Бесплатный автореферат и диссертация по биологии на тему

Новые актиномицеты семейства Microbacteriaceae, ассоциированные с нематодами подсемейства Anguininae

ВАК РФ 03.00.07, Микробиология

Содержание диссертации, кандидата биологических наук, Дорофеева, Любовь Владимировна

ВВЕДЕНИЕ.

ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

Глава 1. Современная система классификации актиномицетов основывается на принципах полифазной таксономии.

1.1. Фенотипические признаки, используемые для классификации и идентификации актиномицетов.

1.2. Характеристики генома, используемые в классификации и идентификации актиномицетов.

Глава 2. Систематика и экология актиномицетов семейства

Microbacteriaceae.

Глава 3. Актиномицетно-нематодные комплексы.

3.1. Краткая характеристика нематод подсемейства Anguininae.

3.2. Актиномицетно-нематодные комплексы.

ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ

Глава 4. Материалы и методы.

4.1. Объекты исследования.

4.2. Обработка галлов и посев образцов.

4.3. Изучение морфологических и культуральных признаков.

4.4. Изучение физиолого-биохимических признаков.

4.5. Изучение хемотаксономических признаков.

4.6. Молекулярно-генетические методы.

РЕЗУЛЬТАТЫ

Глава 5. Выделение микроорганизмов.

Глава 6. Таксономическое изучение актиномицетов с диаминомасляной кислотой (ДАМК) в клеточной стенке.

6.1. Штаммы В КМ Ас-1401т, ВКМ Ас-1802 и близкие организмы.

6.2. Штаммы ВКМ Ас-1390т и ВКМ Ас-1799т из галла на Festuca rubra.

6.3. Штаммы из галлов на листьях Cousinia onopordioides, семенах

Agrostis sp. и стеблях Elymus repens.

6.4. Штаммы ВКМ Ас-1790 и ВКМ Ас-1792 из семенных галлов на

Agrostis sp.

6.5. Штамм ВКМ Ас-1800 из филлосферы Androsace sp.

Глава 7. Таксономическое изучение актиномицетов, содержащих ДАМК и орнитин в клеточной стенке.

Глава 8. Таксономическое изучение актиномицетов с орнитином в клеточной стенке.

Глава 9. Таксономическое изучение актиномицетов с лизином в клеточной стенке.

9.1. Штаммы ВКМ Ас-2059т и ВКМ Ас-2062 из семян рябчика русского и клематиса.

9.2. Штамм ВКМ Ас-1396 из листового галла на Festuca rubra.

ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ

Глава 10. Выделение и описания новых таксонов актиномицетов.

10.1. Новый род Leifsonia и его видовой состав.

10.2. Новый род Agreia и его видовой состав.

10.3. Новый род Okibacterium и вид Okibacterium fritillariae.

10.4. Новые виды Rathayibacter caricis и Rathayibacter festucae.

10.5. Plantibacter agrosticola sp. nov., Plantibacter elymi sp. nov. и

Plantibacter cousiniae sp. nov.

10.6. Agromyces albus sp. nov.

10.7. Curtobacterium calamagrosticola sp. nov.

10.8. Frigoribacterium mesophilum sp. nov.

Глава 11. Местообитание бактерий изученных таксонов и актиномицетнонематодные фитопатогенные комплексы.

Введение Диссертация по биологии, на тему "Новые актиномицеты семейства Microbacteriaceae, ассоциированные с нематодами подсемейства Anguininae"

Актуальность темы. С точки зрения разнообразия генофонда и значимости для поддержания гомеостаза биосферы планеты, микроорганизмы превосходят все другие формы жизни на Земле. Между тем, доля изученных видов микроорганизмов ничтожно мала. Актуальность исследования и сохранения биологического разнообразия микроорганизмов подчеркивается рядом правительственных и международных документов последних лет, принятых, в частности, в связи с Конвенцией по биологическому разнообразию. Микробные сообщества, тесно ассоциированные с растениями и животными, являются потенциально богатыми источниками новых видов и родов бактерий. Организмы актиномицетной линии эволюции (актиномицеты) выделяются среди других бактерий наиболее сложной организацией генома и фенотипа на прокариотном уровне и превосходят все другие группы микроорганизмов по способности синтезировать антибиотики и другие физиологически активные соединения. Среди актиномицетов, ассоциированных с нематодами подсемейства Anguininae - высоко специализированными паразитами злаковых и сложноцветных растений, наиболее изученными являются коринеформные организмы семейства Microbacteriaceae (.Rathayibacter toxicus, R. tritici, R. iranicus. R. rathayi), привлекавшие внимание исследователей в связи с решением практических задач фитопатологии и сельского хозяйства. Бактерии вызывают гуммоз пшеницы и ряда пастбищных культур (Vidaver, 1982; Price, 1979); некоторые из них синтезируют коринетоксин, высокотоксичный для животных (Bird, 1981). Бактерии переносятся на хозяйские растения нематодами рода Anguina (А. funesta, A. tritici, Anguina sp.) и могут заселять растительные галлы, индуцированные ангвинами на хозяйских растениях (Sabet, 1954; Bird, 1981; McKay and Ophel, 1993). Крайне мало известно о возможных микробных ассоциантах других нематод подсемейства Anguininae, включающего более 30 галлообразующих видов (Krall, 1991). Вместе с тем, имеются некоторые косвенные данные в пользу того, что различные ангвинины, паразитирующие на дикорастущих растениях, могут быть также ассоциированы с бактериями. Изучение таких бактерий имеет теоретическое и практическое значение и находится в русле общих задач, стоящих перед микробиологией, экологией, нематологией.

Цель и задачи исследования. Целью настоящей работы являлся направленный поиск и таксономическое изучение новых и малоизученных групп актиномицетов из растительных галлов, индуцированных фитопатогенными нематодами различных видов и родов подсемейства Anguininae на дикорастущих растениях.

В конкретные задачи работы входило:

1. Выделение штаммов микроорганизмов из растительных галлов, индуцированных ангвининами, а также из контрольных образцов растений, не пораженных нематодами; создание рабочей коллекции.

2. Изучение морфологических и хемотаксономических признаков - основных родовых критериев актиномицетов; идентификация организмов до рода и выявление потенциальных представителей новых родов.

3. Определение последовательности нуклеотидов 16S рРНК генов и определение филогенетического положения организмов.

4. Изучение широкого спектра физиологических признаков, определение уровня ДНК-гомологии между представителями фенотипически близких групп; идентификация штаммов на уровне вида.

5. Оценка полученных данных; описание новых таксонов и таксономическая ревизия изученных групп актиномицетов семейства Microbacteriaceae на основе принципов полифазной таксономии.

Научная новизна работы. Валидно описаны 3 новых рода - Agreia, Leifsonia и Okibacterium, включающие 5 новых и реклассифицированных видов - Agreia bicolorata, Leifsonia роае, Leifsonia aquatica, Leifsonia xyli и Okibacterium fritillaria. Обнаружены и описаны 8 новых видов ранее известных родов: Rathayibacter carisis, Rathayibacter festucae, Agromyces albus, Plantibacter cousiniae, Plantibacter agrosticola, Plantibacter elymi, Frigoribacterium mesophilum и Curtobacterium calamagrosticola. Вывлено 7 новых ассоциаций фитопатогенных галлообразующих нематод подсемейства Anguininae и актиномицетов семейства Microbacteriaceae, Обнаружена новая структура пептидогликана клеточной стенки у организмов рода Agreia.

