Бесплатный автореферат и диссертация по биологии на тему

Анализ изменчивости мтДНК коренных жителей Нижней Оби и Енисея

ВАК РФ 03.00.15, Генетика

Содержание диссертации, кандидата биологических наук, Дербенева, Ольга Александровна

Введение.

Глава 1. Обзор литературы.

A. Структурно-функциональные особенности мт-генома человека.

Биоэнергетика митохондрий.

Митохондриальные гены.

Репликация, транскрипция и трансляция.

Б. Гетероплазмия и экспрессия митохондриальных генов, несущих мутации с патологическими эффектами.

B. Особенности мт-генома, обуславливающие полиморфизм мтДНК в популяциях человека.

Г. Анализ изменчивости мтДНК в популяциях ЧСВ.

Д. Разнообразие типов мтДНК в Северной Евразии.

Е. Описание популяций манси, энцев/нганасан и кетов.

Манси.

Энцы/нганасаны.

Кеты.

Введение Диссертация по биологии, на тему "Анализ изменчивости мтДНК коренных жителей Нижней Оби и Енисея"

Актуальность

Археологические свидетельства первоначального заселения территории к востоку от Уральских гор кочевыми группами охотников на мамонта и другую плейстоценовую фауну 40-45 тысячелетней давности хорошо документированы и датированы с высокой степенью точности (Derev'anko et al., 1998; Goebel, 1999). Последующие волны миграции пришлись на период после окончания ледникового времени (~11 тыс. лет назад), ознаменовавшегося сменой ландшафтов, флоры и фауны, когда приполярные районы Урала, речные долины Оби и Енисея были освоены полу оседлыми племенами рыболовов и охотников. С течением времени они подверглись значительной ассимиляции или были оттеснены ещё дальше к северу популяциями, которые формировались в климатически более благоприятных районах южной Сибири. К приходу первых русских в Сибирь в XVI в. лишь некоторые популяции охотничье-собирательского типа сохранились в виде антропологических изолятов, однако в настоящее время они пребывают в стадии полного распада и ассимиляции (Долгих, 1960; Чернецов, 1964; Хлобыстин, 1973; Симченко, 1976; Сукерник, 1986). Поэтому остатки их уникальных генофондов представляют собой бесценный источник генетической информации, важный для реконструкции генетической истории как отдельных популяций приполярной Сибири, так и для реконструкции эволюционной истории ЧСВ.

Любая популяция человека, даже ограниченной численности, содержит набор мутаций мтДНК, которые накапливались с момента первоначальной дивергенции человека современного вида в Африке, и далее в процессе дифференциации и экспансии дочерних популяций на другие континенты (Сапп, 1994; Torroni, Wallace, 1994; Soodyal et al., 1996; Stone, Stoneking, 1998; Herrnstadt et al., 2002). Анализ разнообразия типов мтДНК в популяциях северной Европы обнаружил, что их общий пул содержит все основные западно-евразийские гаплогруппы - Н, I, J, К, Т, U, V, W и X (Sajantila et al., 1995; Torroni et al., 1998, 2001; Macaulay et al., 1999; Richards et al., 2000; Finnila et al., 2001; Helgason et al., 2001; Meinila et al., 2001 Малярчук и др., 2001). Напротив, митохондриальный ландшафт Восточной и Северо-Восточной Сибири содержит набор так называемых восточно-евразийских (азиатских) гаплогрупп - А, В, С, D, G, Z и Y (Torroni et al., 1993а; Сукерник и др., 1996; Starikovskaya et al., 1998; Schurr et al., 1999; Деренко, Шилдс, 1997).

Между тем, мало что известно о структуре и происхождении мтДНК-гаплогрупп у таких аборигенов приуралья и енисейского севера, как манси, кеты, энцы и нганасаны. Данные по изменчивости мтДНК кетов и энцев/нганасан, полученные ранее с применением методов и приемов анализа изменчивости мтДНК с низким разрешением (Казаковцева, 1998; Сукерник и др., 1996), оказались неспособны определить принадлежность к гаплогруппам достаточно большого числа вариантов мтДНК, а значит, их невозможно использовать для проверки существующих эколого-археологических и лингвистических моделей первоначального заселения Северной Евразии человеком (Goebel, 1999; Rogers, 1986). Митохондриальный генофонд манси, судя по литературным данным, ранее не изучали. Своевременное молекулярно-генетическое изучение остатков манси, кетов, энцев/нганасан, связанных генетической непрерывностью и культурной преемственностью с автохтонным населением зоны тайги и северного леса Евразии, диктуется ускоренными процессами размывания и исчезновения уникальных генофондов.

Цель и задачи исследования

Предстояло изучить мт-генофонд (спектр и частоту встречаемости типов мтДНК) наиболее древних популяций низовьев Оби и Енисея - манси, энцев/нганасан и кетов; сравнить полученные данные с уже имеющимися для северной Евразии; выполнить статистический и филогенетический анализ с целью: (1) выяснить состав и происхождение филетических материнских линий у манси, кетов и энцев/нганасан; (2) оценить возможный вклад протоевразийских популяций в генетическое разнообразие коренного народонаселения Сибири.

