Бесплатный автореферат и диссертация по биологии на тему

Характеристика бактерий, ассоциированных с морской травой Zostera marina, их биология и экология

ВАК РФ 03.00.07, Микробиология

Содержание диссертации, кандидата биологических наук, Куриленко, Валерия Валерьевна

ВВЕДЕНИЕ

Глава 1. Литературный обзор

1.1. Характеристика структуры морских сообществ макрофитов

1.1.1. Особенности макрофитов семейства взморниковые (2о$1егасеае)

1.1.2. Химический состав морских трав семейства 1о8Хетасеае

1.2. Экологические особенности взаимодействий эпифитных сообществ и макрофитов

1.2.1. Степень эвтрофикации сообществ морских трав

1.2.2. Симбиотрофия: транспорт углерода, азота и фосфора в трофических цепях

1.2.3. Таксономическое разнообразие эпифитных бактерий морских трав

1.3. Экологические адаптации живых систем в ответ на загрязнение морской среды тяжелыми металлами

1.3.1. Пути проникновения ионов тяжелых металлов в клетку

1.3.2. Механизмы детоксикации ионов тяжелых металлов ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ

Глава 2. Объекты и методы исследования

2.1. Объекты исследования.

2.2. Условия выделения. Среды культивирования и консервации

2.3. Методы изучения биологических свойств бактерий

2.4. Изучение действия кадмия на бактерий

2.5. Определение фосфолипидного состава

Введение Диссертация по биологии, на тему "Характеристика бактерий, ассоциированных с морской травой Zostera marina, их биология и экология"

Актуальность темы Структура и функционирование морских сообществ, эдификатором в которых являются погруженные в воду многолетние травы семейства Zosteraceae, во многом определяются сложными трофическими взаимосвязями их членов. Продуктивность и биомасса трав, многие виды которых применяются в пищевых целях или используются в качестве ценного сырья для получения биологически активных соединений (Лоенко и др., 1997), регулируются различными биотическими и абиотическими факторами (Kirchman et al., 1984). Погруженные в воду травы являются субстратами для заселения эпифитами, которые представлены микроводорослями, бактериями, микроскопическими грибами, простейшими. Увеличение биомассы эпифитов приводит к уменьшению количества света, попадающего на поверхность листовых пластин и нарушению обмена углерода, что в свою очередь снижает продуктивность сообщества (Neckles et al., 1994; Харламенко, 1985). Тесная ассоциация бактерий-эпифитов с Zostera marina L. приводит к симбиотрофным связям между ними, когда микроорганизмы получают органический углерод, соединения фосфора и азота из листьев травы (Kirchman et al., 1984; Penhaie, Thayer, 1980). В то же время исследования, касающиеся изучения таксономического разнообразия бактерий-эпифитов Zostera marina, практически отсутствуют, за исключением сообщений о том, что с поверхности зостеры были выделены бактерии родов Flavobacterium, Pseudomonas и Vibrio (Harrison, 1982; Shien et al., 1988). В связи с этим изучение биологии и экологии бактерий-эпифитов морских трав, в частности Zostera marina, обитающей в морях Дальнего Востока России, представляется актуальной задачей. 5

Цель и задачи исследования Целью настоящего исследования явилось изучение таксономического и экологического разнообразия бактерий-эпифитов морской травы Zostera marina, их биологических особенностей и экологических адаптаций.

Исходя из поставленной цели, решали следующие основные задачи:

- Исследование таксономической структуры эпифитных сообществ морской травы Zostera marina.

- Изучение симбиотических связей и адаптационных механизмов в системе "бактерии-эпифиты - растение-хозяин".

Научная новизна и теоретическая значимость работы Впервые проведено детальное исследование таксономической структуры эпифитных микробных сообществ морской травы Z. marina и показано зональное распространение бактерий различных таксонов на различных морфологических частях растений. Показано наличие симбионтных связей эпифитных бактерий и морской травы по способности избирательно прикреплятся и выживать на поверхности листовых пластин, наличию специфического хемотаксиса к полисахаридам, входящим в состав клеточных стенок растения, и к фенолкарбоновым кислотам. Среди эпифитных и свободноживущих бактерий выявлены штаммы способные к детоксикации ионов некоторых тяжелых металлов. Детоксикация ионов кадмия осуществляется тиоловым пептидом с молекулярной массой около 1000 Да, что для прокариот показано впервые.