Практическое значение. Усовершенствована система классификации бактерий семейства Microbacteriaceae, охватывающего около половины известных фитопатогенных видов актиномицетов. Предложены диагнозы и схемы идентификации новых и реклассифицированных таксонов и уточнены диагнозы ряда ранее описанных родов и видов, включая фитопатогенные и/или ассоциированные с фитопатогенными нематодами. Таксономические предложения вошли в практику микробиологии и фитопатологии и нашли отражение в ряде документов и рекомендаций, касающихся вопросов защиты растений. Создана представительная коллекция детально охарактеризованных бактерий, которые включены в фонд Всероссийской коллекции микроорганизмов, а также переданы в национальные коллекции Японии (IFO и JCM), Германии (DSMZ), Франции (CIP) и могут быть использованы широким кругом специалистов в качестве объектов исследований в области микробиологии, экологии, фитопатологии, а также для поиска метаболитов, перспективных для использования в биотехнологии.

Апробация работы. Материалы диссертации были представлены на 7-ом Международном конгрессе бактериологов (Прага, 1994), Междуна-родном симпозиуме по биологии актиномицетов (Москва, 1994), Международной конференции "Микробное разнообразие" (Пермь, 1996), Международных нематологических симпозиумах (Москва, 1997; Санкт-Петербург, 1999), Международном симпозиуме "Современные проблемы биохимии микроорганизмов и биотехнологии" (Пущино, 2000), рабочем совещании микробиологов Поволжья (Саратов, 2000), 5ой конференции молодых ученых (Пущино, 2001), докладывались на заседаниях Ученого Совета ИБФМ им. Г.К. Скрябина РАН (1999), а также семинарах отдела Всероссийская коллекция микроорганизмов ИБФМ им. Г.К. Скрябина РАН (1994-2001).

Публикации. По материалам диссертации опубликовано 14 работ.

Структура и объем работы. Диссертация изложена на 136 страницах и состоит из введения, обзора литературы, экспериментальной части, включающей описание материалов и методов исследований, результатов исследований и их обсуждения, выводов и списка цитируемой литературы, включающего 232 ссылки; содержит 23 таблицы и 7 рисунков.

Заключение Диссертация по теме "Микробиология", Дорофеева, Любовь Владимировна

выводы

На основании филогенетической обособленности по 16S рДНК и принадлежности изученных организмов к различным геномовидам, согласующихся с отличиями по фенотипическим и экологическим характеристикам, описано 3 новых рода и 13 новых видов бактерий семейства Microbacteriaceae, изолированных из индуцированных ангвининами растительных галлов и растений без видимых признаков нематодного заражения.

1. Валидно описан новый род Agreia, характеризующийся новой структурой пептидогликана клеточной стенки, содержащего две диаминокислоты - диаминомасляную и орнитин. Род включает типовой вид Agreia bicolorata и реклассифицированный вид Agreia pratensis, описанный ранее как Subtercola pratensis. Уточнен диагноз рода Subtercola.

2. Валидно описан новый род Leifsonia, включающий новые виды Leifsonia aquatica, Leifsonia роае, и реклассифицированный вид Leifsonia xyli, описанный ранее как Clavibacter xylt уточнен диагноз рода Clavibacter.

3. Валидно описан новый род Okibacterium с единственным видом Okibacterium fritillaria.

4. Обнаружены и описаны новые виды ранее известных родов: Rathayibacter carisis, Rathayibacter festucae, Agromyces albus sp. nov., Plantibacter cousiniae sp. nov., Plantibacter agrosticola sp. nov., Plantibacter elymi sp. nov., Frigoribacterium mesophilum sp. nov., Curtobacterium calamagrosticola sp. nov. Уточнены и дополнены диагнозы родов Plantibacter и Frigoribacterium.

5. Выявлено 7 новых ассоциаций актиномицетов семейства Microbacteriaceae и фитопатогенных галлообразующих нематод подсемейства Anguininae: Agreia bicolorata -Heteroanguina graminophila, Leifsonia poae - Subanguina radicicola, Rathayibacter festucae -Anguina graminis, Plantibacter cousiniae - Mesoanguina picridis, Plantibacter agrosticola -Anguina agrostis, Plantibacter elymi - Anguina agropyri, Curtobacterium calamagrosticola -Heteroanguina graminophila.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

Проведенные исследования показали, что галлы, индуцированные различными нематодами подсемейства Anguininae - богатый источник новых видов и родов актиномицетов. На основании филогенетической обособленности по 16S рДНК и принадлежности ряда изученных организмов к различным геномовидам, согласующихся с отличиями по фенотипическим и экологическим характеристикам, валидно описан ряд новых видов и родов и усовершенствована система классификации бактерий семейства Microbacteriaceae, охватывающего около половины известных фитопатогенных видов актиномицетов.

Бактерии, отнесенные к 7 новым видам, были обнаружены в галлах, индуцированных нематодой одного вида, и в большинстве случаев доминировали или абсолютно преобладали среди микроорганизмов, выросших из суспензий поверхностно-стерилизованных галлов. Представители этих видов не были обнаружены нами и другими авторами в многочисленных исследованиях бактерий микробных сообществ, в той или иной мере ассоциированных с надземной или корневой системой растений без признаков поражения ангвининами. Такие бактерии, по всей вероятности, можно рассматривать в качестве ассоциантов соответствующих видов нематод.

Ранее опубликованные данные и полученные нами результаты позволяют говорить о специфичности компонентов фитопатогенных комплексов "актиномицет-нематода", поражающих сельскохозяйственные и дикорастущие растения. В галлах, индуцированных нематодами рода Anguina, помимо Rathayibacter spp., могут обнаруживаться также бактерии рода Plantibacter, фенотипически сходные с актиномицетами рода Rathayibacter. Актиномицеты родов Agreia, Leifsonia, Plantibacter и Curtobacterium выделены из галлов, индуцированных нематодами родов Heteroanguina, Subanguina и Mesoanguina, для которых ранее не было описано актиномицетов-ассоциантов.

Проведенное исследование, задачей которого был ответ на вопрос - какие актиномицеты присутствуют в нематодных галлах - является первым этапом изучения сложных многокомпонентных фитопатогенных комплексов. Выяснение роли актиномицетов и других микроорганизмов, обнаруженных в таких комплексах, присутствие в них возможных некультивируемых бактерий, понимание их взаимодействия с нематодами, растениями и фагами - задачи будущих комплексных исследований микробиологов, молекулярных биологов, фитопатологов и нематологов.

Библиография Диссертация по биологии, кандидата биологических наук, Дорофеева, Любовь Владимировна, Пущино

1. Агре Н. С. 1986. Систематика термофильных актиномицетов. Пущино, ОНТИ НЦБИ АН СССР, 132 с.

2. Гнилозуб, В.А., Г.М. Стрешинская, Л.И. Евтушенко, И.Б. Наумова, и А.С. Шашков. 1994. 1,5-Поли(рибит)фосфат с тетрасахаридными заместителями в клеточной стенке Agromyces fucosus ssp. hippuratus. Биохимия, т. 59, с. 1892-1829.