Научная новизна и практическая ценность

В настоящем исследовании впервые были получены подробные фундаментальные данные по изменчивости мтДНК в трех древних популяциях коренных жителей Нижней Оби и Енисея (манси, энцев/нганасан и кетов). Статистический и филогенетический анализ данных позволил уточнить генетическую историю их происхождения и внести существенный вклад в задачу реконструкции эволюционной истории северной Евразии.

Полученные сведения имеют междисциплинарное значение и могут быть использованы как для развития и планирования дальнейших задач популяционной генетики человека, так и в антропологии, истории, медицинской науке, в том числе и судебно-медицинской практике.

Апробация

Результаты работы были доложены на VI-й международной конференции «Древние ДНК и биомолекулы» (Тель-Авив, Израиль) в июле 2002 г.; на международной конференции «Биоразнообразие и динамика экосистем в северной Евразии» (Новосибирск) в августе 2000; обсуждались на межлабораторном семинаре в Институте цитологии и генетики СО РАН и Отделе генетики и молекулярной медицины университета Эмори, Атланта, США.

Вклад автора

Автором совместно с Р.И.Сукерником, Е.Б.Стариковской и Н.В.Володько выполнены экспедиционные сборы первичной генетической информации (родословные и т.д.) и проб крови в двух территориальных группах манси (кондинские и сосьвинско-ляпинские). Пробы крови кетов и энцев/нганасан были получены Сукерником Р.И. и Стариковской Е.Б. Молекулярно-генетический анализ мтДНК (ПДРФ, секвенирование) выполнен автором во время рабочих командировок (в 2000, 2001 и 2002 гг. -общей длительностью 9 мес.) в Отделе генетики и молекулярной медицины Университета Эмори, Атланта, США (зав. проф. Дуглас С. Уоллес - Douglas

C. Wallace).

Публикации

По результатам и проблематике настоящего исследования опубликованы следующие работы:

Derbeneva О.A., Starikovskaya Е.В., Wallace D.C., Sukernik R.I. Traces of Early Eurasians in the Mansi of Northwest Siberia Revealed by mtDNA Analysis // Am. J. Hum. Gen. - 2002. - V.70. - P. 1009-1014.

Дербенева O.A., Стариковская Е.Б., Володъко H.B., Уоллес Д., Сукерник Р.И. Изменчивость митохондриальной ДНК у кетов и нганасан в связи с первоначальным заселением Северной Евразии // Генетика. - 2002. -Т. 38. -№11. -С.1554-1559).

Derbeneva О.A., Sukernik R.I., Volodko N. V., Hosseini S.H., Wallace D.C. Analysis of mtDNA Diversity in Aleut of the Commanders: Implications for the Genetic History of the Latest Inhabitants of Beringia // Am. J. Hum. Genet. 2002b. V. 71. P. 415-421.

Сукерник Р.И., Дербенева O.A., Стариковская Е.Б., Володъко H.B., Михайловская И.Е., Бычков И.Ю., Лотт М.Т., Браун М.Д., Уоллес Д. Митохондриальный геном и митохондриальные болезни человека // Генетика. 2002. Т. 38. С. 161-170.

Sukernik R.I., Derbeneva О.А., Starikovskaya Е.В., Volodko N. V., Wallace

D.C. Traces of Early Eurasians in Ancient Populations of Northern Siberia revealed by mtDNA analysis // The 6th International Meeting on Ancient DNA & Associated Biomolecules. Tel-Aviv, Israel. July. 2002.

Sukernik R.I., Starikovskaya E.B., Torroni A., Brown M.D., Derbeneva O.A., Schurr T.G., Zhadanov S.I., Allen J.C., Hosseini S.H., Wallace D.C. Diffusion of Neutral and Deleterious Mitochondrial Genes Throughout Siberia: Implications for the History and Nature of Human Evolution // Matherials of International Meeting "Biodiversity and Dynamics of Ecosystems in North Eurasia". Novosibirsk. 2000. V.2. P.182-183.

Структура и объем диссертации

Работа состоит из введения, обзора литературы, описания популяций и выборок, методов, результатов и обсуждения, выводов, списка цитированной литературы, содержащего 145 ссылок, из которых 24 на русском языке. Диссертация изложена на 99 страницах машинописного текста, содержит 10 таблиц и 16 рисунков.

Заключение Диссертация по теме "Генетика", Дербенева, Ольга Александровна

ВЫВОДЫ

Выполнен детальный анализ изменчивости мтДНК у 160 коренных жителей северной Сибири - 98 манси, 24 энцев/нганасан и 38 кетов. На основании полученных молекулярно-генетических данных проведен статистический и филогенетический анализ обнаруженных вариантов мтДНК.

1. Установлено, что митохондриальный генофонд древних популяций западной и средней Сибири (манси, кетов и энцев/нганасан) отличает уникальная комбинация западно-евразийских (Н, Н2, НЗ, Н8, U2, U4, U5, U7, J2, W) и восточно-евразийских (А, С, D, Z) гаплогрупп, ведущих свое начало от предковой евразийской L3. Западно-евразийские гаплогруппы обнаружены у 63,3% манси, 47,3% кетов и 33,4% энцев/нганасан, тогда как на долю гаплогрупп А, С и D, общих для северо-восточной Евразии и Америки, приходится соответственно 28,6%, 26,3% и 62,5%.

