et al (1996) Paleolithic and neolithic lineages in the European mitochondrial gene pool. Am J Hum Genet 59:185-203

93. Richards M, Macaulay V, Hickey E, Vega E, Sykes B, Guida V, Rengo C, et al2000) Tracing European founder lineages in the Near Eastern mtDNA pool. Am J Hum Genet 67:1251-76.

94. Richards M, Macaulay V, Sykes B, Pettit P, Forster P, Hedges R, Bandelt H-J (1997) Reply to Cavalli-Sforza and Minch. Am J Hum Genet 61:251-254

95. Richards M, Sykes В (1998) Reply to Barbujani et al. Am J Hum Genet 62:491

96. Richards MB, Macaulay VA, Bandelt H-J, Sykes ВС (1998) Phylogeography of mitochondrial DNA in western Europe. Ann Hum Genet 62:241-60

97. Ruiz-Pesini Е, Lapena AC, Diez-Sanchez С, Perez-Martos A, Montoya J, Alvarez E, Diaz M, et al (2000) Human mtDNA haplogroups associated with high or reduced spermatozoa motility. Am J Hum Genet 67:682-96.

98. Salas A, Lareu MV, Carracedo A (2001a) Heteroplasmy in mtDNA and the weight of evidence in forensic mtDNA analysis: a case report. Int J Legal Med 114:186-90.

99. Salas A, Rasmussen EM, Lareu MV, Morling N, Carracedo A (2001b) Fluorescent SSCP of overlapping fragments (FSSCP-OF): a highly sensitive method for the screening of mitochondrial DNA variation. Forensic Sci Int 124:97-103.

100. Savolainen P, Arvestad L, Lundeberg J (2000) A novel method for forensic DNA investigations: repeat-type sequence analysis of tandemly repeated mtDNA in domestic dogs. J Forensic Sci 45:990-9.

101. Schurr TG, Sukernik RI, Starikovskaya YB, Wallace DC (1999) Mitochondrial DNA variation in Koryaks and Itel'men: population replacement in the Okhotsk Sea-Bering Sea region during the Neolithic. Am J Phys Anthropol 108:1-39

102. Scozzari R, Torroni A, Semino O, Sirugo G, Brega A, Santachiara-Benerecetti AS (1988) Genetic studies on the Senegal population. I. Mitochondrial DNA polymorphisms. Am J Hum Genet 43:534-44

103. Sigurgardottir S, Helgason A, Gulcher JR, Stefansson K, Donnelly P (2000) The mutation rate in the human mtDNA control region. Am J Hum Genet 66:1599-609.

104. Soodyall H, Jenkins T, Mukherjee A, du Toit E, Roberts DF, Stoneking M (1997) The founding mitochondrial DNA lineages of Tristan da Cunha Islanders. Am J Phys Anthropol 104:157-66

105. Starikovskaya YB, Sukernik RI, Schurr TG, Kogelnik AM, Wallace DC (1998) mtDNA diversity in Chukchi and Siberian Eskimos: implications for the genetic history of Ancient Beringia and the peopling of the New World. Am J Hum Genet 63:1473-91

106. Steighner RJ, Tully LA, Karjala JD, Coble MD, Holland MM (1999) Comparative identity and homogeneity testing of the mtDNA HV1 region using denaturing gradient gel electrophoresis. J Forensic Sci 44:1186-98.

107. Stewart JE, Fisher CL, Aagaard PJ, Wilson MR, Isenberg AR, Polanskey D, Pokorak E, et al (2001) Length variation in HV2 of the human mitochondrial DNA control region. J Forensic Sci 46:862-70.

108. Stone AC, Stoneking M (1999) Analysis of ancient DNA from a prehistoric Amerindian cemetery. Philos Trans R Soc Lond В Biol Sci 354:153-9

109. Stoneking M, Hedgecock D, Higuchi RG, Vigilant L, Erlich HA (1991) Population variation of human mtDNA control region sequences detected by enzymatic amplification and sequence-specific oligonucleotide probes. Am J Hum Genet 48:370-82

110. Szibor R, Michael M, Plate I, Krause D (2000) Efficiency of forensic mtDNA analysis. Case examples demonstrating the identification of traces. Forensic Sci Int 113:718.

