Диссертации » Биологические науки » Генетика

Бесплатный автореферат и диссертация по биологии на тему
Анализ полиморфизма ДНК ядерного и митохондриального геномов в популяциях Средней Азии
ВАК РФ 03.00.15, Генетика

Автореферат диссертации по теме "Анализ полиморфизма ДНК ядерного и митохондриального геномов в популяциях Средней Азии"

На правах рукописи

БАТЫРОВААЛИЯ ЗАМИЛОВНА

АНАЛИЗ ПОЛИМОРФИЗМА ДНК ЯДЕРНОГО И МИТОХОНДРИАЛЬНОГО ГЕНОМОВ В ПОПУЛЯЦИЯХ СРЕДНЕЙ АЗИИ

03.00.15 - генетика

Автореферат диссертации на соискание учёной степени кандидата биологических наук

Уфа-2004

Работа выполнена в Институте биохимии и генетики Уфимского научного центра Российской академии наук

Научный руководитель: доктор биологических наук, профессор

Хуснутдинова Эльза Камилевна

Официальные оппоненты: доктор биологических наук, профессор

Спицын Виктор Алексеевич

кандидат биологических наук, с.н.с. Мустафина Ольга Евгеньевна

Ведущая организация:

Институт общей генетики им. Н.И.Вавилова РАН, Москва

Защита диссертации состоится « (} » мая 2004 г. в/^"часов на заседании Регионального диссертационного совета КМ 002.133.01 при Институте биохимии и генетики УНЦ РАН по адресу: 450054, Уфа, просп. Октября, 69.

С диссертацией можно ознакомиться в Научной библиотеке Уфимского научного центра РАН

Автореферат разослан 5 апреля 2004 г.

Ученый секретарь

Регионального диссертационного совета

Гималов Ф.Р.

ОБЩАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА РАБОТЫ

Актуальность проблемы. В настоящее время в ряду новых направлений ге-номики стоит исследование разнообразия генома, а наиболее популярными и продуктивными приложениями являются исследования, связанные с анализом происхождения и эволюционной истории популяций человека. Развитие этих исследований привело к появлению нового раздела науки — этногеномики. Основная ее задача- изучение особенностей геномного полиморфизма и геномного разнообразия отдельных популяций, этнотерриториальных общностей. Наряду с классическим изучением полиморфизма на уровне белков и ферментов, для решения попу-ляционно-генетических проблем все шире используется исследование полиморфизма ядерного и митохондриалыюго геномов, основанное на выявлении внутри-и межпопуляционных различий. Изучение полиморфизма ДНК ядерного и мито-хондриального геномов в популяциях человека важно как для молекулярно-генетической характеристики генофонда народов и генетических взаимоотношений между ними, так и для решения общетеоретических проблем популяционной генетики человека. В настоящее время накоплен большой объем данных по полиморфизму ядерного [Batzer M.A. et al 1994, 1996; Stonecking M. etal., 1997; Wat-kins et al., 2001; Zhivotovsky, 2002; Хуснутдинова 1995, 1996, 1999, 2003; Лимбор-ская 2002; Степанов 2002, Хитринская 2003 и др.] и митохондриального геномов [Cann et al. 1987; Torroni et al., 1993-1996; 1998; Stoneking et al., 1994; 1996; Wallace et al., 1995,2001; Richards et al., 1996,1998,2003; Comas, 1996,1998; Macaulay et al., 1999; Kivisild et al., 2003; Yao et al., 2003; Деренко, 1998-2000; Хуснутдинова, 1999,2002,2003, Малярчук, 2002 и др.].

Несомненный интерес для популяционно-генетических исследований представляет Средняя Азия. Несмотря на обилие этнографических, лингвистических, антропологических, палеоантропологических, краниологических, одонтологических, соматологических, дерматоглифических и иммуно-биохимических данных, остаются неясными вопросы о генетических взаимоотношениях среднеазиатских народов, о вкладе различных предковых групп в их современный генофонд, о времени его происхождения [Ясевич, 1929; Либман, 1930, 1934; Ошанин 1931, 1953, 1957; Гинзбург, 1972; Спицын 1984; Исмагу-лов, 1964, 1968, 1981, 1982; Кабиров, 1975; Кармышева, 1976; Алексеев, 1984; Кляшторный, 1992; Генофонд и геногеография народонаселения, т.1, 2000, под ред. Рычкова и др.] Главную особенность формирования населения Средней Азии определяет географическое положение этого региона, который является во многих смыслах пограничным. Это nnnnnn»«iif мштту Прртр^пьной Л^ией и

РОС. НАЦИОНАЛЬНАЯ

БИБЛИОТЕКА

Восточной Европой; между Южной Азией и Южной Сибирью. На протяжении тысячелетий на территории Средней Азии происходит смешение культур, движение тюрко-язычных и индоиранских народов. Это, очевидно, имеет отражение в структуре генофонда современного населения Средней Азии. Анализ полиморфизма аутосомных локусов и мтДНК, используемых в популяционно-генетических исследованиях позволит выявить особенности генетической структуры, межэтнических взаимоотношений, миграции и эволюции генофондов народов, дифференцированность по аутосомной и женской линиям. Результаты исследований внесут значительный вклад в решение проблемы этногенеза, этнической истории и культуры не только самих среднеазиатских народов, но и некоторых других этносов, имевших тесные исторические связи с населением Средней Азии. Все вышеизложенное аргументирует своевременность и актуальность данного исследования.

Цель работы - анализ генетической структуры, эволюции генофонда и филогенетических взаимоотношений народов Средней Азии по данным о полиморфизме ДНК локусов ядерного генома и митохондриальной ДНК. Задачи:

1. Изучить полиморфизм 15 аутосомных ДНК-локусов (9 Л1и-инсерций, 5 са-теллитных локусов и делеции 32 п.н. гена ССК5) в популяциях Средней Азии (казахи, узбеки, уйгуры).

2. Изучить характер распределения частот гаплогрупп митохондриальной ДНК в популяциях казахов, узбеков, уйгуров.

3. Исследовать генетическую дифференциацию народов Средней Азии по данным о полиморфизме аутосомных локусов и митохондриальной ДНК.

4. Определить филогенетические взаимоотношения современных этносов Средней Азии по данным о полиморфизме ДНК локусов ядерного и митохондриального геномов.

5. Оценить время дивергенции линий в некоторых гаплогруппах мтДНК на территории Средней Азии.

Научная новизна. Впервые охарактеризован генофонд казахов, узбеков и уйгуров одновременно по 15 аутосомным локусам (9 Л1и-инсерций: АСЕ, АРОА1, РУ92, ТРА25, УяКБС27, УяКБС148, В65, А25, Б1; 5 сателлитных: УЭТЯ-повторы гена РАН, АроВ, БШО, еК08, СТО-повторы гена БМРК и де-леция 32 п.н. в гене хемокинового рецептора ССЯ5) и митохондриальной ДНК. Дана молекулярно-генетическая характеристика положения народов данного региона в мировом распределении частот генов.

Выявлена существенная гетерогенность популяций пародов Средней Азии по распределению частот аллелей А^-инсерциснных аутосомных локусов и частот гаплотипов мтДНК.

Впервые для коренных народов Средней Азии подсчитано время дивергенции линий гаплогрупп Н и D по данным о полиморфизме ГВС1 мтДНК.

Впервые на основе данных полиморфизма ДНК-локусов ядерного и мито-хондриального геномов рассчитаны генетические расстояния между популяциями казахов, узбеков и уйгуров.

Теоретическое и практическое значение работы. Молекулярно-генетическая характеристика популяций Средней Азии является новой информацией для гсногеографического изучения одного из важнейших регионов мира. Результаты исследования будут представлять интерес для антропологов, этнографов, лингвистов и демографов, занимающихся проблемами истории народонаселения. Данные по распределению частот аллелей гипервариабельных ло-кусов в различных этнических группах Средней Азии могут быть применены в судебно-медицинской экспертизе для идентификации личности и определения генетического родства. Полученные сведения могут использоваться при чтении лекций в научно-педагогическом процессе на биологических факультетах.

Положения, выносимые на защиту:

1. Высокое внутрипопуляционное разнообразие и низкий уровень генетической подразделенности изученных народов Средней Азии по Alu-инсерционному полиморфизму.

2. Своеобразие генофонда народов Средней Азии, заключающееся в распределении частот VNTR-аллелей генов РАН и D1S80, близком к европеоидным популяциям, по локусу АроВ — к монголоидным популяциям.

3. Высокая информативность Alu-инсерционного полиморфизма при оценке межпопуляционной дифференциации народов Средней Азии по сравнению с мини- и микросателлитными локусами.

4. Высокое разнообразие гаплотипов мтДНК и сформированных на их основе гаплогрупп в популяциях Средней Азии.

5. Оценка времени дивергенции линий мтДНК в популяциях Средней Азии для гаплогрупп D и Н.

6. Корреляция между матрицами генетических расстояний, рассчитанных на основе частот гаплогрупп мтДНК и географических расстояний, а также Alu-инсерционного и сателлитного полиморфизмов, Alu локусов и митохондри-альной ДНК.

Апробация работы. Основные положения диссертации представлены на Human Genom Meeting (HGM, Shanghai, 2002); European Human Genetics Conference (ESHG, Strasbourg, 2002); European Human Genetics Conference (ESHG, Birmigham, 2003); Biodiversity and Dynamic of Ecosystems in North Eurasia (BDENE, Novosibirsk, 2002); 2-ой конференции Московского общества генетиков и селекционеров «Актуальные проблемы генетики» (Москва, 2003); межлабораторном генетическом семинаре ИБГ УНЦ РАН (Уфа, 2003).

Публикации. По материалам диссертации опубликовано 10 работ. Cтруктypa и объем диссертации. Диссертационная работа изложена на 175 страницах машинописного текста и состоит из введения, обзора литературы, глав «Материалы и методы исследования», «Результаты исследования и обсуждение», заключения, выводов, списка литературы. Работа проиллюстрирована 20 таблицами и 25 рисунками. Список литературы включает 303 источника, из них 121 — отечественных и 182 - зарубежных авторов.

МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ Материалы исследования. В работе использованы 570 образцов ДНК коренных жителей Средней Азии: казахов - дисперсная выборка из Республики Казахстан (N=334), узбеков — дисперсная выборка из Самаркандской области Республики Узбекистан (N=114), уйгуров - из г. Алма-Аты и Алма-Атинской области Республики Казахстан (N=122). Материал для исследования собран в ходе экспедиционных выездов в 2001-2002 гг. Население было информировано о целях и задачах популяционно-генетических исследований. Данные по этнической принадлежности обследованных индивидов выясняли путем опроса, включая указание на национальную принадлежность предков до третьего поколения. Забор крови производили после медицинского осмотра у взрослых жителей, принадлежащих к разным семьям, что позволяет рассматривать выборки случайными для популяций.

Методы исследования. Выделение ДНК проводили стандартным методом фенольно-хлороформной экстракции [Mathew, 1984]. Амплификация изученных локусов осуществлялась с помощью метода ПЦР ДНК. Продукты амплификации анализировались электрофоретически в ПААГ после окрашивания гелей бромистым этидием с последующей визуализацией ДНК-фрагментов в УФ-свете. Изучение мтДНК проводили с помощью ПДРФ-анализа с последующим секвенированием первичной нуклеотидной последовательности ГВС1 мт ДНК. Амплификацию мтДНК выполняли методом ПЦР согласно протоколу Saiki et

al. [1998] на термоциклере «Biometr UNOII». Определение нуклеотидных последовательностей осуществляли на автомагическом секвенаторе Applied Biosystems модель 377 (Perkin Elmer) с использованием набора для флюоресцентного мечения DYEnamic™ET согласно протоколу фирмы производителя (Аш-ersham Pharmacia Biotech DYEnamic ET Terminator Cycle Sequencing Kit).

Статистическая обработка полученных данных. Частоты аллелей и их ошибки, фактическую и теоретическую гетерозиготность, соответствие распределения генотипов равновесию Харди-Вайнберга, коэффициент генной дифференциации, сравнение характера распределения частот аллелей и генотипов между популяциями при анализе аутосомных локусов проводили с помощью пакета программ Genepop v. 1.2 [Raymond and Rousset, 1995] и RxC-статистика [Rofif, Bentzen, 1989]. Для расчета генетических расстояний между популяциями использовали метод Нея [Nei, 1983, 1987], основанный на частотах аллелей аутосомных локусов или частотах гаплогрупп мтДНК. Коэффициенты корреляции между матрицами расстояний рассчитывали по Мантелю [Mantel, 1967]. Филогенетические древа создавались с помощью алгоритма объединения «ближайших соседей» (neibor joning) в пакете программ Philip v.3.5c [Felsenstein, 1993], консенсунсные дендрограммы построены с помощью программы Tree View v. 1.6.1 [Page, 2000]. Факторный анализ проводился с использованием метода главных компонент в пакете программ Statistica v.5.5 [StatSoft Inc., USA]. Филогенетический анализ разнообразия нуклеотидных последовательностей мтДНК проводили методом максимального сходства (Maksimum parsimoni, MP) [Fitch, 1977; Swofford, 1993] с построением медианных сетей [Bandelt et al., 2000]. Для иллюстрации полученных результатов применяли программу NetViz v.4.0 [NetViz Corporetion].

РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ

В трех коренных этносах Средней Азии — казахов, уйгуров и узбеков — проведено изучение 15 аутосомных локусов ядерного генома: 9 Alu-инсерций подсемейств Ya 5/8 и Yb8, расположенных в области генов ангиотензин-конвертирующего фермента (АСЕ), активатора плазминогена (PLAT), аполипо-протеина Al (APOA1) и в локусах PV92, YaNBC27, YaNBC148, B65, А25, Dl; 5 сателлитных локусов (D1S80 и VNTR-повторы генов фенилаланингидроксила-зы, эндотелиальной синтазы окиси азота, аполипопротеина В, CTG-повторы гена DMPK) и делеции 32 п.н. в гене хемокинового рецептора CCR5.

Все изученные Л1и-инсерции оказались полиморфными во всех исследованных популяциях (табл. 1). Наиболее информативными маркерами для анализа дифференциации популяций являются АРОА1, Уя5КБС148, А25 локусы. Наблюдаются широкие пределы вариации частот Л1и-инсерций, характерные как для европеоидов, так и для монголоидов.

Азиатский компонент в генофонде изученных популяций подтверждает относительно низкая частота Л1и-инсерции в локусе АРОА1 (0,6935 - 0,8832), относительно высокая частота вставки в УяКБС148 в популяциях казахов и уйгуров (0,3629 и 0,3071, соответственно), наличие УяКБС27-инсерции во всех изученных популяциях (0,2217-0,2824). Относительно низкие частоты Л1и-повторов в локусе РУ92 у казахов, уйгуров и узбеков (0,5139, 0,4798 и 0,4579 соответственно) и в локусе УяКБС148 у узбеков (0,2346) указывают на наличие европеоидного компонента в генофонде народов Средней Азии. Частоты Л1и-инсерций в локусах АСЕ и ТРА25, зафиксированные в изученных популяциях, характерны как для европеоидных, так и для азиатских популяций.