Практическая значимость Результаты проведенных исследований могут быть использованы для формирования представлений о взаимодействии микроорганизмов и растения-хозяина в морской среде. Детальное описание таксономического состава и выяснение экологических свойств эпифитных микробных популяций необходимы для 6 разработки биотехнологических принципов управления изучаемой экобиосистемы. Полученные в исследовании сведения важны также при оценке адаптационных возможностей микробных сообществ в условиях антропогенной нагрузки.

Основные положения, выносимые на защиту

1. Таксономическая структура микробных эпифитных сообществ морской травы Zostera marina отражает зональность распределения бактерий различных таксонов на различных морфологических частях растения.

2. Существование истинных бактерий-эпифитов подтверждается их селективной адсорбцией к поверхностям листовых пластин морской травы и наличием специфического хемотаксиса.

3. Устойчивость к ионам Cd2+ у изученных бактерий детерминирована в бактериальных хромосомах и не зависит от наличия плазмид. Тиоловый пептид молекулярной массой около 1000 Да эффективно связывает ионы Cd2+ и способствует выживанию бактерий Pseudoalteromonas citrea и Marinobacter sp. при концентрации 12 мг/л Cd2+ в среде.

Апробация работы Материалы диссертации были представлены на "Региональной естественнонаучной конференции студентов, аспирантов и молодых ученых" (Владивосток, Россия, 1997); научной конференции ТИБОХ ДВО РАН "Исследования в области физико-химической биологии и биотехнологии" (Владивосток, Россия, 1998; 2000); втором международном симпозиуме "Химия и химическое образование" (Владивосток, Россия, 2000).

Публикации По теме диссертации опубликовано 5 работ. 7

Структура и объем работы Диссертация состоит их введения, обзора литературы, экспериментальной части и выводов, списка цитированной литературы, включающего 136 наименований (в том числе 125 на иностранных языках). Работа изложена на 124 страницах машинописного текста, иллюстрирована 16 рисунками, 17 таблицами.

Автор работы выражает глубокую признательность и искреннюю благодарность научным руководителям: д.б.н. Е. П. Ивановой и к.х.н. Г. М. Фроловой; а также научному консультанту д.б.н., профессору В. В. Михайлову. Автор благодарит академика Г. Б. Елякова, чл.-корр. РАН В. А. Стоника, сотрудников лаборатории микробиологии ТИБОХ ДВО РАН к.б.н. JI. А. Романенко, к.б.н. О. И. Недашковскую, н.с. JI. С. Шевченко, к.б.н. Н. М. Горшкову; гл.н.с., д.б.н. А. В. Реунова, н.с. В.П. Нагорскую, к.б.н. H.H. Баринова, к.х.н. Р. П. Горшкову, к.х.н. Е. JI. Назаренко, к.х.н. В. А. Зубкова, н.с. И. Г. Гавриленко; д.б.н., профессора Ф. Н. Шубина, сотрудников лаборатории морской экотоксикологии ТОЙ ДВО РАН д.б.н., профессора В. П. Челомина, к.б.н. Н. Н. Бельчеву, м.н.с. А. В. Куриленко; сотрудников лаборатории сравнительной биохимии ИБМ ДВО РАН к.б.н. Н. В. Жукову, д.б.н. В. И. Светашева, н.с. В. П. Шеину, сотрудника ИХ ДВО РАН Л. Н. Куриленко, а также зарубежных коллег. 8

Заключение Диссертация по теме "Микробиология", Куриленко, Валерия Валерьевна

ВЫВОДЫ

1. Впервые изучена сукцессия эпифитных микроорганизмов зостеры и выявлена зональность распространения бактерий-эпифитов одних и тех же таксонов на морской траве Zostera marina. Актинобактерии, включая Micrococcus/Halococcus, фирмикуты с низким ГЦ в ДНК Bacillus/Halobacillus, цитофаги sensu lato Cytophaga и Flavobacterium и протеобактерии Alteromonas, Pseudoalteromonas, Marinobacter, Marinobacterium, Fundibacter, Pseudomonas, Halomonas, Shewanella, Vibrio были идентифиированы в составе эпифитных микроорганизмов, ассоциированных с морской травой Zostera marina. Доминировали бактерии филогенетического кластера Flavobacterium-Cytophaga-Bacteroides, которые присутствовали на всех морфологических частях морской травы и составляли от 30% до 55% от общего числа выделенных из отдельных частей штаммов, и аэробные протеобактерии родов Alteromonas, Pseudoalteromonas, Marinobacter, Marinobacterium, представители которых доминировали на поверхности листьев нижнего яруса, соцветий и корневищ (до 65%, 96% и 56%, соответственно).