2. Впервые описаны новые гаплотипы в составе гаплогрупп Н, Т, Т1, С и W: вариант гаплогруппы Н (Н*), отличающийся мутациями С16169Т, С16184Т и A73G; варианты гаплогрупп Т и Т1 с потерей сайта рестрикции 13704 вариант гаплогруппы С без характерной замены в позиции 16223; вариант гаплогруппы W, с характерными группоспецифическими заменами G5046A, С11674Т и Т12414С в кодирующем районе.

3. Впервые во всех трех популяциях обнаружена "палеолитическая" гаплогруппа U4 с беспрецедентно высокой частотой - 28,9% у кетов, 20,8% у энцев/нганасан и 16,3% у манси - и разнообразием.

4. Показано, что вероятность идентичности гаплотипов мтДНК между уралоязычными манси и энцами/нганасанами составила 0,26%, между манси и кетами - 0,05% и между кетами и энцами/нганасанами - 0,00%.

5. Выявленная структура гаплогрупп мтДНК и результаты филогенетического анализа согласуются с гипотезой В.В.Бунака о

Ж. Заключение

Сибирь занимает особое положение в эволюционной истории человека как вида. К приходу первых русских в Сибирь в XVI в. лишь некоторые популяции охотничье-собирательского типа сохранились в виде антропологических изолятов, которые в настоящее время переживают стадию полного распада и ассимиляции (Goebel, 1999; Долгих, 1960; Симченко, 1976; Rogers, 1986). В связи с этим остатки их уникальных генофондов представляют собой бесценный источник генетической информации, важный не только для анализа молекулярной эволюции популяций Северной Евразии, но и для реконструкции эволюционной истории человека как вида (Uinuk-ool et al., 2002).

Структура и происхождение мтДНК-гаплогрупп у таких аборигенов енисейского севера, как кеты, энцы и нганасаны, остаются малоизученными. По причине применения только неполного ПДРФ-анализа имеющиеся

39 сведения по изменчивости мтДНК этих популяций (Сукерник и др., 1996) являются недостаточно информативными для проверки существующих эколого-археологических и лингвистических моделей первоначального заселения Северной Евразии человеком (Goebel, 1999; Rogers, 1986). Исходя из литературных данных, можно сделать вывод, что митохондриальный пул уралоязычных манси ранее не изучался.

Данная работа позволит восполнить имеющийся недостаток данных по изменчивости мтДНК для северной периферии Евразии; оценить возможный вклад протоевразийских популяций в генетическое разнообразие коренного народонаселения Сибири. Для достижения этой цели были поставлены следующие задачи: .

1) провести экспедиционные выезды для сбора первичной генетической информации (родословные и т.д.) и образцов крови манси, энцев/нганасан и кетов;

2) выделить мтДНК из полученных проб крови и выполнить молекулярно-генетический анализ (ПДРФ-анализ мтДНК-генома по 19 рестриктазам и секвенирование 1-го и 2-го гипервариабельных сегментов контрольного района мтДНК);

3) провести статистический и филогенетический анализ обнаруженных вариантов мтДНК, сопоставить с известными аналогичными данными, имеющимися для Сибири и Евразии.

ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

А. Величина и состав выборки

Манси

Оставшиеся несмешанными с другими популяциями группы манси можно еще найти в удаленных маленьких поселениях, располагающихся в Ханты-Мансийском автономном округе Тюменской области, в бассейнах рек верхняя Конда (восточные или кондинские манси) и северная Сосьва (северные или сосьвинско-ляпинские манси), где и проводились экспедиционные сборы (рис. 7).

В 2000 г. были собраны пробы крови 59 кондинских манси, живущих в маленьких деревнях Шаим, Чантарья, Половинка и Шугур, расположенных в бассейне реки Конда (Кондинский район Ханты-Мансийского автономного округа) и 39 проб крови сосьвинско-ляпинских манси, живущих в четырех поселениях - Саранпауль, Щекурья, Ломбовож и Сосьва, расположенных в бассейне рек северная Сосьва и ее притока р. Ляпин (Березовский район Ханты-Мансийского автономного округа).

Энцы/нганасаны

В нашей выборке пропорционально представлены все роды и территориальные подразделения энцев/нганасан. При отборе потенциальных доноров, с целью получения пропорциональной выборки из основных родов нганасан (Костеркины, Порбины, Турдагины, Момдя, Кокаре, Чунанчар, Купчик) и нескольких родов слившихся с ними энцев (Турутины, Мирных, Пальчины, Силкины), были использованы генеалогические данные, собранные в середине 70-х гг. (Гольцова, Сукерник, 1979; Сукерник Р.И., Гольцова Т.В. - неопубл. данные). Пробы крови были собраны в 2001 году в селе Дудинка на нижнем Енисее (Красноярский край) у 24 человек, родом из деревень Воронцово, Усть-Авама, Волочанки, Фактория Новая и прилежащих тундровых стойбищ.

