Бесплатный автореферат и диссертация по биологии на тему
Дифференциация возбудителей висна-маеди и артрита-энцефалита коз на основе анализа генома
ВАК РФ 03.02.02, Вирусология
Автореферат диссертации по теме "Дифференциация возбудителей висна-маеди и артрита-энцефалита коз на основе анализа генома"
На правах рукописи
005004697
Барышникова Елена Ивановна
ДИФФЕРЕНЦИАЦИЯ ВОЗБУДИТЕЛЕЙ ВИСНА-МАЕДИ И АРТРИТА-ЭНЦЕФАЛИТА КОЗ НА ОСНОВЕ АНАЛИЗА ГЕНОМА
03.02.02 Вирусология
Автореферат
диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук
-1 ДЕК 2011
Покров-2011
005004697
Работа выполнена в Государственном научном учреждении Всероссийский научно-исследовательский институт ветеринарной вирусологии и микробиологии Российской академии сельскохозяйственных наук (ГНУ ВНИИВВиМ Россельхозакадемии)
Научный руководитель
кандидат биологических наук,
ведущий научный сотрудник Колбасова Ольга Львовна
(ГНУ ВНИИВВиМ Россельхозакадемии)
Официальные оппоненты:
доктор биологических наук,
профессор Рыбаков Сергей Сергеевич
(ФГБУ «ВНИИЗЖ»)
доктор биологических наук,
профессор Юрков Сергей Григорьевич
(ГНУ ВНИИВВиМ Россельхозакадемии)
Ведущая организация - Государственное научное учреждени Всероссийский научно-исследовательский институт экспериментально ветеринарии имени Я.Р. Коваленко (ГНУ ВИЭВ), г. Москва.
Защита диссертации состоится «23» декабря 2011 г. в 11— часов на заседании диссертационного совета 006.003.01 при Государственном научном учреждении Всероссийский научно-исследовательский институт ветеринарной вирусологии и микробиологии Россельхозакадемии по адресу: 601120, Владимирская область, г. Покров, ГНУ ВНИИВВиМ Россельхозакадемии. Тел./факс: (49243) 62125.
С диссертацией можно ознакомиться в библиотеке ГНУ ВНИИВВиМ Россельхозакадемии.
Автореферат разослан «18» ноября 2011 г. и размещен на официальном сайте ГНУ ВНИИВВиМ Россельхозакадемии www.vniivvim.ru
Ученый секретарь диссертационного совета ГНУ ВНИИВВиМ Россельхозакадемии, кандидат биологических наук
£ — Е.А. Балашова
1. ОБЩАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА РАБОТЫ
1.1 Актуальность
Вирусы артрита-энцефалита коз (АЭК) и висна-маеди (ВМ) относятся к семейству Retroviridae, роду Lentivirus, в состав которого входит не только группа лентивирусов овец и коз, но и крупного рогатого скота (КРС), лошадей, кошек, приматов [1, 3, 13]. Многие исследователи объединяют возбудителей ВМ и АЭК под общим названием - лентивирусы мелких жвачных (ЛМЖ) [10, 12].
АЭК и ВМ были зарегистрированы в странах Европы, Латинской Америки, Австралии [9, 12]. В Российской Федерации (РФ) в последнее время возрос интерес к козоводству, который связан с потребностью у населения в диетических продуктах питания и к козьему молоку в частности [3, 7]. Кроме того, формируются системы фермерских козоводческих и овцеводческих хозяйств, пополняющих генофонд за счет импорта животных. В настоящее время в некоторых фермах РФ уже обнаружены случаи заболевания коз и овец ЛМЖ; при этом эпизоотологический анализ показал, что больные животные завезены из неблагополучных по ЛМЖ стран [2, 3]. Таким образом, можно сделать вывод об увеличении угрозы дальнейшего заноса и распространения ЛМЖ на территории нашей страны.
Возбудители АЭК и ВМ вызывают у животных медленные инфекции, представляющие серьезную проблему для животноводства в связи с их скрытым течением, летальным исходом, отсутствием средств лечения и профилактики. Для медленных инфекций не характерны сезонность, периодичность эпизоотий, географическая приуроченность [1]. Кроме этого, доказано, что ЛМЖ гетерогенны и могут инфицировать как овец, так и коз [7, 9]. Вирусы АЭК и ВМ вызывают одинаковую клиническую картину, патологоанатомические изменения, что затрудняет постановку дифференциального диагноза и соответственно проведение противоэпизоотологических мероприятий [1, 7].
В связи с вышеизложенным, дифференциация возбудителей АЭК и ВМ является актуальной.
1.2 Степень разработанности проблемы
Многие работы иностранных и российских исследователей посвящены изучению ЛМЖ [4, 6, 8, 12]. В работах И.Ю. Волковой, A.A. Стрижакова, В. Г. Бурдинского [2, 3, 5] изложены материалы по разработке тест-системы для выявления генома вирусов АЭК и ВМ методом ПЦР и мониторингу распространения болезни в хозяйствах РФ. Проблеме поиска чувствительной клеточной системы (культура клеток синовиальной мембраны козленка (СМК)) для размножения вируса АЭК и дальнейшего его применения в качестве антигена в РДП посвящена работа Г.Д. Сидельникова [7]. И.В. Кувшинов [6] подробно описал гистологические изменения, вызванные медленными инфекциями мелких жвачных.
В данной работе представлена характеристика участков трех генов (gag-, env-, pol-) различных штаммов ЛМЖ, полученных из коллекции микроорганизмов ГНУ ВНИИВВиМ Россельхозакдемии. Разработана тест-система на основе ПЦР в режиме реального времени (ПЦР-РВ) для дифференциации данных возбудителей. Предложен HRM-анализ (методика плавления ПЦР-продуктов с высоким разрешением), позволяющий дифференцировать возбудителей АЭК и ВМ. Получен новый штамм диплоидных клеток синовиальной мембраны ягненка (СМЯ), пригодный для наработки антигенов ЛМЖ, используемых в серологических реакциях (РДП, иммуноблотинг), и проведения молекулярно-генетической работы.
1.3 Цель и задачи исследования
В связи с вышеуказанным, основной целью исследований являлись разработка и совершенствование средств и методов дифференциации вирусов АЭК и ВМ на основе анализа генома.
Для достижения поставленной цели необходимо было решить следующи задачи:
1. получить штамм диплоидных клеток СМЯ и определить его пер-миссивность к вирусам АЭК и ВМ, необходимого для наработки вируссодер-жащего материала;
2. изучить возможность дифференциации вирусов АЭК и ВМ с помощью серологических реакций;
3. разработать тест-систему на основе ПЦР-РВ для выявления и дифференциации геномов вирусов АЭК и ВМ;
4. провести филогенетический анализ нуклеотидной последовательности env-, gag- и ро1-генов вирусов АЭК и ВМ, находящихся в коллекции микроорганизмов ГНУ ВНИИВВиМ Россельхозакадемии, для молекулярно-эпизоотологических исследований;
5. провести мониторинг ЛМЖ на территории РФ.
1.4 Научная новизна работы
1. Получен штамм диплоидных клеток СМЯ, оптимизированы условия его культивирования и использования в качестве лабораторной модели для изучения вирусов АЭК и ВМ.
2. Разработан комплекс методов для выявления и дифференциации вирусов АЭК и ВМ с использованием ПЦР-РВ, секвенирования участков gag-, env- и ро1-генов и HRM-анализа.
3. Определена групповая принадлежность штаммов, находящихся в коллекции микроорганизмов ГНУ ВНИИВВиМ Россельхозакдемии (штамм Тверской вируса АЭК к группе В, штамм М-88, К-796 вируса ВМ к группе А), на основе филогенетического анализа gag-, env- и ро1-генов.
1.5 Практическая значимость работы
1. Создан криобанк клеток СМЯ под авторским наименованием: штамм диплоидных клеток синовиальной мембраны ягненка, рекомендуемый для изучения вирусов АЭК и ВМ, регистрационный номер: № 64 в каталоге клеточной коллекции ГНУ ВНИИВВиМ Россельхозакадемии. Культура клеток депонирована под № 82 Специализированной Коллекции перевиваемых соматических клеточных культур сельскохозяйственных и промысловых животных РККК(П) (СХЖ РАСХН) при ВНИИ экспериментальной ветеринарии им. Я.Р. Коваленко (ВИЭВ).
2. Разработаны «Методические положения по выявлению провирус-ной ДНК лентивирусов мелких жвачных методом полимеразной цепной реакции», которые рассмотрены на секции «Инфекционная патология животных» Отделения ветеринарной медицины Россельхозакадемии (протокол №4 от 23.
09. 2011г.) и утверждены академиком-секретарем Отделения ветеринарной медицины РАСХН Смирновым A.M. (10.11.2011г.).
2.8 Разработаны «Методические положения по выявлению и дифференциации ЛМЖ методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени», которые рассмотрены на секции «Инфекционная патология животных» Отделения ветеринарной медицины Россельхозакадемии (протокол №4 от 23.09.2011г.) и утверждены академиком-секретарем Отделения ветеринарной медицины РАСХН Смирновым A.M. (10.11.2011г.).
3. Проведено генотипирование трех штаммов вируса АЭК и ВМ, депонированных в коллекции микроорганизмов ГНУ ВНИИВВиМ Россельхозак-демии.
4. Методом ПЦР с электрофоретической детекцией в период 20072011 гг. исследовано 1783 пробы крови от овец и коз из различных регионов РФ. Выявлено 93 инфицированных животных.
1.6 Публикации результатов
По теме диссертации опубликовано 9 научных работ, в том числе 1 статья в журнале «Вопросы вирусологии», 2 статьи в журнале «Ветеринария», включенные в перечень изданий, рекомендованных ВАК Министерства образования и науки РФ.
1.7 Апробация работы
Основные положения диссертационной работы доложены и обсуждены на заседаниях Ученого совета ГНУ ВНИИВВиМ Россельхозакадемии (2008-2011 гг.).
Материалы диссертации доложены на конференции «Актуальные проблемы инфекционной патологии ветеринарной медицины», посвященной 50-летию ВНИИВВиМ (г. Покров, 2009 г.), Международной научно-практической конференции «Аграрная наука и образование на современном этапе развития: опыт, проблемы и пути их решения» (г. Ульяновск, 2009 г.), Международной научно-практической конференции «Задачи ветеринарной науки в реализации доктрины продовольственной безопасности РФ» (г. Покров, 2011 г.).