2. Показано, что фосфолипиды бактерий родов Alteromonas, Pseudoalteromonas, Glaciecola, Idiomarina, Marinomonas, Marinobacter, Marinobacterium и Microbulbifer являются основными полярными фосфолипидами и представлены фосфатидилэтаноламином и фосфатидилглицерином, у бактерий рода Fundibacter основными фосфолипидами были ФЭ, дифостатидилглицерин и неидентифицированный ФЛ-Х, хроматографическое поведение которого отличалось от известных ФЛ, ФГ отсутствовал. Выявлены характеристичные жирные кислоты, которые могут быть использованы в качестве родо-специфичных хемотаксономических маркеров для бактерий изученных родов.

Установлено, что филлоплана морской травы заселена не всеми видами бактерий биотопа, а столько теми, которые имеют специфические механизмы связывания с поверхностью растения, в результате чего формируется характерное эпифитное микробное сообщество. Наличие специфических хеморецепторов определяет положительный хемотаксис бактерий-эпифитов как к полисахаридам, входящим в состав клеточных стенок растений, так и фенолкарбоновым кислотам, что позволяет микроорганизмам использовать органические соединения, ассимилированные морской травой.

В местах обитания морской травы выделены штаммы, способные к детоксикации тяжелых металлов, в частности ионов кадмия. Показано, что, свободноживущие бактерии были наиболее устойчивы к высоким концентрациям кадмия. Штамм ЗкемкжеИа ер. КММ 734, выделенный из морской воды, поддерживал высокий уровень физиологической активности, синтезируя внеклеточные кислые полисахариды, которые связывают ионы тяжелых металлов. Бактерии двух других таксонов РзеийоаЫеготопаз сИгеа КММ 461 и МагтоЪааег эр. КММ 181, выделенные из морской воды и зостеры, синтезировали низкомолекулярные тиоловые пептиды (около 1000 Да), состоящие из глутаминовой кислоты, цистеина и глицина. Такие пептиды являются типичными представителями Ш класса металлотионеинов, которые были впервые обнаружены у прокариот.

110

Библиография Диссертация по биологии, кандидата биологических наук, Куриленко, Валерия Валерьевна, Владивосток

1. Гепатоцит: Функционально метаболические свойства. 1985. Под ред. Лукьяновой Л. Д. М: Наука. 272 с.

2. Жизнь растений. 1974. Под ред. Красильникова Н. А., Уранова А. А. М.: Просвещение. Т. 1. 486 с.

3. Зигель X., Зигель А. 1993. Некоторые вопросы токсичности ионов металлов. Пер. с англ. Давыдовой С. Л. М.: Мир. 368 с.

4. Кейтс М. 1975. Техника липидологии. М.: Мир. 311с.

5. Лоенко Ю. Н., Артюков А. А., Козловская Э. П., Мирошниченко В. А., Еляков Г. Б. 1997. Зостерин. В.: Дальнаука. 212 с.

6. Методы общей бактериологии. 1983-1984. Под ред. Герхардта Ф. М.: Мир. (Т. 1 -536 е., Т. 3 264 е.).

7. Одум Ю. 1986. Экология. Пер. с англ. М.: Мир. Т. 2. 376 с.

8. Рубан Е. Л. 1977. Морские липиды и липазы. М.: Наука. 218 с.

9. Свободные радикалы в биологии. 1979. Под ред. У. Прайора. Т. 2. . М.: Мир. 328 с.

10. Справочник по микробиологическим и вирусологическим методам исследования. 1982. Под ред. М. О. Биргера. М.: Медицина. 464 с.

11. Харламенко. 1985. Автореферат кандидатской диссертации. В.: Дальнаука. 24 с.

12. Abmann S., Sigler К., Höfer М. 1996. Cd2+-induced damage to yeast plasma membrane and its alleviation by Zn2+: studies on Schizosaccharomyces pombe cells and reconstituted plasma membrane vesicles. Arch. Microbiol. V. 165. P. 279-284.

13. Adler J. 1973. A method for measuring Chemotaxis and use of the method to determine optimum condition for Chemotaxis by Escherichia coli. J. . Microbiol. V. 74. P. 77-91.1.l

14. Albergoni V., Piccinni E. 1983. Biological response to trace metals and their biochemical effects. In: Trace Element Speciation in Surface Waters and Its Ecological Implications (Ed. by Albergoni V.). Academic Press. London. P. 159-175.