41

Кеты

Традиционная территория кетов охватывает притоки Нижнего и Среднего Енисея (рис. 7) - реки Елогую, Сургутиху, Пакулиху и Курейку. Центр елогуйских кетов - пос. Келлог, сургутинских - Сургутиха, курейских - Бакланиха (Туруханский район Красноярского края). Подкаменская группа- «верховские» кеты (центральная усадьба- пос. Суломай),- согласно современному административному делению, входит в Байкитский район Эвенкийского автономного округа.

В данной работе, кроме 22 проб крови «верховских» кетов из деревни Суломай, собранных в 1992 году (Сукерник и др., 1996), дополнительно использованы 16 новых проб крови «низовских» кетов, полученных во время плановой экспедиции в 2001 году в низовья Енисея, в г. Туруханске (Красноярский край). Происхождение кетов последней выборки - деревни Мадуйка, Пакулиха, Сургутиха, Келлог, Вахта и др. Некоторые из этих деревень в настоящее время не существуют.

В качестве потенциальных доноров отбирали людей среднего и старшего возраста, в родословных семей которых нет общих предков на глубину, как минимум, трех поколений, а все материнские предки не смешаны с другими популяциями. Все пробы крови из вены были взяты с добровольного письменного согласия доноров.

Величина и состав выборки суммированы в таблице 2.

Библиография Диссертация по биологии, кандидата биологических наук, Дербенева, Ольга Александровна, Новосибирск

1. Алексеев В.П. География человеческих рас // М.: Мысль. 1974. 351 с.

2. Алексеенко Е.А. Кеты. Историко-этнографические очерки // Ленинград. М.: Наука. 1967. 261 с.

3. Булатова Н.Ш. Открытие «филогеографии» Джона Си Ависа // Вестник ВОГиС. 2002. №19. С. 18-20.

4. Бунак В.В. Человеческие расы и пути их образования // Сов. этнография. 1956. №1. С. 86-105.

5. Гольцова Т.В., Сукерник Р.И. Генетическая структура обособленной группы коренного населения северной Сибири -нганасан (тавгийцев) Таймыра. Сообщение IV. Изучение популяционной динамики // Генетика. 1979. Т. 15. С. 734-744.

6. Гольцова Т.В., Сукерник Р.И. Генетическая структура обособленной группы коренного населения северной Сибири -нганасан (тавгийцев) Таймыра. Сообщение IV. Изучение популяционной динамики // Генетика. 1979. Т. 15. С. 734-744.

7. Дебец Г.Ф. О принципах классификации человеческих рас // Сов. этнография. 1956. №4. С. 129-142.

8. Деренко М.В., Шилдс Д. Ф. Разнообразие нуклеотидных последовательностей митохондриальной ДНК в трех группах коренного населения Северной Азии // Молекулярная биология. 1997. Т. 31. С. 784-789.

9. Долгих Б.О. Происхождение нганасан // Тр. Ин-та этнографии АН СССР. М.: 1952. Т. 18. С. 5-88.

10. Долгих Б. О. Родовой и племенной состав народов Сибири в 17 веке // Тр. Ин-та этнографии АН СССР. М.: 1960. Т. 55. С. 3-623.

11. Долгих Б.О. Родовая экзогамия у нганасан и энцев // Тр. Ин-та этнографии АН СССР. М.: 1962. Т. 78. С. 197.

12. Дульзон А.П. Кетский язык // Томск. 1968.

13. Золотарева И.М. Антропологическая дифференциация восточных самодийцев // Антропология и геногеография (ред. В.П.Алексеев). М., Наука. 1974.215 с.

14. Казаковцева М.А. Полиморфизм митохондриальных ДНК в популяциях коренного населения западной Сибири и восточных славян // Рукопись канд. диссертации. Институт цитологии и генетики СО РАН. Новосибирск. 1998.

15. Малярчук Б.А., Денисова Г.А., Деренко М.В., Рогаев Е.И., Власенко Я.В., Жукова С.Г. Изменчивость митохондриальной ДНК в популяциях русского населения Краснодарского края, Белгородской и Нижегородской областей // Генетика. 2001. Т. 37. С. 1411-1416.

16. Симченко Ю.Б. Культура охотников на оленей Северной Евразии // М: Наука. 1976. 230 с.

17. Стариковская Е.Б. Изменчивость митохондриальных ДНК коренных жителей Чукотки в связи с генетической историей древней Берингии // Рукопись канд. диссертации. Институт цитологии и генетики СО РАН. Новосибирск. 1999.

18. Стрингер К.Б. Происхождение современных людей // В мире науки. 1991. №2. С. 54-61.

19. Сукерник Р.И. Генетическая структура изолятов коренного населения азиатской субарктики и микроэволюционный процесс. //

20. Рукопись, докт. дисс. Институт цитологии и генетики СО РАН. Новосибирск. 1986. 264 с.

21. Сукерник Р.И., Дербенева О.А., Стариковская Е.Б., Володъко Н.В., Михайловская И.Е., Бычков И.Ю., Лотт М.Т., Браун М.Д., Уоллес Д. Митохондриальный геном и митохондриальные болезни человека // Генетика. 2002. Т. 38. С. 161-170.

22. Сукерник Р.И., Шур Т.Г., Стариковская Е.Б., Уоллес Д.С. Изменчивость митохондриальных ДНК у коренных жителей Сибири в связи с реконструкцией эволюционной истории американских индейцев // Генетика. 1996. Т. 32. С. 432-439.

