Изучение генетической структуры популяций кабардинцев и балкарцев

Боготова, Залина Ихсановна

Бесплатный автореферат и диссертация по биологии на тему
Изучение генетической структуры популяций кабардинцев и балкарцев
ВАК РФ 03.00.15, Генетика

Автореферат диссертации по теме "Изучение генетической структуры популяций кабардинцев и балкарцев"

На правах рукописи

1авах рукомс

ЩГ

003487998

Боготова Залина Ихсановна

ИЗУЧЕНИЕ ГЕНЕТИЧЕСКОЙ СТРУКТУРЫ ПОПУЛЯЦИИ КАБАРДИНЦЕВ И БАЛКАРЦЕВ

03.00.15-генетика

АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук

1 О ДЕК 2009

Уфа-2009

003487998

Работа выполнена в Учреждении Российской Академии наук Институте биохимии и генетики Уфимского научного центра РАН и на биологическом факультете ГОУ ВПО Кабардино-Балкарского Государственного Университета.

Защита состоится 22 декабря 2009 г. в «/С» часов на заседании Объединенного диссертационного совета ДМ 002.133.01 при ИБГ УНЦ РАН по адресу: г. Уфа, пр. Октября, 71

С диссертацией можно ознакомиться в библиотеке Уфимского научного центра РАН по адресу: 450054, г. Уфа пр. Октября, 71 и на сайте ibg.anrb.ru/dissoy.html. e-ma^l:moigen@anrb.щ

Научный руководитель: доктор биологических наук, профессор

Хуснугдинова Эльза Камилевна Официальные оппоненты: доктор медицинских наук, профессор

Викторова Татьяна Викторовна

ГОУ ВПО Башкирский Государственный

Медицинский Университет

доктор биологических наук, профессор

Спицын Виктор Алексеевич

ГУ Медико-генетический Научный Центр

РАМН

Ведущая организация: Учреждение Российской Академии наук Институт

общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН

2009

г.

Ученый секретарь диссертационного совета

Бикбулатова С.М.

Общая характеристика работы. Актуальность исследования. Исследование происхождения и эволюционной истории популяций человека основывается на анализе особенностей геномного разнообразия отдельных популяций и этнотерриториальных общностей различных регионов мира. Наиболее информативными и удобными высокополиморфными маркерными системами являются митохондриальная ДНК (мтДНК), нерекомбшшрующая область Y-хромосомы и Alu-инсерционный полиморфизм [Batzer, 1996; Stoneking, 1997; Nasidze, 2001].

Популяционно-генетические исследования популяций Кавказа проводились и ранее [Булаева К. с соавт., 1985, 1995, 1996, 1997, 2003; Почешхова Э. с соавг., 1998, 2008; Коршунова, 2004; Юиусбаев Б., 2006; Tambets К. et al., 2000; Nasidze I. et al.,2001, 2003, 2004; Roostalu U. et al, 2007]. Однако исследования по изучению генетической структуры популяций кабардинцев и балкарцев недостаточны и носят фрагментарный характер, что связано с некоторыми техническими ошибками при работе с мтДНК, малым филогенетическим разрешением используемых генетических маркеров. В связи с этим более детальный анализ трех систем генетических маркеров (мтДНК, Y-хромосомы, Alu-инсерционпого полиморфизма) позволит выяснить особенности генетической структуры популяций кабардинцев и балкарцев, получить ответ на многие вопросы для более глубокого понимания происхождения и формирования генофонда этих этносов, а также станет основой для дальнейших молекулярно-эпидемиологических исследований наследственных и мультифакториальных заболеваний в популяциях.

Цель данной работы: исследование генетической структуры и филогенетических взаимоотношений популяций кабардинцев и балкарцев по данным полиморфизма мтДНК, Y-хромосомы и Alu инсерционных локусов.

В соответствии с целью исследования были поставлены следующие задачи:

1. Провести анализ распределения частот 15 Alu инсерций в популяциях кабардинцев и балкарцев.

2. Оценить степень генетической дифференциации популяций кабардинцев и балкарцев на основе распределения частот 15 Alu инсерций.

3. Провести филогеографический анализ гаплогрупп и линий митохондриальной

ДНК в популяциях кабардинцев и балкарцев.

4. Провести филогсчнрафический анализ гаплогрупп Y хромосомы в популяциях кабардинцев и балкарцев.

5. Охарактеризовать генетические взаимоотношения между популяциями кабардинцев и балкарцев и другими популяциями Европы и Азии по данным полиморфизма мгДНК, Y-хромосомы и ЛЬмшсерционных локусов. Научная новизна. Впервые в популяциях кабардинцев и балкарцев проведено

комплексное исследование генетической структуры на основе трех молекулярио-гепетическнх систем: аутосомньтх Alu инсерции, мтДНК, Y хромосомы. В популяциях кабардинцев и балкарцев проведен филогенетический и филогеографический анализ гаплогрупп и линий мтДНК и гаплогрупп Y хромосомы. На основе изучения полиморфизма Alu инсерций, мтДНК и Y хромосомы определено положение кабардинцев и балкарцев в ряду иопуляний Европы и Азии. Показана генетическая близость популяций Кавказа к популяциям Ближнего Востока но данным о распределении частот raimojpynn мтДНК и Y хромосомы. Полученные в работе данные существен) го дополняют и расширяют историко-этнографичсские представления о формировании кабардинцев и балкарцев как этносов. Научно-практическая значимость.

Полученные результаты совместно с данными историков, этнографов, археологов, антропологов и лингвистов могут применяться для уточнения и дополнения вопросов об этногенезе этих народов. Созданные коллекции ДНК иопуляшй кабардинцев и балкарцев могут использоваться в д&чънейшем для проведения поиуляииошшх, эволюционных и медико-генетических исследований. Результаты исследования могут быть использованы в научно-образовательном процессе при создании курсов лекций для студентов биологических. медицинских, исторических специальностей.

Апробация работы. Основные результаты диссертационной работы были представлены на V Съезде Вавиловского общества генетиков и селекционеров (Москва, 2009); па научно-практической конференции «Инновации в современной медицине» (Нальчик. 2009); 6th ISABS Conference on Humati Genome Project Based Applications in Forensic Science, Anthropology and Individualized Medicine (Split, Croatia, 2009).

Публикации. По теме диссертации было опубликовано 6 работ, из них 2 в журналах, рекомендованных ВАК.

Структура и объем диссертации. Диссертационная работа изложена на 130 страницах текста и состоит из введения, обзора литературы, описания материалов и

методов, результатов н обсуждения, заключения, выводов, списка литературы.

Данные проиллюстрированы 5 таблицами и 13 рисунками. Список литературы включает 235 публикаций отечественных и зарубежных авторов.

МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ

Материалом для исследования служили образцы ДНК, выделенные из венозной крови, взятой у представителей популяций кабардинцев (п=143) и балкарцев (п=140), проживающих в Кабардино-Балкарской Республике.

Генотипирование 15 Alu инсерциоцных локусов проводили с помощью полимеразной цепной реакции (Ш (Р) синтеза ДНК на амплификаторе "Терцин" производства компании «ДНК-технология» (г. Москва). Разделение фрагментов ДНК проводили с помощью электрофореза в 7% полиакриламидном геле с последующей детекцией в ультрафиолетовом свете.

Был проведен ПДРФ-анализ 49 маркеров кодирующего региона и секвенирование ГВС1 мтДНК в популяциях кабардинцев и балкарцев.

Анализ гипервариабельного сегмента I (ГВС1) мтДНК включал ПЦР-амплификацию фрагмецта с использованием праймеров А15909 и В16498, с последующим секвенированием мтДНК между позициями 16024 и 16400 п.н. с использованием праймеров Н15975 и F16420 с применением набора для секвенировашм DYEnamic™£T Terminator Cycle Sequencing Kit (Amersham Pharmacia Biotech) [Sullivan et al., 1992].

Мутации мтДНК определены относительно пересмотренной кембриджской эталонной последовательности ГВС1 {Andrews et al., 1999]. Филогенетическую сеть конструировали в программе Network 4.2.0.1 с использованием метода редуцированной медианной сети [Bandelt, et al., 1995].

Анализ диаллельных маркеров нерекомбинирующей области Y-хромосомы проводился по 53 локусам. Классификация гаплогрупп Y хромосомы приведена согласно "The Y chromosome consortium" [YCC, 2002; Jobling M.A. and Tyler-Smith C., 2003; Karafet et al., 2008].

Статистическую обработку полученных данных проводили с использованием программного обеспечения Statistica 5.5, Network 4.2.0.1 (http://www.fluxus-engineering.com). GenePop 3.3 [Rousset F., 2001], ARLEQUIN 3.01 [Schneider et al., 2000].

РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ 1. Анализ полиморфизма А1и-ннсерциоиных локусов в популяциях кабардинцев и балкарцев.

Проведено изучение 15 /Ми-шксршюплих локусов (¥а5МВС27, Уа5КВС51, Уа5АгВС102, Га5ЫВС123, 1га5КВС148, \a5NBC182. АСЕ, АРО, В65, РУ92, ТРА25, УаЗтСП], УаШВС242. П8МВС480, УЬ8ЫВС485) у 147 неродственных индивидов в популяциях кабардинцев и балкарцев, проживающих на территории Кабардино-Балкарской Республики.

Распределение частот А1и-иисерций в популяциях кабардинцев и балкарцев представлены на рис. !.

N8051 ИВС51

Кабардинцы Балкарцы

РисЛ. Распределение частот аллелей 15/Ш инсерний в популяциях кабардинцев и балкарцев.

Распределение частот 15 Alu-инсерщюниых локусов в исследуемых популяциях соответствовало паттерну распределения в популяциях Кавказа [Коршунова, 2004; Юнусбаев. 2006; Bulaeva et al„ 2003; Kutucv et al„ 2006].

Попарное сравнение популяций кабардинцев и балкарцев по распределению частот 15 Alu инсерций выявило генетическую гетерогенность исследуемых популяций по локусам PV92 (р =0.0076) и ТРА25 (р= 0.0141). По сумме всех 15 Alu инссрционных локусов популяции кабардинцев и балкарцев также статистически достоверно отличались (-/"-44.95, df-'ЗО, р-^0.039).

Половина из проанализированных Alu инсерций обнаружили довольно отчетливую лонгигудинальную географическую изменчивость (АРО, PV92,

Уа5ЫВС148, Уа5ЫВС182, Уа5ЫВС242, УЬ8ЫВС480, УЬ8ИВС485), что позволяет дискриминировать азиатские и европейские популяции.

При проведении тестов на соответствие распределения частот генотипов равновесию Харди-Вайнберга был выявлен статистически достоверный избыток гетерозигот по локусам В65 и РУ92 в популяции балкарцев и недостаток гетерозигот по локусам УсоКВС! 02, УЬНКВС485 в этой же популяции, по локусу Уа5МВС123 у кабардинцев и в обеих этнических группах по локусу Уа5А!ВС182 (во всех случаях р<0.05), что можно объяснить случайными стохастическими процессами в данных выборках.

Среднее значение ожидаемой гетерозиготности по 15 А1и ипсерциям составило в популяции кабардинцев 0.359, в популяции балкарцев 0.397. При этом по некоторым локусам величина фактической гетерозиготности достигала 0.5, что является максимальным значением для диаллельного локуса. Наибольшие показатели уровня разнообразия из 15 А1и-инсершш были выявлены по локусам Уа5ЫВС51, Уа5ЫВС182, АСЕ, В65, Уа5ШС242, П8№С.485. Отметим, что в популяциях кабардинцев и балкарцев наблюдаюсь относительно невысокое генетическое разнообразие: среднее значение теоретической гетерозиготности составило 0.378, а в ранее изученных популяциях Северного Кавказа (карачаевцев, кумыков, кубанских ногайцев, караногайцев, адыгов и абазинов) - 0.418 [Коршунова, 2004; КиШеу й а!., 2006].

Для оценки межпопуляционного разнообразия был рассчитан коэффициент генной дифференциации (Оз1). Показатель Сьь полученный нами для популяций кабардинцев и балкарцев по результатам изучения 15 А1и инсерций, оказался равным 0.1%. Для четырех популяций Европы показатель Оя, рассчитанный по тому же набору А1и инсерций, составил 0.4% [\Vatkins е1 а!., 2003]. Эта показатели являлись наиболее низкими среди изученных регионов мира. Так, для популяций Юго-восточной Азии и Индии С5, составил 2.6% и 2.4%, соответственно [и^кни й а1., 2003]. Самый высокий показатель был получен для популяций Африки - 3.1% (^а!!^ й а1., 2003]. При объединении четырех популяций Европы с популяциями кабардинцев и балкарцев мы получили величину Ст51> равной 1.4%, что уже существенно выше, чем показатели, полученные для каждого из этих регионов в отдельности, что объясняется значительными отличиями в распределении частот аллелей в популяциях Кавказа и Европы.

Для оценки степени генетического родства изученных популяций был

проведен анализ методом главных компонент (РС) по данным частот 15 А1и-инсерций

с привлечением дополнительных литературных данных [\Vatkins \У.8. е! а!., 2003]

(рис. 2). При использовании для сравнительного анализа данных ряда европейских и азиатских популяций, кабардинцы и балкарцы на графике располагались рядом с европейскими популяциями.

' МсЛЗЙЦЫ

I Ф Камбоджи йць? )

{ " | Финны

] Индийцы Ф Поляки

I________

РС2 (14.0%)

? Китайцы ^ ф Япскцы

I ' Сео.е^опойцы \

j Французы jj

' Вдеткэмць: { |

I_______________,_____________________________i

Рис. 2. Положение популяций в пространстве двух первых главных компонент поданным о частотах 15 Alu ииссрций.