15. Ansell G. 1972. Form and function of phospholipids. (Ed.). Amsterdam. 210 p.

16. Barry A. I. 1980. Procedures and theoretical considerations for testing antimicrobial agents in agar media. In: Antibiotics in laboratory medicine Ed. Logan V. Baltimore / Maryland: William & Wilkins. P. 10-16.

17. Baumann L., Baumann P., Mandel M., Allen R. D. 1972. Taxonomy of aerobic marine eubacteria. J. Bacteriol. V. 110. P. 402-429.

18. Baumann P., Gauthier M. J., Baumann L. 1984. Genus Alteromonas. Baumann, Baumann, Mandel and Allen 1972. In Bergey^s Manual of Systematic Bacteriology, pp. 243-354. Edited by N. R. Krieg, and J. G. Baltimore: Williams & Wilkins Co.

19. Bergey's manual of determinative bacteriology. 1994. Eds. Holt J. G., Krieg N. R, Sneath P. H. A., Staley J. T., Williams S. T. 9th ed. Baltimore / Philadelphia / Hong Kong / London / Munich / Sydney / Tokyo: Williams & Wilkins. 787 p.

20. Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. 1984. Eds. Noel R, Krieg J., Holt G. Baltimore / London: Williams & Wilkins Co. V. 1. 964 p.

21. Bertone S., Giacomini M., Ruggiero C., Piccarolo C., Calegari L. 1996. Automated systems for identification of heterotrophic marine bacteria on the basis of their fatty acid composition. Appl. Environ. Microbiol. V. 62. № 6. P. 2122-2132.112

22. Bolinches J., Lemos M. L., Barja J. L. 1988. Population dynamics of heterotrophic bacterial communities associated with Fucus vesiculosus and Ulva rigida in an estuary. Microb. Ecol. V. 15. P. 345-357.

23. Bos R., vander Hei H. C., Busscher H. J. 1999. Physico-chemistry of initial microbial adhesive interactions its mechanisms and methods for study. FEMS Microbiol. Rev. V. 23. P. 179-230.

24. Bouquegneau J. M., Joiris C. 1988. The fate of stable pollutants heavy metals and organochlorines in marine organisms. Advances in Comparative and Environmental Physiology. Verlag. Berlin. Heidelberg. Springer. V. 2. P. 219-247.

25. Bowen H. J. M. 1979. Environmental chemistry of the elements. London: Acad. Press. 45 p.

26. Bowie S, H. U., Webb J. S. 1980. Environmental geochemistry and health. London: The Royal Society. 115 p.

27. Bruns A., Berthe-Corti L. 1999. Fundibacter jadensis gen. nov., sp. nov., a new slightly halophilic bacterium, isolated from intertidal sediment. Int. J. Syst. Bacteriol. V. 49. P. 441-448.113

28. Carpene E., George S. G. 1981. Absorption of cadmium by gills of Mytilus edulis (L.). Mol. Phys. V. 1. P. 23-34.

29. Chet I., Mitchell R. 1976. Ecological aspects of microbial chemotactic behavior. Ann. Rev. Microbiol. V. 30. P. 221-239.

30. Christie N. T., Costa M. 1984. In vitro assessment of the toxicity of metal compound. Biol. Trace. Elements. Res. V. 6. P. 139-158.

31. Cifuentes A., Anton J., Benlloch S., Donnelly A., Herbert R. A., Rodriguez-Yalera F. 2000. Prokaryotic diversity in Zostera «o/rt'/'-colonized marine sediments. Appl. Environ. Microbiol. V. 66. № 4. P. 1715-1719.

32. Colpaert J. V., Van Assche J. A. 1992. The effects of cadmium and the cadmium-zinc interaction on the axenic growth of ectomycorrhizal fungi. Plant. Soil. V. 145. P. 237243.

33. Cossa D. 1989. A review of the use of Mytilus spp. as quantitative indicators of cadmium and mercury contamination in coastal waters. Oceanol. Acta. V. 12. № 4. P. 417-432.

34. Crisp D. J. 1974. Factor in fluencing the settlement of marine invertebrate larvae. In: Chemoreception in marine organisms. Ed. T. P. Grant and A. M. Mackie. pp. 177-265. New-York: Academic Press.

35. De Siervo A. J., Reynolds J. W. 1975. Phospholipids composition and cardiolipin synthesis in fermentative and nonfermentative marine bacteria. J. Bacteriol. V. 123. № 1. P. 294-301.

36. Depledge M. H., Rainbow P. S. 1990. Models of regulation and accumulation of trace metals in marine invertebrates. Comp. Biochem. Physiol. V. 97. P. 1-7.