23. Хлобыстин Jl.Il. О древнем заселении Арктики // Краткие сообщения Института археологии АН СССР. М.: 1973. Вып. 136.1. C. 11-16.

24. Чернецов В.Н. К вопросу об этническом субстрате в циркумполярной культуре//М.: Наука. 1964. 13 с.

25. Andrews R.M., Kubacka I., Chinnery P.F., Lightowlers R.N., Turnbull

26. D.M., Howell N. Reanalysis and revision of the Cambridge reference sequence for human mitochondrial DNA // Nat. Genet. 1999. V. 23. P. 147.

27. A vise J.C. Phylogeography. The history and formation of species // Harvard Univ. Press. Cambridge. Massachusetts/London. England. 2000. 447 p.

28. Ayala F.J. The myth of Eve: molecular biology and human origins // Science. 1995. V. 270. P. 1930-1936.

29. Ballinger S.W., Shoffner J.M., Hedaya E.V., Trounce I., Polak M.A., Koontz D.A., Wallace D.C. Maternally transmitted diabetes and deafness associated with a 10.4 kb mitochondrial DNA deletion // Nat. Genet. 1992. V. l.P. 11-15.

30. Bandelt H.-J., Forster P., Sykes ВС., Richards M.B. Mitochondrial portraits of human populations using median networks // Genetics.1995. V. 141. P. 743-753.

31. Bendall K.E., Macaulay V.A., Baker J.R, Sykes B.C. Heteroplasmic point mutations in human mtDNA control region // Am. J. Hum. Genet.1996. V. 59. P. 1276-1287.

32. Brown W.M., George M., Wilson A.C. Rapid evolution of animal mitochondrial DNA // Proc. Natl. Acad. Sci. 1979. V. 76. P. 19671971.

33. Brown W.M., Prager E.M., Wang A, Wilson AC. Mitochondrial DNA sequences in primates: tempo and mode of evolution // J. Mol. Evol. 1982. V.18. P. 225-239.

34. Cann R.L. mtDNA and Native Americans: a southern perspective // Am. J. Hum. Genet. 1994. V. 55. P. 7-11.

35. Cann R.L., Stoneking М., Wilson А. С. Mitochondrial DNA and human evolution // Nature. 1987. V. 325. P. 31-36.

36. Cavalli-Sforza L.L., Bodmer W.F. The genetics of human populations // San Francisco, Freeman Co., 1971.

37. Chen Y.S., Olckers A., Schurr T.G., Kogelnik A.M., Huoponen K., Wallace D. C. mtDNA variation in the South African Kung and Khwe-and their genetic relationships to other African populations // Am. J. Hum. Genet. 2000. V. 66. P. 1362-1383.

38. Chen Y.-S., Torroni A., Excoffier L., Santachiara-Benerecetti A.S., Wallace D.C. Analysis of mtDNA variation in African populations reveals the most ancient of all human continent-specific haplogroups // Am. J. Hum. Genet. 1995. V. 57. P. 133-149.

39. Chinnery P.F., Johnson M.A., Wardell T.M., Singh-Kler R., Hayes C., Brown D.T., Taylor R.W., Bindoff L.A., Turnbull D.M. The epidemiology of pathogenic mitochondrial DNA mutations // Ann. Neurol. 2000. V. 48. P. 188-193.

40. Chinnery P.F., Samuels D.S. Relaxed replication of mtDNA: a model with implications for the expression of disease // Am. J. Hum. Genet. 1999. V. 64. P. 1158-1165.

41. Denaro M.H., Blanc H., Johnson M.J., Chen K.H., Wilmsen E., Cavalli-Sforza L.L., Wallace D.C. Ethnic variation in Hpal endonuclease cleavage patterns of human mitochondrial DNA // Proc. Natl. Acad. Sci. 1981. V. 78. P. 5768-5772.

42. Derbeneva O.A., Sukernik R.I., Volodko N. V, Hosseini S.H., Wallace D.C. Analysis of mtDNA Diversity in Aleut of the Commanders: Implications for the Genetic History of the Latest Inhabitants of Beringia // Am. J. Hum. Genet 2002. V. 71. P. 415-421.

43. Derev 'anko A.P., Shimkin D.B., Powers R. W. The Paleolithic of Siberia // University of Illinois Press, Urbana and Chicago. 1998.

44. Elson J.L,. Samuels D.S., Turnbull D.M., Chinnery P.F. Random intracellular drift explains the clonal expansion of mitochondrial DNA mutations with age 11 Am. J. Hum. Genet. 2001. V. 68. P. 802-806.

45. ExcoffierL., Smouse P.E. Using allele frequencies and geographic subdivision to reconstruct gene trees within a species: molecular variance parsimony // Genetics. 1994. V. 136. P. 343-359.

46. Finnila S., Lehtonen M.S., Majamaa K. Phylogenetic network for European mtDNA // Am. J. Hum. Genet. 2001. V. 68. P. 1475-1484.

47. Giles R.I., Blanc H., Cann H.M., Wallace D.C. Maternal inheritance of human mitochondrial DNA // Proc. Natl. Acad. Sci. 1980. V. 77. P. 6715-6719.

