Бесплатный автореферат и диссертация по биологии на тему

Генетический и молекулярно-биологический анализ функций гена HSM2 в репарации предмутационных повреждений ДНК у дрожжей Saccharomyces cerevisiae

ВАК РФ 03.00.15, Генетика

Содержание диссертации, кандидата биологических наук, Алексеев, Сергей Юрьевич

ВВЕДЕНИЕ.

ГЛАВА 1. СИСТЕМЫ ПОДЕРЖАНИЯ СТАБИЛЬНОСТИ ГЕНЕТИЧЕСКОГО МАТЕРИАЛА У ДРОЖЖЕЙ SACCHAROMYCE CEREVISIAE (ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ).

1.1. Основные типы повреждений ДНК и пути их репарации.

1.2. Типы взаимодействий между мутациями радиочувствительности. Эпистатические группы генов.

1.3. Эксцизионная репарация нуклеотидов (Эпистатическая группа ДАрЗ).

1.4. Пострепликативная репащ$ия (Эпистатическая группа RAD6).

1.5. Рекомбинационная репарация (Эпистатическая группа RAD52).

1.6. Эксцизионная репарация оснований.

1.7. Коррекция ошибочно спаренных оснований.

1.7.1. Роль коррекции ошибочно спаренных оснований. Универсальная система коррекции ошибочно спаренных оснований.

1.7.2. Прочие системы коррекции ошибочно спаренных оснований. HIM и HSM гены.

1.7.3. Способы экспериментальной регистрации нарушения коррекции ошибочно спаренных оснований.

ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ.

2.1. Список сокращенных названий веществ и буферных растворов.

2.2. Основные штаммы и условия их культивирования.

2.2.1. Обозначения генотипов дрожжей.

2.2.2. Штаммы.

2.2.3. Состав питательных сред и условия культивирования штаммов, использованных в работе.

2.3. Методы.

2.3.1. Осаждение ДНК этанолом.

2.3.2. Аналитический электрофорез с выделением ДНК в лунках.

2.3.3. Выделение небольших количеств двуцепочечной плазмидной ДНК из Е. coli кипячением.

2.3.4. Выделение больших количеств двуцепочечной плазмидной ДНК из Е. coli методом щелочного лизиса.

2.3.5. Выделение ДНК из дрожжей при переносе челночных плазмид в Е. coli.

2.3.6. Выделение одноцепочечной плазмидной ДНК.

2.3.7. Наработка бактериофага-помощника М13К в больших количествах.

2.3.8. Секвенирование ДНК.

2.3.9. Трансформация Е. coli.

2.3.10. Трансформация S. cerevisiae.

2.3.11. Микроманипулирование и тетрадный анализ.

2.3.12. Учет частоты спонтанных мутаций канаванинустойчивости.

2.3.13. УФ-облучение суспензии клеток.

2.3.14. Учет выживаемости при УФ-облучении.

2.3.15. Учет частоты появления мутантов при УФ-облучении культуры дрожжей.

2.3.16. Качественная оценка мутаторности по частоте прямых мутаций канаванинустойчивости.

2.3.17. Качественная оценка чувствительности к метилметансульфонату.

2.3.18. Стандартные молекулярно-биологические и микробиологические методы.

2.3.19. Статистические методы обработки результатов.

ГЛАВА 3. СОЗДАНИЕ СИСТЕМЫ ОЦЕНКИ ЭФФЕКТИВНОСТИ И

НАПРАВЛЕНИЯ КОРРЕКЦИИ ОШИБОЧНО СПАРЕННЫХ ОСНОВАНИЙ.

3.1. Конструирование плазмид с однонуклеотидными заменами в гене АОЕ2.

3.2. Конструирование плазмид, содержащих ошибочно спаренные основания.

ГЛАВА 4. КАРТИРОВАНИЕ ГЕНА ШМ2.

4.1. Хромосомная локализация гена НБМ2.

4.2. Картирование гена ШМ2 относительно маркеров правого плеча хромосомы IV.

ГЛАВА 5. СВОЙСТВА МУТАЦИИ 11зт2.

5.1. Влияние мутации 11зт2 на коррекцию искусственных гетеродуплексов и спонтанный мутагенез.

5.1.1. Эффективность и преимущественное направление коррекции использованных в работе искусственных гетеродуплексов в штамме дикого типа.

5.1.2. Влияние мутации 1т8гп2 на эффективность коррекции искусственных гетеродуплексов.

5.1.3. Влияние мутации hsm2 на преимущественное направление коррекции искусственных гетеродуплексов.

5.1.4. Взаимодействие мутаций hsm.2 и мутации pmsl при коррекции ошибочно спаренных оснований.

5.1.5. Влияние мутации hsm2 на спонтанный мутагенез. Взаимодействие мутаций hsm2 и мутации pmsl при спонтанном мутагенезе.

5.2. Взаимодействие мутации hsm2 с мутациями в генах других систем репарации ДНК при УФ-облучении и при обработке метилметансульфонатом.

5.2.1. Влияние мутации hsm2 на чувствительность к УФ-облучению и ММС и на и УФ-индуцированный мутагенез.

5.2.2. Взаимодействие мутаций hsm2 и rad2.

5.2.3. Взаимодействие мутаций hsm2 и rev3.

5.2.4. Взаимодействие мутаций hsm2 и rad54.

5.2.5. Взаимодействие мутаций hsm2 и pmsl.

5.2.6. Взаимодействие мутации hsm2 и hsm3.

ГЛАВА 6. ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ.

6.1. Система оценки эффективности и направления коррекции ошибочно спаренных оснований.

6.2. Новые аспекты коррекции ошибочно спаренных оснований у S. cerevisiae.

6.3. Влияние мутации hsm2 на коррекцию ошибочно спаренных оснований в плазмидах. Роль продукта гена HSM2 в коррекции ошибочно спаренных оснований.

6.4. Участие продукта гена HSM2 в репарации предмутационных повреждений, возникающих в результате работы "склонной к ошибкам" репарации".

6.5. Гипотетическая схема механизма репарации предмутационных повреждений, возникающих при обходе некодирующих повреждений ДНК с участием продукта гена HSM2.

6.6. Участие продукта гена PMS1 в репарации предмутационных повреждений при УФ-облучении.

6.7. Совместное участие продуктов генов HSM2 и HSM в репарации предмутационных повреждений.

6.8. Репарация предмутационных повреждений с участием продукта гена HSM2 как новый пример участия КОСО в процессах рекомбинации.

ВЫВОДЫ.

Введение Диссертация по биологии, на тему "Генетический и молекулярно-биологический анализ функций гена HSM2 в репарации предмутационных повреждений ДНК у дрожжей Saccharomyces cerevisiae"

Системы репарации ДНК, являясь механизмами, обеспечивающими поддержание стабильности генетического материала, играют важную роль как в жизнедеятельности отдельных клеток и организмов, так и в эволюции в целом. Знание принципов функционирования этих систем, их взаимодействия друг с другом и другими системами клетки необходимо для понимания таких фундаментальных явлений, как наследственность, изменчивость и мутагенез. Исследование механизмов репарации ДНК является одним из наиболее активно развивающихся направлений современной генетики.

Актуальность данной проблемы связана также с тем , что изучение репарационных систем имеет весьма высокое практическое значение. Первая группа практических задач, решаемых при изучении систем репарации, связана с их участием в защите ДНК от воздействия физических и химических мутагенов, которому постоянно подвергается в современных условиях организм человека. Информация о принципах и параметрах функционирования систем репарации ДНК у человека позволит учитывать опасность воздействия различных мутагенных факторов. Вторая группа задач возникла в последнее десятилетие, когда была обнаружена связь между нарушением работы систем репарации ДНК и развитием ряда онкологических заболеваний (Miyamoto et al., 1992; Fishel et al., 1993; Leach et al., 1993). Изучение репарационных процессов, нарушение которых определяет предрасположенность к подобного рода заболеваниям, позволит обеспечить их более точную и раннюю диагностику и приведет к решению ряда связанных с ними терапевтических проблем.