1.8 Соответствие содержания диссертации паспорту специальности, по которой она рекомендуется к защите
В соответствии с формулой специальность 03.02.02 Вирусология, занимающаяся проблемами изучения природы и происхождения вирусов как автономных генетических структур, способных функционировать и репродуцироваться в восприимчивых к ним клетках животных, особенностей репродукции вирусов и их взаимоотношений с восприимчивыми к вирусам клеткам; генетики вирусов, структурной организации генома вирусов; их географического распространения, выявления естественных хозяев; классификации вирусов и их номенклатуры; разработки диагностики и совершенствования лабораторных диагностических систем. В диссертационной работе проведены исследования по получению новой пермиссивной к ЛМЖ клеточной системы, показано использование культуры клеток СМЯ с целью получения антигенов для постановки серологических реакций. Разработана тест-система на основе ПЦР-РВ и HRM-анализа, позволяющая выявлять и дифференцировать вирусы АЭК и ВМ с использованием праймеров, фланкирующих участок env-гсна. Проведено нуклеотидное секвенирование env-, gag-, ро1-генов трех штаммов ЛМЖ, депонированных в коллекции микроорганизмов ГНУ ВНИИВВиМ Россельхозакдемии.
Результаты научного исследования соответствуют пунктам паспорта специальности - 1, 3,4, 8, 9, 10.
1.9 Структура диссертации
Диссертация изложена на 122 страницах машинописного текста и состоит из разделов: введение, обзор литературы, материалы, методы, результаты собственных исследований, обсуждение, выводы, практические предложения, список использованной литературы, включающий 35 отечественных и 112 иностранных источников, дополнена приложениями. Диссертация содержит 8 таблиц и 25 рисунков. В приложении представлены документы, подтверждающие достоверность результатов работы, ее научную и практическую значимость.
1.10 Основные положения диссертации, выносимые на защиту
1. Штамм диплоидных клеток синовиальной мембраны ягненка, пригодный для изучения вирусов АЭК и ВМ.
2. Анализ серологических реакций для выявления и дифференциации
ЛМЖ.
3. Тест-системы для идентификации генома ЛМЖ методом ПЦР с электрофоретической детекцией и ПЦР в режиме реального времени.
4. Филогенетические взаимоотношения штаммов ЛМЖ, находящихся в коллекции микроорганизмов ГНУ ВНИИВВиМ Россельхозакдемии, на основе секвенирования различных участков генома и HRM-анализа.
5. Данные мониторинговых исследований распространения ЛМЖ на территории РФ с использованием ПЦР с электрофоретической детекцией, РДП и ИФА.
1.11 Личный вклад автора в выполнении работы
Основной объем исследований проведен автором самостоятельно. Консультативную и методическую помощь при выполнении отдельных этапов работы оказывали следующие сотрудники института: к.б.н., зав. сектором по диагностике АЧС Малоголовкин A.C. (освоение молекулярно-биологических методов), к.б.н., ведущий научный сотрудник лаборатории Биотехнологии Капустина О.В., к.б.н., научный сотрудник научно-патентного отдела НИР Чурин А.И., к.б.н., научный сотрудник лаборатории Экспериментальной микробиологии Лягоскин И.В. и аспирант лаборатории Бактериологии Васина Н.К. (освоение серологических, иммунологических методов), микробиолог лаборатории Биохимии Казакова A.C. (освоение методов конструирования рекомбинантных молекул).
2. СОБСТВЕННЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ 2.1 Материалы 2.1.1 Вирусы
В работе использованы следующие штаммы: 75G-63, любезно предоставленный д-ром Л. Херрманн, США; штамм Тверской вируса АЭК; штамм К-796, штамм М-88 вируса ВМ, находящиеся в коллекции микроорганизмов ГНУ ВНИИВВиМ Россельхозакдемии.
8
Клиническим материалом служили кровь, молоко и пробы органов (легкие, селезенка) от больных и подозреваемых в заражении ЛМЖ животных из различных хозяйств РФ.
В качестве отрицательных контролен использовали пробы культур клеток, инфицированных вирусам лейкоза КРС, иммунодефицита КРС, пробы легких овец больных аденоматозом и пробы крови от здоровых овец и коз.
2.1.2 Животные
Для получения культуры клеток СМЯ и гипериммунных сывороток использовали клинически здоровых ягнят и овец из сектора подготовки животных ГНУ ВНИИВВиМ Россельхозакадемии.
2.1.3 Культура клеток
Первичная культура клеток синовиальной мембраны козленка (СМК), выращенная в пластиковых культуральных сосудах.
2.1.4 Плазмиды и бактериальные штаммы
Для клонирования использовали коммерческий набор Qiagen PCR Cloning Kit (Qiagen, Германия). В качестве вектора для клонирования использовали плазмиду pDrive (Qiagen, Германия) в клетках E.coli штамма ТОР 10 и pTZ57R (Fermentas, Латвия) в клетках XL-1 (Promega, США).
2.2 Методы
2.2.1 Культивирование клеток
Выращивание культуры клеток СМЯ осуществляли в матрасах, чашках Карреля, микропанелях и на покровных стеклах, помещенных в пробирки в условиях стационарного монослоя. Для снятия клеток со стекла и пластика при пересевах использовали смесь 0,02 % раствора версена и 0,25 % раствора трипсина в соотношении 2:1, подогретую до 37 °С. Посевная концентрация составила 150-200 тыс. кл/см3.
2.2.2 Цитологические исследования
На 5-е, 7-е и 9-е сутки культивирования зараженную культуру клеток фиксировали раствором Буэна, после чего проводили простую окраску гемотаксилин-эозином по общепринятой методике. Проводили учет цитопатического изменения в инфицированной культуре клеток по сравнению с интактными клетками.
2.2.3 Серологические методы
Наличие специфического антигена и антител в органах и тканях определяли в реакциях РДП, иммуноцитохимически и в ИФА (набор фирмы ID Vet, Франция) в соответствии с методическими указаниями производителя.
2.2.4 Выделение и очистка нуклеиновых кислот
Нуклеиновые кислоты выделяли из проб органов, крови инфицированных и интактных животных и культур клеток с использованием нуклеосорбента и фенол-хлороформа.
В качестве матрицы для ПЦР использовали провирусные ДНК, выделенные из культурального вируссодержащего материала, зараженного вирусом ВМ, штамм К-796 (III пассаж на культуре клеток СМК и почки ягненка (ПЯ)), штамм М-88 и вирусом АЭК, штамм Тверской.
2.2.5 Постановка ПЦР с электрофоретической детекцией
Исследования по выявлению генома ЛМЖ осуществляли при помощи
разработанных в ГНУ ВНИИВВиМ Россельхозакадемии (2011 г.) тест-систем и наборов препаратов на основе ПЦР. Для постановки ПЦР с электрофоретической детекцией использовали термоциклеры «Терцик МС-2» (ДНК-технология, Россия) и PalmCycler (Corbett Research, Австралия).
Амплификацию проводили в 25 мкл реакционной смеси, содержащей по 10 рт прямого и обратного праймеров, 25 мМ смеси dNTP, 5х ПЦР-буфер (Интерлабсервис, Россия), pH 8.0, 25 мМ MgCl2, 1,0 ед. Taq-полимеразы, ДНК (исследуемый образец), деионизованную воду.
Реакцию проводили при следующем температурном режиме: предварительная денатурация при 95 °С - 3 мин 10 сек, затем 30 циклов: денатурация 94 °С - 15 сек, отжиг 50 °С - 15 сек, элонгация 72 °С - 15 сек, окончательная элонгация 72 °С - 5 мин. Учет результатов ПЦР проводили в 2 % агарозном геле.
2.2.6 ПЦР в режиме реального времени
В работе использовали технологию гибридизационных флуоресцентных зондов - TaqMan. Амплификацию и детекцию репортерной флуоресценции проводили в термоциклерах «IQ-5» (BioRad, США) и «Rotor-Gene 6000» (Corbett Research, Австралия) по каналу FAM.
Постановку ПЦР-РВ проводили в 25 мкл реакционной смеси, состоящей из следующих компонентов в указанном порядке: 5х буфер для ПЦР, дНТФ (2,5 мМ), зонд (3 pm), MgCl2 (25 мМ), смесь праймеров (10 рт каждого), Taq ДНК-полимераза (1 ед.), ДНК (исследуемый образец), деионизованная вода.
Реакцию проводили при следующем температурном режиме: денатурация - 95 °С - 3 мин; амплификация - 95 °С -20 сек, 50 °С - 20 сек, 72 °С - 20 сек (5 циклов); амплификация - 95 °С - 20 сек, 50 °С - 20 сек (детекция), 72 °С - 20 сек (35 циклов).
2.2.7 Нуклеотидное секвенирование
ПЦР-продукты очищали с помощью набора QIAquick PCR Purification Kit (250) согласно инструкции производителя (QIAGEN, Германия). Для анализа первичной последовательности продуктов, амплифицируемых в ходе ПЦР, использовали метод нуклеотидного секвенирования. Определение состава фрагментов проводили на приборе Applied Biosystem Genetic Analyser 3130 XL (США) с набором компонентов BigDye Terminator kit 3.1 (Applied Biosystem, США). Полученные последовательности сравнивали с опубликованными последовательностями gag-, pol- и env-генов, представлеными в базе данных GenBank.
2.2.8 Программное обеспечение
Для подбора специфических праймеров и зондов использовали пакет прикладных программ «Bio Edit», «Oligo 6.0». Построение филогенетических древ осуществляли с помощью программы Mega 4.0. Специфичность рассчитанных олигонуклеотидов проверяли при помощи интернет-сервиса BLAST (http://www.ncbi.gov.nlm.com).
3. РЕЗУЛЬТАТЫ СОБСТВЕННЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ
3.1 Получение культуры клеток СМЯ, определение ее пеумиссивности к лентивирусам мелких жвачных
Учитывая тот факт, что овцы так же, как и козы болеют АЭК, первым этапом работы являлось получение первичной культуры клеток СМЯ и определение ее пермиссивности для ЛМЖ.
Культуру клеток СМЯ получали методом выращивания тканевых эксплантатов. В качестве доноров использовали ягнят до 10-дневного возраста.