Полученные результаты подтверждают исторические данные о взаимодействии различных расовых типов на территории Средней Азии на протяжении тысячелетий, что, в свою очередь, объясняется географическим положением этого региона, который является во многих смыслах пограничным.

По распределению частот Л1и-инсерций во всех популяциях поддерживается равновесие Харди-Вайнберга, кроме популяции казахов по локусу АРОА1, узбеков по локусам АСЕ, А25, уйгуров по локусу РУ92 (р<0,0100), что связано как с недостатком, так и с избытком гетерозигот и можно объяснить случайными стохастическими событиями в данных выборках.

Распределение частот Л1и-инсерций по изученным локусам указывает на существование значительного внутрипопуляционного генетического разнообразия в исследованных популяциях. Среднее значение теоретической гетерози-готности по девяти Л1и-инсерциям колеблется от 0,3930 у узбеков до 0,4030 у казахов, достигая по отдельным локусам предельного значения (0,500) для ди-аллельной системы. Наибольший уровень разнообразия по Л1и-инсерциям обнаружен по локусам АСЕ, РУ92, ТРА25 (0,500).

Попарное сравнение популяций выявило достоверные различия в распределении частот Л1и-инсерций между казахами и узбеками по локусам УяКБС148 (х2=6,172, р=0,04568), АРОА1 (х2=0°, р=0,0001), А25 (х2=°°, р=0,0001), уйгурями и узбекями по локусям Уа^С148 (х2^1 1,608, р=0,00302), АРОА1 (х2=оо, р=0,0001),А25 <х3=эо, р=0,0001).

СА в целом ч » «5 "3 2 Узбеки я » » х 5 Популяция

о ~4 м К> & и м 2

1Л См Ц1 ~4 N1 о\ и> N1 00 VI и| ы «в ы Частота > П В

1». <о о О О V1 о о о Л »о V« о Гетерозиготность

Сч (Л V* О- о и и> оо ОС ы м ч Частота > о >

.346(1 ю О ¡о о -1 е ¡и о 'л о Гетерозиготность

ж V» о V чс 90 ¿ь (Л -О 1п •в Частота < о К1

.5000 1п о о Л. О о о 1п о 9 О Гетерозиготность

к 3! 1и Ц) 'VI в* вч а -4 О О Частота •в > ы Ох

'■и о >5 Ой О о О О и о о о Гетерозиготность

'Л К» м -1 к> 00 о ¿ъ м ОС к» Л. Частота 2 -4

и> Ж VI А. О 'Л о & е Гетерозиготность

и» •г V) с\ ы ы VI ¿ь Частота 5 < О » 90

± № о 3 К* с* а Гетерозиготность

К» >5 1/1 ы СЧ ы -4 Ж к| ы Частота Я и>

и м и и> и 1*1 с «ь о -1 О Гетерозиготность

Й К* 5 !Л к> л. -4 СЧ ъ 00 ы Частота > ы (л

к» ^ м V* е V» -4 о •л о Гетерозиготность

ы К1 о = к> К» VI Частота с

Ь = К> о К1 VI ы о в VI Гетерозиготность

1 и ; ъ Ж 1 V« ж и = 1 в £ Средняя гетерозиготность

.с

а

0

1

сг

Е

Ь1 а Ь

со »

Я 8

о

о *

3

о о 2 О

ПС ?. я

"а о

о >

О

га тз

» а

V:

ь »

!е X

0 ■о

1 ге

5С

О £

Между популяциями казахов и уйгуров не обнаружено достоверных различий по Л1и-инсерционному полиморфизму, что подтверждает длительные исторические контакты в процессе этнического становления этих народов.

Значение коэффициента генной дифференциации по 9 Л1и-инсерционным локусам составило 0,0097, что свидетельствует об относительно невысоком уровне генетической подразделенности населения изучаемого региона (рис. 1).

Наибольший вклад в межпопуляционное разнообразие изученных популяций Средней Азии вносят различия по частотам Л1и-инсерций в локусах А25 (0,0749) и ЛроЛ1 (0,0384). По литературным данным, степень генетической дифференциации (Ре!) по Л1и-инсерциям составила 0,0114 в Восточной Сибири, 0,0277 в Южной Сибири [Степанов, 2002], 0,0610 в Волго-Уральском регионе [Хусаинова и др., 2004], 0,0170 в Европе, 0,0670 и 0,0530 в Восточной и Западной Азии соответственно ^опеЫод й а1., 1997], 0,0258 в ранее изученных популяциях Средней Азии [Хитринская, 2003].

Рис. 1. Коэффициенты генной дифференциации (Ре!) по данным Л1и-инсерционного полиморфизма у народов Средней Азии

Обобщая вышеуказанные данные, можно отметить, что степень межпопу-ляционных генетических различий в Средней Азии более близка к таковой в Восточной Сибири [Степанов, 2002] и в Европе ^опеЫод е! а1., 1997]. Оценка степени родства и генетических взаимоотношений по данным частот Л1и-инсерций изученных популяций с другими народами мира показала, что изученные популяции Средней Азии в целом занимают промежуточное положение между популяциями Европы и Азии (рис. 2). При этом популяции казахов и уйгуров объединяются в один общий кластер, что согласуется с историческими данными этногенеза казахского и уйгурского народов.

Рис. 2. Расположение популяций Средней Азии и популяций мира в пространстве двух главных компонент по данным распределения частот А1и-инссрций

Этапы формирования этнического состава населения Казахстана были обусловлены сложными метисационными процессами в условиях многократных наслоений монголоидных элементов на древний европеоидный пласт. Примесь монголоидных компонентов у казахов заметно увеличилась в античное время, вследствие продвижения гуннов в тюркский период и во время монгольского нашествия. Гунны также вошли в состав уйгурского народа, который первоначально слагался в одном из древнейших ареалов монголоидных рас, поэтому в исходных своих корнях уйгуры были не только тюрками по языку, но монголоидами по тепу.

Популяция узбеков больше тяготеет к популяциям Волго-Уральского региона (рис. 3), что подтверждает большую долю европеоидного компонента в генофонде узбекского этноса.

Рис. 3. Дендрограмма генетических взаимоотношений между изученными популяциями Средней Азии и Волго-Уральского региона по данным распределения частот

А1и-инсерций.

Исследование частоты делеции 32 п.н. в гене ССЯ5 в популяциях Средней Азии показало незначительное колебание частоты мутантного аллеля (от 0,0281 у узбеков до 0,0357 у казахов и уйгуров) (рис. 4), что ниже, чем в европейских популяциях и подтверждает рассоспецифичность этого локуса и снижение градиента распространенности этой делеции с запада на восток.

Рис. 4. Распределение частот аллелей гена хемокининового рецептора ССЯ5 в популяциях Средней Азии

Анализ распределения частот аллелей 5 мини- и микросателлитных локу-сов в популяциях казахов, узбеков и уйгуров показывает, что, в целом, этнические группы Средней Азии также демонстрируют сходство как с азиатскими, так с и европейскими популяциями.

Во всех изученных популяциях было обнаружено 8 УЭТК-аллелей гена ФАГ, которые ранее были описаны для европейцев и китацев (Оо^оу й я1., 1992; Е1$ешт1& й я1., 1992; Ахметова и др., 2000; Коршунова и др., 2004]. Аллели 380, 500 и 530 преобладали во всех популяциях Средней Азии (рис. 5), так же как и в европейских популяциях.

I казахи [_1 узбеки -*- уйгуры

Рис 5. Распределение частот УЭТК-аллелей гена РАН в популяциях Средней Азии

В распределении аллелей минисателлита D1S80 имелись два мажорных аллеля: 18 и 24 (рис. 6). Характер распределения аллелей оказался типичным для описанных европеоидных популяций [Budowle et al., 1995; Asmundo, Crino 1998; Lahermo et al., 1996; Woller et al., 1995].

Рис. 6. Распределение частот аллелей локуса Б1880 в популяциях Средней Азии

По локусу еК08 нами идентифицировано только 2 аллеля с числом повтора 4 (аллель А) и 5 (аллель В) (табл. 2).

Таблица 2

Распределение частот генотипов и аллелей гена еК08 в популяциях Средней Азии

Популяции N Частота аллеля Частота гепотипа

Л В А/А А/В В/В

Казахи 324 0,1069 ±0,0123 0,8904 ±0,0123 0,0185 0,1821 0,7994 0,8360 (0,2474)

Узбеки 124 0,1215 ¿0,0128 0.8785 ±0,0128 0,0187 0,2056 0,7757 0,8360 (0,6485)

Уйгуры 107 0,0685 ±0,0099 0,9316 ±0,0099 0,0000 0,1371 0,8629 0,6170 (10,000)

Во всех изученных популяций частота аллеля В значительно превосходила частоту аллеля А, а наиболее распространенным генотипом был ВВ, что согласуется с литературными данными [Мустафина, 2001]. В целом, распределение частот аллелей (А и В) гена eNOS в среднеазиатских популяций близко к таковым, описанным ранее для Волго-Уральского региона, Северного Кавказа и некоторых популяций мира (австралийских европеоидов, японцев и турок) [Wang et al., 1996; Ishihara et al., 1998; Nakagami et al., 1999; Akar et al., 1999; Мустафина и др., 2001; Коршунова и др., 2004].

Частоты аллелей по локусу АроВ значительно варьировало в исследованных популяциях (рис. 7). Наиболее частыми были аллели 34 и 36, с преобладанием аллеля 34. По распределению частот VNTR-аллелей гена АроВ популяции Средней Азии оказались более близки к монголоидным популяциям [Deka et ah, 1992; Renges et al., 1992; Lahermo et al., 1996].

I казахи СИЗ узбеки уйгуры

Рис. 7. Распределение частот аллелей локуса АроВ в популяцях Средней Азии

В исследуемых популяциях обнаружено 22 варианта аллелей СТО-повторов гена ВМРК (от 14 до 21 в разных популяциях) (рис. 8), соответствующих числу тринуклеотидных повторов от 5 до 34; отмечается два пика частот аллелей - с числом СТО-повторов 5 и от 11 до 13. По характеру распределения частот аллелей данного локуса, популяции Средней Азии занимают промежуточное положение между популяциями Европы и Азии, тяготея в большей степени в сторону последних [Вау1е8 е! а1., 1992; ОДёшап е! а1., 1994; Фатхлисламова и др., 1999].

Рис. 8. Распределение частот СТО-повторов гена ВМРК в популяциях Средней Азии

В целом, по 5 сателлитным локусам ядерного генома изученные этносы Средней Азии характеризуются высоким уровнем внутрипопуляционного разнообразия: индекс теоретической гетерозиготности колеблется от 0,6209 у уйгуров до 0,6760 у казахов (табл. 3). Наибольшее разнообразие выявлено по ло-кусу Б1880, по которому среднее значение гетерозиготности составило 0,8437.

Проведенный кластерный анализ по данным о полиморфизме сателлитных локусов позволил выявить наибольшее сходство генетической структуры популяций узбеков и уйгуров, а в целом, популяции Средней Азии объединились в общий кластер (рис. 9).

По 15 аутосомным локусам обнаружены достоверные различия в распределении частот изученных локусов между казахами и узбеками (х2=28,3140, р=0,0000), уйгурами и узбеками (х2=54,7010, р=0,0018). Коэффициент генного разнообразия Бе! для народов Средней Азии составил 0,0073, что меньше такового значения для народов Волго-Уральского региона (0,0160) [Викторова, 2002]. Наибольший вклад в межпопуляционное разнообразие народов Средней Азиии вносят различия по частотам девяти А1и-инсерционных локусов ^1=0,0097) по сравнению с мини- и микросателлитными локусами ^=0,0049) (рис. 10).

Таким образом, обобщая результаты анализа полиморфизма аутосомных ДНК-локусов в популяциях Средней Азии, можно предположить, что генофонды изученных этнических групп развивались на гетерогенной основе. По-видимому, это обусловлено присутствием выраженного в различной степени европеоидного и монголоидного компонентов в их этногенезе.

Анализ мтДНК свидетельствует о том, что в митохондриальном генофонде народов Средней Азии присутствуют как восточноевразийские гаплогруппы: А, В, С, Б, О, Б, М, 2, У, так и западноевразийские и, Н, НУ, I, К, X, Т и др (табл.4). У казахов и уйгуров на долю восточноевразийских гаплогрупп приходится 55,07 и 52,46% соответственно, э для узбеков оказалось характерным увеличение доли западноевразийских гаплогрупп мтДНК до 59,67%, подтверждая существование градиента увеличения частоты восточноевразийских линий в направлении с запада на восток. Эти результаты соотносятся с литературными данными по этногенезу о более значительном вкладе монголоидного компонента в генофонд казахов и уйгуров по сравнению с популяцией узбеков.

В популяциях казахов и уйгуров выявлены восточноевразийские гапло-группы У и 2, и западноевразийские -1 и У, которые отсутствуют в популяции узбеков.

Таблица 3

Индексы гетерозиготности по частотам УЫТЯ-аллелей генов сК08, гена РАН, АроВ, Б1880 и СТО-повторов гена БМРК в популяциях Средней Азии

Рис. 9. Дендрограмма генетических взаимоотношений между изученными популяциями Вол го-Уральского региона и Средней Азии по данным о распределении частот четырех сателлитных локусов (УКТЯ гена РАН, ЛроВ, Б1880, СТО-повторы гена БМРК)

Рис. 10. Коэффициент генной дифференциации ^г) по локусам еК08, УОТЯ гена РАМ , АроВ, Б!880, БМРК в популяциях Средней Азии

У казахов, относящихся к кыпчакской группе западной ветви тюркской группы алтайской языковой семьи, наибольшее распространение получила вос-точноевразийская гаплогруппа Э, а в популяциях узбеков и уйгуров, относящихся к карлужской группе западной ветви тюркской группы алтайской языковой семьи - западноевразийские гаплогруппы и и Н. Поскольку очевидных географических барьеров между изученными популяциями не существовало, то можно сделать вывод о различной этнической истории казахов, узбеков и уйгуров по материнской линии.

Таблица 4

Частота распределения гаплогрупп мтДНК в популяциях Средней Азии

Гаплогруппа Казахи Узбеки Уйгуры

N=334 N=114 N=122

А 0,0389 0,0614 0,0164

В 0,0389 0,0175 0,0574

С 0,0928 0,1140 0,0984

Э 0,1826 0,1140 0,1393

в 0,0629 0,0175 0,0738

Р 0,0449 0,0263 0,0245

Н 0,1387 0,1404 0,1639

НУ 0,0298 0,0526 0,0410

I 0,0029 0,0000 0,0246

] 0,0389 0,0175 0,0328

к 0,0269 0,0351 0,0164

ь 0,0000 0,0000 0,0000

м 0,0629 0,0526 0,0656

N 0,0209 0,0614 0,0082

Рге-НУ 0,0000 0,0000 0,0000

Я 0,0089 0,0439 0,0082

Т 0,0508 0,0263 0,0328

Ь'сумм 0,0958 0,1842 0,1147

V/ 0,0179 0,0263 0,0082

X 0,0119 0,0090' 0,0164

ъ 0,0179 0,0000 0,0164

У 0,0089 0,0000 0,0328

ргеУ 0,0000 0,0000 0,0000

V 0,0059 0,0000 0,0082

Для всех исследованных этнических групп нами установлено высокое разнообразие гаплотипов мтДНК и сформированных на их основе гаплогрупп. Индекс гаплотипического разнообразия народов Средней Азии в среднем составил

0,9936, что свидетельствует о высокой гетерогенности типов мтДНК в изученном регионе и совпадает с таковым у монголоидов и популяций Ближнего Востока (0,9900).