Дрожжи Засскаготусех сегеумше^ являясь одним из наиболее удобных для проведения генетических экспериментов эукариотических организмов, с конца 60х годов использовались для исследования систем репарации ДНК. Благодаря существованию простых методик обнаружения у дрожжей чувствительности к повреждающим ДНК агентам и мутаторных фенотипов они весьма удобны для поиска мутантов по генам репарационных систем.

В настоящее время у cerevisiae известно более 150 генов, участвующих в различных системах репарации ДНК. Очевидно, однако, что известные сейчас репарационные системы и гены далеко не полностью исчерпывают их многообразие у дрожжей. Активно использовавшийся в последние годы метод поиска таких генов по гомологии с соответствующими генами прокариот в настоящее время практически исчерпал свои возможности. Таким образом, в настоящее время по-прежнему актуально получение новых мутаций, имеющих фенотипическое проявление, свидетельствующее о нарушений работы репарационных систем: сверхчувствительность к летальному и мутагенному эффекту повреждающих ДНК воздействий и/или повышение уровня спонтанного мутагенеза. Исследование таких мутаций позволит обнаружить новые гены и системы, участвующие в репарации ДНК у сегеу/яше.

К таким новым генам относится ген ШМ2, исследованию которого посвящена данная работа. Штамм, несущий мутацию в гене ШМ2 был получен в лаборатории генетики эукариот Отделения молекулярной и радиационной биофизики ПИЯФ РАН в числе прочих мутантов с повышенным уровнем спонтанного и индуцированного ультрафиолетовыми лучами мутагенеза. Мутация 11зш2 не приводила к повышению чувствительности к цитотоксическому действию различных повреждающих ДНК воздействий и термочувствительности (Иванов и др.,

1992). Некоторые свойства мутанта 1181п2, такие как повышенный уровень спонтанного мутагенеза при нормальной чувствительности к летальному воздействию различных мутагенов и температуры и влияние на генную конверсию, были аналогичны свойствам мутантов по генам систем коррекции ошибочно спаренных оснований (КОСО). Однако, оказываемое мутацией 11зт2 влияние на уровень индуцированного ультрафиолетовыми лучами мутагенеза, отличало её от мутаций в генах известных систем коррекции ошибочно спаренных оснований.

Исследование мутанта 1шп2, проведенное в настоящей работе предусматривало решение следующих основных задач:

1. Генетическое картирование мутации 11зт2.

2. Разработка метода оценки эффективности и направления коррекции ошибочно спаренных оснований ДНК и влияния на эти параметры одноцепочечных разрывов ДНК (ников).

3. Изучение, с использованием разработанного метода, влияния мутации 118т2 на коррекцию ошибочно спаренных оснований.

4. Установление характера взаимодействия мутации 118ш2 и мутаций в генах ряда известных систем репарации ДНК при сравнении чувствительности к летальному и мутагенному действию УФ-лучей двойных и одиночных мутантов. Изучение такого взаимодействия было направлено на определение места процесса, в котором участвует продует гена ШМ2, среди других клеточных процессов, контролирующих уровень индуцированного мутагенеза.

Картирование мутации Иэпгё методом тетрадного анализа выявило её локализацию на правом плече хромосомы. IV на расстоянии 14 сМ дистальнее гена НОМ2.

В ходе работы была разработана и апробирована методика синтеза плазмид, содержащих различные ошибочно спаренные основания (ОСО) в стартовом кодоне гена ADE2. Трансформация такими плазмидами позволяла определять по фенотипу колоний трансформантов не только эффективность коррекции ОСО, как в ранее использованных методиках, но следить за направлением коррекции, то есть за сохранением в ходе коррекции информации той или другой нити ДНК. Особенности процесса сборки плазмид позволяли сохранять одноцепочечные разрывы (ники) в любой из цепей ДНК, что дало возможность впервые у S. cerevisiae оценить влияние ников на эффективность и направление коррекции ошибочно спаренных оснований in vivo.

При использовании предложенного метода установлено, что у штамма S. cerevisiae дикого типа наличие ников в ДНК служит сигналом для направления коррекции на цепь, содержащую ники, что ведет к предпочтительному сохранению информации непрерывной цепи. Эта закономерность не зависела от типа использованных ОСО. Обнаружено, что наличие ников не влияет на эффективность КОСО.

Мутация hsm2 приводила к падению эффективности КОСО в 1,5 -2,5 раза, в зависимости от типа ОСО. При наличии ников в ДНК мутация hsm2 оказывала влияние также на преимущественное направление коррекции. В отличие от штамма дикого типа, в клетках мутанта hsm2 независимо от ников предпочтительно сохранялась информация цепи, несущей транскрибируемую нить гена ADE2. Таким образом, было доказано участие продукта гена HSM2 в ник-зависимом процессе коррекции ошибочно спаренных оснований.

Было проведено исследование выживаемости при УФ-облучении и индуцированного УФ-лучами мутагенеза у двойных мутантов, несущих мутацию hsm2 и мутацию в гене одной из трех основных систем репарации ДНК (эксцизионной (rad2), пострепликативной (rev3) и рекомбинационной (rad54)), а также с мутациями hsm3 и pmsl, контролирующими различные

11 ветви коррекции ошибочно спаренных оснований. Результаты этого исследования свидетельствуют об участии продукта гена НБМ2 в репарации предмутационных повреждений, возникающих в ходе работы пострепликативной репарации ДНК.

На основании полученных результатов рассматривается роль продукта гена ШМ2 в контроле уровня спонтанного и индуцированного мутагенеза.

Работа выполнена в Лаборатории генетики эукариот Отделения молекулярной и радиационной биофизики Петербургского института ядерной физики им. Б. П. Константинова Российской Академии Наук.

Заключение Диссертация по теме "Генетика", Алексеев, Сергей Юрьевич

ВЫВОДЫ

1. Осуществлено генетическое картирование мутации 11зт2. Установлена локализация гена ШМ2 на правом плече хромосомы IV на 14 сМ дистальнее гена НОМ2.

2. Разработана новая методика конструирования плазмид, содержащих ошибочно спаренные основания ДНК. При трансформации штаммов Засскаютусеа сегеУ1ьчае этими плазмидами впервые стало возможно оценивать направление коррекции различных ошибочно спаренных оснований в зависимости от разрывов в той или иной цепи ДНК.

3. Обнаружено существование у Засскаготусез сегеушае механизма коррекции ошибочно спаренных оснований, в котором коррекция направлена на нить, содержащую разрывы ДНК. Этот процесс контролируется геном ШМ2.

4. Ген ШМ2 участвует в контроле репарации предмутационных повреждений ДНК, возникающих при обходе некодирующих повреждений ДНК-полимеразой С,.

5. Репарация предмутационных повреждений, контролируемая геном Н8М2, проходит с участием рекомбинации. Действие этой репарации может иметь летальный эффект для клетки.

6. В процессе репарации предмутационных повреждений ДНК, в котором задействован продукт гена НБМ2, участвует также продукт гена ШМЗ.

7. Установлена новая минорная функция продукта гена РМБ1 -участие в репарации индуцированных УФ-лучами предмутационных повреждений.