37. Eichhorn G. L. 1974. In: Ecological toxicity research. Eds. Mc Intire A.D., Mill C.F. New York: Plenum Press. P. 123.

38. Embley T. M., Wait R. 1994. Strurtural lipids of eubacteria. In: Morden microbialimethods. Chemical methods in prokaryotic systematic. Eds. Goodfellow M., O'Donnel A G. Chichester: John Wiley & Sons. P. 121-163.

39. Eminson D., Phillips G. 1978. A laboratory experiment to examine the effects of nutrient enrichment on macrophyte and epiphyte growth. Verh. Internat. Verein Limnol. V. 20. P. 82-87.

40. Franzmann P. D., Tindall B. J. 1990. A chemotaxonomic study of membranes of the family Halomonadaceae. System. Appl. Microbiol. V. 13. P. 142-147.

41. Freedman J. H., Ciriolo M. R., Peisach J. 1989. Role of glutathione in copper metabolism and toxicity. J. Biol. Chem. V. 264. № 10. P. 5589-5605.

42. Gauthier M. J. 1976. Alteromonas rubra sp. nov., a new marine antibiotic-producing bacterium. Int. J. Syst. Bacteriol. V. 26. P. 459-466.

43. Gauthier M. J. 1977. Alteromonas citrea, a new gram-negative, yellow-pigmented species from seawater. Int. J. Syst. Bacteriol. V. 27. P. 349-354.

44. Gauthier M. J. 1982. Validation of the name Alteromonas luteoviolacea. Int. J. Syst. Bacteriol. V. 32. P. 82-86.

45. Gauthier M. J., Breittmayer V. A. 1979. A new antibiotic-producing bacterium from seawater: Alteromonas aurantia sp. nov. Int. J. Syst. Bacteriol. V. 29. P. 356-372.

46. Gauthier M. J., Breittmayer V. A. 1992. The genera Alteromonas and Marinomonas. In The Prokaryotes, pp.3046-3070. Edited by A. Balows, H. G. Triiper, M. Dworkin, W. Harder, and K.-H. Schleifer. New York: Springer-Verlag.

47. Gauthier M. J., Flatau G. N. 1976. Antibacterial activity of marine violet pigmented Alteromonas with special reference to the production of brominated compounds. Can. J. Microbiol. V. 22. P. 349-354.

48. Gekeler W., Grill E., Winnacker E.-L., Zenk M. H. 1988. Algae sequester heavy-metals via synthesis of phytochelatin complexes. Arch. Microbiol. V. 150. P. 197-202.

49. George S. G. 1982. Subcellular accumulation and detoxication of metals in aquatic animals. In: Physiological Mechanisms of Marine Pollutant Toxicity (Eds. by Vernberg W.B., Calabrese A., Thurberg F.P., Vernberg F.J.), Academic Press, N.Y. P. 3-52.

50. George S. G. Coombs T. L. 1977. The effects of chelating agents on the uptake and accumulation of cadmium by Mytilus edulis. Mar. Biol. V. 39. P. 261-268.

51. George S. G., Pirie B. J. S. 1980. Metabolism of zinc in the mussel Mytilus edulis (L.): a combined ultrastructural and biochemical study. J. Mar. Biol. Ass. U.K. V. 60. P. 575590.

52. Gherna R., Woese C. R. 1992. A partial phylogenetic analysis of the «flavobacter-bacteroides» phylum: a basis for taxonomic restructuring. Syst Appl Microbiol. V. 15. P. 513-521.

53. Glaeser H., Coblenz A., Kruczek R., Ruttke I., Ebert-Jung A., Wolf K. 1991. Glutathione metabolism and heavy metal detoxification in Schizosaccharomyces pombe. Current Genetics. V. 19. P. 207-213.

54. Grill E., Gekeler W., Winnacker E.-L., Zenk M. H. 1986. Homophytochelatins are heavy metal-binding peptides of homo-glutathione. FEBS Lett. V 205. P. 47-50.

55. Grill E., Winnacker E.-L., Zenk M. H. 1985. Phytochelatins: the principal heavy-metal binding peptides of higher plants. Science. V. 230. P. 674-676.

56. Hammer D. H. 1986. Metallothionein. Ann. Rev. Biochem. V. 55. P. 913-951.

57. Harrison P. G. 1982. Control of microbial growth and of amphipod grazing by water-soluble compounds from leaves of Zostera marina. Mar. Biol. V. 67. P. 225-230.