Проведена оценка времени дивергенции линий внутри нескольких гаплог-рупп митохондриальной ДНК. Для гаплогруппы D это значение составило 22,000±4600 лет, а для гаплогруппы Н - 20,800±4300 лет, что соответствует периоду верхнего палеолита.

Консенсусная дендрограмма генетических взаимоотношений между популяциями Средней Азии и Волго-Уральского региона по частотам гаплогрупп мтДНК (рис. 11) отразила близкое взаиморасположение казахов и уйгуров, которые образовали единый кластер, в то время как популяция узбеков, на долю которой приходится около 40% восточноевразийских линий мтДНК, наиболее близка к популяции башкир, в митохондриальном генофонде которых эти линии составляют практически такое же количество.

Рис. 11. Дендрограмма генетических взаимоотношений между изученными популяциями Средней Азии и Волго-Уральского региона по данным частот гаплогрупп

мтДНК

Коэффициенты попарного сравнения матриц генетических расстояний демонстрируют сходную картину генетических отношений между популяциями Средней Азии по системам Alu-инсерционного и сателлитного полиморфизмов (r=0,6551, р=0,0020), между Alu локусами и митохондриальной ДНК (r=0,5582, р=0,0080) (табл. 5). Матрица генетических расстояний, рассчитанная на основе частот гаплогрупп мтДНК, коррелирует с матрицей географических расстояний (r=0,5359, р=0,019). Полученные результаты свидетельствуют о том, что все изученные системы маркеров отражают сходные процессы эволюции генофондов изученных этносов Средней Азии. Географическая близость этих популяций отразилась на их генетической дифференциации по митохондриальной линии.

Таблица 5

Коэффициенты корреляции (по Мантелю) между генетическими и географическими расстояниями популяций Средней Азии

Сателлитные локусы А1и-инссрции мтДНК Географические расстояния

Сателлитные покусы - •

А1и-инсерции 0,6551 (Р=0,002) -

мтДНК 0,2544 (р=0,079) 0,5582 (р=0,008) -

Географические расстояния 0,2553 (И),119) 0,3515 (р=0,068) 0,5359 (р=0,019) -

Таким образом, исследование двух типов полиморфизма ДНК - ядерного и митохондриального, в трех коренных этносах Средней Азии позволило выявить особенности их генетической структуры и межпопуляционных взаимоотношений, оценить возраст дивергенции отдельных гаплогруп мтДНК, определить положение генофонда народов Средней Азии среди генофонда народов Евразии.

ВЫВОДЫ

1. Проведено комплексное изучение популяций казахов, уйгуров, узбеков на основе А1и-инсерционного, микро- и минисаттелитного полиморфизма ядерного генома и гаплотипического разнообразия митохондриальной ДНК

2. Анализ полиморфизма девяти А1и-инсерций ядерного генома выявил высокое внутрипопуляционное разнообразие (0,3950) у казахов, узбеков и уйгуров и низкий уровень генетической подразделенности (Р8Т = 0,0097) изученных народов Средней Азии по данной системе маркеров.

3. По распределению частот УЭТК-аллелей генов РАН, еК08 и Б1880 изученные популяции Средней Азии оказались более близки к европеоидным популяциям, по локусу АроВ - к монголоидным популяциям, а по СТО-повторам гена БМРК занимают промежуточное положение между популяциями Европы и Азии, тяготея в большей степени в сторону последних.

4. Коэффициент межпопуляционной дифференциации (Ре!) для народов Средней Азии по 15 аутосомным локусам ядерного генома составил 0,0073. Наибольший вклад в межпопуляционное разнообразие народов Средней Азиии вносят различия по частотам девяти А1и-инсерционных локусов ^1=0,0097) по сравнению с мини- и микросателлитными локусами ^1=0,0049).

5. Установлено высокое разнообразие гаплотипов мтДНК и, сформированных на их основе, гаплогрупп. Индекс гаплотипического разнообразия мтДНК народов Средней Азии в среднем составил 0,9936, что соответствует таковому в популяциях Центральной Азии (0,9900).

6. Время дивергенции линий мтДНК в популяциях Средней Азии составило для гаплогруппы D - 22,000±4600 лет, а для гаплогруппы Н — 20,800±4300 лет, что соответствует периоду верхнего палеолита.

7. Выявлена корреляция между генетическими расстояниями, рассчитанными на основе частот гаплогрупп мтДНК, и географическими расстояниями (r=0,5359, р—0.019), а также между генетическими расстояниями, полученными на основе Alu-инсерционного и сателлитного полиморфизмов (r=0,6551, р=0,0020), Alu-инсерционного и полиморфизма митохондриальной ДНК (r=0,5582, р=0,0080).

8. Оценка степени родства и генетических взаимоотношений изученных популяций с другими народами мира на основе полиморфизма ядерного и митохонд-риального геномов показала, что изученные популяции Средней Азии в целом занимают промежуточное положение между популяциями Европы и Азии.

СПИСОК ПУБЛИКАЦИЙ ПО ТЕМЕ ДИССЕРТАЦИИ

1. A.Z. Salimova, G.S. Svyatova, G.M. Berezina, M.A. Bermisheva et all. Polymorphism of the ACE gene in populations of Middle Asia // Abstracts of European Human Genetics Conferens - Shanghai, 2002. - P.576.

2. M. Bermisheva, A. Salimova, T. Korshunova, G. Svyatova, G. Berezina. Mito-hondrial DNA diversity in the populations of the Middle Asia and Northen Caucasus // Abstracts of European Human Genetics Conference - Strasburg, 2002. - P.0503.

3. T.Y. Korshunova, A.Z. Salimova, V.L. Akhmetova, M.A. Bermisheva, G.M. Berezina, I.A. Kutyev, R.I. Fatkhislamova, G.M. Svyatova. Insertion-Deletion Polymorphism of the North Caucasus and Middle Asia // Abstracts of European Human Genetics Conference - Strasburg, 2002. - P.0501.

4. E. Khusnutdinova, M. Bermisheva, K. Tambets, A. Salimova, T. Korshunova, G. Svyatova, R. Mukhamedov, R.Villems. Mitohondrial DNA variety in Turkic and Uralic-speaking people.// Abstracts of European Human Genetics Conferens -Shanghai, 2002. - Р.548.В.Л. Ахметова, Т.Ю. Коршунова, A3. Салимова, И.А. Кутуев, Г. Святова, Г. Березина, Э.К. Хуснутдинова. Анализ полиморфизма ALU-инсерций в популяциях Северного Кавказа и Средней Азии // Материалы конференции «Актуальные проблемы генетики» - Москва, 2002. -

C.47.Khusnutdinova E., Bermisheva M., Victorova Т., Korshunova Т., Salimova Л., Svyatova G., Tambets K., Willems R. Phylogeograpby of mitohondrial lineages of turkic and uralic-speaking people // Biodiversity and Dynamic of Ecosystems in North Eurasia - Новосибирск, 2002 - P.84-85.A.Z. Salimova, V.L. Akhmetova, G.S. Svyatova, G.M. Berezina, E.K. Khusnutdinova. Alu-insertion polymorphisms in population of Middle Asia // Abstracts of European Human Genetics Conference -Birmingham, 2003. - P.845

8. Хуснутдинова Э., Бермишева М., Ахметова В., Кутуев И., Хусаинова Р., Салимова А., Коршунова Т., Осипова Л., Губина М., Жданов С, Виллемс Р. Разнообразие митохондриальной ДНК в популяциях Евразии в аспекте их генетической истории. // Материалы конференции «Актуальные проблемы генетики» - Москва, 2003. - С. 56.

9. Хусаинова Р.И., Ахметова В.Л., Кутуев И.А., Салимова А.З., Коршунова Т.Ю., Лебедев Ю.Б., Хуснутдинова Э.К. Генетическая структура народов Волго-Уральского региона и Средней Азии по данным Alu-полиморфизма.// Генетика.- 2004. - №4. - С. 552 - 559.

10. Салимова A3., Кутуев И.А., Ахметова В Л., Хусаинова Р.И., Святова Г.С., Березина Г.М., Хуснутдинова Э.К. Изучение полиморфизма Alu-инсерций у казахов. // Сборник научных трудов конференции «Научный прорыв - 2003». -Уфа, 2003.-С.43.

БАТЫРОВА АЛИЯ ЗАМИЛОВНА

АНАЛИЗ ПОЛИМОРФИЗМА ДНК ЯДЕРНОГО И МИТОХОНДРИАЛЬНОГО ГЕНОМОВ В ПОПУЛЯЦИЯХ СРЕДНЕЙ АЗИИ

Автореферат диссертации на соискание учёной степени кандидата биологических наук

Издательская лицензия № 06788 от 01.11.2001 г. ООО «Издательство «Здравоохранение Башкортостана» 450077, РБ, г. Уфа, ул. Ленина, 3, тел. (3472) 22-73-50, факс 22-37-51.

Подписано в печать 31.03.2004 г. Формат 60x84/16. Гарнитура Times New Roman. Бумага офсетная. Усл. печ.л. 1,4. Уч.-изд. л. 1,5. Тираж 100. Заказ № 104.

W- 67 9 9

Содержание диссертации, кандидата биологических наук, Батырова, Алия Замиловна

ВВЕДЕНИЕ

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Полиморфизм ДНК и его использование в популяционно-генетических исследованиях

1.1.1. Полиморфизм ядерной ДНК человека

1.1.2. Полиморфизм митохондриальной ДНК человека

1.2. Этногенез и этническая история народов Средней Азии

1.2.1. Антропологическая характеристика народов Средней Азии

1.2.2. Этническая история народов Средней Азии

1.2.2.1. Этногенез казахов

1.2.2.2. Этногенез узбеков

1.2.2.3. Этногенез уйгуров

1.3. Популяционно-генетические исследования народов Средней Азии

ГЛАВА И. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ

2.1. Материал для исследований

2.2. Методы исследования

2.2.1. Выделение геномной ДНК

2.2.2. Полимеразная цепная реакция синтеза ДНК

2.2.3. Методы изучения полиморфизма мтДНК

2.2.4. Статистическая обработка результатов

ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ 67 3.1. Анализ полиморфизма аутосомных ДНК-локусов в популяциях

Средней Азии

3.1.1. Анализ полиморфизма у4/«-повторов в популяциях Средней Азии (АСЕ, ТРА25, PV92, АРОА1, YaNBC27, YaNBC148,

В65, А25, D1)

3.1.2. Анализ распространенности делеции 32 п.н.гена хемокинового рецептора CCR5 в популяциях Средней Азии

3.1.3. Изучение VNTR-полиморфизма генов конститутивной эндотелиальной синтазы окиси азота (eNOS), фенилаланингидроксилазы (РАН), аполипротеина В (АРОВ) и DIS80 в популяциях

Средней Азии

3.1.4. Анализ (СТС)п-полиморфизма микросателлитного локуса в гене миотонинпротеинкиназы (DMPK) в популяциях Средней Азии 100 3.2. Анализ полиморфизма митохондриальной ДНК в популяциях

Средней Азии

Введение Диссертация по биологии, на тему "Анализ полиморфизма ДНК ядерного и митохондриального геномов в популяциях Средней Азии"

В настоящее время в ряду новых направлений геномики стоит исследование разнообразия генома, а наиболее популярными и продуктивными приложениями являются исследования, связанные с анализом происхождения и эволюционной истории популяций человека. Развитие этих исследований привело к появлению нового раздела науки — этногеномики. Основная ее задача - изучение особенностей геномного полиморфизма и геномного разнообразия отдельных популяций, этнотерриториальных общностей. Наряду с классическим изучением полиморфизма на уровне белков и ферментов, для решения популяционно-генетических проблем все шире используется исследование полиморфизма ядерного и митохондриального геномов, основанное на выявлении внутри- и межпопуляционных различий в частотах аллелей. Изучение полиморфизма ДНК ядерного и митохондриального геномов в популяциях человека важно как для молекулярно-генетической характеристики генофонда народов и генетических взаимоотношений между ними, так и для решения общетеоретических проблем популяционной генетики человека. В настоящее время накоплен большой объем данных по полиморфизму ядерного [Batzer М.А. et al. 1994, 1996; Stonecking М. et al., 1997; Watkins et al., 2001; Zhivotovsky, 2001, 2003; Хуснутдинова 1995, 1996, 1999, 2002; Лимборская, Хуснутдинова, Балановская 2002; Степанов 2002, Хитринская 2003 и др.] и митохондриального геномов [Cann et al. 1987; Torroni et al., 1993-1996; 1998; Stoneking et al., 1994; 1996; Wallace et al., 1995, 2001; Richards et al., 1996; 1998; Comas, 1996,1998; Macaulay et al., 1999; Kivisild et al., 2003; Richards et al., 2003; Yao et al., 2003; Деренко и др, 1998-2000; Хуснутдинова, 1999, 2003, Малярчук, 2002 и др.].

Несомненный интерес для популяционно-генетических исследований представляет Средняя Азия. Несмотря на обилие этнографических, лингвистических и антропологических, палеоантропологических, краниологических, одонтологических, соматологических, дерматоглифических, изосерологических, иммуно-биохимических данных, остаются неясными вопросы о генетических взаимоотношениях среднеазиатских народов, о вкладе различных предковых групп в их современный генофонд, о времени его происхождения [Ясевич, 1929; Либман, 1930, 1934; Ошанин 1931, 1953, 1957; Гинзбург, 1972; Спицын, 1984, 1985; Исмагулов, 1968, 1981, 1982, 1989; Кармышева, 1976; Алексеев, 1984; Кляшторный, 1992; Генофонд и геногеография народонаселения, т.1, 2000, под ред. Рычкова; Кабиров, 1975 и др.] Главную особенность формирования населения Средней Азии определяет географическое положение этого региона, которое является во многих смыслах пограничным. Это положение между Центральной Азией и Восточной Европой; между Южной Азией и Южной Сибирью. На протяжении тысячелетий на территории Средней Азии происходит смешение культур, движение тюрко-язычных и индоиранских народов. Это должно иметь отражение в структуре генофонда современного населения Средней Азии. Анализ полиморфизма ядерной и мтДНК, используемого для популяционно-генетических исследований, позволит как в целом, так и отдельно по женской линии, выявить особенности генофонда и генетической структуры изучаемых народов, их происхождения и межэтнических взаимоотношений. Результаты исследований внесут значительный вклад в решение проблемы этногенеза, этнической истории и культуры не только самих среднеазиатских народов, но и некоторых других этносов, имевших тесные исторические связи с населением Средней Азии.

Все вышеизложенное аргументирует своевременность и актуальность данного исследования.

Цель работы: Анализ генетической структуры, эволюции генофонда и филогенетических взаимоотношений народов Средней Азии по данным о полиморфизме ДНК ядерного и митохондриального геномов.