3. Добровольская, Т. Г., И. Ю. Чернов, Л. И. Евтушенко, Д. Г. Звягинцев. 1999. Разнообразие сапротрофных бактерий в пустынных биогеоценозах. Успехи современной биологии, т. 119, с. 151-164.

4. Добровольская, Т. Г. 2002. Структура бактериальных сообществ почв. М., ИКЦ «Академкнига», 282 с.

5. Згурская, Е. И. 1993. Систематика актиномицетов, содержащих диаминомасляную кислоту в клеточной стенке. Кандидатская диссертация. Институт биохимии и физиологии микроорганизмов РАН, Пущино, 170 с.

6. Зеленкова Н. Ф. 1988. Итоги науки и техники. Серия хроматография, т. 6, с. 146.

7. Калакуцкий, Л. В. и Н. С. Агре. 1977. Развитие актиномицетов. М., Наука. 285 с.

8. Кирьянова, Е. С. и Е. Л. Кролл. 1972. Фитопатогенные нематоды и их контроль. Ленинград, Наука. 522 с.

9. Конева, Н. Д. и Ю. В. Круглов. 2001. Динамика объема и структура почвенного бактериального комплекса в присутствии азобензена. Микробиология, т. 70, с. 552-557.

10. Красильников, Н. А. 1970. Лучистые грибки. М., Наука. 345 с.

11. Методы общей бактериологии. Под ред. Герхарда Ф. и др. 1983. М., Мир, т. 3. 536 с.

12. Методы почвенной микробиологии. Под ред. проф. Звягинцева Д. Г. 1980. М., Изд-во Московского университета, 224 с.

13. Наумова, И. Б. и А. С. Шашков. 1997. Анионные полимеры в клеточной стенке грамположительных бактерий. Биохимия, N 4, т. 62, с. 809-840.

14. Нестеренко, О. А., Е. И. Квасников, и Т. М. Ногина. 1985. Нокардиоподобные и коринеподобные бактерии. Киев, Наукова думка, 334 с.

15. Соловьева, Г. И. и Е. Л. Кролл. 1983. Нематодные галлы осоки. Ленинград. Наука. 231 с.

16. Стрешинская, Г. М., И. Б. Наумова, и Л. И. Панина. 1979. Химический состав клеточной стенки Streptomyces chrysomallus, образующего антибиотик аурантин. Микробиология, т. 48, с. 814-819.

17. Парамонов, А. А. 1967. Критический обзор подотряда Tylenchina (Филипьев, 1934) (Нематода: Secernentea). Труды лаборатории гельминтологии Академии Наук СССР, т. 18, с. 78-101.

18. Чижов, В. Н. 1980. Таксономический статус некоторых видов рода Anguina Scopoli, 1777. Сборник Всесоюзного Института Гельминтологии, т. 26, с. 83-95.

19. Чижов, В. Н. и С. А. Субботин. 1985. Ревизия нематод подсемейства Anguininae (Нематода, Tylenchida) на основании их биологических характеристик. Зоологический Журнал, т. 64 (10), с. 1476-1486.

20. Чижов, В. Н. и С. А. Субботин. 1990. Фитопатогенные нематоды подсемейства Anguininae (Нематода, Tylenchida). Морфология, пищевая специализация. Зоологический журнал, т. 69 (1), с. 15-26.

21. Agrios, G. 1997. Plant pathology, 4th edn. Academic Press, Toronto.

22. Altenburger, P., P. Kampfer, A. Makristathis, W. Lubitz, and H.-J. Busse. 1996. Classification of bacteria isolated from a medieval wall painting. J. Biotechnol., vol. 47, pp. 39-52.

23. Beattie, G. A., and S. E. Lindow. 1995. The secret life of foliar bacterial pathogens on leaves. Annu. Rev. Phytopathol., vol. 33, pp. 145-172.

24. Behrendt, U., T. Muller, and W. Seyfarth. 1997. The influence of extensification in grassland management on the populations of micro-organisms in the phyllosphere of grasses. Microbiol. Res., vol. 152, pp. 75-85.

25. Bergey, D. H., F. C. Harrison, R. S. Breed, B. W. Hammer, and F. M. Huntoon. 1923. p. 1-442. In, pp. Bergey's manual of determinative bacteriology, 1st edn. Williams and Wilkins, Baltimore.

26. Bird, A. F. 1981. The Anguina-coryneform association. In: В. M. Zuckerman and R. A. Rhode (ed.), Plant parasitic nematodes, vol. 3, Academic Press, New York, pp. 303-323.

27. Bird, A. F. 1985. The nature of the adhesion of Corynebacterium rathayi to the cuticle of the infective larva of Anguina agrostis. Int. J. Parasitol., vol. 15, pp. 301-308.

28. Bradbury, J. F. 1986. Guide to plant pathogenic bacteria. Commonwealth Agricultural Bureau (CAB), International Mycological Institute, Kew, UK.

29. Brennan, N. M., R. Brown, M. Goodfellow, A. Ward, T. P. Beresford, N. Vancanneyt, T.M. Cogan, and P. F. Fox. 2001. Microbacterium gubbeenense sp. nov., from the surface of a smear-ripened cheese. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., vol. 51, pp. 1969-1976.

30. Brzeski, M. W. 1981. The genera of Anguinidae (Nematoda, Tylenchida). Rev. Nematol., vol. 4, pp. 23-34.

31. Busse, H.-J. and P. Schumann. 1999. Polyamine profiles within genera of the class Actinobacteria with LL-diaminopimelic acid in the peptidoglycan. Int. J. Syst. Bacterid., vol. 49, pp. 179-184.

32. Carlson, R. R., and A. K. Vidaver. 1982. Taxonomy of Corynebacterium plant pathogens, including a new pathogen of wheat, based on polyacrylamide gel electrophoresis of cellular proteins. Int. J. Syst. Bacterid., vol. 32, pp. 1315-1326.

33. Cavalier-Smith, T. 2002. The neomuran origin of archaebacteria, the negibacterial root of the Universal tree and bacterial megaclassification. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., vol. 52, pp. 7-76.

34. Chandler, D.P, F. J. Brockman, T. J. Bailey, and J. K. Fredrickson. 1998. Phylogenetic diversity of Archaea and Bacteria in a deep subsurface Paleosol. Microb. Ecol., vol. 36, pp. 37-50.

35. Chatelain, R., and L. Second. 1966. Taxonomie numerique de quelques Brevibacterium. Ann. Inst. Pasteur (Paris)., vol. 111, pp. 630-644.

36. Cheeke, P. R. 1995. Endogenous toxins and mycotoxins in forage grasses and their effects on livestock. J. Anim. Sci., vol. 73, pp. 909-918.

37. Christner, В. C. 2002. Recovery of bacteria from glacial and subglacial environments. Thesis. Ohio State University, Columbus, OH, USA.

38. Clise, E. H. 1948. Appendix to suborder Eubacteriineae. In: R. S. Breeds, E. G. D. Murray and A. P. Hitchens (ed.), Bergey's mannual of determinative bacteriology, 6th edn. Williams and Wilkins, Baltimore, pp. 692-693.