48. Gill P., Ivanov P.L., Kimpton K., Piercy R., Benson N., Tully G., Evett I., Hagelberg E., Sullivan K. Identification of the remains of the Romanov family by DNA analysis // Nat. Genet. 1994. V. 6. P. 130135.

49. Goebel T. Pleistocene human colonization of Siberia and peopling of the Americas: an ecological approach // Evol. Anthropol. 1999. V. 8. P. 208-227.

50. Hammer M.F. and Horai S. Y chromosomal DNA variation and the piopling of Japan // Am. J. Hum. Genet. 1995. V. 59. P. 951-962.

51. Harpending H.C., Batzer M.A., Gurven M., Jorde L.B., Rogers A.R., Sherry S.T. Genetic traces of ancient demography // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1998. V. 95. P. 1961-1967.

52. Hart L.M., Jansen J.J., Lemkes H.H., de Kniff P., Maassen J.A. Heteroplasmy level of a mitochondrial gene mutation associated with diabetes mellitus decrease in leukocyte DNA upon aging // Hum. Mut. 1996. V. 7. P. 193-197.

53. Hayes M.G., O'Rourke D.H. Genetic signatures of migrations and population replacements during human colonization of the North American Arctic // Am. J. Hum. Genet. 2001. Suppl. 69. P. 179.

54. Hedges S.B. Human evolution. A start for population genomics // Nature. 2000. V. 408. P. 652-653.

55. Hedges S.B., Kumar S., Tamura K., Stoneking M. Human origins and analysis of mitochondrial DNA sequences // Science. 1992. V. 255. P. 737-739.

56. Helgason A., Hickey E., Goodacre S., Bosnes V., Stefansson K., Ward R., Sykes B. mtDNA and the Islands of the North Atlantic: estimating the proportions of Norse and Gaelic ancestry // Am. J. Hum. Genet. 2001. V. 68. P. 723-737.

57. Helgason A., Sigurethardottir S., Gulcher J.R., Ward R., Stefansson K. mtDNA and the origin of the Icelanders: deciphering signals of recent population history // Am. J. Hum. Genet. 2000. V. 66. P. 999-1016.

58. Horai S., Kondo R., Nakagawa-Hattori Y., Hayashi S., Sonoda S., Tajima K. Peopling of the Americas, founded by four major lineages of mitochondrial DNA // Mol. Evol. Biol. 1993. V. 10. P. 23-47.

59. Horai S., Matsunaga E. Mitochondrial DNA polymorphism in Japanes. Analysis with restriction endonucleases of six base-pair recognition // Hum. Genet. 1986. V. 68. P. 324-332.

60. Howell N., Xu M., Halvorson S., Bodis-Wollner I., Sherman J. A heteroplasmic LHON family: tissue distribution and transmission of the 11778 mutation // Am. J. Hum. Genet. 1994. V. 55. P. 203-206.

61. Ingman M., Kaessmann H., Paabo S., Gyllensten U. Mitochondrial genome variation and the origin of modern humans // Nature. 2000. V. 408. P. 708-713.

62. Jackson M.J., Schaefer J.A., Johnson M.A., Morris A.A.M., Turnbull D.M., Bindoff L.A. Presentation and clinical investigation of mitochondrial respiratory chain disease. A study of 51 patients // Brain. 1995. V. 118. P. 339-357.

63. Jenuth J.P., Peterson A.C., Fu K., Shoubridge E.A. Random genetic drift in the female germline explains the rapid segregation of mammalian mitochondrial DNA // Nat. Genet. 1996. V. 14. P. 146-151.

64. Johnson M.J., Wallace D.C., Ferris S.D. Radiation of human mitochondrial DNA types analysed by restriction endonuclease cleavage patterns // J. Mol. Evol. 1983. V. 19. P. 255-271.

65. Kaneda H„ Hayashi J., Takahama S., Taya C., Lindahl K.F., Yoneda H. Elimination of paternal mitochondrial DNA in intraspecific crossesduring early mouse embriogenesis // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1995. V. 92. P. 4542-4546.

66. Kaufmann P., Koga Y., Shanske S., Hirano M., DiMauro S., King MP., Schon E.A. Mitochondrial DNA and RNA processing in MELAS // Ann. Neurol. 1996. V. 40. P. 172-180.

67. Kogelnik A.M., Lott M.T., Brown M.D., Navathe S.B., Wallace D.C. MITOMAP: a human mitochondrial genome database 1998 update // Nucleic Acids Res. 1998. V. 26. P. 112-115.

68. Korf B.R. Human Genetics. A problem-based approach // Blackwell Science Inc., Cambridge, USA, 1996.

69. Krakauer D.C., Mir a A. Mitochondria and germ-cell death // Nature. 1999. V. 400. P. 125-126.

70. Krings M., Capelli C, Tschentscher F., Geisert H., Meyer S., von Haeseler A., Grossschmidt K., Possnert G., Paunovic M., Paabo S. A view of Neandertal genetic diversity //Nat. Genet. 2000. V. 26. P. 144146.

71. Lahr M.M., Foley R. Multiple dispersals and modern human origins // Evol. Anthropol. 1994. V. 3. P. 48-60.

72. Larsson N-G., Clayton D.F. Molecular genetic aspects of human mitochondrial disorders // Annu. Rev. Genet. 1995. V. 29. P. 151-178.