58. Harrison P. G., Chan A. T. 1980. Inhibition of the growth of micro-algae and bacteria by extracts of eelgrass {Zostera marina) leaves. Mar. Biol. V. 61. P. 21-26.

59. Hayashi Y., Nakagawa C. W., Mutoh N., Isobe M., Goto T. 1991. Two pathways in the biosynthesis of cadystins (yEC)nG in the cell-free system of the fission yeast. Biochem. Cell Biol. Y.69. P. 115-121.

60. Higham D. P., Sadler P. J. 1984. Cadmium-resistant Pseudomonas putida synthesizes novel cadmium proteins. Science. V. 225. P. 1043-1046.

61. Holmes B., Owen R. J., McMeekin. 1984. Genus Flavobacterium Harrison, Breed, Hammer and Huntoon. In Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, pp. 353-361. Edited by N. R. Krieg, and J. G. Baltimore: Williams & Wilkins Co.

62. Howard R. K. 1982. Impact of feeding activities of epibenthic amphipods on surface-fouling of eelgrass leaves. Aquat. Bot. V. 14. P. 91-97.

63. Howard R. K., Short F. T. 1986. Seagrass growth and survivorship under the influence of epiphyte grazers. Aquat. Bot. V. 24. P. 287-302.

64. Huu N. B., Denner E. B. M., Ha D. T. C., Wanner G., Stan-Lotter H. 1999. Marinobacter aquaeolei sp. nov., a halophilic bacterium isolated from a Vietnamese oil-producing well. Int. J. Syst. Bacteriol. V. 49. P. 367-375.

65. Ikawa M. 1967. Bacterial phospholipids and natural relationship. Bacteriol. Rev. V. 31. № l.P. 54-64.

66. Kagi J. H. R. 1991. Overwiev of metallothioneins. Methods in enzymology. V. 205. P. 613.

67. Kaneda T. 1977. Fatty acids of the genus Bacillus: an example of branched-chain preference. Bacteriol. Rev. V. 41. № 2. P. 391-418.

68. Kaneda T. 1991. Iso- and anteiso-fatty acids in bacteria: biosynthesis, function, and taxonomic significance. Microbiol. Rev. V. 55. № 2. P. 288-302.

69. Kirchman D. L., Mazzella L., Alberte R. S., Mitchell R. 1984. Epiphytic bacterial production on Zostera marina. Mar. Ecol. Prog. Ser. V. 15. P. 117-123.

70. Klapheck S., Fliegner W., Zimmer I. 1994. Hydroxymethyl-phytochelatins (y-glutamylcysteine)n-serine. are metal-induced peptides of the Poaceae. Plant Physiol. V. 104. P. 1325-1332.

71. Kojima Y. 1991. Definitions and nomenclature of metallothioneins. Methods Enzymol. V. 205. P. 8-10.

72. Kojima Y., Berger C., Vallee B. L., Kagi J. H. R. 1976. Amino acid sequence of equine renal metallothionein. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. V. 73. P. 3413-3417.

73. Komagata K., Suzuki, K. 1987. Lipid and cell wall analysis in bacterial systematics. In: Meth. Microbiol. Eds. ColwellR, GrigorovaR. London: Acad. Press. P. 161-207.

74. Kovacz N. 1956. Identification of Pseudomonas pyocianea by the oxidase reaction. Nature. V. 178. P. 703.

75. Kramer C. J. M., Duinker J. C. 1984. Complexation of trace metals in natural waters. The Hague: The Netherlands. 180 p.

76. Kunsman J. E. 1973. Characterization of the lipids of six strains of Bacterioides ruminicola. J. Bacteriol. V. 113. P. 1121-1126.

77. Lemos M. L., Toranzo A. E., Barja J. L. 1985. Antibiotic activity of epiphytic bacteria isolated from intertidal seaweeds. Microb. Ecol. V. 11. P. 149-163.

78. Maki J. S., Rittschof G., Costlow J. D., Mitchell R. 1988. Inhibition of attachment of larval barnacles 13alanus amphitite, by bacterial surface films. Mar. Biol. V. 97. P. 199119

79. Marmur J. 1961. A procedure for the isolation of deoxyribonucleic acid from microorganisms. J. Mol. Biol. V. 3. P. 208-218.

80. Marmur J., Dotty P. 1962. Determination of the base composition of deoxyribonucleic acid from its thermal denaturation. J. Mol. Biol. V. 5. P. 100-118.