Библиография Диссертация по биологии, кандидата биологических наук, Алексеев, Сергей Юрьевич, Санкт-Петербург

1. Булат С. А., Захаров И. А., Степанова В. П., Яровой Б. Ф. Использование эффекта дестабилизации хромосом после интеграции в них плазмид для генетического картирования дрожжей // Докл. АН СССР. -1983.-Т. 273.-С. 473.

2. Грачева Л. М., Евстюхина Т. А., Ковальцова С. В., Королев В. Г. Участие гена Н1М1 дрожжей БассНаготусез сегеу^яше в коррекции гетеродуплексной ДНК // Генетика. 1992. - Т. 28. - С. 56-65.

3. Захаров И. А., Кожина Т. Н. Мутант дрожжей сверхчувствительный к ультрафиолетовым лучам // ДАН СССР. 1967. - Т. 176. С. 1417-1418.

4. Захаров И. А., Кожина Т. Н., Федорова И. В. Повышение спонтанной мутабельности у радиочувствительных мутантов дрожжей // Докл. АН СССР. 1968. - Т. 181. - С. 470-472.

5. Захаров И. А., Ковальцова С. В., Кожина Т. Н., Федорова И. В., Яровой Б. Ф. Мутационный процесс у грибов. Л.: Наука, 1980.

6. Захаров И. А., Кожина Т. Н., Федорова И. В. Повышение спонтанной мутабельности у радиочувствительных мутантов дрожжей // Докл. АН СССР. 1968. - Т. 181. - С. 470-472.

7. Захаров И. А., Кожин С. А., Кожине Т. Н., Федорова И. В. Сборник методик по генетике дрожжей-сахаромицетов. Л.: Наука, 1984.

8. Иванов Е. Л., Федорова И. В., Ковальцова С. В. Выделение и характеристика новых мутантов дрожжей ^ассЬаготусек сегеутае с повышенной спонтанной мутабельностью // Генетика. 1992 . -Т. 28. - С. 47-55.

9. Ивантер Э. В. Коросов А. В. Основы биометрии. Петрозаводск.: Изд-во ПГУ, 1992.

10. Ковальцова С. В. Репарация и мутагенез. III. Влияние мутаций радиочувствительности на индукцию УФ-лучами прямых и обратных мутаций по потребности в аденине у дрожжей Saccharomyces cerevisiae И Генетика. 1973. - Т. 9. - С. 110-115.

11. Ковальцова С. В., Степанова В. П., Яровой Б. Ф., Королев В. Г., Захаров И. А. Картирование генов XRS2 и ШМ1 дрожжей Saccharomyces cerevisiae методом, основанным на эффекте дестабилизации хромосом // Генетика. 1990. - Т. 26. - С. 1667-1670.

12. Королев В. Г. Генетический контроль митотической рекомбинации у дрожжей Saccharomyces cerevisiae II Генетика. 1993. - Т. 29.-С. 197-211.

13. Левитин М. М., Ковальцова С. В., Королев В. Г., Федорова И. В. Использование дрожжей-сахаромицетов как тест-объекта для оценки генетических эффектов системных фунгицидов // Микол. и фитопотол. -1993.-Т. 27. С. 60-66.

14. Лобашев М. Е. Физиологическая (паранекротическая) гипотеза мутационного процесса // Вестник ЛГУ., Сер. биол. 1947. -Т. 8. - С. 10-29.

15. Маниатис Т., Фрич Э., Сэмбрук Д. Методы генетической инженерии. Молекулярное клонирование. М.: Мир, 1984.

16. Суслова Н. Г., Захаров И. А. Изучение спонтанного мутационного процесса у радиочувствительных мутантов Saccharomyces cerevisiae // Генетика. 1971. -Т. 7. - С. 91-98.

17. Федорова И. В., Ковальцова С. В., Иванов Е. JT. Влияние мутаций hsm, повышающих спонтанную мутабельность, на индуцированный мутагенез и митотическую рекомбинацию у дрожжей Saccharomyces cerevisiae II Генетика. 1992. - Т. 28. - С. 54-65.

18. Чепурная О. В., Кожина Т. Н., Пешехонов В. Т., Королев В. Г. REC41 новый ген, участвующий в контроле рекомбинации у дрожжей Saccharomyces cerevisiae II Генетика. - 1993а . -Т. 29. - С. 245-246.

19. Чепурная О. В., Пешехонов В. Т., Кожина Т. Н. Ген XRS2 контролирует рекомбинационную репарацию у дрожжей // Генетика. -19936.-Т. 29.-С. 571-580.

20. Яровой Б. Ф., Степанова В. П., Булат С. А. Генетическое изучение интеграции плазмид в дрожжевые хромосомы. Сообщение IV/ Интеграция плазмиды pYFl в различные хромосомы дрожжей // Генетика. 1987.-Т. 23.-С. 2138.

21. Acharya S., Wilson Т., Gradia S., Kane M. F., Guerrette S., Marsischky G.T., Kolodner R., Fishel R // liMSH2 forms specific mispair-binding complexes with hMSH3 and I1MSH6 // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. -1996. V. 93. - P. 136229-13634.

22. Alani E., Padmore R., Kleckner N. Analysis of wild-type and rad50 mutants of yeast suggests an intimate relationship between meiotic chromosome synapsis and recombination // Cell. 1990. - V. 61. - P. 419-436.

23. Alani E., Reenan R. A. G., Kolodner R. D. Interaction between mismatch repair and genetic recombination in Saccharomyces cerevisiae ¡1 Genetics. 1994. - V. 137. - P. -19-39.

24. Alani E., Lee S., Griffith J., Kolodner R. D. Saccharomyces cerevisiae Msh2, a mispaired base recognition protein, also recognizes Holliday junctions in DNA // J. Mol. Biol. 1997. - V. 265. - P. 289-301.

25. Allen D. J., Makhov A., Grilley M., Taylor J., Thresher R., Modrich P., Griffith J. D. MutS mediates heteroduplex loop formation by a translocation mechanism. //EMBO J. 1997. - V. 16. - P. 4467-4476.

26. ATCC (American type culture collection) catalogue of yeast. 18th ed.,1990.

27. Au K. G., Welsh K., Modrich P. Initiation of methyl-directed mismatch repair.// J. Biol. Chem. 1992. - V. 267. - P. 12142-12148.

28. Bailly V., Sung P., Prakash L., Prakash S. DNA-RNA helicase activity of RAD3 protein of Saccharomyces cerevisiae II Proc. Natl. Acad. Sci. USA. -1991. V. 88. - P. 9712-9716

29. Bailly V., Summers C. H., Sung P., Prakash L., Prakash S. Specific complex formation between proteins encoded by the yeast DNA repair and recombination genes RAD1 and RADIO // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1992. -V. 89. - P. 8273-8277.

30. Bailly V., Lauder S., Prakash S., Prakash L. Yeast DNA repair proteins Rad6 and Radl8 form a heterodimer that has ubiquitin conjugating, DNA binding, and ATP hydrolytic activities // J. Biol. Chem. 1997. - V. 272. -P. 23360-23365.

31. Ban C., Yang W. Structural basis for MutH activation in E. coli mismatch repair and relationships of MutH to restriction endonucleases. // EMBO J. 1998. - V. 17. - P. 1526-1534.

32. Baranovska H., Prazmo W., Putrament A. A search for Saccharomyces cerevisiae mutants with an increased sensitivity to nitrous acid // Acto Microbiol. Polon. ser. A. - 1975. - V. 7. - P. 25-32.