111. Tanaka M, Gong JS, Zhang J, Yoneda M, Yagi К (1998) Mitochondrial genotype associated with longevity letter. [see comments]. Lancet 351:185-6

112. Templeton AR (1992) Human origins and analysis of mitochondrial DNA sequences. Science 255:737

113. Torroni A, Bandelt HJ, D'Urbano L, Lahermo P, Moral P, Sellitto D, Rengo C, et al (1998) mtDNA analysis reveals a major late Paleolithic population expansion from southwestern to northeastern Europe. Am J Hum Genet 62:1137-52

114. Torroni A, Bandelt HJ, Macaulay V, Richards M, Cruciani F, Rengo C, Martinez-Cabrera V, et al (2001) A signal, from human mtDNA, of postglacial recolonization in Europe. Am J Hum Genet 69:844-52.

115. Torroni A, Huoponen K, Francalacci P, Petrozzi M, Morelli L, Scozzari R, Obinu D, et al (1996) Classification of European mtDNAs from an analysis of three European populations. Genetics 144:1835-50

116. Torroni A, Sukernik RI, Schurr TG, Starikorskaya YB, Cabell MF, Crawford MH, Comuzzie AG, et al (1993) mtDNA variation of aboriginal Siberians reveals distinct genetic affinities with Native Americans. Am J Hum Genet 53:591-608

117. Tully G, Sullivan KM, Nixon P, Stones RE, Gill P (1996) Rapid detection of mitochondrial sequence polymorphisms using multiplex solid-phase fluorescent minise-quencing. Genomics 34:107-13.

118. Vernesi C, Di Benedetto G, Caramelli D, Secchieri E, Simoni L, Katti E, Malaspina P, et al (2001) Genetic characterization of the body attributed to the evangelist Luke. Proc Natl Acad Sci U S A 98:13460-3.

119. Vigilant L, Pennington R, Harpending H, Kocher TD, Wilson AC (1989) Mitochondrial DNA sequences in single hairs from a southern African population. Proc Natl Acad Sci U S A 86:9350-4

120. Wallace DC, Brown MD, Lott MT (1999) Mitochondrial DNA variation in human evolution and disease. Gene 238:211-30

121. Watkins WS, Bamshad M, Dixon ME, Bhaskara Rao B, Naidu JM, Reddy PG, Prasad BV, et al (1999) Multiple origins of the mtDNA 9-bp deletion in populations of South India. Am J Phys Anthropol 109:147-58

122. Watson E, Forster P, Richards M, Bandelt HJ (1997) Mitochondrial footprints of human expansions in Africa. Am J Hum Genet 61:691-704

123. Whittam TS, Clark AG, Stoneking M, Cann RL, Wilson AC (1986) Allelic variation in human mitochondrial genes based on patterns of restriction site polymorphism. Proc Natl Acad Sci U S A 83:9611-5

124. Wilkinson-Herbots HM, Richards MB, Forster P, Sykes ВС (1996) Site 73 in hypervariable region II of the human mitochondrial genome and the origin of European populations. Ann Hum Genet 60:499-508

125. Wilson A, Cann R, Carr S, George M, Gyllensten U, Helm-Bychowski K, Higuchi R, et al (1985) Mitochondrial DNA and two perspectives on evolutionary genetics. Biological Journal of the Linnean Society 26:375-400

126. Wilson MR HM, Stoneking M, DiZinno JA, Budowle В (1993) Guidelines for the use of mitochondrial DNA sequencing in forensic science. Crime Lab Digest 20:68-77

127. Wilson MR, Polanskey D, Butler J, DiZinno JA, Replogle J, Budowle В (1995) Extraction, PCR amplification and sequencing of mitochondrial DNA from human hair shafts. Biotechniques 18:662-9.

128. РОССИЙСКАЯ ГОСУДАРСТВЕННА^ БИБЛИОТЕКА1. Z-<oOB \ - с^-Ъ