11
Синовиальную мембрану отбирали от запястных и скакательных суставов. В качестве ростовой среды использовали питательную среду ЭМЕМ с 10% фетальной сывороткой КРС. На 2-4-е сутки культивирования эксплантатов синовиальной мембраны отмечали интенсивный рост клеток по периметру прикрепившихся тканевых фрагментов. На 6-8-е сутки образовывался сплошной монослой (рис. 1).
А Б
Рис.1 Эксплантат СМЯ с мигрирующими клеточными элементами: А) на 2-е сутки культивирования (нативный препарат, х150); Б) на 8-е сутки культивирования (нативный препарат, х150)
При заражении культуры клеток СМЯ вирусами АЭК и ВМ в дозе 0,1-0,01 ТЦД50/кл получены следующие результаты:
- на 5-е сутки культивирования в зараженной штаммом 750-63 вируса АЭК культуре клеток СМЯ отмечали цитопатический эффект, при котором клетки удлинялись и в 50 % из них обнаруживали небольшие скопления ядер, что не было характерно для интактной или инфицированных вирусом ВМ, штамм К-796 и штамм М-88 и вирусом АЭК, штамм Тверской культур клеток;
- на 7-е сутки после заражения СМЯ штаммом 750-63 вируса АЭК наблюдали разрушение монослоя. При этом количество ядер в одной клетке достигало 5-9 за счет слияния мембран близко расположенных клеток. Клетки, зараженные штаммами К-796 и М-88 вируса ВМ и Тверской вируса АЭК, увеличивались в размере в 1,5-3 раза (рис. 2);
- на 9-е сутки после заражения культуры клеток СМЯ штаммом 750-63 вируса АЭК обнаруживали полное разрушение монослоя и единичные симпласты, содержащие более 10 ядер.
При этом уровень инфекционной активности культуры клеток СМЯ, зараженной штаммом 750-63 вируса АЭК составил
105,5_10б,о Тцд50/см3;
штаммом Тверской вируса АЭК 104,5-105,° ТЦЦ50/см3, штаммом М-88 вируса ВМ - 104 0-105 5 ТЦД50/см3и штаммом К-796 вируса ВМ - 104'75-Ю5'5 ТЦД5о/см3.
Таким образом, получена культура клеток СМЯ пригодная для наработки вируссодержащего материала для проведения серологических и молекулярно-генетических исследований.
3.2 Получение антигенов и гипериммунных сывороток от экспериментально зараженных животных
Были получены вирусные антигены и гипериммунные сыворотки к вирусам АЭК и ВМ для решения задачи по изучению возможности дифференциации вирусов АЭК и ВМ с помощью серологических реакций.
А Б
В Г
Рис. 2 Результаты культивирования вирусов АЭК и ВМ в культуре клеток СМЯ: А) интактная культура СМЯ на 7-е сутки культивирования, х240; Б) культура клеток СМЯ, зараженная штаммом «Тверской» на 7-е сутки культивирования, х320; В) культура клеток СМЯ, зараженная штаммом К-796 на 7-е сутки культивирования, х240; Г) культура клеток СМЯ, зараженная штаммом 75в-63 на 7-е сутки культивирования, х320. Примечание: стрелкой показан симпласт
Для получения вирусных антигенов использовали культуру клеток СМЯ
с 90 %-м монослоем, не отличающуюся по морфологическим признакам от
исходной популяции. Клетки культивировали в пластиковых матрасах, объемом
13
0,5 л. Заражение проводили путем контакта 2-3 см3 вируссодержащей культуральной жидкости (штамм 750-63 вируса АЭК и штамм М-88 вируса ВМ) с инфекционной активностью 105,с ТЦЩо/см3 с монослоем клеточной культуры в течение 1,5-2 часов при 37±0,5 °С. Затем добавляли поддерживающую среду ДМЕМ с 2 % РВБ. Культуру клеток СМЯ культивировали до проявления характерного ЦПД. После этого проводили 3-кратное замораживание и оттаивание вируссодержащего материала и культуральную жидкость подвергали низкоскоростному центрифугированию (600 g) для осаждения клеточного детрита. Супернатант ультрацентрифугировали при 140 тыс. § в течение 4 ч. Полученный осадок растворяли буферным раствором в 50 раз меньше исходного объема. Полученные антигены использовали для анализа полипептидного состава методом электрофореза в полиакриламидном геле, иммуноблотинга, РДП.
Для получения гипериммунных сывороток вируссодержащий материал (штамм М-88 вируса ВМ с титром Ю5'°ТЦД5о/см3) вводили ягнятам 2-3-месячного возраста в объеме 1-2 см3 интратрахеально и 2-3 см3 интрапульмонально каждые 3 дня в течение месяца. Для получения сыворотки отбор крови проводили каждые 7 дней и исследовали их активность в ИФА (набор фирмы ШУе1, Франция). При этом титр антител составил 1:80-1:160. Максимальный титр антител в ИФА получен на 14 сутки. В работе использовали также сыворотки против вируса АЭК, полученные ранее Сидельниковым Г.Д., с титром антител в ИФА 1:80.
3.3 Цитохимический анализ инфицированных клеток
Для выявления вирусных антигенов в монослое инфицированных клеток СМЯ использовали цитохимический вариант ИФА на основе гипериммунных сывороток к вирусу АЭК и конъюгата протеина А с пероксидазой хрена.
Цитоплазма клеток СМЯ и СМК, фиксированных глютаровым
альдегидом, после обработки раствором хромогенного субстрата приобретала
красно-коричневое окрашивание. А при фиксировании монослоя 80%
охлажденным ацетоном и обработки тем же субстратом наблюдали
окрашивание ядер зараженных клеток. В результате проведенных исследований
были отработаны основные параметры реакции: рабочее разведение нормальной
14
сыворотки козы, обеспечивающее отсутствие фонового окрашивания, составляло 1:20; рабочее разведение специфических гипериммунных сывороток коз к вирусу АЭК- 1:80-1:160.
Данный метод позволяет на 3-й сутки культивирования (до проявления цитопатического действия вируса) определять наличие ЛМЖ в культуре клеток СМК и СМЯ, но не дает возможность дифференцировать вирусы АЭК и ВМ.
3.4 Исследование антигенов вируса артрита-энцефалита коз и висна-маеди в иммуноблотинге
Анализ электрофореграмм показал, что полипептидные профили антигенов ВВМ и ВАЭК имеют значительное сходство и состоят в основном из 5 мажорных полос, характерных для ЛМЖ, с молекулярными массами полипептидов от 14 до 135 кДа.
Данные иммуноблотинга показали, что обе гипериммунные сыворотки против вируса АЭК и ВМ реагировали с полипептидами вирусов АЭК и ВМ с молекулярной массой 16, 24, 30 кДа. Установлено, что иммуноблотинг не позволяет дифференцировать вирусы АЭК и ВМ.
3.6 Постановка РДП
РДП входит в перечень реакций, рекомендованных МЭБ для диагностики АЭК и ВМ. Поэтому приготовленные антигены вирусов АЭК и ВМ исследовали в РДП с использованием гипериммунных и специфических сывороток крови от коз и овец из хозяйств РФ, которые были положительными по данным ИФА.
Специфические полосы преципитации обнаруживали как с сыворотками от коз, так и с сыворотками от овец. Это еще раз подтверждает тот факт, что белки вирусов ВМ и АЭК в серологических реакциях имеют схожие антигенные свойства.
3.7 Разработка ПЦР с электрофоретической детекцией
В настоящее время ПЦР и определение нуклеотидной последовательности различных участков геномов возбудителей являются наиболее точным и информативными методами идентификации.
В связи с вышеизложенным для дифференциации ЛМЖ были выбраны три метода: ПЦР-РВ, НИМ-анализ и филогенетический анализ.
Основными критериями при разработке тест-системы на основе ПЦР с электрофоретической детекцией для обнаружения участков генома ЛМЖ в пробах крови, молока и молозива от коз и овец разных возрастных групп и пород из хозяйств РФ являлись чувствительность и специфичность компонентов, не уступающих уже существующим, а также позволяющих дифференцировать ЛМЖ. На основе анализа нуклеотидного состава генома ЛМЖ рассчитаны специфические праймеры, комплементарные к gag-, env-, pol-генам, которые использовали в дальнейшем для создания тест-систем на основе ПЦР с электрофоретической детекцией и ПЦР-РВ, а так же секвенирования с последующим определением филогенетического родства.
Для выявления генома ЛМЖ методом ПЦР с электрофоретической детекцией использованы вырожденные праймеры, фланкирующие участок env-гена. Полученное значение аналитической чувствительности разработанной тест-системы составило 2,5 lg ТЦД50/см3, специфичность - 100% (акт комиссионных испытаний № 3 от 06. 05. 2011 г.).
3.8 Получение рекомбинантных конструкций, несущих встройку sas-, env- и ро1-генов
Одним из компонентов тест-систем, применяемых для выявления генома вирусов, должен быть положительный контроль (ПК), который является индикатором условий проведения реакции. Основными требованиями, предъявляемыми к ПК, являются специфичность, безопасность использования и длительный срок его хранения.
В результате клонирования получены рекомбинантные плазмиды (pDrive и pTZ57R), несущие встройку участка гена вирусов АЭК (штаммы Тверской и 75G-63) и ВМ (штаммы М-88, К-796) размером 178 п.о., 213 п.о., 395 п.о. для gag-, env- и ро1-генов, соответственно. Специфичность рекомбинантных плазмид проверена в ПЦР с электрофоретической детекцией и ПЦР-РВ, HRM-анализе. Полученные конструкции использованы в дальнейшем в качестве ПК в тест-системах для выявления ЛМЖ методом ПЦР с электрофоретической детекцией, ПЦР-РВ и HRM-анализа.
3.9 Изучение филогенетического родства музейных штаммов лентивирусов мелких жвачных
Для дифференциации ЛМЖ в 2004 г. Shah предложил классификацию на основе анализа генома, по которой ЛМЖ делятся на группы: А, В, С, D, Е. Группа А включает прототипы вируса ВМ: субтипы Al, А2 выделенны от овец; А5, А7 изолированы от коз; A3, A4, А6 изолированы от коз и овец. Прототипы вируса АЭК, изолированные от коз, составляют группу В, включающую В1 и В2 субтипы. Два штамма ЛМЖ, выделенные от коз из Норвегии и Швейцарии, предварительно классифицируют как новые группы С и D, соответственно. На данный момент в Италии выделена еще одна группа - группа Е [10, 11, 13].