Задачи:

1. Изучить полиморфизм 15 аутосомных ДНК-локусов (9 Alu-инсерций, 5 гипервариабельных локусов и делеции 32 п.н. гена CCR5) в популяциях Средней Азии (казахи, узбеки, уйгуры).

2. Изучить характер распределения частот гаплогрупп митохондриальной ДНК в популяциях казахов, узбеков, уйгуров.

3. Исследовать генетическую дифференциацию народов Средней Азии по данным о полиморфизме аутосомных локусов и митохондриальной ДНК.

4. Определить филогенетические взаимоотношения современных этносов Средней Азии по данным о полиморфизме ДНК ядерного и митохондриального геномов.

5. Оценить время дивергенции линий в некоторых гаплогруппах мтДНК на территории Средней Азии.

Научная новизна

Впервые охарактеризован генофонд казахов, узбеков и уйгуров одновременно по 15 аутосомным локусам (9 Л/м-инсерций: АСЕ, APOAJ, PV92, ТРА25, YaNBC27, YaNBC148, В65, А25, Dl\ 5 гипервариабельных: VNTR-повторы гена РАН, АроВ, DIS80, eNOS, CTG-повторы гена DMPK и делеция 32 п.н. в гене хемокинового рецептора CCR5) и митохондриальной ДНК. Дана молекулярно-генетическая характеристика положения народов данного регона в мировом распределении частот генов.

Выявлена существенная гетерогенность популяций народов Средней Азии по распределению частот аллелей ^4/м-инсерционных аутосомных локусов и частот гаплотипов мтДНК.

Впервые для коренных народов Средней Азии по данным о полиморфизме ГВС1 мтДНК подсчитано время дивергенции линий гаплогрупп Н и D.

Впервые на основе данных полиморфизма ДНК-локусов ядерного и митохондриального геномов рассчитаны генетические расстояния между популяциями казахов, узбеков и уйгуров.

Теоретическое и практическое значение работы

Молекулярно-генетическая характеристика популяций Средней Азии является новой информацией для геногеографического изучения одного из важнейших регионов мира. Результаты исследования будут представлять интерес для антропологов, этнографов, лингвистов и демографов, занимающихся проблемами истории народонаселения. Данные по распределению частот аллелей гипервариабельных локусов в различных этнических группах Средней Азии могут использоваться в судебно-медицинской экспертизе для идентификации личности и определения генетического родства. Полученные сведения могут быть использованы при чтении лекций в научно-педагогическом процессе на биологических факультетах.

Положения, выносимые на защиту

1. Высокое внутрипопуляционное разнообразие и низкий уровень генетической подразделенности изученных народов Средней Азии по Л/м-инсерционному полиморфизму.

2. Своеобразие генофонда народов Средней Азии, заключающееся в распределении частот ГАТЯ-аллелей генов РАН и D1S80, близком к европеоидным популяциям, по локусу АроВ - к монголоидным популяциям.

3. Высокая информативность Л/м-инсерционного полиморфизма при оценке межпопуляционной дифференциации народов Средней Азии по сравнению с мини- и микросателлитными локусами.

4. Высокое разнообразие гаплотипов мтДНК и сформированных на их основе гаплогрупп в популяциях Средней Азии.

5. Оценка времени дивергенции линий мтДНК в популяциях Средней Азии для гаплогрупп D и Н.

6. Корреляция между матрицами генетических расстояний, рассчитанных на основе частот гаплогрупп мтДНК и географических расстояний, а также Alu-инсерционного и сателлитного полиморфизмов, Alu- локусов и митохондриальной ДНК.

Заключение Диссертация по теме "Генетика", Батырова, Алия Замиловна

ВЫВОДЫ

1) Проведено комплексное изучение популяций казахов, уйгуров, узбеков на основе Alu инсерционного, микро- и минисаттелитного полиморфизма ядерного генома и гаплотипического разнообразия митохондриальной ДНК.

2) Анализ полиморфизма девяти Alu инсерций ядерного генома выявил высокое внутрипопуляционное разнообразие (0,3950) у казахов, узбеков и уйгуров и низкий уровень генетической подразделенности (Fst=0,0097) изученных народов Средней Азии по данной системе маркеров.

3) По распределению частот FTVTK-аллелей генов РАН, и D1S80 изученные популяции Средней Азии оказались более близки к европеоидным популяциям, по локусу АроВ - к монголоидным популяциям, а по распределению аллелей гена eNOS и С7Т7-повторов гена DMPK занимают промежуточное положение между популяциями Европы и Азии.

4) Коэффициент межпопуляционной дифференциации (Fst) для народов Средней Азии по 15 аутосомным локусам ядерного генома составил 0,0073. Наибольший вклад в межпопуляционное разнообразие народов Средней Азиии вносят различия по частотам девяти Л/и-инсерционных локусов (Fst=0,0097) по сравнению с мини- и микросателлитными локусами (Fst=0,0049).

5) Установлено высокое разнообразие гаплотипов мтДНК и, сформированных на их основе, гаплогрупп. Индекс гаплотипического разнообразия мтДНК народов Средней Азии в среднем составил 0,9936, что соответствует таковому в популяциях Центральной Азии (0,9900).

6) Время дивергенции линий мтДНК в популяциях Средней Азии составило для гаплогруппы D - 22,000±4600 лет, а для гаплогруппы Н -20,800±4300 лет, что соответствует периоду верхнего палеолита.

7) Выявлена корреляция между генетическими расстояниями, рассчитанными на основе частот гаплогрупп мтДНК, и географическими расстояниями (г=0,5359, р=0,019), а также между генетическими расстояниями, полученными на основе у4/и-инсерционного и сателлитного полиморфизмов (г=0,6551, р=0,0020); у4/и-инсерционного и полиморфизма митохондриальной ДНК (г=0,5582, р=0,0080).

8) Оценка степени родства и генетических взаимоотношений изученных популяций с другими народами мира на основе полиморфизма ядерного и митохондриального геномов показала, что изученные популяции Средней Азии в целом занимают промежуточное положение между популяциями Европы и Азии.

137

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

В трех коренных этносах Средней Азии - казахов, уйгуров и узбеков -проведено изучение 15 аутосомных локусов ядерного генома: 9 полиморфных локусов Л/и-повторов подсемейств Ya 5/8 и Yb8, расположенных в области генов ангиотензин-конвертирующего фермента (АСЕ), активатора плазминогена (PLAT), аполипопротеина Al (АРОА1) и в локусах PV92, YaNBC27, YaNBC148, В65, А25, Dl; 5 сателлитных локусов (D1S80 и VNTR-участки генов фенилаланицгидроксилазы, эндотелиальной синтазы окиси азота, аполипопротеина В, СГ(7-повторы гена DMPK) и делеции 32 п.н. в гене хемокинового рецептора CCR5.

Все изученные /4/«-инсерции оказались полиморфными во всех изученных популяциях. Наиболее информативными маркерами для анализа дифференциации популяций являются АРОА1, Ya5NBC148, А25 локусы. Наблюдаются широкие пределы вариации частот Л/м-инсерций, характерные как для европеоидов, так и для монголоидов. По распределению частот Alu-инсерций во всех популяциях поддерживается равновесие Харди-Вайнберга, кроме популяции казахов по локусу АРОА1, узбеков по локусам АСЕ, А25, уйгуров по локусу PV92 (р<0,0100), что связано как с недостатком, так и с избытком гетерозигот и можно объяснить случайными стохастическими событиями в данных выборках.

Распределение частот Л/и-инсерций по изученным локусам указывает на существование значительного внутрипопуляционного генетического разнообразия в исследованных популяциях. Среднее значение теоретической гетерозиготности по девяти А/w-инсерциям колеблется от 0,3930 у узбеков до 0,4030 у казахов, достигая по отдельным локусам предельного значения (0,5000) для диаллельной системы. Наибольший уровень разнообразия по Alu-инсерциям обнаружен по локусам АСЕ, PV92, ТРА25.

Попарное сравнение популяций выявило достоверные различия в распределении частот Л/и-инсерций между казахами и узбеками по локусам YaNBC148 (%2=6,172, р=0,04568), АРОА1 (%2=оо, р=0,0001), А25 (%2=оо, р=0,0001), уйгурами и узбеками по локусам YaNBCl48 (%2=11,608, р=0,00302), АРОА1 (Х2=а>, р=0,0001), А25 (%2=оо, р=0,0001). Между популяциями казахов и уйгуров не обнаружено достоверных различий по Л/м-инсерционному полиморфизму, что подтверждает длительные исторические контакты в процессе этнического становления этих народов.

Значение коэффициента генной дифференциации по 9 Л/м-инсерционным локусам составило 0,0097, что свидетельствует об относительно невысоком уровне генетической подразделенности населения изучаемого региона. Наибольший вклад в межпопуляционное разнообразие изученных популяций Средней Азии вносят различия по частотам Л/и-инсерций в локусах А25 (0,0749) и ApoAl (0,0384).

Оценка степени родства и генетических взаимоотношений изученных популяций с другими народами мира показала, что изученные популяции Средней Азии в целом занимают промежуточное положение между популяциями Европы и Азии. При этом, популяции казахов и уйгуров объединяются в один общий кластер, что согласуется с историческими данными об общих чертах этногенеза казахского и уйгурского народов. Популяция узбеков стоит отдельно, тяготея к популяциям Волго-Уральского региона и Европы, что свидетельствует о большей доле европеоидного компонента в генофонде узбекского этноса.

Исследование частоты делеции 32 п.н. в гене CCR5 в популяциях Средней Азии показало незначительное колебание частоты мутантного аллеля (от 0,0281 у узбеков до 0,0357 у казахов и уйгуров), что ниже, чем в европейских популяциях и подтверждает расоспецифичность этого локуса и снижение градиента распространенности этой делеции с запада на восток.

Сравнительный анализ распределения частот аллелей мини- и микросателлитных локусов в популяциях казахов, узбеков и уйгуров с таковыми в других популяциях мира, показывает, что, в целом, этнические группы Средней Азии также демонстрируют сходство с азиатскими и европейскими популяциями. По распределению частот Р7У77?-аллелей генов РАН и DJS80 популяции Средней Азии оказались более близки к европеоидным популяциям, по локусу АроВ - к монголоидным популяциям, а по распределению частот аллелей гена eNOS и СГ(7-повторов гена DMPK занимают промежуточное положение между популяциями Европы и Азии, что согласуется с данными по Alu инсерционному полиморфизму о различном вкладе европеоидных и монголоидных признаков в генофонды изученных народов.

В целом, по 5 сателлитным локусам ядерного генома изученные этносы Средней Азии характеризуются высоким уровнем внутрипопуляционного разнообразия. Индекс теоретической гетерозиготности колеблется от 0,6209 у уйгуров до 0,6760 у казахов. Наибольшее разнообразие выявлено по локусу DJS80, по которому среднее значение гетерозиготности составило 0,8437.

Проведенный кластерный анализ по данным полиморфизма сателлитных локусов позволил выявить наибольшее сходство генетической структуры популяций узбеков и уйгуров, а в целом, популяции Средней Азии объединились в общий кластер.

По 15 аутосомным локусам обнаружены достоверные различия в распределении частот аллелей изученных локусов между казахами и узбеками (Х2=28,3140, р=0,0000), уйгурами и узбеками (х2=54,7010, р=0,0018). Коэффициент генного разнообразия Fst для народов Средней Азии составил 0,0073, что меньше такового значения для народов Волго-Уральского региона (0,0160). Наибольший вклад в межпопуляционное разнообразие народов Средней Азии вносят различия по частотам девяти Л/и-инсерционных локусов (Fst=0,0097) по сравнению с мини- и микросателлитными локусами (Fst=0,0049).

Анализ мтДНК свидетельствует о том, что в митохондриальном генофонде народов Средней Азии присутствуют как восточноевразийские гаплогруппы: А, В, С, D, G, F, М, Z, Y, так и западноевразийские: U, Н, HV, J,

К, X, Т и др. У казахов и уйгуров на долю восточноевразийских гаплогрупп приходится 55,07% и 52,46% соответственно, а для узбеков оказалось характерным увеличение доли западноевразийских гаплогрупп мтДНК до 59,67%, подтверждая существование градиента увеличения частоты восточноевразийских линий в направлении с запада на восток. В популяциях казахов и уйгуров выявлены восточноевразийские гаплогруппы Y и Z, и западноевразийские — I и V, которые отсутствуют в популяции узбеков. У казахов, относящихся к кыпчакской группе западной ветви тюркской группы алтайской языковой семьи, наибольшее распространение получила восточноевразийская гаплогруппа D, а популяциях узбеков и уйгуров, относящихся к карлужской группе западной ветви тюркской группы алтайской языковой семьи — западноевразийские гаплогруппы U и Н. Поскольку очевидных географических барьеров между изученными популяциями не существовало, то можно сделать вывод о различной этнической истории казахов, узбеков и уйгуров по материнской линии внутри тюркской языковой семьи.

Для всех исследованных этнических групп нами установлено высокое разнообразие гаплотипов мтДНК и сформированных на их основе гаплогрупп. Индекс гаплотипического разнообразия народов Средней Азии в среднем составил 0,9936, что свидетельствует о высокой гетерогенности типов мтДНК в изученном регионе.

Проведена оценка времени дивергенции линий внутри нескольких гаплогрупп митохондриальной ДНК. Для гаплогруппы D это значение составило 22,000±4600 лет, а для гаплогруппы Н - 20,800±4300 лет, что соответствует периоду верхнего палеолита.

Консенсусная дендрограмма генетических взаимоотношений между популяциями Средней Азии и Волго-Уральского региона по частотам гаплогрупп мтДНК отразила близкое взаиморасположение казахов и уйгуров, которые образовали единый кластер, в то время как популяция узбеков, на долю которой приходится около 40% восточноевразийских линий мтДНК, наиболее близка к популяции башкир, в митохондриальном генофонде которых эти линии составляют практически такое же количество.

Коэффициенты корреляции матриц генетических расстояний демонстрируют сходную картину генетических отношений между популяциями Средней Азии по системам Л/и-инсерционного и сателлитного полиморфизмов (г=0,6551, р=0,0020), между Alu локусами и митохондриальной ДНК (г=0,5582, р=0,0080). Матрица генетических расстояний, рассчитанная на основе частот гаплогрупп мтДНК, коррелирует с матрицей географических расстояний (г=0,5359, р=0,019). Полученные результаты свидетельствуют о том, что все изученные системы маркеров отражают сходные процессы эволюции генофондов изученных этносов Средней Азии. Географическая близость этих популяций отразилась на генетической дифференциации этнических групп по митохондриальной линии.

Таким образом, исследование двух типов полиморфизма ДНК — ядерного и митохондриального, в трех коренных этносах Средней Азии позволило выявить особенности их генетической структуры и межпопуляционных взаимоотношений, оценить возраст дивергенции отдельных гаплогрупп мтДНК, определить положение генофонда народов Средней Азии среди генофонда народов Евразии.

135

Библиография Диссертация по биологии, кандидата биологических наук, Батырова, Алия Замиловна, Уфа

1. Алексеев В.П. География человеческих рас. — М.: Мысль, 1974. — 325 с.