33. Barker D. G., Johnson A. L., Johnston L. H. A improved assay for DNA ligase reveals temperature-sensitive activity in cdc9 mutants of Saccharomyces cerevisiae II Mol. Gen. Genet. 1985. - V. 200. - P. 458-462.

34. Bende S. M., Grafstrom R. H. The DNA binding properties of the MutL protein isolated from Escherichia coli.I I Nucl. Acids Res. 1991. - V. -19.-P. 1549-1555.

35. Berdal K. G., Bjoras M., Bjelland S., Seeberg E. Cloning and expression in Escherichia coli of a gene for an alkylbase DNA glycosilase from Saccharomyces cerevisiae: a homologue to the bacterial alkA gene // EMBO J. -1990. V.9. - P. 4563 4568.

36. Bishop D. K., Kolodner R. D. Repair of heteroduplex plasmid DNA after transformation into Saccharomyces cerevisiae II Mol. Cell. Biol. 1986. -V. 16. - P. 3401-3409.

37. Bishop D. K., Park D., Xu L., Kleckner N. DMC1: a meiosis-specific yeast homologue of bacterial recA required for meiotic recombination, synaptonemal complex formation and cell cycle progression // Cell. 1992. - V. 69. - P. 439-456.

38. Bishop D. K., Williamson M. S., Fogel S., Kolodner R. D. The role of heteroduplex correction in gene conversion in Saccharomyces cerevisiae II Nature. 1987. - V. 328. - P. 362-364.

39. Bonneaud N. O., Orier-Kologeropulos G. L., Labouesse M., Minvielle-Sebastia L. A family of low and high copy replicative, integrative, and single-stranded S. cerevisiae/E. coli shuttle vectors // Yeast. 1991. - V. 7. -P. 609-615.

40. Brankman M., Prakash L., Prakash S. Yeast RAD14 and human xeroderma pigmentosum group A DNA-repair genes encode homologous proteins //Nature. 1992. - V. 355. - P. 555-558.

41. Burgers P. M. J., Klein M. B. Selection by genetic transformation of a Saccharomyces cerevisiae mutant defective for the nuclear uracil-DNA-glycosylase // J. Bacterid. 1986. - V. 166. - P.905-913.

42. Burns J. L., Guzder S. N., Sung P., Prakash L., Prakash S. An Affinity of Human Replication Protein A for Ultraviolet-damaged DNA. Implications for damage recognition in nucleotide excision repair.

43. Chambers S. R., Hunter N., Louis E. J., Borts R. H. The mismatch repair system reduced meiotic homeologous recombination and stimulates recombination dependent chromosomic loss // Mol. Cell. Biol. 1996. - V. 16. -P. 6110-6120.

44. Chang D.-Y., Lu A.-L. Base mismatch-specific endonuclease activity in extracts from Saccharomyces cerevisiae II Nucleic Acids Res. 1991. - V. -19. - P.4761-4766.

45. Chen J., Derfler B., Maskati A., Samson L. Cloning a eukariotic gene by the suppression of a DNA repair defect in Escherichia coli II Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1989. - V. 86. - P. 7961-7965.

46. Chen J., Derfler B., Samson L. Saccharotnyces cerevisiae 3-methyladenine DNA glycosilase has homology to the alkA glycosylase of E. coli and is induced in response to DNA alkylation damage // EMBO J. 1990. -V. 9. - P. 4569-4575.

47. Clever B., Interthal H., Schmukli-Maurer J., King J., Sigrist M., Heyerl W.-D. Recombinational repair in yeast: functional interactions between Rad51 and Rad54 proteins // EMBO J. 1997. - V. 16. - P. 2535-2544.

48. Cole G. M., Schild D., Lovett S. T. Mortimer R. K. Regulation of RAD54- and RAD52-lacZ gene fusions in response to DNA damage // Mol. Cell. Biol. 1987. - V. 7. - P. 1078-1084.

49. Cole G., Schild D., Mortimer R. K. Two DNA repair and recombination genes in Saccharomyces cerevisiae, RAD52 and RAD54, are induced during meiosis // Mol. Cell. Biol. 1989. - V. 9. - P. 3101-3104.

50. Cooper A. J., Kelly S. L. DNA repair and mutagenesis in Saccharomyces cerevisiae. / In: " Enzyme induction, mutagen activation and carcinogen testing in yeast", Ed. by A. Wiseman, Ellis Horwood Ltd., Chichester, 1987, P. 73-114.

51. Cooper D. L., Lahue R. S., Modrich P. Methyl-directed mismatch repair is biderectional // J. Biol. Chem. 1993. - V. 268. - P. 11823-11829.

52. Cox B. C., Game J. Repair systems in Saccharomyces. II Mutat. Res. -1974. V. 26. - P. 257-264.

53. Datta A., Adjiri A., Now. L., Crouse G. F., Jinks-Robertson S. Mitotic crossovers between diverged sequences are regulated by mismatch repair proteins in Saccharomyces cerevisiae. // Mol. Cell. Biol. 1996. - V. 16. - P. 1085-1093.

54. Davies A. A., Friedberg E. C., Tomkinson A. E., Wood R. D., West S. C. Role of the radl and radlO proteins in nucleotide excision repair and recombination//J. Biol. Chem. 1995. - V. 270. - P. 24638-24641.

55. Doetsch P. W. Monomeric base damage products from adenine, guanine, and thymine induced by exposure of DNA to ultraviolet radiation // Biochem. 1995. - V. 34. - P. 737-742.

56. Donovan J. W., Milne G. T., Weaver D. T. Homotipic and heterotipic protein associations control Rad51 function in double-strand break repair // Genes & Dev. 1994. - V. 8. - P. 2552-2562.

57. Dor Y., Raboy B., Kulka R. G. Role of the conserved carboxy-terminal alpha helix of Rad6p in ubiqutination and DNA repair // Mol. Microbiol. 1996. - V. 21. 1197-1206.

58. Dower W. J., Miller J. F., Ragsdale C. W. High efficiency transformation of E. coli by high voltage electroporation // Nucleic Acids Res. -1988.-V. 16.-P. 6127-6138.

59. Eckardt F., Soo-Jeet T., Haynes R.H. Heteroduplex repair as intermediate step of UV-mutagenesis in yeast// Genetics. 1980. - V. 95. - P. 63-80.

60. Emery H. S., Schild D., Kellog D. E., Mortimer R. K. Sequence of RAD54, a Saccharomyces cerevisiae gene involved in recombination and repair //Gene, 1991. -V. 104. P. 103-106.

61. Falko S. A., Botstein D. A. A rapid chromosome mapping method for cloned fragments of yeast DNA // Genetics. 1983. - V. 105. - P. 857-872.

62. Fedorova I. V., Gracheva L. M., Kovaltzova S. V., Evstyukhina T. A., Alekseev S. Yu, Korolev V. G. The yeast HSM3 gene acts in one of the mismatch repair pathways // Genetics. 1998. - V. 148. - P. 963-973.

63. Fergusson L. R., Cox B. S. Excision of bases accompanying the excision of dimers from DNA of UV-irradiated yeast // Mol. Gen. Genet. 1974. - V. 135.-P. 87-90.

64. Fishel R., Lescoe M. K., Rao M. R., Copeland N. G., Jenkins N. A., Garber J., Kane M., Kolodner R. The human mutator gene homolog MSH2 and its association with hereditary nonpolyposis colon cancer. // Cell. 1993. - V. 75.-P. 1027-1038.

65. Fleck O., Schar P., Kohli J. Identification of two mismatch-binding activities in protein extracts of Schizosaccharomyces pombe // Nucleic Acids Res. 1994. - V. 22. - P. 5289-5295.