39. Collins, M. D., and J. F. Bradbury. 1986. Plant pathogenic species of Corynebacterium. In: V. H. Sneath, N. A. Mair, M. E. Sharpe and J. G. Holt (ed.), Bergey's manual of systematic bacteriology, vol. 2. Williams and Wilkins, Baltimore, pp. 1276-1283.

40. Collins, M. D., and D. Jones. 1980. Lipids in the classification and identification of coryneformbacteria containing peptidoglycans based on 2,4-diaminobutyric acid. J. Appl. Bacterid, vol. 48, pp. 459-470.

41. Collins, M. D., and D. Jones. 1981. The distribution of isoprenoid quinone structural types in bacteria and their taxonomic implications. Microbiol. Rev., vol. 45, pp. 316-354.

42. Collins, M.D., and D. Jones. 1984. In: Validation of the publication of new names and new combinations previously effectively published outside the IJSB. List No. 14. Int. J. Syst. Bacterid., vol. 34, pp. 270-271.

43. Collins, M. D., M. Goodfellow, M., and D. E. Minnikin. 1980. Fatty acid, isoprenoid quinone and polar lipid composition in the classification of Curtobacterium and related taxa. J.Gen. Microbiol., vol. 118, pp. 29-37.

44. Collins, M. D., D. Jones, R. M. Keddie, R. M. Kroppenstedt, and К. H. Schleifer. 1983b. Classification of some coryneform bacteria in a new genus Aureobacterium. System. Appl. Microbiol., vol. 4, pp. 236-252.

45. Collins, M. D., R. A. Burton, D. Jones. 1988. Title Corynebacterium amycolatum sp. nov. a new mycolic acid-less Corynebacterium species from human skin. FEMS Microbiol. Lett., vol. 49, pp. 349-352.

46. Cross, G., and Alderson. 1988. What weight morphology in current actinomycete taxonomy? In: Biology of Actinomycetes'88 , pp.216-220. Edited by Y.Okami, T.Beppu, H.Ogawara, eds.), proceeddings of 7th Int. Symp. On biology of Actinomycetes,

47. Crosti, R, M. Malerba, and R. Bianchetti. 2001. Tunicamycin and brefeldin A induce in plant cells a programmed cell death showing apoptotic features. Protoplasma, vol. 216, pp. 31-38.

48. Cummins, C. S., R.A. Lelliott, and M. Rogosa. 1974. Genus Corynebacterium. In: R. E. Buchanan and N.E. Bibbons (ed.), Bergey's mannual determinative bacteriology, 8th edn. Williams and Wilkins, Baltimore, pp. 602-617.

49. Davis, M. J., A. Ci. Jr. Gillaspie, R. W. Harris, and R. H. Lawson. 1980. Ratoon stunting disease of sugarcane: isolation ol the causal bacterium. Science, vol. 210, pp. 1365-1367.

50. De Bruyne, E., J. Swings, and A. Kersters. 1992. Enzymaic relatedness amongst phytopathogenic coryneform bacteria and its potential use for their identification. System. Appl. Microbiol., vol. 15, pp. 393-401.

51. Dias, F. F. 1963. Studies in the bacteriology of sewage. J. Indian Inst. Sci., vol. 45, pp. 36-48.

52. Dias, F. F., and J. V. Bhat. 1962. A new levan producing bacterium, Corynebacterium laevaniformans. Antonie van Leeuwenhoek, vol. 28, pp. 63-72.

53. Dias, F. F., M. H. Bilimoria, and J. V. Bhat. 1962. Corynebacterium barkeri nov. spec., a pectinolytic bacterium exhibiting a biotin-folic acid inter-relationship. J. Ind. Inst. Sci., vol. 44, pp.59-67.

54. Dopfer, H., E. Stackebrandt, and F. Fiedler. 1982. Nucleic acid hybridization studies on Microbacterium, Curtobacterium, Agromyces and related taxa. J. Gen. Microbiol., vol. 128, pp. 1697-1708.

55. Dowson, W. J. 1942. On the generic name of the gram-positive bacterial plant pathogens. Trans. Brit. Mycol. Soc., vol. 25, pp. 311-314.

56. Duncan, К. E., K. L. Sublette, P. A. Rider, A. Stepp, R. R. Beitle, J. A. Conner, and R. Kolhatkar. 2001. Analysis of a microbial community oxidizing inorganic sulfide and mercaptans. Biotechnol. Prog., vol. 17, pp. 768-774.

57. Dunleavy, J. M. 1989. Curtobacterium plantarum sp. nov. is ubiquitous in plant leaves and is seed transmitted in soybean and corn. Int. J. Syst. Bacteriol., vol. 39, pp. 240-249.

58. Dye, D. W., and W. J. Kemp. 1977. A taxonomic study of plant pathogenic Corynebacterium species. N. Z. J. Agric. Res., vol. 20, pp. 563-582.

59. Finne, H. 2001. Effect of tunicamycin on hepatocytes in vitro. 2001. J. Сотр. Pathol., vol. 125, pp. 318-321.

60. Finnie, J. W., and Т. M. Mukherjee. 1986. Ultrastructural changes in the cerebellum of nursling rats given corynetoxin, the aetiological agent of annual ryegrass toxicity. J. Сотр. Pathol., vol. 96, pp. 205-216.

61. Frankland, G. C., and P. F. Frankland. 1889. Ueber einige typische Mikroorganismen im Wasser und im Boden. Zent. Bakt. Parasit. Inf. Med. Mikrobiol. Immunol., vol. 6, pp. 373400.

62. Fortuner, R., and A. R. Maggenti. 1987. A reappraisal of Tylenchina (Nemata). 4. The family Anguinidae Nicoll, 1935 (1926). Revue Nematol., vol. 10, pp. 163-176.

63. Funke, G., E. Falsen, and C. Barreau. 1995. Primary identification of Microbacterium spp. encountered in clinical specimens as CDC coryneform group A-4 and A-5 bacteria. J. Clin. Microbiol, vol. 33, pp. 188-192.

64. Funke, G., P. A. Lawson, F. S. Nolte, N. Weiss, and M. D. Collins. 1998. Aureobacterium resistens sp. nov., exhibiting vancomycin resistance and teicoplanin susceptibility. FEMS Microbiol. Lett., vol. 158, pp. 89-93.

65. Galloway, J. H. 1961. Grass seed nematode poisoning in livestock. J. Am. Vet. Assoc., vol. 139,pp. 1212-1214.

66. Gillaspie, A. G. Jr., and D. S. Teackle. 1989. Ratoon stunting disease. In: C, Ricaud, В. T. Egan, A. G. Gillaspie Jr., and C. G. Hudges (ed), Diseases of sugarcane. Elsevier Publ., Amsterdam, pp. 59-80.

67. Gillies, A. J. 1971. Significance of thermoduric organisms in Queensland Cheddar cheese, Australian J. Dairy Techonol., vol. 26, pp. 145-149.

68. Gledhill, W. E., and L. E. Casida. 1969. Predominant catalase-negative soil bacteria. III. Agromyces gen. п., microorganisms intermediary to Actinomyces and Nocardia. Appl. Microbiol., vol. 18, pp. 340-349.

69. Goodfellow, M. 1989. The actinomycetes 1, Supra genetic classification of actinomycetes, pp. 2333-2339. In: S. T. Williams, M. E. Sharpe, and J. G. Holt (ed.), Bergey's manual of systematic bacteriology, vol. 4. Williams and Wilkins, Baltimore.