Рис. 3. Положение популяций в пространстве двух первых главных компонент по данным о частотах 8 Alu инсерциП.

В дальнейшем нами были использованы литературные данные по популяциям Кавказа, Центральной Азии, Волго-Уральского региона, а также ряда популяций Центральной, Западной и Северной Европы по данным о частотах 8 А!и инсерций (АСЕ, АроА), РУ92, ТРА25, КВС27, КВС102, №С148, N ВС 182) [\Vatkins й а1„ 2003; Ки1иеу I. е1 а1., 2006]. Первые две компоненты в сумме объясняют 54.2% вариабельности частот аллелей по 8 А1и-инсерционным локусам (рис. 3). По оси X хорошо дискриминируются азиатские и европейские популяции преимущественно благодаря существенным различиям в частотах инсерции РГ92, распределение частоты которой имеет отчетливый географический градиент с ее увеличением с запада на восток. На графике популяции Кавказа, включая балкарцев и кабардинцев, группируются вместе. Популяции различных регионов Европы также формируют отдельный кластер. В то же время следует отметить, что разделение популяций Кавказа и Европы отмечается только по оси У, что происходит благодаря локусам АроА1, ТРА25 и МВС182.

Таким образом, популяции Кавказа, включая кабардинцев и балкарцев, выявляют очевидную генетическую близость друт к другу, демонстрируя относительную близость к европейским популяциям и отчетливо дифференцируясь от популяций Центральной Азии.

2. Анализ полиморфизма митохондриальной ДНК в популяциях кабардинцев и балкарцев.

Проведено секвенирование ГВС1 контрольного региона мтДНК и ЦДРФ-анализ 49 диагностических маркеров кодирующего региона мтДНК в популяциях кабардинцев и балкарцев. Полученные в результате исследования данные представлены в виде филогенетического древа линий мтДНК в изученных популяциях (рис.4 и 5).

В популяции кабардинцев было выявлено 82 линии мтДНК, относящиеся к 24 гаплогруппам, в популяции балкарцев было обнаружено 63 линии, относящихся к 21 гаплогруппе мтДНК. Из 82 линий мтДНК, обнаруженных в популяции кабардинцев, 12.6% относились к гаплогруппам С, Д Г, М*, У, характерным для народов Восточной Евразии, остальные линии принадлежали к гаплогруппам Н, НУ, НУ!, 1, ^ К, N1Ъ, Я Н2, Т, Ш, и2, 113, 114, 115, 118, Ж, X, широко распространенным в Европе и на Ближнем Востоке; с частотой 0.7% встречалась североафриканская линия М1.

В популяции балкарцев из 63 линий 5% относились к восточно-евразийским гаплогруппам А, Д б. Остальные линии, встречающиеся в этой популяции,

относились к западно-евразийским гаплогруппам.

2.1. Анализ западпоевразийских гаплотрутт мтДНК в популяциях кабардинцев и балкарцев.

Самой частой гаплогрунпой мтДНК в популяциях кабардинцев и балкарцев являлась гаплогруппа II. У кабардинцев она встречалась с частотой 14.7%, у балкарцев - 25.0%. Гаплогруппа Я является наиболее характерной для европейских популяций и имеет широкую геофафию распространения. С наибольшей частотой гаплогруппа II выявлена в Западной и Северной Европе - 0.4-0.6; со средними значениями в Северной Африке, Турции, Восточной Европе - 0.2-0.4; с низкой частотой а странах Ближнего Востока, Индии, Центральной Сибири - менее 0.2 [Richards el al., 2000; Bamshad M. et al, 2001; Derenko V.M. et al., 2003; Loogvali et al., 2004; Roostalu et al., 2007; Malyarchuk B. et al., 2008]. Среди популяций Кавказа эта гаплогруппа с наибольшей частотой встречалась у адыгов, абазинов, ингушей (по 0.28), армян (0.30), с наименьшей у фузии и осетин (по 0.18) [Коршунова. 2004; Macaulay et al., 1999; Richards et al., 2000; Tambets et al., 2000].

Второй но частоте всфечаемости i¡ популяциях кабардинцев и балкарцев была гаплогруппа (/, которая имеет очень широкую геофафию и распространена в Северной Африке, Сибири, Ближнем Востоке, Кавказе и в Южной Азии и подразделяется на гамлогруппы V1-U8 [Rando J.C. et al., 1998; Kivisild Т. et а!.. 1999, 2003; Richards et al., 2000; Bamshad M. et al., 2001; Derenko M.V. et al., 20031.

Среди интересных наблюдений следует отметить линию 168-192-343 гаплогруппы U3, которая часто встречается в популяциях Кавказа и Турции [Maeaulav et al.. 1999: Tambets et al., 2000]. Мы проанализировали доступную базу данных сиквенсов ГВС1 и сравнили с опубликованными ранее другими авторами данными по ГВС1 мтДНК, включающей в себя свыше 35000 сиквенсов и не обнаружили этой линии где-либо за пределами Кавказа и Турции. То есть линия 168192-343 является специфичной для популяций Кавказа. У кабардинцев из 14 линий гаплофушш U3 12 имеют именно этот контекст ГВС1. В популяции балкарцев - это 3 из 9 линий гаплогруппы U3. В целом, частоты встречающихся гаплофупп U и популяциях кабардинцев и балкарцев были близки к таковым показателям, характерным для кавказских популяций.

Рис. 4. Филогенетическое древо линий мтДНК в популяции кабардинцев. Синим цветом выделены западно-евразийские линии, желтым - восточно-евразийские, красным - североафриканские.

Одним из клэйдов. характерных для Западной Азии и Кавказа, является клэйд НУ. Субгруппы этого клэйда встречаются с максимальной частотой в популяциях Ближнего Востока, где их частоты достигают 10-11% [К.о\\о1ё ег а!.. 2007]. средняя же их частота в местах максимального географического распространения не превышает 2-3% [Ме1зра1и <Л а1„ 2004; Оштапа-Мига' е( а1.. 2004: Яо\\оИ й а!., 2007]. У кабардинцев и балкарцев обнаруживаются гаплогруппы НУ* и НУ1 с относительно высокими для этих гаплофупп частотами: порядка 2% в обеих популяциях. Следует отметить, что эти показатели одни из наиболее высоких среди кавказских популяций [МасаЫау ег а1., 1999; ТатЬйБ сП а1., 2000].

"ж6

J^P _ / 356 36S

ё áj /ё

^^^ 362

Рис. 5. Филогенетическое древо линий мтДНК в популяции балкарцев. Размер каждого круга пропорционален частоте гаплотипа. Синим цветом выделены западно-евразийские линии, желтым - восточно-евразийские.

В популяции балкарцев обращает на себя внимание высокая частота

гаплогруппы W - 13.6%, у кабардинцев ее частота ниже - 6.0%. Географически эта

гаплогруппа возникла на территории Передней Азии. Она встречается у населения

Европы с частотой не более 3%. Распространение этой гаплогруппы ограничивается

Южной Европой. Кавказом и Западной Азией [Richards et al.. 1998. 2000]. Средняя

частота этой гаплогруппы для популяций Кавказа составляет порядка 3%, в

популяциях кабардинцев же и балкарцев частота этой гаплогруппы существенно

выше. Если мы обратимся к анализу линий, то очевидно, что высокая частота этой

гаплогруппы у балкарцев является следствием хоть и относительно давнего, но все же

дрейфа генов. Из 19 линий W в этой популяции 13 несут один и тот же контекст ГВС1

- 192-223-292-325. Интересно, что эта линия обнаруживается только в единичных

случаях в других кавказских популяциях: абазинов, адыгов, мегрелов, кабардинцев и

кубанских ногайцев (Бермишева с соавт., 2004; Коршунова Т., 2004). За пределами Кавказа эта линия также в единичных случаях встречается в Иране, Турции и Палестине [Richards et al., 2000; Metspalu et al., 2004; Quintana-Murci et al., 2004].

Североафриканская линия MI возникла в Северо-Восточной Африке, на территории Эфиопии [Quintana-Murci et al. 1999; Pereira et al., 2005]. Данная гаплогруппа lie специфична для Кавказа. Вероятно, что появление линии М1 в этом регионе, связано с активной работорговлей во времена греческой колонизации. Начиная с VI в. до н.э. отмечено возникновение тесных экономических, политических и культурных связей с греческими городами-колониями синдо-меотских племен -древних предков адыгов, кабардинцев и черкесов [Пиотровский, 1988]. Эта субгаплогруппа была выявлена в популяции кабардинцев с частотой 0.7%. Во всех изученных кавказских популяциях (карачаевцев, кумыков, кубанских ногайцев, адыгов и абазинов, ногайцев, кроме караногайцев была зафиксирована эта североафриканская линия [Бермишева и др., 2004; Коршунова, 2004].

2.1. Анализ восточноевразийских гаплогрупп мтДНК в популяциях кабардинцев и балкарцев.

Из гаплогрупп мтДНК восточно-евразийского происхождения в популяции кабардинцев обнаружены гаплогруппы С, М* D, F, У (рис. 4), в популяции балкарцев выявлены А, D, G (рис. 5).

Для того чтобы проследить возможные источники и проанализировать детально филогеографию восточно-евразийских гаплогрупп, был проведен более подробный анализ восточно-евразийских линий в популяции кабардинцев и балкарцев. Для сравнительного анализа нами были использованы данные Бермишевой с соавт. (2004) по популяции ногайцев. Ногайцы - народ Кавказа, в антропологическом типе которых в большей степени преобладает монголоидный комплекс признаков, имеющих самую высокую частоту восточно-евразийских линий мтДНК среди всех народов Кавказа, и говорящих на языке тюркской ветви алтайской языковой семьи. Сравнительный анализ линий мтДНК балкарцев и кабардинцев с данными по ногайцам особенно интересны в силу того, что последние также говорят на тюркском языке, но заселили территорию Кавказа сравнительно недавно и их генетический пул в значительной мере сохранил первоначальные черты.

На рисунке 6 представлено филогенетическое древо восточно-евразийских линий мтДНК в популяциях кабардинцев, балкарцев и ногайцев, построенное по данным о полиморфизме ГВС1 контрольного региона и ПДРФ-анализа кодирующего региона мтДНК.

В результате анализа медианной сети было обнаружено всего несколько общих линий у ногайцев, кабардинцев и балкарцев.

На следующем этапе нами был проведен филогеографический анализ восточно-евразийских линий мтДНК в популяциях кабардинцев и балкарцев среди 35000 опубликованных сиквенсов ГВС1 мтДНК. Полученные результаты позволили заключить, что наличие части восточно-евразийских линий в популяциях кабардинцев и балкарцев явилось следствием потока генов в популяции Кавказа относительно недавно, а часть линий была привнесена на территорию Кавказа достаточно давно и эволюционировала на территории независимо от предковых популяций, некогда послуживших источниками этих линий в популяциях Кавказа.

Рис. 6. Филогенетическое древо восточно-евразийских линий мтДНК в популяциях кабардинцев, балкарцев и ногайцев. Синим цветом отмечены линии кабардинцев, красным - балкарцев, зеленым - ногайцев. Данные по ногайцам взяты из статьи Бермишевой с соавт. (2004).

Оценка уровня генетических различий популяций кабардинцев и балкарцев по данным полиморфизма мтДНК показала, что степень генетического межпопуляционного разнообразия исследуемых популяций составила Fst=1.3%.

С целью изучения генетических взаимоотношений популяций кабардинцев и балкарцев с другими популяциями Кавказа и различными популяциями мира нами бы проведен анализ распределения частот гаплогрупп мтДНК методом главных компонент (рис. 7). Первые две компоненты в сумме объясняют 42.6% вариабельности частот гаплогрупп мтДНК в изученных популяциях. Так же как и в случае анализа данных о распределении частот Alu инсерций, мы здесь видим, что ось X также дискриминирует популяции Азии и Европы, что в данном случае обусловлено характерным распределением восточно- и западно-евразийских гаплогрупп мтДНК в анализируемых популяциях.

На графике можно выделить три отчетливых кластера. Популяции Центральной Азии и близко к ним расположенные башкиры дифференцируются от других популяций благодаря высоким частотам восточно-евразийских гаплогрупп. Популяции как Западной, так и Восточной Европы формируют отдельную группу. Их объединение на графике обусловлено, прежде всего, высокими частотами гаплогрупп Н и U5. Третий кластер сформирован популяциями Кавказа (включая кабардинцев и балкарцев) и популяциями Ближнего Востока. Популяции этого кластера демонстрируют относительно высокие частоты гаплогрупп Ul, U3, X, ROa, W, HV. Здесь следует отметить, что, несмотря на высокую разрешающую способность мтДНК, внутри кластера Кавказ/Ближний Восток очень трудно выделить какие-либо отдельные группы.

^ • Кот

РС1 (27.4%)

Рис.7. Положение популяций кабардинцев и балкарцев в пространстве двух первых главных компонент по данным о частотах гаплогрупп мтДНК.

Таким образом, учитывая результаты, полученные методом главным компонент, а также на основании распределения частот гаплогрупп мтДНК в популяциях Кавказа, Центральной Азии, Восточной и Западной Европы можно заключить, что популяции кабардинцев и балкарцев помимо генетической близости к популяциям Кавказа демонстрируют близость к популяциям Ближнего Востока.

3. Анализ полиморфизма Y-хромосомы в популяциях кабардинцев и балкарцев.

Анализ 53 диаллельных маркеров Y- хромосомы в популяции кабардинцев позволил выявить 20 гаплогрупп Y-хромосомы, в популяции балкарцев - 11 гаплогрупп (рис. 8А, Б).