66. Friedberg E. C. Yeast genes involved in DNA-repair processes: New looks on old faces // Mol. Biol. 1991. - V. 5. - P. 2303-2310.

67. Friedberg E. C. DNA repair: Looking back and peering forward.// BioAssays, 1994. V. 16. - P. 645-649.

68. Friedberg E. C., Walker J. C. Siede W. DNA repair and mutagenesis. Washington: Amer. Soc. Microbiol. Press, 1995.

69. Friedberg E. C. Relationships between DNA repair and transcription // Annu. Rev. Biochem. 1996. - V. 65. - P. 15-42.

70. Gietz R. D., Prakash S. Cloning and nucleotide sequence analysis of the Saccharomyces cerevisiae RAD4 gene required for excision repair of UV-damaged DNA // Gene, 1988. V. 74. - P. 535-541.

71. Glickinan B. W. Spontaneous mutagenesis in Escherichia coli strains lacking 6-methiladenine residues in their DNA. An altered mutation spectrum in dam- mutants //Mutation Res. 1979. - V. 61. - P. 153-162.

72. Glickman B. W., Radman M. Escherichia coli mutator mutants deficient in methylation-instructed DNA mismatch correction // Proc. Natl. Acad. Sei. USA. 1980. - V. 77. - P. 1063-1067.

73. Golin J. E., Esposito M. S. Evidence for joint genetic control of spontaneous mutation and genetic recombination during mitosis in Saccharomyces//Mol. Gen. Genet. 1977. - V. 150. - P. 127-135.

74. Gool A. Y. van., Verhage R., Swagemarkers S. M., van de Putt P., Brower Y., Troelsta C., Bootsma D., Hoeijamakers J. H. RAD26, the functional S. cerevisiae homolog of the Cockaine syndrome gene ERCC6 // EMBO J. -1994.-V. 13.-P. 5361-5369.

75. Goth-Goldstein R., Johnson P. L. Repair of alkylation damage in Saccharomyces cerevisiae // Mol. Gen. Genet. 1990. - V. 2221. - P. 353-357.

76. Gottlieb D. J. C., Von Borstel R. S. Mutators in Saccharomyces cerevisiae: mutl-1, mutl-2 and mut2-l // Genetics. 1976. - V. 83.P. 655-666.

77. Grilley M., Welsh K. M., Su S.-S., Modrich P. Isolation and characterization of the Escherichia coli mutL gene product // J. Biol. Chem. -1989.-V. 264.-P. 1000-1004.

78. Grossman L., Grafstrom R. AP sites and AP endonucleases // Biochem. 1982. - V. 64. - P. 577-580.

79. Guzder S. N., Sung P., Prakash L., Prakash S. Yeast DNA repair gene encodes a zinc metalloprotein with affinity for ultraviolet-damaged DNA // Proc. Natl. Acad. Sei. USA. 1993. - V. 90. - 5433-5437.

80. Guzder S. N., Qiu H., Sommers C. H., Sung P., Prakash L., Prakash S. DNA repair gene RAD3 of Saccharomyces cerevisiae is essential for transcription by RNA polymerase II // Nature. 1994. - V. 367. - P. 91-94.

81. Guzder S. N. Bailly V., Sung P., Prakash L., Prakash S. Yeast DNA repair protein RAD23 promotes complex formation between transcription factor TFIIH and DNA damage recognition factor RAD14. // J. Biol. Chem. 1995a. -V. 270. - P. 8385-8388.

82. Guzder S. N., Habraken Y., Sung P., Prakash, L., Prakash, S. Reconstitution of Yeast Nucleotide Excision Repair with Purified Rad Proteins, Replication Protein A, and Transcription Factor TFIIH //J. Biol. Chem. 1995b. - V. 270.-P. 12973-12976

83. Guzder S. N., Sung P., Prakash L., Prakash S. Nucleotide excision in yeast is mediated by sequential assembly of repair factors and not by a pre-assembled reparasome. // J. Biol. Chem. 1996a. - V. 271. - P. 8903-8910.

84. Guzder S. N., Habraken Y., Sung P., Prakash L., Prakash S. RAD26, the yeast homolog of human Cockaine's syndrome group B gene, encodes a DNA-dependent ATPase // J. Biol. Chem. 1996b. - V. 271. - P. 18314-18317.

85. Guzder S. N., Sung P., Prakash L., Prakash S. Yeast Rad7-Radl6 complex, specific for the nucleotide excision repair of the nontranscribed DNA strand, is an ATP-dependent DNA damage sensor // J. Biol. Chem. 1997. - V. 272.-P. 21665-21668.

86. Habraken Y., Sung P., Prakash L., Prakash S. Yeast excision repair gene RAD2 gene encodes a single stranded DNA endonuclease // Nature. -1993. V. 366. - P. 365-368.

87. Habraken Y., Sung P., Prakash L., Prakash S. Binding of insertion/deletion DNA mismatches by the heterodimer of yeast mismatch repair proteins MSH2 and MSH3 // Curr. Biol. 1996a. - V. 6. - P. 1185-1897.

88. Habraken Y., Sung P., Prakash L., Prakash S. Enhancement of MSH2-MSH3-mediated mismatch recognition by the yeast MLH1-PMS1 complex // Curr. Biol. 1997. - V. 7. - P. 790-793.

89. Harosh I., Numovsky L., Friedberg E. C. Purification and characterization of Rad3 ATPase/DNA helicase from Saccharomyces cerevisiae //J. Biol. Chem. - 1989. - V. 264. - P. 20532-20539.

90. Hastings P. I., Quah S. K., von Borstel R. C. Spontaneous mutation by mutagenic repair of spontaneous lesions in DNA // Nature. 1976. - V. 264. -P.719-722.

91. Haynes R. H. Yeast DNA repair./ In : Molecular mechanisms for repair of DNA. Part B., N.Y. - London, Plenum Press, 1975, P. 529-540.

92. Hays S. L., Firmmmenich A. A., Berg P. Complex formation in yeast double-strand break repair: participation of Rad51, Rad52, Rad55, and Rad57 proteins // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1995. - V. 92. - P. 6925-6929.

93. He Z., Henricksen L. A., Wold M. S., Ingles S. J. RPA involvement in the damage-recognition and incision steps of nucleotide excision repair. // Nature. 1995. - V. 374. - P. 566-569.

94. Heyer W.-D. The search for the right partner: Homologous pairing and DNA strand exchange proteins in eukariotes // Experientia. 1994. V. 50. -P. 223-233.

95. Hickson J. D., Arthur H. M., Bramhill D., Emmerson P. T. The E. coli uvrD gene product is DNA helicase II // Mol. Gen. Genet. 1983. - V. 190. - P. 265-270.

96. Higgins D. R., Prakash S., Reynolds P., Prakash L. Molecular cloning and characterization of the RAD1 gene of Saccharomyces cerevisiae II Gene. 1983a. - V. 226. - P. 119-126.

97. Holbeck S. L., Strathern J. N. A role for REV3 in mutagenesis during double-strand break repair in Saccharomyces cerevisiae II Genetics. -1997.-V. 147.-P. 1017-1024.

98. Holmes J., Clark S., Modrich P. Strand-specific mismatch correction in nuclear extracts of human and Drosophila melanogasler cell lines. // Proc. Natl. Acad., Sci. USA. 1990 - V. 87. - P. 5837-5841.

99. Hunter N., Borts R. H., Mlhl is unique among mismatch repair proteins in its ability to promote crossing-over during meiosis // Genes Dev. -1997.-V.ll.-P. 1573-1582

100. Iaccarino I., Palombo F., Drummond J., Totty N. F., Hsuan J. J., Modrich P., Jirichny J. MSH6, a Saccharomyces cerevisiae protein that binds to mismatches as heterodimer with MSH2 // Curr. Biol. 1996. - V. 6. - P. 484486.