2. Алексеев В.П., Гохман И.И. Антропология азиатской части СССР. -М.: Наука, 1984.-208 с.

3. Алексеев В.П., Аскаров А.А., Ходжайов Т.К. Историческая антропология Средней Азии (палеолит эпоха античности). Ташкент. -1990.- 112 с.

4. Андриянов Б.В. Этническая история и хозяйственное культурное развитие древних и средневековых народов Средней Азии и Казахстана // Проблемы этногенеза и этнической истории народов Средней Азии и Казахстана М.: 1998. - С. 10 - 13.

5. Асеев М.В., Шауи А., Дин М. и др. Популяционные особенности частот мутации гена хемокининового рецептора CKR- 5, определяющего чувствительность к вирусу СПИДа //Генетика. — 1997. — Т. 33. -С. 1724 — 1726.

6. Ахмедов Б.Ф. Государство кочевых узбеков. М., 1965. - 178 с.

7. Ахметова B.JL, Викторова Т.В., Хуснутдинова Э.К. Молекулярно-генетический анализ полиморфизма VNTR аллелей гена фенилаланингидроксилазы у народов Волго-Уральского региона // Генетика. 2000. - Т. 36. - С. 1161 - 1165.

8. Баранов П.О., Бабенко В.Н. и др. Особенности митохондриального генофонда российских немцев // Генетика. 1999. - Т.35 - С . 249 - 254.

9. Бартольд В.В. Исторический обзор. Ташкент, 1926.

10. Бермишева М., Тамбетс К., Виллемс Р. и др. Разнообразие линий митохондриальной ДНК в популяциях Волго-Уральского региона // Мол. Биол. 2002. - Т. 6. - С. 990- 1001.

11. Бернштам А.Н., Социально-экономический строй орхоно-енисейских тюрок в VI-VIII вв. Институт востоковедения АН УзССР, 1946.-564 с.

12. Бичурин Н.Я. Собрание сведений о народах, обитавших в Средней

13. Азии в древние времена, т.1. М. - Л. - 1960. - 613 с.

14. Викторова Т.В. Генофонд народов Волго-Уральского региона: полиморфизм ядерной, митохондриальной ДНК и анализ мутаций в генах наследственных заболеваний. Автореф. дис. . докт. мед. наук. 2002. -46 с.

15. Галеева А.Р., Хуснутдинова Э.К., Сломинский П.А. и др. Распространенность делеции 32 пн в гене рецептора хемокинов CCR5 в популяциях Волго-Уральского региона // Генетика. 1998. - Т. 34. - С. 1160- 1162.

16. Галеева А.Р., Хуснутдинова Э.К. Особенности распределения мутации гена хемокиного рецептора CCR5, определяющего резистентность к СПИДУ, в популяциях Волго-Уральского региона // Здравоохранение Башкортостана. 1999. - Т.1. - С. 49 - 53.

17. Генофонд и геногеография народонаселения // Под ред. Ю.Г.Рычкова: Том I. Генофонд населения России и сопредельных стран. Санкт- Петербург: Наука, 2000. - 611 с.

18. Гинзбург В.В. Антропологический состав населения Западного Памира (по материалам Н.В.Богоявленского) // АЖ. №1. - 1937. - С. 34.

19. Гинзбург В.В., Трофимова Т.А. Палеоантропология Средней Азии в связи с изучением этногенеза ее народов // КСИЭ. — вып. 31. —1959. — С. 47.

20. Гинзбург В.В. Антропологический состав населения Средней Азии и Казахстана. Народы Средней Азии и Казахстана. — Москва, 1962. — Т. 1. -489 с.

21. Глиндеман В.П., Корешкова Л.П., Хорват Г.Н. Распределение групп крови систем ABO, MN и Rhesus (D и С) среди коренного населения Узбекистана // Bonpv Антропологии. Вып. 37. - 1971. - С. 140.

22. Глиндеман В.П. Частота антигенов и фенотипов системы HLA в узбекской популяции // Новое в трансфузиологии и гематологии: Материалы конф., посвященной 40-летию НИИ гематологии и переливания крови Минздрава УзССР. Ташкент. — 1980 - С. 170.

23. Голубенко М.В. Полиморфизм митохондриальной ДНК у коренного населения республики Тува: Автореф. дис. . канд. биол. наук. Томск. 1998.-24 с.

24. Голубенко М., Пузырев. В., Салюков В. с соав. Анализ распространенности "монголоидных" гаплогрупп митохондриальной ДНК среди коренного населения Тувы // Генетика. 2001. - Т. 37. - С. 1 -9.

25. Дебец Г.Ф. Палеоантропология СССР // Труды Иститута этнографии АН СССР. М.-Л.: Изд-во АН ССР. - 1948. - Т. 4. - 517 с.

26. Деренко М.В., Шилдс Дж.Ф. Разнообразие нуклеотидных последовательнсоетй митохондриальной ДНК в трех группах коренного населения Северной Азии // Мол. Биол. 1997. - Т.31. — С. 784 - 789.

27. Деренко М.В., Шилдс Дж.Ф. Изменчивость митохондриальной ДНК в трех группах коренного населения Северной Азии // Генетика. 1998. -Т. 34.-С. 676-681.

28. Деренко М.В., Дамбуева И.К., Малярчук Б.А. и др. Структура и разнообразие митохондриального генофонда коренного населения Тувы и Бурятии по данным о рестрикционном полиморфизме // Генетика. — 1999. -Т.35.-С. 1706-1712.

29. Деренко М.В., Денисова Г.А., Малярчук Б.А. и др. Структура генофондов этнических групп Алтае-Саянского нагорья по данным о полиморфизме митохондриальной ДНК // Генетика. 2002. - Т. 37. — С. 1402- 1410.

30. Дубова Н.А. Антропологический состав населения Северного Таджикистана. Дис. канд. Наук. М., МГУ. - 1978. - 356 с.

31. Дубова Н.А. Антропологический состав современного населения

32. Средней Азии и пути его формирования // Проблемы этногенеза и этнической истории народов Средней Азии и Казахстана. Вып. IV. - М. 1991.-С. 61 -73.

33. Дубова Н.А. Антропогические и этнические общности на территории Средней Азии // Антропогические и этнографические сведения о населении Средней Азии. Вып. 2. - М.: Старый сад. - 2000.— С. 167-206.

34. Животовский JI.A. Популяционная биометрия. М.: Наука. — 1991. - 272 с.

35. Иванова А.В., Воевода М.И., Казаковцева М.А. и др. Рестрикционно-делеционный полиморфизм региона V митохондриальной ДНК в нескольких популяциях коренного населения Сибири и Дальнего Востока // Генетика. 1994. - Т. 30. - С. 1525 - 1529.

36. Иващенко Т.Э., Глазов П.Б., Хромов-Борисов Н.Н., Баранов B.C. Популяционный анализ тринуклеотидных CTG-повторов в гене миотонической протеинкиназы I // Генетика. 1997. - Т. 33. — С. 1287 — 1290.

37. Исмагулов О.' Процесс становления антропологического типа казахов в связи с проблемами этногенеза. М, Наука, 1964. 7с.

38. Исмагулов О. Материалы по группам крови у населения юго-восточного Казахстана // Вопросы антропологии. — 1968. Вып. 30. — С. 111.

39. Исмагулов О. Материалы к генетической структуре популяции казахов // Популяционно-генетические исследования народов Южного Урала. Уфа. - 1981. - С. 83.

40. Исмагулов О. Этническая антропология Казахстана: (Соматические исследования) Алма- Ата: Наука, 1982. - 256 с.

41. Кабиров М.Н. Очерки истории уйгуров Советского Казахстана. Алма-Ата: Наука, 1975. 285 с.

42. Казаковцева М.А. Полиморфизм митохондриальной ДНК в популяциях коренного населения Западной Сибири и восточных славян. Автореферат дис.канд. биол. наук. Новосибирск: ИЦиГ СО РАН. — 1998.- 17 с.

43. Каримов Х.А. Распределение некоторых генетических систем групп крови (ABO, Rh, MN, Р и Le) у популяций дунган и уйгур Ферганской долины // Вопр. Гематологии и переливания крови. 1977. - Т.З. - С. 21.

44. Каримов Х.А. Антрополого-генетические исследования популяции уйгур и дунган Ферганской долины: Автореф. дис . канд. биол. наук. — М.- 1984.-24с.

45. Кармышева Б.Х. Очерки этнической истории южных районов Таджикистана и Узбекистана (Этнографические данные). — М. — 1976. — 321 с.

46. Керейтов Р.Х. Этническая история ногайцев. Ставрополь — 1999. - 176 с.

47. Кляшторный С. Г., Султанов Т.И. Казахстан. Летопись трех тысячелетий. Алма-Ата. - Рауан. - 1992. - 375 с.

48. Коршунова Т.Ю., Ахметова В.Л., Кутуев И.А. и др. Изучение VNTR-полиморфизма генов РАН, eNOS и делеции гена CCR5 у народов Северного Кавказа // Генетика. 2004. - Т. 40. - С. 409 - 414.

49. Котлярова С. Э., Масленников А.Б., Коваленко С.П. Полиморфизм 3' фланкирующей 'области гена аполипопротеина В в популяции Сибирского региона // Генетика. 1994. - Т. 30. - С. 709 - 712.

50. Кравченко С.А., Малярчук С. Г., Пампуха В.М. и др. Генетика и селекция на Украине на рубеже тысячелетий. Киев: Логос. - 2001. -Т.4. - С. 410 - 422.

51. Либман Е.Г. Распределение групп крови среди великороссов // Тр.

52. I Всесоюз. Съезда зоологов, анатомов и гистологов. Л., 1929. - С. 337.

53. Либман Е.Г. К вопросу о серологических расах Средней Азии // Тр.

54. Всесоюз. Съезда зоологов, анатомов и гистологов. — Киев. Харьков. — 1981.-С. 27.

55. Лимборская С.А., Хуснутдинова Э.К., Балановская Е.В. Этногеномика и геногеография народов Восточной Европы" // Москва: Наука, 2002.-261 с.

56. Лысенко А.Я., Идельсон Л.И., Воронов А.А. и др. Распространение наследственного дефицита глюкозо-6-фосфатдегидрогеназы среди населения СССР // I Всесоюз. Съезд по мед. Генетике: Тез. Докл. М., 1975.-С. 23.

57. Малярчук Б.А., Деренко М.В. Полиморфизм региона V митохондриальной ДНК у коренного и пришлого населения СевероВосточной Азии // Генетика. 1995. - Т. 30. - С. 1308 - 1313.

58. Малярчук Б.А., Деренко М.В. Изменчивость митохондриальной ДНК человека: распределение "горячих точек" в гипервариабельном сегменте I главной некодирующей области // Генетика. 2000. — Т. 37. -С. 991 - 1001.

59. Малярчук Б.А. Изменчивость митохондриального генома человека в аспекте генетической истории славян. Дис . докт. биол. наук. 2002. -46 с.

60. Малярчук Б.А. Дифференциация славян и их генетическое положение среди генофондов Евроазии по данным об изменчивости митохондриальной ДНК // Генетика. 2003 - Т. 37. - С. 1705 - 1712.

61. Маниатис Т., Фрич Э. Сэмбрук Дж. Методы генетической инженерии. Молекулярное клонирование. М.: Мир. - 1984. - 399 с.

62. Народы Средней Азии и Казахстана в 2-х т. Под ред. С.П.Толстова и др. М. - Изд-во АН СССР. - 1962 - 1963. - Т. 1-2.

63. Т. 2. 1963.779с. Т.1: 1962. 768 с.

64. Ошанин JI.B. Данные к географическому распределению главнейших антропологических признаков населения Средней Азии и опыт выявления основных расовых типов Средней Азии // Труды IV Всесоюзного съезда зоологов, анатомов и гистологов. Киев. - 1931.

65. Ошанин JI.B. Вопросы этногенеза народов Средней Азии в свете данных антропологии. Ташкент. - 1953. - 187 с.

66. Ошанин JI.B. Антропологический состав и вопросы этногенеза таджиков и узбекских племен Южного Таджикистана. Сталинабад. — 1957.- 112 с.

67. Пестряков А.П. Антропологическое изучение юго-востока Средней Азии (проблема генезиса расы Среднеазиатского междуречья). Автореф. дисс.канд. ист. наук. М. - 1980. - 23 с.

68. Пестряков А.П. Антропология населения юго-востока Средней Азии // Под ред. Т\В.Рыкушиной. Серия "Этническая антропология Средней Азии". Вып. 3. Ред. Серии Н.А.Дубова. М.: Старый сад. - 2000.- 176 с.

69. Погода Т.В., Никонова A.JL, Колосова Т.В. и др. Аллельные варианты генов аполипопротеинов В и С2 у больных ишемической болезнью сердца и здоровых лиц из московской популяции // Генетика. -1995.-Т. 31.-С. 1001 1009.

70. Пузырев К.В. Клинико-генетическое исследование факторов предрасположенности к эссенциальной гипертензии и идиопатической гипертрофической кардиомиопатии: дис. . канд. мед. наук. Томск: Томск, науч. Центр Сиб. отд. РАМП. 1999. - 159 с.

71. Радлов В.В., К вопросу об уйгурах. Предисловие к изданию Кудатку Билик. - Приложение к 72 тому Записок Академии наук, СПб.- 1983.-48 с.

72. Ранов В.А. Каменный век Таджикистана. Палеолит. Душанбе. — 1965.- 156 с.

73. Ревазов А.А., Ахмина Н.И., Гинтер Е.К. и др. Медико — генетическое изучения населения Самаркандской обл. И. Популяционно-генетическое описание четырех кишлаков Ургутского р-на // Генетика. — 1977.-Т. 13.-С. 2033.

74. Ревазов А.А., Асанов А.Ю., Лунге И.М, БахрамовС.М. Частоты групп крови системы AB0 и гаптоглобинов в Узбекистане. Некоторые проблемы выборочных исследований // Генетика. 1983. - Т. 19. - С. 1193.

75. Рынков Ю.Г. Происхождение расы Среднеазиатского междуречья // Проблемы этнической антропологии Средней Азии. — Ташкент. 1964.

76. Рычков Ю.Г. Происхождение расы Среднеазиатского междуречья // Труды Ташкентского государственного университета. — 1964. — Вып. 235.

77. Салиев К.К, Сеттарова Д.А., Чуеканин Н.Н. Распространение недостаточности щюкозо-б-фосфатдегидрогеназы эритроцитов среди населения Ферганской долины // Проблемы гематологии и переливания крови. 1977. - Т. 22. - С. 59.

78. Самбуугийн Н., Петрищев В.Н., Рынков Ю.Г. Полиморфизм ДНК в населении Монголии. Анализ ПДРФ митохондриальной ДНК // Генетика. 1991.-Т. 27.-С. 2143-2151.

79. Сломинский П.А., Шадрина М.И., Спицын В.А. и др. Простой и быстрый способ определения делеции 32 пн в гене рецептора хемокинов CCR5 // Генетика. 1997. - Т. 33. - № 11. - С. 1596 - 1598.

80. Сломинский П.А., Попова С.Н., Фатхлисламова Р.И. и др. Анализ экспансии триплетного повтора (CTG)n у больных миотонической дистрофией из Башкирии // Генетика. 2000. - Т. 36. - С. 844 — 848.