Доля западно-евразийских гаплогрупп Y-хромосомы (G, Е, 1, J, R1) в популяции кабардинцев составила 95.0%, а в популяции балкарцев - 96.3%. Полученные результаты согласуются с данными об антропологическом типе этих народов, которые относятся к кавкасионскому типу большой европеоидной расы [Пиотровский, 1988].

Из восточно-евразийских гаплогрупп Y хромосомы в популяции кабардинцев выявлены гаплогруппы С, Q, N (в сумме 4.23%), в популяции балкарцев обнаружена гаплогруппа Q (3.7%). У кабардинцев также выявлены гаплогруппы Н, Т, L, в сумме составляющие 2.1%.

Наиболее частыми гаплогруппами У хромосомы в популяциях кабардинцев и балкарцев являлись гаплогруппы G2, J2, Rial, в сумме объясняющие 74.3 и 76.3% вариабельности гаплогрупп Y хромосомы, что характерно для всех популяций западной части Северного Кавказа [Nasid/e et al., 2003,2004а].

Степень межпопуляционного генетического разнообразия между популяциями кабардинцев и балкарцев по данным частот гаплогрупп Y хромосомы составила Fst=4.1%.

МП

R1b1b2 ™Ч

R1b1b1

N1c

nrf"

R1a1a7

R1a1

'îff

\ + У

\ 0

s- \l Г*-'

Е/Ь'Ц"©

R1b1b1

R1a1a7£¡)

ф-«»»—< R1b1b2 "4

"V"

R1*T

R1a1

G2a

PIS

G2*

l*\

и»

*22T

Рис. 8. Филогенетическое древо гаплогрупп Y-хромосомы в популяциях кабардинцев (А) и балкарцев (Б). Площадь круга пропорциональна частоте гаплогрупп, число индивидов указано внутри. Номенклатура гаплогрупп приведена в соответствии с YCC, 2002, Jobling М.А. and Tyler-Smith С., 2003, Karafet et al., 2008, Underhill et al., 2009.

3.1. Гаплогруппы Y-хромосомы в популяциях кабардинцев и балкарцев, характерные для популяций Западной Евразии

Филогеография гаплогруппы R В популяциях кабардинцев и балкарцев гаплогруппа R1* выявлена в единичных случаях. Клэйд R1 представлен субгруппами Rial, Rlala7, Rlblbl, Rlblb2. Rial встречается с максимальными частотами в популяциях восточной части Европы и Средней Азии [Semino et al., 2000а; Rosser et al., 2000; Underhill et al., 2009]. В популяции кабардинцев гаплогруппа Rial была выявлена с частотой - 14.2%, у балкарцев - 26.5%. В популяциях северной части России данная гаплогруппа отмечена с частотой до 35%, в центральной части России - 46.5%, в южной части России - 55.4% [Balanovsky et al., 2008]. Максимальное значение Rial отмечено у поляков (64 %) [Kayser, 2005].

Гаплогруппа Rib была представлена в изученных популяциях ветвями Rlblbl, Rlblb2, Распространение гаплогруппы Rlblbl в восточной части Евразии ограничивается Центральной Азией и Волга-Уральским регионом, и не встречается в западной части этого континента. Эта гаплогруппа найдена только у народа Хазара на севере Пакистана (32%) и у Анатолийских турков (0.7 %) [Qamar R. et al., 2002; Cinnioglu С. et al., 2004; Sengupta S. et al., 2006], единично встречается на северо-западе Испании [Brion M., 2004], у тюрко-язычных народов ВУР (башкир и татар) с частотой до 55 % [Лобов А., 2009]. Ветвь Rlblbl пока не выявлена в Европе, Африке, Западной Азии и Южной Азии [Cruciani F. et al., 2002; Luis J.R. et al., 2004; Alonso S. et al., 2005; Karlsson A.O. et al., 2006;. Sengupta S. et al., 2006; Zalloua P.A. et al., 2008]. Гаплогруппа Rlblbl была выявлена в популяции кабардинцев в единичном случае.

Гаплогруппа R1 b 1Ь2 доминирует в западной части Евразии, но при этом распространение ее не ограничивается этим континентом [Semino О. et al., 2000; Karafet Т.М. et al., 2002; Kivisild T. et al., 2003; Cinnioglu С. et al., 2004; Sengupta S. et al., 2006]. В различных субпопуляциях башкир частота данной гаплогруппы варьирует от 0.07 до 0.84 [Лобов А., 2009]. В популяциях анатолийских турков эта гаплогруппа встречается с частотой 14.5 % [Cinnioglu С. et al., 2004], в европейской части России - 5.7 % [Balanovsky О. et al., 2008]. Гаплогруппа Rlblb2 встречалась во всех популяциях Дагестана [Юнусбаев Б., 2006], была отмечена с частотой до 3% в исследуемых выборках популяций кабардинцев и балкарцев.

Филогеография гаплогруппы G

Для большинства кавказских популяций специфичной особенностью является

высокая частота гаплогруппы G, варьирующая от 5 до 74 % [Юнусбаев, 2006; Nasidze

et al., 2004а; 2004Ь]. В объединенной выборке Дагестана (за исключением

караногайцев) частота вышеуказанной гаплогруппы составляла 6 % и не была

обнаружена в популяциях аварцев, багуалинцев, табасаранцев, что говорит об

особенностях формирования генофонда восточно-кавказских групп [Юнусбаев Б.,

2006]. Помимо Кавказа, гаплогруппа G широко встречается с частотой около 10 % в

Турции, Иране и Италии [Semino et al., 2000; Cinnoglu С. et al., 2004; Regueiro M. Et

al., 2006]. Анализ литературных данных по гаплогруппе G позволяет предположить,

что носители этой гаплогруппы встречаются по всей западной части Евразии, начиная

на западе с частотой 0,01 в Португалии до 0,1 заканчивая на юго-востоке в Пакистане

[Semino О. et al., 2000; Al-Zahery N. et al., 2003; Behar D.M. et al., 2004; Cinnioglu C. et

al., 2004; Flores C. et al., 2004; Lius J.R. et al., 2004; Nasidze I. et al., 2004a, 2004b;

Kharkov V. et al., 2005; Mrjanovich D. et al., 2005; Pericic M. et al., 2005; Regueiro M. et

al., 2006; Sengupta S. et al., 2006]. На территории Кавказа, Турции, Ирака и Ближнего

Востока наблюдается наивысшая частота гаплогрунпы G. Однако, основную долю гаплогрунпы G па этой территории составляет одна псин, G2 [Hammer et al., 2000; Cinnioglu et al., 2004]. С незначительной чаетыо гаплогрушш G1 встречается у турков и в кавказских популяциях, частота которой не превышает одного процента, исключение составляют армяне (24 %) [Cinnioglu С. et al., 2004].

Гаплогругща О составляла в популяции кабардинцев основную долю Y-хромосомного пула (43.2 %). У балкарцев па долю G приходилось 32.4 %. Полученные высокие частоты пишогрушш G у исследуемых популяций согласуются е литературными данными о том, что основная доля разнообразия Y-хромосомного пула кавказских популяций приходится на G-ranjioipynuy.

Филогеог рафия ганлогрупиы J Гаплогруппа J представлена двумя производными ветвями J1 и .12. В качестве центров происхождения двух этих ветвей рассматривают Переднюю Азию и Ближний Восток [Semino et al., 2004].

Особенности распределения дочерних ветвей в популяциях восточного и западного Кавказа, вероягао, отражают региональные отличия филогеографни этой гаплогрунпы. Ветвь J2 является » целом более распространенной, распределение другой ветви - Л имеет более офаниченный ареал. В популяциях турков, армян, грузин и популяций Северного Кавказа (кроме северо-восточных жителей, которые представлены популяциями Дагестана) частота гаплогрунпы Л не превышала 9%. В отдельных выборках Дагестана частота гаплогрунпы J1 варьировала от 21% {у абазин) до 91% (у даргинцев) [Юпуебаев Б., 2006]. У большинства кавказских народов преобладает гаплмруппа 12 (до 32%) [Nasidze et а]., 2004]. Частота J1 и S2 составляла в популяции кабардинцев 9.2 % и 15.6 %, соответственно, в популяции балкарцев - 3.7 % и 15.4 %, соответственно.

Филогеография гаплогрунпы 1 Производные кластера I (М170) встречались в популяции кабардинцев с частотой 4.2 %. у балкарцев - 2.9 %. Несмотря па низкие значения частот, наличие этой гаплогрунпы позволяет говорить об j-часгии популяций Европы в этногенезе этих кавказских популяций, т.к. гаплогрушт / произошла и распространилась па территории Европы и встречается практически только там, достигая 40-50 % в различных частях континента: в Скандинавии и на северо-западе Балкан [Rootsi S. et al., 2004]. В популяциях Дагестана гашюгруппа I встречаюсь с частотой от 2% до 24 % [Юнусбаев Б., 2006], в ряде других кавказских популяций до 58 % [Nasidze et al..

2004]. Высокие значения Па наблюдались у норвежцев (39 %), ПЬ боснийцев (54 %) [ту\у. genofond.ru].

Филогеография гаплогруппы ЕЗЬ У кабардинцев выявлена, хотя и с низкой частотой (2,13 %), гаплогруппа /Ш. В популяциях Дагестана ЕЗЬ встречается с частотой 2-7 % [Юнусбаев Б., 2006]. Возраст гаплогруппы ЕЗЬ оценивается в 25 тыс. лег [Сгиааш й а1, 2004]. В результате независимых миграций из различных частей Африки произошло распространение ЕЗЬ по территории Ближнего Востока и Южных областей Европы [Бетто й а1., 2004; Сгайаш е! а1, 2004]. Гаплогруппа ЕЗЬ является одной из составляющих основ У-хромосомного пула местных народов Передней Азии. В связи с этим, можно предполагать, о контактах предков кабардинцев с населением Передней Азии, северной границей которой является Кавказ.

3.2. Гаплогруппы У-хромосомы в популяциях кабардинцев и балкарцев, характерные

для популяний Восточной Евразии

Гаплогруппы С, Н, Т, Ь, Ы1с, 0 выявлены у кабардинцев с низкими частотами и

составляют в пуле У-хромосомы в сумме 6.33 %. У балкарцев из 12 выявленных

гаплогрупп обнаружена лишь одна восточно-евразийская гаплогруппа У-хромосомы

<3 с частотой 4 %, у кабардинцев наблюдался единичный случай (}. Гаплогруппа <3

имеет наибольшие частоты в Западной Сибири и на Чукотке, также обнаружена в

популяциях эвенков и юкагиров [Федорова С., 2008; КагаГй й а1., 2002; Раке^ог!" еХ

а!., 2006]. В литературе не отмечены случаи выявления этой гаплогруппы в

кавказских популяциях.

Гаплогруппа С имеет неравномерное распространение по территории Евразии в

направлении с юга на север от Австралии до Сибири. Гаплогруппа С характерна для

Северной Азии, и встречается в основном у народов, говорящих на языках различных

ветвей алтайской языковой семьи [КагаГй ег а1., 2002; КаЮЬ Т., 2005; Хие У. с( а1.,

2006]. Эта гаплогруппа отсутствует в Африке и Европе, западной границей ее

распространения является Средняя Азия и Ближний Восток [КаМе1 й а1., 1999]. С

низкими частотами эта гаплогруппа встречается в популяциях татар и русских

[Бермишева с соавт., 2004; Ва1апоу$ку й а1., 2008], в пределах Восточной Азии -

только на северо-востоке и северо-западе Китая [Ка1оЬ Т., 2005; Хие У. й а1., 2006].

Среди кавказских популяций гаплогруппа С У-хромосомы отмечена у абазин (7 %),

чеченцев (5%) Р>}а51ске й а1., 2004], у табасаранцев (7%), караногайцев (10%)

[Юнусбаев Б., 2006], у кабардинцев (2 %). Наличие гаплогруппы С вУ хромосоме в

этих популяциях, вероятно, связано продвижением в предкавказские степи вплоть до

предгорий Кавказа стенных кочевников Монголии, Южной Сибири и Средней Азии (ирано-язычные киммерийцы, скифы, сарматы, гунны, болгары, хазары и кипчаки), однако их вклад в генофонд популяции кабардинцев оказался несущественным.

Ганлофупна N имеет широкое распространение в Евразии от Северной Европы до Дачьнего Востока с максимальными частотами в северных широтах [Zerjal et al., 1997; Karafet et al., 2002; Tambets el al., 2004; Rootsi et al., 2007]. Высокая частота N-это отличительная особенность популяций Чукотки, Якутии, Западной Сибири, а также народов фшшо-угорской языковой группы, которая занимает 30-90 % пула Y-хромосомы у различных этносов [Степанов. 2006; Федорова, 2008: Karafet et al., 2002: ílammer et al.. 2006; Rootsi et al., 2007]. В пяти субиопуляииях башкир частота галлогрутшы N достигает 65 % [Лобов, 2009), что значительно выше, чем у тюрко-язычных соседей в Центральной Азии (казахи - 10%. узбеки - 1.85%), у татар и чу вашей частота 18.98 % и 25.64 %, соответственно [Karafet Т.М. et al., 2002; Tambets К. et al,, 2004; Rootsi S. et al.. 2007; Pimetioff V.N. et al., 2008]. Из ветвей гаплогруппы N наиболее распространенной яиляется ветвь Nlc, которая распространилась на территории Северной и Восточной Европы, но практически отсутствует в Западной и Южпой Европе [Zerjal et al., 1997. 2001].