101. Ito H., Fukuda Y., Murata K., Kimura A. Transformation of intact yeast cells treated with alkali cations // J. Bacteriol. 1983. - V. 153. - P. 163168.

102. Jentsch S., McGrath J. P. Varshavsky A. The yeast DNA repair gene RAD6 encodes ubiquitin-conjugating enzyme // Nature. 1987. - V. 329. - P. 131-134.

103. Jiang H., Xic Y., Houston P., Stemke-Hale K., Mortensen U. H., Rothstein R., Kodadek T. Direct association between the yeast Rad51 and Rad54 recombination proteins // J. Biol. Chem. 1996. - V. 271. - P. 3318133186.

104. Johnson A. W., Demple B. Yeast DNA 3'-repair diesterase is the major cellular apurinic/apyrimidinic endonuclease: substrate specificity and kinetics // J. Biol. Chem. 1988. - V. 263. - P. 18017-18022.

105. Johnston L. H., Nasmyth K. A. Saccharomyces cerevisiae cell cycle mutant cdc9 is defective in DNA ligase // Nature. 1978. - V. 274. - P. 891-893.

106. Johzuka K., Ogawa H. Interaction of Mrell and Rad50: Two proteins required for DNA repair and meiosis-specific double-strand break repair formation in Saccharomyces cerevisiae II Genetics. 1995. - V. 139. - P. 15221-1532.

107. Jones J. S., Weber S., Prakash L. The Saccharomyces cerevisiae RAD18 gene encodes a protein that contains potential zinc finger domains fornucleic acid binding and nucleotide binding sequence // Nucleic Acids Res. -1988.-V. 16.- P. 7119-7131.

108. Kadyk L. C., Hartwell L H. Sister chromatids are preferred over homologs as substrates for recombination repair in Saccharomyces cerevisiae H Genetics. 1992. - V. 132. - P. 387-402.

109. Kadyk L. C., Hartwell L H. Replication-dependent sister chromatid recombination in radl mutants of Saccharomyces cerevisiae II Genetics. 1993. -V. 133.-P. 469-487.

110. Khromov-Borisov N. N. Biochemical aspects of measuring mutational rates. Appendics to: von Borstel R. C. Measuring spontaneous mutation rates in yeast. // Methods Cell Biol. 1978. - V. 20. - P. 20-24.

111. Kimura K., Sekiguchi M. Identification of the uvrD gene product of Escherichia coli as DNA helicase II and its induction by DNA damaging agents //J. Biol. Chem. 1983. - V. 259. - P. 1560-1565.

112. Kirkpatrick D. T., Petes T. D. Repair of DNA loops involves DNA-mismatch and nucleotide-excision proteins // Nature. 1997. - V. 387. - P. 929931.

113. Kohli J., Bahler J. Homologous recombination in fission yeast: Absence of crossover interference and synaptonemal complex // Experientia. -1994. -V. 50. P. 295-306.

114. Kovaltzova S. V., Fedorova I. V., Gracheva L. M., Evstyukhina T. A., Korolev V.G. The role of the yeast HSM3 gene in the spontaneous and UV-induced mutagenesis. 1999. - (in press).

115. Kramer B., Kramer W., Fritz H.-J., Different base / base mismatches are corrected with different efficiencies by the methyl directed DNA mismatch-repair system of Escherichia coli // Cell. 1984. - V. 38. - P. 879-887.

116. Kramer W., Kramer B., Willamson M. S., Fogel S. Cloning and nucleotide sequence of DNA mismatch repair gene PMS1 from Saccharomyces cerevisiae: homology of PMS1 to prokaryotic MutL and HexB // J. Bacteriol. -1989a.-V. 171.-P. 5339-5346.

117. Kramer B., Kramer W., Willamson M. S., Fogel S. Heteroduplex DNA correction in Saccharomyces cerevisiae is mismatch specific and requires functional PMS gene // Mol. Cell Biol. 1989b. - V. 9. - P. 4432-4440.

118. Laengle-Rouault F., Maenhaut-Michel G., Radman M. GATC sequence and mismatch repair in Escherichia coli // EMBO J. 1986. - V. 5. - P. 2009-2013.

119. Lahue R. S., Su S. S., Modrich P. Requirement for d(GATC) sequences in Escherichia coli mutLSH mismatch correction // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 1987. - V. 84. - P. 1482-1486.

120. Lahue R. S., Au K. G., Modrich P. DNA mismatch correction in a defined system // Science. 1989. - V. 245. - P. 160-164.

121. Larimer F. W., Perry J. R., Hardigree A. A. The REV1 gene of Saccharomyces cerevisiae: isolation, sequence, and functional analysis // J. Bacteriol. 1989. - V. 171. - P.230-237.

122. Lauder S., Baukmann P., Guzder S. N., Sung P., Prakash S. Dual requirement for the yeast MMS19 gene in DNA repair and RNA polymerase II transcription // Mol. Cell. Biol. 1996. - V. 16. - P. 6783-6793.

123. Lawrence C. W., Clirictensen R. B. UV-mutagenesis in radiation sensitive strains in yeast // Genetics. 1976. - V. 82. - P. 207-232.

124. Lawrence C. W. Mutagenesis in Saccharomyces cerevisiae II Adv. Genet. 1982. - V. 21. - P. 173-253.

125. Leach F. S., Nicolaides N. C., Papadopoulos N., Liu B., Jen J., Parsons R., Peltomaki P., Sistonen P., Aaltonen L. A., Nystrom-Lahti M. Mutations of a mutS homolog in hereditary nonpolyposis colorectal cancer. // Cell. 1993. - V. 75. - P. 1215-1225.

126. Leadon S. A., Lawrence D. A. Strand-selective repair of DNA damage in the yeast GAL7 gene requires RNA polymerase II // J. Biol. Chem. -1992. V. 267. - P. 23175-23182.

127. Leadon S. A., Barbee S. L., Dunn A. B. The yeast RAD2, but not RAD1, gene is involved in the transcription-coupled repair of thymine glycols // Mutat. Res. 1995. - V.337. - P. 169-178.

128. Lieb M. Specific mismatch correction in bacteriophage lambda crosses by very short patch repair // Genetics. 1983. - V. - 191. - P. 118-125.

129. Lombaerts M., Tijsterman M., Verhage R. A., Brouwer J. Saccharomyces cerevisiae mmsl9 mutants are deficient in transcription-coupled and global excision repair // Nucleic Acids Res. V. 25. - P. 3974-3979.

130. Luhr B., Scheller J., Meyer P., Kramer W. Analysis of in vivo correction of defined mismatches in the DNA mismatch repair mutants msh2, msh3 and msh6 of Saccharomyces cerevisiae. I I Mol. Gen. Genet. 1998. - V. 257.-P. 362-367.

131. McGill C., Holbeck S. L., Strathern J. N. The chromosome bias of misincorporations during double-strand break repair is not altered in mismatch repair-defective strains of Saccharomyces cerevisiae. //Genetics. 1998. - V. 148. - P. 1525-1533.

132. Meneghini R., Hanawalt P. C. Postreplication repair in human cells: on the presence of gaps opposite dimers and recombination. // Basic Life Sci. -1975. V. 5B. - P. 639-642.

133. Microbal genetics bulletin. Yeast genetics. Suppl. 1969. V. 31.

134. Michaels M. L., Pham 1., Nghiem Y., Cruz C., Miller J.H. MutY, an adenine glycosylase active on G-A mispairs, has homology to endonuclease III. //Nucleic Acids Res. 1990. - V.18. - P.3841-3845.