73. Lightowlers R.N., Chinnery P.F., Turnbull D.M, Howell N. Mammalian mitochondrial genetics: heredity, heteroplasmy and disease // Trends. Genet. 1997. V. 13. P. 450-455.

74. Macaulay V., Richards M., Hickey E., Vega E., Cruciani E., Guida V., Scozzari R., Bonne-Tamir В., Sykes В., Torroni A. The emerging tree of

75. West Eurasian mtDNAs: a synthesis of control-region sequences and RFLPs //Am. J. Hum. Genet. 1999. V. 64. P. 232-249.

76. Meinila M., Finnila S., Majamaa K. Evidence for mtDNA admixture between the Finns and the Saami // Hum. Hered. 2001. V. 52. P. 160170.

77. Moilanen J.S., Majamaa K. Relative fitness of carriers of the mitochondrial DNA mutation 3243A > G // Eur. J. Hum. Genet. 2001. V. 9. P. 59-62.

78. Nachman M. W, Brown W.M., Stoneking M., Aquadro C.F. Nonneutral mitichondrial variation in Humans and Chimpanzees // Genetics. 1996. V. 142. P. 953-963.

79. Nei M. Molecular Evolutionary Genetics // New York. Columbia University Press. 1987.

80. Nei M., Takezaki N. The root of the phylogenetic tree of human population//Mol. Biol. Evol. 1996. V. 13. P. 170-177.

81. Parsons T.J., Muniec D.S., Sullivan K. A high observed substitution rate in the human mitochondrial DNA control region // Nat. Genet. 1997. V. 15. P. 363-377.

82. Patterson M. Does a common mitochondrial DNA polymorphism underlie susceptibility to diabetes and the thrifty genotype? // Trends in Genet. 1998. V. 14. P. 387-389.

83. Penny D., Steel M., Waddell P.J., Hendy M.D. Improved analyses of human mtDNA sequences support a recent African origin for Homo sapiens. II Mol Biol Evol. 1995. V. 12. P. 863-882.

84. Popov A.A., Dolgikh B.O. The Ketts // The peoples of Siberia (eds. -Levin M.G., Potapov L.P.). Chicago: The University of Chicago Press. 1964. P. 607-619.

85. Posada D., Crandall K.A. Intraspecific gene genealogies: trees grafting into networks // Trends Ecol. Evol. 2001. V. 16. P. 37-45.

86. Quintana-Murci L., Semino O., Bandelt H.-J., Passarino G., McElreavey K., Santachiara-Benerecetti A.S. Genetic evidence of an early exit of Homo sapiens sapiens from Africa through eastern Africa //Nat. Genet. 1999. V. 23. P. 437-441.

87. Richards M., Macaulay V., Hickey E., Vega E., Sykes В., Guida V., Rengo C., et al. Tracing European founder lineages in the Near Eastern mitochondrial gene pool // Am. J. Hum. Genet. 2000. V. 67. P. 12511276.

88. Richards M.B., Macaulay V.A., Bandelt H.-J., Sykes B.C. Phylogeography of mitochondrial DNA in western Europe // Ann. Hum. Genet. 1998. V. 62. P. 241-260.

89. Robinson B.H. Human Complex I deficiency: clinical spectrum and involvement of oxygen free radicals in the pathogenecity of the defect // Bichem. Biophys. Acta. 1998. V. 1364. P. 271-286.

90. Rogers R.A. Language, human subspecification, and Ice Age barriers in Northern Siberia //Canad. J. Anthropol. 1986. V. 5. P. 11-22.

91. Ruvolo M. A new approach to studying modern human origins: hypothesis testing with coalescence time distributions // Mol. Phylogenet. Evol. 1996. V. 5. P. 202-219.

92. Saitou N., Nei M. The neighbor-joining method: a new method for reconstructin phylogenetic trees 11 Mol. Biol. Evol. 1987. V. 4. P. 406425.

93. Schurr T.G., Sukernik R.I., Starikovskaya Y.B., Wallace D.C. Mitochondrial DNA variation in Koryaks and Itel'men: population replacement in the Okhotsk Sea Bering Sea region during the Neolithic //Am. J. Phys. Anthropol. 1999. V. 108. P. 1-39.

94. Soodyall H, Vigilant L., Hill A.V., Stoneking M., Jenkins T. mtDNA control-region sequence variation suggests multiple independent origins or an "Asian-specific" deletion in sub-Saharan Africans // Am. J. Hum. Genet. 1996. V. 58. P. 595-608.

95. Stone A.C., Stoneking M. mtDNA analysis of a prehistoric Oneota population: implications for the peopling of the New World 11 Am. J. Hum. Genet. 1998. V. 62. P. 1153-1170.

96. Stoneking M. Mitochondrial DNA variation and human evolution // Mitochondrial DNA variation and human evolution. Oxford. 1996. P.263-281.

97. Stoneking M., Jorde L.B., Bhatia K., Wilson A. C. Geographic variation in human mitochondrial DNA from Papua New Guinea // Genetics. 1990. V. 124. P. 717-733.