70. Goodfellow, M., and A.G. O'Donnell. 1994. Roots of bacterial systematics. In: Handbook of new bacterial systematics. pp. 3-56. Edited by Goodfellow M. and O'Donnel A.G. London: Academic Press.

71. Goodfellow, M., and T. Cross. 1984. The biology of the actinomycetes. In: The Biology of the Actinomyces, pp. 7-164. Edited by M. Goodfellow, M. Mordarski, S.T. Williams. London: Academic Press.

72. Goodfellow, M., and D.E. Minnikin. 1985. Introduction to chemosystematics In: Chemical Methods in Bacterial Systematics, pp. 1-15. Edited by M. Goodfellow and D.E. Minnikin. London, Academic Press.

73. Gross, D. C., and Vidaver, A. K. 1979. Bacteriocins of phytopathogenic Corynebacterium species. Can. J. Microbiol., vol. 25, pp. 367-374.

74. Groth, I., P. Schumann, N. Weiss, K. Martin, and F. A. Rainey. 1996. Agrococcus jenensis gen. nov., sp. nov., a new genus of actinomycetes with diaminobutyric acid in the cell wall. Int. J. Syst. Bacteriol, vol. 46, pp. 234-239.

75. Grove, D. I., V. Der-Haroutian, and R. M. Ratcliff. 1999. Aureobacterium masquerading as 'Corynebacterium aquaticum' infection: case report and review of the literature. J. Med. Microbiol., vol. 48, pp. 965-970.

76. Gupta, P., and G. Swarup. 1972. Ear-cockle and yellow ear rot disease of wheat II. Nematode bacterial association. Nematologia, vol. 18, pp. 320-324.

77. Hallmann, J., A. Quart-Hallmann, W. F. Mahaffee, and J. W. Kloepper. 1997. Bacterial endophytes in agricultural crops. Can. J. Microbiol., vol. 43, pp. 895-914.

78. Hayward, A. C. 1974. Latent infections of bacteria. Ann. Rev. Phytopathol., vol. 12, pp. 87-97.

79. Hedges, F. 1922. A bacterial wilt of beans caused by Bacterium flaccumfaciens nov. sp. Science, vol. 55, pp. 433-434.

80. Hou, С. Т., W. Brown, D. P. Labeda, T. P. Abbott, and D. Weisleder. 1997. Microbial production of a novel trihydroxy unsaturated fatty acid from linoleic acid. J. Ind. Microbiol. Biotechnol., vol. 19, pp. 34-38.

81. Inoue, K., and K. Komagata. 1976. Taxonomic study on obligately psychrophilic bacteria isolated from Antarctica. J. Gen. Appl. Microbiol, vol. 22, pp. 165-176.

82. Jacobs J.L., and G. W. Sundin. 2001. Effect of solar UV-B radiation on a phyllosphere bacterialcommunity. Appl. Env. Microbiol., vol. 67, pp. 5488-5496.

83. Jago, M. V., A. L. Payne, J. E. Peterson, and T. J. Bagust. 1983. Inhibition of glycosylation by corynetoxin, the causative agent of annual ryegrass toxicity: a comparison with tunicamycin. Chem. Biol. Interact., vol. 45, pp. 223-234.

84. Kado, С. I. 1992. Plant pathogenic bacteria, p. 659-674. In A. Balows, H. G. Truper, M. Dworkin, W. Harder and К. H. Schleifer. (ed.), The Prokaryotes, 2 ed. Vol. 1, Springer Verl., New York.

85. Kampfer, P., and M. Kroppenstedt. 1996. Numerical analysis of fatty acid patterns of coryneform bacteria and related taxa. Can. J. Microbiol., vol. 42, pp. 989-1005.

86. Keddie, R. M., and G. L. Cure. 1977. The cell wall composition and distribution of free mycolic acids in named strains of coryneform bacteria and in isolates from various natural sources. J. Appl. Bacteriol., vol. 42, pp. 229-252.

87. Keyworth, W. G., J. Howell, and W. J. Dowson. 1956. Corynebacterium betae (sp. nov.). The casual organisms of silvering disease of red beet. Plant Pathol., vol. 5, pp. 88-90.

88. Kimura, M., and T. Ohta. 1972. On the stochastic model for estimation of mutation distance between homologous proteins. J. Mol. Evol., vol 2, pp. 87-90.

89. Kobayashi, M., Y. Mitsuishi, and K. Matsuda. 1978. Pronounced hydrolysis of highly branched dextrans with a new type of dextranase. Biochem. Biophys. Res. Commun., vol. 80, pp. 306312.

90. Komagata, К., and H. Iizuka. 1964. New species of Brevibacterium isolated from rice. J. Agric. Chem. Soc. Jpn., vol. 38, pp. 496-502.

91. Korzybski, Т., Z. Kowszyk-Gindifer, and W. Kurylowicz. 1978. Antibiotics. Origin, nature properties, vol. 1. Am. Soc. Microbiol., Washington, pp. 773-774.

92. Kotani, S., T. Kato, T. Matsubara, M. Sakagoshi, and Y. Hirachi. 1972. Inducible enzyme degrading serologically active polysaccharides from mycobacterial and corynebacterial cells. Biken J., vol. 15, pp. 1-15.

93. Krall, E. L. 1991. Wheat and grass nematodes: Anguina, Subanguina, and related genera. In: W. R. Nickle (ed.), Manual of agricultural nematology. Marcel Dekker, Inc., New York, pp.721-760.

94. Kroppenstedt R. M., E. Stackebrandt, M .Goodfellow. 1990. Taxonomic revision of the actinomycete genera Actinomadura and Microtetraspora . Syst. Appl. Microbiol., vol. 13, pp. 148-160.

95. Labeda, D. R 1987. Actinomycete taxonomy: generic characterization. Developments in Industrial Microbiology, vol. 28, pp. 115-121.

96. Laiz, L., I. Groth, P. Schumann, F. Zezza, A. Felske, B. Hermosin, and C. Saiz-Jimenez. 2000. Microbiology of the stalactites from Grotta dei Cervi, Porto Badisco, Italy. Int. Microbiol., vol. 3, pp. 25-30.

97. Lechevalier M.P. 1968. Identification of aerobic actinomycetes of clinical importance. J. Lab. Clin. Med., vol. 71, pp. 934-944.

98. Lechevalier, H., M. P. Lechevalier, N. N. Gerber. 1971. Chemical composition as a criterion in the classification of actinomycetes. Adv. Appl. Microbiol., vol. 14, pp. 47-72.

99. Lednicka D., J. Mergaert, M.C. Cnockaert, and J. Swings. 2000. Isolation and identification of cellulolytic bacteria involved in the degradation of natural cellulosic fibres. Syst. Appl. Microbiol., vol. 23, pp. 292-299.

100. Leifson, E. 1962. The bacterial flora of distilled and stored water. III. New species of genera Corynebacterium, Flavobacterium, Spirillum, and Pseudomonas. Int. Bull. Bacteriol. Nomencl. Taxon., vol. 12, pp.161-170.

101. Lochhead, A. G. 1958. Two new species of Arthrobacter requiring respectively vitamin В12 and the terregens factor. Arch. Mikrobiol., vol. 31, pp. 163-170.