135. Michaels M. L., Tchou J., Grollman A. P., Miller J. H. A repair system for 8-oxo-7,8-dihydrodeoxyguanine. //Biochemistry. 1992. - V.31. - P. 10964-10968.

136. Modrich P. DNA mismatch correction // Ann. Rev. Biochem. 1987. -V. 56.-P. 435-466.

137. Modrich P. Mechanisms and biological effects of mismatch repair // Ann. Rev. Genet. -1991. V. 25. - P. 229-253.

138. Modrich P. Mismatch repair, genetic stability and cancer // Science. -1994. V. 266. - P. - 1959-1960.

139. Modrich P., Lahue R. Mismatch repair in replication fidelity, genetic recombination, and cancer biology // Annu. Rev. Biochem. 1996. - V. 65. - P. 101-133.

140. Moore J. K., Haber J. E. Cell cycle and genetic requirements of two pathways of nonhomologous end-joining repair of double strand breaks in Saccharomyces cerevisiae //Mol. Cell. Biol. 1996. - V. 16. - P. 2164-2173.

141. Moustacchi E. DNA repair in yeast: genetic control and biological consequences. / In: "Advances in radiational research.", Ed. by J. Lett, Academic Press, N.Y. 1986.

142. Mueller J. P., Smerdon M. J. Repair of plasmid and genomic DNA in a rad7 delta mutant of yeast // Nucleic Acid Res. - 1995. - V. 23. - P. 34573464.

143. Mueller J. P., Smerdon M. J. Rad23 is required for transcription-coupled repair and efficient overall repair in Saccharomyces cerevisiae I I Mol. Cell. Biol. - 1996. - V. 16. - P. 2361-2368.

144. Munz P. On some properties of five mutator alleles in Schizosaccharomyces pombe I I Mutat. Res. 1975. - V. 29. - P. 155-157.

145. Muster-Nassal C., Kolodner R. Mismatch-correction catalyzed by cell-free extracts of Saccharomyces cerevisiae II Proc. Natl. Acad. Sci. USA. -1986.-V. 83.-P. 7618-7622.

146. Nakai S., Matsumoto S. Two types of radiosensitive mutants in yeast // Mutat. Res. 1967. - V. 4. - P. 129-136.

147. Nasim A., Brychy T. Cross-sensitivity of mutator strains to physical and chemical mutagens // Canad. J. Genet. Cytol. 1979. - V. 21. - P. 129-137.

148. Nelson J. R., Lawrence C. W., Hinkle D. C. Thymine-thymine dimer bypass by yeast DNA polymerase zeta // Science. 1996. - V. 272. - P. 16461649.

149. Nem L., Lin K., Crouse G. F. The yeast gene MSH3 defines a new class of eukariotic MutS homologues // Mol. Gen. Genet. 1993. - V. 239. - P. 97-108.

150. Pagues F., Haber J. E. Two pathways for removal of nonhomologous DNA ends during double strand break repair in Saccharomyces cerevisiae II Mol. Cell. Biol. 1997. - V. 17. - P. 6765-6771.

151. Petukhova G., Stratton S., Sung P. Catalysis of homologous DNA pairing by yeast Rad51 and Rad54 proteins // Nature. ■• 1998. V. 393. - P. 9194.

152. Pochart P., Woltering D., HollingsworthN. M. Conserved properties between functional distinct MutS homologs in yeast // J. Biol. Chem. 1997. -V. 272. - P. 30345-30349.

153. Popoff S.C., Spira A. I., Johnson A. W., Demple, B. Yeast structural gene (APN1) for the major apurinic endonuclease: homology to Escherichia coli endonuclease IV. //Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1990. V. 87. - P. 4193-4197

154. Prakash L. Repair of pyrimidine dimers in radiation-sensitive mutants rad3, rad4, rad6 and rad9 of Saccharomyces cerevisiae II Mutat. Res. -1977. -V. 45. P. 13-20.

155. Prakash L., Prakash S. Tree additional genes involved in pyrimidine dimer removal in Saccharomyces cerevisiae: RAD7, RAD 14 and MMS19 // Mol. Gen. Genet. 1979. - V. 176. - P. 351-359.

156. Prakash L. Characterization of postreplication repair in Saccharomyces cerevisiae and effects of rad6, radl8, rev3, and rad52 mutations // Mol. Gen. Genet. 1981. - V. 184. - P. 471-478.

157. Prolla T., Christie D. M., Iiscog R. M. Dual requirement in yeast DNA mismatch repair homolog of the bacterial mutL gene // Molec. Cell. Biol. -1994a. -V. 14.-P. 402-415.

158. Prolla T. A., Pang Q., Alani E., Kolodner R. D., Liskay R. M. MLH1, PMS1 and MSH2 interactions during initiation of DNA mismatch repair in yeast// Science. 1994b. - V. 265. - P. 1091-1093.

159. Promega Protocols and Applications Guide, Promega Corporation,1991.

160. Qui H., Park E., Prakash L., Prakash S. The Saccharomyces cerevisiae DNA repair gene Rad25 is required for transcription by RNA polymerase II // Gen. Dev. 1993. - V. 7. - P. 2161 -2171.

161. Ramotar D., Popoff S. C., Demple B. Cellular role of yeast Apnl apurinic endonuclease/3'-diesterase: repair of oxidative and alkylation DNA damage and control of spontaneous mutation. // Mol. Cell. Biol. 1991. - V. 11. - P. 4537-4544.

162. Reenan R. A. G., Kolodner R. D. Isolation and characterization of two Saccharomyces cerevisiae genes encoding homologues of the bacterial HexA and MutS mismatch repair proteins // Genetics. 1992a. - V.132. - P.963-973.

163. Reenan R. A. G., Kolodner R. D. Characterization of insertion mutations in the Saccharomyces cerevisiae MSH1 and MSH2 genes: evidence for separate mitochondrial and nuclear functions // Genetics. 1992b. - V. 132. -P. 975-985.

164. Resnick M. A. Induction of mutations in Saccharomyces cerevisiae by ultraviolet light //Mutat. Res. 1969. - V. 7. - P. 315-332.

165. Resnick M. A. The repair of double-strand breaks in the nuclear DNA of yeast // Radiat. Res. 1974. - V. 59. - P. 95-96.

166. Resnick M. A. The repair of double-strand breaks in DNA: A model involving recombination // J. Theor. Biol. 1976. - V. 59. - P. 97-106.

167. Roman, H. A system selective for mutations affecting the synthesis of adenine in yeast. // Compt. Rend. Trav. Lab. Carlsberg. Ser. Physiol. 1956. -V. 26.-P. 299-314.

168. Runyon G.T, Bear D. G., Lohman T. M. Escherichia coli helicase II (UvrD) protein initiates DNA unwinding at nicks and blunt ends. // Proc. Natl. Acad. Sei. USA. 1990. - V. 16. - P. 6383-6387

169. Rothstein R. J. One step gene disruption in yeast. // Methods Enzimol. 1983. - V. 101. - P. 202-211.

170. Saffran W. A., Cantor C. R., Smith E. D., Magdi M. Psoralen damage induced plasmid recombination in Saccharomyces cerevisiae: dependence on RAD1 and RAD52 // Mutation. Res. - 1992. - V. 274. - P. 1-9.