Для дифференциации ЛМЖ нами был применен метод нуклеотидного секвенирования участков gag-, pol- и епу-генов штаммов К-796, М-88 вируса ВМ, штамма Тверской вируса АЭК.
При построении филогенетических древ использовали метод Neighbor Joining пакета программ Mega 4.0. Для определения геногруппы изучаемых штаммов ЛМЖ использовали произвольную выборку из опубликованных последовательностей pol-, gag- и env-генов, представленных в базе данных GenBank.
Филогенетический анализ нуклеотидных последовательностей gag-гена штаммов К-796, М-88 вируса ВМ показал их наибольшее сходство с представителями группы А ЛМЖ (рис. 3). В данную группу также входят штаммы, выделенные в США, Англии, Исландии [11, 12]. Топология филогенетического древа указывает на высокую вероятность принадлежности штаммов М-88 и К-796 ЛМЖ, находящихся в коллекции микроорганизмов ГНУ ВНИИВВиМ Россельхозакдемии, к группе А, в которую входят штаммы и изоляты, выделенные в Исландии. В группу А входят прототипы вируса ВМ, что подтверждает данные о происхождении изучаемых штаммов.
Дендрограмма, построенная на основе участка gag-гена (рис. 3), показала принадлежность штамма Тверской вируса АЭК к группе В, в которую входят штаммы, выделенные в США, Швейцарии [11, 12]. Результаты исследований дают основания предполагать, что штамм Тверской вируса АЭК занесен в Россию с инфицированным импортированным скотом.
17
MW 151 4 (A1)
- mw esSTfffi)-
- Очпз lerlNrus P10LV
- Очге lertiwus SA-OM W (A)
- MW EV1
- MW Z2V10S0
Group A
, SRLV 7592 "eFlSRLV 7731 — SRLV 5561 (A3) -SRLV 5Ш2
!9 56
33
SRLV55E0 (AS) -SRLV5720 (B2) _ SRLV It-OQI g02£QB <B1) £AEV strain T\erskoy
AEVCork (B1) CAEVNC-p) CAEV1GACC) r SRLV lt-121 gQ207E
69 L CAEVRoccawrano (E)
Group В
GrounC
Group Е
Рис. 3 Дендрограмма, отражающая положение штамма Тверской вируса АЭК и штаммов М-88 и К-796 вируса ВМ па филогенетическом древе. Основана на нуклеотидных последовательностях §а§-гена ЛМЖ
При анализе дендрограмм, построенных на основе изучения епу- и ро1-генов, штаммы М-88 и К-796 вируса ВМ так же были отнесены к одной группе (группе А), а штамм Тверской вируса АЭК - к группе В. Полученные результаты подтверждают возможность дифференцировать эти вирусы на основе §а§-гена.
3.10 Разработка ПЦР в режиме реального времени для выявления и дифференциации вирусов артрита-энцефалита коз и висна-маеди
Одним из методов дифференциации вирусов ВМ от АЭК является использование ПЦР-РВ с праймерами и зондами, подобранными на высоко вариабельные области их генома.
Подбор типоспеиифических праймеров.
В связи с тем, что праймеры, использованные в ПЦР с электрофоретической детекцией, подобраны на епу-ген и фланкируемый ими фрагмент составляет 213 п.о., что является подходящим условием для постановки ПЦР-РВ, мы использовали данные олигонуклеотиды в ПЦР-РВ.
При разработке ПЦР-РВ ставилась задача не только выявить геном ЛМЖ, но и дифференцировать вирусы ВМ и АЭК. Данное условие выполнено при использовании подобранных нами ДНК-зондов, комплементарных участку env-гена только к вирусу АЭК (Z CAEV) и к вирусу ВМ (Z OOP). Применение вырожденных олигонуклеотидов и ДНК-зондов увеличило вероятность выявления гомологичных вирусов с помощью ПЦР-РВ. Полученное значение аналитической чувствительности данной реакции составило 1,5 lg ТЦД50/см3. Специфичность предложенного метода равна 100%. Разработанная тест-система прошла комиссионные испытания с положительным результатом на базе ГНУ ВНИИВВиМ Россельхозакадемии (акт комиссионных испытаний №3 от 06. 05.2011г.).
3.11 Проведение HRM- анализа
Одним из методов дифференциации близкородственных вирусов является HRM-анализ, позволяющий обнаружить единичные нуклеотидные замены в исследуемой последовательности благодаря различию температурных профилей продуктов реакции.
Для дифференциации возбудителей ВМ и АЭК в работе использованы штаммы вируса ВМ: М-88, К-796 и штамм вируса АЭК - Тверской. Для амплификации использовали вырожденные праймеры к env-гену.
Анализ кривых плавления с высоким разрешением исследуемых штаммов ЛМЖ показал наличие одного пика для каждого образца, что свидетельствует о привутствии специфичного продукта реакции. Диапазон температурных пиков соответствовал среднему значению 83,1±0,1 °С для штаммов М-88 и К-796 вируса ВМ, а для штамма Тверской вируса АЭК - 84,1±0,1 °С. Различные значения температурных пиков для образцов, принадлежащих к разным генотипам, подтверждают структурные различия в составе ПЦР-продуктов. При
анализе температурных пиков плавления данные штаммы разделены на две группы (рис. 4).
Таким образом, в результате секвенирования, Н1Ш-анализа, ПЦР-РВ, показано, что с помощью методов анализа генома можно дифференцировать штаммы вирусов АЭК и ВМ, на примере изучения вирусов, депонированных в коллекции микроорганизмов ГНУ ВНИИВВиМ Россельхозакадемии.
ВВМ —ф
Рис. 4 Результаты ШШ- анализа
Примечание: ось ординат - уровень флюоресценции; ось абсцисс - температура плавления ПЦР-продуктов
3.12 Проведение мониторинговых исследований на наличие ЛМЖ в хозяйствах РФ
Опубликованные данные ряда зарубежных ученых указывают, что ЛМЖ распространены во многих странах мира [1, И]. Установлено, что вирусы ВМ и АЭК поражают как коз, так и овец. В результате роста импорта мелкого рогатого скота из стран Европы, являющихся неблагополучными по ЛМЖ, высок риск заноса и дальнейшего распространения этих болезней на территории РФ.
Поэтому одной из задач работы являлось проведение мониторинговых исследований проб крови, сывороток крови, молока и молозива от мелкого рогатого скота. За период 2007-2011 гг. исследовано 1783 проб из хозяйств различных регионов РФ.
При обследовании хозяйств использовали ПЦР с электрофоретической детекцией, а также РДП, ИФА (набор фирмы ID Vet, Франция).
Обнаружение по результатам ПЦР с электрофоретической детекцией, РДП и ИФА положительно реагирующих животных из хозяйств Тверской, Ленинградской, Брянской, Ивановской, Калужской областей указывает на наличие циркуляции вируса в Центральном и Северо-Западном административных округах.
Все исследованные, в том числе, ПЦР, ИФА и РДП-позитивные животные не имели клинических признаков заболевания. Возрастных или породных особенностей среди положительно реагирующих особей не отмечено.
4. ВЫВОДЫ
1. Получен штамм диплоидных клеток синовиальной мембраны ягненка (СМЯ) и изучены его биологические свойства. Показана чувствительность клеток СМЯ к вирусам АЭК и ВМ. При этом уровень инфекционной активности штамма 75G-63 вируса АЭК составил 5,5 -6,0 lg ТЦД50/СМ3, штамма Тверской вируса АЭК - 4,5-5,0 lg ТЦД5о/см3, штамма М-88 вируса ВМ - 4,0-5,5 lg ТЦЦ50/см3 и штамма К-796 вируса ВМ - 4,75-5,5 lg ТЦД50/см3.
2. Показано, что серологические реакции (иммуноблотинг, РДП, ИФА) и полипептидный электрофорез в полиакриламидном геле не позволяют дифференцировать возбудителей АЭК и ВМ.
3. Разработана тест-система ПЦР с электрофоретической детекцией с аналитической чувствительностью 2,5 lg ТЦД5о/см3, позволяющая выявлять наличие генома ЛМЖ (вирусов ВМ и АЭК) в культуральном материале, в крови, молоке, молозиве инфицированных животных.
4. На основе подобранных ДНК-зондов разработана тест-система ПЦР в режиме реального времени с аналитической чувствительностью 1,5 lg ТЦД50/СМ3, позволяющая дифференцировать возбудителей АЭК и ВМ.
5. На основании данных нуклеотидного секвенирования участков gag-, env-, ро1-генов и анализа филогенетических древ установлена наибольшая гомология вируса ВМ штамма М-88 и К-796 с группой А, а вируса АЭК штамма Тверской - с группой В ЛМЖ.
6. Анализ температурных пиков плавления (HRM-анализ) ПЦР-продуктов позволяет дифференцировать возбудителей АЭК и ВМ.
7. Установлена циркуляция ЛМЖ в хозяйствах Тверской, Ленинградской, Брянской, Ивановской, Калужской областей РФ.
5. ПРАКТИЧЕСКИЕ ПРЕДЛОЖЕНИЯ
1. Полученный штамм диплоидных клеток СМЯ рекомендуется для изучения вирусов АЭК и ВМ и пригоден для накопления вируссодержащего материала с целью получения вирусных антигенов и проведения молекулярно-генетических исследований.
2. «Методические положения по выявлению провирусной ДНК ленти-вирусов мелких жвачных методом полимеразной цепной реакции», рассмотренные на секции «Инфекционная патология животных» Отделения ветеринарной медицины Россельхозакадемии (23. 09. 2011г.) и утвержденные академиком-секретарем Отделения ветеринарной медицины РАСХН Смирновым A.M. (10.11.2011г.), рекомендуются для использования в специализированных ПЦР-лабораториях при проведении диагностических исследований и научно-исследовательских работ.
3. «Методические положения по выявлению и дифференциации ЛМЖ методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени» рассмотренные на секции «Инфекционная патология животных» Отделения ветеринарной медицины Россельхозакадемии (23. 09. 2011г.) и утвержденные академиком-секретарем Отделения ветеринарной медицины РАСХН Смирновым A.M. (10.11.2011г.), предлагаются для дифференциальной диагностики ЛМЖ в специализированных ПЦР-лабораториях.
6. СПИСОК ИСПОЛЬЗУЕМОЙ ЛИТЕРАТУРЫ
1. Архипов, Н.И. Медленные инфекции животных / Н.И. Архипов, И.А. Бакулов, Л.И. Соковых. - М.: Агропромиздат, 1987.- 190 с.