102. Lochhead, A. G., and M. O. Burton. 1953. An essential bacterial growth factor produced by microbial synthesis. Canadian J. Bot., vol. 31, pp. 7-22.

103. Lysenko, О. 1959. The occurrence of species of the genus Brevibacterium in insects. J. Insect Pathol., vol. l,pp. 34-42.

104. Marmur, J., and P. Doty. 1962. Determination of the dase composition of deoxyribonucleic acid from its thermal denaturation temperature. J. Mol. Biol., vol. 5, pp. 109-И 8.

105. Matsuyama, H., K. Kawasaki, I. Yumoto, and O. Shida. 1999. Microbacterium kitamiense sp. nov., a new polysaccharide-producing bacterium isolated from the wastewater of a sugar-beet factory. Int. J. Syst. Bacterid., vol. 49, pp. 1353-1357.

106. McCulloch, L. 1925. Aplanobacter insidiosum n. sp. The cause of an alfalfa disease. Phytopathology, vol. 15, pp. 496-497.

107. McKay, A. C., and К. M. Ophel. 1993. Toxigenic Clavibacter/Anguina associations infecting grass seedheads. Annu. Rev. Phytopathol., vol. 31, pp. 151-167.

108. McKay, A.C., K.M. Ophel, Т. B. Reardon, and J. M. Gooden. 2001. Livestock deaths associated with Clavibacter toxicus!Anguina sp. infection in seedheads of Agrostis avenacea and Polypogon monspeliensis. Plant Disease, vol. 77, pp. 635-641.

109. Metzler, M. С., M. J. Laine, and S. H. De Boer. 1997. The status of molecular biological research on the plant pathogenic genus Clavibacter. FEMS Microbiol. Lett., vol. 150, pp. 1-8.

110. Meyer, A. J. 1998. The biology of Anguina agrostis (Nematoda: Anguinidae) and annual ryegrass toxicity (A.R.G.T.) in the Western Cape Province of South Africa. Russian Journal of Nematology, vol. 6, pp. 67.

111. Meyer, S. A., and К. H. Schleifer. 1978. Deoxyribonucleic acid reassoaciation in the classification of coagulase-positive staphylococci. Arch. Microbiol., vol. 117, pp. 183-188.

112. Moffett, M. L., P. C. Fahy, and D. Cartwright. 1983. Corynebactcrium. In: P. C. Fahy and G. J. Persley (ed.), Plant bacterial diseases; a diagnostic guide. Academic Press, Sydney, Australia, p. 45-65.

113. Murray, T. D. 1986. Isolation of Corynebacterium agropyri from 30 to 40-year-old herbarium speciments of Agropyron species. Plant Dis., vol. 70, pp. 378-380.

114. Nakayama, K., A. Kato, Y. Ueno, Y. Minoda, and K. Komagata. 1980. Studies on the metabolism of trichothecene mycotoxins. II. Metabolism of T-2 toxin with the soil bacteria. Proc. Jpn. Assoc. Mycotoxicol., vol. 12, pp. 30-32.

115. Nakazawa, K. and S. Suzuki. 1975. Purification of keratan sulfate-endogalactosidase and its action on keratan sulfates of different origin. J. Biol. Chem., vol. 250, pp. 912-917.

116. Nakazawa, К., N. Suzuki, and S. Suzuki. 1975. Sequential degradation of keratan sulfate by bacterial enzymes and purification of a sulfatase in the enzymatic system. J. Biol. Chem., vol. 250, pp. 905-911.

117. Naumova, I. B. 1988. The teichoic acids of actinomycetes. Microbiol Sci., vol. 5, pp. 275-279.

118. Norton, D. C. 1965. Anguina agropyronifloris n. sp. infecting florets of Agropyron smithii. Proc. Helminth. Soc. Wash, vol. 32, pp. 118-123.

119. Oberreuter, H., H. Seiler, and S. Scherer. 2002. Identification of coryneform bacteria and related taxa by Fourier-transform infrared (FT-IR) spectroscopy. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., vol. 52, pp. 91-100.

120. O'Gara, P. J. 1916. A bacterial disease of western wheat grases. First acount of the occurrence of a new type of bacterial disease in America. Science (Washington), vol. 42, pp. 616-617.

121. Omelianski, V. L. 1923. Aroma-producing microorganisms. J. Bacteriol., vol. 8, pp. 393-419.

122. Orla-Jensen, S. 1919. The lactic acid bacteria. Host and Son, Copenhagen.

123. Ozerskaya S. M. and A. N. Vasilenko. 1992. Package for cluster analysis on an IBM PC computer. Binary, vol.4, pp. 33-34.

124. Powers, Т. O., J. A. Griesbach, A. L. Szalanski, and B. J. Adams. 1998. Molecular identification of anguinid species. J. Nematol. vol. 30, pp. 511.

125. Powers, Т. O., A. L. Szalanski, P. G. Mullin, T. S. Harris, T. Bertozzi, and J. A. Griesbach. 2001. Identification of seed gall nematodes of agronomic and regulatory concern with PCR-RFLP of ITS1. J. Nematol., vol. 33, pp. 191-194.

126. Price, P. G., J. M. Fisher, and A. Kerr. 1979. On Anguina funesta n. sp. and its association with Corynebacterium sp. in infected Loluim rigidum. Nematologica, vol. 25, pp. 76-85

127. Pridham, T.G., and D. Gottlieb. 1948. The utilization of carbon compounds by some Actinomycetales as an aid for species determination. J. Bacteriol., vol. 56, pp. 107-114.

128. Rainey, F. A., R. U. Ehlers, and E. Stackebrandt. 1995. Inability of the polyphasic approach to systematics to determine the relatedness of the genera Xenorhabdus and Photorhabdus. Int. J. Syst. Bacterid., vol. 45, pp. 379-381.

129. Renfro, B. L., and E. W. Sprague. 1959. Reaction of Medicago species to eigth Alfalfa pathogens. Agr. J., vol. 51, pp. 481-483.

130. Richardson, M. J. 1979. An annotated list of seed-borne disease, third edition. Phytopathological Paper 23, Commonwealth Agricultural Bureau (CAB), International Mycological Institute, Kew, UK.

131. Richardson, M. J. 1983. An annotated list of seed-borne diseases, 3rd ed., Suppl. 2. International Seed Testing Association, Zurich.

132. Riley, I. T. 1987. Serological relationships between strains of coryneform bacteria responsible for annual ryegrass toxicity and other plant-pathogenic corynebacteria. Int. J. Syst. Bacteriol., vol. 35, pp. 53-159.

133. Riley, I. Т., and J. M. Gooden. 1991. Bacteriophage specific for the Clavibacter spp. associated with annual ryegrass toxicity. Lett. Appl. Microbiol., vol. 12, pp. 158-160.

134. Riley, I. Т., and A. C. Mc Kay. 1990. Specificity of the adhesion of some plant pathogenic microorganisms to the cuticle of the nematodes in the genus Anguina (Nematoda, pp. Anguinidae). Nematologica, vol. 36, pp. 90-103.

135. Riley, I. Т., and К. M. Ophel. 1992. Clavibacter toxicus sp. nov., the bacterium responsible for annyal ryegrass toxicity in Australia. Int. J. Syst. Bacteriol., vol. 42, pp. 64-68.