81. Спицын В.А. Антропологические аспекты изучения генетико-биохимического полиморфизма: Дис . д-ра биол. наук // НИИ и Музей антропологи МГУ. М. - 1984. - 344 с.

82. Спицын В.А. Биохимический полиморфизм человека. М.: МГУ. — 1985. -216 с.

83. Степанов В.А. Этногеномика населения Северной Евразии. — Томск., Печатная мануфактура. 2002. - 244 с.

84. Тихонов Д.И. Хозяйство и общественный строй уйгурского государства. Москва-Ленинград., Наука. 1966. - 287 с.

85. Трофимова Т. А. Основные итоги и задачи палеоантропологического изучения Средней Азии // СЭ. — 1960. — №2. — С. 63.

86. Фатхлисламова Р.И., Хидиятова И.М., Хуснутдинова Э.К. и др. Анализ полиморфизма CTG-повторов в гене миотонической дистрофии в популяциях народов Волго-Уральского региона // Генетика. 1999. — Т. 35.-С. 1-6.

87. Федорова С.А., Бермишева М.А., Виллемс Р. и др. Анализ линий митохондриальной ДНК в популяции якутов // Молекулярная биология.2003.-Т. 37.-С. 1-11.

88. Хидиятова И.М., Фатхлисламова Р.И., Магжанов Р.В. и др. Изучение экспансии и частоты мутирования CTG повторов гена миотонической дистрофии // Генетика. 2000. - Т. 36. — С. 1410 - 1413.

89. Хидиятова И.М., Фатхлисламова Р.И., Магжанов Р.В. и др. Анализ CTG-повторов гена миотонинпротеинкиназы у больных миотонической дистрофией из Башкортостана // Журнал неврологии и психиатрии. -2002. С. 54 - 58.

90. Хитринская И.Ю., Степанов В.А. Мобильный генетический элемент Alu в геноме человека: эволюционный и медико-генетический аспекты // Сб. "Генетика человека и патология". Томск. - 2000. — Вып. 5. — С. 112 - 124.

91. Хитринская И.Ю., Степанов В.А., Пузырев В.П. Анализ полиморфизма Alu-инсерций в бурятских популяциях // Генетика. — 2001. -Т.37.-С. 1553 1558.

92. Хитринская И.Ю. Генетическое разнообразие коренного населения Сибири и Средней Азии по полиморфным Alu-инсерциям: диссер. . канд. биол. наук. Томск. - 2003. - 163 с.

93. Хитринская И.Ю., Степанов В.А., Пузырев В.П. и др. Генетическая дифференциация населения Средней Азии по данным аутосомных маркеров // Генетика. 2003. - Т. 39. - С. 1389 - 1397.

94. Хить Г.JI. Расо- и этногенетические связи населения Средней Азии по данным дерматоглифики // Проблемы этногенеза и этнической истории народов Средней Азии и Казахстана. — М. 1988. — С. 113 — 115.

95. Ходжайов Т.К. Палеоантропология Средней Азии и этногенетические проблемы: Автореф. дисс. докт. ист. наук. М. -1981.

96. Ходжайова Г.К. Этническая антропология Узбекистана: Автореф. дис. док. ист. наук. Ташкент. - 1997. - 47 с.

97. Хусаинова Р.И., Ахметова В.Л., Кутуев И.А. и др. Генетическая струтура народов Волго-Уральского региона и Средней Азии по данным Alu-полиморфизма // Генетика. 2004. - Т. 41. - С. 552 - 559.

98. Хуснутдинова Э.К. , Погода Т.В., Просняк М.И. и др. Анализ аллельных вариантов гипервариабельного локуса аполипопротеина В в популяциях башкир и коми // Генетика. 1995 - Т. 31. - С. 995 — 1000.

99. Хуснутдинова Э.К., Хидиятова И.М., Танеева А.Р. и др. Анализ полиморфизма гипервариабельного локуса гена аполипопротеина В в популяциях народов Волго-Уральского региона // Генетика. 1996. -Т.32. - С. 12.

100. Хуснутдинова Э.К. Молекулярно-генетическая характеристика популяции башкир и других народов Волго-Уральского региона: Дис.докт. биол. наук. М, 1997. -343 с.

101. Хуснутдинова Э.К., Фатхлисламова Р.И., Хидиятова И.М. и др. Рестрикционно-делеционный полиморфизм V-области митохондриальной ДНК в популяциях Волго-Уральского региона // Генетика. 1997. - Т.ЗЗ. - С. 996 - 1001.

102. Хуснутдинова Э.К. Молекулярная этногенетика народов Волго

103. Уральского региона // Уфа: Гилем, 1999. 237 с.

104. Хуснутдинова Э.К. Этногеномика и генетическая история народов Восточной Европы Н Вестник Российской Академии Наук. — 2003. Т. 73.-С. 614-621.

105. Хуснутдинова Э.К. Генетическая история народов восточной Европы // Успехи современной биологии. 2004 (принято к печати).

106. Якубовский А.Ю. К вопросу об этногенезе узбекского народа. — УзФАН. Ташкент. - 1941. - 54 с.

107. Ярхо А.И. Алтае-Саянские тюрки: Антропологический очерк. -Абакан. 1947.- 148 с.

108. Ясевич В.К. Кровяные группы узбеков Кашка-Дарьинского округа // Материалы по антропогии населения Узбекистана. Ташкент. — 1929.-Вып. 1.-С. 163.

109. Akar N., Akar Е., Cin S. et al., Endothelial nitric oxide synthase intron 4, 27-bp repeat polymorphism in Turkish patients with deep vein thrombosis and cerebrovascular accidents // Thrombosis Res 1999. - V. 94. - P. 63 — 64.

110. Alavantic D., Glisic S., Kandic I. АРОВ 3, HVR polymophism in healthy population: relationships to serum lipid levels // Genet. Epidemiol. — 1998. V. 15.-P.- 113- 122.

111. Anderson S., Bankier A.T., Barrell B.G. et. al. Sequence and organization of the human mitochondrial genome // Nature. 1981.— V. 290. -P. 457-465.

112. Arakura A., Lui C., Ota M., Fukushima H. Subtyping and characterization of DLS80 alleles in a Japanese population using PCR-RFLP // Int. J. Legal Med. 1998. - V. 111. - P. 183 - 187.

113. Arcot S.A., Fontius J.J., Deininger P.L., Batzer M.A. Identification and analysis of'young' polymorphic Alu element // Biochimica et Biophysica Acta.- 1995.- V. 1263.-P. 99- 102.

114. Ashizawa Т., Dubel J.R., Dunne P.W. et al. Anticpation in myotonic dystrophy. II. Complex relationships between clinical findigs and structure of the CTG repeat // Neurology 1992. - V. 42(10). - P. 1877 - 1833.

115. Asmundo A., Crino C. The distribution of D1S80 (pMCTl 18) alleles in a Southern Italian population sample // J. Forensic Sci. 1998. - V. 43. — P. 911-912.

116. Ballinger S.W., Schurr T.G., Torroni A. et al. Southeast Asian mitochondrial DNA analysis reveals genetic continuity of ancient mongoloid migrations // Genetics. 1992. - V.130. - P. 139 - 152.

117. Bandelt H.-J., Macaulay V., Richards M. Median networks: speedy construction and greedy reduction, one simulation, and two case studies from human mtDNA In Process Citation. // Mol. Phylogenet. Evol. 2001. - V.16.- P. 8 28.

118. Barrientos A., Casademont J., Solans A. et al. The 9-bp deletion in region V of mitochondrial DNA: evidence of mutation recurrence // Hum. Genet. 1995. - V. 96. - P. 225 - 228.

119. Batzer M.A., Kilroy G.E., Richard P.E. et al. Structure and variability of recently inserted Alu family members // Nucleic Acids Res. 1990. - V. 18. -P. 6793 - 6798.

120. Batzer M.A., Stoneking M., Alegria-Hartman H. et al. African origin of human-specific polymorphic Alu insertion // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. -1994.-V. 91.-P. 12288- 12292.

121. Batzer M.A., Deininger P.L., Hellmann-Blumberg U. et al. Standardized nomenclature for Alu repeats // J. Mol. Evol. 1996. - V. 42. - P. 3 — 6.

122. Batzer M.A., Deininger P.L. Alu repeats and human genomic diversity // Nature Reviews Genetics. 2002. - V. 3. - P. 370 - 379.

123. Boerwinkle E., Xiong W., Fourest E., Chan L. Rapid typing of tandemly repeated hypervariable loci by the polymerase chain reaction: Application to the apolipoprotein В 3'- hypervariable region // Proc. Nat. Acad. Sci. US. -1989.-V. 89.-P. 212-216.

124. Bosch E., Calafell F., Rosser Z. H. • et al. High level of male-biased Scandinavian admixture in Greenlandic Inuit shown by Y-chromosomal analysis // Hum. Genet. 2003. - V. 112. - P. 353 - 363.

125. Botstein D., White R.L., Skolnik M., Davis R.W. Construction of a genetic linkage map in man using restriction fragment length polymorphisms // Am. J. Hum. Genet. 1980. - V. 32. - P. 314 - 331.

126. Bowcock A.M., Kidd J.D., Mountain J.L. et al. Drift, admixture, and selection in human evolution: a study with DNA polymorphisms // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1991. - V. 88. - P. 839 - 843.

127. Bowcock A.M.; Ruis-Linares A., Tomfohrde J. et al. Hight resolution of human evolutionary trees with polymorphic minisatellites // Nature. — 1994. — V. 368.-P. 455-457.

128. Brook J.D., McCurrach M.E., Harley H.G. et al. Molecular basis of myotonic dystrophy: expansion of a trinucleotide (CTG) repeat at the 3' end of a transcript encoding a protein kinase family member // Cell.- 1992. V. 68. -799 - 808.

129. Brown W.M., George M.Jr., Wilson A.C. Rapid evolution of animal mitochondrial DNA // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1979. - V. 76. - P. 1967 -1971.

130. Brown M.D., Hosseini S.H., Torroni A. et al. mtDNA haplogroup X: an ancient link between Europe/Western Asia and North America? // Am. J. Hum. Genet. 1998. - V. 63. - P. 1852 - 1861.

131. Budowle В., Baechtel F.S., Smerick J.B. et al. D1S80 population data in African Americas, Caucasians, Southeastern Hispanics, Southwestern Hispanics, and Orientals // J. Forensic Sci. 1995. - V. 40. - P. 38 - 44.

132. Calo C.M., Autuori L., Di Gaetano C. et al. The polymorphism of the АРОВ 3' VNTR in the populations of the three largest islands of the Western Mediterranean // Anthropol. Anz. 1998. - V. 56. - P. 227 - 223.

133. Cann R.L., Stoneking M., Wilson A.C. Mitochondrial DNA and human evolution // Nature. 1987. - V. 325. - P. 31 - 36.

134. Case J. Т., Wallace D. C. Maternal inheritance of mitochondrial DNApolymorphisms in cultured human fibroblasts // Somat. Cell Genet. 1981. — V. 7.-P. 103- 108.

135. Cavalli-Sforza L.L., Piazza A., Menozzi P., Mountain J. Reconstruction of human evolution: Bringing together genetic, arheological, and linguistic data // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1988. - V. 85. - P. 6002 - 6006.

136. Cavalli-Sforza L.L., Minch E. Paleolithic and Neolithic lineages in the European mitochondrial gene pool // Am. J. Hum. Genet. — 1997. — V. 61. — P. 247 254.

137. Chen Y.-C., Olckers A., Schurr T.G. et al. mtDNA variation in the South African Kung and Khwe and their genetic relationships to other African populations // Am. J. Hum. Genet. - 2000. - V. 66. - P. 1362 - 1383.

138. Cidl K., Strelcova L., Vasku A., Vaeha J. Angiotensin I-converting enzyme (ACE): Areview of I/D polymorphism in the world populations // Scr. Med. (Brno). 1997. - Vol. 70. - P. 81 - 87.

139. Comas D., Calafell F., Mateu E. et al. Geographic variation in human mitochondrial DNA control region sequence: the population history of Turkey and its relationship to the European populations // Mol. Biol. Evol. 1996. — V. 13.-P. 1067- 1077.

140. Comas D., Calafell F., Mateu E. et al. Trading genes along the silk road: mtDNA sequences and the origin of Central Asian populations // Am. J. Hum. Genet. 1998. - V. 63. - P. 331 - 350.

141. Daiger S.P., Reed L., Huang S-S. et al. Polymorphic DNA haplotypes at the phenylalanine hydroxilase (PAH) locus ' in Asian families withphenylketonuria (PKU) // Am. J. Hum. Genet. 1989a. - V. 45. - P. 319 -324.

142. Daiger St.P., Chakraborty R., Reed L. et al. Polymorphic DNA haplotypes at the penylalanine hydroxilase (PAH) locus in European families with phenylketonuria (PKU) // Am. J. Hum. Genet. 1989b. - V. 45. - P. 310 -318.

143. Davies J.D., Yamagata H., Selbourne P. et al. Comparison of miotonic dystrophy assotiated CTG repeat in European and Japanes populations // J. Med. Genet. 1992. - V. 29. - P. 766 - 769.

144. Decorte R., Cuppens H., Marynen P., Cassiman J.-J. Rapid detection of hupervariable regions by the polymerase chain reaction technique // DNA and Cell Biol. 1990. - V. 9. - P. 461 - 469.

145. Deen M., Carrington M., Winkler Ch. et al. Genetic restriction of HIV-1 infection and progression to AIDS by a deletion allele of the CtrR-5 structural gene // Science. -1996. -V. 273.- P. 1856 - 1862.

146. Degen S.J., Rajput В., Reich E. The human tissue plasminogen activator gene // J. Biol. Chem. 1986. - V. 261. - P. 6972 - 6985.

147. Deka R., Chakraborty R., De Croo S., Rothammer F. et al. Characteristics of polymorphism at a VNTR locus 3' to the apolipoprotein В gene in five human populations // Amer. J. Human Genet. 1992. - V. 51. - P. 1325 - 1333.

148. Derenko M., Malyarchuk В., Dambueva I. et al. Mitochondrial DNA variation in tow south Siberian aboriginal populations: implications for the Genetic History of North Asia // Human Biology. 2000. - V. 72. - P. 945 -973.

149. Derenko M.V., Grzybowski Т., Malyarchuk B.A. et al. The presence of mitochondrial haplogroup X in Altaians from South Siberia // Amer. J. Human Genet. 2001a. - V. 69. - P. 237 - 241.

150. Di Rienzo A., Wilson A.C. Branching pattern in the evolutionary tree for human mitochondrial DNA // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1991. - V. 88. - P. 1597- 15601.

151. Dorit R.L., Akashi H., Gilbert W. Absence of polymorphism at the ZFY locus on the human Y chromosome // Science. 1995. - V. 268. — P. 1183 — 1185.

152. Eisensmith R.C., Okano Y., Dasovich M. et al. Multiple origins for phenylketonuria in Europe // Amer. J. Human Genet. — 1992. — V. 51. — P. 1355- 1365.