На Кавказе Ю отмечена только в популяции караногайцев (3 %) [Юпуебаев Б., 2006] и у кабардинцев (1.4%), вероятно, полупившими генетическое наследство от кочевых племен, пришедших на Кавказ.

Широко представленные в Индии таилотруины П и L отмечены в популяции кабардинцев единичными случаями. Гшшогруппа L распространена в Юго-Западной Азии, является специфической чертой мужского генного пула популяций таджиков и узбеков (частота около 15 %), характеризующий индоиранский компонент генофонда этих этносов [Степанов, 2002]. На Кавказе L выявлена в популяциях аварцев (10 %), чамалинцев (4 %) [Юнусбаев Б., 2006].

Оценка генетических взаимоотношений между популяциями кабардинцев и балкарцев с использованием метода главных компонент по частотам гашшгрупл У хромосомы показал, что первые две компоненты в целом объясняют 42.9% вариабельности частот гаплогрупп Y хромосомы (рпс. 9).

На графике можно отметить два больших кластера. Один включает в себя

популяции Европы (Волго-Уральского региона, Балкан и восточных славян). Другой

кластер включает в себя популяции Кавказа вместе с популяциями Ближнего Востока.

Популяции Европы группируются благодаря высокой частоте Rlal, /, н N.

Разбросанность популяций Кавказа на графике объясняется дрейфом генов.

Популяции Дагестана имеют в целом схожий профиль гашклрупп У хромосомы:

высокие частоты гаплогрупп Л и ШЫЬ2 и низкую частоту гаплогруппы в (Юнусбаев Б.Б., 2006). Однако благодаря дрейфу генов и, как следствие этого, существенным различиям в распределении частот гаплогрупп У хромосомы, популяции Дагестана оказались разбросаны на графике. В то же время они формируют отдельный кластер вместе с популяциями западной части Северного Кавказа (включаю балкарцев и кабардинцев) и популяциями Ближнего Востока.

/г Боснийцы^^ /Белорусы ♦ Русские \ . V Чуваши * MY1 / \ * Тат¿рыгрвки/ ( Aaepi -—"-----——— • ж . . Даргенцы : • Андийцы ♦ Яезганы X ; • Багуапикцы ♦ Чамапинцф Йемен \ ^ * Катар \ | ♦ Армяне • Аварцы / !

I ! ♦ Караиогайцы | ♦ Пакистан у ♦ Узбеки ♦ Уйгуры • »г^щшы л Ира«" » иалмтинии / М . Каба^Кь. С-Р»«4 Табассаранцы / ; 1 Ира»" '4 ^ ♦ Турки Е 4 ОАЭ ——■■— ! ! ! | | | ! с 1

РС1 (30,6%)

Рис. 9. Положение популяций кабардинцев и балкарцев в пространстве двух первых главных компонент по данным о частотах гаплогрупп Y хромосомы.

Популяции Кавказа по распределению частот гаплогрупп У хромосомы близки к популяциям Ближнего Востока, которые характеризуются высокими частотами гаплогрупп J! и J2. На долю всех субклэйдов J в ближневосточных популяциях приходится свыше 50% вариабельности У хромосомы. В то же время популяции Кавказа, характеризуются не только высокими частотами гаплогрупп Л и J2, но и высокой частотой гаплогруппы G (до 70%). Последняя за пределами Кавказа встречается с относительно низкой частотой (не более 10%) [Nasidze et al., 2003; Юнусбаев, 2006J. В целом же на долю гаплогрупп J и G за пределами Кавказа и Ближнего Востока приходится не более 10-20% вариабельности гаплогрупп У хромосомы.

Таким обратом, исходя из результатов, получепных по методу главных компонент, а также исходя из характерного профиля распределения частот гаплогрупп У хромосомы в популяциях Европы, Центральной Азии, Ближнего Востока и Кавказа, можно заключить, что кабардинцы и балкарцы но данным У хромосомы генетически наиболее близки к популяциям Ближнего Востока.

Таким образом, исследование но системе трех молекулярно-генетических маркеров (Ahí ипсерций, мтДНК' и У хромосомы) в популяциях кабардинцев и балкарцев позволило сформировать целостную картину генетических межпопулящкншых взаимоотношений, выявить особенности их генетической структуры. Различные генетические маркеры дополняют друг друга, давая раздельную информацию об отцовском и материнском вкладе в генетическую струиуру популяций. По данным Alu-ннсерциоппого полиморфизма изучениые популяции оказались близки к популяциям Европы. Результаты анализа гашюгрунп мтДНК и У хромосомы хорошо согласуются друг с другом и демонстрирую! близость популяций кабардинцев и балкарцев к популяциям Ближнего Востока. Различия в результатах, полученных по разным системам генетических маркеров можно объяснить их разной природой, а также влиянием различных демографических факторов в разные этапы становления этносов, которые оставили след в генетической структуре современных попу ляций кабардинцев и балкарцев.

Выводы

1. По данным о распределении частот 15 А1и ннсерцнй выявлена генетическая гетерогенность популяций кабардинцев и балкарцев. Характер распределения их часто г в изученных популяциях соответствует таковому в популяциях Европы.

2. Показатель межпонуляциопиою разнообразия по 15 Ли инсерциям в популяциях кабардинцев и балкарцев составил 0.1%, чго существенно ниже, чем в популяциях Европы (0.4%).

3. Подавляющее большинство гашюгрунп мтДНК и У хромосомы в популяциях кабардинцев (86.7 и 95.0% соответственно) и балкарцев (95.0 и 96.3% соответственно) принадлежат к западиоевразийским кластерам.

4. Популяции кабардинцев и балкарцев характеризуются высокими частотами гаплогрупп G2, J2 и Rial, в сумме объясняющие 74.3 и 76.3% вариабельности гаплогрупп Y хромосомы, что является характерной особенностью нопуляшш западной части Северного Кавказа.

5. Степень генетической дифференциации между популяциями кабардинцев и балкарцев по 15 Alu инсерциям намного ниже (Fst=0.1%), чем по гаплогруппам Y хромосомы (Fst=4.1%) и мтДНК (Fst=1.3%), что объясняется большей эффективной численностью и меньшей генетической вариабельностью Alu инсерций в сравнении с системами Y хромосомы и мтДНК.

6. Установлено, что по распределению частот гашюгрупп мтДНК и Y хромосомы популяции кабардинцев и балкарцев наиболее близки к популяциям Ближнего Востока

Публикации

1. Боготова З.И. Кутуев И.А., Хусаииова Р.И., Валиев P.P., Керефова М.К., Хуснутдинова Э.К. Анализ Alu-инсерционного полиморфизма в популяциях кабардинцев и балкарцев // Медицинская генетика. Москва, 2009, Т.8. №1 (79). С. 19-24.

2. Кутуев И.А., Боготова З.И.. Хусаииова Р.И., Валиев Р.И., Виллемс Р., Хуснутдинова Э.К. Изучение линий мтДНК в популяциях кабардинцев и балкарцев. //Медицинская генетика. Москва, 2009. №11 С. 16-22.

3. Боготова 3. Анализ полиморфизма 16 Alu-инсерций у кабардинцев и балкарцев. // Вестник Кабардино-Балкарского Государственного Университета: серия биологические науки. Вып. 9. Нальчик./ Каб-Балк. Университет, 2008. 26с.

4. Боготова З.И., Кутуев И.А., Хусаииова Р.И., Валиев P.P., Керефова М.К. Генетическая структура популяций кабардинцев и балкарцев по данным полиморфизма 16 Alu-инсерционных локусов. // Тезисы докладов V Съезда Вавиловского общества генетиков и селекционеров. Часть 1. Симпозиум «Генетика человека». Москва. 2009. 392 с.

5. Боготова З.И.. Хандохов Т.Х., Бипуева М.М., Паритов А.Ю. Керефова М.К., Хуснутдинова Э.К. Полиморфизм Alu-инсерционных локусов в популяциях кабардинцев и балкарцев. // Тезисы докладов научно-практической конференции «Инновации в современной медицине»., Нальчик, 2009, С. 159-162.

6. Bogotova Z.. Kutuev I., Khusnutdinova E. Genetic structure of Kabardinians and Balkars of the North Caucasus based on 15 Alu insertions/ Abstract of 6th ISABS Conference on Human Genome Project Based Applications in Forensic Science, Anthropology and Individualized Medicine, June 1-5, 2009, Split, Croatia. 2009. - P. 25.

Подписано в печать 20.11.09 г. Формат 60x84 1/16. Бумага офсетная. Печать ризографическая. Тираж 100 экз. Заказ 329. Гарнитура «TimesNewRoman». Отпечатано в типографии «ПЕЧАТНЫЙ ДОМЪ» ИП ВЕРКО. Объем 1 п. л. Уфа, Карла Маркса 12 корп. 4, т/ф: 27-27-600, 27-29-123

Содержание диссертации, кандидата биологических наук, Боготова, Залина Ихсановна

ВВЕДЕНИЕ.

Глава I. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. ПОЛИМОРФИЗМ ДНК И ЕГО ИСПОЛЬЗОВАНИЕ В ПОПУЛЯЦИОННО-ГЕНЕТИЧЕСКИХ ИССЛЕДОВАНИЯХ.

1.2. ПОЛИМОРФИЗМ АУТОСОМНЫХ ALU-ИНСЕРЦИЙ.

1.3. ПОЛИМОРФИЗМ МИТОХОНДРИАЛЬНОЙ ДНК ЧЕЛОВЕКА

1.3.1. Структура и особенности мтДНК.

1.3.2. Номенклатура гаплогрупп мтДНК.

1.3.3. Основные ветви филогенетического дерева мтДНК.

1.3.4. Вариабельность мтДНК в Европе.

1.3.5. Вариабельность мтДНК в Азии.

1.4. ПОЛИМОРФИЗМ Y-ХРОМОСОМЫ ЧЕЛОВЕКА.

1.4.1. Вариабельность линий Y хромосомы в Азии.

1.4.2. Вариабельность линий Y хромосомы в Европе.

1.5. ПОПУЛЯЦИОННО-ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ИССЛЕДОВАНИЯ

НАРОДОВ СЕВЕРНОГО КАВКАЗА.

1.6. ЭТНОГЕНЕЗ И ЭТНИЧЕСКАЯ ИСТОРИЯ НАРОДОВ

СЕВЕРНОГО КАВКАЗА.

1.6.1. Этногенез кабардинцев.

1.6.2. Этногенез балкарцев.

ГЛАВА II. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

2.1. МАТЕРИАЛЫ ИССЛЕДОВАНИЯ.

2.2. МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ.

2.2.1. В ыделение геномной ДНК.

2.2.2. Анализ аутосомных Alu -инсерционных локусов.

2.2.3. Анализ мтДШ.

2.2.4. Анализ полиморфизма диаллельных локусов Y-хромосомы.

2.2.5. Статистическая обработка результатов.

ГЛАВА III. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ

3.1. Анализ полиморфизма Alu-инсерционных локусов в популяциях кабардинцев и балкарцев.

3.2. Анализ полиморфизма митохондриальной ДНК в популяциях кабардинцев и балкарцев.

3.2.1. Анализ западно-евразийских линий мтДНК в популяциях кабардинцев и балкарцев.

3.2.2. Анализ восточно-евразийских линий мтДНК в популяциях кабардинцев и балкарцев.

3.3. Анализ полиморфизма У-хромосомы в популяциях кабардинцев и балкарцев.

3.3.1. Гаплогруппы Y-хромосомы в популяциях кабардинцев и балкарцев, характерные для популяций Западной Евразии.

3.3.2. Гаплогруппы Y-хромосомы в популяциях кабардинцев и балкарцев, характерные для популяций Восточной Евразии.

Введение Диссертация по биологии, на тему "Изучение генетической структуры популяций кабардинцев и балкарцев"

Исследование происхождения и эволюционной истории популяций человека основывается на анализе особенностей геномного разнообразия отдельных популяций и этнотерриториальных общностей различных регионов мира.

Наиболее информативными и удобными высокополиморфными маркерными системами являются митохондриальная ДНК (мтДНК), нерекомбинирующая область Y-хромосомы и Alu-инсерционный полиморфизм [Batzer M.et al., 1996; Stoneking M. et al., 1997; Nasidze I. et al., 2001].

Северный Кавказ всегда был и остается очень сложным регионом как по уникальности географического положения (между Европой и Западной Азией, Черным и Каспийским морями) и разнообразию естественно-географических условий, так и по этническому составу его населения. Этот регион характеризуется высокой степенью лингвистического разнообразия [Народы Кавказа, 1960; Лавров JL, 1978]. Накопленные этнографией, историей, лингвистикой и антропологией данные о происхождении народов этого региона, не всегда решают вопросы об участии различных этнических групп в формировании генофонда ныне живущих этносов, а также вопросы об их филогенетических взаимоотношениях [Tambets К. et al., 2000; Nasidze I. el al., 2001, 2003, 2004a, 2004b]. Более того, здесь имели место сложные взаимосвязи автохтонных и пришлых генетических элементов. В течение веков на территории современного Северного Кавказа происходила смена населения, этническое смешение разных родов, племен, народов, ассимиляция одних другими. Следы этих процессов хранят гены проживающих здесь народов. В частности, это относится к кабардинцам и балкарцам, живущим в Кабардино-Балкарской Республике. Балкарский этнос был активно вовлечен в процесс «тюркизации» начиная с конца I - начала II в н.э., что впоследствии привело к переходу с местных языков на тюркскую речь, кабардинцы же остались индифферентными к чужому языку. Тюркоязычность балкарцев порождала самые неожиданные теории об их происхождении. Антропологически балкарцы, как и кабардинцы, являются представителями кавкасионского типа европеоидной расы. Но при этом, балкарцы относятся к кипчако-огузской подгруппе кипчакской группы тюркских языков алтайской языковой семьи, кабардинцы говорят на кабардино-черкесском языке абхазо-адыгской группы северокавказской семьи, близком адыгейскому языку и составляющем вместе с ним единый литературный язык [Народы Кавказа, 1960; Языки народов СССР, 1966-67]. Предполагают, что у некоторых народов происходила не только тюркизация языка, но и активное слияние местного и тюркского населения [Народы Кавказа, 1960; Бетрозов Р., 1991]. Другие считают, что переход с местных, кавказских языков некоторых народностей (кумыки, карачаевцы, балкарцы) на тюркскую речь проходил без включения в свой расовый состав значительного количества тюркского компонента [Дебец Г., 1956; Гаджиев А., 1975; Алексеев В., 1989], то есть путем простого заимствования языка (хотя в их речи по-прежнему сохранялась обширная кавказская основа) [Баскаков Н., 1960].