2. Бурдинский, В.Г. Выявление геномов возбудителей аденоматоза и ВМ овец с помощью полимеразной цепной реакции: дис. ...канд. вет. наук: 03.00.06/ Бурдинский Владимир Геннадьевич. - Покров, 2009. - 114 с.
3. Волкова, И. Ю. Эпизоотологический мониторинг и совершенствование мер борьбы с артритом-энцефалитом коз в РФ: автореф. дис. ...канд. вет. наук / Волкова Ирина Юсупжановна. - Покров, 2008. - 25 с.
4. Диагностика скрепи и висны овец / В.А. Шубин, B.C. Суворов, B.JI. Кувшинов, Р.Д. Поздеев, В.В. Исаев, А.К. Моругин // Ветеринария. - 1994. -N 2.-С. 6-11.
5. Клиническая и патоморфологическая диагностика артрита-энцефалита коз / И.Ю. Волкова, А.Ю. Чичикин, А.А. Стрижаков, С.Ж. Цыбанов // Ветеринария. - N.1 - 2007. - С. 23-25.
6. Кувшинов, B.JI. Висна овец романовской породы: гистологические изменения головного мозга / B.J1. Кувшинов, М.А. Смирнов // Российский ветеринарный журнал СХЖ. - 2009. - N 1. - С. 3 8-41.
7. Сидельников, Г.Д. Биологические свойства вируса артрита-энцефалита коз: дис. ... канд. вет. наук 16.00.03/ Сидельников Георгий Дмитриевич. - Покров, 2009. - 117с.
8. Haase, А.Т. Amplification and detection of lentiviral DNA inside cells / A.T. Haase, E.F. Retzel, K.A.cStaskus // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 1990. - Vol. 87.-P. 4971-4975.
9. Demonstration of coinfection with and recombination by caprine arthritis-encephalitis virus and maedi-visna virus in naturally infected goats / G. Pisoni, G. Bertoni, M. Puricelli, P. Moroni // J. of Virology. - 2008. - Vol. 81, N. 10. - P. 49484955.
10. Direct evidence for natural transmission of small ruminant lentiviruses of subtype A4 from goats to sheep and vice versa / C. Shah, J.B. Huder, J. Boni, M. Schonmann, J. Muhlherr, H. Lutz, J. Schupbach // J. of Virology. - 2004. - Vol. 78, N. 4.-P. 7518-7522.
11. Genome Analysis of Small-Ruminant Lentivirus Genotype E: a Capri-neLentivirus with Natural Deletions of the dUTPase Subunit, vpr-Like Accessory Gene, and 70-Base-Pair Repeat of the U3 Region/ R.S. Reina, E.Grego, L. Bertolotti, D. De Meneghi, S. Rosati // J. of Virology. - 2009. - Vol. 83, N.2. - P. 1152-1155.
12. Molecular characterization and phylogenetic study of maedi visna and caprine arthritis-encephalitis viral sequences in sheep and goats from Spain / R. Reina, MI. Mora, I. Glaria, I. Garcia, C. Solano, L. Lujan, JJ. Badiola, A. Contreras et al. //Virus Res.-2006.-Vol. 121, N. 2.-P. 189-198.
13. Zanoni, R. G. Phylogenetic analysis of small ruminant lentiviruses / R. G. Zanoni // Journal of General Virology. - 1998. - Vol. 79. - P. 1951-1961.
7. СПИСОК НАУЧНЫХ РАБОТ, ОПУБЛИКОВАННЫХ ПО ТЕМЕ ДИССЕРТАЦИИ
1. Барышникова, Е.И. Идентификация генома ЛМЖ методом ПЦР/ Е.И. Барышникова, С.Ж. Цыбанов, Д.В. Колбасов // Ветеринария. - 2009. -№8.-С. 58-59.
2. Барышникова, Е.И. Новая клеточная система для изучения ЛМЖ/ Е.И. Барышникова, О.Л. Колбасова// Задачи ветеринарной науки в реализации доктрины продовольственной безопасности РФ: материалы Международной научно-практической конференции / ГНУ ВНИИВВиМ Россельхозакадемии. -Покров, 2011.- С. 253-257.
3. Барышникова, Е.И. Сравнительная характеристика биологических свойств ЛМЖ / Е. И. Барышникова, A.C. Малоголовкин, О.Л. Колбасова, С.Ж. Цыбанов // Вопросы вирусологии. - 2011. - №4. - С. 42-45.
4. Барышникова, Е.И. Мониторинг АЭК и ВМ овец в популяциях мелкого рогатого скота Российской Федерации/ Е.И. Барышникова, A.C. Малоголовкин // Актуальные проблемы инфекционной патологии ветеринарной медицины: материалы конференции молодых ученых/ ГНУ ВНИИВВиМ Россельхозакадемии. - Покров, 2009. - С. 99-102.
5. Барышникова, Е.И. Филогенетический анализ некоторых штаммов ЛМЖ на основе участков pol-, gag-, и env-генов / Е.И. Барышникова, A.C. Малоголовкин, О.Л. Колбасова// Молекулярная диагностика -2010: материалы Международной конференции. - М., 2010. - Т. 2. - С. 57-59.
6. Конструирование рекомбинантной плазмиды для диагностических
тест-систем, выявляющих вирус АЭК/ Е.И. Барышникова, A.C. Казакова, С.Ж.
Цыбанов, A.C. Малоголовкин // Аграрная наука и образование на современном
24
этапе развития: опыт, проблемы и пути их решения: материалы Международной научно-практической конференции / УГСХА. - Ульяновск: ГСХА, 2009. - Т.4 — С.10-13.
7. Нозогеография АЭК/ А.Ю. Чичикин, А.В. Книзе, Барышникова Е.И., О.Л. Колбасова//Ветеринария. - 2011,-№2.-С. 19-22.
8. Baryshnikova, E.I. Evaluation of env-gene HRM assay for genetic subtyping of Small-ruminant lentiviruses / E.I. Baryshnikova, A.S. Malogolovkin, O.L. Kolbasova // 5th Annual meeting Epizone «Bluetongue and other vector borne diseases» 11-14 April 2011. - Arnhem, The Netherlands, 2011. - P. 234.
9. Sidelnikov, G.D. Detection of caprine arthritis encephalitis virus in the Russian Federation/ G.D. Sidelnikov, D.V. Kolbasov, E.I. Baryshnikova // 3th Annual meeting Epizone «Crossing borders» 12-15 May 2009. - Antalya, Turkey, 2009.-P. 173.
8. СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
АЭК - артрит-энцефалит коз ВМ - висна-маеди
ДНК - дезоксирибонуклеиновая кислота ЛМЖ - лентивирусы мелких жвачных ПЦР - полимеразная цепная реакция
ПЦР-РВ - полимеразная цепная реакция в режиме реального времени РДП - реакция диффузионной преципитации СМК - синовиальная мембрана козленка СМЯ - синовиальная мембрана ягненка
Отпечатано в типографии ГНУ ВНИИВВиМ Россельхозакадемии, г. Покров Владимирской области Тираж 80 экз.
V
Содержание диссертации, кандидата биологических наук, Барышникова, Елена Ивановна
1. ВВЕДЕНИЕ.
1.1. Актуальность.
1.2. Степень разработанности проблемы.
1.3. Цель работы и задачи исследования.
1.4. Научная новизна работы.
1.5. Практическая значимость работы.
1.6. Публикации результатов.
1.7. Апробация работы.
1.8. Соответствие содержания диссертации паспорту специальности, по которой рекомендуется к защите.
1.9. Структура и объем диссертационной работы.131.10. Основные положения, выносимые на защиту.
1.11. Личный вклад автора.
2. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.
2.1. Определение болезни артрита-энцефалита коз и висна-маеди
2.2. Общая характеристика ретровирусов.
2.3. Филогенетический анализ лентивирусов мелких жвачных.
2.4. Морфология и химический состав вирусов артрита-энцефалита коз и висна-маеди.
2.5. Репликация лентивирусов мелких жвачных.
2.6. Устойчивость вирусов лентивирусов мелких жвачных к воздействию внешних факторов.
2.7. Эпизоотологические данные лентивирусов мелких жвачных.
2.8. Патологоанатомические изменения при лентивирусах мелких жвачных.
2.9. Диагностика лентивирусов мелких жвачных.
2.10. Дифференциальная диагностика лентивирусов мелких жвачных.
2.11. Культивирование вирусов артрита-энцефалита коз и висна-маеди.
2.12. Иммунитет при лентивирусах мелких жвачных.
2.13. Специфические средства лечения и профилактики.
Введение Диссертация по биологии, на тему "Дифференциация возбудителей висна-маеди и артрита-энцефалита коз на основе анализа генома"
j
1.1 Актуальность
Вирусы артрита-энцефалита коз (АЭК) и висна-маеди (ВМ) относятся к семейству Retroviridae, роду Lentivirus, в состав которого входит не только группа лентивирусов овец и коз, но и крупного рогатого скота (КРС), лошадей, кошек, приматов [1, 6, 147]. Многие исследователи объединяют возбудителей ВМ и АЭК под общим названием — лентивирусы мелких жвачных (ЛМЖ) [76, 113].
АЭК и ВМ' были зарегистрированы в странах Европы, Латинской Америки, Австралии [66, 113]. В Российской Федерации (РФ) в последнее время возрос интерес к козоводству, который связан с потребностью у населения в диетических продуктах питания и к козьему молоку в частности [6, 27]. Кроме того; формируются системы фермерских козоводческих и овцеводческих хозяйств, пополняющих генофонд за счет импорта животных. В настоящее время, в некоторых фермах РФ уже обнаружены случаи заболевания! коз и овец ЛМЖ; принтом*эпизоотологический анализ показал, что больные животные завезены из неблагополучных по ЛМЖ стран [3, 6]. Таким образом, можно сделать вывод об увеличении угрозы дальнейшего заноса и распространения ЛМЖ на территории нашей страны.
Возбудители АЭК и ВМ вызывают у животных медленные инфекции, представляющие серьезную проблему для животноводства в связи с их скрытым течением, летальным исходом, отсутствием средств лечения и профилактики. Для медленных инфекций не характерны сезонность, периодичность эпизоотий, географическая приуроченность [1]. Кроме этого, доказано, что ЛМЖ гетерогенны и могут инфицировать как овец, так и коз [27, 66]. Вирусы АЭК и ВМ* вызывают одинаковую клиническую картину, патологоанатомические изменения, что затрудняет постановку дифференциального диагноза и соответственно проведение противоэпизоотологических мероприятий [1, 27].