136. Riley, I. Т., Т. В. Reardon, and A. C. McKay. 1988. Genetic analysis of plant pathogenic bacteria in the genus Clavibacter using allozyme electrophoresis. J. Gen. Microbiol., vol. 134, pp. 30253030.

137. Rossello-Mora, R., and R. Amann. 2001. The species concept for prokaryotes. FEMS Microbiol. Rev., vol. 25, pp. 39-67.

138. Saaltink, G. J., and P. H. Maas Geesteranus. 1969. A new disease of tulip caused by Corynebacterium oortii nov. sp. Theth. J. Plant Pathol., vol. 75, pp. 123-128.

139. Sabet, A. K. 1954. On the host range and systematic position of the bacteria responsible for the yellow slime diseases of wheat (Ttiticum vulgare Vill.) and cocksfoot grass (Dactilis glomerata L.). Ann. Appl. Biol., vol. 41, pp. 606-611.

140. Saitou, N., and M. Nei. 1987. The neighbor-joining method, pp. a new method for reconstructing phylogenetic trees. Mol. Biol. Evol., vol. 4, pp. 406-425.

141. Scharif, G. 1961. Corynebacterium iranicum sp. nov. on wheat (Triticum aestivum) in Iran and a comparative study of it with C. tritici and C. rathayi. Entomol. Phytopathol. Appl., vol. 19, pp. 1-4.

142. Schleifer, К. H., I. Hayn, H. P. Seidl, and J. Firl. 1983. Threo-p-hydroxy-ornithine: a natural constituent of the peptidoglycan of Corynebacterium species Co 112. Arch. Microbiol., vol. 134, pp. 243-246.

143. Schleifer, К. H., and O. Kandler, 1972. Peptidoglycan types of bacterial cell walls and their taxonomic implications. Bacteriol. Rev., vol. 36, pp. 407-477.

144. Schumann, P., R A. Rainey, J. Burghardt, E. Stackebrandt, and N. Weiss. 1999. Reclassification of Brevibacterium oxydans (Chatelain and Second 1966) as Microbacterium oxydans comb. nov. Int. J. Syst. Bacteriol., vol. 49, pp. 175-177.

145. Schumann, P., and H. Prauser. 1994. Minimal standards for taxa related to Arthrobacter and Microbacterium. In: Proceeding of the ninth International Symposium on the biology of the Actinomycetes. Pp. 237-241.

146. Shashkov, A. S., G. M. Streshinskaya, V. A. Gnilozub, L. I. Evtushenko, and I. B. Naumova. 1995. Poly(arabitol phosphate) teichoic acid in the cell wall of Agromyces cerinus subsp. VKM Ac-1340. FEBS Letters, vol. 371, pp. 163-166.

147. Slack, S. A. 1987. Biology and ecology of Corynebacterium sepedonicum. Bacterial Ring Rot Proceedings., vol. 64, pp. 665-670.

148. Smith, E. F. 1910. A new tomato disease of economic importance. Science (Washington), vol. 31, pp. 794-796.

149. Sneath, P. H.A. 1972. Computer taxonomy. In Norris and Ribbons, Methods in microbiology, vol. 7A, Academic Press, London New York, pp. 29-98.

150. Soppeland, L. 1924. Flavobacterium suaveolens, a new species of aromatic bacillus isolated from dairy water. J. Agric. Res., vol. 28, pp. 275-276.

151. Southey, J. F. 1973. Anguina agrostis. C.I.H. Description of Plant-parasitic nematodes, vol. 20, pp. 3.

152. Spiekermann, A. and P. Kotthoff. 1914. Untersuchunger uber die Kartoffelpflanze und ihre Krankheiten. Landhr. Jb., vol. 46, pp. 659-732.

153. Starr, M. P. 1949. The nutrition of phytopathogenic bacteria. III. The gram-positive phytopathogenic Corynebacterium species. J. Bacteriol., vol. 57, pp. 253-258.

154. Starr, M. P., and P. P. Pirone. 1942. Phytomonas poinsettiae n. sp., the cause of a bacterial disease of Poinsettia. Phytopathology, vol. 32, pp. 1076-1081.

155. Stackebrandt, E. 1988. Phylogenetic relationships phenotypic diversity: how to achieve a phylogenetic classification system of the eubacteria. Can. J. Microbiol, vol 34, pp. 552-556.

156. Stackebrandt, E., and В. M. Goebel. 1994. Taxonomic note: a place for DNA-DNA reassociation ans 16S rRNA sequence analysis in the present species definition in bacteriology. Int. J. Syst. Bacterid, vol 44, pp. 846-849.

157. Stackebrandt, E., and W. Liesack 1994. Nucleic acids and Classification. In: Handbook of new bacterial systematics. pp. 152-194. Edited by Goodfellow M. and O'Donnel A.G.London: Academic Press.

158. Stackebrandt, E., F. Rainey, and N.L. Ward-Rainey. 1997. Proposal for a new hierarchic classification system, Actinobacteria classis nov. Int. J. Syst. Bacterid., vol 47, pp. 479-491.

159. Stead, D. E. 1988. A study of the bacteria associated fatty acid profiling. Acta Horticulturae, vol. 225, pp. 39-46.

160. Steinhaus, E. A. 1941. A study of the bacteria associated with thirty species of insects. J. Bacterid., vol 42, pp. 757-790.

161. Sturz, A. V., B. R. Christie, B. G. Matheson, and J. Nowak. 1997. Biodiversity of endophytic bacteria which colonize red clover nodules, roots, stems and foliage and their influence on host growth. Biol. Fertil. Soils, vol 25, pp. 13-19.

162. Stynes, B. A., and A. F. Bird. 1980. Anguina agrostis, the vector of annual rye grass toxicity in Australia. Nematologica, vol 26, pp. 475-490.f

163. Stynes, B. A., and A. F. Bird. 1981. Effect of methods of killing, fixing and mounting on measurements of Anguina agrostis. Nematologica, vol 26, pp. 467-474.

164. Sundin G. W., and J. L. Jacobs. 1999. Ultraviolet padiation (UVR) sensitivity analysis and UVR survival strategies of a bacterial community from the phyllosphere of field-grown peanut

165. Arachis hypogeae L.). Microb. Ecol, vol 38, pp. 27-38.

166. Sutcliffe, I.C. 1994. The lipoteichoic acids and lypoglycans of Gram-positive bacteria: a chemotaxonomic perspective. System. Appl. Microbiol, vol. 17, pp. 467-480.

167. Suzuki, K, and K. Komagata. 1983. Taxonomic significance of cellular fatty acid composition in some coryneform bacteria. Int. J. Syst. Bacterid., vol 33, pp. 188-200.

168. Suzuki, К., M. Googfellow, and A.G. O'Donnel. 1994. Cell envelopes and classification. In: Handbook of new bacterial systematics. pp. 195-250. Edited by Goodfellow, M. and O'Donnel, A.G. London, Academic Press.

169. Tabor, C.W., and H. Tabor. 1985. Polyamines in microorganisms. Microbiol. Rev., vol. 49, pp. 81-99.

170. Takeuchi, M., and K. Hatano. 1998a. Union of the genera Microbacterium Orla-Jensen and Aureobacterium Collins et al. in a redefined genus Microbacterium. Int. J. Syst. Bacteriol., vol. 48, pp. 739-747

171. Takeuchi, M., and K. Hatano. 1999. Phylogenetic analysis of actinobacteria in the mangrove rhizosphere. IFO Res. Commun., vol. 19, pp. 47-62.