Популяционно-генетические исследования популяций Кавказа проводились и ранее [Булаева К. с соавт., 1995, 1996, 1997, 2003; Почешхова Э. с соавт., 1998, 2008; Коршунова Т., 2004; Юнусбаев Б., 2006; Tambets К. et al., 2000; Nasidze I. et al., 2001, 2003, 2004; Roostalu U. et al, 2007]. Однако, исследования по изучению генетической структуры популяций кабардинцев и балкарцев недостаточны и носят фрагментарный характер, что связано с некоторыми техническими ошибками при работе с мтДНК, малым филогенетическим разрешением используемых генетических маркеров [Bandelt Н. and Kivisild Т., 2006]. В связи с этим, более детальный анализ трех систем генетических маркеров (мтДНК, Y-хромосомы, Alu-инсерционного полиморфизма) позволит выяснить особенности генетической структуры популяций кабардинцев и балкарцев, получить ответ на многие вопросы для более глубокого понимания происхождения и формирования генофонда этих этносов, а также станет основой для дальнейших молекулярно-эпидемиологических исследований наследственных и мультифакториальных заболеваний в популяциях.

В связи с вышесказанным были определены цели и задачи исследования.

В соответствии с целью исследования были поставлены следующие задачи:

1. Провести анализ распределения частот 15 Alu инсерций в популяциях кабардинцев и балкарцев.

3. Провести филогеографический анализ гаплогрупп и линий митохондриальной ДНК в популяциях кабардинцев и балкарцев.

4. Провести филогеографический анализ гаплогрупп Y хромосомы в популяциях кабардинцев и балкарцев.

5. Охарактеризовать генетические взаимоотношения между популяциями кабардинцев и балкарцев и другими популяциями Европы и Азии по данным полиморфизма мтДНК, Y-хромосомы и Alu-инсерционных локусов.

Научная новизна

Впервые в популяциях кабардинцев и балкарцев проведено комплексное исследование генетической структуры на основе трех молекулярно-генетических систем: аутосомных Alu инсерций, мтДНК, Y хромосомы. В популяциях кабардинцев и балкарцев проведен филогенетический и филогеографический анализ гаплогрупп и линий мтДНК и гаплогрупп Y хромосомы. На основе изучения полиморфизма Alu инсерций, мтДНК и У хромосомы определено положение кабардинцев и балкарцев в ряду популяций Европы и Азии. Показана генетическая близость популяций Кавказа к популяциям Ближнего Востока по данным о распределении частот гаплогрупп мтДНК и Y хромосомы. Полученные в работе данные существенно дополняют и расширяют историко-этнографические представления о формировании кабардинцев и балкарцев как этносов.

Научно-практическая значимость

Полученные результаты совместно с данными историков, этнографов, археологов, антропологов и лингвистов могут применяться для уточнения и дополнения вопросов об этногенезе этих народов. Созданные коллекции ДНК популяций кабардинцев и балкарцев могут использоваться в дальнейшем для проведения популяционных, эволюционных и медико-генетических исследований. Результаты исследования могут быть использованы в научно-образовательном процессе при создании курсов лекций для студентов биологических, медицинских, исторических специальностей.

Положения, выносимые на защиту:

1. Генетическая гетерогенность популяций кабардинцев и балкарцев по данным о распределении частот 15 Alu инсерций.

2. Относительно низкая степень генетической дифференциации (Gst=0.1%) популяций кабардинцев и балкарцев по сравнению с популяциями Европы (Gst=0.4%) по частотам 15 Alu инсерций.

3. Принадлежность подавляющего большинства гаплогрупп мтДНК и Y хромосомы популяций кабардинцев и балкарцев к западно-евразийским кластерам.

4. Высокие частоты гаплогрупп G2, J2 и Rial Y хромосомы в популяциях кабардинцев и балкарцев, являющиеся характерной особенностью популяций западной части Северного Кавказа.

5. Генетическая близость популяций кабардинцев и балкарцев по данным о распределении частот гаплогрупп мтДНК и Y хромосомы.

Заключение Диссертация по теме "Генетика", Боготова, Залина Ихсановна

выводы

1. По данным о распределении частот 15 Alu инсерций выявлена генетическая гетерогенность популяций кабардинцев и балкарцев. Характер распределения их частот в изученных популяциях соответствует таковому в популяциях Европы.

2. Показатель межпопуляционного разнообразия по 15 Alu инсерциям в популяциях кабардинцев и балкарцев составил 0.1%, что существенно ниже, чем в популяциях Европы (0.4%).

3. Подавляющее большинство гаплогрупп мтДНК и Y хромосомы в популяциях кабардинцев (86.7 и 95.0% соответственно) и балкарцев (95.0 и 96.3%) соответственно) принадлежат к западноевразийским кластерам.

4. Популяции кабардинцев и балкарцев характеризуются высокими частотами гаплогрупп G2, J2 и Rial, в сумме объясняющие 74.3 и 76.3% вариабельности гаплогрупп Y хромосомы, что является характерной особенностью популяций западной части Северного Кавказа.

6. Установлено, что по распределению частот гаплогрупп мтДНК и Y хромосомы популяции кабардинцев и балкарцев наиболее близки к популяциям Ближнего Востока.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

Исследование генетической структуры и филогенетических взаимоотношений популяций кабардинцев и балкарцев проводилось с использованием трех молекулярно-генетических маркеров: мтДНК, Y-хромосомы и Alu инсерционных локусов.

Проведено изучение 15 Alu-инсерционных локусов (Ya5NBC27, Ya5NBC51, Ya5NBC102, Ya5NBC123, Ya5NBC148, Ya5NBC182, ACE, APOA1, B65, PV92, TPA25, Ya5NBC171, Ya5NBC242, Yb8NBC480, Yb8NBC485). Выявлено, что для популяций кабардинцев и балкарцев характерен спектр частот Alu-инсерций, характерный для кавказских и европейских популяций.

Попарное сравнение популяций по распределению частот инсерций 15 локусов выявило генетическую дифференциацию кабардинцев и балкарцев.

Половина из проанализированных локусов обнаруживали довольно отчетливую географическую изменчивость, что позволяет дискриминировать азиатские и европейские популяции. Для локусов АР О, Ya5NBC182, Ya5NBC242, Yb8NBC480 наблюдается градиент увеличения частоты с востока на запад, для локусов Ya5NBC148, PV92, Yb8NBC485, Ya5NBC171 отмечен градиент уменьшения частоты с востока на запад.

В популяциях кабардинцев и балкарцев наблюдалось относительно невысокое генетическое разнообразие: среднее значение теоретической гетерозиготности составляет 0.378. Наибольшие показатели уровня разнообразия из 15 Alu-инсерций выявлены по локусам Ya5NBC51, Ya5NBC182, АСЕ, В65, Ya5NBC242, Yb8NBC485.

Для изученных нами популяций было обнаружено невысокое межпопуляционное разнообразие. Показатель генной дифференциации Gst по результатам изучения 15 Alu-инсерций составил 0.1%. Для четырех популяций Европы показатель Gst, рассчитанный по тому же набору Alu инсерций, составил 0.4% [Watkins W. et al., 2003]. Низкий показатель Gst выявляет очевидную генетическую близость популяций кабардинцев и балкарцев. В течение многих веков складывалась совместная культурно-историческая общность этих народов, что подтверждается археологическими материалами еще с эпохи бронзы. Территориальная близость, отсутствие социальных, религиозных различий приводило к постоянному взаимному потоку генов в популяциях, что, вследствии, привело к генетической близости популяций кабардинцев и балкарцев.

Для характеристики степени родства зученных популяций по данным исследования полиморфизма Л/м-инсерций был применен метод главных компонент. При использовании для сравнительного анализа данных ряда европейских и азиатских популяций, популяции Кавказа, включая кабардинцев и балкарцев, выявляли очевидную генетическую близость к европейским популяциям, при этом отчетливо дифференцировались от популяций Центральной Азии.

Полученные нами данные вполне согласуются с данными антропологии и археологии, которые предполагали, что племена Северного Кавказа поддерживали тесные контакты между собой, а также с населением Закавказья и Передней Азии [Пиотровский Б., 1988].

Изучение генетического полиморфизма мтДНК выявило, что большая часть гаплогрупп мтДНК, зарегистрированных в популяциях кабардинцев и балкарцев, принадлежит к западно-евразийским гаплогруппам. Самой частой гаплогруппой в исследованных популяциях была гаплогруппа Н. Второй по частоте встречаемости была гаплогруппа U.

В популяции балкарцев выявлена с высокой частотой гаплогруппа W. В популяциях кабардинцев и балкарцев были обнаружены гаплогруппы HV* и HV1, характерные для Западной Азии и Каваказа, с относительно высокими для этих гаплогрупп частотами: порядка 2% в обеих популяциях. Следует отметить, что это одни из наиболее высоких показателей среди кавказских популяций.

В популяции кабардинцев была выявлена в единичном случае североафриканская гаплогруппа Ml, которая также была определена в ряде кавказских популяций (карачаевцев, кумыков, кубанских ногайцев, адыгов и абазинов, ногайцев) [Коршунова Т., 2004; Бермишева М., 2004]. Вероятнее всего, что появление линии Ml в этом регионе, связано с активной работорговлей во времена греческой колонизации. Начиная с VI в. до н.э. были отмечены тесные экономические, политические и культурные связи с греческими городами-колониями синдо-меотских племен — древних предков адыгов, кабардинцев и черкесов [Пиотровский Б., 1988].

Из гаплогрупп мтДНК восточно-евразийского происхождения в популяции кабардинцев обнаружены гаплогруппы С, М*, D, F, Y, составляющие 12.6% от всех линий мтДНК, в популяции балкарцев выявлены гаплогруппы A, D, G, на долю которых приходилось 5%.

Проведенный сравнительный анализ восточно-евразийских линий мтДНК балкарцев и кабардинцев с данными по ногайцам, представлял интерес в силу того, что последние также говорят на тюркском языке, но заселили территорию Кавказа сравнительно недавно и их генетический пул в значительной мере сохранил первоначальные черты. Были обнаружены всего несколько одинаковых линий. Это позволило нам заключить, что если судить по географии восточно-евразийских линий в популяциях кабардинцев и балкарцев, часть этих линий явилась следствием потока генов в популяции Кавказа относительно недавно, а часть линий была привнесена на территорию Кавказа достаточно давно и эволюционировала на территории независимо от предковых популяций, некогда послуживших источниками этих линий в популяциях Кавказа.

Наличие всего 5% восточно-евразийских линий мтДНК и 3.7% гаплогрупп Y хромосомы в популяции балкарцев позволило нам предположить, что если метисация балкарцев и имела место, то она по своему значению не превышала то влияние, которому подверглись другие популяции Кавказа со стороны тюркоязычных степных кочевников.

Уровень гаплотипического разнообразия мтДНК в популяциях кабардинцев и балкарцев (в среднем Н=0.974) соответствовал таковому в европейских популяциях (0.9300 - 0.9800). Степень генетического межпопуляционного разнообразия исследуемых популяций составила Fst=1.3%.

Анализ распределения частот гаплогрупп мтДНК в популяциях Кавказа, Центральной Азии, Восточной и Западной Европы и результаты, полученные методом главных компонент, позволили заключить, что популяции кабардинцев и балкарцев обнаруживают генетическую близость к популяциям Кавказа и к популяциям Ближнего Востока. Близость изученных популяций к популяциям Ближнего Востока обусловлена тем, что в своем генном пуле и те и другие несут гаплогруппы HV, Tl, J, R0a, максимальная частота и разнообразие которых является характерной особенностью популяций как Кавказа, так и Ближнего Востока.

Проведенный анализ 53 диаллельных маркеров Y- хромосомы в популяции кабардинцев и балкарцев показал, что на долю западно-евразийских гаплогрупп Y-хромосомы в популяции кабардинцев приходится 95.0 %, а у балкарцев - 96.3 %. Такие данные о генетической структуре этих популяций по Y-хромосомному анализу согласуются с данными об антропологическом типе представителей этих народов, которые относятся к кавкасионскому типу большой европеоидной расы [Народы Кавказа, 1960; Пиотровский Б., 1988].

Наиболее частыми гаплогруппами Y хромосомы в популяциях кабардинцев и балкарцев являлись гаплогруппы G2, J2, Rial, что согласуется с литературными данными о том, что большая доля и разнообразие гаплогрупп Y хомосомы на Кавказе приходится именно на эти гаплогруппы.

Из восточно-евразийских гаплогрупп Y хромосомы в популяции кабардинцев выявлены гаплогруппы С, О, N ( в сумме 4.23 %), в популяции балкарцев обнаружена гапогруппа Q (3.7 %). В популяции кабардинцев также выявлены гаплогруппы Д Т, L, в сумме составляющие 2.1 %.