В связи с, вышеизложенным, дифференциация возбудителей АЭК и ВМ являетсяактуальной.
Заключение Диссертация по теме "Вирусология", Барышникова, Елена Ивановна
6. выводы
1. Получен штамм диплоидных клеток синовиальной мембраны ягненка (СМЯ) и изучены его биологические свойства. Показана чувствительность клеток СМЯ к вирусам АЭК и ВМ: При этом уровень инфекционной активности штамма 75G-63 вируса АЭК составил 5,5 -6,0 lg ТЦД50/см3, штамма Тверской вируса АЭК - 4,5-5,0 lg ТЦД50/см3, штамма М-88 вируса ВМ - 4,0-5,5 lg ТЦД50/СМ3 и штамма К-796 вируса ВМ - 4,75-5,5 lg
ТЦЦзо/см3.
2. Показано, что серологические реакции (иммуноблотинг, РДП, ИФА) и» полипептидный электрофорез« в полиакриламидном геле не позволяют дифференцировать возбудителей АЭК и ВМ.
3. Разработана тест-система ПЦР с электрофоретической детекцией о с аналитической чувствительностью 2,5 lg ТЦД5о/см , позволяющая выявлять наличие генома,ЛМЖ (вирусов ВМ и, АЭК) в культуральном материале, в крови, молоке, молозиве инфицированных животных.
4. На основе подобранных ДНК-зондов разработана тест-система ПЦР в режиме реального-времени'с аналитической чувствительностью 1,5 lg ТЦД50/см3, позволяющая дифференцировать возбудителей* АЭК и ВМ.
5. На основании данных нуклеотидного секвенирования участков gag-, env-, ро1-генов и анализа филогенетических древ установлена наибольшая гомология вируса ВМ штамма М-88 и К-796 с группой-А, а вируса АЭК штамма Тверской - с группой,В ЛМЖ.
6. Анализ температурных пиков плавления (HRM-анализ) ПЦР-продуктов позволяет дифференцировать возбудителей АЭК и ВМ.
7. Установлена циркуляция ЛМЖ в хозяйствах Тверской, Ленинградской, Брянской, Ивановской, Калужской областей РФ.
7. ПРАКТИЧЕСКИЕ ПРЕДЛОЖЕНИЯ
1. Полученный штамм диплоидных клеток СМЯ рекомендуется для изучения вирусов АЭК и ВМ и пригоден для накопления вируссодержащего материала с целью получения вирусных антигенов и проведения молекулярно-генетических исследований.
2. «Методические положения по выявлению провирусной ДНК лентивирусов мелких жвачных методом полимеразной цепной реакции», рассмотренные на секции «Инфекционная патология животных» Отделения ветеринарной медицины Россельхозакадемии (23. 09. 2011г.) и утвержденные академиком-секретарем Отделения ветеринарной медицины РАСХН Смирновым A.M. (10.11.2011г.), рекомендуются для использования в специализированных ПЦР-лабораториях при проведении диагностических исследований и научно-исследовательских работ.
3. «Методические положения по выявлению и дифференциации ЛМЖ методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени» рассмотренные на секции «Инфекционная патология животных» Отделения ветеринарной медицины Россельхозакадемии (23. 09. 2011г.) и утвержденные академиком-секретарем Отделения ветеринарной медицины РАСХН Смирновым A.M. (10.11.2011г.), предлагаются для дифференциальной диагностики ЛМЖ в специализированных ПЦР-лабораториях.
Библиография Диссертация по биологии, кандидата биологических наук, Барышникова, Елена Ивановна, Покров
1. Архипов,Н.И. Медленные инфекции животных / Н.И. Архипов, И.А. Бакулов, Л.И. Соковых. -М.: Агропромиздат, 1987.- 190 с.
2. Бслоусова, Р.В. Ветеринарная вирусология /Р.В. Белоусова, Э;А. Преображенская, И.В. Третьякова. М.: КолосС, 2007. — 424 с.
3. ВИЧ и СПИД Тест на ВИЧ Электронный ресурс. — Режим доступа: http://www.aids74. com/ testnavich.html - 20Ю.-Загл. с экрана.
4. Волкова, И. Ю. Эпизоотологический; мониторинг и совершенствование мер борьбы с артритом-энцефалитом коз в.РФ: авт. дис. .канд. вет. наук / Волкова Ирина Юсупжановна. — Покров, 2008: — 25 с.
5. Госманов, P.F. Ветеринарная- вирусология / Р;Г. Госманов; Кольлев Н.М. М:::КолосС, 2006. - 304:с.
6. Гринин, A.C. Очистка, концентрирование и фракционирование вирусов животных / A.C. Гринин, И.Н. Титов. — М.: Колос, 1971.- 239 с.
7. Диагностика скрепи и висны овец / В.А. Шубин, B.C. Суворов, В.Л: Кувшинов, Р.Д: Поздеев, В.В. Исаев, А.К. Моругии // Ветеринария. -1994.-N2.-С. 6-11.
8. Животная клетка в культуре клеток (методы и применение в биотехнологии)/ под ред. Л.П. Дьяконова, В:Н. Ситькова. М.: Компания спутник+, 2000.-400 с.
9. Инфекционная патология животных: в 2-х т. / под ред. А.Я. Самуйленко, Б.В. Соловьева, Е.А. Непоклонова, Е.С. Воронина. М.: ИКЦ «Академкнига», 2006. — 190 с.
10. Исаев, В.В: Дополнительные способы диагностики висна-маеди овец / В.В. Исаев // Ветеринария. 2000. - N 2. - С. 19-22. '
11. Источник появления СПИДа найден? Вирус артрита энцефалита коз стал основой создания вакцины против СПИД Электронный ресурс. -Режим доступа: http://sciteclibrary.ru/rus/catalog/pages/4505.htmK- 2003'. -Загл. с экрана.
12. Кадымов; P.A. Инфекционные болезни овец / P.A. Кадымов, A.A. Кунаков, В.А. Седов. -М.: Агропромиздат, 1987. 303с.
13. Клиническая и патоморфологическая диагностика артрита-энцефалита коз / И.Ю. Волкова, А.Ю. Чичикин, A.A. Стрижаков, С.Ж. Цыбанов // Ветеринария. -N.T- 2007. С. 23-25«.
14. Караваев, Ю.Д. Диагностика и меры борьбы с висной-маэди / Ю.Д. Караваев, Б.Ф. Шуляк, Г.Ф. Коромыслов // Бюллетень ВИЭВ. М., 1986.-Вып. 62.-С. 59-61.
15. Коничев, A.C. Основные термины молекулярной биологии / A.C. Коничев, F.A. Севастьянова. -М.: Колос, 2006. 188с.
16. Кувшинов, B.JI. Висна овец романовской породы: гистологические изменения головного мозга / B.JI. Кувшинов, М.А. Смирнов // Российский ветеринарный журнал СХЖ. 2009. - N 1. - С. 38-41.
17. Лакин, Г.Ф. Биометрия / Г.Ф. Лакин. М. 1990. - 352 с.
18. Маниатис, Т. Молекулярное клонирование/ Т. Маниатис, Э. Фрич, Дж. Сэмбрук. М:: Мир, 1984.- С.97-120.
19. Методы вирусологии и молекулярной биологии / пер. с англ. и предисл. Л.Б. Меклера. М.: Мир, 1972. - 444 с.
20. ПЦР «в реальном времени»/ Д.В. Ребриков, Г.А. Саматов, Д.Ю. Трофимов, П.А. Семенов, A.M. Савилова, И.А. Кофиади, Д.Д. Абрамов.-М.: Бином. Лаборатория знаний, 2009.- 223с.
21. Санитарный кодекс наземных животных / МЭБ. 13-е изд. — М.; Париж, 2004. - С. 207-208.
22. Сергеев, В.А. Вирусные вакцины / В.А. Сергеев. Киев: Урожай, 1993.-368 с.
23. Сидельников, Г.Д. Биологические свойства вируса артрита-энцефалита коз: дис. . канд. вет. наук 16.00.03/ Сидельников Георгий Дмитриевич. Покров, 2009^ - 117с.
24. Сидельников, Г.Д. Выделение вируса артрита-энцефалита коз и разработка серологического метода диагностики инфекции / Г.Д. Сидельников, Д.В. Колбасов, С.Ж. Цыбанов // Российский ветеринарный журнал сельскохозяйственных животные. 2009. - №2. - С. 27-29.
25. Супотницкий, М.В. К вопросу о месте ВИЧ-инфекции и ВИЧ/СПИД- пандемии среди других инфекционных, эпидемических и пандемических процессов Электронный ресурс. .-Режим доступа: http://www.supotnitskiy. га/ book/ book4-l-l/htm.-3ara. с экрана.
26. Сюрин, В.Н. Ветеринарная вирусология / В.Н. Сюрин, Р.В. Белоусова, Н.В. Фомина. -М.: Колос, 1984.- 376 с.
27. Сюрин, В.Н. Частная ветеринарная вирусология/ В.Н. Сюрин, Н.Ф. Фомина.- М.: Колос, 1979.- 472с.
28. Шляхов, Э.Н; Иммунология; иммунодиагностика; иммунопрофилактика: инфекционных болезней / Э.Н. Шляхов. — Кишинев: Картя Молдовеняскэ, 1977. 424 с.
29. Шуляк, Б.Ф. Лентивирозы копытных. III. Патогенез? и, симптоматика / Б;Ф. Шуляк // Российский ветеринарный журнал. — 2006.- N 3.-С.2-4.
30. Шуляк, Б.Ф. Лентивирусы копытных. И. Лабораторные модели /t
31. Б.Ф. Шуляк // Российский ветеринарный журнал.- 2006.-N.- 2. С. 14-17.
32. Activation of caprine arthritis encephalitis virus expression during maturation of-monocytes to macrophages / O. Narayan, S. Kennedy-Stoscopf, D. Shefier, DiE.Griffin and-JiE. Clements // Infection and immunity. —1983. — Vol! 41.-P. 67-73.
33. Adair, B.M. Serological surveillance for maedi-visna virus and caprine arthritis encephalitis virus in Northern Ireland / B.M. Adair // The Veterinary Record. 1986. - Vol: 12. - P. 422-423.