81. Mc Allister D. J., De Siervo A. J. 1975. Identification of bisphosphatidic acid and its plasmalogen analogues in the phospholids of a marine bacterium. J. Bacteriol. V. 123. № 1. P. 302-307.

82. Mc Roy C. P., Goering J. J. 1974. Nutrient transfer between the seagrass Zostera marina and its epiphytes. Nature. V. 248. P. 173-174.

83. Meuwly P., Thibault P., Rauser W. E. 1993. y-Glutamylcysteinylglutamic acid a new homologue of glutathione in maize seedling exposed to cadmium. FEBS Lett. V 336. P. 472-476.

84. Meuwly P., Thibault P., Schwan A. L., Rauser W. E. 1995. Three families of thiol peptides are induced by cadmium in maize. Plant J. V. 7. P. 391-400.

85. Montfrans J., Orth R. J., Vay S. A. 1982. Preliminary studies of grazing by Bittium varium on eelgrass periphiton. Aquat. Bot. V. 14. P. 75-89.

86. Moron M. S., Depierre J. W., Mannervik B. 1979. Levels of glutathione reductase and glutathione S-transferase activities in rat lungs and liver. Biochim. Biophys. Acta. V. 582. P. 67-78.

87. Mudarris M., Austin B., Segers P., Vancanneyt M., Hoste B., Bernardet J. F. 1994. Flavobacterium scophthalmum sp. nov., a pathogen of turbot (Scophthalmus maximus L.). Int. J. Syst. Bacteriol. V. 44. P. 447-453.

88. Nakagawa Y., Hamana K., Sakane T., Yamasato K. 1997. Reclassification of Cytophaga aprica (Lewin 1969) Reichenbach 1989 in Flammeovirga gen. nov. as Flammeovirga aprica comb. nov. and of Cytophaga dijfluens (ex Stanier 1940; emend. Lewin 1969)

89. Reichenbach 1989 in Persicobacter gen. nov. as Persicobacter diffluens comb. nov. Int. J. Syst. Bacteriol. V. 47. P. 220-223.

90. Neckles H. A., Koepfler E. T., Haas L. W., Wetzel R. L., Orth R. J. 1994. Dynamics of epiphytic photo autotrophs and heterotrophs in Zostera marina (eelgrass) microcosms: responses to nutrient enrichment and grazing. Estuaries. V. 17. № 3. P. 597-605.

91. Neckles H. A., Wetzel R. L., Orth R. J. 1993. Relative effects of nutrient enrichment and grazing on epiphyte-macrophyte (Zostera marina L.) dynamics. Oecologia. V. 93. P. 285-295.

92. Nielsen J. T., Liesack W., Finster K. 1999. Desulfovibrio zosterae sp. nov., a new sulfate reducer isolated from surface-sterilized roots of the seagrass Zostera marina. Int. J. Syst. Bacteiol. V. 49. P. 859-865.

93. Olafson R. W., Abel K., Sim R. G. 1979. Prokaryotic metallothionein: preliminary characterization of a blue-green alga heavy metal-binding protein. Biochem. Biophys. Res. Commun. V. 89. P. 36-43.

94. Oliver J. D., Colwell R. R. 1973a. Extractable lipids of Gram-negative marine bacteria: fatty acid composition. Int. J. Syst. Bacteriol. V. 23. P. 442-458.

95. Oliver J. D., Colwell R. R 19736. Extractable lipids of Gram-negative marine bacteria: phospholipid composition. J. Bacteriol. V. 114. № 3. P. 897-908.

96. Owen R. J., Hill L. R, Lapage S. P. 1969. Determination of DNA base composition from melting profiles in delute buffer. Biopolymers. № 7. P. 503-516.

97. Passow H., Rothstein A., Clarkson T. W. 1961. The general pharmacology of heavy metals. Pharm. Rev. V. 13. P. 185.

98. Penhale P. A., Thayer G. W. 1980. Uptake and transfer of carbon and phosphorous by eelgrass (Zostera marina L.) and its epiphytes. J. Exp. Mar. Biol. Ecol. V. 42. P. 114123.

99. Petering D. H., Fowler B. A. 1986. Role of metallothionein and related proteins in metal metabolism and toxicity: problems and perspectives. Environ. Health Perspect. V. 65. P. 217-234. ,

100. Rainbow P. S., Dallinger R. 1993. Metal uptake, regulation and excretion in freshwater invertebrates. In: Ecotoxicology of metals in invertebrates (Dallinger R, Rainbow P. S., Eds.). Lewis Publishers. Chelsea. P. 119-131.