Результаты анализа гаплогрупп Y хромосомы методом главных компонент и анализ характера распределения частот гаплогрупп в популяциях Европы, Центральной Азии, Ближнего Востока и Кавказа, позволили сделать вывод о том, что кабардинцы и балкарцы по данному генетическому маркеру наиболее близки к популяциям Ближнего Востока. Эта близость определяется высокими частотами гаплогрупп Ли J2, максимальная суммарная частота которых составляет свыше 50% вариабельности Y хромосомы ближневосточных популяций. Популяции Каказа обнаруживают генетическую близость друг к другу, благодаря содержанию с высокой частотой гаплогруппы G (до 70%).

Таким образом, исследование по системе трех молекулярно-генетических маркеров (Alu инсерций, мтДНК и Y хромосомы) в популяциях кабардинцев и балкарцев позволило сформировать целостную картину генетических межпопуляционных взаимоотношений, выявить особенности их генетической структуры. Различные генетические маркеры дополняют друг друга, давая раздельную информацию об отцовском и материнском вкладе в генетическую структуру популяций. По данным Alu-инсерционного полиморфизма изученные популяции оказались близки к популяциям Европы. Результаты анализа гаплогрупп мтДНК и Y хромосомы хорошо согласуются друг с другом и демонстрируют близость популяций кабардинцев и балкарцев к популяциям Ближнего Востока. Различия в результатах, полученных по разным системам генетических маркеров можно объяснить их разной природой, а также влиянием различных демографических факторов на разных этапах становления этносов, которые оставили след в генетической структуре современных популяций кабардинцев и балкарцев.

Библиография Диссертация по биологии, кандидата биологических наук, Боготова, Залина Ихсановна, Уфа

1. Алексеев В.П., Происхождение народов Кавказа. Краниологическое исследование. М.: Наука, 1974. - 254 с.

2. Алексеев В.П. Историческая антропология и этногенез. М.: Наука, 1989.- 448 с.

3. Алексеева Е.П. Древняя и средневековая история Карачаево-Черкесии. М.: Наука, 1971. —356 с.

4. Алексеева Е. П. Карачаевцы и балкарцы древний народ Кавказа. -М.: АО "Бриз",1993. - 85 с

5. Анфимов Н.В. Древнее золото Кубани. — Краснодарское издательство, 1987. 232 с.

6. Асанов Ю.Н, Родственные объединения адыгов, балкарцев, карачаевцев и осетин в прошлом. Генезис и проблемы топологии. -Нальчик: Эльбрус, 1990. 119 с

7. Аутлев М., Зевакин Е., Хоретлев А. Адыги. -Майкоп, 1957.-136 с.

8. Балановская Е.В. Геногеографический анализ подразделенной популяции. II География случайного инбридинга (по частотам фамилий у адыгов) /Е.В. Балановская, Э.А. Почешхова, О.П. Балановский, Е.К. Гинтер// Генетика. -2000.- Т. 36, № 8. -С. 1126-1139.

9. Балановская Е.В., Балановский О.П. Русский генофонд на русской равнине. ООО «Луч». Москва. - 2007. -416 с.

10. Баскаков Н.А. Тюркские языки. М, 1960. — 242 с.

11. Бермишева М., Тамбетс К., Виллемс Р.и др. Разнообразие гаплогрупп митохондриальной ДНК у народов Волго-Уральского региона России // Молекулярная биология. 2002. - Т. 36. - № 6. — С. 990-1001.

12. Бермишева М.А., Кутуев И.А., Спицын В.А., Виллемс Р., Батырова А.З., Коршунова Т.Ю., Хуснутдинова Э.К. Анализ разнообразия митохондриальной ДНК в популяции ороков // Генетика. 2005. Т.41. С.78-84

13. Бетрозов Р.Ж Происхождение и этнокультурные связи адыгов. — Нальчик: Нарт, 1991. 165 с.

14. Булаева К.Б., Павлова Т.А. и др. Генетико-демографическое исследование горских популяций Дагестана и мигрантов из них на равнину. Изучение генетической и брачной структуры // Генетика. — 1995. Т. 35. — № 8. - С. 1154-1162.

15. Булаева К.Б., Павлова Т. А., Булаев О. А. Генетический полиморфизм в трех популяциях коренных народов Дагестана // Генетика. 1997. - Т. 33. - № 10. - С. 1395-1405.

16. Булаева К.Б., Давудов О.М., Павлова Т.А. и др. Генетическая подразделенность этнических популяций Дагестана // Генетика. 2003. -Т. 39. -№ 1.-С. 83-92.

17. Булаева К.Б., Жорде JL, Остлер К., Булаева О.А., Павлова Т.А., Харпендинг Г. STR полиморфизм в популяциях коренных народов Дагестана// Генетика. 2004. - Том. 40. - С. 1-13

18. Викторова Т.В. Генофонд народов Волго-Уральского региона: полиморфизм ядерной, митохондриальной ДНК и анализ мутаций вгенах наследственных заболеваний: Автореф. дис. . докт. мед. наук. -Москва, 2002. 46 с.

19. Гаджиев А.Г. Древнее население Дагестана. М.: Наука, 1975. -128 с.

20. Генофонд и геногеография народонаселения. / Под ред. Ю.Г.Рычкова: Том I. Генофонд населения России и сопредельных стран. СПб: Наука, 2000. - 611 с.

21. Дебец Г.Ф. Антропологические исследования в Дагестане // Антропологический сборник. 1956. - Т. 1. - С. 212—213.

22. Деренко М.В. Молекулярная филогеография коренного населения Северной Азии по данным об изменчивости митохондриальной ДНК. Автореф.доктора биологических наук, Магадан, 2009. 49 с.

23. Животовский JI.A. Популяционная биометрия. — М.: Наука, 1991. 272с.

24. Кадошникова М.Ю., Голубцов В.И., Ельчинова Г.И. и др. Генетико-демографическая структура популяций Адыгеи // Генетика. -1991. Т. 27. - № 1. - С. 122-128.

25. Коршунова Т. Ю. Анализ генетической структуры популяций Северного Кавказа по данным о полиморфизме митохондриального и ядерного геномов. Автореф. дис. . канд. биол. наук. Уфа, 2004. - 24 с.

26. Лавров Л.И. Происхождение кабардинцев и заселение ими нынешней территории.// Советская этнография, 1956. № 1. Стр. 23

27. Лавров Л.И. Историко-этнографические очерки Кавказа. Л., 1978.

28. Лайпанов К. Т. Мизиев, И, М, О происхождении тюркских народов. Черкесск: ПАО «ПУП», 1993.

29. Лимборская С. А., Хуснутдинова Э.К., Балановская Е.В. Этногеномика и геногеография народов Восточной Европы" // М.: Наука, 2002.-261 с.

30. Лобов А. Структура генофонда субпопуляций башкир. Афтореф.канд. биол. наук. Уфа, 2009. -23 с.

31. Малярчук Б. А. Изменчивость митохондриального генома человека в аспекте генетической истории славян: Автореф. дис. . докт. биол. наук. Москва, 2002. - 46 с.

32. Маниатис Т., Фрич Э. Сэмбрук Дж. Методы генетической инженерии. Молекулярное клонирование. М.: Мир, 1984. - 399 с.

33. Марковин В.И. Культура племен Северного Кавказа в эпоху бронзы (II тысячелетие до н.э.). МИА, 1960. № 3. - С. 28.

34. Нагоев А. X. Материальная культура кабардинцев в эпоху позднего средневековья (XIV—XVII). Нальчик, 1981. С. 41—45.

35. Народы Кавказа. / Ред. Косвен М.О. и др. Т. I. М.: Изд-во АН СССР, 1960.-612 с.

36. Пиотровский Б.Б. История народов Северного Кавказа с древнейших времен до конца XVIII в. 1988, М.: Наука. 546 с.

37. Почешхова Э. А. Генетико-демографический анализ подразделенной популяции адыгов: Автореф. дисс. . канд. мед. наук. — М., 1998.-26 с.

38. Почешхова Э.А. Положение генофонда Западного Кавказа среди основных регионов Евразии: ДНК и классические маркеры.// VII конгресс этнографов и антропологов России. Саранск, 2007. - С. 274275.

39. Почешхова Э. А, Геногеографическое изучение народов Западного Кавказа // Автореф. дис. . д-ра мед. наук. Москва, 2008. -50 с.

40. Рынков С. Ю., Наумова О.Ю., Фалунин Д.А. и др. Генофонд населения Северо-Восточной Евразии в свете данных о полиморфизме митохондриальной ДНК // Генетика. 1995. - Т. 31. - № 1. - С. 118127.

41. Степанов В.А., Пузырев В.П. Анализ акллельных частот семи микросателлитных локусов Y-хромосомы в трех популяциях тувинцев // Генетика. 2000. - Т. 36. - № 2. - С. 241-248.

42. Степанов В.А. Этногеномика населения Северной Евразии. -Томск. — Печатная мануфактура, 2002. 244 с.

43. Степанов В.А., Харьков В.Н., Пузырев В.П. Эволюция и филогеография линий Y-хромосомы человека// Вестник ВОГиС. 2006. Т. 10. С. 57-73

44. Федоров Я.А. Историческая этнография Северного Кавказа. — М., 1983.- 125 с.

45. Федорова С.А., Бермишева М.А., Виллемс Р. и др. Анализ линий митохондриальной ДНК в популяции якутов // Молекулярная биология. -2003.-Т. 37. № 4. - С. 1-11.

46. Федорова С. Этногеномика коренных народов республики Саха (Якутия) автореферат диссертации на соискание ученой степени доктора биологических наук Москва — 2008.

47. Хитринская И.Ю., Степанов В.А., Пузырев В.П. Анализ полиморфизма ^/w-инсерций в бурятских популяциях // Генетика. -2001.-Т. 37.-№6.-С. 1553-1558.

48. Хитринская И.Ю., Степанов В.А., Пузырев В.П. и др. Генетическая дифференциация населения Средней Азии по данным аутосомных маркеров // Генетика. 2003. - Т. 39. - № 10. - С. 1389-1397.

49. Хусаинова Р.И., Ахметова B.JL, Кутуев И.А. и др. Генетическая струтура народов Волго-Уральского региона и Средней Азии по данным ^/«-полиморфизма // Генетика. 2004. - Т. - № 4. - С. 552-559.

50. Хуснутдинова Э.К., Викторова Т.В., Ахметова B.JI. и др. Популяционно-генетическая структура чувашей (по данным о восьми ДНК-локусах ядерного генома) // Генетика. 2003. — Т. 39. — №11.-С. 1550-1563.

51. Хуснутдинова Э.К., Кутуев И. А., Хусаинова Р.И. и др. Этногеномика и филогенетические взаимоотношения народов Евразии// Вестник ВОГИС. 2006. Т. 10. №1. С.24-40.

52. Шеуджен А.Х., Галкин Г.А., Алешин Н.Е. и др. Земля адыгов. -Майкоп, 1996. -748 с.

53. Юнусбаев Б. Б. Популяционно-генетическое исследование народов Дагестана по данным о полиморфизме Y-хромосомы и alu-инсерций. Автореф.канд. биол. наук. Уфа, 2006, 24 с.

54. Языки народов СССР: В 5 т./ Под ред. Н.А.Виноградова. М.: Наука, 1966- 1967.-Т. 1,4.

55. Achilli A., Perego U.A., Bravi С.М. et al. The phylogeny of the four pan-American mtDNA haplogroups: implications for evolutionary and disease studies // PLoS ONE. 2008. V. 3. N. 3. el764

56. Alonso S., Flores C., Cabrera V. The place of the Basques in the European Y-chromosome diversity landscape.// Eur. J. Hum. Genet. 2005. -Vol. 13.-P. 1293-1302.

57. Anderson S., Bankier A.T., Barrell B.G., et al. Sequence and organization of the human mitochondrial genome // Nature. 1981. - V. 290.-P. 457-465.

58. Andrews R. M. Kubacka, I, Chinnery, P, F, Lightowlers, R, N, Turnbull, D, M, HowellN, Reanalysis and revision of the Cambridge reference sequence for human mitochondrial DNA. // Nat Genet. 1999. -Vol. 23 - P. 147

59. Avise J.C. Phylogeography: the history and formation of species. -Cambridge: Harvard University Press, 2000. 464 p

60. Ballinger S.W., Schurr T.G., Torroni A., et al. Southeast Asian mitochondrial DNA analysis reveals genetic continuity of ancient mongoloid migrations // Genetics. 1992. -V. 130. - P. 139-152.

61. Balanovsky O., Rootsi S., Pshenichnov A., et.al. Two sources of the Russian patrilineal heritage in their Eurasian context// Am. J. Hum. Genet. -2008.-Vol.82.-P.236-250

62. Bandelt, H, J, Forster, P, Sykes, В, C, Richards, MB, Mitochondrial portraits of human populations using median networks. // Genetics. 1995. -Vol. 141 - P. 743-753.

63. Bandelt H.J., Kivisild T. Quality assessment of DNA sequence data: autopsy of a mis-sequenced mtDNA population sample Ann Hum Genet. 2006 May;70(Pt 3):314-26.

64. Barbujani G., Gerard W., Bertorelle G., Nasidze I. Testing Hypotheses on Processes of Genetic and Linguistic Change in Caucasus // Hum. Biol. -1994.-V. 66.-P. 843-864.

65. Batzer M.A., Kilroy G.E., Richard P.E., et al. Structure and variability of recently inserted Alu family members // Nucleic Acids Res. 1990. - V. 18.-№23.-P. 6793-6798.