153. Felsenstein J. PHYLIP, version 3.5. Seatltle Univ. Washinton. 1993.

154. Fitch W. On the problem of discovering the most parsimonious tree // Am. Nat. 1977.-V.l 11.-P. 1169- 1175.

155. Flores C., Maca-Meyer N., Perez J. et al. A Predominant European

156. Ancestry of Paternal Lineages from Canary Islanders // Annals of Human

157. Genetics 2003. -V. 67. - P. 138 - 152.

158. Forster P., Harding R. Origin and evolution of Native American mtDNA variation: a reappraisal // Am. J. Hum. Genet. 1996. - V. 59. - P. 935 - 945.

159. Friedl W., Ludwig E.H., Paulweber B. et al. Hypervariability in a minisatellite 3' of the apolipoprotein В in patients with coronary heart disease compared with normal control // J. Lipid. Res. 1990. - V. 31. - P. 659 — 665.

160. Fukuyama R., Takata M., Kudoh J. et al. DNA diagnosis of hydatidiform mole using polymerase chain reaction // Human Genet. 1991. — V. 87. - P. 216-218.

161. Giles R.E., Blanc H., Cann H.M., Wallace D.C. Maternal inheritance of human mitochondrial DNA // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. 1980. - V. 77. - P. 6715-6719.

162. Goldman A., Ramsay M., Jenkins T. Absence of myotonic dystrophy in southern African Negroids is associated with a significantly lower number of CTG trinucleotide repeats // Med. Genet. 1994. - V. 31. - P. 37 - 40.

163. Goltsov A.A., Eisensmith R.C., Koneski D. S. et al. Linkage disequilibrium between mutations and VNTR in the human phenylalanine hydroxylase gene // Am.J. Hum. Genet. 1992. - V. 51. - P. 627 - 636.

164. Hammer M.F. A recent common ancestry for human Y chromosomes // Nature. 1995. - V. 378. - P. 376 - 378.

165. Hammer M.F., Karafet Т., Rasanayagam A. et al. Out of Africa and back again: nested cladistic analisis of human Y chromosome variation // Mol. Biol. Evol. 1998. - V. 15, - P. 427 - 441.

166. Harley H.G., Brook D.J., Rundle S.A. et al. Expansion of an unstable DNA region and phenotypic variation in myotonic dystrophy // Nature. — 1992. -V. 355.-545-546.

167. Harris S., Moncrieff C., Johnson K. Myotonic dystrophy: will the real gene please step forward // Hum. Mol. Genet. 1996. — V. 5.-1417 — 1423.

168. Helgason A., Sigurdadottir S., Gulcher J. et al. mtDNA and the origins of the Icelanders: deciphering signal of recent population history // Am. J. Hum. Genet. 2000. - V. 66. - P. 999 - 1016.

169. Henderson S.T, Petes T.D. Instability of simple sequence DNA in Saccharomyces cerevisiae // Mol. Cell. Bio. 1992. - V. 12. - P. 2749 - 2757.

170. Horai S., Hayasaka K. Intraspecific nucleotide sequence differences in the major noncoding region of human mitochondrial DNA // Am. J. Hum. Genet. 1990a. - V. 46. - P. 828 - 842.

171. Horai S., Hayasaka K. Intraspecific nucleotide sequence differences in the major noncoding region of human mitochondrial DNA // Am. J. Hum. Genet. 1990b. - V. 46. - P. 828 - 842.

172. Horai S., Murayama K. et al. mtDNA polymorphism in East Asian populations, with special reference to the peopling of Japan // Am. J. Hum. Genet. 1996. - V. 59. - P. 579 - 590.

173. International Human Genome Sequencing Consortium. Initial sequencing and analysis of the human genome // Nature. 2001. - V. 409. - P. 860-921.

174. Ishihara S., Yamada Y., Fujimura Т., Yokota M. Association of polymorphism of the endothelial constitutive nitric oxide synthase gene with myocardial infarction in Japanese population // Am. J. Cardiol. 1998. - V. 81.-P. 83-86.

175. Jeffreys A.J., Wilson V., Thein S.L. Hypervariable minisatellite regions in human DNA // Nature. 1985. - V. 314. - P. 67 - 73.

176. Jeunemaitre X., Lifton R.P., Hunt S.C. Absence of linkage betwwen the angiotensin converting enzyme locus and human essential hypertension // Nature Genet. 1992. - V.l - P. 72 - 75.

177. Jobling M., Samara V. et al. Recurrent duplication and deletion polymorphisms on the long arm of the Y chromosome in normal males // Hum. Mol. Genet. 1996. - V. 5. - P. 1767 - 1775.

178. Jorde L.B., Bamshad M.J., Watkins W.S. et al. Origins and Affinities of Modern Humans: A Comparison of Mitochondrial and Nuclear Genetic Data // Am. J. Hum. Genet. 1995. - V. 57. - P. 523 - 538.

179. Kapitonov V., J. Jurka The age of Alu subfamilies // J. Mol. Evol. — 1996.-V. 42.-P. 59-65.

180. Karathanasis S.K. Apolipoprotein multigene family: tandem organization of human apolipoprotein Al, CIII, and AIV genes // Proc. Natl. Acad. Sci. 1985. - V. 82. - P. 6374 - 6378.

181. Kasai K., Nakamura Y., White R. Amplification of variable number of tandem repeat locus (pMCTl 18) by PCR and its application to forensic science // J. Forensic Sci. 1990. - V. 35. - P.l 196 - 1200.

182. Kashi Y., Soller M. Functional roles of microsatellte and minisatellites // Microsatellites. Evolution and Application / Eds D.B. Goldstein, C. Schlotterer. N.Y.Oxford Univ. Press Inc. 1999. - P. 10 - 23.

183. Khusnutdinova E.K., Victorova T.V., Khidiatova I.M., Bermisheva M.A Genetic diversity of Volga-Ural people: mitochondrial, autosomal and Y— chromosomal DNA-markers // BDENE 2000. - V. 1. - P. 157 - 159.

184. Khusnutdinova E., Bermisheva M., Victorova T.,Korshunova Т., Salimova A., Svyatcva G., Tambets K., Willems R. Phylogeography of mitochondrial lineages of Turkic and Uralic-speaking people // BGRS'2002. -Novosibirsk. 2002. - P. 84 - 88.

185. Kivisild Т., Bamshad M., Kaldma K. et.al. Deep common ancestry of Indian and western-Eurasian mtDNA lineages // Curr. Biol. — 1999. — P. 1331 -1334.

186. Kivisild Т., Kaldma K., Metspalu M. et al. The Place of the Indian mtDNA Variants in the Global Network of Maternal Lineages and the Peopling of the Old World // Academic / Plenum Publishers. 1999. - P. 135 - 152.

187. Kivisild T. The origin of Southern and Western Eurasian populations: an mtDNA study // Thesis, Tartu: Tartu University Press. 2000a.

188. Kivisild Т., Papiha S., Rootsi S. DNA and population prehistory of Europe // McDonald Institute for Archaeological Research. 2000b. — P. 267 — 275.

189. Kivisild Т., Tolk H.-V., Paric J. et al. The emerging limbs and twigs of the East Asian mtDNA tree // Mol. Biol. Evol. 2002. - 19(10): 1737 - 1751.

190. KivisildT., Rootsi S., Metspalu M. et al. The Genetic Heritage of the Earliest Settlers Persists Both in Indian Tribal and Caste Populations // Am. J. Hum. Genet. 2003. - V. 72. - P. 313 - 332.

191. Knott T.J., Wallis S.C., Peace R.L. et al. A hypervariable region 3' to the human apoliprotein В gene // Nuc. Acids Res. 1986. - V. 14. - P. 9215 -9216.

192. Kolman C., Sambuughin N. Mitochondrial DNA analysis of Mongolian populations and implications for the origin of New World founders // Genetics. 1996. - V. 142. - P. 1321 - 1334.

193. Krutovskii K.V., Vollmer S.S., Sorensen F.C. et al. RAPD genome map of Douglas-fir // J. Heredity. 1998. - V. 89. - P. 198 - 205.

194. Lahermo P., Sajantila A., Sistonen P. et al. The genetic relationship between the Finns and the Finnish Saami (Lapps): analysis of nuclear DNA and mtDNA // Am. J. Hum. Genet. 1996. - V. 58. - P. 1309 - 1322.

195. Lahermo P., Sajantila A., Sistonen P. et al. The genetic relationship between the Finns and Finnish Saami: analysis of nuclear DNA and mtDNA // Am. J. Hum. Genet. 1999. - V. 64. - P. 232 - 249.

196. Lahr M., Foley R. Multiple dispersals and modern human origins // Evolutionary Anthropology. 1994. - V. 3. - P. 48 - 60.

197. Lee E.J. Population genetics of the angiotensin-converting enzyme in Chines // Brit. J. Clin. Pharmocol. 1994. - Vol. 37. - P. 212 - 214.

198. Levinson G., Gutman G.A. Slipped-strand mispairing: a maijor mechanism for DNA sequence evolution // Mol. Biol. Evol. 1987. - V. 4. — P. 203-221.

199. Limborska S.A., Balanovsky O.P., Balanovskaya E.V. et al. Analysis of CCR5del32 geographic distribution and correlation with some climatic and geographic factors // Human Heredity. 2002 - V. 53. - 49 - 54.

200. Ludwig E. H., Blackhart B.D., Pierotti V.R. et al. DNA sequence of the human apolipoprotein Bgene // DNA. 1987. - V. 6. - P. 363 - 372.

201. Ludwig E.H., Friedl W., McCarthy B.J. High resolution analysis of a hypervariable region in the human apolipoprotein В gene // Amer. J. Human Genet. 1989. - V. 45. - P. 458 - 464.

202. Luts S., Weisser H.-J., Heizmann J., Pollak S. Location and freqency of polymorphic positions in the mtDNA control region of individuals from Germany // Int. Legal Med. 1998. - V. 111. - P. 67 - 77.

203. Macaulay V., Richards M., Hickey E. et.al. The emerging tree of West Eurasian mtDNA: A synthesis of control-region sequences and RFLPs // Am.V

204. J. Hum. Genet. 1999. - V. 58. - P. 1309 - 1322.

205. Majumder P.P. Human-specific insertion/deletion polymorphisms in Indian populations and their evolutionary implications // Eur. J. Hum. Gen. — 1999.-V. 7.-P. 435-446.

206. Mantel N. The detection of disease clustering and a generalized regression approach // Cancer Res. 1967. - V. 27. - P. 209 - 220.

207. Martinson J.J., Chapman N.H., Rees D.C., Liu Y.T., Clegg J.B. Global distribution of the CCR5 gene 32-basepair deletion // Nature Genet. 1997. — V. 16.-P. 100- 103.

208. Mathew C.C. The isolation of high molecular weight eucariotic DNA // Methods in molecular biology // Ed. Walker J.M.N.Y. Haman Press. - 1984. -P. 31 -34.

209. Mattei M., Hubert C., Alhenc-Gelas F. et al. Angiotensin-I converting enzyme gene is on chromosome 17 // Cytogeet. and Cell Genet. 1989. - V. 51.-P. 1041.

210. Meinila M., Finilla S., Majamaa K. Evidence for mtDNA admixture betwwen the Finns and the Saami // Hum. Hered. V. 52. - P. 160 - 170.

211. Merriwether D.A., Clark A.G., Ballinger S.W. et al. The structure of human mitochondrial DNA variation // J. Mol. Evol. 1991. - V. 33. - P. 543 -555.

212. Merriwether D.A., Huston S.L., Bunker C.A., Ferrell R.E. Origins and dispersal of the mitochondrial DNA region V 9-bp deletion and insertion in Nigeria and the Ivory Coast // Am. J. Hum. Genet. 1994. - V. 3. - A158.

213. Metspalu E., Kivisild Т., Kaldma K. et al. The Trans- Caucasus and the expansion of the Caucasoid-specific human mitochondrial DNA. In Genomic Diversity //Kluwer Academic/Plenum Publishers. 1999.- P. 121 — 134.

214. Metspalu M. Common Maternal Legacy of Indian Caste and Tribial Populations // M.Sc.Thesis, Tartu: Tartu University Press. 2001.

215. Mishmar D., Ruiz-Pesini E., Golik P. et al. Natural selection shaped regional mtDNA variation in humans // PNAS 2003 - V. 100. - P. 171 — 176.

216. Mountain J.L., Cavalli-Sforza L.L. Multilocus genotypes, a tree of individuals, and human evolutionary history // Am. J. Hum. Genet. — 1997. — V. 61.-P. 705-718.

217. Mueller U. G., Wolfenbarger L.L. AFLP genotyping and fingerprinting // Trends Ecol. Evol. 1999. - V. 14. - P. 389 - 394.

218. Nakagami H., Ikeda U., Maeda J. et al. Coronary artery disease and endothelial nitric oxide synthase and angiotensin-converting enzyme gene polymorphisms // J. Thrombolysis. 1999. - V. 8. - P. 191 - 195.

219. Nakamoto M., Takebayashi H., Kawahuchi Y. et al. CAG/CTG expansion in the normal population // Nat. Genet. 1997. - V. 17. - P. 385 -386.

220. Nasidse I., Risch G.M., Robichaux M., et al. Alu insertion polymorphisms and the genetic structure of human populations from the Caucasus // Eur. J. Hum. Gen. 2001. - V. 9. - P. 267 - 272.

221. Nei M. Analysis of gene diversity in subdivided population // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 1973. - V. 3. - P. 3321 - 3323.

222. Nei M. Molecular Population Genetic and Evolution. Amsterdam: North-Holland. 1975. - P. 278.

223. Nei M. Molecular Evolutionary Genetics // Columbia University Press. -New York 1987.

224. Niemi A-K., Hervonen A., Hurme M. et al. Mitochondrial DNA polymorphisms associated with longevity in a Finnish population // Hum Genet 2003. - V. 112.-P. 29-33.

225. Novick G.E., Batzer M.A., Deininger P.L., Herrera R.J. The mobile genetic element Alu in the human genome // Bioscience. 1996. — V. 46. - P. 32-41.

226. Ocano Y., Wang Т., Eisensmith R. C. et al. PKU mutations among Caucasians // Am. Hum. Genet. 1989. - V. 45. - P. 211.

227. Ocano Y., Isshiki G., Hase Y. et al. Molecular basis and population genetics of PKU in Orientals: Abstr. 36 th Annu. Meet. Jap. Soc. Hum. Genet. 1991 // Jap. J. Hum. Gen. 1992. - V. 37. - P. 93.

228. Odawara M., Matsunuma A., Yamashita K. Mistyping frequency of the angiotensin-converting enzyme gene polymorphism and an improved method for its avoidance // Hum. Genet. 1997. - V.100. - P. 163 - 166.

229. Olivo P.D., Van de Walle M.J., Lapis P.J., Hauswirth W.W. Nucleotide sequence evidence for rapid genotypic shifts in the bovine mitochondrial DNA D- loop // Nature. 1983. - V. 306. - P. 400 - 402.

230. Opdal SH, Rognum TO, Vege A. et al. Increased number of substitutions in the D-loop of mitochondrial DNA in the sudden infant death syndrome // Acta Pasdiatr. 1998. - V. 87. P. 1039 - 1044.