101. Remade J., Vercheval C. 1991. A zinc-binding protein in a metalresistant strain, Alcaligenes eutrophus CH34. Can. J. Microbiol. V. 37. P. 875-877.

102. Richards M. P. 1988. Recent development in trace element metabolism and function: role of metallothionein in copper and zinc metabolism. Annual Ruminant Nutrition Conference. Las Vegas. May 1-5.

103. Roesijadi G. 1994. Metallothionein induction as a measure of response to metal exposure in aquatic animals. Environ. Health Perspect. V. 102. P. 91-96.

104. Rygol J., Arnold W. M., Zimmermann U. 1992. Zinc and salinity effects on membrane transport in Chora connivens. Plant. Cell. Environ. V. 15. P. 11-23.

105. Shieh W. Y., Simidu U., Maruyama Y. 1988. New marine nitrogen-fixing bacteria isolated from an eelgrass (Zostera marina) bed. Can. J. Microbiol. V. 34. P. 886-890.

106. Simkiss K. 1983. Lipid solubility of heavy metals in saline solutions. J. Mar. Biol. Ass. V. 63. P. 1-7.

107. Simkiss K., Taylor M., Mason A. Z. 1982 Metal detoxification and bioaccumulation in molluscs. Marine Biol. Lett. V. 3. P. 187-201.

108. Smith W. O., Penhale P. A. 1980. The heterotrophic uptake of dissolved organic carbon by {Zostera marina L.) and its epiphytes. J. Exp. Mar. Biol. Ecol. V. 48. P. 233242.

109. Stewart A. J. 1987. Responses of stream algae to grazing minnows and nutrients: a field test for interactions. Oecologia. V. 72. P. 1-7.

110. Svetashev V. I., Vysotskii M. V., Ivanova E. P., Mikhailov V. V. 1995. Cellular fatty acids of Alteromonas species. Syst. Appl. Microbiol. V. 18. P. 37-43.

111. Suzuki K., Goodfellow M., O'Donnel A. G. 1993. Cell envelopes and classification. In: Handbook of new bacterial systematics. Eds: Goodfellow M., O'Donnel A.G. London: Acad. Press Ltd. P. 195-250.

112. Swings J., De Vos P., Van den Mooter M., De Ley J. 1983. Int. J. Syst. Bacteriol. V.33.P. 409-413.

113. Takada Y., Hayashinaka N., Hagihara-Nukui E., Fukunaga N. 1993. Chemotaxis in a psychrophilic marine bacterium, Vibrio sp. strain ABE-1. J. Gen. Appl. Microbiol. V. 39. P. 371-379.

114. The Prokaryotes. 1992. 2nd ed. Eds. Balows A, Truper H.G., Dworkin M., Harber H., Schleifer K.-H. Berlin: Springer Verlag.V. 3. P. 3046-3070.

115. Vaskovsky V. E., Kostetsky E. Y., Vasendin I. M. 1975. A universal reagent for phospholipid analysis. J. Chromatogr. V. 114. P. 129-141.

116. Vaskovsky V. E., Latyshev N. A. 1975. Modified Jungnickel's reagent for detecting phospholipids and other phosphorus compounds on thin-layer chromatograms. J. Chromatogr. V. 115. P. 246-249.

117. Vaskovsky V. E., Terekhova T. A. 1979. HPTLC of phospholipid mixture containing phosphatidylglycerol. J. High Resol. Chromatogr. V. 2. P. 671-672.

118. Webb M. 1979. Interaction of cadmium with cellular components. In: The chemistry, biochemistry and biology of cadmium. Ed. Webb M. New York: Elsevier. P. 286-298.

119. Wilkinson S. G. 1988. Microbial lipids. U.K. Hull. University of Hull. V. 1. P. 299625.

120. Wright D. A. 1980. Cadmium and calcium interactions in the freshwater amphipod Gammaruspulex. Freshwater Biol. V. 10. P. 123-133.124

121. Yoshida N., Morinaga T., Murooka Y. 1993. Isolation and characterization of a heavy metal-binding protein from a heavy metal-resistant strain of Thiobacillus sp. J. Ferment. Biogen. V. 76. № 1. P. 25-28.

122. Youshimizu M., Kimura T. 1976. Study of intestinal microflora of salmonids. Fish Pathol. V. 10. P. 243-259.

123. Yu C., Bassler B. L., Roseman S. 1993. Chemotaxis of the marine bacterium Vibrio furnissii to sugars. J. Biol. Chem. V. 268, № 13. P. 9405-9409.