66. Batzer M.A., Stoneking M., Alegria-Hartman H., et al. African origin of human-specific polymorphic Alu insertion // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1994.-V. 91.-P. 12288-12292.

67. Batzer M.A., Deininger P.L., Hellmann-Blumberg U., et al. Standardized nomenclature for Alu repeats // J. Mol. Evol. 1996. - V. 42. -P. 3-6.

68. Batzer M.A., Deininger P.L. Alu repeats and human genomic diversity // Nature Reviews Genetics. 2002. - V. 3. - P. 370-379.

69. Bermisheva M. A., Tambets K., Villems R., and Khusnutdinova E. K. Diversity of Mitochondrial DNA Haplogroups in Ethnic Populations of the Volga-Ural Region// Molecular Biology. -2002.- Vol. 36.- № 6,- P. 802812

70. Bogenhagen D.F. Repair of mtDNA in vertebrates // Am. J. Hum. Genet. 1999. V.64. P. 1276-1281

71. Brion M., Quintans В., Zarrabeitia M., Gonzalez-Neira A., Salas A., Lareu V., Tyler-Smith C., Carracedo A. // Micro-geographical differentiation in Northern Iberia revealed by Y-chromosomal DNA analysis. Gene 329 (2004) 17-25

72. Brown W.M., George M., Jr., Wilson A.C. Rapid evolution of animal mitochondrial DNA// Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1979. - V.76. - P. 1967-1971

73. Bulayeva K.B., Jorde L., Ostler C., Watkins S., Harpending H. Genetics and population history of Caucasus populations// Hum. Biology. -2003. Vol. - 75. - P. 837-853

74. Bulayeva К. B, Jorde L, Watkins S, Ostler C, Pavlova ТА, Bulayev OA, Tofanelli S, Paoli G, Harpending H Ethnogenomic diversity of Caucasus, Daghestan.J Hum Biol. 2006 Sep-Oct;18(5):610-20

75. Case J.T., Wallace D.C. Maternal inheritance of mitochondrial DNA polymorphisms in cultured human fibroblasts // Somat. Cell Genet. 1981. V. 7. P. 103-108.

76. Cavalli-Sforza L.L The history and geography of human genes / L.L Cavalli-Sforza, P. Menozzi, A. Piazza. Princeton: Princeton Univ. Press, 1994.

77. Chaix R., Quintana-Murci L., Hegay Т., Hammer M., Mobasher Z., Austerlitz F., Heyer E. From Social to Genetic Structures in Central Asia// Current Biology 2007. - Vol. 17. - P.43-48

78. Chaix R., Austerlitz F., Hegay Т., Quintana-Murci L., Heyer E. Genetic traces of east-to-west human expansion waves in Eurasia// Am. J. Phys. Anthropol. 2008. - Vol. 136. -P.309-326.

79. Chen X., Prosser R., Simonetti S. et al. Rearranged mitochondrial genomes are present in human oocytes // Am. J. Hum. Genet. 1995. V. 57. P. 239-247.

80. Chen Y.-C., Olckers A., Schurr T.G. et al. mtDNA variation in the South African Kung and Khwe — and their genetic relationships to other African populations // Am. J. Hum. Genet. 2000. - V. 66. - P. 1362-1383.

81. Comas D., Calafell F., Mateu E., et al. Trading genes along the silk road: mtDNA sequences and the origin of Central Asian populations // Am. J. Hum. Genet. 1998.-V. 63.-P. 331-350.

82. Comas D., Calafell F., Bendukidze N. Georgian and Kurd sequence analysis shows a lack of correlation between languages and genetic lineages // Am. J.Phys. Anthropol. 2000. - V. 112. - P. 5-6.

83. Comas D., Plaza S., Wells R.S., Yuldaseva N., Lao O., Calafell F., Bertranpetit J. Admixture, migrations, and dispersals in Central Asia: evidence from maternal DNA lineages// Eur. J. Hum. Genet. 2004. - V.12. -P.495-504

84. Cruciani F., La Fratta R., Santolamazza P., Sellitto D., Pascone R., Moral P., Watson E., Guida V., Beraud Colomb E., Zaharova В., Lavinha J., Vona G., Aman R., Cali F., Akar N., Richards M.B., Torroni A., Novelletto

85. A., Scozzari R. Phylogeographic analysis of haplogroup ЕЗЬ (E-M215) Y chromosomes reveals multiple migratory events within and out of Africa// Am. J. Hum. Genet. 2004. - Vol. 74. -P.1014-1022

86. Derbeneva O., Rem I. Sukernik S. et al. Analysis of Mitochondrial DNA Diversity in the Aleuts of the Commander Islands and Its Implications for the Genetic History of Beringia // Am. J. Hum. Genet. 2002. - V. 75. -P. 415-421.

87. Derenko M., Malyarchuk В., Denisova G. et al. Contrasting patterns of Y-chromosome variation in South Siberian populations from Baikal and Altay-Sayan regions // Hum. Genet. 2006. V. 118. N. 5. P. 591-604.

88. Derenko M., Malyarchuk В., Denisova G., et al., Y-chromosome haplogroup N dispersals from south Siberia to Europe// J. Hum. Genet.2007. -Vol. 52. -P.763-770

89. Dongna L., Hui L., Caiying O., Yan L., Yuantian Sun, Bo Y., Zhendong Q., Zhenjian Zh., Shilin L., Li J. Paternal Genetic Structure of Hainan Aborigines Isolated at the Entrance to East Asia// PLoS ONE.2008.-Vol. 5.-P.3-7

90. Finnila S., Lentonen M., Majamaa K. Phylogenetics network for European mtDNA // Am. J. Hum. Genet. 2001. - V. 68. - P. 1475-1484.

91. Giles R.E., Blanc H., Cann H.M., Wallace D.C. Maternal inheritance of human mitochondrial DNA // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. 1980. - V. 77. -P. 6715-6719.

92. Gonzalez A.M., Karadsheh N., Maca-Meyer N., Flores C., Cabrera V.M., Larruga J.M. Mitochondrial DNA variation in Jordanians and their genetic relationship to other Middle East populations// Ann. Hum. Biol. -2008. Mar-Apr. 35. -P.212-231

93. Guo S.W., Thompson E.A. Performing the exact test of Hardy-Weinberg proportions for multiple alleles// Biometrics. 1992. - Vol. 48. -P.361-372.

94. Grzybowski Т., Malyarchuk B.A., Derenko M.V. et al. Complex interactions of the Eastern and Western Slavic populations with other European groups as revealed by mitochondrial DNA analysis // Forensic Sci. Internatl: Genetics. 2007. V. 1. P. 141-147

95. Hammer M.F., Karafet Т., Rasanayagam A., et al. Out of Africa and back again: nested cladistic analisis of human Y chromosome variation // Mol. Biol. Evol.- 1998.- V. 15.-P. 427-441.

96. Hammer M.F., Karafet T.M., Redd A J., Jarjanasi H., Santachiara-Benerecetti S., Soodyall H., Zegura S.L. Hierarchical patterns of global human Y-chromosome diversity // Mol. Biol. Evol. 2001. V.18. P. 1189-1203

97. Hill C., Soares P., Mormina M. et al. A mitochondrial stratigraphy for island southeast Asia // Am. J. Hum. Genet. 2007. V. 80. P. 29-43.

98. Ingman M., Kaessman H., Paabo S., Gyllensten U. Mitochondrial genome variation and the origin of modern humans// Nature. 2000. - V.408. -P.708-713.

99. International Human Genome Sequencing Consortium. Initial sequencing and analysis of the human genome // Nature. — 2001. V. 409. -P. 860-921.

100. Jobling M.A., Tyler-Smith C. The human Y chromosome an evolutionary marker comes of age// Nature. 2003. - Vol. 4. -P.598-612.

101. Kapitonov V., J. Jurka The age of Alu subfamilies // J. Mol. Evol. -1996.-V. 42.-P. 59-65.

102. Karafet T.M, Mendez F.L, Meilerman MB, Underhill P.A, Zegura S.L, Hammer M.F . New binary polymorphisms reshape and increase resolutionof the human Y chromosomal haplogroup tree/ Genome Res. 2008. 18(5):830-8

103. Karathanasis S.K. Apolipoprotein multigene family: tandem organization of human apolipoprotein Al, CIII, and AIV genes // Proc. Natl. Acad. Sci. 1985. - V. 82.-P. 6374-6378.

104. Karlsson A.O., Wallerstrom Т., Gotherstrom A., Holmlund G. Y-chromosome diversity in Sweden A long-time perspective.// Eur. J. Hum. Genet. - 2006. - Vol. 14. -P.963-970.

105. Katoh T, Munkhbat B, Tounai K, Mano S, Ando H, Oyungerel G, Chae G-T, Han H, Jia G-J, Tokunaga K, Munkhtuvshin N, Tamiya G, Inoko H Genetic features of Mongolian ethnic groups revealed by Y-chromosomal analysis. Gene / 2005. 346:63-70.

106. Khusnutdinova E.K., Bermisheva M.A., Kutuev I. A., Unusbev B.B. and Villems. Genetic landscape of the Central Asia and Volga-Ural region. Biosphere origin and evolution. Springer. - 2008. - 427 c.

107. Kivisild Т., Bamshad M., Kaldma K. et.al. Deep common ancestry of Indian and western-Eurasian mtDNA lineages // Curr. Biol. 1999a. - № 9. -P. 1331-1334.

108. Kivisild Т., Kaldma K., Metspalu M. et al. The Place of the Indian mtDNA Variants in the Global Network of Maternal Lineages and the Peopling of the Old World // Academic / Plenum Publishers. 1999b. - P. 135-152.

109. Kivisild Т., Papiha S., Rootsi S. In Indian ancestry: a key for undestanding human diversity in Europe and Beyond/ In Archaeogenetics:

110. DNA and the Populations Prehistory of Europe // Eds. Renfrew C., Boyle K. Cambridge: McDonald Institute for Archeological Research. 2000. - P. 267-275.

111. Kivisild Т., Tolk H.-V., Paric J. et al. The emerging limbs and twigs of the East Asian mtDNA tree // Mol. Biol. Evol. 2002. - V. 19(10). - P. 1737-1751.

112. Kivisild Т., Rootsi S., Metspalu M. et al. The Genetic Heritage of the Earliest Settlers Persists Both in Indian Tribal and Caste Populations // Am. J. Hum. Genet. 2003. - V. 72.-P. 313-332.

113. Kivisild Т., Shen P., Wall D.P. et al. The role of selection in the evolution of human mitochondrial genomes // Genetics. 2006. V. 172. P. 373-387

114. Kolman C., Sambuughin N. Mitochondrial DNA analysis of Mongolian populations and implications for the origin of New World founders // Genetics. 1996. - V. 142. - P. 1321-1334.

115. Kong Q.P., Yao Y.G., Sun C. et al. Phylogeny of East Asian mitochondrial DNA lineages inferred from complete sequences // Am. J. Hum. Genet. 2003b. V. 73. P. 671-676.

116. Krings M., Geisert H., Schmitz R.W., Krainitzki H., Paabo S. DNA sequence of the mitochondrial hypervariable region II from the neandertal type specimen// Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1999. - V.96. -P.5581-5585

117. Kutuev I., Khusainova R., Karunas A., Yunusbayev В., Fedorova S. From East to West: Patterns of Genetic Diversity of Populations Living in Four Eurasian Regions// Yuman Heredity. 2006,- Vol. 61. P. 1-9.

118. Lahermo P., Laitinen V., Sistonen P. et al. MtDNA polymorphism in the Hungarians: comparison to three other Finno-Ugric-speaking populations // Hereditas. 2000. V. 132. P. 35-42.

119. Lightowlers R.N., Chinnery P.F., Turnbull D.M., Howell N. Mammalian mitochondrial genetics: heredity, heteroplasmy and disease // Trends Genet. 1997. V.13. P.450-455.

120. Maca-Meyer N., Gonsales A., Larruga J. et al. Major genomic mitochondrial lineages delineate early human expansion // BMC Genetics. -2001.-V. 2. P. 13.

121. Macaulay V., Richards M., Hickey E. et.al. The emerging tree of West Eurasian mtDNA: A synthesis of control-region sequences and RFLPs // Am. J. Hum. Genet. 1999. - V. 58. - P. 1309-1322.

122. Malyarchuk В., Grzybowski Т., Derenko M., Perkova M., Vanecek Т., Lazur .J, Gomolcak P., Tsybovsky I. Mitochondrial DNA phylogeny in Eastern and Western Slavs// Mol. Biol. Evol. 2008a. - Aug. 25. -P.1651-1658

123. Malyarchuk B.A., Perkova M.A., Derenko M.V. et al. Mitochondrial DNA variability in Slovaks, with application to the Roma origin // Ann. Hum. Genet. 2008b. V. 72. P. 428-440.

124. Mason P.A., Lightowlers R.N. Why do mammalian mitochondria possess a mismatch repair activity? // FEBS Lett. 2003. V.554. P.6-9

125. Mellars P. Why did modern human populations disperse from Africa ca. 60,000 years ago? A new model // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2006a. V. 103. P. 9381-9386.

126. Metspalu M., Kivisild Т., Bandelt H.-J., Richards M., Villems R. The pioneer settlement of modern humans in Asia // Nucl. Acids and Mol. Biol. 2006. V18. P.180-199

127. Nasidze I., Risch G.M., Robichaux M., et al. Alu insertion polymorphisms and the genetic structure of human populations from the Caucasus // Eur. J. Hum. Gen. 2001. - V. 9. - P. 267-272.