171. Sakumi K., Sekiguchi M. Structures and functions of DNA glycosylases // Mutat. Res. 1990. - V. 236, P. 161-172.

172. Sancar A. Mechanisms of DNA excision repair // Science. 1994. -V. 266.-P.- 1954-1956.

173. Sancar A. DNA excision repair // Annu. Rev. Biochem. 1996. - V. 65.-P. 43-81.

174. Sandigursky M., Yacoub A., Kelly M. R., Xu Y. Franklin W. A., Deutch W. A. The yeast 8-oxoguanine DNA glycosylase (Oggl) contains a DNA deoxyribophosphodiesterase (dRpase) activity // Nucleic Acids Res. -1997. -V. 4557-4561.

175. Saparbaev M., Prakash L., Prakash S. Requirement of mismatch repair genes MSH2 and MSH3 in the RAD 1-RAD 10 pathways of mitotic recombination in Saccharomyces cerevisiae II Genetics. 1996. - V. 142. - P. 727-736.

176. Schaaper R. M. Base selection, proofreading, and mismatch repair during DNA replication in Escherichia coli // J. Biol. Chem. 1993. - V. 268. -P. 23762-23765.

177. Schauber C., Chen L., Tongaonkar P., Vega J., Lambertson D., Potts W., Madura K. Rad23 links DNA repair to the ubiquitin/proteosome pathway // Nature. 1998. - V. 391. - P.715-718.

178. Schiestl R. H., Prakash S., Prakash L. The SRS2 suppressor of rad6 mutations of Saccharomyces cerevisiae acts by channeling DNA lesions into the RAD52 DNA repair pathway // Genetics. 1990. - V. 124. - P. 817-831.

179. Sekiguchi M., Horiuchi T., Maki H., Maruyama M., Oeda K. Cloning of mutator genes and identification of their products.// Princess Takamatsu Symp. 1982. - V. 12 - P. 181-188

180. Smith B. T., Walker G. C. Mutagenesis and more: umuDC and the Escherichia coli SOS response // Genetics. 1998. - V. 148. - P. 1599-1610.

181. Snow R. Mutants of yeast sensitive to ultraviolet light // J. Bacteriol. 1967.-V. 94.-P. 571-575.

182. Soo-Hwang T., Jackson S. P. Identification of Saccharomyces cerevisiae DNA ligase IV: involvement in DNA double-strand break repair // EMBO J. 1997. - V. 16., P. 4788-4795.

183. Stalil F. Meiotic recombination in yeast: coronation of the doublestrand break repair model // Cell. 1996. - V. 87. - P. 965-968.

184. Sugawara N., Pagues F., Colaiacovo M., Haber J. E. Role of Saccharomyces cerevisiae Msh2 and Msh3 repair proteins in double-strand break-induced recombination // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1997. - V. 94. - P. 9214-9219.

185. Sung P., Watkins J. F., Prakash L., Prakash S. Negative superhelicity promotes ATP-dependent binding of yeast RAD3 protein to ultraviolet-damaged DNA. // J. Biol. Chem. 1994. - V. 269 - P. 8303-8308.

186. Sung P., Guzder S. N., Prakash L., Prakash S. Reconstitution of TFIIH and requirement of its DNA helicase subunits, Rad3 and Rad25, in the incision step of nucleotide excision repair. // J. Biol. Chem. 1996. - V. 271-P. 10821-10826.

187. Sung P. Function of yeast Rad52 protein as a mediator between replication protein A and Rad51 recombinase // J. Biol. Chem. 1997. - V. 272. -P. 28194-28197.

188. Sung P. Yeast Rad55 and Rad57 form a heterodimer that functions with replication protein A to promote DNA strand exchange by Rad51 recombinase // Genes Dev. 1997. - V. 11. - P. 1111-1121.

189. Suter B., Livingstone-Zatchej M., Thomal F. Chromatin structure modulates DNA repair by photolyase in vivo II EMBO J. 1997. - V. 16. - P. 2150-2160.

190. Sweder K. S., Mori T., Hanawalt P. C. DNA repair deficiency associated with mutations in genes encoding subunits of transcription initiation factor TFIIH in yeast // Nucleic. Acid. Res. 1996. - V. 24. - P. 1540-1546.

191. Szankasi P., Smith G. R. A role for exonuclease I from S. pombe in mutation avoidance and mismatch correction I I Science. 1995. - V.267. - P. 1166-1169.

192. Teo S.-H., Jackson S. P. Identification of Saccharomyces cerevisiae DNA ligase IV: involvement in DNA double-strand break repair // EMBO J. -1997. V. 16. - P. 4788-4795.

193. Teng S.-C., Kim B., Gabriel A. Retrotransposon reverse-transcriptase-mediated repair of chromosome breaks // Nature. 1996. - V. 383. - P. 641-644.

194. Tijsterman M., de Yong J. G. T. Van de Putte P., Brouwer J. Transcription-coupled and global genome repair in the Saccharomycescerevisiae RPB2 gene at nucleotide resolution // Nucleic Acids Res. 1996. - V. 24. - P. 3499-3506.

195. Tomkinson A. E., Bardwell A. Y., Bardwell L., Tappe N. Y., Friedberg E. C. Yeast DNA repair and recombination proteins Radl and RadlO constitute a single-stranded-DNA endonuclease // Nature. 1993. - V. 362. - P. 860-862.

196. Varlet I., Canard B., Brooks P., Cerovic G., Radman M. Mismatch repair in Xenopus egg extracts: DNA strand breaks act as signals rather than excision points.//Proc. Natl. Acad. Sei. USA. 1996. - V.93. - P. 10156-10161

197. Verhage R. A., Zeeman A.M., Lombaerte M. Van de Putte P., Brouwer J. Analysis of gene- and strand-specific repair in the moderately UV-sensitive Saccharomyces cerevisiae rad23 mutant // Mutat. Res. - 1996. - V. 362.-P. 155-165.

198. Verhage R. A., Van de Putte P., Brouer J. Repair of rDNA in Saccharomyces cerevisiae: RAD4-independent strand-specific nucleotide excision repair of DNA polymerase I transcribed genes // Nucleic. Acid. Res. -1996. V. 24. - P. 1020-1025.

199. Ward A. C. Single-step purification of shuttle vectors from yeast for high frequency back-transformation into E. coli II Nucleic Acids Res. 1990. -V. 18.-P. 5319.

200. Waters R., Moustacchi E. The fate of ultraviolet induced pyrimidine dimers in the mitochondrial DNA of Saccharomyces cerevisiae following various post-irradiation cell treatments // Biochem. Biophis. Acta. 1974. - V. 366. - P. 241-250.159

201. Willamson M. S., Game J.C., Fogel S. Meiotic gene conversion mutants in Saccharomyces cerevisiae. 1. Isolation and characterization of pmsl-1 and pmsl-2 // Genetics. 1985. - V. 97. - P.609-614.

202. Выражаю глубокую благодарность своему научному руководителю Владимиру Геннадьевичу Королеву за выработку теоретических и методических подходов к выполнению данной работы, неоценимую помощь при обсуждении результатов, и за постоянную заботу и внимание.

203. Я глубоко признателен Светлане Васильевне Ковальцовой и Ирине Васильевне Федоровой за помощь в овладении методами генетики дрожжей. C.B. Ковальцова также оказала мне помощь в картировании гена HSM2, за что я ей искренне признателен.

204. Выражаю искреннюю признательность Вячеславу Тимофеевичу Пешехонову, обучившему меня множеству методов молекулярной генетики.

205. Я благодарен также Сергею Алексеевичу Кожину за плодотворное обсуждение результатов настоящего исследования и ценные советы по оформлению работы.

206. Большое спасибо всем сотрудникам лаборатории генетики эукариот ОМРБ ПИЯФ за помощь и поддержку.