172. Takeuchi, M., and K. Hatano. 2001. Agromyces luteolus sp. nov., Agromyces rhizosphaerae sp. nov. and Agromyces bracchium sp. nov., from the mangrove rhizosphere. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., vol. 51, pp. 1529-1537.

173. Takeuchi, M., and A. Yokota. 1994. Phylogenetic analysis of the genus Microbacterium based on 16S rRNA gene sequences. FEMS Microbiol. Lett., vol. 124, pp. 11-16.

174. Takeuchi, M., N. Weiss, P. Schumann, and A. Yokota. 1996. Leucobacter komagatae gen. nov., sp. nov., a new aerobic Gram-positive, nonsporulating rod with 2,4-diaminobutyric acid in the cell wall. Int. J. Syst. Bacteriol., vol. 46, pp. 967-971.

175. Topping, L. E. 1937. The predominant microorganisms in soils. I. Description and classification of the organisms. Zentralbl. Bakteriol. Parasitenkd. Infektionskr. Hyg. Abt. 2. vol. 97, pp. 289-304.

176. Vandamme P., B. Pot, M. Gills, P. De Vos, K. Kersters, and J. Swings. 1996. Polyphasic taxonomy, a consensus apptoach to bacterial systematics. Microbiol. Rev., vol. 60, pp. 407438.

177. Van de Peer, and R. De Wachter. 1994. TREECON for Windows: a software package for the construction and drawing of evolutionary trees for the Microsoft Windows environment. Comput. Appl. Biosci., vol. 10, pp. 569-570.

178. Vidaver, A. K. 1982. The plant pathogenic corynebacteria. Annu. Rev. Microbiol., vol. 36, pp. 495-517.

179. Vidaver, A. K., and M. Mandel. 1974. Corynebacterium nebraskense, a new, orange-pigmented phytopathogenic species. Int. J. Syst. Bacteriol., vol. 24, pp. 482-485.

180. Vogel, P., B. A. Stynes, W. Coackley, G. T. Yeoh, and D. S. Petterson. 1982. Glycolipid toxins from parasitised annual ryegrass: a comparison with tunicamycin. Biochem. Biophys. Res. Commun., vol. 105, pp. 835-840.

181. Watson, A.K. 1986. Biology of Subanguinapicridis, a potential biological control agent of Russian knapweed. J. Nematol., vol. 18, pp. 149-154.

182. Wayne, L.G., D.J. Brenner, et al. 1987. Report of the Ad Hoc Commitee on Reconciliation of Approaches to Bacterial Systematics. Int. J. Syst. Bacteriol., vol. 37, pp. 463-464.

183. Weeks, О. B. 1974. Genus Flavobacterium. In: R. E. Buchanan and N. E. Gibbons (ed.), Bergey's mannual of determinative bacteriology, 8th edn. Williams and Wilkins, Baltimore, pp. 357-364.

184. Weisburg, W.G., S.M. Barns, D.A. Pelletier, and D.J. Lane. 1991. 16S ribosomal DNA amplification for phylogenetic study. J. Bacteriol., vol. 173, pp. 697-703.

185. Woese, C.R., G.E. Fox, L. Zablen, T. Uchida, L. Bonen, K. Pechman, B.J. Lewis, and D. Stahl. 1975. Conservation of primary structure in 16S ribosomal RNA. Nature (London), vol. 254, pp. 83-86.

186. Wolfram, Т., G. Gruner, and H. Stolp. 1986. Nucleic acid hybridization of pink-pigmented facultative methylotrophs and pseudomonads. Int. J. Syst. Bacteriol., vol. 36, pp. 24-28.

187. Yamada, K., and K. Komagata. 1970. Taxonomic studies on coryneform bacteria. III. DNA base composition of coryneform bacteria. J. Gen. Appl. Microbiol., vol. 16, pp. 215-224.

188. Yamada, K., and K. Komagata. 1972. Taxonomic studies on coryneform bacteria. V. Classification of coryneform bacteria. J. Gen. Appl. Microbiol., vol. 18, pp. 417-431.

189. Yokota, A., M. Takeuchi, and N. Weiss. 1993b. Proposal of two new species in the genus Microbacterium, pp. Microbacterium dextranolyticum sp. nov. and Microbacterium aurum sp. nov. Int. J. Syst. Bacteriol, vol. 43, pp. 549-554.

190. Young, W. C., D. 0. Chilcote, and H. W. Youngberg. 1996. Annual ryegrass seed yield response to grazing during early stem elongation. Agron. J., vol. 88, pp. 211-215.

191. Young, J. M., G. S. Saddler, Y. Takikawa, S. H. De Boer, L. Vauterin, L. Gardan, R. I. Gvozdyak, and D. E. Stead. 2000. New Names, 31 December 2000. International Society for Plant Pathology (ISPP). http://www.isppweb.org/nppbnewOO.htm

192. Zlamala, C., P. Schumann, P. Kampfer, M. Valens, R. Rossello-More, W. Lubitz, and H.-J. Busse. 2002. Microbacterium aerolatum sp. nov., isolated from the in the 'Virgilkapelle' in Vienna. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., vol. 52, pp. 1229-1234.

193. ZoBell, С. E., and H. C. Upman. 1944. A list of marine bacteria including descriptions of sixty new species. Bull. Scripps. Inst. Oceanogr. Univ. Calif. (Tech. Ser.), vol. 5, pp. 239-292.

194. СПИСОК ПУБЛИКАЦИЙ ПО ТЕМЕ ДИССЕРТАЦИИ

195. Evtushenko, L Л., Dorofeeva, L. V., Dobrovolskaya, Т. G., Subbotin, S.A. 1994. Coryneform bacteria from plant galls induced by nematodes of the subfamily Anguininae. Russ. J. Nematol., vol. 2, pp. 99-104.

196. J. Syst. Evol. Microbiol., vol. 51, pp. 2073-2079.

197. Evtushenko, L. I., Dorofeeva, L. V., Krausova, V. I., Gavrish, E. Yu., Yashina, S. G., Takeuchi, M. 2002. Okibacterium frutillariae gen. nov., sp. nov., a novel genus of the family Microbacteriaceae. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., vol. 52, pp. 987-993.

198. Dorofeeva, L. V., Gavrish, E. Yu., Lysanskaya, V. Ya., Streshinskaya,

199. G. M., Adanin, V. M., Yashina, S. G., Evtushenko, L. I. 2000.Novel bacteria from phyllosphere contain unusual B-type peptidoglycans. Abstr. Int. symposium "Modern problems of microbial biochemistry and biotechnology". Pushchino, 2000. P. 63.

200. Евтушенко, Л. И., Дорофеева, JI. В., Безбородников, С. Г., Шрамко,

201. Гавриш, Е. Ю., Дорофеева, Л. В., Евтушенко, Л.И. 2001. Таксономическое разнообразие актиномицетов семейства Microbacteriaceae, выделенных из филлопланы Тезисы 5-й Пущинской конференции молодых ученых "Биология наука XXI века". Пущино. 2001. С. 210—211.