128. Nasidze I., Stoneking M. Mitochondrial DNA variation and language replacements in the Caucasus// Proceedings of Royal Society of London. Series B. Biological Sciences. 2001. - Vol. 268. - P. 197-206

129. Nasidze I., Sarkisian Т., Kerimov A., Stoneking M. Testing hypotheses of language replasement in the Caucasus: evidence from the Y-chromosome // Hum Genet. 2003. - V. 112. - P. 255-261.

130. Nasidze I., Quinque D., Dupanloup I., Rychkov S., Naumova O., Zhukova O., Stoneking M. Genetic evidence concerning the origin of south and north ossetians// Annals of human Genetics. 2004b. - Vol. 68. -P.588-599.

131. Nasidze I., Quinque D., Udina I. et al. The Gagauz, a linguistic enclave, are not a genetic isolate // Ann. Hum. Genet. 2007. V. 71. P. 379389.

132. Nebel A., Filon D., Brinkmann В., Majumder P.P., Faerman M., Oppenheim A. The Y chromosome pool of Jews as part of the geneticlandscape of the Middle East// Am. J. Hum. Genet. 2001. - Vol. 69. - P. 1095-1112.

133. Novick G.E., Batzer M.A., Deininger P.L., Herrera R.J. The mobile genetic element Alu in the human genome // Bioscience. 1996. - V. 46. -P. 32-41.

134. Olivio P.D., Van de Walle M.J., Laipis P.J., Hauswirth W.W. Nucleotide sequence evidence for rapid genotypic shifts in the bovine mitochondrial DNA D-loop// Nature. 1983. - V.306. - P.400-402

135. Ovchinnikov I.V., Gotherstrom A., Romanova G.P., Kharitonov V.M., Liden K., Goodwin W. Molecular analysis of Neanderthal DNA from the northern Caucasus // Nature. 2000. V.404. P.490-493

136. Pakendorf B, Novgorodov I.N, Osakovskij V.L, Danilova A.P, Protod'jakonov A.P, Stoneking M Investigating the effects of prehistoric migrations in Siberia: genetic variation and the origins of Yakuts. Hum Genet. 2006 Vol. 69 P. 866-878

137. Pimenoff V.N., Comas D., Palo J.U., Vershubsky G., Kozlov A., Sajantila A. Northwest Siberian Khanty and Mansi in the junction of West and East Eurasian gene pools as revealed by uniparental markers// Eur. J. Hum. Genet.-2008.- Vol. 16. P. 1254-1264.

138. Pereira L., Richards M., Goios A. et al. High-resolution mtDNA evidence for the late-glacial resettlement of Europe from an Iberian refugium // Genome Res. 2005. V. 15. P. 19-24

139. Qamar R., Ayub Q., Mohyuddin A., Helgason A., Mazhar K., Mansoor A., Zerjal Т., Tyler-Smith C., Qasim Mehdi S. Y-Chromosomal DNA Variation in Pakistan// Am. J. Hum. Genet. 2002. - Vol.70. - P.1107-1124.

140. Quintana-Murci L., Semino O., Bandelt H- J. et al. Genetic evidence of an early exit of Homo sapiens sapiens from Africa through eastern Africa // Nat. Genet. 1999. - V. 23. - P. 437—441.

141. Quintana-Murci L., Quach H., Harmant C. et al. Maternal traces of deep common ancestry and asymmetric gene flow between Pygmy hunter-gatherers and Bantu-speaking farmers // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2008. V. 105. P. 1596-1601

142. Rosa A., Brehm A., Kivisild Т., Metspalu E., Villems R. MtDNA profile of West Africa Guineans: towards a better understanding of the Senegambia region// Ann. Hum. Genet. 2000. - V.68. - P.340-352.

143. Rousset F. Inferences from spatial population genetics // Balding D., Bishop M., Cannings C. Handbook of Statistical Genetics. John Wiley & Sons, 2001. P. 239-269.

144. Regueiro M., Cadenas A.M., Gayden Т., Underhill P.A., Herrera R.J. Iran: tricontinental nexus for Y-chromosome driven migration// Human Heredity. 2006. - Vol. 61. - P. 132-143.

145. Richards M., Corte-Real H. et al. Paleolithic and neolithic lineages in the European mitochondrial gene pool // Am. J. Hum. Genet. 1996. - V. 59.-P. 185-203.

146. Richards M., Macaulay V., Bandelt H.J. Phylogeography of mitochondrial DNA in western Europe // Ann. Hum. Genet. 1998. - V. 62. -P. 241-260.

147. Richards M., Macaulay V., Hickey E. et.al. Tracing European Founder Lineages in the Near Eastern mtDNA Pool // Am. J. Hum. Genet. 2000. -V. 67.-P. 1251-1276.

148. Richards M., Macaulay V. The Mitochondrial Gene Tree Comes of Age // Am. J. Hum. Genet. 2001. - V. 68. - P. 000-000.

149. Richards M., Macaulay V., Torroni A., Bandelt H.-J. In Search of Geographical Patterns in European Mitochondrial DNA // Am. J. Hum. Genet. -2002. V. 71.-P. 000-000.

150. Richards M., Rengo C., Cruciani F. et al. Extensive Female-Mediated Gene Flow from Sub-Saharan Africa into Near Eastern Arab Populations // Am. J. Hum. Genet. 2003. - V. 72. - P. 000-000.

151. Rosenberg N., Nordborg M. Genealogical trees,coalescent theory and the analysis of genetic polymorphisms // Nature. 2002. - V. 3. - P. 380390.

152. Rosser Z.H., Zerjal Т., Hurles M.E. et al. Y-chromosomal diversity in Europe is clinal and influenced primarily by geography, rather than by language // Am. J. Hum. Genet. 2000. - V. 67. - P. 1526-1543.

153. Rousset F. Inferences from spatial population genetics // Balding D., Bishop M., Cannings C. Handbook of Statistical Genetics. John Wiley and Sons. 2001. P. 239-269.

154. Rowold D.J., Luis J.R., Terreros M.C., Herrera R.J. Mitochondrial DNA geneflow indicates preferred usage of the Levant Corridor over the Horn of Africa passageway // J. Hum. Genet. 2007. V. 52. P.436-447.

155. Salas A., Richards M., Lareu M.V., Scozzari R., Coppa A., Torrini A., Macaulay V., Carracedo A. The African diaspora: mitochondrial DNA and the Atlantic slave trade // Am. J. Hum. Genet. 2004. V.74. P.454-465.

156. Sambrook, J, Fritsch, E, F, ManiatisT, Molecular cloning: a laboratory manual. Second ed. ed. Cold Spring Harbor, NY: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989. c.

157. Schneider S., Roessl D., Excoffier L. Arlequin v. 2.000: A software for population genetics data analysis. Genetics and Biometry Laboratory, University of Geneva, 2000.

158. Semino О., Santachiara-Benerecetti A.S., Falaschi F., Cavalli-Sforza L.L., Underhill P.A. Ethiopians and Khoisan share the deepest clades of the human Y-chromosome phylogeny// Am. J. Hum. Genet. — 2002. Vol. 70. -P. 265-268

159. Slatkin M. A measure of population subdivision based on microsatellite allele frequencies // Genetics. 1995. - V. 139. - P.457-462.

160. Shlush L.I., Behar D.M., Yudkovsky G. et al. The Druze: a population genetic refugium of the Near East // PLoS ONE. 2008. V. 3: e2105

161. Soares P., Trejaut J.A., Loo J.H. et al. Climate change and post-glacial human dispersals in Southeast Asia // Mol. Biol. Evol. 2008. V. 25. P. 12091218

162. Stoneking M. Fontius J.J., Clifford S.L. et al. Alu insertion polymorphisms and human evolution: Evidence for a larger population size in Africa//Genome Res. 1997.-V. 7.-P. 1061-1071.

163. Sullivan, К, M, Hopgood, R, GillP, Identification of human remains by amplification and automated sequencing of mitochondrial DNA. // Int J Legal Med. 1992. - Vol. 105 - P. 83-86.

164. Sykes B. LIuman diversity in Europe and beyond: From blood groups to genes// Archaeogenetics: DNA and the population prehistory of Europe/ Eds. C. Renfrew, K. Boyle. Cambridge: Cambridge University Press, 2000. -P. 23-28.

165. Tajima A., Pan I.H., Fucharoen G., Fucharoen S., Matsuo M., Tokunaga K., Juji Т., et al. Three major lineages of Asian Y chromosomes: implications for the peopling of east and southeast Asia // Hum. Genet. 2002. V.110. P.80-88

166. Tajima A., Hayami M., Tokunaga K. et al. Genetic origins of the Ainu inferred from combined DNA analyses of maternal and paternal lineages // J. Hum. Genet. 2004. V. 49. P. 187-193.

167. Tamm E., Kivisild Т., Reidla M., et al. Beringian standstill and spread of Native American Founders //PLoS ONE. 2007. V. 2. N. 9: e829

168. Tambets К., Rootsi S., , Kivisild T. et al. The western and eastern roots of the Saami the story of genetic "outliers" told by mtDNA and Y-chromosome // Am. J. Hum. Genet. - 2004. - In press.

169. Tanaka M., Cabrera V.M., Gonzalez A.M. et al. Mitochondrial genome variation in Eastern Asia and the peopling of Japan // Genome Res. 2004. V. 14. P. 1832-1850

170. Thangaraj K., Singh L., Reddy A.G., Rao V.R., Underhill P.A., Pierson M., Frame I.G, Hagelberg E. Genetic affinities of the Andaman Islanders, a vanishing human population// Curr. Biol. 2003. - Vol. 13. -P. 86-93

171. Tolk H.V., Pericic M., Barac L. et al. MtDNA Haplogroups in the Populations of Croatian Adriatic Islands // Coll. Antropol. 2000. - V. 24. -P. 267-279.

172. Torroni A., Schurr T.G., Cabell M.F. et al. Asian affinities and continental radiation of the four founding native American mtDNAs // Am. J. Hum. Genet. 1993a. - V. 53. - P. 563-590.

173. Torroni A., Sukernik R.I., Schurr T.G. et al. MtDNA variation of aboriginal Siberians reveals distinct genetic affinities with native Americans // Am. J. Hum. Genet. 1993b. - V. 53. - P. 591-608.

174. Torroni A., Huoponen K. et al. Classification of European mtDNAs from an analysis of three European populations // Genetics. 1996. — V. 144.-P. 1835-1850.

175. Torroni A., Bandelt H.-J. et al. mtDNA analysis reveals a major late Paleolithic population expansion from Southwestern to Northeastern Europe //Am. J. Hum. Genet. 1998. - V. 62.-P. 1137-1152.

176. Torroni A., Bandelt H.-J., Macaulay V. et al. A signal from human mtDNA, of postglacial recolonization in Europe // Am. J. Hum. Genet. -2001.-V. 69.-P. 844-852.

177. Torroni A., Achilli A., Macaulay V. et al., Harvesting the fruit of the human mtDNA tree// Trends Genet. 2006. - Vol. 22 (6). - P. 339-345

178. Underhill P. The pattern of global Y-chromosome binary marker haplotype variation // BDENE 2000. - V. 2. - P. 187-189.

179. Underhill P.A., Passarino G., Lin A.A. The phylogeography of Y chromosome binary haplotypes and the origins of modern human populations // Ann.Hum. Genet. 2001. - V. 65. - P. 43-62.

180. Underhill P.A. Inferring human history: clues from Y-chromosome haplotypes// Cold Spring Harbor Symposia on Quantitative Biology. 2003. -Vol. 48. - P. 487-493

181. Watkins W.S., Ricker C.E., Bamshad M.J. et al. Patterns of ancentral Human Diversity: an analysis of Alu-insertion and restriction-site polymorphism/Mm. J. Hum. Genet. 2001. - V. 68. - P. 738-752

182. Xue Y., Zerjal Т., Bao W., et al., Male demography in East Asia: A north-south contrast in human population expansion times// Genetics. -2006. -Vol. 172.-P. 2431-2439.

183. Yao Y.-G., L.H.-Mei., Luo H.-R. et al. Gene admixture in the Silk Road region of China evidence from mtDNA and melanocortin 1 receptor polymorphism. Genes // Genet. Syst. - 2000. - V. 75. - P. 173-178.

184. Yao Y.-G., Kong Q.-P., Bandelt H. -J. Phylogenetic differentation of mitochondrial DNA in Han Chinese // Am. J. Hum. Genet. 2002. - V. 70. -P. 635-651.

185. Yao Y.-G., Kong Q.-P., Wang C.-Y., Zhu C.-L., Zhang Y.-P. Different matrilineal contributions to genetic structure of ethnic groups in the Silk Road region in China // Mol. Biol. Evol. 2004. V.21. P.2265-2280.

186. Y Chromosome Consortium. A nomenclature system for the tree of human Y-chromosomal binary haplogroups// Genome Res. 2002. - Vol. 12.-P. 339-348.

187. Zalloua P.A., Xue Y., Khalife J. Y-chromosomal diversity in Lebanon is structured by recent historical events.// Am. J. Hum. Genet. 2008. - Vol. 82.-P. 873-882

188. Zerjal Т., Wells R.S., Yuldasheva N., Ruzibakiev R., Tyler-Smith С. A genetic landscape reshaped by recent events: Y-chromosomal insights into Central Asia// Am. J. Hum. Genet. 2002. - Vol. 71. - P. 466-482

Информация о работе

Боготова, Залина Ихсановна
кандидата биологических наук
Уфа, 2009
ВАК 03.00.15

Диссертация

Изучение генетической структуры популяций кабардинцев и балкарцев - тема диссертации по биологии, скачайте бесплатно

Автореферат

Похожие работы