231. Orekhov V. et al. Mitochondrial DNA sequence diversity in Russians // FEBS. 1999.-L. 445.-P. 197-201.

232. Page, R. D. M. TreeView ver. 1.6.1. 2000.

233. Piercy R., Sullivan K.M., Benson N., Gill P. The application of mitochondrial DNA typing to the study of white Caucasian genetic identification // Int. J. Leg. Med. 1993. - V. 106. - P. 85-90.

234. Primmer C.R., Ellegren H., Saino N., Moller A.P. Directional evolution ingermilinemicrosatellite mutations//Nature Genet. 1996. -V. 13.-P. 391 -393.

235. Quintana-Murci L., Semino O., Bandelt H- J. et al. Genetic evidence of an early exit of Homo sapiens sapiens from Africa through eastern Africa // Nat. Genet. 1999. - V. 23. - P. 437 - 441.

236. Raymond M., Rousset F. An exact test for population differentiation// Evolution. 1995. - V. 49. - P. 1280 - 1283.

237. Raynolds M.V., Bristow M.R., Bush E.W. et al. Angiotensin-converting enzyme DD genotype in patients with ischaemic or idiopathic dilated cardiomyopaty // Lancet. 1993. - Vol. 342. - P. 1073 - 1075.

238. Richards M., Corte-Real H. et al. Paleolithic and neolithic lineages in the European mitochondrial gene pool // Am. J. Hum. Genet. —1996. V. 59. - P. 185-203.

239. Richards M., • Macaulay V., Bandelt H.J. Phylogeography of mitochondrial DNA in western Europe // Ann. Hum. Genet. 1998. — V. 62. -P. 241 -260.

240. Richards M., Macaulay V., Hickey E. et.al. Tracing European Founder Lineages in the Near Eastern mtDNA Pool // Am. J. Hum. Genet. 2000. - V. 67.-P. 1251 - 1276.

241. Richards M. and Macaulay V. The Mitochondrial Gene Tree Comes of Age // Am. J. Hum. Genet.- 2001. V. 68. - P.000-000.

242. Richards M., Rengo С., Cruciani F. et al. Extensive Female-Mediated Gene Flow from Sub-Saharan Africa into Near Eastern Arab Populations // Am. J. Hum. Genet. 2003. - V. 72. - P. 000 - 000.

243. Roff D. F., Bentzen P. The statistical analysis of mitochondrial DNA:

244. X2 and problem of small samples // Mol. Biol. Evol. 1989. - V.6. - P. 539 -545.

245. Rousselet F. • Mangin P. Mitochondrial DNA polymorphisms: a study of 50 French Caucasian individuals and application to forensic casework // Int. J. Legal Med. 1998. - V. 111. - P. 292 - 298.

246. Roy-Engel A.M. Non-traditional Alu evolution and primate genomic diversity // J. Mol. Biol. 2002. - V. 316. - P. 1033 - 1040.

247. Sajantila A., Budowle В., Strom M. et al // Am. J. Hum. Genet. 1992. -V. 50.-P. 816-825.

248. Sajantila A., Lahermo P., Anttinen T. et al. Genes and languages in Europe: an analysis of mitochondrial lineages // Gemone Res. 1995.— V. 5. — P. 42-52.

249. Sajantila A., Salem A-H. et al. Paternal and maternal DNA lineages reveal a bottleneck in the founding of the Finnish population // Pop. Biol. — 1996. V. 93. - P. 12035 - 12039.

250. Samson M., Libert. F., Doranz B.J. et al. Resistance to HIV-l infection in caucasian individuals beari,g mutant alleles of the CCR-5 chemokine receptor gene// Nature. 1996. - V. 382. - P. 722-725.

251. Schurr Т., Sukernik R., Starikovskaya Y. et al. Mitochondrial DNA variation in Koryaks and Itel'men: population replacement in the Okhotsk Sea-Bering Sea region during the Neolithic // Am. J. Phys. Anthropol. — 1999. V. 108.-P. 1-39.

252. Shields G.F., Schiechen A.M., Frazier B.L. et al. MtDNA sequences suggest a recent evolutionary divergence for beringian and Northern North American populations // Am. J. Human Genet. 1993. - V. 53. - P. 549 — 562.

253. Slatkin M. A measure of population subdivision based on microsatellite allele frequencies // Genetics. 1995. - V.139. - P.457 - 462.

254. Smith P.D., Steeds R., Channer K., Samani N.J. Constitutive endothelial nitric oxide synthase gene polymorphism and risk of myocardial infarction // XX Congress of the European society of Cardiology. 1998. - Abst 2063.

255. Soubrier F., Alhenc-Gelas F., Hubert C. Two putative active centers in human angiotensin I-converting enzyme revealed by molecular cloning // Proc. Nat. Acad. Sci. US. 1988. - V. 85. - P. 9386 - 9390.

256. Starikovskaya Y. Sukernik R., Schurr T. et al. MtDNA diversity in Chukchi and Siberian Eskimos: implications for the genetic history of Ancient Beringia and the peopling of the New World // Am. J. Hum. Genet. — 1998. — V. 63.-P. 1473- 1491.

257. Stein Aurel. On ancient central-asian traks, Brief narrative of three expeditions in innermost Asia and North-Western China London. 1933.

258. Stoneking M., Hedgecock D., Higuchi R.G. et al. Population variation of human mtDNA control region sequences detected by enzymatic amplification and sequence-specific oligonucleotide probes // Am. J. Human Genet. — 1991. -V. 48.-P. 370-382.

259. Stoneking M. Mitochondrial DNA and human evolution // J. Bioenerg. Biomembr. 1994. - V. 26. - P. 251 - 259.

260. Stoneking M. Mitochondrial DNA variation and human evolution // Hum. Genome Evol. 1996. - P. 263 - 281.

261. Stoneking M. Fontius J.J., Clifford S.L. et al. Alu insertion polymorphisms and human evolution: Evidence for a larger population size in Africa // Genome Resv 1997. - V. 7. - P. 1061- 1071.

262. Svensson E., Wang Y., Eisensmith R.C.,Hagenfeldt L., Woo S.L. Three polymorphisms but no disease-causing mutations in the proximal part of the promoter of the phenylalanine hydroxylase gene // Europ. J. Human Genet. 1993.-V. 1.-P. 306-313.

263. Tambets K., Rootsi S., Kivisild T. And Villems R. The concepts of Richard Inderco about the origin of the Finno-Ugric speakers and the population genetics of the extant North-East European populations // Trames. — 2001.-V. l.-P. 59-74.

264. Tauts D. Hypervariability of simple sequence as a general source for polymorphic DNA markers // Nucl. Acids Res. 1989. - V. 17. - P. 6463 -6471.

265. Tiret L., Rigat В., Visvikis S. et al. Evidence from combined segregation and linkage analysis, that a variant of the angiotensin I-converting enzyme (ACE) gene controls plasma ACE levels // Am. J. Hum. Genet. 1992. — V.51. -P. 197-205.

266. Tolk H.V., Pericic M., Barac L. et al. MtDNA Haplogroups in the Populations of Croatian Adriatic Islands // Coll. Antropol. 2000. - V. 24. — 267-279.

267. Torroni A., Schurr Т., Yang C. et al. Native American mitochondrial DNA analysis indicates that the Amerind and the Nadene populations were founded by tow independent migrations // Genetics. 1992. - V. 130. — P. 153 - 162.

268. Torroni A., Schurr T.G., Cabell M.F. et al. Asian affinities and continental radiation of the four founding native American mtDNAs // Am. J. Hum. Genet. 1993a. - V. 53. - P. 563 - 590.

269. Torroni A., Sukernik R.I., Schurr T.G. et al. MtDNA variation of aboriginal Siberians reveals distinct genetic affinities with native Americans // Am. J. Hum. Genet. 1993b. - V. 53. - P. 591 - 608.

270. Torroni A., Petrozzi M., D'Urbano L. et al. Mitochondrial DNA "clock" for the Amerinds and its implications for timing their entry into North America // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1994c. - V. 91. - P. 1158 - 1162.

271. Torroni A., Petrozzi M., Santolamazza P. et al. About the Asian-specific 9-bp deletion of mtDNA // Am. J. Human Genet. 1995. - V. 57. - P. 507-508.

272. Torroni A., Petrozzi M., Santolamazza P. et al. About the "Asian"-specific 9 bp deletion of mtDNA // Am. J. Human Genet. 1995b. - V. 57. -P. 507-508.

273. Torroni A., Huoponen K. et al. Classification of European mtDNAs from an analysis of three European populations // Genetics. 1996. - V. 144. - P. 1835- 1850.

274. Torroni A., Bandelt H.-J. et al. mtDNA analysis reveals a major late Paleolithic population expansion from Southwestern to Northeastern Europe // Am. J. Hum. Genet. 1998. - V. 62. - P. 1137 - 1152.

275. Underhill P., Li J., Zemans R., Cavalli-Sforza L. A pre-Columbian Y chromosome-specific transition and its implications for human evolutionary history //Genetics.- 1996.- V. 93.-P. 196-200.

276. Underhill P.A., Lin A.A., Mehdi S.Q., et al. Detection of numerous Y chromosome biallelic polymorphisms by denaturing high-performance liquid chromatography // Genome Res. 1997. - V. 7. - P. 996 - 1005.

277. Underhill P. The pattern of global Y-chromosome binary marker haplotype variation // BDENE 2000. - V. 2. - P. 187 - 189.

278. Verbenko D.A., Kekeeva T.V., Pogoda T.V., Khusnutdinova E.K.' et al. Allele Frequencies for DIS80 (pMCT118) locus in some East European populations // Journal of Forensic Science. 2003. - V. 48. - P. 481 - 482

279. Vigiliant L., Pennington R., Harpending H. et al. Mitochondrial DNA // Sciece. 1991. - V. 253. - P. 1503-1507.

280. Villems R., Rootsi S, Tambets R., et al. Archaeogenetics of Finno-Ugric speaking populations./ In: The Roots of peoples and languages of northern Eurasia. IV// Edited by K.Julku. Societas Historiae Fenno-Ugricae. — Oulu. -2002.-P. 271-284.

281. Wallace D.C., Lott M.T., Brown M.D. et al. Report of the Committee on human mitochondrial DNA // In.: Citicchia A.J. (ed) Human gene mapping: a compendium. Johns Hopkins University: Johns Hopkins University Press. -1995.-P. 910-954.

282. Wallace D.C., Brown M.D., Lott M.T. Mitochondrial DNA variation in human evolution and disease // GENE. 1999. - V. 238. - P. 211 - 230.

283. Wallace D.C., Donham B.P., Schurr T.G. et al. Origin of haplogroup M in Ethiopia // Am. J. Hum. Genet. 2000. - V. 67. - P. 217.

284. Wang X.L., Sim A.S., Badenhop R.F. et al. A Smocking-dependent risk of coronary artery disease associated with the polymorphism of endothelial nitric oxide synthase gene // Nat. Med. 1996. - V. 2. - P. 41 - 45.

285. Ward R.H., Frazier B.L., Dew K., Paabo S. Extensive mitochondrial diversity withing a single Amerindian tribe // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. — 1991.-V. 88.-P. 8720-8724.

286. Watkins W.S., Ricker C.E., Bamshad M.J. et al. Patterns of ancentral Human Diversity: .an analysis of Alu-insertion and restriction-site polymorphism //Am. J. Hum. Genet. 2001. - V. 68. - P. 738 - 752.

287. Weber J.L., May P.E. Abundant class of human DNA polymorphism which can be typed using the polymerase chain reaction // Am. J. Hum. Genet. 1989. - V. 44. - P. 388 - 396.

288. Weber J.L., Wong C. Mutation of human short tandem repeats // Mol. Genet. 1993. - V. 2. - P. 1123 - 1128.

289. Williams J.G.K., Hanafey M.K., Rafalski J.A, Tingey S.V. Genetic analysis using random amplifiled polymorphic DNA markers // Metods in Enzymology / Ed. R. Wu. V. 218. - Recombinant DNA. San Diego: Acad. Press. - 1993. - P. 704 - 740.

290. Wilson A., Cann R., George M. et al. Mitochondrial DNA and two perspectives on evolutionary genetics // Biological Journal of the Linnean Society. 1985. - V. 26. - P. 375 - 400.

291. Woller J., Furedi S., Padar Z. AMPLFLP analysis of the VNTR loci D1S80 and ApoB in Hungary // Intern. J. Legal Med. 1995. - V. 107. - P. 273 - 274.

292. Woo S.L.C. Location of RFLP haplotypes at the human phenylalanine hydroxilase (PAH) locus // Am. J. Hum. Genet. 1988. - V. 43. - P. 781 -783.

293. Wright S. The interpretation of population structure by F-statistica with special regards to systems of mating // Evolution. 1965. - V. 19. - P. 3 - 17.

294. Wright J. DNA fingerprinting in fishes // Biochemistry and Molecular Biology of Fishes / Eds. P. Hochachka, T. Mommsen. Amsterdam: Elsevier, — 1993.-V. 2.-P. 57-91.

295. Wright J.M. Mutation at VNTRs: Are minisatellites the evolutionary progeny of microsatellites? // Genome. 1994. - V. 37. - P. 345 - 347.

296. Yang-Feng Т., Opdenakker G., Volekaert g. et al. Human tissue-type plasminogen activator gene located near chromosomal breakpoint in myeloproliferative discorder// Am. J. Hum. Genet. 1984. - V. 39. - P. 79-87.

297. Yao Y.-G., L.H.-Mei., Luo H.-R. et al. Gene admixture in the Silk Road region of China evidence from mtDNA and melanocortin 1 receptor polymorphism. Genes // Genet. Syst. - 2000. - V. 75. - P. 173 - 178.

298. Yao Y-G, Macaulay V., Kivisild T. et al. To Trust or Not to Trust an Idiosyncratic Mitochondrial Data Set // Am. J. Hum. Genet. 2003. - V. 72. -P. 1341-1346.

299. York D.S., Blum V.M., Low J.A. et al. Phylogenetic signals from point mutations and polymorphic Alu insertions // Genetica. 1999. - V. 107. - P. 163-170.

300. Zerjal Т., Xue Y., Bertorelle G. The Genetic Legacy of the Mongols // Am. J. Hum. Genet. 2003. - V. 72. - P. 717 - 721.

301. Zhivotovsky L. Estimating divergence time with the use of microsatellite genetic distances: impacts of population growth and gene flow // Mol. Biol. Evol. 2001. - V. 18. - P. 700-709.

302. Zhivotovsky L.A., Rosenberg N.A., Feldman M.W. Features of evolution and expansion of modern humans inferred from genome-wide microsatellite markers // Am. J. Hum. Genet. 2003.- In press.

Информация о работе
  • Батырова, Алия Замиловна
  • кандидата биологических наук
  • Уфа, 2004
  • ВАК 03.00.15
Диссертация
Анализ полиморфизма ДНК ядерного и митохондриального геномов в популяциях Средней Азии - тема диссертации по биологии, скачайте бесплатно
Автореферат
Анализ полиморфизма ДНК ядерного и митохондриального геномов в популяциях Средней Азии - тема автореферата по биологии, скачайте бесплатно автореферат диссертации
Похожие работы