98. Stringer C.B., Andrews P. Genetic and fossil evidence for the origin of modern humans // Science. 1988. V. 239. P. 1263-1268.

99. Swisher С. C. 3rd, Rink W.J., Anton S.C., Schwarcz H.P., Curtis G.H., Suprijo A., Widiasmoro. Latest Homo erectus of Java: potential contemporaneity with Homo sapiens in southeast Asia // Science. 1996. V. 274. P. 1870-1874.

100. Tajima F. The effect of change in population size on DNA polymorphism // Genetics. 1989. V. 123. P. 597-601.

101. Takahata N. Allelic genealogy and human evolution // Mol. Biol. Evol. 1993. V. 10. P. 2-22.

102. Tamura K., Nei M. Estimation of the number of the nucleotide substitutions in the control region of mitochondrial DNA in humans and chimpanzees // Mol. Biol. Evol. 1993. V. 10. P. 512-526.

103. Templeton A.R. The "Eve" hypothesis: A genetic critique and reanalysis // Am. Anthropol. 1993. V. 95. P. 51-72.

104. Thome A.G., Wolpoff M.H. The multiregional evolution of humans // Sci. Am. 1992. V. 4. P. 76-83.

105. Torroni A., Bandelt H.-J., Macaulay V., Richards M., Cruciani F., Rengo C., Martinez-Cabrera V., Villems R., Kivisild Т., Metspalu E.,

106. Torroni A., Huoponen K., Francalacci P., Petrozzi M., Morelli L., Scozzari R., Obinu D., Savontaus M.L., Wallace D.C. Classification of European mtDNAs from an analysis of three European populations // Genetics. 1996. V. 144. P. 1835-1850.

107. Torroni A., Neel J.V., Barrantes R., Schurr T.G., Wallace D.C. A mitochondrial DNA "clock" for the Amerinds and its implications for timing their entry into North America // Proc. Natl. Acad. Sci. 1994a. V. 91. P. 1158-1162.

108. Torroni A., Schurr T.G., Cabell M.F., Brown M.D., Neel J.V., Larsen, Smith D.G., et al. Asian affinities and continental radiation of the four founding Native American mtDNAs // Am. J. Hum. Genet. 1993b. V. 53. P. 563-590.

109. Torroni A., Wallace D.C. Mitochondrial DNA variation in human populations and implications for detection of mitochondrial DNA mutations of pathological significance // J. Bioenerg. Biomembr. 1994. V. 26. P. 261-271.

110. Uinuk-ool T. S., Takezaki N., Sukernik R.I., Nagl S., Klein J. Origin and affinities of indigenous Siberian populations as revealed by HLA class II gene frequencies // Hum. Genet. 2002. V. 110. P. 209-226.

111. Vigilant L., Stoneking M., Harpending H., Hawkes K., Wilson A.C. African populations and evolution of human mitochondrial DNA // Science. 1991. V. 253. P. 1503-1507.

112. Wallace D.C. Mitochondrial diseases in man and mouse // Science. 1999. V. 283. P. 1482-1488.

113. Wallace D.C. Mitochondrial DNA mutations and bioenergetic defects in aging and degenerative diseases // The Molecular and Genetic Basis of Neurologic of Neurological Disease. Boston. 1997. P. 237-269.

114. Wallace D.C. Mitochondrial DNA sequence variation in human evolution and disease // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1994. V. 91. P. 8739-8746.

115. Wallace D.C. Mitochondrial DNA variation in human evolution, degenerative disease, and aging // Am. J. Hum. Genet. 1995. V. 57. P. 201-223.

116. Wallace D.C., Brown M.D, Lott M.T. Mitochondrial DNA variation in human evolution and disease // Gene. 1999. V. 238. P. 211-230.

117. Wallace D.C., Donham B.R., Schurr T.G., Donham D.L., Panter-Brick C., Lell J.T. Origin of haplogroup M in Ethiopia // Am. J. Hum. Genet. 2000. V. 67 (Suppl). 217.

118. Wallace D.C., Lott M.T., Brown M.D., Kerstann K. Mitochondria and neuroophthalmologic diseases // The metabolic and molecular basis of inherited disease / Eds. Scriver C.R, Beavdet A.L, Valle D. New York: McGraw-Hill, 2001. V. 2. P. 2425-2512.

119. Wallace D.C., Lott M.T., Torroni A. et al. Report of the committee of human mitochondrial DNA // Cytogen. Cell Genet. 1992. V. 59. P. 727.

120. Ward R.H., Frazier B.L., Dew-Jager K., Paabo S. Extensive mitochondrial diversity within a single Amerindian tribe // Proc. Natl. Acad. Sci. 1991. V. 88. P. 8720-8724.

121. Wright S. Size of population and breeding structure in relation to evolution // Science. 1938. V. 87. P. 430.

122. Zishler H., Geisert H., von Haeseler A., Paabo S. A nuclear 'fossil' of the mitochondrial D-loop and the origin of modern humans // Nature. 1995. V. 378. P. 489-492.

123. Zullo S., Sieu L.C., Slightom J.L., Hadler H.I., Eisenstadt J.M. Mitochondrial D-loop sequences are integrated in the rat nuclear genome//J. Mol. Biol. 1991. V. 221. P. 1223-123.