34. Analysis of the antibody response to an immunodoninant epitope of the envelope glycoprotein of a lentivirus and its diagnostic potential / F.
35. Mordasisni, H.-R. Vogt, M.-L. Zahno, A. Maeschli, C. Nenci, R. Zanoni, G. Bertoni // J. Clin. Microbiol. 2006. - Vol.44, N. 3. - P. 981-991.
36. A new sensitive serological assay for detection of lentivirus infections in small ruminants / E. Saman, G.V. Eynde, L. Lujan // Clinical and diagnostic laboratory immunology. 1999-Vol.6, N. 5. - P. 734-740.
37. Application of PCR Technique in diagnosis of small ruminant lentivirus infection in sheep and' goats / A. Gil, M. Rola, J. Kuzmak // Pol. J: Vet. Sci.-2006.-Vol. 9, N. 4.-P. 213-217.
38. A transitional endogenous lentivirus from the genome of a> basal primate and implications for lentivirus evolution / R. J. Gifforda, Aris Katzourakisb, M. Tristemd, O. Pybusb, M.Wintersa, R. W. Shafer // PNAS. -2008. Vol. 105, N. 51. - P. 20362-20367.
39. Bertoni G., Caprine Arthritis Encephalitis Complex / G. Bertoni// Internation Veterinary Information Service. 2007.- 22p.
40. Blacklaws, B.A. Visna-Maedi Viruses / B.A. Blacklaws. 2008. - P. 423-432.
41. Braun, M.J. The visna virus genome: evidence for a hypervariable site in the env gene and sequence homology among lentivirus envelope proteins / M J. Braun, J.E. Clements, M.A. Gonda // J. of Virology. 1987. - Vol. 61, N.12. - P. 4046-4054.
42. Brinkhof, J. Evaluation of five enzyme-linked immunosorbent assays and an agar gel immunodiffusion test for detection of antibodies to small ruminant lentiviruses/ J. Brinkhof, C. van Maanen //Clin Vaccine Immunol. 2007. -Vol.14,N. 9.-P. 1210-1214.
43. Caprine arthritis-encephalitis / OIE, the center of the food Security and Public Health. 2007. - P. 1-5.
44. Caprine arthritis-encephalitis virus in semen of naturally infected bucks / C.E. Travassos, C. BenooAt, S. Valas, A.G. da Silva, G. Perrin // Small Ruminant Research. 1999. - Vol. 32. - P. 101-106.
45. Caprine arthritis-encephalitis. Virús isolation and identification in goat herds in Italy / P. Agrimi, F. Tolari, R. legrottaglie, G. Renzoni, M. Dawson // Microbiologica. 1987. - Vol. 10. - P. 353-361.
46. Carter, J. Virology (prunciples and applications) / J. Carter, V. saunders. Ltd ISBNs, 2007. - P. 185-21 k
47. Characterization, experimental infection and serological response to caprine retrovirus / T. Ellis, W. robinson G. Wilcox // Vet. J. 1983. - Vol. 60, N.ll-P. 321-326.
48. Characterization of a new 5' splice site within the caprine arthritis encephalitis virus genome: evidence for a novel auxiliary protein / S. Valas, M. Rolland, C. Perrin 1, G. Perrin, R. Z Mamoun // Retrovirology. 2008. - Vol.5, N. 22.-P. 1-17.
49. Characterization of an:Irish caprine lentivirus strain-SRLV phylogeny revisited / M. Rolland, J. Mooney, S. Valas, G. Perrin, RZ. Mamoun // Virus Res. -Vol. 85, N. l.-P. 29-39.
50. Chronic arthritis in goats caused by a retrovirus / T.B. Crawford, D.S. Adams, W.P. Cheevers, L.C. Cork// Science.- 1980. Vol. 207. - P. 997-999.
51. Clavijo, A. Application of polymerase chain reaction for the diagnosis of caprine arthritis-encephalitis / A. Clavijo, J. Thorsen // Small Ruminant Research. 1996. - Vol. 22'. - P. 69-77.
52. Clements, J.E. Molecular biology and pathogenesis of animal lentivirus infections / J.E. Clements, M.C. Zink // Clinical microbiology reviews. — 1996. Vol. 9, N. l.-P. 100-117.
53. Cutlip, R.C. Immunodiffusion test for ovine progressive pneumonia / R.C. Cutlip, T.A. Jackson, O.A. Laird // Am. J. Vet. Res. 1977. -Vol. 38, N.7. -P.1081 -1084.
54. Demonstration of coinfection with and recombination by caprine arthritis-encephalitis virus and maedi-visna virus in naturally infected goats / G. Pisoni, G. Bertoni, M. Puricelli, P. Moroni// J of Virology. 2007. - Vol. 81, N. 10.-P. 4948-4955.
55. Desfarges, S. Retroviral integration site selection / S. Desfarges, A. Ciuffi // Viruses. 2010. - Vol. 2. - P. 111-130.
56. Detection of antibodies caprine arthritis-encephalitis virus by protein G enzyme-linked immunosorbent assay and immunobloting / R. Zanoni, A. Grieg, E. Peterhans // Journal of clinical microbiology. 1989. - Vol. 27, N. 3. - P. 580582.
57. Detections of caprine arthritis-encephalitis virus by polymerase chain reaction / P. G. Rcddy, W.J. Sapp, W. Heneine*//Journal of clinical microbiology. -1993.-Vol-. 31,N. 11. —P. 3042-3043.
58. Development andi validation of an ovine progressive pneumonia vims quantitative PGR / E. M. Herrmann-Hoesing, S. N. White,, G. S. Lewis, M. R; Mousel, D. P. Knowlc // Clinical and vaccine immunology. 2007. - Vol. 14, N. 10.-P. 1274-1278.
59. Development of recombinant capsid antigen/transmembrane epitope fusion proteins.for serological diagnosis of animal lentivirus infections,/ S. Rosati,
60. M. Profiti, R. Lorenzetti, P. Bandecchi, A. Mannelli, M. Ortoffi, F. Tolari, IM Ciabatti I IJ Virol Methods. 2004. - Vol. 121, N. 1. - P. 73-78.
61. Diagnosis of human immunodeficiency virus (HTV) infection: multicenter evaluation of a newly developed anti-HIV 1 and 2 enzyme immunoassay / G. Hess, F. Avillez, M.H. Lourenco // Journal of clinical microbiology. 1994 - P. 403-406.
62. Elfahal, A.M. First report of caprine arthritis-encephalitis virus infection in Sudan / A.M. Elfahal, A.M. Zakia, A.M. El-Hussien // Journal of Animal and Veterinary Advances. 2010. - Vol. 9; N. 4. - P. 736-740.
63. Evaluation of an ELISA for detection of ovine progressive pneumonia antibodies using a recombinant transmembrane envelope protein / J. Kwang, J.
64. Keen, R. C. Cutlip, E. T. Littledike // J. Vet. Diagn. Invest. 1993. - Vol. 3. - P. 189-193.
65. Evaluation of three serological tests for diagnosis of maedi-visna virus•>infection using latent class analysis / N. Toft, J. Akerstedt, J. Tharaldsen, P. Hopp // Veterinary microbiology. 2007. - Vol. 120. - P. 77-86.
66. Evidence for interspecies transmission of small ruminant lentiviruses in sheep and goats in Poland / M. Olech, B. Croise, J. Kuzmak, S. Valas // Bull. Vet. Inst. Pulawy. 2009. - Vol. 53. - P. 165-168.
67. Experimental infection- of sheep with visna/maedi virus via the conjunctival*space / Hi Niesalla, TN McNeilly, M. Ross, SM Rhind, GD Harkiss // J. Gen Virol. — 2008. Vol. 89, N. 6. -P. 1329-1337.
68. Federico M, From Lentiviruses to Lentivirus vectors / Ml Federico // Lentivirus gene engineering protocols. — Humana Press, 2003. Vol. 229. - P. 315.
69. Field evaluation of gag/env geteroduplex mobility assay for genetic subtyping of small-ruminant lentiviruses / K. Germain, B. Croise, S. Valas // Virology. 20081 - Vol. 89. - P. 2020-2028'.
70. First partial characterization of small ruminant lentivirus from Greece / K. Angelopoulou, K. Karanikolaou, M. Papanastasopoulou, M. Koumpati-Artopiou, I. Vlemmas, O. Papadopoulos, G. Koptopoulos // Vet miclobiol. 2005. -Vol. 109, N. 1-2.-P. 1-9.
71. Genetic characterization of small-ruminant lentiviruses in Italian flocks: evidence for a novel genotype circulating in a local goat population / E.
72. Grego, L. Bertolotti; A. Quasso, M. Profiti et al.- // Virology. 2007. - Vol. 88. -P. 3423-3427.
73. Genetic and antigenetic characterization of the matrix protein of two genetically distinct ovine lentiviruses / E. Grego, L. Bertolotti, M:L. Carrozza, M. Profiti et al. // Veterinary microbiology. 2005. - Vol. 106. - P. 179-185.
74. Genetic: diversity of small-ruminant lentivirusesxharacterization of Norwegiandsolates of Caprinearthritis;encephalitis virus / B. Gjcrsct, A.K. Storsct, E; Rimstad // Journaliof General Virology. 2006,. Vol- 87. - P. 573-580.
75. Gil"; A. Genetic characterization of field of field isolates of maedi-visna virus (MVV) in sheep from Poland / A. Gil, J. Kuzmak, Y. Chebloune // Bull. Vet. Inst. Pulawy. 2006. - Vol. 50. - P. 413-420.
76. Gjerset, B. Genetic diversity of small-ruminants lentiviruses: characterization of Norwegian isolates of caprine arthritis encephalitis virus / B; Gjerset B., Anne K. Storset, E. Rimstad; // Virology. 2006. - Vol. 87. - P. .573580.
77. Host-virus interaction; as defined by amplification of viral DNA and serology in lentivirus-infected sheep/ SJ Brodie , LD Pearson , GD Snowdcr , JC De Martini // Arch Virol. 1993. - Vol. 130, N. 3-4. - P. 413-428.
78. Hotzel; I. Host, range of small ruminant lentiviruses cytopathic variants determined with a'- selectable caprine arthritis-encephalitis; virus, psevdotype system /1. Hotzel, W.P. Cheevers // J; of Virology. 2001. - Vol. 75, N: 16.-P: 7384-7391. ,
79. Impact: of natural sheep-goat transmission on detection and control of small ruminant lentiviruses'grope C infections / B. Gjeset, E. Rimstad; J. Teige, K. Soetaert, CM. Jonassen // Vet. Microbiol: 2009. - Vol. 135; N 3-4. -P. 231-238.
80. Improvements in the detection of small ruminant lentivirus infection in the blood of sheep by PGR / I. Leginagoikoa, E. Minguijon, E. Berriatua, RA Juste // Journal: of Virological Methods. 2009. - Voh 156, N. 1-2. -P. 145-149.
81. Isolation of caprine arthritis-encephalitis virus from goats in Mexico / M. D. Test, A. de la Concha-Bermejillo, L.E.L. Espinosa, E. L. Rubio, A.A. Setien// Vet. Res. 1999. - Vol.63.- P. 212-215.
82. Klevjer-Anderson, P. Caprine arthritis-encephalitis virus of caprine monocytes / P. Klevjer-Anderson, L.W. Anderson // J. Gen Virol. — 1982. -Vol. 58.-P. 195-198.
83. Laemmli, V.K. Cleavage of structural protection during the assemble of the bacteriophage T4 / V.K.Laemmli // Nature. 1970. - Vol. 27. - P. 680-685.
84. Lerondelle, C. Infection of primary cultures of mammary epithelial cells by small ruminant lentiviruses / C. Lerondelle, M, Godet, J.-F. Momornex // Vet. Res. 1999. - Vol. 30. - P. 467-474.
85. Maedi-visna and sheep pulmonary adenomatosis: a study of concurrent infection / M. Dawson, S.H. Done, C. Venables, C.E. Jenkins // Br. Vet. -1990.-Vol. 146. -P. 531-538.
86. Maedi-visna virus and caprine arthritis encephalitis virus genomes encode a vpr-like but no tat protein / S.Villet, B. A. Bouzar, T. Morin, Ge.rard Verdier, C. Legras, Y. Chebloune // Journal of Virology. 2003. - Vol. 77,N. 17.-P. 9632-9638.
87. Maedi-visna virus infection .in-sheep: a: review, / M. Pepin, C. Vitu, P. Russo, J.F. Mornex, E. Peterhans // Vet. Res. 1998. - Vol. 29, N. 3-4. -P. 341-367.
88. Maedi-visna vims infection of ovine mammary epithelial cells / R. Bolea, E. Monleon, L. Carrasco, A. Vargas, D. DE Andres, B. Amorena, J. J. Badiola, L. Luyan // Vet. Res. 2006. - Vol. 37. - P. 133-144.
89. Manual of diagnostic tests and vaccines for terrestrial animals. Chapter 2.4.4/5 Caprine Arthritis-Encephalitis and Maedi-Visna Электронный ресурс.-Режим доступа: http://www.oie.int. 2004.-Загл. с экрана.
90. Mcguire, Т.С. The immune response to viral antigens as a determinant of arthritis in caprine arthritis-encephalitis virus infection- / T.C. Mcguire // Veterinary immunology and immunopathology. 1987. - Vol. 17. — P. 465-470.
91. Modes of transmission of caprine arthritis-encephalitis virus infection/ N.E. East, J.D. Rowe, J.E. Dahlberg, G.H. Theilen, N.C. Pedersen // Small ruminant Research. 1993. Vol. 10. - P. 251-262.
92. Molincova, D. Purification of Escherichia coli-expressed HIS-tagged maedi-visna p25 core antigen by Ni -chelate affinity chromatography / D. Molincova // Vet.Med.-Czech. 2002. - Vol. 46. - P. 50-54.
93. Narayn, O. Biology and Pathogenesis of Lentiviruses / O. Narayn, J. Clenemts // J. gen. ViroL. 1989. - Vol. 70. - P. 1617-1639.
94. Nucleotide sequence and transcriptional analysis of molecular clones of CAEV wtich generate infectious virus/ M. Saltarelli, G. Querat, D.A. Konings, R. Vigner, J.E. Clements // Virology. 1990. - Vol. 179. - P. 347-364.
95. Palsson, P. Maedi-visna/ P. Palsson // J. Clin. Paht. 1998. -Vol. 6.-P. 115-120.
96. Pasick, J. Maedi-visna virus and caprine arthritis-encephalitis virus: distinct species or quasispecies and its implications for laboratory diagnosis / J. Pasick // J. Vet. Res. 1998. - Vol. 62. - P. 241-244.
97. Pasick, J. Use of recombinant maedi-visna virus protein ELISA for the serologic diagnosis of lentivirus infections in small ruminants / J. Pasick // J. Vet. Res. 1998. - Vol. 62. - P. 307-310.
98. PCR detection of lentiviral gag segment DNA in the white blood cells of sheep and goats / L.H. Wagter, A. Jansen, N.M. Bleumink-Pluym, J.A. Lenstra, DJ. Houwers // Vet. Res. Commun. 1998. - Vol. 22, N. 5. - P. 355362.
99. PCR for detection of lentiviruses from small ruminants / R.G. Zanoni, P. Cordano, I.M. Nauta, Peterhans // Schweiz Arch. Tierheilkd. Vol. 138,N. 2.-P. 93-98.
100. Phylogenetic analysis of small ruminant lentiviruses subtype B1 in mixed flocks: evidence for naturales transmission from goats to sheep / G.Pizoni, A. Quasso, P. Moroni // Virology. 2005. - Vol. 339, N. 2. - P. 147152.
101. Presence of pro-lentiviral DNA in male sexual organs and ejaculates of small ruminants / K. Peterson, J. Brinkhof, D.J. Houwers, B. Colenbrander, B.M. Gagella // Theriogenology. 2007. - Vol. 69, N. 4. - P. 433442.
102. Prevalence of antibodies against caprine arthritis-encephalitis virus in goat herds in »Norway / K. Nord, E. Rimstad, A. K. Storset, T. Loken // Small Ruminant Research. 1998. - Vol! 28. - P.l 15-1211.
103. Rapid and simple method for purification of nucleic acids/ R. Boom, SJ.A. Sol, M.M.M. Salimans, C.L. Jansen, P.M.E. Wertheim-van Dillen and J. van der Noordaa// J. of Clinical Microbiology. 1990. - Vol.28, N3. -P.495-503.
104. Replication and cytopathic effects of ovine lentivirus strains in alveolar macrophages correlate with in vivo pathogenicity / M.D. Leirmore, G.Y.
105. Akita, H.I. Russell, J.C. DeMartini // J. of Virology. 1987. - Vol. 61, N. 12. - P. 4038-4042.
106. Role of alveolar macrophages in respiratory transmission of visna/maedi virus / T.M. McNeilly, A. Baker, J.K. Brown, D. Collie, G. MacLachlan, S.M. Rhind, G.D. Harkiss // J. of Virology. -2008. Vol. 82, N. 3. -P. 1526-1536.
107. Schuljak, B.F. Lentivirus infections of ungulates: I General reatures. history and prevalence// Bulgarian Journal of Veterinary Medicine. — 2006.-Vol. 9N.3.-P. 175-181.
108. Seroconversion and seroreactivity patterns ofdairy goats naturally, exposed to caprine arthritis-encephalitis virus in Brazil / R.S. Castro, R.C. Leite, E.O. Azevedo, M. Resende, A.M. Gouveia // Cienc. Rural. 2002. -Vol. 32,N. 4.-P. 603-606.
109. Serological diagnosis of caprine lentivirus infection by recombinant immunoassays / J. Kwang, J. Keen, R.C. Cutlip, H.S. Kim, A. de la Concha-Bermejillo // Small Ruminant Reserrch. 1995. - Vol. 16. - P. 171-177.
110. Seven new ovine progressive pneumonia virus (OPPV) field isolates from Dubois Idaho sheep comprise part of OPPV clade II based on Surface envelope glycoprotein, (SU) sequences / L.M. Herrmann, I. Hotzel, W.P. Cheevers,
111. K. Pretty On Top, G.S. Levis, D.P. Knowles // Virus research. 2004. - Vol. 102. -P. 215-220.
112. Small ruminant lentivirus enhances PrPSc accumulation in cultured sheep microglial cells / J.B. Stanton, D.P. Knowles, K.I. O'Riurke, L.M. Herrmann-Hoesing, B.A. Mathison, T.V. Baszier // J. of Virology. 2008. - Vol. 82,N. 20.-P. 9839-9847.
113. Small ruminant lentivirus proviral sequences from wild ibexes in contact with domestic goats / E. Erhouma, F. Guiguen, Y. Chebloune, D. Gauthier, LM. Lakhal>et al. J; Gen. Virol. - 2008. - N. 89, N. 6. - P. 14781484.
114. Susceptibility of blood-derived monocytes and macrophages to aprine arthritis-encephalitis virus / L.W. Anderson, P. Klevjer-Anderson, H.D. Liggitt // Infection and immunity. 1983. - Vol. 41, N. 2. - P. 837-840.
115. Thepen, T The roe alveolar macrophages in regulation of lung inflammation / T. Thepen, G. Kraal, P.G. Holt // Ann. N.Y.Acad.Sci. 1994. -Vol. 725.-P. 200-206.
116. Thorman, H. Maedi-visna virus and its relationship to human immunodeficiency virus / H. Thorman // AIDS Rev. 2005. - Vol. 7, N. 4. - P. 233-245.
117. Transmission of small ruminant lentivirus / B.A. Blacklaws, E. Berriatua, S. Torsteinsdottir, N.J. Watt, D. de Andres, G.D. Harkiss // Veterinary microbiology. 2004. - Vol. 101. - P. 199-208.
118. Zanoni, R. G. Phylogenetic analysis of small ruminant lentiviruses / R. G. Zanoni // Journal of General Virology. 1998. - Vol. 79. - P. 1951-1961.
- Барышникова, Елена Ивановна
- кандидата биологических наук
- Покров, 2011
- ВАК 03.02.02
- Выявление геномов возбудителей аденоматоза и висна-маеди овец с помощью полимеразной цепной реакции
- Идентификация вируса инфекционной анемии лошадей на основе молекулярно-генетических методов
- Вопросы генотипирования и анализ генетической вариабельности вируса клещевого энцефалита
- Эволюция клещевого энцефалита в Центральном федеральном округе России. Моделирование смены подтипов возбудителя в эксперименте.
- Разработка и совершенствование методов молекулярно - генетической диагностики аденоматоза легких овец